[go: up one dir, main page]

TW201516045A - 絲胺酸／蘇胺酸激酶抑制劑 - Google Patents

絲胺酸／蘇胺酸激酶抑制劑 Download PDF

Info

Publication number
TW201516045A
TW201516045A TW103125595A TW103125595A TW201516045A TW 201516045 A TW201516045 A TW 201516045A TW 103125595 A TW103125595 A TW 103125595A TW 103125595 A TW103125595 A TW 103125595A TW 201516045 A TW201516045 A TW 201516045A
Authority
TW
Taiwan
Prior art keywords
methyl
cancer
chloro
etoac
phenyl
Prior art date
Application number
TW103125595A
Other languages
English (en)
Inventor
Chudi Ndubaku
Lewis J Gazzard
Joachim Rudolph
James Crawford
Joy Drobnick
Wendy Lee
Original Assignee
Hoffmann La Roche
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Hoffmann La Roche filed Critical Hoffmann La Roche
Publication of TW201516045A publication Critical patent/TW201516045A/zh

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D471/00—Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00
    • C07D471/02—Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D471/04—Ortho-condensed systems
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/519—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/02—Inorganic compounds
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/06—Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/06—Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite
    • A61K47/08—Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite containing oxygen, e.g. ethers, acetals, ketones, quinones, aldehydes, peroxides
    • A61K47/10—Alcohols; Phenols; Salts thereof, e.g. glycerol; Polyethylene glycols [PEG]; Poloxamers; PEG/POE alkyl ethers
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/06—Organic compounds, e.g. natural or synthetic hydrocarbons, polyolefins, mineral oil, petrolatum or ozokerite
    • A61K47/26—Carbohydrates, e.g. sugar alcohols, amino sugars, nucleic acids, mono-, di- or oligo-saccharides; Derivatives thereof, e.g. polysorbates, sorbitan fatty acid esters or glycyrrhizin
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
    • A61K9/0014—Skin, i.e. galenical aspects of topical compositions
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
    • A61K9/0019—Injectable compositions; Intramuscular, intravenous, arterial, subcutaneous administration; Compositions to be administered through the skin in an invasive manner
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/02—Suppositories; Bougies; Bases therefor; Ovules
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/10—Dispersions; Emulsions
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/10—Dispersions; Emulsions
    • A61K9/107—Emulsions ; Emulsion preconcentrates; Micelles
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/20—Pills, tablets, discs, rods
    • A61K9/2004—Excipients; Inactive ingredients
    • A61K9/2013—Organic compounds, e.g. phospholipids, fats
    • A61K9/2018—Sugars, or sugar alcohols, e.g. lactose, mannitol; Derivatives thereof, e.g. polysorbates
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D491/00—Heterocyclic compounds containing in the condensed ring system both one or more rings having oxygen atoms as the only ring hetero atoms and one or more rings having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by groups C07D451/00 - C07D459/00, C07D463/00, C07D477/00 or C07D489/00
    • C07D491/02—Heterocyclic compounds containing in the condensed ring system both one or more rings having oxygen atoms as the only ring hetero atoms and one or more rings having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by groups C07D451/00 - C07D459/00, C07D463/00, C07D477/00 or C07D489/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D491/10—Spiro-condensed systems
    • C07D491/107—Spiro-condensed systems with only one oxygen atom as ring hetero atom in the oxygen-containing ring
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D491/00—Heterocyclic compounds containing in the condensed ring system both one or more rings having oxygen atoms as the only ring hetero atoms and one or more rings having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by groups C07D451/00 - C07D459/00, C07D463/00, C07D477/00 or C07D489/00
    • C07D491/02—Heterocyclic compounds containing in the condensed ring system both one or more rings having oxygen atoms as the only ring hetero atoms and one or more rings having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by groups C07D451/00 - C07D459/00, C07D463/00, C07D477/00 or C07D489/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D491/10—Spiro-condensed systems
    • C07D491/113—Spiro-condensed systems with two or more oxygen atoms as ring hetero atoms in the oxygen-containing ring

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Dermatology (AREA)
  • Dispersion Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Inorganic Chemistry (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Abstract

本發明揭示具有式I之化合物，其中R1、R2、R3、R4、R5、Ra、Rb、Rc、Rd、Re、n、r、s及t係如本文所定義，且該等化合物係PAK1之抑制劑。本發明亦揭示用於治療癌症及過度增殖病症之組合物及方法。

Description

絲胺酸/蘇胺酸激酶抑制劑
本發明係關於抑制絲胺酸/蘇胺酸激酶且可用於藉由抑制通常在癌性組織中過度活躍或過表現之信號轉導路徑治療過度增殖及腫瘤病之化合物。本發明化合物係群組1 p21活化蛋白激酶(PAK1、PAK2及PAK3)之抑制劑。本發明進一步係關於利用本發明範圍內之化合物治療癌症或過度增殖疾病之方法。
蛋白激酶係催化蛋白質中之特定酪胺酸、絲胺酸或蘇胺酸殘基之羥基發生磷酸化之酶之家族。通常，該磷酸化可顯著改變蛋白質之功能，且因此蛋白激酶在眾多細胞過程(包括代謝、細胞增殖、細胞分化及細胞存活)之調控中可能極其重要。該等細胞過程之機制提供靶向蛋白激酶以治療源於或涉及該等細胞過程之病症之疾病病況之基礎。該等疾病之實例包括(但不限於)癌症及糖尿病。
蛋白激酶可分為兩種類型，蛋白質酪胺酸激酶(PTK)及絲胺酸-蘇胺酸激酶(STK)。PTK及STK可為受體蛋白激酶或非受體蛋白激酶。PAK係非受體STK之家族。絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶之p21活化蛋白激酶(PAK)家族在細胞骨架組織、細胞形態發生、細胞過程及細胞存活中起重要作用(Daniels等人，Trends Biochem.Sci.1999 24：350-355；Sells等人，Trends Cell.Biol.1997 7：162-167)。PAK家族係由六個成員組成，該等成員可細分為兩個群組：PAK 1-3(群組I)及PAK 4-6(群組 II)，該等群組係基於序列同源性及群組I PAK中自動抑制區之存在區分開。p21活化激酶(PAK)用作Rac及Cdc42 GTPase功能以及Ras驅動之腫瘤形成所需路徑之重要介導者。(Manser等人，Nature 1994 367：40-46；B.Dummler等人，Cancer Metathesis Rev.2009 28：51-63；R.Kumar等人，Nature Rev.Cancer 2006 6：459-473)。
具體而言，群組1 PAK之含量及活性之改變通常與包括(但不限於)以下之人類惡性腫瘤相關：膀胱癌、乳癌、結腸直腸癌、胃癌、神經膠質母細胞瘤、肝細胞癌、卵巢癌及腎細胞癌、原發性乳腺癌、鱗狀非小細胞肺癌或鱗狀頭頸癌。(J.V.Kichina等人，Expert.Opin.Ther.Targets 2010 14(7)：703)。11q13處之PAK1基因擴增在管腔乳癌中較為普遍，且PAK1蛋白質表現與淋巴結轉移相關。乳房浸潤性乳管癌中PAK2之高表現與增加之存活及乳房腫瘤細胞對化學治療劑之抗性相關(X.Li等人，J.Biol.Chem.2011 286(25)：2291)。鱗狀非小細胞肺癌(NSCLC)及鱗狀頭頸癌具有異常的細胞質PAK1表現。(C.C.Ong等人，Proc.Nat.Acad.Sci.,USA 2011 108(17)：7177)。群組1 PAK有助於鱗狀NSCLC細胞移動性、存活及增殖(C.C.Ong等人，Oncotarget 2011 2(6)：491)，且PAK2與響應各種細胞刺激之有絲分裂完成相關(M.R.Banko等人，Mol.Cell 2011,2011年11月30日)。
業內持續需要可用於癌症及過度增殖病況之新的及新穎的治療劑。PAK家族成員係重要的信號傳導蛋白質，其通常在許多癌性組織中過表現及/或過度活躍。抑制或調節PAK家族成員活性之新的醫藥化合物之設計及研發係必需的。業內持續需要展現群組I PAK相對於群組II PAK之選擇性及/或在其他激酶存在下選擇性地抑制PAK之改良之PAK抑制劑。在本發明之一個態樣中，提供式I化合物，其中：
R 1 係H、C1-3烷基、C1-3氟烷基、氧雜環丁-3-基或3-甲基-氧雜環丁-3-基；R 2 係(i)C2-6羥基烷基或C2-6二羥基烷基，(ii)(伸烷基) n NR a R b ，其中伸烷基鏈視情況經羥基取代，(iii)(伸烷基)1-3OR 5 ，其中R 5 係(伸烷基)2-4NR a R b 、(伸烷基)2-4OR f 或選自氮雜環丁烷、吡咯啶、六氫吡啶或氮呯之雜環，該雜環視情況經C1-6烷基取代，(iv)(伸烷基) r C(O)NR a R b 、(v)(伸烷基)n-CN，(vi)(伸烷基)t-(C4-6-環烷基NR c R d )，(vii)雜環基-(伸烷基)n，其中雜環基係指經取代之氮雜環丁基、吡咯啶基、4,4-二氟-吡咯啶-3-基、六氫吡啶基、3,3-二氟-六氫吡啶-3-基、氮呯基、嗎啉基、4-甲基嗎啉-2-基、5-胺基-1,3-二氧雜環戊-2-基、5-甲基胺基-1,3-二氧雜環戊-2-基、3-氮雜-二環[3.1.0]己-6-基、5-氧雜-2-氮雜螺[3.4]辛-7-基、1-氧雜-8-氮雜螺[4.5]癸-3-基、1-氧雜-7-氮雜螺[4.4]壬-3-基、5,9-二氧雜-2-氮雜螺[3.5]壬-7-基、1,1-二側氧基1-4-噻嗪烷-2-基或六氫吡嗪基，該雜環基部分視情況經C(=O)CHR f NH2、側氧基、羥基、胺基、C1-3烷基胺基、C1-3二烷基胺基、氰基、氧雜環丁-3-基或C1-6-羥基烷基取代，(viii)(伸烷基) r S(O)2 R 5 ，其中R5係(伸烷基)0-3NR a R b 氮雜環丁基、吡咯啶基或六氫吡啶基，或(ix)1-亞胺基-1-氧雜-四氫硫吡喃基(thianyl)-4-基或1,1-二側氧基(dioxido)四氫-2H-硫吡喃-4-基；R a 及R b (a)在每次出現時獨立地係氫、C1-3烷基、C2-4胺基烷基、C2-4-羥基烷基、吡咯啶基、六氫吡啶基或氮雜環丁基，或，(b)R a 及R b 與其所連接之氮一起形成視情況含有選自O、NR e 或S(O)0-2之其他 雜原子之4員至7員單環或二環，該環視情況經一或兩個羥基或(CH2)0-2N(R f )2取代；R c 及R d 在每次出現時獨立地係氫、C1-3烷基或氧雜環丁基；R e 係氫、C1-3烷基或C1-3烷基磺醯基；R f 係氫或C1-3烷基；R 3 係雜芳基，其中雜芳基環係吡啶-2-基、吡嗪-2-基、噻唑-4-基、噻唑-2-基、吡唑-3-基、1,2,4-三唑-2-基或1,2,4-噁二唑-3-基，各自視情況經R 4 或C1-3羥基烷基部分取代；R 4 係C1-6烷基、環丙基或鹵素；n為2至6；r係1至6；s為0、1或2；t為0至6；或，其醫藥上可接受之鹽，限制條件係式I化合物不為：8-(反式-4-胺基環己基)-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡嗪基)苯基]-2-(乙基胺基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮，8-(反式-4-胺基環己基)-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡嗪基)苯基]-2-[(1-甲基乙基)胺基]-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮，6-(2-氯-4-(5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(六氫吡啶-4-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮，或，6-(2-氯-4-(5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基)苯基)-2-(異丙基胺基)-8-(六氫吡啶-4-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。
本發明之另一態樣係關於藉由向有需要之患者投與治療有效量之式I化合物來治療過度增殖病症之方法。本發明之另一態樣係關於藉由向有需要之患者投與治療有效量之式I化合物來治療癌症之方法。該化合物可單獨投與或與至少一種其他抗過度增殖性或化學治療 性化合物共投與。
本發明之另一態樣係關於抑制細胞中PAK活性之方法，其包含用有效減弱或消除PAK活性之量之式I化合物治療細胞。
本發明之另一態樣係關於醫藥組合物，其含有式I化合物以及一或多種醫藥上可接受之賦形劑、稀釋劑及/或載劑。
本文所用片語「一(a或an)」實體係指彼實體之一或多者；例如，一種化合物係指一或多種化合物或至少一種化合物。因此，術語「一(a或an)」、「一或多個(種)」及「至少一個(種)」在本文中可互換使用。
片語「如上文所定義」係指如本發明內容或最廣泛申請專利範圍中所提供之每一基團之最廣泛定義。在下文提供之所有其他實施例中，可存在於每一實施例中且未明確定義之取代基保留本發明內容中提供之最廣泛定義。
如在本說明書中所用，不管在過渡片語中抑或在申請專利範圍之正文中，術語「包含(Comprise(s)及comprising)」應理解為具有開放性含義。亦即，該等術語應理解為與片語「具有至少」或「包括至少」同義。當用於製程背景中時，術語「包含」意指該製程至少包括所列舉步驟，但可包括其他步驟。在用於化合物或組合物背景中時，術語「包含」意指該化合物或組合物至少包括所列舉特徵或組份，但亦可包括其他特徵或組份。
本文所用術語「獨立地」指示在任一情形中應用之變量與相同化合物內存在抑或不存在具有相同或不同定義之變量無關。因此，在R”出現兩次且定義為「獨立地為碳或氮」之化合物中，兩個R”可為 碳，兩個R”可為氮，或可一個R”為碳且另一個為氮。
當任一變量(例如，R1、R4a、Ar、X1或Het)在繪示及闡述本發明所應用或所主張之化合物的任一部分或式中出現一次以上時，其在每次出現時之定義獨立於其在其他各次出現時之定義。同樣，只有當該等化合物可產生穩定化合物時，取代基及/或變量之組合方可容許。
鍵末端之符號「*」或畫過鍵之「」各自係指官能基或其他化學部分與該分子其餘部分的連接點。因此，例如：MeC(=O)OR4其中或。
畫入環系統中之鍵(與連結於明確點相反)指示該鍵可與任一適宜環原子連接。
本文所用術語「可選」或「視情況」意指隨後所述事件或情況可能(但未必)發生，且該闡述包括該事件或情況發生之情形及該事件或情況不發生之情形。例如，「視情況經取代」意指視情況經取代之部分可納入氫或取代基。
本文所用術語「約」意指大約、在附近、概略地或左右。當術語「約」結合數值範圍使用時，其藉由將邊界延伸至高於及低於所述數值來修改該範圍。通常，本文所用術語「約」將數值修改為在所述數值上下變動20%。
如本文所使用，變量之數值範圍之列舉意欲表明，本發明可使用等於該範圍內任一值之變量來實踐。因此，就固有離散性變量而言，該變量可等於數值範圍中之任一整數值，包括該範圍之端點。類似地，就固有連續性變量而言，該變量可等於數值範圍中之任一實數值，包括該範圍之端點。例如，就固有離散性變量而言，闡述為具有介於0與2間之值之變量可為0、1或2；且就固有連續性變量而言，其可為0.0、0.1、0.01、0.001或任一其他實數值。
熟悉此項技術者應瞭解，一些式I化合物可含有一或多個對掌性 中心且因此以兩種或更多種立體異構形式存在。該等異構物之外消旋物、個別異構物及富含一種鏡像異構物之混合物以及非鏡像異構物(當存在兩個對掌性中心時)及部分地富含特定非鏡像異構物之混合物在本發明之範圍內。熟悉此項技術者另外應瞭解，莨若烷環之取代可呈內組態或外組態，且本發明涵蓋兩種組態。本發明包括所有個別立體異構物(例如鏡像異構物)、外消旋混合物或部分拆分之式I化合物混合物及其個別互變異構形式(若適當)。
式I化合物展現互變異構現象。互變異構化合物可以兩種或更多種可相互轉化之物質形式存在。質子移變互變異構物係由共價鍵結氫原子在兩個原子間之遷移產生。互變異構物通常以平衡狀態存在且用於分離出個別互變異構物之嘗試通常會產生化學及物理性質與化合物混合物相符之混合物。平衡位置端視分子內之化學特性而定。例如，在許多脂肪族醛及酮(例如乙醛)中，酮形式佔優勢；而在酚中，烯醇形式佔優勢。常見質子移變互變異構物包括酮/烯醇(-C(=O)-CH-D-C(-OH)=CH-)、醯胺/亞胺基酸(-C(=O)-NH-D-C(-OH)=N-)及脒(-C(=NR)-NH-D-C(-NHR)=N-)互變異構物。後兩者在雜芳基及雜環中尤其常見且本發明涵蓋化合物之所有互變異構形式。
式I化合物可含有酸性或鹼性中心，且適宜鹽係自酸或鹼形成，其可形成具有類似抗病毒活性之無毒鹽。無機酸之鹽之實例包括鹽酸鹽、氫溴酸鹽、氫碘酸鹽、氯化物、溴化物、碘化物、硫酸鹽、硫酸氫鹽、硝酸鹽、磷酸鹽、磷酸氫鹽。有機酸之鹽之實例包括乙酸鹽、富馬酸鹽、雙羥萘酸鹽、天冬胺酸鹽、苯磺酸鹽、碳酸鹽、碳酸氫鹽、樟腦磺酸鹽、D及L-乳酸鹽、D及L-酒石酸鹽、乙磺酸鹽、甲磺酸鹽、丙二酸鹽、乳清酸鹽、葡庚糖酸鹽、甲基硫酸鹽、硬脂酸鹽、葡糖醛酸鹽、2-萘磺酸鹽、甲苯磺酸鹽、羥苯醯苯酸鹽、菸酸鹽、羥乙磺酸鹽、蘋果酸鹽、馬來酸鹽、檸檬酸鹽、葡萄糖酸鹽、琥珀酸 鹽、葡萄糖二酸鹽、苯甲酸鹽、乙磺酸鹽及雙羥萘酸鹽。關於適宜鹽之綜述可參見Berge等人，J.Pharm.Sci.,1977 66：1-19及G.S.Paulekuhn等人，J.Med.Chem.2007 50：6665。
定義
除非另有說明，否則本文所用之技術及科學術語具有熟習本發明所屬領域之技術者通常所瞭解之含義。本文提及為彼等熟習此項技術者所習知之各種方法及材料。闡述一般藥理學原理之標準參考著作包括Goodman及Gilman之The Pharmacological Basis of Therapeutics，第10版，McGraw Hill Companies公司，New York(2001)。在製備該等化合物中所用之起始材料及試劑通常可自商業供應商(例如，Aldrich Chemical公司)購得，或可藉由彼等熟習此項技術者熟知之方法遵循參考文獻中所述程序來製備。除非另有說明，否則在以下闡述及實例中提及之材料、試劑及諸如此類均可自商業來源獲得。一般合成程序已闡述於諸如以下等專著中：Fieser及Fieser之Reagents for Organic Synthesis；Wiley & Sons：New York，第1-21卷；R.C.Larock，Comprehensive Organic Transformations，第2版，Wiley-VCH，New York 1999；Comprehensive Organic Synthesis,B.Trost及I.Fleming(編輯)第1-9卷Pergamon，Oxford，1991；Comprehensive Heterocyclic Chemistry,A.R.Katritzky and C.W.Rees(編輯)Pergamon，Oxford，1984，第1-9卷；Comprehensive Heterocyclic Chemistry II,A.R.Katritzky及C.W.Rees(編輯)Pergamon，Oxford，1996，第1-11卷；及Organic Reactions，Wiley & Sons：New York，1991，第1-40卷，且其為彼等熟習此項技術者所熟知。
本文所述定義可經增補以形成化學相關性組合，例如，「雜烷基芳基」、「鹵烷基雜芳基」、「芳烷基雜環基」、「烷基羰基」、「烷氧基烷基」及諸如此類。當術語「烷基」用作另一術語後之後綴時(如在 「苯基烷基」或「羥基烷基」中)，此欲指經至少一個選自其他明確命名基團之取代基取代的如上文所定義之烷基。因此，例如，「苯基烷基」係指具有一至兩個苯基取代基之烷基，且因此包括苄基(苯甲基)及苯乙基。「烷基胺基烷基」係具有1至2個烷基胺基取代基之烷基。「羥基烷基」包括2-羥基乙基、2-羥基丙基、1-(羥基甲基)-2-甲基丙基、2-羥基丁基、2,3-二羥基丁基、2-(羥基甲基)、3-羥基丙基等等。因此，本文所用術語「羥基烷基」用於定義下文所定義雜烷基之子集。術語-(芳)烷基係指未經取代之烷基或芳烷基。術語(雜)芳基或(het)芳基係指為芳基或雜芳基之部分。
如本文未進行進一步限制所使用之術語「烷基」單獨或與其他基團組合時表示含有1至10個碳原子之無支鏈或具支鏈鏈的飽和單價烴殘基，例如，甲基、乙基、丙基、異丙基、正丁基、異丁基、第二丁基或第三丁基。術語「低碳數烷基」表示含有1至6個碳原子之直鏈或具支鏈烴殘基。本文所用之「C1-6烷基」係指包括1至6個碳之烷基。
術語「環烷基」表示具有3至10個環碳原子之單價飽和單環或二環烴基團，具體而言具有3至8個環碳原子之單價飽和單環烴基團。二環意指由兩個具有一個(例如螺環)、兩個或多個共用碳原子之飽和碳環組成。例如，本文所用之「C3-7環烷基」係指在碳環中包括3至7個碳之環烷基。單環環烷基之實例係環丙基、環丁基、環戊基、環己基或環庚基。二環環烷基之實例係二環[2.2.1]庚基或二環[2.2.2]辛基。
術語「羥基烷基」表示烷基之至少一個氫原子由羥基置換之烷基。羥基烷基之實例包括羥基甲基、2-羥基乙基、2-羥基丙基、3-羥基丙基、1-(羥基甲基)-2-甲基丙基、2-羥基丁基、3-羥基丁基、4-羥基丁基、2,3-二羥基丙基、2-羥基-1-羥基甲基乙基、2,3-二羥基丁基、3,4-二羥基丁基或2-(羥基甲基)-3-羥基丙基。
除非另有指示，否則本文所用之術語「伸烷基」表示具有1至10個碳原子之二價飽和直鏈烴基團(例如，(CH2)n)或具有2個以上至6個碳原子之具支鏈飽和二價烴基團(例如，-CHMe-或-CH2CH(i-Pr)CH2-)。「C0-4伸烷基」或「(CH2)0-4」係指包含1至4個碳原子之直鏈或具支鏈飽和二價烴基團，或者在C0之情形下，省略伸烷基。除亞甲基之情形外，伸烷基之打開化合價並非連接至同一原子。伸烷基之實例包括(但不限於)亞甲基、伸乙基、伸丙基、2-甲基-伸丙基、1,1-二甲基-伸乙基、伸丁基、2-乙基伸丁基。
本文所用之術語「(伸烷基)t(C4-6-環烷基NRcRd)」係指基團R’R”-，其中R’係經NRcRd取代之如本文所定義之環烷基，且R”係如本文所定義之伸烷基，其中應瞭解，胺基環烷基烷基部分之連接點位於伸烷基上。胺基-C3-7環烷基-C1-3烷基係指基團R’R”，其中R’係胺基取代之C3-7環烷基且R”係如本文所定義之C1-3伸烷基。部分(伸烷基)t(C4-6-環烷基NRcRd)係指(i)。
術語「(伸烷基)n-雜環基」表示式R’R”之基團，其中R’係如本文所定義之雜環基團，且R”係如本文所定義之伸烷基且雜環烷基之連接點將位於伸烷基上。如本文所使用之視情況經取代之雜環基係指至少以下部分：其中碳上之2個氫原子視情況經側氧基部分置換，且Re係氫、C1-3烷基或C1-3烷基磺醯基：
術語「治療(treat及treatment)」係指治療性治療，其中目標係減 緩(減輕)不期望之生理學改變或病症，例如癌症之擴散。出於本發明之目的，有益或期望臨床結果包括(但不限於)減輕症狀、縮小疾病範圍、穩定(即不惡化)疾病狀態、延遲或減慢疾病進展、改善或緩和疾病狀態及可檢測或不可檢測地緩解病情(部分或全部)。「治療」亦可意指與不接受治療之預期存活相比延長存活。
片語「治療有效量」意指本發明化合物(i)治療具體疾病、病況或病症，(ii)減弱、改善或消除具體疾病、病況或病症之一或多種症狀，或(iii)預防或延遲本文所述具體疾病、病況或病症之一或多種症狀發作之量。在癌症之情形下，治療有效量之藥物可減少癌細胞數量；減小腫瘤大小；抑制(即在一定程度上減慢且較佳地終止)癌細胞浸潤至周圍器官中；抑制(即在一定程度上減慢且較佳地終止)腫瘤轉移；在一定程度上抑制腫瘤生長；及/或在一定程度上減輕與癌症相關之一或多種症狀。在藥物可預防生長及/或殺傷現有癌細胞之程度上，其可具有細胞生長抑制性及/或細胞毒性。對於癌症療法，可藉由評價疾病進展時間(TTP)及/或測定反應率(RR)來量測效能。
術語「癌症」及「癌性」係指或闡述哺乳動物中特徵通常在於細胞生長失調之生理學病況。「腫瘤」包含一或多個癌性細胞。癌症之實例包括(但不限於)癌、淋巴瘤、母細胞瘤、肉瘤及白血病或淋巴樣惡性腫瘤。該等癌症之更具體實例包括鱗狀細胞癌(例如上皮鱗狀細胞癌)；肺癌，包括小細胞肺癌、非小細胞肺癌(「NSCLC」)、肺腺癌及肺鱗狀癌；腹膜癌；肝細胞癌；胃癌(gastric cancer或stomach cancer)，包括胃腸癌；胰臟癌、膠質母細胞瘤、子宮頸癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、肝細胞瘤、乳癌、結腸癌、直腸癌、結腸直腸癌、子宮內膜癌或子宮癌、唾液腺癌、腎癌(kidney cancer或renal cancer)、前列腺癌、外陰癌、甲狀腺癌、肝癌、肛門癌、陰莖癌以及頭頸癌。
「化學治療劑」係可用於治療癌症之化學化合物。化學治療劑 之實例包括埃羅替尼(erlotinib)(TARCEVA®,Genentech/OSI Pharm.)、硼替佐米(bortezomib)(VELCADE®,Millennium Pharm.)、氟維司群(fulvestrant)(FASLODEX®,AstraZeneca)、舒尼替尼(sunitib)(SUTENT®,Pfizer/Sugen)、來曲唑(letrozole)(FEMARA®,Novartis)、甲磺酸伊馬替尼(imatinib mesylate)(GLEEVEC®,Novartis)、非蘇那特(finasunate)(VATALANIB®,Novartis)、奧沙利鉑(oxaliplatin)(ELOXATIN®,Sanofi)、5-FU(5-氟尿嘧啶)、甲醯四氫葉酸(leucovorin)、雷帕黴素(Rapamycin)(西羅莫司(Sirolimus),RAPAMUNE®,Wyeth)、拉帕替尼(Lapatinib)(TYKERB®,GSK572016,Glaxo Smith Kline)、洛那法尼(lonafarnib)(SCH 66336)、索拉非尼(sorafenib)(NEXAVAR®,Bayer Labs)、吉非替尼(gefitinib)(IRESSA®,AstraZeneca)、AG1478、烷基化劑，例如噻替派(thiotepa)及CYTOXAN®環磷醯胺；磺酸烷基酯，例如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)及哌泊舒凡(piposulfan)；氮丙啶(aziridine)，例如苯唑達帕(benzodopa)、卡波醌(Carboquone)、美托達帕(meturedopa)及尤裡達帕(uredopa)；伸乙亞胺及甲基三聚氰胺，包括六甲蜜胺(altretamine)、三亞乙基三聚氰胺、三伸乙基磷醯胺、三伸乙基硫磷醯胺及三甲基蜜胺；多聚乙醯(尤其布拉它辛(bullatacin)及布拉它辛酮(bullatacinone))；喜樹鹼(Camptothecin)(包括合成類似物托泊替康(topotecan))；苔蘚蟲素(bryostatin)；海綿多聚乙醯(Callystatin)；CC-1065(包括其阿多來新(adozelesin)、卡折來新(Carzelesin)及比折來新(bizelesin)合成類似物)；念珠藻素(Cryptophycin)(尤其念珠藻素1及念珠藻素8)；多拉斯他汀(dolastatin)；多卡米星(duocarmycin)(包括合成類似物KW-2189及CB1-TM1)；軟珊瑚醇(eleutherobin)；水鬼蕉鹼(pancratistatin)；匍枝珊瑚醇(sarcodictyin)；海綿抑制素(spongistatin)；氮芥子氣(nitrogen mustard)，例如苯丁酸氮芥 (Chlorambucil)、萘氮芥(Chlornaphazine)、氯磷醯胺、雌莫司汀(estramustine)、異環磷醯胺(ifosfamide)、氮芥(mechlorethamine)、氧化氮芥鹽酸鹽、美法侖(melphalan)、新氮芥(novembichin)、膽甾醇對苯乙酸氮芥(phenesterine)、潑尼氮芥(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥；亞硝基脲，例如卡莫司汀(Carmustine)、氯脲菌素(Chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)及雷莫司汀(ranimustine)；抗生素，例如烯二炔類抗生素(例如卡奇黴素(Calicheamicin)，尤其卡奇黴素γ 1I、卡奇黴素ω I1(Angew Chem.Intl.Ed.Engl.1994 33：183-186)；達內黴素(dynemicin)，包括達內黴素A；雙磷酸鹽，例如氯屈膦酸鹽(Clodronate)；埃斯波黴素(esperamicin)；以及新製癌菌素(neocarzinostatin)發色團及相關色蛋白烯二炔抗生素發色團)、阿克拉黴素(aclacinomysin)、放線菌素(actinomycin)、胺茴黴素(authramycin)、偶氮絲胺酸、博萊黴素(bleomycin)、放線菌素(Cactinomycin)、卡雷比素(Carabicin)、洋紅黴素(Carminomycin)、嗜癌黴素(Carzinophilin)、色黴素(Chromomycin)、更生黴素(dactinomycin)、柔紅黴素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮基-5-側氧基-L-正白胺酸、ADRIAMYCIN®(多柔比星(doxorubicin))、嗎啉基-多柔比星、氰基嗎啉基-多柔比星、2-吡咯啉基-多柔比星及去氧多柔比星、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、伊達比星(idarubicin)、麻西羅黴素(marcellomycin)、絲裂黴素(mitomycin)(例如絲裂黴素C)、黴酚酸(mycophenolic acid)、諾拉黴素(nogalamycin)、橄欖黴素(olivomycin)、培洛黴素(peplomycin)、泊非黴素(porfiromycin)、嘌羅黴素(puromycin)、三鐵阿黴素(quelamycin)、羅多比星(rodorubicin)、鏈黑黴素(streptonigrin)、鏈佐星(streptozocin)、殺結核菌素(tubercidin)、烏苯 美司(ubenimex)、淨司他汀(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin)；抗代謝物，例如胺甲喋呤及5-氟尿嘧啶(5-FU)；葉酸類似物，例如二甲葉酸(denopterin)、胺甲喋呤、蝶羅呤(pteropterin)、三甲曲沙(trimetrexate)；嘌呤類似物，例如氟達拉濱(fludarabine)、6-巰嘌呤、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鳥嘌呤；嘧啶類似物，例如安西他濱(ancitabine)、阿紮胞苷(azacitidine)、6-阿紮尿苷(6-azauridine)、卡莫氟(Carmofur)、阿糖胞苷(Cytarabine)、二去氧尿苷、去氧氟尿苷(doxifluridine)、依諾他濱(enocitabine)、氟尿苷；雄激素，例如卡普睪酮(Calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、環硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睪內酯；抗腎上腺劑，例如胺魯米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane)；葉酸顯影再生劑，例如亞葉酸；醋葡醛內酯(aceglatone)；醛磷醯胺糖苷；胺基酮戊酸；恩尿嘧啶(eniluracil)；安吖啶(amsacrine)；貝拉布昔(bestrabucil)；比生群(bisantrene)；依達曲沙(edatrexate)；迪福胺(defofamine)；秋水仙胺(demecolcine)；地吖醌(diaziquone)；依氟鳥胺酸(eflomithine)；依利醋銨(elliptinium acetate)；埃博黴素(epothilone)；依託格魯(etoglucid)；硝酸鎵；羥基脲；香菇多糖(lentinan)；氯尼達明(lonidaiaine)；類美坦素，例如美坦辛及安絲菌素；米托胍腙(mitoguazone)；米托蒽醌(mitoxantrone)；莫哌達醇(mopidamnol)；尼曲吖唆(nitraerine)；噴司他丁(pentostatin)；蛋胺氮芥(phenamet)；吡柔比星(pirarubicin)；洛索蒽醌(losoxantrone)；鬼臼酸2-乙肼；丙卡巴肼(procarbazine)；PSK®多糖複合體(JHS Natural Products,Eugene,Oreg.)；雷佐生(razoxane)；根黴素(rhizoxin)；昔唑飛蘭(sizofuran)；鍺螺胺(spirogermanium)；替奴佐酸(tenuazonic acid)；三亞胺醌(triaziquone)；2,2’,2”-三氯三乙胺；單端孢黴烯(trichothecene)(尤其T-2毒素、撫孢菌素A(verrucarin A)、桿 孢菌素A(roridin A)及蛇形菌素(anguidine))；烏拉坦(urethan)；長春地辛(vindesine)；達卡巴嗪(dacarbazine)；甘露莫司汀(mannomustine)；二溴甘露醇(mitobronitol)；二溴衛矛醇(mitolactol)；哌泊溴烷(pipobroman)；葛胞嘧啶(gacytosine)；阿拉伯糖苷(「Ara-C」)；環磷醯胺；噻替派；紫杉烷(taxoid)，例如TAXOL(紫杉醇(paclitaxel)；Bristol-Myers Squibb Oncology,Princeton,N.J.)、ABRAXANE®(不含克列莫佛(Cremophor-free))、紫杉醇之白蛋白改造型奈米粒子調配物(American Pharmaceutical Partners,Schaumberg,Ill.)及TAXOTERE®(多西他賽(docetaxel、doxetaxel)；Sanofi-Aventis)；苯丁酸氮芥；GEMZAR®(吉西他濱(gemcitabine))；6-硫鳥嘌呤；巰嘌呤；胺甲喋呤；鉑類似物，例如順鉑(Cisplatin)及卡鉑(Carboplatin)；長春鹼(vinblastine)；依託泊苷(etoposide)(VP-16)；異環磷醯胺；米托蒽醌；長春新鹼(vincristine)；NAVELBINE®(長春瑞濱(vinorelbine))；諾消靈(novantrone)；替尼泊苷(teniposide)；依達曲沙(edatrexate)；道諾黴素(daunomycin)；胺基蝶呤(aminopterin)；卡培他濱(XELODA®)；伊班膦酸鹽(ibandronate)；CPT-11；拓撲異構酶抑制劑RFS 2000；二氟甲基鳥胺酸(DMFO)；類視色素，例如視黃酸；及上述任一者之醫藥上可接受之鹽、酸及衍生物。
亦包括於「化學治療劑」之定義中者係：(i)抗激素劑，其用於調控或抑制激素對腫瘤之作用，例如抗雌激素及選擇性雌激素受體調節劑(SERM)，包括(例如)他莫昔芬(tamoxifen)(包括NOLVADEX®；檸檬酸他莫昔芬)、雷洛昔芬(raloxifene)、屈洛昔芬(droloxifene)、4-羥基他莫昔芬、曲沃昔芬(trioxifene)、凱奧昔芬(keoxifene)、LY117018、奧那司酮(onapristone)及FARESTON®(檸檬酸托瑞米芬(toremifene citrate))；(ii)芳香酶抑制劑，其抑制酶芳香酶，其調控 腎上腺中之雌激素產生，例如，4(5)-咪唑、胺魯米特、MEGASE®(乙酸甲地孕酮(megestrol acetate))、AROMASIN®(依西美坦(exemestane)；Pfizer)、福美坦(formestanie)、法倔唑(fadrozole)、RIVISOR®(伏氯唑(vorozole))、FEMARA®(來曲唑；Novartis)及ARIMIDEX®(阿那曲唑(anastrozole)；AstraZeneca)；(iii)抗雄激素，例如氟他胺(flutamide)、尼魯米特(nilutamide)、比卡魯胺(bicalutamide)、亮丙瑞林(leuprolide)及亮丙瑞林(goserelin)；以及曲沙他濱(troxacitabine)(1,3-二氧雜環戊烷核苷胞嘧啶類似物)；(iv)蛋白激酶抑制劑；(v)脂質激酶抑制劑；(vi)反義寡核苷酸，尤其彼等抑制信號傳導路徑中與異常細胞增殖有關之基因之表現者，例如，PKC-α、Ralf及H-Ras；(vii)核糖酶，例如VEGF表現抑制劑(例如，ANGIOZYME®)及HER2表現抑制劑；(viii)疫苗，例如基因療法疫苗，例如，ALLOVECTIN®、LEUVECTIN®及VAXID®；PROLEUKIN®、rIL-2；拓撲異構酶1抑制劑，例如LURTOTECAN®；ABARELIX® rmRH；(ix)抗血管生成劑，例如貝伐珠單抗(bevacizumab)(AVASTIN®),Genentech)；及(x)上述任一者之醫藥上可接受之鹽、酸及衍生物。
實施例
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 、R a 、R b 、R c 、R d 、R e 、n、r、s及t係如上文所定義。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係(CH2) n NR a R b ；R 3 係視情況經甲基取代之吡啶 基或吡嗪基；R a 及R b (a)獨立地係氫或C1-3烷基，或，(b)R a 及R b 與其所連接之氮一起形成視情況含有另一選自O、NR e 或S(O)0-2之雜原子之4員至7員環；n係2至6。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之另一子實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係(CH2) n NR a R b ；n係2-4且R a 及R b 獨立地係氫或C1-3烷基；R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之另一子實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係(CH2) n NR a R b ；n係2至4且R a 及R b 與其所連接之氮一起形成視情況含有另一選自O、NR e 或S(O)0-2之雜原子之4員至7員環；R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係(伸烷基)1-3OR 5 ，其中R 5 係(伸烷基)2-4NR a R b 或選自氮雜環丁烷、吡咯啶、六氫吡啶或氮呯之雜環；R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基；在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例 中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係(伸烷基)1-3OR 5 ，其中R 5 係(伸烷基)2-4NR a R b ；R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基；R a 及R b (a)獨立地係氫或C1-3烷基，或，(b)R a 及R b 與其所連接之氮一起形成視情況含有另一選自O、NR e 或S(O)0-2之雜原子之4員至7員環。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係(伸烷基)1-3OR 5 ，其中R 5 係選自氮雜環丁烷、吡咯啶、六氫吡啶或氮呯之雜環；R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之另一子實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係(CH2)2O(CH2)2NR a R b ；R a 及R b (a)獨立地係氫或C1-3烷基，或，(b)R a 及R b 與其所連接之氮一起形成視情況含有另一選自O、NR e 或S(O)0-2之雜原子之4員至7員環；R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之另一實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經 取代之C1-3烷基，R 2 係(CH2) r C(O)NR a R b 且R a 及R b (a)獨立地係氫或C1-3烷基，或，(b)R a 及R b 與其所連接之氮一起形成視情況含有另一選自O、NR e 或S(O)0-2之雜原子之4員至7員環；R e 係氫、C1-3烷基或C1-3烷基磺醯基；且r係1至6；R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之另一實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係(CH2)rC(O)NR a R b 且R a 及R b 獨立地係氫或C1-3烷基且r係1至6；R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之另一實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係(CH2) r C(O)NR a R b 且R a 及R b 與其所連接之氮一起形成視情況含有另一選自O、NR e 或S(O)0-2之雜原子之4員至7員環；R e 係氫、C1-3烷基或C1-3烷基磺醯基且r係1至6。R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係式(i)之一部分，
R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係3-胺基-環戊基甲基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係3-胺基-環戊基乙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係3-胺基-環己基甲基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係3-胺基-環己基乙基，R 3 係視情況經甲基取代之 吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係4-胺基-環己基甲基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係4-胺基-環己基乙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係(i)、(ii)、(iii)、(iv)、(v)、(vi)、(vii)或(viii)，n係2至6，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 2 係2-嗎啉-2-基乙基或2-嗎啉-2-基甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 2 係2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基或2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 2 係(3 3-二氟-4-六氫吡啶基)甲基或(3 3-二氟-4-六氫吡啶基)乙基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係氮雜環丁-3-基乙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係氮雜環丁-3-基丙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經 取代之C1-3烷基，R 2 係吡咯啶-3-基乙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係吡咯啶-3-基丙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係六氫吡啶-4-基丙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係六氫吡啶-4-基乙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係(vii)，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例 中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係5-胺基-[1,3]二噁烷-2-基甲基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係5-胺基-[1,3]二噁烷-2-基乙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係六氫吡嗪-1-基甲基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係六氫吡嗪-1-基乙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6- 基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係4-甲基-六氫吡嗪-1-基乙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之一個實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係視情況經取代之C1-3烷基，R 2 係3-氮雜-二環[3.1.0]己-6-基胺基)-乙基]-2-乙基，R 3 係視情況經甲基取代之吡啶基或吡嗪基。在一個子實施例中，R 3 係2-甲基-吡嗪-6-基。在另一子實施例中，R 3 係2-甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基-吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係2,4-二甲基-吡啶基-6-基。在另一子實施例中，R 1 係乙基或甲基。
在本發明之另一實施例中，提供式I化合物，其中R 3 係視情況經取代之吡嗪基。
在本發明之另一實施例中，提供式I化合物，其中R 3 係視情況經取代之吡嗪基且R 4 係2-氯或2-甲基。在子實施例中，R 3 係6-甲基吡嗪-2-基。
在本發明之另一實施例中，提供式I化合物，其中R 3 係視情況經取代之吡啶基。
在本發明之另一實施例中，提供式I化合物，其中R 3 係視情況經取代之吡啶基且R 4 係2-氯或2-甲基。在另一實施例中，R 3 係6-甲基吡啶-2-基。在另一子實施例中，R 3 係3-甲基吡啶-2-基。在再一子實施例中，R 3 係4,6-二甲基吡啶-2-基。
在本發明之另一實施例中，提供選自表I中之化合物I-1至I-202之任一化合物。
在本發明之另一實施例中，提供選自由以下組成之群之化合物：6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；2-[(2R)-2-[[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]甲基]嗎啉-4-基]乙醯胺；6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；2-(甲基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-4-甲基嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；2-(甲基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮； 6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-4-甲基嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(2-環丙基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(2-環丙基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(4-甲基噻唑-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(4,5-二甲基噻唑-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(1-甲基吡唑-3-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-乙基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-乙基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(1 4-二甲基咪唑-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮； 6-[2-氯-4-[6-(羥基甲基)-2-吡啶基]苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-(2-氯-4-環丙基-苯基)-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；2-(甲基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；2-(甲基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；2-(乙基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(2-嗎啉-2-基乙基)-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(2-嗎啉-2-基乙基)-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；2-(乙基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；2-(22-二氟乙基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮； 6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；2-胺基-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[2-(4-甲基嗎啉-2-基)乙基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；及，6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[2-(4-甲基嗎啉-2-基)乙基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；或其立體異構物或醫藥上可接受之鹽。
在本發明之另一實施例中，提供選自由以下組成之群之化合物：8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；N-[2-[[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]甲基]-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸第三丁基酯； 2-胺基-8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；2-胺基-8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-2-(甲基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[5-(甲基胺基)-1,3-二噁烷-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(二甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(3-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-乙基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[5-(甲基胺基)-1,3-二噁烷-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮； 8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-2-(3-氮雜二環[3.1.0]己-6-基胺基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-乙基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-2-(3-氮雜二環[3.1.0]己-6-基胺基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮； 8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-乙基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-2-(3-氮雜二環[3.1.0]己-6-基胺基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮； 8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；及，8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-乙基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮；或其立體異構物或醫藥上可接受之鹽。
在本發明之另一實施例中，提供抑制有需要之患者之PAK活性之方法，該方法包含向該患者投與式I化合物之步驟，其中R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 、R a 、R b 、R c 、R d 、R e 、n、r、s及t係如上文所定義。
在本發明之另一實施例中，提供在有需要之患者中治療癌症或過度增殖病症或改善其嚴重性之方法，該方法包含向該患者投與式I化合物，其中R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 、R a 、R b 、R c 、R d 、R e 、n、r、s及t係如上文所定義。
在本發明之另一實施例中，提供治療選自由以下組成之群之癌症或過度增殖病症之方法：腺瘤、膀胱癌、腦癌、乳癌、結腸癌、表皮癌、濾泡癌、生殖泌尿道之癌症、神經膠質母細胞瘤、霍奇金氏病(Hodgkin's disease)、頭頸癌、肝細胞瘤、角質棘皮瘤、腎癌、大細胞癌、白血病、肺腺癌、肺癌、淋巴病症、黑色素瘤及非黑色素瘤皮膚癌、骨髓發育不良症候群、神經母細胞瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、卵巢癌、乳突狀癌、胰臟癌、前列腺癌、直腸癌、肉瘤、小細胞癌、睪丸癌、畸胎癌(tetracarcinomas)、甲狀腺癌及未分化性癌，該方法包含 向有需要之患者投與式I化合物，其中R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 、R a 、R b 、R c 、R d 、R e 、n、r、s及t係如上文所定義。
在本發明之另一實施例中，提供治療選自由以下組成之群之癌症之方法：肺癌、乳癌、卵巢癌、膀胱癌及頭頸癌症，該方法包含向有需要之患者投與式I化合物，其中R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 、R a 、R b 、R c 、R d 、R e 、n、r、s及t係如上文所定義。
在本發明之另一實施例中，提供治療選自由以下組成之群之癌症之方法：原發性乳腺癌、鱗狀非小細胞肺癌或鱗狀頭頸癌症，該方法包含向有需要之患者投與式I化合物，其中R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 、R a 、R b 、R c 、R d 、R e 、n、r、s及t係如上文所定義。
在本發明之另一實施例中，提供治療癌症或過度增殖疾病之方法，該方法包含向有需要之患者共投與式I化合物，其中R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 、R a 、R b 、R c 、R d 、R e 、n、r、s及t係如上文所定義，及至少一種用於治療或改善癌症或過度增殖病症之其他化學治療劑。
在本發明之另一實施例中，提供治療癌症或過度增殖疾病之方法，該方法包含向有需要之患者共投與式I化合物，其中R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 、R a 、R b 、R c 、R d 、R e 、n、r、s及t係如上文所定義，及至少一種選自由以下組成之群之其他化學治療劑：細胞凋亡蛋白質之抑制劑(IAP)、EGFR抑制劑或拮抗劑、Ras/Raf/Mek/Erk信號傳導級聯之抑制劑、Akt激酶之抑制劑及Src激酶抑制劑。
在本發明之另一實施例中，提供醫藥組合物，其包含式I化合物，其中R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 、R a 、R b 、R c 、R d 、R e 、n、r、s及t係如上文所定義，及至少一種醫藥上可接受之載劑、賦形劑或稀釋劑。
在本發明之另一實施例中，提供含有式I化合物之組合物之用途，其中R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、R 5 、R a 、R b 、R c 、R d 、R e 、n、r、s及t 係如上文所定義，其用以製造用於抑制異常細胞生長或用於治療哺乳動物之過度增殖病症之醫藥。
在本發明之另一實施例中，提供p21活化之激酶(PAK)抑制劑，其用於治療癌症或過度增殖病症。
在本發明之另一實施例中，提供含有選自表1中之I-1至I-202之化合物之組合物之用途，其用以製造用於抑制異常細胞生長或用於治療哺乳動物之過度增殖病症之醫藥。
在本發明之另一實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係H或視情況經取代之C1-3烷基；R2係(i)C2-6羥基烷基，(ii)(伸烷基) n NR a R b ，其中伸烷基鏈視情況經羥基取代，(iii)(伸烷基)1-3OR 5 ，其中R 5 係(伸烷基)2-4NR a R b 或選自氮雜環丁烷、吡咯啶、六氫吡啶或氮呯之雜環，(iv)(伸烷基) r C(O)NR a R b ，(v)(伸烷基)n-CN，(vi)(伸烷基)t-(C4-6-環烷基NR c R d )，(vii)雜環基-(伸烷基)n，其中雜環基係指視情況經取代之氮雜環丁基、吡咯啶基、六氫吡啶基、氮呯基、嗎啉基、4-胺基-1,3-二氧雜環戊-2-基、3-氮雜-二環[3.1.0]己-6-基或六氫吡嗪基；R a 及R b (a)在每次出現時獨立地係氫或C1-3烷基，或，(b)R a 及R b 與其所連接之氮一起形成視情況含有另一選自O、NR e 或S(O)0-2之雜原子之4員至7員環；R c 及R d 在每次出現時獨立地係氫或C1-3烷基；R e 係氫、C1-3烷基或C1-3烷基磺醯基；R 3 係雜芳基，其中雜芳基環係吡啶基、吡嗪基或1,2,4-噁二唑-3-基，其各自視情況經R 4 部分取代；R 4 係C1-6烷基或鹵素；n係2至6；r係1-6；或者；t係0至6；或其醫藥上可接受之鹽。
在本發明之再一實施例中，提供式I化合物，其中R 1 係H、視情況經取代之C1-3烷基、氧雜環丁-3-基或1-羥基-氧雜環丁-3-基；R2係(i)C2-6羥基烷基或C2-6二羥基烷基，(ii)(伸烷基) n NR a R b ，其中伸烷基鏈視情況經羥基取代，(iii)(伸烷基)1-3OR 5 ，其中R 5 係(伸烷基)2-4NR a R b 或選 自氮雜環丁烷、吡咯啶、六氫吡啶或氮呯之雜環；(iv)(伸烷基) r C(O)NR a R b ，(v)(伸烷基)n-CN，(vi)(伸烷基)t-(C4-6-環烷基NR c R d )，(vii)雜環基-(伸烷基)n，其中雜環基係指經取代之氮雜環丁基、吡咯啶基、六氫吡啶基、氮呯基、嗎啉基、5-胺基-1,3-二氧雜環戊-2-基、3-氮雜-二環[3.1.0]己-6-基、5-氧雜-2-氮雜螺[3.4]辛-7-基、1-氧雜-8-氮雜螺[4.5]癸-3-基、1-氧雜-7-氮雜螺[4.4]壬-3-基或六氫吡嗪基，其視情況經C(=O)CHR f NH2、側氧基、羥基、胺基、C1-3烷基胺基、C1-3二烷基胺基或C1-6-羥基烷基取代；R a 及R b (a)在每次出現時獨立地係氫、C1-3烷基或C2-4-羥基烷基，或，(b)R a 及R b 與其所連接之氮一起形成視情況含有另一選自O、NR e 或S(O)0-2之雜原子之4員至7員環；R c 及R d 在每次出現時獨立地係氫、C1-3烷基或氧雜環丁基；R e 係氫、C1-3烷基或C1-3烷基磺醯基；R f 係氫或C1-3烷基；R 3 係雜芳基，其中雜芳基環係吡啶基、吡嗪基或1,2,4-噁二唑-3-基，其各自視情況經R 4 部分取代；R 4 係C1-6烷基或鹵素；n係2至6；r係1-6；t係0至6；或其醫藥上可接受之鹽，限制條件係式I化合物不為：8-(反式-4-胺基環己基)-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡嗪基)苯基]-2-(乙基胺基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮、8-(反式-4-胺基環己基)-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡嗪基)苯基]-2-[(1-甲基乙基)胺基]-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮、6-(2-氯-4-(5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(六氫吡啶-4-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮或6-(2-氯-4-(5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基)苯基)-2-(異丙基胺基)-8-(六氫吡啶-4-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。
常用縮寫包括：乙醯基(Ac)、水溶液(aq.)、氣氛(Atm)、第三-丁氧基羰基(Boc)、焦碳酸二-第三-丁酯或boc酸酐(BOC2O)、苄基(Bn)、六氟磷酸苯并三唑-1-基氧基-三-(二甲基胺基)鏻(BOP)、丁基(Bu)、苄醯基(Bz)、化學文摘登記號(CASRN)、苄氧基羰基(CBZ或Z)、羰基 二咪唑(CDI)、二亞苄基丙酮(DBA)、1,5-二氮雜雙環[4.3.0]壬-5-烯(DBN)、1,8-二氮雜雙[5.4.0]十一-7-烯(DBU)、N,N’-二環己基碳化二亞胺(DCC)、1,2-二氯乙烷(DCE)、二氯甲烷(DCM)、偶氮二甲酸二乙酯(DEAD)、二-異-丙基偶氮二甲酸酯(DIAD)、二-異-丁基氫化鋁(DIBAL或DIBAL-H)、二-異-丙基乙胺(DIPEA)、N,N-二甲基乙醯胺(DMA)、4-N,N-二甲基胺基吡啶(DMAP)、N,N-二甲基甲醯胺(DMF)、二甲基亞碸(DMSO)、1,1'-雙-(二苯基膦基)乙烷(dppe)、1,1'-雙-(二苯基膦基)二茂鐵(dppf)、1-(3-二甲基胺基丙基)-3-乙基碳化二亞胺鹽酸鹽(EDCI)、乙基(Et)、乙酸乙酯(EtOAc)、乙醇(EtOH)、2-乙氧基-2H-喹啉-1-甲酸乙酯(EEDQ)、乙醚(Et2O)、六氟磷酸乙酸O-(7-氮雜苯并三唑-1-基)-N,N,N’N’-四甲基脲鎓(HATU)、乙酸(HOAc)、1-N-羥基苯并三唑(HOBt)、高壓液相層析(HPLC)、異丙醇(IPA)、甲醇(MeOH)、熔點(mp)、MeSO2-(甲磺醯基或Ms)、甲基(Me)、乙腈(MeCN)、間-氯過苯甲酸(MCPBA)、質譜(ms)、甲基第三-丁基醚(MTBE)、N-甲基嗎啉(NMM)、N-甲基吡咯啶酮(NMP)、石油醚(pet醚，即烴)、苯基(Ph)、雙(頻那醇合)二硼[(PinB)2]、丙基(Pr)、異丙基(i-Pr)、磅/平方英吋(psi)、六氟磷酸溴-三-三-吡咯啶基鏻(PyBrOP)、吡啶(pyr)、室溫(rt或RT)、satd.(飽和)、第三-丁基二甲基矽烷基或第三-BuMe2Si(TBDMS)、三乙胺(TEA或Et3N)、三氟甲磺酸鹽或CF3SO2-(Tf)、三氟乙酸(TFA)、四氟硼酸O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓(TBTU)、薄層層析(TLC)、四氫呋喃(THF)、四甲基乙二胺(TMEDA)、三甲基矽烷基或Me3Si(TMS)、2-(三甲基矽烷基)乙氧基甲基(SEM)、對甲苯磺酸單水合物(TsOH或pTsOH)、4-Me-C6H4SO2-或甲苯磺醯基(Ts)、N-胺基甲酸酯-N-甲酸酐(UNCA)。包括前綴正(n)、異(i-)、第二(sec-)、第三(tert-或t-)及新(neo-)之習用命名在與烷基部分一起使用時具有其慣常含義。(J.Rigaudy及D.P.Klesney， Nomenclature in Organic Chemistry，IUPAC 1979 Pergamon Press，Oxford.)。
化合物及製備
在本發明範圍之代表性化合物之實例提供於以下表中。提供以下該等實例及製備方法以使彼等熟習此項技術者能夠更清楚地瞭解並實踐本發明。其不應視為限制本發明之範圍，而僅用於闡釋及代表本發明。
若所繪示結構與該結構之給定名稱之間存在差異，則以所繪示結構為準。此外，若結構或結構之一部分之立體化學未以(例如)粗體或虛線表示出來，則應將該結構或該結構之一部分理解為涵蓋其所有立體異構物。本文中使用以下編號系統。
可藉由下文所顯示及闡述之闡釋性合成反應方案中所繪示之各種方法來製備本發明化合物。用於製備該等化合物中之起始材料及試劑通常購自商業供應商(例如Aldrich Chemical公司)，或係藉由熟悉此項技術者已知之方法遵循諸如以下等參考文獻中所闡述之程序來製備：Fieser及Fieser之Reagents for Organic Synthesis；Wiley & Sons：New York，第1-21卷；R.C.LaRock,Comprehensive Organic Transformations，等2版Wiley-VCH,New York 1999；Comprehensive Organic Synthesis,B.Trost及I.Fleming(編輯)第1-9卷Pergamon,Oxford,1991；Comprehensive Heterocyclic Chemistry,A.R.Katritzky及C.W.Rees(編輯)Pergamon,Oxford 1984，第1-9卷；Comprehensive Heterocyclic Chemistry II,A.R.Katritzky及C.W.Rees(編輯)Pergamon,Oxford 1996，第1-11卷；及Organic Reactions,Wiley & sons：New York,1991，第1-40卷。以下合成反應方案僅闡釋一些可合成本發明化合物之方法，且可對該等合成反應方案作出各種修改且將向熟悉此項技術者提出已提及該等修改參考此申請案中所含有之揭示內容。
合成反應方案之起始材料及中間體可使用習用技術進行分離並純化(若需要)，該等技術包括(但不限於)過濾、蒸餾、結晶、層析及諸如此類。該等材料可使用習用方式(包括物理常數及光譜數據)予以描述。
除非說明相反之情形，否則本文所闡述之反應較佳地在惰性氣氛下在大氣壓下在約-78℃至約150℃之範圍內、更佳地約0℃至約125℃且最佳地且便利地在約室溫(或環境溫度)或約20℃之反應溫度下實施。
以下方案中之一些化合物係利用一般取代基進行繪示；然而，熟悉此項技術者將立即明瞭，R基團之性質可有所變化，以得到本發明中所涵蓋之各種化合物。另外，反應條件係具有例示性且人們熟知替代條件。以下實例中之反應順序並非意欲限制如申請專利範圍中所闡述之本發明之範圍。
可自6-溴-2-(甲基硫基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(CASRN 352328-87-1)開始藉由方案A中所繪示之製程製備本發明化合物。第一步可藉由在極性非質子性溶劑中在鹼(例如Cs2CO3)存在下利用烷基鹵或磺酸烷基酯烷基化內醯胺氮或藉由利用Mitsunobu偶合方案實施偶合來實現。Mitsunobu條件(D.L.Hughes,The Mitsunobu Reaction,in Organic Reactions，第42卷，1992,John Wiley & Sons,New York；第335頁至第656頁)包含在惰性溶劑(例如THF、甲苯、DCM)中利用膦(例如三烷基膦，如三丁基膦((n-Bu)3P)、三苯基膦(Ph3P)及諸如此類)與偶氮二甲酸二乙基酯(DEAD)、偶氮二甲酸二異丙基酯(DIAD)或偶氮二甲酸二第三丁基酯之混合物活化醇。該反應可在環境溫度至所用溶劑之回流溫度之廣泛溫度範圍內進行。
在第二步驟中，利用鈴木(Suzuki)方案引入芳基取代基。鈴木反 應係鈀催化之酸(R-B(OH)2)，其中R係芳基或乙烯基)與芳基或乙烯基之鹵化物或三氟甲磺酸酯(R'Y，其中R'=芳基或乙烯基；Y=鹵化物或OSO2CF3)之偶合，從而得到化合物R-R'。典型觸媒包括Pd(PPh3)3、Pd(OAc)2及PdCl2(dppf)。利用PdCl2(dppf)，可將一級烷基硼烷化合物偶合至芳基或乙烯基之鹵化物或三氟甲磺酸酯而無需β消除。人們已鑒定出高活性觸媒(例如參見J.P.Wolfe等人之J.Am.Chem.Soc. 1999 121(41)：9550-9561及A.F.Littke等人之J.Am.Chem.Soc. 2000 122(17)：4020-4028)。該反應可在各種有機溶劑(包括甲苯、THF、二噁烷、1,2-二氯乙烷、DMF、PhMe、MeOH、DMSO及乙腈)、水性溶劑中且在雙相條件下實施。反應通常係在約室溫至約150℃下實施。添加劑(例如，CsF、KF、TlOH、NaOEt及KOH)通常可加速偶合反應。鈴木反應中存在大量參數，包括鈀來源、配體、添加劑及溫度，且最佳條件有時需要針對給定反應物對最佳化參數。熟悉此項技術者不需過多實驗即可確定最佳條件。
最後，在步驟3及4中藉由將硫醇氧化為相應碸並用期望胺置換碸引入嘧啶環上之烷基胺取代基。可利用MCPBA或利用過氧硫酸氫鉀便利地實施硫化物之氧化。(B.M.Trost及D.P.Curran,Tetrahedron Lett. 1981 22(14)：1287)。然後，可藉由必需胺直接置換碸。
熟悉此項技術者應瞭解，方案A及B中各步驟之順序可有所變化而並非限制該程序之一般效用。
另一選擇為，可自4-氯-2-(甲基硫基)-5-嘧啶甲酸乙酯(B-1,CASRN 5909-24-0)製備本發明化合物。在步驟1中，利用必需胺側鏈置換氯化物引入內醯胺氮。藉由標準方法實施對酯之還原及所得醇至醛B-4之再氧化。利用適當芳基乙酸對所得醛B-4之縮合及形成之內醯胺，得到必需6-苯基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮B-5。藉由如先前所闡述氧化硫醇及置換所得碸，再次實現嘧啶環上胺取代基之引入。若在B-5或B-6中R係氫，則氮之取代可藉由鹼催化之烷基化或藉由如先前所闡述之Mitsunobu偶合來實現。
生物學活性
在生物學實例1中使用PAK1抑制分析實現對式I化合物之PAK抑制活性之測定。PAK1分析中之例示性化合物之效力值報告於表1中。使用基於細胞之機械分析(生物學實例2)來測定PAK抑制劑對下游信號傳導之效應。該等分析之代表值可參見表1。
劑量及投與
本發明提供含有本發明化合物及至少一種治療上惰性之載劑、稀釋劑或賦形劑之醫藥組合物或醫藥，以及使用本發明化合物製備該等組合物及醫藥之方法。在一個實例中，具有期望純度之式I化合物可藉由在環境溫度及在適當pH與生理上可接受之載劑(即在所用劑量 及濃度對接受者無毒之載劑)混合調配成劑型。調配物之pH主要取決於化合物之特定用途及濃度，但通常在約3至約8之任一範圍內。在一個實例中，將式I化合物調配於乙酸鹽緩衝液(pH 5)中。在另一實施例中，式I化合物係無菌。化合物可以例如固體或非晶形組合物、以凍乾調配物或以水溶液儲存。
組合物係以與良好醫療實施一致之方式調配、給藥及投與。術語「治療有效量」表示本發明化合物之量在投與個體時(i)治療或預防特定疾病、病況或病症，(ii)減弱、改善或消除特定疾病、病況或病症之一或多種症狀，或(iii)預防或延遲本文所闡述之特定疾病、病況或病症之一或多種症狀發作。治療有效量將視以下因素而變化：所治療之特定病症、病症之嚴重性、所治療之特定患者、個別患者之臨床病況、病症之原因、藥劑遞送位點、投與方法、投與時間表及醫療實施者已知之其他因素。
術語疾病狀態之「治療(treating或treatment)」包括(1)抑制疾病狀態，即阻止疾病狀態或其臨床症狀之發生，或(2)緩解疾病狀態，即，使疾病狀態或其臨床症狀暫時或永久消退。
可視用於投與藥物之方法以各種方式包裝所施用之醫藥組合物(或調配物)。通常，分配用物件包括存放呈適當形式之醫藥調配物之容器。適宜容器為熟習此項技術者所熟知且包括諸如以下之材料：瓶(塑膠及玻璃瓶)、藥囊(sachets)、安瓿(ampoules)、塑膠袋、金屬圓筒及諸如此類。容器亦可包括防擾配件以防止不慎接觸到包裝中之內容物。另外，容器上置有闡述容器內容物之標籤。該標籤亦可包括適當警告。
亦可製備持續釋放型製劑。持續釋放型製劑之適宜實例包括含有式I化合物之固態疏水性聚合物之半滲透性基質，該等基質呈成形物件形式，例如薄膜或微膠囊。持續釋放型基質之實例包括聚酯、水 凝膠(例如，聚(2-羥乙基-甲基丙烯酸酯)或聚(乙烯醇))、聚乳酸、L-麩胺酸與γ-乙基-L-麩胺酸酯之共聚物、不可降解之乙烯-乙酸乙烯酯、可降解之乳酸-乙醇酸共聚物(例如LUPRON DEPOTTM，由乳酸-乙醇酸共聚物及乙酸亮丙瑞林組成之可注射微球體)，及聚-D-(-)-3-羥丁酸。
用於治療人類患者之劑量可在約0.1mg至約1000mg式I化合物之範圍內。典型劑量可為約1mg至約300mg該化合物。劑量可每天一次(QID)、每天兩次(BID)或以更高頻率投與，此端視藥物動力學及藥效動力學性質(包括具體化合物之吸收、分佈、代謝及排泄)而定。另外，毒性因素可影響劑量及投與方案。在經口投與時，可經指定時間段每天或以更低頻率攝取丸劑、膠囊或錠劑。可在多個療法循環中重複該方案。
本發明化合物可藉由任何適宜方式來投與，包括經口、局部(包括經頰及舌下)、經直腸、經陰道、經皮、非經腸、皮下、腹膜內、肺內、真皮內、鞘內及硬膜外及鼻內、以及(若期望用於局部治療)病灶內投與。非經腸輸注包括肌內、靜脈內、動脈內、腹膜內或皮下投與。
本發明化合物可以任何便利投與形式投與，例如錠劑、粉劑、膠囊、溶液、分散液、懸浮液、糖漿、噴霧劑、栓劑、凝膠、乳液、貼劑等。該等組合物可含有醫藥製劑中之習用組份，例如稀釋劑、載劑、pH改良劑、甜味劑、膨脹劑及其他活性劑。
典型調配物係藉由將本發明化合物與載劑或賦形劑混合來製備。適宜載劑及賦形劑已為彼等熟習此項技術者所熟知且詳細闡述於以下文獻中：例如Ansel,Howard C.等人，Ansel’s Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems.Philadelphia：Lippincott,Williams & Wilkins,2004；Gennaro,Alfonso R.等人，Remington：The Science and Practice of Pharmacy.Philadelphia：Lippincott,Williams & Wilkins,2000；及Rowe,Raymond C.Handbook of Pharmaceutical Excipients.Chicago,Pharmaceutical Press,2005。調配物亦可包括一或多種緩衝劑、穩定劑、表面活性劑、潤濕劑、潤滑劑、乳化劑、懸浮劑、防腐劑、抗氧化劑、遮光劑、滑動劑、處理助劑、著色劑、甜味劑、芳香劑、矯味劑、稀釋劑及其他已知添加劑以提供藥物(即本發明化合物或其醫藥組合物)之較佳外觀或有助於醫藥產品(即醫藥)製造。
對於經口投與而言，含有各種賦形劑(檸檬酸)之錠劑可與各種崩解劑(例如澱粉、海藻酸及某些複合矽酸鹽)及與黏合劑(例如蔗糖、明膠及阿拉伯膠)一起使用。另外，潤滑劑(例如硬脂酸鎂、月桂基硫酸鈉及滑石粉)通常可用於壓錠目的。類似類型之固體組合物亦可在軟及硬的填充明膠膠囊中使用。因此，較佳材料包括乳糖(乳糖或milk sugar)及高分子量聚乙二醇。當期望經口投與水性懸浮液或酏劑時，其中之活性化合物可與各種甜味劑或矯味劑、著色物質或染料及(若期望)乳化劑或懸浮劑以及與稀釋劑(例如水、乙醇、丙二醇、甘油或其組合)一起組合。
適宜口服劑型之實例係含有約25mg、50mg、100mg、250mg或500mg本發明化合物且混合有約90-30mg無水乳糖、約5-40mg交聯羧甲纖維素鈉、約5-30mg聚乙烯吡咯啶酮(PVP)K30及約1-10mg硬脂酸鎂之錠劑。首先將粉末狀成份混合在一起，且然後與PVP溶液混合。可將所得組合物乾燥，製粒，與硬脂酸鎂混合併使用習用設備壓縮成錠劑形式。氣溶膠調配物之實例可藉由將本發明化合物(例如5mg至400mg)溶解於適宜緩衝溶液(例如磷酸鹽緩衝液)中、添加滲透壓調節劑(tonicifier)(例如諸如氯化鈉等鹽)(若期望)來製備。可使用(例如)0.2微米過濾器來過濾溶液以去除雜質及污染物。
在一個實施例中，醫藥組合物亦包括至少一種其他抗增殖劑。
因此，實施例包括包含式I化合物或其立體異構物或醫藥上可接受之鹽之醫藥組合物。在另一實施例中，其包括包含式I化合物或其立體異構物或醫藥上可接受之鹽以及醫藥上可接受之載劑或賦形劑之醫藥組合物。
因此，本發明進一步提供包含至少一種如上文所定義之活性成份以及獸醫載劑之獸醫組合物。獸醫載劑係可用於投與組合物目的之材料且可為固體、液體或氣態材料，其在其他方面為惰性的或為獸醫界可接受的且可與活性成份相容。該等獸醫組合物可以非經腸、經口方式或藉由任何其他期望途徑來投與。
組合療法
式I化合物可單獨或與其他治療劑組合用於治療本文所闡述之疾病或病症，例如過度增殖病症(例如，癌症)。在某些實施例中，式I化合物係在醫藥組合調配物中或作為組合療法之給藥方案與具有抗過度增殖性質或可用於治療過度增殖病症之第二化合物組合。醫藥組合調配物或給藥方案中之第二化合物較佳地具有與式I化合物互補之活性，從而使得其不會不利地影響彼此。組合療法可提供「協同作用」且證實具有「協同性」，即，在一起使用活性成份時所達成之效應大於分開使用化合物所產生效應之總和。
組合療法可以同時或依序方案來投與。在依序投與時，該組合可以兩次或更多次投與來投與。組合投與包括使用單獨調配物或單一醫藥調配物之共投與，及以任一順序進行之連續投與，其中兩種(或所有)活性劑較佳地在一段時間內同時發揮其生物活性。
上述共投與藥劑中任一者之適宜劑量係彼等當前使用者，且可因新確定藥劑及其他化學治療劑或治療之組合作用(協同作用)而減少。
因此，本發明之組合療法包含投與至少一種式I化合物或立體異構物、幾何異構物、互變異構物、代謝物或醫藥上可接受之鹽，及使用至少一種其他癌症治療方法。將選擇式I化合物及其他醫藥活性化學治療劑之量及相對投與定時，以便達成期望組合治療效應。
製造物件
在本發明之另一實施例中，提供含有可用於治療上述疾病及病症之製造物件或「套組」。在一個實施例中，套組包含包括式I化合物或其立體異構物、互變異構物或醫藥上可接受之鹽之容器。套組可另外包含位於容器上或與該容器結合之標籤或包裝插頁。所用術語「包裝插頁」係指通常包括於治療產品之商業包裝內之說明書，其含有關於適應症、用法、劑量、投與、禁忌症及/或關於該等治療產品之使用之警告的資訊。適宜容器包括(例如)瓶、小瓶、注射器、泡罩包裝等。容器可自各種材料(例如玻璃或塑膠)形成。容器可容納有效治療病況之式I化合物或其調配物，且可具有無菌入口埠(例如，容器可為靜脈內溶液袋或具有可由皮下注射針刺穿之塞子的小瓶)。組合物中之至少一種活性劑係式I化合物。另一選擇為，或另外，製造物件可進一步包含第二容器，該第二容器包含醫藥稀釋劑，例如注射用抑菌水(BWFI)、磷酸鹽緩衝鹽水、林格氏溶液(Ringer's solution)及右旋糖溶液。其可進一步包括自商業及使用者角度來看合意之其他材料，包括其他緩衝劑、稀釋劑、過濾器、針及注射器。
在另一實施例中，套組適於遞送固體口服形式之式I化合物，例如錠劑或膠囊。此一套組可包括多個單位劑量。此一套組之實例系「泡罩包裝」。泡罩包裝為包裝工業所熟知且廣泛用於包裝醫藥單位劑型。
根據一個實施例，套組可包含(a)含有式I化合物之第一容器；及視情況(b)含有第二醫藥調配物之第二容器，其中該第二醫藥調配 物包含具有抗過度增殖活性之第二化合物。另一選擇為或另外，套組可進一步包含第三容器，該第三容器包含醫藥上可接受之緩衝劑，例如注射用抑菌水(BWFI)、磷酸鹽緩衝鹽水、林格氏溶液及右旋糖溶液。其可進一步包括自商業及使用者角度來看合意之其他材料，包括其他緩衝劑、稀釋劑、過濾器、針及注射器。
以下實例闡釋本發明範圍內化合物之製備及生物評價。提供以下該等實例及製備方法以使彼等熟習此項技術者能夠更清楚地瞭解並實踐本發明。其不應視為限制本發明之範圍，而僅用於闡釋及代表本發明。
生物實例1 PAK1-KD(激酶結構域)IC50 Zlyte分析方案
可藉由分析FRET肽受質之磷酸化評價活體外人類重組PAK1-KD蛋白質之活性。藉由自感染人類PAK1-KD重組桿狀病毒表現載體之Tini細胞實施純化獲得催化活性人類重組PAK1-KD蛋白質。
藉由使用Z’-LYTETM分析(Invitrogen)量測標記有香豆素及螢光素之FRET肽受質(Ser/Thr19)之磷酸化估計PAK1-KD之活性/抑制。肽受質係基於科學文獻中報導之各種PAK受質之共有序列(KKRNRRLSVA)。10μL分析混合物含有50mM HEPES(pH 7.5)、0.01% Brij-35、10mM MgCl2、1mM EGTA、2μM FRET肽受質及20pM PAK1-KD。在22℃下在黑色聚丙烯384孔板(Corning Costar)中實施培育。在分析前，將PAK1-KD、FRET肽受質及連續稀釋之測試化合物在分析緩衝液(7.5μL)中一起預培育10分鐘，且藉由添加2.5μL含有160μM ATP之分析緩衝液(4×)開始分析。60分鐘培育後，藉由添加5μL Z’-LYTETM顯影試劑淬滅分析混合物，且在1小時後，在400nm下激發後使用Envision讀板器(Perkin Elmer)測定香豆素(445nm)及螢光素(520nm)之發射。測定發射比(445nm/520nm)以對受質磷酸化 之水準進行定量。數據納入表1中。
生物實例2 細胞PAK IC50分析方案
群組I PAK(PAK1-3)在結合至Rho GTPase、Rac1及Cdc42後經活化。經活化群組I PAK磷酸化絲胺酸298(S298)處之MEK1，催化結構域中兩個位點中之一者對於Raf與MEK1間之穩定締合及後續MAPK活化甚為重要。藉由使用均相時間解析螢光(HTRF)檢測S298處MEK1磷酸化程度之改變評價對EBC1細胞中群組I PAK之抑制。藉由利用PAK抑制劑將2×104個EBC1細胞在含有0.1% FBS之培養基中處理2h估計抑制活性。在抑制劑處理後，用25μL含有1×細胞激酶封阻試劑(Cisbio)之1×細胞激酶溶解緩衝液(Cisbio)溶解細胞。將細胞溶解在4℃下在不斷振盪下實施2h，之後將溶解產物(16μL)轉移至白色384孔ProxiPlatesTM(Perkin Elmer)中。在1×檢測緩衝液(CisBio)中製備標記有銪穴狀化合物供體之抗總MEK1抗體(1ng/孔)(Cell Signaling Technologies目錄編號2352)及標記有d2受體之抗磷酸MEK1(S298)抗體(10ng/孔)(Cell Signaling Technologies目錄編號9128)，並將其添加至分析板之每一孔中並將其在室溫下培育過夜。第二天，在EnVision®(Perkin Elmer)中在330nm之激發及615nm及665nm之雙重激發波長下量測每一孔之螢光發射。將665nm下每一孔中之信號乘以10,000並除以615nm下同一孔中之信號以獲得比率。以化合物濃度之函數繪製比值([665˙10,000]÷615)之圖形，從而確定IC50值。代表性數據列表於表II中。
參考實例1 4-(2-甲基磺醯基氧基乙基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯
在0℃下向4-(2-羥基乙基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(887mg,3.85mmol)於無水DCM(10.2mL)中之溶液中添加TEA(591mg,5.78mmol)。5min後，添加甲烷磺醯氯(529mg,4.62mmol)，並將反應混合物在室溫下在N2下攪拌3h。用EtOAc稀釋反應混合物。用鹽水洗滌有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾，並濃縮，從而得到油狀4-(2-甲基磺醯 基氧基乙基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(1.18g,99.9%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 4.37(2H),3.46(4H),3.07(s,3H),2.80(2H),2.62-2.42(m,4H),1.46(s,9H)。
參考實例2 2-(2-甲基磺醯基氧基乙基)吡咯啶-1-甲酸苄基酯
步驟1：在0℃下向2-吡咯啶-2-基EtOH(1.0g)及TEA(1.76g,17.4mmol)於無水DCM(17.4mL)中之溶液中逐滴添加氯甲酸苄基酯(1.48g,8.68mmol)，並將反應混合物在室溫下在N2下攪拌20h。用EtOAc稀釋反應混合物。用10%檸檬酸水溶液、水及鹽水洗滌有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾，並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用庚烷：/EtOAc洗脫純化粗製殘餘物，從而得到澄清油狀2-(2-羥基乙基)吡咯啶-1-甲酸苄基酯(1.39g,64.3%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 7.43-7.28(m,5H),5.15(d,J=2.1Hz,2H),4.21(br s,1H),3.60(dt,J=9.9,3.6Hz,2H),3.52-3.24(m,2H),3.22(br s,1H),2.01(dtd,J=11.2,9.2,7.6Hz,1H),1.95-1.85(m,2H),1.80-1.60(m,2H),1.79-1.60(m,1H)。
步驟2：使用類似於參考實例1之程序(只是起始材料為2-(2-羥基乙基)吡咯啶-1-甲酸苄基酯)製備2-(2-甲基磺醯基氧基乙基)吡咯啶-1-甲酸苄基酯。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 7.40-7.27(m,5H),5.12(s,2H),4.40-4.14(m,2H),4.02(br s,1H),2.84(br s,1H),3.59-3.39(m,2H),3.07-2.95(m,2H),2.26-2.10(m,1H),2.03(dq,J=12.0,8.1Hz,1H),1.93-1.77(m,3H),1.72(ddt,J=13.9,5.8,3.1Hz,1H)。
參考實例3 4-(2-氯乙醯基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯
在0℃下向六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(2g,10.1mmol)於DCM(20mL)中之混合物中添加2-氯乙醯氯(570mg,5.05mmol)。在室溫下攪拌5h後，用DCM(25mL)稀釋混合物，用稀檸檬酸、水及鹽水洗滌。乾燥(MgSO4)有機層，過濾並在真空中濃縮，從而得到淺黃色固體狀4-(2-氯乙醯基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(1.4g,50%)。MS(ESI)：m/z=263.2[M+1]+。
參考實例4 3-(2-羥基乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯
在100℃(內部溫度)下將3-羥基氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(200mg,1.16mmol)、TEA(120mg,1.16mmol)、四丁基溴化銨(30mg,0.093mmol)及碳酸伸乙酯(155mg,1.74mmol)加熱36h。在室溫下在真空中濃縮反應混合物，並藉由SiO2層析用MeOH/DCM(100：6)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色油狀3-(2-羥基乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(100mg,39%)。LCMS(ESI)：m/z=162.3[M-55]+。
參考實例5 3-(2-羥基乙氧基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯
將3-羥基六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(4.0g,0.02mol)、1,3-二氧雜環戊-2-酮(1.926g,0.022mol)及四丁基溴化銨(128mg,0.4mmol)於TEA(2.22g,0.022mol)中之混合物在120℃下在N2下攪拌18h，隨後冷卻至室溫。將反應混合物傾倒至水(150mL)中，用DCM(3×50mL)萃取，然後在減壓下濃縮，且然後藉由SiO2層析用PE/EtOAc(1：1)洗 脫進行純化，從而得到黃色油狀目標化合物(981mg,20.1%)。MS(ESI)：m/z=190.1[M-55]。
參考實例6 3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯
步驟1：在0℃下向氫化鈉(0.94g,39mmol)於無水THF(200mL)中之溶液中添加3-羥基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(5.61g,30mmol)。在攪拌40min後，逐滴添加氯乙酸乙酯(4.14mL,30mmol)，並將所得深紫色溶液攪拌過夜。用5% HCl溶液淬滅反應混合物並用EtOAc(150mL)萃取。合併萃取物，用鹽水洗滌，乾燥(Na2SO4)，過濾，並在減壓下濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/PE梯度(1：5至1：3)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色油狀3-(2-乙氧基-2-側氧基乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(3.4g,42%)。LCMS(ESI)：m/z=218[M-55]+。
步驟2：在氮氣氛下，在0℃下將3-(2-乙氧基-2-側氧基乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(884mg,3.24mmol)於無水THF(20.0mL)中之溶液逐滴添加至LiAlH4(120mg,3.24mmol)於無水THF(10.0mL)中之攪拌混合物中。將反應物攪拌40min且然後用水(2.0mL)及10% NaOH(0.9mL)進行連續處理。在攪拌2h後，用EtOAc(50mL)萃取所得混合物。在減壓下去除溶劑，從而得到無色油狀3-(2-羥基乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(644mg,86%)。LCMS(ESI)：m/z=176.2(M-55)。
步驟3：向3-(2-羥基乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(644mg,2.78mmol)於DCM(10mL)及THF(4.0mL)中之冰冷溶液中添加TEA(0.77mL)及TsCl(0.63g,0.69mmol)。將混合物於室溫下攪拌過夜。然後添加DMAP(0.18g)，並將反應混合物攪拌2h。添加飽和NaHCO3 水溶液(2.0ml)並分離各層。用飽和CuSO4(2×1.0mL)、水(10mL)及鹽水進一步洗滌有機層，且然後濃縮至乾燥。過濾出所得固體，用水洗滌並在真空中乾燥，從而得到黃色油狀3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙氧基)比咯啶-1-甲酸第三丁基酯(530mg,48%)。LCMS(ESI)：m/z=330.2[M-55]+。
參考實例7 [2-氯-4-(3-甲基吡嗪-2-基)苯基]酸
步驟1：在氮氣氛下吹掃並維持10L 4頸圓底燒瓶，且然後用4-溴-2-氯苯胺(300g,1.45mol,1.00當量)及氧雜環戊烷(3000mL)裝填。經3h在0℃下在攪拌下逐滴添加NaHMDS(1601mL,3.2mol,2.20當量)於THF中之溶液。經1h在0℃下在攪拌下向此溶液中逐滴添加二碳酸二第三丁基酯(381g,1.75mol,1.20當量)。將所得溶液在室溫下攪拌過夜。將此反應再重複1次。然後，藉由添加5L水/冰淬滅反應物並用5L EtOAc萃取所得溶液。經無水Na2SO4乾燥合併之有機層並在真空下濃縮，從而得到955g(粗產物)褐色油狀N-(4-溴-2-氯苯基)胺基甲酸第三丁基酯。
步驟2：在氮氣氛下吹掃並維持10L 4頸圓底燒瓶，然後，用N-(4-溴-2-氯苯基)胺基甲酸第三丁基酯(477g,1.00當量，粗產物)、二噁烷(3500mL)、4,4,5,5-四甲基-2-(四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)-1,3,2-二氧硼(371g,1.46mol,1.00當量)、KOAc(428g,4.36mol,3.00當量)及Pd(dppf)Cl2(18g,24.60mmol,0.02當量)裝填。將所得溶液在90℃下攪拌4h。將此反應再重複1次。過濾出固體且產物未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟3：在氮氣氛下吹掃並維持10L 4頸圓底燒瓶且然後用來自 步驟2之N-[2-氯-4-(四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基]胺基甲酸第三丁基酯(1.00當量)、2-氯-3-甲基吡嗪(187g,1.45mol,1.00當量)、Na2CO3(312g,2.92mol,2.00當量)於水(1460mL)中之溶液及(PPh3)4Pd(II)(10g)裝填。在85℃下將所得溶液攪拌過夜。將此反應再重複1次。使反應混合物冷卻至室溫，用10L水稀釋並用10L EtOAc萃取。用3×10L水洗滌有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。在SiO2管柱上用EtOAc/PE梯度(1：10至1：5)洗脫純化殘餘物，從而得到350g(75%)白色固體狀N-[2-氯-4-(3-甲基吡嗪-2-基)苯基]胺基甲酸第三丁基酯。
步驟4：用N-[2-氯-4-(3-甲基吡嗪-2-基)苯基]胺基甲酸第三丁基酯(350g,1.09mol,1.00當量)及EtOAc(5L)裝填10L 4頸圓底燒瓶且然後引入氯化氫(氣體)。將所得溶液在室溫下攪拌4h並在真空下濃縮。用3L水稀釋固體。用K2CO3將溶液之pH值調節至8並用2×3L EtOAc萃取所得溶液。將合併之有機層經無水Na2SO4乾燥並在真空下濃縮，從而得到240g白色固體狀2-氯-4-(3-甲基吡嗪-2-基)苯胺。
步驟5：將10L 4頸圓底燒瓶放置入2-氯-4-(3-甲基吡嗪-2-基)苯胺(120g,546.27mmol,1.00當量)、水(2400mL)、CH3CN(800mL)、濃HCl(280mL)，隨後經1h在0℃下在攪拌下逐滴添加亞硝酸鈉(45.4g,658.02mmol,1.20當量)於水(500mL)中之溶液。將所得溶液在0℃下攪拌1h。經1h在0℃下在攪拌下向此溶液中逐滴添加NaI(164.25g,1.10mol,2.00當量)於水(500mL)中之溶液。將所得溶液在0℃下攪拌30min。將此反應再重複1次。用5L水稀釋所得溶液並用10L EtOAc萃取。用1×10L Na2SO3、1×10L水及1×10L鹽水洗滌合併之有機層，經無水Na2SO4乾燥並在真空下濃縮。在SiO2管柱上用EtOAc/PE(1：5)洗脫純化殘餘物，從而得到230g(64%)白色固體狀2-(3-氯-4-碘苯基)-3-甲基吡嗪。
步驟6：用惰性氮氣氛吹掃並維持3L 4頸圓底燒瓶，然後用2-(3-氯-4-碘苯基)-3-甲基吡嗪(110g,332.78mmol,1.00當量)、B(i-PrO)3(125.3g,666.49mmol,2.00當量)、氧雜環戊烷(1500mL)裝填。將溶液冷卻至-78℃，並經1h在-78℃下在攪拌下逐滴添加丁基鋰溶液(180mL,433mmol,1.30當量)。將所得溶液攪拌30min。將此反應再重複1次。然後，藉由添加3LNaOH(3N)淬滅反應物並用3×1.5L EtOAc萃取。合併水層並用HCl水溶液(6mol/L)將溶液之pH值調節至6。藉由過濾收集固體並在烘箱中在減壓下乾燥，從而得到103g(62%)白色固體狀[2-氯-4-(3-甲基吡嗪-2-基)苯基]酸。1H-NMR(300MHz,MeOH-d 4 )：δ 8.54-8.51(dd,J=2.4,2H),7.63-7.49(m,3H),2.62(s,3H)；MS(ES,m/z)：249[M+H]+。
參考實例8 4-甲基苯磺酸2-(2-(第三丁氧基羰基胺基)乙氧基)乙基酯
步驟1：將二碳酸二第三丁基酯(12.6g,58mmol)添加至2-(2-胺基乙氧基)乙醇(5.0g,48mmol)於EtOH(100mL)中之混合物中。將反應混合物在室溫下攪拌過夜並在真空中濃縮，從而得到黃色油狀2-(2-羥基乙氧基)乙基胺基甲酸第三丁基酯(10g，粗產物)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=206.2[M+1]+。
步驟2：將DMAP(0.3g,2mmol)、TEA(7.4g,73mmol)及甲苯磺醯氯(6.8g,36mmol)添加至胺基甲酸第三丁基-2-(2-羥基乙氧基)乙基酯(5.0g,24mmol)於DCM(60mL)中之混合物中。將混合物在室溫下攪拌過夜，在真空中濃縮並藉由SiO2層析使用PE/EtOAc(3：1)作為洗脫劑純化，從而得到黃色油狀4-甲基苯磺酸2-(2-(第三丁氧基羰基胺基)乙氧基)乙基酯(8.0g,92%)。LCMS(ESI)：m/z=360.1[M+1]+。
參考實例9 3-(甲苯磺醯基氧基)-1-氧雜-7-氮雜螺[4.4]壬烷-7-甲酸第三丁基酯
將甲苯磺醯氯(4.7g,24.64mmol)、DMAP(150mg,1.2mmol)及TEA(3.74g,36.96mmol)添加至3-羥基-1-氧雜-7-氮雜螺[4.4]壬烷-7-甲酸第三丁基酯(3g,12.32mmol；非鏡像異構物混合物)於DCM(20mL)中之溶液中。將反應混合物在室溫下攪拌過夜，用DCM(30mL)稀釋並用鹽水(3×50mL)洗滌。乾燥(Na2SO4)有機層，在真空中濃縮，並藉由SiO2層析首先用DCM/PE(1：1)且然後DCM/MeOH(100：1)作為洗脫劑洗脫進行純化，得到澄清油狀3-(甲苯磺醯基氧基)-1-氧雜-7-氮雜螺[4.4]壬烷-7-甲酸第三丁基酯(3.62g,74%)。LCMS(ESI)：m/z=298[M+H-Boc]+。
參考實例10 3-(2-羥基乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯
將4-(羥基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(4.0g,18.6mmol)、甲苯磺醯氯(4.25g,22.3mmol)、TEA(5.4mL,37.2mmol)、DMAP(568mg,4.65mmol)於DCM(64mL)及THF(16mL)中之混合物在40℃下攪拌過夜。然後，濃縮反應混合物，用EtOAc(100mL)稀釋，並用HCl水溶液(0.5M,40mL)且然後鹽水(2×50mL)洗滌。乾燥(MgSO4)有機層，過濾並濃縮。藉由SiO2層析用PE/EtOAc梯度(100%至50%，在50min內)洗脫純化殘餘物，從而得到白色固體狀目標化合物(5.2g,76%)。LCMS(ESI)：m/z=314.2[M-55]+。
參考實例11 4-甲基苯磺酸((1s,4s)-4-(第三丁氧基羰基胺基)環己基)甲基酯
步驟1：將((1s,4s)胺基環己基)甲醇(400mg,3.10mmol)、二碳酸二第三丁基酯(743mg,3.41mmol)及TEA(627mg,6.20mmol)於DCM(10mL)中之混合物在25℃下攪拌1h。用DCM(20mL)稀釋混合物並用HCl水溶液(1N,20mL×2)及鹽水(20mL)洗滌。乾燥(Na2SO4)有機層並在真空中濃縮，從而得到白色固體狀粗製產物(1s,4s)-4-(羥基甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(365mg)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟2：將(1s,4s)-4-(羥基甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(480mg,2.09mmol)、TEA(423mg,4.18mmol)、甲苯磺醯氯(478mg,2.51mmol)及DMAP(26mg,0.21mmol)於DCM(10mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。然後，在真空中濃縮反應混合物並藉由SiO2層析用PE/EtOAc(1：3)洗脫進行純化，從而得到白色固體狀4-甲基苯磺酸((1s,4s)-4-(第三丁氧基羰基胺基)環己基)甲基酯(600mg,75%)。MS(ESI)：m/z=328.1[M-55]+。
參考實例12 2-側氧基-4-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯
步驟1：將2-(六氫吡啶-4-基)乙醇(1.00g,7.74mmol)、二碳酸二第三丁基酯(1.86g,8.51mmol)及TEA(1.57g,15.48mmol)於DCM(20mL)中之混合物在25℃下攪拌1h。然後，用DCM(20mL)稀釋混合物並用HCl(1N,2×20mL)及鹽水(20mL)洗滌。乾燥(Na2SO4)有機相並在真空中濃縮，從而得到粗製產物第三丁基4-(2-羥基乙基)六氫吡啶-1-甲酸酯白色固體狀(1.60g,90%)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。MS(ESI)：230.2[M-55]+。
步驟2：將中之混合物第三丁基4-(2-羥基乙基)六氫吡啶-1-甲酸酯(800mg,3.49mmol),TEA(706mg,6.98mmol)，甲苯磺醯氯(698mg,3.66mmol)，並DMAP(43mg,0.35mmol)於DCM(10mL)在室溫下攪拌過夜。然後，在真空中濃縮反應混合物並藉由SiO2層析用PE/EtOAc(1：3)洗脫純化，從而得到白色固體狀4-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(400mg,30%)。MS(ESI)：m/z=328.1[M-55]+。
步驟3：將4-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(400mg,1.04mmol)、過碘酸鈉(667mg,3.12mmol)及氧化釕(IV)(13mg,0.10mmol)於EtOAc(10mL)及水(10mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。過濾混合物，並在真空中濃縮濾液，從而得到白色固體狀2-側氧基-4-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(370mg,87%)，其未經進一步純化即用於後續轉換中。MS(ESI)：m/z=342.0[M-55]+。
參考實例13 (S)-3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯
步驟1：在0℃下將3-羥基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(5.61g,30mmol)添加至氫化鈉(0.94g,39mmol)於無水THF(200mL)中之懸浮液中。將混合物攪拌40min且然後逐滴添加氯乙酸乙酯(4.14mL,30mmol)。然後，將所得深紫色溶液攪拌過夜。用5% HCl溶液淬滅反應混合物並用EtOAc(150mL)萃取。用鹽水洗滌有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/PE梯度(1：5至1：3)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色油狀3-(2-乙氧基-2-側氧基乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(3.4g,42%)。LCMS(ESI)：m/z=218 [M-55]+。
步驟2：在N2下將LiAlH4(900mg,24.3mmol)緩慢添加至3-(2-乙氧基-2-側氧基乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(6.6g,24.1mmol)於無水THF(150mL)中之0℃溶液中。將反應混合物攪拌40min且然後用水(15mL)及10%氫氧化鈉(6.8mL)淬滅。用EtOAc(250mL)萃取混合物並在真空中濃縮，從而得到無色油狀3-(2-羥基乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(3.92g,70%)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=176.2(M-55)+。
步驟3：將TEA(4.62mL)及TsCl(3.78g,19.7mmol)添加至3-(2-羥基乙氧基)比咯啶-1-甲酸第三丁基酯(3.92g,16.9mmol)於DCM(6mL)及THF(24mL)中之冷卻至0℃之溶液中。將反應混合物在室溫下攪拌過夜，然後添加DMAP(1.08g)並將反應物攪拌2h，隨後用飽和NaHCO3水溶液(12ml)淬滅。分離有機層，用飽和CuSO4溶液(2×6.0mL)、水(60mL)、鹽水洗滌，乾燥(MgSO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到黃色油狀3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(4.6g,70%)。對掌性HPLC分離得到黃色油狀(S)-3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(1.84g,42%)。LCMS(ESI)：m/z=330.2[M-55]+。
在來自最後段落之程序之步驟C中所闡述之對掌性HPLC分離中獲得(R)-3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(1.69g,37%)。LCMS(ESI)：m/z=330.2[M-55]+。
參考實例14 3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯
步驟1：將四丁基溴化銨(148mg,0.46mmol)添加至3-羥基氮雜 環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(4g,23mmol)於TEA(2.467g,24mmol)中之溶液中。將反應混合物攪拌5h，且然後添加1,3-二氧雜環戊-2-酮(2.228g,25mmol)，並將混合物在100℃下加熱2.5天。然後，在真空中濃縮混合物並藉由SiO2層析用MeOH/DCM梯度(0%至3% MeOH，在40min內)洗脫進行純化，從而得到橙色油狀3-(2-羥基乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(2.63g,53%)。LCMS(ESI)：m/z=162.1[M-55]+。
步驟2：將3-(2-羥基乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(2.630g,12.1mmol)、甲苯磺醯氯(2.768g,14.5mmol)、TEA(3.5mL,24.2mmol)、DMAP(370mg,3.025mmol)於DCM(36mL)及THF(9mL)中之混合物在40℃下攪拌過夜。然後，濃縮反應混合物，用DCM(50mL)稀釋並用HCl水溶液(0.5M,40mL)洗滌。然後，用DCM(2×30mL)萃取水層並用NaHCO3溶液(50mL)、鹽水(50mL)洗滌合併之有機層，乾燥(MgSO4)，過濾，並濃縮。藉由SiO2層析用PE/DCM(1/1)之EA/混合物之梯度(3%至6%梯度)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色油狀3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(2.36g,52%)。LCMS(ESI)：m/z=316.0[M-55]+。
參考實例15 3-(2-甲基磺醯基氧基乙基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯
向火焰乾燥之燒瓶中添加3-(2-羥基乙基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(200mg,0.883mmol)、TEA(0.25mL,1.77mmol)及DCM(4.4mL)。在氮氣氛下使所得溶液冷卻至0℃。然後，逐滴添加甲烷磺醯氯(0.075mL,0.971mmol)並將溶液在0℃下攪拌90min。將反應混合物傾倒至EtOAc中並用鹽水洗滌。乾燥(MgSO4)有機層，過濾並濃縮， 從而得到黃色油狀粗製產物(259mg,100%)，其未經進一步純化即用於後續轉換。
參考實例16 2-側氧基-4-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯及2-側氧基-3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯
向氯化釕(III)(0.2當量，0.88mmol,182mg)及過碘酸鈉(3當量，13.2mmol,238mg)於水(2.9mL)中之溶液中添加3-[2-(對甲苯基磺醯基氧基)乙基]吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(1.62g,4.38mmol)於MeCN(3.7mL)中之溶液。將所得懸浮液在室溫下劇烈攪拌過夜。藉助矽藻土過濾反應混合物並用EtOAc沖洗。用飽和Na2SO3水溶液淬滅反應物並將其萃取至EtOAc(3×)中。用鹽水洗滌合併之有機層，乾燥(MgSO4)，並濃縮，從而得到深色油狀粗製產物。將粗製殘餘物吸附於矽藻土上並藉由SiO2層析(24g Silicycle HP筒柱)用EtOAc/庚烷梯度(0至100% EtOAc)洗脫進行純化，以分離區域異構物。
2-側氧基-4-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯：1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 7.79(d,J=8.1Hz,2H),7.36(d,J=8.0Hz,2H),4.07(m,2H),3.90-3.78(m,1H),3.29(dd,J=10.8,7.6Hz,1H),2.55(dd,J=16.9,8.2Hz,1H),2.46(s,3H),2.40(m,1H),2.14(dd,J=16.9,8.6Hz,1H),1.81(m,2H),1.52(s,9H)。
2-側氧基-3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯：1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 7.81-7.75(m,2H),7.35(m,2H),4.25-4.15(m,2H),3.76(ddd,J=10.8,8.8,1.9Hz,1H),3.54(ddd,J=10.9,10.2,6.9Hz,1H),2.59(m,1H),2.46(s,3H),2.29-2.15(m,2H), 1.79-1.60(m,2H),1.55-1.49(s,9H)。
參考實例17 3-(甲苯磺醯基氧基)-1-氧雜-8-氮雜螺[4.5]癸烷-8-甲酸第三丁基酯
將甲苯磺醯氯(1.5g,7.8mmol)、DMAP(47.6mg,0.39mmol)及TEA(1.18g,11.7mmol)添加至3-羥基-1-氧雜-8-氮雜螺[4.5]癸烷-8-甲酸第三丁基酯(1g,3.9mmol)於DCM(20mL)中之溶液中。將混合物在室溫下攪拌過夜且然後用DCM(30mL)稀釋並用鹽水(3×50mL)洗滌。將有機層經Na2SO4乾燥並在真空中濃縮。藉由矽膠層析用DCM/PE(1：1)至DCM：MeOH(100：1)洗脫純化粗製產物，從而得到無色油狀3-(甲苯磺醯基氧基)-1-氧雜-7-氮雜螺[4.4]壬烷-7-甲酸第三丁基酯(1.13g,70%)LCMS(ESI)：m/z=312[M+H-BOC]+。
參考實例18 (R)-2-(((甲基磺醯基)氧基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯
在0℃下向(2R)-2-(羥基甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(550mg)於無水DCM(7.2mL)中之溶液中添加TEA(388mg,109mmol)。5min後，添加甲烷磺醯氯(350mg,3.80mmol)，並將反應混合物在室溫下在N2下攪拌3h。用EtOAc稀釋反應混合物。用鹽水洗滌有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾，並濃縮，從而得到740mg(99%)油狀(R)-2-(((甲基磺醯基)氧基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 4.23(d,J=4.9Hz,2H),4.04-3.78(m,3H),3.73-3.65(m,1H),3.54(td,J=11.6,2.8Hz,1H),3.06(s,3H),3.01-2.88(m,1H),2.84-2.68(m,1H),1.47(s,9H)。
參考實例18 2-(2-((甲基磺醯基)氧基)乙基)-嗎啉-4-甲酸苄基酯
步驟1：在0℃下向2-嗎啉-2-基乙醇(1.0g,7.62mmol)及TEA(1.0g,9.9108mmol)於無水DCM(15mL)中之溶液中逐滴添加氯甲酸苄基酯(1.3g,7.62mmol)。使反應混合物緩慢升溫至室溫，攪拌20h，並用EtOAc稀釋。用鹽水洗滌合併之有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在減壓下濃縮。藉由SiO2層析用庚烷/EtOAc洗脫純化粗製殘餘物，從而得到1.71g(84.5%)澄清油狀2-(2-羥基乙基)嗎啉-4-甲酸苄基酯。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 7.42-7.28(m,5H),5.15(d,J=1.7Hz,2H),4.09-3.83(m,3H),3.79(dd,J=6.2,5.1Hz,2H),3.68-3.48(m,2H),3.01(br s,1H),2.75(br s,1H),2.19-2.01(m,1H),1.82-1.62(m,2H)。
步驟2：在0℃下向2-(2-羥基乙基)嗎啉-4-甲酸苄基酯(1.71g,6.45mmol)於無水DCM(17mL)中之溶液中添加TEA(988mg,9.67mmol)。5min後，添加甲烷磺醯氯(886mg,7.73mmol)，並將所得非均質反應混合物在室溫下在N2下攪拌3h。用EtOAc稀釋反應混合物。用鹽水洗滌有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾，並濃縮，從而得到2.18g(98.5%產率)油狀2-(2-((甲基磺醯基)氧基)乙基)-嗎啉-4-甲酸苄基酯。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 7.40-7.29(m,5H),5.15(d,J=1.5Hz,2H),4.45-4.28(m,2H),4.11-3.79(m,3H),3.62-3.45(m,2H),2.99(s,4H),2.71(br s,1H),1.97-1.75(m,2H)。
參考實例19 1-氧雜-6-氮雜-螺[2.5]辛烷-6-甲酸苄基酯
在0℃下，將氫化鈉(600mg,60%存於礦物油中，15mmol)添加至三甲基碘化亞碸(3.3g,15mmol)於DMSO(50mL)中之溶液中。將混合物在室溫下攪拌40min，且然後添加4-側氧基-六氫吡啶-1-甲酸苄基酯(2.33g,10mmol)。將混合物在55℃下攪拌2h，冷卻至室溫並傾倒至冰水中。用EtOAc(2×50mL)萃取粗製混合物並將合併之有機層經無水Na2SO4乾燥並在真空中濃縮。藉由矽膠層析用EtOAc/PE(1：1)洗脫純化殘餘物，從而得到無色油狀1-氧雜-6-氮雜-螺[2.5]辛烷-6-甲酸苄基酯(1.7g,69%)。LCMS(ESI)：m/z=248.0[M+1]+。
參考實例20 4-(2-胺基乙基)-3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯
步驟1：在0℃下向NaH(430mg,1.8mmol)於DMF(5mL)中之混合物中添加3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(3.0g,1.5mmol)及2-溴乙腈(1.8g,1.5mmol)。將混合物於室溫下攪拌過夜。然後，用EtOAc(10mL)及H2O(10mL)稀釋反應混合物。用鹽水洗滌分離之有機層，乾燥(MgSO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用DCM/MeOH(40：1)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色油狀4-(氰基甲基)-3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(3.0g,76%)。LCMS(ESI)：m/z=240.1[M+1]+。
步驟2：將4-(氰基甲基)-3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(3.0g,12.5mmol)、PtO2(300mg,1.32mmol)於EtOH(20mL)中之混合物在20℃下在H2(50psi)下攪拌過夜。藉由過濾去除Pd/C觸媒，並在減壓下濃縮濾液，從而得到黃色固體狀4-(2-胺基乙基)-3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(2.8g,93%)。LCMS(ESI)：m/z=244.2 [M+1]+。
參考實例21 3-(1-(甲苯磺醯基氧基)丙-2-基氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯
步驟1. 在0℃下向3-羥基氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(4.00g,23.09mmol)於無水DMF(20mL)中之攪拌溶液中逐份添加NaH(1.11g,46.18mmol,60%存於礦物中)。在將懸浮液在0℃下攪拌30min後，添加2-溴丙酸乙酯(8.36g,46.18mmol)。將所得混合物於室溫下於N2下攪拌過夜。藉由添加飽和NH4Cl水溶液(40mL)淬滅反應物並用EtOAc(50mL×3)萃取。乾燥合併之有機層(Na2SO4)，過濾，並在減壓下蒸發。藉由SiO2層析用PE/EtOAc(10：1)洗脫純化殘餘物，從而得到無色油狀3-(1-乙氧基-1-側氧基丙-2-基氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯1(1.00g,16%)。LCMS(ESI)：m/z=218.1[M-55]+。
步驟2. 使LiAlH4(625mg,16.47mmol)於無水THF(20mL)中之懸浮液冷卻至0℃。以若干份形式添加3-(1-乙氧基-1-側氧基丙-2-基氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(3.00g,10.98mmol)。將混合物於室溫下攪拌過夜。藉由添加飽和NH4Cl水溶液(40mL)淬滅反應物，並用EtOAc(50mL×3)萃取。將合併之有機層經無水Na2SO4乾燥，過濾，並在減壓下蒸發，從而得到無色油狀粗製產物3-(1-羥基丙-2-基氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(1.50g，粗產物)。LCMS(ESI)：m/z=176.1[M-55]+。
步驟3. 將3-(1-羥基丙-2-基氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(1.30g,5.62mmol)、4-甲基苯-1-磺醯氯(1.61g,8.43mmol)、TEA(1.14g,11.24mmol)及N,N-二甲基-4-胺基吡啶(68mg,0.56mmol)於DCM(30mL)中之溶液在室溫下攪拌過夜。然後，在減壓下濃縮反應 混合物。藉由矽膠層析使用PE/EtOAc(5：1)作為洗脫溶劑純化殘餘物，從而得到無色油狀目標化合物3-(1-(甲苯磺醯基氧基)丙-2-基氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(1.20g,55%，兩個步驟)。LCMS(ESI)：m/z=330.0[M-55]+。
參考實例22 3-(2-(甲苯磺醯基氧基)丙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯
步驟1：在0℃下向第三丁基3-羥基氮雜環丁烷(2.5g,14.5mmol)於DMF(100mL)中之溶液中添加NaH(1.45g,36.3mmol)並攪拌30min。在添加4-甲基-1,3-二氧雜環戊烷-2-酮(3g,29mmol)後，將反應物在120℃下攪拌過夜。使反應混合物冷卻至室溫並藉由添加飽和NH4HCO3水溶液(5mL)淬滅。在減壓下濃縮混合物，從而得到黃色固體狀3-(2-羥基丙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(4g)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=232.1[M+1]+
步驟2：將3-(2-羥基丙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(4.0g,17mmol)、DMAP(0.15g,1mmol)、TEA(3.7g,36.5mmol)及甲苯磺醯氯(4.9g,26mmol)於DCM(60mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。在減壓下濃縮後，藉由SiO2層析用PE/EtOAc(3：1)洗脫純化粗製產物，從而得到黃色油狀3-(2-(甲苯磺醯基氧基)丙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(4.0g,60%，兩個步驟)。LCMS(ESI)：m/z=386.2[M+1]+。
參考實例23 2-(3-(2-羥基乙氧基)環丁基)異吲哚啉-1,3-二酮
步驟1：將3-胺基環丁醇鹽酸鹽(1.91g,15.47mmol)、異苯并呋喃-1,3-二酮(2.52g,17.01mmol)及DIPEA(6.0g,46.40mmol)於PhMe(100mL)中之混合物在110℃下攪拌18h。濃縮反應混合物並藉由SiO2層析用PE/EA(3：1)洗脫進行純化，從而得到白色固體狀2-(3-羥基環丁基)異吲哚啉-1,3-二酮(2.1g,62.6%)。LCMS(ESI)：m/z=218.1[M+1]+
步驟2：將2-(3-羥基環丁基)異吲哚啉-1,3-二酮(1.70g,7.83mmol)、1,3-二氧雜環戊-2-酮(759mg,8.62mmol)及四丁基氟化銨(51mg,0.157mmol)於TEA(870mg,8.62mmol)中之混合物在120℃下攪拌18h。濃縮反應混合物並藉由SiO2層析用PE/EA(3：1)洗脫進行純化，從而得到黃色固體狀2-(3-(2-羥基乙氧基)環丁基)異吲哚啉-1,3-二酮(243mg,11.8%)。LCMS(ESI)：m/z=262.0[M+1]+
參考實例24 4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛
步驟1：在-78℃下向存於DCM(7.4L)中之4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(370.0g,1.59mol)添加二異丁基氫化鋁(1.5M存於甲苯中，2.1L,3.18mol)。經2h使反應混合物升溫至0℃。向反應物中添加20%羅謝爾鹽溶液(Rochelle’s salt solution)(5.0L)。將乳液攪拌30min。藉助矽藻土床過濾混合物。分離有機層並用EtOAc(1.0L×3)萃取水層。乾燥(Na2SO4)合併之有機層，過濾，並在真空中濃縮，從而得到固體狀粗製產物(4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-基)甲醇。藉由SiO2層析用DCM/EtOAc(1：1)洗脫純化粗製產物，從而得到固體狀純產物(4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-基)甲醇(133.0g,44.0%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.55(s,1H),4.74(s,2H),2.58(s,3H)；MS：191[M+H]+。
步驟2：將氧化錳(IV)(137.4g,1.58mol)添加至(4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-基)甲醇(30.0g,0.158mol)於DCM(1.5L)中之溶液中。將 反應物攪拌過夜，藉助矽藻土過濾，並在真空中濃縮濾液，從而得到白色固體狀粗製產物4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛。藉由SiO2層析用PE/EA(10：1)洗脫純化粗製產物，從而得到白色固體狀純4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛(21.0g,74.1%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 10.31(s,1H),8.87(s,1H),2.64(s,3H)；MS：189[M+H]+。
參考實例25 4-胺基-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛
步驟1. 向2L三頸燒瓶中添加4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(100g,0.43mol)、THF(500mL)及TEA(186mL,1.29mol)。以份形式添加氫氧化銨(28%於水中，400mL)，同時使內部溫度保持低於30℃。2h後，添加水(1000mL)，在真空下蒸餾出THF。過濾所得固體並在真空中在50℃下乾燥，從而得到4-胺基-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(90g,99%)。LC/MS：m/z=213.9[M+H]+；1H-NMR(DMSO-d6,400MHz)δ 8.57(s,1H),8.03(br,1H),7.65(br,1H),4.27(q,J=7.5Hz,2H),2.46(s,3H),1.29(t,J=7.2Hz,3H)。
步驟2：向3L三頸燒瓶中添加LiAlH4(25.7g,0.68mol)及THF(1L)，並使懸浮液冷卻至-10℃至0℃。藉助添加漏斗將4-胺基-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(120g,0.56mol)於THF(1L)中之溶液緩慢添加至攪拌混合物中。然後，使反應混合物升溫至20-25℃。2h後，使混合物冷卻至0℃並用水(26mL)緩慢淬滅。然後，添加10%氫氧化鈉(26mL)，隨後攪動2h且添加水(78mL)。過濾後，在減壓下濃縮混合物至乾燥。獲得粗製(4-胺基-2-(甲基硫基)嘧啶-5-基)甲醇(80g,83%)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。LC/MS：m/z=171.8[M+H]+。
步驟3：向3L三頸燒瓶中添加(4-胺基-2-(甲基硫基)嘧啶-5-基)甲 醇(100g,0.58mol)、活化MnO2(152g,1.75mol)及THF(2000mL)。將混合物加熱至40-45℃並保持16h。使反應混合物冷卻至20-25℃，藉助矽藻土墊過濾，並用THF(400mL×3)沖洗。將合併之濾液濃縮至乾燥。藉由在20-25℃下在200mL EtOAc/n-庚烷(1：5)中研磨獲得純4-胺基-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛(51g,51.6%)，隨後在真空中去除溶劑；1H-NMR(CDCl3,400MHz)δ 9.80(s,1H),8.44(s,1H),8.22(br,1H),5.77(br,1H),2.57(s,3H)；LC/MS：m/z=169.8[M+H]+。
參考實例26 [2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]酸
步驟1：向20L之3頸圓底燒瓶中置入THF(6L)及NaH(325g,8.12mol,2.00當量，60%)。以若干批次向此混合物中添加2,6-二氯吡嗪(600g,4.03mol,1.00當量)，同時使溫度保持低於10℃，隨後在攪拌下逐滴添加丙烷二酸1,3-二乙基酯(1386g,8.65mol,2.13當量)，同 時在3h內使溫度保持低於10℃。所得溶液加熱至回流過夜，冷卻，藉由添加水/冰淬滅並用2×3L EtOAc萃取。合併有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到2000g(粗產物)褐色油狀2-(6-氯吡嗪-2-基)丙烷二酸1,3-二乙基酯。
步驟2：向20L之3頸圓底燒瓶中逐份置入水(9L)、NaOH(900g,22.50mol,3.07當量)，隨後在攪拌下逐滴添加2-(6-氯吡嗪-2-基)丙烷二酸1,3-二乙基酯(2kg,1.00當量，粗產物)，同時使溫度保持低於10℃。將所得溶液在室溫下攪拌過夜並冷卻至0℃。利用HCl(37%)將溶液之pH值調節至約9-10，並用3×2L EtOAc萃取所得溶液。合併有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。用PE(1×1.5L)及MTBE(1×1.5L)洗滌殘餘物，乾燥(Na2SO4)，並在真空中濃縮，從而得到463.6g(37%)黃色固體狀2-(6-氯吡嗪-2-基)乙酸。
步驟3：向5L密封管中置入2-(6-氯吡嗪-2-基)乙酸(220g,1.27mol,1.00當量)及水(3L)。將所得溶液在130℃下攪拌過夜，冷卻並用Et2O 2×3L醚萃取。合併有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到238g(73%)黃色固體狀2-氯-6-甲基吡嗪。
步驟4：向20L之3頸圓底燒瓶中置入4-溴-2-氯苯胺(800g,3.87mol,1.00當量)及THF(10L)，隨後在攪拌下逐滴添加NaHMDS(3.9L,7.8mol,2.00當量，2mol/L)，同時使溫度保持低於10℃。將所得溶液在室溫下攪拌1h。在攪拌下向此溶液中逐滴添加BOC2O(1.012kg,4.64mol,1.20當量)，同時使溫度保持低於10℃。將所得溶液在室溫下攪拌過夜，藉由添加10L水/冰淬滅並用EtOAc(3×5L)萃取。合併有機層，用鹽水(1×5)洗滌，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空下濃縮，從而得到2.3kg(粗產物)褐色油狀N-(4-溴-2-氯苯基)胺基甲酸第三丁基酯。
步驟5：用N-(4-溴-2-氯苯基)胺基甲酸第三丁基酯(1.15kg,3.75mol,1.00當量)、二噁烷(3.5L)、KOAc(429g,4.37mol,1.17當量)、4,4,5,5-四甲基-2-(四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)-1,3,2-二氧硼(371g,1.46mol,0.39當量)及Pd(dppf)Cl2(18g)裝填用惰性氮氣氛吹掃並維持之10L之4頸圓底燒瓶。將所得溶液在90℃下攪拌3h。將此反應再重複1次。冷卻反應物並過濾固體。產物N-[2-氯-4-(四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基]胺基甲酸第三丁基酯未經進一步純化即直接用於下一步驟中。
步驟6：向用惰性氮氣氛吹掃並維持之20L之4頸圓底燒瓶中置入N-[2-氯-4-(四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基]胺基甲酸第三丁基酯、Na2CO3(2N,2.90L)、2-氯-6-甲基吡嗪(236g,1.84mol,0.65當量；在步驟3中獲得)及Pd(PPh3)4(20g)之溶液。將所得溶液在85℃下攪拌過夜並冷卻。過濾出固體並用3L水稀釋濾液。用EtOAc(3×3L)萃取所得溶液。合併有機層，用水(3×3L)及鹽水(1×3L)洗滌，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc：PE(1：1)洗脫純化殘餘物，從而得到340g(38%)黃色固體狀N-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]胺基甲酸第三丁基酯。
步驟7：用N-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]胺基甲酸第三丁基酯(340g,1.06mol,1.00當量)及EtOAc(5L)裝填10L之4頸圓底燒瓶。在0℃下引入氯化氫(氣體)並將所得溶液在室溫下攪拌3-4h。在真空中濃縮所得混合物，用水(1L)稀釋並用EtOAc(3×1L)萃取。合併有機層，經無水(Na2SO4)乾燥，過濾並在真空中濃縮，從而得到215g(92%)黃色固體狀2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯胺。
步驟8：用2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯胺(215g,978.74mmol,1.00當量)、MeCN(1.43L),HCl(濃的，501mL)、水(4.3L)裝填10L之 4頸圓底燒瓶，隨後在攪拌下逐滴添加NaNO2(80.9g,1.17mol,1.20當量)於水(500mL)中之溶液，同時使溫度為0-5℃。將所得溶液在0-5℃下攪拌40min。在0-5℃下在攪拌下向此溶液中逐滴添加NaI(293g,1.95mol,2.00當量)於水(500mL)中之溶液。將所得溶液在0-5℃下攪拌30min，用水稀釋並用EtOAc(3×2L)萃取。用Na2SO3(2×2L)、水(2×2L)及鹽水(2×2L)洗滌合併之有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空下濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/石油醚(1：2)洗脫純化殘餘物，從而得到196g(61%)黃色固體狀2-(3-氯-4-碘苯基)-6-甲基吡嗪。
步驟9：用2-(3-氯-4-碘苯基)-6-甲基吡嗪(110g,332.78mmol,1.00當量)、硼酸叁(丙-2-基)酯(125.3g,666.23mmol,2.00當量)、THF(1.5L)裝填用惰性氮氣氛吹掃並維持之3L之4頸圓底燒瓶。在-78℃下在攪拌下逐滴添加n-BuLi(180mL,433mmol,1.30當量，2.4M)。將所得溶液在-78℃下攪拌30min。將此反應再重複2次。藉由添加3% NaOH淬滅反應物直至pH=12，並用EtOAc(3×2L)萃取所得溶液。合併水層並用HCl(6N)將溶液之pH值調節至4-5。藉由過濾收集沈澱物，用2×1L水及2x1L MTBE洗滌，在烘箱中在減壓下乾燥，從而得到152g(61%)淺黃色固體狀[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]觸酸：249[M+H]+。1H-NMR(MeOH-d4,300MHz)：δ 2.64(3H,s),7.49至7.52(1H,d,J=7.8Hz),7.98至8.01(1H,d,J=1.2Hz),8.11(1H,s),8.48(1H,s),8.91(1H,s)；LC-MS(ES,m/z)。
參考實例27 2-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)乙酸甲酯
步驟1：在0℃下以份形式向4-溴-2-甲基苯甲酸1(215.0g,1.0mol)於THF(1L)中之溶液中添加LiAlH4(76.0g,1.0mol)。將反應物在此溫度下攪拌1h且然後用1N HCl(2.0L)淬滅反應物。用EtOAc(2×1000mL)萃取混合物並用鹽水(2×1000mL)洗滌有機層並經無水(Na2SO4)乾燥，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/PE(1/5)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色固體狀(4-溴-2-甲基苯基)甲醇(125g,62%產率)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ7.31(m,2H),7.19(d,J=8.8Hz,1H),4.59(s,2H),2.28(s,3H),1.95(s,1H)。
步驟2：在0℃下向(4-溴-2-甲基苯基)甲醇(200.0g,1.0mol)於DCM(500mL)中之溶液中逐滴添加SOCl2(100mL,1.2mol)。將反應混合物加熱至回流並在此溫度下攪拌4h。使反應混合物冷卻至室溫並在真空中濃縮。用EtOAc(1L)稀釋殘餘物並用水(2×500mL)、飽和NaHCO3(1000mL)及鹽水(1L)洗滌。乾燥有機層(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到黃色油狀4-溴-1-(氯甲基)-2-甲基苯(200g,100%產率)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟3：向4-溴-1-(氯甲基)-2-甲基苯(200.0g,1.0mol)於EtOH(500mL)中之溶液中添加NaCN(72g,2.0mol)。將反應混合物加熱至回流並在此溫度下攪拌12h。使反應混合物冷卻至室溫並在真空中濃 縮。用EtOAc(1L)稀釋殘餘物並用水(2×500mL)、飽和NaHCO3(1L)及鹽水(1L)洗滌。乾燥有機層(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到黃色油狀2-(4-溴-2-甲基苯基)乙腈(200g,100%產率)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 7.32(s,1H),7.27(d,J=8.0Hz,1H),7.06(d,J=8.0Hz,1H),3.66(s,2H),2.31(s,3H)
步驟4：向2-(4-溴-2-甲基苯基)乙腈(200.0g,0.66mol)於EtOH(500mL)中之溶液中添加KOH水溶液(10M,400mL,4mol)。將反應物加熱至回流並在此溫度下攪拌2h。使反應混合物冷卻至室溫並在真空中濃縮。將殘餘物溶解於水中且然後用Et2O(2×500mL)洗滌。使水層冷卻至0℃並用濃HCl將pH調節至5。過濾沈澱物並用水洗滌且然後在真空中乾燥，從而得到黃色固體狀2-(4-溴-2-甲基苯基)乙酸(150g,65.5%產率來自(4-溴-2-甲基苯基)甲醇)。
步驟5：在0℃下向2-(4-溴-2-甲基苯基)乙酸(150.0g,1mol)於MeOH(500mL)中之溶液中逐滴添加SOCl2(50mL,1.2mol)。將反應物加熱至回流並在此溫度下攪拌4h。使反應混合物冷卻至室溫並在真空中濃縮。用EtOAc(1L)稀釋殘餘物並用水(2×500mL)、飽和NaHCO3(1L)及鹽水(1L)洗滌。乾燥有機層(Na2SO4)，過濾並蒸發，從而得到黃色油狀2-(4-溴-2-甲基苯基)乙酸甲酯(130g,81%產率)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 7.36(s,1H),7.34(d,J=8.0Hz,1H),7.23(d,J=8.0Hz,1H),3.68(s,3H),3.58(s,2H),2.27(s,3H)。
步驟6：將2-(4-溴-2-甲基苯基)乙酸甲酯(63.0g,259mmol)、雙(頻那醇合)二硼(79.0g,311mmol)、KOAc(50.0g,518mmol)及Pd(dppf)Cl2(6.1g,7.5mmol)之混合物在無水DMSO(1L)中在N2下加熱至回流並保持18h。過濾此混合物，用水(1L)稀釋並用EtOAc(3× 800mL)萃取。乾燥有機層(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到粗製2-(2-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)乙酸甲酯(76g,100%)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟7：在N2下加熱2-(2-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)乙酸甲酯(75.4g,259mmol)、Na2CO3(83.0g,780mmol)、Pd(dppf)Cl2(6.3g,7.7mmol)及2-溴-6-甲基吡啶(54.0g,312mmol)於二噁烷/H2O(4：1,800mL)中之溶液並在100℃下攪拌18h。用H2O(200ml)稀釋所得混合物並用EtOAc(2×750mL)萃取。合併有機層，用鹽水(2×500mL)洗滌，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。然後，藉由SiO2層析利用PE/EtOAc梯度(10：1至5：1)洗脫純化粗製物質，從而得到黃色油狀2-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)乙酸甲酯(25g,39%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)：δ 7.81(s,1H),7.73(d,J=8.0Hz,1H),7.59(t,1H),7.46d,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=7.6Hz,1H),7.06(d,J=7.6Hz,1H),3.69(s,3H),3.67(s,2H),2.60(s,3H),2.38(s,3H)；MS：m/z 255.9[M+1]+。
參考實例28 2-[2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基]乙酸甲酯
步驟1：用CCl4(5760mL)、4-溴-2-氯-1-甲基苯(800g,3.89mol,1.00當量)、NBS(761.6g,4.28mol,1.10當量)及過氧化苯甲醯(47.8g,186.54mmol,0.05當量)裝填用惰性氮氣氛吹掃並維持之10L之4頸圓底燒瓶。將所得溶液在78℃下攪拌5h並過濾。用H2O(1×3L)及鹽水 (1×3L)洗滌濾液並乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到1.2kg(粗產物)褐色油狀4-溴-1-(溴甲基)-2-氯苯。
步驟2：向20L之4頸圓底燒瓶中置入水(4.5L)、DCM(4.5L)、4-溴-1-(溴甲基)-2-氯苯(1200g,4.22mol,1.00當量)及四丁基溴化銨(126g,390.86mmol,0.10當量)，隨後在室溫下在攪拌下逐滴添加NaCN(292g)於水(9L)中之溶液。將所得溶液在室溫下攪拌15h。用鹽水(1×500mL)洗滌有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/石油醚梯度(1：10-1：5)洗脫純化殘餘物，從而得到550g(57%)白色固體狀2-(4-溴-2-氯苯基)乙腈。
步驟3：用MeOH(2950mL)及2-(4-溴-2-氯苯基)乙腈(295g,1.28mol,1.00當量)裝填10L之4頸圓底燒瓶。經5h在0℃下在攪拌下逐滴添加亞硫醯氯(1500mL)。將所得溶液在室溫下攪拌過夜。重複此反應。濃縮合併之反應混合物並用EtOAc(5L)稀釋。用H2O(1×3L)、NaHCO3(1×3L)及鹽水(1×3L)洗滌所得混合物，經(Na2SO4)乾燥，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/PE梯度(1：0至20：1)洗脫純化殘餘物，從而得到600g(89%)淺黃色油狀2-(4-溴-2-氯苯基)乙酸甲酯。
步驟4：用二噁烷(3.5L)、2-(4-溴-2-氯苯基)乙酸甲酯(310g,1.18mol,1.00當量)、KOAC(347g,3.54mol,3.00當量)、4,4,5,5-四甲基-2-(四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)-1,3,2-二氧硼(299.4g,1.18mol,1.00當量)及Pd(dppf)Cl2(20g)裝填用惰性氮氣氛吹掃並維持之10L之4頸圓底燒瓶。將所得溶液在80℃下攪拌4h。重複此反應。過濾合併之反應溶液。濃縮含有粗製2-(2-氯-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)乙酸甲酯之所得溶液且其未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟5：用來自步驟4之碳酸鈉溶液(2N,1178mL)、2-溴-6-甲基 吡啶(202g,1.17mol,1.00當量)及Pd(PPh3)4(15g,12.98mmol,0.01當量)裝填用惰性氮氣氛吹掃並維持之10L之4頸圓底燒瓶。將所得溶液在85℃下攪拌過夜。重複此反應。使合併之反應混合物冷卻至室溫，過濾，並用水(5L)稀釋。用EtOAc(3×5mL)萃取所得溶液。用鹽水(1×3L)洗滌合併之有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由使用SiO2層析用EtOAc/PE(1：50)洗脫純化殘餘物，從而得到252g(39%)黃色油狀2-[2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基]乙酸甲酯。(ES,m/z)：[M+H+]=276.1H-NMR(CDCl3)：δ8.08(s,1H),7.87-7.84(dd,J=6.0Hz,1H),7.68-7.63(t,J=7.8Hz,1H),7.52-7.49(d,J=1.8Hz,1H),7.40-7.38(d,J=7.8Hz,1H),7.15-7.12(d,J=7.5Hz,1H),3.85(s,2H),3.74(s,3H),2.64(s,3H)。
參考實例29 2-(2-氯-4-(5-甲基噠嗪-3-基)苯基)乙酸甲酯
將2-(2-氯-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)乙酸甲酯(682mg,2.2mmol)、3-氯-5-甲基噠嗪(297mg於1.188g二噁烷中，2.3mmol)、KOAc(431mg,4.4mmol)、Pd(dppf)Cl2(II)(160mg,0.22mmol)於二噁烷(22mL)及水(16mL)中之混合物在90℃下在N2下加熱過夜。然後，用EtOAc(100mL)稀釋反應混合物，且用水(50mL)洗滌。用EtOAc(3×30mL)萃取水層。用鹽水(2×50mL)洗滌合併之有機層，乾燥(MgSO4)，過濾並在真空中濃縮。然後，藉由SiO2層析用PE/EtOAc(55-60%)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色固體狀目標化合物(186mg,30%)。LCMS(ESI)：m/z=277.0[M+1]+。
參考實例30 2-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)乙酸乙酯
步驟1：在氮下向3L三頸燒瓶中添加鋅粉(117g,1.79mol)及THF(0.3L)。以將內部溫度維持低於27℃之速率逐滴添加氯三甲基矽烷(10.4mL)。將混合物在25-27℃下攪拌30min且然後加熱至30℃。將溴乙酸乙酯(150g,0.90mol)於THF(1.2L)中之溶液緩慢逐滴添加至反應混合物中(內部溫度應維持低於50℃)。在完成添加後，使反應混合物冷卻回至25-30℃。在氮下藉助矽藻土墊過濾混合物，從而得到含有溴-(2-乙氧基-2-側氧基乙基)鋅之黃色溶液。將濃度滴定至為0.50M。
步驟2：在氮下用4-溴-2-氯-1-碘-苯(80g,0.25mol)、Pd(0)(dba)2(7.2g,0.0125mol)、Xantphos(7.2g,0.0125mol)及THF(800mL)裝填3L三頸燒瓶。將混合物脫氣並用氮回填三次。將溴-(2-乙氧基-2-側氧基乙基)鋅(960mL,0.48mol)添加至反應混合物中並加熱至65℃。1h後，使反應混合物冷卻至30℃並用飽和1N HCl(400mL)及25%鹽水(400mL)淬滅。分離有機層。然後，藉助矽藻土墊將其過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/庚烷梯度(0至30% EtOAc)洗脫純化粗製產物。獲得淺黃色油狀2-(4-溴-2-氯苯基)乙酸乙酯(60g,86%)。1H-NMR(CDCl3,400MHz)δ 7.48(d,J=2.0Hz,1H),7.29(dd,J 1=8.0Hz,J 2=2.0Hz,1H),7.08(d,J=8Hz,1H),4.10(q,J=6.8Hz,2H),3.64(s,2H),1.18(t,J=6.8Hz,3H)
步驟3：用2-(4-溴-2-氯苯基)乙酸乙酯(50g,0.18mol)、4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-二(1,3,2-二氧硼)(62.5g,0.24mol)、乙酸鉀(33g,0.34mol),Pd(dppf)Cl2(II).DCM(10.4g,0.012mol)及1,4- 二噁烷(250mL)裝填500mL三頸燒瓶。將混合物脫氣並用氮回填三次，然後在回流下加熱20h。過濾此混合物，添加25%鹽水(200mL)並用EtOAc(3×300mL)萃取所得混合物。經無水(Na2SO4)乾燥有機層，過濾並在真空中濃縮。然後，藉由SiO2層析用EtOAc/庚烷梯度(5%至25% EtOAc)洗脫純化粗製物質，從而得到2-(2-氯-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)乙酸乙酯。(54g,90%產率)。
步驟4：用2-(2-氯-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)乙酸乙酯(54g,0.17mol)、KOAc(33g,0.34mol)、Pd(dppf)Cl2(II).DCM(10.4g,0.012mol)、2-氯-6甲基吡嗪(21.3g,0.17mol)及1,4-二噁烷/水(2：1,750mL)裝填2L三頸燒瓶。將混合物脫氣並用氮回填三次，然後加熱至100℃並保持15h。在冷卻至20-25℃後，用水(200mL)將其稀釋並用EtOAc(300mL×3)萃取。用25%鹽水(100mL×2)洗滌合併之有機層，並乾燥(Na2SO4)。藉由SiO2層析用EtOAc/庚烷梯度(5%至25% EtOAc)洗脫純化粗製物質，隨後在正庚烷中漿液化。獲得白色固體狀產物2-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)乙酸乙酯(18g,37.5%)，且純度>98%。1H-NMR(CDCl3,400MHz)δ 8.81(s,1H),8.42(s,1H),8.10(d,J=1.6Hz,1H),7.85(d,J=8Hz,1H),7.43(d,J=8Hz,1H),4.20(q,J=7.2Hz,2H),3.84(s,2H),2.64(s,3H),1.28(t,J=7.2Hz,3H)。
參考實例31 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮
用4-胺基-2-甲基硫基-嘧啶-5-甲醛(11.0g,65.0mmol)、325網目K2CO3(27.0g,3.0當量)、2-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]乙酸乙酯(18.0g,61.9mmol,0.95當量)及DMF(110.0mL)裝填500mL 3頸圓底燒瓶並將混合物在120℃下加熱5h，然後冷卻至室溫。向混合物中添加水(220mL)並使固體沈澱。將漿液攪拌1h吡過濾並用水(55mL×3)沖洗濾餅並在50℃下在真空下乾燥，從而得到橙色固體21.4g(87%)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ 12.69(s,1H),9.17(s,1H),8.90(s,1H),8.58(s,1H),8.29(d,J=1.8Hz,1H),8.18(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),8.01(s,1H),7.58(d,J=8.0Hz,1H),2.60(s,3H),2.59(s,3H)。
以類似方式使用適當起始材料製備6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮之結構類似物(即6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮、6-(2-甲基-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮及6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮)。
參考實例32 2-(2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基)乙酸甲酯
步驟1：將2-(4-溴-2-氯苯基)乙酸甲酯(13g,49.3mmol)、(PinB)2(16.3g,64.1mmol)、KOAc(9.7g,98.7mmol)及Pd(dppf)Cl2(1.8g,2.47mmol)之混合物於二噁烷(250mL)中於N2下回流18h。在冷卻至室溫後，將混合物分配於EtOAc(600mL)與H2O之間。分離有機層並乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用PE/EtOAc梯度(15：1至5：1)作為洗脫溶劑洗脫純化殘餘物，從而得到2-(2-氯-4- (4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)乙酸甲酯(15g,97%產率)。LCMS(ESI)：m/z=311.0[M+H]+。
步驟2：向2-(2-氯-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)乙酸甲酯(149mg,0.48mmol)、2-溴-1,1-二乙氧基乙烷(60mg,0.33mmol)、K2CO3(90mg,0.65mmol)及Pd(dppf)Cl2(8mg,0.01mmol)於二噁烷(5mL)中之溶液中添加水(1mL)。將混合物在100℃下在N2下攪拌16h。在冷卻至室溫後，添加EtOAc(150mL)及H2O。分離有機層並乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用石油醚/EtOAc梯度(1：0至8：1)洗脫純化殘餘物，從而得到無色油狀2-(2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基)乙酸甲酯(100mg,74%)。LCMS(ESI)：m/z=282.1[M+H]+
參考實例33 2-(2-(溴甲基)-1,3-二噁烷-5-基)異吲哚啉-1,3-二酮
步驟1. 用2-胺基丙烷-1,3-二醇(5.0g,54.9mmol,1.0當量)、鄰苯二甲酸酐(8.1g,54.9mmol,1.0當量)及DMF(50mL)裝填100mL三頸燒瓶。將混合物加熱至90℃並保持4h，冷卻至20-25℃，然後濃縮至乾燥。將殘餘物吸收於EtOAc(50mL)中，且在過濾後，獲得橙色固體狀產物(11.2g,92%)。1H NMR(DMSO-d 6,400MHz)δ 7.85(s,1H),4.89(m,2H),4.24(m,1H),3.82-3.77(m,2H),3.68-3.65(m,2H)；LCMS(ESI)：m/z=222[M+H]+。
步驟2. 用2-(1,3-二羥基丙-2-基)異吲哚啉-1,3-二酮(4.0g,18.1mmol,1.0當量)、2-溴-1,1-二乙氧基乙烷(4.3g,21.7mmol,1.2當量)、對甲苯磺酸水合物(0.69g,3.6mmol,0.2當量)及甲苯(120mL)裝 填500mL三頸燒瓶。將混合物加熱至110℃並保持20h且然後冷卻至室溫。用飽和NaHCO3水溶液(50mL)及鹽水(50mL)洗滌混合物。乾燥有機層(Na2SO4)，過濾並用無水硫酸鈉蒸發至乾燥。在濃縮至乾燥後，在EtOAc中漿液化殘餘物，從而得到白色固體(3.1g,53%)。1H NMR(DMSO-d 6,400MHz)δ 7.88-7.85(m,4 H),4.84(t,J=4Hz,1H),4.31(m,3H),4.12(m,2H),3.51(m,2H)；LCMS(ESI)：m/z=327[M+H]+。
參考實例34 3-[(2-羥基乙烷)磺醯基]氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯
步驟1：用3-碘氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(29g,102.43mmol,1.00當量)於DMF(300mL)中之溶液、2-硫基乙酸乙酯(17.2g,143.13mmol,1.40當量)及K2CO3(28.3g,204.76mmol,2.00當量)裝填用惰性氮氣氛吹掃並維持之1L 3頸圓底燒瓶。將所得溶液在50℃下攪拌過夜，冷卻至室溫，用500mL冰/水稀釋並用EtOAc(3×200mL)萃取。用H2O(2×200mL)及鹽水(1×200mL)洗滌合併之有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/PE梯度(0至10% EtOAc)洗脫純化殘餘物，從而得到20g(71%)淺黃色油狀3-[(2-乙氧基-2-側氧基乙基)硫基]氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯。
步驟2：用3-[(2-乙氧基-2-側氧基乙基)硫基]氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(5.5g,19.97mmol,1.00當量)於DCM(100mL)中之溶液裝填用惰性氮氣氛吹掃並維持之250mL之3頸圓底燒瓶，隨後在0℃下以若干批次添加MCPBA(8.63g,50.01mmol,2.50當量)。將所得溶液在室溫下攪拌過夜。然後，用飽和Na2SO3水溶液(2×60mL)及飽和NaHCO3(1×60mL)洗滌所得混合物。合併有機層並用DCM(100mL) 萃取。用鹽水(100mL)洗滌合併之有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/PE梯度(5%至20% EtOAc)洗脫純化殘餘物，從而得到淺黃色固體狀3-[(2-乙氧基-2-側氧基乙烷)磺醯基]氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(5g,81%)。
步驟3：用3-[(2-乙氧基-2-側氧基乙烷)磺醯基]氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(20g,65.07mmol,1.00當量)於THF(400mL)中之溶液裝填用惰性氮氣氛吹掃並維持之1L 3頸圓底燒瓶，隨後在0℃下以若干批次添加LiBH4(7.2g,5.00當量)。將所得溶液在室溫下攪拌過夜，藉由添加200mL水/冰淬滅，用EtOAc(300mL)稀釋並用EtOAc(2×200mL)萃取。用鹽水(200mL)洗滌合併之有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。在SiO2管柱上用EtOAc/PE梯度(10%至20% EtOAc)洗脫純化殘餘物，從而得到白色固體狀3-[(2-羥基乙烷)磺醯基]氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(7g,41%)。1H-NMR(300MHz,CDCl3)：δ 4.35-4.21(m,2H),4.19-4.06(m,5H),3.22-3.18(m,2H),2.76-2.71(m,1H),1.46(s,9H)；LC-MS(ESI)：m/z=288[M+Na]+。
參考實例35 4-氰基-4-(甲苯磺醯基氧基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯
步驟1：將六氫吡啶-4-甲腈(1.1g10.0mmol)、二碳酸二第三丁基酯(2.62g,12mmol)及TEA(4.2mL,30mmol)於DCM(15mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。添加HCl(5% wt水溶液)，直至達到pH<5為止。用DCM萃取水相。用鹽水洗滌有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到黃色油狀4-氰基六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(2.0g,95.2%)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=155.1[M-55]。
步驟2. 在氮氣氛下向4-氰基六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(1.0g粗產物，4.76mmol)於THF(10mL)中且冷卻至-78℃之攪拌混合物中逐滴添加雙(三甲基矽烷基)醯胺鋰(1M於THF中，7.14mL,7.14mmol)。將混合物在-78℃下攪拌1h。然後，添加氯甲酸乙酯(771mg,7.14mmol)，並將混合物在-78℃下再攪拌1h。用飽和水溶液NH4Cl淬滅混合物並用EtOAc萃取水相。乾燥(Na2SO4)有機層，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用PE/EtOAc(4：1)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色油狀4-氰基六氫吡啶-1,4-二甲酸1-第三丁基酯4-乙基酯(1.3g粗產物，83.1%)。LCMS(ESI)：m/z=183.1[M-99]。
步驟3. 在0℃下在氮氣氛下向4-氰基六氫吡啶-1,4-二甲酸1-第三丁基酯4-乙基酯(1.3g粗產物，4.61mmol)於MeOH(15mL)中之攪拌混合物中添加NaBH4(350mg,9.22mmol)。將混合物在0℃下攪拌1.5h，然後用HCl(5% wt水溶液，5mL)淬滅。用EtOAc萃取水相。乾燥(Na2SO4)有機層，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用PE/EtOAc(4：1)洗脫純化殘餘物，從而得到無色油狀4-氰基-4-(羥基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(900mg,81.3%)。LCMS(ESI)：m/z=141.1[M-99]。
步驟4：將4-氰基-4-(羥基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(300mg 1.25mmol)、甲苯磺醯氯(285mg,1.5mmol)、DMAP(16mg,0.13mmol)及TEA(0.52mL,3.75mmol)於DCM(5mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。在真空中濃縮混合物。藉由SiO2層析用PE/EtOAc(6：1)洗脫純化殘餘物，從而得到白色固體狀4-氰基-4-(甲苯磺醯基氧基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(120mg,24.4%)。LCMS(ESI)：m/z=295.0[M-99]。
參考實例36 3-氰基-3-(2-羥基乙基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯
步驟1：在N2下在-78℃下向3-氰基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(600mg,3.06mmol)於THF(10mL)中之攪拌溶液中逐滴添加雙(三甲基矽烷基)醯胺鋰(1M於THF中，4.6mL,4.6mmol)。3-溴prop-1-ene(556mg,4.59mmol)添加，並將混合物在-78℃下攪拌2h。使混合物升溫至室溫並用飽和NH4Cl水溶液淬滅。用EtOAc萃取水相。乾燥(Na2SO4)有機層，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用PE/EtOAc(6：1)洗脫純化殘餘物，從而得到無色油狀3-烯丙基-3-氰基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(600mg,83.1%)。LCMS(ESI)：m/z=181.1[M-55]。
步驟2. 將NaIO4(2.6g,12.0mmol)添加至3-烯丙基-3-氰基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(700mg,3.0mmol)於MeCN、CCl4與水(2：2：3，分別40mL)之混合物中之攪拌溶液中。將混合物劇烈攪拌5min，且添加RuCl3(25mg,0.12mmol)。將混合物再攪拌3h並添加飽和水溶液NaHCO3直至pH為約8。用DCM(3×20ml)洗滌水溶液。然後，用5% HCl水溶液小心酸化所得水層並用DCM(3×20ml)萃取。乾燥(Na2SO4)合併之有機層，過濾並在真空中濃縮，從而得到白色固體狀2-(1-(第三丁氧基羰基)-3-氰基吡咯啶-3-基)乙酸(400mg，粗產物)。LCMS(ESI)：m/z=199.1[M-55]。
步驟3. 在0℃下向2-(1-(第三丁氧基羰基)-3-氰基吡咯啶-3-基)乙酸(250mg,1.00mmol)於THF(5mL)中之攪拌混合物中逐滴添加BH3(1M於THF中，2.0mL,2.0mmol)並將混合物在室溫下攪拌3h。添加MeOH(5mL)，且然後在減壓下濃縮混合物。藉由SiO2層析使用PE/EtOAc(1：1)作為洗脫溶劑純化殘餘物，從而得到黃色油狀3-氰基-3-(2-羥基乙基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(100mg,42.3%)。LCMS(ESI)：m/z=185.1[M-55]。
參考實例37 2-(2-羥基乙基磺醯基)乙基胺基甲酸第三丁基酯
步驟1. 在500mL圓底燒瓶中合併N-第三BOC-乙醇胺(14g,87mmol),TEA(27.3mL,195mmol)及DCM(180mL)並在冰浴中冷卻。添加溶解於DCM(180mL)中之對甲苯磺醯氯(23.1g,122mmol)並去除冰浴。將混合物於室溫下攪拌過夜。用水、鹽水洗滌混合物並乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到淺黃色油狀4-甲基苯磺酸2-(第三丁氧基羰基胺基)乙基酯(26g，粗產物)。LCMS(ESI)：m/z=338(M+Na)+。
步驟2. 在500mL圓底燒瓶中合併2-巰基乙醇(7.25mL,104mmol)、DBU(15.4mL,103mmol)、4-甲基苯磺酸2-(第三丁氧基-羰基胺基)乙基酯(26g，粗產物)及PhMe(200mL)並在室溫下攪拌過夜。用水及鹽水洗滌反應混合物，並乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用PE/EtOAc梯度(325至33% EtOAc)洗脫純化粗製產物，從而得到無色油狀2-(2-羥基乙基硫基)乙基胺基甲酸第三丁基酯(10.7g,56%，對於2個步驟而言)。TLC：Rf=0.35(PE/EtOAc=2：1)。
步驟3. 向存於500mL RB燒瓶中之2-(2-羥基乙基硫基)乙基胺基甲酸第三丁基酯(10.7g,48mmol)於EtOH(150mL)中之溶液中添加45g存於H2O(150mL)中之臭氧。去除冰浴並在室溫下繼續攪拌2h。用H2O(600mL)稀釋反應混合物並用EtOAc(3×)萃取。用鹽水洗滌合併之有機層並乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到淺黃色油狀2-(2-羥基乙基磺醯基)乙基胺基甲酸第三丁基酯(9.23g,75%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 5.34(s,1H),4.16-4.06(m,2H),3.65(m,2H),3.35(t,2H,J=4Hz),3.30-3.21(t,2H,J=4Hz),1.44(s,9H)。
參考實例38 2-(羥基甲基)硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯
在0℃下向4-(第三丁氧基羰基)硫嗎啉-2-甲酸(0.8g,3.24mmol)於無水THF(20mL)中之溶液中緩慢添加BH3溶液(1M於THF中，13.2mL)。將反應混合物在室溫下攪拌過夜，然後用飽和NaHCO3(50mL)淬滅。使用EtOAc(2×50mL)萃取水層。用鹽水洗滌合併之有機層並乾燥(MgSO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到無色油狀2-(羥基甲基)硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(0.75g，粗產物)，其未經進一步純化即使用。
參考實例39 2-(2-{[(4-甲基苯)磺醯基]氧基}乙基)-1,1-二側氧基-硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯
步驟1：將4-硫嗎啉-1,1-二酮鹽酸鹽(4.0g,23.3mmol)、Et3N(7.08g,69.9mmol)及(BOC)2O(6.62g,30.2mmol)於DCM(20mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。在濃縮後，藉由SiO2層析用EtOAc/PE(1：3)洗脫純化殘餘物，從而得到無色油狀1,1-二側氧基-4-硫嗎啉-甲酸第三丁基酯(4.5g,82%)。LCMS(ESI)：m/z=181[M-55]+。
步驟2：在-78℃下向1,1-二側氧基-硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(500mg,2.12mmol)於無水THF(10mL)中之溶液中緩慢逐滴添加LDA(1M於THF中，2.55mL,2.55mmol)。將混合物在-78℃下攪拌30min。在-78℃下向此混合物中逐滴添加2-溴乙酸乙酯(390mg, 2.33mmol)，然後將反應物在室溫下攪拌過夜。添加飽和NH4Cl水溶液及EtOAc(20mL)。分離有機層，用鹽水洗滌，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/PE(1：3)洗脫純化殘餘物，從而得到無色油狀2-(2-乙氧基-2-側氧基乙基)-1,1-二側氧基-硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(300mg,44%)。LCMS(ESI)：m/z=266[M-55]+。
步驟3. 在0℃下向2-(2-乙氧基-2-側氧基乙基)-1,1-二側氧基-硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(1g粗產物)於EtOH(10mL)中之溶液中添加NaBH4(710mg,18.7mmol)。將混合物在室溫下攪拌過夜且然後在減壓下濃縮。將殘餘物分配於EtOAc(50mL)與H2O(50mL)之間。乾燥(Na2SO4)有機層，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/PE(1：1)洗脫純化殘餘物，從而得到2-(2-羥基乙基)-1,1-二側氧基-硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(100mg,10%)。LCMS(ESI)：m/z=225[M-55]+。
步驟4. 將2-(2-羥基乙基)-1,1-二側氧基-硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(200mg,0.72mmol)、甲苯磺醯氯(1.1g,5.73mmol)、TEA(1.45g,14.34mmol)及DMAP(58mg,0.478mmol)於DCM(10mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。在減壓下濃縮溶液。藉由SiO2層析用EtOAc/PE(1：1)作為洗脫溶劑洗脫純化殘餘物，從而得到2-(2-{[(4-甲基苯)磺醯基]氧基}乙基)-1,1-二側氧基-硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(150mg,65%)。LCMS(ESI)：m/z=378[M-55]+。
參考實例40 7-(甲基磺醯基氧基甲基)-5,9-二氧雜-2-氮雜螺[3.5]壬烷-2-甲酸苄基酯
步驟1. 在室溫下將3-側氧基氮雜環丁烷-1-甲酸苄基酯(1.0g,4.7mmol)及2-(羥基甲基)丙烷-1,3-二醇(650mg,1.05當量)溶解於PhMe(32mL)中。添加對甲苯磺酸(183mg,0.2當量)且反應器皿安裝有 Dean-Stark分離器及冷凝器並在130℃下攪拌16h。使反應混合物冷卻至室溫並用飽和NaHCO3水溶液處理。用DCM稀釋溶液，並分離各層。用DCM(2×)萃取水相，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。將粗製產物吸附至矽藻土上並藉由SiO2層析用MeOH/DCM梯度(0至20% MeOH)洗脫進行純化。在乾燥後獲得淺黃色油狀7-(羥基甲基)-5,9-二氧雜-2-氮雜螺[3.5]壬烷-2-甲酸苄基酯(937.2mg,68%)。
步驟2：在0℃下向7-(羥基甲基)-5,9-二氧雜-2-氮雜螺[3.5]壬烷-2-甲酸苄基酯(172mg,0.58mmol)及DCM(1.6mL)之溶液中添加TEA(0.124mL,1.5當量)。添加甲烷磺醯氯(0.06mL,1.2當量)並將反應混合物在室溫下在N2下攪拌3h且然後傾倒至EtOAc中。用鹽水洗滌混合物，並乾燥(Na2SO4)有機層，過濾並在真空中濃縮。在高真空下進一步乾燥，得到濃稠黃色油狀7-(甲基磺醯基氧基甲基)-5,9-二氧雜-2-氮雜螺[3.5]壬烷-2-甲酸苄基酯(290mg，定量產率，含有一些殘餘溶劑)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ 747-7.23(m,5H),5.05(s,2H),4.62(t,J=5.2Hz,1H),4.10-3.82(m,6H),3.62(dd,J=7.2,11.6Hz,2H),3.37(t,J=5.2Hz,2H),1.87-1.74(m,1H)。LCMS(ESI)：m/z=294.1[M+H]+。
參考實例41 6-(2-氯-4-(4-側氧基-5-氮雜螺[2.4]庚-5-基)苯基)-8-((5,5-二氟六氫吡啶-3-基)甲基)-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮
步驟1：5-側氧基六氫吡啶-1,3-二甲酸1-第三丁基酯3-甲基酯-向5-羥基六氫吡啶-1,3-二甲酸1-第三丁基酯3-甲基酯(2.0g,7.7mmol)於DCM(20mL)中之溶液中緩慢添加戴斯-馬丁過碘烷(Dess-Martin periodinane)(DMP,6.5mg,15.4mmol)。將混合物在室溫下攪拌過夜且然後過濾。用H2O及飽和Na2CO3水溶液洗滌濾液。乾燥有機層(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮並藉由SiO2層析用EtOAc/PE(5：1)洗脫純化殘餘物，從而得到無色油狀5-側氧基六氫吡啶-1,3-二甲酸1-第三丁基酯3-甲基酯(1.2g,61%)。LCMS(ESI)：m/z=202.0[[M+1]-56]+
步驟2：5,5-二氟六氫吡啶-1,3-二甲酸1-第三丁基酯3-甲基酯-向冷卻至-78℃之5-側氧基六氫吡啶-1,3-二甲酸1-第三丁基酯3-甲基酯(1.1g,4.06mmol)於DCM(20mL)中之溶液中逐滴添加DAST(2.0g,12.18mmol)。將混合物在室溫下攪拌過夜且然後添加H2O及DCM(30mL)。乾燥(Na2SO4)有機層，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/PE(8：1)洗脫純化殘餘物，從而得到無色油狀5,5-二氟六氫吡啶-1,3-二甲酸1-第三丁基酯3-甲基酯(800mg,67%)。LCMS(ESI)：m/z=224.1[[M+1]-56]+。
步驟3：3,3-二氟-5-(羥基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯-在0℃下向5,5-二氟六氫吡啶-1,3-二甲酸1-第三丁基酯3-甲基酯(800mg,650mmol)於DCM(10mL)中之溶液中緩慢添加NaBH4(650mg,17.2mmol)。將混合物在室溫下攪拌過夜，且然後在真空中濃縮。用EtOAc(50mL)及H2O(50mL)稀釋殘餘物，乾燥有機層(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到無色油狀3,3-二氟-5-(羥基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(1.2g，粗產物)。LCMS(ESI)：m/z=196.1[[M+1]-56]+。
步驟4：3,3-二氟-5-(甲苯磺醯基氧基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯-向3,3-二氟-5-(羥基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(1.2g,4.78mmol)於DCM(10mL)中之溶液中添加甲苯磺醯氯(1.1g,5.73mmol)、TEA(1.45g,14.3mmol)及DMAP(58mg,0.478mmol)。將混合物在室溫下攪拌過夜且然後在真空中濃縮溶液。藉由SiO2層析用 EtOAc/PE(3：1)洗脫純化殘餘物，從而得到白色固體狀3,3-二氟-5-(甲苯磺醯基氧基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(1.2g,62%)。LCMS(ESI)：m/z=350.1[[M+1]-56]+。
參考實例42 ((2R,5R)-2-(2-胺基乙基)-1,3-二噁烷-5-基)胺基甲酸第三丁基酯(反式異構物)及((2S,5S)-2-(2-胺基乙基)-1,3-二噁烷-5-基)胺基甲酸第三丁基酯(順式異構物)
步驟1：在0℃下向10% NaHCO3溶液(aq,3L)中添加向3-胺基丙-1-醇(75g,998mmol)於1,4-二噁烷中之溶液。將Fmoc-Cl(309.6g,1.189mol)逐滴添加至反應混合物中。使溶液升溫至室溫並攪拌過夜。用EtOAc(1L)及H2O(600mL)稀釋反應混合物。分離有機相並用H2O(500mL)及鹽水(500mL)洗滌，隨後經Na2SO4乾燥。在真空中濃縮溶液，從而得到白色固體狀粗製產物。用己烷(5×1L)洗滌粗製產物並在真空中乾燥，從而得到白色固體狀(3-羥基丙基)胺基甲酸(9H-茀-9-基)甲基酯(313g,105.5%)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。1H-NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm)：7.76(d,J=7.5Hz,2H),7.59(d,J=7.4Hz,2H),7.40(t,J=7.2Hz,2H),7.32(td,J=8.6,1.1Hz,2H),5.03(brs,1H),4.44(d,J=6.7Hz,2H),4.21(t,J=6.6Hz,1H),3.64(t,J=5.7Hz,2H),3.30-3.37(m,2H),2.00-2.20(m,2H),1.64-1.73(m,2H)。
步驟B：在-45℃下向DMSO(177.2g,2.268mol)於無水DCM(800ml)中之溶液中緩慢添加存於無水DCM(800mL)中之草醯氯(196.9g,1.549mol)。將反應混合物在-45℃下攪拌20min，且然後逐滴添加(3- 羥基丙基)胺基甲酸(9H-茀-9-基)甲基酯(307g,1.032mol)於無水DCM(3.4L)中之溶液。在-45℃下攪拌30min後，逐滴添加DIPEA(399.8g,3.093mol)。使混合物升溫至-30℃並再攪拌30min。去除溶劑並將殘餘物吸收於EtOAc(3L)中，用H2O(1L)、5% NaHCO3(2×800mL)、H2O(1L)及鹽水(800ml)洗滌。乾燥(Na2SO4)有機相，過濾並蒸發，從而得到粗製黃色固體狀(3-側氧基丙基)胺基甲酸(9H-茀-9-基)甲基酯(310g,104.5%)。LCMS(ESI)：m/z=318[M+23]+。
實例1 8-(2-(氮雜環丁-3-基氧基)乙基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-11)
步驟1：向6-溴-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(432mg,1.6mmol)於DMF(7mL)中之溶液中添加3-(2-羥基乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(0.750g,3.47mmol)及PPh3(0.91g,3.47mmol)。在0℃下向上述混合物中添加DIAD(0.71g,3.47mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌過夜，然後傾倒至水中，用EtOAc萃取。用水洗滌萃取物，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/己烷(2：3)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色油狀3-(2-(6-溴-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(392mg,52%)。LCMS(ESI)：m/z=472.2(M+1)。
步驟2. 向3-(2-(6-溴-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(392mg,0.83mmol) 於DME(7mL)、EtOH(5mL)、PhMe(0.7mL)、水(1.4mL)之混合物中之溶液中添加2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基酸(0.57g,0.82mmol)、Cs2CO3(410mg,1.25mol)及Pd(PPh3)4(50mg,0.04mmol)。將混合物在回流下加熱過夜，冷卻並濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/己烷(2：3)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色油狀3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(313mg,63%)。LCMS(ESI)：m/z=596.1(M+1)。
步驟3. 在-10-0℃下在N2下向3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(313mg,0.53mmol)於DCM(5.0ml)中之混合物中逐滴添加MCPBA(80%,130mg,0.58mmol)於DCM(1.0ml)中之溶液。將混合物於室溫下攪拌過夜。在完成反應後，用飽和NaHCO3溶液淬滅混合物。使用DCM(20mL×3)萃取混合物。乾燥合併之有機層(Na2SO4)，過濾，並蒸發，從而得到350mg粗製3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯。粗製產物未經進一步純化即用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=612.2(M+1)。
步驟4：將粗製3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(350mg,0.53mmol)、DIPEA(0.2mL)及乙胺鹽酸鹽(215mg,2.6mmol)於THF(10.0mL)中之混合物在室溫下在N2下攪拌過夜。用H2O淬滅反應物，隨後用DCM(20mL×3)萃取。乾燥(Na2SO4)合併之有機層，過濾，並蒸發，從而得到黃色油狀3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d] 嘧啶-8(7H)-基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(400mg,100%)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=592.1(M+1)。
步驟5. 在0℃下向粗製3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(400mg,0.53mmol)於無水DCM(5.0ml)中之溶液中添加TFA(5.0ml)。將混合物在室溫下攪拌1h。在減壓下去除溶劑後，將飽和NaHCO3及DCM添加至殘餘物中。用鹽水洗滌經分離有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由製備型HPLC純化殘餘物，從而得到白色固體狀8-(2-(氮雜環丁-3-基氧基)乙基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(110mg,42%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)：δ 9.16(s,1H),8.65(s,1H),8.57(s,1H),8.28-8.27(m,1H),8.16-8.14(m,1H),8.03(br s,1H),7.85(s,1H),7.56-7.54(m,1H),4.50-4.47(m,2H),4.33-4.30(m,1H),3.64-3.58(m,2H),3.43-3.33(m,9H),2.60(s,3H),1.22(t,3H)；LCMS(ESI)：m/z=492.1[M+1]+。
實例2 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(六氫吡啶-3-基氧基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-14)
6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(六氫吡啶-3-基氧基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮係以類似方式製得，只是在步驟1中3-(2-羥基乙氧基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯代替3-(2-羥 基乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯。
1H NMR(500MHz,CDCl3-d3)δ8.83(s,1H),8.47(brs,1H),8.43(s,1H),8.17(d,1H),7.94(dd,1H),7.58(s,1H),7.50(d,1H),5.57(brs,1H),4.67(s,2H),3.88-3.81(m,2H),3.59-3.54(m,2H),3.43(s,1H),3.02(d,1H),2.80-2.78(m,1H),2.66-2.65(m,2H),2.65(s,3H),1.86-1.83(m,1H),1.72-1.68(m,1H),1.54-1.50(m,1H),1.40(brs,1H),1.31(t,3H)。MS(ESI)：m/z=520.3[M+1]。
實例3 8-(((1r,4r)-4-胺基環己基)甲基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-5)
步驟1：在室溫下在N2下向4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(3.00g,13.0mmol)於無水THF(60ml)中之溶液中添加TEA(1.32g,13.04mmol)及(1r,4r)-4-(胺基甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(3.56g,15.65mmol)。將溶液於室溫下攪拌過夜。添加水(40mL)並用DCM(3×50mL)萃取溶液。將合併之有機層經無水Na2SO4乾燥，過濾，並蒸發，從而得到白色固體狀4-(((1r,4r)-4-(第三丁氧基羰基胺基)環己基)甲基胺基)-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(2.1g,38%)。LCMS(ESI)：m/z=424.1[M+1]+。
步驟2：在-20℃下在N2下向4-(((1r,4r)-4-(第三丁氧基羰基胺基)環己基)甲基胺基)-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲酸酯(2.1g,4.9mmol)於THF(35ml)中之溶液中逐份添加LiAlH4(240mg,6.21mmol)。然後，將混 合物在-20℃下攪拌2h。使混合物冷卻至0℃並添加H2O(0.5ml)及10% NaOH水溶液(0.5ml)。用DCM(3×50ml)萃取混合物，並將合併之有機層經無水Na2SO4乾燥，過濾並蒸發。藉由SiO2管柱層析用EtOAc/PE梯度(1：1至2：1)洗脫純化粗製產物，從而得到白色固體狀(1r,4r)-4-((5-(羥基甲基)-2-(甲基硫基)嘧啶-4-基胺基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(1.2g,63%)。LCMS(ESI)：m/z=382.2[M+1]+。
步驟3：將(1r,4r)-4-((5-(羥基甲基)-2-(甲基硫基)嘧啶-4-基胺基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(1.2g,3.13mmol)、MnO2(3.72g,42.5mmol)於DCM(50ml)中之混合物在N2下加熱至回流過夜。使混合物冷卻至室溫，過濾並蒸發，從而得到白色固體狀(1r,4r)-4-((5-甲醯基-2-(甲基硫基)嘧啶-4-基胺基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(1.18g,99%)。該化合物未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=379.2(M+1)。
步驟4：將(1r,4r)-4-((5-甲醯基-2-(甲基硫基)嘧啶-4-基胺基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(60mg,0.16mmol)、2-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)乙酸甲酯(43.6mg,0.16mmol)、K2CO3(65mg,0.47mmol)於DMF(1.0ml)中之混合物在70℃下在N2氣氛下加熱過夜。在冷卻至室溫後，添加冰。過濾混合物並用DCM研磨濾餅並將有機物經無水Na2SO4乾燥，過濾並濃縮，從而得到黃色固體狀(1r,4r)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(57mg,60%)。該化合物未經進一步純化即用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=607.2(M+1)。
步驟5：在-10℃下在N2下向(1r,4r)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(57mg,0.09mmol)於DCM(5.0ml)中之混合 物中逐滴添加MCPBA(80%,22mg,0.10mmol)於DCM(1.0ml)中之溶液。將混合物在室溫下攪拌過夜並用飽和NaHCO3水溶液淬滅混合物。用DCM(3×10mL)萃取混合物並將合併之有機層經無水Na2SO4乾燥，過濾並蒸發，從而得到70mg粗製(1r,4r)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯。該粗製產物未經進一步純化即用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=623.2(M+1)。
步驟6：將粗製(1r,4r)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(70mg,0.09mmol)、DIPEA(163mg,1.26mmol)及乙胺鹽酸鹽(40mg,0.5mmol)於THF(5.0mL)中之混合物在室溫下在N2下攪拌過夜。用H2O淬滅混合物並用DCM(3×50mL)萃取。將合併之有機層經無水Na2SO4乾燥，過濾並蒸發，從而得到黃色固體狀(1r,4r)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(90mg,100%)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=604.4(M+1)。
步驟7：以將溫度維持低於0℃之速率向(1r,4r)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(90mg,0.09mmol)於MeOH(1.0mL)中之溶液中逐滴添加甲醇HCl(2.0mL,4N)。然後，將反應混合物在室溫下攪拌2h。濃縮混合物並藉由製備型HPLC純化，從而得到8-(((1r,4r)-4-胺基環己基)甲基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(23.1mg,51%)。1H NMR(500MHz,MeOD-d 4 )δ9.16(s,1H),8.64(s,1H),8.57(s,1H),8.27(s,1H),8.16-8.15(m,1H),8.02-8.00(m,1H),7.83(s,1H),7.57-7.55(m,1H), 4.19-4.17(m,2H),3.40-3.34(m,2H),2.60(s,3H),1.85-1.84(m,1H),1.76-1.74(m,2H),1.63-1.60(m,2H),2.21-1.01(m,5H),0.96-0.91(m,2H)。LCMS(ESI)：m/z=504.4(M+1)。
實例4 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(((1r,4r)-4-(甲基胺基)環己基)甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-17)
標題化合物係根據實例3使用適當起始材料來製備。
1H NMR(500MHz,CDCl3-d3)δ8.83(s,1H),8.47(brs,1H),8.43(s,1H),8.16(s,1H),7.94(dd,1H),7.58(s,1H),7.51(d,1H),5.52(brs,1H),4.32(s,2H),3.55(t,2H),2.65(s,3H),2.43(s,3H),2.37-2.33(m,1H),1.98(d,3H),1.78(d,2H),1.31(t,3H),1.25-1.19(m,2H),1.07-1.01(m,2H)。MS(ESI)：m/z=518.1[M+1]。
實例5 8-(((1r,4r)-4-胺基環己基)甲基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-15)
標題化合物可根據實例3藉由在步驟4中用2-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)乙酸甲酯代替2-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)乙酸甲酯來製備。[M+1].1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 8.64(s,1H),8.21(s, 1H),8.10-8.06(d,1H),8.00-7.96(brs,1H),7.89-7.85(d,1H),7.84-7.79(m,2H),7.52-7.48(d,1H),7.30-7.26(d,1H),4.20-4.13(d,2H),3.45-3.37(t,3H),2.57(s,3H),1.90-1.82(brs,1H),1.82-1.75(d,2H),1.68-1.59(d,2H),1.22-1.09(m,5H),1.03-0.95(m,2H)；MS(ESI)：m/z=503.1。
實例6 8-(((1r,4r)-4-胺基環己基)甲基)-6-(2-氯-4-(3-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-16)
標題化合物可根據實例3藉由在步驟4中用2-(2-氯-4-(3-甲基吡啶-2-基)苯基)乙酸甲酯代替2-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)乙酸甲酯來製備。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 8.62(s,1H),8.54-8.51(d,1H),8.01-7.95(t,1H),7.84(s,1H),7.79-7.75(d,1H),7.69(s,1H),7.60-7.56(d,1H),7.50-7.46(d,1H),7.37-7.32(m,7H),4.20-4.13(d,2H),3.45-3.37(t,3H),2.40(s,3H),1.92-1.79(d,3H),1.70-1.60(d,2H),1.23-1.01(m,7H)；MS(ESI)：[M+1]m/z=503.1。
實例7 8-(((1r,4r)-4-胺基環己基)甲基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-7)
標題化合物可根據實例3藉由在步驟6中用甲胺鹽酸鹽代替乙胺鹽酸鹽來製備。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ8.827(s,1H),8.471(s,1H),8.426(s,1H),8.166(s,1H),7.949-7.930(d,1H),7.588(s,1H),7.525-7.509(d,1H),5.459(m,1H),4.341(m,2H),3.108-3.099(m,2H),2.649-2.609(m,4H),1.986(m,1H),1.873-1.852(m,1H),1.742-1.738(m,2H),1.252-1.201(t,3H),1.072-1.025(m,2H)；LCMS(ESI)：m/z=490.3[M+1]+。
實例8 2-胺基-8-(((1r,4r)-4-胺基環己基)甲基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-9)
標題化合物可根據實例3藉由在步驟6中用銨鹽酸鹽代替乙胺鹽酸鹽來製備。
1H NMR(500MHz,CDCl3 CDCl3-d 3 )δ 8.828(s,1H),8.516(s,1H),8.432(s,1H),8.168(s,1H),7.945(d,J=7.5Hz,1H),7.602(s,1H),7.508(d,J=9Hz,1H),5.331(s,1H),4.292(d,J=8Hz,2H),2.650(s,4H),1.892(s,1H),1.860(d,J=8.5Hz,2H),1.734(d,J=15.5Hz,3H),1.308-1.199(m,4H),1.045-1024(m,2H)；LCMS[M+1]+(ESI)：m/z=476。
實例9 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(((1r,4r)-4-(二甲基胺基)環己基)甲基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-10)
在室溫下向存於MeOH(20mL)中之實例3步驟4之產物(1r,4r)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(250mg,0.493mmol)中添加HCHO/H2O(1mL)、NaBH(OAc)3(404mg,2.47mmol)及HOAc(0.5mL)。在室溫下攪拌過夜後，用水(3.0mL)淬滅混合物並用DCM(3×50mL)萃取。用鹽水洗滌有機層並經MgSO4乾燥。在減壓下去除溶劑後，獲得黃色固體狀6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(((1r,4r)-4-(二甲基胺基)環己基)甲基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(200mg,84%)。LCMS(ESI)：m/z=535.2[M+1]+
使用實例3步驟5及6中所闡述之類似程序將來自上述反應之產物轉化為最終產物。1H NMR(500MHz,CDCl3CDCl3-d 3 )δ8.826(s,1H),8.467(s,1H),8.426(s,1H),8.165(s,1H),7.948-7.928(d,1H),7.579(s,1H),7.521-7.505(d,1H),5.518(m,1H),4.315(m,2H),3.563-3.537(m,2H),2.648(s,3H),2.257(s,6H),2.184(m,1H),2.920-2.897(m,2H),1.914-1.803(m,5H),1.333-1.305(t,3H),1.254-1.150(m,4H)。LCMS(ESI)：[M+1]+ m/z=532.2。
實例10 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(六氫吡啶-4-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-6)
步驟1：在氮氣氛下向6-溴-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(435mg,1.6mmol)於DMF(3mL)中之溶液中添加4-(羥基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(750mg,3.5mmol)及Ph3P(970mg,3.5mmol)。使混合物冷卻至0℃並逐滴添加DIAD(710mg,3.5mmol)，同時將溫度維持在0-5℃之間。將混合物於室溫下攪拌過夜。將反應混合物傾倒至冰水中並使用EtOAc(3×100mL)萃取。用飽和NaCl溶液(4×100mL)洗滌有機層，乾燥(MgSO4)，過濾並濃縮。藉由SiO2層析用PE/EtOAc梯度(10/1至6/1至4/1)洗脫純化殘餘物，從而得到白色固體狀4-((6-溴-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(485mg,65%)。LCMS(ESI)：m/z=414.0[M-56]+。
步驟2：將4-((6-溴-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(239mg,0.5mmol)、MCPBA(80%,275mg,1.2mmol)於DCM(18mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。用飽和NaHCO3溶液(2×50mL)及飽和NaCl溶液(2×50mL)洗滌反應混合物。乾燥(MgSO4)有機層，過濾並在真空中濃縮，從而得到黃色固體狀粗製4-((6-溴-2-(甲基磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(279mg,100%)。LCMS(ESI)：m/z=445.0[M-56]+。
步驟3：將4-((6-溴-2-(甲基磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(160mg,0.32mmol)、乙胺鹽酸鹽(259mg,3.2mmol)、DIPEA(1.5mL)於IPA(4mL)中之混合 物在90℃下在密封管中在攪拌下加熱過夜。濃縮反應混合物並藉由SiO2層析用DCM/MeOH梯度(80/1至40/1)洗脫純化殘餘物，從而得到白色固體狀4-((6-溴-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(108mg,72%)。LCMS(ESI)：m/z=410.0[M-56]+。
步驟4：將4-((6-溴-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(100mg,0.021mmol)溶解於乙二醇二甲基醚(3mL)、乙醇(2mL)、甲苯(0.3mL)及水(0.6mL)之混合物中。然後，添加2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基酸(61mg,0.21mmol)、Cs2CO3(107mg,0.33mmol)及(PPh3)4Pd(II)(13mg,0.011mmol)。將混合物於85℃下於攪拌下加熱過夜。濃縮反應混合物並將其溶解於DCM(50mL)中。用飽和NaCl溶液(2×30mL)洗滌溶液，經MgSO4乾燥，過濾並濃縮，從而得到淺黃色固體狀粗製4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(203mg,100%)。LCMS(ESI)：m/z=490.1[M-100]+。
步驟5：在冰水浴中在攪拌下將TFA(10mL)緩慢添加至4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(203mg,0.34mmol)於DCM(10mL)中之溶液中。然後，將混合物在室溫下攪拌1h。在蒸發後，將氨(7N於MeOH中，10mL)添加至殘餘物中。濃縮混合物並藉由製備型HPLC純化殘餘物，從而得到白色固體狀6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(六氫吡啶-4-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(46mg,28%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )：δ 9.16(s,1H),8.64(s,1H),8.57(s,1H),8.27(s,1H),8.16-8.14(d,1H),7.99(s,1H),7.83(s,1H),7.56-7.54(d,1H),4.21-4.20(d,2H),3.41-3.37(m,2H),2.93- 2.91(d,2H),2.60(s,3H),2.39-2.34(t,2H),2.00(br s,1H),1.51-1.49(d,2H),1.23-1.19(m,6H)。MS(ESI)：m/z=490.2[M]+。
實例11 8-(3-胺基丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-1)
步驟1：將6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(450mg,1.14mmol)、Cs2CO3(1.11g,3.41mmol)及N-(3-溴丙基)胺基甲酸第三丁基酯(541.3mg,2.28mmol)於無水DMF(5370mg,73.5mmol,5.69mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。然後，去除溶劑且粗製產物未經進一步純化即用於下一步驟中。MS(ESI)m/z 553.4[M+1]+
步驟2：在0℃下向於無水DCM(18.21mL)中之N-[3-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]丙基]胺基甲酸第三丁基酯(628.6mg,1.14mmol)中逐份添加MCPBA(1.10當量，1.25mmol,280.2mg)。將反應混合物在0℃下攪拌15min且然後用飽和NaHCO3水溶液(25mL)淬滅並用DCM(3×30mL)萃取。合併有機層並在真空中減少。粗製產物未經進一步純化即用於下一步驟中。MS(ESI)m/z：569.3[M+1]+
步驟3：將N-[3-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基亞磺醯基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]丙基]胺基甲酸第三丁基酯(323.4mg,0.569mmol)、於THF中之乙胺(2.84mmol,1.421mL)及DIPEA(4.00當量，2.27mmol,293.8mg,0.40mL)於無水THF(64.9當量，36.9 mmol,3mL)中之混合物在室溫下攪拌2h。去除溶劑，從而得到N-[3-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]丙基]胺基甲酸第三丁基酯之粗製橙色物質，其未經進一步純化即用於下一步驟。MS(ESI)m/z：550.3[M+1]+
步驟4：將N-[3-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]丙基]胺基甲酸第三丁基酯(312mg,0.567mmol)吸收於MeOH(2mL)及DCM(2mL)之溶液中。添加HCl溶液(4.0M於二噁烷中，1.42mL)。將反應混合物於室溫下攪拌過夜。去除溶劑在真空中，並藉由反相HPLC純化產物，從而得到灰白色固體狀8-(3-胺基丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(61mg,0.122mmol,21.4%產率)。
MS(ESI)m/z：450.2[M+1]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.15(s,1H),8.74-8.63(m,1H),8.59-8.45(m,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),8.02-7.95(m,1H),7.84(s,1H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),4.42-4.33(m,2H),3.48-3.36(m,2H),2.66-2.58(m,5H),1.86-1.77(m,3H),1.26-1.11(m,4H)。
實例12 8-(4-胺基丁基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-2)
標題化合物係根據實例11來製備，只是在步驟1中用N-(4-溴丁基)胺基甲酸第三丁基酯代替N-(3-溴丙基)胺基甲酸第三丁基酯。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.65(s,1H),8.57(s,1H), 8.27(d,J=1.7Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.97(d,J=6.3Hz,1H),7.86-7.78(m,1H),7.55(d,J=7.9Hz,1H),4.36-4.27(m,2H),3.47-3.35(m,2H),2.70-2.62(m,2H),2.60(s,3H),1.77-1.67(m,3H),1.54-1.42(m,3H),1.25-1.17(m,3H)；MS(ESI)m/z：464.2[M+1]+。
實例13 8-(3-胺基丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-18)
標題化合物係根據實例11來製備，只是在步驟3中用甲胺代替乙胺1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.16(s,1H),8.65(s,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.92-7.72(m,2H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),4.46-4.25(m,2H),2.95-2.87(m,3H),2.63-2.53(m,5H),1.80(q,J=7.1Hz,2H)；MS(ESI)m/z：436.1[M+1]+。
實例14 8-(2-(2-胺基乙氧基)乙基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-12)
標題化合物係根據實例11來製備，只是在步驟1中，用[2-(2-溴乙氧基)乙基]胺基甲酸第三丁基酯(CASRN 164332-88-1)代替N-(3-溴丙 基)胺基甲酸第三丁基酯。1H NMR(500MHz,CDCl3)：δ 8.83(s,1H),8.42(d,2H),8.10(d,1H),7.94(d,1H),7.58(s,1H),7.50(d,1H),5.56(s,1H),4.69(brs,2H),3.85(brs,2H),3.58-3.56(m,4H),2.84-2.81(m,2H),2.64(s,3H),1.32-1.29(m,5H)；LCMS(ESI)：m/z=507.2[M+1]+
實例15 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(吡咯啶-3-基氧基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-13)
標題化合物係根據實例11來製備，只是在步驟1中，用3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯代替N-(3-溴丙基)胺基甲酸第三丁基酯。1H NMR(500MHz,CDCl3-d 3 )：δ 8.83(s,1H),8.48(br s,1H),8.43(s,1H),8.17-8.16(m,1H),7.96-7.93(m,1H),7.58(s,1H),7.50-7.47(m,1H),4.65(br s,2H),4.16(br s,1H),3.79-3.76(m,2H),3.58-3.53(m,2H),3.08(br s,2H),2.95-2.89(m,2H),2.65(s,3H),1.91-1.85(m,2H),1.31(t,3H)。LCMS(ESI)：m/z=506.0[M+1]+。
實例16 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(六氫吡嗪-1-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-4)
標題化合物係根據實例11來製備，只是在步驟1中，用4-(2-甲基磺醯基氧基乙基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯代替N-(3-溴丙基)胺基甲酸第三丁基酯。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.64(s,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),8.00-7.94(m,1H),7.83(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.47-4.36(m,2H),3.46-3.37(m,2H),2.68-2.62(m,4H),2.62-2.54(m,1H),2.60(s,3H),2.45-2.36(s,4H),1.31-1.07(m,5H)；MS(ESI+)m/z：505.3[M+1]+。
實例17 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-側氧基-2-(六氫吡嗪-1-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-8)
標題化合物係根據實例11來製備，只是在步驟1中，用4-(2-氯乙醯基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯代替N-(3-溴丙基)胺基甲酸第三丁基酯。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ9.15(s,1H),8.66(s,1H),8.56(s,1H),8.27(d,J=2.0,1H),8.15(dd,J=2.0,8.0,1H),8.02-8.00(m,1H),7.89(s,1H),7.55(d,J=8.0,1H),5.12(s,2H),3.56-3.54(m,2H),3.36-3.34(m,4H),2.77-2.75(m,2H),2.74-2.72(m,2H),2.47(s,3H),1.14(t,J=6.0,3H)；LCMS(ESI)：m/z=519.2[M+1]+。
實例18 (R)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(吡咯啶-2-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-19)及(S)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡 嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(吡咯啶-2-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-20)
使用如實例11之步驟1至3中所闡述之類似順序在步驟1中使用6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮及2-(2-甲基磺醯基氧基乙基)吡咯啶-1-甲酸苄基酯作為起始材料，製備2-[2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙基]吡咯啶-1-甲酸苄基酯。對掌性SFC分離得到以下鏡像異構物：
峰1：MS(ESI)m/z：643.2[M+1]+；SFC保留時間=1.014min。
峰2：MS(ESI)m/z：643.2[M+1]+；SFC保留時間=1.371min。
向溶解於1,4-二噁烷(10mL)中之2-[2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙基]吡咯啶-1-甲酸苄基酯(來自步驟5之峰1)(125mg,0.20mmol)中添加2N HCl水溶液(8mL,16.0mmol)，並將反應混合物在90℃下攪拌16h。濃縮揮發性溶劑，並將粗製產物再溶解於水(10.0mL)中並用飽和NaHCO3水溶液中和至pH約7。用EtOAc(3×50mL)萃取反應混合物。用水及鹽水洗滌合併之有機層，經Na2SO4乾燥，過濾並濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc(含有1% TEA)：MeOH(含有1% TEA)洗脫隨後製備型HPLC純化粗製殘餘物，從而得到固體狀純鏡像異構物6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(吡咯啶-2-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧 啶-7(8H)-酮(11.1mg,11.3%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ 9.16(s,1H),8.64(s,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.7Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),8.02-7.95(m,1H),7.83(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.42-4.27(m,2H),3.42(p,J=7.0Hz,2H),2.99-2.79(m,2H),2.67(q,J=7.8Hz,1H),2.60(s,3H),1.87-1.77(m,1 H),1.78-1.68(m,2H),1.68-1.52(m,2H),1.32-1.11(m,5H)。MS(ESI)m/z：490.2[M+1]+。
如針對上述其相對鏡像異構物所闡述將由上文所闡述峰2表示之鏡像異構物去保護。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ 9.16(s,1H),8.65(s,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.7Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),8.02-7.95(m,1H),7.83(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.41-4.28(m,2H),3.42(p,J=7.0Hz,2H),2.97-2.88(m,1H),2.88-2.78(m,1H),2.72-2.63(m,1H),2.60(s,3H),1.87-1.77(m,1H),1.79-1.67(m,2H),1.70-1.53(m,2H),1.32-1.12(m,5H)。MS(ESI)m/z：490.2[M+1]+。
實例19 (S)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(嗎啉-2-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-21)及(R)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(嗎啉-2-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-22)
標題化合物係根據實例18使用2-(2-((甲基磺醯基)氧基)乙基)嗎啉-4-甲酸苄基酯替代2-(2-甲基磺醯基氧基乙基)吡咯啶-1-甲酸苄基酯作為起始材料來製備。
峰1鏡像異構物：1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ 9.15(s,1H),8.65(s,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.7Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.97(br s,1H),7.84(s,1H),7.55(d,J=7.9Hz,1H),4.50-4.25(m,2H),3.88-3.80(m,1H),3.63(br s,1H),3.59-3.49(m,1H),3.43(p,J=7.0Hz,2H),3.07(d,J=12.6Hz,1H),2.96(d,J=12.5Hz,1H),2.88-2.78(m,1H),2.69-2.62(m,1H),2.60(s,3H),1.87-1.75(m,2H),1.26-1.14(m,4H)。MS(ESI)m/z：506.2[M+1]+。
峰2鏡像異構物：1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ 9.16(s,1H),8.66(s,1H),8.57(s,1H),8.28(d,J=1.7Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),8.01(t,J=5.8Hz,1H),7.85(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.49-4.30(m,2H),3.89(d,J=11.5Hz,1H),3.69(br s,1H),3.59(t,J=11.8Hz,1H),3.47-3.37(m,2H),3.15(d,J=12.3Hz,1H),3.06(d,J=12.9Hz,1H),2.95-2.84(m,1H),2.71(t,J=11.7Hz,1H),2.60(s,3H),1.89-1.75(m,2H),1.27-1.12(m,4H)。MS(ESI)m/z：506.2[M+1]+。
實例20 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(4-甲基六氫吡嗪-1-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-27)
步驟1：將6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(300mg)、1-(2-氯乙基)-4-甲基-六氫吡嗪鹽酸鹽(271.6mg,1.36mmol)、碳酸銫(2.1g,6.44mmol)於無水DMF(9.5mL)中之混合物在密封管中在120℃下攪拌20h。將水(100mL)添加至經冷卻反應混合物中並用EtOAc(150mL×3)萃取反應混合物。用鹽水洗滌有機層，經Na2SO4乾燥，過濾並在減壓下濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc：MeOH洗脫純化粗製殘餘物，從而得到固體狀6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[2-(4-甲基六氫吡嗪-1-基)乙基]-2-甲基硫基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(89.9mg,22.7%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.82(s,1H),8.65(s,1H),8.42(s,1H),8.17(d,J=1.7Hz,1H),7.95(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.68(s,1H),7.49(d,J=8.0Hz,1H),4.70-4.58(m,2H),2.79-2.74(m,2H),2.64(d,J=1.6Hz,10H),2.48-2.39(m,4H),2.28(s,3H)。MS(ESI)m/z：522.2[M+1]+。
步驟2：在0℃下向存於無水DCM(5.5mL)中之6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[2-(4-甲基六氫吡嗪-1-基)乙基]-2-甲基硫基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(89mg)中添加MCPBA(42mg,0.19mmol)。將反應混合物在0℃下攪拌1h，並添加額外MCPBA(21mg,0.095mmol)。在室溫下攪拌0.5h後，用飽和NaHCO3水溶液(10mL)淬滅反應混合物。在減壓下去除揮發性溶劑，並用EtOAc(25mL×3)萃取殘餘物。用水及鹽水洗滌合併之有機層，經Na2SO4乾燥，過濾，並在減壓下濃縮，從而得到粗製6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[2-(4-甲基六氫吡嗪-1-基)乙基]-2-甲基亞磺醯基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(90mg,98.1%)。MS(ESI)m/z：538.2[M+1]+。
步驟3：將6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[2-(4-甲基六氫吡嗪-1-基)乙基]-2-甲基亞磺醯基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(90mg)、乙胺(2.0M)於THF(8.5mL)及DCM(2.1mL)中之混合物在密封小瓶中在50 ℃下攪拌4天。在減壓下濃縮反應混合物。藉由製備型HPLC純化粗製混合物，從而得到固體狀標題化合物(6.0mg,6.9%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ 9.15(s,1H),8.64(s,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.7Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.9Hz,1H),7.96(s,1H),7.83(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.46-4.36(m,2H),3.46-3.36(m,2H),3.27-3.18(m,4H),2.65-2.56(m,5H),2.28(m,4H),2.13(s,3H),1.20(t,J=7.3Hz,3H)。MS(ESI)m/z：519.2[M+1]+。
實例21 4-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]丁醯胺(I-3)
標題化合物係根據實例20來製備，只是在步驟1中，用4-溴-丁醯胺代替1-(2-氯乙基)-4-甲基-六氫吡嗪鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.20-9.13(m,1H),8.75-8.62(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.99-7.91(m,1H),7.83(s,1H),7.57(d,J=8.0Hz,1H),7.25(s,1H),6.70(s,1H),4.37-4.24(m,2H),3.48-3.36(m,2H),3.28(s,0H),2.60(s,3H),2.17-2.09(m,2H),1.95-1.86(m,2H),1.24-1.16(m,3H)；MS(ESI)m/z：478.3[M+1]+。
實例22 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(4-(氧雜環丁-3-基)六氫吡嗪-1-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-23)
步驟1：使用與實例11之步驟1中所闡述類似之程序製備6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8-(2-六氫吡嗪-1-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮，只是在步驟1中，用N-(3-溴丙基)胺基甲酸第三丁基酯代替4-(2-甲基磺醯基氧基乙基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯。粗製產物未經進一步純化即用於下一步驟中。MS(ESI)m/z：508.2[M+1]+。
步驟2：向6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8-(2-六氫吡嗪-1-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(97mg,0.19mmol)於DCE(9.6mL)中之攪拌溶液中添加冰HOAc(13.8mg,0.23mmol)隨後3-氧雜環丁酮(21.3mg,0.29mmol)。15分鐘後，添加三乙醯氧基硼氫化鈉(101mg,0.48mmol)，並將反應混合物在室溫下在N2下攪拌4h。用EtOAc稀釋反應物。用飽和NaHCO3水溶液、水及鹽水洗滌有機層，經Na2SO4乾燥，過濾並在減壓下濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/MeOH洗脫純化粗製殘餘物，從而得到油狀6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8-[2-[4-(氧雜環丁-3-基)六氫吡嗪-1-基]乙基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(78.6mg,73%)。MS(ESI)m/z：564.2[M+1]+。
類似於實例20之步驟2及3將硫化物氧化為相應碸並置換為乙胺。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ 9.15(s,1H),8.65(s,1H),8.57(s,1H),8.27(s,1H),8.17-8.13(m,1H),7.96(br s,1H),7.83(d,J=3.8Hz,1H),7.55(dd,J=8.0,2.7Hz,1H),4.99(t,J=5.8Hz,1H),4.57-4.36(m,5H),3.46-3.20(m,4H),3.06-2.88(m,2H),2.82-2.52(m, 5H),2.60(s,3H),2.28-2.17(m,2H),1.25-1.13(m,3H).MS(ESI)m/z：561.2[M+1]+。
實例23 8-(3-胺基-2-羥基-丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-24)
步驟1：將6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(491mg,1.24mmol)、碳酸銫(492mg,1.51mmol,1.22當量)及2-(氯甲基)環氧乙烷(120μL,1.53mmol,1.23當量)於DMF(5.0ml)中之混合物在環境溫度下攪拌48h。將混合物分配於水與EtOAc之間，並用水及鹽水洗滌經分離有機相，經Na2SO4乾燥，過濾並在真空中濃縮，從而得到褐色油(568mg)。藉由自動化急驟層析在SiO2上使用EtOAc/庚烷梯度(10%至100% EtOAc)純化粗製殘餘物，從而得到純6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8-(環氧乙烷-2-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(257mg,46%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.84(s,1H),8.69(s,1H),8.45(s,1H),8.20(d,J=1.7Hz,1H),7.98(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.74(s,1H),7.52(d,J=8.0Hz,1H),4.87(dd,J=13.3,4.8Hz,1H),4.58(dd,J=13.3,5.5Hz,1H),3.43(ddd,J=8.3,5.2,3.1Hz,1H),2.82(d,J=3.2Hz,2H),2.67(s,3H),2.65(s,3H)。MS(ESI)m/z：452/454[M+1]+。
步驟2：將6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8-(環氧乙烷-2-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(151mg,0.334mmol)、疊氮化 鈉(44.2mg,0.680mmol,2.03當量)及氯化銨(35.8mg,0.669mmol,2.00當量)於DMF(5.0ml)中之混合物加熱至50℃歷22h。將經冷卻混合物分配於2-甲基四氫呋喃及水之間，分離之有機相用水及鹽水洗，並經Na2SO4乾燥，過濾並在真空中濃縮，得到淺黃色固體狀8-(3-疊氮基-2-羥基-丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(165mg,100%)，其隨後未經進一步純化即使用。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.18(s,1H),8.95(s,1H),8.58(s,1H),8.31(d,J=1.8Hz,1H),8.20(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),8.09(s,1H),7.59(d,J=8.1Hz,1H),5.49(d,J=5.8Hz,1H),4.58(dd,J=12.8,7.0Hz,1H),4.36(dd,J=12.9,6.3Hz,1H),4.20(p,J=6.0Hz,1H),2.65(s,3H),2.61(s,3H)；2個質子經遮蔽。MS(ESI)m/z：495/497[M+1]+。
步驟3：在環境溫度下用MCPBA(105mg,0.467mmol,1.41當量)將8-(3-疊氮基-2-羥基-丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(163mg,0.330mmol)於THF(5.0ml)中之懸浮液處理1h。混合物用2-甲基四氫呋喃稀釋並用水、飽和NaHCO3水溶液及鹽水依序洗，經Na2SO4乾燥，過濾並在真空中濃縮，得到8-(3-疊氮基-2-羥基-丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲硫基(methylsulfenyl)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮與8-(3-疊氮基-2-羥基-丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基磺醯基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮之混合物(約1：1)呈淺黃色固體(190.4mg)，其隨後未經純化即使用。MS(ESI)m/z：511/513[M+1]+及527/529[M+1]+。
步驟4：在環境溫度下將8-(3-疊氮基-2-羥基-丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲硫基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮及8-(3-疊氮基-2-羥基-丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基磺醯基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮之混合物(約1：1)(0.330mmol)懸浮於乙胺於THF中之 溶液(5.0mL,2.0M,10mmol,30當量)中，得到淺黃色溶液。16h後，混合物用2-甲基四氫呋喃稀釋，用飽和NaHCO3水溶液及鹽水洗，經Na2SO4乾燥，過濾並在真空中濃縮，得到淺黃色固體狀8-(3-疊氮基-2-羥基-丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(161.0mg,99%)，其隨後未經純化即使用。MS(ESI)m/z：492/494[M+1]+。
步驟5：將8-(3-疊氮基-2-羥基-丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(0.330mmol)、三(2-羧基乙基)膦鹽酸鹽(473mg,1.65mmol,5.00當量)、TEA(230μL,1.65mmol,5.00當量)及水(500μL)於THF(10mL)中之混合物在室溫攪拌3天。混合物用飽和NaHCO3水溶液處理並以2-甲基四氫呋喃萃取兩次。合併之有機相用水及鹽水洗，經Na2SO4乾燥，過濾，並在真空中濃縮，得到黃色固體(119.1mg,77%粗製產率，於3個步驟)。藉由反相HPLC(C18，乙腈於水(具有0.1%氫氧化銨)中之梯度)純化殘餘物，得到淺黃色固體狀8-(3-胺基-2-羥基-丙基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(15.1mg,9.8%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.72-8.62(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.7Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.9Hz,1H),8.0-7.7(m,1H),7.84(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.9-4.6(m,1H),4.5-4.2(m,2H),4.3-3.8(m,1H),3.42(p,J=6.8Hz,2H),2.60(s,3H),1.3-1.16(m,3H)；4個質子經遮蔽。1H NMR(300MHz,DMSO-d6,359K)δ 9.06(s,1H),8.62(s,1H),8.52(s,1H),8.22(d,J=1.4Hz,1H),8.09(dd,J=8.0,1.7Hz,1H),7.78(s,1H),7.59-7.50(m,1H),7.53(d,J=7.8Hz,1H),4.45-4.30(m,2H),3.97-3.86(m,1H),3.45(p,J=6.5Hz,2H),2.59(s,3H),2.65-2.45(m,2H),1.21(t,J=7.1Hz,3H)；3個質子經遮蔽。MS(ESI)m/z：466.2/468.2[M+1]+。
實例24
6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-[3-(乙基胺基)-2-羥基-丙基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-25)
步驟1：用MCPBA(51.0mg,0.228mmol,1.19當量)將6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8-(環氧乙烷-2-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(86.7mg,0.192mmol)於DCM(2.0ml)中之溶液在環境溫度下處理1h。在真空中濃縮混合物，將殘餘物再溶解於THF中並濃縮，從而得到6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基磺醯基-8-(環氧乙烷-2-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮及6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲硫基-8-(環氧乙烷-2-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮之黃色固體狀混合物(約2：1)，其隨後未經純化即使用。MS(ESI)m/z：468/470[M+1]+及484/486[M+1]+。
步驟2：在環境溫度下將6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基磺醯基-8-(環氧乙烷-2-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮及6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲硫基-8-(環氧乙烷-2-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮之粗製混合物(0.192mmol)懸浮於乙胺於THF中之溶液(3.0mL,2.0M,6.0mmol,31當量)中並保持3d，且然後加熱至60℃並保持22h。用EtOAc稀釋經冷卻混合物並用飽和水溶液NaHCO3及鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，過濾並在真空中濃縮，從而得到黃色固體(82.9mg)。藉由反相HPLC(C18，乙腈水溶液(具有0.1%氫氧化銨)之梯度)純化粗製殘餘物，從而得到米色固體狀6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-[3-(乙基胺基)-2-羥基-丙基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7- 酮(26.6mg,28%對於2個步驟)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.15(s,1H),8.71-8.61(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.7Hz,1H),8.15(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.97-7.88(m,1H),7.83(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.77-4.70(m,1H),4.48-4.38(m,1H),4.36-4.26(m,1H),4.11-4.01(m,1H),3.42(p,J=6.9Hz,2H),2.60(s,3H),1.20(t,J=7.6Hz,3H),0.97(t,J=7.1Hz,3H)；5個質子經遮蔽。MS(ESI)m/z：494.2/496.2[M+1]+。
實例25 6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-(2-嗎啉基-2-側氧基-乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-26)
步驟1：在室溫下用2-氯-1-嗎啉基-乙酮(84.1mg,0.514mmol,1.17當量)將6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(173mg,0.438mmol)及Cs2CO3(184mg,0.565mmol,1.29當量)於DMF(5.0ml)中之懸浮液處理16h。添加另一份2-氯-1-嗎啉基-乙酮(80.3mg,0.491mmol,1.12當量)並將混合物在室溫下攪拌3d。用水稀釋混合物並用2-甲基四氫呋喃萃取兩次，並藉由過濾回收未溶解之懸浮固體，用2-甲基四氫呋喃洗滌並在真空中乾燥(86.6mg)。用鹽水洗滌合併之有機相，經Na2SO4乾燥，過濾並在真空中濃縮，從而得到橙色-褐色固體(164.8mg)。合併該等固體，從而得到橙色-褐色固體狀6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8-(2-嗎啉基-2-側氧基-乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(251mg)，其隨後未經純 化即使用。MS(ESI)m/z：523/525[M+1]+。
步驟2：將粗製6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8-(2-嗎啉基-2-側氧基-乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(0.438mmol)及MCPBA(157.1mg,0.7010mmol,1.600當量)於THF(10ml)中之懸浮液在室溫下攪拌18h。在真空中濃縮混合物，從而得到黃色油狀6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基磺醯基-8-(2-嗎啉基-2-側氧基-乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮，其隨後未經純化即使用。MS(ESI)m/z：555/557[M+1]+。
步驟3：在室溫下將來自步驟2之殘餘物用乙胺於THF中之溶液(5.0ml,2.0M,10mmol,23當量)處理2h。用2-甲基四氫呋喃稀釋混合物並用飽和水溶液NaHCO3及鹽水洗滌，經Na2SO4乾燥，過濾並在真空中濃縮，從而得到淺黃色固體(138mg,61%粗製產率，對於3個步驟)。藉由反相HPLC(C18，乙腈水溶液(具有0.1%氫氧化銨)之梯度)純化粗製殘餘物，從而得到米色固體狀6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-(2-嗎啉基-2-側氧基-乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(13.1mg,5.8%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.15(s,1H),8.75-8.64(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.16(dd,J=8.0,1.9Hz,1H),8.01-7.96(m,1H),7.89(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),5.16(s,2H),3.73-3.63(m,4H),3.62-3.52(m,2H),3.50-3.41(m,2H),3.40-3.29(m,2H),2.60(s,3H),1.15(t,J=7.1Hz,3H)。MS(ESI)m/z：520.2/522.2[M+1]+。
實例26 8-(1-(2-胺基乙醯基)吡咯啶-3-基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-28)
步驟1：於DMF(17.4mL)中混合6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(1.19g,3.01mmol)、3-甲基磺醯基氧基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯(1.7當量，5.11mmol,1360mg)及碳酸銫(2.5當量，7.51mmol,2450mg)，並將反應物在90℃下攪拌18h。用EtOAc稀釋混合物並添加10%檸檬酸以將pH調節至9，並分離各層。用EtOAc萃取水層，併合併有機層，用水及鹽水洗滌，乾燥(MgSO4)，過濾，且最後在真空中濃縮。藉由SiO2層析用DCM/EtOAc洗脫純化粗製殘餘物，從而得到1307mg(77%產率)灰白色泡沫狀物。LCMS及NMR分析指示兩種區域異構物(即，3-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯及3-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-基)氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯)之混合物。該混合物未經進一步純化即用於下一步驟中。MS(ESI)m/z：565[M+1]+。
步驟2：將來自步驟1之混合物溶解於DCM(15mL)及HOAc(1.05當量，2.429mmol,0.1392mL)中。在0℃下一次性添加MCPBA(1.05當量，2.429mmol,544.3mg)，並將反應物在0℃下攪拌1h。蒸發反應混合物，並將黃色凝膠溶解於乙胺(2mol/L)於THF中之溶液(17.0當量，39.32mmol,19.66mL)中。將黃色溶液於25℃下保持18h。添加Na2SO3(1茶匙)，並將懸浮液在25℃下攪拌45min。用EtOAc稀釋混合物。在過濾及蒸發後，藉由SiO2層析用DCM/EtOAc洗脫純化粗製 殘餘物，從而得到3-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯及3-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-基)氧基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯之灰白色固體狀混合物(1.00g,77%總體產率)。該混合物未經進一步純化即用於下一步驟中。MS(ESI)m/z：562[M+1]+。
步驟3：將於步驟2中獲得之混合物(450mg,0.8006mmol)與存於1,4-二噁烷中之HCl(4mol/L)(44.0當量，35.23mmol,8.806mL)混合並將其在25℃下維持4h。用EtOAc及NaHCO3(s,aq)將反應混合物稀釋至pH 9並分離各層。使用EtOAc萃取水層。合併有機層，用水及鹽水洗滌，乾燥(MgSO4)，過濾，且最後在真空中濃縮。獲得產物之6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(吡咯啶-3-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮及6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-N-乙基-7-(吡咯啶-3-基氧基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-胺之混合物(335mg,84%產率)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。MS(ESI)m/z：462[M+1]+。
步驟4：在25℃下在1,4-二噁烷(1.0mL)中將BOC-Gly-OH(4.0當量，0.8745mmol,153.2mg)及HATU(4.0當量，0.8745mmol,339.3mg)混合20min。將白色懸浮液轉移至6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-N-乙基-7-吡咯啶-3-基氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-2-胺及6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-吡咯啶-3-基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(101mg,0.2186mmol)於1,4-二噁烷(1.0mL)及DIPEA(5.0當量，1.093mmol,0.191mL)中之溶液中。將反應物在25℃下保持4h。用EtOAc稀釋粗製產物並藉由添加10%檸檬酸將pH調節至約9。分離各層，並藉由EtOAc萃取水層。合併有機層，用水及鹽水洗滌，乾燥(MgSO4)，過濾，且最後在真空中濃縮。藉由SiO2層析用DCM/EtOAc 洗脫純化粗製殘餘物，從而得到兩種異構物：(2-(3-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)吡咯啶-1-基)-2-側氧基乙基)胺基甲酸第三丁基酯：63mg，46%產率，MS(ESI)m/z：619[M+1]+。
(2-(3-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-基)氧基)吡咯啶-1-基)-2-側氧基乙基)胺基甲酸第三丁基酯：44mg，33%產率，MS(ESI)m/z：619[M+1]+。
步驟5：將N-[2-[3-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]吡咯啶-1-基]-2-側氧基-乙基]胺基甲酸第三丁基酯(63mg,0.1018mmol)與存於1,4-二噁烷中之HCl(4mol/L)(41當量，4.172mmol,1.043mL)混合，並將反應物在40℃下維持4h。用EtOAc及NaHCO3(s,aq)將混合物稀釋至pH 9，並分離各層。用10% MeOH/DCM萃取水層。合併有機層，用水及鹽水洗滌，乾燥(MgSO4)，過濾，且最後在真空中濃縮。藉由RP-HPLC純化粗製產物(53mg)，從而得到白色粉末狀標題化合物8-(1-(2-胺基乙醯基)吡咯啶-3-基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(12mg,23%產率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.16(s,1H),8.66(s,1H),8.57(s,1H),8.27(s,1H),8.15(dd,J=8.0,1.5Hz,1H),8.08-7.94(m,1H),7.85(d,J=4.7Hz,1H),7.57(d,J=8.0Hz,1H),6.43-6.08(m,2H),4.07-3.88(m,1H),3.88-3.61(m,2H),3.57-3.38(m,2H),2.88-2.69(m,1H),2.60(s,3H),2.30-2.01(m,2H),1.46(d,J=16.3Hz,1H),1.15(t,J=7.1Hz,3H)。MS(ESI)m/z：519[M+1]+。
實例27 8-(1-(2-胺基乙醯基)六氫吡啶-4-基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-48)
標題化合物係以與針對上文所闡述之I-28所闡述類似之方式來製備。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.14(s,1H),8.63(s,1H),8.57(s,1H),8.26(s,1H),8.14(d,J=9.6Hz,1H),7.95(s,1H),7.81(s,1H),7.55(d,J=8.1Hz,1H),5.62(s,2H),4.58(m,2H),3.91(m,2H),3.60(m,3H),2.60(s,3H),1.66(m,3H),1.17(t,J=7.1Hz,3H)。MS(ESI)m/z：533[M+1]+。
實例28 6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-[(3-甲基-3-氮雜二環[3.1.0]己-6-基)甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-128)
藉由使用習用程序使6-(羥基甲基)-3-氮雜二環[3.1.0]己烷-3-甲酸第三丁基酯[CASRN 850808-43-4]與甲苯磺醯氯反應製備6-(((亞甲基-(對甲苯基)亞磺醯基)氧基)甲基)-3-氮雜二環[3.1.0]己烷-3-甲酸第三丁基酯。
如實例11中所闡述製備標題化合物，只是在步驟1中用6-(羥基甲基)-3-氮雜二環[3.1.0]己烷-3-甲酸第三丁基酯代替N-(3-溴丙基)胺基甲酸第三丁基酯，且該反應係在85℃下於DMF中使用NaH作為鹼來實施。在步驟4中去除Boc基團(TFA)後，藉由還原型烷基化(i.甲醛、 HOAc/MeOH；ii. NaBH(OAc)3)使氮甲基化，從而得到I-128。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 9.16(s,1H),8.57(s,1H),8.28(d,J=1.6Hz,1H),8.16(dd,J=1.5,8Hz,1H),8.04-7.96(m,1H),7.88-7.84(m,1H),7.57(d,J=8Hz,1H),4.28-4.08(m,2H),3.47-3.35(m,2H),2.94(br s,2H),2.60(s,3H),2.36-2.18(m,3H),1.75-1.59(m,3H),1.27-1.12(m,4H)；MS[M+H]+=502.1。
實例29 8-[2-(2-胺基乙氧基)乙基]-6-[2-乙基-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-129)
藉由2-(2-乙基-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)乙酸甲酯與4-胺基-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛之縮合(K2CO3,DMF,85℃)製備6-(2-乙基-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。
藉由利用[2{2-溴乙氧基)乙基]胺基甲酸第三丁基酯烷基化6-(2-乙基-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮製備標題化合物。使用標準方案實施甲胺之引入及去保護，從而得到I-129。1H NMR(500MHz,MeOH-d 4 )δ 8.92(s,1H),8.59(s,1H),8.45(s,1H),8.06(d,J=1.5Hz,1H),7.94(dd,J=2.5,8Hz,1H),7.73(s,1H),7.33(d,J=8Hz,1H),4.79-4.64(m,2H),3.95-3.82(m,2H),3.63(t,J=5Hz,2H),3.05(s,3H),2.83(t,J=5.5Hz,2H),1.21(t,J=5.5Hz,3H)；MS[M+H]+=460.1。
實例30 6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-[2-(3-側氧基六氫吡 嗪-1-基)乙基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-130)
將6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮與N-乙基-4-甲氧基-苯甲胺[CASRN 22993-76-6]縮合並利用1,2-二溴乙烷將產物烷基化，從而得到8-(2-溴乙基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基(4-甲氧基苄基)胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮，用六氫吡嗪-2-酮處理該酮，從而得到6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基(4-甲氧基苄基)胺基)-8-(2-(3-側氧基六氫吡嗪-1-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。利用TFA去除4-甲氧基-苄基基團(80℃,18h)，得到I-130。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.65(s,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.5Hz,1H),8.15(dd,J=1.5,8.0Hz,1H),8.01-7.81(m,1H),7.84(s,1H),7.70(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.47-4.41(m,2H),3.45-3.39(m,2H),3.11-3.02(m,4H),2.72-2.69(m,4H),2.60(s,3H),1.22-1.17(m,3H)；MS[M+H]+=518.0
實例31 8-(3-胺基丙基)-6-[2-乙基-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-131)
6-(2-乙基-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d] 嘧啶-7(8H)-酮及4-甲基苯磺酸3-(第三丁氧基羰基胺基)丙基酯之縮合(Cs2CO3,DMF,80℃)得到3-(6-(2-乙基-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)丙基胺基甲酸第三丁基酯。藉由標準方案實施甲胺之引入及去保護，從而得到標題化合物。1H NMR(500MHz,MeOH-d 4 )δ 8.93(s,1H),8.61(s,1H),8.45(s,1H),8.06(d,J=1.5Hz,1H),7.94(dd,J=2,7.5Hz,1H),7.74(s,1H),7.34(d,J=7.5Hz,1H),4.64-4.46(m,2H),3.07(s,3H),2.77-2.71(m,2H),2.69-2.63(m,2H),2.10-1.97(m,5H),1.21(t,J=7.5Hz,3H)；MS[M+H]+=430.0。
以類似方式製備8-(5-胺基戊基)-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-138)，只是用4-甲基苯磺酸5-(第三丁氧基羰基胺基)戊基酯代替3-(第三丁氧基羰基胺基)丙基4-甲基苯且6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮為起始材料。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.67-8.62(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.90-7.80(m,2H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),6.68-6.52(m,1H),4.43-4.17(m,3H),2.92(d,J=4.8Hz,3H),2.60(s,3H),2.55-2.51(m,2H),1.75-1.59(m,2H),1.49-1.27(m,4H).)δ 9.15(s,1H),8.67-8.62(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.90-7.80(m,2H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),6.68-6.52(m,1H),4.43-4.17(m,3H),2.92(d,J=4.8Hz,3H),2.60(s,3H),2.55-2.51(m,2H),1.75-1.59(m,2H),1.49-1.27(m,4H)。
實例32 8-(3-羥基丙基)-2-(甲基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-132)
類似於先前實例製備標題化合物只是利用3-溴-丙醇烷基化6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(Cs2CO3,DMF)。使用標準方案引入甲胺。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 8.74-8.57(m,1H),7.99-7.94(m,1H),7.90(dd,J=7.9,1.9Hz,1H),7.81-7.74(m,3H),7.73(s,1H),7.29(d,J=7.9Hz,1H),7.22(dd,J=5.2,3.3Hz,1H),4.52-4.27(m,3H),3.53-3.45(m,2H),2.92(d,J=4.7Hz,3H),2.56(s,3H),2.23(s,3H),1.90-1.77(m,2H)；MS[M+H]+=416.2。
實例33 8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-133)
步驟1：將N-(3-側氧基丙基)胺基甲酸第三丁基酯(9.2g,53mmol)溶解於甲苯(250mL)及氯仿(820mL)中，然後添加Na2SO4十水合物(12g)及TsOH(1.4g)隨後N-[2-羥基-1-(羥基甲基)乙基]胺基甲酸苄基酯(9.2g,41mmol)。將混合物於室溫下攪拌過夜。用Na2CO3中和所得混合物並將其分配於水與DCM之間。用DCM萃取所得水層並乾燥(Na2SO4)合併之有機相，過濾並將其吸附於矽藻土®上。藉由SiO2層析用庚烷/EtOAc梯度(0至100% EtOAc)洗脫純化產物，從而得到11.73g(76%)白色固體狀N-[2-[5-(苄氧基羰基胺基)-1,3-二噁烷-2-基]乙基]胺基甲酸第三丁基酯。
步驟2：將來自步驟1之產物(11.73g)溶解於存於二噁烷中之4M HCl中並在室溫下攪拌1.5h。去除溶劑且所得N-[2-(2-胺基乙基)-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸苄基酯鹽酸鹽(8.973g)未經額外純化即使用。
步驟3：用4,5-雙-(二苯基膦基)9,9-二甲基(0.149g,0.258mmol)、Pd(OAc)2(28.9mg,0.129mmol)、N-[2-(2-胺基乙基)-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸苄基酯鹽酸鹽(1.6g,5.16mmol)、4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯(1g,4.3mmol)及Cs2CO3(2.8g)裝填烘箱乾燥管，然後添加二噁烷並用N2將混合物脫氣約3min。然後，用Teflon螺旋蓋密封該管並將其在預熱油浴中在110℃下放置3h。在冷卻反應混合物後，將產物分配於H2O與DCM之間。用DCM萃取水相並用鹽水洗滌合併之萃取物，乾燥(Na2SO4)，過濾並吸附於矽藻土上。藉由SiO2層析純化粗製產物，從而得到1.76g(87%)4-[2-[5-(苄氧基羰基胺基)-1,3-二噁烷-2-基]乙基胺基]-2-甲基硫基-嘧啶-5-甲酸乙酯。
步驟4：用4-[2-[5-(苄氧基羰基胺基)-1,3-二噁烷-2-基]乙基胺基]-2-甲基硫基-嘧啶-5-甲酸乙酯(1.76g,3.727mmol)於無水THF(8.39mL)中之溶液逐滴處理冷卻至0℃之LiAlH4(1.05當量LAH，存於0.77M THF中)於無水THF(5.08mL)中之混合物。將反應混合物攪拌 15min，且然後小心逐滴添加0.34mL水。將混合物攪拌30min。然後逐滴添加0.16mL 15% NaOH水溶液隨後0.48mL水。在室溫下將所得懸浮液攪拌17h且然後過濾。用3份25mL THF依序洗滌經過濾殘餘物，並用乙酸乙酯及庚烷稀釋合併之濾液及洗滌液。蒸發溶劑並將粗製產物再溶解於EtOAc中並將其吸附於矽藻土上。藉由SiO2層析用庚烷/EtOAc梯度(20%至100% EtOAc)洗脫純化產物，從而得到735mg N-[2-[2-[[5-(羥基甲基)-2-甲基硫基-嘧啶-4-基]胺基]乙基]-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸苄基酯及226mg起始材料
步驟5：用MnO2(2.77g)處理N-[2-[2-[[5-(羥基甲基)-2-甲基硫基-嘧啶-4-基]胺基]乙基]-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸苄基酯(1.527g,3.514mmol)及DCM之攪拌混合物。將所得懸浮液攪拌24h且然後藉助矽藻土過濾。用DCM洗滌過濾殘餘物，並濃縮合併之濾液及洗滌液，從而得到1.493g(98%)白色泡沫狀N-[2-[2-[(5-甲醯基-2-甲基硫基-嘧啶-4-基)胺基]乙基]-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸苄基酯。
步驟6：將N-[2-[2-[(5-甲醯基-2-甲基硫基-嘧啶-4-基)胺基]乙基]-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸苄基酯(1.492g,3.450mmol)及2-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]乙酸甲酯(1.2g,3.622mmol)、K2CO3(3當量)於DMF(120mL)中之混合物在油浴上在110℃下加熱4h。添加額外0.5當量2-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]乙酸甲酯及K2CO3(1.5當量)且將所得混合物在85℃下攪拌3h。此時，添加額外2-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]乙酸甲酯及K2CO3(1.5當量)並將溶液在110℃下加熱1h。
在冷卻至室溫後，添加水(200mL)及庚烷(約50mL)。過濾混合物並用水及庚烷洗滌固體，從而得到淺黃色固體狀N-[2-[2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙基]-1,3二噁烷-5-基]胺基甲酸苄基酯(2.097g,92%)。
使用標準方案引入氧雜環丁-3-基胺基且利用TFA去除CBZ基團， 從而得到I-133。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.70(s,1H),8.63(s,1H),8.22(d,J=1.7Hz,1H),8.08(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.91-7.76(m,3H),7.50(d,J=8.0Hz,1H),7.32-7.24(m,1H),4.96(s,1H),4.87(m,2H),4.71(t,J=4.7Hz,1H),4.61(t,J=6.2Hz,2H),4.39(dd,J=8.6,6.2Hz,2H),3.86(d,J=11.0Hz,2H),3.71(d,J=10.9Hz,2H),2.57(s,3H),2.56(m,1H),1.90-1.65(m,4H)；MS[M+H]+=549.2。
以類似方式製備以下化合物：8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-134)1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.67(m,1H),8.22(d,J=1.7Hz,1H),8.08(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.91-7.76(m,4H),7.50(d,J=8.0Hz,1H),7.32-7.23(m,1H),4.68(t,J=4.8Hz,1H),4.50-4.27(m,2H),3.86-3.78(m,2H),3.68(dd,J=10.9,1.7Hz,2H),2.94(d,J=4.8Hz,3H),2.57(s,3H),2.53(m,1H),1.98-1.75(s,4H)；[M+H]+=507.2
8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-135)1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.70(s,1H),8.63(m,1H),8.22(d,J=1.7Hz,1H),8.08(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.90-7.76(m,3H),7.49(d,J=8.0Hz,1H),7.31-7.25(m,1H),4.96(m,1H),4.86(m,2H),4.61(t,J=6.2Hz,2H),4.54(t,J=4.9Hz,1H),4.35(dd,J=8.4,6.5Hz,2H),3.92(dd,J=10.9,4.9Hz,2H),3.15(t,J=10.6Hz,2H),2.77(dd,J=10.4,5.2Hz,1H),2.57(s,3H),1.89(m,2H),1.41(m,2H)；[M+H]+=549.2。
8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-137)1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.63(m,1H),8.22(d,J=1.7Hz,1H),8.08(dd,J =8.0,1.8Hz,1H),7.91-7.75(m,4H),7.50(d,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=7.4Hz,1H),4.51(t,J=5.0Hz,1H),4.42(m,1H),3.96-3.83(m,2H),3.12(t,J=10.5Hz,2H),2.94(d,J=4.8Hz,3H),2.75(m,1H),2.57(s,3H),1.91(m,2H),1.57(m,2H)；[M+H]+=507.2
實例34 6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-(2-嗎啉基-2-側氧基-乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-136)
利用2-氯-1-(4-嗎啉基)-乙酮[CASRN 1440-61-5]烷基化6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(第三BuOK,DMF)。使用標準方案引入乙胺。1H NMR(500MHz,MeOH-d 4 )δ 8.93(s,1H),8.61(s,1H),8.45(s,1H),8.06(d,J=1.5Hz,1H),7.94(dd,J=2,7.5Hz,1H),7.74(s,1H),7.34(d,J=7.5Hz,1H),4.64-4.46(m,2H),3.07(s,3H),2.77-2.71(m,2H),2.69-2.63(m,2H),2.10-1.97(m,5H),1.21(t,J=7.5Hz,3H)；MS[M+H]+=416.2。
實例35 6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[2-(2-羥基乙基胺基)乙基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-139)
步驟1：在室溫下用3-(2-氯乙基)-噁唑啶-2-酮(62.5mg,0.418mmol,1.31當量)將6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并-[2,3-d]嘧啶-7-酮(126mg,0.319mmol)及Cs2CO3(111mg,0.341mmol,1.07當量)於DMF(5.0ml)中之懸浮液處理16h且然後加熱至60℃並再保持14h。使混合物冷卻，用水稀釋並用EtOAc萃取兩次。用水及鹽水洗滌合併之有機相，乾燥(Na2SO4)，過濾，並在真空中濃縮，從而得到橙色結晶固體狀3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)噁唑啶-2-酮(155mg,95%)，其未經純化即用於下一步驟中。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.84(s,1H),8.68(s,1H),8.44(s,1H),8.18(d,J=1.7Hz,1H),7.97(dd,J=8.0,1.7Hz,1H),7.68(s,1H),7.49(d,J=8.0Hz,1H),4.73(t,J=5.6Hz,2H),4.26(dd,J=8.9,7.1Hz,2H),3.80-3.72(m,4H),2.68(s,3H),2.65(s,3H)。MS(ESI)m/z：509/511[MH]+。
步驟2：在室溫下用固體MCPBA(96.9mg,0.432mmol,1.35當量)將粗製3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)噁唑啶-2-酮(0.319mmol)於DCM(10ml)中之溶液處理1.5h並在真空中濃縮，從而得到3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)噁唑啶-2-酮及3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)噁唑啶-2-酮之黃色泡沫狀1.4：1混合物。粗製殘餘物未經純化即使用。
步驟3：在室溫下用MeNH2於THF中之溶液(1.6mL,2.0M,10當量)將在步驟2中獲得之亞碸及碸之粗製混合物處理2.5h。用飽和NaHCO3水溶液及水處理混合物，並將其萃取至添加MeOH之DCM中。用鹽水洗滌有機相，乾燥(Na2SO4)，過濾，並在真空中濃縮，從而得到黃色固體(161.8mg,103%)。藉由反相HPLC(C18，MeCN水溶 液(具有0.1%氫氧化銨)之梯度)純化一份粗製殘餘物(77.3mg)，從而得到乳霜固體狀3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)噁唑啶-2-酮(48.8mg,61%，對於3個步驟而言)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.15(s,1H),8.75-8.63(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.7Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.93-7.67(m,1H),7.84(s,1H),7.52(d,J=8.0Hz,1H),4.57-4.40(m,2H),4.14(dd,J=9.0,6.9Hz,2H),3.78-3.54(m,4H),2.94(d,J=4.7Hz,3H),2.60(s,3H)。MS(ESI)m/z：492.2/494.2[MH]+。
步驟4：將粗製3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-7-側氧基吡啶并-[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)噁唑啶-2-酮(84.5mg)懸浮於MeOH(10ml)中，用LiOH水溶液(1.6mL,1.0M,10當量)處理並加熱至回流並保持18h。添加第二份LiOH水溶液(10mL,1.0M,63當量)並在回流下再繼續加熱22h，隨後冷卻並在真空中濃縮。用飽和NaHCO3水溶液及水處理殘餘物且然後用DCM及2-甲基四氫呋喃萃取。用鹽水洗滌合併之有機相，乾燥(Na2SO4)，過濾，並在真空中濃縮，從而得到淺黃色固體(79.6mg)，藉由反相HPLC(C18，MeCN水溶液(具有0.1%氫氧化銨)之梯度)純化該固體，從而得到白色固體狀6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(2-((2-羥基乙基)胺基)乙基)-2-(甲基-胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(35.0mg,47%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.16(s,1H),8.75-8.61(m,1H),8.57(s,1H),8.28(d,J=1.8Hz,1H),8.16(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.92-7.72(m,1H),7.84(s,1H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),4.43(q,J=7.8,6.5Hz,2H),4.38-4.29(m,1H),3.42(q,J=5.6Hz,2H),2.92(d,J=4.6Hz,3H),2.87(t,J=6.9Hz,2H),2.84-2.77(m,1H),2.70-2.61(m,2H),2.60(s,3H)；MS(ESI)m/z：466.2/468.2[MH]+。
實例36 8-(3-胺基丙基)-6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-140)
步驟1：將3-(6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)丙基胺基甲酸第三丁基酯(216mg,0.4mmol)、4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-雙(1,3,2-二氧硼)(305mg,1.2mmol)、Pd(dppf)Cl2(59mg,0.08mmol)及KOAc(79mg,0.8mmol)於二噁烷(5mL)中之混合物在80℃下在N2下攪拌過夜。藉助CELITE®墊過濾混合物並藉由EtOAc洗滌。在減壓下濃縮濾液，從而得到黑色油狀4-(8-(3-(第三丁氧基羰基胺基)丙基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基-7,8-二氫吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)-3-氯苯基酸(688mg，粗產物)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟2：將4-(8-(3-(第三丁氧基羰基胺基)丙基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基-7,8-二氫-吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)-3-氯苯基酸(688mg，粗產物)、4-溴-2-甲基噻唑(254mg,1.4mmol)、Pd(PPh3)4(71mg,0.061mmol)及Na2CO3(0.5M於水，4mL)於MeCN(4mL)中之混合物在90℃下在N2下攪拌過夜。在冷卻至室溫後，用EtOAc(200mL)稀釋反應混合物並用飽和NaCl溶液(100mL)洗滌。乾燥(MgSO4)有機層並在減壓下濃縮。藉由SiO2層析用PE/DCM/EtOAc梯度(3：3：2至1：1：2)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色油狀3-(6-(2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)丙基胺基甲酸第三丁基酯(137mg,63%，來自兩個步驟)。LCMS(ESI)：m/z=503.1[M-55]+。
使用標準方案引入甲胺並去除BOC保護基團(TFA)。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 8.72(s,1H),8.13(s,1H),8.08(d,J=1.4Hz,1H),7.95(dd,J=1.5,8.0Hz,1H),7.91-7.84(m,1H),7.88(s,1H),7.83(s,1H),7.46(d,J=8.0Hz,1H),4.35(d,J=41.2Hz,2H),2.93(d,J=4.4Hz,3H),2.74(s,3H),2.61(s,2H),1.87-1.72(m,2H)；MS[M+H]+=441.0。
實例37 6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-(2-六氫吡嗪-1-基磺醯基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-141)
將4-[(2-胺基乙基)磺醯基]-1-六氫吡嗪甲酸第三丁基酯[CASRN 917562-08-4]與4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛縮合(TEA,THF,IPA H2O,0℃)，從而得到4-(2-(5-甲醯基-2-(甲基硫基)嘧啶-4-基胺基)乙基磺醯基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯，用2-[2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基]乙酸甲酯環化該酯(K2CO3,DMF,100℃)，從而得到6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-8-(2-(六氫吡嗪-1-基磺醯基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。使用標準方案引入甲胺並去除BOC保護基團(TFA)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.67(m,1H),8.23(d,J=1.7Hz,1H),8.09(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.94(d,J=5.6Hz,1H),7.87(d,J=5.9Hz,2H),7.81(t,J=7.7Hz,1H),7.51(d,J=8.0Hz,1H),7.33-7.24(m,1H),4.74-4.54(m,2H),3.43(t,J=7.7Hz,2H), 3.17(s,1H),3.09(m,3H),2.95(d,J=4.9Hz,3H),2.70(m,4H),2.57(s,3H),2.35(m,1H)；MS[M+H]+=554.2。
實例38 2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]-N-[(3S)-吡咯啶-3-基]乙醯胺(I-142)
利用氯乙酸乙酯烷基化6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(Cs2CO3,DMF,RT 64h)。利用標準方案實現甲胺之引入。在水解酯(LiOH,MeOH，回流)後，將酸與(3S)-3-胺基-1-吡咯啶甲酸第三丁基酯[CASRN147081-44-5]縮合(HATU,DIPEA,DMF,RT)並去除Boc保護基團(TFA)，從而得到I-142。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.78-8.63(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.24(d,J=6.9Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.89(s,1H),7.85(d,J=4.4Hz,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.93-4.81(m,2H),4.12-4.02(m,1H),2.87(d,J=4.8Hz,3H),2.94-2.79(m,2H),2.77-2.64(m,1H),2.55-2.48(m,3H),1.95-1.81(m,1H),1.56-1.44(m,1H).δ 9.15(s,1H),8.78-8.63(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.24(d,J=6.9Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.89(s,1H),7.85(d,J=4.4Hz,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.93-4.81(m,2H),4.12-4.02(m,1H),2.87(d,J=4.8Hz,3H),2.94 -2.79(m,2H),2.77-2.64(m,1H),2.55-2.48(m,3H),1.95-1.81(m,1H),1.56-1.44(m,1H)；MS[M+H]+=505.2。
根據用於I-142之程序製備2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]-N-[(3R)-吡咯啶-3-基]乙醯胺(I-151)，只是用(3R)-3-胺基-1-吡咯啶甲酸第三丁基酯[CASRN147081-49-0]代替(3S)-3-胺基-1-吡咯啶甲酸第三丁基酯[CASRN147081-44-5]。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.77-8.63(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.26-8.11(m,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.89(s,1H),7.88-7.82(m,1H),7.55(d,J=8.1Hz,1H),4.94-4.82(m,2H),4.12-4.02(m,1H),2.94-2.65(m,6H),2.60(s,3H),1.94-1.81(m,1H),1.57-1.45(m,1H)；其他信號經遮蔽；MS[M+H]+=505.2。
以類似方式製備8-[2-[(3S)-3-胺基吡咯啶-1-基]-2-側氧基-乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-143)，只是用N-(3S)-3-吡咯啶基胺基甲酸第三丁基酯[CASRN 122536-76-9]代替(3S)-3-胺基-1-吡咯啶甲酸第三丁基酯。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.77-8.63(m,1H),8.57(s,1H),8.28(d,J=1.8Hz,1H),8.16(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.90(s,1H),7.88-7.67(m,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),5.12-4.92(m,2H),3.79-2.99(m,4H),2.94-2.80(m,3H),2.60(s,3H),2.08-1.51(m,4H)；MS[M+H]+=505.2。
根據用於I-143之程序製備8-[2-[(3R)-3-胺基吡咯啶-1-基]-2-側氧基-乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-152)，只是用N-(3R)-3-吡咯啶基胺基甲酸第三丁基酯[CASRN 122536-77-09]代替N-(3S)-3-吡咯啶基胺基甲酸第三丁基酯。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.78-8.63(m,1H), 8.57(s,1H),8.28(d,J=1.7Hz,1H),8.16(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.90(s,1H),7.89-7.82(m,1H),7.56(d,J=7.9Hz,1H),5.08-4.92(m,2H),3.79-3.34(m,4H),3.06-2.80(m,4H),2.60(s,3H),2.09-1.96(m,1H),1.95-1.85(m,1H),1.79-1.68(m,1H),1.61-1.52(m,1H)；MS[M+H]+=505.2。
以類似方式製備8-[2-[(2R)-2-(胺基甲基)吡咯啶-1-基]-2-側氧基-乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-153)，只是將2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙酸與(R)-吡咯啶-2-基甲基胺基甲酸第三丁基酯[CASRN 719999-54-9]縮合。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.78-8.64(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.16(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.90(d,J=1.2Hz,1H),7.89-7.83(m,1H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),5.26-4.99(m,2H),4.10-3.59(m,3H),2.96-2.80(m,1H),2.84(d,J=4.6Hz,3H),2.60(s,3H),2.43-2.23(m,4H)；其他信號經遮蔽；MS[M+H]+=519.2。
類似於I-153製備8-[2-[(2S)-2-(胺基甲基)吡咯啶-1-基]-2-側氧基-乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-154)，只是使用(S)-吡咯啶-2-基甲基胺基甲酸第三丁基酯[CASRN 141774-70-1]。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.78-8.63(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.7Hz,1H),8.16(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.90(d,J=1.1Hz,1H),7.89-7.84(m,1H),7.55(d,J=8.1Hz,1H),5.28-4.99(m,2H),4.09-3.59(m,3H),2.94-2.80(m,4H),2.60(s,3H),2.07-1.73(m,4H)；MS[M+H]+=519.2。
類似於I-153製備6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[2-[(1S,4S)-2 5-二氮雜二環[2.2.1]庚-2-基]-2-側氧基-乙基]-2-(甲基胺基)吡啶并 [2,3-d]嘧啶-7-酮(I-155)，只是使用(1S,4S)-2,5-二氮雜二環[2.2.1]庚烷-2-甲酸第三丁基酯[CASRN 113451-59-5]。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.77-8.63(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.7Hz,1H),8.19-8.12(m,1H),7.92-7.83(m,2H),7.55(dd,J=8.0,2.8Hz,1H),5.30-4.46(m,3H),3.77-3.44(m,2H),3.28-3.13(m,1H),2.98-2.69(m,5H),2.60(s,3H),1.77-1.54(m,2H)；MS[M+H]+=517.2。
類似於I-153製備N-(2-胺基乙基)-2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙醯胺(I-156)，只是使用N-(2-胺基乙基)胺基甲酸第三丁基酯[CASRN 57260-73-8)。1H(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.77-8.63(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.15(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),8.14-8.01(m,1H),7.89(s,1H),7.88-7.65(m,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.94-4.83(m,2H),3.11-3.03(m,2H),2.93-2.83(m,3H),2.60(s,3H),2.58(t,J=6.3Hz,2H)；NH經遮蔽；MS[M+H]+=479.2。
以類似方式製備6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[2-(3-羥基吡咯啶-1-基)-2-側氧基-乙基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-157)，將2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙酸與3-羥基吡咯啶縮合(HATU,DIPEA,DMF,RT,45min)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.78-8.63(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.90(s,1H),7.89-7.66(m,1H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),5.15-4.83(m,3H),4.44-4.23(m,1H),3.79-3.63(m,2H),3.53-3.24(m,2H),2.95-2.79(m,3H),2.60(s,3H),2.10-1.72(m,2H)；MS[M+H]+=506.2。
實例39 8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-144)
標題化合物係根據實例38來製備，只是利用反式-2-(2-(溴甲基)-1,3-二噁烷-5-基)異吲哚啉-1,3-二酮烷基化6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。使用標準方案實施乙胺部分之納入。在最後步驟中實現鄰苯二甲醯亞胺之去保護(MeNH2,MeOH)，從而得到I-144。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )：δ 9.16(s,1H),8.64(s,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=2Hz,1H),8.16(dd,J=2.0,8.0Hz,1H),7.85(s,1H),7.56(d,J=7.5Hz,1H),4.92(t,J=5.5Hz,1H),4.49-4.40(m,2H),3.93-3.89(m,2H),3.44-3.36(m,2H),3.12(t,J=10Hz,2H),2.83-2.73(m,1 H),2.60(s,3H),1.23(t,J=7.5Hz,3H)；MS[M+H]+=807.9。
以類似方式製備8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-145)，只是用甲胺代替乙胺。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )：δ 9.17(s,1H),8.65(s,1H),8.58(s,1H),8.28(d,J=1.5Hz,1H),8.16(dd,J=1.5,8.0Hz,1H),7.86(s,1H),7.57(d,J=8.5Hz,1H),4.99(t,J=5.5Hz,1H),4.50-4.42(m,2H),3.94-3.90(m,2H),3.12(t,J=10Hz,2H),2.92(d,J=4.5Hz,3H),2.82-2.73(m,1 H),2.60(s,3H)；MS[M+H]+=494。
使用類似程序製備6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[5-(甲基胺基)-1,3-二噁烷-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I- 178)，只是在嘧啶環上引入甲胺前N-甲基化(NaH,MeI)(2r,5r)-2-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-1,3-二噁烷-5-基胺基甲酸第三丁基酯並對其實施去保護(TFA)，該引入係使用標準程序實現。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 9.17(s,1H),8.64(s,1H),8.57(s,1H),8.28(d,J=2.5Hz,1H),8.16(dd,J=2.0,10.0Hz,1H),7.94-7.92(m,1H),7.86(s,1H),7.56(d,J=10.0Hz,1H),5.01-4.98(m,1H),4.49(d,J=5.5Hz,1H),4.43(d,J=5.0Hz,1H),4.09(dd,J=5.5,13.5Hz,2H),3.15(t,J=13.0Hz,4H),2.91(d,J=6.5Hz,3H),2.68-2.67(m,1H),2.60(s,3H),2.24(s,3H),1.49(s,1H)；MS[M+H]+=508.0。
根據用於I-144之程序製備2-胺基-8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-163)，只是使用氨替代甲胺。1H NMR(500MHz,CDCl3)：δ 8.76(s,1H),8.44(s,1H),8.36(s,1H),8.10(d,J=1.5Hz,1H),7.87(dd,J=1.5,8.0Hz,1H),7.56(s,1H),7.46(d,J=8.0Hz,1H),5.40(s,2H),4.95(t,J=5.0Hz,1H),4.57(d,J=5.0Hz,2H),4.07-4.04(m,2H),3.16-3.12(m,2H),3.08-3.05(m,1H),2.58(s,3H),1.18(s,2H)；MS[M+H]+=479.9。
根據用於I-144之程序製備8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-164)，只是3-胺基-氧雜環丁烷代替乙胺。1H NMR(500MHz,CDCl3)：δ 8.76(s,1H),8.44(s,1H),8.36(s,1H),8.10(d,J=1.5Hz,1H),7.87(dd,J=1.5,8.0Hz,1H),7.56(s,1H),7.46(d,J=8.0Hz,1H),6.06(s,1H),5.07(s,1H),4.99(t,J=6.0Hz,2H),4.88(s,1H),4.61-4.55(m,4H),4.06-4.02(m,2H),3.12(t,J=10Hz,2H),3.05-3.02(m,1H),2.57(s,3H),1.18(s,2H).：δ 8.76(s,1H),8.44(s,1H),8.36(s,1H),8.10(d,J=1.5Hz,1H),7.87(dd,J=1.5,8.0Hz,1H),7.56 (s,1H),7.46(d,J=8.0Hz,1H),6.06(s,1H),5.07(s,1H),4.99(t,J=6.0Hz,2H),4.88(s,1H),4.61-4.55(m,4H),4.06-4.02(m,2H),3.12(t,J=10Hz,2H),3.05-3.02(m,1H),2.57(s,3H),1.18(s,2H)；MS[M+H]+=536。
以類似方式製備8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-167)，只是6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮為起始材料且甲胺代替乙胺。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.68(d,1H，旋轉異構物)，8.22(d,J=1.7Hz,1H),8.08(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.92-7.77(m,4H),7.51(d,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=7.4Hz,1H),5.07-4.85(m,1H),4.52-4.37(m,2H),4.00-3.84(m,2H),3.11(t,J=10.6Hz,2H),2.91(d,J=4.7Hz,3H),2.85-2.70(m,1H),2.57(s,3H)。未觀察到NH2；MS[M+H]+=493.2。
根據用於I-167之程序製備8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-2-(甲基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-170)，只是6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮為起始材料。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.72-8.55(m,1H),7.96(s,1H),7.90(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.81-7.62(m,4H),7.29(d,J=7.9Hz,1H),7.22(dd,J=4.9,3.6Hz,1H),4.93(d,J=40.2Hz,1H),4.49(s,2H),3.90(dt,J=38.3,19.1Hz,2H),3.12(t,J=10.7Hz,4H),2.91(d,J=4.7Hz,3H),2.80(d,J=5.3Hz,1H),2.56(s,3H),2.22(s,4H)；MS[M+H]+=473.3。
藉由利用7-(甲基磺醯基氧基甲基)-5,9-二氧雜-2-氮雜螺[3.5]壬烷-2-甲酸苄基酯實施烷基化(Cs2CO3,DMF,100℃,48h)製備6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(5 9-二氧雜-2-氮雜螺[3.5]壬-7-基甲基)-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-180)，從而得到7-((6-(2-氯-4-(6- 甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-5,9-二氧雜-2-氮雜螺[3.5]壬烷-2-甲酸苄基酯。然後，使用標準方案引入N-甲基胺取代基。最後步驟係去除CBZ保護基團(TFA)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.65(m,1H),8.22(d,J=1.7Hz,1H),8.08(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.92-7.76(m,4H),7.51(d,J=8.0Hz,1H),7.32-7.23(m,1H),4.33-4.10(m,2H),3.84(dd,J=11.5,4.1Hz,2H),3.66(dd,J=11.5,7.6Hz,2H),3.50(s,2H),3.42(s,2H),2.93(d,J=4.7Hz,3H),2.57(s,3H),2.24(m,1H)；MS[M+H]+=519.2。
根據用於製備I-144之程序製備8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-177)，只是使用甲胺替代乙胺來置換甲基亞磺醯基。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)：δ 9.17(s,1H),8.65(s,1H),8.58(s,1H),8.28(d,J=1.5Hz,1H),8.16(dd,J=1.5,8.0Hz,1H),7.86(s,1H),7.57(d,J=8.5Hz,1H),4.99(t,J=5.5Hz,1H),4.50-4.42(m,2H),3.94-3.90(m,2H),3.12(t,J=10Hz,2H),2.92(d,J=4.5Hz,3H),2.82-2.73(m,1 H),2.60(s,3H)；MS[M+H]+=494。
藉由將((2S,5S)-2-(2-胺基乙基)-1,3-二噁烷-5-基)胺基甲酸第三丁基酯(順式異構物)與4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛縮合製備8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-172)，從而得到(2s,5s)-2-(2-(5-甲醯基-2-(甲基硫基)嘧啶-4-基胺基)乙基)-1,3-二噁烷-5-基胺基甲酸第三丁基酯並利用2-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)乙酸甲酯環化產物(K2CO3,DMF,120℃)，從而得到(2s,5s)-2-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)-1,3-二噁烷-5-基胺基甲酸第三丁基酯。使用標準方案實施甲基胺之引入及去保護。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.64(m,1H), 8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.83(m,2H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),4.68(t,J=4.9Hz,1H),4.51-4.29(m,2H),3.87-3.77(m,2H),3.75-3.63(m,2H),2.94(m,3H),2.60(s,3H),2.57-2.52(m,1H),1.95(m,2H),1.82(m,2H)；MS[M+H]+=508.2。
以類似方式製備6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-146)，只是利用(2R)-2-(對甲苯基磺醯基氧基甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(CASRN 135065-71-3)烷基化內醯胺氮(NaH,DMF,85℃)且使用標準方案引入氧雜環丁-3-基胺基取代基。最後步驟係去除BOC基團(TFA)。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 9.16(s,1H),8.71(s,2H),8.57(s,1H),8.28(s,1H),8.16(d,J=7.9Hz,1H),7.88(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.99-4.89(m,1H),4.89-4.75(m,2H),4.68-4.62(m,1H),4.59(t,J=6.1Hz,1H),4.48-4.33(m,1H),4.26-4.17(m,1H),3.74(d,J=10.7Hz,2H),3.40-3.35(m,1H),2.72(d,J=11.9Hz,1H),2.64(d,J=4.8Hz,2H),2.60(s,3H),2.24-2.52(m,1H)；MS[M+H]+=519.9。
以類似方式製備6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-149)，只是用(2S)-2-(對甲苯基磺醯基氧基甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯[CASRN14863/8-79-0]代替(2R)-2-(對甲苯基磺醯基氧基甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯。1H NMR(500MHz,MeOH-d 4 )δ 8.98(s,1H),8.67(s,1H),8.50(s,1H),8.28(s,1H),8.10(d,J=7.8Hz,1H),7.84(s,1H),7.56(d,J=7.9Hz,1H),5.23-4.97(m,3H),4.83-4.69(m,2H),4.68-4.56(m,1H),4.46-4.31(m,1H),4.07-3.92(m,1H),3.89(d,J=11.1Hz,1H),3.57(t,J=11.3Hz,1H),2.93(d,J=12.0Hz,1H),2.89- 2.70(m,3H),2.67(s,3H)；MS[M+H]+=519.9。
根據用於I-149之程序製備6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-150)，只是甲胺代替氧雜環丁-3-胺。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ 9.16(s,1H),8.65(s,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.5Hz,1H),8.15(dd,J=1.6,8.0Hz,1H),7.92(d,J=4.7Hz,1H),7.86(s,1H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),4.49-4.38(m,1H),4.35-4.14(m,1H),3.89-3.77(m,1H),3.77-3.67(m,1H),3.42-3.37(m,1H),2.93(d,J=4.6Hz,3H),2.69(d,J=12.1Hz,1H),2.63(d,J=4.8Hz,2H),2.60(s,3H),2.54(d,J=10.2Hz,1H)；MS[M+H]+=478.0。
根據I-146製備6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-147)，只是6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮代替6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮且利用(2R)-2-(對甲苯基磺醯基氧基甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯實施烷基化(Cs2CO3,DMF,85℃)。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 8.69(s,1H),8.62(br s,1H),7.97(s,1H),7.91(d,J=8.0Hz,1H),7.80-7.74(m,3H),7.28(d,J=8.0Hz,1H),7.25-7.20(m,1H),5.00-4.76(m,3H),4.70-4.54(m,2H),4.49-4.42(m,1H),4.28-4.19(m,1H),3.84-3.72(m,2H),3.43-3.38(m,1H),2.81-2.74(m,1H),2.72-2.65(m,2H),2.60-2.56(m,1H),2.56(s,3H),2.22(s,3H)；MS[M+H]+=499.0。
根據用於I-147之程序製備2-(甲基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-148)，只是引入甲胺替代氧雜環丁-3-基胺。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 8.63(s,1H),7.96(s,1H),7.91(d,J=8.0Hz,1H),7.86-7.80(m,1H), 7.80-7.73(m,3H),7.29(d,J=7.9Hz,1H),7.24-7.20(m,1H),4.53-4.40(m,1H),4.41-4.20(m,1H),3.93-3.80(m,1H),3.79-3.66(m,1H),2.97-2.87(s,3H),2.72-2.60(m,4H),2.56(s,3H),2.23(s,3H)；MS[M+H]+=457.0。
根據用於I-147之程序製備6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-159)，只是6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮代替6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.75-8.64(m,2H),8.22(d,J=1.5Hz,1H),8.09(dd,J=1.5,8Hz,1H),7.87(d,J=8.5Hz,1H),7.86 9(s,1H),7.81(q,J=8Hz,1H),7.50(d,J=8Hz,1H),7.28(d,J=8Hz,1H),4.98-4.77(m,3H),4.69-4.52(m,2H),4.48-4.35(m,1H),4.29-4.17(m,1H),3.78-3.68(m,2H),3.41-3.34(m,1H),2.75-2.68(m,1H),2.67-2.61(m,2H),2.57(s,3H)；MS[M+H]+=519.2。
以類似方式自6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮製備6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-171)，使用(2S)-2-(對甲苯基磺醯基氧基甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯來烷基化內醯胺(Cs2CO3,DMF)。使用標準方案實施甲基胺之引入及去保護。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.45(s,1H),7.87(s,1H),7.80(d,J=8Hz,1H),7.63(t,J=7.6Hz,1H),7.52(d,J=7.6Hz,1H),7.46(s,1H),7.29(d,J=8Hz,1H),7.09(d,J=7.6Hz,1H),5.48-5.42(m,1H),4.67-4.43(m,2H),4.06-3.96(m,1H),3.91(d,J=11.2Hz,1H),3.58(dt,J=2Hz,10.8Hz,1H),3.11(d,J=4.8Hz,3H),2.95-2.86(m,2H),2.85-2.76(m,2H),2.64(s,3H),2.31(s,3H)；MS[M+H]+= 457.2。
根據用於I-171之程序製備6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-187)，只是3-胺基-氧雜環丁烷代替甲胺。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.69(s,1H),7.96(s,1H),7.91 dd,J=0.8,8Hz,1H),7.80-7.73(m,3H),7.28(d,J=8Hz,1H),7.26-7.18(m,1H),5.07-4.79(m,3H),4.68-4.53(m,2H),4.55-4.39(m,1H),4.28-4.16(m,1H),3.81-3.70(m,2H),3.45-3.26(m,2H),2.77-2.60(m,3H),2.56(s,3H),2.22(s,3H)；MS[M+H]+=499.3。
藉由利用(S)-2-(甲苯磺醯基氧基甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯烷基化(Cs2CO3,DMF)6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮製備6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-173)，從而得到(S)-2-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯。使用標準方案實施甲基胺之引入及去保護。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.45(s,1H),7.87(s,1H),7.80(d,J=8Hz,1H),7.63(t,J=7.6Hz,1H),7.52(d,J=7.6Hz,1H),7.46(s,1H),7.29(d,J=8Hz,1H),7.09(d,J=7.6Hz,1H),5.48-5.42(m,1H),4.67-4.43(m,2H),4.06-3.96(m,1H),3.91(d,J=11.2Hz,1H),3.58(dt,J=2Hz,10.8Hz,1H),3.11(d,J=4.8Hz,3H),2.95-2.86(m,2H),2.85-2.76(m,2H),2.64(s,3H),2.31(s,3H)；MS[M+H]+=477.2。
根據用於製備I-173之程序製備6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-188)，只是藉由3-胺基-氧雜環丁烷代替甲胺。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.77-8.65(m,2H),8.22(d,J=1.7Hz,1H),8.09 (dd,J=0.8,8Hz,1H),7.91-7.84(m,2H),7.81(t,J=7.6Hz,1H),7.50(d,J=8Hz,1H),7.28(d=7.6Hz,1H),5.10-4.76(m,3H),4.71-4.54(m,2H),4.53-4.36(m,1H),4.31-4.16(m,1H),3.90-3.71(m,2H),3.45-3.36(m,1H),2.82-2.62(m,3H),2.57(s,3H),2.56-2.53(m,1H)；MS[M+H]+=519.2。
藉由I-172之還原型甲基化(HCHO,NaBH4)製備6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-4-甲基嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-183)。1H NMR(300MHz,MeOH-d 4 )δ 8.58(s,1H),8.12(d,J=1.7Hz,1H),7.94(dd,J=1.8,8.0Hz,1H),7.83-7.73(m,2H),7.69(d,J=7.7Hz,1H),7.49(d,J=8.0Hz,1H),7.26(d,J=7.5Hz,1H),4.73-4.58(m,2H),4.53-4.35(m,1H),4.08(s,1H),3.89(d,J=10.5Hz,1H),3.69-3.48(m,1H),3.05(s,3H),2.87-2.71(m,1H),2.66(d,J=11.0Hz,1H),2.61(s,3H),2.28(s,3H),2.24-2.00(m,2H)；MS[M+H]+=491.2。
實例40 6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-(2-嗎啉基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-158)
將6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮與1-(4-甲氧基苯基)-N-甲基甲胺縮合(DIPEA,THF,50℃,18h)，從而得到6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-((4-甲氧基苄基)(甲基)胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。利用1,2-二溴乙 烷實施烷基化(NaH,DMF,RT,2h)得到8-(2-溴乙基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-((4-甲氧基苄基)(甲基)胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮，用嗎啉處理該酮並用TFA實施去保護。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.16(s,1H),8.71(s,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.0Hz,1H),8.15(dd,J=1.5,8.0Hz,1H),7.91-7.89(m,1H),7.85(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.48-4.39(m,2H),3.58-3.48(m,4H),2.91(d,J=4.5Hz,3H),2.65-2.63(m,2H),2.60(s,3H),2.53-2.50(m,4H)；MS[M+H]+=492.02。
根據用於I-158之程序製備2-(甲基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(2-嗎啉基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-165)，只是6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮代替6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮作為起始材料。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 8.63(s,1H),7.96(s,1H),7.91(d,J=8.0Hz,1H),7.82-7.81(m,1H),7.78-7.77(m,2H),7.75(s,1H),7.28(d,J=8.0Hz,1H),7.23-7.21(m,1H),4.48-4.38(m,2H),3.53(s,4H),2.91(d,J=4.5Hz,3H),2.66-2.64(m,2H),2.58(s,3H),2.52-2.50(m,4H),2.24(s,3H)；MS[M+H]+=471.0。
實例41 8-[2-(氮雜環丁-3-基磺醯基)乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-160)
利用3-[(2-羥基乙烷)磺醯基]氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯烷基化6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(DIAD,PPh3,DMF,RT)。藉由標準方案實現乙胺之引入及BOC基團之去除。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.67(s,1H),8.23(d,J=0.8Hz,1H),8.09(dd,J=1.6,6.8Hz,1H),7.88(d,J=5.6Hz,2H),7.81(t,J=6Hz,1H),7.50(d,J=6.4Hz,1H),7.28(d,J=6Hz,1H),4.70(t,J=5.6Hz,1H),4.62-4.55(m,1H),4.53-4.45(m,1H),3.78(t,J=6Hz,2H),3.62(t,J=6.8Hz,2H),3.48-3.4(m,4H),2.57(s,3H),1.21(t,J=5.6Hz,3H)；MS[M+H]+=538.9。
以類似方式製備8-[2-(2-胺基乙基磺醯基)乙基]-2-(甲基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-174)，只是用2-(2-羥基乙基磺醯基)乙基胺基甲酸第三丁基酯代替3-[(2-羥基乙烷)磺醯基]氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯(DIAD,PPh3,DMF,RT)。藉由標準方案實現甲胺之引入及Boc基團之去除。1H NMR(400MHz,MeOH-d 4 )δ 8.62(brs,1H),7.87(s,1H),7.79(t,J=7.6Hz,2H),7.75(s,1H),7.66(d,J=8Hz,1H),7.33(d,J=8Hz,1H),7.25(d,J=7.6Hz,1H),5.01-4.91(m,2H),3.64(brs,2H),3.45(brs,2H),3.19(t,J=6.8Hz,2H),3.09(s,3H),2.62(s,3H),2.33(s,3H；MS[M+H]+=493.0。
實例42 3-[6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]丙烷-1-磺醯胺(I-161)
將3-胺基-1-丙烷磺醯胺與4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛縮合 (TEA,THF,H2O,RT)，從而得到3-(5-甲醯基-2-(甲基硫基)嘧啶-4-基胺基)丙烷-1-磺醯胺，用2-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)乙酸乙酯環化該磺醯胺(K2CO3,DMF)，從而得到3-(6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)丙烷-1-磺醯胺。藉由標準方案實現氧雜環丁-3-胺之引入。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 8.71(s,1H),8.63(brs,1H),7.97(s,1H),7.91(d,J=8Hz,1H),7.80-7.76(m,3H),7.29(d,J=7..5Hz,1H),7.24-7.20(m,1H),6.80(s,2H),5.00(t,J=7Hz,1H),4.87(t,J=6.5Hz,2H),4.61(t,J=5.5Hz,2H),4.38(t,J=7Hz,2H),3.43-3.33(brs,2H),2.55(s,3H),2.23(s,3H),2.10(brs,2H)；MS[M+H]+=521.1。
以類似方式製備乙烷磺酸2-[6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]酯(I-166)，只是2-胺基乙烷磺醯胺代替3-胺基-1-丙烷磺醯胺。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ8.71(s,1H),8.66(brs,1H),7.97(s,1H),7.91(d,J=8Hz,1H),7.80-7.76(m,3H),7.28(d,J=6Hz,1H),7.24-7.20(m,1H),7.11(brs,2H),4.97(t,J=5Hz,1H),4.90(t,J=6Hz,2H),4.68(t,J=7.5Hz,2H),4.58(t,J=6.5Hz,2H),3.43-3.33(m,2H),2.55(s,3H),2.24(s,3H)；MS[M+H]+=507.0。
實例43 6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-(六氫吡嗪-1-基磺醯基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-162)
用4-[(溴甲基)磺醯基]-1-六氫吡嗪甲酸第三丁基酯(CASRN 1443979-93-8)烷基化6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(Cs2CO3,DMF,100℃)，從而得到6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。利用標準方案實施甲胺之引入及BOC之去除，從而得到I-162。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.74(m,1H),8.23(d,J=1.7Hz,1H),8.10(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),8.05(m,1H),7.93(m,1H),7.87(d,J=8.1Hz,1H),7.81(t,J=7.7Hz,1H),7.50(d,J=8.0Hz,1H),7.28(dd,J=7.5,1.0Hz,1H),5.68(m,2H),3.13-3.04(m,4H),2.95(d,J=4.9Hz,3H),2.70-2.61(m,4H),2.57(s,3H)；MS[M+H]+=540.2。
實例44 8-(3-羥基丙基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-168)
利用3-溴-丙-1-醇烷基化6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(Cs2CO3,DMF)。藉由標準方案實現3-胺基-氧雜環丁烷之引入。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.69(s,1H),8.55(s,1H),7.96(d,J=1.8Hz,1H),7.90(dd,J=8.0,1.9Hz,1H),7.81-7.72(m,3H),7.28(d,J=7.9Hz,1H),7.22(dd,J=5.0,3.5Hz,1H),5.06-4.90(m,1H),4.90-4.78(m,2H),4.60(t,J=6.2Hz,2H),4.56-4.47(m,1H),4.38-4.30(m,2H),3.56-3.46(m,2H),2.55(s,3H),2.23(s,3H),1.87-1.72(m,2H)；MS[M+H]+=458.2。
實例45 4-[[6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]甲基]六氫吡啶-4-甲腈(I-169)
4-氰基-4-(甲苯磺醯基氧基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯
步驟1：將六氫吡啶-4-甲腈(1.1g10.0mmol)、二碳酸二第三丁基酯(2.62g,12mmol)及TEA(4.2mL,30mmol)於DCM(15mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。添加HCl(5% wt水溶液)以將pH調節至5以下。用DCM萃取水相。用鹽水洗滌有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到黃色油狀4-氰基六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(2.0g,95.2%)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=155.1[M-55]。
步驟2：在-78℃下在氮氣氛下向4-氰基六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(1.0g粗產物，4.76mmol)於THF(10mL)中之攪拌混合物中逐滴添加LHMDS(1M於THF中，7.14mL,7.14mmol)。將混合物在-78℃下攪拌1h。然後，添加氯甲酸乙酯(771mg,7.14mmol)，並將混合物在-78℃下再攪拌1h。用飽和NH4Cl水溶液淬滅混合物並用EtOAc萃取水相。乾燥(Na2SO4)有機層，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用PE/EtOAc(4：1)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色油狀4-氰基六氫吡啶-1,4-二甲酸1-第三丁基酯4-乙基酯(1.3g粗產物，83.1%)。LCMS(ESI)：m/z=183.1[M-99]。
步驟3：在氮氣氛下在0℃下向4-氰基六氫吡啶-1,4-二甲酸1-第三丁基酯4-乙基酯(1.3g粗產物，4.61mmol)於MeOH(15mL)中之攪拌混合物中添加NaBH4(350mg,9.22mmol)。將混合物在0℃下攪拌1.5 h，然後用HCl(5% wt水溶液，5mL)淬滅。用EtOAc萃取水相，並乾燥(Na2SO4)有機層，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用PE/EtOAc(4：1)洗脫純化殘餘物，從而得到無色油狀4-氰基-4-(羥基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(900mg,81.3%)。LCMS(ESI)：m/z=141.1[M-99]。
步驟4：將4-氰基-4-(羥基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(300mg 1.25mmol)、甲苯磺醯氯(285mg,1.5mmol)、DMAP(16mg,0.13mmol)及TEA(0.52mL,3.75mmol)於DCM(5mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。濃縮混合物並藉由SiO2層析用PE/EtOAc(6：1)洗脫純化殘餘物，從而得到白色固體狀4-氰基-4-(甲苯磺醯基氧基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(120mg,24.4%)。LCMS(ESI)：m/z=295.0[M-99]。
利用4-氰基-4-(甲苯磺醯基氧基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯烷基化6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(Cs2CO3,DMF,60℃)。利用標準方案實施甲硫基之氧化及甲胺之添加(MeNH2,DIPEA)隨後去保護(TFA)。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 8.67(s,1H),8.22(d,J=1.5Hz,1H),8.08(dd,J=1.0Hz,7.5Hz,1H),7.96(t,J=4.5Hz,1H),7.87(m,2H),7.81(t,J=7.5Hz,1H),7.51(d,J=7.5Hz,1H),7.28(d,J=7.5Hz,1H),4.62(s,2H),2.97-2.86(m,5H),2.61(t,J=12Hz,2H),2.57(s,3H),1.85(d,J=13.5Hz,2H),1.73-1.60(m,2H；MS[M+H]+=500.0。
實例46 6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[(1-甲基-4-六氫吡啶基)甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-175)
利用4-(甲苯磺醯基氧基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯烷基化6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮，從而得到4-((6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯。硼酸酯化(雙(頻那醇合)二硼)及水解得到4-(8-((1-(第三丁氧基羰基)六氫吡啶-4-基)甲基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基-7,8-二氫吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)-3-氯苯基酸，且利用標準方案實施與2-溴-6-甲基-吡啶之鈴木偶合(Pd(dppf)Cl2,KOAc，二噁烷，80℃)，從而得到4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯。藉由標準方案實現乙胺之引入及BOC基團之去除。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.64(s,1H),8.21(d,J=1.7Hz,1H),8.08(dd,J=1.7,8.0Hz,1H),7.95-7.75(m,3H),7.71(br s,1H),7.51(d,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=7.5Hz,1H),4.43-4.14(m,2H),2.91(d,J=4.8Hz,3H),2.82-2.68(m,2H),2.57(s,3H),2.13(s,3H),1.94-1.69(m,3H),1.61-1.45(m,2H),1.43-1.28(m,2H)；MS[M+H]+=489.2。
實例47 6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(1R,5S)-3-甲基-3-氮雜二環[3.1.0]己-6-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-176)
將(1R,5S,6r)3-氮雜二環[3.1.0]己烷-6-甲醇[CASRN 134575-13-6]轉化為(1R,5S,6r)-6-(羥基甲基)-3-氮雜二環[3.1.0]己烷-3-甲酸第三丁基酯((BOC)2O,DMAP)且然後實施溴化，從而得到(1R,5S,6r)-6-(溴甲基)-3-氮雜二環[3.1.0]己烷-3-甲酸第三丁基酯(CBr4,PPh3,DCM)
利用(1R,5S,6r)-6-(溴甲基)-3-氮雜二環[3.1.0]己烷-3-甲酸第三丁基酯烷基化6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(Cs2CO3,DMF,0℃ 18h)。藉由標準方案實現甲胺之引入及BOC基團之去除，從而得到8-((1R,5S,6r)-3-氮雜二環[3.1.0]己-6-基甲基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。藉由還原型烷基化實現吡咯啶氮之甲基化(HCHO,MeOH然後NaBH4)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.65(s,1H),8.22(d,J=1.6Hz,1H),8.08(dd,J=1.7,8.0Hz,1H),7.93-7.74(m,4H),7.52(d,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=7.4Hz,1H),4.24-4.05(m,2H),2.91(d,J=4.7Hz,3H),2.82(d,J=8.7Hz,1H),2.57(s,3H),2.22-2.10(m,5H),2.05-1.91(m,1H),1.71-1.58(m,1H),1.60-1.50(m,2H)；MS[M+H]+=487.0。
以類似方式自替代6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮之6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮開始製備2-(甲基胺基)-8-[(3-甲基-3-氮雜二環[3.1.0]己-6-基)甲基]-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-186)。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )δ 8.63(s,1H),7.97(s,1H),7.91(d,J=8.0Hz,1H),7.87-7.82(m,1H),7.80-7.76(m,2H),7.76-7.73(m,1H),7.30(d,J=7.9Hz,1H),7.25-7.20(m,1H),4.26-4.19(m,1H),4.17-4.09(m,1H),2.94-2.90(m,3H),2.88-2.80(m,2H),2.56(s,3H),2.23(s,3H),2.18(s,3H),1.80-1.45(m,3H)；MS[M+H]+=468.3。
實例48 6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-179)
硼酸酯化(S)-2-((6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(雙(頻那醇合)二硼，Pd(dppf)Cl2,KOAc，二噁烷，80℃,2h)並將所得二氧硼與4-溴-2-甲基噻唑偶合(Pd(dppf)Cl2,K3PO4,NaOAc,MeCN,H2O,100℃,2h)，從而得到(S)-2-((6-(2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯。藉由標準方案實現甲胺之引入及BOC基團之去除。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.45(s,1H),8.00(d,J=1.6Hz,1H),7.78(dd,J=1.6,7.6Hz,1H),7.58(s,1H),7.41(d,J=7.6Hz,1H),7.36(s,1H),5.52-5.50(m,1H),4.61-4.52(m,2H),4.00-3.91(m,2H),3.60-3.55(m,1H),3.11(d,J=4.8Hz,3H),2.93-2.87(m,2H),2.82-2.80(m,2H),2.78(s,3H)；MS[M+H]+=483.0。
以類似方式自(R)-2-((6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基 吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯製備6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-182)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.45(s,1H),8.00(d,J=2.4Hz,1H),7.78(dd,J=2.4,11.8Hz,1H),7.58(s,1H),7.41(d,J=11.8Hz,1H),7.37(s,1H),5.62-5.60(m,1H),4.63-4.52(m,2H),4.00-3.91(m,2H),3.62-3.55(m,1H),3.10(d,J=4.8Hz,3H),2.95-2.91(m,2H),2.87-2.78(m,2H),2.78(s,3H)；MS[M+H]+=483.0。
根據用於製備I-179之程序製備6-[2-氯-4-(2-環丙基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-184)，只是4-溴-2-環丙基噻唑代替4-溴-2-甲基噻唑。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ 8.45(brs,1H),7.99(d,J=1.6Hz,1H),7.78(dd,J=1.6,8.0Hz,1H),7.57(s,1H),7.40(d,J=8.0Hz,1H),7.28(s,1H),5.52(brs,1H),4.69-4.29(m,2H),4.01(brs,1H),3.91(d,J=11.5Hz,1H),3.58(t,J=10.2Hz,1H),3.11(d,J=5.0Hz,3H),2.97-2.85(m,2H),2.85-2.74(m,2H),2.41-2.31(m,1H),1.20-1.09(m,4H)；MS[M+H]+=509.2。
根據用於製備I-182之程序製備6-[2-氯-4-(2-環丙基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-185)，只是4-溴-2-環丙基噻唑代替4-溴-2-甲基噻唑。1H NMR(400MHz,MeOD-d 4 )δ 8.60(s,1H),8.05(d,J=1.6Hz,1H),7.89(dd,J=2.0Hz；8.0Hz,1H),7.69(s,1H),7.43(d,J=8.0Hz,1H),4.62(brs,1H),4.47(brs,1H),4.03(brs,1H),3.89(d,J=11.6Hz,2H),3.61-3.54(m,1H),3.07(s,3H),2.90(d,J=12.4Hz,1H),2.85-2.75(m,3H),2.46-2.42(m,1H),1.25-1.20(m,2H),1.14-1.10(m,2H)；MS[M+H]+=509.1。
實例49 6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-(1-亞胺基-1-側氧基-四氫噻喃-4-基)-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-181)
將4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛與4-胺基四氫-2H-硫吡喃-4-基-1-氧化物[CASRN 919513-33-0]縮合(TEA,THF,IPA,H2O,0℃)，從而得到2-(甲基硫基)-4-(四氫-2H-硫吡喃-4-基胺基)嘧啶-5-甲醛-1-氧化物，且隨後用4-溴-2-氯苯基乙酸環化，從而得到6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)-8-(四氫-2H-硫吡喃-4-基-1-氧化物)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。硼酸酯化(雙(頻那醇合)二硼，Pd(dppf)Cl2,KOAc，二噁烷，80℃,2h)及與2-氯吡嗪之偶合得到6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-8-(四氫-2H-硫吡喃-4-基-1-氧化物)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。
胺化(CF3CONH2,MgO,Rh2(OAc)4,PhI(OAc)2,DCM,RT,16h)得到6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-(1-亞胺基-1-側氧基-四氫噻喃-4-基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮。藉由在50℃下用MeNH2及MeOH處理實現甲胺至嘧啶環上之引入。1H NMR(500MHz, CDCl3)δ 8.83(s,1H),8.46(s,1H),8.43(s,1H),8.17(d,J=1.6Hz,1H),7.94(dd,J=1.7,8.0Hz,1H),7.56(s,1H),7.48(d,J=8.0Hz,1H),5.71-5.55(m,2H),4.01-3.68(m,2H),3.34-3.06(m,7H),2.68(s,1H),2.65(s,3H),2.09-1.96(m,2H)；MS[M+H]+=510.2。
實例50 6-[2-氯-4-(4-甲基噻唑-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-189)
硼酸酯化(S)-2-((6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(雙(頻那醇合)二硼，Pd(dppf)Cl2,KOAc，二噁烷，80℃,2h)，且使所得二氧硼與2-溴-4-甲基噻唑偶合(Pd(dppf)Cl2,K3PO4,NaOAc,MeCN,H2O,100℃,2h)，從而得到(S)-2-((6-(2-氯-4-(4-甲基噻唑-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯。藉由標準方案實現甲胺之引入及BOC基團之去除。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.45(s,1H),8.06(d,J=1.6Hz,1H),7.83(dd,J=2.0,8.0Hz,1H),7.58(s,1H),7.41(d,J=8.0Hz,1H),6.92(s,1H),5.70-5.58(m,1H),4.61-4.50(m,2H),4.00-3.89(m,2H),3.59-3.55(m,1H),3.11(d,J=4.8Hz,3H),2.93-2.90(m,2H),2.88-2.87(m,2H),2.51(s,3H)；MS[M+H]+=483.0。
實例51 8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-190)
使2-氯-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)-苯乙酸甲酯[CASRN 849934-95-8]與4-溴-2-甲基-噻唑偶合(Pd(dppf)Cl2 K2CO3,100℃)，從而得到2-(2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基)乙酸甲酯，用4-胺基-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛環化該酯，從而得到6-(2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。利用2-(2-(溴甲基)-1,3-二噁烷-5-基)異吲哚啉-1,3-二酮對內醯胺氮之烷基化得到2-((2r,5r)-2-((6-(2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-1,3-二噁烷-5-基)異吲哚啉-1,3-二酮。藉由標準方案實現甲胺之引入及鄰苯二甲醯亞胺基團之去除。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.63(s,1H),8.13(s,1H),8.08(d,J=2.0Hz,1H),7.95(dd,J=1.6,8.0Hz,1H),7.83(s,1H),7.45(d,J=8.0Hz,1H),4.99-4.90(m,1H),4.47-4.42(m,2H),3.93-3.89(m,2H),3.31(s,3H),3.11(t,J=2.8Hz,2H),2.91(d,J=4.8Hz,3H),2.81-2.76(m,1H),2.74(s,3H)；MS[M+H]+=499.1。
用(2r,5r)-2-(2-(5-甲醯基-2-(甲基硫基)嘧啶-4-基胺基)乙基)-1,3-二噁烷-5-基胺基甲酸第三丁基酯環化2-(2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基)乙酸甲酯，從而得到(2r,5r)-2-(2-(6-(2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)-1,3-二噁烷-5-基胺基甲酸第三丁基酯。使用標準方案實施甲胺之引入及去保護，從而得到8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-191)。1H NMR(400MHz,MeOD-d 4 )δ 8.45(s,1H),7.94(d,J=1.6Hz,1H), 7.75(dd,J=1.6,8Hz,1H),7.65(s,1H),7.62(s,1H),7.31(d,J=7.6Hz,1H),4.67(t,J=4.8Hz,1H),4.48-4.47(m,2H),3.95-3.68(m,4H),2.95(s,3H),2.66(s,3H),2.58-2.52(m,1H),2.04-1.89(m,2H)；MS[M+H]+=513.2。
實例52 6-[2-氯-4-(1-甲基吡唑-3-基)苯基)-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-191)
硼酸酯化(R)-2-((6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯(雙(頻那醇合)二硼，Pd(dppf)Cl2,KOAc，二噁烷，80℃,2h)，並使所得二氧硼與3-溴-1-甲基-1H-吡唑偶合(Pd(dppf)Cl2,K3PO4,NaOAc,MeCN,H2O,100℃,2h)，從而得到(R)-2-((6-(2-氯-4-(2-甲基噻唑-4-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯。藉由標準方案實現甲胺之引入及BOC基團之去除。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.45(s,1H),7.90(d,J=1.2Hz,1H),7.78(dd,J=1.2,6.4Hz,1H),7.58(s,1H),7.38(d,J=6.4Hz,1H),7.37(s,1H),6.55(s,1H),5.50-5.48(m,1H),4.62-4.49(m,2H),3.99-3.98(m,1H),3.96(s,3H),3.92-3.89(m,1H),3.60-3.54(m,1H),3.11(d,J=4.8Hz,3H),2.92-2.87(m,2H),2.82-2.77(m,2H)；MS[M+H]+=466.1。
以類似方式製備6-[2-氯-4-(1-甲基-124-三唑-3-基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-192)，只是用3-溴-1-甲基-1 2 4三唑代替3-溴-1-甲基-1H-吡唑。1H NMR(400 MHz,CDCl3)δ 8.45(s,1H),8.21(s,1H),8.07(s,1H),8.03-8.00(m,1H),7.58(s,1H),7.44(d,J=8.0Hz,1H),5.66-5.65(m,1H),4.62-4.52(m,2H),3.99-3.98(m,1H),3.97(s,3H),3.92-3.89(m,1H),3.60-3.55(m,1H),3.11(d,J=5.2Hz,3H),2.94-2.88(m,2H),2.80-2.77(m,2H)；MS[M+H]+=467.1。
實例53 6-[2-乙基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-193)
使(S)-2-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯與乙基酸偶合(Pd2(dba)3,Xphos,K2CO3,PhMe,100℃)，從而得到(S)-2-((6-(2-乙基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯。藉由標準方案達成3-胺基-氧雜環丁烷之引入及去保護。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.68(s,1H),8.67-8.63(brs,1H)7.98(d,J=2Hz,1H),7.91-7.88(dd,J=2,8Hz,1H),7.80-7.76(m,2H),7.75(s,1H),7.26-7.20(m,2H),4.95-4.75(m,3H),4.68-4.56(m,2H),4.26-4.18(m,1H),3.77-3.70(m,2H),3.38-3.34(m,1H),3.31(s,1H),2.65-2.60(m,2H),2.56(s,3H),1.09(t,J=8Hz,3H)；MS[M+H]+=513.3。
以類似方式自(R)-2-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁 基酯製備6-[2-乙基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[[(2R)-嗎啉-2-基]甲基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-194)。1H NMR(400MHz,MeOD-d 4 )δ8.66(s,1H),7.91(d,J=1.5Hz,1H),7.83-7.77(m,2H),7.75(s,1H),7.67(d,J=7.6Hz,1H),7.30(d,J=8Hz,1H),7.26(d,J=7.2Hz,1H),5.10-4.98(m,4H),4.86-4.72(m,2H),4.71-4.64(m,1H),4.44-4.36(m,1H),4.00(brs,1H),3.94-3.86(m,2H),3.61-3.53(m,1H),3.07-2.92(m,1H),2.88-2.72(m,3H),2.63(s,4H),1.19(t,J=7.6Hz,3H)；MS[M+H]+=513.3。
實例54 6-[2-氯-4-[6-(羥基甲基)-2-吡啶基]苯基]-2-(甲基胺基)-8-[[(2S)-嗎啉-2-基]甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-195)
使(R)-2-((6-(2-氯-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯與2-溴-6-羥基甲基吡啶偶合(Pd(PPh3)4,K2CO3)，從而得到(R)-2-((6-(2-氯-4-(6-(羥基甲基)吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)嗎啉-4-甲酸第三丁基酯。利用標準方案實現甲胺之引入及去保護，從而得到I-195。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ8.65(s,1H),8.23(d,J=1.6Hz,1H),8.09(dd,J=2,8Hz,1H),7.97-7.86(m,3H),7.84(s,1H),7.58-7.47(m,2H),5.48(t,J=6Hz,1H),4.66(d,J=6Hz,2H),4.48-4.38(m,1H),4.35-4.17(m,1H),3.88-3.69(m,2H),3.42-3.34(m,1H),2.92(d,J=4.4Hz,3H),2.75-2.57(m,4H),2.45-2.25(m,1H)；MS[M+H]+=493.1。
實例55 6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-8-[2-(1-甲基氮雜環丁-3-基)氧基乙基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-196)
利用3-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯烷基化6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(Cs2CO3,DMF,80℃,2h)，從而得到3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙氧基)氮雜環丁烷-1-甲酸第三丁基酯。去除BOC基團(TFA)並將一級胺甲基化(HCHO,Na BH(OAc)3,EtOH,RT,18h)。將甲硫基置換為MeNH2(MeNH2/EtOH，密封管，80℃,18h)，從而得到I-196。1H NMR(400MHz,MeOH-d 4 )δ 8.60(brs,1H),8.14(s,1H),7.95(d,J=8Hz,1H),7.82-7.78(m,2H),7.70(d,J=7.6Hz,1H),7.49(d,J=7.6Hz,1H),7.27(d,J=7.6Hz,1H),4.68(brs,2H),4.26-4.21(m,1H),3.77(brs,2H),3.63-3.62(m,2H),3.06(s,3H),2.99(brs,2H),2.63(s,3H),2.35(s,3H)；MS[M+H]+=491.0。
實例56 6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[(1,1-二側氧基-1 4-噻嗪烷-2-基)甲基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-197)
利用2-(羥基甲基)硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯烷基化6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(DIAD,PPh3,DMF)。氧化雙-硫醚(MCPBA,DCM)得到雙-碸，用甲胺處理該雙-碸，從而得到2-((6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-1,1-二側氧基-硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯。硼酸酯化(KOAc,Pd(dppf)Cl2，二噁烷，80℃)及與2-氯-6-甲基吡啶(Pd(PPh3)4,Cs2CO3 90℃,DME,EtOH,PhMe,H2O)偶合得到2-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-1,1-二側氧基-硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯，藉由對掌性層析拆分該酯並實施去保護(TFA)，從而得到I-197。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.67(s,1H),8.23(d,J=1.6Hz,1H),8.09(dd,J=1.6,8Hz,1H),8.02-7.95(m,1H),7.91-7.85(m,2H),7.81(t,J=8Hz,1H),7.51(d,J=7.6Hz,1H),7.28(d,J=7.6Hz,1H),4.88-4.60(m,2H),3.62-3.53(m,1H),3.23-2.97(m,5H),2.97-2.94(m,3H),2.93-2.80(m,1H),2.57(s,3H)；MS[M+H]+=525.2。
實例57 8-[2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基]-6-[2-乙基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-198)
使2-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)乙酸甲酯與乙基酸偶合(Pd2(dba)3,Xphos,K2CO3,PhMe,100℃)，從而得到2-(2-乙基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)乙酸甲酯，將其與(2r,5r)-2-(2-(5-甲醯基-2-(甲基硫 基)嘧啶-4-基胺基)乙基)-1,3-二噁烷-5-基胺基甲酸第三丁基酯縮合並實施環化，從而得到(2r,5r)-2-(2-(6-(2-乙基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)-1,3-二噁烷-5-基胺基甲酸第三丁基酯。利用標準方案實現氧雜環丁-3-基胺之引入及去保護，從而得到I-198。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.68(s,1H),8.67-8.63(brs,1H)7.98(d,J=2Hz,1H),7.91-7.88(dd,J=2,8Hz,1H),7.81-7.76(m,2H),7.73(s,1H),7.26-7.20(m,2H),5.50-5.48(m,3H),4.65-4.55(m,3H),4.38-4.34(t,J=6Hz,2H),4.00-3.94(dd,J=4,8Hz,1H),3.28-3.20(m,2H),2.95-2.85(m,1H),2.59(s,3H),2.54-2.52(m,2H),1.94-1.86(m,2H),1.08(t,J=8Hz,3H)；MS[M+H]+=543.3。
實例58 3-[2-[6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙基]吡咯啶-3-甲腈(I-199)
利用3-氰基-3-(2-羥基乙基)吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯烷基化6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(DIAD,PPh3,DMF)。硼酸酯化((雙(頻那醇合)二硼),KOAc,Pd(dppf)Cl2，二噁烷，80℃)及與2-氯-6-甲基吡啶偶合(Pd(PPh3)4,K2CO3 90℃,DME,EtOH,PhMe,H2O)得到3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)-3-氰基吡咯啶-1-甲酸第三丁基酯。利用標準方案實現甲胺之引入及去保護，從而得到I-199。 1H NMR(400MHz,MeOH-d 4 )δ8.55(brs,1H),8.22(q,J=3.6Hz,1H),8.03(d,J=2Hz,1H),7.92(d,J=8Hz,1H),7.82(dd,J=2,8Hz,1H),7.76(s,1H),7.62(d,J=7.6Hz,1H),7.53(d,J=8Hz,1H),4.64(brs,2H),3.84(d,J=8.4Hz,1H),3.56-3.33(m,3H),2.99(s,3H),2.71(s,3H),2.66-2.57(m,1H),2.30-2.17(m,3H)；MS[M+H]+=500.1。
實例59 8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(3-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-200)
使2-(2-氯-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)乙酸甲酯與2-溴-3-甲基吡啶偶合(Pd(dppf)Cl2,K2CO3,100℃)，從而得到2-(2-氯-4-(3-甲基吡啶-2-基)苯基)乙酸甲酯，將其與4-(((2r,5r)-5-(1,3-二側氧基異吲哚啉-2-基)-1,3-二噁烷-2-基)甲基胺基)-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛縮合並實施環化，從而得到2-((2r,5r)-2-((6-(2-氯-4-(3-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-1,3-二噁烷-5-基)異吲哚啉-1,3-二酮。利用標準方案實現甲胺之引入及去保護，從而得到I-200。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.47(d,J=4.0Hz,1H),7.59(s,1H),7.54-7.52(d,J=8.0Hz,1H),7.52(s,1H),7.44-7.39(m,2H),7.19(s,1H),7.15-7.12(m,1H),5.49(d,J=4.4Hz,1H),4.98(s,1H),4.62(d,J=2.4Hz,2H),4.07-4.03(m,2H),3.15-3.10(m,2H),3.04(d,J=5.2Hz,3H),2.33(s,3H；MS[M+H]+=493.1。
實例60 6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[(3 3-二氟-4-六氫吡啶基)甲基]-2- (甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-201)
使4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲醛與4-(胺基甲基)-3,3-二氟六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯反應，從而得到3,3-二氟-4-((5-甲醯基-2-(甲基硫基)嘧啶-4-基胺基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯，將其與2-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)乙酸甲酯縮合並實施環化，從而得到4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-3,3-二氟六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯。甲胺之引入係藉由在密封管中用甲基胺處理來實現(80℃,16h)。利用TFA實施去保護得到I-201。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.65(s,1H),8.22(d,J=1.6Hz,1H),8.08(dd,J=2.0,8.4Hz,1H),7.85(m,4H),7.50(d,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=7.6Hz,1H),4.58(m,2H),3.04(m,1H),2.92(d,J=4.8Hz,3H),2.84(m,1H),2.70(m,2H),2.57(s,3H),2.37(m,1H),1.48(m,2H)；MS[M+H]+=511.0。
實例61 6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[2-(1,1-二側氧基-1 4-噻嗪烷-2-基)乙基]-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-202)
利用溴乙酸乙酯(LDA)烷基化1,1-二氧化物-4-硫嗎啉甲酸第三丁 基酯[CASRN 215791-95-0]，將其還原為醇(NaBH4)且進行甲苯磺醯化，從而得到2-(2-(甲苯磺醯基氧基)乙基)-1,1-二側氧基-硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯。利用甲苯磺酸酯烷基化6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(Cs2CO3,DMF)得到2-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)-1,1-二側氧基-硫嗎啉-4-甲酸第三丁基酯。利用標準方案實現甲胺之引入及去保護，從而得到I-202。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.66(s,1H),8.22(d,J=1.6Hz,1H),8.08(dd,J=1.6,8Hz,1H),7.92(d,J=4.4Hz,1H),7.87(d,J=8Hz,1H),7.85(s,1H),7.81(t,J=7.6Hz,1H),7.52(d,J=8Hz,1H),7.28(d,J=7.6Hz,1H),4.6-4.49(m,1H),4.46-4.36(m,1H),3.47-3.35(m,1H),3.21-3.13(m,1H),3.09-2.97(m,3H),2.94(d,J=4.4Hz,4H),2.84-2.74(m,1H),2.57(s,3H),2.38-2.25(m,1H),1.81-1.69(m,1H)；MS[M+H]+=539.3。
實例62 5-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]戊醯胺(I-40)
步驟1：將4-氯丁醯胺(3.5當量，282.8mg,2.20mmol)、Cs2CO3(617.3mg,1.894mmol)及6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(250mg,0.632mmol)於無水DMF(6.3mL)中之混合物在40℃下攪拌16h。去除溶劑，從而得到黃色固體狀產物4-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-7-側氧基-吡啶 并[2,3-d]嘧啶-8-基]丁醯胺。其未經任何另外純化即用於下一步驟中。MS(ESI)m/z 481.3[M+1]+。
步驟2：在0℃下向存於無水DCM(8mL)中之4-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]丁醯胺(240mg,0.499mmol)中逐份添加MCPBA(1.10當量，0.549mmol,123.0mg)。將反應混合物在0℃下攪拌15min，用飽和NaHCO3(25mL)淬滅，並用DCM(3×30mL)萃取。合併有機層並在減壓下濃縮，從而得到粗製4-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基亞磺醯基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]丁醯胺。MS(ESI)m/z 497.3[M+1]+。
步驟3：將4-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基亞磺醯基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]丁醯胺(100mg,0.201mmol)、MeNH2(2mol/L於THF中，1.00mmol,0.50mL)及DIPEA(4.0當量，0.805mmol,0.140mL)於無水THF(0.8mL)中之混合物在室溫下攪拌30min。在真空中去除溶劑，並將粗製物質分配於DCM(40mL)與水(20mL)之間。使用DCM(20mL)萃取水層。藉助相分離器筒柱過濾合併之有機相。藉由反相HPLC純化粗製產物，從而得到灰白色固體狀4-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]丁醯胺(35.2mg,0.074mmol,37%)。MS(ESI)m/z：464.2[M+1]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.20-9.14(m,1H),8.67-8.62(m,1H),8.57(s,1H),8.30-8.25(m,1H),8.23-8.12(m,1H),7.91-7.82(m,2H),7.57(d,1H),7.29-7.24(m,1H),6.75-6.70(m,1H),4.43-4.24(m,2H),3.30(s,0H),2.96-2.90(m,3H),2.60(s,3H),2.17-2.05(m,2H),1.96-1.85(m,2H)。
表IIa中之化合物係藉助與G02850102之合成所使用類似之程序採用適當起始材料製得。
實例63 8-(((1S,4S)-4-胺基環己基)甲基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-38)
步驟1：將氫化鈉(20mg,60%存於礦物油中，0.50mmol)逐份添加至6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(100mg,0.25mmol)於DMF(10mL)中之冷卻至0℃之溶液中。將懸浮液在室溫下攪拌直至均質為止，且然後添加4-甲基苯磺酸((1S,4S)-4-(第三丁氧基羰基胺基)環己基)甲基酯(192mg,0.50mmol)。將混合物在85℃下攪拌2h，使其冷卻至室溫，用DCM(50mL)稀釋並用水(3×50mL)洗滌。乾燥(Na2SO4)有機相，過濾，在真空中濃縮，並藉由SiO2層析用PE/EtOAc(1：1)洗脫進行純化，從而得到黃色固體狀(1s,4s)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(130mg,86%)。MS(ESI)：m/z=551.0[M-55]+。
步驟2：將MCBPA(176mg,0.82mmol)逐份添加至(1s,4s)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(250mg,0.41mmol)於DCM(5mL)中之冷卻至0℃之溶液中。將懸浮液在室溫下攪拌2h且然後用飽和NH4Cl水溶液淬滅。用DCM(50mL×3)萃取混合物，並用水洗滌合併之有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到黃色固體狀粗製產物(1S,4S)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(150mg,57%)。LCMS(ESI)：m/z=583.2[M-55]+。
步驟3：將(1S,4S)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(150mg,0.23mmol)、乙胺鹽酸鹽(38mg,0.46mmol)及DIPEA(121mg,0.92mol)於丙-2-醇(5mL)中之混合物在80℃下攪拌2h。然後，在真空中濃縮混合物並藉由SiO2層析用PE/EtOAc(1：1)洗脫進行純化，從而得到(1S,4S)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(100mg,71%)。LCMS(ESI)：m/z=604.2[M+1]+。
步驟4：將(1S,4S)-4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(100mg,0.17mmol)於TFA(2mL)及DCM(2mL)中之溶液在0℃下攪拌1h。在真空中濃縮反應混合物並藉由製備型HPLC純化，從而得到白色固體狀8-(((1S,4S)-4-胺基環己基)甲基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(60mg,71%)。1H NMR(500MHz,CD3OD-d 4 )：δ 8.98(s,1H),8.61(br,1H),8.50(s,1H),8.27(d,J=1.6Hz,1H),8.11-8.09(dd,J=1.5,8.5Hz,1H), 7.80(s,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),4.35(d,J=5.7Hz,2H),3.54(dd,J=7.1,14.3Hz,2H),2.76-2.69(m,1H),2.67(s,3 H),2.08-2.00(m,1H),1.98-1.91(m,2H),1.85-1.76(m,2H),1.33-1.30(m,3H),1.26-1.09(m,4H)；MS(ESI)：m/z=504.1[M+1]+。
表IIb中之化合物係藉助類似程序採用適當起始材料製得。
實例64 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-((4-羥基六氫吡啶-4-基)甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-54)
步驟1：在0℃下，將氫化鈉(60mg,60%存於礦物油中，1.5mmol)添加至6-[2-氯-4-(6-甲基-吡嗪-2-基)-苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(396mg,1mmol)於DMF(6mL)中之溶液中。將混合物在室溫下攪拌1h，且然後添加1-氧雜-6-氮雜-螺[2.5]辛烷-6-甲酸苄基酯(494g,2mmol)，隨後在室溫下攪拌過夜。用水(10mL)、丙酮(5mL)及EtOAc(50mL)稀釋反應混合物。分離有機層，經無水Na2SO4乾燥，並在真空中濃縮。藉由SiO2層析用MeOH/DCM梯度(1：40至1：20)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色固體狀4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-4-羥基六氫吡啶-1-甲酸苄基酯(800mg,60%)。LCMS(ESI)：m/z=644.0[M+1]+。
步驟2：使用實例63步驟2中所闡述之程序將4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-4-羥基六氫吡啶-1-甲酸苄基酯轉化為4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-4-羥基六氫吡啶-1-甲酸酯。LCMS(ESI)：m/z=660.0[M+1]+。
步驟3：使用實例63步驟3中所闡述之程序將4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-4-羥基六氫吡啶-1-甲酸酯轉化為4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-4-羥基六氫吡啶-1-甲酸苄基酯。LCMS(ESI)：m/z=641.0[M+1]+。
步驟4：將HBr(60%於HOAc中，1mL)添加至4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-4-羥基六氫吡啶-1-甲酸苄基酯(200mg)於DCM(5mL)中之溶液中。將溶液在室溫下攪拌過夜，且然後在0℃下添加氨(30%於MeOH中，10mL)以將pH調節至>7。在真空中濃縮混合物並藉由製備型HPLC純化，從而得到白色固體狀6-(2-氯-4-(6-甲基-吡嗪-2-基)-苯基)-2-乙基胺基-8-(4-羥基-六氫吡啶-4-基甲基)-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(8.3mg,10%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ8.83(s,1H),8.61-45(m,1H),8.43(s,1H),8.17(d,J=1.5Hz,1H),7.95(dd,J=1.5,7.5Hz,1H),7.62(s,1H),7.50(d.J=7.5Hz,1H),5.67-5.50(m,1H),4.76-4.54(m,2H),3.55(q,J=6.5Hz,2H),3.08-2.85(m,4H),2.65(s,3H),1.81-1.70(m,1H),1.40-1.18(m,7H)；LCMS(ESI)：m/z=507.0[M+1]+
實例65 6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-[(4-羥基-1-甲基-4- 六氫吡啶基)甲基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-105)
將6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-((4-羥基六氫吡啶-4-基)甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-54,100mg,0.20mmol)、甲醛(75mg,1.00mmol,40%於水)及HOAc(24mg,0.40mmol)於MeOH(10mL)中之混合物在室溫下攪拌16h。向此混合物中添加NaBH4(30mg,0.80mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌1h。藉由添加飽和NH4Cl水溶液(40mL)淬滅反應物並用DCM(50mL×3)萃取。乾燥(Na2SO4)合併之有機層，過濾並在真空中濃縮。藉由製備型HPLC純化殘餘物，從而得到白色固體狀6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-((4-羥基-1-甲基六氫吡啶-4-基)甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(15mg,14%)。1H NMR(500MHz,MeOH-d 4 )：δ 8.98(s,1H),8.65(brs,1H),8.50(s,1H),8.28(d,J=2.0Hz,1H),8.10(dd,J=8.0,2.0Hz,1H),7.84(s,1H),7.56(d,J=8.0Hz 1H),4.68(m,2H),3.56(m,2H),2.70(m,2H),2.67(s,3H),2.46(t,J=11Hz,2H)),2.31(s,3H)，1.87(m,2H),1.70(m,2H),1.32(m,3H)；LCMS(ESI)：m/z=520.1[M+1]+。
實例66 2-(異丙基胺基)-6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-8-(2-側氧基-2-(六氫吡嗪-1-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-78)
步驟1：向6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并-[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(500mg,1.33mmol)於DMF(5mL)中之混合物中添加t-BuOK(280mg,2.5mmol)及4-(2-氯乙醯基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(395mg,1.5mmol)。然後，將混合物在室溫下攪拌過夜，用EtOAc萃取，用鹽水洗滌，乾燥(MgSO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到黃色固體狀4-(2-(6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙醯基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(500mg，粗產物)。LCMS(ESI)：m/z=601.1[M+1]+。
步驟2：將HOAc(1mL)及MCPBA(155mg,0.9mmol)添加至4-(2-(6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并-[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙醯基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(500mg,0.83mmol)於DCM(5mL)中之混合物中。將反應物攪拌過夜。在減壓下濃縮反應物，然後藉由SiO2層析用DCM/MeOH(10：1)洗脫進行純化，從而得到黃色固體狀4-(2-(6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)-7-側氧基吡啶并-[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙醯基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(300mg，粗產物)。LCMS(ESI)：m/z=617.3[M+1]+。
步驟3：將DIPEA(0.5mL)添加至4-(2-(6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)-7-側氧基吡啶并-[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙醯基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(100mg,0.16mmol)、丙-2-胺(60 mg,1.0mmol)及i-PrOH(5mL)中之混合物中。將混合物在80℃下攪拌2h，在真空中濃縮並藉由SiO2層析用MeOH/DCM(1：10)洗脫進行純化，從而得到4-(2-(2-(異丙基胺基)-6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙醯基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(70mg,72%)。LCMS(ESI)：m/z=612.2[M+1]+。
步驟4：將TFA(2mL)添加至4-(2-(2-(異丙基胺基)-6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)-苯基)7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙醯基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(70mg,0.11mmol)及DCM(10mL)中之混合物中。將混合物在室溫下攪拌2h。然後，藉由減小壓力濃縮混合物同時添加NH3/MeOH(7M)以將pH調節至大於7。然後，藉由製備型HPLC純化殘餘物，從而得到白色固體狀2-(異丙基胺基)-6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-8-(2-側氧基-2-(六氫吡嗪-1-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(40mg,69%)。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ 8.44(s,1H),7.87(s,1H),7.79(d,J=8.0,1H),7.64-7.61(m,1H),7.52(d,J=8.0,1H),7.50(s,1H),7.32(d,J=8.0,1H),7.08(d,J=8.0,1H),5.35-5.32(m,1H),5.24(s,2H),4.11-4.08(m,1H),3.62-3.59(m,4H),2.98-2.96(m,2H),2.88-2.86(m,2H),2.63(s,3H),2.32(s,3H),1.29-1.28(m,6H)。LCMS(ESI)：m/z=512.1[M+1]+。
表IIc中之化合物係藉助與G02851318之合成所使用類似之程序採用適當起始材料製得。
實例67 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-8-(2-側氧基-2-(六氫吡嗪-1-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-84)
步驟1：將6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(2.01g,5.08mmol)、Cs2CO3(1.83g,5.60mmol,1.10當量)及2-氯乙酸乙酯(650μL,6.10mmol,1.20當量)於DMF(20mL)中之混合物在室溫下攪拌64h。用水稀釋混合物並將其萃取兩次至2-甲基THF中。用水及鹽水洗滌合併之有機相，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到淺褐色固體(2.46g)，藉由SiO2層析用EtOAc/庚烷梯度(20%至100% EtOAc)洗脫純化該固體，從而得到白色固體狀2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙酸乙酯(1.77g,72%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.18(s,1H),9.01(s,1H),8.58(s,1H),8.32(d,J=1.7Hz,1H),8.20(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),8.17(s,1H),7.61(d,J=8.0Hz,1H),5.14(s,2H),4.18(q,J=7.1Hz,2H),2.60(s,3H),2.58(s,3H),1.20(t,J=7.1Hz,3H)。MS(ESI)m/z：482/484[MH]+。
步驟2：用固體MCPBA(488mg,2.18mmol,1.11當量)將2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙酸乙酯(946mg,1.96mmol)於THF(20mL)中之懸浮液在室溫下處理2h，且然後添加第二份MCPBA(89mg,0.40mmol,0.20當量)並將反應物攪拌1h。在真空中濃縮混合物。用甲胺於THF中之溶液(2.0M,10mL,20mmol,10當量)在室溫下將粗製殘餘物處理30min且在真空中再次濃縮。將殘餘物分配於飽和NaHCO3水溶液與DCM之間，並用鹽水洗滌經分離有機相，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到淺黃色固體狀2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙酸乙酯(984mg)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.16(s,1H),8.80-8.66(m,1H),8.57(s,1H),8.28(d,J=1.8Hz,1H),8.16(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),8.00-7.94(m,1H),7.94(s,1H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),5.08-4.97(m,2H),4.16 (q,J=6.9Hz,2H),2.93-2.83(m,3H),2.60(s,3H),1.20(t,J=7.1Hz,3H)。MS(ESI)m/z：465/467[MH]+。
步驟3：用LiOH之水溶液(1.0M,20mL,20mmol,10當量)將於MeOH(20mL)中之粗製2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙酸乙酯(1.96mmol)在室溫下處理3h，用MeOH(40mL)稀釋非均質混合物並加熱至回流並保持2h。將經冷卻混合物在真空中濃縮至約20mL並用EtOAc(丟棄)洗滌。用硫酸水溶液(2.0N)將水相酸化至pH 3並用EtOAc萃取兩次。用鹽水洗滌合併之有機相，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到淺黃色固體狀純2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙酸酯(834mg,97%，對於兩個步驟而言)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.82(s,1H),8.42(s,1H),8.38(br s,1H),8.15(d,J=1.7Hz,1H),7.92(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.62(s,1H),7.52(d,J=8.0Hz,1H),7.33(br s,1H),6.6(br s,1H),5.20(s,2H),2.64(s,3H),2.09(s,3H)。MS(ESI)m/z：437/439[MH]+。
步驟4：將2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙酸酯(47.8mg,0.109mmol)及1-[雙(二甲基胺基)亞甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓3-氧化物六氟磷酸鹽(57.1mg,0.149mmol,1.36當量)一起懸浮於DMF(2.0mL)中並在室溫下用DIPEA(100μL,0.1mL,0.57mmol,5.2當量)處理10min。用六氫吡嗪(99.0mg,1.14mmol,10.4當量)於DMF(1.0mL)中之溶液將所得紅色-橙色溶液在室溫下處理30min。將混合物傾倒至飽和NaHCO3水溶液中並用EtOAc及2-甲基THF之混合物萃取。用水及鹽水洗滌經分離有機相，乾燥(Na2SO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到淺色固體(45.3mg)。用DCM萃取合併之水相，並用鹽水洗滌經分離有機相，經硫酸鈉乾燥並過濾。在真空中將合併之萃取物濃縮成橙色固體 (51.4mg)。藉由反相HPLC(C18，乙腈水溶液(具有0.1%氫氧化銨)之梯度)純化粗製殘餘物，從而得到白色固體狀6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-8-(2-側氧基-2-(六氫吡嗪-1-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(22.4mg,41%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 9.16(s,1H),8.78-8.64(m,1H),8.57(s,1H),8.28(d,J=1.7Hz,1H),8.16(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.90(s,1H),7.93-7.84(m,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),5.17-5.05(m,2H),3.60-3.50(m,2H),3.40-3.34(m,2H),2.93-2.83(m,3H),2.81-2.73(m,2H),2.69-2.62(m,2H),2.60(s,3H)。MS(ESI)m/z：505.2[M+1]+。
實例68 2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]-N-(2-羥基乙基)乙醯胺(I-85)
標題化合物係根據實例67使用適當起始材料來製備。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.77-8.63(m,1H),8.57(s,1H),8.28(d,J=1.8Hz,1H),8.22-8.13(m,1H),8.16(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.89(s,1H),7.91-7.81(m,1H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),4.96-4.84(m,2H),4.66(t,J=5.3Hz,1H),3.42(q,J=5.9Hz,2H),3.19-3.11(m,2H),2.93-2.83(m,3H),2.60(s,3H)。MS(ESI)m/z：480.2[M+1]+。
實例69 2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]-N,N-二甲基-乙醯胺(I-86)
標題化合物係根據實例67使用適當起始材料來製備。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.16(s,1H),8.77-8.64(m,1H),8.57(s,1H),8.28(d,J=1.7Hz,1H),8.16(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.90(s,1H),7.92-7.84(m,1H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),5.16-5.06(m,2H),3.19-3.12(m,3H),2.92-2.80(m,6H),2.60(s,3H)。MS(ESI)m/z：464.2[M+1]+。
實例70 8-(1-(2-胺基乙醯基)六氫吡啶-4-基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-29)
標題化合物係根據實例67使用適當起始材料來製備。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.14(s,1H),8.63(s,1H),8.57(s,1H),8.26(s,1H),8.14(d,J=9.6Hz,1H),7.95(s,1H),7.81(s,1H),7.55(d,J=8.1Hz,1H),5.62(s,2H),4.58(m,2H),3.91(m,2H),3.60(m,3H),2.60(s,3H),1.66(m,3H),1.17(t,J=7.1Hz,3H)。MS(ESI)m/z：533[M+1]+。
實例71 6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(2-(六氫吡嗪-1-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-66)
步驟1：將6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(500mg)、4-(2-甲基磺醯基氧基乙基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(346.4mg,1.39mmol)及Cs2CO3(1.24g,3.80mmol)及無水DMF(9.7mL)之混合物在密封管中在90℃下攪拌1h。將經冷卻反應混合物傾倒至水(100mL)中並使其靜置過夜。過濾固體並在真空下濃縮，從而得到4-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(289.1mg,37.6%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.67(s,1H),8.15(d,J=1.7Hz,1H),7.94(dd,J=8.0,1.7Hz,1H),7.69-7.64(m,2H),7.53(d,J=7.9Hz,1H),7.46(d,J=8.0Hz,1H),7.14(d,J=7.6Hz,1H),4.66(br s,2H),3.38(br s,4H),2.78(br s,2H),2.66(s,3H),2.64(s,3H),2.54(br s,4H),1.45(s,9H)MS(ESI)m/z：607.2[M+1]+。
步驟2：在0℃下向冰HOAc(52.2mg,0.95mmol)於DCM(9.5mL)中之攪拌溶液中添加4-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(289mg,0.476mmol)隨後MCPBA(241.6mg,1.19mmol)。將反應混合物在0℃下攪拌1h。用飽和NaHCO3水溶液(10mL)淬滅反應混合物。在減壓下去除揮發性溶劑，並用EtOAc(25mL×3)萃取殘餘物。用水及鹽水洗滌合併之有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾，並在減壓下濃縮，從而得到4-(第三丁氧基羰基)-1-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)- 基)乙基)六氫吡嗪1-氧化物(定量產率)。MS(ESI)m/z：639.2[M+1]+。
步驟3：在密封小瓶在50℃下攪拌4-(第三丁氧基羰基)-1-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基亞磺醯基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)六氫吡嗪1-氧化物(75mg)及乙胺(2.0M)於THF(5.9mL)中之混合物。20h後，添加雙(頻那醇合)二硼(35.8mg,0.14mmol)，並將反應混合物在室溫下攪拌3h。用EtOAc稀釋反應混合物，並用水及鹽水洗滌有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾，並在減壓下濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/庚烷洗脫純化粗製殘餘物，從而得到4-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(46.7mg,65.9%)。MS(ESI)m/z：604.2[M+1]+。
步驟4：向4-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(46.7mg,0.077mmol)於DCM(1.6mL)及MeOH(1.6mL)中之攪拌溶液中添加存於1,4-二噁烷中之HCl(4.0M,1.0mL,4mmol)，並將反應混合物在50℃下攪拌17h。濃縮揮發性溶劑，並將粗產物再溶解於水(1.0mL)中並用飽和NaHCO3水溶液將pH調節至約7。用DCM(3×25mL)萃取反應混合物。用水及鹽水洗滌合併之有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並濃縮。藉由製備型HPLC純化粗製混合物，從而得到固體狀標題化合物(13.3mg,32.6%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ 8.64(s,1H),8.21(s,1H),8.07(d,J=8.1Hz,1H),7.95(br s,1H),7.86(d,J=7.9Hz,1H),7.83-7.78(m,2H),7.49(d,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=7.5Hz,1H),4.50-4.34(m,2H),3.41(t,J=7.0Hz,2H),2.77-2.69(m,4H),2.64-2.58(m,4H),2.57(s,3H),2.53-2.40(m,3H),1.20(t,J=7.4Hz,3H)。MS(ESI+)m/z：504.2[M+1]+。
表IId中之化合物係藉助與I-66之合成所使用類似之程序採用適當 起始材料製得。
實例72 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(5-氧雜-2-氮雜螺[3.4]辛-7-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-58)
標題化合物係根據實例71使用市售7-溴-5-氧雜-2-氮雜螺[3.4]辛烷-2-甲酸第三丁基酯作為起始材料且在步驟1中添加1當量碘化鈉來製備。1H NMR(500MHz,CD3OD)δ8.94(s,1H),8.57(s,1H),8.47(s,1H),8.23(d,J=1.6Hz,1H),8.05(dd,J=8.0,1.7Hz,1H),7.74(s,1H),7.52(d,J=8.0Hz,1H),6.49-6.37(m,1H),4.34(s,1H),4.10-4.00(m,1H),3.93(d,J=9.6Hz,1H),3.89-3.83(m,1H),3.79(d,J=9.3Hz,1H),3.70(d,J=9.3Hz,1H),3.55-3.46(m,2H),2.93(br,1H),2.64(s,3H),2.48(br,1H),1.26(t,J=7.2Hz,3H)；LCMS(ESI)：m/z=504[M+H]+。
實例73 6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-8-(2-(嗎啉-2-基)乙基)-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-113)及6-(2-甲基-4-(6-甲基 吡啶-2-基)苯基)-8-(2-(嗎啉-2-基)乙基)-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-114)
根據實例71採用適當起始材料製備外消旋2-(2-(6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(氧雜環丁-3-基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙基)嗎啉-4-甲酸苄基酯。對掌性SFC分離得到兩種鏡像異構物：峰1：RT=0.944min峰2：RT=1.297min MS(ESI)m/z：647.2[M+1]+。
將由上述峰1表示之物質(51.0mg,0.079mmol)連同甲酸銨(49.7mg,0.79mmol)、10% Pd/C(10mg)及IPA(7.9mL)一起置於10mL微波小瓶中。密封小瓶並將反應混合物在微波中在110℃下攪拌5min。冷卻反應混合物且然後藉助矽藻土墊過濾以去除Pd及甲酸鹽。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC純化粗產物，從而得到固體狀標題化合物(鏡像異構物1)(17.4mg,43%產率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ d 8.68(s,1H),8.57(br s,1H),7.96(d,J=1.8Hz,1H),7.90(dd,J=8.0,1.9Hz,1H),7.80-7.75(m,2H),7.74(s,1H),7.27(d,J=7.9Hz,1H),7.22(dd,J=5.1,3.4Hz,1H),4.98(br s,1H),5.08-4.92(m,1H),4.92-4.75(m,2H),4.43(dt,J=14.5,6.7Hz,2H),4.27(ddd,J=12.4,9.3,5.5Hz,1H),3.75-3.68(m,1H),3.48-3.36(m,2H),2.78(dd,J=12.3,2.2Hz,1H),2.68-2.58(m,2H),2.55(s,3H),2.37(dd,J=12.1,9.9Hz,1H),2.22(s,3H),1.85-1.60(m,2H)；1H未觀察到。MS(ESI)m/z：513.3[M+1]+。
將由上述峰2表示之物質(46.7mg,0.072mmol)連同甲酸銨(45.5mg,0.72mmol)、10% Pd/C(10mg)及IPA(7.2mL)一起置於10mL微波小瓶中。密封小瓶並將反應混合物在微波中在110℃下攪拌10min。冷卻反應混合物且然後藉助矽藻土墊過濾以去除Pd及甲酸鹽。在減壓下濃縮濾液。藉由製備型HPLC純化粗產物，從而得到固體狀標題化合物(鏡像異構物2；未知之絕對組態)(20.5mg,50.8%產率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ 8.68(s,1H),8.57(br s,1H),7.96(d,J=1.8Hz,1H),7.90(dd,J=8.0,1.9Hz,1H),7.80-7.75(m,2H),7.74(s,1H),7.27(d,J=7.9Hz,1H),7.22(dd,J=5.1,3.4Hz,1H),4.98(br s,1H),5.08-4.92(m,1H),4.92-4.75(m,2H),4.43(dt,J=14.5,6.7Hz,2H),4.27(ddd,J=12.4,9.3,5.5Hz,1H),3.75-3.68(m,1H),3.48-3.36(m,2H),2.78(dd,J=12.3,2.2Hz,1H),2.68-2.58(m,2H),2.55(s,3H),2.37(dd,J=12.1,9.9Hz,1H),2.22(s,3H),1.85-1.60(m,2H)；1H未觀察到。MS(ESI)m/z：513.3[M+1]+。
實例74 6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-8-(2-(嗎啉-2-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-104)及(S)-6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-8-(2-(嗎啉-2-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-110)
標題化合物係根據實例73使用適當起始材料來製備。鏡像異構物1：1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ 8.62(s,1H),7.96(d,J=1.7Hz, 1H),7.90(dd,J=7.9,1.9Hz,1H),7.78(s,1H),7.77(d,J=1.7Hz,1H),7.72(s,1H),7.28(d,J=8.0Hz,1H),7.25-7.18(m,1H),4.45-4.31(m,2H),3.69(dd,J=10.8,2.6Hz,1H),3.46-3.34(m,2H),3.34-3.24(m,2H),2.93(d,J=4.7Hz,3H),2.80(d,J=11.9Hz,1H),2.62(dd,J=9.6,3.1Hz,2H),2.56(s,3H),2.38(t,J=11.0Hz,1H),2.23(s,3H),1.75(s,2H)。MS(ESI)m/z：471.3[M+1]+。
鏡像異構物2：1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ 8.62(s,1H),8.25(s,1H),7.96(d,J=1.8Hz,1H),7.90(dd,J=8.0,1.9Hz,1H),7.78-7.76(m,2H),7.72(s,1H),7.28(d,J=7.9Hz,1H),7.22(dd,J=5.1,3.4Hz,1H),4.51-4.33(m,2H),3.71(d,J=11.1Hz,1H),3.51-3.36(m,3H),2.93(d,J=4.8Hz,3H),2.88-2.81(m,1H),2.74-2.60(m,2H),2.55(s,3H),2.47-2.38(m,1H),2.23(s,3H),1.85-1.67(m,2H)。MS(ESI)m/z：471.3[M+1]+。
實例74 2-(乙基胺基)-6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-8-(2-(嗎啉-2-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-112)及(S)-2-(乙基胺基)-6-(2-甲基-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-8-(2-(嗎啉-2-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-115)
標題化合物係根據實例73使用適當起始材料來製備。
鏡像異構物1：1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )d 8.68(s,1H),8.57(br s,1H),7.96(d,J=1.8Hz,1H),7.90(dd,J=8.0,1.9Hz,1H),7.81 -7.76(m,2H),7.74(s,1H),7.27(d,J=7.9Hz,1H),7.22(dd,J=5.1,3.4Hz,1H),4.98(br s,1H),4.92-4.77(m,2H),4.61(td,J=6.2,3.5Hz,2H),4.47-4.38(m,1H),4.32-4.23(m,1H),3.71(d,J=11.2Hz,1H),3.48-3.38(m,2H),2.81-2.74(m,1H),2.64(t,J=3.0Hz,1H),2.55(s,2H),2.37(dd,J=12.1,10.0Hz,1H),2.22(s,3H),1.80-1.60(m,2H),1.23(s,3H)。MS(ESI)m/z：485.3[MH]+。
鏡像異構物2：1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )d 8.62(s,1H),7.96(d,J=1.9Hz,1H),7.90(dd,J=7.9,1.9Hz,2H),7.80-7.75(m,2H),7.71(s,1H),7.28(d,J=7.9Hz,1H),7.25-7.19(m,1H),4.43(br s,1H),4.33(br s,1H),3.74-3.62(m,1H),3.48-3.34(m,4H),2.78(d,J=11.0Hz,1H),2.61(dd,J=9.8,3.1Hz,2H),2.56(s,3H),2.37(dd,J=12.0,9.8Hz,2H),2.23(s,3H),1.83-1.64(m,2H),1.20(t,J=7.1Hz,3H)。MS(ESI)m/z：485.3[MH]+。
實例75 6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-8-(2-(嗎啉-2-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-124)及6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基胺基)-8-(2-(嗎啉-2-基)乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-125)
使用類似於實例73之程序使用適當起始材料製備外消旋2-[2-[6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(甲基胺基)-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙基]嗎啉-4-甲酸苄基酯。對掌性SFC分離得到兩種鏡像異 構物：峰1：RT=0.978min峰2：RT=1.409min MS(ESI)m/z：625.2[M+1]+。
將由上述峰1表示之物質(35.9mg,0.057mmol)於二噁烷(2.9mL)及50%水溶液HCl(2.9mL)中之混合物在100℃下攪拌16h。用10% NaOH水溶液鹼化經冷卻反應混合物直至pH約7，並用存於氯仿(3×)中之25%異丙醇萃取反應混合物。用鹽水洗滌合併之有機層，經Na2SO4乾燥，過濾，並在減壓下濃縮。藉由製備型HPLC純化粗產物，從而得到固體狀標題化合物(鏡像異構物1)(11.2mg,35.7%產率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ 8.64(s,1H),8.22(d,J=1.7Hz,1H),8.08(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.91-7.77(m,4H),7.50(d,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=7.4Hz,1H),4.51-4.32(m,2H),4.33-4.19(m,1H),3.78-3.69(m,1H),3.52-3.38(m,2H),2.97-2.83(m,4H),2.77-2.63(m,2H),2.57(s,3H),2.50-2.40(m,1H),1.86-1.65(m,2H)。MS(ESI)m/z：491.2[M+1]+。
將由峰2表示之物質(40mg,0.064mmol)於二噁烷(3.2mL)及50% HCl水溶液(3.2mL)中之混合物在100℃下攪拌16h。用10% NaOH水溶液鹼化經冷卻反應混合物直至pH約7，並用存於氯仿(3×)中之25%異丙醇萃取反應混合物。用鹽水洗滌合併之有機層，經Na2SO4乾燥，過濾，並在減壓下濃縮。藉由製備型HPLC純化粗產物，從而得到固體狀標題化合物(具有未知之絕對組態之鏡像異構物2)(18mg,63.8%產率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.64(s,1H),8.22(d,J=1.8Hz,1H),8.08(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.90-7.77(m,4H),7.50(d,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=7.0Hz,1H),4.50-4.32(m,2H),4.31-4.19(m,1H),3.72-3.66(m,1H),3.46-3.34(m,2H),2.93(d,J=4.9Hz,3H),2.79(d,J=11.3Hz,1H),2.65-2.59(m,2H),2.57(s,3H),2.38(t,J=11.1Hz,1H),1.84-1.64(m,2H)。MS(ESI)m/z：491.2[M+1]+。
實例76 2-(2,2-二氟乙基胺基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-126)
標題化合物(外消旋)係根據實例75使用類似程序使用適當起始材料來製備。1H NMR：(400MHz,DMSO-d 6 )d 8.62(s,1H),7.96(d,J=1.9Hz,1H),7.90(dd,J=8.0,1.9Hz,1H),7.87(br s,1H),7.81-7.73(m,2H),7.71(s,1H),7.28(d,J=7.9Hz,1H),7.22(dd,J=5.1,3.4Hz,1H),4.49-4.39(m,1H),4.39-4.27(m,1H),3.73-3.66(m,1H),3.47-3.34(m,4H),2.83-2.73(m,1H),2.69-2.58(m,2H),2.56(s,3H),2.37(dd,J=12.1,9.8Hz,1H),2.23(s,3H),1.84-1.61(m,2H),1.26-1.13(m,3H)；MS(ESI)m/z：521.3[M+1]+。
實例77 2-胺基-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-(2-嗎啉-2-基乙基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-127)
標題化合物(外消旋)係根據實例75使用類似程序使用適當起始材料來製備。1H NMR：(400MHz,DMSO-d 6 )d 8.64(s,1H),8.22(d,J=1.7Hz,1H),8.08(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.89-7.78(m,3H),7.50(d, J=8.0Hz,1H),7.31(br s,2H),7.28(d,J=7.4Hz,1H),4.41(ddd,J=12.3,9.1,6.3Hz,1H),4.26(ddd,J=12.2,9.1,5.1Hz,1H),3.69(dt,J=11.1,2.6Hz,1H),3.44-3.33(m,2H),2.78(dd,J=12.1,2.3Hz,1H),2.66-2.58(m,2H),2.57(s,3H),2.36(dd,J=12.2,9.9Hz,1H),1.82-1.70(m,1H),1.70-1.59(m,1H)；MS(ESI)m/z：477.2[M+1]+。
實例77 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-((1-(2-羥基乙基)六氫吡啶-4-基)甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-39)
將6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(六氫吡啶-4-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(100mg,0.20mmol)、2-溴乙醇(25mg,0.20mmol)、K2CO3(55mg,0.40mmol)於DMSO(3mL)中之混合物在90℃下加熱1h。然後，濃縮反應混合物，從而得到粗製產物，藉由製備型HPLC純化該產物，從而得到白色固體狀I-39(40.6mg,37%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )：δ 9.16(s,1H),8.64(s,1H),8.57(s,1H),8.27(s,1H),8.15(s,1H),7.99(d,1H),7.83(s,1H),7.55(d,1H),4.32-4.22(m,3H),3.46-3.40(m,4H),2.83(s,2H),2.60(s,3H),2.33(s,2H),1.88-1.86(m,3H),1.54(d,2H),1.34-1.29(m,2H),1.23-1.15(m,3H)。LCMS(ESI)：m/z=534.3[M+1]+。
實例78 2-(乙基胺基)-8-(4-羥基丁基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-73)
步驟1：將4-溴-1-丁醇(3.5當量，1.87mmol)、Cs2CO3(522.0mg,1.60mmol)及6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(200mg,0.53mmol)於無水DMF(5050mg,69.0mmol,5.340mL)中之混合物在室溫下攪拌2.5d。用鹽水洗滌反應混合物併合併有機層，乾燥(Na2SO4)，並在真空中減少。粗製產物8-(4-羥基丁基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-甲基硫基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮未經任何另外純化即用於下一步驟中。MS(ESI)m/z：447.4[M+1]+。
步驟2：經4h在0℃下向於無水DCM(6.7mL)中之8-(4-羥基丁基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-甲基硫基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(235mg,0.53mmol)中逐份添加MCPBA(3.0當量，1.58mmol,353.7mg)。將反應混合物在0℃下攪拌總共4.5h，用飽和NaHCO3(25mL)淬滅，並用DCM(3×30mL)萃取。合併有機層並在真空中濃縮，從而得到粗製8-(4-羥基丁基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-甲基亞磺醯基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮，其未經進一步純化即用於下一步驟中。MS(ESI)m/z：463.4[M+1]+。
步驟3：將8-(4-羥基丁基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-甲基亞磺醯基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(115mg,0.249mmol)、乙胺(2mol/L於THF中，1.24mmol,0.62mL)及DIPEA(4.0當量，1.0mmol,0.173mL)於無水THF(2mL)中之混合物在室溫下攪拌過夜。將反應混合物傾倒入鹽水中並用DCM萃取。去除合併之有機層之溶劑並藉由反相HPLC純化粗製物質。獲得灰白色固體狀2-(乙基胺基)-8-(4-羥 基丁基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(19.6mg,0.043mmol,17%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.62(s,1H),7.96(s,1H),7.90(d,J=8.2Hz,1H),7.77(d,J=4.3Hz,2H),7.71(s,1H),7.28(d,J=7.9Hz,1H),7.26-7.19(m,1H),4.42-4.34(m,1H),4.34-4.25(m,2H),3.46-3.40(m,3H),2.55(s,3H),2.23(s,3H),1.20(t,J=7.4Hz,4H),3.40-3.37(m,1H),1.88-1.62(m,2H),1.58-1.44(m,2H)；MS(ESI)m/z：444.2[M+1]+。
以類似方式製備8-(4-羥基丁基)-6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-81)，只是在步驟3中氧雜環丁-3-胺代替乙胺。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 8.69(s,1H),8.57(s,1H),7.99-7.87(m,2H),7.78(s,1H),7.77-7.72(m,2H),7.32-7.17(m,2H),4.96(s,1H),4.84(s,2H),4.61(t,J=6.2Hz,2H),4.45-4.37(m,1H),4.33-4.24(m,2H),3.49-3.39(m,2H),2.56(s,3H),2.22(s,3H),1.73-1.64(m,2H),1.56-1.44(m,2H)；MS(ESI)m/z：472.23[M+1]+。
以類似方式製備6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-(4-羥基丁基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-36)，只是在步驟1中用6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮代替6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.16(s,1H),8.67-8.62(m,1H),8.60-8.55(m,1H),8.30-8.25(m,1H),8.23-8.12(m,1H),8.02-7.95(m,1H),7.86-7.81(m,1H),7.63-7.52(m,1H),4.44-4.35(m,1H),4.36-4.28(m,2H),3.48-3.38(m,4H),2.60(s,3H),1.74-1.65(m,2H),1.55-1.43(m,2H),1.20(t,J=7.1Hz,3H)；MS(ESI)m/z：465.2[M+1]+。
以類似方式製備6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-(4-羥基丁 基)-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-50)，只是在步驟1中用6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮代替6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮且在步驟3中氧雜環丁-3-胺代替乙基胺。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.19-9.12(m,1H),8.71(s,1H),8.63(s,1H),8.57(s,1H),8.33-8.24(m,1H),8.15(dd,J=8.1,1.8Hz,1H),7.86(s,1H),7.62-7.52(m,1H),4.99-4.94(m,1H),4.84(s,2H),4.61(t,J=6.3Hz,2H),4.44-4.36(m,1H),4.28(t,J=7.5Hz,2H),3.44(q,J=6.0Hz,2H),2.60(s,3H),1.73-1.64(m,2H),1.56-1.42(m,2H)；MS(ESI)m/z：493.17[M+1]+。
以類似方式製備6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-[2-(2-羥基乙氧基)乙基]-2-(氧雜環丁-3-基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-67)，只是用6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮代替6-[2-甲基-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮且在步驟1中藉由2-(2-溴乙氧基)乙醇代替4-溴-1-丁醇且在步驟3中氧雜環丁-3-胺代替乙胺。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.71(s,1H),8.69-8.64(m,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.7Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.87(s,1H),7.62(d,J=7.9Hz,0H),7.55(d,J=8.0Hz,1H),5.14-4.90(m,1H),4.90-4.74(m,3H),4.65-4.57(m,2H),4.54(t,J=5.1Hz,1H),4.51-4.44(m,2H),3.68(t,J=6.6Hz,2H),3.54-3.42(m,4H),2.60(s,3H)；MS(ESI)m/z：509.2[M+1]+。
實例79 6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(3,4-二羥基丁基)-2-(甲基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-80)
步驟1：在室溫下向NaH(60%分散液存於油中，304mg,5.06mmol)於無水DMF(15mL)中之懸浮液中添加6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(2.004g,5.061mmol)並將反應物在50℃下攪拌0.5h。使反應混合物冷卻至RT並添加4-溴丁-1-烯(1.59mL,15.18mmol)於DMF(5mL)中之溶液並在50℃下攪拌16h。使反應混合物冷卻至室溫並用水淬滅並用EtOAc稀釋。分離各層，並將水層萃取至EtOAc(3×)中。乾燥(Na2SO4)合併之有機物，過濾，並將其吸附於矽藻土上。藉由SiO2管柱層析純化粗製殘餘物，從而得到黃色固體狀8-(丁-3-烯-1-基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(1.751g,77%)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ 8.84(s,1H),8.67(s,1H),8.44(s,1H),8.19(d,J=1.6Hz,1H),7.97(dd,J=8.0,1.7Hz,1H),7.69(s,1H),7.51(d,J=8.0Hz,1H),5.97-5.80(m,1H),5.16-4.98(m,2H),4.64-4.53(m,2H),2.66(d,J=2.8Hz,6H),2.57(q,J=7.2Hz,2H)。
步驟2：將8-(丁-3-烯-1-基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(1.316g,2.924mmol)溶解於THF(2.13L/mol,6.23mL)及第三丁醇(0.93mL,9.797mmol)中。添加N-甲基嗎啉-N-氧化物(2.00當量，706.4mg,5.849mmol)隨後鋨酸鉀(VI)二水合物(0.02當量，19.44mg,0.05849mmol)。將反應混合物在室溫下攪拌5h。添加水(6mL)及額外鋨酸鉀(VI)二水合物(20mg,0.058mmol)。將反應混合物於室溫下攪拌過夜。16h後，用飽和Na2S2O3水 溶液淬滅反應混合物。藉由過濾收集固體並用水洗滌且然後風乾，從而得到棕黃色固體狀6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(3,4-二羥基丁基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(1.304g,92%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.16(s,1H),8.94(s,1H),8.58(s,1H),8.30(s,1H),8.18(d,J=8.2Hz,1H),8.06(s,1H),7.60(d,J=8.1Hz,1H),4.56(s,2H),4.44(d,J=27.3Hz,2H),3.57(s,1H),3.41-3.32(m,1H),2.65(s,3H),2.60(s,3H),1.88(s,1H),1.67(s,1H)。
使用實例63中步驟2及3中所闡述之合成順序將步驟2之產物轉化為最終產物。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.64(s,1H),8.57(s,1H),8.27(d,J=1.8Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.8Hz,1H),7.84(s,1H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),4.58-4.44(m,3H),4.35(s,1H),3.55(s,1H),2.93(d,J=4.6Hz,3H),2.60(s,3H),1.86(s,1H),1.64(s,1H)；MS(ESI)m/z：467.16[M+1]+。
實例80 (R)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(3,4-二羥基丁基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-79)
步驟1：在0℃下將DIAD(461mg,2.28mmol)逐滴添加至6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(300mg,0.76mmol)、PPh3(597mg,2.28mmol)及(S)-2-(2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊-4-基)乙醇(333mg,2.28mmol)於無水DMF(30mL)中之混合物中。將混合物在氮下攪拌18h，且然後在真空中濃縮。藉由 SiO2層析用DCM/EtOAc(8：1)洗脫純化粗製產物，從而得到黃色固體狀(S)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊-4-基)乙基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(268mg,67.5%)。LCMS(ESI)：m/z=523.9[M+1]+。
步驟2：將(S)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊-4-基)乙基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(268mg,0.51mmol)及MCPBA(80%,122mg,0.56mmol)於DCM(20mL)中之混合物在室溫下攪拌4h。然後，將混合物傾倒至10% NaHCO3(150mL)中並用DCM(3×50mL)萃取。在真空中濃縮合併之有機物，從而得到黃色固體狀粗製6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(2-((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊-4-基)乙基)-2-(甲基亞磺醯基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(272mg)，其未經純化即用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=539.8[M+1]+。
步驟3：將粗製6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(2-((S)-2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊-4-基)乙基)-2-(甲基亞磺醯基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(272mg,0.49mmol)、乙胺鹽酸鹽(80mg,0.98mmol)及DIPEA(253mg,1.96mmol)於IPA(10mL)中之混合物在50℃下攪拌18h。濃縮反應混合物並藉由SiO2層析使用DCM/EtOAc(1：1)作為洗脫溶劑進行純化，從而得到黃色固體狀(S)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊-4-基)乙基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(213mg,83.6%)。LCMS(ESI)：m/z=521.0[M+1]+。
步驟4：將(S)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊-4-基)乙基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(190mg,0.365mmol)於HOAc(20mL)中之混合物在60℃下攪拌18h。然後，在真空中濃縮反應混合物並藉由製備型HPLC純化，從而得 到白色固體狀目標化合物(49mg,27.9%)。1H NMR(500MHz,MeOH-d 4 )δ 8.97(s,1H),8.61(brs,1H),8.49(s,1H),8.27(d,1H),8.09(dd,1H),7.80(s,1H),7.55(d,1H),4.69-4.64(m,1H),4.56-4.54(m,1H),3.75-3.73(m,1H),3.59-3.52(m,4H),2.67(s,3H),2.02(brs,1H),1.86(brs,1H),1.31(brs,3H)。LCMS(ESI)m/z：481.0[M+1]+。
以類似方式製備(S)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-8-(3,4-二羥基丁基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-83)，只是在步驟1中使用(R)-2-(2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊-4-基)乙醇代替(S)-2-(2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊-4-基)乙醇。1H NMR(500MHz,MeOH-d 4 )δ 8.97(s,1H),8.61(brs,1H),8.49(s,1H),8.26(d,1H),8.08(dd,1H),7.80(s,1H),7.55(d,1H),4.69-4.66(m,1H),4.54(brs,1H),3.74(brs,1H),3.60-3.52(m,4H),2.67(s,3H),2.03-2.00(m,1H),1.87-1.85(m,1H),1.31-1.30(m,3H)；LCMS(ESI)：m/z=481.0[M+1]+。
以類似方式製備6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-8-[(3S)-3,4-二羥基丁基]-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-123)，只是在步驟1中藉由6-[2-氯1-4-(6-甲基-2-吡啶基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮代替6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮。1H NMR(500MHz,MeOH-d 4 )δ 8.61(brs,1H),8.14(d,J=2.0Hz,1H),7.96(dd,J1=2.0,8.0Hz,1H),7.81-7.79(m,2H),7.71(m,1H),7.51(dd,J=3.0,7.5Hz,1H),7.28(d,J=7.5Hz,1H),4.69-4.66(m,1H),4.55-4.54(m,1H),3.74(brs,1H),3.59-3.54(m,4H),2.63(s,3H),2.02(brs,1H),1.86(brs,1H),1.32-1.30(m,3H)；LCMS(ESI)：m/z=479.9[M+1]+。
實例81 8-(2-(3-胺基環丁氧基)乙基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-117)
標題化合物係藉由利用2-(3-(2-羥基乙氧基)環丁基)異吲哚啉-1,3-二酮烷基化6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(DIAD,PPh3)來製備。根據實例80中之程序製備中間體2-(3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙氧基)環丁基)異吲哚啉-1,3-二酮，只是用2-(3-胺基環丁氧基)乙醇代替(S)-2-(2,2-二甲基-1,3-二氧雜環戊-4-基)乙醇。使用標準方案實施乙胺之引入。實現最後去保護藉由將2-(3-(2-(6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)乙氧基)環丁基)異吲哚啉-1,3-二酮(290mg,0.457mmol)及甲胺(20mL,25%於MeOH中之溶液)中之混合物在80℃下加熱3h。濃縮反應混合物並藉由製備型HPLC純化，從而得到白色固體狀8-(2-(3-胺基環丁氧基)乙基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(153mg,66.2%)。1H NMR(500MHz,MeOD-d4)δ 8.98(s,1H),8.60(brs,1H),8.50(s,1H),8.27(d,J=1.5,1H),8.09(dd,J=1.5,8.0,1H),7.80(s,1H),7.55(d,J=7.5,1H),4.66(brs,2H),3.80-3.77(m,1H),3.74(brs,2H),3.57-3.53(m,2H),2.99-2.95(m,1H),2.67(s,3H),2.63-2.58(m,2H),1.70-1.67(m,2H),1.32(brs,3H)。ESIMS：m/z=506.0[M+1]。
實例82 8-(2-((1R,5S,6s)-3-氮雜二環[3.1.0]己-6-基)乙基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-65)
利用(1R,5S,6s)-6-(2-羥基乙基)-3-氮雜二環[3.1.0]己烷-3-甲酸第三丁基酯烷基化6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(DIAD,PPh3)。藉由標準方案實施乙胺之引入及對胺之去保護。1H NMR(400MHz,DMSO-d 6 )δ 9.15(s,1H),8.65(s,1H),8.57(s,1H),8.27(s,1H),8.14(d,J=8.1Hz,1H),7.94(s,1H),7.82(s,1H),7.54(d,J=8.0Hz,1H),4.37(m,2H),3.47-3.37(m,2H),2.69(d,J=10.4Hz,2H),2.60(s,3H),2.54(m,2H),1.62(m,2H),1.21(m,3H),1.06(m,2H),0.64(m,1H)；MS(ESI)m/z：502.2[M+1]+。
實例83 8-(((1R,4R)-4-胺基環己基)甲基)-6-(2-氯-4-(5-甲基噠嗪-3-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-77)
2-(2-氯-4-(5-甲基噠嗪-3-基)苯基)乙酸甲酯-將2-(2-氯-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)乙酸甲酯(682mg,2.2mmol)、3-氯-5-甲基噠嗪(297mg於1.188g二噁烷中，2.3mmol)、KOAc(431mg,4.4mmol)、Pd(dppf)Cl2(160mg,0.22mmol)於二噁烷(22mL)及水(16mL)中之混合物在90℃下在N2下加熱過夜。然後，用EtOAc(100mL)稀釋反應混合物，且用水(50mL)洗滌。用EtOAc(3×30mL)萃取水層。用鹽水(2×50mL)洗滌合併之有機層，乾燥(MgSO4)，過濾並在 真空中濃縮。然後，藉由SiO2層析用PE/EtOAc(55-60%)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色固體狀目標化合物(186mg,30%)。LCMS(ESI)：m/z=277.0[M+1]+。
將2-(2-氯-4-(5-甲基噠嗪-3-基)苯基)乙酸甲酯(186mg,0.67mmol)、(1r,4r)-4-((5-甲醯基-2-(甲基硫基)嘧啶-4-基胺基)甲基)環己基胺基甲酸第三丁基酯(200mg,0.52mmol)、K2CO3(216mg,1.56mmol)及DMF(6mL)之混合物在100℃下在N2下攪拌過夜。然後，將反應混合物傾倒至冷氯化銨溶液中並用EtOAc(3×30mL)萃取。用鹽水(4×30mL)洗滌合併之有機層，乾燥(MgSO4)，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2管柱層析用PE/EtOAc(60%)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色固體狀(1R,4R)-4-((6-(2-氯-4-(5-甲基噠嗪-3-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)環己基胺基甲第三丁基酸酯(202mg,49%)。LCMS(ESI)：m/z=550.8[M-56]+。
藉由標準方案實現乙胺之引入及BOC基團之去除。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )：δ9.14(s,1H),8.66(d,1H),8.29(d,1H),8.22(s,1H),8.18-8.16(m,1H),8.00-7.98(m,1H),7.84(s,1H),7.59-7.57(m,1H),4.18(d,2H),3.40-3.38(m,2H),2.47-2.45(m,1H),2.42(s,3H),1.85(brs,1H),1.74(d,2H),1.62(d,2H),1.23-1.86(m,3H),1.15-1.07(m,2H),0.94-0.86(m,2H)；LCMS(ESI)：m/z=504.1[M+1]+。
實例84 8-((1R,5S,6R)-3-氮雜二環[3.1.0]己-6-基甲基)-6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-82)
步驟1：將DIAD(817mg,4.05mmol)逐滴添加至6-溴-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(250mg,0.92mmol)、(1R,5S,6R)-6-(羥基甲基)-3-氮雜二環[3.1.0]己烷-3-甲酸第三丁基酯(431mg,2.02mmol)及PPh3(1058mg,4.04mmol)於DMF(4mL)中之混合物中，同時將溫度維持在0至5℃之間。將混合物在室溫下攪拌過夜，然後傾倒於冰上水並用EtOAc(3×100mL)萃取。用飽和鹽水(4×100mL)洗滌合併之有機層，乾燥(MgSO4)，過濾並濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/PE梯度(1：10至1：3)洗脫純化殘餘物，從而得到白色固體狀(1R,5S,6S)-6-((6-溴-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-3-氮雜二環[3.1.0]己烷-3-甲酸第三丁基酯(138mg,32%)。LCMS(ESI)：m/z=410.9[M-55]+。
步驟2：將2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基酸(77mg,0.27mmol)、Cs2CO3(132mg,0.405mmol)，並Pd(PPh3)4(16mg,0.014mmol)添加至(1R,5S,6S)-6-((6-溴-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-3-氮雜二環[3.1.0]己烷-3-甲酸第三丁基酯(130mg,0.27mmol)於乙二醇二甲基醚(3mL)、EtOH(2mL)、PhMe(0.3mL)及水(0.6mL)之混合物中之溶液中。將混合物在85℃下加熱過夜，在真空中濃縮並溶解於DCM(50mL)中。然後，用鹽水(2×30mL)洗滌混合物，乾燥(MgSO4)，過濾，在真空中濃縮並藉由SiO2管柱層析用MeOH：DCM(1：40)洗脫進行純化，從而得到淺黃色油狀(1R,5S,6S)-6-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)-3-氮雜二環[3.1.0]己烷-3-甲酸第三丁基酯(55mg,32%)。LCMS(ESI)：m/z=591.1[M+1]+。
藉由標準方案實現乙胺之引入及BOC基團之去除。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )：δ9.16(s,1H),8.65(s,1H),8.57(s,1H),8.27(s,1H),8.16-8.14(m,1H),7.99(s,1H),7.84(s,1H),7.57(d,1H),4.25(d,2H), 3.44-3.37(m,2H),2.81(d,2H),2.67(d,2H),2.60(s,3H),1.57(s,2H),1.26-1.15(m,4H)；MS(ESI)：m/z=488.0[M+1]+。
實例85 6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(六氫吡啶-4-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(I-44)
步驟1：將DIAD(800mg,3.9mmol)逐滴添加至6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(689mg,1.8mmol)、4-(羥基甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(852mg,3.9mmol)及PPh3(1038mg,3.9mmol)於DMF(4mL)中之0℃溶液中。在添加期間將溫度維持在0至5℃之間，且然後將混合物在室溫下攪拌過夜。將混合物傾倒至冰水中並用EtOAc(3×80mL)萃取。用鹽水(4×50mL)洗滌合併之有機層，乾燥(MgSO4)，過濾並濃縮。藉由SiO2層析用EtOAc/PE梯度(1：20至1：10)洗脫純化所獲得殘餘物，從而得到白色固體狀4-((6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(622mg,59%)。LCMS(ESI)：m/z=579.1[M+1]+。
步驟2：將4-((6-(4-溴-2-氯苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(620mg,1.07mmol)、4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-二(1,3,2-二氧硼)(543mg,2.14mmol)、乙酸鉀(420mg,4.28mmol)及Pd(II)(dppf)Cl2(87mg,0.12mol)於二噁烷(13mL)中之混合物在80℃下同時在N2下攪拌過夜。然後，使混合物冷卻至室溫，藉助矽藻土過濾，並濃縮，從而得 到褐色固體狀4-((6-(2-氯-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(1.254g)，其未經進一步純化即直接用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=627.3[M+1]+。
步驟3：將4-((6-(2-氯-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧硼-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(1.25g,2mmol)、Cs2CO3(953mg,2.92mmol)及Pd(PPh3)4(113mg,0.098mmol)添加至2-溴-6-甲基吡啶(341mg,1.98mmol)於乙二醇二甲基醚(11mL)、EtOH(8mL)、PhMe(1.1mL)及水(2.1mL)中之溶液中。將混合物在80℃下攪拌過夜，然後冷卻，用EtOAc(50mL)稀釋，並用鹽水(30mL)洗滌。用EtOAc(2×50mL)萃取水層。合併有機層，用鹽水(50mL)洗滌，乾燥(MgSO4)，過濾並濃縮。藉由SiO2管柱層析用EtOAc/PE梯度(1：5至1：3)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色固體狀4-((6-(2-氯-4-(6-甲基吡啶-2-基)苯基)-2-(甲基硫基)-7-側氧基吡啶并[2,3-d]嘧啶-8(7H)-基)甲基)六氫吡啶-1-甲酸第三丁基酯(314mg,49%，兩個步驟)。LCMS(ESI)：m/z=492.1[M-100]+。
藉由標準方案實現乙胺之引入及BOC基團之去除。1H NMR(500MHz,DMSO-d 6 )：δ8.66(s,1H),8.22(s,1H),8.21-8.07(m,1H),7.97(d,1H),7.86(d,1H),7.82-7.76(m,2H),7.50-7.49(d,1H),7.28(d,1H),4.20(d,2H),3.41-3.37(m,2H),2.90(d,2H),2.52(s,3H),2.36-2.32(m,2H),2.00-1.98(m,1H),1.49(d,2H),1.23-1.17(m,5H)。LCMS(ESI)：m/z=489.1[M+1]+。
實例86 6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-(乙基胺基)-8-[2-(2-側氧基六氫吡嗪-1-基)乙基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-90)
步驟1：在0℃下向NaH(430mg,1.8mmol)於DMF(5mL)中之混合物中添加3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(3.0g,1.5mmol)及2-溴乙腈(1.8g,1.5mmol)。將混合物於室溫下攪拌過夜。然後，用EtOAc(10mL)及H2O(10mL)稀釋反應混合物。用鹽水洗滌經分離有機層，乾燥(Na2SO4)，過濾並在減壓下濃縮。藉由SiO2層析用DCM/MeOH(40：1)洗脫純化殘餘物，從而得到黃色油狀4-(氰基甲基)-3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(3.0g,76%)。LCMS(ESI)：m/z=240.1[M+1]+
步驟2：將4-(氰基甲基)-3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(3.0g,12.5mmol)、PtO2(300mg,1.32mmol)於EtOH(20mL)中之混合物在20℃下在H2(50psi)下攪拌過夜。藉由過濾去除Pd/C觸媒，並在減壓下濃縮濾液，從而得到黃色固體狀4-(2-胺基乙基)-3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯(2.8g,93%)。LCMS(ESI)：m/z=244.2[M+1]+。
藉由將4-氯-2-(甲基硫基)嘧啶-5-甲酸乙酯與4-(2-胺基乙基)-3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯縮合製備4-(2-((2-(乙基胺基)-5-甲醯基嘧啶-4-基)胺基)乙基)-3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯。使用標準方案實施對酯之還原及對所得醇之MnO2氧化，從而得到4-(2-((2-(乙基胺基)-5-甲醯基嘧啶-4-基)胺基)乙基)-3-側氧基六氫吡嗪-1-甲酸第三丁基酯。藉由對4-溴-2-氯苯基乙酸甲酯縮合及之環化及[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]酸之鈀催化之偶合將產物轉化為I-90。1H NMR(500MHz,MeOH-d 4 )：δ 8.96(s,1H),8.59(brs,1H),8.48(s,1H),8.26(s,1H),8.08(d,J=8.0Hz,1H),7.76(s,1H),7.54(d,J=7.5Hz,1H),4.71(m,2H),3.87(m,2H),3.56(m,2H),3.46(t,J=5.0Hz 2H),3.22(m,2H),2.91(t,J=5.0Hz,2H)，2.65(s,3H),1.29(t,J=5.0Hz,3H)；MS(ESI)m/z：519.0[M+1]+。
實例87 2-胺基-8-[((2s,5s)-5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮及2-胺基-8-[((2r,5r)-5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(I-56)
步驟1：在室溫下向NaH(於礦物油中之60%分散液，300mg,7.6mmol)於無水DMF(15mL)中之懸浮液中添加6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(2.0g,5.1mmol)並將反應物在50℃下攪拌0.5h。使反應混合物冷卻至室溫，並添加2-溴乙氧基-第三丁基-二甲基-矽烷(3.6g,3當量，15mmol)於DMF(1mL)中之溶液。使反應物再次升溫至50℃並攪拌16h。在此時段後，使混合物冷卻至室溫，用水淬滅，並用EtOAc(100mL)及水(100mL)稀釋。分離各層且用EtOAc(3×50mL)萃取水層。乾燥(MgSO4)合併之有機部分，過濾，吸附於矽藻土上，並藉由SiO2層析(40g Gold ISCO管柱)用EtOAc/庚烷梯度(20%至80% EtOAc)洗脫進行純化。收集期望產物 且獲得以下產物：8-[2-[第三丁基(二甲基)矽烷基]氧基乙基]-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(323mg,15%產率)；LCMS(ESI)：m/z=554.2(M+)及6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-(2-羥基乙基)-2-甲基硫基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(820mg,37%產率)；LCMS(ESI)：m/z=440.1(M+H+)。
步驟2：將草醯氯(0.24mL,1.5當量，2.80mmol)溶解於無水DCM(0.44M,6.3mL)中並冷卻至-78℃。然後，逐滴添加DMSO(3.0當量，5.59mmol,0.40mL)。將所得混合物再攪拌0.5h，之後逐滴添加存於5mL DCM中之6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-8-(2-羥基乙基)-2-甲基硫基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(820mg,1.864mmol)。在-78℃下將反應混合物再攪拌1h。然後，逐滴添加TEA(5.0當量，9.32mmol,1.30mL)隨後2mL DCM。將混合物攪拌30min，然後升溫至0℃並用水、0.5M KHSO4及鹽水洗滌。後續之乾燥(MgSO4)將在真空中濃縮得到淺黃色固體狀2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙醛(648mg,79%產率)。
步驟3：將2-[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]乙醛(648mg,1.480mmol)吸收於無水CHCl3(20mL)及PhMe(5mL)中，並添加N-[2-羥基-1-(羥基甲基)乙基]胺基甲酸第三丁基酯(10.0當量，14.80mmol,2.83g)隨後無水硫酸鈉(10當量，2.10g)及pTsOH單水合物(0.1當量，0.148mmol,25.7mg)。將所得反應混合物在室溫下攪拌44h且直至該時間僅形成25%產物。添加額外p-TsOH單水合物(0.1當量，0.148mmol,25.7mg)隨後攪拌96h。未注意到明顯改變且用飽和NaHCO3淬滅反應物並用DCM進一步稀釋。分離各相並使用DCM(2×)萃取水層。乾燥(MgSO4)合併之萃取物，過濾並在真空中濃縮。藉由SiO2層析(40g Gold管柱)用MeOH/DCM梯度(0-10% MeOH)洗脫純化粗製產物，從而得到約40mg N-[2-[[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]甲基]-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸第三丁基酯，將其用於下一步驟中。LCMS(ESI)：m/z=611.2(M+)。
步驟4：將N-[2-[[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基硫基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]甲基]-1,3-二噁烷-5-基]胺基第三丁基甲酸酯(約400mg,0.655mmol)溶解於DCM(5mL)中，並使混合物冷卻至0℃。然後，添加MCPBA(1.1當量，0.720mmol,161.4mg)，隨後攪拌1h。用飽和NaHCO3水溶液淬滅反應物並用DCM稀釋。用DCM(2×)萃取混合物並用鹽水溶液(1×)洗滌合併之有機層，乾燥(MgSO4)，過濾並在真空中濃縮，從而得到粗製黃色殘餘物狀N-[2-[[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基亞磺醯基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]甲基]-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸第三丁基酯(163mg,39%產率)，其未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟5：將懸浮於1.5mL THF中之N-[2-[[6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-2-甲基亞磺醯基-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]甲基]-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸第三丁基酯(163mg,0.26mmol)置於6打蘭(dram)閃爍小瓶中。然後，添加氨於MeOH中之溶液(7N,5當量，1.30mmol,0.19mL)。將反應混合物於室溫下攪拌16h時段。在真空中濃縮溶液，從而得到N-[2-[[2-胺基-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]甲基]-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸第三丁基酯，其未經進一步純化即用於下一步驟中。
步驟6. 將含有N-[2-[[2-胺基-6-[2-氯-4-(6-甲基吡嗪-2-基)苯基]-7-側氧基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-8-基]甲基]-1,3-二噁烷-5-基]胺基甲酸第三丁基酯之乾燥產物混合物吸收於1mL DCM中並添加TFA(1mL)。在室溫下攪拌1h並濃縮後，將殘餘物吸收於最少量DMF中並藉由反相HPLC純化。產物2-胺基-8-[(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基]-6-[2-氯-4- (6-甲基吡嗪-2-基)苯基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮(14mg,12%產率，經2個步驟)分離為非鏡像異構物混合物。1H NMR(400MHz,DMSO)δ 9.14(s,1H),8.64(s,1H),8.59(d,J=17.3Hz,1H),8.26(d,J=1.6Hz,1H),8.15(dd,J=8.0,1.5Hz,1H),7.81(d,J=17.0Hz,1H),7.56(d,J=8.0Hz,1H),7.37(s,2H),5.07(t,J=5.3Hz,1H),5.01-4.88(m,1H),4.46(dd,J=10.8,5.5Hz,2H),3.91(dd,J=10.9,4.9Hz,1H),3.75(dd,J=40.7,11.1Hz,3H),3.11(t,J=10.8Hz,1H),2.60(s,3H),2.57(s,1H)；LCMS(ESI)：(M+H+)m/z=480.2。
實例88
經由若干途徑投與之標的化合物之醫藥組合物可如此實例中所闡述來製備。
用於經口投與之組合物(A)
混合該等成份並將其分配至膠囊中，每一膠囊含有約100mg成份；一粒膠囊將約為總日劑量。
用於經口投與之組合物(B)
使用諸如甲醇等溶劑來合併並粒化該等成份。然後，乾燥調配物並使用適當製錠機使其形成錠劑(含有約20mg活性化合物)。
用於經口投與之組合物(C)
混合該等成份以形成用於經口投與之懸浮液。
非經腸調配物(D)
將活性成份溶解於一部分注射用水中。然後，在攪拌下添加足量氯化鈉以使溶液等滲。使用剩餘注射用水補足溶液重量，藉助0.2微米膜過濾器過濾並在無菌條件下封裝。
栓劑調配物(E)
將各成份溶化在一起並在蒸汽浴上混合，並將其傾倒至含有2.5 g總重量之模具中。
局部調配物(F)
合併除水外之所有成份並在攪拌下加熱至約60℃。然後在約60℃下在劇烈攪拌下添加足量水以乳化各成份，且然後添加水補足約100g。
若適當，以特定形式或根據用於實施所揭示功能之方式或用於達成所揭示結果之方法或製程表達之在上述說明書或以下申請專利範圍中所揭示的特徵，可單獨地或以該等特徵之任一組合用於實現呈多種形式之本發明。
出於清楚及瞭解之目的，已藉助闡釋及實例相當詳細地闡述了上述發明。熟習此項技術者應明瞭，可在隨附申請專利範圍之範圍內進行改變及修改。因此，應瞭解，上文闡述意欲具有闡釋性而非具有限制性。因此，本發明範圍不應參照上文闡述來確定，而應參照以下 隨附申請專利範圍以及該等申請專利範圍能擁有之全部等效內容範圍來確定。
在本文中所提及之專利、公開申請案及科學文獻可確立熟習此項技術者之認知且其全部內容皆以引用方式併入本文中，其併入程度如同每一專利、公開申請案及科學文獻明確地且個別地指明以引用方式併入一般。當在本文所引用任一參考文獻與本說明書之特定教示內容之間出現任何衝突時，應以本說明書之特定教示內容為凖。同樣，當在詞語或片語之業內所瞭解定義與該詞語或片語在本說明書中特定教示之定義之間出現任何衝突時，應以本說明書中特定教示之定義為凖。

Claims (22)

  1. 一種式I化合物， 其中：R 1 係H、C1-3烷基、C1-3氟烷基、氧雜環丁-3-基或3-甲基-氧雜環丁-3-基；R 2 係(i)C2-6羥基烷基或C2-6二羥基烷基，(ii)(伸烷基) n NR a R b ，其中該伸烷基鏈視情況經羥基取代，(iii)(伸烷基)1-3 OR 5 ，其中R 5 係(伸烷基)2-4NR a R b 、(伸烷基)2-4 OR f ，或選自氮雜環丁烷、吡咯啶、六氫吡啶或氮呯之雜環，該雜環視情況經C1-6烷基取代，(iv)(伸烷基) r C(O)NR a R b ，(v)(伸烷基)n-CN，(vi)(伸烷基)t-(C4-6-環烷基NR c R d )，(vii)雜環基-(伸烷基)n，其中雜環基係指經取代之氮雜環丁基、吡咯啶基、4,4-二氟-吡咯啶-3-基、六氫吡啶基、3,3-二氟-六氫吡啶-3-基、氮呯基、嗎啉基、4-甲基嗎啉-2-基、5-胺基-1,3-二氧雜環戊-2-基、5-甲基胺基-1,3-二氧雜環戊-2-基、3-氮雜-二環[3.1.0]己-6-基、5-氧雜-2-氮雜螺[3.4]辛-7-基、1-氧雜-8-氮雜螺[4.5]癸-3-基、1-氧雜-7-氮雜螺[4.4]壬-3-基、5,9-二氧雜-2-氮雜螺[3.5]壬-7-基、1,1-二側氧基(oxo)1-4-噻嗪烷(thiazinan)-2-基或六氫吡嗪基，該雜環基部分視情況經C(=O)CHR f NH2、側氧基、羥基、胺基、C1-3烷基胺基、C1-3二烷基胺基、氰基、氧雜 環丁-3-基或C1-6-羥基烷基取代，或(viii)(伸烷基) r S(O)2 R 5 ，其中R 5 係(伸烷基)0-3NR a R b 氮雜環丁基、吡咯啶基或六氫吡啶基；或(ix)1-亞胺基-1-氧雜-四氫硫吡喃基(thianyl)-4-基或1,1-二側氧基(dioxido)四氫-2H-硫吡喃-4-基；R a 及R b (a)在每次出現時獨立地係氫、C1-3烷基、C2-4胺基烷基、C2-4-羥基烷基、吡咯啶基、六氫吡啶基或氮雜環丁基，或(b)R a 及R b 與其所連接之氮一起形成視情況含有另一選自O、NR e 或S(O)0-2之雜原子之4員至7員單環或二環，該環視情況經一或兩個羥基或(CH2)0-2N(R f )2取代；R c 及R d 在每次出現時獨立地係氫、C1-3烷基或氧雜環丁基；R e 係氫、C1-3烷基或C1-3烷基磺醯基；R f 係氫或C1-3烷基；R 3 係雜芳基，其中該雜芳基環係吡啶-2-基、吡嗪-2-基、噻唑-4-基、噻唑-2-基、吡唑-3-基、1,2,4-三唑-2-基或1,2,4-噁二唑-3-基，各視情況經R 4 或C1-3羥基烷基部分取代；R 4 係C1-6烷基、環丙基或鹵素；n為2至6；r係1至6；s為0、1或2；t為0至6；或其醫藥上可接受之鹽，限制條件係該式I化合物不為：8-(反式-4-胺基環己基)-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡嗪基)苯基]-2-(乙基胺基)-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮，8-(反式-4-胺基環己基)-6-[2-氯-4-(6-甲基-2-吡嗪基)苯基]-2-[(1-甲基乙基)胺基]-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮， 6-(2-氯-4-(5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基)苯基)-2-(乙基胺基)-8-(六氫吡啶-4-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮，或，6-(2-氯-4-(5-甲基-1,2,4-噁二唑-3-基)苯基)-2-(異丙基胺基)-8-(六氫吡啶-4-基甲基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮。
  2. 如請求項1之化合物，其中R 2 係(CH2) n NR a R b 。
  3. 如請求項1之化合物，其中R 2 係(伸烷基)1-3OR 5 ，其中R 5 係(伸烷基)2-4NR a R b 或視情況經取代之選自氮雜環丁烷、吡咯啶、六氫吡啶或氮呯之雜環。
  4. 如請求項1之化合物，其中R 2 係(CH2) r C(O)NR a R b 。
  5. 如請求項1之化合物，其中R 2 係：
  6. 如請求項1之化合物，其中R 2 係選自(i)至(viii)：
  7. 如請求項6之化合物，其中R 2 係2-嗎啉-2-基乙基或2-嗎啉-2-基甲基。
  8. 如請求項6之化合物，其中R 2 係2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)乙基或2-(5-胺基-1,3-二噁烷-2-基)甲基。
  9. 如請求項6之化合物，其中R 2 係(3 3-二氟-4-六氫吡啶基)甲基或(3 3-二氟-4-六氫吡啶基)乙基。
  10. 如請求項2至9中任一項之化合物，其中R 3 係視情況經取代之吡嗪基且R 4 係2-氯或2-甲基。
  11. 如請求項2至9中任一項之化合物，其中R 3 係視情況經取代之吡啶基且R 4 係2-氯或2-甲基。
  12. 如請求項1之化合物，其係選自表I中之化合物I-1至I-202。
  13. 一種如請求項1至12中任一項之化合物之用途，其用於製造用以抑制有需要患者之PAK活性之醫藥。
  14. 一種如請求項1至12中任一項之化合物之用途，其用於製造用以治療有需要患者之癌症或過度增殖病症或改善其嚴重性之醫藥。
  15. 如請求項14之用途，其中該癌症或過度增殖病症係選自由以下組成之群：腺瘤、膀胱癌、腦癌、乳癌、結腸癌、表皮癌、濾泡癌、生殖泌尿道之癌症、神經膠質母細胞瘤、霍奇金氏病(Hodgkin's disease)、頭頸癌、肝細胞瘤、角質棘皮瘤、腎癌、大細胞癌、白血病、肺腺癌、肺癌、淋巴病症、黑色素瘤及非黑色素瘤皮膚癌、骨髓發育不良症候群、神經母細胞瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、卵巢癌、乳突狀癌、胰臟癌、前列腺癌、直腸癌、肉瘤、小細胞癌、睪丸癌、畸胎癌(tetracarcinomas)、甲狀腺癌及未分化性癌。
  16. 如請求項15之用途，其中該癌症或過度增殖病症係選自由以下組成之群：肺癌、乳癌、卵巢癌、膀胱癌及頭頸癌。
  17. 如請求項14之用途，其中該癌症或過度增殖病症係選自由以下組成之群：原發性乳腺癌、鱗狀非小細胞肺癌或鱗狀頭頸癌。
  18. 如請求項14之用途，其中該醫藥係與至少一種用於治療或改善癌症或過度增殖病症之其他化學治療劑共投與。
  19. 如請求項18之用途，其中該其他化學治療劑係選自由以下組成 之群：細胞凋亡蛋白質之抑制劑(IAP)、EGFR抑制劑或拮抗劑、Ras/Raf/Mek/Erk信號傳導級聯之抑制劑、Akt激酶之抑制劑及Src激酶抑制劑。
  20. 一種組合物，其包含如請求項1至12中任一項之化合物及至少一種醫藥上可接受之載劑、賦形劑或稀釋劑。
  21. 如請求項1至9中任一項之化合物，其在治療癌症或過度增殖病症中用作p21活化激酶(PAK)抑制劑。
  22. 一種如請求項1至12中任一項之化合物之用途，其用於製造用以抑制異常細胞生長或用以治療哺乳動物之過度增殖病症之醫藥。
TW103125595A 2013-07-26 2014-07-25 絲胺酸／蘇胺酸激酶抑制劑 TW201516045A (zh)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201361859050P 2013-07-26 2013-07-26
US201461924597P 2014-01-07 2014-01-07

Publications (1)

Publication Number Publication Date
TW201516045A true TW201516045A (zh) 2015-05-01

Family

ID=51260846

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
TW103125595A TW201516045A (zh) 2013-07-26 2014-07-25 絲胺酸／蘇胺酸激酶抑制劑

Country Status (2)

Country Link
TW (1) TW201516045A (zh)
WO (1) WO2015011252A1 (zh)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2015296322B2 (en) 2014-07-26 2019-09-19 Sunshine Lake Pharma Co., Ltd. 2-amino-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8h)-one derivatives as CDK inhibitors and uses thereof
KR20180052762A (ko) 2015-09-22 2018-05-18 글락소스미스클라인 인털렉츄얼 프로퍼티 (넘버 2) 리미티드 브로모도메인 억제제로서 사용하기 위한 피리디논 디카르복스아미드
CN107778242B (zh) * 2017-09-29 2020-05-05 南京药石科技股份有限公司 一种8-烷氧羰基-7-氧代氮杂螺[5.5]十一烷-n-羧酸叔丁酯的合成方法
CN108373472B (zh) * 2018-04-25 2021-03-16 西南大学 一种含原卟啉的杀菌材料及其制备方法和应用
CN112142733A (zh) * 2020-10-16 2020-12-29 湖南师范大学 一种泛fgfr共价抑制剂prn1371的合成路线

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2776770A1 (en) * 2009-10-09 2011-04-14 Afraxis, Inc. 8-ethyl-6-(aryl)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8h)-ones for the treatment of cns disorders
CA2854471A1 (en) * 2011-11-04 2013-05-10 Afraxis Holdings, Inc. Pak inhibitors for the treatment of cell proliferative disorders

Also Published As

Publication number Publication date
WO2015011252A1 (en) 2015-01-29

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR101961500B1 (ko) 세린/트레오닌 키나제 억제제
CN114901660B (zh) 可作为t细胞活化剂的经取代双环化合物
US20240417412A1 (en) Heterocyclic compounds and methods of use
CN115297861A (zh) 化合物及其用途
JP2024513881A (ja) オキサゼピン化合物及びがんの治療におけるその使用
TWI608002B (zh) 布魯頓氏（ｂｒｕｔｏｎ’ｓ）酪胺酸激酶之聯芳基抑制劑
KR20220100879A (ko) Fgfr 저해제로서의 이환식 헤테로사이클
KR20250013185A (ko) 아자-테트라시클릭 옥사제핀 화합물 및 이의 용도
JP2022548822A (ja) がんの治療における使用のためのヘテロ環式化合物
CN118556063A (zh) 杂环类化合物、药物组合物及其应用
CN112166110A (zh) Shp2磷酸酶抑制剂及其使用方法
CN110678466A (zh) 作为hpk1抑制剂的二氮杂萘类
CN112105385A (zh) Irak降解剂和其用途
TW201514145A (zh) 作為ｂｔｋ抑制劑的初級甲醯胺
TWI557126B (zh) 絲胺酸／蘇胺酸激酶抑制劑
CN117881683A (zh) PI3Kα抑制剂及其使用方法
CN112236428A (zh) 抗增殖化合物及其用途
TW201516045A (zh) 絲胺酸／蘇胺酸激酶抑制劑
EP4584274A1 (en) Heterobifunctional compounds and methods of treating disease
US20240239807A1 (en) Sars-cov2 main protease inhibitors
CN104011050A (zh) 作为丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂的2,4-二氨基-嘧啶衍生物
US20150031674A1 (en) Serine/threonine kinase inhibitors
CN117881397A (zh) 杂环化合物及使用方法
HK40044087B (zh) Shp2磷酸酶抑制剂及其使用方法
HK40044087A (zh) Shp2磷酸酶抑制剂及其使用方法