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WO2009095000A3 - Procédé de séquençage d'une molécule d'arn par spectrométrie de masse - Google Patents

Procédé de séquençage d'une molécule d'arn par spectrométrie de masse Download PDF

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WO2009095000A3
WO2009095000A3 PCT/DE2009/000125 DE2009000125W WO2009095000A3 WO 2009095000 A3 WO2009095000 A3 WO 2009095000A3 DE 2009000125 W DE2009000125 W DE 2009000125W WO 2009095000 A3 WO2009095000 A3 WO 2009095000A3
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WO
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rna molecule
mass spectrometry
sequencing
rna
molecule
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PCT/DE2009/000125
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English (en)
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WO2009095000A2 (fr
Inventor
Ute Bahr
Michael Karas
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Goethe Universitaet Frankfurt am Main
Original Assignee
Goethe Universitaet Frankfurt am Main
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
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    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869Methods for sequencing
    • C12Q1/6872Methods for sequencing involving mass spectrometry

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Abstract

L'invention concerne un procédé de séquençage d'une molécule d'ARN, en particulier d'un oligonucléotide d'ARN, par spectrométrie de masse. Le procédé est caractérisé en ce qu'il présente les étapes suivantes : a) préparation d'une molécule d'ARN; b) scission de la molécule d'ARN par hydrolyse acide; et c) détermination de la séquence de la molécule d'ARN par spectrométrie de masse.
PCT/DE2009/000125 2008-01-31 2009-01-30 Procédé de séquençage d'une molécule d'arn par spectrométrie de masse Ceased WO2009095000A2 (fr)

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Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE19714558A1 (de) * 1997-04-09 1998-10-15 Joachim W Prof Dr Engels Ein neues Verfahren zur Sequenzierung von Biopolymeren mit Massenspektrometrie
WO1999057318A2 (fr) * 1998-05-07 1999-11-11 Sequenom, Inc. Analyse de molecules par spectrometrie de masse a desorption/ionisation par laser, assistee par matrice absorbant l'infrarouge

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE19714558A1 (de) * 1997-04-09 1998-10-15 Joachim W Prof Dr Engels Ein neues Verfahren zur Sequenzierung von Biopolymeren mit Massenspektrometrie
WO1999057318A2 (fr) * 1998-05-07 1999-11-11 Sequenom, Inc. Analyse de molecules par spectrometrie de masse a desorption/ionisation par laser, assistee par matrice absorbant l'infrarouge

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
FAULSTICH K ET AL: "A sequencing method for RNA oligonucleotides based on mass spectrometry.", ANALYTICAL CHEMISTRY 1 NOV 1997, vol. 69, no. 21, 1 November 1997 (1997-11-01), pages 4349 - 4353, XP002540491, ISSN: 0003-2700 *
HAHNER STEPHANIE ET AL: "Matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry (MALDI) of endonuclease digests of RNA", NUCLEIC ACIDS RESEARCH, vol. 25, no. 10, 1997, pages 1957 - 1964, XP002540493, ISSN: 0305-1048 *
NORDHOFF E ET AL: "Direct mass spectrometric sequencing of low-picomole amounts of oligodeoxynucleotides with up to 21 bases by matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry", JOURNAL OF MASS SPECTROMETRY 1995 GB, vol. 30, no. 1, 1995, pages 99 - 112, XP002540492, ISSN: 1076-5174 *
TOLSON D A ET AL: "Sequencing RNA by a combination of exonuclease digestion and uridine specific chemical cleavage using MALDI-TOF", NUCLEIC ACIDS RESEARCH, vol. 26, no. 2, 15 January 1998 (1998-01-15), pages 446 - 451, XP002540494, ISSN: 0305-1048 *

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