WO2024143514A1 - 環状ペプチドの精製法及び製造法 - Google Patents
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- C07K1/32—Extraction; Separation; Purification by precipitation as complexes
Definitions
- the present invention relates to a method for purifying a cyclic peptide and a method for producing a cyclic peptide using the same.
- Non-Patent Document 1 purification by column chromatography (Non-Patent Document 1) has been known as a method for purifying cyclic peptides.
- Patent Document 1 describes that "a cyclic peptide compound produced without isolating and purifying an intermediate can be isolated and purified by crystallization without relying on column chromatography to obtain crystals of the cyclic peptide compound.”
- the present invention relates to, for example, each of the following inventions [1] to [150].
- [1] 1.
- the purification method includes the following separation step (i) or (ii): (i) separating the cyclic peptide to be purified from a mixture containing the cyclic peptide to be purified as a complex with a metal atom or a metal ion; (ii) separating the cyclic peptide to be purified or the peptide to be an impurity from a mixture containing the cyclic peptide to be purified and a peptide to be an impurity as a complex with a metal atom or a metal ion, wherein the metal atom is at least one selected from the group consisting of an alkali metal atom, an alkaline earth metal atom, a transition metal atom, a poor metal atom, and a rare earth metal atom;
- the method for purifying wherein the metal atom is at least one selected from the group consist
- a method for purifying a cyclic peptide comprising the steps of: (1)' comprising a step of mixing a mixture containing a cyclic peptide to be purified, or a mixture containing a cyclic peptide to be purified and a peptide as an impurity, with a metal atom or a metal ion in a first solvent;
- the metal atom is at least one selected from the group consisting of an alkali metal atom, an alkaline earth metal atom, a transition metal atom, a poor metal atom, and a rare earth metal atom;
- the method for purifying, wherein the metal ion is at least one selected from the group consisting of an alkali metal ion, an alkaline earth metal ion, a transition metal ion, a poor metal ion and a rare earth metal ion.
- a method for purifying a cyclic peptide comprising the steps of: (4) mixing the cyclic peptide to be purified or the peptide as an impurity with a complex of a metal atom or a metal ion, and a second solvent; the metal atom is at least one selected from the group consisting of an alkali metal atom, an alkaline earth metal atom, a transition metal atom, a poor metal atom, and a rare earth metal atom; The method for purifying, wherein the metal ion is at least one selected from the group consisting of an alkali metal ion, an alkaline earth metal ion, a transition metal ion, a poor metal ion and a rare earth metal ion.
- step (6) further comprises a step of removing the third solvent from the organic phase to obtain the cyclic peptide as the purification target.
- step (6) further comprises a step of removing the third solvent from the organic phase to obtain the cyclic peptide as the purification target.
- the removal of the third solvent from the organic phase is carried out by vacuum distillation.
- step (6) further comprises a step of mixing the separated complex, a fourth solvent, and a ligand or a compound that generates a ligand, or an anion or a compound that generates an anion, to form a first complex or a first metal salt between the metal atom or the metal ion and the ligand or the anion.
- the complex is a complex obtained by contacting the cyclic peptide as a purification target or the peptide as an impurity with the metal atom or the metal ion.
- the poor metal is at least one selected from the group consisting of bismuth and indium.
- the metal atom is at least one selected from the group consisting of magnesium atoms, scandium atoms, and samarium atoms, The purification method according to any one of [1] to [57], wherein the metal ion is at least one selected from the group consisting of magnesium ions, scandium ions, and samarium ions.
- the metal atoms include magnesium atoms, The purification method according to any one of [1] to [57], wherein the metal ion includes a magnesium ion.
- metal salt is at least one selected from the group consisting of iodide salts, bromide salts, chloride salts, perchlorate salts, oxide salts, trifluoromethanesulfonate salts, toluenesulfonate salts, isopropylsulfonate salts, methanesulfonate salts, carbonate salts, acetate salts, bis(trifluoromethanesulfonic acid)imide salts, ethylmalonate salts, and nitrite salts.
- the metal salt is at least one selected from the group consisting of iodide salts, bromide salts, chloride salts, perchlorate salts, oxide salts, trifluoromethanesulfonate salts, toluenesulfonate salts, isopropylsulfonate salts, methanesulfonate salts, carbonate salts, acetate salts, bis(tri
- the bis(trifluoromethanesulfonyl)imide salt is at least one selected from the group consisting of magnesium bis(trifluoromethanesulfonyl)imide, zinc bis(trifluoromethanesulfonyl)imide, and iron(II) bis(trifluoromethanesulfonyl)imide.
- the ethyl malonate is magnesium ethyl malonate.
- the metal atom or the metal ion is selected from the group consisting of lithium iodide, lithium perchlorate, lithium tetrafluoroborate, lithium bromide, lithium chloride, potassium iodide, lithium fluoride, potassium carbonate, potassium nitrite, potassium acetate, potassium tetrafluoroborate, potassium hexafluorophosphate, barium iodide, barium perchlorate, magnesium ethylmalonate, magnesium bis(trifluoromethanesulfonic acid)imide, magnesium oxide, magnesium bromide, magnesium perchlorate, magnesium iodide, magnesium trifluoromethanesulfonate, magnesium sulfate, magnesium acetate, magnesium chloride, magnesium fluoride, calcium iodide, calcium perchlorate, calcium bromide, calcium trifluoromethanesulfonate, calcium carbonate, strontium iodide, scandium trifluoromethanesulfon
- [112] The purification method according to any one of [73] and [109] to [111], wherein the second complex is at least one selected from the group consisting of iron(III) tris(acetylacetonate), ferrocene, zinc(II) acetylacetonate zinc(II) and tungsten hexacarbonyl.
- the first solvent is a solvent capable of forming a complex between the cyclic peptide as a purification target or the peptide as an impurity and the metal atom or the metal ion.
- the third solvent is at least one selected from the group consisting of 2-methyltetrahydrofuran, tetrahydrofuran, dimethyl carbonate, anisole, isopropyl acetate, ethyl acetate, MTBE (tert-butyl methyl ether), diethyl ether, dichloromethane, chloroform, DME (dimethyl ether), CPME (cyclopentyl methyl ether), 4-methyltetrahydropyran, heptane, and toluene.
- the third solvent is at least one selected from the group consisting of 2-methyltetrahydrofuran, tetrahydrofuran, dimethyl carbonate, anisole, isopropyl acetate, ethyl acetate, MTBE (tert-butyl methyl ether), diethyl ether, dichloromethane, chloroform, DME (dimethyl ether), CPME (cyclopentyl methyl ether), 4-
- mixing may mean the “operation” of mixing a substance with another substance, and does not necessarily mean only bringing a substance into a mixed state with another substance.
- mixing (i) and (ii) includes any of the following: adding (i) to (ii), adding (ii) to (i), and adding (i) and (ii) simultaneously.
- the term “to” indicating a range includes both ends of the range, for example, “A to B” means a range equal to or greater than A and equal to or less than B.
- the term “about” when used in combination with a numerical value means a range of +10% and -10% of the numerical value.
- A, B, and/or C includes the following seven variations: (i) A, (ii) B, (iii) C, (iv) A and B, (v) A and C, (vi) B and C, and (vii) A, B, and C.
- the metal atom or the metal ion is preferably 0.2 molar equivalents to 12 molar equivalents, more preferably 0.5 molar equivalents to 4 molar equivalents, and most preferably 0.8 molar equivalents to 1.2 molar equivalents.
- the first complex may mean a complex (complex) between the cyclic peptide to be purified or the peptide that is an impurity and a metal atom or a metal ion, and a complex different from the second complex, and may be the same complex as the complex between the cyclic peptide to be purified or the peptide that is an impurity and a metal atom or a metal ion, and the second complex.
- a solution in which the compound to be measured is dissolved in a solvent suitable for NMR measurement can be added to an NMR measurement sample tube and set in a measurement device for measurement.
- the solvent suitable for NMR measurement is preferably a solvent capable of dissolving the compound to be measured, and a commercially available deuterated solvent can also be used.
- the NMR measurement conditions can be conditions known to those skilled in the art or conditions described in the manual of the measurement device.
- the measurement conditions are not particularly limited as long as the target peak component can be measured, but for example, the measurement temperature can be in the range of 273 K to 320 K, the integration time can be in the range of 1 second to 7 days, and the rotation speed of the sample tube can be in the range of 0 to 20 Hz.
- Each may have a substituent, and the substituents are not limited, and may be independently selected from any substituents including, for example, a halogen atom, an oxygen atom, a nitrogen atom, a sulfur atom, a boron atom, a silicon atom, or a phosphorus atom. That is, examples include alkyl groups, alkoxy groups, alkoxyalkyl groups, alkenyl groups, alkynyl groups, aryl groups, heteroaryl groups, aralkyl groups, cycloalkyl groups, etc., which may be substituted, or oxo, aminocarbonyl, halogen atoms, etc.
- side chain of an amino acid means, in the case of an ⁇ -amino acid, the atomic group attached to the carbon to which the amino group and carboxyl group are attached ( ⁇ -carbon).
- ⁇ -amino acid the atomic group attached to the carbon to which the amino group and carboxyl group are attached
- the methyl group of Ala is the side chain of an amino acid.
- the atomic group attached to the ⁇ -carbon and/or ⁇ -carbon can be the side chain of the amino acid
- the atomic group attached to the ⁇ -carbon, ⁇ -carbon, and/or ⁇ -carbon can be the side chain of the amino acid.
- the "main chain of an amino acid” refers to the chain portion consisting of an amino group, an ⁇ -carbon, and a carboxyl group in the case of an ⁇ -amino acid, the chain portion consisting of an amino group, a ⁇ -carbon, an ⁇ -carbon, and a carboxyl group in the case of a ⁇ -amino acid, and the chain portion consisting of an amino group, a ⁇ -carbon, a ⁇ -carbon, an ⁇ -carbon, and a carboxyl group in the case of a ⁇ -amino acid.
- the main chain amino group of an amino acid may be unsubstituted (-NH 2 ) or substituted (i.e., -NHR, where R is, for example, an alkyl group, an alkenyl group, an alkynyl group, an aryl group, a heteroaryl group, an aralkyl group, a cycloalkyl group, or the like, which may have a substituent, and the carbon chain bonded to the N atom and the carbon atom at the ⁇ -position may form a ring, as in proline).
- R is, for example, an alkyl group, an alkenyl group, an alkynyl group, an aryl group, a heteroaryl group, an aralkyl group, a cycloalkyl group, or the like, which may have a substituent, and the carbon chain bonded to the N atom and the carbon atom at the ⁇ -position may form a ring, as in proline).
- substituteduents containing halogen atoms include fluoro (-F), chloro (-Cl), bromo (-Br), and iodine (-I).
- examples of a "substituent containing a phosphorus atom” include phosphoryl (-P(O)-R 1 R 2 ), phosphonyl (-O-P(O)-R 1 R 2 ) and phospho (-PO 3 H 2 ).
- the cyclic peptide to be purified may contain at least one or more unnatural amino acids.
- the cyclic peptide to be purified may contain an N-substituted amino acid.
- the cyclic peptide to be purified may contain 3 or more, 4 or more, 5 or more, or 6 or more N-substituted amino acids, and may contain 15 or less, 13 or less, or 10 or less.
- the number of N-substituted amino acid residues in the cyclic peptide to be purified may be 45% or more, 50% or more, 55% or more, or 60% or more of the number of amino acid residues in the cyclic portion of the cyclic peptide, and may be 80% or less, 75% or less, 70% or less, or 65% or less, with 45% to 80% being preferred.
- an amino acid whose main chain amino group is unsubstituted is referred to as an "N-unsubstituted amino acid".
- the cyclic peptide to be purified may contain an N-unsubstituted amino acid.
- the N-unsubstituted amino acid may be a non-natural amino acid.
- the ratio of the number of the N-unsubstituted amino acids in the cyclic peptide to be purified to the total number of amino acid residues in the cyclic peptide to be purified may be 55% or less, 50% or less, 45% or less, or 40% or less, and may be 20% or more, 25% or more, 30% or more, or 35% or more, with 20% to 55% being preferred.
- the compounds described herein may contain non-natural isotope atoms in one or more atoms constituting such compounds.
- the present invention also includes compounds in which any atom in a compound is replaced with another isotope atom having the same atomic number (proton number) and a different mass number (sum of the number of protons and neutrons), thereby replacing the isotope with an abundance ratio different from that of the natural isotope, that is, a compound labeled with an isotope atom.
- Examples of isotope elements contained in the compounds of the present specification include hydrogen atoms, carbon atoms, nitrogen atoms, oxygen atoms, phosphorus atoms, sulfur atoms, fluorine atoms, and chlorine atoms, and each of these includes 2 H, 3 H, 13 C, 14 C, 15 N, 17 O, 18 O, 32 P, 35 S, 18 F, and 36 Cl.
- Compounds labeled with isotope atoms are useful as therapeutic agents, preventive agents, research reagents (e.g., assay reagents), or diagnostic agents (e.g., in vivo imaging diagnostic agents).
- Compounds herein containing radioactive or non-radioactive isotopes in all proportions are within the scope of the present invention.
- Compounds labeled with isotope atoms can be prepared in a similar manner to the preparation of unlabeled compounds, using reagents and solvents containing the corresponding isotope atoms.
- the peptide that is an impurity may be a peptide produced during the synthesis process of the cyclic peptide that is the target of purification.
- the peptide that is an impurity may be a cyclic peptide different from the cyclic peptide that is the target of purification.
- the peptide that is an impurity may be a cyclic peptide having twice the number of amino acids as the cyclic peptide that is the target of purification, a cyclic peptide having three times the number of amino acids as the cyclic peptide that is the target of purification, or an isomer of the cyclic peptide that is the target of purification.
- a preferred example of an isomer is a diastereomer.
- the metal atom or metal ion may be an atom or ion of an alkali metal, alkaline earth metal, transition metal, rare earth metal, or poor metal.
- the alkali metal is preferably at least one selected from the group consisting of lithium, sodium, potassium, rubidium and cesium, and more preferably lithium or potassium.
- the alkaline earth metal is preferably at least one selected from the group consisting of magnesium, calcium, strontium, and barium, and more preferably at least one selected from the group consisting of magnesium, calcium, and barium.
- the metal atom or metal ion may be an atom or ion resulting from a metal salt or a solvate thereof, or a second complex, or may be an atom or ion resulting from a metal salt or a solvate thereof.
- the second complex may mean a complex (complex) between the cyclic peptide to be purified or the peptide to be an impurity and a metal atom or a metal ion, or a complex different from the first complex, or a complex between the cyclic peptide to be purified or the peptide to be an impurity and a metal atom or a metal ion, or the same complex as the first complex may be used.
- the metal salt may mean a metal salt different from the first metal salt, or may be the same metal salt as the first metal salt.
- the bromide salt may be at least one selected from the group consisting of lithium bromide, magnesium bromide, calcium bromide, samarium(III) bromide, zinc bromide, and indium bromide.
- the trifluoromethanesulfonate may be at least one selected from the group consisting of magnesium trifluoromethanesulfonate, calcium trifluoromethanesulfonate, scandium trifluoromethanesulfonate, samarium (III) trifluoromethanesulfonate, cerium trifluoromethanesulfonate, ytterbium trifluoromethanesulfonate, zinc trifluoromethanesulfonate, manganese trifluoromethanesulfonate, indium trifluoromethanesulfonate, iron (III) trifluoromethanesulfonate, and copper trifluoromethanesulfonate.
- the toluenesulfonate may be zinc(II) toluenesulfonate.
- the isopropyl sulfonate may be zinc(II) isopropyl sulfonate.
- the methanesulfonate may be at least one selected from the group consisting of cerium(III) methanesulfonate and zinc difluoromethanesulfonate.
- the carbonate may be at least one selected from the group consisting of potassium carbonate, calcium carbonate, and zinc carbonate.
- the bis(trifluoromethanesulfonyl)imide salt may be at least one selected from the group consisting of magnesium bis(trifluoromethanesulfonyl)imide, zinc bis(trifluoromethanesulfonyl)imide, and iron(II) bis(trifluoromethanesulfonyl)imide.
- the ethyl malonate may be magnesium ethyl malonate.
- Metal atoms or metal ions include lithium iodide, lithium perchlorate, lithium tetrafluoroborate, lithium bromide, lithium chloride, potassium iodide, lithium fluoride, potassium carbonate, potassium nitrite, potassium acetate, potassium tetrafluoroborate, potassium hexafluorophosphate, barium iodide, barium perchlorate, magnesium ethylmalonate, magnesium bis(trifluoromethanesulfonic acid)imide, magnesium oxide, magnesium bromide, magnesium perchlorate, magnesium iodide, magnesium trifluoromethanesulfonate, magnesium sulfate, magnesium acetate, magnesium chloride, magnesium fluoride, calcium iodide, calcium perchlorate, calcium bromide, calcium trifluoromethanesulfonate, calcium carbonate, strontium iodide, scandium trifluoromethanesulfonate, scandium chloride, sama
- the metal atom or metal ion is preferably an atom or ion derived from at least one metal salt or a solvate thereof selected from the group consisting of lithium iodide, lithium perchlorate, potassium iodide, barium iodide, barium perchlorate, magnesium bromide, magnesium perchlorate, magnesium iodide, magnesium trifluoromethanesulfonate, calcium bromide, scandium trifluoromethanesulfonate, samarium trifluoromethanesulfonate, cerium trifluoromethanesulfonate, ytterbium trifluoromethanesulfonate, zinc trifluoromethanesulfonate, manganese trifluoromethanesulfonate, indium trifluoromethanesulfonate, magnesium sulfate, magnesium acetate, and magnesium chloride.
- the first solvent may be a solvent capable of forming a complex between the cyclic peptide to be purified or the peptide to be an impurity and the metal atom or the metal ion, and may include at least one solvent selected from the group consisting of alcohol-based solvents, nitrile-based solvents, benzene-based solvents, ether-based solvents, ketone-based solvents, halogen-based solvents, ester-based solvents, sulfoxide-based solvents, and amide-based solvents.
- the first solvent is a solvent described in this paragraph, a complex between the cyclic peptide to be purified or the peptide to be an impurity and the metal atom or metal ion is easily formed.
- alcohol-based solvents include methanol, ethanol, 1-propanol, 2-propanol, tert-butanol, 2,2,2-trifluoroethanol, ethylene glycol, etc.
- nitrile-based solvents include chain nitriles such as acetonitrile, propionitrile, and acrylonitrile; and cyclic nitriles such as benzonitrile.
- benzene-based solvents include toluene, o-dichlorobenzene, 1,2,4-trichlorobenzene, and xylene.
- the ether-based solvent as the first solvent is preferably at least one selected from the group consisting of tetrahydrofuran, 1,4-dioxane, 2-methyltetrahydrofuran, MTBE (tert-butyl methyl ether), DME (dimethyl ether), and CPME (cyclopentyl methyl ether).
- the ketone-based solvent as the first solvent is preferably acetone or methyl ethyl ketone.
- the halogen-based solvent as the first solvent is preferably dichloromethane.
- the sulfoxide-based solvent as the first solvent is preferably dimethyl sulfoxide.
- the amide-based solvent as the first solvent is preferably dimethylformamide or dimethylacetamide.
- the second solvent may include at least one selected from the group consisting of ether-based solvents, benzene-based solvents, ketone-based solvents, halogen-based solvents, ester-based solvents, nitrile-based solvents, hydrocarbon-based solvents, alcohol-based solvents, sulfoxide-based solvents, and amide-based solvents.
- the ether-based solvent as the second solvent is preferably at least one selected from the group consisting of 2-methyltetrahydrofuran, tetrahydrofuran, 1,4-dioxane, MTBE (tert-butyl methyl ether), DME (dimethyl ether), and CPME (cyclopentyl methyl ether).
- the benzene-based solvent as the second solvent is preferably toluene or xylene.
- the ketone-based solvent as the second solvent is preferably acetone or methyl ethyl ketone.
- the halogen-based solvent as the second solvent is preferably dichloromethane.
- the hydrocarbon-based solvent as the second solvent is preferably at least one selected from the group consisting of hexane, heptane, cyclohexane, methylcyclohexane, and isooctane.
- the ester-based solvent as the second solvent is preferably isopropyl acetate or ethyl acetate.
- the nitrile-based solvent as the second solvent is preferably acetonitrile.
- the alcohol-based solvent as the second solvent is preferably at least one selected from the group consisting of methanol, ethanol, butanol, or benzyl alcohol.
- the sulfoxide-based solvent as the second solvent is preferably dimethyl sulfoxide.
- the amide solvent used as the second solvent is preferably dimethylformamide.
- the second solvent is preferably a combination of isopropyl acetate or methyl ethyl ketone and heptane, a combination of dichloromethane and hexane, or a combination of acetonitrile and MTBE.
- the third solvent may be a solvent that is immiscible with water (e.g., a solvent that has low solubility in water, a solvent that has a high octanol/water partition coefficient (log Kow), or a solvent that has a high predicted octanol/water partition coefficient).
- a solvent that is immiscible with water e.g., a solvent that has low solubility in water, a solvent that has a high octanol/water partition coefficient (log Kow), or a solvent that has a high predicted octanol/water partition coefficient).
- the octanol/water partition coefficient may be determined by any method known in the art or described herein.
- the predicted octanol/water partition coefficient (Log Kow) may be determined by known means in separate explicit measurements, such as, but not limited to, a database search or literature search.
- the method for measuring the octanol/water partition coefficient includes, but is not limited to, a method in accordance with Japanese Industrial Standard JIS 7260-107:2000 Determination of partition coefficient (1-octanol/water) - Shake flask method (https://kikakurui.com/z7/Z7260-107-2000-01.html [Accessed: December 25, 2023]).
- the water-immiscible organic solvent includes, but is not limited to, an organic solvent having low water solubility (e.g., solubility in water of 200 g/L or less, preferably 150 g/L or less).
- the water-immiscible organic solvent may contain other water-miscible organic solvents in trace amounts, e.g., 0.01 wt % or less.
- the water solubility may be determined by any method known in the art or described herein. Exemplary methods for determining the solubility include, but are not limited to, gas chromatography, which may be determined by measuring the concentration of the organic solvent in water prepared by mixing equal volumes of the organic solvent and water at room temperature (e.g., 15° C. to 40° C., preferably 20° C. to 30° C.).
- the water immiscible solvent can be characterized as an ester having 3 to 10 carbon atoms, examples of which include ethyl acetate, isopropyl acetate, n-propyl acetate, t-butyl acetate, methyl propionate, or ethyl propionate.
- NMR measurements were performed at absolute temperatures of 298K or 278K using a Bruker AVANCE III 600 Cryo-TCI, AVANCE III HD 600 SMART-BBFO, AVANCE NEO 600 iProbeTBO, or AVANCE NEO 600 Cryo-TCI-H&F.
- N-alkylamino acid An amino acid having an alkylated N-terminus (N-alkylamino acid) can be produced by reacting an amino acid having a non-alkylated N-terminus with an aldehyde in accordance with the method of Freidinger et al. (J. Org. Chem., 1983, 48(1), 77-81) to obtain an oxazolidinone having a cyclic protecting group introduced therein, and then carrying out a ring-opening reaction of the cyclic protecting group.
- compound aa01 was purchased from a commercial supplier.
- the synthesis method of compound aa02 will be described in detail.
- EDCI.HCl (67.1 g, 350 mmol)
- HOBt (43.4 g, 321 mmol)
- Fmoc-Asp(OtBu)-OH (compound aa01, CAS: 71989-14-5) (120 g, 292 mmol) were mixed in order in DMF (600 mL) at 0° C.
- the resulting mixture was stirred at 0° C. for 1 hour.
- Pyrrolidine (26.3 mL, 321 mmol) was slowly added to the resulting reaction solution, and the mixture was stirred at 0° C.
- dichloromethane 350 mL was added and the reaction vessel was shaken for 5 minutes. After applying nitrogen pressure to remove the liquid components in the reaction vessel, dichloromethane (350 mL) was added and the reaction vessel was shaken for 5 minutes. In this way, washing of the resin with dichloromethane was repeated five times.
- compound aa05 Fmoc-Ile-OH, CAS: 71989-23-6
- Fmoc-Pro-OH CAS: 71989-31-6
- Fmoc-Asp(OAl)-OH CAS: 146982-24-3
- peptide elongation was performed by the basic synthesis method of a cyclic peptide shown in Figure 1.
- the basic synthesis method of a cyclic peptide shown in Figure 1 is as follows: 1) A peptide elongation reaction from the N-terminus of an amino acid by the Fmoc method using a carboxyl group of the Asp side chain or a carboxyl group of a peptide main chain supported on a 2-chlorotrityl resin (a peptide chain elongation reaction using an amino acid protected with an Fmoc group as a raw material); 2) Cleavage process of peptide from 2-chlorotrityl resin; 3) Amide cyclization by condensation of the carboxyl group of the Asp side chain or the carboxyl group of the peptide main chain generated by the cleavage process from the 2-chlorotrityl resin with the amino group of the N-terminus of the peptide chain (triangle unit).
- Peptide compounds containing N-alkylamino acids can be synthesized using the N-alkylamino acids protected by Fmoc groups shown in Tables 2 to 4 as starting materials according to " ⁇ General peptide synthesis method>" described in the present Examples and Reference Examples.
- the number of molar equivalents was calculated based on the amino acid loading rate (mmol/g) of the resin used as the raw material multiplied by the amount of resin used (usually 100 mg).
- the resin was washed 4 times with DMF (0.7 mL per reaction vessel) and 4 times with DCM (0.7 mL per reaction vessel), and dried to obtain Fmoc-MeAla-Pro-MeAla-Cha-Leu-Pro-MePhe(34-F2)-Ala(cPent)-MePhe(4-F)-MeVal-Asp(O-Trt(2-Cl)-resin)-pyrro (compound 3).
- the number of molar equivalents was calculated based on the amino acid loading rate (mmol/g) of the resin used as the raw material multiplied by the amount of resin used (usually 100 mg).
- the production of the desired cyclic peptide was confirmed by LC/MS measurement (Waters SQ Detector2), and the reaction solution was distilled under reduced pressure using a Genevac high-throughput centrifugal evaporator (HT-12).
- the compound was extracted with 1,2-dimethyl-2,5-dihydro-1,2,3-tetrahydrofuran-2,6-dihydro-2,7-trimethyl-4-(2-fluorophenyl)methyl-3-isobutyl-25-isopropyl-9,10,18,19,26,29,35-heptamethyl-22-(pyrrolidine-1-carbonyl)-1,4,7,10,16,19,23,26,29,32,35-undecazatricyclo[35.3.0.012,16]tetracontane-2,5,8,11,17,20,24,27,30,33,36-undecaone) (2.3 g, 68%, purity 84% [peak area percentage]).
- isomer 1 and isomer 2, which are isomers of compound 6 were confirmed from the results of accurate mass analysis before and after the retention time of compound 6 (around 11.1 minutes) (around retention time 10.8 minutes and around retention time 11.4 minutes).
- isomer 1 of compound 6 observed around retention time 10.8 minutes was present at a peak area percentage of 2.0%
- isomer 2 of compound 6 observed around retention time 11.4 minutes was present at a peak area percentage of 6.8%.
- isomer 1 and/or isomer 2 are presumed to be diastereomers of compound 6.
- the relative retention time refers to the value obtained by dividing the retention time of each peak by the retention time of the target product (compound 6 in this case).
- the 1 H-NMR spectrum of compound 6 without the addition of magnesium perchlorate was compared with the 1 H-NMR spectrum of compound 6 with the addition of about 1 molar equivalent of magnesium perchlorate relative to compound 6.
- the spectrum was marked as "not formed” if this did not suggest the formation of a complex.
- Example 1-1 The sample for HPLC measurement in Example 1-1 was prepared to have an initial concentration of about 0.3 mg/mL.
- HPLC was performed on a sample prepared under the same conditions (purity analysis conditions A) as the purity confirmation conditions for compound 6 in Reference Example 1-2.
- purity analysis conditions A purity analysis conditions
- an accurately prepared sample of about 0.3 mg/mL was subjected to HPLC measurement under the above conditions, and the purity and recovery rate were calculated based on the peak area percentage and peak area (measured at 220 nm).
- the ratio of isomer 1 and isomer 2 to compound 6 and the purification efficiency were calculated.
- Recovery rate calculation method 1 For example, if an experiment was conducted using about a mg of raw material, the solid and solution were centrifuged, the solvent was removed by vacuum reduction or nitrogen spraying, and the supernatant was vacuum dried. b mL of acetonitrile was added to the solid, and (150 b/a) ⁇ L of the resulting solution was sampled, and then a sample was prepared so that the entire solution was 0.5 mL of 50% v/v acetonitrile aqueous solution. The HPLC of the prepared sample and an accurately prepared 0.30 mg/mL standard were measured, and if the peak areas (220 nm) of the target substance were c, d, and d, respectively, the recovery rate was expressed by the following formula. In addition, correction was performed based on the weighed value in consideration of the case where the actual weighed value (e mg) does not match the assumed weight a mg.
- Recovery rate calculation method 3 In addition, if an experiment was performed using a mg of raw material, the supernatant and solid were centrifuged, the solvent contained in the supernatant or solid was removed by vacuum distillation and dried, and then 0.5 mL (or 1.0 mL) of acetonitrile was added, and 5 ⁇ L (or 10 ⁇ L) of the resulting solution was mixed with 495 ⁇ L (or 490 ⁇ L) of acetonitrile to prepare a sample. Meanwhile, d mg of raw material was weighed and a standard was prepared in a 10 mL measuring flask. The HPLC of the prepared sample and standard were measured, and if the peak areas (220 nm) of the target product were f and e, respectively, the recovery rate was expressed by the following formula.
- the obtained solid was dried for 6 hours and then dissolved in acetonitrile (0.5 mL), and the purity and recovery rate were confirmed by HPLC, showing that the purity was 90% and the recovery rate was 76%. It was confirmed that the precipitated solid was purified by these operations.
- Methyl ethyl ketone (0.33 mL) was further added and stirred for 6 hours, and the resulting solid and solution were centrifuged. After distilling off the solvent, the vacuum-dried supernatant and solid were redissolved in acetonitrile (1.0 mL). From the obtained supernatant and acetonitrile solution of the solid (1.0 mL), 15 ⁇ L was sampled, and the whole solution was adjusted to 0.5 mL of 50% v/v acetonitrile aqueous solution. The purity and recovery rate were confirmed by HPLC, and it was confirmed that the solid was purified.
- the masses of the inorganic salts in Runs 27 to 31 were calculated from the volume of the solution obtained by preparing an acetonitrile solution of each inorganic salt, dispensing it, and mixing it with compound 6.
- the obtained solid was washed with a mixed solution of dichloromethane (1 mL) and hexane (0.5 mL), and the solid obtained by centrifugation was vacuum dried overnight, and 13.64 mg of compound 6-Mg(ClO 4 ) 2 complex was obtained as a solid.
- the purity and recovery rate of the obtained complex were confirmed by HPLC, and it was found that the purity was 90% and the recovery rate was 82%. It was confirmed that the precipitated solid was purified by these operations.
- Table 11 shows the calculation results of the purity of the supernatant and solid, the recovery rate, the ratio of compound 6 to isomer 1 or isomer 2 given by the following formula, and the purification efficiency for confirming the degree to which compound 6, isomer 1, and isomer 2 were separated from compound 6.
- Ratio of isomer 1 to compound 6 x 100 (Peak area of isomer 1) ⁇ (Peak area of compound 6) ⁇ 100
- Runs 27-31 ethanol (or 60% ethanol in water) was used as the solvent for complex formation, and a purification effect was confirmed in the supernatant in Runs 27 and 28, and in the solid in Runs 30 and 31. Although no significant improvement in purity was observed in Run 29, the purification efficiency was calculated by focusing on the peak at relative retention time 0.71 as shown in Figure 8, and the purification efficiency in the solid was -131%, while in the supernatant it was 100% (not observed), confirming the purification effect.
- the reason why a purification effect was observed in Runs 27-31 is thought to be that the metal salt and compound 6 (or impurities) were dissolved and mixed together in ethanol (or 60% ethanol in water), allowing the formation of a complex.
- Hexane (0.5 mL) was added to each solution and stirred for 1 minute, after which the resulting solid and liquid were quickly centrifuged, and 15 ⁇ L was sampled from the supernatant.
- the solution was stirred again, and 10 minutes after the addition of hexane, centrifuged again, and the supernatant was sampled (15 ⁇ L).
- 30 minutes, 1 hour, 2 hours, 6 hours, and 2 days after the addition of hexane each solution was centrifuged and the supernatant was sampled (15 ⁇ L).
- the solvent was removed from the samples at each stage, and the entire solution was prepared to be 50 ⁇ L of 50% v/v acetonitrile aqueous solution.
- the solvent was removed from the samples sampled at each stage, and the entire solution was prepared to be 0.5 mL of 50% v/v acetonitrile aqueous solution.
- the purity and recovery rate of the supernatant were confirmed by HPLC, and the purity of the standard was 80%, while the purity of the supernatant was 62% and the recovery rate was 21%, indicating that there was a purification effect.
- the solvent was removed from the samples sampled at each stage, and the samples were prepared so that the total solution was 250 ⁇ L and 1.5 mL of 50% v/v acetonitrile aqueous solution, respectively, to match the concentration.
- the purity of the supernatant decreased in both cases, and a purification effect was observed.
- Ratio of Impurity 1 to Compound 9 x 100 (Peak area of impurity 1) ⁇ (Peak area of compound 9) ⁇ 100
- Ratio of impurity 2 to compound 9 x 100 (Peak area of impurity 2) ⁇ (Peak area of compound 9) ⁇ 100
- FIG. 2-a is a diagram of the 1 H-NMR spectrum of compound 6 in an acetonitrile-d3 (CD 3 CN) solution (1.4 mM) without the addition of magnesium perchlorate (Mg(ClO 4 ) 2 ).
- FIG. 2-b is a diagram of the 1 H-NMR spectrum of compound 6 in an acetonitrile-d3 (CD 3 CN) solution (1.4 mM) when magnesium perchlorate (Mg(ClO 4 ) 2 ) was added in an amount of 1 molar equivalent to compound 6.
- FIG. 2-d is a diagram of the 1 H-NMR spectrum of compound 6 in an acetonitrile-d3 (CD 3 CN) solution (1.4 mM) when magnesium perchlorate (Mg(ClO 4 ) 2 ) was added in an amount of 6 molar equivalents relative to compound 6.
- Figure 3 shows 1H-NMR spectra obtained by measuring 1H-NMR at 298K for a solution obtained by dissolving compound 6 in acetonitrile-d3 ( CD3CN ) (cyclic peptide concentration: 1.4 mM) and for solutions obtained by adding 1, 3, and 6 molar equivalents of magnesium iodide ( MgI2 ) to the cyclic peptide (cyclic peptide concentration: 1.4 mM, metal salt addition experiment).
- CD3CN acetonitrile-d3
- MgI2 magnesium iodide
- FIG. 4 shows 1H-NMR spectra obtained by measuring 1H-NMR at 298K for a solution obtained by dissolving compound 6 in acetonitrile-d3 ( CD3CN ) (cyclic peptide concentration: 1.4 mM) and for solutions obtained by adding 1, 3, and 6 molar equivalents of magnesium trifluorosulfonate (Mg(OTf) 2 ) to the cyclic peptide (cyclic peptide concentration: 1.4 mM, metal salt addition experiment).
- CD3CN acetonitrile-d3
- Mg(OTf) 2 magnesium trifluorosulfonate
- FIG. 4-b is a diagram of the 1 H-NMR spectrum of compound 6 in an acetonitrile-d3 (CD 3 CN) solution (1.4 mM) when magnesium trifluorosulfonate (Mg(OTf) 2 ) was added in an amount of 1 molar equivalent to compound 6.
- FIG. 5-b is a diagram of the 1 H-NMR spectrum of compound 6 in an acetonitrile-d3 (CD 3 CN) solution (1.4 mM) when calcium iodide (CaI 2 ) was added in an amount of 1 molar equivalent relative to compound 6.
- FIG. 6 shows 1H-NMR spectra obtained by measuring 1H-NMR at 298K for a solution obtained by dissolving compound 6 in acetonitrile-d3 (CD 3 CN) (cyclic peptide concentration: 1.4 mM) and for solutions obtained by adding 1, 3, and 6 molar equivalents of scandium(III) trifluorosulfonate (Sc(OTf) 3 ) to the cyclic peptide (cyclic peptide concentration: 1.4 mM, metal salt addition experiment) .
- CD 3 CN acetonitrile-d3
- Sc(OTf) 3 scandium(OTf) trifluorosulfonate
- FIG. 6-a is a diagram of the 1 H-NMR spectrum of compound 6 in an acetonitrile-d3 (CD 3 CN) solution (1.4 mM) without the addition of scandium (III) trifluorosulfonate (Sc(OTf) 3 ).
- FIG. 6-b is a diagram of the 1 H-NMR spectrum of compound 6 in an acetonitrile-d3 (CD 3 CN) solution (1.4 mM) when scandium(III) trifluorosulfonate (Sc(OTf) 3 ) was added in an amount of 1 molar equivalent to compound 6.
- FIG. 6-d is a diagram of the 1 H-NMR spectrum of compound 6 in an acetonitrile-d3 (CD 3 CN) solution (1.4 mM) when 6 molar equivalents of scandium(III) trifluorosulfonate (Sc(OTf) 3 ) were added to compound 6.
- FIG. 7 shows 1H-NMR spectra obtained by measuring 1H-NMR at 298K for a solution obtained by dissolving compound 6 in acetonitrile-d3 ( CD3CN ) (cyclic peptide concentration: 1.4 mM) and for solutions obtained by adding 1, 3, and 6 molar equivalents of silver trifluorosulfonate (AgOTf) to the cyclic peptide (cyclic peptide concentration: 1.4 mM, metal salt addition experiment).
- CD3CN acetonitrile-d3
- AgOTf silver trifluorosulfonate
- FIG. 7-b is a diagram of the 1 H-NMR spectrum of compound 6 in an acetonitrile-d3 (CD 3 CN) solution (1.4 mM) when 1 molar equivalent of silver trifluorosulfonate (AgOTf) was added to compound 6.
- FIG. 7-c) is a diagram of the 1 H-NMR spectrum of compound 6 in an acetonitrile-d3 (CD 3 CN) solution (1.4 mM) when 3 molar equivalents of silver trifluorosulfonate (AgOTf) were added to compound 6.
- FIG. 8 shows the LC chart measured in Run 29 of Example 2-1.
- Figure 9 shows the LC chart measured in Run 2 of Example 2-3-1.
- FIG. 10-a shows a 1 H-NMR spectrum obtained by adding deuterated acetonitrile (CD 3 CN, 0.6 mL) to 1.13 mg of the solid obtained in Experimental Procedure 1, and measuring 1 H-NMR using 0.5 mL of the resulting solution.
- FIG. 10-b shows the 1 H-NMR spectrum obtained by adding 1 mL of dichloromethane to 1.02 mg of the solid obtained in Experimental Procedure 1, leaving it overnight, drying it, and then adding deuterated acetonitrile (CD 3 CN, 0.5 mL) and measuring the 1 H-NMR.
- FIG. 10-c shows a 1H-NMR spectrum obtained by adding 1 mL of dichloromethane to 1.14 mg of the solid obtained in Experimental Procedure 1 , and then performing a separation operation according to Experimental Procedure 3, to the solid obtained, and adding deuterated acetonitrile (CD 3 CN, 0.5 mL) to measure H-NMR.
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Abstract
Description
〔1〕
環状ペプチドの精製法であって、
前記精製法は、下記(i)又は(ii)の分離工程を含み、
(i)精製目的物である環状ペプチドを含む混合物から、精製目的物である前記環状ペプチドを金属原子又は金属イオンとの複合体として分離する
(ii)精製目的物である環状ペプチド及び不純物であるペプチドを含む混合物から、精製目的物である前記環状ペプチド又は不純物である前記ペプチドを、金属原子又は金属イオンとの複合体として分離する
前記金属原子は、アルカリ金属原子、アルカリ土類金属原子、遷移金属原子、貧金属原子及び希土類金属原子からなる群より選択される少なくとも一種であり、
前記金属イオンは、アルカリ金属イオン、アルカリ土類金属イオン、遷移金属イオン、貧金属イオン及び希土類金属イオンからなる群より選択される少なくとも一種である、精製法。
〔2〕
(1)精製目的物である前記環状ペプチドを含む混合物、又は精製目的物である前記環状ペプチド及び不純物である前記ペプチドを含む混合物と、前記金属原子又は前記金属イオンを混合する工程を前記分離工程の前工程として含む、〔1〕に記載の精製法。
〔3〕
前記(1)工程は、第一の溶媒中で行われる、〔2〕に記載の精製法。
〔4〕
環状ペプチドの精製法であって、
(1)’第一の溶媒中で、精製目的物である環状ペプチドを含む混合物、又は精製目的物である環状ペプチド及び不純物であるペプチドを含む混合物と、金属原子又は金属イオンを混合する工程を含み、
前記金属原子は、アルカリ金属原子、アルカリ土類金属原子、遷移金属原子、貧金属原子及び希土類金属原子からなる群より選択される少なくとも一種であり、
前記金属イオンは、アルカリ金属イオン、アルカリ土類金属イオン、遷移金属イオン、貧金属イオン及び希土類金属イオンからなる群より選択される少なくとも一種である、精製法。
〔5〕
前記(1)’工程において、前記第一の溶媒中で、精製目的物である前記環状ペプチド又は不純物である前記ペプチドと、前記金属原子又は前記金属イオンとの複合体を形成させる、〔4〕に記載の精製法。
〔6〕
(2)前記(1)又は前記(1)’工程において得られた混合物と、第二の溶媒を混合する工程を更に含み、
前記第一の溶媒及び前記第二の溶媒は、互いに異なる溶媒である、〔3〕~〔5〕のいずれかに記載の精製法。
〔7〕
(2)’前記第一の溶媒の少なくとも一部を除去する工程を前記(2)工程の前工程として含む、〔6〕に記載の精製法。
〔8〕
前記(1)工程又は前記(1)’工程において、前記金属原子又は前記金属イオンが、精製目的物である前記環状ペプチドに対し、0.2モル当量~12モル当量である、〔2〕~〔7〕のいずれかに記載の精製法。
〔9〕
前記(1)工程又は前記(1)’工程において、前記金属原子又は前記金属イオンが、精製目的物である前記環状ペプチドに対し、0.5モル当量~4モル当量である、〔2〕~〔8〕のいずれかに記載の精製法。
〔10〕
前記(1)工程又は前記(1)’工程において、前記金属原子又は前記金属イオンが、精製目的物である前記環状ペプチドに対し、0.8モル当量~1.2モル当量である、〔2〕~〔9〕のいずれかに記載の精製法。
〔10-1〕
前記(1)工程又は前記(1)’工程において、前記精製目的物である前記環状ペプチドが、第一の溶媒に対し、0.1mg/mL~1000mg/mLである、〔2〕~〔9〕のいずれかに記載の精製法。
〔10-2〕
前記(1)工程又は前記(1)’工程において、前記精製目的物である前記環状ペプチドが、第一の溶媒に対し、1.0mg/mL~500mg/mLである、〔2〕~〔9〕のいずれかに記載の精製法。
〔10-3〕
前記(1)工程又は前記(1)’工程において、前記精製目的物である前記環状ペプチドが、第一の溶媒に対し、2.7mg/mL~150mg/mLである、〔2〕~〔9〕のいずれかに記載の精製法。
〔11〕
前記(2)工程において、前記(1)又は前記(1)’工程において得られた混合物と、前記第二の溶媒を、液温-20~100℃で混合する、〔6〕~〔10〕のいずれかに記載の精製法。
〔12〕
前記(2)工程において、前記(1)又は前記(1)’工程において得られた混合物と、前記第二の溶媒を、液温20~30℃で混合する、〔6〕~〔11〕のいずれかに記載の精製法。
〔13〕
前記(2)工程において、前記(1)又は前記(1)’工程において得られた混合物と、前記第二の溶媒を、0.5~72時間混合する、〔6〕~〔12〕のいずれかに記載の精製法。
〔14〕
前記(2)工程において、前記(1)又は前記(1)’工程において得られた混合物と、前記第二の溶媒を、1~2時間混合する、〔6〕~〔13〕のいずれかに記載の精製法。
〔15〕
前記(2)工程において、前記第二の溶媒中の前記複合体の濃度が、0.1mg/mL~200mg/mLである、〔6〕~〔14〕のいずれかに記載の精製法。
〔15-1〕
前記(2)工程において、前記第二の溶媒中の前記複合体の濃度が、0.5mg/mL~50mg/mLである、〔6〕~〔14〕のいずれかに記載の精製法。
〔16〕
前記(2)工程において、前記第二の溶媒中の前記複合体の濃度が、1.0mg/mL~30mg/mLである、〔6〕~〔15〕のいずれかに記載の精製法。
〔17〕
(3)前記(1)又は前記(1)’工程において得られた混合物と前記第二の溶媒の混合液から、前記複合体を分離する工程を更に含む、〔6〕~〔16〕のいずれかに記載の精製法。
〔18〕
環状ペプチドの精製法であって、
(4)精製目的物である環状ペプチド又は不純物であるペプチドと、金属原子又は金属イオンとの複合体、及び、第二の溶媒を混合する工程を含み、
前記金属原子は、アルカリ金属原子、アルカリ土類金属原子、遷移金属原子、貧金属原子及び希土類金属原子からなる群より選択される少なくとも一種であり、
前記金属イオンは、アルカリ金属イオン、アルカリ土類金属イオン、遷移金属イオン、貧金属イオン及び希土類金属イオンからなる群より選択される少なくとも一種である、精製法。
〔19〕
(5)前記複合体及び前記第二の溶媒の混合液から、前記複合体を分離する工程を更に含む、〔18〕に記載の精製法。
〔20〕
前記複合体の分離が固液分離、又は液液分配により行われる、〔1〕、〔2〕、〔3〕、〔17〕又は〔19〕に記載の精製法。
〔20-1〕
前記複合体の分離が固液分離により行われる、〔1〕、〔2〕、〔3〕、〔17〕又は〔19〕に記載の精製法。
〔20-2〕
前記複合体の分離が液液分配により行われる、〔1〕、〔2〕、〔3〕、〔17〕又は〔19〕に記載の精製法。
〔21〕
前記固液分離が、遠心分離又は濾過である、〔20〕に記載の精製法。
〔22〕
(6)分離した前記複合体から、前記金属原子又は前記金属イオンを除去する工程を更に含む、〔1〕、〔2〕、〔3〕、〔17〕、〔19〕、〔20〕又は〔21〕に記載の精製法。
〔23〕
前記(6)工程は、分離した前記複合体、第三の溶媒及び水を混合し、水相及び有機相に分液することにより、前記水相中に存在する前記金属原子又は前記金属イオンを除去する工程を含む、〔22〕に記載の精製法。
〔24〕
前記(6)工程は、前記有機相から前記第三の溶媒を除去し、精製目的物である前記環状ペプチドを取得する工程を更に含む、〔23〕に記載の精製法。
〔25〕
前記有機相からの前記第三の溶媒の除去が減圧蒸留により行われる、〔24〕に記載の精製法。
〔26〕
前記(6)工程は、分離した前記複合体、第四の溶媒、及び、配位子若しくは配位子を生じさせる化合物又は陰イオン若しくは陰イオンを生じさせる化合物を混合し、前記金属原子又は前記金属イオンと前記配位子又は前記陰イオンとで第一の錯体又は第一の金属塩を形成させる工程を更に含む、〔22〕に記載の精製法。
〔27〕
前記(6)工程は、前記第一の錯体又は前記第一の金属塩を除去する工程を更に含む、〔26〕に記載の方法。
〔28〕
(7)精製目的物である前記環状ペプチド又は不純物である前記ペプチドと、前記金属原子又は前記金属イオンが前記複合体を形成していることを確認する工程を更に含む、〔1〕~〔4〕及び〔6〕~〔27〕のいずれかに記載の精製法。
〔29〕
前記(7)工程が、精製目的物である前記環状ペプチド又は不純物である前記ペプチドのNMRピークと、前記精製目的物である前記環状ペプチド又は不純物である前記ペプチド、及び、前記金属原子又は前記金属イオンを混合した混合物のNMRピークと、を比較することにより行われる、〔28〕に記載の精製法。
〔30〕
前記複合体が、精製目的物である前記環状ペプチドと前記金属原子又は前記金属イオンの複合体である、〔1〕~〔4〕及び〔6〕~〔29〕のいずれかに記載の精製法。
〔31〕
前記複合体が、不純物である前記ペプチドと前記金属原子又は前記金属イオンの複合体である、〔1〕~〔4〕及び〔6〕~〔29〕のいずれかに記載の精製法。
〔32〕
前記複合体は、精製目的物である前記環状ペプチド又は不純物である前記ペプチドと前記金属原子又は前記金属イオンの接触で得られる複合体である、〔1〕~〔4〕及び〔6〕~〔31〕のいずれかに記載の精製法。
〔33〕
前記複合体は錯体である、〔1〕~〔4〕及び〔6〕~〔32〕のいずれかに記載の精製法。
〔34〕
前記錯体が、固体、結晶、液体又はアモルファスを含む、〔33〕に記載の精製法。
〔35〕
前記錯体が、結晶を含む〔33〕又は〔34〕に記載の精製法。
〔36〕
前記錯体が、アモルファスを含む〔33〕又は〔34〕に記載の精製法。
〔37〕
前記精製目的物である環状ペプチドを含む混合物、又は精製目的物である環状ペプチド及び不純物であるペプチドを含む混合物が、精製目的物である前記環状ペプチドを製造することによって得られた粗生成物である、〔1〕~〔17〕のいずれかに記載の精製法。
〔38〕
精製目的物である前記環状ペプチドのアミノ酸残基数が5~20である、〔1〕~〔37〕のいずれかに記載の精製法。
〔39〕
精製目的物である前記環状ペプチドのアミノ酸残基数が10~14である、〔1〕~〔38〕のいずれかに記載の精製法。
〔40〕
精製目的物である前記環状ペプチドの環状部のアミノ酸残基数が5~15である、〔1〕~〔39〕のいずれかに記載の精製法。
〔41〕
精製目的物である前記環状ペプチドの環状部のアミノ酸残基数が8~14である、〔1〕~〔40〕のいずれかに記載の精製法。
〔42〕
精製目的物である前記環状ペプチドの環状部のアミノ酸残基数が、8、11、13又は14である、〔1〕~〔41〕のいずれかに記載の精製法。
〔43〕
精製目的物である前記環状ペプチドの環状部のアミノ酸残基数が11である、〔1〕~〔42〕のいずれかに記載の精製法。
〔44〕
精製目的物である前記環状ペプチドが非天然アミノ酸を含む、〔1〕~〔43〕のいずれかに記載の精製法。
〔44-1〕
精製目的物である前記環状ペプチドがN-置換アミノ酸を含む、〔1〕~〔43〕のいずれかに記載の精製法。
〔45〕
精製目的物である前記環状ペプチドが、N-置換アミノ酸を3つ以上含む、〔1〕~〔44〕のいずれかに記載の精製法。
〔46〕
精製目的物である前記環状ペプチドが、N-置換アミノ酸を5つ以上含む、〔1〕~〔45〕のいずれかに記載の精製法。
〔47〕
精製目的物である前記環状ペプチドが、N-置換アミノ酸を6つ以上含む、〔1〕~〔46〕のいずれかに記載の精製法。
〔48〕
精製目的物である前記環状ペプチドの前記N-置換アミノ酸残基数が、前記環状ペプチドの前記環状部のアミノ酸残基数に対して45%以上である、〔1〕~〔47〕のいずれかに記載の精製法。
〔49〕
前記N-置換アミノ酸がN-メチルアミノ酸、N-エチルアミノ酸及びN-プロピルアミノ酸からなる群より選択される少なくとも一種である、〔44〕~〔48〕のいずれかに記載の精製法。
〔50〕
前記N-置換アミノ酸がN-メチルアミノ酸である、〔44〕~〔49〕のいずれかに記載の精製法。
〔51〕
精製目的物である前記環状ペプチドが、N-非置換アミノ酸を含む、〔1〕~〔50〕のいずれかに記載の精製法。
〔52〕
前記N-非置換アミノ酸が非天然アミノ酸である、〔51〕に記載の精製法。
〔53〕
精製目的物である前記環状ペプチド中の全アミノ酸残基数に対する、精製目的物である前記環状ペプチド中の前記N-非置換アミノ酸数の割合が55%以下である、〔50〕又は〔51〕に記載の精製法。
〔54〕
精製目的物である前記環状ペプチドのClogP/アミノ酸残基数が1.0以上1.8以下である、〔1〕~〔53〕のいずれかに記載の精製法。
〔55〕
不純物である前記ペプチドが、精製目的物である前記環状ペプチドの合成過程で生じたペプチドである、〔1〕~〔54〕のいずれかに記載の精製法。
〔56〕
不純物である前記ペプチドが、精製目的物である前記環状ペプチドとは異なる環状ペプチドである、〔1〕~〔55〕のいずれかに記載の精製法。
〔57〕
不純物である前記ペプチドが、精製目的物である前記環状ペプチドが有するアミノ酸数の2倍のアミノ酸数を有する環状ペプチド、精製目的物である前記環状ペプチドが有するアミノ酸数の3倍のアミノ酸数を有する環状ペプチド又は精製目的物である前記環状ペプチドの異性体である、〔1〕~〔56〕のいずれかに記載の精製法。
〔58〕
前記金属原子又は前記金属イオンがアルカリ金属の原子又はイオンである、〔1〕~〔57〕のいずれかに記載の精製法。
〔59〕
前記アルカリ金属が、リチウム、ナトリウム、カリウム、ルビジウム及びセシウムからなる群より選択される少なくとも一種である、〔58〕に記載の精製法。
〔60〕
前記アルカリ金属が、リチウム又はカリウムである、〔58〕又は〔59〕に記載の精製法。
〔61〕
前記金属原子又は前記金属イオンがアルカリ土類金属の原子又はイオンである、〔1〕~〔57〕のいずれかに記載の精製法。
〔62〕
前記アルカリ土類金属が、マグネシウム、カルシウム、ストロンチウム及びバリウムからなる群より選択される少なくとも一種である、〔61〕に記載の精製法。
〔63〕
前記アルカリ土類金属が、マグネシウム、カルシウム及びバリウムからなる群より選択される少なくとも一種である、〔60〕又は〔61〕に記載の精製法。
〔64〕
前記金属原子又は前記金属イオンが遷移金属の原子又はイオンである、〔1〕~〔57〕のいずれかに記載の精製法。
〔65〕
前記遷移金属が、スカンジウム、マンガン、鉄、亜鉛及びタングステンからなる群より選択される少なくとも一種である、〔64〕に記載の精製法。
〔66〕
前記遷移金属が、スカンジウム、マンガン及び亜鉛からなる群より選択される少なくとも一種である、〔64〕又は〔65〕に記載の精製法。
〔67〕
前記金属原子又は前記金属イオンが希土類金属の原子又はイオンである、〔1〕~〔57〕のいずれかに記載の精製法。
〔68〕
前記希土類金属が、セリウム、サマリウム及びイッテルビウムからなる群より選択される少なくとも一種である、〔67〕に記載の精製法。
〔69〕
前記金属原子又は前記金属イオンが貧金属の原子又はイオンである、〔1〕~〔57〕のいずれかに記載の精製法。
〔70〕
前記貧金属が、ビスマス及びインジウムからなる群より選択される少なくとも一種である、〔69〕に記載の精製法。
〔71〕
前記金属原子が、マグネシウム原子、スカンジウム原子及びサマリウム原子からなる群より選択される少なくとも一種であり、
前記金属イオンが、マグネシウムイオン、スカンジウムイオン及びサマリウムイオンからなる群より選択される少なくとも一種である、〔1〕~〔57〕のいずれかに記載の精製法。
〔72〕
前記金属原子がマグネシウム原子を含み、
前記金属イオンがマグネシウムイオンを含む、〔1〕~〔57〕のいずれかに記載の精製法。
〔73〕
前記金属原子又は前記金属イオンが、金属塩若しくはその溶媒和物又は第二の錯体から生じた原子又はイオンである、〔1〕~〔72〕のいずれかに記載の精製法。
〔74〕
前記金属原子又は前記金属イオンが、金属塩又はその溶媒和物から生じた原子又はイオンである、〔1〕~〔73〕のいずれかに記載の精製法。
〔75〕
前記金属塩が、ヨウ化物塩、臭化物塩、塩化物塩、過塩素酸塩、酸化物塩、トリフルオロメタンスルホン酸塩、トルエンスルホン酸塩、イソプロピルスルホン酸塩、メタンスルホン酸塩、炭酸塩、酢酸塩、ビス(トリフルオロメタンスルホン酸)イミド塩、エチルマロン酸塩、亜硝酸塩及び硫酸塩からなる群より選択される少なくとも一種である、〔73〕又は〔74〕に記載の精製法。
〔75-1〕
前記金属塩が、ヨウ化物塩、臭化物塩、塩化物塩、過塩素酸塩、酸化物塩、トリフルオロメタンスルホン酸塩、トルエンスルホン酸塩、イソプロピルスルホン酸塩、メタンスルホン酸塩、炭酸塩、酢酸塩、ビス(トリフルオロメタンスルホン酸)イミド塩、エチルマロン酸塩及び亜硝酸塩からなる群より選択される少なくとも一種である、〔73〕又は〔74〕に記載の精製法。
〔76〕
前記金属塩が、ヨウ化物塩、臭化物塩、過塩素酸塩及びトリフルオロメタンスルホン酸塩からなる群より選択される少なくとも一種である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔77〕
前記金属塩が、過塩素酸塩又はトリフルオロメタンスルホン酸塩である、〔73〕~〔76〕のいずれかに記載の精製法。
〔78〕
前記金属塩がヨウ化物塩である、〔73〕~〔76〕のいずれかに記載の精製法。
〔79〕
前記ヨウ化物塩が、ヨウ化リチウム、ヨウ化カリウム、ヨウ化バリウム、ヨウ化マグネシウム、ヨウ化カルシウム、ヨウ化ストロンチウム、ヨウ化サマリウム(III)、ヨウ化亜鉛及びヨウ化インジウムからなる群からなる群より選択される少なくとも一種である、〔78〕に記載の精製法。
〔80〕
前記金属塩が臭化物塩である、〔73〕~〔76〕のいずれかに記載の精製法。
〔81〕
前記臭化物塩が、臭化リチウム、臭化マグネシウム、臭化カルシウム、臭化サマリウム(III)、臭化亜鉛及び臭化インジウムからなる群より選択される少なくとも一種である、〔80〕に記載の精製法。
〔82〕
前記金属塩が塩化物塩である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔83〕
前記塩化物塩が、塩化サマリウム、塩化セリウム又は塩化マグネシウムである、〔82〕に記載の精製法。
〔83-1〕
前記塩化物塩が、塩化サマリウム又は塩化セリウムである、〔82〕に記載の精製法。
〔84〕
前記金属塩が過塩素酸塩である、〔73〕~〔77〕のいずれかに記載の精製法。
〔85〕
前記過塩素酸塩が、過塩素酸リチウム、過塩素酸バリウム、過塩素酸マグネシウム、過塩素酸カルシウム及び過塩素酸亜鉛からなる群より選択される少なくとも一種である、〔84〕に記載の精製法。
〔86〕
前記金属塩が酸化物塩である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔87〕
前記酸化物塩が、酸化マグネシウムである、〔86〕に記載の精製法。
〔88〕
前記金属塩がトリフルオロメタンスルホン酸塩である、〔73〕~〔77〕のいずれかに記載の精製法。
〔89〕
前記トリフルオロメタンスルホン酸塩が、トリフルオロメタンスルホン酸マグネシウム、トリフルオロメタンスルホン酸カルシウム、トリフルオロメタンスルホン酸スカンジウム、トリフルオロメタンスルホン酸サマリウム(III)、トリフルオロメタンスルホン酸セリウム、トリフルオロメタンスルホン酸イッテルビウム、トリフルオロメタンスルホン酸亜鉛、トリフルオロメタンスルホン酸マンガン、トリフルオロメタンスルホン酸インジウム、トリフルオロメタンスルホン酸鉄(III)及びトリフルオロメタンスルホン酸銅からなる群より選択される少なくとも一種である、〔88〕に記載の精製法。
〔90〕
前記金属塩がトルエンスルホン酸塩である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔91〕
前記トルエンスルホン酸塩がトルエンスルホン酸亜鉛(II)である、〔90〕に記載の精製法。
〔92〕
前記金属塩がイソプロピルスルホン酸塩である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔93〕
前記イソプロピルスルホン酸塩がイソプロピルスルホン酸亜鉛(II)である、〔92〕に記載の精製法。
〔94〕
前記金属塩がメタンスルホン酸塩である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔95〕
前記メタンスルホン酸塩がメタンスルホン酸セリウム(III)及びジフルオロメタンスルホン酸亜鉛からなる群より選択される少なくとも一種である、〔94〕に記載の精製法。
〔96〕
前記金属塩が炭酸塩である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔97〕
前記炭酸塩が、炭酸カリウム、炭酸カルシウム及び炭酸亜鉛からなる群より選択される少なくとも一種である、〔96〕に記載の精製法。
〔98〕
前記金属塩が酢酸塩である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔99〕
前記酢酸塩が、酢酸カリウム及び酢酸マグネシウムからなる群より選択される少なくとも一種である、〔98〕に記載の精製法。
〔100〕
前記金属塩がビス(トリフルオロメタンスルホン酸)イミド塩である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔101〕
前記ビス(トリフルオロメタンスルホン酸)イミド塩が、マグネシウムビス(トリフルオロメタンスルホン酸)イミド、亜鉛ビス(トリフルオロメタンスルホン酸)イミド及び鉄(II)ビス(トリフルオロメタンスルホン酸)イミドからなる群より選択される少なくとも一種である、〔100〕に記載の精製法。
〔102〕
前記金属塩がエチルマロン酸塩である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔103〕
前記エチルマロン酸塩がエチルマロン酸マグネシウムである、〔102〕に記載の精製法。
〔104〕
前記金属塩が亜硝酸塩である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔105〕
前記亜硝酸塩が、亜硝酸カリウムである、〔104〕に記載の精製法。
〔105-1〕
前記金属塩が硫酸塩である、〔73〕~〔75〕のいずれかに記載の精製法。
〔105-2〕
前記硫酸塩が、硫酸マグネシウムである、〔105-1〕に記載の精製法。
〔106〕
前記金属原子又は前記金属イオンが、ヨウ化リチウム、過塩素酸リチウム、テトラフルオロホウ酸リチウム、臭化リチウム、塩化リチウム、ヨウ化カリウム、フッ化リチウム、炭酸カリウム、亜硝酸カリウム、酢酸カリウム、テトラフルオロホウ酸カリウム、ヘキサフルオロリン酸カリウム、ヨウ化バリウム、過塩素酸バリウム、エチルマロン酸マグネシウム、マグネシウムビス(トリフルオロメタンスルホン酸)イミド、酸化マグネシウム、臭化マグネシウム、過塩素酸マグネシウム、ヨウ化マグネシウム、トリフルオロメタンスルホン酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、酢酸マグネシウム、塩化マグネシウム、フッ化マグネシウム、ヨウ化カルシウム、過塩素酸カルシウム、臭化カルシウム、トリフルオロメタンスルホン酸カルシウム、炭酸カルシウム、ヨウ化ストロンチウム、トリフルオロメタンスルホン酸スカンジウム、塩化スカンジウム、トリフルオロメタンスルホン酸サマリウム(III)、ヨウ化サマリウム(III)、臭化サマリウム(III)、塩化サマリウム(III)、メタンスルホン酸セリウム(III)、塩化セリウム(III)、塩化セリウム(III)・七水和物、トリフルオロメタンスルホン酸セリウム、トリフルオロメタンスルホン酸イッテルビウム、トリフルオロメタンスルホン酸亜鉛、テトラフルオロホウ酸亜鉛(II)、過塩素酸亜鉛、ジフルオロメタンスルホン酸亜鉛、イソプロピルスルホン酸亜鉛(II)、トルエンスルホン酸亜鉛(II)、亜鉛ビス(トリフルオロメタンスルホン酸)イミド、臭化亜鉛、塩化亜鉛、炭酸亜鉛、フッ化亜鉛、ヨウ化亜鉛、トリフルオロメタンスルホン酸マンガン、塩化マンガン、トリフルオロメタンスルホン酸インジウム、臭化インジウム、塩化インジウム、ヨウ化インジウム、トリフルオロメタンスルホン酸鉄(III)、鉄(II)ビス(トリフルオロメタンスルホン酸)イミド、フッ化タングステン(VI)、塩化タングステン(VI)、トリフルオロメタンスルホン酸銅からなる群より選択される少なくとも一種から生じた原子又はイオンである、〔1〕~〔74〕のいずれかに記載の精製法。
〔107〕
前記金属原子又は前記金属イオンが、ヨウ化リチウム、過塩素酸リチウム、ヨウ化カリウム、ヨウ化バリウム、過塩素酸バリウム、臭化マグネシウム、過塩素酸マグネシウム、ヨウ化マグネシウム、トリフルオロメタンスルホン酸マグネシウム、臭化カルシウム、トリフルオロメタンスルホン酸スカンジウム、トリフルオロメタンスルホン酸サマリウム、トリフルオロメタンスルホン酸セリウム、トリフルオロメタンスルホン酸イッテルビウム、トリフルオロメタンスルホン酸亜鉛、トリフルオロメタンスルホン酸マンガントリフルオロメタンスルホン酸インジウム、硫酸マグネシウム、酢酸マグネシウム、及び塩化マグネシウムからなる群より選択される少なくとも一つの金属塩又はその溶媒和物から生じた原子又はイオンである、〔1〕~〔74〕及び〔106〕のいずれかに記載の精製法。
〔107-1〕
前記金属原子又は前記金属イオンが、ヨウ化リチウム、過塩素酸リチウム、ヨウ化カリウム、ヨウ化バリウム、過塩素酸バリウム、臭化マグネシウム、過塩素酸マグネシウム、ヨウ化マグネシウム、トリフルオロメタンスルホン酸マグネシウム、臭化カルシウム、トリフルオロメタンスルホン酸スカンジウム、トリフルオロメタンスルホン酸サマリウム、トリフルオロメタンスルホン酸セリウム、トリフルオロメタンスルホン酸イッテルビウム、トリフルオロメタンスルホン酸亜鉛、トリフルオロメタンスルホン酸マンガン及びトリフルオロメタンスルホン酸インジウムからなる群より選択される少なくとも一つの金属塩又はその溶媒和物から生じた原子又はイオンである、〔1〕~〔74〕及び〔106〕のいずれかに記載の精製法。
〔108〕
前記金属原子又は前記金属イオンが、過塩素酸リチウム、ヨウ化カリウム、臭化マグネシウム、過塩素酸マグネシウム、ヨウ化マグネシウム及びトリフルオロメタンスルホン酸マンガンからなる群より選択される少なくとも一つの金属塩又はその溶媒和物から生じた原子又はイオンである、〔1〕~〔74〕、〔106〕及び〔107〕のいずれかに記載の精製法。
〔109〕
前記金属原子又は前記金属イオンが、前記第二の錯体から生じた原子又はイオンである、〔1〕~〔73〕のいずれかに記載の精製法。
〔110〕
前記第二の錯体の配位子が、オレフィン系化合物、カルボニル系化合物、ホスフィン系化合物及び一酸化炭素からなる群より選択される少なくとも一種である、〔73〕又は〔109〕に記載の精製法。
〔111〕
前記第二の錯体の配位子が、エチレン、ジベンジリデンアセトン、アセチルアセトナート、トリフェニルホスフィン及び一酸化炭素からなる群より選択される少なくとも一種である、〔73〕、〔109〕又は〔110〕に記載の精製法。
〔112〕
前記第二の錯体が、鉄(III)トリス(アセチルアセトナート)、フェロセン、亜鉛(II)アセチルアセトナート亜鉛(II)及びタングステンヘキサカルボニルからなる群より選択される少なくとも一種である、〔73〕及び〔109〕~〔111〕のいずれかに記載の精製法。
〔113〕
前記第一の溶媒が、精製目的物である前記環状ペプチド又は不純物である前記ペプチドと、前記金属原子又は前記金属イオンとの複合体を形成させることができる溶媒である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔112〕のいずれかに記載の精製法。
〔113-1〕
前記第一の溶媒が、アルコール系溶媒、ニトリル系溶媒、ベンゼン系溶媒、エーテル系溶媒、ケトン系溶媒、ハロゲン系溶媒、エステル系溶媒、スルホキシド系溶媒、及びアミド系溶媒からなる群より選択される少なくとも一種を含む、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔112〕のいずれかに記載の精製法。
〔113-2〕
前記第一の溶媒が、アルコール系溶媒、ニトリル系溶媒、ベンゼン系溶媒、エーテル系溶媒、ケトン系溶媒、ハロゲン系溶媒及びエステル系溶媒からなる群より選択される少なくとも一種を含む、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔112〕のいずれかに記載の精製法。
〔114〕
前記第一の溶媒がアルコール系溶媒である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕のいずれかに記載の精製法。
〔115〕
前記アルコール系溶媒が、2-プロパノール、tert-ブタノール、2,2,2-トリフルオロエタノール、エタノール及びメタノールからなる群より選択される少なくとも一種である、〔113-1〕、〔113-2〕及び〔114〕のいずれかに記載の精製法。
〔115-1〕
前記アルコール系溶媒が、2-プロパノール、tert-ブタノール及び2,2,2-トリフルオロエタノールからなる群より選択される少なくとも一種である、〔113-1〕、〔113-2〕及び〔114〕のいずれかに記載の精製法。
〔116〕
前記第一の溶媒がニトリル系溶媒である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕のいずれかに記載の精製法。
〔117〕
前記ニトリル系溶媒がアセトニトリルである、〔116〕に記載の精製法。
〔118〕
前記第一の溶媒がベンゼン系溶媒である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕のいずれかに記載の精製法。
〔119〕
前記ベンゼン系溶媒が、トルエン又はキシレンである、〔118〕に記載の精製法。
〔120〕
前記第一の溶媒がエーテル系溶媒である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕のいずれかに記載の精製法。
〔121〕
前記エーテル系溶媒が、テトラヒドロフラン、1,4-ジオキサン、2-メチルテトラヒドロフラン、MTBE(tert-ブチルメチルエーテル)、DME(ジメチルエーテル)及びCPME(シクロペンチルペンチルエーテル)からなる群より選択される少なくとも一種である、〔120〕に記載の精製法。
〔122〕
前記第一の溶媒がケトン系溶媒である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕のいずれかに記載の精製法。
〔123〕
前記ケトン系溶媒が、アセトン又はメチルエチルケトンである、〔122〕に記載の精製法。
〔124〕
前記第一の溶媒がハロゲン系溶媒である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕のいずれかに記載の精製法。
〔125〕
前記ハロゲン系溶媒がジクロロメタンである、〔124〕に記載の精製法。
〔125-1〕
前記第一の溶媒がスルホキシド系溶媒である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕のいずれかに記載の精製法。
〔125-2〕
前記スルホキシド系溶媒がジメチルスルホキシドである、〔125-1〕に記載の精製法。
〔125-3〕
前記第一の溶媒がアミド系溶媒である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕のいずれかに記載の精製法。
〔125-4〕
前記アミド系溶媒がジメチルホルムアミド、又はジメチルアセトアミドである、〔125-3〕に記載の精製法。〔126〕
前記第一の溶媒が、2-プロパノール、tert-ブタノール、2,2,2-トリフルオロエタノール、アセトニトリル、テトラヒドロフラン、トルエン、1,4-ジオキサン、アセトン、ジクロロメタン、エタノール、メタノール、ジメチルスルホキシド、ジメチルホルムアミド及びジメチルアセトアミドからなる群より選択される少なくとも一種である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕のいずれかに記載の精製法。
〔126-1〕
前記第一の溶媒が、2-プロパノール、tert-ブタノール、2,2,2-トリフルオロエタノール、アセトニトリル、テトラヒドロフラン、トルエン、1,4-ジオキサン、アセトン及びジクロロメタンからなる群より選択される少なくとも一種である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕のいずれかに記載の精製法。
〔127〕
前記第一の溶媒が、2,2,2-トリフルオロエタノール、アセトニトリル、テトラヒドロフラン及びアセトンからなる群より選択される少なくとも一種である、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕及び〔126〕のいずれかに記載の精製法。
〔128〕
前記第二の溶媒が、エーテル系溶媒、ベンゼン系溶媒、ケトン系溶媒、ハロゲン系溶媒、エステル系溶媒、ニトリル系溶媒、炭化水素系溶媒、アルコール系溶媒、スルホキシド系溶媒、及びアミド系溶媒からなる群より選択される少なくとも一種を含む、〔6〕~〔127〕のいずれかに記載の精製法。
〔128-1〕
前記第二の溶媒が、エーテル系溶媒、ベンゼン系溶媒、ケトン系溶媒、ハロゲン系溶媒、エステル系溶媒、ニトリル系溶媒及び炭化水素系溶媒からなる群より選択される少なくとも一種を含む、〔6〕~〔127〕のいずれかに記載の精製法。
〔129〕
前記第二の溶媒が、エーテル系溶媒である、〔6〕~〔128〕のいずれかに記載の精製法。
〔130〕
前記エーテル系溶媒が、2-メチルテトラヒドロフラン、テトラヒドロフラン、1,4-ジオキサン、MTBE(tert-ブチルメチルエーテル)、DME(ジメチルエーテル)及びCPME(シクロペンチルメチルエーテル)からなる群より選択される少なくとも一種である、〔129〕に記載の精製法。
〔131〕
前記第二の溶媒が、ベンゼン系溶媒である、〔6〕~〔128〕のいずれかに記載の精製法。
〔132〕
前記ベンゼン系溶媒が、トルエン又はキシレンである、〔128〕又は〔131〕に記載の精製法。
〔133〕
前記第二の溶媒が、ケトン系溶媒である、〔6〕~〔128〕のいずれかに記載の精製法。
〔134〕
前記ケトン系溶媒が、アセトン又はメチルエチルケトンである、〔128〕又は〔133〕に記載の精製法。
〔135〕
前記第二の溶媒が、ハロゲン系溶媒である、〔6〕~〔128〕のいずれかに記載の精製法。
〔136〕
前記ハロゲン系溶媒が、ジクロロメタンである、〔128〕又は〔135〕に記載の精製法。
〔137〕
前記第二の溶媒が、炭化水素系溶媒である、〔6〕~〔128〕のいずれかに記載の精製法。
〔138〕
前記炭化水素系溶媒が、ヘキサン、ヘプタン、シクロヘキサン、メチルシクロヘキサン、又はイソオクタンからなる群より選択される少なくとも一種である、〔128〕又は〔137〕に記載の精製法。
〔139〕
前記第二の溶媒が、エステル系溶媒である、〔6〕~〔128〕のいずれかに記載の精製法。
〔139-1〕
前記エステル系溶媒が、酢酸イソプロピル又は酢酸エチルである、〔128〕又は〔139〕に記載の精製法。
〔140〕
前記第二の溶媒が、ニトリル系溶媒である、〔6〕~〔128〕のいずれかに記載の精製法。
〔140-1〕
前記ニトリル系溶媒が、アセトニトリルである、〔128〕又は〔140〕に記載の精製法。
〔140-2〕
前記第二の溶媒が、アルコール系溶媒である、〔6〕~〔128〕のいずれかに記載の精製法。
〔140-3〕
前記アルコール系溶媒が、メタノール、エタノール、ブタノール、又はベンジルアルコールからなる群より選択される少なくとも一種である、〔128〕又は〔140-2〕に記載の精製法。
〔140-4〕
前記第二の溶媒が、スルホキシド系溶媒である、〔6〕~〔128〕のいずれかに記載の精製法。
〔140-5〕
前記スルホキシド系溶媒が、ジメチルスルホキシドである、〔140-4〕に記載の精製法。
〔140-6〕
前記第二の溶媒が、アミド系溶媒である、〔6〕~〔128〕のいずれかに記載の精製法。
〔140-7〕
前記アミド系溶媒が、ジメチルホルムアミドである、〔140-6〕に記載の精製法。
〔140-8〕
前記第二の溶媒が、酢酸イソプロピルもしくはメチルエチルケトン、及びヘプタンの組み合わせ、又はアセトニトリル及びMTBEの組み合わせである、〔3〕~〔17〕及び〔20〕~〔113〕のいずれかに記載の精製法。
〔141〕
前記第三の溶媒が、水と混和しない溶媒である、〔23〕~〔140〕のいずれかに記載の精製法。
〔142〕
前記第三の溶媒が、2-メチルテトラヒドロフラン、テトラヒドロフラン、炭酸ジメチル、アニソール、酢酸イソプロピル、酢酸エチル、MTBE(tert-ブチルメチルエーテル)、ジエチルエーテル、ジクロロメタン、クロロホルム、DME(ジメチルエーテル)、CPME(シクロペンチルメチルエーテル)、4-メチルテトラヒドロピラン、ヘプタン、及びトルエンからなる群より選択される少なくとも一種である、〔23〕~〔141〕に記載の精製法。
〔143〕
前記第四の溶媒がメタノール、エタノール、1-プロパノール、2-プロパノール、1-ブタノール、2-ブタノール、t-ブタノール、エチレングリコール、シクロヘキサン、メチルシクロヘキサン、ヘプタン、イソオクタン、トルエン、キシレン、ジメチルスルホキシド及びアセトニトリルからなる群より選択される少なくとも一種である、〔26〕~〔142〕に記載の精製法。
〔144〕
前記精製法は、精製目的物である前記環状ペプチドの純度が85%以上になるように精製する方法であり、精製目的物である前記環状ペプチドの純度(%)は、精製目的物である環状ペプチドを含んだ混合物のUVスペクトルを、HPLC及びPDA(フォトダイオードアレイ検出器)を用いて測定し、220nmにおける精製目的物である環状ペプチドを含む混合物全体の各ピーク面積の総和に対し、精製目的物である環状ペプチドのピーク面積が占める割合である、〔1〕~〔143〕のいずれかに記載の精製法。
〔144-1〕
前記精製法は、精製目的物である前記環状ペプチドの純度が85%以上になるように精製する方法であり、精製目的物である前記環状ペプチドの純度(%)は、精製目的物である環状ペプチドを含んだ混合物のUVスペクトルを、HPLC及びPDA(フォトダイオードアレイ検出器)を用いて測定し、225nmにおける精製目的物である環状ペプチドを含む混合物全体の各ピーク面積の総和に対し、精製目的物である環状ペプチドのピーク面積が占める割合である、〔1〕~〔143〕のいずれかに記載の精製法。
〔144-2〕
前記精製法は、精製目的物である環状ペプチドを含む混合物に含まれる不純物の精製効率が、正の値である、〔1〕~〔143〕のいずれかに記載の精製法。
〔144-3〕
上記不純物の精製効率が、下記の式によって求められる〔144-2〕に記載の方法
不純物の精製効率(%)={1-(精製操作後の精製目的物である環状ペプチドと不純物の比率)÷(精製操作前の精製目的物である環状ペプチドと不純物の比率)}×100
〔145〕
〔1〕~〔144〕のいずれかに記載の精製法を含む、環状ペプチドの製造法。
〔146〕
液相合成法により精製目的物である前記環状ペプチドを得る工程を更に含む、〔145〕に記載の製造法。
〔147〕
固相合成法により精製目的物である前記環状ペプチドを得る工程を更に含む、〔145〕に記載の製造法。
〔148〕
培養法により精製目的物である前記環状ペプチドを得る工程を更に含む、〔145〕に記載の製造法。
〔149〕
環状ペプチドの精製法において、精製目的物である環状ペプチドを含む混合物から、精製目的物である前記環状ペプチドを金属原子又は金属イオンとの複合体として分離することを特徴とする、金属原子又は金属イオンとの複合体を形成させない場合と比較して、環状ペプチドの純度を向上させる方法。
〔150〕
環状ペプチドの精製法において、精製目的物である環状ペプチドを含む混合物から、精製目的物である前記環状ペプチドを金属原子又は金属イオンとの複合体として分離することを特徴とする、金属原子又は金属イオンとの複合体を形成させない場合と比較して、不純物の含有量を低減させる方法。
不純物の精製効率(%)={1-(精製操作後の精製目的物である環状ペプチドと不純物の比率)÷(精製操作前の精製目的物である環状ペプチドと不純物の比率)}×100{1-(精製操作前の精製目的物である環状ペプチドと不純物の比率)÷(精製操作後の精製目的物である環状ペプチドと不純物の比率)}×100
AA:酢酸アンモニウム
COMU:(1-シアノ-2-エトキシ-2-オキソエチリデンアミノオキシ)ジメチルアミノ-モルホリノ-カルベニウムヘキサフルオロリン酸塩
DBU:1,8-ジアザビシクロ[5.4.0]-7-ウンデセン
DCM:ジクロロメタン
DCE:1,2-ジクロロエタン
DMF:N,N-ジメチルホルムアミド
DIC:N,N’-ジイソプロピルカルボジイミド
DIPEA:N,N-ジイソプロピルエチルアミン
DVB:ジビニルベンゼン
tBu基:tert-ブチル基
FA:ギ酸(メタン酸)
Fmoc基:9-フルオレニルメチルオキシカルボニル基
NMP:N-メチル-2-ピロリドン
NMR:核磁気共鳴分光法
mM:mmol/L
PDA:フォトダイオードアレイ検出器
TFA:トリフルオロ酢酸
TFE:2,2,2-トリフルオロエタノール
THF:テトラヒドロフラン
THP:テトラヒドロピラニル
MTBE:tert-ブチルメチルエーテル
HOAt:1-ヒドロキシ-7-アザベンゾトリアゾール
HOBt:1-ヒドロキシベンゾトリアゾール
IPAC:酢酸イソプロピル
MEK:メチルエチルケトン
HPLC:高速液体クロマトグラフィー
oxyma:シアノ(ヒドロキシイミノ)酢酸エチル
EDCI・HCl:1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩
DMSO:ジメチルスルホキシド
MeCN:アセトニトリル,CH3CN
1H:プロトン
v/v:体積/体積
<アミノ酸の一般的な合成方法>
本実施例及び参考例で用いられた、Fmoc基で保護されたアミノ酸(Fmoc-アミノ酸)は、一般的なアミノ酸合成法により製造することができ、例えば、国際公開第2021/090855号に記載の方法により製造することができる。また、Fmoc基で保護されたアミノ酸は、商業的供給業者から入手可能である。本実施例及び参考例では、市販されているアミノ酸のN末端にFmoc基を導入したアミノ酸、又は市販されているアミノ酸のC末端を脱保護したアミノ酸を、目的とするペプチドの伸長反応に用いることもできる。保護基の脱着反応は、例えば、「Greene’s,“Protective Groups in Organic Synthesis”(第5版,John Wiley & Sons 2014)」に記載の方法により行うことができる。天然に存在するアミノ酸の側鎖(アミノ酸のα炭素上の官能基)とは異なる側鎖を有するアミノ酸は、商業的供給業者から入手可能なアミノ酸(天然に存在するアミノ酸)の側鎖を、目的とする側鎖に適宜変換することで製造可能である。側鎖の変換は、Comprehensive Organic Transformations、A Guide to Functional Group Preparations, 3rd Edition、R. C. Larock著、又は、March’s Advanced Organic Chemistry: Reactions, Mechanisms, and Structure、7th Edition、M. B. March著等に記載の方法により行うことができる。N末端がアルキル化されたアミノ酸(N-アルキルアミノ酸)は、N末端がアルキル化されていないアミノ酸を、Freidingerらの方法(J. Org. Chem., 1983, 48(1), 77-81)に準じてアルデヒドと反応させることで環状保護基が導入されたオキサゾリジノン体を得、次いで、当該環状保護基の開環反応を行うことで製造することができる。
下記式(1)に示すとおり、Fmoc-アミノ酸である化合物aa01、化合物aa02及び化合物aa03を合成し、得られた化合物aa03を用いて、化合物aa03をレジンに担持させた化合物aa03-resin((3S)-3-(9H-フルオレン-9-イルメトキシカルボニルアミノ)-4-オキソ-4-ピロリジン-1-イルブタン酸-2-クロロトリチルレジン(Fmoc-Asp(O-Trt(2-Cl)-resin)-pyrro))を合成した。化合物aa03-resinをペプチド合成機によるペプチド合成に用いた。Fmoc-アミノ酸のレジンへの担持反応は、国際公開第2013/100132号又は国際公開第2018/225864号に記載の方法で行った。2-クロロトリチルクロライドレジン(100-200mesh、1%DVB)は渡辺化学工業株式会社及びChem-Impex社から購入した。なお、pyrroとはピロリジンを意味する。例えば化合物aa03-resinでは、C末端のカルボキシル基がピロリジンとアミド結合を形成している。
LCMS(ESI)m/z=465(M+H)+
保持時間:1.05分(分析条件:SQDAA05)
LCMS(ESI)m/z=409(M+H)+
保持時間:0.83分(分析条件:SQDAA05)
LCMS(ESI)m/z=421(M+H)+
保持時間:0.98分(分析条件:SQDFA05)
LCMS(ESI)m/z=518(M+H)+
保持時間:0.94分(分析条件:SQDFA05)
LCMS(ESI)m/z=674(M+H)+
保持時間:2.94分(分析条件:SQDFA05long)
LCMS(ESI)m/z=633(M+H)+
保持時間:0.80分(分析条件:SQDFA05)
本実施例及び参考例で用いられたペプチド化合物は、固相合成法により合成した。固相合成法としては、例えば、Amino Acids, 2018, 50, 39-68、又はSolid phase peptide synthesis (Bachem社発行)[2022年12月20日検索]、インターネット<URL: https://www.bachem.com/wpfd_file/solid-phase-peptide-synthesis/>を挙げることができる。本実施例及び参考例においては、国際公開第2013/100132号又は国際公開第2018/225864号に記載の、Fmoc法によるペプチド合成法を参照した。本実施例及び参考例においては、図1に示す、環状ペプチドの基本的な合成方法によりペプチドの伸長を行った。図1に示す環状ペプチドの基本的な合成方法は、
1)Asp側鎖のカルボキシル基若しくはペプチド主鎖カルボキシル基を2-クロロトリチルレジンに担持させたものを用い、アミノ酸のN末端からのFmoc法によるペプチドの伸長反応(Fmoc基で保護されたアミノ酸を原料としたペプチド鎖伸長反応)、
2)2-クロロトリチルレジンからのペプチドの切り出し過程、
3)切り出し過程によって2-クロロトリチルレジンから外れて生じたAsp側鎖のカルボキシル基若しくはペプチド主鎖カルボキシル基と、ペプチド鎖N末端(三角ユニット)のアミノ基との縮合によるアミド環化、
4)必要に応じたペプチド鎖に含まれる側鎖官能基の保護基の脱保護、
5)preparativeHPLCによる化合物の精製
の5段階の工程を備える。本実施例及び参考例においては、特に記述がない限り、図1に示す環状ペプチドの基本的な合成方法によって環状ペプチドの合成を行った。
N-アルキルアミノ酸を含むペプチド化合物は、表2~4に示したFmoc基によって保護されたN-アルキルアミノ酸を原料として用いて、本実施例及び参考例に記載した「<ペプチドの一般的な合成方法>」に従って合成することができる。
国際公開第2013/100132号又は国際公開第2018/225864号に記載の方法で、化合物1を合成した。ペプチド合成機(Multipep RS;CEM(旧Intavis)社製)の詳細な操作手順については、合成機に付属されたマニュアルに従った。化合物1(環状ペプチド)及び化合物6(環状ペプチド)を構成する各アミノ酸残基の略称、アミノ酸構造式及び正式名称を下記表5に示す。
精製目的物である環状ペプチドを構成するFmoc-アミノ酸(溶液1中の濃度:0.3-0.6mol/L)と、カルボキシル基の活性化剤である、HOAt、oxyma又はHOOBt(溶液1中の濃度:0.375mol/L)を、NMP又はNMP/DMF(1/1)に溶解させて溶液1を調製した。N,N’-ジイソプロピルカルボジイミド(DIC)(10%v/v)とN,N-ジメチルホルムアミド(DMF)を混合し、溶液2を調製した。
膨潤したレジンを含むフィルター付き反応容器にジアザビシクロウンデセン(DBU)のDMF溶液(2%v/v、0.7mL)を添加し、室温にてN末端のFmoc基の脱保護を行った。1残基目の脱保護においては4.5分間反応させ、2残基目以降の脱保護においては10分間反応させた後、溶液をフィルター付き反応容器から排出した。そこにDMF(0.7mL)を加えてレジンを洗浄し、5分静置後、溶液をフィルター付き反応容器から排出した。このレジンの洗浄工程を更に3回繰り返すことで、レジン上に結合したアミノ酸又はペプチドのN末端のFmoc基が除去されてアミノ基となったレジンを得た。
続いて、溶液1(1つの反応容器あたり0.3mL)と溶液2(1つの反応容器あたり0.36mL)を合成機のmixing vialで混合した後に、上記脱保護処理後のレジンに添加し、フィルター付き反応容器を40℃に加温した。レジン上のアミノ基とFmoc-アミノ酸との縮合反応は、2.5時間行った。反応後、溶液をフィルター付き反応容器から排出した。次いで反応後のレジンをDMF(0.7mL)で3回洗浄した。このFmoc基の脱保護反応に次ぐFmoc-アミノ酸の縮合反応を1サイクルとし、このサイクルを繰り返すことでレジン表面上にペプチドを伸長させた。最後のアミノ酸伸長後は脱Fmoc工程を行わずに、さらにDCM(1反応容器あたり1.0mL)で4回洗浄した。
Fmoc-Pro-MeAla-Cha-Leu-Pro-MePhe(34-F2)-Ala(cPent)-MePhe(4-F)-MeVal-Asp(O-Trt(2-Cl)-resin)-pyrro(化合物1)にトルエン(1反応容器につき1mL)を加えて洗浄し、5分静置後、溶液をフィルター付き反応容器から排出した。このレジンの洗浄工程を更に2回繰り返すことで、トルエンで膨潤されたレジンを得た。
上記により得られたレジンに対し、Fmoc-MeAla-OH(4モル当量)のDCM溶液(0.25mL)と[エチルシアノ(ヒドロキシイミノ)アセタト-O2]トリ1-ピロリジニルホスホニウムヘキサフルオロリン酸(PyOxim,153433-21-7,4モル当量)のDCM溶液(0.25mL)とDIPEA(6モル当量)を混合して1~2分程静置した溶液を添加し、室温で3時間振盪した。モル当量数は原料として用いたレジンのアミノ酸担持率(mmol/g)に使用したレジン量(通常は100mg)を乗算したものを基準に計算した。溶液をフィルター付き反応容器から排出した後、レジンをDMF(1反応容器につき0.7mL)で4回、DCM(1反応容器につき0.7mL)で4回洗浄し、乾燥させFmoc-MeAla-Pro-MeAla-Cha-Leu-Pro-MePhe(34-F2)-Ala(cPent)-MePhe(4-F)-MeVal-Asp(O-Trt(2-Cl)-resin)-pyrro(化合物3)を得た。ペプチド伸長完了後、ジアザビシクロウンデセン(DBU)のDMF溶液(2%v/v、1反応容器につき0.7mL)をレジンに添加し、15分反応させてFmoc基の脱保護反応を行った後、溶液をフィルター付き反応容器から排出した。得られたレジンをDMF(0.7mL)で4回洗浄後、DCM(0.7mL)で4回洗浄しH-MeAla-Pro-MeAla-Cha-Leu-Pro-MePhe(34-F2)-Ala(cPent)-MePhe(4-F)-MeVal-Asp(O-Trt(2-Cl)-resin)-pyrro(化合物4)を得た。
上記の方法によって得られたレジン(化合物4)に対し0.75%(v/v)のDIPEAを含む2,2,2-トリフルオロエタノール(TFE)/DCM(1/1,v/v,2mL)を加え、室温で2時間反応させてレジンからのペプチド鎖の切り出し反応を行った。反応後、チューブ内の溶液をフィルター付き反応容器から回収した。残ったレジンに2,2,2-トリフルオロエタノール(TFE)/DCM(1/1,v/v,1mL)を加え、溶液をフィルター付き反応容器から回収する操作を2回行った。得られた全ての切り出し溶液を混合し、DMF(4mL)又は1,2-ジクロロエタン(4mL)を混合した後、Genevac社製ハイスループット遠心エバポレーター(HT-12)により減圧下溶媒留去しH-MeAla-Pro-MeAla-Cha-Leu-Pro-MePhe(34-F2)-Ala(cPent)-MePhe(4-F)-MeVal-Asp-pyrro(化合物5)を得た。
上記の方法により得られた残渣をDMF(8mL)及びDCM(8mL)の混合液に溶解し、(1-シアノ-2-エトキシ-2-オキソエチリデンアミノオキシ)ジメチルアミノ-モルホリノ-カルベニウムヘキサフルオロリン酸塩(COMU)のDMF溶液(0.5M、1.5モル当量)及びDIPEA(1.8モル当量)を加え、室温にて30分撹拌することで、N末端のアミノ基とC末端のカルボキシル基との縮合環化反応を行った。モル当量数は原料として用いたレジンのアミノ酸担持率(mmol/g)に使用したレジン量(通常は100mg)を乗算したものを基準に計算した。目的の環状ペプチドの生成はLC/MS測定(Waters社製SQ Detector2)によって確認した後、反応液をGenevac社製ハイスループット遠心エバポレーター(HT-12)により減圧下溶媒留去した。
上記の方法により得られた残渣(フィルター付き反応容器×48個)にDMSOを加え、1つのロットにまとめて逆相中圧カラムクロマトグラフィー(0.1%のギ酸を含むアセトニトリル/水)により精製し、化合物6((3S,6S,9S,12S,18S,22S,25S,28S,31S,34S,37S)-6-(シクロヘキシルメチル)-31-(シクロペンチルメチル)-34-[(3,4-ジフルオロフェニル)メチル]-28-[(4-フルオロフェニル)メチル]-3-イソブチル-25-イソプロピル-9,10,18,19,26,29,35-ヘプタメチル-22-(ピロリジン-1-カルボニル)-1,4,7,10,16,19,23,26,29,32,35-ウンデカザトリシクロ[35.3.0.012,16]テトラコンタン-2,5,8,11,17,20,24,27,30,33,36-ウンデカオン)(2.3g,68%,純度84%[ピーク面積百分率])を得た。なお、純度解析用に用いたLCの条件(純度分析条件A)では化合物6の保持時間(11.1分付近)の前後(保持時間10.8分付近及び保持時間11.4分付近)に化合物6の異性体(アイソマー)である異性体1及び異性体2がそれぞれ精密質量解析の結果から確認できた。またLCのピーク面積の解析から、保持時間10.8分付近(相対保持時間:0.972)に観測される化合物6の異性体1はピーク面積百分率で2.0%、保持時間11.4分付近(相対保持時間:1.03)に観測される化合物6の異性体2はピーク面積百分率で6.8%存在することが確認された。異性体1及び/又は異性体2は合成プロセスや精密質量解析の結果から判断すると化合物6のジアステレオマーであると推定される。なお、相対保持時間とは各ピークの保持時間を目的物(今回の場合は化合物6)の保持時間で割った値のことを言う。
純度:84.0%
LCMS(ESI)m/z=1426(M-H)-
保持時間:0.85分(分析条件SQDAA50)
純度解析用HPLC条件(純度分析条件A)
カラム:ACQUITY UPLC Peptide CSH C18,2.1x150mm,1.7μm
溶媒:A)0.1%FA in H2O B)0.1%FA in CH3CN
勾配プログラム:50%→100%B(15分)→100%B(20分)→50%B(20.1分)
カラム温度:50℃
流速:0.3mL/分
オートサンプラー温度:20℃
サンプル濃度:約0.3mg/mL in CH3CN
注入量:5μL
UV検出:220nm
システム:Nexera X2(Shimadzu)
化合物9は、化合物aa09-resin(Fmoc-Asp(O-Trt(2-Cl)-resin)-Pro-Ile-pip)を用い、下記式(7)に示した通り、化合物6と同様の方法で合成及び精製を行うことで得た(246mg,47%,純度93.0%[ピーク面積百分率])。
純度:93.0%
LCMS(ESI)m/z=1237(M-H)-
保持時間:0.81分(分析条件SQDFA50)
純度解析用HPLC条件:純度分析条件C
化合物10((3S,6S,9S,12S,18S,21S,24S,27S,30R,34S)-6,27-ジベンジル-3,12,21,24-テトライソブチル-30-イソプロピル-4,7,13,16,22,28-ヘキサメチル-34-(ピペリジン-1-カルボニル)-9-(プロポキシメチル)-18-((1R)-1-((テトラヒドロ-2H-ピラン-2-イル)オキシ)エチル)-1,4,7,10,13,16,19,22,25,28,31-ウンデカアザシクロテトラトリアコンタン-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-ウンデカオン)は、化合物aa04-resin(Fmoc-Asp(O-Trt(2-Cl)-resin)-pip)を用い、国際公開第2021/090855号の記載に準じて合成することで得た。
側鎖にTHPで保護された水酸基を有するFmoc保護アミノ酸、例えばFmoc-Thr(THP)-OHおよびFmoc-Ser(THP)-OHを用いて合成した配列においては、上記で得られた残渣に硫酸水素テトラメチルアンモニウム(0.05M)の1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロイソプロピルアルコール(HFIP)溶液(2%(v/v)のトリイソプロピルシラン(TIPS)、1%(v/v)の1,2-ジクロロエタンを含む)を4mL加え(反応容器×14個)、残渣を溶解させた後、室温にて4時間静置することでTHP基の脱保護を行った。反応完結をLC/MS(Waters社製SQ Detector2)で確認した後、反応液にジイソプロピルエチルアミン(DIPEA)(70μL)を加え(反応容器×14個)、Genevac社製ハイスループット遠心エバポレーター(HT-12)により減圧下溶媒留去し精製操作を行うことで化合物11(372mg,44%,純度92.3%[ピーク面積百分率])を得た。
純度:92.3%
LCMS(ESI)m/z=1398(M-H)-
保持時間:0.82分(分析条件SQDFA50)
純度解析用HPLC条件:純度分析条件C
純度:85.7%
LCMS(ESI)m/z=1296(M-H)-
保持時間:0.54分(分析条件SQDFA50)
純度解析用HPLC条件:純度分析条件C
純度:92.3%
LCMS(ESI)m/z=1552(M-H)-
保持時間:0.74分(分析条件SQDFA50)
純度解析用HPLC条件:純度分析条件C
純度:84.3%
LCMS(ESI)m/z=1594(M-H)-
保持時間:0.81分(分析条件SQDFA50)
純度解析用HPLC条件:純度分析条件C
純度:89.5%
LCMS(ESI)m/z=1667(M-H)-
保持時間:0.74分(分析条件SQDFA50)
純度解析用HPLC条件:純度分析条件C
<基本操作>
化合物6をアセトニトリル-d3(重アセトニトリル,CD3CN,CAS:2206-26-0)に溶解し得られる溶液(環状ペプチドの濃度:1.4mM,金属塩非添加実験)と、下記表6に示す金属塩を、金属塩が環状ペプチドに対して、それぞれ1,3,6モル当量となるように混合して得られる溶液(環状ペプチドの濃度:1.4mM,金属塩添加実験)の1H-NMRをそれぞれ278K若しくは298Kで測定した。得られた1H-NMRスペクトルを比較した結果を表6にまとめた。
<基本操作>
化合物6を下記表8に示す各種重溶媒に溶解し得られる溶液(環状ペプチドの濃度:1.4mM,金属塩非添加実験)と、過塩素酸マグネシウムを環状ペプチドに対して約1モル当量を添加し表8に示す各種重溶媒に溶解させて得られる溶液(環状ペプチドの濃度:1.4mM,金属塩非添加実験)との1H-NMRを298Kでそれぞれ測定し、1H-NMRスペクトルを得た。
化合物6(30.24mg)のアセトニトリル(CH3CN,CAS:75-05-8,10mL)溶液のうち0.333mL(化合物6,1.01mg,0.705μmol)を容器に分注し濃縮乾固させた後、過塩素酸マグネシウム(Mg(ClO4)2,4.52mg,83w%)のアセトニトリル(2.0mL)溶液0.100mL(Mg(ClO4)2,0.188mg,0.840μmol)をそれぞれの容器に加え濃縮乾固させた。表8に示す重溶媒(トルエン-d8,エタノール-d6,テトラヒドロフラン-d8,アセトン-d6,ジクロロメタン-d2,N,N-ジメチルホルムアミド-d4,ジメチルスルホキシド-d6,1,4-ジオキサン-d8)0.5mLに溶解し、1H-NMRを298Kで測定した。
化合物6(2.78mg)のメタノール-d4(0.0779mL)溶液のうち0.028mL(化合物6,0.999mg,0.700μmol)と、過塩素酸マグネシウム(Mg(ClO4)2,2.31mg,83w%)のメタノール-d4(0.2mL)溶液のうち0.0135mL(Mg(ClO4)2,0.129mg,0.580μmol)を混合させた後、メタノール-d4(0.4585mL)を加え、1H-NMRを298Kで測定した。
化合物6(6.69mg)のアセトニトリル(CH3CN,0.0669mL)溶液のうち0.010mL(化合物6,1.00mg,0.700μmol)と、過塩素酸マグネシウム(Mg(ClO4)2,10.9mg,83w%)のCH3CN(2.0mL)溶液のうち0.0355mL(Mg(ClO4)2,0.160mg,0.717μmol)をそれぞれの容器に加え濃縮乾固させた。表8に示す重溶媒(2-プロパノール-d8,tert-ブタノール-d10,2,2,2-トリフルオロエタノール-d3)0.5mLに溶解し、1H-NMRを298Kで測定した。
化合物6(13.04mg)のアセトニトリル-d3(0.365mL)溶液0.028mL(化合物6,1.00mg,0.700μmol)と、過塩素酸マグネシウム(Mg(ClO4)2,9.25mg,83w%)のアセトニトリル-d3(1.5mL)溶液のうち0.0253mL(Mg(ClO4)2,0.129mg,0.580μmol)、アセトニトリル-d3を0.4467mL混合させ、1H-NMRを298Kで測定した。
[実施例1―1:複合体形成に使用可能な溶媒範囲確認]
<基本操作>
化合物6(約10mg)に約1モル当量の過塩素酸マグネシウムを混合し、下記表9に示す各種溶媒に溶解させた。溶液に直接ヘキサンを加える、あるいは溶媒を減圧または凍結乾燥にて留去し、ジクロロメタンとヘキサンを加え、室温で以下に従って撹拌した。生じた固体と上清を遠心分離し、溶媒を減圧または窒素吹き付けによって留去し、真空乾燥した上清、及び固体をそれぞれアセトニトリルに再溶解させ、それぞれのHPLCを測定した。化合物6のピーク面積百分率、ピーク面積の値を基に算出した純度、回収率、化合物6に対する異性体1及び異性体2の比率、並びに精製効率を表9に示した。
例えば、約a mgの原料を用いて実験したとすると、固体と溶液を遠心分離し、溶媒を減圧または窒素吹き付けによって留去し、真空乾燥した上清、固体にb mLのアセトニトリルを加えて得られた溶液のうち(150b/a)μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。調製したサンプルと正確に調製した0.30mg/mLの標品のHPLCをそれぞれ測定し目的物のピーク面積(220nm)がそれぞれとcとdだとすると、回収率は下記の式で表される。なお、実際の秤量値(e mg)が想定の重さであるa mgと一致しないケースを考慮し、秤量値による補正を行った。
また、化合物6と異性体1又は異性体2の比率、化合物6に対する化合物6と異性体1及び異性体2がどれだけ分離されたかを確認するための精製効率は以下の式で算出した。
・化合物6に対する異性体1の比率×100:
(異性体1のピーク面積)÷(化合物6のピーク面積)×100
・化合物6に対する異性体2の比率×100:
(異性体2のピーク面積)÷(化合物6のピーク面積)×100
・異性体1の精製効率(%):
{1-(化合物6と異性体1の比率)÷(標品の化合物6と異性体1の比率)}×100
・異性体2の精製効率(%):
{1-(化合物6と異性体2の比率)÷(標品の化合物6と異性体2の比率)}×100
化合物6(10.1mg)にMg(ClO4)2(6.5mg)のジメチルホルムアミド溶液(0.325mL)を希釈して調製した35mMジメチルホルムアミド溶液(0.200mL)を加えて凍結乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え3日間撹拌した。ヘキサン(0.33mL)を加えてさらに2日間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(3.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(3.0mL)のうち、45μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体は純度94%、回収率75%であり、上清は純度72%、回収率32%であることが分かった。これらの操作により、沈殿した固体が精製されていることを確認した。上清において化合物6に対する異性体1、2の精製効率がそれぞれ-124%、-123%、固体においてはそれぞれ72%、64%であったことから、化合物6は金属添加条件において異性体1,2より優先して沈殿したために、固体に良好な精製効果が表れたと考えられる。
標品0.30mg/mLの溶液のHPLCを測定後、目的物のピーク面積(2950511,220nm)を測った。調製した50%v/vアセトニトリル水溶液のHPLCを測定し、目的物のピーク面積(上清:962751、固体:2240371)を測り、下記の方法に従い計算し回収率を求めた。
上清:(962751×10)÷(2950511×10.1)×100≒32%
固体:(2240371×10)÷(2950511×10.1)×100≒75%
標品0.30mg/mLの溶液のHPLCを測定後、目的物のピーク面積(2950511,220nm)を測った。同様に異性体のピーク面積(異性体1:77125、異性体2:225732)を測った。調製した50%v/vアセトニトリル水溶液のHPLCを測定し、目的物のピーク面積(上清:962751、固体:2240371)、異性体1のピーク面積(上清:56402、固体:16355)、異性体2のピーク面積(上清:164256、固体:61383)を測り、下記の方法に従い計算し精製効率を求めた。
上清での異性体比1の比率:56402÷962751×100≒5.9%
上清での異性体比2の比率:164256÷962751×100≒17.1%
固体での異性体比1の比率:16355÷2240371×100≒0.7%
固体での異性体比2の比率:61383÷2240371×100≒2.7%
上清での異性体比1の精製効率:
{1-(56402÷962751)÷(77125÷2950511)}×100≒―124%
上清での異性体比2の精製効率:
{1-(164256÷962751)÷(225732÷2950511)}×100≒―123%
固体での異性体比1の精製効率:
{1-(16355÷2240371)÷(77125÷2950511)}×100≒72%
固体での異性体比2の精製効率:
{1-(61383÷2240371)÷(225732÷2950511)}×100≒64%
化合物6(10.0mg)にMg(ClO4)2(5.3mg)のジメチルアセトアミド溶液(0.265mL)を希釈して調製した35mMジメチルアセトアミド溶液(0.200mL)を加えて凍結乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え3日間撹拌した。ヘキサン(0.33mL)を加えてさらに2日間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(3.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(3.0mL)のうち、45μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
化合物6(10.0mg)にMg(ClO4)2(5.2mg)のジメチルスルホキシド溶液(0.260mL)を希釈して調製した35mMジメチルスルホキシド溶液(0.200mL)を加えて凍結乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)、ヘキサン(0.33mL)を順に加えて4日間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(3.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(3.0mL)のうち、45μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
化合物6(10.0mg)にMg(ClO4)2(6.1mg)のメタノール溶液(0.305mL)を希釈して調製した35mMメタノール溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え3日間撹拌した。ヘキサン(0.33mL)を加えてさらに2日間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
化合物6(9.9mg)にMg(ClO4)2(8.2mg)のエタノール溶液(0.410mL)を希釈して調製した35mMエタノール溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え3日間撹拌した。ヘキサン(0.33mL)を加えてさらに2日間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、上清が精製されていることを確認した。
化合物6(10.1mg)とMg(ClO4)2(2.14mg,83w%)の混合物にジクロロメタン(0.66mL)を加え3日間撹拌した。ヘキサン(0.33mL)を加えてさらに2日間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
<基本操作>
化合物6(約15mg又は約10mg)に約1モル当量の過塩素酸マグネシウムを混合しアセトニトリルに溶解させた。溶媒を減圧留去し、下記表10に示した各種溶媒を加えて室温で以下に従って撹拌した。上清と生じた固体を遠心分離し、上清及び真空乾燥した固体のそれぞれのHPLCを測定した。化合物6のピーク面積百分率及びピーク面積の値を基に純度及び回収率を求め表10に示した。
例えば、a mgの原料を用いて実験したとし、使用した溶液量がb mLだとすると、上清のHPLCを測定する際には、まず、上清(b/100)mLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLになるようにアセトニトリルを加えてサンプルを調製した。一方、原料をd mg秤量して10mLメスフラスコで標品を調製した。調製したサンプルと標品のHPLCをそれぞれ測定し目的物のピーク面積(220nm)がそれぞれcとeだとすると、回収率は下記の式で表される。
また、a mgの原料を用いて実験したとすると、上清と固体を遠心分離した後、上清または固体に含まれる溶媒を減圧留去し乾燥させたのちに0.5mL(又は1.0mL)のアセトニトリルを加えて得られた溶液のうち5μL(又は10μL)を495μL(又は490μL)のアセトニトリルと混合しサンプルを調製した。一方、原料をd mg秤量して10mLメスフラスコで標品を調製した。調製したサンプルと標品のHPLCをそれぞれ測定し目的物のピーク面積(220nm)がそれぞれfとeだとすると、回収率は下記の式で表される。
化合物6(15.00mg)とMg(ClO4)2(3.03mg,83w%)のCH3CN溶液(1.0mL)を濃縮した後に得られる固体にジクロロメタン(1mL)とヘキサン(0.5mL)を加え終夜撹拌した。生じた固体と溶液を遠心分離し、溶液は濃縮後6時間乾燥しアセトニトリル(0.5mL)を加えHPLCにて純度及び回収率の確認を行った。その結果、ピーク面積百分率から純度68%、回収率14%であることが分かった。得られた固体はジクロロメタン(1mL)とヘキサン(0.5mL)の混合溶液で洗浄後、遠心分離し得られた固体を終夜真空乾燥した結果、13.64mgの化合物6-Mg(ClO4)2複合体が固体として得られた。得られた複合体の純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、純度90%、回収率82%であることが分かった。これらの操作により、沈殿した固体が精製されていることを確認した。
標品0.297mg/mLの溶液のHPLCを測定後、目的物のピーク面積(51555,220nm)を測った。
得られた固体13.64mgのうち3.00mgを10mLのアセトニトリルに溶かした後、HPLCを測定し、目的物のピーク面積(46818)を測り、下記の方法に従い計算し回収率を求めた。
(13.64/0.300)×46818÷{(15/0.297)×51555}×100≒82%
化合物6(15.00mg)とMg(ClO4)2(3.01mg,83w%)のCH3CN溶液(1.0mL)を濃縮した後に得られる固体にアセトン(1mL)とヘキサン(1mL)を加え終夜撹拌した。生じた固体と溶液を遠心分離し、溶液は濃縮後6時間乾燥しアセトニトリル(0.5mL)を加えHPLCにて純度及び回収率の確認を行った。その結果、ピーク面積百分率から純度69%、回収率22%であることが分かった。得られた固体は6時間乾燥後アセトニトリル(0.5mL)に溶かし、純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、純度92%、回収率68%であることが分かった。これらの操作により、沈殿した固体が精製されていることを確認した。
化合物6(14.98mg)とMg(ClO4)2(2.96mg,83w%)のCH3CN溶液(1.0mL)を濃縮した後に得られる固体に1,4-ジオキサン(1mL)を加え終夜撹拌した。生じた固体と溶液を遠心分離し、溶液は濃縮後6時間乾燥しアセトニトリル(0.5mL)を加えHPLCにて純度及び回収率の確認を行った。その結果、ピーク面積百分率から純度72%、回収率15%であることが分かった。得られた固体は6時間乾燥後アセトニトリル(0.5mL)に溶かし、純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、純度90%、回収率76%であることが分かった。これらの操作により、沈殿した固体が精製されていることを確認した。
化合物6(75.12mg)とMg(ClO4)2(14.68mg,83w%)のCH3CN溶液(5.0mL)を1mLずつ分注し、それぞれを濃縮し得られた固体に下記のRun4~6に示す溶媒を加え、週末撹拌した。生じた固体と溶液を遠心分離し、溶液は濃縮後真空乾燥しアセトニトリル(0.5mL)を加えHPLCにて純度及び回収率の確認を行った。
化合物6(9.9mg)にMg(ClO4)2(20.7mg)のアセトニトリル溶液(0.414mL)を希釈して調製した35mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体に酢酸エチル(0.66mL)を加えて3日間撹拌した。生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
標品0.30mg/mLの溶液のHPLCを測定後、目的物のピーク面積(2950511,220nm)を測った。調製した50%v/vアセトニトリル水溶液のHPLCを測定し、目的物のピーク面積(上清:255084、固体:2369897)を測り、下記の方法に従い計算し回収率を求めた。
上清:(255084×10)÷(2950511×9.9)×100≒9%
固体:(2369897×10)÷(2950511×9.9)×100≒81%
化合物6(10.0mg)にMg(ClO4)2(20.7mg)のアセトニトリル溶液(0.414mL)を希釈して調製した35mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にエタノール(0.66mL)を加えて3日間撹拌した。へプタン(1.0mL)を加えて終夜撹拌した後、さらにへプタン(1.0mL)を加えて2日間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
化合物6(92.5mg)のアセトニトリル溶液(0.925mL)のうち0.100mL、Mg(ClO4)2(25.0mg)のアセトニトリル溶液(0.500mL)のうち0.038mLを分注、希釈して調製した35mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を濃縮、真空乾燥した。得られた固体にブタノール(0.5mL)、へプタン(0.5mL)を加え、2日間撹拌した。さらにへプタン(0.25mL)を加えて6時間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
化合物6(92.5mg)のアセトニトリル溶液(0.925mL)のうち0.100mLずつ、Mg(ClO4)2(25.0mg)のアセトニトリル溶液(0.500mL)のうち0.038mLずつを分注、希釈して調製した35mMアセトニトリル溶液(各0.200mL)を濃縮、真空乾燥した。得られた固体に表10のRun10、12に示す溶媒を加え、3日間撹拌した。生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
化合物6(92.5mg)のアセトニトリル溶液(0.925mL)のうち0.100mL、Mg(ClO4)2(25.0mg)のアセトニトリル溶液(0.500mL)のうち0.038mLを分注、希釈して調製した35mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を濃縮、真空乾燥した。得られた固体にアセトニトリル(0.13mL)、tert-ブチルメチルエーテル(0.87mL)を加え、2日間撹拌した。さらにアセトニトリル(0.13mL)を加えて6時間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
化合物6(92.5mg)のアセトニトリル溶液(0.925mL)のうち0.100mL、Mg(ClO4)2(25.0mg)のアセトニトリル溶液(0.500mL)のうち0.038mLを分注、希釈して調製した35mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を濃縮、真空乾燥した。得られた固体に酢酸イソプロピル(0.66mL)、へプタン(0.33mL)を加え、2日間撹拌した。さらに酢酸イソプロピル(0.66mL)を加えて6時間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
化合物6(92.5mg)のアセトニトリル溶液(0.925mL)のうち0.100mL、Mg(ClO4)2(25.0mg)のアセトニトリル溶液(0.500mL)のうち0.038mLを分注、希釈して調製した35mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を濃縮、真空乾燥した。得られた固体にメチルエチルケトン(0.66mL)、へプタン(0.66mL)を加え、2日間撹拌した。さらにメチルエチルケトン(0.33mL)を加えて6時間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
化合物6(92.5mg)のアセトニトリル溶液(0.925mL)のうち0.100mL、Mg(ClO4)2(25.0mg)のアセトニトリル溶液(0.500mL)のうち0.038mLを分注、希釈して調製した35mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を濃縮、真空乾燥した。得られた固体にメタノール(33.3μL)、トルエン(966.7μL)を加えて3日間撹拌した後、生じたオイル状沈殿と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、沈殿をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、沈殿のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、上清が精製されていることを確認した。
化合物6(48.5mg)のアセトニトリル溶液(0.485mL)のうち0.100mL、Mg(ClO4)2(5.3mg)のアセトニトリル溶液(0.265mL)のうち0.094mLを分注、希釈して調製した35mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジメチルスルホキシド(90μL)、tert-ブチルメチルエーテル(910μL)を加えて3日間撹拌した後、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(3.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(3.0mL)のうち、45μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
化合物6(10.1mg)にMg(ClO4)2(9.5mg)のアセトニトリル溶液(0.475mL)を希釈して調製した35mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジメチルホルムアミド(0.1mL)、tert-ブチルメチルエーテル(0.4mL)を加えて3日間撹拌した後、さらにtert-ブチルメチルエーテル(0.4mL)を加えて終夜撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(3.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(3.0mL)のうち、45μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、純度に顕著な向上は見られなかったが、固体において化合物6に対する異性体1の精製効率が40%、異性体2の精製効率が13%であることが示されたことから、固体が精製されていると判断した。
化合物6(10.1mg)にMg(ClO4)2(9.5mg)のアセトニトリル溶液(0.475mL)を希釈して調製した35mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にベンジルアルコール(0.3mL)、tert-ブチルメチルエーテル(0.7mL)を加えて4日間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(3.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(3.0mL)のうち、45μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、固体が精製されていることを確認した。
<基本操作>
化合物6(約15mgまたは約10mg)に下記の表11に示した各種金属塩約1モル当量を混合しアセトニトリル、エタノール、又はエタノール水溶液に溶解させた後、溶媒を減圧留去し、下記の表11に示した各種溶媒を加え室温で以下に従って撹拌後、上清と生じた固体を遠心分離し、上清及び真空乾燥した固体それぞれのHPLCを純度分析条件Aにより測定し、化合物6のピーク面積百分率及びピーク面積の値を基に純度及び回収率を求め表12に記載した。HPLCの解析はAdvanced Chemistry Development社製のACD/Spectrus(Run1~26)または島津社製のLabsolution(Run27~31)を用いて行った。回収率の計算は、実施例1の回収率算出法1、2、又は3によって算出した。原料として使用した化合物6は、参考例1-2で合成したロットであり、上記純度解析で使用したHPLCの条件(純度分析条件A)でのピーク面積百分率からその純度は84%であったことから、同一条件にて測定したHPLCの解析をもとに純度84%より向上した場合に、精製効果ありとした。また、本操作後の化合物6の純度が84%から向上していない場合においても、化合物6の異性体の精製効率が正の値であるものは精製効果があると判断した。実際に使用した金属塩の質量、モル当量及び化合物6の質量は表13に記載した。
化合物6(15.00mg)とMg(ClO4)2(3.03mg,83w%)のCH3CN溶液(1.0mL)を濃縮した後に得られる固体にジクロロメタン(1mL)とヘキサン(0.5mL)を加え終夜撹拌した。生じた固体と溶液を遠心分離し、溶液は濃縮後6時間乾燥しアセトニトリル(0.5mL)を加えHPLCにて純度及び回収率の確認を行った。その結果、ピーク面積百分率から純度68%、回収率14%であることが分かった。得られた固体はジクロロメタン(1mL)とヘキサン(0.5mL)の混合溶液で洗浄後、遠心分離し得られた固体を終夜真空乾燥した結果、13.64mgの化合物6-Mg(ClO4)2複合体が固体として得られた。得られた複合体の純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、純度90%、回収率82%であることが分かった。これらの操作により、沈殿した固体が精製されていることを確認した。
標品0.297mg/mLの溶液のHPLCを測定後、目的物のピーク面積(51555,220nm)を測った。
得られた固体13.64mgのうち3.00mgを10mLのアセトニトリルに溶かした後、HPLCを測定し、目的物のピーク面積(46818)を測り、下記の方法に従い計算し回収率を求めた。
(13.64/0.300)×46818÷{(15/0.297)×51555}×100≒82%
化合物6(15.0mg)とAgOTf(2.65mg、0.98モル当量)のCH3CN溶液(0.5mL)を真空乾燥して得られた固体にジクロロメタン(1mL)とヘキサン(0.6mL,0.1mLずつを2~5時間毎に合計6回に分けて)を加えた。沈殿が生じなかったため、溶液(上清)の純度及び回収率をHPLCにて確認した(計算法2)。
上記の実験の際にヘキサンを加える前後でHPLCを測定し、目的物のピーク面積(ヘキサンを加える前:55176、ヘキサンを加えた後:49150)を測り、下記の方法に従い計算し回収率を求めた。
(49150÷55176)×100≒89%
化合物6(約15mg)と各種金属塩(約1モル当量)のCH3CN溶液(0.2mL)又は懸濁液(0.2mL)を濃縮した後に得られる固体にジクロロメタン(1mL)とヘキサン(1mL)を加え4.5時間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。上清をデカンテーションした後、得られた固体は真空乾燥後0.5mLのCH3CNに溶解しHPLCにて純度及び回収率を確認した(計算法3)。
化合物6(約15mg)と各種金属塩(約1モル当量)のCH3CN溶液(0.4mL)又は懸濁液(0.4mL)を一晩開封状態にした後真空乾燥して得られた固体にジクロロメタン(1mL)とヘキサン(1mL)を加え5時間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。上清をデカンテーションした後、得られた固体は真空乾燥後に1.0mLのCH3CNに溶解しHPLCにて純度及び回収率を確認した。
化合物6(約15mg)と各種金属塩(約1モル当量)のCH3CN溶液(0.4mL)を一晩開封状態にした後真空乾燥して得られた固体にジクロロメタン(1mL)とヘキサン(1mL)を加え5時間撹拌した後、さらにヘキサン(1mL)を加え19時間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。上清をデカンテーションした後、得られた固体は真空乾燥後1.0mLのCH3CNに溶解しHPLCにて純度及び回収率を確認した(計算法3)。
化合物6(約15mg)と各種金属塩(約1モル当量)のCH3CN溶液(0.2mL)を真空乾燥して得られた固体にジクロロメタン(1mL)とヘキサン(1mL)を加え終夜撹拌した後、さらにヘキサン(1mL)を加え5時間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。上清をデカンテーションした後、得られた固体は真空乾燥後1.0mLのCH3CNに溶解しHPLCにて純度及び回収率を確認した(計算法3)。
化合物6(約15mg)と各種金属塩(約1モル当量)のCH3CN溶液(0.1mL)を真空乾燥して得られた固体にジクロロメタン(1mL)とヘキサン(1mL)を加え17時間撹拌した後、さらにヘキサン(1mL)を加え6時間撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。上清をデカンテーションした後、得られた固体は真空乾燥後1.0mLのCH3CNに溶解しHPLCにて純度及び回収率を確認した(計算法3)。
化合物6(15.02mg)とKI(1.82mg、1.04モル当量)のCH3CN溶液(0.2mL)を超音波で撹拌し、生じた固体と溶液を遠心分離した。上清をデカンテーションした後、得られた固体は真空乾燥後1.0mLのCH3CNに溶解しHPLCにて純度及び回収率を確認した。上清に関しては溶媒を減圧留去した後、真空乾燥し1.0mLのCH3CNに溶解しHPLCにて純度及び回収率を確認した(計算法3)。
・化合物6に対する異性体1の比率×100:
(異性体1のピーク面積)÷(化合物6のピーク面積)×100
・化合物6に対する異性体2の比率×100:
(異性体2のピーク面積)÷(化合物6のピーク面積)×100
・異性体1の精製効率(%):
{1-(化合物6に対する異性体1の比率)÷(標品中の化合物6に対する異性体1の比率)}×100
・異性体2の精製効率(%):
{1-(化合物6に対する異性体2の比率)÷(標品中の化合物6に対する異性体2の比率)}×100
・化合物6に対する不純物の比率×100:
(不純物のピーク面積)÷(化合物6のピーク面積)×100
・不純物の精製効率(%):
{1-(化合物6と不純物の比率)÷(基準の化合物6と不純物1の比率)}×100
run11,12,13,18,19,23の固体回収率の計算(例)
標品0.306mg/mLの溶液のHPLCを測定後、目的物のピーク面積(60127)を測った。上記実験で得られた固体のアセトニトリル溶液4μLを396μLのアセトニトリルで希釈しHPLCを測定後、目的物のピーク面積を測り標品の面積もとに、上清又は固体中の目的物の回収率を計算した。
Mg(OTf)2:(24183÷15.07×5)÷(60127÷3.06)×100≒41%
MgSO4:(257÷15.04×5)÷(60127÷3.06)×100≒0%
Sc(OTf)3:(23815÷14.99×5)÷(60127÷3.06)×100≒40%
Sm(OTf)3:(19507÷15.05×5)÷(60127÷3.06)×100≒33%
Mn(OTf)2:(29747÷15.00×5)÷(60127÷3.06)×100≒50%
Run27~31では、上記記載の回収率の計算法1によって上清、固体の回収率を算出した。Run27の上清及び固体回収率計算を例として記す。
標品0.30mg/mLの溶液のHPLCを測定後、目的物のピーク面積(2950511,220nm)を測った。調製した50%v/vアセトニトリル水溶液のHPLCを測定し、目的物のピーク面積(上清:2704577、固体:234383)を測り、下記の方法に従い計算し回収率を求めた。
上清:(2704577×10)÷(2950511×10.0)×100≒92%
固体:(234383×10)÷(2950511×10.0)×100≒8%
[実施例2-2:実験条件に対する依存性の確認]
<基本操作>
化合物6に約1モル当量の過塩素酸マグネシウムを混合しアセトニトリルに溶解させた。溶媒を減圧留去し、ジクロロメタンとヘキサンを加えて室温で以下に従って撹拌した。生じた固体と液体を遠心分離し、上清をサンプリングしてHPLCを測定した。各化合物のピーク面積百分率、ピーク面積の値を基に算出した純度及び回収率を表14、及び表15に示した。
例えば、a mgの原料を用いて実験したとし、使用した溶液量がb mLすると、上清のHPLCを測定する際には、固体と溶液を遠心分離し、上清(150b/a)μLをサンプリング後、溶媒を留去し、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。調製したサンプルのHPLCをそれぞれ測定し、基準サンプル、及び溶媒添加後の目的物のピーク面積(220nm)がそれぞれとcとdだとすると、回収率は下記の式で表される。
化合物6(Run1:15.0mg、Run2:15.1mg、Run3:15.1mg)にMg(ClO4)2(12.7mg)のアセトニトリル溶液(0.423mL)を分注(Run1:0.094mL、Run2:0.095mL、Run3:0.095mL)後、アセトニトリルで希釈して調製した53mMアセトニトリル溶液(各0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(1.0mL)を加え15分撹拌した後、溶液から10μLをサンプリングした。各溶液にヘキサン(0.5mL)を加え、1分撹拌した後、生じた固体と液体を素早く遠心分離し、上清から15μLをサンプリングした。再び撹拌し、ヘキサンの添加から10分後、再度遠心分離、上清のサンプリング(15μL)を行った。同様にして、ヘキサンの添加から30分後、1時間後、2時間後、6時間後、2日後の段階で各溶液の遠心分離、上清のサンプリング(15μL)を行った。各段階でサンプリングしたものについては溶媒を留去し、溶液全体が50μLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、いずれの時間においても上清の純度が低下し、精製効果が見られた。また、ヘキサン添加後1時間後から純度と回収率はほとんど変化しなくなったことから、平衡化の目安は1時間程度であると考えられる。
Run1にて、ジクロロメタンのみを加えた段階の目的物のピーク面積(3152623360,225nm)、及びヘキサンを添加してから1時間後の目的物のピーク面積(523598976,225nm)を測った。下記の方法に従い計算し回収率を求めた。
5253598976÷3125623360×100≒17%
化合物6(Run1:1.5mg)にMg(ClO4)2(16.7mg)のアセトニトリル溶液(0.550mL)のうち0.0084mLを0.1916mLのアセトニトリルで希釈して調製した5.3mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(1.0mL)を加え15分撹拌した後、ヘキサン(0.5mL)を加えて7時間撹拌したが、沈殿は生じなかった。
化合物6(Run2:1.5mg)にMg(ClO4)2(16.7mg)のアセトニトリル溶液(0.550mL)のうち0.0084mLを0.1916mLのアセトニトリルで希釈して調製した5.3mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(1.0mL)を加え15分撹拌した後、溶液から10μLをサンプリングした。溶媒を留去、真空乾燥した後にジクロロメタン(0.75mL)を加えて再溶解させ、ヘキサン(0.75mL)を加えて終夜撹拌後、生じた固体と液体を遠心分離し、上清から15μLをサンプリングした。各段階でサンプリングしたものについては溶媒を留去し、溶液全体が50μLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、上清の純度が低下し、精製効果が見られた。
化合物6(Run3:7.5mg)にMg(ClO4)2(16.7mg)のアセトニトリル溶液(0.550mL)のうち0.047mLを0.153mLのアセトニトリルで希釈して調製した26mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(1.0mL)を加え15分撹拌した後、各溶液からそれぞれ10μLをサンプリングした。各溶液にヘキサン(0.5mL)を加えて7時間撹拌後、遠心分離を行い、各溶液の上清から15μLをサンプリングした。各段階でサンプリングしたものについては溶媒を留去し、濃度を合わせるためにそれぞれ溶液全体が250μL、1.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、いずれの場合においても上清の純度が低下し、精製効果が見られた。
化合物6(15.1mg)にMg(ClO4)2(7.7mg)のアセトニトリル溶液(0.387mL)のうち0.143mLを0.057mLのアセトニトリルで希釈して調製した53mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(1.0mL)を加え15分撹拌した後、溶液から10μLをサンプリングした。ヘキサン(0.5mL)を加えて終夜撹拌後、生じた固体と液体を遠心分離し、上清から15μLをサンプリングした。各段階でサンプリングしたものについて溶媒を留去し、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。上清の純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、基準の純度が80%であったのに対し、上清は純度62%、回収率21%であったことから、精製効果があるとわかった。
化合物6(Run5:45.0mg)にMg(ClO4)2(16.7mg)のアセトニトリル溶液(0.550mL)のうち0.283mLを0.217mLのアセトニトリルで希釈して調製した63mMアセトニトリル溶液(0.500mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(1.0mL)を加え15分撹拌した後、各溶液からそれぞれ10μLをサンプリングした。各溶液にヘキサン(0.5mL)を加えて7時間撹拌後、遠心分離を行い、各溶液の上清から15μLをサンプリングした。各段階でサンプリングしたものについては溶媒を留去し、濃度を合わせるためにそれぞれ溶液全体が250μL、1.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、いずれの場合においても上清の純度が低下し、精製効果が見られた。
[実施例2-3-1:Mg(ClO 4 ) 2 とジクロロメタン/ヘキサンを用いた精製効果の基質一般性の確認]
<基本操作>
環状ペプチドの環状部のアミノ酸残基数が異なる化合物9、11、12~15(約10mg)に約1モル当量の過塩素酸マグネシウムを混合しアセトニトリルに溶解させた。溶媒を減圧留去し、ジクロロメタンとヘキサンを加えて室温で以下に従って撹拌した。生じた固体と液体を遠心分離し、溶媒を留去し、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリルに再溶解させ、それぞれのHPLCを測定した。HPLCの解析はAdvanced Chemistry Development社製のACD/Spectrusを用いて行った。各化合物のピーク面積百分率、ピーク面積(225nmで測定)の値を基に算出した純度及び回収率を表16および表17に示した。原料として使用した化合物は参考例1-3~8で合成した化合物であり、上記純度解析で使用したHPLCと同一条件(純度分析条件C)にて測定したHPLCの解析を基に、純度が向上した場合に精製効果ありとした。なお、純度が操作前の値から向上していない場合においても、個別の不純物に注目し、その精製効率が正の値であるものは精製効果があると判断した。
化合物9と不純物1(相対保持時間0.88、分子量2604.69、LC-MS/MSから直鎖二量体類縁副生成物ペプチドと推定)又は不純物2(相対保持時間0.89、分子量2618.71、LC-MS/MSから直鎖二量体類縁副生成物ペプチドと推定)の比率、化合物9に対する化合物9と不純物1及び不純物2がどれだけ分離されたかを確認するための精製効率は以下の式で算出した。
・化合物9に対する不純物1の比率×100:
(不純物1のピーク面積)÷(化合物9のピーク面積)×100
・化合物9に対する不純物2の比率×100:
(不純物2のピーク面積)÷(化合物9のピーク面積)×100
・不純物1の精製効率(%):
{1-(化合物9と不純物1の比率)÷(基準の化合物9と不純物1の比率)}×100
・不純物2の精製効率(%):
{1-(化合物9と不純物2の比率)÷(基準の化合物9と不純物2の比率)}×100
化合物9(10.0mg)に対し、アセトニトリル(0.2mL)を添加した溶液を濃縮、真空乾燥した後に得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングした。ヘキサン(0.33mL)を加えて終夜撹拌後、さらにヘキサン(0.33mL)を加えて3.5時間撹拌後、遠心分離を行ったが沈殿は生じなかった。上清から20μLをサンプリングした。溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。
化合物9(10.2mg)に対し、別途調整したMg(ClO4)2(9.9mg)のアセトニトリル溶液(0.99mL)の内0.217mLを添加した溶液を濃縮、真空乾燥した後に得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングした。ヘキサン(0.33mL)を加えて終夜撹拌後、さらにヘキサン(0.33mL)を加えて3.5時間撹拌後、遠心分離を行ったところ固体沈殿、上清から20μLをサンプリングした。固体と液体を遠心分離し、溶媒を留去後、真空乾燥した固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させ、溶液から15μLをサンプリングした。溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果92%であり、初期純度92%に対して向上は見られなかった。一方、図9に示すように不純物1(相対保持時間0.88)、及び不純物2(0.89)の精製効率を算出したところ、上清において化合物9に対する不純物1の精製効率が62%、不純物2の精製効率が67%であることが示されたことから、上清が精製されたと判断した。
化合物12(9.8mg)に対し、アセトニトリル(0.2mL)を添加した溶液を濃縮、真空乾燥した後に得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングした。ヘキサン(0.33mL)を加えて終夜撹拌後、さらにヘキサン(0.33mL)を加えて3.5時間撹拌後、遠心分離を行ったが沈殿は生じなかった。上清から20μLをサンプリングした。溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。
化合物12(10.1mg)に対し、別途調整したMg(ClO4)2(9.9mg)のアセトニトリル溶液(0.99mL)0.207mLを添加した溶液を濃縮、真空乾燥した後に得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングした。ヘキサン(0.33mL)を加えて終夜撹拌後、さらにヘキサン(0.33mL)を加えて3.5時間撹拌後、遠心分離を行ったところ固体沈殿、上清から20μLをサンプリングした。固体と液体を遠心分離し、溶媒を留去後、真空乾燥した固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させ、各溶液から15μLをサンプリングした。溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、いずれも上清が精製されていることを確認した。
化合物14(10.0mg)に対し、アセトニトリル(0.2mL)を添加した溶液を濃縮、真空乾燥した後に得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングした。ヘキサン(0.33mL)を加えて終夜撹拌後、さらにヘキサン(0.33mL)を加えて3.5時間撹拌後、遠心分離を行ったが沈殿は生じなかった。上清から20μLをサンプリングした。溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。
化合物14(10.0mg)に対し、別途調整したMg(ClO4)2(9.9mg)のアセトニトリル溶液(0.99mL)0.169mLを添加した溶液を濃縮、真空乾燥した後に得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングした。ヘキサン(0.33mL)を加えて終夜撹拌後、さらにヘキサン(0.33mL)を加えて3.5時間撹拌後、遠心分離を行ったところ固体沈殿、上清から20μLをサンプリングした。固体と液体を遠心分離し、溶媒を留去後、真空乾燥した固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させ、各溶液から15μLをサンプリングした。溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、いずれも上清が精製されていることを確認した。
化合物11(9.9mg)のアセトニトリル溶液(0.200mL)を濃縮、真空乾燥して得られた後に得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングした。ヘキサン(0.66mL)を加えて4.5時間撹拌後、遠心分離を行ったが沈殿は生じなかった。上清から20μLをサンプリングした。サンプリングした各溶液は溶媒を留去し、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。
化合物11(10.1mg)にMg(ClO4)2(3.8mg)のアセトニトリル溶液(0.380mL)を希釈して調製した36mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた後に得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングした。ヘキサン(0.66mL)を加えて4.5時間撹拌後、遠心分離を行ったところ固体沈殿、上清から20μLをサンプリングした。固体と液体を遠心分離し、溶媒を留去後、真空乾燥した固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させ、各溶液から15μLをサンプリングした。サンプリングした各溶液は溶媒を留去し、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、上清が精製されていることを確認した。
化合物13(9.9mg)のアセトニトリル溶液(0.200mL)を濃縮、真空乾燥して得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングした。ヘキサン(0.66mL)を加えて4.5時間撹拌後、遠心分離を行ったが沈殿は生じなかった。上清から20μLをサンプリングした。サンプリングした各溶液は溶媒を留去し、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。
化合物13(9.9mg)にMg(ClO4)2(4.1mg)のアセトニトリル溶液(0.410mL)を希釈して調製した32mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングした。ヘキサン(0.66mL)を加えて4.5時間撹拌後、遠心分離を行ったところ固体沈殿、上清から20μLをサンプリングした。固体と液体を遠心分離し、溶媒を留去後、真空乾燥した固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させ、各溶液から15μLをサンプリングした。サンプリングした各溶液は溶媒を留去し、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、上清が精製されていることを確認した。
化合物15(9.9mg)のアセトニトリル溶液(0.200mL)を濃縮、真空乾燥して得られた溶液を濃縮、真空乾燥した後に得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングしたヘキサン(1.32mL)を加えて4.5時間撹拌後、遠心分離を行ったが沈殿は生じなかった。上清から30μLをサンプリングした。サンプリングした各溶液は溶媒を留去し、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。
化合物15(9.9mg)にMg(ClO4)2(4.7mg)のアセトニトリル溶液(0.470mL)を希釈して調製した30mMアセトニトリル溶液(0.200mL)を加えて濃縮、真空乾燥した。得られた固体にジクロロメタン(0.66mL)を加え15分撹拌した後、10μLをサンプリングした。ヘキサン(1.32mL)を加えて4.5時間撹拌後、遠心分離を行ったところ固体沈殿、上清から30μLをサンプリングした固体と液体を遠心分離し、溶媒を留去後、真空乾燥した固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させ、各溶液から15μLをサンプリングした。サンプリングした各溶液は溶媒を留去し、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した結果、上清が精製されていることを確認した。
<基本操作>
環状部のアミノ酸残基数が異なる環状ペプチドである下記表18に示す各化合物(約10mg)に約1モル当量のヨウ化マグネシウムを混合しアセトニトリルに溶解させた。溶媒を減圧留去し、下記表18に示した各種溶媒を加えて室温で以下に従って撹拌した。生じた固体と液体を遠心分離し、溶媒を留去し、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリルに再溶解させ、純度分析条件CにてそれぞれのHPLCを測定した。HPLCの解析はAdvanced Chemistry Development社製のACD/Spectrusを用いて行った。各化合物のピーク面積百分率、ピーク面積(225nmで測定)の値を基に算出した純度及び回収率を表18に示した。
各化合物約10mgに対し、別途調整したMgI2(26.2mg)のアセトニトリル溶液(2.62mL)を1モル当量分注した溶液を濃縮、真空乾燥した後に得られた固体に表18のRun1~6に示す溶媒を加え、終夜撹拌した。生じた固体と溶液を遠心分離し、溶媒を留去後、真空乾燥した上清、固体をアセトニトリル(1.0mL)に再溶解させた。得られた上清、固体のアセトニトリル溶液(1.0mL)のうち、15μLをサンプリング後、溶液全体が0.5mLの50%v/vアセトニトリル水溶液となるようにサンプルを調製した。純度及び回収率をHPLCにて確認した。Run1,2,3,4,6では上清が精製されていることを確認した。Run5では固体が精製されていることを確認した。
[実施例3-1:環状ペプチドと金属塩の分離検討]
<実験操作1>
化合物6(30.0mg,純度84%[ピーク面積百分率])とMg(ClO4)2(5.88mg)のCH3CN溶液(1.0mL)を減圧濃縮後、得られる固体を2mLのジクロロメタンに溶解させ、さらに1mLのヘキサンを加え3時間撹拌した。得られた懸濁液を遠心分離し、固体と液体に分けた後、固体をジクロロメタンーヘキサンの混合液(2mL/1mL)を加えさらに3時間撹拌した。得られた懸濁液を遠心分離し乾燥させ固体(43.07mg,純度93%[ピーク面積百分率])を得た。
実験操作1で得られた固体のうち1.13mgに重アセトニトリル(CD3CN,0.6mL)を加えその溶液のうち0.5mLを用いて1H-NMRを測定した(図10-a)。
実験操作1で得られた固体のうち1.02mgに1mLのジクロロメタンを加え一晩放置し乾固させ重アセトニトリル(CD3CN,0.5mL)を加え1H-NMRを測定した(図10-b)。
実験操作1で得られた固体のうち1.14mgにジクロロメタンを1mL加えた後、水を1mL加え分液操作を行った。得られた有機相と水相を分離し、有機相に対して水1mLを加え分液操作を行う作業をさらに2回行った。得られた有機相を乾燥した結果、固体が0.72mg得られた。得られた固体に対し重アセトニトリル(CD3CN,0.5mL)を加え1H-NMRを測定した(図10-c)。比較のため図10-dには、原料の化合物6(純度84%[ピーク面積百分率])の1H-NMRスペクトルを載せた。
図10-aと図10-bに示した1H-NMRスペクトルを比較した結果、両者が同じスペクトルを示したことより、実験操作1で得られた複合体はジクロロメタンを加えたとしても分解しないことを確認した。
<実験操作1(複合体の取り出し及び精製)>
化合物6(15.17mg,純度84%[ピーク面積百分率])とMg(ClO4)2(2.95mg)のCH3CN溶液(0.5mL)を減圧濃縮後、得られる固体を1mLのジクロロメタンに溶解させ、さらに0.6mLのヘキサンを加え2時間撹拌した。得られた懸濁液を遠心分離し、固体と液体に分けた後、固体をジクロロメタンーヘキサンの混合液(1mL/0.6mL)を加えさらに30分撹拌した。得られた懸濁液を遠心分離し乾燥させ固体(13.16mg,純度88%)を得た。
実験操作1で得られた固体にジクロロメタン(1mL)と水(1mL)加え分液操作を行った。水相と有機相を分離し、有機相に水(2mL)を加え分液操作を行った。この操作をさらに1回繰り返し行った。水相と有機相を分離後、有機相に水(2mL)とアセトニトリル(0.05mL)加え分液操作を行った。水相と有機相を分離し、有機相に水(2mL)を加え分液操作を行った。水相と有機相を分離し、有機相にジクロロメタン(0.5mL)と水(1mL)を加え分液操作を行った。水相と有機相を分離し、水相にジクロロメタン(1mL)を加え分液操作を行い、有機相と水相を分離し、同じ操作をさらに2回行った。得られた有機相を集め溶媒を減圧留去し、固体(10.57mg,純度88%,回収率73%)を得た。
回収率計算:10.57×0.88÷(15.17×0.84)×100=73%
Claims (15)
- 環状ペプチドの精製法であって、
前記精製法は、下記(i)又は(ii)の分離工程を含み、
(i)精製目的物である環状ペプチドを含む混合物から、精製目的物である前記環状ペプチドを金属原子又は金属イオンとの複合体として分離する
(ii)精製目的物である環状ペプチド及び不純物であるペプチドを含む混合物から、精製目的物である前記環状ペプチド又は不純物である前記ペプチドを、金属原子又は金属イオンとの複合体として分離する
前記金属原子は、アルカリ金属原子、アルカリ土類金属原子、遷移金属原子、貧金属原子及び希土類金属原子からなる群より選択される少なくとも一種であり、
前記金属イオンは、アルカリ金属イオン、アルカリ土類金属イオン、遷移金属イオン、貧金属イオン及び希土類金属イオンからなる群より選択される少なくとも一種である、精製法。 - (1)精製目的物である前記環状ペプチドを含む混合物、又は、精製目的物である前記環状ペプチド及び不純物である前記ペプチドを含む混合物と、前記金属原子又は前記金属イオンを混合する工程を前記分離工程の前工程として含む、請求項1に記載の精製法。
- 前記(1)工程は、第一の溶媒中で行われる、請求項2に記載の精製法。
- 環状ペプチドの精製法であって、
(1)’第一の溶媒中で、精製目的物である環状ペプチドを含む混合物、又は、精製目的物である環状ペプチド及び不純物であるペプチドを含む混合物と、金属原子又は金属イオンを混合する工程を含み、
前記金属原子は、アルカリ金属原子、アルカリ土類金属原子、遷移金属原子、貧金属原子及び希土類金属原子からなる群より選択される少なくとも一種であり、
前記金属イオンは、アルカリ金属イオン、アルカリ土類金属イオン、遷移金属イオン、貧金属イオン及び希土類金属イオンからなる群より選択される少なくとも一種である、精製法。 - 前記(1)’工程において、前記第一の溶媒中で、精製目的物である前記環状ペプチド又は不純物である前記ペプチドと、前記金属原子又は前記金属イオンとの複合体を形成させる、請求項4に記載の精製法。
- (2)前記(1)工程又は前記(1)’工程において得られた混合物と、第二の溶媒を混合する工程を更に含み、
前記第一の溶媒及び前記第二の溶媒は、互いに異なる溶媒である、請求項3~5のいずれか一項に記載の精製法。 - (2)’前記第一の溶媒の少なくとも一部を除去する工程を前記(2)工程の前工程として含む、請求項6に記載の精製法。
- (3)前記(1)工程又は前記(1)’工程において得られた混合物と前記第二の溶媒の混合液から、精製目的物である前記環状ペプチド又は不純物である前記ペプチドと前記金属原子又は前記金属イオンとの複合体を分離する工程を含む、請求項6又は7に記載の精製法。
- 前記第一の溶媒が、アルコール系溶媒、ニトリル系溶媒、ベンゼン系溶媒、エーテル系溶媒、ケトン系溶媒、ハロゲン系溶媒、エステル系溶媒、スルホキシド系溶媒、及びアミド系溶媒からなる群より選択される少なくとも一種である、請求項3~8のいずれか一項に記載の精製法。
- 環状ペプチドの精製法であって、
(4)精製目的物である環状ペプチド又は不純物であるペプチドと、金属原子又は金属イオンとの複合体、及び、第二の溶媒を混合する工程を含み、
前記金属原子は、アルカリ金属原子、アルカリ土類金属原子、遷移金属原子、貧金属原子及び希土類金属原子からなる群より選択される少なくとも一種であり、
前記金属イオンは、アルカリ金属イオン、アルカリ土類金属イオン、遷移金属イオン、貧金属イオン及び希土類金属イオンからなる群より選択される少なくとも一種である、精製法。 - (5)前記複合体及び前記第二の溶媒の混合液から、前記複合体を分離する工程を更に含む、請求項10に記載の精製法。
- 前記第二の溶媒が、エーテル系溶媒、ベンゼン系溶媒、ケトン系溶媒、ハロゲン系溶媒、エステル系溶媒、ニトリル系溶媒、炭化水素系溶媒、アルコール系溶媒、スルホキシド系溶媒、及びアミド系溶媒からなる群より選択される少なくとも一種である、請求項6~8,10,11のいずれか一項に記載の精製法。
- 請求項1~12のいずれか一項に記載の精製法を含む、環状ペプチドの製造法。
- 液相合成法により精製目的物である前記環状ペプチドを得る工程を更に含む、請求項13に記載の製造法。
- 固相合成法により精製目的物である前記環状ペプチドを得る工程を更に含む、請求項13に記載の製造法。
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