WO2018105667A1 - Aldh3a1検出蛍光プローブ - Google Patents
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- G01N2333/90203—Oxidoreductases (1.) acting on the aldehyde or oxo group of donors (1.2)
Definitions
- the present invention is a novel fluorescent probe. More specifically, the present invention relates to a fluorescent probe capable of detecting ALDH3A1.
- ALDH is an enzyme that oxidizes various aldehydes to carboxylic acids.
- Table 1 shows ALDH isoforms and their characteristics that are relatively actively studied in the field of stem cell and cancer research.
- ALDH1A1 and ALDH1A3 are stem cell markers in normal and cancer cells.
- ALDH3A1 is studied from the viewpoint of anticancer drug resistance because it metabolizes and invalidates some anticancer drugs.
- ALDH3A1 is reported to be involved in cell proliferation by knockdown experiments of lung cancer cell lines (Non-patent Document 1), and in prostate cancer cells, ALDH3A1 is associated with spheroid formation ability and further malignant transformation of cancer tissue. There is a report that it is involved (Non-Patent Document 2).
- ALDH3A1 is considered to have an important function, its research is significantly delayed compared to ALDH1.
- One reason is the presence or absence of a fluorescent probe for ALDH.
- ALDH1 already has a fluorescent probe (ALDEFLUOR (registered trademark)) that can discriminate ALDH1 activity in living cells, sort cells based on their levels, and perform further experiments in succession. Yes.
- the stem cell ability includes self-replication ability and differentiation ability, but it is necessary to show this in an experiment to show that ALDH1 is a stem cell marker. In this case, it is necessary to sort out the cells according to the level of ALDH1 activity using living cells.
- MTT assay a dye that is widely used because it is simple and compatible with high throughput.
- Non-patent Document 3 the activity of ALDH varies from cell to cell even within the same cell line, but there are many reports that this ALDH activity is related to anticancer drug resistance.
- An object of the present invention is to provide an ALDH3A1 detection fluorescent probe that can be used in a flow cytometer that can be adapted to living cells.
- the present inventors diligently studied to solve the above problems, and found that benzaldehyde is effective as a reaction substrate with ALDH3A1, and further binds benzaldehyde and a fluorophore with a linker having a specific structure. Thus, it was found that a fluorescent probe that specifically reacts with ALDH3A1 can be provided.
- the present inventors have found that the benzaldehyde at the reaction site is highly hydrophobic, and therefore, when combined with a highly hydrophobic fluorophore, the water solubility of the entire probe is low even if metabolized to the carboxylic acid type. It was found that the carboxylic acid type probe could not stay and accumulate in the cell.
- an ALDH3A1 detection fluorescent probe that can be used in a flow cytometer that can be adapted to living cells can be provided by setting the hydrophilicity level when the fluorescent probe becomes a carboxylic acid type to a specific range, The present invention has been completed.
- a compound represented by the following general formula (I) or a salt thereof (Where R a represents a hydrogen atom or an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms; T is the following divalent group: -N (R b )-, -C (R c ) 2- -O- (R b represents an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms, R c represents a hydrogen atom or an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms, and each R c may be the same or different.
- R a represents a hydrogen atom or an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms
- T is the following divalent group: -N (R b )-, -C (R c ) 2- -O-
- R b represents an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms
- R c represents a hydrogen atom or an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms
- each R c may be the same or different.
- L represents a linker
- the retention time of the HPLC chromatogram measured under the following conditions is greater than 6.9 minutes in the case of the aldehyde form of the compound, and 6.9 minutes or less in the case of the carboxylic acid form of the compound. Or a salt thereof.
- HPLC conditions solvent A 0.01M ammonium formate / water, solvent B 80% acetonitrile 0.01M ammonium formate / water, 20% solvent B for 2.5 minutes followed by 20% to 100% solvent.
- the bridging group is selected from a substituted or unsubstituted alkylene group having 1 to 6 carbon atoms, — (CH 2 —CH 2 —O) m — (m is 1 or 2), or a combination thereof.
- R 1 represents a hydrogen atom or 1 to 4 identical or different monovalent substituents present on the benzene ring
- R 2 represents a hydrogen atom, a monovalent substituent or a bond
- R 3 and R 4 each independently represents a hydrogen atom, an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a halogen atom or a bond
- R 5 and R 6 each independently represents an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, an aryl group or a bond, provided that X is not an oxygen atom
- R 7 and R 8 each independently represent a hydrogen atom, an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a halogen atom or a bond
- X represents an oxygen atom or a silicon atom
- Heterocyclyl or heteroaryl is alkyl having 1 to 6 carbon atoms, alkenyl having 2 to 6 carbon atoms, or alkynyl having 2 to 6 carbon atoms, aralkyl group having 6 to 10 carbon atoms, or 6 to 10 carbon atoms.
- R 1 to R 8 and X are as defined in formula (II);
- R 9 and R 10 each independently represent a hydrogen atom or an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, R 9 and R 10 together may form a 4-7 membered heterocyclyl containing the nitrogen atom to which R 9 and R 10 are attached;
- R 9 or R 10 , or both R 9 and R 10 together with R 3 or R 7 , respectively, are 5- to 7-membered containing the nitrogen atom to which R 9 or R 10 is
- Heterocyclyl or heteroaryl is alkyl having 1 to 6 carbon atoms, alkenyl having 2 to 6 carbon atoms, or alkynyl having 2 to 6 carbon atoms, aralkyl group having 6 to 10 carbon atoms, or 6 to 10 carbon atoms.
- R 11 and R 12 each independently represent a hydrogen atom, an alkyl group having 1 to 3 carbon atoms or a bond; R 11 and R 12 together may form a 4-7 membered heterocyclyl containing the nitrogen atom to which R 11 and R 12 are attached; R 11 or R 12 , or both R 11 and R 12 together with R 4 or R 8 , respectively, are 5- to 7-membered containing the nitrogen atom to which R 11 or R 12 is attached.
- Heterocyclyl or heteroaryl is alkyl having 1 to 6 carbon atoms, alkenyl having 2 to 6 carbon atoms, or alkynyl having 2 to 6 carbon atoms, aralkyl group having 6 to 10 carbon atoms, or 6 to 10 carbon atoms.
- Optionally substituted with an alkyl-substituted alkenyl group of * Represents a bonding site with L in the formula (I) at an arbitrary position on the benzene ring;
- L is bonded at any position on the benzene ring and at least one position selected from any positions of R 2 to R 12 .
- an ALDH3A1 detection fluorescent probe that can be used in a flow cytometer that can be adapted to living cells.
- ALDH3A1 activity as a cell can be detected using living cells. That is, if ground cells are used, it is possible to evaluate the expression level and activity of ALDH3A1 using conventional techniques. However, by examining the activity of ALDH3A1 while the cells are alive, It becomes possible to approach the essence of biology, such as what kind of fate to follow.
- OE21 cells in which ALDH3A1 was inhibited by CB7 20 ⁇ M were used.
- the Western blotting of OE21 cells into which non-target shRNA (ctrl) or shRNA (KD) for ALDH3A1 was introduced is shown.
- Flow cytometry using OE21 cells into which shRNA has been introduced is shown (Probe5 50 ⁇ M, MK-571 200 ⁇ M).
- an “alkyl group” or an alkyl part of a substituent containing an alkyl part (such as an alkoxy group), for example, unless otherwise specified, has, for example, 1 to 6 carbon atoms, preferably 1 to 4 carbon atoms, More preferably, it means an alkyl group composed of straight, branched, cyclic, or a combination thereof having about 1 to 3 carbon atoms.
- alkyl group for example, methyl group, ethyl group, n-propyl group, isopropyl group, cyclopropyl group, n-butyl group, sec-butyl group, isobutyl group, tert-butyl group, cyclopropyl
- methyl group, an n-pentyl group, an n-hexyl group and the like can be mentioned.
- halogen atom may be any of a fluorine atom, a chlorine atom, a bromine atom, or an iodine atom, preferably a fluorine atom, a chlorine atom, or a bromine atom.
- One embodiment of the present invention is a compound represented by the following general formula (I) or a salt thereof.
- R a represents a hydrogen atom or an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms. 1 to 4 R a are present on the benzene ring, and these may be the same or different. In one preferred embodiment of the present invention, each R a is a hydrogen atom.
- T is the following divalent group: -N (R b )-, -C (R c ) 2- -O- Selected from.
- R b represents an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms, preferably a methyl group or an ethyl group.
- R c represents a hydrogen atom or an alkyl group having 1 to 4 carbon atoms, and each R c may be the same or different.
- T is —N (R b ) —.
- L represents a linker.
- the linker include various substituents that bond the fluorophore and the nitrogen atom.
- the linker is represented by X- (S), X represents a linking group and S, if present, represents a bridging group.
- the linking group is preferably an amide group (—CONH—), an alkylamide group (—R—CONH—), an ester group (—COO—), an alkyl ester group (—R—COO—), an alkyl ether group ( -RO-) or an alkylcarbonyl group (-R-CO-).
- R represents a hydrocarbon group, preferably alkyl having 1 to 8 carbon atoms.
- the bridging group is preferably a substituted or unsubstituted alkylene group having 1 to 6 carbon atoms; ethylene glycol group, diethylene glycol group (that is, — (CH 2 —CH 2 —O) m — (m is 1 or 2)); or a combination thereof.
- the aldehyde group (—CHO) can be introduced at any position on the benzene ring, but is preferably introduced at the p-position with respect to T.
- the fluorophore is preferably selected from xanthene dyes (Tokyo Magenta fluorophore, Tokyo Green fluorophore, rhodamine fluorophore, rhodol fluorophore), BODIPY fluorophore or cyanine fluorophore.
- xanthene dyes Tokyo Magenta fluorophore, Tokyo Green fluorophore, rhodamine fluorophore, rhodol fluorophore
- BODIPY fluorophore or cyanine fluorophore.
- the principle schematically shown in FIG. 1 is used as a mechanism for detecting ALDH3A1 highly active cells using a fluorescent probe.
- the aldehyde type probe is hydrophobic and can penetrate the cell membrane.
- the probe when the probe is metabolized to the carboxylic acid type by the activity of ALDH3A1, it becomes water-soluble due to the negative charge of the carboxylic acid and becomes impermeable to the membrane.
- the principle is that carboxylic acid type probes that have become membrane-impermeable only in cells with high activity stay and accumulate.
- an ALDH3A1 detection fluorescent probe that can be used in a flow cytometer that can be adapted to living cells is provided by setting the hydrophilicity level of the compound of formula (I) to a carboxylic acid type within a specific range. Is possible.
- the retention time of the HPLC chromatogram is a measure of hydrophilicity.
- One preferred embodiment of the present invention is a compound represented by the general formula (I) or a salt thereof, and the retention time of the HPLC chromatogram measured under the following conditions is 6 in the case of the aldehyde form of the compound. Greater than 9 minutes, or less than 6.9 minutes in the case of the carboxylic acid form of the compound.
- HPLC conditions Solvent A 0.01M ammonium formate / water, solvent B 80% acetonitrile 0.01M ammonium formate / water, 20% solvent B for 2.5 minutes followed by 20% to 100% solvent B
- a C18 column HP 3 ⁇ m, inner diameter: 2.1 mm, length: 150 mm, GL Science
- flow rate 500 ⁇ l / min
- a xanthene dye (Tokyo Magenta fluorophore, Tokyo Green fluorophore, rhodamine fluorophore, so that the compound represented by the formula (I) has the retention time of the above-mentioned HPLC chromatogram.
- Any fluorophore selected from a rhodole fluorophore), a BODIPY fluorophore, or a cyanine fluorophore can be used.
- R 1 represents a hydrogen atom or 1 to 4 identical or different monovalent substituents present on the benzene ring.
- the type of monovalent substituent represented by R 1 is not particularly limited, and examples thereof include alkyl groups having 1 to 6 carbon atoms, alkenyl groups having 1 to 6 carbon atoms, alkynyl groups having 1 to 6 carbon atoms, carbon It is preferably selected from the group consisting of several to six alkoxy groups, hydroxyl groups, carboxy groups, sulfonyl groups, alkoxycarbonyl groups, halogen atoms, or amino groups. These monovalent substituents may further have one or more arbitrary substituents.
- the alkyl group represented by R 1 may have one or more halogen atoms, carboxy groups, sulfonyl groups, hydroxyl groups, amino groups, alkoxy groups, and the like.
- the alkyl group represented by R 1 is a halogen atom.
- An alkyl group, a hydroxyalkyl group, a carboxyalkyl group, or an aminoalkyl group may be used.
- each R 1 is a hydrogen atom.
- R 2 represents a hydrogen atom, a monovalent substituent or a bond.
- the kind of the monovalent substituent represented by R 2 is not particularly limited, but for example, as in R 1 , for example, an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, an alkenyl group having 1 to 6 carbon atoms, and 1 to 6 carbon atoms.
- R 2 is an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, preferably a methyl group, a carboxyl group, a methoxy group, or a hydroxymethyl group.
- R 3 and R 4 each independently represent a hydrogen atom, an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, or a halogen atom.
- the alkyl group may contain one or more halogen atoms, carboxy groups, sulfonyl groups, hydroxyl groups, amino groups, alkoxy groups,
- the alkyl group represented by R 3 or R 4 may be a halogenated alkyl group, a hydroxyalkyl group, a carboxyalkyl group, or the like.
- R 3 and R 4 are each independently preferably a hydrogen atom or a halogen atom. When R 3 and R 4 are both hydrogen atoms, or R 3 and R 4 are both fluorine atoms or chlorine atoms. More preferred.
- R 5 and R 6 each independently represent an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, an aryl group or a bond, provided that when X is an oxygen atom, R 5 and R 6 are present. do not do.
- R 5 and R 6 are preferably each independently an alkyl group having 1 to 3 carbon atoms, and more preferably both R 5 and R 6 are methyl groups.
- the alkyl group represented by R 5 and R 6 may contain one or more halogen atoms, carboxy groups, sulfonyl groups, hydroxyl groups, amino groups, alkoxy groups, and the like, for example, R 5 or R 6 represents The alkyl group may be a halogenated alkyl group, a hydroxyalkyl group, a carboxyalkyl group, or the like.
- R 5 or R 6 represents an aryl group
- the aryl group may be either a monocyclic aromatic group or a condensed aromatic group, and the aryl ring has one or more ring-constituting heteroatoms. (For example, a nitrogen atom, an oxygen atom, or a sulfur atom) may be contained.
- the aryl group is preferably a phenyl group.
- One or more substituents may be present on the aryl ring.
- the substituent for example, one or two or more halogen atoms, carboxy groups, sulfonyl groups, hydroxyl groups, amino groups, alkoxy groups and the like may be present.
- R 7 and R 8 each independently represent a hydrogen atom, an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a halogen atom or a bond, and are the same as those described for R 3 and R 4. . It is preferred that R 7 and R 8 are both hydrogen atoms, both chlorine atoms, or both fluorine atoms.
- X represents an oxygen atom or a silicon atom.
- X is an oxygen atom.
- L can be bonded at any position on the benzene ring and at least one position selected from any of R 2 to R 8 .
- L can be bonded to any position of the benzene ring bonded to the xanthene ring skeleton, but is preferably bonded to the 4-position or 5-position of the benzene ring.
- One preferable embodiment of the present invention is a compound represented by the following formula (IIa) or a salt thereof.
- R a , R b and L are as described for formula (I), and R 3 , R 4 , R 7 and R 8 are as described for formula (II).
- R 1 to R 8 and X in the formula (III) are as defined in the formula (II).
- R 9 and R 10 each independently represent a hydrogen atom, an alkyl group having 1 to 3 carbon atoms, or a bond. Furthermore, R 9 and R 10 may form a heterocyclyl 4-7 membered containing a nitrogen atom attached is R 9 and R 10 together. R 9 or R 10 , or both R 9 and R 10 together with R 4 or R 8 , respectively, contain a nitrogen atom to which R 9 or R 10 is bonded. Member heterocyclyl or heteroaryl may be formed. The ring member may contain 1 to 3 further heteroatoms selected from the group consisting of oxygen atom, nitrogen atom and sulfur atom, and the heterocyclyl or heteroaryl has 1 to 6 carbon atoms.
- heterocyclyl or heteroaryl examples include, but are not limited to, pyrrolidine, piperidine, hexamethyleneimine, pyrrole, imidazole, pyrazole, oxazole, thiazole and the like.
- * represents a bonding site with L in the formula (I) at an arbitrary position on the benzene ring.
- L is bonded at any position on the benzene ring and at least one position selected from any positions of R 2 to R 10 .
- L can be bonded to any position of the benzene ring bonded to the xanthene ring skeleton, but is preferably bonded to the 4-position or 5-position of the benzene ring.
- R 1 to R 8 and X are as described for the formula (II).
- R 9 and R 10 each independently represent a hydrogen atom or an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms. Furthermore, R 9 and R 10 may form a heterocyclyl 4-7 membered containing a nitrogen atom attached is R 9 and R 10 together. Examples of the heterocyclyl include azetidine, pyrrolidine and the like, and these heterocyclyl may be substituted with a substituent such as alkyl having 1 to 6 carbon atoms. Also, R 9 or R 10 , or both R 9 and R 10 together with R 3 or R 7 each contain a nitrogen atom to which R 9 or R 10 is attached 5-7 Member heterocyclyl or heteroaryl may be formed.
- the ring member may contain 1 to 3 further heteroatoms selected from the group consisting of oxygen atom, nitrogen atom and sulfur atom, and the heterocyclyl or heteroaryl has 1 to 6 carbon atoms. Or an alkyl-substituted alkenyl group having 2 to 6 carbon atoms, or an alkynyl group having 2 to 6 carbon atoms, an aralkyl group having 6 to 10 carbon atoms, or an alkyl-substituted alkenyl group having 6 to 10 carbon atoms. .
- heterocyclyl or heteroaryl examples include, but are not limited to, pyrrolidine, piperidine, hexamethyleneimine, pyrrole, imidazole, pyrazole, oxazole, thiazole and the like.
- R 11 and R 12 each independently represent a hydrogen atom, an alkyl group having 1 to 3 carbon atoms, or a bond.
- R 11 and R 12 may together form a 4-7 membered heterocyclyl containing the nitrogen atom to which R 11 and R 12 are attached.
- the heterocyclyl include azetidine, pyrrolidine and the like, and these heterocyclyl may be substituted with a substituent such as alkyl having 1 to 6 carbon atoms.
- R 11 or R 12 , or both R 11 and R 12 together with R 4 or R 8 contain a nitrogen atom to which R 11 or R 12 is bonded 5-7 Member heterocyclyl or heteroaryl may be formed.
- the ring member may contain 1 to 3 further heteroatoms selected from the group consisting of oxygen atom, nitrogen atom and sulfur atom, and the heterocyclyl or heteroaryl has 1 to 6 carbon atoms. Or an alkyl-substituted alkenyl group having 2 to 6 carbon atoms, or an alkynyl group having 2 to 6 carbon atoms, an aralkyl group having 6 to 10 carbon atoms, or an alkyl-substituted alkenyl group having 6 to 10 carbon atoms. .
- heterocyclyl or heteroaryl examples include, but are not limited to, pyrrolidine, piperidine, hexamethyleneimine, pyrrole, imidazole, pyrazole, oxazole, thiazole and the like.
- * represents a bonding site with L in the formula (I) at an arbitrary position on the benzene ring.
- L is bonded at any position on the benzene ring and at least one position selected from any positions of R 2 to R 12 .
- R 13 and R 14 each independently represent a hydrogen atom or an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
- R 15 independently represents a hydrogen atom, a carboxyl group or a sulfonic acid group.
- n an integer of 1 to 3.
- * represents the coupling
- R 16 to R 22 are each independently a hydrogen atom, an alkyl group having 1 to 6 carbon atoms, a carbonyl group, an allyl group, an aryl group, a pyrrole group, a thiophene group, a furan group, or a sulfonic acid.
- L is bonded at at least one position selected from any position of R 16 to R 22 .
- the compound of the present invention may have one or more asymmetric carbons depending on the type of substituent, and may have a stereoisomer such as an optical isomer or a diastereoisomer. Pure forms of stereoisomers, any mixture of stereoisomers, racemates, and the like are all within the scope of the present invention.
- the compound of the present invention represented by the general formula (I) or a salt thereof may exist as a hydrate or a solvate, and any of these substances is included in the scope of the present invention.
- solvents such as ethanol, acetone, isopropanol, can be illustrated.
- Another aspect of the present invention is an ALDH3A1 detection fluorescent probe comprising a compound represented by the general formula (I) and having the above-mentioned HPLC chromatogram retention time or a salt thereof.
- the RP-UPLC analysis was measured by Waters Acquity UPLC H-Class / ACQUITY UPLC PDA e ⁇ detector / Xevo TQD quadrupole MS / MS analyzer.
- LC / MS analysis was measured with an Agilent 1200 Series Diode Array Detector / 6130 quadruple MS analyzer. Imaging acquired the image by Leica TCS SP8. For flow cytometry, analysis was performed with BD FACS Canto II, and cell sorting was performed with BD FACS Aria.
- Compound 3 is based on the method described in the paper (Giulio Cas et al. “Site-specific traceless coupling of potent cytotoxic drugs to recombinant antibodies for pharmacodelivery” J. Am. Chem. Soc., 2012 134, pp5887-5892). -Synthesized from cyanobenzaldehyde.
- Compound 3 (10 mg, 25.6 ⁇ mol) and 8 mL of distilled THF were added to a 50 mL round bottom flask.
- DIEA 5.4 ⁇ L, 36.5 ⁇ mol
- BODIPY FL SE dissolved in 1 mL of THF were sequentially added to the reaction solution, heated to 40 ° C. on an oil bath, and stirred for 3 hours.
- reaction solution was diluted with 20 mL of CH 2 Cl 2 , and this was washed with 10 mL of citric acid aqueous solution (10 w / v%), 2 mL of NaHCO 3 aqueous solution 10 mL, and saturated saline 10 mL.
- the organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate, the solution was filtered, and the filtrate was concentrated under reduced pressure.
- the concentrated residue was purified by column chromatography using silica gel as a carrier to obtain Compound 4. A part of the purified product was contaminated with a compound in which acetal was deprotected, but it was directly used in the next reaction.
- Compound 7 was synthesized by the method known in the paper (Dalla Via et al. “DNA-targeting pyrroloquinoline-linked butenone and chalcones: Synthesis and biological evaluation” Eur. J. Med. Chem., 2009 44, pp2854-2861).
- 7 (2 mg, 14 ⁇ mol) and BODIPY FL (3 mg, 7 ⁇ mol) were weighed and 150 ⁇ L of CH 2 Cl 2 was added.
- HATU (15.6 mg 39.5 ⁇ mol) and DIEA (50 ⁇ L) were added to the solution, and the mixture was stirred overnight at room temperature under an argon atmosphere.
- Compound 12 was prepared according to the method described in a paper (Julien Massin, J. et al, “Near-infrared solid-state emitters based on isophorone: Synthesis, crystal structure and spectroscopic properties” Chem. Mater., 2011, 23, pp862-873). Synthesized. Compound 12 (730 mg) was weighed in a 50 mL round bottom flask, and distilled MeOH 40 mL and triethyl orthoformate 1.09 mL were added. After adding 12 drops of concentrated hydrochloric acid, the mixture was heated at 40 ° C. for 3 hours, and then cooled to room temperature. The reaction was diluted with MeOH, CH 2 Cl 2 , sat.
- Compound 18 was synthesized by a method known in the literature (Lorella Pasquinucci et al, “Evaluation” of “N-substitution” in 6,7-benzomorphan “compounds” “Bioorg. Med. Chem., 2010, 18, 18, pp4975-4982).
- a dry 100 mL round bottom two-necked flask 4 g, 26.2 mmol of 2-benzyloxyethanol are weighed and dissolved in 20 mL of distilled THF, and then the inside of the container is filled with an argon atmosphere using a three-way cock equipped with a balloon filled with argon. And sealed with a rubber septum.
- Reduction of the azide group of Compound 25 was performed according to the synthesis method of Compound 14 shown above. Using Compound 25 (823 mg, 2.67 mmol), LiAlH 4 (203 mg, 5.34 mmol) and 10 mL of THF, Compound 26 was obtained as a colorless liquid at 629 mg in a yield of 83%.
- Probes 1 to 3 The reactivity of Probes 1 to 3 synthesized above to ALDH1A1, ALDH1A3, and ALDH3A1 was examined.
- the UPCL chromatogram was run from 5% acetonitrile 0.01M ammonium formate / water to 95% acetonitrile 0.01M ammonium formate / water linear gradient over 5 minutes at a flow rate of 800 ⁇ L / min.
- the aldehyde type and carboxylic acid type probes were detected by absorbance at a wavelength of 504 nm, and it was confirmed that the m / z of the MS spectrum at each peak matched the expected m / z.
- ALDEFLUOR is known to react with ALDH1A1 and ALDH1A3, it was performed only with ALDH3A1. The results are shown in Table 2.
- Probe1 and Probe3 were esophageal squamous cell carcinoma cell lines (OE21 cell line), which are ALDH3A1 highly expressing cells.
- OE21 cell line esophageal squamous cell carcinoma cell lines
- CB7 ALDH3A1 specific inhibitor
- Probe2 can be used in the same manner as ALDEFLUOR, which can detect ALDH1 highly active cells. Therefore, imaging using A549 cells reported in the literature that ALDEFLUOR can detect ALDH1A1 highly active cells is possible. However, no clear difference in brightness was observed with respect to the negative control.
- BODIPY is a hydrophobic probe, but Probes 1 to 3 are aromatic aldehydes having strong hydrophobicity unlike short-chain aliphatic aldehydes contained in the reaction part of ALDEFLUOR. In other words, the combination of hydrophobic substances shifted the water-solubility of the entire probe toward the hydrophobic side, and it was thought that even the carboxylic acid type was not so hydrophilic as to be non-permeable to the membrane.
- Probes 4 and 5 in order to make the probe more hydrophilic, a fluorophore that is more hydrophilic than BODIPY was used, and Tokyo Green (TG) was used as the fluorophore.
- TG Tokyo Green
- As the reaction part DEAB having a relatively high specificity for ALDH3A1 was used. Further, from the results of Probes 1 and 2, since the binding part also affected the reactivity to ALDH, Probes 4 and 5 used two types of linkers having different binding part lengths.
- the HPCL chromatogram shows that solvent A is 0.01M ammonium formate / water, solvent B is 80% acetonitrile 0.01M ammonium formate / water, 20% B for 2.5 minutes, then 20% to 100% B for 5 minutes.
- the measurement was performed under the condition of a linear gradient (flow rate: 500 ⁇ l / min).
- Probes containing BODIPY were detected by absorbance at a wavelength of 504 nm and probes containing TG at a wavelength of 495 nm, and it was confirmed that the m / z of the MS spectrum at each peak matched the expected m / z.
- Three independent experiments were performed and the mean ⁇ S. D. Was calculated. The obtained data is shown in Table 3 and FIG.
- Aldehyde type probes of compounds 1, 2, and 3 were detected after 8 minutes, while aldehyde type Probes 4, 5 and ALDEFLUOR were detected in the first half of 7 minutes.
- the probe 1 with the fastest detection time among the carboxylic acid type probes 1, 2, and 3 was 7.098 minutes, while the carboxylic acid type ALDEFLUOR was 6.741 minutes and the carboxylic acid type Probe 5 was further reduced. Detected earlier. Since the imaging of Probe 1 was not successful, it was considered that there was a threshold at which the membrane permeability changed rapidly between 6.741 minutes and 7.098 minutes (the band in FIG. 2).
- Km and Kcat were calculated by fitting the reaction rate at each probe concentration obtained to the Michaelis-Menten equation. For fitting, Kaleida Graph ver. 4.1 (HULLINKS Inc.) was used. The obtained data is shown in Table 4. Since the Km was relatively small, it was considered that the reaction rate of the probe was close to Vmax at the actual probe use concentration. Therefore, as a measure of the specificity of ALDH1A1 / ALDH3A1, the Kcat ratio (Kcat / ALDH1A1 of ALDH3A1 with respect to Probe1, Probe3, and Probe5) Kcat) was calculated (Table 5). Probe5 is approximately 6 times more reactive with ALDH3A1 than ALDH1A1 under the same ALDH concentration under a probe concentration close to Vmax, making it a more specific probe for ALDH3A1. .
- Example 2 Cell imaging using Probe 5 Imaging was performed using Probe5 and an esophageal squamous cell carcinoma cell line (OE21 cell line), which are cells highly expressing ALDH3A1. 40 ⁇ M Probe 5 was added to the medium (RPMI 1640, 10% FBS, 15 mM HEPES, Phenol Red free), and the cells were incubated at 37 ° C. for 90 minutes. The cells were then washed with an ice-cold medium and observed under a confocal microscope.
- the medium RPMI 1640, 10% FBS, 15 mM HEPES, Phenol Red free
- a sample to which a specific ALDH3A1 inhibitor (1-[(4-Fluorophenyl) sulfonyl] -2-methyl-1H-benzimidazole, CB710 ⁇ M) was added was used as a negative control.
- Excitation was performed with a 488 nm laser, and detection was performed at a wavelength of 500 to 570 nm. As shown in FIG. 3, high-luminance cells were observed with respect to the negative control.
- Example 3 (Flow cytometry using Probe 5) Flow cytometry was performed using Probe5 and OE21 cells. Cells were trypsinized, passed through a cell strainer (40 ⁇ m, Corning), and cell density was measured. A cell suspension of 500 ⁇ l was prepared in a medium containing 40 ⁇ M Probe 5 so as to be 2.5 to 5 ⁇ 10 5 / ml, and cultured at 37 ° C. for 90 minutes. After the reaction, centrifugation was performed at 1500 rpm for 3 minutes to remove the supernatant, and the cells were washed with an ice-cooled medium and centrifuged to remove the medium.
- the cells were suspended again in 100 ⁇ l of the medium, 4 ⁇ l of SYTOX (registered trademark) Red dead cell stain (Thermo Fisher) was added for the purpose of removing dead cells, allowed to stand on ice for 5 minutes, and then 150 ⁇ l of the medium was added.
- SYTOX registered trademark
- Red dead cell stain Thermo Fisher
- a sample to which CB7 (10 ⁇ M) was added was used as a negative control. Analysis was performed with FACS Canto II (BD Biosciences). It was excited with a blue layer (488 nm), and the brightness of Probe 5 in each cell was detected with a FITC channel (515 to 545 nm). Each sample was subjected to removal of doublets and removal of dead cells, and then about 30,000 cells were analyzed.
- the positive gate was set according to the ALDEFLUOR assay in the range from the vicinity of the upper limit of luminance in the negative control to the region above the upper limit so that the cells present in the gate in the negative control sample were below 3% at the maximum. Three independent experiments were performed. As shown in FIG. 4, the positive rate was 10-15%.
- Example 4 (Flow cytometry by ALDH3A1 knockdown) For the purpose of confirming that the positive group in flow cytometry using OE21 cells and compound 5 is due to the activity of ALDH3A1, knockdown of ALDH3A1 using small interference RNA (siRNA) was performed, and flow cytometry was performed. Two siRNAs that were confirmed to be effective from Thermo Fisher (Silencer (registered trademark) Select, s1243 and s1244) and a negative control (Silencer (registered trademark) Negative Control # 1) were purchased.
- siRNA small interference RNA
- RNAiMAX Lipofectamine (registered trademark) RNAiMAX was purchased as Transfection Reagent and Opti-MEM (registered trademark) was purchased from Thermo Fisher as a diluent. According to the procedure, 300 ⁇ l of siRNA-Lipofectamine complex was prepared according to the procedure so that siRNA was 10 nM and Lipofectamine was 3%, of which 250 ⁇ l and 2.5 ml of OE21 cell suspension were mixed and seeded in 6 well dish. . The effect of knockdown was confirmed by Western blotting after 6 days (Figure 6a). When flow cytometry was performed under the same conditions as described above using Probe 5 under these conditions, the positive rate markedly decreased in the ALDH3A1 knockdown group, and the probe 5 positive cells were caused by the activity of ALDH3A1. ( Figure 5).
- Example 5 (Confirmation of ALDH3A1 expression level by sort-out)
- the activity of ALDH is regulated by the expression level.
- ALDEFLUOR assay at least the activities of ALDH1A1, ALDH1A3, and ALDH2 are detected without distinction. Therefore, Western blotting is usually performed using an antibody against the target ALDH isoform when sorting out.
- a high-brightness group and a low-brightness group were sorted out using Probe5 and OE21 cells, and Western blotting was performed.
- FACS Aria II (BD Biosciences) was used.
- the assay was performed in the same manner as in normal flow cytometry, and a positive gate (Top) and a gate (Bottom) were placed in the lower 10-15% of the lower luminance side, and the cells were sorted out. A lysate was prepared from the obtained cells, and Western blotting was performed. Each band was detected and quantified by an luminescence method using ImageQuant LAS 4000mini (GE healthcare).
- the expression level of ALDH3A1 was standardized with ACTB, a housekeeping gene, and the expression level of ALDH3A1 was compared between Top and Bottom. As shown in FIG. 6, the difference in the expression level was not so much as expected.
- Example 6 Optimization by active extracellular discharge of Probe and its control
- MRP multidrug resistance-associated protein
- MK-571 is an agent that inhibits multiple isoforms of MRP.
- the active excretion of Probe 5 was markedly suppressed (FIG. 7b). Therefore, when flow cytometry was performed with MK-571 (200 ⁇ M) added (FIG. 7c), a marked improvement was obtained with a positive rate of about 90%.
- Example 7 (Flow cytometry with ALDH3A1 knockdown cells combined with MK-571) Flow cytometry combined with MK-571 markedly improved the positive rate.
- siRNA was used to knockdown ALDH3A1 in OE21 cells and flow cytometry.
- FIG. 8 When the assay was performed with MK-571 200 ⁇ M, Probe 5 50 ⁇ M, and negative control CB7 at 20 ⁇ M, cells treated with negative control siRNA showed a positive rate of about 90%. From the decrease, it was confirmed that the positive cells in the assay in which the positive rate was markedly improved using MK-571 were derived from the activity of ALDH3A1.
- Example 8 (Separation and sort-out of positive and negative cells)
- cells with ALDH3A1 knocked down constantly by short hairpin RNA (shRNA) were prepared.
- ShRNA against ALDH3A and Non-target shRNA as a negative control were introduced into OE21 cells using lentivirus.
- a lysate is prepared using a negative control cell (ctrl) in which ALDH3A1 is not knocked down and a cell in which ALDH3A1 is constantly knocked down (KD), Western blotting is performed, and ALDH3A1 is knocked down prominently Was confirmed (FIG. 9a).
- Compound 5 can detect ALDH3A1 highly active cells when used in combination with an MRP inhibitor. Moreover, by using a cell sorter, ALDH3A1 high-activity cells / low-activity cells can be sorted, and can be used for biological experiments continuously.
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Abstract
【解決課題】 生細胞に適応可能なフローサイトメーターに用いることができるALDH3A1検出蛍光プローブを提供すること
【解決手段】 一般式(I)で表される化合物又はその塩であって、以下の条件で測定したHPLCクロマトグラムの保持時間は、当該化合物のアルデヒド型の場合においては6.9分より大きく、当該化合物のカルボン酸型の場合においては6.9分以下である、前記化合物又はその塩。
Description
本発明は、新規な蛍光プローブ。より具体的には、ALDH3A1を検出できる蛍光プローブに関する。
ALDHは種々のアルデヒドをカルボン酸に酸化する酵素である。ヒトのALDHは19のアイソフォームが知られており、それぞれ得意とする基質を有する(基質特異性)。
幹細胞や癌の研究分野において比較的盛んに研究が行われているALDHアイソフォームとその特徴を表1に示す。
幹細胞や癌の研究分野において比較的盛んに研究が行われているALDHアイソフォームとその特徴を表1に示す。
マーカーとしての知見が蓄積しているアイソフォームはALDH1A1及びALDH1A3であり、正常および癌細胞において幹細胞マーカーであるとの多くの報告がなされている。一方で、ALDH3A1は一部の抗がん剤を代謝・無効化することから抗がん剤耐性との観点から研究されている。また、ALDH3A1が肺癌細胞株のノックダウン実験により、細胞の増殖に関与しているという報告(非特許文献1)や、前立腺癌細胞においてはALDH3A1がスフェロイド形成能や癌組織の更なる悪性化に関与しているとの報告(非特許文献2)がある。
このように、ALDH3A1は重要な機能を持つと考えられるが、ALDH1と比較してその研究は大幅に遅れている。その理由の1つとして、ALDHに対する蛍光プローブの有無があげられる。ALDH1には生細胞におけるALDH1活性を判別し、その高低に基づいて細胞を分取し、連続して更なる実験を行うことを可能とする蛍光プローブ(ALDEFLUOR(登録商標))がすでに存在している。幹細胞能として自己複製能および分化能があるが、ALDH1が幹細胞マーカーであることを示すにはこれを実験で示す必要がある。この場合、生細胞を使ってALDH1活性の高低に従って細胞をソート・アウトする必要がある。また、抗癌剤の効果をin vitroで調べる場合、MTT assayという色素を用いた生細胞の定量法があり、簡便でHigh throughputにも対応していることから、広く用いられている。
上記のようにALDHの活性は同じ細胞株内でも高低が細胞ごとに異なっているが、このALDH活性の高低と抗癌剤耐性には関連があるとの報告が多数ある(非特許文献3)。抗癌剤投与前後で生細胞のALDH活性の分布をみることにより、抗癌剤耐性とALDH活性の関連性を詳細に検討することが可能である。
このように生細胞に適応可能なALDH3A1のプローブがあればさまざまな研究へ展開することが可能であるが、未だ有用なALDH3A1のプローブは実現していない。
Mol Caner 2008, 7, 87.
Br J Cancer 2014, 110, 2593.
Biomed Pharmacother. 2013 Sep;67(7):669-80. "The role of aldehyde dehydrogenase (ALDH) in cancer drug resistance."
本発明は、生細胞に適応可能なフローサイトメーターに用いることができるALDH3A1検出蛍光プローブを提供することを目的とする。
本発明者等は、上記課題を解決するために鋭意検討したところ、ALDH3A1との反応基質として、ベンズアルデヒドが有効であることを見出し、更にベンズアルデヒドと蛍光団を特定の構造を有するリンカーで結合することにより、ALDH3A1と特異的に反応する蛍光プローブを提供できることを見出した。
また、本発明者等は、蛍光プローブを用いてALDH3A1高活性細胞を検出する際のメカニズムとして、アルデヒド型の蛍光プローブは疎水性で細胞膜を透過可能であるが、ALDH3A1の活性によりプローブがカルボン酸型に代謝されると、カルボン酸の陰性電荷のため水溶性となり膜不透過となるため、ALDH3A1の活性が高い細胞にのみ膜不透過となったカルボン酸型プローブが滞留及び蓄積されるという原理を用いた(図1参照)。
本発明者等は、種々検討したところ、反応部位のベンズアルデヒドの疎水性が高いことから、疎水性の高い蛍光団を組み合わせると、カルボン酸型に代謝されてもプローブ全体としての水溶性が低いために過剰な膜透過性を有し、カルボン酸型プローブを細胞内に滞留及び蓄積できないことを知見した。そこで、蛍光プローブがカルボン酸型になった時の親水性のレベルを特定の範囲とすることにより、生細胞に適応可能なフローサイトメーターに用いることができるALDH3A1検出蛍光プローブを提供できることを見出し、本発明を完成した。
本発明者等は、種々検討したところ、反応部位のベンズアルデヒドの疎水性が高いことから、疎水性の高い蛍光団を組み合わせると、カルボン酸型に代謝されてもプローブ全体としての水溶性が低いために過剰な膜透過性を有し、カルボン酸型プローブを細胞内に滞留及び蓄積できないことを知見した。そこで、蛍光プローブがカルボン酸型になった時の親水性のレベルを特定の範囲とすることにより、生細胞に適応可能なフローサイトメーターに用いることができるALDH3A1検出蛍光プローブを提供できることを見出し、本発明を完成した。
即ち、本発明は、
[1]以下の一般式(I)で表される化合物又はその塩であって、
(式中、
Raは、水素原子又は炭素数1~4のアルキル基を表し;
Tは、以下の二価の基:
-N(Rb)-、
-C(Rc)2-
-O-
から選択され(Rbは、炭素数1~4のアルキル基を表し、Rcは、水素原子又は炭素数1~4のアルキル基を表し、各々のRcは、同じであっても異なっていてもよい);
Lは、リンカーを表し;
は、蛍光団を表し、
前記蛍光団は、キサンテン系色素、BODIPY系蛍光団又はシアニン系蛍光団から選択される)
以下の条件で測定したHPLCクロマトグラムの保持時間は、当該化合物のアルデヒド型の場合においては6.9分より大きく、当該化合物のカルボン酸型の場合においては6.9分以下である、前記化合物又はその塩。
(HPLC条件:溶媒Aを0.01Mギ酸アンモニウム/水、溶媒Bを80%アセトニトリル 0.01Mギ酸アンモニウム/水とし、20%の溶媒Bで2.5分に続いて20%から100%の溶媒B、5分間のリニアグラジエント(流速500μl/分)の条件で行う。)
[2]前記リンカーが、Y-(S)で表され、Yは結合基を表し、Sは存在する場合は架橋基を表す、[1]に記載の化合物又はその塩。
[3]前記結合基が、-CONH-、-R-CONH-、-COO-、-R-COO-、-RO-又は-R-CO-(ここで、Rは炭化水素基を表す)から選択される、[2]に記載の化合物又はその塩。
[4]前記架橋基が、炭素数1~6の置換又は無置換のアルキレン基、-(CH2-CH2-O)m-(mは1又は2である)又はこれらの組合せから選択される、[2]又は[3]に記載の化合物又はその塩。
[5]式(I)における
は、以下の式(II)で表される、[1]~[4]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
R1は、水素原子を示すか、又はベンゼン環上に存在する1ないし4個の同一又は異なる一価の置換基を示し;
R2は、水素原子、一価の置換基又は結合を示し;
R3及びR4は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~6個のアルキル基、ハロゲン原子又は結合を示し;
R5及びR6は、それぞれ独立に、炭素数1~6個のアルキル基、アリール基又は結合を示し、但し、Xが酸素原子の場合は存在しない;
R7及びR8は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~6個のアルキル基、ハロゲン原子又は結合を示し;
Xは、酸素原子又は珪素原子を示し;
*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所を表し、
ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R8のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する。)
[6]以下の式(IIa)で表される、[5]に記載の化合物又はその塩。
(式中、Ra、Rb及びLは式(I)で定義した通りであり、R3、R4、R7、R8は、式(II)で定義した通りである。)
[7]式(I)における
は、以下の式(III)で表される、[1]~[4]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
(式中、R1~R8、Xは、式(II)で定義した通りであり;
R9及びR10は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~3個のアルキル基又は結合を示し、
R9及びR10は一緒になってR9及びR10が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよく、
R9又はR10は、或いは、R9及びR10の両方は、夫々、R4又はR8と一緒になって、R9又はR10が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよく、環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよく;
*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所を表し、
ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R10のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する)
[8]式(I)における
は、以下の式(IV)で表される、[1]~[4]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
(式中、R1~R8、Xは、式(II)で定義した通りであり;
R9及びR10は、それぞれ独立に、水素原子又は炭素数1~6個のアルキル基を示し、
R9及びR10は一緒になってR9及びR10が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよく、
R9又はR10は、或いは、R9及びR10の両方は、夫々、R3又はR7と一緒になって、R9又はR10が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよく、環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよく;
R11及びR12は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~3個のアルキル基又は結合を示し、
R11及びR12は一緒になってR11及びR12が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよく、
R11又はR12は、或いは、R11及びR12の両方は、夫々、R4又はR8と一緒になって、R11又はR12が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよく、環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよく;
*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所を表し、
ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R12のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する。)
[9]式(I)における
は、以下の式(V)で表される、[1]~[4]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
(式中、
R13およびR14は、それぞれ独立に、水素原子又は炭素数1~6個のアルキル基を示し;
R15は、それぞれ独立に、水素原子、カルボキシル基又はスルホン酸基を示し:
nは、1~3の整数を示し;
*は、式(I)のLとの結合箇所を表す。)
[10]式(I)における
は、以下の式(VI)で表される、[1]~[4]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
(式中、R16~R22は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~6個のアルキル基、カルボニル基、アリル基、アリール基、ピロール基、チオフェン基、 フラン基、スルホン酸基、スルホニルアミド基、カルボキシル基、メトキシ基又は結合を示し;
Lは、R16~R22のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する。)
[11][1]~[10]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩を含む、ALDH3A1検出蛍光プローブ。
を、提供するものである。
[1]以下の一般式(I)で表される化合物又はその塩であって、
(式中、
Raは、水素原子又は炭素数1~4のアルキル基を表し;
Tは、以下の二価の基:
-N(Rb)-、
-C(Rc)2-
-O-
から選択され(Rbは、炭素数1~4のアルキル基を表し、Rcは、水素原子又は炭素数1~4のアルキル基を表し、各々のRcは、同じであっても異なっていてもよい);
Lは、リンカーを表し;
は、蛍光団を表し、
前記蛍光団は、キサンテン系色素、BODIPY系蛍光団又はシアニン系蛍光団から選択される)
以下の条件で測定したHPLCクロマトグラムの保持時間は、当該化合物のアルデヒド型の場合においては6.9分より大きく、当該化合物のカルボン酸型の場合においては6.9分以下である、前記化合物又はその塩。
(HPLC条件:溶媒Aを0.01Mギ酸アンモニウム/水、溶媒Bを80%アセトニトリル 0.01Mギ酸アンモニウム/水とし、20%の溶媒Bで2.5分に続いて20%から100%の溶媒B、5分間のリニアグラジエント(流速500μl/分)の条件で行う。)
[2]前記リンカーが、Y-(S)で表され、Yは結合基を表し、Sは存在する場合は架橋基を表す、[1]に記載の化合物又はその塩。
[3]前記結合基が、-CONH-、-R-CONH-、-COO-、-R-COO-、-RO-又は-R-CO-(ここで、Rは炭化水素基を表す)から選択される、[2]に記載の化合物又はその塩。
[4]前記架橋基が、炭素数1~6の置換又は無置換のアルキレン基、-(CH2-CH2-O)m-(mは1又は2である)又はこれらの組合せから選択される、[2]又は[3]に記載の化合物又はその塩。
[5]式(I)における
は、以下の式(II)で表される、[1]~[4]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
R1は、水素原子を示すか、又はベンゼン環上に存在する1ないし4個の同一又は異なる一価の置換基を示し;
R2は、水素原子、一価の置換基又は結合を示し;
R3及びR4は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~6個のアルキル基、ハロゲン原子又は結合を示し;
R5及びR6は、それぞれ独立に、炭素数1~6個のアルキル基、アリール基又は結合を示し、但し、Xが酸素原子の場合は存在しない;
R7及びR8は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~6個のアルキル基、ハロゲン原子又は結合を示し;
Xは、酸素原子又は珪素原子を示し;
*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所を表し、
ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R8のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する。)
[6]以下の式(IIa)で表される、[5]に記載の化合物又はその塩。
(式中、Ra、Rb及びLは式(I)で定義した通りであり、R3、R4、R7、R8は、式(II)で定義した通りである。)
[7]式(I)における
は、以下の式(III)で表される、[1]~[4]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
(式中、R1~R8、Xは、式(II)で定義した通りであり;
R9及びR10は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~3個のアルキル基又は結合を示し、
R9及びR10は一緒になってR9及びR10が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよく、
R9又はR10は、或いは、R9及びR10の両方は、夫々、R4又はR8と一緒になって、R9又はR10が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよく、環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよく;
*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所を表し、
ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R10のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する)
[8]式(I)における
は、以下の式(IV)で表される、[1]~[4]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
(式中、R1~R8、Xは、式(II)で定義した通りであり;
R9及びR10は、それぞれ独立に、水素原子又は炭素数1~6個のアルキル基を示し、
R9及びR10は一緒になってR9及びR10が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよく、
R9又はR10は、或いは、R9及びR10の両方は、夫々、R3又はR7と一緒になって、R9又はR10が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよく、環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよく;
R11及びR12は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~3個のアルキル基又は結合を示し、
R11及びR12は一緒になってR11及びR12が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよく、
R11又はR12は、或いは、R11及びR12の両方は、夫々、R4又はR8と一緒になって、R11又はR12が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよく、環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよく;
*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所を表し、
ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R12のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する。)
[9]式(I)における
は、以下の式(V)で表される、[1]~[4]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
(式中、
R13およびR14は、それぞれ独立に、水素原子又は炭素数1~6個のアルキル基を示し;
R15は、それぞれ独立に、水素原子、カルボキシル基又はスルホン酸基を示し:
nは、1~3の整数を示し;
*は、式(I)のLとの結合箇所を表す。)
[10]式(I)における
は、以下の式(VI)で表される、[1]~[4]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
(式中、R16~R22は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~6個のアルキル基、カルボニル基、アリル基、アリール基、ピロール基、チオフェン基、 フラン基、スルホン酸基、スルホニルアミド基、カルボキシル基、メトキシ基又は結合を示し;
Lは、R16~R22のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する。)
[11][1]~[10]のいずれか1項に記載の化合物又はその塩を含む、ALDH3A1検出蛍光プローブ。
を、提供するものである。
本発明により、生細胞に適応可能なフローサイトメーターに用いることができるALDH3A1検出蛍光プローブを提供することが可能である。
本発明の蛍光プローブにより、ALDH3A1の細胞としての活性を生きた細胞を用いて検出することが可能である。即ち、すりつぶした細胞を用いればALDH3A1の発現量や活性を評価することは従来の技術でも可能であるが、細胞が生きた状態でALDH3A1の活性を調べることにより、高活性の細胞が、その後、どのような運命をたどるか等の生物学の本質により迫ることが可能となる。
本発明の蛍光プローブにより、ALDH3A1の細胞としての活性を生きた細胞を用いて検出することが可能である。即ち、すりつぶした細胞を用いればALDH3A1の発現量や活性を評価することは従来の技術でも可能であるが、細胞が生きた状態でALDH3A1の活性を調べることにより、高活性の細胞が、その後、どのような運命をたどるか等の生物学の本質により迫ることが可能となる。
本明細書において、「アルキル基」又はアルキル部分を含む置換基(例えばアルコキシ基など)のアルキル部分は、特に言及しない場合には例えば炭素数1~6個、好ましくは炭素数1~4個、更に好ましくは炭素数1~3個程度の直鎖、分枝鎖、環状、又はそれらの組み合わせからなるアルキル基を意味している。より具体的には、アルキル基として、例えば、メチル基、エチル基、n-プロピル基、イソプロピル基、シクロプロピル基、n-ブチル基、sec-ブチル基、イソブチル基、tert-ブチル基、シクロプロピルメチル基、n-ペンチル基、n-ヘキシル基などを挙げることができる。
本明細書において「ハロゲン原子」という場合には、フッ素原子、塩素原子、臭素原子、又はヨウ素原子のいずれでもよく、好ましくはフッ素原子、塩素原子、又は臭素原子である。
式(I)において、Raは、水素原子又は炭素数1~4のアルキル基を表す。Raは、ベンゼン環上において、1~4個存在し、これらは同一又は異なっていてもよい。
本発明の1つの好ましい態様においては、Raはいずれも水素原子である。
本発明の1つの好ましい態様においては、Raはいずれも水素原子である。
式(I)において、Tは、以下の二価の基:
-N(Rb)-、
-C(Rc)2-
-O-
から選択される。
ここで、Rbは、炭素数1~4のアルキル基を表し、好ましくは、メチル基、エチル基である。
Rcは、水素原子又は炭素数1~4のアルキル基を表し、各々のRcは、同じであっても異なっていてもよい。
本発明の1つの好ましい態様においては、Tが-N(Rb)-である。
-N(Rb)-、
-C(Rc)2-
-O-
から選択される。
ここで、Rbは、炭素数1~4のアルキル基を表し、好ましくは、メチル基、エチル基である。
Rcは、水素原子又は炭素数1~4のアルキル基を表し、各々のRcは、同じであっても異なっていてもよい。
本発明の1つの好ましい態様においては、Tが-N(Rb)-である。
式(I)において、Lは、リンカーを表す。リンカーとしては、蛍光団と窒素原子を結合する種々の置換基が挙げられる。
本発明の1つの好ましい態様において、リンカーは、X-(S)で表され、Xは結合基を表し、Sは存在する場合は架橋基を表す。
本発明の1つの好ましい態様において、リンカーは、X-(S)で表され、Xは結合基を表し、Sは存在する場合は架橋基を表す。
前記結合基は、好ましくは、アミド基(-CONH-)、アルキルアミド基(-R-CONH-)、エステル基(-COO-)、アルキルエステル基(-R-COO-)、アルキルエーテル基(-RO-)又はアルキルカルボニル基(-R-CO-)から選択される。ここで、Rは炭化水素基を表し、好ましくは炭素数1~8のアルキルである。
前記架橋基は、好ましくは、炭素数1~6の置換又は無置換のアルキレン基;エチレングリコール基、ジエチレングルコール基(即ち、-(CH2-CH2-O)m-(mは1又は2である));又はこれらの組合せから選択される。
式(I)において、アルデヒド基(-CHO)は、ベンゼン環上のいずれの位置に導入することができるが、Tに対してp位に導入することが好ましい、
式(I)における
は、蛍光団を表す。
蛍光団としては、好ましくは、キサンテン系色素(Tokyo Magenta系蛍光団、Tokyo Green系蛍光団、ローダミン系蛍光団、ロドール系蛍光団)、BODIPY系蛍光団又はシアニン系蛍光団から選択される。
は、蛍光団を表す。
蛍光団としては、好ましくは、キサンテン系色素(Tokyo Magenta系蛍光団、Tokyo Green系蛍光団、ローダミン系蛍光団、ロドール系蛍光団)、BODIPY系蛍光団又はシアニン系蛍光団から選択される。
本発明においては、蛍光プローブを用いてALDH3A1高活性細胞を検出する際のメカニズムとして図1で模式的に示した原理を用いた。つまり、アルデヒド型のプローブは疎水性で細胞膜を透過可能であるが、ALDH3A1の活性によりプローブがカルボン酸型に代謝されると、カルボン酸の陰性電荷のため水溶性となり膜不透過となり、ALDH3A1の活性が高い細胞にのみ膜不透過となったカルボン酸型プローブが滞留・蓄積するという原理である。
ここで、本発明の式(I)の化合物の反応部位であるベンズアルデヒドの疎水性が比較的高いため、疎水性の高い蛍光団を組み合わせると、カルボン酸型に代謝されてもプローブ全体としての水溶性が低いために過剰な膜透過性を有し、カルボン酸型プローブを細胞内に滞留及び蓄積できない。そこで、式(I)の化合物においてカルボン酸型になった場合の親水性のレベルを特定の範囲とすることにより、生細胞に適応可能なフローサイトメーターに用いることができるALDH3A1検出蛍光プローブを提供することが可能である。
本発明においては、親水性の尺度としてHPLCクロマトグラムの保持時間を用いるのが好ましい。
本発明の1つの好ましい態様は、一般式(I)で表される化合物又はその塩であって、以下の条件で測定したHPLCクロマトグラムの保持時間は、当該化合物のアルデヒド型の場合においては6.9分より大きく、当該化合物のカルボン酸型の場合においては6.9分以下である、前記化合物又はその塩である。
HPLC条件:溶媒Aを0.01Mギ酸アンモニウム/水、溶媒Bを80%アセトニトリル 0.01Mギ酸アンモニウム/水とし、20%の溶媒Bで2.5分に続いて20%から100%の溶媒B、5分間のリニアグラジエント(流速500μl/分)の条件で行う
カラムとしては、例えば、C18カラム(HP 3 μm、内径:2.1mm、長さ:150mm、ジーエル サイエンス)を好適に用いることができる。
本発明の1つの好ましい態様は、一般式(I)で表される化合物又はその塩であって、以下の条件で測定したHPLCクロマトグラムの保持時間は、当該化合物のアルデヒド型の場合においては6.9分より大きく、当該化合物のカルボン酸型の場合においては6.9分以下である、前記化合物又はその塩である。
HPLC条件:溶媒Aを0.01Mギ酸アンモニウム/水、溶媒Bを80%アセトニトリル 0.01Mギ酸アンモニウム/水とし、20%の溶媒Bで2.5分に続いて20%から100%の溶媒B、5分間のリニアグラジエント(流速500μl/分)の条件で行う
カラムとしては、例えば、C18カラム(HP 3 μm、内径:2.1mm、長さ:150mm、ジーエル サイエンス)を好適に用いることができる。
本発明においては、式(I)で表される化合物が上記のHPLCクロマトグラムの保持時間を具備するように、キサンテン系色素(Tokyo Magenta系蛍光団、Tokyo Green系蛍光団、ローダミン系蛍光団、ロドール系蛍光団)、BODIPY系蛍光団又はシアニン系蛍光団から選択される任意の蛍光団を用いることができる。
式(II)において、R1は、水素原子を示すか、又はベンゼン環上に存在する1ないし4個の同一又は異なる一価の置換基を示す。
R1が示す一価の置換基の種類は特に限定されないが、例えば、炭素数1~6個のアルキル基、炭素数1~6個のアルケニル基、炭素数1~6個のアルキニル基、炭素数1~6個のアルコキシ基、水酸基、カルボキシ基、スルホニル基、アルコキシカルボニル基、ハロゲン原子、又はアミノ基からなる群から選ばれることが好ましい。これらの一価の置換基は更に任意の置換基を1個又は2個以上有していてもよい。例えば、R1が示すアルキル基にはハロゲン原子、カルボキシ基、スルホニル基、水酸基、アミノ基、アルコキシ基などが1個又は2個以上存在していてもよく、例えばR1が示すアルキル基はハロゲン化アルキル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシアルキル基、又はアミノアルキル基などであってもよい。
本発明の1つの好ましい態様においては、R1はいずれも水素原子である。
R1が示す一価の置換基の種類は特に限定されないが、例えば、炭素数1~6個のアルキル基、炭素数1~6個のアルケニル基、炭素数1~6個のアルキニル基、炭素数1~6個のアルコキシ基、水酸基、カルボキシ基、スルホニル基、アルコキシカルボニル基、ハロゲン原子、又はアミノ基からなる群から選ばれることが好ましい。これらの一価の置換基は更に任意の置換基を1個又は2個以上有していてもよい。例えば、R1が示すアルキル基にはハロゲン原子、カルボキシ基、スルホニル基、水酸基、アミノ基、アルコキシ基などが1個又は2個以上存在していてもよく、例えばR1が示すアルキル基はハロゲン化アルキル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシアルキル基、又はアミノアルキル基などであってもよい。
本発明の1つの好ましい態様においては、R1はいずれも水素原子である。
式(II)において、R2は、水素原子、一価の置換基又は結合を示す。R2が示す一価の置換基の種類は特に限定されないが、R1と同様に、例えば、炭素数1~6個のアルキル基、炭素数1~6個のアルケニル基、炭素数1~6個のアルキニル基、炭素数1~6個のアルコキシ基、水酸基、カルボキシ基、スルホニル基、アルコキシカルボニル基、ハロゲン原子、又はアミノ基等が挙げられる。
本発明の1つの好ましい態様においては、R2は、炭素数1~6個のアルキル基であり、好ましくは、メチル基、カルボキシル基,メトキシ基,ハイドロキシメチル基である。
本発明の1つの好ましい態様においては、R2は、炭素数1~6個のアルキル基であり、好ましくは、メチル基、カルボキシル基,メトキシ基,ハイドロキシメチル基である。
式(II)において、R3及びR4は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~6個のアルキル基、又はハロゲン原子を示す。
R3又はR4がアルキル基を示す場合には、該アルキル基にはハロゲン原子、カルボキシ基、スルホニル基、水酸基、アミノ基、アルコキシ基などが1個又は2個以上存在していてもよく、例えばR3又はR4が示すアルキル基はハロゲン化アルキル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシアルキル基などであってもよい。R3及びR4はそれぞれ独立に水素原子又はハロゲン原子であることが好ましく、R3及びR4がともに水素原子である場合、又はR3及びR4がともにフッ素原子又は塩素原子である場合がより好ましい。
R3又はR4がアルキル基を示す場合には、該アルキル基にはハロゲン原子、カルボキシ基、スルホニル基、水酸基、アミノ基、アルコキシ基などが1個又は2個以上存在していてもよく、例えばR3又はR4が示すアルキル基はハロゲン化アルキル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシアルキル基などであってもよい。R3及びR4はそれぞれ独立に水素原子又はハロゲン原子であることが好ましく、R3及びR4がともに水素原子である場合、又はR3及びR4がともにフッ素原子又は塩素原子である場合がより好ましい。
式(II)において、R5及びR6は、それぞれ独立に、炭素数1~6個のアルキル基、アリール基又は結合を示す、但し、Xが酸素原子の場合はR5及びR6は存在しない。
Xが珪素原子の場合は、R5及びR6は、それぞれ独立に、炭素数1~3個のアルキル基であることが好ましく、R5及びR6がともにメチル基であることがより好ましい。R5及びR6が示すアルキル基にはハロゲン原子、カルボキシ基、スルホニル基、水酸基、アミノ基、アルコキシ基などが1個又は2個以上存在していてもよく、例えばR5又はR6が示すアルキル基はハロゲン化アルキル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシアルキル基などであってもよい。R5又はR6がアリール基を示す場合には、アリール基は単環の芳香族基又は縮合芳香族基のいずれであってもよく、アリール環は1個又は2個以上の環構成ヘテロ原子(例えば窒素原子、酸素原子、又は硫黄原子など)を含んでいてもよい。アリール基としてはフェニル基が好ましい。アリール環上には1個又は2個以上の置換基が存在していてもよい。置換基としては、例えばハロゲン原子、カルボキシ基、スルホニル基、水酸基、アミノ基、アルコキシ基などが1個又は2個以上存在していてもよい。
Xが珪素原子の場合は、R5及びR6は、それぞれ独立に、炭素数1~3個のアルキル基であることが好ましく、R5及びR6がともにメチル基であることがより好ましい。R5及びR6が示すアルキル基にはハロゲン原子、カルボキシ基、スルホニル基、水酸基、アミノ基、アルコキシ基などが1個又は2個以上存在していてもよく、例えばR5又はR6が示すアルキル基はハロゲン化アルキル基、ヒドロキシアルキル基、カルボキシアルキル基などであってもよい。R5又はR6がアリール基を示す場合には、アリール基は単環の芳香族基又は縮合芳香族基のいずれであってもよく、アリール環は1個又は2個以上の環構成ヘテロ原子(例えば窒素原子、酸素原子、又は硫黄原子など)を含んでいてもよい。アリール基としてはフェニル基が好ましい。アリール環上には1個又は2個以上の置換基が存在していてもよい。置換基としては、例えばハロゲン原子、カルボキシ基、スルホニル基、水酸基、アミノ基、アルコキシ基などが1個又は2個以上存在していてもよい。
式(II)において、R7及びR8は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~6個のアルキル基、ハロゲン原子又は結合を示し、R3及びR4について説明したものと同様である。R7及びR8が共に水素原子であるか、共に塩素原子であるか、又は共にフッ素原子であることが好ましい。
Xは、酸素原子又は珪素原子を示す。好ましくは、Xは、酸素原子である。
*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所(結合点、以下同様)を表す。ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R8のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合することができる。好ましくは、Lは、キサンテン環骨格に結合しているベンゼン環の任意の位置に結合することができるが、当該ベンゼン環の4位または5位に結合することが好ましい。
式(IIa)において、Ra、Rb及びLは式(I)について記載した通りであり、R3、R4、R7、R8は、式(II)について記載した通りである。
式(III)におけるR1~R8、Xは、式(II)で定義した通りである。
式(III)において、R9及びR10は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~3個のアルキル基又は結合を示す。
また、R9及びR10は一緒になってR9及びR10が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよい。
また、R9又はR10は、或いは、R9及びR10の両方は、夫々、R4又はR8と一緒になって、R9又はR10が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよい。環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよい。このようにして形成されるヘテロシクリル又はヘテロアリールとしては、例えば、ピロリジン、ピペリジン、ヘキサメチレンイミン、ピロール、イミダゾール、ピラゾール、オキサゾール、チアゾールなどが挙げられるが、これらに限定されない。
また、R9及びR10は一緒になってR9及びR10が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよい。
また、R9又はR10は、或いは、R9及びR10の両方は、夫々、R4又はR8と一緒になって、R9又はR10が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよい。環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよい。このようにして形成されるヘテロシクリル又はヘテロアリールとしては、例えば、ピロリジン、ピペリジン、ヘキサメチレンイミン、ピロール、イミダゾール、ピラゾール、オキサゾール、チアゾールなどが挙げられるが、これらに限定されない。
式(III)において、*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所を表す。ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R10のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する。
好ましくは、Lは、キサンテン環骨格に結合しているベンゼン環の任意の位置に結合することができるが、当該ベンゼン環の4位または5位に結合することが好ましい。
好ましくは、Lは、キサンテン環骨格に結合しているベンゼン環の任意の位置に結合することができるが、当該ベンゼン環の4位または5位に結合することが好ましい。
式(IV)において、R1~R8、Xは、式(II)について記載した通りである。
式(IV)において、R9及びR10は、それぞれ独立に、水素原子又は炭素数1~6個のアルキル基を示す。
また、R9及びR10は一緒になってR9及びR10が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよい。ヘテロシクリルとしては、アゼチジン、ピロリジン等があげられ、これらヘテロシクリルは炭素数1~6個のアルキル等の置換基で置換されていてもよい。
また、R9又はR10は、或いは、R9及びR10の両方は、夫々、R3又はR7と一緒になって、R9又はR10が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよい。環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよい。このようにして形成されるヘテロシクリル又はヘテロアリールとしては、例えば、ピロリジン、ピペリジン、ヘキサメチレンイミン、ピロール、イミダゾール、ピラゾール、オキサゾール、チアゾールなどが挙げられるが、これらに限定されない。
また、R9及びR10は一緒になってR9及びR10が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよい。ヘテロシクリルとしては、アゼチジン、ピロリジン等があげられ、これらヘテロシクリルは炭素数1~6個のアルキル等の置換基で置換されていてもよい。
また、R9又はR10は、或いは、R9及びR10の両方は、夫々、R3又はR7と一緒になって、R9又はR10が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよい。環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよい。このようにして形成されるヘテロシクリル又はヘテロアリールとしては、例えば、ピロリジン、ピペリジン、ヘキサメチレンイミン、ピロール、イミダゾール、ピラゾール、オキサゾール、チアゾールなどが挙げられるが、これらに限定されない。
式(IV)において、R11及びR12は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~3個のアルキル基又は結合を示す。
R11及びR12は一緒になってR11及びR12が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよい。ヘテロシクリルとしては、アゼチジン、ピロリジン等があげられ、これらヘテロシクリルは炭素数1~6個のアルキル等の置換基で置換されていてもよい。
また、R11又はR12は、或いは、R11及びR12の両方は、夫々、R4又はR8と一緒になって、R11又はR12が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよい。環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよい。このようにして形成されるヘテロシクリル又はヘテロアリールとしては、例えば、ピロリジン、ピペリジン、ヘキサメチレンイミン、ピロール、イミダゾール、ピラゾール、オキサゾール、チアゾールなどが挙げられるが、これらに限定されない。
R11及びR12は一緒になってR11及びR12が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよい。ヘテロシクリルとしては、アゼチジン、ピロリジン等があげられ、これらヘテロシクリルは炭素数1~6個のアルキル等の置換基で置換されていてもよい。
また、R11又はR12は、或いは、R11及びR12の両方は、夫々、R4又はR8と一緒になって、R11又はR12が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよい。環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよい。このようにして形成されるヘテロシクリル又はヘテロアリールとしては、例えば、ピロリジン、ピペリジン、ヘキサメチレンイミン、ピロール、イミダゾール、ピラゾール、オキサゾール、チアゾールなどが挙げられるが、これらに限定されない。
式(IV)において、*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所を表す。ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R12のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する。
式(V)において、R13およびR14は、それぞれ独立に、水素原子又は炭素数1~6個のアルキル基を示す。
また、R15は、それぞれ独立に、水素原子、カルボキシル基又はスルホン酸基を示す。
また、R15は、それぞれ独立に、水素原子、カルボキシル基又はスルホン酸基を示す。
式(V)において、nは、1~3の整数を示す。
また、*は、式(I)のLとの結合箇所を表す。
また、*は、式(I)のLとの結合箇所を表す。
式(VI)において、R16~R22は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~6個のアルキル基、カルボニル基、アリル基、アリール基、ピロール基、チオフェン基、フラン基、スルホン酸基、スルホニルアミド基、カルボキシル基、メトキシ基又は結合を示す。
式(VI)において、Lは、R16~R22のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する。
本発明の化合物は、置換基の種類に応じて1個または2個以上の不斉炭素を有する場合があり、光学異性体又はジアステレオ異性体などの立体異性体が存在する場合がある。純粋な形態の立体異性体、立体異性体の任意の混合物、ラセミ体などはいずれも本発明の範囲に包含される。また、一般式(I)で表される本発明の化合物又はその塩は、水和物又は溶媒和物として存在する場合もあるが、これらの物質はいずれも本発明の範囲に包含される。溶媒和物を形成する溶媒の種類は特に限定されないが、例えば、エタノール、アセトン、イソプロパノールなどの溶媒を例示することができる。
本発明のもう1つの態様は、一般式(I)で表され、上記のHPLCクロマトグラムの保持時間を有する化合物又はその塩を含む、ALDH3A1検出蛍光プローブである。
以下、実施例により本発明を更に具体的に説明するが、本発明の範囲は下記の実施例に限定されることはない。
[原料及び測定方法]
有機合成に用いた試薬及び溶媒は、東京化成工業、和光純薬、アルドリッチ社から供給を受け、精製せずに用いた。
水素核磁来共鳴(1H NMR)及び炭素NMR(13C NMR)スペクトルはJEOL JMN-LA300及びJMN-LA400測定器で測定した。マススペクトルはJEOL JMS-T100LC AccuTOFで測定した。
有機合成に用いた試薬及び溶媒は、東京化成工業、和光純薬、アルドリッチ社から供給を受け、精製せずに用いた。
水素核磁来共鳴(1H NMR)及び炭素NMR(13C NMR)スペクトルはJEOL JMN-LA300及びJMN-LA400測定器で測定した。マススペクトルはJEOL JMS-T100LC AccuTOFで測定した。
RP-UPLC分析はWaters Acquity UPLC H-Class/ACQUITY UPLC PDA eλ detector/Xevo TQD quadrupole MS/MS analyzerで測定した。
LC/MS分析はAgilent 1200 Series Diode Array Detector/6130 quadruple MS analyzerで測定した。
イメージングはLeica TCS SP8により画像を取得した。フローサイトメトリーは分析をBD FACS CantoIIで行い、セル・ソーティングをBD FACS Ariaで行った。
LC/MS分析はAgilent 1200 Series Diode Array Detector/6130 quadruple MS analyzerで測定した。
イメージングはLeica TCS SP8により画像を取得した。フローサイトメトリーは分析をBD FACS CantoIIで行い、セル・ソーティングをBD FACS Ariaで行った。
化合物3は,論文既知(Giulio Cas et al. ”Site-specific traceless coupling of potent cytotoxic drugs to recombinant antibodies for pharmacodelivery” J. Am. Chem. Soc., 2012 134, pp5887-5892)の方法に基づき,4-シアノベンズアルデヒドから合成した.50mL丸底フラスコに化合物3(10mg、25.6μmol)および蒸留THF8mLを加えた.反応液に、DIEA(5.4μL、36.5μmol)およびTHF1mLに溶解させたBODIPY FL SEを順に加え、オイルバス上で40°Cに加熱し、3時間攪拌した。室温下まで冷却した後に反応液をCH2Cl2 20mLで希釈し、これをクエン酸水溶液(10w/v%)10mL、2M NaHCO3水溶液10mL、飽和食塩水10mLで洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後に溶液をろ過し、濾液を減圧下、濃縮した。濃縮残渣をシリカゲルを担体としたカラムクロマトグラフィーにより精製し、化合物4を得た。精製物には一部、アセタールが脱保護された化合物の混入がみられたが、そのまま次の反応に用いた。
上述の方法で得た化合物4(粗精製)を30mL丸底フラスコに入れ、蒸留THF1.5mL、濃塩酸0.6mL、蒸留水1mLの混合溶液をこれに加えた。1時間、室温下で激しく攪拌した後、反応溶液に飽和食塩水10mL、およびAcOEt10mLを加えた。得られた溶液をAcOEt5mLで2回抽出し、得られた有機層を炭酸ナトリウム水溶液10mL、飽和食塩水10mLで洗浄を行った。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥した後にろ過し、濾液を減圧下、濃縮した。濃縮残渣をシリカゲルを担体としたカラムクロマトグラフィーにより精製し、Probe1を赤色固体として10mg、収率98%(in 2 steps)で得た。
1H-NMR (300 MHz, CD2Cl2): δ 2.25 (s, 3H); 2.51 (s, 3H); 2.70 (t, J = 8.2 Hz, 2H); 3.25 (t, J = 8.2 Hz, 2H); 4.45 (d, J = 6.1 Hz, 2H); 6.15 (s, 1H); 6.25 (br, 1H); 6.28 (d, J = 3.6 Hz, 1H); 6.91 (d, J = 3.6 Hz, 1H); 7.14 (s, 1H); 7.32 (d, J = 8.1 Hz, 2H); 7.75 (d, J = 8.1 Hz, 2H); 9.94 (s, 1H). 13C-NMR (75 MHz, CDCl3): δ 11.5, 15.1, 25.0, 35.9, 43.4, 117.4, 120.9, 124.3, 128.3, 128.5, 130.1, 133.7, 135.6, 135.9, 144.9.146.2, 157.4, 161.0, 171.8, 192.1. HRMS (ESI+): m/z calcd for C22H22BFN3O2, [M-F]+, 390.17891; found 390.17920 (-0.29 mmu).
化合物7は論文既知(Dalla Via et al. ”DNA-targeting pyrroloquinoline-linked butenone and chalcones: Synthesis and biological evaluation”Eur. J. Med. Chem., 2009 44, pp2854-2861)の方法により合成した。2mLのガラスバイアルに、7(2mg、14μmol)およびBODIPY FL(3mg、7μmol)を秤量し、CH2Cl2150μLを加えた。溶液にHATU(15.6mg 39.5μmol)およびDIEA(50μL)を加え、アルゴン雰囲気下で室温終夜攪拌を行った。得られた溶液は後処理を行わず、シリカゲルを担体とするカラムクロマトグラフィーにより直接精製し、化合物8を赤色固体として得た。精製物には一部、アセタールが脱保護された化合物の混入がみられたが、そのまま次の反応に用いた。
(4)N-(4-ホルミルフェニル)-3-(1,3-ジメチル-4,4-ジフルオロ-4-ボラ-3a,4a-ジアザ-s-インダセン-5-イル)-プロピオンアミド(Probe2)の合成
アセタールの脱保護は,probe1の合成法に則り,同様に行った。化合物8(3mg)およびTHF300μL、H2O 200μL、120μLを用い、Probe2を赤色固体として1.8mg、収率67%(in 2 steps)で得た。
アセタールの脱保護は,probe1の合成法に則り,同様に行った。化合物8(3mg)およびTHF300μL、H2O 200μL、120μLを用い、Probe2を赤色固体として1.8mg、収率67%(in 2 steps)で得た。
1H NMR (300 MHz, CDCl3): δ 2.27 (s, 3H);2.60 (s, 3H); 2.85 (t, J = 7.3 Hz, 2H); 3.36 (t, J = 7.3 Hz, 2H); 6.16 (s, 1H); 6.29 (d, J = 3.7 Hz, 1H); 6.86 (d, J = 3.7 Hz, 1H); 7.10 (s, 1H); 7.65 (d, J = 8.8 Hz, 2H); 7.80 (d, J = 8.8 Hz, 2H); 7.89 (br, 1H); 9.89 (s, 1H). 13C NMR (75 MHz, CDCl3): d 11.4, 15.0, 24.8, 38.0, 117.6, 119.1, 119.2, 120.8, 124.9, 128.3, 131.1, 132.1, 133.4, 143.6, 144.6, 156.0, 161.0, 170.5, 191.0. HRMS (ESI+): m/z calcd for C21H20BFN3O2 [M-F]+, 376.16326; found, 376.16131 (-1.95 mmu).
化合物12は論文既知(Julien Massin, J. et al, ”Near-infrared solid-state emitters based on isophorone: Synthesis, crystal structure and spectroscopic properties” Chem. Mater., 2011, 23, pp862-873)の方法により合成した。50mL丸底フラスコに化合物12(730mg)を秤量し、蒸留MeOH40mL、トリエチルオルトホルメート1.09mLを加えた。濃塩酸12滴を滴下した後、40°Cで3時間加熱し、その後、室温まで冷却した。反応液をMeOH、CH2Cl2、sat. NaHCO3 aqで希釈し、混合溶液をCH2Cl220mLで抽出した。抽出液を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させた後、ろ過、濾液を減圧下濃縮し、シリカゲルを担体とするカラムクロマトグラフィーで精製、化合物12を無色液体として753mg、収率85%で得た。
1H-NMR (300 MHz, CD2Cl2): δ 1.67 (t, J = 6.6 Hz, 3H); 3.28 (s, 6H); 3.39-3.65 (m, 6H); 5.26 (s, 1H); 6.69 (d, J = 8.8 Hz, 2H); 7.24 (d, J = 8.8 Hz, 2H). 13C-NMR (75 MHz, CD2Cl2): δ 12.3, 45.8, 49.4, 49.9, 52.8, 104.0, 111.9, 1226.6, 128.2, 147.8. HRMS (ESI+): m/z calcd for C13H21N4O2, [M+H]+, 265.16645, found 265.16582 (-0.63 mmu).
乾燥させた20mLの丸底フラスコに化合物13(500mg、1.89mmol)を秤量し、蒸留THF2mLを加えた。溶液を氷浴上で5分間攪拌した後に、蒸留THF5mLに懸濁させたLiAlH4(143mg、3.78mmol)を、氷冷下、滴下してこれに加えた。滴下後、反応溶液を室温中で12時間攪拌し、反応停止のため飽和炭酸水素ナトリウム水溶液1.5mLを加えた。懸濁液に、六シェル塩水溶液10mLを加え、均一な溶液となるまで攪拌した後、溶液をろ過した。濾液をAcOEt30mLで3回抽出した後、抽出液を飽和食塩水で洗浄、無水炭酸ナトリウムで乾燥させ、ろ過、減圧濃縮を行った。濃縮残渣をNHシリカゲルを担体としたカラムクロマトグラフィーにより精製し、化合物14を無色液体として348mgを収率77%で得た。
1H-NMR (300 MHz, CD2Cl2): δ 1.43 (t, J = 7.3 Hz, 3H); 1.43 (br, 2H); 2.86 (t, J = 6.6 Hz, 2H); 3.28 (s, 6H); 3.29-3.45 (m, 6H); 5.25 (s, 1H); 6.78 (d, J = 8.8 Hz, 2H); 7.22 (d, J = 8.8 Hz, 2H). 13C-NMR (75 MHz, CD2Cl2): δ12.2, 40.3, 45.7, 52.8, 54.0, 104.1, 111.7, 125.7, 128.0, 148.6. HRMS (ESI+): m/z calcd for C13H23N2O2, [M+H]+, 239.17595; found 239.17701 (+1.06 mmu).
(3)2-(N-エチル-N-(4-ホルミルフェニル)アミノ)エチル-3-(1,3-ジメチル-4,4-ジフルオロ-4-ボラ-3a,4a-ジアザ-s-インダセン-5-イル)-プロピオンアミド(Probe3)の合成
化合物4と同様の方法で合成を行った.化合物14(11mg、39μmol)、BODIPY FL SE(15mg、39μmol)、DIEA 7.8μL、46μmol)を用いた。シリカゲルを担体とするカラムクロマトグラフィーで精製を行うと、アセタールが脱保護されたprobe 3を赤色固体として17mg、収率93%で得た。
1H-NMR (300 MHz, CDCl3): δ 1.15 (t, J = 7.3 Hz, 3H); 2.26 (s, 3H); 2.55 (s, 3H); 2.65 (d, J = 7.3 Hz, 2H); 3.26 (t, J = 7.3 Hz, 2H); 3.40 (m, 6H); 6.09 (br, 1H); 6.14 (s, 1H); 6.28 (d, J = 3.7 Hz, 1H); 6.70 (d, J = 8.8 Hz, 2H); 6.87 (d, J = 3.7 Hz, 1H); 7.09 (s, 1H); 7.67 (d, J = 8.8 Hz, 2H); 9.68 (s, 1H). 13C-NMR (100 MHz, CDCl3): δ 11.3, 12.1, 15.0, 24.8, 35.9, 37.2, 45.3, 49.1, 110.9, 117.4, 120.6, 123.8, 125.3, 128.2, 132.2, 133.3, 135.3, 144.3, 152.4, 156.8, 160.7, 172.2, 190.1. HRMS (ESI+): m/z calcd for C25H29BFN4O2, [M-F]+, 447.23676; found 447.23230 (-4.46 mmu).
2mLのガラスバイアルに2-Me-4-COOH TG(10mg、29μmol)と化合物14(8.3mg、47μmol)を秤量し、DMF270μLを加えた。この溶液に、HATU(13.2mg、35μmol)とDIEA 15μLを加え、アルゴン雰囲気下、室温、遮光下で終夜攪拌した。反応溶液に2N HCl aq.270μLを加え15分間室温下で攪拌した後、溶液を反応溶液を分取HPLC用の溶出溶媒(A/B=6/4、A:0.1M Triethylamine acetate buffer;B:A/acetonitril=2/8)で希釈した。その後、希釈溶液を分取HPLCにより精製し、目的物を含むフラクションを2N HCl aqで酸性化した後、飽和食塩水で希釈した。希釈溶液をAcOEt 50mLで3回抽出した後、有機層を飽和食塩水で洗浄、無水硫酸ナトリウムで乾燥した後にろ過、濾液を減圧下濃縮し、Probe4を黄色固体として7.5mg、収率50%で得た。
1H-NMR (300 MHz, CD3OD): δ 1.24 (t, J = 8.0 Hz, 3H); 2.08 (s, 3H); 3.58-3.73 (m, 6H); 6.73 (m, 4H); 6.98 (m, 4H); 7.32 (d, J = 7.4 Hz, 1H); 7.71 (d, J = 8.8 Hz, 2H); 7.80 (m, 2H); 9.58 (s, 1H) . HRMS (ESI+): m/z calcd for C29H31NO8, [M+H]+, 521.20497; found 521.20133 (-3.64 mmu).
化合物18は文献既知(Lorella Pasquinucci et al, ”Evaluation of N-substitution in 6,7-benzomorphan compounds” Bioorg. Med. Chem., 2010, 18, pp4975-4982)の方法で合成した.乾燥した100mL丸底二頸フラスコに,2-ベンジルオキシエタノール4g、26.2mmolを秤量し、蒸留THF20mLに溶解させた後、アルゴンで満たした風船を装着した三方コックを用いて容器内をアルゴン雰囲気に置換しゴムセプタムで密栓した。この溶液に、NaH 1.19g(60% dispersion in mineral oil)を加え、アルゴン雰囲気下、室温中で30分攪拌し、ナトリウム 2-ベンジルオキシエトキシドの溶液を調整した。別途用意した丸底フラスコに化合物17 3mLを秤量し、蒸留THFに溶解させた後、上で用意したナトリウム 2-ベンジルオキシエトキシド溶液をシリンジを用いて加え、室温下で1時間攪拌した。反応を停止させるため、氷水50mLを徐々に加え、混合液をAcOEt 30mLで3回抽出した。抽出液を飽和食塩水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過した後減圧濃縮した。濃縮残渣をシリカゲルを担体としたカラムクロマトグラフィーで精製、化合物19を無色液体として7.04g、収率94%で得た。
1H-NMR (300 MHz, CD2Cl2): δ 1.10 (t, J = 7.3 Hz, 3H); 3.58 (s, 4H); 3.71 (q, J =7.3 Hz, 2H); 3.82 (s, 2H); 4.49 (s, 2H); 7.15-7.18 (m,2H); 7.27-7.41 (m, 8H). 13C-NMR (75 MHz, CD2Cl2): δ 13.1, 44.3, 69.8, 70.1, 70.9, 73.4, 127.8, 128.0, 128.5, 128.6, 128.7 .130.0, 138.9 ,141.3, 168.6. HRMS (ESI+): m/z calcd for C19H23NNaO3, [M+Na]+, 336.15756; found 336.15517 (-2.39 mmu).
200mLの丸底フラスコに化合物19(3g、9.58mmol)を秤量し、蒸留MeOH150mLに溶解させた。10%Pd/C 3gを溶液に懸濁させ、水素雰囲気下、室温で攪拌した。TLCで反応の進行を確認し、原料消失後、反応液をろ過した。得られた濾液を減圧下濃縮し、化合物20を淡黄色液体として2.05g、収率96%で得た。
1H-NMR (300 MHz, CDCl3): δ 1.13 (t, 3H); 3.60 (t, J =4.0 Hz, 2H); 3.69 (t, J = 4.0 Hz, 2H); 3.72-3.80 (m, 3H); 3.84 (s, 2H); 7.15 (d, J = 6.6 Hz, 2H); 7.43 (m, 3H). 13C-NMR (75 MHz, CDCl3): δ 12.5, 44.0, 61.2, 68.9, 73.7, 127.8, 128.2, 129.6, 139.9, 169.4. HRMS (ESI+): m/z calcd for C12H17NNaO3, [M+Na]+, 246.11061; found 246.11242 (+1.80 mmu).
乾燥させた100mL丸底フラスコに化合物20(2.04g、9.16mmol)を秤量し、蒸留THF100mLに溶解させた。フラスコ内をアルゴン雰囲気に置換した後、溶液にBH3 THF溶液(0.9mmol/mL)51mLを室温下、滴下し加えた。反応の進行をTLCでモニターし、室温中で攪拌、原料の消失後、蒸留水の添加により反応を停止させ、減圧下、反応液を濃縮した。濃縮した溶液をAcOEt50mLで3回抽出し、抽出液を飽和食塩水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、これをろ過した。得られた濾液を減圧下濃縮し、化合物21を無色液体として1.84g、収率96%
で得た。
で得た。
1H-NMR (300 MHz, CDCl3): δ1.15 (t, J =6.6 Hz, 3H); 3.42 (q, J = 6.6 Hz, 2H); 3.50 (t, J =5.8 Hz, 2H); 3.56 (t, J = 5.2 Hz, 2H); 3.64 (t, J = 5.8 Hz, 2H); 3.71 (t, J = 5.1 Hz, 2H); 6.69 (m, 3H); 7.21 (m, 2H). 13C-NMR (75 MHz, CDCl3): δ 12.1, 45.4, 50.0, 61.8. 68.9. 72.3, 112.0 116.0, 129.3, 147.8. HRMS (ESI+): m/z calcd for C12H20NO2, [M+H]+, 210.14940; found 210.15041 (+1.01 mmu).
乾燥させた50mL丸底フラスコに化合物21(1.84g、8.8mmol)とTsCl(2.52g、13.2mmol)を秤量した。このフラスコを氷浴上に設置し、蒸留CH2Cl230mLを加えた。この反応溶液に対し、氷冷下、ピリジン(1.06mL、13.2mmol)を滴下した後、反応溶液を室温中で終夜攪拌した。得られた反応溶液に蒸留水30mLを加えた後、混合液をCH2Cl230mLで2回抽出した。抽出液を飽和食塩水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過した。得られた濾液を減圧下濃縮し、残渣をシリカゲルを担体としたカラムクロマトグラフィーにより精製し、化合物22を,6.15g、収率70%で得た。得られた化合物22は不安定であり、すぐに次の反応へと用いた。
1H-NMR (300 MHz, CDCl3): δ1.11 (t, J = 7.3 Hz, 3H); 2.43 (s, 3H); 3.35 (q, J = 7.3 Hz, 2H); 3.42 (t, J = 5.9 Hz, 2H); 3.56 (t, J = 5.8 Hz, 2H); 4.15 (t, J = 4.3 Hz, 2H); 6.65 (m, 3H); 7.19 (m, 2H); 7.33 (d, J = 8.1 Hz, 2H); 7.79 (d, J = 8.1 Hz, 2H). HRMS (ESI+): m/z calcd for C19H26NO4S, [M+H]+, 364.15825; found 364.15403 (-4.23 mmu).
50mL丸底フラスコに化合物22(2.21g、6.09mmol)およびNaN3(474mg、7.3mmol)を加え、DMF10mLを加えた。反応溶液を90°Cに加熱し、終夜攪拌した。得られた反応液を、蒸留水50mLで希釈し、これをAcOEt30mLで3回抽出した。抽出液を、蒸留水20mLで2回、飽和食塩水で1回洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過した。得られた濾液を減圧下濃縮し、濃縮残渣をNHシリカゲルを担体としたカラムクロマトグラフィーで精製、化合物23を得た。
1H-NMR (300 MHz, CDCl3): δ1.16 (t, J = 7.5 Hz, 3H); 3.36 (t, J = 5.1 Hz, 2H); 3.42 (q, J = 7.5 Hz, 2H); 3.51 (t, J = 5.9 Hz, 2H); 3.64 (m, 4H); 6.63-6.70 (m, 3H); 7.18-7.24 (m, 2H). 13C-NMR (75 MHz, CDCl3): δ 12.1, 45.4, 50.0, 50.8, 69.1, 70.1, 111.8, 115.8.128.9, 129.3, 147.7. HRMS (ESI+): m/z calcd for C12H10N4O, [M+H]+, 235.15589; found 235.15256 (-3.32 mmu) .
乾燥させた50mL丸底フラスコに、化合物23(1.21g、5.18mmol)を秤量し、蒸留DMF5mLに溶解させた。フラスコを氷浴上で5分間攪拌し、続いてPOCl3(966mL、10.37mmol)を滴下した。その後、反応液を終夜40°Cに加熱し、攪拌した。その後、フラスコを氷浴上で冷却し、NaHCO3溶液50mLを加えた。得られた溶液のAcOEt30mLで3回抽出した後、抽出液を無水硫酸ナトリウムで乾燥、ろ過し、減圧下濃縮した。濃縮残渣をシリカゲルを担体としたカラムクロマトグラフィーにより精製し、化合物24を薄緑色の液体として1.03g、収率76%で得た。
1H-NMR (300 MHz, CDCl3): δ1.21 (t, J = 7.3 Hz, 3H); 3.37 (t, J = 4.4 Hz, 2H); 3.55 (q, J = 7.3 Hz, 2H); 3.60-3.70 (m, 6H); 6.72 (d, J = 9.5 Hz, 2H); 7.71 (d, J = 8.9 Hz, 2H); 9.73 (s, 1H). 13C-NMR (75 MHz, CDCl3): δ 12.0, 45.8, 50.1, 50.7, 68.8, 70.2, 110.8, 125.1, 132.2, 152.3, 190.0. HRMS (ESI+): m/z calcd for C13H18N4NaO2, [M+Na]+, 285.13274; found 285.13462 (-1.87 mmu).
化合物24のアセタール保護は、化合物13の合成に示した手法を用いて行った。化合物24(1.16g、6.33mmol)、トリメチルオルトホルメート(2.08mL、19.0mmol)、c.HCl(10滴)を用い、化合物25を淡褐色液体として収率100%で得た。
1H-NMR (300 MHz, CDCl3): δ1.15 (t, J = 7.3 Hz, 3H); 3.31 (s, 6H); 3.33-3.65 (m, 10H); 5.28 (s, 1H); 6.65 (d, J = 8.8 Hz, 2H); 7.20 (d, J = 8.8 Hz, 2H). 13C-NMR (75 MHz, CDCl3): δ 12.0, 45.4, 49.7, 50.0, 50.7 .52.6, 52.8, 53.8, 68.9, 70.0, 103.6, 110.8, 111.1, 125.1, 127.6, 147.7. HRMS (ESI+): m/z calcd for C15H24N4NaO3, [M+Na]+, 331.17461; found 331.17097 (-3.64 mmu).
化合物25のアジド基の還元は,上に示した化合物14の合成法に則り、合成した。化合物25(823mg、2.67mmol)、LiAlH4(203mg、5.34mmol)、THF10mLを用い、化合物26を無色液体として629mg、収率83%で得た。
1H-NMR (300 MHz, CD2Cl2): δ1.14 (t, J = 7.3 Hz, 3H); 1.41 (br, 2H); 2.77 (t, J = 5.9 Hz, 2H); 3.26 (s, 6H); 3.40-3.50 (m, 6H); 3.59 (t, J = 6.6 Hz, 2H); 5.23 (s, 1H); 6.66 (d, J = 8.8 Hz, 2H); 7.20 (d, J = 8.8 Hz, 2H). 13C-NMR (75 MHz, CD2Cl2): δ 12.3, 42.3, 45.7, 50.5, 52.8, 69.0, 74.1, 104.1, 111.4, 125.7, 128.0, 148.4. HRMS (ESI+): m/z calcd for C14H23N2O2, [M-OCH3]+, 251.1795; found 251.17451 (-1.45 mmu).
化合物26は、上に示したprobe 4の合成法に則り、合成した。化合物29(21.4mg、75μmol)、2-Me4-COOH TG(20mg、58μmol)、HATU(26mg、69μmol)、DIEA(22mL、173μmol)を用い、Probe5を橙色固体として15mg、収率49%で得た。
1H-NMR (300 MHz, CD3OD): δ 1.19 (t, J = 7.3 Hz, 3H); 2.11 (s, 3H); 3.56-3.73 (m, 11H); 6.70-6.73 (m, 4H); 6.83 (d, J = 8.8 Hz, 2H); 7.32 (d, J = 8.0 Hz, 1H); 7.65 (d, J = 8.8 Hz, 2H); 7.79 (d, 6.6 Hz, 1H); 7.87 (br, 1H); 9.53 (s, 1H). HRMS (ESI+): m/z calcd for C34H33N2O6, [M+H]+, 565.2386 ; found 565.23793.
ヒトrecombinant ALDH1A1/1A3/3A1を購入し、Tris buffer(100mM、pH7.5)にKCL 100mM、DTT 2mM、NAD(P)1mMおよび各ALDH10~100nM、各化合物10~80μMを混和し37℃、30分反応させ等量のアセトニトリルを加え反応を停止させた。反応液はUPLC/MS/MS(Waters)で解析した。UPCLクロマトグラムは5%アセトニトリル 0.01Mギ酸アンモニウム/水から95%アセトニトリル 0.01Mギ酸アンモニウム/水のリニアグラジエントを流速=800μL/分で5分かけて行った。アルデヒド型およびカルボン酸型プローブは504nmの波長における吸光で検出し、それぞれのピークにおけるMSスペクトルのm/zが予想されるm/zと合致していることを確認した。
また、ALDEFLUORに関してはALDH1A1、ALDH1A3に反応することは既知であるため、ALDH3A1に関してのみ行った。結果を表2に示す。
ベンズアルデヒドを反応部とする化合物1は実験を行った3つのアイソフォームすべてに反応したが、化合物2はALDH1A1としか反応性を示さなかった。一方、DEABを反応部とした化合物3はALDH1A1とALDH3A1に反応し、3つのプローブのなかでは最もADLH3A1に特異的といえる結果であった。また、予想された通り、ALDEFLUORはALDH3A1には反応性を示さなかった。
また、ALDEFLUORに関してはALDH1A1、ALDH1A3に反応することは既知であるため、ALDH3A1に関してのみ行った。結果を表2に示す。
ベンズアルデヒドを反応部とする化合物1は実験を行った3つのアイソフォームすべてに反応したが、化合物2はALDH1A1としか反応性を示さなかった。一方、DEABを反応部とした化合物3はALDH1A1とALDH3A1に反応し、3つのプローブのなかでは最もADLH3A1に特異的といえる結果であった。また、予想された通り、ALDEFLUORはALDH3A1には反応性を示さなかった。
ALDH3A1に反応性を示したProbe1とProbe3を用いて細胞イメージングを行った。細胞はALDH3A1高発現細胞である食道扁平上皮癌細胞株(OE21 cell line)を用いた。様々なProbe濃度および反応時間でイメージングを試みたがALDH3A1特異的インヒビター(CB7)を用いた陰性コントロールに対し明らかな輝度の差は認めなかった。また、Probe2はALDH1高活性細胞を検出可能なALDEFLUORと同様の使用が可能であると考えられたためALDEFLUORでALDH1A1高活性細胞が検出可能であると文献的に報告があるA549細胞を用いてイメージングを行ったが、陰性コントロールに対し明らかな輝度の差は認めなかった。
Probe1~3について意図した結果が得られなかった原因として過剰な膜透過性が原因であると考えた。BODIPYは疎水性プローブであるが、Probe1~3はALDEFLUORの反応部に含まれる短鎖脂肪族アルデヒドと違い疎水性の強い芳香族アルデヒドである。つまり、疎水性同士の組み合わせがプローブ全体としての水溶性を疎水性側にシフトさせており、カルボン酸型となっても膜非透過となるほどには親水性にはならないと考えた。そこで、Probe4及び5では、プローブをより親水性にするために、BODIPYよりも親水性である蛍光団を使用することとし、蛍光団としてTokyo Green(TG)を使用した。反応部はALDH3A1に対する特異性が比較的高かったDEABを用いることとした。また、Probe1、2の結果より、結合部もALDHに対する反応性に影響を及ぼしていたことから、Probe4及び5では結合部の長さが違う2種類のリンカーを用いた。
ALDHに対する反応性を確認したところ、Probe4は全く反応性を示さなくなったが、Probe5はProbe3と同様にALDH1A1とALDH3A1に反応性を示した。以上作成した5つのプローブとALDEFLUORの膜透過性を比較するためにLC/MSによる中性条件下での水溶性を検証した。それぞれのプローブを適切なアイソフォーム・濃度のALDHを用いてカルボン酸型とアルデヒド型がともに存在する程度にまで反応を進行させた後に反応を停止させLC/MS(Agilent 1200/6130 quadrupole LC/MSシステム)にて解析した。カラムはC18カラム(HP 3μm、内径:2.1mm、長さ:150mm、ジーエル サイエンス)を用いた。HPCLクロマトグラムは溶媒Aを0.01Mギ酸アンモニウム/水、溶媒Bを80%アセトニトリル 0.01Mギ酸アンモニウム/水とし、20%B 2.5分に続いて20%から100% B、5分間のリニアグラジエント(流速500μl/min)の条件で行った。BODIPYを含むプローブを504nm、TGを含むプローブを495nmの波長における吸光で検出し、それぞれのピークにおけるMSスペクトルのm/zが予想されるm/zと合致していることを確認した。3回の独立した実験を行い平均±S.D.を算出した。得られたデータを表3及び図2に示す。化合物1、2、3のアルデヒド型プローブは8分以降に検出されたが、アルデヒド型のProbe4、5およびALDEFLUORは7分台前半で検出された。一方でカルボン酸型のProbe1、2、3のなかで最も検出時間が早かったProbe1は7.098分であったが、カルボン酸型のALDEFLUORは6.741分でカルボン酸型のProbe5はさらにそれより早い時間に検出された。Probe1のイメージングが成功していないことから、この6.741分から7.098分の間(図2の帯)に膜透過性が急激に変化する閾値が存在すると考えられた。
(プローブの速度論的特性)
各プローブにおいて反応性を示した各ALDHアイソフォームについてMichaelis-Menten式におけるKm, Kcatを求めた。反応はTris buffer (100mM、pH7.5)にKCL 100mM、DTT 2mM、NAD(P)1mMおよび各ALDH10~100nM、各プローブ0.1~80μMの範囲で5~6点での濃度を選択、混和し37℃、5分反応させ等量のアセトニトリルを加え反応を停止させた。アルデヒド型/カルボン酸型プローブの検出はUPLC/MS/MSにて前述と同様の方法で行った。得られた各プローブ濃度における反応速度をMichaelis-Menten式にフィッティングさせることでKm, Kcatを算出した。フィッティングにはKaleida Graph ver.4.1(HULINKS inc.)を用いた。得られたデータを表4に示す。
Kmが比較的小さいことから実際のプローブ使用濃度ではプローブの反応速度はVmaxに近いと考えられたため、ALDH1A1/ALDH3A1の特異性の指標としてProbe1、Probe3、Probe5に関してKcat比(ALDH3A1のKcat/ALDH1A1のKcat)を算出した(表5)。Probe5はALDHの濃度が同一条件下、反応速度がVmaxに近いプローブ濃度下ではALDH1A1に比べALDH3A1の方が約6倍反応性が高いことになり、よりALDH3A1に対し特異性の高いプローブとなった。
各プローブにおいて反応性を示した各ALDHアイソフォームについてMichaelis-Menten式におけるKm, Kcatを求めた。反応はTris buffer (100mM、pH7.5)にKCL 100mM、DTT 2mM、NAD(P)1mMおよび各ALDH10~100nM、各プローブ0.1~80μMの範囲で5~6点での濃度を選択、混和し37℃、5分反応させ等量のアセトニトリルを加え反応を停止させた。アルデヒド型/カルボン酸型プローブの検出はUPLC/MS/MSにて前述と同様の方法で行った。得られた各プローブ濃度における反応速度をMichaelis-Menten式にフィッティングさせることでKm, Kcatを算出した。フィッティングにはKaleida Graph ver.4.1(HULINKS inc.)を用いた。得られたデータを表4に示す。
Kmが比較的小さいことから実際のプローブ使用濃度ではプローブの反応速度はVmaxに近いと考えられたため、ALDH1A1/ALDH3A1の特異性の指標としてProbe1、Probe3、Probe5に関してKcat比(ALDH3A1のKcat/ALDH1A1のKcat)を算出した(表5)。Probe5はALDHの濃度が同一条件下、反応速度がVmaxに近いプローブ濃度下ではALDH1A1に比べALDH3A1の方が約6倍反応性が高いことになり、よりALDH3A1に対し特異性の高いプローブとなった。
[実施例2]
(Probe5を用いた細胞イメージング)
Probe5、及び、ALDH3A1高発現細胞である食道扁平上皮癌細胞株(OE21 cell line)を用いてイメージングを行った。培地(RPMI1640、10%FBS、15mM HEPES、Phenol Redフリー)に40μMのProbe5を加え37℃、90分培養した後、氷冷した培地で細胞を洗浄し、共焦点顕微鏡下で観察した。特異的ALDH3A1インヒビター(1-[(4-Fluorophenyl)sulfonyl]-2-methyl-1H- benzimidazole、CB710μM)を添加したサンプルを陰性コントロールとした。488nmのレーザーで励起し、検出は500~570nmの波長で観察を行った。図3に示すように陰性コントロールに対し、高輝度な細胞を観察できた。
(Probe5を用いた細胞イメージング)
Probe5、及び、ALDH3A1高発現細胞である食道扁平上皮癌細胞株(OE21 cell line)を用いてイメージングを行った。培地(RPMI1640、10%FBS、15mM HEPES、Phenol Redフリー)に40μMのProbe5を加え37℃、90分培養した後、氷冷した培地で細胞を洗浄し、共焦点顕微鏡下で観察した。特異的ALDH3A1インヒビター(1-[(4-Fluorophenyl)sulfonyl]-2-methyl-1H- benzimidazole、CB710μM)を添加したサンプルを陰性コントロールとした。488nmのレーザーで励起し、検出は500~570nmの波長で観察を行った。図3に示すように陰性コントロールに対し、高輝度な細胞を観察できた。
[実施例3]
(Probe5を用いたフローサイトメトリー)
Probe5、および、OE21細胞を用いフローサイトメトリーを行った。細胞をトリプシン処理し、セルストレイナー(40μm、Corning)に通した後に細胞密度を計測した。40μMのProbe5を含む培地に2.5~5×105/mlとなるように500μlの細胞懸濁液を作成し、37℃、90分培養した。反応後に1500rpm、3分間遠心し上清を除去した後、氷冷した培地で細胞を洗浄、遠心し、培地を除去した。100μlの培地に再度細胞を懸濁し死細胞除去目的でSYTOX(登録商標)Red dead cell stain(Thermo Fisher)を4μl添加し、氷上で5分間静置後、培地を150μl加えた。陰性コントロールにはCB7(10μM)を加えたサンプルを用いた。解析はFACS CantoII(BD Biosciences)にて行った。Blue layser(488nm)で励起し、FITCチャンネル(515~545nm)で各細胞におけるProbe5の輝度を検出した。各サンプルはダブレットの除去、死細胞の除去を行った上で30,000個程度の細胞を解析した。陽性ゲートはALDEFLUORアッセイにならい、陰性コントロールにおける輝度の上限付近からそれ以上の領域に設定し、陰性コントロールサンプルでゲート内に存在する細胞が高くとも3%を下回るようにした。独立した実験を3回行った。図4に示すように陽性率10~15%を示した。
(Probe5を用いたフローサイトメトリー)
Probe5、および、OE21細胞を用いフローサイトメトリーを行った。細胞をトリプシン処理し、セルストレイナー(40μm、Corning)に通した後に細胞密度を計測した。40μMのProbe5を含む培地に2.5~5×105/mlとなるように500μlの細胞懸濁液を作成し、37℃、90分培養した。反応後に1500rpm、3分間遠心し上清を除去した後、氷冷した培地で細胞を洗浄、遠心し、培地を除去した。100μlの培地に再度細胞を懸濁し死細胞除去目的でSYTOX(登録商標)Red dead cell stain(Thermo Fisher)を4μl添加し、氷上で5分間静置後、培地を150μl加えた。陰性コントロールにはCB7(10μM)を加えたサンプルを用いた。解析はFACS CantoII(BD Biosciences)にて行った。Blue layser(488nm)で励起し、FITCチャンネル(515~545nm)で各細胞におけるProbe5の輝度を検出した。各サンプルはダブレットの除去、死細胞の除去を行った上で30,000個程度の細胞を解析した。陽性ゲートはALDEFLUORアッセイにならい、陰性コントロールにおける輝度の上限付近からそれ以上の領域に設定し、陰性コントロールサンプルでゲート内に存在する細胞が高くとも3%を下回るようにした。独立した実験を3回行った。図4に示すように陽性率10~15%を示した。
[実施例4]
(ALDH3A1ノックダウンによるフローサイトメトリー)
OE21細胞と化合物5を用いたフローサイトメトリーにおける陽性群がALDH3A1の活性によることを確認する目的でsmall interference RNA(siRNA)を用いたALDH3A1のノックダウンを行い、フローサイトメトリーを行った。siRNAはThermo Fisher社より有効性が確認されているものを2つ(Silencer(登録商標)Select、s1243およびs1244)、および、陰性コントロール(Silencer(登録商標)Negative Control#1)を購入した。Transfection ReagentとしてLipofectamine(登録商標) RNAiMAX、希釈液としてOpti-MEM(登録商標)をThormo Fisherより購入した。手順書に従い、siRNAを10nM、Lipofectamineを3%となるように手順書にしたがってsiRNA-Lipofectamine complexを300μl作成し、そのうち250μlとOE21細胞懸濁液2.5mlを混合し、6 well dishに播種した。ノックダウンの効果は6日後にウエスタン・ブロッティングにより確認した(Figure 6a)。この条件下でProbe 5を用いて前述の条件と同様の条件でフローサイトメトリーを行ったところ、ALDH3A1ノックダウン群で陽性率が著明に低下し、Probe 5陽性細胞がALDH3A1の活性によることが示された(図5)。
(ALDH3A1ノックダウンによるフローサイトメトリー)
OE21細胞と化合物5を用いたフローサイトメトリーにおける陽性群がALDH3A1の活性によることを確認する目的でsmall interference RNA(siRNA)を用いたALDH3A1のノックダウンを行い、フローサイトメトリーを行った。siRNAはThermo Fisher社より有効性が確認されているものを2つ(Silencer(登録商標)Select、s1243およびs1244)、および、陰性コントロール(Silencer(登録商標)Negative Control#1)を購入した。Transfection ReagentとしてLipofectamine(登録商標) RNAiMAX、希釈液としてOpti-MEM(登録商標)をThormo Fisherより購入した。手順書に従い、siRNAを10nM、Lipofectamineを3%となるように手順書にしたがってsiRNA-Lipofectamine complexを300μl作成し、そのうち250μlとOE21細胞懸濁液2.5mlを混合し、6 well dishに播種した。ノックダウンの効果は6日後にウエスタン・ブロッティングにより確認した(Figure 6a)。この条件下でProbe 5を用いて前述の条件と同様の条件でフローサイトメトリーを行ったところ、ALDH3A1ノックダウン群で陽性率が著明に低下し、Probe 5陽性細胞がALDH3A1の活性によることが示された(図5)。
[実施例5]
(ソート・アウトによるALDH3A1発現量の確認)
ALDHの活性は発現量により調節されている。ALDEFLUORアッセイでは少なくともALDH1A1、ALDH1A3、ALDH2の活性を区別なく検出してしまうためソート・アウトした際には目的のALDHアイソフォームに対する抗体を用いてウエスタン・ブロッティングを行うのが通例である。これに倣いProbe5とOE21細胞を用いて高輝度群と低輝度群をソート・アウトしウエスタン・ブロッティングを行った。セル・ソーターはFACS Aria II(BD Biosciences)を用いた。通常のフローサイトメトリーと同様にアッセイし、陽性ゲート(Top)、および、低輝
度側下位10~15%にゲート(Bottom)を設置し、細胞をソート・アウトした。
得られた細胞からライセートを作成し、ウエスタン・ブロッティングを行った。各バンドは発光法によりImageQuant LAS 4000mini(GE healthcare)を用いて検出・定量した。ハウスキーピング遺伝子であるACTBでALDH3A1の発現量を標準化し、TopとBottomでのALDH3A1の発現量を比較した。図6に示すように予想に反しそれほどの発現量の差は認めなかった。
(ソート・アウトによるALDH3A1発現量の確認)
ALDHの活性は発現量により調節されている。ALDEFLUORアッセイでは少なくともALDH1A1、ALDH1A3、ALDH2の活性を区別なく検出してしまうためソート・アウトした際には目的のALDHアイソフォームに対する抗体を用いてウエスタン・ブロッティングを行うのが通例である。これに倣いProbe5とOE21細胞を用いて高輝度群と低輝度群をソート・アウトしウエスタン・ブロッティングを行った。セル・ソーターはFACS Aria II(BD Biosciences)を用いた。通常のフローサイトメトリーと同様にアッセイし、陽性ゲート(Top)、および、低輝
度側下位10~15%にゲート(Bottom)を設置し、細胞をソート・アウトした。
得られた細胞からライセートを作成し、ウエスタン・ブロッティングを行った。各バンドは発光法によりImageQuant LAS 4000mini(GE healthcare)を用いて検出・定量した。ハウスキーピング遺伝子であるACTBでALDH3A1の発現量を標準化し、TopとBottomでのALDH3A1の発現量を比較した。図6に示すように予想に反しそれほどの発現量の差は認めなかった。
[実施例6]
(Probeの細胞外能動排出とその制御による最適化)
細胞は細胞内の物質に対する能動排出機構を有しており、同じcell lineであっても能動排出機能は細胞により異なることが知られている。能動排出を考慮し、イメージングおよびフローサイトメトリーでは氷冷した培地を用いていたが、能動排出を評価するため37℃の条件下で同一視野の経時的観察を行った(図7a)。
その結果、観察開始から10分程度経過した時点で著名な蛍光輝度の低下がみられた。
TGはフルオレセインの誘導体であるが、フルオレセインはトランスポーターであるmultidrug resistance-associated protein(MRP)の働きにより細胞外に排出されることが知られている。MRPの阻害剤はこの能動排出を抑制するとの報告があることから幾つかのMRP阻害剤を用いて、化合物5の輝度低下が抑制されるか実験を試みた。MK-571はMRPの複数のアイソフォームを阻害する薬剤である。MK-571を200μMの濃度で用いたところProbe5の能動排出が著明に抑制された(図7b)。そこで、MK-571(200μM)を添加した状態でフローサイトメトリーを行ったところ(図7c)、陽性率が90%程度と著明な改善が得られた。
(Probeの細胞外能動排出とその制御による最適化)
細胞は細胞内の物質に対する能動排出機構を有しており、同じcell lineであっても能動排出機能は細胞により異なることが知られている。能動排出を考慮し、イメージングおよびフローサイトメトリーでは氷冷した培地を用いていたが、能動排出を評価するため37℃の条件下で同一視野の経時的観察を行った(図7a)。
その結果、観察開始から10分程度経過した時点で著名な蛍光輝度の低下がみられた。
TGはフルオレセインの誘導体であるが、フルオレセインはトランスポーターであるmultidrug resistance-associated protein(MRP)の働きにより細胞外に排出されることが知られている。MRPの阻害剤はこの能動排出を抑制するとの報告があることから幾つかのMRP阻害剤を用いて、化合物5の輝度低下が抑制されるか実験を試みた。MK-571はMRPの複数のアイソフォームを阻害する薬剤である。MK-571を200μMの濃度で用いたところProbe5の能動排出が著明に抑制された(図7b)。そこで、MK-571(200μM)を添加した状態でフローサイトメトリーを行ったところ(図7c)、陽性率が90%程度と著明な改善が得られた。
[実施例7]
(MK-571を併用したALDH3A1ノックダウン細胞によるフローサイトメトリー)
MK-571を併用したフローサイトメトリーでは陽性率が著名に改善したが、この陽性細胞がALDH3A1の活性によるものであることを確認するためsiRNAを用いてOE21細胞のALDH3A1をノックダウンしフローサイトメトリーを行った(図8)。MK-571 200μM、Probe5 50μM、陰性コントロールのCB7を20μMとしアッセイを行ったところ、陰性コントロールsiRNAで処理した細胞では陽性率が90%程度であったものが、ノックダウンにより10%台と著名に低下したことからMK-571を用いて陽性率が著名に改善したアッセイにおける陽性細胞がALDH3A1の活性に由来することが確認された。
(MK-571を併用したALDH3A1ノックダウン細胞によるフローサイトメトリー)
MK-571を併用したフローサイトメトリーでは陽性率が著名に改善したが、この陽性細胞がALDH3A1の活性によるものであることを確認するためsiRNAを用いてOE21細胞のALDH3A1をノックダウンしフローサイトメトリーを行った(図8)。MK-571 200μM、Probe5 50μM、陰性コントロールのCB7を20μMとしアッセイを行ったところ、陰性コントロールsiRNAで処理した細胞では陽性率が90%程度であったものが、ノックダウンにより10%台と著名に低下したことからMK-571を用いて陽性率が著名に改善したアッセイにおける陽性細胞がALDH3A1の活性に由来することが確認された。
[実施例8]
(陽性細胞陰性細胞の分離とソートアウト)
陽性細胞と陰性細胞を分離・ソート・アウト可能であることを示すためshort hairpin RNA(shRNA)により恒常的にALDH3A1がノックダウンされた細胞を作成した。ALDH3Aに対するshRNAおよび陰性コントロールとしてNon-target shRNAをレンチウイルスを用いてOE21細胞に導入した。ALDH3A1がノックダウンされていない陰性コントロール細胞(ctrl)とALDH3A1が恒常的にノックダウンされた細胞(KD)を用いてライセートを作成しウエスタン・ブロッティングを行い、ALDH3A1が著名にノックダウンされていることを確認した(図9a)。この細胞を用いてMK-571、Probe5を用いたフローサイトメトリーを前述と同様のプロトコールで行った(図9b)ところ、ノックダウン細胞(KD)ではCB7を用いた時とほぼ同程度の陽性率となり、さらに、ノックダウン細胞(KD)と非ノックダウン細胞(ctrl)を1:1で混和したサンプルの解析ではProbe5の陽性・陰性率は約1:1となった。なお、同時に行ったSYTOX(登録商標)Red dead cell stainによるアッセイでは死細胞はほとんど認めず、プローブなどの影響による細胞死はほとんど起きていないことを確認した。この陽性と陰性がよく分離されたサンプルを用いて蛍光輝度の上位25%(Top)と下位25%(Bottom)をFACS Aria IIを用いてソート・アウトした。それぞれのライセートを作成し、それらを用いてウエスタン・ブロッティングを行いALDH3A1の発現量を比較検討した(図9c)。するとフローサイトメトリーの結果と一致してProbe 5陽性群でALDH3A1の著名な発現を認め、陰性群ではALDH3A1はほとんど認めなかった。
(陽性細胞陰性細胞の分離とソートアウト)
陽性細胞と陰性細胞を分離・ソート・アウト可能であることを示すためshort hairpin RNA(shRNA)により恒常的にALDH3A1がノックダウンされた細胞を作成した。ALDH3Aに対するshRNAおよび陰性コントロールとしてNon-target shRNAをレンチウイルスを用いてOE21細胞に導入した。ALDH3A1がノックダウンされていない陰性コントロール細胞(ctrl)とALDH3A1が恒常的にノックダウンされた細胞(KD)を用いてライセートを作成しウエスタン・ブロッティングを行い、ALDH3A1が著名にノックダウンされていることを確認した(図9a)。この細胞を用いてMK-571、Probe5を用いたフローサイトメトリーを前述と同様のプロトコールで行った(図9b)ところ、ノックダウン細胞(KD)ではCB7を用いた時とほぼ同程度の陽性率となり、さらに、ノックダウン細胞(KD)と非ノックダウン細胞(ctrl)を1:1で混和したサンプルの解析ではProbe5の陽性・陰性率は約1:1となった。なお、同時に行ったSYTOX(登録商標)Red dead cell stainによるアッセイでは死細胞はほとんど認めず、プローブなどの影響による細胞死はほとんど起きていないことを確認した。この陽性と陰性がよく分離されたサンプルを用いて蛍光輝度の上位25%(Top)と下位25%(Bottom)をFACS Aria IIを用いてソート・アウトした。それぞれのライセートを作成し、それらを用いてウエスタン・ブロッティングを行いALDH3A1の発現量を比較検討した(図9c)。するとフローサイトメトリーの結果と一致してProbe 5陽性群でALDH3A1の著名な発現を認め、陰性群ではALDH3A1はほとんど認めなかった。
以上より、化合物5はMRP阻害剤と併用することによってALDH3A1高活性細胞を検出可能であることが示された。また、セル・ソーターを用いることで、ALDH3A1高活性細胞/低活性細胞をそれぞれ分取可能で、連続して生物学的実験に使用可能である。
Claims (11)
- 以下の一般式(I)で表される化合物又はその塩であって、
(式中、
Raは、水素原子又は炭素数1~4のアルキル基を表し;
Tは、以下の二価の基:
-N(Rb)-、
-C(Rc)2-
-O-
から選択され(Rbは、炭素数1~4のアルキル基を表し、Rcは、水素原子又は炭素数1~4のアルキル基を表し、各々のRcは、同じであってもこ異なっていてもよい);
Lは、リンカーを表し;
は、蛍光団を表し、
前記蛍光団は、キサンテン系色素、BODIPY系蛍光団又はシアニン系蛍光団から選択される)
以下の条件で測定したHPLCクロマトグラムの保持時間は、当該化合物のアルデヒド型の場合においては6.9分より大きく、当該化合物のカルボン酸型の場合においては6.9分以下である、前記化合物又はその塩。
(HPLC条件:溶媒Aを0.01Mギ酸アンモニウム/水、溶媒Bを80%アセトニトリル 0.01Mギ酸アンモニウム/水とし、20%の溶媒Bで2.5分に続いて20%から100%の溶媒B、5分間のリニアグラジエント(流速500μl/分)の条件で行う。) - 前記リンカーが、Y-(S)で表され、Yは結合基を表し、Sは存在する場合は架橋基を表す、請求項1に記載の化合物又はその塩。
- 前記結合基が、-CONH-、-R-CONH-、-COO-、-R-COO-、-RO-又は-R-CO-(ここで、Rは炭化水素基を表す)から選択される、請求項2に記載の化合物又はその塩。
- 前記架橋基が、炭素数1~6の置換又は無置換のアルキレン基、-(CH2-CH2-O)m-(mは1又は2である)、又はこれらの組合せから選択される、請求項2又は3に記載の化合物又はその塩。
- 式(I)における
は、以下の式(II)で表される、請求項1~4のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
R1は、水素原子を示すか、又はベンゼン環上に存在する1ないし4個の同一又は異なる一価の置換基を示し;
R2は、水素原子、一価の置換基又は結合を示し;
R3及びR4は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~6個のアルキル基、ハロゲン原子又は結合を示し;
R5及びR6は、それぞれ独立に、炭素数1~6個のアルキル基、アリール基又は結合を示し、但し、Xが酸素原子の場合は存在しない;
R7及びR8は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~6個のアルキル基、ハロゲン原子又は結合を示し;
Xは、酸素原子又は珪素原子を示し;
*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所を表し、
ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R8のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する。) - 式(I)における
は、以下の式(III)で表される、請求項1~4のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
(式中、R1~R8、Xは、式(II)で定義した通りであり;
R9及びR10は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~3個のアルキル基又は結合を示し、
R9及びR10は一緒になってR9及びR10が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよく、
R9又はR10は、或いは、R9及びR10の両方は、夫々、R4又はR8と一緒になって、R9又はR10が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよく、環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよく;
*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所を表し、
ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R10のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する) - 式(I)における
は、以下の式(IV)で表される、請求項1~4のいずれか1項に記載の化合物又はその塩。
(式中、R1~R8、Xは、式(II)で定義した通りであり;
R9及びR10は、それぞれ独立に、水素原子又は炭素数1~6個のアルキル基を示し、
R9及びR10は一緒になってR9及びR10が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよく、
R9又はR10は、或いは、R9及びR10の両方は、夫々、R3又はR7と一緒になって、R9又はR10が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよく、環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよく;
R11及びR12は、それぞれ独立に、水素原子、炭素数1~3個のアルキル基又は結合を示し、
R11及びR12は一緒になってR11及びR12が結合している窒素原子を含む4~7員のヘテロシクリルを形成していてもよく、
R11又はR12は、或いは、R11及びR12の両方は、夫々、R4又はR8と一緒になって、R11又はR12が結合している窒素原子を含む5~7員のヘテロシクリル又はヘテロアリールを形成していてもよく、環構成員として酸素原子、窒素原子及び硫黄原子からなる群から選択される1~3個の更なるヘテロ原子を含有していてもよく、更に該ヘテロシクリル又はヘテロアリールは、炭素数1~6個のアルキル、炭素数2~6個のアルケニル、又は炭素数2~6個のアルキニル、炭素数6~10個のアラルキル基、炭素数6~10個のアルキル置換アルケニル基で置換されていてもよく;
*は、ベンゼン環上の任意の位置における式(I)のLとの結合箇所を表し、
ここで、Lは、ベンゼン環上の任意の位置、R2~R12のいずれかの位置から選択される少なくとも1つの位置において結合する。) - 請求項1~10のいずれか1項に記載の化合物又はその塩を含む、ALDH3A1検出蛍光プローブ。
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|---|---|---|---|---|
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2017
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