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WO2005037850A3 - Procede de production, en phase solide, de polynucleotides - Google Patents

Procede de production, en phase solide, de polynucleotides Download PDF

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WO2005037850A3
WO2005037850A3 PCT/US2004/033919 US2004033919W WO2005037850A3 WO 2005037850 A3 WO2005037850 A3 WO 2005037850A3 US 2004033919 W US2004033919 W US 2004033919W WO 2005037850 A3 WO2005037850 A3 WO 2005037850A3
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solid phase
annealed
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Hsing-Yeh Parker
John T Mulligan
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Blue Heron Biotechnology Inc
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Blue Heron Biotechnology Inc
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Abstract

L'invention propose un procédé de synthèse en phase solide permettant la production de polynucléotides de plus de 1000 nucléotides. L'une des caractéristiques de ce procédé est l'utilisation d'un support solide réutilisable contenant l'oligonucléotide lié par covalence. Cet oligonucléotide subit une hybridation donnant un oligonucléotide pont dans lequel le pont est également hybridé donnant un premier oligonucléotide formant une partie du polynucléotide cible. Une fois que le polynucléotide cible est synthétisé, il peut être retiré du support solide dans des conditions de dénaturation, le support solide pouvant être réutilisé pour l'élaboration d'autres polynucléotides cibles. Le rendement du polynucléotide cible augmente lorsqu'on applique une force de cisaillement au support solide qui est lié à l'oligonucléotide mis en culture. On pense que la force de cisaillement tend, d'une part à provoquer une extension des extrémités de croissance de l'oligonucléotide en éloignement du contact avec un autre oligonucléotide lié au support solide, et d'autre part à rendre cette extrémité plus accessible au recuit avec l'oligonucléotide de la solution. Cette synthèse s'obtient facilement sur un disque en verre fritté poreux, les réactifs et les solutions de lavage étant pompées au travers du verre fritté.
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Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0385410A2 (fr) * 1989-02-28 1990-09-05 Canon Kabushiki Kaisha Oligonucléotide à double brin partiel et son procédé de formation
US5942609A (en) * 1998-11-12 1999-08-24 The Porkin-Elmer Corporation Ligation assembly and detection of polynucleotides on solid-support
WO2003085094A2 (fr) * 2002-04-01 2003-10-16 Blue Heron Biotechnology, Inc. Methodes de phase solide pour la production de polynucleotides

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6277622B1 (en) * 1997-08-11 2001-08-21 The University Of Sydney Synthetic polynucleotides
US6670127B2 (en) * 1997-09-16 2003-12-30 Egea Biosciences, Inc. Method for assembly of a polynucleotide encoding a target polypeptide

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0385410A2 (fr) * 1989-02-28 1990-09-05 Canon Kabushiki Kaisha Oligonucléotide à double brin partiel et son procédé de formation
US5942609A (en) * 1998-11-12 1999-08-24 The Porkin-Elmer Corporation Ligation assembly and detection of polynucleotides on solid-support
WO2003085094A2 (fr) * 2002-04-01 2003-10-16 Blue Heron Biotechnology, Inc. Methodes de phase solide pour la production de polynucleotides

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