Claims (16)
1. Способ определения наличия дуплексов олигонуклеотидных комплементарных молекул, включающий: а.) конструирование множества различных олигонуклеотидных молекул, каждая с определенной длиной и, каждая, обладающая определенной последовательностью оснований; b.) получение матрицы, обладающей множеством ячеек, адаптированных для принятия и иммобилизации олигонуклеотидных молекул; с.) иммобилизацию различных олигонуклеотидных молекул в ячейках для заполнения этих ячеек; d.) контактирование заполненных в данный момент ячеек с одноцепочечными олигонуклеотидными молекулами с образованием дуплекса; е.) контактирование образованного дуплекса с интеркалирующим агентом; и f.) наблюдение уровней флуоресценции, излучаемой из контактируемого в данный момент дуплекса.1. A method for determining the presence of duplexes of oligonucleotide complementary molecules, comprising: a.) Constructing a variety of different oligonucleotide molecules, each with a certain length and each having a certain sequence of bases; b.) obtaining a matrix having a plurality of cells adapted to accept and immobilize oligonucleotide molecules; c.) immobilization of various oligonucleotide molecules in the cells to fill these cells; d.) contacting the currently filled cells with single-stranded oligonucleotide molecules to form a duplex; e.) contacting the formed duplex with an intercalating agent; and f.) observing the levels of fluorescence emitted from the currently in contact duplex.
2. Способ по п. 1, где определенную длину различных олигонуклеотидных молекул выбирают в пределах между, приблизительно, 5 нуклеотидами и 30 нуклеотидами. 2. The method of claim 1, wherein the specific length of the various oligonucleotide molecules is selected between between about 5 nucleotides and 30 nucleotides.
3. Способ по п. 1, где матрица состоит из полиакриламида. 3. The method according to claim 1, where the matrix consists of polyacrylamide.
4. Способ по п. 1, где интеркалирующий агент выбирают из группы, состоящей из этидийбромида, пропидиййодида, гомодимера тиазолового оранжевого, гомодимера оксазолового желтого, и их сочетаний. 4. The method of claim 1, wherein the intercalating agent is selected from the group consisting of ethidium bromide, propidium iodide, thiazole orange homodimer, yellow oxazole homodimer, and combinations thereof.
5. Способ по п. 1, где флуоресценцию наблюдают в пределах 1 минуты после произошедшего дуплексирования. 5. The method according to p. 1, where fluorescence is observed within 1 minute after the occurrence of duplexing.
6. Способ по п. 1, где интеркалирующий агент ковалентно присоединяют к иммобилизованному олигомеру. 6. The method of claim 1, wherein the intercalating agent is covalently attached to the immobilized oligomer.
7. Способ по п. 6, где первый уровень флуоресценции наблюдают после иммобилизации на матрице олигонуклеотидных молекул. 7. The method according to claim 6, where the first level of fluorescence is observed after immobilization on the matrix of oligonucleotide molecules.
8. Способ по п. 1, где интеркалирующий агент ковалентно присоединяют к одноцепопечным олигонуклеотидным молекулам. 8. The method of claim 1, wherein the intercalating agent is covalently attached to single chain oligonucleotide molecules.
9. Способ по п. 1, где данный интеркалирующий агент добавляют после образования дуплекса. 9. The method of claim 1, wherein the intercalating agent is added after duplexing.
10. Способ конструирования олигонуклеотидных матриц, включающий: а.) удерживание светочувствительной жидкости на поверхности; b.) экспонирование указанной светочувствительной жидкости с освещенным образцом для того, чтобы заставить данную экспонируемую на свету жидкость слиться в дискретные единицы и прилипнуть к данной поверхности; с.) и контактирование каждой из единиц с набором различных олигонуклеотидных молекул с тем, чтобы дать возможность этим молекулам диспергировать в данные единицы. 10. A method for constructing oligonucleotide matrices, comprising: a.) Holding a photosensitive liquid on a surface; B. C.) and contacting each of the units with a set of different oligonucleotide molecules in order to enable these molecules to disperse into these units.
11. Способ по п. 10, где светочувствительная жидкость включает раствор метиленового синего, раствор акриламида и TEMED. 11. The method according to p. 10, where the photosensitive liquid includes a solution of methylene blue, a solution of acrylamide and TEMED.
12. Способ по п. 10, где светочувствительный образец состоит из рядов квадратов. 12. The method according to p. 10, where the photosensitive sample consists of rows of squares.
13. Способ по п. 12, где данные квадраты имеют размеры в диапазоне от, между, 25 микрон на 25 микрон до 1000 микрон на 1000 микрон. 13. The method according to p. 12, where these squares have sizes ranging from, between, 25 microns per 25 microns to 1000 microns per 1000 microns.
14. Способ по п. 10, где стадии экспонирования указанной светочувствительной жидкости с освещенным образцом осуществляют так, чтобы заставить данную жидкость, экспонируемую на свету, сливаться в дискретные единицы, а прилипание к данной поверхности далее включает а) обеспечение прозрачного субстрата с первой стороной и второй стороной; b.) нанесение светонепроницаемой фотомаски на указанную первую сторону подложки; с.) удаление заранее определенных частей этой фотомаски для воздействия на заранее определенный образец; d.) контактирование указанной первой стороны указанной подложки со светочувствительной жидкостью; е.) экспонирование указанной второй стороны указанной подложки на свету так, чтобы заставить жидкость, сопоставленную с указанным образцом, сливаться в капли; и f.) исключение указанного освещения. 14. The method according to p. 10, where the stage of exposure of the specified photosensitive liquid with an illuminated sample is carried out so as to make this liquid exposed to light, merge into discrete units, and adhesion to this surface further includes a) providing a transparent substrate with the first side and second side; b.) applying a lightproof photomask to said first side of the substrate; c.) the removal of predetermined parts of this photomask to affect a predetermined sample; d.) contacting said first side of said substrate with a photosensitive liquid; e.) exposing said second side of said substrate to light so as to cause the liquid matched with said sample to merge into droplets; and f.) the exclusion of the specified lighting.
15. Способ по п. 10, где длина волны света находится в пределах ультрафиолетовой области. 15. The method according to p. 10, where the wavelength of light is within the ultraviolet region.
16. Способ по п. 15, где ультрафиолетовый свет имеет длину волны 312 нанометров. 16. The method of claim 15, wherein the ultraviolet light has a wavelength of 312 nanometers.