Kotor ligger i en undangömd del av Kotorbukten vars infart och öar befästes under medeltiden för att förhindra fiendeinvasion från medelhavet. Kotorbukten är under fortsatt utveckling som populär turist och rekreationsattraktion i östra Medelhavet
Regionen ingick omkring 170 f.Kr. i romerska riket. Under 1000-talet nämndes orten för första gången i en urkund och 1195 var kyrkan St. Lukas färdigställd. Kotor blev den viktigaste hamnen för regionen som regerades av huset Nemanjić. Mellan 1483 och 1687 ingick staden i osmanska riket. Året 1797 till 1805 samt 1814 till 1818 ingick Kotor i Donau-monarkin. En jordskalv förstörde stora delar av staden den 15 april 1979. Återuppbyggnaden började direkt efteråt.[1]