[go: up one dir, main page]

WO2016048994A3 - Systèmes et procédés acellulaires de synthèse de protéines en gouttelettes et autres compartiments - Google Patents

Systèmes et procédés acellulaires de synthèse de protéines en gouttelettes et autres compartiments Download PDF

Info

Publication number
WO2016048994A3
WO2016048994A3 PCT/US2015/051401 US2015051401W WO2016048994A3 WO 2016048994 A3 WO2016048994 A3 WO 2016048994A3 US 2015051401 W US2015051401 W US 2015051401W WO 2016048994 A3 WO2016048994 A3 WO 2016048994A3
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
protein
droplets
cell
free
protein synthesis
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Ceased
Application number
PCT/US2015/051401
Other languages
English (en)
Other versions
WO2016048994A2 (fr
Inventor
David A. Weitz
Shaorong Chong
Huidan ZHANG
Nai Wen CUI
Ye Tao
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
New England Biolabs Inc
Harvard University
Original Assignee
New England Biolabs Inc
Harvard University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by New England Biolabs Inc, Harvard University filed Critical New England Biolabs Inc
Publication of WO2016048994A2 publication Critical patent/WO2016048994A2/fr
Publication of WO2016048994A3 publication Critical patent/WO2016048994A3/fr
Anticipated expiration legal-status Critical
Ceased legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
    • C12P21/02—Preparation of peptides or proteins having a known sequence of two or more amino acids, e.g. glutathione
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/70—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/80—Fusion polypeptide containing a DNA binding domain, e.g. Lacl or Tet-repressor

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

De manière générale, cette invention concerne la synthèse acellulaire de protéines en gouttelettes microfluidiques. Les gouttelettes peuvent être utilisées pour encapsuler l'information génétique (ADN/ARN), et par la technique de la synthèse acellulaire de protéines, fournir une liaison entre l'information génétique et l'information fonctionnelle, p. ex., l'activité de la protéine exprimée, et peuvent être utilisées pour convertir l'information fonctionnelle en un signal détectable permettant, par exemple, de trier les gouttelettes et de récupérer l'information génétique associée aux gouttes. Dans un jeu de modes de réalisation, des gouttelettes microfluidiques contenant un système acellulaire de synthèse de protéines conçu pour détecter toute interaction protéine-protéine (p. ex., systèmes in vitro à deux hybrides ou IVT2H) peuvent être utilisées pour le criblage à haut débit, p. ex., de liants protéiques. Ce système à deux hybrides basé sur des gouttes peut comprendre deux protéines de fusion (ou plus) qui peuvent se lier l'une à l'autre de façon que leur liaison produise un complexe capable de produire un acide nucléique, l'acide nucléique pouvant être exprimé pour produire une protéine. Dans certains modes de réalisation, la protéine peut être produite dans un système acellulaire. La protéine peut être fluorescente ou déterminable autrement, de façon que la détermination de la protéine puisse être utilisée pour permettre la mise en œuvre de dosages dans les gouttelettes, pour permettre le tri des gouttelettes, ou autre, p. ex. comme discuté ci-dessous, par exemple, à des fins de criblage ou autres applications.
PCT/US2015/051401 2014-09-23 2015-09-22 Systèmes et procédés acellulaires de synthèse de protéines en gouttelettes et autres compartiments Ceased WO2016048994A2 (fr)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201462054263P 2014-09-23 2014-09-23
US62/054,263 2014-09-23

Publications (2)

Publication Number Publication Date
WO2016048994A2 WO2016048994A2 (fr) 2016-03-31
WO2016048994A3 true WO2016048994A3 (fr) 2016-05-26

Family

ID=55582238

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/US2015/051401 Ceased WO2016048994A2 (fr) 2014-09-23 2015-09-22 Systèmes et procédés acellulaires de synthèse de protéines en gouttelettes et autres compartiments

Country Status (1)

Country Link
WO (1) WO2016048994A2 (fr)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2018067792A1 (fr) * 2016-10-07 2018-04-12 President And Fellows Of Harvard College Séquençage de bactéries ou d'autres espèces
WO2020077274A1 (fr) 2018-10-11 2020-04-16 Berkeley Lights, Inc. Systèmes et procédés d'identification de production de protéine optimisée et ensembles associés
EP3828283A1 (fr) * 2019-11-28 2021-06-02 Diagenode S.A. Procédé et kit de séquençage améliorés
US11788137B2 (en) 2019-09-30 2023-10-17 Diagenode S.A. Diagnostic and/or sequencing method and kit
AU2021327851B2 (en) * 2020-08-21 2025-07-10 Nuclera Ltd Monitoring of in vitro protein synthesis
GB202311993D0 (en) * 2023-08-04 2023-09-20 Cambridge Entpr Ltd Method and system
KR20250074706A (ko) * 2023-11-15 2025-05-28 대한민국(방위사업청장) 무세포 단백질 합성과 재귀반사신호에 기반한 표적물질 검출방법

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030008398A1 (en) * 1996-12-11 2003-01-09 Rolf Mueller Self-enhancing, pharmacologically controllable expression systems
US20090304699A1 (en) * 2006-05-24 2009-12-10 Biogen Idec Ma Inc. Methods of treating fibrosis
WO2012139134A2 (fr) * 2011-04-07 2012-10-11 Coferon, Inc. Procédés de modulation des protéines de fusion oncogènes
US20130171328A1 (en) * 2010-06-02 2013-07-04 Ganesh M. Kishore Production of steviol glycosides in microorganisms

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030008398A1 (en) * 1996-12-11 2003-01-09 Rolf Mueller Self-enhancing, pharmacologically controllable expression systems
US20090304699A1 (en) * 2006-05-24 2009-12-10 Biogen Idec Ma Inc. Methods of treating fibrosis
US20130171328A1 (en) * 2010-06-02 2013-07-04 Ganesh M. Kishore Production of steviol glycosides in microorganisms
WO2012139134A2 (fr) * 2011-04-07 2012-10-11 Coferon, Inc. Procédés de modulation des protéines de fusion oncogènes

Also Published As

Publication number Publication date
WO2016048994A2 (fr) 2016-03-31

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2016048994A3 (fr) Systèmes et procédés acellulaires de synthèse de protéines en gouttelettes et autres compartiments
WO2014106004A3 (fr) Système et procédé à haut débit d'identification d'anticorps ayant des activités de liaison à un antigène spécifique
WO2012149042A3 (fr) Procédés et compositions pour l'analyse d'acide nucléique
US20200277600A1 (en) Multi-effector crispr based diagnostic systems
WO2018119452A3 (fr) Procédés et systèmes pour analyser des molécules d'acide nucléique
EP4310183A3 (fr) Procédés et systèmes de codage à barres de cellules uniques à base de gouttelettes
JP2015506699A5 (fr)
WO2015200893A3 (fr) Procédés d'analyse d'acides nucléiques provenant de cellules individuelles ou de populations de cellules
WO2006098752A3 (fr) Capteur ultrasensible et detection rapide d'analytes
WO2015200717A3 (fr) Tri activé par pcr (pas)
WO2016205745A3 (fr) Tri cellulaire
WO2011069029A3 (fr) Essais à écoulement latéral
WO2016145416A3 (fr) Analyse protéomique avec des identificateurs d'acide nucléique
GB2568608A (en) Personalized genetic testing
WO2009018003A3 (fr) Analyses de détection et utilisation de celles-ci
RU2012115491A (ru) Способ идентификации гетеромультимерных модифицированных убиквитиновых белков со способностью связываться с лигандами
WO2007084702A3 (fr) Procedes et dispositifs destines a la detection et l’identification de billes codees et de molecules biologiques
WO2007047578A3 (fr) Affichage cellulaire de libraires d'anticorps
WO2020131182A3 (fr) Composés, compositions et méthodes d'amélioration de dosages
AU2018351349B2 (en) Detection of symmetrical dimethylarginine
MX2019009045A (es) Nuevas luciferasas y metodos para su uso.
WO2012004719A3 (fr) Système de traitement sélectif d'un échantillon
WO2007040592A8 (fr) Production de sequences d'acides nucleiques en parallele et utilisation associee
WO2009032316A3 (fr) Polymorphismes génétiques associés à la polyarthrite rhumatoïde, leurs procédés de détection et leurs utilisations
McMahon Avidin-biotin interactions: methods and applications

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 15843501

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A2

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 15843501

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A2