WO2015075396A1 - Sample test system and method - Google Patents
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Definitions
- the present invention relates to systems and methods for testing a sample.
- Tissue Micro Array Tissue Micro Array
- TMA Tissue Micro Array
- It allows to evaluate by immunohistochemistry the expression of the same protein on hundreds of samples of the same tissue of different individuals, or to evaluate the expression of the same protein on different tissue samples. of the same animal (heart, spleen, liver, lungs, ).
- Such a system remains limited to the search for the expression of a target protein on a large number of samples arranged on the same slide or on the same support.
- the present invention is intended to overcome these disadvantages by allowing to perform a large number of different analyzes on the same support, for example simultaneously.
- the invention relates to a sample testing method comprising:
- the sample is a biological sample.
- the reagent is brought into contact with the samples by agitating the assembly.
- the at least one sample is carried by a second device comprising a first and a second opposite face and bearing samples on at least one of its faces, and for which the first face of the first device and one of the faces of the second device are contacted with at least one well facing at least a portion of at least one sample carried by at least one of the faces of the second device.
- At least one of the wells opens on the two opposite faces of the first device.
- the method comprises the following steps:
- the method comprises observing by optical means the samples from the second face of the first device.
- the method comprises closing the outlet of the at least one well on the second face of the first device by a plate.
- the system comprises at least a first device comprising opposite first and second faces, and comprising a network of wells extending between the first face and the second face of the first device, each well opening on at least the first face and each well. containing a reagent, the system also comprising at least one sample, and the system being adapted to contact the first face of the first device with the sample, with at least two wells facing each with at least a respective portion of the sample sealingly, to form an assembly adapted to contact the reagent and the sample.
- the system further comprises at least one second device comprising a first and a second opposite face adapted to carry samples on at least one of its faces and adapted so that the first face of the first device and one of the faces of the second device are brought into contact with at least one well of the first face of the first device facing at least a portion of at least one sample carried by at least one of the faces of the second device.
- the system further comprises a reservoir adapted to be connected to at least one well of the first device, said reservoir being adapted to individually fill said well.
- the system further comprises bores previously machined in the first device, said bores being adapted to assist the separation of the first device and the second device after contacting the reagent and the sample.
- the first device is made of polymer and is suitable for thermo-molding wells.
- the device is anti-ultraviolet material at least on the surface.
- At least one of the wells has a conical geometry and for which the outlet section of said well on the first face (11) is greater than the section of the well between the first face and the second face of the first device.
- FIG. 1 shows the system according to one embodiment of the invention with the first device
- FIG. 2 shows a conical well geometry
- FIG. 3 schematizes the individualized filling of the wells
- FIG. 4 shows the common filling of all the wells by a common tank
- FIG. 5 schematizes the steps of the test method for the system according to the embodiment of the invention with the first device
- FIGS. 6a-6d illustrate possible sealing configurations of the first device
- FIG. 7 shows the system according to one embodiment of the invention with the first and the second device
- FIGS. 8a and 8b show the maintenance of the first and second devices by a hybridization chamber
- FIGS. 9a-9d schematize the steps of the test method for the system according to the embodiment of the invention with the first and the second device,
- FIG. 10 shows the bores in the first device
- FIGS. 12a-12d diagrammatically illustrate steps of the test method in the case of wells opening on both sides of the part.
- FIG. 13 illustrates the case of wells emerging on each face and of conical geometry
- FIG. 14 illustrates the case of wells supplied with solution or gas by lateral connectors
- Figure 15 illustrates the automation of the system.
- the system according to a first embodiment comprises a first device 10 comprising opposite first and second faces, 11 and 12 as shown in FIG.
- the first device 10 is made of biocompatible material. In a variant, it is made of a non- bio ⁇ compatible material whose inner surface of the wells is bio ⁇ compatible. It is easy to clean and reuse frequently. It may be for example a glass plate with a thickness of about one centimeter, for example.
- the first device 10 may also be a plate of polymer material adapted or subjected to a suitable surface treatment. Indeed polymer materials can generating an aspecific binding of the biological molecules (proteins, nucleic acids, etc.) and a preliminary surface treatment with a hydrophobic compound will ensure reliability in the concentration of the compounds to be tested.
- the first device 10 comprises a network of wells 20 which can be made extending between the first face 11 and the second face 12 of the first device 10.
- a well network 20 may comprise, for example, wells 20 arranged in an ordered manner in lines. and in columns. The lines then define the x direction. Each well 20 opens on at least the first face 11.
- the wells 20 may for example be cylindrical with an axis parallel to z.
- a cylindrical well 20 may have any fixed section as a function of z as shown in FIG. 1.
- the geometry of the wells may be adapted according to the intended applications.
- the section of the well 20 may for example be variable as a function of z.
- the well 20 may also for example have a conical shape as shown in FIG. 2.
- a well 20 will have, for example, a diameter size of between 1 mm and 15 mm, preferably between 5 mm and 10 mm, depending on the intended applications. .
- the wells 20 will typically have a depth of the order of a few millimeters, and which may be correlated to the diameter of the wells.
- the wells 20 are produced for example by ultrasonic machining through a mask or by etching or by hot pressing. against a preform.
- An attack by hydrofluoric acid HF can be used to improve the final surface state of the wells.
- the shaping can be done by heat treatment, by molding for example.
- Each well 20 is adapted to receive a reagent.
- the wells 20 open on the first face 11, and are closed on the opposite side. They can receive a surface treatment beforehand which also determines the size of the wells according to the desired treatment.
- the density and size of the wells 20 of the first device 10 are parameters that may vary depending on the size of the materials and the volume of reagent that must be present in the wells 20. This reagent may be different from a well 20 to the same. other. Some wells 20 of the first device 10 may also for example be left empty as shown in FIG.
- the first device 10 may be translucent to allow continuous or sequential temporal observation of the reagent contained in the wells 20 by optical or spectroscopic means.
- the reagent may be for example a liquid, a solid optionally in the form of a powder, for example an aerosol.
- the filling of the wells 20 can be done simultaneously for all the wells 20 by contacting the first face 11 of the first device 10 on which the wells 20 open, with a reservoir containing the reagent for filling the wells 20.
- the filling by a common tank, as shown in FIG. 4, for example, aims at saving time, and ultimately, for example, automating the process.
- the wells 20 can also be individually filled with identical reagents in each well 20 or with different reagents.
- the system of the invention also comprises for example at least one sample 40 of dimensions ranging from a few microns ( ⁇ m) to a few centimeters (cm). It may be for example a biological sample: skin, tissue or cells. It may be a piece of polymer for industrial applications, or a plant sample, any material or an electromechanical micro or nano-structure.
- the structure may be for example passive function such as a film with a substrate or active function such as a sensor.
- the first device 10 is brought into contact with the biological sample 40 as shown in FIG. 5.
- the biological sample 40 is positioned on the first device 10 so that, if the biological sample 40 is to be tested preferably on one side, it is this face of the biological sample 40 which faces the first device 10.
- At least one well 20 is placed facing at least a portion of the biological sample 40.
- the biological sample 40 is of sufficient spatial extent to cover several wells adjacent to each other, and of such rigidity that, at rest, it does not return to contact with the reagent contained in the wells. The reagent and the biological sample are then brought into contact.
- the assembly 80 formed by the biological sample 40 and the first device 10 held together is for example returned around an axis of the plane (x, y) so that, under the effect of gravity, the reagent contained in the at least one well 20 comes into contact with the biological sample 40.
- the assembly 80 is then returned again around an axis of the (x, y) plane, towards its initial position for example, so as to the reagent contained in the well 20, s'1 is liquid, down by gravity bottom wells 20.
- the sample 40 and the first device 10 are separated.
- the assembly 80 may also alternatively be turned around an axis of the plane (x, y) more than twice or shaken vertically or more generally agitated, before separating the sample 40 and the first device 10.
- agitation will be used generally to describe both a simple reversal of the system around an axis of the plane (x, y), as several consecutive reversals of the system around an axis of the plane (x, y), a translational movement of the system in any direction, a periodic movement of the system, a random movement in direction and periodicity suitable for the brought into contact with the reagent and the biological sample.
- Such "agitation” may in particular be automated.
- the tightness between the wells 20 of the first device 10 must be ensured to avoid cross-well contamination during agitation, for example of the assembly 80, for example if different liquids are placed in each well 20.
- the first face 11 of the first device 10 on which the wells 20 open will for example undergo a surface treatment to be rendered locally hydrophobic between the wells 20
- the first face 11 will be treated by mechanical texturing, by chemical treatment or by deposition of material on the first face 11 of the first device 10.
- the first face 11 will for example be treated by a deposition of silica nanoparticles.
- the first face 11 of the first device 10 will for example be subdivided into small zones surrounding each of the wells, and separated from each other by a hydrophobic zone so that after contacting and stirring the assembly 80, the reagent such as a liquid, contained in the wells 20 can not pass between the wells 20, that is to say that the junction between the wells 20 is sealed as shown in Figure 6a.
- the hydrophobicity can be obtained by texturing the surface or by adding a hydrophobic material or whose surface structure makes it hydrophobic.
- the first face 11 may for example be rendered hydrophobic over its entire surface, and then locally treated to release certain areas of hydrophobicity, by treatment through a mask for example, such as etching through a mask .
- These areas of the first face 11 made hydrophobic may be lines delimiting the wells 20. These lines may be thick ( Figure 6b) or multiple such as double lines ( Figure 6c).
- the first face 11 may alternatively be locally treated to be rendered hydrophobic only in certain areas, by treatment through a mask directly for example.
- the seal between the wells 20 can also be provided by silicone grease spread around said wells 20.
- a pasty product such as a grease
- a non-flowing product is preferably chosen, so that the latter is not likely to be placed in the well, and / or has a high chemical neutrality (for example with respect to antibodies) so as not to influence the test.
- Silicone grease has shown superior sealing performance over other tested products in comparative tests using two glass plates.
- the first face 11 is coated with grease which enters the wells 20. These are then cleaned to remove the grease that has entered.
- the tightness between the wells 20 can also be ensured by spacers 70 placed between the wells 20, as shown in FIG. 6d, tightly assembled to the first device 10, and sealed to the sample 40.
- Sealing could also be ensured by using an adhesive polymer or metal film which would be adhered to the device 10, thereby sealing the wells on the surface 12 side.
- an initially frozen tissue disk to be tested is for example selected, and brought into contact with the reactive liquid placed in the wells 20 of the first device 10, for example 1 at 2 mm two by two.
- a minimum surface of the fabric will have to be brought into contact with the test liquid via one or more wells.
- the characteristic dimension of the smallest surface will, for example, typically be order of 600pm.
- it may be for example a method for performing allergy tests, made on the skin of the patient that will constitute the biological sample 40.
- the skin is initially made sensitive by needle-sticking or scraping.
- Wells 20 are filled with different reagents between wells 20 which are allergenic substances.
- the wells 20 are then brought into sealed contact with the surface of the skin undergoing the test.
- the patient's arm may for example be positioned above the first device 10, then the entire arm and the device 10 is assembled by tape for example.
- the patient then shakes his arm for example and then returns to the initial position.
- the patient may also for example turn his arm to contact the allergens and his skin for an hour or more generally shake his arm attached to the device 10.
- the first device 10 is separated from the patient's arm on which the reagents reacted with the patient's skin.
- the method described above thus makes it possible, for example, to carry out the allergology test.
- the same fabric will be sectorized to perform a series of different analyzes.
- the individualized filling of the wells will make it possible to test different reactive compounds or different concentrations of reagent during the same test.
- This type of test can be done on plants in culture.
- the device operates in an uncontrolled environment, in the sense that, unlike laboratory tests, it is necessary to integrate the effects of solar radiation, temperature variations, rain, etc. This is therefore the case in such cases. conditions, to ensure that the products tested on the plants do not degrade and that the test remains valid.
- the device may for example be instrumented, typically with a temperature probe or a "patch" affected by UV radiation or if its temperature exceeds a certain value .
- This condition could be shown in any detectable way, such as a change of color for example.
- industrial applications for which larger quantities of products have to be tested over large areas, much larger device and well dimensions could be envisaged.
- the reaction can be monitored, for example, in an instrumented manner, in situ using spectroscopic methods.
- system of the invention may also comprise a second device 30, which has first and second opposite faces 31 and 32 as shown in FIG.
- the glass plate 30 can typically have dimensions between 1cm and 10cm, for example 2.5cm by 7cm.
- the second device 30 is adapted to receive at least one biological sample 40 on at least one of its faces. It may be for example the face 31 receiving a biological sample 40.
- the biological sample 40 may be for example a tissue sample.
- the biological sample 40 is secured to the face 31 of the second device 30 using any suitable mechanical and / or chemical means for accessing a portion of the biological sample. For example, paraffin is used which allows the positioning and adhesion of the biological sample 40 to the face 31 of the second device 30.
- the second device 30 is then placed on the first device 10 so that the face 31 of the second device 30 is facing the first face 11 of the first device 10 as illustrated in FIG. Figure 9a.
- the biological sample 40 is positioned on the second device 30 so that at least one well containing reagent is contacted with at least a portion of the biological sample. 40.
- the assembly 80 formed by the first device 10 and the second device 30 carrying the biological sample held together is then agitated so that the reagent contained in at least one of the wells 20 is brought into contact with the biological sample 40.
- the first device 10 and the second device 30 are held together by clips, tape or any other suitable means.
- a pressure means may be used to ensure a good seal at the interface between the first device 10 and the second device 30 for the necessary time.
- the inter-well seal can be provided by mechanical pressing, for example between the first device 10 and the second device 30. In this case, particularly in the case of a low roughness of the microscope slide, the adhesion between the first device 10 and the second device 30 may be strong.
- Bores previously machined in the first device 10 and in correspondence with others in the second device 30 may for example be adapted to ensure that the first device 10 and the second device 30 are brought into sealed contact by using a rod, for example threaded and through the two devices 10 and 30 and keeping them in contact via bolts positioned on either side of the assembly 80 and which maintain the contact.
- the tightness may also for example be ensured by the use of two other surfaces sandwiching the assembly 80 to improve the contact between the first device 10 and the second device 30.
- inter-well seal is provided in any of the ways described above for the first embodiment.
- the first device 10 and the second device 30 are held together using a hybridization chamber 100.
- the hybridization chamber comprises a frame 102, for example a metal frame, a positioning support 110, a positioning slide 109.
- the assembly 80 of the first device 10 and the second device 30 is held by the frame 102 of the hybridization chamber 100 which traps the edge of the assembly 80 as shown in Figure 8a.
- the frame 102 comprises an upper part 108, a lower part 106 separated and a connecting element 112 providing the connection between the upper part 108 and the lower part 106.
- the assembly 80 is positioned on the positioning slide 109.
- the positioning slide 109 is for example a frame allowing the first and second devices 10, 30 to be held together and relative to one another. In particular, positioning makes it possible to geometrically align the wells 20 of the first device 10 with the Samples of the second device 30.
- the positioning drawer 109 on which the assembly 80 has been loaded, is placed on the positioning support 110.
- the positioning drawer 109 is alternately bonded to the positioning support 110.
- the positioning support 110 110 thus loaded with the positioning slide 109 itself loaded with the assembly 80, is then moved, for example slid between the lower portion 106 and the upper portion 108 of the hybridization chamber 100.
- the lower portion 106 is of variable thickness, which increases continuously between the end opposite the connecting member 112 and the end adjacent the connecting member 112, as shown in Figure 8b.
- a screw 104 is used to translate the loaded positioning support 110 into the interior of the hybridization chamber 100.
- the screw 104 also makes it possible to block the slide positioning device 109 on which is loaded the assembly 80 in the hybridization chamber 100, as shown in Figure 8b.
- the screw 104 inserted into a hole horizontally traversing the connecting element 112 and opening on either side, will be screwed inside a threaded hole 114 pierced horizontally in the setting drawer 110.
- the screw 104 is accessible for clamping, for example with a key type BTR or other. Actuation of the screw 104 thus causes the slide to slide into a position where it is held tight by the beveled shapes of the lower part 106 and the positioning support 110. To release the assembly 80 and its setting drawer position 110, it will loosen ie turn the said screw in the opposite direction.
- the first device 10 can be inserted before the upper part 108 of the hybridization chamber 100 and the second device 30 carried by the positioning slide 109 can be inserted between the upper part 108 and the lower part 106 of the chamber hybridization 100.
- the upper and lower portions 106, 108, and the connecting member 112 will be molded together.
- an invention relates to a hybridization chamber 100 comprising at least one frame 102, a positioning support 110, a drawer of positioning 109, a screw 104,
- the frame 102 comprising an upper portion 108, a lower portion 106, and a connecting member 112 between the upper portion 108 and the lower portion 106, the lower portion 106 having an increasing thickness between an end opposite the connecting member 112 and an end adjacent to the connecting element 112,
- the positioning slide 109 being adapted to receive an experimental device
- the positioning support 110 being adapted to receive the positioning slide 109, the positioning support 110 comprising a threaded hole 114,
- the screw 104 being adapted, by its insertion into the threaded hole 114, to drive and hold the positioning support 110 between the upper part 108 and the lower part 106.
- the variation of thickness of the lower part makes it possible to ensure a good maintenance of the experimental device mounted on the positioning slide.
- the clamping of the positioning support 110 between the two upper portions 108 and lower 109 by a screw system located in the thickness of the positioning support makes it possible to disengage the experimental device.
- the upper part 108 is pierced with a gap.
- Such a gap allows access from the outside of the hybridization chamber 100 to the experimental device placed in the hybridization chamber. Then the assembly 80 is agitated. The first device 10 and the second device 30 are then separated as shown respectively in FIGS. 9a to 9d. In this embodiment, the separation of the first device 10 and the second device 30 may be assisted for example by bores 90.
- the bores 90 may for example be through the first device 10 as shown in FIG. bear against the bores 90 on the second device 30, and apply to it a force allowing the detachment of the second device 30 of the first device 10.
- the biological sample 40 may be tested for example by several different reagents placed in the different wells 20 of the first device 10 all facing a respective part of the biological sample 40 during agitation of the assembly 80 and second device 30.
- a reagent has reacted with the biological sample 40 in each zone in which a reagent has been brought into contact with a sample zone biological 40.
- the second device 30 can receive several biological samples 40 to be tested, for example simultaneously.
- the second device 30 comprises for example a network of locations capable of receiving the biological samples 40, this network being corresponding to the well network 20 provided by the first device 10.
- the biological samples 40 are therefore, in this case, positioned to so that each biological sample 40 faces at least one well 20 of the first device 10. Some wells 20 may not face any biological sample 40.
- the biological samples 40 are secured to the second device 30 which acts as a sample holder as described above, and for example by the use of paraffin. Each biological sample 40 is for example cast in paraffin and then placed on the second device 30.
- the wells 20 of the first device 10 may contain an identical or different reagent between the wells 20.
- the assembly 80 and second device 30 is then agitated to bring the biological samples 40 into contact with the reagents contained in the wells.
- the biological samples 40 can all be tested by the same reagent or by different reagents contained in the different wells 20 compared with biological samples 40.
- samples of 0.6mm to 2mm in diameter and a few microns thick are taken from impregnated and paraffin-embedded tissues. These samples are then positioned on a plate acting as a second device 30.
- the wells 20 are then for example greater in diameter than the size of the biological sample 40 deposited on the plate.
- the diameter of the wells may be for example between 1mm and 15mm.
- the distance between the wells to avoid contamination may for example be 1mm.
- the plate used to deposit the biological samples 40 may typically have dimensions of the order of 25x70cm, and a thickness of the order of 1 to 2mm.
- a culture The cell is deposited as a stopped cell culture on a microscope slide as a second device 30 for testing, for example, the effectiveness of the antibodies.
- the cell culture can be stopped by being fixed or frozen.
- the cell culture is fixed by a fixing agent, for example paraformaldehyde, acetone or ethanol.
- biological samples 40 can be placed on both faces 31 and 32 of the second device 30.
- tests of each of the faces 31 and 32 can be made successively by contacting each of the faces 31 and 32 of the second device 30 with the reagent contained in the wells 20 of the first device 10 via contacting the first face 11 of the first device 10 successively with the faces 31 and 32 of the second device 30.
- At least one well 20 may also lead to the second face 12.
- the bottom of the well 20 on the second face 12 may then consist of an additional glass plate 50, attached to the second face 12 of the first device 10 sealingly and removably as shown in Figure 11.
- the device 10 ' which can replace the first device 10 of the invention may consist of the first device 10 and a plate 50 for example of glass which is associated with the second face 12 of the first device 10 tightly to form the bottom.
- a plate 50 for example of glass which is associated with the second face 12 of the first device 10 tightly to form the bottom.
- the first device 10 is positioned returned, that is to say with the second face 12 above the first face 11, and the first device 10 is positioned above the second device 30 having biological samples 40 assembled therewith.
- Wells 20 may be filled simultaneously or individually to the brim as shown in FIGS. 12a and 12b.
- a reservoir at the surface 12, on which each well opens, may for example allow filling of all the wells in a single operation as shown in Figures 12a to 12c. Alternatively the wells can also lead individually to the second face 12.
- the biological samples 40 are therefore at this stage brought into contact with the reagents contained in the wells 20.
- a plate such as the additional glass plate 50 can then be positioned above the second face 12 of the first device 10 as shown on Figure 12c.
- the plate 50 may also make it possible to avoid evaporation of the reagent and the change of its concentration.
- the plate 50 can also for example help by adding the weight which seals the junction first device 10- second device 30.
- the contact between the first device 10 and the plate 50 is then sealed, before stirring for example all plate 50 first device 10 second device 30 if necessary alternatively.
- the method may comprise only the first two steps illustrated in FIGS. 12a and 12b.
- the biological samples 40 brought into contact with the reagent contained in the wells can then be observed, for example, by optical means without having to separate the devices 10 and 30 and without having to empty the wells 20, the biological samples 40 having already been placed. in contact with the reagent (s). The observation is done for example through the reagent contained in the wells 20.
- the first device 10 may also include at least one well 20 having a conical geometry.
- the outlet section of said well 20 on the first face 11 may be smaller than the section of the well 20 between the first face 11 and the second face 12 of the first device 10 as shown in FIG.
- the first device 10 in the case where the wells 20 open on either side of the first device 10, the first device 10 may be for example returned the second face 12 above the first face 11.
- the first face 11 of the first device 10 is brought into contact with the face 31 of the second device 30 comprising the biological samples 40, the outlets of the wells on the first face 11 being compared with the biological samples 40.
- the wells 20 can then be filled by the second face 12 of the first device 10.
- Each well 20 being filled by the face on which its section is the widest, towards the part where its section is the narrowest, the air trapped under the reagent during filling, in the case of a liquid reagent for example, can be more easily evacuated.
- the biological samples 40 brought into contact with the reagent contained in the wells 20 can then be observed, for example, by optical means without having to separate the devices 10 and 30, the biological samples 40 having already been brought into contact with the reagent (s). .
- the set 80 maintained, formed of the first device and the second device 30 carrying the biological sample, is then covered on the second face 12 of the first device 10 for example by a glass plate 50.
- the seal between the second face 12 the first device 10 and the plate 50 is then provided for example by mechanical pressing.
- the system comprising the assembly 80 and the plate 50 held together, can then be turned over and the second device 30 comprising the biological samples 40 and located above can then be separated from the first device 10. This system can prior to being agitated.
- the reagent may also be gaseous.
- the filling of the wells 20 can be done for example by lateral connectors and transverse channels 61 as shown in Figure 14, at least one open face of the wells 20 of the device 10 being brought into contact with biological samples 40 of the device. in contact between the biological samples 40 and the wells 20 is directly provided by this configuration.
- the wells can also be supplied with solution by lateral connectors.
- the biological sample 40 is brought into contact with the reagent (s) and the biological sample 40 is separated from the device 10, the biological sample 40 is analyzed. In particular, the biological sample 40 is measured to determine the occurrence of a reaction between the biological sample 40 and the reagent (s). Such a measurement can be visual, optical or other.
- Tissue Micro Array Tissue Micro Array
- Ac monoclonal antibodies
- paraffin-embedded tissues frozen tissues.
- the protocols for example for the use of an Ac immunohistochemistry (unmasking buffer, dilution of Ac, revelation kit).
- the system can be used for immunoglobulin screening and for evaluation. simultaneous interaction of molecules with thin sections of tissue.
- reaction of polymer pieces with chemical substances may be tested.
- the automation of the system is for example applied to different steps of the method, as shown in Figure 15.
- the second device 30 is for example automatically conveyed from one end to the other of the process.
- the filling of the first device 10 is for example automatically in parallel with the process of conveying the second device 30 to lead to the assembly of the first and the second device.
- the assembly 80 is then shaken in a new automated step then the assembly is conveyed and disassembled.
- the first device 10 is transported to the cleaning station while the second device 30 is conveyed to the analysis station, provided for example with a microscope.
- the second device 30 is then conveyed after analysis to the output.
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Abstract
Description
Système et Procédé de test d' échantillon. System and method for sample testing.
La présente invention est relative aux systèmes et procédés de test d'échantillon. The present invention relates to systems and methods for testing a sample.
Dans le domaine de l'histologie, et du criblage haut débit différencié notamment, pour le test d'échantillons biologiques tels que des tissus, le haut débit est réalisé avec le Système TMA (Tissue Micro Array) . II permet soit d'évaluer par immuno-histochimie l'expression d'une même protéine sur des centaines d'échantillons d'un même tissu de différents individus, soit d'évaluer l'expression d'une même protéine sur différents échantillons de tissus d'un même animal (cœur, rate, foie, poumons,...) . Un tel système reste limité à la recherche d'expression d'une protéine cible sur un grand nombre d'échantillons disposés sur une même lame ou sur un même support. La présente invention a notamment pour but de pallier à ces inconvénients en permettant d'effectuer un grand nombre d'analyses différentes sur un même support, par exemple simultanément. In the field of histology, and especially high-throughput screening, for the testing of biological samples such as tissues, high throughput is achieved with the Tissue Micro Array (TMA) System. It allows to evaluate by immunohistochemistry the expression of the same protein on hundreds of samples of the same tissue of different individuals, or to evaluate the expression of the same protein on different tissue samples. of the same animal (heart, spleen, liver, lungs, ...). Such a system remains limited to the search for the expression of a target protein on a large number of samples arranged on the same slide or on the same support. The present invention is intended to overcome these disadvantages by allowing to perform a large number of different analyzes on the same support, for example simultaneously.
A cet effet, l'invention concerne un procédé de test d'échantillon comprenant : For this purpose, the invention relates to a sample testing method comprising:
Fournir un premier dispositif comportant une première et une deuxième face opposées, et comprenant un réseau de puits s 'étendant entre la première face et la deuxième face du premier dispositif, chaque puits débouchant sur au moins la première face et chaque puits contenant un réactif, - Fournir au moins un échantillon, Providing a first device having opposite first and second faces, and comprising an array of wells extending between the first face and the second face of the first device, each well opening on at least the first face and each well containing a reagent, - Provide at least one sample,
Mettre en contact la première face du premier dispositif avec l'échantillon, avec au moins deux puits en regard chacun avec au moins une partie respective de l'échantillon de manière étanche, pour former un ensemble, Put the first face of the first device into contact with the sample, with at least two wells facing each with at least a respective portion of the sample in a sealed manner, to form an assembly,
Mettre en contact le réactif avec l'échantillon. Put the reagent in contact with the sample.
Grâce à ces dispositions, il sera possible de tester plusieurs Anticorps différents sur une même lame. Plus généralement, un grand nombre d'échantillons biologiques pourront être testés simultanément et par différents réactifs, visant une augmentation du débit d'analyses réalisées. Dans une même perspective de procédé de test haut débit, un même échantillon biologique pourra être testé par plusieurs réactifs simultanément, permettant des études statistiques. Un tel procédé de test va notamment dans la direction d'une possible automatisation du système. Thanks to these provisions, it will be possible to test several different antibodies on the same slide. More generally, a large number of biological samples can be tested simultaneously and by different reagents, aiming at an increase in the flow of analyzes performed. In the same perspective of high-speed test method, the same biological sample can be tested by several reagents simultaneously, allowing statistical studies. Such a test method goes in particular in the direction of a possible automation of the system.
Comme autre avantage il sera aussi possible d'optimiser, rapidement sur un même support, des protocoles expérimentaux. As another advantage it will also be possible to optimize, quickly on the same medium, experimental protocols.
Dans des modes de réalisation préférés du procédé de tests d'échantillon biologique selon l'invention, on peut éventuellement avoir recours en outre à l'une et /ou à l'autre des dispositions suivantes : In preferred embodiments of the biological sample test method according to the invention, one or more of the following provisions may also be used:
- l'échantillon est un échantillon biologique. - the sample is a biological sample.
- la mise en contact du réactif avec les échantillons se fait par agitation de l'ensemble. the reagent is brought into contact with the samples by agitating the assembly.
l'au moins un échantillon est porté par un deuxième dispositif comportant une première et une deuxième face opposées et portant des échantillons sur au moins une de ses faces, et pour lequel la première face du premier dispositif et l'une des faces du deuxième dispositif sont mises en contact, avec au moins un puits en regard avec au moins une partie d'au moins un échantillon porté par au moins une des faces du deuxième dispositif. the at least one sample is carried by a second device comprising a first and a second opposite face and bearing samples on at least one of its faces, and for which the first face of the first device and one of the faces of the second device are contacted with at least one well facing at least a portion of at least one sample carried by at least one of the faces of the second device.
au moins un des puits débouche sur les deux faces opposées du premier dispositif. at least one of the wells opens on the two opposite faces of the first device.
- le procédé comprend les étapes suivantes: the method comprises the following steps:
Positionner l'ensemble de sorte que le premier dispositif soit au-dessus du deuxième dispositif, Position the assembly so that the first device is above the second device,
Remplir l'au moins un des puits du premier dispositif par la deuxième face du premier dispositif . le procédé comprend d'observer par des moyens optiques les échantillons depuis la deuxième face du premier dispositif . Fill the at least one of the wells of the first device with the second face of the first device. the method comprises observing by optical means the samples from the second face of the first device.
le procédé comprend de fermer le débouché de l'au moins un puits sur la deuxième face du premier dispositif par une plaque . the method comprises closing the outlet of the at least one well on the second face of the first device by a plate.
Dans des modes de réalisation préférés du système de tests d'échantillon biologique selon l'invention, on peut éventuellement avoir recours en outre à l'une et/ou à l'autre des dispositions suivantes : In preferred embodiments of the biological sample test system according to the invention, one or more of the following may also be used:
Le système comprend au moins un premier dispositif comportant une première et une deuxième face opposées, et comprenant un réseau de puits s 'étendant entre la première face et la deuxième face du premier dispositif, chaque puits débouchant sur au moins la première face et chaque puits contenant un réactif, le système comprenant également au moins un échantillon, et le système étant adapté pour mettre en contact la première face du premier dispositif avec l'échantillon, avec au moins deux puits en regard chacun avec au moins une partie respective de l'échantillon de manière étanche, pour former un ensemble adapté pour mettre en contact le réactif et l'échantillon. The system comprises at least a first device comprising opposite first and second faces, and comprising a network of wells extending between the first face and the second face of the first device, each well opening on at least the first face and each well. containing a reagent, the system also comprising at least one sample, and the system being adapted to contact the first face of the first device with the sample, with at least two wells facing each with at least a respective portion of the sample sealingly, to form an assembly adapted to contact the reagent and the sample.
Le système comprend en outre au moins un deuxième dispositif comportant une première et une deuxième faces opposées, adapté pour porter des échantillons sur au moins une de ses faces et adapté pour que la première face du premier dispositif et l'une des faces du deuxième dispositif soient mises en contact, avec au moins un puits de la première face du premier dispositif en regard avec au moins une partie d'au moins un échantillon porté par au moins une des faces du deuxième dispositif. The system further comprises at least one second device comprising a first and a second opposite face adapted to carry samples on at least one of its faces and adapted so that the first face of the first device and one of the faces of the second device are brought into contact with at least one well of the first face of the first device facing at least a portion of at least one sample carried by at least one of the faces of the second device.
- la première face du premier dispositif est localement hydrophobe autour du débouché d'au moins un puits sur la première face du premier dispositif. - Le système comprend en outre un réservoir adapté pour être connecté à au moins un puits du premier dispositif, ledit réservoir étant adapté pour remplir individuellement ledit puits. the first face of the first device is locally hydrophobic around the outlet of at least one well on the first face of the first device. - The system further comprises a reservoir adapted to be connected to at least one well of the first device, said reservoir being adapted to individually fill said well.
- Le système comprend en outre des alésages préalablement usinés dans le premier dispositif, lesdits alésages étant adaptés pour aider la séparation du premier dispositif et du deuxième dispositif après la mise en contact du réactif et de l'échantillon. - The system further comprises bores previously machined in the first device, said bores being adapted to assist the separation of the first device and the second device after contacting the reagent and the sample.
- le premier dispositif est en polymère et adapté au thermo moulage des puits. the first device is made of polymer and is suitable for thermo-molding wells.
- le dispositif est en matériau anti Ultra-Violet au moins en surface. - The device is anti-ultraviolet material at least on the surface.
- au moins un des puits a une géométrie conique et pour lequel la section de débouché dudit puits sur la première face (11) est supérieure à la section du puits entre la première face et la deuxième face du premier dispositif. at least one of the wells has a conical geometry and for which the outlet section of said well on the first face (11) is greater than the section of the well between the first face and the second face of the first device.
D'autres caractéristiques et avantages de l'invention apparaîtront au cours de la description suivante de plusieurs de ses formes de réalisation, donnée à titre d'exemple non limitatif, en regard des dessins j oints . Other features and advantages of the invention will become apparent from the following description of several of its embodiments, given by way of non-limiting example, with reference to the accompanying drawings.
Sur les dessins : On the drawings:
- la figure 1 montre le système selon un mode de réalisation de l'invention avec le premier dispositif, FIG. 1 shows the system according to one embodiment of the invention with the first device,
- la figure 2 montre une géométrie conique de puits , FIG. 2 shows a conical well geometry,
la figure 3 schématise le remplissage individualisé des puits, FIG. 3 schematizes the individualized filling of the wells,
- la figure 4 montre le remplissage commun de tous les puits par un réservoir commun, FIG. 4 shows the common filling of all the wells by a common tank,
- la figure 5 schématise les étapes du procédé de test pour le système selon le mode de réalisation de l'invention avec le premier dispositif, FIG. 5 schematizes the steps of the test method for the system according to the embodiment of the invention with the first device,
- les figures 6a-6d illustrent des possibles configurations d'étanchéité du premier dispositif, FIGS. 6a-6d illustrate possible sealing configurations of the first device,
la figure 7 montre le système selon un mode de réalisation de l'invention avec le premier et le second dispositif, FIG. 7 shows the system according to one embodiment of the invention with the first and the second device,
- les figures 8a et 8b représentent le maintien du premier et du deuxième dispositif par une chambre d 'hybridation, FIGS. 8a and 8b show the maintenance of the first and second devices by a hybridization chamber,
les figures 9a-9d schématisent les étapes du procédé de test pour le système selon le mode de réalisation de l'invention avec le premier et le second dispositif, FIGS. 9a-9d schematize the steps of the test method for the system according to the embodiment of the invention with the first and the second device,
- la figure 10 montre les alésages dans le premier dispositif, FIG. 10 shows the bores in the first device,
la figure 11 montre le premier dispositif avec des puits débouchants sur les deux faces de la pièce, les figures 12a-12d schématisent des étapes du procédé de test dans le cas de puits débouchants sur les deux faces de la pièce. Figure 11 shows the first device with With open wells on both sides of the part, FIGS. 12a-12d diagrammatically illustrate steps of the test method in the case of wells opening on both sides of the part.
- la figure 13 illustre le cas de puits débouchants sur chaque face et de géométrie conique, FIG. 13 illustrates the case of wells emerging on each face and of conical geometry,
- la figure 14 illustre le cas de puits alimentés en solution ou en gaz par des connecteurs latéraux, FIG. 14 illustrates the case of wells supplied with solution or gas by lateral connectors,
la figure 15 illustre l'automatisation du système. Figure 15 illustrates the automation of the system.
Sur les différentes figures, les mêmes références désignent des éléments identiques ou similaires. Dans tout ce qui suivra, on notera z un axe vertical dans l'espace tel que représenté à la figure 1. On notera également x et y deux axes perpendiculaires entre eux et perpendiculaires à z de manière à ce que les axes (x, y, z) forment un repère orthonormé . In the different figures, the same references designate identical or similar elements. In all that follows, we note z a vertical axis in space as shown in Figure 1. We also note x and y two axes perpendicular to each other and perpendicular to z so that the axes (x, y , z) form an orthonormal frame.
Le système selon un premier mode de réalisation comprend un premier dispositif 10 comportant une première et une deuxième face opposées, 11 et 12 comme représenté à la figure 1. The system according to a first embodiment comprises a first device 10 comprising opposite first and second faces, 11 and 12 as shown in FIG.
Le premier dispositif 10 est en matériau biocompatible. En variante, il est en matériau non bio¬ compatible dont la surface intérieure des puits serait bio¬ compatible. Il est facile à nettoyer et à réutiliser fréquemment. Il peut s'agir par exemple d'une plaque de verre d'épaisseur de l'ordre du centimètre par exemple. Le premier dispositif 10 peut être également une plaque en matériau polymère adapté ou soumis à un traitement de surface adapté. En effet les matériaux polymères peuvent générer une fixation aspécifique des molécules biologiques (protéines, acides nucléiques,...) et un traitement de surface préalable avec un composé hydrophobe assurera une fiabilité dans la concentration des composés à tester. The first device 10 is made of biocompatible material. In a variant, it is made of a non- bio¬ compatible material whose inner surface of the wells is bio¬ compatible. It is easy to clean and reuse frequently. It may be for example a glass plate with a thickness of about one centimeter, for example. The first device 10 may also be a plate of polymer material adapted or subjected to a suitable surface treatment. Indeed polymer materials can generating an aspecific binding of the biological molecules (proteins, nucleic acids, etc.) and a preliminary surface treatment with a hydrophobic compound will ensure reliability in the concentration of the compounds to be tested.
Le premier dispositif 10 comprend un réseau de puits 20 qui peuvent être réalisés s 'étendant entre la première face 11 et la deuxième face 12 du premier dispositif 10. Un réseau de puits 20 peut comprendre par exemple des puits 20 disposés de manière ordonnée en lignes et en colonnes. Les lignes définissent alors la direction x. Chaque puits 20 débouche sur au moins la première face 11. Les puits 20 peuvent être par exemple cylindriques d'axe parallèle à z. Un puits cylindrique 20 peut avoir une section quelconque fixe en fonction de z comme représenté à la figure 1. Dans un autre mode de réalisation, la géométrie des puits peut être adaptée en fonction des applications visées. La section du puits 20 peut par exemple être variable en fonction de z. Le puits 20 peut également par exemple avoir une forme conique comme représentée à la figure 2. Un puits 20 aura par exemple une taille de diamètre comprise entre 1 mm et 15 mm, de préférence entre 5 mm et 10 mm, en fonction des applications visées. The first device 10 comprises a network of wells 20 which can be made extending between the first face 11 and the second face 12 of the first device 10. A well network 20 may comprise, for example, wells 20 arranged in an ordered manner in lines. and in columns. The lines then define the x direction. Each well 20 opens on at least the first face 11. The wells 20 may for example be cylindrical with an axis parallel to z. A cylindrical well 20 may have any fixed section as a function of z as shown in FIG. 1. In another embodiment, the geometry of the wells may be adapted according to the intended applications. The section of the well 20 may for example be variable as a function of z. The well 20 may also for example have a conical shape as shown in FIG. 2. A well 20 will have, for example, a diameter size of between 1 mm and 15 mm, preferably between 5 mm and 10 mm, depending on the intended applications. .
Les puits 20 auront typiquement une profondeur de l'ordre de quelques millimètres, et qui pourra être corrélée au diamètre des puits. The wells 20 will typically have a depth of the order of a few millimeters, and which may be correlated to the diameter of the wells.
Dans une plaque en verre, les puits 20 sont fabriqués par exemple par usinage ultrasonore au travers d'un masque ou par gravage ou encore par pressage à chaud contre une préforme. Une attaque par l'acide fluorhydrique HF peut être utilisée pour améliorer l'état de surface final des puits. Dans le cas de l'usinage de puits 20 dans un matériau polymère, la mise en forme peut être faîte par traitement thermique, par moulage par exemple. In a glass plate, the wells 20 are produced for example by ultrasonic machining through a mask or by etching or by hot pressing. against a preform. An attack by hydrofluoric acid HF can be used to improve the final surface state of the wells. In the case of machining wells 20 in a polymeric material, the shaping can be done by heat treatment, by molding for example.
Chaque puits 20 est adapté pour recevoir un réactif. Les puits 20 débouchent sur la première face 11, et sont obturés du côté opposé. Ils pourront recevoir un traitement de surface au préalable qui conditionne également la dimension des puits en fonction du traitement souhaité . Each well 20 is adapted to receive a reagent. The wells 20 open on the first face 11, and are closed on the opposite side. They can receive a surface treatment beforehand which also determines the size of the wells according to the desired treatment.
La densité et la taille des puits 20 du premier dispositif 10 sont des paramètres qui peuvent varier en fonction de la taille des matériaux et du volume de réactif que doivent contenir les puits 20. Ce réactif peut être différent d'un puits 20 à l'autre. Certains puits 20 du premier dispositif 10 peuvent également par exemple être laissés vides comme représenté à la figure 3. The density and size of the wells 20 of the first device 10 are parameters that may vary depending on the size of the materials and the volume of reagent that must be present in the wells 20. This reagent may be different from a well 20 to the same. other. Some wells 20 of the first device 10 may also for example be left empty as shown in FIG.
Le premier dispositif 10 peut être translucide pour permettre l'observation temporelle continue ou séquentielle du réactif contenu dans les puits 20 par des moyens optiques ou spectroscopiques . Le réactif peut être par exemple un liquide, un solide éventuellement sous forme de poudre, par exemple un aérosol. The first device 10 may be translucent to allow continuous or sequential temporal observation of the reagent contained in the wells 20 by optical or spectroscopic means. The reagent may be for example a liquid, a solid optionally in the form of a powder, for example an aerosol.
Le remplissage des puits 20 peut se faire simultanément pour tous les puits 20 par la mise en contact de la première face 11 du premier dispositif 10 sur laquelle débouchent les puits 20, avec un réservoir contenant le réactif destiné à remplir les puits 20. Le remplissage par un réservoir commun, tel que représenté à la figure 4, vise par exemple le gain de temps, et à terme par exemple l'automatisation du procédé. The filling of the wells 20 can be done simultaneously for all the wells 20 by contacting the first face 11 of the first device 10 on which the wells 20 open, with a reservoir containing the reagent for filling the wells 20. The filling by a common tank, as shown in FIG. 4, for example, aims at saving time, and ultimately, for example, automating the process.
Les puits 20 peuvent également être remplis individuellement par des réactifs identiques dans chaque puits 20 ou par des réactifs différents. The wells 20 can also be individually filled with identical reagents in each well 20 or with different reagents.
Le système de l'invention comprend également par exemple au moins un échantillon 40 de dimensions allant de quelques microns (pm) à quelques centimètres (cm) . Il peut s'agir par exemple d'un échantillon biologique : peau, tissu ou cellules. Il peut s'agir d'un morceau de polymère pour des applications industrielles, ou encore d'un échantillon végétal, d'un matériau quelconque ou d'une micro ou nano-structure électromécanique. La structure peut être par exemple à fonction passive telle qu'un film avec un substrat ou à fonction active telle qu'un capteur. The system of the invention also comprises for example at least one sample 40 of dimensions ranging from a few microns (μm) to a few centimeters (cm). It may be for example a biological sample: skin, tissue or cells. It may be a piece of polymer for industrial applications, or a plant sample, any material or an electromechanical micro or nano-structure. The structure may be for example passive function such as a film with a substrate or active function such as a sensor.
Dans le mode de réalisation qui sera ici décrit, on considérera par soucis de simplification le cas d'un échantillon biologique. In the embodiment which will be described here, it will be considered for the sake of simplification the case of a biological sample.
Le premier dispositif 10 est mis en contact avec l'échantillon biologique 40 comme représenté à la figure 5. Pour cela l'échantillon biologique 40 est positionné sur le premier dispositif 10 de manière à ce que, si l'échantillon biologique 40 doit être testé sur une face préfèrentiellement , ce soit cette face de l'échantillon biologique 40 qui soit mise face au premier dispositif 10. Au moins un puits 20 est placé en regard avec au moins une partie de l'échantillon biologique 40. L'échantillon biologique 40 est d'étendue spatiale suffisamment étendue pour recouvrir plusieurs puits voisins les uns des autres, et d'une rigidité telle qu'au repos il ne rentre pas au contact avec le réactif contenu dans les puits. Le réactif et l'échantillon biologique sont alors mis en contact. Pour cela l'ensemble 80 formé par l'échantillon biologique 40 et le premier dispositif 10 maintenus ensemble est par exemple retourné autour d'un axe du plan (x,y) pour que, sous l'effet de la gravité, le réactif contenu dans l'au moins un puits 20 entre en contact avec l'échantillon biologique 40. L'ensemble 80 est ensuite retourné à nouveau autour d'un axe du plan (x,y), vers sa position initiale par exemple, de manière à ce que le réactif contenu dans le puits 20, s'1 est liquide, redescende par gravité au fond des puits 20. L'échantillon 40 et le premier dispositif 10 sont séparés. Pour amener en contact le réactif avec l'échantillon biologique, l'ensemble 80 peut également en variante être retourné autour d'un axe du plan (x,y) plus de deux fois ou secoué verticalement ou de façon plus générale agité, avant de séparer l'échantillon 40 et le premier dispositif 10. Dans tout ce qui suivra le terme « agitation » sera utilisé de façon générale pour décrire aussi bien un simple retournement du système autour d'un axe du plan (x,y), que plusieurs retournements consécutifs du système autour d'un axe du plan (x,y), qu'un mouvement translationnel du système selon une direction quelconque, qu'un mouvement périodique du système, qu'un mouvement aléatoire en direction et en périodicité adapté pour l'amenée en contact du réactif et de l'échantillon biologique. Une telle « agitation » pourra notamment être automatisée. The first device 10 is brought into contact with the biological sample 40 as shown in FIG. 5. For this, the biological sample 40 is positioned on the first device 10 so that, if the biological sample 40 is to be tested preferably on one side, it is this face of the biological sample 40 which faces the first device 10. At least one well 20 is placed facing at least a portion of the biological sample 40. The biological sample 40 is of sufficient spatial extent to cover several wells adjacent to each other, and of such rigidity that, at rest, it does not return to contact with the reagent contained in the wells. The reagent and the biological sample are then brought into contact. For this, the assembly 80 formed by the biological sample 40 and the first device 10 held together is for example returned around an axis of the plane (x, y) so that, under the effect of gravity, the reagent contained in the at least one well 20 comes into contact with the biological sample 40. The assembly 80 is then returned again around an axis of the (x, y) plane, towards its initial position for example, so as to the reagent contained in the well 20, s'1 is liquid, down by gravity bottom wells 20. The sample 40 and the first device 10 are separated. To bring the reagent into contact with the biological sample, the assembly 80 may also alternatively be turned around an axis of the plane (x, y) more than twice or shaken vertically or more generally agitated, before separating the sample 40 and the first device 10. In all that will follow the term "agitation" will be used generally to describe both a simple reversal of the system around an axis of the plane (x, y), as several consecutive reversals of the system around an axis of the plane (x, y), a translational movement of the system in any direction, a periodic movement of the system, a random movement in direction and periodicity suitable for the brought into contact with the reagent and the biological sample. Such "agitation" may in particular be automated.
L'étanchéité entre les puits 20 du premier dispositif 10 doit être assurée pour éviter la contamination inter-puits lors de l'agitation par exemple de l'ensemble 80, par exemple si des liquides différents sont placés dans chaque puits 20. La première face 11 du premier dispositif 10 sur laquelle débouchent les puits 20 va par exemple subir un traitement de surface pour être rendue localement hydrophobe entre les puits 20. La première face 11 sera traitée par une texturation mécanique, par un traitement chimique ou par un dépôt de matériau sur la première face 11 du premier dispositif 10. La première face 11 sera par exemple traitée par un dépôt de nanoparticules de silice. The tightness between the wells 20 of the first device 10 must be ensured to avoid cross-well contamination during agitation, for example of the assembly 80, for example if different liquids are placed in each well 20. The first face 11 of the first device 10 on which the wells 20 open will for example undergo a surface treatment to be rendered locally hydrophobic between the wells 20 The first face 11 will be treated by mechanical texturing, by chemical treatment or by deposition of material on the first face 11 of the first device 10. The first face 11 will for example be treated by a deposition of silica nanoparticles.
La première face 11 du premier dispositif 10 sera par exemple ainsi subdivisée en petites zones entourant chacun des puits, et séparées les unes des autres par une zone hydrophobe de manière à ce qu'après mise en contact et agitation de l'ensemble 80, le réactif comme par exemple un liquide, contenu dans les puits 20 ne puisse pas transiter entre les puits 20, c'est-à-dire que la jonction entre les puits 20 soit étanche comme représentée à la figure 6a. The first face 11 of the first device 10 will for example be subdivided into small zones surrounding each of the wells, and separated from each other by a hydrophobic zone so that after contacting and stirring the assembly 80, the reagent such as a liquid, contained in the wells 20 can not pass between the wells 20, that is to say that the junction between the wells 20 is sealed as shown in Figure 6a.
L ' hydrophobicité peut être obtenue par texturation de la surface ou par l'ajout d'une matière hydrophobe ou dont la structuration de surface la rend hydrophobe . The hydrophobicity can be obtained by texturing the surface or by adding a hydrophobic material or whose surface structure makes it hydrophobic.
La première face 11 pourra être par exemple rendue hydrophobe sur toute sa surface, puis localement traitée pour libérer certaines zones de 1 'hydrophobie, par un traitement au travers d'un masque par exemple, tel qu'un gravage au travers d'un masque. Ces zones de la première face 11 rendues hydrophobes peuvent être des lignes délimitant les puits 20. Ces lignes peuvent être épaisses (figure 6b) ou multiples telles que de doubles lignes (figure 6c) . La première face 11 pourra en variante être localement traitée pour être rendue hydrophobe seulement dans certaines zones, par traitement au travers d'un masque directement par exemple. The first face 11 may for example be rendered hydrophobic over its entire surface, and then locally treated to release certain areas of hydrophobicity, by treatment through a mask for example, such as etching through a mask . These areas of the first face 11 made hydrophobic may be lines delimiting the wells 20. These lines may be thick (Figure 6b) or multiple such as double lines (Figure 6c). The first face 11 may alternatively be locally treated to be rendered hydrophobic only in certain areas, by treatment through a mask directly for example.
L'étanchéité entre les puits 20 peut également être assurée par de la graisse silicone étalée autour des dits puits 20. On utilise par exemple un produit pâteux, comme une graisse, qu'on dispose tout autour du puits, par exemple sous la forme d'un cordon. On choisit de préférence un produit ne coulant pas, afin que ce dernier ne risque pas de se placer dans le puits, et/ou présentant une grande neutralité chimique (par exemple vis-à-vis d'anticorps) afin de ne pas influer sur le test. La graisse silicone a montré des performances supérieures, en termes d 'étanchéité, par rapport à d'autres produits testés, lors de tests comparatifs effectués à l'aide de deux plaques de verre. En variante la première face 11 est enduite de graisse qui entre dans les puits 20. Ces derniers sont ensuite nettoyés pour retirer la graisse qui y est entrée. L'étanchéité entre les puits 20 peut également être assurée par des entretoises 70 placées entre les puits 20, tel que représenté à la figure 6d, assemblées de manière étanche au premier dispositif 10, et assemblées de manière étanche à l'échantillon 40. The seal between the wells 20 can also be provided by silicone grease spread around said wells 20. For example, a pasty product, such as a grease, is used which is placed around the well, for example in the form of 'a rope. A non-flowing product is preferably chosen, so that the latter is not likely to be placed in the well, and / or has a high chemical neutrality (for example with respect to antibodies) so as not to influence the test. Silicone grease has shown superior sealing performance over other tested products in comparative tests using two glass plates. Alternatively the first face 11 is coated with grease which enters the wells 20. These are then cleaned to remove the grease that has entered. The tightness between the wells 20 can also be ensured by spacers 70 placed between the wells 20, as shown in FIG. 6d, tightly assembled to the first device 10, and sealed to the sample 40.
On pourrait également assurer l'étanchéité en utilisant un film polymère ou métallique adhésif que l'on viendrait coller sur le dispositif 10, assurant ainsi l'étanchéité des puits du côté de la surface 12. Sealing could also be ensured by using an adhesive polymer or metal film which would be adhered to the device 10, thereby sealing the wells on the surface 12 side.
Dans ce mode de réalisation, un disque de tissu initialement congelé à tester est par exemple sélectionné, et mis en contact avec le liquide réactif placé dans les puits 20 du premier dispositif 10 par exemple distants de 1 à 2 mm deux à deux. Pour que la réponse du tissu au liquide réactif soit représentative, une surface minimum du tissu devra être mise en contact avec le liquide de test, via un ou plusieurs puits 20. La dimension caractéristique de la surface la plus petite sera par exemple typiquement de l'ordre de 600pm. In this embodiment, an initially frozen tissue disk to be tested is for example selected, and brought into contact with the reactive liquid placed in the wells 20 of the first device 10, for example 1 at 2 mm two by two. In order for the response of the tissue to the reactive liquid to be representative, a minimum surface of the fabric will have to be brought into contact with the test liquid via one or more wells. The characteristic dimension of the smallest surface will, for example, typically be order of 600pm.
En variante de ce mode de réalisation, il peut s'agir par exemple d'un procédé pour effectuer des tests d ' allergologie, faits sur la peau du patient qui constituera l'échantillon biologique 40. La peau est dans un premier temps rendue sensible par des coups d'aiguille ou en la grattant. Les puits 20 sont remplis de réactifs différents entre les puits 20 qui sont des substances allergènes. Les puits 20 sont alors mis en contact de façon étanche avec la surface de la peau subissant le test. Le bras du patient peut par exemple être positionné au-dessus du premier dispositif 10, puis l'ensemble du bras et du dispositif 10 est assemblé par du scotch par exemple. Le patient secoue ensuite par exemple son bras puis revient à la position initiale. Le patient peut également par exemple retourner son bras pour mettre en contact les allergènes et sa peau pendant une heure ou plus généralement agiter son bras solidarisé au dispositif 10. Après que le patient a remis son bras dans sa position initiale, le premier dispositif 10 est séparé du bras du patient sur lequel les réactifs ont réagi avec la peau du patient. Le procédé décrit précédemment permet donc par exemple de réaliser le test d ' allergologie . As an alternative to this embodiment, it may be for example a method for performing allergy tests, made on the skin of the patient that will constitute the biological sample 40. The skin is initially made sensitive by needle-sticking or scraping. Wells 20 are filled with different reagents between wells 20 which are allergenic substances. The wells 20 are then brought into sealed contact with the surface of the skin undergoing the test. The patient's arm may for example be positioned above the first device 10, then the entire arm and the device 10 is assembled by tape for example. The patient then shakes his arm for example and then returns to the initial position. The patient may also for example turn his arm to contact the allergens and his skin for an hour or more generally shake his arm attached to the device 10. After the patient has returned his arm to its initial position, the first device 10 is separated from the patient's arm on which the reagents reacted with the patient's skin. The method described above thus makes it possible, for example, to carry out the allergology test.
Dans ce mode de réalisation un même tissu sera sectorisé pour effectuer con ointement une série d'analyses différentes . Le remplissage individualisé des puits permettra de tester différents composés réactifs ou différentes concentrations de réactif lors d'un même essai. Dans un autre exemple de ce mode de réalisation, en agronomie on peut par exemple tester l'impact de différents produits phytosanitaires ou différentes doses sur des feuilles de végétaux ou l'impact de pathogènes différents sur une même feuille. Ce type de test peut se faire sur plants en culture. Dans cet exemple le dispositif fonctionne en environnement non maîtrisé, au sens où, contrairement aux tests en laboratoire, il faut intégrer les effets du rayonnement solaire, des variations de température, de la pluie etc.. Il s'agit donc, dans de telles conditions, d'assurer que les produits testés sur les plants ne se dégradent pas et que le test demeure valide . In this embodiment the same fabric will be sectorized to perform a series of different analyzes. The individualized filling of the wells will make it possible to test different reactive compounds or different concentrations of reagent during the same test. In another example of this embodiment, in agronomy one can for example test the impact of different plant protection products or different doses on plant leaves or the impact of different pathogens on the same leaf. This type of test can be done on plants in culture. In this example, the device operates in an uncontrolled environment, in the sense that, unlike laboratory tests, it is necessary to integrate the effects of solar radiation, temperature variations, rain, etc. This is therefore the case in such cases. conditions, to ensure that the products tested on the plants do not degrade and that the test remains valid.
Pour éviter les effets du rayonnement solaire en particulier on peut envisager plusieurs solutions qui sont d'utiliser un matériau constitutif du dispositif 10 non transparent aux UV, ou de réaliser un traitement de surface anti-UV (non transparent aux UV) sur le dispositif 10 ou encore rajouter un autre matériau, sous forme de tissu ou de voile par exemple, autour de la zone sur laquelle les tests sont réalisés. To avoid the effects of solar radiation in particular, it is possible to envisage several solutions that are to use a material constituting the device that is not transparent to UV, or to carry out an anti-UV surface treatment (non-transparent to UV) on the device 10. or add another material, such as fabric or veil for example, around the area on which the tests are performed.
Dans un tel mode de réalisation, pour faire des tests en dehors d'un laboratoire, le dispositif pourra par exemple être instrumenté, typiquement avec une sonde de température ou un « patch » affecté par le rayonnement UV ou si sa température excède une certaine valeur. Cette affection pourrait se traduire de toute manière détectable, telle qu'un changement de couleur par exemple. En variante pour d'autres applications, industrielles par exemple, pour lesquelles de plus grandes quantités de produits doivent être testées sur de grandes surfaces, des dimensions de dispositif et de puits beaucoup plus grandes pourraient être envisagées. In such an embodiment, for testing outside a laboratory, the device may for example be instrumented, typically with a temperature probe or a "patch" affected by UV radiation or if its temperature exceeds a certain value . This condition could be shown in any detectable way, such as a change of color for example. Alternatively for other applications, for example industrial applications, for which larger quantities of products have to be tested over large areas, much larger device and well dimensions could be envisaged.
Pour l'ensemble des modes de réalisation ci- dessus, le suivi de la réaction peut se faire par exemple de façon instrumentée, in situ via des méthodes spectroscopiques . For all of the above embodiments, the reaction can be monitored, for example, in an instrumented manner, in situ using spectroscopic methods.
Selon un deuxième mode de réalisation, le système de l'invention peut également comprendre un deuxième dispositif 30, qui comporte une première et une deuxième faces opposées 31 et 32 comme représenté à la figure 7. According to a second embodiment, the system of the invention may also comprise a second device 30, which has first and second opposite faces 31 and 32 as shown in FIG.
Il peut s'agir par exemple d'une plaque de verre 30 telle qu'une plaque de microscope. La plaque de verre 30 peut avoir typiquement des dimensions comprises entre 1cm et 10cm, par exemple 2,5cm par 7cm. This may be for example a glass plate 30 such as a microscope plate. The glass plate 30 can typically have dimensions between 1cm and 10cm, for example 2.5cm by 7cm.
Le deuxième dispositif 30 est adapté pour recevoir au moins un échantillon biologique 40 sur au moins une de ses faces. Il peut s'agir par exemple de la face 31 recevant un échantillon biologique 40. L'échantillon biologique 40 peut être par exemple un prélèvement de tissu. Dans ce mode de réalisation, l'échantillon biologique 40 est solidarisé à la face 31 du deuxième dispositif 30 en utilisant tout moyen mécanique et/ou chimique adapté permettant d'avoir accès à une portion de l'échantillon biologique. On utilise par exemple de la paraffine qui permet le positionnement et l'adhésion de l'échantillon biologique 40 à la face 31 du deuxième dispositif 30. Le deuxième dispositif 30 est alors placé sur le premier dispositif 10 de sorte que la face 31 du deuxième dispositif 30 soit face à la première face 11 du premier dispositif 10 comme illustré à la figure 9a. Pour que le procédé de test puisse être mis en œuvre, l'échantillon biologique 40 est positionné sur le deuxième dispositif 30 de sorte qu'au moins un puits 20 contenant du réactif soit mis en contact avec au moins une partie de l'échantillon biologique 40. L'ensemble 80 formé par le premier dispositif 10 et le deuxième dispositif 30 portant l'échantillon biologique maintenus ensemble est alors agité pour que le réactif contenu dans au moins un des puits 20 soit mis en contact avec l'échantillon biologique 40. Le premier dispositif 10 et le deuxième dispositif 30 sont maintenus ensemble par des pinces, du ruban adhésif ou tout autre moyen adapté. The second device 30 is adapted to receive at least one biological sample 40 on at least one of its faces. It may be for example the face 31 receiving a biological sample 40. The biological sample 40 may be for example a tissue sample. In this embodiment, the biological sample 40 is secured to the face 31 of the second device 30 using any suitable mechanical and / or chemical means for accessing a portion of the biological sample. For example, paraffin is used which allows the positioning and adhesion of the biological sample 40 to the face 31 of the second device 30. The second device 30 is then placed on the first device 10 so that the face 31 of the second device 30 is facing the first face 11 of the first device 10 as illustrated in FIG. Figure 9a. In order for the test method to be implemented, the biological sample 40 is positioned on the second device 30 so that at least one well containing reagent is contacted with at least a portion of the biological sample. 40. The assembly 80 formed by the first device 10 and the second device 30 carrying the biological sample held together is then agitated so that the reagent contained in at least one of the wells 20 is brought into contact with the biological sample 40. The first device 10 and the second device 30 are held together by clips, tape or any other suitable means.
Un moyen de pression pourra être utilisé afin de garantir une bonne étanchéité à l'interface entre le premier dispositif 10 et le deuxième dispositif 30 pendant le temps nécessaire. L 'étanchéité inter-puits peut être assurée par pressage mécanique par exemple entre le premier dispositif 10 et le deuxième dispositif 30. Dans ce cas, notamment dans le cas d'une faible rugosité de la lame de microscope, l'adhésion entre le premier dispositif 10 et le deuxième dispositif 30 peut être forte. A pressure means may be used to ensure a good seal at the interface between the first device 10 and the second device 30 for the necessary time. The inter-well seal can be provided by mechanical pressing, for example between the first device 10 and the second device 30. In this case, particularly in the case of a low roughness of the microscope slide, the adhesion between the first device 10 and the second device 30 may be strong.
Des alésages préalablement usinés dans le premier dispositif 10 et en correspondance avec d'autres dans le second dispositif 30 peuvent être par exemple adaptés pour assurer cette mise en contact étanche du premier dispositif 10 et du deuxième dispositif 30 par utilisation d'une tige par exemple filetée et traversant les deux dispositifs 10 et 30 et en les maintenant en contact via des boulons positionnés de part et d'autre de l'ensemble 80 et qui maintiennent le contact. L'étanchéité peut également par exemple être assurée par l'utilisation de deux autres surfaces venant prendre en sandwich l'ensemble 80 pour améliorer le contact entre le premier dispositif 10 et le deuxième dispositif 30. Bores previously machined in the first device 10 and in correspondence with others in the second device 30 may for example be adapted to ensure that the first device 10 and the second device 30 are brought into sealed contact by using a rod, for example threaded and through the two devices 10 and 30 and keeping them in contact via bolts positioned on either side of the assembly 80 and which maintain the contact. The tightness may also for example be ensured by the use of two other surfaces sandwiching the assembly 80 to improve the contact between the first device 10 and the second device 30.
En variante, l'étanchéité inter-puits est assurée selon l'une quelconque des façons décrites ci- dessus pour le premier mode de réalisation. Alternatively, the inter-well seal is provided in any of the ways described above for the first embodiment.
En variante le premier dispositif 10 et le deuxième dispositif 30 sont maintenus ensemble en utilisant une chambre d'hybridation 100. La chambre d'hybridation comporte un cadre 102, par exemple métallique, un support de positionnement 110, un tiroir de positionnement 109. In a variant, the first device 10 and the second device 30 are held together using a hybridization chamber 100. The hybridization chamber comprises a frame 102, for example a metal frame, a positioning support 110, a positioning slide 109.
Plus précisément l'ensemble 80 du premier dispositif 10 et du deuxième dispositif 30 est maintenu par le cadre 102 de la chambre d'hybridation 100 venant emprisonner la bordure de l'ensemble 80 comme illustré à la figure 8a. Le cadre 102 comprend une partie supérieure 108, une partie inférieure 106 séparées et un élément de liaison 112 assurant la liaison entre la partie supérieure 108 et la partie inférieure 106. Specifically, the assembly 80 of the first device 10 and the second device 30 is held by the frame 102 of the hybridization chamber 100 which traps the edge of the assembly 80 as shown in Figure 8a. The frame 102 comprises an upper part 108, a lower part 106 separated and a connecting element 112 providing the connection between the upper part 108 and the lower part 106.
L'ensemble 80 est positionné sur le tiroir de positionnement 109. Le tiroir de positionnement 109 se présente par exemple comme un cadre permettant le maintien ensemble et relativement l'un à l'autre des premier et deuxième dispositifs 10, 30. Le tiroir de positionnement permet notamment d'assurer la mise en correspondance géométrique des puits 20 du premier dispositif 10 avec les échantillons du deuxième dispositif 30. Le tiroir de positionnement 109, sur lequel a été chargé l'ensemble 80, est placé sur le support de positionnement 110. Le tiroir de positionnement 109 est en variante collé au support de positionnement 110. Le support de positionnement 110, ainsi chargé du tiroir de positionnement 109 lui-même chargé de l'ensemble 80, est ensuite déplacé, par exemple glissé, entre la partie inférieure 106 et la partie supérieure 108 de la chambre d'hybridation 100. The assembly 80 is positioned on the positioning slide 109. The positioning slide 109 is for example a frame allowing the first and second devices 10, 30 to be held together and relative to one another. In particular, positioning makes it possible to geometrically align the wells 20 of the first device 10 with the Samples of the second device 30. The positioning drawer 109, on which the assembly 80 has been loaded, is placed on the positioning support 110. The positioning drawer 109 is alternately bonded to the positioning support 110. The positioning support 110 110, thus loaded with the positioning slide 109 itself loaded with the assembly 80, is then moved, for example slid between the lower portion 106 and the upper portion 108 of the hybridization chamber 100.
La partie inférieure 106 est d'épaisseur variable, qui augmente continûment entre l'extrémité opposée à l'élément de liaison 112 et l'extrémité qui jouxte l'élément de liaison 112, comme illustré à la figure 8b. The lower portion 106 is of variable thickness, which increases continuously between the end opposite the connecting member 112 and the end adjacent the connecting member 112, as shown in Figure 8b.
Donc, lors du coulissement horizontal du support de positionnement 110 chargé, entre la partie inférieure 106 et la partie supérieure 108 de la chambre d'hybridation 100, l'ensemble 80 monté sur le tiroir de positionnement 109 sera maintenu comprimé entre la partie inférieure 106 et la partie supérieure 108 de la chambre d'hybridation 100. Une vis 104 est utilisée pour mettre en translation le support de positionnement 110 chargé, à l'intérieur de la chambre d'hybridation 100. La vis 104 permet également de bloquer le tiroir de positionnement 109 sur lequel est chargé l'ensemble 80 dans la chambre d'hybridation 100, comme illustré à la figure 8b. Thus, during the horizontal sliding of the loaded positioning support 110, between the lower part 106 and the upper part 108 of the hybridization chamber 100, the assembly 80 mounted on the positioning slide 109 will be kept compressed between the lower part 106 and the upper portion 108 of the hybridization chamber 100. A screw 104 is used to translate the loaded positioning support 110 into the interior of the hybridization chamber 100. The screw 104 also makes it possible to block the slide positioning device 109 on which is loaded the assembly 80 in the hybridization chamber 100, as shown in Figure 8b.
La vis 104, insérée dans un trou traversant horizontalement l'élément de liaison 112 et débouchant de part et d'autre, sera vissée à l'intérieur d'un trou fileté 114 percé horizontalement dans le tiroir de mise en position 110. La vis 104 est accessible pour un serrage, par exemple avec une clef de type BTR ou autre. L ' actionnement de la vis 104 provoque donc un coulissement du tiroir jusque dans une position où il est maintenu serré par les formes biseautées de la partie inférieure 106 et du support de positionnement 110. Pour libérer l'ensemble 80 et son tiroir de mise en position 110, il faudra desserrer c'est à dire tourner la dite vis dans le sens inverse. The screw 104, inserted into a hole horizontally traversing the connecting element 112 and opening on either side, will be screwed inside a threaded hole 114 pierced horizontally in the setting drawer 110. The screw 104 is accessible for clamping, for example with a key type BTR or other. Actuation of the screw 104 thus causes the slide to slide into a position where it is held tight by the beveled shapes of the lower part 106 and the positioning support 110. To release the assembly 80 and its setting drawer position 110, it will loosen ie turn the said screw in the opposite direction.
Le premier dispositif 10 peut être préalablement inséré sous la partie supérieure 108 de la chambre d'hybridation 100 puis le deuxième dispositif 30 porté par le tiroir de positionnement 109 peut être inséré entre la partie supérieure 108 et la partie inférieure 106 de la chambre d'hybridation 100. The first device 10 can be inserted before the upper part 108 of the hybridization chamber 100 and the second device 30 carried by the positioning slide 109 can be inserted between the upper part 108 and the lower part 106 of the chamber hybridization 100.
En variante, les parties supérieure et inférieure 106, 108, et l'élément de liaison 112, seront moulées ensemble. Alternatively, the upper and lower portions 106, 108, and the connecting member 112, will be molded together.
Ainsi, selon un aspect, indépendamment d'autres considérations, si on cherche à maintenir étanche l'ensemble 80, une invention se rapporte à une chambre d'hybridation 100 comprenant au moins un cadre 102, un support de positionnement 110, un tiroir de positionnement 109, une vis 104, Thus, according to one aspect, independently of other considerations, if one seeks to keep the assembly 80 sealed, an invention relates to a hybridization chamber 100 comprising at least one frame 102, a positioning support 110, a drawer of positioning 109, a screw 104,
le cadre 102 comprenant une partie supérieure 108, une partie inférieure 106, et un élément de liaison 112 entre la partie supérieure 108 et la partie inférieure 106, la partie inférieure 106 ayant une épaisseur croissante entre une extrémité opposée à l'élément de liaison 112 et une extrémité jouxtant l'élément de liaison 112, the frame 102 comprising an upper portion 108, a lower portion 106, and a connecting member 112 between the upper portion 108 and the lower portion 106, the lower portion 106 having an increasing thickness between an end opposite the connecting member 112 and an end adjacent to the connecting element 112,
le tiroir de positionnement 109 étant adapté pour recevoir un dispositif expérimental, le support de positionnement 110 étant adapté pour recevoir le tiroir de positionnement 109, le support de positionnement 110 comprenant un trou fileté 114, the positioning slide 109 being adapted to receive an experimental device, the positioning support 110 being adapted to receive the positioning slide 109, the positioning support 110 comprising a threaded hole 114,
la vis 104 étant adaptée, par son insertion dans le trou fileté 114, pour entraîner et maintenir le support de positionnement 110 entre la partie supérieure 108 et la partie inférieure 106. the screw 104 being adapted, by its insertion into the threaded hole 114, to drive and hold the positioning support 110 between the upper part 108 and the lower part 106.
La variation d'épaisseur de la partie inférieure permet d'assurer un bon maintien du dispositif expérimental monté sur le tiroir de positionnement. The variation of thickness of the lower part makes it possible to ensure a good maintenance of the experimental device mounted on the positioning slide.
Le serrage du support de positionnement 110 entre les deux parties supérieure 108 et inférieure 109 par un système de vis située dans l'épaisseur du support de positionnement permet de dégager le dispositif expérimental. The clamping of the positioning support 110 between the two upper portions 108 and lower 109 by a screw system located in the thickness of the positioning support makes it possible to disengage the experimental device.
Selon un autre aspect, on prévoira en complément la caractéristique décrite ici, quand compatible avec cette invention : According to another aspect, the characteristic described here, when compatible with this invention:
La partie supérieure 108 est percée d'une trouée. The upper part 108 is pierced with a gap.
Une telle trouée permet d'accéder par l'extérieur de la chambre d'hybridation 100 au dispositif expérimental placé dans la chambre d'hybridation. Puis l'ensemble 80 est agité. Le premier dispositif 10 et le deuxième dispositif 30 sont ensuite séparés comme représenté respectivement aux figures 9a à 9d. Dans ce mode de réalisation la séparation du premier dispositif 10 et du deuxième dispositif 30 peut être aidée par exemple par des alésages 90. Les alésages 90 peuvent être par exemple traversants du premier dispositif 10 comme représenté à la figure 10. Des tiges peuvent alors venir en appui à travers les alésages 90 sur le deuxième dispositif 30, et lui appliquer un effort permettant le décollement de ce deuxième dispositif 30 du premier dispositif 10. Such a gap allows access from the outside of the hybridization chamber 100 to the experimental device placed in the hybridization chamber. Then the assembly 80 is agitated. The first device 10 and the second device 30 are then separated as shown respectively in FIGS. 9a to 9d. In this embodiment, the separation of the first device 10 and the second device 30 may be assisted for example by bores 90. The bores 90 may for example be through the first device 10 as shown in FIG. bear against the bores 90 on the second device 30, and apply to it a force allowing the detachment of the second device 30 of the first device 10.
Dans cette configuration du système, l'échantillon biologique 40 peut être testé par exemple par plusieurs réactifs différents placés dans les différents puits 20 du premier dispositif 10 tous en regard avec une partie respective de l'échantillon biologique 40 lors de l'agitation de l'ensemble 80 et deuxième dispositif 30. Lorsque le premier dispositif 10 et le deuxième dispositif 30 sont séparés, un réactif a réagi avec l'échantillon biologique 40 dans chaque zone dans laquelle un réactif a été mis en contact avec une zone de l'échantillon biologique 40. In this configuration of the system, the biological sample 40 may be tested for example by several different reagents placed in the different wells 20 of the first device 10 all facing a respective part of the biological sample 40 during agitation of the assembly 80 and second device 30. When the first device 10 and the second device 30 are separated, a reagent has reacted with the biological sample 40 in each zone in which a reagent has been brought into contact with a sample zone biological 40.
Dans cet exemple de réalisation, le deuxième dispositif 30 peut recevoir plusieurs échantillons biologiques 40 à tester par exemple simultanément. Le deuxième dispositif 30 comprend par exemple un réseau d'emplacements susceptibles de recevoir les échantillons biologiques 40, ce réseau étant correspondant du réseau de puits 20 fourni par le premier dispositif 10. Les échantillons biologiques 40 sont donc, dans ce cas, positionnés de telle sorte que chaque échantillon biologique 40 fasse face à au moins un puits 20 du premier dispositif 10. Certains puits 20 peuvent ne faire face à aucun échantillon biologique 40. In this embodiment, the second device 30 can receive several biological samples 40 to be tested, for example simultaneously. The second device 30 comprises for example a network of locations capable of receiving the biological samples 40, this network being corresponding to the well network 20 provided by the first device 10. The biological samples 40 are therefore, in this case, positioned to so that each biological sample 40 faces at least one well 20 of the first device 10. Some wells 20 may not face any biological sample 40.
Les échantillons biologiques 40 sont solidarisés au deuxième dispositif 30 qui joue le rôle de porte échantillon comme décrit ci-dessus, et par exemple par l'utilisation de paraffine. Chaque échantillon biologique 40 est par exemple coulé dans de la paraffine puis placé sur le deuxième dispositif 30. The biological samples 40 are secured to the second device 30 which acts as a sample holder as described above, and for example by the use of paraffin. Each biological sample 40 is for example cast in paraffin and then placed on the second device 30.
Les puits 20 du premier dispositif 10 peuvent contenir un réactif identique ou différent entre les puits 20. The wells 20 of the first device 10 may contain an identical or different reagent between the wells 20.
L'ensemble 80 et deuxième dispositif 30 est ensuite agité pour mettre en contact les échantillons biologiques 40 avec les réactifs contenus dans les puits. The assembly 80 and second device 30 is then agitated to bring the biological samples 40 into contact with the reagents contained in the wells.
Les échantillons biologiques 40 peuvent être tous testés par un même réactif ou par différents réactifs contenus dans les différents puits 20 mis en regard avec des échantillons biologiques 40. The biological samples 40 can all be tested by the same reagent or by different reagents contained in the different wells 20 compared with biological samples 40.
Dans un mode de réalisation du système dans cette configuration, des échantillons de 0.6mm à 2mm de diamètre et de quelques micromètres d'épaisseur sont prélevés dans des tissus imprégnés et inclus en paraffine. Ces échantillons sont ensuite positionnés sur une plaque jouant le rôle de deuxième dispositif 30. Les puits 20 sont alors par exemple de diamètre supérieur à la taille de l'échantillon biologique 40 déposé sur la plaque. Le diamètre des puits pourra être par exemple compris entre 1mm et 15mm. La distance entre les puits pour éviter la contamination pourra être par exemple de 1mm. En variante on pourra avoir des puits de 1mm de diamètre, avec une distance entre deux puits typiquement de 2mm. La plaque utilisée pour déposer les échantillons biologiques 40 pourra avoir typiquement des dimensions de l'ordre de 25x70cm, et une épaisseur de l'ordre de 1 à 2mm. In one embodiment of the system in this configuration, samples of 0.6mm to 2mm in diameter and a few microns thick are taken from impregnated and paraffin-embedded tissues. These samples are then positioned on a plate acting as a second device 30. The wells 20 are then for example greater in diameter than the size of the biological sample 40 deposited on the plate. The diameter of the wells may be for example between 1mm and 15mm. The distance between the wells to avoid contamination may for example be 1mm. Alternatively we can have wells of 1mm in diameter, with a distance between two wells typically 2mm. The plate used to deposit the biological samples 40 may typically have dimensions of the order of 25x70cm, and a thickness of the order of 1 to 2mm.
Dans un autre mode de réalisation, une culture cellulaire est déposée, sous forme de culture de cellules arrêtée, sur une lame de microscope comme deuxième dispositif 30, pour tester par exemple l'efficacité des anticorps. La culture de cellules peut être arrêtée en étant fixée ou congelée. La culture de cellules est fixée par un agent fixant, par exemple par du para formaldéhyde, de l'acétone ou de l'éthanol. In another embodiment, a culture The cell is deposited as a stopped cell culture on a microscope slide as a second device 30 for testing, for example, the effectiveness of the antibodies. The cell culture can be stopped by being fixed or frozen. The cell culture is fixed by a fixing agent, for example paraformaldehyde, acetone or ethanol.
Dans un autre mode de réalisation, en envisageant l'absence de problèmes de contamination, des échantillons biologiques 40 peuvent être placés sur les deux faces 31 et 32 du deuxième dispositif 30. Dans ce mode de réalisation, des tests de chacune des faces 31 et 32 peuvent être réalisés successivement par mise en contact de chacune des faces 31 et 32 du deuxième dispositif 30 avec le réactif contenu dans les puits 20 du premier dispositif 10 via la mise en contact de la première face 11 du premier dispositif 10 successivement avec les faces 31 et 32 du deuxième dispositif 30. In another embodiment, considering the absence of contamination problems, biological samples 40 can be placed on both faces 31 and 32 of the second device 30. In this embodiment, tests of each of the faces 31 and 32 can be made successively by contacting each of the faces 31 and 32 of the second device 30 with the reagent contained in the wells 20 of the first device 10 via contacting the first face 11 of the first device 10 successively with the faces 31 and 32 of the second device 30.
Dans un autre mode de réalisation, au moins un puits 20 peut également déboucher sur la deuxième face 12. Dans ce mode de réalisation, le fond du puits 20 sur la deuxième face 12 peut être alors constitué d'une plaque de verre supplémentaire 50, jointe à la deuxième face 12 du premier dispositif 10 de façon étanche et amovible comme représenté à la figure 11. In another embodiment, at least one well 20 may also lead to the second face 12. In this embodiment, the bottom of the well 20 on the second face 12 may then consist of an additional glass plate 50, attached to the second face 12 of the first device 10 sealingly and removably as shown in Figure 11.
Dans ce mode de réalisation le dispositif 10' qui peut remplacer le premier dispositif 10 de l'invention, peut être constitué du premier dispositif 10 et d'une plaque 50 par exemple en verre qui est associée à la deuxième face 12 du premier dispositif 10 de façon étanche pour en constituer le fond. Une telle configuration permet par exemple un nettoyage plus facile des puits 20 du premier dispositif 10. In this embodiment the device 10 'which can replace the first device 10 of the invention may consist of the first device 10 and a plate 50 for example of glass which is associated with the second face 12 of the first device 10 tightly to form the bottom. Such a configuration makes it possible, for example, easier to clean the wells 20 of the first device 10.
Dans cette configuration, comme représenté à la figure 12a, le premier dispositif 10 est positionné retourné, c'est-à-dire avec la deuxième face 12 au-dessus de la première face 11, et le premier dispositif 10 est positionné au-dessus du deuxième dispositif 30 comportant des échantillons biologiques 40 d'assemblés à celui-ci. Les puits 20 peuvent être remplis simultanément ou individuellement, à ras bord, comme représenté sur les figures 12a et 12b. Un réservoir au niveau de la surface 12, sur laquelle débouche chaque puit, peut par exemple permettre un remplissage de l'ensemble des puits en une seule opération comme représenté aux figures 12a à 12c. En variante les puits peuvent également déboucher individuellement sur la deuxième face 12. In this configuration, as shown in FIG. 12a, the first device 10 is positioned returned, that is to say with the second face 12 above the first face 11, and the first device 10 is positioned above the second device 30 having biological samples 40 assembled therewith. Wells 20 may be filled simultaneously or individually to the brim as shown in FIGS. 12a and 12b. A reservoir at the surface 12, on which each well opens, may for example allow filling of all the wells in a single operation as shown in Figures 12a to 12c. Alternatively the wells can also lead individually to the second face 12.
Les échantillons biologiques 40 sont donc à ce stade mis en contact avec les réactifs contenus dans les puits 20. Une plaque telle que la plaque en verre supplémentaire 50 peut alors être positionnée au-dessus de la deuxième face 12 du premier dispositif 10 comme représenté sur la figure 12c. La plaque 50 peut également permettre d'éviter 1 ' évaporâtion du réactif et le changement de sa concentration. La plaque 50 peut également par exemple aider en ajoutant du poids qui étanchéifie à la jonction premier dispositif 10- deuxième dispositif 30. Le contact entre le premier dispositif 10 et la plaque 50 est alors rendu étanche, avant d'agiter par exemple l'ensemble plaque 50- premier dispositif 10- deuxième dispositif 30 si nécessaire en variante. En variante de cette configuration, le procédé peut ne comporter que les deux premières étapes illustrées aux figures 12a et 12b. Les échantillons biologiques 40 mis en contact avec le réactif contenu dans les puits peuvent alors être par exemple observés par des moyens optiques sans avoir à séparer les dispositifs 10 et 30 et sans avoir à vider les puits 20, les échantillons biologiques 40 ayant déjà été mis en contact avec le/les réactifs. L'observation se fait par exemple au travers du réactif contenu dans les puits 20. The biological samples 40 are therefore at this stage brought into contact with the reagents contained in the wells 20. A plate such as the additional glass plate 50 can then be positioned above the second face 12 of the first device 10 as shown on Figure 12c. The plate 50 may also make it possible to avoid evaporation of the reagent and the change of its concentration. The plate 50 can also for example help by adding the weight which seals the junction first device 10- second device 30. The contact between the first device 10 and the plate 50 is then sealed, before stirring for example all plate 50 first device 10 second device 30 if necessary alternatively. As an alternative to this configuration, the method may comprise only the first two steps illustrated in FIGS. 12a and 12b. The biological samples 40 brought into contact with the reagent contained in the wells can then be observed, for example, by optical means without having to separate the devices 10 and 30 and without having to empty the wells 20, the biological samples 40 having already been placed. in contact with the reagent (s). The observation is done for example through the reagent contained in the wells 20.
Dans le cas de puits 20 débouchant sur les deux faces 11 et 12, on peut envisager de fabriquer le premier dispositif 10 par un usinage par jets d'eau. In the case of wells 20 opening on both faces 11 and 12, it is conceivable to manufacture the first device 10 by water jet machining.
En variante le premier dispositif 10 peut également comporter au moins un puits 20 ayant une géométrie conique. Par exemple dans une telle configuration, la section de débouché dudit puits 20 sur la première face 11 peut être inférieure à la section du puits 20 entre la première face 11 et la deuxième face 12 du premier dispositif 10 comme représenté à la figure 13. Dans une telle configuration, dans le cas où les puits 20 débouchent de part et d'autre du premier dispositif 10, le premier dispositif 10 peut être par exemple retourné la deuxième face 12 au-dessus de la première face 11. La première face 11 du premier dispositif 10 est mise en contact avec la face 31 du deuxième dispositif 30 comportant les échantillons biologiques 40, les débouchés des puits sur la première face 11 étant mis en regard avec les échantillons biologiques 40. Les puits 20 peuvent alors être remplis par la deuxième face 12 du premier dispositif 10. Chaque puits 20 étant rempli par la face sur laquelle sa section est la plus évasée, vers la partie où sa section est la plus étroite, l'air piégé sous le réactif lors du remplissage, dans le cas d'un réactif liquide par exemple, peut être plus facilement évacué. Alternatively the first device 10 may also include at least one well 20 having a conical geometry. For example, in such a configuration, the outlet section of said well 20 on the first face 11 may be smaller than the section of the well 20 between the first face 11 and the second face 12 of the first device 10 as shown in FIG. such a configuration, in the case where the wells 20 open on either side of the first device 10, the first device 10 may be for example returned the second face 12 above the first face 11. The first face 11 of the first device 10 is brought into contact with the face 31 of the second device 30 comprising the biological samples 40, the outlets of the wells on the first face 11 being compared with the biological samples 40. The wells 20 can then be filled by the second face 12 of the first device 10. Each well 20 being filled by the face on which its section is the widest, towards the part where its section is the narrowest, the air trapped under the reagent during filling, in the case of a liquid reagent for example, can be more easily evacuated.
Les échantillons biologiques 40 mis en contact avec le réactif contenu dans les puits 20 peuvent alors être par exemple observés par des moyens optiques sans avoir à séparer les dispositifs 10 et 30, les échantillons biologiques 40 ayant déjà été mis en contact avec le/les réactifs . The biological samples 40 brought into contact with the reagent contained in the wells 20 can then be observed, for example, by optical means without having to separate the devices 10 and 30, the biological samples 40 having already been brought into contact with the reagent (s). .
L'ensemble 80 maintenu, formé du premier dispositif et du deuxième dispositif 30 portant l'échantillon biologique, est alors recouvert sur la deuxième face 12 du premier dispositif 10 par exemple par une plaque en verre 50. L'étanchéité entre la deuxième face 12 du premier dispositif 10 et la plaque 50 est ensuite assurée par exemple par pressage mécanique. The set 80 maintained, formed of the first device and the second device 30 carrying the biological sample, is then covered on the second face 12 of the first device 10 for example by a glass plate 50. The seal between the second face 12 the first device 10 and the plate 50 is then provided for example by mechanical pressing.
En variante, le système comprenant l'ensemble 80 et la plaque 50 maintenus ensemble, peut être ensuite retourné et le deuxième dispositif 30 comprenant les échantillons biologiques 40 et se trouvant au-dessus peut être ensuite séparé du premier dispositif 10. Ce système peut au préalable avoir été agité. Alternatively, the system comprising the assembly 80 and the plate 50 held together, can then be turned over and the second device 30 comprising the biological samples 40 and located above can then be separated from the first device 10. This system can prior to being agitated.
Dans un mode particulier de réalisation le réactif peut également être gazeux. Dans cette variante le remplissage des puits 20 peut se faire par exemple par des connecteurs latéraux et des canaux transversaux 61 tel que représenté à la figure 14, au moins une face débouchante des puits 20 du dispositif 10 étant mise en contact avec des échantillons biologiques 40 du dispositif 30. La mise en contact entre les échantillons biologiques 40 et les puits 20 est directement assurée par cette configuration. Les puits peuvent également être alimentés en solution par des connecteurs latéraux. In a particular embodiment, the reagent may also be gaseous. In this variant the filling of the wells 20 can be done for example by lateral connectors and transverse channels 61 as shown in Figure 14, at least one open face of the wells 20 of the device 10 being brought into contact with biological samples 40 of the device. in contact between the biological samples 40 and the wells 20 is directly provided by this configuration. The wells can also be supplied with solution by lateral connectors.
Ces connecteurs latéraux, dans le cas des liquides ou des gaz peuvent intercepter les puits à différentes hauteurs, en fonction de leur application. Après la mise en contact de l'échantillon biologique 40 avec le ou les réactifs et la séparation de l'échantillon biologique 40 du dispositif 10, l'échantillon biologique 40 est analysé. En particulier, l'échantillon biologique 40 est mesuré pour déterminer l'occurrence d'une réaction entre l'échantillon biologique 40 et le/les réactif (s). Une telle mesure peut être visuelle, optique ou autre . These side connectors, in the case of liquids or gases, can intercept wells at different heights, depending on their application. After the biological sample 40 is brought into contact with the reagent (s) and the biological sample 40 is separated from the device 10, the biological sample 40 is analyzed. In particular, the biological sample 40 is measured to determine the occurrence of a reaction between the biological sample 40 and the reagent (s). Such a measurement can be visual, optical or other.
En variante on pourra utiliser à la place du second dispositif 30 portant l'échantillon biologique, une lame de Tissue Micro Array (TMA) sur laquelle chaque échantillon pourra être analysé indépendamment. Il sera, dans ce mode de réalisation, possible de tester plusieurs Anticorps différents et ainsi de valider, sur une même lame, des séries d'hybridomes lors de la synthèse d'anticorps (Ac) monoclonaux aussi bien sur des tissus inclus en paraffine que des tissus congelés. Il sera également possible d'optimiser, rapidement sur le même support, les protocoles par exemple pour l'utilisation d'un Ac en immuno-histochimie (tampon de démasquage, dilution des Ac, kit de révélation) . Alternatively, in place of the second device 30 carrying the biological sample, a Tissue Micro Array (TMA) slide on which each sample can be analyzed independently. It will be possible, in this embodiment, to test several different antibodies and thus to validate, on the same slide, series of hybridomas during the synthesis of monoclonal antibodies (Ac) as well as on paraffin-embedded tissues. frozen tissues. It will also be possible to optimize, quickly on the same support, the protocols, for example for the use of an Ac immunohistochemistry (unmasking buffer, dilution of Ac, revelation kit).
Le système pourra en particulier être utilisé pour le criblage d ' immunoglobuline et pour l'évaluation simultanée de l'interaction de molécules avec des coupes fines de tissus. In particular, the system can be used for immunoglobulin screening and for evaluation. simultaneous interaction of molecules with thin sections of tissue.
Dans le cadre d'applications industrielles pourront par exemple être testés la réaction de morceaux de polymères par des substances chimiques. In the context of industrial applications, for example, the reaction of polymer pieces with chemical substances may be tested.
L'automatisation du système est par exemple appliquée à différentes étapes du procédé, tel qu'illustré à la figure 15. Le second dispositif 30 est par exemple convoyé automatiquement d'un bout à l'autre du processus. Le remplissage du premier dispositif 10 se fait par exemple automatiquement en parallèle du processus de convoyage du second dispositif 30 pour mener à l'assemblage du premier et du second dispositif. L'ensemble 80 est alors secoué dans une nouvelle étape automatisée puis l'ensemble est convoyé et désassemblé. Le premier dispositif 10 est transporté jusqu'à la station de nettoyage alors que le deuxième dispositif 30 est convoyé vers la station d'analyse, munie par exemple d'un microscope. Le deuxième dispositif 30 est ensuite convoyé après analyse vers la sortie . The automation of the system is for example applied to different steps of the method, as shown in Figure 15. The second device 30 is for example automatically conveyed from one end to the other of the process. The filling of the first device 10 is for example automatically in parallel with the process of conveying the second device 30 to lead to the assembly of the first and the second device. The assembly 80 is then shaken in a new automated step then the assembly is conveyed and disassembled. The first device 10 is transported to the cleaning station while the second device 30 is conveyed to the analysis station, provided for example with a microscope. The second device 30 is then conveyed after analysis to the output.
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