[go: up one dir, main page]

WO2024254834A1 - Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof - Google Patents

Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof Download PDF

Info

Publication number
WO2024254834A1
WO2024254834A1 PCT/CN2023/100518 CN2023100518W WO2024254834A1 WO 2024254834 A1 WO2024254834 A1 WO 2024254834A1 CN 2023100518 W CN2023100518 W CN 2023100518W WO 2024254834 A1 WO2024254834 A1 WO 2024254834A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
compound
alkyl
mmol
substituted
disease
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
PCT/CN2023/100518
Other languages
French (fr)
Inventor
Xiaodong Li
Lin SU
Zhaokui WAN
Gurmit Grewal
Michael Lawrence Vazquez
Weiyu Lin
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Lynk Pharmaceuticals Co Ltd
Original Assignee
Lynk Pharmaceuticals Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Lynk Pharmaceuticals Co Ltd filed Critical Lynk Pharmaceuticals Co Ltd
Priority to PCT/CN2023/100518 priority Critical patent/WO2024254834A1/en
Priority to PCT/CN2023/137938 priority patent/WO2024255164A1/en
Priority to PCT/CN2024/099405 priority patent/WO2024255885A1/en
Priority to TW113122024A priority patent/TW202502755A/en
Publication of WO2024254834A1 publication Critical patent/WO2024254834A1/en
Anticipated expiration legal-status Critical
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/435Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom
    • A61K31/44Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof
    • A61K31/4427Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof containing further heterocyclic ring systems
    • A61K31/4439Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof containing further heterocyclic ring systems containing a five-membered ring with nitrogen as a ring hetero atom, e.g. omeprazole
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/435Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom
    • A61K31/44Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof
    • A61K31/4427Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof containing further heterocyclic ring systems
    • A61K31/444Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof containing further heterocyclic ring systems containing a six-membered ring with nitrogen as a ring heteroatom, e.g. amrinone
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D401/00Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom
    • C07D401/02Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom containing two hetero rings
    • C07D401/12Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom containing two hetero rings linked by a chain containing hetero atoms as chain links
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D403/00Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by group C07D401/00
    • C07D403/02Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by group C07D401/00 containing two hetero rings
    • C07D403/12Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by group C07D401/00 containing two hetero rings linked by a chain containing hetero atoms as chain links
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D471/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00
    • C07D471/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D471/04Ortho-condensed systems
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D487/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00
    • C07D487/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D487/04Ortho-condensed systems

Definitions

  • the invention generally relates to novel compounds and methods for their therapeutic use. More particularly, the invention provides a novel class of tyrosine kinase 2 inhibitors as well as pharmaceutical compositions of these compounds and methods of preparation and use thereof against various diseases and conditions.
  • Janus kinase is a family of intracellular, nonreceptor tyrosine kinases that transduce cytokine-mediated signals via the Janus kinase -Signal Transduction Activators of Transcription (JAK-STAT) pathway.
  • JAK1, JAK2, JAK3 and tyrosine kinase 2 TYK2
  • the family is defined by the presence of two adjacent kinase domains, JH1 and JH2, of which JH1 performs the phosphorylation involved in pathway activation whereas JH2 regulates JH1 function.
  • cytoplasmic tyrosine kinases are associated with membrane cytokine receptors such as common gamma-chain receptors and the glycoprotein 130 (gp130) transmembrane proteins.
  • membrane cytokine receptors such as common gamma-chain receptors and the glycoprotein 130 (gp130) transmembrane proteins.
  • gp130 glycoprotein 130
  • TYK2 is a key component of the JAK-STAT signaling pathway. TYK2 regulates INF ⁇ , IL12 and IL23. (Ihle, et al. 1995 Annu Rev Immunol. 13: 369–398; Leonard, et al. 1998 Annu Rev Immunol. 16: 293–322; Liu, et al. 1998 Curr Opin Immunol. 10: 271–278.
  • Cytokines implicated in TYK2 activation include interferons (e.g., IFN-a, IFN-b, IFN-k, IFN-d, IFN-e, IFN-t, IFN-w, and IFN-z, and interleukins (e.g., IL-4, IL-6, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, L-22, IL-23, IL-27, IL-31, oncostatin M, ciliary neurotrophic factor, cardiotrophin 1, cardiotrophin-like cytokine, and LIF) .
  • interferons e.g., IFN-a, IFN-b, IFN-k, IFN-d, IFN-e, IFN-t, IFN-w, and IFN-z
  • interleukins e.g., IL-4, IL-6, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, L-22, IL-23, IL-27,
  • the activated TYK2 goes on to phosphorylate further signaling proteins such as members of the STAT family, including STAT1, STAT2, STAT4, and STAT6.
  • Selective inhibition of TYK2 can be utilized to treat a variety of autoimmune inflammatory diseases, such as psoriasis, systemic lupus erythematosus (SLE) , inflammatory bowel disease (IBD) , rheumatoid arthritis (RA) , as well as cancer and diabetes.
  • the selectivity against other JAK family subtypes is regarded as crucial in order to increase the intended pharmacological effects and to reduce side effects. Identifying kinase inhibitors with a high degree of TYK2 selectivity has posed a significant challenge partly due to the high sequence homology of the active site among the JAK family kinases. TYK2 specificity is critical for clinical application of TYK2 kinase inhibitors, because Tyk2 knockout mice are viable with normal blood cell counts, whereas deficiency of JAK3 results in severe combined immunodeficiency in mice, and JAK1 or JAK2 knockout mice show perinatal lethality. (Ghoreschi, et al. 2009 Immunol Rev.
  • the invention provides novel, selective and potent compounds that are orally available. These therapeutic agents are safe and effective TYK2 inhibitors and exhibit fewer and/or lesser side effects than currently available drugs.
  • the invention also provides pharmaceutical compositions of these compounds and methods of their preparation and use.
  • the invention generally relates to a compound having the structural formula (I) :
  • Y 1 is CH, CF or N
  • Y 2 is CH or N
  • Y 3 is NR, O, CH 2 , CF 2 or O-NH;
  • R 1 is a H, F, C 1 -C 3 alkyl and CD 3 , provided that R 1 is not F when Y 3 is N, O or O-NH;
  • R 2’ wherein R 2’ is a C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 6 cycloalkyl, C 5- C 7 spirocycloalkyl, or C 3 -C 6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R 2a , wherein R 2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
  • X 6 is CR 6 or N
  • X 7 is CR 7 or N
  • X 8 is C or N
  • X 9 is CR 9 , O, S, N or NR 9 ;
  • X 10 is CR 9 , O, S, N or NR 10 ;
  • Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group
  • R 2b is a C 1-6 alkyl or C 3-6 cycloalkyl, C 5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R 2c ;
  • R 2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF 3 , CF 3 , C 1-6 alkyl, C 1-6 haloalkyl, C 2-6 alkenyl, C 2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R 2a ; and
  • R 4 is a C 1-3 alkyl, substituted with 0-5 R 4a , wherein R 4a is selected from D, F and Cl;
  • each of R 6 , R 7 , R 9 and R 10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD 3 , CH 2 CF 3 , CF 3 , OR, NRR’, C 1 -C 3 alkyl and C 3 -C 5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R 2a ; and
  • each of R and R’ is independently H or a C 1 -C 6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO 2 .
  • the invention generally relates to a method for preparing a compound disclosed herein, as exemplified by the synthetic schemes and experimental procedure disclosed herein.
  • the invention generally relates to a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising a compound disclosed herein, effective to treat or reduce one or more diseases or disorders, in a mammal, including a human, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent.
  • the invention generally relates to a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising an amount of a compound having the structural formula of (I) :
  • Y 1 is CH, CF or N
  • Y 2 is CH or N
  • Y 3 is NR, O, CH 2 , CF 2 or O-NH;
  • R 1 is a H, F, C 1 -C 3 alkyl and CD 3 , provided that R 1 is not F when Y 3 is N, O or O-NH;
  • R 2’ wherein R 2’ is a C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 6 cycloalkyl, C 5- C 7 spirocycloalkyl, or C 3 -C 6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R 2a , wherein R 2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
  • X 6 is CR 6 or N
  • X 7 is CR 7 or N
  • X 8 is C or N
  • X 9 is CR 9 , O, S, N or NR 9 ;
  • X 10 is CR 9 , O, S, N or NR 10 ;
  • Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group
  • R 2b is a C 1-6 alkyl or C 3-6 cycloalkyl, C 5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R 2c ;
  • R 2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF 3 , CF 3 , C 1-6 alkyl, C 1-6 haloalkyl, C 2-6 alkenyl, C 2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R 2a ; and
  • R 4 is a C 1-3 alkyl, substituted with 0-5 R 4a , wherein R 4a is selected from D, F and Cl;
  • each of R 6 , R 7 , R 9 and R 10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD 3 , CH 2 CF 3 , CF 3 , OR, NRR’, C 1 -C 3 alkyl and C 3 -C 5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R 2a ; and
  • each of R and R’ is independently H or a C 1 -C 6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO 2 ,
  • a mammal including a human, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent.
  • the invention generally relates to a unit dosage form comprising a pharmaceutical composition disclosed herein.
  • the invention generally relates to a method for treating, reducing or preventing a disease or disorder, comprising administering to a subject in need thereof a therapeutically effective amount of a compound according to any one of claims 1-61, wherein the disease or disorder is selected from inflammatory diseases, immune-mediated diseases, cancer, or a related disease or disorder thereof, in a mammal, including a human.
  • the invention generally relates to a method for treating, reducing or preventing a disease or disorder, comprising administering to a subject in need thereof a therapeutically effective amount of a compound having the structural formula of (I) :
  • Y 1 is CH, CF or N
  • Y 2 is CH or N
  • Y 3 is NR, O, CH 2 , CF 2 or O-NH;
  • R 1 is a H, F, C 1 -C 3 alkyl and CD 3 , provided that R 1 is not F when Y 3 is N, O or O-NH;
  • R 2’ wherein R 2’ is a C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 6 cycloalkyl, C 5- C 7 spirocycloalkyl, or C 3 -C 6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R 2a , wherein R 2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
  • X 6 is CR 6 or N
  • X 7 is CR 7 or N
  • X 8 is C or N
  • X 9 is CR 9 , O, S, N or NR 9 ;
  • X 10 is CR 9 , O, S, N or NR 10 ;
  • Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group
  • R 2b is a C 1-6 alkyl or C 3-6 cycloalkyl, C 5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R 2c ;
  • R 2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF 3 , CF 3 , C 1-6 alkyl, C 1-6 haloalkyl, C 2-6 alkenyl, C 2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R 2a ; and
  • R 4 is a C 1-3 alkyl, substituted with 0-5 R 4a , wherein R 4a is selected from D, F and Cl;
  • each of R 6 , R 7 , R 9 and R 10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD 3 , CH 2 CF 3 , CF 3 , OR, NRR’, C 1 -C 3 alkyl and C 3 -C 5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R 2a ; and
  • each of R and R’ is independently H or a C 1 -C 6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO 2 ,
  • disease or disorder is selected from inflammatory diseases, immune-mediated diseases, cancer, or a related disease or disorder thereof, in a mammal, including a human.
  • the invention generally relates to use of a compound disclosed herein, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent, in preparation of a medicament for treating a disease or disorder.
  • Ranges provided herein are understood to be shorthand for all of the values within the range.
  • a range of 1 to 16 is understood to include any number, combination of numbers, or sub-range from the group consisting 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 or 16.
  • “more than one” is understood as 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 40, 50, 100, etc., or any value therebetween.
  • the term “about” is understood as within a range of normal tolerance in the art, for example within 2 standard deviations of the mean. About can be understood as within 10%, 9%, 8%, 7%, 6%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1%, 0.5%, 0.1%, 0.05%, or 0.01%of the stated value. Unless otherwise clear from context, all numerical values provided herein can be modified by the term about.
  • compositions or methods disclosed herein can be combined with one or more of any of the other compositions and methods provided herein.
  • compositions and methods when used to define compositions and methods, is intended to mean that the compositions and methods include the recited elements, but do not exclude other elements.
  • the term “consisting essentially of” when used to define compositions and methods, shall mean that the compositions and methods include the recited elements and exclude other elements of any essential significance to the compositions and methods.
  • “consisting essentially of” refers to administration of the pharmacologically active agents expressly recited and excludes pharmacologically active agents not expressly recited.
  • consisting essentially of does not exclude pharmacologically inactive or inert agents, e.g., pharmaceutically acceptable excipients, carriers or diluents.
  • the term “consisting of” when used to define compositions and methods, shall mean excluding trace elements of other ingredients and substantial method steps. Embodiments defined by each of these transition terms are within the scope of this invention.
  • Certain compounds of the present invention may exist in particular geometric or stereoisomeric forms.
  • the present invention contemplates all such compounds, including cis-and trans-isomers, atropisomers, R-and S-enantiomers, diastereomers, (D) -isomers, (L) -isomers, the racemic mixtures thereof, and other mixtures thereof, as falling within the scope of the invention.
  • Additional asymmetric carbon atoms may be present in a substituent such as an alkyl group. All such isomers, as well as mixtures thereof, are intended to be included in this invention.
  • each asymmetric atom has at least 50 %enantiomeric excess, at least 60 %enantiomeric excess, at least 70 %enantiomeric excess, at least 80 %enantiomeric excess, at least 90 %enantiomeric excess, at least 95 %enantiomeric excess, or at least 99 %enantiomeric excess of either the R-or S-configuration.
  • Isomeric mixtures containing any of a variety of isomer ratios may be utilized in accordance with the present invention. For example, where only two isomers are combined, mixtures containing 50: 50, 60: 40, 70: 30, 80: 20, 90: 10, 95: 5, 96: 4, 97: 3, 98: 2, 99: 1, or 100: 0 isomer ratios are contemplated by the present invention. Those of ordinary skill in the art will readily appreciate that analogous ratios are contemplated for more complex isomer mixtures.
  • a particular enantiomer of a compound of the present invention may be prepared by asymmetric synthesis, or by derivation with a chiral auxiliary, where the resulting diastereomeric mixture is separated and the auxiliary group cleaved to provide the pure desired enantiomers.
  • the molecule contains a basic functional group, such as amino, or an acidic functional group, such as carboxyl, diastereomeric salts are formed with an appropriate optically-active acid or base, followed by resolution of the diastereomers thus formed by fractional crystallization or chromatographic methods well known in the art, and subsequent recovery of the pure enantiomers.
  • a mixture of isomers can be separated on the basis of the physicochemical differences of the constituents, into the pure or substantially pure geometric or optical isomers, diastereomers, racemates, for example, by chromatography and/or fractional crystallization.
  • C 1-6 alkyl is intended to encompass, C 1 , C 2 , C 3 , C 4 , C 5 , C 6 , C 1-6 , C 1-5 , C 1-4 , C 1-3 , C 1-2 , C 2-6 , C 2-5 , C 2-4 , C 2-3 , C 3-6 , C 3-5 , C 3-4 , C 4-6 , C 4-5 , and C 5-6 alkyl.
  • Structures of compounds of the invention are limited by principles of chemical bonding known to those skilled in the art. Accordingly, where a group may be substituted by one or more of a number of substituents, such substitutions are selected so as to comply with principles of chemical bonding and to give compounds that are not inherently unstable and/or would be known to one of ordinary skill in the art as likely to be unstable under ambient conditions (e.g., aqueous, neutral, and several known physiological conditions) .
  • Solvates and polymorphs of the compounds of the invention are also contemplated herein.
  • Solvates of the compounds of the present invention include, for example, hydrates.
  • alkyl refers to a straight or branched hydrocarbon chain radical consisting solely of carbon and hydrogen atoms, containing no unsaturation, having from one to ten carbon atoms (e.g., C 1-10 alkyl) .
  • a numerical range such as “1 to 10” refers to each integer in the given range; e.g., "1 to 10 carbon atoms” means that the alkyl group can consist of 1 carbon atom, 2 carbon atoms, 3 carbon atoms, etc., up to and including 10 carbon atoms, although the present definition also covers the occurrence of the term "alkyl” where no numerical range is designated.
  • alkyl can be a C 1-6 alkyl group. In some embodiments, alkyl groups have 1 to 10, 1 to 8, 1 to 6, or 1 to 3 carbon atoms.
  • Representative saturated straight chain alkyls include, but are not limited to, -methyl, -ethyl, -n-propyl, -n-butyl, -n-pentyl, and -n-hexyl; while saturated branched alkyls include, but are not limited to, -isopropyl, -sec-butyl, -isobutyl, -tert-butyl, -isopentyl, 2-methylbutyl, 3-methylbutyl, 2-methylpentyl, 3-methylpentyl, 4-methylpentyl, 2-methylhexyl, 3-methylhexyl, 4-methylhexyl, 5-methylhexyl, 2, 3-dimethylbutyl, and the like.
  • alkyl is attached to the parent molecule by a single bond.
  • an alkyl group is optionally substituted by one or more of substituents which independently include: acyl, alkyl, alkenyl, alkynyl, alkoxy, alkylaryl, cycloalkyl, aralkyl, aryl, aryloxy, amino, amido, amidino, imino, azide, carbonate, carbamate, carbonyl, heteroalkyl, heteroaryl, heteroarylalkyl, heterocycloalkyl, hydroxy, cyano, halo, haloalkoxy, haloalkyl, ester, ether, mercapto, thio, alkylthio, arylthio, thiocarbonyl, nitro, oxo, phosphate, phosphonate, phosphinate, silyl, sulfinyl, sulfonyl, sulfona
  • a substituted alkyl can be selected from fluoromethyl, difluoromethyl, trifluoromethyl, 2-fluoroethyl, 3-fluoropropyl, hydroxymethyl, 2-hydroxyethyl, 3-hydroxypropyl, benzyl, and phenethyl.
  • alkoxy refers to the group -O-alkyl, including from 1 to 10 carbon atoms (C 1-10 ) of a straight, branched, saturated cyclic configuration and combinations thereof, attached to the parent molecular structure through an oxygen. Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted alkoxy groups. Examples include methoxy, ethoxy, propoxy, isopropoxy, butoxy, t-butoxy, pentoxy, cyclopropyloxy, cyclohexyloxy and the like. "Lower alkoxy” refers to alkoxy groups containing one to six carbons.
  • C 1-3 alkoxy is an alkoxy group that encompasses both straight and branched chain alkyls of from 1 to 3 carbon atoms.
  • an alkoxy group can be optionally substituted by one or more substituents which independently include: acyl, alkyl, alkenyl, alkynyl, alkoxy, alkylaryl, cycloalkyl, aralkyl, aryl, aryloxy, amino, amido, amidino, imino, azide, carbonate, carbamate, carbonyl, heteroalkyl, heteroaryl, heteroarylalkyl, heterocycloalkyl, hydroxy, cyano, halo, haloalkoxy, haloalkyl, ester, ether, mercapto, thio, alkylthio, arylthio, thiocarbonyl, nitro, oxo, phosphate, phosphonate, phosphinate, si
  • aromatic or “aryl” refer to a radical with 6 to 14 ring atoms (e.g., C 6-14 aromatic or C 6-14 aryl) that has at least one ring having a conjugated pi electron system which is carbocyclic (e.g., phenyl, fluorenyl, and naphthyl) . Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted aryl groups. In some embodiments, the aryl is a C 6-10 aryl group. For example, bivalent radicals formed from substituted benzene derivatives and having the free valences at ring atoms are named as substituted phenylene radicals.
  • bivalent radicals derived from univalent polycyclic hydrocarbon radicals whose names end in"-yl" by removal of one hydrogen atom from the carbon atom with the free valence are named by adding "-idene” to the name of the corresponding univalent radical, e.g., a naphthyl group with two points of attachment is termed naphthylidene.
  • a numerical range such as "6 to 14 aryl” refers to each integer in the given range; e.g., "6 to 14 ring atoms” means that the aryl group can consist of 6 ring atoms, 7 ring atoms, etc., up to and including 14 ring atoms.
  • the term includes monocyclic or fused-ring polycyclic (i.e., rings which share adjacent pairs of ring atoms) groups.
  • Polycyclic aryl groups include bicycles, tricycles, tetracycles, and the like. In a multi-ring group, only one ring is required to be aromatic, so groups such as indanyl are encompassed by the aryl definition.
  • Non-limiting examples of aryl groups include phenyl, phenalenyl, naphthalenyl, tetrahydronaphthyl, phenanthrenyl, anthracenyl, fluorenyl, indolyl, indanyl, and the like.
  • an aryl moiety can be optionally substituted by one or more substituents which independently include: acyl, alkyl, alkenyl, alkynyl, alkoxy, alkylaryl, cycloalkyl, aralkyl, aryl, aryloxy, amino, amido, amidino, imino, azide, carbonate, carbamate, carbonyl, heteroalkyl, heteroaryl, heteroarylalkyl, heterocycloalkyl, hydroxy, cyano, halo, haloalkoxy, haloalkyl, ester, ether, mercapto, thio, alkylthio, arylthio, thiocarbonyl, nitro, oxo, phosphate, phosphonate, phosphinate, silyl, sulfinyl, sulfonyl, sulfonamidyl, sulfoxyl, sulfon
  • cycloalkyl and “carbocyclyl” each refers to a monocyclic or polycyclic radical that contains only carbon and hydrogen, and can be saturated or partially unsaturated.
  • Partially unsaturated cycloalkyl groups can be termed “cycloalkenyl” if the carbocycle contains at least one double bond, or "cycloalkynyl” if the carbocycle contains at least one triple bond.
  • Cycloalkyl groups include groups having from 3 to 13 ring atoms (i.e., C 3-13 cycloalkyl) . Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted cycloalkyl groups.
  • a numerical range such as “3 to 10" refers to each integer in the given range; e.g., "3 to 13 carbon atoms” means that the cycloalkyl group can consist of 3 carbon atoms, 4 carbon atoms, 5 carbon atoms, etc., up to and including 13 carbon atoms.
  • the term "cycloalkyl” also includes bridged and spiro-fused cyclic structures containing no heteroatoms.
  • the term also includes monocyclic or fused-ring polycyclic (i.e., rings which share adjacent pairs of ring atoms) groups.
  • Polycyclic aryl groups include bicycles, tricycles, tetracycles, and the like.
  • cycloalkyl can be a C 3-8 cycloalkyl radical. In some embodiments, “cycloalkyl” can be a C 3-5 cycloalkyl radical.
  • Illustrative examples of cycloalkyl groups include, but are not limited to the following moieties: C 3-6 carbocyclyl groups include, without limitation, cyclopropyl (C 3 ) , cyclobutyl (C 4 ) , cyclopentyl (C 5 ) , cyclopentenyl (C 5 ) , cyclohexyl (C 6 ) , cyclohexenyl (C 6 ) , cyclohexadienyl (C 6 ) and the like.
  • C 3-7 carbocyclyl groups include norbornyl (C 7 ) .
  • Examples of C 3-8 carbocyclyl groups include the aforementioned C 3-7 carbocyclyl groups as well as cycloheptyl (C 7 ) , cycloheptadienyl (C 7 ) , cycloheptatrienyl (C 7 ) , cyclooctyl (C 8 ) , bicyclo [2.2.1] heptanyl, bicyclo [2.2.2] octanyl, and the like.
  • C 3-13 carbocyclyl groups include the aforementioned C 3-8 carbocyclyl groups as well as octahydro-1H indenyl, decahydronaphthalenyl, spiro [4.5] decanyl and the like.
  • a cycloalkyl group can be optionally substituted by one or more substituents which independently include: acyl, alkyl, alkenyl, alkynyl, alkoxy, alkylaryl, cycloalkyl, aralkyl, aryl, aryloxy, amino, amido, amidino, imino, azide, carbonate, carbamate, carbonyl, heteroalkyl, heteroaryl, heteroarylalkyl, heterocycloalkyl, hydroxy, cyano, halo, haloalkoxy, haloalkyl, ester, ether, mercapto, thio, alkylthio, arylthio, thiocarbonyl, nitro, oxo, phosphate, phosphonate, phosphinate, silyl, sulfinyl, sulfonyl, sulfonamidyl, sulfoxyl, s
  • cycloalkenyl and “cycloalkynyl” mirror the above description of “cycloalkyl” wherein the prefix “alk” is replaced with “alken” or “alkyn” respectively, and the parent “alkenyl” or “alkynyl” terms are as described herein.
  • a cycloalkenyl group can have 3 to 13 ring atoms, such as 5 to 8 ring atoms.
  • a cycloalkynyl group can have 5 to 13 ring atoms.
  • halogen refers to fluorine (F) , chlorine (Cl) , bromine (Br) , or iodine (I) .
  • halide or “halo” , means fluoro, chloro, bromo or iodo.
  • haloalkyl, “ “haloalkenyl, “ “haloalkynyl” and “haloalkoxy” include alkyl, alkenyl, alkynyl and alkoxy structures that are substituted with one or more halo groups or with combinations thereof.
  • fluoroalkyl and fluoroalkoxy include haloalkyl and haloalkoxy groups, respectively, in which the halo is fluorine, such as, but not limited to, trifluoromethyl, difluoromethyl, 2, 2, 2-trifluoroethyl, 1-fluoromethyl-2-fluoroethyl, and the like.
  • halo is fluorine, such as, but not limited to, trifluoromethyl, difluoromethyl, 2, 2, 2-trifluoroethyl, 1-fluoromethyl-2-fluoroethyl, and the like.
  • alkyl, alkenyl, alkynyl and alkoxy groups are as defined herein and can be optionally further substituted as defined herein.
  • heteroatom refers to oxygen (O) , nitrogen (N) , sulfur (S) , and phosphorus (P) .
  • heteroalkyl refers to an alkyl radical, which have one or more skeletal chain atoms selected from an atom other than carbon, e.g., oxygen, nitrogen, sulfur, phosphorus or combinations thereof. Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted heteroalkyl groups.
  • a numerical range can be given, e.g., C 1-4 heteroalkyl, which refers to the chain length in total, which in this example is 4 atoms long.
  • a -CH 2 OCH 2 CH 3 radical is referred to as a "C 4 " heteroalkyl, which includes the heteroatom center in the atom chain length description.
  • an N-containing heteroalkyl moiety refers to a group in which at least one of the skeletal atoms is a nitrogen atom.
  • One or more heteroatom (s) in the heteroalkyl radical can be optionally oxidized.
  • One or more nitrogen atoms, if present, can also be optionally quaternized.
  • heteroalkyl also includes skeletal chains substituted with one or more nitrogen oxide (-O-) substituents.
  • heteroalkyl groups include, without limitation, ethers such as methoxyethanyl (-CH 2 CH 2 OCH 3 ) , ethoxymethanyl (-CH 2 OCH 2 CH 3 ) , (methoxymethoxy) ethanyl (-CH 2 CH 2 OCH 2 OCH 3 ) , (methoxymethoxy) methanyl (-CH 2 OCH 2 OCH 3 ) and (methoxyethoxy) methanyl (-CH 2 OCH 2 CH 2 OCH 3 ) and the like; amines such as (-CH 2 CH 2 NHCH 3 , -CH 2 CH 2 N (CH 3 ) 2 , -CH 2 NHCH 2 CH 3 , -CH 2 N (CH 2 CH 3 ) (CH 3 ) ) and the like.
  • ethers such as methoxyethanyl (-CH 2 CH 2 OCH 3 ) , ethoxymethanyl (-CH 2 OCH 2 CH 3 )
  • heterocycloalkyl refers to a cycloalkyl radical, which have one or more skeletal chain atoms selected from an atom other than carbon, e.g., oxygen, nitrogen, sulfur, phosphorus or combinations thereof. Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted heterocycloalkyl groups.
  • Illustrative examples of heterocycloalkyl include 2-hydroxy-aziridin-1-yl, 3-oxo-1-oxacyclobutan-2-yl, 2, 2-dimethyl-tetrahydrofuran-3-yl, 3-carboxy-morpholin-4-yl, 1-cyclopropyl-4-methyl-piperazin-2-yl.
  • heteroaryl or, alternatively, “heteroaromatic” refers to a radical of a 5-18 membered monocyclic or polycyclic (e.g., bicyclic, tricyclic, tetracyclic and the like) aromatic ring system (e.g., having 6, 10 or 14 ⁇ electrons shared in a cyclic array) having ring carbon atoms and 1-6 ring heteroatoms provided in the aromatic ring system, wherein each heteroatom is independently selected from nitrogen, oxygen, phosphorous and sulfur ("5-18 membered heteroaryl” ) . Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted heteroaryl groups.
  • Heteroaryl polycyclic ring systems can include one or more heteroatoms in one or both rings.
  • a numerical range such as “5 to 18" refers to each integer in the given range; e.g., "5 to 18 ring atoms” means that the heteroaryl group can consist of 5 ring atoms, 6 ring atoms, etc., up to and including 18 ring atoms.
  • a heteroaryl can have 5 to 14 ring atoms.
  • the heteroaryl has, for example, bivalent radicals derived from univalent heteroaryl radicals whose names end in "-yl” by removal of one hydrogen atom from the atom with the free valence are named by adding "-ene" to the name of the corresponding univalent radical, e.g., a pyridyl group with two points of attachment is a pyridylene.
  • an N-containing “heteroaromatic” or “heteroaryl” moiety refers to an aromatic group in which at least one of the skeletal atoms of the ring is a nitrogen atom.
  • One or more heteroatom (s) in the heteroaryl radical can be optionally oxidized.
  • One or more nitrogen atoms, if present, can also be optionally quaternized.
  • Heteroaryl also includes ring systems substituted with one or more nitrogen oxide (-O-) substituents, such as pyridinyl N-oxides. The heteroaryl is attached to the parent molecular structure through any atom of the ring (s) .
  • Heteroaryl also includes ring systems wherein the heteroaryl ring, as defined above, is fused with one or more aryl groups wherein the point of attachment to the parent molecular structure is either on the aryl or on the heteroaryl ring, or wherein the heteroaryl ring, as defined above, is fused with one or more cycloalkyl or heterocycyl groups wherein the point of attachment to the parent molecular structure is on the heteroaryl ring.
  • the point of attachment to the parent molecular structure can be on either ring, i.e., either the ring bearing a heteroatom (e.g., 2-indolyl) or the ring that does not contain a heteroatom (e.g., 5-indolyl) .
  • a heteroaryl group is a 5-10 membered aromatic ring system having ring carbon atoms and 1-4 ring heteroatoms provided in the aromatic ring system, wherein each heteroatom is independently selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur ("5-10 membered heteroaryl” ) .
  • a heteroaryl group is a 5-8 membered aromatic ring system having ring carbon atoms and 1-4 ring heteroatoms provided in the aromatic ring system, wherein each heteroatom is independently selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur ( “5-8 membered heteroaryl” ) .
  • a heteroaryl group is a 5-6 membered aromatic ring system having ring carbon atoms and 1-4 ring heteroatoms provided in the aromatic ring system, wherein each heteroatom is independently selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur ("5-6 membered heteroaryl" ) .
  • the 5-6 membered heteroaryl has 1-3 ring heteroatoms selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur.
  • the 5-6 membered heteroaryl has 1-2 ring heteroatoms selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur.
  • the 5-6 membered heteroaryl has 1 ring heteroatom selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur.
  • heteroaryls include, but are not limited to, azepinyl, acridinyl, benzimidazolyl, benzindolyl, 1, 3-benzodioxolyl, benzofuranyl, benzooxazolyl, benzo [d] thiazolyl, benzothiadiazolyl, benzo [b] [1, 4] dioxepinyl, benzo [b] [1, 4] oxazinyl, 1, 4-benzodioxanyl, benzonaphthofuranyl, benzoxazolyl, benzodioxolyl, benzodioxinyl, benzoxazolyl, benzopyranyl, benzopyranonyl, benzofuranyl, benzopyranonyl, benzofurazanyl, benzothiazolyl, benzothienyl (benzothiophenyl) , benzothieno [3, 2-d] pyrimidinyl
  • a heteroaryl moiety can be optionally substituted by one or more substituents which independently include: acyl, alkyl, alkenyl, alkynyl, alkoxy, alkylaryl, cycloalkyl, aralkyl, aryl, aryloxy, amino, amido, amidino, imino, azide, carbonate, carbamate, carbonyl, heteroalkyl, heteroaryl, heteroarylalkyl, heterocycloalkyl, hydroxy, cyano, halo, haloalkoxy, haloalkyl, ester, ether, mercapto, thio, alkylthio, arylthio, thiocarbonyl, nitro, oxo, phosphate, phosphonate, phosphinate, silyl, sulfinyl, sulfonyl, sulfonamidyl, sulfoxyl, sulf
  • administering refers to oral administration, administration as a suppository, topical contact, intravenous, parenteral, intraperitoneal, intramuscular, intralesional, intrathecal, intracranial, intranasal or subcutaneous administration, or the implantation of a slow-release device, e.g., a mini-osmotic pump, to a subject. Suitable routes of administration for a particular patient will depend on the nature and severity of the disease or condition being treated or the nature of the therapy being used and on the nature of the active compound.
  • Administration may be by any suitable route, including parenteral and transmucosal (e.g., buccal, sublingual, palatal, gingival, nasal, vaginal, rectal, or transdermal) .
  • Parenteral administration includes, e.g., intravenous, intramuscular, intra-arteriole, intradermal, subcutaneous, intraperitoneal, intraventricular, and intracranial.
  • Other modes of delivery include, but are not limited to, the use of liposomal formulations, intravenous infusion, transdermal patches, etc.
  • composition described herein is administered at the same time, just prior to, or just after the administration of one or more additional therapies.
  • the compound of the invention can be administered alone or can be co-administered to the patient.
  • Co-administration is meant to include simultaneous or sequential administration of the compound individually or in combination (more than one compound or agent) .
  • the preparations can also be combined, when desired, with other active substances (e.g., to reduce metabolic degradation) .
  • compositions of the present invention can be delivered transdermally, by a topical route, formulated as applicator sticks, solutions, suspensions, emulsions, gels, creams, ointments, pastes, jellies, paints, powders, and aerosols.
  • Oral preparations include tablets, pills, powder, dragees, capsules, liquids, lozenges, cachets, gels, syrups, slurries, suspensions, etc., suitable for ingestion by the patient.
  • Solid form preparations include powders, tablets, pills, capsules, cachets, suppositories, and dispersible granules.
  • Liquid form preparations include solutions, suspensions, and emulsions, gels, for example, water or water/propylene glycol solutions.
  • compositions of the present invention may additionally include components to provide sustained release and/or comfort.
  • Such components include high molecular weight, anionic mucomimetic polymers, gelling polysaccharides and finely-divided drug carrier substrates. These components are discussed in greater detail in U.S. Pat. Nos. 4,911,920; 5,403,841; 5,212,162; and 4,861,760. The entire contents of these patents are incorporated herein by reference in their entirety for all purposes.
  • the compositions of the present invention can also be delivered as microspheres for slow release in the body.
  • microspheres can be administered via intradermal injection of drug-containing microspheres, which slowly release subcutaneously (see Rao, 1995 J. Biomater Sci. Polym. Ed.
  • disease As used herein, the terms “disease, ” “condition, ” and “disorder” are used interchangeably herein and refer to a state of being or health status of a patient or subject capable of being treated with a compound, pharmaceutical composition, or method provided herein.
  • the term “effective amount” of an active agent refers to an amount sufficient to elicit the desired biological response.
  • the effective amount of a compound of the invention may vary depending on such factors as the desired biological endpoint, the pharmacokinetics of the compound, the disease being treated, the mode of administration, and the patient.
  • the terms “inhibition, ” “inhibit” and “inhibiting” and the like in reference to a biological target (e.g., TYK2) inhibitor interaction refers to negatively affecting (e.g., decreasing) the activity or function of the protein relative to the activity or function of the protein in the absence of the inhibitor.
  • inhibition means negatively affecting (e.g. decreasing) the concentration or levels of the protein relative to the concentration or level of the protein in the absence of the inhibitor.
  • inhibition refers to reduction of a disease or symptoms of disease.
  • inhibition refers to a reduction in the activity of a particular protein target.
  • Inhibition includes, at least in part, partially or totally blocking stimulation, decreasing, preventing, or delaying activation, or inactivating, desensitizing, or down-regulating signal transduction or enzymatic activity or the amount of a protein.
  • inhibition refers to a reduction of activity of a target protein resulting from a direct interaction (e.g., an inhibitor binds to the target protein) .
  • inhibition refers to a reduction of activity of a target protein from an indirect interaction (e.g., an inhibitor binds to a protein that activates the target protein, thereby preventing target protein activation) .
  • isolated or “purified” refer to a material that is substantially or essentially free from components that normally accompany it in its native state. Purity and homogeneity are typically determined using analytical chemistry techniques such as polyacrylamide gel electrophoresis or high-performance liquid chromatography.
  • the term “modulate” refers to the production, either directly or indirectly, of an increase or a decrease, a stimulation, inhibition, interference, or blockage in a measured activity when compared to a suitable control.
  • a “modulator” of a polypeptide or polynucleotide refers to a substance that affects, for example, increases, decreases, stimulates, inhibits, interferes with, or blocks a measured activity of the polypeptide or polynucleotide, when compared to a suitable control.
  • a “modulator” may bind to and /or activate or inhibit the target with measurable affinity, or directly or indirectly affect the normal regulation of a receptor activity.
  • a “pharmaceutically acceptable form” of a disclosed compound includes, but is not limited to, pharmaceutically acceptable salts, esters, hydrates, solvates, isomers, prodrugs, and isotopically labeled derivatives thereof.
  • a “pharmaceutically acceptable form” includes, but is not limited to, pharmaceutically acceptable salts, esters, prodrugs and isotopically labeled derivatives thereof.
  • a “pharmaceutically acceptable form” includes, but is not limited to, pharmaceutically acceptable isomers and stereoisomers, prodrugs and isotopically labeled derivatives thereof.
  • the pharmaceutically acceptable form is a pharmaceutically acceptable salt.
  • pharmaceutically acceptable salt refers to those salts which are, within the scope of sound medical judgment, suitable for use in contact with the tissues of subjects without undue toxicity, irritation, allergic response and the like, and are commensurate with a reasonable benefit/risk ratio.
  • Pharmaceutically acceptable salts are well known in the art. For example, Berge et al. describes pharmaceutically acceptable salts in detail in J. Pharmaceutical Sciences (1977) 66: 1-19.
  • Pharmaceutically acceptable salts of the compounds provided herein include those derived from suitable inorganic and organic acids and bases.
  • Examples of pharmaceutically acceptable, nontoxic acid addition salts are salts of an amino group formed with inorganic acids such as hydrochloric acid, hydrobromic acid, phosphoric acid, sulfuric acid and perchlorate acid or with organic acids such as acetic acid, maleic acid, tartaric acid, citric acid, succinic acid or malonic acid or by using other methods used in the art such as ion exchange.
  • inorganic acids such as hydrochloric acid, hydrobromic acid, phosphoric acid, sulfuric acid and perchlorate acid
  • organic acids such as acetic acid, maleic acid, tartaric acid, citric acid, succinic acid or malonic acid or by using other methods used in the art such as ion exchange.
  • salts include adipate, alginate, ascorbate, aspartate, benzenesulfonate, besylate, benzoate, bisulfate, borate, butyrate, camphorate, camphorsulfonate, citrate, cyclopentanepropionate, digluconate, dodecylsulfate, ethanesulfonate, formate, fumarate, glucoheptonate, glycerophosphate, gluconate, hemisulfate, heptanoate, hexanoate, hydroiodide, 2-hydroxy-ethanesulfonate, lactobionate, lactate, laurate, lauryl sulfate, malate, maleate, malonate, methanesulfonate, 2-naphthalenesulfonate, nicotinate, nitrate, oleate, oxalate, palmitate, pamoate,
  • organic acids from which salts can be derived include, for example, acetic acid, propionic acid, glycolic acid, pyruvic acid, lactic acid, maleic acid, malonic acid, succinic acid, fumaric acid, tartaric acid, citric acid, benzoic acid, cinnamic acid, mandelic acid, methanesulfonic acid, ethanesulfonic acid, p-toluenesulfonic acid, salicylic acid, and the like.
  • the salts can be prepared in situ during the isolation and purification of the disclosed compounds, or separately, such as by reacting the free base or free acid of a parent compound with a suitable base or acid, respectively.
  • Pharmaceutically acceptable salts derived from appropriate bases include alkali metal, alkaline earth metal, ammonium and N + (C 1-4 alkyl) 4 salts.
  • Representative alkali or alkaline earth metal salts include sodium, lithium, potassium, calcium, magnesium, iron, zinc, copper, manganese, aluminum, and the like.
  • compositions include, when appropriate, nontoxic ammonium, quaternary ammonium, and amine cations formed using counterions such as halide, hydroxide, carboxylate, sulfate, phosphate, nitrate, lower alkyl sulfonate and aryl sulfonate.
  • Organic bases from which salts can be derived include, for example, primary, secondary, and tertiary amines, substituted amines, including naturally occurring substituted amines, cyclic amines, basic ion exchange resins, and the like, such as isopropylamine, trimethylamine, diethylamine, triethylamine, tripropylamine, and ethanolamine.
  • the pharmaceutically acceptable base addition salt can be chosen from ammonium, potassium, sodium, calcium, and magnesium salts.
  • the pharmaceutically acceptable form is a “solvate” (e.g., a hydrate) .
  • solvate refers to compounds that further include a stoichiometric or non-stoichiometric amount of solvent bound by non-covalent intermolecular forces.
  • the solvate can be of a disclosed compound or a pharmaceutically acceptable salt thereof. Where the solvent is water, the solvate is a “hydrate. ”
  • Pharmaceutically acceptable solvates and hydrates are complexes that, for example, can include 1 to about 100, or 1 to about 10, or 1 to about 2, about 3 or about 4, solvent or water molecules. It will be understood that the term “compound” as used herein encompasses the compound and solvates of the compound, as well as mixtures thereof.
  • the pharmaceutically acceptable form is a prodrug.
  • prodrug refers to compounds that are transformed in vivo to yield a disclosed compound or a pharmaceutically acceptable form of the compound.
  • a prodrug can be inactive when administered to a subject, but is converted in vivo to an active compound, for example, by hydrolysis (e.g., hydrolysis in blood) .
  • hydrolysis e.g., hydrolysis in blood
  • a prodrug has improved physical and/or delivery properties over the parent compound.
  • Prodrugs can increase the bioavailability of the compound when administered to a subject (e.g., by permitting enhanced absorption into the blood following oral administration) or which enhance delivery to a biological compartment of interest (e.g., the brain or lymphatic system) relative to the parent compound.
  • exemplary prodrugs include derivatives of a disclosed compound with enhanced aqueous solubility or active transport through the gut membrane, relative to the parent compound.
  • the prodrug compound often offers advantages of solubility, tissue compatibility or delayed release in a mammalian organism (see, e.g., Bundgard, H., Design of Prodrugs (1985) , pp. 7-9, 21-24 (Elsevier, Amsterdam) .
  • a discussion of prodrugs is provided in Higuchi, T., et al., "Pro-drugs as Novel Delivery Systems, " A.C.S. Symposium Series, Vol. 14, and in Bioreversible Carriers in Drug Design, ed. Edward B. Roche, American Pharmaceutical Association and Pergamon Press, 1987, both of which are incorporated in full by reference herein.
  • Prodrug forms often offer advantages of solubility, tissue compatibility, or delayed release in the mammalian organism.
  • Prodrugs commonly known in the art include well-known acid derivatives, such as, for example, esters prepared by reaction of the parent acids with a suitable alcohol, amides prepared by reaction of the parent acid compound with an amine, basic groups reacted to form an acylated base derivative, etc.
  • acid derivatives such as, for example, esters prepared by reaction of the parent acids with a suitable alcohol, amides prepared by reaction of the parent acid compound with an amine, basic groups reacted to form an acylated base derivative, etc.
  • Other prodrug derivatives may be combined with other features disclosed herein to enhance bioavailability.
  • Prodrugs include compounds having a carbonate, carbamate, amide or alkyl ester moiety covalently bonded to any of the above substituents disclosed herein.
  • Exemplary advantages of a prodrug can include, but are not limited to, its physical properties, such as enhanced water solubility for parenteral administration at physiological pH compared to the parent compound, or it can enhance absorption from the digestive tract, or it can enhance drug stability for long-term storage.
  • the term “pharmaceutically acceptable” excipient, carrier, or diluent refers to a pharmaceutically acceptable material, composition or vehicle, such as a liquid or solid filler, diluent, excipient, solvent or encapsulating material, involved in carrying or transporting the subject pharmaceutical agent from one organ, or portion of the body, to another organ, or portion of the body.
  • a pharmaceutically acceptable material, composition or vehicle such as a liquid or solid filler, diluent, excipient, solvent or encapsulating material, involved in carrying or transporting the subject pharmaceutical agent from one organ, or portion of the body, to another organ, or portion of the body.
  • Each carrier must be “acceptable” in the sense of being compatible with the other ingredients of the formulation and not injurious to the patient.
  • materials which can serve as pharmaceutically-acceptable carriers include: sugars, such as lactose, glucose and sucrose; starches, such as corn starch and potato starch; cellulose, and its derivatives, such as sodium carboxymethyl cellulose, ethyl cellulose and cellulose acetate; powdered tragacanth; malt; gelatin; talc; excipients, such as cocoa butter and suppository waxes; oils, such as peanut oil, cottonseed oil, safflower oil, sesame oil, olive oil, corn oil and soybean oil; glycols, such as propylene glycol; polyols, such as glycerin, sorbitol, mannitol and polyethylene glycol; esters, such as ethyl oleate and ethyl laurate; agar; buffering agents, such as magnesium hydroxide and aluminum hydroxide; alginic acid; pyrogen-free water; isotonic saline; Ring
  • wetting agents such as sodium lauryl sulfate, magnesium stearate, and polyethylene oxide-polypropylene oxide copolymer as well as coloring agents, release agents, coating agents, sweetening, flavoring and perfuming agents, preservatives and antioxidants can also be present in the compositions.
  • the term “subject” refers to any animal (e.g., a mammal) , including, but not limited to humans, non-human primates, rodents, and the like, which is to be the recipient of a particular treatment.
  • a subject to which administration is contemplated includes, but is not limited to, humans (e.g., a male or female of any age group, e.g., a pediatric subject (e.g., infant, child, adolescent) or adult subject (e.g., young adult, middle-aged adult or senior adult) ) and/or other non-human animals, for example, non-human mammals (e.g., primates (e.g., cynomolgus monkeys, rhesus monkeys) ; commercially relevant mammals such as cattle, pigs, horses, sheep, goats, cats, and/or dogs) , rodents (e.g., rats and/or mice) , etc.
  • humans e.g., a male or female of any age group, e.g., a pediatric subject (e.g., infant, child, adolescent) or adult subject (e.g., young adult, middle-aged adult or senior adult)
  • non-human mammals
  • the non-human animal is a mammal.
  • the non-human animal may be a male or female at any stage of development.
  • a non-human animal may be a transgenic animal.
  • the terms “subject” and “patient” are used interchangeably herein in reference to a human subject.
  • treatment refers to a method of reducing, delaying or ameliorating such a condition before or after it has occurred. Treatment may be directed at one or more effects or symptoms of a disease and/or the underlying pathology.
  • the treatment can be any reduction and can be, but is not limited to, the complete ablation of the disease or the symptoms of the disease.
  • Treating or treatment thus refers to any indicia of success in the therapy or amelioration of an injury, disease, pathology or condition, including any objective or subjective parameter such as abatement; remission; diminishing of symptoms or making the injury, pathology or condition more tolerable to the patient; slowing in the rate of degeneration or decline; making the final point of degeneration less debilitating; improving a patient's physical or mental well-being.
  • the treatment or amelioration of symptoms can be based on objective or subjective parameters, for example, the results of a physical examination, neuropsychiatric exams, and/or a psychiatric evaluation. As compared with an equivalent untreated control, such reduction or degree of amelioration may be at least 5%, 10%, 20%, 40%, 50%, 60%, 80%, 90%, 95%, or 100%as measured by any standard technique.
  • Treatment methods include administering to a subject a therapeutically effective amount of a compound described herein.
  • the administering step may be a single administration or may include a series of administrations.
  • the length of the treatment period depends on a variety of factors, such as the severity of the condition, the patient’s age, the concentration of the compound, the activity of the compositions used in the treatment, or a combination thereof.
  • the effective dosage of an agent used for the treatment may increase or decrease over the course of a particular treatment regime. Changes in dosage may result and become apparent by standard diagnostic assays known in the art. In some instances, chronic administration may be required.
  • the compositions are administered to the subject in an amount and for a duration sufficient to treat the patient.
  • the invention is based on an unexpected discovery of novel, selective and potent compounds that are TYK2 inhibitors.
  • the invention also provides pharmaceutical compositions of these compounds and methods of their preparation and use.
  • the compounds are orally available and exhibit fewer and/or lesser side effects than currently available drugs.
  • TYK2 inhibitors disclosed herein exhibit exceptional potency profiles and are useful in treating one or more TYK2-mediated diseases and conditions, such as allergic, autoimmune, inflammatory, metabolic, neurological and proliferative diseases and conditions.
  • compounds of the invention are modulators of interleukins (e.g., IL-12, IL-23) and interferons (e.g., IFN-a) by inhibiting TYK2-mediated signal transduction.
  • the invention also provides pharmaceutical compositions of these compounds and methods of preparation and use thereof.
  • the TYK2 inhibitors disclosed herein exhibit favorable pharmacokinetic profiles and drug properties that are suitable for the target indications.
  • the invention generally relates to a compound having the structural formula (I) :
  • Y 1 is CH, CF or N
  • Y 2 is CH or N
  • Y 3 is NR, O, CH 2 , CF 2 or O-NH;
  • R 1 is a H, F, C 1 -C 3 alkyl and CD 3 , provided that R 1 is not F when Y 3 is N, O or O-NH;
  • R 2’ wherein R 2’ is a C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 6 cycloalkyl, C 5- C 7 spirocycloalkyl, or C 3 -C 6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R 2a , wherein R 2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
  • X 6 is CR 6 or N
  • X 7 is CR 7 or N
  • X 8 is C or N
  • X 9 is CR 9 , O, S, N or NR 9 ;
  • X 10 is CR 9 , O, S, N or NR 10 ;
  • Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group
  • R 2b is a C 1-6 alkyl or C 3-6 cycloalkyl, C 5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R 2c ;
  • R 2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF 3 , CF 3 , C 1-6 alkyl, C 1-6 haloalkyl, C 2-6 alkenyl, C 2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R 2a ; and
  • R 4 is a C 1-3 alkyl, substituted with 0-5 R 4a , wherein R 4a is selected from D, F and Cl;
  • each of R 6 , R 7 , R 9 and R 10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD 3 , CH 2 CF 3 , CF 3 , OR, NRR’, C 1 -C 3 alkyl and C 3 -C 5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R 2a ; and
  • each of R and R’ is independently H or a C 1 -C 6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO 2 .
  • each of Ring A and Ring B is independently a heteroaryl group.
  • each of Ring A is an aryl group and Ring B is a heteroaryl group.
  • each of Ring A is a heteroaryl group and Ring B is an aryl group.
  • each of Ring A and Ring B is independently an aryl group.
  • X 6 is CH and X 7 is CH, with R 3 having the structure:
  • X 7 is CH and X 8 is C, with R 3 having the structure:
  • X 6 is CH and X 8 is C, with R 3 having the structure:
  • X 7 is CH and X 10 is CH, with R 3 having the structure:
  • R 4 is CH 3 .
  • R 4 is CD 3 .
  • R 3 is selected from:
  • R 3 is:
  • R 3 is:
  • R 7 is H.
  • R 9 is C 1-3 alkyl.
  • R 10 is H.
  • R 10 is C 1-3 alkyl.
  • R 5 is a C 1-4 alkyl, optionally substituted with an OH, alkoxy or ester group.
  • R 5 is:
  • R 5’ is a C 1-3 alkyl, substituted with 0-5 F’s ;
  • R is H, C 1-3 alkyl or acyl.
  • R is CH 3 .
  • R is H and R 5 is:
  • R is CH 3 .
  • Y 3 is NH
  • Y 1 is CH and Y 2 is CH:
  • Y 1 is CH and Y 2 is N:
  • Y 1 is N and Y 2 is CH:
  • Y 1 is N and Y 2 is N:
  • R 2 is R 2’ .
  • R 2b is selected from C 1 -C 6 alkyl, cyclopropyl or cyclobutyl, substituted with 0-2 R 2c .
  • R 2b is cyclopropyl.
  • R 2 is phenyl substituted with 0-2 R 2b .
  • R 2 is pyridinyl substituted with 0-2 R 2c .
  • R 2 is pyrazolyl substituted with 0-2 R 2c .
  • R 2 is pyrimidyl substituted with 0-2 R 2c .
  • R 1 is CH 3 .
  • R 1 is CD 3 .
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • X 6 is N or CH.
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • the compound of (I) has the structural formula:
  • each is H.
  • R 2b is C 1 -C 6 alkyl, cyclopropyl or cyclobutyl, substituted with 0-2 R 2c .
  • R 5 is:
  • R 5’ is a C 1-3 alkyl, substituted with 0-5 F’s.
  • R is H, C 1-3 alkyl or acyl.
  • R is H and R 5 is:
  • R is CH 3 .
  • R 1 is CH 3 .
  • R 1 is CD 3 .
  • R 1 is CD 3
  • R 2b is cyclopropyl
  • R 5’ is a C 2-3 alkyl, substituted with 2-5 F’s .
  • Non-limiting examples of compounds of the invention include those listed in Table 1 in the Examples section herein.
  • the invention generally relates to a method for preparing a compound disclosed herein, as exemplified by the synthetic schemes and experimental procedure disclosed herein.
  • the invention generally relates to a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising a compound disclosed herein, effective to treat or reduce one or more diseases or disorders, in a mammal, including a human, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent.
  • the invention generally relates to a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising an amount of a compound having the structural formula of (I) :
  • Y 1 is CH, CF or N
  • Y 2 is CH or N
  • Y 3 is NR, O, CH 2 , CF 2 or O-NH;
  • R 2’ wherein R 2’ is a C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 6 cycloalkyl, C 5- C 7 spirocycloalkyl, or C 3 -C 6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R 2a , wherein R 2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
  • X 6 is CR 6 or N
  • X 7 is CR 7 or N
  • X 8 is C or N
  • X 9 is CR 9 , O, S, N or NR 9 ;
  • X 10 is CR 9 , O, S, N or NR 10 ;
  • Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group
  • R 2b is a C 1-6 alkyl or C 3-6 cycloalkyl, C 5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R 2c ;
  • R 2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF 3 , CF 3 , C 1-6 alkyl, C 1-6 haloalkyl, C 2-6 alkenyl, C 2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R 2a ; and
  • R 4 is a C 1-3 alkyl, substituted with 0-5 R 4a , wherein R 4a is selected from D, F and Cl;
  • each of R 6 , R 7 , R 9 and R 10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD 3 , CH 2 CF 3 , CF 3 , OR, NRR’, C 1 -C 3 alkyl and C 3 -C 5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R 2a ; and
  • each of R and R’ is independently H or a C 1 -C 6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO 2 ,
  • a mammal including a human, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent.
  • the pharmaceutical composition is suitable for oral administration.
  • the pharmaceutical composition is suitable for topical administration.
  • the pharmaceutical composition is suitable for GI-restricted administration.
  • the pharmaceutical composition is useful to treat or reduce one or more of inflammatory diseases, immune-mediated diseases and cancers, or a related disease or disorder.
  • the disease or disorder is an inflammatory disease.
  • the disease or disorder is an immune-mediated disease.
  • the disease or disorder is cancer.
  • the disease or disorder is selected from: inflammatory bowel disease, psoriasis, vitiligo, atopic dermatitis, systemic lupus erythematosus, asthma, diabetic nephropathy, chronic myelogenous leukemia (CML) , essential thrombocythemia (ET) , polycythemia vera (PV) , myelofibrosis (MF) , breast cancer and ovarian cancer.
  • CML chronic myelogenous leukemia
  • ET essential thrombocythemia
  • PV polycythemia vera
  • MF myelofibrosis
  • the invention generally relates to a unit dosage form comprising a pharmaceutical composition disclosed herein.
  • the unit dosage form is a tablet.
  • the unit dosage form is a capsule.
  • the unit dosage form is a topical formulation.
  • the invention generally relates to a method for treating, reducing or preventing a disease or disorder, comprising administering to a subject in need thereof a therapeutically effective amount of a compound according to any one of claims 1-61, wherein the disease or disorder is selected from inflammatory diseases, immune-mediated diseases, cancer, or a related disease or disorder thereof, in a mammal, including a human.
  • the invention generally relates to a method for treating, reducing or preventing a disease or disorder, comprising administering to a subject in need thereof a therapeutically effective amount of a compound having the structural formula of (I) :
  • Y 1 is CH, CF or N
  • Y 2 is CH or N
  • Y 3 is NR, O, CH 2 , CF 2 or O-NH;
  • R 1 is a H, F, C 1 -C 3 alkyl and CD 3 , provided that R 1 is not F when Y 3 is N, O or O-NH;
  • R 2’ wherein R 2’ is a C 1 -C 6 alkyl, C 3 -C 6 cycloalkyl, C 5- C 7 spirocycloalkyl, or C 3 -C 6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R 2a , wherein R 2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
  • X 6 is CR 6 or N
  • X 7 is CR 7 or N
  • X 8 is C or N
  • X 9 is CR 9 , O, S, N or NR 9 ;
  • X 10 is CR 9 , O, S, N or NR 10 ;
  • Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group
  • R 2b is a C 1-6 alkyl or C 3-6 cycloalkyl, C 5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R 2c ;
  • R 2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF 3 , CF 3 , C 1-6 alkyl, C 1-6 haloalkyl, C 2-6 alkenyl, C 2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R 2a ; and
  • R 4 is a C 1-3 alkyl, substituted with 0-5 R 4a , wherein R 4a is selected from D, F and Cl;
  • each of R 6 , R 7 , R 9 and R 10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD 3 , CH 2 CF 3 , CF 3 , OR, NRR’, C 1 -C 3 alkyl and C 3 -C 5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R 2a ; and
  • each of R and R’ is independently H or a C 1 -C 6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO 2 ,
  • disease or disorder is selected from inflammatory diseases, immune-mediated diseases, cancer, or a related disease or disorder thereof, in a mammal, including a human.
  • the disease or disorder is an inflammatory disease.
  • the disease or disorder is an immune-mediated disease.
  • the disease or disorder is cancer.
  • the disease or disorder is selected from: inflammatory bowel disease, psoriasis, vitiligo, atopic dermatitis, systemic lupus erythematosus, asthma, diabetic nephropathy, chronic myelogenous leukemia (CML) , essential thrombocythemia (ET) , polycythemia vera (PV) , myelofibrosis (MF) , breast cancer and ovarian cancer.
  • CML chronic myelogenous leukemia
  • ET essential thrombocythemia
  • PV polycythemia vera
  • MF myelofibrosis
  • administration is via oral administration.
  • administration is via topical administration.
  • administration is via GI-restricted administration.
  • the invention generally relates to use of a compound disclosed herein, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent, in preparation of a medicament for treating a disease or disorder.
  • the disease or disorder is one or more of inflammatory diseases, immune-mediated diseases and cancer.
  • the disease or disorder is an inflammatory disease.
  • the disease or disorder is an immune-mediated disease.
  • the disease or disorder is cancer.
  • the medicament is for oral administration.
  • the medicament is for topical administration.
  • the medicament is for GI restriction administration.
  • isotope derivative compounds having one or more hydrogen atoms (e.g., 1, 2, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, etc. ) replaced with deuterium atoms are contemplated in the presented invention.
  • inflammatory disease refers to a disease or condition characterized by aberrant inflammation, e.g. an increased level of inflammation compared to a control such as a healthy person not suffering from a disease.
  • inflammatory diseases include autoimmune diseases, traumatic brain injury, arthritis, rheumatoid arthritis, psoriatic arthritis, juvenile idiopathic arthritis, multiple sclerosis, systemic lupus erythematosus (SLE) , myasthenia gravis, juvenile onset diabetes, diabetes mellitus type 1, Guillain-Barre syndrome, Hashimoto's encephalitis, Hashimoto's thyroiditis, ankylosing spondylitis, psoriasis, Sjogren's syndrome, vasculitis, glomerulonephritis, auto-immune thyroiditis, Behcet's disease, Crohn's disease, ulcerative colitis, bullous pemphigoid
  • inflammatory-related diseases, disorders and conditions which may, for example, be caused by inflammatory cytokines, include, arthritis, kidney failure, lupus, asthma, psoriasis, colitis, pancreatitis, allergies, fibrosis, surgical complications (e.g., where inflammatory cytokines prevent healing) , anemia, and fibromyalgia.
  • diseases and disorders which may be associated with chronic inflammation include Alzheimer's disease, congestive heart failure, stroke, aortic valve stenosis, arteriosclerosis, osteoporosis, Parkinson's disease, infections, inflammatory bowel disease (IBD) , allergic contact dermatitis and other eczemas, systemic sclerosis, transplantation and multiple sclerosis.
  • IBD inflammatory bowel disease
  • autoimmune disease refers to a disease or condition in which a subject's immune system has an aberrant immune response against a substance that does not normally elicit an immune response in a healthy subject.
  • autoimmune diseases that may be treated with a compound, pharmaceutical composition, or method described herein include acne vulgaris, acute disseminated encephalomyelitis, acute necrotizing hemorrhagic leukoencephalitis, Addison's disease, agammaglobulinemia, Aicardi-Goutines syndrome (AGS) , alopecia areata, alopecia totalis, amyloidosis, ankylosing spondylitis, anti-GBM/anti-TBM nephritis, antiphospholipid syndrome, autoimmune angioedema, autoimmune aplastic anemia, autoimmune dysautonomia, autoimmune hepatitis, autoimmune hyperlipidemia, autoimmune immunodeficiency, autoimmune inner ear disease, autoimmune myocarditis, autoimmune o
  • Immune-mediated disease refers to chronic inflammatory diseases perpetuated by antibodies and cellular immunity.
  • Immune-mediated diseases include, for example, but not limited to, asthma, allergies, arthritis (e.g., rheumatoid arthritis, psoriatic arthritis, and ankylosing spondylitis) , juvenile arthritis, inflammatory bowel diseases (e.g., ulcerative colitis and Crohn's disease) , endocrinopathies (e.g., type 1 diabetes and Graves’ disease) , neurodegenerative diseases (e.g., multiple sclerosis (MS) ) , autistic spectrum disorder, depression, Alzheimer's disease, Guillain-Barre syndrome, obsessive-compulsive disorder, optic neuritis, retinal degeneration, dry eye syndrome DES, Sjogren's syndrome, amyotrophic lateral sclerosis (ALS) , Parkinson's disease, Huntington's Disease, Guillain-Barre syndrome, myasthenia gravis, and
  • Hashimoto's thyroiditis pernicious anemia, Cushing's disease, Addison's disease, chronic active hepatitis, polycystic ovary syndrome (PCOS) , celiac disease, pemphigus, transplant rejection (allograft transplant rejection) , graft-versus-host disease (GVDH) .
  • cancer refers to all types of cancer, neoplasm or malignant tumors found in mammals, e.g., humans, including hematological cancers leukemia, and lymphomas, T-ALL, large B-cell lymphoma , solid cancers such as carcinomas and sarcomas.
  • Exemplary cancers include blood cancer, brain cancer, glioma, glioblastoma, neuroblastoma, prostate cancer, colorectal cancer, pancreatic cancer, cervical cancer, gastric cancer, ovarian cancer, lung cancer, and cancer of the head.
  • Exemplary cancers include cancer of the thyroid, endocrine system, brain, breast, cervix, colon, head &neck, liver, kidney, lung, non-small cell lung, melanoma, mesothelioma, ovary, sarcoma, stomach, uterus, medulloblastoma, colorectal cancer, pancreatic cancer.
  • Additional examples include penile, skin –non-melanoma, anal, hepatobiliary, esophagogastric, uterine sarcoma, gastrointestinal stromal tumor, salivary gland, peripheral nervous system, soft tissue sarcoma, bone, renal, myeloproliferative neoplasms, thyroid carcinoma, cholangiocarcinoma, pancreatic adenocarcinoma, skin cutaneous melanoma, colon adenocarcinoma, rectum adenocarcinoma, stomach adenocarcinoma, esophageal carcinoma, head and neck squamous cell carcinoma, breast invasive carcinoma, lung adenocarcinoma, lung squamous cell carcinoma, Hodgkin's Disease, Non-Hodgkin's Lymphoma, multiple myeloma, neuroblastoma, glioma, glioblastoma multiforme, ovarian cancer, r
  • the disease or disorder is selected from: inflammatory bowel disease, psoriasis, vitiligo, atopic dermatitis, systemic lupus erythematosus, asthma, diabetic nephropathy, chronic myelogenous leukemia (CML) , essential thrombocythemia (ET) , polycythemia vera (PV) , myelofibrosis (MF) , breast cancer and ovarian cancer.
  • CML chronic myelogenous leukemia
  • ET essential thrombocythemia
  • PV polycythemia vera
  • MF myelofibrosis
  • Isotopically-labeled compounds are also within the scope of the present disclosure.
  • an "isotopically-labeled compound” refers to a presently disclosed compound including pharmaceutical salts and prodrugs thereof, each as described herein, in which one or more atoms are replaced by an atom having an atomic mass or mass number different from the atomic mass or mass number usually found in nature.
  • isotopes that can be incorporated into compounds presently disclosed include isotopes of hydrogen, carbon, nitrogen, oxygen, phosphorous, fluorine and chlorine, such as 2 H, 3 H, 13 C, 14 C, 15 N, 18 O, 17 O, 31 P, 32 P, 35 S, 18 F, and 36 Cl, respectively.
  • the compounds may be useful in drug and/or substrate tissue distribution assays.
  • Tritiated ( 3 H) and carbon-14 ( 14 C) labeled compounds are particularly preferred for their ease of preparation and detectability.
  • substitution with heavier isotopes such as deuterium ( 2 H) can afford certain therapeutic advantages resulting from greater metabolic stability, for example increased in vivo half-life or reduced dosage requirements and, hence, may be preferred in some circumstances.
  • Isotopically labeled compounds presently disclosed, including pharmaceutical salts, esters, and prodrugs thereof, can be prepared by any means known in the art.
  • Stereoisomers e.g., cis and trans isomers
  • optical isomers of a presently disclosed compound e.g., R and S enantiomers
  • racemic, diastereomeric and other mixtures of such isomers are within the scope of the present disclosure.
  • Compounds of the present invention are, subsequent to their preparation, preferably isolated and purified to obtain a composition containing an amount by weight equal to or greater than 95% ( “substantially pure” ) , which is then used or formulated as described herein. In certain embodiments, the compounds of the present invention are more than 99%pure. Solvates and polymorphs of the compounds of the invention are also contemplated herein. Solvates of the compounds of the present invention include, for example, hydrates.
  • Any appropriate route of administration can be employed, for example, parenteral, intravenous, subcutaneous, intramuscular, intraventricular, intracorporeal, intraperitoneal, rectal, or oral administration. Most suitable means of administration for a particular patient will depend on the nature and severity of the disease or condition being treated or the nature of the therapy being used and on the nature of the active compound.
  • Solid dosage forms for oral administration include capsules, tablets, pills, powders, and granules.
  • the compounds described herein or derivatives thereof are admixed with at least one inert customary excipient (or carrier) such as sodium citrate or dicalcium phosphate or
  • fillers or extenders as for example, starches, lactose, sucrose, glucose, mannitol, and silicic acid
  • binders as for example, carboxymethylcellulose, alignates, gelatin, polyvinylpyrrolidone, sucrose, and acacia
  • humectants as for example, glycerol
  • disintegrating agents as for example, agar-agar, calcium carbonate, potato or tapioca starch, alginic acid, certain complex silicates, and sodium carbonate
  • solution retarders as for example, paraffin
  • absorption accelerators as for example, quaternary
  • the dosage forms may also comprise buffering agents.
  • Solid compositions of a similar type may also be employed as fillers in soft and hard-filled gelatin capsules using such excipients as lactose or milk sugar as well as high molecular weight polyethyleneglycols, and the like.
  • Solid dosage forms such as tablets, dragees, capsules, pills, and granules can be prepared with coatings and shells, such as enteric coatings and others known in the art.
  • Liquid dosage forms for oral administration include pharmaceutically acceptable emulsions, solutions, suspensions, syrups, and elixirs.
  • the liquid dosage forms may contain inert diluents commonly used in the art, such as water or other solvents, solubilizing agents, and emulsifiers, such as for example, ethyl alcohol, isopropyl alcohol, ethyl carbonate, ethyl acetate, benzyl alcohol, benzyl benzoate, propyleneglycol, 1, 3-butyleneglycol, dimethylformamide, oils, in particular, cottonseed oil, groundnut oil, corn germ oil, olive oil, castor oil, sesame oil, glycerol, tetrahydrofurfuryl alcohol, polyethyleneglycols, and fatty acid esters of sorbitan, or mixtures of these substances, and the like.
  • the composition can also include additional agents, such as
  • Method A NH 4 HCO 3 : Column: Gilson2-Xbridge C18 19*150 mm, 5 ⁇ m; mobile phase: CH 3 CN in water (0.1%NH 4 HCO 3 ) from 20%to 60%, Flow rate: 15 mL/min.
  • Method B TFA: Column: Waters-Xbridge C18 10*190 mm, 5 ⁇ m; mobile phase: CH 3 CN in water (0.1%TFA) from 15%to 40%, Flow rate: 15 mL/min.
  • Method C HCOOH: Column: Waters-Xbridge C18 10*190 mm, 5 ⁇ m; mobile phase: CH 3 CN in water (0.1%formic acid) from 15%to 40%, Flow rate: 15 mL/min.
  • Method D HCOOH: Column: Waters Prep C18 OBDTM (5 micron, 19*150 mm) ; mobile phase: CH 3 CN in water (0.1%formic acid) from 18%to 38%, Flow rate: 20 mL/min.
  • Method E NH 4 HCO 3 : Column: Waters Prep C18 OBD TM (5 micron, 19*150 mm) ; mobile phase: CH 3 CN in water (10 mM NH 4 HCO 3 ) from 20%to 60%, Flow rate: 20 mL/min.
  • Method 1 Analysis was performed on an Agilent 1200_series HPLC-6120MS. UHPLC Long Gradient Equivalent 5%to 95%acetonitrile in water (containing 0.02%NH 4 OAc) run time of 6.5 minutes with a flow rate of 1.5 mL/min. A Waters Xbridge C18 column (18.5 micron, 4.6*50 mm) was used at a temperature of 40 °C.
  • Method 2 Analysis was performed on an Agilent 1200_series HPLC-6120MS. UHPLC Long Gradient Equivalent 5%to 95%acetonitrile in water (containing 0.1%trifluoroacetic acid) run time of 6.5 minutes with a flow rate of 1.5 mL/min. A Waters Xbridge C18 column (18.5 micron, 4.6*50 mm) was used at a temperature of 40 °C.
  • Method 3 Analysis was performed on an Agilent 1260_series HPLC-6120MS. UHPLC Long Gradient Equivalent 5%to 95%acetonitrile in water (containing 0.02%NH 4 OAc) run time of 2.5 minutes with a flow rate of 0.5 mL/min. A Diamonsil Plus C18 column (18.5 micron, 4.6*30 mm) was used at a temperature of 40 °C.
  • Method 4 Analysis was performed on an Agilent 1260_series HPLC-6125C MS. HPLC Long Gradient Equivalent 20%to 100%acetonitrile in water (containing 0.1%FA) run time of 6 minutes with a flow rate of 0.8 mL/min. Agilent ZORBAX SB-C18 column (1.8 micron, 2.1*50 mm) was used at a temperature of 30 °C.
  • Method 5 Analysis was performed on a SHIMADZU 20A HPLC. HPLC Long Gradient Equivalent Hexane/EtOH/DEA (70/30/0.2) run time of 20 minutes with a flow rate of 1 mL/min. CHIRALPAK IE (5 ⁇ m, 4.6*250 mm) was used at a temperature of 30 °C.
  • Method 7 Analysis was performed on a SHIMADZU 20A HPLC. HPLC Long Gradient Equivalent Hexane/IPA/DEA (80/20/0.2) run time of 30 minutes with a flow rate of 1 mL/min. CHIRALPAK IB N-5 (5 ⁇ m, 4.6*250 mm) was used at a temperature of 30 °C.
  • Method 8 Analysis was performed on a SHIMADZU 20A HPLC. HPLC Long Gradient Equivalent Hexane/EtOH (70/30) run time of 30 minutes with a flow rate of 1 mL/min. CHIRALPAK IG (5 ⁇ m, 4.6*250 mm) was used at a temperature of 30 °C.
  • Step 3 4-Chloro-6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (Int. B)
  • Step 4 4- ( (5-Bromo-4-methoxy-1-methyl-1H-indol-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide hydrochloride (2e)
  • Step 8 4- ( (5-Chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) nicotinic acid (3i)
  • Step 9 4- ( (5-Chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (3)
  • Step 8 4- (N- (5-chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) cyclopropane carboxamido) -2- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d 3 ) pyrimidine-5-carboxamide (4h)
  • Step 9 4- ( (5-Chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -2- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d 3 ) pyrimidine-5-carboxamide (4)
  • Step 7 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5-methylpyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) nicotinic acid (5h)
  • Step 8 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5-methylpyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (5)
  • Step 7 (S) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (7A) and (R) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (7B)
  • Step 1 1- (3- ( (2- (Cyclopropanecarboxamido) -5- ( (methyl-d 3 ) carbamoyl) pyridin-4-yl) amino) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) -2, 2, 2-trifluoroethyl methanesulfonate (8a)
  • Step 7 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (9)
  • Step 8 (R*) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (9A) and (S*) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (9B)
  • Step 1 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (trifluoromethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (11)
  • Step 6 4- ( (5-Cyano-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (12)
  • Step 1 4- ( (5-Cyano-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (13)
  • Step 1 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-3- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) amino) -N-methylnicotinamide (14)
  • Step 2 (S) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-3- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) amino) -N-methylnicotinamide (14A) and (R) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-3- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) amino) -N-methylnicotinamide (14B)
  • Step 1 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (15)
  • Step 2 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- ( (S) -2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (15A) and 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- ( (R) -2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (15B)
  • Step 1 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (methoxymethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (17)
  • Step 4 4- ( (5- (Cyanomethyl) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (18)
  • Step 1 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (5- (hydroxymethyl) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (22)
  • Step 5 4- ( (5- (1- ( (Tert-butyldiphenylsilyl) oxy) ethyl) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (23e)
  • Step 4 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- ( (methoxy-d 3 ) methyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (29)
  • Step 1.4- (4-Methoxy-5- ( (S) -2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) -6- (spiro [2.2] pentane-1-carboxamido) nicotinamide (32)
  • Step 7 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4, 5-dimethoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (35)
  • Step 1 4- ( (4, 5-Dimethoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) amino) -6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (36)
  • Step 8 Methyl 4-methoxy-5- (3, 3, 3-trifluoroprop-1-en-2-yl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylate (37h)
  • Step 13 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (37)
  • Step 1 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (38)
  • Step 7 2, 2-Trifluoro-1- (3-iodo-4-methoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-5-yl) ethan-1-ol (39g)
  • Step 8 1- (3- ( (Diphenylmethylene) amino) -4-methoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-5-yl) -2, 2, 2-trifluoroethan-1-ol (39h)
  • Step 9 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) amino) -N- (methyl-d 3 ) nicotinamide (39)
  • Step 4 2, 2-Trifluoro-1- (pyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) ethan-1-ol (41e)
  • Step 7 6- (Cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d 3 ) -4- ( (5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) nicotinamide (41)
  • the compounds are prepared in DMSO for 200x top dose, then serial dilute it with 27-fold for 3 more points. Add 8 ⁇ L/well in echo source plate, echo will add 75nL/well with 3-fold serial dilution for 11 points in assay plate. 75nL DMSO for high control and low control.
  • RLU_compound the relative light unit of cells treated with test compounds
  • RLU_low control the relative light unit of medium with DMSO only
  • RLU_high control the relative light unit of cells treated with DMSO only
  • the dose-response (percent inhibition) curve was plotted and IC50 values (the concentration that causes 50%growth inhibition) were determined by GraphPad software.
  • IC50 values the concentration that causes 50%growth inhibition
  • Exemplary compounds of the invention showed good selectivity over JAK1. These compounds can be used to reduce or eliminate the side effects caused by JAK1 inhibition in autoimmune disease.
  • JAK activity was determined in the reaction buffer 50 mM HEPES, 0.01%Brij35, 10 mM MgCl 2 , 2 mM DTT by a microfluidic assay.
  • the phosphorylation of a FAM labeled peptide substrate was monitored in the Caliper EZ Reader II (Perkin Elmer) .
  • the assay condition for each batch of enzyme was optimized to obtain 10%conversion rate of peptide substrate.
  • test compounds were dissolved in DMSO to a stock concentration of 10 mM. Three-fold serially diluted compounds with top concentration of 5 ⁇ M were pre-incubated with JAK1, JAK2 or TYK2 for 10 min at ambient temperature. The final DMSO concentration of assay mixture was 1%. FAM labeled peptide substrate (final concentration 3 ⁇ M) and ATP (Km concentration or 1mM) were sequentially added to initiate the kinase reaction at 28°C for 90 min (JAK) , 15 min (JAK2) and 30 min (TYK2) , respectively. The reaction was stopped by adding 50 mM EDTA.
  • the dose-response (percent inhibition) curve was plotted and IC50 values were determined by GraphPad software.
  • the IC50 values of tested compounds were list in Table 3.
  • Exemplary compounds of the invention showed excellent selectivity over JAK1,
  • JAK2 and TYK2 kinase domain inhibition JAK2 and TYK2 kinase domain inhibition.
  • Ba/F3 cells Dimerization domain of Tel protein fused with JAK kinase domain was permanently transduced into Ba/F3 cells, whose proliferation is dependent on JAK activity in the absence of IL-3 induction.
  • These engineered Ba/F3-FL-TYK2-P760L cells were used to monitor JAK inhibitory activities of the compounds in the cellular.
  • Ba/F3 cells were cultured in RPMI-1640 (Corning) containing 10%fetal bovine serum. Cells were seeded at 2000/well of white flat bottom 96-well plates. The well containing medium only was used as background control. After 24h growth, cells were treated with compounds. The test compounds were dissolved in DMSO to a stock concentration of 20 mM.
  • RLU_compound the relative light unit of cells treated with test compounds
  • RLU_blank the relative light unit of medium with DMSO only
  • RLU_control the relative light unit of cells treated with DMSO only
  • the dose-response (percent inhibition) curve was plotted and IC50 values (the concentration that causes 50%growth inhibition) were determined by GraphPad software.
  • IC50 values the concentration that causes 50%growth inhibition
  • Exemplary compounds of the invention showed good TYK2 pathway inhibition activity in cells.
  • test articles in human whole blood assay was evaluated by the method of flow cytometry.
  • IFN-alpha will activate JAK1 and TYK2 kinase in T cells by binding to IFN receptors, and then lead to phosphorylation of STAT1 and STAT2.
  • the phosphorylated STAT1 enter nuclear and promote transcription and expression of IFN-gamma.
  • To evaluate the efficacy of TYK2i in T cells freshly collected human whole blood will be stimulated with certain unit of human IFN-alpha (Universal Type I IFN (1MU) , R&D, 11200-2) for 20 mins in incubator. After stimulation, fix cells with PhosflowTM Fix Buffer I (BD, 557870) , and then collect fixed cells by centrifugation (500 g, 8min) .
  • Microsomes were pre-incubated with test compound or control compounds for 5 min at 37°C in 100 mM potassium phosphate buffer, pH 7.4, 1.0 mM EDTA.
  • the reaction was initiated by addition of 15 ⁇ L of the NADPH regenerating system to 30 ⁇ L of each incubation mixture per time point.
  • the final incubation condition was composed of 0.5 mg/mL microsomal protein, 1 ⁇ M test article/positive control, 2 mM NADPH.
  • the 0-minute samples were prepared by addition of a 30 ⁇ L aliquot of each incubation mixture to 135 ⁇ L quench reagent to precipitate proteins. And then a 15 ⁇ L aliquot of the NADPH regenerating system was added.
  • the reaction will be stopped by the addition of cold acetonitrile solution containing internal standard.
  • the samples taken at all time points were centrifuged at 5000 ⁇ g for 15 minutes. 50 ⁇ L of supernatant are taken into 96-well assay plates pre-added with 50 ⁇ L ultrapure water, and then analyzed by LC/MS/MS.
  • CL int (mic) 0.693/T 1/2 /mg microsome protein per mL.
  • the slope was measured by the natural logarithm of the percentage of the residual compound and time, T1/2 was calculated according to the following formula.
  • Exemplary compounds of the invention showed ideal solubility for further development.
  • PK parameter values including, but not necessarily limited to, the maximum plasma concentrations (Cmax) , and the area under the plasma concentration vs. time curve (AUC) from time zero to 24-hour (AUC0-24h) were determined using WinNonlin program.
  • Example 42 showed good brain exposure in Rats.

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Abstract

The invention provides a novel class of therapeutic agents that are safe and effective TYK2 inhibitors and pharmaceutical compositions of these compounds and methods of preparation and use thereof against various TYK2-mediated diseases and disorders.

Description

TYK2 INHIBITORS AND COMPOSITIONS AND METHODS THEREOF
Technical Fields of the Invention
The invention generally relates to novel compounds and methods for their therapeutic use. More particularly, the invention provides a novel class of tyrosine kinase 2 inhibitors as well as pharmaceutical compositions of these compounds and methods of preparation and use thereof against various diseases and conditions.
Background of the Invention
Janus kinase (JAK) is a family of intracellular, nonreceptor tyrosine kinases that transduce cytokine-mediated signals via the Janus kinase -Signal Transduction Activators of Transcription (JAK-STAT) pathway. There are four members in the JAK family of enzymes in humans, i.e., JAK1, JAK2, JAK3 and tyrosine kinase 2 (TYK2) . The family is defined by the presence of two adjacent kinase domains, JH1 and JH2, of which JH1 performs the phosphorylation involved in pathway activation whereas JH2 regulates JH1 function. (Thomas, et al., 2015 British Journal of Cancer 113, 365–371. )
These cytoplasmic tyrosine kinases are associated with membrane cytokine receptors such as common gamma-chain receptors and the glycoprotein 130 (gp130) transmembrane proteins. (Murray, et al. 2007 Immunol. 178 (5) : 2623-2629. ) About 40 cytokine receptors signal through combinations of these four JAKs and their 7 downstream substrates: the STAT family members. (Ghoreschi et al. 2009 Immunol Rev. 228 (l) : 273-287. )
TYK2 is a key component of the JAK-STAT signaling pathway. TYK2 regulates INFα, IL12 and IL23. (Ihle, et al. 1995 Annu Rev Immunol. 13: 369–398; Leonard, et al. 1998 Annu Rev Immunol. 16: 293–322; Liu, et al. 1998 Curr Opin Immunol. 10: 271–278. ) Cytokines implicated in TYK2 activation include interferons (e.g., IFN-a, IFN-b, IFN-k, IFN-d, IFN-e, IFN-t, IFN-w, and IFN-z, and interleukins (e.g., IL-4, IL-6, IL-10, IL-11, IL-12, IL-13, L-22, IL-23, IL-27, IL-31, oncostatin M, ciliary neurotrophic factor, cardiotrophin 1, cardiotrophin-like cytokine, and LIF) . The activated TYK2 goes on to phosphorylate further signaling proteins such as members  of the STAT family, including STAT1, STAT2, STAT4, and STAT6. Selective inhibition of TYK2 can be utilized to treat a variety of autoimmune inflammatory diseases, such as psoriasis, systemic lupus erythematosus (SLE) , inflammatory bowel disease (IBD) , rheumatoid arthritis (RA) , as well as cancer and diabetes.
The selectivity against other JAK family subtypes is regarded as crucial in order to increase the intended pharmacological effects and to reduce side effects. Identifying kinase inhibitors with a high degree of TYK2 selectivity has posed a significant challenge partly due to the high sequence homology of the active site among the JAK family kinases. TYK2 specificity is critical for clinical application of TYK2 kinase inhibitors, because Tyk2 knockout mice are viable with normal blood cell counts, whereas deficiency of JAK3 results in severe combined immunodeficiency in mice, and JAK1 or JAK2 knockout mice show perinatal lethality. (Ghoreschi, et al. 2009 Immunol Rev. 228: 273–287; Karaghiosoff, et al. 2000 Immunity. 13: 549–560; Shimoda, et al. 2000 Immunity. 13: 561–571. ) Genetic evidence suggests that pharmacological inhibition of TYK2 should not result in acute toxicity in human patients, but careful monitoring for viral or mycobacterial infections would be warranted in patients treated for prolonged periods. (Akahane, et al. 2017 Br J Haematol. 177 (2) : 271–282. ) 
An urgent need exists and challenges remain across broad therapeutic areas for selective TYK2 inhibitors with improved potency and minimal side effects.
Summary of the Invention
The invention provides novel, selective and potent compounds that are orally available. These therapeutic agents are safe and effective TYK2 inhibitors and exhibit fewer and/or lesser side effects than currently available drugs. The invention also provides pharmaceutical compositions of these compounds and methods of their preparation and use.
In one aspect, the invention generally relates to a compound having the structural formula (I) :

or a pharmaceutically acceptable form or an isotope derivative thereof,
wherein
Y1 is CH, CF or N;
Y2 is CH or N;
Y3 is NR, O, CH2, CF2 or O-NH;
R1 is a H, F, C1-C3 alkyl and CD3, provided that R1 is not F when Y3 is N, O or O-NH;
R2 is
R2’, wherein R2’ is a C1-C6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl, C5-C7 spirocycloalkyl, or C3-C6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R2a, wherein R2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
an aryl or heteroaryl group, each substituted with 0-2 R2a;
(C=O) R2b; or
(C=O) NHR2b;
R3 is
wherein
X6 is CR6 or N;
X7 is CR7 or N;
X8 is C or N;
X9 is CR9, O, S, N or NR9;
X10 is CR9, O, S, N or NR10; and
wherein each of Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group;
R2b is a C1-6 alkyl or C3-6 cycloalkyl, C5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R2c;
R2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF3, CF3, C1-6 alkyl, C1-6 haloalkyl, C2-6 alkenyl, C2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R2a; and
R4 is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 R4a, wherein R4a is selected from D, F and Cl;
R5 is H, CN, halo, OCH3, C (=O) OCH3, C1-6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl or heterocyclic, wherein said alkyl, cycloalkyl or heterocyclic is substituted with 0-3 R5a, wherein each R5a is independently selected from OH, D, F, Cl, CN, OCH3, OCD3, OCF3 and OC (=O) CH3;
each of R6, R7, R9 and R10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD3, CH2CF3, CF3, OR, NRR’, C1-C3 alkyl and C3-C5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R2a; and
each of R and R’ is independently H or a C1-C6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO2.
In another aspect, the invention generally relates to a method for preparing a compound disclosed herein, as exemplified by the synthetic schemes and experimental procedure disclosed herein.
In yet another aspect, the invention generally relates to a pharmaceutical composition comprising a compound disclosed herein, effective to treat or reduce one or more diseases or disorders, in a mammal, including a human, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent.
In yet another aspect, the invention generally relates to a pharmaceutical composition comprising an amount of a compound having the structural formula of (I) :
or a pharmaceutically acceptable form or an isotope derivative thereof,
wherein
Y1 is CH, CF or N;
Y2 is CH or N;
Y3 is NR, O, CH2, CF2 or O-NH;
R1 is a H, F, C1-C3 alkyl and CD3, provided that R1 is not F when Y3 is N, O or O-NH;
R2 is
R2’, wherein R2’ is a C1-C6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl, C5-C7 spirocycloalkyl, or C3-C6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R2a, wherein R2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
an aryl or heteroaryl group, each substituted with 0-2 R2a;
(C=O) R2b; or
(C=O) NHR2b;
R3 is 
wherein
X6 is CR6 or N;
X7 is CR7 or N;
X8 is C or N;
X9 is CR9, O, S, N or NR9;
X10 is CR9, O, S, N or NR10; and
wherein each of Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group;
R2b is a C1-6 alkyl or C3-6 cycloalkyl, C5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R2c;
R2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF3, CF3, C1-6 alkyl, C1-6 haloalkyl, C2-6 alkenyl, C2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R2a; and
R4 is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 R4a, wherein R4a is selected from D, F and Cl;
R5 is H, CN, halo, OCH3, C (=O) OCH3, C1-6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl or heterocyclic, wherein said alkyl, cycloalkyl or heterocyclic is substituted with 0-3 R5a, wherein each R5a is independently selected from OH, D, F, Cl, CN, OCH3, OCD3, OCF3 and OC (=O) CH3;
each of R6, R7, R9 and R10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD3, CH2CF3, CF3, OR, NRR’, C1-C3 alkyl and C3-C5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R2a; and
each of R and R’ is independently H or a C1-C6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO2,
effective to treat, or reduce one or more diseases or disorders, in a mammal, including a human, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent.
In yet another aspect, the invention generally relates to a unit dosage form comprising a pharmaceutical composition disclosed herein.
In yet another aspect, the invention generally relates to a method for treating, reducing or preventing a disease or disorder, comprising administering to a subject in need thereof a therapeutically effective amount of a compound according to any one of claims 1-61, wherein the disease or disorder is selected from inflammatory diseases, immune-mediated diseases, cancer, or a related disease or disorder thereof, in a mammal, including a human.
In yet another aspect, the invention generally relates to a method for treating, reducing or preventing a disease or disorder, comprising administering to a subject in need thereof a therapeutically effective amount of a compound having the structural formula of (I) :
or a pharmaceutically acceptable form or an isotope derivative thereof,
wherein
Y1 is CH, CF or N;
Y2 is CH or N;
Y3 is NR, O, CH2, CF2 or O-NH;
R1 is a H, F, C1-C3 alkyl and CD3, provided that R1 is not F when Y3 is N, O or O-NH;
R2 is
R2’, wherein R2’ is a C1-C6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl, C5-C7 spirocycloalkyl, or C3-C6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R2a, wherein R2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
an aryl or heteroaryl group, each substituted with 0-2 R2a;
(C=O) R2b; or
(C=O) NHR2b;
R3 is 
wherein
X6 is CR6 or N;
X7 is CR7 or N;
X8 is C or N;
X9 is CR9, O, S, N or NR9;
X10 is CR9, O, S, N or NR10; and
wherein each of Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group;
R2b is a C1-6 alkyl or C3-6 cycloalkyl, C5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R2c;
R2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF3, CF3, C1-6 alkyl, C1-6 haloalkyl, C2-6 alkenyl, C2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R2a; and
R4 is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 R4a, wherein R4a is selected from D, F and Cl;
R5 is H, CN, halo, OCH3, C (=O) OCH3, C1-6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl or heterocyclic, wherein said alkyl, cycloalkyl or heterocyclic is substituted with 0-3 R5a, wherein each R5a is independently selected from OH, D, F, Cl, CN, OCH3, OCD3, OCF3 and OC (=O) CH3;
each of R6, R7, R9 and R10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD3, CH2CF3, CF3, OR, NRR’, C1-C3 alkyl and C3-C5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R2a; and
each of R and R’ is independently H or a C1-C6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO2,
wherein the disease or disorder is selected from inflammatory diseases, immune-mediated diseases, cancer, or a related disease or disorder thereof, in a mammal, including a human.
In yet another aspect, the invention generally relates to use of a compound disclosed herein, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent, in preparation of a medicament for treating a disease or disorder.
Definitions
Unless defined otherwise, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which this invention belongs. General principles of organic chemistry, as well as specific functional moieties and reactivity, are described in “Organic Chemistry” , Thomas Sorrell, University Science Books, Sausalito: 2006.
The following terms, unless indicated otherwise according to the context wherein the terms are found, are intended to have the following meanings.
Ranges provided herein are understood to be shorthand for all of the values within the range. For example, a range of 1 to 16 is understood to include any number, combination of numbers, or sub-range from the group consisting 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 or 16.
As used herein, “at least” a specific value is understood to be that value and all values greater than that value.
As used herein, “more than one” is understood as 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 40, 50, 100, etc., or any value therebetween.
In this specification and the appended claims, the singular forms "a, " "an, " and "the" include plural reference, unless the context clearly dictates otherwise.
Unless specifically stated or obvious from context, as used herein, the term “about” is understood as within a range of normal tolerance in the art, for example within 2 standard deviations of the mean. About can be understood as within 10%, 9%, 8%, 7%, 6%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1%, 0.5%, 0.1%, 0.05%, or 0.01%of the stated value. Unless otherwise clear from context, all numerical values provided herein can be modified by the term about.
Unless specifically stated or obvious from context, as used herein, the term “or” is understood to be inclusive.
Any compositions or methods disclosed herein can be combined with one or more of any of the other compositions and methods provided herein.
The recitation of a listing of chemical groups in any definition of a variable herein includes definitions of that variable as any single group or combination of listed groups. The recitation of an embodiment for a variable or aspect herein includes that embodiment as any single embodiment or in combination with any other embodiments or portions thereof.
The term “comprising” , when used to define compositions and methods, is intended to mean that the compositions and methods include the recited elements, but do not exclude other elements. The term “consisting essentially of” , when used to define compositions and methods, shall mean that the compositions and methods include the recited elements and exclude other elements of any essential significance to the compositions and methods. For example, “consisting essentially of” refers to administration of the pharmacologically active agents expressly recited and excludes pharmacologically active agents not expressly recited. The term consisting essentially of does not exclude pharmacologically inactive or inert agents, e.g., pharmaceutically acceptable excipients, carriers or diluents. The term “consisting of” , when used to define compositions and methods, shall mean excluding trace elements of other ingredients and substantial method steps. Embodiments defined by each of these transition terms are within the scope of this invention.
Certain compounds of the present invention may exist in particular geometric or stereoisomeric forms. The present invention contemplates all such compounds, including cis-and trans-isomers, atropisomers, R-and S-enantiomers, diastereomers, (D) -isomers, (L) -isomers, the racemic mixtures thereof, and other mixtures thereof, as falling within the scope of the invention. Additional asymmetric carbon atoms may be present in a substituent such as an alkyl group. All such isomers, as well as mixtures thereof, are intended to be included in this  invention. In certain embodiments, each asymmetric atom has at least 50 %enantiomeric excess, at least 60 %enantiomeric excess, at least 70 %enantiomeric excess, at least 80 %enantiomeric excess, at least 90 %enantiomeric excess, at least 95 %enantiomeric excess, or at least 99 %enantiomeric excess of either the R-or S-configuration. For optically active compounds, it is often preferred to use one enantiomer to the substantial exclusion of the other enantiomer.
Isomeric mixtures containing any of a variety of isomer ratios may be utilized in accordance with the present invention. For example, where only two isomers are combined, mixtures containing 50: 50, 60: 40, 70: 30, 80: 20, 90: 10, 95: 5, 96: 4, 97: 3, 98: 2, 99: 1, or 100: 0 isomer ratios are contemplated by the present invention. Those of ordinary skill in the art will readily appreciate that analogous ratios are contemplated for more complex isomer mixtures.
If, for instance, a particular enantiomer of a compound of the present invention is desired, it may be prepared by asymmetric synthesis, or by derivation with a chiral auxiliary, where the resulting diastereomeric mixture is separated and the auxiliary group cleaved to provide the pure desired enantiomers. Alternatively, where the molecule contains a basic functional group, such as amino, or an acidic functional group, such as carboxyl, diastereomeric salts are formed with an appropriate optically-active acid or base, followed by resolution of the diastereomers thus formed by fractional crystallization or chromatographic methods well known in the art, and subsequent recovery of the pure enantiomers.
A mixture of isomers can be separated on the basis of the physicochemical differences of the constituents, into the pure or substantially pure geometric or optical isomers, diastereomers, racemates, for example, by chromatography and/or fractional crystallization.
Definitions of specific functional groups and chemical terms are described in more detail below. When a range of values is listed, it is intended to encompass each value and sub-range within the range. For example, “C1-6 alkyl” is intended to encompass, C1, C2, C3, C4, C5, C6, C1-6, C1-5, C1-4, C1-3, C1-2, C2-6, C2-5, C2-4, C2-3, C3-6, C3-5, C3-4, C4-6, C4-5, and C5-6 alkyl.
Where substituent groups are specified by their conventional chemical formulae, written from left to right, they equally encompass the chemically identical substituents that would result from writing the structure from right to left, e.g., -C (=O) -O-is equivalent to -O-C (=O) -.
Structures of compounds of the invention are limited by principles of chemical bonding known to those skilled in the art. Accordingly, where a group may be substituted by one or more  of a number of substituents, such substitutions are selected so as to comply with principles of chemical bonding and to give compounds that are not inherently unstable and/or would be known to one of ordinary skill in the art as likely to be unstable under ambient conditions (e.g., aqueous, neutral, and several known physiological conditions) .
Solvates and polymorphs of the compounds of the invention are also contemplated herein. Solvates of the compounds of the present invention include, for example, hydrates.
As used herein, the term “alkyl” refers to a straight or branched hydrocarbon chain radical consisting solely of carbon and hydrogen atoms, containing no unsaturation, having from one to ten carbon atoms (e.g., C1-10 alkyl) . Whenever it appears herein, a numerical range such as "1 to 10" refers to each integer in the given range; e.g., "1 to 10 carbon atoms" means that the alkyl group can consist of 1 carbon atom, 2 carbon atoms, 3 carbon atoms, etc., up to and including 10 carbon atoms, although the present definition also covers the occurrence of the term "alkyl" where no numerical range is designated. In some embodiments, “alkyl” can be a C1-6 alkyl group. In some embodiments, alkyl groups have 1 to 10, 1 to 8, 1 to 6, or 1 to 3 carbon atoms. Representative saturated straight chain alkyls include, but are not limited to, -methyl, -ethyl, -n-propyl, -n-butyl, -n-pentyl, and -n-hexyl; while saturated branched alkyls include, but are not limited to, -isopropyl, -sec-butyl, -isobutyl, -tert-butyl, -isopentyl, 2-methylbutyl, 3-methylbutyl, 2-methylpentyl, 3-methylpentyl, 4-methylpentyl, 2-methylhexyl, 3-methylhexyl, 4-methylhexyl, 5-methylhexyl, 2, 3-dimethylbutyl, and the like. The alkyl is attached to the parent molecule by a single bond. Unless stated otherwise in the specification, an alkyl group is optionally substituted by one or more of substituents which independently include: acyl, alkyl, alkenyl, alkynyl, alkoxy, alkylaryl, cycloalkyl, aralkyl, aryl, aryloxy, amino, amido, amidino, imino, azide, carbonate, carbamate, carbonyl, heteroalkyl, heteroaryl, heteroarylalkyl, heterocycloalkyl, hydroxy, cyano, halo, haloalkoxy, haloalkyl, ester, ether, mercapto, thio, alkylthio, arylthio, thiocarbonyl, nitro, oxo, phosphate, phosphonate, phosphinate, silyl, sulfinyl, sulfonyl, sulfonamidyl, sulfoxyl, sulfonate, urea, -Si (Ra3 , -ORa, -SRa, -OC (O) -Ra, -N (Ra2, -C (O) Ra, -C (O) ORa, -OC (O) N (Ra2, -C (O) N (Ra2, -N (Ra) C (O) ORa, -N (Ra) C (O) Ra, -N (Ra) C (O) N (Ra2, -N (Ra) C (NRa) N (Ra2, -N (Ra) S (O) tN (Ra2 (where t is 1 or 2) , -P (=O) (Ra) (Ra) , or -O-P (=O) (ORa2 where each Ra is independently hydrogen, alkyl, haloalkyl, carbocyclyl, carbocyclylalkyl, aryl, aralkyl, heterocycloalkyl, heterocycloalkylalkyl, heteroaryl or heteroarylalkyl, and each of these moieties can be optionally substituted as defined herein. In a  non-limiting embodiment, a substituted alkyl can be selected from fluoromethyl, difluoromethyl, trifluoromethyl, 2-fluoroethyl, 3-fluoropropyl, hydroxymethyl, 2-hydroxyethyl, 3-hydroxypropyl, benzyl, and phenethyl.
As used herein, the term “alkoxy” refers to the group -O-alkyl, including from 1 to 10 carbon atoms (C1-10) of a straight, branched, saturated cyclic configuration and combinations thereof, attached to the parent molecular structure through an oxygen. Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted alkoxy groups. Examples include methoxy, ethoxy, propoxy, isopropoxy, butoxy, t-butoxy, pentoxy, cyclopropyloxy, cyclohexyloxy and the like. "Lower alkoxy" refers to alkoxy groups containing one to six carbons. In some embodiments, C1-3 alkoxy is an alkoxy group that encompasses both straight and branched chain alkyls of from 1 to 3 carbon atoms. Unless stated otherwise in the specification, an alkoxy group can be optionally substituted by one or more substituents which independently include: acyl, alkyl, alkenyl, alkynyl, alkoxy, alkylaryl, cycloalkyl, aralkyl, aryl, aryloxy, amino, amido, amidino, imino, azide, carbonate, carbamate, carbonyl, heteroalkyl, heteroaryl, heteroarylalkyl, heterocycloalkyl, hydroxy, cyano, halo, haloalkoxy, haloalkyl, ester, ether, mercapto, thio, alkylthio, arylthio, thiocarbonyl, nitro, oxo, phosphate, phosphonate, phosphinate, silyl, sulfinyl, sulfonyl, sulfonamidyl, sulfoxyl, sulfonate, urea, -Si (Ra3 , -ORa, -SRa, -OC (O) -Ra, -N (Ra2, -C (O) Ra, -C (O) ORa, -OC (O) N (Ra2, -C (O) N (Ra2, -N (Ra) C (O) ORa, -N (Ra) C (O) Ra, -N (Ra) C (O) N (Ra2, -N (Ra) C (NRa) N (Ra2, -N (Ra) S (O) tN (Ra2 (where t is 1 or 2) , -P (=O) (Ra) (Ra) , or -O-P (=O) (ORa2 where each Ra is independently hydrogen, alkyl, haloalkyl, carbocyclyl, carbocyclylalkyl, aryl, aralkyl, heterocycloalkyl, heterocycloalkylalkyl, heteroaryl or heteroarylalkyl, and each of these moieties can be optionally substituted as defined herein.
As used herein, the terms “aromatic” or “aryl” refer to a radical with 6 to 14 ring atoms (e.g., C6-14 aromatic or C6-14 aryl) that has at least one ring having a conjugated pi electron system which is carbocyclic (e.g., phenyl, fluorenyl, and naphthyl) . Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted aryl groups. In some embodiments, the aryl is a C6-10 aryl group. For example, bivalent radicals formed from substituted benzene derivatives and having the free valences at ring atoms are named as substituted phenylene radicals. In other embodiments, bivalent radicals derived from univalent polycyclic hydrocarbon radicals whose names end in"-yl" by removal of one hydrogen atom from the carbon atom with the free valence are named by adding "-idene" to the name of the  corresponding univalent radical, e.g., a naphthyl group with two points of attachment is termed naphthylidene. Whenever it appears herein, a numerical range such as "6 to 14 aryl" refers to each integer in the given range; e.g., "6 to 14 ring atoms" means that the aryl group can consist of 6 ring atoms, 7 ring atoms, etc., up to and including 14 ring atoms. The term includes monocyclic or fused-ring polycyclic (i.e., rings which share adjacent pairs of ring atoms) groups. Polycyclic aryl groups include bicycles, tricycles, tetracycles, and the like. In a multi-ring group, only one ring is required to be aromatic, so groups such as indanyl are encompassed by the aryl definition. Non-limiting examples of aryl groups include phenyl, phenalenyl, naphthalenyl, tetrahydronaphthyl, phenanthrenyl, anthracenyl, fluorenyl, indolyl, indanyl, and the like. Unless stated otherwise in the specification, an aryl moiety can be optionally substituted by one or more substituents which independently include: acyl, alkyl, alkenyl, alkynyl, alkoxy, alkylaryl, cycloalkyl, aralkyl, aryl, aryloxy, amino, amido, amidino, imino, azide, carbonate, carbamate, carbonyl, heteroalkyl, heteroaryl, heteroarylalkyl, heterocycloalkyl, hydroxy, cyano, halo, haloalkoxy, haloalkyl, ester, ether, mercapto, thio, alkylthio, arylthio, thiocarbonyl, nitro, oxo, phosphate, phosphonate, phosphinate, silyl, sulfinyl, sulfonyl, sulfonamidyl, sulfoxyl, sulfonate, urea, -Si (Ra3 , -ORa, -SRa, -OC (O) -Ra, -N (Ra2, -C (O) Ra, -C (O) ORa, -OC (O) N (Ra2, -C (O) N (Ra2, -N (Ra) C (O) ORa, -N (Ra) C (O) Ra, -N (Ra) C (O) N (Ra2, -N (Ra) C (NRa) N (Ra2, -N (Ra) S (O) tN (Ra2 (where t is 1 or 2) , -P (=O) (Ra) (Ra) , or -O-P (=O) (ORa2 where each Ra is independently hydrogen, alkyl, haloalkyl, carbocyclyl, carbocyclylalkyl, aryl, aralkyl, heterocycloalkyl, heterocycloalkylalkyl, heteroaryl or heteroarylalkyl, and each of these moieties can be optionally substituted as defined herein.
As used herein, the terms “cycloalkyl” and “carbocyclyl” each refers to a monocyclic or polycyclic radical that contains only carbon and hydrogen, and can be saturated or partially unsaturated. Partially unsaturated cycloalkyl groups can be termed "cycloalkenyl" if the carbocycle contains at least one double bond, or "cycloalkynyl" if the carbocycle contains at least one triple bond. Cycloalkyl groups include groups having from 3 to 13 ring atoms (i.e., C3-13 cycloalkyl) . Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted cycloalkyl groups. Whenever it appears herein, a numerical range such as "3 to 10" refers to each integer in the given range; e.g., "3 to 13 carbon atoms" means that the cycloalkyl group can consist of 3 carbon atoms, 4 carbon atoms, 5 carbon atoms, etc., up to and including 13 carbon atoms. The term "cycloalkyl" also includes bridged and spiro-fused  cyclic structures containing no heteroatoms. The term also includes monocyclic or fused-ring polycyclic (i.e., rings which share adjacent pairs of ring atoms) groups. Polycyclic aryl groups include bicycles, tricycles, tetracycles, and the like. In some embodiments, “cycloalkyl” can be a C3-8 cycloalkyl radical. In some embodiments, “cycloalkyl” can be a C3-5 cycloalkyl radical. Illustrative examples of cycloalkyl groups include, but are not limited to the following moieties: C3-6 carbocyclyl groups include, without limitation, cyclopropyl (C3) , cyclobutyl (C4) , cyclopentyl (C5) , cyclopentenyl (C5) , cyclohexyl (C6) , cyclohexenyl (C6) , cyclohexadienyl (C6) and the like. Examples of C3-7 carbocyclyl groups include norbornyl (C7) . Examples of C3-8 carbocyclyl groups include the aforementioned C3-7 carbocyclyl groups as well as cycloheptyl (C7) , cycloheptadienyl (C7) , cycloheptatrienyl (C7) , cyclooctyl (C8) , bicyclo [2.2.1] heptanyl, bicyclo [2.2.2] octanyl, and the like. Examples of C3-13 carbocyclyl groups include the aforementioned C3-8 carbocyclyl groups as well as octahydro-1H indenyl, decahydronaphthalenyl, spiro [4.5] decanyl and the like. Unless stated otherwise in the specification, a cycloalkyl group can be optionally substituted by one or more substituents which independently include: acyl, alkyl, alkenyl, alkynyl, alkoxy, alkylaryl, cycloalkyl, aralkyl, aryl, aryloxy, amino, amido, amidino, imino, azide, carbonate, carbamate, carbonyl, heteroalkyl, heteroaryl, heteroarylalkyl, heterocycloalkyl, hydroxy, cyano, halo, haloalkoxy, haloalkyl, ester, ether, mercapto, thio, alkylthio, arylthio, thiocarbonyl, nitro, oxo, phosphate, phosphonate, phosphinate, silyl, sulfinyl, sulfonyl, sulfonamidyl, sulfoxyl, sulfonate, urea, -Si (Ra3 , -ORa, -SRa, -OC (O) -Ra, -N (Ra2, -C (O) Ra, -C (O) ORa, -OC (O) N (Ra2, -C (O) N (Ra2, -N (Ra) C (O) ORa, -N (Ra) C (O) Ra, -N (Ra) C (O) N (Ra2, -N (Ra) C (NRa) N (Ra2, -N (Ra) S (O) tN (Ra2 (where t is 1 or 2) , -P (=O) (Ra) (Ra) , or -O-P (=O) (ORa2 where each Ra is independently hydrogen, alkyl, haloalkyl, carbocyclyl, carbocyclylalkyl, aryl, aralkyl, heterocycloalkyl, heterocycloalkylalkyl, heteroaryl or heteroarylalkyl, and each of these moieties can be optionally substituted as defined herein. The terms “cycloalkenyl" and "cycloalkynyl" mirror the above description of "cycloalkyl" wherein the prefix "alk" is replaced with "alken" or "alkyn" respectively, and the parent "alkenyl" or "alkynyl" terms are as described herein. For example, a cycloalkenyl group can have 3 to 13 ring atoms, such as 5 to 8 ring atoms. In some embodiments, a cycloalkynyl group can have 5 to 13 ring atoms.
As used herein, the term “halogen” refers to fluorine (F) , chlorine (Cl) , bromine (Br) , or iodine (I) . As used herein, the term "halide" or "halo" , means fluoro, chloro, bromo or iodo. The  terms "haloalkyl, " "haloalkenyl, " "haloalkynyl" and "haloalkoxy" include alkyl, alkenyl, alkynyl and alkoxy structures that are substituted with one or more halo groups or with combinations thereof. For example, the terms "fluoroalkyl" and "fluoroalkoxy" include haloalkyl and haloalkoxy groups, respectively, in which the halo is fluorine, such as, but not limited to, trifluoromethyl, difluoromethyl, 2, 2, 2-trifluoroethyl, 1-fluoromethyl-2-fluoroethyl, and the like. Each of the alkyl, alkenyl, alkynyl and alkoxy groups are as defined herein and can be optionally further substituted as defined herein.
As used herein, the term “heteroatom” refers to oxygen (O) , nitrogen (N) , sulfur (S) , and phosphorus (P) .
As used herein, the term "heteroalkyl" refers to an alkyl radical, which have one or more skeletal chain atoms selected from an atom other than carbon, e.g., oxygen, nitrogen, sulfur, phosphorus or combinations thereof. Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted heteroalkyl groups. A numerical range can be given, e.g., C1-4 heteroalkyl, which refers to the chain length in total, which in this example is 4 atoms long. For example, a -CH2OCH2CH3 radical is referred to as a "C4" heteroalkyl, which includes the heteroatom center in the atom chain length description. Connection to the parent molecular structure can be through either a heteroatom or a carbon in the heteroalkyl chain. For example, an N-containing heteroalkyl moiety refers to a group in which at least one of the skeletal atoms is a nitrogen atom. One or more heteroatom (s) in the heteroalkyl radical can be optionally oxidized. One or more nitrogen atoms, if present, can also be optionally quaternized. For example, heteroalkyl also includes skeletal chains substituted with one or more nitrogen oxide (-O-) substituents. Exemplary heteroalkyl groups include, without limitation, ethers such as methoxyethanyl (-CH2CH2OCH3) , ethoxymethanyl (-CH2OCH2CH3) , (methoxymethoxy) ethanyl (-CH2CH2OCH2OCH3) , (methoxymethoxy) methanyl (-CH2OCH2OCH3) and (methoxyethoxy) methanyl (-CH2OCH2CH2OCH3) and the like; amines such as (-CH2CH2NHCH3, -CH2CH2N (CH32, -CH2NHCH2CH3, -CH2N (CH2CH3) (CH3) ) and the like.
As used herein, the term “heterocycloalkyl” refers to a cycloalkyl radical, which have one or more skeletal chain atoms selected from an atom other than carbon, e.g., oxygen, nitrogen, sulfur, phosphorus or combinations thereof. Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted heterocycloalkyl  groups. Illustrative examples of heterocycloalkyl include 2-hydroxy-aziridin-1-yl, 3-oxo-1-oxacyclobutan-2-yl, 2, 2-dimethyl-tetrahydrofuran-3-yl, 3-carboxy-morpholin-4-yl, 1-cyclopropyl-4-methyl-piperazin-2-yl. 2-pyrrolinyl, 3-pyrrolinyl, dihydro-2H-pyranyl, 1, 2, 3, 4-tetrahydropyridine, 3, 4-dihydro-2H- [1, 4] oxazine, etc.
As used herein, the term “heteroaryl” or, alternatively, “heteroaromatic” refers to a radical of a 5-18 membered monocyclic or polycyclic (e.g., bicyclic, tricyclic, tetracyclic and the like) aromatic ring system (e.g., having 6, 10 or 14 π electrons shared in a cyclic array) having ring carbon atoms and 1-6 ring heteroatoms provided in the aromatic ring system, wherein each heteroatom is independently selected from nitrogen, oxygen, phosphorous and sulfur ("5-18 membered heteroaryl" ) . Unless stated otherwise in the specification, the term is intended to include both substituted and unsubstituted heteroaryl groups. Heteroaryl polycyclic ring systems can include one or more heteroatoms in one or both rings. Whenever it appears herein, a numerical range such as "5 to 18" refers to each integer in the given range; e.g., "5 to 18 ring atoms" means that the heteroaryl group can consist of 5 ring atoms, 6 ring atoms, etc., up to and including 18 ring atoms. In some instances, a heteroaryl can have 5 to 14 ring atoms. In some embodiments, the heteroaryl has, for example, bivalent radicals derived from univalent heteroaryl radicals whose names end in "-yl" by removal of one hydrogen atom from the atom with the free valence are named by adding "-ene" to the name of the corresponding univalent radical, e.g., a pyridyl group with two points of attachment is a pyridylene.
For example, an N-containing “heteroaromatic” or “heteroaryl” moiety refers to an aromatic group in which at least one of the skeletal atoms of the ring is a nitrogen atom. One or more heteroatom (s) in the heteroaryl radical can be optionally oxidized. One or more nitrogen atoms, if present, can also be optionally quaternized. Heteroaryl also includes ring systems substituted with one or more nitrogen oxide (-O-) substituents, such as pyridinyl N-oxides. The heteroaryl is attached to the parent molecular structure through any atom of the ring (s) .
“Heteroaryl” also includes ring systems wherein the heteroaryl ring, as defined above, is fused with one or more aryl groups wherein the point of attachment to the parent molecular structure is either on the aryl or on the heteroaryl ring, or wherein the heteroaryl ring, as defined above, is fused with one or more cycloalkyl or heterocycyl groups wherein the point of attachment to the parent molecular structure is on the heteroaryl ring. For polycyclic heteroaryl groups wherein one ring does not contain a heteroatom (e.g., indolyl, quinolinyl, carbazolyl and  the like) , the point of attachment to the parent molecular structure can be on either ring, i.e., either the ring bearing a heteroatom (e.g., 2-indolyl) or the ring that does not contain a heteroatom (e.g., 5-indolyl) . In some embodiments, a heteroaryl group is a 5-10 membered aromatic ring system having ring carbon atoms and 1-4 ring heteroatoms provided in the aromatic ring system, wherein each heteroatom is independently selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur ("5-10 membered heteroaryl" ) . In some embodiments, a heteroaryl group is a 5-8 membered aromatic ring system having ring carbon atoms and 1-4 ring heteroatoms provided in the aromatic ring system, wherein each heteroatom is independently selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur ( “5-8 membered heteroaryl” ) . In some embodiments, a heteroaryl group is a 5-6 membered aromatic ring system having ring carbon atoms and 1-4 ring heteroatoms provided in the aromatic ring system, wherein each heteroatom is independently selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur ("5-6 membered heteroaryl" ) . In some embodiments, the 5-6 membered heteroaryl has 1-3 ring heteroatoms selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur. In some embodiments, the 5-6 membered heteroaryl has 1-2 ring heteroatoms selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur. In some embodiments, the 5-6 membered heteroaryl has 1 ring heteroatom selected from nitrogen, oxygen, phosphorous, and sulfur.
Examples of heteroaryls include, but are not limited to, azepinyl, acridinyl, benzimidazolyl, benzindolyl, 1, 3-benzodioxolyl, benzofuranyl, benzooxazolyl, benzo [d] thiazolyl, benzothiadiazolyl, benzo [b] [1, 4] dioxepinyl, benzo [b] [1, 4] oxazinyl, 1, 4-benzodioxanyl, benzonaphthofuranyl, benzoxazolyl, benzodioxolyl, benzodioxinyl, benzoxazolyl, benzopyranyl, benzopyranonyl, benzofuranyl, benzopyranonyl, benzofurazanyl, benzothiazolyl, benzothienyl (benzothiophenyl) , benzothieno [3, 2-d] pyrimidinyl, benzotriazolyl, benzo [4, 6] imidazo [1, 2-a] pyridinyl, carbazolyl, cinnolinyl, cyclopenta [d] pyrimidinyl, 6, 7-dihydro-5H-cyclopenta [4, 5] thieno [2, 3-d] pyrimidinyl, 5, 6-dihydrobenzo [h] quinazolinyl, 5, 6-dihydrobenzo [h] cinnolinyl, 6, 7-dihydro-5H benzo [6, 7] cyclohepta [1, 2-c] pyridazinyl, dibenzofuranyl, dibenzothiophenyl, furanyl, furazanyl, furanonyl, furo [3, 2 -c] pyridinyl, 5, 6, 7, 8, 9, 10-hexahydrocycloocta [d] pyrimidinyl, 5, 6, 7, 8, 9, 10-hexahydrocycloocta [d] pyridazinyl, 5, 6, 7, 8, 9, 10-hexahydrocycloocta [d] pyridinyl, isothiazolyl, imidazolyl, indazolyl, indolyl, indazolyl, isoindolyl, indolinyl, isoindolinyl, isoquinolyl, indolizinyl, isoxazolyl, 5, 8-methano-5, 6, 7, 8-tetrahydroquinazolinyl, naphthyridinyl, 1, 6-naphthyridinonyl, oxadiazolyl, 2- oxoazepinyl, oxazolyl, oxiranyl, 5, 6, 6a, 7, 8, 9, 10, 10a-octahydrobenzo [h] quinazolinyl, 1-phenyl-lH-pyrrolyl, phenazinyl, phenothiazinyl, phenoxazinyl, phthalazinyl, pteridinyl, purinyl, pyranyl, pyrrolyl, pyrazolyl, pyrazolo [3, 4-d] pyrimidinyl, pyridinyl, pyrido [3, 2-d] pyrimidinyl, pyrido [3, 4-d] pyrimidinyl, pyrazinyl, pyrimidinyl, pyridazinyl, pyrrolyl, quinazolinyl, quinoxalinyl, quinolinyl, isoquinolinyl, tetrahydroquinolinyl, 5, 6, 7, 8-tetrahydroquinazolinyl, 5, 6, 7, 8-tetrahydrobenzo [4, 5 ] thieno [2, 3 -d] pyrimdinyl, 6, 7, 8, 9-tetrahydro-5H-cyclohepta [4, 5] thieno [2, 3-d] pyrimidinyl, 5, 6, 7, 8-tetrahydropyrido [4, 5-c] pyridazinyl, thiazolyl, thiadiazolyl, thiapyranyl, triazolyl, tetrazolyl, triazinyl, thieno [2, 3-d] pyrimidinyl, thieno [3, 2-d] pyrimidinyl, thieno [2, 3-c] pridinyl, and thiophenyl (i.e., thienyl) . Unless stated otherwise in the specification, a heteroaryl moiety can be optionally substituted by one or more substituents which independently include: acyl, alkyl, alkenyl, alkynyl, alkoxy, alkylaryl, cycloalkyl, aralkyl, aryl, aryloxy, amino, amido, amidino, imino, azide, carbonate, carbamate, carbonyl, heteroalkyl, heteroaryl, heteroarylalkyl, heterocycloalkyl, hydroxy, cyano, halo, haloalkoxy, haloalkyl, ester, ether, mercapto, thio, alkylthio, arylthio, thiocarbonyl, nitro, oxo, phosphate, phosphonate, phosphinate, silyl, sulfinyl, sulfonyl, sulfonamidyl, sulfoxyl, sulfonate, urea, -Si (Ra3 , -ORa, -SRa, -OC (O) -Ra, -N (Ra2, -C (O) Ra, -C (O) ORa, -OC (O) N (Ra2, -C (O) N (Ra2, -N (Ra) C (O) ORa, -N (Ra) C (O) Ra, -N (Ra) C (O) N (Ra2, -N (Ra) C (NRa) N (Ra2, -N (Ra) S (O) tN (Ra2 (where t is 1 or 2) , -P (=O) (Ra) (Ra) , or -O-P (=O) (ORa2 where each Ra is independently hydrogen, alkyl, haloalkyl, carbocyclyl, carbocyclylalkyl, aryl, aralkyl, heterocycloalkyl, heterocycloalkylalkyl, heteroaryl or heteroarylalkyl, and each of these moieties can be optionally substituted as defined herein.
As used herein, the term “administering” refers to oral administration, administration as a suppository, topical contact, intravenous, parenteral, intraperitoneal, intramuscular, intralesional, intrathecal, intracranial, intranasal or subcutaneous administration, or the implantation of a slow-release device, e.g., a mini-osmotic pump, to a subject. Suitable routes of administration for a particular patient will depend on the nature and severity of the disease or condition being treated or the nature of the therapy being used and on the nature of the active compound.
Administration may be by any suitable route, including parenteral and transmucosal (e.g., buccal, sublingual, palatal, gingival, nasal, vaginal, rectal, or transdermal) . Parenteral administration includes, e.g., intravenous, intramuscular, intra-arteriole, intradermal, subcutaneous, intraperitoneal, intraventricular, and intracranial. Other modes of delivery include,  but are not limited to, the use of liposomal formulations, intravenous infusion, transdermal patches, etc.
By "co-administer" it is meant that a composition described herein is administered at the same time, just prior to, or just after the administration of one or more additional therapies.
The compound of the invention can be administered alone or can be co-administered to the patient. Co-administration is meant to include simultaneous or sequential administration of the compound individually or in combination (more than one compound or agent) . Thus, the preparations can also be combined, when desired, with other active substances (e.g., to reduce metabolic degradation) .
The compositions of the present invention can be delivered transdermally, by a topical route, formulated as applicator sticks, solutions, suspensions, emulsions, gels, creams, ointments, pastes, jellies, paints, powders, and aerosols. Oral preparations include tablets, pills, powder, dragees, capsules, liquids, lozenges, cachets, gels, syrups, slurries, suspensions, etc., suitable for ingestion by the patient. Solid form preparations include powders, tablets, pills, capsules, cachets, suppositories, and dispersible granules. Liquid form preparations include solutions, suspensions, and emulsions, gels, for example, water or water/propylene glycol solutions.
The compositions of the present invention may additionally include components to provide sustained release and/or comfort. Such components include high molecular weight, anionic mucomimetic polymers, gelling polysaccharides and finely-divided drug carrier substrates. These components are discussed in greater detail in U.S. Pat. Nos. 4,911,920; 5,403,841; 5,212,162; and 4,861,760. The entire contents of these patents are incorporated herein by reference in their entirety for all purposes. The compositions of the present invention can also be delivered as microspheres for slow release in the body. For example, microspheres can be administered via intradermal injection of drug-containing microspheres, which slowly release subcutaneously (see Rao, 1995 J. Biomater Sci. Polym. Ed. 7: 623-645; as biodegradable and injectable gel formulations (see, e.g., Gao 1995 Pharm. Res. 12: 857-863) ; or, as microspheres for oral administration (see, e.g., Eyles 1997 J. Pharm. Pharmacol. 49: 669-674) .
As used herein, the terms “disease, ” “condition, ” and “disorder” are used interchangeably herein and refer to a state of being or health status of a patient or subject capable of being treated with a compound, pharmaceutical composition, or method provided herein.
As used herein, the term “effective amount” of an active agent refers to an amount  sufficient to elicit the desired biological response. As will be appreciated by those of ordinary skill in this art, the effective amount of a compound of the invention may vary depending on such factors as the desired biological endpoint, the pharmacokinetics of the compound, the disease being treated, the mode of administration, and the patient.
As used herein, the terms “inhibition, ” “inhibit” and “inhibiting” and the like in reference to a biological target (e.g., TYK2) inhibitor interaction refers to negatively affecting (e.g., decreasing) the activity or function of the protein relative to the activity or function of the protein in the absence of the inhibitor. In embodiments, inhibition means negatively affecting (e.g. decreasing) the concentration or levels of the protein relative to the concentration or level of the protein in the absence of the inhibitor. In embodiments, inhibition refers to reduction of a disease or symptoms of disease. In embodiments, inhibition refers to a reduction in the activity of a particular protein target. Inhibition includes, at least in part, partially or totally blocking stimulation, decreasing, preventing, or delaying activation, or inactivating, desensitizing, or down-regulating signal transduction or enzymatic activity or the amount of a protein. In embodiments, inhibition refers to a reduction of activity of a target protein resulting from a direct interaction (e.g., an inhibitor binds to the target protein) . In embodiments, inhibition refers to a reduction of activity of a target protein from an indirect interaction (e.g., an inhibitor binds to a protein that activates the target protein, thereby preventing target protein activation) .
As used herein, the terms “isolated” or “purified” refer to a material that is substantially or essentially free from components that normally accompany it in its native state. Purity and homogeneity are typically determined using analytical chemistry techniques such as polyacrylamide gel electrophoresis or high-performance liquid chromatography.
As used herein, the term “modulate” refers to the production, either directly or indirectly, of an increase or a decrease, a stimulation, inhibition, interference, or blockage in a measured activity when compared to a suitable control. A “modulator” of a polypeptide or polynucleotide refers to a substance that affects, for example, increases, decreases, stimulates, inhibits, interferes with, or blocks a measured activity of the polypeptide or polynucleotide, when compared to a suitable control. For example, a “modulator” may bind to and /or activate or inhibit the target with measurable affinity, or directly or indirectly affect the normal regulation of a receptor activity.
As used herein, a “pharmaceutically acceptable form” of a disclosed compound  includes, but is not limited to, pharmaceutically acceptable salts, esters, hydrates, solvates, isomers, prodrugs, and isotopically labeled derivatives thereof. In one embodiment, a "pharmaceutically acceptable form" includes, but is not limited to, pharmaceutically acceptable salts, esters, prodrugs and isotopically labeled derivatives thereof. In some embodiments, a "pharmaceutically acceptable form" includes, but is not limited to, pharmaceutically acceptable isomers and stereoisomers, prodrugs and isotopically labeled derivatives thereof.
In certain embodiments, the pharmaceutically acceptable form is a pharmaceutically acceptable salt. As used herein, the term “pharmaceutically acceptable salt” refers to those salts which are, within the scope of sound medical judgment, suitable for use in contact with the tissues of subjects without undue toxicity, irritation, allergic response and the like, and are commensurate with a reasonable benefit/risk ratio. Pharmaceutically acceptable salts are well known in the art. For example, Berge et al. describes pharmaceutically acceptable salts in detail in J. Pharmaceutical Sciences (1977) 66: 1-19. Pharmaceutically acceptable salts of the compounds provided herein include those derived from suitable inorganic and organic acids and bases. Examples of pharmaceutically acceptable, nontoxic acid addition salts are salts of an amino group formed with inorganic acids such as hydrochloric acid, hydrobromic acid, phosphoric acid, sulfuric acid and perchlorate acid or with organic acids such as acetic acid, maleic acid, tartaric acid, citric acid, succinic acid or malonic acid or by using other methods used in the art such as ion exchange. Other pharmaceutically acceptable salts include adipate, alginate, ascorbate, aspartate, benzenesulfonate, besylate, benzoate, bisulfate, borate, butyrate, camphorate, camphorsulfonate, citrate, cyclopentanepropionate, digluconate, dodecylsulfate, ethanesulfonate, formate, fumarate, glucoheptonate, glycerophosphate, gluconate, hemisulfate, heptanoate, hexanoate, hydroiodide, 2-hydroxy-ethanesulfonate, lactobionate, lactate, laurate, lauryl sulfate, malate, maleate, malonate, methanesulfonate, 2-naphthalenesulfonate, nicotinate, nitrate, oleate, oxalate, palmitate, pamoate, pectinate, persulfate, 3-phenylpropionate, phosphate, picrate, pivalate, propionate, stearate, succinate, sulfate, tartrate, p-toluenesulfonate, undecanoate, valerate salts, and the like. In some embodiments, organic acids from which salts can be derived include, for example, acetic acid, propionic acid, glycolic acid, pyruvic acid, lactic acid, maleic acid, malonic acid, succinic acid, fumaric acid, tartaric acid, citric acid, benzoic acid, cinnamic acid, mandelic acid, methanesulfonic acid, ethanesulfonic acid, p-toluenesulfonic acid, salicylic acid, and the like.
The salts can be prepared in situ during the isolation and purification of the disclosed compounds, or separately, such as by reacting the free base or free acid of a parent compound with a suitable base or acid, respectively. Pharmaceutically acceptable salts derived from appropriate bases include alkali metal, alkaline earth metal, ammonium and N+ (C1-4alkyl) 4 salts. Representative alkali or alkaline earth metal salts include sodium, lithium, potassium, calcium, magnesium, iron, zinc, copper, manganese, aluminum, and the like. Further pharmaceutically acceptable salts include, when appropriate, nontoxic ammonium, quaternary ammonium, and amine cations formed using counterions such as halide, hydroxide, carboxylate, sulfate, phosphate, nitrate, lower alkyl sulfonate and aryl sulfonate. Organic bases from which salts can be derived include, for example, primary, secondary, and tertiary amines, substituted amines, including naturally occurring substituted amines, cyclic amines, basic ion exchange resins, and the like, such as isopropylamine, trimethylamine, diethylamine, triethylamine, tripropylamine, and ethanolamine. In some embodiments, the pharmaceutically acceptable base addition salt can be chosen from ammonium, potassium, sodium, calcium, and magnesium salts.
In certain embodiments, the pharmaceutically acceptable form is a “solvate” (e.g., a hydrate) . As used herein, the term “solvate” refers to compounds that further include a stoichiometric or non-stoichiometric amount of solvent bound by non-covalent intermolecular forces. The solvate can be of a disclosed compound or a pharmaceutically acceptable salt thereof. Where the solvent is water, the solvate is a “hydrate. ” Pharmaceutically acceptable solvates and hydrates are complexes that, for example, can include 1 to about 100, or 1 to about 10, or 1 to about 2, about 3 or about 4, solvent or water molecules. It will be understood that the term “compound” as used herein encompasses the compound and solvates of the compound, as well as mixtures thereof.
In certain embodiments, the pharmaceutically acceptable form is a prodrug. As used herein, the term “prodrug” (or “pro-drug” ) refers to compounds that are transformed in vivo to yield a disclosed compound or a pharmaceutically acceptable form of the compound. A prodrug can be inactive when administered to a subject, but is converted in vivo to an active compound, for example, by hydrolysis (e.g., hydrolysis in blood) . In certain cases, a prodrug has improved physical and/or delivery properties over the parent compound. Prodrugs can increase the bioavailability of the compound when administered to a subject (e.g., by permitting enhanced absorption into the blood following oral administration) or which enhance delivery to a  biological compartment of interest (e.g., the brain or lymphatic system) relative to the parent compound. Exemplary prodrugs include derivatives of a disclosed compound with enhanced aqueous solubility or active transport through the gut membrane, relative to the parent compound.
The prodrug compound often offers advantages of solubility, tissue compatibility or delayed release in a mammalian organism (see, e.g., Bundgard, H., Design of Prodrugs (1985) , pp. 7-9, 21-24 (Elsevier, Amsterdam) . A discussion of prodrugs is provided in Higuchi, T., et al., "Pro-drugs as Novel Delivery Systems, " A.C.S. Symposium Series, Vol. 14, and in Bioreversible Carriers in Drug Design, ed. Edward B. Roche, American Pharmaceutical Association and Pergamon Press, 1987, both of which are incorporated in full by reference herein.
Prodrug forms often offer advantages of solubility, tissue compatibility, or delayed release in the mammalian organism. (See, Bundgard, Design of Prodrugs, pp. 7-9, 21-24, Elsevier, Amsterdam 1985 and Silverman, The Organic Chemistry of Drug Design and Drug Action, pp. 352-401, Academic Press, San Diego, Calif., 1992. ) Prodrugs commonly known in the art include well-known acid derivatives, such as, for example, esters prepared by reaction of the parent acids with a suitable alcohol, amides prepared by reaction of the parent acid compound with an amine, basic groups reacted to form an acylated base derivative, etc. Other prodrug derivatives may be combined with other features disclosed herein to enhance bioavailability. As such, those of skill in the art will appreciate that certain of the presently disclosed compounds having free amino, amido, hydroxy or carboxylic groups can be converted into prodrugs. Prodrugs include compounds having a carbonate, carbamate, amide or alkyl ester moiety covalently bonded to any of the above substituents disclosed herein.
Exemplary advantages of a prodrug can include, but are not limited to, its physical properties, such as enhanced water solubility for parenteral administration at physiological pH compared to the parent compound, or it can enhance absorption from the digestive tract, or it can enhance drug stability for long-term storage.
As used herein, the term “pharmaceutically acceptable” excipient, carrier, or diluent refers to a pharmaceutically acceptable material, composition or vehicle, such as a liquid or solid filler, diluent, excipient, solvent or encapsulating material, involved in carrying or transporting the subject pharmaceutical agent from one organ, or portion of the body, to another organ, or  portion of the body. Each carrier must be "acceptable" in the sense of being compatible with the other ingredients of the formulation and not injurious to the patient. Some examples of materials which can serve as pharmaceutically-acceptable carriers include: sugars, such as lactose, glucose and sucrose; starches, such as corn starch and potato starch; cellulose, and its derivatives, such as sodium carboxymethyl cellulose, ethyl cellulose and cellulose acetate; powdered tragacanth; malt; gelatin; talc; excipients, such as cocoa butter and suppository waxes; oils, such as peanut oil, cottonseed oil, safflower oil, sesame oil, olive oil, corn oil and soybean oil; glycols, such as propylene glycol; polyols, such as glycerin, sorbitol, mannitol and polyethylene glycol; esters, such as ethyl oleate and ethyl laurate; agar; buffering agents, such as magnesium hydroxide and aluminum hydroxide; alginic acid; pyrogen-free water; isotonic saline; Ringer's solution; ethyl alcohol; phosphate buffer solutions; and other non-toxic compatible substances employed in pharmaceutical formulations. Wetting agents, emulsifiers and lubricants, such as sodium lauryl sulfate, magnesium stearate, and polyethylene oxide-polypropylene oxide copolymer as well as coloring agents, release agents, coating agents, sweetening, flavoring and perfuming agents, preservatives and antioxidants can also be present in the compositions.
As used herein, the term “subject” refers to any animal (e.g., a mammal) , including, but not limited to humans, non-human primates, rodents, and the like, which is to be the recipient of a particular treatment. A subject to which administration is contemplated includes, but is not limited to, humans (e.g., a male or female of any age group, e.g., a pediatric subject (e.g., infant, child, adolescent) or adult subject (e.g., young adult, middle-aged adult or senior adult) ) and/or other non-human animals, for example, non-human mammals (e.g., primates (e.g., cynomolgus monkeys, rhesus monkeys) ; commercially relevant mammals such as cattle, pigs, horses, sheep, goats, cats, and/or dogs) , rodents (e.g., rats and/or mice) , etc. In certain embodiments, the non-human animal is a mammal. The non-human animal may be a male or female at any stage of development. A non-human animal may be a transgenic animal. Typically, the terms “subject” and “patient” are used interchangeably herein in reference to a human subject.
As used herein, the terms “treatment” or “treating” a disease or disorder refers to a method of reducing, delaying or ameliorating such a condition before or after it has occurred. Treatment may be directed at one or more effects or symptoms of a disease and/or the underlying pathology. The treatment can be any reduction and can be, but is not limited to, the complete ablation of the disease or the symptoms of the disease. Treating or treatment thus refers to any  indicia of success in the therapy or amelioration of an injury, disease, pathology or condition, including any objective or subjective parameter such as abatement; remission; diminishing of symptoms or making the injury, pathology or condition more tolerable to the patient; slowing in the rate of degeneration or decline; making the final point of degeneration less debilitating; improving a patient's physical or mental well-being. The treatment or amelioration of symptoms can be based on objective or subjective parameters, for example, the results of a physical examination, neuropsychiatric exams, and/or a psychiatric evaluation. As compared with an equivalent untreated control, such reduction or degree of amelioration may be at least 5%, 10%, 20%, 40%, 50%, 60%, 80%, 90%, 95%, or 100%as measured by any standard technique.
Treatment methods include administering to a subject a therapeutically effective amount of a compound described herein. The administering step may be a single administration or may include a series of administrations. The length of the treatment period depends on a variety of factors, such as the severity of the condition, the patient’s age, the concentration of the compound, the activity of the compositions used in the treatment, or a combination thereof. It will also be appreciated that the effective dosage of an agent used for the treatment may increase or decrease over the course of a particular treatment regime. Changes in dosage may result and become apparent by standard diagnostic assays known in the art. In some instances, chronic administration may be required. For example, the compositions are administered to the subject in an amount and for a duration sufficient to treat the patient.
Detailed Description of the Invention
The invention is based on an unexpected discovery of novel, selective and potent compounds that are TYK2 inhibitors. The invention also provides pharmaceutical compositions of these compounds and methods of their preparation and use. The compounds are orally available and exhibit fewer and/or lesser side effects than currently available drugs.
The new class of TYK2 inhibitors disclosed herein exhibit exceptional potency profiles and are useful in treating one or more TYK2-mediated diseases and conditions, such as allergic, autoimmune, inflammatory, metabolic, neurological and proliferative diseases and conditions. Without wishing to be bound by the theory, compounds of the invention are modulators of interleukins (e.g., IL-12, IL-23) and interferons (e.g., IFN-a) by inhibiting TYK2-mediated signal transduction.
These compounds are designed to show good potency against TYK2 with good oral absorption and good in vivo stability. The invention also provides pharmaceutical compositions of these compounds and methods of preparation and use thereof. The TYK2 inhibitors disclosed herein exhibit favorable pharmacokinetic profiles and drug properties that are suitable for the target indications.
In one aspect, the invention generally relates to a compound having the structural formula (I) :
or a pharmaceutically acceptable form or an isotope derivative thereof,
wherein
Y1 is CH, CF or N;
Y2 is CH or N;
Y3 is NR, O, CH2, CF2 or O-NH;
R1 is a H, F, C1-C3 alkyl and CD3, provided that R1 is not F when Y3 is N, O or O-NH;
R2 is
R2’, wherein R2’ is a C1-C6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl, C5-C7 spirocycloalkyl, or C3-C6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R2a, wherein R2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
an aryl or heteroaryl group, each substituted with 0-2 R2a;
(C=O) R2b; or
(C=O) NHR2b;
R3 is
wherein
X6 is CR6 or N;
X7 is CR7 or N;
X8 is C or N;
X9 is CR9, O, S, N or NR9;
X10 is CR9, O, S, N or NR10; and
wherein each of Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group;
R2b is a C1-6 alkyl or C3-6 cycloalkyl, C5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R2c;
R2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF3, CF3, C1-6 alkyl, C1-6 haloalkyl, C2-6 alkenyl, C2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R2a; and
R4 is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 R4a, wherein R4a is selected from D, F and Cl;
R5 is H, CN, halo, OCH3, C (=O) OCH3, C1-6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl or heterocyclic, wherein said alkyl, cycloalkyl or heterocyclic is substituted with 0-3 R5a, wherein each R5a is independently selected from OH, D, F, Cl, CN, OCH3, OCD3, OCF3 and OC (=O) CH3;
each of R6, R7, R9 and R10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD3, CH2CF3, CF3, OR, NRR’, C1-C3 alkyl and C3-C5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R2a; and
each of R and R’ is independently H or a C1-C6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO2.
In certain embodiments, each of Ring A and Ring B is independently a heteroaryl group.
In certain embodiments, each of Ring A is an aryl group and Ring B is a heteroaryl group.
In certain embodiments, each of Ring A is a heteroaryl group and Ring B is an aryl group.
In certain embodiments, each of Ring A and Ring B is independently an aryl group.
In certain embodiments, X6 is CH and X7 is CH, with R3 having the structure:
In certain embodiments, X7 is CH and X8 is C, with R3 having the structure:
In certain embodiments, X6 is CH and X8 is C, with R3 having the structure:
In certain embodiments, X7 is CH and X10 is CH, with R3 having the structure:
In certain embodiments, R4 is CH3.
In certain embodiments, R4 is CD3.
In certain embodiments, R3 is selected from:
In certain embodiments, R3 is:
In certain embodiments, R3 is:
In certain embodiments, if present R7 is H.
In certain embodiments, if present R9 is C1-3 alkyl.
In certain embodiments, if present R10 is H.
In certain embodiments, if present R10 is C1-3 alkyl.
In certain embodiments, R5 is a C1-4 alkyl, optionally substituted with an OH, alkoxy or ester group.
In certain embodiments, R5 is:
wherein
R5’ is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 F’s ; and
R is H, C1-3 alkyl or acyl.
In certain embodiments, R is CH3.
In certain embodiments, R is C (=O) CH3.
In certain embodiments, R is H and R5 is:
In certain embodiments, R is CH3.
In certain embodiments, R is C (=O) CH3.
In certain embodiments, Y3 is NH.
In certain embodiments, Y1 is CH and Y2 is CH:
In certain embodiments, Y1 is CH and Y2 is N:
In certain embodiments, Y1 is N and Y2 is CH:
In certain embodiments, Y1 is N and Y2 is N:
In certain embodiments, R2 is R2’ .
In certain embodiments, R2 is (C=O) R2b. In certain embodiments, R2b is selected from C1-C6 alkyl, cyclopropyl or cyclobutyl, substituted with 0-2 R2c. In certain embodiments, R2b is cyclopropyl.
In certain embodiments, R2 is (C=O) NHR2b.
In certain embodiments, R2 is phenyl substituted with 0-2 R2b.
In certain embodiments, R2 is pyridinyl substituted with 0-2 R2c.
In certain embodiments, R2 is pyrazolyl substituted with 0-2 R2c.
In certain embodiments, R2 is pyrimidyl substituted with 0-2 R2c.
In certain embodiments, R1 is CH3.
In certain embodiments, R1 is CD3.
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
wherein X6 is N or CH.
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments, the compound of (I) has the structural formula:
In certain embodiments of (I) - (It) , R6 and R7, if present, each is H.
In certain embodiments of (I) - (It) , R2b is C1-C6 alkyl, cyclopropyl or cyclobutyl, substituted with 0-2 R2c.
In certain embodiments of (I) - (It) , R5 is:
wherein
R5’ is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 F’s; and
R is H, C1-3 alkyl or acyl.
In certain embodiments, R is H and R5 is:
In certain embodiments, R is CH3.
In certain embodiments, R is C (=O) CH3.
In certain embodiments of (I) - (It) , R1 is CH3.
In certain embodiments of (I) - (It) , R1 is CD3.
In certain embodiments of (I) - (It) , R1 is CD3, R2b is cyclopropyl and R5’ is a C2-3 alkyl, substituted with 2-5 F’s .
Non-limiting examples of compounds of the invention include those listed in Table 1 in the Examples section herein.
In yet another aspect, the invention generally relates to a method for preparing a compound disclosed herein, as exemplified by the synthetic schemes and experimental procedure disclosed herein.
In another aspect, the invention generally relates to a pharmaceutical composition comprising a compound disclosed herein, effective to treat or reduce one or more diseases or disorders, in a mammal, including a human, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent.
In yet another aspect, the invention generally relates to a pharmaceutical composition comprising an amount of a compound having the structural formula of (I) :
or a pharmaceutically acceptable form or an isotope derivative thereof,
wherein
Y1 is CH, CF or N;
Y2 is CH or N;
Y3 is NR, O, CH2, CF2 or O-NH;
R1 is a H, F, C1-C3 alkyl and CD3, provided that R1 is not F when Y3 is N, O or O-NH;
R2 is
R2’, wherein R2’ is a C1-C6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl, C5-C7 spirocycloalkyl, or C3-C6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R2a, wherein R2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
an aryl or heteroaryl group, each substituted with 0-2 R2a;
(C=O) R2b; or
(C=O) NHR2b;
R3 is
wherein
X6 is CR6 or N;
X7 is CR7 or N;
X8 is C or N;
X9 is CR9, O, S, N or NR9;
X10 is CR9, O, S, N or NR10; and
wherein each of Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group;
R2b is a C1-6 alkyl or C3-6 cycloalkyl, C5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R2c;
R2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF3, CF3, C1-6 alkyl, C1-6 haloalkyl, C2-6 alkenyl, C2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R2a; and
R4 is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 R4a, wherein R4a is selected from D, F and Cl;
R5 is H, CN, halo, OCH3, C (=O) OCH3, C1-6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl or heterocyclic, wherein said alkyl, cycloalkyl or heterocyclic is substituted with 0-3 R5a, wherein each R5a is independently selected from OH, D, F, Cl, CN, OCH3, OCD3, OCF3 and OC (=O) CH3;
each of R6, R7, R9 and R10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD3, CH2CF3, CF3, OR, NRR’, C1-C3 alkyl and C3-C5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R2a; and
each of R and R’ is independently H or a C1-C6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO2,
effective to treat, or reduce one or more diseases or disorders, in a mammal, including a human, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent.
In certain embodiments, the pharmaceutical composition is suitable for oral administration.
In certain embodiments, the pharmaceutical composition is suitable for topical administration.
In certain embodiments, the pharmaceutical composition is suitable for GI-restricted administration.
In certain embodiments, the pharmaceutical composition is useful to treat or reduce one or more of inflammatory diseases, immune-mediated diseases and cancers, or a related disease or disorder.
In certain embodiments, the disease or disorder is an inflammatory disease.
In certain embodiments, the disease or disorder is an immune-mediated disease.
In certain embodiments, the disease or disorder is cancer.
In certain embodiments, the disease or disorder is selected from: inflammatory bowel disease, psoriasis, vitiligo, atopic dermatitis, systemic lupus erythematosus, asthma, diabetic nephropathy, chronic myelogenous leukemia (CML) , essential thrombocythemia (ET) , polycythemia vera (PV) , myelofibrosis (MF) , breast cancer and ovarian cancer.
In yet another aspect, the invention generally relates to a unit dosage form comprising a pharmaceutical composition disclosed herein.
In certain embodiments, the unit dosage form is a tablet.
In certain embodiments, the unit dosage form is a capsule.
In certain embodiments, the unit dosage form is a topical formulation.
In yet another aspect, the invention generally relates to a method for treating, reducing or preventing a disease or disorder, comprising administering to a subject in need thereof a therapeutically effective amount of a compound according to any one of claims 1-61, wherein the disease or disorder is selected from inflammatory diseases, immune-mediated diseases, cancer, or a related disease or disorder thereof, in a mammal, including a human.
In yet another aspect, the invention generally relates to a method for treating, reducing or preventing a disease or disorder, comprising administering to a subject in need thereof a therapeutically effective amount of a compound having the structural formula of (I) :
or a pharmaceutically acceptable form or an isotope derivative thereof,
wherein
Y1 is CH, CF or N;
Y2 is CH or N;
Y3 is NR, O, CH2, CF2 or O-NH;
R1 is a H, F, C1-C3 alkyl and CD3, provided that R1 is not F when Y3 is N, O or O-NH;
R2 is
R2’, wherein R2’ is a C1-C6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl, C5-C7 spirocycloalkyl, or C3-C6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R2a, wherein R2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
an aryl or heteroaryl group, each substituted with 0-2 R2a;
(C=O) R2b; or
(C=O) NHR2b;
R3 is
wherein
X6 is CR6 or N;
X7 is CR7 or N;
X8 is C or N;
X9 is CR9, O, S, N or NR9;
X10 is CR9, O, S, N or NR10; and
wherein each of Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group;
R2b is a C1-6 alkyl or C3-6 cycloalkyl, C5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R2c;
R2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF3, CF3, C1-6 alkyl, C1-6 haloalkyl, C2-6 alkenyl, C2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R2a; and
R4 is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 R4a, wherein R4a is selected from D, F and Cl;
R5 is H, CN, halo, OCH3, C (=O) OCH3, C1-6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl or heterocyclic, wherein said alkyl, cycloalkyl or heterocyclic is substituted with 0-3 R5a, wherein each R5a is independently selected from OH, D, F, Cl, CN, OCH3, OCD3, OCF3 and OC (=O) CH3;
each of R6, R7, R9 and R10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD3, CH2CF3, CF3, OR, NRR’, C1-C3 alkyl and C3-C5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R2a; and
each of R and R’ is independently H or a C1-C6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO2,
wherein the disease or disorder is selected from inflammatory diseases, immune-mediated diseases, cancer, or a related disease or disorder thereof, in a mammal, including a human.
In certain embodiments, the disease or disorder is an inflammatory disease.
In certain embodiments, the disease or disorder is an immune-mediated disease.
In certain embodiments, the disease or disorder is cancer.
In certain embodiments, the disease or disorder is selected from: inflammatory bowel disease, psoriasis, vitiligo, atopic dermatitis, systemic lupus erythematosus, asthma, diabetic nephropathy, chronic myelogenous leukemia (CML) , essential thrombocythemia (ET) , polycythemia vera (PV) , myelofibrosis (MF) , breast cancer and ovarian cancer.
In certain embodiments, administration is via oral administration.
In certain embodiments, administration is via topical administration.
In certain embodiments, administration is via GI-restricted administration.
In yet another aspect, the invention generally relates to use of a compound disclosed herein, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent, in preparation of a medicament for treating a disease or disorder.
In certain embodiments of the use, the disease or disorder is one or more of inflammatory diseases, immune-mediated diseases and cancer.
In certain embodiments of the use, the disease or disorder is an inflammatory disease.
In certain embodiments of the use, the disease or disorder is an immune-mediated disease.
In certain embodiments of the use, the disease or disorder is cancer.
In certain embodiments of the use, the medicament is for oral administration.
In certain embodiments of the use, the medicament is for topical administration.
In certain embodiments of the use, the medicament is for GI restriction administration.
As discussed herein, isotope derivative compounds having one or more hydrogen atoms (e.g., 1, 2, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, etc. ) replaced with deuterium atoms are contemplated in the presented invention.
The term “inflammatory disease” refers to a disease or condition characterized by aberrant inflammation, e.g. an increased level of inflammation compared to a control such as a healthy person not suffering from a disease. Examples of inflammatory diseases that may be treated with a compound, pharmaceutical composition, or method described herein include autoimmune diseases, traumatic brain injury, arthritis, rheumatoid arthritis, psoriatic arthritis, juvenile idiopathic arthritis, multiple sclerosis, systemic lupus erythematosus (SLE) , myasthenia gravis, juvenile onset diabetes, diabetes mellitus type 1, Guillain-Barre syndrome, Hashimoto's  encephalitis, Hashimoto's thyroiditis, ankylosing spondylitis, psoriasis, Sjogren's syndrome, vasculitis, glomerulonephritis, auto-immune thyroiditis, Behcet's disease, Crohn's disease, ulcerative colitis, bullous pemphigoid, sarcoidosis, ichthyosis, Graves ophthalmopathy, inflammatory bowel disease, Addison's disease, Vitiligo, asthma, allergic asthma, acne vulgaris, celiac disease, chronic prostatitis, inflammatory bowel disease, pelvic inflammatory disease, reperfusion injury, ischemia reperfusion injury, stroke, sarcoidosis, transplant rejection, interstitial cystitis, atherosclerosis, scleroderma, and atopic dermatitis. Such conditions are frequently inextricably intertwined with other diseases, disorders and conditions. A non-limiting list of inflammatory-related diseases, disorders and conditions which may, for example, be caused by inflammatory cytokines, include, arthritis, kidney failure, lupus, asthma, psoriasis, colitis, pancreatitis, allergies, fibrosis, surgical complications (e.g., where inflammatory cytokines prevent healing) , anemia, and fibromyalgia. Other diseases and disorders, which may be associated with chronic inflammation include Alzheimer's disease, congestive heart failure, stroke, aortic valve stenosis, arteriosclerosis, osteoporosis, Parkinson's disease, infections, inflammatory bowel disease (IBD) , allergic contact dermatitis and other eczemas, systemic sclerosis, transplantation and multiple sclerosis. Some of the aforementioned diseases, disorders and conditions for which a compound of the present disclosure may be particularly efficacious (due to, for example, limitations of current therapies) are described in more detail hereafter.
The term “autoimmune disease” refers to a disease or condition in which a subject's immune system has an aberrant immune response against a substance that does not normally elicit an immune response in a healthy subject. Examples of autoimmune diseases that may be treated with a compound, pharmaceutical composition, or method described herein include acne vulgaris, acute disseminated encephalomyelitis, acute necrotizing hemorrhagic leukoencephalitis, Addison's disease, agammaglobulinemia, Aicardi-Goutières syndrome (AGS) , alopecia areata, alopecia totalis, amyloidosis, ankylosing spondylitis, anti-GBM/anti-TBM nephritis, antiphospholipid syndrome, autoimmune angioedema, autoimmune aplastic anemia, autoimmune dysautonomia, autoimmune hepatitis, autoimmune hyperlipidemia, autoimmune immunodeficiency, autoimmune inner ear disease, autoimmune myocarditis, autoimmune oophoritis, autoimmune pancreatitis, autoimmune retinopathy, autoimmune thrombocytopenic purpura, autoimmune thyroid disease, autoimmune urticaria, axonal or neuronal neuropathies, balo disease, Behcet's disease, bullous pemphigoid, cardiomyopathy,  Castleman disease, celiac disease, Chagas disease, chronic atypical neutrophilic dermatosis with lipodystrophy and elevated temperature (CANDLE) , chronic active hepatitis, chronic fatigue syndrome, chronic inflammatory demyelinating polyneuropathy, chronic recurrent multifocal ostomyelitis, Churg-Strauss syndrome, cicatricial pemphigoid/benign mucosal pemphigoid, Crohn's disease, Cogans syndrome, cold agglutinin disease, congenital heart block, coxsackie myocarditis, CREST disease, Cushing's disease, demyelinating neuropathies, depression, dermatitis herpetiformis, dermatomyositis, Devic's disease (neuromyelitis optica) , discoid lupus, Dressler's syndrome, dry eye syndrome DES (keratoconjunctivitis sicca) , endometriosis, eosinophilic esophagitis, eosinophilic fasciitis, erythema nodosum, essential mixed cryoglobulinemia, experimental allergic encephalomyelitis, Evans syndrome, fibromyalgia, fibrosing alveolitis, giant cell arteritis (temporal arteritis) , giant cell myocarditis, glomerulonephritis, Goodpasture's syndrome, granulomatosis with polyangiitis, graft-versus-host disease (GVDH) , Graves'disease, Guillain-Barre syndrome, Hashimoto's encephalitis, Hashimoto's thyroiditis, hemolytic anemia, Henoch-Schonlein purpura, herpes gestationis, hidradenitis suppurativa, hypogammaglobulinemia, idiopathic thrombocytopenic purpura, IgA nephropathy, IgG4-related sclerosing disease, inflammatory bowel disease (IBD) , immunoregulatory lipoproteins, inclusion body myositis, interstitial cystitis, juvenile arthritis, juvenile diabetes (Type 1 diabetes) , juvenile dermatomyositis (JDM) , juvenile myositis, Kawasaki syndrome, Lambert-Eaton syndrome, leukocytoclastic vasculitis, lichen planus, lichen sclerosus, ligneous conjunctivitis, linear IgA disease, lupus, lyme disease, chronic, Meniere's disease, microscopic polyangiitis, mixed connective tissue disease, Mooren's ulcer, Mucha-Habermann disease, multiple sclerosis (MS) , myasthenia gravis, myositis, narcolepsy, neuromyelitis optica, neutropenia, ocular cicatricial pemphigoid, optic neuritis, palindromic rheumatism, pediatric autoimmune neuropsychiatric disorders associated with streptococcus, paraneoplastic cerebellar degeneration, paroxysmal nocturnal hemoglobinuria p, Parry Romberg syndrome, Parsonnage-Turner syndrome, Pars planitis (peripheral uveitis) , pemphigus, peripheral neuropathy, perivenous encephalomyelitis, pernicious anemia, POEMS syndrome, polyarteritis nodosa, polycystic ovary syndrome (PCOS) , Type I, II, &III autoimmune polyglandular syndromes, polymyalgia rheumatica, polymyositis, postmyocardial infarction syndrome, postpericardiotomy syndrome, progesterone dermatitis, primary biliary cirrhosis, primary sclerosing cholangitis, psoriasis, psoriatic arthritis, plaque psoriasis, idiopathic  pulmonary fibrosis, pyoderma gangrenosum, pure red cell aplasia, Raynauds phenomenon, reactive Arthritis, reflex sympathetic dystrophy, Reiter's syndrome, relapsing polychondritis, restless legs syndrome, retroperitoneal fibrosis, rheumatic fever, rheumatoid arthritis, sarcoidosis, Schmidt syndrome, scleritis, scleroderma, Sjogren's syndrome, sperm &testicular autoimmunity, stiff person syndrome, stimulator of interferon genes (STING) -associated vasculopathy with onset during infancy (SAVI) , subacute bacterial endocarditis, Susac's syndrome, sympathetic ophthalmia, systemic lupus erythematosus (SLE) , Takayasu's arteritis, temporal arteritis/Giant cell arteritis, thrombocytopenic purpura, Tolosa-Hunt syndrome, transplant rejection (allograft transplant rejection) , transverse myelitis, Type 1 diabetes, ulcerative colitis, undifferentiated connective tissue disease, uveitis, vasculitis, vesiculobullous dermatosis, vitiligo, or Wegener's granulomatosis.
The term “immune-mediated disease” refers to chronic inflammatory diseases perpetuated by antibodies and cellular immunity. Immune-mediated diseases include, for example, but not limited to, asthma, allergies, arthritis (e.g., rheumatoid arthritis, psoriatic arthritis, and ankylosing spondylitis) , juvenile arthritis, inflammatory bowel diseases (e.g., ulcerative colitis and Crohn's disease) , endocrinopathies (e.g., type 1 diabetes and Graves’ disease) , neurodegenerative diseases (e.g., multiple sclerosis (MS) ) , autistic spectrum disorder, depression, Alzheimer's disease, Guillain-Barre syndrome, obsessive-compulsive disorder, optic neuritis, retinal degeneration, dry eye syndrome DES, Sjogren's syndrome, amyotrophic lateral sclerosis (ALS) , Parkinson's disease, Huntington's Disease, Guillain-Barre syndrome, myasthenia gravis, and chronic idiopathic demyelinating disease (CID) ) , vascular diseases (e.g., autoimmune hearing loss, systemic vasculitis, and atherosclerosis) , and skin diseases (e.g., acne vulgaris dermatomyositis, pemphigus, systemic lupus erythematosus (SLE) , discoid lupus erthematosus, scleroderma, psoriasis, plaque psoriasis, vasculitics, vitiligo and alopecias) . Hashimoto's thyroiditis, pernicious anemia, Cushing's disease, Addison's disease, chronic active hepatitis, polycystic ovary syndrome (PCOS) , celiac disease, pemphigus, transplant rejection (allograft transplant rejection) , graft-versus-host disease (GVDH) .
The term “cancer” as used herein refers to all types of cancer, neoplasm or malignant tumors found in mammals, e.g., humans, including hematological cancers leukemia, and lymphomas, T-ALL, large B-cell lymphoma, solid cancers such as carcinomas and sarcomas. Exemplary cancers include blood cancer, brain cancer, glioma, glioblastoma, neuroblastoma,  prostate cancer, colorectal cancer, pancreatic cancer, cervical cancer, gastric cancer, ovarian cancer, lung cancer, and cancer of the head. Exemplary cancers include cancer of the thyroid, endocrine system, brain, breast, cervix, colon, head &neck, liver, kidney, lung, non-small cell lung, melanoma, mesothelioma, ovary, sarcoma, stomach, uterus, medulloblastoma, colorectal cancer, pancreatic cancer. Additional examples include penile, skin –non-melanoma, anal, hepatobiliary, esophagogastric, uterine sarcoma, gastrointestinal stromal tumor, salivary gland, peripheral nervous system, soft tissue sarcoma, bone, renal, myeloproliferative neoplasms, thyroid carcinoma, cholangiocarcinoma, pancreatic adenocarcinoma, skin cutaneous melanoma, colon adenocarcinoma, rectum adenocarcinoma, stomach adenocarcinoma, esophageal carcinoma, head and neck squamous cell carcinoma, breast invasive carcinoma, lung adenocarcinoma, lung squamous cell carcinoma, Hodgkin's Disease, Non-Hodgkin's Lymphoma, multiple myeloma, neuroblastoma, glioma, glioblastoma multiforme, ovarian cancer, rhabdomyosarcoma, primary thrombocytosis, primary macroglobulinemia, primary brain tumors, cancer, malignant pancreatic insulanoma, malignant carcinoid, urinary bladder cancer, premalignant skin lesions, testicular cancer, lymphomas, thyroid cancer, neuroblastoma, esophageal cancer, genitourinary tract cancer, malignant hypercalcemia, endometrial cancer, adrenal cortical cancer, neoplasms of the endocrine or exocrine pancreas, medullary thyroid cancer, medullary thyroid carcinoma, melanoma, colorectal cancer, papillary thyroid cancer, hepatocellular carcinoma, metastatic leiomyosarcoma, synovial sarcoma, undifferentiated pleomorphic sarcoma, round cell liposarcoma or prostate cancer.
In certain embodiments of the use, the disease or disorder is selected from: inflammatory bowel disease, psoriasis, vitiligo, atopic dermatitis, systemic lupus erythematosus, asthma, diabetic nephropathy, chronic myelogenous leukemia (CML) , essential thrombocythemia (ET) , polycythemia vera (PV) , myelofibrosis (MF) , breast cancer and ovarian cancer.
Isotopically-labeled compounds are also within the scope of the present disclosure. As used herein, an "isotopically-labeled compound" refers to a presently disclosed compound including pharmaceutical salts and prodrugs thereof, each as described herein, in which one or more atoms are replaced by an atom having an atomic mass or mass number different from the atomic mass or mass number usually found in nature. Examples of isotopes that can be incorporated into compounds presently disclosed include isotopes of hydrogen, carbon, nitrogen,  oxygen, phosphorous, fluorine and chlorine, such as 2H, 3H, 13C, 14C, 15N, 18O, 17O, 31P, 32P, 35S, 18F, and 36Cl, respectively.
By isotopically-labeling the presently disclosed compounds, the compounds may be useful in drug and/or substrate tissue distribution assays. Tritiated (3H) and carbon-14 (14C) labeled compounds are particularly preferred for their ease of preparation and detectability. Further, substitution with heavier isotopes such as deuterium (2H) can afford certain therapeutic advantages resulting from greater metabolic stability, for example increased in vivo half-life or reduced dosage requirements and, hence, may be preferred in some circumstances. Isotopically labeled compounds presently disclosed, including pharmaceutical salts, esters, and prodrugs thereof, can be prepared by any means known in the art.
Further, substitution of normally abundant hydrogen (1H) with heavier isotopes such as deuterium can afford certain therapeutic advantages, e.g., resulting from improved absorption, distribution, metabolism and/or excretion (ADME) properties, creating drugs with improved efficacy, safety, and/or tolerability. Benefits may also be obtained from replacement of normally abundant 12C with 13C. (See, WO 2007/005643, WO 2007/005644, WO 2007/016361, and WO 2007/016431. ) 
Stereoisomers (e.g., cis and trans isomers) and all optical isomers of a presently disclosed compound (e.g., R and S enantiomers) , as well as racemic, diastereomeric and other mixtures of such isomers are within the scope of the present disclosure.
Compounds of the present invention are, subsequent to their preparation, preferably isolated and purified to obtain a composition containing an amount by weight equal to or greater than 95% ( “substantially pure” ) , which is then used or formulated as described herein. In certain embodiments, the compounds of the present invention are more than 99%pure. Solvates and polymorphs of the compounds of the invention are also contemplated herein. Solvates of the compounds of the present invention include, for example, hydrates.
Any appropriate route of administration can be employed, for example, parenteral, intravenous, subcutaneous, intramuscular, intraventricular, intracorporeal, intraperitoneal, rectal, or oral administration. Most suitable means of administration for a particular patient will depend on the nature and severity of the disease or condition being treated or the nature of the therapy being used and on the nature of the active compound.
Solid dosage forms for oral administration include capsules, tablets, pills, powders,  and granules. In such solid dosage forms, the compounds described herein or derivatives thereof are admixed with at least one inert customary excipient (or carrier) such as sodium citrate or dicalcium phosphate or (i) fillers or extenders, as for example, starches, lactose, sucrose, glucose, mannitol, and silicic acid, (ii) binders, as for example, carboxymethylcellulose, alignates, gelatin, polyvinylpyrrolidone, sucrose, and acacia, (iii) humectants, as for example, glycerol, (iv) disintegrating agents, as for example, agar-agar, calcium carbonate, potato or tapioca starch, alginic acid, certain complex silicates, and sodium carbonate, (v) solution retarders, as for example, paraffin, (vi) absorption accelerators, as for example, quaternary ammonium compounds, (vii) wetting agents, as for example, cetyl alcohol, and glycerol monostearate, (viii) adsorbents, as for example, kaolin and bentonite, and (ix) lubricants, as for example, talc, calcium stearate, magnesium stearate, solid polyethylene glycols, sodium lauryl sulfate, or mixtures thereof. In the case of capsules, tablets, and pills, the dosage forms may also comprise buffering agents. Solid compositions of a similar type may also be employed as fillers in soft and hard-filled gelatin capsules using such excipients as lactose or milk sugar as well as high molecular weight polyethyleneglycols, and the like. Solid dosage forms such as tablets, dragees, capsules, pills, and granules can be prepared with coatings and shells, such as enteric coatings and others known in the art.
Liquid dosage forms for oral administration include pharmaceutically acceptable emulsions, solutions, suspensions, syrups, and elixirs. In addition to the active compounds, the liquid dosage forms may contain inert diluents commonly used in the art, such as water or other solvents, solubilizing agents, and emulsifiers, such as for example, ethyl alcohol, isopropyl alcohol, ethyl carbonate, ethyl acetate, benzyl alcohol, benzyl benzoate, propyleneglycol, 1, 3-butyleneglycol, dimethylformamide, oils, in particular, cottonseed oil, groundnut oil, corn germ oil, olive oil, castor oil, sesame oil, glycerol, tetrahydrofurfuryl alcohol, polyethyleneglycols, and fatty acid esters of sorbitan, or mixtures of these substances, and the like. Besides such inert diluents, the composition can also include additional agents, such as wetting, emulsifying, suspending, sweetening, flavoring, or perfuming agents.
Materials, compositions, and components disclosed herein can be used for, can be used in conjunction with, can be used in preparation for, or are products of the disclosed methods and compositions. It is understood that when combinations, subsets, interactions, groups, etc. of these materials are disclosed that while specific reference of each various individual and  collective combinations and permutations of these compounds may not be explicitly disclosed, each is specifically contemplated and described herein. For example, if a method is disclosed and discussed and a number of modifications that can be made to a number of molecules including in the method are discussed, each and every combination and permutation of the method, and the modifications that are possible are specifically contemplated unless specifically indicated to the contrary. Likewise, any subset or combination of these is also specifically contemplated and disclosed. This concept applies to all aspects of this disclosure including, but not limited to, steps in methods using the disclosed compositions. Thus, if there are a variety of additional steps that can be performed, it is understood that each of these additional steps can be performed with any specific method steps or combination of method steps of the disclosed methods, and that each such combination or subset of combinations is specifically contemplated and should be considered disclosed.
The following examples are meant to be illustrative of the practice of the invention and not limiting in any way.
Examples
Abbreviations

Representative methods of prep-HPLC: Flow rate and gradient may change.
Exemplary methods for prep-HPLC are provided below.
Method A: NH4HCO3: Column: Gilson2-Xbridge C18 19*150 mm, 5 μm; mobile phase: CH3CN in water (0.1%NH4HCO3) from 20%to 60%, Flow rate: 15 mL/min.
Method B: TFA: Column: Waters-Xbridge C18 10*190 mm, 5 μm; mobile phase: CH3CN in water (0.1%TFA) from 15%to 40%, Flow rate: 15 mL/min.
Method C: HCOOH: Column: Waters-Xbridge C18 10*190 mm, 5 μm; mobile phase: CH3CN in water (0.1%formic acid) from 15%to 40%, Flow rate: 15 mL/min.
Method D: HCOOH: Column: WatersPrep C18 OBDTM (5 micron, 19*150 mm) ; mobile phase: CH3CN in water (0.1%formic acid) from 18%to 38%, Flow rate: 20 mL/min.
Method E: NH4HCO3: Column: WatersPrep C18 OBDTM (5 micron, 19*150 mm) ; mobile phase: CH3CN in water (10 mM NH4HCO3) from 20%to 60%, Flow rate: 20 mL/min.
Representative method of chiral prep-HPLC:
Method F: Gilson 281, Daicel Chiralpak IE, 10 μm, 30*250 mm; Mobile phase: Hexane/EtOH/Diethylamine = 70/30/0.3, Flow rate: 25 mL/min.
Method G: Gilson 281, Daicel Chiralpak IG, 10 μm, 30*250 mm; Mobile phase: Hexane/EtOH = 70/30, Flow rate: 25 mL/min.
Method H: Gilson 281, Daicel Chiralpak IB N, 10 μm, 30*250 mm; Mobile phase: Hexane/IPA/Diethylamine = 80/20/0.3, Flow rate: 30 mL/min.
Method I: Gilson 281, Daicel Chiralpak IA, 10 μm, 30*250 mm; Mobile phase: Hexane/EtOH/Diethylamine = 30/70/0.3, Flow rate: 25 mL/min.
Representative methods of analytical-HPLC
Method 1: Analysis was performed on an Agilent 1200_series HPLC-6120MS. UHPLC Long Gradient Equivalent 5%to 95%acetonitrile in water (containing 0.02%NH4OAc) run time of 6.5 minutes with a flow rate of 1.5 mL/min. A Waters Xbridge C18 column (18.5 micron, 4.6*50 mm) was used at a temperature of 40 ℃.
Method 2: Analysis was performed on an Agilent 1200_series HPLC-6120MS. UHPLC Long Gradient Equivalent 5%to 95%acetonitrile in water (containing 0.1%trifluoroacetic acid) run time of 6.5 minutes with a flow rate of 1.5 mL/min. A Waters Xbridge C18 column (18.5 micron, 4.6*50 mm) was used at a temperature of 40 ℃.
Method 3: Analysis was performed on an Agilent 1260_series HPLC-6120MS. UHPLC Long Gradient Equivalent 5%to 95%acetonitrile in water (containing 0.02%NH4OAc) run time of 2.5 minutes with a flow rate of 0.5 mL/min. A Diamonsil Plus C18 column (18.5 micron, 4.6*30 mm) was used at a temperature of 40 ℃.
Method 4: Analysis was performed on an Agilent 1260_series HPLC-6125C MS. HPLC Long Gradient Equivalent 20%to 100%acetonitrile in water (containing 0.1%FA) run time of 6 minutes with a flow rate of 0.8 mL/min. Agilent ZORBAX SB-C18 column (1.8 micron, 2.1*50 mm) was used at a temperature of 30 ℃.
Method 5: Analysis was performed on a SHIMADZU 20A HPLC. HPLC Long Gradient Equivalent Hexane/EtOH/DEA (70/30/0.2) run time of 20 minutes with a flow rate of 1 mL/min. CHIRALPAK IE (5 μm, 4.6*250 mm) was used at a temperature of 30 ℃.
Method 6: Analysis was performed on a SHIMADZU 20A HPLC. HPLC Long Gradient Equivalent Hexane/EtOH/DEA (30/70/0.2) run time of 30 minutes with a flow rate of 1 mL/min. CHIRALPAK IA (5 μm, 4.6*250 mm) was used at a temperature of 30 ℃.
Method 7: Analysis was performed on a SHIMADZU 20A HPLC. HPLC Long Gradient Equivalent Hexane/IPA/DEA (80/20/0.2) run time of 30 minutes with a flow rate of 1 mL/min. CHIRALPAK IB N-5 (5 μm, 4.6*250 mm) was used at a temperature of 30 ℃.
Method 8: Analysis was performed on a SHIMADZU 20A HPLC. HPLC Long Gradient Equivalent Hexane/EtOH (70/30) run time of 30 minutes with a flow rate of 1 mL/min. CHIRALPAK IG (5 μm, 4.6*250 mm) was used at a temperature of 30 ℃.
Intermediate A
Step 1. Methyl 4-chloro-6- (cyclopropanecarboxamido) nicotinate (A2)
A mixture of A1 (2.0 g, 9.71 mmol) , cyclopropanecarboxamide (826 mg, 9.71 mmol) , Pd (OAc) 2 (109 mg, 0.49 mmol) , dppf (538 mg, 0.97 mmol) , K3PO4 (4.12 g, 19.42 mmol) in dioxane (30 mL) was stirred at 90 ℃ for 4 h under N2. The mixture was diluted with H2O (100 mL) , extracted with EtOAc (30 mL*3) , washed with brine (30 mL) , dried over Na2SO4, concentrated and purified by flash chromagraphy (PE/EA = 10/1 to 1/1) to get compound A2 (1.8 g, 73%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 3.33 min, m/z (M+H) + = 255.0.
Step 2. Lithium 4-chloro-6- (cyclopropanecarboxamido) nicotinate (A3)
To a solution of A2 (500 mg, 1.96 mmol) in a co-solvent of MeOH (2 mL) , THF (2 mL) and water (1 mL) was added LiOH. H2O (165 mg, 3.93 mmol) . Then the mixture was stirred at r.t. overnight. The mixture was concentrated to dryness to give compound A3 (480 mg, 99%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 3.81 min, m/z (M+H) + = 241.1.
Step 3.4-Chloro-6- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d3) nicotinamide (Int. A) 
To a solution of A3 (480 mg, 1.95 mmol) in DCM (15 mL) was sequentially added methan-d3-amine hydrochloride (275 mg, 3.89 mmol) , DIPEA (1.51 g, 11.68 mmol) and T3P (1.86 g, 2.92 mmol, 50%in EtOAc) at 0 ℃. The resulting mixture was stirred at r. t. overnight. The mixture was diluted with H2O (30 mL) and extracted with DCM (30 mL*3) . The organic layer was washed with brine (50 mL) , dried over Na2SO4 and filtered. The filtrate was  concentrated to dryness to give Int. A (300 mg, 60%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.25 min, m/z (M+H) + = 257.1.
Intermediate B
Step 1. Methyl 4-chloro-6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) nicotinate (B1)
A mixture of A1 (1.0 g, 4.85 mmol) , (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamide (751 mg, 7.28 mmol) , K3PO4 (2.04 g, 9.67 mmol) , dppf (269 mg, 0.49 mmol) and Pd (OAc) 2 (109 mg, 0.49 mmol) in dioxane (8 mL) was stirred at 90 ℃ for 12 h under N2. After cooling to r.t., the mixture was filtered and the filtrate was concentrated. The residue was purified by flash chromatography on silica gel (DCM/MeOH = 30/1) to afford B1 (220 mg, 17%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.16 min, m/z (M+H) + = 273.6.
Step 2. 4-Chloro-6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) nicotinic acid (B2)
To a solution of B1 (900 mg, 3.30 mmol) in MeOH/THF/H2O (15 mL, v/v/v = 2/2/1) was added LiOH. 2H2O (990 mg, 16.50 mmol) and stirred at 25 ℃ for 12 h. The reaction mixture was concentrated to dryness and acidified with 1 N HCl to pH = 2. The formed solid was filtered and the filter cake was dried to afford B2 (700 mg, 82%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.00 min, m/z (M+H) + = 258.9.
Step 3. 4-Chloro-6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -N- (methyl-d3) nicotinamide (Int. B)
A mixture of B2 (700 mg, 2.71 mmol) , DIPEA (2.10 g, 16.24 mmol, 2.83 mL) , T3P (1.72 g, 5.41 mmol, 3.45 mL, 50%wt. in DMF) and methan-d3-amine hydrochloride (379 mg, 5.41 mmol) in DMF (4 mL) was stirred at 30 ℃ for 48 h. The mixture was diluted with H2O (10 mL) , extracted with DCM (10*3 mL) . The organic layer was washed with brine (2 mL) , dried over Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography on silical gel (DCM/MeOH = 20/1) to afford Int. B (500 mg, 67%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.24 (s, 1H) , 8.43 (s, 1H) , 8.29 (s, 1H) , 8.19 (s, 1H) , 5.04-4.86 (m,  1H) , 2.49-2.40 (m, 1H) , 1.69-1.62 (m, 1H) , 1.24-1.18 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.91 min, m/z (M+H) + = 275.0.
Intermediate C
Step 1. 4-Chloro-6- (cyclopropanecarboxamido) -N-methylnicotinamide (Int. C)
A mixture of A3 (338 mg, 1.37 mmol) , DIPEA (1.06 g, 8.23 mmol) , methylamine hydrochloride (184 mg, 2.75 mmol) and T3P (1.75 g, 2.74 mmol, 50%wt. in DMF) in DMF (2 mL) was stirred at 50 ℃ for 24 h. The reaction mixture was poured into water (5 mL) and extracted with EtOAc (20 mL*3) . The separated organic layer was washed with water (5 mL) and concentrated under reduced pressure. The residue was purified by flash chromatography on silica gel (DCM/MeOH = 10/1) to afford Int. C (120 mg, 34%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.19 (s, 1H) , 8.46 (s, 1H) , 8.37 (s, 1H) , 8.19 (s, 1H) , 2.75 (d, J = 5.2 Hz, 3H) , 2.02-1.99 (m, 1H) , 0.85-0.82 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.94 min, m/z (M+H) + = 254.2.
Intermediate D
Step 1. Methyl 6-chloro-4- ( (4-methoxybenzyl) amino) nicotinate (D1)
To a solution of A1 (5 g, 24.27 mmol) in ACN (8 mL) was added (4-methoxyphenyl) methanamine (3.33 g, 24.27 mmol, 3.2 mL) and TEA (4.91 g, 48.54 mmol, 6.8 mL) . Then the mixture was stirred at r. t. for 24 h. The mixture was diluted with H2O (100 mL) , extracted with EA (50 mL*3) , washed with brine, dried over Na2SO4, concentrated and purified by flash chromtography (PE/EA = 20/1 to 5/1) to get compound D1 (6.5 g, 87%yield) as an off- white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 4.18 min, m/z (M+H) + = 307.1.
Step 2. Methyl 6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxybenzyl) amino) nicotinate (D2) 
A mixture of D1 (2 g, 6.52 mmol) , cyclopropanecarboxamide (1.11 g, 13.04 mmol) , XantPhos (754 mg, 1.30 mmol) , Pd2 (dba) 3 (597 mg, 0.65 mmol) , Cs2CO3 (5.31 g, 16.30 mmol) in 1, 4-dioxane (30 mL) was stirred at 110 ℃ for 2 h. Then the mixture was diluted with H2O (100 mL) , extracted with EA (60 mL*3) , washed with brine, dried over Na2SO4 and concentrated to get compound D2 (2.3 g, 99%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method4) tR = 2.91 min, m/z (M+H) + = 356.2.
Step 3. Methyl 4-amino-6- (cyclopropanecarboxamido) nicotinate 2, 2, 2-trifluoroacetate (Int. D)
A solution of D2 (2.1 g, 5.91 mmol) in TFA (10 mL) was stirred at 80 ℃ for 16 h. Then the mixture was concentrated and diluted with EA (10 mL) , filtered and wash with EA (5 mL*2) . Then the solid was dried to get compound Int. D (1.8 g, 87%yield, TFA salt) as an off-white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.28 min, m/z (M+H) + = 236.2.
Intermediate E
Step 1. 2, 4-Dichloro-N- (methyl-d3) pyrimidine-5-carboxamide (Int. E)
To a mixture of methan-d3-amine hydrochloride (1.40 g, 19.86 mmol) in DCM (200 mL) was added E1 (3.5 g, 16.55 mmol) slowly followed by TEA (1.68 g, 16.55 mmol, 2.31 mL) at -78 ℃. After stirring for 1 h at this temperature, the reaction was quenched with water (30 mL) . The organic layer was separated and concentrated. The residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 5/1) to afford Int. E (1.38 g, 35%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.88 (s, 1H) , 8.85 (s, 1H) . LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.80 min, m/z (M+H) + = 208.9.
Intermediate F
Step 1. Methyl 4-chloro-6- ( (5-fluoropyridin-2-yl) amino) nicotinate (F1)
A mixture of A1 (2.0 g, 9.71 mmol) , 5-fluoropyridin-2-amine (1.31 g, 11.65 mmol) , K3PO4 (4.12 g, 19.42 mmol) , DPPF (807 mg, 1.46 mmol) and Pd (OAc) 2 (327 mg, 1.46 mmol) in anhydrous dioxane (20 mL) was stirred at 90 ℃ for 12 h. After cooling to r. t., the mixture was filtered and the filtrate was concentrated. The residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 7/1) to afford F1 (2.0 g, 73%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.11 min, m/z (M+H) + = 282.4.
Step 2. 4-Chloro-6- ( (5-fluoropyridin-2-yl) amino) nicotinic acid (F2)
To a solution of F1 (2.0 g, 7.10 mmol) in MeOH/THF/H2O (20 mL, v/v/v = 2/2/1) was added LiOH. H2O (1.49 g, 35.50 mmol) . After stirring at r. t. for 12 h, the reaction mixture was concentrated to dryness and acidified with 1 N HCl to pH = 2. The formed solid was collected by filtering and the filter cake was dried to give compound F2 (1.8 g, 95%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.88 min, m/z (M+H) + = 268.2.
Step 3. 4-Chloro-6- ( (5-fluoropyridin-2-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (Int. F) 
A mixture of F2 (400 mg, 1.50 mmol) , methan-d3-amine hydrochloride (529 mg, 7.50 mmol) and DIPEA (1.16 g, 9.00 mmol) in T3P (2 mL, 50%wt in DMF) was stirred at 50 ℃ for 16 h. After cooling to r. t., the reaction mixture was poured into water (10 mL) and the formed solid was collected by filtering. The filter cake was slurried with MeOH (5 mL) for 30 min. The solid was filtered and dried to afford Int. F (380 mg, 90%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.10 min, m/z (M+H) + = 284.1.
Example 1
Step 1. 3-Iodo-4-methoxy-1-methyl-1H-indole (1b)
To a solution of 1a (2.78 g, 10.18 mmol) in DMF (15 mL) was added KOH (2.28 g, 40.72 mmol) and CH3I (4.34 g, 30.54 mmol) at 0 ℃. The mixture was stirred at r. t. for 1 h. The reaction mixture was poured into ice-water (50 mL) and the formed solid was filtered. The solid was dried to give compound 1b (2.8 g, 96%yield) as a brown solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.37 (s, 1H) , 7.11-7.05 (m, 2H) , 6.55 (dd, J = 7.6, 1.2 Hz, 1H) , 3.84 (s, 3H) , 3.74 (s, 3H) .
Step 2. Tert-butyl (4-methoxy-1-methyl-1H-indol-3-yl) carbamate (1c)
A mixture of 1b (500 mg, 1.74 mmol) , K3PO4 (738 mg, 3.48 mmol) , BocNH2 (612 mg, 5.22 mmol) , CuI (100 mg, 0.52 mmol) and N, N-dimethylethane-1, 2-diamine (46 mg, 0.52 mmol) in toluene (5 mL) was stirred at 110 ℃ overnight. The mixture was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 4/1) to give compound 1c (240 mg, 50%yield) as a white solid. 1H NMR (300 MHz, DMSO-d6) δ 7.76 (s, 1H) , 7.34 (s, 1H) , 7.10-6.97 (m, 2H) , 6.52 (d, J = 10.4 Hz, 1H) , 3.90 (s, 3H) , 3.71 (s, 3H) , 1.50 (s, 9H) .
Step 3. 4-Methoxy-1-methyl-1H-indol-3-amine hydrochloride (1d)
To a solution of 1c (300 mg, 1.09 mmol) in EtOAc (2 mL) was added HCl/EA (2 mL, 6 M) at r.t. The mixture was stirred at r. t. overnight. The formed solid was filtered and the filter cake was dried to give compound 1d (158 mg, 68%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9.99 (brs, 3H) , 7.37 (s, 1H) , 7.17 (t, J = 8.0 Hz, 1H) , 7.09 (d, J = 8.4 Hz, 1H) , 6.64  (d, J = 8.0 Hz, 1H) , 3.94 (s, 3H) , 3.76 (s, 3H) .
Step 4. Methyl 6-chloro-4- ( (4-methoxy-1-methyl-1H-indol-3-yl) amino) pyridazine-3-carboxylate (1e)
A mixture of 1d (90 mg, 0.42 mmol) , methyl 4, 6-dichloropyridazine-3-carboxylate (88 mg, 0.42 mmol) and DIPEA (273 mg, 2.12 mmol) in DMF (1 mL) was stirred at 80 ℃ for 10 h. The reaction was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 4/1) to give compounc 1e (80 mg, 55%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.45 min, m/z (M+H) + = 347.1.
Step 5. Methyl 6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-1-methyl-1H-indol-3-yl) amino) pyridazine-3-carboxylate (1f)
A mixture of 1e (98 mg, 0.28 mmol) , cyclopropanecarboxamide (48 mg, 0.57 mmol) , Cs2CO3 (276 mg, 0.85 mmol) , BrettPhos (26 mg, 0.028 mmol) and BrettPhos Pd G3 (15 mg, 28 mmol) in anhydrous 1, 4-dioxane (1 mL) was stirred at 80 ℃ for 6 h. The mixture was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (DCM/MeOH =20/1) to give compound 1f (65 mg, 58%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR =0.49 min, m/z (M+H) + = 396.2.
Step 6. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-1-methyl-1H-indol-3-yl) amino) -N-methylpyridazine-3-carboxamide (1)
A mixture of 1f (50 mg, 0.13 mmol) in methylamine (1.5 mL, 30%alcohol solution) was stirred at 80 ℃ for 48 h. The mixture was concentrated. The residue was purified by prep-HPLC (Method C) to give compound 1 (4 mg, 8%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.18 (s, 1H) , 11.02 (s, 1H) , 9.02-8.99 (m, 1H) , 7.98 (s, 1H) , 7.23 (s, 1H) , 7.12 (t, J = 8.0 Hz, 1H) , 7.04 (d, J = 8.0 Hz, 1H) , 6.53 (d, J = 7.6 Hz, 1H) , 3.81 (s, 3H) , 3.76 (s, 3H) , 2.86 (d, J = 4.8 Hz, 3H) , 2.10-2.06 (m, 1H) , 0.83-0.81 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.43 min, m/z (M+H) + = 395.2.
Example 2
Step 1. 5-Bromo-4-methoxy-1-methyl-1H-indole-3-carbaldehyde (2b)
A mixture of 2a (1.5 g, 6.3 mmol) and tBuOK (1.7 g, 15.6 mmol) in DMF (15 mL) was stirred for 10 min at 0 ℃. Then iodomethane (3.5 g, 24.9 mmol) was added to the reaction mixture. After stirring at r. t. for 18 h, the mixture was diluted with water (30 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic phase was washed with brine (40 mL) , concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/DCM = 1/1) to afford 2b (1.6 g, 96%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.12 (s, 1H) , 8.25 (s, 1H) , 7.48 (d, J = 8.8 Hz, 1H) , 7.36 (d, J = 8.8 Hz, 1H) , 3.88 (s, 3H) , 3.85 (s, 3H) .
Step 2. 5-Bromo-4-methoxy-1-methyl-1H-indole-3-carboxylic acid (2c)
A mixture of 2b (1.2 g, 4.5 mmol) and KMnO4 (1.4 g, 8.9 mmol) in acetone/H2O (80 mL, v/v = 1/1) was stirred at r. t. for 10 h. The mixture was filtered and the organic solvent was removed under reduced pressure. The aqueous layer was basified with 1 M NaOH to pH >10 and washed with EtOAc (20 mL) . The separated aqueous layer was acidified with 2 M HCl to pH = 5 and extracted with DCM/MeOH (40 mL*3, v/v = 10/1) . The combined organic phase was washed with brine (40 mL) , concentrated to afford the crude 2c (0.60 g, 50%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.11 min, m/z (79Br, M+H) + = 284.0.
Step 3. Tert-butyl (5-bromo-4-methoxy-1-methyl-1H-indol-3-yl) carbamate (2d) 
A mixture of 2c (417 mg, 1.5 mmol) , DPPA (444 mg, 1.6 mmol) , Et3N (444 mg, 4.40 mmol) in toluene (4 mL) was stirred at 110 ℃ for 1 h. Then tBuOH (217 mg, 2.9 mmol) was added into the mixture. After stirring at 110 ℃ for 12 h, the reaction mixture was cooled,  concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 20/1) to afford 2d (60 mg, 12%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.47 min, m/z (79Br, M+H) + = 355.2.
Step 4. 4- ( (5-Bromo-4-methoxy-1-methyl-1H-indol-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d3) nicotinamide hydrochloride (2e)
A mixture of 2d (55 mg, 0.15 mmol) , Int. A (40 mg, 0.14 mmol) , cat. conc. HCl in EtOH (1 mL) was stirred at 90 ℃ for 18 h. The reaction mixture was cooled, concentrated and purified by prep-TLC (DCM/MeOH = 30/1) to afford 2e (46 mg, 60%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.30 min, m/z (79Br, M+H) + = 475.3.
Step 5. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-1-methyl-5-vinyl-1H-indol-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (2f)
A mixture of 2e (56 mg, 0.11 mmol) , 4, 4, 5, 5-tetramethyl-2-vinyl-1, 3, 2-dioxaborolane (19 mg, 0.13 mmol) , CsF (48 mg, 0.315 mmol) and Pd (dppf) Cl2 (8 mg, 0.01 mmol) in dioxane/H2O (1.2 mL, v/v=3/1) was stirred at 150 ℃ for 5 h under microwave under N2. After cooling to r. t., the mixture was filtered and the residue was concentrated to afford the crude 2f (40 mg, 90%yield) as a black solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.26 min, m/z (M+H) + = 423.4.
Step 6. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (5-ethyl-4-methoxy-1-methyl-1H-indol-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (2)
A mixture of 2f (40 mg, 0.095 mmol) and Pd/C (4 mg, 0.036 mmol, wetted with ca. 50%water) in MeOH was stirred at r. t under H2 (0.1 MPa) for 5 h. The mixture was filtered and purified by prep-HPLC (Method A) to afford 2 (11.4 mg, 28%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.57 (s, 1H) , 10.33 (s, 1H) , 8.44-8.46 (m, 2H) , 7.74 (s, 1H) , 7.27 (s, 1H) , 7.16 (d, J = 8.4 Hz, 1H) , 7.02 (d, J = 8.4 Hz, 1H) , 3.74 (s, 3H) , 3.61 (s, 3H) , 2.63 (q, J = 7.6 Hz, 2H) , 1.97-1.91 (m, 1H) , 1.16 (t, J = 7.6 Hz, 3H) , 0.73-0.69 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.58 min, m/z (M+H) + = 425.2.
Example 3
Step 1. Tert-butyl (3-methoxypyridin-4-yl) carbamate (3b)
A solution of 3a (800 mg, 6.44 mmol) , Boc2O (1.83 g, 8.38 mmol, 1.9 mL) and DIPEA (1.67 g, 12.89 mmol, 2.24 mL) in DCM (15 mL) was stirred at 20 ℃ for 12 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was concentrated and purified by flash chromatography (EA in PE is 10-50%) to give compound 3b (1.45 g, yield given) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.92 min, m/z (M+H) + = 225.1.
Step 2. 1-Amino-4- ( (tert-butoxycarbonyl) amino) -3-methoxypyridin-1-ium 2, 4-dinitrophenolate (3c)
A mixture of 3b (1.45 g, 6.47 mmol) and O- (2, 4-dinitrophenyl) hydroxylamine (1.42 g, 7.11 mmol) in MeCN (50 mL) was stirred at 50 ℃ for 16 h. A yellow solution was formed. The reaction was concentrated to give 3c (2.73 g, crude) as a yellow solid, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.66 min, m/z M+= 240.1.
Step 3. Ethyl 5- ( (tert-butoxycarbonyl) amino) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (3d)
A mixture of ethyl propiolate (685 mg, 6.98 mmol, 0.71 mL) , 3c (1.29 g, 5.37 mmol)  and K2CO3 (1.48 g, 10.74 mmol) in DMF (15 mL) was stirred at 20 ℃ for 2 h. A black suspension was formed. The reaction mixture was concentrated in vacuo and diluted with water (50 mL) , then extracted with EtOAc (50 mL*2) . The combined organic layer was washed with water (50 mL*2) , brine (50 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 10-30%) to give 3d (428 mg, 22%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 4.16 min, m/z (M+H) + = 336.1.
Step 4. Ethyl 5-chloro-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (3e) 
To a mixture of 3d (330 mg, 0.98 mmol) in DCM (2 mL) was added HCl/dioxane (4 M, 2 mL) at 20 ℃. The resulting mixture was stirred at 20 ℃ for 1 h. A yellow solution was formed. The rection mixture was concentrated to give ethyl 5-amino-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (231 mg, HCl salt, crude) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.48 min, m/z (M+H) + = 236.1.
To a mixture of ethyl 5-amino-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (231 mg, HCl salt, crude) in MeCN (5 mL) , was added tert-butyl nitrite (152 mg, 1.47 mmol, 0.18 mL) at 0 ℃ and stirred for 10 min. Then CuCl (145.8 mg, 1.47 mmol) was added into the above mixture. The resulting mixture was stirred at 80 ℃ for 12 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was concentrated and purified by flash chromatograph (EA in PE is 10-30%) to give 3e (100 mg, 40%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.44 min, m/z (M+H) + = 255.2.
Step 5. 5-Chloro-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine (3f)
Heat a well-stirred solution of 3e (100 mg, 0.39 mmol) in 2 mL of 50%H2SO4 at 110℃ for 3 h. A yellow solution was formed. Cool down the solution to room temperature. Neutralize the solution with aq. NaOH (1.0 M) . Add 40 mL of water to the above solution. Extract the solution by EtOAc (30 mL*3) . Combine the organic layer. Dry the organic layer over anhydrous Na2SO4. Filter the organic layer through a pad of Celite. Evaporate the organic layer in vacuum to give 3f (33 mg, 46%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.20 (dd, J = 7.6 Hz, 1.2 Hz, 1H) , 7.92 (d, J = 2.4 Hz, 1H) , 6.72 (d, J = 7.6 Hz, 1H) , 6.63 (dd, J = 2.4 Hz, 1.2 Hz, 1H) , 4.06 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.46 min, m/z (M+H) + = 183.1.
Step 6. 5-Chloro-3-iodo-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine (3g)
A mixture of 3f (31 mg, 0.17 mmol) and NIS (38.2 mg, 0.17 mmol) in DMF (2 mL) was stirred at 20 ℃ for 12 h. A yellow suspension was formed. The reaction mixture was quenched with water (50 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with brine (40 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatograph (EA in PE is 10-30%) to give 3g (50 mg, 95%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 3.12 min, m/z (M+H) + = 308.9.
Step 7. Methyl 4- ( (5-chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) nicotinate (3h)
A mixture of 3g (50 mg, 0.16 mmol) , Int. D (68 mg, 0.19 mmol, TFA salt) , BrettPhos (17.4 mg, 0.032 mmol) , Cs2CO3 (132 mg, 0.41 mmol) and BrettPhos Pd G3 (14.7 mg, 0.016 mmol) in dioxane (1 mL) was degassed and purged with nitrogen for 3 times. The resulting mixture was stirred at 100 ℃ under N2 atmosphere for 24 h. A yellow suspension was formed. The reaction mixture was concentrated and purified by prep-TLC (PE/EA = 1/2) to give 3h (60 mg, 89%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.85 (s, 1H) , 9.58 (s, 1H) , 8.67 (s, 1H) , 8.54 (d, J = 7.2 Hz, 1 H) , 8.15 (s, 1H) , 7.64 (s, 1H) , 6.98 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 3.89 (s, 3H) , 3.77 (s, 3H) , 1.98-1.90 (m, 1H) , 0.78-0.70 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.42 min, m/z (M+H) + = 416.2.
Step 8. 4- ( (5-Chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) nicotinic acid (3i)
A mixture of 3h (60 mg, 0.144 mmol) and LiOH. H2O (18 mg, 0.433 mmol) in co-solvent of THF (3 mL) and water (1 mL) was stirred at 40 ℃ for 12 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was concentrated and dried in vacuo to give 3i (58 mg, crude) as a yellow solid, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.01 min, m/z (M+H) + = 402.2.
Step 9 4- ( (5-Chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d3) nicotinamide (3)
A mixture of CD3NH2. HCl (30.5 mg, 0.433 mmol) , 3i (58 mg, crude) , DIPEA (93.3 mg, 0.721 mmol, 0.13 mL) and T3P (275.6 mg, 0.433 mmol, 50%purity in EtOAc) in DMF (2  mL) was stirred at 20 ℃ for 12 h. A yellow solution was formed. The rection mixture was filtered and purified by Prep-HPLC (Method E) to give 3 (3.6 mg, 6%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.69 (s, 1H) , 10.35 (s, 1H) , 8.55 (s, 1H) , 8.51-8.43 (m, 2H) , 8.11 (s, 1H) , 7.65 (s, 1H) , 6.94 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 3.79 (s, 3H) , 1.98-1.90 (m, 1H) , 0.76-0.71 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.97 min, m/z (M+H) + = 418.2.
Example 4
Step 1. Methyl 5- ( (tert-butoxycarbonyl) amino) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (4a)
A mixture of methyl propiolate (749 mg, 8.91 mmol, 7.93 mL) , 3c (1.89 g, 4.45 mmol) and K2CO3 (1.23 g, 8.91 mmol) in DMF (5 mL) was stirred at 20 ℃ for 2 h. A black suspension was formed. The reaction mixture was concentrated and diluted with water (50 mL) , then extracted with EtOAc (50 mL*2) . The combined organic layer was washed with water (50 mL*2) , brine (50 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 10-30%) to give 4a (350 mg, 24%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.35 (s, 1H) , 8.28 (d, J = 7.6 Hz, 1H) , 8.01 (d, J =7.6 Hz, 1H) , 7.32 (brs, 1H) , 3.89 (s, 3H) , 3.88 (s, 3H) , 1.55 (s, 9H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR =4.13 min, m/z (M+H) + = 322.1.
Step 2. Methyl 5-chloro-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (4b) 
To a mixture of 4a (1.25 g, 3.89 mmol) in DCM (5 mL) , was added TFA (2 mL) at 20 ℃. The resulting mixture was stirred at 20 ℃ for 1 h. A yellow solution was formed. The rection mixture was concentrated to give methyl 5-amino-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (800 mg, TFA salt, crude) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.46 min, m/z (M+H) + = 222.1.
To a mixture of methyl 5-amino-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (800 mg, TFA salt, crude) in MeCN (10 mL) , was added tert-butyl nitrite (559 mg, 5.42 mmol, 0.65 mL) at 0 ℃, and stirred for 10 min. Then CuCl (716 mg, 7.23 mmol) was added into the above mixture, the resulting mixture was stirred at 80 ℃ for 2 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was concentrated and purified by flash chromatography (EA in PE is 10-30%) to give 4b (600 mg, 69%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.31 min, m/z (M+H) + = 241.2.
Step 3. 5-Chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylic acid (4c)
A mixture of 4b (300 mg, 1.25 mmol) and LiOH. H2O (157 mg, 3.74 mmol) in co-solvent of THF (6 mL) and water (2 mL) was stirred at 70 ℃ for 12 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was diluted with water (30 mL) and extracted with EtOAc (20 mL) . The aqueous layer was adjusted to pH = 3 with aq. HCl (2 M) and extracted with EtOAc (20 mL*3) . The organic layer was concentrated and dried in vacuo to give 4c (180 mg, 64%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.79 min, m/z (M+H) + = 227.0.
Step 4. Tert-butyl (5-chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) carbamate (4d)
A mixture of 4c (180 mg, 0.79 mmol) , N, N-diethylethanamine (161 mg, 1.59 mmol, 0.22 mL) and DPPA (284 mg, 1.03 mmol, 0.22 mL) in tBuOH (3 mL) was stirred at 110 ℃ for 6 h. A yellow suspension was formed. The reaction mixture was diluted with water (50 mL) and extracted with EtOAc (50 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (100 mL*3) , brine (100 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 5-30%) to give 4d (100 mg, 42%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.31 min, m/z (M+H) + = 298.1.
Step 5. 5-Chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-amine (4e)
To a mixture of 4d (100 mg, 0.34 mmol) in DCM (3 mL) was added TFA (1 mL) at 20 ℃. The resulting mixture was stirred at 20 ℃ for 1 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was quenched with sat. aq. NaHCO3 (50 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (60 mL*3) , brine (60 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 10-60%) to give 4e (40 mg, 60%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.65 min, m/z (M+H) + = 198.1.
Step 6. 2-Chloro-4- ( (5-chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) pyrimidine-5-carboxamide (4f)
To a mixture of 4e (40 mg, 0.20 mmol) and Int. E (42 mg, 0.20 mmol) in DCM (5 mL) , was added DIPEA (52 mg, 0.40 mmol, 0.07 mL) at 0 ℃. The resulting mixture was stirred at 20 ℃ for 12 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was quenched with water (50 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (60 mL*3) , brine (60 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated to give 4f (74 mg, 98%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.88 min, m/z (M+H) += 370.1.
Step 7. 2-Amino-4- ( (5-chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) pyrimidine-5-carboxamide (4g)
A mixture of 4f (20 mg, 0.054 mmol) and TsOH (19 mg, 0.11 mmol) in NH3/dioxane solution (3 mL, 0.4 M) was stirred at 80 ℃ for 72 h. A white suspension was formed. The reaction mixture was diluted with water (40 mL) and extracted with DCM (40 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (40 mL*3) , brine (40 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by prep-TLC (DCM/MeOH = 10/1) to give 4g (12 mg, 63%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.87 min, m/z (M+H) + = 351.2.
Step 8. 4- (N- (5-chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) cyclopropane carboxamido) -2- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d3) pyrimidine-5-carboxamide (4h)
A mixture of 4g (12 mg, 0.034 mmol) , cyclopropane carbonyl chloride (11 mg, 0.103  mmol) and DIPEA (17 mg, 0.171 mmol, 0.024 mL) in DCM (2 mL) was stirred at 20 ℃ for 12 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was concentrated and dried in vacuo to give 4h (16 mg, crude) as a yellow solid, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.94 min, m/z (M+H) + = 487.3.
Step 9. 4- ( (5-Chloro-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -2- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d3) pyrimidine-5-carboxamide (4)
A mixture of 4h (16 mg, crude) and K2CO3 (9 mg, 0.066 mmol) in MeOH (3 mL) was stirred at 20 ℃ for 12 h. A yellow solution was formed. The rection mixture was filtered and purified by prep-HPLC (Method D) further lyophilizate to give 4 (2.3 mg, 16.7%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.82 (s, 1H) , 10.98 (s, 1H) , 9.62 (s, 1H) , 8.72 (s, 1H) , 8.62 (s, 1H) , 8.39 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 6.83 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 4.09 (s, 3H) , 2.15-2.06 (m, 1H) , 0.93-0.80 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.17 min, m/z (M+H) + = 419.2.
Example 5
Step 1. 3-Methoxy-4-methylpyridine (5b)
To a mixture of 5a (2.50 g, 22.91 mmol) in DMF (20 mL) , was added NaH (1.37 g, 34.36 mmol, 60%in mineral oil) and CH3I (3.58 g, 25.20 mmol, 1.57 mL) at 0 ℃. The resulting mixture was stirred at 20 ℃ for 2 h. A black suspension was formed. The reaction mixture was diluted with water (100 mL) , then extracted with EtOAc (50 mL*2) . The combined organic layer was washed with water (50 mL*2) , brine (50 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 10-30%) to give 5b (230 mg, 8%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.15 (s, 1H) , 8.10 (d, J = 4.8 Hz, 1H) , 6.72 (m, 1H) , 3.90 (s, 3H) , 2.21 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.56 min, m/z (M+H) + = 124.0.
Step 2. 1-Amino-3-methoxy-4-methylpyridin-1-ium 2, 4-dinitrophenolate (5c)
A mixture of 5b (230 mg, 1.87 mmol) and O- (2, 4-dinitrophenyl) hydroxylamine (409 mg, 2.05 mmol) in MeCN (3 mL) was stirred at 50 ℃ for 16 h. A yellow solution was formed. The reaction was concentrated to give 5c (260 mg, crude) as a yellow solid, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.16 min, m/z M+= 140.1.
Step 3. Methyl 4-methoxy-5-methylpyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (5d)
A mixture of methyl propiolate (236 mg, 2.80 mmol, 0.25 mL) , 5c (260 mg, 1.87 mmol) and K2CO3 (516 mg, 3.74 mmol) in DMF (3 mL) was stirred at 20 ℃ for 2 h. A black suspension was formed. The reaction mixture was concentrated in vacuo and diluted with water (50 mL) , then extracted with EtOAc (50 mL*2) . The combined organic layer was washed with water (50 mL*2) , brine (50 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 10-30%) to give 5d (140 mg, 34%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.60 min, m/z (M+H) + = 221.0.
Step 4. 4-Methoxy-5-methylpyrazolo [1, 5-a] pyridine (5e)
A well-stirred solution of 5d (140 mg, 0.636 mmol) in 2 mL of 50%H2SO4 was heated at 110℃ for 3 h. A yellow solution was formed. Cool down the solution to room temperature. Neutralize the solution with aq. NaOH (1.0 M) using litmus paper as the indicator. Add 40 mL of water to the above solution. Extract the solution by EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was dried over anhydrous Na2SO4, filtered through a pad of celite and evaporated to give 5e (50 mg, 48%yield) as a light-yellow solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ8.18 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 7.87 (d, J = 2.4 Hz, 1H) , 6.54 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 6.51 (d, J = 2.4 Hz, 1H) , 3.95 (s, 3H) , 2.28 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.29 min, m/z (M+H) + = 163.1.
Step 5. 3-Iodo-4-methoxy-5-methylpyrazolo [1, 5-a] pyridine (5f)
A mixture of 5e (50 mg, 0.308 mmol) and NIS (73 mg, 0.324 mmol) in DMF (1 mL) was stirred at 20 ℃ for 24 h. A yellow suspension was formed. The reaction mixture was quenched with water (50 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer  was washed with brine (40 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 10-30%) to give 5f (70 mg, 79%yield) as a yellow solid. LCMS (ESI, Method 4) tR = 2.93 min, m/z (M+H) + = 289.0. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.20 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 7.85 (s, 1H) , 6.59 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 3.88 (s, 3H) , 2.32 (s, 3H) .
Step 6. Methyl 6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5-methylpyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) nicotinate (5g)
A mixture of 5f (70 mg, 0.243 mmol) , Int. D (102 mg, 0.29 mmol, TFA salt) , BrettPhos (26 mg, 0.049 mmol) , Cs2CO3 (198 mg, 0.607 mmol) and BrettPhos Pd G3 (22 mg, 0.024 mmol) in dioxane (3 mL) was degassed and purged with nitrogen for 3 times. The resulting mixture was stirred at 100 ℃ under N2 atmosphere for 72 h. A yellow suspension was formed. The reaction mixture was concentrated and purified by prep-TLC (DCM/MeOH = 10/1) to give 5g (60 mg, 62%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.18 min, m/z (M+H) + = 396.3.
Step 7. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5-methylpyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) nicotinic acid (5h)
A mixture of 5g (60 mg, 0.152 mmol) and LiOH. H2O (19 mg, 0.455 mmol) in THF (3 mL) and water (1 mL) was stirred at 40 ℃ for 12 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was concentrated and dried in vacuo to give 5h (58 mg, crude) as a yellow solid, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.78 min, m/z (M+H) + = 382.2.
Step 8. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5-methylpyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (5)
A mixture of CD3NH2. HCl (32 mg, 0.456 mmol) , 5h (58 mg, crude) , DIPEA (118 mg, 0.912 mmol, 0.158 mL) and T3P (290 mg, 0.456 mmol, 50%purity in EtOAc) in DMF (2 mL) was stirred at 20 ℃ for 12 h. A yellow solution was formed. The rection mixture was filtered and purified by prep-HPLC (Method D) to give 5 (5.2 mg, 9%yield) as a light-yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.65 (s, 1H) , 10.28 (s, 1H) , 8.51 (s, 1H) , 8.48 (s, 1H) , 8.35 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 7.99 (s, 1H) , 7.64 (s, 1H) , 6.73 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 3.66 (s, 3H) , 2.22 (s, 3H) ,  1.98-1.90 (m, 1H) , 0.74-0.70 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.82 min, m/z (M+H) + =398.3.
Example 6
Step 1. 1-Amino-3-methoxy-4- (methoxycarbonyl) pyridin-1-ium 2, 4-dinitrophenolate (6b) 
A mixture of 6a (6.8 g, 40.68 mmol) and O- (2, 4-dinitrophenyl) hydroxylamine (9.72 g, 48.82 mmol) in ACN (60 mL) was stirred at 50 ℃ overnight. The mixture was concentrated to afford 6b (14.9 g, crude) as a yellow solid, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.46 min, m/z M+ = 183.0.
Step 2. Dimethyl 4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine-3, 5-dicarboxylate (6c)
A mixture of 6b (14.9 g, 40.68 mmol) , methyl prop-2-ynoate (3.53 g, 42.03 mmol) and K2CO3 (10.56 g, 76.43 mmol) in DMF (60 mL) was stirred at 30 ℃ for 2 h. The reaction mixture was poured into ice-water (200 mL) and extracted with EtOAc (200 mL*2) . The combined organic phase was washed with brine (100 mL*2) and concentrated. The residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EtOAc = 5/1) to afford 6c (6.62 g, 62%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.10 min, m/z (M+H) + = 265.2.
Step 3. 4-Methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine-5-carboxylic acid (6d)
A mixture of 6c (7 g, 26.49 mmol) in aq. H2SO4 (130 mL, 50%wt in water) was stirred at 85 ℃ for 4 h. After cooling to r. t., the mixture was diluted with water (200 mL) , neutralized with aq. NaOH (1 N) to pH = 3. The mixture was extracted with EtOAc (200 mL*3) . The compound orgainc layer was washed with brine (100 mL) and concentrated to afford 6d (4.4 g, 86%yield) as a brown solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.94 min, m/z (M+H) + = 193.1.
Step 4. Methyl 4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine-5-carboxylate (6e)
To a solution of 6d (4.4 g, 22.90 mmol) in MeOH (250 mL) was added conc. HCl (3.75 mL, 46 mmol) . After stirring for 18 h at 80 ℃, the mixture was concentrated and the residue was diluted with DCM (20 mL) . The solution was washed with sat. NaHCO3 (20 mL) and the aqeous layer was extracted with DCM (20 mL*2) . The combined organic layer was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 4/1) to afford 6e (2.76 g, 58%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.14 min, m/z (M+H) + = 207.1.
Step 5. Methyl 4-methoxy-3-nitropyrazolo [1, 5-a] pyridine-5-carboxylate (6f)
To a solution of 6e (500 mg, 2.42 mmol) in TFA (5 mL) was added KNO3 (245 mg, 2.42 mmol) at r.t. and the mixture was stirred at 35 ℃ for 3 h. The solvent was removed by pumping through N2. The mixture was basified with sat. Na2CO3 to pH > 8 and extracted with EtOAc (5 mL*3) . The organic layer was concentrated and purified by flash chromatography (PE/EA = 3/1) to afford the crude product. The crude product was triturated with EtOAc (3 mL) . The formed soid was filtered and dried to afford 6f (300 mg, 49%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.06 min, m/z (M+H) + = 252.2.
Step 6. Methyl 3-amino-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine-5-carboxylate hydrochloride (6g)
To a solution of 6f (200 mg, 0.79 mmol) in conc. HCl (4 mL) was added SnCl2·2H2O (359 mg, 1.59 mmol) at 0 ℃ and the mixture was stirred at 0 ℃ for 2 h. The formed soild was filtered and dried to afford 6g (150 mg, 73%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.53 min, m/z (M+H) + = 222.0.
Step 7. Methyl 3- ( (2- (cyclopropanecarboxamido) -5- ( (methyl-d3) carbamoyl) pyridin-4-yl) amino) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine-5-carboxylate (6)
To a solution of 6g (150 mg, 0.58 mmol) and Int. A (149 mg, 0.58 mmol) in dioxane (2 mL) was added TsOH. H2O (22 mg, 0.12 mmol) and stirred at 100 ℃ for 12 h. The reaction mixture was concentrated and purified by flash chromatography on silical gel (DCM/MeOH =10/1) to afford 6 (110 mg, 43%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.76 (s, 1H) , 10.68 (s, 1H) , 8.56 (s, 1H) , 8.51 (s, 1H) , 8.44 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.18 (s, 1H) , 7.87 (s,  1H) , 7.07 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 3.87 (s, 3H) , 3.87 (s, 3H) , 2.03-1.92 (m, 1H) , 0.80-0.70 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.05 min, m/z (M+H) + = 442.1.
Example 7
Step 1. (4-Methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) methanol (7a)
To a solution of 6e (1.3 g, 6.30 mmol) in THF (15 mL) was added LiAlH4 (455 mg, 11.98 mmol) at 0 ℃. After stirring at 0 ℃ for 1 h, the reaction was quenched with aqueous solution of seignette salt (10 mL) and extracted with EtOAc (15 mL*2) . The combined organic layer was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 2/1) to afford 7a (1.07 g, 95%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR =0.94 min, m/z (M+H) + = 179.0.
Step 2. 4-Methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine-5-carbaldehyde (7b)
To a solution of 7a (1.0 g, 5.62 mmol) in EtOAc (10 mL) was added MnO2 (2.92 g, 33.68 mmol) at r.t. After stirring for 4 h at 80 ℃, the mixture was filtered and the filtrate was concentrated to afford 7b (800 mg, 81%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR =1.02 min, m/z (M+H) + = 177.3.
Step 3. 2, 2, 2-Trifluoro-1- (4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) ethan-1-ol (7c)
To a solution of 7b (620 mg, 3.52 mmol) and trimethyl (trifluoromethyl) silane (1.10 g, 7.74 mmol) in THF (10 mL) was added TBAF (0.2 mL, 0.2 mmol, 1.0 M in THF) at 0 ℃. The mixture was stirred at 0 ℃ for 1 h and at 25 ℃ for 16 h. Then 1 M HCl solution was added and the reaction was stirred at 25 ℃ for 2 h. The mixture was adjusted to pH = 8 with aq. NaOH (1 M) . The mixture was extracted with EtOAc (5 mL*3) . The organic layer was concentrated and the residue was purified by flash chromatography (PE/EA = 3/1) to afford 7c (834 mg, 96% yield) as a yellow oil. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.52 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 8.04 (d, J = 2.4 Hz, 1H) , 6.97-6.88 (m, 3H) , 5.48-5.45 (m, 1H) , 4.03 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.09 min, m/z (M+H) + = 247.2.
Step 4. 2, 2, 2-Trifluoro-1- (4-methoxy-3-nitropyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) ethan-1-ol (7d)
A mixture of 7c (210 mg, 0.85 mmol) and KNO3 (95 mg, 0.94 mmol) in TFA (3 mL) was stirred at 30 ℃ for 2 h. The solvent was removed with pumping through N2. The residue was dissolved in EtOAc (5 mL) and basified with sat. Na2CO3 solution (10 mL) to pH = 9. The mixture was extracted with EtOAc (10 mL*2) . The combined organic phase was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (DCM/MeOH = 19/1) to afford 7d (150 mg, 60%yield) as a brown solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.96 (s, 1H) , 8.86 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 7.35 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 7.31 (d, J = 6.0 Hz, 1H) , 5.62-5.55 (m, 1H) , 3.80 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.12 min, m/z (M+H) + = 292.1.
Step 5. 1- (3-Amino-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) -2, 2, 2-trifluoroethan-1-ol hydrochloride (7e)
To a mixture of 7d (200 mg, 0.69 mmol) in conc. HCl (4 mL) was added SnCl2·2H2O (620 mg, 2.75 mmol) at 0 ℃. After stirring at 10 ℃ for 1 h, the reaction mixture was filtered. The filter cake was dried under vacuum to afford 7e (150 mg, 66%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.85 min, m/z (M+H) + = 262.0.
Step 6. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (7)
A mixture of 7e (193 mg, 0.59 mmol) , Int. A (151 mg, 0.59 mmol) and TsOH. H2O (45 mg, 0.24 mmol) in 1, 4-dioxane (3 mL) was stirred at 100 ℃ for 16 h in a sealed tube. The reaction mixture was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (DCM/MeOH = 9/1) to afford the crude product. The crude product was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 7 (250 mg, 88%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.68 (s, 1H) , 10.36 (s, 1H) , 8.55 (s, 1H) , 8.51-8.49 (m, 2H) , 8.11 (s, 1H) , 7.68 (s, 1H) , 7.02 (d, J = 5.6 Hz, 1H) , 6.90 (d, J = 7.6 Hz, 1H) , 5.43-5.36 (m, 1H) , 3.72 (s, 3H) , 1.99-1.90 (m, 1H) , 0.76-0.67 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 3.15 min, m/z (M+H) + = 482.0.
Step 7. (S) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (7A) and (R) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (7B)
Compound 7 (520 mg, 1.08 mmol) was separated by chiral prep-HPLC (Method F) to obtain 7A (204.2 mg, 39%yield) as a white solid and 7B (206.1 mg, 40%yield) as a white solid.
7A: 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.67 (s, 1H) , 10.36 (s, 1H) , 8.54 (s, 1H) , 8.51-8.49 (m, 2H) , 8.11 (s, 1H) , 7.68 (s, 1H) , 7.01 (d, J = 5.6 Hz, 1H) , 6.90 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.45-5.32 (m, 1H) , 3.72 (s, 3H) , 1.97-1.90 (m, 1H) , 0.74-0.71 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR =2.39 min, m/z (M+H) + = 482.1. HPLC (Method 5) tR = 10.03 min. The chirality of 7A was identified by microcrystal electron diffraction method with L-tartaric acid as ligand.
7B: 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.67 (s, 1H) , 10.36 (s, 1H) , 8.54 (s, 1H) , 8.51-8.49 (m, 2H) , 8.11 (s, 1H) , 7.68 (s, 1H) , 7.01 (d, J = 6.0 Hz, 1H) , 6.89 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.41-5.30 (m, 1H) , 3.72 (s, 3H) , 1.97-1.90 (m, 1H) , 0.74-0.71 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR =2.40 min, m/z (M+H) + = 482.1. HPLC (Method 5) tR = 12.27 min.
Example 8
Step 1. 1- (3- ( (2- (Cyclopropanecarboxamido) -5- ( (methyl-d3) carbamoyl) pyridin-4-yl) amino) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) -2, 2, 2-trifluoroethyl methanesulfonate (8a)
To a solution of 7 (80 mg, 0.17 mmol) and TEA (100 mg, 1.00 mmol, 0.14 mL) in DCM (1 mL) was added MsCl (29 mg, 0.50 mmol) at 0 ℃. Then the mixture was stirred at 14 ℃ for 30 min. The reaction was quenched with ice-water (3 mL) , extracted with DCM (5 mL*3) . The combined organic layer was dried over Na2SO4, filtered and the filtrate was concentrated to afford 8a (90 mg, crude) as a yellow oil, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.12 min, m/z (M+H) + = 560.2.
Step 2. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoroethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (8)
To a solution of 8a (90 mg, 0.16 mmol) in EtOH (1 mL) was added NaBH4 (9 mg, 0.24 mmol) at 0 ℃, then the mixture was stirred at 15 ℃ for 18 h. The reaction mixture was quenched with ice-water (3 mL) and extracted with EtOAc (5 mL*2) . The combined organic layer was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 8 (3.5 mg, 5%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.68 (s, 1H) , 10.35 (s, 1H) , 8.55 (s, 1H) , 8.51-8.48 (m, 2H) , 8.10 (s, 1H) , 7.69 (s, 1H) , 6.83 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 3.71 (s, 3H) , 3.74-3.65 (m, 2H) , 1.96-1.93 (m, 1H) , 0.75-0.72 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.91 min, m/z (M+H) + = 466.1.
Example 9
Step 1. Methyl 5-bromo-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (9a)
To a mixture of 4a (2.20 g, 6.85 mmol) in DCM (10 mL) , was added TFA (10 mL) at 20 ℃. The resulting mixture was stirred at 20 ℃ for 1 h. A yellow solution was formed. The rection mixture was concentrated to give methyl 5-amino-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (1.51 g, TFA salt, crude) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.38 min, m/z (M+H) + = 222.1.
To a mixture of methyl 5-amino-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (1.51 mg, TFA salt, crude) in MeCN (10 mL) , was added tert-butyl nitrite (1.06 g, 10.24 mmol, 1.22 mL) at 0 ℃, and stirred for 10 min. Then CuBr (1.96 g, 13.65 mmol) was added into the  above mixture, the resulting mixture was stirred at 80 ℃ for 2 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was concentrated and purified by flash chromatography (EA in PE is 10-30%) to give 9a (300 mg, 15%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.53 min, m/z (79Br, M+H) + = 285.0.
Step 2. Methyl 4-methoxy-5- (3, 3, 3-trifluoroprop-1-en-2-yl) pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (9b)
A mixture of 9a (80 mg, 0.281 mmol) , 4, 4, 6-trimethyl-2- (3, 3, 3-trifluoroprop-1-en-2-yl) -1, 3, 2-dioxaborinane (86 mg, 0.365 mmol) , Na2CO3 (89 mg, 0.842 mmol) and Pd (dppf) Cl2 (46 mg, 0.056 mmol) in dioxane (2 mL) and water (0.2 mL) was degassed and purged with nitrogen for 3 times. The resulting mixture was stirred at 100 ℃ under N2 atmosphere for 1 h. A yellow suspension was formed. The reaction mixture was diluted with water (30 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (50 mL*3) , brine (50 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 0-20%) to give 9b (84 mg, 99%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.91 min, m/z (M+H) + = 301.1.
Step 3. Methyl 4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (9c)
To a solution of 9b (84 mg, 0.28 mmol) in MeOH (5 mL) , was added Pd/C (8 mg, 10%wt%, 10%Pd (dry basis) , wetted with 55%H2O) . The reaction mixture was degassed and purged with hydrogen for 3 times. The resulting mixture was stirred at 40 ℃ under H2 atmosphere for 24 h. A black suspension was formed. The reaction mixture was filtered and concentrated to give 9c (80 mg, 99%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.93 min, m/z (M+H) + = 303.2.
Step 4. 4-Methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylic acid (9d)
A mixture of 9c (80 mg, 0.26 mmol) and LiOH. H2O (89 mg, 2.12 mmol) in co-solvent of THF (3 mL) and water (1 mL) was stirred at 70 ℃ for 24 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was diluted with water (30 mL) , extracted with EtOAc (20 mL) and the organic layer was discarded. The aqueous layer was adjusted to pH = 3 with aq. HCl (2  M) , then extracted with EtOAc (20 mL*3) . The organic layer was concentrated and dried in vacuo to give 9d (76 mg, 99%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.35 min, m/z (M+H) + = 289.1.
Step 5. Tert-butyl (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) carbamate (9e)
A mixture of 9d (80 mg, 0.28 mmol) , N, N-diethylethanamine (56 mg, 0.56 mmol, 0.08 mL) and DPPA (99 mg, 0.36 mmol, 0.08 mL) in tBuOH (1 mL) was stirred at 110 ℃ for 6 h.A yellow suspension was formed. The reaction mixture was diluted with water (30 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (50 mL*3) , brine (50 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 5-30%) to give 9e (20 mg, 20%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 3.20 min, m/z (M+H) + = 360.2.
Step 6. 4-Methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-amine (9f)
To a mixture of 9e (20 mg, 0.056 mmol) in DCM (3 mL) , was added TFA (1 mL) at 20 ℃. The resulting mixture was stirred at 20 ℃ for 1 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was quenched with sat. aq. NaHCO3 (50 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (60 mL*3) , brine (60 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 10-60%) to give 9f (12 mg, 83%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.87 min, m/z (M+H) + = 260.2.
Step 7. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (9)
A mixture of 9f (10 mg, 0.039 mmol) , Int. A (10 mg, 0.039 mmol) and TsOH (7 mg, 0.041 mmol) in dioxane (1 mL) was stirred at 100 ℃ for 2 h. A yellow solution was formed. The rection mixture was filtered and purified by prep-HPLC (Method E) to give 9 (3.7 mg, 20%yield) as an off-white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.68 (s, 1H) , 10.36 (s, 1H) , 8.55 (s, 1H) , 8.52-8.49 (m, 2H) , 8.10 (s, 1H) , 7.69 (s, 1H) , 6.86 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 4.16-4.07 (m, 1H) , 3.68 (s, 3H) , 1.98-1.90 (m, 1H) , 1.44 (d, J = 7.2 Hz, 3H) , 0.74-0.70 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.27 min, m/z (M+H) + = 480.3.
Step 8. (R*) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (9A) and (S*) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (9B)
Compound 9 (24 mg, 0.05 mmol) was separated by chiral prep-HPLC (Method I) to obtain 9A (9.5 mg, 40%yield) as a white solid and 9B (9.1 mg, 38%yield) as a white solid.
9A: LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.26 min, m/z (M+H) + = 480.2. HPLC (Method 6) tR = 6.42 min.
9B: LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.27 min, m/z (M+H) + = 480.3. HPLC (Method 6) tR = 11.56 min.
Example 10
Step 1. 5-Bromo-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine (10a)
Heat a well-stirred solution of 9a (285 mg, 1.00 mmol) in 5 mL of 50%H2SO4 at 110℃ for 3 h. A yellow solution was formed. Cool down the solution to room temperature. Neutralize the solution with aq. NaOH (1.0 M) using litmus paper as the indicator. Add 40 mL of water to the above solution. Extract the solution by EtOAc (30 mL*3) . Combine the organic layer. Dry the organic layer over anhydrous Na2SO4. Filter the organic layer through a pad of celite. Evaporate the solvent in vacuum to give 10a (220 mg, 97%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.15 (dd, J = 7.2 Hz, 1.2 Hz, 1H) , 7.91 (d, J = 2.4 Hz, 1H) , 6.84 (d, J = 7.6 Hz, 1H) , 6.63 (dd, J = 2.4 Hz, 0.8 Hz, 1H) , 4.05 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.54 min, m/z (79Br, M+H) + = 227.0.
Step 2. 5-Bromo-4-methoxy-3-nitro-pyrazolo [1, 5-a] pyridine (10b)
A mixture of 10a (100 mg, 0.44 mmol) and KNO3 (40 mg, 0.40 mmol) in TFA (3 mL) was stirred at 30 ℃ for 2 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was diluted with EtOAc (30 mL) , quenched with aq. NaHCO3 (50 mL) , separated and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (50 mL*3) , brine (50 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 5-30%) to give 10b (100 mg, 83%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.53 min, m/z (79Br, M+H) + = 272.0.
Step 3. 4-Methoxy-3-nitro-5- (trifluoromethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridine (10c)
A mixture of 10b (80 mg, 0.29 mmol) , CuI (67 mg, 0.35 mmol) and MDFA (85 mg, 0.44 mmol) in DMF (1 mL) was stirred at 100 ℃ for 12 h. A yellow suspension was formed. The reaction mixture was diluted with water (30 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (50 mL*3) , brine (50 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 5-30%) to give 10c (60 mg, 78%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.74 (s, 1H) , 8.47 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 7.26 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 4.01 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.75 min, m/z (M+H) + = 262.1.
Step 4. 4-Methoxy-5- (trifluoromethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-amine (10d)
To a solution of 10c (60 mg, 0.23 mmol) in MeOH (5 mL) , was added Pd/C (6 mg, 10%wt%, 10%Pd (dry basis) , wetted with 55%H2O) . The equipment was degassed and purged with hydrogen for 3 times. The resulting mixture was stirred at 40 ℃ under H2 atmosphere for 24 h. A black suspension was formed. The reaction mixture was filtered and concentrated to give 10d (27 mg, 51%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.92 min, m/z (M+H) + =232.1.
Step 5. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (trifluoromethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (10)
A mixture of 10d (27 mg, 0.12 mmol) , Int. A (29 mg, 0.12 mmol) and TsOH (24 mg, 0.14 mmol) in dioxane (1 mL) was stirred at 100 ℃ for 2 h. A yellow solution was formed. The rection mixture was filtered and purified by flash chromatography (MeOH in DCM is 0-10%)  and further triturated with MeCN to give 10 (9.7 mg, 18%yield) as an off-white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.74 (s, 1H) , 10.48 (s, 1H) , 8.63-8.59 (m, 2H) , 8.52 (s, 1H) , 8.25 (s, 1H) , 7.73 (s, 1H) , 7.01 (d, J = 7.6 Hz, 1H) , 3.81 (s, 3H) , 1.98-1.90 (m, 1H) , 0.76-0.71 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.15 min, m/z (M+H) + = 452.3.
Example 11
Step 1. 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (trifluoromethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (11)
A mixture of 10d (16 mg, 0.068 mmol) , Int. B (15 mg, 0.055 mmol) and TsOH (14 mg, 0.082 mmol) in dioxane (1 mL) was stirred at 100 ℃ for 6 h. A yellow suspension was formed. The reaction mixture was diluted with aq. NaHCO3 (30 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (60 mL*2) , brine (60 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (MeOH in DCM is 0-10%) and recrystallized in MeCN to give 11 (17.4 mg, 66%yield) as a light-yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.74 (s, 1H) , 10.46 (s, 1H) , 8.59-8.55 (m, 2H) , 8.49 (s, 1H) , 8.23 (s, 1H) , 7.69 (s, 1H) , 6.97 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 4.93-4.72 (m, 1H) , 3.78 (s, 3H) , 2.14-2.06 (m, 1H) , 1.56-1.43 (m, 1H) , 1.11-1.02 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.22 min, m/z (M+H) + = 470.2.
Example 12
Step 1. 1-Amino-4-cyano-3-methoxypyridin-1-ium 2, 4-dinitrophenolate (12b)
A mixture of 12a (500 mg, 3.73 mmol) and O- (2, 4-dinitrophenyl) hydroxylamine (816 mg, 4.10 mmol) in MeCN (10 mL) was stirred at 50 ℃ for 16 h. A yellow solution was formed. The reaction was concentrated to give 12b (559 mg, crude) as a yellow solid, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.64 min, m/z M+ = 150.1.
Step 2. Methyl 5-cyano-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (12c)
A mixture of methyl propiolate (626 mg, 7.45 mmol, 0.66 mL) , 12b (559 mg, 3.72 mmol) and K2CO3 (1.03 g, 7.45 mmol) in DMF (10 mL) was stirred at 20 ℃ for 2 h. A black suspension was formed. The reaction mixture was concentrated in vacuo and diluted with water (50 mL) , then extracted with EtOAc (50 mL*2) . The combined organic layer was washed with water (50 mL*2) , brine (50 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 10-30%) to give 12c (400 mg, 46%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.45 (s, 1H) , 8.32 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 6.94 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 4.29 (s, 3H) , 3.92 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.18 min, m/z (M+H) + = 232.1.
Step 3. 4-Methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine-5-carbonitrile (12d)
Heat a well-stirred solution of 12c (50 mg, 0.216 mmol) in 1 mL of 50%H2SO4 at 100℃ for 1 h. A brown solution was formed. Cool down the solution to room temperature.  Neutralize the solution with aq. NaOH (1.0 M) using litmus paper as the indicator. Add 40 mL of water to the above solution. Extract the solution by EtOAc (30 mL*3) . Combine the organic layer. Dry the organic layer over anhydrous Na2SO4. Filter the organic layer through a pad of celite. Evaporate the organic layer in vacuum to give 12d (20 mg, 53%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.18 (dd, J = 7.2 Hz, 0.8 Hz, 1H) , 7.98 (d, J = 2.4 Hz, 1H) , 6.88 (dd, J = 2.4 Hz, 0.8 Hz, 1H) , 6.72 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 4.40 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.07 min, m/z (M+H) + = 174.2.
Step 4. 4-Methoxy-3-nitro-pyrazolo [1, 5-a] pyridine-5-carbonitrile (12e)
A mixture of 12d (20 mg, 0.115 mmol) in TFA (1 mL) was added KNO3 (11 mg, 0.11 mmol) at 20 ℃. The resulting mixture was stirred at 30 ℃ for 2 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was quenched with aq. NaHCO3 (50 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with brine (40 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 10-30%) to give 12e (20 mg, 79%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.19 min, m/z (M+H) + = 219.1.
Step 5. 3-Amino-4-methoxy-pyrazolo [1, 5-a] pyridine-5-carbonitrile (12f)
A mixture of 12e (20 mg, 0.092 mmol) and Pd/C (5 mg, 10%Pd (dry basis) , wetted with 55%H2O) in MeOH (3 mL) was degassed and purged with hydrogen for 3 times. The resulting mixture was stirred at 40 ℃ under H2 atmosphere for 12 h. A black suspension was formed. The reaction mixture was filtered and concentrated to give 12f (12 mg, 70%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.62 min, m/z (M+H) + = 189.1. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 7.83 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 7.50 (s, 1H) , 6.40 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 4.41 (s, 3H) .
Step 6. 4- ( (5-Cyano-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d3) nicotinamide (12)
A mixture of 12f (12 mg, 0.064 mmol) , Int. A (13 mg, 0.051 mmol) and TsOH (13 mg, 0.076 mmol) in dioxane (2 mL) was stirred at 100 ℃ for 6 h. A yellow suspension was formed. The reaction mixture was diluted with aq. NaHCO3 (30 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (60 mL*2) , brine (50 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash  chromatography (MeOH in DCM is 0-10%) and recrystallized in MeOH to give 12 (9.0 mg, 34%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.89 (s, 1H) , 10.81 (s, 1H) , 8.58 (s, 1H) , 8.52 (s, 1H) , 8.41 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.20 (s, 1H) , 7.94 (s, 1H) , 6.94 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 4.25 (s, 3H) , 2.01-1.94 (m, 1H) , 0.80-0.77 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.87 min, m/z (M+H) + = 409.3.
Example 13
Step 1. 4- ( (5-Cyano-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -N- (methyl-d3) nicotinamide (13)
A mixture of 12f (18 mg, 0.096 mmol) , Int. B (21 mg, 0.076 mmol) and TsOH (20 mg, 0.115 mmol) in dioxane (2 mL) was stirred at 100 ℃ for 6 h. A yellow suspension was formed. The reaction mixture was diluted with aq. NaHCO3 (30 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (60 mL*2) , brine (100 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (MeOH in DCM is 0-10%) and recrystallized in MeCN to give 13 (23.4 mg, 72%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.90 (s, 1H) , 10.85 (s, 1H) , 8.60 (s, 1H) , 8.53 (s, 1H) , 8.42 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.22 (s, 1H) , 7.94 (s, 1H) , 6.95 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.00-4.79 (m, 1H) , 4.25 (s, 3H) , 2.22-2.14 (m, 1H) , 1.66-1.55 (m, 1H) , 1.18-1.09 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.85 min, m/z (M+H) + = 427.2.
Example 14
Step 1. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-3- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) amino) -N-methylnicotinamide (14)
A solution of 7e (150 mg, 0.46 mmol) , Int. C (116 mg, 0.46 mmol) and TsOH. H2O (38 mg, 0.20 mmol) in dioxane (3 mL) was stirred at 100 ℃ for 16 h. After cooling to r.t., the mixture was concentrated and the residue was purified by chromatography column on silica gel (DCM/MeOH = 20/1) to afford 14 (136 mg, 62%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.08 min, m/z (M+H) + = 479.2.
Step 2. (S) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-3- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) amino) -N-methylnicotinamide (14A) and (R) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-3- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) amino) -N-methylnicotinamide (14B) 
Compound 14 (136 mg, 0.28 mmol) was separated by chiral prep-HPLC (Method F) to afford 14A (43 mg, 32%yield) as a white solid and 14B (39 mg, 29%yield) as a white solid.
14A: 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.66 (s, 1H) , 10.34 (s, 1H) , 7.56 (d, J = 4.4 Hz, 1H) , 8.51-8.49 (m, 2H) , 8.11 (s, 1H) , 7.68 (s, 1H) , 7.02 (d, J = 5.6 Hz, 1H) , 6.89 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.41-5.37 (m, 1H) , 3.72 (s, 3H) , 2.80 (d, J = 4.4 Hz, 3H) , 1.94-1.92 (m, 1H) , 0.73-0.71 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.39 min, m/z (M+H) + = 479.2. HPLC (Method 5) tR =8.98 min.
14B: 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.66 (s, 1H) , 10.35 (s, 1H) , 7.56 (d, J = 4.4 Hz, 1H) , 8.51-8.49 (m, 2H) , 8.11 (s, 1H) , 7.68 (s, 1H) , 7.03 (d, J = 5.6 Hz, 1H) , 6.90 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.41-5.38 (m, 1H) , 3.72 (s, 3H) , 2.80 (d, J = 4.4 Hz, 3H) , 1.95-1.92 (m, 1H) , 0.74-0.72 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.39 min, m/z (M+H) + = 479.2. HPLC (Method 5) tR =10.89 min.
Example 15
Step 1. 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (15)
A mixture of 7e (252 mg, 0.77 mmol) , Int. B (210 mg, 0.77 mmol) and TsOH. H2O (58 mg, 0.31 mmol) in 1, 4-dioxane (2 mL) was stirred at 100 ℃ for 12 h. After cooling to r.t., the mixture was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 15 (170 mg, 45%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.06 min, m/z (M+H) + =500.2.
Step 2. 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- ( (S) -2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (15A) and 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- ( (R) -2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (15B)
Compound 15 (170 mg, 0.34 mmol) was separated by chiral prep-HPLC (Method F) to afford 15A (66 mg, 17%yield) as a white solid and 15B (73 mg, 19%yield) as a white solid.
15A: 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.71 (s, 1H) , 10.37 (s, 1H) , 8.55 (s, 1H) , 8.52-8.50 (m, 2H) , 8.13 (s, 1H) , 7.68 (s, 1H) , 7.04 (d, J = 5.6 Hz, 1H) , 6.91 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.42-5.38 (m, 1H) , 4.96-4.75 (m, 1H) , 3.73 (s, 3H) , 2.16-2.12 (m, 1H) , 1.58-1.51 (m, 1H) , 1.12-1.06 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.36 min, m/z (M+H) + = 500.2. HPLC (Method 5) tR = 9.59 min.
15B: 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.71 (s, 1H) , 10.38 (s, 1H) , 8.55 (s, 1H) , 8.52-8.50 (m, 2H) , 8.12 (s, 1H) , 7.69 (s, 1H) , 7.01 (d, J = 5.6 Hz, 1H) , 6.90 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.42-5.38 (m, 1H) , 4.96-4.76 (m, 1H) , 3.72 (s, 3H) , 2.17-2.10 (m, 1H) , 1.57-1.49 (m, 1H) , 1.13-1.05 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.34 min, m/z (M+H) + = 500.2. HPLC (Method 5) tR = 11.56 min.
Example 16
Step 1. 4-Methoxy-5- (methoxymethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridine (16a)
To a solution of 7a (200 mg, 1.12 mmol) in THF (2 mL) was added NaH (67 mg, 1.68 mmol, 60%purity in mineral oil) at 0 ℃, then the mixture was stirred at 0 ℃ for 30 min. Iodomethane (191 mg, 1.35 mmol) was added into the mixture and stirred at r. t. for 5 h. The mixture was diluted with H2O (30 mL) , extracted with EtOAc (15 mL*3) , washed with brine (20 mL) , dried over Na2SO4 and concnetrated to get compound 16a (181 mg, 84%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.08 min, m/z (M+H) + = 193.1.
Step 2. 4-Methoxy-5- (methoxymethyl) -3-nitropyrazolo [1, 5-a] pyridine (16b)
To a solution of 16a (180 mg, 0.94 mmol) in TFA (2 mL) was added KNO3 (95 mg, 0.94 mmol) at 0 ℃, then the mixture was stirred at r. t. for 4 h. The mixture was diluted with H2O (20 mL) , extracted with EtOAc (10 mL*3) . The combined organic layer was washed with aq. Na2CO3 and brine, dried over Na2SO4 and concentrated to get compound 16b (150 mg, 67%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.16 min, m/z (M+H) + = 238.1.
Step 3. 4-Methoxy-5- (methoxymethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-amine (16c)
To a solution of 16b (150 mg, 0.63 mmol) in EtOH (3 mL) and H2O (1 mL) was added Fe powder (177 mg, 3.16 mmol) and NH4Cl (169 mg, 3.16 mmol) . Then the mixture was stirred at 80 ℃ for 2 h. The mixture was filtered and the filter cake was washed with EtOAc (10 mL) . The filtrate was concentrated and diluted with H2O (10 mL) , extracted with EtOAc (10 mL*3) , washed with brine (10 mL) , dried over Na2SO4, concentrated and purified by flash chromatography (DCM/MeOH = 50/1 to 5/1) to get compound 16c (75 mg, 57%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.44 min, m/z (M+H) + = 208.1.
Step 4. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (methoxymethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (16)
A mixture of 16c (20 mg, 0.96 mmol) , Int. A (25 mg, 0.096 mmol) and pTSA (17 mg, 0.096 mmol) in dioxane (1 mL) was stirred at 100 ℃ for 2 h. then the mixture was concentrated and purified by prep-HPLC (Method E) to get compound 16 (11.4 mg, 28%yield) as a pale-yellow solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 10.34 (s, 1H) , 8.38 (s, 1H) , 8.31 (s, 1H) , 8.16 (d, J =6.8 Hz, 1H) , 8.05 (s, 1H) , 7.87 (s, 1H) , 6.77 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 6.39 (s, 1H) , 4.51 (s, 2H) , 3.80 (s, 3H) , 3.39 (s, 3H) , 1.52-1.47 (m, 1H) , 1.05-1.01 (m, 2H) , 0.89-82 (m, 2H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.72 min, m/z (M+H) + = 428.4.
Example 17
Step 1. 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (methoxymethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (17)
A mixture of 16c (15 mg, 0.72 mmol) , Int. B (16 mg, 0.058 mmol) and pTSA (12 mg, 0.072 mmol) in dioxane (1 mL) was stirred at 100 ℃ for 2 h. Then the mixture was concentrated and purified by prep-HPLC (Method E) to get compound 17 (10.7 mg, 33%yield) as a pale-yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.68 (s, 1H) , 10.33 (s, 1H) , 8.51 (s, 1H) , 8.46 (s, 1H) , 8.39 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 8.03 (s, 1H) , 7.64 (s, 1H) , 6.79 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 4.92-4.72 (m, 1H) , 4.41 (s, 2H) , 3.67 (s, 3H) , 3.26 (s, 3H) , 2.11-2.08 (m, 1H) , 1.55-1.45 (m, 1H) , 1.08-1.03 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.68 min, m/z (M+H) + = 446.3.
Example 18
Step 1. 2- (4-Methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) acetonitrile (18a)
To a suspension of t-BuOK (127 mg, 1.14 mmol) in THF (2 mL) was added TosMIC (111 mg, 0.57 mmol) in THF (2 mL) at -60 ℃, then the mixture was stirred at -60 ℃ for 15 min. A solution of 7b (50 mg, 0.28 mmol) in THF (1 mL) was added into the mixture dropwise at -60 ℃ and stirred for another 1.5 h at -60 ℃. MeOH (5 mL) was added into the mixture and the mixture was stirred at 70 ℃ for 20 min. The mixture was then concentrated and diluted with H2O (20 mL) , extracted with EtOAc (10 mL*3) , wash with brine (15 mL) , dried over Na2SO4, concentrated and purified by flash chromatography (PE/EA = 10/1 to 1/2) to get compound 18a (10 mg, 19 %yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.82 min, m/z (M+H) + =188.1.
Step 2. 2- (4-Methoxy-3-nitropyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) acetonitrile (18b)
To a solution of 18a (10 mg, 0.053 mmol) in TFA (1 mL) was added KNO3 (5 mg, 0.053 mmol) at 0 ℃, then the mixture was stirred at r. t. for 4 h. The mixture was diluted with H2O (20 mL) , extracted with EtOAc (10 mL*3) . The combined organic layer was washed with aq. Na2CO3 and brine, dried over Na2SO4, concentrated to get compound 18b (10 mg, 81%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.94 min, m/z (M+H) + = 233.1.
Step 3. 2- (3-Amino-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) acetonitrile (18c)
To a solution of 18b (10 mg, 0.043 mmol) in EtOH (1 mL) and H2O (0.2 mL) was added Fe powder (12 mg, 0.22 mmol) and NH4Cl (12 mg, 0.22 mmol) . Then the mixture was stirred at 80 ℃ for 2 h. The mixture was filtered and the filter cake was washed with EtOAc (10 mL) . The filtrate was concentrated and diluted with H2O (10 mL) , extracted with EtOAc (10 mL*3) , washed with brine (10 mL) , dried over Na2SO4, concentrated to get compound 18c (5  mg, 57%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.45 min, m/z (M+H) + = 203.2.
Step 4. 4- ( (5- (Cyanomethyl) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d3) nicotinamide (18)
A solution of 18c (5 mg, 0.025 mmol) , Int. A (6 mg, 0.025 mmol) and pTSA (4 mg, 0.025 mmol) in dioxane (0.5 mL) was stirred at 100 ℃ for 2 h. Then the mixture was concentrated and purified by prep-HPLC (Method E) to get compound 18 (2 mg, 19%yield) as a pale-yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.64 (s, 1H) , 10.31 (s, 1H) , 8.51 (s, 1H) , 8.48-8.46 (m, 2H) , 8.06 (s, 1H) , 7.62 (s, 1H) , 6.83 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 3.98 (s, 2H) , 3.70 (s, 3H) , 1.93-1.87 (m, 1H) , 0.70-0.68 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.48 min, m/z (M+H) + =423.3.
Example 19
Step 1. (S) -2, 2, 2-trifluoro-1- (4-methoxy-3-nitropyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) ethan-1-ol (7d-A)
7d (5.9 g, 20 mmol) was separated by chiral prep-HPLC (Method G) to afford 7d-A(2.6 g, 44%yield) as a green solid.
1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.68 (s, 1H) , 8.42 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 7.33 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 5.70-7.67 (m, 1H) , 3.92 (s, 3H) . HPLC (Method 8) tR = 6.06 min.
Step 2. (S) -1- (3-amino-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) -2, 2, 2-trifluoroethan-1-ol hydrochloride (7e-A)
To a mixture of 7d-A (1.1 g, 3.78 mmol) in conc. HCl (15 mL) was added SnCl2·2H2O (1.7 g, 7.56 mmol) at 0 ℃. After stirring at 10 ℃ for 1 h, the reaction mixture was filtered. The filter cake was dried under vacuum to afford 7e-A (1 g, 89%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.81 min, m/z (M+H) + = 262.0.
Step 3. (S) -6-chloro-4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (19a)
A mixture of 7e-A (55 mg, 0.21 mmol) , 4, 6-dichloro-N- (methyl-d3) nicotinamide (48 mg, 0.23 mmol) and TsOH. H2O (16 mg, 0.084 mmol) in 1, 4-dioxane (0.3 mL) was stirred at 100 ℃ for 18 h. After cooling to r. t., the mixture was concentrated. And the residue was purified by flash chromatography on silica gel (DCM/MeOH = 19/1) to afford 19a (50 mg, 55%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.16 min, m/z (M+H) + = 433.0.
Step 4. (S) -6- (1-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (19)
A mixture of 19a (50.0 mg, 0.12 mmol) , 1-fluorocyclopropane-1-carboxamide (60.0 mg, 0.58 mmol) , Cs2CO3 (113 mg, 0.35 mmol) and Brettphos Pd G3 (21 mg, 0.023 mmol) in 1, 4-dioxane (0.5 mL) was stirred at 90 ℃ for 12 h under N2 atmosphere. The reaction mixture was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 19 (5.2 mg, 9%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.37 (s, 1H) , 9.97 (s, 1H) , 8.63 (s, 1H) , 8.61-8.51 (m, 2H) , 8.15 (s, 1H) , 7.61 (s, 1H) , 7.03 (d, J = 4.4 Hz, 1H) , 6.91 (d, J = 6.4 Hz, 1H) , 5.43-5.38 (m, 1H) , 3.73 (s, 3H) , 1.47-1.35 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.48 min, m/z (M+H) + = 500.1.
Example 20
Step 1. Methyl 4-methoxy-5- (2-oxopropyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridine-3-carboxylate (20a)
A mixture of 9a (500 mg, 1.7 mmol) , prop-1-en-2-yl acetate (263 mg, 2.6 mmol) , tri- o-tolylphosphine (32 mg, 0.105 mmol) , tributylmethoxystannane (844 mg, 2.6 mmol) in toluene (5 mL) was stirred at 100 ℃ for 15 min. To the mixture was added PdCl2 (9 mg, 0.052 mmol) and stirred at 100 ℃ for 3 h. The mixture was concentrated. The residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 3/1) to afford compound 20a (130 mg, 28%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.60 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.42 (s, 1H) , 6.96 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 3.96 (s, 2H) , 3.79 (s, 3H) , 3.68 (s, 3H) , 2.24 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 3) tR =1.36 min, m/z (M+H) + =263.1.
Step 2. 1- (4-Methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) propan-2-one (20b)
A mixture of 20a (270 mg, 1 mmol) in 50%H2SO4 (3 mL) was stirred at 85 ℃ for 4 h. After cooling down, the reaction mixture was diluted with ice-water (5 mL) , basified with 1 N NaOH to pH = 3. The mixture was extracted with EtOAc (5 mL*3) . The organic layer was washed with brine (5 mL) , dried over Na2SO4 and filtered. The filtrate was concentrated. The residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 3/1) to afford 20b (200 mg, 95%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.29 min, m/z (M+H) + =205.2.
Step 3. 1- (4-Methoxy-3-nitropyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) propan-2-one (20c)
To a solution of 20b (200 mg, 0.98 mmol) in TFA (2 mL) was added KNO3 (99 mg, 0.98 mmol) at 0 ℃. The mixture was stirred at 30 ℃ for 2 h. The solvent was removed by pumping through N2. The residue was dissolved in EtOAc (15 mL) and basified with sat. Na2CO3 to pH = 9. The mixture was extracted with EtOAc (20 mL*2) . The combined organic phase was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA= 3/1) to afford 20c (153 mg, 62%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR =1.34 min, m/z (M+H) + =250.1.
Step 4. 5- (2, 2-Difluoropropyl) -4-methoxy-3-nitropyrazolo [1, 5-a] pyridine (20d)
To a solution of 20c (110 mg, 0.44 mmol) in DCM (2 mL) was added DAST (355 mg, 2 mmol) at 0 ℃. Then the mixture was stirred at 25 ℃ for 10 h. The mixture was diluted with DCM (5 mL) , washed with sat. NaHCO3 (5 mL) . The organic layer was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 3/1) to afford 20d (84 mg, 70%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.55 min, m/z (M+H) + =272.2.
Step 5. 5- (2, 2-Difluoropropyl) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-amine (20e)
To a solution of 20d (74 mg, 0.27 mmol) , 4, 4'-Bipyridine (2 mg, 0.013 mmol) in DMF (1 mL) was added tetrahydroxydiboron (73 mg, 0.82 mmol) at 0 ℃. After stirred at 10 ℃for 10 min, the mixture was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 20e (50 mg, 75%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.42 min, m/z (M+H) + =242.2.
Step 6. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (5- (2, 2-difluoropropyl) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (20)
A mixture of 20e (40 mg, 0.16 mmol) , Int. A (46 mg, 0.18 mmol) , TsOH. H2O (15 mg, 0.08 mmol) in 1, 4-dioxane (1 mL) was stirred at 90 ℃ for 7 h. The mixture was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 20 (63 mg, 82%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.67 (s, 1H) , 10.31 (s, 1H) , 8.54 (s, 1H) , 8.49 (s, 1H) , 8.43 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.05 (s, 1H) , 7.65 (s, 1H) , 6.76 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 3.66 (s, 3H) , 3.26 (t, J = 16.4 Hz, 2H) , 1.94-1.91 (m, 1H) , 1.61 (t, J = 18.8 Hz, 3H) , 0.73-0.70 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.94 min, m/z (M+H) + = 462.1.
Example 21
Step 1. (S) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) -6- ( (1-methyl-1H-pyrazol-3-yl) amino) nicotinamide (21)
A mixture of 19a (44 mg, 0.10 mmol) , 1-methyl-1H-pyrazol-3-amine (49 mg, 0.51 mmol) , Cs2CO3 (66 mg, 0.20 mmol) and Brettphos Pd G3 (18 mg, 0.02 mmol) in 1, 4-dioxane (0.5 mL) was stirred at 90 ℃ for 12 h under N2 atmosphere. The reaction mixture was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 21 (23 mg, 47%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.38 (s, 1H) , 9.14 (s, 1H) , 8.51 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.40 (s, 1H) , 8.34 (s, 1H) , 8.22 (s, 1H) , 7.45 (s, 1H) , 7.03-7.01 (m, 2H) , 6.89 (d, J =6.8 Hz, 1H) , 6.08 (s, 1H) , 5.44-5.39 (m, 1H) , 3.77 (s, 3H) , 3.63 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 0.94 min, m/z (M+H) + = 494.1.
Example 22
Step 1. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (5- (hydroxymethyl) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (22)
To a solution of 6 (110 mg, 0.25 mmol) in THF (5 mL) was slowly added LiAlH4 (51 mg, 1.50 mmol) at 0 ℃ and the mixture was stirred at 0 ℃ for 2 h. The mixture was quenched with H2O (0.05 mL) , 15%aq. NaOH (0.05 mL) and H2O (0.1 mL) at 0 ℃ sequentially. Then the mixture was stirred at r. t. for 15 min, dried over Na2SO4 and filtered. The filtrate was concentrated and purified by flash chromatography on silica gel (DCM/MeOH = 8/1) to afford 22 (70 mg, 68%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.64 (s, 1H) , 11.31 (s, 1H) , 8.50 (s, 1H) , 8.48 (s, 1H) , 8.42 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.02 (s, 1H) , 7.66 (s, 1H) , 6.91 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.29-5.26 (m, 1H) , 4.53 (d, J = 6.0 Hz, 2H) , 3.69 (s, 3H) , 1.97-1.91 (m, 1H) , 0.73-0.72 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.73 min, m/z (M+H) + = 414.0.
Example 23
Step 1. 1- (4-Methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) ethan-1-ol (23a)
To a stirred solution of 7b (755 mg, 4.29 mmol) in anhydrous DCM (10 mL) was added methylmagnesium bromide (2.89 mL, 8.67mmol, 3 M in Et2O) dropwise at 0 ℃. Then the reaction mixture was stirred at 0 ℃ for 0.5 h. Then it was quenched with sat. NH4Cl (5 mL) and extracted with DCM (10 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (15 mL) , brine (10 mL) and dried over anhydrous Na2SO4. After filtration, the filtrate was concentrated under vacuum and the residue was purified by flash chromatography (MeOH/DCM = 3/100) to afford compound 23a (787 mg, 96%yield) as a light-yellow oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR =1.49 min, m/z (M+H) + = 193.1.
Step 2. 1- (4-Methoxy-3-nitropyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) ethan-1-ol (23b)
To a stirred solution of 23a (740 mg, 3.85 mmol) in TFA (7 mL) was added KNO3 (385 mg, 3.77 mmol) at 0 ℃. Then it was stirred at 25 ℃ for 0.5 h. The solvent was evaporated under reduced pressure to give a residue, which was purified by flash chromatography (PE/EA =2/1) to give compound 23b (830 mg, 91%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR =1.75 min, m/z (M+H) + = 238.0.
Step 3. 1- (3-Amino-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) ethan-1-ol hydrochloride (23c)
To a suspension of 23b (830 mg, 3.50 mmol) in conc. HCl (10 mL) was added  SnCl2. H2O (3.28 g, 12.83 mmol) at 0 ℃. Then it was stirred at 25 ℃ for 0.5 h. After filtration, the solid was dried under vacuum to give 23c (802 mg, 94%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.34 min, m/z (M+H) + = 208.2.
Step 4. 5- (1- ( (Tert-butyldiphenylsilyl) oxy) ethyl) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-amine (23d)
To a solution of 23c (710 mg, 2.91 mmol) , imidazole (992 mg, 14.57 mmol) , DMAP (36 mg, 0.29 mmol) in THF (10 mL) was added tert-butylchlorodiphenylsilane (1.04 g, 3.79 mmol) . Then the mixture was stirred at 50 ℃ for 2 h. The mixture was diluted with H2O (20 mL) , extracted with EtOAc (15 mL*3) , washed with brine (20 mL) , dried over Na2SO4, filtered, concentrated and purified by flash chromatography (DCM/MeOH = 100/1 to 10/1) to get compound 23d (70 mg, 5.4%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 4.10 min, m/z (M+H) + = 446.3.
Step 5. 4- ( (5- (1- ( (Tert-butyldiphenylsilyl) oxy) ethyl) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -6- (cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d3) nicotinamide (23e)
A mixture of 23d (60 mg, 0.13 mmol) , Int. A (21 mg, 0.081 mmol) , pTSA (23 mg, 0.13 mmol) in dioxane (1 mL) was stirred at 70 ℃ for 6 h. The mixture was diluted with H2O (10 mL) , extracted with EtOAc (10 mL*3) , washed with brine (20 mL) , dried over Na2SO4, filtered, concentrated and purified by flash chromatography (DCM/MeOH = 100/1 to 20/1) to get compound 23e (20 mg, 22%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 3.87 min, m/z (M+H) + = 666.5.
Step 6. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (5- (1-hydroxyethyl) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (23)
Compound 23e (20 mg, 0.03 mmol) was dissolved in TBAF solution (1 M in THF, 0.5 mL) , then the mixture was stirred at r. t. for 2 h. The mixture was diluted with H2O (10 mL) , extracted with EtOAc (10 mL*3) , washed with aq. NH4Cl (10 mL) and brine (10 mL) , dried over Na2SO4, concentrated and purified by flash chromatography (DCM/MeOH = 50/1 to 10/1) to get the crude product. Then the crude was purified by prep-HPLC (Method E) to get compound 23 (4.0 mg, 35%yield) as a pale-yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.66 (s, 1H) , 10.29 (s, 1H) , 8.52 (s, 1H) , 8.48 (s, 1H) , 8.43 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.02 (s, 1H) , 7.66 (s, 1H) , 6.93  (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.26 (d, J = 4.4 Hz, 1H) , 5.10-5.04 (m, 1H) , 3.68 (s, 3H) , 1.96-1.90 (m, 1H) , 1.31 (d, J = 6.4 Hz, 3H) , 0.74-0.71 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.00 min, m/z (M+H) += 428.3.
Example 24
Step 1. (S) -6- ( (5-fluoropyridin-2-yl) amino) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (24)
A mixture of 7e-A (35 mg, 0.12 mmol) , Int. F (33 mg, 0.12 mmol) and TsOH. H2O (2 mg, 0.012 mmol) in NMP (0.1 mL) and 1, 4-dioxane (0.3 mL) was stirred at 100 ℃ for 12 h. After cooling to r.t., the mixture was concentrated. And the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 24 (14 mg, 23%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ10.34 (s, 1H) , 9.64 (s, 1H) , 8.52 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.47-8.44 (m, 2H) , 8.20 (s, 1H) , 8.00 (s, 1H) , 7.82-7.79 (m, 1H) , 7.62-7.58 (m, 1H) , 7.17 (s, 1H) , 7.04 (d, J = 5.2 Hz, 1H) , 6.91 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.43-5.39 (m, 1H) , 3.77 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.87 min, m/z (M+H) + =509.0.
Example 25
Step 1. (S) -6- ( (2, 6-Dimethylpyrimidin-4-yl) amino) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (25)
To a mixture of 19a (50 mg, 0.11 mmol) and 2, 6-dimethylpyrimidin-4-amine (28 mg, 0.23 mmol) in dioxane (2 mL) was added BrettPhos Pd G3 (41 mg, 0.05 mmol) and Cs2CO3 (75 mg, 0.23 mmol) . The mixture was stirred at 100 ℃ for 3 h under N2 atmosphere. The mixture was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 25 (7.3 mg, 12%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.36 (s, 1H) , 9.90 (s, 1H) , 8.54-8.49 (m, 3H) , 8.24 (s, 1H) , 7.73 (s, 1H) , 7.06-7.02 (m, 2H) , 6.90 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 5.42-5.39 (m, 1H) , 3.76 (s, 3H) , 2.25 (s, 3H) , 2.19 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 0.88 min, m/z (M+H) + = 520.2.
Example 26
Step 1. Methyl (S) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) nicotinate (26)
A mixture of 7e-A (30 mg, 0.10 mmol) , A2 (23 mg, 0.090 mmol) and TsOH. H2O (7.0 mg, 0.036 mmol) in dioxane (0.5 mL) was stirred at 100 ℃ for 18 h. The mixture was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 26 (12.2 mg, 25%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.82 (s, 1H) , δ 9.57 (s, 1H) , 8.67 (s, 1H) , 8.54 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 8.15 (s, 1H) , 7.66 (s, 1H) , 7.04 (d, J = 4.4 Hz, 1H) , 6.93 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 5.46-5.33 (m, 1H) , 3.89 (s, 3H) , 3.70 (s, 3H) , 2.03-1.86 (m, 1H) , 0.79-0.65 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.64 min, m/z (M+H) + = 480.1.
Example 27
Step 1. (S) -4-methoxy-3-nitro-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-methoxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridine (27a)
To a solution of 7d-A (100 mg, 0.34 mmol) in THF (5 mL) was added NaH (21 mg, 0.52 mmol, 60%in mineral oil) at 0 ℃. The mixture was stirred for 20 min, then CH3I (73 mg, 0.52 mmol, 0.032 mL) was added slowly. The mixture was moved to room temperature and stirred for 4 h. The mixture was quenched with sat. NH4Cl (20mL) and extracted with EtOAc (30 mL*2) . The combined organic layer was washed with brine (20 mL*2) , dried over anhydrous sodium sulfate and concentrated under vacuum. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 25%) to give 27a (52 mg, 49%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.69 (s, 1H) , 8.42 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 7.24 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.23 (q, J =6.4 Hz, 1H) , 3.92 (s, 3H) , 3.45 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.94 min, m/z (M+H) + =306.1.
Step 2. (S) -4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-methoxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-amine (27b)
To a solution of 27a (52 mg, 0.17 mmol) in MeOH (2 mL) was added Pd/C (5 mg, 0.05 mmol, 10%on charcoal) under H2 atmosphere, the mixture was stirred at 25 ℃ for 3 h. The reaction mixture was filtered and the filtrate was concentrated to give 27b (45 mg, 96%yield) as a brown solid, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.92 min, m/z (M+H) + = 276.1.
Step 3. (S) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-methoxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (27)
To a solution of 27b (45 mg, 0.16 mmol) and Int. A (34 mg, 0.13 mmol) in dioxane (2 mL) was added TsOH (31 mg, 0.18 mmol) . The mixture was stirred at 85 ℃ for 3 h. The  mixture was concentrated under vacuum and the residue was purified by prep-HPLC (Method E) to give 27 (18 mg, 22%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.66 (s, 1H) , 10.37 (s, 1H) , 8.53 (s, 1H) , 8.49 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.47 (s, 1H) , 8.11 (s, 1H) , 7.68 (s, 1H) , 6.73 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.24 (q, J = 6.8 Hz, 1H) , 3.69 (s, 3H) , 3.30 (s, 3H) , 1.97-1.82 (m, 1H) , 0.73-0.61 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.29 min, m/z (M+H) + = 496.4.
Example 28
Step 1. (S) -4-methoxy-3-nitro-5- (2, 2, 2-trifluoro-1- (methoxy-d3) ethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridine (28a)
To a solution of 7d-A (100 mg, 0.34 mmol) in THF (5 mL) was added NaH (21 mg, 0.52 mmol, 60%in mineral oil) at 0 ℃. The mixture was stirred for 20 min, then CD3I (75 mg, 0.52 mmol, 0.032 mL) was added slowly. The mixture was moved to room temperature and stirred for 4 h. The mixture was quenched with sat. NH4Cl (20mL) and extracted with EtOAc (30 mL*2) . The combined organic layer was washed with brine (20 mL*2) , dried over anhydrous sodium sulfate and concentrated under vacuum. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 25%) to give 28a (55 mg, 52%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.91 min, m/z (M+H) + = 309.1.
Step 2. (S) -4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1- (methoxy-d3) ethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-amine (28b)
To a solution of 28a (55 mg, 0.17 mmol) in MeOH (2 mL) was added Pd/C (5 mg, 0.05 mmol, 10%on charcoal) under H2 atmosphere. The mixture was stirred at 25 ℃ for 3 h. The reaction mixture was filtered and the filtrate was concentrated to give 28b (45mg, 91%yield) as a brown solid, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.89 min, m/z (M+H) + = 279.1.
Step 3. (S) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1- (methoxy-d3) ethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (28)
To a solution of 28b (45 mg, 0.16 mmol) and Int. A (34 mg, 0.13 mmol) in dioxane (2 mL) was added TsOH (31 mg, 0.18 mmol) , the mixture was stirred at 85 ℃ for 3 h. The mixture was concentrated under vacuum and the residue was purified by prep-HPLC (Method E) to give 28 (23 mg, 28%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.66 (s, 1H) , 10.37 (s, 1H) , 8.53 (s, 1H) , 8.49 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.47 (s, 1H) , 8.11 (s, 1H) , 7.68 (s, 1H) , 6.73 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.24 (q, J = 6.8 Hz, 1H) , 3.69 (s, 3H) , 1.95-1.85 (m, 1H) , 0.74-0.61 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.27 min, m/z (M+H) + = 499.4.
Example 29
Step 1. 4-Methoxy-5- ( (methoxy-d3) methyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridine (29a)
To a solution of 7a (80 mg, 0.45 mmol) in THF (1 mL) was added NaH (23 mg, 0.58 mmol, 60%purity in mineral oil) at 0 ℃, then the mixture was stirred at 0 ℃ for 30 min. Iodomethane-d3 (78 mg, 0.54 mmol) was added into the mixture, then the mixture was stirred at r.t. for 1 h. The mixture was diluted with H2O (30 mL) , extracted with EtOAc (15 mL*3) , washed with brine (20 mL) , dried over Na2SO4 and concentrated to get compound 29a (80 mg, 91%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.05 min, m/z (M+H) + = 196.1.
Step 2. 4-Methoxy-5- ( (methoxy-d3) methyl) -3-nitropyrazolo [1, 5-a] pyridine (29b)
To a solution of 29a (80 mg, 0.41 mmol) in TFA (1 mL) was added KNO3 (41 mg, 0.41 mmol) at 0 ℃, then the mixture was stirred at r. t. for 4 h. The mixture was diluted with H2O (20 mL) , extracted with EtOAc (10 mL*3) . The combined organic layer was washed with aq. Na2CO3 and sat. brine, dried over Na2SO4 and concentrated to get compound 29b (90 mg, 91%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.16 min, m/z (M+H) + = 241.1.
Step 3. 4-Methoxy-5- ( (methoxy-d3) methyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-amine (29c)
To a solution of 29b (90 mg, 0.37 mmol) in MeOH (2 mL) and H2O (0.5 mL) was added Fe powder (105 mg, 1.87 mmol) and NH4Cl (100 mg, 1.87 mmol) . Then the mixture was stirred at 70 ℃ for 2 h. The mixture was filtered and washed with EtOAc (10 mL) . The filtrate was concentrated and diluted with H2O (10 mL) , extracted with EtOAc (10 mL*3) , washed with brine (10 mL) , dried over Na2SO4, concentrated and purified by flash chromatography (DCM/MeOH = 50/1 to 5/1) to get compound 29c (70 mg, 89%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.45 min, m/z (M+H) + = 211.3.
Step 4. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- ( (methoxy-d3) methyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (29)
A mixture of 29c (33 mg, 0.16 mmol) , Int. A (40 mg, 0.16 mmol) and pTSA (27 mg, 0.16 mmol) in dioxane (1 mL) was stirred at 100 ℃ for 2 h. then the mixture was concentrated and purified by prep-HPLC (Method E) to get compound 29 (18.4 mg, 27%yield) as a pale-yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.67 (s, 1H) , 10.34 (s, 1H) , 8.52 (s, 1H) , 8.48 (s, 1H) , 8.42 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.05 (s, 1H) , 7.68 (s, 1H) , 6.82 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 4.44 (s, 2H) , 3.70 (s, 3H) , 1.96-1.90 (m, 1H) , 0.74-0.71 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.68 min, m/z (M+H) + = 431.4.
Example 30
Step 1. (S) -1- (3-amino-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) -2, 2, 2-trifluoroethan-1-ol (30a)
To a solution of 7d-A (100 mg, 0.34 mmol) , 4, 4'-Bipyridine (2 mg, 0.013 mmol) in DMF (1 mL) was added tetrahydroxydiboron (92 mg, 1.032 mmol) at 0 ℃. After stirred at 10 ℃for 10 min, the mixture was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 30a (45 mg, 50%yield) as a green solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 8.16 (d,  J = 7.2 Hz, 1H) , 7.49 (s, 1H) , 6.83 (d, J = 6.0 Hz, 1H) , 6.58 (d, J = 7.6 Hz, 1H) , 5.36-5.29 (m, 1H) , 4.31 (s, 2H) , 3.87 (3, 3H) .
Step 2. (S) -6-chloro-4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) pyridazine-3-carboxamide (30b)
To a solution of 30a (45 mg, 0.17 mmol) and 4, 6-dichloro-N- (methyl-d3) pyridazine-3-carboxamide (47 mg, 0.22 mmol) in EtOH (0.5 mL) was added conc. HCl (7 mg, 0.17 mmol) and stirred at 80 ℃ for 12 h. The reaction mixture was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 30b (60 mg, 80%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.14 min, m/z (M+H) + = 434.1.
Step 3. (S) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) pyridazine-3-carboxamide (30)
A mixture of 30b (60 mg, 0.14 mmol) , cyclopropanecarboxamide (35 mg, 0.41 mmol) , BrettPhos (15 mg, 0.03 mmol) and BrettPhos Pd G3 (25.08 mg, 0.03 mmol) in dioxane (0.5 mL) was stirred at 100 ℃ under N2 for 12 h. The reaction mixture was concentrated to dryness and purified by flash chromatography on silica gel (DCM/MeOH = 10/1) to give compound 30 (15 mg, 22%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.24 (s, 1H) , 10.55 (s, 1H) , 9.09 (s, 1H) , 8.54 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.12 (s, 1H) , 7.79 (s, 1H) , 7.04 (d, J =5.6Hz, 1H) , 6.93 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.40-5.37 (m, 1H) , 3.72 (s, 3H) , 2.01-1.99 (m, 1H) , 0.79-0.75 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 0.98 min, m/z (M+H) + = 483.1.
Example 31
6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoroacetyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide and 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4- methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1, 1-dihydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (31)
To a solution of 7 (50 mg, 0.10 mmol) in EtOAc (0.5 mL) was added 2-iodoxybenzoic acid (116 mg, 0.40 mmol) . After stirring at 95 ℃ for 12 h, the reaction mixture was concentrated to dryness and purified by flash chromatography (DCM/MeOH = 10/1) to afford 31 as a brown solid as a mixture. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.81 (s, 0.2H) , 10.79 (s, 0.2H) , 10.69 (s, 0.8H) , 10.37 (s, 0.8H) , 8.62 (s, 0.2H) , 8.56 (s, 0.2H) , 8.55 (s, 0.8H) , 8.54 (d, J = 8.0 Hz, 0.2H) , 8.53 (s, 0.8H) , 8.42 (d, J = 7.6 Hz, 0.8H) , 8.28 (s, 0.2H) , 8.10 (s, 0.8H) , 7.93 (s, 0.2H) , 7.75 (s, 0.8H) , 7.71 (s, 1.6H) , 7.04 (d, J = 7.2 Hz, 0.2H) , 6.98 (d, J = 7.6 Hz, 0.8H) , 3.90 (s, 0.6H) , 3.70 (s, 2.4H) , 1.97-1.93 (m, 1H) , 0.77-0.73 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR =1.99 min, m/z (M+H) + = 480.2, 498.2.
Example 32
Step 1.4- ( (4-Methoxy-5- ( (S) -2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) -6- (spiro [2.2] pentane-1-carboxamido) nicotinamide (32)
A mixture of 19a (30.0 mg, 0.07 mmol) and spiro [2.2] pentane-1-carboxamide (39.0 mg, 0.35 mmol) , Xantphos (8 mg, 0.014 mmol) , XPhos Pd G2 (11 mg, 0.014 mmol) and Cs2CO3 (45 mg, 0.14 mmol) in 1, 4-dioxane (0.4 mL) was stirred at 100 ℃ for 12 h under N2 atmosphere. The reaction mixture was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 32 (7 mg, 20%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.49 (s, 1H) , 10.40 (d, J = 6.4 Hz, 1H) , 8.56-8.49 (m, 3H) , 8.14 (s, 1H) , 7.74-7.71 (m, 1H) , 7.04 (d, J = 5.6 Hz, 1H) , 6.90 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.42-5.39 (m, 1H) , 3.72 (s, 3H) , 2.31-2.28 (m, 1H) , 1.35-1.30 (m, 1H) , 1.26-1.23 (m, 1H) , 0.85-0.79 (m, 3H) , 0.68-0.67 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR =1.11 min, m/z (M+H) + = 508.0.
Step 2.4- ( (4-Methoxy-5- ( (S) -2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) -6- ( (S*) -spiro [2.2] pentane-1-carboxamido) nicotinamide (32A) and 4- ( (4-Methoxy-5- ( (S) -2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) -6- ( (R*) -spiro [2.2] pentane-1-carboxamido) nicotinamide (32B)
Compound 32 (23 mg, 0.05 mmol) was separated by chiral prep-HPLC (Method H) to obtain 32A (5 mg, 22%yield) as a white solid and 32B (6.5 mg, 28%yield) as a white solid. 32A: 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.47 (s, 1H) , 10.40 (s, 1H) , 8.54-8.49 (m, 3H) , 8.14 (s, 1H) , 7.74 (s, 1H) , 7.04 (d, J = 4.4 Hz, 1H) , 6.91 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 5.42-5.38 (m, 1H) , 3.73 (s, 3H) , 2.31-2.28 (m, 1H) , 1.30-1.26 (m, 2H) , 0.83-0.82 (m, 3H) , 0.68-0.65 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 1.11 min, m/z (M+H) + = 508.0. HPLC (Method 7) tR = 8.14 min.
32B: 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.47 (s, 1H) , 10.38 (s, 1H) , 8.56-8.49 (m, 3H) , 8.14 (s, 1H) , 7.71 (s, 1H) , 7.04 (d, J = 5.2 Hz, 1H) , 6.91 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.42-5.39 (m, 1H) , 3.73 (s, 3H) , 2.31-2.28 (m, 1H) , 1.30-1.25 (m, 2H) , 0.84-0.81 (m, 3H) , 0.69-0.66 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 1.11 min, m/z (M+H) + = 508.0. HPLC (Method 7) tR = 10.48 min.
Example 33
Step 1. (S) -2-chloro-4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) pyrimidine-5-carboxamide (33a)
To a solution of 30a (80 mg, 0.31 mmol) and Int. E (77 mg, 0.37 mmol) in THF (0.8 mL) was added LiHMDS (1.2 mL, 1.2 mmol, 1 M in THF) at -40 ℃. The reaction was stirred at -40 ℃ to r.t. for 1 h and quenched with H2O (2 mL) . The organic solvent was removed under reduced pressure. The formed solid was collected by filtering and purified by flash chromatography (DCM/MeOH = 20/1) to afford 33a (32 mg, 24%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.18 min, m/z (M+H) + = 434.2.
Step 2. (S) -2- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) pyrimidine-5-carboxamide (33)
A mixture of 33a (60 mg, 0.07 mmol) , cyclopropanecarboxamide (31 mg, 0.37 mmol) , BrettPhos Pd G3 (13 mg, 0.015 mmol) and Cs2CO3 (48 mg, 0.15 mmol) in dioxane (0.4 mL) was stirred at 90 ℃ for 12 h under N2 atmosphere. The reaction mixture was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 33 (8 mg, 22%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 11.73 (s, 1H) , 10.96 (s, 1H) , 9.61 (s, 1H) , 8.74 (s, 1H) , 8.63 (s, 1H) , 8.43 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 7.04 (d, J = 5.6 Hz, 1H) , 6.84 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.47-5.44 (m, 1H) , 3.95 (s, 3H) , 2.14-2.11 (m, 1H) , 0.93-0.86 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 1.11 min, m/z (M+H) + = 483.0.
Example 34
Step 1.6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (5- (2-hydroxypropan-2-yl) -4-methylpyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (34)
To a solution of 6 (5 mg, 0.01 mmol) in THF (1 mL) was added CH3MgBr (0.041 mL, 0.12 mmol, 3 M in Et2O) slowly at 0 ℃ under N2 atmosphere. The mixture was stirred for 10 min, then heated to 50 ℃ and stirred for 12 h. The mixture was quenched with sat. NH4Cl (20mL) and extracted with DCM (20 mL*2) . The combined organic layer was washed with brine (20 mL*2) , dried and condensed by vacuum. The residue was purified by prep-HPLC (Method A) to give 34 (1.8 mg, 37%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.58 (s, 1H) , 9.96 (s, 1H) , 8.48 (s, 1H) , 8.44 (s, 1H) , 8.37 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 7.87 (s, 1H) , 7.24 (s, 1H) , 6.99 (d, J = 7.6 Hz, 1H) , 5.14 (s, 1H) , 2.55 (s, 3H) , 1.91-1.82 (m, 1H) , 1.47 (s, 6H) , 0.69-0.59 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.46 min, m/z (M+H) + = 426.3.
Example 35
Step 1. Dimethyl 2- (6-chloro-5-methoxypyrimidin-4-yl) malonate (35b)
To a solution of dimethyl malonate (7.38 g, 55.86 mmol, 6.36 mL) in DMF (100 mL) was added Cs2CO3 (36.40 g, 111.73 mmol) and 4, 6-dichloro-5-methoxy-pyrimidine (10 g, 55.86 mmol) , then the mixture was stirred at 100 ℃ for 2 h. The mixture was concentrated in vacuo, diluted with H2O (100 mL) , adjusted pH to 2 with 2 N HCl, extracted with EtOAc (100 mL*3) , washed with brine (100 mL*2) , dried over Na2SO4, concentrated to get the crude compound 35b (15 g, 98%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.23 min, m/z (M+H) + = 275.1.
Step 2. Methyl 2- (5, 6-dimethoxypyrimidin-4-yl) acetate (35c)
To a solution of 35b (12 g, 43.69 mmol) in MeOH (50 mL) was added NaOMe (16.2 mL, 87.38 mmol, 5.4 M in MeOH) , then the mixture was stirred at 60 ℃ for 2 h. The mixture was concentrated and diluted with H2O (100 mL) , adjusted pH to 2 with 2 N HCl, extracted with EtOAc (100 mL*3) , washed with brine (100 mL) , dried over Na2SO4, concentrated and purified by flash chromatography (PE/EA = 20/1 to 1/1) to get compound 35c (9 g, 97%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.79 min, m/z (M+H) + = 213.1.
Step 3. Methyl 2- (5, 6-dimethoxypyrimidin-4-yl) -3- (dimethylamino) acrylate (35d)
A solution of 35c (1 g, 4.71 mmol) in DMF-DMA (1 mL) was stirred at 120 ℃ for 6 h. The mixture was concentrated to get compound 35d (1.26 g, crude) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.23 min, m/z (M+H) + = 268.1.
Step 4. Methyl 4, 5-dimethoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylate (35e)
To a solution of 35d (1.26 g, 4.71 mmol) in DCM (10 mL) was added O- (mesitylsulfonyl) hydroxylamine (2.90 g, 9.43 mmol) at 0 ℃, then the mixture was stirred at r.t. for 2 h. Then the mixture was concentrated and the solid was triturated with H2O (10 mL) , filtered, and the filter cake was washed with DCM (2 mL*2) . The solid was dried in vacuo to get compound 35e (600 mg, 54%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9.42 (s, 1H) , 8.45 (s, 1H) , 3.99 (s, 3H) , 3.78 (s, 3H) , 3.75 (s, 3H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.04 min, m/z (M+H) + = 238.1.
Step 5. 4, 5-Dimethoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylic acid (35f)
To a suspension of 35e (550 mg, 2.32 mmol) in MeOH (11 mL) was added a solution of NaOH (4.64 mL, 4.64 mmol, 1 M in H2O) slowly, then the mixture was stirred at 40 ℃ for 16 h. The mixture was concentrated and then treated with H2O (5 mL) , adjusted pH to 1 with 2 N HCl. Then the mixture was filtered and the filter cake was washed with Et2O (2 mL) . The solid was dried in vacuo to get compound 35f (90 mg, 17%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.20 min, m/z (M+H) + = 224.1.
Step 6. Tert-butyl (4, 5-dimethoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) carbamate (35g)
To a solution of 35f (30 mg, 0.134 mmol) in toluene (1 mL) was added DPPA (74 mg, 0.27 mmol) and TEA (54 mg, 0.54 mmol) , then the mixture was stirred at 80 ℃ for 1 h and cooled to r.t., then tBuOH (0.5 mL) was added into the mixture. The mixture was stirred at 110 ℃ for 4 h, concentrated and purified by flash chromatography (DCM/MeOH = 50/1 to 15/1) to get compound 35g (25 mg, 63%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.64 min, m/z (M+H) + = 295.2.
Step 7. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4, 5-dimethoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (35)
A mixture of 35g (25 mg, 0.085 mmol) , Int. A (22 mg, 0.085 mmol) and pTSA (15 mg, 0.085 mmol) in dioxane (1 mL) was stirred at 100 ℃ for 2 h. Then the mixture was concentrated and purified by prep-HPLC (Method E) to get compound 35 (10.7 mg, 30%yield) as a pale-yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.63 (s, 1H) , 10.13 (s, 1H) , 9.22 (s, 1H) , 8.48 (s, 1H) , 8.44 (s, 1H) , 8.13 (s, 1H) , 7.49 (s, 1H) , 3.92 (s, 3H) , 3.67 (s, 3H) , 1.92-1.86  (m, 1H) , 0.70-0.67 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.71 min, m/z (M+H) + = 415.3.
Example 36
Step 1. 4- ( (4, 5-Dimethoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) amino) -6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -N- (methyl-d3) nicotinamide (36)
A mixture of 35g (18 mg, 0.061 mmol) , Int. B (17 mg, 0.061 mmol) and pTSA (11 mg, 0.061 mmol) in dioxane (1 mL) was stirred at 100 ℃ for 2 h. Then the mixture was concentrated and purified by prep-HPLC (Method E) to get compound 36 (6.5 mg, 24%yield) as a pale-yellow solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 10.00 (s, 1H) , 8.79 (s, 1H) , 8.25 (s, 1H) , 8.23 (s, 1H) , 8.04 (s, 1H) , 7.64 (s, 1H) , 6.22 (s, 1H) , 4.86-4.65 (m, 1H) , 4.02 (s, 3H) , 3.84 (s, 3H) , 1.85-1.82 (m, 1H) , 1.64-1.60 (m, 1H) , 1.21-1.13 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.65 min, m/z (M+H) + = 433.3.
Example 37
Step 1. 1-Tert-butyl 3-methyl 2- (6-chloro-5-methoxypyrimidin-4-yl) malonate (37a)
To a solution of tert-butyl methyl malonate (13.08 g, 75.08 mmol) in THF (200 mL) was added NaH (6.01 g, 150.16 mmol, 60%in mineral oil) at 0 ℃. The mixture was stirred at 0 ℃ for 30 min. Then a solution of 35a (11.2 g, 62.57 mmol) in THF (20 mL) was added to the mixture at 0 ℃. The mixture was stirred at 80 ℃ for 3 h and poured into ice-water (150 mL) . The mixture was acidified with 2 N HCl to pH = 2 and extracted with EtOAc (300 mL*2) . The combined organic layer was washed with brine (100 mL) , dried over Na2SO4, filtered and concentrated to afford 37a (19.8 g, crude) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.26 min, m/z (M+H-56) + = 261.2.
Step 2. Methyl 2- (6-chloro-5-methoxypyrimidin-4-yl) acetate (37b)
To a mixture of 37a (18.0 g, 56.83 mmol) in DCM (150 mL) was added TFA (75 mL) at 0 ℃. After stirring at r.t. for 4 h, the reaction mixture was concentrated. The residue was diluted with EtOAc (500 mL) and washed with sat. NaHCO3 (150 mL) and brine (100 mL) . The organic layer was concentrated. The residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 10/1) to afford 37b (10.5 g, 85%yield) as a yellow oil. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ8.67 (s, 1H) , 3.95 (s, 3H) , 3.91 (s, 2H) , 3.75 (s, 3H) .
Step 3. Methyl 2- (6- ( (2, 4-dimethoxybenzyl) amino) -5-methoxypyrimidin-4-yl) acetate (37c)
A mixture of 37b (1.0 g, 4.62 mmol) , TEA (934 mg, 9.23 mmol) and DMBNH2 (1.00 g, 6.00 mmol) in EtOH (10 mL) was stirred at 80 ℃ for 5 h. The mixture was diluted with H2O (20 mL) , extracted with EtOAc (40 mL*2) . The organic layer was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 1/1) to afford 37c (1.33 g, 83%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.07 min, m/z (M+H) + = 348.2.
Step 4. (Z) -Methyl 2- (6- ( (2, 4-dimethoxybenzyl) amino) -5-methoxypyrimidin-4-yl) -3- (dimethylamino) acrylate (37d)
A mixture of 37c (1.33 g, 3.83 mmol) in DMF-DMA (10 mL) was stirred at 120 ℃for 18 h. The mixture was concentrated to afford 37d (1.54 g, crude) as a brown oil. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.07 min, m/z (M+H) + = 403.3.
Step 5. Methyl 5- ( (2, 4-dimethoxybenzyl) amino) -4-methoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylate (37e)
To a mixture of 37d (1.61 g, 4.00 mmol) in DCM (30 mL) was added dropwise a solution of O- (mesitylsulfonyl) hydroxylamine (1.03 g, 4.80 mmol) in DCM (5 mL) at 0 ℃. The mixture was stirred at 0 ℃ for 2 h. Another batch of a solution of O- (mesitylsulfonyl) hydroxylamine (515 mg, 2.40 mmol) in DCM (5 mL) was added into the mixture at 0 ℃. The mixture was stirred at 0 ℃ for 1 h. The mixture was concentrated and purified by flash chromatography on silica gel (DCM/MeOH = 50/1) to afford 37e (788 mg, 53%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.84 (s, 1H) , 8.27 (s, 1H) , 7.21 (d, J = 8.4 Hz, 1H) , 6.46 (d, J = 2.0 Hz, 1H) , 6.41 (dd, J = 8.0 Hz, 2.4 Hz, 1H) , 5.64 (t, J = 6.0 Hz, 1H) , 4.64 (d, J = 6.0 Hz, 2H) , 3.86 (s, 3H) , 3.85 (s, 3H) , 3.80 (s, 3H) , 3.79 (s, 3H) .
Step 6. Methyl 5-amino-4-methoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylate (37f)
To a mixture of 37e (4.26 g, 11.44 mmol) in DCM (15 mL) was added TFA (15 mL) dropwise at r.t. The reaction mixture was stirred at r. t. for 1 h and concentrated under vacuum at 30 ℃. The residue was dissolved in DCM (80 mL) and the solution was basified with 1 M NaOH to pH = 12. The mixture was extracted with DCM (80 mL) . The organic layer was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (DCM/MeOH =10/1) to afford 37f (1.94 g, 76%yield) as a yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9.09 (s, 1H) , 8.27 (s, 1H) , 6.68 (brs, 2H) , 3.77 (s, 3H) , 3.71 (s, 3H) .
Step 7. Methyl 5-iodo-4-methoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylate (37g)
To a mixture of 37f (1.1 g, 4.95 mmol) in ACN (12 mL) was added tert-Butyl nitrite (766 mg, 7.43 mmol, 0.88 mL) at 0 ℃. The mixture was stirred at 15 ℃ for 10 min. CuI (1.41 g, 7.43 mmol) was added to the mixture and stirred at 70 ℃ for 2 h. After cooling to r.t., the reaction was quenched with 40 mL of 25%aq. NH3. H2O and extracted with EtOAc (60 mL*2) . The combined organic layer was concentrated and the residue was purified by flash chromatography (PE/EA = 2/1) to afford 37g (410 mg, 25%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.24 min, m/z (M+H) + = 333.9.
Step 8. Methyl 4-methoxy-5- (3, 3, 3-trifluoroprop-1-en-2-yl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylate (37h)
A mixture of 37g (450 mg, 1.35 mmol) , 4, 4, 6-trimethyl-2- (3, 3, 3-trifluoroprop-1-en-2-yl) -1, 3, 2-dioxaborinane (600 mg, 2.70 mmol) , Na2CO3 (287 mg, 2.70 mmol) and Pd (dppf) Cl2 (99 mg, 0.14 mmol) in 1, 4-dioxane/H2O (4.5 mL/1.5 mL) was stirred at 90 ℃ for 3 h. After cooled to r.t., the reaction mixture was diluted with EtOAc (15 mL) , washed with water (7 mL) and brine (7mL) . The organic layer was concentrated to afford 37h (400 mg, crude) as a yellow oil, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.25 min, m/z (M+H) + = 302.0.
Step 9. Methyl 4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylate (37i)
A mixture of 37h (400 mg, 1.33 mmol) , Pd (OH) 2/C (200 mg, Pd 20%on carbon, wetted with water) and Pd/C (200 mg, 10%wt. wetted with water) in MeOH (4 mL) was stirred at 50 ℃ under H2 (50 psi) atmosphere for 18 h. The reaction mixture was filtered and the filtrate was concentrated to afford 37i (400 mg, crude) as a yellow solid, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.27 min, m/z (M+H) + =304.2.
Step 10. 4-Methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylic acid (37j)
A mixture of 37i (400 mg, 1.32 mmol) and NaOH (106 mg, 2.64 mmol) in MeOH (8 mL) and H2O (4 mL) was stirred at 40 ℃ for 10 h. The reaction mixture was concentrated and added into water (8 mL) . The aqueous solution was acidified with 2 N HCl to pH = 1. The resultant mixture was extracted with EtOAc (20 mL*2) and the combined organic phase was concentrated. The residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 37j (180 mg, 51%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.47 min, m/z (M+H) + = 290.1.
Step 11. 3-Iodo-4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidine (37k)
To a mixture of 37j (92 mg, 0.32 mmol) and NaHCO3 (80 mg, 0.95 mmol) in DMF (2 mL) was added NIS (215 mg, 0.95 mmol) at 0 ℃. The mixture was stirred at 40 ℃ for 10 h. After cooling to r. t., the reaction mixture was diluted with sat. Na2S2O3 (5 mL) at 0 ℃. Then the  mixture was extracted with EtOAc (8 mL*2) . The combined organic layer was washed with brine (5 mL*2) , dried over Na2SO4, filtered and the filtrate was concentrated to afford 37k (115 mg, crude) as a yellow solid, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.38 min, m/z (M+H) + = 371.9.
Step 12. N- (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) -1, 1-diphenylmethanimine (37l)
A mixture of 37k (115 mg, 0.31 mmol) , diphenylmethanimine (112 mg, 0.62 mmol, 0.1 mL) , Xantphos (18 mg, 0.031 mmol) , Pd2 (dba) 3 (28 mg, 0.031 mmol) and Cs2CO3 (202 mg, 0.62 mmol) in 1, 4-dioxane (1 mL) was stirred at 90 ℃ for 16 h under N2. After cooling to r. t., the mixture was diluted with water (5 mL) , extracted with EtOAc (8 mL*3) . The combined organic layer was concentrated and the residue was purified by flash chromatography (PE/EA =5/1) to afford 37l (20 mg, 15%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.62 min, m/z (M+H) + = 425.2.
Step 13. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (37)
A mixture of 37l (20 mg, 0.047 mmol) , Int. A (12 mg, 0.047 mmol) and TsOH. H2O (2 mg, 0.01 mmol) in 1, 4-dioxane (0.5 mL) was stirred at 60 ℃ for 16 h. The mixture was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 37 (7.2 mg, 32%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.69 (s, 1H) , 10.36 (s, 1H) , 9.37 (s, 1H) , 8.56 (s, 1H) , 8.52 (s, 1H) , 8.33 (s, 1H) , 7.63 (s, 1H) , 4.20-4.03 (m, 1H) , 3.74 (s, 3H) , 2.02-1.87 (m, 1H) , 1.45 (d, J = 7.2 Hz, 3H) , 0.80-0.66 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.75 min, m/z (M+H) + = 481.2.
Example 38
Step 1. 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (1, 1, 1-trifluoropropan-2-yl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (38)
A mixture of 37l (20 mg, 0.047 mmol) , Int. B (13 mg, 0.047 mmol) and TsOH. H2O (3 mg, 0.016 mmol) in 1, 4-dioxane (0.5 mL) was stirred at 80 ℃ for 8 h. After cooling to r.t., the mixture was diluted with EtOAc (6 mL) , washed with water (2 mL) and brine (2 mL) . The organic layer was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 38 (10.2 mg, 43%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.76 (s, 1H) , 10.40-10.38 (m, 1H) , 9.38 (s, 1H) , 8.59 (s, 1H) , 8.53 (s, 1H) , 8.35 (s, 1H) , 7.64-7.63 (m, 1H) , 4.94-4.77 (m, 1H) , 4.13-4.11 (m, 1H) , 3.75-3.74 (m, 3H) , 2.14-2.12 (m, 1H) , 1.56-1.44 (m, 4H) , 1.13-1.10 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.73 min, m/z (M+H) + = 499.2.
Example 39
Step 1. Methyl 2- (5-methoxy-6-vinylpyrimidin-4-yl) acetate (39a)
To a mixture of 37b (12.1 g, 55.86 mmol) in dioxane (64 mL) and water (16 mL) was added Pd (dppf) Cl2 (2.0 g, 2.79 mmol) , XPhos Pd G3 (472 mg, 0.56 mmol) and Na2CO3 (11.8 g, 111.72 mmol) . The reaction mixture was stirred at 90 ℃ for 28 h under N2 atmosphere. After cooling to r.t., the mixture was diluted with water (20 mL) and extracted with EtOAc (70 mL*3) . The organic layer was washed by brine (30 mL) , dried over Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 3/1) to afford 39a (7 g, 60%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.02 min, m/z (M+H) + = 209.3.
Step 2. Methyl 3- (dimethylamino) -2- (5-methoxy-6-vinylpyrimidin-4-yl) acrylate (39b)
A mixture of 39a (7 g, 33.61 mmol) in DMF-DMA (13.4 mL, 100.83 mmol) was stirred at 60 ℃ for 4 h. The mixture was concentrated to afford 39b (8.7 g, crude) as a yellow  oil, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.94 min, m/z (M+H) + = 264.3.
Step 3. Methyl 4-methoxy-5-vinylpyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylate (39c)
To a mixture 39b (8.7 g, 33.04 mmol) in DCM (30 mL) was dropped a solution of amino 2, 4, 6-trimethylbenzenesulfonate (14.23 g, 66.09 mmol) in DCM (30 mL) at 0 ℃. The reaction was stirred at 0 ℃ for 1 h. The mixture was basified to pH = 9 with sat. Na2CO3. The separated aqueous layer was extracted with DCM (200 mL*3) . The combined organic layer was concentrated and the residue was purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 1/1) to afford 39c (2.1 g, 27%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.17 min, m/z (M+H) + = 234.2.
Step 4. Methyl 5-formyl-4-methoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylate (39d)
To a mixture 39c (2.0 g, 8.58 mmol) in acetone (10 mL) was added K2OsO4.2H2O (158 mg, 0.43 mmol) . A solution of NaIO4 (3.67 g, 17.15 mmol) in water (10 mL) was added to the mixture at 0 ℃. The mixture was stirred at 25 ℃ for 1 h and filtered. The filtrate was concentrated and purified by flash chromatography on silica gel (PE/EA = 1/1) to afford 39d (1.2 g, 59%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.94 min, m/z (M+H) + = 236.0.
Step 5. Methyl 4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylate (39e)
To a mixture of 39d (1.20 g, 5.10 mmol) in THF (10 mL) was added TMSCF3 (1.60 g, 11.22 mmol) dropwise followed by TBAF (1.0 M in THF, 0.25 mL) . After stirring at 0 ℃ for 10 min, the reaction mixture was diluted with THF (10 mL) and aq. HCl (10 mL, 1 M) . The mixture was stirred at 25 ℃ for 1 h. The mixture was basified with aq. NaOH (1 M) to pH = 8 and extracted with EtOAc (50 mL*3) . The combined organic layer was concentrated to afford 39e (1 g, 64%yield) as a brown oil, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.12 min, m/z (M+H) + = 306.0.
Step 6. 4-Methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidine-3-carboxylic acid (39f)
To a mixture of 39e (600 mg, 1.97 mmol) in methanol (4 mL) and water (2 mL) was added NaOH (157.3 mg, 3.93 mmol) and the mixture was stirred at 45 ℃ for 8 h. The mixture  was adjusted with aq. HCl (2 M) to pH = 1 and extracted with EtOAc (20 mL*3) . The organic layer was concentrated and the residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 39f (130 mg, 23%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 0.92 min, m/z (M+H) + =292.0.
Step 7. 2, 2, 2-Trifluoro-1- (3-iodo-4-methoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-5-yl) ethan-1-ol (39g)
To a solution of 39f (110 mg, 0.38 mmol) and NaHCO3 (95 mg, 1.13 mmol) in DMF (1.2 mL) was added NIS (255 mg, 1.13 mmol) at 0 ℃. The mixture was stirred at 15 ℃ for 18 h. The reaction was quenched with sat. Na2S2O3 (10 mL) under ice-water bath, and extracted with EtOAc (15 mL*2) . The combined organic layer was washed with brine (5 mL) , dried over Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by prep-HPLC (Method A) to afford 39g (16 mg, 11%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.19 min, m/z (M+H) + =373.9.
Step 8. 1- (3- ( (Diphenylmethylene) amino) -4-methoxypyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-5-yl) -2, 2, 2-trifluoroethan-1-ol (39h)
A mixture of 39g (17 mg, 0.045 mmol) , diphenylmethanimine (17 mg, 0.091 mmol) , Xantphos (3 mg, 0.0046 mmol) , Pd2 (dba) 3 (4 mg, 0.0046 mmol) and Cs2CO3 (30 mg, 0.091 mmol) in 1, 4-dioxane (0.5 mL) was stirred at 90 ℃ for 8 h under N2 atmosphere. The mixture was diluted with water (3 mL) , extracted with EtOAc (5 mL*3) . The combined organic layer was concentrated and the residue was purified by prep-TLC (PE/EA = 5/1) to afford 39h (8 mg, 41%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 3) tR = 1.44 min, m/z (M+H) + = 427.2.
Step 9. 6- ( (1S, 2S) -2-fluorocyclopropane-1-carboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-c] pyrimidin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (39)
A mixture of 39h (16 mg, 0.038 mmol) , Int. B (12 mg, 0.045 mmol) and TsOH. H2O (3 mg, 0.015 mmol) in 1, 4-dioxane (0.5 mL) was stirred at 80 ℃ for 8 h. The mixture was filtered and washed with DCM (2 mL) . The filter cake was purified by prep-TLC (DCM/MeOH = 10/1) to afford 39 (5.8 mg, 31%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ10.78 (s, 1H) , 10.43 (s, 1H) , 9.38 (s, 1H) , 8.60 (s, 1H) , 8.54 (s, 1H) , 8.38 (s, 1H) , 7.64 (s, 1H) , 5.39-5.27 (m, 1H) , 4.95-4.74 (m, 1H) , 3.78 (s, 3H) , 2.20-2.07 (m, 1H) , 2.05-1.94 (m, 1H) , 1.59-1.41 (m, 1H) , 1.15-1.03 (m, 1H) . LC-MS (ESI, Method 2) tR = 2.45 min, m/z (M+H) + = 501.0.
Example 40
Step 1. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d3) -4- (pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-ylamino) nicotinamide (40)
To a solution of Int. A (20 mg, 0.078 mmol) , pTSA (13 mg, 0.078mmol) in dioxane (7 mL) was added 40a (21 mg, 0.16 mmol) at r. t. The mixture was stirred at 100 ℃ for 3 h. It was added into H2O (10 mL) and extracted by EA (20 mL) . The combined organic layer was washed by brine (20 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated in vacuo. The residue was purified by prep-HPLC (Method E) to afford 40 (16.5 mg, 60%yield) as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.63 (s, 1H) , 10.06 (s, 1H) , 8.68-8.65 (m, 1H) , 8.54 (s, 1H) , 8.49 (s, 1H) , 8.04 (s, 1H) , 7.42-7.39 (m, 1H) , 7.38 (s, 1H) , 7.23-7.18 (m, 1H) , 6.95-6.90 (m, 1H) , 1.95-1.86 (m, 1H) , 0.72-0.63 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 4.44 min, m/z (M+H) += 354.3.
Example 41
Step 1. (Isobutyl carbonic) pyrazolo [1, 5-a] pyridine-5-carboxylic anhydride (41b)
To a solution of 41a (1 g, 6.17 mmol) in THF (20 mL) was added NMM (749 mg, 7.40 mmol) at 0 ℃ under nitrogen. Isobutyl chloroformate (1.01 g, 7.40 mmol) was dropped 5 minutes later. The reaction was stirred at 0 ℃ to r. t. for 2 h. The resulting solution was added  into H2O (30 mL) and extracted by EA (50 mL) . The combined organic layer was washed by brine (30 mL*2) , dried over Na2SO4 and filtered. The filtrate was concentrated in vacuo to afford 41b (1.8 g, crude) as a yellow oil, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 3.14 min, m/z (M+H) + = 263.1.
Step 2. Pyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-ylmethanol (41c)
To a solution of 41b (1.8 g, crude) in methanol (20 mL) was added NaBH4 (662 mg, 17.5 mmol) at 0 ℃. The reaction was stirred at 0 ℃ for 2 h. The resulting solution was added into NH4Cl solution (30 mL) and extracted by EA (40 mL) . The combined organic layer was washed by brine (30 mL*2) , dried over Na2SO4, filtered and concentrated in vacuo to afford 41c (1 g, crude) as a yellow oil, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.72 min, m/z (M+H) + = 149.1.
Step 3. Pyrazolo [1, 5-a] pyridine-5-carbaldehyde (41d)
To a solution of 41c (1 g, 5.40 mmol) in DCM (15 mL) was added Dess-Martin Periodinane (3.44 g, 8.10 mmol) at r. t. The reaction was stirred at 25 ℃ for 1 h. The resulting solution was filtered and the combined organic layer was concentrated in vacuo. The crude was purified by flash chromatography (EA in PE is 10-40%) to afford 41d (600 mg, 76%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.34 min, m/z (M+H) + = 147.1.
Step 4. 2, 2, 2-Trifluoro-1- (pyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) ethan-1-ol (41e)
To a solution of 41d (300 mg, 2.05 mmol) and TMSCF3 (409 mg, 2.87 mmol) in THF (15 mL) was added TBAF (1.0 M in THF, 107 mg, 0.41 mmol) at 0 ℃. The mixture was stirred at 0 ℃ for 1 h and at 25 ℃ for 12 h. Then 1 M HCl solution was added, and the reaction was stirred at 25 ℃ for 2 h. The mixture was adjusted to pH = 8 with aq. NaOH (1 M) . The mixture was extracted with EA (15 mL*3) . The organic layer was concentrated and the residue was purified by flash chromatography (PE/EA = 2/1) to afford 41e (238 mg, 54%yield) as a white solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.00 min, m/z (M+H) + = 217.1.
Step 5. 2, 2, 2-Trifluoro-1- (3-nitropyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) ethan-1-ol (41f)
To a solution of 41e (100 mg, 0.46 mmol) in TFA (5 mL) was added KNO3 (56 mg, 0.56 mmol) at r.t. The reaction was stirred at 25 ℃ for 2 h. The resulting solution was added into H2O (10 mL) and the pH was adjusted to 8-9 with sat. Na2CO3 solution. The mixture was  extracted with EA (20 mL*2) . The combined organic phase was concentrated and the residue was purified by flash chromatography (PE/EA = 1/1) to afford 41f (100 mg, 83%yield) as a yellow oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.33 min, m/z (M+H) + = 262.0.
Step 6. 1- (3-Aminopyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) -2, 2, 2-trifluoroethan-1-ol (41g)
To a solution of 41f (100 mg, 0.38 mmol) in methanol (10 mL) was added Pd/C (10%on carbon, wetted with ca. 55%water) (8 mg) under H2 atmosphere. The mixture was stirred at 25 ℃ for 3 h. The catalyst was filtered off and the filtrate was condensed by vacuum to give 41g (100 mg, crude) as a brown solid, which was used in the next step without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.38 min, m/z (M+H) + = 232.0.
Step 7. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -N- (methyl-d3) -4- ( (5- (2, 2, 2-trifluoro-1-hydroxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) nicotinamide (41)
To a solution of Int. A (15 mg, 0.058 mmol) , 4-methylbenzenesulfonic acid (10 mg, 0.058 mmol) in dioxane (4 mL) was added 41g (27 mg, 0.12 mmol) at r. t. The mixture was stirred at 100 ℃ for 3 h. The resulting solution was added into H2O (20 mL) and extracted by EA (30 mL) . The combined organic layer was washed by brine (20 mL*2) , dried over Na2SO4, filtered and concentrated in vacuo. The crude was purified by flash chromatography and then prep-HPLC (Method E) to afford 41 (6.4 mg, 24%yield) as a light pink solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.64 (s, 1H) , 10.09 (s, 1H) , 8.71 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.56 (s, 1H) , 8.50 (s, 1H) , 8.09 (s, 1H) , 7.56 (d, J = 1.6 Hz, 1H) , 7.43 (s, 1H) , 7.06 (d, J = 6.0 Hz, 1H) , 6.99 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.36-5.27 (m, 1H) , 1.94-1.85 (m, 1H) , 0.73-0.62 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR =1.47 min, m/z (M+H) + = 452.2.
Example 42
Step 1. Methyl (S) -6- (cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxy-5- (2, 2, 2-trifluoro-1-methoxyethyl) pyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) nicotinate (42)
To a solution of 27b (70 mg, 0.25 mmol) and A2 (45 mg, 0.18 mmol) in dioxane (2 mL) was added TsOH (48 mg, 0.28 mmol) , the mixture was stirred at 85 ℃ for 3 h. The mixture was condensed by vacuum and the residue was purified by prep-HPLC (Method E) to give 42 (30 mg, 24%yield) as an off-white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.81 (s, 1H) , 9.57 (s, 1H) , 8.64 (s, 1H) , 8.53 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.14 (s, 1H) , 7.64 (s, 1H) , 6.76 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 5.25 (q, J = 6.8 Hz, 1H) , 3.85 (s, 3H) , 3.67 (s, 3H) , 3.30 (s, 3H) , 1.95-1.84 (m, 1H) , 0.75-0.57 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.82 min, m/z (M+H) + = 494.3.
Example 43
Step 1. (S) -2, 2, 2-trifluoro-1- (4-methoxy-3-nitropyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) ethyl acetate (43a)
To a solution of 7d-A (150 mg, 0.52 mmol) , TEA (261 mg, 2.58 mmol, 0.36 mL) and DMAP (6 mg, 0.052 mmol) in THF (5 mL) was added Ac2O (526 mg, 5.15 mmol, 0.49 mL) , the mixture was stirred at 55 ℃ for 2 h. The mixture was quenched with sat. NaHCO3 (20 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*2) . The combined organic layer was washed with brine (20 mL*2) , dried and condensed by vacuum. The residue was purified by flash chromatography (EtOAc in PE is 20%) to give 43a (149 mg, 87%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.95 min, m/z (M+H) + = 334.1.
Step 2. (S) -1- (3-amino-4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) -2, 2, 2-trifluoroethyl acetate (43b)
To a solution of 43a (90 mg, 0.27 mmol) in MeOH (4 mL) was added Pd/C (9 mg, 0.081 mmol, 10%on carbon, wetted with ca. 55%water) under H2 atmosphere. The mixture was  stirred at 25 ℃ for 3 h. The reaction mixture was filtered and the filtrate was concentrated to give 43b (70 mg, 85%yield) as a brown oil, which was used for the next step directly without further purification. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.18 min, m/z (M+H) + = 304.1.
Step 3. (S) -1- (3- ( (2- (cyclopropanecarboxamido) -5- ( (methyl-d3) carbamoyl) pyridin-4-yl) amino) -4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-5-yl) -2, 2, 2-trifluoroethyl acetate (43)
To a solution of 43b (70 mg, 0.23 mmol) and Int. A (41 mg, 0.16 mmol) in dioxane (4 mL) was added TsOH (44 mg, 0.25 mmol) . The mixture was stirred at 85 ℃ for 3 h. The mixture was condensed by vacuum and the residue was purified by prep-HPLC (Method E) to give 43 (45 mg, 37%yield) as an off-white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.71 (s, 1H) , 10.41 (s, 1H) , 8.58 (s, 1H) , 8.55 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 8.52 (s, 1H) , 8.17 (s, 1H) , 7.71 (s, 1H) , 6.83 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 6.59 (q, J = 7.2 Hz, 1H) , 3.78 (s, 3H) , 2.20 (s, 3H) , 1.97-1.89 (m, 1H) , 0.78-0.66 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.34 min, m/z (M+H) + = 524.4.
Example 44
Step 1. 4-Methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridine (44b)
Heat a well-stirred solution of 44a (200 mg, 1.04 mmol) in 1 mL of 50%H2SO4 at 100 ℃ for 1 h. A brown solution was formed. Cool down the solution to room temperature. Neutralize the solution with aq. NaOH (1.0 M) using litmus paper as the indicator. Add 40 mL of water to the above solution. Extract the solution by EtOAc (30 mL*3) . Combine the organic layer. Dry the organic layer over anhydrous Na2SO4. Filter the organic layer through a pad of celite. Evaporate the organic layer in vacuum to give 44b (45 mg, 94%yield) as a colorless oil. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 2.01 min, m/z (M+H) + = 149.1.
Step 2. 4-Methoxy-3-nitro-pyrazolo [1, 5-a] pyridine (44c)
A mixture of 44b (145 mg, 0.98 mmol) in TFA (2 mL) was added into KNO3 (89 mg, 0.88 mmol) at 20 ℃. The resulting mixture was stirred at 30 ℃ for 1 h. A yellow solution was formed. The reaction mixture was quenched with aq. NaHCO3 (50 mL) and extracted with  EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with brine (40 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (EA in PE is 20-60%) to give 44c (80 mg, 42%yield) as a yellow solid. LC-MS (ESI, Method 4) tR = 1.78 min, m/z (M+H) + = 194.1.
Step 3. 4-Methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-amine (44d)
A mixture of 44c (50 mg, 0.26 mmol) and Pd/C (5 mg, 10%Pd (dry basis) , wetted with 55%H2O) in MeOH (3 mL) was degassed and purged with hydrogen for 3 times. The resulting mixture was stirred at 40 ℃ under H2 atmosphere for 12 h. A black suspension was formed. The reaction mixture was filtered and concentrated. The residue was purified by prep-TLC (DCM/MeOH = 10/1) to give 44d (20 mg, 47%yield) as a red solid. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 7.85 (d, J = 7.2 Hz, 1H) , 7.46 (s, 1H) , 6.43 (t, J = 7.2 Hz, 1H) , 6.40 (d, J = 7.6 Hz, 1H) , 3.92 (s, 3H) , 3.56 (brs, 2H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 0.43 min, m/z (M+H) + = 164.1.
Step 4. 6- (Cyclopropanecarboxamido) -4- ( (4-methoxypyrazolo [1, 5-a] pyridin-3-yl) amino) -N- (methyl-d3) nicotinamide (44)
A mixture of 44d (20 mg, 0.12 mmol) , Int. A (31 mg, 0.12 mmol) and pTSA (42 mg, 0.24 mmol) in dioxane (2 mL) was stirred at 100 ℃ for 12 h. A yellow suspension was formed. The reaction mixture was diluted with aq. NaHCO3 (30 mL) and extracted with EtOAc (30 mL*3) . The combined organic layer was washed with water (60 mL*2) and brine (50 mL*2) , dried over anhydrous Na2SO4, filtered and concentrated. The residue was purified by flash chromatography (MeOH in DCM is 0-10%) and recrystallized in MeCN to give 44 (26.5 mg, 56%yield) as a light-yellow solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 10.69 (s, 1H) , 10.58 (s, 1H) , 8.49 (s, 1H) , 8.46 (s, 1H) , 8.19 (d, J = 6.8 Hz, 1H) , 7.99 (s, 1H) , 7.84 (s, 1H) , 6.78 (t, J =7.2 Hz, 1H) , 6.53 (d, J = 7.6 Hz, 1H) , 3.86 (s, 3H) , 2.00-1.93 (m, 1H) , 0.78-0.73 (m, 4H) . LC-MS (ESI, Method 4) tR = 4.92 min, m/z (M+H) + = 384.3.
A Summary of representative compounds are shown in Table 1.
Table 1. Exemplary Compounds








Binding Activity test for JH2 domain of JAK1 and TYK2
The compounds are prepared in DMSO for 200x top dose, then serial dilute it with 27-fold for 3 more points. Add 8μL/well in echo source plate, echo will add 75nL/well with 3-fold serial dilution for 11 points in assay plate. 75nL DMSO for high control and low control.
Prepare 3X working solutions (1.5nM) of JAK1-JH2 domain or TYK2-JH2 domain enzyme in assay buffer, add 5μL of enzyme working solutions per well to the assay plate including high control. For low control, add 5μL/well assay buffer. And then spin down at 1000rpm and centrifuge for 30 seconds. After enzyme system prepared, add 5μL of Tb-antibody solution into each well of assay plate. Spin down at 1000 rpm and centrifuge for 30sec. After Tb-antibody added, also add 5μL of tracer into the assay plate. Spin down at 1000rpm and centrifuge for 30sec. Incubate for 60mins at 25℃ firstly and then continue to incubate the plate at 4℃overnight. Read by envision in FRET mode. The Luminescence value was recorded by a multi-label reader Envision (PerkinElmer) . Inhibition Rate was calculated relative to vehicle (DMSO) treated control wells using following formula:
wherein
RLU_compound = the relative light unit of cells treated with test compounds
RLU_low control = the relative light unit of medium with DMSO only
RLU_high control = the relative light unit of cells treated with DMSO only
The dose-response (percent inhibition) curve was plotted and IC50 values (the concentration that causes 50%growth inhibition) were determined by GraphPad software. The IC50 of tested compounds are shown in Table 2.
Table 2. IC50 on JH2 domain activity (nM)

Exemplary compounds of the invention showed good selectivity over JAK1. These compounds can be used to reduce or eliminate the side effects caused by JAK1 inhibition in autoimmune disease.
Biochemical assay
Testing for JAK1, JAK2 and TYK2 Kinase Activities
JAK activity was determined in the reaction buffer 50 mM HEPES, 0.01%Brij35, 10 mM MgCl2, 2 mM DTT by a microfluidic assay. The phosphorylation of a FAM labeled peptide substrate was monitored in the Caliper EZ Reader II (Perkin Elmer) . The assay condition for  each batch of enzyme (Carna Biosciences) was optimized to obtain 10%conversion rate of peptide substrate.
The test compounds were dissolved in DMSO to a stock concentration of 10 mM. Three-fold serially diluted compounds with top concentration of 5 μM were pre-incubated with JAK1, JAK2 or TYK2 for 10 min at ambient temperature. The final DMSO concentration of assay mixture was 1%. FAM labeled peptide substrate (final concentration 3 μM) and ATP (Km concentration or 1mM) were sequentially added to initiate the kinase reaction at 28℃ for 90 min (JAK) , 15 min (JAK2) and 30 min (TYK2) , respectively. The reaction was stopped by adding 50 mM EDTA.
The well in the test plate without enzyme was defined as 100%inhibition. And the well without compound but with equivalent DMSO was defined as no inhibition. The percent inhibition was calculated by the following formula: 
wherein
Conversion%_max = the conversion rate in the positive well without addition of compound
Conversion%_sample = the conversion rate of test compounds
Conversion%_min = the conversion rate in the well without addition of enzyme
The dose-response (percent inhibition) curve was plotted and IC50 values were determined by GraphPad software. The IC50 values of tested compounds were list in Table 3.
Table 3. JAK1, JAK2 and TYK2 IC50 Values of Illustrative Compounds
Exemplary compounds of the invention showed excellent selectivity over JAK1,
JAK2 and TYK2 kinase domain inhibition.
Anti-proliferative assay
Dimerization domain of Tel protein fused with JAK kinase domain was permanently transduced into Ba/F3 cells, whose proliferation is dependent on JAK activity in the absence of IL-3 induction. These engineered Ba/F3-FL-TYK2-P760L cells were used to monitor JAK inhibitory activities of the compounds in the cellular. Ba/F3 cells were cultured in RPMI-1640 (Corning) containing 10%fetal bovine serum. Cells were seeded at 2000/well of white flat bottom 96-well plates. The well containing medium only was used as background control. After 24h growth, cells were treated with compounds. The test compounds were dissolved in DMSO to a stock concentration of 20 mM. 3-fold serially diluted compounds for 9 concentrations with top concentration of 20 μM was added into the each well. The final DMSO concentration was 0.1%. The cells continued to grow at 37℃ in 5%CO2 for 72 h after compound treatment. The viability was measured by cellular ATP determination using the Cell-Titer Glo luciferase reagent (Promega) . The Luminescence value was recorded by a multi-label reader Envision (PerkinElmer) . Inhibition Rate was calculated relative to vehicle (DMSO) treated control wells using following formula:
wherein
RLU_compound = the relative light unit of cells treated with test compounds
RLU_blank = the relative light unit of medium with DMSO only
RLU_control = the relative light unit of cells treated with DMSO only
The dose-response (percent inhibition) curve was plotted and IC50 values (the concentration that causes 50%growth inhibition) were determined by GraphPad software. The IC50 of tested compounds are shown in Table 4.
Table 4. Ba/F3-FL-TYK2-P760L Cells IC50 Values of Exemplary Compounds

IFN-γ Release in NK92 Cells Stimulated by IL-12
Purpose: To evaluate the inhibition activity of TYK2 inhibitors in NK92 cells on TYK2 pathway through ELISA method.
Materials:

Procedure: 1) Seeding NK92 cells into 96-well plate, cell density is 1.5E5 cells/well, 100uL/well; 2) Add prepared test articles into indicated wells, 50uL/well, and continue incubate for 1h, at 37℃; 3) After compound treatment, add 50uL/well IL-12 into indicated wells, final concentration of IL-12 is 2.5ng/mL; 4) Incubate cytokine stimulated cells at 37℃ for another 15hrs in CO2 incubator; 5) After cytokine stimulation, transfer culture supernatant into a new plate and centrifuge for 5min at 350x g, and detect IFN-γ concentration in the supernatant with ELISA kit; 6) Data analysis with GrapdPad Prism6.0 software.
Table 5. IC50 Values ofExemplary Compounds on TYK2 pathway
Exemplary compounds of the invention showed good TYK2 pathway inhibition activity in cells.
Phosphorylation Inhibition of STAT in Human Whole Blood Testing:
The inhibitory potential of test articles in human whole blood assay was evaluated by the method of flow cytometry.
IFN-alpha will activate JAK1 and TYK2 kinase in T cells by binding to IFN receptors, and then lead to phosphorylation of STAT1 and STAT2. The phosphorylated STAT1 enter nuclear and promote transcription and expression of IFN-gamma. To evaluate the efficacy of TYK2i in T cells, freshly collected human whole blood will be stimulated with certain unit of human IFN-alpha (Universal Type I IFN (1MU) , R&D, 11200-2) for 20 mins in incubator. After  stimulation, fix cells with PhosflowTM Fix Buffer I (BD, 557870) , and then collect fixed cells by centrifugation (500 g, 8min) . Wash cells once with pre-cooled PBS, and then permeabilize cells with cold Perm Buffer III buffer (BD, 558050) for 45 mins on ice. Collect cells by centrifugation (600 g, 8min) and washed twice with cold PBS. Stain cells with anti-human CD3 (FITC Mouse Anti-Human CD3, BD, 555332) and anti-pSTAT1_Y701 (Alexa Fluor 647 Mouse Anti-Stat1 (pY701) , BD, 612597) antibodies. Detect pSTAT1 by flow cytometry (CytoFlex S) and analyze data with FlowJo and GraphPad Prism 8 software. IC50 values of test articles were determined using 4-parameter logistic equation.
Exemplary results are summarized in Table 6.
Table 6
ADME
Microsomal Metabolic Stability assay
Microsomes were pre-incubated with test compound or control compounds for 5 min at 37℃ in 100 mM potassium phosphate buffer, pH 7.4, 1.0 mM EDTA. The reaction was initiated by addition of 15 μL of the NADPH regenerating system to 30 μL of each incubation mixture per time point. The final incubation condition was composed of 0.5 mg/mL microsomal protein, 1 μM test article/positive control, 2 mM NADPH. The 0-minute samples were prepared by addition of a 30 μL aliquot of each incubation mixture to 135 μL quench reagent to precipitate proteins. And then a 15 μL aliquot of the NADPH regenerating system was added. At  5, 15, 30 and 45 minutes, the reaction will be stopped by the addition of cold acetonitrile solution containing internal standard. The samples taken at all time points were centrifuged at 5000×g for 15 minutes. 50 μL of supernatant are taken into 96-well assay plates pre-added with 50 μL ultrapure water, and then analyzed by LC/MS/MS.
Concentrations of test articles, control compounds in the samples were determined by using LC/MS/MS method. Plotting of the chromatograms and peak area integrations are carried out by Analyst (AB Sciex) .
In the determination of the in vitro elimination constant (ke) of the control compounds, the analyte/internal standard peak area ratios will be converted to percentage remaining (%Remaining) with the following equation:
The CLint of microsomes was calculated using the formula: CLint (mic) =0.693/T1/2 /mg microsome protein per mL. The slope was measured by the natural logarithm of the percentage of the residual compound and time, T1/2 was calculated according to the following formula.
Exemplary results are summarized in Table 7.
Table 7

Kinetic solubility
Aliquots of 8 μL of reference and test compound stock solutions (10 mM/5 mM) are added into 792 μL of 100 mM pH 7.4 phosphate buffer. The final DMSO concentration is 1%. Sample tubes are shaken for 2 hours at 1000 rpm at room temperature. Samples are centrifuged at 12000 rpm for 10 min to precipitate un-dissolved particles. And transfer the supernatants to a new tube or plate. Add 5 μL of samples (no diluted, 10 times diluted and 100 times diluted) and standard curve samples to 95 μL of ACN containing IS for LC-MS/MS analysis.
Exemplary results are summarized in Table 8
Table 8
Exemplary compounds of the invention showed ideal solubility for further development.
Brian Pharmacokinetic study in rats
Pharmacokinetic profiles of test articles were evaluated in fasted Sprague-Dawley rats. Formulation of 5%DMSO+65%PEG400+30%Water was designed to ensure test articles fully dissolved and wouldn’ t precipitate in 1: 10 SGF or FaSSIF dilution. Typically, SD rats were  dosed with 3 mg/kg by intravenous injection. The animal was restrained manually at the designated time points, approximately 150 μL of blood sample was collected via jugular vein for serial bleeding into K2EDTA tubes. Sampling at 0.083, 0.5 and 1 hr, 3 time points. The blood samples were maintained in wet ice first and centrifuged to obtain plasma (2000g, 4℃, 5 min) within 30 minutes post sampling. Anesthetizing the rat with the Isoflurane vaporizer to 2%~3%and place its back on the operation table. Spread the animal limbs and pin the limbs on the operation table. Make a cut along the sternum about 4cm long, low enough to expose the sternum’s end. Expose the heart and use a 25-gauge needle connected with a 20 mL syringe filled with 20 mL of cold saline to pierce the left ventricle. Maintain the placement of the needle, and slowly push the syringe plunger to wash the brain with saline. The perfusion will be finished within about 2 min and then take the brain out of the body carefully without damaging the tissue. Dry the tissue on filtrate paper, which should be placed on ice, and then weigh the brain tissue and store at -70 ℃ and analyzed by LC/MS/MS for quantification. PK parameter values, including, but not necessarily limited to, the maximum plasma concentrations (Cmax) , and the area under the plasma concentration vs. time curve (AUC) from time zero to 24-hour (AUC0-24h) were determined using WinNonlin program.
Table 9. Systemic Pharmacokinetic Parameters in Sprague-Dawley Rats by Intravenous  Administration
Table 10. Brain Pharmacokinetic Parameters in Sprague-Dawley Rats by Intravenous  Administration
Example 42 showed good brain exposure in Rats.
Applicant’s disclosure is described herein in preferred embodiments with reference to the Figures, in which like numbers represent the same or similar elements. Reference throughout this specification to “one embodiment, ” “an embodiment, ” or similar language means that a particular feature, structure, or characteristic described in connection with the embodiment is included in at least one embodiment of the present invention. Thus, appearances of the phrases “in one embodiment, ” “in an embodiment, ” and similar language throughout this specification may, but do not necessarily, all refer to the same embodiment.
The described features, structures, or characteristics of Applicant’s disclosure may be combined in any suitable manner in one or more embodiments. In the description, herein, numerous specific details are recited to provide a thorough understanding of embodiments of the invention. One skilled in the relevant art will recognize, however, that Applicant’s composition and/or method may be practiced without one or more of the specific details, or with other methods, components, materials, and so forth. In other instances, well-known structures, materials, or operations are not shown or described in detail to avoid obscuring aspects of the disclosure.
Unless defined otherwise, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art. Although any methods and materials similar or equivalent to those described herein can also be used in the practice or testing of the present disclosure, the preferred methods and materials are now described. Methods recited herein may be carried out in any order that is logically possible, in addition to a particular order disclosed.
Incorporation by Reference
References and citations to other documents, such as patents, patent applications, patent publications, journals, books, papers, web contents, have been made in this disclosure. All such documents are hereby incorporated herein by reference in their entirety for all purposes. Any material, or portion thereof, that is said to be incorporated by reference herein, but which conflicts with existing definitions, statements, or other disclosure material explicitly set forth herein is only incorporated to the extent that no conflict arises between that incorporated material and the present disclosure material. In the event of a conflict, the conflict is to be resolved in favor of the present disclosure as the preferred disclosure.
Equivalents
The representative examples are intended to help illustrate the invention, and are not intended to, nor should they be construed to, limit the scope of the invention. Indeed, various modifications of the invention and many further embodiments thereof, in addition to those shown and described herein, will become apparent to those skilled in the art from the full contents of this document, including the examples and the references to the scientific and patent literature included herein. The examples contain important additional information, exemplification and guidance that can be adapted to the practice of this invention in its various embodiments and equivalents thereof.

Claims (93)

  1. A compound having the structural formula (I) :
    or a pharmaceutically acceptable form or an isotope derivative thereof,
    wherein
    Y1 is CH, CF or N;
    Y2 is CH or N;
    Y3 is NR, O, CH2, CF2 or O-NH;
    R1 is a H, F, C1-C3 alkyl and CD3, provided that R1 is not F when Y3 is N, O or O-NH;
    R2 is
    R2’, wherein R2’ is a C1-C6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl, C5-C7 spirocycloalkyl, or C3-C6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R2a, wherein R2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
    an aryl or heteroaryl group, each substituted with 0-2 R2a;
    (C=O) R2b; or
    (C=O) NHR2b;
    R3 is
    wherein
    X6 is CR6 or N;
    X7 is CR7 or N;
    X8 is C or N;
    X9 is CR9, O, S, N or NR9;
    X10 is CR9, O, S, N or NR10; and
    wherein each of Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group;
    R2b is a C1-6 alkyl or C3-6 cycloalkyl, C5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R2c;
    R2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF3, CF3, C1-6 alkyl, C1-6 haloalkyl, C2-6 alkenyl, C2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R2a; and
    R4 is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 R4a, wherein R4a is selected from D, F and Cl;
    R5 is H, CN, halo, OCH3, C (=O) OCH3, C1-6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl or heterocyclic, wherein said alkyl, cycloalkyl or heterocyclic is substituted with 0-3 R5a, wherein each R5a is independently selected from OH, D, F, Cl, CN, OCH3, OCD3, OCF3 and OC (=O) CH3;
    each of R6, R7, R9 and R10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD3, CH2CF3, CF3, OR, NRR’, C1-C3 alkyl and C3-C5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R2a; and
    each of R and R’ is independently H or a C1-C6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO2.
  2. The compound of claim 1, wherein each of Ring A and Ring B is independently a heteroaryl group.
  3. The compound of claim 1 or 2, wherein X6 is CH and X7 is CH, with R3 having the structure:
  4. The compound of claim 1 or 2, wherein X7 is CH and X8 is C, with R3 having the structure:
  5. The compound of claim 1 or 2, wherein X6 is CH and X8 is C, with R3 having the structure:
  6. The compound of claim 1 or 2, wherein X7 is CH and X10 is CH, with R3 having the structure:
  7. The compound of any one of claims 1-6, wherein R4 is CH3.
  8. The compound of any one of claims 1-7, wherein R3 is selected from:
  9. The compound of claim 8, wherein R3 is:
  10. The compound of any one of claims 1-9, wherein R10 if present is H.
  11. The compound of claim 8, wherein R3 is:
  12. The compound of any one of claims 1-11, wherein R9 if present is C1-3 alkyl.
  13. The compound of any one of claims 1-12, wherein R5 is a C1-4 alkyl, substituted with an OH.
  14. The compound of claim 13, wherein R5 is:
    wherein
    R5’ is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 F’s; and
    R is H, C1-3 alkyl or acyl.
  15. The compound of claim 14, wherein R is H and R5 is:
  16. The compound of claim 14, wherein R is CH3.
  17. The compound of claim 14, wherein R is C (=O) CH3.
  18. The compound of any one of claims 1-17, wherein Y3 is NH.
  19. The compound of claim 18, wherein Y1 is CH and Y2 is CH:
  20. The compound of claim 18, wherein Y1 is CH and Y2 is N:
  21. The compound of claim 18, wherein Y1 is N and Y2 is CH:
  22. The compound of claim 18, wherein Y1 is N and Y2 is N:
  23. The compound of any one of claims 1-22, wherein R6 and R7, if present, is H.
  24. The compound of any one of claims 1-23, wherein R2 is R2’.
  25. The compound of any one of claims 1-23, wherein R2 is (C=O) R2b.
  26. The compound of claim 25, wherein R2b is selected from C1-C6 alkyl, cyclopropyl or cyclobutyl, substituted with 0-2 R2c.
  27. The compound of claim 26, wherein R2b is cyclopropyl.
  28. The compound of any one of claims 1-23, wherein R2 is (C=O) NHR2b.
  29. The compound of any one of claims 1-23, wherein R2 is pyridinyl substituted with 0-2 R2c.
  30. The compound of any one of claims 1-23, wherein R2 is phenyl substituted with 0-2 R2b.
  31. The compound of any one of claims 1-23, wherein R2 is pyrazolyl substituted with 0-2 R2c.
  32. The compound of any one of claims 1-23, wherein R2 is pyrimidyl substituted with 0-2 R2c.
  33. The compound of any one of claims 1-32, wherein R1 is CH3.
  34. The compound of any one of claims 1-32, wherein R1 is CD3.
  35. The compound of claim 1, having the structural formula:
    wherein X6 is N or CH.
  36. The compound of claim 1, having the structural formula:
  37. The compound of claim 1, having the structural formula:
  38. The compound of claim 1, having the structural formula:
  39. The compound of claim 1, having the structural formula:
  40. The compound of claim 1, having the structural formula:
  41. The compound of claim 1, having the structural formula:
  42. The compound of claim 1, having the structural formula:
  43. The compound of claim 1, having the structural formula:
  44. The compound of claim 1, having the structural formula:
  45. The compound of claim 1, having the structural formula:
  46. The compound of claim 1, having the structural formula:
  47. The compound of claim 1, having the structural formula:
  48. The compound of claim 1, having the structural formula:
  49. The compound of claim 1, having the structural formula:
  50. The compound of claim 1, having the structural formula:
  51. The compound of claim 1, having the structural formula:
  52. The compound of any one of claims 35-51, wherein R6 and R7, if present, is H.
  53. The compound of any one of claims 35-52, wherein R2b is C1-C6 alkyl, cyclopropyl or cyclobutyl, substituted with 0-2 R2c.
  54. The compound of any one of claims 35-53, wherein R5 is:
    wherein
    R5’ is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 F’s; and
    R is H, C1-3 alkyl or acyl.
  55. The compound of claim 54, wherein R is H and R5 is:
  56. The compound of claim 54, wherein R is CH3.
  57. The compound of claim 54, wherein R is C (=O) CH3.
  58. The compound of any one of claims 35-57, wherein R1 is CH3.
  59. The compound of any one of claims 35-57, wherein R1 is CD3.
  60. The compound of claim 59, wherein R2b is cyclopropyl and R5’ is a C2-3 alkyl, substituted with 2-5 F’s.
  61. A compound selected from Table 1 or a pharmaceutically acceptable form or an isotope derivative thereof. [WILL NEED TO INCLUDE A TABLE OF COMPOUNDS IN THE DESCRIPTION SECTION, WHICH WE CAN REFERENCE HERE]
  62. A pharmaceutical composition comprising a compound according to any of claims 1-61, effective to treat or reduce one or more diseases or disorders, in a mammal, including a human, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent.
  63. A pharmaceutical composition comprising an amount of a compound having the structural formula of (I) :
    or a pharmaceutically acceptable form or an isotope derivative thereof,
    wherein
    Y1 is CH, CF or N;
    Y2 is CH or N;
    Y3 is NR, O, CH2, CF2 or O-NH;
    R1 is a H, F, C1-C3 alkyl and CD3, provided that R1 is not F when Y3 is N, O or O-NH;
    R2 is
    R2’, wherein R2’ is a C1-C6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl, C5-C7 spirocycloalkyl, or C3-C6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R2a, wherein R2a is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
    an aryl or heteroaryl group, each substituted with 0-2 R2a;
    (C=O) R2b; or
    (C=O) NHR2b;
    R3 is
    wherein
    X6 is CR6 or N;
    X7 is CR7 or N;
    X8 is C or N;
    X9 is CR9, O, S, N or NR9;
    X10 is CR9, O, S, N or NR10; and
    wherein each of Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group;
    R2b is a C1-6 alkyl or C3-6 cycloalkyl, C5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R2c;
    R2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF3, CF3, C1-6 alkyl, C1-6 haloalkyl, C2-6 alkenyl, C2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R2a; and
    R4 is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 R4a, wherein R4a is selected from D, F and Cl;
    R5 is H, CN, halo, OCH3, C (=O) OCH3, C1-6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl or heterocyclic, wherein said alkyl, cycloalkyl or heterocyclic is substituted with 0-3 R5a, wherein each R5a is independently selected from OH, D, F, Cl, CN, OCH3, OCD3, OCF3 and OC (=O) CH3;
    each of R6, R7, R9 and R10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD3, CH2CF3, CF3, OR, NRR’, C1-C3 alkyl and C3-C5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R2a; and
    each of R and R’ is independently H or a C1-C6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO2,
    effective to treat, or reduce one or more diseases or disorders, in a mammal, including a human, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent.
  64. The pharmaceutical composition of claim 62 or 63, being suitable for oral administration.
  65. The pharmaceutical composition of claim 62 or 63, being suitable for topical administration.
  66. The pharmaceutical composition of claim 62 or 63, being suitable for GI-restricted administration.
  67. The pharmaceutical composition of claim 62 or 63, being useful to treat or reduce one or more of inflammatory diseases, immune-mediated diseases and cancers, or a related disease or disorder.
  68. The pharmaceutical composition of claim 67, wherein the disease or disorder is an inflammatory disease.
  69. The pharmaceutical composition of claim 67, wherein the disease or disorder is an immune-mediated disease.
  70. The pharmaceutical composition of claim 67, wherein the disease or disorder is cancer.
  71. The pharmaceutical composition of claim 67, wherein the disease or disorder is selected from: inflammatory bowel disease, psoriasis, vitiligo, atopic dermatitis, systemic lupus erythematosus, asthma, diabetic nephropathy, chronic myelogenous leukemia (CML) ,  essential thrombocythemia (ET) , polycythemia vera (PV) , myelofibrosis (MF) , breast cancer and ovarian cancer.
  72. A unit dosage form comprising a pharmaceutical composition according to any of claims 62-71.
  73. The unit dosage form of claim 72, being a tablet.
  74. The unit dosage form of claim 72, being a capsule.
  75. The unit dosage form of claim 72, being a topical formulation.
  76. A method for treating, reducing or preventing a disease or disorder, comprising administering to a subject in need thereof a therapeutically effective amount of a compound according to any one of claims 1-61, wherein the disease or disorder is selected from inflammatory diseases, immune-mediated diseases, cancer, or a related disease or disorder thereof, in a mammal, including a human.
  77. A method for treating, reducing or preventing a disease or disorder, comprising administering to a subject in need thereof a therapeutically effective amount of a compound having the structural formula of (I) :
    or a pharmaceutically acceptable form or an isotope derivative thereof,
    wherein
    Y1 is CH, CF or N;
    Y2 is CH or N;
    Y3 is NR, O, CH2, CF2 or O-NH;
    R1 is a H, F, C1-C3 alkyl and CD3, provided that R1 is not F when Y3 is N, O or O-NH;
    R2 is
    R2’, wherein R2’ is a C1-C6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl, C5-C7 spirocycloalkyl, or C3-C6 heterocycloalkyl, each substituted with 0-2 R2a, wherein R2a  is selected from the group consisting of halogen, CN, OR, NRR’, alkyl, cycloalkyl, heterocyclic;
    an aryl or heteroaryl group, each substituted with 0-2 R2a;
    (C=O) R2b; or
    (C=O) NHR2b;
    R3 is
    wherein
    X6 is CR6 or N;
    X7 is CR7 or N;
    X8 is C or N;
    X9 is CR9, O, S, N or NR9;
    X10 is CR9, O, S, N or NR10; and
    wherein each of Ring A and Ring B is independently an aryl or heteroaryl group;
    R2b is a C1-6 alkyl or C3-6 cycloalkyl, C5-7 spirocycloalkyl, aryl or heteroaryl, each substituted with 0-2 R2c;
    R2c at each occurrence is independently halo, CN, OR, NRR’, OCF3, CF3, C1-6 alkyl, C1-6 haloalkyl, C2-6 alkenyl, C2-6 alkynyl, wherein said alkyl, haloalkyl, alkenyl, alkynyl, R and R’ is substituted with 0-3 R2a; and
    R4 is a C1-3 alkyl, substituted with 0-5 R4a, wherein R4a is selected from D, F and Cl;
    R5 is H, CN, halo, OCH3, C (=O) OCH3, C1-6 alkyl, C3-C6 cycloalkyl or heterocyclic, wherein said alkyl, cycloalkyl or heterocyclic is substituted with 0-3 R5a, wherein each R5a is independently selected from OH, D, F, Cl, CN, OCH3, OCD3, OCF3 and OC (=O) CH3;
    each of R6, R7, R9 and R10 is independently selected from H, F, Cl, CN, CD3, CH2CF3, CF3, OR, NRR’, C1-C3 alkyl and C3-C5 cycloalkyl, wherein said alkyl, cycloalkyl, R and R’ is substituted with 0-2 R2a; and
    each of R and R’ is independently H or a C1-C6 alkyl or acyl, or R and R’, together with the nitrogen atom to which they are bound, form a 4-to 7-membered ring comprising 0-2 heteroatoms selected from O, NR, S and SO2,
    wherein the disease or disorder is selected from inflammatory diseases, immune-mediated diseases, cancer, or a related disease or disorder thereof, in a mammal, including a human.
  78. The method of claim 76 or 77, wherein the disease or disorder is an inflammatory disease.
  79. The method of claim 76 or 77, wherein the disease or disorder is an immune-mediated disease.
  80. The method of claim 76 or 77, wherein the disease or disorder is cancer.
  81. The method of claim 76 or 77, wherein the disease or disorder is selected from: inflammatory bowel disease, psoriasis, vitiligo, atopic dermatitis, systemic lupus erythematosus, asthma, diabetic nephropathy, chronic myelogenous leukemia (CML) , essential thrombocythemia (ET) , polycythemia vera (PV) , myelofibrosis (MF) , breast cancer and ovarian cancer.
  82. The method of any of claims 76-81, wherein administration is via oral administration.
  83. The method of any of claims 76-81, wherein administration is via topical administration.
  84. The method of any of claims 76-81, wherein administration is via GI-restricted administration.
  85. Use of a compound of any of claims 1-61, and a pharmaceutically acceptable excipient, carrier, or diluent, in preparation of a medicament for treating a disease or disorder.
  86. The use of claim 85, wherein the disease or disorder is one or more of inflammatory diseases, immune-mediated diseases and cancer.
  87. The use of claim 86, wherein the disease or disorder is an inflammatory disease.
  88. The use of claim 86, wherein the disease or disorder is an immune-mediated disease.
  89. The use of claim 86, wherein the disease or disorder is cancer.
  90. The use of any one of claims 85-89, wherein the medicament is for oral administration.
  91. The use of any one of claims 85-89, wherein the medicament is for topical administration.
  92. The use of any one of claims 85-89, wherein the medicament is for GI restriction administration.
  93. A method for preparing a compound of any one of claims 1-61.
PCT/CN2023/100518 2023-06-15 2023-06-15 Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof Pending WO2024254834A1 (en)

Priority Applications (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/CN2023/100518 WO2024254834A1 (en) 2023-06-15 2023-06-15 Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof
PCT/CN2023/137938 WO2024255164A1 (en) 2023-06-15 2023-12-11 Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof
PCT/CN2024/099405 WO2024255885A1 (en) 2023-06-15 2024-06-14 Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof
TW113122024A TW202502755A (en) 2023-06-15 2024-06-14 Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/CN2023/100518 WO2024254834A1 (en) 2023-06-15 2023-06-15 Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2024254834A1 true WO2024254834A1 (en) 2024-12-19

Family

ID=93851113

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/CN2023/100518 Pending WO2024254834A1 (en) 2023-06-15 2023-06-15 Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof
PCT/CN2023/137938 Pending WO2024255164A1 (en) 2023-06-15 2023-12-11 Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/CN2023/137938 Pending WO2024255164A1 (en) 2023-06-15 2023-12-11 Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof

Country Status (1)

Country Link
WO (2) WO2024254834A1 (en)

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111484480A (en) * 2019-01-29 2020-08-04 上海翰森生物医药科技有限公司 Polycyclic derivative inhibitor, preparation method and application thereof
CN115003667A (en) * 2020-02-26 2022-09-02 百济神州有限公司 TYK-2 inhibitors
CN115466257A (en) * 2021-06-11 2022-12-13 爱科诺生物医药(香港)有限公司 Compound with TYK2 inhibitory activity, pharmaceutical composition containing same, and application thereof

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP4240362A4 (en) * 2020-11-09 2024-10-23 Merck Sharp & Dohme LLC HPK1 DIAMINOPYRIMIDINE CARBOXAMIDE INHIBITORS

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111484480A (en) * 2019-01-29 2020-08-04 上海翰森生物医药科技有限公司 Polycyclic derivative inhibitor, preparation method and application thereof
CN115003667A (en) * 2020-02-26 2022-09-02 百济神州有限公司 TYK-2 inhibitors
CN115466257A (en) * 2021-06-11 2022-12-13 爱科诺生物医药(香港)有限公司 Compound with TYK2 inhibitory activity, pharmaceutical composition containing same, and application thereof

Also Published As

Publication number Publication date
WO2024255164A1 (en) 2024-12-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11851431B2 (en) Tricyclic Janus kinase 1 inhibitors, and compositions and methods thereof
WO2020118683A1 (en) Benzamides of pyrazolyl-amino-pyrimidinyl derivatives, and compositions and methods thereof
US12024503B2 (en) Benzethers and anilines of pyrazolyl-amino-pyrimidinyl derivatives, and compositions and methods thereof
WO2023109120A1 (en) Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof
WO2024254834A1 (en) Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof
WO2024255885A1 (en) Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof
JP2020530443A (en) Inhibitors of mutant isocitrate dehydrogenase, their compositions, and methods
WO2024255886A1 (en) Tyk2 inhibitors and compositions and methods thereof
RU2824349C2 (en) Tricyclic janus kinase 1 inhibitors, compositions, methods of production and use thereof

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 23941069

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1