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WO2004111230A1 - ストレプトマイセス属に属するネマデクチン生産能を有する菌株、該菌株を用いるネマデクチンの製造法 - Google Patents

ストレプトマイセス属に属するネマデクチン生産能を有する菌株、該菌株を用いるネマデクチンの製造法 Download PDF

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WO2004111230A1
WO2004111230A1 PCT/JP2003/007407 JP0307407W WO2004111230A1 WO 2004111230 A1 WO2004111230 A1 WO 2004111230A1 JP 0307407 W JP0307407 W JP 0307407W WO 2004111230 A1 WO2004111230 A1 WO 2004111230A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
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nemadectin
streptomyces
strain
producing
belonging
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
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Application number
PCT/JP2003/007407
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English (en)
French (fr)
Inventor
Satoshi Omura
Haruo Ikeda
Yumiko Ogasawara
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Kitasato Institute
Original Assignee
Kitasato Institute
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Kitasato Institute filed Critical Kitasato Institute
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Priority to CNB038256355A priority patent/CN100429308C/zh
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Priority to CN2008101692574A priority patent/CN101372681B/zh
Priority to AU2003244109A priority patent/AU2003244109B2/en
Priority to EP03817253A priority patent/EP1632569B1/en
Priority to PCT/JP2003/007407 priority patent/WO2004111230A1/ja
Priority to JP2005500741A priority patent/JP4310750B2/ja
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Ceased legal-status Critical Current

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    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P17/00—Preparation of heterocyclic carbon compounds with only O, N, S, Se or Te as ring hetero atoms
    • C12P17/18—Preparation of heterocyclic carbon compounds with only O, N, S, Se or Te as ring hetero atoms containing at least two hetero rings condensed among themselves or condensed with a common carbocyclic ring system, e.g. rifamycin
    • C12P17/181—Heterocyclic compounds containing oxygen atoms as the only ring heteroatoms in the condensed system, e.g. Salinomycin, Septamycin

Definitions

  • the present invention relates to a strain belonging to the genus Streptomyces and having the ability to produce nemadectin, a method for producing nemadectin using said strain.
  • the present invention relates to a strain belonging to the genus Streptomyces and having a nemadectin-producing ability, and a method for producing nemadectin using the strain. More specifically, the present invention relates to a C-13 hydroxylamine using a microorganism belonging to the genus Streptomyces having a nemadectin-producing ability. The present invention relates to a method for producing Madectin and C-113 glycosylnemadectin, and to a strain belonging to Streptomyces cyaneaglyceus' subsp. Conventional technology
  • Nemadectin having a benzofuran ring skeleton has four components, ⁇ and 5, and the following structure is located at the C13 position As shown by, there is no substituent and the compound is saturated.
  • KS-AT-DH-ER-KR-ACP module 7 of nemadectin polyketide synthase (nemadectin PKS) involved in the formation of the nemadectin aglycone moiety. This is because it has a configuration. It is structurally difficult to chemically synthesize the stereoselective modification of the saturated C- 13 position, and it is expected to increase the anti-insect and anti-parasitic activity by sugar addition, as shown in the following structure of evacectin. Despite this, no derivatives were produced by chemical synthesis.
  • the present inventors have eagerly proposed a structure in which it was difficult to stereoselectively introduce a hydroxyl group at the C-13 position of nemadectin and glycosylate the hydroxyl group in chemical synthesis.
  • the present invention has been completed on the basis of such findings, and its purpose is to produce C13 glycosylnemadetin-producing bacteria by molecular genetic techniques and obtain a stereoselectively glycosylated nemadectin. Has the ability to produce nemadectin belonging to the genus Streptomyces, which can be expected to improve its biological activity ⁇ Provide strains.
  • Another object of the present invention is to provide a microorganism belonging to the genus Streptomyces which produces nemadectin, by introducing DNA of a microorganism producing a nemadectin-like compound into C-13 hydroxylnemadectin and C-13 glycosyl.
  • An object of the present invention is to provide a method for producing nemadectin which is produced by accumulating and accumulating nemadectin.
  • nemadectin-aglycone biosynthesis genes have studied the modification of nemadectin-aglycone biosynthesis genes in order to obtain nemadectin as a C-13 hydroxylnemadectin which can be chemically synthesized, particularly to which sugars can be added. Then, a strain producing C-11 hydroxylnemadectin was prepared by forming a hybrid polyketide synthase (hybrid PKS) of nemadectin PKS and avermectin polyketide synthase (evermectin PKS).
  • hybrid PKS hybrid polyketide synthase
  • evermectin PKS a hybrid polyketide synthase
  • the strain is Streptomyces 'Caneoglyceus' subsp.
  • Noncyanogenus ⁇ nem A4 :: vphatt BTGI :: aveA4—aveA3—aveE att B C31: : Av eR, based on the Budapest Treaty on the International Recognition of the Deposit of Microorganisms in Patent Procedures, 1-1-1, Higashi, Tsukuba, Ibaraki, Japan, Central No.
  • a strain into which the aveB I-BVIII gene group involved in the glycosylation of evermectin and oreandrosus biosynthesis was introduced was prepared, and a C-13 glycosyl nemadectin producing strain was prepared.
  • the strain is a strain of Streptomyces cinerea glyceus subsp.
  • the present invention provides a method for culturing a strain belonging to Streptomyces cyaneoglyceus 'subspecies' Noncyanogenus in a medium, producing and accumulating C-13 glycosylnemadectin in the culture, and producing C-1 from the culture. 3. Glycosylnemadectin is collected This is a method for producing C-13 glycosylnemadectin. Further, the present invention is a strain belonging to Streptomyces cyaneoglyceus' subsp. Noxianogenas, and having the ability to produce C-13 hydroxylnemadectin and C-13 glycosylnemadectin.
  • the DNA of a microorganism producing a nemadectin-like compound was introduced into a microorganism belonging to the genus Streptomyces producing nemadectin, and C-13 hydroxynemadectin and C-13 glycosylne There is no report of the production and accumulation of Madectin.
  • the present invention relates to a Streptomyces cyaneogliseus subsp.
  • the present invention provides a strain belonging to Noncyanogenus and having the ability to produce C-11-glycosylated nemadectin. .
  • the present invention relates to Streptomyces ′
  • the present invention provides a method for culturing a microorganism belonging to Streptomyces cyaneoglycesus subsp. It is intended to provide a method for producing C-11-hydroxylated nemadectin, which comprises producing and accumulating hydroxylated nemadectin at position 113, and collecting C-11-hydroxylated nemadectin from the culture.
  • the present invention relates to a microorganism belonging to Streptomyces cyaneoglycesus subspecies non-cyanogenus, which is capable of producing C-1-3 glycosylated nemadectin, and cultivates the microorganism in a culture medium.
  • An object of the present invention is to provide a method for producing C-11-glycated nemadectin, which comprises producing and accumulating 3-glycated nemadectin at the 3-position, and collecting C-1-3-glycated nemadectin from the culture.
  • the present invention relates to Streptomyces cyaneoglyceus subspecies.
  • the present invention relates to Streptomyces cyaneoglyceus 'subspecies'
  • the present invention relates to Streptomyces, Cianeogriseus, Subsp.
  • a nemadectin-non-producing strain (KS10 insertion-displacement strain) that belongs to Noncyanogenus and has a biomycin resistance gene inserted into the KS10-encoding region of the nemadectin aglycone biosynthesis gene group nem A3 — 4 operon ).
  • the present invention belongs to Streptomyces cyaneoglyceus subspecies non-cyanogenus, and the KS10-inserted strain described above is Streptomyces cerevisiae.
  • the present invention provides a microorganism which has a vermichiris avermectin aglycone biosynthesis gene group aVeA3-4 and can form a hybrid PKS with NemA1-2 and AVES3-4.
  • the present invention relates to a microorganism belonging to Streptomyces' Cyaneoglyceus subsp. Nonnonogenus, which can form hybrid PKS with NemA 1-2 and AVES 3-4.
  • the present invention relates to Streptomyces 'Caneo Griseus subspecies'.
  • FIG. 1 is a restriction map of a 3. O kb fragment containing the KS region of nemadectin PKS module 10, and the arrow indicates the transcription direction.
  • FIG. 2 is a restriction enzyme map of the Sah1 I site vph insert fragment of the nemadectin KS10 region, and the arrow indicates the transcription direction.
  • Figure 3 shows the —NMR spectrum of C-13 hydroxyl nemadectin.
  • Figure 4 shows the 13. C-NMR spectrum of C- 13 hydroxylnemadectin.
  • Figure 5 is the C-1 3-glycosyl Ne Made Kuching - NMR scan Bae c
  • Figure 6 is a vector the c invention for implementing a 13 C-NMR scan Bae spectrum of C one 1 3 glycosyl Ne Made Kuching Best form
  • Nematodectin PKS Streptococcus cerevisiae with a biomycin resistance gene (Vio cin phos pho tran sferase; vph) introduced into the KS10 region (Streptomyces subsp. es cyane ogr is eu ss p. noncyanog enus) Acquired NRRL 15773
  • cosmid DNA containing DNA encoding the KS domain of module 10 is restricted to BamHI.
  • agarose gel electrophoresis was performed, and a 3.0 kb DNA fragment containing the KS10 region was separated using Gene Clean II kit (Bio 101, USA) '' Purified.
  • Plasmid pUC19 (Takara Shuzo, Japan) was digested with BamHI and then dephosphorylated with a1k a1ine phosphatase (Calfinstein, Japan) (Takara Shuzo, Japan).
  • This DNA ligation reaction product 10a1 was brought into contact with a competent cell of Escherichia coli DH5 (manufactured by Nippon Gene, Japan). Transformants were selected on a 2 Om 1 LB agar medium containing 50 g / ml ampicillin (manufactured by Wako Pure Chemical Industries, Japan), using 0.1 mo1 / L isopropyl-1-D —Aqueous solution of thiogalactobilanoside (IPTG), 2% 5-Promo 4-Cro-one 3—Indolyl — ⁇ — Dimethylformamid of D-galactoside (X-ga 1, Nacalai Tesque, Japan.) Solution (Nacalai Tesque, Japan) Each of the solutions was applied 50/1 in advance.
  • Colonies of transformed strains carrying the recombinant plasmid In the first, X-ga1 cannot be decomposed because it has lost its galactosidase activity, and it is white. The white colonies were picked up with a protease, inoculated in a 1 Om1 LB medium, cultured at 37 ° C for 16 hours with shaking, and then the plasmid was extracted and purified from the cells by an alkaline method. A part of the obtained recombinant plasmid was digested with the restriction enzyme BamHI, and the plasmid pUC19.::NEM-KS10 in which a 3.0 kb DNA fragment was inserted into pUC19 was obtained. It was confirmed that it was obtained.
  • Example 1 Recombinant plasmid pUC19 :: NEM—KS10 obtained in (1) was added to Exp andTaq DNA polymerase buffer (Roch, USA), dATP, dGTP, dCTP, dTTP A synthetic DNA having a base sequence of 5'-GTGCTGCAAG GCGATTAAGTTGG-3 'described in SEQ ID NO: 1 and a synthetic DNA having a base sequence of 5'-TCCGGCTCGTATGTTGTGTGGA-3' described in SEQ ID NO: 2 as a set of primers After adding ExpandTaq DNA polymerase (Roch, USA), the mixture is treated at 96 ° C for 5 minutes, and the reaction is performed at 96 ° C for 30 seconds and at 70 ° C for 3 minutes.
  • the enzyme was used as a chimeric DNA to obtain an IR-labeled primer (manufactured by AROKA, Japan) and a thermosequenase Fl uo resc en t ab elledpr ime r cy clese quen ci ng kit ng kitith 7 -deaz a-dGTP (manufactured by Amersham Pharmacia Biotech, USA) was added to perform a cycle sequence reaction. After completion of the reaction, a reaction terminating solution was added and mixed to prepare a sample solution. This sample solution was heated at 90 ° C. for 2 minutes, cooled on ice, and subjected to sequence electrophoresis.
  • the electrophoresis apparatus used was a DNA sequencer Mode 1 4000 series (LI-COR, USA).
  • the analysis of the image after electrophoresis was performed using the Image Image of Base Image IR Software 2.30. l ys is Versi on 2.10.
  • a BLAST search was performed for the amino acid sequence based on the nucleotide sequence of each DNA fragment obtained. The result was a sequence with high homology to S. a Vermiti 1 is aveA4 at the end, and a S at the opposite end. A sequence highly homologous to the reduce verse of a Vermiti 1 is found. From these nucleotide sequences, the direction of transcription of the nemadectin PKS gene of the BamHI fragment was confirmed (see FIG. 1).
  • Transformation was performed by bringing the ligation reaction product 1Q1 into contact with a competent cell of Escherichia coli DH5, and a recombinant plasmid pB1uescript SK + :: ⁇ ; in which NEM-KS10 fragment was ligated to pBluescript SK +. M-KS 10 was obtained. Furthermore, pBluescript SK + :: NE-KS10 was digested with restriction enzymes Hindlll (Takara Shuzo, Japan) and SstI (GIBC ⁇ BRL, US3 ⁇ 4) and subjected to agarose gel electrophoresis.
  • the DNA fragment containing about 3.0 kb of NEM-KS10 and the about 2.7 kb DNA fragment obtained by digesting the plasmid pUC19 with HindIII and SstI were each used to obtain 0.1%.
  • the mixture was mixed by reacting 1 II g at a time and reacting at 16 for 16 hours using Ligati 0 n High.
  • Escherichia coli DH 5 Into PUC19—Bg1 (pUC 19. multi-cloning site of pUC19 with Bg1II cleavage sequence AG ATCT inserted on both ends of EcoR I and Hindill).
  • ⁇ Recombinant plasmid pUC 19 —Bgl :: NEM-KS10 ligated with KS10 fragment was obtained.
  • vph is a plasmid pUC19 :: After digesting vph with restriction enzymes EcoRI (Takara Shuzo, Japan) and PstI (Takara Shuzo, Japan), agarose gel electrophoresis was performed. It was obtained by separating and purifying a 1.7 kb DNA fragment containing vph. The 1.7 kb EcoRI / Pst.I DNA fragment containing this vph is blunt-ended by using the BKL kit (Takara Shuzo, Japan) at 37 ° C for 15 minutes. Was.
  • pUC19-Bg1 NEM-KS10—vph is digested with restriction enzyme Bg1II (Takara Shuzo, Japan), and then subjected to agarose gel electrophoresis to contain the KS10-vph region.4. A 7 kb DNA fragment was isolated and purified. After pGM160, a vector for actinomycetes, was digested with the restriction enzyme BamHI, it was subjected to agarose gel electrophoresis, and a 6.8 kb DNA fragment was separated and purified. Furthermore, the DNA 5 ′ end was dephosphorylated using al ka line phos hatase (Calfintestine).
  • the pGM160 BamHI digest and the 4.7 kb DNA fragment containing the NEM-KS10-vph region were each mixed at 0.gzg, and the DNA was ligated using Liga tion Hi'gh. went.
  • Escherichia coli DH5 was transformed with the DNA ligation product 101 to obtain a recombinant plasmid pGMl60 :: NEM-KS10-vph.
  • Selection of transformants An LB medium containing 50 fig / ml of ampicillin and 150 g / ml of tuberacactinomycin N was used.
  • E. coli GM2929hsdS :: Tn10 was transformed using pGMl60 :: NEM-KS10-vph.
  • the transformants were selected from those containing 30 / m1 chloramphenicilol (Wako Pure Chemical Industries, Japan), 50 g / m1 ampicillin and 150 g / m1 bellabactinomycin N.
  • LB medium was used.
  • Escherichia coli GM29 29 hsd S :: Tn10 was used to prepare an unmethylated plasmid DNA pGM160 :: NEM-KS10—vph.
  • the cells were collected by centrifugation at 300 rpm for 10 minutes, added with 20 ml of P10 medium, suspended well, and then centrifuged at 3.0 rpm for 10 minutes to wash the cells.
  • the washed cells were suspended in P10 medium containing 1 mg Zm1 of egg white lysozyme, and suspended at 30 ° C for 30 minutes to produce protoplasts.
  • the protoplast suspension was passed through a cotton plug filter to remove undigested mycelia with lysozyme.
  • the protoplast suspension that had passed through the cotton plug filter was centrifuged at 300 rpm for 10 minutes to precipitate protoplasts.
  • Example 11 Recombinant plasmid pGMl 60 obtained in (3) :: NEM-KS 10—vph about 1 and Streptomyces cyaneogliseus subsp. Obtained in Example 1- (4) placed in Etsu Eppendorf tube with a sterile approximately 5 X 1 0 8 single protoplasts of Ichizu-Nonshianogenasu immediately 50, 0 Z 1 of 25% polyethylene glycol MW1 000 solution (2.5% sucrose, 0.05 % KH 2 P0 4, 0. 1 M CaC l 2, 50 mM Tr is- maleic acid, added and mixed ⁇ H 8. 0), and allowed to stand at room temperature for 1 minute.
  • Transformants resistant to thiostrepton grown on the surface of R 2 YE agar medium were aseptically scraped, the hypha was cut with a homogenizer, and spread on YMS agar medium. After culturing at 37 ° C. for 4 days, the spores were replicated as a master plate on YMS agar medium containing Nbbella cutinomycin N. After culturing at 30 for 2 days, colonies resistant to tuberactinomycin were selected and each was spread on a YMS agar medium. This was cultured at 30 ° C.
  • spores formed were used as master plates, which were then replied on a YMS agar medium containing 20 gZm 1 thiostrepton and cultured at 30 ° C. for 2 days.
  • a strain that became resistant to tubellactinomycin and susceptible to thiostrepton was selected, and the introduction of vph into the nemadectin PKS and KS10 regions on the chromosome was confirmed by the Sout he rnhybridization method. In addition, it was confirmed that nemadectin was not produced.
  • strains were Streptomyces, cyaneoglyceus, subsp., Noncyanogenus ⁇ nem A4 :: v h3 ⁇ 4 (Streptomyces cyane ogr is euss ubs p. Non cyanogenu s ⁇ ne mA 4:: vp h).
  • a phage dilution buffer (SM buffer) and 301 of pi-roform were added and mixed by inversion. Then, the mixture was centrifuged at 132.00 rpm for 30 seconds, and the supernatant was transferred to a new sterile Eppendorf tube to obtain a lambda phage packaging solution.
  • SM buffer phage dilution buffer
  • Example 1- (6) transduction was performed using an E. coli BL21 recA-deficient strain as a host.
  • Host large fl bacillus BL21 recA-deficient strain was cultured overnight at 37 ° C in LB medium and added to 0.4% maltose-supplemented LB medium at 1%.
  • the cells were cultured with shaking at 7 ° C for 3 hours.
  • the cells were collected by centrifugation and washed with a 1 OmM magnesium sulfate solution. Further, the cells were collected by centrifugation and suspended in an appropriate amount of a 1.0 mM magnesium sulfate solution to obtain a host cell solution.
  • This host bacterial solution and the lambda fuzzy packaging solution obtained in Example 1- (6) were mixed at a ratio of 1: 1 in an Eppendorf tube, and allowed to stand at room temperature for 30 minutes. Thereafter, an LB medium was added, and the mixture was shaken at 30 ° C. for 1.5 hours, applied onto a LA medium containing kanamycin (50 jg / ml), and cultured at ⁇ 30 ° C. at ⁇ ⁇ ° C. Kanamycin-resistant colonies were cultured as a library on a 96-well test plate, and a clone having a cosmid DNA that hybridized with the synthetic DNA described in SEQ ID NO: 4 was selected from among them.
  • Recombinant plasmid DNA harboring the eV lectin glycosynthase gene aVeA3-4 was obtained from cells cultured overnight in an LB medium containing potassium namycin (50 zg / ml) according to a standard method. Purified by the alkali method.
  • Example 2 Introduction of the avermectin biosynthesis gene group a ve A3-4 into the nemadectin PKS module 10 vph ⁇ strain
  • the spore suspension of the nemadectin PKS module 10 region vph ⁇ -introduced strain obtained in Example 1- (5) was mixed with 50 ml of 30% w / v sucrose, 0.5% W / Y glycine, 5 mM
  • the cells were transferred to a YEME medium (500 ml Erlenmeyer flask) containing MgC12, and cultured at 30% for 48 hours by mouth-tally-force.
  • the cells were collected by centrifugation at 3000 rpm for 10 minutes, 20 ml of P10 medium was added and suspended well, and then the cells were washed by centrifugation at 300 rpm for 10 minutes.
  • P10 medium containing lmg / ml egg white lysozyme was added to the washed cells, suspended, and kept at 30 ° C for 30 minutes to produce protoplasts. After adding 10 ml of P10 medium and mixing well, the protoplast suspension was passed through a cotton filter to remove undigested mycelia with lysozyme. The protoplast suspension that had passed through the cotton plug filter was centrifuged at 3000 rpm for 10 minutes to precipitate the protoplasts. After removing the supernatant, the cells were well suspended in 10 ml of a P10 medium, and centrifuged at 3000 rpm for 10 minutes to precipitate protoplasts.
  • Example 1-(7) About 1 ⁇ g of pTG 1 int-c 0 s:: ave A 3-4 prepared in Example 1-(7) was added to this protoplast, and immediately 5001 of a 25% polyethylene glycol MW1 000 solution (2.5. % Sucrose, 0.05% KH 2 PO 4 , 0.1 M CaCl 2 , 50 mM Tris-maleic acid, pH 8.0.0) were added and mixed, and allowed to stand at room temperature for 1 minute. Next, 4501 of P10 medium was added and mixed well, and each 1001 was placed on R 2.YE agar medium and spread with 2.5 ml of soft agar medium. After culturing at 30 ° C.
  • a 25% polyethylene glycol MW1 000 solution 2.5. % Sucrose, 0.05% KH 2 PO 4 , 0.1 M CaCl 2 , 50 mM Tris-maleic acid, pH 8.0.0
  • the chromosomal integration vector plasmid pUC19aad3 "-int ⁇ C31 contains the aveR-containing 3.27 kb XbaI-Hindill fragment at the XbaI and Hindill recognition sites and ligated into E. coli BL21.
  • a strain obtained by incorporating aVeA3-4 and aVeR into a 7vph ⁇ transfected strain on the chromosomal nemadectin PKS module obtained in Example 3 was inoculated into a nemadectin seed medium, and cultured with shaking at 30 ° C for 3 days. 1 mL of the mixture was added to 5 OmL of nemadectin production medium dispensed into a 500-mL triangular corben. This was cultured at 28 ° C. for 5 days with shaking at 180 rpm, and then centrifuged at 3000 rpm for 10 minutes to collect the cells. The obtained cells were suspended in acetone and stirred at room temperature for 1 hour.
  • the cells were separated from the acetone layer, and the solvent was distilled off from the acetone layer. Water and chloroform were added to the solvent-dried substance, and the mixture was stirred. The foam layer was separated, and anhydrous sodium sulfate was added to perform dehydration treatment. The solvent was distilled off from the black form layer, and the obtained residue was used as a crude extract. Was. The crude extract was dissolved in a very small amount of black-mouthed form, passed through a column of silica gel (Sigma, USA) equilibrated with black-faced form, washed with black-faced form, and then washed with 25% vZv ethyl acetate.
  • ave BI—BVIII derived from Streptomyces enokuichi mitilis (Streptomyces ave rm iti 1 is) is a DNA fragment of 11041 bp described in SEQ ID NO: 6, ie, ave BI- Controls pUC19 :: aveBI-BVIII linked to DNA containing the entire BVIII Digestion with restriction enzymes XbaI and Hindill, DNA fragment containing whole aveBI-BVIII was subjected to low melting point agarose gel electrophoresis, and then separated and purified by phenol extraction, phenol-cloth form extraction, and alcohol precipitation. .
  • the chromosomal integration vector plasmid pUC19intR4-tsr was digested with a restriction enzyme XbaI-HindIII, followed by agarose gel electrophoresis to separate and purify a 11 kb DNA fragment. These DNA fragments were ligated using Ligation High, and Escherichia coli BL21 ⁇ AecA was transformed using the DNA ligation reaction product 10P1, and the recombinant plasmid pUC 19 int R 4— tsr :: ave BI -BVIII was obtained. The transformants were selected on an LB medium containing 50 g gm1 of ampicillin.
  • the cells were collected by centrifugation at 300 rpm for 10 minutes, added with 20 ml of P10 medium, suspended well, and then centrifuged at 300 rpm for 10 minutes to wash the cells.
  • the washed cells were suspended by adding Pmg medium containing lmgZml of egg white lysozyme, and incubated at 30 ° C for 30 minutes to generate protoplasts.
  • the protoplast suspension was passed through a cotton plug filter to remove undigested mycelia with lysozyme.
  • the protoplast suspension that has passed through the cotton plug filter is centrifuged at 300 rpm for 10 minutes to precipitate the protoplasts. I let you.
  • the suspension was well suspended in 1 Om1 of P10 medium, and then centrifuged at 3000 rpm for 10 minutes to precipitate protoplasts. Again, 1 Oml of P10 medium was added, and the toptop was suspended and centrifuged to wash the protoblast. The obtained washed protoplasts were suspended in 5 ml of P10 medium, dispensed into sterilized eppendorf tubes in 0.1 ml portions, and stored at -80. About 1 g of the plasmid 'DNA pUC 19 int R 4 -tsr :: aveBI-BVIII obtained in Example 5 was added to this protoplast, and immediately, a 50% 25% polyethylene glycol MW 1.000 solution (2. 5% sucrose, 0. 05% KH 2 PO 4 , 0. 1 MC a C 1 2, 5 OmM Tr is- maleate, pH 8. 0) were added and mixed and allowed to stand for 1 minute at room temperature.
  • a strain obtained by incorporating aveA3_4, aveR and ave BI-BVIII into the Vph-inserted strain of nemadectin PKS module 10 on chromosome obtained in Example 6 was inoculated into nemadectin seed medium, and cultured with shaking at 30 ° C for 3 days. 1 mL to 50 OmL It was added to 50 mL of nemadectin production medium dispensed into a triangular colben. This was cultured at 28 ° C. for 5 days with shaking at 180 rpm, and then centrifuged at 3000 rpm for 10 minutes to collect the cells. The obtained cells were suspended in acetone and stirred at room temperature for 1 hour.
  • the membrane was washed with a mouth form to remove a fraction containing no C-13 glycosyl nedectin.
  • the obtained eluate was dried under reduced pressure.
  • a solid was obtained as a yellow oil. The resulting yellow oil was then separated and purified using HPLC.
  • the column used was Pega sil ODS (3 m, column size 20 ⁇ x 25 Omm; manufactured by Sensh Ichigaku Co., Ltd.), and a mixture of acetonitrile 'methanol' water at a ratio of 55: 18: 27 was used as the mobile phase. Using. The flow rate was set to 6 mL / min, and components with a retention time of 120 minutes were collected using the absorbance at 246 nm as an index. The obtained compound! H- NMR spectrum (see Fig. 5) data, and 13 C- NM R spectrum (see FIG.
  • compositions of the various media and buffers used in each of the above Examples are as follows.
  • Tris hydrochloric acid pH 7.5
  • 10 mM Sodium chloride 10 OmM
  • Magnesium sulfate heptahydrate 1 OmM Cycle sequence stop solution
  • Nemadectin-producing bacterial culture medium After adjusting the pH to 7.2 with 2M potassium hydroxide, steam at 121 ° C for 15 minutes. Air sterilization. Nemadectin-producing bacterial culture medium
  • the present invention provides a method for introducing C-11 hydroxylnemadectin and C-13 glycosylne into a microorganism belonging to the genus Streptomyces, which produces nemadectin, by introducing DNA of a microorganism producing a nemadectin-like compound.
  • Madectin can be produced, stored, and collected.
  • by producing a C-13 glycosylnemadetin-producing bacterium by a molecular genetic technique it is possible to efficiently obtain stereoselectively glycosylated nemadectin. It is expected to improve biological activities such as.

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Abstract

本発明は、ネマデクチンを、糖が付加し得るC-13ヒドロキシルネマデクチンとして得るためにネマデクチンアグリコン生合成遺伝子群の改変を行い、C-13ヒドロキシルネマデクチンを生産する生産株を作製する。更にまた、エバーメクチンの配糖化およびオレアンドロース生合成に関与するaveBI-BVIII遺伝子群を導入して、C-13グリコシルネマデクチン生産株を作製する。このように、分子遺伝学的手法によって作製した生産株によりC-13ヒドロキシルネマデクチン及びC-13位が配糖化されたネマデクチンを効率的に取得することができ、その生物活性の改善が期待できる。

Description

明細書 ストレブトマイセス属に属するネマデクチン生産能を有する菌株、 .該菌株を用いるネマデクチンの製造法 景技 fe 産業上の利用分野
本発明はストレプトマイセス属に属するネマデクチン生産能を有する菌株、 該菌株を用いるネマデクチンの製造法に関し、 更に詳しくはネマデクチン生産能 を有するストレブトマイセス属に属する微生物を用いる C— 1 3ヒドロキシルネ マデクチン及び C一 1 3グリコシルネマデクチンの製造法及ぴストレブトマイセ ス · シァネオグリセウス 'サブスピ一シ一ズりンシァノゲナスに属する菌株に 関する。 従来の技術
ベンゾフラン環骨格を有する一連の化合物は優れた抗寄生虫 ·抗昆虫活性を 有し、 エバーメクチンやミルべマイシンが実用化されている。 ストレブドマイセ ス · シァネオグリセウス ·サブスピ一シーズ · ノンシァノゲネスが生産する.ベン ゾフラン環骨格を有するネマデクチンは 、 β γおよび 5の 4種の成分が存在 し、 その C一 Γ 3位には下記の構造で表されるように置換基が存在せず飽和して いる。
Figure imgf000002_0001
ネマデクチン α Ri =H R2 =CH (CH3
Figure imgf000003_0001
r R: = CH3 R2 =し ri 3
Figure imgf000003_0002
ネマデクチンの C一 1 3位が飽和する理由はネマデクチンァグリコン部分の 生成に関与するネマデクチンポリケチド合成酵素 （ネマデクチン PKS) のモジ ユール 7が KS— AT— DH— ER— KR— ACPという構成をしている為めで ある。 飽和した C一 13位について化学合成的に立体選択的修飾をもたらすこと は構造上困難であり、 下記構造のエバ一メクチンのように糖付加による抗昆虫 · 抗寄生虫活性の上昇への期待がもてるにもかかわらず、 化学合成による誘導体の 製造はなされていなかった。
Figure imgf000003_0003
上記のように、 化学合成ではネマデクチンの C - 13位に立体選択的に水酸 基を導入することやその水酸基を配糖化することは困難とされていた構造を、 本 発明者らは、 鋭意研究の結果、 分子遺伝学的手法によって C一 1 3グリコシルネ マデクチン生産菌を作製することにより立体選択的に配糖化されたネマデクチン を効率的に取得することに成功した。
本発明はこのような知見に基いて完成されたものであり、 その目的は分子遺 伝学的手法によって C一 1 3グリコシルネマデクチン生産菌を作製し、 立体選択 的に配糖化されたネマデクチ を効率的に取得することができ、 その生物活性 φ 改善を期待し得る、 ストレプトマイセス属に属するネマデクチン生産能を有する 菌株を提供するものである。
本発明の他の目的は、 ネマデクチンを生産するストレブトマイセス属に属す る微生物に、 ネマデクチン類似化合物を生産する微生物の DNAを導入して C— 1 3ヒドロキシルネマデクチン及び C一 1 3グリコシルネマデクチンを生産蓄積 させ採取するネマデクチンの製造法を提供するものである。 発明の開示 本発明者らは、 ネマデクチンを化学合成的に修飾可能な、 特に糖が付加しう る C一 1 3ヒドロキシルネマデクチンとして得るためにネマデクチンァグリコン 生合成遺伝子群の改変を行い、 ネマデクチン P K Sとエバーメクチンポリケチド 合成酵素 （エバーメクチン PKS) とのハイブリッドポリケチド合成酵素 （ハイ ブリツド PKS) を形成することにより C一 1 3ヒドロキシルネマデクチンを生 産する菌株を作製した。 そして、 エバ一メクチン PKSの転写調節に関与する a veR遺伝子を導入してエバ一メクチン P K S遺伝子の転写を促進させるととも に C— 1 3ヒドロキシルネマデクチンの生産性を向上させた。'
なお、.本菌株は、 ストレブトマイセス ' シァネオグリセウス 'サブスピ一シ ーズ - ノンシァノゲナス (Streptomyces cyaneogriseus subsp. noncyanogenus) Δ n e m A 4 ： ： v p h a t t BTGI ： : aveA4— aveA3— aveE a t t B C31 ： ： a v eRとして、 特許手続上の微生物の寄託の国際的承認 に関するブタペスト条約に基ずき日本国茨城県つくば市東 1丁目 1番地 1 中央 第 6 (郵便番号 305— 8566 ) [A I ST Ts ukub a Cen t r a 1 6 , 1 - 1 , Η i g a s h l 1— C ho me Ts ukub a-s h i, I b a r ak i -ken 305 - 8566 Ja an] の独立行政法人産業 技術総合研究所 特許生物寄託センター （I n t e rna t i ona l Pa t e n t Or gan i sm Depo s i t a r y Na t i ona l I n s t i t υ t e o f Advan c e d I ndu s t r i a l S c i e n c e and Te chno l ogy) に寄託した。 受託日は平成 1 5年 6月 6日 であり、 受託番号は FERM BP— 8395である。 さらにまた、 エバ一メクチンの配糖化及びォレアンドロ一ス生合成に関与す る aveB I— BVIII遺伝子群を導入した菌株を作製し、 C— 1 3グリコシル ネマデクチン生産株を作製した。
なお、 本菌株は、 ストレブトマイセス■シァネオグリセウス 'サブスピ一シ
—ズ - ノンシァノゲナス (Streptotnyces cyaneogriseus subsp. noncyanogenus)
Δ n e mA 4 ： ： v p h a t t BTGI ： ： aveA4-ay eA3-aveE a t t B 0c3i ： ： a v e R a t t BR4： : a v e B 1— B VIII として、 特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関するブタぺスト条約に基ずき日本国 茨城県つくば巿東 1丁目 1番地 1 中央第 6 (郵便番号 305— 8566 ) [ A 1 ST T s u k u b a Cen t r a l 6， 1 - 1， Hi ga s h i 1 -
Chome Ts uku a-s h i, I ba r ak i -ken 305 - 85 66 Ja an] の独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託セン夕一 w i n t e r n a t i o n a 1 a t en t Or gan i sm D e p o s i t a r y Na t i ona l I n s t i t u t e o f Advan c e d I n du s t r i a l S c i en ce and Te'chno'l o'gy) に 寄託した。 受託日は平成 1 5年 6月 6日であり、 受託番号は FERM BP— 8 394である。
本発明はストレブトマイセス · シァネオグリセウス 'サブスピーシ一ズ 'ノ ンシァノゲナスに属する菌株を培地で培養し、 培養物中に C— 1 3グリコシルネ マデクチンを生産蓄積させ、 該培養物より C— 1 3グリコシルネマデクチンを採 取する C— 1 3グリコシルネマデクチンの製造法である。 また、 本発明は、 スト レブトマイセス ·シァネオグリセウス 'サブスピ一シ一ズ ·ノクシァノゲナスに 属し、 C— 1 3ヒドロキシルネマデクチン及び C— 1 3グリコシルネマデクチン 生産能を有する菌株である。
以上のごとく、 ネマデクチンを生産するストレブトマイセス属に属する微生 物に、 ネマデクチン類似化合物を生産する微生物の DNAを導入して C一 1 3ヒ ドロキシルネマデクチン及び C一 1 3グリコシルネマデクチンを生産蓄積せしめ たという報告は未だ知られていない。
従って、 本発明はストレブトマイセス■シァネオグリセウス ·サブスピ一シ —ズ ' ノンシァノゲナスに属し、 C一 1 3位配糖化ネマデクチン生産能を有する 菌株を提供するものである。 .
更に本発明はストレブトマイセス ' シァネオグリセウス ·サプスピーシ一ズ
• ノンシァノゲナスに属し、 C— 1 3位水酸化ネマデクチン生産能を有する菌株 を提供するものである。
更に本発明はストレブトマイセス■ シァネオグリセウス ·サブスピ一シ一ズ ■ ノンシァノゲナスに属し、 C一 1 3位水酸化ネマデグチン生産能を有する微生 物を培地で培養し、 培養物中に C一 1 3位水酸化ネマデクチンを生産蓄積させ、 該培養物より C一 1 3位水酸化ネマデクチンを採取する C一 1 3位水酸化ネマデ クチンの製造法を提供'するものである。
更に本発明はストレブトマイセス■ シァネオグリセウス ·サブスピーシ一ズ - ノンシァノゲナスに属し、 C— 1 3位配糖化ネマデクチン生産能を有する微生 物を培地で培養し、 培養物中に C— 1 3位配糖化ネマデクチンを生産蓄積させ、 該培養物より C— 1 3位配糖化ネマデクチンを採取する C一 1 3位配糖化ネマデ クチンの製造法を提供するものである。
更に本発明はストレブトマイセス · シァネオグリセウス■サブスピーシ一ズ
• ノンシァノゲナスに属し、 ストレプトマイセス■アベルミチリスのエバ一メク チンァグリコン生合成遺伝子群を保有する C一 1 3位水酸化ネマデクチン生産能 を有する微生物及びその製造法を提供するものである。
更に本発明はストレブトマイセス · シァネオグリセウス 'サブスピーシ一ズ
• ノンシァノゲナスに属し、 ストレブトマイセス ·アベルミチリスのエバ一メク チンァグリコン生合成遺伝子群を保有する C一 1 3位配糖化ネマデクチン生産能 を有する微生物及びその製造法を提供するものである。
更に本発明はストレブトマイセス · シァネオグリセウス ·サブスピ一シーズ
• ノンシァノゲナスに属し、 ネマデクチンァグリコン生合成遺伝子群 n e m A 3 — 4オペロンの K S 1 0をコードする領域にバイオマイシン耐性遺伝子を挿入し たネマデクチン非生産性の菌株 （K S 1 0挿入変位株) を提供するものである。
更に本発明はストレプトマイセス · シァネオグリセウス■サブスピーシ一ズ - ノンシァノゲナスに属し、 上記 K S 1 0揷入変位株にストレブトマイセス ·ァ ベルミチリスのエバーメクチンァグリコン生合成遺伝子群 a V e A 3— 4を保有 し、 NemA 1— 2及び AVE S 3— 4とのハイプリッド PKSを形成しうる微 生物を提供するものである。
更に本発明はストレブトマイセス 'シァネオグリセウス ·サブスピ一シ一ズ •ノンシァノゲナスに属し、 N emA 1— 2及び AVE S 3-4とのハイブリッ ド PKSを形成しうる微生物でストレブトマイセス ·アベルミチリスのエバ一メ クチン生合成遺伝子群の制御遺伝子 a V e Rを保有する菌株を提供するものであ o
更に本発明はストレブトマイセス 'シァネオグリセウス ·サブスピ一シーズ
' ノンシァノゲナスに属し、 N emA 1— 2及び AVE S 3-4とのハイプリッ ド PKSを形成しうる微生物でストレプトマイセス ·アベルミチリスのエバーメ クチン生合成遺伝子群の制御遺伝子 a V e R及びエバ一メクチン配糖化およびォ レアンドロース生合成遺伝子群 a v e B I -BVIII を保有する菌株を提供 ^"る ものである。 図面の簡単な説明
第 1図はネマデクチン PKSモジュール 1 0の KS領域を含む 3. O kb断 片の制限酵素地図であり、 矢印は転写方向を示す。
第 2図はネマデクチン KS 1 0領域の S a 1 I部位 vp h挿入断片の制限酵 素地図であり、 矢印は転写方向を示す。
第 3図は C一 1 3ヒドロキシルネマデクチンの — NMRスぺクトルであ る 0
第 4図は C— 1 3ヒドロキシルネマデクチンの13. C— NMRスぺクトルであ る ο
第 5図は C— 1 3グリコシルネマデクチンの — NMRスぺクトルである c 第 6図は C一 1 3グリコシルネマデクチンの13 C— NMRスぺクトルである c 発明を実施するための最良の形態
以下に本発明の実施例について具体的に説明するが、 本発明はけつしてこれ のみに限定されるものではない。 実施例 1
ネマデクチン PKS、 KS 10領域にバイオマイシン耐性遺伝子 （V i omy c i n pho s pho t r an s f e r a s e ; vph) を揷入したストレプト マイセス 'シァネオグリセウス■サブスピ一シ一ズ ·ノンシァノゲナス （S t r ep t omyc e s cyane ogr i s eu s s p. noncyanog e n u s ) NRRL 15773の取得
(1) ネマデクチン PKS、 KS 10をコードする DN A断片のサブクロ一ニン グ
ネマデクチンァグリコ'ン合成酵素遺伝子を含むコスミ ド D.NAのうち、 モジ ユール 1 0の KSドメイン （NEM— KS 10) をコードする DN Aを含むコス ミ ド DNAを制限酵素 B amH I (宝酒造社製、 日本国） で消化した後、 ァガロ ースゲル電気泳動し、 KS 10領域を含有する 3. 0 kbの DNA断片をジーン クリーン Πキット （バイオ 101社製、 米国） を用いて分離 '精製した。 また、 プラスミ ド pUC l 9 (宝酒造社製、 日本国） は、 BamHIで消化した後、 a 1 k a 1 i n e pho spha t a s e (Ca l f i n t e s t i ne) ( 宝酒造社製、 日本国） で脱リン酸化した。 NEM— KS 10を含む 3. Okb断 片と pUCl 9の BamH I消化物、 各々約 0. 1 gを L i g a t ,i o n H i gh (東洋紡社製、 日本国） を用いて、 16 °Cで 16時間反応することで連結 させた。
この DNA連結反応物 10 a 1と大腸菌 DH5 のコンビテントセル （日本 ジーン社製、 日本国） を接触させる；:とにより、 形質転換を行った。 形質転換株 の選択には、 50 g/mlのアンピシリン （和光純薬社製、 日本国） を含有し た 2 Om 1の LB寒天培地を用い、 0. 1 m o 1 /Lイソプロピル一^— D—チ ォガラクトビラノシド （ I P T G)水溶液、 2%5—プロモー 4—クロ口一 3— インドリル—^— D—ガラクトシド （X— g a 1、 ナカライテスク社製、 日本国 .) のジメチルホルムアミ ド （ナカライテスク社製、 日本国） 溶液を、 あらかじめ 各々 50 / 1塗布しておいた。 組換えプラスミ ドを保持する形質転換株のコロニ 一は、 ーガラクドシダ一ゼ活性を失っているため、 X— ga 1を分解できず、 白色を呈する。 この白コロニーをェ一ゼで拾い、 1 Om 1の L B培地に植菌し、 37°Cで 1 6時間、 振盪培養後、 アルカリ法にて菌体からプラスミ ドを抽出 ·精 製した。 得られた組換えプラスミ ドの一部を制限酵素 BamH Iで消化し、 3. 0 kbの DNA断片が pUC 1 9に挿入されているプラスミ ド pUC 1 9. : ： N EM—KS 1 0が得られていることを確認した。
(2) ストレプトマイセス · シァネオグリセウス ·サブスピ一シ一ズ · ノンシァ ノゲナス （S t r ep t omyc e s cyan e ogr i s eu s s p . n on cyanogenu s) NRRL 1 5773由来 BamH I 3. 0 k b DNA断片の末端配列の決定
はじめにサイクルシークェンス反応の鎳型 D N Aの調製を行なつた。 実施例 1— ( 1 ) で得た組換えプラスミ ド pUC 1 9 ： ： NEM— KS 1 0に、 Exp andTaqDNAポリメラ一ゼ緩衝液 （Ro ch社製、 米国） 、 dATP、 d GTP、 dCTP、 dTTP、 配列番号 1に記載の 5 ' -GTGCTGCAAG GCGATTAAGTTGG- 3' の塩基配列を有する合成 DN A、 配列番号 2 に記載の 5' -TCCGGCTCGTATGTTGTGTGGA-3' の塩基配 列を有する合成 DNAをプライマ一セットとして添加し、 Exp an dTa qD NAポリメラ一ゼ （Ro c h社製、 米国） を加えた後、 96 °Cで 5分間処理した 後、 96 °Cで 30秒間、 70°Cで 3分間の反応を 1サイクルとして 30サイクル 繰り返した。 反応終了後、 ェキソヌクレア一ゼ I (アマシャムフアルマシアバイ ォテック社製、 米国） 及びアルカリフォスファターゼ （アマシャムフアルマシア バイオテック社製、 米国） を加え、 37でで 1 5分間反応させた後、 80°Cで 1 0分間処理して両酵素を失活させた。 両酵素を失活させた後、 これを錢型 DNA として I R標識ブライマー （ァロカ社製、 日本国） 及び Th e r mo s e qu e n a s e F l uo r e s c en t l ab e l l e d p r ime r cy c l e s e quen c i ng k i t i t h 7-de a z a-dGTP (アマシャムフアルマシアバイオテック社製、 米国） を添加し、 サイクルシーク エンス反応を行った。 反応終了後、 反応停止液を加え、 混合し試料溶液とした。 この試料溶液を: 90°C、 2分間加熱し、 氷冷した後、 シーケンス電気泳動を 行った。，電気泳動装置は DNAシーケンサー Mode 1 4000シリーズ （L I—COR社製、 米国） を使用し、 電気泳動後のイメージの解析は B a s e I mage I R So f twar e Ve r s i on 2. 30の Image Ana l ys i s Ve r s i on 2. 10で行った。 得られた各 DNA断片 の塩基配列をもとに、 そのアミノ酸配列について B L A S T検索を行つた結果、 —端は S. a V e r m i t i 1 i s aveA4と相同性の高い配列、 反対側の 末端には S. a V e r m i t i 1 i sの r e duc t a s eと相同性の高い配列 が見いだされた。.これらの塩基配列から、 B amH I断片のネマデクチン PKS 遺伝子の転写方向を確認した （第 1図参照） 。
(3) NEM-KS 1 0領域へのバイオマイシン耐性遺伝子 （V i omy c i n pho spho t r ans f e r a s e ； vph) の揷入
pUC 1 9 ： ： NEM-KS 10を制限酵素 B a mH Iで消化した後、 ァガ ロースゲル電気泳動し、 KS 10領域を含有する 3. 0 kbの DNA断片を分離 '精製した。 また、 pB 1 u e s c r i p t SK+ (東洋紡社製、 日本国） を BamHIで消化して得た約 3. Okbの DNA断片 0. l /zgと NEM— KS 10を含む B amH I断片 0. 1 gを混合し、 L i g a t i o n Hi gh ( 東洋紡社製、 日本国） を用いて、 .1 6°Cで 16時間反応することで連結させた。 この 連結反応物 1 Q 1と大腸菌 DH5 のコンビテントセルを接触させ ることにより形質転換を行い、 pB l u e s c r i p t SK+に NEM— KS 10断片を連結した組換えプラスミ ド pB 1 u e s c r i p t SK +： ： ΝΕ; M-KS 10を得た。 さらに、 pB l ue s c r i p t SK+： ： NE -K S 1 0を制限酵素 Hi ndlll (宝酒造社製、 日本国） 及び S s t I (G I BC 〇 BRL社製、 米 ¾) で消化し、 ァガロースゲル電気泳動して得た約 3. 0 k bの NEM— KS 10を含有する DNA断片と、 プラスミ ド pUC 1 9を H i n d III 及び S s t Iで制限酵素消化した約 2. 7 kbの DNA断片を各々 0. 1 II gずつ混合し、 L i g a t i 0 n H i g hを用いて、 16でで 1 6時間反応 することで連結させた。 この DNA連結反応物 10 ^ 1を用いて大腸菌 DH 5 の形質転換を行い、 PUC 19— B g 1 (pUC 19.のマルチクロ一ニングサイ トの両端 E c oR Iと H i n dill の外側に Bg 1 II切断配列 AG AT C Tを揷 入させたもの） に ΝΕΜ— KS 10断片を連結した組換えプラスミ ド pUC 1 9 — Bg l : ： NEM-KS 10を得た。
vp hはプラスミ ド pUC 1 9 ： ： vp hを制限酵素 E c oR I (宝酒造社 製、 日本国） 及び Ps t I (宝酒造社製、 日本国） で消化した後、 ァガロースゲ ル電気泳動し、 vphを含む 1. 7kbの DNA断片を分離 '精製することによ つて得た。 この vp hを含む 1. 7kbの Ec oR I/Ps t .I DNA断片は BKL k i t (宝酒造社製、 日本国） を用いて 37°Cで 15分間反応すること で DNA末端の平滑化を行った。 PUC 1 9— Bg l ： ： NEM— KS 10を制 限酵素 S a 1 I (宝酒造社製： 日本国） で消化した後、 BKL k i tを用いて S a 1 I切断部位の平滑末端化を行った。 平滑末端化した断片と上記の平滑末端 化した vph 1. 7 kbの DNA断片と混合し、 L i g a t i 0 n Hi ghを 用いて DNAの連結を行なった。 この DNA連結反応物 10 / 1を用いて大腸菌 DH5 を形質転換し、 KS 10領域内に vphを挿入した組換えプラスミ ド p UC 1 9-Bg 1 ： ： NEM-KS 10— vp hを得た （第 2図参照） 。 なお、 形質転換体の選択には 50 z gZm 1のアンピシリン及び 150〃 g/m 1のッ ベラクチノマイシン N含有の L B培地を用いた。
pUC 1 9-Bg 1 ： ： NEM-KS 10— vphを制限酵素 Bg 1 II (宝 酒造社製、 日本国） で消化した後、 ァガロースゲル電気泳動し、 KS 10 - vp h領域を含有する 4. 7 kbの DNA断片を分離 '精製した。 放線菌用べクタ一 プラスミ ド pGMl 60を制限酵素 BamHIで消化した後、 ァガロースゲル電 気泳動し、 6. 8 kbの DNA断片を分離 '精製した。 さらに、 a l ka l i n e pho s ha t a s e (Ca l f i n t e s t i n e) を用いて D N A 5' 末端の脱リン酸化を行った。 この pGM160 BamHI消化物と NEM — KS 10— vp h領域を含有する 4. 7 kbの DNA断片を各々 0. Γzgず つ混合し、 L i ga t i on H i' g hを用いて DNAの連結を行った。 この D NA連結反応物 10 1を用いて大腸菌 DH5 を形質転換し、 組換えプラスミ ド pGMl 60 : : NEM-KS 10— vphを得た。 なお、 形質転換体の選択 には 5 0 fi g/m 1のアンピシリン及び 1 5 0 g/m 1のッベラクチノマイシ ン N含有の LB培地を用いた。 p GMl 6 0 ： ： NEM-KS 1 0— vp hを用 いて大腸菌 GM 2 92 9 h s d S ： ： Tn 1 0の形質転換を行った。 なお、 形 質転換体の選択には 3 0 /m 1のクロラムフエニコ一ル （和光純薬社製、 日 本国） 、 50 g/m 1のアンピシリン及び 1 50 g/m 1のッベラクチノマ イシン N含有の LB培地を用いた。 大腸菌 GM29 29 h s d S ： ： T n 1 0 の形質転換体から非メチル化プラスミ ド DNA p GM 1 6 0 ： ： NEM-KS 1 0— vp hを調製した。
(4) ストレプトマイセス ·シァネオグリセウス ·サブスピーシーズ■ノンシァ ノゲナス (S t r e p t omy c e s c y an e o g r i s e u s s ρ . η o n c y a n o g e nu s) NRRL 1 5 773からのプロトプラストの調製 凍結 （一 30°C) 保存してあるストレブトマイセス■ シァネオグリセウス · サブスピーシ一ズ■ノンシァノゲナスの胞子懸濁液を 5 0 m 1の 30 %w/vシ ョ糖、 0. 5%w/vグリシン、 5mM MgC 12 を含む YEME培地 （5 0 Om l容三角フラスコ） に移植し、 ロータリ一シヱ一カーで 3 0°C、 4 8時間培 養した。 菌体を 3 0 0 0 r pm、 1 0分間遠心して集め、 20m 1の P 1 0培地 を加えよく懸濁した後、 3.0 0 0 r pm、 1 0分間遠心して菌体を洗浄した。 洗 浄した菌体に 1 mgZm 1の卵白リゾチーム含有の P 1 0培地を加えて懸濁し、 3 0°Cで 30分間保温してプロトプラストを生じさせた。 1 0 m 1の P 1 0培地 を加えてよく混合した後、 プロトプラスト懸濁液を綿栓フィルターに通しリゾチ —ムで未消化の菌糸を除去した。 綿栓フィル夕一を通過したプロトプラスト懸濁 液を 3 0 0 0 r pm、 1 0分間遠心し、 プロトプラストを沈澱させた。 上清を除 き 1 0 m 1の P 1 0培地でよく懸濁した後、 3 0 0 0 r p m、 1 0分間遠心しプ ロトプラストを沈澱させた。 再度 P 1 0培地を 1 Om l加え、 プロトプラストを 懸濁、 遠心してプロトプラストを洗浄した。 得られた洗浄プロトプラストを 5 m 1の P I 0培地に懸濁し、 0. 1 m lずつ滅菌したエツペンドルフチューブに分 注した後、 — 8 0°Cで保存した。 (5) 染色体上のネマデクチン PKS、 KS 1 0領域にバイオマイシン耐性遺伝 子 （v i omyc i n pho s pho t r an s f e r a s e ； v p h) を揷 入した遺伝子交換体の作成
実施例 1一 （3) で得た組換えプラスミ ド pGMl 60 ： ： NEM-KS 1 0— vp h約 1 と実施例 1 - (4) で得たストレブトマイセス · シァネオグ リセウス■サブスピ一シ一ズ ·ノンシァノゲナスのおよそ 5 X 1 08 個のプロト プラストを滅菌したエツペンドルフチューブに入れ、 直ちに 50 ,0 Z 1の 25 % ポリエチレングリコール MW1 000溶液 （2. 5%ショ糖、 0. 05%KH2 P04 、 0. 1 M CaC l 2 、 50 mM Tr i s—マレイン酸、 ρ H 8. 0 ) を加えて混合し、 室温で 1分間放置した。.次に、 450 1の P 1 0培地を加 えてよく混合した後、 その 1 00 1ずつを R 2 YE寒天培地上にのせ、 2. 5 m 1の軟寒天培地とともに塗り広げた。 30でで 20時間培養した後、 200 gZmlのチォストレプトン （シグマ社製、 米国） 含有の軟寒天培地 2. 5 m 1 を重層した。 30でで 5日間培養し、 チォストレプトンに耐性な形質転換体を得 た。
R 2 YE寒天培地表面に生育したチォストレプトンに耐性の形質転換体を無 菌的にかきとり、 ホモジナイザーで菌糸を切断し、 YMS寒天培地に塗り広げた 。 37°Cで 4日間培養し、 胞子が着生したものをマスタ一プレ一トとしてッベラ クチノマイシン N含有 YMS寒天培地にレプリカした。 30でで 2日間培養し、 ッベラクチノマイシンに耐性のコロニーを選択し、 それぞれを YMS寒天培地上 に塗布した。 これを 30°Cで 5日間培養して胞子が着生したものをマスタ一プレ —トとし、 20 gZm 1チォストレプトン含有 YMS寒天培地にレプリ力して 30°Cで 2日間培養した。 ッベラクチノマイシンに耐性、 チォストレプトンに感 受性となった株を選択し、 染色体上のネマデクチン PKS、 KS 1 0領域に vp hが揷入したことを S ou t he r n h y b r i d i z a t i o n法で確認す るとともにネマデクチンを生産しないことを確認した。 得られたそれぞれの菌株 はストレプトマイセス · シァネオグリセウス ·サブスピ一シ一ズ ·ノンシァノゲ ナス Δ n e m A 4 ： ： v h¾ (S t r ep t omyc e s cyan e ogr i s eu s s ub s p. non cyanogenu s Δ n e mA 4 : : v p h). とした。
なお、 本菌株は、 ストレブトマイセス · シァネオグリセウス ·サブスピーシ ーズ - ノンシァノケナス (Streptomyces cyanogriseus subsp. noncyanogenus) Δη emA4 ： ： v p hとして、 特許手続上の微生物の寄託の国際的承認に関す るブタペスト条約 基ずき日本国茨城県つくば市東 1丁目 1番地 1 中央第 6 ( 郵便番号 305— 8566 ) [A I ST Ts ukub a Cen t r a l 6 , 1— 1， Hi ga s h i 1 - C h om e Ts ukub a-sh i, I b a r ak i— ken 305- 8566 Japan] の独立行政法人産業技術総 合研究所 特許生物寄託センター （ I n t e r n a t i 0 n a 1 Pa t en t Or gan i sm Depo s i t a r y Na t i ona l I n s t i t υ t e o f Advan c e d I ndu s t r i a l Sc i en c e a n d Te chno l ogy) に寄託した。 受託日は平成 1 5年 6月 6日であり 、 受託番号は FERM BP- 8393である。
(6) ストレブトマイセス 'エバーミチリス （S t r ep t omyc e s a v e r m i t i 1 i s ) 由来エバ一メクチンァグリコン合成酵素遺伝子 a v e A 3 一 4の取得
ストレプトマイセス 'エバ一ミチリスの染色体 DNAを制限酵素 E c 0 R Γ で消化し、 低融点ァガロースゲル電気泳動した後、 a V e A 3— 4全体を含有す る配列番号.3に記載の 3991 2 b pの DNA断片をゲルごと切り出し、 フヱノ —ル抽出、 フヱノールクロ口ホルム抽出、 アルコール沈澱することにより分離 ' 精製した。 また、 染色体組込み ベクタ一プラスミ ド pTG 1 i n t— c 0 sを 制限酵素 E c oR Iで消化した後、 ァガロースゲル電気泳動し、 5. 2kbの D NA断片を分離 ·精製した。 この E c oR I消化した pTG 1 i n t— c o sを a l ka l i ne pho s pha t a s e (Ca l f i n t e s t i n e を用いて DNA5' 末端の脱リン酸化を行った後、 約 0. 5 gを av eA3— 4全体を含有す 399 1 2 bpの DNA断片約 2〃 gと混合し、 L i ga t i on k i t v e r . 2 (宝酒造社製、 日本国） の I液および U液を用いて、 25でで 1 0分間反応することで連結させた。 この DNA連結反応物をアルコール沈澱後、 DNAを 2 1の TE緩衝液に 溶角早した。 これを R e a dyToGo L amb d a P a c k a g i n g K i t (アマシャムフアルマシアバイオテック社製、 米国） の P a c k a g i n g E t r a c tに加え、 さらに 2 3〃 1の滅菌水を加え室温で 2時間放置した 後、 0. 5m 1のファージ希釈緩衝液 （SM緩衝液） および 30 1のク πロホ ルムを加え、 転倒混和した。 次いで、 1 32.0 0 r pmで 3 0秒間遠心し、 上清 を新たな滅菌ェッペンドルフチューブに移し、 ラムダファージパッケ一ジング溶 液を得た。
( 7 ) エバーメクチンァグリコン合成酵素遺伝子 a V e A 3— 4を保有する大腸 菌 B L 2 1 r e c A欠損株の取得
実施例 1— (6) で得たラムダファージパッケージング溶液を用いて大腸菌 BL 2 1 r e c A欠損株を宿主としてトランスダクションを行った。 宿主大 fl暴 菌 BL 2 1 r e c A欠損株を LB培地を用いて、 3 7 °C、 一晩振盪培養したも のを 0. 4%麦芽糖添加 LB培地に 1 %となるように加え、 3 7°C、 3時間振盪 培養した。 遠心分離により菌体を回収し、 1 OmM硫酸マグネシウム溶液を用い て洗浄した。 さらに遠心分離により菌体を回収し、 適量の 1.0 mM硫酸マグネシ ゥム溶液に懸濁して宿主菌液を得た。 この宿主菌液と実施例 1— (6) で得たラ 厶ダファ一ジパッケージング溶液をェッペンドルフチューブ内で 1 ： 1の割合で 混合し、 室温で 3 0分間静置した。 その後、 LB培地を加え、 3 0°Cで 1. 5時 間振盪したものをカナマイシン （5 0 j g/m l ) 含有 LA培地上に塗布し、 3 0°Cでー晚培養した。 カナマイシン耐性のコロニーを 9 6穴テストプレートにラ ィブラリーとして培養し、 その中から配列番号 4に記載の合成 D N Aとハイブリ ダイズするコスミ ド D N Aを保有するクロ一ンを選択した。 エバ一メクチンァグ リコン合成酵素遺伝子 a V e A 3— 4を保有する組換えプラスミ ド DNAは、 力 ナマイシン （5 0 zg/m l ) 含有 LB培地を用いて一晩培養した菌体から常法 にしたがってアルカリ法で精製した。 実施例 2 ネマデクチン PKSモジュール 1 0 v p h揷入変位株へのエバーメクチン生合成 遺伝子群 a ve A3 - 4の導入
実施例 1— (5) で得たネマデクチン PKSモジュール 1 0領域 vp h揷入 株の胞子懸濁液を 50 m 1の 30 %w/vショ糖、 0. 5 %W/Yグリシン、 5 mM MgC 12 を含む YEME培地 （ 500 m l容三角フラスコ） に移植し、 口—タリ—シヱ— '力—で 30で、 48時間培養した。 菌体を 3000 r pm、 1 0分間遠心して集め、 20m 1の P 1 0培地を加えよく懸濁した後、 300 O r pm、 1 0.分間遠心して菌体を洗浄した。 洗浄 た菌体に lmg/mlの卵白リ ゾチーム含有の P 1 0培地を加えて懸濁し、 30°Cで 30分間保温してプロトプ ラストを生! させた。 1 0mlの P 1 0培地を加えてよく混合した後、 プロトプ ラスト懸濁液を綿拴フィルタ一に通しリゾチームで未消化の菌糸を除去した。 綿 . 栓フィル夕一を通過したプロトプラスト懸濁液を 3000 r pm、 1 0分間.遠心 し、 プロトプラストを沈澱させた。 上清を除き 1 0m 1の P 1 0培地でよく懸濁 した後、 3000 r pm、 1 0分間遠心しプロトプラストを沈澱させた。 再度 P 1 0培地を 1 Oml加え、 プロトプラストを懸濁、 遠心してプロトプラストを洗 浄した。 得られた洗浄プロトプラストを 5m 1の P 1 0培地に懸濁し、 0. lm 1ずつ滅菌したエツペンドルフチューブに分注した後、 一 80でで保存した。
このプロトプラストに実施例 1— (7) で作製した pTG 1 i n t - c 0 s ： ： a v e A 3— 4約 1〃 gを加え、 直ちに 500 1の 25 %ポリエチレング リコール MW1 000溶液 （2. 5%ショ糖、 0. 05%KH2 PO4、 0. 1 M CaC l 2、 50mM T r i s—マレイン酸、 p H 8..0 ) を加えて混合 し、 室温で 1分間放置し 。 次に、 450 1の P 1 0培地を加えてよく混合し た後、.その 1 00 1ずつを R 2.YE寒天培地上にのせ、 2. 5mlの軟寒天培 地とともに塗り広げた。 30°Cで 20時間培養した後、 1 00 gZm 1のネオ マイシン （シグマ社製、 米国） 含有の軟寒天培地 2. 5mlを重層した。 30°C で 5日間培養し、 ネオマイシンに耐性な形質転換体を得た。 R2YE寒天培地表 面に生育したネオマイシンに耐性の形質転換体を無菌的に 2 g/m 1ネオマイ シン含有 YM S寒天培地に塗り広げた。 得られたそれぞれの菌株はストレプトマ イセス ·シァネオグリセウス■サブスピ一シ一ズ ·ノンシァノゲナス厶 n emA 4 ： : v p ； a t t BTGI ： ： a v e A 4 - aveA3-aye E株とした。 実施例 3
ストレプトマイセス ·シァネオグリセウス■サブスピーシ一ズ ·ノンシァノゲナ ス厶 n emA4 : : vph a t t BTGI ： ： a v e A 4 - a v e A 3 - a v e E株への a N e Rの導入
配列番号 5に記載のエバーメクチン生合成遺伝子群の転写制御遺伝子 a V e Rを含む制限酵素 A ge l DN A断片を連結したベクタ一プラスミ ド p U C B M21 ： ： a veRを制限酵素 Xba Iおよび Hi ndlll で消化し、 ァガロー スゲル電気泳動し、 aveRを含有する 3. 27 k bの DNA断片を分離 ·精製 した。 染色体組込み型ベクタープラスミ ド pUC 1 9 a a d 3 " - i n t Φ C 3 1の Xb a Iおよび Hi n dill 認識部位に aveR含有 3. 27 kb Xb a I— H i n dill 断片を連結し、 大腸菌 BL 21 Δ r e c Aを形質転換した。' . 実施例 2で得たストレブトマイセス 'シァネオグリセウス ·サブスピーシ一 ズ■ノンシァノゲナス Δ n e m A 4 ： ： v p h a t t BTGI ： : a v e A 4 - a v e A 3 - a v e E株の胞子懸濁液を 50 m 1の 30 %W/Yショ糖、 0. 5 %w/vグリシン、 5mM MgC 12 を含む YEME培地 （50 Om 1容三角 フラスコ） に移植し、 ロータリシヱ一力一で 30°C、 48時間培養した。 菌体を 3000 r pm、 1 0分間遠心して集め、 20 m 1の P 1 0培地を加えよく懸濁 した後、 3000 r pm、 1 0分間遠心して菌体を洗浄した。 洗浄した菌体に 1 mg/m 1の卵白リゾチーム含有の P 1 0培地を加えて懸濁し、 30°Cで 30分 間保温してプロトプラストを生じさせた。 1 Om 1の P 1 0培地を加えてよく混 合した後、 プロトプラスト懸濁液を綿栓フィルターに通しリゾチームで未消化の 菌糸を除去した。 綿栓フィル夕一を通過したプロトプラスト懸濁液を 300 O r pm、 1 0分間遠心し、 プロトプラストを沈澱させた。 上清を除き 1 Om 1の P 1 0培地でよく懸濁した後、 3000 r pm、 1 0分間遠心しプロトプラストを 沈澱させた。 再度 P 1 0培地を 1 Oml加え、 プロトプラストを懸濁、 遠心して プロトプラストを洗浄した。 得られた洗浄プロトプラストを 5m 1の P 1 0培地 に懸濁し、 0. 1 m 1ずつ滅菌したエツペンドルフチュ ブに分注した後、 — 8 0°Cで保存した。 このプロトプラストに上記で得たプラスミ ド DNA p UC 1 9 a a d 3 " - i n t C 31 ： : a v e R約 1 tzgを加え、 直ちに 500 1 の 25%ポリエチレングリコール MW1 000溶液 （2. 5%ショ糖、 0. 05 %KH2 P〇4 、 0. 1 M C a C 12 > 50 mM Tr i s—マレイン酸、 p . H8. 0) を加えて混合し、 室温で 1分間放置した。
次に、 450〃 1の P 1 0培地を加えてよく混合した後、 その 1 00 / 1ず つを R 2 YE寒天培地上にのせ、 2. 5m 1の軟寒天培地とともに塗り広げた。 30°Cで 20時間培養した後、 スぺクチノマイシン 3mg/m 1含有軟寒天培地 2. 5mlを重層した。 30°Cで 5日間培養しスぺクチノマイシンに耐性な形質 転換体を得た。 R 2 Y E寒天培地表面に生育したスぺクチノマイシンに耐性の形 質転換体を無菌的に 300 Z g/m 1スぺクチノマイシン含有 YMS寒天培地に 塗り広げた。 得られたそれぞれの菌株はストレブトマイセス■ シァネオグリセゥ ス■サブスピ一シ一ズ ·ノンシァノゲナス Δ η emA 4 ： ： v p h a t t BTG i ： ： aveA4-aveA3一 a v e E a t t B 0C3 i ： ： a v e R株とし た。 実施例 4
ストレプトマイセス · シァネオグリセウス，サブスピーシ一ズ ' ノンシァノゲナ ス An emA4 : : vph a t t BTG i ： ： aveA4-aveA3-av e E a t t B C3! ： ： a veR株の培養および生産物の分離 '精製
実施例 3で得た染色体上ネマデクチン PKSモジュール 7vph揷入株に a V e A 3— 4および a V e Rを組み込んだ株をネマデクチン種培地に植菌し、 3 0°Cで 3日間振盪培養したもの lmLを 500 mL容三角コルベンに分注したネ マデクチン生産培地 5 OmLに加えた。 これを 28°Cで 5日間、 1 80 r pmで 振盪培養した後、 3000 r pmで 1 0分間遠心し、 菌体を回収した。 得られた 菌体をアセトンで懸濁し、 室温で 1時間攪拌した後、 菌体とアセトン層を分取し 、 アセトン層について溶媒留去した。 溶媒乾固した物質に水およびクロ口ホルム を加え攪拌した後、 クロ口ホルム層を分取し、 無水硫酸ナトリウムを加え脱水処 理を行った。 クロ口ホルム層の溶媒留去を行い、 得られた残留物を粗抽出物とし た。 粗抽出物をごく少量のクロ口ホルムに溶解し、 クロ口ホルムで平衡化したシ リカゲル （シグマ社製、 米国） カラムに通塔し、 クロ口ホルムで洗浄した後、 2 5 %vZv酢酸ェチル /クロ口ホルムで洗浄し、 C— 13ヒドロキシルネマデク チンを含まない画分を除去した。 次いで、 40%v/v酢酸ェチル クロ口ホル ムで溶出される画分を除去し、 50%vZv酢酸ェチル /クロ口ホルムで C— 1 3ヒドロキシルネマデクチンを多く含む画分を集めた後、 得られた溶出液を減圧 乾固して黄色油状の物質を得た。 次いで、 得られた黄色油状の物質は以下の条件 で H P L Cを用いて分離 '精製した。
Pega s i l ODSカラム （ODS 3 zm、 カラムサイズ 200mm X 25 Omm；センシュ一科学社製、 日本国） を用い、 ァセトニトリル 50 %、 メタノール 1 8%、 水 32%の混合溶媒を移動相、 検出 246 nm、 流速 8mL /m i nで分離した時、 保持時間 28分の成分を単離した。 得られた化合物は、
!H— NMRスぺクトル （第 3図参照） デ一夕、 及び13 C— NMRスぺクトル （ 第 4図参照） データおよびマススペクトルデータ （M+ 1 = 629 ) によってそ の構造を解析し、 下記式で表される C一 1 3ヒドロキシルネマデクチン （分子 式： C36H5209 ) であることを確認した。
Figure imgf000019_0001
実施例 5 .
ストレプトマイセス ·エノく一ミチリス （S t r ep t omyc e s ave rm i t i 1 i s) 由来エバーメクチン配糖化遺伝子群 a v e B I— BVIII の取得 配列番号 6記載の 1 1 041 bpの DNA断片、 すなわち a v e B I -BV III 全体を含有する DNAを連結した pUC 1 9 ： ： a v e B I -BVIII を制 限酵素 Xb a Iおよび H i n dill で消化し、 a v e B I— BVIII 全体を含有 する DNA断片を低融点ァガロースゲル電気泳動した後、 フエノール抽出、 フエ ノールクロ口ホルム抽出、 アルコール沈澱することにより分離 '精製した。 また 、 染色体組込み型ベクタープラスミ ド pUC 1 9 i n t R 4 - t s rを制限酵素 Xb a I -H i n d III で消化した後、 ァガロースゲル電気泳動し、 1 1 kbの DNA断片を分離 ·精製した。 これらの DNA断片を L i g a t i o n H i g hを用いて連結し、 この DNA連結反応物 1 0 P 1を用いて大腸菌 BL 2 1 Δ Γ e c Aを形質転換し、 組換えプラスミ ド pU C 1 9 i n t R 4— t s r ： ： a v e B I -BVIII を得た。 なお、 形質転換体の選択には 5 0〃 gZm 1のアンピ シリン含有の L B培地を用いた。 実施例 6
ストレプトマイセス · シァネオグリセウス ·サブスピ一シ一ズ · ノ,ンシァノゲナ ス An emA4 ： ： v p h a t t Bi ntTGi ： ： a v eA4 - a v eA 3 - a v e E a t t B c3i ： : a v e R株へのストレプトマイセス 'エバ一ミチリス (S t r e p t omy c e s a v e rm i t i l i s) 由来エバーメクチン配 糖化及びォレアンドロ一ス生合成遺伝子群 a V e B I -BVIII の導入
実施例 3で得たストレプトマイセス 'シァネオグリセウス 'サブスピーシ一 ズ · ノンシァノゲナス厶 n e mA 4 ： ： v p h a t t BTGI ： ： a v e A 4 - a v eA3 -a v e E a t t B 0C3i ： ： a v e R株の胞子懸濁液を 5 0m l の 3 0 %w/vショ糖、 0. 5%w/vグリシン、 5mM MgC l 2 を含む Y E ME培地 （5 0 Om l容三角 7ラスコ） に移植し、 ロータリシェ一力一で 3 0 °C、 4 8時間培養した。 菌体を 30 0 0 r pm、 1 0分間遠心して集め、 2 0m 1の P 1 0培地を加えよく懸濁した後、 3 0 0 0 r pm、 1 0分間遠心して菌体 を洗浄した。 洗浄した菌体に lmgZmlの卵白リゾチーム含有の P 1 0培地を 加えて懸濁し、 3 0°Cで 30分間保温してプロトプラストを生じさせた。 1 0m 1の P I 0培地を加えてよく混合した後、 プロトプラスト懸濁液を綿栓フィルタ —に通しリゾチームで未消化の菌糸を除去した。 綿栓フィルターを通過したプロ トプラスト懸濁液を 30 0 0 r pm、 1 0分間遠心し、 プロトプラストを沈澱さ せた。 上清を除き 1 Om 1の P 10培地でよく懸濁した後、 3000 r pm、 1 0分間遠心しプロトプラストを沈澱させた。 再度 P 1 0培地を 1 Oml加え、 プ 口トプラストを懸濁、 遠心してプロトブラストを洗浄した。 得られた洗浄プロト プラストを 5mlの P 1 0培地に懸濁し、 0. 1 mlずつ滅菌したエツペンドル フチューブに分注した後、. - 80でで保存した。 このプロトプラストに実施例 5 で得たプラスミ ド' DNA pUC 1 9 i n t R 4 - t s r ： ： a v e B I— BV III 約 1 gを加え、 直ちに 50 Ο 1の 25%ポリエチレングリコール MW1 . 000溶液 （2. 5%ショ糖、 0. 05%KH2 PO4 、 0. 1 M C a C 12 、 5 OmM Tr i s—マレイン酸、 pH8. 0 ) を加えて混合し、 室温で 1分 間放置した。
次に、 450 1の P 1 0培地を加えてよく混合した後、 その 1 00 1ず つを R 2 YE寒天培地上にのせ、 .2. 5m 1の軟寒天培地とともに塗り広げた。 30°Cで 20時間培養した後、 チォストレプトン 200 gZm 1含有軟寒天培 地 2. 5mlを重層した。 30でで 5日間培養しチォストレブトンに耐性な形質 転換体を得た。 R 2 YE寒天培地表面に生育したチォストレプトンに耐性の形質 転換体を無菌的に 20 n g/m 1チォストレブトン含有 YMS寒天培地に塗り広 げた。 得られたそれぞれの菌株はストレブトマイセス ·シァネオグリセウス ·サ ブスピーシーズ■ノンシァノゲナス Δη emA 4 ： ： v p h a t t BTG ： ： aveA4-av eA3-aveE a t t B ø csi ： ： a v e R a t t BR4 ： ： a v e B I -BVIII とした。 実施例 7
ストレブトマイセス ·シァネオグリセウス■サブスピーシーズ■ ノンシァノゲナ ス厶 n emA4 : : vph a t t BTGI ： ： a v e A 4 - a v e A 3 - a v e E a t t B c3i ： ： a v e R a t t BR4： : a v e B I— B VIII 株の培 養および生産物の分離 .精製
実施例 6で得た染色体上ネマデクチン P K Sモジュール 1 0の V p h挿入株 に aveA3_4， a v eRおよび a v e B I - BVIII を組み込んだ株をネマ デクチン種培地に植菌し、 30°Cで 3日間振盪培養したもの 1 mLを 50 OmL 容三角コルべンに分注したネマデクチン生産培地 50 m Lに加えた。 これを 28 °Cで 5日間、 1 80 r pmで振盪培養した後、 3000 r pmで 1 0分間遠心し 、 菌体を回収した。 得られた菌体をアセトンで懸濁し、 室温で 1時間攪拌した後 、 菌体とァセトン層を分取し、 ァセトン層について溶媒留去した。 溶媒乾固した 物質に水およびクロ口ホルムを加え攪拌した後、 クロ口ホルム層を分取し、 無水 硫酸ナトリウムを加え脱水処理を行った。 クロ口ホルム層の溶媒留去を行い、 得 られた残留物を粗抽出物とした。 粗抽出物をごく少量のクロ口ホルムに溶解し、 クロ口ホルムで平衡化したシリカゲル （シグマ社製、 米国） カラムに通塔し、 ク ロロホルムで洗浄した後、 30 %v/v酢酸ェチル クロ口ホルムで洗浄し、 C — 1 3グリコシルネデクチンを含まない画分を除去した。 次いで、 40 % /Ύ 酢酸ェチル /クロ αホルムで溶出される画分、 50 %ν/ν酢酸ェチル /クロ口 ホルムで溶出される画分を集めた後、 得られた溶出液をそれぞれ減圧乾固して黄 色油状の物質を得た。 次いで、 得られた黄色油状の物質を H PLCを用いて分離 '精製した。
カラムは Pega s i l ODS (3 m、 カラムサイズ 20 ø x 25 Om m；センシュ一科学社製） を使用し、 ァセトニトリル ' メタノール '水を 55 ： 1 8 : 27の割合で混合したものを移動層として用いた。 流速は 6mL/mi n に設定し、 246 nmの吸収を指標に、 保持時間 1 20分の成分を分取した。 得 られた化合物は ！H— NMRスペクトル （第 5図参照） データ、 及び13 C— NM Rスペクトル （第 6図参照） データ、 マススぺクトルデータ （M+ 1 = 9 1 7) によってその構造を解析し、 下記式 C— 1 3グリコシルネマデクチンひ （分子式 ： C5QH76015) であることを確認した。
Figure imgf000022_0001
前記の各実施例において使用した各種培地および緩衝液の組成は以下に示す 通りである。
ファージ希釈緩衝液 （ S M緩衝液）
Tr i s塩酸 （pH7. 5) 1 0 mM 塩化ナトリウム 1 0 OmM 硫酸マグネシウム 7水和物 1 OmM サイクルシーケンス反応停止液
ブロモフヱノールブル一 0. 02% EDTA (pH8. 0) 2 OmM ホルムァミ ド 95 %
YEME培地
酵母エキス （D i f c o社製） 3 g
麦芽エキス （Ox 0 i d社製） 3
ペプトン （D i f c o社製） 5 g
グルコース 1 0 g
ショ糖 300 g
蒸留水 1 000ml p H無調整、 121 °C、 1分間高圧蒸気滅菌 c
塩化第 2鉄 6水和物 200 mg 塩化亜鉛 40 m g 塩化第 2銅 2水和物 1 0 mg 塩化マンガン 4水和物 1 Omg ホウ酸ナトリウム 1 0水和物 1 0 m g モリブデン酸ァンモニゥム 4水和物 . 1 Omg 蒸留水 1 000ml P 1 0培地
ショ糖. 1 03 g
硫酸力リウム 0. 25 g 塩化マグネシウム 6水和物 2. 03 g
2. Oml 蒸留水 800ml
1 21で、 15分間の高圧蒸気滅菌後、 以下の組成のものを無菌的に加 える。
0. 5%リン酸 1カリウム 1 0 m 1
3. 68 %塩化カルシウム 2水和物 1 00ml
0. 25M TES* (pH7. 2) 1 00ml
*N—トリス （ヒドロキシメチル） メチルー 2—アミノエ夕ンスルホン酸
R 2 YE寒天培地
ショ糖 1 03 g
硫酸カリウム 0. 25 g 塩化マグネシウム 6水和物 1 0. 1 2 g グルコース 1 0 g
カザミノ酸 （D i f c o社製） 0. 1 g
22 g
蒸留水 800 ml
1 21°C、 1 5分間の高圧蒸気滅菌後、 以下の組成のものを無菌的に加 る (
2ml
0. 5%リン酸 1カリウム 1 0ml
3. 68%塩化カルシウム 2水和物 80ml
20 %L—プロリン 1 5ml
0. 25M TES (pH7. 2) 1 00ml
1 0%酵母エキス （D i f c o社製） 50ml 1M 水酸化ナトリウム 5ml, 軟寒天培地
ショ糖 1 03 g
塩化マグネシゥム 6水和物 1 0. 1 2 g 寒天 （D i f c o社製） 6. 5 g 蒸留水 820 ml
1 21°C、 1 5分間の高圧蒸気滅菌後、 以下の組成のものを無菌的に加 える <
3. 68 %塩化力ルシゥム 2水和物 80ml
0. 25M TES* (pH7. 2) 1 00ml
YMS寒天培地
麦芽エキス （D i f c o社製） 1 0 g
酵母エキス （D i f c o社製） 4 g
可溶性澱粉 （D i f c o社製） 4 g
20 g
蒸留水 1 000ml
2 M水酸化カリウムで pH 7. 4とした後、 1 21°C、 1 5分間高圧蒸 気滅菌する。 滅菌終了後、 塩化マグネシウム、 硝酸カルシウムを各々 1 0mM、 8 mMと成るように加える。
LA培地
トリプトン （Oxo i d社製） 1 0 g
酵母エキス （Ox 0 i d社製） 5 g
塩化ナトリウム 5 g
寒天 1 5 g
蒸留水 1 000ml
2M水酸化カリウムで pH 7. 2とした後、 121°C、 1 5分間高圧蒸 気滅菌する。 ネマデクチン生産菌種培地
グルコース 1 0 g
デキストリン 20 g
酵母エキス 5 g
NZ—ァミン A 5 g
炭酸カルシウム 1 g
蒸留水 1 000ml ！！無翻整、 1 21°C、 1 5分間高圧蒸気滅菌する。 ネマデクチン生産培地
グルコース 50 g
綿実粉 25 g
炭酸カルシウム 7 g
蒸留水 1 000ml pH無調整、 1 21。C、 1 5分間高圧蒸気滅菌する。 産業上の利用分野
以上のごとく本発明は、 ネマデクチンを生産するストレブトマイセス属に属 する微生物に、 ネマデクチン類似化合物を生産する微生物の DNAを導入して C 一 1 3ヒドロキシルネマデクチン及び C— 1 3グリコシルネマデクチンを生産蓄 積せしめて、 採取することができる。 このように、 分子遺伝学的手法によって C 一 1 3グリコシルネマデクチン生産菌を作製することで立体選択的に配糖化され たネマデクチンを効率的に取得することができ、 抗昆虫■抗寄生虫等の生物活性 の改善が期待される。

Claims

請求の範囲
1. ストレブトマイセス ' シァネオグリセウス 'サブスピーシ一ズ . ノンシァノゲナスに属し、 C一 1 3位配糖化ネマデクチン生産能を有する菌株。 '
2. C一 1 3位配糖化ネマデクチン生産能を有する菌株がストレプト マイセス · シァネオグリセゥム 'サブスピーシーズ ノンシァノゲナス （Strept omyces cyaneogriseus subsp. noncyanogenus ) Δ n e m A 4 ： ： v p h a t t BTGI ： ： aveA4-aveA3-aveE a t t B 0C3i ： ： a v.e R a t t BR4 ： ： a v e B I -BVIII (FERM BP - 8394 ) である請 求の範囲第 1項記載の菌株。
3. ストレプトマイセス■ シァネオグリセウス ·サブスピ一シ一ズ · ノンシァノゲナスに属し、 C— 1 3位水酸化ネマデクチン生産能を有する菌株。
4. C- 1 3位水酸化ネマデクチン生産能を有する菌株がストレプト マイセス · シァネオグリセウス■サブスピ一シ一ズ■ノンシァノゲナス （Strept omyces cyaneogriseus subsp. noncyanogenus ) Δ n e m A 4 ： ： v p h a t t BTGI ： ： a v e A 4 - a v e A 3 - a v e E a t t B'0c3i ： ： a v e R (FERM BP- 8395 ) である請求の範囲第 3項記載の菌株。
5. ストレプトマイセス · シァネオグリセウス ·サブスピーシーズ■ ノンシァノゲナスに属し、 C— 1 3位水酸化ネマデクチン生産能を有する微生物 を培地で培養し、 培養物中に C— 1 3位水酸化ネマデクチンを生産蓄積させ、 該 培養物より C— 1 3位水酸化ネマデクチンを採取することを特徴とする C— 1 3 位水酸化ネマデクチンの製造法。
6. ストレプトマイセス · シァネオグリセウス .サブスピ一シ一ズ . ノンシァノゲナスに属し、 C— 1 3位配糖化ネマデクチン生産能を有する微生物 を培地で培養し、 培養物中に C— 1 3位配糖化ネマデクチンを生産蓄積させ、 該 培養物より C一 1 3位配糖化ネマデクチンを採取することを特徴とする C一 1 3 位配糖化ネマデクチンの製造法。
7 . ストレプトマイセス ·シァネオグリセウス .サブスピ一シーズ · ノンシァノゲナスに属し、 ストレプトマイセス ·アベルミチリスのエバ一メクチ ンァグリコン生合成遺伝子群を保有する C一 1 3位水酸化ネマデクチン生産能を 有する微生物。
8 . ストレプトマイセス · シァネオグリセウス■サブスピ一シ一ズ■ ノンシァノゲナスに属し、 ストレプトマイセス ·アベルミチリスのエバ一メクチ ンァグリコン生合成遺伝子群を保有する C— 1 3位水酸化ネマデクチン生産能を 有する請求の範囲第 7項記載の微生物の製造法。
9 . ストレプトマイセス . シァネオグリセウス 'サブスピーシーズ■ ノンシァノゲナスに属し、 ストレプトマイセス ·アベルミチリスのエバーメクチ ンァグリコン生合成遺伝子群を保有する C一 1 3位配糖化ネマデクチン生産能を 有する微生物。 . .
1 0 . ストレプトマイセス · シァネオグリセウス ·サブスピ一シ一ズ · ノ ンシァノゲナスに属し、 ストレプトマイセス 'アベルミチリスのエバ一メクチン ァグリコン生合成遺伝子群を保有する C一 1 3位配糖化ネマデクチン生産能を有 する請求の範囲第 9項記載の微生物の製造法。
1 1 . ストレブトマイセス · シァネオグリセウス ·サブスピ一シーズ ·ノ ンシァノゲナスに属し、 ネマデクチンァグリコン生合成遺伝子群 n e m A 3 - 4 オペロンの K S 1 0をコードする領域にバイオマイシン耐性遺伝子を挿入したネ マデクチン非生産性の菌株 （K S 1 0挿入変位株） 。
1 2. ネマデクチン非生産性の菌株が、 ストレブトマイセス ' シァネオグ リセウス 'サブスピ一シ一ズ · ノンシァノゲナス （Streptomyces cyaneogriseus subsp. 匪 cyanogenus ) 厶 n e mA 4 ： ： v p h (F E RM B P - 8393
) である請求の範囲第 1 1項記載の菌株。
1 3. ストレブトマイセス · シァネオグリセウス■サブスピーシ一ズ ' ノ ンシァノゲナスに属し、 上記 KS 1 0揷入変位株 ストレブトマイセス .アベル ミチリスのエバ一メクチンァグリコン生合成遺伝子群 a V e A 3— 4を保有し、 NemA 1— 2及び AVES 3一 4とのハイプリッ ド P KSを形成しうる菌株。
14. ズトレプトマイセス · シァネオグ.リセウス ·サブスピ一シ一ズ · ノ ンシァノゲナスに属し、 NemA 1一 2および AVES 3-4とのハイプリッ ド PKSを形成しうる.微生物でストレプトマイセス 'アベルミチリスのエバ一メク チン生合成遺伝子群の制御遺伝子 a V e Rを保有する菌株。
1 5. ストレプトマイセス · シァネオグリセウス 'サブスピ一シーズ · ノ ンシァノゲナスに属し、 NemA 1— 2及び AVES 3一 4とのハイプリッ ド P K Sを形成しうる微生物でストレプトマイセス 'アベルミチリスのエバーメクチ ン生合成遺伝子群の制御遺伝子 a V e R及びエバ一メクチン配糖化およびォレア ンドロース生合成遺伝子群 a V e B I— BVIII を保有する菌株。
PCT/JP2003/007407 2003-06-11 2003-06-11 ストレプトマイセス属に属するネマデクチン生産能を有する菌株、該菌株を用いるネマデクチンの製造法 Ceased WO2004111230A1 (ja)

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