이하, 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 실시할 수 있도록 본 발명의 실시예에 대하여 상세히 설명한다. 그러나 본 발명은 여러 가지 상이한 형태로 구현될 수 있으며 여기에서 설명하는 실시예에 한정되지 않는다.
제조예 1
하기 단계 A 내지 C 단계를 순차적으로 수행하여 하기 화학식 a인 (4,5-디클로로―2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘을 제조하였다.
[화학식 a]
(1) 단계 A: 2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미디닐-4-올의 제조
에틸 4,4,4-트리플루오로-3-옥소부타노에이트(4.0 g, 21.7 mmol), S-메틸이소티오우레아 반황산염(6.0 g, 43.4 mmol)과 소듐 카보네이트(9.2 g, 86.9 mmol)을 물 50 ml에 녹인 후 상온에서 12시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응 용액에 1N 염산 용액을 0℃에서 서서히 첨가하였다. 생성된 고체를 여과하고 물로 씻어준 후 건조하여 2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미디닐-4-올(2.5 g, 11.9 mmol, 수율 55%)를 수득하였다. 수득한 2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미디닐-4-올은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 2.51 (s, 3H).
(2) 단계 B: 5-클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미디닐-4-올의 제조
상기 단계 A에서 얻어진 2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미디닐-4-올(9.3 g, 44.2 mmol), N-클로로석신이미드(8.9 g, 66.4 mmol)과 아세트산(5.1 ml, 88.0 mmol)을 아세토나이트릴 300 ml에 녹인 후, 80℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 감압증류하여 농축된 5-클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미디닐-4-올 을 수득하고, 별도의 정제 과정 없이 다음 반응에 사용하였다. 또한, 수득한 5-클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미디닐-4-올은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ 2.51 (s, 3H).
(3) 단계 C: 4,5-디클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘의 제조
상기 단계 B에서 얻어진 5-클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미디닐-4-올, 포스포릴 트리클로라이드(20.6 ml, 221 mmol)와 벤질트리에틸암모늄 클로라이드(10.1 g, 44.2 mmol)을 디클로로에탄 200 ml에 녹인 후, 80℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응용액을 감압증류하여 농축하고, 농축액에 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압 농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/10 중량비)로 정제하여 4,5-디클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘(8.63 g, 32.8 mmol, 수율 74%)을 수득하였다. 수득한 4,5-디클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ 2.54 (s, 3H).
제조예 2
하기 단계 A 내지 K 단계를 순차적으로 수행하여 하기 화학식 b인 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘을 제조하였다.
[화학식 b]
(1) 단계 A: 5-(tert-부틸) 1-에틸 2,2-디플루오로펜탄디오에이트의 제조
에틸 2-브로모-2,2-디플루오로아세테이트(20 g, 99 mmol), tert-부틸 아크릴레이트(11.1 ml, 76 mmol), 구리(9.6 g, 152 mmol), N1, N1, N2, N2-테트라메틸에탄-1,2-디아민(5.7 ml, 37.9 mmol)과 아세트산(4.8 ml, 83 mmol)을 테트라하이드로퓨란 100 ml에 녹인 후, 50℃에서 4시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응 용액에 포화 암모늄 클로라이드 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압 농축하여 5-(tert-부틸) 1-에틸 2,2-디플루오로펜탄디오에이트를 수득하였다. 수득한 5-(tert-부틸) 1-에틸 2,2-디플루오로펜탄디오에이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 4.31 (q, J=7.0 Hz, 2H), 2.32-2.47 (m, 4H), 1.43 (s, 9H), 1.34 (t, J=7.3 Hz, 3H).
(2) 단계 B: 5-에톡시-4,4-디플루오로-5-옥소펜타노익산의 제조
상기 단계 A에서 얻어진 5-(tert-부틸) 1-에틸 2,2-디플루오로펜탄디오에이트를 트리플루오로아세트산 (30 ml)과 디클로로메탄(70 ml)에 녹인 후, 상온에서 8시간 교반하였다. 반응이 완료된 후, 감압농축하였다. 농축액에 포화 소듐 바이카보네이트 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 5-에톡시-4,4-디플루오로-5-옥소펜타노익산(15 g, 76 mmol, 수율 100%)을 수득하였다. 수득한 5-에톡시-4,4-디플루오로-5-옥소펜타노익산은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.36 (q, J=7.2 Hz, 2H), 2.66 (t, J=7.6 Hz, 2H), 2.42-2.51 (m, 2H), 1.39 (t, J=7.2 Hz, 3H).
(3) 단계 C: 에틸 2,2-디플루오로-5-하이드록시펜타노에이트의 제조
상기 단계 B에서 얻어진 5-에톡시-4,4-디플루오로-5-옥소펜타노익산(12.0 g, 61 mmol)과 보레인 디메틸설파이드 테트라하이드로퓨란 용액(2M, 36.6 ml. 73 mmol)을 테트라하이드로퓨란 300 ml에 녹인 후, 50℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응용액에 물(10 ml)을 넣고 60℃에서 1시간동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응용액에 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압 농축하여 에틸 2,2-디플루오로-5-하이드록시펜타노에이트(6.5 g, 35.7 mmol, 수율 59%)을 수득하였다. 수득한 에틸 2,2-디플루오로-5-하이드록시펜타노에이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.35 (q, J=7.1 Hz, 2H), 3.74 (t, J=6.3 Hz, 2H), 2.16-2.26 (m, 2H), 1.72-1.81 (m, 2H), 1.38 (t, J=7.2 Hz, 3H).
(4) 단계 D: 에틸 2,2-디플루오로-5-((메탄설포닐)옥시)펜타노에이트의 제조
상기 단계 C에서 얻어진 에틸 2,2-디플루오로-5-하이드록시펜타노에이트(9.4 g, 51.6 mmol), 메탄설포닐 클로라이드(4.42 ml, 56.8 mmol), 디이소프로필에틸아민(18.0 ml, 103 mmol)과 4-디메틸아미노피리딘(315 mg, 2.58 mmol)을 디클로로메탄(200 ml)에 녹인 후, 상온에서 3시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응용액에 N 염산 용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피 (에틸아세테이트/헥산=1/3 중량비)로 정제하여 에틸 2,2-디플루오로-5-((메탄설포닐)옥시)펜타노에이트(13.3 g, 51.1 mmol, 수율 99%)를 수득하였다. 수득한 에틸 2,2-디플루오로-5-((메탄설포닐)옥시)펜타노에이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.37 (q, J=7.1 Hz, 2H), 4.31 (t, J=6.3 Hz, 2H), 3.06 (s, 3H), 2.20-2.29 (m, 2H), 1.99-2.05 (m, 2H), 1.38-1.40 (m, 3H).
(5) 단계 E: 에틸 5-시아노-2,2-디플루오로펜타노에이트의 제조
상기 단계 D에서 제조된 에틸 2,2-디플루오로-5-((메탄설포닐)옥시)펜타노에이트(13.3 g, 51.1 mmol), 포타슘 시아네이트(10,0 g, 153.3 mmol)을 테트라하이드로퓨란 150 ml와 디메틸포름아마이드 150 ml 혼합용액에 녹인 후, 70℃에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응용액을 감압농축하였다. 농축액에 포화 암모늄 클로라이드 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 에틸 5-시아노-2,2-디플루오로펜타노에이트(7.1 g, 37.1 mmol, 수율 73%)를 수득하였다. 수득한 에틸 5-시아노-2,2-디플루오로펜타노에이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.27-4.35 (m, 2H), 2.45 (t, J=7.1 Hz, 2H), 2.15-2.29 (m, 2H), 1.91 (t, 7.1 Hz, 2H), 1.31-1.37 (m, 3H).
(6) 단계 F: 디에틸 2,2-디플루오로헥산디오에이트의 제조
상기 단계 E에서 제조된 에틸 5-시아노-2,2-디플루오로펜타노에이트(7.1 g, 37.7 mmol)와 아세틸클로라이드(30 ml)을 에탄올 60 ml에 녹인 후 48시간 동안 환류하였다. 반응이 완결된 후, 감압농축하였다. 농축액에 포화 소듐 바이카보네이트 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 디에틸 2,2-디플루오로헥산디오에이트(6.5 g, 27.3 mmol, 수율 74%)를 수득하였다. 수득한 디에틸 2,2-디플루오로헥산디오에이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.35 (q. J=7.1 Hz, 2H), 4.16 (q, J=7.1 Hz, 2H), 2.40 (t, J=7.3 Hz, 2H), 2.07-2.20 (m, 2H), 1.86 (m, 2H), 1.38 (t, J=7.2 Hz, 3H), 1.28 (t, J=7.2 Hz, 3H).
(7) 단계 G: 에틸 3,3-디플루오로-2-옥소사이클로펜탄-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 F에서 제조된 디에틸 2,2-디플루오로헥산디오에이트(51.57 g, 216 mmol)를 테트라하이드로퓨란(1000 ml)에 녹인 후 칼륨 tert-부톡사이드(26.7 g, 238 mmol)를 천천히 넣어주고 상온에서 4시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 용액에 1N 염산 수용액 240 ml를 0℃에서 천천히 첨가한 후 10분 정도 교반하였다. 반응물을 에틸아세테이트로 묽힌 후 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어주었다. 수용액을 에틸아세테이트로 추출하고 모은 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압 농축하고 감압상태에서 충분히 건조하여 에틸 3,3-디플루오로-2-옥소사이클로펜탄-1-카르복실레이트(41.6 g, 216 mmol, 수율 99%)를 수득하여 별도의 정제없이 이후 반응에 사용하였다.
(8) 단계 H: 7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-올의 제조
상기 단계 G에서 제조된 에틸 3,3-디플루오로-2-옥소사이클로펜탄-1-카르복실레이트(540 mg, 2.41 mmol), 메틸이소티오우레아 반황산염(672 mg, 4.82 mmol)과 소듐 카보네이트(767 mg, 7.24 mmol)를 물 50 ml에 녹인 후 상온에서 12시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 반응용액에 과량의 물을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압 농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-올(250 mg, 1.15 mmol, 수율 48%)을 수득하였다. 수득한 7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-올은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, DMSO-D6) δ 1.92-1.97 (m, 2H), 1.81 (s, 3H), 1.71-1.79 (m, 2H).
(9) 단계 I: 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘의 제조
상기 단계 H에서 제조된 7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-올(5.2 g, 23.83 mmol), 포스포릴트리클로라이드(22.21 ml, 238 mmol)와 벤질트리에틸암모늄 클로라이드(5.43 g, 23.93 mmol)을 디클로로에탄 150 ml에 녹인 후 80℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액을 감압증류하였다. 농축액에 포화소듐 바이카보네이트 용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/10 중량비)로 정제하여 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(5.00 g, 23.83 mmol, 수율 89%)을 수득하였다. 수득한 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 2.99-3.03 (m, 2H), 2.62-2.71 (m, 5H).
제조예 3
하기 반응을 수행하여 하기 화학식 c의 4-클로로-8,8-디플루오로-2-(메틸티오)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린을 제조하였다.
8,8-디플루오로-2-(메틸티오)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-올(1.5 g, 6.45 mmol), 벤질트리에틸암모늄 클로라이드(1.4 g, 6.45 mmol)을 디클로로에탄 50 ml에 녹인 후, 0℃로 온도를 낮춰주었다. 포스포릴 트리클로라이드(4.95 g, 32.29 mmol)을 첨가하고 90℃로 승온하여 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 반응용액을 감압농축하였다. 과량의 물과 에틸아세테이트를 넣은 후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 하기 화학식 c의 4-클로로-8,8-디플루오로-2-(메틸티오)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린(0.95 g, 3.82 mmol, 수율 59%)를 수득하였다. 수득한 4-클로로-8,8-디플루오로-2-(메틸티오)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 c]
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 2.86-2.68 (m, 2H), 2.69-2.51 (m, 3H), 2.50-2.23 (m, 2H), 2.04 (tt, J=9.4, 3.2 Hz, 2H).
제조예 4
하기 반응을 수행하여 하기 화학식 d의 4-클로로-8,8-디플루오로-2-(메틸티오)-5,8-디하이드로-6H-피라노[3,4-d]피리미딘을 제조하였다.
8,8-디플루오로-2-(메틸티오)-5,8-디하이드로-6H-피라노[3,4-d]피리미딘-4-올(3.13 g, 13.36 mmol), 벤질트리에틸암모늄 클로라이드(3.03 g, 13.36 mmol)을 디클로로에탄 50 ml에 녹인 후, 0℃로 온도를 낮춰주었다. 포스포릴 트리클로라이드(10.24 g, 66.78 mmol)을 첨가하고 90℃로 승온하여 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 반응용액을 감압농축하였다. 과량의 물과 에틸아세테이트를 넣은 후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 하기 화학식 d의 4-클로로-8,8-디플루오로-2-(메틸티오)-5,8-디하이드로-6H-피라노[3,4-d]피리미딘 (2.60 g, 10.29 mmol, 수율 77%)를 수득하였다. 수득한 4-클로로-8,8-디플루오로-2-(메틸티오)-5,8-디하이드로-6H-피라노[3,4-d]피리미딘은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 d]
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.37 (t, J=6.0 Hz, 2H), 3.01-2.87 (m, 2H), 2.60 (s, 3H).
제조예 5
하기 반응을 수행하여 하기 화학식 e의 4-클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘을 제조하였다.
2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미디닐-4-올(44 g, 209 mmol), 포스포릴 트리클로라이드(66 ml, 837 mmol)와 벤질트리에틸암모늄 클로라이드(23.8 g, 104.7 mmol)을 80℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 반응용액을 감압증류하여 농축하였다. 농축액에 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화 소듐 수용액으로 싯어준 후 무수 황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/10 중량비)로 정제하여 하기 화학식 e의 4-클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘(38.9 g, 170 mmol, 수율 81%)을 수득하였다. 수득한 4-클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 e]
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.27 (s, 1H), 2.60 (s, 3H).
제조예 6
하기 단계 A 및 B를 순차적으로 실시하여 하기 화학식 f의 4-클로로-5-메틸-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘을 제조하였다.
[화학식 f]
(1) 단계 A: 5-메틸-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-올의 제조
에틸 4,4,4-트리플루오로-2-메틸-3-옥소부타노에이트(5.0 g, 25.2 mmol), 매틸이소티오우레아 반황산염(7.0 g, 50.3 mmol)과 소듐 카보네이트(5.3 g, 50 mmol)을 물 40 ml에 녹인 후 상온에서 12시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 반응용액에 과량의 물을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수 황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 5-메틸-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-올(4.0 g, 17.8 mmol, 수율 71%)을 수득하였다. 수득한 5-메틸-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-올은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, DMSO-d6) δ 13.29 (s, 1H), 2.49 (s, 3H), 2.03 (s, 3H).
(2) 단계 B: 4-클로로-5-메틸-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘의 제조
상기 제조예 5에 있어서, 2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미디닐-4-올 대신에 상기 단계 A에서 제조된 5-메틸-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-올(18 g, 80 mmol)을 사용하여 표제 화합물인 4-클로로-5-메틸-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘(16.46 g, 67.8 mmol, 수율 84%)을 수득하였다. 수득한 4-클로로-5-메틸-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 2.57 (s, 3H), 2.42 (q, J=1.5 Hz, 3H).
제조예 7
하기 반응을 수행하여 하기 화학식 g의 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 제조하였다.
tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(6.00 g, 32.21 mmol)와 디이소프로필에틸아민(8.32 g, 64.37 mmol)을 디클로로메탄 200 ml에 녹인 후 -78℃로 온도를 낮춰주었다. 브로모아세틸 브로마이드(7.15 g, 35.43 mmol)을 천천히 넣어준 후, 상온상태로 온도를 서서히 높여주며 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 1N 염산 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 하기 화학식 g의 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(6.62 g, 21.5 mmol, 수율 66%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 g]
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 3.87 (s, 2H), 3.77-3.55 (m, 2H), 3.51 (dd, J=16.2, 5.8 Hz, 4H), 3.47-3.32 (m, 2H), 1.49 (d, J=18.3 Hz, 9H).
제조예 8
하기 단계 A 및 B를 순차적으로 수행하여 하기 화학식 h의 tert-부틸 4-(2-(아제티딘-3-일올)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 제조하였다.
[화학식 h]
(1) 단계 A: 벤질 4-(2-((1-tert-부톡시카보닐)아제티딘-3-일올)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
벤질 3-하이드록시아제티딘-1-카르복실레이트(15 g, 72.34 mmol)를 디메틸포름아마이드 200 ml에 녹인 후 0℃로 온도를 낮춰주었다. 수소화나트륨(60%, 3.18 g, 79.57 mmol)을 넣은 후 30분간 교반하였다. tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(26.67 g, 86.81 mmol)을 천천히 넣어준 후 상온상태로 온도를 서서히 높여주며 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 물과 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 벤질 4-(2-((1-tert-부톡시카보닐)아제티딘-3-일올)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(27.61 g, 63.68 mmol, 수율 88%)를 수득하였다. 수득한 벤질 4-(2-((1-tert-부톡시카보닐)아제티딘-3-일올)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, MeOD) δ 7.32 (d, J=16.2 Hz, 5H), 5.07 (s, 2H), 4.38 (d, J=4.6 Hz, 1H), 4.20 (d, J=27.2 Jz. 4H), 3.93 (s, 2H), 3.63-3.49 (m, 2H), 3.43 (s, 6H), 1.64-1.35 (m, 9H).
(2) 단계 B: tert-부틸 4-(2-(아제티딘-3-일올)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 벤질 4-(2-((1-tert-부톡시카보닐)아제티딘-3-일올)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(51.01 g, 117.66 mmol)를 메탄올 300 ml에 녹인 후 팔라듐/차콜(10 wt%, 3 g)을 넣고 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 셀라이트로 여과하고 메탄올로 씻어주었다. 여액을 감압농축하여 tert-부틸 4-(2-(아제티딘-3-일올)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(38.81 g, 129.63 mmol, 수율 110%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(아제티딘-3-일올)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, MeOD) δ 4.48-4.32 (m, 1H), 4.19 (s, 2H), 32.77-3.66 (m, 2H), 3.63 (t, J=7.3 Hz, 2H), 3.55 (s, 2H), 3.50-3.38 (m, 6H), 1.64-1.38 (m, 9H).
제조예 9
제조예 8에 있어서, 단계 A에서 벤질 3-하이드록시아제티딘-1-카르복실레이트 대신에 벤질 4-하이드록시피페리딘-1-카르복실레이트(750 mg, 3.19 mmol)을 사용한 것을 제외하고는 제조예 8의 단계 A 및 B를 순차적으로 실시하여 하기 화학식 i의 tert-부틸 4-(2-(피페리딘-2-4-일올)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(800 mg, 2.44 mmol, 수율 76%)를 제조하였다. 제조된 tert-부틸 4-(2-(피페리딘-2-4-일올)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 i]
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.37-7.28 (m, 5H), 5.14 (s, 2H), 4.61 (s, 2H), 3.82 (m, 2H), 3.59-3.44 (m, 9H), 3.25 (m, 2H), 1.88 (m, 2H), 1.59 (m, 2H), 1.49 (s, 9H).
제조예 10
하기 단계 A 내지 E를 순차적으로 수행하여 하기 화학식 j의 tert-부틸 4-((((1R,5S,6R)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-5-일)메틸)설포닐)피페라진-1-카르복실레이트의 제조하였다.
[화학식 j]
(1) 단계 A: 벤질 (1R,5S,6R)-6-(((메틸설포닐)옥시)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트의 제조
벤질 (1R,5S,6R)-6-(하이드록시메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트(862 mg, 3.49 mmol)을 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후 얼음물을 이용하여 냉각한 후, 트리에틸아민(0.73 ml, 5.23 mmol)을 넣어주었다. 메탄설포닐 클로라이드(0.35 ml, 4.53 mmol)을 천천히 넣어주고 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 물을 넣고 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 벤질 (1R,5S,6R)-6-(((메틸설포닐)옥시)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트(1.174 g, 수율 99%)을 수득하였다. 별도의 정제과정 없이 이후 반응에 사용하였다. 제조된 벤질 (1R,5S,6R)-6-(((메틸설포닐)옥시)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.32-7.40 (m, 5H), 5.13 (d, J=2.1 Hz, 2H), 4.10-4.20 (m, 2H), 3.73 (m, 2H), 3.46-3.50 (m, 2H), 3.04 (s, 3H), 1.66 (s, 2H), 1.12-1.16 (m, 1H).
(2) 단계 B: 벤질 (1R,5S,6R)-6-((아세틸티오)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 벤질 (1R,5S,6R)-6-(((메틸설포닐)옥시)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트(135 mg, 0.145 mmol), 포타슘 티오아세테이트(62 mg, 0.539 mmol)을 아세토나이트릴에 녹인 후 60℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 에틸아세테이트로 추출하고 물과 포화 염화 소듐 용액으로 세척하고 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로토그래피(에틸아세테이트/헥산)로 정제하여 하여 벤질 (1R,5S,6R)-6-((아세틸티오)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트(93 mg, 수율 73%)를 수득하였다. 수득한 벤질 (1R,5S,6R)-6-((아세틸티오)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.27-7.36 (m, 5H), 5.08 (d, J=2.3 Hz, 2H), 3.63 (dd, J=17.8, 11.0 Hz, 2H), 3.38 (t, J=9.1 Hz, 2H), 2.80-2.87 (m, 2H), 2.32 (s, 3H), 1.46 (s, 2H), 0.81-0.86 (m, 1H).
(3) 단계 C: 벤질 (1R,5S,6R)-6-((클로로설포닐)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트의 제조
상기 단계 B에서 제조된 벤질 (1R,5S,6R)-6-((아세틸티오)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트(93 mg, 0.305 mmol)을 아세토나이트릴 10 ml에 녹인 후 0℃로 냉각하였다. N-클로로석신이미드(163 mg, 1.218 mmol)과 1N 염산용액(0.365 ml, 0.365 mmol)을 넣고 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 감압농축하고 에틸아세테이트로 녹인 후 포화 염화 소듐 용액으로 세척하고, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 벤질 (1R,5S,6R)-6-((클로로설포닐)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트(151 mg)을 수득하고, 이를 정제 없이 다음 반응에 사용하였다.
(4) 단계 D: 벤질 (1R,5S,6R)-6-(((4-(tert-부톡시카보닐)피페라진-1-일)설포닐)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트의 제조
상기 단계 C에서 제조된 벤질 (1R,5S,6R)-6-((클로로설포닐)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트(100 mg, 0.303 mmol)을 디클로로메탄 10 ml에 녹인 후 0℃로 냉각하였다. tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(68 mg, 0.364 mmol)와 디이소프로필에틸아민(0.11 ml, 0.606 mmol)을 넣고 상온에서 3시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 디클로로메탄으로 추출하고, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축한 후 컬럼 크로토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 벤질 (1R,5S,6R)-6-(((4-(tert-부톡시카보닐)피페라진-1-일)설포닐)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트(145 mg, 수율 86%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.27-7.37 (m, 5H), 5.09 (m, 2H), 3.70 (dd, J=15.6, 11.0 Hz, 2H), 3.42-3.50 (m, 6H), 3.24 (t, J=5.0 Hz, 4H), 2.88 (m, 2H), 1.58-1.62 (m, 2H), 1.48 (d, J=14.6 Hz, 9H), 0.92-0.97 (m, 1H).
(5) 단계 E: tert-부틸 4-((((1R,5S,6R)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)메틸)설포닐)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 D에서 제조된 벤질 (1R,5S,6R)-6-(((4-(tert-부톡시카보닐)피페라진-1-일)설포닐)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-카르복실레이트(125 mg, 0.261 mmol)을 메탄올 10 ml에 녹인 후 10 wt% 팔라듐/차콜(27 mg, 0.026 mmol)을 넣고 수소기체와 함께 교반하였다. 반응이 완료된 후 셀라이트로 여과하고 감압농축하여 tert-부틸 4-((((1R,5S,6R)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)메틸)설포닐)피페라진-1-카르복실레이트(89 mg, 수율 99%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 3.50 (t, J=5.0 Hz, 4H), 3.25 (t, J=4.8 Hz, 4H), 3.00-3.05 (m, 2H), 2.90 (d, J=7.3 Hz, 4H), 1.59 (br, 2H), 1.46 (s, 9H), 0.90-0.95 (m, 1H).
실시예 1: (S)-2-((1-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 1에서와 같이, 단계 A 내지 D의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-1의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 1]
(1) 단계 A: 1-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-올의 제조
2,4-디클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘(500 mg, 2.30 mmol), 아제티딘-3-올 염산염(252 mg, 2.30 mmol)과 디이소프로필에틸아민(1.2 ml, 6.91 mmol)을 디클로로메탄 50 ml에 녹인 후, 상온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 1N 염산 수용액을 넣은 후 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여과액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 1-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-올(550 mg, 2.17 mmol, 수율 94%)을 수득하고(mass [M+H]=254.6), 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 6.40 (d, J=12.5 Hz, 1H), 4.90 (d, J=4.9 Hz, 1H), 4.63-4.27 (m, 2H), 4.08 (s, 2H), 2.43 (d, J=5.2 Hz, 1H).
(2) 단계 B: (S)-1-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-올의 제조
상기 단계 A에서 제조된 1-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-올(200 mg, 0.78 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트(285 mg, 0.94 mmol)과 트리에틸아민(236 mg, 2.36 mmol)을 아세토나이트릴 10 ml에 녹인 후, 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 상온으로 냉각하고 감압농축하고 에틸아세테이트로 녹인 후 포화 염화 용액으로 세척하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 (S)-1-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-올(219 mg, 0.75 mmol, 수율 96%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 5.84 (d, J=2.4 Hz, 1H), 4.85-4.70 (m, 1H), 4.51-4.37 (m, 1H), 4.37-4.21 (m, 2H), 4.03 (td, J=8.9, 5.0 Hz, 1H), 3.99-3.81 (m, 3H), 2.47-2.30 (m, 1H), 2.23 (d, J=6.1 Hz, 1H), 2.02-1.85 (m, 1H), 1.48 (t, J=5.6 Hz, 3H).
(3) 단계 C: tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 B에서 제조된 (S)-1-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-올(50 mg, 0.17 mmol)을 디메틸포름아마이드 10 ml에 녹인 후 0℃로 냉각하였다. 수소화나트륨(60%, 8 mg, 0.20 mmol)을 넣어준 후 30분 동안 교반하였다. 제조예 7에서 제조된 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(64 mg, 0.21 mmol)을 넣어준 후 상온에서 16시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 에틸아세테이트로 녹인 후 포화 염화 소듐 용액으로 세척하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(29 mg, 0.05 mmol, 수율 21%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 5.84 (d, J=3.1 Hz, 1H), 4.51 (dd, J=10.4, 4.3 Hz, 1H), 4.48-4.36 (m, 1H), 4.32-4.21 (m, 2H), 4.18 (s, 2H), 4.09-3.95 (m, 2H), 3.66-3.57 (m, 2H), 3.55-3.31 (m, 8H), 2.46-2.30 (m, 1H), 2.01-1.85 (m, 1H), 1.49-1.40 (m, 12H).
(4) 단계 D: (S)-2-((1-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 C에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(29 mg, 0.056 mmol)와 트리플루오로아세트산 1 ml를 디클로로메탄 5 ml에 녹이고, 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압건조하고, 에틸아세테이트와 포화 암모늄 수용액을 첨가한 후 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/7N 암모니아 메탄올=10/1 중량비)로 정제하여 (S)-2-((1-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(23 mg, 0.056 mmol, 수율 100%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 5.79 (d, J=2.7 Hz, 1H), 4.59-4.35 (m, 2H), 4.33-4.18 (m, 4H), 4.07-3.83 (m, 4H), 3.64-3.37 (m, 4H), 2.89-2.74 (m, 4H), 2.49-2.32 (m, 1H), 1.96 (d, J=6.4 Hz, 1H), 1.55-1.39 (m, 3H).
실시예 2: (S)-2-((1-(5-클로로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 2에서와 같이, 단계 A 내지 D의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-2의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 2]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-((1-(5-클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
4,5-디클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘(1.0 g, 3.80 mmol), tert-부틸 4-(2-(아제티딘-3-일옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(1.7 g, 5.70 mmol)와 디이소프로필에틸아민(2.0 ml, 11.4 mmol)을 디클로로메탄 100 ml에 녹인 후, 상온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 과량의 물을 넣고 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 포화 염화 수용액으로 씻어준 후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여과액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-((1-(5-클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(1.2 g, 2.28 mmol, 수율 60%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.62 (br, s, 2H), 4.67 (m, 1H), 4.36 (br, s, 2H), 4.18 (s, 2H), 3.58 (br, s, 2H), 3.44 (br, s, 6H), 2.47 (s, 3H), 1.46 (s, 9H).
(2) 단계 B: tert-부틸 4-(2-((1-(5-클로로-2-(메틸설포닐)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((1-(5-클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(1.2 g, 2.28 mmol)와 3-클로로퍼벤조익산(70%, 1.41 g, 5.70 mmol)을 디클로로메탄 100 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 싸이오황산 나트륨 용액과 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 순차적으로 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(메탄올/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-((1-(5-클로로-2-(메틸설포닐)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(1.2 g, 2.28 mmol, 수율 94%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 5.11-4.90 (1H), 4.48-4.53 (m, 2H), 4.21 (s, 2H), 3.58 (s, 2H), 3.39-3.44 (m, 6H), 3.29 (d, J=6.9 Hz, 3H), 1.46 (s, 9H).
(3) 단계 C: tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(5-클로로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((1-(5-클로로-2-(메틸설포닐)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(200 mg, 0.36 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트(253 mg, 0.54 mmol)와 포타슘 카보네이트(149 mg, 1.08 mmol)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 과량의 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(5-클로로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(140 mg, 0.26 mmol, 수율 72%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.59 (m, 2H), 4.45 (m, 2H), 4.26 (m, 2H), 4.19 (s, 2H), 4.01 (m, 1H), 3.03 (m, 1H), 3.61 (s, 2H), 3.48 (br s, 6H), 2.40 (m, 1H), 1.95 (m, 1H), 1.60 (s, 9H), 1.59 (d, 3H).
(4) 단계 D: (S)-4-(2-((1-(5-클로로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 C에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(5-클로로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(140 mg, 0.26 mmol)와 트리플루오로아세트산 1 ml를 디클로로메탄 3 ml에 녹이고, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(7N 암모니아 메탄올 용액/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 (S)-4-(2-((1-(5-클로로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(100 mg, 0.22 mmol, 수율 87%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.50 (d, J=6.4 Hz, 2H), 4.36-4.44 (m, 2H), 4.23 (d, J=10.1 Hz, 2H), 4.16 (s, 2H), 3.86-4.00 (m, 2H), 3.64 (s, 2H), 3.51 (s, 2H), 2.91 (s, 4H), 2.32-2.41 (m, 1H), 1.88-1.96 (m, 1H), 1.46 (t, J=6.4 Hz, 3H).
실시예 3: (S)-2-((1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 3에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-3의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 3]
(1) 단계 A: 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘의 제조
4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(3.00 g, 12.73 mmol), 3-클로로퍼벤조익산(5.51 g, 31.82 mmol)을 디클로로메탄 200 ml에 녹인 후, 상온에서 16시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 포화 싸이오황산 나트륨 용액과 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 순차적으로 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여과액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(3.21 g, 11.94 mmol, 수율 93%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 3.44 (d, J=12.5 Hz, 3H), 3.34-3.11 (m, 2H), 2.88-2.68 (m, 2H).
(2) 단계 B: 1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올의 제조
상기 단계 A에서 제조된 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(348 mg, 1.29 mmol)와 아제티딘-3-올 염산염(156 mg, 1.42 mmol)과 트리에틸아민(393 mg, 3.88 mmol)을 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후, 상온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 1N 염산 수용액을 넣은 후 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(메탄올/디클로로메탄=1/10 중량비)로 정제하여 1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올(257 mg, 0.84 mmol, 수율 65%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.89 (s, 1H), 4.66 (s, 1H), 4.31 (s, 1H), 3.35 (s, 3H), 3.03 (d, J=7.6 Hz, 2H), 2.72-2.55 (m, 2H), 1.37-1.26 (m, 2H).
(3) 단계 C: (S)-1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올의 제조
상기 단계 B에서 제조된 1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올(257 mg, 0.84 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트(306 mg, 1.01 mmol)와 포타슘 카보네이트(348 mg, 2.52 mmol)를 아세토나이트릴 30 ml에 녹인 후 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하고, 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 (S)-1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올(182 mg, 0.61 mmol, 수율 72%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 4.73-4.59 (m, 1H), 4.51-4.33 (m, 3H), 4.00 (td, J=8.7, 4.9 Hz, 3H), 3.88 (dd, J=16.0, 8.7 Hz, 1H), 2.85 (d, J=4.3 Hz, 2H), 2.55-2.30 (m, 3H), 2.01-1.84 (m, 1H), 1.52 (dd, J=48.1, 6.3 Hz, 3H).
(4) 단계 D: tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 C에서 제조된 (S)-1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올(182 mg, 0.61 mmol)을 디메틸포름아마이드 10 ml에 녹인 후 0℃로 냉각시켰다. 수소화나트륨(60%, 30 mg, 0.73 mmol)을 넣어준 후 30분 동안 교반하였다. 제조예 7에서 제조된 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(283 mg, 0.92 mmol)를 첨가한 후 상온에서 16시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하고, 포화 암모늄 클로라이드 수용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=2/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(171 mg, 0.32 mmol, 수율 53%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.58-4.47 (m, 1H), 4.39 (s, 1H), 4.20 (s, 2H), 4.14 (s, 3H), 4.04-3.90 (m, 1H), 3.76-3.56 (m, 2H), 3.48 (s, 8H), 2.80 (d, J=4.3 Hz, 2H), 2.57-2.42 (m, 2H), 2.42-2.29 (m, 1H), 2.01-1.86 (m, 1H), 1.50 (d, J=6.4 Hz, 12H).
(5) 단계 E: (S)-2-((1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 D에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(133 mg, 0.25 mmol)와 트리플루오로아세트산 1ml을 디클로로메탄 5 ml에 녹이고 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하고, 포화 암모늄 클로라이드 수용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/7N 암모니아 메탄올=10/1 중량비)로 정제하여 (S)-2-((1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(68 mg, 0.16 mmol, 수율 63%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 4.52-4.25 (m, 4H), 4.21 (s, 2H), 4.07 (s, 2H), 4.00-3.75 (m, 2H), 3.44 (dt, J=58.6, 4.9 Hz, 4H), 2.85-2.67 (m, 6H), 2.49-2.24 (m, 3H), 1.96-1.79 (m, 1H), 1.42 (d, J=6.4 Hz, 3H).
실시예 4: (S)-2-((1-(8,8-디플루오로-2-(2-(메틸아제티딘-1-일)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 4에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-4의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 4]
(1) 단계 A: 4-클로로-8,8-디플루오로-2-(메틸설포닐)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린의 제조
실시예 3의 단계 A에서 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘 대신에 4-클로로-8,8-디플루오로-2-(메틸티오)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린(89 mg, 0.35 mmol)을 사용한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 A와 동일하게 실시하여 4-클로로-8,8-디플루오로-2-(메틸설포닐)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린을 제조하였다.
(2) 단계 B: 1-(8,8-디플루오로-2-(메틸설포닐)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-올의 제조
실시예 3의 단계 B에서 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘 대신에 상기 단계 A에서 제조된 4-클로로-8,8-디플루오로-2-(메틸설포닐)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린을 아제티딘-3-올 염산염(41 mg, 0.38 mmol)과 반응시킨 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 B와 동일하게 실시하여 1-(8,8-디플루오로-2-(메틸설포닐)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-올을 제조하였다.
(3) 단계 C: (S)-1-(8,8-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-올의 제조
상기 실시예 3의 단계 C에서, 1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올 대신에 상기 단계 B에서 제조된 1-(8,8-디플루오로-2-(메틸설포닐)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-올을 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트(105 mg, 0.41 mmol)와 반응시킨 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 C와 동일하게 실시하여 (S)-1-(8,8-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-올을 제조하였다.
(4) 단계 D: tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(8,8-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 실시예 3의 단계 D에서 (S)-1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올 대신에 상기 단계 C에서 제조된(S)-1-(8,8-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-올을 제조예 7에서 제조된 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(105 mg, 0.34 mmol)와 반응시킨 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 D와 동일하게 실시하여 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(8,8-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 제조하였다.
(5) 단계 E: (S)-2-((1-(8,8-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 실시예 3의 단계 E에서 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트 대신에 상기 단계 D에서 제조된tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(8,8-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 사용한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 E와 동일하게 실시하여 (S)-2-((1-(8,8-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(73 mg, 0.13 mmol, 수율 39%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 4.49-4.30 (m, 4H), 4.24 (s, 2H), 4.19-4.01 (m, 2H), 4.02-3.92 (m, 1H), 3.85 (q, J=8.3 Hz, 1H), 3.63-3.50 (m, 2H), 3.43 (t, J=4.9 Hz, 2H), 2.89-2.73 (m, 4H), 2.55 (s, 2H), 2.43-2.31 (m, 1H), 2.31-2.10 (m, 2H), 2.00-1.89 (m, 1H), 1.85 (q, J=6.1 Hz, 2H), 1.55-1.37 (m, 3H).
실시예 5: 2-(((2S,3R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 5에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-5의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 5]
(1) 단계 A: 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘의 제조
실시예 3의 단계 A에서 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘을 94 mg, 0.40 mmol로 사용한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 A와 동일하게 실시하여 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘을 제조하였다.
(2) 단계 B: (2S)-1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)- 6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-올의 제조
실시예 3의 단계 B에서 아제티딘-3-올 염산염 대신에 (2S,3R)-2-메틸아제티딘-3-올(7,7-디메틸-2-옥소바이사이클[2.2.1]헵탄-1-일)메탄술포네이트(142 mg, 0.44 mmol)을 사용한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 B와 동일하게 실시하여 (2S)-1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-올을 제조하였다.
(3) 단계 C: (2S)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-올의 제조
상기 실시예 3의 단계 C에서, 1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올 대신에 상기 단계 B에서 제조된 (2S)-1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-올을 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)- 7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트(134 mg, 0.44 mmol)와 반응시킨 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 C와 동일하게 실시하여 (2S)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-올을 제조하였다.
(4) 단계 D: tert-부틸 4-(2-(((2S)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 실시예 3의 단계 D에서 (S)-1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올 대신에 상기 단계 C에서 제조된 (2S)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-올을 제조예 7에서 제조된 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(149 mg, 0.48 mmol)와 반응시킨 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 D와 동일하게 실시하여 tert-부틸 4-(2-(((2S)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 제조하였다.
(5) 단계 E: 2-(((2S,3R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페리진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 실시예 3의 단계 E에서 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트 대신에 상기 단계 D에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(((2S)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 사용한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 E와 동일하게 실시하여 2-(((2S,3R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-메틸아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페리진-1-일)에탄-1-온(59 mg, 0.13 mmol, 수율 32%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 4.52-4.35 (m, 3H), 4.35-4.19 (m, 2H), 4.13-3.96 (m, 3H), 3.89 (q, J=8.2 Hz, 1H), 3.54 (d, J=4.3 Hz, 2H), 3.44 (s, 2H), 2.95-2.86 (m, 1H), 2.86-2.70 (m, 5H), 2.54-2.30 (m, 3H), 2.01-1.86 (m, 1H), 1.59-1.50 (m, 3H), 1.47 (dd, J=14.8, 6.3 Hz, 3H).
실시예 6: 2-(((S)-1-(2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 6에서와 같이, 단계 A 내지 D의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-6의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 6]
(1) 단계 A: 1-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올의 제조
상기 실시예 1의 단계 A에서 2,4-디클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘(45 mg, 0.17 mmol)을 아제티딘-3-올 염산염 대신에 (S)-피롤리딘-3-올(14 mg, 0.17 mmol)과 반응시킨 것을 제외하고는 실시예 1의 단계 A와 동일하게 실시하여 1-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올을 제조하였다.
(2) 단계 B: 1-(2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리디민-4-일)피롤리딘-3-올의 제조
상기 실시예 1의 단계 B에서 1-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-올 대신에 상기 단계 A에서 제조된 1-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올을 (S)-2-메틸아제티딘(7,7-디메틸-2-옥소바이사이클[2.2.1]헵탄-1-일)메탄술포네이트(62 mg, 0.20 mmol)과 반응시킨 것을 제외하고는 상기 실시예 1의 단계 B와 동일하게 실시하여 1-(2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리디민-4-일)피롤리딘-3-올을 제조하였다.
(3) 단계 C: tert-부틸 4-(2-((1-(2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 실시예 1의 단계 C에서 (S)-1-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-올 대신에 상기 단계 B에서 제조된 1-(2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리디민-4-일)피롤리딘-3-올을 제조예 7에서 제조된 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(61 mg, 0.19 mmol)과 반응시킨 것을 제외하고는 실시예 1의 단계 C와 동일하게 실시하여 tert-부틸 4-(2-((1-(2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트을 제조하였다.
(4) 단계 D: 2-(((S)-1-(2-((s)-2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 실시예 1의 단계 D에서 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트 대신에 상기 단계 C에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((1-(2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트을 사용한 것을 제외하고는 실시예 1의 단계 D와 동일하게 실시하여 2-(((S)-1-(2-((s)-2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(28 mg, 0.07 mmol, 수율 41%)을 제조하였으며, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 5.96 (s, 1H), 4.52-4.36 (m, 1H), 4.28 (s, 1H), 4.18 (s, 2H), 4.10-3.86 (m, 2H), 3.67-3.35 (m, 7H), 2.84 (d, J=4.1 Hz, 4H), 2.46-2.29 (m, 1H), 2.30-1.85 (m, 3H), 1.72 (s, 1H), 1.56-1.41 (m, 3H).
실시예 7: 2-(((2S,3R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 7에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-7의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 7]
(1) 단계 A: 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘의 제조
실시예 3의 단계 A에서 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘을 141 mg, 0.60 mmol로 사용한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 A와 동일하게 실시하여 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘을 제조하였다.
(2) 단계 B: 1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)- 6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올의 제조
실시예 3의 단계 B에서 아제티딘-3-올 염산염 대신에 (S)-피롤리딘-3-올(53 mg, 0.61 mmol)을 사용한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 B와 동일하게 실시하여 1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올을 제조하였다.
(3) 단계 C: 1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸설포닐-1-일)- 6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올의 제조
상기 실시예 3의 단계 C에서, 1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올 대신에 상기 단계 B에서 제조된 1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올을 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트(203 mg, 0.67 mmol)와 반응시킨 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 C와 동일하게 실시하여 1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸설포닐-1-일)- 6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올을 제조하였다.
(4) 단계 D: tert-부틸 4-(2-((1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 실시예 3의 단계 D에서 (S)-1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-올 대신에 상기 단계 C에서 제조된 1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸설포닐-1-일)- 6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올을 제조예 7에서 제조된 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(204 mg, 0.66 mmol)와 반응시킨 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 D와 동일하게 실시하여 tert-부틸 4-(2-((1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 제조하였다.
(5) 단계 E: 2-(((S)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)옥시)-1-(피페리진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 실시예 3의 단계 E에서 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트 대신에 상기 단계 D에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-올)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 사용한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 E와 동일하게 실시하여 2-(((S)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)옥시)-1-(피페리진-1-일)에탄-1-온(93 mg, 0.17 mmol, 수율 28%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 4.41 (q, J=6.5 Hz, 1H), 4.25 (q, J=13.6 Hz, 3H), 4.07-3.56 (m, 6H), 3.48 (dt, J=36.5, 4.7 Hz, 4H), 3.09 (d, J=23.2 Hz, 2H), 2.86-2.68 (m, 4H), 2.53-2.29 (m, 3H), 2.17 (s, 1H), 2.04 (s, 1H), 1.97-1.89 (m, 1H), 1.48 (d, J=6.4 Hz, 3H).
실시예 8: 2-(((R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 실시예 7에서, 단계 B에서 (S)-피롤리딘-3-올 대신에 (R)-피롤리딘-3-올 염산염(75 mg, 0.61 mmol)을 사용하고, 단계 C에서 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트를 188 mg, 0.62 mmol로 사용하고, 단계 D에서 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 194 mg, 0.63 mmol로 사용하여 반응을 실시한 것을 제외하고는 실시예 7과 동일하게 실시하여 화학식 1-7의 화합물의 이성질체인 화학식 1-8의 표제 화합물(108 mg, 0.25 mmol, 수율 41%)을 제조하였다.
[화학식 1-8]
1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 4.40 (q, J=6.5 Hz, 1H), 4.24 (q, J=14.0 Hz, 3H), 4.07-3.59 (m, 6H), 3.58-3.38 (m, 4H), 3.08 (dd, J=33.9, 15.0 Hz, 2H), 2.86-2.68 (m, 4H), 2.53-2.29 (m, 3H), 2.17 (s, 1H), 2.03 (d, J=8.8 Hz, 1H), 1.97-1.85 (m, 1H), 1.48 (d, J=6.1 Hz, 3H).
실시예 9: 2-((R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온)의 제조
하기 반응식 8에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-9의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 8]
(1) 단계 A: 에틸 (R)-2-(1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜다[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세테이트의 제조
실시예 3의 단계 A에서 제조된 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(100 mg, 0.37 mmol)과 에틸 (R)-2-(피롤리딘-3-일)아세테이트 염산염(86 mg, 0.44 mmol), 트리에틸아민(113 mg, 1.11 mmol)을 디클로로메탄 10ml에 녹인 후 상온에서 16시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하고 1N 염산 수용액을 첨가한 후 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 (R)-2-(1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜다[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세테이트(129 mg, 0.33 mmol, 수율 89%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.28-4.06 (m, 2H), 4.08-3.62 (m, 3H), 3.59-3.34 (m, 1H), 3.31 (d, J=11.3 Hz, 3H), 3.30-3.17 (m, 2H), 2.73 (s, 1H), 2.64-2.49 (s, 3H), 2.49-2.14 (m, 2H), 1.82-1.58 (m, 1H), 1.37-1.23 (m, 3H).
(2) 단계 B: 에틸 2-((R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세테이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 (R)-2-(1-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜다[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세테이트(129 mg, 0.33 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트(120 mg, 0.39 mmol)와 포타슘 카보네이트(137 mg, 0.99 mmol)를 아세토나이트릴 10 ml에 녹인 후, 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 감압농축액에 포화 염소 소듐 수용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 에틸 2-((R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세테이트(103 mg, 0.27 mmol, 수율 81%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.28-4.32 (m, 1H), 4.24-4.08 (m, 2H), 4.06-3.99 (m, 1H), 3.95 (q, J=8.2 Hz, 2H), 3.87-3.69 (m, 1H), 3.62 (q, J=8.7 Hz, 1H), 3.37-3.22 (m, 1H), 3.13-2.93 (m, 2H), 2.71-2.54 (m, 1H), 2.53-2.37 (m, 4H), 2.16 (dd, J=10.8, 4.7 Hz, 1H), 2.01-1.84 (m, 1H), 1.63 (dt, J=20.5, 8.7 Hz, 1H), 1.49 (d, J=6.1 Hz, 3H), 1.24 (dt, J=30.2, 7.0 Hz, 3H).
(3) 단계 C: S-((R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세트산의 제조
상기 단계 B에서 제조된 에틸 2-((R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세테이트(103 mg, 0.27 mmol)와 리튬 하이드라이드 모노하이드레이트(45 mg, 1.08 mmol)를 테트라하이드로퓨란/물/메탄올(4/1/1 중량비, 24 ml) 혼합액에 녹인 후 상온에서 16시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 1N 염산용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/메탄올=20/1 중량비)로 정제하여 S-((R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세트산(75 mg, 0.21 mmol, 수율 78%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 4.42 (td, J=13.3, 6.7 Hz, 1H), 4.12-3.92 (m, 2H), 3.92-3.55 (m, 3H), 3.34 (s, 1H), 3.19-2.99 (m, 2H), 2.59 (q, J=7.4 Hz, 1H), 2.53-2.41 (m, 4H), 2.41-2.29 (m, 1H), 2.17 (d, J=5.8 Hz, 1H), 2.03-1.84 (m, 1H), 1.66 (dd, J=19.1, 9.0 Hz, 1H), 1.55-1.40 (m, 3H).
(4) 단계 D: tert-부틸 4-(2-((R)-1-(7,7- 디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 C에서 제조된 S-((R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세트산(75 mg, 0.21 mmol), N-[(디메틸아미노)-1H-1,2,3-트리아졸-[4-5-b]피리딘-1-일메틸렌]-N-메틸메탄아미니움 헥사플루우로포스페이트 N-옥사이드(121 mg, 0.31 mmol), tert-부틸 페피라진-1-카르복실레이트(59 mg, 0.31 mmol)와 N,N-디이소프로필에틸아민(82 mg, 0.63 mmol)을 디메틸포름아마이드 10 ml에 녹인 후 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하고, 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/메탄올=20/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-((R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(109 mg, 0.20 mmol, 수율 98%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.41 (dd, J=13.9, 6.3 Hz, 1H), 4.05 (td, J=8.7, 4.6 Hz, 1H), 3.96 (q, J=8.2 Hz, 2H), 3.78 (s, 1H), 3.62 (d, J=21.4 Hz, 3H), 3.53-3.34 (m, 6H), 3.34-3.23 (m, 1H), 3.12-2.98 (m, 2H), 2.76-2.63 (m, 1H), 2.54-2.26 (m, 6H), 2.16 (d, J=47.0 Hz, 1H), 2.01-1.84 (m, 1H), 1.71-1.55 (m, 1H), 1.55-1.30 (m, 12H).
(5) 단계 E: 2-((R)-1-(7,7- 디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 D에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((R)-1-(7,7- 디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(109 mg, 0.20 mmol)와 트리플루오로아세트산 1 ml를 디클로로메탄 10 ml에 녹이고, 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하고, 포화 암모늄 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/7N 암모니아 메탄올=10/1 중량비)로 정제하여 2-((R)-1-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피롤리딘-3-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(80 mg, 0.19 mmol, 수율 90%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 4.39 (q, J=6.7 Hz, 1H), 3.99 (td, J=8.7, 4.7 Hz, 2H), 3.87 (t, J=8.1 Hz, 1H), 3.84-3.60 (m, 1H), 3.60-3.45 (m, 4H), 3.15-2.98 (m, 2H), 2.79 (dt, J=18.4, 5.0 Hz, 4H), 2.67-2.49 (m, 3H), 2.48-2.27 (m, 3H), 2.15 (s, 1H), 1.91 (dd, J=17.2, 7.5 Hz, 1 H), 1.65 (s, 1H), 1.53-1.39 (m, 3H).
실시예 10: (S)-2-((1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-4-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 9에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-10의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 9]
상기 실시예 9에서, 단계 A에서 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘을 200 mg, 0.74 mmol로 사용하고, 에틸 (R)-2-(피롤리딘-3-일)아세테이트 염산염 대신에 에틸 2-(피페리딘-4-일옥시)아세테이트 염산염(251 mg, 1.12 mmol)을 사용하고, 단계 B에서 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트를 302 mg, 0.64 mmol로 사용하여 반응을 실시한 것을 제외하고는 실시예 9와 동일하게 단계 A 내지 단계 E를 순차적으로 실시하여 화학식 1-10의 표제 화합물(110 mg, 0.24 mmol, 수율 33%)을 제조하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.40 (q, J=6.9 Hz, 1H), 4.18 (s, 2H), 3.91-4.07 (m, 4H), 3.67 (td, J=7.9, 4.0, 1H), 3.57 (t, J=4.8 Hz, 2H), 3.50 (t, J=5.0 Hz, 2H), 3.31-3.38 (m, 2H), 2.83-2.91 (m, 6H), 2.31-2.49 (m, 3H), 1.88-1.96 (m, 3H), 1.61 (m, 2H), 1.47 (d, J=5.9 Hz, 3H).
실시예 11: (S)-2-(4-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피페라진-1-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 10에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-11의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 10]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-클로로-6-(트리플루오로)피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
2,4-디클로로-6-(트리플루오로)피리미딘(5 g, 23.04 mmol), tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(4.3 g, 23.04 mmol)와 디이소프로필에틸아민(12 ml, 69.12 mmol)을 디클로로메탄 200 ml에 녹인 후, 상온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 1N 염산 수용액을 넣은 후 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 tert-부틸 4-(2-클로로-6-(트리플루오로)피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트(7.28 g, 19.84 mmol, 수율 86%)fmf 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 6.71 (s, 1H), 3.78 (s, 4H), 3.56 (s, 4H), 1.49 (s, 9H).
(2) 단계 B: tert-부틸 (S)-4-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(2-클로로-6-(트리플루오로)피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트(7.28 g, 19.84 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트(7.23 g, 23.81 mmol)와 포타슘 카보네이트(8.23 g, 59.52 mmol)를 아세토나이트릴 300 ml에 녹인 후, 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 상온으로 냉각하고, 감암농축하고 에틸아세테이트로 녹인 후 포화 염화 용액으로 세척하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트(7.48 g, 18.63 mol, 수율 93%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 6.15 (s, 1H), 4.45 (td, J=13.0, 6.5 Hz, 1H), 4.12-3.87 (m, 2H), 3.61 (s, 4H), 3.50 (d, J=4.6 Hz, 4H), 2.49-2.31 (m, 1H), 2.03-1.86 (m, 1H), 1.53-1.30 (m, 12H).
(3) 단계 C: (S)-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-4-(피페라진-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트(7.48 g, 18.63 mmol)와 트리플루오로아세트산 14 ml를 디클로로메탄 10 ml에 녹인 후 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하고, 포화 암모늄 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 (S)-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-4-(피페라진-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘(5.6 g, 18.63 mmol, 수율 100%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 6.18 (s, 1H), 4.50 (s, 1H), 4.21-3.94 (m, 2H), 3.89 (d, J=4.0 Hz, 4H), 3.29-3.16 (m, 4H), 2.55-2.36 (m, 1H), 2.02-1.88 (m, 1H), 1.51 (d, J=6.4 Hz, 3H).
(4) 단계 D: tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피페라진-1-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 C에서 제조된 (S)-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-4-(피페라진-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘(5.6 g, 18.63 mmol)을 디메틸포름아마이드 100 ml에 녹인 후 포타슘 카보네이트(6.86 g, 22.36 mmol)을 넣어준 후, 제조예 7에서 제조된 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(7.72 g, 55.89 mmol)을 첨가하고 상온에서 16시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하고, 에틸아세테이트로 녹인 후 포화 염화 소듐 용액으로 세척하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피페라진-1-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(10.22 g, 19.37 mmol, 수율 104%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 6.15 (s, 1H), 4.44 (q, J=6.5 Hz, 1H), 4.03 (dd, J=13.7, 8.8 Hz, 1H), 3.95 (q, J=8.2 Hz, 1H), 3.61 (d, J=28.4 Hz, 8H), 3.44 (d, J=22.3 Hz, 4H), 3.25 (d, J=12.8 Hz, 2H), 2.56 (s, 4H), 2.39 (dd, J=23.7, 9.3 Hz, 1H), 1.93 (dd, J=17.5, 8.4 Hz, 1H), 1.53-1.42 (m, 12H).
(5) 단계 E: ((S)-2-(4-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피페라진-1-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 D에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피페라진-1-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(10.22 g, 19.37 mmol)와 트리플루오로아세트산 4 ml를 디클로로메탄 20 ml에 녹이고, 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하고, 에틸아세테이트와 포화 암모늄 수용액을 첨가한 후 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/7N 암모니아 메탄올=10/1 중량비)로 정제하여 ((S)-2-(4-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피페라진-1-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(8.28 g, 19.37 mmol, 수율 100%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, MeOH-d4) δ 6.35 (s, 1H), 4.42 (d, J=7.3 Hz, 1H), 4.05-3.85 (m, 2H), 3.69 (s, 4H), 3.64-3.49 (m, 4H), 3.27 (s, 2H), 2.81 (dt, J=24.9, 5.0 Hz, 4H), 2.55 (t, J=5.0 Hz, 4H), 2.40 (s, 1H), 1.95 (s, 1H), 1.54-1.41 (m, 3H).
실시예 12: (S)-4-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)-1-(2-옥소-2-(피페라진-1-일)에틸)피페라진-2-온의 제조
하기 반응식 11에서와 같이 단계 A 내지 단계 D의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-12의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 11]
상기 실시예 1에서, 단계 A에서 2,4-디클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘을 104 mg, 0.48 mmol로 사용하고, 아제티딘-3-올 염산염 대신에 피페라진-2-온(48 mg, 0.48 mmol)을 사용하고, 단계 B에서 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트를 181 mg, 0.59 mmol로 사용하고, 단계 C에서 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 166 mg, 0.54 mmol로 사용하여 반응을 실시한 것을 제외하고는 실시예 1과 동일하게 단계 A 내지 단계 D를 순차적으로 실시하여 화학식 1-13의 표제 화합물(71 mg, 0.16 mmol, 수율 34%)을 제조하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, MeOH-d4) δ 6.38 (s, 1H), 4.60-4.41 (m, 1H), 4.34 (d, J=11.6 Hz, 4H), 3.95 (s, 4H), 3.61-3.43 (m, 6H), 2.92-2.75 (m, 4H), 2.47-2.37 (m, 1H), 2.02-1.84 (m, 1H), 1.50 (d, J=6.1 Hz, 3H).
실시예 13: (S)-2-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-1-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 12에서와 같이 단계 A 내지 단계 F 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-13의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 12]
상기 반응식 12에서 단계 A 및 B는 실시예 2의 단계 A 및 B에 따라 실시하고, 상기 반응식 12에서 단계 C 내지 단계 F는 상기 실시예 11의 단계 B 내지 E에 따라 실시하였다.
구체적으로, 실시예 2의 단계 A 및 단계 B에서 4,5-디클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘 대신에 4-클로로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘을 20 mg, 0.07 mmol로, tert-부틸 4-(2-(아제티딘-3-일옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트 대신에 tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트를 15 mg, 0.11 mmol로 사용한 것을 제외하고는 동일하게 하여 상기 반응식 12에서의 단계 A 및 단계 B를 실시하고, 이후 실시예 11의 단계 B 내지 단계 E를 연속적으로 수행하되, 단계 B에서 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트를 25 mg, 0.08 mmol로, 단계 D에서 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 18 mg, 0.12 mmol로 사용한 것을 제외하고는 동일하게 하여 반응식 12에서의 단계 C 내지 단계 F를 실시하여 화학식 1-13의 표제 화합물을(29 mg, 0.06 mmol, 수율 95%)을 제조하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, MeOH-d4) δ 4.48-4.33 (m, 1H), 4.01 (td, J=8.7, 4.8 Hz, 1H), 3.89 (q, J=8.2 Hz, 1H), 3.78 (t, J=4.7 Hz, 4H), 3.58 (dt, J=23.8, 4.9 Hz, 4H), 3.26 (s, 2H), 2.96 (s, 2H), 2.82 (dt, J=26.5, 4.9 Hz, 4H), 2.57 (t, J=4.7 Hz, 4H), 2.53-2.32 (m, 3H), 1.94 (dd, J=19.1, 7.2 Hz, 1H), 1.55-1.40 (m, 3H).
실시예 14: (S)-2-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜사[d]피리미딘-1-일)-1-(피페라진-1-일)모폴리노에탄-1-온의 제조
하기 반응식 13에서와 같이, 단계 A 내지 단계 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-14의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 13]
상기 반응식 13에서 단계 A 내지 단계 E는 실시예 13의 단계 A 내지 단계 E에 따라 실시하였다.
구체적으로, 실시예 13의 단계 A에서 4-클로로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘을 10 mg, 0.04 mmol로, tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트를 8 mg, 0.06 mmol로 사용하고, 단계 C에서 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트를 12 mg, 0.04 mmol로 사용하고, 단계 D에서 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트 대신에 2-브로모-1-모폴리노에탄-1-온(10 mg, 0.05 mmol)을 사용하여 반응을 실시한 것을 제외하고는 실시예 13과 동일하게 단계 A 내지 단계 E를 순차적으로 실시하여 화학식 1-14의 표제 화합물(10 mg, 0.02 mmol, 수율 50%)을 제조하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, MeOH-d4) δ 4.41 (q, J=6.8 Hz, 1H), 4.01 (td, J=8.8, 4.9 Hz, 1H), 3.89 (q, J=8.2 Hz, 1H), 3.78 (t, J=4.9 Hz, 4H), 3.73-3.61 (m, 6H), 3.57 (t, J=4.6 Hz, 2H), 3.27 (s, 2H), 2.96 (d, J=3.1 Hz, 2H), 2.64-2.53 (m, 4H), 2.53-2.31 (m, 3H), 2.02-1.85 (m, 1H), 1.47 (d, J=6.1 Hz, 3H).
실시예 15: (S)-1-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-(피페라진-1-일)프로판-1,3-디온의 제조
하기 반응식 14에서와 같이 단계 A 내지 단계 D의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-15의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 14]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(385 mg, 1.433 mmol), tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(294 mg, 1.576 mmol)와 트리에틸아민(0.3 ml, 2.150 mmol)을 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 디클로로메탄과 물을 넣어 추출하였다. 유기층을 무수 황산 마그네슘으로 건조 후 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트(555.8 mg, 수율 93%)를 수득하고, 1H NMR로 분석하여 합성된 것을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 3.88 (t, J=5.3 Hz, 4H), 3.55 (t, J=5.3 Hz, 4H), 3.33 (s, 3H), 3.11-3.14 (m, 2H), 2.59 (dt, J=21.0, 7.5 Hz, 2H), 1.47 (s, 9H).
(2) 단계 B: tert-부틸 (S)-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트(555 mg, 1.326 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트(443 mg, 1.459 mmol)와 포타슘 카보네이트(458 mg, 3.32 mmol)를 아세토나이트릴 50 ml에 녹인 후 80℃에서 6시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 에틸아세테이트와 물을 넣고 추출하였다. 유기층을 무수 황산 마그네슘으로 건조 후 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(0~50% 에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)으로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트(395 mg, 수율 72%)를 수득하고, 1H NMR로 분석하여 합성된 것을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.42 (dd, J=14.2, 5.9 Hz, 1H), 4.05 (td, J=8.7, 4.6 Hz, 1H), 3.96 (q, J=8.2 Hz, 1H), 3.66 (t, J=5.3 Hz, 4H), 3.47 (t, J=5.3 Hz, 4H), 2.88-2.91 (m, 2H), 2.33-2.51 (m, 3H), 1.89-1.97 (m, 1H), 1.47-1.49 (m, 12H).
(3) 단계 C: (S)-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-4-(피페라진-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘의 제조
단계 B에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페라진-1-카르복실레이트(390 mg, 0.952 mmol)을 디클로로메탄 12 ml에 녹인 후 트리플루오로아세트산 3 ml를 넣고 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액을 감압농축하였다. 농축액을 디클로로메탄에 녹인 후 포화 소듐 바이카보네이트로 중화 후 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산 마그네슘으로 건조 후 여과하였다. 여액을 감압농축하여 (S)-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-4-(피페라진-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(308 mg)을 얻어 분리정제없이 다음 반응에 사용하였다.
(4) 단계 D: (S)-3-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페라진-1-일)-3-(피페라진-1-일)프로판-1,3-디온의 제조
단계 C에서 제조된 (S)-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-4-(피페라진-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(106 mg, 0.343 mmol), 3-(4-(tert-부톡시카보닐)피페라진-1-일)-3-옥소프로파노익산(103 mg, 0.377 mmol)과 트리에틸아민(0.096 ml, 0.685 mmol)을 디클로로메탄 10 ml에 녹인 후 프로필포스포닉 언하이드라이드(50 wt%, 0.255 ml, 0.428 mmol)을 넣고 상온에서 4시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 디클로로메탄과 물을 넣고 추출하였다. 유기층을 무수 황산 마그네슘으로 건조 후 여과하였다. 여액을 감압농축하여 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 tert-부틸 (S)-3-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페라진-1-일)-3-옥소프로파노일)피페라진-1-카르복실레이트(122 mg, 수율 63%)를 얻었다.
제조된 tert-부틸 (S)-3-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페라진-1-일)-3-옥소프로파노일)피페라진-1-카르복실레이트와 트리플루오로아세트산 1ml을 디클로로메탄 4 ml에 녹인 후 상온에서 3시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 감압농축하였다. 농축액에 포화 소듐 바이카보네이트 수용액으로 중화 후 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 무수 황산 마그네슘으로 건조 후 여과하였다. 여액을 감압농축하여 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 (S)-(3-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페라진-1-일)-3-(피페라진-1-일)프로판-1,3-디온(88 mg, 수율 88%)를 수득하고, 1H NMR로 분석하여 합성된 것을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.38-4.43 (m, 1H), 4.02-4.06 (m, 1H), 3.95 (q, J=8.2 Hz, 1H), 3.74 (m, 2H), 3.68 (m, 6H), 3.60 (m, 4H), 3.55 (s, 2H), 2.85-2.90 (m, 6H), 2.55 (s, 1H), 2.41-2.49 (m, 2H), 2.34-2.39 (m, 1H), 1.90-1.97 (m, 1H), 1.48 (d, J=6.1 Hz, 3H).
실시예 16: (S)-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-1-(2-옥소-2-(피페라진-1-일)에틸)피페라진-2-온의 제조
[반응식 15]
상기 실시예 3의 단계 B 내지 단계 E를 적용하여, 상기 반응식 15에 따라 화학식 1-16의 표제 화합물을 제조하였다.
(1) 단계 A
실시예 3의 단계 B에서, 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(100 mg, 0.37 mmol)을 사용하고 아제티딘-3-올 염산염 대신에 피페라진-2-온(224 mg, 2.23 mmol)을 사용한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 B와 동일하게 실시하였다.
(2) 단계 B
실시예 3의 단계 C에서 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트 대신에 (S)-2-메틸아제티딘(7,7-디메틸-2-옥소바이사이클[2.2.1]헵탄-1-일)메탄술포네이트(209 mg, 0.45 mmol)을 사용한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 C와 동일하게 실시하였다.
(3) 단계 C
실시예 3의 단계 D에서 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 125 mg, 0.41 mmol로 사용하여 반응을 실시한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 D와 동일하게 실시하였다.
(4) 단계 D
실시예 3의 단계 E에서 tert-부틸 (S)-4-(2-((1-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트 대신에 상기 단계 C에서 제조된 화합물을 사용한 것을 제외하고는 실시예 3의 단계 E와 동일하게 실시하여 화학식 1-16의 표제 화합물(25 mg, 0.06 mmol, 수율 15%)을 제조하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.40-4.45 (m, 1H), 4.32-4.38 (m, 2H), 4.22 (s, 2H), 4.06 (m, 1H), 3.93-4.01 (m, 3H), 3.60 (t, J=5.0 Hz, 2H), 3.53 (t, J=5.3 Hz, 2H), 3.45 (t, J=4.8 Hz, 2H), 3.93-2.98 (m, 2H), 2.89 (td, J=9.4, 4.3 Hz, 4H), 2.34-2.51 (m, 3H), 1.89-1.97 (m, 1H), 1.48 (d, J=6.4 Hz, 3H).
실시예 17: (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페피리딘-1-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 16에서와 같이 단계 A 내지 단계 G의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-17의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 16]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3,6-디하이드로피리딘-1(2H)-카르복실레이트의 제조
4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(577 mg, 2.438 mmol), tert-부틸 4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤란-2-일)-3,6-디하이드로피리딘-1(2H)-카르복실레이트(1131 mg, 3.66 mmol), 테트라키스(트리페닐포스핀)팔라듐(O)(141 mg, 0.122 mmol)과 2M 소듐 카보네이트 수용액(3.66 ml, 7.31 mmol)을 1,4-디옥산 30 ml에 녹인 후 80℃에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액을 상온으로 냉각시켜 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산 마그네슘으로 건조 후 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=4/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3,6-디하이드로피리딘-1(2H)-카르복실레이트(1.104 g, 수율 99%)를 수득하고, 1H NMR로 분석하여 합성된 것을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 6.52 (m, 1H), 4.17 (d, J=2.3 Hz, 2H), 3.61 (t, J=5.7 Hz, 2H), 3.05-3.10 (m, 2H), 2.68 (d, J=1.4 Hz, 2H), 2.53-2.64 (m, 5H), 1.48 (s, 9H).
(2) 단계 B: tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3,6-디하이드로피리딘-1(2H)-카르복실레이트의 제조
단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3,6-디하이드로피리딘-1(2H)-카르복실레이트(1.1 g, 2.87 mmol), m-클로로벤조익퍼옥시산(70 wt%, 1.556 mg, 6.31 mmol)을 디클로로메탄 100 ml에 녹이고 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 물과 소듐 티오설페이트를 넣고 교반하였다. 디클로로메탄과 포화 소듐 바이카보네이트 수용액을 넣어 추출하였다. 유기층을 무수 황산 마그네슘으로 건조 후 여과하였다. 여액을 감압농축하여 tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3,6-디하이드로피리딘-1(2H)-카르복실레이트(552 mg, 수율 46%)를 수득하고, 1H NMR로 분석하여 합성된 것을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 6.74 (s, 1H), 4.23 (br, s, 2H), 3.64 (t, J=5.5 Hz, 2H), 3.41 (s, 3H), 3.25 (m, 2H), 2.65-2.76 (m, 4H), 1.48 (s, 9H).
(3) 단계 C: tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-1-카르복실레이트의 제조
단계 C에서 제조된 tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3,6-디하이드로피리딘-1(2H)-카르복실레이트(456 mg, 1.098 mmol)을 메탄올 20 ml에 녹인 후 팔라듐/차콜(10 wt%, 50 mg)을 넣고 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액을 셀라이트로 여과하고 메탄올로 씻어주었다. 여액을 감압농축하여 tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-1-카르복실레이트(473 mg, 수율 99%)를 수득하고, 1H NMR로 분석하여 합성된 것을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.30 (m, 2H), 3.40 (s, 3H), 3.12-3.15 (m, 2H), 2.98-3.04 (m, 1H), 2.67-2.86 (m, 4H), 1.95 (m, 2H), 1.80 (m, 2H), 1.47 (s, 9H).
(4) 단계 D: tert-부틸 (S)-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-1-카르복실레이트의 제조
단계 C에서 제조된 tert-부틸 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-1-카르복실레이트(150 mg, 0.359 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트(120 mg, 0.395 mmol), 포타슘 카보네이트(124 mg, 0.898 mmol)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후 80℃에서 4시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액을 상온으로 냉각 후 물과 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수 황산 마그네슘으로 건조 후 여과하였다. 여액을 감압농축하여 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-1-카르복실레이트(140 mg, 수율 95%)를 수득하고, 1H NMR로 분석하여 합성된 것을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.48 (m, 1H), 3.98-4.20 (m, 5H), 2.81 (m, 4H), 2.69 (m, 1H), 2.44-2.57 (m, 3H), 2.01 (m, 1H), 1.71-1.82 (m, 4H), 1.50 (d, J=5.9 Hz, 3H), 1.47 (s, 9H).
(5) 단계 E: (S)-7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-4-(피페리딘-4-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘의 제조
단계 D에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-1-카르복실레이트(140 mg, 0.343 mmol)을 디클로로메탄 4 ml에 녹인 후 트리플루오로아세트산 0.5 ml를 넣고 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액을 감압농축하고, 농축액을 포화 소듐 바이카보네이트 수용액으로 중화 후 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 무수 황산 마그네슘으로 건조 후 여과하였다. 여액을 감압농축하여 (S)-7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-4-(피페리딘-4-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(86 mg, 수율 82%)를 수득하고, 1H NMR로 분석하여 합성된 것을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.48 (q, J=6.9 Hz, 1H), 3.96-4.12 (m, 2H), 3.20 (d, J=13.3 Hz, 2H), 2.80 (m, 2H), 2.66-2.76 (m, 3H), 2.37-2.57 (m, 3H), 1.93-2.01 (m, 1H), 1.76-1.86 (m, 2H), 1.70 (m, 2H), 1.52 (d, J=6.4 Hz, 3H).
(6) 단계 F: tert-부틸 (S)-4-(2-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-1-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
단계 E에서 제조된 (S)-7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-4-(피페리딘-4-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(34 mg, 0.110 mmol), tert-부틸 4-(2-프로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(45 mg, 0.331 mmol)을 N,N-디메틸푸름아마이드(5 ml)에 녹인 후 상온에서 8시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액을 감압농축하고, 에틸아세테이트와 물로 추출하였다. 유기층을 무수 황산 마그네슘으로 건조 후 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-1-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(58 mg, 수율 99%)를 수득하고, 1H NMR로 분석하여 합성된 것을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.47 (q, J=6.9 Hz, 1H), 4.06-4.11 (m, 1H), 3.98 (m, 1H), 3.57-3.65 (m, 4H), 3.39-3.46 (m, 4H), 3.20 (s, 2H), 2.93-2.97 (m, 2H), 2.78-2.81 (m, 2H), 2.36-2.57 (m, 4H), 2.15-2.21 (m, 2H), 1.85-2.01 (m, 3H), 1.71 (m, 2H), 1.50 (d, J=6.4 Hz, 3H), 1.45 (s, 9H).
(7) 단계 G: (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-1-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
단계 F에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-1-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(58 mg, 0.108 mmol)를 디클로로메탄 4 ml에 녹인 후 트리플루오로아세트산 1 ml를 넣고 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액을 감압농축하고, 포화 소듐 바이카보네이트 수용액으로 중화 후 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 무수 황산 마그네슘으로 건조 후 여과하고, 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피페리딘-1-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(32 mg, 수율 68%)를 수득하고, 1H NMR로 분석하여 합성된 것을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.70 (br, 1H), 4.46 (q, J=6.7 Hz, 1H), 4.07 (td, J=8.9, 5.0 Hz, 1H), 3.97 (q, J=8.2 Hz, 1H), 3.59-3.72 (m, 4H), 3.20 (s, 2H), 2.95-2.98 (m, 4H), 2.78 (t, J=3.4 Hz, 2H), 2.35-2.57 (m, 6H), 2.19 (t, J=11.7 Hz, 2H), 1.87-2.00 (m, 3H), 1.71 (d, J=12.8 Hz, 2H), 1.49 (q, J=2.9 Hz, 3H).
실시예 18: 2-((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 17에서와 같이, 단계 A 및 B의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-18의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 17]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-((1R,5S,6R)-2-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
2-((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)아세테이트(200 mg, 0.518 mmol, KR10-2021-0129607A의 실시예 9에 따라 제조하여 사용), tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(116 mg, 0.621 mmol), 프로필포스포닉 언하이드라이드(50 wt%, 0.244 ml, 0.647 mmol)와 트리에틸아민(0.144 ml, 1.035 mmol)을 디클로로메탄 10 ml에 녹인 후 상온에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 물과 디클로로메탄을 넣어 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 tert-부틸 4-(2-((1R,5S,6R)-2-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(93 mg, 수율 34%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.38 (q, J=6.9 Hz, 1H), 3.90-4.05 (m, 4H), 3.58-3.63 (m, 4H), 3.42 (s, 6H), 2.94-3.01 (m, 2H), 2.28-2.46 (m, 5H), 1.87-1.95 (m, 1H), 1.50 (s, 2H), 1.42-1.48 (m, 12H), 0.94 (td, J=6.9, 3.2 Hz, 1H).
(2) 단계 B: 2-((1R,5S,6R)-2-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((1R,5S,6R)-2-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(93 mmol, 0.175 mmol)을 디클로로메탄 4 ml에 녹인 후 트리플루오로아세트산 0.5 ml를 넣고 상온에서 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하고, 포화 소듐 바이카보네이트 수용액으로 중화하고 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 2-((1R,5S,6R)-2-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(67 mg, 수율 88%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.41 (q, J=6.7 Hz, 1H), 3.93-4.07 (m, 4H), 3.61-3.74 (m, 4H), 3.45-3.50 (m, 2H), 3.01 (t, J=3.8 Hz, 2H), 2.93 (d, J=4.3 Hz, 4H), 2.32-2.51 (m, 5H), 1.90-1.97 (m, 1H), 1.54 (s, 2H), 1.50 (d, J=6.1 Hz, 3H), 0.95 (td, J=6.7, 3.5 Hz, 1H).
실시예 19: 2-((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)-1-(4-메틸피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 실시예 18의 단계 A에서, 2-((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)아세테이트를 50 mg, 0.13 mmol로 사용하고, 피페라진-1-카르복실레이트 대신에 1-메틸피페라진(19 mg, 0.19 mmol)을 사용한 것을 제외하고는 상기 실시예 18의 단계 A와 동일하게 실시하여 화학식 1-19의 2-((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)-1-(4-메틸피페라진-1-일)에탄-1-온(5.0 mg, 0.01 mmol, 수율 8%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 1-19]
1H NMR (400MHz, MeOH-d4) δ 4.40 (q, J=6.7 Hz, 1H), 4.12-3.96 (m, 3H), 3.87 (q, J=8.2 Hz, 1H), 3.61 (s, 4H), 3.58-3.47 (m, 2H), 3.06 (d, J=3.7 Hz, 2H), 2.52-2.34 (m, 9H), 2.31 (s, 3H), 1.93 (t, J=9.5 Hz, 1H), 1.62-1.49 (m, 2H), 1.49-1.40 (m, 3H), 0.94-0.79 (m, 1H).
실시예 20: 4-(2-((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)아세틸)피페라진-2-온의 제조
상기 실시예 18의 단계 A에서, 2-((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)아세테이트를 50 mg, 0.13 mmol로 사용하고, 피페라진-1-카르복실레이트 대신에 2-옥소피페라진(19 mg, 0.19 mmol)을 사용한 것을 제외하고는 상기 실시예 18의 단계 A와 동일하게 실시하여 화학식 1-20의 4-(2-((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)아세틸)피페라진-2-온(47 mg, 0.10 mmol, 수율 81%)을 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 1-20]
1H NMR (400MHz, MeOH-d4) δ 4.39 (t, J=7.0 Hz, 1H), 4.14 (s, 2H), 4.10-3.93 (m, 3H), 3.87 (d, J=7.6 Hz, 1H), 3.74 (dt, J=27.5, 5.3 Hz, 2H), 3.64 (s, 2H), 3.43-3.32 (m, 1H), 3.07 (d, J=12.2 Hz, 2H), 2.55-2.21 (m, 5H), 1.93 (s, 1H), 1.57 (s, 2H), 1.48 (d, J=6.1 Hz, 3H), 1.37 (d, J=7.0 Hz, 1H), 0.90 (s, 1H).
실시예 21: 2-((1R,5S,6S)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헵탄-6-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 18에서와 같이, 단계 A 및 B의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-21의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 18]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-((1R,5S,6S)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헵탄-6-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
2-((1R,5S,6S)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)아세트산(177 mg, 0.468 mmol, KR10-2021-0129607A의 실시예 8에 따라 제조하여 사용), tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(87 mg, 0.468 mmol), N-[(다이메틸아미노)-1H-1,2,3-트리아졸-[4-5-b]피리딘-1-일메틸렌]-N-메틸메탄아미니움 헥사플루오로포스페이트 N-옥사이드(213 mg, 0.561 mmol)을 디메틸포름아마이드 10 ml에 녹인 후, 상온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 에틸아세테이트와 물을 넣어 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 tert-부틸 4-(2-((1R,5S,6S)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(272 mg, 수율 99%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.40 (q, J=6.9 Hz, 1H), 3.92-4.10 (m, 5H), 3.58 (m, 2H), 3.39-3.46 (m, 6H), 3.14 (m, 2H), 2.68 (d, J=7.8 Hz, 2 H), 2.29-2.46 (m, 6H), 2.11 (m, 1H), 1.87-1.96 (m, 1H), 1.46-1.51 (m, 12H), 1.41 (m, 1H).
(2) 단계 B: 2-((1R,5S,6S)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((1R,5S,6S)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(270 mg, 0.464 mmol)을 디클로로메탄 4 ml에 녹인 후 트리플루오로아세트산 1 ml를 넣고 상온에서 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하고, 디클로로메탄과 포화 소듐 바이카보네이트 수용액으로 중화하고 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 2-((1R,5S,6S)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(210 mg, 수율 95%)를 수득하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.40 (m, 1H), 3.92-4.07 (m, 6H), 3.73 (m, 2H), 3.63 (s, 2H), 3.15 (m, 2H), 2.94-3.02 (m, 4H), 2.67 (d, J=7.8 Hz, 2H), 2.29-2.46 (m, 6H), 2.10 (m, 1H), 1.88-1.96 (m, 1H), 1.48 (d, J=5.9 Hz, 3H), 1.42 (dd, J=9.1, 5.5 Hz, 1H).
실시예 22: 1-(4-아세틸피페라진-1-일)-2-((1R,5S,6S)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)에탄-1-온의 제조
상기 실시예 21에 따라 제조된 2-((1R,5S,6S)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(30 mg, 0.067 mmol)과 아세틱언하이드라이드(9.51 ㎕, 0.101 mmol)을 디클로로메탄 4 ml에 녹이고 0℃로 냉각하였다. 트리에틸아민(18.73 ㎕, 0.134 mmol)을 넣고 상온에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 디클로로메탄과 포화 소듐 바이카보네이트 수용액으로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 하기 화학식 1-22의 표제 화합물을 수득(17 mg, 수율 52%)하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 1-22]
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.42-4.47 (m, 1H), 3.97-4.10 (m, 6H), 3.66 (m, 4H), 3.49-3.55 (m, 4H), 3.18 (m, 2H), 2.73 (d, J=7.6 Hz, 2H), 2.34-2.48 (m, 6H), 2.16 (s, 3H), 1.92-1.99 (m, 1H), 1.51 (d, J=6.1 Hz, 3H), 1.46 (q, J=4.8 Hz, 1H).
실시예 23: 2-((1R,5S,6S)-3-(8,8-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 실시예 21의 단계 A에서 2-((1R,5S,6S)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)아세트산 대신에 2-((1R,5S,6S)-3-(8,8-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-5,6,7,8-테트라하이드로퀴나졸린-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)아세트산(68 mg, 0.164 mmol)을 사용하고, tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트를 33.6 mg, 0.180 mmol로 사용한 것을 제외하고는 상기 실시예 21과 동일하게 실시하여 하기 화학식 1-23의 표제 화합물을 제조(69 mg. 0.150 mmol, 수율 91%)하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 1-23]
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.39-4.44 (m, 1H), 3.88-4.09 (m, 6H), 3.65 (t, J=4.9 Hz, 2H), 3.54 (t, J=4.9 Hz, 2H), 3.19 (s, br, 1H), 2.92 (m, 4H), 2.77 (m, 2H), 2.68 (d, J=7.6 Hz, 2H), 2.30-2.38 (m, 4H), 2.19-2.30 (m, 2H), 2.15 (dd, J=13.1, 7.6 Hz, 1H), 1.91-1.97 (m, 1H), 1.83 (d, J=5.8 Hz, 2H), 1.50 (d, J=6.1 Hz, 3H), 1.44 (dd, J=9.0, 5.3 Hz, 1H).
실시예 24: 2-((1R,5S,6S)-3-(8,8-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-5,8-디하이드로-6H-피라졸[3,4-d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 실시예 21의 단계 A에서 2-((1R,5S,6S)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)아세트산 대신에 2-((1R,5S,6S)-3-(8,8-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-5,8-디하이드로-6H-피라노[3,4-d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.1]헵탄-6-일)아세트산(160 mg, 0.384 mmol)을 사용하고, tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트를 75 mg, 0.403 mmol로 사용한 것을 제외하고는 상기 실시예 21과 동일하게 실시하여 하기 화학식 1-24의 표제 화합물을 제조(69 mg. 0.150 mmol, 수율 91%)하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 1-24]
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.40-4.46 (m, 1H), 4.14 (t, J=5.3 Hz, 2H), 3.94-4.09 (m, 6H), 3.52-3.82 (m, 4H), 2.99-3.11 (m, 6H), 2.70 (d, J=7.3 Hz, 2H), 2.34-2.40 (m, 4H), 2.15 (dd, J=12.4, 7.2 Hz, 1H), 1.92-1.99 (m, 1H), 1.50 (d, J=6.1 Hz, 3H),. 1.42-1.46 (m, 1H).
실시예 25: 7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-4-((1R,5S,6S)-6-((피레라진-1-일설포닐)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘의 제조
[반응식 19]
상기 실시예 16의 단계 A, 단계 B 및 단계 D의 방법을 적용하되, 상기 반응식 19에 따라 순차적으로 실시하여 화학식 1-25의 표제 화합물을 제조하였다.
(1) 단계 A: tert-부틸 4-((((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)메틸)설포닐)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 실시예 16의 단계 A에서 피페라진-2-온 대신에 제조예 10에서 제조된 tert-부틸 4-((((1R,5S,6R)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)메틸)설포닐)피페라진-1-카르복실레이트(89 mg, 0.258 mmol)을 사용한 것을 제외하고는 실시예 16의 단계 A와 동일하게 실시하여 표제 화합물을 제조(135 mg, 0.234 mmol)하고, 질량분석으로 합성된 것을 확인하였다(mass [M+H]=522.1).
(2) 단계 B: tert-부틸 4-((((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)메틸)설포닐)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 실시예 16의 단계 B 방법을 적용하되, 상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-((((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)메틸)설포닐)피페라진-1-카르복실레이트(135 mg, 0.234 mmol)와 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일] 메탄술포네이트를 반응시킨 것을 제외하고는 실시예 16의 단계 B와 동일하게 실시하여 표제 화합물을 제조(95 mg, 0.167 mmol)하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.43 (q, J=6.7 Hz, 1H), 3.97-4.09 (m, 4H), 3.64-3.69 (m, 2H), 3.54 (s, 4H), 3.29 (s, 4H), 3.01 (d, J=3.7 Hz, 2H), 2.92-2.95 (m, 2H), 2.43-2.50 (m, 2H), 2.38 (s, 1H), 1.96 (d, J=9.5 Hz, 1H), 1.75 (s, 2H), 1.51 (d, J=6.4 Hz, 3H), 1.49 (s, 8H). 1.07 (dd, J=6.6, 3.6 Hz, 1H).
(3) 단계 C: 7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-4-((1R,5S,6S)-6-((피레라진-1-일설포닐)메틸)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-3-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘의 제조
상기 실시예 16의 단계 D를 적용하되, 상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 4-((((1R,5S,6R)-3-(7,7-디플루오로-2-((S)-2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-3-아자바이사이클로[3.1.0]헥산-6-일)메틸)설포닐)피페라진-1-카르복실레이트(95 mg, 0.167 mmol)를 사용한 것을 제외하고는 실시예 16의 단계 D와 동일하게 실시하여 화학식 1-25의 표제 화합물(61 mg, 0.130 mmol)을 제조하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.42 (td, J=13.2, 6.5 Hz, 1H), 4.01-4.08 (m, 3H), 3.97 (q, J=8.2 Hz, 1H), 3.66 (t, J=12.2 Hz, 2H), 3.30 (t, J=4.7 Hz, 4H), 2.98-3.01 (m, 2H), 2.95-2.98 (m, 4H), 2.88-2.93 (m, 2H), 2.40-2.49 (m, 2H), 2.34-2.39 (m, 1H), 1.91-1.98 (m, 1H), 1.79 (s, 1H), 1.75 (s, 2H), 1.46-1.51 (m, 3H), 1.06-1.10 (m, 1H).
실시예 26: (S)-2-((1-(5-메틸-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로)피리미딘-4-일)아제티딘-3-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
[반응식 20]
상기 실시예 2의 단계 A 내지 단계 D의 방법을 적용하되, 상기 반응식 20에 따라 순차적으로 실시하여 화학식 1-26의 표제 화합물을 제조하였다.
구체적으로, 상기 실시예 2의 단계 A에서 4,5-디클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘 대신에 4-클로로-5-메틸-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로)피리미딘(12.0 g, 49.45 mmol)과 tert-부틸 4-(2-(아제티딘-3-일옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(14.8 g, 49.45 mmol)을 반응시키고, 단계 C에서 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트을 18.0 g, 59.28 mmol로 사용한 것을 제외하고는 상기 실시예 2와 동일하게 실시하여 화학식 1-26의 표제 화합물(12.1 g, 28.31 mmol, 수율 57%)를 제조하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 4.84 (br, s, 3H), 4.42 (m, 1H). 4.35 (s, 2H), 4.14 (m, 2H), 3.95 (m, 1H), 3.87 (m, 1H), 3.55 (br, s, 2H), 3.44 (br, s, 2H), 2.81 (br, s, 4H), 2.37 (m, 1H). 2.09 (m, 1H), 1.47 (d, 3H).
실시예 27: ((S)-2-((1-(2--(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로)피리미딘-4-일)피페리딘-4-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
[반응식 21]
상기 실시예 2의 단계 A 내지 단계 D의 방법을 적용하되, 상기 반응식 21에 따라 순차적으로 실시하여 화학식 1-27의 표제 화합물을 제조하였다.
구체적으로, 상기 실시예 2의 단계 A에서 4,5-디클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘 대신에 4-클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로)피리미딘(229 mg, 1.00 mmol)과 tert-부틸 4-(2-(아제티딘-3-일옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트 대신 제조예 9에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(피페리딘-4-일옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(354 mg, 1.08 mmol)를 반응시키고, 단계 C에서 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트를225 mg, 0.744 mmol로 사용한 것을 제외하고는 상기 실시예 2와 동일하게 실시하여 화학식 1-27의 표제 화합물(219 mg, 0.50 mmol, 수율 50%)를 제조하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 6.37 (s, 1H), 4.42 (q, J=6.5 Hz, 1H), 4.27 (s, 2H), 4.11-3.83 (m, 4H), 3.70 (s, 1H), 3.53 (d, J=23.8 Hz, 4 H), 3.40 (t, J=10.2 Hz, 2H), 2.81 (d, J=14.0 Hz, 4H), 2.49-2.32 (m, 1H), 2.03-1.84 (m, 3H), 1.60 (d, J=8.8 Hz, 2H), 1.48 (d, J=6.1 Hz, 3H).
실시예 28: ((S)-2-((1-(5-메틸-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로)피리미딘-4-일)피페리딘-4-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
[반응식 22]
상기 실시예 2의 단계 A 내지 단계 D의 방법을 적용하되, 상기 반응식 22에 따라 순차적으로 실시하여 화학식 1-28의 표제 화합물을 제조하였다.
구체적으로, 상기 실시예 2의 단계 A에서 4,5-디클로로-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘 대신에 4-클로로-5-메틸-2-(메틸티오)-6-(트리플루오로)피리미딘(243 mg, 1.00 mmol)과 tert-부틸 4-(2-(아제티딘-3-일옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트 대신 제조예 9에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(피페리딘-4-일옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(354 mg, 1.08 mmol)를 반응시키고, 단계 C에서 (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트를264 mg, 0.87 mmol로 사용한 것을 제외하고는 상기 실시예 2와 동일하게 실시하여 화학식 1-28의 표제 화합물(213 mg, 0.47 mmol, 수율 47%)를 제조하고, 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOH-d4) δ 4.48-4.32 (m, 1H), 4.26 (s, 2H), 4.04-3.81 (m, 2H), 3.65 (s, 3H), 3.53 (d, J=18.9 Hz, 4H), 3.11 (t, J=9.6 Hz, 2H), 2.82 (d, J=16.2 Hz, 4H), 2.41 (d, J=13.7 Hz, 1H), 2.14 (s, 3H), 2.09-1.84 (m, 3H), 1.71 (q, J=8.8 Hz, 2H), 1.48 (d, J=6.1 Hz, 3H).
제조예 11
하기 단계 A 내지 K 단계를 순차적으로 수행하여 하기 화학식 k인 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘을 제조하였다.
[화학식 k]
(1) 단계 A: 5-(tert-부틸) 1-에틸 2,2-디플루오로펜탄디오에이트의 제조
에틸 2-브로모-2,2-디플루오로아세테이트(20 g, 99 mmol), tert-부틸 아크릴레이트(11.1 ml, 76 mmol), 구리(9.6 g, 152 mmol), N1, N1, N2, N2-테트라메틸에탄-1,2-디아민(5.7 ml, 37.9 mmol)과 아세트산(4.8 ml, 83 mmol)을 테트라하이드로퓨란 100 ml에 녹인 후, 50℃에서 4시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응 용액에 포화 암모늄 클로라이드 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압 농축하여 5-(tert-부틸) 1-에틸 2,2-디플루오로펜탄디오에이트를 수득하였다. 수득한 5-(tert-부틸) 1-에틸 2,2-디플루오로펜탄디오에이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 4.31 (q, J=7.0 Hz, 2H), 2.32-2.47 (m, 4H), 1.43 (s, 9H), 1.34 (t, J=7.3 Hz, 3H).
(2) 단계 B: 5-에톡시-4,4-디플루오로-5-옥소펜타노익산의 제조
상기 단계 A에서 얻어진 5-(tert-부틸) 1-에틸 2,2-디플루오로펜탄디오에이트를 트리플루오로아세트산 (30 ml)과 디클로로메탄(70 ml)에 녹인 후, 상온에서 8시간 교반하였다. 반응이 완료된 후, 감압농축하였다. 농축액에 포화 소듐 바이카보네이트 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 5-에톡시-4,4-디플루오로-5-옥소펜타노익산(15 g, 76 mmol, 수율 100%)을 수득하였다. 수득한 5-에톡시-4,4-디플루오로-5-옥소펜타노익산은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.36 (q, J=7.2 Hz, 2H), 2.66 (t, J=7.6 Hz, 2H), 2.42-2.51 (m, 2H), 1.39 (t, J=7.2 Hz, 3H).
(3) 단계 C: 에틸 2,2-디플루오로-5-하이드록시펜타노에이트의 제조
상기 단계 B에서 얻어진 5-에톡시-4,4-디플루오로-5-옥소펜타노익산(12.0 g, 61 mmol)과 보레인 디메틸설파이드 테트라하이드로퓨란 용액(2M 36.6 ml. 73 mmo)을 테트라하이드로퓨란 300 ml에 녹인 후, 50℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응용액에 물(10 ml)을 넣고 60℃에서 1시간동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응용액에 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압 농축하여 에틸 2,2-디플루오로-5-하이드록시펜타노에이트(6.5 g, 35.7 mmol, 수율 59%)을 수득하였다. 수득한 에틸 2,2-디플루오로-5-하이드록시펜타노에이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.35 (q, J=7.1 Hz, 2H), 3.74 (t, J=6.3 Hz, 2H), 2.16-2.26 (m, 2H), 1.72-1.81 (m, 2H), 1.38 (t, J=7.2 Hz, 3H).
(4) 단계 D: 에틸 2,2-디플루오로-5-((메탄설포닐)옥시)펜타노에이트의 제조
상기 단계 C에서 얻어진 에틸 2,2-디플루오로-5-하이드록시펜타노에이트(9.4 g, 51.6 mmol), 메탄설포닐 클로라이드(4.42 ml, 56.8 mmol), 디이소프로필에틸아민(18.0 ml, 103 mmol)와 4-디메틸아미노피리딘(315 mg, 2.58 mmol)을 디클로로메탄(200 ml)에 녹인 후, 상온에서 3시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응용액에 N 염산 용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피 (에틸아세테이트/헥산=1/3 중량비)로 정제하여 에틸 2,2-디플루오로-5-((메탄설포닐)옥시)펜타노에이트(13.3 g, 51.1 mmol, 수율 99%)를 수득하였다. 수득한 에틸 2,2-디플루오로-5-((메탄설포닐)옥시)펜타노에이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.37 (q, J=7.1 Hz, 2H), 4.31 (t, J=6.3 Hz, 2H), 3.06 (s, 3H), 2.20-2.29 (m, 2H), 1.99-2.05 (m, 2H), 1.38-1.40 (m, 3H).
(5) 단계 E: 에틸 5-시아노-2,2-디플루오로펜타노에이트의 제조
상기 단계 D에서 제조된 에틸 2,2-디플루오로-5-((메탄설포닐)옥시)펜타노에이트(13.3 g, 51.1 mmol), 포타슘 시아네이트(10,0 g, 153.3 mmol)을 테트라하이드로퓨란 150 ml와 디메틸포름아마이드 150 ml 혼합용액에 녹인 후, 70℃에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후, 반응욕앨을 감압농축하였다. 농축액에 포화 암모늄 클로라이드 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 에틸 5-시아노-2,2-디플루오로펜타노에이트(7.1 g, 37.1 mmol, 수율 73%)를 수득하였다. 수득한 에틸 5-시아노-2,2-디플루오로펜타노에이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.27-4.35 (m, 2H), 2.45 (t, J=7.1 Hz, 2H), 2.15-2.29 (m, 2H), 1.91 (t, 7.1 Hz, 2H), 1.31-1.37 (m, 3H).
(6) 단계 F: 디에틸 2,2-디플루오로헥산디오에이트의 제조
상기 단계 E에서 제조된 에틸 5-시아노-2,2-디플루오로펜타노에이트(7.1 g, 37.7 mmol)와 아세틸클로라이드(30 ml)을 에탄올 60 ml에 녹인 후 48시간 동안 환류하였다. 반응이 완결된 후, 감압농축하였다. 농축액에 포화 소듐 바이카보네이트 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 디에틸 2,2-디플루오로헥산디오에이트(6.5 g, 27.3 mmol, 수율 74%)를 수득하였다. 수득한 디에틸 2,2-디플루오로헥산디오에이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 4.35 (q. J=7.1 Hz, 2H), 4.16 (q, J=7.1 Hz, 2H), 2.40 (t, J=7.3 Hz, 2H), 2.07-2.20 (m, 2H), 1.86 (m, 2H), 1.38 (t, J=7.2 Hz, 3H), 1.28 (t, J=7.2 Hz, 3H).
(7) 단계 G: 에틸 3,3-디플루오로-2-옥소사이클로펜탄-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 F에서 제조된 디에틸 2,2-디플루오로헥산디오에이트(51.57 g, 216 mmol)를 테트라하이드로퓨란(1000 ml)에 녹인 후 칼륨 tert-부톡사이드(26.7 g, 238 mmol)를 천천히 넣어주고 상온에서 4시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 용액에 1N 염산 수용액 240 ml를 0℃에서 천천히 첨가한 후 10분 정도 교반하였다. 반응물을 에틸아세테이트로 묽힌 후 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어주었다. 수용액을 에틸아세테이트로 추출하고 모은 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압 농축하고 감압상태에서 충분히 건조하여 에틸 3,3-디플루오로-2-옥소사이클로펜탄-1-카르복실레이트(41.6 g, 216 mmol, 수율 99%)를 수득하여 별도의 정제없이 이후 반응에 사용하였다.
(8) 단계 H: 7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-올의 제조
상기 단계 G에서 제조된 에틸 3,3-디플루오로-2-옥소사이클로펜탄-1-카르복실레이트(540 mg, 2.41 mmol), 메틸이소티오우레아 반황산염(672 mg, 4.82 mmol)과 소듐 카보네이트(767 mg, 7.24 mmol)를 물 50 ml에 녹인 후 상온에서 12시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 반응용액에 과량의 물을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압 농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-올(250 mg, 1.15 mmol, 수율 48%)을 수득하였다. 수득한 7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-올은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, DMSO-D6) δ 1.92-1.97 (m, 2H), 1.81 (s, 3H), 1.71-1.79 (m, 2H).
(9) 단계 I: 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘의 제조
상기 단계 H에서 제조된 7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-올(5.2 g, 23.83 mmol), 포스포릴트리클로라이드(22.21 ml, 238 mmol)와 벤질트리에틸암모늄 클로라이드(5.43 g, 23.93 mmol)을 디클로로에탄 150 ml에 녹인 후 80℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액을 감압증류하였다. 농축액에 포화소듐 바이카보네이트 용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/10 중량비)로 정제하여 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(5.00 g, 23.83 mmol, 수율 89%)을 수득하였다. 수득한 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 2.99-3.03 (m, 2H), 2.62-2.71 (m, 5H).
제조예 12
제조예 11에서 제조된 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(26.84 g, 113 mmol), 3-클로로퍼벤조익애시드(61.5 g, 250 mmol)을 디클로로메탄 500 ml에 녹이고 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 반응용액에 소듐 티오설페이트(3.6 g, 22.68 mmol)을 넣고 물과 포화 소듐카보네이트 용액을 순차적으로 넣어 교반하였다. 디클로로메탄으로 추출한 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 하기 화학식 l의 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘을 수득(30.5 g, 수율 >99%)하고, 별도의 정제 없이 이후 반응에 사용하였다. 수득한 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘 은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 l]
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 2.80 (m, 2H), 2.65 (s, 3H), 2.49-2.60 (m, 2H).
제조예 13
tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(6.00 g, 32.21 mmol), 디이소프로필에틸아민(8.32 g, 64.37 mmol)을 디클로로메탄 200 ml에 녹인 후 -78℃로 온도를 낮춰주었다. 브로모아세틸 브로마이드(7.15 g, 35.43 mmol)을 천천히 넣어준 후, 상온상태로 온도를 서서히 높여주며 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 1N 염산 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 하기 화학식 m의 tert-부틸 4(2-브로모아세틸)피페라진-1-카복시레이트(6.62 g, 21.5 mmol, 수율 66%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4(2-브로모아세틸)피페라진-1-카복시레이트은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 m]
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 3.87 (s, 2H), 3.77-3.55 (m, 2H), 3.51 (dd, J=16.2, 5.8 Hz, 4H), 3.47-3.32 (m, 2H), 1.49 (d, J=18.3 Hz, 9H).
제조예 14
tert-부틸 1,4-디아제페인-1-카복시레이트(3.00 g, 14.97 mmol), 디이소프로필에틸아민(3.86 g, 29.94 mmol)을 디클로로메탄 100 ml에 녹인 후 -78℃로 온도를 낮춰주었다. 브로모아세틸 브로마이드(3.32 g, 16.47 mmol)을 천천히 넣어준 후, 상온상태로 온도를 서서히 높여주며 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 1N 염산 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 하기 화학식 n의 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)-1,4-디아제페인-1-카복시레이트(2.21 g, 6.88 mmol, 수율 45%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)-1,4-디아제페인-1-카복시레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 n]
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 3.87 (d, J=8.8 Hz, 2H), 3.72-3.34 (m, 8H), 2.01-1.77 (m, 2H), 1.45 (d, J=8.8 Hz, 9H).
제조예 15
글리콜산(5.00 g, 65.74 mmol), N-[(디메틸아미노)-1H-1,2,3-트리아졸-[4-5-b]피리딘-1-일메틸렌]-N-메틸메탄아미니움 헥사플루오로포스페이트 N-옥사이드(37.47 g, 98.54 mmol), tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(12.24 g, 65.71 mmol)와 트리에틸아민(13.29 g, 131.33 mmol)을 디메틸포름아마이드 200 ml에 녹인 후 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 하기 화학식 o의 tert-부틸 4-(2-하이드록시아세틸)피페라진-1-카복시레이트(4.81 g, 19.68 mmol, 수율 29%)를 수득하였다. 수득된 tert-부틸 4-(2-하이드록시아세틸)피페라진-1-카복시레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
[화학식 o]
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 4.19 (s, 2H), 3.66 (br, s, 2H), 3.59 (s, 1H), 3.48 (br, s, 4H), 2.27 (br s, 2H), 1.49 (s, 9H).
제조예 16
하기 단계 A 및 B를 순차적으로 수행하여 하기 화학식 p의 tert-부틸 4-(2-(5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 제조하였다.
[화학식 p]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-(5-브로모피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
2-(5-브로모피리딘-2-일)아세트산(1 g, 4.63 mmol), tert-부틸-피페라진-1-카르복실레이트(862 mg, 4.63 mmol), 1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥사이드 헥사플루오로포스페이트(1.2 g, 3.16 mmol)를 디메틸포름아마이드 20 ml에 녹인 후 디이소프로필에틸아민(2.7 ml, 15.47 mmol)을 넣고 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출한 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(5-브로모피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(884.8 mg, 2.303 mmol, 수율 50%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(5-브로모피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.57 (d, J=2.3 Hz, 1H), 7.76 (dd, J=8.2, 2.3 Hz, 1H), 7.25 (d, J=8.0 Hz, 1H), 3.87 (s, 2H), 3.57 (dd, J=10.7, 7.1 Hz, 4H), 3.35 (dt, J=13.1, 5.1 Hz, 4H), 1.44 (d, J=7.8 Hz, 9H).
(2) 단계 B: tert-부틸 4-(2-(5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)아세틸)피레라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(5-브로모피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(1.18 g, 3.07 mmol), 4,4,4',4'5,5,5',5'-옥타메틸-2,2-비(1,3,2-디옥사보롤레인)(1.17 g, 4.61 mmol), 포타슘 아세테이트(904 mg, 9.21 mmol)를 1,4-디옥산 30 ml에 녹인 후 [1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센]디클로로팔라듐 디클로로메탄 복합체(251 mg, 0.307 mmol)를 넣고 100℃에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 상온으로 냉각시키고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 tert-부틸 4-(2-(5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(1.74 g, 4.03 mmol, crude)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.33 (s, 1H), 8.01 (dd, J=7.5, 1.6 Hz, 1H), 7.33 (d, J=7.8 Hz, 1H). 3.94 (s, 2H), 3.53-3.59 (m, 4H), 3.34 (t, J=5.0 Hz, 2H), 3.24 (t, J=5.3 Hz, 2H), 1.43 (s, 9H), 1.34 (s, 12H).
제조예 17
하기 단계 A 및 B를 순차적으로 수행하여 하기 화학식 q의 tert-부틸 4-(2-((5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 제조하였다.
[화학식 q]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-((5-브로모피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
tert-부틸 4(2-하이드록시아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(2,3 g, 9.35 mmol)과 소듐 하이드라이드(60%, 374 mg, 9.35 mmol)을 디메틸포름아마이드 30 ml에 녹이고 0℃에서 30분 동안 교반한 후 5-브로모-2-클로로피리딘(1.5 g, 7.79 mmol)을 넣고 50℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 1N 염산용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출한 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마노트그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4(2-((5-브로모피리딘-2-일)옥시)아세틸)피레라진-1-카복시레이트(1.58 g, 3.95 mmol, 수율 51%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4(2-((5-브로모피리딘-2-일)옥시)아세틸)피레라진-1-카복시레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.15 (s, 1H), 7.70 (d, 1H), 6.83 (d, 1H), 5.00 (s, 2H), 3.62 (br, s, 2H), 3.50 (br s, 4H), 3.45 (br s, 2H), 1.49 (s, 9H).
(2) 단계 B: tert-부틸 4-(2-((5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4(2-((5-브로모피리딘-2-일)옥시)아세틸)피레라진-1-카복시레이트(6 g, 14.99 mmol), 비스(피나콜라토)디보론(4.19 g, 16.49 mmol), 포타슘 아세테이트(3.68 g, 37.5 mmol)을 1,4-디옥산 20 ml에 녹인 후 5분간 탈기과정을 실시하였다. 1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센-팔라듐(II)디클로라이드디클로로메탄 복합체(612 mg, 0.749 mmol)를 넣고 80℃에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 에틸아세테이트를 넣고 물과 포화염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 tert-부틸 4-(2-((5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(6.71 g, 23.96 mmol, crude)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-((5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 질량분석법(MS)측정으로 합성되었음을 확인하였다.
MS 448.3, 470.2(Na+)
제조예 18
하기 단계 A 및 B를 순차적으로 수행하여 하기 화학식 r의 tert-부틸 4-(2-((3-클로로-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 제조하였다.
[화학식 r]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-((5-브로모-3-클로로피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
tert-부틸 4(2-하이드록시아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(2.5 g, 10.1 mmol)과 소듐 하이드라이드(60%, 402 mg, 10.1 mmol)을 디메틸포름아마이드 30 ml에 녹이고 0℃에서 30분 동안 교반한 후 5-브로모-2,3-디클로로피리딘(1.5 g, 7.79 mmol)을 넣고 50℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 1N 염산용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출한 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고 컬럼 크로마노트그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-((5-브로모-3-클로로피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(2.1 g, 4.83 mmol, 수율 58%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-((5-브로모-3-클로로피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.05 (s, 1H), 7.80 (d, J=5.5 Hz, 1H), 5.08 (d, J=11.6 Hz, 2H), 3.60 (s, 2H), 3.47 (d, J=30.5 Hz, 6H), 1.48 (s, 9H).
(2) 단계 B: tert-부틸 4-(2-((3-클로로-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((5-브로모-3-클로로피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(700 mg, 1.61 mmol), 비스(피나콜라토)디보론(450 mg, 1.77 mmol), 포타슘 아세테이트(395 mg, 4.03 mmol)을 1,4-디옥산 20 ml에 녹인 후 5분간 탈기과정을 실시하였다. 1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센-팔라듐(II)디클로라이드디클로로메탄 복합체(66 mg, 0.08 mmol)를 넣고 80℃에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 에틸아세테이트를 넣고 물과 포화염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 tert-부틸 4-(2-((3-클로로-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-((3-클로로-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 질량분석법(MS)측정으로 합성되었음을 확인하였다.
실시예 29: ((S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세트산의 제조
하기 반응식 23에서와 같이, 단계 A 내지 D의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-29의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 23]
(1) 단계 A: 메틸 2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트의 제조
제조예 11에서 제조된 화학식 (a)의 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-사이클로펜타[d]피리미딘(200 mg, 0.845 mmol), 메틸 2-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)페닐)아세테이트(350 mg, 1.268 mmol), 테트라키스(트리페닐포스핀)팔라듐(O)(49 mg, 0.04 mmol)과 소듐카보네이트 용액(2M, 27 ml, 2.54 mmol)을 1,4-디옥산 20 ml에 녹인 후 5분간 탈기과정을 실시하였다. 이후, 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 물로 씻어준 후, 에틸아세테이트를 넣고 물과 포화염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여과액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/3 중량비)로 정제하여 메틸 2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트(200 mg, 0.57 mmol, 수율 98%)를 수득하였다. 수득한 메틸 2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.93 (d, 2H), 7.44 (d, 2H), 3.71 (s, 3H), 3.70 (s, 2H), 3.21 (m, 2H), 2.64 (s, 3H), 2.62 (m, 2H).
(2) 단계 B: 메틸 2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 메틸 2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트(200 mg, 0.57 mmol)와 3-클로로퍼벤조익산(70%, 352 mg, 1.43 mmol)을 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화싸이오황산 나트륨 용액과 포화소듐 바이카보네이트 용액을 순차적으로 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 메틸 2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트(150 mg, 0.39 mmol, 수율 68%)를 수득하였다. 수득한 메틸 2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 8.03 (d, 2H), 7.49 (d, 2H), 3.73 (s, 3H), 3.72 (s, 2H), 3.45 (s, 3H), 3.38 (m, 2H), 2.74 (m, 2H).
(3) 단계 C: 메틸 (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트의 제조
상기 단계 B에서 제조된 메틸 2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트(130 mg, 0.34 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄설포네이트(239 mg, 0.51 mmol)와 포타슘 카보네이트(141 mg, 1.02 mmo)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후, 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 메틸 (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트(110 mg, 0.30 mmol, 수율 88%)를 수득하였다. 수득한 메틸 (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.87 (d, 2H), 7.39 (d, 2H), 4.59 (m, 1H), 4.15 (m, 1H), 4.08 (m, 1H), 3.70 (s, 3H), 3.68 (s, 2H), 3.08 (m, 2H), 2.53 (m, 2H), 2.47 (m, 1H), 2.01 (m, 1H), 1.59 (d, 3H).
(4) 단계 D: (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세트산의 제조
상기 단계 C에서 제조된 메틸 (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세테이트(110 mg, 0.30 mmol)와 1N 소듐 하이드록사이드 수용액 1 ml을 테트라하이드로퓨란 3 ml에 녹인 후 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 1N 염산용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(메탄올/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세트산(38 mg, 0.11 mmol, 수율 38%)를 수득하였다. 수득한 (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세트산은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.87 (d, 2H), 7.40 (d, 2H), 4.59 (m, 1H), 4.16 (m, 1H), 4.06 (m, 1H), 3.70 (s, 3H), 3.07 (s, 2H), 2.55 (m, 2H), 2.47 (m, 1H), 2.01 (m, 1H), 1.58 (d, 3H).
실시예 30: (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 24에서와 같이, 단계 A 및 B의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-30의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 24]
(1) 단계 A: tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 실시예 29에서 제조된 화학식 1-29의 (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세트산(38 mg, 0.11 mmol), 2,4,6-트리프로필-1,3,5,2,4,6-트리옥사트리포스피나네-2,4,6-트리옥사이드(40.4 mg, 0.13 mmol), tert-부틸 피페라진-1-카르복실레이트(24 mg, 0.13 mmol)와 트리에틸아민(0.04 ml, 0.32 mmol)을 디클로로메탄 5 ml에 녹인 후 상온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 1N 염산용액을 넣고, 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여과액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(디클로로메탄/메탄올=9/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(55 mg, 0.10 mmol, 수율 99%)로 수득하였다. 수득한 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.88 (d, 2H), 7.34 (d, 2H), 4.57 (m, 1H), 4.10 (m, 1H), 3.78 (s, 2H), 3.60 (s, 2H), 3.40 (m, 4H), 3.20 (m, 2H), 3.07 (m, 2H), 2.52 (m, 2H), 2.49 (m, 1H), 2.00 (m, 1H), 1.57 (d, 23H), 1.43 (s, 9H).
(2) 단계 B: (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(55 mg, 0.10 mmol)와 트리플루오로아세트산 1 ml를 디클로로메탄 4 ml에 녹인 후, 상온에서 8시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 감압농축하였다. 농축액에 포화 암모늄하이드록사이드 수용액을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(디클로로메탄/메탄올=9/1 중량비)로 정제하여 (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(32 mg, 0.075 mmol, 수율 75%)를 수득하였다. 수득한 (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페닐)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.87 (d, 2H), 7.34 (d, 2H), 4.59 (m, 1H), 4.15 (m, 1H), 4.06 (m, 1H), 3.76 (s, 2H), 3.61 (m, 2H), 3.43 (m, 2H), 3.08 (m, 2H), 2.83 (m, 2H), 2.72 (m, 2H), 3.60 (m, 2H), 3.50 (m, 1H), 2.00 (m, 1H), 1.57 (d, 3H).
실시예 31: ((S)-2-(5-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 25에서와 같이, 단계 A 내지 C의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-31의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 25]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-(5-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
2,4-디클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘(98 mg, 0.450 mmol), 상기 제조예 16에서 제조된 화학식 p의 tert-부틸 4-(2-(5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(388 mg, 0.900 mmol), 소듐 카보네이트 용액(2M, 0.675 ml, 1.349 mmol)과 테트라키스(트리페닐포스핀)팔라듐(52 mg, 0.045 mmol)을 1,4-디옥산 10 ml에 녹인 후 80℃에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 물을 넣고, 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여과액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(5-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(140 mg, 수율 64%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(5-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 9.23 (d, J=1.8 Hz, 1H), 8.42 (dd, J=8.2, 2.3 Hz, 1H), 7.95 (s, 1H), 4.03 (s, 2H), 3.61 (t, J=5.0 Hz, 4H), 3.35-3.40 (m, 4H), 1.45 (s, 9H).
(2) 단계 B: tert-부틸 (S)-4-(2-(5-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(5-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(140 mg, 0.29 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄설포네이트 (105 mg, 0.35 mmol)과 포타슘 카보네이트(120 mg, 0.87 mmoㅣ)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후 80℃에서 3시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-(5-(2-메틸아제티딘-1-일)-5-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(135 mg, 수율 90%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 (S)-4-(2-(5-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 9.17 (d, J=2.3 Hz, 1H), 8.27 (dd, J=8.2, 2.3 Hz, 1H), 7.53 (dd, J=7.5, 1.6 Hz, 1H), 7.16 (s, 1H), 4.61 (dd, J=14.4, 6.2 Hz, 1H), 4.06-4.20 (m, 2H), 3.99 (s, 2H), 3.60 (t, J=5.3 Hz, 4H), 3.37 (dd, J=13.3, 5.5 Hz, 4H), 2.47-2.55 (m, 1H), 2.00-2.08 (m, 1H), 1.58 (d, J=6.4 Hz, 3H), 1.44 (s, 9H).
(3) 단계 C: (S)-2-(5-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-(5-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(135 mg, 0.259 mmol)와 트리플루오로아세트산 1 ml를 디클로로메탄 4 ml에 녹인 후 상온에서 4시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 감압농축하였다. 감압농축액을 포화소듐 바이카보네이트 수용액으로 중화한 후 디클로로메탄으로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(메탄올/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 (S)-2-(5-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(78 mg, 수율 72%)를 수득하였다. 수득한 (S)-2-(5-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 9.16 (d, J=1.8 Hz, 1H), 8.27 (dd, J=8.2, 2.3 Hz, 1H), 7.46 (d, J=8.2 Hz, 1H), 7.16 (s, 1H), 4.60 (dd, J=14.0, 6.2 Hz, 1H), 4.06-4.19 (m, 2H), 3.98 (s, 2H), 3.59 (td, J=9.6, 4.7 Hz, 4H), 2.79 (dt, J=22.0, 5.0 Hz, 4H), 2.46-2.55 (m, 1H), 1.99-2.08 (m, 1H), 1.58 (d, J=6.4 Hz, 3H).
실시예 32: (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온)의 제조
하기 반응식 26에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-32의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 26]
(1) 단계 A: 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페놀의 제조
제조예 11에서 제조된 화학식 k의 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-사이클로펜타[d]피리미딘(200 mg, 0.845 mmol), (4-하이드록시페닐)보로닉산(175 mg, 1.268 mmol), 테트라키스(트리페닐포스핀)팔라듐(O)(49 mg, 0.042 mmol)과 소듐카보네이트 용액(2M, 1.27 ml, 2.54 mmol)을 1,4-디옥산 20 ml에 녹인 후 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 물을 넣어 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여과액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/3 중량비)로 정제하여 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페놀(130 mg, 0.44 mmol, 수율 52%)를 수득하였다. 수득한 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페놀는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.69 (d, 2H), 6.70 (d, 2H), 3.24 (m, m, 2H), 2.69 (s, 3H), 2.65 (m, 2H).
(2) 단계 B: tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페놀(130 mg, 0.44 mmol)와 상기 제조예 3에서 제조된 화학식 c의 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(203 mg, 0.66 mmol)와 포타슘 카보네이트(183 mg, 1.33 mmol)을 디메틸포름아마이드 10 ml에 녹인 후, 상온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 에틸아세테이트로 녹인 후 포화염화소듐 용액으로 세척하였다. 이후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(160 mg, 0.31 mmol, 수율 70%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.97 (dd, J=6.9, 2.3 Hz, 2H), 7.07 (dd, J=6.9, 1.8 Hz, 2H), 4.78 (s, 2H), 3.57 (q, J=5.6 Hz, 4H), 3.39-3.44 (m, 4H), 3.18-3.22 (m, 2H), 2.66 (s, 3H), 2.63 (m, 2H), 1.46 (s, 9H).
(3) 단계 C: tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(160 mg, 0.31 mmol)와 3-클로로퍼벤조익산(70%, 189 mg, 0.77 mmol)을 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 싸이오황산 나트륨 용액과 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 순차적으로 첨가하고, 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(메탄올/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(141 mg, 0.26 mmol, 수율 84%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 질량분석법(MS) 측정을 통해 합성되었음을 확인하였다.
MS 552.6, 574.6 (Na+)
(4) 단계 D: tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 C에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(141 mg, 0.26 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄설포네이트(173 mg, 0.37 mmol)와 포타슘 카보네이트(127 mg, 0.92 mmol)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 과량의 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(95 mg, 0.18 mmol, 수율 58%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.90 (d, 2H), 7.02 (d, 2H), 4.75 (s, 2H), 4.55 (m, 1H), 4.13 (m, 1H), 4.05 (m, 1H), 3.57 (m, 2H), 3.40 (m, 4H), 3.05 (m, 2H), 2.50 (m, 3H), 2.00 (m, 1H), 1.56 (d, 3H), 1.43 (s, 9H).
(5) 단계 E: (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 D에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(95 mg, 0.18 mmol)와 트리플루오로아세트산 1 ml를 디클로로메탄 3 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(7N 암모니아 메탄올 용액/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(55 mg, 0.12 mmol, 수율 69%)를 수득하였다. 수득한 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.88 (d, 2H), 7.01 (d, 2H), 4.71 (s, 2H), 4.54 (m, 1H), 4.13 (m, 1H), 4.03 (m, 1H), 3.56 (m, 2H), 3.51 (m, 2H), 3.05 (m, 2H), 2.81 (m, 4H), 2.52 (m, 2H), 2.48 (m, 1H), 1.97 (m, 1H), 1.55 (d, 3H).
실시예 33: (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온)의 제조
하기 반응식 27에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-33의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 27]
(1) 단계 A: 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페놀의 제조
제조예 11에서 제조된 화학식 k의 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-사이클로펜타[d]피리미딘(200 mg, 0.845 mmol), (3-플루오로-4-하이드록시페닐)보로닉산(198 mg, 1.27 mmol), 테트라키스(트리페닐포스핀)팔라듐(O)(49 mg, 0.042 mmol)과 소듐카보네이트 용액(2M, 1.27 ml, 2.54 mmol)을 1,4-디옥산 20 ml에 녹인 후 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 물을 넣어 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여과액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/3 중량비)로 정제하여 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페놀(260 mg, 0.83 mmol, 수율 98%)를 수득하였다. 수득한 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페놀은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.8 (d, 1H), 7.72 (2H, 1H), 7.13 (t, 1H), 3.24 (m, 2H), 2.67 (s, 3H), 2.66 (m, 2H).
(2) 단계 B: tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페놀(260 mg, 0.83 mmol)과 제조예 3에서 제조된 화학식 c의 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(307 mg, 1.00 mmol)와 포타슘 카보네이트(345 mg, 345 mmol)을 디메틸포름아마이드 10 ml에 녹인 후, 상온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 에틸아세테이트로 녹인 후 포화염화소듐 용액으로 세척하였다. 이후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(447 mg, 0.83 mmol, 수율 100%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 질량분석법(MS) 측정으로 합성되었음을 확인하였다.
MS 538.6, 560.6 (Na+)
(3) 단계 C: tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(447 mg, 0.83 mmol)와 3-클로로퍼벤조익산(70%, 512 mg, 2.08 mmol)을 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 싸이오황산 나트륨 용액과 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 순차적으로 첨가하고, 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(메탄올/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(420 mg, 0.74 mmol, 수율 89%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 질량분석법(MS) 측정을 통해 합성되었음을 확인하였다.
MS 570.6, 592.6 (Na+)
(4) 단계 D: tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 C에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(420 mg, 0.74mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄설포네이트(481 mg, 1.02 mmol)와 포타슘 카보네이트(127 mg, 0.92 mmol)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 과량의 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(320 mg, 0.57 mmol, 수율 77%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.79 (d, 1H), 7.66 (d, 1H). 7.13 (t, 1H), 4.83 (s, 2H), 4.58 (m, 1H), 4.16 (m, 1H), 4.08 (m, 1H), 3.59 (m, 4H), 3.50 (m, 2H), 3.40 (m, 2H), 2.59-2.40 (m, 3H), 2.03 (m, 1H), 1.58 (d, 3H), 1.45 (s, 9H).
(5) 단계 E: (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 D에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(320 mg, 0.57 mmol)와 트리플루오로아세트산 1 ml를 디클로로메탄 3 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(7N 암모니아 메탄올 용액/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(150 mg, 0.33 mmol, 수율 58%)를 수득하였다. 수득한 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2-플루오로페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.73 (dd, 1H), 7.62 (d, 1H), 7.08 (t, 1H), 4.80 (s, 2H), 4.53 (m, 1H), 4.12 (m, 1H), 4.04 (m, 1H), 3.55 (m, 4H), 3.04 (m, 2H), 2.85 (m, 4H), 2.51 (m, 2H), 2.48 (m, 1H), 1.99 (m, 1H), 1.54 (d, 3H).
실시예 34: (S)-2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온)의 제조
하기 반응식 28에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-34의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 28]
(1) 단계 A: 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페놀의 제조
제조예 11에서 제조된 화학식 k의 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-사이클로펜타[d]피리미딘(200 mg, 0.845 mmol), (3,5-디플루오로-4-하이드록시페닐)보로닉산(176 mg, 1.01 mmol), 테트라키스(트리페닐포스핀)팔라듐(O)(49 mg, 0.042 mmol)과 소듐카보네이트 용액(2M, 1.27 ml, 2.54 mmol)을 1,4-디옥산 20 ml에 녹인 후 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 물을 넣어 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여과액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/3 중량비)로 정제하여 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-플루오로페놀(214 mg, 0.647 mmol, 수율 76%)를 수득하였다. 수득한 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페놀은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.66 (dd, J=16.3, 7.8 Hz, 2H), 3.73 (s, 1H), 3.32-3.18 (m, 2H), 2.07 (s, 1H), 1.58 (s, 3H), 1.28 (t, J=7.0 Hz, 1H).
(2) 단계 B: tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페놀(214 mg, 0.647 mmol)과 제조예 3에서 제조된 화학식 c의 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(238 mg, 0.77 mmol)와 포타슘 카보네이트(282 mg, 2.04 mmol)을 디메틸포름아마이드 10 ml에 녹인 후, 상온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 에틸아세테이트로 녹인 후 포화염화소듐 용액으로 세척하였다. 이후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(310 mg, 0.556 mmol, 수율 85%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 7.63 (d, J=9.2 Hz, 2H), 5.01-4.91 (m, 3H), 3.63 (d, J=4.0 Hz, 2H), 3.52 (d, J=35.4 Hz, 10H), 3.24 (t, J=6.6 Hz, 2H), 1.50 (d, J=3.1 Hz, 9H).
(3) 단계 C: tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(310 mg, 0.556 mmol)와 3-클로로퍼벤조익산(70%, 288 mg, 1.67 mmol)을 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 싸이오황산 나트륨 용액과 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 순차적으로 첨가하고, 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(메탄올/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(244 mg, 0.414 mmol, 수율 74%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.81-7.67 (m, 2H), 5.04 (s, 2H), 3.63 (s, 2H), 3.54 (d, J=8.5 Hz, 4H), 3.49 (s, 3H), 3.42 (t, J=6.6 Hz, 2H), 2.90-2.71 (m, 2H), 1.51 (s, 9H).
(4) 단계 D: tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 C에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(244 mg, 0.41 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,2S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄설포네이트(150 mg, 0.49 mmol) 와 포타슘 카보네이트(171 mg, 1.24 mmol)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 과량의 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(228 mg, 0.39 mmol, 수율 94%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 7.62-7.48 (m, 2H), 4.91 (s, 2H), 4.58 (q, J=6.7 Hz, 1H), 4.25-4.01 (m, 2H), 3.69-3.39 (m, 8H), 3.09 (d. J=3.7 Hz, 2H), 2.67-2.42 (m, 3H), 1.62-1.55 (m, 3H), 1.47 (d, J=12.8 Hz, 10H), 1.26 (t, J=7.2 Hz, 1H).
(5) 단계 E: (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 D에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(0.18 mmol)와 트리플루오로아세트산 1 ml를 디클로로메탄 3 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(7N 암모니아 메탄올 용액/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(139 mg, 0.2828 mmol, 수율 73%)를 수득하였다. 수득한 (S)-4-(2-(4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOD) δ 7.55 (dd, J=15.3, 5.5 Hz, 2H), 5.00 (s, 2H), 4.60-4.45 (m, 1H), 4.17-3.93 (m, 2H), 3.64-3.44 (m, 4H), 3.15-2.99 (m, 2H), 2.95-2.75 (m, 4H), 2.64-2.40 (m, 3H), 2.11-1.89 (m, 1H), 1.61-1.47 (m, 3H).
실시예 35: (S)-2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온)의 제조
하기 반응식 29에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-35의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 29]
(1) 단계 A: 2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페놀의 제조
제조예 11에서 제조된 화학식 k의 4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-사이클로펜타[d]피리미딘(200 mg, 0.845 mmol), (3-클로로-4-하이드록시페닐)보로닉산(174 mg, 1.01 mmol), 테트라키스(트리페닐포스핀)팔라듐(O)(49 mg, 0.042 mmol)과 소듐카보네이트 용액(2M, 1.27 ml, 2.54 mmol)을 1,4-디옥산 20 ml에 녹인 후 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완결된 후 반응용액에 물을 넣어 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여과액을 감압농축한 후 컬럼 크로마토그래피(에틸아세테이트/헥산=1/3 중량비)로 정제하여 2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페놀(224 mg, 0.68 mmol, 수율 80%)를 수득하였다. 수득한 2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페놀은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 8.07 (d, J=1.7 Hz, 1H), 7.84 (dd, J=8.5, 2.1 Hz, 1H), 7.22-7.02 (m, 1H), 3.22 (t, J=6.6 Hz, 2H), 2.75-2.55 (m, 5H).
(2) 단계 B: tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)-2,6-디플루오로페놀(224 mg, 0.681 mmol)과 제조예 3에서 제조된 화학식 c의 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(251 mg, 0.81 mmol)와 포타슘 카보네이트(282 mg, 2.04 mmol)을 디메틸포름아마이드 10 ml에 녹인 후, 상온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 에틸아세테이트로 녹인 후 포화염화소듐 용액으로 세척하였다. 이후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(333 mg, 0.59 mmol, 수율 88 %)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.22 (s, 1H), 8.01 (d, J=7.9 Hz, 1H), 7.21 (d, J=8.8 Hz, 1H), 4.93 (s, 2H), 3.72-3.55 (m, 4H), 3.57-3.46 (m, 5H), 3.46-3.34 (m, 4H), 2.88-2.70 (m, 2H), 1.49 (s, 9H).
(3) 단계 C: tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(333 mg, 0.559 mmol)와 3-클로로퍼벤조익산(70%, 310 mg, 1.779 mmol)을 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 싸이오황산 나트륨 용액과 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 순차적으로 첨가하고, 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(메탄올/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(329 mg, 0.566 mmol, 수율 93%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 8.22 (s, 1H), 8.01 (d, J=7.9 Hz, 1H), 7.21 (d, J=8.8 Hz, 1H), 4.93 (s, 2H), 3.72-3.55 (m, 4H), 3.57-3.46 (m, 5H), 3.46-3.34 (m, 4H), 2.88-2.70 (m, 2H), 1.49 (s, 9H).
(4) 단계 D: tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 C에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(329 mg, 0.56 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일] 메탄술포네이트(204 mg, 0.67 mmol)와 포타슘 카보네이트(232 mg, 1.68 mmol)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 과량의 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(299 mg, 0.51 mmol, 수율 92%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 8.03 (d, J=1.8 Hz, 1H), 7.81 (d, J=8.5 Hz, 1H), 7.11 (d, J=8.5 Hz, 1H), 4.86 (s, 2H), 4.59 (dt, J=20.0, 6.3 Hz, 1H), 4.26-4.01 (m, 3H), 3.72-3.51 (m, 4H), 3.44 (d, J=35.1 Hz, 4H), 3.20-2.99 (m, 2H), 2.66-2.39 (m, 3H), 2.12-1.94 (m, 1H), 1.61-1.57 (m, 3H), 1.52-1.38 (m, 9H).
(5) 단계 E: (S)-2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 D에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(299 mg, 0.51 mmol)와 트리플루오로아세트산 1 ml를 디클로로메탄 3 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(7N 암모니아 메탄올 용액/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 (S)-2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(179 mg, 0.37 mmol, 수율 72%)를 수득하였다. 수득한 (S)-2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOD) δ 7.97 (d, J=1.8 Hz, 1H), 7.85-7.66 (m, 1H), 7.08-6.91 (m, 1H), 5.12-4.87 (m, 2H), 4.49 (dt, J=19.8, 6.3 Hz, 1H), 4.17-3.88 (m, 2H), 3.71-3.40 (m, 4H), 3.14-2.93 (m, 2H), 2.93-2.60 (m, 4H), 2.65-2.35 (m, 3H), 2.10-1.89 (m, 1H), 1.72-1.18 (m, 3H).
실시예 36: (S)-2-(2-(클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(1,4-디아제판-1-일)에탄-1-온)의 제조
하기 반응식 30에서와 같이, 단계 A 내지 E의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-36의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 30]
(1) 단계 A: 2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페놀의 제조
상기 실시예 35의 (1)과 동일하게 실시하여 2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페놀을 제조하였다.
(2) 단계 B: tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페놀(205 mg, 0.62 mmol)과 제조예 4에서 제조된 화학식 d의 tert-부틸 4-(2-브로모아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트(240 mg, 0.74 mmol)와 포타슘 카보네이트(258 mg, 1.87 mmol)을 디메틸포름아마이드 10 ml에 녹인 후, 상온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 에틸아세테이트로 녹인 후 포화염화소듐 용액으로 세척하였다. 이후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트(303 mg, 0.53 mmol, 수율 85%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.11 (s, 1H), 7.88 (d, J=8.5 Hz, 1H), 7.14 (d, J=8.8 Hz, 1H), 4.90 (d, J=7.9 Hz, 2H), 3.78-3.11 (m, 12H), 2.76-2.57 (m, 5H), 2.03-1.81 (m, 2H), 1.60 (d, J=11.0 Hz, 6H), 1.48 (s, 6H), 1.46 (s, 4H).
(3) 단계 C: tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-아제판-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸티오)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트(303 mg. 0.532 mmol)와 3-클로로퍼벤조익산(70%, 189 mg, 0.77 mmol)을 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 싸이오황산 나트륨 용액과 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 순차적으로 첨가하고, 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화 소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(메탄올/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트(281 mg, 0.467 mmol, 수율 87%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 8.22 (d, J=22.3 Hz, 1H), 8.06-7.93 (m, 1H), 7.17 (d, J=8.8 Hz, 1H), 4.93 (d, J=6.7 Hz, 2H), 3.79-3.29 (m, 12H), 2.88-2.69 (m, 2H), 2.05-1.81 (m, 2H), 1.47 (d, J=10.1 Hz, 9H).
(4) 단계 D: (S)-tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 C에서 제조된 tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트(281 mg, 0.24 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]헵탄-메탄술포네이트(170 mg, 0.56 mmol)와 포타슘 카보네이트(193 mg, 1.40 mmol)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 과량의 물을 넣고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 (S)-tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트(255 mg, 0.43 mmol, 수율 92%)를 수득하였다. 수득한 (S)-tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 8.04 (s, 1H), 7.82 (d, J=7.9 Hz, 1H), 7.13 (s, 1H), 4.61 (s, 1H), 4.26-4.04 (m, 4H), 3.72 (s, 3H), 3.66-3.42 (m, 1H), 3.44-3.27 (m, 2H), 3.12 (s, 3H), 2.67-2.48 (m, 2H), 2.02 (d, J=49.4 Hz, 4H), 1.61 (d, J=6.4 Hz, 5H), 1.47 (d, J=9.5 Hz, 12H).
(5) 단계 E: (S)-2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(1,4-디아제판-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 D에서 제조된 (S)-tert-부틸 4-(2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)아세틸)-1,4-디아제판-1-카르복실레이트(255 mg, 0.43 mmol)와 트리플루오로아세트산 1 ml를 디클로로메탄 3 ml에 녹인 후, 상온에서 10시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액에 포화 소듐 바이카보네이트 용액을 첨가하고 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(7N 암모니아 메탄올 용액/디클로로메탄=1/9 중량비)로 정제하여 (S)-2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(190 mg, 0.368 mmol, 수율 90%)를 수득하였다. 수득한 (S)-2-(2-클로로-4-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)페녹시)-1-(1,4-디아제판-1-일)에탄-1-온은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOD) δ 8.07 (s, 1H), 7.88 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.16 (t, J=8.2 Hz, 1H), 5.02 (d, J=9.5 Hz, 2H), 4.57 (q, J=6.6 Hz, 1H), 4.19-3.98 (m, 2H), 3.75-3.57 (m, 4H), 3.14 (t, J=6.4 Hz, 2H), 3.03 (t, J=5.3 Hz, 1H), 2.97-2.79 (m, 3H), 2.66-2.43 (m, 3H), 2.05 (d, J=9.5 Hz, 1H), 1.94 (d, J=11.3 Hz, 1H), 1.80 (t, J=5.8 Hz, 1H), 1.57 (d, J=6.4 Hz, 3H).
실시예 37: (S)-2-((5-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온)의 제조
하기 반응식 31에서와 같이, 단계 A 내지 C의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-37의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 31]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-((5-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(317 mg, 1.18 mmol), 제조예 17에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(792 mg, 1.77 mmol), 포타슘 카보네이트(489 mg, 3.54 mmol)을 1,2-디메톡시에탄/물 20 ml(4/1 중량비)에 녹인 후, 5분간 탈기과정을 실시하였다. 1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센-팔라듐(II)디클로라이드디클로로메탄 복합체(48 mg, 0.059 mmol)을 넣고 60℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 에틸아세테이트로 묽힌 후 물과 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(디클로로메탄/메탄올=19/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-((5-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(367 mg, 0.66 mmol, 수율 56%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-((5-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ 8.87 (d, J=2.1 Hz, 1H), 8.48 (dd, J=8.7, 2.3 Hz, 1H), 7.16 (d, J=8.8 Hz, 1H), 5.23 (s, 2H), 3.54 (s, 3H), 3.45 (d, J=24.1 Hz, 8H), 3.29-3.23 (m, 2H), 2.87-2.67 (m, 2H), 1.41 (d, J=12.8 Hz, 9H).
(2) 단계 B: tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((5-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(367 mg, 0.66 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄설포네이트(241 mg, 0.79 mmol), 포타슘 카보네이트(274 mg, 1.98 mmol)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후, 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 감압농축액에 에틸아세테이트를 넣고 포화 염화소듐 수용액으로 세척하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(332 mg, 0.60 mmol, 수율 91%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 8.88 (d, J=2.1 Hz, 1H), 8.25 (dd, J=8.7, 2.3 Hz, 1H), 7.00 (d, J=8.5 Hz, 1H), 5.10 (s, 2H), 4.71-4.47 (m, 1H), 4.10 (dd, J=21.8, 2.1 Hz, 3H), 3.62 (s, 2H), 3.48 (d, J=30.5 Hz, 6H), 3.09 (d, J=6.7 Hz, 2H), 2.57 (s, 2H), 2.04-1.99 (m, 1H), 1.58 (d, J=6.1 Hz, 3H), 1.48 (s, 9H).
(3) 단계 C: (S)-2-((5- (7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(332 mg, 0.60 mmol)와 트리플루오로아세트산 2 ml를 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후, 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 감압농축액에 포화 암모늄 수용액을 넣은 후, 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(7N 암모니아 메탄올 용액/디클로로메탄=1/10 중량비)로 정제하여 (S)-2-((5- (7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(230 mg, 0.51 mmol, 수율 84%)를 수득하였다. 수득한 (S)-2-((5- (7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOD) δ 8.72 (s, 1H), 8.35 (d, J=8.5 Hz, 1H), 7.02 (d, J=8.8 Hz, 1H), 5.17 (s, 2H), 4.57 (q, J=7.0 Hz, 1H), 4.19-3.98 (m, 2H), 3.55 (d. J=4.9 Hz, 4H), 3.13 (d, J=4.6 Hz, 2H), 2.96-2.75 (m, 4H), 2.66-2.44 (m, 3H), 2.05 (d, J=9.8 Hz, 1H), 1.57 (d, J=6.1 Hz, 3H).
실시예 38: (S)-2-((3-클로로-5-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온)의 제조
하기 반응식 32에서와 같이, 단계 A 내지 C의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-38의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 32]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-((3-클로로-5-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
4-클로로-7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘(260 mg, 0.97 mmol), 제조예 18에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((3-클로로-5-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(776 mg, 1.61 mmol), 포타슘 카보네이트(416 mg, 3.00 mmol)을 1,2-디메톡시에탄/물 20 ml(4/1 중량비)에 녹인 후, 5분간 탈기과정을 실시하였다. 1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센-팔라듐(II)디클로라이드디클로로메탄 복합체(41 mg, 0.05 mmol)을 넣고 60℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 에틸아세테이트로 묽힌 후 물과 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(디클로로메탄/메탄올=19/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-((3-클로로-5-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(560 mg, 0.95 mmol, 수율 98%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-((3-클로로-5-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 질량분석법(MS) 측정을 통해 합성되었음을 확인하였다.
MS 588.0, 610.0 (Na+)
(2) 단계 B: tert-부틸 (S)-4-(2-((3-클로로-5-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((3-클로로-5-(7,7-디플루오로-2-(메틸설포닐)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(560 mg, 0.95 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)- 7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄술포네이트(490 mg, 1.62 mmol), 포타슘 카보네이트(525 mg, 3.80 mmol) 을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후, 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 감압농축액에 에틸아세테이트를 넣고 포화 염화소듐 수용액으로 세척하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-((3-클로로-5-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(299 mg, 0.51 mmol, 수율 54%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 (S)-4-(2-((3-클로로-5-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 8.55 (s, 1H), 8.32 (s, 1H), 5.17 (s, 2H), 4.59 (td, J=13.4, 6.7 Hz, 1H), 4.18-4.00 (m, 2H), 3.70-3.37 (m, 8H), 3.09 (d, J=3.1 Hz, 2H), 2.68-2.40 (m, 3H), 1.53-1.41 (m, 9H).
(3) 단계 C: (S)-2-((3-클로로-5- (7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-((3-클로로-5-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(299 mg, 0.52 mmol), 트리플루오로아세트산 2 ml를 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후, 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 감압농축액에 포화 암모늄 수용액을 넣은 후, 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(7N 암모니아 메탄올 용액/디클로로메탄=1/10 중량비)로 정제하여 (S)-2-((3-클로로-5- (7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(214 mg, 0.44 mmol, 수율 86%)를 수득하였다. 수득한 (S)-2-((3-클로로-5-(7,7-디플루오로-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6,7-디하이드로-5H-사이클로펜타[d]피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, MeOD) δ 8.62 (s, 1H), 8.41 (d, J=1.8 Hz, 1H), 5.30-5.19 (m, 2H), 4.58 (q, J=6.7 Hz, 1H), 4.21 -3.98 (m, 2H), 3.56 (d, J=4.3 Hz, 4H), 3.14 (d, J=3.1 Hz, 2H), 2.97-2.74 (m, 4H), 2.68-2.44 (m, 3H), 2.20-1.98 (m, 1H), 1.57 (d, J=6.1 Hz, 3H).
실시예 39: (S)-2-((5-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 33에서와 같이, 단계 A 내지 C의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-39의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 33]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-((5-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
2,4-디클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘(456 mg, 2.10 mmol), 제조예 17에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((5- (4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(1128 mg, 2.52 mmol), 소듐 카보네이트(2M, 3.15 ml, 6.30 mmol)을 1,4-디옥산 20 ml에 녹인 후, 5분간 탈기과정을 실시하였다. 1,1'-비스(디페닐포스피노)페로센-팔라듐(II)디클로라이드(44 mg, 0.063 mmol)을 넣고 60℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 에틸아세테이트로 묽힌 후 물과 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하여 tert-부틸 4-(2-((5-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(976 mg, 1.945 mmol, crude)를 수득하여 별도의 정제 과정 없이 이후 반응을 진행하였다.
(2) 단계 B: tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((5-(2-클로로-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(976 mg, 1.945 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보난-1-일]메탄설포네이트(708 mg, 2.334 mmol), 포타슘 카보네이트(274 mg, 1.98 mmol)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후, 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 감압농축액에 에틸아세테이트를 넣고 포화 염화소듐 수용액으로 세척하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(558 mg, 1.041 mmol, 수율 53%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 8.84 (s, 1H), 8.31 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.13 (s, 1H), 7.01 (d, J=8.5 Hz, 1H), 5.12 (s, 2H), 4.62 (q, J=6.6 Hz, 1H), 4.10-4.19 (m, 2H), 3.47-3.64 (m, 8H), 2.52 (m, 1H), 2.06 (m, 1H), 1.60 (d, J=7.6 Hz, 3H), 1.49 (s, 9H).
(3) 단계 C: (S)-2-((5-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸) 피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(558 mg, 1.040 mmol), 트리플루오로아세트산 2 ml를 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후, 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 감압농축액에 포화 소듐 바이카보네이트 수용액을 넣은 후, 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(7N 암모니아 메탄올 용액/디클로로메탄=1/10 중량비)로 정제하여 (S)-2-((5- 2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(230 mg, 0.528 mmol, 수율 50%)를 수득하였다. 수득한 (S)-2-((5- 2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (500MHz, CDCl3) δ 8.84 (s, 1H), 8.30 (d, J=8.5 Hz, 1H), 7.13 (s, 1H), 7.02 (d, J=8.5 Hz, 1H), 5.12 (s, 2H), 4.62 (q, J=6.6 Hz, 1H), 4.08-4.21 (m, 2H), 3.65 (s, 2H), 3.53 (s, 2H), 2.93 (d, J=24.7 Hz, 4H), 2.53 (dd, J=8.5, 5.5 Hz, 1H), 2.03-2.08 (m, 1H), 1.61 (d, J=5.8 Hz, 3H).
실시예 40: (S)-2-((5-(5-메틸-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
하기 반응식 34에서와 같이, 단계 A 내지 C의 과정을 순차적으로 실시하여 화학식 1-40의 표제 화합물을 제조하였다.
[반응식 34]
(1) 단계 A: tert-부틸 4-(2-((5-(2-클로로-5-메틸-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
2,4-디클로로-5-메틸-6-(트리플루오로메틸)피리미딘(253 mg, 1.095 mmol), 제조예 17에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((5- (4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-디옥사보롤렌-2-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(588 mg, 1.314mmol), 소듐 카보네이트(2M, 1.64 ml, 3.29 mmol)을 1,4-디옥산 20 ml에 녹인 후, 5분간 탈기과정을 실시하였다. 비스(트리페닐포스핀) 팔라듐(II)(23 mg, 0.033 mmol)을 넣고 60℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 에틸아세테이트로 묽힌 후 물과 포화 염화소듐 수용액으로 씻어준 후, 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(디클로로메탄/메탄올=2/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 4-(2-((5-(2-클로로-5-메틸-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(275 mg, 0.533 mmol, 수율 48%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 4-(2-((5-(2-클로로-5-메틸-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.39 (d, J=1.8 HZ, 1H), 7.91 (dd, J=8.7, 2.3 Hz, 1H), 7.03 (d, J=8.7 Hz, 1H), 5.09 (s, 2H), 3.44-3.60 (m, 8H), 2.50 (d, J=1.8 Hz, 3H), 1.46 (s, 9H).
(2) 단계 B: tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(5-메틸-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트의 제조
상기 단계 A에서 제조된 tert-부틸 4-(2-((5-(2-클로로-5-메틸-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(0.533 mmol), (2S)-2-메틸아제티딘[(1R,4S)-7,7-디메틸-2-옥소-노보란--1-일]메탄설포네이트(0.64 mmol), 포타슘 카보네이트(221 mg, 1.60 mmol)을 아세토나이트릴 20 ml에 녹인 후, 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 감압농축액에 에틸아세테이트를 넣고 포화 염화소듐 수용액으로 세척하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(에틸아세테이트/헥산=1/1 중량비)로 정제하여 tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(5-메틸-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(232 mg, 0.42 mmol, 수율 79%)를 수득하였다. 수득한 tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(5-메틸-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트는 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.32 (d, J=2.7 Hz, 1H), 7.82 (dd, J=8.5, 2.5 Hz, 1H), 6.95-6.98 (m, 1H), 5.07 (s, 2H), 4.51 (m, 1H), 3.98-4.12 (m, 2H), 3.56 (m, 8H), 2.50-2.34 (1H), 2.02 (m, 2H), 1.47 (s, 9H).
(3) 단계 C: (S)-2-((5-(5-메틸-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온의 제조
상기 단계 B에서 제조된 tert-부틸 (S)-4-(2-((5-(5-메틸-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)아세틸)피페라진-1-카르복실레이트(0.60 mmol), 트리플루오로아세트산 2 ml를 디클로로메탄 20 ml에 녹인 후, 상온에서 18시간 동안 교반하였다. 반응이 완료된 후 반응용액을 감압농축하였다. 감압농축액에 포화 암모늄 수용액을 넣은 후, 에틸아세테이트로 추출하였다. 유기층을 무수황산 마그네슘으로 건조하고 여과하였다. 여액을 감압농축하고, 감압농축액을 컬럼 크로마노그래피(7N 암모니아 메탄올 용액/디클로로메탄=1/10 중량비)로 정제하여 (S)-2-((5-(5-메틸-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온(95.4 mg, 0.212 mmol, 수율 50%)를 수득하였다. 수득한 (S)-2-((5-(5-메틸-2-(2-메틸아제티딘-1-일)-6-(트리플루오로메틸)피리미딘-4-일)피리딘-2-일)옥시)-1-(피페라진-1-일)에탄-1-온은 1H NMR 분석을 통해 합성되었음을 확인하였다.
1H NMR (400MHz, CDCl3) δ 8.32 (d, J=2.3 Hz, 1H), 7.81 (dd, J=8.7, 2.3 Hz, 1H), 6.97 (d, J=8.2 Hz, 1H), 5.07 (s, 2H), 4.50 (q, J=6.9 Hz, 1H), 3.96-4.10 (m, 2H), 3.55 (m, 4H), 2.89 (m, 4H), 2.39-2.48 (m, 1H), 2.25 (d, J=1.8 Hz, 3H), 1.96-2.06 (m, 1H), 1.52 (d, J=6.4 Hz, 3H).
실험예: 케토헥소카이네이즈 저해제 in vitro 활성 측정
대장균에서 케토헥소카이네이즈(KHK)를 발현하고 His tag를 이용하여 정제하였다. 정제된 KHK의 활성을 측정하기 위해 BellBrook Labs의 Transcreener ADP2 TR-FRET Red Asssay kit를 이용하였다. 적정 농도의 KHK 단백질과 ATP, 과당(fructose)이 포함된 용액을 15분 반응시킨 후 TR-FRET을 이용, 생성된 ADP의 양을 측정하는 방법을 사용하였다. 케토헥소카이네이즈(KHK) 저해제의 활성을 보기 위해서는 케토헥소카이네이즈(KHK)와 적정 농도의 저해제를 30분간 우선 반응시킨후 그 다음 케토헥소카이네이즈(KHK)의 기질이 포함된 용액과 15분 반응시켰다. 그리고 TR-FRET을 위한 반응을 1시간 시킨 후 PerkinElmer의 Envision기기를 이용하여 형광을 측정하였다. BellBrook Lab에서 발행한 TR-FRET의 optimization 절차에 따라 Envision기기의 설정값을 결정하였다.
케토헥소카이네이즈(KHK) 저해제의 각 농도별 결과 값은 665nm 파장과 615nm 파장의 비율로 결정된다. 각 저해제의 농도별 665/615 비율 값은 ADP 표준곡선(standard curve)을 바탕으로 ADP 농도로 환산하였고, 통계 소프트웨이 (Prizm)에서 모리슨 방정식(Morrison equation)을 사용하여 저해 활성 Ki값을 구하였다. 한편, Ki 값은 저해제와 효소의 결합 친화성(binding affinity)을 나타내는 값으로, 낮은 값일수록 좋은 저해 활성을 나타냄을 의미한다.
| 구분 |
실시예 |
| 1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
10 |
11 |
12 |
13 |
14 |
| Ki |
C |
D |
D |
C |
C |
B |
D |
D |
D |
D |
D |
C |
D |
C |
| 구분 |
실시예 |
| 15 |
16 |
17 |
18 |
19 |
20 |
21 |
22 |
23 |
24 |
25 |
26 |
27 |
28 |
| Ki |
D |
D |
D |
D |
D |
D |
D |
B |
C |
C |
D |
D |
C |
C |
| 구분 |
실시예 |
| 29 |
30 |
31 |
32 |
33 |
34 |
35 |
36 |
37 |
38 |
39 |
40 |
| Ki |
C |
D |
D |
C |
C |
D |
D |
D |
D |
D |
D |
D |
상기 표 1에서, A≥1μM, B=1~0.1μM, C=0.1~0.01μM, D≤0.01μM을 나타낸다. 상기 표 1의 결과를 통해, 본 발명에 따른 실시예 1 내지 실시예 40의 화합물이 케토헥소카이네이즈에 대해 우수한 저해활성을 가짐을 확인할 수 있다.