WO2013039010A1 - Microorganism examination device - Google Patents
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- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M41/00—Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation
- C12M41/30—Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation of concentration
- C12M41/36—Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation of concentration of biomass, e.g. colony counters or by turbidity measurements
Definitions
- the present invention relates to a microorganism testing apparatus for a medium fixed to a tray.
- the Japanese Food Sanitation Law sets bacteriological component standards for specific foods such as meat products and fish paste products.
- meat products the number of general viable bacteria, coliforms, coliforms, Staphylococcus aureus, etc. Is required to meet certain standards.
- Counting with an agar medium has been adopted as an official method, but various microorganism culture sheets have been developed in place of the agar medium.
- a microorganism culture sheet for example, there is a sheet-like culture medium having a structure in which a medium laminate composed of a porous matrix layer and a water-soluble polymer compound layer is adhered to an adhesive sheet and a transparent film is covered thereon (patented) Reference 1).
- the recording operation refers to an operation for recording information about a sample in a ledger or the like. For example, a sample number, a sample collection date, a collection location, a sampler, a sample dilution rate, a microorganism name to be counted, and the number of colonies counted. This refers to the work of listing each sample number.
- the counting work refers to preparation of a medium suitable for a test item, preparation of a diluted bacterial solution, inoculation of the bacterial solution into the medium, culture operation, counting of colonies after culture, and the like.
- the sample number and the dilution rate in the culture medium in order to match the counted number of colonies with the sample or to specify the dilution rate of the inoculated sample.
- the specimen number and dilution rate are written with a pen on the petri dish lid, or a seal or tape is attached so that such contents can be understood.
- the petri dish with the sample number attached is removed, the corresponding bacterial solution is inoculated, and after culturing for a predetermined time, colonies are counted. Thereby, the counting result can be recorded in correspondence with the sample number.
- Microorganism inspection has many work processes, but the technology for automating the counting of microbial colonies described above is known. For example, receiving one or more image data of a biological growth medium; analyzing the received image data to identify a first number of colonies in the biological growth medium; Identifying a second number of colonies around the growth medium and one or more colonies within a defined distance from a growth region edge of the growth medium if the first number is less than a threshold value
- a method of automatically counting colonies including a step of excluding from the second number is known (Patent Document 2).
- Patent Document 2 A technique of automatically counting colonies including a step of excluding from the second number is known.
- a technique has been proposed in which biological growth medium is put into a scanning device one by one, the image data is formed, the obtained image data is transmitted to an external computer, and the computer counts colonies. .
- the counting step can be automated. However, since the agar medium to be counted is associated with the specimen number, it is not possible to omit the step of previously describing the specimen number on the agar medium.
- some microorganism culture sheets are given a unique identifier such as a barcode. If the sample information of the bacterial solution at the time of inoculating the bacterial solution and the barcode information of the microorganism culture sheet inoculated with the bacterial solution are stored in a computer, the corresponding sample is determined using the barcode as an index after culture and colony counting. The number of colonies can be stored in the record. However, even in this case, at the time of inoculating the bacterial solution, it is necessary to describe the sample number of the bacterial solution on the microorganism culture sheet to inoculate the bacterial solution.
- the microorganism culture sheet is generally a small, lightweight body with a length of about 90 mm, a width of about 70 mm, and a weight of less than 10 g, it is not easy to stably perform the inoculation work.
- the above problem can be solved by fixing the microorganism culture sheet to a larger tray.
- a plurality of microorganism culture sheets are fixed to the tray, it is possible to efficiently carry in and out the culture apparatus.
- the tray can be heated to the culture temperature and the tray can be heated. Since the colonies of each medium can be automatically counted while being stored, the specimen information and the counted number of colonies can be centrally managed.
- the above aspect is premised on the use of an apparatus in which a tray, a culture apparatus, and a colony counting apparatus are integrated, and a large number of apparatuses are required to process a large amount of specimens, which is not practical.
- the present invention can carry out a microbial test by associating a culture medium with a specimen without describing the specimen number or the dilution rate of the bacterial solution in the culture medium, and further, the counted colony count as specimen information.
- An object of the present invention is to provide a microorganism testing apparatus that can be stored in association with each other.
- the present inventors can simplify the operation of carrying in and out the medium to and from the culture apparatus by fixing a plurality of culture media to the tray, and the bacteria for each bacterial solution inoculating the specimen with the culture medium.
- the microorganism testing apparatus identifies the type of medium based on the bacterial liquid identifier and the sample information corresponding to the bacterial liquid identifier, and a tray for fixing the medium, and the fixing position of the medium in the tray If this information is specified and the information is displayed, the operator can fix the medium on the tray and inoculate the bacterial solution while observing this display.
- the fungus identifier and the fixed position information in the tray and the tray are stored in association with each other, an image of the tray on which the medium is fixed is captured, and the colony is based on the medium image included in the captured image. Counting and detecting the corresponding bacterial liquid identifier by collating with the fixed position information of the culture medium image, finding that the counted number of colonies can be stored in association with the bacterial liquid identifier, and completed the present invention .
- the present invention is a microorganism testing apparatus for performing microorganism testing of a medium fixed to a tray
- the bacterial solution of the specimen is one in which a bacterial solution identifier is assigned for each bacterial solution, Input means for inputting the test item for inspecting the bacterial solution specified by the bacterial solution identifier and the bacterial solution identifier;
- Medium type specifying means for specifying the type of medium inoculated with the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier based on the test item input by the input means;
- a fixed position specifying means for specifying a tray identifier for specifying a tray for fixing the type of medium specified by the medium type specifying means, and a position identifier in the tray for specifying a position for fixing the medium in the tray;
- Display means for displaying the bacterial cell identifier and information indicating the type of medium specified by the medium type specifying means together with the tray identifier specified by the fixed position specifying means and the position identifier in the tray;
- the input means further inputs a dilution rate of the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier
- the display means provides the microorganism testing apparatus, which displays the bacterial liquid identifier and the dilution rate of the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier together with information indicating the type of the culture medium. .
- the input means accepts an input of a tray identifier for specifying a tray for fixing a medium corresponding to the bacterial liquid identifier
- the storage means provides the microorganism testing apparatus, which updates the tray identifier specified by the fixed position specifying means with the tray identifier received by the input means.
- the present invention provides a captured image acquisition unit that acquires a captured image of the tray in which the culture medium is fixed according to a fixed position displayed by the display unit;
- the tray identifier displayed on the tray image acquired by the captured image acquisition unit and the information indicating the position of the culture medium image displayed on the tray image in the tray image are acquired and stored by the storage unit.
- the corresponding tray identifier and the position identifier in the tray are identified to identify the corresponding bacterial liquid identifier, and the bacterial liquid identifier acquisition means for acquiring the bacterial liquid identifier of the medium image;
- a colony counting unit that counts colonies of the medium image corresponding to the bacterial liquid identifier acquired by the bacterial liquid identifier acquisition unit;
- the storage means provides the microorganism testing apparatus, which stores the number of colonies obtained by the colony counting means in association with the bacterial liquid identifier corresponding to the medium image.
- the present invention further includes a culture medium table that associates the test item with the type of culture medium to be used,
- the culture medium type identification means provides the microorganism testing apparatus, which identifies a culture medium corresponding to the bacterial liquid identifier from the culture medium table based on the test item input by the input means.
- the apparatus specifies a medium suitable for the inspection of the bacterial solution based on information input by the operator, and the type of medium and the tray for fixing the medium together with the bacterial solution identifier for specifying the bacterial solution.
- the operator can inoculate the culture medium without subjecting the medium with a specimen number or the like.
- the present invention after culturing a tray on which a medium is fixed, when the whole tray is imaged with a microorganism culture apparatus, colonies are counted based on the medium image included in the captured image, and the position of the medium on the tray And the counted number of colonies can be stored in association with each other, so that measurement results can be obtained very easily without human error.
- FIG. 2A is a plan view
- FIG. 2B is a cross-sectional view taken along the line AA in FIG. 2A
- FIG. 2C is a cross-sectional view when the petri dish is fixed.
- FIG. 2C is a cross-sectional view when the petri dish is fixed.
- FIG. 2C is a figure explaining the microorganism culture sheet
- Embodiment 1 of this invention It is a figure which shows the aspect by which the fixed position information which consists of a tray identifier and a tray position identifier was added to the sample database illustrated in Embodiment 1 of this invention. It is a figure explaining an example of the display content by the display means based on Embodiment 1 of this invention. It is a figure explaining a display content in the aspect different from FIG. It is a figure explaining the content of the sample database of the modification 1. This is a mode in which the two-dimensional code A of the microorganism culture sheet fixed to the in-tray position identifier “1” is read, and the tray identifier “1” is updated with this information. It is a figure explaining the content of the sample database of the modification 2.
- Bacterial liquid identifier in colony counting process, tray identifier and tray position identifier specified by fixed position specifying unit corresponding to the bacterial liquid identifier, tray identifier and medium image tray position identifier specified from captured image, and colony It is a figure explaining the relationship with a number. It is a figure explaining the culture medium table which can be used when performing a microbe test
- the present invention is an apparatus for carrying out a microbial test for inoculating a bacterial solution into a medium for general viable count, coliform group, coliform count, Staphylococcus aureus, etc., and counting colonies generated in the cultured medium. is there.
- a culture medium is fixed to a tray, inoculated with a bacterial solution, cultured, and imaged.
- a “bacterial fluid identifier” is assigned to the bacterial solution of the specimen to be examined for each bacterial solution inoculated into the medium. Therefore, if the bacterial liquid identifier is “n”, the bacterial liquid “n” corresponding to the bacterial liquid identifier “n” and the culture medium “n” inoculating the bacterial liquid “n” are uniquely identified.
- bacterial fluid identifiers such as “n1”, “n2”, and “n3” are given to the bacterial fluid, even if they are prepared from the same specimen. Then, the medium for inoculating the bacterial solution is specified by the bacterial solution identifier.
- the medium composition corresponding to the bacterial liquid identifier based on the inspection item input by the apparatus is specified, and a tray for fixing the medium and an identifier (hereinafter, referred to as an in-tray position identifier) indicating a position for fixing the medium in the tray are specified.
- the apparatus displays the bacterial liquid identifier and the type of medium corresponding to the bacterial liquid identifier together with the tray identifier and the tray position identifier for fixing the medium.
- Bacteria solution can be inoculated without filling in.
- the microbiological examination apparatus includes a captured image acquisition unit and a colony counting unit that counts colonies based on the captured image
- the tray identifier or the tray image displayed on the obtained captured image is imaged after the culture is performed.
- the information on the fixed position of the medium image in the inside is acquired, and the corresponding bacterial solution identifier can be acquired by collating with the tray identifier stored in the storage means or the position identifier in the tray.
- colony counting is performed based on the medium image, the number of colonies can be stored in association with the acquired bacterial liquid identifier.
- a microbiological test apparatus 100 includes a CPU (Central Processing Unit) 101, a ROM (Read Only Memory) 102, a RAM (Random Access Memory) 103, a storage device 104, an input device 105, a communication device 106, and an imaging control.
- an imaging device 108 is connected to the imaging control unit 107.
- a display device 111 is connected to the display control unit 110.
- an audio output device 113 is connected to the audio processing unit 112.
- the communication device 106 is connected to an Internet database server 114.
- the CPU 101 controls the overall operation of the microorganism testing apparatus 100. Note that the CPU 101 operates according to a program stored in the ROM 102 and uses the RAM 103 as a work area.
- the ROM 102 stores a program and data for controlling the overall operation of the microorganism testing apparatus 100.
- the RAM 103 functions as a work area for the CPU 101. That is, the CPU 101 temporarily writes programs and data in the RAM 103 and refers to these programs and data as appropriate.
- the CPU 101, the ROM 102, and the RAM 103 constitute a control unit.
- the control unit controls each unit connected to the bus 120 to specify the type of medium, the fixed position where the medium is fixed, and the like.
- the storage device 104 stores programs, captured images, a specimen database, a culture medium table, a fixed position information table, and other parameters described later. In addition, a program for performing barcode and two-dimensional code reading processing, a program for performing optical character recognition processing, and data are stored.
- the storage device 104 may be a built-in storage device or a removable storage device.
- the storage device 104 includes, for example, a hard disk device, a memory card slot including a memory card, a CD-ROM drive including a CD-ROM (Compact Disk Read Only Memory), and the like.
- the input device 105 is a device that receives an operation input from an operator or the like.
- the input device 105 includes, for example, a mouse, a keyboard, a touch screen, a code reader, a controller, and buttons.
- the communication device 106 establishes communication with an external device of the microorganism testing device 100 by wireless communication or wired communication under the control of the CPU 101, and receives and transmits data. For example, the communication device 106 receives a captured image captured by the imaging device 108 or the like from the database server 114 connected to the microorganism testing device 100 via an electric communication network such as the Internet.
- the communication device 106 includes a NIC (Network Interface Card), a USB (Universal Serial Bus) port, and the like.
- the imaging control unit 107 controls the imaging device 108 connected to the imaging control unit 107 under the control of the CPU 101. For example, the imaging control unit 107 controls the operation of the imaging device 108 by transmitting a control signal indicating an imaging start instruction, an imaging end instruction, or the like to the imaging device 108. In addition, the imaging control unit 107 sets imaging conditions in the imaging device 108 by transmitting imaging settings such as resolution, exposure time, and brightness to the imaging device 108, for example. Then, the imaging control unit 107 receives the captured image acquired by the imaging device 108 from the imaging device 108.
- the imaging device 108 images a subject and generates a captured image indicating the subject.
- the imaging device 108 images a subject in accordance with a control signal supplied from the imaging control unit 107.
- the imaging device 108 transmits the generated captured image to the imaging control unit 107.
- the captured image is, for example, a color image in which each pixel is represented by a luminance value of R (Red), a luminance value of G (Green), and a luminance value of B (Blue).
- the captured image may be a monochrome image in which each pixel is represented by one luminance value.
- the captured image is represented by digital data, for example. The aspect ratio and resolution of the captured image can be adjusted as appropriate.
- the imaging device 108 includes a digital camera, a digital video camera, a flat bed scanner, a dedicated reader, and the like.
- the subject to be imaged by the imaging device 108 is a tray after a medium is fixed on the tray, inoculated with a bacterial solution, and cultured.
- FIG. 1 shows an agar medium tray 300 on which six agar medium dishes 400 are fixed.
- the imaging device 108 images this tray and generates a captured image.
- the captured image is, for example, 300 dpi, 2472 ⁇ 3496 Pixels, 2.7 Mbytes.
- the resolution and the like are not limited to this example.
- the image storage unit 109 stores a captured image acquired from the imaging device 108, a captured image stored in the storage device 104, a captured image acquired from an external device by the communication device 106, or the like.
- the image storage unit 109 is configured by, for example, a flash memory.
- the display control unit 110 controls the display device 111 under the control of the CPU 101. For example, the display control unit 110 generates an image signal representing an image to be displayed on the display device 111 and supplies the generated image signal to the display device 111.
- Display device 111 displays an image based on the image signal supplied from display control unit 110.
- the display device 111 includes, for example, an LCD (Liquid Crystal Display) or an organic EL (Electro Luminescence).
- the display device 111 may be a touch screen.
- the touch screen functions not only as a display device but also as an input device 105.
- the audio processing unit 112 converts the digital audio signal supplied from the CPU 101 into an analog audio signal by a D / A (Digital / Analog) converter (not shown), and supplies the analog audio signal to the audio output device 113.
- the audio processing unit 112 may include a DSP (Digital Signal Processor) that performs various processes on the digital audio signal supplied from the CPU 101.
- DSP Digital Signal Processor
- the audio output device 113 converts the analog audio signal supplied from the audio processing unit 112 into audio and outputs it.
- the audio output device 113 is configured by a speaker, for example.
- the audio output device 113 may include an amplifying device that amplifies a digital audio signal or an analog audio signal.
- FIG. 2 shows an agar medium tray 300 when an agar medium is used.
- FIG. 2A is a plan view of a square agar medium tray 300 on which six petri dishes for agar medium can be fixed
- FIG. 2B is a cross-sectional view taken along line AA in FIG. FIG.
- FIGS. 2A to 2C are a cross-sectional views of the tray on which the petri dish 400 filled with the agar medium 410 is placed.
- the petri dish lid 413 is locked to the protrusion 305 of the agar medium tray 300 and fixed in position.
- the tray 300 has a through-hole 303 formed in a flat plate, and a protrusion 305 protruding toward the center of the through-hole at the edge of the through-hole 303.
- the petri dish 400 which is formed and accommodates the agar medium 410 by the protrusion 305 can be locked.
- the top and bottom of the petri dish are usually reversed and cultured with the lid portion 413 of the petri dish 400 facing down.
- the shape of the agar medium tray 300 may be a square shape, a disc shape, or the like. There is no limitation on the size of the medium to be fixed to the agar medium tray 300. Therefore, the culture medium of a different size may be fixed according to the size of the petri dish 400 to be used.
- the tray in which the recessed part which can be fitted with a protrusion part was formed can be used.
- the petri dish can be attached and the lid portion can be prevented from rotating.
- the material of the agar medium tray 300 is not limited, but a material having a strength capable of fixing a plurality of petri dishes 400 can be widely used.
- metals such as aluminum and synthetic resins such as polyethylene, polypropylene, and polyester are suitable.
- a microorganism culture sheet can be used as a medium, and a tray different from the agar medium tray 300 is used.
- FIG. 3 shows an example of the microorganism culture sheet.
- 3A is a plan view
- FIG. 3B is a cross-sectional view.
- the microorganism culture sheet 500 includes a base material sheet 501, a culture layer 502 formed on the upper surface of the base material sheet 501, and a cover sheet 503 that covers the culture layer 502. It is a thing.
- the culture layer 502 is disposed in the approximate center of the base sheet 501, but the culture layer 502 may be formed on the entire surface of the base sheet 501.
- a medium identification color bar 505 that displays red for general viable count, green for Escherichia coli, yellow for Staphylococcus aureus, and the like may be displayed.
- the type of the culture layer can be visually determined from its appearance.
- an identifier unique to the microorganism culture sheet (hereinafter simply referred to as a medium identifier) 504 may be displayed on the surface.
- FIG. 4 illustrates a tray 350 for fixing such a microorganism culture sheet 500 (hereinafter, sometimes referred to as “culture sheet tray”).
- the culture sheet tray 350 shown in FIG. 4 is formed by forming eight sections (a) separated by a partition line (L) having two rows of four squares on the inner side of the dark border.
- the microorganism culture sheet 500 can be fixed to each of the compartments (a).
- the culture sheet tray 350 may have no partition line (L) as long as the position where the microorganism culture sheet 500 is fixed can be specified. For example, if a slit (b) or the like for inserting a corner of the microorganism culture sheet 500 is formed corresponding to the position to be fixed, the fixing position can be specified without the partition line (L).
- the slit (b) and the partition line (L) can be appropriately selected according to the material of the culture sheet tray 350.
- the partition line (L) may be formed by embossing unevenness in addition to printing.
- FIG. 4 the aspect which has both a partition line (L) and a slit (b) is shown.
- the material of the culture sheet tray 350 is not only paper but also synthetic resin, metal, and a composite material thereof.
- the method for fixing the microorganism culture sheet to the culture sheet tray 350 can be appropriately selected according to the material of the culture sheet tray 350 and the like.
- FIG. 4 shows an aspect of the culture sheet tray 350 that forms slits (b) into which the corners of the microorganism culture sheet can be inserted, but the corners of the microorganism culture sheet are replaced with such slits (b). What forms the photo corner etc. to fix, or what an adhesive layer has may be used.
- a fixing force sufficient to prevent the microorganism culture sheet from being detached even when the culture sheet tray 350 is turned upside down can be secured.
- FIG. 4 shows an example in which a total of eight sections are formed in two rows of four squares in the horizontal direction. As a stand, 4 squares each with 2 squares, 8 sections in total, 3 squares each with 2 squares, 6 sections in total, other shapes of microorganism culture sheet to be fixed, and subsequent imaging means It can be appropriately selected according to the above.
- a tray with an identifier unique to the tray (hereinafter referred to as “tray identifier”) can be suitably used regardless of the type of the medium to be fixed.
- the tray identifier include a serial number, a bar code, a two-dimensional code, letters, numbers, pictures, and other symbols.
- FIG. 2 shows a mode in which the serial number “1” is displayed as the tray identifier at the approximate center of the agar medium tray 300. If the tray identifier is a serial number, it is easy for humans to visually recognize, and the operator can easily prepare the tray specified by the display means.
- the tray identifier when the tray identifier is attached to the surface of the tray, since the captured image also includes the tray identifier, the tray identifier and the fixed position information in the tray image of each medium image included in the captured image are displayed.
- the corresponding bacterial liquid identifier can be identified by referring to these information and the information on the fixed position stored by the storage means. After identifying the bacterial liquid identifier of the culture medium image and counting colonies based on the culture medium image, the number of colonies can be stored in association with the bacterial liquid identifier.
- the tray may be attached with a position recognition marker indicating the top and bottom or left and right.
- a position recognition marker By referring to such a position recognition marker, it is possible to perform image alignment and to improve the efficiency of processing of the captured image.
- a color chart for color correction or a color sample arrangement table such as gray scale may be displayed on the tray.
- a color chart for color correction or a color sample arrangement table such as gray scale may be displayed on the tray.
- JIS standard A4 size and B4 size can be exemplified. This is because it is easy to carry in and out of the culture apparatus and to image.
- the microorganism testing apparatus identifies the position where the medium is fixed in the tray by the position identifier in the tray.
- the position identifier in the tray There is no limitation on the specification of the position identifier in the tray.
- the position identifier in the tray For example, in a tray that can fix a total of 8 media in 4 rows and 2 rows, in the order of the upper row, from the left side to the right end, in the order of integers 1 to 4, from the bottom row, from the left side to the right end An integer of 5 to 8 can be assigned as the position identifier in the tray.
- Such specification of the in-tray position identifier is stored in the storage device 104 or the like of the microorganism testing apparatus. Therefore, the tray position identifier need not be attached to the tray.
- FIG. 5 shows an example of a mode in which the microorganism culture sheet 500 is fixed to all eight sections of the culture sheet tray 350 in which the tray identifier “1” is clearly specified.
- the microorganism testing apparatus 100 includes an input information acquisition unit 10, a medium type specification unit 20, a fixed position specification unit 30, a display control unit 40, a storage unit 50, an image acquisition unit 60, and a bacterial liquid identifier acquisition unit. 70, an image processing unit 80, and a colony counting unit 90.
- the microorganism testing apparatus 100 should also be called a microorganism testing support apparatus in that it can support a worker's microorganism testing.
- the input information acquisition unit 10 acquires input information input by the worker from the input device 105.
- the input information includes information such as the acquisition date of the specimen, the bacterial liquid identifier of the bacterial liquid prepared from the specimen, the inspection item of the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier, and the dilution rate of the bacterial liquid. Further, information such as a barcode and a two-dimensional code from the code reader 115 can be used as input information.
- the input information acquired by the input information acquisition unit 10 is stored in the RAM 103 or the storage unit 50, for example.
- the input information acquisition unit 10 includes a CPU 101, for example.
- the culture medium type identification unit 20 identifies the type of medium suitable for the inspection of the bacterial liquid based on the inspection item of the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier acquired by the input information acquisition unit 10. When there is only one type of medium corresponding to the inspection item, the type of medium is uniquely specified by the input inspection item.
- the culture medium type specifying unit 20 includes, for example, a CPU 101.
- the fixed position specifying unit 30 specifies a tray identifier for specifying a tray for fixing the type of medium specified by the medium type specifying unit 20, and an in-tray position identifier for specifying the fixed position of the medium in the tray for fixing the medium. Is identified in correspondence with the bacterial liquid identifier. Accordingly, the fixed position of the culture medium is specified by the tray identifier and the in-tray position identifier.
- the tray identifier and the in-tray position identifier specified by the fixed position specifying unit 30 are stored in the RAM 103 or the storage unit 50 in correspondence with the bacterial liquid identifier.
- the fixed position specifying unit 30 includes, for example, a CPU 101.
- the display control unit 40 corresponds to the bacterial liquid identifier the bacterial liquid identifier acquired by the input information acquisition unit 10 and information indicating the type of medium specified by the medium type specifying unit 20 corresponding to the bacterial liquid identifier. Then, it is displayed on the display device 111 together with the tray identifier and the tray internal position identifier specified by the fixed position specifying unit 30. The display may be performed for each bacterial solution identifier or for each tray identifier. Further, when the dilution rate of the bacterial solution specified by the bacterial solution identifier is input as input information, the dilution rate of the bacterial solution specified by the bacterial solution identifier is displayed together with the bacterial solution identifier.
- the display control unit 40 includes, for example, a CPU 101 and a display control unit 110.
- the storage unit 50 stores the input information acquired by the input information acquisition unit 10, and further acquires the fixed position information such as the tray identifier and the tray position identifier acquired by the fixed position specifying unit 30, the image acquisition unit 60 acquires,
- the image stored in the image processing unit 80, the number of colonies counted by the colony counting unit 90, and the like are stored in correspondence with the bacterial liquid identifier.
- the storage unit 50 includes, for example, a RAM 103 and a storage device 104.
- the storage unit 50 may include a database server 114 connected to the communication device 60 via a telecommunication network such as the Internet.
- the image acquisition unit 60 acquires an image captured by the imaging device 108 or an image showing an entire state of the tray after the culture medium is cultured from the storage unit of the database server 114 via the communication device 106.
- the image acquisition unit 60 includes, for example, a CPU 101.
- the bacterial liquid identifier acquisition unit 70 acquires the tray identifier displayed in the tray image displayed in the captured image and information indicating the position of the medium in the tray image of the medium image included in the captured image. Subsequently, the acquired tray identifier and the fixed position information of the medium in the tray are collated with the tray identifier and the position identifier in the tray stored in the storage unit 50, and the corresponding liquid identifier is acquired. To do.
- the bacterial liquid identifier acquisition unit 70 includes, for example, a CPU 101.
- the image processing unit 80 aligns the captured image acquired by the image acquisition unit 60 with reference to a coordinate axis and the like, and performs color adjustment with reference to a color sample built in the storage unit 50. Further, a cutting process is performed for each culture medium image displayed in the tray image displayed in the captured image.
- the image processing unit 80 includes, for example, a CPU 101.
- the colony counting unit 90 counts the number of colonies contained in the medium based on the cut-out medium image.
- the colony counting unit 90 includes, for example, a CPU 101.
- Embodiment 1 an example of a preferred embodiment in which the microorganism inspection apparatus 100 performs the microorganism inspection will be described.
- the medium an agar medium of general viable cell count, coliform group, and Staphylococcus aureus abbreviated as AC, CC and SA, respectively.
- the culture medium type identification unit 20 of the microorganism testing apparatus 100 selects “AC” when the test item acquired by the input information acquisition unit 10 is “general viable count”, and selects “CC” for the coliform group. Then, it is set to select “SA” for S. aureus and stored in the storage device 104 or the like.
- the “AC” is an abbreviation for a medium composition suitable for counting the number of general viable bacteria
- “CC” and “SA” are abbreviations for a medium composition suitable for counting coliform bacteria and Staphylococcus aureus, respectively. It is.
- a tray identifier is represented by an integer of “1”, “2”, “3”... “N” for each tray.
- the fixed position specifying unit 30 of the microorganism testing apparatus 100 is set to be assigned in ascending order from the tray identifier “1”, and is stored in the storage device 104 or the like.
- the tray is formed in two rows of 4 squares in total, for a total of 8 sections.
- the fixed position specifying unit 30 of the microbiological testing apparatus 100 sets an integer of “1” to “4” in order from the upper stage and the left side to the right side for the eight sections of the tray, and from the lower stage and the left side to the right side.
- the integers “5” to “8” are set to be assigned as tray position identifiers in order and stored in the storage device 104 or the like.
- the fixed position specifying unit of the microorganism testing apparatus 100 is set to select the position identifier in the tray so that the culture items corresponding to the adjacent bacterial liquid identifiers are fixed above and below the same row of the tray with the same test item. And stored in the storage device 104 or the like.
- the microorganism testing apparatus will be described in the case where the liquid is counted by the test number “2” for each test item.
- FIG. 8 is a flowchart of execution contents of the microorganism testing apparatus 100. For example, when the microbe inspection apparatus 100 detects that an instruction to start processing by an operator is received by the input device 105, the microbe inspection apparatus 100 starts the processing illustrated in FIG.
- FIG. 9 shows an example of the sample database.
- a bacterial cell identifier is assigned to each bacterial solution inoculated into the culture medium.
- FIG. 7 when the bread produced in Production 3 Section is used as a specimen, and the number of general viable bacteria, coliform bacteria, and Staphylococcus aureus are counted in duplicates, the number of general viable bacteria, coliform bacteria, yellow Two each of three types of staphylococcal media are used.
- the bacterial liquid inoculated in each medium is specified by a total of six different bacterial liquid identifiers.
- the specimen database includes at least a bacterial fluid identifier and a test item of the bacterial fluid specified by the bacterial fluid identifier as display items.
- One record is provided for each bacterial fluid identifier, and various types of information regarding the bacterial fluid identifier are stored. It is configured to allow input.
- the display items of the specimen database include the information on the collection date of the specimen, the collection place, the sampler, the inspection items of the bacterial liquid, etc. before preparing the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier, in addition to the bacterial liquid identifier Can be included. Further, when the sample is food, the expiration date, date of manufacture, storage conditions, etc. of the food can be set as display items and stored in the storage device 104 or the like.
- the worker inputs at least the content corresponding to the bacterial fluid test item specified by the bacterial fluid identifier and the bacterial fluid identifier from the input device 105 corresponding to the display item of the specimen database indicated by the display device 111.
- the specimen database may be set to display the bacterial solution identifiers in ascending order by serial number. Such a setting can be stored in advance in the storage device 104 and executed.
- the CPU 101 acquires, as input information, information on each of the bacterial fluid identifiers “0901” to “0906” input by the operator from the input device 105 or automatically selected and displayed by setting (step S101). ).
- the CPU 101 stores the input information in the RAM 103 or the storage device 104.
- the CPU 101 specifies the type of medium inoculated with the bacterial liquid corresponding to the bacterial liquid identifier “0901” (step S102).
- the inspection item corresponding to the bacterial liquid identifier “0901” is “the number of general viable bacteria”.
- the culture medium type identifying unit 20 of the microorganism testing apparatus 100 identifies “AC” when the test item acquired by the input information acquiring unit 10 is “general viable count”, and identifies “CC” for the coliform group. Then, it is set to specify “SA” for S. aureus and stored in the storage device 104 or the like.
- the CPU 101 specifies “AC” as the type of culture medium inoculated with the bacterial liquid corresponding to the bacterial liquid identifier “0901”.
- a medium of a type called “AC” as the general viable cell count is specified for the bacterial fluid identifier “0902”, and the bacterial fluid identifiers “0903”, “
- a medium called “CC” that counts the number of coliforms in food is identified for “0904”, and “SA” that counts Staphylococcus aureus in all foods is identified for “bacteria identifiers” “0905” and “0906”.
- the types of media to be identified are identified sequentially.
- the CPU 101 stores the type of the medium specified corresponding to the bacterial liquid identifier in the RAM 103 corresponding to the bacterial liquid identifier.
- Step S103 the CPU 101 acquires a tray identifier that specifies a tray for fixing a medium inoculating the bacterial fluid corresponding to the bacterial fluid identifier “0901”.
- the fixed position specifying unit 30 of the microorganism testing apparatus 100 is set to be assigned in ascending order from the tray identifier “1” when specifying the tray, and is stored in the storage device 104 or the like. Therefore, the CPU 101 obtains the tray identifier “1” for the bacterial liquid identifier “0901”.
- the tray identifier “1” is sequentially obtained for the bacterial fluid identifiers “0902” to “0906”.
- the CPU 101 stores the acquired tray identifier in the RAM 103 in association with the bacterial liquid identifier.
- the CPU 101 specifies the position where the medium for inoculating the bacterial liquid corresponding to the bacterial liquid identifier “0901” is fixed to the tray specified by the tray identifier “1” acquired corresponding to the bacterial liquid identifier “0901”.
- An in-tray position identifier is acquired (step S104).
- the microorganism testing apparatus 100 sets the integers of “1” to “4” in order from the upper stage and the left side left edge to the right edge as the arrangement of the position identifiers in the eight sections of the tray, from the lower stage and the left side left to the right edge.
- the culture medium “AC” inoculated with the bacterial liquid corresponding to the bacterial liquid identifier “0901” is specified to be fixed at the position specified by the tray internal position identifier “1” of the tray specified by the tray identifier “1”. Is done.
- the CPU 101 stores the allocated tray position identifier in the RAM 103 in association with the fungus liquid identifier. Further, it may be stored as a part of the specimen database in the storage device 104.
- FIG. 10 shows an aspect in which the type of medium inoculated with the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier, the tray identifier for fixing the medium, and the position identifier in the tray are stored in the specimen database for each bacterial liquid identifier.
- the tray identifier and the in-tray position identifier are stored as “fixed position information”, and an abbreviation indicating the type of medium is stored as the medium information together with the fixed position information.
- the display control unit 40 is instructed to display the bacterial fluid identifier (step S105).
- An example of the display content is shown in FIG. FIG. 11 shows the tray identifier assigned by the CPU 101, the tray position identifier, the corresponding bacterial fluid identifier, the abbreviation of the type of medium inoculated with the bacterial fluid identified by the bacterial fluid identifier, and the dilution rate of the bacterial fluid It is an example displayed by. Note that the tray identifier for specifying the tray to be used is clearly shown in the center.
- the display format is not limited to the table format shown in FIG. 11, and may be displayed with an image that approximates the real thing, such as a tray or an agar medium used, for example, as illustrated in FIG. 12.
- FIG. 12 it is devised so that the letters “Miss” are indicated in a section where the culture medium is not fixed, and the medium non-attachment is clearly displayed.
- the type of medium is indicated by abbreviations “AC”, “CC”, “SA”, etc., but “AC” is yellow, “CC” is blue, “SA” is red, etc.
- the area may be displayed in color.
- the CPU 101 stores display contents in the RAM 103.
- the CPU 101 displays the tray position identifier, the type of medium fixed to each tray position identifier, and the bacterial liquid identifier of the bacterial liquid inoculated on the medium for all the bacterial liquid identifiers assigned the tray identifier “1”.
- the presence / absence of the bacterial liquid identifier assigned the tray identifier “2” is confirmed (step S106). If there is an undisplayed bacterial liquid identifier to which the tray identifier “2” is assigned, step S105 is executed for the tray identifier “2”. The presence / absence of the undisplayed bacterial solution identifier is confirmed until there is no tray identifier “n” to which the undisplayed bacterial solution identifier is assigned.
- the CPU 101 determines that there is no undisplayed fungal fluid identifier to which the tray identifier “n” is assigned, the CPU 101 locates the tray identifier corresponding to each fungus fluid identifier, the position identifier in the tray, and the position specified by the position identifier in the tray.
- the type of medium to be fixed is stored in the storage device 104 as a specimen database (step S107).
- the CPU 101 may store the sample database from the communication device 106 in the database server 114 connected to the microorganism testing device 100 via an electric communication network such as the Internet. After saving, the above process is terminated.
- the CUP 101 completes step S101 for all the bacterial liquid identifiers.
- Step S102 was executed later, and Step S103 was executed after completing Step 102 for all bacterial fluid identifiers.
- each step was executed for all bacterial fluid identifiers.
- the above steps S103 to S106 may be performed for the tray identifier “n”, and then the above steps S103 to S106 may be performed for the tray identifier “n + 1”.
- the process returns to step S103, and steps S103 to S106 are repeated for the tray identifier “n”. .
- the CPU 101 determines, for each bacterial solution identifier, the corresponding tray identifier, fixed position information such as the tray position identifier, and the type of medium fixed to the tray position identifier.
- the sample database is stored in the storage device 104 (step S107).
- the bacterial liquid identifier and the type of medium corresponding to the bacterial liquid identifier are displayed on the display device 111 together with the tray identifier and the tray position identifier in step S105. Therefore, the operator can prepare a tray to which a tray identifier is assigned according to the display content, and can fix the culture medium at the position indicated by the tray position identifier.
- step S101 when input information is acquired in step S101, steps S102 to S107 are performed based on the input information.
- the CPU 101 accepts an input by the operator after displaying the medium type and the bacterial liquid identifier and the tray identifier and the tray position identifier for fixing the corresponding medium in step S105. This is a mode in which the information of the tray identifier is updated with the received information.
- the storage device 104 of the microorganism testing apparatus 100 is fixed at the position specified by the in-tray position identifier “1” input by the operator via the input device 105, with the in-tray position identifier specified by the fixed position specifying unit 30. It is preset and stored to be updated with the two-dimensional code of the culture medium.
- the medium identifier may be a serial number or a two-dimensional code as long as it is attached to the surface of the medium.
- the medium identifier is a two-dimensional code will be described.
- the CPU 101 executes steps S101 to S105.
- the CPU 101 instructs the display control unit 40 to display the bacteria identifier and the type of medium corresponding to the bacteria identifier together with the tray identifier “1” and the tray position identifier (step S105).
- the operator uses the same tray as the tray used in the first embodiment for arranging the position identifiers in the tray regardless of the display contents of the apparatus, and fixes the medium at the position specified by the position identifier in the tray indicated by the display contents. To do.
- a medium identifier is attached to the surface of the medium.
- the operator After fixing the medium on the tray, the operator reads the medium identifier of the medium fixed at the position of the tray position identifier “1” with the input device 105 such as a code reader or the imaging device 108.
- the CPU 101 receives the medium identifier information from the input device 105 and the imaging device 108, and updates the tray identifier “1” assigned by the CPU 101 with the medium identifier information (step S105 ′).
- the CPU 101 stores the tray identifier updated with the culture medium identifier in the RAM 103.
- step S105 ' the CPU 101 confirms the presence or absence of the bacterial liquid identifier to which the tray identifier "2" is assigned in the same manner as in the first embodiment (step S106). If there is an undisplayed bacterial fluid identifier to which the tray identifier “2” is assigned, Steps S105 and S105 ′ are executed for the tray identifier “2”.
- the CPU 101 determines that there is no undisplayed fungal fluid identifier to which the tray identifier “n” is assigned, the CPU 101 uses the tray identifier corresponding to each fungus fluid identifier, the fixed position information such as the tray position identifier, and the tray position identifier.
- the type of medium fixed at the specified position is stored in the storage device 104 as a specimen database (step S107). After saving, the above process is terminated.
- FIG. 13 shows an example of the specimen database stored in the first modification. In FIG. 13, the two-dimensional code of the medium identifier is displayed as a two-dimensional code A.
- the worker can use the tray without being limited to the tray identifier assigned by the CPU 101. Since any tray can be arbitrarily selected and used, the preparation of the tray is easy and the work efficiency is excellent.
- the information on the medium identifier to be updated is not limited to the information fixed in the tray position identifier “1”, but may be derived from the position specified by any tray position identifier. However, it is a condition that in the microorganism testing apparatus 100, the position identifier in the tray of the medium for acquiring information about the medium identifier for update is stored in advance.
- step S105 after displaying the medium type and the bacterial liquid identifier, and the tray identifier and the tray position identifier for fixing the corresponding medium, the CPU 101 accepts the input by the operator, and the information of the tray identifier by the input information. Another mode of updating the will be described as a second modification.
- Modification 2 is a mode in which the operator fixes the culture medium to an arbitrary tray, reads the tray identifier attached to the surface of the tray after fixing, and updates the tray identifier assigned by the CPU 101 with the read tray identifier. is there.
- the storage device 104 of the microorganism testing apparatus 100 is preset and stored so as to update the in-tray position identifier specified by the fixed position specifying unit 30 with the two-dimensional code of the tray input by the operator via the input device 105. ing.
- the tray identifier to be updated may be a serial number or a two-dimensional code.
- the medium identifier is a two-dimensional code.
- the CPU 101 executes steps S101 to S105.
- the CPU 101 instructs the display control unit 40 to display the bacteria identifier and the type of medium corresponding to the bacteria identifier together with the tray identifier “1” and the tray position identifier (step S105).
- the operator uses any tray whose tray position identifier array is the same as the tray used in the first embodiment, and is in a position specified by the tray position identifier indicated by the display content. Fix the medium.
- a tray identifier is attached to the surface of the tray.
- the operator After fixing the medium on the tray, the operator reads the two-dimensional code attached to the tray with the input device 105 such as a code reader or the imaging device 108.
- the CPU 101 receives tray identifier information from the input device 105 and the imaging device 108, and updates the tray identifier “1” assigned by the CPU 101 with the information of the tray identifier made up of this two-dimensional code (step S105 ′).
- the CPU 101 stores the updated tray identifier in the RAM 103.
- step S105 ' the CPU 101 confirms whether or not there is an undisplayed fungal fluid identifier to which the tray identifier "2" is assigned, as in the first embodiment (step S106). If there is a bacterial liquid identifier to which the tray identifier “2” is assigned, Steps S105 and S105 ′ are executed for the tray identifier “2”.
- the CPU 101 determines that there is no undisplayed fungal fluid identifier to which the tray identifier “n” is assigned, the CPU 101 uses the tray identifier corresponding to each fungus fluid identifier, the fixed position information such as the tray position identifier, and the tray position identifier.
- the type of medium fixed at the specified position is stored in the storage device 104 as a specimen database (step S107).
- FIG. 14 shows an example of the sample database stored in the second modification. After saving, the process ends.
- the two-dimensional code of the updated tray identifier is displayed as a two-dimensional code B.
- the worker can use the tray without being limited to the tray identifier assigned by the CPU 101. Since any tray can be arbitrarily selected and used, the preparation of the tray is easy and the work efficiency is excellent.
- the tray identifier is not limited to a two-dimensional code as long as it is attached to the surface of the tray, and may be a barcode or a serial number.
- the method of assigning tray identifiers by the CPU 101 may be set so that the same tray identifier is assigned to the bacterial solution identifier of the bacterial solution having the same test item, culture time, and the like. Such a setting can be stored in advance in the storage device 104 and executed by the CPU 101. Further, the CPU 101 may be set to allow the operator to select which setting is to be performed at the start of the microorganism test.
- the method for assigning tray position identifiers is the same.
- a fixed position information table in which the arrangement of the position identifiers in the tray is stored in advance for each different tray such as the position where the medium is fixed is stored in the storage device 104, and the operator can start the microorganism test or end the step S102. You may set so that a tray type can be selected.
- the CPU 101 acquires information related to the selected tray type, and executes step S103 and subsequent steps according to the acquired information.
- the CPU 101 may set the worker so that any of the display contents can be changed.
- the medium “SA” corresponding to the bacterial solution identifier “0906” is fixed to the in-tray position identifier “7”.
- the CPU 101 receives this input information, and the bacterial liquid Information on the position identifier in the tray with the identifier “0906” is updated to “4”.
- the CPU 101 instructs the display control unit 40 to redisplay the updated content.
- the CPU 101 stores update information in the RAM 103.
- the CPU 101 stores the input information and fixed position information (tray identifier, updated tray position identifier) in the storage device 104 as a sample database (step S107).
- Bacterial fluid inoculation and imaging processing The operator fixes the medium on the tray according to the display of the microorganism culture apparatus 100, inoculates the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier, and then transports the whole tray to the culture apparatus for culturing. .
- the inoculation of the bacterial solution is not limited to the plate smearing method when an agar medium is used, and may be a pour method.
- the operator takes an image of the tray with the imaging device 108 during or after the culture.
- a change in the number of colonies over time can be evaluated by taking an image of the tray taken out of the culture apparatus after the predetermined culture time has elapsed with the imaging apparatus 108.
- the imaging device 108 can be appropriately selected depending on the tray and the culture medium, but when a microorganism culture sheet is used as the culture medium, a flat bed scanner or a digital camera connected to the main body of the apparatus 100 can be preferably used.
- the flatbed scanner is general-purpose and inexpensive and easy to operate.
- the cultured microorganism culture sheet can be turned over while being fixed to a tray, set on a glass platen of a flatbed scanner, and image data can be scanned according to the usage of the scanner.
- the position of each microorganism culture sheet in the captured image is also substantially fixed, so that the position correction of the image data can be omitted.
- the medium is an agar medium
- light may be irradiated from the lower part of the tray, and the upper part of the agar medium may be imaged with the petri dish covered.
- an image for each tray is taken. By capturing an image for each tray, the tray identifier can be stored in the image.
- the tray identifier can be stored in the image.
- the resolution of the captured image is not particularly limited as long as the tray identifier, the medium identifier can be read and the colony count is possible.
- the captured image is stored in the image storage unit 109. Further, the communication device 106 may store the captured image in the database server 114 connected to the microorganism testing device 100 via an electric communication network such as the Internet.
- FIG. 15 is a flowchart showing the colony counting process executed by the microorganism testing apparatus 100.
- the microbe inspection apparatus 100 starts the colony counting process shown in FIG. 15 when detecting that the input device 105 has received an instruction to start the colony counting process by the operator, for example.
- the CPU 101 obtains a captured image stored in image storage unit 109 (step S201).
- the acquisition source of the captured image is typically the imaging device 108, but may be an external device or server with which the storage device 104, the image storage unit 109, and the communication device 106 can communicate.
- the captured image is an image obtained by capturing an image of the tray cultured for a predetermined time after the operator fixed the medium on the predetermined tray and inoculated with the bacterial solution according to the display content of step S105 of the first embodiment.
- the CPU 101 adjusts the tray image included in the captured image to a predetermined position according to the position recognition marker, or according to the coordinate axis of the captured image, when the acquired captured image has a position recognition marker indicating the top and bottom or left and right.
- the color tone correction process may be executed with reference to this color sample arrangement.
- the CPU 101 stores the acquired captured image in the RAM 103.
- CPU101 will acquire the tray identifier displayed on the tray image of a captured image, if the process of step S201 is completed about one captured image (step S202).
- the relationship between the captured image and the pixel coordinates is shown in FIG. FIG. 16 illustrates a case where 300 dpi, the image size of the tray is 2480 ⁇ 3508 Pixels, and the upper left of the image is the origin (0, 0).
- the position of the tray identifier included in the image is stored and managed in the storage device 104 or the like.
- the CPU 101 is set to recognize a rectangle having two corners of coordinates (1600, 1150) and (1900, 1330) as diagonal corner coordinates as the image position of the tray identifier, and is stored in the storage device 104. Yes. In FIG. 16, this rectangle is indicated by a broken line. In this area, “1” is displayed.
- the CPU 101 reads the rectangular image and converts it into character information using an optical character recognition program stored in the storage device 104.
- the CPU 101 stores the converted character information in the RAM 103.
- CPU101 will complete
- in-tray position identifiers are assigned to the eight medium images according to the arrangement of the tray position identifiers in the tray set in the first embodiment, and are acquired as in-tray position identifiers of the medium images.
- CPU101 memorize
- an integer of “1” to “4” is sequentially added from the upper row and the horizontal left end to the right end, and from the lower row and the horizontal left end.
- the integers “5” to “8” are set so as to be assigned as tray position identifiers in order toward the right end, and these settings are stored in the storage device 104.
- the CPU 101 stores, in the storage device 104 or the like, a program that classifies the captured image for each medium image on the basis of the coordinates of the captured image, corresponding to the setting stored in the storage device 104. As shown in FIG.
- the upper left corner coordinates of the culture medium image are (0, 0), (877, 0), (1754, 0), and (2631, 0).
- the lower right corner coordinates are (877, 1140), (1754, 1140), (2631, 1140), and (3508, 1140), respectively.
- the partial coordinates are (0, 1340), (877, 1340), (1754, 1340), (2631, 1340), and the lower right corner coordinates are (877, 2480), (1754, 2480), ( 2631, 2480) and (3508, 2480), and four areas divided by rectangles are divided into a total of eight areas.
- the storage device 104 is set to add “1” to “8” as tray position identifiers in the above-described order to the eight regions of the captured image.
- the CPU 101 sets “1” as an in-tray position identifier to the culture medium image in a region divided by a rectangle in which the upper left corner coordinate is (0, 0) and the lower right corner coordinate is (877, 1140). And obtained as a position identifier in the tray corresponding to the culture medium image.
- the CPU 101 refers to the sample database for the medium image specified by the tray identifier “1” and the tray position identifier “1”, and corresponds to the tray identifier “1” and the tray position identifier “1”.
- the fungus identifier to be acquired is acquired (step S204).
- the CPU 101 is made to recognize the position recognition marker included in the captured image in advance, perform alignment, and / or store the medium image by dividing into predetermined sections based on the position recognition marker. It may be stored in the device 104.
- Information on the bacterial liquid identifier is stored in the storage device 104 as a specimen database.
- the CPU 101 collates the information on the tray identifier and tray position identifier of the medium image with the information shown in the display items “tray identifier” and “tray position identifier” of the sample database, and information on the tray identifier and the tray position identifier. Is searched for, and “0901” is identified as the fungus identifier associated with the tray identifier “1” and the in-tray position identifier “1”, and “0901” is associated with the medium image. Obtained as a liquid identifier.
- the CPU 101 stores the acquired bacterial liquid identifier in, for example, the RAM 103.
- CPU101 performs colony count based on the said image about a culture medium image after completion
- colonies can be counted by detecting pixels corresponding to the colonies of the medium contained in the image data.
- TPE triphenylformazan
- TTC triphenyltetrazolium chloride
- the CPU 101 stores, for example, the RAM 103 in the RAM 103, the number of colonies in the medium image assigned with “1” as the tray position identifier.
- the tray identifier and the tray position identifier specified by the fixed position specifying unit 30 the tray identifier acquired from the culture image, the tray position identifier of the culture image, and the count The relationship with the number of colonies made is shown.
- the number of colonies in the medium image corresponding to the bacterial liquid identifier “0901” was set to “136”.
- step S205 When step S205 is completed for the medium image assigned with “1” as the tray position identifier, the CPU 101 has the upper right corner coordinates (877, 0) and the lower left corner coordinates (1754, 1140). Is assigned to the medium image divided into rectangles as a position identifier in the tray, is acquired as a position identifier in the tray corresponding to the medium image, and is stored in, for example, the RAM 103 (step S203). Next, in the same manner as the medium image to which “1” is assigned as the tray position identifier, the corresponding fungal fluid identifier is acquired (step S204), and the colonies are counted (step S205).
- the CPU 101 sequentially determines the position in the tray for the medium image specified in the above eight regions with reference to the coordinates of the captured image. “3”... “N” are assigned as identifiers, acquired as in-tray position identifiers corresponding to the culture medium images, and stored in, for example, the RAM 103 (step S203).
- the corresponding bacterial liquid identifier is acquired (step S204), and the colonies are counted (step S205).
- colony count is not performed.
- the CPU 101 determines whether or not there is a medium image in an area to which no tray position identifier is assigned (step 206). If there is a medium image to which no tray position identifier is assigned, the tray position identifier is assigned according to the above, and steps S204 and S205 are executed. On the other hand, if there is no medium image to which the tray position identifier is not assigned, the number of colonies is stored in the storage device 104 in association with the bacterial liquid identifier (step 207). In addition, you may preserve
- step S207 the CPU 101 confirms the presence or absence of an unprocessed captured image or confirms whether the operator has continued or not (step 208). If there is an unprocessed captured image, steps S201 to S207 are executed. If there is no unprocessed captured image, the colony counting process is terminated (step 209).
- the culture medium identifier is a two-dimensional code and is input and updated via a code reader
- the CPU 101 reads an image in the display area with a two-dimensional code reading program stored in the storage device 104 in advance, and serves as a tray identifier for the captured image. For example, it is stored in the RAM 103. Thereafter, steps S202 to S209 are executed in the same manner as described above.
- the tray identifier is a two-dimensional code and is input and updated via a code reader
- the CPU 101 reads an image in the display area with a two-dimensional code reading program stored in advance in the storage device 104, and as a tray identifier of the captured image, For example, it is stored in the RAM 103. Thereafter, steps S202 to S209 are executed in the same manner as described above.
- the microorganism culture apparatus includes a culture medium table in which test items are associated with types of media to be used in advance, and the culture medium type specifying unit 20 is based on the test items input by the input information acquiring unit 10. You may identify the culture medium corresponding to a microbe identifier from a table.
- An example of such a medium table is shown in FIG.
- the test item is associated with the abbreviation of the type of the medium to be used, the culture conditions such as the culture temperature and the culture time of the medium, the properties of the generated colonies, and a suitable inspection target product.
- FIG. 18 there are a culture medium in which all foods are tested for counting the number of coliforms and a food for which the target food is specialized for mineral forter.
- a culture medium table in which a test item, a medium type, and other information are associated in advance is stored in the storage device 104 of the microorganism testing apparatus, and programmed so that the type of the medium corresponding to the test item or the inspection target product can be specified. By storing various settings in the storage device 104, it is possible to specify a culture medium suitable for the purpose of inspection.
- the test items, the type of medium, the number of colonies, the medium image, and the like are stored in a unified manner corresponding to the bacterial liquid identifier, so that a report can be easily created.
- the medium is not limited to a microorganism culture sheet or an agar medium, and may be a so-called stamp medium that can be used in the stamp agar method. If the shape of the tray is adjusted in accordance with the shape of the culture medium, the microorganism test can be performed using various culture media.
- Microbiological testing devices can be implemented with so-called personal computers and photocopiers such as photocopiers and conventional microbiological culture devices, so they can be installed in any facility that requires microbiological testing, such as a food manufacturing factory or hospital. it can.
- the microorganism culture device displays a tray for fixing the medium for each bacterial liquid identifier
- the medium and bacterial liquid must be prepared according to the displayed contents and the microorganism test can be performed without describing the sample number or dilution factor on the medium. Can be useful.
- 100 microbiological testing device 10 input information acquisition unit, 20 medium type identification unit, 30 fixed position identification unit, 40 display control unit, 50 storage unit, 60 image acquisition unit, 70 fungal fluid identifier acquisition unit, 80 image processing unit, 90 Colony counting unit, 101 CPU, 102 ROM, 103 RAM, 104 storage device, 105 input device, 106 communication device, 107 imaging control unit, 108 imaging device, 109 image storage unit, 110 display control unit, 111 display device, 112 audio Processing unit, 113 audio output device, 114 database server, 120 bus, 200 tray, 300 agar medium tray, 350 microorganism culture sheet tray, 410 agar medium, 500 microorganism culture sheet, 501 substrate sheet, 502 culture layer, 503 Cover sheet 504 medium identifier, 505 medium identification color bar
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Abstract
Description
本発明は、トレイに固定された培地の微生物検査装置に関する。 The present invention relates to a microorganism testing apparatus for a medium fixed to a tray.
日本の食品衛生法では、食肉製品や魚肉ねり製品など特定の食品について細菌学的成分規格を設定し、食肉製品であれば、一般生菌数、大腸菌群数、大腸菌数、黄色ブドウ球菌数などが所定の基準に適合することを要求している。寒天培地による計数が公定法として採用されているが、寒天培地に代えて各種の微生物培養シートも開発されている。このような微生物培養シートとして例えば、多孔質マトリックス層と水溶性高分子化合物層とからなる培地積層物を粘着シートに接着し、その上に透明フィルムを被せた構造のシート状培地がある(特許文献1)。 The Japanese Food Sanitation Law sets bacteriological component standards for specific foods such as meat products and fish paste products. For meat products, the number of general viable bacteria, coliforms, coliforms, Staphylococcus aureus, etc. Is required to meet certain standards. Counting with an agar medium has been adopted as an official method, but various microorganism culture sheets have been developed in place of the agar medium. As such a microorganism culture sheet, for example, there is a sheet-like culture medium having a structure in which a medium laminate composed of a porous matrix layer and a water-soluble polymer compound layer is adhered to an adhesive sheet and a transparent film is covered thereon (patented) Reference 1).
寒天培地、微生物培養シート、その他の微生物検査用培地のいずれを使用するかに係わらず、微生物試験では、記録作業と計数作業とが並行して行われる。ここに記録作業とは、検体に関する情報を台帳などに記録する作業をいい、たとえば検体番号、検体の採取日、採取場所、採取者、検体の希釈倍率、計数対象の微生物名、計数したコロニー数などを検体番号ごとに記載する作業をいう。また、計数作業とは、検査項目に適する培地を準備し、希釈菌液の調製、菌液の培地への接種、培養操作、培養後のコロニーの計数作業などをいう。 Regardless of whether an agar medium, a microorganism culture sheet, or other microorganism testing medium is used, the recording operation and the counting operation are performed in parallel in the microorganism test. Here, the recording operation refers to an operation for recording information about a sample in a ledger or the like. For example, a sample number, a sample collection date, a collection location, a sampler, a sample dilution rate, a microorganism name to be counted, and the number of colonies counted. This refers to the work of listing each sample number. In addition, the counting work refers to preparation of a medium suitable for a test item, preparation of a diluted bacterial solution, inoculation of the bacterial solution into the medium, culture operation, counting of colonies after culture, and the like.
微生物検査の記録作業において、計数したコロニー数と検体とを対応させるため、あるいは接種する検体の希釈倍率を特定するため、培地に検体番号や希釈倍率を記入する必要がある。例えば、寒天培地を使用する場合にはシャーレの蓋部にペンで検体番号や希釈倍率を記載し、またはこのような内容がわかるようにシールやテープなどを添付する。次いで、検体番号が付されたシャーレの蓋を取り、対応する菌液を接種し、所定時間の培養を行った後にコロニーを計数する。これにより、計数結果を検体番号と対応させて記録することができる。 In the microbiological test recording work, it is necessary to enter the sample number and the dilution rate in the culture medium in order to match the counted number of colonies with the sample or to specify the dilution rate of the inoculated sample. For example, when an agar medium is used, the specimen number and dilution rate are written with a pen on the petri dish lid, or a seal or tape is attached so that such contents can be understood. Next, the petri dish with the sample number attached is removed, the corresponding bacterial solution is inoculated, and after culturing for a predetermined time, colonies are counted. Thereby, the counting result can be recorded in correspondence with the sample number.
微生物検査は作業工程が多いが、上記した微生物コロニーの計数を自動化する技術は公知である。例えば、生物学的生育培地の1つ以上の画像データを受信するステップと、受信した画像データを解析して、生物学的生育培地内のコロニーの第1の数を同定するステップと、生物学的生育培地の周辺部のコロニーの第2の数を同定するステップと、第1の数が閾値未満である場合に、生育培地の生育領域縁からの画定された距離内の1つ以上のコロニーを第2の数から除外するステップとを含む、コロニーの自動計数方法が知られている(特許文献2)。また、生物学的生育培地を一枚ずつスキャニング装置に投入し、その画像データを形成し、得られた画像データを外部コンピュータに送信し、当該コンピューターがコロニーを計数するという技術も提案されている。 Microorganism inspection has many work processes, but the technology for automating the counting of microbial colonies described above is known. For example, receiving one or more image data of a biological growth medium; analyzing the received image data to identify a first number of colonies in the biological growth medium; Identifying a second number of colonies around the growth medium and one or more colonies within a defined distance from a growth region edge of the growth medium if the first number is less than a threshold value A method of automatically counting colonies including a step of excluding from the second number is known (Patent Document 2). In addition, a technique has been proposed in which biological growth medium is put into a scanning device one by one, the image data is formed, the obtained image data is transmitted to an external computer, and the computer counts colonies. .
微生物検査では、予め調製した菌液を培地へ接種し、培養し、およびコロニーを計数するなどの工程があるが、コロニーカウンターを使用すれば計数工程を自動化することができる。しかしながら、計数する寒天培地と検体番号とを対応させるため、予め寒天培地に検体番号などを記載する工程を省くことはできない。 In the microbiological examination, there are steps such as inoculating a culture solution prepared in advance into a culture medium, culturing, and counting colonies. If a colony counter is used, the counting step can be automated. However, since the agar medium to be counted is associated with the specimen number, it is not possible to omit the step of previously describing the specimen number on the agar medium.
また、微生物培養シートには、バーコードなどのシート固有の識別子が付与されているものがある。菌液接種時に菌液の検体情報と、菌液を接種する微生物培養シートのバーコードの情報とを対応してコンピューターに保存すると、培養およびコロニー計数後に前記バーコードを指標として対応する検体を割り出し、当該レコードにコロニー数を保存することができる。しかしながらこの場合であっても、菌液接種の際に、菌液を接種する微生物培養シートに当該菌液の検体番号などを記載する必要がある。 Also, some microorganism culture sheets are given a unique identifier such as a barcode. If the sample information of the bacterial solution at the time of inoculating the bacterial solution and the barcode information of the microorganism culture sheet inoculated with the bacterial solution are stored in a computer, the corresponding sample is determined using the barcode as an index after culture and colony counting. The number of colonies can be stored in the record. However, even in this case, at the time of inoculating the bacterial solution, it is necessary to describe the sample number of the bacterial solution on the microorganism culture sheet to inoculate the bacterial solution.
一方、微生物培養シートは、一般に縦90mm、横70mm程度、重さ10g未満の小型、軽量体であり動きやすいため、接種作業を安定して行うことが容易でない。上記問題は、微生物培養シートをより大きなトレイに固定することで解決されうる。しかも、トレイに複数の微生物培養シートを固定すれば、培養装置への搬入搬出操作も効率的に行うことができる。しかしながら、検体番号とコロニー数とを対応して記録するために微生物培養シートごとに検体番号を記載したりバーコードを読み取って保存するのは、操作が煩雑である。 On the other hand, since the microorganism culture sheet is generally a small, lightweight body with a length of about 90 mm, a width of about 70 mm, and a weight of less than 10 g, it is not easy to stably perform the inoculation work. The above problem can be solved by fixing the microorganism culture sheet to a larger tray. In addition, if a plurality of microorganism culture sheets are fixed to the tray, it is possible to efficiently carry in and out the culture apparatus. However, in order to record the sample number and the number of colonies correspondingly, it is troublesome to describe the sample number for each microorganism culture sheet or to read and store the barcode.
これに対し、寒天培地を固定するトレイと培養装置とコロニー計数装置とが一体化された装置を使用し、トレイに複数の検体を収納すれば、トレイごと培養温度に加温でき、かつトレイに収納したまま各培地のコロニーを自動計数できるため、検体情報と計数したコロニー数とを一元管理することができる。しかしながら上記態様は、トレイと培養装置とコロニー計数装置とを一体化された装置の利用を前提とするものであり、大量の検体を処理するには多数の装置が必要となり、実用的でない。しかも、菌液接種の際に培地と検体とを対応させるため、培地に予め検体番号などを記載する必要がある。 On the other hand, if a tray in which an agar medium is fixed, a culture device, and a colony counting device are used and a plurality of specimens are stored in the tray, the tray can be heated to the culture temperature and the tray can be heated. Since the colonies of each medium can be automatically counted while being stored, the specimen information and the counted number of colonies can be centrally managed. However, the above aspect is premised on the use of an apparatus in which a tray, a culture apparatus, and a colony counting apparatus are integrated, and a large number of apparatuses are required to process a large amount of specimens, which is not practical. Moreover, in order to make the culture medium correspond to the specimen at the time of inoculating the bacterial solution, it is necessary to describe the specimen number and the like in advance in the culture medium.
このように、従来から、微生物検査を自動化すべく種々の改良がなされているが、寒天培地や微生物培養シートなどの培地に、検体番号を記載せずに大量の検体を処理しうる装置は存在せず、微生物検査の計数作業を煩雑にする一因となっている。 As described above, various improvements have been made so far to automate the microbiological examination. However, there is an apparatus that can process a large amount of specimens on a medium such as an agar medium or a microorganism culture sheet without describing specimen numbers. Therefore, it is one factor that complicates the counting work of the microbial test.
上記現状に鑑み、本発明は、培地に検体番号や菌液の希釈倍率を記載することなく培地と検体とを対応させて微生物検査を行うことができ、さらに、計数したコロニー数を検体情報と対応付けて保存できる微生物検査装置を提供することを目的とする。 In view of the above-mentioned present situation, the present invention can carry out a microbial test by associating a culture medium with a specimen without describing the specimen number or the dilution rate of the bacterial solution in the culture medium, and further, the counted colony count as specimen information. An object of the present invention is to provide a microorganism testing apparatus that can be stored in association with each other.
微生物検査では、検査項目に対応する培地に検体の希釈菌液を接種してコロニーを発生させ、コロニーを計数する。例えば、ある検体について一般生菌数をデュープリケートで計数する場合には、一般生菌数用の培地2枚にそれぞれ菌液を接種する。培地に接種する菌液を特定する識別子を「菌液識別子」とすれば、2枚の培地に異なる菌液識別子が割り当てられる。本発明者らは、微生物検査について詳細に検討した結果、トレイに複数の培地を固定することで培養装置への培地の搬入搬出操作を簡略化できること、検体を培地に接種する菌液毎に菌液識別子で管理し、微生物検査装置が、菌液識別子と当該菌液識別子に対応する検体情報に基づいて培地の種類を特定し、かつこの培地を固定するトレイおよびトレイ内の前記培地の固定位置を特定しおよびこれらの情報を表示すれば、作業者はこの表示を見ながら培地をトレイに固定し菌液を接種できるため、従来のように培地に検体番号などを記入することなく作業できること、および菌液識別子とトレイ及びトレイ内の固定位置情報とを関連付けて保存すれば、培地を固定したトレイの画像を撮像し、撮像画像に含まれる培地画像に基づいてコロニーを計数し、および前記培地画像の固定位置情報とを照合することで対応する菌液識別子を検出し、計数したコロニー数を菌液識別子と対応付けて保存できることなどを見出し、本発明を完成させた。 In microbiological examination, inoculate the culture medium corresponding to the test item with the diluted bacterial solution of the specimen to generate colonies, and count the colonies. For example, when counting the number of general viable bacteria in a duplicate for a sample, the bacterial solution is inoculated on each of the two media for the number of general viable bacteria. If the identifier for identifying the bacterial solution to be inoculated on the medium is “bacterial solution identifier”, different bacterial solution identifiers are assigned to the two culture media. As a result of examining the microorganism test in detail, the present inventors can simplify the operation of carrying in and out the medium to and from the culture apparatus by fixing a plurality of culture media to the tray, and the bacteria for each bacterial solution inoculating the specimen with the culture medium. Managed by the liquid identifier, the microorganism testing apparatus identifies the type of medium based on the bacterial liquid identifier and the sample information corresponding to the bacterial liquid identifier, and a tray for fixing the medium, and the fixing position of the medium in the tray If this information is specified and the information is displayed, the operator can fix the medium on the tray and inoculate the bacterial solution while observing this display. If the fungus identifier and the fixed position information in the tray and the tray are stored in association with each other, an image of the tray on which the medium is fixed is captured, and the colony is based on the medium image included in the captured image. Counting and detecting the corresponding bacterial liquid identifier by collating with the fixed position information of the culture medium image, finding that the counted number of colonies can be stored in association with the bacterial liquid identifier, and completed the present invention .
すなわち本発明は、トレイに固定された培地の微生物検査を行うための微生物検査装置であって、
検体の菌液は、前記菌液毎に菌液識別子が割り当てられるものであり、
前記菌液識別子と前記菌液識別子により特定される菌液を検査する検査項目とを入力する入力手段と、
前記入力手段で入力された検査項目に基づいて前記菌液識別子により特定される菌液を接種する培地の種類を特定する培地種類特定手段と、
前記培地種類特定手段で特定された種類の培地を固定するトレイを特定するトレイ識別子と前記トレイ内で前記培地を固定する位置を特定するトレイ内位置識別子とを特定する固定位置特定手段と、
前記菌液識別子と、前記培地種類特定手段で特定された培地の種類を示す情報とを、前記固定位置特定手段によって特定された前記トレイ識別子と前記トレイ内位置識別子と共に表示する表示手段と、
前記トレイ識別子と前記トレイ内位置識別子とを、前記菌液識別子と対応付けて保存する保存手段とを備える、微生物検査装置を提供するものである。
That is, the present invention is a microorganism testing apparatus for performing microorganism testing of a medium fixed to a tray,
The bacterial solution of the specimen is one in which a bacterial solution identifier is assigned for each bacterial solution,
Input means for inputting the test item for inspecting the bacterial solution specified by the bacterial solution identifier and the bacterial solution identifier;
Medium type specifying means for specifying the type of medium inoculated with the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier based on the test item input by the input means;
A fixed position specifying means for specifying a tray identifier for specifying a tray for fixing the type of medium specified by the medium type specifying means, and a position identifier in the tray for specifying a position for fixing the medium in the tray;
Display means for displaying the bacterial cell identifier and information indicating the type of medium specified by the medium type specifying means together with the tray identifier specified by the fixed position specifying means and the position identifier in the tray;
The present invention provides a microorganism testing apparatus comprising storage means for storing the tray identifier and the in-tray position identifier in association with the fungus liquid identifier.
また本発明は、前記入力手段が、さらに前記菌液識別子により特定される菌液の希釈倍率が入力されるものであり、
前記表示手段は、前記菌液識別子と、前記培地の種類を示す情報と共に、前記菌液識別子により特定される菌液の希釈倍率を表示するものである、前記微生物検査装置を提供するものである。
In the present invention, the input means further inputs a dilution rate of the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier,
The display means provides the microorganism testing apparatus, which displays the bacterial liquid identifier and the dilution rate of the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier together with information indicating the type of the culture medium. .
また本発明は、前記入力手段が、前記菌液識別子に対応する培地を固定するトレイを特定するトレイ識別子の入力を受け付けるものであり、
前記保存手段は、前記固定位置特定手段によって特定された前記トレイ識別子を、前記入力手段により受け付けたトレイ識別子で更新するものである、前記微生物検査装置を提供するものである。
In the present invention, the input means accepts an input of a tray identifier for specifying a tray for fixing a medium corresponding to the bacterial liquid identifier,
The storage means provides the microorganism testing apparatus, which updates the tray identifier specified by the fixed position specifying means with the tray identifier received by the input means.
また本発明は、前記表示手段で表示される固定位置に従って前記培地を固定した前記トレイの撮像画像を取得する撮像画像取得手段と、
前記撮像画像取得手段で取得したトレイ画像に表示されたトレイ識別子と、前記トレイ画像に表示される培地画像の前記トレイ画像内での位置を示す情報とを取得し、これらを前記保存手段によって保存されたトレイ識別子とトレイ内位置識別子と照合して対応する菌液識別子を特定し、前記培地画像の菌液識別子として取得する菌液識別子取得手段と、
前記菌液識別子取得手段で取得した菌液識別子に対応する培地画像のコロニーを計数するコロニー計数手段とを備え、
前記保存手段は、前記コロニー計数手段によるコロニー数を、前記培地画像に対応する前記菌液識別子と対応付けて保存するものである、前記微生物検査装置を提供するものである。
Further, the present invention provides a captured image acquisition unit that acquires a captured image of the tray in which the culture medium is fixed according to a fixed position displayed by the display unit;
The tray identifier displayed on the tray image acquired by the captured image acquisition unit and the information indicating the position of the culture medium image displayed on the tray image in the tray image are acquired and stored by the storage unit The corresponding tray identifier and the position identifier in the tray are identified to identify the corresponding bacterial liquid identifier, and the bacterial liquid identifier acquisition means for acquiring the bacterial liquid identifier of the medium image;
A colony counting unit that counts colonies of the medium image corresponding to the bacterial liquid identifier acquired by the bacterial liquid identifier acquisition unit;
The storage means provides the microorganism testing apparatus, which stores the number of colonies obtained by the colony counting means in association with the bacterial liquid identifier corresponding to the medium image.
また本発明は、更に、検査項目と使用する培地の種類とを対応づけた培地テーブルを備え、
前記培地種類特定手段は、前記入力手段で入力された検査項目に基づいて前記培地テーブルから前記菌液識別子に対応する培地を特定するものである、前記微生物検査装置を提供するものである。
The present invention further includes a culture medium table that associates the test item with the type of culture medium to be used,
The culture medium type identification means provides the microorganism testing apparatus, which identifies a culture medium corresponding to the bacterial liquid identifier from the culture medium table based on the test item input by the input means.
本発明によれば、装置が作業者による入力情報に基づいて菌液の検査に好適な培地を特定し、かつ菌液を特定する菌液識別子と共に培地の種類および前記培地を固定するトレイとトレイに固定する培地の固定位置情報を表示するなど微生物検査の支援を行うため、作業者は、培地に検体番号などを付することなく検査対象の菌液を接種することができる。 According to the present invention, the apparatus specifies a medium suitable for the inspection of the bacterial solution based on information input by the operator, and the type of medium and the tray for fixing the medium together with the bacterial solution identifier for specifying the bacterial solution. In order to support microorganism testing such as displaying information on the fixed position of the medium to be fixed on the operator, the operator can inoculate the culture medium without subjecting the medium with a specimen number or the like.
また、本発明によれば、培地を固定したトレイを培養した後、微生物培養装置でトレイ全体を撮像させると、撮像画像に含まれる培地画像に基づいてコロニーを計数し、トレイ上の培地の位置と計数したコロニー数とを対応付けて保存できるため、人為的なミス無く、極めて簡便に測定結果を取得することができる。 Further, according to the present invention, after culturing a tray on which a medium is fixed, when the whole tray is imaged with a microorganism culture apparatus, colonies are counted based on the medium image included in the captured image, and the position of the medium on the tray And the counted number of colonies can be stored in association with each other, so that measurement results can be obtained very easily without human error.
本発明は、一般生菌数用、大腸菌群用、大腸菌数、黄色ブドウ球菌数用などの培地に菌液を接種し、培養後の培地に発生するコロニーを計数する微生物検査を実施する装置である。培地をトレイに固定して菌液を接種し、および培養、撮像することを特徴とする。検査対象の検体の菌液に、培地に接種する菌液毎に「菌液識別子」を割り当てるものとする。従って、菌液識別子を「n」とすれば、当該菌液識別子「n」に対応する菌液「n」と、当該菌液「n」を接種する培地「n」とが一義的に特定される。同じ検体から調製される菌液でも、例えば一般生菌数用に3枚の培地を使用する場合は、例えば、「n1」、「n2」、「n3」という異なる菌液識別子が菌液に付与され、当該菌液識別子により菌液を接種する培地が特定される。
作業者が微生物検査装置に菌液識別子と前記菌液識別子により特定される菌液の検査項目とを入力すると、当該装置が入力された検査項目に基づいて前記菌液識別子に対応する培地組成などで識別される培地の種類が特定し、および、前記培地を固定するトレイと、前記トレイ内の前記培地を固定する位置を示す識別子(以下、トレイ内位置識別子と称する。)とを特定する。当該装置は、前記菌液識別子と前記菌液識別子に対応する培地の種類とを、この培地を固定するトレイ識別子およびトレイ内位置識別子とともに表示するため、作業者は、培地に菌液識別子その他を記入することなく菌液を接種することができる。このトレイを培養装置に搬入すると、所定の培養を行うことができる。
微生物検査装置が、撮像画像取得手段と、撮像画像に基づいてコロニーを計数するコロニー計数手段とを備えると、培養後のトレイを撮像させ、得られた撮像画像に表示されるトレイ識別子やトレイ画像内の培地画像の固定位置の情報を取得させ、保存手段で保存されたトレイ識別子やトレイ内位置識別子と照合させることで対応する菌液識別子を取得できる。更に、培地画像に基づいてコロニー計数を行なわせると、当該コロニー数を、前記取得した菌液識別子と対応付けて保存することができる。
The present invention is an apparatus for carrying out a microbial test for inoculating a bacterial solution into a medium for general viable count, coliform group, coliform count, Staphylococcus aureus, etc., and counting colonies generated in the cultured medium. is there. A culture medium is fixed to a tray, inoculated with a bacterial solution, cultured, and imaged. A “bacterial fluid identifier” is assigned to the bacterial solution of the specimen to be examined for each bacterial solution inoculated into the medium. Therefore, if the bacterial liquid identifier is “n”, the bacterial liquid “n” corresponding to the bacterial liquid identifier “n” and the culture medium “n” inoculating the bacterial liquid “n” are uniquely identified. The For example, when using three culture media for the number of general viable bacteria, different bacterial fluid identifiers such as “n1”, “n2”, and “n3” are given to the bacterial fluid, even if they are prepared from the same specimen. Then, the medium for inoculating the bacterial solution is specified by the bacterial solution identifier.
When an operator inputs a bacterial liquid identifier and an inspection item of the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier to the microorganism testing apparatus, the medium composition corresponding to the bacterial liquid identifier based on the inspection item input by the apparatus The type of the medium identified in (1) is specified, and a tray for fixing the medium and an identifier (hereinafter, referred to as an in-tray position identifier) indicating a position for fixing the medium in the tray are specified. The apparatus displays the bacterial liquid identifier and the type of medium corresponding to the bacterial liquid identifier together with the tray identifier and the tray position identifier for fixing the medium. Bacteria solution can be inoculated without filling in. When this tray is carried into the culture apparatus, predetermined culture can be performed.
When the microbiological examination apparatus includes a captured image acquisition unit and a colony counting unit that counts colonies based on the captured image, the tray identifier or the tray image displayed on the obtained captured image is imaged after the culture is performed. The information on the fixed position of the medium image in the inside is acquired, and the corresponding bacterial solution identifier can be acquired by collating with the tray identifier stored in the storage means or the position identifier in the tray. Furthermore, when colony counting is performed based on the medium image, the number of colonies can be stored in association with the acquired bacterial liquid identifier.
(1)ハードウェア構成
撮像手段およびコロニー計数手段とを備えた微生物検査装置100のハードウェア構成の実施態様の一例を示す図1を用いて説明する。図1に示すように微生物検査装置100は、CPU(Central Processing Unit)101、ROM(Read Only Memory)102、RAM(Random Access Memory)103、記憶装置104、入力装置105、通信装置106、撮像制御部107、画像記憶部109、表示制御部110、音声処理部112、コードリーダー115を備える。微生物検査装置100が備えるこれらの構成要素は、バス120により相互に接続される。なお、撮像制御部107には、撮像装置108が接続される。また、表示制御部110には、表示装置111が接続される。また、音声処理部112には、音声出力装置113が接続される。そして、通信装置106には、インターネットのデータベースサーバ114が接続される。
(1) Hardware Configuration A description will be given with reference to FIG. 1 showing an example of an embodiment of a hardware configuration of a
CPU101は、微生物検査装置100の全体の動作を制御する。なお、CPU101は、ROM102に格納されているプログラムに従って動作し、RAM103をワークエリアとして使用する。
The
ROM102には、微生物検査装置100の全体の動作を制御するためのプログラムやデータが記憶される。
The
RAM103は、CPU101のワークエリアとして機能する。つまり、CPU101は、RAM103にプログラムやデータを一時的に書き込み、これらのプログラムやデータを適宜参照する。
The
CPU101とROM102とRAM103とは、制御部を構成する。制御部は、バス120に接続された各部を制御して、培地種類の特定、培地を固定する固定位置の特定などを行う。
The
記憶装置104は、プログラムや撮像画像、後記する検体データベース、培地テーブル、固定位置情報テーブルその他のパラメータなどを記憶する。また、バーコードや二次元コード読み取り処理を行うプログラムや光学文字認識処理を行うプログラムやデータを記憶する。記憶装置104は、内蔵型の記憶装置であってもよいし、リムーバル型の記憶装置であってもよい。記憶装置104は、例えば、ハードディスク装置、メモリカードを備えるメモリカードスロット、CD-ROM(Compact Disk Read Only Memory)を備えるCD-ROMドライブなどにより構成される。
The
入力装置105は、作業者などの操作入力を受け付ける装置である。入力装置105は、例えば、マウス、キーボード、タッチスクリーン、コードリーダー、コントローラ、ボタンなどにより構成される。
The
通信装置106は、CPU101による制御のもと、無線通信もしくは有線通信により、微生物検査装置100の外部の装置などと通信を確立し、データを受信したり送信したりする。例えば、通信装置106は、インターネットなどの電気通信網を介して微生物検査装置100に接続されたデータベースサーバ114から、撮像装置108などにより撮像された撮像画像を受信する。通信装置106は、NIC(Network Interface Card)、USB(Universal Serial Bus)ポートなどにより構成される。
The
撮像制御部107は、CPU101による制御のもと、撮像制御部107に接続された撮像装置108を制御する。撮像制御部107は、例えば、撮像開始指示、撮像終了指示などを示す制御信号を撮像装置108に送信することにより、撮像装置108の動作を制御する。また、撮像制御部107は、例えば、解像度、露光時間、明るさなどの撮像設定を撮像装置108に送信することにより、撮像条件を撮像装置108に設定する。そして、撮像制御部107は、撮像装置108により取得された撮像画像を、撮像装置108から受信する。
The
撮像装置108は、被写体を撮像し、この被写体を示す撮像画像を生成する。撮像装置108は、撮像制御部107から供給される制御信号に従って、被写体を撮像する。撮像装置108は、生成した撮像画像を撮像制御部107に送信する。撮像画像は、例えば、各画素が、R(Red)の輝度値とG(Green)の輝度値とB(Blue)の輝度値とにより表されるカラー画像である。ただし、撮像画像は、各画素が1つの輝度値により表されるモノクロ画像であってもよい。撮像画像は、例えば、ディジタルデータにより表される。また、撮像画像のアスペクト比や解像度は、適宜調整が可能である。撮像装置108は、ディジタルカメラ、ディジタルビデオカメラ、フラットベッドスキャナ、専用リーダなどにより構成される。
The
なお、撮像装置108による撮像の被写体は、トレイに培地を固定し、菌液を接種し培養した後のトレイである。図1では、寒天培地用シャーレ400を6個固定した寒天培地用トレイ300が図示されている。撮像装置108は、このトレイを撮像して、撮像画像を生成する。撮像画像は、例えば、300dpi、2472×3496Pixels、2.7Mbytesである。ただし、解像度等はこの例に限定されない。
Note that the subject to be imaged by the
画像記憶部109は、撮像装置108から取得された撮像画像、記憶装置104に記憶されている撮像画像、もしくは、通信装置106により外部の装置から取得された撮像画像などを記憶する。画像記憶部109は、例えば、フラッシュメモリなどにより構成される。
The
表示制御部110は、CPU101による制御のもと、表示装置111を制御する。例えば、表示制御部110は、表示装置111に表示させる画像を表す画像信号を生成し、生成した画像信号を表示装置111に供給する。
The
表示装置111は、表示制御部110から供給された画像信号に基づく画像を表示する。表示装置111は、例えば、LCD(Liquid Crystal Display)や有機EL(Electro Luminescence)などにより構成される。表示装置111は、タッチスクリーンであってもよい。タッチスクリーンは、表示装置として機能するほか、入力装置105としても機能する。
音声処理部112は、CPU101から供給されたディジタルオーディオ信号をD/A(Digital/Analog)コンバータ(図示せず)でアナログオーディオ信号に変換して、音声出力装置113に供給する。音声処理部112は、CPU101から供給されたディジタルオーディオ信号に各種処理を加えるDSP(Digital Signal Processor)を含んでもよい。
The
音声出力装置113は、音声処理部112から供給されたアナログオーディオ信号を音声に変換して、出力する。音声出力装置113は、例えば、スピーカにより構成される。音声出力装置113は、ディジタルオーディオ信号またはアナログオーディオ信号を増幅する増幅装置を含んでもよい。
The
(2)トレイおよび培地
微生物検査装置を使用して行う微生物検査では、作業者が培地を固定するトレイを用いることを前提とする。培地としては寒天培地や微生物培養シート、その他の平板培地を広く使用することができる。培地の形状等によってトレイへの固定方法が相異する。例えば、寒天培地を使用する場合の寒天培地用トレイ300を図2に示す。図2(a)は6個の寒天培地用シャーレを固定しうる方形の寒天培地用トレイ300の平面図であり、図2(b)は図2(a)のA-A線断面図であり、図2(c)は、寒天培地410を充填したシャーレ400を載置したトレイの断面図である。シャーレの蓋部413が寒天培地用トレイ300の突起305に係止されかつ位置が固定されている。図2(a)~(c)に示すように、トレイ300は、平板に貫通孔303が形成され、かつ貫通孔303の辺縁部に、貫通孔の中心部に向けて突出する突起305が形成され、突起305によって寒天培地410を収納したシャーレ400が係止できるように構成されている。微生物検査では、通常、シャーレの天地を逆転し、シャーレ400の蓋部413を下にして培養する。このため、突起305によりシャーレ400の蓋部413の外周が係止される。貫通孔303を形成することで、下部から光を照射し、上部から寒天培地内で増殖したコロニーを撮像することができる。なお、寒天培地用トレイ300の形状は、方形であっても円盤状その他であってもよい。寒天培地用トレイ300に固定する培地のサイズに限定はない。従って、使用するシャーレ400のサイズに応じて異なるサイズの培地を固定しうるものであってもよい。更に、シャーレの蓋部の外周に1以上の突出部が形成されたものを使用する場合には、突出部と嵌着しうる凹部が形成されたトレイを使用することができる。トレイに嵌着部を形成することで、シャーレの装着を可能とし、かつ蓋部の回転を防止することができる。
寒天培地用トレイ300の材質に限定はないが、複数のシャーレ400を固定しうる強度を有するものを広く使用することができる。たとえば、アルミなどの金属や、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリエステルなどの合成樹脂が好適である。
(2) Tray and culture medium It is assumed that an operator uses a tray on which a culture medium is fixed in a microbiological test performed using a microbiological test apparatus. As the medium, an agar medium, a microorganism culture sheet, and other plate media can be widely used. The method of fixing to the tray differs depending on the shape of the medium. For example, FIG. 2 shows an
The material of the
本発明では、培地として微生物培養シートを使用することができ、寒天培地用トレイ300とは異なるトレイを使用する。図3に、微生物培養シートの一例を示す。図3(a)は平面図、図3(b)は断面図である。図3(b)に示すように、微生物培養シート500は、基材シート501と、基材シート501の上面に形成された培養層502と、培養層502を被覆するカバーシート503とが積層されたものである。図3(a)では、培養層502が基材シート501の略中央に配設されているが基材シート501の全面に培養層502が形成されるものであってもよい。本発明で使用する微生物培養シート500として、一般生菌数用は赤、大腸菌は緑、黄色ブドウ球菌は黄色などで表示する培地識別カラーバー505などが表示されていてもよい。培地識別カラーバー505により、培養層の種類をその外観から目視により判別することができる。また、その表面に微生物培養シート固有の識別子(以下単に、培地識別子と称する。)504が表示されるものであってもよい。
In the present invention, a microorganism culture sheet can be used as a medium, and a tray different from the
このような微生物培養シート500を固定するためのトレイ(以下、「培養シート用トレイ」と称する場合がある。)350を図4に例示する。図4に示す培養シート用トレイ350は、暗色の縁取りの内側に、横4マスずつ2段となる仕切り線(L)で区切られた8つの区画(a)が形成されたものである。区画(a)のそれぞれに微生物培養シート500を固定することができる。培養シート用トレイ350は、微生物培養シート500を固定する位置を特定できれば、仕切り線(L)は無くても良い。例えば、固定すべき位置に対応して微生物培養シート500の角部を挿入するスリット(b)などを形成すれば、仕切り線(L)が無くても固定位置を特定することができる。スリット(b)や仕切り線(L)は、培養シート用トレイ350の材質に応じて適宜選択することができる。仕切り線(L)は、印刷のほか、エンボス加工の凹凸などで形成されるものであってもよい。図4では、仕切り線(L)とスリット(b)との双方を有する態様を示す。培養シート用トレイ350の材質は、紙のほか、合成樹脂、金属、これらの複合材などである。
FIG. 4 illustrates a
培養シート用トレイ350への微生物培養シートの固定方法は、培養シート用トレイ350の材質などに応じて適宜選択することができる。図4では、微生物培養シートの角部を挿入しうるスリット(b)を形成する培養シート用トレイ350の態様を示したが、このようなスリット(b)に代えて微生物培養シートの角部を固定するフォトコーナー等を形成するものや、粘着剤層が有するものであってもよい。微生物培養シートを固定した後は、培養シート用トレイ350を裏返した場合にも微生物培養シートが外れない程度の固定力を確保しうることが好ましい。後記するように、スラットベッドスキャナでは、培養シート用トレイ350を裏返して撮像するからである。なお、図4では、横に4マスずつ2段、合計8つの区画が形成される一例を示したが、横に3マスずつ2段、合計6つの区画や、前記した横置きに変えて縦置きとして横に2マスずつ4段、合計8つの区画を形成したもの、横に2マスずつ3段、合計6つの区画を形成したもの、その他、固定する微生物培養シートの形状、その後の撮像手段などに応じて適宜選択することができる。
The method for fixing the microorganism culture sheet to the
培地を固定するトレイは、固定する培地の種類に係わらずその表面にトレイ固有の識別子(以下、「トレイ識別子」と称する)が付されたものを好適に使用できる。トレイ識別子としては、シリアルナンバーの他、バーコード、二次元コード、文字、数字、絵、その他の記号などがある。図2に、寒天培地用トレイ300の略中央に、トレイ識別子としてシリアルナンバー「1」が表示される態様を示す。トレイ識別子がシリアルナンバーであればヒトによる視認が容易であり、表示手段によって特定されたトレイを作業者が容易に準備することができる。後記するように、トレイ識別子がトレイの表面に付されると、撮像画像にもトレイ識別子が含まれるため、このトレイ識別子と撮像画像に含まれる各培地画像のトレイ画像内の固定位置情報とを取得し、これらの情報と保存手段で保存された固定位置の情報とを参照して対応する菌液識別子を特定することができる。培地画像の菌液識別子を特定し、培地画像に基づいてコロニーを計数した後に、当該コロニー数を前記菌液識別子と対応付けて保存することができる。
As the tray for fixing the medium, a tray with an identifier unique to the tray (hereinafter referred to as “tray identifier”) can be suitably used regardless of the type of the medium to be fixed. Examples of the tray identifier include a serial number, a bar code, a two-dimensional code, letters, numbers, pictures, and other symbols. FIG. 2 shows a mode in which the serial number “1” is displayed as the tray identifier at the approximate center of the
更に、トレイには、天地や左右を示す位置認識マーカーなど付されるものであっても良い。このような位置認識マーカーを参照することで画像の位置合わせを行うことができ、撮像画像の処理の効率化を図ることができる。 Furthermore, the tray may be attached with a position recognition marker indicating the top and bottom or left and right. By referring to such a position recognition marker, it is possible to perform image alignment and to improve the efficiency of processing of the captured image.
更に、トレイには、色補正用のカラーチャートやグレースケールなどの色見本配列表などを表示してもよい。トレイのサイズに限定はないが、たとえばJIS規格のA4判やB4判を例示することができる。培養装置への搬入、搬出、および撮像が容易だからである。 Furthermore, a color chart for color correction or a color sample arrangement table such as gray scale may be displayed on the tray. Although there is no limitation on the size of the tray, for example, JIS standard A4 size and B4 size can be exemplified. This is because it is easy to carry in and out of the culture apparatus and to image.
後記するように、微生物検査装置は、トレイ内における培地を固定する位置をトレイ内位置識別子で特定する。トレイにおけるトレイ内位置識別子の特定に限定はない。例えば、横4列、縦2行、合計8枚の培地を固定しうるトレイにおいて、上段、横左端から右端に向かって順に、1~4の整数を、下段、横左端から右端に向かって順に、5~8の整数をトレイ内位置識別子として割り当てることができる。このようなトレイ内位置識別子の特定は微生物検査装置の記憶装置104などに保存されるものである。従って、トレイ内位置識別子は、トレイに付される必要はない。
As will be described later, the microorganism testing apparatus identifies the position where the medium is fixed in the tray by the position identifier in the tray. There is no limitation on the specification of the position identifier in the tray. For example, in a tray that can fix a total of 8 media in 4 rows and 2 rows, in the order of the upper row, from the left side to the right end, in the order of
図5に、トレイ識別子「1」が明示された培養シート用トレイ350の8つの区画の全てに微生物培養シート500を固定した態様の一例を示す。
FIG. 5 shows an example of a mode in which the
(3)機能的構成
次に、微生物検査装置100の機能的な構成について説明する。図6に示すように、微生物検査装置100は、入力情報取得部10、培地種類特定部20、固定位置特定部30、表示制御部40、記憶部50、画像取得部60、菌液識別子取得部70、画像処理部80、コロニー計数部90、を備える。微生物検査装置100は、作業者の微生物検査を支援しうる点で微生物検査支援装置ともいうべきものである。
(3) Functional Configuration Next, a functional configuration of the
入力情報取得部10は、入力装置105から作業者が入力した入力情報を取得する。入力情報としては、検体の取得日、検体から調製した菌液の菌液識別子、菌液識別子で特定される菌液の検査項目、菌液の希釈倍率などの情報がある。また、コードリーダー115からバーコードや二次元コードなどの情報を、入力情報とすることもできる。入力情報取得部10が取得した入力情報は、例えばRAM103や記憶部50に記憶される。入力情報取得部10は、例えば、CPU101を含む。
The input
培地種類特定部20は、入力情報取得部10が取得した菌液識別子により特定される菌液の検査項目に基づいて、前記菌液の検査に好適な培地の種類を特定する。検査項目に対応する培地が一種類しか存在しない場合、入力された検査項目により一義的に培地の種類が特定される。培地種類特定部20は、例えば、CPU101を含む。
The culture medium
固定位置特定部30は、培地種類特定部20が特定した種類の培地を固定するトレイを特定するトレイ識別子と、前記培地を固定する当該トレイ内の培地の固定位置を特定するトレイ内位置識別子とを前記菌液識別子と対応して特定する。従って、培地の固定位置は、トレイ識別子とトレイ内位置識別子とによって特定される。固定位置特定部30によって特定された前記トレイ識別子およびトレイ内位置識別子とは、菌液識別子と対応してRAM103や記憶部50に記憶される。固定位置特定部30は、例えば、CPU101を含む。
The fixed
表示制御部40は、入力情報取得部10が取得した菌液識別子と、当該菌液識別子に対応して培地種類特定部20で特定された培地の種類を示す情報とを、菌液識別子に対応して固定位置特定部30が特定したトレイ識別子およびトレイ内位置識別子と共に表示装置111に表示する。前記表示は、菌液識別子ごとに行ってもトレイ識別子毎に行ってもよい。さらに、入力情報として前記菌液識別子により特定される菌液の希釈倍率が入力された場合には、前記菌液識別子と共に、当該菌液識別子により特定される菌液の希釈倍率を表示する。表示制御部40は、例えば、CPU101、表示制御部110を含む。
The
記憶部50は、入力情報取得部10が取得した入力情報を記憶し、更に、固定位置特定部30が取得したトレイ識別子、トレイ内位置識別子などの固定位置情報、画像取得部60が取得し、画像処理部80に保存される画像、コロニー計数部90が計数したコロニー数などを菌液識別子に対応して記憶する。記憶部50は、例えば、RAM103や記憶装置104により構成される。なお、記憶部50として、インターネットなどの電気通信網を介して通信装置60に接続されるデータベースサーバ114を含めることもできる。
The
画像取得部60は、撮像装置108が撮像した、または、データベースサーバ114の記憶部から通信装置106を介して、培地を培養した後のトレイ全体の様子を示す画像を取得する。画像取得部60は、例えば、CPU101を含む。
The
菌液識別子取得部70は、撮像画像に表示されるトレイ画像に表示されるトレイ識別子と撮像画像に含まれる前記培地画像の前記トレイ画像内での培地の位置を示す情報とを取得する。次いで、前記取得したトレイ識別子とトレイ内の培地の固定位置情報とを記憶部50に記憶された前記固定位置情報のトレイ識別子およびトレイ内位置識別子と照合してこれらに対応する菌液識別子を取得する。菌液識別子取得部70は、例えば、CPU101を含む。
The bacterial liquid
画像処理部80は、画像取得部60で取得した撮像画像について座標軸などを基準として位置合わせを行い、記憶部50に内蔵された色見本を基準として色調整を行う。さらに撮像画像に表示されるトレイ画像に表示される培地画像ごとの切出し処理を行う。画像処理部80は、例えば、CPU101を含む。
The
コロニー計数部90は、切出された培地画像に基づいて、培地に含まれるコロニーの個数を計数する。コロニー計数部90は、例えば、CPU101を含む。
The
(4)実施態様1
以下、微生物検査装置100により、微生物検査を実施する好適な実施態様の1例を説明する。
培地は、それぞれAC、CC、SAと略称される一般生菌数、大腸菌群、黄色ブドウ球菌の寒天培地を使用する。微生物検査装置100の培地種類特定部20は、入力情報取得部10で取得した検査項目が「一般生菌数」である場合に「AC」を選択し、大腸菌群に対して「CC」を選択し、黄色ブドウ球菌に対して「SA」を選択するよう設定され、記憶装置104などに記憶されている。なお、前記「AC」は一般生菌数を計数するに適した培地組成の略号であり、「CC」および「SA」は、それぞれ大腸菌群、黄色ブドウ球菌を計数するに適した培地組成の略号である。
トレイの表面略中央には、トレイ毎にトレイ識別子が「1」,「2」,「3」・・・「n」の整数で表出されている。微生物検査装置100の固定位置特定部30は、トレイを特定する際に、トレイ識別子「1」から昇順に割り当てるよう設定され、記憶装置104などに記憶されている。
前記トレイは、横に4マスずつ2段、合計8つの区画が形成されるものである。微生物検査装置100の固定位置特定部30は、前記トレイの8つの区画に対し、上段、横左端から右端に向かって順に「1」~「4」の整数を、下段、横左端から右端に向かって順に「5」~「8」の整数をトレイ内位置識別子として付与するよう設定され、記憶装置104などに記憶されている。
さらに、微生物検査装置100の固定位置特定部は、検査項目が同じで、隣接する菌液識別子に対応する培地は、トレイの同一列の上下に固定するようトレイ内位置識別子を選択するように設定され、記憶装置104などに記憶されている。
以上の設定条件の下、図7の検査依頼内容に示す、2011年7月11日に製造3課で製造されたパンを検体とし、前記検体を希釈倍率1/10で希釈して調製した菌液を、検査項目毎に試験数「2」で計数する場合で微生物検査装置を説明する。
(4)
Hereinafter, an example of a preferred embodiment in which the
As the medium, an agar medium of general viable cell count, coliform group, and Staphylococcus aureus abbreviated as AC, CC and SA, respectively. The culture medium
In the approximate center of the surface of the tray, a tray identifier is represented by an integer of “1”, “2”, “3”... “N” for each tray. When the tray is specified, the fixed
The tray is formed in two rows of 4 squares in total, for a total of 8 sections. The fixed
Furthermore, the fixed position specifying unit of the
Bacteria prepared by diluting the specimen at a dilution ratio of 1/10 using the bread produced in July 3rd, 2011, as shown in the contents of the inspection request in FIG. The microorganism testing apparatus will be described in the case where the liquid is counted by the test number “2” for each test item.
図8は、微生物検査装置100の実行内容のフローチャートである。微生物検査装置100は、例えば、作業者による処理開始指示が入力装置105に受け付けられたことを検知すると、図8に示す処理を開始する。
FIG. 8 is a flowchart of execution contents of the
まず、CPU101は、予め記憶装置104などに記憶させた検体データベースを入力画面として表示するよう表示制御部40に指示する。図9に、検体データベースの一例を示す。本発明では、培地に接種する菌液ごとに菌液識別子を割り当てる。図7に示すように、製造3課で製造したパンを検体とし、一般生菌数、大腸菌群、黄色ブドウ球菌とをそれぞれデュープリケートで計数する場合には、一般生菌数、大腸菌群、黄色ブドウ球菌の3種類の培地をそれぞれ2枚ずつ使用する。各培地に接種する菌液は合計6個の異なる菌液識別子で特定される。検体データベースは、少なくとも菌液識別子と前記菌液識別子で特定される菌液の検査項目とを表示項目とするものであり、菌液識別子毎に1レコードとし、前記菌液識別子に関する各種の情報が入力できるように構成されている。前記検体データベースの表示項目としては、菌液識別子のほか、菌液識別子で特定される菌液を調製する前の検体の採取日、採取場所、採取者、前記菌液の検査項目などに関する情報などを含めることができる。更に、検体が食品である場合には、当該食品の賞味期限や製造日、保管条件などを表示項目に設定し、記憶装置104などに記憶させることができる。作業者は、表示装置111が示す検体データベースの表示項目に対応して入力装置105から、少なくとも菌液識別子と前記菌液識別子で特定される菌液の検査項目に対応する内容を入力する。なお、検体データベースは、菌液識別子をシリアルナンバーで昇順に表示するよう設定されるものであってもよい。このような設定は予め記憶装置104にプログラムを保存し、実行させることができる。
First, the
CPU101は、入力装置105から作業者によって入力された、または設定により自動的に選択表示された菌液識別子「0901」~「0906」の各菌液識別子に対する情報を入力情報として取得する(ステップS101)。CPU101は、前記入力情報をRAM103や記憶装置104に記憶する。
The
CPU101は、ステップS101の処理を終了すると、菌液識別子「0901」に対応する菌液を接種する培地の種類を特定する(ステップS102)。菌液識別子「0901」に対応する検査項目は「一般生菌数」である。微生物検査装置100の培地種類特定部20は、入力情報取得部10で取得した検査項目が「一般生菌数」である場合に「AC」を特定し、大腸菌群に対して「CC」を特定し、黄色ブドウ球菌に対して「SA」を特定するよう設定され、記憶装置104などに記憶されている。CPU101は、菌液識別子「0901」に対応する菌液を接種する培地の種類として、「AC」を特定する。次に、図10に示すように、菌液識別子「0902」に対し、一般生菌数として「AC」と称される種類の培地を特定し、以下同様に、菌液識別子「0903」、「0904」に対し食品の大腸菌群数を計数する「CC」と称される培地を特定し、菌液識別子「0905」、「0906」に対し全食品の黄色ブドウ球菌を計数する「SA」と称される種類の培地を順次特定する。CPU101は、菌液識別子に対応して特定した培地の種類を前記菌液識別子と対応してRAM103に記憶する。
When the
次いでCPU101は、入力された全ての菌液識別子についてステップS102の処理を終了すると、菌液識別子「0901」に対応する菌液を接種する培地を固定するためのトレイを特定するトレイ識別子を取得する(ステップS103)。微生物検査装置100の固定位置特定部30は、トレイを特定する際に、トレイ識別子「1」から昇順に割り当てるように設定され、記憶装置104などに記憶されている。従って、CPU101は、菌液識別子「0901」に対し、トレイ識別子「1」を取得する。次いで、菌液識別子「0902」~「0906」に対し、それぞれトレイ識別子「1」を順次取得する。CPU101は、取得したトレイ識別子を菌液識別子と関連づけてRAM103に記憶する。
Next, when the
次いで、CPU101は、菌液識別子「0901」に対応して取得したトレイ識別子「1」で特定されるトレイに、菌液識別子「0901」に対応する菌液を接種する培地を固定する位置を特定するためのトレイ内位置識別子を取得する(ステップS104)。微生物検査装置100は、トレイの8つの区画のトレイ内位置識別子の配置として、上段、横左端から右端に向かって順に「1」~「4」の整数を、下段、横左端から右端に向かって順に「5」~「8」の整数を割り当てるよう設定され、かつ検査項目が同じで隣接する菌液識別子は、トレイの上下にトレイ内位置識別子を割り当てるように設定され、記憶装置104などに記憶されている。従って、CPU101は、菌液識別子「0901」に対してトレイ内位置識別子「1」を割り当てる。その後、CPU101は、菌液識別子「0902」に対してトレイ内位置識別子「5」を割り当て、以下同様に、菌液識別子「0903」,「0904」に対してトレイ内位置識別子「2」,「6」を、菌液識別子「0905」,「0906」に対してトレイ内位置識別子「3」,「7」を割り当てる。菌液識別子「0901」に対応する菌液を接種する培地「AC」は、トレイ識別子「1」で特定されるトレイの、トレイ内位置識別子「1」によって特定される位置に固定するように特定される。CPU101は、例えば、割り当てたトレイ内位置識別子を菌液識別子と対応してRAM103に記憶する。また、記憶装置104の検体データベースの一部として記憶してもよい。
Next, the
図10に、検体データベースに、菌液識別子毎に、菌液識別子により特定される菌液を接種する培地の種類と、培地を固定するトレイ識別子およびトレイ内位置識別子とが保存された態様を示す。図10では、トレイ識別子およびトレイ内位置識別子が「固定位置情報」として保存され、固定位置情報と共に培地情報として培地の種類を示す略号が保存されている。 FIG. 10 shows an aspect in which the type of medium inoculated with the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier, the tray identifier for fixing the medium, and the position identifier in the tray are stored in the specimen database for each bacterial liquid identifier. . In FIG. 10, the tray identifier and the in-tray position identifier are stored as “fixed position information”, and an abbreviation indicating the type of medium is stored as the medium information together with the fixed position information.
CPU101は、入力された全ての菌液識別子に対してトレイ内位置識別子を割り当てると、トレイ識別子毎に、トレイ内位置識別子、各トレイ内位置識別子に固定する培地の種類、培地に接種する菌液の菌液識別子とを表示するよう、表示制御部40に指示する(ステップS105)。表示内容の一例を図11に示す。図11は、CPU101が割り当てたトレイ識別子、トレイ内位置識別子、これらに対応する菌液識別子、菌液識別子により特定される菌液を接種する培地の種類の略称、菌液の希釈倍率が表形式で表示される一例である。なお、使用するトレイを特定するトレイ識別子は、略中央に明示されている。
When the
表示形式は、図11に示す表形式に限定されず、例えば図12に例示するように、使用するトレイや寒天培地など、実物に近似する画像をもって表示してもよい。図12では、培地を固定しない区画に[欠」の文字が表記され、培地不添付が明瞭に表示されるよう工夫されている。なお、図12では、培地の種類を略号「AC」、「CC」、「SA」などで表示したが、予め「AC」は黄色、「CC」は青、「SA」は赤など、培地の領域をカラーで表示してもよい。CPU101は、例えば、表示内容をRAM103に記憶する。
The display format is not limited to the table format shown in FIG. 11, and may be displayed with an image that approximates the real thing, such as a tray or an agar medium used, for example, as illustrated in FIG. 12. In FIG. 12, it is devised so that the letters “Miss” are indicated in a section where the culture medium is not fixed, and the medium non-attachment is clearly displayed. In FIG. 12, the type of medium is indicated by abbreviations “AC”, “CC”, “SA”, etc., but “AC” is yellow, “CC” is blue, “SA” is red, etc. The area may be displayed in color. For example, the
CPU101は、トレイ識別子「1」を割り当てた全ての菌液識別子について、トレイ内位置識別子、各トレイ内位置識別子に固定する培地の種類、培地に接種する菌液の菌液識別子とを表示するよう、表示制御部40に指示した後、トレイ識別子「2」が割り当てられた菌液識別子の有無を確認する(ステップS106)。トレイ識別子「2」が割り当てられた未表示の菌液識別子が存在する場合、当該トレイ識別子「2」についてステップS105を実行する。未表示の菌液識別子の有無の確認は、未表示の菌液識別子が割り当てられたトレイ識別子「n」が存在しなくなるまで行う。
The
CPU101は、トレイ識別子「n」が割り当てられた未表示の菌液識別子が存在しないと判別すると、菌液識別子毎に対応するトレイ識別子、トレイ内位置識別子、トレイ内位置識別子で特定される位置に固定する培地の種類を検体データベースとして記憶装置104に保存する(ステップS107)。CPU101は、通信装置106から、インターネットなどの電気通信網を介して微生物検査装置100に接続されたデータベースサーバ114に検体データベースを保存してもよい。保存後、上記処理を終了する。
When the
上記態様は、菌液識別子が6個で、1枚のトレイに菌液識別子に対応する培地を固定することができるものであるため、CUP101は、全菌液識別子に対してステップS101を終了した後にステップS102を実行し、全菌液識別子に対してステップ102を終了した後にステップS103を実行し、同様に全菌液識別子に対してそれぞれのステップを実行するものであった。しかしながら、予め培地の種類毎に異なるトレイ識別子を割り当てるように設定した場合や、菌液識別子が9個を超える場合など、2枚以上のトレイを使用する必要がある。このように複数のトレイを使用する場合には、例えば、トレイ識別子「n」について上記ステップS103~ステップS106を行い、次いでトレイ識別子「n+1」について上記ステップS103~ステップS106を行ってもよい。この場合は、図8と相違し、未表示のトレイ識別子「n」が割り当てられた菌液識別子が存在する場合は、ステップS103に戻り、当該トレイ識別子「n」についてステップS103~ステップS106を繰り返す。未表示のトレイ識別子「n」が存在しないと判別すると、CPU101は、菌液識別子毎に、対応するトレイ識別子、トレイ内位置識別子などの固定位置情報、トレイ内位置識別子に固定する培地の種類を検体データベースとして記憶装置104に保存する(ステップS107)。
In the above embodiment, since the number of bacterial liquid identifiers is six and the medium corresponding to the bacterial liquid identifier can be fixed to one tray, the
微生物検査装置100によれば、ステップS105により表示装置111に菌液識別子とこの菌液識別子に対応する培地の種類が、トレイ識別子およびトレイ内位置識別子と共に表示される。従って、作業者は、この表示内容に従いトレイ識別子が付与されたトレイを用意し、トレイ内位置識別子の示す位置に培地を固定することができる。
According to the
(5)変形例1
上記実施態様1は、ステップS101で入力情報を取得すると、この入力情報に基づいてステップS102~ステップS107を実施するものであった。しかしながら、変形例1は、ステップS105で培地の種類と菌液識別子、および対応する培地を固定するトレイ識別子とトレイ内位置識別子とを表示した後に、CPU101が作業者による入力を受け付け、当該入力された情報でトレイ識別子の情報を更新する態様である。
(5)
In the first embodiment, when input information is acquired in step S101, steps S102 to S107 are performed based on the input information. However, in the first modification, the
微生物検査装置100の記憶装置104は、固定位置特定部30が特定したトレイ内位置識別子を、作業者が入力装置105を介して入力したトレイ内位置識別子「1」で特定される位置に固定された培地の二次元コードで更新するよう予め設定され、記憶している。培地識別子は、培地の表面に付されたものであれば、シリアルナンバーであってもよく、二次元コードなどであってもよい。以下、培地識別子が二次元コードの場合で説明する。
The
実施態様1と同様に、CPU101は、ステップS101からステップS105を実行する。CPU101は、菌液識別子とこの菌液識別子に対応する培地の種類を、トレイ識別子「1」およびトレイ内位置識別子と共に表示するよう表示制御部40に指示する(ステップS105)。
As in the first embodiment, the
作業者は、装置の表示内容に係わらず、トレイ内位置識別子の配列が実施形態1で使用するトレイと同じトレイを使用し、表示内容で示すトレイ内位置識別子で特定される位置に培地を固定する。この培地の表面には、培地識別子が付されている。 The operator uses the same tray as the tray used in the first embodiment for arranging the position identifiers in the tray regardless of the display contents of the apparatus, and fixes the medium at the position specified by the position identifier in the tray indicated by the display contents. To do. A medium identifier is attached to the surface of the medium.
トレイに培地を固定した後、作業者は、トレイ内位置識別子「1」の位置に固定した培地の培地識別子をコードリーダーなどの入力装置105や撮像装置108で読み取る。CPU101は、入力装置105や撮像装置108による培地識別子の情報を受け付け、CPU101が割り当てたトレイ識別子「1」を、この培地識別子の情報で更新する(ステップS105’)。CPU101は、培地識別子で更新されたトレイ識別子をRAM103に記憶する。
After fixing the medium on the tray, the operator reads the medium identifier of the medium fixed at the position of the tray position identifier “1” with the
CPU101は、ステップS105’に次いで、実施態様1と同様に、トレイ識別子「2」が割り当てられた菌液識別子の有無を確認する(ステップS106)。トレイ識別子「2」が割り当てられた未表示の菌液識別子が存在する場合、当該トレイ識別子「2」についてステップS105およびステップS105’を実行する。
Next to step S105 ', the
CPU101は、トレイ識別子「n」が割り当てられた未表示の菌液識別子が存在しないと判別すると、菌液識別子毎に対応するトレイ識別子、トレイ内位置識別子などの固定位置情報、トレイ内位置識別子で特定される位置に固定する培地の種類を検体データベースとして記憶装置104に保存する(ステップS107)。保存後、上記処理を終了する。図13に、変形例1で保存された検体データベースの一例を示す。図13では、培地識別子の二次元コードを二次元コードAとして表示する。
When the
変形例1によれば、作業者は、CPU101が割り当てたトレイ識別子に制限されることなくトレイを使用することができる。いずれのトレイでも任意に選択して使用できるため、トレイの準備が簡単で作業効率に優れる。なお、更新する培地識別子の情報は、トレイ内位置識別子「1」に固定されたものに限定されず、いずれのトレイ内位置識別子で特定された位置に由来するものであってもよい。ただし、予め、微生物検査装置100に、更新用の培地識別子の情報を取得する培地のトレイ内位置識別子が保存されていることを条件とする。
According to the first modification, the worker can use the tray without being limited to the tray identifier assigned by the
(6)変形例2
ステップS105で培地の種類と菌液識別子、および対応する培地を固定するトレイ識別子とトレイ内位置識別子とを表示した後に、CPU101が作業者による入力を受け付け、当該入力された情報でトレイ識別子の情報を更新する他の態様を変更例2として説明する。変形例2は、作業者が、任意のトレイに培地を固定し、固定後に当該トレイの表面に付されたトレイ識別子を読み取り、当該読み取ったトレイ識別子でCPU101が割り当てたトレイ識別子を更新する態様である。
(6)
In step S105, after displaying the medium type and the bacterial liquid identifier, and the tray identifier and the tray position identifier for fixing the corresponding medium, the
微生物検査装置100の記憶装置104は、固定位置特定部30が特定したトレイ内位置識別子を、作業者が入力装置105を介して入力したトレイの二次元コードで更新するよう予め設定され、記憶している。なお、更新するトレイ識別子は、シリアルナンバーであってもよく、二次元コードなどであってもよい。以下、培地識別子が二次元コードの場合で説明する。
The
実施態様1と同様に、CPU101は、ステップS101からステップS105を実行する。CPU101は、菌液識別子とこの菌液識別子に対応する培地の種類を、トレイ識別子「1」およびトレイ内位置識別子と共に表示するよう表示制御部40に指示する(ステップS105)。
As in the first embodiment, the
作業者は、表示内容に係わらず、トレイ内位置識別子の配列が実施形態1で使用するトレイと同じであるいずれかのトレイを使用し、表示内容で示すトレイ内位置識別子で特定される位置に培地を固定する。このトレイの表面には、トレイ識別子が付されている。 Regardless of the display content, the operator uses any tray whose tray position identifier array is the same as the tray used in the first embodiment, and is in a position specified by the tray position identifier indicated by the display content. Fix the medium. A tray identifier is attached to the surface of the tray.
トレイに培地を固定した後、作業者は、トレイに付された二次元コードをコードリーダーなどの入力装置105や撮像装置108で読み取る。CPU101は、入力装置105や撮像装置108によるトレイ識別子の情報を受け付け、CPU101が割り当てたトレイ識別子「1」を、この二次元コードからなるトレイ識別子の情報で更新する(ステップS105’)。CPU101は、更新されたトレイ識別子をRAM103に記憶する。
After fixing the medium on the tray, the operator reads the two-dimensional code attached to the tray with the
CPU101は、ステップS105’に次いで、実施態様1と同様に、トレイ識別子「2」が割り当てられた未表示の菌液識別子の有無を確認する(ステップS106)。トレイ識別子「2」が割り当てられた菌液識別子が存在する場合、当該トレイ識別子「2」についてステップS105およびステップS105’を実行する。
Next to step S105 ', the
CPU101は、トレイ識別子「n」が割り当てられた未表示の菌液識別子が存在しないと判別すると、菌液識別子毎に対応するトレイ識別子、トレイ内位置識別子などの固定位置情報、トレイ内位置識別子で特定される位置に固定する培地の種類を検体データベースとして記憶装置104に保存する(ステップS107)。図14に、変形例2で保存された検体データベースの一例を示す。保存後、処理を終了する。図14では、更新したトレイ識別子の二次元コードを二次元コードBとして表示する。
When the
変形例2によれば、作業者は、CPU101が割り当てたトレイ識別子に制限されることなくトレイを使用することができる。いずれのトレイでも任意に選択して使用できるため、トレイの準備が簡単で作業効率に優れる。トレイ識別子は、トレイの表面に付されたものであれば、二次元コードに限定されず、バーコードやシリアルナンバーなどであってもよい。
According to the second modification, the worker can use the tray without being limited to the tray identifier assigned by the
(7)応用
CPU101によるトレイ識別子の割り当て方法は、検査項目や培養時間などが同じ菌液の菌液識別子に同じトレイ識別子が割り当てられるように設定してもよい。このような設定は予めプログラムを記憶装置104に記憶させ、CPU101に実行させることができる。また、CPU101が、微生物検査のスタート時に、いずれの設定で実施するかを作業者に選択させるように設定してもよい。
(7) Application The method of assigning tray identifiers by the
トレイ内位置識別子の割り当て方法も同様である。予め、培地を固定する位置などの異なるトレイ毎にトレイ内位置識別子の配置を保存した固定位置情報テーブルを記憶装置104に保存し、微生物検査のスタート時に、または、ステップS102の終了時に作業者がトレイタイプを選択できるように設定してもよい。CPU101は、当該選択したトレイタイプに関する情報を取得し、この取得情報に従ってステップS103以降を実施する。
The method for assigning tray position identifiers is the same. A fixed position information table in which the arrangement of the position identifiers in the tray is stored in advance for each different tray such as the position where the medium is fixed is stored in the
さらに、ステップS105により割り当て内容を表示した後、CPU101は、作業者が表示内容のいずれかを変更できるように設定してもよい。例えば、前記図12では、トレイ内位置識別子「7」に菌液識別子「0906」に対応する培地「SA」が固定されるよう表示されている。このような場合、作業者が、入力装置105からトレイ内位置識別子「4」に、菌液識別子「0906」に対応する培地「SA」を入力すると、CPU101は、この入力情報を受け付け、菌液識別子「0906」のトレイ内位置識別子の情報を「4」に更新する。次いで、CPU101は、更新された内容を再表示するよう表示制御部40に指示する。CPU101は、更新情報をRAM103に記憶する。CPU101は、入力情報、固定位置情報(トレイ識別子、更新されたトレイ内位置識別子)を検体データベースとして記憶装置104に保存する(ステップS107)。
Furthermore, after displaying the assignment contents in step S105, the
(8)菌液接種および撮像処理
作業者は、微生物培養装置100の表示に従いトレイに培地を固定し、菌液識別子により特定される菌液を接種した後、トレイごと培養装置に搬送し培養する。菌液の接種は、寒天培地を使用する場合、平板塗沫法に限定されず、混釈法であってもよい。
(8) Bacterial fluid inoculation and imaging processing The operator fixes the medium on the tray according to the display of the
作業者は、培養経過中または培養後に撮像装置108によりトレイの画像を撮像する。所定培養時間経過後に培養装置から搬出したトレイを撮像装置108にて撮像することで、コロニー数の経時変化を評価することができる。なお、複数のトレイを撮像する際は、天地を同じ向きにするとトレイに含まれる培地とトレイ内位置識別子との対応が容易となる。
The operator takes an image of the tray with the
撮像装置108としては、トレイや培地によって適宜選択しうるが、培地として微生物培養シートを使用する場合は、フラットベッドスキャナやデジタルカメラを装置100本体と接続したものを好適に使用することができる。フラットベッドスキャナは、汎用かつ安価であり、その操作も容易である。スキャナによって撮像する場合は、培養後の微生物培養シートをトレイに固定したまま裏返し、フラットベッドスキャナのガラス原稿台にセットして当該スキャナの用法に従って画像データをスキャンすることができる。トレイのサイズが固定されていると、撮像画像における各微生物培養シートの位置も略固定されるため、画像データの位置補正などを省略することができる。
The
一方、培地が寒天培地の場合には、トレイの下部から光を照射し、シャーレの蓋をしたまま上部にある寒天培地を撮像してもよい。この場合もトレイ毎の画像を撮像する。トレイ毎の画像を撮像することで、トレイ識別子を画像中に保存することができる。なお、シャーレの蓋部に水滴が付着してコロニーの計数に影響を与える場合には、予めトレイごと加温するとシャーレ内の水滴が霧散するため、正確にコロニーを撮像することができる。 On the other hand, when the medium is an agar medium, light may be irradiated from the lower part of the tray, and the upper part of the agar medium may be imaged with the petri dish covered. Also in this case, an image for each tray is taken. By capturing an image for each tray, the tray identifier can be stored in the image. In addition, when a water droplet adheres to the cover part of a petri dish and influences the count of colonies, when the whole tray is heated in advance, the water droplet in the petri dish is scattered, so that the colony can be accurately imaged.
撮像画像の解像度としては、トレイ識別子、培地識別子の判読およびコロニー計数が可能であれば、特に制限はない。撮像画像は、画像記憶部109に保存される。また、通信装置106がインターネットなどの電気通信網を介して、微生物検査装置100に接続されたデータベースサーバ114に撮像画像を保存してもよい。
The resolution of the captured image is not particularly limited as long as the tray identifier, the medium identifier can be read and the colony count is possible. The captured image is stored in the
(9)コロニー計数処理
図15は、微生物検査装置100が実行するコロニー計数処理を示すフローチャートである。
(9) Colony Counting Process FIG. 15 is a flowchart showing the colony counting process executed by the
微生物検査装置100は、例えば、作業者によるコロニー計数処理の開始指示が入力装置105に受け付けられたことを検知すると、図15に示すコロニー計数処理を開始する。
The
CPU101は、画像記憶部109に保存された撮像画像を取得する(ステップS201)。撮像画像の取得元は、典型的には、撮像装置108であるが、記憶装置104、画像記憶部109、通信装置106が通信可能な外部の装置やサーバなどであってもよい。
撮像画像は、上記実施態様1のステップS105の表示内容に従って作業者が所定のトレイに培地を固定し菌液を接種した後、所定時間培養したトレイを撮像して得た画像である。CPU101は、取得した撮像画像に天地や左右を示す位置認識マーカーが付されている場合にはこの位置認識マーカーに従い、または撮像画像の座標軸に従い、撮像画像に含まれるトレイ画像を所定の位置へ調整してもよく、画像データに色見本配列表が表示される場合にはこの色見本配列を参照して色調補正処理を実行してもよい。CPU101は、例えば、取得した撮像画像をRAM103に記憶する。
The captured image is an image obtained by capturing an image of the tray cultured for a predetermined time after the operator fixed the medium on the predetermined tray and inoculated with the bacterial solution according to the display content of step S105 of the first embodiment. The
CPU101は、1枚の撮像画像についてステップS201の処理を完了すると、撮像画像のトレイ画像に表示されるトレイ識別子を取得する(ステップS202)。便宜のため、撮像画像とピクセル座標との関係を図16に示す。図16は、300dpi、トレイの画像サイズが2480×3508Pixelsであり、画像の左上を原点(0,0)とした場合で例示する。 CPU101 will acquire the tray identifier displayed on the tray image of a captured image, if the process of step S201 is completed about one captured image (step S202). For convenience, the relationship between the captured image and the pixel coordinates is shown in FIG. FIG. 16 illustrates a case where 300 dpi, the image size of the tray is 2480 × 3508 Pixels, and the upper left of the image is the origin (0, 0).
画像に含まれるトレイ識別子の位置は、記憶装置104などに記憶され管理される。例えば、CPU101は、座標(1600,1150)と(1900、1330)の二点を対角の角部座標とする矩形をトレイ識別子の画像位置と認定するよう設定され、記憶装置104に保存されている。図16ではこの矩形を破線で示す。この領域には「1」と表示されている。CPU101は、上記矩形の画像を読み取り、記憶装置104に保存した光学文字認識プログラムにより文字情報に変換する。CPU101は、変換した文字情報をRAM103に記憶する。
The position of the tray identifier included in the image is stored and managed in the
CPU101は、ステップS202の処理を完了すると、トレイ画像に表示される培地画像を、培地を固定したトレイの区分と等しく撮像座標に基づいて8つの培地画像に区分する。次いで、実施態様1で設定したトレイのトレイ内位置識別子の配置に従って上記8つの培地画像にトレイ内位置識別子を付与し、培地画像のトレイ内位置識別子として取得する。CPU101は、培地画像のトレイ内位置識別子を、例えばRAM103に記憶する(ステップS203)。 CPU101 will complete | finish the process of step S202, and will classify | categorize the culture medium image displayed on a tray image into eight culture medium images based on an imaging coordinate equally with the division of the tray which fixed the culture medium. Next, in-tray position identifiers are assigned to the eight medium images according to the arrangement of the tray position identifiers in the tray set in the first embodiment, and are acquired as in-tray position identifiers of the medium images. CPU101 memorize | stores the position identifier in a tray of a culture medium image, for example in RAM103 (step S203).
実施態様1では、横に4マスずつ2段、合計8つの区画が形成されるトレイについて、上段、横左端から右端に向かって順に「1」~「4」の整数を、下段、横左端から右端に向かって順に「5」~「8」の整数をトレイ内位置識別子として割り当てるよう設定され、この設定は記憶装置104に保存されている。CPU101は、記憶装置104に保存された上記設定に対応して、撮像画像の座標を基準に、撮像画像を培地画像毎に区分するプログラムを記憶装置104などに保存している。
図16に示すように、撮像画像に含まれる培地画像は、培地画像の左上の角部座標が(0,0)、(877,0)、(1754,0)、(2631,0)であり、右下の角部座標がそれぞれ(877,1140)、(1754,1140)、(2631,1140)、(3508,1140)となる矩形で区分される4つの領域と、培地画像の左上の角部座標が(0,1340)、(877,1340)、(1754,1340)、(2631,1340)であり、右下の角部座標がそれぞれ(877,2480)、(1754,2480)、(2631,2480)、(3508,2480)となる矩形で区分される4つの領域との合計8つの領域に区分される。記憶装置104は、撮像画像の上記8領域に対し、上記順にトレイ内位置識別子として「1」~「8」を付するように設定されている。CPU101は、左上の角部座標が(0,0)であり右下の角部座標が(877,1140)となる矩形で区分される領域の培地画像に、トレイ内位置識別子として「1」を付与し、培地画像に対応するトレイ内位置識別子として取得する。
In the first embodiment, for a tray in which a total of 8 sections are formed in two rows of four squares in the horizontal direction, an integer of “1” to “4” is sequentially added from the upper row and the horizontal left end to the right end, and from the lower row and the horizontal left end. The integers “5” to “8” are set so as to be assigned as tray position identifiers in order toward the right end, and these settings are stored in the
As shown in FIG. 16, in the culture medium image included in the captured image, the upper left corner coordinates of the culture medium image are (0, 0), (877, 0), (1754, 0), and (2631, 0). The lower right corner coordinates are (877, 1140), (1754, 1140), (2631, 1140), and (3508, 1140), respectively. The partial coordinates are (0, 1340), (877, 1340), (1754, 1340), (2631, 1340), and the lower right corner coordinates are (877, 2480), (1754, 2480), ( 2631, 2480) and (3508, 2480), and four areas divided by rectangles are divided into a total of eight areas. The
次いで、CPU101は、トレイ識別子「1」とトレイ内位置識別子「1」とで特定された培地画像について、検体データベースを参照して、トレイ識別子「1」とトレイ内位置識別子「1」とに対応する菌液識別子を取得する(ステップS204)。なお、上記は各培地画像の特定に関して撮像画像の左上の角部座標を基準に培地画像を8つに区分する方法を示したが、トレイとして天地や左右を示す位置認識マーカーなど付したものを使用する場合は、予めCPU101に撮像画像に含まれる位置認識マーカーを認識させ、位置合わせを行い、および/または位置認識マーカーを基準に所定の区画に区分して各培地画像を取得するように記憶装置104に保存してもよい。
Next, the
菌液識別子の情報は、検体データベースとして記憶装置104に保存されている。CPU101は、培地画像のトレイ識別子およびトレイ内位置識別子の情報と検体データベースの表示項目「トレイ識別子」および「トレイ内位置識別子」に示される情報とを照合し、トレイ識別子とトレイ内位置識別子の情報とが一致する菌液識別子を検索し、トレイ識別子「1」およびトレイ内位置識別子「1」に対応付けられる菌液識別子として「0901」を特定し、「0901」を当該培地画像に対応する菌液識別子として取得する。CPU101は、取得した菌液識別子を、例えばRAM103に保存する。
Information on the bacterial liquid identifier is stored in the
CPU101は、ステップS204の終了後、培地画像について、当該画像に基づいてコロニー計数を行う(ステップS205)。 CPU101 performs colony count based on the said image about a culture medium image after completion | finish of step S204 (step S205).
コロニーの計数としては、画像データに含まれる培地のコロニーに対応する画素を検出することでコロニーを計数することができる。一般生菌用培地のコロニーを計数する場合には、TTC(トリフェニルテトラゾリウムクロライド)が還元されたTPE(トリフェニルフォルマザン)が赤色コロニーとして観察されるため、画像データの中から、培地に対応する位置に存在する赤色コロニーの画素を選択し、計数すればよい。培地は評価する菌液によって異なるため、予め培地の色やコロニーの色を設定することで、異なる培地のコロニーを正確に計数することができる。なお、コロニーの計数方法は上記に限定されず、従前公知の方法や将来新たに開発されるいずれの方法であってもよい。 As colony counting, colonies can be counted by detecting pixels corresponding to the colonies of the medium contained in the image data. When counting colonies in a medium for general living bacteria, TPE (triphenylformazan) reduced with TTC (triphenyltetrazolium chloride) is observed as a red colony. What is necessary is just to select and count the pixel of the red colony which exists in the position to perform. Since the culture medium varies depending on the bacterial solution to be evaluated, colonies of different culture media can be accurately counted by setting the color of the culture medium and the color of the colony in advance. The colony counting method is not limited to the above, and may be a conventionally known method or any method newly developed in the future.
CPU101は、トレイ内位置識別子として「1」が付与された培地画像のコロニー数を、例えばRAM103に保存する。なお、図17に、菌液識別子「0901」について、固定位置特定部30によって特定されたトレイ識別子とトレイ内位置識別子、および培画像から取得したトレイ識別子と培地画像のトレイ内位置識別子、および計数したコロニー数との関係を示す。菌液識別子「0901」に対応する培地画像のコロニー数を「136」とした。
The
トレイ内位置識別子として「1」が付与された培地画像について、ステップS205を終了すると、CPU101は、右上の角部座標が(877,0)であり、左下の角部座標が(1754,1140)である矩形で区分される培地画像に対し、トレイ内位置識別子として「2」を付与し、培地画像に対応するトレイ内位置識別子として取得し、例えばRAM103に保存する(ステップS203)。次いで、トレイ内位置識別子として「1」が付与された培地画像と同様にして、対応する菌液識別子を取得し(ステップS204)、コロニーを計数する(ステップS205)。
When step S205 is completed for the medium image assigned with “1” as the tray position identifier, the
トレイ内位置識別子として「2」が付与された培地画像について、ステップS205を終了すると、CPU101は、撮像画像の座標を基準として、上記8つの領域で特定される培地画像について、順次、トレイ内位置識別子として「3」・・・「n」を付与し、培地画像に対応するトレイ内位置識別子として取得し、例えばRAM103に保存する(ステップS203)。次いで、トレイ内位置識別子として「1」が付与された培地画像と同様に、対応する菌液識別子を取得し(ステップS204)、コロニーを計数する(ステップS205)。なお、培地画像に付与されたトレイ識別子およびトレイ内位置識別子に対応付けられる菌液識別子が存在しない場合は、コロニーの計数は行わない。
When the step S205 is completed for the medium image assigned “2” as the position identifier in the tray, the
CPU101は、トレイ内位置識別子を付与しない領域の培地画像が存在するか否かを判断する(ステップ206)。トレイ内位置識別子を付与しない培地画像が存在する場合は、上記に従いトレイ内位置識別子を付与し、ステップS204およびステップS205を実行する。一方、トレイ内位置識別子を付与しない培地画像が存在しない場合は、コロニー数を菌液識別子と対応して記憶装置104に記憶する(ステップ207)。なお、コロニー数と共に、撮像画像を保存してもよい。その場合、CPU101は、例えば、培地画像やコロニー計数結果を菌液識別子と対応して表示するよう表示制御部40に指示する。CPU101は、通信装置106からインターネットなどの電気通信網を介して微生物検査装置100に接続されたデータベースサーバ114に、菌液識別子に対応してコロニー数や培地画像を保存してもよい。
CPU101は、1つの撮像画像に含まれる全ての培地画像についてステップS207を終了すると、未処理の撮像画像の有無を確認し、または作業者による継続の有無の入力を確認する(ステップ208)。未処理の撮像画像が存在する場合は、ステップS201~ステップ207を実行する。未処理の撮像画像が存在しない場合は、コロニー計数処理を終了する(ステップ209)。
When the
(10)変形例1
トレイ内位置識別子「1」の位置に固定した培地の培地識別子の二次元コードを読み取り、当該情報で、CPU101が割り当てたトレイ識別子の情報を更新した場合の態様について説明する。変形例1では、撮像画像における、培地識別子の表示領域の座標が予め記憶装置104などに保存されている。
CPU101は、上記ステップS202で、トレイ画像に表示されるトレイ識別子を取得するのに代えて、予め設定した培地識別子の表示領域の座標の画像を読み取りとる。培地識別子は二次元コードでありコードリーダーを介して入力しおよび更新したため、CPU101は、予め記憶装置104に保存された二次元コード読み取りプログラムで表示領域の画像を読み取り、撮像画像のトレイ識別子として、例えばRAM103に記憶する。その後、上記と同様に、ステップS202~209を実行する。
(10)
A mode in which the two-dimensional code of the medium identifier of the medium fixed at the position of the in-tray position identifier “1” is read and the information of the tray identifier assigned by the
In step S <b> 202, the
(11)変形例2
CPU101が割り当てたトレイ識別子「1」の情報を、トレイに付された二次元コードの情報で更新した場合の態様について説明する。変形例2では、撮像画像における、トレイ識別子の表示領域の座標が予め記憶装置104などに保存されている。
CPU101は、上記ステップS202で、トレイ画像に表示されるトレイ識別子を取得するに代えて、予め設定したトレイ識別子の表示領域の座標の画像を読み取りとる。トレイ識別子は二次元コードでありコードリーダーを介して入力しおよび更新したため、CPU101は、予め記憶装置104に保存された二次元コード読み取りプログラムで表示領域の画像を読み取り、撮像画像のトレイ識別子として、例えばRAM103に記憶する。その後、上記と同様に、ステップS202~209を実行する。
(11)
A mode in which the information of the tray identifier “1” assigned by the
In step S202, the
(12)応用
微生物培養装置は、予め検査項目と使用する培地の種類とを対応づけた培地テーブルを備え、培地種類特定部20は、入力情報取得部10で入力された検査項目に基づいて培地テーブルから菌液識別子に対応する培地を特定してもよい。このような培地テーブルの一例を図18に示す。図18では、検査項目と使用する培地の種類の略号、当該培地の培養温度や培養時間などの培養条件、発生するコロニーの性状、好適な検査対象品などを関連づけている。図18に示すように、大腸菌群数カウント用でも検査対象が全食品である培地と、対象食品をミネラルフォーターに特化したものとがある。また、培地によっては、培養時間が異なるもの、発色が異なるものなどが存在する。予め検査項目と培地の種類、その他の情報を関連づけた培地テーブルを微生物検査装置の記憶装置104に保存し、検査項目や検査対象品に対応する培地の種類を特定できるようにプログラムし、そのような設定を記憶装置104に保存することで、検査目的に好適な培地を特定することができる。
(12) Application The microorganism culture apparatus includes a culture medium table in which test items are associated with types of media to be used in advance, and the culture medium
微生物検査装置によれば、菌液識別子に対応して検査項目、培地の種類、コロニー数、培地画像などが一元的に保存されるため、報告書などの作成を簡便に行うことができる。また、培地としては、微生物培養シートや寒天培地に限定されず、スタンプアガー法に使用できる、いわゆるスタンプ培地などであってもよい。トレイの形状を培地の形状に合わせて調整すれば、種々の培地を用いて微生物検査を行うことができる。 According to the microorganism testing apparatus, the test items, the type of medium, the number of colonies, the medium image, and the like are stored in a unified manner corresponding to the bacterial liquid identifier, so that a report can be easily created. The medium is not limited to a microorganism culture sheet or an agar medium, and may be a so-called stamp medium that can be used in the stamp agar method. If the shape of the tray is adjusted in accordance with the shape of the culture medium, the microorganism test can be performed using various culture media.
微生物検査装置は、いわゆるパーソナルコンピューターとコピー機などの撮像装置および従来の微生物培養装置があれば実施できるため、食品製造工場、病院など、微生物検査を必要とするいずれの施設にも導入することができる。 Microbiological testing devices can be implemented with so-called personal computers and photocopiers such as photocopiers and conventional microbiological culture devices, so they can be installed in any facility that requires microbiological testing, such as a food manufacturing factory or hospital. it can.
本発明は2011年9月15日に出願された日本国特許出願2011-202424号に基づく。本明細書中に日本国特許出願2011-202424号の明細書、特許請求の範囲、図面全体を参照として取り込むものとする。 The present invention is based on Japanese Patent Application No. 2011-202424 filed on September 15, 2011. The specification, claims, and entire drawings of Japanese Patent Application No. 2011-202424 are incorporated herein by reference.
微生物培養装置は、菌液識別子ごとに培地を固定するトレイなどを表示するため、培地に検体番号や希釈倍率を記載することなくこの表示内容に従って培地や菌液を調製して微生物検査を行うことができ、有用である。 Since the microorganism culture device displays a tray for fixing the medium for each bacterial liquid identifier, the medium and bacterial liquid must be prepared according to the displayed contents and the microorganism test can be performed without describing the sample number or dilution factor on the medium. Can be useful.
100 微生物検査装置、 10 入力情報取得部、 20 培地種類特定部、 30 固定位置特定部、 40 表示制御部、 50 記憶部、 60 画像取得部、 70 菌液識別子取得部、 80 画像処理部、 90 コロニー計数部、101 CPU、102 ROM、103 RAM、104 記憶装置、105 入力装置、106 通信装置、107 撮像制御部、108 撮像装置、109 画像記憶部、110 表示制御部、111 表示装置、112 音声処理部、113 音声出力装置、114 データベースサーバ、120 バス、200 トレイ、300 寒天培地用トレイ、350 微生物培養シート用トレイ、410 寒天培地、500 微生物培養シート、501 基材シート、502 培養層、503 カバーシート、504 培地識別子、505 培地識別カラーバー
100 microbiological testing device, 10 input information acquisition unit, 20 medium type identification unit, 30 fixed position identification unit, 40 display control unit, 50 storage unit, 60 image acquisition unit, 70 fungal fluid identifier acquisition unit, 80 image processing unit, 90 Colony counting unit, 101 CPU, 102 ROM, 103 RAM, 104 storage device, 105 input device, 106 communication device, 107 imaging control unit, 108 imaging device, 109 image storage unit, 110 display control unit, 111 display device, 112 audio Processing unit, 113 audio output device, 114 database server, 120 bus, 200 tray, 300 agar medium tray, 350 microorganism culture sheet tray, 410 agar medium, 500 microorganism culture sheet, 501 substrate sheet, 502 culture layer, 503
Claims (5)
検体の菌液は、前記菌液毎に菌液識別子が割り当てられるものであり、
前記菌液識別子と前記菌液識別子により特定される菌液を検査する検査項目とを入力する入力手段と、
前記入力手段で入力された検査項目に基づいて前記菌液識別子により特定される菌液を接種する培地の種類を特定する培地種類特定手段と、
前記培地種類特定手段で特定された種類の培地を固定するトレイを特定するトレイ識別子と前記トレイ内で前記培地を固定する位置を特定するトレイ内位置識別子とを特定する固定位置特定手段と、
前記菌液識別子と、前記培地種類特定手段で特定された培地の種類を示す情報とを、前記固定位置特定手段によって特定された前記トレイ識別子と前記トレイ内位置識別子と共に表示する表示手段と、
前記トレイ識別子と前記トレイ内位置識別子とを、前記菌液識別子と対応付けて保存する保存手段とを備える、微生物検査装置。 A microorganism testing apparatus for performing microorganism testing of a medium fixed to a tray,
The bacterial solution of the specimen is one in which a bacterial solution identifier is assigned for each bacterial solution,
Input means for inputting the test item for inspecting the bacterial solution specified by the bacterial solution identifier and the bacterial solution identifier;
Medium type specifying means for specifying the type of medium inoculated with the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier based on the test item input by the input means;
A fixed position specifying means for specifying a tray identifier for specifying a tray for fixing the type of medium specified by the medium type specifying means, and a position identifier in the tray for specifying a position for fixing the medium in the tray;
Display means for displaying the bacterial cell identifier and information indicating the type of medium specified by the medium type specifying means together with the tray identifier specified by the fixed position specifying means and the position identifier in the tray;
A microorganism testing apparatus, comprising: a storage unit that stores the tray identifier and the in-tray position identifier in association with the bacterial liquid identifier.
前記表示手段は、前記菌液識別子と、前記培地の種類を示す情報と共に、前記菌液識別子により特定される菌液の希釈倍率を表示するものである、請求項1記載の微生物検査装置。 The input means is further for inputting a dilution rate of the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier,
The microorganism testing apparatus according to claim 1, wherein the display means displays a dilution rate of the bacterial liquid specified by the bacterial liquid identifier together with the information indicating the type of the bacterial liquid identifier and the medium.
前記保存手段は、前記固定位置特定手段によって特定された前記トレイ識別子を、前記入力手段により受け付けたトレイ識別子で更新するものである、請求項1または2記載の微生物検査装置。 The input means receives an input of a tray identifier for specifying a tray for fixing a medium corresponding to the bacterial liquid identifier,
The microorganism testing apparatus according to claim 1 or 2, wherein the storage means updates the tray identifier specified by the fixed position specifying means with the tray identifier received by the input means.
前記撮像画像取得手段で取得したトレイ画像に表示されたトレイ識別子と、前記トレイ画像に表示される培地画像の前記トレイ画像内での位置を示す情報とを取得し、これらを前記保存手段によって保存されたトレイ識別子とトレイ内位置識別子と照合して対応する菌液識別子を特定し、前記培地画像の菌液識別子として取得する菌液識別子取得手段と、
前記菌液識別子取得手段で取得した菌液識別子に対応する培地画像のコロニーを計数するコロニー計数手段とを備え、
前記保存手段は、前記コロニー計数手段によるコロニー数を、前記培地画像に対応する前記菌液識別子と対応付けて保存するものである、請求項1~3のいずれかに記載の微生物検査装置。 Captured image acquisition means for acquiring a captured image of the tray in which the culture medium is fixed according to the fixed position displayed by the display means;
The tray identifier displayed on the tray image acquired by the captured image acquisition unit and the information indicating the position of the culture medium image displayed on the tray image in the tray image are acquired and stored by the storage unit The corresponding tray identifier and the position identifier in the tray are identified to identify the corresponding bacterial liquid identifier, and the bacterial liquid identifier acquisition means for acquiring the bacterial liquid identifier of the medium image;
A colony counting unit that counts colonies of the medium image corresponding to the bacterial liquid identifier acquired by the bacterial liquid identifier acquisition unit;
The microorganism testing apparatus according to any one of claims 1 to 3, wherein the storage unit stores the number of colonies obtained by the colony counting unit in association with the fungus liquid identifier corresponding to the medium image.
前記培地種類特定手段は、前記入力手段で入力された検査項目に基づいて前記培地テーブルから前記菌液識別子に対応する培地を特定するものである、請求項1~4のいずれかに記載の微生物検査装置。 Furthermore, it has a medium table that associates the inspection items with the type of medium to be used,
The microorganism according to any one of claims 1 to 4, wherein the medium type specifying means specifies a medium corresponding to the bacterial cell identifier from the medium table based on the inspection item input by the input means. Inspection device.
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