WO2024019110A1 - SARS-CoV-2に対する抗体 - Google Patents
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Definitions
- the present invention relates to antibodies against SARS-CoV-2, and more particularly, antibodies that bind to the spike glycoprotein receptor binding site (RBD) of SARS-CoV-2, and prevention or treatment of COVID-19 using the same.
- the present invention relates to therapeutic compositions, compositions for immunologically detecting SARS-CoV-2, and methods for immunologically detecting SARS-CoV-2.
- coronavirus severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2, SARS-CoV-2
- COVID-19 severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2, SARS-CoV-2
- mRNA vaccines and DNA vaccines have begun worldwide, but since vaccines are generally preventive drugs, there is a strong desire for useful therapeutic drugs.
- functional inhibitors such as remdesivir, an RNA-dependent RNA polymerase inhibitor, and anti-inflammatory agents such as dexamethasone are known as treatments for COVID-19, but these drugs have serious side effects. tends to appear more easily.
- therapeutic antibodies As a therapeutic drug that has both high efficacy and low side effects, therapeutic antibodies have been used in the medical field to treat various diseases such as infectious diseases, cancer, and rheumatoid arthritis. Research into antibodies as therapeutic agents is also actively conducted. For example, in Japan, "antibody cocktail therapy" in which two types of anti-SARS-CoV-2 antibodies are administered to patients was approved in 2021 as a treatment method for mild to moderate cases of COVID-19. - It has been reported that the combination of two or more types of CoV-2 antibodies can suppress the generation of antibody escape mutant viruses (escape viruses) (Baum et al., Science 369, p. 1014-1018, 2020 (non-patent literature) 1).
- escape viruses escape mutant viruses
- SARS-CoV-2 is known to infect the host cell by the spike glycoprotein (S protein) on the surface of the virus recognizing angiotensin converting enzyme 2 (ACE-2, S protein receptor) on the host cell.
- S protein spike glycoprotein
- ACE-2 angiotensin converting enzyme 2
- Many of the current antibodies for treating COVID-19 exert their infection-neutralizing effects by blocking the binding of the spike glycoprotein to ACE-2.
- SARS-CoV-2 has undergone numerous mutations, and mutant strains that have mutations in the base sequence of the viral genome and amino acid substitutions or deletions in the viral protein often have poor immune escape ability. It is known that such mutant strains can acquire growth advantages and replace previously prevalent strains. Therefore, when a mutant strain with a mutation in the spike glycoprotein receptor binding site (RBD), which is the ACE-2 binding region, replaces a new epidemic strain, the strain that was previously developed for the previous epidemic strain is replaced. The therapeutic effect of antibodies for treating COVID-19 will no longer be exerted.
- RBD spike glycoprotein receptor binding site
- the present invention was made in view of the above-mentioned problems of the conventional technology, and has a binding affinity for not only the conventional SARS-CoV-2 (Wuhan strain) but also other mutant strains including the Omicron strain. and novel antibodies with high infection-neutralizing activity, compositions for preventing or treating COVID-19 using the same, compositions for immunologically detecting SARS-CoV-2, and SARS-CoV-2.
- the purpose of this invention is to provide a method for immunologically detecting.
- the present inventors have conducted intensive research to achieve the above-mentioned objective, and have determined that the SARS-CoV-2 spike glycoprotein receptor binding site (RBD ) and that recognize serine at position 443 or tyrosine at position 489 of the amino acid sequence of the spike glycoprotein.
- RBD SARS-CoV-2 spike glycoprotein receptor binding site
- These antibodies have binding affinity not only for the conventional SARS-CoV-2 (Wuhan strain) but also for other mutant strains including the Delta strain and Omicron strains (BA.1, BA.2, etc.). It was also found that the infection neutralizing activity was high. Furthermore, by further improving such antibodies, we have also improved the binding affinity and infection resistance for the later Omicron strains (BA.5, BA.2.75, BQ.1.1, XBB, XBB.1.5), etc. We have developed an antibody with higher anti-oxidation activity and completed the present invention.
- the present invention provides an antibody against SARS-CoV-2, a composition for preventing or treating COVID-19 using the same, a composition for immunologically detecting SARS-CoV-2, and a composition for immunologically detecting SARS-CoV-2.
- a composition for immunologically detecting SARS-CoV-2 a composition for immunologically detecting SARS-CoV-2.
- the method of immunologically detecting -2 more specifically, the following is provided.
- An antibody against SARS-CoV-2 which binds to the spike glycoprotein receptor binding site (RBD) of SARS-CoV-2, and is an antibody that binds to the spike glycoprotein receptor binding site (RBD), and is an antibody that binds to the 443rd serine or 489th amino acid sequence of the spike glycoprotein.
- An anti-SARS-CoV-2 antibody that recognizes tyrosine at position.
- [2] The anti-SARS-CoV-2 according to [1], which binds to the spike glycoprotein receptor binding site (RBD) of SARS-CoV-2 with a dissociation constant (K D ) of 1.0 ⁇ 10 ⁇ 6 M or less antibody.
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2 is used as the heavy chain complementarity determining region 3-1. and hold each as The amino acid sequence at positions 27 to 32 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 31, or the substitution or deletion of one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 27 to 32 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 31.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-1; the amino acid sequence at positions 50 to 52 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 31, or The amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added and/or inserted in the amino acid sequence at positions 50 to 52 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-1; SEQ ID NO: 3. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 3, respectively, as light chain complementarity determining region 3-1.
- Antibodies (2) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 32, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 32.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-2; the amino acid sequence at positions 51 to 58 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 32, or SEQ ID NO: 32.
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 4, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 4, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-2. and hold each as The amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 33, or the substitution or deletion of one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 33.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-2; the amino acid sequence at positions 52 to 54 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 33, or The amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence at positions 52 to 54 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-2; SEQ ID NO: 5. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 5, respectively, as light chain complementarity determining region 3-2.
- Antibodies (3) The amino acid sequence at positions 19 to 28 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 34, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 19 to 28 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 34.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-3; the amino acid sequence at positions 46 to 52 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 34, or SEQ ID NO: 34.
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 6, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 6, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-3. and hold each as In the amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 35, or in the amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 35, one or several amino acids are substituted or deleted.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-3; the amino acid sequence at positions 52 to 54 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 35, or The amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence at positions 52 to 54 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-3; SEQ ID NO: 7. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 7, respectively, as light chain complementarity determining region 3-3.
- Antibodies (4) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 36, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 36.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-4; the amino acid sequence at positions 51 to 60 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 36, or SEQ ID NO: 36.
- Heavy chain complementarity determining region 2-4 SEQ ID NO: The amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 8, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 8, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-4. and hold each as In the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 37, or in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 37, one or several amino acids are substituted or deleted.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-4; the amino acid sequence at positions 51 to 53 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 37, or The amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added and/or inserted in the amino acid sequence at positions 51 to 53 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-4; SEQ ID NO: 9. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 9, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-4.
- Antibodies (5) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 38, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 38.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-5; the amino acid sequence at positions 51 to 58 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 38, or SEQ ID NO: 38.
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 10 or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 10, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-5. and hold each as The amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 39, or the substitution or deletion of one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 39.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-5; the amino acid sequence at positions 52 to 54 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 39, or An amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added and/or inserted in the amino acid sequence at positions 52 to 54 of the amino acid sequence is described as light chain complementarity determining region 2-5; SEQ ID NO: 11 or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 11, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-5.
- Antibodies (6) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 40, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 40.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-6; the amino acid sequence at positions 51 to 58 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 40, or SEQ ID NO: 40.
- SEQ ID NO: 12 The amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 12, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 12, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-6. and hold each as The amino acid sequence at positions 27 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 41, or the substitution or deletion of one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 27 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 41.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-6; the amino acid sequence at positions 51 to 53 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 41, or The amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added and/or inserted in the amino acid sequence at positions 51 to 53 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-6; SEQ ID NO: 13. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 13, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-6.
- Antibodies (7) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 42, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 42.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-7; the amino acid sequence at positions 51 to 58 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 42, or SEQ ID NO: 42.
- Heavy chain complementarity determining region 2-7 SEQ ID NO: The amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 14, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 14, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-7. and hold each as In the amino acid sequence at positions 26 to 31 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 43, or in the amino acid sequence at positions 26 to 31 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 43, one or several amino acids are substituted or deleted.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-7; the amino acid sequence at positions 49 to 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 43, or The amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added and/or inserted in the amino acid sequence at positions 49 to 51 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-7; SEQ ID NO: 15. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 15, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-7.
- Antibodies (8) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 44, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 44.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-8; the amino acid sequence at positions 51 to 57 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 44, or SEQ ID NO: 44.
- Heavy chain complementarity determining region 2-8 SEQ ID NO: The amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 16, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 16, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-8. and hold each as In the amino acid sequence at positions 27 to 32 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 45, or in the amino acid sequence at positions 27 to 32 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 45, one or several amino acids are substituted or deleted.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-8; the amino acid sequence at positions 50 to 52 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 45, or The amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence at positions 50 to 52 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-8; SEQ ID NO: 17. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 17, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-8.
- Antibodies (9) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 46, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 46.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-9; the amino acid sequence at positions 51 to 57 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 46, or SEQ ID NO: 46.
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 18, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 18, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-9. and hold each as The amino acid sequence at positions 27 to 32 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 47, or the substitution or deletion of one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 27 to 32 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 47.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-9; the amino acid sequence at positions 50 to 52 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 47, or The amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added and/or inserted in the amino acid sequence at positions 50 to 52 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-9; SEQ ID NO: 19. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 19, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-9.
- Antibodies (10) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 48, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 48.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-10; the amino acid sequence at positions 51 to 58 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 48, or SEQ ID NO: 48.
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 20, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 20, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-10. and hold each as The amino acid sequence at positions 27 to 37 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 49, or the substitution or deletion of one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 27 to 37 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 49.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-10; the amino acid sequence at positions 55 to 57 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 49, or The amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added and/or inserted in the amino acid sequence at positions 55 to 57 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-10; SEQ ID NO: 21. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 21, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-10.
- Antibodies (11) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 50, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 50.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-11; the amino acid sequence at positions 51 to 58 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 50, or SEQ ID NO: 50.
- Heavy chain complementarity-determining region 2-11 SEQ ID NO: The amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 22, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 22, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-11. and hold each as The amino acid sequence at positions 27 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 51, or the substitution or deletion of one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 27 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 51.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-11; the amino acid sequence at positions 51 to 53 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 51, or The amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added and/or inserted in the amino acid sequence at positions 51 to 53 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-11; SEQ ID NO: 23. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 23, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-11.
- Antibodies (12) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 52, or the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 52, in which one or several amino acids are The substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-12; the amino acid sequence at positions 51 to 57 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 52, or SEQ ID NO: 52.
- Heavy chain complementarity determining region 2-12 SEQ ID NO:
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-12; the amino acid sequence at positions 50 to 52 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 53, or The amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence at positions 50 to 52 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-12; SEQ ID NO: 25. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 25, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-12.
- Antibodies (13) The amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 54, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 54.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-13; the amino acid sequence at positions 52 to 58 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 54, or SEQ ID NO: 54.
- Heavy chain complementarity determining region 2-13 SEQ ID NO:
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 26, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 26, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-13. and hold each as In the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 55, or in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 55, one or several amino acids are substituted or deleted.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-13; the amino acid sequence at positions 51 to 53 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 55, or The amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence at positions 51 to 53 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-13; SEQ ID NO: 27. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 27, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-13.
- Antibodies (14) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 56, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 56.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-14; the amino acid sequence at positions 51 to 58 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 56, or SEQ ID NO: 56.
- Heavy chain complementarity determining region 2-14 is an amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added and/or inserted in the amino acid sequence at positions 51 to 58 of the amino acid sequence described in The amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 28, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 28, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-14. and hold each as In the amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 57, or in the amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 57, one or several amino acids are substituted or deleted.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-14; the amino acid sequence at positions 52 to 54 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 57, or The amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence at positions 52 to 54 of the amino acid sequence is described as light chain complementarity determining region 2-14; SEQ ID NO: 29. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 29, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-14.
- Antibodies (15) The amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 65, or one or several amino acids in the amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 65.
- the substituted, deleted, added and/or inserted amino acid sequence is the heavy chain complementarity determining region 1-15; the amino acid sequence at positions 51 to 58 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 65, or SEQ ID NO: 65.
- Heavy chain complementarity determining region 2-15 SEQ ID NO: The amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 63, or the amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 63, is used as the heavy chain complementarity determining region 3-15. and hold each as In the amino acid sequence at positions 23 to 31 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 66, or in the amino acid sequence at positions 23 to 31 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 66, one or several amino acids are substituted or deleted.
- the deleted, added, and/or inserted amino acid sequence is the light chain complementarity determining region 1-15; the amino acid sequence at positions 49 to 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 66, or The amino acid sequence in which one or several amino acids are substituted, deleted, added and/or inserted in the amino acid sequence at positions 49 to 51 of the amino acid sequence is described in light chain complementarity determining region 2-15; SEQ ID NO: 64. or an amino acid sequence in which one or several amino acids have been substituted, deleted, added, and/or inserted in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 64, respectively, as light chain complementarity determining regions 3-15.
- Antibodies The anti-SARS-CoV-2 antibody according to [1] or [2], which is selected from the group consisting of.
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 54 an amino acid sequence having 80% or more homology to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 54, or 1 or 1 in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 54.
- the anti-SARS-CoV-2 antibody according to any one of [1] to [3], selected from the group consisting of.
- composition for preventing or treating COVID-19 which contains the antibody according to any one of [1] to [4].
- composition for immunologically detecting SARS-CoV-2 which contains the antibody according to any one of [1] to [4].
- [7] A method for immunologically detecting SARS-CoV-2 using the antibody according to any one of [1] to [4].
- [8] A method for preventing or treating COVID-19, which comprises administering to a subject the antibody according to any one of [1] to [4] or the composition according to [6].
- the present invention in addition to the conventional SARS-CoV-2 (Wuhan strain), a novel antibody with high binding affinity and infection-neutralizing activity against other mutant strains including the Omicron strain, as well as its It is possible to provide a composition for preventing or treating COVID-19 using the present invention, a composition for immunologically detecting SARS-CoV-2, and a method for immunologically detecting SARS-CoV-2. It becomes possible.
- Antibody No. 2 against SARS-CoV-2 (Wuhan strain, Delta strain, Omicron strain (BA.1), Omicron strain (BA.2)). 1 is a heat map showing the infection neutralizing activity (log 10 IC 50 (ng/mL)) of recombinant monoclonal antibodies 1 to 14 and the sotrovimab parent antibody (S309). Antibody No. against each mutant RBD. Binding properties of recombinant monoclonal antibodies 1 to 14 and sotrovimab parent antibody (S309) (Relative binding amount when the amount of recombinant monoclonal antibody bound to Wuhan strain RBD (Ancestral) is taken as 100 (%) (%)).
- Hamsters infected with the Wuhan strain of SARS-CoV-2 were given antibody No. Average change in body weight from the day of infection (change when the body weight on the day of infection (day 0) is set as 100) when recombinant monoclonal antibodies 5 to 7, PBS, or sotrovimab parent antibody (S309) were administered. It is a graph showing values. Hamsters infected with the Wuhan strain of SARS-CoV-2 were given antibody No.
- FIG. 7 is a graph showing the weights (g) of the right posterior lobe of the right lung on day 6 from the day of infection and their average values when recombinant monoclonal antibodies 5 to 7, PBS, or sotrovimab parent antibody (S309) were administered.
- FIG. 7 is a graph showing the number of virus copies in the nasal wash fluid and their average values on the third day from the day of infection when recombinant monoclonal antibodies 5 to 7, PBS, or sotrovimab parent antibody (S309) were administered.
- Hamsters infected with SARS-CoV-2 Omicron strain (BA.2) were given antibody No.
- FIG. 7 is a graph showing the number of virus copies in the nasal wash fluid and their average values on the third day from the day of infection when recombinant monoclonal antibodies 5 to 7, PBS, or sotrovimab parent antibody (S309) were administered.
- a heat map showing the binding properties of 15 recombinant monoclonal antibodies (Relative to Ancestral (%) when the amount of recombinant monoclonal antibodies bound to Wuhan strain RBD (Ancestral) is taken as 100 (%)).
- the anti-SARS-CoV-2 antibody of the present invention is an antibody against SARS-CoV-2 that binds to the spike glycoprotein receptor binding site (RBD) of SARS-CoV-2, and is an antibody that binds to the spike glycoprotein receptor binding site (RBD) of SARS-CoV-2.
- This is an antibody that recognizes serine at position 443 or tyrosine at position 489 of the amino acid sequence of (hereinafter simply referred to as "the antibody of the present invention” in some cases).
- SARS-CoV-2 refers to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, which is also referred to as the "new coronavirus.”
- the size of the SARS-CoV-2 virus particle is approximately 50 to 200 nm in diameter, and it consists of spike glycoprotein (S protein), nucleocapsid protein (N protein), membrane protein (M protein), and envelope protein (E protein). It is composed of four proteins and RNA.
- S protein spike glycoprotein
- N protein nucleocapsid protein
- M protein membrane protein
- E protein envelope protein
- SARS-CoV-2 has spread to various mutant strains since the conventional strain (referred to herein as the "Wuhan strain” in some cases) that was first confirmed to occur near Wuhan City, Hubei province, People's Republic of China in 2019. have been confirmed, and the prevalent strains change depending on the country or region.
- the main variants of concern that have occurred to date include alpha strains, beta strains, gamma strains, delta strains, and omicron strains, which are named by the World Health Organization (WHO).
- these mutant strains are further divided into strains, for example, Omicron strains include BA. 1. BA. A second class system has been confirmed. Furthermore, in recent years, BA. 2.75, BA. 4. BA. 5. BQ.
- the SARS-CoV-2 according to the present invention is not particularly limited as long as it has the following RBD, but is preferably at least one selected from the group consisting of the Wuhan strain, Delta strain, and Omicron strain, for example.
- SARS-CoV-2 is a single-stranded positive-strand RNA virus with a total length of the viral genome of approximately 29,900 bases. Analysis of the nucleotide sequence of the SARS-CoV-2 viral genome and the amino acid sequence encoded by it, including the above-mentioned mutant strains, is progressing all over the world, and can be obtained from known databases such as GenBank (NCBI), for example. It is.
- RBD refers to the spike glycoprotein receptor binding domain within the S protein, and typically consists of 223 amino acids.
- SARS-CoV-2 this RBD is known to recognize and bind to angiotensin-converting enzyme 2 (ACE-2) on host cells, thereby infecting the host. Therefore, inhibiting (neutralizing) this binding is important in the prevention and treatment of COVID-19.
- ACE-2 angiotensin-converting enzyme 2
- the amino acid sequence of the RBD and the nucleotide sequence encoding it, including the mutant strain can be obtained from known databases such as GenBank (NCBI).
- NCBI GenBank
- a typical amino acid sequence of the RBD of SARS-CoV-2 according to the present invention includes the amino acid sequence at positions 319 to 541 of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1.
- the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 is the amino acid sequence of the spike glycoprotein of the Wuhan strain of SARS-CoV-2 (NCBI Reference Sequence: YP_009724390.1).
- the "RBD amino acid sequence" according to the present invention includes the serine at position 443 and / or tyrosine at position 489 (including the amino acid corresponding to serine at position 443 and the amino acid corresponding to tyrosine at position 489 below), but are not limited to this. do not have.
- the "RBD amino acid sequence" preferably includes, for example, 70% or more, preferably 80% or more, 90% or more of the amino acid sequence at positions 319 to 541 of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1, 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, or 99% or more) homology (preferably identity), and the following serine at position 443 and/or tyrosine at position 489
- Amino acid sequence having one or several amino acids (within 70 amino acids, preferably within 45 amino acids, within 25 amino acids, within 20 amino acids, within 10 amino acids, within 5
- the anti-SARS-CoV-2 antibody of the present invention recognizes serine at position 443 or tyrosine at position 489 of the amino acid sequence of the spike glycoprotein in the RBD.
- the amino acid positions indicated as “position 443” and “position 489” are based on the amino acid sequence of the spike glycoprotein of SARS-CoV-2 (typically, SEQ ID NO: 1). The number of amino acid residues from the N-terminus in the shown amino acid sequence) is shown.
- SARS-CoV-2 serine at position 443 and tyrosine at position 489 of the amino acid sequence are highly conserved.
- nucleotide sequence of a virus changes due to mutations, etc.
- amino acid sequence of the protein encoded by it can also be changed accordingly.
- tyrosine at position 489 of the amino acid sequence of the spike glycoprotein each include the corresponding amino acids (preferably serine and tyrosine, respectively).
- an amino acid that "corresponds" to a specific amino acid in an amino acid sequence is defined as an amino acid that is defined using amino acid sequence analysis software (e.g., GENETYX-MAC, Sequencher, etc.) or ClustalW, etc. (e.g., parameters: default values (i.e., initial settings). Value))
- amino acid sequence analysis software e.g., GENETYX-MAC, Sequencher, etc.
- ClustalW e.g., parameters: default values (i.e., initial settings). Value)
- select the amino acid that is the same as the reference amino acid i.e., for example, serine at position 443 and/or tyrosine at position 489 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1). show.
- Amino acids that "correspond" to a particular amino acid in an amino acid sequence include amino acids with chemically similar amino acid side chains (e.g., amino acids with hydroxy groups (serine, threonine), amino acids with aromatic groups (phenylalanine, tyrosine), etc. ⁇ Tryptophan)) is preferable, and the amino acid corresponding to "serine at position 443 of the amino acid sequence of spike glycoprotein" is more preferably serine, and "tyrosine at position 489 of the amino acid sequence of spike glycoprotein" Tyrosine is more preferred as the corresponding amino acid.
- amino acids with chemically similar amino acid side chains e.g., amino acids with hydroxy groups (serine, threonine), amino acids with aromatic groups (phenylalanine, tyrosine), etc. ⁇ Tryptophan)
- amino acid corresponding to "serine at position 443 of the amino acid sequence of spike glycoprotein" is more preferably serine
- antibody includes not only complete antibodies but also functional fragments thereof.
- functional fragment refers to a part (partial fragment) of a complete antibody that recognizes the RBD, specifically, Fab, F(ab')2, Fab' , variable region fragment (Fv), disulfide bond Fv, single chain Fv (scFv), sc(Fv)2, diabody, and polymers thereof.
- Fab refers to a monovalent antigen-binding fragment of an immunoglobulin consisting of one light chain and part of a heavy chain, and can be obtained, for example, by papain digestion of an antibody or by recombinant methods.
- F(ab')2 means a bivalent antigen-binding fragment of an immunoglobulin consisting of portions of both light chains and both heavy chains, which can be obtained, for example, by pepsin digestion of antibodies or by recombinant methods. Can be done.
- Fab' can be obtained, for example, by reducing F(ab')2, including one or more cysteines in the hinge region of the antibody, and only a few at the carboxy terminus of the heavy chain CH1 domain. It differs from Fab by the addition of a residue.
- variable region fragment refers to the smallest antibody fragment that has a complete antigen recognition and binding site.
- Fv is a dimer in which a heavy chain variable region and a light chain variable region are tightly linked by non-covalent bonds.
- a "single chain Fv (scFv)” includes the heavy and light chain variable regions of an antibody, which regions are present in a single polypeptide chain.
- sc(Fv)2 is a single chain made by linking two heavy chain variable regions and two light chain variable regions with a linker or the like.
- a “diabody” is a small antibody fragment with two antigen-binding sites, which contains a heavy chain variable region joined to a light chain variable region in the same polypeptide chain, each region having a distinct It forms a pair with the complementary region of the strand.
- antibody includes all classes and subclasses of immunoglobulin, and also includes polyclonal antibodies and monoclonal antibodies.
- Polyclonal antibody refers to an antibody preparation that includes different antibodies directed against different epitopes
- monoclonal antibody refers to antibodies (including antibody fragments) that are obtained from a substantially homogeneous population of antibodies.
- the antibody of the present invention is preferably a monoclonal antibody.
- the antibody of the present invention may be any antibody that recognizes serine at position 443 or tyrosine at position 489 of the amino acid sequence of the spike glycoprotein, and its origin, type, shape, etc. are not particularly limited. Specific examples include antibodies derived from humans, antibodies derived from non-human animals (e.g. rabbit antibodies, mouse antibodies, rat antibodies, camel antibodies), chimeric antibodies, humanized antibodies, and functional fragments of these antibodies. When used for the purpose of a therapeutic antibody, it is preferably a human-derived antibody or a humanized antibody, and more preferably a human-derived antibody.
- the antibody of the present invention recognizes serine at position 443 or tyrosine at position 489 of the amino acid sequence of the spike glycoprotein.
- "recognizing" each of the above amino acids means that the presence of at least one of these amino acids on the RBD increases the binding affinity for the antigen RBD and the infection neutralizing activity for SARS-CoV-2. It means to show.
- the binding affinity can be evaluated by a person skilled in the art using a well-known immunological method or a method similar thereto.
- a part for example, a protein consisting of the amino acid sequence from positions 331 to 529 of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 (Ancestral)
- RBD of Delta strain or a part thereof for example, L452R and T478K mutations in the amino acid sequence of Ancestral
- the number indicates the position in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, hereinafter the same applies to the Omicron strain.
- the dissociation constant (K D ) between the RBD and the antibody is, for example, the dissociation constant (K D ) between the RBD of Omicron strain (BA.1) and the antibody, for example, 1.0 ⁇ It is even more preferably 10 ⁇ 7 M or less, and particularly preferably 1.0 ⁇ 10 ⁇ 8 M or less.
- the infection neutralizing activity can also be evaluated by a person skilled in the art using a well-known immunological method or a method similar thereto.
- SARS-CoV-2 e.g., Wuhan strain, Delta strain, Omicron strain
- VeroE6/TMPRSS2 cells e.g., Wuhan strain, Delta strain, Omicron strain
- Absorbance, luminescence intensity, etc. is 50% of the number of infected cells when SARS-CoV-2 alone (no antibody) is added to VeroE6/TMPRSS2 cells (IC 50 ) at an antibody concentration (IC 50 ) of 1 ⁇ g/mL or less. It is preferable that there be.
- the antibody recognizes serine at position 443 or tyrosine at position 489 of the amino acid sequence of the spike glycoprotein is determined, for example, as shown in the Examples below. This can be evaluated by measuring the amount of binding to a protein consisting of an amino acid sequence in which the S443N or Y489S mutation has been introduced. More specifically, if the amount of binding to the mutant RBD is lower than that to the RBD before mutation introduction (for example, a protein (Ancestral) consisting of the amino acid sequence of positions 331 to 529 of the RBD of the Wuhan strain), the Preferably, the spike It can be determined that the antibody recognizes serine at position 443 or tyrosine at position 489 of the amino acid sequence of glycoprotein.
- antibodies of the present invention include antibodies that retain the following variable regions.
- an antibody that has a heavy chain variable region 3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 34 and a light chain variable region 3 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 35;
- the complementarity determining regions can also be determined based on the sequences. Can be done. Accordingly, the present invention also provides antibodies that retain each of the following CDRs 1 to 3.
- Light chain variable region 1 retaining heavy chain CDRs 1 to 3 determined from heavy chain variable region 1 containing the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 30, and containing the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 31 an antibody that retains light chain CDRs 1-3 determined from;
- Light chain variable region 2 retaining heavy chain CDRs 1 to 3 determined from heavy chain variable region 2 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 32 and comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 33 an antibody that retains light chain CDRs 1-3 determined from;
- Light chain variable region 3 retaining heavy chain CDRs 1 to 3 determined from heavy chain variable region 3 containing the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 34, and containing the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 35 an antibody that retains light chain CDRs 1-3 determined from;
- Light chain variable region 4 retaining heavy chain CDRs 1 to 3 determined from heavy chain variable region 4 comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 36, and comprising the amino
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2 is retained as heavy chain CDR3 (HV CDR3-1), and the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 3 is retained as light chain CDR3 (LV CDR3-1). ,antibody;
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 4 is retained as heavy chain CDR3 (HV CDR3-2), and the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 5 is retained as light chain CDR3 (LV CDR3-2).
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 12 is retained as heavy chain CDR3 (HV CDR3-6), and the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 13 is retained as light chain CDR3 (LV CDR3-6).
- the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 14 is retained as heavy chain CDR3 (HV CDR3-7), and the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 15 is retained as light chain CDR3 (LV CDR3-7).
- HV CDR3-1, LV CDR3-1 Heavy chain CDR1 (HV CDR1-1): Amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 30.
- Heavy chain CDR2 (HV CDR2-1): amino acid sequence at position 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 30.
- Amino acid sequence at positions 27 to 32 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-1): set forth in SEQ ID NO: 31
- Light chain CDR2 (LV CDR2-1): set forth in SEQ ID NO: 31
- Heavy chain CDR1 (HV CDR1-2): Amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 32.
- Heavy chain CDR2 (HV CDR2-2): amino acid sequence at position 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 32.
- Amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-2): set forth in SEQ ID NO: 33
- Light chain CDR2 (LV CDR2-2): set forth in SEQ ID NO: 33
- the amino acid sequence of positions 52 to 54 of the amino acid sequence of; (3) HV CDR3-3, LV CDR3-3 Heavy chain CDR1 (HV CDR1-3): Amino acid sequence at positions 19 to 28 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 34 Heavy chain CDR2 (HV CDR2-3): Position 46 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 34
- Amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-3): set forth in SEQ ID NO: 35
- Light chain CDR2 (LV CDR2-3): set forth in SEQ ID NO: 35
- Heavy chain CDR2 (HV CDR2-5): amino acid sequence at position 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 38. Amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-5): set forth in SEQ ID NO: 39 Light chain CDR2 (LV CDR2-5): set forth in SEQ ID NO: 39 The amino acid sequence of positions 52 to 54 of the amino acid sequence of; (6) HV CDR3-6, LV CDR3-6 Heavy chain CDR1 (HV CDR1-6): Amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 40 Heavy chain CDR2 (HV CDR2-6): Position 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 40 Amino acid sequence at positions 27 to 33 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-6): set forth in SEQ ID NO: 41 Light chain CDR2 (LV CDR2-6): set forth in SEQ ID NO: 41 The amino acid sequence of positions 51 to 53 of
- Heavy chain CDR2 (HV CDR2-8): amino acid sequence at position 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 44. Amino acid sequence at positions 27 to 32 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-8): set forth in SEQ ID NO: 45 Light chain CDR2 (LV CDR2-8): set forth in SEQ ID NO: 45 The amino acid sequence of positions 50 to 52 of the amino acid sequence of; (9) HV CDR3-9, LV CDR3-9 Heavy chain CDR1 (HV CDR1-9): Amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 46 Heavy chain CDR2 (HV CDR2-9): Position 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 46 Amino acid sequence at positions 27 to 32 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-9): set forth in SEQ ID NO: 47 Light chain CDR2 (LV CDR2-9): set forth in SEQ ID NO: 47 The amino acid sequence of positions
- Heavy chain CDR2 (HV CDR2-10): amino acid sequence at position 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 48. Amino acid sequence at positions 27 to 37 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-10): set forth in SEQ ID NO: 49 Light chain CDR2 (LV CDR2-10): set forth in SEQ ID NO: 49 The amino acid sequence of positions 55 to 57 of the amino acid sequence of; (11) HV CDR3-11, LV CDR3-11 Heavy chain CDR1 (HV CDR1-11): Amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 50.
- Heavy chain CDR2 (HV CDR2-11): amino acid sequence at position 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 50. Amino acid sequence at positions 27 to 33 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-11) at positions ⁇ 58: SEQ ID NO:51 Light chain CDR2 (LV CDR2-11): set forth at SEQ ID NO:51 The amino acid sequence of positions 51 to 53 of the amino acid sequence of; (12) HV CDR3-12, LV CDR3-12 Heavy chain CDR1 (HV CDR1-12): Amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 52.
- Heavy chain CDR2 (HV CDR2-12): amino acid sequence at position 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 52. Amino acid sequence at positions 27 to 32 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-12): set forth in SEQ ID NO: 53 Light chain CDR2 (LV CDR2-12): set forth in SEQ ID NO: 53 The amino acid sequence of positions 50 to 52 of the amino acid sequence of; (13) HV CDR3-13, LV CDR3-13 Heavy chain CDR1 (HV CDR1-13): Amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 54.
- Heavy chain CDR2 (HV CDR2-13): amino acid sequence at position 52 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 54. Amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-13) set forth in SEQ ID NO:55 Light chain CDR2 (LV CDR2-13): set forth in SEQ ID NO:55 The amino acid sequence of positions 51 to 53 of the amino acid sequence of; (14) HV CDR3-14, LV CDR3-14 Heavy chain CDR1 (HV CDR1-14): Amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 56.
- Heavy chain CDR2 (HV CDR2-14): amino acid sequence at position 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 56. Amino acid sequence at positions 26 to 34 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-14): set forth in SEQ ID NO: 57 Light chain CDR2 (LV CDR2-14): set forth in SEQ ID NO: 57 The amino acid sequence of positions 52 to 54 of the amino acid sequence of; (15) HV CDR3-15, LV CDR3-15 Heavy chain CDR1 (HV CDR1-15): Amino acid sequence at positions 26 to 33 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 65.
- Heavy chain CDR2 (HV CDR2-15): amino acid sequence at position 51 of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 65.
- Amino acid sequence at positions 23 to 31 of the amino acid sequence light chain CDR1 (LV CDR1-15): set forth in SEQ ID NO: 66
- Light chain CDR2 (LV CDR2-15): set forth in SEQ ID NO: 66
- the antibody of the present invention may also be an antibody that further recognizes amino acids other than these amino acids.
- the antibodies (6) to (7), (10), (11), and (13) above also recognize phenylalanine at position 486 of the amino acid sequence of the spike glycoprotein; ) also recognizes asparagine at position 487 of the amino acid sequence of the spike glycoprotein.
- the antibodies of the present invention include the above (2), (5), and (6) from the viewpoint that they tend to have higher binding affinity for the RBD and/or infection neutralizing activity for SARS-CoV-2. ) and (7) are preferred, and the antibodies (5), (6), and (7) are more preferred. Furthermore, from the viewpoint that they tend to have higher binding affinity and/or infection neutralizing activity for mutant strains, the antibodies (5), (6), and (7) above are preferable, and the antibodies (6) and (7) above are preferable. Antibodies are more preferred. Furthermore, from the viewpoint that antibody escape mutant viruses (escape viruses) are particularly unlikely to occur, the antibodies described in (5) and (6) above are preferable.
- the antibody (15), which is a further improved version of the antibody (5), is preferable from the viewpoint that it tends to have higher binding affinity and/or infection neutralizing activity for RBDs such as (5).
- the antibodies of the present invention include not only antibodies that retain variable regions and/or CDRs consisting of the above-mentioned specific amino acid sequences, but also antibodies that have desirable reactivity (binding affinity for the above-mentioned RBD, Antibodies may have their amino acid sequences modified without reducing their activity, etc.). Examples of the modification of the amino acid sequence include substitution, deletion, insertion, and/or addition of one or several amino acids within the amino acid sequence.
- the site where the amino acid sequence is modified may be the constant region of the heavy chain or light chain of the antibody, as long as it has an activity equivalent to that of the antibody before modification, or the variable region.
- Framework Framework region
- CDR Modification of amino acids other than CDRs is thought to have relatively little effect on reactivity with antigens, but currently there is a method of modifying amino acids of CDRs to screen for antibodies with increased affinity for antigens.
- PNAS, 102:8466-8471 (2005), Protein Engineering, Design & Selection, etc.
- an integrated computational chemistry system for example, Molecular Operating Environment, manufactured by CCG, Canada
- the number of amino acids modified in the variable region is preferably within 25 amino acids, more preferably within 20 amino acids, even more preferably within 10 amino acids, within 5 amino acids, or within 3 amino acids (for example, within 2 amino acids, 1 amino acid). Furthermore, all such modifications are preferably made in areas other than CDRs, that is, FRs, from the viewpoint of having little effect on reactivity with antigens.
- "several" when “one or several amino acids have been substituted, deleted, added and/or inserted” is preferably within 5 amino acids, more preferably within 3 amino acids (for example, within 2 amino acids, 1 amino acid).
- the modification of the amino acid sequence is preferably a conservative substitution.
- "conservative substitution” means substitution with another amino acid residue having a chemically similar side chain.
- Groups of amino acid residues having chemically similar amino acid side chains are well known in the art to which this invention pertains.
- acidic amino acids aspartic acid and glutamic acid
- basic amino acids lysine, arginine, histidine
- neutral amino acids include amino acids with hydrocarbon chains (glycine, alanine, valine, leucine, isoleucine, proline), and hydroxy groups.
- an antibody whose modified amino acid sequence has a variable region containing an amino acid sequence having 80% or more homology at the amino acid sequence level with a variable region consisting of the above-mentioned specific amino acid sequence is also an antibody before modification. It is included in the antibodies of the present invention as long as it has an activity equivalent to that of the antibody. Such homology may be at least 80%, preferably 85% or more, more preferably 90% or more, still more preferably 95% or more (for example, 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more). % or more).
- the identity is at least 80%, preferably 85% or more, more preferably 90% or more, even more preferably 95% or more (e.g., 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more). It is. Sequence homology and identity can also be determined using the BLASTP (amino acid level) program (Altschul et al. J. Mol. Biol., 215:403-410, 1990, parameters: default). can. The program is based on the algorithm BLAST by Karlin and Altschul (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87:2264-2268, 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:5873-5877, 1993). There is.
- BLASTP amino acid level
- “having equivalent activity” means, for example, that the binding affinity for the RBD and/or the infection neutralizing activity for SARS-CoV-2 is higher than that of the target antibody (typically, the above (1) to (15) ), preferably at least any of the antibodies (5) to (7) above, more preferably the antibodies (6) and/or (7) above) (e.g. 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more).
- the constant region other than the variable region is not particularly limited.
- ⁇ 1 can be combined with each of the heavy chain variable regions, but is not limited to this, and ⁇ 2 to ⁇ 4 may also be used.
- ⁇ or ⁇ can be appropriately combined with each of the light chain variable regions as the light chain constant region.
- the amino acid sequences of these constant regions and the base sequences encoding them can be obtained from known databases such as GenBank (NCBI), for example.
- the amino acid sequence of ⁇ 1 is the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58
- the amino acid sequence of ⁇ is the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60
- the amino acid sequence of ⁇ is the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59.
- the amino acid sequence is not limited to these, and the amino acid sequence may be modified as appropriate.
- the antibody of the present invention may be a functional fragment as described above, and in this case, the constant region may be a part thereof or may not include the constant region.
- the antibody of the present invention can be produced by a conventionally known method or a method analogous thereto, for example, by a hybridoma method or a recombinant DNA method.
- the hybridoma method typically includes the method of Kohler and Milstein (Kohler & Milstein, Nature, 256:495 (1975)) and methods similar thereto.
- the recombinant DNA method involves cloning or synthesizing DNA encoding the antibody of the present invention from hybridomas, B cells, etc., inserting it into an appropriate vector, and injecting it into host cells (e.g., mammalian cell lines such as HEK cells). , Escherichia coli, yeast cells, insect cells, plant cells, etc.) to produce the antibody of the present invention as a recombinant antibody (for example, P.J. Delves, Antibody Production: Essential Techniques, 1997 WILEY, P. .Shepherd and C. Dean Monoclonal Antibodies, 2000 OXFORD UNIVERSITY PRESS, Vandamme A.M.
- the DNA encoding the heavy chain or light chain may be separately incorporated into an expression vector to transform host cells. It may be integrated into a single expression vector to transform host cells.
- nucleotide sequences encoding the heavy chain variable region (HV) and light chain variable region (LV) of the antibodies of the present invention include the sequences set forth in SEQ ID NOs: 30-57, 65, and 66.
- Examples include, but are not limited to, nucleotide sequences encoding amino acid sequences; each sequence may independently correspond to, for example, an antibody in which the above amino acid sequence has been modified; It may also be codon-optimized.
- the antibody of the present invention can be obtained in a substantially pure and homogeneous form by culturing the above-mentioned host cells, separating and purifying the antibodies within the host cells or from the culture solution. For isolation and purification of antibodies, methods commonly used for purification of polypeptides can be used.
- transgenic animal cow, goat, sheep, pig, etc.
- monoclonal antibodies derived from the antibody gene can be produced from the milk of the transgenic animal. It is also possible to obtain large amounts of.
- the present invention provides a DNA encoding the antibody of the present invention, a vector containing the DNA, a host cell retaining the DNA, and a method for producing an antibody, which includes the steps of culturing the host cell and recovering the antibody. can also be provided.
- composition for prevention or treatment of COVID-19 also provides a composition for preventing or treating COVID-19 (hereinafter, in some cases, simply referred to as "therapeutic composition of the present invention") containing the anti-SARS-CoV-2 antibody of the present invention. .
- the antibody of the present invention (anti-SARS-CoV-2 antibody) has high binding affinity with RBD as described above and has high neutralizing activity against SARS-CoV-2.
- the therapeutic composition of the present invention can be used for the prevention or treatment of COVID-19, a SARS-CoV-2 infection. Therefore, the present invention provides the use of an anti-SARS-CoV-2 antibody of the present invention or a therapeutic composition of the present invention for the prevention or treatment of COVID-19, as well as a composition for the prevention or treatment of COVID-19. Also provided is the use of an anti-SARS-CoV-2 antibody of the invention for the production of a SARS-CoV-2 antibody.
- the therapeutic composition of the present invention may contain only one type of antibody of the present invention, or may contain a combination of two or more types.
- the content of the antibody of the present invention includes the form of the composition, dosage, purpose and method of administration or ingestion, etc. Although not particularly limited as it can be adjusted appropriately depending on , 30 to 70% by weight, 40 to 60% by weight, or 40 to 50% by weight.
- the content of the antibody may be 5 to 10% by mass, 10 to 20% by mass, 20 to 30% by mass, 30 to 40% by mass, 40 to 50% by mass. It may be 50-60% by mass, 60-70% by mass, 70-80% by mass, 80-90% by mass, 90-99% by mass, or 99% by mass or more.
- the form of the therapeutic composition of the present invention is not particularly limited, but examples include liquid preparations such as general solutions (including oral preparations and injections), suspensions, emulsions, and syrups; suppositories, eye drops, and drops. Examples include external preparations such as nasal preparations.
- the therapeutic composition of the present invention may further contain other components that are acceptable as therapeutic agents, depending on the form thereof.
- Such other ingredients include, for example, pharmacologically acceptable carriers or diluents (sterile water, physiological saline, vegetable oil, etc.), excipients, disintegrants, buffers, emulsifiers, suspending agents, stabilizers, etc.
- agents preservatives, and antiseptics, and these may be used alone or in combination of two or more. Furthermore, it may contain anti-SARS-CoV-2 antibodies other than the antibodies of the present invention.
- the content of the other components is not particularly limited and can be adjusted as appropriate depending on the form of the composition, dosage, purpose and method of administration, etc.
- Examples of the excipient include lactose, starch, sorbitol, D-mannitol, and sucrose.
- Examples of the disintegrant include starch, carboxymethyl cellulose, and calcium carbonate.
- Examples of the buffer include phosphate, citrate, and acetate.
- Examples of the emulsifier include gum arabic, sodium alginate, and tragacanth.
- Examples of the suspending agent include glyceryl monostearate, aluminum monostearate, methylcellulose, carboxymethylcellulose, hydroxymethylcellulose, and sodium lauryl sulfate.
- Examples of the stabilizer include propylene glycol, diethyl sulfite, and ascorbic acid.
- Examples of the preservative include phenol, benzalkonium chloride, benzyl alcohol, chlorobutanol, and methylparaben.
- Examples of the preservative include sodium azide, benzalkonium chloride, paraoxybenzoic acid, and chlorobutanol.
- the therapeutic composition of the present invention can be produced, for example, by adding one or more of the other components to the antibody of the present invention, as appropriate, by a known method or a method analogous thereto depending on the form of the antibody. be able to.
- the present invention also provides a method for preventing or treating COVID-19 (hereinafter referred to as the "therapeutic method of the present invention” as the case may be), in which the anti-SARS-CoV-2 antibody of the present invention or the therapeutic composition of the present invention is administered to a subject. ) is also provided.
- the therapeutic method of the present invention includes the step of administering to a subject an effective amount of the antibody of the present invention.
- Targets for the treatment method of the present invention include humans or non-human mammals (mouse, sheep, cows, pigs, horses, monkeys, dogs, cats, rabbits, etc.), with humans being preferred.
- the above-mentioned subjects include those who have not been infected with SARS-CoV-2, and those who have already been infected with SARS-CoV-2 but have not developed COVID-19.
- it may be for any mild to severe form of COVID-19.
- the antibody of the present invention can be administered to the subject as it is or as a therapeutic composition of the present invention, and is preferably administered by injection.
- the effective amount of the antibody of the present invention is appropriately determined depending on each individual case, taking into account the purpose and method of administration; the species, age, weight, sex, and severity of symptoms of the subject.
- the amount of the antibody of the present invention in the case of two or more types, the total amount thereof may be sufficient to meet the target's needs, although there is no particular limitation.
- the amount can be 0.0001 to 1000 mg per kg of body weight and per dose, but the present invention is not necessarily limited to these values.
- the number of administrations can be from once a day to an appropriate number of times.
- the present invention also provides a method for immunologically detecting SARS-CoV-2 in a sample, which method uses the anti-SARS-CoV-2 antibody of the present invention described above (hereinafter, in some cases, simply referred to as "the present invention”). Detection method).
- the "sample” to be subjected to the detection method of the present invention includes SARS-CoV-2 (complete virus particles as well as constituent proteins containing at least the above-mentioned RBD).
- SARS-CoV-2 complete virus particles as well as constituent proteins containing at least the above-mentioned RBD.
- the detection method and detection composition of the present invention will be described.
- the sample can contain the same substance (same in the body); for example, body fluids (blood, lymph, tissue fluid, body cavity fluid, cerebrospinal fluid, synovial fluid, nasal mucus, etc.) isolated from living organisms, tissues, etc. It may be a cultured cell or a culture thereof (culture supernatant, etc.). Moreover, it may be diluted or suspended with a diluent as necessary.
- the diluent include phosphate buffer, Tris buffer, Good's buffer, borate buffer, acetate buffer, citrate buffer, glycine buffer, succinate buffer, phthalate buffer
- the detection method of the present invention involves bringing SARS-CoV-2 in a sample into contact with the antibody of the present invention, and detecting SARS-CoV-2 in the sample based on an immune complex formed by an antigen-antibody reaction. It is something.
- Immunological detection methods include, for example, the EIA method (enzyme immunoassay) using an enzyme as a labeling substance, the ELISA method or CLEIA method (chemiluminescent enzyme immunoassay), which is a form of the EIA method, and the use of a labeling substance.
- Labeled immunoassay using an antigen or antibody labeled with RIA method (radioimmunoassay) using a radioactive isotope as a labeling substance
- CLIA method chemiluminescent immunoassay
- immunochromatography examples include, but are not limited to, immunoagglutination methods (latex agglutination method, colloidal gold agglutination method, etc.) that measure by detecting agglutination.
- labeling substance those generally used in immunoassays and similar assays can be used as appropriate, such as horseradish peroxidase (HRP), alkaline phosphatase (ALP), ⁇ -galactosidase, etc. ( ⁇ -gal), enzymes such as firefly luciferase; fluorescent dyes such as fluorescein isothiocyanate (FITC) and rhodamine isothiocyanate (RITC); fluorescent proteins such as allophycocyanin (APC) and phycoerythrin (R-PE); 125 Examples include radioactive isotopes such as I; particles such as latex particles and colloidal gold particles; avidin and biotin.
- HRP horseradish peroxidase
- ALP alkaline phosphatase
- ⁇ -galactosidase etc.
- enzymes such as firefly luciferase
- fluorescent dyes such as fluorescein isothiocyanate (FITC) and
- the detection method of the present invention it is preferable to detect the presence or absence of SARS-CoV-2 in a sample by detecting the presence or absence of a signal corresponding to the labeling substance.
- the above-mentioned “signals” include coloration (color development), extinction, reflected light, luminescence, fluorescence, radiation from radioactive isotopes, etc., and in addition to those that can be confirmed with the naked eye, they can also be detected by detection methods and devices depending on the type of signal. This includes things that can be confirmed.
- the substrate when an enzyme is used as the labeling substance, the substrate may be a chromogenic substrate (for example, 3,3',5,5'-tetramethylbenzidine, which develops color through an oxidation catalytic reaction by HRP in the presence of hydrogen peroxide).
- TMB chromogenic substrate
- chemiluminescent substrates e.g. AMPPD (3-(2'-spiroadamantane)-4-methoxy-4-(3''-phosphoryloxy)phenyl-1,2-
- AMPPD 3-(2'-spiroadamantane)-4-methoxy-4-(3''-phosphoryloxy)phenyl-1,2-
- the labeling substance may be bound to the antibody of the present invention to directly detect SARS-CoV-2, or the antibody of the present invention may not be bound to the labeling substance, but a secondary antibody bound to the labeling substance may be used.
- SARS-CoV-2 may be detected indirectly using methods such as SARS-CoV-2.
- the "secondary antibody” is an antibody that shows reactivity with an antibody (primary antibody, ie, the antibody of the present invention) that directly binds to an antigen.
- primary antibody ie, the antibody of the present invention
- protein G, protein A, etc. bound to a labeling substance may be used.
- the binding of the antibody and the labeling substance conventionally known methods or methods similar thereto can be appropriately employed.
- the antibody and the labeling substance may be directly bound by an active group, etc.
- the binding may be performed indirectly via a biotin-avidin system (for example, an antibody is biotinylated, an avidinized labeling substance is applied to the antibody, and the interaction between biotin and avidin is used to bind the antibody to the antibody. (binding of a labeling substance) may also be used.
- a sandwich method such as the CLEIA method is preferred from the viewpoint that it tends to be more sensitive.
- a detection target substance SARS-CoV-2
- a capture antibody capture body
- a detection antibody labeled body
- B/F separation washing
- detection is performed depending on the type of labeling substance.
- the target substance to be detected is recognized by a labeled body, and while B/F separation is performed, the target substance to be detected is captured by a capture body, and detection is performed according to the type of labeled substance. Good too.
- those generally used in immunoassay methods and similar assay methods can be used as appropriate, such as particles such as magnetic particles and latex particles, plates such as plastic plates, Fibrous materials such as nitrocellulose fibers can be used.
- the antibody of the present invention is preferable to use as at least one of the capture antibody and the detection antibody.
- the other antibody may be an antibody against the RBD, but is preferably an antibody that does not compete with the antibody of the present invention in binding to the RBD (more preferably an antibody at serine at position 443 of the spike glycoprotein or This is an antibody that does not recognize tyrosine at position 489).
- the other antibody may be a monoclonal antibody or a polyclonal antibody, but from the viewpoint of supply stability, it is preferably a monoclonal antibody.
- the amount of SARS-CoV-2 When quantifying the amount of SARS-CoV-2 from the measured value of the detected signal, it can generally be done by comparing it with the measured value of a standard specimen. In this case, for example, it is possible to determine the amount of SARS-CoV-2 in the sample by examining where the actual measured value is located on the standard curve created based on the measured value of the standard sample. can.
- the detection method of the present invention can be used as a method for testing COVID-19, which is an infectious disease caused by SARS-CoV-2. Furthermore, the method of obtaining data regarding the amount of SARS-CoV-2 using the detection method of the present invention includes a method of collecting data regarding the amount of SARS-CoV-2 described above for diagnosis by a doctor, and a method of presenting the data to a doctor. , it can also be expressed as a method for assisting a doctor's diagnosis.
- the present invention also provides a composition for immunologically detecting SARS-CoV-2 containing the anti-SARS-CoV-2 antibody of the present invention (hereinafter, as the case may be, "detection composition of the present invention”). ).
- detection composition of the present invention can be suitably used in the detection method of the present invention described above.
- the antibodies contained in the detection composition of the present invention are as described above, but depending on various immunological techniques, even in the form in which the above-mentioned labeling substance is bound, the antibodies may be immobilized on the solid phase. It may be in any other form.
- the method for binding such a labeling substance and the method for immobilizing it on a solid phase are as described above.
- the detection composition of the present invention can further contain other components that are acceptable as reagents.
- Such other components include, for example, those similar to those listed in the therapeutic composition of the present invention.
- the antibodies and detection compositions of the present invention include substrates necessary for signal detection, solutions for dissolving sample proteins (protein dissolution reagents), and buffers used for diluting and washing samples (dilution solutions). , washing solution), a reagent for stopping the signal detection reaction (reaction stopper), a positive control (e.g., RBD), a negative control, an isotype control antibody for the antibody of the present invention, etc., as appropriate. You can.
- Such a kit includes, for example, the antibody of the present invention bound to a labeling substance or the detection composition of the present invention containing the same, a reagent (e.g., a substrate) necessary for detecting a signal according to the labeling substance, and a positive control. , and at least one selected from a negative control.
- a substance that binds to the antibody for example, a secondary antibody, protein G, protein A, etc.
- a kit can include instructions for using the kit.
- Each RBD expression vector was created by inserting each base sequence into a pCAGGS vector together with an N-terminal signal peptide sequence, a C-terminal His tag, and a C-terminal Avitag.
- the proteins encoded by each base sequence were expressed using each of the prepared RBD expression vectors and Expi293 Expression System (manufactured by Thermo Fisher Scientific), and each protein was extracted from the culture supernatant using a TALON column (manufactured by Takara).
- RBD antigen protein
- each biotinylated RBD was prepared in the same manner except that during expression, BirA-Flag plasmid (manufactured by Addgene) and biotin were added to the culture system to add biotin to the RBD.
- RBD 2 Ancestral (each RBD in which amino acid mutations of each mutant strain were introduced in the amino acid sequence of the spike glycoprotein of the Wuhan strain of SARS-CoV-2 (Wuhan strain RBD, positions 331 to 529 of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1): Alpha strain RBD: RBD with N501Y mutation introduced into the amino acid sequence of Ancestral; Omicron strain (BA.5) RBD: BA. RBD with L452R, F486V, and R493Q mutations introduced into the amino acid sequence of 2; Omicron strain (BA.2.75) RBD: BA.
- RBD with G339H, G446S, N460K, and R493Q mutations introduced into the amino acid sequence of 2; Omicron strain (BA.2.75.2) RBD: BA. RBD with R346T and F486S mutations introduced into the amino acid sequence of 2; Omicron strain (BQ.1.1) RBD: BA. RBD with R346T, K444T, and N460K mutations introduced into the amino acid sequence of 5; Omicron Stock (XBB) RBD: BA.
- RBD in which mutations of L368I, V445P, and F490S were introduced into the amino acid sequence of 2.75.2; and Omicron strain (XBB.1.5) RBD: RBD in which mutations of F486P were introduced into the amino acid sequence of XBB.
- the nucleotide sequences encoding each were synthesized. From each base sequence, each biotinylated RBD was prepared in the same manner as in ⁇ Preparation of RBD 1> above.
- Preparation example 3 ⁇ Isolation of antigen-specific B cells and culture of single B cells> The mononuclear cells separated in Preparation Example 1 were treated with BUV395-labeled CD19 antibody (HIB19), BV510-labeled CD2 antibody (RPA-2.10), BV510-labeled CD4 antibody (RPA-T4), BV510-labeled CD10 antibody (HI10a), and BV510-labeled CD10 antibody (HI10a).
- HAB19 BUV395-labeled CD19 antibody
- RPA-2.10 BV510-labeled CD2 antibody
- RPA-T4 antibody BV510-labeled CD4 antibody
- HI10a BV510-labeled CD10 antibody
- HI10a BV510-labeled CD10 antibody
- the isolated living cells were cultured on MS40L-low feeder cells for 24 days.
- the culture medium contained 10% FBS, 55 ⁇ M 2-mercaptoethanol, 100 U/mL penicillin, 100 ⁇ g/mL streptomycin, 10 mM HEPES, 1 mM sodium pyruvate, 1% MEM non-essential amino acids, 50 ng/mL human IL-2, RPMI1640 medium supplemented with 10 ng/mL human IL-4, 10 ng/mL human IL-21, and 10 ng/mL human BAFF was used.
- RNA was first extracted from the cells cultured for 24 days in Preparation Example 3 using an RNeasy micro kit (manufactured by Qiagen), and cDNA was synthesized from the extracted RNA by reverse transcription reaction. Using the obtained cDNA as a template, Tiller et al. , Journal of Immunological Methods, 329: p. Using the primers described in 112-124, the heavy chain variable region and light chain variable region of the antibody gene were each amplified by PCR method, and the base sequence was analyzed by Sanger method.
- the obtained base sequences were analyzed by IgBLAST (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/) to determine the amino acid sequences of the heavy chain variable region and light chain variable region, as well as the complementarity determining region.
- the amino acid sequences of 1 to 3 were determined.
- Table 1 shows the amino acid sequences of the heavy chain variable region and light chain variable region of the 14 analyzed antibodies, as well as the sequence number of the amino acid sequence of each complementarity determining region 3 (CDR3).
- the amino acid sequences of each complementarity determining region 1 to 2 (CDR1 and CDR2) in the heavy chain variable region and light chain variable region of the 14 analyzed antibodies are shown in Table 2 below.
- the nucleotide sequences encoding the heavy chain variable region and light chain variable region of the 14 antibody genes amplified and analyzed above are the combinations of human IgG1 constant region ( ⁇ 1, sequence A base sequence encoding the constant region of human IgKappa ( ⁇ ) (amino acid sequence of SEQ ID NO: 59), or a constant region of human IgLambda ( ⁇ ) (SEQ ID NO: 60)
- a heavy chain expression vector and a light chain expression vector were prepared by introducing the nucleotide sequences encoding the amino acid sequence (amino acid sequence) into mammalian expression vectors, respectively.
- the proteins encoded by each base sequence were expressed using each of the prepared expression vectors and Expi293 Expression System (manufactured by Thermo Fisher Scientific), and the recombinant monoclonal antibody was purified from the culture supernatant using a Protein G column. , 14 (No. 1 to 14) recombinant monoclonal antibodies were obtained.
- the combinations of each variable region and CDR3 in the heavy chain and light chain of the produced recombinant monoclonal antibody and each constant region are shown in Table 1 below.
- a complex model (antibody-RBD) of the Fv region of the 5 antibody and Omicron strain (XBB.1.5) RBD was created, and this was improved using the FastRelax protocol (Nivon et al., PloS One 8, e59004, 2013) ( 2,000 complex models were designed using the FastDesign protocol (Maguire et al., Proteins 89, p. 436-449, 2021) using the InterfaceDesign2019 script. Docking calculations (Gray et al., J. Mol. Biol. 331, p.
- nucleotide sequence encoding the heavy chain variable region and the nucleotide sequence encoding the light chain variable region of the improved antibody selected above are respectively replaced with the nucleotide sequence encoding the human IgG1 constant region ( ⁇ 1, amino acid sequence of SEQ ID NO: 58).
- a heavy chain expression vector and a light chain expression vector were produced by introducing the vector into a mammalian expression vector containing the base sequence encoding the sequence and the constant region (amino acid sequence of SEQ ID NO: 60) of human IgLambda ( ⁇ ), respectively.
- the proteins encoded by each base sequence were expressed using each of the prepared expression vectors and Expi293 Expression System (manufactured by Thermo Fisher Scientific), and the recombinant monoclonal antibody was purified from the culture supernatant using a Protein G column. , No. Fifteen recombinant monoclonal antibodies were obtained.
- the SEQ ID numbers of the amino acid sequences of the heavy chain variable region, light chain variable region, and each complementarity determining region 3 (CDR3) of the produced recombinant monoclonal antibody, and the combination with the constant region are set according to Table 1 above. Shown. Furthermore, the amino acid sequences of each complementarity determining region 1 to 2 (CDR1 and CDR2) in the heavy chain variable region and light chain variable region of the produced recombinant monoclonal antibody are shown in Table 2 above.
- Example 1 ⁇ Neutralizing activity measurement using virus isolates> This experiment was conducted at the BSL3 experimental facility of the National Institute of Infectious Diseases. First, each recombinant monoclonal antibody (No. 1 to 14) produced in Preparation Example 4 was serially diluted with DMEM culture medium supplemented with 2% FBS, 100 U/mL penicillin, and 100 ⁇ g/mL streptomycin, and diluted with 100 TCID 50 . of SARS-CoV-2 (Wuhan strain, Delta strain, Omicron strain (BA.1), Omicron strain (BA.2)) and reacted for 1 hour in a CO 2 incubator at 37°C.
- SARS-CoV-2 Wang strain, Delta strain, Omicron strain (BA.1), Omicron strain (BA.2)
- the IC 50 of the antibody concentration required for each test was calculated.
- a heat map showing the log 10 IC 50 is shown in Figure 1.
- the IC 50 was also calculated when the sotrovimab parent antibody (S309), which is a conventional anti-SARS-CoV-2 antibody, was used in place of the recombinant monoclonal antibody. Since infection neutralization was not shown under the concentration conditions, it could not be calculated ("X" in FIG. 1).
- Preparation Example 4 was added to each well (RBD amount: 60 ng/well) of a U-plex plate (manufactured by MSD) on which each biotinylated mutant RBD prepared in ⁇ Preparation of RBD 1> of Preparation Example 2 was immobilized.
- the recombinant monoclonal antibodies (No. 1 to 14) prepared in the above were diluted with Diluent 100 (manufactured by MSD) and added (antibody amount: 250 pg/well), and reacted for 1 hour at room temperature while shaking at 700 rpm. Ta.
- the amount of IgG antibody bound to the recombinant monoclonal antibody was determined by electrochemiluminescence method. It was measured.
- the amount of recombinant monoclonal antibody bound when using Wuhan strain RBD (Ancestral) as RBD is set as 100 (%), and the relative binding amount of recombinant monoclonal antibody bound when using each mutant RBD (Relative to Ancestral) (%)) was calculated.
- Example 3 [Preparation of recombinant Fab protein] Among the antibody genes amplified in Preparation Example 4, antibody No.
- the nucleotide sequences encoding each of the heavy chain variable regions of 2, 5 to 7 encode the CH1 region of the constant region of human IgG1 (amino acid sequence at positions 1 to 105 of the amino acid sequence ( ⁇ 1) of SEQ ID NO: 58). It was introduced into a mammalian expression vector containing the nucleotide sequence and a His tag, and used as a heavy chain expression vector.
- the heavy chain expression vector produced and the antibody No. 1 produced in Preparation Example 4 were used.
- the proteins encoded by each of the nucleotide sequences were expressed using a light chain expression vector containing the nucleotide sequences encoding each of the light chain variable regions of 2, 5 to 7, and Expi293 Expression System (manufactured by Thermo Fisher Scientific).
- the recombinant Fab protein was purified from the culture supernatant using a TALON column (manufactured by Takara).
- Example 4 ⁇ Antibody escape mutant virus (escape virus) analysis> First, the recombinant monoclonal antibodies (No. 2, 5 to 7) prepared in Preparation Example 4 were serially diluted with DMEM culture medium supplemented with 2% FBS, 100 U/mL penicillin, and 100 ⁇ g/mL streptomycin, and diluted with 100 TCID. The mixture was mixed with 50 SARS-CoV-2 (Wuhan strain) and reacted for 1 hour in a CO 2 incubator at 37°C. Next, this was added to VeroE6/TMPRSS2 cells cultured overnight on a 12-well plate, and cultured in a CO 2 incubator at 37° C. (Culture 1).
- the obtained antibody evacuation mutant virus candidate was cloned using the limiting dilution method, then RNA was extracted using a Direct-zol RNA kit (manufactured by ZYMO RESEARCH), and the base sequence encoding its RBD was extracted using the Sanger method. An analysis was conducted.
- Example 5 ⁇ Evaluation of therapeutic effects in animals> This experiment was conducted at the BSL3 experimental facility of the National Institute of Infectious Diseases. Seven to nine Syrian hamsters were infected by intranasal inoculation with 10,000 TCID 50 of SARS-CoV-2 (Wuhan strain, Omicron strain (BA.1), Omicron strain (BA.2)), and the next day, The recombinant monoclonal antibodies (No. 5 to 7, antibody amount: 5 mg/kg) prepared in Preparation Example 4 were intraperitoneally administered. In addition, as a comparative example, PBS or sotrovimab parent antibody (S309), which is a conventional anti-SARS-CoV-2 antibody, was administered in the same manner.
- S309 sotrovimab parent antibody
- FIG. 3 shows the average change in body weight from the day of infection, where the body weight on the day of infection (day 0) is taken as 100.
- the right lung lobe was collected on the 6th day from the day of infection and its weight was measured.
- Figure 4 shows the weights (g) of the right lung posterior lobe on the 6th day from the day of infection and their average values (indicated by bars).
- Figure 5 shows the virus copy numbers and their average values (indicated by bars) in the nasal wash on the third day from the day of infection when infected with Omicron strain (BA.1). The number of virus copies in the nasal wash fluid and their average value (indicated by bars) on the third day from the day of infection when infected with (BA.2) are shown.
- Example 6 ⁇ Neutralizing activity measurement using pseudotyped virus>
- a neutralization activity test using pseudotyped virus was conducted.
- No. prepared in Preparation Example 5 was prepared. 15 recombinant monoclonal antibodies were serially diluted in DMEM medium supplemented with 2% FBS, 100 U/mL penicillin, and 100 ⁇ g/mL streptomycin, and 100 TCID 50 of SARS-CoV-2 pseudotyped virus (Omicron strain (XBB .1.5)) and reacted for 1 hour in a CO 2 incubator at 37°C.
- Example 7 As the biotinylated mutant RBD (antigen protein), Ancestral prepared in Preparation Example 2 ⁇ Preparation of RBD 1>, Beta strain RBD, Delta strain RBD, Omicron strain (BA.1) RBD, Omicron strain (BA.2) RBD In addition to the biotinylated RBD of Y489S, each biotinylated RBD prepared in ⁇ Preparation of RBD 2> was used, and as a recombinant monoclonal antibody, No. Binding analysis between the antigen protein and the monoclonal antibody was performed in the same manner as in Example 2 except that No. 15 recombinant monoclonal antibody was used.
- a novel antibody with high binding affinity and infection-neutralizing activity against other mutant strains including Omicron strain in addition to the conventional SARS-CoV-2, a novel antibody with high binding affinity and infection-neutralizing activity against other mutant strains including Omicron strain, and , a composition for preventing or treating COVID-19 using the same, a composition for immunologically detecting SARS-CoV-2, and a method for immunologically detecting SARS-CoV-2. becomes possible.
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Description
本発明は、SARS-CoV-2に対する抗体に関し、より詳しくは、SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(RBD)に結合する抗体、並びに、それを用いたCOVID-19の予防又は治療用組成物、SARS-CoV-2を免疫学的に検出するための組成物、及びSARS-CoV-2を免疫学的に検出する方法に関する。
2019年12月に起こったとみられる新型コロナウイルス(重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2、SARS-CoV-2)感染症(COVID-19)は、瞬く間に世界中に拡散し、世界中の総感染者数や死亡者数は現在も増加を続けている。COVID-19に対しては、mRNAワクチンやDNAワクチンの接種が世界的に開始されているが、ワクチンは一般的には予防薬であるため、有用な治療薬が渇望されている。現在、COVID-19の治療薬としては、RNA依存性RNAポリメラーゼ阻害剤であるレムデシビル等の機能阻害剤や、デキサメタゾン等の抗炎症剤が知られているが、これらの治療薬では重篤な副作用が表れやすい傾向にある。
高い有効性と低い副作用とを併せ持つ治療薬としては、従来から、感染症、癌、関節リウマチ等の様々な疾患に対する治療薬として、治療用抗体が医療分野で活用されており、COVID-19の治療薬としての抗体の研究も盛んに行なわれている。例えば、日本では、COVID-19の軽症~中等症用の治療方法として、2種類の抗SARS-CoV-2抗体を患者に投与する「抗体カクテル療法」が2021年に承認されており、抗SARS-CoV-2抗体の2種以上の組み合わせにより抗体退避変異ウイルス(エスケープウイルス)の発生を抑制できることが報告されている(Baum et al.,Science 369,p.1014-1018,2020(非特許文献1)。
SARS-CoV-2は、ウイルス表面にあるスパイク糖タンパク質(Sタンパク質)が宿主細胞上のアンジオテンシン変換酵素2(ACE-2、Sタンパク質受容体)を認識して同宿主に感染することが知られており、現在のCOVID-19治療用抗体の多くは、かかるスパイク糖タンパク質のACE-2に対する結合を阻止することで感染中和効果を発揮する。
しかしながら、SARS-CoV-2はこれまでに多数回の変異を繰り返しており、ウイルスゲノムの塩基配列に変異が生じてウイルスタンパク質にアミノ酸置換や欠失が発生した変異株では、しばしば免疫逃避能や増殖優位性を獲得して、かかる変異株がそれまでの流行株から置き替わることが知られている。そのため、ACE-2結合領域であるスパイク糖タンパク質受容体結合部位(RBD)に変異が生じた変異株が置き替わって新たな流行株になると、それまで従前の流行株に対して開発されていたCOVID-19治療用抗体による治療効果が発揮されなくなってしまう。
例えば、2021年末から世界的に流行しているオミクロン株では、RBDに15個以上のアミノ酸変異が生じており、それまでに開発されていた多くのモノクローナル抗体がその感染中和活性を大きく失ってしまうことが報告されている(Cameroni et al.,Nature 602,p.664-670,2022(非特許文献2)、Liu et al.,Nature 602,p.676-681,2022(非特許文献3))。そのため、従来型のSARS-CoV-2である武漢株に加えて、オミクロン株を含む他の変異株に対しても結合親和性及び感染中和活性の高い抗SARS-CoV-2抗体の開発が求められている。
Baum et al.,Science 369,p.1014-1018,2020
Cameroni et al.,Nature 602,p.664-670,2022
Liu et al.,Nature 602,p.676-681,2022
本発明は、上記従来技術の有する課題に鑑みてなされたものであり、従来型のSARS-CoV-2(武漢株)に加えて、オミクロン株を含む他の変異株に対しても結合親和性及び感染中和活性の高い新規抗体、並びに、それを用いたCOVID-19の予防又は治療用組成物、SARS-CoV-2を免疫学的に検出するための組成物、及びSARS-CoV-2を免疫学的に検出する方法を提供することを目的とする。
本発明者らは、前記目的を達成すべく鋭意研究を重ね、COVID-19を発症して回復した回復者より採取した末梢血から、SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(RBD)に結合する抗体であり、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識する新たな抗体を複数見出した。これらの抗体は、従来型のSARS-CoV-2(武漢株)に加えて、デルタ株や、オミクロン株(BA.1、BA.2等)を含む他の変異株に対しても結合親和性及び感染中和活性が高いことを見出した。さらに、かかる抗体をさらに改良して、後代のオミクロン株(BA.5、BA.2.75、BQ.1.1、XBB、XBB.1.5)等に対しても結合親和性及び感染中和活性がより高い抗体を開発し、本発明を完成するに至った。
すなわち、本発明は、SARS-CoV-2に対する抗体、それを用いたCOVID-19の予防又は治療用組成物、SARS-CoV-2を免疫学的に検出するための組成物、及びSARS-CoV-2を免疫学的に検出する方法に関し、より具体的には以下を提供する。
[1]
SARS-CoV-2に対する抗体であって、SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(RBD)に結合する抗体であり、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識する、抗SARS-CoV-2抗体。
SARS-CoV-2に対する抗体であって、SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(RBD)に結合する抗体であり、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識する、抗SARS-CoV-2抗体。
[2]
SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(RBD)に対して解離定数(KD)1.0×10-6M以下で結合する、[1]に記載の抗SARS-CoV-2抗体。
SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(RBD)に対して解離定数(KD)1.0×10-6M以下で結合する、[1]に記載の抗SARS-CoV-2抗体。
[3]
下記(1)~(15):
(1)配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-1;配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-1;配列番号:2に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:2に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-1としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-1;配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-1;配列番号:3に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:3に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-1としてそれぞれ保持する、抗体;
(2)配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-2;配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-2;配列番号:4に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:4に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-2としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-2;配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-2;配列番号:5に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:5に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-2としてそれぞれ保持する、抗体;
(3)配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第19~28位のアミノ酸配列、又は、配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第19~28位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-3;配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第46~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第46~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-3;配列番号:6に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:6に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-3としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-3;配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-3;配列番号:7に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:7に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-3としてそれぞれ保持する、抗体;
(4)配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-4;配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第51~60位のアミノ酸配列、又は、配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第51~60位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-4;配列番号:8に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:8に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-4としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-4;配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-4;配列番号:9に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:9に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-4としてそれぞれ保持する、抗体;
(5)配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-5;配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-5;配列番号:10に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:10に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-5としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-5;配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-5;配列番号:11に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:11に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-5としてそれぞれ保持する、抗体;
(6)配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-6;配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-6;配列番号:12に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:12に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-6としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-6;配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-6;配列番号:13に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:13に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-6としてそれぞれ保持する、抗体;
(7)配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-7;配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-7;配列番号:14に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:14に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-7としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第26~31位のアミノ酸配列、又は、配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第26~31位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-7;配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列、又は、配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-7;配列番号:15に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:15に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-7としてそれぞれ保持する、抗体;
(8)配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-8;配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-8;配列番号:16に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:16に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-8としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-8;配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-8;配列番号:17に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:17に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-8としてそれぞれ保持する、抗体;
(9)配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-9;配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-9;配列番号:18に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:18に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-9としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-9;配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-9;配列番号:19に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:19に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-9としてそれぞれ保持する、抗体;
(10)配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-10;配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-10;配列番号:20に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:20に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-10としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第27~37位のアミノ酸配列、又は、配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第27~37位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-10;配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第55~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第55~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-10;配列番号:21に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:21に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-10としてそれぞれ保持する、抗体;
(11)配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-11;配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-11;配列番号:22に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:22に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-11としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-11;配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-11;配列番号:23に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:23に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-11としてそれぞれ保持する、抗体;
(12)配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-12;配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-12;配列番号:24に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:24に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-12としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-12;配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-12;配列番号:25に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:25に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-12としてそれぞれ保持する、抗体;
(13)配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-13;配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第52~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第52~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-13;配列番号:26に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:26に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-13としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-13;配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-13;配列番号:27に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:27に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-13としてそれぞれ保持する、抗体;
(14)配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-14;配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-14;配列番号:28に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:28に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-14としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-14;配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-14;配列番号:29に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:29に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-14としてそれぞれ保持する、抗体;
(15)配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-15;配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-15;配列番号:63に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:63に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-15としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第23~31位のアミノ酸配列、又は、配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第23~31位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-15;配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列、又は、配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-15;配列番号:64に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:64に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-15としてそれぞれ保持する、抗体;
からなる群から選択される、[1]又は[2]に記載の抗SARS-CoV-2抗体。
下記(1)~(15):
(1)配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-1;配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-1;配列番号:2に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:2に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-1としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-1;配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-1;配列番号:3に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:3に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-1としてそれぞれ保持する、抗体;
(2)配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-2;配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-2;配列番号:4に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:4に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-2としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-2;配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-2;配列番号:5に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:5に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-2としてそれぞれ保持する、抗体;
(3)配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第19~28位のアミノ酸配列、又は、配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第19~28位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-3;配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第46~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第46~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-3;配列番号:6に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:6に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-3としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-3;配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-3;配列番号:7に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:7に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-3としてそれぞれ保持する、抗体;
(4)配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-4;配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第51~60位のアミノ酸配列、又は、配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第51~60位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-4;配列番号:8に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:8に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-4としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-4;配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-4;配列番号:9に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:9に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-4としてそれぞれ保持する、抗体;
(5)配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-5;配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-5;配列番号:10に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:10に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-5としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-5;配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-5;配列番号:11に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:11に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-5としてそれぞれ保持する、抗体;
(6)配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-6;配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-6;配列番号:12に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:12に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-6としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-6;配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-6;配列番号:13に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:13に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-6としてそれぞれ保持する、抗体;
(7)配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-7;配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-7;配列番号:14に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:14に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-7としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第26~31位のアミノ酸配列、又は、配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第26~31位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-7;配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列、又は、配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-7;配列番号:15に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:15に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-7としてそれぞれ保持する、抗体;
(8)配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-8;配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-8;配列番号:16に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:16に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-8としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-8;配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-8;配列番号:17に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:17に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-8としてそれぞれ保持する、抗体;
(9)配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-9;配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-9;配列番号:18に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:18に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-9としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-9;配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-9;配列番号:19に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:19に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-9としてそれぞれ保持する、抗体;
(10)配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-10;配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-10;配列番号:20に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:20に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-10としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第27~37位のアミノ酸配列、又は、配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第27~37位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-10;配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第55~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第55~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-10;配列番号:21に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:21に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-10としてそれぞれ保持する、抗体;
(11)配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-11;配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-11;配列番号:22に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:22に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-11としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-11;配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-11;配列番号:23に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:23に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-11としてそれぞれ保持する、抗体;
(12)配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-12;配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-12;配列番号:24に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:24に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-12としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-12;配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-12;配列番号:25に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:25に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-12としてそれぞれ保持する、抗体;
(13)配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-13;配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第52~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第52~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-13;配列番号:26に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:26に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-13としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-13;配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-13;配列番号:27に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:27に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-13としてそれぞれ保持する、抗体;
(14)配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-14;配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-14;配列番号:28に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:28に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-14としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-14;配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-14;配列番号:29に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:29に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-14としてそれぞれ保持する、抗体;
(15)配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-15;配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-15;配列番号:63に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:63に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-15としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第23~31位のアミノ酸配列、又は、配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第23~31位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-15;配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列、又は、配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-15;配列番号:64に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:64に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-15としてそれぞれ保持する、抗体;
からなる群から選択される、[1]又は[2]に記載の抗SARS-CoV-2抗体。
[4]
下記(1)~(15):
(1)配列番号:30に記載のアミノ酸配列、配列番号:30に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:30に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域1を保持し、かつ、配列番号:31に記載のアミノ酸配列、配列番号:31に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:31に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域1を保持する、抗体;
(2)配列番号:32に記載のアミノ酸配列、配列番号:32に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:32に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域2を保持し、かつ、配列番号:33に記載のアミノ酸配列、配列番号:33に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:33に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域2を保持する、抗体;
(3)配列番号:34に記載のアミノ酸配列、配列番号:34に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:34に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域3を保持し、かつ、配列番号:35に記載のアミノ酸配列、配列番号:35に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:35に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域3を保持する、抗体;
(4)配列番号:36に記載のアミノ酸配列、配列番号:36に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:36に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域4を保持し、かつ、配列番号:37に記載のアミノ酸配列、配列番号:37に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:37に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域4を保持する、抗体;
(5)配列番号:38に記載のアミノ酸配列、配列番号:38に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:38に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域5を保持し、かつ、配列番号:39に記載のアミノ酸配列、配列番号:39に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:39に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域5を保持する、抗体;
(6)配列番号:40に記載のアミノ酸配列、配列番号:40に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:40に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域6を保持し、かつ、配列番号:41に記載のアミノ酸配列、配列番号:41に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:41に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域6を保持する、抗体;
(7)配列番号:42に記載のアミノ酸配列、配列番号:42に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:42に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域7を保持し、かつ、配列番号:43に記載のアミノ酸配列、配列番号:43に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:43に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域7を保持する、抗体;
(8)配列番号:44に記載のアミノ酸配列、配列番号:44に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:44に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域8を保持し、かつ、配列番号:45に記載のアミノ酸配列、配列番号:45に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:45に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域8を保持する、抗体;
(9)配列番号:46に記載のアミノ酸配列、配列番号:46に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:46に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域9を保持し、かつ、配列番号:47に記載のアミノ酸配列、配列番号:47に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:47に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域9を保持する、抗体;
(10)配列番号:48に記載のアミノ酸配列、配列番号:48に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:48に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域10を保持し、かつ、配列番号:49に記載のアミノ酸配列、配列番号:49に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:49に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域10を保持する、抗体;
(11)配列番号:50に記載のアミノ酸配列、配列番号:50に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:50に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域11を保持し、かつ、配列番号:51に記載のアミノ酸配列、配列番号:51に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:51に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域11を保持する、抗体;
(12)配列番号:52に記載のアミノ酸配列、配列番号:52に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:52に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域12を保持し、かつ、配列番号:53に記載のアミノ酸配列、配列番号:53に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:53に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域12を保持する、抗体;
(13)配列番号:54に記載のアミノ酸配列、配列番号:54に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:54に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域13を保持し、かつ、配列番号:55に記載のアミノ酸配列、配列番号:55に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:55に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域13を保持する、抗体;
(14)配列番号:56に記載のアミノ酸配列、配列番号:56に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:56に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域14を保持し、かつ、配列番号:57に記載のアミノ酸配列、配列番号:57に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:57に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域14を保持する、抗体;
(15)配列番号:65に記載のアミノ酸配列、配列番号:65に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:65に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域15を保持し、かつ、配列番号:66に記載のアミノ酸配列、配列番号:66に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:66に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域15を保持する、抗体;
からなる群から選択される、[1]~[3]のうちのいずれか一項に記載の抗SARS-CoV-2抗体。
下記(1)~(15):
(1)配列番号:30に記載のアミノ酸配列、配列番号:30に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:30に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域1を保持し、かつ、配列番号:31に記載のアミノ酸配列、配列番号:31に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:31に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域1を保持する、抗体;
(2)配列番号:32に記載のアミノ酸配列、配列番号:32に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:32に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域2を保持し、かつ、配列番号:33に記載のアミノ酸配列、配列番号:33に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:33に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域2を保持する、抗体;
(3)配列番号:34に記載のアミノ酸配列、配列番号:34に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:34に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域3を保持し、かつ、配列番号:35に記載のアミノ酸配列、配列番号:35に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:35に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域3を保持する、抗体;
(4)配列番号:36に記載のアミノ酸配列、配列番号:36に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:36に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域4を保持し、かつ、配列番号:37に記載のアミノ酸配列、配列番号:37に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:37に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域4を保持する、抗体;
(5)配列番号:38に記載のアミノ酸配列、配列番号:38に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:38に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域5を保持し、かつ、配列番号:39に記載のアミノ酸配列、配列番号:39に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:39に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域5を保持する、抗体;
(6)配列番号:40に記載のアミノ酸配列、配列番号:40に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:40に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域6を保持し、かつ、配列番号:41に記載のアミノ酸配列、配列番号:41に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:41に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域6を保持する、抗体;
(7)配列番号:42に記載のアミノ酸配列、配列番号:42に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:42に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域7を保持し、かつ、配列番号:43に記載のアミノ酸配列、配列番号:43に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:43に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域7を保持する、抗体;
(8)配列番号:44に記載のアミノ酸配列、配列番号:44に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:44に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域8を保持し、かつ、配列番号:45に記載のアミノ酸配列、配列番号:45に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:45に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域8を保持する、抗体;
(9)配列番号:46に記載のアミノ酸配列、配列番号:46に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:46に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域9を保持し、かつ、配列番号:47に記載のアミノ酸配列、配列番号:47に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:47に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域9を保持する、抗体;
(10)配列番号:48に記載のアミノ酸配列、配列番号:48に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:48に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域10を保持し、かつ、配列番号:49に記載のアミノ酸配列、配列番号:49に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:49に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域10を保持する、抗体;
(11)配列番号:50に記載のアミノ酸配列、配列番号:50に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:50に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域11を保持し、かつ、配列番号:51に記載のアミノ酸配列、配列番号:51に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:51に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域11を保持する、抗体;
(12)配列番号:52に記載のアミノ酸配列、配列番号:52に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:52に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域12を保持し、かつ、配列番号:53に記載のアミノ酸配列、配列番号:53に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:53に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域12を保持する、抗体;
(13)配列番号:54に記載のアミノ酸配列、配列番号:54に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:54に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域13を保持し、かつ、配列番号:55に記載のアミノ酸配列、配列番号:55に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:55に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域13を保持する、抗体;
(14)配列番号:56に記載のアミノ酸配列、配列番号:56に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:56に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域14を保持し、かつ、配列番号:57に記載のアミノ酸配列、配列番号:57に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:57に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域14を保持する、抗体;
(15)配列番号:65に記載のアミノ酸配列、配列番号:65に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:65に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域15を保持し、かつ、配列番号:66に記載のアミノ酸配列、配列番号:66に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:66に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域15を保持する、抗体;
からなる群から選択される、[1]~[3]のうちのいずれか一項に記載の抗SARS-CoV-2抗体。
[5]
[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体を含有する、COVID-19の予防又は治療用組成物。
[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体を含有する、COVID-19の予防又は治療用組成物。
[6]
[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体を含有する、SARS-CoV-2を免疫学的に検出するための組成物。
[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体を含有する、SARS-CoV-2を免疫学的に検出するための組成物。
[7]
[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体を用いる、SARS-CoV-2を免疫学的に検出する方法。
[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体を用いる、SARS-CoV-2を免疫学的に検出する方法。
[8]
[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体又は[6]に記載の組成物を対象に投与する、COVID-19の予防又は治療方法。
[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体又は[6]に記載の組成物を対象に投与する、COVID-19の予防又は治療方法。
[9]
COVID-19の予防又は治療用組成物の製造のための、[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体の使用。
COVID-19の予防又は治療用組成物の製造のための、[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体の使用。
[10]
COVID-19の予防又は治療のための、[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体又は[6]に記載の組成物の使用。
COVID-19の予防又は治療のための、[1]~[4]のうちのいずれか一項に記載の抗体又は[6]に記載の組成物の使用。
本発明によれば、従来型のSARS-CoV-2(武漢株)に加えて、オミクロン株を含む他の変異株に対しても結合親和性及び感染中和活性の高い新規抗体、並びに、それを用いたCOVID-19の予防又は治療用組成物、SARS-CoV-2を免疫学的に検出するための組成物、及びSARS-CoV-2を免疫学的に検出する方法を提供することが可能となる。
<SARS-CoV-2に対する抗体>
本発明の抗SARS-CoV-2抗体は、SARS-CoV-2に対する抗体であって、SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(RBD)に結合する抗体であり、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識する抗体(以下、場合により単に「本発明の抗体」という)である。
本発明の抗SARS-CoV-2抗体は、SARS-CoV-2に対する抗体であって、SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(RBD)に結合する抗体であり、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識する抗体(以下、場合により単に「本発明の抗体」という)である。
(SARS-CoV-2)
「SARS-CoV-2」とは、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2)のことを示し、「新型コロナウイルス」とも称されている。
「SARS-CoV-2」とは、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2)のことを示し、「新型コロナウイルス」とも称されている。
SARS-CoV-2のウイルス粒子の大きさは直径50~200nm程度であり、スパイク糖タンパク質(Sタンパク質)、ヌクレオカプシドタンパク質(Nタンパク質)、膜タンパク質(Mタンパク質)、及びエンベロープタンパク質(Eタンパク質)の4つのタンパク質、並びに、RNAによって構成されている。
SARS-CoV-2としては、2019年に中華人民共和国湖北省武漢市付近で初めて発生が確認された従来型の株(本明細書中、場合により「武漢株」という)以降、様々な変異株が確認されており、国や地域により流行株が入れ替わっている。例えば、現在までに発生した懸念すべき主な変異株としては、世界保健機関(WHO)による呼称で、アルファ株、ベータ株、ガンマ株、デルタ株、オミクロン株等が挙げられる。また、これらの変異株はさらに系統に分けられ、例えば、オミクロン株には、BA.1、BA.2等の系統が確認されている。さらに近年では、オミクロン株として、BA.2.75、BA.4、BA.5、BQ.1.1、XBB、XBB.1、XBB.1.5等の系統も確認されている。本発明に係るSARS-CoV-2としては、下記のRBDを有する限り特に限定されないが、例えば、武漢株、デルタ株、及びオミクロン株からなる群から選択される少なくとも1種であることが好ましい。
SARS-CoV-2は、ウイルスゲノムの全長が約29900塩基の一本鎖プラス鎖RNAウイルスである。前記変異株も含めて、SARS-CoV-2のウイルスゲノムの塩基配列及びそれにコードされるアミノ酸配列については世界中で解析が進んでおり、例えば、GenBank(NCBI)等の公知のデータベースより取得可能である。
(RBD)
本発明において、「RBD」とは、前記Sタンパク質内のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(Receptor Binding Domain)を示し、典型的には223アミノ酸からなる。SARS-CoV-2においては、このRBDが宿主細胞上のアンジオテンシン変換酵素2(ACE-2)を認識して結合し、同宿主に感染することが知られている。そのため、この結合を阻害する(中和する)ことがCOVID-19の予防及び治療において重要である。
本発明において、「RBD」とは、前記Sタンパク質内のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(Receptor Binding Domain)を示し、典型的には223アミノ酸からなる。SARS-CoV-2においては、このRBDが宿主細胞上のアンジオテンシン変換酵素2(ACE-2)を認識して結合し、同宿主に感染することが知られている。そのため、この結合を阻害する(中和する)ことがCOVID-19の予防及び治療において重要である。
前記変異株も含めて、前記RBDのアミノ酸配列及びそれをコードする塩基配列も、例えば、GenBank(NCBI)等の公知のデータベースより取得可能である。例えば、本発明に係るSARS-CoV-2のRBDの典型的アミノ酸配列としては、配列番号:1に示すアミノ酸配列の第319~541位のアミノ酸配列が挙げられる。配列番号:1に示すアミノ酸配列は、SARS-CoV-2の武漢株のスパイク糖タンパク質のアミノ酸配列(NCBI Reference Sequence:YP_009724390.1)である。ただし、ウイルスのヌクレオチド配列は変異等によって変化し、それにコードされるタンパク質のアミノ酸配列もそれに伴って改変され得ることから、本発明に係る「RBDのアミノ酸配列」は下記の第443位のセリン及び/又は第489位のチロシン(それぞれ、下記の第443位のセリンに対応するアミノ酸、第489位のチロシンに対応するアミノ酸を包含する)を有していればよく、これに限定されるものではない。本発明に係る「RBDのアミノ酸配列」として好ましくは、例えば、配列番号:1に示すアミノ酸配列の第319~541位のアミノ酸配列に対して70%以上、好ましくは80%以上、90%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、又は99%以上)の相同性(好ましくは同一性)を有し、下記の第443位のセリン及び/又は第489位のチロシンを有するアミノ酸配列;配列番号:1に示すアミノ酸配列の第319~541位のアミノ酸配列において1若しくは数個(70アミノ酸以内、好ましくは45アミノ酸以内、25アミノ酸以内、20アミノ酸以内、10アミノ酸以内、5アミノ酸以内、3アミノ酸以内、2アミノ酸以内、又は1アミノ酸)のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列であり、下記の第443位のセリン及び/又は第489位のチロシンを有するアミノ酸配列等が挙げられる。
本発明の抗SARS-CoV-2抗体は、前記RBDのうち、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識する。なお、本明細書中、「第443位」及び「第489位」等で示すアミノ酸の位置は、前記SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質のアミノ酸配列(典型的には、配列番号:1に示すアミノ酸配列)におけるN末端側からのアミノ酸残基数を示す。SARS-CoV-2において、前記アミノ酸配列の第443位のセリン及び第489位のチロシンは高い保存性で保存されている。ただし、自然界においてウイルスのヌクレオチド配列は変異等によって変化し、それにコードされるタンパク質のアミノ酸配列もそれに伴って改変され得ることから、本発明に係る「スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン」及び「スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第489位のチロシン」は、それぞれ、これらに対応するアミノ酸(好ましくは、それぞれ、セリン及びチロシン)を包含する。
本発明において、アミノ酸配列の特定のアミノ酸に「対応する」アミノ酸とは、アミノ酸配列解析ソフトウェア(例えば、GENETYX-MAC、Sequencher等)やClustalW等を用いて(例えば、パラメータ:デフォルト値(すなわち初期設定値))アミノ酸配列を整列させた際に、対照のアミノ酸(すなわち、例えば、配列番号:1に記載のアミノ酸配列の第443位のセリン及び/又は第489位のチロシン)と同列になるアミノ酸を示す。アミノ酸配列の特定のアミノ酸に「対応する」アミノ酸としては、化学的に同様なアミノ酸側鎖を有するアミノ酸(例えば、ヒドロキシ基を持つアミノ酸(セリン・トレオニン)、芳香族基を持つアミノ酸(フェニルアラニン・チロシン・トリプトファン))であることが好ましく、「スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン」に対応するアミノ酸としてはセリンがより好ましく、「スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第489位のチロシン」に対応するアミノ酸としてはチロシンがより好ましい。
(抗SARS-CoV-2抗体)
本発明において、「抗体」には、完全な抗体の他、その機能的断片も含まれる。本発明において、「機能的断片」とは、完全な抗体の一部分(部分断片)であって、前記RBDを認識するものを示し、具体的には、Fab、F(ab’)2、Fab’、可変領域断片(Fv)、ジスルフィド結合Fv、一本鎖Fv(scFv)、sc(Fv)2、ダイアボディー、及びこれらの重合体等が挙げられる。
本発明において、「抗体」には、完全な抗体の他、その機能的断片も含まれる。本発明において、「機能的断片」とは、完全な抗体の一部分(部分断片)であって、前記RBDを認識するものを示し、具体的には、Fab、F(ab’)2、Fab’、可変領域断片(Fv)、ジスルフィド結合Fv、一本鎖Fv(scFv)、sc(Fv)2、ダイアボディー、及びこれらの重合体等が挙げられる。
ここで「Fab」とは、1つの軽鎖及び重鎖の一部からなる免疫グロブリンの一価の抗原結合断片を意味し、例えば、抗体のパパイン消化や組換え方法によって得ることができる。「F(ab’)2」とは、両方の軽鎖と両方の重鎖の部分からなる免疫グロブリンの二価の抗原結合断片を意味し、例えば、抗体のペプシン消化や組換え方法によって得ることができる。「Fab’」は、例えば、F(ab’)2を還元することによって得ることができ、抗体のヒンジ領域の1つ又はそれより多いシステインを含めて、重鎖CH1ドメインのカルボキシ末端でのわずかの残基の付加によって、Fabとは異なる。
また、「可変領域断片(Fv)」とは、完全な抗原認識及び結合部位を有する最少の抗体断片を意味する。Fvは、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域が非共有結合によって強く連結されたダイマーである。「一本鎖Fv(scFv)」は、抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、これらの領域は、単一のポリペプチド鎖に存在する。「sc(Fv)2」は、2つの重鎖可変領域及び2つの軽鎖可変領域をリンカー等で結合して一本鎖にしたものである。「ダイアボディー」とは、二つの抗原結合部位を有する小さな抗体断片であり、この断片は、同一ポリペプチド鎖の中に軽鎖可変領域に結合した重鎖可変領域を含み、各領域は別の鎖の相補的領域とペアを形成している。
また、本発明において、「抗体」には、免疫グロブリンの全てのクラス及びサブクラスを含み、また、ポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体を含む。「ポリクローナル抗体」は、異なるエピトープに対する異なる抗体を含む抗体調製物を示し、「モノクローナル抗体」は、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体(抗体断片を含む)を示す。本発明の抗体としては、好ましくは、モノクローナル抗体である。
本発明の抗体としては、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識するものであればよく、その由来、種類、形状等は特に限定されない。具体的には、ヒト由来の抗体、非ヒト動物由来の抗体(例えば、ウサギ抗体、マウス抗体、ラット抗体、ラクダ抗体)、キメラ抗体、ヒト化抗体、及びこれら抗体の機能的断片が挙げられるが、治療用抗体の目的で用いる場合には、ヒト由来の抗体又はヒト化抗体であることが好ましく、ヒト由来の抗体であることがより好ましい。
本発明の抗体は、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識する。本発明において、前記各アミノ酸を「認識する」とは、これらアミノ酸の少なくともいずれかが前記RBD上に存在することにより、抗原であるRBDに対する結合親和性及びSARS-CoV-2に対する感染中和活性を示すことを意味する。
前記結合親和性は、当業者であれば公知の免疫学的手法又はそれに準じた方法によって評価することができ、例えば、後述の実施例において示す方法、すなわち、RBDとして、武漢株のRBD又はその一部(例えば、配列番号:1のアミノ酸配列の第331~529位のアミノ酸配列からなるタンパク質(Ancestral))、デルタ株のRBD又はその一部(例えば、Ancestralのアミノ酸配列にL452R及びT478Kの変異(数字は配列番号:1のアミノ酸配列における位置、以下オミクロン株においても同じ)を導入したアミノ酸配列からなるタンパク質)、及びオミクロン株のRBD又はその一部(例えば、Ancestralのアミノ酸配列にG339D、S371L、S373P、S375F、K417N、N440K、G446S、S477N、T478K、E484A、Q493R、Q498R、N501Y、及びY505Hの変異を導入したアミノ酸配列からなるタンパク質(BA.1);Ancestralのアミノ酸配列にG339D、S371F、S373P、S375F、T376A、D405N、R408S、K417N、N440K、S477N、T478K、E484A、Q493R、Q498R、N501Y、及びY505Hの変異を導入したアミノ酸配列(BA.2))からなる群から選択される少なくとも1種のRBDを用いたバイオレイヤー干渉(bio-layer interferometry:BLI)法によって測定される、当該RBDと抗体との間の解離定数(KD)で、1.0×10-6M以下であることが好ましく、1.0×10-7M以下であることがより好ましく、1.0×10-8M以下であることがさらに好ましい。また、前記RBDと抗体との間の解離定数(KD)としては、例えば、オミクロン株(BA.1)のRBDと抗体との間の解離定数(KD)で、例えば、1.0×10-7M以下であることがさらにより好ましく、1.0×10-8M以下であることが特に好ましい。
前記感染中和活性も、当業者であれば公知の免疫学的手法又はそれに準じた方法によって評価することができ、例えば、後述の実施例において示す基準、すなわち、段階希釈した抗体と100 TCID50のSARS-CoV-2(例えば、武漢株、デルタ株、オミクロン株)とを混合してVeroE6/TMPRSS2細胞に添加したときの感染細胞数(死細胞若しくは変性細胞数又はこれらに対応する測定値(吸光度、発光強度等))が、SARS-CoV-2のみ(抗体なし)をVeroE6/TMPRSS2細胞に添加したときの感染細胞数の50%になる抗体濃度(IC50)で、1μg/mL以下であることが好ましい。
また、抗体が、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識するか否かは、例えば、後述の実施例において示すように、変異RBD(例えば、前記Ancestralのアミノ酸配列にS443N又はY489Sの変異を導入したアミノ酸配列からなるタンパク質)に対する結合量を測定することによって評価することができる。より具体的には、変異RBDに対する結合量が、変異導入前のRBD(例えば、武漢株のRBDの第331~529位のアミノ酸配列からなるタンパク質(Ancestral))に対するそれと比較して低ければ、より好ましくは90%未満(例えば89.9%以下)、さらに好ましくは80%未満(例えば79.9%以下)、さらにより好ましくは70%未満(例えば69.9%以下)であれば、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識する抗体であると判断することができる。
このような本発明の抗体として、より具体的には、以下のような可変領域を保持する抗体が挙げられる。
(1)配列番号:30に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域1を保持し、かつ、配列番号:31に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域1を保持する、抗体;
(2)配列番号:32に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域2を保持し、かつ、配列番号:33に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域2を保持する、抗体;
(3)配列番号:34に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域3を保持し、かつ、配列番号:35に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域3を保持する、抗体;
(4)配列番号:36に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域4を保持し、かつ、配列番号:37に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域4を保持する、抗体;
(5)配列番号:38に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域5を保持し、かつ、配列番号:39に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域5を保持する、抗体;
(6)配列番号:40に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域6を保持し、かつ、配列番号:41に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域6を保持する、抗体;
(7)配列番号:42に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域7を保持し、かつ、配列番号:43に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域7を保持する、抗体;
(8)配列番号:44に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域8を保持し、かつ、配列番号:45に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域8を保持する、抗体;
(9)配列番号:46に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域9を保持し、かつ、配列番号:47に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域9を保持する、抗体;
(10)配列番号:48に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域10を保持し、かつ、配列番号:49に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域10を保持する、抗体;
(11)配列番号:50に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域11を保持し、かつ、配列番号:51に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域11を保持する、抗体;
(12)配列番号:52に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域12を保持し、かつ、配列番号:53に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域12を保持する、抗体;
(13)配列番号:54に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域13を保持し、かつ、配列番号:55に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域13を保持する、抗体;
(14)配列番号:56に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域14を保持し、かつ、配列番号:57に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域14を保持する、抗体;
(15)配列番号:65に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域15を保持し、かつ、配列番号:66に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域15を保持する、抗体。
(1)配列番号:30に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域1を保持し、かつ、配列番号:31に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域1を保持する、抗体;
(2)配列番号:32に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域2を保持し、かつ、配列番号:33に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域2を保持する、抗体;
(3)配列番号:34に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域3を保持し、かつ、配列番号:35に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域3を保持する、抗体;
(4)配列番号:36に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域4を保持し、かつ、配列番号:37に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域4を保持する、抗体;
(5)配列番号:38に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域5を保持し、かつ、配列番号:39に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域5を保持する、抗体;
(6)配列番号:40に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域6を保持し、かつ、配列番号:41に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域6を保持する、抗体;
(7)配列番号:42に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域7を保持し、かつ、配列番号:43に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域7を保持する、抗体;
(8)配列番号:44に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域8を保持し、かつ、配列番号:45に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域8を保持する、抗体;
(9)配列番号:46に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域9を保持し、かつ、配列番号:47に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域9を保持する、抗体;
(10)配列番号:48に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域10を保持し、かつ、配列番号:49に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域10を保持する、抗体;
(11)配列番号:50に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域11を保持し、かつ、配列番号:51に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域11を保持する、抗体;
(12)配列番号:52に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域12を保持し、かつ、配列番号:53に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域12を保持する、抗体;
(13)配列番号:54に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域13を保持し、かつ、配列番号:55に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域13を保持する、抗体;
(14)配列番号:56に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域14を保持し、かつ、配列番号:57に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域14を保持する、抗体;
(15)配列番号:65に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域15を保持し、かつ、配列番号:66に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域15を保持する、抗体。
さらに、当業者であれば、抗体の塩基配列及びアミノ酸配列が決定されれば、その配列に基づき、相補性決定領域(Complementarity Determining Region 1、2、3:CDR1、CDR2、CDR3)も決定することができる。したがって、本発明は、以下のようなCDR1~3をそれぞれ保持する抗体をも提供する。
(1)配列番号:30に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域1から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:31に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域1から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(2)配列番号:32に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域2から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:33に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域2から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(3)配列番号:34に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域3から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:35に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域3から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(4)配列番号:36に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域4から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:37に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域4から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(5)配列番号:38に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域5から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:39に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域5から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(6)配列番号:40に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域6から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:41に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域6から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(7)配列番号:42に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域7から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:43に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域7から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(8)配列番号:44に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域8から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:45に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域8から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(9)配列番号:46に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域9から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:47に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域9から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(10)配列番号:48に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域10から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:49に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域10から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(11)配列番号:50に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域11から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:51に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域11から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(12)配列番号:52に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域12から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:53に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域12から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(13)配列番号:54に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域13から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:55に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域13から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(14)配列番号:56に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域14から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:57に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域14から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(15)配列番号:65に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域15から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:66に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域15から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体。
(1)配列番号:30に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域1から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:31に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域1から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(2)配列番号:32に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域2から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:33に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域2から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(3)配列番号:34に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域3から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:35に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域3から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(4)配列番号:36に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域4から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:37に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域4から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(5)配列番号:38に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域5から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:39に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域5から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(6)配列番号:40に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域6から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:41に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域6から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(7)配列番号:42に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域7から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:43に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域7から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(8)配列番号:44に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域8から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:45に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域8から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(9)配列番号:46に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域9から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:47に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域9から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(10)配列番号:48に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域10から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:49に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域10から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(11)配列番号:50に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域11から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:51に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域11から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(12)配列番号:52に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域12から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:53に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域12から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(13)配列番号:54に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域13から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:55に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域13から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(14)配列番号:56に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域14から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:57に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域14から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体;
(15)配列番号:65に記載のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域15から決定される重鎖CDR1~3を保持し、かつ、配列番号:66に記載のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域15から決定される軽鎖CDR1~3を保持する、抗体。
CDRの決定方法としては特に制限はないが、例えば、Kabat、Chothia、Aho、IMGT等の公知のナンバリング法が挙げられる。より具体的には、IMGTナンバリング法によって決定された例として、以下のようなCDR3を保持する抗体を挙げることができる。
(1)配列番号:2に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-1)として保持し、かつ、配列番号:3に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-1)として保持する、抗体;
(2)配列番号:4に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-2)として保持し、かつ、配列番号:5に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-2)として保持する、抗体;
(3)配列番号:6に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-3)として保持し、かつ、配列番号:7に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-3)として保持する、抗体;
(4)配列番号:8に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-4)として保持し、かつ、配列番号:9に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-4)として保持する、抗体;
(5)配列番号:10に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-5)として保持し、かつ、配列番号:11に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-5)として保持する、抗体;
(6)配列番号:12に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-6)として保持し、かつ、配列番号:13に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-6)として保持する、抗体;
(7)配列番号:14に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-7)として保持し、かつ、配列番号:15に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-7)として保持する、抗体;
(8)配列番号:16に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-8)として保持し、かつ、配列番号:17に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-8)として保持する、抗体;
(9)配列番号:18に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-9)として保持し、かつ、配列番号:19に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-9)として保持する、抗体;
(10)配列番号:20に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-10)として保持し、かつ、配列番号:21に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-10)として保持する、抗体;
(11)配列番号:22に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-11)として保持し、かつ、配列番号:23に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-11)として保持する、抗体;
(12)配列番号:24に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-12)として保持し、かつ、配列番号:25に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-12)として保持する、抗体;
(13)配列番号:26に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-13)として保持し、かつ、配列番号:27に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-13)として保持する、抗体;
(14)配列番号:28に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-14)として保持し、かつ、配列番号:29に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-14)として保持する、抗体;
(15)配列番号:63に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-15)として保持し、かつ、配列番号:64に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-15)として保持する、抗体。
(1)配列番号:2に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-1)として保持し、かつ、配列番号:3に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-1)として保持する、抗体;
(2)配列番号:4に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-2)として保持し、かつ、配列番号:5に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-2)として保持する、抗体;
(3)配列番号:6に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-3)として保持し、かつ、配列番号:7に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-3)として保持する、抗体;
(4)配列番号:8に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-4)として保持し、かつ、配列番号:9に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-4)として保持する、抗体;
(5)配列番号:10に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-5)として保持し、かつ、配列番号:11に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-5)として保持する、抗体;
(6)配列番号:12に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-6)として保持し、かつ、配列番号:13に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-6)として保持する、抗体;
(7)配列番号:14に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-7)として保持し、かつ、配列番号:15に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-7)として保持する、抗体;
(8)配列番号:16に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-8)として保持し、かつ、配列番号:17に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-8)として保持する、抗体;
(9)配列番号:18に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-9)として保持し、かつ、配列番号:19に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-9)として保持する、抗体;
(10)配列番号:20に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-10)として保持し、かつ、配列番号:21に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-10)として保持する、抗体;
(11)配列番号:22に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-11)として保持し、かつ、配列番号:23に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-11)として保持する、抗体;
(12)配列番号:24に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-12)として保持し、かつ、配列番号:25に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-12)として保持する、抗体;
(13)配列番号:26に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-13)として保持し、かつ、配列番号:27に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-13)として保持する、抗体;
(14)配列番号:28に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-14)として保持し、かつ、配列番号:29に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-14)として保持する、抗体;
(15)配列番号:63に記載のアミノ酸配列を重鎖CDR3(HV CDR3-15)として保持し、かつ、配列番号:64に記載のアミノ酸配列を軽鎖CDR3(LV CDR3-15)として保持する、抗体。
また、上記(1)~(15)の抗体において、各CDR3と組み合わせられるCDR1及びCDR2としては、より具体的には、以下のとおりである。
(1)HV CDR3-1、LV CDR3-1
重鎖CDR1(HV CDR1-1):配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-1):配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-1):配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-1):配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列;
(2)HV CDR3-2、LV CDR3-2
重鎖CDR1(HV CDR1-2):配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-2):配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-2):配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-2):配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列;
(3)HV CDR3-3、LV CDR3-3
重鎖CDR1(HV CDR1-3):配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第19~28位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-3):配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第46~52位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-3):配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-3):配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列;
(4)HV CDR3-4、LV CDR3-4
重鎖CDR1(HV CDR1-4):配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-4):配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第51~60位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-4):配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-4):配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列;
(5)HV CDR3-5、LV CDR3-5
重鎖CDR1(HV CDR1-5):配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-5):配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-5):配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-5):配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列;
(6)HV CDR3-6、LV CDR3-6
重鎖CDR1(HV CDR1-6):配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-6):配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-6):配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-6):配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列;
(7)HV CDR3-7、LV CDR3-7
重鎖CDR1(HV CDR1-7):配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-7):配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-7):配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第26~31位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-7):配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列;
(8)HV CDR3-8、LV CDR3-8
重鎖CDR1(HV CDR1-8):配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-8):配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-8):配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-8):配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列;
(9)HV CDR3-9、LV CDR3-9
重鎖CDR1(HV CDR1-9):配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-9):配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-9):配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-9):配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列;
(10)HV CDR3-10、LV CDR3-10
重鎖CDR1(HV CDR1-10):配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-10):配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-10):配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第27~37位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-10):配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第55~57位のアミノ酸配列;
(11)HV CDR3-11、LV CDR3-11
重鎖CDR1(HV CDR1-11):配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-11):配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-11):配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-11):配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列;
(12)HV CDR3-12、LV CDR3-12
重鎖CDR1(HV CDR1-12):配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-12):配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-12):配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-12):配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列;
(13)HV CDR3-13、LV CDR3-13
重鎖CDR1(HV CDR1-13):配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-13):配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第52~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-13):配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-13):配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列;
(14)HV CDR3-14、LV CDR3-14
重鎖CDR1(HV CDR1-14):配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-14):配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-14):配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-14):配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列;
(15)HV CDR3-15、LV CDR3-15
重鎖CDR1(HV CDR1-15):配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-15):配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-15):配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第23~31位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-15):配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列。
上記(1)~(15)の抗体のうち、上記(1)~(3)の抗体は、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリンを認識する抗体であり、上記(4)~(15)の抗体は、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第489位のチロシンを認識する抗体である。本発明の抗体としては、これらのアミノ酸以外をさらに認識する抗体であってもよい。例えば、上記(6)~(7)、(10)、(11)、(13)の抗体は、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第486位のフェニルアラニンも認識し、上記(7)、(10)の抗体は、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第487位のアスパラギンも認識する。
(1)HV CDR3-1、LV CDR3-1
重鎖CDR1(HV CDR1-1):配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-1):配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-1):配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-1):配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列;
(2)HV CDR3-2、LV CDR3-2
重鎖CDR1(HV CDR1-2):配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-2):配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-2):配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-2):配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列;
(3)HV CDR3-3、LV CDR3-3
重鎖CDR1(HV CDR1-3):配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第19~28位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-3):配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第46~52位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-3):配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-3):配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列;
(4)HV CDR3-4、LV CDR3-4
重鎖CDR1(HV CDR1-4):配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-4):配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第51~60位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-4):配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-4):配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列;
(5)HV CDR3-5、LV CDR3-5
重鎖CDR1(HV CDR1-5):配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-5):配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-5):配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-5):配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列;
(6)HV CDR3-6、LV CDR3-6
重鎖CDR1(HV CDR1-6):配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-6):配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-6):配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-6):配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列;
(7)HV CDR3-7、LV CDR3-7
重鎖CDR1(HV CDR1-7):配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-7):配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-7):配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第26~31位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-7):配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列;
(8)HV CDR3-8、LV CDR3-8
重鎖CDR1(HV CDR1-8):配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-8):配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-8):配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-8):配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列;
(9)HV CDR3-9、LV CDR3-9
重鎖CDR1(HV CDR1-9):配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-9):配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-9):配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-9):配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列;
(10)HV CDR3-10、LV CDR3-10
重鎖CDR1(HV CDR1-10):配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-10):配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-10):配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第27~37位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-10):配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第55~57位のアミノ酸配列;
(11)HV CDR3-11、LV CDR3-11
重鎖CDR1(HV CDR1-11):配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-11):配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-11):配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-11):配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列;
(12)HV CDR3-12、LV CDR3-12
重鎖CDR1(HV CDR1-12):配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-12):配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-12):配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-12):配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列;
(13)HV CDR3-13、LV CDR3-13
重鎖CDR1(HV CDR1-13):配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-13):配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第52~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-13):配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-13):配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列;
(14)HV CDR3-14、LV CDR3-14
重鎖CDR1(HV CDR1-14):配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-14):配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-14):配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-14):配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列;
(15)HV CDR3-15、LV CDR3-15
重鎖CDR1(HV CDR1-15):配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列
重鎖CDR2(HV CDR2-15):配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列
軽鎖CDR1(LV CDR1-15):配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第23~31位のアミノ酸配列
軽鎖CDR2(LV CDR2-15):配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列。
上記(1)~(15)の抗体のうち、上記(1)~(3)の抗体は、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリンを認識する抗体であり、上記(4)~(15)の抗体は、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第489位のチロシンを認識する抗体である。本発明の抗体としては、これらのアミノ酸以外をさらに認識する抗体であってもよい。例えば、上記(6)~(7)、(10)、(11)、(13)の抗体は、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第486位のフェニルアラニンも認識し、上記(7)、(10)の抗体は、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第487位のアスパラギンも認識する。
これらの中でも、本発明の抗体としては、前記RBDに対する結合親和性及び/又はSARS-CoV-2に対する感染中和活性がより高い傾向にある観点から、上記(2)、(5)、(6)、(7)の抗体が好ましく、上記(5)、(6)、(7)の抗体がより好ましい。さらに、変異株に対する結合親和性及び/又は感染中和活性がより高い傾向にある観点から、上記(5)、(6)、(7)の抗体が好ましく、上記(6)、(7)の抗体がより好ましい。また、抗体退避変異ウイルス(エスケープウイルス)が特に生じにくいという観点からは、上記(5)、(6)の抗体が好ましい。さらに、近年の変異株であるオミクロン株(BA.5)、オミクロン株(BA.2.75)、オミクロン株(BQ.1.1)、オミクロン株(XBB)、オミクロン株(XBB.1.5)等のRBDに対しても結合親和性及び/又は感染中和活性がより高い傾向にある観点からは、(5)の抗体をさらに改良した抗体である(15)の抗体が好ましい。
また、本発明の抗体としては、上記の特定のアミノ酸配列からなる可変領域及び/又はCDRを保持する抗体のみならず、望ましい反応性(前記RBDに対する結合親和性、SARS-CoV-2に対する感染中和活性等)を減少させることなく、そのアミノ酸配列が改変された抗体であってもよい。前記アミノ酸配列の改変としては、例えば、当該アミノ酸配列内の1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入及び/又は付加が挙げられる。
本発明の抗体に関し、前記アミノ酸配列が改変される部位は、改変される前の抗体と同等の活性を有する限り、抗体の重鎖又は軽鎖の定常領域であってもよく、また、可変領域(フレーム領域(FR)及びCDR)であってもよい。CDR以外のアミノ酸の改変は、抗原との反応性への影響が相対的に少ないと考えられるが、現在では、CDRのアミノ酸を改変して、抗原へのアフィニティーが高められた抗体をスクリーニングする手法も公知である(PNAS,102:8466-8471(2005)、Protein Engineering,Design&Selection等)。また、統合計算化学システム等(例えば、Molecular Operating Enviroment、カナダCCG社製)を利用することにより、抗原へのアフィニティーが高められた抗体をモデリングすることも可能である。さらに、抗体の抗原へのアフィニティーにおいては、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域各々のCDRの全てを要せずとも、同等の活性を発揮し得ることが報告されている(Biochem Biophys Res Commun.2003 Jul 18;307(1):198-205等)。
本発明の抗体に関し、可変領域において改変されるアミノ酸数、すなわち、可変領域について、「1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入された」というときの「数個」とは、好ましくは、25アミノ酸以内、より好ましくは20アミノ酸以内、さらに好ましくは10アミノ酸以内、5アミノ酸以内、3アミノ酸以内(例えば、2アミノ酸以内、1アミノ酸)である。さらに、かかる改変は全て、抗原との反応性への影響が少ないという観点から、CDR以外、すなわちFRに施されていることが好ましい。また、CDRにおいて改変されるアミノ酸数、すなわち、CDR(相補性決定領域)について、「1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入された」というときの「数個」とは、好ましくは5アミノ酸以内、より好ましくは3アミノ酸以内(例えば、2アミノ酸以内、1アミノ酸)である。
アミノ酸配列の改変は、好ましくは、保存的な置換である。本発明において「保存的な置換」とは、化学的に同様な側鎖を有する他のアミノ酸残基で置換することを意味する。化学的に同様なアミノ酸側鎖を有するアミノ酸残基のグループは、本発明の属する技術分野でよく知られている。例えば、酸性アミノ酸(アスパラギン酸及びグルタミン酸);塩基性アミノ酸(リシン・アルギニン・ヒスチジン);中性アミノ酸においては、炭化水素鎖を持つアミノ酸(グリシン・アラニン・バリン・ロイシン・イソロイシン・プロリン)、ヒドロキシ基を持つアミノ酸(セリン・トレオニン)、硫黄を含むアミノ酸(システイン・メチオニン)、アミド基を持つアミノ酸(アスパラギン・グルタミン)、イミノ基を持つアミノ酸(プロリン)、芳香族基を持つアミノ酸(フェニルアラニン・チロシン・トリプトファン)で分類することができる。
また、改変後のアミノ酸配列が、上述の特定のアミノ酸配列からなる可変領域とアミノ酸配列レベルで80%以上の相同性を有するアミノ酸配列を含む可変領域を保持する抗体も、改変される前の抗体と同等の活性を有する限り、本発明の抗体に含まれる。かかる相同性としては、少なくとも80%であればよいが、好ましくは85%以上、より好ましくは90%以上、さらに好ましくは95%以上(例えば、96%以上、97%以上、98%以上、99%以上)である。より好ましくは、同一性で、少なくとも80%、好ましくは85%以上、より好ましくは90%以上、さらに好ましくは95%以上(例えば、96%以上、97%以上、98%以上、99%以上)である。また、配列の相同性及び同一性は、BLASTP(アミノ酸レベル)のプログラム(Altschul et al.J.Mol.Biol.,215:403-410,1990、パラメーター:デフォルト)を利用して決定することができる。該プログラムは、Karlin及びAltschulによるアルゴリズムBLAST(Proc.Natl.Acad.Sci.USA,87:2264-2268,1990,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:5873-5877,1993)に基づいている。
また、「同等の活性を有する」とは、例えば、前記RBDに対する結合親和性及び/又はSARS-CoV-2に対する感染中和活性が、対象抗体(代表的には、上記(1)~(15)のうちの少なくともいずれかの抗体、好ましくは上記(5)~(7)のうちの少なくともいずれかの抗体、より好ましくは上記(6)及び/又は(7)の抗体)と同等(例えば、70%以上、好ましくは80%以上、より好ましくは90%以上)であることを意味する。
本発明の抗体として、前記可変領域以外の定常領域としては特に制限されない。例えば、後述の実施例に示すように、重鎖の定常領域としては、γ1を前記重鎖可変領域の各々に組み合わることができるが、これに制限されず、γ2~γ4であってもよい。また、例えば、後述の実施例に示すように、軽鎖の定常領域としては、λやκを前記軽鎖可変領域の各々に適宜組み合わることができる。これらの定常領域のアミノ酸配列及びそれをコードする塩基配列は、例えば、GenBank(NCBI)等の公知のデータベースより取得可能である。例えば、γ1のアミノ酸配列としては配列番号:58のアミノ酸配列が、λのアミノ酸配列としては配列番号:60のアミノ酸配列が、κのアミノ酸配列としては配列番号:59のアミノ酸配列が、それぞれ挙げられるが、これらに制限されず、また、適宜アミノ酸配列が改変されたものであってもよい。さらに、本発明の抗体としては、上記のように機能性断片であってもよく、このときの定常領域はその一部であっても、定常領域が無くともよい。
本発明の抗体は、従来公知の方法又はそれに準じた方法によって作成することができ、例えば、ハイブリドーマ法や組換えDNA法によって作製することができる。ハイブリドーマ法としては、代表的には、コーラー及びミルスタインの方法(Kohler&Milstein,Nature,256:495(1975))やこれに準じた方法が挙げられる。
組換えDNA法は、上記本発明の抗体をコードするDNAをハイブリドーマやB細胞等からクローニングし、又は合成し、適当なベクターに組み込んで、これを宿主細胞(例えば、HEK細胞等の哺乳類細胞株、大腸菌、酵母細胞、昆虫細胞、植物細胞等)に導入し、本発明の抗体を組換え抗体として産生させる手法である(例えば、P.J.Delves,Antibody Production:Essential Techniques,1997 WILEY、P.Shepherd and C.Dean Monoclonal Antibodies,2000 OXFORD UNIVERSITY PRESS、Vandamme A.M.et al.,Eur.J.Biochem.192:767-775(1990))。本発明の抗体をコードするDNAの発現においては、重鎖又は軽鎖をコードするDNAを別々に発現ベクターに組み込んで宿主細胞を形質転換してもよく、重鎖及び軽鎖をコードするDNAを単一の発現ベクターに組み込んで宿主細胞を形質転換してもよい。本発明の抗体の重鎖可変領域(HV)をコードするヌクレオチド配列の例及び軽鎖可変領域(LV)をコードするヌクレオチド配列の例としては、配列番号:30~57、65、66に記載のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列が挙げられるが、これらに限定されるものではなく、各配列はそれぞれ独立して、例えば、上記アミノ酸配列が改変された抗体に対応するものであってよく、また、コドン最適化等されたものであってもよい。本発明の抗体は、上記宿主細胞を培養し、宿主細胞内又は培養液から分離・精製し、実質的に純粋で均一な形態で取得することができる。抗体の分離・精製は、通常のポリペプチドの精製で使用されている方法を使用することができる。また、トランスジェニック動物作製技術を用いて、抗体遺伝子が組み込まれたトランスジェニック動物(ウシ、ヤギ、ヒツジ、ブタ等)を作製すれば、そのトランスジェニック動物のミルクから、抗体遺伝子に由来するモノクローナル抗体を大量に取得することも可能である。
本発明は、上記本発明の抗体をコードするDNA、該DNAを含むベクター、及び該DNAを保持する宿主細胞、並びに、該宿主細胞を培養し、抗体を回収する工程を含む抗体の生産方法をも提供することができる。
<COVID-19の予防又は治療用組成物>
本発明は、また、本発明の抗SARS-CoV-2抗体を含有する、COVID-19の予防又は治療用組成物(以下、場合により単に「本発明の治療用組成物」という)を提供する。
本発明は、また、本発明の抗SARS-CoV-2抗体を含有する、COVID-19の予防又は治療用組成物(以下、場合により単に「本発明の治療用組成物」という)を提供する。
本発明の抗体(抗SARS-CoV-2抗体)は、上記のようにRBDとの結合親和性が高く、SARS-CoV-2に対する中和活性も高いため、本発明の抗体及びこれを含有する本発明の治療用組成物は、SARS-CoV-2感染症であるCOVID-19の予防又は治療のために用いることができる。そのため、本発明は、COVID-19の予防又は治療のための、本発明の抗SARS-CoV-2抗体又は本発明の治療用組成物の使用、並びに、COVID-19の予防又は治療用組成物の製造のための、本発明の抗SARS-CoV-2抗体の使用も提供する。
本発明の治療用組成物としては、本発明の抗体を1種のみで含有していても、2種以上の組み合わせで含有していてもよい。本発明の治療用組成物において、本発明の抗体の含有量(2種以上である場合にはそれらの合計含有量)としては、組成物の形態、投与量、投与又は摂取の目的や方法等に応じて適宜調整されるものであるため、特に限定されないが、組成物の全質量に対して、例えば、5~99質量%の範囲が挙げられ、5~95質量%、20~80質量%、30~70質量%、40~60質量%、又は40~50質量%とすることができる。また、本発明の治療用組成物の態様に応じて、前記抗体の含有量としては、5~10質量%、10~20質量%、20~30質量%、30~40質量%、40~50質量%、50~60質量%、60~70質量%、70~80質量%、80~90質量%、90~99質量%、又は99質量%以上としてもよい。
本発明の治療用組成物の形態は特に限定されないが、例えば、一般液剤(内服剤の他、注射剤を含む)、懸濁剤、乳剤、シロップ剤等の液剤;坐剤、点眼剤、点鼻剤等の外用剤等が挙げられる。また、本発明の治療用組成物としては、本発明の抗体の他、その形態に応じて、治療薬として許容される他の成分をさらに含有していてもよい。このような他の成分としては、例えば、薬理学上許容される担体又は希釈剤(滅菌水、生理食塩水、植物油等)、賦形剤、崩壊剤、緩衝剤、乳化剤、懸濁剤、安定剤、保存剤、防腐剤が挙げられ、これらのうちの1種であっても2種以上の組み合わせであってもよい。また、本発明の抗体以外の抗SARS-CoV-2抗体を含有していてもよい。これら他の成分を含有する場合、当該他の成分の含有量は特に限定されず、組成物の形態、用量、投与の目的や方法等に応じて適宜調整することができる。
前記賦形剤としては、例えば、乳糖、デンプン、ソルビトール、D-マンニトール、白糖が挙げられる。前記崩壊剤としては、例えば、デンプン、カルボキシメチルセルロース、炭酸カルシウムが挙げられる。前記緩衝剤としては、例えば、リン酸塩、クエン酸塩、酢酸塩が挙げられる。前記乳化剤としては、例えば、アラビアゴム、アルギン酸ナトリウム、トラガントが挙げられる。前記懸濁剤としては、例えば、モノステアリン酸グリセリン、モノステアリン酸アルミニウム、メチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、ヒドロキシメチルセルロース、ラウリル硫酸ナトリウムが挙げられる。前記安定剤としては、例えば、プロピレングリコール、ジエチリン亜硫酸塩、アスコルビン酸が挙げられる。前記保存剤としては、例えば、フェノール、塩化ベンザルコニウム、ベンジルアルコール、クロロブタノール、メチルパラベンが挙げられる。前記防腐剤としては、例えば、アジ化ナトリウム、塩化ベンザルコニウム、パラオキシ安息香酸、クロロブタノールが挙げられる。
本発明の治療用組成物は、例えば、本発明の抗体に前記他の成分のうちの1種又は2種以上を加えて、その形態に応じた公知の方法又はそれに準じた方法によって適宜製造することができる。
<COVID-19の予防又は治療方法>
<COVID-19の予防又は治療方法>
本発明は、また、本発明の抗SARS-CoV-2抗体又は本発明の治療用組成物を対象に投与する、COVID-19の予防又は治療方法(以下、場合により「本発明の治療方法」という)も提供する。
本発明の治療方法は、本発明の抗体の有効量を対象に投与する工程を含む。本発明の治療方法に係る対象としては、ヒト又は非ヒト哺乳動物(マウス、ヒツジ、ウシ、ブタ、ウマ、サル、イヌ、ネコ、ウサギ等)が挙げられ、ヒトが好ましい。前記対象としては、予防目的の場合には、SARS-CoV-2に感染していないものであっても、既にSARS-CoV-2に感染しているがCOVID-19を発症していないものであってもよく、また、治療目的の場合には、COVID-19の軽症~重症のいずれのものであってもよい。
本発明の治療方法において、本発明の抗体は、そのまま、又は本発明の治療用組成物として前記対象投与することができ、注射により投与することが好ましい。
本発明の治療方法において、本発明の抗体の有効量としては、投与の目的や方法;対象の種、年齢、体重、性別、症状の程度等を考慮して、個々の場合に応じて適宜決定されるものであるため、特に限定されないが、例えば、ヒト(好ましくは、成人)に対しては、本発明の抗体の量(2種以上である場合にはそれらの合計量)で、対象の体重1kgあたり、かつ、1回あたり、0.0001~1000mgとすることができるが、本発明はこれらの数値に必ずしも制限されるものではない。また、本発明の治療方法において、投与回数は、1日1回~適当な回数とすることができる。
<SARS-CoV-2を免疫学的に検出する方法>
本発明は、また、試料中のSARS-CoV-2を免疫学的に検出する方法であって、上述の本発明の抗SARS-CoV-2抗体を用いる方法(以下、場合により単に「本発明の検出方法」という)を提供する。
本発明は、また、試料中のSARS-CoV-2を免疫学的に検出する方法であって、上述の本発明の抗SARS-CoV-2抗体を用いる方法(以下、場合により単に「本発明の検出方法」という)を提供する。
本発明の検出方法に供される「試料」としては、SARS-CoV-2(完全なウイルス粒子の他、少なくとも前記RBDを含む構成タンパク質を包含する。以下、本発明の検出方法及び検出用組成物において同じ)が存在し得る試料である限り特に制限はなく、例えば、生体から単離された体液(血液、リンパ液、組織液、体腔液、髄液、関節液、鼻腔粘液等)、組織が挙げられ、培養細胞又はその培養物(培養上清等)であってもよい。また、必要に応じて希釈液で希釈又は懸濁したものであってもよい。前記希釈液としては、例えば、リン酸緩衝液、Tris緩衝液、グッド緩衝液、ホウ酸緩衝液、酢酸緩衝液、クエン酸緩衝液、グリシン緩衝液、コハク酸緩衝液、フタル酸緩衝液等の緩衝液が挙げられる。
本発明の検出方法は、試料中のSARS-CoV-2と本発明の抗体とを接触させ、抗原抗体反応によって形成した免疫複合体に基づいて、当該試料中のSARS-CoV-2を検出するものである。免疫学的に検出する方法としては、例えば、標識物質として酵素を用いるEIA法(酵素免疫測定法)、EIA法の一態様であるELISA法やCLEIA法(化学発光酵素免疫測定法)、標識物質で標識された抗原又は抗体を用いる標識イムノアッセイ、標識物質として放射性同位元素を用いるRIA法(放射免疫測定法)、標識物質として化学発光性化合物を用いるCLIA法(化学発光免疫測定法)、イムノクロマトグラフィー法、凝集の検出により測定する免疫凝集法(ラテックス凝集法、金コロイド凝集法等)等が挙げられるが、これらに制限されるものではない。
前記標識物質としては、一般的に免疫学的測定法及びそれに準じた測定法に用いられているものを適宜用いることができ、例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)、アルカリホスファターゼ(ALP)、βガラクトシダーゼ(β-gal)、ホタルルシフェラーゼ等の酵素;フルオレセインイソチオシアネート(FITC)やローダミンイソチオシアネート(RITC)等の蛍光色素;アロフィコシアニン(APC)やフィコエリスリン(R-PE)等の蛍光蛋白質;125I等の放射性同位元素;ラテックス粒子、金コロイド粒子等の粒子;アビジン、ビオチン等が挙げられる。
本発明の検出方法としては、前記標識物質に応じたシグナルの有無を検出することにより、試料中のSARS-CoV-2の有無を検出することが好ましい。前記「シグナル」には、呈色(発色)、消光、反射光、発光、蛍光、放射性同位体による放射線等が含まれ、肉眼で確認できるものの他、シグナルの種類に応じた検出方法・装置によって確認できるものも含まれる。例えば、前記標識物質として酵素を用いた場合には、基質として、発色基質(例えば、過酸化水素の存在下、HRPによる酸化触媒反応により発色する3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジン(TMB))、化学発光基質(例えば、ALPによる加水分解により発光するAMPPD(3-(2’-スピロアダマンタン)-4-メトキシ-4-(3’’-ホスホリルオキシ)フェニル-1,2-ジオキセタン・2ナトリウム塩))、蛍光基質等を添加することにより、酵素-基質反応によって発生した種々のシグナル(発光、蛍光等)を検出することができる。
前記標識物質は、本発明の抗体に結合させてSARS-CoV-2を直接的に検出してもよく、本発明の抗体には標識物質を結合させず、標識物質を結合させた二次抗体等を利用してSARS-CoV-2を間接的に検出してもよい。ここで「二次抗体」とは、抗原に直接結合する抗体(一次抗体、すなわち本発明の抗体)に対して反応性を示す抗体である。また。二次抗体に代えて、標識物質を結合させたプロテインGやプロテインA等を用いてもよい。
抗体と標識物質との結合には、適宜従来公知の方法又はそれに準じた方法を適宜採用することができ、抗体と標識物質とを、活性基等によって直接結合させてもよく、オリゴペプチドやリンカー等を介して間接的に結合させてもよく、ビオチン-アビジン系(例えば、抗体をビオチン化し、これに、アビジン化した標識物質を作用させ、ビオチンとアビジンとの相互作用を利用して抗体に標識物質を結合させる)を利用してもよい。
本発明の検出方法としては、より感度が高い傾向にあるという観点から、CLEIA法等のサンドイッチ法が好適である。サンドイッチ法においては、固相に固定した捕捉用抗体(捕捉体)で検出対象物質(SARS-CoV-2)を捕捉し、それを標識物質が結合した検出用抗体(標識体)に認識させ、B/F分離(洗浄)後、前記標識物質の種類に応じた検出を行う。また、イムノクロマトグラフィー法のように、標識体で検出対象物質を認識させ、B/F分離を行ないつつ、捕捉体で検出対象物質を捕捉し、標識物質の種類に応じた検出を行うようにしてもよい。
前記固相としては、一般的に免疫学的測定法及びそれに準じた測定法に用いられているものを適宜用いることができ、例えば、磁性粒子やラテックス粒子等の粒子、プラスチックプレート等のプレート、ニトロセルロース繊維等の繊維状物質を用いることができる。
抗体の固相への固定には、適宜従来公知の方法又はそれに準じた方法を適宜採用することができ、抗体を固相に、物理的吸着法、化学的結合法、又はこれらの併用等の公知の方法によって直接固定してもよく、上記の二次抗体、プロテインG、プロテインAやビオチン-アビジン系によって間接的に固定してもよい。
前記サンドイッチ法においては、捕捉用抗体及び検出用抗体のうちの少なくとも一方として、本発明の抗体を用いることが好ましい。他の一方の抗体は、前記RBDに対する抗体であればよいが、好ましくは、本発明の抗体と前記RBDとの結合において競合しない抗体(より好ましくは、前記スパイク糖タンパク質の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識しない抗体)である。また、他の一方の抗体は、モノクローナル抗体であっても、ポリクローナル抗体であってもよいが、供給安定性の観点から、モノクローナル抗体であることが好ましい。
検出されたシグナルの測定値からSARS-CoV-2量を定量する場合には、一般的に、標準検体による測定値との比較により行うことができる。この場合、例えば、標準検体による測定値に基づいて作成された標準曲線上のどの位置に、実際の測定値が位置づけられるかを調べることにより、試料中のSARS-CoV-2量を求めることができる。
本発明の検出方法は、SARS-CoV-2の感染症であるCOVID-19の検査方法とすることができる。また、本発明の検出方法によってSARS-CoV-2量に関するデータを得る方法は、医師による診断のために上述のSARS-CoV-2量に関するデータを収集する方法、当該データを医師に提示する方法、医師による診断を補助するための方法とも表現することができる。
<SARS-CoV-2検出用組成物>
本発明は、また、本発明の抗SARS-CoV-2抗体を含有する、SARS-CoV-2を免疫学的に検出するための組成物(以下、場合により「本発明の検出用組成物」という)を提供する。本発明の検出用組成物は上記本発明の検出方法に好適に用いることができる。
本発明は、また、本発明の抗SARS-CoV-2抗体を含有する、SARS-CoV-2を免疫学的に検出するための組成物(以下、場合により「本発明の検出用組成物」という)を提供する。本発明の検出用組成物は上記本発明の検出方法に好適に用いることができる。
本発明の検出用組成物に含有される抗体としては、上述のとおりであるが、各種免疫学的手法に応じて、上述の標識物質が結合した形態であっても、前記固相に固定された形態であってもよい。かかる標識物質との結合方法及び固相への固定方法としては、上述のとおりである。
本発明の検出用組成物としては、本発明の抗体の他に、試薬として許容される他の成分をさらに含有することができる。このような他の成分としては、例えば、本発明の治療用組成物において挙げたものと同様のものが挙げられる。
また、本発明の抗体及び検出用組成物としては、シグナルの検出に必要な基質、試料のタンパク質を溶解するための溶液(タンパク質溶解用試薬)、試料の希釈や洗浄に用いる緩衝液(希釈液、洗浄液)、シグナルの検出反応を停止するための試薬(反応停止薬)、陽性対照(例えば、RBD)、陰性対照、本発明の抗体に対するアイソタイプコントロール抗体等と適宜組み合わせることにより、キットとして提供されてもよい。
かかるキットとしては、例えば、標識物質が結合した本発明の抗体又はそれを含有する本発明の検出用組成物と、前記標識物質に応じたシグナルの検出に必要な試薬(例えば基質)、陽性対照、及び陰性対照から選択される少なくとも1種と、を含むキットが挙げられる。また、標識物質が結合していない抗体を含む場合には、当該抗体に結合する物質(例えば、二次抗体、プロテインG、プロテインA等)に標識物質を結合させたものを組み合わせることができる。さらに、かかるキットには、当該キットの使用説明書等を含めることができる。
以下、実施例に基づいて本発明をより具体的に説明するが、本発明は以下の実施例に限定されるものではない。
(調製例1)
<回復者末梢血単核球の単離及び保管>
SARS-CoV-2の武漢株の流行期間内、かつ、変異株(ベータ株、デルタ株、オミクロン株)の流行前にSARS-CoV-2に感染し、COVID-19を発症して回復した回復者3名より採取した末梢血から、BDバキュテイナCPT単核球分離用採血管(BD社製)を用いて、遠心操作により単核球を分離した。分離した単核球はセルバンカーに懸濁して、使用まで超低温槽に保管した。
<回復者末梢血単核球の単離及び保管>
SARS-CoV-2の武漢株の流行期間内、かつ、変異株(ベータ株、デルタ株、オミクロン株)の流行前にSARS-CoV-2に感染し、COVID-19を発症して回復した回復者3名より採取した末梢血から、BDバキュテイナCPT単核球分離用採血管(BD社製)を用いて、遠心操作により単核球を分離した。分離した単核球はセルバンカーに懸濁して、使用まで超低温槽に保管した。
(調製例2)
<RBDの作製1>
SARS-CoV-2の武漢株のスパイク糖タンパク質(武漢株RBD、配列番号:1のアミノ酸配列の第331~529位のアミノ酸配列(Ancestral)をコードする塩基配列、並びに、Ancestralのアミノ酸配列において、各変異株のアミノ酸変異を導入した各RBD:
ベータ株RBD:Ancestralのアミノ酸配列にK417N、E484K、N501Yの変異(数字は配列番号:1のアミノ酸配列における位置、以下デルタ株、オミクロン株、及び変異RBDにおいて同じ)を導入したRBD;
デルタ株RBD:Ancestralのアミノ酸配列にL452R、T478Kの変異を導入したRBD;
オミクロン株(BA.1)RBD:Ancestralのアミノ酸配列にG339D、S371L、S373P、S375F、K417N、N440K、G446S、S477N、T478K、E484A、Q493R、Q498R、N501Y、及びY505Hの変異を導入したRBD;及び
オミクロン株(BA.2)RBD:Ancestralのアミノ酸配列にG339D、S371F、S373P、S375F、T376A、D405N、R408S、K417N、N440K、S477N、T478K、E484A、Q493R、Q498R、N501Y、及びY505Hの変異を導入したRBD
をコードする塩基配列をそれぞれ合成した。
<RBDの作製1>
SARS-CoV-2の武漢株のスパイク糖タンパク質(武漢株RBD、配列番号:1のアミノ酸配列の第331~529位のアミノ酸配列(Ancestral)をコードする塩基配列、並びに、Ancestralのアミノ酸配列において、各変異株のアミノ酸変異を導入した各RBD:
ベータ株RBD:Ancestralのアミノ酸配列にK417N、E484K、N501Yの変異(数字は配列番号:1のアミノ酸配列における位置、以下デルタ株、オミクロン株、及び変異RBDにおいて同じ)を導入したRBD;
デルタ株RBD:Ancestralのアミノ酸配列にL452R、T478Kの変異を導入したRBD;
オミクロン株(BA.1)RBD:Ancestralのアミノ酸配列にG339D、S371L、S373P、S375F、K417N、N440K、G446S、S477N、T478K、E484A、Q493R、Q498R、N501Y、及びY505Hの変異を導入したRBD;及び
オミクロン株(BA.2)RBD:Ancestralのアミノ酸配列にG339D、S371F、S373P、S375F、T376A、D405N、R408S、K417N、N440K、S477N、T478K、E484A、Q493R、Q498R、N501Y、及びY505Hの変異を導入したRBD
をコードする塩基配列をそれぞれ合成した。
また、Ancestralのアミノ酸配列において、1アミノ酸をそれぞれ置換した変異RBD(R346S、K417N、N440K、S443N、Y449G、L452R、A475V、T478K、E484K、F486S、N487G、Y489S、F490S、S494P、N501Y、又はG504T)をコードする塩基配列をそれぞれ合成した。
各塩基配列を、N末端シグナルペプチド配列、C末端ヒスタグ、及びC末端アビタグと共にpCAGGSベクターに挿入して、各RBD発現ベクターを作製した。作製した各RBD発現ベクターとExpi293 Expression System(Thermo Fisher Scientific社製)とを用いて各塩基配列にコードされるタンパク質をそれぞれ発現させ、TALONカラム(Takara社製)を用いて、培養上清から各RBD(抗原タンパク質)を精製した。また、発現の際にBirA-Flagプラスミド(Addgene社製)及びビオチンを培養系に添加してRBDにビオチンを付加させたこと以外は同様にして、各ビオチン化RBDを調製した。
<RBDの作製2>
Ancestral(SARS-CoV-2の武漢株のスパイク糖タンパク質(武漢株RBD、配列番号:1のアミノ酸配列の第331~529位)のアミノ酸配列において、各変異株のアミノ酸変異を導入した各RBD:
アルファ株RBD:Ancestralのアミノ酸配列にN501Yの変異を導入したRBD;
オミクロン株(BA.5)RBD:BA.2のアミノ酸配列にL452R、F486V、R493Qの変異を導入したRBD;
オミクロン株(BA.2.75)RBD:BA.2のアミノ酸配列にG339H、G446S、N460K、R493Qの変異を導入したRBD;
オミクロン株(BA.2.75.2)RBD:BA.2のアミノ酸配列にR346T、F486Sの変異を導入したRBD;
オミクロン株(BQ.1.1)RBD:BA.5のアミノ酸配列にR346T、K444T、N460Kの変異を導入したRBD;
オミクロン株(XBB)RBD:BA.2.75.2のアミノ酸配列にL368I、V445P、F490Sの変異を導入したRBD;及び
オミクロン株(XBB.1.5)RBD:XBBのアミノ酸配列にF486Pの変異を導入したRBD
をコードする塩基配列をそれぞれ合成した。各塩基配列より、上記<RBDの作製1>と同様にして各ビオチン化RBDをそれぞれ調製した。
Ancestral(SARS-CoV-2の武漢株のスパイク糖タンパク質(武漢株RBD、配列番号:1のアミノ酸配列の第331~529位)のアミノ酸配列において、各変異株のアミノ酸変異を導入した各RBD:
アルファ株RBD:Ancestralのアミノ酸配列にN501Yの変異を導入したRBD;
オミクロン株(BA.5)RBD:BA.2のアミノ酸配列にL452R、F486V、R493Qの変異を導入したRBD;
オミクロン株(BA.2.75)RBD:BA.2のアミノ酸配列にG339H、G446S、N460K、R493Qの変異を導入したRBD;
オミクロン株(BA.2.75.2)RBD:BA.2のアミノ酸配列にR346T、F486Sの変異を導入したRBD;
オミクロン株(BQ.1.1)RBD:BA.5のアミノ酸配列にR346T、K444T、N460Kの変異を導入したRBD;
オミクロン株(XBB)RBD:BA.2.75.2のアミノ酸配列にL368I、V445P、F490Sの変異を導入したRBD;及び
オミクロン株(XBB.1.5)RBD:XBBのアミノ酸配列にF486Pの変異を導入したRBD
をコードする塩基配列をそれぞれ合成した。各塩基配列より、上記<RBDの作製1>と同様にして各ビオチン化RBDをそれぞれ調製した。
(調製例3)
<抗原特異的B細胞の単離及びシングルB細胞の培養>
調製例1で分離した単核球を、BUV395標識CD19抗体(HIB19)、BV510標識CD2抗体(RPA-2.10)、BV510標識CD4抗体(RPA-T4)、BV510標識CD10抗体(HI10a)、BV510標識CD14抗体(M5E2)、BV510標識IgD抗体(IA6-2)、BV421標識IgG抗体(G18-145)、BB790標識CD27抗体(O323)、Live/Dead Aqua、APC標識武漢株RBD(調製例2で調製したビオチン化武漢株RBDとAPC標識ストレプトアビジンとを結合させたもの)、及びPE標識ベータ型RBD(調製例2で調製したビオチン化ベータ株RBDとPE標識ストレプトアビジンとを結合させたもの)で染色した後、セルソーター(BD FACSymphony S6、BD社製)を用いて、CD19陽性CD2陰性CD4陰性CD10陰性CD14陰性IgD陰性CD27陽性IgG陽性であり、かつ、武漢株RBD及びベータ型RBDに結合する生細胞(抗原特異的B細胞、シングルB細胞)を単離した。
<抗原特異的B細胞の単離及びシングルB細胞の培養>
調製例1で分離した単核球を、BUV395標識CD19抗体(HIB19)、BV510標識CD2抗体(RPA-2.10)、BV510標識CD4抗体(RPA-T4)、BV510標識CD10抗体(HI10a)、BV510標識CD14抗体(M5E2)、BV510標識IgD抗体(IA6-2)、BV421標識IgG抗体(G18-145)、BB790標識CD27抗体(O323)、Live/Dead Aqua、APC標識武漢株RBD(調製例2で調製したビオチン化武漢株RBDとAPC標識ストレプトアビジンとを結合させたもの)、及びPE標識ベータ型RBD(調製例2で調製したビオチン化ベータ株RBDとPE標識ストレプトアビジンとを結合させたもの)で染色した後、セルソーター(BD FACSymphony S6、BD社製)を用いて、CD19陽性CD2陰性CD4陰性CD10陰性CD14陰性IgD陰性CD27陽性IgG陽性であり、かつ、武漢株RBD及びベータ型RBDに結合する生細胞(抗原特異的B細胞、シングルB細胞)を単離した。
単離した生細胞は、MS40L-lowフィーダー細胞上で24日間培養した。当該培養の培地には、10% FBS、55μM 2-メルカプトエタノール、100U/mL ペニシリン、100μg/mL ストレプトマイシン、10mM HEPES、1mM ピルビン酸ナトリウム、1% MEM非必須アミノ酸、50ng/mL ヒトIL-2、10ng/mL ヒトIL-4、10ng/mL ヒトIL-21、及び10ng/mL ヒトBAFFを添加したRPMI1640培地を用いた。
(調製例4)
〔抗体解析〕
調製例3で24日間培養後の培養上清を用いたこと以外は下記の中和活性測定(実施例1)と同様にして、SARS-CoV-2(武漢株、デルタ株、オミクロン株(BA.1)、オミクロン株(BA.2))に対する感染中和活性を評価した。また、前記培養上清及び武漢株RBD固相化プレートを用いたこと以外は下記の結合性解析(実施例2)と同様にして、RBDとの結合性を評価した。評価の結果、特に感染中和活性及びRBDとの結合性の高い14のB細胞を選択した。
〔抗体解析〕
調製例3で24日間培養後の培養上清を用いたこと以外は下記の中和活性測定(実施例1)と同様にして、SARS-CoV-2(武漢株、デルタ株、オミクロン株(BA.1)、オミクロン株(BA.2))に対する感染中和活性を評価した。また、前記培養上清及び武漢株RBD固相化プレートを用いたこと以外は下記の結合性解析(実施例2)と同様にして、RBDとの結合性を評価した。評価の結果、特に感染中和活性及びRBDとの結合性の高い14のB細胞を選択した。
選択したB細胞について、先ず、調製例3で24日間培養後の細胞からRNeasy micro kit(Qiagen社製)を用いてRNAを抽出し、抽出したRNAから逆転写反応によってcDNAを合成した。得られたcDNAを鋳型として、Tiller et al.,Journal of Immunological Methods,329:p.112-124に記載のプライマーを用いて、PCR法により抗体遺伝子の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域をそれぞれ増幅して、サンガー法によって塩基配列を解析した。得られた塩基配列は、IgBLAST(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/)により解析して、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配、並びに、相補性決定領域1~3(CDR1~3)のアミノ酸配列を決定した。下記の表1に、解析した14個の抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域のアミノ酸配列、並びに、そのうちの各相補性決定領域3(CDR3)のアミノ酸配列の配列番号をそれぞれ示す。また、解析した14個の抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域における各相補性決定領域1~2(CDR1及びCDR2)のアミノ酸配列を下記の表2にそれぞれ示す。
〔組換えモノクローナル抗体の作製〕
上記で増幅、解析した14個の抗体遺伝子の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域をコードする塩基配列は、それぞれ、下記の表1の組み合わせとなるように、ヒトIgG1の定常領域(γ1、配列番号:58のアミノ酸配列)をコードする塩基配列、ヒトIgKappa(κ)の定常領域(配列番号:59のアミノ酸配列)をコードする塩基配列、又はヒトIgLambda(λ)の定常領域(配列番号:60のアミノ酸配列)をコードする塩基配列をそれぞれ含む哺乳類発現用ベクターに導入し、重鎖発現ベクター及び軽鎖発現ベクターをそれぞれ作製した。作製した各発現ベクターとExpi293 Expression System(Thermo Fisher Scientific社製)とを用いて各塩基配列にコードされるタンパク質を発現させ、Protein Gカラムを用いて、培養上清から組換えモノクローナル抗体を精製し、14個(No.1~14)の組換えモノクローナル抗体を得た。作製した組換えモノクローナル抗体の重鎖及び軽鎖における各可変領域及びCDR3と、各定常領域との組み合わせを下記の表1に合わせて示す。
上記で増幅、解析した14個の抗体遺伝子の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域をコードする塩基配列は、それぞれ、下記の表1の組み合わせとなるように、ヒトIgG1の定常領域(γ1、配列番号:58のアミノ酸配列)をコードする塩基配列、ヒトIgKappa(κ)の定常領域(配列番号:59のアミノ酸配列)をコードする塩基配列、又はヒトIgLambda(λ)の定常領域(配列番号:60のアミノ酸配列)をコードする塩基配列をそれぞれ含む哺乳類発現用ベクターに導入し、重鎖発現ベクター及び軽鎖発現ベクターをそれぞれ作製した。作製した各発現ベクターとExpi293 Expression System(Thermo Fisher Scientific社製)とを用いて各塩基配列にコードされるタンパク質を発現させ、Protein Gカラムを用いて、培養上清から組換えモノクローナル抗体を精製し、14個(No.1~14)の組換えモノクローナル抗体を得た。作製した組換えモノクローナル抗体の重鎖及び軽鎖における各可変領域及びCDR3と、各定常領域との組み合わせを下記の表1に合わせて示す。
(調製例5)
〔抗体のコンピュテーショナルデザイン〕
上記で作製したNo.5の組み換えモノクローナル抗体(以下、場合により「No.5抗体」)のアミノ酸配列を基に、これがオミクロン株(XBB.1.5)RBDに対してより高い親和性で結合できるように抗体の配列設計を行なった。すなわち、Rosettaソフトウェア スイート(Rosetta Commons;Lemanら,Nat.Methods 17,p.665-680,2020)を用い、初期座標としてはNo.5抗体のFabとAncestralとの結晶構造から導出した座標を用いた。Ancestralのアミノ酸配列をオミクロン株(XBB.1.5)RBDのアミノ酸配列に置き換えて暫定的なNo.5抗体のFv領域とオミクロン株(XBB.1.5)RBDとの複合体モデル(抗体-RBD)を作成し、これをFastRelaxプロトコル(Nivonら,PloS One 8,e59004,2013)により改良し(RBDから5Å以内となるCDR残基を選択)、InterfaceDesign2019スクリプトを使用したFastDesignプロトコル(Maguireら,Proteins 89,p.436-449,2021)により、2,000個の複合体モデルを設計した。これらのモデルに対してドッキング計算(Grayら,J.Mol.Biol.331,p.281-299,2003)を実施し、抗体-RBD界面における相補性を界面エネルギー(<-35kcal/mol)、形状相補性(Sc>0.65)、水素結合の数(>4)、及び視覚検査により評価した。さらに、Ancestral及びオミクロン株(XBB)RBD)についても上記評価を実施し、上記全ての基準を満たす抗体を改良抗体として選択した。
〔抗体のコンピュテーショナルデザイン〕
上記で作製したNo.5の組み換えモノクローナル抗体(以下、場合により「No.5抗体」)のアミノ酸配列を基に、これがオミクロン株(XBB.1.5)RBDに対してより高い親和性で結合できるように抗体の配列設計を行なった。すなわち、Rosettaソフトウェア スイート(Rosetta Commons;Lemanら,Nat.Methods 17,p.665-680,2020)を用い、初期座標としてはNo.5抗体のFabとAncestralとの結晶構造から導出した座標を用いた。Ancestralのアミノ酸配列をオミクロン株(XBB.1.5)RBDのアミノ酸配列に置き換えて暫定的なNo.5抗体のFv領域とオミクロン株(XBB.1.5)RBDとの複合体モデル(抗体-RBD)を作成し、これをFastRelaxプロトコル(Nivonら,PloS One 8,e59004,2013)により改良し(RBDから5Å以内となるCDR残基を選択)、InterfaceDesign2019スクリプトを使用したFastDesignプロトコル(Maguireら,Proteins 89,p.436-449,2021)により、2,000個の複合体モデルを設計した。これらのモデルに対してドッキング計算(Grayら,J.Mol.Biol.331,p.281-299,2003)を実施し、抗体-RBD界面における相補性を界面エネルギー(<-35kcal/mol)、形状相補性(Sc>0.65)、水素結合の数(>4)、及び視覚検査により評価した。さらに、Ancestral及びオミクロン株(XBB)RBD)についても上記評価を実施し、上記全ての基準を満たす抗体を改良抗体として選択した。
〔組換えモノクローナル抗体の作製〕
上記で選択した改良抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列及び軽鎖可変領域をコードする塩基配列を、それぞれ、ヒトIgG1の定常領域(γ1、配列番号:58のアミノ酸配列)をコードする塩基配列及びヒトIgLambda(λ)の定常領域(配列番号:60のアミノ酸配列)をコードする塩基配列をそれぞれ含む哺乳類発現用ベクターに導入し、重鎖発現ベクター及び軽鎖発現ベクターをそれぞれ作製した。作製した各発現ベクターとExpi293 Expression System(Thermo Fisher Scientific社製)とを用いて各塩基配列にコードされるタンパク質を発現させ、Protein Gカラムを用いて、培養上清から組換えモノクローナル抗体を精製し、No.15の組換えモノクローナル抗体を得た。作製した組換えモノクローナル抗体の重鎖可変領域、軽鎖可変領域、及びそのうちの各相補性決定領域3(CDR3)のアミノ酸配列の配列番号、並びに、定常領域との組み合わせを上記の表1に合わせて示す。また、作製した組換えモノクローナル抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域における各相補性決定領域1~2(CDR1及びCDR2)のアミノ酸配列を上記の表2に合わせて示す。
上記で選択した改良抗体の重鎖可変領域をコードする塩基配列及び軽鎖可変領域をコードする塩基配列を、それぞれ、ヒトIgG1の定常領域(γ1、配列番号:58のアミノ酸配列)をコードする塩基配列及びヒトIgLambda(λ)の定常領域(配列番号:60のアミノ酸配列)をコードする塩基配列をそれぞれ含む哺乳類発現用ベクターに導入し、重鎖発現ベクター及び軽鎖発現ベクターをそれぞれ作製した。作製した各発現ベクターとExpi293 Expression System(Thermo Fisher Scientific社製)とを用いて各塩基配列にコードされるタンパク質を発現させ、Protein Gカラムを用いて、培養上清から組換えモノクローナル抗体を精製し、No.15の組換えモノクローナル抗体を得た。作製した組換えモノクローナル抗体の重鎖可変領域、軽鎖可変領域、及びそのうちの各相補性決定領域3(CDR3)のアミノ酸配列の配列番号、並びに、定常領域との組み合わせを上記の表1に合わせて示す。また、作製した組換えモノクローナル抗体の重鎖可変領域及び軽鎖可変領域における各相補性決定領域1~2(CDR1及びCDR2)のアミノ酸配列を上記の表2に合わせて示す。
(実施例1)
<ウイルス分離株を用いた中和活性測定>
本実験は、国立感染症研究所BSL3実験施設にて実施した。先ず、調製例4で作製した各組換えモノクローナル抗体(No.1~14)を、2% FBS、100U/mL ペニシリン、及び100μg/mL ストレプトマイシンを添加したDMEM培養液で段階希釈し、100 TCID50のSARS-CoV-2(武漢株、デルタ株、オミクロン株(BA.1)、オミクロン株(BA.2))の各々と混合して、37℃のCO2インキュベーターにて1時間反応させた。次いで、これを96ウェルプレート上で一晩培養したVeroE6/TMPRSS2細胞に加え、37℃のCO2インキュベーターにて培養した。2日間(オミクロン株は3日間)培養した後、Cell Counting Kit-8(富士フイルム和光純薬株式会社製)を加えて1時間培養し、死細胞又は変性細胞数(すなわち感染した細胞数)に対応する450nmにおける吸光度を測定した。抗体なしウイルスなしの組み合わせのときの吸光度、及び抗体なしウイルスありの組み合わせのときの吸光度を基に、感染中和活性(感染細胞数を、抗体なしウイルスありの組み合わせのときの50%にするために必要な抗体濃度)のIC50をそれぞれ算出した。log10IC50を示すヒートマップを図1に示す。また、比較例として、上記組換えモノクローナル抗体に代えて従来の抗SARS-CoV-2抗体であるソトロビマブ親抗体(S309)を用いたときのIC50も算出したが、実験に用いた全ての抗体濃度の条件では感染中和を示さなかったため、算出することができなかった(図1中、「X」)。
<ウイルス分離株を用いた中和活性測定>
本実験は、国立感染症研究所BSL3実験施設にて実施した。先ず、調製例4で作製した各組換えモノクローナル抗体(No.1~14)を、2% FBS、100U/mL ペニシリン、及び100μg/mL ストレプトマイシンを添加したDMEM培養液で段階希釈し、100 TCID50のSARS-CoV-2(武漢株、デルタ株、オミクロン株(BA.1)、オミクロン株(BA.2))の各々と混合して、37℃のCO2インキュベーターにて1時間反応させた。次いで、これを96ウェルプレート上で一晩培養したVeroE6/TMPRSS2細胞に加え、37℃のCO2インキュベーターにて培養した。2日間(オミクロン株は3日間)培養した後、Cell Counting Kit-8(富士フイルム和光純薬株式会社製)を加えて1時間培養し、死細胞又は変性細胞数(すなわち感染した細胞数)に対応する450nmにおける吸光度を測定した。抗体なしウイルスなしの組み合わせのときの吸光度、及び抗体なしウイルスありの組み合わせのときの吸光度を基に、感染中和活性(感染細胞数を、抗体なしウイルスありの組み合わせのときの50%にするために必要な抗体濃度)のIC50をそれぞれ算出した。log10IC50を示すヒートマップを図1に示す。また、比較例として、上記組換えモノクローナル抗体に代えて従来の抗SARS-CoV-2抗体であるソトロビマブ親抗体(S309)を用いたときのIC50も算出したが、実験に用いた全ての抗体濃度の条件では感染中和を示さなかったため、算出することができなかった(図1中、「X」)。
図1に示したように、調製例4で作製したいずれの組換えモノクローナル抗体においても、武漢株、デルタ株、及びオミクロン株の全てに対して高い感染中和活性を示すことが確認され、従来の抗SARS-CoV-2抗体(S309)に比べても感染中和活性が顕著に高いことが確認された。
(実施例2)
<変異導入済み抗原タンパク質とモノクローナル抗体との結合性解析>
先ず、調製例2の<RBDの作製1>で調製した各ビオチン化変異RBDを固相化したU-plexプレート(MSD社製)の各ウェル(RBD量:60ng/ウェル)に、調製例4で作製した組換えモノクローナル抗体(No.1~14)をそれぞれDiluent 100(MSD社製)で希釈して添加し(抗体量:250pg/ウェル)、700rpmで振盪しながら室温にて1時間反応させた。次いで、ウェルを洗浄した後、SULFO-TAG標識抗IgG抗体を添加して、電気化学発光法により、組換えモノクローナル抗体に結合したIgG抗体量、すなわち各RBDに結合した組換えモノクローナル抗体の量を測定した。RBDとして武漢株RBD(Ancestral)を用いたときに結合した組換えモノクローナル抗体の量を100(%)として、各変異RBDを用いたときに結合した組換えモノクローナル抗体の相対結合量(Relative to Ancestral(%))を算出した。また、比較例として、各組換えモノクローナル抗体に代えて従来の抗SARS-CoV-2抗体であるソトロビマブ親抗体(S309)を用いたときの相対結合量も算出した。結果を示すヒートマップを図2に示す。
<変異導入済み抗原タンパク質とモノクローナル抗体との結合性解析>
先ず、調製例2の<RBDの作製1>で調製した各ビオチン化変異RBDを固相化したU-plexプレート(MSD社製)の各ウェル(RBD量:60ng/ウェル)に、調製例4で作製した組換えモノクローナル抗体(No.1~14)をそれぞれDiluent 100(MSD社製)で希釈して添加し(抗体量:250pg/ウェル)、700rpmで振盪しながら室温にて1時間反応させた。次いで、ウェルを洗浄した後、SULFO-TAG標識抗IgG抗体を添加して、電気化学発光法により、組換えモノクローナル抗体に結合したIgG抗体量、すなわち各RBDに結合した組換えモノクローナル抗体の量を測定した。RBDとして武漢株RBD(Ancestral)を用いたときに結合した組換えモノクローナル抗体の量を100(%)として、各変異RBDを用いたときに結合した組換えモノクローナル抗体の相対結合量(Relative to Ancestral(%))を算出した。また、比較例として、各組換えモノクローナル抗体に代えて従来の抗SARS-CoV-2抗体であるソトロビマブ親抗体(S309)を用いたときの相対結合量も算出した。結果を示すヒートマップを図2に示す。
図2に示したように、武漢株RBD(Ancestral)のアミノ酸配列の第443位のS(S443)、又は第489位のY(Y489)を別のアミノ酸(N又はS)に置換すると、抗体No.1~3ではS443Nの変異RBD、抗体No.4~14ではY489Sの変異RBDに対する結合性がそれぞれ顕著に低下した。そのため、調製例4で作製した組換えモノクローナル抗体は、S443又はY489を特異的に認識することが確認された。なお、従来の抗SARS-CoV-2抗体(S309)にはこのような特異性は確認されなかった。
(実施例3)
〔組換えFabタンパク質の作製〕
調製例4で増幅した抗体遺伝子のうち、抗体No.2、5~7の各重鎖可変領域をコードする塩基配列を、ヒトIgG1の定常領域のCH1領域(配列番号:58のアミノ酸配列(γ1)の第1~105位のアミノ酸配列)をコードする塩基配列とヒスタグとを含む哺乳類発現用ベクターに導入し、重鎖発現ベクターとした。作製した重鎖発現ベクターと、調製例4で作製した抗体No.2、5~7の各軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含む軽鎖発現ベクターと、Expi293 Expression System(Thermo Fisher Scientific社製)とを用いて各塩基配列にコードされるタンパク質をそれぞれ発現させ、TALONカラム(Takara社製)を用いて、培養上清から組換えFabタンパク質を精製した。
〔組換えFabタンパク質の作製〕
調製例4で増幅した抗体遺伝子のうち、抗体No.2、5~7の各重鎖可変領域をコードする塩基配列を、ヒトIgG1の定常領域のCH1領域(配列番号:58のアミノ酸配列(γ1)の第1~105位のアミノ酸配列)をコードする塩基配列とヒスタグとを含む哺乳類発現用ベクターに導入し、重鎖発現ベクターとした。作製した重鎖発現ベクターと、調製例4で作製した抗体No.2、5~7の各軽鎖可変領域をコードする塩基配列を含む軽鎖発現ベクターと、Expi293 Expression System(Thermo Fisher Scientific社製)とを用いて各塩基配列にコードされるタンパク質をそれぞれ発現させ、TALONカラム(Takara社製)を用いて、培養上清から組換えFabタンパク質を精製した。
〔抗体抗原結合親和性測定〕
SARS-CoV-2(武漢株、デルタ株、オミクロン株(BA.1)、オミクロン株(BA.2))のRBDとして、それぞれ、調製例2で調製した各ビオチン化RBDを用い、上記で調製した組換えFabタンパク質と各RBDとの結合親和性を、Octetシステム(ザルトリウス社)を用いて、バイオレイヤー干渉法にて測定した。より具体的には、各ビオチン化RBDを固相化したOctetシステムのストレプトアビジンバイオセンサーを、各組換えFabタンパク質を添加したKinetics buffer(ザルトリウス社)中に浸漬して、Fabタンパク質とRBDとの間の解離定数(KD(M))、結合速度定数(kon(1/Ms(ミリ秒)))、及び解離速度定数(koff(1/s))をそれぞれ測定した。結果を下記の表3に示す。
SARS-CoV-2(武漢株、デルタ株、オミクロン株(BA.1)、オミクロン株(BA.2))のRBDとして、それぞれ、調製例2で調製した各ビオチン化RBDを用い、上記で調製した組換えFabタンパク質と各RBDとの結合親和性を、Octetシステム(ザルトリウス社)を用いて、バイオレイヤー干渉法にて測定した。より具体的には、各ビオチン化RBDを固相化したOctetシステムのストレプトアビジンバイオセンサーを、各組換えFabタンパク質を添加したKinetics buffer(ザルトリウス社)中に浸漬して、Fabタンパク質とRBDとの間の解離定数(KD(M))、結合速度定数(kon(1/Ms(ミリ秒)))、及び解離速度定数(koff(1/s))をそれぞれ測定した。結果を下記の表3に示す。
表3に示したように、抗体No.2、5~7の組換えFabタンパク質においてはいずれも、武漢株、デルタ株、及びオミクロン株のRBDに対する解離定数が1.0×10-7M以下であり、これらのRBDに対して高い結合親和性を有することが確認された。
(実施例4)
<抗体退避変異ウイルス(エスケープウイルス)解析>
先ず、調製例4で作製した組換えモノクローナル抗体(No.2、5~7)を、2% FBS、100U/mL ペニシリン、及び100μg/mL ストレプトマイシンを添加したDMEM培養液で段階希釈し、100 TCID50のSARS-CoV-2(武漢株)と混合して、37℃のCO2インキュベーターにて1時間反応させた。次いで、これを12ウェルプレート上で一晩培養したVeroE6/TMPRSS2細胞に加え、37℃のCO2インキュベーターにて培養した(培養1)。培養1の培養開始から3日目に、細胞変性効果が観察されたウェルのうち最も抗体濃度が高かったものの培養上清を、再度、段階希釈した組換えモノクローナル抗体と混合し、37℃のCO2インキュベーターにて1時間反応させた。次いで、これを12ウェルプレート上で一晩培養したVeroE6/TMPRSS2細胞に加え、37℃のCO2インキュベーターにて培養した(培養2)。培養2の培養開始から3日目に、細胞変性効果が観察されたウェルのうち最も抗体濃度が高かったものの培養上清として、抗体退避変異ウイルス候補を得た。得られた抗体退避変異ウイルス候補は、限界希釈法にてクローニングした後、Direct-zol RNA kit(ZYMO RESEARCH社製)を用いてRNAを抽出し、サンガー法を使ってそのRBDをコードする塩基配列の解析を行った。
<抗体退避変異ウイルス(エスケープウイルス)解析>
先ず、調製例4で作製した組換えモノクローナル抗体(No.2、5~7)を、2% FBS、100U/mL ペニシリン、及び100μg/mL ストレプトマイシンを添加したDMEM培養液で段階希釈し、100 TCID50のSARS-CoV-2(武漢株)と混合して、37℃のCO2インキュベーターにて1時間反応させた。次いで、これを12ウェルプレート上で一晩培養したVeroE6/TMPRSS2細胞に加え、37℃のCO2インキュベーターにて培養した(培養1)。培養1の培養開始から3日目に、細胞変性効果が観察されたウェルのうち最も抗体濃度が高かったものの培養上清を、再度、段階希釈した組換えモノクローナル抗体と混合し、37℃のCO2インキュベーターにて1時間反応させた。次いで、これを12ウェルプレート上で一晩培養したVeroE6/TMPRSS2細胞に加え、37℃のCO2インキュベーターにて培養した(培養2)。培養2の培養開始から3日目に、細胞変性効果が観察されたウェルのうち最も抗体濃度が高かったものの培養上清として、抗体退避変異ウイルス候補を得た。得られた抗体退避変異ウイルス候補は、限界希釈法にてクローニングした後、Direct-zol RNA kit(ZYMO RESEARCH社製)を用いてRNAを抽出し、サンガー法を使ってそのRBDをコードする塩基配列の解析を行った。
解析の結果、SARS-CoV-2の武漢株のRBD(武漢株RBD、配列番号:1のアミノ酸配列の第319~541位のアミノ酸配列)に比べて、抗体No.2の組換えモノクローナル抗体に対しては、7個のうちの6個のクローンでK444Mのエスケープ変異、及び、7個のうちの残り1個のクローンでG447Dのエスケープ変異が確認され、抗体No.7の組換えモノクローナル抗体に対しては、8個の全てのクローンでF486Sのエスケープ変異が確認された。他方、抗体No.5、6の組換えモノクローナル抗体に対してはいずれもエスケープ変異が確認されず、抗体退避変異ウイルスが特に生じ難いことが確認された。結果を下記の表4に示す。
(実施例5)
<動物における治療効果の評価>
本実験は、国立感染症研究所BSL3実験施設にて実施した。10000 TCID50のSARS-CoV-2(武漢株、オミクロン株(BA.1)、オミクロン株(BA.2))をそれぞれ7~9匹のシリアンハムスターに経鼻接種して感染させ、その翌日に、調製例4で作製した組換えモノクローナル抗体(No.5~7、抗体量:5mg/kg)を腹腔内投与した。また、比較例として、PBS又は従来の抗SARS-CoV-2抗体であるソトロビマブ親抗体(S309)を同様に投与した。武漢株に感染させたハムスターは、感染日(経鼻摂取日)から6日間に亘って体重変化を観察した。感染日(0日目)の体重を100としたときの感染日からの体重変化の平均値を図3に示す。また、感染日から6日目の右肺後葉(Lung lobe)を採取して重量を測定した。感染日から6日目の右肺後葉重量(g)及びそれらの平均値(バーで示す)を図4に示す。
<動物における治療効果の評価>
本実験は、国立感染症研究所BSL3実験施設にて実施した。10000 TCID50のSARS-CoV-2(武漢株、オミクロン株(BA.1)、オミクロン株(BA.2))をそれぞれ7~9匹のシリアンハムスターに経鼻接種して感染させ、その翌日に、調製例4で作製した組換えモノクローナル抗体(No.5~7、抗体量:5mg/kg)を腹腔内投与した。また、比較例として、PBS又は従来の抗SARS-CoV-2抗体であるソトロビマブ親抗体(S309)を同様に投与した。武漢株に感染させたハムスターは、感染日(経鼻摂取日)から6日間に亘って体重変化を観察した。感染日(0日目)の体重を100としたときの感染日からの体重変化の平均値を図3に示す。また、感染日から6日目の右肺後葉(Lung lobe)を採取して重量を測定した。感染日から6日目の右肺後葉重量(g)及びそれらの平均値(バーで示す)を図4に示す。
また、オミクロン株に感染させたハムスターは、感染日(経鼻摂取日)から3日目に1mLの洗浄液で洗浄した鼻腔洗浄液をそれぞれ採取し、Direct-zol RNA kit (ZYMO RESEARCH社)を用いてRNAを抽出して、プライマー(forward primer:配列番号:61に記載のヌクレオチド配列、reverse primer:配列番号:62に記載のヌクレオチド配列)を用いて、QuantiTect Probe RT-PCR Kit(QIAGEN社)を用いたqRT-PCR法により、鼻腔洗浄液1mLあたりのウイルスコピー数を測定した。結果を図5及び図6に示す。図5は、オミクロン株(BA.1)を感染させたときの感染日から3日目の鼻腔洗浄液中のウイルスコピー数及びそれらの平均値(バーで示す)を示し、図6は、オミクロン株(BA.2)を感染させたときの感染日から3日目の鼻腔洗浄液中のウイルスコピー数及びそれらの平均値(バーで示す)を示す。
図3~6において、「*」、「**」、「***」、及び「****」は、PBSを投与したときに対するANOVA検定において、それぞれ、p<0.05、p<0.01、p<0.001、及びp<0.0001であったことを示す。
図3に示したように、SARS-CoV-2の武漢株を感染させたハムスターにおいては、抗体No.6、7の組換えモノクローナル抗体の投与によって有意な体重減少の抑制が確認され、特に、抗体No.7の組換えモノクローナル抗体を投与した場合には、S309よりも早くから体重減少の抑制が確認された。さらに、図4に示したように、SARS-CoV-2の武漢株を感染させたハムスターにおいては、いずれの組換えモノクローナル抗体を投与した場合にも、S309と同様に、PBS投与に比べて有意に右肺後葉重量が小さくなり、優れた治療効果が確認された。
また、図5~6に示したように、オミクロン株(BA.1、BA.2)に感染させたハムスターにおいては、いずれの組換えモノクローナル抗体を投与した場合にも、PBSを投与したときに比べて有意に鼻腔洗浄液中のウイルスコピー数が減少し、抗体No.6、7の組換えモノクローナル抗体を投与した場合には、特に優れた治療効果が確認された。
図3に示したように、SARS-CoV-2の武漢株を感染させたハムスターにおいては、抗体No.6、7の組換えモノクローナル抗体の投与によって有意な体重減少の抑制が確認され、特に、抗体No.7の組換えモノクローナル抗体を投与した場合には、S309よりも早くから体重減少の抑制が確認された。さらに、図4に示したように、SARS-CoV-2の武漢株を感染させたハムスターにおいては、いずれの組換えモノクローナル抗体を投与した場合にも、S309と同様に、PBS投与に比べて有意に右肺後葉重量が小さくなり、優れた治療効果が確認された。
また、図5~6に示したように、オミクロン株(BA.1、BA.2)に感染させたハムスターにおいては、いずれの組換えモノクローナル抗体を投与した場合にも、PBSを投与したときに比べて有意に鼻腔洗浄液中のウイルスコピー数が減少し、抗体No.6、7の組換えモノクローナル抗体を投与した場合には、特に優れた治療効果が確認された。
(実施例6)
<シュードタイプウイルスを用いた中和活性測定>
調製例5で作製したモノクローナル抗体によるSARS-CoV-2ウイルス感染阻害効果を評価するために、シュードタイプウイルスを用いた中和活性試験を行なった。先ず、調製例5で作製したNo.15の組換えモノクローナル抗体を、2% FBS、100U/mL ペニシリン、及び100μg/mLストレプトマイシンを添加したDMEM培養液で段階希釈し、100 TCID50のSARS-CoV-2シュードタイプウイルス(オミクロン株(XBB.1.5))と混合して、37℃のCO2インキュベーターにて1時間反応させた。次いで、これを96ウェルプレート上で一晩培養したVeroE6/TMPRSS2細胞に加え、37℃のCO2インキュベーターにて培養した。1日間培養した後、Bright-Glo Luciferase Assay system(Promega社製)を加え、感染した細胞数に対応するルシフェラーゼの発光強度を測定した。抗体なしウイルスなしの組み合わせのときの発光強度、及び抗体なしウイルスありの組み合わせのときの発光強度を基に、感染中和活性(感染細胞数を、抗体なしウイルスありの組み合わせのときの50%にするために必要な抗体濃度)のIC50を算出した。その結果、No.15の組換えモノクローナル抗体のオミクロン株(XBB.1.5)に対する感染中和活性は、IC50で、56.78ng/mLであり、高い感染中和活性を示すことが確認された。
<シュードタイプウイルスを用いた中和活性測定>
調製例5で作製したモノクローナル抗体によるSARS-CoV-2ウイルス感染阻害効果を評価するために、シュードタイプウイルスを用いた中和活性試験を行なった。先ず、調製例5で作製したNo.15の組換えモノクローナル抗体を、2% FBS、100U/mL ペニシリン、及び100μg/mLストレプトマイシンを添加したDMEM培養液で段階希釈し、100 TCID50のSARS-CoV-2シュードタイプウイルス(オミクロン株(XBB.1.5))と混合して、37℃のCO2インキュベーターにて1時間反応させた。次いで、これを96ウェルプレート上で一晩培養したVeroE6/TMPRSS2細胞に加え、37℃のCO2インキュベーターにて培養した。1日間培養した後、Bright-Glo Luciferase Assay system(Promega社製)を加え、感染した細胞数に対応するルシフェラーゼの発光強度を測定した。抗体なしウイルスなしの組み合わせのときの発光強度、及び抗体なしウイルスありの組み合わせのときの発光強度を基に、感染中和活性(感染細胞数を、抗体なしウイルスありの組み合わせのときの50%にするために必要な抗体濃度)のIC50を算出した。その結果、No.15の組換えモノクローナル抗体のオミクロン株(XBB.1.5)に対する感染中和活性は、IC50で、56.78ng/mLであり、高い感染中和活性を示すことが確認された。
(実施例7)
ビオチン化変異RBD(抗原タンパク質)として、調製例2の<RBDの作製1>で調製したAncestral、ベータ株RBD、デルタ株RBD、オミクロン株(BA.1)RBD、オミクロン株(BA.2)RBD、Y489Sのビオチン化RBDに加えて、<RBDの作製2>で調製した各ビオチン化RBDを用い、かつ、組換えモノクローナル抗体として、調製例5で作製したNo.15の組換えモノクローナル抗体を用いたこと以外は実施例2と同様にして、抗原タンパク質とモノクローナル抗体との結合性解析を行なった。RBDとして武漢株RBD(Ancestral)を用いたときに結合した組換えモノクローナル抗体の量を100(%)として、各RBDを用いたときに結合した組換えモノクローナル抗体の相対結合量(Relative to Ancestral(%))を算出した。結果を示すヒートマップを図7に示す。
ビオチン化変異RBD(抗原タンパク質)として、調製例2の<RBDの作製1>で調製したAncestral、ベータ株RBD、デルタ株RBD、オミクロン株(BA.1)RBD、オミクロン株(BA.2)RBD、Y489Sのビオチン化RBDに加えて、<RBDの作製2>で調製した各ビオチン化RBDを用い、かつ、組換えモノクローナル抗体として、調製例5で作製したNo.15の組換えモノクローナル抗体を用いたこと以外は実施例2と同様にして、抗原タンパク質とモノクローナル抗体との結合性解析を行なった。RBDとして武漢株RBD(Ancestral)を用いたときに結合した組換えモノクローナル抗体の量を100(%)として、各RBDを用いたときに結合した組換えモノクローナル抗体の相対結合量(Relative to Ancestral(%))を算出した。結果を示すヒートマップを図7に示す。
図7に示したように、武漢株RBD(Ancestral)のアミノ酸配列の第489位のY(Y489)を別のアミノ酸(S)に置換すると、かかる変異RBDに対する結合性が顕著に低下した。そのため、調製例5で作製した組換えモノクローナル抗体はY489を特異的に認識することが確認された。また、調製例5で作製した組換えモノクローナル抗体は、武漢株RBD(Ancestral)も含めて、上記の全ての変異株のRBDに対して高い結合親和性を有することが確認された。
以上説明したように、本発明によれば、従来型のSARS-CoV-2に加えて、オミクロン株を含む他の変異株に対しても結合親和性及び感染中和活性の高い新規抗体、並びに、それを用いたCOVID-19の予防又は治療用組成物、SARS-CoV-2を免疫学的に検出するための組成物、及びSARS-CoV-2を免疫学的に検出する方法を提供することが可能となる。
Claims (7)
- SARS-CoV-2に対する抗体であって、SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(RBD)に結合する抗体であり、前記スパイク糖タンパク質のアミノ酸配列の第443位のセリン又は第489位のチロシンを認識することを特徴とする、抗SARS-CoV-2抗体。
- SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質受容体結合部位(RBD)に対して解離定数(KD)1.0×10-6M以下で結合することを特徴とする、請求項1に記載の抗SARS-CoV-2抗体。
- 下記(1)~(15):
(1)配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-1;配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:30に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-1;配列番号:2に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:2に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-1としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-1;配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:31に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-1;配列番号:3に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:3に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を軽鎖相補性決定領域3-1としてそれぞれ保持する、抗体;
(2)配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-2;配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:32に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-2;配列番号:4に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:4に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-2としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-2;配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:33に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-2;配列番号:5に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:5に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-2としてそれぞれ保持する、抗体;
(3)配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第19~28位のアミノ酸配列、又は、配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第19~28位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-3;配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第46~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:34に記載のアミノ酸配列の第46~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-3;配列番号:6に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:6に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-3としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-3;配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:35に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-3;配列番号:7に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:7に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を軽鎖相補性決定領域3-3としてそれぞれ保持する、抗体;
(4)配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-4;配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第51~60位のアミノ酸配列、又は、配列番号:36に記載のアミノ酸配列の第51~60位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-4;配列番号:8に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:8に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-4としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-4;配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:37に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-4;配列番号:9に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:9に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-4としてそれぞれ保持する、抗体;
(5)配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-5;配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:38に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-5;配列番号:10に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:10に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-5としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-5;配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:39に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-5;配列番号:11に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:11に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-5としてそれぞれ保持する、抗体;
(6)配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-6;配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:40に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-6;配列番号:12に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:12に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-6としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-6;配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:41に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-6;配列番号:13に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:13に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-6としてそれぞれ保持する、抗体;
(7)配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-7;配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:42に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-7;配列番号:14に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:14に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-7としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第26~31位のアミノ酸配列、又は、配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第26~31位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-7;配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列、又は、配列番号:43に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-7;配列番号:15に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:15に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-7としてそれぞれ保持する、抗体;
(8)配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-8;配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:44に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-8;配列番号:16に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:16に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-8としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-8;配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:45に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-8;配列番号:17に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:17に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-8としてそれぞれ保持する、抗体;
(9)配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-9;配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:46に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-9;配列番号:18に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:18に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-9としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-9;配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:47に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-9;配列番号:19に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:19に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-9としてそれぞれ保持する、抗体;
(10)配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-10;配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:48に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-10;配列番号:20に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:20に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-10としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第27~37位のアミノ酸配列、又は、配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第27~37位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-10;配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第55~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:49に記載のアミノ酸配列の第55~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-10;配列番号:21に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:21に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-10としてそれぞれ保持する、抗体;
(11)配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-11;配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:50に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-11;配列番号:22に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:22に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-11としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第27~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-11;配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:51に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-11;配列番号:23に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:23に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-11としてそれぞれ保持する、抗体;
(12)配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-12;配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列、又は、配列番号:52に記載のアミノ酸配列の第51~57位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-12;配列番号:24に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:24に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-12としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列、又は、配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第27~32位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-12;配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列、又は、配列番号:53に記載のアミノ酸配列の第50~52位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-12;配列番号:25に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:25に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-12としてそれぞれ保持する、抗体;
(13)配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-13;配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第52~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:54に記載のアミノ酸配列の第52~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-13;配列番号:26に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:26に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-13としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-13;配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列、又は、配列番号:55に記載のアミノ酸配列の第51~53位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-13;配列番号:27に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:27に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-13としてそれぞれ保持する、抗体;
(14)配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-14;配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:56に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-14;配列番号:28に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:28に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-14としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列、又は、配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第26~34位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-14;配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列、又は、配列番号:57に記載のアミノ酸配列の第52~54位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-14;配列番号:29に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:29に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-14としてそれぞれ保持する、抗体;
(15)配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列、又は、配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第26~33位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域1-15;配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列、又は、配列番号:65に記載のアミノ酸配列の第51~58位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域2-15;配列番号:63に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:63に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を重鎖相補性決定領域3-15としてそれぞれ保持し、かつ、
配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第23~31位のアミノ酸配列、又は、配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第23~31位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域1-15;配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列、又は、配列番号:66に記載のアミノ酸配列の第49~51位のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域2-15;配列番号:64に記載のアミノ酸配列、又は、配列番号:64に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を軽鎖相補性決定領域3-15としてそれぞれ保持する、抗体;
からなる群から選択されることを特徴とする、請求項1に記載の抗SARS-CoV-2抗体。 - 下記(1)~(15):
(1)配列番号:30に記載のアミノ酸配列、配列番号:30に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:30に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域1を保持し、かつ、配列番号:31に記載のアミノ酸配列、配列番号:31に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:31に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域1を保持する、抗体;
(2)配列番号:32に記載のアミノ酸配列、配列番号:32に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:32に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域2を保持し、かつ、配列番号:33に記載のアミノ酸配列、配列番号:33に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:33に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域2を保持する、抗体;
(3)配列番号:34に記載のアミノ酸配列、配列番号:34に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:34に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域3を保持し、かつ、配列番号:35に記載のアミノ酸配列、配列番号:35に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:35に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域3を保持する、抗体;
(4)配列番号:36に記載のアミノ酸配列、配列番号:36に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:36に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域4を保持し、かつ、配列番号:37に記載のアミノ酸配列、配列番号:37に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:37に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域4を保持する、抗体;
(5)配列番号:38に記載のアミノ酸配列、配列番号:38に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:38に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域5を保持し、かつ、配列番号:39に記載のアミノ酸配列、配列番号:39に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:39に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域5を保持する、抗体;
(6)配列番号:40に記載のアミノ酸配列、配列番号:40に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:40に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域6を保持し、かつ、配列番号:41に記載のアミノ酸配列、配列番号:41に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:41に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域6を保持する、抗体;
(7)配列番号:42に記載のアミノ酸配列、配列番号:42に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:42に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域7を保持し、かつ、配列番号:43に記載のアミノ酸配列、配列番号:43に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:43に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域7を保持する、抗体;
(8)配列番号:44に記載のアミノ酸配列、配列番号:44に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:44に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域8を保持し、かつ、配列番号:45に記載のアミノ酸配列、配列番号:45に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:45に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域8を保持する、抗体;
(9)配列番号:46に記載のアミノ酸配列、配列番号:46に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:46に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域9を保持し、かつ、配列番号:47に記載のアミノ酸配列、配列番号:47に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:47に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域9を保持する、抗体;
(10)配列番号:48に記載のアミノ酸配列、配列番号:48に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:48に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域10を保持し、かつ、配列番号:49に記載のアミノ酸配列、配列番号:49に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:49に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域10を保持する、抗体;
(11)配列番号:50に記載のアミノ酸配列、配列番号:50に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:50に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域11を保持し、かつ、配列番号:51に記載のアミノ酸配列、配列番号:51に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:51に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域11を保持する、抗体;
(12)配列番号:52に記載のアミノ酸配列、配列番号:52に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:52に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域12を保持し、かつ、配列番号:53に記載のアミノ酸配列、配列番号:53に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:53に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域12を保持する、抗体;
(13)配列番号:54に記載のアミノ酸配列、配列番号:54に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:54に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域13を保持し、かつ、配列番号:55に記載のアミノ酸配列、配列番号:55に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:55に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域13を保持する、抗体;
(14)配列番号:56に記載のアミノ酸配列、配列番号:56に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:56に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域14を保持し、かつ、配列番号:57に記載のアミノ酸配列、配列番号:57に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:57に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域14を保持する、抗体;
(15)配列番号:65に記載のアミノ酸配列、配列番号:65に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:65に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む重鎖可変領域15を保持し、かつ、配列番号:66に記載のアミノ酸配列、配列番号:66に記載のアミノ酸配列に対して80%以上の相同性を有するアミノ酸配列、又は、配列番号:66に記載のアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が置換、欠失、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列、を含む軽鎖可変領域15を保持する、抗体;
からなる群から選択されることを特徴とする、請求項1に記載の抗SARS-CoV-2抗体。 - 請求項1~4のうちのいずれか一項に記載の抗体を含有することを特徴とする、COVID-19の予防又は治療用組成物。
- 請求項1~4のうちのいずれか一項に記載の抗体を含有することを特徴とする、SARS-CoV-2を免疫学的に検出するための組成物。
- 請求項1~4のうちのいずれか一項に記載の抗体を用いることを特徴とする、SARS-CoV-2を免疫学的に検出する方法。
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