RU2819204C2 - Cd73 blocking antibodies - Google Patents
Cd73 blocking antibodies Download PDFInfo
- Publication number
- RU2819204C2 RU2819204C2 RU2021129218A RU2021129218A RU2819204C2 RU 2819204 C2 RU2819204 C2 RU 2819204C2 RU 2021129218 A RU2021129218 A RU 2021129218A RU 2021129218 A RU2021129218 A RU 2021129218A RU 2819204 C2 RU2819204 C2 RU 2819204C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- ser
- antibody
- val
- thr
- gly
- Prior art date
Links
Images
Abstract
Description
ССЫЛКА НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИLINK TO RELATED APPLICATIONS
Настоящая заявка испрашивает приоритет на основании предварительной заявки на патент США № US 62/837214, поданной 23 апреля 2019 г., которая полностью включена в данную заявку посредством ссылки, включая все чертежи.This application claims benefit from U.S. Provisional Patent Application No. US 62/837214, filed April 23, 2019, which is incorporated herein by reference in its entirety, including all drawings.
ССЫЛКА НА ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙLINK TO LIST OF SEQUENCES
Настоящая заявка подана вместе с Перечнем последовательностей в электронном формате. Перечень последовательностей предоставлен в виде файла, названного «CD73-6_ST25», созданного 1 апреля 2020 г., размер которого составляет 62 килобайта. Информация в электронном формате о Перечне последовательностей полностью включена в данную заявку посредством ссылки.This application is filed together with the Sequence Listing in electronic format. The sequence listing is provided as a file named "CD73-6_ST25", created on April 1, 2020, which is 62 kilobytes in size. The electronic format information on the Sequence Listing is incorporated herein by reference in its entirety.
ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИTECHNICAL FIELD
В соответствии с настоящим изобретением предложены антитела и их фрагменты, которые связывают и ингибируют CD73. В соответствии с настоящим изобретением также предложены клетки, продуцирующие такие соединения; способы получения таких соединений и антител, их фрагментов, вариантов и производных; фармацевтические композиции, содержащие их; способы применения соединений для диагностики, лечения или профилактики заболеваний, например, рака.The present invention provides antibodies and fragments thereof that bind and inhibit CD73. The present invention also provides cells that produce such compounds; methods for producing such compounds and antibodies, fragments, variants and derivatives thereof; pharmaceutical compositions containing them; methods of using the compounds for the diagnosis, treatment or prevention of diseases, such as cancer.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИBACKGROUND OF THE ART
CD73 (экто-5'-нуклеотидаза) представляет собой заякоренный гликозилфосфатидилинозитолом (ГФИ) белок размером 70 кДа, который обычно экспрессируется на эндотелиальных клетках и субпопуляциях гематопоэтических клеток. CD73, вместе с CD39, регулирует метаболизм аденозинтрифосфата (АТФ). CD39 (НТФДаза-1) превращает АТФ в АМФ, причем высвобождаются только следовые количества АДФ, тогда как CD73 катализирует превращение АМФ в аденозин.CD73 (ecto-5'-nucleotidase) is a 70 kDa glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored protein that is typically expressed on endothelial cells and subsets of hematopoietic cells. CD73, together with CD39, regulates adenosine triphosphate (ATP) metabolism. CD39 (NTPDase-1) converts ATP to AMP, releasing only trace amounts of ADP, while CD73 catalyzes the conversion of AMP to adenosine.
Аденозинтрифосфат (АТФ) и его метаболиты АМФ и аденозин играют важную роль в клеточном метаболизме, передаче сигналов и иммунном гомеостазе. Высвобождение внеклеточных аденозинтрифосфатов (АТФ) в ответ на гибель клеток или клеточный стресс приводит к активации иммунных ответов. Тем не менее, их метаболит аденозин проявляет иммуносупрессорную активность. Внеклеточный аденозин накапливается в раковых тканях и является частью важного механизма ускользания опухоли от иммунного ответа. Среди других эффектов, аденозин, происходящий из опухоли, сильно ингибирует инфильтрирующие опухоль эффекторные Т-клетки через рецепторы А2А, активирующие аденилатциклазу.Adenosine triphosphate (ATP) and its metabolites AMP and adenosine play important roles in cellular metabolism, signal transduction, and immune homeostasis. The release of extracellular adenosine triphosphates (ATP) in response to cell death or cellular stress leads to the activation of immune responses. However, their metabolite adenosine exhibits immunosuppressive activity. Extracellular adenosine accumulates in cancer tissues and is part of an important tumor immune evasion mechanism. Among other effects, tumor-derived adenosine potently inhibits tumor-infiltrating effector T cells via A2A receptors that activate adenylate cyclase.
Сообщали об экспрессии CD73 в различных опухолевых клетках, включая клетки лейкоза, рака мочевого пузыря, глиомы, глиобластомы, рака яичников, меланомы, рака предстательной железы, рака щитовидной железы, рака пищевода и рака молочной железы. Экспрессия CD73 также была ассоциирована с прометастатическим фенотипом при меланоме и раке молочной железы. Сообщалось, что терапия антителом, которое связывает CD73 мыши, может ингибировать рост и метастазирование опухоли молочной железы у мышей (Stagg, и др. (2010) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104:1547-1552). Было показано, что генетическая делеция рецепторов А2А может вызывать зависимое от Т-клеток отторжение опухоли (Ohta, и др., (2006) Proc Natl Acad Sci USA 103:13132-13137). Нокдаун с применением миРНК или сверхэкспрессия CD73 на опухолевых клетках может модулировать рост и метастазирование опухоли (Beavis и др., 2013, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 110:14711 -716; Stagg и др. (2010), выше; Jin и др. (2010) Cancer Res. 70: 2245-55). Мыши CD73-/-защищены от трансплантированных и спонтанных опухолей (Stagg и др. (2010) Cancer Res. 71: 2892-2900). Было показано, что у людей высокая экспрессия CD73 является отрицательным прогностическим фактором при трижды негативном раке молочной железы (Loi и др., 2013, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 110: 11091-11096). Тем не менее, хотя CD73 экспрессируется на опухолевых клетках, он также экспрессируется на различных клетках иммунной системы, в частности, на CD4 и CD8 Т-клетках, а также на В-клетках. Кроме того, еще одним осложняющим фактором является то, что многие антитела, описанные в литературе, как правило, принадлежали к изотипам мыши, с которыми способны связываться рецепторы Fcγ, что мешает отличить любой потенциально блокирующий эффект от Fc-опосредованных эффектов.CD73 expression has been reported in various tumor cells, including leukemia, bladder cancer, glioma, glioblastoma, ovarian cancer, melanoma, prostate cancer, thyroid cancer, esophageal cancer, and breast cancer. CD73 expression has also been associated with a prometastatic phenotype in melanoma and breast cancer. It has been reported that therapy with an antibody that binds mouse CD73 can inhibit mammary tumor growth and metastasis in mice (Stagg, et al. (2010) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104:1547-1552). It has been shown that genetic deletion of A2A receptors can cause T cell-dependent tumor rejection (Ohta, et al., (2006) Proc Natl Acad Sci USA 103:13132-13137). SiRNA knockdown or overexpression of CD73 on tumor cells can modulate tumor growth and metastasis (Beavis et al., 2013, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 110:14711 -716; Stagg et al. (2010), supra; Jin et al. (2010) Cancer Res. 70: 2245-55). CD73-/- mice are protected against transplanted and spontaneous tumors (Stagg et al. (2010) Cancer Res. 71: 2892-2900). In humans, high CD73 expression has been shown to be a negative prognostic factor in triple-negative breast cancer (Loi et al., 2013, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 110: 11091-11096). However, although CD73 is expressed on tumor cells, it is also expressed on various cells of the immune system, particularly CD4 and CD8 T cells, as well as B cells. Additionally, another complicating factor is that many of the antibodies described in the literature tended to be of mouse isotypes that Fcγ receptors are able to bind, making it difficult to distinguish any potential blocking effect from Fc-mediated effects.
Несмотря на давний интерес к CD73 в качестве терапевтической мишени, сохраняется потребность в антителах с более высокой эффективностью ингибирования ферментативной активности CD73, которые пригодны для применения в терапии человека.Despite the long-standing interest in CD73 as a therapeutic target, there remains a need for antibodies with higher potency in inhibiting CD73 enzymatic activity that are suitable for use in human therapy.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯBRIEF DESCRIPTION OF THE INVENTION
Авторы настоящего изобретения предлагают антитела, которые связываются с эпитопом, присутствующим на CD73, экспрессированном на поверхности клеток, включая опухолевые клетки, и которые ингибируют ферментативную (экто-5'нуклеотидазную) активность фермента CD73. Указанные антитела содержат каркасные области человеческого происхождения с минимальным содержанием последовательности нечеловеческого происхождения (например, из мыши). Антитела могут связывать CD73 внутридимерным способом и могут ингибировать ферментативную активность как растворимого CD73, так и связанного с мембраной белка CD73, экспрессированного на поверхности клеток. Предпочтительно, данные антитела можно применять в качестве исключительно блокирующих CD73 антител, например, они ингибируют ферментативную активность связанного с мембраной белка CD73, экспрессированного на поверхности клеток, по существу не связывая Fcγ-рецепторы и/или по существу не направляя АЗКЦ на экспрессирующую CD73 клетку. Необязательно антитела сохраняют домен Fc и сохраняют связывание с FcRn человека. Предпочтительно, у указанных антител может быть низкий риск иммуногенности, например, низкая или пониженная (по сравнению с исходным антителом мыши) вероятность вызвать ответ антител человека против антител мыши (НАМА) при введении человеку.The present inventors provide antibodies that bind to an epitope present on CD73 expressed on the surface of cells, including tumor cells, and that inhibit the enzymatic (ecto-5'nucleotidase) activity of the CD73 enzyme. These antibodies contain framework regions of human origin with minimal sequence of non-human origin (eg, mouse). Antibodies can bind CD73 in an intradimeric manner and can inhibit the enzymatic activity of both soluble CD73 and membrane-associated CD73 protein expressed on the cell surface. Preferably, these antibodies can be used as purely CD73 blocking antibodies, for example, they inhibit the enzymatic activity of the membrane associated CD73 protein expressed on the surface of cells without substantially binding Fcγ receptors and/or without substantially targeting ADCC to the CD73 expressing cell. Optionally, the antibodies retain the Fc domain and retain binding to human FcRn. Preferably, said antibodies may have a low risk of immunogenicity, eg, a low or reduced likelihood (compared to the parent mouse antibody) of eliciting a human anti-mouse antibody (HAMA) response when administered to a human.
Антитела связываются с эпитопом, присутствующим на полипептиде CD73 человека, экспрессированном на поверхности клеток, включая, но не ограничиваясь опухолевыми клетками, и ингибируют ферментативную (экто-5'-нуклеотидазную) активность фермента CD73. Они обладают особенно предпочтительной способностью ингибировать подавление пролиферации Т-клеток, опосредованное CD73, и, следовательно, могут вызывать повышение биологической активности, включая, но не ограничиваясь пролиферацией, цитотоксических CD4 и/или CD8 Т-клеток, например, которое наблюдают в анализе пролиферации Т-клеток. В одном варианте реализации ингибирование или нейтрализацию ферментативной активности CD73 определяют путем оценки способности антитела или фрагмента антитела повышать пролиферацию Т-клеток, когда вызвана пролиферация указанных Т-клеток in vitro (например, посредством костимуляции TCR) в присутствии АМФ (например, экзогенно добавленного АМФ).The antibodies bind to an epitope present on the human CD73 polypeptide expressed on the surface of cells, including but not limited to tumor cells, and inhibit the enzymatic (ecto-5'-nucleotidase) activity of the CD73 enzyme. They have a particularly advantageous ability to inhibit CD73-mediated suppression of T cell proliferation and may therefore cause an increase in biological activity, including, but not limited to, proliferation of cytotoxic CD4 and/or CD8 T cells, for example, as observed in the T proliferation assay -cells. In one embodiment, inhibition or neutralization of CD73 enzymatic activity is determined by assessing the ability of an antibody or antibody fragment to enhance T cell proliferation when said T cells are induced to proliferate in vitro (e.g., through TCR costimulation) in the presence of AMP (e.g., exogenously added AMP) .
В одном варианте реализации предложено антитело или фрагмент антитела, или их антигенсвязывающий домен, содержащий вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 37, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность аминокислот, выбранную из группы, состоящей из последовательностей аминокислот SEQ ID NO: 33, 34, 35 или 36. В одном варианте реализации предложено антитело или фрагмент антитела, или их антигенсвязывающий домен, содержащий вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 37, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 33.In one embodiment, there is provided an antibody or antibody fragment, or an antigen binding domain thereof, comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37 and a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 33, 34, 35 or 36. In one embodiment, there is provided an antibody or antibody fragment, or an antigen binding domain thereof, comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37 and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37 ID NO: 33.
В одном варианте реализации предложено антитело или фрагмент антитела, или их антигенсвязывающий домен, содержащий вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 42, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность аминокислот, выбранную из группы, состоящей из последовательностей аминокислот SEQ ID NO: 43, 44, 45 или 46. В одном варианте реализации предложено антитело или фрагмент антитела, или их антигенсвязывающий домен, содержащий вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 42, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 43.In one embodiment, there is provided an antibody or antibody fragment, or an antigen binding domain thereof, comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42 and a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 43, 44, 45 or 46. In one embodiment, there is provided an antibody or antibody fragment, or an antigen binding domain thereof, comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42 and a light chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42 ID NO: 43.
В одном варианте реализации предложены направленные против CD73 антитело или фрагмент антитела, содержащие тяжелую цепь, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 38, и легкую цепь, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 39.In one embodiment, an anti-CD73 antibody or antibody fragment is provided comprising a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 39.
В одном варианте реализации предложены направленные против CD73 антитело или фрагмент антитела, содержащие тяжелую цепь, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 47, и легкую цепь, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 48.In one embodiment, an anti-CD73 antibody or antibody fragment is provided comprising a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 47 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 48.
В одном варианте реализации предложен направленный против CD73 антигенсвязывающий домен или белок, который содержит его (например, антитело или фрагмент антитела, полиспецифический связывающий белок, биспецифическое антитело и т.д.), содержащие вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую CDR1, CDR2 и CDR3 с соответствующими последовательностями аминокислот, представленными в SEQ ID NO: 2, 3 и 4, и последовательности аминокислот каркасных областей FR1, FR2 и FR3 из гена IGHV1-3 человека (и, необязательно, дополнительные последовательности аминокислот каркасной области 4 (FR4) из гена IGHJ4 человека); и CDR1, CDR2 и CDR3 вариабельной области легкой цепи (VL) с соответствующими последовательностями аминокислот, представленными в SEQ ID NO: 5, 6 и 7, и последовательности аминокислот каркасных областей FR1, FR2 и FR3 из гена IGKV1-33 человека (и, необязательно, дополнительные последовательности аминокислот каркасной области 4 (FR4) из гена IGKJ2 человека). Необязательно остаток, присутствующий в вариабельной области тяжелой цепи в положении 59 по Кабату (HCDR2), представляет собой остаток лейцина или глутамина. Необязательно остаток, присутствующий в вариабельной области тяжелой цепи в положении 60 по Кабату (HCDR2), представляет собой остаток треонина или лизина. Необязательно остаток, присутствующий в вариабельной области тяжелой цепи в положении 97 по Кабату (HCDR3), представляет собой остаток глицина или аспарагина. Необязательно остаток, присутствующий в вариабельной области легкой цепи в положении 30 по Кабату (LCDR1), представляет собой остаток серина или треонина. Необязательно остаток, присутствующий в вариабельной области легкой цепи в положении 53 по Кабату (LCDR2), представляет собой остаток треонина или аспарагина.In one embodiment, there is provided an anti-CD73 antigen-binding domain or a protein that contains it (e.g., an antibody or antibody fragment, a multispecific binding protein, a bispecific antibody, etc.) containing a heavy chain variable region (VH) containing CDR1, CDR2 and CDR3 with the corresponding amino acid sequences shown in SEQ ID NOs: 2, 3 and 4, and the amino acid sequences of framework regions FR1, FR2 and FR3 from the human IGHV1-3 gene (and, optionally, additional amino acid sequences of framework region 4 (FR4) from human IGHJ4 gene); and CDR1, CDR2 and CDR3 of the variable light chain (VL) region with the corresponding amino acid sequences set forth in SEQ ID NOs: 5, 6 and 7, and the amino acid sequences of the framework regions FR1, FR2 and FR3 from the human IGKV1-33 gene (and, optionally , additional amino acid sequences of framework region 4 (FR4) from the human IGKJ2 gene). Optionally, the residue present in the heavy chain variable region at Kabat position 59 (HCDR2) is a leucine or glutamine residue. Optionally, the residue present in the heavy chain variable region at Kabat position 60 (HCDR2) is a threonine or lysine residue. Optionally, the residue present in the heavy chain variable region at Kabat position 97 (HCDR3) is a glycine or asparagine residue. Optionally, the residue present in the light chain variable region at Kabat position 30 (LCDR1) is a serine or threonine residue. Optionally, the residue present in the light chain variable region at Kabat position 53 (LCDR2) is a threonine or asparagine residue.
В одном варианте реализации предложен направленный против CD73 антигенсвязывающий домен или белок, который содержит его (например, антитело или фрагмент антитела, полиспецифический связывающий белок, биспецифическое антитело и т.д.), содержащие вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую CDR1, CDR2 и CDR3 с соответствующими последовательностями аминокислот, представленными в SEQ ID NO: 2, 8 и 9, и последовательности аминокислот каркасных областей FR1, FR2 и FR3 из гена IGHV1-3 человека (и, необязательно, дополнительные последовательности аминокислот каркасной области 4 (FR4) из гена IGHJ4 человека); и CDR1, CDR2 и CDR3 вариабельной области легкой цепи (VL) с соответствующими последовательностями аминокислот, представленными в SEQ ID NO: 10, 11 и 7, и последовательности аминокислот каркасных областей FR1, FR2 и FR3 из гена IGKV1-33 человека (и, необязательно, дополнительные последовательности аминокислот каркасной области 4 (FR4) из гена IGKJ2 человека). В одном варианте реализации VH дополнительно содержит одну, две или три аминокислотные замены в CDR тяжелой цепи по Кабату в положениях тяжелой цепи по Кабату, выбранных из группы, состоящей из 59 (HCDR2), 60 (HCDR2) и 97 (HCDR3). Необязательно остаток лейцина в положении 59 заменен на остаток глутамина. Необязательно остаток треонина в положении 60 заменен на остаток лизина. Необязательно остаток глицина в положении 97 заменен на остаток аспарагина. В одном варианте реализации VL дополнительно содержит замену аминокислоты в CDR легкой цепи по Кабату в положениях по Кабату легкой цепи 30 (LCDR1) и/или 53 (LCDR2), необязательно дополнительно при этом остаток серина в положении 30 заменен на остаток треонина, необязательно дополнительно при этом остаток треонина в положении 53 заменен на остаток аспарагина.In one embodiment, there is provided an anti-CD73 antigen-binding domain or a protein that contains it (e.g., an antibody or antibody fragment, a multispecific binding protein, a bispecific antibody, etc.) containing a heavy chain variable region (VH) containing CDR1, CDR2 and CDR3 with the corresponding amino acid sequences shown in SEQ ID NOs: 2, 8 and 9, and the amino acid sequences of framework regions FR1, FR2 and FR3 from the human IGHV1-3 gene (and, optionally, additional amino acid sequences of framework region 4 (FR4) from human IGHJ4 gene); and CDR1, CDR2 and CDR3 of the variable light chain (VL) region with the corresponding amino acid sequences set forth in SEQ ID NOs: 10, 11 and 7, and the amino acid sequences of the framework regions FR1, FR2 and FR3 from the human IGKV1-33 gene (and, optionally , additional amino acid sequences of framework region 4 (FR4) from the human IGKJ2 gene). In one embodiment, VH further comprises one, two or three amino acid substitutions in the Kabat heavy chain CDR at Kabat heavy chain positions selected from the group consisting of 59 (HCDR2), 60 (HCDR2) and 97 (HCDR3). Optionally, the leucine residue at position 59 is replaced by a glutamine residue. Optionally, the threonine residue at
В одном варианте реализации предложен направленный против CD73 антигенсвязывающий домен или белок, который содержит его (например, антитело или фрагмент антитела, полиспецифический связывающий белок, биспецифическое антитело и т.д.), содержащие вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую CDR1, CDR2 и CDR3 с соответствующими последовательностями аминокислот, представленными в SEQ ID NO: 2, 12 и 13, и последовательности аминокислот каркасных областей FR1, FR2 и FR3 из гена IGHV1-3 человека (и, необязательно, дополнительные последовательности аминокислот каркасной области 4 (FR4) из гена IGHJ4 человека); и CDR1, CDR2 и CDR3 вариабельной области легкой цепи (VL) с соответствующими последовательностями аминокислот, представленными в SEQ ID NO: 14, 15 и 7, и последовательности аминокислот каркасных областей FR1, FR2 и FR3 из гена IGKV1-33 человека (и, необязательно, дополнительные последовательности аминокислот каркасной области 4 (FR4) из гена IGKJ2 человека).In one embodiment, there is provided an anti-CD73 antigen-binding domain or a protein that contains it (e.g., an antibody or antibody fragment, a multispecific binding protein, a bispecific antibody, etc.) containing a heavy chain variable region (VH) containing CDR1, CDR2 and CDR3 with the corresponding amino acid sequences shown in SEQ ID NOs: 2, 12 and 13, and the amino acid sequences of framework regions FR1, FR2 and FR3 from the human IGHV1-3 gene (and, optionally, additional amino acid sequences of framework region 4 (FR4) from human IGHJ4 gene); and CDR1, CDR2 and CDR3 of the variable light chain (VL) region with the corresponding amino acid sequences set forth in SEQ ID NOs: 14, 15 and 7, and the amino acid sequences of the framework regions FR1, FR2 and FR3 from the human IGKV1-33 gene (and, optionally , additional amino acid sequences of framework region 4 (FR4) from the human IGKJ2 gene).
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в настоящем документе, вариабельная область тяжелой цепи (VH) может быть охарактеризована как содержащая одну, две, три, четыре или пять замен аминокислот в положениях по Кабату, выбранных из группы, состоящей из 2, 30, 48, 69 и 73, тяжелой цепи, необязательно при этом остаток, присутствующий в последовательности человека в конкретном положении, заменен на остаток, присутствующий в донорной последовательности мыши в этом конкретном положении; и вариабельная область легкой цепи (VL) может быть охарактеризована как содержащая замену аминокислоты в положении 67 по Кабату легкой цепи, необязательно при этом остаток, присутствующий в последовательности человека в конкретном положении, заменен на остаток, присутствующий в донорной последовательности мыши в этом конкретном положении. В одном варианте реализации VL содержит замену в положении 67 по Кабату легкой цепи и, необязательно, дополнительно содержит одну, две или три аминокислотные замены в положениях по Кабату, выбранных из группы, состоящей из 2, 67 и 87, легкой цепи, необязательно при этом остаток, присутствующий в последовательности человека в конкретном положении, заменен на остаток, присутствующий в донорной последовательности мыши в этом конкретном положении. В одном варианте реализации антитело или связывающий домен антитела содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую замены аминокислот V2I, Т30А, M48I, I69L и T73K, и вариабельную область легкой цепи, содержащую замену аминокислоты S67Y, причем нумерация представлена по Кабату.In one aspect of any embodiment described herein, the heavy chain variable region (VH) can be characterized as containing one, two, three, four, or five amino acid substitutions at Kabat positions selected from the group consisting of 2, 30, 48, 69 and 73, heavy chain, optionally wherein the residue present in the human sequence at a particular position is replaced by a residue present in the mouse donor sequence at that particular position; and the light chain variable region (VL) can be characterized as comprising an amino acid substitution at Kabat position 67 of the light chain, optionally wherein the residue present in the human sequence at a particular position is replaced by a residue present in the mouse donor sequence at that particular position. In one embodiment, VL comprises a substitution at Kabat position 67 of the light chain and optionally further comprises one, two or three amino acid substitutions at Kabat positions selected from the group consisting of 2, 67 and 87 of the light chain, optionally a residue present in the human sequence at a particular position is replaced by a residue present in the mouse donor sequence at that particular position. In one embodiment, the antibody or antibody binding domain comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid substitutions V2I, T30A, M48I, I69L and T73K, and a light chain variable region containing the amino acid substitution S67Y, the numbering being represented by Kabat.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 2 по Кабату тяжелой цепи представляет собой изолейцин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 2 of the Kabat heavy chain is isoleucine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 30 по Кабату тяжелой цепи представляет собой аланин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 30 of the Kabat heavy chain is alanine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 48 по Кабату тяжелой цепи представляет собой изолейцин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 48 of the Kabat heavy chain is isoleucine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 69 по Кабату тяжелой цепи представляет собой лейцин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 69 of the Kabat heavy chain is leucine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 73 по Кабату тяжелой цепи представляет собой лизин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 73 of the Kabat heavy chain is lysine.
В одном варианте реализации VH содержит остаток изолейцина в положении 2 по Кабату, аланин в положении 30, изолейцин в положении 48, лейцин в положении 69 и лизин в положении 73.In one embodiment, VH contains an isoleucine residue at the Kabat position 2, an alanine at position 30, an isoleucine at position 48, a leucine at position 69, and a lysine at position 73.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 67 по Кабату легкой цепи представляет собой тирозин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at Kabat position 67 of the light chain is tyrosine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 60 по Кабату легкой цепи представляет собой аспарагиновую кислоту.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 2 по Кабату легкой цепи представляет собой изолейцин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 2 of the Kabat light chain is isoleucine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 87 по Кабату легкой цепи представляет собой фенилаланин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 87 of the Kabat light chain is phenylalanine.
В одном варианте реализации VL содержит остаток тирозина в положении 67 по Кабату; необязательно VL не содержит других замен в каркасной области по Кабату на остатки, не являющиеся человеческими, и/или содержит каркасную область по Кабату VL, которая является полностью человеческой, кроме замены в остатке 67.In one embodiment, VL contains a tyrosine residue at Kabat position 67; optionally, VL contains no other substitutions in the Kabat framework region for non-human residues, and/or contains a Kabat framework region VL that is entirely human, other than the substitution at residue 67.
В одном варианте реализации VL содержит остаток тирозина в положении 67 по Кабату и аспарагиновую кислоту в положении 60.In one embodiment, VL contains a tyrosine residue at Kabat position 67 and an aspartic acid residue at
В одном варианте реализации VL содержит остаток тирозина в положении 67 по Кабату, аспарагиновую кислоту в положении 60 и изолейцин в положении 2.In one embodiment, VL contains a tyrosine residue at Kabat position 67, aspartic acid at
В одном варианте реализации VL содержит остаток тирозина в положении 67 по Кабату, аспарагиновую кислоту в положении 60, изолейцин в положении 2 и фенилаланин в положении 87.In one embodiment, VL contains a tyrosine residue at Kabat position 67, aspartic acid at
В одном варианте реализации предложен направленный против CD73 антигенсвязывающий домен или белок, который содержит указанный антигенсвязывающий домен (например, антитело или фрагмент антитела, полиспецифический связывающий белок, биспецифическое антитело и т.д.), содержащий вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую последовательность аминокислот, по меньшей мере на 80%, 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичную последовательности аминокислот SEQ ID NO: 37, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую последовательность аминокислот, по меньшей мере на 80%, 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичную последовательности аминокислот, представленной в любой из последовательностей SEQ ID NO: 33, 34, 35 или 36. В одном варианте реализации VH содержит CDR1, CDR2 и CDR3 с соответствующими последовательностями аминокислот, представленными в последовательностях SEQ ID NO: 2, 12 и 13, и VL содержит CDR1, CDR2 и CDR3 с соответствующими последовательностями аминокислот, представленными в SEQ ID NO: 14, 15 и 7. В одном варианте реализации VH содержит остаток изолейцина в положении 2 по Кабату, аланин в положении 30, изолейцин в положении 48, лейцин в положении 69 и лизин в положении 73. В одном варианте реализации VL содержит остаток тирозина в положении 67 по Кабату.In one embodiment, a CD73-directed antigen binding domain or protein is provided that comprises said antigen binding domain (e.g., an antibody or antibody fragment, a multispecific binding protein, a bispecific antibody, etc.) containing a heavy chain variable region (VH) containing the sequence amino acids having at least 80%, 90%, 95%, 97%, 98%, or 99% identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37, and a light chain variable region (VL) containing an amino acid sequence of at least 80 %, 90%, 95%, 97%, 98% or 99% identical to the amino acid sequence presented in any of SEQ ID NO: 33, 34, 35 or 36. In one embodiment, VH contains CDR1, CDR2 and CDR3 with corresponding amino acid sequences set forth in SEQ ID NOs: 2, 12, and 13, and VL contains CDR1, CDR2, and CDR3 with the corresponding amino acid sequences set forth in SEQ ID NOs: 14, 15, and 7. In one embodiment, VH contains an isoleucine residue at Kabat position 2, alanine at position 30, isoleucine at position 48, leucine at position 69, and lysine at position 73. In one embodiment, VL contains a tyrosine residue at Kabat position 67.
В одном варианте реализации предложен направленный против CD73 антигенсвязывающий домен или белок, который содержит указанный антигенсвязывающий домен (например, антитело или фрагмент антитела, полиспецифический связывающий белок, биспецифическое антитело и т.д.), содержащий вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую CDR1, CDR2 и CDR3 с соответствующими последовательностями аминокислот, представленными в SEQ ID NO: 2, 3 и 4, и каркасные области из человека (например, FR1, FR2, FR3 и FR4 человеческого происхождения); и CDR1, CDR2 и CDR3 вариабельной области легкой цепи (VL), содержащие соответствующие последовательности аминокислот, представленные в SEQ ID NO: 5, 6 и 7, и каркасные области из человека (например, FR1, FR2, FR3 и FR4 человеческого происхождения), причем (VH) содержит последовательность аминокислот, по меньшей мере на 80%, 90%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичную последовательности аминокислот SEQ ID NO: 37 или 42, и вариабельная область легкой цепи (VL) содержит последовательность аминокислот, по меньшей мере на 80%, 95%, 97%, 98% или 99% идентичную последовательности аминокислот, представленной в любой из последовательностей SEQ ID NO: 33-36 или 43-46). Необязательно остаток, присутствующий в вариабельной области тяжелой цепи в положении 59 по Кабату (HCDR2), представляет собой остаток лейцина или глутамина. Необязательно остаток, присутствующий в вариабельной области тяжелой цепи в положении 60 по Кабату (HCDR2), представляет собой остаток треонина или лизина. Необязательно остаток, присутствующий в вариабельной области тяжелой цепи в положении 97 по Кабату (HCDR3), представляет собой остаток глицина или аспарагина. Необязательно остаток, присутствующий в вариабельной области легкой цепи в положении 30 по Кабату (LCDR1), представляет собой остаток серина или треонина. Необязательно остаток, присутствующий в вариабельной области легкой цепи в положении 53 по Кабату (LCDR2), представляет собой остаток треонина или аспарагина. В одном варианте реализации VH содержит остаток изолейцина в положении 2 по Кабату, аланин в положении 30, изолейцин в положении 48, лейцин в положении 69 и лизин в положении 73. В одном варианте реализации VL содержит остаток тирозина в положении 67 по Кабату.In one embodiment, a CD73-directed antigen-binding domain or protein is provided that comprises said antigen-binding domain (e.g., an antibody or antibody fragment, a multispecific binding protein, a bispecific antibody, etc.) containing a heavy chain variable region (VH) containing CDR1 , CDR2 and CDR3 with the corresponding amino acid sequences shown in SEQ ID NO: 2, 3 and 4, and framework regions from human (eg, FR1, FR2, FR3 and FR4 of human origin); and CDR1, CDR2 and CDR3 of the variable light chain (VL) region containing the corresponding amino acid sequences set forth in SEQ ID NO: 5, 6 and 7, and framework regions from human (for example, FR1, FR2, FR3 and FR4 of human origin), wherein (VH) contains an amino acid sequence that is at least 80%, 90%, 95%, 97%, 98% or 99% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37 or 42, and the light chain variable region (VL) contains the sequence amino acids that are at least 80%, 95%, 97%, 98% or 99% identical to the amino acid sequence presented in any of SEQ ID NO: 33-36 or 43-46). Optionally, the residue present in the heavy chain variable region at Kabat position 59 (HCDR2) is a leucine or glutamine residue. Optionally, the residue present in the heavy chain variable region at Kabat position 60 (HCDR2) is a threonine or lysine residue. Optionally, the residue present in the heavy chain variable region at Kabat position 97 (HCDR3) is a glycine or asparagine residue. Optionally, the residue present in the light chain variable region at Kabat position 30 (LCDR1) is a serine or threonine residue. Optionally, the residue present in the light chain variable region at Kabat position 53 (LCDR2) is a threonine or asparagine residue. In one embodiment, VH contains an isoleucine residue at position 2 of Kabat, alanine at position 30, isoleucine at position 48, leucine at position 69, and lysine at position 73. In one embodiment, VL contains a tyrosine residue at position 67 of Kabat.
В любом варианте реализации VH можно охарактеризовать как содержащий последовательности аминокислот акцепторной каркасной области VH человека, и VL содержит последовательности аминокислот акцепторной каркасной области VL человека. В одном варианте реализации VH-сегмент акцепторной каркасной области VH человека происходит из сегмента гена IGHV1-3 человека, а J-сегмент происходит из сегмента гена IGHJ4 человека. В одном варианте реализации акцепторная каркасная область VH человека происходит из сегмента гена IGHV1-3*01 человека. В одном варианте реализации человеческая акцепторная каркасная область домена VL происходит из сегмента гена IGKV1-33 человека, необязательно человеческая акцепторная каркасная область домена VL происходит из сегмента гена IGKV1-33*01 человека. В одном варианте реализации акцепторная каркасная область домена VL человека содержит J-сегмент из сегмента гена IGKJ2 человека.In any embodiment, VH can be characterized as comprising amino acid sequences of a human VH acceptor framework region, and VL comprises amino acid sequences of a human VL acceptor framework region. In one embodiment, the VH segment of the human VH acceptor framework region is derived from the human IGHV1-3 gene segment, and the J segment is derived from the human IGHJ4 gene segment. In one embodiment, the human VH acceptor framework region is derived from the human IGHV1-3*01 gene segment. In one embodiment, the human VL domain acceptor framework region is derived from the human IGKV1-33 gene segment, optionally the human VL domain acceptor framework region is derived from the human IGKV1-33*01 gene segment. In one embodiment, the human VL domain acceptor framework region comprises a J segment from a human IGKJ2 gene segment.
В одном варианте реализации антитело или фрагмент антитела содержит домен Н4+VH и домен L1, L2, L3 или L4 VL. В одном варианте реализации антитело представляет собой антитело H4+L1.In one embodiment, the antibody or antibody fragment comprises an H4+VH domain and an L1, L2, L3, or L4 VL domain. In one embodiment, the antibody is an H4+L1 antibody.
В одном варианте реализации предложен направленный против CD73 антигенсвязывающий домен или белок, который содержит указанный антигенсвязывающий домен (например, антитело или фрагмент антитела, полиспецифический связывающий белок, биспецифическое антитело и т.д.), содержащий вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 37, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность аминокислот, выбранную из группы, состоящей из последовательностей аминокислот SEQ ID NO: 33, 34, 35 или 36.In one embodiment, a CD73-directed antigen binding domain or protein is provided that comprises said antigen binding domain (e.g., an antibody or antibody fragment, a multispecific binding protein, a bispecific antibody, etc.) comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37, and a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 33, 34, 35 or 36.
В одном варианте реализации предложено антитело или фрагмент антитела, которые связывают CD73 человека и которые нейтрализуют АТФазную активность CD73, причем указанное антитело или фрагмент антитела содержат вариабельную область тяжелой цепи и вариабельную область легкой цепи антитела H4+L1.In one embodiment, an antibody or antibody fragment is provided that binds human CD73 and that neutralizes the ATPase activity of CD73, wherein the antibody or antibody fragment comprises a heavy chain variable region and a light chain variable region of an H4+L1 antibody.
В одном варианте реализации предложено антитело или фрагмент антитела, которые связывают полипептид CD73 человека и которые нейтрализуют АТФазную активность CD73, причем антитело или фрагмент антитела содержат вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 37, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 33.In one embodiment, an antibody or antibody fragment is provided that binds a human CD73 polypeptide and that neutralizes the ATPase activity of CD73, wherein the antibody or antibody fragment comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37 and a light chain variable region comprising the sequence amino acids SEQ ID NO: 33.
В одном варианте реализации предложено антитело или фрагмент антитела, которые связывают полипептид CD73 человека и которые нейтрализуют АТФазную активность CD73, причем антитело или фрагмент антитела содержит тяжелую цепь, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 38, и легкую цепь, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 39.In one embodiment, an antibody or antibody fragment is provided that binds a human CD73 polypeptide and that neutralizes the ATPase activity of CD73, wherein the antibody or antibody fragment comprises a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 : 39.
В одном варианте реализации антитело или фрагмент антитела содержит домен 2Н4+VH и домен 2L1, 2L2, 2L3 или 2L4 VL. В одном варианте реализации антитело представляет собой антитело 2H4+2L1.In one embodiment, the antibody or antibody fragment comprises a 2H4+VH domain and a 2L1, 2L2, 2L3, or 2L4 VL domain. In one embodiment, the antibody is a 2H4+2L1 antibody.
В одном варианте реализации предложен направленный против CD73 антигенсвязывающий домен или белок, который содержит указанный антигенсвязывающий домен (например, антитело или фрагмент антитела, полиспецифический связывающий белок, биспецифическое антитело и т.д.), содержащий вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 42, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность аминокислот, выбранную из группы, состоящей из последовательностей аминокислот SEQ ID NO: 43, 44, 45 или 46.In one embodiment, a CD73-directed antigen binding domain or protein is provided that comprises said antigen binding domain (e.g., an antibody or antibody fragment, a multispecific binding protein, a bispecific antibody, etc.) comprising a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42, and a light chain variable region comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 43, 44, 45 or 46.
В одном варианте реализации предложено антитело или фрагмент антитела, которые связывают CD73 человека и которые нейтрализуют АТФазную активность CD73, причем указанное антитело или фрагмент антитела содержат вариабельную область тяжелой цепи и вариабельную область легкой цепи антитела 2H4+2L1.In one embodiment, an antibody or antibody fragment is provided that binds human CD73 and that neutralizes the ATPase activity of CD73, wherein the antibody or antibody fragment comprises a heavy chain variable region and a light chain variable region of a 2H4+2L1 antibody.
В одном варианте реализации предложено антитело или фрагмент антитела, которые связывают полипептид CD73 человека и которые нейтрализуют АТФазную активность CD73, причем антитело или фрагмент антитела содержат вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 42, и вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 43.In one embodiment, an antibody or antibody fragment is provided that binds a human CD73 polypeptide and that neutralizes the ATPase activity of CD73, wherein the antibody or antibody fragment comprises a heavy chain variable region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42 and a light chain variable region comprising the sequence amino acids SEQ ID NO: 43.
В одном варианте реализации предложено антитело или фрагмент антитела, которые связывают полипептид CD73 человека и которые нейтрализуют АТФазную активность CD73, причем антитело или фрагмент антитела содержат тяжелую цепь, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 47, и легкую цепь, содержащую последовательность аминокислот SEQ ID NO: 48.In one embodiment, an antibody or antibody fragment is provided that binds a human CD73 polypeptide and that neutralizes the ATPase activity of CD73, wherein the antibody or antibody fragment comprises a heavy chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 47 and a light chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 47 : 48.
В одном варианте реализации антитела не являются обедняющими и нейтрализуют ферментативную активность CD73 в окружении опухоли.In one embodiment, the antibodies are non-depleting and neutralize CD73 enzymatic activity in the tumor environment.
В одном варианте реализации антитело представляет собой антитело изотипа IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4 человека. Например, антитело может представлять собой антитело, содержащее домен Fc изотипа IgG4 человека, или антитело, содержащее домен Fc любого изотипа IgG человека (например, IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4), модифицированный для уменьшения или утраты связывания между доменом Fc и рецептором Fcγ человека (например, CD16), необязательно модифицированный для уменьшения связывания между доменом Fc и множеством рецепторов Fcγ человека, например, CD16A, CD16B, CD32A, CD32B и CD64). В одном варианте реализации антитела содержат домен Fc подтипа IgG человека (например, IgG1), содержащий модификацию аминокислоты, которая приводит к снижению (по сравнению с антителом, содержащим домен Fc IgG1 человека дикого типа) или по существу к полной утрате связывания с каждым из CD16A, CD16B, CD32A, CD32B и CD64.In one embodiment, the antibody is an antibody of the human IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 isotype. For example, the antibody may be an antibody containing the Fc domain of a human IgG4 isotype, or an antibody containing the Fc domain of any human IgG isotype (e.g., IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4) modified to reduce or lose binding between the Fc domain and the human Fcγ receptor (eg CD16), optionally modified to reduce binding between the Fc domain and a variety of human Fcγ receptors, eg CD16A, CD16B, CD32A, CD32B and CD64). In one embodiment, the antibodies comprise an Fc domain of a human IgG subtype (e.g., IgG1) containing an amino acid modification that results in reduced (compared to an antibody containing a wild-type human IgG1 Fc domain) or substantially complete loss of binding to each of the CD16A , CD16B, CD32A, CD32B and CD64.
В любом варианте реализации тяжелая цепь антитела содержит константный домен СН1 человека и модифицированный домен Fc человека, необязательно изотипа IgG1 человека, необязательно дополнительно содержащий последовательность аминокислот, представленную в любой из последовательностей SEQ ID NO: 16, 17, 18 или 19. В любом варианте реализации легкая цепь антитела содержит константный домен легкой цепи человека, необязательно при этом константный домен представляет собой домен каппа человека.In any embodiment, the antibody heavy chain comprises a human CH1 constant domain and a modified human Fc domain, optionally of the human IgG1 isotype, optionally further comprising an amino acid sequence set forth in any of SEQ ID NO: 16, 17, 18, or 19. In any embodiment the light chain of the antibody comprises a human light chain constant domain, optionally the constant domain being a human kappa domain.
В одном аспекте антитела в соответствии с настоящим изобретением не вызывают или не повышают внутриклеточную интернализацию, или в более общем смысле, понижающую модуляцию, экспрессированного на поверхности клетки полипептида CD73 и/или не зависят от нее для проявления своей ингибирующей активности в отношении CD73. Антитела в соответствии с настоящим изобретением могут оказывать большую ингибирующую активность (способность по существу нейтрализовать ферментативную активность CD73), чем антитела, которые ингибируют CD73, вызывая интернализацию CD73. В отличие от антител, которые ингибируют растворимый CD73 посредством других механизмов (например, вызывая образование олигомера CD73-антитело), антитела в соответствии с настоящим изобретением способны ингибировать ферментативную активность CD73 при высоком (например, 10-кратном) избытке антитело:фермент. Кроме того, в отличие от антител, которые связывают эпитоп на рекомбинантном CD73, который может быть модифицирован или может отсутствовать на CD73 на поверхности клетки (например, антитело 7G2), или связывают его с аффинностью, которая слишком низка, чтобы привести к эффективности в экспрессирующих CD73 клетках, антитела в соответствии с настоящим изобретением связываются с высокой аффинностью с эпитопом, который присутствует и/или остается интактным на CD73 на поверхности клетки, что дает антителам способность эффективно нейтрализовать ферментативную активность клеточного CD73. Антитела в соответствии с настоящим изобретением ингибируют ферментативную активность CD73 в клетках, но необязательно могут также ингибировать экто-5'-нуклеотидазную активность растворимого рекомбинантного CD73 (что наблюдали в бесклеточном анализе с использованием растворимого димерного полипептида CD73).In one aspect, antibodies in accordance with the present invention do not cause or increase intracellular internalization, or more generally, down-modulation, of a cell surface expressed CD73 polypeptide and/or do not depend on it to exert their CD73 inhibitory activity. Antibodies of the present invention may have greater inhibitory activity (the ability to substantially neutralize the enzymatic activity of CD73) than antibodies that inhibit CD73 by causing internalization of CD73. Unlike antibodies that inhibit soluble CD73 through other mechanisms (eg, causing the formation of a CD73-antibody oligomer), the antibodies of the present invention are capable of inhibiting CD73 enzymatic activity at high (eg, 10-fold) excess antibody:enzyme. Additionally, in contrast to antibodies that bind an epitope on recombinant CD73 that may be modified or may be absent from CD73 on the cell surface (e.g., antibody 7G2), or bind it with an affinity that is too low to result in efficacy in expressing CD73 cells, antibodies in accordance with the present invention bind with high affinity to an epitope that is present and/or remains intact on CD73 on the cell surface, which gives the antibodies the ability to effectively neutralize the enzymatic activity of cellular CD73. Antibodies of the present invention inhibit the enzymatic activity of CD73 in cells, but may optionally also inhibit the ecto-5'-nucleotidase activity of soluble recombinant CD73 (as observed in a cell-free assay using soluble dimeric CD73 polypeptide).
В одном аспекте антитела в соответствии с настоящим изобретением способны ингибировать активность полипептида CD73 человека, не связываясь с активным центром фермента полипептида CD73, и/или являются неконкурентными ингибиторами CD73, например, они ингибируют активность полипептида CD73 человека без детектируемого снижения связывания между полипептидом CD73 и его природным субстратом.In one aspect, the antibodies of the present invention are capable of inhibiting the activity of a human CD73 polypeptide without binding to the active site of the CD73 polypeptide enzyme, and/or are non-competitive inhibitors of CD73, e.g., they inhibit the activity of a human CD73 polypeptide without detectably reducing the binding between the CD73 polypeptide and its natural substrate.
В одном аспекте антитела в соответствии с настоящим изобретением утрачивают связывание с мутантами CD73, содержащими замену в остатке K136. В одном аспекте наблюдается снижение связывания антител в соответствии с настоящим изобретением с мутантами CD73, содержащими замену в остатках K136 (на основании последовательности SEQ ID NO: 1; и по сравнению с CD73 дикого типа, содержащим последовательность аминокислот SEQ ID NO: 1); необязательно также наблюдается снижение связывания антител с мутантами CD73, содержащими замену в остатках А99, Е129, K133, Е134 и А135 (в последовательности SEQ ID NO: 1; и по сравнению с CD73 дикого типа, содержащим последовательность аминокислот SEQ ID NO: 1; необязательно дополнительно наблюдается снижение связывания антител с мутантами CD73, содержащими замену в остатках K97, Е125, Q153 и K330 (на основании последовательности SEQ ID NO: 1; и по сравнению с CD73 дикого типа, содержащим последовательность аминокислот SEQ ID NO: 1.In one aspect, antibodies of the present invention lose binding to CD73 mutants containing a substitution at residue K136. In one aspect, there is reduced binding of antibodies in accordance with the present invention to CD73 mutants containing a substitution at residues K136 (based on the sequence of SEQ ID NO: 1; and compared to wild-type CD73 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1); optionally there is also a decrease in antibody binding to CD73 mutants containing substitutions at residues A99, E129, K133, E134 and A135 (in the sequence SEQ ID NO: 1; and compared to wild-type CD73 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 1; optional Additionally, there is a decrease in antibody binding to CD73 mutants containing substitutions at residues K97, E125, Q153 and K330 (based on the sequence SEQ ID NO: 1; and compared to wild-type CD73 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 1.
В одном варианте реализации антитела связываются с эпитопом на каждой полипептидной цепи CD73 в димере CD73 (то есть связываются с CD73 внутридимерным способом), необязательно дополнительно при этом эпитоп присутствует на одной и той же поверхности димера CD73. Таким образом, антитела могут связываться бивалентно с одним димером CD73, то есть, в положении, которое является более «закрытым», в котором сайты связывания антител пространственно более отдалены друг от друга, чем в «открытом» положении. Ввиду связывания со связанным с лигандом CD73, антитела, описанные в данном документе, могут быть пригодны для связывания с CD73, когда он связан с АМФ, например, для лечения индивида или рака, характеризующегося (например, как известно или предполагается, характеризующегося) окружением опухоли, в котором предшественник АДФ и/или АМФ присутствуют на значительных уровнях до лечения. Антитела могут быть пригодны для лечения индивида или рака, при котором (например, как известно или предполагается) для окружения опухоли характерны высокие уровни АДФ (например, продуцированного умирающими клетками, который захватывает CD73 на стромальном и клеточном инфильтрате (например, на клетках TReg) с образованием высоких уровней АМФ), а также, в более общем случае, АМФ, аденозин, присутствие или уровни экспрессии CD73 или экспрессирующих CD73 клеток, высокие (например, по сравнению со здоровыми тканями) количества или частоты встречаемости экспрессирующих CD73 клеток и/или высокие уровни экспрессии CD73 на клетках (например, которые оценивали с помощью иммуногистохимического анализа), высокие (например, по сравнению со здоровыми тканями) уровни растворимых полипептидов CD73 (например, которые оценивали с помощью ELISA или, в общем, любого анализа детектирования на основе антител) или присутствие или уровни экспрессии рецептора аденозина или экспрессирующих рецептор аденозина клеток. Молекулы CD73 в окружении опухоли могут находиться в связанной с субстратом конформации, и способность связывать и ингибировать связанный с субстратом клеточный CD73 (например, клетки, экспрессирующие CD73, предварительно инкубированные с субстратом, таким как АМФ), дополнительно к несвязанному с субстратом CD73, может обусловить большую способность ингибировать CD73 in vivo. Необязательно перед лечением можно оценить уровень растворимого белка CD73, количество или частоту встречаемости экспрессирующих CD73 клеток и/или уровни экспрессии CD73 на клетках в окружении опухоли. Антитела могут быть особенно полезны для лечения индивида, имеющего значительные уровни (например, высокие уровни по сравнению с референсными) растворимого белка CD73, количества или частоты встречаемости экспрессирующих CD73 клеток и/или уровни экспрессии CD73 на клетках в образце опухоли.In one embodiment, the antibodies bind to an epitope on each CD73 polypeptide chain in a CD73 dimer (ie, bind to CD73 in an intradimeric manner), optionally further wherein the epitope is present on the same surface of the CD73 dimer. Thus, antibodies can bind bivalently to one CD73 dimer, that is, in a position that is more “closed,” in which the antibody binding sites are spatially further apart than in the “open” position. In view of binding to ligand-bound CD73, the antibodies described herein may be useful for binding to CD73 when bound to AMP, for example, to treat an individual or cancer characterized (e.g., known or suspected to be characterized by) a tumor environment , in which the precursor ADP and/or AMP are present at significant levels before treatment. The antibodies may be useful for treating an individual or cancer in which (eg, known or suspected) the tumor environment is characterized by high levels of ADP (eg, produced by dying cells, which hijacks CD73 on the stromal and cellular infiltrate (eg, on TReg cells) with production of high levels of AMP), and also, more generally, AMP, adenosine, the presence or levels of expression of CD73 or CD73-expressing cells, high (e.g., compared to healthy tissue) numbers or frequencies of CD73-expressing cells, and/or high levels expression of CD73 on cells (eg, as assessed by immunohistochemical analysis), high (eg, compared with healthy tissue) levels of soluble CD73 polypeptides (eg, as assessed by ELISA or, in general, any antibody-based detection assay), or the presence or expression levels of adenosine receptor or adenosine receptor-expressing cells. CD73 molecules in the tumor environment may be in a substrate-bound conformation, and the ability to bind and inhibit substrate-bound cellular CD73 (e.g., cells expressing CD73 preincubated with a substrate such as AMP), in addition to non-substrate CD73, may cause greater ability to inhibit CD73 in vivo. Optionally, the level of soluble CD73 protein, the number or frequency of CD73-expressing cells, and/or the levels of CD73 expression on cells surrounding the tumor may be assessed prior to treatment. The antibodies may be particularly useful for treating an individual who has significant levels (eg, high levels compared to reference levels) of soluble CD73 protein, the number or frequency of CD73 expressing cells, and/or levels of CD73 expression on cells in a tumor sample.
Соответственно, в одном аспекте настоящего изобретения предложено гуманизированное антитело или фрагмент антитела, которое связывает полипептид CD73 человека, экспрессированный на поверхности клеток, и ингибирует ферментативную (экто-5'нуклеотидазную) активность полипептида CD73, причем антитело способно бивалентно связываться с одним димером полипептидов CD73 (с растворимым димером полипептидов CD73 или с димером полипептидов CD73, экспрессированным клеткой). Необязательно антитело связывается первым связывающим антиген доменом с первым полипептидом CD73 в димере и вторым связывающим антиген доменом со вторым полипептидом CD73. В одном аспекте антитело представляет собой аллостерический ингибитор полипептида CD73.Accordingly, in one aspect of the present invention there is provided a humanized antibody or antibody fragment that binds a human CD73 polypeptide expressed on the surface of cells and inhibits the enzymatic (ecto-5'nucleotidase) activity of the CD73 polypeptide, wherein the antibody is capable of bivalently binding to one dimer of CD73 polypeptides ( with a soluble dimer of CD73 polypeptides or with a dimer of CD73 polypeptides expressed by the cell). Optionally, the antibody binds the first antigen binding domain to the first CD73 polypeptide in the dimer and the second antigen binding domain to the second CD73 polypeptide. In one aspect, the antibody is an allosteric inhibitor of a CD73 polypeptide.
Эпитоп на CD73, с которым связываются указанные антитела, присутствует на полипептидах CD73, экспрессируемых рядом клеток, например, раковыми клетками, CD4 Т-клетками, CD8 Т-клетками, В-клетками, трансфицированными клетками, и связывание происходит с высокой аффинностью, что определяют с помощью проточной цитометрии. Например, для антитела может быть характерна ЕС50, определенная с помощью проточной цитометрии, составляющая не более 5 мкг/мл, необязательно не более 2 мкг/мл, не более 1 мкг/мл, не более 0,5 мкг/мл, не более 0,1 мкг/мл или не более 0,05 мкг/мл для связывания с клетками, которые экспрессируют на поверхности полипептид CD73. В одном варианте реализации клетки представляют собой клетки, которые заставили экспрессировать CD73 на своей поверхности. В одном варианте реализации клетки представляют собой клетки, которые эндогенно экспрессируют CD73 на поверхности, например, раковые клетки, клетки лейкоза, клетки рака мочевого пузыря, клетки глиомы, клетки глиобластомы, клетки рака яичников, клетки меланомы, клетки рака предстательной железы, клетки рака щитовидной железы, клетки рака пищевода или клетки рака молочной железы.The epitope on CD73 to which these antibodies bind is present on CD73 polypeptides expressed by a number of cells, for example, cancer cells, CD4 T cells, CD8 T cells, B cells, transfected cells, and binding occurs with high affinity, as determined by using flow cytometry. For example, an antibody may have an EC50 determined by flow cytometry of no more than 5 µg/ml, optionally no more than 2 µg/ml, no more than 1 µg/ml, no more than 0.5 µg/ml, no more 0.1 µg/ml or no more than 0.05 µg/ml for binding to cells that express CD73 polypeptide on the surface. In one embodiment, the cells are cells that are caused to express CD73 on their surface. In one embodiment, the cells are cells that endogenously express CD73 on the surface, e.g., cancer cells, leukemia cells, bladder cancer cells, glioma cells, glioblastoma cells, ovarian cancer cells, melanoma cells, prostate cancer cells, thyroid cancer cells glands, esophageal cancer cells or breast cancer cells.
В одном варианте реализации нейтрализующие CD73 антитела можно охарактеризовать как способные вызывать снижение 5'-эктонуклеотидазной активности CD73 в клетках по меньшей мере на 60%, 75% или 80%. В одном варианте реализации для нейтрализующих CD73 антител может быть характерна ЕС50 для ингибирования 5'-эктонуклеотидазной активности CD73, экспрессируемого клеткой, составляющая не более 1 мкг/мл, необязательно не более 0,5 мкг/мл, необязательно не более 0,2 мкг/мл.In one embodiment, CD73 neutralizing antibodies can be characterized as being capable of causing a reduction in CD73 5'-ectonucleotidase activity in cells by at least 60%, 75%, or 80%. In one embodiment, CD73 neutralizing antibodies may have an EC 50 for inhibiting the 5'-ectonucleotidase activity of CD73 expressed by the cell of no more than 1 μg/ml, optionally no more than 0.5 μg/ml, optionally no more than 0.2 μg /ml.
Необязательно ингибирование 5'-эктонуклеотидазной активности CD73, экспрессируемого клеткой, определяют путем оценки нейтрализации 5'-эктонуклеотидазной активности в экспрессирующих CD73 клетках (например, клетках MDA-MB-231) путем количественного анализа гидролиза АМФ с образованием аденозина.Optionally, inhibition of the 5'-ectonucleotidase activity of cell-expressed CD73 is determined by assessing the neutralization of 5'-ectonucleotidase activity in CD73-expressing cells (eg, MDA-MB-231 cells) by quantitating the hydrolysis of AMP to adenosine.
Необязательно ингибирование 5'-эктонуклеотидазной активности CD73, экспрессируемого клеткой, определяют путем оценки способности антитела или фрагмента антитела повышать пролиферацию Т-клеток, когда вызвана пролиферация указанных Т-клеток (например, от здорового донора-человека) in vitro (например, посредством костимуляции TCR, стимуляции сигнализации CD3 и CD28, например, путем приведения Т-клеток в контакт с гранулами, функционализированными агонистами CD3 и агонистами CD28) в присутствии АМФ (например, экзогенно добавленного АМФ). Необязательно пролиферацию Т-клеток оценивают с использованием анализа, описанного в разделе Примеры в данном документе (см. Пример 5 и Методы).Optionally, inhibition of the 5'-ectonucleotidase activity of CD73 expressed by a cell is determined by assessing the ability of the antibody or antibody fragment to enhance T cell proliferation when said T cells (e.g., from a healthy human donor) are induced to proliferate in vitro (e.g., through TCR costimulation , stimulating CD3 and CD28 signaling, for example by contacting T cells with beads functionalized with CD3 agonists and CD28 agonists) in the presence of AMP (eg, exogenously added AMP). Optionally, T cell proliferation is assessed using the assay described in the Examples section herein (see Example 5 and Methods).
В одном аспекте антитело против CD73 связывает общую антигенную детерминанту, присутствующую как на растворимом CD73, так и на CD73, экспрессированном на поверхности клеток.In one aspect, an anti-CD73 antibody binds a common antigenic determinant present on both soluble CD73 and CD73 expressed on the surface of cells.
В одном аспекте антитело против CD73 связывает антигенную детерминанту в каждой полипептидной цепи CD73 в димере CD73 (внутридимерным способом), например, когда антигенные детерминанты присутствуют на общей поверхности димера CD73.In one aspect, an anti-CD73 antibody binds an antigenic determinant on each CD73 polypeptide chain in a CD73 dimer (in an intradimeric manner), for example, when the antigenic determinants are present on the common surface of the CD73 dimer.
В одном аспекте антитело против CD73 связывает эпитоп на CD73, содержащий остаток K136 (в последовательности SEQ ID NO: 1).In one aspect, an anti-CD73 antibody binds an epitope on CD73 containing residue K136 (at SEQ ID NO: 1).
В одном аспекте антитело против CD73 связывает эпитоп на CD73, содержащий один, два, три или четыре остатка, выбранных из группы, состоящей из K97, Е125, Q153 и K330 (в последовательности SEQ ID NO: 1).In one aspect, an anti-CD73 antibody binds an epitope on CD73 containing one, two, three or four residues selected from the group consisting of K97, E125, Q153 and K330 (in SEQ ID NO: 1).
В одном аспекте антитело против CD73 связывает эпитоп на CD73, содержащий один, два, три, четыре или пять остатков, выбранных из группы, состоящей из А99, Е129, K133, Е134 и А135 (в последовательности SEQ ID NO: 1).In one aspect, an anti-CD73 antibody binds an epitope on CD73 containing one, two, three, four, or five residues selected from the group consisting of A99, E129, K133, E134, and A135 (in the sequence of SEQ ID NO: 1).
В одном аспекте антитело против CD73 связывается по меньшей мере частично внутри домена или фрагмента из аминокислотных остатков на белке CD73 человека (например, гомодимерном белке CD73), содержащего аминокислотные остатки K97, А99, E125, Е129, K133, Е134, А135, K136, Q153 и K330 (в последовательности SEQ ID NO: 1). В одном аспекте антитело против CD73 связывает эпитоп на CD73, содержащий по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или более остатков, выбранных из группы, состоящей из K97, А99, Е125, Е129, K133, Е134, А135, K136, Q153 и K330 (в последовательности SEQ ID NO: 1).In one aspect, the anti-CD73 antibody binds at least partially within a domain or fragment of amino acid residues on a human CD73 protein (e.g., CD73 homodimeric protein) comprising amino acid residues K97, A99, E125, E129, K133, E134, A135, K136, Q153 and K330 (in sequence SEQ ID NO: 1). In one aspect, an anti-CD73 antibody binds an epitope on CD73 containing at least one, two, three, four, five or more residues selected from the group consisting of K97, A99, E125, E129, K133, E134, A135, K136, Q153 and K330 (in sequence SEQ ID NO: 1).
В одном аспекте антитело против CD73 проявляет пониженное связывание с полипептидом CD73, содержащим мутацию в остатке K136 (в последовательности SEQ ID NO: 1), по сравнению с полипептидом CD73 дикого типа, содержащим последовательность аминокислот SEQ ID NO: 1; необязательно мутантный полипептид CD73 содержит мутацию K136A.In one aspect, an anti-CD73 antibody exhibits reduced binding to a CD73 polypeptide containing a mutation at residue K136 (at SEQ ID NO: 1) compared to a wild-type CD73 polypeptide containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 1; optionally the mutant CD73 polypeptide contains the K136A mutation.
В одном аспекте антитело против CD73 проявляет пониженное связывание с полипептидом CD73, содержащим мутацию в остатке, выбранном из группы, состоящей из: K97, Е125, Q153 и K330 (в последовательности SEQ ID NO: 1), по сравнению с полипептидом CD73 дикого типа, содержащим последовательность аминокислот SEQ ID NO: 1; необязательно мутантный полипептид CD73 содержит следующие мутации: K97A, Е125А, Q153A и/или K330A (например, K97A, Е125А и K330A; K97A, Е125А и/или Q153A).In one aspect, an anti-CD73 antibody exhibits reduced binding to a CD73 polypeptide containing a mutation at a residue selected from the group consisting of: K97, E125, Q153, and K330 (in SEQ ID NO: 1), compared to a wild-type CD73 polypeptide. containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 1; optionally, the mutant CD73 polypeptide contains the following mutations: K97A, E125A, Q153A and/or K330A (eg, K97A, E125A and K330A; K97A, E125A and/or Q153A).
В одном аспекте антитело против CD73 проявляет пониженное связывание с полипептидом CD73, содержащим мутацию в остатке, выбранном из группы, состоящей из: А99, Е129, K133, Е134 и А135 (в последовательности SEQ ID NO: 1), по сравнению с полипептидом CD73 дикого типа, содержащим последовательность аминокислот SEQ ID NO: 1; необязательно мутантный полипептид CD73 содержит следующие мутации: A99S, Е129А, K133A, E134N и A135S.In one aspect, an anti-CD73 antibody exhibits reduced binding to a CD73 polypeptide containing a mutation at a residue selected from the group consisting of: A99, E129, K133, E134, and A135 (in SEQ ID NO: 1), compared to wild-type CD73 polypeptide type containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 1; optionally, the mutant CD73 polypeptide contains the following mutations: A99S, E129A, K133A, E134N and A135S.
В одном варианте реализации предложены способы применения антител для лечения или предотвращения заболевания, например, инфекционного заболевания или рака. В одном аспекте антитела вводят индивиду, страдающему от рака, в количестве и с частотой, достаточной, чтобы нейтрализовать активность CD73 в микроокружении опухоли. Водном варианте реализации антитела вводят в количестве и с частотой, достаточной для снижения образования и/или концентрации аденозина в микроокружении опухоли. Водном варианте реализации антитела вводят в количестве и с частотой, достаточной для повышения образования и/или концентрации АТФ в микроокружении опухоли. В одном варианте реализации антитела вводят в количестве и с частотой, достаточной для нейтрализации активности CD73, экспрессированного опухолевыми клетками. В одном варианте реализации антитела вводят в количестве и с частотой, достаточной для нейтрализации активности CD73, экспрессированного CD4 Т-клетками, CD8 Т-клетками и/или В-клетками.In one embodiment, methods are provided for using antibodies to treat or prevent a disease, such as an infectious disease or cancer. In one aspect, the antibodies are administered to an individual suffering from cancer in an amount and frequency sufficient to neutralize CD73 activity in the tumor microenvironment. In an aqueous embodiment, the antibodies are administered in an amount and frequency sufficient to reduce the formation and/or concentration of adenosine in the tumor microenvironment. In an aqueous embodiment, the antibodies are administered in an amount and frequency sufficient to increase the production and/or concentration of ATP in the tumor microenvironment. In one embodiment, the antibodies are administered in an amount and frequency sufficient to neutralize the activity of CD73 expressed by the tumor cells. In one embodiment, the antibodies are administered in an amount and frequency sufficient to neutralize the activity of CD73 expressed by CD4 T cells, CD8 T cells and/or B cells.
Антитела будут полезны для ингибирования опосредованного CD73 катаболизма АМФ с образованием аденозина, например, для уменьшения концентрации аденозина в микроокружении опухоли. Данные антитела, следовательно, будут полезны для обращения иммуносупрессорного действия CD73 и/или аденозина на Т-клетки, В-клетки и другие клетки, которые экспрессируют рецепторы аденозина, например, при лечении рака. В одном варианте реализации антитело против CD73 нейтрализует опосредованное аденозином ингибирование пролиферации, продукции цитокинов, цитотоксичности и/или активности NFkB в Т-клетках.Antibodies will be useful for inhibiting CD73-mediated catabolism of AMP to adenosine, for example, to reduce adenosine concentrations in the tumor microenvironment. These antibodies will therefore be useful in reversing the immunosuppressive effects of CD73 and/or adenosine on T cells, B cells and other cells that express adenosine receptors, for example in the treatment of cancer. In one embodiment, the anti-CD73 antibody neutralizes adenosine-mediated inhibition of proliferation, cytokine production, cytotoxicity, and/or NFkB activity in T cells.
Поскольку опосредованный CD73 катаболизм АМФ с образованием аденозина является необратимым, в то время как катаболизм посредством CD73 АТФ с образованием АДФ и АДФ с образованием АМФ является обратимым (с помощью киназы NDK и аденилаткиназы, соответственно), антитела, которые блокируют необратимый катаболизм, опосредованный CD73, будут увеличивать запас АМФ и, тем самым, будут полезны для повышения концентраций АДФ и АТФ, например, в микроокружении опухоли. Указанные антитела могут быть полезны для повышения образования АДФ из АМФ и образования АТФ из АДФ. Поскольку АТФ играет иммуностимулирующую роль, антитела против CD73 могут быть полезны для активации Т-клеток, например, при лечении рака.Because CD73-mediated catabolism of AMP to adenosine is irreversible, while CD73-mediated catabolism of ATP to ADP and ADP to AMP is reversible (via NDK kinase and adenylate kinase, respectively), antibodies that block CD73-mediated irreversible catabolism will increase the supply of AMP and thus be useful for increasing ADP and ATP concentrations, for example, in the tumor microenvironment. These antibodies may be useful in increasing the formation of ADP from AMP and the formation of ATP from ADP. Since ATP plays an immunostimulatory role, antibodies against CD73 may be useful in activating T cells, for example in the treatment of cancer.
Антитела будут полезны для ингибирования продукции, количеств и/или концентраций аденозина в микроокружении опухоли.Antibodies will be useful for inhibiting the production, amounts and/or concentrations of adenosine in the tumor microenvironment.
Антитела, которые нейтрализуют активность растворимого димера полипептида CD73 человека, могут дополнительно нейтрализовать CD73 в любом другом подходящем контексте, например, в репортерной клетке, которую заставили экспрессировать CD73, в Т-клетке и т.д.Antibodies that neutralize the activity of a soluble human CD73 polypeptide dimer may further neutralize CD73 in any other suitable context, for example, in a reporter cell that has been induced to express CD73, a T cell, etc.
Предложен способ лечения индивида, указанный способ включает введение индивиду (например, индивиду, страдающему от заболевания, опухоли и т.д.) терапевтически активного количества любого из антигенсвязывающих соединений против CD73, описанных в настоящем документе. В одном аспекте предложен способ лечения индивида, указанный способ включает, состоит по существу из или состоит из: введения индивиду (например, индивиду, страдающему от заболевания, опухоли и т.д.) терапевтически активного количества антигенсвязывающего соединения в соответствии с настоящим изобретением.A method of treating an individual is provided, the method comprising administering to an individual (eg, an individual suffering from a disease, tumor, etc.) a therapeutically active amount of any of the anti-CD73 antigen-binding compounds described herein. In one aspect, a method of treating an individual is provided, the method comprising, consisting essentially of, or consisting of: administering to an individual (eg, an individual suffering from a disease, tumor, etc.) a therapeutically active amount of an antigen-binding compound in accordance with the present invention.
В одном аспекте предложен способ уменьшения количества аденозина, продуцируемого экспрессирующей CD73 клеткой (например, иммунной клеткой и/или опухолевой клеткой у индивида), или способ нейтрализации ферментативной активности клеточного CD73, указанный способ включает, состоит по существу из или состоит из: приведения экспрессирующей CD73 клетки в контакт с антигенсвязывающим соединением в соответствии с настоящим изобретением (например, направленным против CD73 антителом или фрагментом антитела, или композицией, содержащей его). В одном варианте реализации этап приведения экспрессирующей CD73 клетки в контакт с антигенсвязывающим соединением в соответствии с настоящим изобретением включает введение индивиду терапевтически активного количества антигенсвязывающего соединения. В одном варианте реализации у индивида есть рак.In one aspect, there is provided a method of reducing the amount of adenosine produced by a CD73 expressing cell (e.g., an immune cell and/or a tumor cell in an individual), or a method of neutralizing the enzymatic activity of a cellular CD73, the method comprising, consisting essentially of, or consisting of: bringing the CD73 expressing cells into contact with an antigen-binding compound in accordance with the present invention (eg, an anti-CD73 antibody or antibody fragment, or a composition containing the same). In one embodiment, the step of contacting a CD73-expressing cell with an antigen-binding compound in accordance with the present invention comprises administering to a subject a therapeutically active amount of the antigen-binding compound. In one embodiment, the individual has cancer.
В одном аспекте предложен способ уменьшения количества аденозина, присутствующего в окружении опухоли (например, в организме индивида), указанный способ включает, состоит по существу из или состоит из: введения индивиду терапевтически активного количества соединения в соответствии с настоящим изобретением (например, направленного против CD73 антитела или фрагмента антитела, или композиции, содержащей его). В одном варианте реализации у индивида есть рак. Необязательно индивид представляет собой человека, у которого есть рак или который предрасположен к раку.In one aspect, a method is provided for reducing the amount of adenosine present in the environment of a tumor (e.g., in the body of an individual), said method comprising, consisting essentially of, or consisting of: administering to the individual a therapeutically active amount of a compound of the present invention (e.g., directed against CD73 antibody or antibody fragment, or a composition containing the same). In one embodiment, the individual has cancer. The individual is not necessarily a person who has cancer or is susceptible to cancer.
Для антител необязательно характерна аффинность связывания (KD) с полипептидом CD73 человека (например, в виде димера CD73), которую определяют с помощью поверхностного плазмонного резонанса (ППР, например, в соответствии со способами, описанными в разделе Примеры), менее (лучше) 10-9 М, предпочтительно менее 10-10 M или предпочтительно менее 10-11 М, и/или связывание с полипептидом CD73 человека с ЕС50 менее (лучшее связывание) 1 мкг/мл. В некоторых случаях можно уточнить, что аффинность связывания представляет собой аффинность бивалентного связывания.Antibodies do not necessarily have a binding affinity (K D ) for human CD73 polypeptide (e.g., as a CD73 dimer), as determined by surface plasmon resonance (SPR, e.g., according to the methods described in the Examples section), less (better) 10 -9 M, preferably less than 10 -10 M or preferably less than 10 -11 M, and/or binding to a human CD73 polypeptide with an EC 50 of less (best binding) 1 μg/ml. In some cases, it can be specified that the binding affinity is a bivalent binding affinity.
В одном варианте реализации ЕС50 указанного антитела составляет не более 0,5 мкг/мл, в некоторых случаях не более 0,2 мкг/мл, в некоторых случаях не более 0,1 мкг/мл для связывания с клетками (например, опухолевыми клетками, клетками MDA-МВ-231), экспрессирующими CD73 человека на своей поверхности.In one embodiment, the EC 50 of said antibody is no more than 0.5 μg/ml, in some cases no more than 0.2 μg/ml, in some cases no more than 0.1 μg/ml for binding to cells (e.g., tumor cells , MDA-MB-231 cells) expressing human CD73 on their surface.
Для антител необязательно характерна ЕС50 для нейтрализации ферментативной активности CD73 в экспрессирующих CD73 клетках (например, опухолевых клетках, клетках MDA-MB-231) менее (лучше) 1 мкг/мл, необязательно менее 0,5 мкг/мл.Antibodies optionally have an EC 50 for neutralizing CD73 enzymatic activity in CD73 expressing cells (eg, tumor cells, MDA-MB-231 cells) of less than (better) 1 μg/ml, optionally less than 0.5 μg/ml.
В одном варианте реализации антитело представляет собой моноклональное антитело или его фрагмент, у которого сохраняется специфичность связывания и способность нейтрализовать ферментативную активность CD73 (например, которую определяют путем оценки способности антитела или фрагмента антитела повышать пролиферацию Т-клеток, когда вызвана пролиферация указанных Т-клеток in vitro в присутствии АМФ (например, экзогенно добавленного АМФ). В одном варианте реализации антитело по существу так же эффективно или по меньшей мере так же эффективно, как и исходное антитело, содержащее соответствующие последовательности аминокислот VH и VL, представленные в SEQ ID NO: 40 и 41, в отношении нейтрализации ферментативной активности CD73, необязательно при этом ЕС50 антитела для нейтрализации ферментативной активности CD73 находится в пределах 1-log, 0,5-log ЕС50 исходного антитела. В одном варианте реализации указанное антитело более эффективно, чем исходное антитело, содержащее соответствующие последовательности аминокислот VH и VL, представленные в SEQ ID NO: 40 и 41, в отношении нейтрализации ферментативной активности CD73, причем необязательно ЕС50 антитела для нейтрализации ферментативной активности CD73 ниже, чем у исходного антитела, содержащего соответствующие последовательности аминокислот VH и VL, представленные в SEQ ID NO: 40 и 41.In one embodiment, the antibody is a monoclonal antibody or fragment thereof that retains binding specificity and ability to neutralize CD73 enzymatic activity (e.g., as determined by assessing the ability of the antibody or antibody fragment to enhance T cell proliferation when said T cells are induced to proliferate in vitro in the presence of AMP (eg, exogenously added AMP). In one embodiment, the antibody is substantially as effective or at least as effective as the parent antibody containing the corresponding VH and VL amino acid sequences set forth in SEQ ID NO: 40. and 41, for neutralizing CD73 enzymatic activity, optionally wherein the EC 50 of the antibody to neutralize CD73 enzymatic activity is within 1-log, 0.5-log EC 50 of the parent antibody. In one embodiment, said antibody is more effective than the parent antibody. containing the corresponding VH and VL amino acid sequences set forth in SEQ ID NOs: 40 and 41 for neutralizing CD73 enzymatic activity, wherein the EC 50 of the antibody for neutralizing CD73 enzymatic activity is optionally lower than that of the parent antibody containing the corresponding VH and VL amino acid sequences , presented in SEQ ID NO: 40 and 41.
В одном варианте реализации антитело по существу так же эффективно или по меньшей мере так же эффективно, как и исходное антитело, содержащее соответствующие последовательности аминокислот VH и VL, представленные в SEQ ID NO: 27 и 28, в отношении нейтрализации ферментативной активности CD73, необязательно при этом ЕС50 антитела для нейтрализации ферментативной активности CD73 находится в пределах 1-log или 0,5-log ЕС50 исходного антитела. В одном варианте реализации указанное антитело более эффективно, чем исходное антитело, содержащее соответствующие последовательности аминокислот VH и VL, представленные в SEQ ID NO: 27 и 28, в отношении нейтрализации ферментативной активности CD73, необязательно при этом ЕС50 антитела для нейтрализации ферментативной активности CD73 меньше, чем у исходного антитела, имеющего соответствующие последовательности аминокислот VH и VL SEQ ID NO: 27 и 28.In one embodiment, the antibody is substantially as effective or at least as effective as the parent antibody comprising the corresponding VH and VL amino acid sequences set forth in SEQ ID NOs: 27 and 28 in neutralizing CD73 enzymatic activity, optionally at This antibody's EC 50 to neutralize CD73 enzymatic activity is within 1-log or 0.5-log of the parent antibody's EC 50 . In one embodiment, the antibody is more effective than the parent antibody comprising the corresponding VH and VL amino acid sequences set forth in SEQ ID NOs: 27 and 28 at neutralizing CD73 enzymatic activity, optionally the EC 50 of the antibody for neutralizing CD73 enzymatic activity being less. than the parent antibody having the corresponding amino acid sequences VH and VL SEQ ID NO: 27 and 28.
Также предложены изолированные и/или рекомбинантные нуклеиновые кислоты (например, наборы нуклеиновых кислот), кодирующие антитело (или его тяжелую или легкую цепь) или домен VH и/или VL согласно настоящему изобретению, вектор или набор векторов, содержащих такую нуклеиновую(-ые) кислоту(-ы), клетка, содержащая такой вектор, и способ получения направленного против CD73 антитела или фрагмента антитела человека, включающий культивирование такой клетки в условиях, подходящих для экспрессии направленного против CD73 антитела или фрагмента антитела. В соответствии с настоящим изобретением также предложены композиции, такие как фармацевтически приемлемые композиции, и наборы, содержащие такие белки, нуклеиновые кислоты, векторы и/или клетки и, как правило, один или более дополнительных ингредиентов, которые могут представлять собой активные ингредиенты или неактивные ингредиенты, которые способствуют составлению, доставке, стабильности или другим характеристикам композиции (например, различные носители). В соответствии с настоящим изобретением дополнительно предложены различные новые и пригодные способы получения и применения таких антител, нуклеиновых кислот, векторов, клеток, организмов и/или композиций, например, для модулирования опосредованной CD73 биологической активности, например, для лечения заболеваний, связанных с ней, в частности, рака.Also provided are isolated and/or recombinant nucleic acids (for example, sets of nucleic acids) encoding an antibody (or a heavy or light chain thereof) or a VH and/or VL domain according to the present invention, a vector or a set of vectors containing such nucleic acid(s) acid(s), a cell containing such a vector, and a method of producing a human anti-CD73 antibody or antibody fragment, comprising culturing such cell under conditions suitable for expression of the anti-CD73 antibody or antibody fragment. The present invention also provides compositions, such as pharmaceutically acceptable compositions, and kits containing such proteins, nucleic acids, vectors and/or cells and typically one or more additional ingredients, which may be active ingredients or inactive ingredients that contribute to formulation, delivery, stability, or other characteristics of the composition (eg, various media). The present invention further provides various new and useful methods for producing and using such antibodies, nucleic acids, vectors, cells, organisms and/or compositions, for example, to modulate CD73-mediated biological activity, for example, to treat diseases associated therewith, in particular cancer.
В соответствии с настоящим изобретением также предложены способы получения или тестирования антитела или фрагмента антитела, которое связывает и нейтрализует ферментативную активность CD73.The present invention also provides methods for producing or testing an antibody or antibody fragment that binds and neutralizes the enzymatic activity of CD73.
В настоящем изобретении также предложен способ усиления активности лимфоцитов (например, Т-клеток) у нуждающегося в этом субъекта или восстановления активности лимфоцитов (например, Т-клеток), или способ ослабления опосредованного аденозином ингибирования активности лимфоцитов (например, Т-клеток), указанный способ включает введение субъекту эффективного количества любой из указанных выше композиций. В одном варианте реализации субъект представляет собой пациента, страдающего от рака. Например, пациент может страдать от солидной опухоли, например, коло ректального рака, рака почки, рака яичников, рака легких, рака молочной железы или злокачественной меланомы. В качестве альтернативы, пациент может страдать от гематопоэтического рака, например, острого миелоидного лейкоза, хронического миелоидного лейкоза, множественной миеломы или неходжкинской лимфомы.The present invention also provides a method of enhancing the activity of lymphocytes (eg, T cells) in a subject in need thereof or restoring the activity of lymphocytes (eg, T cells), or a method of attenuating adenosine-mediated inhibition of lymphocyte activity (eg, T cells), such as the method includes administering to the subject an effective amount of any of the above compositions. In one embodiment, the subject is a patient suffering from cancer. For example, the patient may suffer from a solid tumor, such as colorectal cancer, kidney cancer, ovarian cancer, lung cancer, breast cancer or malignant melanoma. Alternatively, the patient may suffer from a hematopoietic cancer, such as acute myeloid leukemia, chronic myeloid leukemia, multiple myeloma or non-Hodgkin's lymphoma.
Указанные аспекты более полно изложены в описании, представленном в данном документе, и при его изучении будут очевидны дополнительные аспекты, особенности и преимущества.These aspects are set forth more fully in the description provided herein, and upon examination thereof additional aspects, features and advantages will become apparent.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙBRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS
На Фигурах 1А-1В показаны кривые титрования, полученные для гуманизированных вариантов, содержащих вариабельные области тяжелой цепи Н0, Н1, Н2, Н3 и Н4, каждая из которых находится в комбинации с каждой из вариабельных областей легкой цепи L0, L1, L2, L3 и L4, и исходного антитела мыши HPLP, исследованные на трансфицированных линиях клеток, экспрессирующих белок CD73 человека (Фигура 1А) или яванского макака (Фигура 1В).Figures 1A-1B show the titration curves obtained for humanized variants containing the heavy chain variable regions H0, H1, H2, H3 and H4, each of which is in combination with each of the light chain variable regions L0, L1, L2, L3 and L4, and the parent mouse HPLP antibody, tested in transfected cell lines expressing human (Figure 1A) or cynomolgus (Figure 1B) CD73 protein.
На Фигуре 2 показано блокирование ферментативной активности растворимого рекомбинантного CD73. На верхней левой панели (А) показано, что был измерен высокий уровень люминесценции при смешивании субстратов АТФ и CTG. При добавлении АМФ в реакционную смесь реакция CTG ингибировалась, что приводило к снижению люминесценции. В присутствии белка rhCD73, который гидролизует АМФ, уровень люминесценции восстанавливался. Показано блокирование ферментативной активности CD73 различными гуманизированными вариантами.Figure 2 shows the blocking of the enzymatic activity of soluble recombinant CD73. The top left panel (A) shows that high levels of luminescence were measured when the substrates ATP and CTG were mixed. When AMF was added to the reaction mixture, the CTG reaction was inhibited, resulting in a decrease in luminescence. In the presence of the rhCD73 protein, which hydrolyzes AMP, the level of luminescence was restored. Blocking of CD73 enzymatic activity by various humanized variants has been shown.
На Фигурах 3А-3С и 4А-4С показаны две серии экспериментов, проведенных для сравнения гуманизированных антител по их эффективности обращать опосредованное АМФ ингибирование пролиферации Т-клеток. На Фигурах 3А и 4А показан контроль пролиферации Т-клеток и ее ингибирование посредством АМФ для каждой серии экспериментов. На Фигурах 3В и 4В показана эффективность антител против CD73 в отношении восстановления пролиферации CD4+ Т-клеток, а на Фигурах 3С и 4С показана эффективность антител против CD73 в отношении восстановления пролиферации CD8+ Т-клеток. Пролиферацию клеток определяли по разведению маркера Cell Trace Violet. Данные выражены в виде среднего по двум повторам +/- стандартное отклонение.Figures 3A-3C and 4A-4C show two sets of experiments performed to compare humanized antibodies for their effectiveness in reversing AMP-mediated inhibition of T cell proliferation. Figures 3A and 4A show the control of T cell proliferation and its inhibition by AMP for each set of experiments. Figures 3B and 4B show the effectiveness of anti-CD73 antibodies in restoring CD4+ T cell proliferation, and Figures 3C and 4C show the effectiveness of anti-CD73 antibodies in restoring CD8+ T cell proliferation. Cell proliferation was determined by dilution of the Cell Trace Violet marker. Data are expressed as the mean of two replicates +/- standard deviation.
На Фигурах 5А-5С показано, что пролиферация Т-клеток восстанавливалась всеми антителами против CD73. На фиг. 5А показан контроль пролиферации субпопуляции Т-клеток и ее ингибирование посредством АМФ. На Фигуре 5В показана эффективность антител Н4+Lx и исходного антитела HPLP в отношении восстановления пролиферации CD4+ и CD8+ Т-клеток. На Фигуре 5С показана эффективность антител 2H4+2Lx (цепи 2Н4+ в комбинации с цепями 2L1, 2L2, 2L3 или 2L4) и исходного антитела 2HP2LP в отношении восстановления пролиферации CD4+ и CD8+ Т-клеток. Данные выражены в виде среднего по двум повторам +/- стандартное отклонение.Figures 5A-5C show that T cell proliferation was restored by all anti-CD73 antibodies. In fig. 5A shows the control of proliferation of a subset of T cells and its inhibition by AMP. Figure 5B shows the effectiveness of the H4+Lx antibody and the parent HPLP antibody in restoring CD4+ and CD8+ T cell proliferation. Figure 5C shows the effectiveness of 2H4+2Lx antibodies (2H4+ chains in combination with 2L1, 2L2, 2L3 or 2L4 chains) and the parent antibody 2HP2LP in restoring CD4+ and CD8+ T cell proliferation. Data are expressed as the mean of two replicates +/- standard deviation.
На Фигурах 6А и 6В показано, что пролиферация Т-клеток, восстановленная гуманизированными вариантами, воспроизводима, соответственно, в двух типичных донорах-людях. Показана эффективность вариантов 2H4+2Lx антитела против CD73 в отношении восстановления пролиферации CD4 и CD8 Т-клеток. Данные выражены в виде среднего по двум повторам +/- стандартное отклонение.Figures 6A and 6B show that T cell proliferation restored by the humanized variants is reproducible, respectively, in two representative human donors. The 2H4+2Lx variants of the anti-CD73 antibody have been shown to be effective in restoring the proliferation of CD4 and CD8 T cells. Data are expressed as the mean of two replicates +/- standard deviation.
На Фигуре 7 показано, что пролиферация CD4+ Т-клеток ингибируется АТФ и восстанавливается вариантами антитела 2H4+2Lx. Контроль пролиферации CD4+ Т-клеток и ее ингибирование посредством 100 мкМ АТФ, показанные при исследовании в двух типичных донорах D795 (фиг. 7А) и D664 (фиг. 7В). Данные выражены в виде среднего по двум повторам +/- стандартное отклонение.Figure 7 shows that CD4+ T cell proliferation is inhibited by ATP and restored by the 2H4+2Lx antibody variants. Control of CD4+ T cell proliferation and its inhibition by 100 μM ATP demonstrated in two representative donors D795 (Fig. 7A) and D664 (Fig. 7B). Data are expressed as the mean of two replicates +/- standard deviation.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
ОпределенияDefinitions
В настоящем описании формы единственного числа могут означать один или более. В пункте(-ах) формулы изобретения, при использовании в сочетании с термином «включающий», формы единственного числа могут означать один или более чем один. В данном документе «другой» может означать по меньшей мере второй или более.As used herein, singular forms may mean one or more. In claim(s), when used in conjunction with the term “including,” the singular forms may mean one or more than one. As used herein, “other” may mean at least a second or more.
Если используется термин «включающий», то его необязательно можно заменить на «состоящий по существу из» или на «состоящий из».If the term "comprising" is used, it may not necessarily be replaced by "consisting essentially of" or "consisting of".
CD73 человека, также известный как экто-5'-нуклеотидаза и как 5'-рибонуклеотидфосфогидролаза, ЕС 3.1.3.5, кодируемый геном NT5E, проявляет 5'-нуклеотидазную, а именно АМФ-, НАД- и НМН-нуклеозидазные активности. При нейтральном рН CD73 катализирует превращение пуриновых 5'-мононуклеотидов в нуклеозиды, предпочтительным субстратом является АМФ. Данный фермент состоит из димера из 2 идентичных субъединиц с молекулярной массой 70 кДа, связанных гликозилфосфатидилинозитольной связью с внешней поверхностью плазматической мембраны. Последовательность аминокислот пребелка CD73 человека (мономера), включая сигнальную последовательность (аминокислоты 1-26), представлена в Genbank под номером доступа NP_002517, сведения о которой полностью включены в данную заявку посредством ссылки и приведены далее:Human CD73, also known as ecto-5'-nucleotidase and as 5'-ribonucleotide phosphohydrolase, EC 3.1.3.5, encoded by the NT5E gene, exhibits 5'-nucleotidase, namely AMP, NAD and HMN nucleosidase activities. At neutral pH, CD73 catalyzes the conversion of purine 5'-mononucleotides to nucleosides, the preferred substrate being AMP. This enzyme consists of a dimer of 2 identical subunits with a molecular weight of 70 kDa, linked by a glycosylphosphatidylinositol bond to the outer surface of the plasma membrane. The amino acid sequence of the human CD73 preprotein (monomer), including the signal sequence (amino acids 1-26), is presented in Genbank under accession number NP_002517, details of which are incorporated herein by reference in their entirety and are set forth below:
В контексте данного документа «нейтрализовать ферментативную активность CD73» относится к процессу, в котором 5'-нуклеотидазная (5'-эктонуклеотидазная) активность CD73 ингибируется. Это включает, в частности, ингибирование опосредованного CD73 образования аденозина, т.е., ингибирование опосредованного CD73 катаболизма АМФ с образованием аденозина. Это можно измерить, например, в бесклеточном анализе, в котором измеряют способность тестируемого соединения ингибировать превращение АМФ в аденозин, либо непосредственно, либо опосредованно. В одном варианте реализации препарат антител вызывает снижение по меньшей мере на 50% превращения АМФ в аденозин, снижение по меньшей мере на 70% превращения АМФ в аденозин или снижение по меньшей мере на 80% превращения АМФ в аденозин, что определяют, например, в способах анализа, описанных в данной заявке.As used herein, “neutralize the enzymatic activity of CD73” refers to the process in which the 5'-nucleotidase (5'-ectonucleotidase) activity of CD73 is inhibited. This includes, in particular, inhibition of CD73-mediated adenosine formation, ie, inhibition of CD73-mediated catabolism of AMP to adenosine. This can be measured, for example, in a cell-free assay that measures the ability of a test compound to inhibit the conversion of AMP to adenosine, either directly or indirectly. In one embodiment, the antibody preparation causes at least a 50% reduction in the conversion of AMP to adenosine, an at least 70% reduction in the conversion of AMP to adenosine, or an at least 80% reduction in the conversion of AMP to adenosine, as determined, for example, in the methods analysis described in this application.
Всякий раз, когда в данном описании "лечение рака" или тому подобные формулировки упоминаются в отношении направленного против CD73 связывающего агента (например, антитела), они означают: (а) способ лечения рака, причем указанный способ включает этап введения (для по меньшей мере одного лечения) направленного против CD73 связывающего агента (предпочтительно в фармацевтически приемлемом материале-носителе) индивиду, млекопитающему, в частности, человеку, нуждающемуся в таком лечении, в дозе, которая позволяет лечить рак (терапевтически эффективном количестве), предпочтительно в дозе (количестве), указанной в настоящем документе; (b) применение направленного против CD73 связывающего агента для лечения рака, или направленный против CD73 связывающий агент для применения для указанного лечения (в частности, у человека); (с) применение направленного против CD73 связывающего агента для производства фармацевтического состава для лечения рака, способ применения направленного против CD73 связывающего агента для производства фармацевтического состава для лечения рака, включающий смешивание направленного против CD73 связывающего агента с фармацевтически приемлемым носителем, или фармацевтический состав, содержащий эффективную дозу направленного против CD73 связывающего агента, подходящую для лечения рака; или (d) любую комбинацию а), b) и с), в соответствии с объектом изобретения, допустимым для патентования в стране, в которой подана настоящая заявка.Whenever "treating cancer" or the like is referred to herein with respect to an anti-CD73 binding agent (e.g., an antibody), it means: (a) a method of treating cancer, wherein said method includes the step of administering (for at least one treatment) of an anti-CD73 binding agent (preferably in a pharmaceutically acceptable carrier material) to an individual, mammal, in particular a human, in need of such treatment, at a dose that treats the cancer (therapeutically effective amount), preferably at a dose (amount) specified in this document; (b) the use of an anti-CD73 binding agent for the treatment of cancer, or an anti-CD73 binding agent for use in such treatment (particularly in humans); (c) using an anti-CD73 binding agent for the production of a pharmaceutical composition for the treatment of cancer, a method of using an anti-CD73 binding agent for the production of a pharmaceutical composition for the treatment of cancer, comprising mixing the anti-CD73 binding agent with a pharmaceutically acceptable carrier, or a pharmaceutical composition containing an effective a dose of an anti-CD73 binding agent suitable for the treatment of cancer; or (d) any combination of a), b) and c), in accordance with the subject matter of the invention, which is eligible for patenting in the country in which this application is filed.
Термин «антитело» в данном документе относится к поликлональным и моноклональным антителам. В зависимости от типа константного домена в тяжелых цепях, антитела относят к одному из пяти основных классов: IgA, IgD, IgE, IgG и IgM. Некоторые из них дополнительно подразделяют на подклассы или изотипы, такие как IgG1, IgG2, IgG3, IgG4 и тому подобные изотипы. Типичная структурная единица иммуноглобулина (антитела) включает тетрамер. Каждый тетрамер состоит из двух идентичных пар поли пептидных цепей, каждая пара содержит одну «легкую» (приблизительно 25 кДа) и одну «тяжелую» (приблизительно 50-70 кДа) цепь. N-конец каждой цепи содержит вариабельную область из приблизительно 100-110 или более аминокислот, которая в первую очередь отвечает за распознавание антигена. Термины вариабельная легкая цепь (VL) и вариабельная тяжелая цепь (VH) относятся к данным легкой и тяжелой цепям, соответственно. Константные домены тяжелой цепи, которые соответствуют различным классам иммуноглобулинов, называют «альфа», «дельта», «эпсилон», «гамма» и «мю», соответственно. Субъединичные структуры и трехмерные конфигурации различных классов иммуноглобулинов хорошо известны. IgG являются примерами классов антител, используемых в данной заявке, потому что они представляют собой наиболее распространенные антитела в физиологических условиях и потому что их наиболее просто получить в лабораторных условиях. Необязательно антитело представляет собой моноклональное антитело. Конкретными примерами антител являются гуманизированные, химерные, человеческие или другим образом подходящие человеку антитела. Термин «антитела» также включает любой фрагмент или производное любого из описанных в данной заявке антител.The term “antibody” as used herein refers to polyclonal and monoclonal antibodies. Depending on the type of constant domain in the heavy chains, antibodies are classified into one of five main classes: IgA, IgD, IgE, IgG and IgM. Some of them are further divided into subclasses or isotypes, such as IgG1, IgG2, IgG3, IgG4 and similar isotypes. A typical immunoglobulin (antibody) structural unit includes a tetramer. Each tetramer consists of two identical pairs of polypeptide chains, each pair containing one "light" (approximately 25 kDa) and one "heavy" (approximately 50-70 kDa) chain. The N-terminus of each chain contains a variable region of approximately 100-110 or more amino acids, which is primarily responsible for antigen recognition. The terms variable light chain ( VL ) and variable heavy chain ( VH ) refer to these light and heavy chains, respectively. The heavy chain constant domains that correspond to the different classes of immunoglobulins are called "alpha", "delta", "epsilon", "gamma" and "mu", respectively. The subunit structures and three-dimensional configurations of the various classes of immunoglobulins are well known. IgG are examples of antibody classes used in this application because they are the most abundant antibodies under physiological conditions and because they are the easiest to obtain in vitro. Optionally, the antibody is a monoclonal antibody. Specific examples of antibodies include humanized, chimeric, human or otherwise human antibodies. The term "antibodies" also includes any fragment or derivative of any of the antibodies described in this application.
Термин «специфически связывается» означает, что антитело может предпочтительно связываться в анализе конкурентного связывания с партнером по связыванию, например, CD73, что оценивают, используя либо рекомбинантные формы белков, либо эпитопы из них, либо нативные белки, присутствующие на поверхности изолированных клеток-мишеней. Способы анализа конкурентного связывания и другие способы определения специфического связывания дополнительно описаны ниже и хорошо известны в данной области.The term “specifically binds” means that the antibody may preferentially bind in a competitive binding assay to a binding partner, such as CD73, as assessed using either recombinant forms of the proteins, or epitopes thereof, or native proteins present on the surface of isolated target cells . Competitive binding assay methods and other methods for determining specific binding are further described below and are well known in the art.
Если указано, что антитело «конкурирует с» конкретным моноклональным антителом, то это означает, что антитело конкурирует с моноклональным антителом в анализе связывания с применением либо рекомбинантных молекул CD73, либо экспрессированных на поверхности молекул CD73. Например, если тестируемое антитело уменьшает связывание референсного антитела с полипептидом CD73 или экспрессирующей CD73 клеткой в анализе связывания, то говорят, что указанное антитело «конкурирует», соответственно, с референсным антителом.When an antibody is stated to “compete with” a particular monoclonal antibody, this means that the antibody competes with the monoclonal antibody in a binding assay using either recombinant CD73 molecules or surface expressed CD73 molecules. For example, if a test antibody reduces the binding of a reference antibody to a CD73 polypeptide or CD73-expressing cell in a binding assay, the antibody is said to “compete,” respectively, with the reference antibody.
Термин «аффинность» в данном документе означает силу связывания антитела с эпитопом. Аффинность антитела задается константой диссоциации Kd, которую определяют как [AT]x[АГ]/[АТ-АГ], где [АТ-АГ] представляет собой молярную концентрацию комплекса антитело-антиген, [AT] представляет собой молярную концентрацию несвязанного антитела и [АГ] представляет собой молярную концентрацию несвязанного антигена. Константу аффинности Ka определяют как 1/Kd. Способы определения аффинности МАТ можно найти в Harlow, и др., Antibodies: А Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Колд Спринг Харбор, Нью-Йорк, 1988), Coligan и др., ред., Current Protocols in Immunology, Greene Publishing Assoc. и Wiley Interscience, Нью-Йорк, (1992, 1993), и Muller, Meth. Enzymol. 92:589-601 (1983), указанные материалы полностью включены в данную заявку посредством ссылки. Одним стандартным способом, хорошо известным в данной области для определения аффинности МАТ, является применение скрининга методом поверхностного плазмонного резонанса (ППР) (такого как анализ с применением аналитического устройства для ППР BIAcore™).The term “affinity” as used herein refers to the strength of binding of an antibody to an epitope. The affinity of an antibody is given by the dissociation constant Kd, which is defined as [AT]x[AG]/[AT-AG], where [AT-AG] is the molar concentration of the antibody-antigen complex, [AT] is the molar concentration of unbound antibody, and [ AG] is the molar concentration of unbound antigen. The affinity constant K a is defined as 1/Kd. Methods for determining the affinity of mAbs can be found in Harlow, et al., Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 1988), Coligan et al., eds., Current Protocols in Immunology, Greene Publishing Assoc. and Wiley Interscience, New York, (1992, 1993), and Muller, Meth. Enzymol. 92:589-601 (1983), these materials are incorporated herein by reference in their entirety. One standard method well known in the art for determining mAb affinity is the use of surface plasmon resonance (SPR) screening (such as the BIAcore™ SPR assay).
В рамках контекста в данном документе «детерминанта» обозначает место взаимодействия или связывания на полипептиде.As used herein, “determinant” refers to an interaction or binding site on a polypeptide.
Термин «эпитоп» относится к антигенной детерминанте и представляет собой область или участок на антигене, с которым связывается антитело. Эпитоп белка может содержать аминокислотные остатки, непосредственно участвующие в связывании, а также аминокислотные остатки, которые эффективно блокируются специфическим связывающим антиген антителом или пептидом, т.е., аминокислотные остатки внутри «области узнавания» антитела. Это наиболее простая форма или наименьшая структурная область на сложной молекуле антигена, которая может соединяться, например, с антителом или рецептором. Эпитопы могут быть линейными или конформационными/структурными. Термин «линейный эпитоп» представляет собой эпитоп, состоящий из аминокислотных остатков, которые являются смежными на линейной последовательности аминокислот (первичной структуре). Термин «конформационный или структурный эпитоп» представляет собой эпитоп, состоящий из аминокислотных остатков, не все из которых являются смежными и, следовательно, представляют собой раздельные части линейной последовательности аминокислот, которые сближены друг с другом посредством укладки молекулы (вторичной, третичной и/или четвертичной структур). Конформационный эпитоп зависит от 3-мерной структуры. Термин «конформационный», следовательно, часто используют взаимозаменяемо с термином «структурный».The term "epitope" refers to an antigenic determinant and is the region or region on an antigen to which an antibody binds. A protein epitope may contain amino acid residues directly involved in binding, as well as amino acid residues that are effectively blocked by a specific antigen-binding antibody or peptide, i.e., amino acid residues within the “recognition region” of the antibody. It is the simplest form or smallest structural region on a complex antigen molecule that can bind to, for example, an antibody or receptor. Epitopes can be linear or conformational/structural. The term "linear epitope" is an epitope consisting of amino acid residues that are contiguous on a linear amino acid sequence (primary structure). The term "conformational or structural epitope" is an epitope consisting of amino acid residues, not all of which are contiguous and therefore represent distinct parts of a linear sequence of amino acids that are brought into close proximity to each other by molecular folding (secondary, tertiary and/or quaternary structures). The conformational epitope depends on the 3-dimensional structure. The term "conformational" is therefore often used interchangeably with the term "structural".
Термин «обеднять» или «обеднение», в отношении экспрессирующих CD73 клеток, означает процесс, способ или соединение, которые приводят к уничтожению, устранению, лизису или индукции такого уничтожения, устранения или лизиса, чтобы отрицательно повлиять на количество таких экспрессирующих CD73 клеток, присутствующих в образце или в организме субъекта.The term “deplete” or “depletion”, with respect to CD73 expressing cells, means a process, method or compound that results in the destruction, elimination, lysis or induction of such destruction, elimination or lysis so as to adversely affect the number of such CD73 expressing cells present in the sample or in the subject's body.
Термин «интернализация», используемый взаимозаменяемо с термином «внутриклеточная интернализация», относится к молекулярным, биохимическим и клеточным событиям, связанным с процессом перемещения молекулы с внеклеточной поверхности клетки на внутриклеточную поверхность клетки. Процессы, отвечающие за внутриклеточную интернализацию молекул, хорошо известны и могут включать, среди прочего, интернализацию внеклеточных молекул (таких как гормоны, антитела и малые органические молекулы); ассоциированных с мембраной молекул (таких как рецепторы на поверхности клеток); и комплексов ассоциированных с мембраной молекул, связанных с внеклеточными молекулами (например, лиганда, связанного с трансмембранным рецептором, или антитела, связанного с ассоциированной с мембраной молекулой). Таким образом, формулировка «вызвать и/или повысить интернализацию» включает события, при которых вызывается внутриклеточная интернализация и/или скорость и/или масштаб внутриклеточной интернализации повышается.The term "internalization", used interchangeably with the term "intracellular internalization", refers to the molecular, biochemical and cellular events associated with the process of moving a molecule from the extracellular surface of a cell to the intracellular surface of a cell. The processes responsible for the intracellular internalization of molecules are well known and may include, among others, the internalization of extracellular molecules (such as hormones, antibodies and small organic molecules); membrane-associated molecules (such as cell surface receptors); and complexes of membrane-associated molecules associated with extracellular molecules (eg, a ligand associated with a transmembrane receptor or an antibody associated with a membrane-associated molecule). Thus, the phrase “cause and/or enhance internalization” includes events in which intracellular internalization is caused and/or the rate and/or extent of intracellular internalization is increased.
Термин «агент» используют в данной заявке для обозначения химического соединения, смеси химических соединений, биологической макромолекулы или экстракта, полученного из биологических материалов. Термин «терапевтический агент» относится к агенту, который проявляет биологическую активность.The term "agent" is used herein to refer to a chemical compound, a mixture of chemical compounds, a biological macromolecule, or an extract derived from biological materials. The term "therapeutic agent" refers to an agent that exhibits biological activity.
Для целей, описанных в данной заявке, «гуманизированное» или «человеческое» антитело относится к антителу, в котором константная и вариабельная область каркасной области одного или более иммуноглобулинов человека соединена со связывающей областью, например, определяющей комплементарность областью (CDR), иммуноглобулина животного. Такие антитела разработаны, чтобы сохранить специфичности связывания не принадлежащего человеку антитела, из которого получены указанные связывающие области, но избежать реакции иммунной системы против не принадлежащего человеку антитела. Такие антитела можно получить из трансгенных мышей или других животных, которые были «сконструированы», чтобы они продуцировали специфические человеческие антитела в ответ на провокацию антигеном (см., например, Green и др. (1994) Nature Genet 7:13; Lonberg и др. (1994) Nature 368:856; Taylor и др. (1994) Int Immun 6:579, информация из которых полностью включена в данную заявку посредством ссылки). Полностью человеческое антитело также можно сконструировать с помощью способов генетической или хромосомной трансфекции, а также технологии фагового дисплея, все из которых известны в данной области (см., например, McCafferty и др. (1990) Nature 348:552-553). Человеческие антитела также могут вырабатываться активированными in vitro В-клетками (см., например, патенты США номер 5567610 и 5229275, содержания которых полностью включены в данную заявку посредством ссылки).For purposes described herein, a “humanized” or “human” antibody refers to an antibody in which a constant and variable region of a framework region of one or more human immunoglobulins is linked to a binding region, such as a complementarity determining region (CDR), of an animal immunoglobulin. Such antibodies are designed to retain the binding specificities of the non-human antibody from which the binding regions are derived, but to avoid an immune system reaction against the non-human antibody. Such antibodies can be obtained from transgenic mice or other animals that have been "engineered" to produce specific human antibodies in response to antigen challenge (see, for example, Green et al. (1994) Nature Genet 7:13; Lonberg et al. (1994) Nature 368:856; Taylor et al (1994) Int Immun 6:579, the information of which is incorporated herein by reference in its entirety. A fully human antibody can also be constructed using genetic or chromosomal transfection techniques, as well as phage display technology, all of which are known in the art (see, for example, McCafferty et al. (1990) Nature 348:552-553). Human antibodies can also be produced by in vitro activated B cells (see, for example, US Pat. Nos. 5,567,610 and 5,229,275, the contents of which are incorporated herein by reference in their entirety).
Термин «гипервариабельный участок», используемый в данной заявке, относится к аминокислотным остаткам антитела, которые отвечают за связывание с антигеном. Гипервариабельный участок, как правило, содержит аминокислотные остатки из «определяющей комплементарность области» или «CDR» (например, остатки 24-34 (L1), 50-56 (L2) и 89-97 (L3) в вариабельном домене легкой цепи и 31-35 (Н1), 50-65 (Н2) и 95-102 (Н3) в вариабельном домене тяжелой цепи; Kabat и др. 1991) и/или остатки из «гипервариабельной петли» (например, остатки 26-32 (L1), 50-52 (L2) и 91-96 (L3) в вариабельном домене легкой цепи и 26-32 (Н1), 53-55 (Н2) и 96-101 (Н3) в вариабельном домене тяжелой цепи; Chothia и Lesk, J. Mol. Biol 1987;196:901-917), или см. аналогичную систему определения необходимых аминокислот, отвечающих за связывание антигена. Обычно, нумерацию аминокислотных остатков в данном участке осуществляют с помощью способа, описанного в Kabat и др., выше. Такие формулировки, как «положение по Кабату», «нумерация остатков вариабельного домена по Кабату» и «согласно Кабату», используемые в данном документе, относятся к этой системе нумерации для вариабельных доменов тяжелой цепи или вариабельных доменов легкой цепи. При использовании системы нумерации по Кабату фактическая линейная последовательность аминокислот пептида может содержать меньшее количество аминокислот, что соответствует укорачиванию, или дополнительные аминокислоты, что соответствует вставке в FR или CDR вариабельного домена. Например, вариабельный домен тяжелой цепи может содержать вставку одной аминокислоты (остаток 52а согласно Кабату) после остатка 52 в CDR Н2 и вставленные остатки (например, остатки 82а, 82b и 82 с и т.д. согласно Кабату) после остатка 82 FR тяжелой цепи. Нумерацию остатков по Кабату можно определить для данного антитела путем выравнивания в участках гомологии последовательности антитела со «стандартной» пронумерованной по Кабату последовательностью.The term "hypervariable region" as used herein refers to the amino acid residues of an antibody that are responsible for binding to an antigen. The hypervariable region typically contains amino acid residues from the “complementarity determining region” or “CDR” (for example, residues 24-34 (L1), 50-56 (L2) and 89-97 (L3) in the light chain variable domain and 31 -35 (H1), 50-65 (H2) and 95-102 (H3) in the heavy chain variable domain; Kabat et al. 1991) and/or residues from the “hypervariable loop” (e.g. residues 26-32 (L1) , 50-52 (L2) and 91-96 (L3) in the light chain variable domain and 26-32 (H1), 53-55 (H2) and 96-101 (H3) in the heavy chain variable domain, Chothia and Lesk, J. Mol. Biol 1987;196:901-917), or see a similar system for determining the essential amino acids responsible for antigen binding. Typically, the numbering of amino acid residues in a given region is carried out using the method described in Kabat et al., above. Phrases such as “Kabat position,” “Kabat variable domain residue numbering,” and “Kabat numbering” as used herein refer to this numbering system for heavy chain variable domains or light chain variable domains. When using the Kabat numbering system, the actual linear amino acid sequence of the peptide may contain fewer amino acids, corresponding to a shortening, or additional amino acids, corresponding to an insertion into the FR or CDR of the variable domain. For example, the heavy chain variable domain may contain a single amino acid insertion (residue 52a according to Kabat) after residue 52 in the H2 CDR and inserted residues (e.g., residues 82a, 82b and 82c, etc. according to Kabat) after residue 82 of the heavy chain FR . Kabat numbering of residues can be determined for a given antibody by aligning regions of homology between the antibody sequence and a “standard” Kabat numbering sequence.
Термин остатки «каркаса» или «FR» в данном документе означает участок вариабельного домена антитела за исключением участков, определенных как CDR. Каждый каркас вариабельного домена антитела можно дополнительно подразделить на непрерывные участки, разделенные участками CDR (FR1, FR2, FR3 и FR4).The term “framework” residues or “FR” as used herein means the variable domain region of an antibody excluding regions defined as CDRs. Each antibody variable domain framework can be further subdivided into contiguous regions separated by CDR regions (FR1, FR2, FR3 and FR4).
Термины «домен Fc», «часть Fc» и «область Fc» относятся к С-концевому фрагменту тяжелой цепи антитела, например, от приблизительно аминокислоты (АК) 230 до приблизительно АК 450 тяжелой цепи γ (гамма) человека или аналогичной ей последовательности в другом типе тяжелых цепей антитела (например, α, δ, ε и μ для антитела человека), или встречающегося в природе ее аллотипа. Если не указано иное, в настоящем описании используют общепринятую нумерацию аминокислот по Кабату для иммуноглобулинов (см. Кабат и др. (1991), Sequences of Protein of Immunological Interest, 5oe изд., Министерство здравоохранения Соединенных Штатов Америки, Национальный институт здоровья, Бетесда, Мэриленд).The terms “Fc domain,” “Fc portion,” and “Fc region” refer to the C-terminal portion of an antibody heavy chain, for example, from about amino acid (AA) 230 to about AA 450 of human γ (gamma) heavy chain or similar sequence in another type of antibody heavy chain (eg, α, δ, ε, and μ for a human antibody), or a naturally occurring allotype thereof. Unless otherwise noted, Kabat's generally accepted amino acid numbering for immunoglobulins is used herein (see Kabat et al. (1991), Sequences of Protein of Immunological Interest, 5th ed., United States Department of Health, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland).
Термины «выделенный», «очищенный» или «биологически чистый» относятся к материалу, который практически или по существу не содержит компонентов, которые при нормальных условиях сопутствуют ему при нахождении в природном состоянии. Чистоту и гомогенность обычно определяют, применяя методики аналитической химии, такие как электрофорез в полиакриламидном геле или высокоэффективная жидкостная хроматография. Белок, который является преобладающим видом из присутствующих в препарате, является по существу очищенным.The terms “isolated,” “purified,” or “biologically pure” refer to a material that is virtually or substantially free of the components that would normally accompany it in its natural state. Purity and homogeneity are usually determined using analytical chemistry techniques such as polyacrylamide gel electrophoresis or high performance liquid chromatography. The protein, which is the predominant species present in the preparation, is essentially purified.
Термины «полипептид», «пептид» и «белок» используют взаимозаменяемо в данной заявке по отношению к полимеру из аминокислотных остатков. Указанные термины распространяются на полимеры аминокислот, в которых один или более аминокислотных остатков представляет собой искусственный химический миметик соответствующей встречающейся в природе аминокислоты, а также на встречающиеся в природе полимеры аминокислот и не встречающиеся в природе полимеры аминокислот.The terms "polypeptide", "peptide" and "protein" are used interchangeably in this application to refer to a polymer of amino acid residues. These terms include amino acid polymers in which one or more amino acid residues is an artificial chemical mimetic of the corresponding naturally occurring amino acid, as well as naturally occurring amino acid polymers and non-naturally occurring amino acid polymers.
Термин «рекомбинантный», используемый, например, по отношению к клетке, или нуклеиновой кислоте, белку или вектору, указывает на то, что клетка, нуклеиновая кислота, белок или вектор были модифицированы путем внедрения гетерологичной нуклеиновой кислоты или белка или изменения нативной нуклеиновой кислоты или белка, или что клетка произошла из клетки, модифицированной таким образом. Следовательно, например, рекомбинантные клетки экспрессируют гены, которые не обнаруживаются внутри нативной (нерекомбинантной) формы клетки, или экспрессируют нативные гены, которые иным образом аномально экспрессируются, экспрессируются на пониженном уровне или не экспрессируются вовсе.The term "recombinant", used for example in relation to a cell, or nucleic acid, protein or vector, indicates that the cell, nucleic acid, protein or vector has been modified by the introduction of a heterologous nucleic acid or protein or by alteration of a native nucleic acid or protein, or that the cell originated from a cell modified in this way. Therefore, for example, recombinant cells express genes that are not found within the native (non-recombinant) form of the cell, or express native genes that are otherwise abnormally expressed, expressed at a reduced level, or not expressed at all.
В рамках контекста в данной заявке, термин антитело, которое «связывает» полипептид или эпитоп, означает антитело, которое связывает указанную детерминанту со специфичностью и/или аффинностью.As used herein, the term antibody that “binds” a polypeptide or epitope means an antibody that binds the determinant with specificity and/or affinity.
Термин «идентичность» или «идентичный», используемый по отношению к родству между последовательностями двух или более полипептидов, относится к степени родства между последовательностями полипептидов, которую определяют по количеству совпадений между цепочками из двух или более аминокислотных остатков. «Идентичность» является мерой процента точных совпадений меньшей из двух или более последовательностей с выровненными с использованием гэпов (при необходимости) последовательностями, что вычисляют с помощью конкретной математической модели или компьютерной программы (т.е., «алгоритмов»). Идентичность родственных полипептидов можно легко рассчитать с помощью известных способов. Такие способы включают, но не ограничены способами, описанными в Computational Molecular Biology, Lesk, A.M., ред., Oxford University Press, Нью-Йорк, 1988; Biocomputing: Informatics and Genome Projects, Smith, D.W., ред., Academic Press, Нью-Йорк, 1993; Computer Analysis of Sequence Data, часть 1, Griffin, A.M., и Griffin, H.G., ред., Humana Press, Нью-Джерси, 1994; Sequence Analysis in Molecular Biology, von Heinje, G., Academic Press, 1987; Sequence Analysis Primer, Gribskov, M. и Devereux, J., ред., M. Stockton Press, Нью-Йорк, 1991; и Carillo и др., SIAM J. Applied Math. 48, 1073 (1988).The term "identity" or "identical", as used in relation to the relatedness between the sequences of two or more polypeptides, refers to the degree of relatedness between polypeptide sequences, which is determined by the number of matches between chains of two or more amino acid residues. “Identity” is a measure of the percentage of exact matches of the smaller of two or more sequences to gap-aligned (if necessary) sequences, as calculated using a specific mathematical model or computer program (i.e., “algorithms”). The identity of related polypeptides can be easily calculated using known methods. Such methods include, but are not limited to those described in Computational Molecular Biology, Lesk, A.M., ed., Oxford University Press, New York, 1988; Biocomputing: Informatics and Genome Projects, Smith, D.W., ed., Academic Press, New York, 1993; Computer Analysis of Sequence Data,
Способы определения идентичности разработаны, чтобы определить наибольшее совпадение между исследуемыми последовательностями. Способы определения идентичности описаны в общедоступных компьютерных программах. Способы определения идентичности между двумя последовательностями с помощью компьютерных программ включают пакет программ GCG, включая GAP (Devereux и др., Nucl. Acid. Res. 12, 387 (1984); Genetics Computer Group, Университет Висконсина, Мэдисон, Висконсин), BLASTP, BLASTN и FASTA (Altschul и др., J. Mol. Biol. 215, 403-410 (1990)). Программа BLASTX общедоступна на National Center for Biotechnology Information (NCBI) и в других источниках (BLAST Manual, Altschul и др. NCB/NLM/NIH Бетесда, Мэриленд. 20894; Altschul и др., выше). Хорошо известный алгоритм Смита-Уотермана также можно использовать для определения идентичности.Identity determination methods are designed to determine the closest match between sequences of interest. Methods for determining identity are described in publicly available computer programs. Methods for determining identity between two sequences using computer programs include the GCG software package, including GAP (Devereux et al., Nucl. Acid. Res. 12, 387 (1984); Genetics Computer Group, University of Wisconsin, Madison, Wis.), BLASTP, BLASTN and FASTA (Altschul et al., J. Mol. Biol. 215, 403-410 (1990)). The BLASTX program is publicly available from the National Center for Biotechnology Information (NCBI) and other sources (BLAST Manual, Altschul et al. NCB/NLM/NIH Bethesda, MD 20894; Altschul et al., supra). The well-known Smith-Waterman algorithm can also be used to determine identity.
Получение антител.Obtaining antibodies.
В основе настоящего изобретения, отчасти, лежит открытие модифицированных акцепторных каркасных последовательностей человека, в которые можно встроить CDR антитела, так что у полученной вариабельной области, направленной против CD73, наблюдают высокую эффективность нейтрализации ферментативной активности CD73 человека. Преимуществом указанных антител является низкая или пониженная иммуногенность у людей, например, более низкая способность или вероятность вызывать нежелательный направляемый антителом против CD73 иммунный ответ при введении человеку. Примеры таких антител согласно настоящему изобретению включают антитела, содержащие домен Н4+ или 2Н4+VH в комбинации с доменом L1, L2, L3, L4, 2L1, 2L2, 2L3 или 2L4 VL. Примеры антител в соответствии с настоящим изобретением включают антитела, содержащие пары доменов VH и VL любого из антител H4+L1, H4+L2, H4+L3, H4+L4, 2H4+L1, 2H4+L2, 2H4+L3 или 2H4+L4.The present invention is based, in part, on the discovery of modified human acceptor framework sequences into which antibody CDRs can be inserted such that the resulting anti-CD73 variable region exhibits high potency in neutralizing human CD73 enzymatic activity. These antibodies have the advantage of low or reduced immunogenicity in humans, eg, a lower ability or likelihood of causing an undesirable anti-CD73 antibody-directed immune response when administered to a human. Examples of such antibodies according to the present invention include antibodies containing an H4+ or 2H4+VH domain in combination with an L1, L2, L3, L4, 2L1, 2L2, 2L3 or 2L4 VL domain. Examples of antibodies in accordance with the present invention include antibodies containing pairs of VH and VL domains of any of the antibodies H4+L1, H4+L2, H4+L3, H4+L4, 2H4+L1, 2H4+L2, 2H4+L3 or 2H4+L4 .
В одном аспекте антитело или фрагмент антитела, которое связывает полипептид CD73 человека, содержит каркасы VH и VL (например, FR1, FR2, FR3 и FR4) человеческого происхождения. В одном аспекте антитело или фрагмент антитела содержит: HCDR1 (CDR1 тяжелой цепи), содержащий последовательность аминокислот SYNMY, представленную в SEQ ID NO: 2; HCDR2 (CDR2 тяжелой цепи), содержащий последовательность аминокислот YIDPYNGGSSYNQKFKG, представленную в SEQ ID NO: 12, необязательно дополнительно при этом остаток глутамина (Q) в положении 13 SEQ ID NO: 12 может быть заменен на остаток лейцина (L), причем остаток лизина (K) в положении 14 SEQ ID NO: 12 может быть необязательно заменен на остаток треонина (Т); HCDR3 (CDR3 тяжелой цепи) содержащий последовательность аминокислот GYNNYKAWFAY, представленную в SEQ ID NO: 13, необязательно дополнительно при этом остаток аспарагина (N) в положении 3 SEQ ID NO: 13 может быть заменен на остаток глицина (G); LCDR1 (CDR1 легкой цепи), содержащий последовательность аминокислот KASQSVTNDVA, представленную в SEQ ID NO: 14, необязательно дополнительно при этом остаток треонина (Т) в положении 7 SEQ ID NO: 14 может быть заменен на остаток серина (S); LCDR2 (CDR2 легкой цепи), содержащий последовательность аминокислот YASNRYT, представленную в SEQ ID NO: 15, необязательно при этом остаток аспарагина (N) в положении 4 SEQ ID NO: 15 может быть заменен на остаток треонина (Т); и LCDR3 (CDR3 легкой цепи), содержащий последовательность аминокислот QQDYSSLT, представленную в SEQ ID NO: 7.In one aspect, an antibody or antibody fragment that binds a human CD73 polypeptide comprises VH and VL scaffolds (eg, FR1, FR2, FR3, and FR4) of human origin. In one aspect, the antibody or antibody fragment comprises: HCDR1 (heavy chain CDR1) comprising the amino acid sequence SYNMY set forth in SEQ ID NO: 2; HCDR2 (heavy chain CDR2) containing the amino acid sequence YIDPYNGGSSYNQKFKG presented in SEQ ID NO: 12, optionally additionally, the glutamine residue (Q) at position 13 of SEQ ID NO: 12 can be replaced by a leucine residue (L), and a lysine residue (K) at position 14 of SEQ ID NO: 12 may optionally be replaced by a threonine residue (T); HCDR3 (heavy chain CDR3) containing the amino acid sequence GYNNYKAWFAY presented in SEQ ID NO: 13, optionally further, the asparagine (N) residue at position 3 of SEQ ID NO: 13 may be replaced by a glycine (G) residue; LCDR1 (light chain CDR1) containing the amino acid sequence KASQSVTNDVA presented in SEQ ID NO: 14, optionally further, the threonine (T) residue at position 7 of SEQ ID NO: 14 can be replaced by a serine (S) residue; LCDR2 (light chain CDR2) containing the amino acid sequence YASNRYT shown in SEQ ID NO: 15, optionally the asparagine (N) residue at position 4 of SEQ ID NO: 15 may be replaced by a threonine (T) residue; and LCDR3 (light chain CDR3) containing the amino acid sequence QQDYSSLT shown in SEQ ID NO: 7.
В одном варианте реализации HCDR2 содержит последовательность аминокислот Формулы I:In one embodiment, HCDR2 comprises a Formula I amino acid sequence:
Y - I - D - P - Y - N - G - G - S - S - Y - N - Xaa1 - Хаа2 - F - K - G (SEQ ID NO: 3) или ее подпоследовательность, где Xaa1 представляет собой Q (Gln) или L (Leu), и где Хаа2 представляет собой K (Lys) или T (Thr).Y - I - D - P - Y - N - G - G - S - S - Y - N - Xaa 1 - Xaa 2 - F - K - G (SEQ ID NO: 3) or a subsequence thereof, where Xaa 1 represents is Q (Gln) or L (Leu), and where Xaa 2 is K (Lys) or T (Thr).
В одном варианте реализации HCDR3 содержит последовательность аминокислот Формулы II:In one embodiment, HCDR3 comprises a Formula II amino acid sequence:
G - Y - Xaa1 - N - Y - K - A - W - F - A - Y (SEQ ID NO: 4) или ее подпоследовательность, где Xaa1 представляет собой N (Asp) или G (Gly).G - Y - Xaa 1 - N - Y - K - A - W - F - A - Y (SEQ ID NO: 4) or a subsequence thereof, where Xaa 1 is N (Asp) or G (Gly).
В одном варианте реализации LCDR1 содержит последовательность аминокислот Формулы III:In one embodiment, LCDR1 comprises a Formula III amino acid sequence:
K - A - S - Q - S - V - Xaa1 - N - D - V - A (SEQ ID NO: 5),K - A - S - Q - S - V - Xaa 1 - N - D - V - A (SEQ ID NO: 5),
или ее подпоследовательность, где Xaa1 представляет собой T (Thr) или S (Ser).or a subsequence thereof, where Xaa 1 represents T (Thr) or S (Ser).
В одном варианте реализации LCDR2 содержит последовательность аминокислот Формулы IV:In one embodiment, LCDR2 comprises a Formula IV amino acid sequence:
Y - А - S - Xaa1 - R - Y - T (SEQ ID NO: 6),Y - A - S - Xaa 1 - R - Y - T (SEQ ID NO: 6),
или ее подпоследовательность, где Xaa1 представляет собой T (Thr) или N (Asn).or a subsequence thereof, where Xaa 1 represents T (Thr) or N (Asn).
В одном аспекте изолированное антитело, которое связывает полипептид CD73 человека, содержит: HCDR1, содержащий последовательность аминокислот SYNMY, представленную в SEQ ID NO: 2; HCDR2, содержащий последовательность аминокислот YIDPYNGGSSYNLTFKG, представленную в SEQ ID NO: 8; HCDR3, содержащий последовательность аминокислот GYGNYKAWFAY, представленную в SEQ ID NO: 9; LCDR1, содержащий последовательность аминокислот KASQSVSNDVA, представленную в SEQ ID NO: 10; LCDR2, содержащий последовательность аминокислот YASTRYT, представленную в SEQ ID NO: 11; и LCDR3, содержащий последовательность аминокислот QQDYSSLT, представленную в SEQ ID NO: 7.In one aspect, an isolated antibody that binds a human CD73 polypeptide comprises: HCDR1 comprising the amino acid sequence SYNMY set forth in SEQ ID NO: 2; HCDR2 containing the amino acid sequence YIDPYNGGSSYNLTFKG shown in SEQ ID NO: 8; HCDR3 containing the amino acid sequence GYGNYKAWFAY shown in SEQ ID NO: 9; LCDR1 containing the amino acid sequence KASQSVSNDVA shown in SEQ ID NO: 10; LCDR2 containing the amino acid sequence YASTRYT presented in SEQ ID NO: 11; and LCDR3 containing the amino acid sequence QQDYSSLT shown in SEQ ID NO: 7.
В одном аспекте изолированное антитело, которое связывает полипептид CD73 человека, содержит: HCDR1, содержащий последовательность аминокислот SYNMY, представленную в SEQ ID NO: 2; HCDR2, содержащий последовательность аминокислот YIDPYNGGSSYNQKFKG, представленную в SEQ ID NO: 12; HCDR3, содержащий последовательность аминокислот GYNNYKAWFAY, представленную в SEQ ID NO: 13; LCDR1, содержащий последовательность аминокислот KASQSVTNDVA, представленную в SEQ ID NO: 14; LCDR2, содержащий последовательность аминокислот YASNRYT, представленную в SEQ ID NO: 15; и LCDR3, содержащий последовательность аминокислот QQDYSSLT, представленную в SEQ ID NO: 7.In one aspect, an isolated antibody that binds a human CD73 polypeptide comprises: HCDR1 comprising the amino acid sequence SYNMY set forth in SEQ ID NO: 2; HCDR2 containing the amino acid sequence YIDPYNGGSSYNQKFKG shown in SEQ ID NO: 12; HCDR3 containing the amino acid sequence GYNNYKAWFAY presented in SEQ ID NO: 13; LCDR1 containing the amino acid sequence KASQSVTNDVA shown in SEQ ID NO: 14; LCDR2 containing the amino acid sequence YASNRYT shown in SEQ ID NO: 15; and LCDR3 containing the amino acid sequence QQDYSSLT shown in SEQ ID NO: 7.
В одном варианте реализации антитело содержит каркасную область тяжелой цепи из подгруппы IGHV1-3 человека (необязательно вместе с IGHJ4), необязательно IGHV1-3 представляет собой IGHV1-3*01. В одном варианте реализации гуманизированное антитело содержит каркасную область легкой цепи из подгруппы IGKV1-33 человека (необязательно вместе с IGKJ2), необязательно из IGKV1-33*01.In one embodiment, the antibody comprises a heavy chain framework region from the human IGHV1-3 subgroup (optionally together with IGHJ4), optionally IGHV1-3 being IGHV1-3*01. In one embodiment, the humanized antibody comprises a light chain framework region from the human IGKV1-33 subgroup (optionally together with IGKJ2), optionally from IGKV1-33*01.
Антитело может дополнительно содержать одну, две, три, четыре, пять или более замен аминокислот в каркасных областях тяжелой и/или легкой цепи человека, например, для улучшения аффинности, стабильности или других свойств антитела.The antibody may further contain one, two, three, four, five or more amino acid substitutions in the human heavy and/or light chain framework regions, for example, to improve the affinity, stability or other properties of the antibody.
Примеры последовательностей аминокислот VH и VL антител против CD73 представлены в Примере 6 (показана последовательность для цепи Н4+ и в Таблице 5 - для антител 2H4+2Lx) и в Таблице 1 для цепей L1-L4.Examples of the VH and VL amino acid sequences of anti-CD73 antibodies are presented in Example 6 (sequence shown for the H4+ chain and Table 5 for the 2H4+2Lx antibodies) and Table 1 for the L1-L4 chains.
В одном аспекте настоящего изобретения предложен антигенсвязывающий домен или антитело, или фрагмент антитела, которые связывают полипептид CD73 человека, содержащий:In one aspect of the present invention there is provided an antigen binding domain or antibody or antibody fragment that binds a human CD73 polypeptide comprising:
(a) CDR-H1, содержащий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 2;(a) CDR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2;
(b) CDR-H2, содержащий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 3, 8 или 12;(b) CDR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3, 8 or 12;
(c) CDR-H3, содержащий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 4, 9 или 13;(c) CDR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, 9 or 13;
(d) CDR-L1, содержащий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 5, 10 или 14;(d) CDR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, 10 or 14;
(e) CDR-L2, содержащий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 6, 11 или 15;(e) CDR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6, 11 or 15;
(f) CDR-L3, содержащий последовательность аминокислот SEQ ID NO: 7; и(f) CDR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; And
(g) последовательности каркасных областей тяжелой и легкой цепи человека.(g) sequences of human heavy and light chain framework regions.
В одном варианте реализации антитело содержит каркасную область тяжелой цепи из подгруппы IGHV1-3 человека вместе с IGHJ4, необязательно указанные антитела содержат IGHV1-3*01, вместе с IGHJ4. В одном варианте реализации гуманизированное антитело содержит каркасную область легкой цепи из подгруппы IGKV1-33 человека, необязательно IGKV1-33*01, вместе с IGKJ2.In one embodiment, the antibody comprises a heavy chain framework region from the human IGHV1-3 subgroup together with IGHJ4, optionally said antibodies contain IGHV1-3*01, together with IGHJ4. In one embodiment, the humanized antibody comprises a light chain framework region from the human IGKV1-33 subgroup, optionally IGKV1-33*01, together with IGKJ2.
Необязательно в любом варианте реализации может быть указано, что антитело может представлять собой антитело, отличное от исходного антитела мыши, например, исходного антитела мыши, содержащего VH и VL с соответствующими последовательностями SEQ ID NO: 27 и 28, или содержащего VH и VL с соответствующими последовательностями SEQ ID NO: 40 и 41.Optionally, any embodiment may specify that the antibody may be an antibody other than the parent mouse antibody, for example, a parent mouse antibody comprising VH and VL with the corresponding sequences of SEQ ID NOs: 27 and 28, or containing VH and VL with the corresponding sequences SEQ ID NO: 40 and 41.
Необязательно, человеческая каркасная область содержит одну или более мутаций, например, обратных мутаций для введения остатка, присутствующего в конкретном положении у млекопитающего, не являющегося человеком (например, мыши).Optionally, the human framework region contains one or more mutations, for example, back mutations to introduce a residue present at a particular position in a non-human mammal (eg, mouse).
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 2 по Кабату тяжелой цепи представляет собой изолейцин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 2 of the Kabat heavy chain is isoleucine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 30 по Кабату тяжелой цепи представляет собой аланин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 30 of the Kabat heavy chain is alanine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 48 по Кабату тяжелой цепи представляет собой изолейцин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 48 of the Kabat heavy chain is isoleucine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 69 по Кабату тяжелой цепи представляет собой лейцин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 69 of the Kabat heavy chain is leucine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 73 по Кабату тяжелой цепи представляет собой лизин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 73 of the Kabat heavy chain is lysine.
В одном варианте реализации VH содержит остаток изолейцина в положении 2 по Кабату, аланин в положении 30, изолейцин в положении 48, лейцин в положении 69 и лизин в положении 73.In one embodiment, VH contains an isoleucine residue at the Kabat position 2, an alanine at position 30, an isoleucine at position 48, a leucine at position 69, and a lysine at position 73.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 67 по Кабату легкой цепи представляет собой тирозин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at Kabat position 67 of the light chain is tyrosine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 60 по Кабату легкой цепи представляет собой серии или аспарагиновую кислоту.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 2 по Кабату легкой цепи представляет собой валин или изолейцин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 2 of the Kabat light chain is valine or isoleucine.
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 87 по Кабату легкой цепи представляет собой тирозин или фенилаланин.In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 87 of the Kabat light chain is tyrosine or phenylalanine.
В одном варианте реализации VL содержит остаток тирозина в положении 67 по Кабату, серии в положении 60, изолейцин в положении 2 и тирозин в положении 87.In one embodiment, VL contains a tyrosine residue at Kabat position 67, a series at
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 28 по Кабату тяжелой цепи представляет собой треонин (Т).In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 28 of the Kabat heavy chain is threonine (T).
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота в положении 66 по Кабату тяжелой цепи представляет собой аргинин (R).In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 66 of the Kabat heavy chain is arginine (R).
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота положении 67 по Кабату тяжелой цепи представляет собой валин (V).In one aspect of any embodiment described herein, the amino acid at position 67 of the Kabat heavy chain is valine (V).
В одном аспекте любого варианта реализации, описанного в данной заявке, аминокислота положении 71 по Кабату тяжелой цепи представляет собой аргинин (R).In one aspect of any embodiment described herein, the Kabat heavy chain amino acid position 71 is arginine (R).
Положения в доменах VH и VL в настоящем документе описаны с использованием системы нумерации по Кабату (Kabat et al. (1991), Sequences of Protein of Immunological Interest, 5oe изд., Министерство здравоохранения Соединенных Штатов Америки, Национальный институт здоровья, Бетесда, Мэриленд).Positions in the VH and VL domains are described herein using the Kabat numbering system (Kabat et al. (1991), Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., United States Department of Health, National Institutes of Health, Bethesda, MD) .
В одном аспекте антитело против CD73 содержит домен VH, последовательность которого идентична по меньшей мере приблизительно на 80% (например, идентична по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 97%, 98% или 99% или на 100%) последовательности домена VH, представленной в SEQ ID NO: 37 или 42.In one aspect, the anti-CD73 antibody comprises a VH domain that is at least about 80% sequence identical (e.g., at least about 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, or 99% identical, or 100% identical to ) VH domain sequence shown in SEQ ID NO: 37 or 42.
В одном аспекте антитело или фрагмент антитела против CD73 содержит домен VL, последовательность которого идентична по меньшей мере приблизительно на 80% (например, идентична по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 97%, 98% или 99% или идентична на 100%) последовательности домена VL, представленной в любой из SEQ ID NO: 33-36 или 43-46.In one aspect, an anti-CD73 antibody or antibody fragment comprises a VL domain that is at least about 80% sequence identical (e.g., at least about 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, or 99% identical, or is 100%) identical to the VL domain sequence presented in any of SEQ ID NO: 33-36 or 43-46.
В одном аспекте антитело или фрагмент антитела против CD73 содержит домен VH, последовательность которого идентична по меньшей мере приблизительно на 80% (например, идентична по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 97%, 98% или 99% или идентична на 100%) последовательности домена VH, представленной в SEQ ID NO: 42, и домен VL, последовательность которого идентична по меньшей мере приблизительно на 80% (например, идентична по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 97%, 98% или 99% или идентична на 100%) последовательности домена VL, представленной в любой из SEQ ID NO: 43 -46.In one aspect, an anti-CD73 antibody or antibody fragment comprises a VH domain that is at least about 80% sequence identical (e.g., at least about 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, or 99% identical, or is 100% identical to the sequence of a VH domain set forth in SEQ ID NO: 42, and a VL domain that is at least about 80% sequence identical (e.g., at least about 85%, 90%, 95% identical, 97 %, 98% or 99% or 100% identical to the VL domain sequence presented in any of SEQ ID NO: 43 -46.
В одном аспекте антитело или фрагмент антитела против CD73 содержит тяжелую цепь, последовательность которой идентична по меньшей мере приблизительно на 80% (например, идентична по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 97%, 98% или 99% или идентична на 100%) последовательности тяжелой цепи антитела H4+L1, представленной в SEQ ID NO: 38. В одном варианте реализации антитело или фрагмент антитела содержит легкую цепь, последовательность которой идентична по меньшей мере приблизительно на 80% (например, идентична по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 97%, 98% или 99% или идентична на 100%) последовательности легкой цепи антитела H4+L1, представленной в SEQ ID NO: 39.In one aspect, an anti-CD73 antibody or antibody fragment comprises a heavy chain that is at least about 80% sequence identical (e.g., at least about 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, or 99% identical, or is 100% identical to the heavy chain sequence of the H4+L1 antibody set forth in SEQ ID NO: 38. In one embodiment, the antibody or antibody fragment comprises a light chain that is at least about 80% identical in sequence (e.g., identical to at least approximately 85%, 90%, 95%, 97%, 98% or 99% identical or 100%) identical to the light chain sequence of the H4+L1 antibody shown in SEQ ID NO: 39.
В одном аспекте антитело или фрагмент антитела против CD73 содержит тяжелую цепь, последовательность которой идентична по меньшей мере приблизительно на 80% (например, идентична по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 97%, 98% или 99% или идентична на 100%) последовательности тяжелой цепи антитела 2Н4+2L1, представленной в SEQ ID NO: 47. В одном варианте реализации антитело или фрагмент антитела содержит легкую цепь, последовательность которой идентична по меньшей мере приблизительно на 80% (например, идентична по меньшей мере приблизительно на 85%, 90%, 95%, 97%, 98% или 99% или идентична на 100%) последовательности легкой цепи антитела 2Н4+2L1, представленной в SEQ ID NO: 48.In one aspect, an anti-CD73 antibody or antibody fragment comprises a heavy chain that is at least about 80% sequence identical (e.g., at least about 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, or 99% identical, or is 100% identical to the heavy chain sequence of the 2H4+2L1 antibody set forth in SEQ ID NO: 47. In one embodiment, the antibody or antibody fragment comprises a light chain that is at least about 80% identical in sequence (e.g., identical to at least approximately 85%, 90%, 95%, 97%, 98% or 99% identical or 100% identical to the light chain sequence of the 2H4+2L1 antibody shown in SEQ ID NO: 48.
ДНК, кодирующую антитело, можно получить и поместить в подходящий вектор экспрессии для трансфекции подходящего хозяина. Хозяина затем используют для рекомбинантной продукции антитела, или его вариантов, таких как гуманизированный вариант данного моноклонального антитела, активные фрагменты антитела, химерные антитела, содержащие участок распознавания антигена из антитела, или варианты, содержащие детектируемую молекулу.The DNA encoding the antibody can be prepared and placed into a suitable expression vector for transfection into a suitable host. The host is then used to recombinantly produce the antibody, or variants thereof, such as a humanized version of the monoclonal antibody, active antibody fragments, chimeric antibodies containing an antigen recognition site from the antibody, or variants containing a detection molecule.
ДНК, кодирующую моноклональные антитела в соответствии с настоящим изобретением, можно легко выделить и секвенировать, применяя обычные процедуры (например, применяя олигонуклеотидные зонды, которые способны специфически связываться с генами, кодирующими тяжелую и легкую цепи антител мыши). В одном аспекте предложена нуклеиновая кислота, кодирующая тяжелую цепь или легкую цепь антитела против CD73 согласно любому варианту реализации, описанному в настоящем документе. После выделения ДНК можно поместить в векторы экспрессии, которыми затем трансфицируют клетки-хозяева, такие как клетки Е. coli, клетки обезьян COS, клетки яичника китайского хомячка (СНО) или клетки миеломы, которые в противном случае не продуцируют белок иммуноглобулина, чтобы добиться синтеза моноклональных антител в рекомбинантных клетках-хозяевах. Такие последовательности ДНК можно модифицировать для любой из большого числа целей, например, для гуманизирования антител, получения фрагментов или производных, или для модификации последовательности антитела, например, в сайте связывания антигена, чтобы оптимизировать специфичность связывания антитела. В одном варианте реализации предложена изолированная последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая легкую цепь и/или тяжелую цепь антитела, а также рекомбинантная клетка-хозяин, содержащая (например, в своем геноме) такую нуклеиновую кислоту. Рекомбинантная экспрессия в бактериях ДНК, кодирующей антитело, хорошо известна в данной области техники (см., например, Skerra и др., Curr. Opinion in Immunol., 5, стр. 256 (1993); и Pluckthun, Immunol. 130, стр. 151 (1992).DNA encoding the monoclonal antibodies of the present invention can be readily isolated and sequenced using conventional procedures (eg, using oligonucleotide probes that are capable of specifically binding to the genes encoding the heavy and light chains of mouse antibodies). In one aspect, a nucleic acid encoding the heavy chain or light chain of an anti-CD73 antibody according to any embodiment described herein is provided. Once isolated, the DNA can be placed into expression vectors, which are then transfected into host cells, such as E. coli cells, COS monkey cells, Chinese hamster ovary (CHO) cells, or myeloma cells that do not otherwise produce immunoglobulin protein, to achieve synthesis monoclonal antibodies in recombinant host cells. Such DNA sequences can be modified for any of a variety of purposes, for example, to humanize antibodies, produce fragments or derivatives, or to modify the antibody sequence, for example, at the antigen binding site, to optimize the binding specificity of the antibody. In one embodiment, an isolated nucleic acid sequence encoding an antibody light chain and/or a heavy chain is provided, as well as a recombinant host cell containing (eg, in its genome) such nucleic acid. Recombinant expression in bacteria of DNA encoding an antibody is well known in the art (see, for example, Skerra et al., Curr. Opinion in Immunol., 5, p. 256 (1993); and Pluckthun, Immunol. 130, p. 151 (1992).
Фрагменты и производные антител (которые входят в объем термина «антитело» или «антитела», используемого в данном описании, если не указано иное или нет явных противоречий с контекстом) можно получить с помощью методик, которые известны в данной области техники. «Фрагменты» содержат часть интактного антитела, как правило, сайт связывания антигена или вариабельную область. Примеры фрагментов антител включают фрагменты Fab, Fab', Fab'-SH, F (ab')2 и Fv; диатела; любой фрагмент антитела, который представляет собой полипептид, имеющий первичную структуру, состоящую из одной непрерывной последовательности смежных аминокислотных остатков (называемый в данном документе «одноцепочечным фрагментом антитела» или «одноцепочечным полипептидом»); и полиспецифические (например, биспецифические) антитела, образованные из фрагментов антител.Antibody fragments and derivatives (which are included within the scope of the term “antibody” or “antibodies” as used herein unless otherwise indicated or the context clearly requires) can be prepared using techniques known in the art. "Fragments" contain part of an intact antibody, typically an antigen binding site or variable region. Examples of antibody fragments include Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2 and Fv fragments; diabodies; any antibody fragment that is a polypeptide having a primary structure consisting of one contiguous sequence of contiguous amino acid residues (referred to herein as a “single chain antibody fragment” or “single chain polypeptide”); and multispecific (eg, bispecific) antibodies formed from antibody fragments.
Обычно, аффинность антитела против CD73, предложенного в данной заявке, к полипептиду CD73 (например, полипептиду CD73, полученному, как описано в разделе Примеры в данном документе) находится в диапазоне от приблизительно 104 до приблизительно 1011 М-1 (например, от приблизительно 108 до приблизительно 1010 М-1). Например, в конкретном аспекте настоящего изобретения предложено антитело против CD73 со средней константой диссоциации (KD) от CD73 менее 1x109 M, что определяют с помощью, например, скрининга методом поверхностного плазмонного резонанса (ППР) (например, с помощью анализа на аналитическом устройстве для ППР BIAcore™). В более конкретном типичном аспекте настоящего изобретения предложены антитела против CD73 с KD от CD73 от приблизительно 1x10-8 M до приблизительно 1x10-10 M, или от приблизительно 1x10-9 М до приблизительно 1x10-11 M.Typically, the affinity of the anti-CD73 antibody provided herein for a CD73 polypeptide (e.g., a CD73 polypeptide prepared as described in the Examples section herein) ranges from about 10 4 to about 10 11 M -1 (e.g., approximately 10 8 to approximately 10 10 M -1 ). For example, a particular aspect of the present invention provides an anti-CD73 antibody with an average dissociation constant (K D ) from CD73 of less than 1x10 9 M, as determined by, for example, surface plasmon resonance (SPR) screening (for example, by assay for PPR BIAcore™). In a more specific exemplary aspect of the present invention, anti-CD73 antibodies are provided with a CD73 K D of from about 1x10 -8 M to about 1x10 -10 M, or from about 1x10 -9 M to about 1x10 -11 M.
Антитела можно охарактеризовать, например, по средней KD, не более чем приблизительно (т.е., лучшей аффинности) 100, 60, 10, 5 или 1 наномолярной, предпочтительно субнаномолярной или в некоторых случаях не более чем приблизительно 500, 200, 100 или 10 пикомолярной. KD можно определить, например, путем иммобилизации полученных рекомбинантным способом белков CD73 человека на поверхности микрочипа, а затем нанесения антитела, которое нужно исследовать, в растворе. В одном варианте реализации указанный способ дополнительно включает этап (d) селекции антител из (b), которые способны конкурировать с контрольным антителом за связывание с CD73.Antibodies can be characterized, for example, by an average KD of no more than about (i.e., best affinity) 100, 60, 10, 5, or 1 nanomolar, preferably subnanomolar, or in some cases no more than about 500, 200, 100, or 10 picomolar. KD can be determined, for example, by immobilizing recombinantly produced human CD73 proteins on the surface of a microchip and then applying the antibody to be tested in solution. In one embodiment, the method further includes the step of (d) selecting antibodies from (b) that are capable of competing with the control antibody for binding to CD73.
В одном варианте реализации антитела против CD73 могут быть получены таким образом, что они не проявляют существенного связывания с Fcγ-рецепторами человека, например, любым одним или более из CD16A, CD16B, CD32A, CD32B и/или CD64). Такие антитела могут содержать константные области различных тяжелых цепей, которые, как известно, не проявляют или проявляют пониженное связывание с Fcγ-рецепторами. В альтернативном варианте фрагменты антител, которые не содержат (или содержат части) константных областей, такие как фрагменты F(ab')2, можно применять для предотвращения связывания с Fc-рецептором. Связывание с Fc-рецептором можно оценить в соответствии со способами, известными в данной области техники, включая, например, тестирование связывания антитела с белком Fc-рецептора в анализе BIACORE. Кроме того, как правило, можно использовать любой изотип IgG антитела, в котором Fc-часть модифицирована (например, путем введения 1, 2, 3, 4, 5 или более замен аминокислот) для минимизирования или устранения связывания с Fc-рецепторами (см., например, WO 03/101485, описание которого включено в данную заявку посредством ссылки). Анализы, которые используют для оценки связывания с Fc-рецептором, хорошо известны в данной области техники и описаны, например, в WO 03/101485.In one embodiment, anti-CD73 antibodies can be prepared such that they do not exhibit significant binding to human Fcγ receptors, for example, any one or more of CD16A, CD16B, CD32A, CD32B and/or CD64). Such antibodies may contain constant regions of various heavy chains that are known to exhibit no or reduced binding to Fcγ receptors. Alternatively, antibody fragments that do not contain (or contain parts of) constant regions, such as F(ab')2 fragments, can be used to prevent binding to the Fc receptor. Fc receptor binding can be assessed according to methods known in the art, including, for example, testing antibody binding to Fc receptor protein in the BIACORE assay. In addition, any isotype of IgG antibody in which the Fc portion is modified (e.g., by introducing 1, 2, 3, 4, 5 or more amino acid substitutions) to minimize or eliminate binding to Fc receptors can generally be used (see eg WO 03/101485, the disclosure of which is incorporated herein by reference). Assays that are used to assess Fc receptor binding are well known in the art and are described, for example, in WO 03/101485.
В одном варианте реализации антитело может содержать одну или более определенных мутаций в Fc-области, которые приводят к образованию "Fc-молчащих" антител, которые на минимальном уровне взаимодействуют с эффекторными клетками. Замалчивания эффекторных функций можно добиться путем введения мутации в Fc-области антител, и такие мутации были описаны в данной области техники: мутация N297A, мутации LALA (Strohl, W., 2009, Curr. Opin. Biotechnol. Vol. 20(6):685-691); и D265A (Baudino и др., 2008, J. Immunol. 181: 6664-69) см. также Heusser и др., WO 2012/065950, описания которых включены в данную заявку посредством ссылки. В одном варианте реализации антитело содержит одну, две, три или более замен аминокислот в шарнирной области. В одном варианте реализации антитело представляет собой IgG1 или IgG2 и содержит одну, две или три замены в остатках 233-236, необязательно 233-238 (нумерация EU). В одном варианте реализации антитело представляет собой IgG4 и содержит одну, две или три замены в остатках 327, 330 и/или 331 (нумерация EU). Примерами Fc-молчащих антител против IgG1 являются мутант LALA, содержащий мутации L234A и L235A в последовательности аминокислот Fc IgG1. Другим примером мутации, замалчивающей Fc, является мутация в остатке D265 или в D265 и Р329, например, используемая в антителе IgG1, называемая мутацией DAPA (D265A, Р329А) (US 6737056). Другое молчащее антитело IgG1 содержит мутацию в остатке N297 (например, мутацию N297A, N297S), которая приводит к образованию агликозилированных/негликозилированных антител. Другие молчащие мутации включают: замены в остатках L234 и G237 (L234A/G237A); замены в остатках S228, L235 и R409 (S228P/L235E/R409K,T,M,L); замены в остатках Н268, V309, А330 и А331 (H268Q/V309L/A330S/A331S); замены в остатках С220, С226, С229 и Р238 (C220S/C226S/C229S/P238S); замены в остатках С226, С229, Е233, L234 и L235 (C226S/C229S/E233P/L234V/L235A; замены в остатках K322, L235 и L235 (K322A/L234A/L235A); замены в остатках L234, L235 и Р331 (L234F/L235S/P331S); замены в остатках 234, 235 и 297; замены в остатках Е318 и K320 и K322 (L235E/E318A/K320A/K322A); замены в остатках (V234A, G237A, P238S); замены в остатках 243 и 264; замены в остатках 297 и 299; замены, такие как замены в остатках 233, 234, 235, 237 и 238, определенных по системе нумерации EU, включающие последовательность, выбранную из РАААР, PAAAS и SAAAS (см. WO 2011/066501).In one embodiment, the antibody may contain one or more specified mutations in the Fc region that result in the formation of "Fc-silent" antibodies that interact minimally with effector cells. Silencing of effector functions can be achieved by introducing mutations into the Fc region of antibodies, and such mutations have been described in the art: N297A mutation, LALA mutations (Strohl, W., 2009, Curr. Opin. Biotechnol. Vol. 20(6): 685-691); and D265A (Baudino et al., 2008, J. Immunol. 181: 6664-69) see also Heusser et al., WO 2012/065950, the disclosures of which are incorporated herein by reference. In one embodiment, the antibody contains one, two, three, or more amino acid substitutions in the hinge region. In one embodiment, the antibody is IgG1 or IgG2 and contains one, two or three substitutions at residues 233-236, optionally 233-238 (EU numbering). In one embodiment, the antibody is IgG4 and contains one, two or three substitutions at residues 327, 330 and/or 331 (EU numbering). Examples of Fc-silencing antibodies against IgG1 are the LALA mutant, which contains the L234A and L235A mutations in the IgG1 Fc amino acid sequence. Another example of an Fc silencing mutation is a mutation at residue D265 or at D265 and P329, such as that used in an IgG1 antibody called the DAPA mutation (D265A, P329A) (US Pat. No. 6,737,056). Another silent IgG1 antibody contains a mutation at residue N297 (eg, N297A, N297S mutation), which results in the formation of aglycosylated/non-glycosylated antibodies. Other silent mutations include: substitutions at residues L234 and G237 (L234A/G237A); substitutions in residues S228, L235 and R409 (S228P/L235E/R409K,T,M,L); substitutions in residues H268, V309, A330 and A331 (H268Q/V309L/A330S/A331S); substitutions in residues C220, C226, C229 and P238 (C220S/C226S/C229S/P238S); replacements in residues C226, C229, E233, L234 and L235 (C226S/C229S/E233P/L234V/L235A; replacements in residues K322, L235 and L235 (K322A/L234A/L235A); replacements in residues L234, L235 and P331 (L234F / L235S/P331S); replacements in residues 234, 235 and 297; replacements in residues E318 and K320 and K322 (L235E/E318A/K320A/K322A); replacements in residues 243 and 264; substitutions at residues 297 and 299; substitutions such as substitutions at residues 233, 234, 235, 237 and 238, defined by the EU numbering system, including a sequence selected from PAAAP, PAAAS and SAAAS (see WO 2011/066501).
В одном варианте реализации антитело может содержать одну или более определенных мутаций в Fc-области. Например, такое антитело может содержать домен Fc, происходящий из IgG1 человека, содержащий мутацию в остатке(-ах) по Кабату 234, 235, 237, 330 и/или 331. Один пример такого домена Fc содержит замены в остатках L234, L235 и Р331 по Кабату (например, L234A/L235E/P331S или (L234F/L235E/P331S). Другой пример такого домена Fc содержит замены в остатках по Кабату L234, L235, G237 и Р331 (например, L234A/L235E/G237A/P331S). Другой пример такого домена Fc содержит замены в остатках по Кабату L234, L235, G237, А330 и Р331 (например, L234A/L235E/G237A/A330S/P331S). В одном варианте реализации антитело содержит домен Fc, необязательно изотипа IgG1 человека, содержащий: замену L234X1, замену L235X2 и замену Р331Х3, где X1 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от лейцина, Х2 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от лейцина, и Х3 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от пролина; необязательно при этом X1 представляет собой аланин или фенилаланин или их консервативную замену; необязательно при этом Х2 представляет собой глутаминовую кислоту или ее консервативную замену; необязательно при этом Х3 представляет собой серии или его консервативную замену. В другом варианте реализации антитело содержит домен Fc, необязательно изотипа IgG1 человека, содержащий: замену L234X1, замену L235X2, замену G237X3 и замену Р331Х4, где X1 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от лейцина, Х2 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от лейцина, Х3 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от глицина, и Х4 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от пролина; необязательно при этом X1 представляет собой аланин или фенилаланин или их консервативную замену; необязательно при этом Х2 представляет собой глутаминовую кислоту или ее консервативную замену; необязательно Х3 представляет собой аланин или его консервативную замену; необязательно Х4 представляет собой серии или его консервативную замену. В другом варианте реализации антитело содержит домен Fc, необязательно изотипа IgG1 человека, содержащий: замену L234X1, замену L235X2, замену G237X3, замену G330X4 и замену P331X5, где X1 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от лейцина, X2 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от лейцина, Х3 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от глицина, Х4 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от аланина, и Х5 представляет собой любой аминокислотный остаток, отличный от пролина; необязательно при этом X1 представляет собой аланин или фенилаланин или их консервативную замену; необязательно при этом Х2 представляет собой глутаминовую кислоту или ее консервативную замену; необязательно Х3 представляет собой аланин или его консервативную замену; необязательно Х4 представляет собой серии или его консервативную замену; необязательно Х5 представляет собой серии или его консервативную замену.In one embodiment, the antibody may contain one or more specified mutations in the Fc region. For example, such an antibody may contain an Fc domain derived from human IgG1 containing a mutation at Kabat residue(s) 234, 235, 237, 330 and/or 331. One example of such an Fc domain contains substitutions at residues L234, L235 and P331 Kabat (e.g. L234A/L235E/P331S or (L234F/L235E/P331S). Another example of such an Fc domain contains substitutions at Kabat residues L234, L235, G237 and P331 (e.g. L234A/L235E/G237A/P331S). Other an example of such an Fc domain contains substitutions at Kabat residues L234, L235, G237, A330, and P331 (e.g., L234A/L235E/G237A/A330S/P331S) In one embodiment, the antibody comprises an Fc domain, optionally of the human IgG1 isotype, comprising: a substitution). L234X 1 , the L235X 2 substitution, and the P331X 3 substitution, wherein X 1 is any amino acid residue other than leucine, X 2 is any amino acid residue other than leucine, and X 3 is optionally any amino acid residue other than proline; wherein X 1 represents alanine or phenylalanine or a conservative replacement thereof; optionally, X 2 represents glutamic acid or a conservative replacement thereof; optionally, X 3 represents a series or a conservative replacement thereof. In another embodiment, the antibody contains an Fc domain, optionally of the human IgG1 isotype, containing: an L234X 1 substitution, a L235X 2 substitution, a G237X 3 substitution, and a P331X 4 substitution, where X 1 represents any amino acid residue other than leucine, X 2 represents any an amino acid residue other than leucine, X 3 is any amino acid residue other than glycine, and X 4 is any amino acid residue other than proline; optionally, X 1 represents alanine or phenylalanine or a conservative replacement thereof; optionally, X 2 represents glutamic acid or a conservative replacement thereof; optionally X 3 represents alanine or a conservative substitute thereof; optionally X 4 is a series or a conservative replacement thereof. In another embodiment, the antibody comprises an Fc domain, optionally of the human IgG1 isotype, comprising: an L234X 1 substitution, a L235X 2 substitution, a G237X 3 substitution, a G330X 4 substitution, and a P331X 5 substitution, where X 1 is any amino acid residue other than leucine, X 2 is any amino acid residue other than leucine, X 3 is any amino acid residue other than glycine, X 4 is any amino acid residue other than alanine, and X 5 is any amino acid residue other than proline; optionally, X 1 represents alanine or phenylalanine or a conservative replacement thereof; optionally, X 2 represents glutamic acid or a conservative replacement thereof; optionally X 3 represents alanine or a conservative substitute thereof; optionally X 4 is a series or a conservative replacement thereof; optionally X 5 is a series or a conservative replacement thereof.
В используемом в данном документе сокращенном обозначении принят следующий формат: Остаток дикого типа: Положение в полипептиде: Мутантные остатки, причем положения остатков указаны в соответствии с нумерацией EU по Кабату.The abbreviated notation used herein adopts the following format: Wild-type residue: Position in polypeptide: Mutant residues, with residue positions indicated according to EU Kabat numbering.
В одном варианте реализации антитело содержит константную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот, представленную ниже, или последовательность аминокислот, по меньшей мере на 90%, 95% или 99% идентичную ей, но в которой сохранились аминокислотные остатки в положениях 234, 235 и 331 по Кабату (подчеркнуты):In one embodiment, the antibody comprises a heavy chain constant region comprising the amino acid sequence set forth below, or an amino acid sequence at least 90%, 95%, or 99% identical thereto but retaining amino acid residues at positions 234, 235, and 331 according to Kabat (underlined):
В одном варианте реализации антитело содержит константную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот, представленную ниже, или последовательность аминокислот, по меньшей мере на 90%, 95% или 99% идентичную ей, но в которой сохранились аминокислотные остатки в положениях 234, 235 и 331 по Кабату (подчеркнуты):In one embodiment, the antibody comprises a heavy chain constant region comprising the amino acid sequence set forth below, or an amino acid sequence that is at least 90%, 95%, or 99% identical thereto, but which retains amino acid residues at positions 234, 235, and 331 according to Kabat (underlined):
В одном варианте реализации антитело содержит константную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот, представленную ниже, или последовательность аминокислот, по меньшей мере на 90%, 95% или 99% идентичную ей, но в которой сохранились аминокислотные остатки в положениях 234, 235, 237, 330 и 331 по Кабату (подчеркнуты):In one embodiment, the antibody comprises a heavy chain constant region comprising the amino acid sequence set forth below, or an amino acid sequence at least 90%, 95%, or 99% identical thereto but retaining amino acid residues at positions 234, 235, 237 , 330 and 331 according to Kabat (underlined):
В одном варианте реализации антитело содержит константную область тяжелой цепи, содержащую последовательность аминокислот, представленную ниже, или последовательность, по меньшей мере на 90%, 95% или 99% идентичную ей, но в которой сохранились аминокислотные остатки в положениях 234, 235, 237 и 331 по Кабату (подчеркнуты):In one embodiment, the antibody comprises a heavy chain constant region comprising the amino acid sequence set forth below, or a sequence at least 90%, 95%, or 99% identical thereto, but retaining amino acid residues at positions 234, 235, 237, and 331 according to Kabat (underlined):
У Fc-молчащих антител отсутствует или низка активность АЗКЦ, что означает, что Fc-молчащее антитело проявляет активность АЗКЦ, которая ниже 50% специфического клеточного лизиса. Предпочтительно у антитела по существу отсутствует активность АЗКЦ, например, Fc-молчащее антитело проявляет активность АЗКЦ (специфический клеточный лизис), которая ниже 5% или ниже 1%. У Fc-молчащих антител также может отсутствовать FcγR-опосредованное перекрестное связывание CD73 на поверхности экспрессирующей CD73 клетки.Fc-silenced antibodies have no or low ADCC activity, which means that the Fc-silenced antibody exhibits ADCC activity that is below 50% specific cell lysis. Preferably, the antibody has substantially no ADCC activity, for example, an Fc-silenced antibody exhibits ADCC (specific cell lysis) activity that is below 5% or below 1%. Fc-silencing antibodies may also lack FcγR-mediated cross-linking of CD73 on the surface of CD73-expressing cells.
В одном варианте реализации антитело содержит замену в константной области тяжелой цепи в любом одном, двух, трех, четырех, пяти или более остатках, выбранных из группы, состоящей из: 220, 226, 229, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 243, 264, 268, 297, 298, 299, 309, 310, 318, 320, 322, 327, 330, 331 и 409 (нумерация остатков в константной области тяжелой цепи соответствует нумерации EU по Кабату). В одном варианте реализации антитело содержит замену в остатках 234, 235 и 322. В одном варианте реализации антитело содержит замену в остатках 234, 235 и 331. В одном варианте реализации антитело содержит замену в остатках 234, 235, 237 и 331. В одном варианте реализации антитело содержит замену в остатках 234, 235, 237, 330 и 331. В одном варианте реализации домен Fc относится к подтипу IgG1 человека. Аминокислотные остатки указаны в соответствии с нумерацией EU по Кабату.In one embodiment, the antibody contains a substitution in the heavy chain constant region at any one, two, three, four, five or more residues selected from the group consisting of: 220, 226, 229, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 243, 264, 268, 297, 298, 299, 309, 310, 318, 320, 322, 327, 330, 331 and 409 (residue numbering in the heavy chain constant region corresponds to Kabat's EU numbering). In one embodiment, the antibody contains a substitution at residues 234, 235, and 322. In one embodiment, the antibody contains a substitution at residues 234, 235, and 331. In one embodiment, the antibody contains a substitution at residues 234, 235, 237, and 331. In one embodiment implementation, the antibody contains a substitution at residues 234, 235, 237, 330, and 331. In one embodiment, the Fc domain is of the human IgG1 subtype. Amino acid residues are indicated according to Kabat's EU numbering.
В одном варианте реализации антитело содержит домен Fc, содержащий замену аминокислоты, которая повышает связывание с полипептидами FcRn человека, чтобы увеличить период полужизни антитела in vivo. Типичные мутации описаны в источнике Strohl, W., 2009, Curr. Opin. Biotechnol. Vol. 20(6):685-691, описание которого включено в данную заявку посредством ссылки. Примерами замен, используемых в антителах изотипа IgG1 человека, являются замены в остатках по Кабату М252, S254 и Т256; замены в остатках Т250 и М428; замены в остатке N434; замены в остатках Н433 и N434; замены в остатках Т307, Е380 и N434; замены в остатках Т307, Е380 и N434; замены в остатках М252, S254, Т256, H433, N434 и 436; замены в остатке I253; замены в остатках Р257, N434, D376 и N434. На любом желаемом этапе можно оценить способность антигенсвязывающего соединения ингибировать ферментативную активность CD73, в частности, блокировать 5'-нуклеотидазную активность CD73 и снижать продукцию аденозина экспрессирующей CD73 клеткой, и, в свою очередь, восстанавливать активность и/или снимать опосредованное аденозином ингибирование лимфоцитов.In one embodiment, the antibody comprises an Fc domain containing an amino acid substitution that enhances binding to human FcRn polypeptides to increase the half-life of the antibody in vivo. Typical mutations are described in Strohl, W., 2009, Curr. Opin. Biotechnol. Vol. 20(6):685-691, the description of which is incorporated herein by reference. Examples of substitutions used in human IgG1 isotype antibodies include substitutions at Kabat residues M252, S254 and T256; replacements in the remnants of T250 and M428; substitutions in residue N434; substitutions in residues H433 and N434; substitutions in residues T307, E380 and N434; substitutions in residues T307, E380 and N434; substitutions in residues M252, S254, T256, H433, N434 and 436; substitutions in residue I253; substitutions in residues P257, N434, D376 and N434. At any desired step, the ability of the antigen binding compound to inhibit CD73 enzymatic activity, particularly to block CD73 5'-nucleotidase activity and reduce adenosine production by a CD73 expressing cell, and in turn restore activity and/or reverse adenosine-mediated inhibition of lymphocytes, can be assessed.
Способность антитела ингибировать ферментативную активность CD73 можно исследовать в анализе в бесклеточной системе с применением рекомбинантного растворимого CD73 человека (в виде димеров) и АМФ, в котором превращение АМФ в аденозин (и/или его ингибирование) детектируют непосредственно (например, путем измерения субстратов и продуктов, т.е. АМФ, аденозина и/или фосфата), или опосредованно. В одном примере АМФ и/или аденозин детектируют с помощью ВЭЖХ до и после инкубации тестируемого соединения с рекомбинантным CD73.The ability of an antibody to inhibit CD73 enzymatic activity can be examined in a cell-free assay using recombinant soluble human CD73 (as dimers) and AMP, in which the conversion of AMP to adenosine (and/or its inhibition) is detected directly (for example, by measuring substrates and products , i.e. AMP, adenosine and/or phosphate), or indirectly. In one example, AMP and/or adenosine are detected by HPLC before and after incubation of the test compound with recombinant CD73.
Ингибиторную активность антитела в отношении CD73 также можно оценить любым из множества других способов. Например, в непрямом анализе применяют реагент на основе люциферазы (например, систему CellTiter-Glo®, доступную для приобретения у Promega), чтобы детектировать исчезновение АМФ. Реакция люциферазы в данном анализе ингибируется АМФ. Добавление фермента CD73 в реакционную смесь разрушает АМФ и снимает ингибирование, вызывая детектируемый сигнал.The inhibitory activity of an antibody against CD73 can also be assessed by any of a variety of other methods. For example, an indirect assay uses a luciferase-based reagent (eg, the CellTiter-Glo® system, available from Promega) to detect the disappearance of AMP. The luciferase reaction in this assay is inhibited by AMP. Addition of the CD73 enzyme to the reaction mixture degrades AMP and relieves inhibition, causing a detectable signal.
Способы анализа с применением растворимого CD73 будут включать тестирование в условиях, в которых антитела представлены в значительном молярном избытке (например, 10-кратном, 20-кратном, 50-кратном, 100-кратном и т.д.) над димерами полипептида CD73. Когда они представлены в молярном избытке над ферментом, антитела против CD73 будут более не способны образовывать мультимерные комплексы антител и димеров CD73; затем можно выбрать антитела, у которых сохранилась способность ингибировать ферментативную активность CD73.Assay methods using soluble CD73 will involve testing under conditions in which the antibodies are present in a significant molar excess (eg, 10-fold, 20-fold, 50-fold, 100-fold, etc.) over CD73 polypeptide dimers. When present in molar excess over the enzyme, anti-CD73 antibodies will no longer be able to form multimeric complexes of antibodies and CD73 dimers; antibodies that retain the ability to inhibit CD73 enzymatic activity can then be selected.
Способность антитела ингибировать 5'-эктонуклеотидазную ферментативную активность CD73 можно в качестве альтернативы или дополнения также исследовать в клеточном анализе (применяя клетки, которые экспрессируют CD73). Предпочтительно, антитела можно сначала исследовать или подвергнуть скринингу в анализе в бесклеточной системе, чтобы определить антитела, которые блокируют активность фермента, чтобы снизить вероятность выбора антител, которые ингибируют CD73, вызывая интернализацию CD73, а затем исследовать в виде очищенного антитела в клеточном анализе. Клеточный анализ можно проводить, как показано в разделе Примеры в данном документе, или как описано в публикации РСТ № WO 2016/055609, описание которой включено в данную заявку посредством ссылки. Например, экспрессирующие CD73 клетки (например, линию клеток MDA-MB-231) высевают в 96-луночные планшеты с плоским дном лунок в присутствии антител против CD73 и инкубируют, как описано в WO 2016/055609. АМФ добавляют к клеткам и инкубируют при 4°С (чтобы избежать понижающей модуляции CD73). Планшеты затем центрифугируют и супернатант переносят в 96-луночный культуральный планшет с плоским дном лунок. Затем проводят количественный анализ свободного фосфата, полученного в результате гидролиза АМФ с образованием аденозина. Снижение гидролиза АМФ с образованием аденозина в присутствии антитела свидетельствует о том, что антитело ингибирует клеточный CD73.The ability of an antibody to inhibit the 5'-ectonucleotidase enzymatic activity of CD73 can alternatively or in addition also be tested in a cell-based assay (using cells that express CD73). Preferably, the antibodies can be first tested or screened in an assay in a cell-free system to identify antibodies that block enzyme activity to reduce the likelihood of selecting antibodies that inhibit CD73 by causing internalization of CD73, and then tested as a purified antibody in a cell-based assay. Cellular analysis can be performed as shown in the Examples section of this document, or as described in PCT Publication No. WO 2016/055609, the description of which is incorporated herein by reference. For example, CD73-expressing cells (eg, MDA-MB-231 cell line) are seeded in 96-well flat-bottom plates in the presence of anti-CD73 antibodies and incubated as described in WO 2016/055609. AMP is added to the cells and incubated at 4°C (to avoid CD73 down-modulation). The plates are then centrifuged and the supernatant is transferred to a 96-well culture plate with a flat bottom well. Free phosphate resulting from the hydrolysis of AMP to form adenosine is then quantitated. The reduction in AMP hydrolysis to adenosine in the presence of the antibody indicates that the antibody inhibits cellular CD73.
В одном варианте реализации препарат антител вызывает снижение по меньшей мере на 50% ферментативной активности полипептида CD73, предпочтительно снижение по меньшей мере на 60%, 70% или 80% ферментативной активности полипептида CD73 (например, растворимого гомодимерного полипептида CD73; экспрессированного клетками CD73).In one embodiment, the antibody preparation causes a reduction of at least 50% in the enzymatic activity of a CD73 polypeptide, preferably a reduction of at least 60%, 70%, or 80% in the enzymatic activity of a CD73 polypeptide (e.g., a soluble homodimeric CD73 polypeptide; expressed by CD73 cells).
Активность антитела также можно измерить в непрямом анализе в отношении его способности модулировать активность лимфоцитов, например, чтобы снять опосредованное аденозином ингибирование активности лимфоцитов или чтобы вызвать активацию активности лимфоцитов. Это можно осуществить, например, применяя анализ высвобождения цитокинов. В другом примере антитело можно оценить в непрямом анализе в отношении его способности модулировать пролиферацию лимфоцитов.Antibody activity can also be measured in an indirect assay for its ability to modulate lymphocyte activity, for example, to reverse adenosine-mediated inhibition of lymphocyte activity or to cause activation of lymphocyte activity. This can be done, for example, using a cytokine release assay. In another example, an antibody can be assessed in an indirect assay for its ability to modulate lymphocyte proliferation.
В одном варианте реализации антитело нейтрализует 5'-эктонуклеотидазную активность гомодимерного полипептида CD73 человека в растворе. В одном варианте реализации антитело связывает и ингибирует ферментативную активность растворимого полипептида CD73 человека, в частности, антитела, которое нейтрализует опосредованный CD73 катаболизм АМФ с образованием аденозина. В одном варианте реализации антитело связывает CD73 бивалентным образом. В одном варианте реализации антитело представляет собой необедняющее антитело, например, Fc-молчащее антитело, которое по существу не связывается с рецепторами Fcγ человека. В одном варианте реализации антитело нейтрализует CD73 в растворе без необходимости индукции образования олигомеров полипептид CD73:антитело против CD73.In one embodiment, the antibody neutralizes the 5'-ectonucleotidase activity of a human CD73 homodimeric polypeptide in solution. In one embodiment, the antibody binds to and inhibits the enzymatic activity of a soluble human CD73 polypeptide, particularly an antibody that neutralizes CD73-mediated catabolism of AMP to adenosine. In one embodiment, the antibody binds CD73 in a bivalent manner. In one embodiment, the antibody is a non-depleting antibody, such as an Fc-silencing antibody, that does not substantially bind to human Fcγ receptors. In one embodiment, the antibody neutralizes CD73 in solution without the need to induce the formation of CD73 polypeptide:anti-CD73 antibody oligomers.
В одном варианте реализации антитело специфично связывает CD73 человека на поверхности клетки и способно нейтрализовать 5'-эктонуклеотидазную активность растворимого полипептида CD73 человека. В одном варианте реализации антитело не вызывает олигомеризацию растворимого CD73.In one embodiment, the antibody specifically binds human CD73 on the surface of a cell and is capable of neutralizing the 5'-ectonucleotidase activity of a soluble human CD73 polypeptide. In one embodiment, the antibody does not cause oligomerization of soluble CD73.
В одном варианте реализации антитело специфично связывает CD73 человека на поверхности клетки и способно нейтрализовать 5'-эктонуклеотидазную активность клеточного CD73 (CD73, экспрессируемого клетками). В одном варианте реализации антитело специфично связывает и нейтрализует 5'-эктонуклеотидазную активность CD73 человека на поверхности клетки, и не интернализуется в экспрессирующие CD73 клетки при связывании с CD73. Антитело не вызывает мультимеризацию и последующую интернализацию CD73. В одном варианте реализации антитело связывает и способно ингибировать ферментативную активность рекомбинантного полипептида CD73 человека в растворе, причем указанное антитело не интернализуется в экспрессирующие CD73 клетки. В одном варианте реализации неинтернализующееся антитело связывает CD73 бивалентным образом. В одном варианте реализации антитело представляет собой необедняющее антитело, например, Fc-молчащее антитело. Антитело способно нейтрализовать 5'-эктонуклеотидазную активность димерного полипептида CD73 человека в растворе, более того, без необходимости вызывать образование олигомеров полипептиды CD73:антитела против CD73.In one embodiment, the antibody specifically binds human CD73 on the surface of a cell and is capable of neutralizing the 5'-ectonucleotidase activity of cellular CD73 (cell-expressed CD73). In one embodiment, the antibody specifically binds and neutralizes the 5'-ectonucleotidase activity of human CD73 on the cell surface, and is not internalized into CD73-expressing cells upon binding to CD73. The antibody does not induce multimerization and subsequent internalization of CD73. In one embodiment, the antibody binds to and is capable of inhibiting the enzymatic activity of recombinant human CD73 polypeptide in solution, wherein the antibody is not internalized into CD73 expressing cells. In one embodiment, the non-internalizing antibody binds CD73 in a bivalent manner. In one embodiment, the antibody is a non-depleting antibody, such as an Fc-silencing antibody. The antibody is capable of neutralizing the 5'-ectonucleotidase activity of dimeric human CD73 polypeptide in solution, furthermore, without the need to induce the formation of CD73 polypeptide:anti-CD73 polypeptide oligomers.
В одном варианте реализации антитело специфично двухвалентно связывается с полипептидами CD73 человека и ингибирует ферментативную активность клеточного CD73 человека (и необязательно дополнительно рекомбинантного растворимого CD73 человека), причем указанное антитело не вызывает или не повышает внутриклеточную интернализацию CD73 в экспрессирующих CD73 клетках. Предпочтительно, антитело по существу не связывается с Fcγ-рецептором (например, посредством своего домена Fc).In one embodiment, the antibody specifically binds divalently to human CD73 polypeptides and inhibits the enzymatic activity of cellular human CD73 (and optionally additionally recombinant soluble human CD73), wherein the antibody does not cause or enhance intracellular internalization of CD73 in CD73-expressing cells. Preferably, the antibody does not substantially bind to the Fcγ receptor (eg, through its Fc domain).
В одном аспекте антитело специфично связывает CD73 человека на поверхности клетки, предварительно инкубированной с АМФ, и способно нейтрализовать его 5'-эктонуклеотидазную активность. Необязательно нейтрализацию 5'-эктонуклеотидазной активности определяют путем оценки нейтрализации 5'-эктонуклеотидазной активности в экспрессирующих CD73 клетках (например, клетках MDA-MB-231) путем количественного анализа гидролиза АМФ с образованием аденозина.In one aspect, the antibody specifically binds human CD73 on the surface of a cell pre-incubated with AMP and is capable of neutralizing its 5'-ectonucleotidase activity. Optionally, neutralization of 5'-ectonucleotidase activity is determined by assessing neutralization of 5'-ectonucleotidase activity in CD73-expressing cells (eg, MDA-MB-231 cells) by quantitating the hydrolysis of AMP to adenosine.
В одном аспекте нейтрализацию 5'-эктонуклеотидазной активности CD73, экспрессируемого клеткой, определяют путем оценки способности антитела повышать пролиферацию Т-клеток, когда вызвана пролиферация указанных Т-клеток in vitro (например, посредством костимуляции TCR, стимуляции передачи сигналов CD3 и CD28, например, путем приведения Т-клеток в контакт с гранулами, функционализированными агонистами CD3 и агонистами CD28) в присутствии АМФ (например, экзогенно добавленного АМФ). В одном аспекте нейтрализацию активности 5'-эктонукпеотидазы оценивают, применяя анализ пролиферации Т-клеток, описанный в разделе «Методы» в разделе «Примеры».In one aspect, neutralization of the 5'-ectonucleotidase activity of CD73 expressed by a cell is determined by assessing the ability of the antibody to enhance T cell proliferation when said T cells are induced to proliferate in vitro (e.g., through TCR co-stimulation, stimulation of CD3 and CD28 signaling, e.g. by contacting T cells with beads functionalized with CD3 agonists and CD28 agonists) in the presence of AMP (eg, exogenously added AMP). In one aspect, neutralization of 5'-ectonucleotidase activity is assessed using the T cell proliferation assay described in the Methods section of the Examples section.
Антитела можно охарактеризовать по их способности связываться с клетками, трансфицированными мутантами CD73, по сравнению со способностью антитела против CD73 связывать полипептид CD73 дикого типа (например, SEQ ID NO: 1). Снижение связывания между антителом против CD73 и мутантным полипептидом CD73 означает, что наблюдается снижение аффинности связывания (например, что измеряют с помощью известных способов, таких как тестирование методом FACS клеток, экспрессирующих определенного мутанта, или путем анализа связывания с мутантными полипептидами с помощью метода Biacore) и/или снижение общей способности антитела против CD73 к связыванию (например, о чем свидетельствует уменьшение Bmax на графике концентрации антитела против CD73 в зависимости от концентрации полипептида). Значимое снижение связывания свидетельствует о том, что мутированный остаток непосредственно участвует в связывании с антителом против CD73 или находится в непосредственной близости от связывающего белка, когда антитело против CD73 связано с CD73.Antibodies can be characterized by their ability to bind to cells transfected with CD73 mutants, compared with the ability of an anti-CD73 antibody to bind wild-type CD73 polypeptide (eg, SEQ ID NO: 1). A decrease in binding between an anti-CD73 antibody and a mutant CD73 polypeptide means that there is a decrease in binding affinity (e.g., as measured by known methods such as FACS testing of cells expressing a particular mutant or by analyzing binding to mutant polypeptides using the Biacore method) and/or a decrease in the overall binding capacity of the anti-CD73 antibody (eg, as evidenced by a decrease in B max in a graph of anti-CD73 antibody concentration versus polypeptide concentration). The significant reduction in binding indicates that the mutated residue is directly involved in binding to the anti-CD73 antibody or is in close proximity to the binding protein when the anti-CD73 antibody is bound to CD73.
В некоторых вариантах реализации значимое снижение связывания означает, что аффинность и/или способность связывания между антителом против CD73 и мутантным полипептидом CD73 снижена более чем на 40%, более чем на 50%, более чем на 55%, более чем на 60%, более чем на 65%, более чем на 70%, более чем на 75%, более чем на 80%, более чем на 85%, более чем на 90% или более чем на 95% по сравнению со связыванием между антителом и полипептидом CD73 дикого типа. В некоторых вариантах реализации связывание снижается ниже детектируемых пределов. В некоторых вариантах реализации о значимом снижении связывания свидетельствует связывание антитела против CD73 с мутантным полипептидом CD73, составляющее менее 50% (например, менее 45%, 40%, 35%, 30%, 25%, 20%, 15% или 10%) от связывания, наблюдаемого между антителом против CD73 и полипептидом CD73 дикого типа.In some embodiments, a significant reduction in binding means that the binding affinity and/or ability between the anti-CD73 antibody and the mutant CD73 polypeptide is reduced by more than 40%, more than 50%, more than 55%, more than 60%, more greater than 65%, greater than 70%, greater than 75%, greater than 80%, greater than 85%, greater than 90%, or greater than 95% compared to binding between antibody and wild-type CD73 polypeptide type. In some embodiments, binding is reduced below detectable limits. In some embodiments, a significant reduction in binding is indicated by less than 50% binding of the anti-CD73 antibody to the mutant CD73 polypeptide (e.g., less than 45%, 40%, 35%, 30%, 25%, 20%, 15%, or 10%) from the binding observed between anti-CD73 antibody and wild-type CD73 polypeptide.
В одном аспекте антитела против CD73 проявляют пониженное связывание с полипептидом CD73, содержащим мутацию в остатке K136 (в последовательности SEQ ID NO: 1); необязательно мутантный полипептид CD73 содержит мутацию: K136A.In one aspect, anti-CD73 antibodies exhibit reduced binding to a CD73 polypeptide containing a mutation at residue K136 (in SEQ ID NO: 1); optionally the mutant CD73 polypeptide contains the mutation: K136A.
В одном аспекте антитела против CD73 проявляют пониженное связывание с полипептидом CD73, содержащим мутацию в остатке, выбранном из группы, состоящей из: K97, Е125, Q153 и K330 (в последовательности SEQ ID NO: 1); необязательно мутантный полипептид CD73 содержит следующие мутации: K97A, Е125А, Q153A и/или K330A (например, K97A, Е125А и K330A; K97A, Е125А и/или Q153A).In one aspect, anti-CD73 antibodies exhibit reduced binding to a CD73 polypeptide containing a mutation at a residue selected from the group consisting of: K97, E125, Q153 and K330 (in the sequence of SEQ ID NO: 1); optionally, the mutant CD73 polypeptide contains the following mutations: K97A, E125A, Q153A and/or K330A (eg, K97A, E125A and K330A; K97A, E125A and/or Q153A).
В одном аспекте антитела против CD73 проявляют пониженное связывание с полипептидом CD73, содержащим мутацию в остатке, выбранном из группы, состоящей из: А99, Е129, K133, Е134 и А135 (в последовательности SEQ ID NO: 1); необязательно мутантный полипептид CD73 содержит следующие мутации: A99S, Е129А, K133A, E134N и/или A135S.In one aspect, anti-CD73 antibodies exhibit reduced binding to a CD73 polypeptide containing a mutation at a residue selected from the group consisting of: A99, E129, K133, E134 and A135 (in the sequence of SEQ ID NO: 1); optionally, the mutant CD73 polypeptide contains the following mutations: A99S, E129A, K133A, E134N and/or A135S.
Необязательно, в одном аспекте, антитела против CD73 не проявляют пониженного связывания с полипептидом CD73, содержащим мутацию в остатке, выбранном из группы, состоящей из: Q70, R73, А74, А107 и R109 (в последовательности SEQ ID NO: 1); необязательно мутантный полипептид CD73 содержит следующие мутации: A99S, Q70S, R73A, А74Е, A107I и/или R109G.Optionally, in one aspect, anti-CD73 antibodies do not exhibit reduced binding to a CD73 polypeptide containing a mutation at a residue selected from the group consisting of: Q70, R73, A74, A107 and R109 (in the sequence of SEQ ID NO: 1); optionally, the mutant CD73 polypeptide contains the following mutations: A99S, Q70S, R73A, A74E, A107I and/or R109G.
В одном аспекте антитела против CD73 связывают эпитоп на CD73, содержащий остаток K136 (в последовательности SEQ ID NO: 1).In one aspect, anti-CD73 antibodies bind an epitope on CD73 containing residue K136 (at SEQ ID NO: 1).
В одном аспекте антитела против CD73 связывают эпитоп на CD73, содержащий один, два, три или четыре остатка, выбранных из группы, состоящей из K97, Е125, Q153 и K330 (в последовательности SEQ ID NO: 1).In one aspect, anti-CD73 antibodies bind an epitope on CD73 containing one, two, three or four residues selected from the group consisting of K97, E125, Q153 and K330 (in SEQ ID NO: 1).
В одном аспекте антитела против CD73 связывают эпитоп на CD73, содержащий один, два, три, четыре или пять остатков, выбранных из группы, состоящей из А99, Е129, K133, Е134 и А135 (в последовательности SEQ ID NO: 1).In one aspect, anti-CD73 antibodies bind an epitope on CD73 containing one, two, three, four or five residues selected from the group consisting of A99, E129, K133, E134 and A135 (in the sequence of SEQ ID NO: 1).
В одном аспекте антитела против CD73 связывают эпитоп на CD73, содержащий один, два, три, четыре, пять или более остатков, выбранных из группы, состоящей из K97, А99, Е125, Е129, K133, Е134, А135 и K136 (в последовательности SEQ ID NO: 1). В одном аспекте антитела против CD73 связывают эпитоп на CD73, содержащий один, два, три, четыре, пять или более остатков, выбранных из группы, состоящей из K97, А99, Е125, Е129, K133, Е134, А135, K136, Q153 и K330 (в последовательности SEQ ID NO: 1).In one aspect, anti-CD73 antibodies bind an epitope on CD73 containing one, two, three, four, five or more residues selected from the group consisting of K97, A99, E125, E129, K133, E134, A135 and K136 (in SEQ ID NO: 1). In one aspect, anti-CD73 antibodies bind an epitope on CD73 containing one, two, three, four, five or more residues selected from the group consisting of K97, A99, E125, E129, K133, E134, A135, K136, Q153 and K330 (in sequence SEQ ID NO: 1).
Необязательно, в одном аспекте, антитела против CD73 не связывают эпитоп на CD73, содержащий один, два, три, четыре или пять остатков, выбранных из группы, состоящей из Q70, R73, А74, А107 и R109 (в последовательности SEQ ID NO: 1).Optionally, in one aspect, anti-CD73 antibodies do not bind an epitope on CD73 containing one, two, three, four or five residues selected from the group consisting of Q70, R73, A74, A107 and R109 (in the sequence SEQ ID NO: 1 ).
Антитело против CD73 можно включить в фармацевтический состав в концентрации, включая от 1 мг/мл до 500 мг/мл, причем рН указанного состава составляет от 2,0 до 10,0. Указанный состав может дополнительно содержать буферную систему, консервант(ы), агент(ы), регулирующий(-е) тоничность, хелатирующий(-е) агент(ы), стабилизаторы и поверхностно-активные вещества. В одном варианте реализации фармацевтический состав представляет собой водный состав, т.е., состав, содержащий воду. Такой состав обычно представляет собой раствор или суспензию. В дополнительном варианте реализации фармацевтический состав представляет собой водный раствор. Термин «водный состав» описывает состав, содержащий по меньшей мере 50% по массе воды. Аналогичным образом, термин «водный раствор» описывает раствор, содержащий по меньшей мере 50% по массе воды, и термин «водная суспензия» описывает суспензию, содержащую по меньшей мере 50% по массе воды.The anti-CD73 antibody may be included in a pharmaceutical formulation at a concentration including from 1 mg/ml to 500 mg/ml, the pH of the composition being from 2.0 to 10.0. Said composition may further contain a buffer system, preservative(s), tonicity control agent(s), chelating agent(s), stabilizers and surfactants. In one embodiment, the pharmaceutical composition is an aqueous composition, i.e., a composition containing water. This composition is usually a solution or suspension. In a further embodiment, the pharmaceutical composition is an aqueous solution. The term "aqueous composition" describes a composition containing at least 50% by weight water. Likewise, the term “aqueous solution” describes a solution containing at least 50% by weight water, and the term “aqueous suspension” describes a suspension containing at least 50% by weight water.
В другом варианте реализации фармацевтический состав представляет собой лиофилизированный состав, в который врач или пациент добавляет растворители и/или разбавители перед применением.In another embodiment, the pharmaceutical formulation is a lyophilized formulation to which the physician or patient adds solvents and/or diluents prior to use.
В другом варианте реализации фармацевтический состав представляет собой высушенный состав (например, лиофилизированный или высушенный распылением), готовый для применения без какого-либо предварительного растворения.In another embodiment, the pharmaceutical composition is a dried composition (eg, lyophilized or spray dried) ready for use without any prior dissolution.
В дополнительном аспекте фармацевтический состав содержит водный раствор такого антитела и буфер, причем антитело присутствует в концентрации от 1 мг/мл или выше, и причем рН указанного состава составляет от приблизительно 2,0 до приблизительно 10,0.In a further aspect, the pharmaceutical composition contains an aqueous solution of such antibody and a buffer, wherein the antibody is present at a concentration of 1 mg/ml or higher, and wherein the pH of the composition is from about 2.0 to about 10.0.
В другом варианте реализации рН состава находится в диапазоне, выбранном из перечня, состоящего из: от приблизительно 2,0 до приблизительно 10,0, от приблизительно 3,0 до приблизительно 9,0, от приблизительно 4,0 до приблизительно 8,5, от приблизительно 5,0 до приблизительно 8,0 и от приблизительно 5,5 до приблизительно 7,5.In another embodiment, the pH of the formulation is within a range selected from: about 2.0 to about 10.0, about 3.0 to about 9.0, about 4.0 to about 8.5, from about 5.0 to about 8.0 and from about 5.5 to about 7.5.
В дополнительном варианте реализации буфер выбран из группы, состоящей из ацетата натрия, карбоната натрия, цитрата, глицилглицина, гистидина, глицина, лизина, аргинина, однозамещенного фосфата натрия, двузамещенного фосфата натрия, фосфата натрия и трис(гидроксиметил)аминометана, бицина, трицина, яблочной кислоты, сукцината, малеиновой кислоты, фумаровой кислоты, винной кислоты, аспарагиновой кислоты или их смеси. Каждый из данных конкретных буферов представляет собой альтернативный вариант реализации.In a further embodiment, the buffer is selected from the group consisting of sodium acetate, sodium carbonate, citrate, glycylglycine, histidine, glycine, lysine, arginine, monosodium phosphate, disodium phosphate, sodium phosphate and tris(hydroxymethyl)aminomethane, bicine, tricine, malic acid, succinate, maleic acid, fumaric acid, tartaric acid, aspartic acid or mixtures thereof. Each of these specific buffers represents an alternative implementation.
В дополнительном варианте реализации состав дополнительно содержит фармацевтически приемлемый консервант. В дополнительном варианте реализации состав дополнительно содержит изотонический агент. В дополнительном варианте реализации состав также содержит хелатирующий агент. В дополнительном варианте реализации состав дополнительно содержит стабилизатор. В дополнительном варианте реализации состав дополнительно содержит поверхностно-активное вещество. Для удобства можно сослаться на Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 19oe издание, 1995.In a further embodiment, the composition further comprises a pharmaceutically acceptable preservative. In a further embodiment, the composition further comprises an isotonic agent. In a further embodiment, the composition also contains a chelating agent. In a further embodiment, the composition further comprises a stabilizer. In a further embodiment, the composition further comprises a surfactant. For convenience, reference may be made to Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 19th edition, 1995.
Возможно, что в пептидном фармацевтическом составе могут присутствовать другие ингредиенты. Такие дополнительные ингредиенты могут включать смачивающие агенты, эмульгаторы, антиоксиданты, наполнители, модификаторы тоничности, хелатирующие агенты, ионы металлов, маслянистые среды, белки (например, человеческие сывороточный альбумин, желатин или белки) и цвиттер-ион (например, аминокислоту, такую как бетаин, таурин, аргинин, глицин, лизин и гистидин). Такие дополнительные ингредиенты, разумеется, не должны нежелательно влиять на общую стабильность фармацевтического состава.It is possible that other ingredients may be present in the peptide pharmaceutical formulation. Such additional ingredients may include wetting agents, emulsifiers, antioxidants, fillers, tonicity modifiers, chelating agents, metal ions, oily media, proteins (for example, human serum albumin, gelatin or proteins) and zwitterion (for example, an amino acid such as betaine , taurine, arginine, glycine, lysine and histidine). Such additional ingredients, of course, should not undesirably affect the overall stability of the pharmaceutical composition.
Фармацевтические композиции, содержащие антитело, можно вводить пациенту, нуждающемуся в таком лечении, в несколько мест, например, в места местного применения, например, в места на коже и слизистой оболочке, в места, в которых не требуется абсорбция, например, введение в артерию, в вену, в сердце, и в места, в которых происходит абсорбция, например, введение в кожу, под кожу, в мышцу или в брюшную полость. Введение фармацевтических композиций можно осуществить несколькими путями введения, например, подкожным, внутримышечным, интраперитонеальным, внутривенным, лингвальным, сублингвальным, буккальным, через рот, пероральным, в желудок и кишечник, назальным, легочным, например, через бронхиолы и альвеолы, или их комбинацией, эпидермальным, дермальным, трансдермальным, вагинальным, ректальным, офтальмологическим путем, например, через конъюнктиву, через мочеиспускательный канал и парентерально, пациентам, нуждающимся в таком лечении.Pharmaceutical compositions containing the antibody can be administered to a patient in need of such treatment at multiple sites, for example, at topical sites, such as skin and mucosal sites, at sites that do not require absorption, such as injection into an artery , into a vein, into the heart, and into sites where absorption occurs, such as injection into the skin, subcutaneously, into a muscle, or into the abdominal cavity. Administration of pharmaceutical compositions can be accomplished by several routes of administration, for example, subcutaneous, intramuscular, intraperitoneal, intravenous, lingual, sublingual, buccal, oral, oral, gastric and intestinal, nasal, pulmonary, for example, bronchioles and alveoli, or a combination thereof, epidermal, dermal, transdermal, vaginal, rectal, ophthalmological routes, for example, through the conjunctiva, through the urethra and parenterally, to patients requiring such treatment.
Диагностика и лечение злокачественных новообразованийDiagnosis and treatment of malignant neoplasms
Также предложены способы лечения индивида, в частности, пациента-человека, с применением антитела или фрагмента антитела против СD73, описанного в настоящем документе. В одном варианте реализации в соответствии с настоящим изобретением предложено применение антитела или фрагмента антитела, описанного в настоящем документе, для получения фармацевтической композиции для введения пациенту-человеку. Как правило, пациент страдает от рака или инфекционного заболевания (например, вирусной или бактериальной инфекции), или у него есть риск их развития.Also provided are methods of treating an individual, particularly a human patient, using an anti-CD73 antibody or antibody fragment described herein. In one embodiment, the present invention provides the use of an antibody or antibody fragment described herein to prepare a pharmaceutical composition for administration to a human patient. Typically, the patient has or is at risk of developing cancer or an infectious disease (such as a viral or bacterial infection).
Например, в одном аспекте предложен способ восстановления или усиления активности иммунных клеток (например, лимфоцитов) у пациента, нуждающегося в этом, включающий этап введения указанному пациенту нейтрализующего антитела против CD73 в соответствии с настоящим изобретением. В одном варианте реализации указанный способ направлен на повышение активности иммунных клеток (например, Т-клеток) у пациентов, страдающих заболеванием, таким как рак или инфекционное заболевание, при котором предпочтительна повышенная активность и/или инфильтрация иммунных клеток в очаге заболевания (например, в окружении опухоли или очаге инфекции), или которое вызвано или характеризуется иммуносупрессией, иммуносупрессорными клетками или, например, аденозином, вырабатываемым CD4 Т-клетками, CD8 Т-клетками, В-клетками).For example, in one aspect, there is provided a method of restoring or enhancing the activity of immune cells (eg, lymphocytes) in a patient in need thereof, comprising the step of administering to said patient an anti-CD73 neutralizing antibody in accordance with the present invention. In one embodiment, the method is directed to increasing the activity of immune cells (e.g., T cells) in patients suffering from a disease, such as cancer or an infectious disease, in which increased activity and/or infiltration of immune cells at the site of the disease is preferred (e.g., in surrounding a tumor or site of infection), or which is caused or characterized by immunosuppression, immunosuppressive cells or, for example, adenosine produced by CD4 T cells, CD8 T cells, B cells).
Указанные способы будут особенно полезны для лечения индивидов с опухолью, при которой есть подозрение, что микроокружение опухоли (и опосредованная CD73 продукция аденозина в нем) может способствовать отсутствию распознавания иммунной системой (ускользанию от иммунного ответа). Для окружения опухоли, например, могут быть характерны экспрессирующие CD73 иммунные клетки, например, CD4 Т-клетки, CD8 Т-клетки, В-клетки и/или экспрессирующие CD73 опухолевые клетки.These methods will be particularly useful for the treatment of individuals with a tumor in which it is suspected that the tumor microenvironment (and CD73-mediated production of adenosine therein) may contribute to a lack of recognition by the immune system (immune evasion). The tumor environment, for example, may be characterized by CD73-expressing immune cells, eg, CD4 T cells, CD8 T cells, B cells and/or CD73-expressing tumor cells.
Указанные способы и антитела против CD73 можно применять для лечения и/или предотвращения различных видов рака и других пролиферативных заболеваний. Поскольку эти способы действуют путем уменьшения количества аденозина, который ингибирует противоопухолевую активность лимфоцитов, и, возможно, дополнительно путем повышения АТФ, который может повышать противоопухолевую активность лимфоцитов, они применимы для широкого спектра видов рака, включая, в частности, солидные опухоли, при которых аденозин в микроокружении опухоли может играть значительную роль в подавлении противоопухолевого иммунного ответа. В одном варианте реализации настоящего изобретения у пациента-человека, получающего лечение антителом против CD73, есть рак печени, рак костей, рак поджелудочной железы, рак кожи, рак головы или шеи, рак молочной железы, рак легкого, немелкоклеточный рак легкого (НМРЛ), кастрационно-резистентный рак предстательной железы (CRPC), меланома, рак матки, рак толстой кишки, рак прямой кишки, рак анальной области, рак желудка, рак яичек, рак матки, карцинома фаллопиевых труб, карцинома эндометрия, карцинома шейки матки, карцинома влагалища, карцинома вульвы, неходжкинская лимфома, рак пищевода, рак тонкой кишки, рак эндокринной системы, рак щитовидной железы, рак паращитовидной железы, рак надпочечников, саркома мягких тканей, рак мочеиспускательного канала, рак полового члена, солидные опухоли детского возраста, лимфоцитарная лимфома, рак мочевого пузыря, рак почки или мочеточника, карцинома почки, новообразование центральной нервной системы (ЦНС), первичная лимфома ЦНС, опухолевый ангиогенез, опухоль позвоночника, глиома ствола головного мозга, аденома гипофиза, саркома Капоши, эпидермоидный рак, плоскоклеточный рак, вызванный окружающей средой рак, в том числе рак, вызванный асбестом, гематологические злокачественные новообразования, включая, например, множественную миелому, В-клеточную лимфому, лимфому Ходжкина/первичную медиастинальную В-клеточную лимфому, неходжкинские лимфомы, острую миелоидную лимфому, хронический миелогенный лейкоз, хронический лимфоидный лейкоз, фолликулярную лимфому, диффузную крупно-В-клеточную лимфому, лимфому Беркитта, иммунобластную крупно клеточную лимфому, В-лимфобластную лимфому из клеток-предшественников, мантийноклеточную лимфому, острый лимфобластный лейкоз, грибовидный микоз, анапластическую крупноклеточную лимфому, Т-клеточную лимфому и Т-лимфобластную лимфому из клеток-предшественников, и любые комбинации указанных видов рака. Настоящее изобретение также можно применять для лечения метастатических раковых заболеваний. Пациентов можно протестировать или выбрать по одному или более из описанных выше клинических признаков до, во время или после лечения.These methods and anti-CD73 antibodies can be used to treat and/or prevent various types of cancer and other proliferative diseases. Because these methods act by reducing the amount of adenosine, which inhibits the antitumor activity of lymphocytes, and possibly additionally by increasing ATP, which can enhance the antitumor activity of lymphocytes, they are applicable to a wide range of cancers, including, in particular, solid tumors in which adenosine in the tumor microenvironment may play a significant role in suppressing the antitumor immune response. In one embodiment of the present invention, the human patient receiving anti-CD73 antibody treatment has liver cancer, bone cancer, pancreatic cancer, skin cancer, head or neck cancer, breast cancer, lung cancer, non-small cell lung cancer (NSCLC), castration-resistant prostate cancer (CRPC), melanoma, uterine cancer, colon cancer, rectal cancer, anal cancer, stomach cancer, testicular cancer, uterine cancer, fallopian tube carcinoma, endometrial carcinoma, cervical carcinoma, vaginal carcinoma, vulvar carcinoma, non-Hodgkin's lymphoma, esophageal cancer, small bowel cancer, endocrine cancer, thyroid cancer, parathyroid cancer, adrenal cancer, soft tissue sarcoma, urethral cancer, penile cancer, childhood solid tumors, lymphocytic lymphoma, urinary cancer bladder, kidney or ureteral cancer, renal carcinoma, central nervous system (CNS) neoplasm, primary CNS lymphoma, tumor angiogenesis, spinal tumor, brainstem glioma, pituitary adenoma, Kaposi's sarcoma, epidermoid carcinoma, squamous cell carcinoma, environmentally induced carcinoma, including asbestos-related cancers, hematological malignancies including, for example, multiple myeloma, B-cell lymphoma, Hodgkin's lymphoma/primary mediastinal B-cell lymphoma, non-Hodgkin's lymphomas, acute myeloid lymphoma, chronic myelogenous leukemia, chronic lymphoid leukemia, follicular lymphoma, diffuse large B-cell lymphoma, Burkitt's lymphoma, immunoblastic large cell lymphoma, B-lymphoblastic progenitor cell lymphoma, mantle cell lymphoma, acute lymphoblastic leukemia, mycosis fungoides, anaplastic large cell lymphoma, T-cell lymphoma and T-lymphoblastic lymphoma from progenitor cells, and any combination of these cancers. The present invention can also be used to treat metastatic cancers. Patients may be tested or selected for one or more of the clinical signs described above before, during or after treatment.
Поскольку способы и антитела против CD73 действуют путем уменьшения количества аденозина, который ингибирует активность и/или инфильтрацию иммунных клеток (например, лимфоцитов), и, возможно, дополнительно путем повышения АТФ, который может повышать активность лимфоцитов, они применимы для широкого спектра инфекционных заболеваний, включая, предпочтительно, любые инфекции, вызванные инфицированием вирусами, бактериями, простейшими, плесенью или грибами.Because anti-CD73 methods and antibodies act by reducing the amount of adenosine, which inhibits the activity and/or infiltration of immune cells (eg, lymphocytes), and possibly additionally by increasing ATP, which can increase the activity of lymphocytes, they are applicable to a wide range of infectious diseases, including, preferably, any infections caused by infection with viruses, bacteria, protozoa, mold or fungi.
В одном варианте реализации антитело против CD73 вводят в количестве, эффективном для достижения и/или поддержания у индивида (например, в течение 1, 2, 3, 4 недель и/или до последующего введения антигенсвязывающего соединения) концентрации в крови, составляющей по меньшей мере ЕС50, необязательно ЕС70, необязательно по существу ЕС100, для нейтрализации ферментативной активности CD73. В одном варианте реализации активное количество антитела против CD73 представляет собой количество, эффективное для достижения ЕС50, необязательно ЕС70, необязательно по существу ЕС100, для нейтрализации ферментативной активности CD73 во внесосудистой ткани индивида. В одном варианте реализации активное количество антитела против CD73 представляет собой количество, эффективное для достижения (или поддержания) у индивида ЕС50, необязательно ЕС70, необязательно по существу ЕС100, для ингибирования или нейтрализации ферментативной активности CD73.In one embodiment, the anti-CD73 antibody is administered in an amount effective to achieve and/or maintain in the individual (e.g., for 1, 2, 3, 4 weeks and/or until subsequent administration of the antigen-binding compound) a blood concentration of at least EC 50 , optionally EC 70 , optionally essentially EC 100 , to neutralize the enzymatic activity of CD73. In one embodiment, the active amount of an anti-CD73 antibody is an amount effective to achieve EC 50 , optionally EC 70 , optionally substantially EC 100 , to neutralize CD73 enzymatic activity in extravascular tissue of an individual. In one embodiment, the active amount of an anti-CD73 antibody is an amount effective to achieve (or maintain) in an individual an EC 50 , optionally EC 70 , optionally substantially EC 100 , to inhibit or neutralize the enzymatic activity of CD73.
В одном варианте реализации антитело против CD73 вводят в количестве, эффективном для достижения и/или поддержания (например, в течение 1, 2, 3, 4 недель и/или до последующего введения антитела против CD73) у индивида концентрации в крови, составляющей по меньшей мере ЕС50, необязательно ЕС70, необязательно по существу ЕС100, для ингибирования опосредованного CD73 катаболизма АМФ с образованием аденозина (например, что определяют путем оценки нейтрализации 5'-эктонуклеотидазной активности в клетках MDA-MB-231 путем количественного анализа гидролиза АМФ с образованием аденозина). В одном варианте реализации количество антитела против CD73 представляет собой количество, эффективное для достижения (или поддержания) ЕС50, необязательно ЕС70, необязательно по существу ЕС100, для ингибирования опосредованного CD73 катаболизма АМФ с образованием аденозина во внесосудистой ткани индивида.In one embodiment, the anti-CD73 antibody is administered in an amount effective to achieve and/or maintain (e.g., for 1, 2, 3, 4 weeks and/or until subsequent administration of the anti-CD73 antibody) a blood concentration in the individual of at least at least EC 50 , optionally EC 70 , optionally substantially EC 100 , to inhibit CD73-mediated catabolism of AMP to adenosine (e.g., as determined by assessing neutralization of 5'-ectonucleotidase activity in MDA-MB-231 cells by quantitating AMP hydrolysis to adenosine). In one embodiment, the amount of anti-CD73 antibody is an amount effective to achieve (or maintain) EC 50 , optionally EC 70 , optionally substantially EC 100 , to inhibit CD73-mediated catabolism of AMP to adenosine in extravascular tissue of an individual.
В одном варианте реализации предложен способ лечения или предотвращения рака у индивида, указанный способ включает введение индивиду, страдающему заболеванием, антитела против CD73 в количестве, которое позволяет достичь или поддерживать в течение определенного периода времени концентрации в кровотоке, необязательно в представляющей интерес внесосудистой ткани (например, в опухоли или в окружении опухоли), которая выше, чем концентрация, необходимая для 50%-ного, 70%-ного или полного (например, 90%-ного) насыщения рецепторов экспрессирующих CD73 клеток в кровотоке (например, что оценивают в МКПК). Необязательно достигнутая концентрация по меньшей мере на 20%, 50% или 100% выше, чем концентрация, необходимая для насыщения определенных рецепторов.In one embodiment, a method of treating or preventing cancer in an individual is provided, the method comprising administering to the individual suffering from the disease an anti-CD73 antibody in an amount that achieves or maintains for a specified period of time a concentration in the bloodstream, optionally in the extravascular tissue of interest (eg , in the tumor or in the tumor environment) that is higher than the concentration required to achieve 50%, 70%, or complete (eg, 90%) receptor saturation of CD73-expressing cells in the circulation (eg, as assessed by PBMC ). Optionally, the concentration achieved is at least 20%, 50% or 100% higher than the concentration required to saturate certain receptors.
В одном варианте реализации предложен способ лечения или предотвращения рака у индивида, указанный способ включает введение индивиду антитела против CD73 в количестве, которое позволяет достичь или поддерживать в течение определенного периода времени концентрацию в кровотоке, необязательно в представляющей интерес внесосудистой ткани (например, опухоли или в окружении опухоли), которая выше, чем ЕС50, необязательно ЕС70 или необязательно ЕС100, для связывания с клетками, экспрессирующими CD73 (например, что оценивают путем титрования антитела против CD73 на клетках, экспрессирующих CD73, например, клетках MDA-MB-231). Необязательно достигнутая концентрация по меньшей мере на 20%, 50% или 100% выше, чем ЕС50, необязательно ЕС70 или необязательно ЕС100, для связывания с клетками, экспрессирующими CD73.In one embodiment, a method of treating or preventing cancer in an individual is provided, the method comprising administering to the individual an anti-CD73 antibody in an amount that achieves or maintains for a specified period of time a concentration in the bloodstream, optionally in the extravascular tissue of interest (e.g., tumor or tumor environment) that is higher than EC 50 , optionally EC 70 or optionally EC 100 , to bind to CD73-expressing cells (e.g., as assessed by titrating anti-CD73 antibody on CD73-expressing cells, e.g., MDA-MB-231 cells ). Optionally, the achieved concentration is at least 20%, 50% or 100% higher than EC 50 , optionally EC 70 or optionally EC 100 for binding to cells expressing CD73.
В любом варианте реализации у антитела может, например, наблюдаться ЕС50, в некоторых случаях ЕС70 или в некоторых случаях ЕС100 для связывания с экспрессирующими CD73 клетками среди МКПК человека, составляющая 0,5-100 нг/мл, в некоторых случаях 1-100 нг/мл, в некоторых случаях 30-100 нг/мл, например, приблизительно 30-90 нг/мл (например, что оценивают путем титрования антитела против CD73 на клетках, экспрессирующих CD73, например, клетках MDA-MB-231).In any embodiment, the antibody may, for example, have an EC50 , in some cases an EC70 , or in some cases an EC100 for binding to CD73-expressing cells among human PBMCs of 0.5-100 ng/ml, in some cases 1- 100 ng/ml, in some cases 30-100 ng/ml, eg about 30-90 ng/ml (eg, as assessed by titrating anti-CD73 antibody on cells expressing CD73, eg MDA-MB-231 cells).
ЕС50 для нейтрализации ферментативной активности CD73 с помощью антитела против CD73 может составлять, например, приблизительно от 0,01 мкг/мл до 1 мкг/мл, необязательно от 0,1 мкг/мл до 10 мкг/мл, необязательно от 0,1 мкг/мл до 1 мкг/мл. Например, ЕС50 может составлять приблизительно 0,1 мкг/мл, приблизительно 0,2 мкг/мл или приблизительно 0,3 мкг/мл. Таким образом, количество указанного антитела против CD73, например, вводят, чтобы достичь и/или поддерживать концентрацию в крови, составляющую по меньшей мере 0,1 мкг/мл, в некоторых случаях по меньшей мере 0,2 мкг/мл, в некоторых случаях по меньшей мере 1 мкг/мл или в некоторых случаях по меньшей мере 2 мкг/мл.The EC 50 for neutralizing CD73 enzymatic activity with an anti-CD73 antibody may be, for example, from about 0.01 μg/ml to 1 μg/ml, optionally from 0.1 μg/ml to 10 μg/ml, optionally from 0.1 µg/ml to 1 µg/ml. For example, the EC 50 may be about 0.1 μg/ml, about 0.2 μg/ml, or about 0.3 μg/ml. Thus, an amount of said anti-CD73 antibody is, for example, administered to achieve and/or maintain a blood concentration of at least 0.1 μg/ml, in some cases at least 0.2 μg/ml, in some cases at least 1 μg/ml or in some cases at least 2 μg/ml.
Когда мишенью являются ткани за пределами сосудистой сети (окружение опухоли, например, при лечении солидных опухолей), обычно считается, что необходима приблизительно в 10 раз более высокая доза по сравнению с дозой, которая приводит к соответствующей концентрации в кровотоке. Ожидается, что количество антитела против CD73, введенное для достижения (и/или поддержания) концентрации в кровотоке (крови), равной приблизительно 1 мкг/мл, 2 мкг/мл, 10 мкг/мл или 20 мкг/мл, приведет к достижению (и/или поддержанию) концентрации во внесосудистой ткани (например, в опухолевой ткани), равной приблизительно 0,1 мкг/мл, 0,2 мкг/мл, 1 мкг/мл, 2 мкг/мл, соответственно.When tissues outside the vasculature (tumor surroundings, such as in the treatment of solid tumors) are targeted, it is generally believed that a dose approximately 10 times higher than the dose that results in the corresponding concentration in the bloodstream is required. An amount of anti-CD73 antibody administered to achieve (and/or maintain) a circulating (blood) concentration of approximately 1 μg/mL, 2 μg/mL, 10 μg/mL, or 20 μg/mL is expected to achieve ( and/or maintaining) a concentration in extravascular tissue (eg, tumor tissue) of approximately 0.1 μg/ml, 0.2 μg/ml, 1 μg/ml, 2 μg/ml, respectively.
В одном варианте реализации антитело против CD73, например, вводят в количестве, достаточном для достижения и/или поддержания концентрации в ткани (например, в окружении опухоли), равной по меньшей мере 0,1 мкг/мл, необязательно по меньшей мере 0,2 мкг/мл, необязательно по меньшей мере 1 мкг/мл или необязательно по меньшей мере 2 мкг/мл. Антитело можно, например, вводить в количестве, достаточном для достижения и/или поддержания концентрации в крови, равной по меньшей мере приблизительно 1 мкг/мл, 2 мкг/мл, 10 мкг/мл или 20 мкг/мл, например, в диапазоне 1-100 мкг/мл, 10-100 мкг/мл, 1-50 мкг/мл, 1-20 мкг/мл или 1-10 мкг/мл. Вводимое количество можно скорректировать таким образом, чтобы обеспечить поддержание необходимой концентрации в течение определенного периода времени после введения (например, 1, 2, 3, 4 недель и т.д.).In one embodiment, the anti-CD73 antibody is, for example, administered in an amount sufficient to achieve and/or maintain a concentration in tissue (eg, surrounding a tumor) of at least 0.1 μg/ml, optionally at least 0.2 μg/ml, optionally at least 1 μg/ml or optionally at least 2 μg/ml. The antibody may, for example, be administered in an amount sufficient to achieve and/or maintain a blood concentration of at least about 1 μg/ml, 2 μg/ml, 10 μg/ml, or 20 μg/ml, for example, in the range of 1 -100 µg/ml, 10-100 µg/ml, 1-50 µg/ml, 1-20 µg/ml or 1-10 µg/ml. The amount administered can be adjusted to ensure that the required concentration is maintained for a specified period of time after administration (eg, 1, 2, 3, 4 weeks, etc.).
В некоторых вариантах реализации вводят такое количество антитела против CD73, чтобы получить концентрацию в крови (сыворотке) или во внесосудистой ткани (например, в окружении опухоли), которая соответствует по меньшей мере ЕС70 или ЕС100 для нейтрализации ферментативной активности CD73. Антитело можно, например, вводить в количестве, достаточном для достижения и/или поддержания концентрации в крови или во внесосудистой ткани (например, в окружении опухоли), равной по меньшей мере приблизительно 1 мкг/мл, 2 мкг/мл, 10 мкг/мл или 20 мкг/мл.In some embodiments, an amount of anti-CD73 antibody is administered to obtain a concentration in the blood (serum) or extravascular tissue (eg, surrounding a tumor) that is at least EC 70 or EC 100 to neutralize CD73 enzymatic activity. The antibody may, for example, be administered in an amount sufficient to achieve and/or maintain a concentration in the blood or in extravascular tissue (eg, surrounding a tumor) of at least about 1 μg/ml, 2 μg/ml, 10 μg/ml or 20 mcg/ml.
ЕС50, ЕС70 или ЕС100 можно оценить, например, в клеточном анализе нейтрализации ферментативной активности CD73 (например, нейтрализации 5'-эктонуклеотидазной активности в клетках MDA-MB-231, путем количественного анализа гидролиза АМФ с образованием аденозина). «ЕС50» в отношении нейтрализации ферментативной активности CD73 относится к эффективной концентрации антитела против CD73, которая вызывает 50% от максимального ответа или эффекта в отношении нейтрализации ферментативной активности). «ЕС70» в отношении нейтрализации ферментативной активности CD73 относится к эффективной концентрации антитела против CD73, которая вызывает 70% от максимального ответа или эффекта. «ЕС100» в отношении нейтрализации ферментативной активности CD73 относится к эффективной концентрации антитела против CD73, которая вызывает по существу максимальный ответ или эффект в отношении такой нейтрализации ферментативной активности.EC 50 , EC 70 or EC 100 can be assessed, for example, in a cell-based assay for neutralizing CD73 enzymatic activity (eg, neutralizing 5'-ectonucleotidase activity in MDA-MB-231 cells by quantitating the hydrolysis of AMP to form adenosine). "EC 50 " for neutralizing CD73 enzymatic activity refers to the effective concentration of anti-CD73 antibody that produces 50% of the maximum response or effect in neutralizing enzymatic activity). "EC 70 " with respect to neutralizing CD73 enzymatic activity refers to the effective concentration of anti-CD73 antibody that produces 70% of the maximum response or effect. "EC 100 " with respect to neutralizing CD73 enzymatic activity refers to the effective concentration of anti-CD73 antibody that produces substantially maximum response or effect with respect to such neutralizing enzymatic activity.
В некоторых вариантах реализации, в частности, для лечения солидных опухолей, предполагается, что достигнутая концентрация приведет к концентрации в тканях (за пределами сосудистой сети, например, в опухоли или окружении опухоли), которая соответствует по меньшей мере ЕС50 для нейтрализации ферментативной активности, и необязательно приблизительно или по меньшей мере приблизительно равна ЕС100.In some embodiments, particularly for the treatment of solid tumors, it is expected that the concentration achieved will result in a tissue concentration (outside the vasculature, e.g., in the tumor or tumor surroundings) that corresponds to at least EC 50 to neutralize enzymatic activity. and optionally approximately or at least approximately equal to EC 100 .
В одном варианте реализации количество антитела против CD73 составляет от 1 до 20 мг/кг массы тела. В одном варианте реализации указанное количество вводят индивиду еженедельно, каждые две недели, ежемесячно или каждые два месяца.In one embodiment, the amount of anti-CD73 antibody is from 1 to 20 mg/kg body weight. In one embodiment, said amount is administered to a subject weekly, every two weeks, monthly, or every two months.
В одном варианте реализации предложен способ лечения индивида-человека, включающий введение указанному индивиду эффективного количества антитела против CD73 в соответствии с настоящим изобретением в течение по меньшей мере одного цикла введения (необязательно по меньшей мере 2, 3, 4 или более циклов введения), причем указанный цикл представляет собой период, составляющий восемь недель или менее, причем в каждом из по меньшей мере одного цикла вводят одну, две, три или четыре дозы антитела против CD73 по 1-20 мг/кг массы тела. В одном варианте реализации антитело против CD73 вводят путем внутривенной инфузии.In one embodiment, there is provided a method of treating a human subject, comprising administering to said subject an effective amount of an anti-CD73 antibody according to the present invention over at least one administration cycle (optionally at least 2, 3, 4 or more administration cycles), wherein said cycle is a period of eight weeks or less, with one, two, three or four doses of 1-20 mg/kg body weight of anti-CD73 antibody administered in each of at least one cycle. In one embodiment, the anti-CD73 antibody is administered by intravenous infusion.
Подходящие протоколы лечения для лечения человека включают, например, введение пациенту количества, описанного в настоящем документе, антитела против CD73, причем указанный способ включает по меньшей мере один цикл введения, в котором вводят по меньшей мере одну дозу антитела против CD73. Необязательно, вводят по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8 доз антитела против CD73. В одном варианте реализации цикл введения длится от 2 недель до 8 недель.Suitable treatment protocols for treating a human include, for example, administering to a patient an amount described herein of an anti-CD73 antibody, the method comprising at least one dosing cycle in which at least one dose of an anti-CD73 antibody is administered. Optionally, at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, or 8 doses of anti-CD73 antibody are administered. In one embodiment, the administration cycle lasts from 2 weeks to 8 weeks.
Пациента, страдающего от рака, можно лечить антителом против CD73 с предварительным этапом детектирования, или без него, для оценки экспрессии CD73 на клетках в микроокружении опухоли (например, на опухолевых клетках, CD4 Т-клетках, CD8 Т-клетках, В-клетках). Необязательно способы лечения могут включать этап обнаружения нуклеиновой кислоты или полипептида CD73 в биологическом образце из опухоли из индивида (например, ткани рака или ткани, находящейся вблизи или в отдалении от рака, прилегающей к раку ткани, прилегающей неопухолевой ткани или прилегающей нормальной ткани). Определение того, что биологический образец содержит клетки, экспрессирующие CD73 (например, экспрессирующие CD73 на высоком уровне, определение высокой интенсивности окрашивания антителом против CD73 по сравнению с референсной, например, здоровой тканью), свидетельствует о том, что у пациента есть рак, который можно очень успешно лечить антителом против CD73. В одном варианте реализации способ включает определение уровня экспрессии нуклеиновой кислоты или полипептида CD73 в биологическом образце и сравнение указанного уровня с референсным уровнем, соответствующим здоровому индивиду. Определение того, что биологический образец содержит клетки, экспрессирующие нуклеиновую кислоту или полипептид CD73 на уровне, который повышен по сравнению с референсным уровнем (например, здоровой тканью), свидетельствует о том, что у пациента есть рак, который можно успешно лечить антителом против CD73 в соответствии с настоящим изобретением. Необязательно детектирование полипептида CD73 в биологическом образце включает детектирование полипептида CD73, экспрессированного на поверхности злокачественной клетки или CD4 Т-клетки, CD8 Т-клетки или В-клетки.A patient suffering from cancer can be treated with an anti-CD73 antibody, with or without a pre-detection step, to assess CD73 expression on cells in the tumor microenvironment (eg, tumor cells, CD4 T cells, CD8 T cells, B cells) . Optionally, the treatment methods may include the step of detecting a CD73 nucleic acid or polypeptide in a biological sample from a tumor from an individual (eg, cancer tissue or tissue adjacent to or distant from cancer, adjacent tissue to cancer, adjacent non-tumor tissue, or adjacent normal tissue). Determining that a biological specimen contains cells expressing CD73 (eg, expressing CD73 at high levels, detecting high staining intensity with anti-CD73 antibody compared to a reference, e.g., healthy tissue) indicates that the patient has cancer that can be very successfully treated with anti-CD73 antibody. In one embodiment, the method includes determining the expression level of a CD73 nucleic acid or polypeptide in a biological sample and comparing the level with a reference level corresponding to a healthy individual. Determining that a biological sample contains cells expressing CD73 nucleic acid or polypeptide at a level that is elevated relative to a reference level (eg, healthy tissue) indicates that the patient has a cancer that can be successfully treated with an anti-CD73 antibody in in accordance with the present invention. Optionally, detecting a CD73 polypeptide in a biological sample includes detecting a CD73 polypeptide expressed on the surface of a cancer cell or a CD4 T cell, CD8 T cell or B cell.
Определение того, есть ли у индивида рак, для которого характерны клетки, экспрессирующие полипептид CD73, может, например, включать получение биологического образца (например, путем проведения биопсии) из индивида, который содержит клетки из окружения рака (например, опухоли или прилегающей к опухоли ткани), приведение указанных клеток в контакт с антителом, которое связывает полипептид CD73, и детектирование того, экспрессируют ли клетки CD73 на своей поверхности. Необязательно определение того, есть ли у индивида клетки, которые экспрессируют CD73, включает проведение иммуногистохимического анализа.Determining whether an individual has a cancer characterized by cells expressing the CD73 polypeptide may, for example, involve obtaining a biological sample (eg, by performing a biopsy) from the individual that contains cells from the environment of the cancer (eg, the tumor or adjacent to the tumor). tissue), contacting said cells with an antibody that binds the CD73 polypeptide, and detecting whether the cells express CD73 on their surface. Optionally, determining whether an individual has cells that express CD73 involves performing an immunohistochemical analysis.
Композиции антител можно успешно применять в комбинации с одним или более другими терапевтическими агентами, включая агенты, обычно используемые для конкретной терапевтической цели, для которой вводится антитело. Дополнительный терапевтический агент обычно вводят в количествах и используя схемы лечения, обычно используемые для этого агента при монотерапии конкретного заболевания или патологического состояния, подлежащего лечению. Такие терапевтические агенты включают, но не ограничены противораковыми агентами и химиотерапевтическими агентами.Antibody compositions can be advantageously used in combination with one or more other therapeutic agents, including agents typically used for the particular therapeutic purpose for which the antibody is administered. The additional therapeutic agent is typically administered in amounts and using treatment regimens typically used for that agent in monotherapy for the particular disease or condition being treated. Such therapeutic agents include, but are not limited to, anticancer agents and chemotherapeutic agents.
В одном варианте реализации антитела против CD73 повышают эффективность агентов, которые нейтрализуют ингибиторную активность PD-1 человека, например, которые ингибируют взаимодействие между PD-1 и PD-L1. Соответственно, в одном варианте реализации второй или дополнительный второй терапевтический агент представляет собой антитело или другой агент, который нейтрализует ингибиторную активность PD-1 человека.In one embodiment, anti-CD73 antibodies enhance the effectiveness of agents that neutralize human PD-1 inhibitory activity, for example, those that inhibit the interaction between PD-1 and PD-L1. Accordingly, in one embodiment, the second or additional second therapeutic agent is an antibody or other agent that neutralizes human PD-1 inhibitory activity.
Белок запрограммированной гибели 1 (PD-1) (также называемый "белком запрограммированной клеточной гибели 1") является ингибиторным представителем семейства рецепторов CD28. Полноразмерную последовательность PD-1 человека можно найти под номером доступа в GenBank U64863. Ингибирование или нейтрализация ингибиторной активности PD-1 может включать применение полипептидного агента (например, антитела, полипептида, слитого с доменом Fc, иммуноадгезина и т.д.), который предотвращает индуцированную PD-L1 передачу сигналов PD-1. На сегодняшний день существует по меньшей мере шесть агентов, блокирующих сигнальный путь PD-1/PD-L1, которые доступны на рынке или проходят клиническую оценку. Один агент представляет собой BMS-936558 (ниволумаб/ONO-4538, Bristol-Myers Squibb; прежнее название MDX-1106). Ниволумаб (торговое наименование Опдиво®) представляет собой одобренное FDA полностью человеческое MAT IgG4 против PD-L1, которое ингибирует связывание лиганда PD-L1 как с PD-1, так и CD80 и описано как антитело 5С4 в WO 2006/121168, описание которого включено в данную заявку посредством ссылки. Для пациентов с меланомой наиболее значимый общий ответ (ОО) наблюдали при дозе 3 мг/кг, тогда как при других типах рака его наблюдали при дозе 10 мг/кг. Ниволумаб, как правило, вводили в дозе 10 мг/кг раз в 3 недели до тех пор, пока не происходило прогрессирование рака. Термины «снижает ингибиторную активность PD-1 человека», «нейтрализует PD-1» или «нейтрализует ингибиторную активность PD-1 человека» относятся к процессу, в котором ингибируется способность PD-1 передавать сигнал в результате взаимодействия PD-1 с одним или более его партнерами по связыванию, такими как PD-L1 или PD-L2. Агент, который нейтрализует ингибиторную активность PD-1, снижает, блокирует, ингибирует, прекращает или препятствует передаче сигнала в результате взаимодействия PD-1 с одним или более его партнерами по связыванию, такими как PD-L1, PD-L2. Таким образом, такой агент может уменьшать отрицательный костимулирующий сигнал, опосредованный или проходящий через белки на поверхности клетки, экспрессированные на Т-лимфоцитах, чтобы усиливать эффекторные функции Т-клеток, такие как пролиферация, продукция цитокинов и/или цитотоксичность.Programmed death protein 1 (PD-1) (also called “programmed
MK-3475 (человеческое MAT IgG4 против PD1 от Merck), также называемый ламбролизумабом или пембролизумабом (торговое наименование Китруда®), был одобрен FDA для лечения меланомы и тестируется при других типах рака. Пембролизумаб исследовали при дозе 2 мг/кг или 10 мг/кг раз в 2 или 3 недели до тех пор, пока не происходило прогрессирование заболевания. MK-3475, также известный как Merck 3745 или SCH-900475, также описан в WO 2009/114335.MK-3475 (human IgG4 anti-PD1 MAT from Merck), also called lambrolizumab or pembrolizumab (trade name Keytruda®), has been approved by the FDA for the treatment of melanoma and is being tested in other types of cancer. Pembrolizumab was studied at a dose of 2 mg/kg or 10 mg/kg every 2 or 3 weeks until disease progression occurred. MK-3475, also known as Merck 3745 or SCH-900475, is also described in WO 2009/114335.
MPDL3280A/RG7446 (атезолизумаб, торговое название Тецентрик™, антитело против PD-L1 от Roche/Genentech) представляет собой человеческое МАТ против PD-L1, которое содержит сконструированный домен Fc, разработанный для оптимизации эффективности и безопасности путем минимизирования связывания FcγR и последующей антителозависимой клеточной цитотоксичности (АЗКЦ). Дозы ≤ 1, 10, 15 и 25 мг/кг MPDL3280A вводили раз в 3 недели в течение до 1 года. В 3 фазе клинического испытания, MPDL3280A вводят в дозе 1200 мг путем внутривенной инфузии раз в три недели при НМРЛ.MPDL3280A/RG7446 (atezolizumab, brand name Tecentriq™, anti-PD-L1 antibody from Roche/Genentech) is a human anti-PD-L1 mAb that contains an engineered Fc domain designed to optimize efficacy and safety by minimizing FcγR binding and subsequent antibody-dependent cell death. cytotoxicity (ADCC). Doses ≤ 1, 10, 15, and 25 mg/kg MPDL3280A were administered every 3 weeks for up to 1 year. In a phase 3 clinical trial, MPDL3280A is administered at a dose of 1200 mg by intravenous infusion every three weeks for NSCLC.
АМР-224 (амплиммун (Amplimmune) и GSK) представляет собой иммуноадгезин, содержащий внеклеточный домен PD-L2, слитый с доменом Fc. Другие примеры агентов, которые нейтрализуют PD-1, могут включать антитело, которое связывает PD-L2 (антитело против PD-L2) и блокирует взаимодействие между PD-1 и PD-L2.AMP-224 (Amplimmune and GSK) is an immunoadhesin containing an extracellular PD-L2 domain fused to an Fc domain. Other examples of agents that neutralize PD-1 may include an antibody that binds PD-L2 (anti-PD-L2 antibody) and blocks the interaction between PD-1 and PD-L2.
Другим примером является пидлизумаб (СТ-011; CureTech) (гуманизированное MAT IgG1 против PD1 от CureTech/Teva), пидлизумаб (СТ-011; CureTech) (см., например, WO 2009/101611); указанный агент тестировали на тридцати пациентах с чувствительной к ритуксимабу рецидивирующей фолликулярной лимфомой (FL), которым вводили внутривенно 3 мг/кг СТ-011 каждые 4 недели, всего 4 инфузии, в комбинации с ритуксимабом в дозе 375 мг/м2 еженедельно в течение 4 недель, начиная через 2 недели после первой инфузии СТ-011.Another example is pidlizumab (CT-011; CureTech) (humanized anti-PD1 IgG1 MAT from CureTech/Teva), pidlizumab (CT-011; CureTech) (see, for example, WO 2009/101611); This agent was tested in thirty patients with rituximab-sensitive relapsed follicular lymphoma (FL) who were administered intravenously 3 mg/kg ST-011 every 4 weeks for a total of 4 infusions, in combination with rituximab at a dose of 375 mg/m 2 weekly for 4 weeks, starting 2 weeks after the first infusion of ST-011.
Дополнительные известные антитела против PD-1 и другие ингибиторы PD-1 включают АМР-224 (слитый белок B7-DC/IgG1, запатентованный GSK), АМР-514, описанный в WO 2012/145493, антитело MEDI-4736 (дурвалумаб, торговое наименование Имфинзи™, антитело против PD-L1, разработанное AstraZeneca/Medimmune), описанное в WO 2011/066389 и US 2013/034559, антитело YW243.55.S70 (антитело против PD-L1), описанное в WO 2010/077634, MDX-1105, также известное как BMS-936559, представляет собой антитело против PD-L1, разработанное Bristol-Myers Squibb, описанное в WO 2007/005874, и антитела и ингибиторы, описанные в WO 2006/121168, WO 2009/014708, WO 2009/114335 и WO 2013/019906, описания которых включены в данную заявку посредством ссылки. Дополнительные примеры антител против PD-1 описаны в WO 2015/085847 (Shanghai Hengrui Pharmaceutical Co. Ltd.), например, антитела, содержащие CDR1, 2 и 3 вариабельного домена легкой цепи с последовательностями SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7 и/или SEQ ID NO: 8, соответственно, и CDR1, 2 и 3 вариабельного домена тяжелой цепи антитела с последовательностями SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 5, соответственно, причем в упомянутых SEQ ID NO используется нумерация согласно WO 2015/085847, описание которой включено в данную заявку посредством ссылки. Антитела, которые конкурируют с любыми из данных антител за связывание с PD-1 или PD-L1, также можно применять. В некоторых вариантах реализации нейтрализующий PD-1 агент представляет собой антитело против PD-L1, которое ингибирует связывание PD-L1 с PD-1. В некоторых вариантах реализации нейтрализующий PD-1 агент представляет собой антитело против PD-1, которое ингибирует связывание PD-1 с PD-L1. Примером антитела против PD-1 является пембролизумаб (выведенный на рынок Merck & Со. как Китруда™, см. также WO 2009/114335, описание которой включено в данную заявку посредством ссылки). Примером антитела против PD-L1 является антитело MEDI-4736 (дурвалумаб, торговое наименование Имфинзи™, антитело против PD-L1, разработанное AstraZeneca/Medimmune).Additional known anti-PD-1 antibodies and other PD-1 inhibitors include AMP-224 (a B7-DC/IgG1 fusion protein proprietary to GSK), AMP-514 described in WO 2012/145493, MEDI-4736 antibody (durvalumab, trade name Imfinzi™, anti-PD-L1 antibody developed by AstraZeneca/Medimmune), described in WO 2011/066389 and US 2013/034559, antibody YW243.55.S70 (anti-PD-L1 antibody), described in WO 2010/077634, MDX- 1105, also known as BMS-936559, is an anti-PD-L1 antibody developed by Bristol-Myers Squibb described in WO 2007/005874, and antibodies and inhibitors described in WO 2006/121168, WO 2009/014708, WO 2009/ 114335 and WO 2013/019906, the disclosures of which are incorporated herein by reference. Additional examples of anti-PD-1 antibodies are described in WO 2015/085847 (Shanghai Hengrui Pharmaceutical Co. Ltd.), for example, antibodies containing CDR1, 2 and 3 of the light chain variable domain with the sequences SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7 and/or SEQ ID NO: 8, respectively, and CDR1, 2 and 3 of the variable domain of the heavy chain of the antibody with the sequences SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 5, respectively, and in the mentioned SEQ ID NO The numbering used is according to WO 2015/085847, the description of which is incorporated into this application by reference. Antibodies that compete with any of these antibodies for binding to PD-1 or PD-L1 can also be used. In some embodiments, the PD-1 neutralizing agent is an anti-PD-L1 antibody that inhibits the binding of PD-L1 to PD-1. In some embodiments, the PD-1 neutralizing agent is an anti-PD-1 antibody that inhibits the binding of PD-1 to PD-L1. An example of an anti-PD-1 antibody is pembrolizumab (marketed by Merck & Co. as Keytruda™, see also WO 2009/114335, the disclosure of which is incorporated herein by reference). An example of an anti-PD-L1 antibody is MEDI-4736 (durvalumab, trade name Imfinzi™, an anti-PD-L1 antibody developed by AstraZeneca/Medimmune).
В указанных способах лечения связывающее CD73 соединение и второй терапевтический агент можно вводить отдельно, совместно или последовательно, или в виде коктейля. В некоторых вариантах реализации связывающее антиген соединение вводят перед введением второго терапевтического агента. Например, связывающее CD73 соединение можно вводить приблизительно за 0-30 дней до введения второго терапевтического агента. В некоторых вариантах реализации связывающее CD73 соединение вводят за от приблизительно 30 минут до приблизительно 2 недель, от приблизительно 30 минут до приблизительно 1 недели, от приблизительно 1 часа до приблизительно 2 часов, от приблизительно 2 часов до приблизительно 4 часов, от приблизительно 4 часов до приблизительно 6 часов, от приблизительно 6 часов до приблизительно 8 часов, от приблизительно 8 часов до 1 дня или приблизительно от 1 до 5 дней до введения второго терапевтического агента. В некоторых вариантах реализации связывающее CD73 соединение вводят одновременно с введением указанных терапевтических агентов. В некоторых вариантах реализации связывающее CD73 соединение вводят после введения второго терапевтического агента. Например, связывающее CD73 соединение можно вводить приблизительно через 0-30 дней после введения второго терапевтического агента. В некоторых вариантах реализации связывающее CD73 соединение вводят через от приблизительно 30 минут до приблизительно 2 недель, от приблизительно 30 минут до приблизительно 1 недели, от приблизительно 1 часа до приблизительно 2 часов, от приблизительно 2 часов до приблизительно 4 часов, от приблизительно 4 часов до приблизительно 6 часов, от приблизительно 6 часов до приблизительно 8 часов, от приблизительно 8 часов до 1 дня или от приблизительно 1 до 5 дней после введения второго терапевтического агента.In these methods of treatment, the CD73 binding compound and the second therapeutic agent can be administered separately, together or sequentially, or as a cocktail. In some embodiments, the antigen binding compound is administered prior to administration of the second therapeutic agent. For example, the CD73 binding compound can be administered approximately 0-30 days prior to administration of the second therapeutic agent. In some embodiments, the CD73 binding compound is administered over about 30 minutes to about 2 weeks, about 30 minutes to about 1 week, about 1 hour to about 2 hours, about 2 hours to about 4 hours, about 4 hours to about 6 hours, about 6 hours to about 8 hours, about 8 hours to 1 day, or about 1 to 5 days before administration of the second therapeutic agent. In some embodiments, the CD73 binding compound is administered concomitantly with the administration of the therapeutic agents. In some embodiments, the CD73 binding compound is administered after administration of the second therapeutic agent. For example, the CD73 binding compound can be administered approximately 0-30 days after administration of the second therapeutic agent. In some embodiments, the CD73 binding compound is administered over about 30 minutes to about 2 weeks, about 30 minutes to about 1 week, about 1 hour to about 2 hours, about 2 hours to about 4 hours, about 4 hours to about 6 hours, about 6 hours to about 8 hours, about 8 hours to 1 day, or about 1 to 5 days after administration of the second therapeutic agent.
ПримерыExamples
СпособыMethods
Клонирование, получение и очистка рекомбинантного huCD73 Молекулярная биологияCloning, production and purification of recombinant huCD73 Molecular Biology
Белок huCD73 клонировали из кДНК MIAPACA-2, применяя следующие праймеры TACGACTCACAAGCTTGCCGCCACCATGTGTCCCCGAGCCGCGCG (SEQ ID NO: 20) (прямой) и CCGCCCCGACTCTAGAtcaGTGATGGTGATGATGGTGcttgatccgaccttcaactg SEQ ID NO: 21) (обратный). Очищенный продукт ПЦР затем клонировали в вектор экспрессии, применяя систему клонирования InFusion. Метку 6xHis добавляли в С-концевую часть белка для этапа очистки.The huCD73 protein was cloned from the MIAPACA-2 cDNA using the following primers TACGACTCACAAGCTTGCCGCCACCATGTGTCCCCGAGCCGCGCG (SEQ ID NO: 20) (forward) and CCGCCCCGACTCTAGAtcaGTGATGGTGATGATGGTGcttgatccgaccttcaactg SEQ ID NO: 21 (reverse). The purified PCR product was then cloned into an expression vector using the InFusion cloning system. A 6xHis tag was added to the C-terminal portion of the protein for the purification step.
Последовательность аминокислот клонированного huCD73:Amino acid sequence of cloned huCD73:
Экспрессия и очистка белков huCD73Expression and purification of huCD73 proteins
После подтверждения клонированной последовательности клетки подвергали нуклеофекции и совокупность продуцирующих клеток затем субклонировали с получением клона клетки, продуцирующей белок huCD73. Собирали супернатант клона huCD73, выращенного в устройстве для культивирования роллерного типа, и очищали, используя колонку Ni-NTA и элюирование с применением 250 мМ имидазола. Очищенные белки затем загружали на колонку для эксклюзионной хроматографии S200. Очищенный белок, соответствующий димеру, помещали в буферный раствор, содержащий трис 20 мМ, рН 7,5, NaCl 120 мМ и CaCl2 4 мМ, для анализа активности ферментов, тогда как в буфер для состава добавляли 20% глицерина.Once the cloned sequence was confirmed, the cells were nucleofected and the production cell pool was then subcloned to produce a huCD73 protein-producing cell clone. The supernatant of the huCD73 clone grown in a roller culture apparatus was collected and purified using a Ni-NTA column and eluting with 250 mM imidazole. The purified proteins were then loaded onto an S200 size exclusion chromatography column. The purified protein corresponding to the dimer was placed in a buffer
Анализ ППР для оценки KD AT на рекомбинантном белке CD73SPR assay to evaluate KD AT on recombinant CD73 protein
Измерения ППР проводили на устройстве Biacore™ Т200 при 25°С. Белок A (GE Healthcare) иммобилизовали на сенсорном чипе СМ5 (GE Healthcare). Поверхность чипа активировали с помощью EDC/NHS (N-этил-N'-(3-диметиламинопропил)карбодиимида гидрохлорида и N-гидроксисукцинимида (Biacore™, GE Healthcare). Белок А разбавляли до 10 мкг/мл в буфере для связывания (10 мМ ацетат, рН 5,6) и вводили в систему до достижения соответствующего уровня иммобилизации (т.е. 2000 RU). Деактивирование оставшихся активированных групп осуществляли с использованием 100 мМ этаноламина с рН 8 (Biacore™, GE Healthcare). Исследование аффинности проводили в соответствии со стандартным протоколом анализа кинетики связывания, рекомендованным производителем (Biacore™, GE Healthcare kinetic wizard). Серийные разведения человеческого рекомбинантного растворимого белка CD73 в диапазоне от 1,23 до 300 нМ последовательно впрыскивали на захваченные антитела против CD73 и позволяли им диссоциировать в течение 10 минут перед регенерацией. Весь набор сенсограмм аппроксимировали с использованием кинетической модели связывания 1:1. Рассчитывали бивалентные аффинности и кинетические константы скорости ассоциации и диссоциации.SPR measurements were carried out on a Biacore™ T200 device at 25°C. Protein A (GE Healthcare) was immobilized on a CM5 sensor chip (GE Healthcare). The chip surface was activated with EDC/NHS (N-ethyl-N'-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide hydrochloride and N-hydroxysuccinimide (Biacore™, GE Healthcare). Protein A was diluted to 10 μg/ml in binding buffer (10 mM acetate, pH 5.6) and introduced into the system until the appropriate immobilization level was achieved (i.e. 2000 RU). Deactivation of the remaining activated groups was carried out using 100 mM ethanolamine pH 8 (Biacore™, GE Healthcare). According to the standard binding kinetics assay protocol recommended by the manufacturer (Biacore™, GE Healthcare kinetic wizard), serial dilutions of human recombinant soluble CD73 protein ranging from 1.23 to 300 nM were sequentially injected onto the captured anti-CD73 antibodies and allowed to dissociate for 10. minutes before regeneration. The entire set of sensorograms was fitted using a 1:1 binding kinetic model. Bivalent affinities and kinetic rate constants of association and dissociation were calculated.
Анализ методом проточной цитометрии для оценки распознавания CD73 антителамиFlow cytometry analysis to assess CD73 antibody recognition
105 клеток MDA-MB-231, ресуспендированных в буфере FCSB, распределяли по 96-луночным микропланшетам со скругленным дном лунок (по 50 мкл на лунку). В планшеты добавляли диапазон доз МАТ против CD73 и инкубировали клетки в течение 1 часа при +5±3°С. Клетки трижды промывали в FCSB путем центрифугирования планшетов при 400 g в течение 3 мин при 4°С. К клеткам добавляли конъюгированное с РЕ вторичное AT F(ab')2 козы против IgG (H+L) человека, разведенное в FCSB, и планшеты инкубировали в течение 30 дополнительных минут при +5±3°С. Клетки промывали три раза, как описано выше, и анализировали на проточном цитометре.10 5 MDA-MB-231 cells resuspended in FCSB buffer were distributed into 96-well round-bottom microplates (50 μl per well). A range of doses of anti-CD73 mAbs were added to the plates and the cells were incubated for 1 hour at +5±3°C. Cells were washed three times in FCSB by centrifuging the plates at 400 g for 3 min at 4°C. PE-conjugated goat anti-human IgG (H+L) secondary AT F(ab')2 diluted in FCSB was added to the cells and the plates were incubated for an additional 30 minutes at +5±3°C. Cells were washed three times as described above and analyzed on a flow cytometer.
Строили графики зависимости медианы интенсивности флуоресценции от концентрации МАТ и рассчитывали ЕС50 с использованием программы GraphPad Prism™.The dependence of the median fluorescence intensity on the MAT concentration was plotted and EC 50 was calculated using the GraphPad Prism™ program.
Ферментативный анализ in vitro с рекомбинантным CD73 человека или яванского макака Вкратце, рекомбинантный CD73 человека или яванского макака инкубировали в белых 96-луночных микропланшетах с плоским дном лунок в присутствии диапазона доз МАТ против CD73 или МАТ изотипического контроля. Планшеты инкубировали в течение 1 ч при +37±1°С. АТФ (12,5 мкМ) и АМФ (125 мкМ) добавляли в каждую лунку и инкубировали планшеты при +37±1°С в течение 30 дополнительных минут. В лунки добавляли люциферазу/содержащий люциферин CellTiter-Glo™ (Promega), планшеты инкубировали в течение 5 минут при комнатной температуре в темноте и измеряли излученный свет, используя устройство Enspire™ (Perkin Elmer).In Vitro Enzymatic Assay with Recombinant Human or Cynomolgus CD73 Briefly, recombinant human or cynomolgus CD73 was incubated in white 96-well flat-bottomed microplates in the presence of a range of doses of anti-CD73 mAb or isotype control mAb. The plates were incubated for 1 hour at +37±1°C. ATP (12.5 μM) and AMP (125 μM) were added to each well and the plates were incubated at +37 ± 1°C for an additional 30 minutes. Luciferase/luciferin-containing CellTiter-Glo™ (Promega) was added to the wells, the plates were incubated for 5 minutes at room temperature in the dark, and the emitted light was measured using an Enspire™ device (Perkin Elmer).
• Условия:• Conditions:
• АТФ+АМФ: максимальное ингибирование люциферазы (100%)• ATP+AMP: maximum luciferase inhibition (100%)
• CD73+АТФ+АМФ: ингибирование люциферазы отсутствует (0%)• CD73+ATP+AMP: no luciferase inhibition (0%)
Строили графики зависимости остаточной активности фермента от концентрации AT против CD73, применяя программное обеспечение GraphPad Prism7™.Graphs of residual enzyme activity versus anti-CD73 AT concentration were plotted using GraphPad Prism7™ software.
Анализ пролиферации Т-клеток.T cell proliferation assay.
Получали периферическую кровь из здоровых доноров и выделяли мононуклеарные клетки в градиенте фиколла. Проводили дополнительное обогащение лимфоцитами в градиенте 52% перколла™ (осадки клеток) и окрашивали их 2 мкМ CellTrace™ Violet (Thermofisher). 5x104-1x105 окрашенных клеток распределяли по 96-луночным планшетам со скругленным дном лунок, инкубировали в течение 1 часа при 37°С с антителами против CD73 и активировали в течение от 3 до 5 дней путем добавления гранул, покрытых антителом против CD3/против CD28. Ингибирования пролиферации Т-клеток добивались путем добавления 200 мкМ АМФ. Пролиферацию Т-клеток и способность AT блокировать иммуносупрессорное действие АМФ оценивали с помощью проточной цитометрии путем количественного анализа разведения красителя на пролиферирующих Т-клетках. Строили графики зависимости процента пролиферирующих Т-клеток от концентрации AT против CD73, применяя программное обеспечение GraphPad Prism™. Некоторые эксперименты проводили на цельных МКПК из здоровых доноров или пациентов с раком; протокол был таким, как описано выше, за исключением того, что супрессии Т-клеток добивались путем добавления от 0,5 до 1 мМ АТФ.Peripheral blood was obtained from healthy donors and mononuclear cells were isolated in a Ficoll gradient. Lymphocytes were further enriched on a 52% Percoll™ gradient (cell pellets) and stained with 2 µM CellTrace™ Violet (Thermofisher). 5x10 4 -1x10 5 stained cells were distributed into 96-well round-bottom plates, incubated for 1 hour at 37°C with anti-CD73 antibodies and activated for 3 to 5 days by adding anti-CD3/anti-CD3 antibody-coated beads. CD28. Inhibition of T cell proliferation was achieved by adding 200 μM AMP. T cell proliferation and the ability of AT to block the immunosuppressive effects of AMP were assessed using flow cytometry by quantitatively analyzing dye dilution on proliferating T cells. The percentage of proliferating T cells was plotted against the concentration of anti-CD73 AT using GraphPad Prism™ software. Some experiments were performed on whole PBMCs from healthy donors or patients with cancer; the protocol was as described above, except that T cell suppression was achieved by adding 0.5 to 1 mM ATP.
Для сравнения доноров или пациентов, пролиферацию Т-клеток нормировали с использованием следующей формулы:For donor or patient comparisons, T cell proliferation was normalized using the following formula:
Анализ аллогенной реакции смешанной культуры лимфоцитов (СКЛ)Analysis of the allogeneic reaction of a mixed culture of lymphocytes (MSC)
Мононуклеарные клетки из здоровых доноров выделяли в градиенте фиколла, и моноциты очищали путем иммуномагнитной селекции с применением микрогранул с CD14 (Miltenyi Biotec). Моноциты дифференцировали в дендритные клетки (МоДК) путем культивирования в течение 5-7 дней в присутствии ГМ-КСФ (400 нг/мл) и IL-4 (20 нг/мл). В день получения ДК, CD4+ Т-клетки из аллогенных доноров очищали с помощью иммуномагнитного обеднения клетками, не являющимися CD4+ Т-клетками (Miltenyi Biotec), и окрашивали Cell Trace™ Violet. ДК (104 клеток/лунку) и Т-клетки (5x104 клеток/лунку) смешивали в 96-луночных планшетах со скругленным дном лунок в присутствии диапазонов доз МАТ против huCD73 и постоянной дозы АТФ. Пролиферацию Т-клеток и способность AT обращать опосредованную АТФ супрессию оценивали, как описано для анализа пролиферации Т-клеток.Mononuclear cells from healthy donors were isolated on a Ficoll gradient, and monocytes were purified by immunomagnetic selection using CD14 microbeads (Miltenyi Biotec). Monocytes were differentiated into dendritic cells (MoDCs) by culturing for 5-7 days in the presence of GM-CSF (400 ng/ml) and IL-4 (20 ng/ml). On the day of DC collection, CD4+ T cells from allogeneic donors were purified by immunomagnetic depletion of non-CD4+ T cells (Miltenyi Biotec) and stained with Cell Trace™ Violet. DCs (10 4 cells/well) and T cells (5x10 4 cells/well) were mixed in 96-well round-bottom plates in the presence of a range of doses of anti-huCD73 mAb and a constant dose of ATP. T cell proliferation and the ability of AT to reverse ATP-mediated suppression were assessed as described for the T cell proliferation assay.
Пример 1. Моделирование и получение антител против huCD73 с каркасными последовательностями человекаExample 1: Modeling and production of anti-huCD73 antibodies with human framework sequences
Исходное антитело 3С12, описанное в публикации РСТ WO 2016/055609, содержащее последовательности аминокислот VH и VL, представленные в SEQ ID NO: 27 и 28, соответственно, модифицировали путем вставки в VH каркасных областей тяжелой цепи (FR1, FR2, FR3) из подгруппы IGHV1-3*01 человека вместе с IGHJ4*01 (FR4) и вставки в VL каркасных областей легкой цепи (FR1, FR2, FR3) из подгруппы IGKV1-33*01 человека вместе с IGKJ2*01 (FR4).The original antibody 3C12, described in PCT publication WO 2016/055609, containing the amino acid sequences VH and VL presented in SEQ ID NO: 27 and 28, respectively, was modified by inserting heavy chain framework regions (FR1, FR2, FR3) from the subgroup into VH human IGHV1-3*01 together with IGHJ4*01 (FR4) and insertions into VL light chain framework regions (FR1, FR2, FR3) from the human IGKV1-33*01 subgroup together with IGKJ2*01 (FR4).
Трехмерные модели, основанные на различных сегментах генов VH и VL человека, накладывали друг на друга, и все различия аминокислот тщательно изучали по одному. Молекулярный дизайн in silico проверяли с использованием 3D-моделей как исходных химерных (HPLP), так и гуманизированных (H0L0) антител. Также оценивали внутрицепочечные и внецепочечные связи между остатками, чтобы выявить и избежать нарушения любой важной низкоэнергетической связи.3D models based on different segments of the human VH and VL genes were superimposed and all amino acid differences were carefully examined one at a time. The in silico molecular design was validated using 3D models of both the original chimeric (HPLP) and humanized (H0L0) antibodies. Intra- and extra-chain connections between residues were also assessed to identify and avoid disruption of any important low-energy connections.
Последовательности VH и VL каждого разработанного домена клонировали в векторы, содержащие константные домены, происходящие из huIgG1, содержащие замены L234A/L235E/G237A/A330S/P331S, и константный домен huCk, соответственно. Двумя полученными векторами котрансфицировали линию клеток СНО. Созданный пул клеток использовали для получения антитела в среде СНО. Антитело затем очищали, применяя белок А. Последовательности тяжелой и легкой цепей, используемые для моделирования химерного варианта Fab 3С12 с константными областями IgG1 человека, включая домен Fc, содержащий замены L234A/L235E/G237A/A330S/P331S (сохраняющие N297-связанное гликозилирование), были следующими:The VH and VL sequences of each designed domain were cloned into vectors containing huIgG1-derived constant domains containing the L234A/L235E/G237A/A330S/P331S substitutions and the huCk constant domain, respectively. The CHO cell line was cotransfected with the two resulting vectors. The created pool of cells was used to obtain antibodies in CHO medium. The antibody was then purified using Protein A. The heavy and light chain sequences used to model the chimeric Fab 3C12 variant with human IgG1 constant regions, including the Fc domain containing the substitutions L234A/L235E/G237A/A330S/P331S (retaining N297-linked glycosylation), were as follows:
Тяжелая цепь HP Fab (вариабельный домен подчеркнут)HP Fab heavy chain (variable domain underlined)
Легкая цепь LP Fab (вариабельный домен подчеркнут)LP Fab light chain (variable domain underlined)
Тяжелая цепь Н0 Fab (вариабельный домен подчеркнут)H0 Fab heavy chain (variable domain underlined)
Легкая цепь L0 Fab (вариабельный домен подчеркнут)L0 Fab light chain (variable domain underlined)
Последовательности вариабельной области тяжелой цепи и вариабельной области легкой цепи исходного антитела HPLP представлены ниже:The sequences of the heavy chain variable region and light chain variable region of the parent HPLP antibody are shown below:
HP VHHP VH
LP VLLP VL
Дизайн тяжелой цепиHeavy chain design
Для исследования того, образует ли остаток 12 (также положение 2 в соответствии с нумерацией по Кабату) гидрофобную связь с CDR_H3-Y109 и играет ли он роль в позиционировании или гибкости CDR_H3, остаток валина в положении 2 был заменен на изолейцин. Боковые цепи V2 и 12 не совмещаются в двух моделях. V2 также образует гидрофобную связь с H0-Y109 (Y108 по Кабату), но положение Y109 слегка модифицировано, и H0-Y109 образует водородную связь с LC-Y55 (Y54 по Кабату). Y55 представляет собой остаток CDR_L2. Замена V2 может влиять на положение как CDR_H3, так и CDR_L2.To investigate whether residue 12 (also position 2 according to Kabat numbering) forms a hydrophobic bond with CDR_H3-Y109 and whether it plays a role in the positioning or flexibility of CDR_H3, the valine residue at position 2 was replaced by isoleucine. Sidechains V2 and 12 are not compatible between the two models. V2 also forms a hydrophobic bond with H0-Y109 (Kabat's Y108), but the position of Y109 is slightly modified and H0-Y109 forms a hydrogen bond with LC-Y55 (Kabat's Y54). Y55 is the residue of CDR_L2. Substitution of V2 may affect the position of both CDR_H3 and CDR_L2.
Для того чтобы исследовать, влияют ли остатки в положениях 28 и 30 (каркасная область 1, положения 28 и 30 также по Кабату) на связывание с антигеном, в этих положениях была проведена заменена на аланин. Исходное антитело содержит последовательность YAFA по сравнению с YTFT в антителе H0L0. Остатки А28 и А30 выставлены на молекулярной поверхности вблизи паратопа. Представляется вероятным, что треонин в положении 28, вероятно, отрицательно повлияет на связывание с антигеном. С другой стороны, А30, как представляется, вряд ли будет иметь решающее значение.In order to investigate whether residues at positions 28 and 30 (
Для того чтобы исследовать, играет ли остаток в положении 44 (также 44 по Кабату) какую-либо роль для поверхности контакта VH/VL, осуществляли обратную мутацию этого остатка, тем самым сохраняя серии, присутствующий в исходном антителе. Исходное антитело содержит последовательность GKS по сравнению с GQR антитела H0L0. R44 расположен на поверхности контакта VH/VL, очень близко к L45 боковой цепи.In order to investigate whether the residue at position 44 (also Kabat 44) plays any role in the VH/VL interface, this residue was backmutated, thereby retaining the series present in the original antibody. The parent antibody contains the GKS sequence compared to the GQR of the H0L0 antibody. R44 is located at the VH/VL contact surface, very close to L45 of the side chain.
Для того чтобы исследовать, важен ли остаток в положении 48 (также 48 по Кабату), осуществляли обратную мутацию этого остатка, тем самым сохраняя остаток, присутствующий в исходном антителе. Исходное антитело содержит последовательность WIG по сравнению с WMG антитела H0L0. I48 и М48, по-видимому, занимают важные положения непосредственно под CDR_H2 и участвуют в сложной гидрофобной сети.In order to investigate whether the residue at position 48 (also Kabat 48) is important, this residue was reverse-mutated, thereby retaining the residue present in the original antibody. The parent antibody contains the WIG sequence compared to the WMG of the H0L0 antibody. I48 and M48 appear to occupy important positions directly downstream of CDR_H2 and participate in a complex hydrophobic network.
Для того чтобы исследовать, важны ли остатки в положениях 67 (положение 66 по Кабату) и 68 (положение 67 по Кабату), осуществляли обратную мутацию этих остатков, тем самым сохраняя остатки, присутствующие в исходном антителе. Исходное антитело содержит последовательность KAT по сравнению с RVT в антителе H0L0. Выявили очень разные конформации петли между F64 (F63 по Кабату) и K67/R67 (K66/R66 по Кабату) в двух моделях. А68 (67 по Кабату) представляет собой остаток Вернье (Vernier).To examine whether residues at positions 67 (Kabat position 66) and 68 (Kabat position 67) are important, these residues were backmutated, thereby retaining the residues present in the original antibody. The parent antibody contains the KAT sequence compared to the RVT in the H0L0 antibody. We found very different loop conformations between F64 (Kabat's F63) and K67/R67 (Kabat's K66/R66) in the two models. A68 (67 according to Kabat) is a Vernier remainder.
Для того чтобы исследовать роль остатка в положении Abnum 70 (положение 69 по Кабату), осуществляли обратную мутацию этого остатка, тем самым сохраняя лейцин, присутствующий в исходном антителе. Исходное антитело содержит последовательность TLT по сравнению с TIT антитела H0L0. L70 и 170 (L69 и 169 по Кабату) участвуют в сложной гидрофобной сети.In order to investigate the role of the residue at position Abnum 70 (position 69 according to Kabat), this residue was reverse-mutated, thereby retaining the leucine present in the original antibody. The parent antibody contains the TLT sequence compared to the TIT of the H0L0 antibody. L70 and 170 (Kabat's L69 and 169) participate in a complex hydrophobic network.
Для того чтобы исследовать роль остатка в положении 72 (71 по Кабату), осуществляли обратную мутацию этого остатка, тем самым сохраняя серии, присутствующий в исходном антителе. Исходное антитело содержит последовательность TVD по сравнению с TRD антитела H0L0. V72 и R72 (V71 и R71 по Кабату) занимают важные положения непосредственно под CDR_H2. Отдаленная гидрофильная боковая цепь остатка V72 выступает на поверхность молекулы и образует водородную связь с N55 (N54 по Кабату). N55 занимает одинаковое положение в обеих моделях. Однако водородная связь с R72 (R71 по Кабату) может снижать гибкость соответствующей петли. Следовательно, влияние замены исходного валина на аргинин в H0L0 на связывание антигена предсказать невозможно.In order to investigate the role of the residue at position 72 (Kabat 71), this residue was reverse-mutated, thereby retaining the series present in the original antibody. The parent antibody contains the TVD sequence compared to the TRD of the H0L0 antibody. V72 and R72 (V71 and R71 according to Kabat) occupy important positions directly below CDR_H2. The distant hydrophilic side chain of residue V72 protrudes onto the surface of the molecule and forms a hydrogen bond with N55 (Kabat's N54). The N55 occupies the same position in both models. However, hydrogen bonding with R72 (Kabat's R71) may reduce the flexibility of the corresponding loop. Therefore, the effect of replacing the original valine with arginine in H0L0 on antigen binding cannot be predicted.
Для того чтобы исследовать, влияет ли остаток в положении 74 (73 по Кабату) на связывание с антигеном, осуществляли обратную мутацию этого остатка, тем самым сохраняя серии, присутствующий в исходном антителе. Исходное антитело содержит последовательность DKS по сравнению с DTS в антителе H0L0. K74 и Т74 (K73 и Т73 по Кабату) выставлены на поверхность молекулы вблизи паратопа и могут участвовать в связывании антигена.In order to investigate whether the residue at position 74 (Kabat 73) affects antigen binding, this residue was reverse-mutated, thereby retaining the series present in the original antibody. The original antibody contains the DKS sequence compared to the DTS in the H0L0 antibody. K74 and T74 (K73 and T73 according to Kabat) are exposed on the surface of the molecule near the paratope and can participate in antigen binding.
Первый вариант тяжелой цепи (Н1) с последовательностью аминокислот, представленной в SEQ ID NO: 29, содержит замены V2I и T73K. Второй вариант тяжелой цепи (Н2) с последовательностью аминокислот, представленной в SEQ ID NO: 30, содержит замены V2I, Т28А, R71V и T73K. Третий вариант тяжелой цепи (Н3) с последовательностью аминокислот, представленной в SEQ ID NO: 31, содержит замены V2I, Т28А, M48I, R66K, V67A, R71V и T73K. Четвертый вариант тяжелой цепи (Н4) с последовательностью аминокислот, представленной в SEQ ID NO: 32, содержит замены V2I, Т28А, Т30А, M48I, R66K, V67A, I69L, R71V и T73K. Нумерация замен указана в соответствии с нумерацией по Кабату.The first heavy chain variant (H1) with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 29 contains substitutions V2I and T73K. The second heavy chain variant (H2) with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 30 contains substitutions V2I, T28A, R71V and T73K. The third heavy chain variant (H3) with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 31 contains substitutions V2I, T28A, M48I, R66K, V67A, R71V and T73K. The fourth heavy chain variant (H4) with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 32 contains substitutions V2I, T28A, T30A, M48I, R66K, V67A, I69L, R71V and T73K. The numbering of replacements is indicated in accordance with the numbering according to Kabat.
Дизайн легкой цепиLight chain design
Исходное антитело содержит последовательность DWM по сравнению с DIQM антитела H0L0. Остаток V2 образует гидрофобную связь с А25. Остаток 12 может быть выставлен на поверхность паратопа, но влияние на организацию паратопа предсказать невозможно. 12 не образует гидрофобной связи с А25, и это может незначительно изменить положение CDR-L1. Таким образом, изолейцин в остатке 2 был заменен на валин.The parent antibody contains the DWM sequence compared to the DIQM of the H0L0 antibody. Residue V2 forms a hydrophobic bond with A25. Residue 12 may be exposed to the surface of the paratope, but the effect on paratope organization cannot be predicted. 12 does not form a hydrophobic bond with A25, and this may slightly change the position of CDR-L1. Thus, the isoleucine in residue 2 was replaced by valine.
Исходное антитело содержит последовательность PDR по сравнению с PSR в антителе H0L0. Остаток R61 занимает ротамерные положения. Петли, по-видимому, ориентированы одинаково, но не перекрываются (боковое смещение, соответствующее общему смещению всего домена). В исходном антителе D60 образует солевой мостик и водородную связь с CDR-L2-R54. В антителе H0L0 остаток S60 не контактирует с R54. R54 занимает ротамерные положения. Контакт с D60 может иметь важное значение для того, чтобы остатки CDR-L2 заняли определенное и подходящее положение. Поэтому остаток аспарагиновой кислоты в положении 60 в антителе H0L0 заменили на серии.The original antibody contains a PDR sequence compared to the PSR in the H0L0 antibody. Residue R61 occupies rotameric positions. The loops appear to be oriented in the same way, but do not overlap (lateral displacement corresponding to the overall displacement of the entire domain). In the parent antibody, D60 forms a salt bridge and hydrogen bond with CDR-L2-R54. In the H0L0 antibody, the S60 residue does not contact R54. R54 occupies rotameric positions. Contact with D60 may be important for the CDR-L2 remnants to occupy a specific and appropriate position. Therefore, the aspartic acid residue at
Исходное антитело содержит последовательность GYG по сравнению с GSG в антителе H0L0. Для того чтобы исследовать, вносит ли остаток Y67 вклад в паратоп, серии в антителе H0L0 был заменен на тирозин.The original antibody contains the sequence GYG compared to the GSG in the H0L0 antibody. To examine whether residue Y67 contributes to the paratope, the serine in the H0L0 antibody was replaced by tyrosine.
Исходное антитело содержит последовательность YFC по сравнению с YYC в антителе H0L0. Хотя Y87, по-видимому, не образует водородную связь со смежными остатками, роль этого остатка предстоит изучить, и тирозин в положении 87 в H0L0 заменили на фенилаланин.The parent antibody contains the YFC sequence compared to the YYC in the H0L0 antibody. Although Y87 does not appear to form a hydrogen bond with adjacent residues, the role of this residue remains to be studied, and the tyrosine at position 87 in H0L0 was replaced by phenylalanine.
Первый вариант легкой цепи (L1) с последовательностью аминокислот, представленной в SEQ ID NO: 33, содержит замену S67Y. Второй вариант легкой цепи (L2) с последовательностью аминокислот, представленной в SEQ ID NO: 34, содержит замены S60D и S67Y. Третий вариант легкой цепи (L3) с последовательностью аминокислот, представленной в SEQ ID NO: 35, содержит замены I2V, S60D и S67Y. Четвертый вариант легкой цепи (L4) с последовательностью аминокислот, представленной в SEQ ID NO: 36, содержит замены I2V, S60D, S67Y и Y87F.The first light chain variant (L1) with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 33 contains the S67Y substitution. The second light chain variant (L2) with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 34 contains substitutions S60D and S67Y. The third light chain variant (L3) with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 35 contains substitutions I2V, S60D and S67Y. The fourth light chain variant (L4) with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 36 contains substitutions I2V, S60D, S67Y and Y87F.
Последовательности аминокислот соответствующих вариабельных областей тяжелой (цепи "Н" в Таблице 1) и легкой (цепи "L" в Таблице 1) цепей представлены в Таблице 1 ниже.The amino acid sequences of the corresponding variable regions of the heavy ("H" chain in Table 1) and light ("L" chain in Table 1) chains are presented in Table 1 below.
Получали антитела, содержащие комбинации тяжелой и легкой цепей, представленные в таблице 2 ниже.Antibodies were produced containing combinations of heavy and light chains presented in Table 2 below.
Пример 2. Связывание с растворимым белком CD73/ исследованное с помощью ППРExample 2: Binding to Soluble Protein CD73/ Investigated by SPR
Исследовали связывание антител, представленных в Таблице 2 Примера 1, с растворимыми димерными белками CD73 человека, и клонировали, продуцировали и очищали их. Константы аффинности и ассоциации и диссоциации гуманизированных вариантов оценивали с помощью анализа ППР. В Таблице 3 обобщены все рассчитанные константы.The antibodies shown in Table 2 of Example 1 were tested for binding to soluble human CD73 dimeric proteins and cloned, produced and purified. The affinity and association and dissociation constants of the humanized variants were assessed using SPR analysis. Table 3 summarizes all calculated constants.
Для антитела H0L0 с полностью человеческой каркасной областью тяжелой цепи IGHV1-3*01 и IGHJ4*01 и полностью человеческой каркасной областью легкой цепи IGKV1-33*01 и IGKJ2*01 выявили KD 65 нМ. В Таблице 3 показано, что для гуманизированных вариантов HxL0 (H1L0, H2L0, H3L0 и H4L0) продемонстрировали константу ассоциации, эквивалентную другим вариантам, но более быстрый профиль диссоциации. KD вариантов HxL0, соответственно, были выше, чем таковые, наблюдаемые для всех остальных вариантов (Таблица 3). Следовательно, введение полностью человеческих последовательностей аминокислот легкой цепи IGKV1-33*01 и IGKJ2*01 в гуманизированные варианты, по-видимому, неблагоприятно сказывается на аффинности гуманизированного AT против CD73.For antibody H0L0 with the fully human heavy chain framework region IGHV1-3*01 and IGHJ4*01 and the fully human light chain framework region IGKV1-33*01 and IGKJ2*01, a KD of 65 nM was detected. Table 3 shows that the humanized HxL0 variants (H1L0, H2L0, H3L0, and H4L0) exhibited an association constant equivalent to the other variants but a faster dissociation profile. The KDs of the HxL0 variants were correspondingly higher than those observed for all other variants (Table 3). Therefore, the introduction of fully human light chain amino acid sequences IGKV1-33*01 and IGKJ2*01 into humanized variants appears to adversely affect the affinity of the humanized AT against CD73.
Тем не менее, для всех остальных гуманизированных вариантов выявили аффинность к CD73, сходную с таковой для химерного исходного антитела 3С12 (0,68 нМ). Примечательно, что все тяжелые цепи, содержащие полностью человеческие немодифицированные каркасные области тяжелой цепи IGHV1-3*01 и IGHJ4*01, обеспечивали высокоаффинное связывание c CD73.However, all other humanized variants showed an affinity for CD73 similar to that of the chimeric parent antibody 3C12 (0.68 nM). Notably, all heavy chains containing the fully human unmodified IGHV1-3*01 and IGHJ4*01 heavy chain framework regions provided high-affinity binding to CD73.
Пример 3. Связывание с клетками, экспрессирующими CD73 человека, измеренное с помощью проточной цитометрииExample 3 Binding to Cells Expressing Human CD73 Measured by Flow Cytometry
Исследовали связывание гуманизированных антител, представленных в Таблице 2, с клетками, экспрессирующими CD73, с помощью проточной цитометрии. На Фигуре 1 показано, что все протестированные AT распознавали белки CD73 человека. Эффективность связывания huCD73 была сходной среди гуманизированных вариантов и химерного формата, за исключением H0L0, H2L0 и H3L0, которые оказались менее эффективными, чем исходное антитело. Эти наблюдения соответствуют данным ППР, которые выявили более низкую аффинность у вариантов HxL0 (H1L0, H2L0, H3L0 и H4L0). Следовательно, все тяжелые цепи, содержащие немодифицированные полностью человеческие каркасные области тяжелой цепи IGHV1-3*01 и IGHJ4*01, обеспечивали превосходное связывание с экспрессирующими CD73 клетками, сравнимое с таковым для исходного антитела.The binding of the humanized antibodies shown in Table 2 to CD73-expressing cells was examined by flow cytometry. Figure 1 shows that all ATs tested recognized human CD73 proteins. The binding efficiency of huCD73 was similar among the humanized variants and the chimeric format, with the exception of H0L0, H2L0 and H3L0, which were less effective than the parent antibody. These observations are consistent with SPR data that revealed lower affinity for HxL0 variants (H1L0, H2L0, H3L0, and H4L0). Consequently, all heavy chains containing the unmodified fully human heavy chain framework regions of IGHV1-3*01 and IGHJ4*01 provided excellent binding to CD73-expressing cells, comparable to that of the parent antibody.
Пример 4. Ферментативный анализ in vitro с рекомбинантным растворимым белком CD73 человекаExample 4 In Vitro Enzymatic Assay with Recombinant Soluble Human CD73 Protein
Эффективность ингибирования ферментативной активности рекомбинантного белка CD73 гуманизированными вариантами сравнивали с таковой у исходного антитела (Фигура 2).The efficiency of inhibition of the enzymatic activity of the recombinant CD73 protein by the humanized variants was compared with that of the parent antibody (Figure 2).
На фигуре 2 (панель А) показано, что измеренные уровни люминесценции были высокими при смешивании субстратов АТФ и CTG. При добавлении АМФ в реакционную смесь реакция CTG ингибировалась, что приводило к уменьшению люминесценции. В присутствии белка rhCD73, который осуществляет гидролиз АМФ, уровень люминесценции восстанавливался. Блокирование ферментативной активности CD73 гуманизированными вариантами показана на Фигуре 2.Figure 2 (panel A) shows that measured luminescence levels were high when ATP and CTG substrates were mixed. When AMF was added to the reaction mixture, the CTG reaction was inhibited, resulting in a decrease in luminescence. In the presence of the rhCD73 protein, which hydrolyzes AMP, the level of luminescence was restored. The blocking of CD73 enzymatic activity by humanized variants is shown in Figure 2.
Результаты показали, что за исключением вариантов с L0 (H0L0, H1L0, H2L0, H3L0 и H4L0), у которых была снижена активность по сравнению с исходным антителом, для всех гуманизированных вариантов продемонстрировали сильное ингибирование ферментативной активности растворимого белка CD73. Тем не менее, неожиданно, у большинства антител активность была несколько ниже, чем у исходного антитела. Только H1L4 и все варианты Н4 блокировали ферментативную активность с эффективностью, сходной с таковой у исходного антитела.The results showed that with the exception of the L0 variants (H0L0, H1L0, H2L0, H3L0 and H4L0), which had reduced activity compared to the parent antibody, all humanized variants showed strong inhibition of the enzymatic activity of soluble CD73 protein. However, unexpectedly, most antibodies had slightly lower activity than the parent antibody. Only H1L4 and all H4 variants blocked enzymatic activity with potency similar to that of the parent antibody.
Данные эксперименты показали, что независимо от количества обратных мутаций в тяжелой цепи, отсутствие мутации в легкой цепи при использовании последовательностей IGKV1-33*01 и IGKJ2*01 в качестве акцепторной каркасной области приводило к значительному снижению способности ингибировать активность растворимого белка CD73.These experiments showed that regardless of the number of back mutations in the heavy chain, the absence of mutation in the light chain using the sequences IGKV1-33*01 and IGKJ2*01 as the acceptor framework region resulted in a significant reduction in the ability to inhibit the activity of soluble CD73 protein.
Наилучшей эффективности блокирования активности белка CD73 добились с помощью вариантов H1L4 и H4Lx, отличных от H4L0 (т.е. H4L1, H4L2, H4L3 и H4L4).The best efficacy in blocking CD73 protein activity was achieved with non-H4L0 variants H1L4 and H4Lx (i.e., H4L1, H4L2, H4L3, and H4L4).
Пример 5. Анализ пролиферации Т-клеток.Example 5 T Cell Proliferation Assay.
Концентрацию АМФ, способную ингибировать пролиферацию Т-клеток, исследовали в двух сериях экспериментов с целью установления концентрации АМФ, которая вызывает сильный эффект супрессии и которая позволяет восстановить пролиферацию в присутствии исходного антитела 3С12. Обогащенную фракцию лимфоцитов инкубировали в течение 3 дней в присутствии гранул против CD3/против CD28 и диапазона доз АМФ (от 1,6 мМ до 50 мкМ). Наилучший процент восстановления CD4+ и CD8+ Т-клеток наблюдался с 0,2-0,8 мМ и 0,2-1 мМ АМФ, соответственно, в двух сериях экспериментов.The concentration of AMP capable of inhibiting T cell proliferation was tested in two sets of experiments to determine the concentration of AMP that produces a strong suppressive effect and that allows proliferation to be restored in the presence of the parent antibody 3C12. The enriched lymphocyte fraction was incubated for 3 days in the presence of anti-CD3/anti-CD28 beads and a range of AMP doses (1.6 mM to 50 μM). The best percentage of recovery of CD4+ and CD8+ T cells was observed with 0.2-0.8 mM and 0.2-1 mM AMP, respectively, in two sets of experiments.
Гуманизированные варианты и исходное антитело оценивали в двух сериях экспериментов для сравнения их способности восстанавливать пролиферацию Т-клеток, ингибированную 0,8 мМ АМФ.The humanized variants and the parent antibody were evaluated in two sets of experiments to compare their ability to restore T cell proliferation inhibited by 0.8 mM AMP.
На Фигуре 3 показано, что, за исключением вариантов HxL0, химерные и гуманизированные AT были способны восстанавливать пролиферацию Т-клеток (в обеих субпопуляциях CD4+ и CD8+). Несмотря на их способность восстанавливать пролиферацию, эффективность большинства гуманизированных вариантов была ниже по сравнению с таковой у исходного антитела. Для вариантов H0L4, H1L4 и H4L4 продемонстрировали уровень активности, аналогичный таковому у исходного антитела, хотя они и не достигли полной активности исходного антитела.Figure 3 shows that, with the exception of HxL0 variants, chimeric and humanized ATs were able to restore T cell proliferation (in both CD4+ and CD8+ subsets). Despite their ability to restore proliferation, the potency of most humanized variants was lower than that of the parent antibody. For the variants, H0L4, H1L4, and H4L4 showed levels of activity similar to that of the parent antibody, although they did not achieve the full activity of the parent antibody.
Второй эксперимент проводили при тех же условиях эксперимента, за исключением того, что варианты L0 заменяли на изотипический контроль. Результаты представлены на Фигуре 4.The second experiment was carried out under the same experimental conditions, except that the L0 variants were replaced by an isotype control. The results are presented in Figure 4.
Аналогично продемонстрированному на фигуре 3, за исключением вариантов HxL0, химерные и гуманизированные AT были способны восстанавливать пролиферацию Т-клеток (в обеих субпопуляциях CD4+ и CD8+). Тем не менее, несмотря на их способность восстанавливать пролиферацию, активность большинства гуманизированных вариантов снова была несколько ниже по сравнению с таковой у исходного антитела. Эффективность вариантов H0L4, H1L4 и H4L4 наиболее близко приближалась к эффективности исходного антитела.Similar to that demonstrated in Figure 3, with the exception of the HxL0 variants, chimeric and humanized ATs were able to restore T cell proliferation (in both CD4+ and CD8+ subsets). However, despite their ability to restore proliferation, the activity of most humanized variants was again slightly lower compared to that of the parent antibody. The effectiveness of the H0L4, H1L4 and H4L4 variants most closely approximated the effectiveness of the parent antibody.
Пример 6. Дизайн новых вариантов каркасной области и CDRExample 6: Design of new wireframe and CDR options
В предыдущих примерах показали, неожиданно, что не было прямой корреляции между титрованием в анализе методом проточной цитометрии и эффективностью ингибирования ферментативной активности CD73. Интересно, что в то время как варианты Н1, Н2, Н3 и Н4 по существу невозможно было различить на основании аффинности связывания с рекомбинантным белком CD73 в анализах ППР и с клетками, экспрессирующими CD73, в анализе методом проточной цитометрии, варианты Н2 и Н3 оказались менее эффективными, чем варианты Н4, в функциональном анализе способности восстанавливать пролиферацию Т-клеток, описанном в примере 5. Одной из вероятных причин является то, что мутации, введенные в каркасные области Н2 и Н3, которые отрицательно влияли на эффективность ингибирования CD73 (но не оказывали отрицательного влияния на аффинность связывания с CD73), были компенсированы мутациями, введенными в каркасные области варианта Н4. Следовательно, были разработаны новые варианты с заменами в каркасной области и/или остатках CDR тяжелой цепи. Основываясь на этих наблюдениях, замены, введенные в цепи Н2, Н3 и Н4, были классифицированы либо как остатки, которые, как полагают, необходимы для функции, остатки, которые, вероятно, не будут влиять на функцию, остатки, которые отрицательно влияют на функцию, и остатки, которые восстанавливают функцию.The previous examples showed, surprisingly, that there was no direct correlation between the titration in the flow cytometry assay and the effectiveness of inhibition of CD73 enzymatic activity. Interestingly, while variants H1, H2, H3 and H4 were essentially unable to be distinguished based on binding affinities to recombinant CD73 protein in SPR assays and to CD73-expressing cells in flow cytometry analyses, variants H2 and H3 were less effective than the H4 variants in the functional assay for the ability to restore T cell proliferation described in Example 5. One likely reason is that mutations introduced into the H2 and H3 framework regions, which negatively affected the effectiveness of CD73 inhibition (but did not negative effect on CD73 binding affinity) were compensated by mutations introduced into the framework regions of the H4 variant. Consequently, new variants have been developed with substitutions in the framework region and/or heavy chain CDR residues. Based on these observations, substitutions introduced in chains H2, H3, and H4 were classified as either residues that are believed to be essential for function, residues that are not likely to affect function, or residues that negatively affect function. , and residues that restore function.
Разработали новый вариант тяжелой цепи, названный "Н4+", с последовательностью аминокислот, представленной ниже (SEQ ID NO: 37; замены аминокислот выделены жирным шрифтом, CDR по Кабату подчеркнуты), и комбинировали с легкими цепями L1, L2, L3 и L4 (SEQ ID NO: 33, 34, 35 и 36, соответственно) с получением четырех новых антител, H4+L1, H4+L2, H4+L3 и H4+L4.A new heavy chain variant called "H4+" was developed with the amino acid sequence shown below (SEQ ID NO: 37; amino acid substitutions are in bold, Kabat CDRs are underlined) and combined with the light chains L1, L2, L3 and L4 (SEQ ID NO: 33, 34, 35 and 36, respectively) yielding four new antibodies, H4+L1, H4+L2, H4+L3 and H4+L4.
Н4+VH:H4+VH:
Последовательность аминокислот полноразмерной тяжелой цепи Н4+, содержащей домен Fc IgG1 человека с заменами L234A/L235E/G237A/A330S/P331S, представлена ниже:The amino acid sequence of the full-length H4+ heavy chain containing the human IgG1 Fc domain with substitutions L234A/L235E/G237A/A330S/P331S is presented below:
Антитело H4+L1 содержало легкую цепь L1, содержащую домен С-каппа человека, полноразмерная последовательность которой представлена ниже:Antibody H4+L1 contained the human C-kappa domain-containing L1 light chain, the full length sequence of which is shown below:
Для того чтобы исследовать, как одни и те же замены в каркасной области будут влиять на антитело с различиями в CDR его тяжелой и легкой цепей, получили еще одну серию из четырех антител, содержащих общую тяжелую цепь и одну из четырех различных легких цепей. Общая тяжелая цепь, обозначенная "2Н4+", содержала глутамин в положении 59 по Кабату (Q59) в HCDR2 (т.е., замену L59Q по сравнению с цепью Н4+), лизин в остатке 60 по Кабату (K60) в HCDR2 (т.е. замену T60K по сравнению с цепью Н4+) и аспарагин в положении 97 по Кабату (N97) в HCDR3 (т.е. замену G97N по сравнению с цепью Н4+). Четыре легкие цепи, обозначенные 2L1, 2L2, 2L3 и 2L4, содержали те же каркасные остатки, что и цепи L1, L2, L3 и L4, соответственно, но их CDR отличались от таковых в цепях L1-L4 наличием треонина в положении 30 по Кабату (Т30) в LCDR1 (т.е., заменой S30T по сравнению с цепями L1-L4) и аспарагина в остатке 53 по Кабату (N53) в LCDR2 (т.е., заменой T53N по сравнению с цепями L1-L4). Полученные четыре новых антитела обозначили 2H4+2L1, 2H4+2L2, 2H4+2L3 и 2H4+2L4 (см. ниже Таблицу 4). Исходное антитело с такими же CDR в каркасных областях мыши получали с вариабельными областями тяжелой и легкой цепи, обозначенными 2НР и 2LP (последовательности аминокислот представлены ниже в Таблице 5).To examine how the same framework substitutions would affect an antibody with differences in its heavy and light chain CDRs, another series of four antibodies containing a common heavy chain and one of four different light chains was prepared. The common heavy chain, designated "2H4+", contained glutamine at Kabat position 59 (Q59) in HCDR2 (i.e., the L59Q substitution compared to the H4+ chain), lysine at Kabat residue 60 (K60) in HCDR2 (i.e. i.e. T60K substitution compared to the H4+ chain) and asparagine at Kabat position 97 (N97) in HCDR3 (i.e. G97N substitution compared to the H4+ chain). The four light chains, designated 2L1, 2L2, 2L3 and 2L4, contained the same backbone residues as chains L1, L2, L3 and L4, respectively, but their CDRs differed from those of chains L1-L4 by the presence of a threonine at Kabat position 30 (T30) in LCDR1 (i.e., substitution S30T compared to chains L1-L4) and asparagine at Kabat residue 53 (N53) in LCDR2 (i.e., substitution T53N compared to chains L1-L4). The resulting four new antibodies were designated 2H4+2L1, 2H4+2L2, 2H4+2L3 and 2H4+2L4 (see Table 4 below). A parent antibody with the same CDRs in the mouse framework regions was generated with heavy and light chain variable regions designated 2HP and 2LP (amino acid sequences are shown below in Table 5).
Как и в примере 1, все антитела получали в виде изотипа IgG1 человека с заменами L234A/L235E/G237A/A330S/P331S для снижения связывания с Fc-рецептором.As in Example 1, all antibodies were produced as the human IgG1 isotype with substitutions L234A/L235E/G237A/A330S/P331S to reduce binding to the Fc receptor.
Последовательность аминокислот полноразмерной тяжелой цепи 2Н4+, содержащей домен Fc IgG1 человека с заменами L234A/L235E/G237A/A330S/P331S, представлена ниже:The amino acid sequence of the full-length 2H4+ heavy chain containing the human IgG1 Fc domain with substitutions L234A/L235E/G237A/A330S/P331S is presented below:
Последовательность аминокислот полноразмерной легкой цепи 2L1 антитела, содержащего домен С-каппа человека, представлена ниже:The amino acid sequence of the full-length light chain of the human C-kappa domain-containing antibody 2L1 is given below:
Пример 7. Исследование новых вариантов в ферментативном анализе in vitro с рекомбинантным белком CD73Example 7: Investigation of new variants in an in vitro enzymatic assay with recombinant CD73 protein
Эффективность ингибирования ферментативной активности рекомбинантного белка CD73 гуманизированными вариантами сравнивали с таковой для исходного антитела, применяя способы, описанные в Примере 4. Все новые гуманизированные варианты, полученные, как описано в Примере 6, эффективно ингибировали активность белка CD73.The effectiveness of the humanized variants in inhibiting the enzymatic activity of the recombinant CD73 protein was compared with that of the parent antibody using the methods described in Example 4. All of the new humanized variants prepared as described in Example 6 effectively inhibited the activity of the CD73 protein.
Антитела Н4+Lx были такими же эффективными, как и исходный их аналог. Кроме того, для всех вариантов 2H4+2Lx (2H4+L1, 2H4+L2, 2H4+L3 и 2H4+L4) продемонстрировали повышение эффективности ингибирования CD73 по сравнению с вариантами H4+Lx. Варианты 2H4+2Lx ингибировали активность CD73 с эффективностью, аналогичной эффективности исходного антитела 2HP2LP.Antibodies H4+Lx were as effective as their original counterpart. Additionally, all 2H4+2Lx variants (2H4+L1, 2H4+L2, 2H4+L3, and 2H4+L4) showed increased CD73 inhibition potency compared to H4+Lx variants. The 2H4+2Lx variants inhibited CD73 activity with potency similar to that of the parent antibody 2HP2LP.
Проводили дополнительный эксперимент с различными концентрациями белка CD73 (50, 100, 200, 400 нг/мл). Цель данного эксперимента заключалась в изучении способности гуманизированных антител блокировать активность больших количеств белка CD73. Снова, варианты 2H4+2Lx были такими же эффективными, как и исходное антитело 2HP2LP.An additional experiment was carried out with different concentrations of CD73 protein (50, 100, 200, 400 ng/ml). The purpose of this experiment was to study the ability of humanized antibodies to block the activity of large quantities of the CD73 protein. Again, the 2H4+2Lx variants were as effective as the parent antibody 2HP2LP.
Пример 8. Исследование эффективности новых вариантов с использованием белка CD73 яванского макакаExample 8: Study of the effectiveness of new variants using the cynomolgus CD73 protein
Эксперимент на рекомбинантном белке рек.cyCD73 проводили с вариантами 2H1Lx и 2H4+2Lx. Условия эксперимента были такими же, как и в экспериментах с человеческим белком, за исключением используемой концентрации белка cyCD73 (400 нг/мл).An experiment on the recombinant protein rec.cyCD73 was carried out with the 2H1Lx and 2H4+2Lx variants. The experimental conditions were the same as those for the human protein experiments, except for the concentration of cyCD73 protein used (400 ng/ml).
Эффективность блокирования гуманизированными вариантами ферментативной активности белка cyCD73 была такой же, как и у исходного (химерного) антитела.The effectiveness of blocking the enzymatic activity of the cyCD73 protein by humanized variants was the same as that of the original (chimeric) antibody.
Пример 9. Исследование новых вариантов в анализе пролиферации Т-клеток.Example 9: Exploration of New Variants in T Cell Proliferation Assay.
Исследовали способность гуманизированных вариантов различных антител восстанавливать пролиферацию Т-клеток, ингибированную АМФ.The ability of humanized variants of various antibodies to restore T cell proliferation inhibited by AMP was examined.
На Фигуре 5А показано ингибиторное действие АМФ на пролиферацию Т-клеток. Все гуманизированные варианты эффективно блокировали ингибиторное действие АМФ на пролиферацию Т-клеток (Фигуры 5В и С). В то время как большинство гуманизированных вариантов, как правило, оказывались такими же эффективными, как и их химерный исходный аналог в отношении обращения опосредованной АМФ супрессии Т-клеток, варианты 2H4+2Lx были наиболее эффективными среди всех вариантов, и, неожиданно, они еще более эффективно блокировали супрессорное действие АМФ, чем исходное антитело 2HP2LP.Figure 5A shows the inhibitory effect of AMP on T cell proliferation. All humanized variants effectively blocked the inhibitory effect of AMP on T cell proliferation (Figures 5B and C). While most humanized variants were generally as effective as their chimeric parental counterpart in reversing AMP-mediated T cell suppression, the 2H4+2Lx variants were the most effective of all variants, and surprisingly, they were even more effectively blocked the suppressive effect of AMP than the parent antibody 2HP2LP.
Пример 10. Сравнительное исследование новых вариантов в анализе пролиферации Т-клеток от двух доноров-людей.Example 10: Comparative Study of New Variants in T Cell Proliferation Assay from Two Human Donors.
В соответствии с полученными ранее результатами, гуманизированные варианты 2H4+2Lx дополнительно исследовали в дополнительной серии экспериментов по пролиферации Т-клеток.Consistent with previous results, humanized 2H4+2Lx variants were further examined in an additional series of T cell proliferation experiments.
На Фиг. 6А и 6В показаны результаты, полученные в анализе пролиферации Т-клеток с использованием клеток двух здоровых доноров, соответственно. Как наблюдали ранее, каждый из вариантов 2H4+2Lx более эффективно восстанавливал пролиферацию Т-клеток, чем исходное 2HP2LP (Фиг. 6А и В, правые панели). Не наблюдали явных различий между различными вариантами 2H4+2Lx. Следовательно, опять же, варианты 2H4+2Lx более эффективно блокировали супрессорное действие АМФ, чем исходное антитело 2HP2LP.In FIG. 6A and 6B show the results obtained in a T cell proliferation assay using cells from two healthy donors, respectively. As previously observed, each of the 2H4+2Lx variants was more effective in restoring T cell proliferation than the parent 2HP2LP (Fig. 6A and B, right panels). No obvious differences were observed between the different 2H4+2Lx variants. Therefore, again, the 2H4+2Lx variants blocked the suppressive effects of AMP more effectively than the parent antibody 2HP2LP.
В совокупности, результаты, полученные при анализе пролиферации Т-клеток, свидетельствуют о том, что гуманизированные варианты, содержащие каркасные области Н4+ и цепи Н4+, являются наиболее эффективными вариантами антител, и что варианты 2H4+2Lx в целом являются наиболее эффективными среди всех антител.Taken together, the results obtained from the T cell proliferation assay suggest that humanized variants containing H4+ frameworks and H4+ chains are the most effective antibody variants, and that the 2H4+2Lx variants are overall the most effective of all antibodies.
Пример 11. Исследование новых вариантов в анализе аллогенной реакции смешанной культуры лимфоцитов (РСКЛ)Example 11. Study of new options in the analysis of allogeneic reaction of mixed culture of lymphocytes (RMCL)
Вариант антитела 2H4+2Lx тестировали в аллогенной РСКЛ, чтобы подтвердить результаты, полученные ранее в анализе пролиферации Т-клеток. Пролиферацию Т-клеток ингибировали путем добавления 100 мкМ АТФ (который расщеплялся на АДФ и АМФ под действием CD39), как показано на Фигуре 7 для образцов из двух доноров-людей.The 2H4+2Lx antibody variant was tested in allogeneic RSCL to confirm the results obtained previously in the T cell proliferation assay. T cell proliferation was inhibited by adding 100 μM ATP (which was cleaved into ADP and AMP by CD39) as shown in Figure 7 for samples from two human donors.
На Фигуре 7 на левой панели показано, что пролиферацию Т-клеток ингибировали добавлением АТФ. Пролиферация Т-клеток восстанавливалась в присутствии антител против CD73 (средняя и правая панели). Все гуманизированные варианты 2H4+2Lx были способны восстанавливать пролиферацию Т-клеток с эффективностью, сопоставимой с таковой или лучшей, чем у исходного антитела 2HP2LP. Все варианты 2H4+2Lx более эффективно, чем исходное 2HP2LP, восстанавливали пролиферацию Т-клеток в этих условиях. Эти результаты соответствовали результатам, полученным в анализе пролиферации Т-клеток с использованием АМФ в качестве ингибитора.Figure 7 left panel shows that T cell proliferation was inhibited by the addition of ATP. T cell proliferation was restored in the presence of anti-CD73 antibodies (middle and right panels). All humanized 2H4+2Lx variants were able to restore T cell proliferation with efficacy comparable to or better than the parent 2HP2LP antibody. All 2H4+2Lx variants were more effective than the parent 2HP2LP in restoring T cell proliferation under these conditions. These results were consistent with those obtained in a T cell proliferation assay using AMP as an inhibitor.
В заключение, замены, введенные в вариабельные области Н4+ и 2Н4+, вместе с заменами, введенными в цепи L1 и 2L1 (и цепи L2, L3, L4, 2L2, 2L3, 2L4), по-видимому, восстанавливают (и даже улучшают) важные функциональные свойства исходных мышиных антител, которые при этом содержат каркасные области человека и, следовательно, имеют пониженный риск иммуногенности у человека. Антитела 2H4+2Lx являются наиболее эффективными из всех.In conclusion, substitutions introduced into the H4+ and 2H4+ variable regions, together with substitutions introduced into chains L1 and 2L1 (and chains L2, L3, L4, 2L2, 2L3, 2L4), appear to restore (and even improve) important functional properties of the original murine antibodies, which also contain human framework regions and therefore have a reduced risk of immunogenicity in humans. Antibodies 2H4+2Lx are the most effective of all.
Одно из возможных объяснений неожиданного открытия, что аффинность связывания с CD73 напрямую не коррелирует с эффективностью функционального ингибирования активности CD73, может быть связано с тем, что эти антитела, связывающиеся с CD73, действуют как аллостерические ингибиторы. Антитела связываются с CD73 способом внутридимерного связывания в стехиометрии 1:1 между интактным полноразмерным антителом и димером CD73. Предшествующие структурные исследования CD73 показали, что для его ферментативной активности требуется значительное вращение N-концевого домена, определяющего открытое (неактивное) и закрытое (активное, связанное с субстратом) состояния фермента (Knapp и др., 2012 Structure 20(12):2161-73). На основании кристаллической структуры исходного F(ab) против CD73 в комплексе с эктодоменом CD73 и принимая во внимание стехиометрию 1:1 между интактным антителом и димером CD73, предполагают, что в результате стерического затруднения маловероятно, чтобы интактное антитело могло связаться с открытыми конформационными изомерами CD73. Вместо этого, интактное антитело связывает CD73 в промежуточном состоянии, в котором АМФ не может быть гидролизован. Поскольку антитела связывают CD73, таким образом, при нахождении в энергетически нестабильной конформации, небольшие изменения, которые изменяют жесткость структуры антитела, описанные здесь, могут влиять на способность антитела приспосабливаться к изменяющейся конформации димера CD73. Следовательно, эти изменения могут влиять на способность антитела ингибировать активность CD73 в присутствии субстрата. Однако эти небольшие изменения в структуре антитела не будут наблюдаться в анализе методом ППР или в других способах анализа связывания, которые, кроме того, проводятся в отсутствие субстрата. Вариабельные области тяжелой и легкой цепей, описанные в настоящем документе, по-видимому, способны сохранять (и даже улучшать) полную динамику взаимодействия с CD73 исходных антител, и при этом содержат человеческие каркасные области.One possible explanation for the unexpected finding that CD73 binding affinity does not directly correlate with the effectiveness of functional inhibition of CD73 activity may be due to the fact that these CD73-binding antibodies act as allosteric inhibitors. Antibodies bind to CD73 by an intradimer binding mode in a 1:1 stoichiometry between the intact full-length antibody and the CD73 dimer. Previous structural studies of CD73 have shown that its enzymatic activity requires significant rotation of the N-terminal domain, which defines the open (inactive) and closed (active, substrate-bound) states of the enzyme (Knapp et al., 2012 Structure 20(12):2161- 73). Based on the crystal structure of the parent anti-CD73 F(ab) in complex with the CD73 ectodomain and taking into account the 1:1 stoichiometry between the intact antibody and the CD73 dimer, it is suggested that, as a result of steric hindrance, it is unlikely that the intact antibody would bind to open conformational isomers of CD73 . Instead, the intact antibody binds CD73 in an intermediate state in which AMP cannot be hydrolyzed. Because antibodies bind CD73 thus while in an energetically unstable conformation, small changes that alter the rigidity of the antibody structure described here may affect the ability of the antibody to accommodate the changing conformation of the CD73 dimer. Therefore, these changes may affect the ability of the antibody to inhibit CD73 activity in the presence of substrate. However, these small changes in antibody structure will not be observed in SPR assays or other binding assays that are also performed in the absence of substrate. The heavy and light chain variable regions described herein appear to be able to maintain (and even improve upon) the full CD73 interaction dynamics of the parent antibodies while containing human framework regions.
Все ссылочные материалы, включая публикации, заявки на патент и патенты, цитированные в данной заявке, настоящим полностью включены посредством ссылки и в той же степени, как если бы каждый ссылочный материал был отдельно и конкретно указан как включенный посредством ссылки, и были полностью изложены в данной заявке (в максимальный объеме, дозволенном законом), независимо от любого отдельно приведенного включения конкретных документов, сделанного в других местах в данной заявке.All referenced material, including publications, patent applications and patents cited in this application, are hereby incorporated by reference in their entirety to the same extent as if each referenced material had been separately and specifically identified as being incorporated by reference and were set forth in their entirety in this application (to the maximum extent permitted by law), notwithstanding any specifically cited inclusion of specific documents made elsewhere in this application.
Использование формы единственного числа следует толковать как включающее как единственное, так и множественное число, если в данном документе не указано иное, или если это явно не противоречит контексту.The use of the singular form should be construed to include both the singular and plural unless otherwise indicated herein or unless clearly inconsistent with the context.
Если не указано иное, все точные значения, приведенные в данной заявке, являются примером соответствующих приблизительных значений (например, все точные примеры значений, предложенные в отношении конкретного показателя или меры, можно считать также включающими соответствующую приблизительную меру, измененную термином «приблизительно», когда это целесообразно).Unless otherwise indicated, all precise values provided in this application are examples of the corresponding approximate values (for example, all precise exemplary values proposed with respect to a particular indicator or measure may be considered to also include the corresponding approximate measure, modified by the term "about" when this is appropriate).
В данной заявке предполагается, что описание любого аспекта или варианта реализации в настоящем документе с использованием таких терминов как «включающий», «имеющий», «заключающий в себе» или «содержащий» в отношении некоторого элемента или элементов включает аналогичный аспект или вариант реализации в данной заявке, который «состоит из», «состоит по существу из» или «по существу включает» данный конкретный элемент или элементы, если не указано иное или нет явных противоречий с контекстом (например, упоминание композиции, описанной в данном документе как содержащей конкретный элемент, следует понимать как также описывающее композицию, состоящую из такого элемента, если не указано иное или нет явных противоречий с контекстом).It is intended herein that the description of any aspect or embodiment herein by use of terms such as “including,” “having,” “comprising,” or “comprising” with respect to some element or elements includes a similar aspect or embodiment in this application, which “consists of,” “consists essentially of,” or “essentially includes” that specific element or elements, unless otherwise indicated or the context clearly contradicts (for example, reference to a composition described herein as containing a specific element, should be understood to also describe the composition consisting of such element, unless otherwise indicated or there is a clear conflict with the context).
Использование любого и всех примеров или языка примеров (например, «такой как»), предложенных в данной заявке, предназначено только для лучшего освещения настоящего изобретения и не устанавливает ограничения на объем настоящего изобретения, если не утверждается иное. Ни одна формулировка в настоящем описании не должна рассматриваться как указывающая, что какой-либо незаявленный элемент незаменим для осуществления настоящего изобретения.The use of any and all examples or example language (eg, “such as”) provided in this application is intended only to better illuminate the present invention and does not constitute a limitation on the scope of the present invention unless otherwise stated. Nothing in this specification should be construed as indicating that any unclaimed element is essential to the practice of the present invention.
--->--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ LIST OF SEQUENCES
<110> INNATE PHARMA<110> INNATE PHARMA
<120> АНТИТЕЛА, БЛОКИРУЮЩИЕ CD73<120> ANTIBODIES THAT BLOCK CD73
<130> CD73-6<130> CD73-6
<150> US 62/837,214<150> US 62/837.214
<151> 2019-04-23<151> 2019-04-23
<160> 48 <160> 48
<170> PatentIn версии 3.5<170> PatentIn version 3.5
<210> 1<210> 1
<211> 574<211> 574
<212> Белок<212> Protein
<213> homo sapiens<213> homo sapiens
<400> 1<400> 1
Met Cys Pro Arg Ala Ala Arg Ala Pro Ala Thr Leu Leu Leu Ala Leu Met Cys Pro Arg Ala Ala Arg Ala Pro Ala Thr Leu Leu Leu Ala Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Ala Val Leu Trp Pro Ala Ala Gly Ala Trp Glu Leu Thr Ile Leu Gly Ala Val Leu Trp Pro Ala Ala Gly Ala Trp Glu Leu Thr Ile Leu
20 25 30 20 25 30
His Thr Asn Asp Val His Ser Arg Leu Glu Gln Thr Ser Glu Asp Ser His Thr Asn Asp Val His Ser Arg Leu Glu Gln Thr Ser Glu Asp Ser
35 40 45 35 40 45
Ser Lys Cys Val Asn Ala Ser Arg Cys Met Gly Gly Val Ala Arg Leu Ser Lys Cys Val Asn Ala Ser Arg Cys Met Gly Gly Val Ala Arg Leu
50 55 60 50 55 60
Phe Thr Lys Val Gln Gln Ile Arg Arg Ala Glu Pro Asn Val Leu Leu Phe Thr Lys Val Gln Gln Ile Arg Arg Ala Glu Pro Asn Val Leu Leu
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Asp Ala Gly Asp Gln Tyr Gln Gly Thr Ile Trp Phe Thr Val Tyr Leu Asp Ala Gly Asp Gln Tyr Gln Gly Thr Ile Trp Phe Thr Val Tyr
85 90 95 85 90 95
Lys Gly Ala Glu Val Ala His Phe Met Asn Ala Leu Arg Tyr Asp Ala Lys Gly Ala Glu Val Ala His Phe Met Asn Ala Leu Arg Tyr Asp Ala
100 105 110 100 105 110
Met Ala Leu Gly Asn His Glu Phe Asp Asn Gly Val Glu Gly Leu Ile Met Ala Leu Gly Asn His Glu Phe Asp Asn Gly Val Glu Gly Leu Ile
115 120 125 115 120 125
Glu Pro Leu Leu Lys Glu Ala Lys Phe Pro Ile Leu Ser Ala Asn Ile Glu Pro Leu Leu Lys Glu Ala Lys Phe Pro Ile Leu Ser Ala Asn Ile
130 135 140 130 135 140
Lys Ala Lys Gly Pro Leu Ala Ser Gln Ile Ser Gly Leu Tyr Leu Pro Lys Ala Lys Gly Pro Leu Ala Ser Gln Ile Ser Gly Leu Tyr Leu Pro
145 150 155 160 145 150 155 160
Tyr Lys Val Leu Pro Val Gly Asp Glu Val Val Gly Ile Val Gly Tyr Tyr Lys Val Leu Pro Val Gly Asp Glu Val Val Gly Ile Val Gly Tyr
165 170 175 165 170 175
Thr Ser Lys Glu Thr Pro Phe Leu Ser Asn Pro Gly Thr Asn Leu Val Thr Ser Lys Glu Thr Pro Phe Leu Ser Asn Pro Gly Thr Asn Leu Val
180 185 190 180 185 190
Phe Glu Asp Glu Ile Thr Ala Leu Gln Pro Glu Val Asp Lys Leu Lys Phe Glu Asp Glu Ile Thr Ala Leu Gln Pro Glu Val Asp Lys Leu Lys
195 200 205 195 200 205
Thr Leu Asn Val Asn Lys Ile Ile Ala Leu Gly His Ser Gly Phe Glu Thr Leu Asn Val Asn Lys Ile Ile Ala Leu Gly His Ser Gly Phe Glu
210 215 220 210 215 220
Met Asp Lys Leu Ile Ala Gln Lys Val Arg Gly Val Asp Val Val Val Met Asp Lys Leu Ile Ala Gln Lys Val Arg Gly Val Asp Val Val Val
225 230 235 240 225 230 235 240
Gly Gly His Ser Asn Thr Phe Leu Tyr Thr Gly Asn Pro Pro Ser Lys Gly Gly His Ser Asn Thr Phe Leu Tyr Thr Gly Asn Pro Pro Ser Lys
245 250 255 245 250 255
Glu Val Pro Ala Gly Lys Tyr Pro Phe Ile Val Thr Ser Asp Asp Gly Glu Val Pro Ala Gly Lys Tyr Pro Phe Ile Val Thr Ser Asp Asp Gly
260 265 270 260 265 270
Arg Lys Val Pro Val Val Gln Ala Tyr Ala Phe Gly Lys Tyr Leu Gly Arg Lys Val Pro Val Val Gln Ala Tyr Ala Phe Gly Lys Tyr Leu Gly
275 280 285 275 280 285
Tyr Leu Lys Ile Glu Phe Asp Glu Arg Gly Asn Val Ile Ser Ser His Tyr Leu Lys Ile Glu Phe Asp Glu Arg Gly Asn Val Ile Ser Ser His
290 295 300 290 295 300
Gly Asn Pro Ile Leu Leu Asn Ser Ser Ile Pro Glu Asp Pro Ser Ile Gly Asn Pro Ile Leu Leu Asn Ser Ser Ile Pro Glu Asp Pro Ser Ile
305 310 315 320 305 310 315 320
Lys Ala Asp Ile Asn Lys Trp Arg Ile Lys Leu Asp Asn Tyr Ser Thr Lys Ala Asp Ile Asn Lys Trp Arg Ile Lys Leu Asp Asn Tyr Ser Thr
325 330 335 325 330 335
Gln Glu Leu Gly Lys Thr Ile Val Tyr Leu Asp Gly Ser Ser Gln Ser Gln Glu Leu Gly Lys Thr Ile Val Tyr Leu Asp Gly Ser Ser Gln Ser
340 345 350 340 345 350
Cys Arg Phe Arg Glu Cys Asn Met Gly Asn Leu Ile Cys Asp Ala Met Cys Arg Phe Arg Glu Cys Asn Met Gly Asn Leu Ile Cys Asp Ala Met
355 360 365 355 360 365
Ile Asn Asn Asn Leu Arg His Thr Asp Glu Met Phe Trp Asn His Val Ile Asn Asn Asn Leu Arg His Thr Asp Glu Met Phe Trp Asn His Val
370 375 380 370 375 380
Ser Met Cys Ile Leu Asn Gly Gly Gly Ile Arg Ser Pro Ile Asp Glu Ser Met Cys Ile Leu Asn Gly Gly Gly Ile Arg Ser Pro Ile Asp Glu
385 390 395 400 385 390 395 400
Arg Asn Asn Gly Thr Ile Thr Trp Glu Asn Leu Ala Ala Val Leu Pro Arg Asn Asn Gly Thr Ile Thr Trp Glu Asn Leu Ala Ala Val Leu Pro
405 410 415 405 410 415
Phe Gly Gly Thr Phe Asp Leu Val Gln Leu Lys Gly Ser Thr Leu Lys Phe Gly Gly Thr Phe Asp Leu Val Gln Leu Lys Gly Ser Thr Leu Lys
420 425 430 420 425 430
Lys Ala Phe Glu His Ser Val His Arg Tyr Gly Gln Ser Thr Gly Glu Lys Ala Phe Glu His Ser Val His Arg Tyr Gly Gln Ser Thr Gly Glu
435 440 445 435 440 445
Phe Leu Gln Val Gly Gly Ile His Val Val Tyr Asp Leu Ser Arg Lys Phe Leu Gln Val Gly Gly Ile His Val Val Tyr Asp Leu Ser Arg Lys
450 455 460 450 455 460
Pro Gly Asp Arg Val Val Lys Leu Asp Val Leu Cys Thr Lys Cys Arg Pro Gly Asp Arg Val Val Lys Leu Asp Val Leu Cys Thr Lys Cys Arg
465 470 475 480 465 470 475 480
Val Pro Ser Tyr Asp Pro Leu Lys Met Asp Glu Val Tyr Lys Val Ile Val Pro Ser Tyr Asp Pro Leu Lys Met Asp Glu Val Tyr Lys Val Ile
485 490 495 485 490 495
Leu Pro Asn Phe Leu Ala Asn Gly Gly Asp Gly Phe Gln Met Ile Lys Leu Pro Asn Phe Leu Ala Asn Gly Gly Asp Gly Phe Gln Met Ile Lys
500 505 510 500 505 510
Asp Glu Leu Leu Arg His Asp Ser Gly Asp Gln Asp Ile Asn Val Val Asp Glu Leu Leu Arg His Asp Ser Gly Asp Gln Asp Ile Asn Val Val
515 520 525 515 520 525
Ser Thr Tyr Ile Ser Lys Met Lys Val Ile Tyr Pro Ala Val Glu Gly Ser Thr Tyr Ile Ser Lys Met Lys Val Ile Tyr Pro Ala Val Glu Gly
530 535 540 530 535 540
Arg Ile Lys Phe Ser Thr Gly Ser His Cys His Gly Ser Phe Ser Leu Arg Ile Lys Phe Ser Thr Gly Ser His Cys His Gly Ser Phe Ser Leu
545 550 555 560 545 550 555 560
Ile Phe Leu Ser Leu Trp Ala Val Ile Phe Val Leu Tyr Gln Ile Phe Leu Ser Leu Trp Ala Val Ile Phe Val Leu Tyr Gln
565 570 565 570
<210> 2<210> 2
<211> 5<211> 5
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<400> 2<400> 2
Ser Tyr Asn Met Tyr Ser Tyr Asn Met Tyr
1 5 15
<210> 3<210> 3
<211> 17<211> 17
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<220><220>
<221> X<221>X
<222> (13)..(13)<222> (13)..(13)
<223> X может представлять собой Gln или Leu<223> X may be Gln or Leu
<220><220>
<221> X<221>X
<222> (14)..(14)<222> (14)..(14)
<223> X может представлять собой Lys или Thr<223> X may represent Lys or Thr
<400> 3<400> 3
Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Xaa Xaa Phe Lys Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Xaa Xaa Phe Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Gly
<210> 4<210> 4
<211> 11<211> 11
<212> Белок<212> Protein
<213> Mus musculus<213> Mus musculus
<220><220>
<221> X<221>X
<222> (3)..(3)<222> (3)..(3)
<223> X может представлять собой Asp или Gly<223> X may represent Asp or Gly
<400> 4<400> 4
Gly Tyr Xaa Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Gly Tyr Xaa Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 5<210> 5
<211> 11<211> 11
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<220><220>
<221> X<221>X
<222> (7)..(7)<222> (7)..(7)
<223> X может представлять собой Thr или Ser<223> X may be Thr or Ser
<400> 5<400> 5
Lys Ala Ser Gln Ser Val Xaa Asn Asp Val Ala Lys Ala Ser Gln Ser Val Xaa Asn Asp Val Ala
1 5 10 1 5 10
<210> 6<210> 6
<211> 7<211> 7
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<220><220>
<221> X<221>X
<222> (4)..(4)<222> (4)..(4)
<223> X может представлять собой Thr или Asn<223> X may represent Thr or Asn
<400> 6<400> 6
Tyr Ala Ser Xaa Arg Tyr Thr Tyr Ala Ser Xaa Arg Tyr Thr
1 5 15
<210> 7<210> 7
<211> 8<211> 8
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<400> 7<400> 7
Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
1 5 15
<210> 8<210> 8
<211> 17<211> 17
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<400> 8<400> 8
Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe Lys Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Gly
<210> 9<210> 9
<211> 11<211> 11
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<400> 9<400> 9
Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 10<210> 10
<211> 11<211> 11
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<400> 10<400> 10
Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp Val Ala Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp Val Ala
1 5 10 1 5 10
<210> 11<210> 11
<211> 7<211> 7
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<400> 11<400> 11
Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr
1 5 15
<210> 12<210> 12
<211> 17<211> 17
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<400> 12<400> 12
Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Gln Lys Phe Lys Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Gln Lys Phe Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Gly
<210> 13<210> 13
<211> 11<211> 11
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<400> 13<400> 13
Gly Tyr Asn Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Gly Tyr Asn Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 14<210> 14
<211> 11<211> 11
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<400> 14<400> 14
Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp Val Ala Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp Val Ala
1 5 10 1 5 10
<210> 15<210> 15
<211> 7<211> 7
<212> Белок<212> Protein
<213> mus musculus<213> mus musculus
<400> 15<400> 15
Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr
1 5 15
<210> 16<210> 16
<211> 330<211> 330
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 16<400> 16
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45 35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60 50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95 85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110 100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Glu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Pro Ala Pro Glu Ala Glu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125 115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160 145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175 165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190 180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205 195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Lys Ala Leu Pro Ala Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220 210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240 225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255 245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270 260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285 275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300 290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320 305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330 325 330
<210> 17<210> 17
<211> 330<211> 330
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 17<400> 17
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45 35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60 50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95 85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110 100 105 110
Pro Ala Pro Glu Phe Glu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Pro Ala Pro Glu Phe Glu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125 115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160 145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175 165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190 180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205 195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Lys Ala Leu Pro Ala Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220 210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240 225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255 245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270 260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285 275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300 290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320 305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330 325 330
<210> 18<210> 18
<211> 330<211> 330
<212> Белок<212> Protein
<213> Синтетическая<213> Synthetic
<400> 18<400> 18
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45 35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60 50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95 85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110 100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Glu Gly Ala Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Pro Ala Pro Glu Ala Glu Gly Ala Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125 115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160 145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175 165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190 180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205 195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Lys Ala Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220 210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240 225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255 245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270 260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285 275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300 290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320 305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330 325 330
<210> 19<210> 19
<211> 330<211> 330
<212> Белок<212> Protein
<213> Синтетическая<213> Synthetic
<400> 19<400> 19
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45 35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60 50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95 85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110 100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Glu Gly Ala Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Pro Ala Pro Glu Ala Glu Gly Ala Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125 115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160 145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175 165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190 180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205 195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Lys Ala Leu Pro Ala Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220 210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240 225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255 245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270 260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285 275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300 290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320 305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330 325 330
<210> 20<210> 20
<211> 45<211> 45
<212> ДНК<212> DNA
<213> homo sapiens<213> homo sapiens
<400> 20<400> 20
tacgactcac aagcttgccg ccaccatgtg tccccgagcc gcgcg 45tacgactcac aagcttgccg ccaccatgtg tccccgagcc gcgcg 45
<210> 21<210> 21
<211> 57<211> 57
<212> ДНК<212> DNA
<213> homo sapiens<213> homo sapiens
<400> 21<400> 21
ccgccccgac tctagatcag tgatggtgat gatggtgctt gatccgacct tcaactg 57ccgccccgac tctagatcag tgatggtgat gatggtgctt gatccgacct tcaactg 57
<210> 22<210> 22
<211> 553<211> 553
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 22<400> 22
Met Cys Pro Arg Ala Ala Arg Ala Pro Ala Thr Leu Leu Leu Ala Leu Met Cys Pro Arg Ala Ala Arg Ala Pro Ala Thr Leu Leu Leu Ala Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Ala Val Leu Trp Pro Ala Ala Gly Ala Trp Glu Leu Thr Ile Leu Gly Ala Val Leu Trp Pro Ala Ala Gly Ala Trp Glu Leu Thr Ile Leu
20 25 30 20 25 30
His Thr Asn Asp Val His Ser Arg Leu Glu Gln Thr Ser Glu Asp Ser His Thr Asn Asp Val His Ser Arg Leu Glu Gln Thr Ser Glu Asp Ser
35 40 45 35 40 45
Ser Lys Cys Val Asn Ala Ser Arg Cys Met Gly Gly Val Ala Arg Leu Ser Lys Cys Val Asn Ala Ser Arg Cys Met Gly Gly Val Ala Arg Leu
50 55 60 50 55 60
Phe Thr Lys Val Gln Gln Ile Arg Arg Ala Glu Pro Asn Val Leu Leu Phe Thr Lys Val Gln Gln Ile Arg Arg Ala Glu Pro Asn Val Leu Leu
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Asp Ala Gly Asp Gln Tyr Gln Gly Thr Ile Trp Phe Thr Val Tyr Leu Asp Ala Gly Asp Gln Tyr Gln Gly Thr Ile Trp Phe Thr Val Tyr
85 90 95 85 90 95
Lys Gly Ala Glu Val Ala His Phe Met Asn Ala Leu Arg Tyr Asp Ala Lys Gly Ala Glu Val Ala His Phe Met Asn Ala Leu Arg Tyr Asp Ala
100 105 110 100 105 110
Met Ala Leu Gly Asn His Glu Phe Asp Asn Gly Val Glu Gly Leu Ile Met Ala Leu Gly Asn His Glu Phe Asp Asn Gly Val Glu Gly Leu Ile
115 120 125 115 120 125
Glu Pro Leu Leu Lys Glu Ala Lys Phe Pro Ile Leu Ser Ala Asn Ile Glu Pro Leu Leu Lys Glu Ala Lys Phe Pro Ile Leu Ser Ala Asn Ile
130 135 140 130 135 140
Lys Ala Lys Gly Pro Leu Ala Ser Gln Ile Ser Gly Leu Tyr Leu Pro Lys Ala Lys Gly Pro Leu Ala Ser Gln Ile Ser Gly Leu Tyr Leu Pro
145 150 155 160 145 150 155 160
Tyr Lys Val Leu Pro Val Gly Asp Glu Val Val Gly Ile Val Gly Tyr Tyr Lys Val Leu Pro Val Gly Asp Glu Val Val Gly Ile Val Gly Tyr
165 170 175 165 170 175
Thr Ser Lys Glu Thr Pro Phe Leu Ser Asn Pro Gly Thr Asn Leu Val Thr Ser Lys Glu Thr Pro Phe Leu Ser Asn Pro Gly Thr Asn Leu Val
180 185 190 180 185 190
Phe Glu Asp Glu Ile Thr Ala Leu Gln Pro Glu Val Asp Lys Leu Lys Phe Glu Asp Glu Ile Thr Ala Leu Gln Pro Glu Val Asp Lys Leu Lys
195 200 205 195 200 205
Thr Leu Asn Val Asn Lys Ile Ile Ala Leu Gly His Ser Gly Phe Glu Thr Leu Asn Val Asn Lys Ile Ile Ala Leu Gly His Ser Gly Phe Glu
210 215 220 210 215 220
Met Asp Lys Leu Ile Ala Gln Lys Val Arg Gly Val Asp Val Val Val Met Asp Lys Leu Ile Ala Gln Lys Val Arg Gly Val Asp Val Val Val
225 230 235 240 225 230 235 240
Gly Gly His Ser Asn Thr Phe Leu Tyr Thr Gly Asn Pro Pro Ser Lys Gly Gly His Ser Asn Thr Phe Leu Tyr Thr Gly Asn Pro Pro Ser Lys
245 250 255 245 250 255
Glu Val Pro Ala Gly Lys Tyr Pro Phe Ile Val Thr Ser Asp Asp Gly Glu Val Pro Ala Gly Lys Tyr Pro Phe Ile Val Thr Ser Asp Asp Gly
260 265 270 260 265 270
Arg Lys Val Pro Val Val Gln Ala Tyr Ala Phe Gly Lys Tyr Leu Gly Arg Lys Val Pro Val Val Gln Ala Tyr Ala Phe Gly Lys Tyr Leu Gly
275 280 285 275 280 285
Tyr Leu Lys Ile Glu Phe Asp Glu Arg Gly Asn Val Ile Ser Ser His Tyr Leu Lys Ile Glu Phe Asp Glu Arg Gly Asn Val Ile Ser Ser His
290 295 300 290 295 300
Gly Asn Pro Ile Leu Leu Asn Ser Ser Ile Pro Glu Asp Pro Ser Ile Gly Asn Pro Ile Leu Leu Asn Ser Ser Ile Pro Glu Asp Pro Ser Ile
305 310 315 320 305 310 315 320
Lys Ala Asp Ile Asn Lys Trp Arg Ile Lys Leu Asp Asn Tyr Ser Thr Lys Ala Asp Ile Asn Lys Trp Arg Ile Lys Leu Asp Asn Tyr Ser Thr
325 330 335 325 330 335
Gln Glu Leu Gly Lys Thr Ile Val Tyr Leu Asp Gly Ser Ser Gln Ser Gln Glu Leu Gly Lys Thr Ile Val Tyr Leu Asp Gly Ser Ser Gln Ser
340 345 350 340 345 350
Cys Arg Phe Arg Glu Cys Asn Met Gly Asn Leu Ile Cys Asp Ala Met Cys Arg Phe Arg Glu Cys Asn Met Gly Asn Leu Ile Cys Asp Ala Met
355 360 365 355 360 365
Ile Asn Asn Asn Leu Arg His Thr Asp Glu Met Phe Trp Asn His Val Ile Asn Asn Asn Leu Arg His Thr Asp Glu Met Phe Trp Asn His Val
370 375 380 370 375 380
Ser Met Cys Ile Leu Asn Gly Gly Gly Ile Arg Ser Pro Ile Asp Glu Ser Met Cys Ile Leu Asn Gly Gly Gly Ile Arg Ser Pro Ile Asp Glu
385 390 395 400 385 390 395 400
Arg Asn Asn Gly Thr Ile Thr Trp Glu Asn Leu Ala Ala Val Leu Pro Arg Asn Asn Gly Thr Ile Thr Trp Glu Asn Leu Ala Ala Val Leu Pro
405 410 415 405 410 415
Phe Gly Gly Thr Phe Asp Leu Val Gln Leu Lys Gly Ser Thr Leu Lys Phe Gly Gly Thr Phe Asp Leu Val Gln Leu Lys Gly Ser Thr Leu Lys
420 425 430 420 425 430
Lys Ala Phe Glu His Ser Val His Arg Tyr Gly Gln Ser Thr Gly Glu Lys Ala Phe Glu His Ser Val His Arg Tyr Gly Gln Ser Thr Gly Glu
435 440 445 435 440 445
Phe Leu Gln Val Gly Gly Ile His Val Val Tyr Asp Leu Ser Arg Lys Phe Leu Gln Val Gly Gly Ile His Val Val Tyr Asp Leu Ser Arg Lys
450 455 460 450 455 460
Pro Gly Asp Arg Val Val Lys Leu Asp Val Leu Cys Thr Lys Cys Arg Pro Gly Asp Arg Val Val Lys Leu Asp Val Leu Cys Thr Lys Cys Arg
465 470 475 480 465 470 475 480
Val Pro Ser Tyr Asp Pro Leu Lys Met Asp Glu Val Tyr Lys Val Ile Val Pro Ser Tyr Asp Pro Leu Lys Met Asp Glu Val Tyr Lys Val Ile
485 490 495 485 490 495
Leu Pro Asn Phe Leu Ala Asn Gly Gly Asp Gly Phe Gln Met Ile Lys Leu Pro Asn Phe Leu Ala Asn Gly Gly Asp Gly Phe Gln Met Ile Lys
500 505 510 500 505 510
Asp Glu Leu Leu Arg His Asp Ser Gly Asp Gln Asp Ile Asn Val Val Asp Glu Leu Leu Arg His Asp Ser Gly Asp Gln Asp Ile Asn Val Val
515 520 525 515 520 525
Ser Thr Tyr Ile Ser Lys Met Lys Val Ile Tyr Pro Ala Val Glu Gly Ser Thr Tyr Ile Ser Lys Met Lys Val Ile Tyr Pro Ala Val Glu Gly
530 535 540 530 535 540
Arg Ile Lys His His His His His His Arg Ile Lys His His His His His
545 550 545 550
<210> 23<210> 23
<211> 216<211> 216
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 23<400> 23
Gln Ile Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala Gln Ile Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Ala Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Ala Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Asn Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Ser Leu Asp Trp Ile Asn Met Asn Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Ser Leu Asp Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Thr Thr Ala Tyr Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Thr Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met His Leu Asn Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys Met His Leu Asn Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125 115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140 130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160 145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175 165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190 180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205 195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
210 215 210 215
<210> 24<210> 24
<211> 213<211> 213
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 24<400> 24
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Lys Phe Leu Leu Val Ser Ala Gly Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Lys Phe Leu Leu Val Ser Ala Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Thr Val Gln Ala Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Thr Val Gln Ala
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Leu Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Leu Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro
100 105 110 100 105 110
Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr
115 120 125 115 120 125
Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys
130 135 140 130 135 140
Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu
145 150 155 160 145 150 155 160
Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser
165 170 175 165 170 175
Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala
180 185 190 180 185 190
Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe
195 200 205 195 200 205
Asn Arg Gly Glu Cys Asn Arg Gly Glu Cys
210 210
<210> 25<210> 25
<211> 216<211> 216
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 25<400> 25
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Met Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Met
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Ile Thr Arg Asp Thr Ser Ala Ser Thr Ala Tyr Lys Gly Arg Val Thr Ile Thr Arg Asp Thr Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125 115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140 130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160 145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175 165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190 180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205 195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
210 215 210 215
<210> 26<210> 26
<211> 213<211> 213
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 26<400> 26
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro
100 105 110 100 105 110
Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr
115 120 125 115 120 125
Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys
130 135 140 130 135 140
Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu
145 150 155 160 145 150 155 160
Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser
165 170 175 165 170 175
Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala
180 185 190 180 185 190
Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe
195 200 205 195 200 205
Asn Arg Gly Glu Cys Asn Arg Gly Glu Cys
210 210
<210> 27<210> 27
<211> 120<211> 120
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 27<400> 27
Gln Ile Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala Gln Ile Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Ala Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Ala Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Asn Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Ser Leu Asp Trp Ile Asn Met Asn Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Ser Leu Asp Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Thr Thr Ala Tyr Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Thr Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met His Leu Asn Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys Met His Leu Asn Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala
115 120 115 120
<210> 28<210> 28
<211> 106<211> 106
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 28<400> 28
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Lys Phe Leu Leu Val Ser Ala Gly Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Lys Phe Leu Leu Val Ser Ala Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Thr Val Gln Ala Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Thr Val Gln Ala
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Leu Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Leu Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
100 105 100 105
<210> 29<210> 29
<211> 120<211> 120
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 29<400> 29
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Met Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Met
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Ile Thr Arg Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr Lys Gly Arg Val Thr Ile Thr Arg Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 30<210> 30
<211> 120<211> 120
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 30<400> 30
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Thr Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Thr Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Ser Leu Glu Trp Met Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Ser Leu Glu Trp Met
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Ile Thr Val Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr Lys Gly Arg Val Thr Ile Thr Val Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 31<210> 31
<211> 120<211> 120
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 31<400> 31
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Thr Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Thr Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Ser Leu Glu Trp Ile Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Ser Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Ile Thr Val Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr Lys Gly Lys Ala Thr Ile Thr Val Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 32<210> 32
<211> 120<211> 120
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 32<400> 32
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Ala Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Ala Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Ser Leu Glu Trp Ile Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Ser Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 33<210> 33
<211> 106<211> 106
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 33<400> 33
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 34<210> 34
<211> 106<211> 106
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 34<400> 34
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 35<210> 35
<211> 106<211> 106
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 35<400> 35
Asp Val Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Val Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 36<210> 36
<211> 106<211> 106
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 36<400> 36
Asp Val Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Val Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 37<210> 37
<211> 120<211> 120
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 37<400> 37
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ala Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ala Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Ile Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr Lys Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 38<210> 38
<211> 450<211> 450
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 38<400> 38
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ala Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ala Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Ile Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Leu Thr Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr Lys Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Gly Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125 115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140 130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160 145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175 165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190 180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205 195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp
210 215 220 210 215 220
Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Glu Gly Ala Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Glu Gly Ala
225 230 235 240 225 230 235 240
Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile
245 250 255 245 250 255
Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu
260 265 270 260 265 270
Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His
275 280 285 275 280 285
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg
290 295 300 290 295 300
Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315 320 305 310 315 320
Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ser Ser Ile Glu Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ser Ser Ile Glu
325 330 335 325 330 335
Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr
340 345 350 340 345 350
Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu
355 360 365 355 360 365
Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp
370 375 380 370 375 380
Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val
385 390 395 400 385 390 395 400
Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp
405 410 415 405 410 415
Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His
420 425 430 420 425 430
Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
435 440 445 435 440 445
Gly Lys Gly Lys
450 450
<210> 39<210> 39
<211> 213<211> 213
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 39<400> 39
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Tyr Tyr Ala Ser Thr Arg Tyr Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro
100 105 110 100 105 110
Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr
115 120 125 115 120 125
Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys
130 135 140 130 135 140
Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu
145 150 155 160 145 150 155 160
Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser
165 170 175 165 170 175
Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala
180 185 190 180 185 190
Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe
195 200 205 195 200 205
Asn Arg Gly Glu Cys Asn Arg Gly Glu Cys
210 210
<210> 40<210> 40
<211> 120<211> 120
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 40<400> 40
Glu Ile Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala Glu Ile Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Thr Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Thr Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Arg Leu Glu Trp Ile Asn Met Tyr Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Arg Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Gln Lys Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met His Leu Asn Asn Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys Met His Leu Asn Asn Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Asn Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Asn Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala
115 120 115 120
<210> 41<210> 41
<211> 106<211> 106
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 41<400> 41
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Lys Phe Leu Leu Val Ser Ala Gly Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Lys Phe Leu Leu Val Ser Ala Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Thr Met Gln Ala Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Thr Met Gln Ala
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Leu Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Leu Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
100 105 100 105
<210> 42<210> 42
<211> 120<211> 120
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 42<400> 42
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ala Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ala Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Ile Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Gln Lys Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr Lys Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Asn Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Asn Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 43<210> 43
<211> 106<211> 106
<212> Белок<212> Protein
<213> Синтетическая<213> Synthetic
<400> 43<400> 43
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 44<210> 44
<211> 106<211> 106
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 44<400> 44
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 45<210> 45
<211> 106<211> 106
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 45<400> 45
Asp Val Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Val Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 46<210> 46
<211> 106<211> 106
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 46<400> 46
Asp Val Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Val Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 47<210> 47
<211> 450<211> 450
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 47<400> 47
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ala Ser Tyr Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Ala Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Ile Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Gln Lys Phe Gly Tyr Ile Asp Pro Tyr Asn Gly Gly Ser Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr Lys Gly Arg Val Thr Leu Thr Arg Asp Lys Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Gly Tyr Asn Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Ala Arg Gly Tyr Asn Asn Tyr Lys Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125 115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140 130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160 145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175 165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190 180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205 195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp
210 215 220 210 215 220
Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Glu Gly Ala Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Ala Glu Gly Ala
225 230 235 240 225 230 235 240
Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile
245 250 255 245 250 255
Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu
260 265 270 260 265 270
Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His
275 280 285 275 280 285
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg
290 295 300 290 295 300
Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315 320 305 310 315 320
Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ser Ser Ile Glu Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ser Ser Ile Glu
325 330 335 325 330 335
Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr
340 345 350 340 345 350
Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu
355 360 365 355 360 365
Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp
370 375 380 370 375 380
Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val
385 390 395 400 385 390 395 400
Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp
405 410 415 405 410 415
Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His
420 425 430 420 425 430
Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
435 440 445 435 440 445
Gly Lys Gly Lys
450 450
<210> 48<210> 48
<211> 213<211> 213
<212> Белок<212> Protein
<213> Искусственная<213> Artificial
<220><220>
<223> Синтетическая<223> Synthetic
<400> 48<400> 48
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Thr Asn Asp
20 25 30 20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Ser Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro
100 105 110 100 105 110
Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr
115 120 125 115 120 125
Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys
130 135 140 130 135 140
Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu
145 150 155 160 145 150 155 160
Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser
165 170 175 165 170 175
Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala
180 185 190 180 185 190
Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe
195 200 205 195 200 205
Asn Arg Gly Glu Cys Asn Arg Gly Glu Cys
210 210
<---<---
Claims (9)
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US62/837,214 | 2019-04-23 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2021129218A RU2021129218A (en) | 2023-05-23 |
| RU2819204C2 true RU2819204C2 (en) | 2024-05-15 |
Family
ID=
Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2345090C2 (en) * | 2003-03-10 | 2009-01-27 | Санкио Компани, Лимитед | Antibody against tumor-specific antigens as target |
| WO2016055609A1 (en) * | 2014-10-10 | 2016-04-14 | Innate Pharma | Cd73 blockade |
Patent Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2345090C2 (en) * | 2003-03-10 | 2009-01-27 | Санкио Компани, Лимитед | Antibody against tumor-specific antigens as target |
| WO2016055609A1 (en) * | 2014-10-10 | 2016-04-14 | Innate Pharma | Cd73 blockade |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| ALLARD B. et al., Anti-CD73 therapy impairs tumor angiogenesis, International Journal of Cancer, 2014, Volume 134, Issue 6, pp.1466-1473. STAGG J. et al., Anti-CD73 antibody therapy inhibits breast tumor growth and metastasis, PNAS, 2010, vol.107, no.4, pp.1547-1552. ДЕЕВ С.М. и др., Неприродные антитела и иммуноконъюгаты с заданными свойствами: оптимизация функций через направленное изменение структуры, УСПЕХИ ХИМИИ, 2015, Том 84, Номер 1, стр.1-26, см. стр.5-8. * |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP7530913B2 (en) | CD73 blocking antibodies | |
| JP7132981B2 (en) | CD73 blockade | |
| US20230340143A1 (en) | Compositions and methods for treating cancer | |
| US12157771B2 (en) | Proteins binding NKG2D, CD16 and CLEC12A | |
| EP3193931B1 (en) | Neutralization of inhibitory pathways in lymphocytes | |
| TWI870353B (en) | Compositions and methods for treating cancer | |
| KR20200060471A (en) | Restoration of T cell activity through the CD39 / CD73 axis | |
| EP4347655A1 (en) | Anti-ccr8 antibodies and uses thereof | |
| JP2022553927A (en) | Treatment of cancer with ILT-2 inhibitors | |
| RU2819204C2 (en) | Cd73 blocking antibodies | |
| KR20230050378A (en) | Methods of Treating Cancer Using Anti-CD73 Antibodies | |
| RU2781116C1 (en) | Compositions and methods for treatment of cancer | |
| HK40060535A (en) | Cd73 blocking antibodies | |
| EA047070B1 (en) | COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATING CANCER | |
| HK40040395A (en) | Compositions and methods for treating cancer |