[go: up one dir, main page]

WO2025075163A1 - 自己反応性dn2b細胞が産生する自己抗体およびその使用 - Google Patents

自己反応性dn2b細胞が産生する自己抗体およびその使用 Download PDF

Info

Publication number
WO2025075163A1
WO2025075163A1 PCT/JP2024/035660 JP2024035660W WO2025075163A1 WO 2025075163 A1 WO2025075163 A1 WO 2025075163A1 JP 2024035660 W JP2024035660 W JP 2024035660W WO 2025075163 A1 WO2025075163 A1 WO 2025075163A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
cells
antibody
amino acid
acid sequence
autoantibody
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
PCT/JP2024/035660
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
康悦 小笠原
智徳 石井
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Tohoku University NUC
Original Assignee
Tohoku University NUC
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Tohoku University NUC filed Critical Tohoku University NUC
Publication of WO2025075163A1 publication Critical patent/WO2025075163A1/ja
Pending legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants

Definitions

  • the present invention relates to an autoantibody produced by autoreactive DN2B cells and its use. More specifically, the present invention relates to an autoantibody produced by autoreactive DN2B cells or an antigen-binding fragment thereof, an antibody having the antigen-binding site of the autoantibody, a diagnostic agent for systemic lupus erythematosus, and a method for testing a blood sample.
  • This application claims priority to U.S. Provisional Application No. 63/542,310, filed in the United States on October 4, 2023, the contents of which are incorporated herein by reference.
  • SLE Systemic lupus erythematosus
  • Non-Patent Document 1 It has been reported that double negative 2 (DN2) cells are increased in SLE patients (Non-Patent Document 1).
  • the present disclosure aims to provide an antibody or an antigen-binding fragment thereof that is useful for diagnosing systemic lupus erythematosus, a diagnostic agent for systemic lupus erythematosus that uses the antibody or antigen-binding fragment, and a method for testing blood samples that is useful for diagnosing systemic lupus erythematosus.
  • the present disclosure includes the following aspects.
  • An antibody or an antigen-binding fragment thereof selected from the group consisting of the following (a) to (c): (a) an antibody comprising a heavy chain variable region having HCDR1, HCDR2 and HCDR3 derived from a V chain shown in Table 1 in any combination of Nos.
  • a diagnostic agent for systemic lupus erythematosus comprising the autoantibody or antigen-binding fragment thereof according to [1] or [2].
  • a diagnostic agent for systemic lupus erythematosus comprising the antibody or antigen-binding fragment thereof according to [3] or [4].
  • a method for testing a blood sample comprising a step of measuring the expression level of an autoantibody produced by autoreactive DN2B cells in a blood sample collected from a test subject, wherein a higher expression level of the autoantibody than a reference value indicates a high possibility that the test subject is suffering from systemic lupus erythematosus.
  • the present disclosure provides an antibody or antigen-binding fragment thereof useful for diagnosing systemic lupus erythematosus, a diagnostic agent for systemic lupus erythematosus using the antibody or antigen-binding fragment, and a method for testing blood samples useful for diagnosing systemic lupus erythematosus.
  • Bar graph (n 1) examining PLD4 expression in immune cells from healthy donors (HD) and systemic lupus erythematosus (SLE) patients.
  • pDCs human plasmacytoid dendritic cells
  • BDCA-2 + cells indicate pDCs.
  • the results of FSC-A analysis of CD19 + cells, PLD4 + cells, and plasmablasts (PB) from SLE patients (SLE21, SLE17) are shown.
  • Flow cytometry plots compartmentalizing CD19 + B cells into "PLD4+ blast” and "PLD4+ small” based on PLD4 expression and FSC-A Box plot showing the proportion of PLD4+blasts in SLE patients. Box plot comparing SLEDAI scores between SLE patients with a high (H) and low (L) PLD4+ blast ratio. Box plot comparing SLEDAI scores between SLE patients with a high (H) and low (L) proportion of PLD4 + B cells. A plot evaluating the correlation between the ratio of PLD4+ blasts and the ratio of plasmablasts in SLE patients. Plot assessing the correlation between the proportion of PLD4 + B cells and the proportion of plasmablasts in SLE patients.
  • FIG. 1 shows the results of IgG ELISpot analysis of CD19 + B cells and PLD4 + blast cells collected from two SLE patients (SLE13 and SLE28) cultured in vitro for 4 days with a TLR7 ligand or a TLR9 ligand.
  • pDCs were defined as CD14-, CD3-, CD19-, and CD11c-negative and BDCA-2-positive.
  • B cells were defined as CD19-, CD2-, CD14-, and CD16-negative.
  • Tr transitional B cells
  • NAV naive B cells
  • Mem memory B cells
  • DN double negative B cells
  • PB plasmablasts. Box plots showing the results of comparing the proportions of each B cell subpopulation between CD19 + B cells and PLD4 + B cells. *P ⁇ 0.05, ***P ⁇ 0.005. Mann-Whitney U test.
  • Tr transitional B cells
  • NAV naive B cells
  • Mem memory B cells
  • DN double-negative B cells
  • PB plasmablasts.
  • Flow cytometry plots analyzing the ratios of CD11c + cells and CXCR5 - cells for the subpopulations of CD27 + memory cells and IgD + naive cells contained in PLD4 + blast.
  • Alexa488 Recombinant monoclonal antibody was used as the primary antibody, Purified anti-human CD16 (Mouse IgG) was used as the secondary antibody, and Goat anti-Mouse IgG (Alexa Fluor 488) was used as the tertiary antibody.
  • a numerical range expressed using " ⁇ ” means that the range includes the numbers written before and after " ⁇ " as the lower and upper limits.
  • the term “comprises” means that it may contain components other than the target component.
  • the term “consists of” means that it does not contain components other than the target component.
  • the term “consists essentially of” means that it does not contain components other than the target component in a form that exerts a special function (such as a form that completely loses the effect of the invention). In this specification, when “comprises,” it includes forms that "consist of” and forms that “consist essentially of.”
  • Proteins, peptides, nucleic acids, vectors, and cells may be isolated. "Isolated” means in a natural state or separated from other components. “Isolated” may be substantially free of other components. “Substantially free of other components” means that the content of other components contained in the isolated component is negligible. The content of other components contained in the isolated component may be, for example, 10% by mass or less, 5% by mass or less, 4% by mass or less, 3% by mass or less, 2% by mass or less, 1% by mass or less, 0.5% by mass or less, or 0.1% by mass or less.
  • the proteins, peptides, nucleic acids, vectors, and cells described herein may be isolated proteins, isolated peptides, isolated nucleic acids, isolated vectors, and isolated cells, respectively.
  • Nucleic acid sequences are written in generally accepted single letter codes unless otherwise indicated. Nucleic acid sequences are written from 5' to 3' unless otherwise indicated.
  • Amino acid sequences are written in the commonly accepted one-letter or three-letter codes unless otherwise specified. Amino acid sequences are written from N-terminus to C-terminus unless otherwise specified.
  • sequence identity between nucleic acid sequences or amino acid sequences is determined by aligning two nucleic acid sequences or amino acid sequences with gaps at the insertion and deletion sites so that the corresponding bases or amino acids are most commonly matched, and calculating the percentage of matching bases or amino acids relative to the entire nucleic acid sequence or the entire amino acid sequence excluding gaps in the resulting alignment.
  • sequence identity between nucleic acid sequences or amino acid sequences can be determined using various homology search software known in the art.
  • the value of sequence identity between nucleic acid sequences can be obtained by calculation based on an alignment obtained by the known homology search software BLASTN, and the value of sequence identity between amino acid sequences can be obtained by calculation based on an alignment obtained by the known homology search software BLASTP.
  • Antibody refers to immunoglobulin molecules and immunologically active portions of immunoglobulin molecules, i.e., molecules that contain an antigen-binding site that specifically binds an antigen. Antibodies may be polyclonal, monoclonal, or chimeric.
  • the basic antibody structural unit is known to comprise a tetramer.
  • Each tetramer has two identical pairs of polypeptide chains, each pair having one light chain (about 25 kDa) and one heavy chain (about 50-70 kDa).
  • the amino-terminal portion of each chain contains a variable region primarily responsible for antigen recognition.
  • the carboxy-terminal portion of each chain defines a constant region primarily responsible for effector function.
  • antibody molecules obtained from humans are associated with one of the classes IgG, IgM, IgA, IgE and IgD, which differ from each other depending on the nature of the heavy chain present in the molecule. Some classes have subclasses such as IgG1, IgG2.
  • the light chains may be kappa or lambda chains.
  • Antibodies may be derived from any organism. Examples of organisms from which antibodies may be derived include, but are not limited to, mammals (humans, mice, rats, rabbits, horses, cows, pigs, monkeys, dogs, etc.) and birds (chickens, ostriches).
  • Specifically bind means that an antibody reacts with one or more antigenic determinants of a specific antigen, but does not react with other antigens or binds with a much lower affinity.
  • the dissociation constant (KD) between the antibody and the specific antigen is preferably 10 -8 mol/L or less, and more preferably 10 -13 mol/L or more and 10 -9 mol/L or less.
  • the dissociation constant (KD) between the antibody and the specific antigen can be measured by a plasmon resonance assay (e.g., BIAcore, GE-Healthcare Uppsala, Sweden, etc.) using purified antigen.
  • the complementarity determining region is the site in an antibody that is involved in binding to an antigen, and is the site in an antibody molecule where the amino acid sequence changes the most depending on the antigen.
  • CDR complementarity determining region
  • the three CDRs in the heavy chain variable region are referred to as HCDR1, HCDR2, and HCDR3, in order from the N-terminus.
  • the three CDRs in the light chain variable region are referred to as LCDR1, LCDR2, and LCDR3, in order from the N-terminus.
  • CDRs can be determined according to known definitions.
  • CDRs can be determined, for example, by the definitions of Kabat (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest (National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1987) and (1991))) or Chothia (Chothia & Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987) and Chothia et al., Nature 342:877-883 (1989)).
  • the CDR may be one defined on the ImMunoGeneTics (http://imgt.org) site.
  • a V gene segment, a D gene segment, and a J gene segment are rearranged to form a heavy chain variable region coding region.
  • a J gene segment and a J gene segment are rearranged to form a light chain variable region coding region.
  • HCDR3 is usually located in a region extending from the 3' end of the V region to the 5' end of the J region.
  • the region from the 104th cysteine residue (C) from the N-terminus encoded by the V region to the 5th tryptophan residue (W) from the N-terminus encoded by the J region may be defined as HCDR3.
  • LCDR3 is usually located in a region extending from the 3'-end of the V region to the 5'-end of the J region.
  • the region from the cysteine residue (C) located at the most C-terminus in the amino acid sequence encoded by the J region to the tryptophan residue (W) or phenylalanine residue (F) located at the most N-terminus in the amino acid sequence encoded by the J region may be defined as LCDR3.
  • Antigen-binding site refers to the site in an antibody that is involved in binding to an antigen.
  • the antigen-binding site preferably includes the HCDR3 of an antibody, more preferably includes the three CDRs of the heavy chain variable region (HCDR1 to HCDR3), and even more preferably includes the three CDRs of the heavy chain variable region (HCDR1 to HCDR3) and the three CDRs of the light chain variable region (LCDR1 to LCDR3).
  • Antibodies that include the same antigen-binding site bind to the same epitope.
  • an "antigen-binding fragment” refers to a polypeptide that contains a portion of an antibody and maintains the antigen-binding ability of the original antibody.
  • the antigen-binding fragment preferably contains the antigen-binding site of the original antibody, more preferably contains the HCDR3 of the original antibody, and further preferably contains all six CDRs (HCDR1 to HCDR3, LCDR1 to LCDR3) of the original antibody.
  • antigen-binding fragments include Fab, Fab', F(ab') 2 , variable region fragments (Fv), disulfide-linked Fv, single chain Fv (scFv), sc(Fv) 2 , and the like.
  • Autoantibody refers to an antibody that specifically binds to an antigen produced in one's own body.
  • Examples of autoantibodies include antinuclear antibodies.
  • Antinuclear antibodies refer to autoantibodies whose antigens are components that make up the cell nuclei present in one's own cells.
  • antinuclear antibodies include anti-dsDNA antibodies whose antigens are double-stranded DNA, anti-Sm antibodies whose antigens are non-histone nuclear proteins, and anti-histone antibodies whose antigens are histones.
  • DN2B cells refers to double negative 2B cells. DN2B cells are IgD-negative and CD27-negative B cells. "Autoreactive DN2B cells” are DN2B cells that produce autoantibodies. In one embodiment, autoreactive DN2B cells are strongly CD11c positive, CD21 negative, strongly CD19 positive, and CXCR5 negative. IgD (Immunoglobulin D) is composed of one pair of heavy chains and one pair of light chains. CD27 is a member of the TNF receptor superfamily.
  • Examples of the amino acid sequence of human CD27 include those registered under NCBI Reference Sequence: NP_001233.2, NP_001400192.1, NP_001400193.1, NP_001400194.1, NP_001400195.1, NP_001400196.1, or NP_001400197.1.
  • CD11c (ITGAX integrin subunit alpha X) is a member of the integrin family and covalently associates with the integrin ⁇ 2 chain. Examples of the amino acid sequence of human CD11c include those registered under NCBI Reference Sequence: NP_000878.2 or NP_001273304.1.
  • CD21 (CR2 complement C3d receptor 2) is a complement regulatory protein.
  • Examples of the amino acid sequence of human CD21 include those registered under NCBI Reference Sequence: NP_001006659.1 or NP_001868.2.
  • CD19 is a member of the immunoglobulin superfamily and is known as a B cell marker.
  • Examples of the amino acid sequence of human CD19 include those registered under NCBI Reference Sequence: NP_001171569.1, NP_001372661.1, or NP_001761.3.
  • CXCR5 CXC motif chemokine receptor 5
  • Examples of the amino acid sequence of human CXCR5 include those registered under NCBI Reference Sequence: NP_001707.1 or NP_116743.1.
  • a cell is "positive” for a protein means that the cell expresses the protein in detectable amounts. If a cell is positive for a membrane protein, the protein is present in detectable amounts on the cell membrane. A cell is "negative” for a protein means that the cell does not express that protein in detectable amounts. If a cell is negative for a membrane protein, the cell does not have detectable amounts of that protein present in its cell membrane.
  • the protein is a membrane protein, whether a cell is positive or negative for the protein can be determined by flow cytometry analysis using an antibody that specifically binds to the protein.
  • a cell When a cell is "strongly positive" for a protein, it means that the cell expresses a high amount of that protein compared to the average expression of that protein in cells of the same type. B cells that are strongly positive for CD11c express more of CD11c compared to the average expression of CD11c in B cells. B cells that are strongly positive for CD19 express more of CD19 compared to the average expression of CD19 in B cells.
  • PLD4 phospholipase D family member 4
  • PLD4 is an enzyme that catalyzes the reaction of hydrolyzing phosphatidylcholine to produce phosphatidic acid and choline, and induces various intracellular signal transduction.
  • amino acid sequence of human PLD4 include those registered in the NCBI Reference Sequence database as NP_001295103.1 (sequence number 131) and NP_620145.2 (sequence number 132).
  • a first aspect of the present disclosure is an autoantibody or an antigen-binding fragment thereof produced by DN2B cells.
  • the DN2B cells are IgD-negative and CD27-negative B cells.
  • the autoreactive DN2B cells are strongly CD11c-positive, CD21-negative, strongly CD19-positive, and CXCR5-negative.
  • the autoreactive DN2B cells are PLD4-positive.
  • the autoreactive DN2B cells can be obtained by obtaining IgD-negative and CD27-negative B cells by flow cytometry analysis, and then selecting cells that are strongly CD11c-positive, CD21-negative, strongly CD19-positive, and CXCR5-negative from this B cell fraction.
  • the autoreactive DN2B cells can be obtained by selecting PLD4-positive B cells by flow cytometry analysis.
  • PLD4-positive B cells refer to B cells that express PLD4 as a surface antigen. PLD4-positive B cells can be obtained by selecting B cells by flow cytometry analysis using an anti-PLD4 antibody. In the examples described below, PLD4-positive B cells are also referred to as "PLD4 + B cells.”
  • the animal from which the autoreactive DN2B cells are derived is not particularly limited.
  • animals from which the autoreactive DN2B cells are derived include mammals (humans, mice, rats, rabbits, horses, cows, pigs, monkeys, dogs, etc.), birds (chickens, ostriches), etc.
  • B cells can be isolated from peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) by known methods.
  • B cells can be obtained from PBMCs, for example, using a commercially available B cell isolation kit.
  • the autoreactive DN2B cells may be induced by stimulating B cells with a TLR ligand.
  • TLR ligand examples include TLR7 ligands and TLR9 ligands.
  • TLR7 ligand examples include R-848 (Resiquimod), Gardiquimod, Imiquimod, Loxoribine, etc.
  • TLR9 ligand examples include oligonucleotides containing a CpG motif.
  • a drug that induces BCR cross-linking signaling may be used to induce the autoreactive DN2B cells.
  • the drug that induces BCR cross-linking signaling include anti-IgG antibodies or antigen-binding fragments thereof, and anti-IgM antibodies or antigen-binding fragments thereof.
  • the autoreactive DN2B cells that produce autoantibodies may be autoreactive DN2B cells of similar size to plasmablasts (diameter of about 8 to 20 ⁇ m).
  • the 25th percentile of the FSC-A of plasmablasts determined by flow cytometry analysis may be set as a threshold (e.g., 60K), and autoreactive DN2 cells (hereinafter also referred to as "DN2B+blast” or "PLD4+blast”) larger than this FSC-A may be used.
  • DN2B+blast autoreactive DN2 cells
  • FSC-A represents the voltage pulse area where the FSC is detected by an optical detector.
  • autoreactive DN2B cells can be produced by known methods.
  • autoreactive DN2B cells can be produced by culturing P autoreactive DN2B cells in the presence of a TLR ligand (e.g., a TLR7 ligand, a TLR9 ligand, etc.).
  • a TLR ligand e.g., a TLR7 ligand, a TLR9 ligand, etc.
  • the medium used for culturing the autoreactive DN2B cells may be a medium normally used for culturing B cells.
  • Specific examples of the medium include RPMI1640 medium, Doulbecco's modified Eagle's Medium (DMEM) medium, DMEM/F12 medium, Advanced DMEM/F12 medium, IMDM medium, Medium199 medium, Eagle's Minimum Essential Medium (EMEM) medium, ⁇ MEM medium, Ham's F12 medium, Fischer's medium, and mixed media thereof. Serum (fetal bovine serum (FBS)), serum substitutes, etc. may be added to these media.
  • Autoreactive DN2B cells can produce autoantibodies by culturing them in the medium described above with the addition of a TLR ligand.
  • the culture conditions for autoreactive DN2B cells can be the same as those typically used for culturing B cells. Temperature conditions include 37°C, which is close to body temperature. Carbon dioxide concentrations include, for example, 0.03 to 10%, with 5% being a specific example.
  • the autoantibodies produced by autoreactive DN2B cells can be purified by combining known purification techniques such as salting out, ion exchange chromatography, affinity chromatography, and gel filtration chromatography.
  • Examples of autoantibodies produced from autoreactive DN2B cells include antibodies selected from the group consisting of the following (a) to (c): (a) an antibody comprising a heavy chain variable region having HCDR1, HCDR2 and HCDR3 derived from a V chain shown in Table 1 above in any combination of Nos. 1 to 10 of Table 1; (b) an antibody comprising a light chain variable region having LCDR1, LCDR2 and LCDR3 derived from a V chain shown in Table 2 above in any combination of Nos. 1 to 10 in Table 1; (c) An antibody comprising a heavy chain variable region having HCDR1, HCDR2, and HCDR3 derived from a V chain listed in Table 1 in any combination of Nos. 1 to 10 in Table 1, and a light chain variable region having LCDR1, LCDR2, and LCDR3 derived from a V chain listed in Table 2 in any combination of Nos. 1 to 10 in Table 1.
  • the heavy chain variable region defined by combination No. 1 has CDR1 and CDR2 derived from the V chain that is VH1-18-01, and HCDR3 No. 1 (CAREQLGLIDYW: SEQ ID NO: 10).
  • the heavy chain variable region defined by combination No. 2 has CDR1 and CDR2 derived from the V chain that is VH4-34-01, and HCDR3 of No. 2 (CARAGATLNRFDPW: SEQ ID NO: 11).
  • the heavy chain variable region defined by the combination of No. 3 has CDR1 and CDR2 derived from the V chain of VH1-18-01, and HCDR3 of No. 3 (CPRGIVVNWFDPW: SEQ ID NO: 12). The same applies to the heavy chain variable regions defined by the combinations of No. 4 to No. 10 in Table 1.
  • the light chain variable region defined by combination No. 1 has CDR1 and CDR2 derived from the V chain of KV1-16-02, and LCDR3 of No. 1 (CQQYSSYPRTF: SEQ ID NO: 20).
  • the light chain variable region defined by the combination of No. 2 has CDR1 and CDR2 derived from the V chain of KV2-30-02, and LCDR3 of No. 2 (CMQGTHWPPDPHTF: SEQ ID NO: 21).
  • the light chain variable region defined by the combination of No. 3 has CDR1 and CDR2 derived from the V chain of KV2-30-02, and HCDR3 of No. 3 (CQQYNSYPLTF: SEQ ID NO: 22). The same applies to the light chain variable regions defined by the combinations of No. 4 to No. 10 in Table 2.
  • the V chain sequences in Tables 1 and 2 can be obtained from the ImMunoGeneTics (http://imgt.org) website.
  • the V chains in Tables 1 and 2 are human V chains.
  • Amino acid sequences encoded by nucleic acid sequences that have 60% or more sequence identity to nucleic acid sequences registered in ImMunoGeneTics can be used as the amino acid sequences of the V chains listed in Tables 1 and 2.
  • the amino acid sequence of the V chain of VH1-18-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:112.
  • the amino acid sequence of the V chain of VH4-34-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:113.
  • the amino acid sequence of the V chain of VH1-8-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:114.
  • the amino acid sequence of the V chain of VH1-8-02 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:115.
  • the amino acid sequence of the V chain of VH7-4-1-02 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:116.
  • the amino acid sequence of the V chain of VH5-51-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:117.
  • the amino acid sequence of the V chain of VH3-30-04 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:118.
  • the amino acid sequence of the V chain of VH3-30-3-03 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:119.
  • the amino acid sequence of the V chain of VH3-74-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:120.
  • the amino acid sequence of the V chain of VH2-70-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:121.
  • the amino acid sequence of the V chain of VH3-64-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:122.
  • the amino acid sequence of the V chain of KV1-16-02 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:123.
  • the amino acid sequence of the V chain of KV2-30-02 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:124.
  • the amino acid sequence of the V chain of KV1-5-03 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:125.
  • the amino acid sequence of the V chain of KV3-15-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:126.
  • the amino acid sequence of the V chain of KV1-6-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:127.
  • the amino acid sequence of the V chain of KV3-20-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:128.
  • the amino acid sequence of the V chain of KV1-27-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:129.
  • the amino acid sequence of the V chain of KV1-NL1-01 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:130.
  • the heavy chain variable region of the combination No. 1 in Table 1 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity with the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:59.
  • the heavy chain variable region of the combination No. 2 in Table 1 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity with the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:60.
  • the heavy chain variable region of the combination No. 3 in Table 1 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity with the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:61.
  • the light chain variable region of the combination No. 1 in Table 2 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity with the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:65.
  • the light chain variable region of the combination No. 2 in Table 2 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity with the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:66.
  • the heavy chain variable region of the combination No. 3 in Table 2 includes an amino acid sequence having 60% or more, 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more sequence identity with the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:67.
  • amino acid sequence of HCDR1 contained in the heavy chain variable region of No. 1 in Table 1 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 77.
  • amino acid sequence of HCDR2 contained in the heavy chain variable region of No. 1 in Table 1 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 78.
  • amino acid sequence of HCDR1 contained in the heavy chain variable region of No. 2 in Table 1 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 80.
  • amino acid sequence of HCDR2 contained in the heavy chain variable region of No. 2 in Table 1 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 81.
  • amino acid sequence of HCDR1 contained in the heavy chain variable region of No. 3 in Table 1 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 83.
  • amino acid sequence of HCDR2 contained in the heavy chain variable region of No. 3 in Table 1 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 84.
  • amino acid sequence of LCDR1 contained in the light chain variable region of No. 1 in Table 2 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 97 or 98.
  • amino acid sequence of LCDR2 contained in the light chain variable region of No. 1 in Table 2 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 99.
  • amino acid sequence of LCDR1 contained in the light chain variable region of No. 2 in Table 2 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 101.
  • amino acid sequence of LCDR2 contained in the light chain variable region of No. 1 in Table 2 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 102.
  • amino acid sequence of LCDR1 contained in the light chain variable region of No. 3 in Table 2 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 104.
  • amino acid sequence of LCDR2 contained in the light chain variable region of No. 3 in Table 2 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 105.
  • autoantibodies produced by PLD4-positive B cells include the following antibodies:
  • An antibody comprising a heavy chain variable region including HCDR1 having an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 77, 80 or 83, HCDR2 having an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 78, 81 or 84, and HCDR3 having an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 79, 82 or 85.
  • An antibody comprising a light chain variable region including an LCDR1 having an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 97, 98, 101 or 104, an LCDR2 having an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 99, 102 or 105, and an LCDR3 having an amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 100, 103, 106 or 107.
  • An antibody comprising a heavy chain variable region defined in (4) above and a light chain variable region defined in (7) above.
  • An antibody comprising a heavy chain variable region defined in (6) above and a light chain variable region defined in (9) above.
  • the HCDR1 to HCDR3 and LCDR1 to LCDR3 described in (1) to (9) above each preferably consist of the amino acid sequence of the designated sequence number.
  • An antibody comprising a heavy chain variable region defined in (18) above and a light chain variable region defined in (21) above.
  • An antibody comprising a heavy chain variable region defined in (17) above, the heavy chain variable region comprising HCDR1 to HCDR3 defined in (4) above, and a light chain variable region defined in (20) above, the light chain variable region comprising LCDR1 to LCDR3 defined in (7) above.
  • An antibody comprising a heavy chain variable region defined in (18) above, the heavy chain variable region comprising HCDR1 to HCDR3 defined in (5) above, and a light chain variable region defined in (21) above, the light chain variable region comprising LCDR1 to LCDR3 defined in (8) above.
  • An antibody comprising a heavy chain variable region defined in (19) above, the heavy chain variable region comprising HCDR1 to HCDR3 defined in (6) above, and a light chain variable region defined in (22) above, the light chain variable region comprising LCDR1 to LCDR3 defined in (9) above.
  • An antibody comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:59.
  • the mutation when the heavy chain variable region or the light chain variable region has a mutation with respect to the amino acid sequence described in the designated SEQ ID NO:, the mutation may be any of substitution, deletion, insertion, and addition, or a combination of these.
  • the mutation is preferably present in a region (framework region) other than the CDRs (HCDR1 to HCDR3, LCDR1 to LCDR3).
  • amino acids with similar chemical properties can be classified into groups, for example, acidic amino acids, basic amino acids, and neutral amino acids.
  • the acidic amino acid group includes aspartic acid and glutamic acid.
  • the basic amino acid group includes lysine, arginine, and histidine.
  • neutral amino acids can be further classified into amino acids with a hydrocarbon chain (glycine, alanine, valine, leucine, isoleucine, proline), amino acids with a hydroxyl group (serine, threonine), amino acids with a sulfur atom (cysteine, methionine), amino acids with an amide group (asparagine, glutamine), amino acids with an imino group (proline), amino acids with an aromatic group (phenylalanine, tyrosine, tryptophan), etc.
  • a hydrocarbon chain glycine, alanine, valine, leucine, isoleucine, proline
  • amino acids with a hydroxyl group serine, threonine
  • amino acids with a sulfur atom cysteine, methionine
  • amino acids with an amide group asparagine, glutamine
  • amino acids with an imino group proline
  • amino acids with an aromatic group phenylalanine, tyros
  • the autoantibody produced by autoreactive DN2B cells is preferably an antinuclear antibody. It is believed that the autoantibody produced by autoreactive DN2B cells is involved in the pathology of SLE. As shown in the examples described later, the BCR repertoire of autoreactive DN2B cells (especially PLD4+blast) is biased. Therefore, the antibody produced by autoreactive DN2B cells has the same base sequence as BCR and is an autoantibody. This autoantibody can be used as a marker for SLE. In addition, the autoantibody produced by autoreactive DN2B cells can be used as a diagnostic agent for SLE. For example, it can be used to quantify the autoantibody involved in the pathology of SLE in a blood sample (plasma, serum, etc.) to be tested by competitive ELISA or the like.
  • a second aspect of the present disclosure is an antibody (hereinafter also referred to as an "autoantibody-derived antibody”) or an antigen-binding fragment thereof, comprising an antigen-binding site contained in the autoantibody according to the first aspect (hereinafter also referred to as an "autoreactive DN2B cell-derived autoantibody”).
  • the autoantibody-derived antibody preferably contains a heavy chain variable region including HCDR3 possessed by an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody. It is more preferable that the autoantibody-derived antibody contains a heavy chain variable region including HCDR1 to HCDR3 possessed by an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody. It is even more preferable that the autoantibody-derived antibody contains a heavy chain variable region including HCDR1 to HCDR3 possessed by an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody, and a light chain variable region including LCDR1 to LCDR3 possessed by an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody.
  • Antibodies derived from autoantibodies can be obtained, for example, by using antibody genes possessed by autoreactive DN2B cells.
  • messenger RNA mRNA
  • cDNA complementary DNA
  • the heavy chain VDJ region and light chain VJ region are amplified from the cDNA by a nucleic acid amplification method (e.g., PCR method), and the obtained fragment is linked to a constant region coding sequence and cloned into an appropriate expression vector.
  • the expression vector is introduced into an appropriate cell and cultured to obtain an autoantibody-derived antibody.
  • the autoantibody-derived antibody can be purified by a known purification method (salting out, ion exchange chromatography, affinity chromatography, gel filtration chromatography, etc.).
  • the constant region coding sequence may be derived from the same animal species as the animal species from which the autoreactive DN2B cells are derived, or may be derived from a different animal species.
  • An autoantibody-derived antibody may be obtained by designing an antibody gene or an antigen-binding fragment gene based on the amino acid sequence of an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody.
  • a nucleic acid sequence encoding HCDR1 to HCDR3 of an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody is linked to a nucleic acid sequence encoding a heavy chain framework (FR) to design a heavy chain variable region coding sequence.
  • FR heavy chain framework
  • a nucleic acid having a heavy chain variable region coding sequence may be chemically synthesized by the phosphoramidite method or the like.
  • a nucleic acid having a heavy chain variable region coding sequence is linked to a heavy chain constant region coding sequence and cloned into an appropriate expression vector.
  • a nucleic acid sequence encoding LCDR1 to LCDR3 of an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody is linked to a nucleic acid sequence encoding a light chain framework (FR) to design a light chain variable region coding sequence.
  • a nucleic acid having a light chain variable region coding sequence may be chemically synthesized by the phosphoramidite method or the like.
  • a nucleic acid having a light chain variable region coding sequence is linked to a light chain constant region coding sequence and cloned into an appropriate expression vector.
  • the heavy chain coding sequence and the light chain coding sequence may be cloned into the same expression vector. This expression vector can be introduced into appropriate cells and cultured to obtain an autoantibody-derived antibody.
  • the FR coding sequence and the constant region coding sequence may be derived from the same animal species as the animal species from which the DN2B cells are derived, or may be derived from a different animal species.
  • the heavy chain variable region and/or the light chain variable region may be derived from an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody in its entirety, including the FCDR and FR.
  • the autoantibody-derived antibody may be obtained by producing a transgenic animal incorporating a gene encoding the autoantibody-derived antibody designed as described above.
  • the autoantibody-derived antibody can be obtained by purifying the body fluids (e.g., blood, milk, etc.) of the transgenic animal.
  • the nucleic acid sequence encoding the antigen-binding fragment can be designed appropriately depending on the structure of the antigen-binding fragment.
  • scFv has a structure in which a heavy chain variable region and a light chain variable region are linked by a linker. Therefore, by linking a heavy chain variable region containing HCDR1 to HCDR3 of an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody and a light chain variable region containing LCDR1 to LCDR3 of an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody via a linker coding sequence, a nucleic acid containing an scFv coding sequence can be obtained.
  • Antibodies derived from autoantibodies include antibodies selected from the group consisting of (a) to (c) above, and antibodies selected from the group consisting of (1) to (37) above.
  • Representative examples of nucleic acid sequences encoding the V chains and CDRs in Tables 1 and 2 described in (a) to (c) are shown in Tables 8 to 13.
  • Representative examples of nucleic acid sequences encoding the amino acid sequences of the SEQ ID NOs designated in (1) to (37) are shown in Tables 14 to 17.
  • the autoantibody-derived antibody has the same antigen specificity as the autoreactive DN2B cell-derived autoantibody. Therefore, the autoantibody-derived antibody binds to an antigen produced in the body of the individual from which the autoreactive DN2B cell is derived.
  • the autoantibody-derived antibody is preferably an antinuclear antibody. Since the autoantibody-derived antibody has the same antigen specificity as the autoreactive DN2B cell-derived autoantibody, it can be used as a diagnostic agent for SLE, similar to the autoreactive DN2B cell-derived autoantibody.
  • a third aspect of the present disclosure is a diagnostic agent for systemic lupus erythematosus (hereinafter also referred to as an "SLE diagnostic agent”), which comprises at least one selected from the group consisting of the autoantibody according to the first aspect (autoreactive DN2B cell-derived autoantibody) or an antigen-binding fragment thereof, and the antibody according to the third aspect (antibody derived from an autoantibody) or an antigen-binding fragment thereof.
  • SLE diagnostic agent for systemic lupus erythematosus
  • the SLE diagnostic agent may contain other components in addition to at least one of the autoreactive DN2B cell-derived autoantibody, the autoantibody-derived antibody, and the antigen-binding fragment thereof.
  • the other components include, but are not limited to, solvents, diluents, vehicles, excipients, flow enhancers, binders, granulating agents, dispersing agents, suspending agents, wetting agents, lubricants, disintegrants, solubilizing agents, stabilizers, emulsifiers, and fillers.
  • One type of pharma- ceutically acceptable carrier may be used alone, or two or more types may be used in combination.
  • the SLE diagnostic agent may be at least one of an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody, an autoantibody-derived antibody, and an antigen-binding fragment thereof dissolved in a buffer solution.
  • the SLE diagnostic agent may be at least one of an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody, an autoantibody-derived antibody, and an antigen-binding fragment thereof dissolved in a buffer solution and lyophilized.
  • buffer solutions include, but are not limited to, phosphate buffered saline, Tris buffer, citrate buffer, acetate buffer, etc.
  • the autoreactive DN2B cell-derived autoantibody, the autoantibody-derived antibody, and the antigen-binding fragments thereof may be labeled.
  • the labeling substance for labeling is not particularly limited, and any known substance may be used.
  • the labeling substance include enzyme labeling substances, fluorescent labeling substances, radioisotope labeling substances, electrochemiluminescence labeling substances, metal nanoparticles, and the like.
  • the enzyme labeling substance include peroxidase (e.g., horseradish peroxidase), alkaline phosphatase, and the like.
  • fluorescent labeling substance examples include carboxyfluorescein (FAM), 6-carboxy-4',5'-dichloro-2',7'-dimethoxyfluorescein (JOE), fluorescein isothiocyanate (FITC), tetrachlorofluorescein (TET), 5'-hexachloro-fluorescein-CE phosphoramidite (HEX), Cy3, Cy5, Alexa568, Alexa647, and the like.
  • radioisotope-labeled substances examples include iodine-125.
  • electrochemiluminescent labeling substances include ruthenium complexes. Labeling can be performed by appropriately selecting a known method depending on the type of labeling substance.
  • the SLE diagnostic agent may be combined with other items to form an SLE diagnostic kit.
  • Other items included in the SLE diagnostic kit include instruments and reagents used in competitive ELISA.
  • Instruments used in competitive ELISA include, but are not limited to, solid-phase carriers such as well plates, antigens, labeling substance detection reagents, blood sample preparation reagents, diluents, buffer solutions, blocking reagents, and instructions for use.
  • the autoreactive DN2B cell-derived autoantibody and the autoantibody-derived antibody are antinuclear antibodies
  • the antigen may be cells of the animal species from which the autoreactive DN2B cells are derived.
  • a fourth aspect of the present disclosure is a method for testing a blood sample.
  • the method includes a step of measuring the expression level of an autoantibody produced by autoreactive DN2B cells in a blood sample collected from a test subject.
  • a higher expression level of the autoantibody than a reference value indicates that the test subject is likely to be affected by systemic lupus erythematosus.
  • the test of the blood sample can be performed in vitro.
  • the test subject is a subject to be tested for the possibility of suffering from SLE.
  • the test subject is not particularly limited as long as it is an animal that may suffer from SLE. Specific examples of the test subject include humans and non-human mammals.
  • Blood sample refers to a sample derived from blood components collected from a test subject.
  • Blood samples include plasma, serum, and blood cells, as well as samples obtained by subjecting these to some kind of processing.
  • Samples obtained by processing blood cells include cell populations obtained by culturing blood cells, and culture supernatants obtained by culturing blood cells.
  • Methods for measuring the expression level of autoreactive DN2B cell-derived autoantibodies include a method for measuring the mRNA of autoreactive DN2B cell-derived autoantibodies and a method for measuring autoreactive DN2B cell-derived autoantibodies.
  • a sample containing B cells is used as the blood sample.
  • An example of the sample containing B cells is peripheral blood mononuclear cells (PBMCs).
  • PBMCs peripheral blood mononuclear cells
  • a cell population obtained by culturing a blood cell sample (e.g., PBMCs) containing B cells in the presence of a TLR ligand (TLR7 ligand, TLR9 ligand, etc.) may be used.
  • a known method can be used for measuring mRNA.
  • An example of a method for measuring mRNA is RT-qPCR.
  • a primer specific to the mRNA of an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody is used as a primer for use in RT-qPCR.
  • Such a primer can be designed, for example, from any of the nucleic acid sequences set forth in SEQ ID NOs: 50 to 55 (see Tables 8 to 13).
  • the primer is preferably a primer capable of amplifying the heavy chain variable region coding region or the light chain variable region coding region of an autoreactive DN2B cell-derived autoantibody, and more preferably a primer capable of amplifying the heavy chain variable region coding region.
  • the primer is preferably a primer capable of amplifying at least a part of the HCDR3 coding region or the LCDR3 coding region, and more preferably a primer capable of amplifying at least a part of the HCDR3 coding region.
  • the forward primer can be designed, for example, to anneal to a region 5' from the HCDR3 coding region.
  • the reverse primer can be designed, for example, to anneal to a region including at least a part of the HCDR3 coding region.
  • Measurement of mRNA also allows detection of autoantibodies and diagnosis of SLE.
  • primers capable of amplifying nucleic acid sequences encoding H1 to H3 can be used.
  • Specific examples of nucleic acid sequences encoding H1 to H3 are shown in Tables 8 to 10, respectively.
  • primers can be designed in the region where the sequences of H1-1 to H1-5 shown in Table 8 are common.
  • the blood sample may be plasma or serum, or may be a culture supernatant obtained by culturing a blood cell sample (e.g., PBMC) containing B cells in the presence of a TLR ligand (e.g., TLR7 ligand, TLR9 ligand, etc.).
  • a blood cell sample e.g., PBMC
  • TLR ligand e.g., TLR7 ligand, TLR9 ligand, etc.
  • Methods for measuring autoreactive DN2B cell-derived autoantibodies include, for example, competitive ELISA using at least one selected from the group consisting of isolated autoreactive DN2B cell-derived autoantibodies, autoantibody-derived antibodies, and antigen-binding fragments thereof (hereinafter also referred to as "test antibody").
  • test antibody an antigen is immobilized on a solid-phase carrier such as a well plate, and reacted with a blood sample and a labeled test antibody. The binding of the test antibody to the antigen is inhibited depending on the amount of autoreactive DN2B cell-derived autoantibody contained in the blood sample.
  • the autoreactive DN2B cell-derived autoantibody present in the blood sample can be measured by measuring the test antibody bound to the antigen.
  • the test antibody is an antinuclear antibody
  • the antigen can be cells of the same animal species as the test subject.
  • an expression level of autoreactive DN2B cell-derived autoantibodies higher than the reference value indicates that the test subject is highly likely to be suffering from SLE.
  • an expression level of autoreactive DN2B cell-derived autoantibodies higher than the reference value indicates that the blood sample is derived from a test subject who is highly likely to be suffering from SLE.
  • An expression level of autoreactive DN2B cell-derived autoantibodies lower than the reference value indicates that the blood sample is derived from a test subject who is low likely to be suffering from SLE.
  • the reference value may be, for example, a numerical value calculated by performing statistical processing or the like from the expression levels of autoreactive DN2B cell-derived autoantibodies measured in a group of healthy subjects consisting of an arbitrary number of people.
  • the reference value may be, for example, a numerical value calculated by performing statistical processing or the like from the expression levels of autoreactive DN2B cell-derived autoantibodies measured in a group of subjects consisting of an arbitrary number of people suffering from SLE.
  • the reference value may be, for example, a cutoff value calculated by ROC analysis or the like from the expression levels of autoreactive DN2B cell-derived autoantibodies measured in a group of healthy subjects and a group of subjects suffering from SLE.
  • the method of this embodiment may include other steps in addition to the measurement step.
  • the other steps include a step of definitively diagnosing SLE in a test subject who is likely to have SLE, and a step of treating SLE in a test subject who is likely to have SLE.
  • SLE can be diagnosed, for example, by clinical and immunological findings associated with the symptoms of SLE.
  • SLE treatment methods include, for example, administration of nonsteroidal anti-inflammatory drugs, glucocorticoids, hydroxychloroquine, and immunosuppressants.
  • the present disclosure may also include the following aspects.
  • a method for diagnosing systemic lupus erythematosus comprising a step of measuring the expression level of an autoantibody produced by autoreactive DN2B cells in a blood sample collected from a test subject, wherein a higher expression level of the autoantibody than a standard value indicates a high possibility that the test subject is suffering from systemic lupus erythematosus.
  • a method for treating systemic lupus erythematosus comprising: a step (a) of measuring the expression level of an autoantibody produced by autoreactive DN2B cells in a blood sample collected from the test subject; a step (b) of determining that the test subject, in which the expression level of the autoantibody measured in the step (a) is higher than a reference value, is suffering from systemic lupus erythematosus; and a step (c) of treating the test subject for systemic lupus erythematosus determined to be suffering from systemic lupus erythematosus in the step (b).
  • (C) A method for collecting data for diagnosing systemic lupus erythematosus, comprising a step of measuring the expression level of an autoantibody produced by autoreactive DN2B cells in a blood sample collected from a test subject, wherein a higher expression level of the autoantibody than a standard value indicates a high possibility that the test subject is suffering from systemic lupus erythematosus.
  • D Systemic lupus erythematosus markers including DN2B cell-derived autoantibodies.
  • F Use of a polypeptide selected from the group consisting of an isolated DN2B cell-derived autoantibody, an autoantibody-derived antibody, and an antigen-binding fragment thereof, for the manufacture of a diagnostic agent for systemic lupus erythematosus.
  • Anti-human PLD4 monoclonal antibodies were generated by immunizing female BALB/c mice with a purified recombinant fusion protein (cDNA: SEQ ID NO: 1) in which the extracellular domain of the PLD4 molecule was bound to the Fc region of mouse immunoglobulin (Ig) G2a.
  • cDNA SEQ ID NO: 1
  • Ig mouse immunoglobulin
  • PBMC peripheral blood mononuclear cell isolation and naive B cell isolation
  • PBMCs PBMCs after removal of RBCs were used for flow cytometry, cell culture, or isolation of naive B cells.
  • Naive B cells were isolated using the Naive B Cell Isolation Kit ii, human (Miltenyi Biotec, Gladbach, Germany) according to the manufacturer's instructions.
  • RT-qPCR real-time quantitative PCR analysis of PLD4 gene expression
  • ABI Prism 7000 Applied Biosystems
  • cDNA was synthesized from individual cells using the SYBR green qPCR SuperMix-UDG kit (Invitrogen).
  • human PBMCs were isolated from apheresis products of healthy donor blood (Memorial Blood Centers of Minnesota, Minneapolis, MN, USA) (Takeda Y, S, et al. Int J Mol Sci 2017 18:1162.).
  • tissue expression BD TM MTC multiple tissue cDNA panel (Takara Bio) was used.
  • PCR was performed using ABI Prism 7000 (Applied Biosystems). 50 cycles of 50°C, 2 minutes; 95°C, 10 minutes; 95°C, 15 seconds; and 60°C, 1 minute were performed. Each transcript was normalized with the value of human glyceraldehyde-3-phosphatase (GAPDH) gene to account for sample variability.
  • GPDH human glyceraldehyde-3-phosphatase
  • PLD4 sense primer sequence 1 5'-AGGACATCCACCGACCTG-3' (SEQ ID NO: 2)
  • PLD4 sense primer sequence 2 5'-GTGAAAGTCTTCATCGTGCCG-3' (SEQ ID NO: 3)
  • PLD4 antisense primer sequence 1 5'-GCAAAACCCCTGTGA-3' (SEQ ID NO: 4)
  • PLD4 antisense primer sequence 2 5'-GTGCTGCTGAAGTAATCCTCC-3' (SEQ ID NO: 5)
  • GAPDH sense primer sequence 5'-AGCCACATCGCTCAGACAG-3' (SEQ ID NO: 6)
  • RT-qPCR was performed to estimate the expression of PLD4 in cultured naive B cells.
  • Total RNA was extracted from cultured naive B cells using RNeasy Plus Micro Kit (Qiagen), and cDNA was synthesized using ReverTra Ace qPCR RT kit (Toyobo).
  • the relative expression of PLD4 was analyzed by RT-qPCR using SYBR Green PCR kit (Qiagen).
  • PCR was performed using CFX Connect TM Real Time System (BioRad). PCR was performed for 40 cycles of 50°C, 2 minutes; 95°C, 15 minutes; 94°C, 10 seconds; 55°C, 1 minute; and 72°C, 1 minute.
  • RNA expression was normalized to the housekeeping gene ⁇ 2MG.
  • PBMCs (1 ⁇ 10 6 cells/tube) suspended in staining buffer (PBS containing 1% bovine serum albumin (BSA) and 10% normal mouse serum (Abeam, Cambridge, UK) were stained with the following fluorescent antibodies.
  • staining buffer PBS containing 1% bovine serum albumin (BSA) and 10% normal mouse serum (Abeam, Cambridge, UK)
  • B cells were defined using CD20 (PE-Cy7) and CD3CD14CD16 (V450). PLD4 was then stained as described above. To remove dead cells, 5 ⁇ L of 7-AAD (BD Pharmingen) was added to 100 ⁇ L of cell solution 5 min before cytometric analysis. Compensation was performed using anti-mouse Ig, ⁇ /Negative Control Compensation Particle Set (BD, Biosciences).
  • 7-AAD BD Pharmingen
  • mice were fixed and permeabilized with True-Nuclear TM Transcription Factor Buffer Set (BioLegend) according to the manufacturer's instructions.
  • Mouse IgG (Peprotech, NJ, USA) was added at a concentration of 100 ⁇ g/mL to block non-specific binding, followed by the addition of fluorescent antibodies against T-bet (APC) or mouse IgG1 (APC).
  • APC fluorescent antibodies against T-bet
  • API mouse IgG1
  • Flow cytometry data were analyzed using FlowJo software (Treestar).
  • PLD4+ blast or CD19 + B cells were sorted using FACS Aria II (BD, Biosciences). Because the number of sortable PLD4+ blast cells was not sufficiently large (maximum 3,000 cells from 20 mL of peripheral blood), CD19- and CD3 + , CD14 + , or CD16 + cells (non-B cell PBMCs) were simultaneously sorted as scaffold cells.
  • RPMI1640 no stimulation
  • 0.15 ⁇ M CpG ODN 2006 Invivogen
  • 1 ⁇ g/mL R848 Sigma-Aldrich
  • AffiniPure F(ab')2 Fragment Goat Antihuman IgG and IgM H+L
  • Jackson ImmunoResearch PA, USA
  • IgG-ASCs IgG antibody-secreting cells
  • 1,000 sorted PLD4+blast or plasmablast-gated CD19 + B cells were plated with 10,000 non-B PBMCs. Then, 1 ⁇ g/mL R848 or 0.15 ⁇ M CpG ODN 2006 was added. After 4 days of culture, IgG-ASCs were counted by ELISpot.
  • IgG-secreting cells were detected using ELISpot Human IgG (HRP) Kit (Mabtech) according to the manufacturer's instructions. Briefly, Multiscreen IP HTS 0.45 ⁇ m (Merck Millipore) was coated with 15 ⁇ g/mL anti-IgG antibody overnight at 4°C. The wells were washed twice with PBS and then blocked with PBS and 1% BSA for 1 h. After removing the blocking solution, cultured cells were added to the wells and incubated at 37°C under 5% CO2 for 16-20 h.
  • HRP ELISpot Human IgG Kit
  • BCR repertoire analysis of cultured B cells B cell receptor (BCR) repertoire analysis was performed similarly to the method previously described for T cell repertoire (Cho M, Ishida K, et al. Int Immunol. 2008 Jan;20(1):155-64). Briefly, cultured B cells were harvested and washed with PBS by centrifugation. First-strand cDNA was synthesized using oligo(dT) primers and SuperscriptTM III Reverse Transcriptase (Invitrogen), and second-strand cDNA was synthesized using RNase H and T4 DNA polymerase (Invitrogen). A short adapter with "T” replaced by "U” was ligated to the cDNA library.
  • Uracil DNA Glycosylase (Takara) was added to digest the short strands and generate single-stranded adapter ligations.
  • the adapted library was amplified by PCR.
  • the amplified products (BCR library) were sequenced using a next-generation sequencer (Illumina) according to the manufacturer's instructions. Sequencing results were analyzed using IMGT-V-QUEST (https://www.imgt.org/IMGT_vquest/input). Sequences sharing identical V- and J-gene segments and with identical CDR3 sequences were identified as identical.
  • V(D)J and constant region (IgG1) sequences were amplified separately by PCR, and sequences overlapping the vector cloning site were added.
  • the PCR products were individually inserted into pHEK Ultra expression vector (Takara Bio) using NEBuilder HiFi DNA Assembly cloning kit (New England BioLabs).
  • the closed vector containing the V(D)J + constant region sequence was transformed into One Shot Top10 chemically competent Escherichia coli cells (Invitrogen), cultured overnight, and the plasmid was purified using Plasmid Midi kit (Qiagen).
  • This plasmid was transfected into Expi293FTM cells using ScreenFectTMUP-293 kit (FUJIFILM Wako). Expi293 cells were grown to 7.5 x 107 cells. After 5 days of culture, secreted mAbs were purified using Protein G Sepharose 4 Fast Flow Lab Packs (Cytiva). Specifically, the cultured cell supernatant was added to a PierceTM Disposable 5 mL Polypropylene Column (Thermo Fisher Scientific) loaded with 500 ⁇ L of Protein G Sepharose. After washing the column with 20 mM sodium phosphate, the antibody was eluted with 100 mM Tris-HCl (pH 9.0).
  • a control antibody for enzyme-linked immunosorbent assay ELISA
  • IgG sequence from B cells isolated from a normal donor was subcloned, and then mAbs were synthesized and purified.
  • ELISA Human Antinuclear Antibody
  • ANA Human Antinuclear Antibody
  • CUSABIO Human Antinuclear Antibody
  • sera from SLE patients known to be ANA + and sera from healthy subjects were used at 101-fold dilution.
  • 50 ⁇ g/mL of PLD4+blast-derived mAbs or mAbs from control samples were added to the healthy subject sera.
  • OD450 was measured for each sample.
  • PLD4 is predominantly expressed in pDCs and then B cells
  • SAGE sequence analysis of gene expression comparing gene transcription in human plasmacytoid dendritic cells (pDCs) and monocytes detected that the PLD4 gene was predominantly transcribed in pDCs (Takeda Y, et al. Int J Mol Sci 2017 18:1162.).
  • RT-qPCR was performed using pDCs, B cells, T cells, monocytes, and natural killer cells to examine PLD4 mRNA expression in peripheral immune cells. As a result, PLD4 expression was highest in pDCs, followed by B cells. PLD4 expression in B cells was much lower than that in pDCs ( Figure 1A).
  • PLD4 + pDCs The frequency of PLD4 + pDCs was similar to that of HD, but PLD4 + B cells were significantly increased in SLE patients (Fig. 1C).
  • B cells from SLE patients have various characteristics. For example, transitional B cells, double negative (DN) cells, and plasmablasts are increased in SLE patients compared to healthy controls (Akita K, et al, Front Immunol. 2020;11:498703; doi 10.3389/fimmu.2020.498703; Wardowska A, et al. Int Immunopharmacol. 2020 Jun 1;83:106451; doi 10.1016/j.intimp.2020.106451; Grodonne Y, et al. J Autoimmun.
  • PLD4+blast overlaps phenotypically and functionally with DN2B cells
  • PLD4 + B cells contain almost no plasmablasts, so we considered that these PLD4 + B cells were more activated than other cells and focused on cells with a size similar to that of plasmablasts. Therefore, we defined the larger portion of PLD4 + B cells as "PLD4 + blast” and the rest as “PLD4 + small” by using the 25th percentile of FSC-A of plasmablasts as a threshold (Fig. 1E).
  • PLD4+blast Further characterization of PLD4+blast revealed that it overlapped with DN2 cells, which are phenotypically characterized as IgD- , CD27- , CD11c ++ , and CXCR5- (Fig. 2A).
  • DN2 cells which are phenotypically characterized as IgD- , CD27- , CD11c ++ , and CXCR5- (Fig. 2A).
  • PLD4+blast were not included in the DN cell population (IgD + or CD27 + cells), and most were CD11c ++ and CXCR5- cells, suggesting that PLD4+blast are highly homogenous in terms of cell ontology (Fig. 7A).
  • intracellular staining of the transcription factor T-bet revealed that most of the PLD4+blast were T-bet++, one of the key features of DN2B cells (Fig. 2B).
  • TLR7 or TLR9 Stimulation of TLR7 or TLR9 is sufficient to induce PLD4 + B cells in HD.
  • PBMCs isolated from HD were stimulated with anti-IgG/IgM (BCR cross-linking), TLR7 ligand alone, TLR9 ligand alone, or BCR + TLR9 ligand, and flow cytometry analysis was performed on the second day.
  • PLD4 + B cells were not induced by BCR signal alone, but PLD4 + B cells were significantly induced by TLR alone or BCR + TLR stimulation (Figure 3A, B).
  • PLD4+blast was obtained from one patient with an SLE flare who had elevated antibody titers of anti-dsDNA antibodies (>400 IU/mL), anti-Sm antibodies (>46 IU/mL), and anti-SS-A antibodies (>1200 IU/mL) and had developed class IV lupus nephritis.
  • PLD4+blast accounted for 8.5% of CD19 + B cells.
  • the obtained PLD4+blast was stimulated with TLR7 ligands and inflammatory cytokines for 4 days to promote the differentiation of B cells into antibody-secreting cells (ASCs).
  • ASCs antibody-secreting cells
  • the repertoire of TLR-stimulated PLD4+blast was biased.
  • the ratio of the top three repertoires accounted for more than 50% of the total, but this was probably due to stimulation and culture, and was not included in the repertoire of CD19 + B cells cultured in a similar manner (Tables 2 to 5).
  • these amplified repertoires were probably repertoires of antibodies secreted in vitro, and synthesized recombinant monoclonal antibodies from the sequences of the three largest repertoires. Of the three antibodies synthesized, two showed antinuclear activity in ELISA ( Figure 4D). Therefore, PLD4+blast is likely to contain autoreactive cells.
  • Table 4 shows the top 10 heavy chain sequences obtained from the repertoire analysis of cultured PLD4+blast.
  • Table 5 shows the top 10 ⁇ chain sequences obtained from the repertoire analysis of cultured PLD4+blast.
  • Table 6 shows the top 10 heavy chain sequences obtained in the repertoire analysis of cultured CD19 + B cells.
  • Table 7 shows the top 10 ⁇ chain sequences obtained in the repertoire analysis of cultured CD19 + B cells.
  • amino acid sequences of the V chains in Tables 2 and 4 above can be obtained from the ImMunoGeneTics (IMGT) IMGT Repertoire (IG and TR) website (https://www.imgt.org/IMGTrepertoire/Proteins/#h2_4).
  • IMGT ImMunoGeneTics
  • IG and TR IMGT Repertoire
  • nucleic acid sequence of H1 is shown in Table 8.
  • nucleic acid sequence of H2 is shown in Table 9.
  • nucleic acid sequence of H3 is shown in Table 10.
  • nucleic acid sequence of L1 is shown in Table 11.
  • nucleic acid sequence for L2 is shown in Table 12.
  • nucleic acid sequence for L3 is shown in Table 13.
  • the boxed "atg” indicates the translation initiation site of BCR mRNA.
  • the portion from this "atg” to the underlined sequence is the signal peptide.
  • the underlined sequence indicates the start of the variable region of the BCR.
  • the double underlines indicate, from the 5' side, CDR1, CDR2 and CDR3.
  • the sequences of the H1, H2 and H3 variable regions are shown in Table 14.
  • the sequences of the L1, L2 and L3 variable regions are shown in Table 15.
  • the sequences of the CDRs of H1, H2 and H3 are shown in Table 16.
  • the sequences of the CDRs of L1, L2 and L3 are shown in Table 17.
  • a fraction of cells thought to be autoantibody-producing cells was obtained from the peripheral blood of SLE patients and used as a positive control cell population.
  • the autoantibody gene (H1) was amplified by RT-PCR for the cell populations isolated from the peripheral blood of SLE patients, the cell populations from the peripheral blood of healthy subjects, and the positive control.
  • the RT-PCR method is shown below.
  • SLE positive control
  • PLD4-positive cells and peripheral blood mononuclear cells not containing B cells were stimulated with R848 (TLR7/8 ligand). Only PLD4-positive cells were antibody-producing cells.
  • the Amplification Plot and Melt Curve Plot when using the index-head (internal control) primer are shown in Figures 8A and 8B, respectively.
  • the present disclosure provides an antibody or antigen-binding fragment thereof useful for diagnosing systemic lupus erythematosus, a diagnostic agent for systemic lupus erythematosus using the antibody or antigen-binding fragment, and a method for testing blood samples useful for diagnosing systemic lupus erythematosus.

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

自己反応性DN2B細胞が産生する自己抗体又はその抗原結合断片。また、前記自己抗体の抗原結合部位を含む抗体又はその抗原断片。また、前記自己抗体若しくは前記抗体又はそれらの抗原結合断片を含む、全身性エリテマトーデスの診断薬。また、検査対象から採取された血液試料において、自己反応性DN2B細胞から産生される自己抗体の発現量を測定する工程を含み、前記自己抗体の発現量が基準値よりも高いことが、前記検査対象が全身性エリテマトーデスに罹患している可能性が高いことを示す、血液試料の検査方法。

Description

自己反応性DN2B細胞が産生する自己抗体およびその使用
 本発明は、自己反応性DN2B細胞が産生する自己抗体およびその使用に関する。より具体的には、本発明は、自己反応性DN2B細胞が産生する自己抗体又はその抗原結合断片、前記自己抗体の抗原結合部位を有する抗体、全身性エリテマトーデスの診断薬、および血液試料の検査方法に関する。
 本願は、2023年10月4日に、米国に出願された米国仮出願第63/542,310号に基づき優先権を主張し、その内容をここに援用する。
 全身性エリテマトーデス(SLE)は、血液に複数の自己抗体が存在することを特徴とする自己免疫性慢性疾患である。これらの自己抗体は、免疫複合体を形成することにより臓器組織に沈着し、病原性の役割を果たすと考えられている。
 SLE患者においては、ダブルネガティブ2(DN2)細胞が増加していることが報告されている(非特許文献1)。
Jenks SA, Cashman KS, Zumaquero E, Marigorta UM, Patel AV, Wang Xiaoqian, et al. Distinct Effector B Cells Induced by Unregulated Toll-like Receptor 7 Contribute to Pathogenic Responses in Systemic Lupus Erythematosus. Immunity. 2018 Oct 16;49(4):725-739.e6; doi 10.1016/j.immuni.2018.08.015
 本開示は、全身性エリテマトーデスの診断に有用な抗体又はその抗原結合断片、前記抗体又は抗原結合断片を用いた全身性エリテマトーデスの診断薬、および全身性エリテマトーデスの診断に有用な血液試料の検査方法を提供することを課題とする。
 本開示は、以下の態様を含む。
 [1]自己反応性DN2B細胞が産生する自己抗体又はその抗原結合断片。
 [2]前記自己抗体が抗核抗体である、[1]に記載の自己抗体又はその抗原結合断片。
 [3][1]又は[2]に記載の自己抗体が含む抗原結合部位を含む抗体又はその抗原結合断片。
 [4]下記(a)~(c)からなる群より選択される抗体又はその抗原結合断片:
 (a)表1に記載のV鎖に由来するHCDR1及びHCDR2並びにHCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する重鎖可変領域を含む抗体;
 (b)表2に記載のV鎖に由来するLCDR1及びLCDR2並びにLCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する軽鎖可変領域を含む抗体;
 (c)表1に記載のV鎖に由来するHCDR1及びHCDR2並びにHCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する重鎖可変領域と、表2に記載のV鎖に由来するLCDR1及びLCDR2並びにLCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する軽鎖可変領域と、を含む抗体。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000003
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000004
 [5][1]又は[2]に記載の自己抗体又はその抗原結合断片を含む、全身性エリテマトーデスの診断薬。
 [6][3]又は[4]に記載の抗体又はその抗原結合断片を含む、全身性エリテマトーデスの診断薬。
 [7]検査対象から採取された血液試料において、自己反応性DN2B細胞から産生される自己抗体の発現量を測定する工程を含み、前記自己抗体の発現量が基準値よりも高いことが、前記検査対象が全身性エリテマトーデスに罹患している可能性が高いことを示す、血液試料の検査方法。
 本開示によれば、全身性エリテマトーデスの診断に有用な抗体又はその抗原結合断片、前記抗体又は抗原結合断片を用いた全身性エリテマトーデスの診断薬、および全身性エリテマトーデスの診断に有用な血液試料の検査方法を提供することができる。
健常ドナー(HD)と全身性エリテマトーデス(SLE)患者の免疫細胞におけるPLD4発現を調べた棒グラフ(n=1)。 HDおよびSLE患者のヒト形質細胞様樹状細胞(pDC)およびB細胞におけるPLD4細胞を示す代表的なフローサイトメトリープロット。BDCA-2細胞はpDCを示す。CD19細胞はB細胞を示す。 HD(n=19)およびSLE患者(n=40)におけるPLD4 B細胞の比率を示す箱ひげ図。 SLE患者(SLE21、SLE17)のCD19細胞、PLD4細胞、および形質芽細胞(PB)について、FSC-Aを解析した結果を示す。 PLD4発現とFSC-Aに基づいて、CD19 B細胞を「PLD4+ blast」および「PLD4+ small」にコンパ―メント化したフローサイトメトリープロット。 SLE患者におけるPLD4+blastの比率を示す箱ひげ図。 SLE患者をPLD4+blastの比率が高い群(H)および低い群(L)でSLEDAIスコアを比較した箱ひげ図。 SLE患者をPLD4 B細胞の比率が高い群(H)および低い群(L)でSLEDAIスコアを比較した箱ひげ図。 SLE患者において、PLD4+blastの比率と形質芽細胞の比率との相関を評価したプロット図。 SLE患者において、PLD4 B細胞の比率と形質芽細胞の比率との相関を評価したプロット図。 代表的なSLE患者において、PLD4 B細胞、PLD4+small、およびPLD4+blastの各細胞集団におけるDN2B細胞(CD27、CXCR5)の比率を評価したフローサイトメトリープロット。 代表的なSLE患者において、PLD4 B細胞、PLD4+small、およびPLD4+blastの各細胞集団における細胞内T-betの陽性度を示すヒストグラム。 DN2B細胞の比率とPLD4+blastの比率との相関を示すプロット図。 DN2B細胞をPLD4およびFSC-Aで評価した代表的なプロ―サイトメトリープロット。 PLD4+blastの比率が高い群(H)および低い群(L)で、腎炎の合併率を比較した棒グラフ。***P<0.005。Fisherの正確検定とMann-WhitneyのU検定。 PLD4+blastの比率が高い群(H)および低い群(L)で、抗Sm抗体価を比較した棒グラフ。***P<0.005。Fisherの正確検定とMann-WhitneyのU検定。 PLD4+blastの比率が高い群(H)および低い群(L)で、抗dsDNA抗体価を比較した棒グラフ。ns,有意差なし。Fisherの正確検定とMann-WhitneyのU検定。 新たにSLEを発症した11人の患者において、免疫抑制療法前および免疫抑制療法後のPLD4+blastの比率を解析した図。***P<0.005。Wilcoxonの符号順位検定。 HDのPBMCを、刺激物質(抗IgG/IgM(BCR架橋)、TLR7リガンド、TLR9リガンド)とともにin vitroで培養したときの代表的なフローサイトメトリープロット。 HDのPBMCを、刺激物質(抗IgG/IgM(BCR架橋)、TLR7リガンド、TLR9リガンド)とともにin vitroで培養したときに誘導されたPLD4 B細胞の比率を比較した箱ひげ図。***P<0.005。Mann-WhitneyのU検定。 3人のHDから単離したナイーブB細胞をTLR9リガンド有りまたはTLR9リガンド無しで2日間培養した後、PLD4 mRNAの発現をRT-qPCRで測定した結果を示すグラフ。*P<0.05。Wilcoxonの符号順位検定。 2人のSLE患者(SLE13、SLE28)から採取された形質芽細胞(Plasmablast)およびPLD4+blastを、PVDF膜に直接播種した後、IgG ELISpotを行った結果を示す図。 2人のSLE患者(SLE13、SLE28)から採取したCD19 B細胞及びPLD4+blastを、TLR7リガンド又はTLR9リガンドとともにin vitroで4日間培養し、IgG ELISpotを行った結果を示す図。 図4BのELISpotの結果から算出されたB細胞1000個当たりのスポット数を示すグラフ。 培養PLD4+blastのレパトアから作製されたから組み換えモノクローナルを用いたELISAにより得られたOD450の測定値を示す棒グラフ。I:H1+L1,II:H2+L2,III:H3+L3,IV:1人のHDからのランダム増幅モノクローナル抗体,V:HD血清,VI:SLE患者血清。ND,検出されず。 複数の臓器組織のcDNA(n=1)についてRT-qPCRによりPLD4 mRNAを定量した結果を示す棒グラフ。PLD4 mRNAの相対発現量は、GAPDH遺伝子の発現により正規化した。Br:脳、Col:結腸、Hrt:心臓、Kid:腎臓、Leu:白血球、Liv:肝臓、Mu:筋肉、Ov:卵巣、Pan:膵臓、Pla:胎盤、Pro:前立腺、S.Int:小腸、Spl:脾臓、Tes:精巣、Thy:胸腺。 フローサイトメトリーのゲーティングストラテジーを示す図。pDCは、CD14陰性、CD3陰性、CD19陰性およびCD11c陰性で、BDCA-2陽性と定義した。B細胞は、CD19陽性で、CD2陰性、CD14陰性およびCD16陰性と定義した。 HDから採取されたCD3CD4 T細胞、CD3CD8 T細胞、CD14細胞およびCD16細胞の亜集団におけるPLD4の陽性度を示す代表的なヒストグラム。 transitional B細胞(Transitional)、ナイーブB細胞(Naive)、ダブルネガティブB細胞(DN)、メモリーB細胞(Memory)および形質芽細胞(Plasmablast)を定義するフローサイトメトリーのゲーティングストラテジーを示す図。 B細胞の各亜集団の比率をHD(n=6)およびSLE患者(n=36)で比較した結果を示す箱ひげ図。*P<0.05,***P<0.005。Mann-WhitneyのU検定。Tr:transitional B細胞、NAV:ナイーブB細胞、Mem:メモリーB細胞、DN:ダブルネガティブB細胞、PB:形質芽細胞。 B細胞の各亜集団の比率をCD19 B細胞およびPLD4 B細胞で比較した結果を示す箱ひげ図。*P<0.05,***P<0.005。Mann-WhitneyのU検定。Tr:transitional B細胞、NAV:ナイーブB細胞、Mem:メモリーB細胞、DN:ダブルネガティブB細胞、PB:形質芽細胞。 PLD4+blastに含まれるCD27メモリー細胞およびIgDナイーブ細胞の亜集団について、CD11c細胞およびCXCR5細胞の比率を解析したフローサイトメトリープロット。 SLE患者におけるPLD4+blastの比率と血清C3値(左図)および血清C4値(右図)との相関を評価したプロット図。スピアマン順位相関係数(ρ)およびp値を示す。 陽性対照、SLE患者PBMCおよびHDのPBMCから取得されたcDNAにおいて、Index-head(internal control)用プライマーを用いてRT-PCRを行ったときのAmplification Plot。 陽性対照(2H)、SLE患者PBMC(4H)およびHDのPBMC(6H)から取得されたcDNAにおいて、Index-head(internal control)用プライマーを用いてRT-PCRを行ったときのMelt Curve Plot。 陽性対照(2H)、SLE患者PBMC(4H)およびHDのPBMC(6H)から取得されたcDNAにおいて、H1用プライマーを用いてRT-PCRを行ったときのAmplification Plot。 陽性対照(2H)、SLE患者PBMC(4H)およびHDのPBMC(6H)から取得されたcDNAにおいて、H1用プライマーを用いてRT-PCRを行ったときのMelt Curve Plot。 H1(VH1-18-01-J4-02) の核酸配列を用いて作製された組み換えモノクローナル抗体を用いて行われた蛍光免疫染色画像。DAPI:DAPI染色。Alexa488:1次抗体として組み換えモノクローナル抗体、2次抗体としてPurified anti-human CD16 (Mouse IgG)、3次抗体としてGoat anti-Mouse IgG(Alexa Fluor 488)を用いた。
 「~」を用いて表される数値範囲は、「~」の前後に記載される数値を下限値及び上限値として含む範囲を意味する。
 特に明示されない限り、「a」、「an」、および「the」は、単数および複数を包含し、「1以上」と理解される。
 「を含む」(comprise)という用語は、対象となる構成要素以外の構成要素を含んでいてもよいことを意味する。「からなる」(consist of)という用語は、対象となる構成要素以外の構成要素を含まないことを意味する。「から本質的になる」(consist essentially of)という用語は、対象となる構成要素以外の構成要素を特別な機能を発揮する態様(発明の効果を完全に喪失させる態様など)では含まないことを意味する。本明細書において、「を含む」(comprise)と記載する場合、「からなる」(consist of)態様、及び「から本質的になる」(consist essentially of)態様を包含する。
 タンパク質、ペプチド、核酸、ベクター、及び細胞は、単離されたものであり得る。「単離された」とは、天然状態又は他の成分から分離された状態を意味する。「単離された」ものは、他の成分を実質的に含まないものであり得る。「他の成分を実質的に含まない」とは、単離された成分に含まれる他の成分の含有量が無視できる程度であることを意味する。単離された成分に含まれる他の成分の含有量は、例えば、10質量%以下、5質量%以下、4質量%以下、3質量%以下、2質量%以下、1質量%以下、0.5質量%以下、又は0.1質量%以下であり得る。本明細書に記載されるタンパク質、ペプチド、核酸、ベクター、及び細胞は、それぞれ、単離されたタンパク質、単離されたペプチド、単離された核酸、単離されたベクター、及び単離された細胞であり得る。
 核酸配列は、特に明示しない限り、一般的に認められている1文字コードで記載される。特に明示しない限り、核酸配列は、5’側から3’側に向かって記載される。
 アミノ酸配列は、特に明示しない限り、一般的に認められている1文字コード又は3文字コードで記載される。特に明示しない限り、アミノ酸配列は、N末端側からC末端側に向かって記載される。
 核酸配列どうし又はアミノ酸配列どうしの配列同一性(又は相同性)は、2つの核酸配列又はアミノ酸配列を、対応する塩基又はアミノ酸が最も多く一致するように、挿入及び欠失に当たる部分にギャップを入れながら並置し、得られたアライメント中のギャップを除く、核酸配列全体又はアミノ酸配列全体に対する一致した塩基又はアミノ酸の割合として求められる。核酸配列又はアミノ酸配列どうしの配列同一性は、当該技術分野で公知の各種相同性検索ソフトウェアを用いて求めることができる。例えば、核酸配列の配列同一性の値は、公知の相同性検索ソフトウェアBLASTNにより得られたアライメントを元にした計算によって得ることができ、アミノ酸配列の配列同一性の値は、公知の相同性検索ソフトウェアBLASTPにより得られたアライメントを元にした計算によって得ることができる。
 「抗体」は、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分、即ち、抗原と特異的に結合する抗原結合部位を含有する分子を指す。抗体はポリクローナルでもよく、モノクローナルでもよく、キメラでもよい。
 基本的抗体構造単位は4量体を含むことが知られている。各4量体は同一の2対のポリペプチド鎖を有し、各対が1つの軽鎖(約25kDa)および1つの重鎖(約50~70kDa)を有する。各鎖のアミノ末端部分は抗原認識を主に担っている可変領域を含む。各鎖のカルボキシ末端部分はエフェクター機能を主に担っている定常領域を定義している。一般的に、ヒトから得られた抗体分子は、分子中に存在する重鎖の性質により相互に異なっているクラスIgG、IgM、IgA、IgEおよびIgDのいずれかに関連する。一部のクラスは、IgG1、IgG2のようなサブクラスを有する。ヒトにおいては、軽鎖は、κ鎖またはλ鎖であってよい。
 抗体は、いずれの生物に由来するものでもよい。抗体が由来する生物としては、例えば、哺乳類(ヒト、マウス、ラット、ウサギ、ウマ、ウシ、ブタ、サル、イヌ等)、鳥類(ニワトリ、ダチョウ)等が挙げられるが、これらに限定されない。
 「特異的に結合する」とは、抗体が特定の抗原の1つ以上の抗原決定基と反応するが、他の抗原とは反応しないか、はるかに低値の親和性で結合することを意味する。抗体が特定の抗原に特異的に結合する場合、抗体と特定の抗原と解離定数(KD)は、10-8mol/L以下であることが好ましく、10-13mol/L以上10-9mol/L以下であることがより好ましい。抗体と特定の抗原と解離定数(KD)は、精製抗原を用いたプラズモン共鳴アッセイ(例えば、BIAcore、GE-Healthcare Uppsala、Sweden等)等により測定することができる。
 相補性決定領域(CDR)は、抗体において抗原との結合に関与する部位であり、抗体分子中で抗原に応じて最もアミノ酸配列が変化する部位である。CDRは、一般的に、重鎖可変領域に3つ、および軽鎖可変領域に3つ存在する。本明細書および請求の範囲においては、重鎖可変領域に存在する3つのCDRを、N末端側から順にHCDR1、HCDR2、およびHCDR3と記載する。軽鎖可変領域に存在する3つのCDRを、N末端側から順にLCDR1、LCDR2、およびLCDR3と記載する。CDRは、公知の定義により決定することができる。CDRは、例えば、Kabat(Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest (National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1987) and (1991)))、又はChothia(Chothia & Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987) and Chothia et al., Nature 342:877-883 (1989))の定義により、決定することができる。
 CDRは、ImMunoGeneTics(http://imgt.org)のサイトで定義されるものを用いてもよい。ヒトの抗体の重鎖の遺伝子座では、V遺伝子断片、D遺伝子断片、およびJ遺伝子断片が再構成されて、重鎖可変領域コード領域が形成される。ヒトの抗体の軽鎖の遺伝子座では、J遺伝子断片およびJ遺伝子断片が再構成されて、軽鎖可変領域コード領域が形成される。
 HCDR3は、通常、V領域の3’末端からJ領域の5’末端にわたる領域に位置する。V領域にコードされるN末端側から104番目のシステイン残基(C)から、J領域にコードされるN末端側5番目のトリプトファン残基(W)までの領域を、HCDR3として定義してもよい。
 LCDR3は、通常、V領域の3’末端からJ領域の5’末端にわたる領域に位置する。J領域にコードされるアミノ酸配列において最もC末端側に位置するシステイン残基(C)から、J領域にコードされるアミノ酸配列において最もN末端側に位置するトリプトファン残基(W)もしくはフェニルアラニン残基(F)までの領域を、LCDR3として定義してもよい。
 「抗原結合部位」とは、抗体において抗原との結合に関与する部位を指す。抗原結合部位は、抗体のHCDR3を含むことが好ましく、重鎖可変領域の3つのCDR(HCDR1~HCDR3)を含むことがより好ましく、重鎖可変領域の3つのCDR(HCDR1~HCDR3)および軽鎖可変領域の3つのCDR(LCDR1~LCDR3)を含むことがさらに好ましい。同一の抗原結合部位を含む抗体は、同一のエピトープに結合する。
 「抗原結合断片」は、抗体の一部を含むポリペプチドであって、元の抗体の抗原結合性を維持しているポリペプチドを指す。抗原結合断片は、元の抗体の抗原結合部位を含むことが好ましく、元の抗体のHCDR3を有することがより好ましく、元の抗体の6つのCDR(HCDR1~HCDR3、LCDR1~LCDR3)を全て含むことがさらに好ましい。抗原結合断片としては、例えば、Fab、Fab’、F(ab’)、可変領域断片(Fv)、ジスルフィド結合Fv、一本鎖Fv(scFv)、sc(Fv)等が挙げられる。
 「自己抗体」とは、自己の体内で生成される抗原に対して特異的に結合する抗体を指す。自己抗体としては、例えば、抗核抗体が挙げられる。
 「抗核抗体」とは、自己の細胞中に存在する細胞核を構成する成分を抗原とする自己抗体を指す。抗核抗体としては、例えば、二本鎖DNAを抗原とする抗dsDNA抗体、非ヒストン核タンパク質を抗原とする抗Sm抗体、ヒストンを抗原とする抗ヒストン抗体等が挙げられる。
 「DN2B細胞」とは、ダブルネガティブ2B細胞を指す。DN2B細胞は、IgD陰性且つCD27陰性のB細胞である。「自己反応性DN2B細胞」とは、自己抗体を産生するDN2B細胞である。一実施形態において、自己反応性DN2B細胞は、CD11c強陽性、CD21陰性、CD19強陽性、且つCXCR5陰性である。
 IgD(Immunogloblin D)は、1対の重鎖及び1対の軽鎖から構成される。
 CD27は、TNF受容体スーパーファミリーのメンバーである。ヒトCD27のアミノ酸配列としては、例えば、NCBI Reference Sequence:NP_001233.2、NP_001400192.1、NP_001400193.1、NP_001400194.1、NP_001400195.1、NP_001400196.1、又はNP_001400197.1で登録されたもの等が挙げられる。
 CD11c(ITGAX integrin subunit alpha X)は、インテグリンファミリーのメンバーであり、インテグリンβ2鎖と共有結合的に会合する。ヒトCD11cのアミノ酸配列としては、例えば、NCBI Reference Sequence:NP_000878.2、又はNP_001273304.1で登録されたもの等が挙げられる。
 CD21(CR2 complement C3d receptor 2)は、補体調節タンパク質である。ヒトCD21のアミノ酸配列としては、例えば、NCBI Reference Sequence:NP_001006659.1、又はNP_001868.2で登録されたもの等が挙げられる。
 CD19は、免疫グロブロンスーパーファミリーのメンバーであり、B細胞マーカーとして知られている。ヒトCD19のアミノ酸配列としては、例えば、NCBI Reference Sequence:NP_001171569.1、NP_001372661.1、又はNP_001761.3で登録されたもの等が挙げられる。
 CXCR5(C-X-C motif chemokine receptor 5)は、CXCケモカイン受容体ファミリーのメンバーである。ヒトCXCR5のアミノ酸配列としては、例えば、NCBI Reference Sequence:NP_001707.1、又はNP_116743.1で登録されたもの等が挙げられる。
 細胞がタンパク質に関して「陽性」とは、細胞が当該タンパク質を検出可能な量で発現していることを意味する。細胞が膜タンパク質について陽性である場合、当該細胞の細胞膜には当該タンパク質が検出可能な量で存在している。
 細胞がタンパク質に関して「陰性」とは、細胞が当該タンパク質を検出可能な量で発現していないことを意味する。細胞が膜タンパク質について陰性である場合、当該細胞の細胞膜には当該タンパク質が検出可能な量で存在していない。
 タンパク質が膜タンパク質である場合、細胞が当該タンパク質について陽性であるか陰性であるかは、当該タンパク質に特異的に結合する抗体を用いたフローサイトメトリー解析により、判定することができる。
 細胞がタンパク質に関して「強陽性」とは、細胞が、同種の細胞における当該タンパク質の平均的な発現量と比較して、当該タンパク質を多く発現していることを意味する。CD11c強陽性であるB細胞は、B細胞におけるCD11cの平均的な発現量と比較して、CD11cを多く発現している。CD19強陽性であるB細胞は、B細胞におけるCD19の平均的な発現量と比較して、CD19を多く発現している。
 「PLD4」(phospholipase D family member 4)は、ホスファチジルコリンを加水分解してホスファチジン酸とコリンを産生する反応を触媒し、様々な細胞内シグナル伝達を引き起こす酵素である。ヒトPLD4のアミノ酸配列としては、NCBI Reference Sequenceデータベースに、NP_001295103.1(配列番号131)およびNP_620145.2(配列番号132)として登録されたものが挙げられる。
 [DN2B細胞が産生する自己抗体又はその抗原結合断片]
 本開示の第1の態様は、DN2B細胞が産生する自己抗体又はその抗原結合断片である。
 DN2B細胞は、IgD陰性且つCD27陰性のB細胞である。一実施形態において、自己反応性DN2B細胞は、CD11c強陽性、CD21陰性、CD19強陽性、且つCXCR5陰性である。一実施形態において、自己反応性DN2B細胞は、PLD4陽性である。自己反応性DN2B細胞は、フローサイトメトリー解析により、IgD陰性且つCD27陰性のB細胞を取得し、次いでこのB細胞画分から、CD11c強陽性、CD21陰性、CD19強陽性、且つCXCR5陰性である細胞を選別することにより、取得することができる。あるいは、自己反応性DN2B細胞は、フローサイトメトリー解析により、PLD4陽性B細胞を選別することにより取得することができる。
 「PLD4陽性B細胞」とは、PLD4を表面抗原として発現するB細胞を指す。PLD4陽性B細胞は、抗PLD4抗体を用いたフローサイトメトリー解析によりB細胞を選別することにより取得することができる。後述の実施例において、PLD4陽性B細胞は、「PLD4 B細胞」とも記載される。
 自己反応性DN2B細胞の由来する動物は特に限定されない。例えば、自己反応性DN2B細胞が由来する動物としては、哺乳類(ヒト、マウス、ラット、ウサギ、ウマ、ウシ、ブタ、サル、イヌ等)、鳥類(ニワトリ、ダチョウ)等が挙げられる。
 B細胞は、末梢血単核球(PBMC)から公知の方法により単離することができる。B細胞は、例えば、市販のB細胞単離キットを用いて、PBMCから取得することができる。
 自己反応性DN2B細胞は、B細胞をTLRリガンドで刺激することにより誘導してもよい。TLRリガンドとしては、TLR7リガンド、TLR9リガンド等が挙げられる。TLR7リガンドとしては、R-848(Resiquimod)、Gardiquimod、Imiquimod、Loxoribine等が挙げられる。TLR9リガンドとしては、CpGモチーフを含むオリゴヌクレオチドが挙げられる。自己反応性DN2B細胞の誘導には、TLRリガンドに加えて、BCR架橋シグナリングを誘導する薬剤を用いてもよい。BCR架橋シグナリングを誘導する薬剤としては、例えば、抗IgG抗体もしくはその抗原結合断片、抗IgM抗体もしくはその抗原結合断片等が挙げられる。
 自己抗体を産生させる自己反応性DN2B細胞は、形質芽細胞(plasmablast)と同程度の大きさ(直径8~20μm程度)の自己反応性DN2B細胞を用いてもよい。例えば、フローサイトメトリー解析により、形質芽細胞のFSC-Aの25パーセンタイルを閾値(例えば、60K)とし、このFSC-Aよりも大きい自己反応性DN2細胞(以下、「DN2B+blast」又は「PLD4+blast」ともいう)を用いてもよい。「FSC」は、細胞にレーザーが照射された場合の前方散乱光を表す。「FSC-A」は、FSCが光学検出器により検出された電圧パルス面積を表す。
 自己反応性DN2B細胞からの自己抗体の産生は、公知の方法により行うことができる。例えば、P自己反応性DN2B細胞を、TLRリガンド(例えば、TLR7リガンド、TLR9リガンド等)の存在下で培養することにより、自己反応性DN2B細胞から自己抗体を産生させることができる。
 自己反応性DN2B細胞の培養に用いる培地は、B細胞の培養に通常用いられる培地を用いることができる。培地の具体例としては、例えば、RPMI1640培地、Doulbecco’s modified Eagle’s Medium(DMEM)培地、DMEM/F12培地、Advanced DMEM/F12培地、IMDM培地、Medium199培地、Eagle’sMinimum Essential Medium(EMEM)培地、αMEM培地、Ham’s F12培地、Fischer’s培地、及びこれらの混合培地等が挙げられる。これらの培地に、血清(ウシ胎仔血清(FBS))、血清代替物等を添加してもよい。自己反応性DN2B細胞は、前記のような培地に、TLRリガンドを添加して培養することにより、自己抗体を産生させることができる。
 自己反応性DN2B細胞の培養条件は、B細胞の培養に通常用いられる培養条件とすることができる。温度条件としては、体温に近い37℃が挙げられる。二酸化炭素濃度としては、例えば、0.03~10%が挙げられ、具体例としては5%が挙げられる。
 自己反応性DN2B細胞から産生された自己抗体は、塩析、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー等の公知の精製手法を組み合わせて、精製することができる。
 自己反応性DN2B細胞から産生される自己抗体としては、例えば、下記(a)~(c)からなる群より選択される抗体が挙げられる。
 (a)上記表1に記載のV鎖に由来するHCDR1及びHCDR2並びにHCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する重鎖可変領域を含む抗体;
 (b)上記表2に記載のV鎖に由来するLCDR1及びLCDR2並びにLCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する軽鎖可変領域を含む抗体;
 (c)上記表1に記載のV鎖に由来するHCDR1及びHCDR2並びにHCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する重鎖可変領域と、表2に記載のV鎖に由来するLCDR1及びLCDR2並びにLCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 表1において、No.1の組合せで定義される重鎖可変領域は、VH1-18-01であるV鎖に由来するCDR1及びCDR2、並びに、No.1のHCDR3(CAREQLGLIDYW:配列番号10)を有する。
 表1において、No.2の組合せで定義される重鎖可変領域は、VH4-34-01であるV鎖に由来するCDR1及びCDR2、並びに、No.2のHCDR3(CARAGATLNRFDPW:配列番号11)を有する。
 表1において、No.3の組合せで定義される重鎖可変領域は、VH1-18-01であるV鎖に由来するCDR1及びCDR2、並びに、No.3のHCDR3(CPRGIVVNWFDPW:配列番号12)を有する。
 表1におけるNo4~No.10の組合せで定義される重鎖可変領域も同様である。
 表2において、No.1の組合せで定義され軽鎖可変領域は、KV1-16-02であるV鎖に由来するCDR1及びCDR2、並びに、No.1のLCDR3(CQQYSSYPRTF:配列番号20)を有する。
 表2において、No.2の組合せで定義される軽鎖可変領域は、KV2-30-02であるV鎖に由来するCDR1及びCDR2、並びに、No.2のLCDR3(CMQGTHWPPDPHTF:配列番号21)を有する。
 表2において、No.3の組合せで定義される軽鎖可変領域は、KV2-30-02であるV鎖に由来するCDR1及びCDR2、並びに、No.3のHCDR3(CQQYNSYPLTF:配列番号22)を有する。
 表2におけるNo4~No.10の組合せで定義される軽鎖可変領域も同様である。
 表1および表2のV鎖の配列は、ImMunoGeneTics(http://imgt.org)のサイトから取得することができる。表1および表2のV鎖は、ヒトのV鎖である。ImMunoGeneTicsに登録されている核酸配列に60%以上の配列同一性を有する核酸配列にコードされるアミノ酸配列を、表1および表2に記載のV鎖のアミノ酸配列として用いることができる。
 VH1-18-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号112に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 VH4-34-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号113に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 VH1-8-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号114に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 VH1-8-02のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号115に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 VH7-4-1-02のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号116に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 VH5-51-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号117に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 VH3-30-04のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号118に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 VH3-30-3-03のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号119に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 VH3-74-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号120に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 VH2-70-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号121に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 VH3-64-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号122に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 KV1-16-02のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号123に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 KV2-30-02のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号124に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 KV1-5-03のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号125に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 KV3-15-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号126に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 KV1-6-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号127に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 KV3-20-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号128に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 KV1-27-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号129に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 KV1-NL1-01のV鎖のアミノ酸配列としては、配列番号130に記載のアミノ酸配列と60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 表1のNo.1の組合せの重鎖可変領域としては、配列番号59に記載されるアミノ酸配列と、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 表1のNo.2の組合せの重鎖可変領域としては、配列番号60に記載されるアミノ酸配列と、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 表1のNo.3の組合せの重鎖可変領域としては、配列番号61に記載されるアミノ酸配列と、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 表2のNo.1の組合せの軽鎖可変領域としては、配列番号65に記載されるアミノ酸配列と、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 表2のNo.2の組合せの軽鎖可変領域としては、配列番号66に記載されるアミノ酸配列と、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 表2のNo.3の組合せの重鎖可変領域としては、配列番号67に記載されるアミノ酸配列と、60%以上、70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列が挙げられる。
 表1のNo.1の重鎖可変領域に含まれるHCDR1のアミノ酸配列としては、配列番号77に記載のアミノ酸配列が挙げられる。表1のNo.1の重鎖可変領域に含まれるHCDR2のアミノ酸配列としては、配列番号78に記載のアミノ酸配列が挙げられる。
 表1のNo.2の重鎖可変領域に含まれるHCDR1のアミノ酸配列としては、配列番号80に記載のアミノ酸配列が挙げられる。表1のNo.2の重鎖可変領域に含まれるHCDR2のアミノ酸配列としては、配列番号81に記載のアミノ酸配列が挙げられる。
 表1のNo.3の重鎖可変領域に含まれるHCDR1のアミノ酸配列としては、配列番号83に記載のアミノ酸配列が挙げられる。表1のNo.3の重鎖可変領域に含まれるHCDR2のアミノ酸配列としては、配列番号84に記載のアミノ酸配列が挙げられる。
 表2のNo.1の軽鎖可変領域に含まれるLCDR1のアミノ酸配列としては、配列番号97または98に記載のアミノ酸配列が挙げられる。表2のNo.1の軽鎖可変領域に含まれるLCDR2のアミノ酸配列としては、配列番号99に記載のアミノ酸配列が挙げられる。
 表2のNo.2の軽鎖可変領域に含まれるLCDR1のアミノ酸配列としては、配列番号101に記載のアミノ酸配列が挙げられる。表2のNo.1の軽鎖可変領域に含まれるLCDR2のアミノ酸配列としては、配列番号102に記載のアミノ酸配列が挙げられる。
 表2のNo.3の軽鎖可変領域に含まれるLCDR1のアミノ酸配列としては、配列番号104に記載のアミノ酸配列が挙げられる。表2のNo.3の軽鎖可変領域に含まれるLCDR2のアミノ酸配列としては、配列番号105に記載のアミノ酸配列が挙げられる。
 PLD4陽性B細胞から産生される自己抗体の具体例としては、例えば、以下の抗体が挙げられる。
 (1)配列番号77、80または83に記載のアミノ酸配列を含むHCDR1、配列番号78、81または84に記載のアミノ酸配列を含むHCDR2、および、配列番号79、82または85に記載のアミノ酸配列を含むHCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (2)配列番号97、98、101または104に記載のアミノ酸配列を含むLCDR1、配列番号99、102または105に記載のアミノ酸配列を含むLCDR2、および、配列番号100、103、106または107に記載のアミノ酸配列を含むLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体。
 (3)上記(1)に定義される重鎖可変領域と、上記(2)に定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (4)配列番号77に記載のアミノ酸配列を含むHCDR1、配列番号78に記載のアミノ酸配列を含むHCDR2、および、配列番号79に記載のアミノ酸配列を含むHCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (5)配列番号80に記載のアミノ酸配列を含むHCDR1、配列番号81に記載のアミノ酸配列を含むHCDR2、および、配列番号82に記載のアミノ酸配列を含むHCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (6)配列番号83に記載のアミノ酸配列を含むHCDR1、配列番号84に記載のアミノ酸配列を含むHCDR2、および、配列番号85に記載のアミノ酸配列を含むHCDR3を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (7)配列番号97または98に記載のアミノ酸配列を含むLCDR1、配列番号99に記載のアミノ酸配列を含むLCDR2、および、配列番号100に記載のアミノ酸配列を含むLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体。
 (8)配列番号101に記載のアミノ酸配列を含むLCDR1、配列番号102に記載のアミノ酸配列を含むLCDR2、および、配列番号103に記載のアミノ酸配列を含むLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体。
 (9)配列番号104に記載のアミノ酸配列を含むLCDR1、配列番号105に記載のアミノ酸配列を含むLCDR2、および、配列番号106または107に記載のアミノ酸配列を含むLCDR3を含む軽鎖可変領域を含む抗体。
 (10)上記(4)~(6)のいずれかに定義される重鎖可変領域と、上記(7)~(9)のいずれかに定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (11)上記(4)に定義される重鎖可変領域と、上記(7)に定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (12)上記(5)に定義される重鎖可変領域と、上記(8)に定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (13)上記(6)に定義される重鎖可変領域と、上記(9)に定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 前記(1)~(9)に記載されるHCDR1~HCDR3およびLCDR1~LCDR3は、それぞれ指定される配列番号のアミノ酸配列からなるものが好ましい。
 (14)配列番号59~61のいずれかに記載されるアミノ酸配列と70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (15)配列番号65~67のいずれかに記載されるアミノ酸配列と70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (16)上記(14)に定義される重鎖可変領域と、上記(15)に定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (17)配列番号59に記載されるアミノ酸配列と70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (18)配列番号60に記載のアミノ酸配列と70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (19)配列番号61に記載のアミノ酸配列と70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (20)配列番号65に記載のアミノ酸配列と70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体。
 (21)配列番号66に記載のアミノ酸配列と70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体。
 (22)配列番号67に記載のアミノ酸配列と70%以上、80%以上、90%以上、または95%以上の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体。
 (23)上記(17)に定義される重鎖可変領域と、上記(20)に定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (24)上記(18)に定義される重鎖可変領域と、上記(21)に定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (25)上記(19)に定義される重鎖可変領域と、上記(22)に定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (26)上記(17)に定義される重鎖可変領域であって、上記(4)に定義されるHCDR1~HCDR3を含む重鎖可変領域と、上記(20)に定義される重鎖可変領域であって、上記(7)に定義されるLCDR1~LCDR3を含む軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (27)上記(18)に定義される重鎖可変領域であって、上記(5)に定義されるHCDR1~HCDR3を含む重鎖可変領域と、上記(21)に定義される重鎖可変領域であって、上記(8)に定義されるLCDR1~LCDR3を含む軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (28)上記(19)に定義される重鎖可変領域であって、上記(6)に定義されるHCDR1~HCDR3を含む重鎖可変領域と、上記(22)に定義される重鎖可変領域であって、上記(9)に定義されるLCDR1~LCDR3を含む軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (29)配列番号59に記載されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (30)配列番号60に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (31)配列番号61に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む抗体。
 (32)配列番号65に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体。
 (33)配列番号66に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体。
 (34)配列番号67に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体。
 (35)上記(29)に定義される重鎖可変領域と、上記(32)に定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (36)上記(30)に定義される重鎖可変領域と、上記(33)に定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 (37)上記(31)に定義される重鎖可変領域と、上記(34)に定義される軽鎖可変領域と、を含む抗体。
 上記(14)~(22)において、重鎖可変領域又は軽鎖可変領域が、指定される配列番号に記載のアミノ酸配列に対して変異を有する場合、前記変異は、置換、欠失、挿入および付加のいずれでもよく、これらの組合せでもよい。前記変異は、CDR(HCDR1~HCDR3、LCDR1~LCDR3)以外の領域(フレームワーク領域)に存在することが好ましい。
 アミノ酸配列のアミノ酸残基が置換される場合、元のアミノ酸残基が有する側鎖と化学的性質が類似する側鎖を有するアミノ酸残基に置換されることが好ましい。このようなアミノ酸残基の置換は、保存的置換と呼ばれる。
 化学的性質が類似するアミノ酸は、例えば、酸性アミノ酸、塩基性アミノ酸、および中性アミノ酸のグループに分類することができる。
 酸性アミノ酸のグループとしては、アスパラギン酸、グルタミン酸が挙げられる。塩基性アミノ酸のグループとしては、リシン、アルギニン、ヒスチジンが挙げられる。中性アミノ酸は、側鎖に応じてさらに、炭化水素鎖を有するアミノ酸(グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン)、ヒドロキシ基を有するアミノ酸(セリン、スレオニン)、硫黄原子を有するアミノ酸(システイン・メチオニン)、アミド基を有するアミノ酸(アスパラギン・グルタミン)、イミノ基を有するアミノ酸(プロリン)、芳香族基を有するアミノ酸(フェニルアラニン・チロシン・トリプトファン)等に分類することができる。
 自己反応性DN2B細胞が産生する自己抗体は、好ましくは抗核抗体である。自己反応性DN2B細胞が産生する自己抗体は、SLEの病態に関与すると考えられる。後述する実施例に示すように、自己反応性DN2B細胞(特にPLD4+blast)のBCRレパトアには偏りがある。したがって、自己反応性DN2B細胞が産生する抗体は、BCRと同じ塩基配列であって、自己抗体である。この自己抗体は、SLEのマーカーとして使用することができる。また、自己反応性DN2B細胞が産生する自己抗体は、SLEの診断薬として用いることができる。例えば、検査対象の血液サンプル(血漿、血清等)において、競合ELISA等により、SLEの病態に関与する自己抗体を定量するために用いることができる。
 [抗体またはその抗原結合断片]
 本開示の第2の態様は、前記第1の態様にかかる自己抗体(以下、「自己反応性DN2B細胞由来自己抗体」ともいう)が含む抗原結合部位を含む抗体(以下、「自己抗体由来抗体」ともいう)又はその抗原結合断片である。
 自己抗体由来抗体は、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体が有するHCDR3を含む重鎖可変領域を含むことが好ましい。自己抗体由来抗体は、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体が有するHCDR1~HCDR3を含む重鎖可変領域を含むことがより好ましい。自己抗体由来抗体は、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体が有するHCDR1~HCDR3を含む重鎖可変領域と、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体が有するLCDR1~LCDR3を含む軽鎖可変領域と、を含むことがさらに好ましい。
 自己抗体由来抗体は、例えば、自己反応性DN2B細胞が有する抗体遺伝子を利用して取得することができる。例えば、自己反応性DN2B細胞からメッセンジャーRNA(mRNA)を抽出し、前記RNAから相補的DNA(cDNA)を合成し、前記cDNAから重鎖のVDJ領域および軽鎖のVJ領域を核酸増幅法(例えば、PCR法)により増幅して、得られた断片を定常領域コード配列と結合させて、適切な発現ベクターにクローニングする。この発現ベクターを適切な細胞に導入して培養することにより、自己抗体由来抗体を取得することができる。自己抗体由来抗体は、公知の精製手法(塩析、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー等)により精製することができる。定常領域コード配列は、自己反応性DN2B細胞が由来する動物種と同じ動物種に由来してもよく、異なる動物種に由来してもよい。
 自己抗体由来抗体は、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体のアミノ酸配列に基づいて抗体遺伝子又は抗原結合断片遺伝子を設計して、取得してもよい。例えば、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体のHCDR1~HCDR3をコードする核酸配列を、重鎖フレームワーク(FR)をコードする核酸配列と連結して、重鎖可変領域コード配列を設計する。重鎖可変領域コード配列を有する核酸は、ホスホロアミダイト法等により化学合成してもよい。重鎖可変領域コード配列を有する核酸は、重鎖定常領域コード配列と連結して、適切な発現ベクターにクローニングする。同様に、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体のLCDR1~LCDR3をコードする核酸配列を、軽鎖フレームワーク(FR)をコードする核酸配列と連結して、軽鎖可変領域コード配列を設計する。軽鎖可変領域コード配列を有する核酸は、ホスホロアミダイト法等により化学合成してもよい。軽鎖可変領域コード配列を有する核酸は、軽鎖定常領域コード配列と連結して、適切な発現ベクターにクローニングする。重鎖コード配列及び軽鎖コード配列は、同一の発現ベクターにクローニングしてもよい。この発現ベクターを適切な細胞に導入して培養することにより、自己抗体由来抗体を取得することができる。FRコード配列および定常領域コード配列は、DN2B細胞が由来する動物種と同じ動物種に由来してもよく、異なる動物種に由来してもよい。また、重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域は、FCDRおよびFRを含む全体について、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体に由来するものを用いてもよい。
 自己抗体由来抗体は、上記のように設計した自己抗体由来抗体をコードする遺伝子を組み込んだトランスジェニック動物を作製して取得してもよい。自己抗体由来抗体は、当該トランスジェニック動物の体液(例えば、血液、ミルク等)を精製から精製することにより、取得することができる。
 抗原結合断片をコードする核酸配列は、抗原結合断片の構造に応じて、適宜設計することができる。例えば、scFvは、重鎖可変領域と軽鎖可変領域とがリンカーで連結された構造を有する。そのため、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体のHCDR1~HCDR3を含む重鎖可変領域と、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体のLCDR1~LCDR3を含む軽鎖可変領域とをリンカーコード配列を介して連結することにより、scFvコード配列を含む核酸を取得することができる。
 自己抗体由来抗体としては、上記(a)~(c)からなる群より選択される抗体、並びに、上記(1)~(37)からなる群より選択される抗体、が挙げられる。(a)~(c)に記載される表1および表2のV鎖およびCDRをコードする核酸配列の代表例が、表8~13に示されている。(1)~(37)で指定される配列番号のアミノ酸配列をコードする核酸配列の代表例が、表14~17に示されている。
 自己抗体由来抗体は、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体と同一の抗原特異性を有する。したがって、自己抗体由来抗体は、自己反応性DN2B細胞が由来する個体の体内で生成される抗原に結合する。自己抗体由来抗体は、好ましくは抗核抗体である。自己抗体由来抗体は、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体と同一の抗原特異性を有するため、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体と同様に、SLEの診断薬として用いることができる。
 [全身性エリテマトーデスの診断薬]
 本開示の第3の態様は、全身性エリテマトーデスの診断薬(以下、「SLE診断薬」ともいう)である。SLE診断薬は、上記第1の態様にかかる自己抗体(自己反応性DN2B細胞由来自己抗体)もしくはその抗原結合断片、および、上記第3の態様にかかる抗体(自己抗体由来抗体)もしくはその抗原結合断片からなる群より選択される少なくとも1種を含む。
 SLE診断薬は、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体、自己抗体由来抗体、および、これらの抗原結合断片からなる少なくとも1種に加えて、他の成分を含んでもよい。他の成分としては、溶媒、希釈剤、ビヒクル、賦形剤、流動促進剤、結合剤、造粒剤、分散化剤、懸濁化剤、湿潤剤、滑沢剤、崩壊剤、可溶化剤、安定剤、乳化剤、充填剤等が挙げられるが、これらに限定されない。薬学的に許容される担体は、1種を単独で用いてもよく、2種以上を併用してもよい。
 SLE診断薬は、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体、自己抗体由来抗体、および、これらの抗原結合断片からなる少なくとも1種を緩衝液に溶解したものでもよい。あるいは、SLE診断薬は、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体、自己抗体由来抗体、および、これらの抗原結合断片からなる少なくとも1種を緩衝液に溶解させて、凍結乾燥したものでもよい。緩衝液としては、例えば、リン酸緩衝生理食塩水、Tris緩衝液、クエン酸緩衝液、酢酸緩衝液等が挙げられるが、これらに限定されない。
 自己反応性DN2B細胞由来自己抗体、自己抗体由来抗体、および、これらの抗原結合断片は、標識かされていてもよい。標識化のための標識物質は、特に限定されず、公知のものを用いることができる。標識物質としては、例えば、酵素標識物質、蛍光標識物質、放射性同位体標識物質、電気化学発光標識物質、金属ナノ粒子等が挙げられる。酵素標識物質としては、例えば、ペルオキシダーゼ(例、西洋ワサビペルオキシダーゼ)、アルカリホスファターゼ等が挙げられる。蛍光標識物質としては、例えば、カルボキシフルオレセイン(FAM)、6-カルボキシ-4’,5’-ジクロロ2’,7’-ジメトキシフルオレセイン(JOE)、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)、テトラクロロフルオレセイン(TET)、5'-ヘキサクロロ-フルオレセイン-CEホスホロアミダイト(HEX)、Cy3、Cy5、Alexa568、Alexa647等が挙げられる。放射性同位体標識物質としては、ヨウ素125等が挙げられる。電気化学発光標識物質としては、ルテニウム錯体等が挙げられる。標識化は、標識物質の種類に応じて、公知の方法を適宜選択して行うことができる。
 SLE診断薬は、他の物品と組み合わせて、SLE診断キットとしてもよい。SLE診断キットが含む他の物品としては、例えば、競合ELISAに使用される器具および試薬が挙げられる。競合ELISAに使用される器具としては、ウェルプレート等の固相担体、抗原、標識物質検出試薬、血液試料調製試薬、希釈剤、緩衝液、ブロッキング試薬、使用説明書等が挙げられるが、これらに限定されない。自己反応性DN2B細胞由来自己抗体および自己抗体由来抗体が抗核抗体である場合、抗原としては自己反応性DN2B細胞が由来する動物種の細胞を用いることができる。
 [血液試料の検査方法]
 本開示の第4の態様は、血液試料の検査方法である。前記検査方法は、検査対象から採取された血液試料において、自己反応性DN2B細胞から産生される自己抗体の発現量を測定する工程を含む。前記自己抗体の発現量が基準値よりも高いことが、前記検査対象が全身性エリテマトーデスに罹患している可能性が高いことを示す。血液試料の検査は、in vitroで行うことができる。
 <自己反応性DN2B細胞由来自己抗体の発現量測定工程>
 検査対象は、SLEに罹患している可能性が検査される対象である。検査対象は、SLEに罹患する可能性がある動物であれば、特に限定されない。検査対象の具体例としては、ヒト、および非ヒト哺乳動物が挙げられる。
 「血液試料」とは、検査対象から採取された血液成分に由来する試料を指す。血液試料は、血漿、血清、および血液細胞、並びに、これらに何らかの処理をして得られる試料を包含する。血液細胞を処理して得られる試料としては、血液細胞を培養して得られる細胞集団、および、血液細胞を培養して得られる培養上清が挙げられる。
 自己反応性DN2B細胞由来自己抗体の発現量の測定方法としては、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体のmRNAを測定する方法、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体を測定する方法が挙げられる。
 (mRNAを測定する方法)
 自己反応性DN2B細胞由来自己抗体のmRNAを測定する場合、血液試料としては、B細胞を含む試料を用いる。B細胞を含む試料としては、末梢血単核球(PBMC)が挙げられる。血液試料としては、B細胞を含む血液細胞試料(例えば、PBMC)を、TLRリガンド(TLR7リガンド、TLR9リガンド等)の存在下で培養して得られた細胞集団を用いてもよい。
 mRNAの測定は、公知の方法を用いることができる。mRNAの測定方法としては、RT-qPCRが挙げられる。RT-qPCRに用いるプライマーは、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体のmRNAに特異的なプライマーを用いる。そのようなプライマーは、例えば、配列番号50~55(表8~13参照)のいずれかに記載の核酸配列から設計することができる。プライマーは、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体の重鎖可変領域コード領域又は軽鎖可変領域コード領域を増幅可能なプライマーが好ましく、重鎖可変領域コード領域を増幅可能なプライマーを用いることがより好ましい。プライマーは、HCDR3コード領域又はLCDR3コード領域の少なくとも一部を増幅可能なプライマーが好ましく、HCDR3コード領域の少なくとも一部を増幅可能なプライマーがより好ましい。フォワードプライマーは、例えば、HCDR3コード領域よりも5’側の領域にアニーリングするように設計することができる。リバースプライマーは、例えば、HCDR3コード領域の少なくとも一部を含む領域にアニーリングするように設計することができる。
 mRNAの測定により、自己抗体の検出および、SLEの診断を行うこともできる。
 後述する実施例で示すように、自己反応性DN2B細胞のBCRのレパトアは偏っている。重鎖については、表4に示されるH1~H3の比率が全体の50%を占めていた。したがって、プライマーとしては、H1~H3をコードする核酸配列を増幅可能なプライマーを用いることができる。H1~H3をコードする核酸配列の具体例は、表8~10にそれぞれ示されている。中でも、表8に示される核酸配列(H1をコードする核酸配列)に基づいて、プライマーを設計することが好ましい。例えば、表8に示されるH1-1~H1-5で配列が共通する領域に、プライマーを設計することができる。
 (自己反応性DN2B細胞由来自己抗体を測定する方法)
 自己反応性DN2B細胞由来自己抗体を測定する場合、血液試料としては、血漿または血清を用いることができる。あるいは、血液試料としては、B細胞を含む血液細胞試料(例えば、PBMC)を、TLRリガンド(TLR7リガンド、TLR9リガンド等)の存在下で培養して得られた培養上清を用いてもよい。
 自己反応性DN2B細胞由来自己抗体の測定方法としては、例えば、単離された自己反応性DN2B細胞由来自己抗体および自己抗体由来抗体、ならびにこれらの抗原結合断片からなる群より選択される少なくとも1種(以下、「検査用抗体」ともいう)を用いた競合ELISAが挙げられる。例えば、ウェルプレート等の固相担体に、抗原を固定し、血液試料および標識化された検査用抗体と反応させる。血液試料中に含まれる自己反応性DN2B細胞由来自己抗体の量に応じて、検査用抗体の抗原への結合が阻害される。したがって、抗原に結合した検査用抗体を測定することにより、血液試料中に存在する自己反応性DN2B細胞由来自己抗体を測定することができる。検査用抗体が抗核抗体である場合、抗原としては、検査対象と同じ動物種の細胞を用いることができる。
 自己反応性DN2B細胞由来自己抗体の発現量が基準値よりも高いことは、検査対象がSLEに罹患している可能性が高いことを示す。すなわち、自己反応性DN2B細胞由来自己抗体の発現量が基準値よりも高いことは、血液試料が、SLEに罹患している可能性が高い検査対象に由来することを示す。自己反応性DN2B細胞由来自己抗体の発現量が基準値よりも低いことは、血液試料が、SLEに罹患している可能性が低い検査対象に由来することを示す。
 基準値は、例えば、任意の人数で構成される健常対象グループにおいて測定された自己反応性DN2B細胞由来自己抗体の発現量から、統計処理等を行って算出された数値でもよい。基準値は、例えば、任意の人数で構成されるSLEに罹患している対象グループにおいて測定された自己反応性DN2B細胞由来自己抗体の発現量から、統計処理等を行って算出された数値であってもよい。基準値は、例えば、健常対象グループおよびSLEに罹患している対象グループにおいて測定された自己反応性DN2B細胞由来自己抗体の発現量から、ROC解析等により算出されたカットオフ値であってもよい。
 本実施形態の方法は、上記測定工程に加えて、他の工程を含んでもよい。他の工程としては、SLEに罹患している可能性が高い検査対象についてSLEの確定診断をする工程、SLEに罹患している可能性が高い検査対象についてSLEの治療を行う工程が挙げられる。
 SLEの診断は、例えば、SLEの症状に関連する臨床所見および免疫所見により行うことができる。
 SLEの治療方法としては、例えば、非ステロイド系消炎鎮痛剤、グルココルチコイド、ヒドロキシクロロキン、免疫抑制剤の投与等が挙げられる。
 [他の態様]
 本開示は、以下の態様も含み得る。
 (A)検査対象から採取された血液試料において、自己反応性DN2B細胞から産生される自己抗体の発現量を測定する工程を含み、前記自己抗体の発現量が基準値よりも高いことが、前記検査対象が全身性エリテマトーデスに罹患している可能性が高いことを示す、全身性エリテマトーデスの診断方法。
 (B)検査対象から採取された血液試料において、自己反応性DN2B細胞から産生される自己抗体の発現量を測定する工程(a)と、前記工程(a)で測定された前記自己抗体の発現量が基準値よりも高い検査対象を、前記検査対象が全身性エリテマトーデスに罹患していると判定する工程(b)と、前記工程(b)で全身性エリテマトーデスに罹患していると判定された検査対象に対して全身性エリテマトーデスの治療を行う工程(c)と、を含む、全身性エリテマトーデスの治療方法。
 (C)検査対象から採取された血液試料において、自己反応性DN2B細胞から産生される自己抗体の発現量を測定する工程を含み、前記自己抗体の発現量が基準値よりも高いことが、前記検査対象が全身性エリテマトーデスに罹患している可能性が高いことを示す、全身性エリテマトーデスを診断するためのデータを収集する方法。
 (D)DN2B細胞由来自己抗体を含む全身性エリテマトーデスマーカー。
 (E)全身性エリテマトーデスの診断に用いるための、単離されたDN2B細胞由来自己抗体、自己抗体由来抗体、およびこれらの抗原結合断片からなる群より選択されるポリペプチド。
 (F)全身性エリテマトーデスの診断薬を製造するための、単離されたDN2B細胞由来自己抗体、自己抗体由来抗体、およびこれらの抗原結合断片からなる群より選択されるポリペプチドの使用。
 (G)全身性エリテマトーデスの診断するための、単離されたDN2B細胞由来自己抗体、自己抗体由来抗体、およびこれらの抗原結合断片からなる群より選択されるポリペプチドの使用。
 以下、実施例により本発明をさらに詳細に説明するが、本発明はこれらの例によって限定されるものではない。
 [方法]
 (実験モデル及び被験者詳細)
 合計23人の成人の健常ドナー(HD)から末梢血を採取した。生体外フローサイトメトリー解析とin vitro刺激アッセイには、それぞれ19人と9人のドナーのサンプルを用いた。2018~2021年の間に活動性疾患状態の有無にかかわらずACR1997基準を満たし、本研究への参加に同意した全身性エリテマトーデス(SLE)患者40人を集めた。培養及びレパートリー解析アッセイでは、SLE患者1人のサンプルを用いた。当該SLE患者は、活動性腎炎と抗dsDNA抗体及び抗Sm抗体の上昇とを伴う疾患フレア(disease flare)を有するSLE患者である。
 (PLD4に対するモノクローナル抗体の生成)
 抗ヒトPLD4モノクローナル抗体(mAbs)であるT1S-mAbsは、PLD4分子の細胞外ドメインがマウス免疫グロブリン(Ig)G2aのFc領域に結合した精製組換え融合タンパク質(cDNA:配列番号1)を雌のBALB/cマウスに免疫することにより作製した。詳細な方法は、国際公開第WO2013/115410号に記載の方法に従った。
 (末梢血単核細胞(PBMC)の単離及びナイーブB細胞の単離)
 30mLの末梢血をヘパリンコートチューブで採取した。PBMCは、Ficoll-PaqueTM(Thermo Fisher Scientific,Waltham,MA,USA)を用いたFicoll勾配法により単離した。その後、PBMCをアンピシリン/ストレプトマイシンと10%ウシ胎仔血清(FBS,SERANA,NY,USA)とを添加したcomplete RPMI1640培地(Sigma-Aldrich,MO,USA)に懸濁し、RBC溶解バッファー(Sigma-Aldrich)を用いて赤血球(RBC)溶解反応を行った。RBCを除去した残りのPBMCを、フローサイトメトリー、細胞培養又はナイーブB細胞の単離に用いた。ナイーブB細胞は、Naive B Cell Isolation Kit ii,human (Miltenyi Biotec, Gladbach, Germany)を用いて、製造者の指示に従って単離した。
 (PLD4遺伝子発現のリアルタイム定量PCR解析)
 免疫細胞及び組織臓器におけるPLD4遺伝子発現の比較のために、ABI Prism 7000(Applied Biosystems)を用いてリアルタイム定量PCR(RT-qPCR)を行った。簡単に説明すると、SYBR green qPCR SuperMix-UDGキット(Invitrogen)を用いて、個々の細胞からcDNAを合成した。免疫細胞の解析には、健常ドナーの血液のアフェレーシス産物(Memorial Blood Centers of Minnesota,Minneapolis,MN,USA)からヒトPBMCを単離した(Takeda Y, S, et al. Int J Mol Sci 2017 18:1162.)。組織発現を調べるために、BDTM MTC multiple tissue cDNA panel(Takara Bio)を用いた。PCRはABI Prism 7000(Applied Biosystems)を用いて行った。PCRは、50℃,2分間;95℃,10分間;95℃,15秒間;及び60℃,1分間を50サイクル行った。各転写物は、サンプルのばらつきを考慮し、ヒトグリセルアルデヒド-3-リン酸化水素酵素(GAPDH)遺伝子の値で正規化した。PCR反応のプライマー配列は以下の通りである。
 PLD4センスプライマー配列1:5’-AGGACATCCACCGACCTG-3’(配列番号2)
 PLD4センスプライマー配列2:5’-GTGAAAGTCTTCATCGTGCCG-3’(配列番号3)
 PLD4アンチセンスプライマー配列1:5’-GCAAAACCCCTGTGA-3’(配列番号4)
 PLD4アンチセンスプライマー配列2:5’-GTGCTGCTGAAGTAATCCTCC-3’(配列番号5)
 GAPDHセンスプライマー配列:5’-AGCCACATCGCTCAGACAG-3’(配列番号6)
 GAPDHアンチセンスプライマー配列:5’-GCCCAATACGACCAAATCC-3’(配列番号7)
 β2MGセンスプライマー配列:5’-CCACTGAAAAAGATGAGTATGCCT-3’(配列番号8)
 β2MGアンチセンスプライマー配列:5’-CCAATCCAAATGCGGCATCTTCA-3’(配列番号9)
 培養ナイーブB細胞におけるPLD4の発現を推定するために、RT-qPCRを行った。培養ナイーブB細胞からRNeasy(登録商標) Plus Micro Kit(Qiagen)を用いて全RNAを抽出し、ReverTra Ace(登録商標) qPCR RT kit(Toyobo)を用いてcDNAを合成した。PLD4の相対発現は、SYBR(登録商標) Green PCRキット(Qiagen)を用いたRT-qPCRで解析した。PCRは、CFX ConnectTM Real Time System(BioRad)を用いて行った。PCRは、50℃,2分間;95℃,15分間;94℃,10秒間;55℃,1分間;及び72℃,1分間を40サイクル行った。各サンプルにおいて、cDNAコピー数は、閾値サイクル(Ct)を標準プラスミド(コピー数10、10、10、10、10および10)により生成されたものと比較することにより決定した。RNA発現はハウスキーピング遺伝子β2MGで正規化した。
 (フローサイトメトリー解析及びセルソーティング)
 染色バッファー(1%ウシ血清アルブミン(BSA)および10%正常マウス血清を含むPBS(Abcam,Cambridge,UK))に懸濁した1×10個/tubeのPBMCを以下の蛍光抗体で染色した。
 セット1:CD43(FITC),CD19(PerCP-Cy5.5),CD38(APC),IgD(PE-Cy7),CD24(APC-Cy7),CD3CD14CD16(V450),CD27(V500)
 セット2:CD11c(FITC),CD19(PerCP-Cy5.5),CD38(APC)/CD21(APC),IgD(PE-Cy7),CXCR5(APC-Cy7),CD3CD14CD16(V450),CD27(V500)
 セット3:CD11c(FITC),BDCA2(APC),CD14(APC-Cy7),CD3CD14(V450),CD16(V500)
 セット4:CD4(FITC),CD8(PerCP-Cy5.5),CD3(APC-Cy7),CD14CD19CD16(V450)
 氷上で20分間インキュベートした後、各チューブ内の細胞を1mLのFACSバッファーで洗浄し、FACSバッファーで懸濁し、アイソタイプ染色とホスホリパーゼD4(PLD4)染色用に2本のチューブに分けた。ビオチン化マウスIgG2b(BioLegend,CA,USA)またはビオチン化T1S-mAbsを5μg/mL添加した。氷上で20分間インキュベートした後、両方のチューブを洗浄し、再度懸濁し、PE-ストレプトアビジン(BD Pharmingen,CA,USA)を1μg/mL添加した。氷上で15分間インキュベートした後、染色したPBMCをFACS Canto II(BD,Biosciences,NJ,USA)で分析した。
 in vitro培養PBMCについては、CD20(PE-Cy7)とCD3CD14CD16(V450)を用いてB細胞を定義した。その後、上記のようにPLD4を染色した。死細胞を除去するために、サイトメトリー解析の5分前に、100μLの細胞液に5μLの7-AAD(BD Pharmingen)を添加した。補正は、抗マウスIg,κ/Negative Control Compensation Particle Set(BD,Biosciences)を用いて行った。
 細胞内T-bet染色のために、2×10個のPBMCを固定し、True-NuclearTM Transcription Factor Buffer Set(BioLegend)を用いて製造者の指示に従って透過処理した。マウスIgG(Peprotech,NJ,USA)を100μg/mLの濃度で添加し、非特異的結合をブロックした後、T-bet(APC)またはマウスIgG1(APC)に対する蛍光抗体を添加した。フローサイトメトリーデータは、FlowJoソフトウェア(Treestar)を用いて解析した。
 後述の細胞培養アッセイのために、PLD4+blastまたはCD19B細胞をFACS Aria II(BD、Biosciences)を用いて選別した。選別可能なPLD4+blastの数は十分多くないため(末梢血20mLから最大3,000細胞)、CD19およびCD3、CD14もしくはCD16細胞(非B細胞PBMC)を足場細胞として同時に選別した。
 (in vitroでの細胞刺激及び培養)
 PLD4誘導アッセイのために、完全RPMI1640培地(10%FBS)に懸濁した5×10個のPBMCまたは1×10個のナイーブB細胞を96ウェル非組織培養処理プレート(Corning,NY,USA)に播種した。刺激として、RPMI1640(刺激なし)、0.15μMのCpG ODN 2006(Invivogen)、1μg/mLのR848(Sigma-Aldrich)、または1μg/mL、5μg/mLもしくは25μg/mLのAffiniPure F(ab’)2 Fragment Goat Antihuman IgG and IgM(H+L)(Jackson ImmunoResearch,PA,USA)を添加し、細胞を2日間培養した後、上記のようにフローサイトメトリー解析を行った。
 B細胞をIgG抗体分泌細胞(IgG-ASC)に分化させるために、選別した1,000個のPLD4+blastまたは形質芽細胞をゲートアウトしたCD19 B細胞を、10,000個の非B細胞PBMCとともにプレートに播種した。その後、1μg/mLのR848または0.15μMのCpG ODN 2006を添加した。培養4日後、IgG-ASCをELISpotでカウントした。
 (IgG分泌細胞のELISpot)
 IgG分泌細胞は、ELISpot Human IgG (HRP) Kit(Mabtech)を用い、製造者の指示に従い検出した。簡単に説明すると、Multiscreen IP HTS 0.45μm(Merck Millipore)に15μg/mLの抗IgG抗体を4℃で一晩コートした。ウェルをPBSで2回洗浄した後、PBSと1%BSAで1時間ブロッキングした。ブロッキング溶液を除去した後、培養細胞をウェルに加え、5% CO下、37℃で16~20時間インキュベートした。
 0.1%Tween20(Sigma-Aldrich)を含むPBS(PBS-T)でウェルを洗浄した後、二次ビオチン化抗IgG抗体を1μg/mLの濃度で添加した。二次ビオチン化抗IgG抗体は、キットに含まれる二次ビオチン化抗IgG抗体をMillex-HV 0.45μm(Merck Millipore)で濾過して用いた。2時間インキュベート後、ウェルをPBS-Tで4回洗浄し、ストレプトアビジン-HRPを100μL加え、プレートを1時間インキュベートした。プレートを洗浄後、ELISpot用基質(Mabtech)を100μL加えた。スポットを15~20分間現像し、ウェルを水道水で洗浄して現像を停止した。プレートをMINERVATECHに送り、スポット数をカウントした。
 (培養B細胞のBCRレパトア解析)
 B細胞レセプタ(BCR)レパトア解析は、T細胞レパトアについて以前に記載された方法と同様に行った(Cho M, Ishida K, et al. Int Immunol. 2008 Jan;20(1):155-64)。簡単に説明すると、培養B細胞を回収し、遠心分離によってPBSで洗浄した。オリゴ(dT)プライマーとSuperscriptTM III Reverse Transcriptase(Invitrogen)をと用いて第一鎖cDNAを合成し、RNase HとT4 DNA polymerase(Invitrogen)とを用いて第二鎖cDNAを合成した。「T」を「U」に置き換えた短鎖アダプターをcDNAライブラリーに結合させた。Uracil DNA Glycosylase(Takara)を加えて短鎖を消化し、一本鎖アダプターのライゲーションを作製した。アダプターを付加したライブラリーをPCRで増幅した。増幅産物(BCRライブラリー)には、次世代シーケンサー(Illumina)を製造者の指示に従い使用した。シーケンシングの結果は、IMGT-V-QUEST(https://www.imgt.org/IMGT_vquest/input)を用いて解析した。同一のV-遺伝子セグメントおよびJ-遺伝子セグメントを共有し、同一のCDR3配列を有する配列は、同一のものとして同定された。
 (組み換えモノクローナル抗体の合成)
 ベクタークローニング、トランスフェクション、および抗体の精製を行った。V(D)Jと定常領域(IgG1)の配列を別々にPCRで増幅し、ベクタークローニング部位と重なる配列を付加した。PCR産物を、NEBuilder(登録少々)HiFi DNA Assembly cloning kit(New England BioLabs)を用いて、pHEK Ultra発現ベクター(Takara Bio)に個別に挿入した。V(D)J+定常領域配列を含むクローズドベクターをOne Shot Top10 chemically competent Escherichia coli cells(Invitrogen)に形質転換し、一晩培養した後、Plasmid Midi kit(Qiagen)を用いてプラスミドを精製した。このプラスミドを、ScreenFectTMUP-293キット(FUJIFILM Wako)を用いてExpi293FTM細胞にトランスフェクトした。Expi293細胞は7.5×10細胞まで増殖させた。5日間の培養後、分泌されたmAbsをProtein G Sepharose 4 Fast Flow Lab Packs(Cytiva)を用いて精製した。具体的には、培養細胞の上清を500μLのプロテインGセファロースをロードしたPierceTM Disposable 5 mL Polypropylene Column(Thermo Fisher Scientific)に加えた。20mMリン酸ナトリウムでカラムを洗浄後、100mM Tris-HCl(pH9.0)で抗体を溶出した。
 酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)用の対照抗体としては、正常ドナーから分離したB細胞のIgG配列からランダムに1つを選んでサブクローニングし、その後mAbsを合成し、精製した。
 (抗核抗体活性測定のためのELISA)
 組換え型mAbの自己反応性を調べるために、Human antinuclear antibody(ANA) ELISA Kit(CUSABIO)を製造者の指示に従い使用した。対照にはANAであることが既知であるSLE患者血清と健常人血清とを101倍希釈で用いた。健常人血清にはPLD4+blast由来mAbsまたは対照サンプル由来mAbsを50μg/mL添加した。各サンプルについてOD450を測定した。
 (統計解析)
 Nonparametric Mann-Whitney検定を用いて群間の値を比較した。スピアマンの順位相関係数は、細胞頻度と臨床測定値との相関を解析するために計算された。Fisherの正確検定は、特定の臨床症状の群間相対リスクの有意性を分析するために使用された。同じ患者または検体で異なる時点または異なる条件で測定された幾つかの値については、Wilcoxon符号順位和検定を行った。すべての解析は、Rバージョン4.1.2(The R Foundation for Statistical Computing,Vienna,Austria)を用いて行った。P値は、*P<0.05、**P<0.01、***P<0.005で示した。
 [結果]
 (PLD4はpDCで次いでB細胞で優位に発現される)
 ヒト形質細胞様樹状細胞(pDC)と単球の遺伝子転写を比較した遺伝子発現連鎖解析(SAGE)では、PLD4遺伝子がpDCで優位に転写されていることが検出された(Takeda Y, et al. Int J Mol Sci 2017 18:1162.)。pDC、B細胞、T細胞、単球、およびナチュラルキラー細胞を用いてRT-qPCRを行い、末梢免疫細胞におけるPLD4のmRNA発現を調べた。その結果、PLD4の発現はpDCで最も高く、次いでB細胞で高かった。B細胞でのPLD4の発現は、pDCよりもはるかに低かった(図1A)。次に、臓器別のPLD4発現を調べた。複数の組織から採取したcDNAパネルを用いてRT-qPCRを行ったところ、脾臓と末梢白血球においてPLD4のmRNA発現が最も高かった(図5A)。これらの結果から、PLD4はpDCで高発現し、B細胞ではpDCよりも発現量が少なく、その発現は免疫関連臓器に集中していることが確認された。
 (PLD4B細胞はSLE患者で有意に増加している)
 PBMCにおけるPLD4の細胞表面発現を調べた。PLD4に対するモノクローナル抗体(T1S-mAb)を作製した。これを用いて、まず健常ドナー(HD)のPBMCに対してフローサイトメトリーを行った(図5B)。pDCの大部分はPLD4陽性であったが、PLD4 B細胞はCD19 B細胞のわずか数%であった(図1B)。他の免疫細胞では表面PLD4の発現は検出されず(n=3、図5C)、mRNA発現解析と一致した。次いで、SLE患者のPBMCを検査した。SLE患者40人を検査し、そのほとんど(32人、80%)が新たに発症した未治療のSLEであった(表3)。PLD4 pDCの頻度はHDと同程度であったが、PLD4 B細胞はSLE患者で有意に増加していた(図1C)。SLE患者のB細胞には様々な特徴がある。例えば、transitional B細胞、ダブルネガティブ(DN)細胞、および形質芽細胞は、健常対照と比較してSLE患者で増加している(Akita K, et al, Front Immunol. 2020;11:498703; doi 10.3389/fimmu.2020.498703; Wardowska A, et al. Int Immunopharmacol. 2020 Jun 1;83:106451; doi 10.1016/j.intimp.2020.106451; Dieudonne Y, et al. J Autoimmun. 2019 Aug;102:150-8; doi 10.1016/j.jaut.2019.05.002)。これまでの報告と一致して、DN細胞と形質芽細胞は、我々のコホートではHDよりも有意に豊富であった。さらに、統計学的に有意ではなかったが、SLE患者ではtransitional B細胞の頻度が高く、30%まで激増した患者もいた(図6A、図6B)。SLE患者で増加したPLD4 B細胞の細胞組成を見ると、transitional B細胞、メモリーB細胞、およびDN細胞の占める割合が、B細胞全体よりも大きかった。しかしながら、PLD4 B細胞は、形質芽細胞をほとんど含んでいなかった(図6C)。これらの結果から、PLD4 B細胞は、SLE患者で増殖しており、細胞組成の点でユニークであることが確認された。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000005
 (「PLD4+blast」は表現型的及び機能的にDN2B細胞とオーバーラップする)
 PLD4 B細胞の特異性を解析するために、細胞の活性化状態をほぼ反映すると推定されるFSC-Aで表される細胞サイズに注目した(Akita K, et al,. Front Immunol. 2020;11:498703; doi 10.3389/fimmu.2020.498703)。B細胞集団全体の中で、形質芽細胞が最も大きな細胞サイズを示した。SLE患者の一部では、PLD4 B細胞の分画が細胞サイズの点で形質芽細胞に匹敵した(図1D)。上述したように、PLD4 B細胞は形質芽細胞をほとんど含まないので、このPLD4 B細胞は他の細胞よりも活性化されていると考え、形質芽細胞と同程度の大きさの細胞に注目した。そこで、形質芽細胞のFSC-Aの25パーセンタイルを閾値として、このようなPLD4 B細胞のより大きな部分を「PLD4+blast」、それ以外を「PLD4+small」と定義した(図1E)。PLD4+blastの比率は、SLE患者ではほぼ0%から最大10%超(平均=3.1%、SD=2.6)の範囲であった(図1F)。SLE患者をPLD4+blastの比率(平均値[3.1%]より高いか低いか)で2群に分けると、高値群(H)は低値群(L)より有意にSLEDAIスコアが高かったが、PLD4 B細胞(blast+small)の比率で分けるとこの差はなくなった(図1G、H)。さらに、形質芽細胞とPLD4+blastの比率は有意に相関していたが、PLD4 B細胞の比率は有意に相関していなかった(図1I、J)。このことは、PLD4+blastはPLD4 B細胞の中の別個の集団として見るべきであり、SLE患者の疾患活動性を反映していることを示唆している。
 さらにPLD4+blastの特徴を調べると、表現型的にIgD、CD27、CD11c++、およびCXCR5を特徴とするDN2細胞とオーバーラップすることがわかった(図2A)。加えて、PLD4+blastはDN細胞集団(IgDまたはCD27の細胞)に含まれず、ほとんどがCD11c++且つCXCR5細胞であったことから、PLD4+blastは細胞オントロジーの点で非常に均質であることが示唆された(図7A)。これと一致して、転写因子T-betの細胞内染色から、PLD4+blastのほとんどがDN2B細胞の重要な特徴の一つであるT-bet++であることが明らかになった(図2B)。予想通り、PLD4+blastとDN2B細胞の比率は有意に相関していた(図2C)。さらに、DN2B細胞集団の中で、PLD4 DN2B細胞はPLD4細胞よりも大きな細胞サイズを示した(図2D)。臨床症状に関しては、高発現のPLD4+blast群(PLD4+blast H)は、低発現のPLD4+blast群(PLD4+blastL)と比較して、腎炎の合併率が高く、抗dsDNA抗体ではなく抗Sm抗体価が高かった(図2E-G)。さらに、PLD4+blastの比率は、血清C3レベルおよび血清C4レベルと有意に逆相関していた(図7B)。一部の症例では免疫抑制療法後にPLD4+blastの有意な減少が観察された(n=11、図2H)。これらの結果から、PLD4+blastの増加は、DN2B細胞の増加と同様に、ある種の疾患活動性を反映していることが示唆された。
 (TLR7またはTLR9の刺激はHDにおけるPLD4 B細胞の誘導に十分である)
 B細胞の表面PLD4発現量が活性化状態によって異なるかどうかを検討した。HDからの単離PBMCを抗IgG/IgM(BCR架橋)、TLR7リガンド単独もしくはTLR9リガンド単独、またはBCR+TLR9リガンドで刺激し、2日目にフローサイトメトリー解析を行った。PLD4 B細胞はBCRシグナルのみでは誘導されなかったが、TLR単独またはBCR+TLR刺激ではPLD4 B細胞が有意に誘導された(図3A、B)。ナイーブB細胞を単離した後、TLR9リガンドで刺激すると、PLD4のmRNAレベルは非刺激時と比較して有意に上昇した(図3C)。したがって、TLR7またはTLR9刺激後のPLD4発現の上昇は、刺激pDCからのサイトカインなどの外的要因によるものではなく、TLR刺激に応答したB細胞内在性のde novo合成によるものであった。ほとんどのサンプルにおいて、BCR+TLR9刺激の組み合わせは、TLR9単独よりもPLD4 B細胞を誘導することができ、下流のシグナル伝達経路の相乗効果を示唆していた(図3B)。
 (PLD4+blastの最大レパトアから合成されたIgG抗体は抗核活性を示した)
 PLD4+blastは、ある種の疾患状態と相関し、DN2B細胞とオーバーラップすることから、自己反応性が高く、SLE患者における自己抗体産生に関与している可能性が高いと推測された。まず、2人のSLE患者から採取したPLD4+blastのIgG抗体産生能をELISpotで評価した。PLD4+blastはIgG産生能を示さなかったが(図4A)、TLR7またはTLR9リガンドと共に培養すると、CD19 B細胞全体よりも旺盛なIgG抗体産生を示した(図4B、C)。
 次いで、PLD4+blastの自己反応性を調べようと試みた。目的のB細胞集団の自己反応性を調べるには、細胞を培養して産生された抗体を測定する方法がよく用いられる。しかし、この方法は再現性と感度の点で問題があり、特に細胞数が少ない場合には難しい。これらの問題を回避するために、培養PLD4+blastのBCRレパトア解析を行った。PLD4+blastは、抗dsDNA抗体(>400 IU/mL)、抗Sm抗体(>46 IU/mL)、および抗SS-A抗体(>1200 IU/mL)の上昇した抗体価を有し、且つクラスIVのループス腎炎を発症したSLEフレアを有する1人の患者1人から取得された。PLD4+blastは、CD19 B細胞の8.5%を占めた。取得されたPLD4+blastをTLR7リガンドと炎症性サイトカインで4日間刺激し、B細胞の抗体分泌細胞(ASC)への分化を促進した。TLR刺激を受けたPLD4+blastのレパトアは偏っていた。その結果、上位3つのレパトアの比率が全体の50%以上を占めたが、これはおそらく刺激と培養によるもので、同様に培養されたCD19 B細胞のレパトアには含まれていなかった(表2~5)。これらの増幅されたレパトアは、おそらくin vitroで分泌された抗体のレパトアであろうと推論し、3つの最も大きなレパトアの配列から組換えモノクローナル抗体を合成した。合成された3つの抗体のうち、2つはELISAで抗核活性を示した(図4D)。したがって、PLD4+blastは自己反応性細胞を含む可能性が高い。
 表4は、培養PLD4+blastのレパトア解析で得られた重鎖の上位10配列を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
 表5は、培養PLD4+blastのレパトア解析で得られたκ鎖の上位10配列を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000007
 表6は、培養CD19 B細胞のレパトア解析で得られた重鎖の上位10配列を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000008
 表7は、培養CD19 B細胞のレパトア解析で得られたκ鎖の上位10配列を示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000009
 上記表2および表4のV鎖のアミノ酸配列は、ImMunoGeneTics(IMGT)のIMGT Repertoire(IG and TR)のサイト(https://www.imgt.org/IMGTrepertoire/Proteins/#h2_4)から取得することができる。
 H1の核酸配列の例を表8に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000010
 H2の核酸配列の例を表9に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000011
 H3の核酸配列の例を表10に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000012
 L1の核酸配列の例を表11に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000013
 L2の核酸配列の例を表12に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000014
 L3の核酸配列の例を表13に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000015
 表7~13中、四角で囲んだ「atg」は、BCRmRNAの翻訳開始点を示す。この「atg」から下線で示す配列の前までがシグナルペプチドである。
 下線で示す配列は、BCRの可変領域の開始点を示す。
 二重下線は、5’側から順に、CDR1、CDR2およびCDR3を示す。
 H1、H2およびH3の可変領域の配列を表14に示す。L1、L2およびL3の可変領域の配列を表15に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000016
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000017
 H1、H2およびH3のCDRの配列を表16に示す。L1、L2およびL3のCDRの配列を表17に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000018
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000019
 [リアルタイム(RT)-PCRによるSLEの診断]
 自己抗体遺伝子を選択的に増幅して検出することにより、SLEの診断が可能かを検討とした。
 SLE患者末梢血から、自己抗体産生細胞と思われる分画を取得し、陽性対照の細胞集団とした。SLE患者の末梢血から分離した細胞集団、健常人末梢血から細胞集団、および前記陽性対照について、RT-PCR法により、自己抗体遺伝子(H1)を増幅した。RT-PCRの方法を以下に示す。
 機材:QuantStudio 3(Applied Biosystems)
 使用した試薬:Applied BiosystemsTM Power SYBRTM Green PCR Master Mix
 プライマー配列:
 <Index-head(internal control)>
 フォワード:AATGATACGGCGACCACCGAGATCTAC(配列番号108)
 リバース:GGAATTCCTGTCCGGTG(配列番号109)
 <H1(VH1-18-01-J4-02)>
 フォワード:AGCCTACATGGAGCTGAGGA(配列番号110)
 リバース:GGCCCCAGTAGTCAATGAGA(配列番号111)
 PCR反応条件を表18に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000020
 各細胞集団は、TLRリガンドを用いて刺激した後、全RNAを抽出し、cDNA合成を行った。cDNA合成後、次世代シークエンサー解析のためのインデックス配列を付与した。これをもとに、Index-head(internal control)を用いて、cDNA量を定量した。H1用プライマーを用いてRT-PCRを行い、cDNA量当たりの増幅割合(PCRサイクル数)によりH1遺伝子の増幅を評価した。
 使用した各細胞集団の詳細は以下の通りである。
 2H:SLE(陽性対照):PLD4陽性細胞と、B細胞を含まない末梢血単核球とをR848(TLR7/8リガンド)で刺激。抗体産生細胞は、PLD4陽性細胞のみ。
 4H:SLE:PBMC(PLD4陽性細胞を含む末梢血から得られた単核球)をCpG(TLR9リガンド)で刺激。
 6H:健常人末梢血単核球をCpG(TLR9リガンド)で刺激。
 Index-head(internal control)用プライマーを用いたときのAmplification PlotおよびMelt Curve Plotを図8A及び図8Bにそれぞれ示す。
 H1用プライマーを用いたときのAmplification PlotおよびMelt Curve Plotを図9A及び図9Bにそれぞれ示す。
 陽性対照(2H)では、PCRのサイクル数が少ない段階(7サイクル程度)で、増幅産物を検出することができた(図9A)。
 SLE患者サンプル(4H)では、32サイクルで増幅産物を検出することができた(図9A)。
 健常人サンプル(6H)では、28サイクルで増幅産物を検出できたように見えた(図9A)。しかしながら、Melt curve Plotにより、H1遺伝子の増幅産物とは異なる別の産物が増幅していることが確認された(図9B)。
 以上の結果から、Amplification PlotおよびMelt Curve Plotを組み合わせて用いることにより、RT-PCR法により、SLEの診断が可能であることが示された。
 [組み換えモノクローナル抗体を用いた蛍光免疫染色]
 H1(V鎖:VH1-18-01、J鎖:4-02)およびL1(V鎖:KV1-16-02、J鎖:1-01)の核酸配列を用いて作製された組み換えモノクローナル抗体(定常領域:ヒトFc IgG)について、蛍光免疫染色により、抗核活性を調べた。蛍光免疫染色の詳細を以下に示す。
 使用細胞:Hep-2(ヒト咽頭癌由来)
 固定:4%パラホルムアルデヒド
 透過処理:0.2% Triton X
 ブロッキング:1% BSA-PBS、室温(約25℃)、1時間
 1次抗体:組み換えモノクローナル抗体(H1(V鎖:VH1-18-01、J鎖:4-02);L1(V鎖:KV1-16-02、J鎖:1-01);Fc-Human IgG)、室温(約25℃)、1時間
 2次抗体:Purified anti-human CD16 (Mouse IgG)、室温(約25℃)、1時間
 3次抗体:Goat anti-Mouse IgG(Alexa Fluor 488)、室温(約25℃)、1時間
 蛍光免疫染色の結果を図10に示す。組み換えモノクローナル抗体により、核が染色されていることが確認された。この結果から、組み換えモノクローナル抗体は、抗核活性を有することが確認された。
 本開示によれば、全身性エリテマトーデスの診断に有用な抗体又はその抗原結合断片、前記抗体又は抗原結合断片を用いた全身性エリテマトーデスの診断薬、および全身性エリテマトーデスの診断に有用な血液試料の検査方法を提供することができる。
 以上、本発明の好ましい実施例を説明したが、本発明はこれら実施例に限定されることはない。本発明の趣旨を逸脱しない範囲で、構成の付加、省略、置換、およびその他の変更が可能である。本発明は前述した説明によって限定されることはなく、添付のクレームの範囲によってのみ限定される。

Claims (7)

  1.  自己反応性DN2B細胞が産生する自己抗体又はその抗原結合断片。
  2.  前記自己抗体が抗核抗体である、請求項1に記載の自己抗体又はその抗原結合断片。
  3.  請求項1又は2に記載の自己抗体の抗原結合部位を含む抗体又はその抗原結合断片。
  4.  下記(a)~(c)からなる群より選択される抗体又はその抗原結合断片:
     (a)表1に記載のV鎖に由来するHCDR1及びHCDR2並びにHCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する重鎖可変領域を含む抗体;
     (b)表2に記載のV鎖に由来するLCDR1及びLCDR2並びにLCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する軽鎖可変領域を含む抗体;
     (c)表1に記載のV鎖に由来するHCDR1及びHCDR2並びにHCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する重鎖可変領域と、表2に記載のV鎖に由来するLCDR1及びLCDR2並びにLCDR3を表1のNo.1~10のいずれかの組合せで有する軽鎖可変領域と、を含む抗体。
    Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
    Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
  5.  請求項1又は2に記載の自己抗体又はその抗原結合断片を含む、全身性エリテマトーデスの診断薬。
  6.  請求項3に記載の抗体又はその抗原結合断片を含む、全身性エリテマトーデスの診断薬。
  7.  検査対象から採取された血液試料において、DN2B細胞から産生される自己抗体の発現量を測定する工程を含み、
     前記自己抗体の発現量が基準値よりも高いことが、前記検査対象が全身性エリテマトーデスに罹患している可能性が高いことを示す、
     血液試料の検査方法。
PCT/JP2024/035660 2023-10-04 2024-10-04 自己反応性dn2b細胞が産生する自己抗体およびその使用 Pending WO2025075163A1 (ja)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US202363542310P 2023-10-04 2023-10-04
US63/542,310 2023-10-04

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2025075163A1 true WO2025075163A1 (ja) 2025-04-10

Family

ID=95283486

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/JP2024/035660 Pending WO2025075163A1 (ja) 2023-10-04 2024-10-04 自己反応性dn2b細胞が産生する自己抗体およびその使用

Country Status (1)

Country Link
WO (1) WO2025075163A1 (ja)

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2015189638A2 (en) * 2014-06-12 2015-12-17 Queen Mary University Of London Antibody
JP2018050532A (ja) * 2016-09-28 2018-04-05 株式会社膠原病研究所 自己免疫疾患の発症の原因となる細胞を被験体が有しているか否かを判定する方法、および、自己免疫疾患の治療剤をスクリーニングする方法
JP2018526443A (ja) * 2015-08-31 2018-09-13 メルク パテント ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツングMerck Patent Gesellschaft mit beschraenkter Haftung 全身性エリテマトーデスを治療するためのlgals3bpの調節方法

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2015189638A2 (en) * 2014-06-12 2015-12-17 Queen Mary University Of London Antibody
JP2018526443A (ja) * 2015-08-31 2018-09-13 メルク パテント ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツングMerck Patent Gesellschaft mit beschraenkter Haftung 全身性エリテマトーデスを治療するためのlgals3bpの調節方法
JP2018050532A (ja) * 2016-09-28 2018-04-05 株式会社膠原病研究所 自己免疫疾患の発症の原因となる細胞を被験体が有しているか否かを判定する方法、および、自己免疫疾患の治療剤をスクリーニングする方法

Non-Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
C. STRENZEL, J. DIRKS, G. HAASE, U. FISCHER, J. FISCHER, A. HOLL-WIEDEN C. HOFMANN, H. MORBACH: " Expansion of autoreactive CD27-IGD- double negative b cells in the joints of antinuclear antibody positive JIA patients", PEDIATRIC RHEUMATOLOGY, vol. 20, no. Suppl 2 no. 75, 20 September 2022 (2022-09-20) - 23 September 2022 (2022-09-23), Lo , pages 19 - 035, XP009562249, ISSN: 1546-0096 *
IMANISHI, AKIKO; HAYASHI, NOBUHIDE: "The automation and international guideline of the examination for antinuclear antibodies", BULLETIN OF KOBE TOKIWA UNIVERSITY, vol. 12, 31 March 2019 (2019-03-31), JP, pages 1 - 8, XP009562596, ISSN: 1884-5487, DOI: 10.20608/00001035 *
JENKS SCOTT A.; CASHMAN KEVIN S.; ZUMAQUERO ESTHER; MARIGORTA URKO M.; PATEL AAKASH V.; WANG XIAOQIAN; TOMAR DEEPAK; WOODRUFF MATT: "Distinct Effector B Cells Induced by Unregulated Toll-like Receptor 7 Contribute to Pathogenic Responses in Systemic Lupus Erythematosus", IMMUNITY, vol. 49, no. 4, 9 October 2018 (2018-10-09), AMSTERDAM, NL , pages 725, XP085507079, ISSN: 1074-7613, DOI: 10.1016/j.immuni.2018.08.015 *
MIMORI AKIO: "II. Systemic lupus erythematosus", JOURNAL OF THE JAPANESE SOCIETY OF INTERNAL MEDICINE, vol. 104, no. 10, 1 January 2015 (2015-01-01), pages 2118 - 2124, XP093299943 *
MOCKRIDGE; CHAPMAN; SPELLERBERG; SHETH; FLEMING; ISENBERG; STEVENSON: "Sequence analysis of V4–34‐encoded antibodies from single B cells of two patients with systemic lupus erythematosus (SLE)", CLINICAL AND EXPERIMENTAL IMMUNOLOGY, vol. 114, no. 1, 25 December 2001 (2001-12-25), GB , pages 129 - 136, XP071084220, ISSN: 0009-9104, DOI: 10.1046/j.1365-2249.1998.00703.x *
YASAKA KEN: " Expansion of PLD4-positive B cells and its significance in systemic lupus erythematosus", NEWSLETTER (HEMATOLOGY AND IMMUNOLOGY NEWSLETTER)), vol. 37, 1 February 2023 (2023-02-01), pages 1 - 8, XP093299948 *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US10604576B2 (en) Antibodies and immunocytokines
JP6767931B2 (ja) T細胞受容体ベータ定常領域に対する抗原結合ドメインを有するキメラ抗原抗体(car)
JP6412072B2 (ja) 抗ヒト受容体型プロテインチロシンホスファターゼσ抗体
JP2021120374A (ja) 疾患の処置における使用のためのcd3イプシロンおよびbcmaに対する二重特異的抗体
JP2021508475A (ja) 共有抗原を標的とする抗原結合タンパク質
JP6868655B2 (ja) Cd6結合パートナーの使用およびそれに基づく方法
AU2010225456A1 (en) Biomarkers and uses thereof
CN104284903B (zh) 抗磷脂酶d4抗体
JP2021520208A (ja) Hhla2受容体としてのkir3dl3、抗hhla2抗体、およびその使用
KR20190057113A (ko) 인터루킨-2에 결합하는 항체 및 그 용도
JP2016503286A (ja) Clec14aに特異性を持つ新規な抗体及びその用途
JP2022517461A (ja) Gm-csfアンタゴニストを使用した免疫療法関連毒性の治療方法
JP2021530511A (ja) 抗pd−1抗体、投薬量、およびその使用
JP2025134794A (ja) 多発性硬化症に対する交差反応性エピトープ
JP2010527978A (ja) 抗TNFα抗体を用いた治療に対する患者の応答を予測するための方法
US20200115452A1 (en) Anti-phosphotyrosinylated pd-1 antibodies and uses thereof
JP2018025554A (ja) 炎症性疾患のマーカー
US8435530B2 (en) Methods for suppressing activity of activated interferon-producing cells
JP2024514830A (ja) 新規腫瘍特異的抗原を使用する骨髄性障害および急性白血病の診断および処置
WO2025075163A1 (ja) 自己反応性dn2b細胞が産生する自己抗体およびその使用
AU2006295717B2 (en) T-cell adhesion molecule and antibody directed against the molecule
KR102896511B1 (ko) SIRPα 변이체에 특이적으로 결합하는 항체
TW202308688A (zh) 以gm-csf拮抗劑治療免疫療法相關毒性之方法
JP2025516472A (ja) 胃腸炎症性障害を処置する方法における使用のための抗btn3a抗体
TW202342528A (zh) 抗人類cxcl1抗體

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 24874762

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1