RU2816898C2 - Nucleic acid, pharmaceutical composition and conjugate, method of production and use - Google Patents
Nucleic acid, pharmaceutical composition and conjugate, method of production and use Download PDFInfo
- Publication number
- RU2816898C2 RU2816898C2 RU2021134268A RU2021134268A RU2816898C2 RU 2816898 C2 RU2816898 C2 RU 2816898C2 RU 2021134268 A RU2021134268 A RU 2021134268A RU 2021134268 A RU2021134268 A RU 2021134268A RU 2816898 C2 RU2816898 C2 RU 2816898C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- seq
- nucleotide sequence
- nucleotide
- sirna
- nucleotides
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 90
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims description 10
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 title description 53
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title description 35
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title description 18
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title description 18
- 239000000562 conjugate Substances 0.000 title description 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 1235
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 1134
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 claims abstract description 502
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 claims abstract description 261
- 108091081021 Sense strand Proteins 0.000 claims abstract description 192
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 37
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 claims abstract description 23
- 206010028417 myasthenia gravis Diseases 0.000 claims abstract description 19
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims abstract description 17
- 101150069146 C5 gene Proteins 0.000 claims abstract description 12
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims abstract description 11
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 142
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 131
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 104
- -1 D-4-thioribose Chemical compound 0.000 claims description 88
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 87
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 claims description 79
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 68
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 58
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 51
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 44
- 125000001188 haloalkyl group Chemical group 0.000 claims description 41
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims description 40
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 claims description 36
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 claims description 36
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 claims description 35
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims description 35
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 claims description 34
- 125000005037 alkyl phenyl group Chemical group 0.000 claims description 32
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims description 26
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims description 26
- 125000004437 phosphorous atom Chemical group 0.000 claims description 25
- 125000000548 ribosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 claims description 24
- YCKRFDGAMUMZLT-UHFFFAOYSA-N Fluorine atom Chemical compound [F] YCKRFDGAMUMZLT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 22
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 claims description 21
- MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N N-acetyl-D-galactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(O)C(O)CO MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 20
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims description 20
- OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N N-Acetyl-D-Galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N 0.000 claims description 18
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims description 18
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 claims description 17
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims description 14
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims description 13
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims description 13
- 102000005427 Asialoglycoprotein Receptor Human genes 0.000 claims description 11
- 108010006523 asialoglycoprotein receptor Proteins 0.000 claims description 11
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 claims description 10
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 claims description 10
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 claims description 10
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 claims description 9
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 claims description 9
- 229960003082 galactose Drugs 0.000 claims description 9
- 150000002367 halogens Chemical group 0.000 claims description 9
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 claims description 9
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 claims description 8
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 claims description 8
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 claims description 8
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 claims description 8
- 125000004450 alkenylene group Chemical group 0.000 claims description 7
- 125000004419 alkynylene group Chemical group 0.000 claims description 7
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 125000000732 arylene group Chemical group 0.000 claims description 7
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 claims description 7
- 125000005549 heteroarylene group Chemical group 0.000 claims description 7
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims description 7
- 125000001313 C5-C10 heteroaryl group Chemical group 0.000 claims description 6
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 claims description 6
- 125000004093 cyano group Chemical group *C#N 0.000 claims description 6
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 claims description 6
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 claims description 5
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- WQZGKKKJIJFFOK-SVZMEOIVSA-N (+)-Galactose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-SVZMEOIVSA-N 0.000 claims description 4
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 claims description 4
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 claims description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-UHFFFAOYSA-N alpha-D-glucopyranose Natural products OCC1OC(O)C(O)C(O)C1O WQZGKKKJIJFFOK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- MSWZFWKMSRAUBD-UHFFFAOYSA-N beta-D-galactosamine Natural products NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O MSWZFWKMSRAUBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 claims description 4
- 229960001031 glucose Drugs 0.000 claims description 4
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 claims description 4
- 108010002913 Asialoglycoproteins Proteins 0.000 claims description 3
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 claims description 3
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N Thiophosphoric acid Chemical group OP(O)(S)=O RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N beta-N-Acetyl-D-neuraminic acid Natural products CC(=O)NC1C(O)CC(O)(C(O)=O)OC1C(O)C(O)CO SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 125000001153 fluoro group Chemical group F* 0.000 claims description 3
- SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N sialic acid Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)C[C@@](O)(C(O)=O)OC1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N 0.000 claims description 3
- KGSURTOFVLAWDC-DGPNFKTASA-N (2R,3R,4R,5R,6R)-6-(hydroxymethyl)-5-sulfanyloxane-2,3,4-triol Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1S KGSURTOFVLAWDC-DGPNFKTASA-N 0.000 claims description 2
- FKHFKRQKTXSSIN-QZABAPFNSA-N (2R,3R,4R,5S)-5-[(1R)-2-hydroxy-1-sulfanylethyl]oxolane-2,3,4-triol Chemical compound OC[C@@H](S)[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O FKHFKRQKTXSSIN-QZABAPFNSA-N 0.000 claims description 2
- ZXNYUXIMAXVSFN-VFUOTHLCSA-N 2,2,2-trifluoro-n-[(2r,3r,4r,5r,6r)-2,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](NC(=O)C(F)(F)F)[C@@H](O)[C@H]1O ZXNYUXIMAXVSFN-VFUOTHLCSA-N 0.000 claims description 2
- MSWZFWKMSRAUBD-GASJEMHNSA-N 2-amino-2-deoxy-D-galactopyranose Chemical compound N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O MSWZFWKMSRAUBD-GASJEMHNSA-N 0.000 claims description 2
- MSWZFWKMSRAUBD-IVMDWMLBSA-N 2-amino-2-deoxy-D-glucopyranose Chemical compound N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O MSWZFWKMSRAUBD-IVMDWMLBSA-N 0.000 claims description 2
- KXTUJUVCAGXOBN-WQXQQRIOSA-N 2-methyl-N-[(3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]propanamide Chemical compound CC(C)C(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O KXTUJUVCAGXOBN-WQXQQRIOSA-N 0.000 claims description 2
- HMFHBZSHGGEWLO-IOVATXLUSA-N D-xylofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-IOVATXLUSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-DHVFOXMCSA-N L-galactose Chemical compound OC[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-DHVFOXMCSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-ZZWDRFIYSA-N L-glucose Chemical compound OC[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-ZZWDRFIYSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-JFNONXLTSA-N L-mannopyranose Chemical compound OC[C@@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-JFNONXLTSA-N 0.000 claims description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-OWMBCFKOSA-N L-ribopyranose Chemical compound O[C@H]1COC(O)[C@@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-OWMBCFKOSA-N 0.000 claims description 2
- HMFHBZSHGGEWLO-CZBDKTQLSA-N L-xylofuranose Chemical compound OC[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-CZBDKTQLSA-N 0.000 claims description 2
- OSTPHDDSCGGHJD-PPRREVKSSA-N N-[(2R,3R,4S,5S)-6-hydroxy-4,5-dimethoxy-2-methyloxan-3-yl]formamide Chemical compound CO[C@@H]1C(O)O[C@H](C)[C@@H](NC=O)[C@@H]1OC OSTPHDDSCGGHJD-PPRREVKSSA-N 0.000 claims description 2
- RTEOJYOKWPEKKN-HXQZNRNWSA-N N-[(3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]propanamide Chemical compound CCC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O RTEOJYOKWPEKKN-HXQZNRNWSA-N 0.000 claims description 2
- FDJKUWYYUZCUJX-VTERZIIISA-N N-glycoloyl-alpha-neuraminic acid Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O[C@@](O)(C(O)=O)C[C@H](O)[C@H]1NC(=O)CO FDJKUWYYUZCUJX-VTERZIIISA-N 0.000 claims description 2
- PRDZVHCOEWJPOB-IVMDWMLBSA-N N-sulfo-D-glucosamine Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](NS(O)(=O)=O)[C@@H](O)[C@@H]1O PRDZVHCOEWJPOB-IVMDWMLBSA-N 0.000 claims description 2
- 229910052770 Uranium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-MROZADKFSA-N aldehydo-L-ribose Chemical compound OC[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-MROZADKFSA-N 0.000 claims description 2
- RFSUNEUAIZKAJO-ZXXMMSQZSA-N alpha-D-fructofuranose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 claims description 2
- LKDRXBCSQODPBY-ZXXMMSQZSA-N alpha-D-fructopyranose Chemical compound OC[C@]1(O)OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O LKDRXBCSQODPBY-ZXXMMSQZSA-N 0.000 claims description 2
- AVVWPBAENSWJCB-TVIMKVIFSA-N alpha-D-galactofuranose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AVVWPBAENSWJCB-TVIMKVIFSA-N 0.000 claims description 2
- GZCGUPFRVQAUEE-UHFFFAOYSA-N alpha-D-galactose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C(O)C=O GZCGUPFRVQAUEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- AVVWPBAENSWJCB-UKFBFLRUSA-N alpha-D-glucofuranose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AVVWPBAENSWJCB-UKFBFLRUSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-DVKNGEFBSA-N alpha-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-DVKNGEFBSA-N 0.000 claims description 2
- AVVWPBAENSWJCB-DVKNGEFBSA-N alpha-D-mannofuranose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H]1O[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O AVVWPBAENSWJCB-DVKNGEFBSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-PQMKYFCFSA-N alpha-D-mannose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PQMKYFCFSA-N 0.000 claims description 2
- AVVWPBAENSWJCB-DGPNFKTASA-N beta-D-galactofuranose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AVVWPBAENSWJCB-DGPNFKTASA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-FPRJBGLDSA-N beta-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-FPRJBGLDSA-N 0.000 claims description 2
- AVVWPBAENSWJCB-QZABAPFNSA-N beta-D-glucofuranose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AVVWPBAENSWJCB-QZABAPFNSA-N 0.000 claims description 2
- AVVWPBAENSWJCB-VFUOTHLCSA-N beta-D-mannofuranose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O AVVWPBAENSWJCB-VFUOTHLCSA-N 0.000 claims description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-RWOPYEJCSA-N beta-D-mannose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-RWOPYEJCSA-N 0.000 claims description 2
- 229960002246 beta-d-glucopyranose Drugs 0.000 claims description 2
- MSFSPUZXLOGKHJ-KTZFPWNASA-N beta-muramic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](C)O[C@@H]1[C@@H](N)[C@H](O)O[C@H](CO)[C@H]1O MSFSPUZXLOGKHJ-KTZFPWNASA-N 0.000 claims description 2
- 229960002442 glucosamine Drugs 0.000 claims description 2
- DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N Uridine Natural products O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-XVFCMESISA-N 0.000 claims 1
- DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N beta-L-uridine Natural products O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@@H]1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-PSQAKQOGSA-N 0.000 claims 1
- 229940126601 medicinal product Drugs 0.000 claims 1
- DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N uracil arabinoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C=C1 DRTQHJPVMGBUCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229940045145 uridine Drugs 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 abstract description 18
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 11
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 11
- 229940079593 drug Drugs 0.000 abstract description 7
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 7
- 108010069112 Complement System Proteins Proteins 0.000 abstract description 6
- 102000000989 Complement System Proteins Human genes 0.000 abstract description 5
- 239000004055 small Interfering RNA Substances 0.000 description 408
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 110
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 103
- 239000002585 base Substances 0.000 description 100
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 90
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 80
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 62
- 108091070501 miRNA Proteins 0.000 description 59
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 56
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 54
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 53
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 52
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 48
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 47
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 47
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 45
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 44
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 43
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 description 43
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N ether Substances CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 41
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 38
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 35
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 33
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 31
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 30
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 29
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 29
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 27
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 26
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 25
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 23
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 22
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 22
- 239000000047 product Substances 0.000 description 21
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 20
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 19
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 19
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 19
- 238000005987 sulfurization reaction Methods 0.000 description 19
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 18
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 17
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 17
- JXTHNDFMNIQAHM-UHFFFAOYSA-N dichloroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(Cl)Cl JXTHNDFMNIQAHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 16
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 15
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 14
- 239000007822 coupling agent Substances 0.000 description 14
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 14
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 14
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 14
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 14
- 150000003512 tertiary amines Chemical class 0.000 description 14
- VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 4-Dimethylaminopyridine Chemical compound CN(C)C1=CC=NC=C1 VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 13
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 13
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 13
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 13
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 13
- 230000008569 process Effects 0.000 description 13
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 12
- 230000006870 function Effects 0.000 description 12
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 12
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 11
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 11
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 11
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 11
- 125000002103 4,4'-dimethoxytriphenylmethyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)(C1=C([H])C([H])=C(OC([H])([H])[H])C([H])=C1[H])C1=C([H])C([H])=C(OC([H])([H])[H])C([H])=C1[H] 0.000 description 10
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 10
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 10
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 10
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 10
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 10
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 10
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 10
- MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-1H-imidazole Chemical compound CN1C=CN=C1 MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 9
- 239000004593 Epoxy Substances 0.000 description 9
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 150000001350 alkyl halides Chemical class 0.000 description 9
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 9
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 9
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 9
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 9
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 9
- BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N Methyl tert-butyl ether Chemical compound COC(C)(C)C BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 description 8
- 150000001408 amides Chemical group 0.000 description 8
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 8
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 8
- 238000011033 desalting Methods 0.000 description 8
- 229960005215 dichloroacetic acid Drugs 0.000 description 8
- AJDPNPAGZMZOMN-UHFFFAOYSA-N diethyl (4-oxo-1,2,3-benzotriazin-3-yl) phosphate Chemical compound C1=CC=C2C(=O)N(OP(=O)(OCC)OCC)N=NC2=C1 AJDPNPAGZMZOMN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000005886 esterification reaction Methods 0.000 description 8
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 8
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 8
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 8
- 239000012046 mixed solvent Substances 0.000 description 8
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 8
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 8
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 8
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 8
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonium chloride Substances [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 7
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N ammonia Natural products N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 235000011114 ammonium hydroxide Nutrition 0.000 description 7
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 7
- UNXNGGMLCSMSLH-UHFFFAOYSA-N dihydrogen phosphate;triethylazanium Chemical compound OP(O)(O)=O.CCN(CC)CC UNXNGGMLCSMSLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 7
- 125000001072 heteroaryl group Chemical group 0.000 description 7
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 7
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 7
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 7
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 7
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 7
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran Natural products C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 6
- WSLDOOZREJYCGB-UHFFFAOYSA-N 1,2-Dichloroethane Chemical compound ClCCCl WSLDOOZREJYCGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- GONFBOIJNUKKST-UHFFFAOYSA-N 5-ethylsulfanyl-2h-tetrazole Chemical compound CCSC=1N=NNN=1 GONFBOIJNUKKST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N N-Methylmorpholine Chemical compound CN1CCOCC1 SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 6
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 description 6
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 6
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 6
- 239000007800 oxidant agent Substances 0.000 description 6
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 description 6
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 6
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 6
- JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 1-[chloro-(4-methoxyphenyl)-phenylmethyl]-4-methoxybenzene Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC(OC)=CC=1)C1=CC=CC=C1 JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 5
- 108010009685 Cholinergic Receptors Proteins 0.000 description 5
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N Guanine Natural products O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 5
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Natural products O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102000034337 acetylcholine receptors Human genes 0.000 description 5
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 5
- 125000000304 alkynyl group Chemical group 0.000 description 5
- 150000007942 carboxylates Chemical class 0.000 description 5
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 5
- 239000012351 deprotecting agent Substances 0.000 description 5
- 125000000532 dioxanyl group Chemical group 0.000 description 5
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 5
- 230000032050 esterification Effects 0.000 description 5
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 5
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 description 5
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 5
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 5
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 5
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 5
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N phosphoric acid Substances OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 5
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 5
- 230000004044 response Effects 0.000 description 5
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 5
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 5
- 241000894007 species Species 0.000 description 5
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 5
- KJUGUADJHNHALS-UHFFFAOYSA-N 1H-tetrazole Chemical compound C=1N=NNN=1 KJUGUADJHNHALS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 2-(chloromethyl)pyridine-3-carbonitrile Chemical compound ClCC1=NC=CC=C1C#N FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101000887162 Gallus gallus Gallinacin-5 Proteins 0.000 description 4
- 101000887166 Gallus gallus Gallinacin-7 Proteins 0.000 description 4
- 101150112014 Gapdh gene Proteins 0.000 description 4
- 239000012124 Opti-MEM Substances 0.000 description 4
- 238000012228 RNA interference-mediated gene silencing Methods 0.000 description 4
- 101000608768 Rattus norvegicus Galectin-5 Proteins 0.000 description 4
- 125000002015 acyclic group Chemical group 0.000 description 4
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 4
- 238000007112 amidation reaction Methods 0.000 description 4
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 4
- 239000007975 buffered saline Substances 0.000 description 4
- 229960001701 chloroform Drugs 0.000 description 4
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 4
- 238000006482 condensation reaction Methods 0.000 description 4
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Natural products NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000001028 difluoromethyl group Chemical group [H]C(F)(F)* 0.000 description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 4
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 4
- 230000009368 gene silencing by RNA Effects 0.000 description 4
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 4
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 description 4
- 125000001183 hydrocarbyl group Chemical group 0.000 description 4
- 239000005457 ice water Substances 0.000 description 4
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 4
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 4
- 239000012669 liquid formulation Substances 0.000 description 4
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 4
- 125000004123 n-propyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 4
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N nitrogen Substances N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000009437 off-target effect Effects 0.000 description 4
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 4
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 4
- 239000003208 petroleum Substances 0.000 description 4
- 150000008301 phosphite esters Chemical class 0.000 description 4
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 4
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 4
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 4
- HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M sodium;chloride;hydrate Chemical class O.[Na+].[Cl-] HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 4
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 4
- 229940014800 succinic anhydride Drugs 0.000 description 4
- 125000004434 sulfur atom Chemical group 0.000 description 4
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 4
- 125000002023 trifluoromethyl group Chemical group FC(F)(F)* 0.000 description 4
- FTVLMFQEYACZNP-UHFFFAOYSA-N trimethylsilyl trifluoromethanesulfonate Chemical compound C[Si](C)(C)OS(=O)(=O)C(F)(F)F FTVLMFQEYACZNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 4
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 4
- 125000000027 (C1-C10) alkoxy group Chemical group 0.000 description 3
- SCYULBFZEHDVBN-UHFFFAOYSA-N 1,1-Dichloroethane Chemical compound CC(Cl)Cl SCYULBFZEHDVBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 1-Hydroxybenzotriazole Chemical compound C1=CC=C2N(O)N=NC2=C1 ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 3
- 102000000844 Cell Surface Receptors Human genes 0.000 description 3
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 description 3
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 3
- 108010001496 Galectin 2 Proteins 0.000 description 3
- 108010001517 Galectin 3 Proteins 0.000 description 3
- 108010001515 Galectin 4 Proteins 0.000 description 3
- 102100021735 Galectin-2 Human genes 0.000 description 3
- 102100039558 Galectin-3 Human genes 0.000 description 3
- 102100039556 Galectin-4 Human genes 0.000 description 3
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 3
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- FKNQFGJONOIPTF-UHFFFAOYSA-N Sodium cation Chemical group [Na+] FKNQFGJONOIPTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000010933 acylation Effects 0.000 description 3
- 238000005917 acylation reaction Methods 0.000 description 3
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 3
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 3
- 229910001413 alkali metal ion Inorganic materials 0.000 description 3
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 3
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 3
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N chloroacetic acid Chemical compound OC(=O)CCl FOCAUTSVDIKZOP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 3
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 3
- 125000004772 dichloromethyl group Chemical group [H]C(Cl)(Cl)* 0.000 description 3
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 3
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 3
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 3
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 3
- 238000000799 fluorescence microscopy Methods 0.000 description 3
- 125000005059 halophenyl group Chemical group 0.000 description 3
- UIZVMOZAXAMASY-UHFFFAOYSA-N hex-5-en-1-ol Chemical compound OCCCCC=C UIZVMOZAXAMASY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 3
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 3
- 238000001668 nucleic acid synthesis Methods 0.000 description 3
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 3
- 239000003223 protective agent Substances 0.000 description 3
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 3
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 3
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 3
- 230000001743 silencing effect Effects 0.000 description 3
- 229910001415 sodium ion Inorganic materials 0.000 description 3
- JQWHASGSAFIOCM-UHFFFAOYSA-M sodium periodate Chemical compound [Na+].[O-]I(=O)(=O)=O JQWHASGSAFIOCM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- 125000001544 thienyl group Chemical group 0.000 description 3
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N trichloroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(Cl)(Cl)Cl YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000003866 trichloromethyl group Chemical group ClC(Cl)(Cl)* 0.000 description 3
- GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N (±)-α-Tocopherol Chemical compound OC1=C(C)C(C)=C2OC(CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KWVJHCQQUFDPLU-YEUCEMRASA-N 2,3-bis[[(z)-octadec-9-enoyl]oxy]propyl-trimethylazanium Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC(C[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC KWVJHCQQUFDPLU-YEUCEMRASA-N 0.000 description 2
- 125000003903 2-propenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C([H])[H] 0.000 description 2
- KQIGMPWTAHJUMN-UHFFFAOYSA-N 3-aminopropane-1,2-diol Chemical compound NCC(O)CO KQIGMPWTAHJUMN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GXGKKIPUFAHZIZ-UHFFFAOYSA-N 5-benzylsulfanyl-2h-tetrazole Chemical compound C=1C=CC=CC=1CSC=1N=NNN=1 GXGKKIPUFAHZIZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010002091 Anaesthesia Diseases 0.000 description 2
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101150077194 CAP1 gene Proteins 0.000 description 2
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010034753 Complement Membrane Attack Complex Proteins 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 description 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 2
- IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N Dimethyl sulfoxide Chemical compound [2H]C([2H])([2H])S(=O)C([2H])([2H])[2H] IAZDPXIOMUYVGZ-WFGJKAKNSA-N 0.000 description 2
- GKQLYSROISKDLL-UHFFFAOYSA-N EEDQ Chemical compound C1=CC=C2N(C(=O)OCC)C(OCC)C=CC2=C1 GKQLYSROISKDLL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 239000005909 Kieselgur Substances 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 2
- BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-N Methylamine Chemical compound NC BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 2
- 101100170604 Mus musculus Dmap1 gene Proteins 0.000 description 2
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 2
- 229920002873 Polyethylenimine Polymers 0.000 description 2
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical group [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 2
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 2
- 229920003180 amino resin Polymers 0.000 description 2
- 230000037005 anaesthesia Effects 0.000 description 2
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 2
- 108010044715 asialofetuin Proteins 0.000 description 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical group [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 2
- 125000000499 benzofuranyl group Chemical group O1C(=CC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 2
- 125000004541 benzoxazolyl group Chemical group O1C(=NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 2
- 125000002619 bicyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- VPWAVWZPVGDNMN-UHFFFAOYSA-L calcium;2,3-dihydroxypropanoate Chemical compound [Ca+2].OCC(O)C([O-])=O.OCC(O)C([O-])=O VPWAVWZPVGDNMN-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 150000001719 carbohydrate derivatives Chemical class 0.000 description 2
- 150000001721 carbon Chemical group 0.000 description 2
- 239000011203 carbon fibre reinforced carbon Substances 0.000 description 2
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 2
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 2
- 150000001841 cholesterols Chemical class 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 2
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 2
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 238000005538 encapsulation Methods 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 238000013230 female C57BL/6J mice Methods 0.000 description 2
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 230000030279 gene silencing Effects 0.000 description 2
- 238000012226 gene silencing method Methods 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- VANNPISTIUFMLH-UHFFFAOYSA-N glutaric anhydride Chemical compound O=C1CCCC(=O)O1 VANNPISTIUFMLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 description 2
- 230000002440 hepatic effect Effects 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- GPRLSGONYQIRFK-UHFFFAOYSA-N hydron Chemical compound [H+] GPRLSGONYQIRFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IKGLACJFEHSFNN-UHFFFAOYSA-N hydron;triethylazanium;trifluoride Chemical compound F.F.F.CCN(CC)CC IKGLACJFEHSFNN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 2
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 2
- 239000008176 lyophilized powder Substances 0.000 description 2
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 2
- FYFFGSSZFBZTAH-UHFFFAOYSA-N methylaminomethanetriol Chemical compound CNC(O)(O)O FYFFGSSZFBZTAH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 239000002808 molecular sieve Substances 0.000 description 2
- 125000002950 monocyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 2
- 238000002663 nebulization Methods 0.000 description 2
- 210000000715 neuromuscular junction Anatomy 0.000 description 2
- 239000012299 nitrogen atmosphere Substances 0.000 description 2
- 238000001821 nucleic acid purification Methods 0.000 description 2
- 238000012634 optical imaging Methods 0.000 description 2
- 239000008055 phosphate buffer solution Substances 0.000 description 2
- RHDXSLLGPJSSGW-VEGRVEBRSA-N phosphoric acid;(2r,3r,4r)-2,3,4,5-tetrahydroxypentanal Chemical group OP(O)(O)=O.OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O RHDXSLLGPJSSGW-VEGRVEBRSA-N 0.000 description 2
- 229920000729 poly(L-lysine) polymer Polymers 0.000 description 2
- 229920000962 poly(amidoamine) Polymers 0.000 description 2
- 229920002246 poly[2-(dimethylamino)ethyl methacrylate] polymer Polymers 0.000 description 2
- 125000003367 polycyclic group Chemical group 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 230000001242 postsynaptic effect Effects 0.000 description 2
- SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M potassium acetate Chemical compound [K+].CC([O-])=O SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 2
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 2
- 125000004076 pyridyl group Chemical group 0.000 description 2
- 125000001453 quaternary ammonium group Chemical group 0.000 description 2
- 150000003254 radicals Chemical class 0.000 description 2
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 125000006413 ring segment Chemical group 0.000 description 2
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 2
- URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N sodium aluminosilicate Chemical compound [Na+].[Al+3].[O-][Si]([O-])=O.[O-][Si]([O-])=O URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JHJLBTNAGRQEKS-UHFFFAOYSA-M sodium bromide Chemical compound [Na+].[Br-] JHJLBTNAGRQEKS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 2
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 2
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 2
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 2
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 2
- 239000011593 sulfur Chemical group 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 239000006188 syrup Substances 0.000 description 2
- 235000020357 syrup Nutrition 0.000 description 2
- 238000007910 systemic administration Methods 0.000 description 2
- 230000001839 systemic circulation Effects 0.000 description 2
- AYEKOFBPNLCAJY-UHFFFAOYSA-O thiamine pyrophosphate Chemical compound CC1=C(CCOP(O)(=O)OP(O)(O)=O)SC=[N+]1CC1=CN=C(C)N=C1N AYEKOFBPNLCAJY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 2
- 125000003396 thiol group Chemical class [H]S* 0.000 description 2
- 125000004568 thiomorpholinyl group Chemical group 0.000 description 2
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K thiophosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=S RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 2
- 229910021642 ultra pure water Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 2
- 239000012498 ultrapure water Substances 0.000 description 2
- 239000008215 water for injection Substances 0.000 description 2
- 239000012224 working solution Substances 0.000 description 2
- 229920001285 xanthan gum Polymers 0.000 description 2
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YIMATHOGWXZHFX-WCTZXXKLSA-N (2r,3r,4r,5r)-5-(hydroxymethyl)-3-(2-methoxyethoxy)oxolane-2,4-diol Chemical compound COCCO[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@H]1O YIMATHOGWXZHFX-WCTZXXKLSA-N 0.000 description 1
- NAWXUBYGYWOOIX-SFHVURJKSA-N (2s)-2-[[4-[2-(2,4-diaminoquinazolin-6-yl)ethyl]benzoyl]amino]-4-methylidenepentanedioic acid Chemical compound C1=CC2=NC(N)=NC(N)=C2C=C1CCC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CC(=C)C(O)=O)C(O)=O)C=C1 NAWXUBYGYWOOIX-SFHVURJKSA-N 0.000 description 1
- CYNAPIVXKRLDER-LBPRGKRZSA-N (2s)-2-benzamido-3-(4-hydroxy-3-nitrophenyl)propanoic acid Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)C=1C=CC=CC=1)C1=CC=C(O)C([N+]([O-])=O)=C1 CYNAPIVXKRLDER-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 1
- UCTWMZQNUQWSLP-VIFPVBQESA-N (R)-adrenaline Chemical compound CNC[C@H](O)C1=CC=C(O)C(O)=C1 UCTWMZQNUQWSLP-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 229930182837 (R)-adrenaline Natural products 0.000 description 1
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- 125000005988 1,1-dioxo-thiomorpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005877 1,4-benzodioxanyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004973 1-butenyl group Chemical group C(=CCC)* 0.000 description 1
- 125000004972 1-butynyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C#C* 0.000 description 1
- 125000005987 1-oxo-thiomorpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- JPSKCQCQZUGWNM-UHFFFAOYSA-N 2,7-Oxepanedione Chemical compound O=C1CCCCC(=O)O1 JPSKCQCQZUGWNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004974 2-butenyl group Chemical group C(C=CC)* 0.000 description 1
- 125000004777 2-fluoroethyl group Chemical group [H]C([H])(F)C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000006088 2-oxoazepinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001494 2-propynyl group Chemical group [H]C#CC([H])([H])* 0.000 description 1
- NOIIUHRQUVNIDD-UHFFFAOYSA-N 3-[[oxo(pyridin-4-yl)methyl]hydrazo]-N-(phenylmethyl)propanamide Chemical compound C=1C=CC=CC=1CNC(=O)CCNNC(=O)C1=CC=NC=C1 NOIIUHRQUVNIDD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RKVHNYJPIXOHRW-UHFFFAOYSA-N 3-bis[di(propan-2-yl)amino]phosphanyloxypropanenitrile Chemical compound CC(C)N(C(C)C)P(N(C(C)C)C(C)C)OCCC#N RKVHNYJPIXOHRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000474 3-butynyl group Chemical group [H]C#CC([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000005986 4-piperidonyl group Chemical group 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 description 1
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 101150014715 CAP2 gene Proteins 0.000 description 1
- 229920001661 Chitosan Polymers 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283074 Equus asinus Species 0.000 description 1
- 241000283073 Equus caballus Species 0.000 description 1
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 1
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 1
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 1
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 1
- 102100021736 Galectin-1 Human genes 0.000 description 1
- 102400000321 Glucagon Human genes 0.000 description 1
- 108060003199 Glucagon Proteins 0.000 description 1
- NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N Guanosine Chemical class C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N 0.000 description 1
- 102000015779 HDL Lipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010010234 HDL Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 101100342821 Haemonchus contortus GAL-1 gene Proteins 0.000 description 1
- SQUHHTBVTRBESD-UHFFFAOYSA-N Hexa-Ac-myo-Inositol Natural products CC(=O)OC1C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C1OC(C)=O SQUHHTBVTRBESD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100440311 Homo sapiens C5 gene Proteins 0.000 description 1
- 101001066129 Homo sapiens Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 101000600434 Homo sapiens Putative uncharacterized protein encoded by MIR7-3HG Proteins 0.000 description 1
- PIWKPBJCKXDKJR-UHFFFAOYSA-N Isoflurane Chemical compound FC(F)OC(Cl)C(F)(F)F PIWKPBJCKXDKJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 1
- 102000007330 LDL Lipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010007622 LDL Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 241000282553 Macaca Species 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 101100245221 Mus musculus Prss8 gene Proteins 0.000 description 1
- 208000010428 Muscle Weakness Diseases 0.000 description 1
- 206010028372 Muscular weakness Diseases 0.000 description 1
- QOELQYIFQXVVAD-DBKUKYHUSA-N N-[(3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide hydrochloride Chemical compound Cl.C(C)(=O)N[C@H]1C(O)O[C@@H]([C@@H]([C@@H]1O)O)CO QOELQYIFQXVVAD-DBKUKYHUSA-N 0.000 description 1
- 101100438378 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) fac-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100326803 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) fac-2 gene Proteins 0.000 description 1
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 229920000604 Polyethylene Glycol 200 Polymers 0.000 description 1
- 229920002556 Polyethylene Glycol 300 Polymers 0.000 description 1
- 229920002565 Polyethylene Glycol 400 Polymers 0.000 description 1
- 102100037401 Putative uncharacterized protein encoded by MIR7-3HG Human genes 0.000 description 1
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 1
- 230000006819 RNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 1
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 241000282898 Sus scrofa Species 0.000 description 1
- 241000953555 Theama Species 0.000 description 1
- 102000004338 Transferrin Human genes 0.000 description 1
- 108090000901 Transferrin Proteins 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 description 1
- 229930003427 Vitamin E Natural products 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000001015 abdomen Anatomy 0.000 description 1
- OIPILFWXSMYKGL-UHFFFAOYSA-N acetylcholine Chemical compound CC(=O)OCC[N+](C)(C)C OIPILFWXSMYKGL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004373 acetylcholine Drugs 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 125000000641 acridinyl group Chemical group C1(=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3C=C12)* 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N alpha,alpha-trehalose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N 0.000 description 1
- HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N alpha-acetylene Natural products C#C HSFWRNGVRCDJHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004202 aminomethyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 150000008064 anhydrides Chemical class 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N arabinose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- CPQAYCKAPBVIEP-UHFFFAOYSA-N azane;n,n-diethylethanamine Chemical compound N.CCN(CC)CC CPQAYCKAPBVIEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KXWUTVZLENTDDB-UHFFFAOYSA-N azane;n-ethyl-n-propan-2-ylpropan-2-amine Chemical compound N.CCN(C(C)C)C(C)C KXWUTVZLENTDDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002785 azepinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 125000003785 benzimidazolyl group Chemical group N1=C(NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000005605 benzo group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005875 benzo[b][1,4]dioxepinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005876 benzo[b][1,4]oxazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005873 benzo[d]thiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002047 benzodioxolyl group Chemical group O1OC(C2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000005878 benzonaphthofuranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004619 benzopyranyl group Chemical group O1C(C=CC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000005874 benzothiadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004196 benzothienyl group Chemical group S1C(=CC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000003354 benzotriazolyl group Chemical group N1N=NC2=C1C=CC=C2* 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- 239000003613 bile acid Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 239000000337 buffer salt Substances 0.000 description 1
- 125000005510 but-1-en-2-yl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005514 but-1-yn-3-yl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004369 butenyl group Chemical group C(=CCC)* 0.000 description 1
- 125000000480 butynyl group Chemical group [*]C#CC([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 1
- 238000010805 cDNA synthesis kit Methods 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 125000000609 carbazolyl group Chemical group C1(=CC=CC=2C3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- 239000002041 carbon nanotube Substances 0.000 description 1
- 229910021393 carbon nanotube Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 1
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000001734 carboxylic acid salts Chemical class 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 125000000259 cinnolinyl group Chemical group N1=NC(=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Natural products OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 239000007859 condensation product Substances 0.000 description 1
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 125000005507 decahydroisoquinolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000412 dendrimer Substances 0.000 description 1
- 229920000736 dendritic polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000005595 deprotonation Effects 0.000 description 1
- 238000010537 deprotonation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 125000004988 dibenzothienyl group Chemical group C1(=CC=CC=2SC3=C(C21)C=CC=C3)* 0.000 description 1
- FFYPMLJYZAEMQB-UHFFFAOYSA-N diethyl pyrocarbonate Chemical compound CCOC(=O)OC(=O)OCC FFYPMLJYZAEMQB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 238000002224 dissection Methods 0.000 description 1
- 230000012202 endocytosis Effects 0.000 description 1
- 210000001163 endosome Anatomy 0.000 description 1
- 229960005139 epinephrine Drugs 0.000 description 1
- 125000002534 ethynyl group Chemical group [H]C#C* 0.000 description 1
- 125000003983 fluorenyl group Chemical group C1(=CC=CC=2C3=CC=CC=C3CC12)* 0.000 description 1
- 238000001917 fluorescence detection Methods 0.000 description 1
- 239000006260 foam Substances 0.000 description 1
- 229940014144 folate Drugs 0.000 description 1
- OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N folic acid Chemical compound C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 1
- 235000019152 folic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011724 folic acid Substances 0.000 description 1
- 229960002737 fructose Drugs 0.000 description 1
- 125000003844 furanonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002541 furyl group Chemical group 0.000 description 1
- WIGCFUFOHFEKBI-UHFFFAOYSA-N gamma-tocopherol Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCC1CCC2C(C)C(O)C(C)C(C)C2O1 WIGCFUFOHFEKBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MASNOZXLGMXCHN-ZLPAWPGGSA-N glucagon Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)C(C)C)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC=1NC=NC=1)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)C1=CC=CC=C1 MASNOZXLGMXCHN-ZLPAWPGGSA-N 0.000 description 1
- 229960004666 glucagon Drugs 0.000 description 1
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 210000002216 heart Anatomy 0.000 description 1
- 150000002391 heterocyclic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000012510 hollow fiber Substances 0.000 description 1
- 102000047486 human GAPDH Human genes 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 150000002431 hydrogen Chemical class 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- UTCSSFWDNNEEBH-UHFFFAOYSA-N imidazo[1,2-a]pyridine Chemical compound C1=CC=CC2=NC=CN21 UTCSSFWDNNEEBH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002632 imidazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002636 imidazolinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002883 imidazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000036737 immune function Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 description 1
- 238000011503 in vivo imaging Methods 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 125000003453 indazolyl group Chemical group N1N=C(C2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000003387 indolinyl group Chemical group N1(CCC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000003406 indolizinyl group Chemical group C=1(C=CN2C=CC=CC12)* 0.000 description 1
- 125000001041 indolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 150000007529 inorganic bases Chemical class 0.000 description 1
- CDAISMWEOUEBRE-GPIVLXJGSA-N inositol Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O CDAISMWEOUEBRE-GPIVLXJGSA-N 0.000 description 1
- 229960000367 inositol Drugs 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000010255 intramuscular injection Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N iodine Chemical compound II PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000959 isobutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 229960002725 isoflurane Drugs 0.000 description 1
- 125000004594 isoindolinyl group Chemical group C1(NCC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000000904 isoindolyl group Chemical group C=1(NC=C2C=CC=CC12)* 0.000 description 1
- 125000000555 isopropenyl group Chemical group [H]\C([H])=C(\*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000005956 isoquinolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004628 isothiazolidinyl group Chemical group S1N(CCC1)* 0.000 description 1
- 125000001786 isothiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003965 isoxazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000842 isoxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 231100000636 lethal dose Toxicity 0.000 description 1
- 150000002634 lipophilic molecules Chemical class 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- 210000003712 lysosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000001868 lysosomic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002122 magnetic nanoparticle Substances 0.000 description 1
- 238000013227 male C57BL/6J mice Methods 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- JCFQSYXHEYSBQT-UHFFFAOYSA-N methylaminomethanediol Chemical compound CNC(O)O JCFQSYXHEYSBQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IZXGZAJMDLJLMF-UHFFFAOYSA-N methylaminomethanol Chemical compound CNCO IZXGZAJMDLJLMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 238000013365 molecular weight analysis method Methods 0.000 description 1
- 150000002771 monosaccharide derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 125000002757 morpholinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004108 n-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000001624 naphthyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004593 naphthyridinyl group Chemical group N1=C(C=CC2=CC=CN=C12)* 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 239000002858 neurotransmitter agent Substances 0.000 description 1
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005060 octahydroindolyl group Chemical group N1(CCC2CCCCC12)* 0.000 description 1
- 125000005061 octahydroisoindolyl group Chemical group C1(NCC2CCCCC12)* 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 1
- 125000001715 oxadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000160 oxazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002971 oxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000466 oxiranyl group Chemical group 0.000 description 1
- ZJHUBLNWMCWUOV-UHFFFAOYSA-N oxocane-2,8-dione Chemical compound O=C1CCCCCC(=O)O1 ZJHUBLNWMCWUOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012856 packing Methods 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000000149 penetrating effect Effects 0.000 description 1
- 125000006340 pentafluoro ethyl group Chemical group FC(F)(F)C(F)(F)* 0.000 description 1
- 125000001791 phenazinyl group Chemical group C1(=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3N=C12)* 0.000 description 1
- 125000001484 phenothiazinyl group Chemical group C1(=CC=CC=2SC3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- 125000001644 phenoxazinyl group Chemical group C1(=CC=CC=2OC3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- WVDDGKGOMKODPV-ZQBYOMGUSA-N phenyl(114C)methanol Chemical compound O[14CH2]C1=CC=CC=C1 WVDDGKGOMKODPV-ZQBYOMGUSA-N 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 125000004592 phthalazinyl group Chemical group C1(=NN=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000004193 piperazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003386 piperidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229920000768 polyamine Polymers 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 230000008092 positive effect Effects 0.000 description 1
- 235000011056 potassium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001103 potassium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011164 potassium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 244000144977 poultry Species 0.000 description 1
- 238000012257 pre-denaturation Methods 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 230000000770 proinflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 125000006238 prop-1-en-1-yl group Chemical group [H]\C(*)=C(/[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N propan-1-ol Chemical compound CCCO BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004368 propenyl group Chemical group C(=CC)* 0.000 description 1
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 235000013772 propylene glycol Nutrition 0.000 description 1
- 125000002568 propynyl group Chemical group [*]C#CC([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 125000001042 pteridinyl group Chemical group N1=C(N=CC2=NC=CN=C12)* 0.000 description 1
- 125000000561 purinyl group Chemical group N1=C(N=C2N=CNC2=C1)* 0.000 description 1
- 125000003373 pyrazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003072 pyrazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003226 pyrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002098 pyridazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000714 pyrimidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000719 pyrrolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000168 pyrrolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000012797 qualification Methods 0.000 description 1
- 239000002096 quantum dot Substances 0.000 description 1
- 125000002294 quinazolinyl group Chemical group N1=C(N=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000002943 quinolinyl group Chemical group N1=C(C=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000001567 quinoxalinyl group Chemical group N1=C(C=NC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000004621 quinuclidinyl group Chemical group N12C(CC(CC1)CC2)* 0.000 description 1
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 1
- 238000009877 rendering Methods 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 229910052701 rubidium Inorganic materials 0.000 description 1
- YBCAZPLXEGKKFM-UHFFFAOYSA-K ruthenium(iii) chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Cl-].[Ru+3] YBCAZPLXEGKKFM-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- CDAISMWEOUEBRE-UHFFFAOYSA-N scyllo-inosotol Natural products OC1C(O)C(O)C(O)C(O)C1O CDAISMWEOUEBRE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002914 sec-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 1
- 239000010703 silicon Substances 0.000 description 1
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 1
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 1
- 125000000547 substituted alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000003718 tetrahydrofuranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001412 tetrahydropyranyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000147 tetrahydroquinolinyl group Chemical group N1(CCCC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000003831 tetrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 125000001113 thiadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001984 thiazolidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000335 thiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 239000012096 transfection reagent Substances 0.000 description 1
- 239000012581 transferrin Substances 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 125000004306 triazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001425 triazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 150000004043 trisaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 125000005455 trithianyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000003828 vacuum filtration Methods 0.000 description 1
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 description 1
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 1
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 1
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 1
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 1
- 229940046009 vitamin E Drugs 0.000 description 1
- 235000019165 vitamin E Nutrition 0.000 description 1
- 239000011709 vitamin E Substances 0.000 description 1
- 239000003643 water by type Substances 0.000 description 1
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 1
- 238000005303 weighing Methods 0.000 description 1
Abstract
Description
ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИTECHNICAL FIELD
Настоящее изобретение относится к нуклеиновой кислоте, фармацевтической композиции и конъюгату миРНК, способным ингибировать экспрессию гена белка комплемента 5 (C5). Настоящее изобретение также относится к способу получения и применению указанных конъюгата нуклеиновой кислоты, фармацевтической композиции и конъюгата миРНК.The present invention relates to a nucleic acid, pharmaceutical composition and siRNA conjugate capable of inhibiting the expression of the complement protein 5 (C5) gene. The present invention also relates to a method for preparing and using said nucleic acid conjugate, pharmaceutical composition and siRNA conjugate.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИBACKGROUND OF THE ART
Миастения гравис (МГ) - это приобретенное аутоиммунное заболевание, главным образом опосредованное антителом к ацетилхолиновому рецептору (AchR-Ab), зависимостью от клеточного иммунитета и вовлечением комплементов, и связанное с ацетилхолиновым рецептором (AChR) на постсинаптической мембране нервно-мышечного синапса.Myasthenia gravis (MG) is an acquired autoimmune disease primarily mediated by acetylcholine receptor antibody (AchR-Ab), cellular immune dependence and complement involvement, and associated with the acetylcholine receptor (AChR) on the postsynaptic membrane of the neuromuscular junction.
Белок комплемента (C5) является одной из ключевых мишеней для лечения миастении гравис. При участии комплементов AchR-Ab объединяется с AchR, что приводит к разрушению большого количества AchR посредством комплемент-опосредованного лизиса клеточной мембраны, что приводит к мышечной слабости из-за нарушения передачи сигнала ацетилхолином в постсинаптической мембране. Исследования показали, что путем специфичного связывания лекарственных средств с белком комплемента C5 можно предотвратить расщепление C5 на C5a и C5b, предотвращая таким образом образование мембраноатакующего комплекса, блокируя повреждение нервно-мышечного синапса мембраноатакующим комплексом и последующее продуцирование провоспалительных факторов, тем самым обеспечивая иммуносупрессивный эффект и лечение миастении гравис.Complement protein (C5) is one of the key targets for the treatment of myasthenia gravis. With the participation of complements, AChR-Ab combines with AChR, which leads to the destruction of large numbers of AChR through complement-mediated lysis of the cell membrane, resulting in muscle weakness due to disruption of acetylcholine signaling in the postsynaptic membrane. Research has shown that by specifically binding drugs to the complement protein C5, it is possible to prevent the cleavage of C5 into C5a and C5b, thereby preventing the formation of the membrane attack complex, blocking the damage to the neuromuscular junction by the membrane attack complex and the subsequent production of pro-inflammatory factors, thereby providing an immunosuppressive effect and treatment myasthenia gravis.
Малая интерферирующая РНК (миРНК), основанная на механизме РНК-интерференции (РНКи), может ингибировать или блокировать экспрессию представляющих интерес генов-мишеней сиквенс-специфичным образом, обеспечивая тем самым достижение цели лечения заболеваний. Если удастся обеспечить ингибирование экспрессии C5 для блокирования продукции белков комплемента, поддержания нормальных иммунных функций и ингибирования патологического иммунного ответа на уровне мРНК, это, несомненно, будет представляться самым совершенным вариантом лечения.Small interfering RNA (siRNA), based on the RNA interference (RNAi) mechanism, can inhibit or block the expression of target genes of interest in a sequence-specific manner, thereby achieving the goal of treating diseases. If inhibition of C5 expression can be achieved to block the production of complement proteins, maintain normal immune functions and inhibit the pathological immune response at the mRNA level, this would undoubtedly represent the most advanced treatment option.
Ключом к разработке лекарственных средств на основе миРНК для ингибирования экспрессии гена C5 и лечения миастении гравис является поиск подходящей миРНК и ее модифицирование, а также эффективная система ее доставки.The key to developing siRNA-based drugs to inhibit C5 gene expression and treat myasthenia gravis is to find a suitable siRNA and modify it, as well as an effective delivery system.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯBRIEF DESCRIPTION OF THE INVENTION
Авторы настоящего изобретения неожиданно обнаружили, что конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению может специфично ингибировать экспрессию гена C5, специфично нацеливаться на печень, ингибировать экспрессию гена C5 в печени и осуществлять лечение или предупреждение миастении гравис. Кроме того, авторы изобретения также разработали обладающую высокой активностью миРНК и фармацевтическую композицию.The present inventors have unexpectedly discovered that the siRNA conjugate of the present invention can specifically inhibit the expression of the C5 gene, specifically target the liver, inhibit the expression of the C5 gene in the liver, and treat or prevent myasthenia gravis. In addition, the inventors have also developed a highly active siRNA and pharmaceutical composition.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предложен конъюгат миРНК, имеющий структуру, представленную Формулой (308):In some embodiments, the present invention provides an siRNA conjugate having the structure represented by Formula (308):
Формула (308),Formula (308),
где: n1 представляет собой целое число от 1 до 3, а n3 представляет собой целое число от 0 до 4; каждый из m1, m2 и m3 независимо представляет собой целое число от 2 до 10; каждый из R10, R11, R12, R13, R14 или R15 независимо представляет собой H или выбран из группы, состоящей из C1-C10 алкила, C1-C10 галогеналкила и C1-C10 алкокси;where: n1 is an integer from 1 to 3, and n3 is an integer from 0 to 4; each of m1, m2 and m3 independently represents an integer from 2 to 10; each of R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 or R 15 independently represents H or is selected from the group consisting of C 1 -C 10 alkyl, C 1 -C 10 haloalkyl and C 1 -C 10 alkoxy ;
R3 представляет собой группу, имеющую структуру, представленную Формулой A59:R 3 is a group having the structure represented by Formula A59:
(A59), (A59),
где E1 представляет собой OH, SH или BH2; иwhere E 1 represents OH, SH or BH 2 ; And
Nu представляет собой миРНК; указанная миРНК содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, каждый нуклеотид в указанной миРНК независимо представляет собой модифицированный или немодифицированный нуклеотид, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность I, а антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность II; нуклеотидная последовательность I и нуклеотидная последовательность II по меньшей мере частично обратно комплементарны, образуя двухцепочечную область; и нуклеотидная последовательность I и нуклеотидная последовательность II выбраны из группы последовательностей согласно следующим i) - vi):Nu is an siRNA; the specified siRNA contains a sense strand and an antisense strand, each nucleotide in the specified siRNA independently represents a modified or unmodified nucleotide, where the sense strand contains a nucleotide sequence I, and the antisense strand contains a nucleotide sequence II; nucleotide sequence I and nucleotide sequence II are at least partially reverse complementary, forming a double-stranded region; and nucleotide sequence I and nucleotide sequence II are selected from the group of sequences according to the following i) to vi):
i) нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 1, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 2, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:i) nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 1, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II has the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 2 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-CUUCAUUCAUACAGACAAZ1-3’ (SEQ ID NO: 1);5'-CUUCAUUCAUCAGACAAZ 1 -3' (SEQ ID NO: 1);
5’-Z2UUGUCUGUAUGAAUGAAG-3’ (SEQ ID NO: 2),5'-Z 2 UUGUCUGUAUGAAUGAAG-3' (SEQ ID NO: 2),
где Z1 представляет собой A, Z2 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z3 в сайте, соответствующем Z1, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z4 в сайте, соответствующем Z2, и Z4 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи;where Z 1 is A, Z 2 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 3 at the site corresponding to Z 1 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 4 at the site corresponding to Z 2 , and Z 4 is the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand;
ii) нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 61, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 62, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:ii) nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 61, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II is the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 62 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-CUACAGUUUAGAAGAUUUZ5-3’ (SEQ ID NO: 61);5'-CUACAGUUUAGAAGAUUUZ 5 -3' (SEQ ID NO: 61);
5’-Z6AAAUCUUCUAAACUGUAG-3’ (SEQ ID NO: 62),5'-Z 6 AAAUCUUCUAAACUGUAG-3' (SEQ ID NO: 62),
где Z5 представляет собой A, Z6 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z7 в сайте, соответствующем Z5, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z8 в сайте, соответствующем Z6, и Z8 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи;where Z 5 is A, Z 6 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 7 at the site corresponding to Z 5 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 8 at the site corresponding to Z 6 , and Z 8 represents the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand;
iii) нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 121, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 122, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:iii) nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 121, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II has the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 122 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-GGAAGGUUACCGAGCAAUZ9-3’ (SEQ ID NO: 121);5'-GGAAGGUUACCGAGCAAUZ 9 -3' (SEQ ID NO: 121);
5’-Z10AUUGCUCGGUAACCUUCC-3’ (SEQ ID NO: 122),5'-Z 10 AUUGCUCGGUAACCUUCC-3' (SEQ ID NO: 122),
где Z9 представляет собой A, Z10 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z11 в сайте, соответствующем Z9, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z12 в сайте, соответствующем Z10, и Z12 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи;where Z 9 is A, Z 10 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 11 at the site corresponding to Z 9 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 12 at the site corresponding to Z 10 , and Z 12 represents the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand;
iv) нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 181, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 182, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:iv) nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 181, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II has the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 182 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-AGAACAGACAGCAGAAUUZ13-3’ (SEQ ID NO: 181);5'-AGAACAGACAGCAGAUUZ 13 -3' (SEQ ID NO: 181);
5’-Z14AAUUCUGCUGUCUGUUCU-3’ (SEQ ID NO: 182),5'-Z 14 AAUUCUGCUGUCUGUUCU-3' (SEQ ID NO: 182),
где Z13 представляет собой A, Z14 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z15 в сайте, соответствующем Z13, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z16 в сайте, соответствующем Z14, и Z16 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи;where Z 13 is A, Z 14 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 15 at the site corresponding to Z 13 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 16 at the site corresponding to Z 14 , and Z 16 represents the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand;
v) нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 241, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 242, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:v) nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 241, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II has the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 242 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-CCAAGAAGAACGCUGCAAZ17-3’ (SEQ ID NO: 241);5'-CCAAGAAGAACGCUGCAAZ 17 -3' (SEQ ID NO: 241);
5’-Z18UUGCAGCGUUCUUCUUGG-3’ (SEQ ID NO: 242),5'-Z 18 UUGCAGCGUUCUUCUUGG-3' (SEQ ID NO: 242),
где Z17 представляет собой A, Z18 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z19 в сайте, соответствующем Z17, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z20 в сайте, соответствующем Z18, и Z20 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; иwhere Z 17 is A, Z 18 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 19 at the site corresponding to Z 17 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 20 at the site corresponding to Z 18 , and Z 20 represents the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand; And
vi) нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 301, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 302, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:vi) nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 301, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II has the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 302 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-CCAGUAAGCAAGCCAGAAZ21-3’ (SEQ ID NO: 301);5'-CCAGUAAGCAAGCCAGAAZ 21 -3' (SEQ ID NO: 301);
5’-Z22UUCUGGCUUGCUUACUGG-3’ (SEQ ID NO: 302),5'-Z 22 UUCUGGCUUGCUUACUGG-3' (SEQ ID NO: 302),
где Z21 представляет собой A, Z22 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z23 в сайте, соответствующем Z21, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z24 в сайте, соответствующем Z22, и Z24 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи;where Z 21 is A, Z 22 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 23 at the site corresponding to Z 21 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 24 at the site corresponding to Z 22 , and Z 24 is the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand;
R2 представляет собой линейный алкилен длиной от 1 до 20 атомов углерода, где один или более атомов углерода необязательно замещены любым одним или более из группы, состоящей из: C(O), NH, O, S, CH=N, S(O)2, C2-C10 алкенилена, C2-C10 алкинилена, C6-C10 арилена, C3-C18 гетероциклилена и C5-C10 гетероарилена, и где R2 необязательно замещен любым одним или более из группы, состоящей из: C1-C10 алкила, C6-C10 арила, C5-C10 гетероарила, C1-C10 галогеналкила, -OC1-C10 алкила, -OC1-C10 алкилфенила, -C1-C10 алкил-OH, -OC1-C10 галогеналкила, -SC1-C10 алкила, -SC1-C10 алкилфенила, -C1-C10 алкил-SH, -SC1-C10 галогеналкила, галогенового заместителя, -OH, -SH, -NH2, -C1-C10 алкил-NH2, -N(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкила), -NH(C1-C10 алкила), -N(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкилфенила), -NH(C1-C10 алкилфенила), циано, нитро, -CO2H, -C(O)O(C1-C10 алкила), -CON(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкила), -CONH(C1-C10 алкила), -CONH2, -NHC(O)(C1-C10 алкила), -NHC(O)(фенила), -N(C1-C10 алкил)C(O)(C1-C10 алкила), -N(C1-C10 алкил)C(O)(фенила), -C(O)C1-C10 алкила, -C(O)C1-C10 алкилфенила, -C(O)C1-C10 галогеналкила, -OC(O)C1-C10 алкила, -SO2(C1-C10 алкила), -SO2(фенила), -SO2(C1-C10 галогеналкила), -SO2NH2, -SO2NH(C1-C10 алкила), -SO2NH(фенила), -NHSO2(C1-C10 алкила), -NHSO2(фенила) и -NHSO2(C1-C10 галогеналкила);R 2 is a linear alkylene of 1 to 20 carbon atoms in length, where one or more carbon atoms are optionally substituted by any one or more of the group consisting of: C(O), NH, O, S, CH=N, S(O ) 2 , C 2 -C 10 alkenylene, C 2 -C 10 alkynylene, C 6 -C 10 arylene, C 3 -C 18 heterocyclylene and C 5 -C 10 heteroarylene, and where R 2 is optionally substituted by any one or more of the group , consisting of: C 1 -C 10 alkyl, C 6 -C 10 aryl, C 5 -C 10 heteroaryl, C 1 -C 10 haloalkyl, -OC 1 -C 10 alkyl, -OC 1 -C 10 alkylphenyl, -C 1 -C 10 alkyl-OH, -OC 1 -C 10 haloalkyl, -SC 1 -C 10 alkyl, -SC 1 -C 10 alkylphenyl, -C 1 -C 10 alkyl-SH, -SC 1 -C 10 haloalkyl, halogen substituent, -OH, -SH, -NH 2 , -C 1 -C 10 alkyl-NH 2 , -N(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 -C 10 alkyl), -NH(C 1 -C 10 alkyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 -C 10 alkylphenyl), -NH(C 1 -C 10 alkylphenyl), cyano, nitro, -CO 2 H, -C(O)O( C 1 -C 10 alkyl), -CON(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 -C 10 alkyl), -CONH(C 1 -C 10 alkyl), -CONH 2 , -NHC(O)(C 1 -C 10 alkyl), -NHC(O)(phenyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)C(O)(C 1 -C 10 alkyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)C( O)(phenyl), -C(O)C 1 -C 10 alkyl, -C(O)C 1 -C 10 alkylphenyl, -C(O)C 1 -C 10 haloalkyl, -OC(O)C 1 - C 10 alkyl, -SO 2 (C 1 -C 10 alkyl), -SO 2 (phenyl), -SO 2 (C 1 -C 10 haloalkyl), -SO 2 NH 2 , -SO 2 NH (C 1 -C 10 alkyl), -SO 2 NH(phenyl), -NHSO 2 (C 1 -C 10 alkyl), -NHSO 2 (phenyl) and -NHSO 2 (C 1 -C 10 haloalkyl);
каждый L1 независимо представляет собой линейный алкилен длиной от 1 до 70 атомов углерода, где один или более атомов углерода необязательно замещены любым одним или более из группы, состоящей из: C(O), NH, O, S, CH=N, S(O)2, C2-C10 алкенилена, C2-C10 алкинилена, C6-C10 арилена, C3-C18 гетероциклилена и C5-C10 гетероарилена; и где L1 необязательно замещен любым одним или более из группы, состоящей из: C1-C10 алкила, C6-C10 арила, C5-C10 гетероарила, C1-C10 галогеналкила, -OC1-C10 алкила, -OC1-C10 алкилфенила, -C1-C10 алкил-OH, -OC1-C10 галогеналкила, -SC1-C10 алкила, -SC1-C10 алкилфенила, -C1-C10 алкил-SH, -SC1-C10 галогеналкила, галогенового заместителя, -OH, -SH, -NH2, -C1-C10 алкил-NH2, -N(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкила), -NH(C1-C10 алкила), -N(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкилфенила), -NH(C1-C10 алкилфенила), циано, нитро, -CO2H, -C(O)O(C1-C10 алкила), -CON(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкила), -CONH(C1-C10 алкила), -CONH2, -NHC(O)(C1-C10 алкила), -NHC(O)(фенила), -N(C1-C10 алкил)C(O)(C1-C10 алкила), -N(C1-C10 алкил)C(O)(фенила), -C(O)C1-C10 алкила, -C(O)C1-C10 алкилфенила, -C(O)C1-C10 галогеналкила, -OC(O)C1-C10 алкила, -SO2(C1-C10 алкила), -SO2(фенила), -SO2(C1-C10 галогеналкила), -SO2NH2, -SO2NH(C1-C10 алкила), -SO2NH(фенила), -NHSO2(C1-C10 алкила), -NHSO2(фенила) и -NHSO2(C1-C10 галогеналкила); иeach L 1 is independently a linear alkylene of 1 to 70 carbon atoms in length, wherein one or more carbon atoms are optionally substituted by any one or more of the group consisting of: C(O), NH, O, S, CH=N, S (O) 2 , C 2 -C 10 alkenylene, C 2 -C 10 alkynylene, C 6 -C 10 arylene, C 3 -C 18 heterocyclylene and C 5 -C 10 heteroarylene; and wherein L 1 is optionally substituted by any one or more of the group consisting of: C 1 -C 10 alkyl, C 6 -C 10 aryl, C 5 -C 10 heteroaryl, C 1 -C 10 haloalkyl, -OC 1 -C 10 alkyl, -OC 1 -C 10 alkylphenyl, -C 1 -C 10 alkyl-OH, -OC 1 -C 10 haloalkyl, -SC 1 -C 10 alkyl, -SC 1 -C 10 alkylphenyl, -C 1 -C 10 alkyl-SH, -SC 1 -C 10 haloalkyl, halogen substituent, -OH, -SH, -NH 2 , -C 1 -C 10 alkyl-NH 2 , -N(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 - C 10 alkyl), -NH(C 1 -C 10 alkyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 -C 10 alkylphenyl), -NH(C 1 -C 10 alkylphenyl), cyano, nitro, -CO 2 H, -C(O)O(C 1 -C 10 alkyl), -CON(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 -C 10 alkyl), -CONH(C 1 -C 10 alkyl), -CONH 2 , -NHC(O)(C 1 -C 10 alkyl), -NHC(O)(phenyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)C(O)(C 1 -C 10 alkyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)C(O)(phenyl), -C(O)C 1 -C 10 alkyl, -C(O)C 1 -C 10 alkylphenyl, -C(O)C 1 - C 10 haloalkyl, -OC(O)C 1 -C 10 alkyl, -SO 2 (C 1 -C 10 alkyl), -SO 2 (phenyl), -SO 2 (C 1 -C 10 haloalkyl), -SO 2 NH 2 , -SO 2 NH (C 1 -C 10 alkyl), -SO 2 NH (phenyl), -NHSO 2 (C 1 -C 10 alkyl), -NHSO 2 (phenyl) and -NHSO 2 (C 1 - C 10 haloalkyl); And
обозначает сайт ковалентного присоединения группы; и M1 представляет собой нацеливающую группу. denotes the site of covalent attachment of a group; and M 1 represents a targeting group.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предложена миРНК, способная ингибировать экспрессию гена C5, где указанная миРНК содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, и каждый нуклеотид в смысловой цепи и антисмысловой цепи независимо представляет собой модифицированный фтором нуклеотид или нуклеотид с отличной от фтора модификацией; смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность I, антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность II, нуклеотидная последовательность I и нуклеотидная последовательность II по меньшей мере частично обратно комплементарны, образуя двухцепочечную область, модифицированные фтором нуклеотиды расположены в нуклеотидной последовательности I и нуклеотидной последовательности II, и, в направлении от 5’-конца к 3’-концу, нуклеотиды в положениях 7, 8 и 9 нуклеотидной последовательности I в смысловой цепи представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в смысловой цепи представляют собой нуклеотиды с отличной от фтора модификацией; в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 2, 6, 14 и 16 нуклеотидной последовательности II в антисмысловой цепи представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в антисмысловой цепи представляют собой нуклеотиды с отличной от фтора модификацией, и нуклеотидная последовательность I и нуклеотидная последовательность II выбраны из одной из вышеперечисленных i) - vi).In some embodiments, the present invention provides an siRNA capable of inhibiting the expression of a C5 gene, wherein the siRNA comprises a sense strand and an antisense strand, and each nucleotide in the sense strand and antisense strand is independently a fluorine-modified nucleotide or a nucleotide with a non-fluorine modification; the sense strand contains nucleotide sequence I, the antisense strand contains nucleotide sequence II, nucleotide sequence I and nucleotide sequence II are at least partially reverse complementary, forming a double-stranded region, fluorine-modified nucleotides are located in nucleotide sequence I and nucleotide sequence II, and, in the direction from 5'-end to 3'-end, nucleotides at positions 7, 8 and 9 of nucleotide sequence I in the sense strand are fluorine-modified nucleotides, and nucleotides at the remaining positions in the sense strand are non-fluorine-modified nucleotides; in a 5' to 3' direction, nucleotides at positions 2, 6, 14, and 16 of nucleotide sequence II in the antisense strand are fluorine-modified nucleotides, and nucleotides at the remaining positions in the antisense strand are non-fluorine-modified nucleotides , and the nucleotide sequence I and the nucleotide sequence II are selected from one of the above i) to vi).
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предложена фармацевтическая композиция, содержащая вышеупомянутую миРНК согласно настоящему изобретению и фармацевтически приемлемый носитель.In some embodiments, the present invention provides a pharmaceutical composition comprising the aforementioned siRNA of the present invention and a pharmaceutically acceptable carrier.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предложен конъюгат миРНК, содержащий вышеупомянутую миРНК согласно настоящему изобретению и конъюгирующую группу, связанную путем конъюгации с указанной миРНК.In some embodiments, the present invention provides an siRNA conjugate comprising the aforementioned siRNA of the present invention and a conjugating group linked by conjugation to said siRNA.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предложено применение миРНК, и/или фармацевтической композиции, и/или конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению для производства лекарственного средства для лечения и/или предупреждения миастении гравис.Some embodiments of the present invention provide the use of an siRNA and/or a pharmaceutical composition and/or a siRNA conjugate of the present invention for the production of a medicament for the treatment and/or prevention of myasthenia gravis.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предложен способ лечения и/или предупреждения миастении гравис, включающий введение эффективного количества миРНК, и/или фармацевтической композиции, и/или конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению субъекту, страдающему от миастении гравис.In some embodiments, the present invention provides a method of treating and/or preventing myasthenia gravis, comprising administering an effective amount of siRNA and/or a pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate of the present invention to a subject suffering from myasthenia gravis.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предложен способ ингибирования экспрессии гена C5 в гепатоците, включающий приведение эффективного количества миРНК, и/или фармацевтической композиции, и/или конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению в контакт с указанным гепатоцитом.In some embodiments, the present invention provides a method of inhibiting C5 gene expression in a hepatocyte, comprising bringing an effective amount of siRNA and/or a pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate of the present invention into contact with said hepatocyte.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предложен набор, содержащий миРНК, и/или фармацевтическую композицию, и/или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению.In some embodiments, the present invention provides a kit containing siRNA and/or a pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate according to the present invention.
Положительные эффектыPositive effects
В некоторых вариантах осуществления миРНК, фармацевтическая композиция и конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению имеют лучшую стабильность, более высокую ингибирующую активность в отношении мРНК C5 и более низкое нецелевое действие, и/или могут в значительной степени лечить или облегчать симптомы миастении гравис.In some embodiments, the siRNA, pharmaceutical composition and siRNA conjugate of the present invention have better stability, higher C5 mRNA inhibitory activity and lower off-target effects, and/or can significantly treat or alleviate the symptoms of myasthenia gravis.
В некоторых вариантах осуществления миРНК, фармацевтическая композиция или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению проявляют превосходную ингибирующую активность в отношении мРНК-мишени в экспериментах на клетках in vitro. В некоторых вариантах осуществления миРНК, фармацевтическая композиция или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению проявляют процент ингибирования мРНК-мишени в гепатоците, равный по меньшей мере 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95%.In some embodiments, the siRNA, pharmaceutical composition, or siRNA conjugate of the present invention exhibits superior inhibitory activity against target mRNA in in vitro cell experiments. In some embodiments, the siRNA, pharmaceutical composition, or siRNA conjugate of the present invention exhibits a percentage of inhibition of the target mRNA in a hepatocyte of at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% or 95%.
В некоторых вариантах осуществления миРНК согласно настоящему изобретению проявляет более высокую ингибирующую активность в клетках HepG2, и IC50 в отношении мРНК C5 составляет от 1,494 нМ до 9,688 нМ. В некоторых вариантах осуществления конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению с флуоресцентной меткой подкожно инъецируют мышам C57 для проведения флуоресцентной визуализации в режиме реального времени на мышах и наблюдения за распределением флуоресценции по органам. Через 48 часов мышей умерщвляют для диссекции органов, и обнаруживается, что почти все конъюгаты миРНК скопились в печени, что указывает на то, что конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению может эффективно и специфично доставлять миРНК в печень, что указывает на то, что конъюгат может специфично ингибировать экспрессию мРНК-мишени в печени.In some embodiments, the siRNA of the present invention exhibits greater inhibitory activity in HepG2 cells, and the IC 50 for C5 mRNA ranges from 1.494 nM to 9.688 nM. In some embodiments, a fluorescently tagged siRNA conjugate of the present invention is injected subcutaneously into C57 mice to perform real-time fluorescence imaging on the mice and monitor the distribution of fluorescence across organs. After 48 hours, the mice were sacrificed for organ dissection, and it was found that almost all of the siRNA conjugates accumulated in the liver, indicating that the siRNA conjugate of the present invention can efficiently and specifically deliver siRNA to the liver, indicating that the conjugate can specifically inhibit the expression of target mRNA in the liver.
В некоторых вариантах осуществления миРНК, фармацевтическая композиция или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению могут проявлять более высокую стабильность и/или более высокую активность in vivo. В некоторых вариантах осуществления миРНК, фармацевтическая композиция или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению проявляют процент ингибирования мРНК-мишени, равный по меньшей мере 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95%, in vivo. В некоторых вариантах осуществления миРНК, фармацевтическая композиция или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению проявляют процент ингибирования экспрессии мРНК C5, равный по меньшей мере 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95%, in vivo. В некоторых вариантах осуществления миРНК, фармацевтическая композиция или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению проявляют процент ингибирования экспрессии мРНК C5 в печени, равный по меньшей мере 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95%, in vivo. В некоторых вариантах осуществления миРНК, фармацевтическая композиция или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению проявляют процент ингибирования экспрессии мРНК C5 в печени модельных животных, равный по меньшей мере 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95%, in vivo. В некоторых вариантах осуществления миРНК, фармацевтическая композиция или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению проявляют процент ингибирования экспрессии мРНК C5 в печени у людей, равный по меньшей мере 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95%, in vivo.In some embodiments, the siRNA, pharmaceutical composition, or siRNA conjugate of the present invention may exhibit greater stability and/or greater activity in vivo. In some embodiments, the siRNA, pharmaceutical composition, or siRNA conjugate of the present invention exhibits a percentage of target mRNA inhibition of at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, or 95 %, in vivo. In some embodiments, the siRNA, pharmaceutical composition, or siRNA conjugate of the present invention exhibits a percentage inhibition of C5 mRNA expression equal to at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, or 95 %, in vivo. In some embodiments, the siRNA, pharmaceutical composition, or siRNA conjugate of the present invention exhibits a percentage inhibition of hepatic C5 mRNA expression of at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% or 95%, in vivo. In some embodiments, the siRNA, pharmaceutical composition, or siRNA conjugate of the present invention exhibits a percentage inhibition of C5 mRNA expression in the liver of model animals of at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% or 95%, in vivo. In some embodiments, the siRNA, pharmaceutical composition, or siRNA conjugate of the present invention exhibits a percentage inhibition of hepatic C5 mRNA expression in humans of at least 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% or 95%, in vivo.
В некоторых вариантах осуществления миРНК, фармацевтическая композиция или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению не проявляют существенного нецелевого действия. Нецелевое действие может представлять собой, например, ингибирование нормальной экспрессии гена, который не является геном-мишенью. Оно считается несущественным, если связывание/ингибирование экспрессии нецелевого гена находится на уровне ниже 50%, 40%, 30%, 20% или 10% от целевого действия.In some embodiments, the siRNA, pharmaceutical composition, or siRNA conjugate of the present invention does not exhibit significant off-target effects. An off-target effect may be, for example, inhibition of normal expression of a gene that is not the target gene. It is considered non-significant if the binding/inhibition of non-target gene expression is below 50%, 40%, 30%, 20% or 10% of the target effect.
Отсюда следует, что миРНК, фармацевтическая композиция и конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению могут ингибировать экспрессию мРНК C5, эффективно лечат и/или предупреждают симптомы миастении гравис и имеют хорошие перспективы применения.It follows that the siRNA, pharmaceutical composition and siRNA conjugate of the present invention can inhibit the expression of C5 mRNA, effectively treat and/or prevent the symptoms of myasthenia gravis, and have good application prospects.
Другие особенности и преимущества настоящего изобретения будут подробно описаны в приведенном ниже разделе подробного описания изобретения.Other features and advantages of the present invention will be described in detail in the following section of the detailed description of the invention.
ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВDESCRIPTION OF GRAPHIC MATERIALS
ФИГ. 1A-1H представляют собой кривые «доза-эффект», аппроксимированные на основании относительных уровней экспрессии мРНК C5 в клетках HepG2 после трансфекции различных конъюгатов 1-8.FIG. 1A-1H are dose-response curves fitted based on the relative levels of C5 mRNA expression in HepG2 cells following transfection of various conjugates 1-8.
ФИГ. 2A представляет собой фотографию флуоресцентной визуализации различных органов у мышей C57 через 48 часов после введения 5 мл/кг 1 × PBS, 3 мг/кг Cy5-миРНК 1 или 3 мг/кг Cy5-конъюгата 1.FIG. 2A is a photograph of fluorescence imaging of various organs in C57 mice 48 hours after administration of 5 ml/kg 1× PBS, 3 mg/kg Cy5-siRNA 1, or 3 mg/kg Cy5-conjugate 1.
ФИГ. 2B представляет собой фотографию флуоресцентной визуализации различных органов у мышей C57 через 48 часов после введения 5 мл/кг 1 × PBS, 3 мг/кг Cy5-миРНК 2 или 3 мг/кг Cy5-конъюгата 2.FIG. 2B is a photograph of fluorescence imaging of various organs in C57 mice 48 hours after administration of 5 ml/kg 1× PBS, 3 mg/kg Cy5-siRNA 2, or 3 mg/kg Cy5-conjugate 2.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
Конкретные варианты осуществления настоящего изобретения подробно описаны ниже. Следует иметь в виду, что конкретные варианты осуществления, описанные в настоящем документе, служат только для иллюстрации и пояснения настоящего изобретения и не служат для ограничения настоящего изобретения в каком-либо отношении.Specific embodiments of the present invention are described in detail below. It should be understood that the specific embodiments described herein serve only to illustrate and explain the present invention and do not serve to limit the present invention in any respect.
В настоящем изобретении мРНК C5 относится к мРНК с последовательностью, представленной под регистрационным номером в Genbank M57729.1. Кроме того, если не указано иное, термин «ген-мишень», используемый в настоящем изобретении, относится к гену, способному транскрибировать вышеуказанную мРНК C5, а термин «мРНК-мишень» относится к вышеуказанной мРНК C5.In the present invention, C5 mRNA refers to the mRNA with the sequence presented under Genbank accession number M57729.1. In addition, unless otherwise specified, the term “target gene” as used in the present invention refers to a gene capable of transcribing the above C5 mRNA, and the term “target mRNA” refers to the above C5 mRNA.
ОпределенияDefinitions
В контексте настоящего изобретения, если не указано иное, заглавные буквы C, G, U и A обозначают основания в составе нуклеотидов; строчная буква m обозначает, что нуклеотид, расположенный слева от буквы m, представляет собой метокси-модифицированный нуклеотид; строчная буква f обозначает, что нуклеотид, расположенный слева от буквы f, представляет собой модифицированный фтором нуклеотид; строчная буква s обозначает, что два нуклеотида, расположенные слева и справа от буквы s, соединены тиофосфатом; P1 обозначает, что нуклеотид, расположенный справа от P1, представляет собой нуклеотид с 5’-фосфатной группой или нуклеотид, модифицированный аналогом 5’-фосфатной группы, комбинация букв VP обозначает, что нуклеотид, расположенный справа от комбинации букв VP, представляет собой модифицированный винилфосфатом нуклеотид, комбинация букв Ps обозначает, что нуклеотид, расположенный справа от комбинации букв Ps, представляет собой модифицированный тиофосфатом нуклеотид, а заглавная буква P обозначает, что нуклеотид, расположенный справа от буквы P, представляет собой нуклеотид с 5’-фосфатной группой.In the context of the present invention, unless otherwise indicated, the capital letters C, G, U and A indicate the bases of the nucleotides; a lowercase m indicates that the nucleotide to the left of the m is a methoxy-modified nucleotide; a lowercase f indicates that the nucleotide to the left of the f is a fluorine-modified nucleotide; the lowercase s indicates that the two nucleotides to the left and right of the s are joined by a thiophosphate; P1 indicates that the nucleotide to the right of P1 is a nucleotide with a 5'-phosphate group or a nucleotide modified with a 5'-phosphate analogue, the letter combination VP indicates that the nucleotide to the right of the letter combination VP is a vinyl phosphate modified nucleotide, the letter combination Ps indicates that the nucleotide located to the right of the letter combination Ps is a thiophosphate-modified nucleotide, and the capital letter P indicates that the nucleotide located to the right of the letter P is a nucleotide with a 5'-phosphate group.
В контексте настоящего изобретения «модифицированный фтором нуклеотид» относится к нуклеотиду, образованному путем замещения 2’-гидроксигруппы рибозной группы нуклеотида фтором, а термин «нуклеотид с отличной от фтора модификацией» относится к нуклеотиду, образованному путем замещения 2’-гидроксигруппы рибозной группы нуклеотида группой, отличной от фтора, или к аналогу нуклеотида. «Аналог нуклеотида» относится к группе, которая может заменять нуклеотид в нуклеиновой кислоте, при этом она структурно отличается от аденинового рибонуклеотида, гуанинового рибонуклеотида, цитозинового рибонуклеотида, урацилового рибонуклеотида или тимидинового дезоксирибонуклеотида, например, представляет собой изонуклеотид, нуклеотид мостиковой нуклеиновой кислоты (BNA) или ациклический нуклеотид. «Метокси-модифицированный нуклеотид» относится к нуклеотиду, образованному путем замещения 2’-гидроксигруппы рибозной группы метоксигруппой.In the context of the present invention, a "fluorine-modified nucleotide" refers to a nucleotide formed by replacing the 2'-hydroxy group of a ribose group of a nucleotide with fluorine, and the term "non-fluorine modified nucleotide" refers to a nucleotide formed by replacing the 2'-hydroxy group of a ribose group of a nucleotide with a , other than fluorine, or a nucleotide analogue. "Nucleotide analogue" refers to a group that can replace a nucleotide in a nucleic acid and is structurally different from an adenine ribonucleotide, guanine ribonucleotide, cytosine ribonucleotide, uracil ribonucleotide, or thymidine deoxyribonucleotide, such as an isonucleotide, a bridging nucleic acid (BNA) nucleotide or acyclic nucleotide. "Methoxy-modified nucleotide" refers to a nucleotide formed by replacing the 2'-hydroxy group of a ribose group with a methoxy group.
В контексте настоящего изобретения выражения «комплементарный» и «обратно комплементарный» могут использоваться взаимозаменяемо и имеют общеизвестное в данной области техники значение, а именно, основания в одной цепи комплементарно спарены с основаниями в другой цепи двухцепочечной молекулы нуклеиновой кислоты. В ДНК пуриновое основание аденин (A) всегда спарено с пиримидиновым основанием тимином (T) (или урацилом (U) в РНК); и пуриновое основание гуанин (G) всегда спарено с пиримидиновым основанием цитозином (C). Каждая пара оснований содержит пурин и пиримидин. Если аденины в одной цепи всегда спарены с тиминами (или урацилами) в другой цепи, а гуанины всегда спарены с цитозинами, эти две цепи считаются комплементарными друг другу; и последовательность цепи может быть выведена из последовательности ее комплементарной цепи. Соответственно, «ошибочное спаривание» означает, что в двухцепочечной нуклеиновой кислоте основания в соответствующих сайтах не представлены в виде комплементарно спаренных.In the context of the present invention, the expressions “complementary” and “reverse complementary” can be used interchangeably and have the meaning generally known in the art, namely, bases on one strand are complementarily paired with bases on the other strand of a double-stranded nucleic acid molecule. In DNA, the purine base adenine (A) is always paired with the pyrimidine base thymine (T) (or uracil (U) in RNA); and the purine base guanine (G) is always paired with the pyrimidine base cytosine (C). Each base pair contains a purine and a pyrimidine. If adenines on one chain are always paired with thymines (or uracils) on the other chain, and guanines are always paired with cytosines, the two chains are considered complementary to each other; and the sequence of a strand can be inferred from the sequence of its complementary strand. Accordingly, “mispairing” means that in a double-stranded nucleic acid the bases at the corresponding sites are not represented as complementary pairs.
В контексте настоящего изобретения, если не указано иное, «преимущественно обратно комплементарный» означает, что между двумя нуклеотидными последовательностями присутствует не более 3 ошибочно спаренных оснований. «По существу обратно комплементарный» означает, что между двумя нуклеотидными последовательностями присутствует не более 1 ошибочно спаренного основания. «Полностью комплементарный» означает, что между двумя нуклеотидными последовательностями отсутствуют ошибочно спаренные основания.In the context of the present invention, unless otherwise indicated, “predominantly reverse complementary” means that no more than 3 mismatched bases are present between two nucleotide sequences. “Substantially reverse complementary” means that there is no more than 1 mismatched base between two nucleotide sequences. “Fully complementary” means that there are no mismatched bases between two nucleotide sequences.
В контексте настоящего изобретения, если нуклеотидная последовательность имеет «различие по нуклеотидам» от другой нуклеотидной последовательности, нуклеотидные основания в одном и том же положении в них изменены. Например, если нуклеотидное основание во второй последовательности представляет собой A, а нуклеотидное основание в том же положении в первой последовательности представляет собой U, C, G или T, эти две нуклеотидные последовательности считаются имеющими различие по нуклеотиду в этом положении. В некоторых вариантах осуществления, если нуклеотид в каком-либо положении заменен лишенным азотистого основания нуклеотидом или аналогом нуклеотида, также считается, что в этом положении имеется различие по нуклеотиду.In the context of the present invention, if a nucleotide sequence has a "nucleotide difference" from another nucleotide sequence, the nucleotide bases at the same position therein are changed. For example, if the nucleotide base in the second sequence is A, and the nucleotide base at the same position in the first sequence is U, C, G, or T, the two nucleotide sequences are considered to have a difference in the nucleotide at that position. In some embodiments, if a nucleotide at any position is replaced by a baseless nucleotide or nucleotide analogue, there is also a nucleotide difference at that position.
В контексте настоящего изобретения, в частности, в описании способа получения миРНК, композиции, содержащей миРНК, или конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению, если не указано иное, нуклеозидный мономер относится, в соответствии с видом и последовательностью нуклеотидов в миРНК или конъюгате миРНК, которые необходимо получить, к немодифицированным или модифицированным рибонуклеозидным амидофосфитам, применяемым в твердофазном амидофосфитном синтезе (РНК-амидофосфиты в других местах также называются нуклеозидными амидофосфитами). Твердофазный амидофосфитный синтез представляет собой метод, хорошо известный специалистам в данной области техники и используемый в синтезе РНК. Нуклеозидные мономеры, используемые в настоящем изобретении, могут быть доступны на рынке.In the context of the present invention, in particular, in the description of the method for producing siRNA, a composition containing siRNA, or a siRNA conjugate according to the present invention, unless otherwise indicated, the nucleoside monomer refers, in accordance with the type and sequence of nucleotides in the siRNA or siRNA conjugate that is required obtain, to unmodified or modified ribonucleoside amidophosphites used in solid-phase amidophosphite synthesis (RNA amidophosphites are also called nucleoside amidophosphites elsewhere). Solid phase amidophosphite synthesis is a method well known to those skilled in the art and used in RNA synthesis. Nucleoside monomers used in the present invention may be commercially available.
В контексте настоящего изобретения, если не указано иное, «конъюгирование» относится к двум или более химическим фрагментам, каждый из которых имеет определенную функцию, соединенным друг с другом посредством ковалентной связи. Соответственно, «конъюгат» относится к соединению, образованному ковалентным связыванием отдельных химических фрагментов. Кроме того, «конъюгат миРНК» представляет собой соединение, образованное ковалентным связыванием одного или более химических фрагментов с определенными функциями с миРНК. Далее в настоящем документе конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению иногда сокращенно называется «конъюгатом». Конъюгат миРНК следует понимать в соответствии с контекстом как общий термин для множества конъюгатов миРНК или конъюгатов миРНК, представленных в определенных химических формулах. В контексте настоящего изобретения термин «конъюгирующая молекула» следует понимать как конкретное соединение, которое может быть конъюгировано с миРНК посредством реакций с получением в конечном итоге конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению.In the context of the present invention, unless otherwise indicated, "conjugation" refers to two or more chemical moieties, each having a specific function, connected to each other by a covalent bond. Accordingly, “conjugate” refers to a compound formed by the covalent linkage of individual chemical moieties. Furthermore, a “siRNA conjugate” is a compound formed by covalently linking one or more chemical moieties with specific functions to siRNA. Hereinafter, the siRNA conjugate of the present invention is sometimes abbreviated as “conjugate.” siRNA conjugate should be understood according to the context as a general term for a variety of siRNA conjugates or siRNA conjugates represented by specific chemical formulas. In the context of the present invention, the term "conjugating molecule" should be understood as a specific compound that can be conjugated to siRNA through reactions to ultimately obtain the siRNA conjugate of the present invention.
Применительно к настоящему изобретению термин «необязательный» или «необязательно» означает, что описанное далее событие или условие может происходить или может не происходить, и что описание включает случаи, когда событие или условие может происходить или может не происходить. Например, термин «необязательно замещенный» «алкил» включает как «алкил», так и «замещенный алкил», как определено ниже. Специалистам в данной области техники будет ясно, в отношении любой группы, содержащей один или более заместителей, что такие группы не подразумевают введения какого-либо замещения или типа замещения, которые являются стерически невыгодными, синтетически неосуществимыми и/или нестабильными по своей природе.As used herein, the term “optional” or “optional” means that the event or condition described below may or may not occur, and that the description includes instances in which the event or condition may or may not occur. For example, the term "optionally substituted" "alkyl" includes both "alkyl" and "substituted alkyl" as defined below. Those skilled in the art will recognize, with respect to any group containing one or more substituents, that such groups do not involve the introduction of any substitution or type of substitution that is sterically unfavorable, synthetically infeasible and/or unstable in nature.
Применительно к настоящему изобретению «алкил» относится к линейной цепи и разветвленной цепи, имеющей указанное количество атомов углерода, обычно от 1 до 20 атомов углерода, например, от 1 до 10 атомов углерода, например, от 1 до 8 или от 1 до 6 атомов углерода. Например, C1-C6 алкил включает алкил как с линейной, так и с разветвленный цепью, имеющий от 1 до 6 атомов углерода. При обозначении алкильного остатка, имеющего определенное количество атомов углерода, подразумевается включение всех форм с разветвленной цепью и линейной цепью, имеющих это количество атомов углерода; таким образом, например, под «бутилом» подразумевается н-бутил, втор-бутил, изобутил и трет-бутил; а под «пропилом» подразумевается н-пропил и изопропил. Алкилен представляет собой разновидность алкила, относящуюся к тем же остаткам, что и алкил, но имеющую два положения присоединения.As used herein, "alkyl" refers to straight chain and branched chain having a specified number of carbon atoms, typically 1 to 20 carbon atoms, e.g. 1 to 10 carbon atoms, e.g. 1 to 8 or 1 to 6 atoms carbon. For example, C 1 -C 6 alkyl includes both straight and branched chain alkyl having from 1 to 6 carbon atoms. When referring to an alkyl moiety having a specific number of carbon atoms, it is intended to include all branched chain and straight chain forms having that number of carbon atoms; thus, for example, "butyl" means n-butyl, sec-butyl, isobutyl and tert-butyl; and by “propyl” we mean n-propyl and isopropyl. Alkylene is a species of alkyl, belonging to the same radicals as alkyl, but having two attachment positions.
Применительно к настоящему изобретению «алкенил» относится к ненасыщенному разветвленному или линейному алкилу, имеющему по меньшей мере одну двойную связь углерод-углерод, образованную путем соответствующего удаления одной молекулы водорода от двух соседних атомов углерода исходного алкила. Группа может иметь цис- или транс-конфигурацию двойной связи. Типичные алкенильные группы включают, не ограничиваясь перечисленным, этенил; пропенилы, такие как проп-1-ен-1-ил, проп-1-ен-2-ил, проп-2-ен-1-ил (аллил) и проп-2-ен-2-ил; и бутенилы, такие как бут-1-ен-1-ил, бут-1-ен-2-ил, 2-метилпроп-1-ен-1-ил, бут-2-ен-1-ил, бут-2-ен-2-ил, бута-1,3-диен-1-ил, бута-1,3-диен-2-ил и тому подобное. В отдельных вариантах осуществления алкенильная группа имеет от 2 до 20 атомов углерода, а в других вариантах осуществления от 2 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 6 атомов углерода. Алкенилен представляет собой разновидность алкенила, относящуюся к тем же остаткам, что и алкенил, но имеющую два положения присоединения.As used herein, “alkenyl” refers to an unsaturated branched or straight alkyl having at least one carbon-carbon double bond formed by the corresponding removal of one hydrogen molecule from two adjacent carbon atoms of the parent alkyl. The group may have a cis or trans double bond configuration. Typical alkenyl groups include, but are not limited to, ethenyl; propenyls such as prop-1-en-1-yl, prop-1-en-2-yl, prop-2-en-1-yl (allyl) and prop-2-en-2-yl; and butenyls such as but-1-en-1-yl, but-1-en-2-yl, 2-methylprop-1-en-1-yl, but-2-en-1-yl, but-2 -en-2-yl, buta-1,3-dien-1-yl, buta-1,3-dien-2-yl and the like. In some embodiments, the alkenyl group has from 2 to 20 carbon atoms, and in other embodiments from 2 to 10, from 2 to 8, or from 2 to 6 carbon atoms. Alkenylene is a species of alkenyl belonging to the same radicals as alkenyl but having two attachment positions.
Применительно к настоящему изобретению «алкинил» относится к ненасыщенному разветвленному или линейному алкилу, имеющему по меньшей мере одну тройную связь углерод-углерод, образованную путем соответствующего удаления двух молекул водорода от двух соседних атомов углерода исходного алкила. Типичные алкинильные группы включают, не ограничиваясь перечисленным, этинил; пропинилы, такие как проп-1-ин-1-ил и проп-2-ин-1-ил; и бутинилы, такие как бут-1-ин-1-ил, бут-1-ин-3-ил, бут-3-ин-1-ил и тому подобное. В отдельных вариантах осуществления алкинильная группа имеет от 2 до 20 атомов углерода, а в других вариантах осуществления от 2 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 6 атомов углерода. Алкинилен представляет собой разновидность алкинила, относящуюся к тем же остаткам, что и алкинил, но имеющую два положения присоединения.As used herein, “alkynyl” refers to an unsaturated branched or straight alkyl having at least one carbon-carbon triple bond formed by the corresponding removal of two hydrogen molecules from two adjacent carbon atoms of the parent alkyl. Typical alkynyl groups include, but are not limited to, ethynyl; propynyls such as prop-1-yn-1-yl and prop-2-yn-1-yl; and butynyls such as but-1-yn-1-yl, but-1-yn-3-yl, but-3-yn-1-yl and the like. In some embodiments, the alkynyl group has 2 to 20 carbon atoms, and in other embodiments, 2 to 10, 2 to 8, or 2 to 6 carbon atoms. Alkynylene is a species of alkynyl, belonging to the same residues as alkynyl, but having two attachment positions.
Применительно к настоящему изобретению «алкокси» относится к алкильной группе с указанным количеством атомов углерода, присоединяемой посредством кислородного мостика, такой как метокси, этокси, пропокси, изопропокси, н-бутокси, втор-бутокси, трет-бутокси, пентилокси, 2-пентилокси, изопентилокси, неопентилокси, гексилокси, 2-гексилокси, 3-гексилокси, 3-метилпентилокси и тому подобное. Алкокси обычно имеет от 1 до 10, от 1 до 8, от 1 до 6 или от 1 до 4 атомов углерода, присоединенных посредством кислородного мостика.As used herein, "alkoxy" refers to an alkyl group of a specified number of carbon atoms, attached via an oxygen bridge, such as methoxy, ethoxy, propoxy, isopropoxy, n-butoxy, sec-butoxy, t-butoxy, pentyloxy, 2-pentyloxy, isopentyloxy, neopentyloxy, hexyloxy, 2-hexyloxy, 3-hexyloxy, 3-methylpentyloxy and the like. Alkoxy typically has from 1 to 10, 1 to 8, 1 to 6, or 1 to 4 carbon atoms attached via an oxygen bridge.
Применительно к настоящему изобретению «арил» относится к группе, получаемой из ароматической моноциклической или полициклической углеводородной кольцевой системы путем удаления атома водорода от атома углерода кольца. Ароматическая моноциклическая или полициклическая углеводородная кольцевая система содержит только водород и от 6 до 18 атомов углерода, причем по меньшей мере одно кольцо в кольцевой системе является полностью ненасыщенным, т. е. содержит циклическую делокализованную (4n+2)π-электронную систему в соответствии с теорией Хюккеля. Арильные группы включают, не ограничиваясь перечисленным, фенил, флуоренил, нафтил и тому подобное. Арилен представляет собой разновидность арила, относящуюся к тем же остаткам, что и арил, но имеющую два положения присоединения.As used herein, "aryl" refers to a group derived from an aromatic monocyclic or polycyclic hydrocarbon ring system by removing a hydrogen atom from a carbon atom of the ring. An aromatic monocyclic or polycyclic hydrocarbon ring system contains only hydrogen and from 6 to 18 carbon atoms, and at least one ring in the ring system is completely unsaturated, i.e. contains a cyclic delocalized (4n+2)π-electron system in accordance with Hückel's theory. Aryl groups include, but are not limited to, phenyl, fluorenyl, naphthyl and the like. Arylene is a species of aryl that has the same moieties as aryl but has two attachment positions.
Применительно к настоящему изобретению «галогеновый заместитель» или «галоген» относится к фтору, хлору, брому и иоду, а термин «галоген» включает фтор, хлор, бром или иод.As used herein, "halogen substituent" or "halogen" refers to fluorine, chlorine, bromine and iodine, and the term "halogen" includes fluorine, chlorine, bromine or iodine.
Применительно к настоящему изобретению «галогеналкил» относится к алкилу, как определено выше, в котором указанное количество атомов углерода замещено одним или более атомами галогена, вплоть до максимально допустимого количества атомов галогена. Примеры галогеналкила включают, не ограничиваясь перечисленным, трифторметил, дифторметил, 2-фторэтил и пентафторэтил.As used herein, “haloalkyl” refers to an alkyl as defined above in which a specified number of carbon atoms is replaced by one or more halogen atoms, up to the maximum number of halogen atoms allowed. Examples of haloalkyl include, but are not limited to, trifluoromethyl, difluoromethyl, 2-fluoroethyl and pentafluoroethyl.
«Гетероциклил» относится к стабильному 3-18-членному неароматическому кольцевому радикалу, содержащему 2-12 атомов углерода и 1-6 гетероатомов, выбранных из азота, кислорода или серы. Если в описании не указано иное, гетероциклил представляет собой моноциклическую, бициклическую, трициклическую или тетрациклическую кольцевую систему, которая может содержать конденсированные или мостиковые кольцевые системы. Гетероатомы в гетероциклиле необязательно могут быть окислены. Один или более атомов азота, если они присутствуют, необязательно являются кватернизированными. Гетероциклил является частично или полностью насыщенным. Гетероциклил может быть соединен с остальной частью молекулы через любой атом кольца. Примеры такого гетероциклила включают, не ограничиваясь перечисленным, диоксанил, тиенил[1,3]дисульфонил, декагидроизохинолил, имидазолинил, имидазолидинил, изотиазолидинил, изоксазолидинил, морфолинил, октагидроиндолил, октагидроизоиндолил, 2-оксапиперазинил, 2-оксапиперидинил, 2-оксапирролидинил, оксазолидинил, пиперидинил, пиперазинил, 4-пиперидонил, пирролидинил, пиразолидинил, хинуклидинил, тиазолидинил, тетрагидрофурил, тритианил, тетрагидропиранил, тиоморфолинил, тиаморфолинил, 1-оксотиоморфолинил и 1,1-диоксотиоморфолинил."Heterocyclyl" refers to a stable 3-18 membered non-aromatic ring radical containing 2-12 carbon atoms and 1-6 heteroatoms selected from nitrogen, oxygen or sulfur. Unless otherwise indicated in the specification, heterocyclyl is a monocyclic, bicyclic, tricyclic or tetracyclic ring system, which may contain fused or bridged ring systems. The heteroatoms in the heterocyclyl may optionally be oxidized. One or more nitrogen atoms, if present, are not necessarily quaternized. Heterocyclyl is partially or fully saturated. The heterocyclyl can be connected to the rest of the molecule through any ring atom. Examples of such heterocyclyl include, but are not limited to, dioxanyl, thienyl[1,3]disulfonyl, decahydroisoquinolyl, imidazolinyl, imidazolidinyl, isothiazolidinyl, isoxazolidinyl, morpholinyl, octahydroindolyl, octahydroisoindolyl, 2-oxapiperazinyl, 2-oxapiperidinyl, 2-oxapyr rolidinyl, oxazolidinyl, piperidinyl , piperazinyl, 4-piperidonyl, pyrrolidinyl, pyrazolidinyl, quinuclidinyl, thiazolidinyl, tetrahydrofuryl, trithianyl, tetrahydropyranyl, thiomorpholinyl, thiamorpholinyl, 1-oxothiomorpholinyl and 1,1-dioxothiomorpholinyl.
«Гетероарил» относится к группе, происходящей из 3-18-членного ароматического кольцевого радикала, содержащего от 2 до 17 атомов углерода и от 1 до 6 гетероатомов, выбранных из азота, кислорода и серы. Применительно к настоящему изобретению гетероарил может представлять собой моноциклическую, бициклическую, трициклическую или тетрациклическую кольцевую систему, причем по меньшей мере одно кольцо в кольцевой системе является полностью ненасыщенным, т. е. содержит циклическую делокализованную (4n+2)π-электронную систему в соответствии с теорией Хюккеля. Гетероарил включает конденсированные или мостиковые кольцевые системы. Гетероатомы в гетероариле необязательно окислены. Один или более атомов азота, если они присутствуют, необязательно являются кватернизированными. Гетероарил может быть соединен с остальной частью молекулы через любой атом кольца. Примеры таких гетероарилов включают, не ограничиваясь перечисленным, азепинил, акридинил, бензимидазолил, бензиндолил, 1,3-бензодиоксазолил, бензофуранил, бензоксазолил, бензо[d]тиазолил, бензотиадиазолил, бензо[b][1,4]диоксепинил, бензо[b][1,4]оксазинил, 1,4-бензодиоксанил, бензонафтофуранил, бензоксазолил, бензодиоксолил, бензопиранил, бензопиранонил, бензофуранил, бензофуранонил, бензотиенил, бензотиено[3,2-d]пиримидинил, бензотриазолил, бензо[4,6]имидазо[1,2-а]пиридинил, карбазолил, циннолинил, циклопента[d]пиримидинил, 6,7-дигидро-5Н-циклопента[4,5]-тиено[2,3-d]пиримидинил, 5,6-дигидробензо[h]хиназолинил, 5,6-дигидробензо[h]циннолинил, 6,7-дигидро-5H-бензо[6,7]циклогепта[1,2-c]пиридазинил, дибензофуранил, дибензотиенил, фуранил, фуранонил, фуро[3,2-c]пиридинил, 5,6,7,8,9,10-гексагидроциклоокта[d]пиримидинил, 5,6,7,8,9,10-гексагидроциклоокта[d]пиридазинил, 5,6,7,8,9,10-гексагидроциклоокта[d]пиридинил, изотиазолил, имидазолил, индазолил, индолил, изоиндолил, индолинил, изоиндолинил, изохинолил, индолизинил, изоксазолил, 5,8-метан-5,6,7,8-тетрагидрохиназолинил, нафтиридинил, 1,6-нафтиридинонил, оксадиазолил, 2-оксоазепинил, оксазолил, оксиранил, 5,6,6a,7,8,9,10,10a-октагидробензо[h]хиназолинил, 1-фенил-1H-пирролил, феназинил, фенотиазинил, феноксазинил, фталазинил, птеридинил, пуринил, пирролил, пиразолил, пиразоло[3,4-d]пиримидинил, пиридинил, пиридо[3,2-d]пиримидинил, пиридо[3,4-d]пиримидинил, пиразинил, пиримидинил, пиридазинил, хиназолинил, хиноксалинил, хинолинил, тетрагидрохинолинил, 5,6,7,8-тетрагидрохиназолинил, 5,6,7,8-тетрагидробензо[4,5]тиено[2,3-d]пиримидинил, 6,7,8,9-тетрагидро-5H-циклогепта[4,5]тиено[2,3-d]пиримидинил, 5,6,7,8-тетрагидропиридо[4,5-c]пиридазинил, тиазолил, тиадиазолил, триазолил, тетразолил, триазинил, тиено[2,3-d]пиримидинил, тиено[3,2-d]пиримидинил, тиено[2,3-c]придинил и тиофенил/тиенил."Heteroaryl" refers to a group derived from a 3 to 18 membered aromatic ring radical containing from 2 to 17 carbon atoms and from 1 to 6 heteroatoms selected from nitrogen, oxygen and sulfur. For purposes of the present invention, heteroaryl may be a monocyclic, bicyclic, tricyclic or tetracyclic ring system, wherein at least one ring in the ring system is completely unsaturated, i.e., contains a cyclic delocalized (4n+2)π-electron system in accordance with Hückel's theory. Heteroaryl includes fused or bridged ring systems. The heteroatoms in the heteroaryl are optionally oxidized. One or more nitrogen atoms, if present, are not necessarily quaternized. Heteroaryl can be connected to the rest of the molecule through any ring atom. Examples of such heteroaryls include, but are not limited to, azepinyl, acridinyl, benzimidazolyl, benzidolyl, 1,3-benzodioxazolyl, benzofuranyl, benzoxazolyl, benzo[d]thiazolyl, benzothiadiazolyl, benzo[b][1,4]dioxepinyl, benzo[b] [1,4]oxazinyl, 1,4-benzodioxanyl, benzonaphthofuranyl, benzoxazolyl, benzodioxolyl, benzopyranyl, benzopyranonyl, benzofuranyl, benzofuranonyl, benzothienyl, benzothieno[3,2-d]pyrimidinyl, benzotriazolyl, benzo[4,6]imidazo[1 ,2-a]pyridinyl, carbazolyl, cinnolinyl, cyclopenta[d]pyrimidinyl, 6,7-dihydro-5H-cyclopenta[4,5]-thieno[2,3-d]pyrimidinyl, 5,6-dihydrobenzo[h] quinazolinyl, 5,6-dihydrobenzo[h]cinnolinyl, 6,7-dihydro-5H-benzo[6,7]cyclohepta[1,2-c]pyridazinyl, dibenzofuranyl, dibenzothienyl, furanyl, furanonyl, furo[3,2- c]pyridinyl, 5,6,7,8,9,10-hexahydrocycloocta[d]pyrimidinyl, 5,6,7,8,9,10-hexahydrocycloocta[d]pyridazinyl, 5,6,7,8,9, 10-hexahydrocycloocta[d]pyridinyl, isothiazolyl, imidazolyl, indazolyl, indolyl, isoindolyl, indolinyl, isoindolinyl, isoquinolyl, indolizinyl, isoxazolyl, 5,8-methane-5,6,7,8-tetrahydroquinazolinyl, naphthyridinyl, 1,6- naphthyridinonyl, oxadiazolyl, 2-oxoazepinyl, oxazolyl, oxiranyl, 5,6,6a,7,8,9,10,10a-octahydrobenzo[h]quinazolinyl, 1-phenyl-1H-pyrrolyl, phenazinyl, phenothiazinyl, phenoxazinyl, phthalazinyl, pteridinyl, purinyl, pyrrolyl, pyrazolyl, pyrazolo[3,4-d]pyrimidinyl, pyridinyl, pyrido[3,2-d]pyrimidinyl, pyrido[3,4-d]pyrimidinyl, pyrazinyl, pyrimidinyl, pyridazinyl, quinazolinyl, quinoxalinyl, quinolinyl, tetrahydroquinolinyl, 5,6,7,8-tetrahydroquinazolinyl, 5,6,7,8-tetrahydrobenzo[4,5]thieno[2,3-d]pyrimidinyl, 6,7,8,9-tetrahydro-5H- cyclohepta[4,5]thieno[2,3-d]pyrimidinyl, 5,6,7,8-tetrahydropyrido[4,5-c]pyridazinyl, thiazolyl, thiadiazolyl, triazolyl, tetrazolyl, triazinyl, thieno[2,3- d]pyrimidinyl, thieno[3,2-d]pyrimidinyl, thieno[2,3-c]pridinyl and thiophenyl/thienyl.
В настоящем изобретении могут быть использованы различные гидроксизащитные группы. Как правило, защитные группы делают химические функциональные группы инертными к определенным условиям реакции и могут быть присоединены к таким функциональным группам в молекуле и удалены из них без значительного повреждения остальной части молекулы. Иллюстративные гидроксизащитные группы раскрыты в источнике Tetrahedron 1992, 48, 2223-2311 за авт. Beaucage, et al., а также в источнике Greene and Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis, Chapter 2, 2d ed, John Wiley & Sons, New York, 1991, каждый из которых включен в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме. В некоторых вариантах осуществления защитная группа стабильна в основных условиях, но может быть удалена в кислых условиях. В некоторых вариантах осуществления неисключающие примеры гидроксизащитных групп, применяемых в настоящем документе, включают диметокситритил (DMT), монометокситритил, 9-фенилксантен-9-ил (Pixyl) или 9-(п-метоксифенил)ксантен-9-ил (Mox). В некоторых вариантах осуществления неисключающие примеры гидроксизащитных групп, применяемых в настоящем документе, включают Tr (тритил), MMTr (4-метокситритил), DMTr (4,4'-диметокситритил) и TMTr (4,4',4"-триметокситритил).Various hydroxy protecting groups can be used in the present invention. In general, protecting groups render chemical functional groups inert to certain reaction conditions and can be attached to and removed from such functional groups in a molecule without significant damage to the rest of the molecule. Exemplary hydroxy protecting groups are disclosed in Tetrahedron 1992, 48, 2223-2311 per ed. Beaucage, et al., and Greene and Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis, Chapter 2, 2d ed, John Wiley & Sons, New York, 1991, each of which is incorporated herein by reference in its entirety. In some embodiments, the protecting group is stable under basic conditions but may be removed under acidic conditions. In some embodiments, non-exclusive examples of hydroxy protecting groups used herein include dimethoxytrityl (DMT), monomethoxytrityl, 9-phenylxanthen-9-yl (Pixyl), or 9-(p-methoxyphenyl)xanthen-9-yl (Mox). In some embodiments, non-exclusive examples of hydroxy protecting groups used herein include Tr (trityl), MMTr (4-methoxytrityl), DMTr (4,4'-dimethoxytrityl), and TMTr (4,4',4"-trimethoxytrityl).
Применительно к настоящему изобретению термин «субъект» относится к любому животному, например, млекопитающему или сумчатому. Субъект согласно настоящему изобретению включает, не ограничиваясь перечисленным, человека, примата, отличного от человека (например, макака-резуса или другие виды макак), мышь, свинью, лошадь, осла, корову, овцу, крысу и любые виды домашней птицы.As used herein, the term "subject" refers to any animal, such as a mammal or marsupial. Subjects of the present invention include, but are not limited to, human, non-human primate (eg, rhesus or other macaque species), mouse, pig, horse, donkey, cow, sheep, rat, and any species of poultry.
Применительно к настоящему изобретению «лечение» относится к способу получения благоприятного или желаемого результата, включая, не ограничиваясь перечисленным, терапевтический эффект. «Терапевтический эффект» означает устранение или улучшение потенциального расстройства, подлежащего лечению. Более того, терапевтический эффект достигается путем устранения или ослабления одного или более физиологических симптомов, ассоциированных с потенциальным расстройством, так, что у субъекта наблюдается улучшение, несмотря на то, что субъект все еще может быть поражен потенциальным расстройством.As used herein, “treatment” refers to a method of obtaining a beneficial or desired result, including, but not limited to, a therapeutic effect. "Therapeutic effect" means the elimination or improvement of the potential disorder being treated. Moreover, a therapeutic effect is achieved by eliminating or reducing one or more physiological symptoms associated with the potential disorder such that the subject shows improvement although the subject may still be affected by the potential disorder.
Применительно к настоящему изобретению «предупреждение» относится к способу получения благоприятного или целевого результата, включая, не ограничиваясь перечисленным, профилактический эффект. Для достижения «профилактического эффекта» конъюгат миРНК или композиция могут быть введены субъекту, подверженному риску развития конкретного заболевания, или субъекту, сообщающему об одном или более физиологических симптомах заболевания, даже это заболевание еще не было диагностировано.As used herein, “prevention” refers to a method of obtaining a beneficial or intended result, including, but not limited to, a prophylactic effect. To achieve a “prophylactic effect,” the siRNA conjugate or composition may be administered to a subject at risk of developing a particular disease, or to a subject reporting one or more physiological symptoms of a disease, even if the disease has not yet been diagnosed.
миРНКsiRNA
В одном аспекте настоящее изобретение относится к шести типам миРНК, способных ингибировать экспрессию гена C5.In one aspect, the present invention provides six types of siRNAs capable of inhibiting C5 gene expression.
миРНК согласно настоящему изобретению содержит нуклеотиды в качестве основных структурных единиц. Специалистам в данной области техники хорошо известно, что нуклеотид содержит фосфатную группу, рибозную группу и основание. Подробные иллюстрации, относящиеся к таким группам, в настоящем документе не представлены.The siRNA of the present invention contains nucleotides as basic structural units. It is well known to those skilled in the art that a nucleotide contains a phosphate group, a ribose group and a base. Detailed illustrations relating to such groups are not presented in this document.
миРНК согласно настоящему изобретению содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь, причем длины смысловой цепи и антисмысловой цепи являются одинаковыми или различными, длина смысловой цепи составляет 19-23 нуклеотида, а длина антисмысловой цепи составляет 19-26 нуклеотидов. Таким образом, отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи миРНК согласно настоящему изобретению может составлять 19/19, 19/20, 19/21, 19/22, 19/23, 19/24, 19/25, 19/26, 20/20, 20/21, 20/22, 20/23, 20/24, 20/25, 20/26, 21/20, 21/21, 21/22, 21/23, 21/24, 21/25, 21/26, 22/20, 22/21, 22/22, 22/23, 22/24, 22/25, 22/26, 23/20, 23/21, 23/22, 23/23, 23/24, 23/25 или 23/26. В некоторых вариантах осуществления отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи миРНК составляет 19/21, 21/23 или 23/25.The siRNA of the present invention contains a sense strand and an antisense strand, wherein the lengths of the sense strand and the antisense strand are the same or different, the length of the sense strand is 19-23 nucleotides, and the length of the antisense strand is 19-26 nucleotides. Thus, the ratio of the sense strand length to the antisense strand length of the siRNA according to the present invention can be 19/19, 19/20, 19/21, 19/22, 19/23, 19/24, 19/25, 19/26, 20 /20, 20/21, 20/22, 20/23, 20/24, 20/25, 20/26, 21/20, 21/21, 21/22, 21/23, 21/24, 21/25 , 21/26, 22/20, 22/21, 22/22, 22/23, 22/24, 22/25, 22/26, 23/20, 23/21, 23/22, 23/23, 23 /24, 23/25 or 23/26. In some embodiments, the ratio of the sense strand length to the antisense strand length of the siRNA is 19/21, 21/23, or 23/25.
Первая миРНКFirst siRNA
Согласно настоящему изобретению миРНК может представлять собой первую миРНК.According to the present invention, the siRNA may be a first siRNA.
Первая миРНК содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь. Каждый нуклеотид в первой миРНК независимо представляет собой модифицированный или немодифицированный нуклеотид, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность I, антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность II, и нуклеотидная последовательность I и нуклеотидная последовательность II по меньшей мере частично обратно комплементарны, образуя двухцепочечную область, где нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 1, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 2, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:The first siRNA contains a sense strand and an antisense strand. Each nucleotide in the first siRNA is independently a modified or unmodified nucleotide, wherein the sense strand contains a nucleotide sequence I, the antisense strand contains a nucleotide sequence II, and the nucleotide sequence I and nucleotide sequence II are at least partially reverse complementary, forming a double-stranded region where the nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 1, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II has the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 2 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-CUUCAUUCAUACAGACAAZ1-3’ (SEQ ID NO: 1);5'-CUUCAUUCAUCAGACAAZ 1 -3' (SEQ ID NO: 1);
5’-Z2UUGUCUGUAUGAAUGAAG-3’ (SEQ ID NO: 2),5'-Z 2 UUGUCUGUAUGAAUGAAG-3' (SEQ ID NO: 2),
где Z1 представляет собой A, Z2 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z3 в сайте, соответствующем Z1, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z4 в сайте, соответствующем Z2, и Z4 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи.where Z 1 is A, Z 2 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 3 at the site corresponding to Z 1 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 4 at the site corresponding to Z 2 , and Z 4 is the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand.
В данном контексте термин «соответствующий сайт» означает нахождение в одном и том же сайте в нуклеотидной последовательности при отсчете с одного и того же конца нуклеотидной последовательности. Например, первый нуклеотид на 3’-конце нуклеотидной последовательности I представляет собой нуклеотид в сайте, соответствующем первому нуклеотиду на 3’-конце SEQ ID NO: 1.As used herein, the term "corresponding site" means being at the same site in a nucleotide sequence when starting from the same end of the nucleotide sequence. For example, the first nucleotide at the 3' end of nucleotide sequence I is the nucleotide at the site corresponding to the first nucleotide at the 3' end of SEQ ID NO: 1.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность I, а антисмысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность II.In some embodiments, the sense strand contains exclusively nucleotide sequence I, and the antisense strand contains exclusively nucleotide sequence II.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 1, не более чем по одному нуклеотиду, и/или нуклеотидная последовательность II отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 2, не более чем по одному нуклеотиду.In some embodiments, nucleotide sequence I differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 1 by no more than one nucleotide, and/or nucleotide sequence II differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 2 by no more than one nucleotide.
В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду между нуклеотидной последовательностью II и нуклеотидной последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 2, включает различие в сайте Z4, и Z4 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду представляет собой различие в сайте Z4, и Z4 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления Z3 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z4. миРНК, имеющие вышеуказанное различие по нуклеотиду, обладают более высокой способностью миРНК ингибировать мРНК-мишень, и эти миРНК также включены в объем настоящего изобретения.In some embodiments, the nucleotide difference between nucleotide sequence II and the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 2 includes a difference in the Z 4 site, and Z 4 is selected from A, C, or G. In some embodiments, the nucleotide difference is the difference is the Z 4 site, and Z 4 is selected from A, C, or G. In some embodiments, Z 3 is a nucleotide complementary to Z 4 . siRNAs having the above nucleotide difference have a higher ability of the siRNA to inhibit the target mRNA, and these siRNAs are also included in the scope of the present invention.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I является преимущественно обратно комплементарной, по существу обратно комплементарной или полностью обратно комплементарной нуклеотидной последовательности II. «Преимущественно обратно комплементарный» означает наличие не более чем трех ошибочно спаренных основания между двумя нуклеотидными последовательностями; «по существу обратно комплементарный» означает наличие не более чем одного ошибочно спаренного основания между двумя нуклеотидными последовательностями; и «полностью обратно комплементарный» означает отсутствие ошибочно спаренного основания между двумя нуклеотидными последовательностями.In some embodiments, nucleotide sequence I is substantially reverse complementary, substantially reverse complementary, or completely reverse complementary to nucleotide sequence II. “Mostly reverse complementary” means the presence of no more than three mismatched bases between two nucleotide sequences; “substantially reverse complementary” means the presence of no more than one mispaired base between two nucleotide sequences; and “fully reverse complementary” means that there is no mispaired base between two nucleotide sequences.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 3, а нуклеотидная последовательность II представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 4:In some embodiments, nucleotide sequence I is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 3, and nucleotide sequence II is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 4:
5’-CUUCAUUCAUACAGACAAZ3-3’ (SEQ ID NO: 3);5'-CUUCAUUCAUCAGACAAZ 3 -3' (SEQ ID NO: 3);
5’-Z4UUGUCUGUAUGAAUGAAG-3’ (SEQ ID NO: 4),5'-Z 4 UUGUCUGUAUGAAUGAAG-3' (SEQ ID NO: 4),
где Z4 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z3 выбран из A, U, G или C; и Z4 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z3; и в некоторых вариантах осуществления Z3 представляет собой A, а Z4 представляет собой U.where Z 4 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 3 selected from A, U, G or C; and Z 4 is a nucleotide complementary to Z 3 ; and in some embodiments, Z 3 is A and Z 4 is U.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность III, антисмысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность IV, и каждая из нуклеотидной последовательности III и нуклеотидной последовательности IV независимо имеет длину 1-4 нуклеотида; нуклеотидная последовательность III имеет ту же длину и по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV; нуклеотидная последовательность III связана с 5’-концом нуклеотидной последовательности I, а нуклеотидная последовательность IV связана с 3’-концом нуклеотидной последовательности II. В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность IV по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности II, и нуклеотидная последовательность II относится к нуклеотидной последовательности, примыкающей к 5’-концу нуклеотидной последовательности, представленной SEQ ID NO: 1, в мРНК-мишени, и имеющей ту же длину, что и нуклеотидная последовательность IV.In some embodiments, the sense strand further comprises nucleotide sequence III, the antisense strand further comprises nucleotide sequence IV, and nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are each independently 1-4 nucleotides in length; nucleotide sequence III has the same length and is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence IV; nucleotide sequence III is linked to the 5' end of nucleotide sequence I, and nucleotide sequence IV is linked to the 3' end of nucleotide sequence II. In some embodiments, nucleotide sequence IV is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence II, and nucleotide sequence II refers to a nucleotide sequence adjacent to the 5' end of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1 in the target mRNA, and having the same length as the nucleotide sequence IV.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV обе имеют длину в один нуклеотид. Основание нуклеотидной последовательности III представляет собой U, а основание нуклеотидной последовательности IV представляет собой A; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 20/20; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой CU, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой AG; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину три нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой UCU, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой AGA; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 22/22; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину четыре нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой UUCU, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой AGAA; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 23/23. В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой CU, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой AG; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21.In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are both one nucleotide in length. The base of nucleotide sequence III is U, and the base of nucleotide sequence IV is A; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 20/20; or nucleotide sequences III and IV are both two nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is CU and the base composition of nucleotide sequence IV is AG; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 21/21; or nucleotide sequences III and IV are both three nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is UCU and the base composition of nucleotide sequence IV is AGA; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 22/22; or nucleotide sequences III and IV are both four nucleotides in length, and in the 5' to 3' direction, the base composition of nucleotide sequence III is UUCU and the base composition of nucleotide sequence IV is AGAA; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 23/23. In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are two nucleotides in length, and in the 5' to 3' end direction, the base composition of nucleotide sequence III is CU and the base composition of nucleotide sequence IV is AG; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 21/21.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV. Таким образом, если известно основание(ия) нуклеотидной последовательности III, то основание(ия) нуклеотидной последовательности IV также может быть определено.In some embodiments, nucleotide sequence III is completely reverse complementary to nucleotide sequence IV. Thus, if the base(s) of nucleotide sequence III is known, then the base(s) of nucleotide sequence IV can also be determined.
Вторая миРНКSecond miRNA
Согласно настоящему изобретению миРНК может представлять собой вторую миРНК.According to the present invention, the siRNA may be a second siRNA.
Вторая миРНК содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь. Каждый нуклеотид во второй миРНК независимо представляет собой модифицированный или немодифицированный нуклеотид, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность I, антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность II, и нуклеотидная последовательность I и нуклеотидная последовательность II по меньшей мере частично обратно комплементарны, образуя двухцепочечную область, где нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 61, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 62, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:The second siRNA contains a sense strand and an antisense strand. Each nucleotide in the second siRNA is independently a modified or unmodified nucleotide, wherein the sense strand contains a nucleotide sequence I, the antisense strand contains a nucleotide sequence II, and the nucleotide sequence I and nucleotide sequence II are at least partially reverse complementary, forming a double-stranded region where the nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 61, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II is the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 62 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-CUACAGUUUAGAAGAUUUZ5-3’ (SEQ ID NO: 61);5'-CUACAGUUUAGAAGAUUUZ 5 -3' (SEQ ID NO: 61);
5’-Z6AAAUCUUCUAAACUGUAG-3’ (SEQ ID NO: 62),5'-Z 6 AAAUCUUCUAAACUGUAG-3' (SEQ ID NO: 62),
где Z5 представляет собой A, Z6 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z7 в сайте, соответствующем Z5, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z8 в сайте, соответствующем Z6, и Z8 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи.where Z 5 is A, Z 6 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 7 at the site corresponding to Z 5 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 8 at the site corresponding to Z 6 , and Z 8 represents the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность I, а антисмысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность II.In some embodiments, the sense strand contains exclusively nucleotide sequence I, and the antisense strand contains exclusively nucleotide sequence II.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 61, не более чем по одному нуклеотиду, и/или нуклеотидная последовательность II отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 62, не более чем по одному нуклеотиду.In some embodiments, nucleotide sequence I differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 61 by no more than one nucleotide, and/or nucleotide sequence II differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 62 by no more than one nucleotide.
В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду между нуклеотидной последовательностью II и нуклеотидной последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 62, включает различие в сайте Z8, и Z8 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду представляет собой различие в сайте Z8, и Z8 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления Z7 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z8. миРНК, имеющие вышеуказанное различие по нуклеотиду, обладают более высокой способностью миРНК ингибировать мРНК-мишень, и эти миРНК также включены в объем настоящего изобретения.In some embodiments, the nucleotide difference between nucleotide sequence II and the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 62 includes a difference in site Z 8 , and Z 8 is selected from A, C, or G. In some embodiments, the nucleotide difference is the difference is the Z 8 site, and Z 8 is selected from A, C, or G. In some embodiments, Z 7 is a nucleotide complementary to Z 8 . siRNAs having the above nucleotide difference have a higher ability of the siRNA to inhibit the target mRNA, and these siRNAs are also included in the scope of the present invention.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I является преимущественно обратно комплементарной, по существу обратно комплементарной или полностью обратно комплементарной нуклеотидной последовательности II.In some embodiments, nucleotide sequence I is substantially reverse complementary, substantially reverse complementary, or completely reverse complementary to nucleotide sequence II.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 63, а нуклеотидная последовательность II представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 64:In some embodiments, nucleotide sequence I is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 63, and nucleotide sequence II is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 64:
5’-CUACAGUUUAGAAGAUUUZ7-3’ (SEQ ID NO: 63);5'-CUACAGUUUAGAAGAUUUZ 7 -3' (SEQ ID NO: 63);
5’-Z8AAAUCUUCUAAACUGUAG-3’ (SEQ ID NO: 64),5'-Z 8 AAAUCUUCUAAACUGUAG-3' (SEQ ID NO: 64),
где Z8 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z7 выбран из A, U, G или C; и Z8 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z7; и в некоторых вариантах осуществления Z7 представляет собой A, а Z8 представляет собой U.where Z 8 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 7 selected from A, U, G or C; and Z 8 is a nucleotide complementary to Z 7 ; and in some embodiments, Z 7 is A and Z 8 is U.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность III, антисмысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность IV, и каждая из нуклеотидной последовательности III и нуклеотидной последовательности IV независимо имеет длину 1-4 нуклеотида; нуклеотидная последовательность III имеет ту же длину и по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV; нуклеотидная последовательность III связана с 5’-концом нуклеотидной последовательности I, а нуклеотидная последовательность IV связана с 3’-концом нуклеотидной последовательности II. Нуклеотидная последовательность IV по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности II, и нуклеотидная последовательность II относится к нуклеотидной последовательности, примыкающей к 5’-концу нуклеотидной последовательности, представленной SEQ ID NO: 61, в мРНК-мишени, и имеющей ту же длину, что и нуклеотидная последовательность IV.In some embodiments, the sense strand further comprises nucleotide sequence III, the antisense strand further comprises nucleotide sequence IV, and nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are each independently 1-4 nucleotides in length; nucleotide sequence III has the same length and is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence IV; nucleotide sequence III is linked to the 5' end of nucleotide sequence I, and nucleotide sequence IV is linked to the 3' end of nucleotide sequence II. Nucleotide sequence IV is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence II, and nucleotide sequence II refers to the nucleotide sequence adjacent to the 5' end of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 61 in the target mRNA and having the same length , the same as the nucleotide sequence of IV.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV обе имеют длину в один нуклеотид. Основание нуклеотидной последовательности III представляет собой A, а основание нуклеотидной последовательности IV представляет собой U; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 20/20; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой UA, и состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой UA; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину три нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой AUA, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой UAU; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 22/22; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину четыре нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой CAUA, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой UAUG; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 23/23. В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой UA, и состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой UA; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21.In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are both one nucleotide in length. The base of nucleotide sequence III is A, and the base of nucleotide sequence IV is U; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 20/20; or nucleotide sequences III and IV are both two nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is UA, and the base composition of nucleotide sequence IV is UA; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 21/21; or nucleotide sequences III and IV are both three nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is AUA and the base composition of nucleotide sequence IV is UAU; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 22/22; or nucleotide sequences III and IV are both four nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is CAUA and the base composition of nucleotide sequence IV is UAUG; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 23/23. In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are two nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is UA, and the base composition of nucleotide sequence IV is UA; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 21/21.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV. Таким образом, если известно основание(ия) нуклеотидной последовательности III, то основание(ия) нуклеотидной последовательности IV также может быть определено.In some embodiments, nucleotide sequence III is completely reverse complementary to nucleotide sequence IV. Thus, if the base(s) of nucleotide sequence III is known, then the base(s) of nucleotide sequence IV can also be determined.
Третья миРНКThird miRNA
Согласно настоящему изобретению миРНК может представлять собой третью миРНК.According to the present invention, the siRNA may be a third siRNA.
Третья миРНК содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь. Каждый нуклеотид в третьей миРНК независимо представляет собой модифицированный или немодифицированный нуклеотид, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность I, антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность II, и нуклеотидная последовательность I и нуклеотидная последовательность II по меньшей мере частично обратно комплементарны, образуя двухцепочечную область, где нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 121, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 122, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:The third siRNA contains a sense strand and an antisense strand. Each nucleotide in the third siRNA is independently a modified or unmodified nucleotide, wherein the sense strand contains a nucleotide sequence I, the antisense strand contains a nucleotide sequence II, and the nucleotide sequence I and nucleotide sequence II are at least partially reverse complementary, forming a double-stranded region where the nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 121, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II has the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 122 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-GGAAGGUUACCGAGCAAUZ9-3’ (SEQ ID NO: 121);5'-GGAAGGUUACCGAGCAAUZ 9 -3' (SEQ ID NO: 121);
5’-Z10AUUGCUCGGUAACCUUCC-3’ (SEQ ID NO: 122),5'-Z 10 AUUGCUCGGUAACCUUCC-3' (SEQ ID NO: 122),
где Z9 представляет собой A, Z10 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z11 в сайте, соответствующем Z9, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z12 в сайте, соответствующем Z10, и Z12 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи.where Z 9 is A, Z 10 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 11 at the site corresponding to Z 9 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 12 at the site corresponding to Z 10 , and Z 12 represents the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность I, а антисмысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность II.In some embodiments, the sense strand contains exclusively nucleotide sequence I, and the antisense strand contains exclusively nucleotide sequence II.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 121, не более чем по одному нуклеотиду, и/или нуклеотидная последовательность II отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 122, не более чем по одному нуклеотиду.In some embodiments, nucleotide sequence I differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 121 by no more than one nucleotide, and/or nucleotide sequence II differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 122 by no more than one nucleotide.
В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду между нуклеотидной последовательностью II и нуклеотидной последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 122, включает различие в сайте Z12, и Z12 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду представляет собой различие в сайте Z12, и Z12 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления Z11 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z12. миРНК, имеющие вышеуказанное различие по нуклеотиду, обладают более высокой способностью миРНК ингибировать мРНК-мишень, и эти миРНК также включены в объем настоящего изобретения.In some embodiments, the nucleotide difference between nucleotide sequence II and the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 122 includes a difference in site Z 12 , and Z 12 is selected from A, C, or G. In some embodiments, the nucleotide difference is the difference is the Z 12 site, and Z 12 is selected from A, C, or G. In some embodiments, Z 11 is a nucleotide complementary to Z 12 . siRNAs having the above nucleotide difference have a higher ability of the siRNA to inhibit the target mRNA, and these siRNAs are also included in the scope of the present invention.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I является преимущественно обратно комплементарной, по существу обратно комплементарной или полностью обратно комплементарной нуклеотидной последовательности II.In some embodiments, nucleotide sequence I is substantially reverse complementary, substantially reverse complementary, or completely reverse complementary to nucleotide sequence II.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 123, а нуклеотидная последовательность II представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 124:In some embodiments, nucleotide sequence I is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 123, and nucleotide sequence II is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 124:
5’-GGAAGGUUACCGAGCAAUZ11-3’ (SEQ ID NO: 123);5'-GGAAGGUUACCGAGCAAUZ 11 -3' (SEQ ID NO: 123);
5’-Z12AUUGCUCGGUAACCUUCC-3’ (SEQ ID NO: 124),5'-Z 12 AUUGCUCGGUAACCUUCC-3' (SEQ ID NO: 124),
где Z12 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z11 выбран из A, U, G или C; и Z12 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z11; и в некоторых вариантах осуществления Z11 представляет собой A, а Z12 представляет собой U.where Z 12 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 11 selected from A, U, G or C; and Z 12 is a nucleotide complementary to Z 11 ; and in some embodiments, Z 11 is A and Z 12 is U.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность III, антисмысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность IV, и каждая из нуклеотидной последовательности III и нуклеотидной последовательности IV независимо имеет длину 1-4 нуклеотида; нуклеотидная последовательность III имеет ту же длину и по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV; нуклеотидная последовательность III связана с 5’-концом нуклеотидной последовательности I, а нуклеотидная последовательность IV связана с 3’-концом нуклеотидной последовательности II. Нуклеотидная последовательность IV по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности II, и нуклеотидная последовательность II относится к нуклеотидной последовательности, примыкающей к 5’-концу нуклеотидной последовательности, представленной SEQ ID NO: 121, в мРНК-мишени, и имеющей ту же длину, что и нуклеотидная последовательность IV.In some embodiments, the sense strand further comprises nucleotide sequence III, the antisense strand further comprises nucleotide sequence IV, and nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are each independently 1-4 nucleotides in length; nucleotide sequence III has the same length and is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence IV; nucleotide sequence III is linked to the 5' end of nucleotide sequence I, and nucleotide sequence IV is linked to the 3' end of nucleotide sequence II. Nucleotide sequence IV is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence II, and nucleotide sequence II refers to the nucleotide sequence adjacent to the 5' end of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 121 in the target mRNA and having the same length , the same as the nucleotide sequence of IV.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV обе имеют длину в один нуклеотид. Основание нуклеотидной последовательности III представляет собой G, а основание нуклеотидной последовательности IV представляет собой C; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 20/20; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой AG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CU; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину три нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой CAG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CUG; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 22/22; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину четыре нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой CCAG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CUGG; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 23/23. В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой AG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CU; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21.In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are both one nucleotide in length. The base of nucleotide sequence III is G and the base of nucleotide sequence IV is C; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 20/20; or nucleotide sequences III and IV are both two nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is AG, and the base composition of nucleotide sequence IV is CU; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 21/21; or nucleotide sequences III and IV are both three nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is CAG and the base composition of nucleotide sequence IV is CUG; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 22/22; or nucleotide sequences III and IV are both four nucleotides in length, and in the 5' to 3' direction, the base composition of nucleotide sequence III is CCAG and the base composition of nucleotide sequence IV is CUGG; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 23/23. In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are two nucleotides in length, and in the 5' to 3' end direction, the base composition of nucleotide sequence III is AG and the base composition of nucleotide sequence IV is CU; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 21/21.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV. Таким образом, если известно основание(ия) нуклеотидной последовательности III, то основание(ия) нуклеотидной последовательности IV также может быть определено.In some embodiments, nucleotide sequence III is completely reverse complementary to nucleotide sequence IV. Thus, if the base(s) of nucleotide sequence III is known, then the base(s) of nucleotide sequence IV can also be determined.
Четвертая миРНКFourth miRNA
Согласно настоящему изобретению миРНК может представлять собой четвертую миРНК.According to the present invention, the siRNA may be a fourth siRNA.
Четвертая миРНК содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь. Каждый нуклеотид в четвертой миРНК независимо представляет собой модифицированный или немодифицированный нуклеотид, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность I, антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность II, и нуклеотидная последовательность I и нуклеотидная последовательность II по меньшей мере частично обратно комплементарны, образуя двухцепочечную область, где нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 181, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 182, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:The fourth siRNA contains a sense strand and an antisense strand. Each nucleotide in the fourth siRNA is independently a modified or unmodified nucleotide, wherein the sense strand contains a nucleotide sequence I, the antisense strand contains a nucleotide sequence II, and the nucleotide sequence I and nucleotide sequence II are at least partially reverse complementary, forming a double-stranded region where the nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 181, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II has the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 182 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-AGAACAGACAGCAGAAUUZ13-3’ (SEQ ID NO: 181);5'-AGAACAGACAGCAGAUUZ 13 -3' (SEQ ID NO: 181);
5’-Z14AAUUCUGCUGUCUGUUCU-3’ (SEQ ID NO: 182),5'-Z 14 AAUUCUGCUGUCUGUUCU-3' (SEQ ID NO: 182),
где Z13 представляет собой A, Z14 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z15 в сайте, соответствующем Z13, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z16 в сайте, соответствующем Z14, и Z16 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи.where Z 13 is A, Z 14 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 15 at the site corresponding to Z 13 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 16 at the site corresponding to Z 14 , and Z 16 represents the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность I, а антисмысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность II.In some embodiments, the sense strand contains exclusively nucleotide sequence I, and the antisense strand contains exclusively nucleotide sequence II.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 181, не более чем по одному нуклеотиду, и/или нуклеотидная последовательность II отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 182, не более чем по одному нуклеотиду.In some embodiments, nucleotide sequence I differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 181 by no more than one nucleotide, and/or nucleotide sequence II differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 182 by no more than one nucleotide.
В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду между нуклеотидной последовательностью II и нуклеотидной последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 182, включает различие в сайте Z16, и Z16 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду представляет собой различие в сайте Z16, и Z16 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления Z15 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z16. миРНК, имеющие вышеуказанное различие по нуклеотиду, обладают более высокой способностью миРНК ингибировать мРНК-мишень, и эти миРНК также включены в объем настоящего изобретения.In some embodiments, the nucleotide difference between nucleotide sequence II and the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 182 includes a difference in the Z 16 site, and Z 16 is selected from A, C, or G. In some embodiments, the nucleotide difference is the difference is the Z 16 site, and Z 16 is selected from A, C, or G. In some embodiments, Z 15 is a nucleotide complementary to Z 16 . siRNAs having the above nucleotide difference have a higher ability of the siRNA to inhibit the target mRNA, and these siRNAs are also included in the scope of the present invention.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I является преимущественно обратно комплементарной, по существу обратно комплементарной или полностью обратно комплементарной нуклеотидной последовательности II.In some embodiments, nucleotide sequence I is substantially reverse complementary, substantially reverse complementary, or completely reverse complementary to nucleotide sequence II.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 183, а нуклеотидная последовательность II представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 184:In some embodiments, nucleotide sequence I is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 183, and nucleotide sequence II is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 184:
5’-AGAACAGACAGCAGAAUUZ15-3’ (SEQ ID NO: 183);5'-AGAACAGACAGCAGAUUZ 15 -3' (SEQ ID NO: 183);
5’-Z16AAUUCUGCUGUCUGUUCU-3’ (SEQ ID NO: 184),5'-Z 16 AAUUCUGCUGUCUGUUCU-3' (SEQ ID NO: 184),
где Z16 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z15 выбран из A, U, G или C; и Z16 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z15; и в некоторых вариантах осуществления Z15 представляет собой A, а Z16 представляет собой U.where Z 16 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 15 selected from A, U, G or C; and Z 16 is a nucleotide complementary to Z 15 ; and in some embodiments, Z 15 is A and Z 16 is U.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность III, антисмысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность IV, и каждая из нуклеотидной последовательности III и нуклеотидной последовательности IV независимо имеет длину 1-4 нуклеотида; нуклеотидная последовательность III имеет ту же длину и по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV; нуклеотидная последовательность III связана с 5’-концом нуклеотидной последовательности I, а нуклеотидная последовательность IV связана с 3’-концом нуклеотидной последовательности II. Нуклеотидная последовательность IV по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности II, и нуклеотидная последовательность II относится к нуклеотидной последовательности, примыкающей к 5’-концу нуклеотидной последовательности, представленной SEQ ID NO: 181, в мРНК-мишени, и имеющей ту же длину, что и нуклеотидная последовательность IV.In some embodiments, the sense strand further comprises nucleotide sequence III, the antisense strand further comprises nucleotide sequence IV, and nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are each independently 1-4 nucleotides in length; nucleotide sequence III has the same length and is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence IV; nucleotide sequence III is linked to the 5' end of nucleotide sequence I, and nucleotide sequence IV is linked to the 3' end of nucleotide sequence II. Nucleotide sequence IV is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence II, and nucleotide sequence II refers to the nucleotide sequence adjacent to the 5' end of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 181 in the target mRNA and having the same length , the same as the nucleotide sequence of IV.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV обе имеют длину в один нуклеотид. Основание нуклеотидной последовательности III представляет собой G, а основание нуклеотидной последовательности IV представляет собой C; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 20/20; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой GG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CC; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину три нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой AGG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CCU; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 22/22; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину четыре нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой CAGG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CCUG; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 23/23. В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой GG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CC; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21.In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are both one nucleotide in length. The base of nucleotide sequence III is G and the base of nucleotide sequence IV is C; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 20/20; or nucleotide sequences III and IV are both two nucleotides in length, and in the direction from the 5' end to the 3' end, the base composition of nucleotide sequence III is GG and the base composition of nucleotide sequence IV is CC; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 21/21; or nucleotide sequences III and IV are both three nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is AGG and the base composition of nucleotide sequence IV is CCU; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 22/22; or nucleotide sequences III and IV are both four nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is CAGG and the base composition of nucleotide sequence IV is CCUG; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 23/23. In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are two nucleotides in length, and in the 5' to 3' end direction, the base composition of nucleotide sequence III is GG and the base composition of nucleotide sequence IV is CC; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 21/21.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV. Таким образом, если известно основание(ия) нуклеотидной последовательности III, то основание(ия) нуклеотидной последовательности IV также может быть определено.In some embodiments, nucleotide sequence III is completely reverse complementary to nucleotide sequence IV. Thus, if the base(s) of nucleotide sequence III is known, then the base(s) of nucleotide sequence IV can also be determined.
Пятая миРНКFifth miRNA
Согласно настоящему изобретению миРНК может представлять собой пятую миРНК.According to the present invention, the siRNA may be a fifth siRNA.
Пятая миРНК содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь. Каждый нуклеотид в пятой миРНК независимо представляет собой модифицированный или немодифицированный нуклеотид, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность I, антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность II, и нуклеотидная последовательность I и нуклеотидная последовательность II по меньшей мере частично обратно комплементарны, образуя двухцепочечную область, где нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 241, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 242, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:The fifth miRNA contains a sense strand and an antisense strand. Each nucleotide in the fifth siRNA is independently a modified or unmodified nucleotide, wherein the sense strand contains a nucleotide sequence I, the antisense strand contains a nucleotide sequence II, and the nucleotide sequence I and nucleotide sequence II are at least partially reverse complementary, forming a double-stranded region where the nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 241, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II has the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 242 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-CCAAGAAGAACGCUGCAAZ17-3’ (SEQ ID NO: 241);5'-CCAAGAAGAACGCUGCAAZ 17 -3' (SEQ ID NO: 241);
5’-Z18UUGCAGCGUUCUUCUUGG-3’ (SEQ ID NO: 242),5'-Z 18 UUGCAGCGUUCUUCUUGG-3' (SEQ ID NO: 242),
где Z17 представляет собой A, Z18 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z19 в сайте, соответствующем Z17, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z20 в сайте, соответствующем Z18, и Z20 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи.where Z 17 is A, Z 18 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 19 at the site corresponding to Z 17 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 20 at the site corresponding to Z 18 , and Z 20 represents the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность I, а антисмысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность II.In some embodiments, the sense strand contains exclusively nucleotide sequence I, and the antisense strand contains exclusively nucleotide sequence II.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 241, не более чем по одному нуклеотиду, и/или нуклеотидная последовательность II отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 242, не более чем по одному нуклеотиду.In some embodiments, nucleotide sequence I differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 241 by no more than one nucleotide, and/or nucleotide sequence II differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 242 by no more than one nucleotide.
В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду между нуклеотидной последовательностью II и нуклеотидной последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 242, включает различие в сайте Z20, и Z20 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду представляет собой различие в сайте Z20, и Z20 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления Z19 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z20. миРНК, имеющие вышеуказанное различие по нуклеотиду, обладают более высокой способностью миРНК ингибировать мРНК-мишень, и эти миРНК также включены в объем настоящего изобретения.In some embodiments, the nucleotide difference between nucleotide sequence II and the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 242 includes a difference in the Z 20 site, and Z 20 is selected from A, C, or G. In some embodiments, the nucleotide difference is the difference is the Z 20 site, and Z 20 is selected from A, C, or G. In some embodiments, Z 19 is a nucleotide complementary to Z 20 . siRNAs having the above nucleotide difference have a higher ability of the siRNA to inhibit the target mRNA, and these siRNAs are also included in the scope of the present invention.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I является преимущественно обратно комплементарной, по существу обратно комплементарной или полностью обратно комплементарной нуклеотидной последовательности II.In some embodiments, nucleotide sequence I is substantially reverse complementary, substantially reverse complementary, or completely reverse complementary to nucleotide sequence II.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 243, а нуклеотидная последовательность II представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 244:In some embodiments, nucleotide sequence I is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 243, and nucleotide sequence II is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 244:
5’-CCAAGAAGAACGCUGCAAZ19-3’ (SEQ ID NO: 243);5'-CCAAGAAGAACGCUGCAAZ 19 -3' (SEQ ID NO: 243);
5’-Z20UUGCAGCGUUCUUCUUGG-3’ (SEQ ID NO: 244),5'-Z 20 UUGCAGCGUUCUUCUUGG-3' (SEQ ID NO: 244),
где Z20 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z19 выбран из A, U, G или C; и Z20 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z19; и в некоторых вариантах осуществления Z19 представляет собой A, а Z20 представляет собой U.where Z 20 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 19 selected from A, U, G or C; and Z 20 is a nucleotide complementary to Z 19 ; and in some embodiments, Z 19 is A and Z 20 is U.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность III, антисмысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность IV, и каждая из нуклеотидной последовательности III и нуклеотидной последовательности IV независимо имеет длину 1-4 нуклеотида; нуклеотидная последовательность III имеет ту же длину и по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV; нуклеотидная последовательность III связана с 5’-концом нуклеотидной последовательности I, а нуклеотидная последовательность IV связана с 3’-концом нуклеотидной последовательности II. Нуклеотидная последовательность IV по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности II, и нуклеотидная последовательность II относится к нуклеотидной последовательности, примыкающей к 5’-концу нуклеотидной последовательности, представленной SEQ ID NO: 241, в мРНК-мишени, и имеющей ту же длину, что и нуклеотидная последовательность IV.In some embodiments, the sense strand further comprises nucleotide sequence III, the antisense strand further comprises nucleotide sequence IV, and nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are each independently 1-4 nucleotides in length; nucleotide sequence III has the same length and is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence IV; nucleotide sequence III is linked to the 5' end of nucleotide sequence I, and nucleotide sequence IV is linked to the 3' end of nucleotide sequence II. Nucleotide sequence IV is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence II, and nucleotide sequence II refers to the nucleotide sequence adjacent to the 5' end of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 241 in the target mRNA and having the same length , the same as the nucleotide sequence of IV.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV обе имеют длину в один нуклеотид. Основание нуклеотидной последовательности III представляет собой G, а основание нуклеотидной последовательности IV представляет собой C; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 20/20; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой GG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CC; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину три нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой AGG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CCU; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 22/22; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину четыре нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой CAGG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CCUG; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 23/23. В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой GG, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой CC; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21.In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are both one nucleotide in length. The base of nucleotide sequence III is G and the base of nucleotide sequence IV is C; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 20/20; or nucleotide sequences III and IV are both two nucleotides in length, and in the direction from the 5' end to the 3' end, the base composition of nucleotide sequence III is GG and the base composition of nucleotide sequence IV is CC; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 21/21; or nucleotide sequences III and IV are both three nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is AGG and the base composition of nucleotide sequence IV is CCU; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 22/22; or nucleotide sequences III and IV are both four nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is CAGG and the base composition of nucleotide sequence IV is CCUG; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 23/23. In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are two nucleotides in length, and in the 5' to 3' end direction, the base composition of nucleotide sequence III is GG and the base composition of nucleotide sequence IV is CC; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 21/21.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV. Таким образом, если известно основание(ия) нуклеотидной последовательности III, то основание(ия) нуклеотидной последовательности IV также может быть определено.In some embodiments, nucleotide sequence III is completely reverse complementary to nucleotide sequence IV. Thus, if the base(s) of nucleotide sequence III is known, then the base(s) of nucleotide sequence IV can also be determined.
Шестая миРНКSixth miRNA
Согласно настоящему изобретению миРНК может представлять собой шестую миРНК.According to the present invention, the siRNA may be a sixth siRNA.
Шестая миРНК содержит смысловую цепь и антисмысловую цепь. Каждый нуклеотид в шестой миРНК независимо представляет собой модифицированный или немодифицированный нуклеотид, где смысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность I, антисмысловая цепь содержит нуклеотидную последовательность II, и нуклеотидная последовательность I и нуклеотидная последовательность II по меньшей мере частично обратно комплементарны, образуя двухцепочечную область, где нуклеотидная последовательность I имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 301, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам; и нуклеотидная последовательность II имеет ту же длину, что и нуклеотидная последовательность, представленная в SEQ ID NO: 302, и отличается от нее не более чем по трем нуклеотидам:The sixth miRNA contains a sense strand and an antisense strand. Each nucleotide in the sixth siRNA is independently a modified or unmodified nucleotide, wherein the sense strand contains a nucleotide sequence I, the antisense strand contains a nucleotide sequence II, and the nucleotide sequence I and nucleotide sequence II are at least partially reverse complementary, forming a double-stranded region where the nucleotide sequence I has the same length as the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 301, and differs from it by no more than three nucleotides; and nucleotide sequence II has the same length as the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 302 and differs from it by no more than three nucleotides:
5’-CCAGUAAGCAAGCCAGAAZ21-3’ (SEQ ID NO: 301);5'-CCAGUAAGCAAGCCAGAAZ 21 -3' (SEQ ID NO: 301);
5’-Z22UUCUGGCUUGCUUACUGG-3’ (SEQ ID NO: 302),5'-Z 22 UUCUGGCUUGCUUACUGG-3' (SEQ ID NO: 302),
где Z21 представляет собой A, Z22 представляет собой U, нуклеотидная последовательность I содержит нуклеотид Z23 в сайте, соответствующем Z21, нуклеотидная последовательность II содержит нуклеотид Z24 в сайте, соответствующем Z22, и Z24 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи.where Z 21 is A, Z 22 is U, nucleotide sequence I contains nucleotide Z 23 at the site corresponding to Z 21 , nucleotide sequence II contains nucleotide Z 24 at the site corresponding to Z 22 , and Z 24 is the first nucleotide with 5 '-end of the antisense strand.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность I, а антисмысловая цепь содержит исключительно нуклеотидную последовательность II.In some embodiments, the sense strand contains exclusively nucleotide sequence I, and the antisense strand contains exclusively nucleotide sequence II.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 301, не более чем по одному нуклеотиду, и/или нуклеотидная последовательность II отличается от нуклеотидной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 302, не более чем по одному нуклеотиду.In some embodiments, nucleotide sequence I differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 301 by no more than one nucleotide, and/or nucleotide sequence II differs from the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 302 by no more than one nucleotide.
В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду между нуклеотидной последовательностью II и нуклеотидной последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 302, включает различие в сайте Z24, и Z24 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления различие по нуклеотиду представляет собой различие в сайте Z24, и Z24 выбран из A, C или G. В некоторых вариантах осуществления Z23 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z24. миРНК, имеющие вышеуказанное различие по нуклеотиду, обладают более высокой способностью миРНК ингибировать мРНК-мишень, и эти миРНК также включены в объем настоящего изобретения.In some embodiments, the nucleotide difference between nucleotide sequence II and the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 302 includes a difference in the Z 24 site, and Z 24 is selected from A, C, or G. In some embodiments, the nucleotide difference is the difference is the Z 24 site, and Z 24 is selected from A, C, or G. In some embodiments, Z 23 is a nucleotide complementary to Z 24 . siRNAs having the above nucleotide difference have a higher ability of the siRNA to inhibit the target mRNA, and these siRNAs are also included in the scope of the present invention.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I является преимущественно обратно комплементарной, по существу обратно комплементарной или полностью обратно комплементарной нуклеотидной последовательности II.In some embodiments, nucleotide sequence I is substantially reverse complementary, substantially reverse complementary, or completely reverse complementary to nucleotide sequence II.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность I представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 303, а нуклеотидная последовательность II представляет собой нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 304:In some embodiments, nucleotide sequence I is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 303, and nucleotide sequence II is the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 304:
5’-CCAGUAAGCAAGCCAGAAZ23-3’ (SEQ ID NO: 303);5'-CCAGUAAGCAAGCCAGAAZ 23 -3' (SEQ ID NO: 303);
5’-Z24UUCUGGCUUGCUUACUGG-3’ (SEQ ID NO: 304),5'-Z 24 UUCUGGCUUGCUUACUGG-3' (SEQ ID NO: 304),
где Z24 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z23 выбран из A, U, G или C; и Z24 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z23; и в некоторых вариантах осуществления Z23 представляет собой A, а Z24 представляет собой U.where Z 24 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 23 selected from A, U, G or C; and Z 24 is a nucleotide complementary to Z 23 ; and in some embodiments, Z 23 is A and Z 24 is U.
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность III, антисмысловая цепь дополнительно содержит нуклеотидную последовательность IV, и каждая из нуклеотидной последовательности III и нуклеотидной последовательности IV независимо имеет длину 1-4 нуклеотида; нуклеотидная последовательность III имеет ту же длину и по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV; нуклеотидная последовательность III связана с 5’-концом нуклеотидной последовательности I, а нуклеотидная последовательность IV связана с 3’-концом нуклеотидной последовательности II. Нуклеотидная последовательность IV по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности II, и нуклеотидная последовательность II относится к нуклеотидной последовательности, примыкающей к 5’-концу нуклеотидной последовательности, представленной SEQ ID NO: 301, в мРНК-мишени, и имеющей ту же длину, что и нуклеотидная последовательность IV.In some embodiments, the sense strand further comprises nucleotide sequence III, the antisense strand further comprises nucleotide sequence IV, and nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are each independently 1-4 nucleotides in length; nucleotide sequence III has the same length and is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence IV; nucleotide sequence III is linked to the 5' end of nucleotide sequence I, and nucleotide sequence IV is linked to the 3' end of nucleotide sequence II. Nucleotide sequence IV is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence II, and nucleotide sequence II refers to the nucleotide sequence adjacent to the 5' end of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 301 in the target mRNA and having the same length , the same as the nucleotide sequence of IV.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV обе имеют длину в один нуклеотид. Основание нуклеотидной последовательности III представляет собой A, а основание нуклеотидной последовательности IV представляет собой U; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 20/20; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой UA, и состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой UA; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину три нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой UUA, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой UAA; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 22/22; или нуклеотидные последовательности III и IV обе имеют длину четыре нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой GUUA, а состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой UAAC; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 23/23. В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III и нуклеотидная последовательность IV имеют длину два нуклеотида, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу состав оснований нуклеотидной последовательности III представляет собой UA, и состав оснований нуклеотидной последовательности IV представляет собой UA; в этом случае отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи составляет 21/21.In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are both one nucleotide in length. The base of nucleotide sequence III is A, and the base of nucleotide sequence IV is U; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 20/20; or nucleotide sequences III and IV are both two nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is UA, and the base composition of nucleotide sequence IV is UA; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 21/21; or nucleotide sequences III and IV are both three nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is UUA and the base composition of nucleotide sequence IV is UAA; in this case, the ratio of the length of the sense chain to the length of the antisense chain is 22/22; or nucleotide sequences III and IV are both four nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is GUUA and the base composition of nucleotide sequence IV is UAAC; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 23/23. In some embodiments, nucleotide sequence III and nucleotide sequence IV are two nucleotides in length, and in the 5'-end to 3'-end direction, the base composition of nucleotide sequence III is UA, and the base composition of nucleotide sequence IV is UA; in this case, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand is 21/21.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность III полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности IV. Таким образом, если известно основание(ия) нуклеотидной последовательности III, то основание(ия) нуклеотидной последовательности IV также может быть определено.In some embodiments, nucleotide sequence III is completely reverse complementary to nucleotide sequence IV. Thus, if the base(s) of nucleotide sequence III is known, then the base(s) of nucleotide sequence IV can also be determined.
Выступающие концы и модификация миРНКProtruding ends and siRNA modification
Следующее описание нуклеотидной последовательности V, последовательности нуклеиновой кислоты, нуклеотидной модификации в миРНК и модифицированной последовательности применимо к любой из миРНК с первой по шестую. То есть, если не указано иное, следующее описание миРНК следует рассматривать как описывающее первую миРНК, вторую миРНК, третью миРНК, четвертую миРНК, пятую миРНК и шестую миРНК поочередно. Например, если конкретная миРНК не указана, «миРНК дополнительно содержит нуклеотидную последовательность V» означает «первая миРНК, вторая миРНК, третья миРНК, четвертая миРНК, пятая миРНК или шестая миРНК дополнительно содержит нуклеотидную последовательность V».The following description of the V nucleotide sequence, the nucleic acid sequence, the nucleotide modification in the miRNA and the modified sequence applies to any of the first to sixth miRNAs. That is, unless otherwise indicated, the following description of the miRNA should be considered to describe the first miRNA, second miRNA, third miRNA, fourth miRNA, fifth miRNA, and sixth miRNA in turn. For example, if a specific miRNA is not specified, "miRNA further comprises a V nucleotide sequence" means "a first miRNA, a second miRNA, a third miRNA, a fourth miRNA, a fifth miRNA, or a sixth miRNA further comprises a V nucleotide sequence."
В некоторых вариантах осуществления смысловая цепь и антисмысловая цепь имеют разную длину. Нуклеотидная последовательность II дополнительно содержит нуклеотидную последовательность V, которая имеет длину 1-3 нуклеотида и связана с 3’-концом антисмысловой цепи с образованием 3’-выступающего конца антисмысловой цепи. Таким образом, отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи в миРНК согласно настоящему изобретению может составлять 19/20, 19/21, 19/22, 20/21, 20/22, 20/23, 21/22, 21/23, 21/24, 22/23, 22/24, 22/25, 23/24, 23/25 или 23/26. В некоторых вариантах осуществления нуклеотидная последовательность V имеет длину 2 нуклеотида. Таким образом, отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи в миРНК согласно настоящему изобретению может составлять 19/21, 21/23 или 23/25.In some embodiments, the sense strand and the antisense strand are of different lengths. Nucleotide sequence II further contains a nucleotide sequence V, which is 1-3 nucleotides in length and is linked to the 3' end of the antisense strand to form a 3' overhanging end of the antisense strand. Thus, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand in the siRNA according to the present invention can be 19/20, 19/21, 19/22, 20/21, 20/22, 20/23, 21/22, 21/23, 21/24, 22/23, 22/24, 22/25, 23/24, 23/25 or 23/26. In some embodiments, the V nucleotide sequence is 2 nucleotides in length. Thus, the ratio of the length of the sense strand to the length of the antisense strand in the siRNA according to the present invention may be 19/21, 21/23 or 23/25.
Каждый нуклеотид в нуклеотидной последовательности V может представлять собой любой нуклеотид. Для упрощения синтеза и снижения затрат на его проведение нуклеотидная последовательность V представляет собой 2 тимидиновых дезоксирибонуклеотида подряд (dTdT) или 2 урациловых рибонуклеотида подряд (UU); или, для улучшения аффинности антисмысловой цепи миРНК к мРНК-мишени, нуклеотидная последовательность V комплементарна нуклеотидам в соответствующем сайте мРНК-мишени. Следовательно, в некоторых вариантах осуществления отношение длины смысловой цепи к длине антисмысловой цепи миРНК согласно настоящему изобретению составляет 19/21 или 21/23. В этом случае миРНК согласно настоящему изобретению обладает лучшей сайленсинговой активностью в отношении мРНК.Each nucleotide in the V nucleotide sequence may be any nucleotide. To simplify the synthesis and reduce the cost of its implementation, the nucleotide sequence V is 2 thymidine deoxyribonucleotides in a row (dTdT) or 2 uracil ribonucleotides in a row (UU); or, to improve the affinity of the antisense strand of the siRNA for the target mRNA, the nucleotide sequence V is complementary to the nucleotides at the corresponding site of the target mRNA. Therefore, in some embodiments, the ratio of sense strand length to antisense strand length of the siRNA of the present invention is 19/21 or 21/23. In this case, the siRNA according to the present invention has better silencing activity against mRNA.
Нуклеотид в соответствующем сайте мРНК-мишени относится к нуклеотиду или нуклеотидной последовательности, примыкающей к нуклеотидной последовательности III мРНК-мишени с 5’-конца. Нуклеотидная последовательность III по существу обратно комплементарна или полностью обратно комплементарна нуклеотидной последовательности II, или представляет собой нуклеотидную последовательность, по существу обратно комплементарную или полностью обратно комплементарную нуклеотидной последовательности, образованной нуклеотидной последовательностью II и нуклеотидной последовательностью IV.A nucleotide at the corresponding site of the target mRNA refers to the nucleotide or nucleotide sequence adjacent to nucleotide sequence III of the target mRNA at the 5' end. Nucleotide sequence III is substantially reverse complementary or completely reverse complementary to nucleotide sequence II, or is a nucleotide sequence substantially reverse complementary or completely reverse complementary to the nucleotide sequence formed by nucleotide sequence II and nucleotide sequence IV.
В некоторых вариантах осуществления для первой миРНК смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 5, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 6:In some embodiments, for the first siRNA, the sense strand of the miRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 5, and the antisense strand of the siRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 6:
5’-CUUCAUUCAUACAGACAAZ3-3’ (SEQ ID NO: 5);5'-CUUCAUUCAUCAGACAAZ 3 -3' (SEQ ID NO: 5);
5’-Z4UUGUCUGUAUGAAUGAAGAG-3’ (SEQ ID NO: 6);5'-Z 4 UUGUCUGUAUGAAUGAAGAG-3' (SEQ ID NO: 6);
или смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 7, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 8:or the sense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 7, and the antisense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 8:
5’-CUCUUCAUUCAUACAGACAAZ3-3’ (SEQ ID NO: 7);5'-CUCUUCAUUCAUCAGACAAZ 3 -3' (SEQ ID NO: 7);
5’-Z4UUGUCUGUAUGAAUGAAGAGAA-3’ (SEQ ID NO: 8);5'-Z 4 UUGUCUGUAUGAAUGAAGAGAA-3' (SEQ ID NO: 8);
где Z4 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z3 выбран из A, U, G или C; и Z4 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z3.where Z 4 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 3 selected from A, U, G or C; and Z 4 is a nucleotide complementary to Z 3 .
В некоторых вариантах осуществления для миРНК смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 65, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 66:In some embodiments, for miRNAs, the sense strand of the miRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 65, and the antisense strand of the siRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 66:
5’-CUACAGUUUAGAAGAUUUZ7-3’ (SEQ ID NO: 65);5'-CUACAGUUUAGAAGAUUUZ 7 -3' (SEQ ID NO: 65);
5’-Z8AAAUCUUCUAAACUGUAGUA-3’ (SEQ ID NO: 66),5'-Z 8 AAAUCUUCUAAACUGUAGUA-3' (SEQ ID NO: 66),
или смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 67, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 68:or the sense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 67, and the antisense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 68:
5’-UACUACAGUUUAGAAGAUUUZ7-3’ (SEQ ID NO: 67);5'-UACUACAGUUAGAAGAUUUZ 7 -3' (SEQ ID NO: 67);
5’-Z8AAAUCUUCUAAACUGUAGUAUG-3’ (SEQ ID NO: 68),5'-Z 8 AAAUCUUCUAAACUGUAGUAUG-3' (SEQ ID NO: 68),
где Z8 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z7 выбран из A, U, G или C; и Z8 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z7.where Z 8 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 7 selected from A, U, G or C; and Z 8 is a nucleotide complementary to Z 7 .
В некоторых вариантах осуществления для третьей миРНК смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 125, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 126:In some embodiments, for the third siRNA, the sense strand of the siRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 125, and the antisense strand of the siRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 126:
5’-GGAAGGUUACCGAGCAAUZ11-3’ (SEQ ID NO: 125);5'-GGAAGGUUACCGAGCAAUZ 11 -3' (SEQ ID NO: 125);
5’-Z12AUUGCUCGGUAACCUUCCCU-3’ (SEQ ID NO: 126),5'-Z 12 AUUGCUCGGUAACCUUCCCU-3' (SEQ ID NO: 126),
или смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 127, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 128:or the sense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 127, and the antisense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 128:
5’-AGGGAAGGUUACCGAGCAAUZ11-3’ (SEQ ID NO: 127);5'-AGGGAAGGUUACCGAGCAAUZ 11 -3' (SEQ ID NO: 127);
5’-Z12AUUGCUCGGUAACCUUCCCUGG-3’ (SEQ ID NO: 128),5'-Z 12 AUUGCUCGGUAACCUUCCCUGG-3' (SEQ ID NO: 128),
где Z12 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z11 выбран из A, U, G или C; и Z12 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z11.where Z 12 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 11 selected from A, U, G or C; and Z 12 is a nucleotide complementary to Z 11 .
В некоторых вариантах осуществления для четвертой миРНК смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 185, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 186:In some embodiments, for the fourth miRNA, the sense strand of the miRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 185, and the antisense strand of the siRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 186:
5’-AGAACAGACAGCAGAAUUZ15-3’ (SEQ ID NO: 185);5'-AGAACAGACAGCAGAUUZ 15 -3' (SEQ ID NO: 185);
5’-Z16AAUUCUGCUGUCUGUUCUCC-3’ (SEQ ID NO: 186),5'-Z 16 AAUUCUGCUGUCUGUUCUCC-3' (SEQ ID NO: 186),
или смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 187, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 188:or the sense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 187, and the antisense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 188:
5’-GGAGAACAGACAGCAGAAUUZ15-3’ (SEQ ID NO: 187);5'-GGAGAACAGACAGCAGAAUUZ 15 -3' (SEQ ID NO: 187);
5’-Z16AAUUCUGCUGUCUGUUCUCCUG-3’ (SEQ ID NO: 188),5'-Z 16 AAUUCUGCUGUCUGUUCUCCUG-3' (SEQ ID NO: 188),
где Z16 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z15 выбран из A, U, G или C; и Z16 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z15.where Z 16 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 15 selected from A, U, G or C; and Z 16 is a nucleotide complementary to Z 15 .
В некоторых вариантах осуществления для пятой миРНК смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 245, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 246:In some embodiments, for the fifth siRNA, the sense strand of the siRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 245 and the antisense strand of the siRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 246:
5’-CCAAGAAGAACGCUGCAAZ19-3’ (SEQ ID NO: 245);5'-CCAAGAAGAACGCUGCAAZ 19 -3' (SEQ ID NO: 245);
5’-Z20UUGCAGCGUUCUUCUUGGCC-3’ (SEQ ID NO: 246),5'-Z 20 UUGCAGCGUUCUUCUUGGCC-3' (SEQ ID NO: 246),
или смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 247, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 248:or the sense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 247, and the antisense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 248:
5’-GGCCAAGAAGAACGCUGCAAZ19-3’ (SEQ ID NO: 247);5'-GGCCAAGAAGAACGCUGCAAZ 19 -3' (SEQ ID NO: 247);
5’-Z20UUGCAGCGUUCUUCUUGGCCUG-3’ (SEQ ID NO: 248),5'-Z 20 UUGCAGCGUUCUUCUUGGCCUG-3' (SEQ ID NO: 248),
где Z20 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z19 выбран из A, U, G или C; и Z20 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z19.where Z 20 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 19 selected from A, U, G or C; and Z 20 is a nucleotide complementary to Z 19 .
В некоторых вариантах осуществления для шестой миРНК смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 305, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 306:In some embodiments, for the sixth siRNA, the sense strand of the miRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 305 and the antisense strand of the siRNA comprises the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 306:
5’-CCAGUAAGCAAGCCAGAAZ23-3’ (SEQ ID NO: 305);5'-CCAGUAAGCAAGCCAGAAZ 23 -3' (SEQ ID NO: 305);
5’-Z24UUCUGGCUUGCUUACUGGUA-3’ (SEQ ID NO: 306),5'-Z 24 UUCUGGCUUGCUUACUGGUA-3' (SEQ ID NO: 306),
или смысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 307, а антисмысловая цепь миРНК содержит нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 308:or the sense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 307, and the antisense strand of the siRNA contains the nucleotide sequence presented in SEQ ID NO: 308:
5’-UACCAGUAAGCAAGCCAGAAZ23-3’ (SEQ ID NO: 307);5'-UACCAGUAAGCAAGCCAGAAZ 23 -3' (SEQ ID NO: 307);
5’-Z24UUCUGGCUUGCUUACUGGUAAC-3’ (SEQ ID NO: 308),5'-Z 24 UUCUGGCUUGCUUACUGGUAAC-3' (SEQ ID NO: 308),
где Z24 представляет собой первый нуклеотид с 5’-конца антисмысловой цепи; Z23 выбран из A, U, G или C; и Z24 представляет собой нуклеотид, комплементарный Z23.where Z 24 represents the first nucleotide from the 5' end of the antisense strand; Z 23 selected from A, U, G or C; and Z 24 is a nucleotide complementary to Z 23 .
В некоторых вариантах осуществления миРНК согласно настоящему изобретению представляет собой siC5a1, siC5a2, siC5b1, siC5b2, siC5c1, siC5c2, siC5d1, siC5d2, siC5e1, siC5e2, siC5f1 или siC5f2, перечисленные в таблицах 1a-1f.In some embodiments, the siRNA of the present invention is siC5a1, siC5a2, siC5b1, siC5b2, siC5c1, siC5c2, siC5d1, siC5d2, siC5e1, siC5e2, siC5f1, or siC5f2 listed in Tables 1a-1f.
Как описано выше, каждый из нуклеотидов в миРНК согласно настоящему изобретению независимо представляет собой модифицированные или немодифицированные нуклеотиды. В некоторых вариантах осуществления нуклеотиды в миРНК согласно настоящему изобретению представляют собой немодифицированные нуклеотиды. В некоторых вариантах осуществления некоторые или все нуклеотиды в миРНК согласно настоящему изобретению представляют собой модифицированные нуклеотиды. Такие модификации на нуклеотидах не будут вызывать значительного уменьшения или потери функции миРНК согласно настоящему изобретению в отношении ингибирования экспрессии генов C5.As described above, each of the nucleotides in the siRNA according to the present invention is independently modified or unmodified nucleotides. In some embodiments, the nucleotides in the siRNA of the present invention are unmodified nucleotides. In some embodiments, some or all of the nucleotides in the siRNA of the present invention are modified nucleotides. Such nucleotide modifications will not cause a significant reduction or loss of function of the siRNA of the present invention to inhibit C5 gene expression.
В некоторых вариантах осуществления миРНК согласно настоящему изобретению содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеотид. В контексте настоящего изобретения термин «модифицированный нуклеотид», применяемый в настоящем документе, относится к нуклеотиду, образованному путем замещения 2’-гидроксигруппы рибозной группы нуклеотида другими группами, аналогу нуклеотида или нуклеотиду с модифицированным основанием. Такие модифицированные нуклеотиды не будут вызывать значительного уменьшения или потери функции миРНК в отношении ингибирования экспрессии генов. Например, могут быть выбраны модифицированные нуклеотиды, раскрытые в источнике Chemically Modified siRNA: tools and applications. Drug Discov Today, 2008.13(19-20): 842-55 за авт. J.K. Watts, G. F. Deleavey и M. J.Damha.In some embodiments, the siRNA of the present invention comprises at least one modified nucleotide. As used herein, the term "modified nucleotide" as used herein refers to a nucleotide formed by replacing the 2'-hydroxy group of the ribose group of a nucleotide with other groups, a nucleotide analogue, or a nucleotide with a modified base. Such modified nucleotides will not cause a significant reduction or loss of miRNA function in inhibiting gene expression. For example, modified nucleotides may be selected as disclosed in Chemically Modified siRNA: tools and applications. Drug Discov Today, 2008.13(19-20): 842-55 per ed. J.K. Watts, G. F. Deleavey, and M. J. Damha.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один нуклеотид в смысловой цепи или антисмысловой цепи миРНК согласно настоящему изобретению представляет собой модифицированный нуклеотид, и/или по меньшей мере один фосфат представляет собой фосфатную группу с модифицированной группой. Другими словами, по меньшей мере часть фосфатной группы и/или рибозной группы в фосфатно-рибозном остове по меньшей мере одной одиночной цепи в смысловой цепи и антисмысловой цепи представляет собой фосфатную группу с модифицированной группой и/или рибозную группу с модифицированной группой.In some embodiments, at least one nucleotide in the sense strand or antisense strand of a siRNA of the present invention is a modified nucleotide, and/or at least one phosphate is a modified phosphate group. In other words, at least a portion of the phosphate group and/or ribose group in the phosphate-ribose backbone of at least one single strand in the sense strand and the antisense strand is a group-modified phosphate group and/or a group-modified ribose group.
В некоторых вариантах осуществления все нуклеотиды в смысловой цепи и/или антисмысловой цепи представляют собой модифицированные нуклеотиды. В некоторых вариантах осуществления каждый нуклеотид в смысловой цепи и антисмысловой цепи миРНК согласно настоящему изобретению независимо представляет собой модифицированный фтором нуклеотид или нуклеотид с отличной от фтора модификацией.In some embodiments, all nucleotides in the sense strand and/or antisense strand are modified nucleotides. In some embodiments, each nucleotide in the sense strand and antisense strand of the siRNA of the present invention is independently a fluorine-modified nucleotide or a nucleotide with a non-fluorine modification.
Авторы настоящего изобретения неожиданно обнаружили, что миРНК согласно настоящему изобретению обладает высокой степенью равновесия между стабильностью в сыворотке и эффективностью сайленсинга генов в экспериментах на животных.The inventors of the present invention have surprisingly found that the siRNA of the present invention has a high degree of balance between serum stability and gene silencing efficiency in animal experiments.
В некоторых вариантах осуществления модифицированные фтором нуклеотиды расположены в нуклеотидной последовательности I и нуклеотидной последовательности II; и в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 7, 8 и 9 нуклеотидной последовательности I представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды; и в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 2, 6, 14 и 16 нуклеотидной последовательности ii представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды.In some embodiments, the fluorine-modified nucleotides are located in nucleotide sequence I and nucleotide sequence II; and in the direction from the 5' end to the 3' end, the nucleotides at positions 7, 8 and 9 of nucleotide sequence I are fluorine modified nucleotides; and in the direction from the 5' end to the 3' end, the nucleotides at positions 2, 6, 14 and 16 of nucleotide sequence ii are fluorine modified nucleotides.
В некоторых вариантах осуществления модифицированные фтором нуклеотиды расположены в нуклеотидной последовательности I и нуклеотидной последовательности II; в нуклеотидной последовательности I присутствует не более 5 модифицированных фтором нуклеотидов, и в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 7, 8 и 9 в нуклеотидной последовательности I представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды; в нуклеотидной последовательности II присутствует не более 7 модифицированных фтором нуклеотидов, и нуклеотиды в положениях 2, 6, 14 и 16 в нуклеотидной последовательности II представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды.In some embodiments, the fluorine-modified nucleotides are located in nucleotide sequence I and nucleotide sequence II; there are no more than 5 fluorine modified nucleotides in the nucleotide sequence I, and in the direction from the 5' end to the 3' end, the nucleotides at positions 7, 8 and 9 in the nucleotide sequence I are fluorine modified nucleotides; there are no more than 7 fluorine-modified nucleotides in nucleotide sequence II, and nucleotides at positions 2, 6, 14 and 16 in nucleotide sequence II are fluorine-modified nucleotides.
В некоторых вариантах осуществления в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 7, 8 и 9 или 5, 7, 8 и 9 нуклеотидной последовательности I в смысловой цепи представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в смысловой цепи представляют собой нуклеотиды с отличной от фтора модификацией; и в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 2, 6, 14 и 16 или 2, 6, 8, 9, 14 и 16 нуклеотидной последовательности II в антисмысловой цепи представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в антисмысловой цепи представляют собой нуклеотиды с отличной от фтора модификацией.In some embodiments, in a 5' to 3' direction, the nucleotides at positions 7, 8, and 9 or 5, 7, 8, and 9 of nucleotide sequence I in the sense strand are fluorine modified nucleotides, and the nucleotides at the remaining positions in the sense chain are nucleotides with a modification other than fluorine; and in the direction from the 5' end to the 3' end, the nucleotides at positions 2, 6, 14 and 16 or 2, 6, 8, 9, 14 and 16 of nucleotide sequence II in the antisense strand are fluorine modified nucleotides, and the nucleotides at the remaining positions in the antisense chain are nucleotides with a modification other than fluorine.
В контексте настоящего изобретения термин «модифицированный фтором нуклеотид» относится к нуклеотиду, образованному путем замещения 2’-гидроксигруппы рибозной группы нуклеотида фтором, который имеет структуру, представленную Формулой (7). «Нуклеотид с отличной от фтора модификацией» относится к нуклеотиду, образованному путем замещения 2’-гидроксигруппы рибозной группы нуклеотида группой, отличной от фтора, или аналогу нуклеотида. В некоторых вариантах осуществления каждый нуклеотид с отличной от фтора модификацией независимо выбран из нуклеотида, образованного путем замещения 2’-гидроксигруппы рибозной группы нуклеотида группой, отличной от фтора, или аналога нуклеотида.In the context of the present invention, the term “fluorine-modified nucleotide” refers to a nucleotide formed by replacing the 2'-hydroxy group of the ribose group of a nucleotide with fluorine, which has the structure represented by Formula (7). “Nucleotide with a non-fluorine modification” refers to a nucleotide formed by replacing the 2'-hydroxy group of the ribose group of a nucleotide with a non-fluorine group or nucleotide analogue. In some embodiments, each nucleotide with a non-fluorine modification is independently selected from a nucleotide formed by replacing the 2'-hydroxy group of the ribose group of the nucleotide with a non-fluorine group or a nucleotide analogue.
Эти нуклеотиды, образованные путем замещения 2’-гидроксигруппы рибозной группы группой, отличной от фтора, хорошо известны специалистам в данной области техники, и эти нуклеотиды могут быть выбраны из одного из 2’-алкокси-модифицированного нуклеотида, 2’-замещенный алкокси-модифицированного нуклеотида, 2’-алкил-модифицированного нуклеотида, 2’-замещенный алкил-модифицированного нуклеотида, 2’-амино-модифицированного нуклеотида, 2’-замещенный амино-модифицированного нуклеотида и 2’-дезоксинуклеотида.These nucleotides, formed by replacing the 2'-hydroxy group of the ribose group with a group other than fluorine, are well known to those skilled in the art, and these nucleotides can be selected from one of 2'-alkoxy-modified nucleotide, 2'-substituted alkoxy-modified nucleotide, 2'-alkyl-modified nucleotide, 2'-substituted alkyl-modified nucleotide, 2'-amino-modified nucleotide, 2'-substituted amino-modified nucleotide and 2'-deoxynucleotide.
В некоторых вариантах осуществления 2’-алкокси-модифицированный нуклеотид представляет собой 2’-метокси-модифицированный нуклеотид (2’-OMe), представленный Формулой (8). В некоторых вариантах осуществления 2’-замещенный алкокси-модифицированный нуклеотид представляет собой, например, 2’-O-метоксиэтокси-модифицированный нуклеотид (2’-MOE), представленный Формулой (9). В некоторых вариантах осуществления 2’-амино-модифицированный нуклеотид (2’-NH2) соответствует представленному Формулой (10). В некоторых вариантах осуществления 2’-дезоксинуклеотид (ДНК) соответствует представленному Формулой (11):In some embodiments, the 2'-alkoxy-modified nucleotide is a 2'-methoxy-modified nucleotide (2'-OMe) represented by Formula (8). In some embodiments, the 2'-substituted alkoxy-modified nucleotide is, for example, a 2'-O-methoxyethoxy-modified nucleotide (2'-MOE) represented by Formula (9). In some embodiments, the 2'-amino modified nucleotide (2'-NH 2 ) is as represented by Formula (10). In some embodiments, the 2'-deoxynucleotide (DNA) is as represented by Formula (11):
Аналог нуклеотида относится к группе, которая может заменять нуклеотид в нуклеиновой кислоте и при этом структурно отличается от аденинового рибонуклеотида, гуанинового рибонуклеотида, цитозинового рибонуклеотида, урацилового рибонуклеотида или тимидинового дезоксирибонуклеотида. В некоторых вариантах осуществления аналог нуклеотида может представлять собой изонуклеотид, мостиковую нуклеиновую кислоту или ациклический нуклеотид.A nucleotide analog refers to a group that can replace a nucleotide in a nucleic acid and is structurally different from adenine ribonucleotide, guanine ribonucleotide, cytosine ribonucleotide, uracil ribonucleotide, or thymidine deoxyribonucleotide. In some embodiments, the nucleotide analogue may be an isonucleotide, a bridged nucleic acid, or an acyclic nucleotide.
Мостиковая нуклеиновая кислота (BNA) представляет собой нуклеотид, который пространственно ограничен или недоступен. BNA может содержать структуру 5-членного кольца, 6-членного кольца или 7-членного кольца, связанного мостиком, имеющую выступ сахара в «фиксированной» C3’-эндоконформации. Мостик, как правило, встроен в 2’- и 4'-положения рибозы, образуя 2’,4'-BNA нуклеотид. В некоторых вариантах осуществления BNA может представлять собой LNA, ENA и cET BNA, где LNA соответствует представленной Формулой (12), ENA соответствует представленной Формулой (13), и cET BNA соответствует представленной Формулой (14):A bridging nucleic acid (BNA) is a nucleotide that is spatially restricted or inaccessible. BNA may contain a 5-membered ring, 6-membered ring, or bridged 7-membered ring structure having a sugar overhang in a “fixed” C3' endo conformation. The bridge is typically inserted at the 2' and 4' positions of the ribose, forming a 2',4'-BNA nucleotide. In some embodiments, the BNA may be an LNA, an ENA, and a cET BNA, wherein the LNA is as represented by Formula (12), the ENA is as represented by Formula (13), and the cET BNA is as represented by Formula (14):
Ациклический нуклеотид представляет собой нуклеотид, в котором рибозное кольцо открыто. В некоторых вариантах осуществления ациклический нуклеотид может представлять собой незаблокированную нуклеиновую кислоту (UNA) или гликолевую нуклеиновую кислоту (GNA), где UNA соответствует представленной Формулой (15), а GNA соответствует представленной Формулой (16):An acyclic nucleotide is a nucleotide in which the ribose ring is open. In some embodiments, the acyclic nucleotide may be an unblocked nucleic acid (UNA) or a glycolic nucleic acid (GNA), where UNA is as represented by Formula (15) and GNA is as represented by Formula (16):
В Формуле (15) и Формуле (16) R выбран из H, OH или алкокси (O-алкила).In Formula (15) and Formula (16), R is selected from H, OH or alkoxy (O-alkyl).
Изонуклеотид представляет собой соединение, образованное при изменении положения основания на рибозном кольце в нуклеотиде. В некоторых вариантах осуществления изонуклеотид может представлять собой соединение, в котором основание перемещено из положения-1' в положение-2’ или положение-3’ на рибозном кольце, как представлено Формулами (17) или (18): An isonucleotide is a compound formed by changing the position of a base on the ribose ring in a nucleotide. In some embodiments, an isonucleotide may be a compound in which a base is moved from the -1' position to the -2' position or the -3' position on the ribose ring, as represented by Formulas (17) or (18):
В соединениях, представленных Формулой (17) и Формулой (18) выше, Основание представляет собой основание, такое как A, U, G, C или T; и R выбран из H, OH, F или группы, отличной от фтора, описанной выше.In the compounds represented by Formula (17) and Formula (18) above, the Base is a base such as A, U, G, C or T; and R is selected from H, OH, F or a group other than fluorine described above.
В некоторых вариантах осуществления аналог нуклеотида выбран из одного из изонуклеотида, LNA, ENA, cET, UNA и GNA. В некоторых вариантах осуществления каждый нуклеотид с отличной от фтора модификацией представляет собой метокси-модифицированный нуклеотид. В контексте настоящего изобретения метокси-модифицированный нуклеотид относится к нуклеотиду, образованному путем замещения 2’-гидроксигруппы рибозной группы метоксигруппой.In some embodiments, the nucleotide analog is selected from one of isonucleotide, LNA, ENA, cET, UNA, and GNA. In some embodiments, each nucleotide with a non-fluorine modification is a methoxy-modified nucleotide. In the context of the present invention, a methoxy-modified nucleotide refers to a nucleotide formed by replacing the 2'-hydroxy group of a ribose group with a methoxy group.
В контексте настоящего изобретения термины «модифицированный фтором нуклеотид», «2’-фтор-модифицированный нуклеотид», «нуклеотид, в котором 2’-гидроксигруппа рибозной группы замещена фтором» и «2’-фторрибозил» имеют одинаковое значение и относятся к соединению, образованному путем замещения 2’-гидроксигруппы рибозной группы нуклеотида фтором, имеющему структуру, представленную Формулой (7). Термины «метокси-модифицированный нуклеотид», «2’-метокси-модифицированный нуклеотид», «нуклеотид, в котором 2’-гидроксигруппа рибозной группы замещена метокси» и «2’-метоксирибозил» имеют одинаковое значение и относятся к соединению, образованному путем замещения 2’-гидроксигруппы рибозной группы нуклеотида метоксигруппой, имеющему структуру, представленную Формулой (8).In the context of the present invention, the terms "fluorine-modified nucleotide", "2'-fluoro-modified nucleotide", "nucleotide in which the 2'-hydroxy group of the ribose group is replaced by fluorine" and "2'-fluororibosyl" have the same meaning and refer to the compound formed by replacing the 2'-hydroxy group of the ribose group of a nucleotide with fluorine, having the structure represented by Formula (7). The terms "methoxy-modified nucleotide", "2'-methoxy-modified nucleotide", "nucleotide in which the 2'-hydroxy group of the ribose group is replaced by methoxy" and "2'-methoxyribosyl" have the same meaning and refer to the compound formed by the substitution The 2'-hydroxy group of the ribose group of the nucleotide is a methoxy group having the structure represented by Formula (8).
В некоторых вариантах осуществления миРНК согласно настоящему изобретению представляет собой миРНК со следующими модификациями: в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 7, 8 и 9 или 5, 7, 8 и 9 нуклеотидной последовательности I в смысловой цепи представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в смысловой цепи представляют собой метокси-модифицированные нуклеотиды; и нуклеотиды в положениях 2, 6, 14 и 16 или 2, 6, 8, 9, 14 и 16 нуклеотидной последовательности II в антисмысловой цепи представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в антисмысловой цепи представляют собой метокси-модифицированные нуклеотиды.In some embodiments, the siRNA of the present invention is an siRNA with the following modifications: in a 5' to 3' direction, the nucleotides at positions 7, 8, and 9 or 5, 7, 8, and 9 of nucleotide sequence I in the sense strand are are fluorine-modified nucleotides, and the nucleotides at other positions in the sense strand are methoxy-modified nucleotides; and nucleotides at positions 2, 6, 14 and 16 or 2, 6, 8, 9, 14 and 16 of nucleotide sequence II in the antisense strand are fluorine-modified nucleotides, and nucleotides at the remaining positions in the antisense strand are methoxy-modified nucleotides.
В некоторых вариантах осуществления миРНК согласно настоящему изобретению представляет собой миРНК со следующими модификациями: в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 5, 7, 8 и 9 нуклеотидной последовательности I в смысловой цепи миРНК представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в смысловой цепи миРНК представляют собой метокси-модифицированные нуклеотиды; и в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 2, 6, 8, 9, 14 и 16 нуклеотидной последовательности II в антисмысловой цепи миРНК представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в антисмысловой цепи миРНК представляют собой метокси-модифицированные нуклеотиды;In some embodiments, the siRNA of the present invention is an siRNA with the following modifications: in a 5' to 3' direction, the nucleotides at positions 5, 7, 8, and 9 of nucleotide sequence I in the sense strand of the siRNA are fluorine modified nucleotides, and the nucleotides at other positions in the sense strand of the siRNA are methoxy-modified nucleotides; and in the direction from the 5' end to the 3' end, the nucleotides at positions 2, 6, 8, 9, 14 and 16 of nucleotide sequence II in the antisense strand of the siRNA are fluorine modified nucleotides, and the nucleotides at the remaining positions in the antisense strand of the siRNA are are methoxy-modified nucleotides;
или в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 5, 7, 8 и 9 нуклеотидной последовательности I в смысловой цепи миРНК представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в смысловой цепи миРНК представляют собой метокси-модифицированные нуклеотиды; и в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 2, 6, 14 и 16 нуклеотидной последовательности II в антисмысловой цепи миРНК представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в антисмысловой цепи миРНК представляют собой метокси-модифицированные нуклеотиды; or in a direction from the 5' end to the 3' end, nucleotides at positions 5, 7, 8 and 9 of nucleotide sequence I in the sense strand of the siRNA are fluorine-modified nucleotides, and nucleotides at the remaining positions in the sense strand of the siRNA are methoxy-modified nucleotides; and in the direction from the 5' end to the 3' end, the nucleotides at positions 2, 6, 14 and 16 of nucleotide sequence II in the antisense strand of the siRNA are fluorine-modified nucleotides, and the nucleotides at the remaining positions in the antisense strand of the siRNA are methoxy-modified nucleotides;
или в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 7, 8 и 9 нуклеотидной последовательности I в смысловой цепи миРНК представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в смысловой цепи миРНК представляют собой метокси-модифицированные нуклеотиды; и в направлении от 5’-конца к 3’-концу нуклеотиды в положениях 2, 6, 14 и 16 нуклеотидной последовательности II в антисмысловой цепи миРНК представляют собой модифицированные фтором нуклеотиды, а нуклеотиды в остальных положениях в антисмысловой цепи миРНК представляют собой метокси-модифицированные нуклеотиды.or in a direction from the 5' end to the 3' end, the nucleotides at positions 7, 8 and 9 of nucleotide sequence I in the sense strand of the siRNA are fluorine-modified nucleotides, and the nucleotides at the remaining positions in the sense strand of the siRNA are methoxy-modified nucleotides; and in the direction from the 5' end to the 3' end, the nucleotides at positions 2, 6, 14 and 16 of nucleotide sequence II in the antisense strand of the siRNA are fluorine-modified nucleotides, and the nucleotides at the remaining positions in the antisense strand of the siRNA are methoxy-modified nucleotides.
В некоторых вариантах осуществления миРНК согласно настоящему изобретению представляет собой любую из siC5a1-M1, siC5a1-M2, siC5a1-M3, siC5a2-M1, siC5a2-M2, siC5a2-M3, siC5b1-M1, siC5b1-M2, siC5b1-M3, siC5b2-M1, siC5b2-M2, siC5b2-M3, siC5c1-M1, siC5c1-M2, siC5c1-M3, siC5c2-M1, siC5c2-M2, siC5c2-M3, siC5d1-M1, siC5d1-M2, siC5d1-M3, siC5d2-M1, siC5d2-M2, siC5d2-M3, siC5e1-M1, siC5e1-M2, siC5e1-M3, siC5e2-M1, siC5e2-M2, siC5e2-M3, siC5f1-M1, siC5f1-M2, siC5f1-M3, siC5f2-M1, siC5f2-M2 или siC5f2-M3, перечисленных в таблицах 1a-1f.In some embodiments, the siRNA of the present invention is any of siC5a1-M1, siC5a1-M2, siC5a1-M3, siC5a2-M1, siC5a2-M2, siC5a2-M3, siC5b1-M1, siC5b1-M2, siC5b1-M3, siC5b2- M1, siC5b2-M2, siC5b2-M3, siC5c1-M1, siC5c1-M2, siC5c1-M3, siC5c2-M1, siC5c2-M2, siC5c2-M3, siC5d1-M1, siC5d1-M2, siC5d1-M3, siC5d2-M1, siC5d2-M2, siC5d2-M3, siC5e1-M1, siC5e1-M2, siC5e1-M3, siC5e2-M1, siC5e2-M2, siC5e2-M3, siC5f1-M1, siC5f1-M2, siC5f1-M3, siC5f2-M1, siC5f2- M2 or siC5f2-M3 listed in Tables 1a-1f.
миРНК с вышеуказанными модификациями не только могут быть получены с более низкими затратами, но также снижают склонность рибонуклеаз в крови расщеплять нуклеиновую кислоту, повышая тем самым стабильность нуклеиновой кислоты и обеспечивая более высокую устойчивость нуклеиновой кислоты к нуклеазному гидролизу.siRNAs with the above modifications not only can be produced at a lower cost, but also reduce the tendency of ribonucleases in the blood to degrade nucleic acid, thereby increasing the stability of the nucleic acid and making the nucleic acid more resistant to nuclease hydrolysis.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере часть фосфатной группы в фосфатно-рибозном остове по меньшей мере одной одиночной цепи в смысловой цепи и антисмысловой цепи миРНК согласно настоящему изобретению представляет собой фосфатную группу с модифицированной группой. В некоторых вариантах осуществления фосфатная группа с модифицированной группой представляет собой тиофосфатную группу, образованную путем замещения по меньшей мере одного атома кислорода в фосфодиэфирной связи в фосфатной группе атомом серы; и в некоторых вариантах осуществления фосфатная группа с модифицированной группой представляет собой тиофосфатную группу, имеющую структуру, представленную Формулой (1):In some embodiments, at least a portion of the phosphate group in the phosphate-ribose backbone of at least one single strand in the sense strand and antisense strand of the siRNA of the present invention is a group-modified phosphate group. In some embodiments, the modified phosphate group is a thiophosphate group formed by replacing at least one oxygen atom in the phosphodiester bond in the phosphate group with a sulfur atom; and in some embodiments, the modified phosphate group is a thiophosphate group having the structure represented by Formula (1):
Формула (1). Formula 1).
Эта модификация может стабилизировать двухцепочечную структуру миРНК, тем самым сохраняя высокую специфичность и высокую аффинность спаривания оснований.This modification can stabilize the double-stranded structure of siRNA, thereby maintaining high specificity and high base-pairing affinity.
В некоторых вариантах осуществления в миРНК согласно настоящему изобретению тиофосфатная связь присутствует в по меньшей мере одном из следующих положений: положение между первым нуклеотидом и вторым нуклеотидом на любом конце смысловой цепи или антисмысловой цепи; положение между вторым и третьим нуклеотидами на любом конце смысловой цепи или антисмысловой цепи; или любой их комбинации. В некоторых вариантах осуществления тиофосфатная связь присутствует во всех вышеуказанных положениях, за исключением 5’-конца смысловой цепи. В некоторых вариантах осуществления тиофосфатная связь присутствует во всех вышеуказанных положениях, за исключением 3’-конца смысловой цепи. В некоторых вариантах осуществления тиофосфатная связь присутствует в по меньшей мере одном из следующих положений:In some embodiments, in the siRNA of the present invention, the thiophosphate bond is present at at least one of the following positions: a position between the first nucleotide and the second nucleotide at either end of the sense strand or antisense strand; the position between the second and third nucleotides at either end of the sense strand or antisense strand; or any combination thereof. In some embodiments, a thiophosphate bond is present at all of the above positions except the 5' end of the sense strand. In some embodiments, a thiophosphate bond is present at all of the above positions except the 3' end of the sense strand. In some embodiments, the thiophosphate bond is present at at least one of the following positions:
положение между первым нуклеотидом и вторым нуклеотидом на 5’-конце смысловой цепи;the position between the first nucleotide and the second nucleotide at the 5' end of the sense strand;
положение между вторым нуклеотидом и третьим нуклеотидом на 5’-конце смысловой цепи;the position between the second nucleotide and the third nucleotide at the 5' end of the sense strand;
положение между первым нуклеотидом и вторым нуклеотидом на 3’-конце смысловой цепи;the position between the first nucleotide and the second nucleotide at the 3' end of the sense strand;
положение между вторым нуклеотидом и третьим нуклеотидом на 3’-конце смысловой цепи;the position between the second nucleotide and the third nucleotide at the 3' end of the sense strand;
положение между первым нуклеотидом и вторым нуклеотидом на 5’-конце антисмысловой цепи;the position between the first nucleotide and the second nucleotide at the 5' end of the antisense strand;
положение между вторым нуклеотидом и третьим нуклеотидом на 5’-конце антисмысловой цепи;the position between the second nucleotide and the third nucleotide at the 5' end of the antisense strand;
положение между первым нуклеотидом и вторым нуклеотидом на 3’-конце антисмысловой цепи; иthe position between the first nucleotide and the second nucleotide at the 3' end of the antisense strand; And
положение между вторым нуклеотидом и третьим нуклеотидом на 3’-конце антисмысловой цепи.the position between the second nucleotide and the third nucleotide at the 3' end of the antisense strand.
В некоторых вариантах осуществления миРНК согласно настоящему изобретению представляет собой любую из siC5a1-M1S, siC5a1-M2S, siC5a1-M3S, siC5a2-M1S, siC5a2-M2S, siC5a2-M3S, siC5b1-M1S, siC5b1-M2S, siC5b1-M3S, siC5b2-M1S, siC5b2-M2S, siC5b2-M3S, siC5c1-M1S, siC5c1-M2S, siC5c1-M3S, siC5c2-M1S, siC5c2-M2S, siC5c2-M3S, siC5d1-M1S, siC5d1-M2S, siC5d1-M3S, siC5d2-M1S, siC5d2-M2S, siC5d2-M3S, siC5e1-M1S, siC5e1-M2S, siC5e1-M3S, siC5e2-M1S, siC5e2-M2S, siC5e2-M3S, siC5f1-M1S, siC5f1-M2S, siC5f1-M3S, siC5f2-M1S, siC5f2-M2S или siC5f2-M3S, перечисленных в таблицах 1a-1f.In some embodiments, the siRNA of the present invention is any of siC5a1-M1S, siC5a1-M2S, siC5a1-M3S, siC5a2-M1S, siC5a2-M2S, siC5a2-M3S, siC5b1-M1S, siC5b1-M2S, siC5b1-M3S, siC5b2- M1S, SIC5B2-M2S, SIC5B2-M3S, SIC5C1-M1S, SIC5C1-M2S, SIC5C1-M3S, SIC5C2-M1S, SIC5C2-M2S, SIC5C2-M3S, SIC5D1-M1S, SIC5D1-SIC5D1-M3S, SIC5D2-M1S, SIC siC5d2-M2S, siC5d2-M3S, siC5e1-M1S, siC5e1-M2S, siC5e1-M3S, siC5e2-M1S, siC5e2-M2S, siC5e2-M3S, siC5f1-M1S, siC5f1-M2S, siC5f1-M3S, siC5f2-M1S, siC5f 2- M2S or siC5f2-M3S listed in Tables 1a-1f.
В некоторых вариантах осуществления 5’-концевой нуклеотид в антисмысловой цепи миРНК представляет собой нуклеотид с 5’-фосфатной группой или нуклеотид, модифицированный аналогом 5’-фосфатной группы.In some embodiments, the 5' terminal nucleotide on the antisense strand of the siRNA is a nucleotide with a 5' phosphate group or a nucleotide modified with a 5' phosphate group analogue.
Обычные типы нуклеотидов с 5’-фосфатной группой или нуклеотидов, модифицированных аналогом 5’-фосфатной группы, хорошо известны специалистам в данной области техники; например, нуклеотиды с 5’-фосфатной группой могут иметь следующую структуру:Common types of nucleotides with a 5'-phosphate group or nucleotides modified with a 5'-phosphate analogue are well known to those skilled in the art; for example, nucleotides with a 5'-phosphate group may have the following structure:
В качестве еще одного примера, в источнике The chemical evolution of oligonucleotide therapies of clinical utility. Nature Biotechnology, 2017, 35(3): 238-48 за авт. Anastasia Khvorova и Jonathan K. Watts, раскрыты следующие четыре нуклеотида, модифицированные аналогом 5’-фосфатной группы:As another example, see The chemical evolution of oligonucleotide therapies of clinical utility. Nature Biotechnology, 2017, 35(3): 238-48 per ed. Anastasia Khvorova and Jonathan K. Watts, disclosed the following four nucleotides modified with an analogue of the 5'-phosphate group:
где R выбран из H, OH, метокси или F; и Основание представляет собой основание, выбранное из A, U, C, G или T.where R is selected from H, OH, methoxy or F; and The base is a base selected from A, U, C, G or T.
В некоторых вариантах осуществления нуклеотид с 5’-фосфатной группой представляет собой нуклеотид с 5’-фосфатной модификацией, представленный Формулой (2); нуклеотид, модифицированный аналогом 5’-фосфатной группы, представляет собой нуклеотид с 5’-(E)-винилфосфонатной (E-VP) модификацией, представленный Формулой (3), или модифицированный тиофосфатом нуклеотид, представленный Формулой (5).In some embodiments, the nucleotide with a 5'-phosphate group is the nucleotide with a 5'-phosphate modification represented by Formula (2); the 5'-phosphate analogue-modified nucleotide is a 5'-(E)-vinylphosphonate (E-VP) modified nucleotide represented by Formula (3) or a thiophosphate-modified nucleotide represented by Formula (5).
В некоторых вариантах осуществления миРНК согласно настоящему изобретению представляет собой любую из siC5a1-M1P1, siC5a1-M2P1, siC5a1-M3P1, siC5a2-M1P1, siC5a2-M2P1, siC5a2-M3P1, siC5b1-M1P1, siC5b1-M2P1, siC5b1-M3P1, siC5b2-M1P1, siC5b2-M2P1, siC5b2-M3P1, siC5c1-M1P1, siC5c1-M2P1, siC5c1-M3P1, siC5c2-M1P1, siC5c2-M2P1, siC5c2-M3P1, siC5d1-M1P1, siC5d1-M2P1, siC5d1-M3P1, siC5d2-M1P1, siC5d2-M2P1, siC5d2-M3P1, siC5e1-M1P1, siC5e1-M2P1, siC5e1-M3P1, siC5e2-M1P1, siC5e2-M2P1, siC5e2-M3P1, siC5f1-M1P1, siC5f1-M2P1, siC5f1-M3P1, siC5f2-M1P1, siC5f2-M2P1, siC5f2-M3P1, siC5a1-M1SP1, siC5a1-M2SP1, siC5a1-M3SP1, siC5a2-M1SP1, siC5a2-M2SP1, siC5a2-M3SP1, siC5b1-M1SP1, siC5b1-M2SP1, siC5b1-M3SP1, siC5b2-M1SP1, siC5b2-M2SP1, siC5b2-M3SP1, siC5c1-M1SP1, siC5c1-M2SP1, siC5c1-M3SP1, siC5c2-M1SP1, siC5c2-M2SP1, siC5c2-M3SP1, siC5d1-M1SP1, siC5d1-M2SP1, siC5d1-M3SP1, siC5d2-M1SP1, siC5d2-M2SP1, siC5d2-M3SP1, siC5e1-M1SP1, siC5e1-M2SP1, siC5e1-M3SP1, siC5e2-M1SP1, siC5e2-M2SP1, siC5e2-M3SP1, siC5f1-M1SP1, siC5f1-M2SP1, siC5f1-M3SP1, siC5f2-M1SP1, siC5f2-M2SP1 или siC5f2-M3SP1, перечисленных в таблицах 1a-1f.In some embodiments, the siRNA of the present invention is any of siC5a1-M1P1, siC5a1-M2P1, siC5a1-M3P1, siC5a2-M1P1, siC5a2-M2P1, siC5a2-M3P1, siC5b1-M1P1, siC5b1-M2P1, siC5b1-M3P1, siC5b2- M1P1, siC5b2-M2P1, siC5b2-M3P1, siC5c1-M1P1, siC5c1-M2P1, siC5c1-M3P1, siC5c2-M1P1, siC5c2-M2P1, siC5c2-M3P1, siC5d1-M1P1, siC5d1-M2P1, siC5d1-M3P 1, siC5d2-M1P1, siC5d2-M2P1, siC5d2-M3P1, siC5e1-M1P1, siC5e1-M2P1, siC5e1-M3P1, siC5e2-M1P1, siC5e2-M2P1, siC5e2-M3P1, siC5f1-M1P1, siC5f1-M2P1, siC5f1-M3P1, siC5 f2-M1P1, siC5f2- M2P1, siC5f2-M3P1, siC5a1-M1SP1, siC5a1-M2SP1, siC5a1-M3SP1, siC5a2-M1SP1, siC5a2-M2SP1, siC5a2-M3SP1, siC5b1-M1SP1, siC5b1-M2SP1, siC5b1-M3SP1, siC5b2-M1SP 1, siC5b2-M2SP1, siC5b2-M3SP1, siC5c1-M1SP1, siC5c1-M2SP1, siC5c1-M3SP1, siC5c2-M1SP1, siC5c2-M2SP1, siC5c2-M3SP1, siC5d1-M1SP1, siC5d1-M2SP1, siC5d1-M3SP1, siC5d2-M1SP1, siC5 d2-M2SP1, siC5d2- M3SP1, siC5e1-M1SP1, siC5e1-M2SP1, siC5e1-M3SP1, siC5e2-M1SP1, siC5e2-M2SP1, siC5e2-M3SP1, siC5f1-M1SP1, siC5f1-M2SP1, siC5f1-M3SP1, siC5f2-M1SP1, siC5f2-M2SP 1 or siC5f2-M3SP1, listed in Tables 1a-1f.
Авторы настоящего изобретения неожиданно обнаружили, что миРНК согласно настоящему изобретению обладает значительно повышенной стабильностью в плазме и лизосомах и обладает более высокой ингибирующей активностью в отношении мРНК-мишени.The inventors of the present invention have surprisingly found that the siRNA of the present invention has significantly increased stability in plasma and lysosomes and has a higher inhibitory activity against target mRNA.
миРНК согласно настоящему изобретению может быть получена с помощью обычных способов получения миРНК в данной области техники (например, с помощью способов твердофазного синтеза и жидкофазного синтеза). Для твердофазного синтеза уже доступны коммерческие услуги по изготовлению на заказ. Модифицированные нуклеотиды могут быть введены в миРНК согласно настоящему изобретению с применением нуклеотидного мономера, имеющего соответствующую модификацию, где способы получения нуклеотидного мономера, имеющего соответствующую модификацию, и способы введения модифицированного нуклеотида в миРНК также хорошо известны специалистам в данной области техники. Модифицированные нуклеотидные группы могут быть введены в миРНК согласно настоящему изобретению с применением нуклеотидного мономера, имеющего соответствующую модификацию, где способы получения нуклеотидного мономера, имеющего соответствующую модификацию, и способы введения модифицированного нуклеотида в миРНК также хорошо известны специалистам в данной области техники.The siRNA of the present invention can be produced using conventional methods for producing siRNA in the art (eg, solid phase synthesis methods and liquid phase synthesis methods). Commercial customization services are already available for solid-phase synthesis. Modified nucleotides can be introduced into siRNA according to the present invention using a nucleotide monomer having a suitable modification, where methods for producing a nucleotide monomer having a suitable modification and methods for introducing a modified nucleotide into siRNA are also well known to those skilled in the art. Modified nucleotide groups can be introduced into siRNA according to the present invention using a nucleotide monomer having a suitable modification, where methods for producing a nucleotide monomer having a suitable modification and methods for introducing the modified nucleotide into siRNA are also well known to those skilled in the art.
Фармацевтическая композицияPharmaceutical composition
Согласно настоящему изобретению предложена фармацевтическая композиция, содержащая миРНК, описанную выше, в качестве активного ингредиента и фармацевтически приемлемый носитель.According to the present invention, there is provided a pharmaceutical composition containing the siRNA described above as an active ingredient and a pharmaceutically acceptable carrier.
Фармацевтически приемлемый носитель может представлять собой носитель, обычно применяемый в области введения миРНК, например, не ограничиваясь перечисленным, одно или более из магнитных наночастиц (таких как наночастицы на основе Fe3O4 или Fe2O3), углеродных нанотрубок, мезопористого кремния, наночастиц фосфата кальция, полиэтиленимина (PEI), дендримера полиамидоамина (PAMAM), поли(L-лизина) (PLL), хитозана, 1,2-диолеоил-3-триметиламмоний-пропана (DOTAP), сополимера D,L-молочной и гликолевой кислот (PLGA), поли(2-аминоэтилэтиленфосфата) (PPEEA), поли(2-диметиламиноэтилметакрилата) (PDMAEMA) и их производных.The pharmaceutically acceptable carrier may be one commonly used in the field of siRNA administration, such as, but not limited to, one or more of magnetic nanoparticles (such as Fe 3 O 4 or Fe 2 O 3 -based nanoparticles), carbon nanotubes, mesoporous silicon, nanoparticles of calcium phosphate, polyethylenimine (PEI), polyamidoamine dendrimer (PAMAM), poly(L-lysine) (PLL), chitosan, 1,2-dioleoyl-3-trimethylammonium propane (DOTAP), D,L-lactic-glycolic copolymer acids (PLGA), poly(2-aminoethylethylene phosphate) (PPEEA), poly(2-dimethylaminoethyl methacrylate) (PDMAEMA) and their derivatives.
Нет никаких особых требований к содержанию миРНК и фармацевтически приемлемого носителя в фармацевтической композиции, и оно может представлять собой обычное содержание каждого компонента. В некоторых вариантах осуществления массовое отношение миРНК к фармацевтически приемлемому носителю составляет 1:(1-500), а в некоторых вариантах осуществления вышеуказанное массовое отношение составляет 1:(1-50).There are no special requirements for the content of siRNA and pharmaceutically acceptable carrier in the pharmaceutical composition, and it may be the usual content of each component. In some embodiments, the weight ratio of siRNA to pharmaceutically acceptable carrier is 1:(1-500), and in some embodiments, the above weight ratio is 1:(1-50).
В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция также может содержать другие фармацевтически приемлемые вспомогательные вещества, которые могут представлять собой один или более из различных общепринятых в данной области техники составов или соединений. Например, другие фармацевтически приемлемые вспомогательные вещества могут содержать по меньшей мере один из pH-буферного раствора, защитного агента и регулятора осмотического давления.In some embodiments, the pharmaceutical composition may also contain other pharmaceutically acceptable excipients, which may be one or more of various formulations or compounds conventional in the art. For example, other pharmaceutically acceptable excipients may contain at least one of a pH buffer solution, a protecting agent, and an osmotic pressure regulator.
pH-буферный раствор может представлять собой буферный раствор гидрохлорида трис(гидроксиметил)аминометана с pH = 7,5-8,5, и/или фосфатный буферный раствор с pH = 5,5-8,5, предпочтительно фосфатный буферный раствор с pH = 5,5-8,5.The pH buffer solution may be a tris(hydroxymethyl)aminomethane hydrochloride buffer solution with pH = 7.5-8.5, and/or a phosphate buffer solution with pH = 5.5-8.5, preferably a phosphate buffer solution with pH = 5.5-8.5.
Защитный агент может представлять собой по меньшей мере один из инозита, сорбита, сахарозы, трегалозы, маннозы, мальтозы, лактозы и глюкозы. Содержание защитного агента может составлять от 0,01 мас.% до 30 мас.% от общей массы фармацевтической композиции.The protecting agent may be at least one of inositol, sorbitol, sucrose, trehalose, mannose, maltose, lactose and glucose. The content of the protective agent may range from 0.01 wt.% to 30 wt.% of the total weight of the pharmaceutical composition.
Регулятор осмотического давления может представлять собой хлорид натрия и/или хлорид калия. Содержание регулятора осмотического давления обеспечивает осмотическое давление фармацевтической композиции на уровне 200-700 миллиосмоль/кг (мОсм/кг). В зависимости от целевого осмотического давления специалисты в данной области техники могут легко определить содержание регулятора осмотического давления.The osmotic pressure regulator may be sodium chloride and/or potassium chloride. The content of the osmotic pressure regulator ensures the osmotic pressure of the pharmaceutical composition at a level of 200-700 milliosmol/kg (mOsm/kg). Depending on the target osmotic pressure, those skilled in the art can easily determine the content of the osmotic pressure regulator.
В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция может представлять собой жидкий состав, например, раствор для инъекций; или лиофилизированный порошок для инъекций, который смешивают с жидким вспомогательным веществом для получения жидкого состава при введении. Жидкий состав может быть введен, не ограничиваясь перечисленным, путем подкожной, внутримышечной или внутривенной инъекции, а также может быть введен, не ограничиваясь перечисленным, в легкие путем распыления или другие органы (такие как печень) через легкие путем распыления. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическую композицию вводят путем внутривенной инъекции.In some embodiments, the pharmaceutical composition may be a liquid formulation, such as an injection; or lyophilized powder for injection, which is mixed with a liquid excipient to produce a liquid formulation for administration. The liquid formulation may be administered by, but not limited to, subcutaneous, intramuscular, or intravenous injection, and may be administered, but not limited to, to the lungs by nebulization or other organs (such as the liver) through the lungs by nebulization. In some embodiments, the pharmaceutical composition is administered by intravenous injection.
В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция может находиться в форме липосомного препарата. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемый носитель, применяемый в липосомном препарате, содержит аминосодержащее соединение для трансфекции (далее в настоящем документе также называемое органическим амином), вспомогательный липид и/или пегилированный липид. Органический амин, вспомогательный липид и пегилированный липид могут быть выбраны, соответственно, из одного или более из аминосодержащих соединений для трансфекции или их фармацевтически приемлемых солей или производных, вспомогательных липидов и пегилированных липидов, описанных в источнике CN103380113A (включенном в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме).In some embodiments, the pharmaceutical composition may be in the form of a liposomal preparation. In some embodiments, the pharmaceutically acceptable carrier used in the liposome preparation comprises an amine-containing transfection compound (hereinafter also referred to as an organic amine), an auxiliary lipid, and/or a PEGylated lipid. The organic amine, auxiliary lipid, and PEGylated lipid may be selected, respectively, from one or more of the amine-containing transfection compounds or pharmaceutically acceptable salts or derivatives thereof, auxiliary lipids, and PEGylated lipids described in CN103380113A (incorporated herein by reference in its entirety). volume).
В некоторых вариантах осуществления органический амин может представлять собой соединение, представленное Формулой (201), описанное в источнике CN103380113A, или его фармацевтически приемлемую соль:In some embodiments, the organic amine may be the compound represented by Formula (201) described in reference CN103380113A, or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
Формула (201), Formula (201),
где: Where:
X101 или X102 независимо выбран из O, S, N-A или C-A, где A представляет собой водород или C1-C20 углеводородную цепь;X 101 or X 102 is independently selected from O, S, NA or CA, where A represents hydrogen or a C1-C20 hydrocarbon chain;
Y101 или Z101 независимо выбран из C=O, C=S, S=O, CH-OH или SO2;Y 101 or Z 101 is independently selected from C=O, C=S, S=O, CH-OH or SO 2 ;
R101, R102, R103, R104, R105, R106 или R107 независимо выбран из водорода; циклической или алифатической, замещенной или незамещенной, разветвленной или линейной алифатической группы; циклической или алифатической, замещенной или незамещенной, разветвленной или линейной гетероалифатической группы; замещенной или незамещенной, разветвленной или линейной ацильной группы; замещенного или незамещенного, разветвленного или линейного арила или замещенного или незамещенного, разветвленного или линейного гетероарила;R 101 , R 102 , R 103 , R 104 , R 105 , R 106 or R 107 are independently selected from hydrogen; cyclic or aliphatic, substituted or unsubstituted, branched or linear aliphatic group; cyclic or aliphatic, substituted or unsubstituted, branched or linear heteroaliphatic group; substituted or unsubstituted, branched or linear acyl group; substituted or unsubstituted, branched or linear aryl or substituted or unsubstituted, branched or linear heteroaryl;
x представляет собой целое число от 1 до 10;x is an integer from 1 to 10;
n представляет собой целое число от 1 до 3, m представляет собой целое число от 0 до 20, и p равно 0 или 1, где, если m и p оба равны 0, то R102 представляет собой водород, иn is an integer from 1 to 3, m is an integer from 0 to 20, and p is 0 or 1, where if m and p are both 0, then R 102 is hydrogen, and
если по меньшей мере один из n или m равен 2, то R103 и азот в Формуле (201) образуют структуру, представленную Формулой (202) или (203):if at least one of n or m is 2, then R 103 and nitrogen in Formula (201) form the structure represented by Formula (202) or (203):
где g, e или f независимо представляет собой целое число от 1 до 6, «HCC» представляет собой углеводородную цепь, и каждый *N представляет собой атом азота, показанный в Формуле (201).where g, e or f independently represents an integer from 1 to 6, "HCC" represents a hydrocarbon chain, and each *N represents a nitrogen atom shown in Formula (201).
В некоторых вариантах осуществления R103 представляет собой полиамин. В других вариантах осуществления R103 представляет собой кеталь. В некоторых вариантах осуществления каждый из R101 и R102 в Формуле (201) независимо представляет собой любой замещенный или незамещенный, разветвленный или линейный алкил или алкенил, где указанный алкил или алкенил имеет от 3 до приблизительно 20 атомов углерода (например, от 8 до приблизительно 18 атомов углерода) и от 0 до 4 двойных связей (например, от 0 до 2 двойных связей).In some embodiments, R 103 is a polyamine. In other embodiments, R 103 is a ketal. In some embodiments, each of R 101 and R 102 in Formula (201) independently represents any substituted or unsubstituted, branched or straight alkyl or alkenyl, wherein said alkyl or alkenyl has from 3 to about 20 carbon atoms (e.g., from 8 to approximately 18 carbon atoms) and 0 to 4 double bonds (eg, 0 to 2 double bonds).
В некоторых вариантах осуществления, если каждый из n и m независимо равен от 1 до 3, R103 может быть представлен любой из следующих Формул (204)-(213):In some embodiments, if n and m are each independently equal to 1 to 3, R 103 may be represented by any of the following Formulas (204)-(213):
где в Формуле (204) - Формуле (213) каждый из g, e и f независимо представляет собой целое число от 1 до 6; каждый «HCC» представляет собой углеводородную цепь, и каждая * обозначает потенциальную точку присоединения R103 к атому азота в Формуле (201), где каждый H в любом отмеченном * положении может быть замещен, чтобы осуществить присоединение к атому азота в Формуле (201).where in Formula (204) - Formula (213), each of g, e and f independently represents an integer from 1 to 6; each "HCC" represents a hydrocarbon chain, and each * represents a potential point of attachment of R 103 to a nitrogen atom in Formula (201), where each H at any marked * position can be substituted to effect attachment to a nitrogen atom in Formula (201) .
Соединение, представленное в (201), может быть получено, как описано в источнике CN103380113A.The compound shown in (201) can be prepared as described in reference CN103380113A.
В некоторых вариантах осуществления органический амин может представлять собой органический амин, представленный Формулой (214), и/или органический амин, представленный Формулой (215):In some embodiments, the organic amine may be an organic amine represented by Formula (214) and/or an organic amine represented by Formula (215):
Формула (214), Formula (214),
Формула (215). Formula (215).
Вспомогательный липид представляет собой холестерин, аналог холестерина и/или производное холестерина.The accessory lipid is cholesterol, a cholesterol analog and/or a cholesterol derivative.
Пегилированный липид представляет собой 1,2-дипальмитоил-sn-глицеро-3-фосфатидилэтаноламин-N-[метокси(полиэтиленгликоль)]-2000.The PEGylated lipid is 1,2-dipalmitoyl-sn-glycero-3-phosphatidylethanolamine-N-[methoxy(polyethylene glycol)]-2000.
В некоторых вариантах осуществления молярное отношение между органическим амином, вспомогательным липидом и пегилированным липидом в фармацевтической композиции составляет (19,7-80): (19,7-80): (0,3-50); например, молярное отношение может составлять (50-70): (20-40): (3-20).In some embodiments, the molar ratio between the organic amine, the auxiliary lipid and the PEGylated lipid in the pharmaceutical composition is (19.7-80): (19.7-80): (0.3-50); for example, the molar ratio may be (50-70): (20-40): (3-20).
В некоторых вариантах осуществления фармацевтические композиции, образованные миРНК согласно настоящему изобретению и вышеуказанным аминосодержащим агентом для трансфекции, имеют средний диаметр от приблизительно 30 нм до приблизительно 200 нм, как правило, от приблизительно 40 нм до приблизительно 135 нм, и чаще средний диаметр липосомных частиц составляет от приблизительно 50 нм до приблизительно 120 нм, от приблизительно 50 нм до приблизительно 100 нм, от приблизительно 60 нм до приблизительно 90 нм или от приблизительно 70 нм до приблизительно 90 нм, например, средний диаметр липосомных частиц составляет приблизительно 30, 40, 50, 60, 70, 75, 80, 85, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150 или 160 нм.In some embodiments, the pharmaceutical compositions formed by the siRNA of the present invention and the above amine-containing transfection agent have an average diameter of from about 30 nm to about 200 nm, typically from about 40 nm to about 135 nm, and more often the average diameter of the liposome particles is from about 50 nm to about 120 nm, from about 50 nm to about 100 nm, from about 60 nm to about 90 nm, or from about 70 nm to about 90 nm, for example, the average diameter of the liposome particles is about 30, 40, 50, 60, 70, 75, 80, 85, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150 or 160 nm.
В некоторых вариантах осуществления в фармацевтической композиции, образованной миРНК согласно настоящему изобретению и вышеуказанным аминосодержащим агентом для трансфекции, массовое отношение (отношение масса/масса) миРНК к общему количеству липидов (например, органического амина, вспомогательного липида и/или пегилированного липида) варьируется от приблизительно 1:1 до приблизительно 1:50, от приблизительно 1:1 до приблизительно 1:30, от приблизительно 1:3 до приблизительно 1:20, от приблизительно 1:4 до приблизительно 1:18, от приблизительно 1:5 до приблизительно 1:17, от приблизительно 1:5 до приблизительно 1:15, от приблизительно 1:5 до приблизительно 1:12, от приблизительно 1:6 до приблизительно 1:12, или от приблизительно 1:6 до приблизительно 1:10. Например, массовое отношение миРНК согласно настоящему изобретению к общему количеству липидов составляет приблизительно 1:5, 1:6, 1:7, 1:8, 1:9, 1:10, 1:11, 1:12, 1:13, 1:14, 1:15, 1:16, 1:17 или 1:18.In some embodiments, in the pharmaceutical composition formed by the siRNA of the present invention and the above amine-containing transfection agent, the weight ratio (w/w ratio) of the siRNA to the total amount of lipids (e.g., organic amine, auxiliary lipid, and/or PEGylated lipid) ranges from about 1:1 to about 1:50, about 1:1 to about 1:30, about 1:3 to about 1:20, about 1:4 to about 1:18, about 1:5 to about 1 :17, from about 1:5 to about 1:15, from about 1:5 to about 1:12, from about 1:6 to about 1:12, or from about 1:6 to about 1:10. For example, the weight ratio of siRNA according to the present invention to total lipids is approximately 1:5, 1:6, 1:7, 1:8, 1:9, 1:10, 1:11, 1:12, 1:13, 1:14, 1:15, 1:16, 1:17 or 1:18.
В некоторых вариантах осуществления каждый компонент в фармацевтической композиции при ее реализации на рынке может быть предоставлен отдельно, и композиция может применяться в форме жидкого состава. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция, образованная миРНК согласно настоящему изобретению и вышеуказанным фармацевтически приемлемым носителем, может быть получена с помощью различных известных способов, за исключением замены существующей миРНК с помощью миРНК согласно настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция может быть получена в соответствии со следующим способом.In some embodiments, each component in a pharmaceutical composition may be provided separately when marketed and the composition may be administered in the form of a liquid formulation. In some embodiments, the pharmaceutical composition formed by the siRNA of the present invention and the above pharmaceutically acceptable carrier can be prepared by various known methods other than replacing an existing siRNA with the siRNA of the present invention. In some embodiments, the pharmaceutical composition can be prepared in accordance with the following method.
Органические амины, вспомогательные липиды и пегилированные липиды суспендируют в спирте в молярном отношении, описанном выше, и смешивают до однородности с получением раствора липидов; и спирт применяют в таком количестве, чтобы полученный раствор липидов имел общую массовую концентрацию от 2 до 25 мг/мл, например, от 8 до 18 мг/мл. Спирт представляет собой фармацевтически приемлемый спирт, такой как спирт, который находится в жидкой форме при приблизительно комнатной температуре, например, один или более из этанола, пропиленгликоля, бензилового спирта, глицерина, ПЭГ 200, ПЭГ 300, ПЭГ 400 и, например, этанол.Organic amines, auxiliary lipids and PEGylated lipids are suspended in alcohol at the molar ratio described above and mixed until homogeneous to obtain a lipid solution; and the alcohol is used in such an amount that the resulting lipid solution has a total mass concentration of 2 to 25 mg/ml, for example 8 to 18 mg/ml. The alcohol is a pharmaceutically acceptable alcohol, such as an alcohol that is in liquid form at about room temperature, for example, one or more of ethanol, propylene glycol, benzyl alcohol, glycerin, PEG 200, PEG 300, PEG 400, and, for example, ethanol.
миРНК согласно настоящему изобретению растворяют в забуференном солевом растворе для получения водного раствора миРНК. Забуференный солевой раствор имеет концентрацию 0,05-0,5 М, например, 0,1-0,2 М. pH забуференного солевого раствора доводят до 4,0-5,5, например, 5,0-5,2. Забуференный солевой раствор применяют в таком количестве, чтобы миРНК присутствовала в концентрации менее 0,6 мг/мл, например, 0,2-0,4 мг/мл. Буферная соль может представлять собой одну или более из группы, состоящей из растворимого ацетата и растворимого цитрата, таких как ацетат натрия и/или ацетат калия.The siRNA of the present invention is dissolved in a buffered saline solution to obtain an aqueous siRNA solution. The buffered saline solution has a concentration of 0.05-0.5 M, for example 0.1-0.2 M. The pH of the buffered saline solution is adjusted to 4.0-5.5, for example 5.0-5.2. The buffered saline solution is used in such an amount that the siRNA is present at a concentration of less than 0.6 mg/ml, for example 0.2-0.4 mg/ml. The buffer salt may be one or more of the group consisting of soluble acetate and soluble citrate, such as sodium acetate and/or potassium acetate.
Раствор липидов и водный раствор миРНК смешивают. Продукт, полученный после смешивания, инкубируют при температуре 40-60°C в течение по меньшей мере 2 минут (например, 5-30 минут) с получением инкубированного препарата на липидной основе. Объемное отношение раствора липидов к водному раствору миРНК составляет 1:(2-5).The lipid solution and the aqueous siRNA solution are mixed. The product obtained after mixing is incubated at a temperature of 40-60°C for at least 2 minutes (for example, 5-30 minutes) to obtain an incubated lipid-based drug. The volume ratio of lipid solution to aqueous siRNA solution is 1:(2-5).
Инкубированный липосомный препарат концентрируют или разбавляют, очищают для удаления примесей, а затем стерилизуют с получением фармацевтической композиции согласно настоящему изобретению, имеющей следующие физико-химические параметры: pH 6,5-8, процент инкапсуляции более 80%, размер частиц 40-200 нм, коэффициент полидисперсности менее 0,30 и осмотическое давление 250-400 мОсм/кг; например, физико-химические параметры могут быть следующими: pH 7,2-7,6, процент инкапсуляции более 90%, размер частиц 60-100 нм, коэффициент полидисперсности менее 0,20 и осмотическое давление 300-400 мОсм/кг.The incubated liposome preparation is concentrated or diluted, purified to remove impurities and then sterilized to obtain a pharmaceutical composition according to the present invention having the following physicochemical parameters: pH 6.5-8, encapsulation percentage more than 80%, particle size 40-200 nm, polydispersity coefficient less than 0.30 and osmotic pressure 250-400 mOsm/kg; for example, the physicochemical parameters may be: pH 7.2-7.6, percent encapsulation greater than 90%, particle size 60-100 nm, polydispersity coefficient less than 0.20, and osmotic pressure 300-400 mOsm/kg.
Стадия концентрирования или разбавления может быть проведена до, после или одновременно со стадией удаления примесей. Способ удаления примесей может представлять собой любой из различных существующих способов, таких как ультрафильтрация с применением колонки с полыми волокнами на 100 кДа и фосфатного буферного раствора (PBS) при pH = 7,4 в качестве заменяемого раствора для ультрафильтрации, и системы с тангенциальным потоком. Способ стерилизации может представлять собой любой из различных существующих способов, таких как стерилизующая фильтрация на фильтре с размером пор 0,22 мкм.The concentration or dilution step may be carried out before, after or simultaneously with the impurity removal step. The impurity removal method may be any of various existing methods, such as ultrafiltration using a 100 kDa hollow fiber column and phosphate buffer saline (PBS) at pH = 7.4 as a replacement ultrafiltration solution, and a tangential flow system. The sterilization method may be any of various existing methods, such as sterilizing filtration on a filter with a pore size of 0.22 microns.
Конъюгат миРНКsiRNA conjugate
Настоящее изобретение относится к конъюгату миРНК, содержащему вышеуказанную миРНК и конъюгирующую группу, связанную путем конъюгации с указанной миРНК.The present invention relates to an siRNA conjugate containing the above siRNA and a conjugating group linked by conjugation to the specified siRNA.
Конъюгирующая группа, как правило, содержит по меньшей мере одну фармацевтически приемлемую нацеливающую группу и необязательный линкер. Кроме того, миРНК, линкер и нацеливающая группа соединены последовательно. В некоторых вариантах осуществления присутствует 1-6 нацеливающих групп. В некоторых вариантах осуществления присутствует 2-4 нацеливающие группы. Молекула миРНК может быть нековалентно или ковалентно конъюгирована с конъюгирующей группой, например, молекула миРНК может быть ковалентно конъюгирована с конъюгирующей группой. Сайт конъюгации миРНК и конъюгирующей группы может быть расположен на 3’-конце или 5’-конце смысловой цепи миРНК, или на 5’-конце антисмысловой цепи, или во внутренней последовательности миРНК. В некоторых вариантах осуществления сайт конъюгации миРНК и конъюгирующей группы расположен на 3’-конце смысловой цепи миРНК.The conjugating group typically contains at least one pharmaceutically acceptable targeting group and an optional linker. In addition, the siRNA, linker and targeting group are connected in series. In some embodiments, 1-6 targeting groups are present. In some embodiments, 2-4 targeting groups are present. The siRNA molecule may be non-covalently or covalently conjugated to a conjugating group, for example, the siRNA molecule may be covalently conjugated to a conjugating group. The conjugation site of the siRNA and the conjugating group may be located at the 3' end or 5' end of the sense strand of the siRNA, or at the 5' end of the antisense strand, or in the internal sequence of the siRNA. In some embodiments, the conjugation site of the siRNA and the conjugating group is located at the 3' end of the sense strand of the siRNA.
В некоторых вариантах осуществления конъюгирующая группа связана с фосфатной группой, 2’-гидрокси или основанием нуклеотида. В некоторых вариантах осуществления конъюгирующая группа может быть связана с 3’-гидрокси, когда нуклеотиды связаны посредством 2’-5’-фосфодиэфирной связи. Если конъюгирующая группа связана с концом миРНК, конъюгирующая группа, как правило, связана с фосфатной группой нуклеотида; если конъюгирующая группа связана с внутренней последовательностью миРНК, конъюгирующая группа, как правило, связана с рибозным кольцом или основанием. Конкретные варианты связывания приведены в источнике siRNA conjugates carrying sequentially assembled trivalent N-acetylgalactosamine linked through nucleosides elicit robust gene silencing in vivo in hepatocytes. ACS Chemical biology, 2015,10(5):1181-7, за авт. Muthiah Manoharan et.al.In some embodiments, the conjugating group is linked to a phosphate group, a 2'-hydroxy group, or a nucleotide base. In some embodiments, the conjugating group may be linked to a 3'-hydroxy when the nucleotides are linked through a 2'-5' phosphodiester bond. If a conjugating group is linked to the end of the siRNA, the conjugating group is typically linked to the phosphate group of the nucleotide; if the conjugating group is linked to an internal sequence of the siRNA, the conjugating group is typically linked to a ribose ring or base. Specific binding options are given in the source siRNA conjugates carrying sequentially assembled trivalent N-acetylgalactosamine linked through nucleosides identify robust gene silencing in vivo in hepatocytes. ACS Chemical biology, 2015, 10(5):1181-7, per ed. Muthiah Manoharan et al.
В некоторых вариантах осуществления миРНК и конъюгирующая группа могут быть связаны посредством кислото-неустойчивой или восстанавливаемой химической связи, и эти химические связи могут быть разрушены в кислой среде эндосом клетки, приводя миРНК в свободное состояние. Для вариантов неразрушаемой конъюгации конъюгирующая группа может быть связана со смысловой цепью миРНК, что сводит к минимуму влияние конъюгации на активность миРНК.In some embodiments, the siRNA and the conjugating group may be linked through an acid-labile or reducible chemical bond, and these chemical bonds may be disrupted in the acidic environment of the cell's endosomes, rendering the siRNA free. For non-degradable conjugation options, the conjugating group can be linked to the sense strand of the siRNA, thereby minimizing the effect of conjugation on siRNA activity.
В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая нацеливающая группа может представлять собой обычно используемый в области введения миРНК лиганд, например, различные лиганды, описанные в источнике WO2009082607A2, включенном в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.In some embodiments, the pharmaceutically acceptable targeting group may be a ligand commonly used in the field of siRNA administration, such as the various ligands described in WO2009082607A2, incorporated herein by reference in its entirety.
В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая нацеливающая группа может быть выбрана из одного или более из лигандов, образованных следующими нацеливающими молекулами или их производными: липофильные молекулы, такие как холестерин, желчные кислоты, витамины (такие как витамин Е), молекулы липидов с разной длиной цепи; полимеры, такие как полиэтиленгликоль; полипептиды, такие как проникающий пептид; аптамеры; антитела; квантовые точки; сахариды, такие как лактоза, полилактоза, манноза, галактоза и N-ацетилгалактозамин (GalNAc); фолат; и лиганды рецепторов, экспрессируемые в паренхимных клетках печени, такие как асиалогликопротеин, асиало-сахарный остаток, липопротеины (такие как липопротеин высокой плотности, липопротеин низкой плотности), глюкагон, нейромедиаторы (такие как адреналин), факторы роста, трансферрин и тому подобное.In some embodiments, the pharmaceutically acceptable targeting moiety may be selected from one or more of the ligands formed by the following targeting molecules or derivatives thereof: lipophilic molecules such as cholesterol, bile acids, vitamins (such as vitamin E), lipid molecules of various chain lengths ; polymers such as polyethylene glycol; polypeptides such as penetrating peptide; aptamers; antibodies; quantum dots; saccharides such as lactose, polylactose, mannose, galactose and N-acetylgalactosamine (GalNAc); folate; and receptor ligands expressed in liver parenchyma cells, such as asialoglycoprotein, asialosugar moiety, lipoproteins (such as high-density lipoprotein, low-density lipoprotein), glucagon, neurotransmitters (such as epinephrine), growth factors, transferrin and the like.
В некоторых вариантах осуществления каждый лиганд независимо представляет собой лиганд, способный связываться с поверхностным клеточным рецептором. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один лиганд представляет собой лиганд, способный связываться с поверхностным рецептором гепатоцита. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один лиганд представляет собой лиганд, способный связываться с поверхностным рецептором клетки млекопитающего. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один лиганд представляет собой лиганд, способный связываться с поверхностным рецептором клетки человека. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один лиганд представляет собой лиганд, способный связываться с асиалогликопротеиновым рецептором (ASGPR) на поверхности гепатоцита. Типы этих лигандов хорошо известны специалистам в данной области техники, и они, как правило, выполняют функцию связывания с определенными рецепторами на поверхности клетки-мишени, опосредуя доставку миРНК, связанной с лигандом, в клетку-мишень.In some embodiments, each ligand is independently a ligand capable of binding to a cell surface receptor. In some embodiments, the at least one ligand is a ligand capable of binding to a hepatocyte surface receptor. In some embodiments, the at least one ligand is a ligand capable of binding to a mammalian cell surface receptor. In some embodiments, the at least one ligand is a ligand capable of binding to a human cell surface receptor. In some embodiments, the at least one ligand is a ligand capable of binding to an asialoglycoprotein receptor (ASGPR) on the surface of a hepatocyte. The types of these ligands are well known to those skilled in the art, and they typically have the function of binding to certain receptors on the surface of a target cell, mediating the delivery of siRNA bound to the ligand into the target cell.
В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая нацеливающая группа может представлять собой любой лиганд, который связывается с асиалогликопротеиновыми рецепторами (ASGPR) на поверхности гепатоцитов млекопитающего. В одном варианте осуществления каждый лиганд независимо представляет собой асиалогликопротеин, такой как асиалоорозомукоид (ASOR) или асиалофетуин (ASF). В некоторых вариантах осуществления лиганд представляет собой сахарид или производное сахарида.In some embodiments, the pharmaceutically acceptable targeting moiety can be any ligand that binds to asialoglycoprotein receptors (ASGPRs) on the surface of mammalian hepatocytes. In one embodiment, each ligand is independently an asialoglycoprotein, such as asialorosomucoid (ASOR) or asialofetuin (ASF). In some embodiments, the ligand is a saccharide or a saccharide derivative.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один лиганд представляет собой сахарид. В некоторых вариантах осуществления каждый лиганд представляет собой сахарид. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один лиганд представляет собой моносахарид, полисахарид, модифицированный моносахарид, модифицированный полисахарид или производное сахарида. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один лиганд может представлять собой моносахарид, дисахарид или трисахарид. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один лиганд представляет собой модифицированный сахарид. В некоторых вариантах осуществления каждый лиганд представляет собой модифицированный сахарид. В некоторых вариантах осуществления каждый лиганд независимо выбран из группы, состоящей из полисахаридов, модифицированных полисахаридов, моносахаридов, модифицированных моносахаридов, производных полисахаридов или производных моносахаридов. В некоторых вариантах осуществления каждый лиганд или по меньшей мере один лиганд выбран из группы, состоящей из следующих сахаридов: глюкозы и ее производного, маннозы и ее производного, галактозы и ее производного, ксилозы и ее производного, рибозы и ее производного, фукозы и ее производного, лактозы и ее производного, мальтозы и ее производного, арабинозы и ее производного, фруктозы и ее производного, и сиаловой кислоты.In some embodiments, the at least one ligand is a saccharide. In some embodiments, each ligand is a saccharide. In some embodiments, the at least one ligand is a monosaccharide, a polysaccharide, a modified monosaccharide, a modified polysaccharide, or a saccharide derivative. In some embodiments, the at least one ligand may be a monosaccharide, disaccharide, or trisaccharide. In some embodiments, the at least one ligand is a modified saccharide. In some embodiments, each ligand is a modified saccharide. In some embodiments, each ligand is independently selected from the group consisting of polysaccharides, modified polysaccharides, monosaccharides, modified monosaccharides, polysaccharide derivatives, or monosaccharide derivatives. In some embodiments, each ligand or at least one ligand is selected from the group consisting of the following saccharides: glucose and a derivative thereof, mannose and a derivative thereof, galactose and a derivative thereof, xylose and a derivative thereof, ribose and a derivative thereof, fucose and a derivative thereof , lactose and a derivative thereof, maltose and a derivative thereof, arabinose and a derivative thereof, fructose and a derivative thereof, and sialic acid.
В некоторых вариантах осуществления каждый лиганд может быть независимо выбран из одного из следующих: D-маннопираноза, L-маннопираноза, D-арабиноза, D-ксилофураноза, L-ксилофураноза, D-глюкоза, L-глюкоза, D-галактоза, L-галактоза, α-D-маннофураноза, β-D-маннофураноза, α-D-маннопираноза, β-D-маннопираноза, α-D-глюкопираноза, β-D-глюкопираноза, α-D-глюкофураноза, β-D-глюкофураноза, α-D-фруктофураноза, α-D-фруктопираноза, α-D-галактопираноза, β-D-галактопираноза, α-D-галактофураноза, β-D-галактофураноза, глюкозамин, сиаловая кислота, галактозамин, N-ацетилгалактозамин, N-трифторацетилгалактозамин, N-пропионилгалактозамин, N-н-бутирилгалактозамин, N-изобутирилгалактозамин, 2-амино-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопираноза, 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопираноза, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-O-метил-D-маннопираноза, 2-дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопираноза, N-гликолил-α-нейраминовая кислота, 5-тио-β-D-глюкофураноза, метил-2,3,4-трис-O-ацетил-1-тио-6-O-тритил-α-D-глюкофураноза, 4-тио-β-D-галактопираноза, этил-3,4,6,7-тетра-O-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюкогептопиранозид, 2,5-ангидро-D-аллононитрил, рибоза, D-рибоза, D-4-тиорибоза, L-рибоза или L-4-тиорибоза. Другие подборки лигандов можно найти, например, в источнике CN105378082A, включенном в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.In some embodiments, each ligand may be independently selected from one of the following: D-mannopyranose, L-mannopyranose, D-arabinose, D-xylofuranose, L-xylofuranose, D-glucose, L-glucose, D-galactose, L-galactose , α-D-mannofuranose, β-D-mannofuranose, α-D-mannopyranose, β-D-mannopyranose, α-D-glucopyranose, β-D-glucopyranose, α-D-glucofuranose, β-D-glucofuranose, α -D-fructofuranose, α-D-fructopyranose, α-D-galactopyranose, β-D-galactopyranose, α-D-galactofuranose, β-D-galactofuranose, glucosamine, sialic acid, galactosamine, N-acetylgalactosamine, N-trifluoroacetylgalactosamine, N-propionylgalactosamine, N-n-butyrylgalactosamine, N-isobutyrylgalactosamine, 2-amino-3-O-[(R)-1-carboxyethyl]-2-deoxy-β-D-glucopyranose, 2-deoxy-2-methylamino- L-glucopyranose, 4,6-dideoxy-4-formamido-2,3-di-O-methyl-D-mannopyranose, 2-deoxy-2-sulfoamino-D-glucopyranose, N-glycolyl-α-neuraminic acid, 5 -thio-β-D-glucofuranose, methyl-2,3,4-tris-O-acetyl-1-thio-6-O-trityl-α-D-glucofuranose, 4-thio-β-D-galactopyranose, ethyl -3,4,6,7-tetra-O-acetyl-2-deoxy-1,5-dithio-α-D-glucoheptopyranoside, 2,5-anhydro-D-allononitrile, ribose, D-ribose, D-4 -thioribose, L-ribose or L-4-thioribose. Other collections of ligands can be found, for example, in reference CN105378082A, which is incorporated herein by reference in its entirety.
В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая нацеливающая группа в конъюгате миРНК может представлять собой галактозу или N-ацетилгалактозамин, где молекулы галактозы или N-ацетилгалактозамина могут быть одновалентными, двухвалентными, трехвалентными и четырехвалентными. Следует иметь в виду, что термины «одновалентный», «двухвалентный», «трехвалентный» и «четырехвалентный», описанные в настоящем документе, соответственно означают, что молярное отношение молекулы миРНК к молекуле галактозы или N-ацетилгалактозамина в конъюгате миРНК составляет 1:1, 1:2, 1:3 или 1:4, где конъюгат миРНК образован из молекулы миРНК и конъюгирующей группы, содержащей галактозу или N-ацетилгалактозамин в качестве нацеливающей группы. В некоторых вариантах осуществления фармацевтически приемлемая нацеливающая группа представляет собой N-ацетилгалактозамин. В некоторых вариантах осуществления, когда миРНК согласно настоящему изобретению конъюгирована с конъюгирующей группой, содержащей N-ацетилгалактозамин, молекула N-ацетилгалактозамина является трехвалентной или четырехвалентной. В некоторых вариантах осуществления, когда миРНК согласно настоящему изобретению конъюгирована с конъюгирующей группой, содержащей N-ацетилгалактозамин, молекула N-ацетилгалактозамина является трехвалентной.In some embodiments, the pharmaceutically acceptable targeting moiety in the siRNA conjugate may be galactose or N-acetylgalactosamine, wherein the galactose or N-acetylgalactosamine molecules may be monovalent, divalent, trivalent, or tetravalent. It should be understood that the terms “monivalent,” “divalent,” “trivalent,” and “tetravalent” as used herein respectively mean that the molar ratio of the siRNA molecule to the galactose or N-acetylgalactosamine molecule in the siRNA conjugate is 1:1 , 1:2, 1:3 or 1:4, where the siRNA conjugate is formed from a siRNA molecule and a conjugating group containing galactose or N-acetylgalactosamine as a targeting group. In some embodiments, the pharmaceutically acceptable targeting moiety is N-acetylgalactosamine. In some embodiments, when the siRNA of the present invention is conjugated to a conjugating group containing N-acetylgalactosamine, the N-acetylgalactosamine molecule is trivalent or tetravalent. In some embodiments, when the siRNA of the present invention is conjugated to a conjugating group containing N-acetylgalactosamine, the N-acetylgalactosamine molecule is trivalent.
Нацеливающая группа может быть связана с молекулой миРНК посредством подходящего линкера, и указанный подходящий линкер может быть выбран специалистами в данной области техники в соответствии с конкретным типом нацеливающей группы. Типы этих линкеров и нацеливающих групп, а также методы связывания с миРНК можно найти в источнике WO2015006740A2, включенном в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.The targeting group can be linked to the siRNA molecule through a suitable linker, and said suitable linker can be selected by those skilled in the art according to the particular type of targeting group. The types of these linkers and targeting groups, as well as methods for binding to siRNAs, can be found in WO2015006740A2, which is incorporated herein by reference in its entirety.
В некоторых вариантах осуществления, когда нацеливающая группа представляет собой N-ацетилгалактозамин, подходящий линкер может представлять собой структуру, представленную Формулой (301):In some embodiments, when the targeting group is N-acetylgalactosamine, a suitable linker may be the structure represented by Formula (301):
Формула (301), Formula (301),
гдеWhere
k представляет собой целое число от 1 до 3; иk is an integer from 1 to 3; And
LA представляет собой фрагмент цепи, содержащий амидную связь, имеющий структуру, представленную Формулой (302), причем каждый LA соответствующим образом связан с нацеливающей группой и фрагментом LC посредством простой эфирной связи на двух его концах:L A is an amide bond-containing chain moiety having the structure represented by Formula (302), with each L A suitably linked to a targeting group and an L C moiety via an ether bond at its two ends:
Формула (302); Formula (302);
LB представляет собой фрагмент цепи, содержащий N-ацилпирролидин, имеющий структуру, представленную Формулой (303), причем фрагмент цепи содержит карбонил на одном его конце и связан с фрагментом LC посредством амидной связи, и содержит оксигруппу на другом его конце и связан с миРНК посредством фосфоэфирной связи:L B is a chain moiety containing N-acylpyrrolidine having the structure represented by Formula (303), wherein the chain moiety contains a carbonyl at one end thereof and is linked to the L C moiety via an amide bond, and contains an hydroxy group at the other end thereof and is linked to siRNA via phosphoester linkage:
Формула (303); Formula (303);
LC представляет собой двух-четырехвалентную связывающую группу на основе гидроксиметиламинометана, дигидроксиметиламинометана или тригидроксиметиламинометана, причем LC связан с каждым из фрагментов LA посредством простой эфирной связи через атом кислорода и связан с фрагментом LB посредством амидной связи через атом азота.L C is a di- to tetravalent linking group based on hydroxymethylaminomethane, dihydroxymethylaminomethane or trihydroxymethylaminomethane, wherein L C is linked to each of the L A moieties via an ether bond via an oxygen atom and linked to the L B moiety via an amide bond via a nitrogen atom.
В некоторых вариантах осуществления, когда n=3 и LC представляет собой четырехвалентную связывающую группу на основе тригидроксиметиламинометана, конъюгат миРНК, образованный путем связывания молекулы N-ацетилгалактозамина с молекулой миРНК с помощью -(LA)3-тригидроксиметиламинометан-LB- в качестве линкера, имеет структуру, представленную Формулой (304):In some embodiments, when n=3 and L C is a tetravalent trihydroxymethylaminomethane-based linking group, the siRNA conjugate formed by linking an N-acetylgalactosamine molecule to a siRNA molecule using -(L A ) 3 -trihydroxymethylaminomethane-L B - as linker, has the structure represented by Formula (304):
Формула (304), Formula (304),
где структура двойной спирали представляет собой миРНК.where the double helix structure is siRNA.
Аналогичным образом, сайт конъюгации миРНК и конъюгирующей группы может быть расположен на 3’-конце или 5’-конце смысловой цепи миРНК, или на 5’-конце антисмысловой цепи, или во внутренней последовательности миРНК.Likewise, the conjugation site of the siRNA and the conjugating group may be located at the 3' end or 5' end of the sense strand of the siRNA, or at the 5' end of the antisense strand, or in the internal sequence of the siRNA.
В некоторых вариантах осуществления 3’-конец смысловой цепи миРНК согласно настоящему изобретению ковалентно конъюгирован с тремя молекулами N-ацетилгалактозамина (GalNAc) с помощью линкера -(LA)3-тригидроксиметиламинометан-LB- с получением конъюгата миРНК, в котором молярное отношение молекулы миРНК к молекуле GaINAc составляет 1:3, который далее в настоящем документе также может называться (GaINAc)3-миРНК), и конъюгат миРНК имеет структуру, представленную Формулой (305):In some embodiments, the 3' end of the sense strand of an siRNA of the present invention is covalently conjugated to three molecules of N-acetylgalactosamine (GalNAc) via a linker -(L A ) 3 -trihydroxymethylaminomethane-L B - to produce an siRNA conjugate in which the molar ratio of the molecule The siRNA to GaINAc molecule is 1:3, which may also be referred to herein as (GaINAc) 3 -siRNA), and the siRNA conjugate has the structure represented by Formula (305):
Формула (305), Formula (305),
где структура двойной спирали представляет собой миРНК; и линкер связан с 3’-концом смысловой цепи миРНК.wherein the double helix structure is siRNA; and the linker is connected to the 3' end of the sense strand of the siRNA.
В некоторых вариантах осуществления, когда нацеливающая группа представляет собой N-ацетилгалактозамин, подходящий линкер может представлять собой структуру, представленную Формулой (306):In some embodiments, when the targeting group is N-acetylgalactosamine, a suitable linker may be the structure represented by Formula (306):
, Формула (306), , Formula (306),
гдеWhere
l представляет собой целое число от 0 до 3;l represents an integer from 0 to 3;
* обозначает сайт, связанный с нацеливающей группой посредством простой эфирной связи на линкере; и* denotes a site linked to the targeting group via an ether bond on the linker; And
# обозначает сайт, связанный с миРНК посредством фосфоэфирной связи на линкере.# denotes the site linked to the siRNA via a phosphoester bond on the linker.
В некоторых вариантах осуществления, когда l=2, конъюгат миРНК имеет структуру, представленную Формулой (307):In some embodiments, when l=2, the siRNA conjugate has the structure represented by Formula (307):
Формула (307), Formula (307),
где структура двойной спирали представляет собой миРНК; и линкер связан с 3’-концом смысловой цепи миРНК.wherein the double helix structure is siRNA; and the linker is connected to the 3' end of the sense strand of the siRNA.
Вышеуказанные конъюгаты могут быть синтезированы в соответствии со способами, подробно описанными в уровне техники. Например, в источнике WO2015006740A2 подробно описан способ получения различных конъюгатов. Конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению может быть получен способами, хорошо известными специалистам в данной области техники. В качестве еще одного примера в источнике WO2014025805A1 описан способ получения конъюгата, имеющего структуру, представленную Формулой (305). Rajeev et al. описывают способ получения конъюгата, имеющего структуру, представленную Формулой (307), в ChemBioChem 2015, 16, 903-908.The above conjugates can be synthesized in accordance with methods described in detail in the prior art. For example, WO2015006740A2 describes in detail a method for preparing various conjugates. The siRNA conjugate of the present invention can be prepared by methods well known to those skilled in the art. As another example, WO2014025805A1 describes a method for preparing a conjugate having the structure represented by Formula (305). Rajeev et al. describe a method for preparing a conjugate having the structure represented by Formula (307) in ChemBioChem 2015, 16, 903-908.
В некоторых вариантах осуществления конъюгат миРНК имеет структуру, представленную Формулой (308):In some embodiments, the siRNA conjugate has the structure represented by Formula (308):
Формула (308),Formula (308),
где:Where:
n1 представляет собой целое число от 1 до 3, а n3 представляет собой целое число от 0 до 4;n1 is an integer from 1 to 3, and n3 is an integer from 0 to 4;
каждый из m1, m2 и m3 независимо представляет собой целое число от 2 до 10;each of m1, m2 and m3 independently represents an integer from 2 to 10;
каждый из R10, R11, R12, R13, R14 или R15 независимо представляет собой H или выбран из группы, состоящей из C1-C10 алкила, C1-C10 галогеналкила и C1-C10 алкокси; иeach of R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 or R 15 independently represents H or is selected from the group consisting of C 1 -C 10 alkyl, C 1 -C 10 haloalkyl and C 1 -C 10 alkoxy ; And
R3 представляет собой группу, имеющую структуру, представленную Формулой A59:R 3 is a group having the structure represented by Formula A59:
(A59),(A59),
где E1 представляет собой OH, SH или BH2, а Nu представляет собой миРНК согласно настоящему изобретению;where E 1 represents OH, SH or BH 2 and Nu represents siRNA according to the present invention;
R2 представляет собой линейный алкилен длиной от 1 до 20 атомов углерода, где один или более атомов углерода необязательно замещены любым одним или более из группы, состоящей из: C(O), NH, O, S, CH=N, S(O)2, C2-C10 алкенилена, C2-C10 алкинилена, C6-C10 арилена, C3-C18 гетероциклилена и C5-C10 гетероарилена, и где R2 необязательно замещен любым одним или более из группы, состоящей из: C1-C10 алкила, C6-C10 арила, C5-C10 гетероарила, C1-C10 галогеналкила, -OC1-C10 алкила, -OC1-C10 алкилфенила, -C1-C10 алкил-OH, -OC1-C10 галогеналкила, -SC1-C10 алкила, -SC1-C10 алкилфенила, -C1-C10 алкил-SH, -SC1-C10 галогеналкила, галогенового заместителя, -OH, -SH, -NH2, -C1-C10 алкил-NH2, -N(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкила), -NH(C1-C10 алкила), -N(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкилфенила), -NH(C1-C10 алкилфенила), циано, нитро, -CO2H, -C(O)O(C1-C10 алкила), -CON(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкила), -CONH(C1-C10 алкила), -CONH2, -NHC(O)(C1-C10 алкила), -NHC(O)(фенила), -N(C1-C10 алкил)C(O)(C1-C10 алкила), -N(C1-C10 алкил)C(O)(фенила), -C(O)C1-C10 алкила, -C(O)C1-C10 алкилфенила, -C(O)C1-C10 галогеналкила, -OC(O)C1-C10 алкила, -SO2(C1-C10 алкила), -SO2(фенила), -SO2(C1-C10 галогеналкила), -SO2NH2, -SO2NH(C1-C10 алкила), -SO2NH(фенила), -NHSO2(C1-C10 алкила), -NHSO2(фенила) и -NHSO2(C1-C10 галогеналкила); иR 2 is a linear alkylene of 1 to 20 carbon atoms in length, where one or more carbon atoms are optionally substituted by any one or more of the group consisting of: C(O), NH, O, S, CH=N, S(O ) 2 , C 2 -C 10 alkenylene, C 2 -C 10 alkynylene, C 6 -C 10 arylene, C 3 -C 18 heterocyclylene and C 5 -C 10 heteroarylene, and where R 2 is optionally substituted by any one or more of the group , consisting of: C 1 -C 10 alkyl, C 6 -C 10 aryl, C 5 -C 10 heteroaryl, C 1 -C 10 haloalkyl, -OC 1 -C 10 alkyl, -OC 1 -C 10 alkylphenyl, -C 1 -C 10 alkyl-OH, -OC 1 -C 10 haloalkyl, -SC 1 -C 10 alkyl, -SC 1 -C 10 alkylphenyl, -C 1 -C 10 alkyl-SH, -SC 1 -C 10 haloalkyl, halogen substituent, -OH, -SH, -NH 2 , -C 1 -C 10 alkyl-NH 2 , -N(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 -C 10 alkyl), -NH(C 1 -C 10 alkyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 -C 10 alkylphenyl), -NH(C 1 -C 10 alkylphenyl), cyano, nitro, -CO 2 H, -C(O)O( C 1 -C 10 alkyl), -CON(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 -C 10 alkyl), -CONH(C 1 -C 10 alkyl), -CONH 2 , -NHC(O)(C 1 -C 10 alkyl), -NHC(O)(phenyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)C(O)(C 1 -C 10 alkyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)C( O)(phenyl), -C(O)C 1 -C 10 alkyl, -C(O)C 1 -C 10 alkylphenyl, -C(O)C 1 -C 10 haloalkyl, -OC(O)C 1 - C 10 alkyl, -SO 2 (C 1 -C 10 alkyl), -SO 2 (phenyl), -SO 2 (C 1 -C 10 haloalkyl), -SO 2 NH 2 , -SO 2 NH (C 1 -C 10 alkyl), -SO 2 NH(phenyl), -NHSO 2 (C 1 -C 10 alkyl), -NHSO 2 (phenyl) and -NHSO 2 (C 1 -C 10 haloalkyl); And
каждый L1 независимо представляет собой линейный алкилен длиной от 1 до 70 атомов углерода, где один или более атомов углерода необязательно замещены любым одним или более из группы, состоящей из: C(O), NH, O, S, CH=N, S(O)2, C2-C10 алкенилена, C2-C10 алкинилена, C6-C10 арилена, C3-C18 гетероциклилена и C5-C10 гетероарилена; и где L1 необязательно замещен любым одним или более из группы, состоящей из: C1-C10 алкила, C6-C10 арила, C5-C10 гетероарила, C1-C10 галогеналкила, -OC1-C10 алкила, -OC1-C10 алкилфенила, -C1-C10 алкил-OH, -OC1-C10 галогеналкила, -SC1-C10 алкила, -SC1-C10 алкилфенила, -C1-C10 алкил-SH, -SC1-C10 галогеналкила, галогенового заместителя, -OH, -SH, -NH2, -C1-C10 алкил-NH2, -N(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкила), -NH(C1-C10 алкила), -N(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкилфенила), -NH(C1-C10 алкилфенила), циано, нитро, -CO2H, -C(O)O(C1-C10 алкила), -CON(C1-C10 алкил)(C1-C10 алкила), -CONH(C1-C10 алкила), -CONH2, -NHC(O)(C1-C10 алкила), -NHC(O)(фенила), -N(C1-C10 алкил)C(O)(C1-C10 алкила), -N(C1-C10 алкил)C(O)(фенила), -C(O)C1-C10 алкила, -C(O)C1-C10 алкилфенила, -C(O)C1-C10 галогеналкила, -OC(O)C1-C10 алкила, -SO2(C1-C10 алкила), -SO2(фенила), -SO2(C1-C10 галогеналкила), -SO2NH2, -SO2NH(C1-C10 алкила), -SO2NH(фенила), -NHSO2(C1-C10 алкила), -NHSO2(фенила) и -NHSO2(C1-C10 галогеналкила).each L 1 is independently a linear alkylene of 1 to 70 carbon atoms in length, wherein one or more carbon atoms are optionally substituted by any one or more of the group consisting of: C(O), NH, O, S, CH=N, S (O) 2 , C 2 -C 10 alkenylene, C 2 -C 10 alkynylene, C 6 -C 10 arylene, C 3 -C 18 heterocyclylene and C 5 -C 10 heteroarylene; and wherein L 1 is optionally substituted by any one or more of the group consisting of: C 1 -C 10 alkyl, C 6 -C 10 aryl, C 5 -C 10 heteroaryl, C 1 -C 10 haloalkyl, -OC 1 -C 10 alkyl, -OC 1 -C 10 alkylphenyl, -C 1 -C 10 alkyl-OH, -OC 1 -C 10 haloalkyl, -SC 1 -C 10 alkyl, -SC 1 -C 10 alkylphenyl, -C 1 -C 10 alkyl-SH, -SC 1 -C 10 haloalkyl, halogen substituent, -OH, -SH, -NH 2 , -C 1 -C 10 alkyl-NH 2 , -N(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 - C 10 alkyl), -NH(C 1 -C 10 alkyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 -C 10 alkylphenyl), -NH(C 1 -C 10 alkylphenyl), cyano, nitro, -CO 2 H, -C(O)O(C 1 -C 10 alkyl), -CON(C 1 -C 10 alkyl)(C 1 -C 10 alkyl), -CONH(C 1 -C 10 alkyl), -CONH 2 , -NHC(O)(C 1 -C 10 alkyl), -NHC(O)(phenyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)C(O)(C 1 -C 10 alkyl), -N(C 1 -C 10 alkyl)C(O)(phenyl), -C(O)C 1 -C 10 alkyl, -C(O)C 1 -C 10 alkylphenyl, -C(O)C 1 - C 10 haloalkyl, -OC(O)C 1 -C 10 alkyl, -SO 2 (C 1 -C 10 alkyl), -SO 2 (phenyl), -SO 2 (C 1 -C 10 haloalkyl), -SO 2 NH 2 , -SO 2 NH (C 1 -C 10 alkyl), -SO 2 NH (phenyl), -NHSO 2 (C 1 -C 10 alkyl), -NHSO 2 (phenyl) and -NHSO 2 (C 1 - C 10 haloalkyl).
В некоторых вариантах осуществления L1 может быть выбран из группы, состоящей из групп (A1)-(A26) и любой их комбинации, где структуры и определения (A1)-(A26) представляют собой следующие:In some embodiments, L 1 may be selected from the group consisting of groups (A1)-(A26) and any combination thereof, wherein the structures and definitions (A1)-(A26) are as follows:
где каждый j1 независимо представляет собой целое число от 1 до 20; и каждый j2 независимо представляет собой целое число от 1 до 20;where each j1 independently represents an integer from 1 to 20; and each j2 is independently an integer from 1 to 20;
каждый R' независимо представляет собой C1-C10 алкил; иeach R' independently represents C 1 -C 10 alkyl; And
каждый Ra независимо выбран из группы, состоящей из групп (A27)-(A45) и любых комбинаций их соединений:each Ra is independently selected from the group consisting of groups (A27)-(A45) and any combinations of their compounds:
каждый Rb независимо представляет собой C1-C10 алкил; и обозначает сайт ковалентного присоединения группы.each Rb independently represents C 1 -C 10 alkyl; And denotes the site of covalent addition of a group.
Специалистам в данной области техники будет ясно, что, несмотря на то, что для удобства L1 определен как линейный алкилен, он может не представлять собой линейную группу или может называться по-другому, например, амином или алкенилом, полученным посредством вышеуказанной замены и/или замещения. Для целей настоящего изобретения длина L1 представляет собой количество атомов в цепи, соединяющей две точки присоединения. Для этой цели кольцо, получаемое путем замены атома углерода линейного алкилена, такого как гетероциклилен или гетероарилен, считается за один атом.Those skilled in the art will appreciate that while L 1 is defined as a linear alkylene for convenience, it may not be a linear group or may be called something else, such as an amine or an alkenyl derived from the above substitution and/ or substitution. For the purposes of the present invention, the length L 1 represents the number of atoms in the chain connecting two points of attachment. For this purpose, a ring obtained by replacing a carbon atom of a linear alkylene such as heterocyclylene or heteroarylene is counted as one atom.
M1 представляет собой нацеливающую группу, определения и варианты которой аналогичны описанным выше. В некоторых вариантах осуществления каждая M1 независимо выбрана из одного из лигандов, обладающих аффинностью к асиалогликопротеиновому рецептору на поверхности гепатоцитов млекопитающего.M 1 is a targeting group, the definitions and variations of which are similar to those described above. In some embodiments, each M 1 is independently selected from one of the ligands having affinity for the asialoglycoprotein receptor on the surface of mammalian hepatocytes.
Когда M1 представляет собой лиганд, обладающий аффинностью к асиалогликопротеиновому рецептору на поверхности гепатоцитов млекопитающего, в некоторых вариантах осуществления n1 может представлять собой целое число от 1 до 3, а n3 может представлять собой целое число от 0 до 4, чтобы количество нацеливающих групп M1 в конъюгате миРНК могло составлять по меньшей мере 2. В некоторых вариантах осуществления n1+n3≥2, так что количество нацеливающих групп M1 в конъюгате может составлять по меньшей мере 3, обеспечивая тем самым более легкое связывание нацеливающей группы M1 с асиалогликопротеиновым рецептором на поверхности гепатоцитов, что может облегчать эндоцитоз конъюгата миРНК в клетки. Эксперименты показали, что, когда количество нацеливающих групп M1 превышает 3, легкость связывания нацеливающей группы M1 с асиалогликопротеиновым рецептором на поверхности гепатоцитов существенно не увеличивается. Таким образом, с учетом различных аспектов, таких как удобство синтеза, структура/затраты на проведение способа и эффективность доставки, в некоторых вариантах осуществления n1 представляет собой целое число от 1 до 2, n3 представляет собой целое число от 0 до 1, и n1+n3=2-3.When M 1 is a ligand having affinity for an asialoglycoprotein receptor on the surface of mammalian hepatocytes, in some embodiments n1 may be an integer from 1 to 3 and n3 may be an integer from 0 to 4 such that the number of targeting groups M 1 in the siRNA conjugate could be at least 2. In some embodiments, n1+n3≥2, such that the number of M 1 targeting moieties in the conjugate can be at least 3, thereby allowing for easier binding of the M 1 targeting moiety to the asialoglycoprotein receptor on surface of hepatocytes, which may facilitate endocytosis of the siRNA conjugate into cells. Experiments have shown that when the number of M 1 targeting groups exceeds 3, the ease of binding of the M 1 targeting group to the asialoglycoprotein receptor on the surface of hepatocytes does not increase significantly. Thus, taking into account various aspects such as ease of synthesis, process design/cost, and delivery efficiency, in some embodiments, n1 is an integer from 1 to 2, n3 is an integer from 0 to 1, and n1+ n3=2-3.
В некоторых вариантах осуществления, когда каждый из m1, m2 или m3 независимо выбран из целого числа от 2 до 10, взаимные пространственные расположения множества нацеливающих групп M1 могут быть подходящими для связывания нацеливающих групп M1 с асиалогликопротеиновым рецептором на поверхности гепатоцитов. Для того, чтобы конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению имел более простую структуру, более простой синтез и/или сниженную стоимость, в некоторых вариантах осуществления m1, m2 или m3 независимо представляет собой целое число от 2 до 5, и в некоторых вариантах осуществления m1=m2=m3.In some embodiments, when m1, m2, or m3 are each independently selected from an integer of 2 to 10, the relative spatial arrangements of the plurality of M 1 targeting groups may be suitable for binding the M 1 targeting groups to the asialoglycoprotein receptor on the surface of hepatocytes. In order for the siRNA conjugate of the present invention to have a simpler structure, easier synthesis, and/or reduced cost, in some embodiments, m1, m2, or m3 is independently an integer from 2 to 5, and in some embodiments, m1=m2 =m3.
Специалистам в данной области техники будет ясно, что, когда каждый из R10, R11, R12, R13, R14 или R15 независимо выбран из H, C1-C10 алкила, C1-C10 галогеналкила и C1-C10 алкокси, они не изменяют свойства конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению и все способны достичь цели настоящего изобретения. В некоторых вариантах осуществления каждый из R10, R11, R12, R13, R14 или R15 независимо выбран из H, метила или этила. В некоторых вариантах осуществления все из R10, R11, R12, R13, R14 и R15 представляют собой H.Those skilled in the art will appreciate that when each of R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 or R 15 is independently selected from H, C 1 -C 10 alkyl, C 1 -C 10 haloalkyl and C 1 -C 10 alkoxy, they do not change the properties of the siRNA conjugate according to the present invention and are all capable of achieving the purpose of the present invention. In some embodiments, R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 or R 15 are each independently selected from H, methyl or ethyl. In some embodiments, R10 , R11 , R12 , R13 , R14 , and R15 are all H.
R3 представляет собой группу, имеющую структуру, представленную Формулой A59, где E1 представляет собой OH, SH или BH2, и при доступности исходных веществ в некоторых вариантах осуществления E1 представляет собой OH или SH.R 3 represents a group having the structure represented by Formula A59, where E 1 represents OH, SH or BH 2 , and when the starting materials are available, in some embodiments, E 1 represents OH or SH.
R2 выбирают таким образом, чтобы обеспечить связь между группой, представленной Формулой A59, и атомом N на азотсодержащем остове. В контексте настоящего изобретения «азотсодержащий остов» относится к цепочечной структуре, в которой атомы углерода, присоединенные к R10, R11, R12, R13, R14 и R15, и атомы N связаны друг с другом. Следовательно, R2 может представлять собой любую связывающую группу, способную присоединять группу, представленную Формулой A59, к атому N на азотсодержащем остове с помощью подходящих средств. В некоторых вариантах осуществления, в случае, если конъюгат миРНК, представленный Формулой (308), согласно настоящему изобретению, получают с помощью процесса твердофазного синтеза, группа R2 должна иметь как сайт связывания с атомом N на азотсодержащем остове, так и сайт связывания с атомом P в R3. В некоторых вариантах осуществления в R2 сайт связывания с атомом N на азотсодержащем остове образует амидную связь с атомом N, а сайт связывания с атомом P в R3 образует фосфоэфирную связь с атомом P. В некоторых вариантах осуществления R2 может представлять собой B5, B6, B5' или B6':R 2 is chosen to provide a bond between the group represented by Formula A59 and the N atom on the nitrogen backbone. In the context of the present invention, “nitrogen-containing backbone” refers to a chain structure in which the carbon atoms attached to R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 and R 15 and the N atoms are connected to each other. Therefore, R 2 can be any linking group capable of attaching the group represented by Formula A59 to the N atom on the nitrogen backbone by suitable means. In some embodiments, when the siRNA conjugate represented by Formula (308) according to the present invention is prepared by a solid-phase synthesis process, the R 2 group must have both a binding site to the N atom on the nitrogen backbone and a binding site to the N atom P to R3 . In some embodiments, in R 2 the binding site to the N atom on the nitrogen backbone forms an amide bond to the N atom, and the binding site to the P atom in R 3 forms a phosphoester bond to the P atom. In some embodiments, R 2 may be B5, B6 , B5' or B6':
где обозначает сайт ковалентного присоединения группы; иWhere denotes the site of covalent attachment of a group; And
диапазон значений q2 может представлять собой целое число от 1 до 10; и в некоторых вариантах осуществления q2 представляет собой целое число от 1 до 5.the range of q 2 values may be an integer from 1 to 10; and in some embodiments, q 2 is an integer from 1 to 5.
L1 используется для связывания нацеливающей группы M1 с атомом N на азотсодержащем остове, что наделяют конъюгат миРНК, представленный Формулой (308), функцией нацеливания на печень. В некоторых вариантах осуществления L1 выбран из комбинаций соединений одной или более из групп, представленных Формулами A1-A26. В некоторых вариантах осуществления L1 выбран из комбинаций соединений одной или более из A1, A4, A5, A6, A8, A10, A11 и A13. В некоторых вариантах осуществления L1 выбран из комбинаций соединений по меньшей мере двух из A1, A4, A8, A10 и A11. В некоторых вариантах осуществления L1 выбран из комбинаций соединений по меньшей мере двух из A1, A8 и A10.L 1 is used to bind the targeting group M 1 to the N atom on the nitrogen backbone, which provides the siRNA conjugate represented by Formula (308) with liver targeting function. In some embodiments, L 1 is selected from combinations of compounds from one or more of the groups represented by Formulas A1-A26. In some embodiments, L 1 is selected from combinations of compounds of one or more of A1, A4, A5, A6, A8, A10, A11, and A13. In some embodiments, L 1 is selected from combinations of compounds of at least two of A1, A4, A8, A10, and A11. In some embodiments, L 1 is selected from combinations of compounds of at least two of A1, A8 and A10.
В некоторых вариантах осуществления длина L1 может составлять 3-25 атомов, 3-20 атомов, 4-15 атомов или 5-12 атомов. В некоторых вариантах осуществления длина L1 составляет 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60 атомов.In some embodiments, the length of L 1 may be 3-25 atoms, 3-20 atoms, 4-15 atoms, or 5-12 atoms. In some embodiments, the length L 1 is 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60 atoms.
В некоторых вариантах осуществления j1 представляет собой целое число от 2 до 10, и в некоторых вариантах осуществления j1 представляет собой целое число от 3 до 5. В некоторых вариантах осуществления j2 представляет собой целое число от 2 до 10, и в некоторых вариантах осуществления j2 представляет собой целое число от 3 до 5. R' представляет собой C1-C4 алкил, и в некоторых вариантах осуществления R' представляет собой один из метила, этила и изопропила. Ra представляет собой одну из A27, A28, A29, A30 и A31, и в некоторых вариантах осуществления Ra представляет собой A27 или A28. Rb представляет собой C1-C5 алкил, и в некоторых вариантах осуществления Rb представляет собой один из метила, этила, изопропила и бутила. В некоторых вариантах осуществления j1, j2, R', Ra и Rb Формул A1-A26 выбраны соответствующим образом, чтобы обеспечить связывание между нацеливающей группой M1 и атомом N на азотсодержащем остове, а также чтобы создать взаимное пространственное расположение нацеливающих групп M1, более подходящее для связывания нацеливающей группы M1 с асиалогликопротеиновым рецептором на поверхности гепатоцитов.In some embodiments, j1 is an integer from 2 to 10, and in some embodiments, j1 is an integer from 3 to 5. In some embodiments, j2 is an integer from 2 to 10, and in some embodiments, j2 is is an integer from 3 to 5. R' is C 1 -C 4 alkyl, and in some embodiments, R' is one of methyl, ethyl and isopropyl. Ra is one of A27, A28, A29, A30, and A31, and in some embodiments, Ra is A27 or A28. Rb is C 1 -C 5 alkyl, and in some embodiments, Rb is one of methyl, ethyl, isopropyl, and butyl. In some embodiments, j1, j2, R', Ra and Rb of Formulas A1-A26 are appropriately selected to provide binding between the targeting group M 1 and the N atom on the nitrogen backbone, as well as to create a relative spatial arrangement of the targeting groups M 1 , more suitable for binding the M 1 targeting group to the asialoglycoprotein receptor on the surface of hepatocytes.
В некоторых вариантах осуществления конъюгат миРНК имеет структуру, представленную Формулой (403), (404), (405), (406), (407), (408), (409), (410), (411), (412), (413), (414), (415), (416), (417), (418), (419), (420), (421) или (422):In some embodiments, the siRNA conjugate has the structure represented by Formula (403), (404), (405), (406), (407), (408), (409), (410), (411), (412) , (413), (414), (415), (416), (417), (418), (419), (420), (421) or (422):
Формула (403)Formula (403)
Формула (404)Formula (404)
Формула (405)Formula (405)
Формула (406)Formula (406)
Формула (407)Formula (407)
Формула (408)Formula (408)
Формула (409)Formula (409)
Формула (410)Formula (410)
Формула (411)Formula (411)
Формула (412)Formula (412)
Формула (413)Formula (413)
Формула (414)Formula (414)
Формула (415)Formula (415)
Формула (416)Formula (416)
Формула (417)Formula (417)
Формула (418)Formula (418)
Формула (419)Formula (419)
Формула (420)Formula (420)
Формула (421)Formula (421)
Формула (422).Formula (422).
В некоторых вариантах осуществления атом P в Формуле A59 может быть связан с любым возможным положением в последовательности миРНК, например, атом P в Формуле A59 может быть связан с любым нуклеотидом в смысловой цепи или антисмысловой цепи миРНК. В некоторых вариантах осуществления атом P в Формуле A59 связан с любым нуклеотидом в смысловой цепи миРНК. В некоторых вариантах осуществления атом P в Формуле A59 связан с концом смысловой цепи или антисмысловой цепи миРНК. В некоторых вариантах осуществления атом P в Формуле A59 связан с концом смысловой цепи миРНК. Конец относится к первым 4 нуклеотидам, отсчитанным от одного конца смысловой цепи или антисмысловой цепи. В некоторых вариантах осуществления атом P в Формуле A59 связан с концом смысловой цепи или антисмысловой цепи миРНК. В некоторых вариантах осуществления атом P в Формуле A59 связан с 3’-концом смысловой цепи миРНК. В случае, если атом P в Формуле A59 связан с вышеуказанным положением в смысловой цепи миРНК, после проникновения в клетки конъюгат миРНК, представленный Формулой (308), может высвобождать отдельную антисмысловую цепь миРНК во время расплетания, тем самым блокируя трансляцию мРНК C5 в белок и ингибируя экспрессию гена белка комплемента C5.In some embodiments, the P atom in Formula A59 can be linked to any possible position in the siRNA sequence, for example, the P atom in Formula A59 can be linked to any nucleotide in the sense strand or antisense strand of the siRNA. In some embodiments, the P atom in Formula A59 is linked to any nucleotide in the sense strand of the siRNA. In some embodiments, the P atom in Formula A59 is associated with the end of the sense strand or antisense strand of the siRNA. In some embodiments, the P atom in Formula A59 is associated with the end of the siRNA sense strand. The end refers to the first 4 nucleotides counted from one end of the sense strand or antisense strand. In some embodiments, the P atom in Formula A59 is associated with the end of the sense strand or antisense strand of the siRNA. In some embodiments, the P atom in Formula A59 is associated with the 3' end of the siRNA sense strand. In case the P atom in Formula A59 is associated with the above position in the siRNA sense strand, after entering the cells, the siRNA conjugate represented by Formula (308) can release a separate antisense strand of the siRNA during unwinding, thereby blocking the translation of C5 mRNA into protein and inhibiting the expression of the complement protein gene C5.
В некоторых вариантах осуществления атом P в Формуле A59 может быть связан с любым возможным положением нуклеотида в миРНК, например, с положением 5’, 2’ или 3’, или с основанием нуклеотида. В некоторых вариантах осуществления атом P в Формуле A59 может быть связан с положением 2’, 3’ или 5’ нуклеотида в миРНК путем образования фосфодиэфирной связи. В некоторых вариантах осуществления атом P в Формуле A59 связан с атомом кислорода, образованным в результате депротонирования 3’-гидроксигруппы нуклеотида на 3’-конце смысловой цепи миРНК (в это время атом P в Формуле A59 также может рассматриваться как атом P в фосфатной группе, содержащейся в миРНК), или атом P в Формуле A59 связан с нуклеотидом путем замещения атома водорода в 2’-гидроксигруппе нуклеотида смысловой цепи миРНК, или атом P в Формуле A59 связан с нуклеотидом путем замещения водорода в 5’-гидроксигруппе нуклеотида на 5’-конце смысловой цепи миРНК.In some embodiments, the P atom in Formula A59 may be associated with any possible nucleotide position in the siRNA, such as the 5', 2', or 3' position, or the base of the nucleotide. In some embodiments, the P atom in Formula A59 may be linked to a 2', 3', or 5' nucleotide position in the siRNA by forming a phosphodiester bond. In some embodiments, the P atom in Formula A59 is bonded to an oxygen atom formed by deprotonation of the 3'-hydroxy group of the nucleotide at the 3' end of the sense strand of the siRNA (at which time, the P atom in Formula A59 may also be considered the P atom in the phosphate group, contained in siRNA), or the P atom in Formula A59 is bonded to the nucleotide by replacing a hydrogen atom in the 2'-hydroxy group of the nucleotide of the sense strand of the siRNA, or the P atom in Formula A59 is bonded to the nucleotide by replacing the hydrogen in the 5'-hydroxy group of the nucleotide with a 5'- end of the sense strand of the miRNA.
Авторы настоящего изобретения неожиданно обнаружили, что конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению обладает значительно улучшенной стабильностью в плазме и низким нецелевым действием, а также демонстрируют более высокую сайленсинговую активность в отношении мРНК C5. В некоторых вариантах осуществления миРНК согласно настоящему изобретению может представлять собой одну из миРНК, представленных в таблицах 1a-1f. Конъюгаты миРНК, содержащие эти миРНК, демонстрируют более высокую сайленсинговую активность в отношении мРНК C5.The inventors of the present invention have surprisingly found that the siRNA conjugate of the present invention has significantly improved plasma stability and low off-target activity, and also exhibits higher C5 mRNA silencing activity. In some embodiments, the miRNA of the present invention may be one of the miRNAs presented in Tables 1a-1f. SiRNA conjugates containing these siRNAs exhibit higher silencing activity against C5 mRNA.
Таблица 1a. Последовательность первой миРНК согласно настоящему изобретениюTable 1a. Sequence of the first miRNA according to the present invention
Таблица 1b. Последовательность второй миРНК согласно настоящему изобретениюTable 1b. Sequence of the second siRNA according to the present invention
Таблица 1c. Последовательность третьей миРНК согласно настоящему изобретениюTable 1c. Sequence of the third siRNA according to the present invention
Таблица 1d. Последовательность четвертой миРНК согласно настоящему изобретениюTable 1d. Sequence of the fourth miRNA according to the present invention
Таблица 1e. Последовательность пятой миРНК согласно настоящему изобретениюTable 1e. Sequence of the fifth miRNA according to the present invention
Таблица 1f. Последовательность шестой миРНК согласно настоящему изобретениюTable 1f. Sequence of the sixth miRNA according to the present invention
В миРНК или конъюгате миРНК согласно настоящему изобретению каждая пара соседних нуклеотидов связана фосфодиэфирной связью или тиофосфатной связью. Немостиковый атом кислорода или атом серы в фосфодиэфирной связи или тиофосфатной связи заряжен отрицательно и может присутствовать в форме гидроксигруппы или сульфгидрильной группы. Кроме того, ион водорода в гидроксигруппе или сульфгидрильной группе может быть частично или полностью замещен катионом. Катион может представлять собой любой катион, такой как катион металла, ион аммония NH4+ или катион органического аммония. Чтобы повысить растворимость, в некоторых вариантах осуществления катион выбран из одного или более из иона щелочного металла, катиона аммония, образованного третичным амином, и катиона четвертичного аммония. Ион щелочного металла может представлять собой K+ и/или Na+, а катион, образованный третичным амином, может представлять собой ион аммония, образованный триэтиламином, и/или ион аммония, образованный N,N-диизопропилэтиламином. Таким образом, миРНК или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению может по меньшей мере частично присутствовать в форме соли. В одном из вариантов осуществления немостиковый атом кислорода или атом серы в фосфодиэфирной связи или тиофосфатной связи по меньшей мере частично связывается с ионом натрия, и, таким образом, миРНК или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению присутствует или частично присутствует в форме натриевой соли.In the siRNA or siRNA conjugate of the present invention, each pair of adjacent nucleotides is linked by a phosphodiester bond or a thiophosphate bond. The non-bridging oxygen atom or sulfur atom in a phosphodiester bond or thiophosphate bond is negatively charged and may be present in the form of a hydroxy group or a sulfhydryl group. In addition, the hydrogen ion in the hydroxy group or sulfhydryl group may be partially or completely replaced by a cation. The cation may be any cation such as a metal cation, an ammonium ion NH4 + or an organic ammonium cation. To increase solubility, in some embodiments, the cation is selected from one or more of an alkali metal ion, a tertiary amine ammonium cation, and a quaternary ammonium cation. The alkali metal ion may be K + and/or Na + , and the tertiary amine cation may be an ammonium ion formed by triethylamine and/or an ammonium ion formed by N,N-diisopropylethylamine. Thus, the siRNA or siRNA conjugate of the present invention may be at least partially present in salt form. In one embodiment, the non-bridging oxygen atom or sulfur atom in the phosphodiester bond or thiophosphate bond is at least partially bound to a sodium ion, and thus the siRNA or siRNA conjugate of the present invention is present or partially present in the form of a sodium salt.
Специалистам в данной области техники хорошо известно, что модифицированная нуклеотидная группа может быть введена в миРНК согласно настоящему изобретению с помощью нуклеозидного мономера, имеющего соответствующую модификацию. Способы получения нуклеозидного мономера, имеющего соответствующую модификацию, и способы введения модифицированной нуклеотидной группы в миРНК также хорошо известны специалистам в данной области техники. Все модифицированные нуклеозидные мономеры могут быть доступны на рынке или получены с помощью известных способов.It is well known to those skilled in the art that a modified nucleotide group can be introduced into the siRNA according to the present invention using a nucleoside monomer having a suitable modification. Methods for preparing a nucleoside monomer having a suitable modification and methods for introducing a modified nucleotide group into siRNA are also well known to those skilled in the art. All modified nucleoside monomers may be commercially available or prepared by known methods.
Получение конъюгата миРНК, представленного Формулой (308)Preparation of siRNA conjugate represented by Formula (308)
Конъюгат миРНК, представленный Формулой (308), может быть получен с помощью любых подходящих путей синтеза.The siRNA conjugate represented by Formula (308) can be prepared by any suitable synthetic route.
В некоторых вариантах осуществления конъюгат миРНК, представленный Формулой (308), может быть получен с помощью следующего способа. Способ включает: последовательное связывание нуклеозидных мономеров в направлении от 3’ к 5’ в соответствии с типами и последовательностями нуклеотидов в смысловой цепи и антисмысловой цепи, соответственно, в условиях твердофазного амидофосфитного синтеза, где стадия связывания каждого нуклеозидного мономера включает четырехстадийную реакцию снятия защиты, сочетания, кэпирования и окисления или сульфуризации; выделение смысловой цепи и антисмысловой цепи миРНК; и отжиг; где миРНК представляет собой миРНК согласно настоящему изобретению, упомянутую выше.In some embodiments, the siRNA conjugate represented by Formula (308) can be prepared using the following method. The method includes: sequential binding of nucleoside monomers in the direction from 3' to 5' in accordance with the types and sequences of nucleotides in the sense chain and antisense chain, respectively, under the conditions of solid-phase amidophosphite synthesis, where the stage of binding each nucleoside monomer includes a four-stage deprotection reaction, combination , capping and oxidation or sulfurization; isolation of the sense strand and antisense strand of siRNA; and annealing; wherein the siRNA is the siRNA of the present invention mentioned above.
Кроме того, способ дополнительно включает: приведение соединения, представленного Формулой (321), в контакт с нуклеозидным мономером или нуклеотидной последовательностью, связанной с твердофазной подложкой, в условиях реакции сочетания и в присутствии агента реакции сочетания, обеспечивая связывание соединения, представленного Формулой (321), с нуклеотидной последовательностью посредством реакции сочетания. Далее в настоящем документе соединение, представленное Формулой (321), также называется конъюгирующей молекулой.In addition, the method further includes: bringing the compound represented by Formula (321) into contact with a nucleoside monomer or nucleotide sequence bound to a solid phase support under coupling reaction conditions and in the presence of a coupling agent, causing binding of the compound represented by Formula (321) , with a nucleotide sequence through a coupling reaction. Hereinafter, the compound represented by Formula (321) is also referred to as a conjugating molecule.
Формула (321),Formula (321),
где:Where:
R4 представляет собой группу, способную связываться с миРНК, представленной Nu в соединении, представленном Формулой (308). В некоторых вариантах осуществления R4 представляет собой группу, способную связываться с миРНК, представленной Nu, посредством ковалентной связи. В некоторых вариантах осуществления R4 представляет собой группу, способную конъюгироваться с любой функциональной группой миРНК, представленной Nu, посредством фосфодиэфирной связи в ходе реакции;R 4 represents a group capable of binding to the siRNA represented by Nu in the compound represented by Formula (308). In some embodiments, R 4 is a group capable of binding to the siRNA represented by Nu through a covalent bond. In some embodiments, R 4 is a group capable of being conjugated to any siRNA functional group represented by Nu via a phosphodiester bond during the reaction;
каждый S1 независимо представляет собой M1, которая представляет собой группу, образованную замещением всех активных гидроксигрупп группой YCOO-, где каждый Y независимо выбран из одного из метила, трифторметила, дифторметила, монофторметила, трихлорметила, дихлорметила, монохлорметила, этила, н-пропила, изопропила, фенила, галогенфенила и алкилфенила. В некоторых вариантах осуществления Y представляет собой метил.each S 1 independently represents M 1 , which is a group formed by replacing all active hydroxy groups with YCOO-, where each Y is independently selected from one of methyl, trifluoromethyl, difluoromethyl, monofluoromethyl, trichloromethyl, dichloromethyl, monochloromethyl, ethyl, n-propyl , isopropyl, phenyl, halophenyl and alkylphenyl. In some embodiments, Y is methyl.
Определения и варианты n1, n3, m1, m2, m3, R10, R11, R12, R13, R14, R15, L1 и M1 соответственно представляют собой такие, как описано выше.The definitions and options n1, n3, m1, m2, m3, R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 , R 15 , L 1 and M 1 , respectively, are as described above.
R4 выбирают таким образом, чтобы обеспечить связывание с атомом N на азотсодержащем остове и обеспечить подходящий реакционный сайт для синтеза конъюгата миРНК, представленного Формулой (308). В некоторых вариантах осуществления R4 содержит связывающую группу R 2 или защищенную связывающую группу R2 и может образовывать функциональную группу, представленную Формулой (A59), с миРНК посредством реакции.R 4 is selected to bind to the N atom on the nitrogen backbone and provide a suitable reaction site for the synthesis of the siRNA conjugate represented by Formula (308). In some embodiments, R 4 contains an R 2 linking group or a protected R 2 linking group and can form the functional group represented by Formula (A59) with siRNA through reaction.
В некоторых вариантах осуществления R4 содержит первую функциональную группу, которая может реагировать с группой на миРНК или нуклеозидном мономере, представленном Nu, с образованием фосфитного эфира, и вторую функциональную группу, которая может образовывать ковалентную связь с гидроксигруппой или аминогруппой или содержит твердофазную подложку, связанную посредством ковалентной связи. В некоторых вариантах осуществления первая функциональная группа представляет собой амидофосфит, гидроксигруппу или защищенную гидроксигруппу. В некоторых вариантах осуществления вторая функциональная группа представляет собой амидофосфит, карбоксил или карбоксилат. В некоторых вариантах осуществления вторая функциональная группа представляет собой твердофазную подложку, связанную с остальной частью молекулы посредством ковалентной связи, образованной гидроксигруппой или аминогруппой. В некоторых вариантах осуществления твердофазная подложка связана посредством фосфоэфирной связи, карбоксиэфирной связи или амидной связи. В некоторых вариантах осуществления твердофазная подложка представляет собой смолу.In some embodiments, R4 contains a first functional group that can react with a group on the siRNA or nucleoside monomer represented by Nu to form a phosphite ester, and a second functional group that can form a covalent bond with a hydroxy group or an amino group or contains a solid phase support linked by covalent bond. In some embodiments, the first functional group is an amidophosphite, a hydroxy group, or a protected hydroxy group. In some embodiments, the second functional group is an amidophosphite, carboxyl, or carboxylate. In some embodiments, the second functional group is a solid phase support linked to the rest of the molecule through a covalent bond formed by a hydroxy group or an amino group. In some embodiments, the solid phase support is linked through a phosphoester bond, a carboxyester bond, or an amide bond. In some embodiments, the solid phase support is a resin.
В некоторых вариантах осуществления первая функциональная группа содержит гидроксигруппу, -ORk или группу, представленную Формулой (C3); а вторая функциональная группа содержит группу, представленную Формулой (C1), (C2), (C3), (C1') или (C3’):In some embodiments, the first functional group contains a hydroxy group, -OR k or a group represented by Formula (C3); and the second functional group contains a group represented by Formula (C1), (C2), (C3), (C1') or (C3'):
где q1 представляет собой целое число от 1 до 4, X представляет собой O или NH, M+ представляет собой катион, Rk представляет собой гидроксизащитную группу, ТФП представляет собой твердофазную подложку, и обозначает сайт ковалентного присоединения группы.where q 1 is an integer from 1 to 4, X is O or NH, M + is a cation, R k is a hydroxy protecting group, TPP is a solid phase support, and denotes the site of covalent addition of a group.
В некоторых вариантах осуществления первая функциональная группа содержит амидофосфитную группу, представленную Формулой (C3). Амидофосфитная группа может образовывать фосфитный эфир с гидроксигруппой в любом положении на нуклеотиде, такой как 2’- или 3’ -гидроксигруппа, посредством реакции сочетания, а фосфитный эфир может образовывать фосфодиэфирную связь или тиофосфатную связь, представленную Формулой (A59), посредством окисления или сульфуризации, чтобы конъюгировать конъюгирующую молекулу с миРНК. В этом случае, даже если вторая функциональная группа не существует, соединение, представленное Формулой (321), по-прежнему может быть конъюгировано с нуклеотидом, не влияя на получение конъюгата миРНК, представленного Формулой (308). В таких обстоятельствах после получения смысловой цепи или антисмысловой цепи миРНК с помощью такого способа, как твердофазный амидофосфитный синтез, соединение, представленное Формулой (321), подвергают взаимодействию с гидроксигруппой на концевом нуклеотиде нуклеотидной последовательности, и обеспечивают образование фосфодиэфирной связи или тиофосфатной связи в результате последующего процесса окисления или сульфуризации, что приводит к конъюгации соединения, представленного Формулой (321), с миРНК.In some embodiments, the first functional group contains an amidophosphite group represented by Formula (C3). The amidophosphite group can form a phosphite ester with a hydroxy group at any position on the nucleotide, such as a 2'- or 3'-hydroxy group, through a coupling reaction, and the phosphite ester can form a phosphodiester bond or a thiophosphate bond represented by Formula (A59) through oxidation or sulfurization to conjugate the conjugating molecule to the siRNA. In this case, even if the second functional group does not exist, the compound represented by Formula (321) can still be conjugated to a nucleotide without affecting the production of the siRNA conjugate represented by Formula (308). In such circumstances, after obtaining the sense strand or antisense strand of siRNA by a method such as solid-phase amidophosphite synthesis, the compound represented by Formula (321) is reacted with a hydroxy group at the terminal nucleotide of the nucleotide sequence, and a phosphodiester bond or thiophosphate bond is subsequently formed the process of oxidation or sulfurization, which leads to the conjugation of the compound represented by Formula (321) with siRNA.
В некоторых вариантах осуществления первая функциональная группа содержит защищенную гидроксигруппу. В некоторых вариантах осуществления вторая функциональная группа содержит группу, которая может реагировать с твердофазной подложкой с получением конъюгирующей молекулы, содержащей твердофазную подложку. В некоторых вариантах осуществления вторая функциональная группа содержит карбоксил, карбоксилат или амидофосфит, как представлено Формулой (C1), (C2) или (C3). Когда вторая функциональная группа содержит карбоксил или карбоксилат, соединение, представленное Формулой (321), реагирует с гидроксигруппой или аминогруппой на твердофазной подложке, такой как смола, посредством реакции этерификации или амидирования, с образованием конъюгирующей молекулы, содержащей твердофазную подложку, связанную посредством карбоксиэфирной связи. Когда вторая функциональная группа содержит амидофосфитную функциональную группу, соединение, представленное Формулой (321), может быть связано с гидроксигруппой на универсальной твердофазной подложке, такой как смола, и образовать путем окисления конъюгирующую молекулу, содержащую твердофазную подложку, связанную посредством фосфодиэфирной связи. Затем, начиная с выше указанного продукта, связанного с твердофазной подложкой, последовательно связывают нуклеозидные мономеры с помощью способа твердофазного амидофосфитного синтеза с получением таким образом смысловой цепи или антисмысловой цепи миРНК, связанной с конъюгирующей группой. Во время твердофазного амидофосфитного синтеза снимают защиту с первой функциональной группы, а затем подвергают ее реакции сочетания с амидофосфитной группой на нуклеозидном мономере в условиях реакции сочетания.In some embodiments, the first functional group contains a protected hydroxy group. In some embodiments, the second functional group contains a group that can react with the solid phase support to produce a conjugating molecule containing the solid phase support. In some embodiments, the second functional group contains a carboxyl, carboxylate, or amidophosphite, as represented by Formula (C1), (C2), or (C3). When the second functional group contains a carboxyl or carboxylate, the compound represented by Formula (321) reacts with a hydroxy group or an amino group on a solid-phase support such as a resin through an esterification or amidation reaction to form a conjugating molecule containing the solid-phase support linked through a carboxyester bond. When the second functional group contains an amidophosphite functional group, the compound represented by Formula (321) can be bonded to a hydroxy group on a universal solid-phase support such as a resin and form, by oxidation, a conjugating molecule containing the solid-phase support linked through a phosphodiester bond. Then, starting from the above product bound to a solid-phase support, nucleoside monomers are sequentially coupled using a solid-phase amidophosphite synthesis method, thereby obtaining a sense strand or an antisense strand of siRNA linked to a conjugating group. During solid-phase amidophosphite synthesis, the first functional group is deprotected and then coupled to an amidophosphite group on a nucleoside monomer under coupling reaction conditions.
В некоторых вариантах осуществления первая функциональная группа содержит гидроксигруппу или защищенную гидроксигруппу; а вторая функциональная группа содержит твердофазную подложку, связанную посредством карбоксиэфирной связи, твердофазную подложку, связанную посредством амидной связи, или твердофазную подложку, связанную посредством фосфоэфирной связи, как представлено Формулой (C1') или (C3’). В этом случае, начиная с соединения, представленного Формулой (321), вместо твердофазной подложки последовательно связывают нуклеозидные мономеры с помощью твердофазного амидофосфитного синтеза с получением таким образом смысловой цепи или антисмысловой цепи миРНК, связанной с конъюгирующей группой.In some embodiments, the first functional group contains a hydroxy group or a protected hydroxy group; and the second functional group contains a carboxyester bonded solid support, an amide bonded solid support, or a phosphoester bonded solid support as represented by Formula (C1') or (C3'). In this case, starting from the compound represented by Formula (321), instead of a solid-phase support, nucleoside monomers are sequentially coupled using solid-phase amidophosphite synthesis, thereby obtaining a sense strand or an antisense strand of siRNA linked to a conjugating group.
В некоторых вариантах осуществления карбоксилат может быть обозначен в виде -COO-M+, где M+ представляет собой катион, такой как один из катиона металла, катиона аммония NH4+ и катиона органического аммония. В одном из вариантов осуществления ион металла может представлять собой ион щелочного металла, такой как K+ или Na+. Чтобы повысить растворимость и облегчить протекание реакции, в некоторых вариантах осуществления ион органического аммония представляет собой катион аммония, образованный третичным амином, или катион четвертичного аммония, такой как ион аммония, образованный триэтиламином, или ион аммония, образованный N,N-диизопропилэтиламином. В некоторых вариантах осуществления карбоксилат представляет собой карбоксилат триэтиламина или карбоксилат N,N-диизопропилэтиламина.In some embodiments, the carboxylate may be designated as -COO - M + , where M + is a cation such as one of a metal cation, an NH4 + ammonium cation, and an organic ammonium cation. In one embodiment, the metal ion may be an alkali metal ion such as K + or Na + . To increase solubility and facilitate the reaction, in some embodiments, the organic ammonium ion is a tertiary amine ammonium cation or a quaternary ammonium cation such as a triethylamine ammonium ion or an N,N-diisopropylethylamine ammonium ion. In some embodiments, the carboxylate is triethylamine carboxylate or N,N-diisopropylethylamine carboxylate.
В некоторых вариантах осуществления R4 содержит структуру, представленную Формулой (B9), (B10), (B9'), (B10'), (B11), (B12), (B11') или (B12’):In some embodiments, R 4 contains a structure represented by Formula (B9), (B10), (B9'), (B10'), (B11), (B12), (B11') or (B12'):
где q1 представляет собой целое число от 1 до 4, q2 представляет собой целое число от 1 до 10, X представляет собой O или NH, M+ представляет собой катион, Rk представляет собой гидроксизащитную группу, ТФП представляет собой твердофазную подложку, и обозначает сайт ковалентного присоединения группы. В некоторых вариантах осуществления q1 равно 1 или 2. В некоторых вариантах осуществления q2 представляет собой целое число от 1 до 5. В некоторых вариантах осуществления R4 содержит структуру, представленную Формулой (B9) или (B10). В некоторых вариантах осуществления R4 содержит структуру, представленную Формулой (B11) или (B12).where q 1 is an integer from 1 to 4, q 2 is an integer from 1 to 10, X is O or NH, M + is a cation, R k is a hydroxy protecting group, TPP is a solid phase support, and denotes the site of covalent addition of a group. In some embodiments, q 1 is 1 or 2. In some embodiments, q 2 is an integer from 1 to 5. In some embodiments, R 4 contains the structure represented by Formula (B9) or (B10). In some embodiments, R 4 contains the structure represented by Formula (B11) or (B12).
В некоторых вариантах осуществления Rk представляет собой один или более из Tr (тритил), MMTr (4-метокситритил), DMTr (4,4'-диметокситритил) и TMTr (4,4',4"-триметокситритил). В некоторых вариантах осуществления Rk может представлять собой DMTr, т. е. 4,4'-диметокситритил.In some embodiments, R k is one or more of Tr (trityl), MMTr (4-methoxytrityl), DMTr (4,4'-dimethoxytrityl), and TMTr (4,4',4"-trimethoxytrityl). In some embodiments In an embodiment, R k may be DMTr, i.e. 4,4'-dimethoxytrityl.
Определение L1 соответствует описанному выше.The definition of L 1 is as described above.
В некоторых вариантах осуществления L1 используется для связывания нацеливающей группы M1 с атомом N на азотсодержащем остове, что наделяют конъюгат миРНК, представленный Формулой (308), функцией нацеливания на печень. В некоторых вариантах осуществления L1 содержит любую из Формул (A1) - (A26) или их комбинацию.In some embodiments, L 1 is used to link the targeting group M 1 to the N atom on the nitrogen backbone, which provides the siRNA conjugate represented by Formula (308) with liver targeting function. In some embodiments, L 1 contains any of Formulas (A1) - (A26) or a combination thereof.
В соответствии с приведенным выше описанием, специалисты в данной области техники без труда поймут, что по сравнению со способами твердофазного амидофосфитного синтеза, хорошо известными в данной области техники, конъюгат миРНК, в котором конъюгирующая молекула связана с любым возможным положением нуклеотидной последовательности, может быть получен с помощью вышеуказанной первой функциональной группы и необязательной второй функциональной группы. Например, конъюгирующая молекула связана с концом нуклеотидной последовательности или с обоими концами нуклеотидной последовательности. Соответственно, если не указано иное, в следующем описании применительно к получению конъюгата миРНК и/или конъюгирующей молекулы при упоминании таких реакций, как «снятие защиты», «сочетание», «кэпирование», «окисление», «сульфуризация», подразумевается, что к этим реакциям также будут применимы условия реакции и агенты, используемые в хорошо известных в данной области техники способах твердофазного амидофосфитного синтеза нуклеиновых кислот. Примеры условий реакции и агентов будут подробно описаны ниже.In accordance with the above description, those skilled in the art will readily understand that, compared with solid phase amidophosphite synthesis methods well known in the art, an siRNA conjugate in which the conjugating molecule is linked to any possible position of the nucleotide sequence can be prepared using the above first functional group and an optional second functional group. For example, a conjugating molecule is linked to the end of a nucleotide sequence or to both ends of a nucleotide sequence. Accordingly, unless otherwise indicated, in the following description, when referring to reactions such as “deprotection,” “coupling,” “capping,” “oxidation,” “sulfurization,” when referring to the preparation of an siRNA conjugate and/or conjugating molecule, it is intended that these reactions will also be applicable to the reaction conditions and agents used in solid phase amidophosphite nucleic acid synthesis processes well known in the art. Examples of reaction conditions and agents will be described in detail below.
В некоторых вариантах осуществления каждый S1 независимо представляет собой M1. В некоторых вариантах осуществления каждый S1 независимо представляет собой группу, образованную в результате защиты по меньшей мере одной активной гидроксигруппы в M1 гидроксизащитными группами. В некоторых вариантах осуществления каждый S1 независимо представляет собой группу, образованную в результате защиты всех активных гидроксигрупп в M1 гидроксизащитными группами. В некоторых вариантах осуществления любая гидроксизащитная группа, известная специалистам в данной области техники, может быть ипользована для защиты активной гидроксигруппы в M1. В некоторых вариантах осуществления защищенная гидроксигруппа обозначена формулой YCOO-, где каждый Y независимо выбран из группы, состоящей из C1-C10 алкила и C6-C10 арила, где C1-C10 алкил и C6-C10 арил необязательно замещены одним или более заместителями, выбранными из группы, состоящей из галогена и C1-C6 алкила. В некоторых вариантах осуществления каждый Y независимо выбран из группы, состоящей из метила, трифторметила, дифторметила, монофторметила, трихлорметила, дихлорметила, монохлорметила, этила, н-пропила, изопропила, фенила, галогенфенила и C1-C6 алкилфенила.In some embodiments, each S 1 is independently M 1 . In some embodiments, each S 1 independently represents a group formed by protecting at least one active hydroxy group in M 1 with hydroxy protecting groups. In some embodiments, each S 1 independently represents a group formed by protecting all active hydroxy groups in M 1 with hydroxy protecting groups. In some embodiments, any hydroxy protecting group known to those skilled in the art can be used to protect the active hydroxy group on M 1 . In some embodiments, the protected hydroxy group is indicated by the formula YCOO-, wherein each Y is independently selected from the group consisting of C 1 -C 10 alkyl and C 6 -C 10 aryl, wherein C 1 -C 10 alkyl and C 6 -C 10 aryl are optional substituted with one or more substituents selected from the group consisting of halogen and C 1 -C 6 alkyl. In some embodiments, each Y is independently selected from the group consisting of methyl, trifluoromethyl, difluoromethyl, monofluoromethyl, trichloromethyl, dichloromethyl, monochloromethyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, phenyl, halophenyl, and C 1 -C 6 alkylphenyl.
В некоторых вариантах осуществления каждый S1 независимо выбран из группы, состоящей из Формул A46-A54:In some embodiments, each S 1 is independently selected from the group consisting of Formulas A46-A54:
В некоторых вариантах осуществления S1 представляет собой Формулу A49 или A50.In some embodiments, S 1 is Formula A49 or A50.
В некоторых вариантах осуществления каждый Y независимо выбран из одного из метила, трифторметила, дифторметила, монофторметила, трихлорметила, дихлорметила, монохлорметила, этила, н-пропила, изопропила, фенила, галогенфенила и алкилфенила. В некоторых вариантах осуществления Y представляет собой метил.In some embodiments, each Y is independently selected from one of methyl, trifluoromethyl, difluoromethyl, monofluoromethyl, trichloromethyl, dichloromethyl, monochloromethyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, phenyl, halophenyl, and alkylphenyl. In some embodiments, Y is methyl.
Как упоминалось ранее, способ получения конъюгата миРНК, представленного Формулой (308), дополнительно включает следующие стадии: синтез другой цепи миРНК (например, когда смысловая цепь миРНК, связанная с конъюгирующей молекулой, синтезирована на вышеуказанной стадии, способ дополнительно включает синтез антисмысловой цепи миРНК методом твердофазного синтеза, и наоборот); выделение смысловой цепи и антисмысловой цепи; и отжиг. В частности, на стадии выделения твердофазную подложку, связанную с нуклеотидной последовательностью и/или конъюгируемой молекулой, отщепляют, и в это же время удаляют необходимую защитную группу (в этом случае каждая группа S1 в соединении, представленном Формулой (321), превращается в соответствующую нацеливающую группу M1), с получением смысловой цепи (или антисмысловой цепи) миРНК, связанной с конъюгирующей молекулой, и соответствующей антисмысловой цепи (или смысловой цепи). Смысловую цепь и антисмысловую цепь отжигают с образованием двухцепочечной структуры РНК, с получением таким образом конъюгата миРНК, представленного Формулой (308).As mentioned earlier, the method for producing the siRNA conjugate represented by Formula (308) further includes the following steps: synthesizing another siRNA strand (for example, when the siRNA sense strand associated with the conjugating molecule is synthesized in the above step, the method further includes synthesizing the siRNA antisense strand by the method solid-phase synthesis, and vice versa); separation of the sense chain and the antisense chain; and annealing. In particular, in the isolation step, the solid phase support associated with the nucleotide sequence and/or the conjugated molecule is cleaved off, and at the same time the necessary protecting group is removed (in this case, each S 1 group in the compound represented by Formula (321) is converted to the corresponding targeting group M 1 ), producing a sense strand (or antisense strand) of the siRNA associated with a conjugating molecule and a corresponding antisense strand (or sense strand). The sense strand and the antisense strand are annealed to form a double-stranded RNA structure, thereby obtaining the siRNA conjugate represented by Formula (308).
В некоторых вариантах осуществления способ получения конъюгата миРНК, представленного Формулой (308), дополнительно включает следующие стадии: приведение соединения, представленного Формулой (321), в контакт с первым нуклеозидным мономером на 3’-конце смысловой цепи или антисмысловой цепи в условиях реакции сочетания в присутствии агента реакции сочетания, тем самым связывая соединение, представленное Формулой (321), с первым нуклеотидом в последовательности; последовательное связывание нуклеозидных мономеров в направлении от 3’ к 5’ для синтеза смысловой цепи или антисмысловой цепи миРНК в соответствии с желаемым типом нуклеотидов и последовательностью смысловой цепи или антисмысловой цепи, в условиях твердофазного амидофосфитного синтеза; где соединение, представленное Формулой (321), представляет собой соединение, в котором R4 содержит первую функциональную группу и вторую функциональную группу, первая функциональная группа содержит защищенную гидроксигруппу, а вторая функциональная группа содержит группу, представленную Формулой (C1') или (C3’), и с соединения, представленного Формулой (321), снимают защиту перед связыванием с первым нуклеозидным мономером; и связывание каждого нуклеозидного мономера включает четырехстадийную реакцию снятия защиты, сочетания, кэпирования и окисления или сульфуризации, с получением таким образом смысловой цепи или антисмысловой цепи нуклеиновой кислоты, связанной с конъюгирующей молекулой; последовательное связывание нуклеозидных мономеров в направлении от 3’ к 5’ для синтеза смысловой цепи или антисмысловой цепи нуклеиновой кислоты в соответствии с типом нуклеотидов и последовательностью смысловой цепи или антисмысловой цепи, в условиях твердофазного амидофосфитного синтеза; где связывание каждого нуклеозидного мономера включает четырехстадийную реакцию снятия защиты, сочетания, кэпирования и окисления или сульфуризации; удаление защитных групп и отщепление твердофазной подложки; выделение и очистка с получением смысловой цепи и антисмысловой цепи; и отжиг.In some embodiments, the method of producing an siRNA conjugate represented by Formula (308) further includes the following steps: contacting the compound represented by Formula (321) with a first nucleoside monomer at the 3' end of the sense strand or antisense strand under coupling reaction conditions in the presence of a coupling agent, thereby binding the compound represented by Formula (321) to the first nucleotide in the sequence; sequential binding of nucleoside monomers in the 3' to 5' direction to synthesize the sense strand or antisense strand of siRNA in accordance with the desired type of nucleotides and the sequence of the sense strand or antisense strand, under solid-phase amidophosphite synthesis conditions; where the compound represented by Formula (321) is a compound in which R4 contains a first functional group and a second functional group, the first functional group contains a protected hydroxy group, and the second functional group contains a group represented by Formula (C1') or (C3') , and the compound represented by Formula (321) is deprotected before binding to the first nucleoside monomer; and the coupling of each nucleoside monomer involves a four-step reaction of deprotection, coupling, capping and oxidation or sulfurization, thereby producing a sense strand or an antisense nucleic acid strand linked to the conjugating molecule; sequential binding of nucleoside monomers in the 3' to 5' direction to synthesize the sense strand or antisense strand of a nucleic acid in accordance with the type of nucleotides and the sequence of the sense strand or antisense strand, under solid-phase amidophosphite synthesis conditions; wherein the binding of each nucleoside monomer involves a four-step reaction of deprotection, coupling, capping and oxidation or sulfurization; removal of protective groups and cleavage of solid-phase support; isolation and purification to obtain the sense strand and the antisense strand; and annealing.
В некоторых вариантах осуществления способ получения конъюгата миРНК, представленного Формулой (308), дополнительно включает следующие стадии: последовательное связывание нуклеозидных мономеров в направлении от 3’ к 5’ для синтеза смысловой цепи или антисмысловой цепи в соответствии с типом нуклеотидов и последовательностью смысловой цепи или антисмысловой цепи в двухцепочечной миРНК; где связывание каждого нуклеозидного мономера включает четырехстадийную реакцию снятия защиты, сочетания, кэпирования и окисления или сульфуризации, с получением таким образом смысловой цепи, связанной с твердофазной подложкой, и антисмысловой цепи, связанной с твердофазной подложкой; приведение соединения, представленного Формулой (321), в контакт со смысловой цепью, связанной с твердофазной подложкой, или антисмысловой цепью, связанной с твердофазной подложкой, в условиях реакции сочетания в присутствии агента реакции сочетания, тем самым связывая соединение, представленное Формулой (321), со смысловой цепью или антисмысловой цепью; где соединение, представленное Формулой (321), представляет собой соединение, в котором R4 содержит амидофосфитную группу в качестве первой функциональной группы; удаление защитных групп и отщепление твердофазной подложки; соответственно выделение и очистка с получением смысловой цепи или антисмысловой цепи миРНК; и отжиг; где смысловая цепь или антисмысловая цепь миРНК связана с конъюгирующей молекулой.In some embodiments, the method of producing the siRNA conjugate represented by Formula (308) further includes the following steps: sequentially linking nucleoside monomers in a 3' to 5' direction to synthesize the sense strand or antisense strand according to the type of nucleotides and the sequence of the sense strand or antisense strands in double-stranded siRNA; wherein the binding of each nucleoside monomer involves a four-step reaction of deprotection, coupling, capping, and oxidation or sulfurization, thereby producing a solid-phase support-bound sense strand and a solid-phase support-linked antisense strand; bringing the compound represented by Formula (321) into contact with a sense strand bound to a solid phase support or an antisense strand bound to a solid phase support under coupling reaction conditions in the presence of a coupling agent, thereby binding the compound represented by Formula (321), with a sense strand or an antisense strand; wherein the compound represented by Formula (321) is a compound in which R 4 contains an amidophosphite group as the first functional group; removal of protective groups and cleavage of solid-phase support; respectively, isolating and purifying to obtain the sense strand or antisense strand of siRNA; and annealing; where the sense strand or antisense strand of the siRNA is linked to a conjugating molecule.
В некоторых вариантах осуществления атом P в Формуле A59 связан с 3’-концом смысловой цепи миРНК, и способ получения конъюгата миРНК, представленного Формулой (308), включает:In some embodiments, the P atom in Formula A59 is linked to the 3' end of the siRNA sense strand, and a method for preparing the siRNA conjugate represented by Formula (308) includes:
(1) удаление гидроксизащитной группы Rk из соединения, представленного Формулой (321) (где соединение, представленное Формулой (321), представляет собой соединение, в котором R4 содержит первую функциональную группу и вторую функциональную группу, первая функциональная группа содержит защищенную гидроксигруппу ORk, а вторая функциональная группа содержит структуру, представленную Формулой (C1') или (C3’)); и приведение продукта со снятой защитой в контакт с нуклеозидным мономером с получением нуклеозидного мономера, связанного с твердофазной подложкой через конъюгирующую молекулу в условиях реакции сочетания в присутствии агента реакции сочетания;(1) removing a hydroxy protecting group R k from a compound represented by Formula (321) (wherein the compound represented by Formula (321) is a compound in which R 4 contains a first functional group and a second functional group, the first functional group contains a protected hydroxy group OR k and the second functional group contains the structure represented by Formula (C1') or (C3')); and contacting the deprotected product with a nucleoside monomer to produce a nucleoside monomer bound to the solid phase support via a conjugating molecule under coupling reaction conditions in the presence of a coupling agent;
(2) синтезирование, начиная с нуклеозидного мономера, связанного с твердофазной подложкой через конъюгирующую молекулу, смысловой цепи миРНК в направлении от 3’ к 5’ с помощью твердофазного амидофосфитного синтеза;(2) synthesizing, starting from a nucleoside monomer bound to a solid-phase support through a conjugating molecule, the siRNA sense strand in the 3' to 5' direction using solid-phase amidophosphite synthesis;
(3) синтезирование антисмысловой цепи миРНК методом твердофазного амидофосфитного синтеза; и(3) synthesis of the antisense strand of siRNA using solid-phase amidophosphite synthesis; And
(4) выделение смысловой цепи и антисмысловой цепи миРНК и их отжиг с получением конъюгата миРНК, представленного Формулой (308).(4) isolating the sense strand and the antisense strand of the siRNA and annealing them to obtain the siRNA conjugate represented by Formula (308).
На стадии (1) способ удаления защитной группы Rk из соединения, представленного Формулой (321), включает приведение соединения, представленного Формулой (321), в контакт с агентом для снятия защиты в условиях снятия защиты. Условия снятия защиты включают температуру 0-50°C, и в некоторых вариантах осуществления 15-35°C, и продолжительность проведения реакции 30-300 секунд, и в некоторых вариантах осуществления 50-150 секунд. Агент для снятия защиты может быть выбран из одной или более из трифторуксусной кислоты, трихлоруксусной кислоты, дихлоруксусной кислоты и монохлоруксусной кислоты, и в некоторых вариантах осуществления агент для снятия защиты представляет собой дихлоруксусную кислоту. Молярное отношение агента для снятия защиты к соединению, представленному Формулой (321), может составлять от 10:1 до 1000:1, и в некоторых вариантах осуществления от 50:1 до 500:1.In step (1), a method for removing a protecting group R k from a compound represented by Formula (321) includes contacting the compound represented by Formula (321) with a deprotecting agent under deprotecting conditions. Deprotection conditions include a temperature of 0-50°C, and in some embodiments, 15-35°C, and a reaction duration of 30-300 seconds, and in some embodiments, 50-150 seconds. The deprotection agent may be selected from one or more of trifluoroacetic acid, trichloroacetic acid, dichloroacetic acid, and monochloroacetic acid, and in some embodiments, the deprotection agent is dichloroacetic acid. The molar ratio of the deprotecting agent to the compound represented by Formula (321) may be from 10:1 to 1000:1, and in some embodiments, from 50:1 to 500:1.
Условия реакции сочетания и агент реакции сочетания могут представлять собой любые условия и агенты, подходящие для вышеуказанной реакции сочетания. В некоторых вариантах осуществления могут быть использованы те же условия и агент, что и в реакции сочетания в методе твердофазного синтеза.The coupling reaction conditions and the coupling reaction agent may be any conditions and agents suitable for the above coupling reaction. In some embodiments, the same conditions and agent may be used as in the coupling reaction in the solid phase synthesis method.
В некоторых вариантах осуществления условия реакции сочетания включают температуру реакции 0-50°C, и в некоторых вариантах осуществления 15-35°C. Молярное отношение соединения, представленного Формулой (321), к нуклеозидному мономеру может составлять от 1:1 до 1:50, и в некоторых вариантах осуществления от 1:2 до 1:5. Молярное отношение соединения, представленного Формулой (321) к агенту реакции сочетания может составлять от 1:1 до 1:50, и в некоторых вариантах осуществления от 1:3 до 1:10. Продолжительность проведения реакции может составлять 200-3000 секунд, и в некоторых вариантах осуществления 500-1500 секунд. Агент реакции сочетания может быть выбран из одного или более из 1H-тетразола, 5-этилтио-1H-тетразола и 5-бензилтио-1H-тетразола, и в некоторых вариантах осуществления представляет собой 5-этилтио-1H-тетразол. Органический растворитель может быть выбран из одного или более из безводного ацетонитрила, безводного ДМФА и безводного дихлорметана, и в некоторых вариантах осуществления представляет собой безводный ацетонитрил. Количество органического растворителя может составлять 3-50 л/моль, и в некоторых вариантах осуществления 5-20 л/моль, относительно соединения, представленного Формулой (321).In some embodiments, coupling reaction conditions include a reaction temperature of 0-50°C, and in some embodiments, 15-35°C. The molar ratio of the compound represented by Formula (321) to nucleoside monomer may be from 1:1 to 1:50, and in some embodiments, from 1:2 to 1:5. The molar ratio of the compound represented by Formula (321) to the coupling agent may be from 1:1 to 1:50, and in some embodiments, from 1:3 to 1:10. The duration of the reaction may be 200-3000 seconds, and in some embodiments, 500-1500 seconds. The coupling agent may be selected from one or more of 1H-tetrazole, 5-ethylthio-1H-tetrazole, and 5-benzylthio-1H-tetrazole, and in some embodiments is 5-ethylthio-1H-tetrazole. The organic solvent may be selected from one or more of anhydrous acetonitrile, anhydrous DMF, and anhydrous dichloromethane, and in some embodiments is anhydrous acetonitrile. The amount of organic solvent may be 3-50 L/mol, and in some embodiments, 5-20 L/mol, relative to the compound represented by Formula (321).
На стадии (2) смысловую цепь SS конъюгата миРНК синтезируют в направлении от 3’ к 5’ методом твердофазного амидофосфитного синтеза нуклеиновых кислот, начиная с нуклеозидного мономера, связанного с твердофазной подложкой через конъюгирующую молекулу, полученного на вышеуказанных стадиях. В этом случае конъюгирующая молекула связана с 3’-концом полученной смысловой цепи.In step (2), the sense strand SS of the siRNA conjugate is synthesized in the 3' to 5' direction by solid-phase amidophosphite nucleic acid synthesis, starting from the nucleoside monomer bound to the solid-phase support through the conjugating molecule obtained in the above steps. In this case, the conjugating molecule is bound to the 3' end of the resulting sense strand.
Другие условия твердофазного синтеза на стадиях (2) и (3), включающие условия снятия защиты с нуклеозидного мономера, тип и количество агента для снятия защиты, условия реакции сочетания, тип и количество агента реакции сочетания, условия реакции кэпирования, тип и количество кэпирующего агента, условия реакции окисления, тип и количество окисляющего агента, условия реакции сульфуризации и тип и количество агента для сульфуризации, включают использование агентов, количеств и условий, общепринятых в данной области техники.Other solid phase synthesis conditions in steps (2) and (3), including conditions for deprotecting the nucleoside monomer, type and amount of deprotecting agent, coupling reaction conditions, type and amount of coupling agent, capping reaction conditions, type and amount of capping agent , oxidation reaction conditions, type and amount of oxidizing agent, sulfurization reaction conditions, and type and amount of sulfurization agent include the use of agents, amounts, and conditions conventional in the art.
Например, в некоторых вариантах осуществления для твердофазного синтеза на стадиях (2) и (3) могут быть использованы следующие условия:For example, in some embodiments, the following conditions may be used for solid phase synthesis in steps (2) and (3):
Условия снятия защиты для нуклеозидного мономера включают температуру 0-50°C, и в некоторых вариантах осуществления 15-35°C, и продолжительность проведения реакции 30-300 секунд, и в некоторых вариантах осуществления 50-150 секунд. Агент для снятия защиты может быть выбран из одной или более из трифторуксусной кислоты, трихлоруксусной кислоты, дихлоруксусной кислоты и монохлоруксусной кислоты, и в некоторых вариантах осуществления агент для снятия защиты представляет собой дихлоруксусную кислоту. Молярное отношение агента для снятия защиты к 4,4'-диметокситритильной защитной группе на твердофазной подложке составляет от 2:1 до 100:1, и в некоторых вариантах осуществления от 3:1 до 50:1.Deprotection conditions for the nucleoside monomer include a temperature of 0-50°C, and in some embodiments, 15-35°C, and a reaction time of 30-300 seconds, and in some embodiments, 50-150 seconds. The deprotection agent may be selected from one or more of trifluoroacetic acid, trichloroacetic acid, dichloroacetic acid, and monochloroacetic acid, and in some embodiments, the deprotection agent is dichloroacetic acid. The molar ratio of deprotectant to 4,4'-dimethoxytrityl protecting group on the solid phase support ranges from 2:1 to 100:1, and in some embodiments, from 3:1 to 50:1.
Условия реакции сочетания включают температуру реакции 0-50°C, и в некоторых вариантах осуществления 15-35°C. Молярное отношение последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой, к нуклеозидному мономеру составляет от 1:1 до 1:50, и в некоторых вариантах осуществления от 1:5 до 1:15. Молярное отношение последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой, к агенту реакции сочетания составляет от 1:1 до 1:100, и в некоторых вариантах осуществления от 1:50 до 1:80. Продолжительность проведения реакции и агент реакции сочетания могут быть выбраны так же, как указано выше.Coupling reaction conditions include a reaction temperature of 0-50°C, and in some embodiments, 15-35°C. The molar ratio of the nucleic acid sequence bound to the solid phase support to the nucleoside monomer is from 1:1 to 1:50, and in some embodiments from 1:5 to 1:15. The molar ratio of the nucleic acid sequence bound to the solid phase support to the coupling agent is from 1:1 to 1:100, and in some embodiments from 1:50 to 1:80. The duration of the reaction and the coupling reaction agent can be selected in the same manner as above.
Условия реакции кэпирования включают температуру реакции 0-50°C, и в некоторых вариантах осуществления 15-35°C, и продолжительность проведения реакции 5-500 секунд, и в некоторых вариантах осуществления 10-100 секунд. Кэпирующий агент может быть выбран так же, как указано выше. Молярное отношение общего количества кэпирующего агента к последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой, может составлять от 1:100 до 100:1, и в некоторых вариантах осуществления составляет от 1:10 до 10:1. В случае, когда в качестве кэпирующего агента используют эквимолярные количества уксусного ангидрида и N-метилимидазола, молярное отношение уксусного ангидрида к N-метилимидазолу и последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой, может составлять от 1:1:10 до 10:10:1, и в некоторых вариантах осуществления составляет от 1:1:2 до 2:2:1.Capping reaction conditions include a reaction temperature of 0-50°C, and in some embodiments, 15-35°C, and a reaction duration of 5-500 seconds, and in some embodiments, 10-100 seconds. The capping agent may be selected in the same manner as above. The molar ratio of the total amount of capping agent to the nucleic acid sequence bound to the solid phase support can be from 1:100 to 100:1, and in some embodiments is from 1:10 to 10:1. In the case where equimolar amounts of acetic anhydride and N-methylimidazole are used as the capping agent, the molar ratio of acetic anhydride to N-methylimidazole to the nucleic acid sequence associated with the solid phase support may be from 1:1:10 to 10:10:1 , and in some embodiments is from 1:1:2 to 2:2:1.
Условия реакции окисления включают температуру реакции 0-50°C, и в некоторых вариантах осуществления 15-35°C, и продолжительность проведения реакции 1-100 секунд, и в некоторых вариантах осуществления 5-50 секунд. В некоторых вариантах осуществления окисляющий агент представляет собой иод (в некоторых вариантах осуществления обеспечиваемый в виде иодной воды). Молярное отношение окисляющего агента к последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой на стадии сочетания, может составлять от 1:1 до 100:1, и в некоторых вариантах осуществления составляет от 5:1 до 50:1. В некоторых вариантах осуществления реакцию окисления проводят в смешанном растворителе, в котором отношение тетрагидрофуран:вода:пиридин составляет от 3:1:1 до 1:1:3. Условия реакции сульфуризации включают температуру реакции 0-50°C, и в некоторых вариантах осуществления 15-35°C, и продолжительность проведения реакции 50-2000 секунд, и в некоторых вариантах осуществления 100-1000 секунд. В некоторых вариантах осуществления агент для сульфуризации представляет собой гидрид ксантана. Молярное отношение агента для сульфуризации к последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой на стадии сочетания, составляет от 10:1 до 1000:1, и в некоторых вариантах осуществления составляет от 10:1 до 500:1. В некоторых вариантах осуществления реакцию сульфуризации проводят в смешанном растворителе, в котором отношение ацетонитрил:пиридин составляет от 1:3 до 3:1.Oxidation reaction conditions include a reaction temperature of 0-50°C, and in some embodiments, 15-35°C, and a reaction duration of 1-100 seconds, and in some embodiments, 5-50 seconds. In some embodiments, the oxidizing agent is iodine (in some embodiments, provided as iodine water). The molar ratio of oxidizing agent to nucleic acid sequence bound to the solid phase support in the coupling step can be from 1:1 to 100:1, and in some embodiments is from 5:1 to 50:1. In some embodiments, the oxidation reaction is carried out in a mixed solvent in which the ratio of tetrahydrofuran:water:pyridine is from 3:1:1 to 1:1:3. The sulfurization reaction conditions include a reaction temperature of 0-50°C, and in some embodiments, 15-35°C, and a reaction duration of 50-2000 seconds, and in some embodiments, 100-1000 seconds. In some embodiments, the sulfurization agent is xanthan hydride. The molar ratio of the sulfurization agent to the nucleic acid sequence bound to the solid phase support in the coupling step is from 10:1 to 1000:1, and in some embodiments is from 10:1 to 500:1. In some embodiments, the sulfurization reaction is carried out in a mixed solvent in which the acetonitrile:pyridine ratio is from 1:3 to 3:1.
Способ дополнительно включает выделение смысловой цепи и антисмысловой цепи миРНК после связывания всех нуклеозидных мономеров и перед отжигом. Способы выделения хорошо известны специалистам в данной области техники и обычно включают отщепление синтезированной нуклеотидной последовательности от твердофазной подложки, удаление защитных групп на основаниях, фосфатных группах и лигандах, очистку и обессоливание.The method further includes isolating the sense strand and antisense strand of the siRNA after binding of all nucleoside monomers and before annealing. Isolation methods are well known to those skilled in the art and typically involve cleavage of the synthesized nucleotide sequence from a solid phase support, removal of protecting groups on bases, phosphate groups and ligands, purification and desalting.
Для отщепления синтезированной нуклеотидной последовательности от твердофазной подложки и удаления защитных групп на основаниях, фосфатных группах и лигандах могут быть использованы общепринятые способы отщепления и снятия защиты при синтезе миРНК. Например, приведение полученной нуклеотидной последовательности, связанной с твердофазной подложкой, в контакт с крепким водным раствором аммиака; во время снятия защиты защитная группа YCOO- на группах A46-A54 превращается в гидроксигруппу, и, таким образом, группы S1 превращаются в соответствующую группу M1, с получением конъюгата, представленного Формулой (308); где крепкий водный раствор аммиака может представлять собой водный раствор аммиака концентрацией 25-30 мас.%. Количество крепкого водного раствора аммиака может составлять от 0,2 мл/мкмоль до 0,8 мл/мкмоль относительно целевой миРНК.Conventional methods for cleavage and deprotection during siRNA synthesis can be used to cleave the synthesized nucleotide sequence from the solid phase support and remove protecting groups on bases, phosphate groups and ligands. For example, bringing the resulting nucleotide sequence associated with a solid-phase support into contact with a strong aqueous ammonia solution; during deprotection, the protecting group YCOO- on groups A46-A54 is converted to a hydroxy group, and thus the S 1 groups are converted to the corresponding M 1 group, obtaining the conjugate represented by Formula (308); where the strong aqueous ammonia solution may be an aqueous ammonia solution with a concentration of 25-30 wt.%. The amount of strong aqueous ammonia solution can be from 0.2 ml/μmol to 0.8 ml/μmol relative to the target siRNA.
Когда на синтезированной нуклеотидной последовательности имеется по меньшей мере одна защитная группа 2’-TBDMS, способ дополнительно включает приведение нуклеотидной последовательности, снятой с твердофазной подложки, в контакт с тригидрофторидом триэтиламина для снятия 2’-TBDMS-защиты. В этом случае полученная целевая последовательность миРНК содержит соответствующий нуклеозид, имеющий свободную 2’-гидроксигруппу. Количество чистого тригидрофторида триэтиламина составляет от 0,4 мл/мкмоль до 1,0 мл/мкмоль относительно целевой последовательности миРНК. Таким образом может быть получен конъюгат миРНК, представленный Формулой (308).When the synthesized nucleotide sequence has at least one 2'-TBDMS protecting group, the method further includes contacting the nucleotide sequence removed from the solid phase support with triethylamine trihydrofluoride to deprotect the 2'-TBDMS. In this case, the resulting siRNA target sequence contains the corresponding nucleoside having a free 2’-hydroxy group. The amount of pure triethylamine trihydrofluoride ranges from 0.4 ml/µmol to 1.0 ml/µmol relative to the target siRNA sequence. In this way, the siRNA conjugate represented by Formula (308) can be obtained.
Способы очистки и обессоливания хорошо известны специалистам в данной области техники. Например, очистка нуклеиновой кислоты может быть проведена с помощью колонки для очистки методом препаративной ионообменной хроматографии с градиентным элюированием NaBr или NaCl; после сбора и объединения продукта может быть проведено обессоливание с помощью колонки для очистки методом обращенно-фазовой хроматографии.Purification and desalting methods are well known to those skilled in the art. For example, nucleic acid purification can be accomplished using a preparative ion exchange chromatography purification column with NaBr or NaCl gradient elution; Once the product is collected and combined, desalting can be done using a reverse phase chromatography purification column.
Немостиковый атом кислорода или атом серы в фосфодиэфирной связи или тиофосфатной связи между нуклеотидами в полученном конъюгате миРНК, представленном Формулой (308), по существу связывается с ионом натрия, и конъюгат миРНК, представленный Формулой (308), по существу присутствует в форме натриевой соли. Могут быть использованы хорошо известные методы ионного обмена, в которых ион натрия может быть заменен ионом водорода и/или другими катионами, обеспечивая другие формы конъюгатов миРНК, представленных Формулой (308). Катионы представляют собой описанные выше.The non-bridging oxygen atom or sulfur atom in the phosphodiester bond or thiophosphate bond between nucleotides in the resulting siRNA conjugate represented by Formula (308) is substantially bound to a sodium ion, and the siRNA conjugate represented by Formula (308) is substantially present in the form of a sodium salt. Well-known ion exchange methods can be used, in which the sodium ion can be replaced with a hydrogen ion and/or other cations, providing other forms of siRNA conjugates represented by Formula (308). The cations are as described above.
Во время синтеза чистоту и молекулярную массу последовательности нуклеиновой кислоты можно определить в любое время. Для лучшего контроля качества синтеза такие способы определения хорошо известны специалистам в данной области техники. Например, чистоту нуклеиновой кислоты можно определить с помощью ионообменной хроматографии, а молекулярную массу можно определить с помощью жидкостной хроматографии с масс-спектрометрией (ЖХ-МС).During synthesis, the purity and molecular weight of the nucleic acid sequence can be determined at any time. For better control of the quality of the synthesis, such determination methods are well known to those skilled in the art. For example, nucleic acid purity can be determined using ion exchange chromatography, and molecular weight can be determined using liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS).
Способы отжига также хорошо известны специалистам в данной области техники. Например, синтезированная смысловая цепь (SS-цепь) и антисмысловая цепь (AS-цепь) могут быть просто смешаны в воде для инъекций в эквимолярном соотношении, нагреты до 70-95°C, а затем охлаждены при комнатной температуре с образованием двухцепочечной структуры посредством водородных связей. Таким образом может быть получен конъюгат миРНК, представленный Формулой (308).Annealing methods are also well known to those skilled in the art. For example, the synthesized sense strand (SS strand) and antisense strand (AS strand) can simply be mixed in equimolar ratio in water for injection, heated to 70-95°C, and then cooled at room temperature to form a double-stranded structure via hydrogen bonding. connections. In this way, the siRNA conjugate represented by Formula (308) can be obtained.
После получения конъюгата в некоторых вариантах осуществления синтезированный таким образом конъюгат миРНК, представленный Формулой (308), также может быть охарактеризован с помощью таких средств, как определение молекулярной массы, такими методами, как жидкостная хроматография с масс-спектрометрией, чтобы подтвердить, что синтезированный конъюгат миРНК представляет собой целевой разработанный конъюгат миРНК, представленный Формулой (308), и последовательность синтезированной миРНК представляет собой последовательность миРНК, которую требовалось синтезировать, например, представляет собой одну из последовательностей, перечисленных в таблицах 1a-1f.After preparing the conjugate, in some embodiments, the thus synthesized siRNA conjugate represented by Formula (308) can also be characterized by means such as molecular weight determination, methods such as liquid chromatography-mass spectrometry to confirm that the synthesized conjugate The siRNA is the target designed siRNA conjugate represented by Formula (308), and the sequence of the synthesized siRNA is the sequence of the siRNA that was required to be synthesized, for example, is one of the sequences listed in Tables 1a-1f.
Соединение, представленное Формулой (321), может быть получено с помощью следующего способа, включающего: приведение соединения, представленного Формулой (313), в контакт с циклическим ангидридом в органическом растворителе в условиях реакции этерификации в присутствии основания и катализатора этерификации; и выделение соединения, представленного Формулой (321), с помощью ионного обмена:The compound represented by Formula (321) can be produced by the following method, including: contacting the compound represented by Formula (313) with a cyclic anhydride in an organic solvent under an esterification reaction condition in the presence of a base and an esterification catalyst; and isolating the compound represented by Formula (321) by ion exchange:
Формула (313),Formula (313),
где определения и варианты n1, n3, m1, m2, m3, R10, R11, R12, R13, R14, R15, L1 и S1 соответственно представляют собой такие, как описано выше;where the definitions and options n1, n3, m1, m2, m3, R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 , R 15 , L 1 and S 1 , respectively, are as described above;
R6 представляет собой группу, обеспечивающую R4 Формулы (321). В некоторых вариантах осуществления R6 содержит структуру, представленную Формулой (A61):R 6 is the group providing R 4 of Formula (321). In some embodiments, R 6 contains the structure represented by Formula (A61):
, ,
(A61),(A61),
где Ri представляет собой любую группу, способную связываться с атомом N на азотсодержащем остове, связываться с RkO и связываться со свободной гидроксигруппой; и Rk представляет собой гидроксизащитную группу. В этом случае получают соединение, представленное Формулой (321), где R4 содержит первую функциональную группу в виде гидроксизащитной группы и вторую функциональную группу, содержащую группу, представленную Формулой (C1) или (C2).where R i represents any group capable of bonding to an N atom on a nitrogen-containing backbone, bonding to R k O and bonding to a free hydroxy group; and R k represents a hydroxy protecting group. In this case, a compound represented by Formula (321) is obtained, wherein R 4 contains a first functional group as a hydroxy protecting group and a second functional group containing a group represented by Formula (C1) or (C2).
Условия реакции этерификации включают температуру реакции 0-100°C и продолжительность проведения реакции 8-48 часов. В некоторых вариантах осуществления условия реакции этерификации включают температуру реакции 10-40°C и продолжительность проведения реакции 20-30 часов.The esterification reaction conditions include a reaction temperature of 0-100°C and a reaction time of 8-48 hours. In some embodiments, the esterification reaction conditions include a reaction temperature of 10-40°C and a reaction time of 20-30 hours.
В некоторых вариантах осуществления органический растворитель включает один или более из эпоксидного растворителя, простого эфирного растворителя, галогеналканового растворителя, диметилсульфоксида, N,N-диметилформамида и N,N-диизопропилэтиламина. В некоторых вариантах осуществления эпоксидный растворитель представляет собой диоксан и/или тетрагидрофуран, простой эфирный растворитель представляет собой диэтиловый эфир и/или метил-трет-бутиловый эфир, и галогеналкановый растворитель представляет собой один или более из дихлорметана, трихлорметана и 1,2-дихлорэтана. В некоторых вариантах осуществления органический растворитель представляет собой дихлорметан. Количество органического растворителя составляет 3-50 л/моль, и в некоторых вариантах осуществления 5-20 л/моль, относительно соединения, представленного Формулой (313).In some embodiments, the organic solvent includes one or more of an epoxy solvent, an ether solvent, a haloalkane solvent, dimethyl sulfoxide, N,N-dimethylformamide, and N,N-diisopropylethylamine. In some embodiments, the epoxy solvent is dioxane and/or tetrahydrofuran, the ether solvent is diethyl ether and/or methyl tert-butyl ether, and the haloalkane solvent is one or more of dichloromethane, trichloromethane, and 1,2-dichloroethane. In some embodiments, the organic solvent is dichloromethane. The amount of organic solvent is 3-50 L/mol, and in some embodiments, 5-20 L/mol, relative to the compound represented by Formula (313).
В некоторых вариантах осуществления циклический ангидрид представляет собой один из янтарного ангидрида, глутарового ангидрида, адипинового ангидрида или пимелинового ангидрида, и в некоторых вариантах осуществления циклический ангидрид представляет собой янтарный ангидрид. Молярное отношение циклического ангидрида к соединению, представленному Формулой (313), составляет от 1:1 до 10:1, и в некоторых вариантах осуществления от 2:1 до 5:1.In some embodiments, the cyclic anhydride is one of succinic anhydride, glutaric anhydride, adipic anhydride, or pimelic anhydride, and in some embodiments, the cyclic anhydride is succinic anhydride. The molar ratio of the cyclic anhydride to the compound represented by Formula (313) is from 1:1 to 10:1, and in some embodiments from 2:1 to 5:1.
Катализатор этерификации может представлять собой любой катализатор, способный катализировать этерификацию, например, катализатор может представлять собой 4-диметиламинопиридин. Молярное отношение катализатора к соединению, представленному Формулой (313), составляет от 1:1 до 10:1, и в некоторых вариантах осуществления от 2:1 до 5:1.The esterification catalyst may be any catalyst capable of catalyzing esterification, for example the catalyst may be 4-dimethylaminopyridine. The molar ratio of catalyst to compound represented by Formula (313) is from 1:1 to 10:1, and in some embodiments from 2:1 to 5:1.
В некоторых вариантах осуществления основание может представлять собой любое неорганическое основание, органическое основание или их комбинацию. Учитывая растворимость и стабильность продукта, основание может представлять собой, например, третичный амин. В некоторых вариантах осуществления третичный амин представляет собой триэтиламин или N,N-диизопропилэтиламин. Молярное отношение третичного амина к соединению, представленному Формулой (313), составляет от 1:1 до 20:1, и в некоторых вариантах осуществления от 3:1 до 10:1.In some embodiments, the base may be any inorganic base, organic base, or a combination thereof. Considering the solubility and stability of the product, the base may be, for example, a tertiary amine. In some embodiments, the tertiary amine is triethylamine or N,N-diisopropylethylamine. The molar ratio of tertiary amine to the compound represented by Formula (313) is from 1:1 to 20:1, and in some embodiments from 3:1 to 10:1.
Ионный обмен выполняет функцию превращения соединения, представленного Формулой (321), в целевую форму карбоновой кислоты или соли карбоновой кислоты, и способы ионного обмена хорошо известны специалистам в данной области техники. Вышеуказанная конъюгирующая молекула, в которой катион представляет собой M+, может быть получена с использованием подходящего ионообменного раствора и условий ионного обмена, которые не описаны подробно в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления в реакции ионного обмена используют раствор фосфата триэтиламина, и концентрация раствора фосфата триэтиламина составляет 0,2-0,8 М. В некоторых вариантах осуществления концентрация раствора фосфата триэтиламина составляет 0,4-0,6 М. В некоторых вариантах осуществления количество раствора фосфата триэтиламина составляет 3-6 л/моль, и в дополнительном варианте осуществления 4-5 л/моль, относительно соединения, представленного Формулой (313).Ion exchange has the function of converting the compound represented by Formula (321) into the target form of carboxylic acid or carboxylic acid salt, and ion exchange methods are well known to those skilled in the art. The above conjugating molecule in which the cation is M + can be prepared using a suitable ion exchange solution and ion exchange conditions, which are not described in detail herein. In some embodiments, a triethylamine phosphate solution is used in the ion exchange reaction, and the concentration of the triethylamine phosphate solution is 0.2-0.8 M. In some embodiments, the concentration of the triethylamine phosphate solution is 0.4-0.6 M. In some embodiments, the amount of triethylamine phosphate solution is 3-6 L/mol, and in a further embodiment 4-5 L/mol, relative to the compound represented by Formula (313).
Соединение, представленное Формулой (321), может быть выделено из реакционной смеси с помощью любых подходящих способов выделения. В некоторых вариантах осуществления соединение, представленное Формулой (321), может быть выделено посредством удаления растворителя выпариванием с последующей хроматографией, например, с использованием следующих двух условий хроматографирования для выделения: (1) нормально-фазовая очистка силикагелевым фильтром с размером зерен 200-300 меш и градиентное элюирование 1 мас. триэтиламина в смеси дихлорметан:метанол в соотношении от 100:18 до 100:20; или (2) обращенно-фазовая очистка с наполнителем с обращенной фазой C18 и C8 и градиентное элюирование смесью метанол:ацетонитрил в соотношении от 0,1:1 до 1:0,1. В некоторых вариантах осуществления растворитель может быть сразу же удален с получением неочищенного продукта соединения, представленного Формулой (321), который может быть сразу использован в последующих реакциях.The compound represented by Formula (321) can be isolated from the reaction mixture using any suitable isolation methods. In some embodiments, the compound represented by Formula (321) can be isolated by solvent removal by evaporation followed by chromatography, for example, using the following two isolation chromatographic conditions: (1) normal phase purification with a 200-300 mesh silica gel filter and gradient elution 1 wt. triethylamine in a mixture of dichloromethane:methanol in a ratio of 100:18 to 100:20; or (2) reverse phase purification with C18 and C8 reverse phase excipient and gradient elution with 0.1:1 to 1:0.1 methanol:acetonitrile. In some embodiments, the solvent can be immediately removed to obtain the crude product of the compound represented by Formula (321), which can be immediately used in subsequent reactions.
В некоторых вариантах осуществления способ получения соединения, представленного Формулой (321), дополнительно включает: приведение продукта, полученного в результате вышеуказанной реакции ионного обмена, в контакт с твердофазной подложкой, содержащей аминогруппы или гидроксигруппы в органическом растворителе, в условиях реакции конденсации в присутствии конденсирующего агента, катализатора конденсации и третичного амина. В этом случае получают соединение, представленное Формулой (321), где R4 содержит первую функциональную группу, содержащую гидроксизащитную группу, и вторую функциональную группу, имеющую структуру, представленную Формулой (C1').In some embodiments, the method of producing the compound represented by Formula (321) further includes: contacting the product obtained from the above ion exchange reaction with a solid phase support containing amino groups or hydroxy groups in an organic solvent under condensation reaction conditions in the presence of a condensing agent , condensation catalyst and tertiary amine. In this case, a compound represented by Formula (321) is obtained, wherein R 4 contains a first functional group containing a hydroxy protecting group and a second functional group having the structure represented by Formula (C1').
Твердофазная подложка представляет собой один из носителей, применяемых в твердофазном синтезе миРНК, некоторые из которых хорошо известны специалистам в данной области техники. Например, твердофазная подложка может быть выбрана из твердофазных подложек, содержащих активную функциональную гидроксигруппу или аминогруппу. В некоторых вариантах осуществления твердофазная подложка представляет собой аминосмолу или гидроксисмолу. В некоторых вариантах осуществления аминосмола или гидроксисмола имеет следующие параметры: размер частиц 100-400 меш и удельное содержание аминогрупп или гидроксигрупп 0,2-0,5 ммоль/г. Отношение соединения, представленного Формулой (321), к твердофазной подложке составляет 10-400 мкмоль соединения на грамм твердофазной подложки (мкмоль/г). В некоторых вариантах осуществления отношение соединения Формулы (321) к твердофазной подложке составляет 50-200 мкмоль/г.A solid phase support is one of the supports used in solid phase siRNA synthesis, some of which are well known to those skilled in the art. For example, the solid phase support may be selected from solid phase supports containing an active hydroxy or amino functional group. In some embodiments, the solid phase support is an amino resin or a hydroxy resin. In some embodiments, the amino resin or hydroxy resin has the following parameters: a particle size of 100-400 mesh and a specific amino or hydroxy group content of 0.2-0.5 mmol/g. The ratio of the compound represented by Formula (321) to the solid support is 10-400 μmol of compound per gram of solid support (μmol/g). In some embodiments, the ratio of compound of Formula (321) to solid phase support is 50-200 µmol/g.
Органический растворитель может представлять собой любой подходящий растворитель или смешанные растворители, известные специалистам в данной области техники. В некоторых вариантах осуществления органический растворитель включает один или более из ацетонитрила, эпоксидного растворителя, простого эфирного растворителя, галогеналканового растворителя, диметилсульфоксида, N,N-диметилформамида и N,N-диизопропилэтиламина. В некоторых вариантах осуществления эпоксидный растворитель представляет собой диоксан и/или тетрагидрофуран, простой эфирный растворитель представляет собой диэтиловый эфир и/или метил-трет-бутиловый эфир, и галогеналкановый растворитель представляет собой один или более из дихлорметана, трихлорметана и 1,2-дихлорэтана. В некоторых вариантах осуществления органический растворитель представляет собой ацетонитрил. Количество органического растворителя может составлять 20-200 л/моль, и в некоторых вариантах осуществления 50-100 л/моль, относительно соединения, представленного Формулой (321).The organic solvent may be any suitable solvent or mixed solvents known to those skilled in the art. In some embodiments, the organic solvent includes one or more of acetonitrile, an epoxy solvent, an ether solvent, a haloalkane solvent, dimethyl sulfoxide, N,N-dimethylformamide, and N,N-diisopropylethylamine. In some embodiments, the epoxy solvent is dioxane and/or tetrahydrofuran, the ether solvent is diethyl ether and/or methyl tert-butyl ether, and the haloalkane solvent is one or more of dichloromethane, trichloromethane, and 1,2-dichloroethane. In some embodiments, the organic solvent is acetonitrile. The amount of organic solvent may be 20-200 L/mol, and in some embodiments, 50-100 L/mol, relative to the compound represented by Formula (321).
В некоторых вариантах осуществления конденсирующий агент может представлять собой бензотриазол-1-ил-окситрипирролидинофосфония гексафторфосфат (PyBop), 3-(диэтоксифосфорилокси)-1,2,3-бензотриазин-4(3H)-он (DEPBT) и/или O-бензотриазол-1-ил-тетраметилурония гексафторфосфат. В некоторых вариантах осуществления конденсирующий агент представляет собой O-бензотриазол-1-ил-тетраметилурония гексафторфосфат. Молярное отношение конденсирующего агента к соединению, представленному Формулой (321), составляет от 1:1 до 20:1, и в некоторых вариантах осуществления от 1:1 до 5:1.In some embodiments, the condensing agent may be benzotriazol-1-yl-oxytripyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate (PyBop), 3-(diethoxyphosphoryloxy)-1,2,3-benzotriazin-4(3H)-one (DEPBT), and/or O-benzotriazole -1-yl-tetramethyluronium hexafluorophosphate. In some embodiments, the condensing agent is O-benzotriazol-1-yl-tetramethyluronium hexafluorophosphate. The molar ratio of the condensing agent to the compound represented by Formula (321) is from 1:1 to 20:1, and in some embodiments from 1:1 to 5:1.
В некоторых вариантах осуществления третичный амин представляет собой триэтиламин и/или N,N-диизопропилэтиламин, и в некоторых вариантах осуществления N,N-диизопропилэтиламин. Молярное отношение третичного амина к соединению, представленному Формулой (321), составляет от 1:1 до 20:1, и в некоторых вариантах осуществления от 1:1 до 5:1.In some embodiments, the tertiary amine is triethylamine and/or N,N-diisopropylethylamine, and in some embodiments, N,N-diisopropylethylamine. The molar ratio of tertiary amine to the compound represented by Formula (321) is from 1:1 to 20:1, and in some embodiments from 1:1 to 5:1.
В некоторых вариантах осуществления способ получения соединения, представленного Формулой (321), дополнительно включает: приведение полученного продукта конденсации в контакт с кэпирующим агентом и катализатором ацилирования в органическом растворителе в условии реакции кэпирования и выделение соединения, представленного Формулой (321). Реакция кэпирования используется для удаления любых активных функциональных групп, полностью не вступающих в реакцию, чтобы избежать образования побочных продуктов в последующих реакциях. Условия реакции кэпирования включают температуру реакции 0-50°C, и в некоторых вариантах осуществления 15-35°C, и продолжительность проведения реакции 1-10 часов, и в некоторых вариантах осуществления 3-6 часов. Кэпирующий агент может представлять собой кэпирующий агент, применяемый в твердофазном синтезе миРНК, и кэпирующий агент, применяемый в твердофазном синтезе миРНК, хорошо известен специалистам в данной области техники.In some embodiments, a method for preparing the compound represented by Formula (321) further includes: contacting the resulting condensation product with a capping agent and an acylation catalyst in an organic solvent under a capping reaction condition, and isolating the compound represented by Formula (321). The capping reaction is used to remove any reactive functional groups that are completely unreactive to avoid the formation of by-products in subsequent reactions. Capping reaction conditions include a reaction temperature of 0-50°C, and in some embodiments, 15-35°C, and a reaction duration of 1-10 hours, and in some embodiments, 3-6 hours. The capping agent may be a capping agent used in solid-phase siRNA synthesis, and the capping agent used in solid-phase siRNA synthesis is well known to those skilled in the art.
В некоторых вариантах осуществления кэпирующий агент состоит из кэпирующего агента 1 (cap1) и кэпирующего агента 2 (cap2). Cap1 представляет собой N-метилимидазол, и в некоторых вариантах осуществления обеспечивают в виде смешанного раствора N-метилимидазола в пиридине/ацетонитриле, где объемное отношение пиридина к ацетонитрилу составляет от 1:10 до 1:1, и в некоторых вариантах осуществления от 1:3 до 1:1. В некоторых вариантах осуществления отношение общего объема пиридина и ацетонитрила к объему N-метилимидазола составляет от 1:1 до 10:1, и в некоторых вариантах осуществления от 3:1 до 7:1. Кэпирующий агент 2 представляет собой уксусный ангидрид. В некоторых вариантах осуществления кэпирующий агент 2 обеспечивают в виде раствора уксусного ангидрида в ацетонитриле, где объемное отношение уксусного ангидрида к ацетонитрилу составляет от 1:1 до 1:10, и в некоторых вариантах осуществления от 1:2 до 1:6.In some embodiments, the capping agent consists of capping agent 1 (cap1) and capping agent 2 (cap2). Cap1 is N-methylimidazole, and in some embodiments is provided as a mixed solution of N-methylimidazole in pyridine/acetonitrile, wherein the volume ratio of pyridine to acetonitrile is from 1:10 to 1:1, and in some embodiments from 1:3 up to 1:1. In some embodiments, the ratio of the total volume of pyridine and acetonitrile to the volume of N-methylimidazole is from 1:1 to 10:1, and in some embodiments from 3:1 to 7:1. Capping agent 2 is acetic anhydride. In some embodiments, capping agent 2 is provided as a solution of acetic anhydride in acetonitrile, where the volume ratio of acetic anhydride to acetonitrile is from 1:1 to 1:10, and in some embodiments from 1:2 to 1:6.
В некоторых вариантах осуществления отношение объема смешанного раствора N-метилимидазола в пиридине/ацетонитриле к массе соединения, представленного Формулой (321), составляет от 5 мл/г до 50 мл/г, и в некоторых вариантах осуществления от 15 мл/г до 30 мл/г. Отношение объема раствора уксусного ангидрида в ацетонитриле к массе соединения, представленного Формулой (321), составляет от 0,5 мл/г до 10 мл/г, и в некоторых вариантах осуществления от 1 мл/г до 5 мл/г.In some embodiments, the ratio of the volume of the mixed solution of N-methylimidazole in pyridine/acetonitrile to the weight of the compound represented by Formula (321) is from 5 ml/g to 50 ml/g, and in some embodiments from 15 ml/g to 30 ml /G. The ratio of the volume of a solution of acetic anhydride in acetonitrile to the weight of the compound represented by Formula (321) is from 0.5 ml/g to 10 ml/g, and in some embodiments, from 1 ml/g to 5 ml/g.
В некоторых вариантах осуществления кэпирующий агент содержит эквимолярные количества уксусного ангидрида и N-метилимидазола. В некоторых вариантах осуществления органический растворитель включает один или более из ацетонитрила, эпоксидного растворителя, простого эфирного растворителя, галогеналканового растворителя, диметилсульфоксида, N,N-диметилформамида и N,N-диизопропилэтиламина. В некоторых вариантах осуществления органический растворитель представляет собой ацетонитрил. Количество органического растворителя может составлять 10-50 л/моль, и в некоторых вариантах осуществления 5-30 л/моль, относительно соединения, представленного Формулой (321).In some embodiments, the capping agent contains equimolar amounts of acetic anhydride and N-methylimidazole. In some embodiments, the organic solvent includes one or more of acetonitrile, an epoxy solvent, an ether solvent, a haloalkane solvent, dimethyl sulfoxide, N,N-dimethylformamide, and N,N-diisopropylethylamine. In some embodiments, the organic solvent is acetonitrile. The amount of organic solvent may be 10-50 L/mol, and in some embodiments, 5-30 L/mol, relative to the compound represented by Formula (321).
В некоторых вариантах осуществления катализатор ацилирования может быть выбран из любого катализатора, который может быть использован для конденсации путем этерификации или амидной конденсации, такого как щелочные гетероциклические соединения. В некоторых вариантах осуществления катализатор ацилирования представляет собой 4-диметиламинопиридин. Массовое отношение катализатора к соединению, представленному Формулой (321), может составлять от 0,001:1 до 1:1, и в некоторых вариантах осуществления от 0,01:1 до 0,1:1.In some embodiments, the acylation catalyst may be selected from any catalyst that can be used for esterification or amide condensation, such as alkaline heterocyclic compounds. In some embodiments, the acylation catalyst is 4-dimethylaminopyridine. The weight ratio of catalyst to compound represented by Formula (321) may be from 0.001:1 to 1:1, and in some embodiments, from 0.01:1 to 0.1:1.
В некоторых вариантах осуществления соединение, представленное Формулой (321), может быть выделено из реакционной смеси с помощью любых подходящих способов выделения. В некоторых вариантах осуществления соединение, представленное Формулой (321), может быть получено путем тщательной промывки органическим растворителем и фильтрации для удаления непрореагировавших реагентов, избытка кэпирующего агента и других примесей, где органический растворитель выбран из ацетонитрила, дихлорметана или метанола. В некоторых вариантах осуществления органический растворитель представляет собой ацетонитрил.In some embodiments, the compound represented by Formula (321) can be isolated from the reaction mixture using any suitable isolation methods. In some embodiments, the compound represented by Formula (321) can be prepared by thorough washing with an organic solvent and filtration to remove unreacted reagents, excess capping agent, and other impurities, where the organic solvent is selected from acetonitrile, dichloromethane, or methanol. In some embodiments, the organic solvent is acetonitrile.
В некоторых вариантах осуществления получение конъюгирующей молекулы, представленной Формулой (321), включает приведение соединения, представленного Формулой (313), в контакт с диамидофосфитом в органическом растворителе в условиях реакции сочетания в присутствии агента реакции сочетания, и выделение соединения, представленного Формулой (321). В этом случае получают соединение, представленное Формулой (321), где R4 содержит первую функциональную группу, содержащую гидроксизащитную группу, и вторую функциональную группу, имеющую структуру, представленную Формулой (C3).In some embodiments, producing the conjugating molecule represented by Formula (321) involves contacting the compound represented by Formula (313) with diamidophosphite in an organic solvent under coupling reaction conditions in the presence of a coupling agent, and isolating the compound represented by Formula (321) . In this case, a compound represented by Formula (321) is obtained, wherein R 4 contains a first functional group containing a hydroxy protecting group and a second functional group having the structure represented by Formula (C3).
В некоторых вариантах осуществления условия реакция сочетания включают температуру реакции 0-50°C, например, 15-35°C. Молярное отношение соединения, представленного Формулой (313), к диамидофосфиту может составлять от 1:1 до 1:50, например, от 1:5 до 1:15.Молярное отношение соединения, представленного Формулой (313), к агенту реакции сочетания может составлять от 1:1 до 1:100, например, от 1:50 до 80. Продолжительность проведения реакции может составлять 200-3000 секунд, например, 500-1500 секунд. Диамидофосфит может представлять собой, например, бис(диизопропиламино)(2-цианоэтокси)фосфин, который может быть доступен на рынке или синтезирован в соответствии со способами, хорошо известными в данной области техники. Агент реакции сочетания выбран из одного или более из 1H-тетразола, 5-этилтио-1H-тетразола и 5-бензилтио-1H-тетразола, например, 5-этилтио-1H-тетразола. Реакция сочетания может проводиться в органическом растворителе, и органический растворитель выбран из одного или более из безводного ацетонитрила, безводного ДМФА (диметилформамид) и безводного дихлорметана, например, безводного ацетонитрила. Количество органического растворителя может составлять 3-50 л/моль, например, 5-20 л/моль, относительно соединения, представленного Формулой (313). При проведении реакции сочетания гидроксигруппа в соединении, представленном Формулой (313), реагирует с диамидофосфитом с образованием амидофосфитной группы. В некоторых вариантах осуществления растворитель может быть сразу же удален с получением неочищенного продукта соединения, представленного Формулой (321), который может быть сразу использован в последующих реакциях.In some embodiments, the coupling reaction conditions include a reaction temperature of 0-50°C, for example, 15-35°C. The molar ratio of the compound represented by Formula (313) to diamidophosphite may be from 1:1 to 1:50, such as 1:5 to 1:15. The molar ratio of the compound represented by Formula (313) to the coupling agent may be from 1:1 to 1:100, for example from 1:50 to 80. The duration of the reaction can be 200-3000 seconds, for example 500-1500 seconds. The diamidophosphite may be, for example, a bis(diisopropylamino)(2-cyanoethoxy)phosphine, which may be commercially available or synthesized according to methods well known in the art. The coupling agent is selected from one or more of 1H-tetrazole, 5-ethylthio-1H-tetrazole and 5-benzylthio-1H-tetrazole, for example 5-ethylthio-1H-tetrazole. The coupling reaction may be carried out in an organic solvent, and the organic solvent is selected from one or more of anhydrous acetonitrile, anhydrous DMF (dimethylformamide) and anhydrous dichloromethane, such as anhydrous acetonitrile. The amount of the organic solvent may be 3-50 L/mol, such as 5-20 L/mol, relative to the compound represented by Formula (313). In a coupling reaction, the hydroxy group in the compound represented by Formula (313) reacts with diamidophosphite to form an amidophosphite group. In some embodiments, the solvent can be immediately removed to obtain the crude product of the compound represented by Formula (321), which can be immediately used in subsequent reactions.
В некоторых вариантах осуществления способ получения соединения, представленного Формулой (321), дополнительно включает: приведение выделенного продукта в контакт с твердофазной подложкой, содержащей гидроксигруппы, в органическом растворителе в условиях реакции сочетания в присутствии агента реакции сочетания с последующим кэпированием, окислением и выделением, с получением соединения, представленного Формулой (321). В этом случае получают соединение, представленное Формулой (321), где R4 содержит первую функциональную группу, содержащую гидроксизащитную группу, и вторую функциональную группу, имеющую структуру, представленную Формулой (C3’).In some embodiments, a method for preparing the compound represented by Formula (321) further comprises: contacting the isolated product with a solid phase support containing hydroxy groups in an organic solvent under coupling reaction conditions in the presence of a coupling agent, followed by capping, oxidation and isolation, with obtaining the compound represented by Formula (321). In this case, a compound represented by Formula (321) is obtained, wherein R 4 contains a first functional group containing a hydroxy protecting group and a second functional group having the structure represented by Formula (C3').
В некоторых вариантах осуществления твердофазная подложка представляет собой хорошо известную твердофазную подложку в области твердофазного синтеза нуклеиновых кислот, такую как доступная на рынке незащищенная универсальная твердофазная подложка (подложка для синтеза олигонуклеотидов NittoPhase®HL UnyLinker™ 300, Kinovate Life Sciences, представленная Формулой B80):In some embodiments, the solid phase support is a well known solid phase support in the field of solid phase nucleic acid synthesis, such as a commercially available unprotected universal solid phase support (NittoPhase®HL UnyLinker™ 300 Oligonucleotide Synthesis Support, Kinovate Life Sciences, represented by Formula B80):
(B80).(B80).
Реакция снятия защиты хорошо известна в данной области техники. В некоторых вариантах осуществления условия снятия защиты включают температуру 0-50°C, например, 15-35°C, и продолжительность проведения реакции 30-300 секунд, например, 50-150 секунд. Агент для снятия защиты может быть выбран из одной или более из трифторуксусной кислоты, трихлоруксусной кислоты, дихлоруксусной кислоты и монохлоруксусной кислоты. В некоторых вариантах осуществления агент для снятия защиты представляет собой дихлоруксусную кислоту. Молярное отношение агента для снятия защиты к защитной группе -DMTr (4,4'-диметокситритил) на твердофазной подложке может составлять от 2:1 до 100:1, например, от 3:1 до 50:1. С помощью такого снятия защиты на поверхности твердофазной подложки получают реакционноспособные гидроксигруппы для облегчения последующей реакции сочетания.The deprotection reaction is well known in the art. In some embodiments, deprotection conditions include a temperature of 0-50°C, such as 15-35°C, and a reaction duration of 30-300 seconds, such as 50-150 seconds. The deprotection agent may be selected from one or more of trifluoroacetic acid, trichloroacetic acid, dichloroacetic acid and monochloroacetic acid. In some embodiments, the deprotection agent is dichloroacetic acid. The molar ratio of the deprotecting agent to the -DMTr (4,4'-dimethoxytrityl) protecting group on the solid phase support can be from 2:1 to 100:1, for example from 3:1 to 50:1. With this deprotection, reactive hydroxy groups are produced on the surface of the solid phase support to facilitate the subsequent coupling reaction.
Условия реакции сочетания и агент реакции сочетания могут быть выбраны, как указано выше. При проведении реакции сочетания свободные гидроксигруппы, образованные в реакции снятия защиты, реагируют с амидофосфитными группами с образованием фосфитной эфирной связи.The coupling reaction conditions and the coupling reaction agent may be selected as above. During the coupling reaction, the free hydroxy groups formed in the deprotection reaction react with the amidophosphite groups to form a phosphite ester linkage.
В некоторых вариантах осуществления условия реакции кэпирования включают температуру реакции 0-50°C, например, 15-35°C, и продолжительность проведения реакции 5-500 секунд, например, 10-100 секунд. Реакцию кэпирования проводят в присутствии кэпирующего агента. Кэпирующий агент и его количество выбирают, как указано выше.In some embodiments, the capping reaction conditions include a reaction temperature of 0-50°C, such as 15-35°C, and a reaction duration of 5-500 seconds, such as 10-100 seconds. The capping reaction is carried out in the presence of a capping agent. The capping agent and its amount are selected as above.
Условия реакции окисления могут включать температуру 0-50°C, например, 15-35°C, и продолжительность проведения реакции 1-100 секунд, например, 5-50 секунд. Окисляющий агент может представлять собой, например, иод (в некоторых вариантах осуществления обеспечиваемый в виде иодной воды). В некоторых вариантах осуществления молярное отношение окисляющего агента к последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой, составляет от 1:1 до 100:1, например, от 5:1 до 50:1. В некоторых вариантах осуществления реакцию окисления проводят в смешанном растворителе, в котором отношение тетрагидрофуран:вода:пиридин составляет от 3:1:1 до 1:1:3.The oxidation reaction conditions may include a temperature of 0-50°C, for example 15-35°C, and a reaction time of 1-100 seconds, for example 5-50 seconds. The oxidizing agent may be, for example, iodine (in some embodiments, provided as iodine water). In some embodiments, the molar ratio of the oxidizing agent to the nucleic acid sequence associated with the solid phase support is from 1:1 to 100:1, for example, from 5:1 to 50:1. In some embodiments, the oxidation reaction is carried out in a mixed solvent in which the ratio of tetrahydrofuran:water:pyridine is from 3:1:1 to 1:1:3.
В некоторых вариантах осуществления R6 представляет собой группу, представленную Формулой B7 или B8:In some embodiments, R 6 is a group represented by Formula B7 or B8:
где определения q2 и Rk соответствуют описанным выше.where the definitions of q 2 and R k correspond to those described above.
В этом случае соединение, представленное Формулой (313), может быть получено с помощью следующего способа: приведение соединения, представленного Формулой (314), в контакт с соединением, представленным Формулой (A-1), или соединением, представленным Формулой (A-2), в органическом растворителе в условиях реакции амидирования в присутствии агента для амидной конденсации и третичного амина, и выделение:In this case, the compound represented by Formula (313) can be produced by the following method: bringing the compound represented by Formula (314) into contact with the compound represented by Formula (A-1) or the compound represented by Formula (A-2 ), in an organic solvent under amidation reaction conditions in the presence of an amide condensation agent and a tertiary amine, and isolating:
где определения и варианты n1, n3, m1, m2, m3, R10, R11, R12, R13, R14, R15, L1, S1, q2 и Rk соответственно представляют собой такие, как описано выше.where the definitions and options n1, n3, m1, m2, m3, R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 , R 15 , L 1 , S 1 , q 2 and R k respectively are as described higher.
Условия реакции амидирования могут включать температуру реакции 0-100°C и продолжительность проведения реакции 1-48 часов. В некоторых вариантах осуществления условия реакции амидирования включают температуру реакции 10-40°C и продолжительность проведения реакции 2-16 часов.The amidation reaction conditions may include a reaction temperature of 0-100°C and a reaction time of 1-48 hours. In some embodiments, the amidation reaction conditions include a reaction temperature of 10-40°C and a reaction time of 2-16 hours.
В некоторых вариантах осуществления органический растворитель представляет собой один или более из спиртового растворителя, эпоксидного растворителя, простого эфирного растворителя, галогеналканового растворителя, диметилсульфоксида, N,N-диметилформамида и N,N-диизопропилэтиламина. В некоторых вариантах осуществления спиртовой растворитель представляет собой один или более из метанола, этанола и пропанола, и в некоторых вариантах осуществления представляет собой этанол. В некоторых вариантах осуществления эпоксидный растворитель представляет собой диоксан и/или тетрагидрофуран. В некоторых вариантах осуществления простой эфирный растворитель представляет собой диэтиловый эфир и/или метил-трет-бутиловый эфир. В некоторых вариантах осуществления галогеналкановый растворитель представляет собой один или более из дихлорметана, трихлорметана и 1,2-дихлорэтана. В некоторых вариантах осуществления органический растворитель представляет собой дихлорметан. Количество органического растворителя составляет 3-50 л/моль, и в дополнительных вариантах осуществления 3-20 л/моль, относительно соединения, представленного Формулой (314).In some embodiments, the organic solvent is one or more of an alcohol solvent, an epoxy solvent, an ether solvent, a haloalkane solvent, dimethyl sulfoxide, N,N-dimethylformamide, and N,N-diisopropylethylamine. In some embodiments, the alcohol solvent is one or more of methanol, ethanol, and propanol, and in some embodiments is ethanol. In some embodiments, the epoxy solvent is dioxane and/or tetrahydrofuran. In some embodiments, the ether solvent is diethyl ether and/or methyl tert-butyl ether. In some embodiments, the haloalkane solvent is one or more of dichloromethane, trichloromethane, and 1,2-dichloroethane. In some embodiments, the organic solvent is dichloromethane. The amount of organic solvent is 3-50 L/mol, and in additional embodiments, 3-20 L/mol, relative to the compound represented by Formula (314).
В некоторых вариантах осуществления агент для амидной конденсации представляет собой бензотриазол-1-ил-окситрипирролидинофосфония гексафторфосфат, 3-(диэтоксифосфорилокси)-1,2,3-бензотриазин-4(3H)-он, 4-(4,6-диметокситриазин-2-ил)-4-метилморфолина гидрохлорид, 2-этокси-1-этоксикарбонил-1,2-дигидрохинолин (EEDQ) или O-бензотриазол-1-ил-тетраметилурония гексафторфосфат, и в дополнительных вариантах осуществления представляет собой 3-(диэтоксифосфорилокси)-1,2,3-бензотриазин-4(3H)-он. Молярное отношение агента для амидной конденсации к соединению, представленному Формулой (314), может составлять от 1:1 до 10:1, и в некоторых вариантах осуществления от 2,5:1 до 5:1.In some embodiments, the amide condensation agent is benzotriazol-1-yl-oxytripyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate, 3-(diethoxyphosphoryloxy)-1,2,3-benzotriazin-4(3H)-one, 4-(4,6-dimethoxytriazine-2 -yl)-4-methylmorpholine hydrochloride, 2-ethoxy-1-ethoxycarbonyl-1,2-dihydroquinoline (EEDQ) or O-benzotriazol-1-yl-tetramethyluronium hexafluorophosphate, and in additional embodiments is 3-(diethoxyphosphoryloxy)- 1,2,3-benzotriazin-4(3H)-one. The molar ratio of the amide condensation agent to the compound represented by Formula (314) may be from 1:1 to 10:1, and in some embodiments, from 2.5:1 to 5:1.
В некоторых вариантах осуществления третичный амин представляет собой триэтиламин и/или N,N-диизопропилэтиламин, и в дополнительных вариантах осуществления N,N-диизопропилэтиламин. Молярное отношение третичного амина к соединению, представленному Формулой (314), составляет от 3:1 до 20:1, и в некоторых вариантах осуществления от 5:1 до 10:1.In some embodiments, the tertiary amine is triethylamine and/or N,N-diisopropylethylamine, and in additional embodiments, N,N-diisopropylethylamine. The molar ratio of tertiary amine to the compound represented by Formula (314) is from 3:1 to 20:1, and in some embodiments from 5:1 to 10:1.
Соединения, представленные Формулой (A-1) и Формулой (A-2), могут быть получены с помощью любых подходящих способов. Например, когда Rk представляет собой группу DMTr, соединение, представленное Формулой (A-1), может быть получено путем взаимодействия с DMTrCl глицерата кальция. Аналогичным образом, соединение, представленное Формулой (A-2), может быть получено путем приведения 3-амино-1,2-пропандиола в контакт с циклическим ангидридом и последующим взаимодействием с DMTrCl, где циклический ангидрид может содержать 4-13 атомов углерода, и в некоторых вариантах осуществления 4-8 атомов углерода. Специалисты в данной области техники без труда поймут, что выбираемые циклические ангидриды соответствуют различным значениям q2 в соединении, представленном Формулой (A-2). Например, если циклический ангидрид представляет собой янтарный ангидрид, q2=1; если циклический ангидрид представляет собой глутаровый ангидрид, q2=2, и так далее.The compounds represented by Formula (A-1) and Formula (A-2) can be prepared by any suitable methods. For example, when R k represents a DMTr group, the compound represented by Formula (A-1) can be prepared by reacting calcium glycerate with DMTrCl. Likewise, the compound represented by Formula (A-2) can be prepared by contacting 3-amino-1,2-propanediol with a cyclic anhydride and then reacting with DMTrCl, wherein the cyclic anhydride may contain 4 to 13 carbon atoms, and in some embodiments, 4-8 carbon atoms. Those skilled in the art will readily appreciate that the cyclic anhydrides selected correspond to the various q 2 values in the compound represented by Formula (A-2). For example, if the cyclic anhydride is succinic anhydride, q 2 =1; if the cyclic anhydride is glutaric anhydride, q 2 =2, and so on.
В некоторых вариантах осуществления соединение, представленное Формулой (313), также может быть получено путем последовательного взаимодействия соединения, представленного Формулой (314), с циклическим ангидридом, 3-амино-1,2-пропандиолом и DMTrCl. Специалисты в данной области техники без труда поймут, что эти варианты не будут влиять на структуру и функцию соединения, представленного Формулой (313), и эти варианты могут быть легко осуществлены специалистами в данной области техники на основе вышеуказанных способов.In some embodiments, the compound represented by Formula (313) can also be prepared by sequentially reacting the compound represented by Formula (314) with a cyclic anhydride, 3-amino-1,2-propanediol and DMTrCl. Those skilled in the art will readily understand that these variations will not affect the structure and function of the compound represented by Formula (313), and these variations can be easily implemented by those skilled in the art based on the above methods.
Аналогичным образом, соединение, представленное Формулой (313), может быть выделено из реакционной смеси с помощью любых подходящих способов выделения. В некоторых вариантах осуществления соединение, представленное Формулой (313), может быть выделено посредством удаления растворителя выпариванием с последующей хроматографией, например, с использованием следующих двух условий хроматографирования для выделения: (1) нормально-фазовая очистка силикагелевым фильтром с размером частиц 200-300 меш и градиентное элюирование смесью петролейный эфир:этилацетат:дихлорметан:N,N-диметилформамид в соотношении от 1:1:1:0,5 до 1:1:1:0,6; и (2) обращенно-фазовая очистка с наполнителями с обращенной фазой C18 и C8 и градиентное элюирование смесью метанол:ацетонитрил в соотношении от 0,1:1 до 1:0,1. В некоторых вариантах осуществления растворитель может быть сразу же удален с получением неочищенного продукта соединения, представленного Формулой (313), который может быть сразу использован в последующих реакциях.Likewise, the compound represented by Formula (313) can be isolated from the reaction mixture using any suitable isolation methods. In some embodiments, the compound represented by Formula (313) can be isolated by solvent removal by evaporation followed by chromatography, for example, using the following two isolation chromatography conditions: (1) normal phase purification with a 200-300 mesh silica gel filter and gradient elution with a mixture of petroleum ether: ethyl acetate: dichloromethane: N,N-dimethylformamide in a ratio of 1:1:1:0.5 to 1:1:1:0.6; and (2) reverse phase purification with C18 and C8 reverse phase excipients and gradient elution with 0.1:1 to 1:0.1 methanol:acetonitrile. In some embodiments, the solvent can be immediately removed to obtain the crude product of the compound represented by Formula (313), which can be immediately used in subsequent reactions.
В некоторых вариантах осуществления соединение, представленное Формулой (314), может быть получено с помощью следующего способа, включающего: приведение соединения, представленного Формулой (320), в контакт с соединением, представленным Формулой (316), в органическом растворителе в условиях реакции конденсации в присутствии агента для амидной конденсации и третичного амина, и выделение:In some embodiments, the compound represented by Formula (314) can be prepared by the following method, comprising: contacting the compound represented by Formula (320) with the compound represented by Formula (316) in an organic solvent under condensation reaction conditions in the presence of an amide condensation agent and a tertiary amine, and the release of:
Формула (316)Formula (316)
Формула (320),Formula (320),
где определения и варианты n1, n3, m1, m2, m3, R10, R11, R12, R13, R14 и R15 соответственно представляют собой такие, как описано выше.where the definitions and options n1, n3, m1, m2, m3, R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 and R 15 respectively are as described above.
Соединение, представленное Формулой (316), может представлять собой такое, как описано в источнике J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 16958-16961, или соединение, представленное Формулой (316), может быть получено специалистами в данной области техники с помощью различных способов. Например, некоторые соединения, представленные Формулой (316), могут быть получены в соответствии со способами, раскрытыми в примере 1 патента США № 8106022 B2, включенного в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.The compound represented by Formula (316) may be as described in J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 16958-16961, or the compound represented by Formula (316), can be prepared by those skilled in the art using various methods. For example, certain compounds represented by Formula (316) can be prepared in accordance with the methods disclosed in Example 1 of US Pat. No. 8,106,022 B2, incorporated herein by reference in its entirety.
В некоторых вариантах осуществления условия реакции конденсации включают температуру реакции 0-100°C и продолжительность проведения реакции 0,1-24 часа. В некоторых вариантах осуществления условия реакции конденсации включают температуру реакции 10-40°C и продолжительность проведения реакции 0,5-16 часов.In some embodiments, the condensation reaction conditions include a reaction temperature of 0-100°C and a reaction duration of 0.1-24 hours. In some embodiments, the condensation reaction conditions include a reaction temperature of 10-40°C and a reaction duration of 0.5-16 hours.
Учитывая структуру целевого соединения, представленного Формулой (314), молярное отношение соединения, представленного Формулой (316), к соединению, представленному Формулой (320), следует определять, основываясь на сумме n1 и n3 в Формуле (320). В некоторых вариантах осуществления, например, когда n1+n3=3, для обеспечения полноты протекания реакции и отсутствия избытка, молярное отношение соединения, представленного Формулой (316), к соединению, представленному Формулой (320), может составлять от 3:1 до 3,5:1, и в некоторых вариантах осуществления составляет от 3,01:1 до 3,15:1.Considering the structure of the target compound represented by Formula (314), the molar ratio of the compound represented by Formula (316) to the compound represented by Formula (320) should be determined based on the sum of n1 and n3 in Formula (320). In some embodiments, for example, when n1+n3=3, to ensure complete reaction and no excess, the molar ratio of the compound represented by Formula (316) to the compound represented by Formula (320) may be from 3:1 to 3 .5:1, and in some embodiments is between 3.01:1 and 3.15:1.
В некоторых вариантах осуществления органический растворитель представляет собой один или более из ацетонитрила, эпоксидного растворителя, простого эфирного растворителя, галогеналканового растворителя, диметилсульфоксида, N,N-диметилформамида и N,N-диизопропилэтиламина. В некоторых вариантах осуществления эпоксидный растворитель представляет собой диоксан и/или тетрагидрофуран. В некоторых вариантах осуществления простой эфирный растворитель представляет собой диэтиловый эфир и/или метил-трет-бутиловый эфир. В некоторых вариантах осуществления галогеналкановый растворитель представляет собой один или более из дихлорметана, трихлорметана и 1,2-дихлорэтана. В некоторых вариантах осуществления органический растворитель представляет собой ацетонитрил. Количество органического растворителя составляет 3-50 л/моль, и в некоторых вариантах осуществления 5-20 л/моль, относительно соединения, представленного Формулой (320).In some embodiments, the organic solvent is one or more of acetonitrile, an epoxy solvent, an ether solvent, a haloalkane solvent, dimethyl sulfoxide, N,N-dimethylformamide, and N,N-diisopropylethylamine. In some embodiments, the epoxy solvent is dioxane and/or tetrahydrofuran. In some embodiments, the ether solvent is diethyl ether and/or methyl tert-butyl ether. In some embodiments, the haloalkane solvent is one or more of dichloromethane, trichloromethane, and 1,2-dichloroethane. In some embodiments, the organic solvent is acetonitrile. The amount of organic solvent is 3-50 L/mol, and in some embodiments, 5-20 L/mol, relative to the compound represented by Formula (320).
В некоторых вариантах осуществления агент для амидной конденсации представляет собой бензотриазол-1-ил-окситрипирролидинофосфония гексафторфосфат, 3-(диэтоксифосфорилокси)-1,2,3-бензотриазин-4(3H)-он (DEPBT), O-бензотриазол-1-ил-тетраметилурония гексафторфосфат, 4-(4,6-диметокситриазин-2-ил)-4-метилморфолина гидрохлорид или 1-гидроксибензотриазол, и в дополнительных вариантах осуществления представляет собой смесь бензотриазол-1-ил-окситрипирролидинофосфония гексафторфосфата и 1-гидроксибензотриазола, где бензотриазол-1-ил-окситрипирролидинофосфония гексафторфосфат (PyBop) и 1-гидроксибензотриазол содержатся в эквимолярных количествах. Молярное отношение общего количества агента для амидной конденсации к соединению, представленному Формулой (316), может составлять от 1:1 до 3:1, и в некоторых вариантах осуществления составляет от 1,05:1 до 1,5:1.In some embodiments, the amide condensation agent is benzotriazol-1-yl-oxytripyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate, 3-(diethoxyphosphoryloxy)-1,2,3-benzotriazin-4(3H)-one (DEPBT), O-benzotriazol-1-yl -tetramethyluronium hexafluorophosphate, 4-(4,6-dimethoxytriazin-2-yl)-4-methylmorpholine hydrochloride, or 1-hydroxybenzotriazole, and in additional embodiments is a mixture of benzotriazol-1-yl-oxytripyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate and 1-hydroxybenzotriazole, wherein benzotriazole -1-yl-hydroxytripyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate (PyBop) and 1-hydroxybenzotriazole are contained in equimolar quantities. The molar ratio of the total amount of amide condensation agent to the compound represented by Formula (316) may be from 1:1 to 3:1, and in some embodiments is from 1.05:1 to 1.5:1.
Третичный амин может представлять собой N-метилморфолин, триэтиламин или N,N-диизопропилэтиламин, и в некоторых вариантах осуществления N-метилморфолин. Молярное отношение третичного амина к соединению, представленному Формулой (316), может составлять от 2:1 до 10:1, и в некоторых вариантах осуществления составляет от 2:1 до 5:1.The tertiary amine may be N-methylmorpholine, triethylamine or N,N-diisopropylethylamine, and in some embodiments N-methylmorpholine. The molar ratio of tertiary amine to the compound represented by Formula (316) may be from 2:1 to 10:1, and in some embodiments is from 2:1 to 5:1.
Аналогичным образом, соединение, представленное Формулой (314), может быть выделено из реакционной смеси с помощью любых подходящих способов выделения. В некоторых вариантах осуществления соединение, представленное Формулой (314), выделяют посредством удаления растворителя выпариванием с последующей хроматографией, например, с использованием следующих двух условий хроматографирования для выделения: (1) нормально-фазовая очистка силикагелевым фильтром с размером зерен 200-300 меш и градиентное элюирование смесью дихлорметан:метанол в соотношении от 100:5 до 100:7; и (2) обращенно-фазовая очистка с наполнителями с обращенной фазой C18 и C8 и градиентное элюирование смесью метанол:ацетонитрил в соотношении от 0,1:1 до 1:0,1. В некоторых вариантах осуществления растворитель сразу же удаляют с получением неочищенного продукта соединения, представленного Формулой (314), который может быть сразу использован в последующих реакциях.Likewise, the compound represented by Formula (314) can be isolated from the reaction mixture using any suitable isolation methods. In some embodiments, the compound represented by Formula (314) is isolated by solvent removal by evaporation followed by chromatography, for example, using the following two isolation chromatography conditions: (1) normal phase 200-300 mesh silica gel filter purification and gradient elution with a mixture of dichloromethane:methanol in a ratio of 100:5 to 100:7; and (2) reverse phase purification with C18 and C8 reverse phase excipients and gradient elution with 0.1:1 to 1:0.1 methanol:acetonitrile. In some embodiments, the solvent is immediately removed to obtain the crude product of the compound represented by Formula (314), which can be immediately used in subsequent reactions.
Соединение, представленное Формулой (320), может быть доступно на рынке или получено специалистами в данной области техники с помощью известных способов. Например, в случае, если m1=m2=m3=3, n1=1, n3=2, и R10, R11, R12, R13, R14 и R15 все представляют собой H, соединение, представленное Формулой (320), доступно на рынке от Alfa Aesar Inc.The compound represented by Formula (320) may be commercially available or prepared by those skilled in the art using known methods. For example, in the case where m1=m2=m3=3, n1=1, n3=2, and R 10 , R 11 , R 12 , R 13 , R 14 and R 15 are all H, the compound represented by Formula ( 320), available commercially from Alfa Aesar Inc.
Конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению также может быть применен в комбинации с другими фармацевтически приемлемыми вспомогательными веществами, которые могут представлять собой один или более из различных общепринятых в данной области техники составов или соединений. Подробная информация содержится в приведенном выше описании фармацевтических композиций согласно настоящему изобретению.The siRNA conjugate of the present invention may also be used in combination with other pharmaceutically acceptable excipients, which may be one or more of various formulations or compounds conventional in the art. Detailed information is contained in the above description of the pharmaceutical compositions according to the present invention.
Применение миРНК, фармацевтической композиции и конъюгата миРНК согласно настоящему изобретениюUse of siRNA, pharmaceutical composition and siRNA conjugate according to the present invention
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предложено применение миРНК, и/или фармацевтической композиции, и/или конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению для производства лекарственного средства для лечения и/или предупреждения миастении гравис.Some embodiments of the present invention provide the use of an siRNA and/or a pharmaceutical composition and/or a siRNA conjugate of the present invention for the production of a medicament for the treatment and/or prevention of myasthenia gravis.
Согласно некоторым вариантам осуществления настоящего изобретения предложен способ предупреждения и/или лечения миастении гравис, включающий введение эффективного количества миРНК, и/или фармацевтической композиции, и/или конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению нуждающемуся субъекту.According to some embodiments of the present invention, there is provided a method of preventing and/or treating myasthenia gravis, comprising administering an effective amount of siRNA and/or a pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate of the present invention to a subject in need.
Цель предупреждения и/или лечения миастении гравис может быть достигнута на основе механизма РНК-интерференции путем введения активных ингредиентов миРНК согласно настоящему изобретению нуждающемуся субъекту. Таким образом, миРНК, и/или фармацевтическая композиция, и/или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению могут применяться для предупреждения и/или лечения миастении гравис или для производства лекарственного средства для предупреждения и/или лечения миастении гравис.The purpose of preventing and/or treating myasthenia gravis can be achieved based on the RNA interference mechanism by administering the active ingredients of the siRNA according to the present invention to a subject in need. Thus, the siRNA and/or pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate of the present invention can be used for the prevention and/or treatment of myasthenia gravis or for the production of a medicament for the prevention and/or treatment of myasthenia gravis.
Применительно к настоящему изобретению термин «введение/вводить» относится к доставке миРНК, фармацевтической композиции и/или конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению в организм субъекта с помощью способа или пути, который по меньшей мере частично локализует миРНК, фармацевтическую композицию и/или конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению в желаемом месте для получения желаемого эффекта. Подходящие пути введения для способов согласно настоящему изобретению включают местное введение и системное введение. Как правило, местное введение приводит к доставке большего количества конъюгата миРНК в определенное место по сравнению с системным кровотоком субъекта, тогда как системное введение приводит к доставке миРНК, фармацевтической композиции и/или конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению по существу в системный кровоток субъекта. Принимая во внимание, что согласно настоящему изобретению могут быть предложены средства для предупреждения и/или лечения миастении гравис, в некоторых вариантах осуществления применяется способ введения, способный доставлять лекарственные средства в печень.In connection with the present invention, the term "administration" refers to the delivery of siRNA, pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate according to the present invention into the body of a subject using a method or route that at least partially localizes siRNA, pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate according to the present invention in the desired location to obtain the desired effect. Suitable routes of administration for the methods of the present invention include local administration and systemic administration. In general, local administration results in the delivery of a greater amount of siRNA conjugate to a specific site compared to the systemic circulation of the subject, while systemic administration results in delivery of the siRNA, pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate of the present invention substantially into the systemic circulation of the subject. Whereas the present invention may provide agents for the prevention and/or treatment of myasthenia gravis, some embodiments employ a route of administration capable of delivering drugs to the liver.
Введение субъекту может быть осуществлено с помощью любых подходящих путей, известных в данной области техники, включая, не ограничиваясь перечисленным, пероральный или парентеральный путь, такой как внутривенное введение, внутримышечное введение, подкожное введение, трансдермальное введение, внутритрахеальное введение (аэрозоль), ингаляционное введение, интраназальное введение, ректальное введение и местное введение (включая трансбуккальное введение и сублингвальное введение). Частота введения может составлять один или более раз в сутки, еженедельно, один раз в две недели, один раз в три недели, ежемесячно, один раз в два месяца, один раз в три месяца, один раз в полгода или ежегодно.Administration to a subject may be by any suitable route known in the art, including, but not limited to, the oral or parenteral route, such as intravenous administration, intramuscular administration, subcutaneous administration, transdermal administration, intratracheal administration (aerosol), inhalation administration , intranasal administration, rectal administration and local administration (including buccal administration and sublingual administration). The frequency of administration may be one or more times per day, weekly, once every two weeks, once every three weeks, monthly, once every two months, once every three months, once every six months, or annually.
Доза миРНК, фармацевтической композиции или конъюгата второй миРНК согласно настоящему изобретению может представлять собой обычную дозу в данной области техники, и доза может быть определена в соответствии с различными параметрами, в частности, возрастом, массой тела и полом субъекта. Токсичность и эффективность могут быть измерены в клеточных культурах или на подопытных животных с помощью стандартных фармацевтических процедур, например, путем определения LD50 (летальная доза, вызывающая гибель 50% популяции), ED50 (доза, которая при количественном ответе может вызвать 50% от максимальной интенсивности ответа, и при качественном ответе обеспечивает положительный ответ у 50% подопытных субъектов) или IC50 (концентрация ингибитора/лекарственного средства, необходимая для подавления количественной реакции наполовину). Диапазон доз для человека может быть получен на основании данных, полученных из анализа на клеточной культуре и исследований на животных.The dose of the siRNA, pharmaceutical composition or second siRNA conjugate according to the present invention may be a conventional dose in the art, and the dose may be determined according to various parameters, particularly the age, body weight and gender of the subject. Toxicity and efficacy can be measured in cell cultures or experimental animals using standard pharmaceutical procedures, for example, by determining LD 50 (lethal dose that causes death of 50% of the population), ED 50 (dose that, when quantitatively responded, can cause 50% of the population). maximum intensity of response, and with a qualitative response provides a positive response in 50% of test subjects) or IC 50 (concentration of inhibitor/drug required to suppress the quantitative response by half). Dose ranges for humans can be derived from data obtained from cell culture assays and animal studies.
При введении миРНК, фармацевтической композиции или конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению, например, самцам или самкам мышей C57BL/6J в возрасте 6-12 недель и с массой тела 18-25 г, и вычислении на основании количества миРНК: (i) для конъюгата миРНК дозировка содержащейся в нем миРНК может составлять 0,001-100 мг/кг массы тела, и в дополнительных вариантах осуществления составляет 0,01-50 мг/кг массы тела, и в некоторых вариантах осуществления составляет 0,05-20 мг/кг массы тела, в некоторых других вариантах осуществления составляет 0,1-15 мг/кг массы тела, и в некоторых других вариантах осуществления настоящего изобретения составляет 0,1-10 мг/кг массы тела; и (ii) для фармацевтической композиции, состоящей из миРНК и фармацевтически приемлемого носителя, дозировка содержащейся в ней миРНК может составлять 0,001-50 мг/кг массы тела, в некоторых вариантах осуществления составляет 0,01-10 мг/кг массы тела, в некоторых вариантах осуществления составляет 0,05-5 мг/кг массы тела, и в некоторых вариантах осуществления составляет 0,1-3 мг/кг массы тела.When the siRNA, pharmaceutical composition or siRNA conjugate of the present invention is administered to, for example, male or female C57BL/6J mice aged 6-12 weeks and weighing 18-25 g, and calculated based on the amount of siRNA: (i) for the siRNA conjugate the dosage of siRNA contained therein may be 0.001-100 mg/kg body weight, and in additional embodiments is 0.01-50 mg/kg body weight, and in some embodiments is 0.05-20 mg/kg body weight, in some other embodiments, the implementation is 0.1-15 mg/kg body weight, and in some other embodiments, the implementation of the present invention is 0.1-10 mg/kg body weight; and (ii) for a pharmaceutical composition consisting of siRNA and a pharmaceutically acceptable carrier, the dosage of the siRNA contained therein may be 0.001-50 mg/kg body weight, in some embodiments, 0.01-10 mg/kg body weight, in some in embodiments, is 0.05-5 mg/kg body weight, and in some embodiments, is 0.1-3 mg/kg body weight.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предложен способ ингибирования экспрессии гена C5 в гепатоците. Указанный способ включает приведение эффективного количества миРНК, и/или фармацевтической композиции, и/или конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению в контакт с указанным гепатоцитом, введение миРНК, и/или фармацевтической композиции, и/или конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению в указанный гепатоцит и достижение цели ингибирования экспрессии гена C5 в указанном гепатоците посредством механизма РНК-интерференции. Гепатоцит может быть выбран из SMMC-7721, HepG2, Huh7 и других линий клеток гепатомы или выделенных первичных гепатоцитов. В некоторых вариантах осуществления клетки представляют собой клетки гепатомы HepG2.In some embodiments, the present invention provides a method of inhibiting C5 gene expression in a hepatocyte. Said method involves bringing an effective amount of siRNA and/or pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate according to the present invention into contact with said hepatocyte, introducing siRNA and/or pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate according to the present invention into said hepatocyte and achieving the purpose of inhibiting the expression of the C5 gene in the specified hepatocyte through the mechanism of RNA interference. The hepatocyte may be selected from SMMC-7721, HepG2, Huh7 and other hepatoma cell lines or isolated primary hepatocytes. In some embodiments, the cells are HepG2 hepatoma cells.
При ингибировании экспрессии C5 в клетке с помощью способа согласно настоящему изобретению количество миРНК в предложенных модифицированной миРНК, фармацевтической композиции и/или конъюгате миРНК, как правило, представляет собой количество, достаточное для снижения экспрессии гена-мишени и достижения внеклеточной концентрации от 1 пМ до 1 мкМ, или от 0,01 нМ до 100 нМ, или от 0,05 нМ до 50 нМ, или от 0,05 нМ до приблизительно 5 нМ на поверхности клетки-мишени. Количество, требуемое для достижения этой локальной концентрации, будет варьировать в зависимости от различных факторов, включая способ доставки, место доставки, количество клеточных слоев между местом доставки и клетками- или тканями-мишенями, путь доставки (местный или системный) и т. д. Концентрация в месте доставки может быть значительно выше, чем концентрация на поверхности клеток- или тканей-мишеней.When inhibiting C5 expression in a cell using the method of the present invention, the amount of siRNA in the proposed modified siRNA, pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate is generally an amount sufficient to reduce expression of the target gene and achieve an extracellular concentration of 1 pM to 1 µM, or 0.01 nM to 100 nM, or 0.05 nM to 50 nM, or 0.05 nM to approximately 5 nM at the surface of the target cell. The amount required to achieve this local concentration will vary depending on various factors, including the method of delivery, the site of delivery, the number of cellular layers between the site of delivery and the target cells or tissues, the route of delivery (local or systemic), etc. The concentration at the site of delivery may be significantly higher than the concentration on the surface of the target cells or tissues.
НаборKit
Согласно настоящему изобретению предложен набор, содержащий эффективное количество по меньшей мере одного из модифицированной миРНК, фармацевтической композиции и конъюгата миРНК согласно настоящему изобретению.The present invention provides a kit containing an effective amount of at least one of a modified siRNA, a pharmaceutical composition, and a siRNA conjugate of the present invention.
В некоторых вариантах осуществления в наборе, раскрытом в настоящем документе, может предоставляться модифицированная миРНК в одном контейнере. В некоторых вариантах осуществления набор согласно настоящему изобретению может содержать контейнер, в котором предоставляются фармацевтически приемлемые вспомогательные вещества. В некоторых вариантах осуществления указанный набор может дополнительно содержать дополнительные ингредиенты, такие как стабилизаторы или консерванты. В некоторых вариантах осуществления набор согласно настоящему изобретению может содержать по меньшей мере один дополнительный терапевтический агент в контейнере, отличном от контейнера, в котором предоставляется модифицированная миРНК согласно настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления набор может содержать инструкцию по смешиванию модифицированной миРНК с фармацевтически приемлемым носителем и/или адъювантами или другими ингредиентами (если таковые имеются).In some embodiments, a kit disclosed herein may provide the modified siRNA in a single container. In some embodiments, the kit of the present invention may contain a container in which pharmaceutically acceptable excipients are provided. In some embodiments, the kit may further contain additional ingredients, such as stabilizers or preservatives. In some embodiments, a kit of the present invention may contain at least one additional therapeutic agent in a container different from the container in which the modified siRNA of the present invention is provided. In some embodiments, the kit may contain instructions for mixing the modified siRNA with a pharmaceutically acceptable carrier and/or adjuvants or other ingredients (if any).
В наборе согласно настоящему изобретению модифицированная миРНК и фармацевтически приемлемый носитель и/или адъюванты, а также модифицированная миРНК, фармацевтическая композиция и/или конъюгат миРНК, и/или фармацевтически приемлемые адъюванты могут предоставляться в любой форме, например, в жидкой форме, сухой форме или лиофилизированной форме. В некоторых вариантах осуществления модифицированная миРНК и фармацевтически приемлемый носитель и/или адъюванты, а также фармацевтическая композиция и/или конъюгат миРНК и необязательные фармацевтически приемлемые адъюванты являются по существу чистыми и/или стерильными. В некоторых вариантах осуществления в наборе согласно настоящему изобретению может быть предоставлена стерильная вода.In the kit of the present invention, the modified siRNA and pharmaceutically acceptable carrier and/or adjuvants, as well as the modified siRNA, pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate, and/or pharmaceutically acceptable adjuvants may be provided in any form, for example, liquid form, dry form or lyophilized form. In some embodiments, the modified siRNA and pharmaceutically acceptable carrier and/or adjuvants, as well as the pharmaceutical composition and/or siRNA conjugate and optional pharmaceutically acceptable adjuvants are substantially pure and/or sterile. In some embodiments, the kit of the present invention may provide sterile water.
Далее в настоящем документе настоящее изобретение будет дополнительно описано с помощью примеров, но не ограничивается ими ни в каком отношении.Hereinafter, the present invention will be further described by way of examples, but is not limited thereto in any respect.
ПримерыExamples
Если не указано иное, все агенты и культуральные среды, использованные в следующих примерах, доступны на рынке, и все применяемые процедуры, такие как электрофорез нуклеиновых кислот и ПЦР в реальном времени, проведены в соответствии с методами, описанными в источнике Molecular Cloning (Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)).Unless otherwise noted, all agents and culture media used in the following examples are commercially available, and all procedures used, such as nucleic acid electrophoresis and real-time PCR, were performed in accordance with the methods described in Molecular Cloning (Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)).
Lipofectamine™ 2000 (Invitrogen) использовали в качестве реагента для трансфекции при трансфекции клеток миРНК и конъюгатом миРНК к гену C5, синтезированными в настоящем изобретении, или миРНК и конъюгатом миРНК в качестве отрицательного контроля, и конкретный процесс соответствует инструкциям, предоставленным производителем.Lipofectamine™ 2000 (Invitrogen) was used as a transfection reagent when transfecting cells with siRNA and siRNA conjugate to the C5 gene synthesized in the present invention, or siRNA and siRNA conjugate as a negative control, and the specific process followed the instructions provided by the manufacturer.
Если не указано иное, все отношения реагентов, приведенные ниже, рассчитаны как отношения по объему (об./об.).Unless otherwise noted, all reactant ratios given below are calculated as ratios by volume (v/v).
Все экспериментальные данные выражены как , и анализ данных осуществлен с помощью программного обеспечения для статистического анализа Graphpad prism 5.0.All experimental data are expressed as , and data analysis was performed using Graphpad prism 5.0 statistical analysis software.
Пример получения 1. Получение конъюгата 1Preparation example 1. Preparation of conjugate 1
В этом примере получения синтезировали конъюгат 1 (т. е. L10-siC5a1M1SP). Конъюгированная миРНК в конъюгате имеет последовательности смысловой цепи и антисмысловой цепи, соответствующие конъюгату 1 из таблицы 3.In this preparation example, conjugate 1 (ie L10-siC5a1M1SP) was synthesized. The conjugated siRNA in the conjugate has the sense strand and antisense strand sequences corresponding to conjugate 1 from Table 3.
(1-1) Синтез соединения L-10(1-1) Synthesis of compound L-10
Соединение L-10 синтезировали в соответствии со следующим способом:Compound L-10 was synthesized according to the following method:
(1-1-1) Синтез GAL-5 (концевой конъюгирующей молекулы)(1-1-1) Synthesis of GAL-5 (terminal conjugating molecule)
(1-1-1a) Синтез GAL-2(1-1-1a) Synthesis of GAL-2
100,0 г GAL-1 (гидрохлорида N-ацетил-D-галактозамина, № CAS 1772-03-8, приобретен у Ningbo Hongxiang Bio-Chem Co., Ltd., 463,8 ммоль) растворяли в 1000 мл безводного пиридина, к которому добавляли 540 мл уксусного ангидрида (приобретен у Enox Inc., 5565,6 ммоль) на бане с ледяной водой для проведения взаимодействия при перемешивании при комнатной температуре в течение 1,5 часов. Полученный реакционный раствор выливали в 10 л ледяной воды и подвергали вакуумной фильтрации при пониженном давлении. Остаток промывали 2 л ледяной воды, а затем добавляли смешанный растворитель ацетонитрил/толуол (отношение об./об. = 1:1) до полного растворения. Растворитель удаляли с помощью выпаривания с получением 130,0 г продукта GAL-2 в виде белого твердого вещества.100.0 g of GAL-1 (N-acetyl-D-galactosamine hydrochloride, CAS No. 1772-03-8, purchased from Ningbo Hongxiang Bio-Chem Co., Ltd., 463.8 mmol) was dissolved in 1000 ml of anhydrous pyridine, to which 540 ml of acetic anhydride (purchased from Enox Inc., 5565.6 mmol) was added in an ice water bath to react with stirring at room temperature for 1.5 hours. The resulting reaction solution was poured into 10 L of ice water and subjected to vacuum filtration under reduced pressure. The residue was washed with 2 L of ice water, and then acetonitrile/toluene mixed solvent (v/v ratio = 1:1) was added until completely dissolved. The solvent was removed by evaporation to obtain 130.0 g of product GAL-2 as a white solid.
(1-1-1b) Синтез GAL-3(1-1-1b) Synthesis of GAL-3
GAL-2 (35,1 г, 90,0 ммоль), полученный на стадии (1-1-1a), растворяли в 213 мл безводного 1,2-дихлорэтана, к которому добавляли 24,0 г триметилсилилтрифторметансульфоната (TMSOTf, № CAS 27607-77-8, приобретен у Macklin Inc., 108,0 ммоль) на бане с ледяной водой и в защитной атмосфере азота для проведения взаимодействия при комнатной температуре в течение ночи.GAL-2 (35.1 g, 90.0 mmol) obtained in step (1-1-1a) was dissolved in 213 ml of anhydrous 1,2-dichloroethane, to which was added 24.0 g of trimethylsilyl trifluoromethanesulfonate (TMSOTf, CAS No. 27607-77-8, purchased from Macklin Inc., 108.0 mmol) in an ice water bath and under a protective nitrogen atmosphere to react at room temperature overnight.
К реакционному раствору добавляли 400 мл дихлорметана для разбавления, фильтровали через диатомит, а затем добавляли 1 л насыщенного водного раствора бикарбоната натрия и перемешивали до однородности. Выделяли органическую фазу. Оставшуюся водную фазу дважды экстрагировали, каждый раз с помощью 300 мл дихлорэтана, и все органические фазы объединяли и промывали с помощью 300 мл насыщенного водного раствора бикарбоната натрия и 300 мл насыщенного рассола, соответственно. Органическую фазу, полученную в результате промывки, выделяли и сушили с помощью безводного сульфата натрия. Растворитель удаляли с помощью выпаривания при пониженном давлении с получением 26,9 г продукта GAL-3 в виде светло-желтого вязкого сиропа.400 ml of dichloromethane was added to the reaction solution to dilute it, filtered through diatomaceous earth, and then 1 L of saturated aqueous sodium bicarbonate was added and stirred until homogeneous. The organic phase was isolated. The remaining aqueous phase was extracted twice, each time with 300 ml of dichloroethane, and all organic phases were combined and washed with 300 ml of saturated aqueous sodium bicarbonate solution and 300 ml of saturated brine, respectively. The organic phase obtained from washing was isolated and dried using anhydrous sodium sulfate. The solvent was removed by evaporation under reduced pressure to obtain 26.9 g of product GAL-3 as a light yellow viscous syrup.
(1-1-1c) Синтез GAL-4(1-1-1c) Synthesis of GAL-4
GAL-3 (26,9 г, 81,7 ммоль), полученный на стадии (1-1-1b), растворяли в 136 мл безводного 1,2-дихлорэтана, добавляли 30 г порошка сухих молекулярных сит 4, а затем 9,0 г 5-гексен-1-ола (№ CAS 821-41-0, приобретен у Adamas-beta Inc., 89,9 ммоль), и перемешивали при комнатной температуре в течение 30 минут. Добавляли 9,08 мл TMSOTf (40,9 ммоль) на ледяной бане и в защитной атмосфере азота для проведения взаимодействия при перемешивании при комнатной температуре в течение ночи. Порошок молекулярных сит 4 удаляли с помощью фильтрации. К фильтрату добавляли 300 мл дихлорэтана для разбавления, фильтровали через диатомит, а затем добавляли 500 мл насыщенного водного раствора бикарбоната натрия и перемешивали в течение 10 минут для промывки. Выделяли органическую фазу. Водную фазу однократно экстрагировали с помощью 300 мл дихлорэтана. Все органические фазы объединяли и промывали с помощью 300 мл насыщенного водного раствора бикарбоната натрия и 300 мл насыщенного рассола, соответственно. Органическую фазу, полученную в результате промывки, выделяли и сушили с помощью безводного сульфата натрия. Растворитель удаляли с помощью выпаривания при пониженном давлении с получением 41,3 г продукта GAL-4 в виде желтого сиропа, который сразу использовали в следующей реакции окисления без очистки.GAL-3 (26.9 g, 81.7 mmol) obtained in step (1-1-1b) was dissolved in 136 ml of anhydrous 1,2-dichloroethane, 30 g of dry molecular sieve powder was added 4 followed by 9.0 g of 5-hexen-1-ol (CAS No. 821-41-0, purchased from Adamas-beta Inc., 89.9 mmol), and stirred at room temperature for 30 minutes. 9.08 ml TMSOTf (40.9 mmol) was added in an ice bath and under a protective nitrogen atmosphere to react with stirring at room temperature overnight. Molecular Sieve Powder 4 removed by filtration. 300 ml of dichloroethane was added to the filtrate for dilution, filtered through diatomaceous earth, and then 500 ml of saturated aqueous sodium bicarbonate was added and stirred for 10 minutes to wash. The organic phase was isolated. The aqueous phase was extracted once with 300 ml of dichloroethane. All organic phases were combined and washed with 300 ml saturated aqueous sodium bicarbonate solution and 300 ml saturated brine, respectively. The organic phase obtained from washing was isolated and dried using anhydrous sodium sulfate. The solvent was removed by evaporation under reduced pressure to obtain 41.3 g of GAL-4 product as a yellow syrup, which was immediately used in the next oxidation reaction without purification.
(1-1-1d) Синтез GAL-5(1-1-1d) Synthesis of GAL-5
GAL-4 (14,9 г, 34,7 ммоль), полученный в соответствии со способом, описанным на стадии (1-1 1c), растворяли в смешанном растворителе из 77 мл дихлорметана и 77 мл ацетонитрила, добавляли 103 мл деионизированной воды и 29,7 г периодата натрия (№ CAS 7790-28-5, приобретен у Aladdin Inc., 138,8 ммоль), соответственно, и перемешивали на ледяной бане в течение 10 минут. Добавляли трихлорид рутения (№ CAS 14898-67-0, приобретен у Energy Chemical, 238 мг, 1,145 ммоль) для проведения взаимодействия при комнатной температуре в течение ночи. Полученный реакционный раствор разбавляли путем добавления 300 мл воды при перемешивании и доводили до pH приблизительно 7,5, добавляя насыщенный бикарбонат натрия. Органическую фазу выделяли и отбрасывали. Водную фазу трижды экстрагировали, каждый раз с помощью 200 мл дихлорметана, и отбрасывали органическую фазу, полученную в результате экстракции. Водную фазу, полученную в результате экстракции, доводили до pH, равного приблизительно 3, с помощью порошка лимонной кислоты, трижды экстрагировали, каждый раз с помощью 200 мл дихлорметана, и полученные органические фазы объединяли и сушили с помощью безводного сульфата натрия. Растворитель удаляли с помощью выпаривания при пониженном давлении с получением 6,85 г продукта GAL-5 в виде белого пенистого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО) δ 12,01 (br, 1H), 7,83 (d, J = 9,2 Гц, 1H), 5,21 (d, J = 3,2 Гц, 1H), 4,96 (dd, J = 11,2, 3,2 Гц, 1H), 4,49 (d, J = 8,4 Гц, 1H), 4,07 - 3,95 (m, 3H), 3,92 - 3,85 (m, 1H), 3,74 - 3,67 (m, 1H), 3,48 - 3,39 (m, 1H), 2,20 (t, J = 6,8 Гц, 2H), 2,11 (s, 3H), 2,00 (s, 3H), 1,90 (s, 3H), 1,77 (s, 3H), 1,55 - 1,45 (m, 4H).GAL-4 (14.9 g, 34.7 mmol) prepared according to the method described in step (1-1 1c) was dissolved in a mixed solvent of 77 ml dichloromethane and 77 ml acetonitrile, added 103 ml deionized water and 29.7 g of sodium periodate (CAS No. 7790-28-5, purchased from Aladdin Inc., 138.8 mmol), respectively, and stirred in an ice bath for 10 minutes. Ruthenium trichloride (CAS No. 14898-67-0, purchased from Energy Chemical, 238 mg, 1.145 mmol) was added to react at room temperature overnight. The resulting reaction solution was diluted by adding 300 ml of water with stirring and adjusted to a pH of approximately 7.5 by adding saturated sodium bicarbonate. The organic phase was isolated and discarded. The aqueous phase was extracted three times, each time with 200 ml of dichloromethane, and the organic phase resulting from the extraction was discarded. The aqueous phase obtained from the extraction was adjusted to a pH of approximately 3 with citric acid powder, extracted three times, each time with 200 ml of dichloromethane, and the resulting organic phases were combined and dried with anhydrous sodium sulfate. The solvent was removed by evaporation under reduced pressure to obtain 6.85 g of product GAL-5 as a white foamy solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO) δ 12.01 (br, 1H), 7.83 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 5.21 (d, J = 3.2 Hz, 1H) , 4.96 (dd, J = 11.2, 3.2 Hz, 1H), 4.49 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 4.07 - 3.95 (m, 3H), 3.92 - 3.85 (m, 1H), 3.74 - 3.67 (m, 1H), 3.48 - 3.39 (m, 1H), 2.20 (t, J = 6.8 Hz, 2H), 2.11 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 1.90 (s, 3H), 1.77 (s, 3H), 1.55 - 1.45 (m , 4H).
(1-1-2) Синтез L-8:(1-1-2) Synthesis of L-8:
J-0 (9,886 г, 52,5 ммоль, приобретен у AlfaAesar) и GAL-5 (72,819 г, 162,75 ммоль, получен путем объединения продуктов нескольких партий), полученный на стадии (1-1-1), растворяли в 525 мл дихлорметана, добавляли диизопропилэтиламин (DIEA, 44,782 г, 346,50 ммоль), бензотриазол-1-ил-окситрипирролидинофосфония гексафторфосфат (PyBop, 90,158 г, 173,25 ммоль) и гидроксибензотриазол (HOBt, 23,410 г, 173,25 ммоль) для проведения взаимодействия при комнатной температуре в течение 4 часов, а затем добавляли 20 мл насыщенного бикарбоната натрия и 200 мл насыщенного рассола для промывки. Водную фазу дважды экстрагировали, каждый раз с помощью 100 мл дихлорметана, и полученные органические фазы объединяли и сушили с помощью безводного сульфата натрия. Растворитель удаляли с помощью выпаривания при пониженном давлении с получением неочищенного продукта. Неочищенный продукт очищали с помощью нормально-фазовой колонки с силикагелем (200-300 меш). В колонку вносили 10 мас.% триэтиламина для нейтрализации кислотности силикагеля, уравновешивали 1 мас. триэтиламина и элюировали в режиме градиентного элюирования смесью дихлорметан:метанол в соотношении от 100:30 до 100:40. Собирали элюат и удаляли растворитель с помощью выпаривания при пониженном давлении с получением 38,8 г чистого продукта L-8. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО) δ 7,84 (d, J = 9,0 Гц, 3H), 7,27 - 7,23 (m, 1H), 7,13 - 7,18 (m, 1H), 5,22 (d, J = 3,1 Гц, 3H), 4,97 (dd, J = 11,3, 3,1 Гц, 3H), 4,48 (d, J = 8,4 Гц, 3H), 4,09 - 3,98 (m, 9H), 3,88 (dd, J = 19,3, 9,3 Гц, 3H), 3,75 - 3,66 (m, 3H), 3,44 - 3,38 (m, 3H), 3,17 - 3,30 (m, 4H), 3,10 - 2,97 (m, 4H), 2,35 - 2,20 (m, 6H), 2,15 - 2,08 (m, 9H), 2,07 - 1,98 (m, 13H), 1,94 - 1,87 (m, 9H), 1,81 - 1,74 (m, 9H), 1,65 - 1,42 (m, 18H). МС m/z: C85H119N7O30, [M+H]+, рассчитано: 1477,59, измерено: 1477,23.J-0 (9.886 g, 52.5 mmol, purchased from AlfaAesar) and GAL-5 (72.819 g, 162.75 mmol, prepared by combining products from several batches) obtained in step (1-1-1) were dissolved in 525 ml of dichloromethane, diizopropidylamine was added (DIEA, 44.782 g, 346.50 mmol), benzotriazole-1-il-octirolidinophosphonia hexaphotosphate (Pybop, 90.158 g, 173.25 mmol) and hydroxybenzorisol (Hobt, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23, 23 410 g, 173.25 mmol) react at room temperature for 4 hours, and then add 20 ml saturated sodium bicarbonate and 200 ml saturated brine for washing. The aqueous phase was extracted twice, each time with 100 ml of dichloromethane, and the resulting organic phases were combined and dried with anhydrous sodium sulfate. The solvent was removed by evaporation under reduced pressure to obtain the crude product. The crude product was purified using a normal phase silica gel column (200-300 mesh). 10 wt.% triethylamine was added to the column to neutralize the acidity of silica gel, balanced with 1 wt. triethylamine and eluted using a gradient elution mode with a mixture of dichloromethane:methanol in a ratio of 100:30 to 100:40. The eluate was collected and the solvent was removed by evaporation under reduced pressure to obtain 38.8 g of pure product L-8. 1H NMR (400 MHz, DMSO) δ 7.84 (d, J = 9.0 Hz, 3H), 7.27 - 7.23 (m, 1H), 7.13 - 7.18 (m, 1H ), 5.22 (d, J = 3.1 Hz, 3H), 4.97 (dd, J = 11.3, 3.1 Hz, 3H), 4.48 (d, J = 8.4 Hz , 3H), 4.09 - 3.98 (m, 9H), 3.88 (dd, J = 19.3, 9.3 Hz, 3H), 3.75 - 3.66 (m, 3H), 3.44 - 3.38 (m, 3H), 3.17 - 3.30 (m, 4H), 3.10 - 2.97 (m, 4H), 2.35 - 2.20 (m, 6H ), 2.15 - 2.08 (m, 9H), 2.07 - 1.98 (m, 13H), 1.94 - 1.87 (m, 9H), 1.81 - 1.74 (m , 9H), 1.65 - 1.42 (m, 18H). MS m/z: C 85 H 119 N 7 O 30 , [M+H] + , calculated: 1477.59, measured: 1477.23.
(1-1-3a) Синтез A-1(1-1-3a) Synthesis A-1
DMTrCl (хлорид 4,4'-диметокситритила, 101,65 г, 300 ммоль) растворяли в 1000 мл безводного пиридина и добавляли гидрат DL-глицерата кальция (28,63 г, 100 ммоль) для проведения взаимодействия при 45°C в течение 20 часов. Реакционный раствор фильтровали. Остаток промывали с помощью 200 мл DCM и концентрировали фильтрат досуха при пониженном давлении. Остаток повторно растворяли в 500 мл дихлорметана и дважды промывали, каждый раз с помощью 200 мл 0,5 М фосфата триэтиламина (pH=7-8). Выделенную водную фазу дважды экстрагировали, каждый раз с помощью 200 мл дихлорметана. Все органические фазы объединяли, сушили с помощью безводного сульфата натрия и фильтровали. Растворитель удаляли с помощью выпаривания при пониженном давлении, и остаток очищали с помощью нормально-фазовой колонки с силикагелем (200-300 меш), которую элюировали в режиме градиентного элюирования смесью петролейный эфир:этилацетат:дихлорметан:метанол в соотношении от 1:1:1:0,35 до 1:1:1:0,55. Собирали элюат и удаляли растворитель с помощью выпаривания при пониженном давлении. Остаток повторно растворяли в 600 мл дихлорметана и однократно промывали с помощью 200 мл 0,5 М фосфата триэтиламина. Выделенную водную фазу однократно экстрагировали с помощью 200 мл дихлорметана. Все органические фазы объединяли, сушили с помощью безводного сульфата натрия и фильтровали. Растворитель удаляли с помощью выпаривания при пониженном давлении и в течение ночи при пониженном давлении, создаваемом вакуумным масляным насосом, с получением 50,7 г продукта A-1 в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ 7,46 (ddd, J = 6,5, 2,3, 1,1 Гц, 1H), 7,40 - 7,28 (m, 7H), 6,89 - 6,81 (m, 4H), 4,84 (d, J = 5,0 Гц, 1H), 4,36 - 4,24 (m, 1H), 4,29 (s, 6H), 3,92 (dd, J = 12,4, 7,0 Гц, 1H), 3,67 (dd, J = 12,3, 7,0 Гц, 1H), 2,52 (q, J = 6,3 Гц, 6H), 1,03 (t, J = 6,3 Гц, 9H). МС m/z: C24H23O6, [M-H]-, рассчитано: 407,15, измерено: 406,92.DMTrCl (4,4'-dimethoxytrityl chloride, 101.65 g, 300 mmol) was dissolved in 1000 ml anhydrous pyridine and calcium DL-glycerate hydrate (28.63 g, 100 mmol) was added to react at 45°C for 20 hours. The reaction solution was filtered. The residue was washed with 200 ml DCM and the filtrate was concentrated to dryness under reduced pressure. The residue was redissolved in 500 ml of dichloromethane and washed twice, each time with 200 ml of 0.5 M triethylamine phosphate (pH=7-8). The isolated aqueous phase was extracted twice, each time with 200 ml of dichloromethane. All organic phases were combined, dried with anhydrous sodium sulfate and filtered. The solvent was removed by evaporation under reduced pressure and the residue was purified using a normal phase silica gel column (200-300 mesh) eluted using a 1:1:1 petroleum ether:ethyl acetate:dichloromethane:methanol gradient. :0.35 to 1:1:1:0.55. The eluate was collected and the solvent was removed by evaporation under reduced pressure. The residue was redissolved in 600 ml of dichloromethane and washed once with 200 ml of 0.5 M triethylamine phosphate. The isolated aqueous phase was extracted once with 200 ml of dichloromethane. All organic phases were combined, dried with anhydrous sodium sulfate and filtered. The solvent was removed by evaporation under reduced pressure and overnight under reduced pressure using a vacuum oil pump to obtain 50.7 g of product A-1 as a white solid. 1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 7.46 (ddd, J = 6.5, 2.3, 1.1 Hz, 1H), 7.40 - 7.28 (m, 7H), 6 .89 - 6.81 (m, 4H), 4.84 (d, J = 5.0 Hz, 1H), 4.36 - 4.24 (m, 1H), 4.29 (s, 6H), 3.92 (dd, J = 12.4, 7.0 Hz, 1H), 3.67 (dd, J = 12.3, 7.0 Hz, 1H), 2.52 (q, J = 6, 3 Hz, 6H), 1.03 (t, J = 6.3 Hz, 9H). MS m/z: C 24 H 23 O 6 , [MH] - , calculated: 407.15, measured: 406.92.
(1-1-3b) Синтез L-7(1-1-3b) Synthesis of L-7
L-8 (40 г, 27,09 ммоль, получен путем объединения продуктов нескольких партий), полученный на стадии (1-1-2), и A-1 (41,418 г, 81,27 ммоль), полученный на стадии (1-1-3a), смешивали и растворяли в 271 мл дихлорметана, добавляли 3-(диэтоксифосфорилокси)-1,2,3-бензотриазин-4(3H)-он (DEPBT, 24,318 г, 81,37 ммоль), а затем добавляли диизопропилэтиламин (21,007 г, 162,54 ммоль) для проведения взаимодействия при перемешивании при 25°C в течение 1,5 часов. Органическую фазу промывали с помощью 800 мл насыщенного раствора бикарбоната натрия. Выделенную водную фазу трижды экстрагировали, каждый раз с помощью 50 мл дихлорметана. Органическую фазу промывали с помощью 150 мл насыщенного рассола, а водную фазу однократно экстрагировали с помощью 50 мл дихлорметана. Полученные органические фазы объединяли и сушили с помощью безводного сульфата натрия. Растворитель удаляли с помощью выпаривания при пониженном давлении, а остаток сушили во вспененном состоянии с помощью вакуумного масляного насоса в течение ночи с получением неочищенного продукта. Неочищенный продукт подвергали очистке на колонке. Колонку заполняли 2 кг силикагеля с нормальной фазой (200-300 меш), добавляли 200 мл триэтиламина для нейтрализации кислотности силикагеля, уравновешивали петролейным эфиром, содержащим 1 мас.% триэтиламина, и элюировали в режиме градиентного элюирования смесью петролейный эфир:этилацетат:дихлорметан:N,N-диметилформамид в соотношении от 1:1:1:0,5 до 1:1:1:0,6. Собирали элюат и удаляли растворитель с помощью выпаривания при пониженном давлении с получением 40,4 г чистого продукта L-7. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО) δ 7,90 - 7,78 (m, 4H), 7,75 - 7,64 (m, 1H), 7,38 - 7,18 (m, 9H), 6,91 - 6,83 (m, 4H), 5,25 - 5,10 (m, 4H), 4,97 (dd, J = 11,2, 3,2 Гц, 3H), 4,48 - 4,30 (m, 4H), 4,02 (s, 9H), 3,93 - 3,84 (m, 3H), 3,76 - 3,66 (m, 9H), 3,45 - 3,35 (m, 3H), 3,24 - 2,98 (m, 10H), 2,30 - 2,20 (m, 2H), 2,11 - 1,88 (m, 31H), 1,80 - 1,40 (m, 28H). МС m/z: C90H128N7O35, [M-DMTr]+, рассчитано: 1564,65, измерено: 1564,88.L-8 (40 g, 27.09 mmol, prepared by combining products from several batches) obtained from step (1-1-2), and A-1 (41.418 g, 81.27 mmol) obtained from step (1 -1-3a) were mixed and dissolved in 271 ml of dichloromethane, 3-(diethoxyphosphoryloxy)-1,2,3-benzotriazin-4(3H)-one (DEPBT, 24.318 g, 81.37 mmol) was added and then diisopropylethylamine (21.007 g, 162.54 mmol) to react with stirring at 25°C for 1.5 hours. The organic phase was washed with 800 ml of saturated sodium bicarbonate solution. The isolated aqueous phase was extracted three times, each time with 50 ml of dichloromethane. The organic phase was washed with 150 ml of saturated brine and the aqueous phase was extracted once with 50 ml of dichloromethane. The resulting organic phases were combined and dried using anhydrous sodium sulfate. The solvent was removed by evaporation under reduced pressure and the residue was foam dried using an oil vacuum pump overnight to obtain the crude product. The crude product was subjected to column purification. The column was filled with 2 kg of normal phase silica gel (200-300 mesh), 200 ml of triethylamine was added to neutralize the acidity of the silica gel, equilibrated with petroleum ether containing 1 wt.% triethylamine, and eluted in a gradient elution mode with a mixture of petroleum ether: ethyl acetate: dichloromethane: N ,N-dimethylformamide in a ratio from 1:1:1:0.5 to 1:1:1:0.6. The eluate was collected and the solvent was removed by evaporation under reduced pressure to obtain 40.4 g of pure product L-7. 1H NMR (400 MHz, DMSO) δ 7.90 - 7.78 (m, 4H), 7.75 - 7.64 (m, 1H), 7.38 - 7.18 (m, 9H), 6 .91 - 6.83 (m, 4H), 5.25 - 5.10 (m, 4H), 4.97 (dd, J = 11.2, 3.2 Hz, 3H), 4.48 - 4 .30 (m, 4H), 4.02 (s, 9H), 3.93 - 3.84 (m, 3H), 3.76 - 3.66 (m, 9H), 3.45 - 3.35 (m, 3H), 3.24 - 2.98 (m, 10H), 2.30 - 2.20 (m, 2H), 2.11 - 1.88 (m, 31H), 1.80 - 1 .40 (m, 28H). MS m/z: C 90 H 128 N 7 O 35 , [M-DMTr] + , calculated: 1564.65, measured: 1564.88.
(1-1-4) Синтез L-9(1-1-4) Synthesis of L-9
L-7 (40 г, 21,4247 ммоль), полученный на стадии (1-1-3b), янтарный ангидрид (4,288 г, 42,8494 ммоль) и 4-диметиламинопиридин (DMAP, 5,235 г, 42,8494 ммоль) смешивали и растворяли в 215 мл дихлорметана, затем добавляли диизопропилэтиламин (DIPEA, 13,845 г, 107,1235 ммоль) и перемешивали при 25°C в течение 24 часов. Реакционный раствор промывали с помощью 800 мл 0,5 М фосфата триэтиламина. Водную фазу трижды экстрагировали, каждый раз с помощью 5 мл дихлорметана. Все органические фазы объединяли и выпаривали растворитель при пониженном давлении с получением неочищенного продукта. Неочищенный продукт подвергали очистке на колонке. Колонку заполняли 1 кг силикагеля с нормальной фазой (200-300 меш), добавляли 1 мас.% триэтиламина для нейтрализации кислотности силикагеля, уравновешивали дихлорметаном и элюировали в режиме градиентного элюирования смесью дихлорметан (содержащий 1 мас. триэтиламина):метанол в соотношении от 100:18 до 100:20. Собирали элюат и выпаривали растворитель при пониженном давлении с получением 31,0 г чистого продукта конъюгирующей молекулы L-9. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО) δ 8,58 (d, J = 4,2 Гц, 1H), 7,94 - 7,82 (m, 3H), 7,41 - 7,29 (m, 5H), 7,22 (d, J = 8,1 Гц, 5H), 6,89 (d, J = 8,3 Гц, 4H), 5,49 - 5,37 (m, 1H), 5,21 (d, J = 3,0 Гц, 3H), 4,97 (d, J = 11,1 Гц, 3H), 4,49 (d, J = 8,2 Гц, 3H), 4,02 (s, 9H), 3,88 (dd, J = 19,4, 9,4 Гц, 3H), 3,77 - 3,65 (m, 9H), 3,50 - 3,39 (m, 6H), 3,11 - 2,90 (m, 5H), 2,61 - 2,54 (m, 4H), 2,47 - 2,41 (m, 2H), 2,26 - 2,17 (m, 2H), 2,15 - 1,95 (m, 22H), 1,92 - 1,84 (m, 9H), 1,80 - 1,70 (m, 10H), 1,65 - 1,35 (m, 17H), 1,31 - 1,19 (m, 4H), 0,96 (t, J = 7,1 Гц, 9H). МС m/z: C94H132N7O38, [M-DMTr]+, рассчитано: 1664,72, измерено: 1665,03.L-7 (40 g, 21.4247 mmol) obtained from step (1-1-3b), succinic anhydride (4.288 g, 42.8494 mmol) and 4-dimethylaminopyridine (DMAP, 5.235 g, 42.8494 mmol) mixed and dissolved in 215 ml of dichloromethane, then diisopropylethylamine (DIPEA, 13.845 g, 107.1235 mmol) was added and stirred at 25°C for 24 hours. The reaction solution was washed with 800 ml of 0.5 M triethylamine phosphate. The aqueous phase was extracted three times, each time with 5 ml of dichloromethane. All organic phases were combined and the solvent was evaporated under reduced pressure to obtain the crude product. The crude product was subjected to column purification. The column was filled with 1 kg of normal phase silica gel (200-300 mesh), 1 wt.% triethylamine was added to neutralize the acidity of the silica gel, equilibrated with dichloromethane and eluted in a gradient elution mode with a mixture of dichloromethane (containing 1 wt. triethylamine):methanol in a ratio of 100:18 to 100:20. The eluate was collected and the solvent was evaporated under reduced pressure to obtain 31.0 g of pure L-9 conjugating molecule product. 1H NMR (400 MHz, DMSO) δ 8.58 (d, J = 4.2 Hz, 1H), 7.94 - 7.82 (m, 3H), 7.41 - 7.29 (m, 5H ), 7.22 (d, J = 8.1 Hz, 5H), 6.89 (d, J = 8.3 Hz, 4H), 5.49 - 5.37 (m, 1H), 5.21 (d, J = 3.0 Hz, 3H), 4.97 (d, J = 11.1 Hz, 3H), 4.49 (d, J = 8.2 Hz, 3H), 4.02 (s , 9H), 3.88 (dd, J = 19.4, 9.4 Hz, 3H), 3.77 - 3.65 (m, 9H), 3.50 - 3.39 (m, 6H), 3.11 - 2.90 (m, 5H), 2.61 - 2.54 (m, 4H), 2.47 - 2.41 (m, 2H), 2.26 - 2.17 (m, 2H ), 2.15 - 1.95 (m, 22H), 1.92 - 1.84 (m, 9H), 1.80 - 1.70 (m, 10H), 1.65 - 1.35 (m , 17H), 1.31 - 1.19 (m, 4H), 0.96 (t, J = 7.1 Hz, 9H). MS m/z: C94H132N7O38 , [ M -DMTr] + , calculated: 1664.72, measured: 1665.03 .
(1-1-5) Синтез соединения L-10:(1-1-5) Synthesis of compound L-10:
На этой стадии получали соединение L-10 путем связывания конъюгирующей молекулы L-9 с твердофазной подложкой.At this stage, compound L-10 was prepared by coupling the conjugating molecule L-9 to a solid phase support.
Конъюгирующую молекулу L-9 (22,751 г, 11 ммоль), полученную на стадии (1-1-4), O-бензотриазол-1-ил-тетраметилурония гексафторфосфат (HBTU, 6,257 г, 16,5 ммоль) и диизопропилэтиламин (DIEA, 2,843 г, 22 ммоль) смешивали, растворяли в 900 мл ацетонитрила и перемешивали при комнатной температуре в течение 5 минут. К реакционному раствору добавляли аминометиловую смолу (88 г, 100-200 меш, содержание аминогрупп: 400 мкмоль/г, приобретена у Tianjin Nankai HECHENG S&T Co., Ltd.). Реакцию проводили на шейкере при 25°C и 150 об/мин в течение 18 часов с последующей фильтрацией. Остаток дважды промывали, каждый раз с помощью 300 мл DCM, и трижды промывали, каждый раз с помощью 300 мл ацетонитрила, и сушили в течение 18 часов с помощью вакуумного масляного насоса. Затем проводили реакцию кэпирования путем добавления исходных веществ (CapA, CapB, 4-диметиламинопиридина (DMAP) и ацетонитрила) в соответствии с соотношением, приведенным в таблице 2. Реакцию проводили на шейкере при 25°C и 150 об/мин в течение 5 часов. Реакционный раствор фильтровали. Остаток трижды промывали, каждый раз с помощью 300 мл ацетонитрила, растворитель выпаривали досуха и сушили смесь в течение ночи при пониженном давлении с помощью вакуумного масляного насоса с получением 102 г соединения L-10 (т. е. конъюгирующей молекулы L-9, связанной с твердофазной подложкой), с содержанием 90,8 мкмоль/г.The conjugating molecule L-9 (22.751 g, 11 mmol) obtained in step (1-1-4), O-benzotriazol-1-yl-tetramethyluronium hexafluorophosphate (HBTU, 6.257 g, 16.5 mmol) and diisopropylethylamine (DIEA, 2.843 g, 22 mmol) were mixed, dissolved in 900 ml of acetonitrile and stirred at room temperature for 5 minutes. Aminomethyl resin (88 g, 100-200 mesh, amino content: 400 μmol/g, purchased from Tianjin Nankai HECHENG S&T Co., Ltd.) was added to the reaction solution. The reaction was carried out on a shaker at 25°C and 150 rpm for 18 hours, followed by filtration. The residue was washed twice, each time with 300 ml DCM, and washed three times, each time with 300 ml acetonitrile, and dried for 18 hours using a vacuum oil pump. The capping reaction was then carried out by adding starting materials (CapA, CapB, 4-dimethylaminopyridine (DMAP) and acetonitrile) according to the ratio shown in Table 2. The reaction was carried out on a shaker at 25°C and 150 rpm for 5 hours. The reaction solution was filtered. The residue was washed three times, each time with 300 ml of acetonitrile, the solvent was evaporated to dryness and the mixture was dried overnight under reduced pressure using an oil vacuum pump to obtain 102 g of compound L-10 (i.e. the conjugating molecule L-9 bound to solid-phase support), with a content of 90.8 µmol/g.
Таблица 2. Соотношение исходных веществ в реакции кэпированияTable 2. Ratio of starting materials in the capping reaction
В приведенной выше таблице CapA и CapB представляют собой растворы кэпирующих агентов. CapA представляет собой 20 об.% раствор N-метилимидазола в смеси пиридин/ацетонитрил, где объемное отношение пиридина к ацетонитрилу составляет 3:5. CapB представляет собой 20 об.% раствор уксусного ангидрида в ацетонитриле.In the table above, CapA and CapB represent solutions of capping agents. CapA is a 20 vol.% solution of N-methylimidazole in a mixture of pyridine/acetonitrile, where the volume ratio of pyridine to acetonitrile is 3:5. CapB is a 20 vol.% solution of acetic anhydride in acetonitrile.
(1-2) Синтез смысловой цепи конъюгата 1(1-2) Synthesis of the sense strand of conjugate 1
Нуклеозидные мономеры последовательно связывали в направлении от 3’ к 5’ в соответствии с последовательностью расположения нуклеотидов в смысловой цепи методом твердофазного фосфоамидитного синтеза, циклы начинали с соединения L-10, полученного на вышеописанной стадии, для синтеза смысловой цепи SS конъюгата 1 из таблицы 3. Связывание каждого нуклеозидного мономера включало четырехстадийную реакцию снятия защиты, сочетания, кэпирования и окисления или сульфуризации. Когда два нуклеотида были связаны посредством фосфоэфира, четырехстадийную реакцию снятия защиты, сочетания, кэпирования и окисления проводили во время связывания следующего нуклеозидного мономера. Когда два нуклеотида были связаны посредством тиофосфата, четырехстадийную реакцию снятия защиты, сочетания, кэпирования и сульфуризации проводили во время связывания следующего нуклеозидного мономера. Условия синтеза были заданы следующим образом.Nucleoside monomers were sequentially conjugated in the 3' to 5' direction according to the sequence of nucleotides in the sense strand by solid-phase phosphoamidite synthesis, cycles starting with compound L-10 obtained in the above step to synthesize the sense strand SS conjugate 1 from Table 3. Binding of each nucleoside monomer involved a four-step reaction of deprotection, coupling, capping, and oxidation or sulfurization. When two nucleotides were linked via a phosphoester, a four-step reaction of deprotection, coupling, capping and oxidation was carried out during the binding of the next nucleoside monomer. When two nucleotides were linked via a thiophosphate, a four-step deprotection, coupling, capping, and sulfurization reaction was performed while the next nucleoside monomer was bound. The synthesis conditions were set as follows.
Нуклеозидные мономеры были предоставлены в 0,1 М растворе ацетонитрила. Условия реакции снятия защиты были идентичными на всех стадиях, т. е. температура 25°C, продолжительность проведения реакции 70 секунд, раствор дихлоруксусной кислоты в дихлорметане (3% об./об.) в качестве агента для снятия защиты и молярное отношение дихлоруксусной кислоты к 4,4'-диметокситритильной защитной группе на твердофазной подложке, равное 5:1.Nucleoside monomers were provided in 0.1 M acetonitrile solution. The deprotection reaction conditions were identical in all steps, i.e., temperature 25°C, reaction time 70 seconds, dichloroacetic acid solution in dichloromethane (3% v/v) as deprotecting agent and molar ratio of dichloroacetic acid to the 4,4'-dimethoxytrityl protecting group on a solid-phase support, equal to 5:1.
Условия реакции сочетания были идентичными на всех стадиях и включали температуру 25°C, молярное отношение последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой, к нуклеозидным мономерам, равное 1:10, молярное отношение последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой, к агенту реакции сочетания, равное 1:65, продолжительность проведения реакции 600 секунд и 0,5 М раствор 5-этилтио-1H-тетразола (ETT) в ацетонитриле в качестве агента реакции сочетания.The coupling reaction conditions were identical in all stages and included a temperature of 25°C, a molar ratio of the nucleic acid sequence bound to the solid phase support to nucleoside monomers of 1:10, a molar ratio of the nucleic acid sequence bound to the solid phase support to the coupling agent , equal to 1:65, reaction time of 600 seconds and 0.5 M solution of 5-ethylthio-1H-tetrazole (ETT) in acetonitrile as the coupling agent.
Условия реакции кэпирования были идентичными на всех стадиях и включали температуру 25°C и продолжительность проведения реакции 15 секунд. Кэпирующий агент представлял собой смешанный раствор Cap A и Cap B в молярном отношении 1:1, и молярное отношение кэпирующего агента к последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой, составляло 1:1:1 (ангидрид:N-метилимидазол:последовательность нуклеиновой кислоты, связанная с твердофазной подложкой).The capping reaction conditions were identical for all stages and included a temperature of 25°C and a reaction duration of 15 seconds. The capping agent was a mixed solution of Cap A and Cap B in a 1:1 molar ratio, and the molar ratio of the capping agent to the nucleic acid sequence bound to the solid phase support was 1:1:1 (anhydride:N-methylimidazole:nucleic acid sequence, associated with the solid-phase substrate).
Условия реакции окисления были идентичными на всех стадиях и включали температуру 25°C, продолжительность проведения реакции 15 секунд и 0,05 М иодную воду в качестве окисляющего агента. Молярное отношение иода к последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой на стадии сочетания, составляло 30:1. Реакцию проводили в смешанном растворителе, в котором отношение тетрагидрофуран:вода:пиридин составляло 3:1:1.The oxidation reaction conditions were identical for all stages and included a temperature of 25°C, a reaction time of 15 seconds, and 0.05 M iodine water as the oxidizing agent. The molar ratio of iodine to nucleic acid sequence bound to the solid phase support during the coupling step was 30:1. The reaction was carried out in a mixed solvent in which the ratio of tetrahydrofuran:water:pyridine was 3:1:1.
Условия реакции сульфуризации были идентичными на всех стадиях и включали температуру 25°C, продолжительность проведения реакции 300 секунд и гидрид ксантана в качестве агента для сульфуризации. Молярное отношение агента для сульфуризации к последовательности нуклеиновой кислоты, связанной с твердофазной подложкой на стадии сочетания, составляло 120:1. Реакцию проводили в смешанном растворителе, в котором отношение ацетонитрил: пиридин составляло 1:1.The sulfurization reaction conditions were identical in all stages and included a temperature of 25°C, a reaction time of 300 seconds, and xanthan hydride as the sulfurization agent. The molar ratio of sulfurization agent to nucleic acid sequence bound to the solid phase support in the coupling step was 120:1. The reaction was carried out in a mixed solvent in which the ratio of acetonitrile: pyridine was 1:1.
После связывания последнего нуклеозидного мономера последовательность нуклеиновой кислоты, связанную с твердофазной подложкой, отщепляли, снимали защиту, очищали и обессоливали, а затем лиофилизировали с получением смысловой цепи, гдеAfter binding of the last nucleoside monomer, the nucleic acid sequence bound to the solid phase support was cleaved, deprotected, purified and desalted, and then lyophilized to produce the sense strand, where
условия отщепления и снятия защиты были следующими: добавление синтезированной нуклеотидной последовательности, связанной с подложкой, в 25 мас.% водный раствор аммиака для проведения взаимодействия в течение 16 часов при 55°C, где количество водного раствора аммиака составляло 0,5 мл/мкмоль; фильтрация для удаления подложки и концентрирование супернатанта в вакууме досуха.The conditions for cleavage and deprotection were as follows: adding the synthesized nucleotide sequence bound to the support into a 25 wt.% aqueous ammonia solution to react for 16 hours at 55°C, where the amount of aqueous ammonia solution was 0.5 ml/μmol; filtration to remove the support and concentration of the supernatant in vacuo to dryness.
Условия очистки и обессоливания были следующими: очистка нуклеиновой кислоты с помощью колонки для препаративной ионообменной хроматографии (Source 15Q) с градиентным элюированием NaCl. В частности, элюент A: 20 мМ фосфат натрия (pH = 8,1), растворитель: вода/ацетонитрил = 9:1 (об./об.); элюент B: 1,5 М хлорид натрия, 20 мМ фосфат натрия (pH = 8,1), растворитель: вода/ацетонитрил = 9:1 (об./об.); градиент элюирования: элюент A:элюент B = от 100:0 до 50:50. Элюат собирали, объединяли и обессоливали, используя колонку для очистки методом обращенно-фазовой хроматографии. Конкретные условия включали использование колонки с Sephadex (наполнитель: Sephadex-G25) для обессоливания и деионизированной воды для элюирования.Purification and desalting conditions were as follows: nucleic acid purification using a preparative ion exchange chromatography column (Source 15Q) with NaCl gradient elution. Specifically, eluent A: 20 mM sodium phosphate (pH = 8.1), solvent: water/acetonitrile = 9:1 (v/v); eluent B: 1.5 M sodium chloride, 20 mM sodium phosphate (pH = 8.1), solvent: water/acetonitrile = 9:1 (v/v); elution gradient: eluent A:eluent B = 100:0 to 50:50. The eluate was collected, pooled and desalted using a reverse phase chromatography purification column. Specific conditions included using a Sephadex column (packing: Sephadex-G25) for desalting and deionized water for elution.
Метод обнаружения представлял собой следующий: определение чистоты вышеописанной смысловой цепи методом ионообменной хроматографии (ИОХ-ВЭЖХ); и анализ молекулярной массы методом жидкостной хроматографии с масс-спектрометрией (ЖХ-МС). Измеренное значение соответствовало рассчитанному значению, что свидетельствует о синтезировании смысловой цепи SS, конъюгированной с конъюгирующей молекулой L-9 на 3’-конце.The detection method was as follows: determination of the purity of the above-described sense chain by ion exchange chromatography (IOC-HPLC); and molecular weight analysis by liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS). The measured value was consistent with the calculated value, indicating the synthesis of the sense strand SS conjugated to the conjugating molecule L-9 at the 3′ end.
(1-3) Синтез антисмысловой цепи конъюгата 1(1-3) Synthesis of the antisense chain of conjugate 1
Антисмысловую цепь AS конъюгата 1 из таблицы 3 синтезировали, начиная циклы с использованием универсальной твердофазной подложки (твердофазные подложки NittoPhase®HL, загруженные UnyLinker™, Kinovate Life Sciences Inc.) в соответствии с методом твердофазного амидофосфитного синтеза. В методе твердофазного синтеза использовали те же условия проведения реакций снятия защиты, сочетания, кэпирования, окисления или сульфуризации, и те же условия отщепления и снятия защиты, очистки и обессоливания, как при синтезе смысловой цепи. Отличие заключалось в том, что антисмысловая цепь содержала 5’-фосфорную кислоту на первом нуклеотиде с 5’-конца. Поэтому в процессе получения антисмысловой цепи в соответствии с методом твердофазного амидофосфитного синтеза после связывания последнего нуклеозидного мономера антисмысловой цепи мономер CPR-I (Suzhou GenePharma, арт. № кат. № 13-2601-XX) был связан с 5’-концом антисмысловой цепи с образованием 5’-фосфоэфирной модификации посредством четырех стадий снятия защиты, сочетания, кэпирования и окисления.The antisense chain AS of conjugate 1 from Table 3 was synthesized by starting cycles using a universal solid-phase support (NittoPhase ® HL Solid-Phase Supports loaded with UnyLinker™, Kinovate Life Sciences Inc.) according to the solid-phase amidophosphite synthesis method. The solid-phase synthesis method used the same conditions for deprotection, coupling, capping, oxidation or sulfurization reactions, and the same conditions for elimination and deprotection, purification and desalting as for the synthesis of the sense chain. The difference was that the antisense strand contained a 5'-phosphoric acid at the first nucleotide at the 5' end. Therefore, in the process of preparing the antisense chain according to the solid-phase amidophosphite synthesis method, after binding the last nucleoside monomer of the antisense chain, the CPR-I monomer (Suzhou GenePharma, Part No. Cat. No. 13-2601-XX) was linked to the 5' end of the antisense chain with formation of a 5'-phosphoester modification through four steps of deprotection, coupling, capping and oxidation.
(CPR-I)(CPR-I)
Для этого связывания использовали те же условия проведения реакций снятия защиты, сочетания, кэпирования и окисления, и те же условия отщепления и снятия защиты, очистки и обессоливания, как при синтезе смысловой цепи. Остаток лиофилизировали с получением в результате антисмысловой цепи. Чистоту антисмысловой цепи определяли методом ионообменной хроматографии (ИОХ-ВЭЖХ), а молекулярную массу анализировали методом жидкостной хроматографии с масс-спектрометрией (ЖХ-МС). Измеренное значение соответствовало рассчитанному значению, что свидетельствует о синтезировании антисмысловой цепи AS, имеющей целевую последовательность.For this coupling, the same conditions for the deprotection, coupling, capping and oxidation reactions, and the same conditions for elimination and deprotection, purification and desalting, were used as for the synthesis of the sense chain. The residue was lyophilized to obtain the antisense chain. The purity of the antisense chain was determined by ion exchange chromatography (IOC-HPLC), and the molecular weight was analyzed by liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS). The measured value was consistent with the calculated value, indicating the synthesis of the antisense strand AS having the target sequence.
(1-4) Синтез конъюгата 1(1-4) Synthesis of conjugate 1
Смысловую цепь и антисмысловую цепь соответственно растворяли в воде для инъекций с получением раствора 40 мг/мл, смешивали в эквимолярном соотношении, нагревали при 50°C в течение 15 минут, а затем охлаждали при комнатной температуре, в результате чего получали отожженный продукт, а затем лиофилизировали с получением лиофилизированного порошка. Конъюгат разбавляли до концентрации 0,2 мг/мл сверхчистой водой (приготовленной с помощью установки для получения сверхчистой воды Milli-Q, с удельным сопротивлением 18,2 МОм*см (25°C)). Молекулярную массу измеряли методом жидкостной хроматографии с масс-спектрометрией (ЖХ-МС, прибор приобретен у Waters Corp., модель: LCT Premier). Поскольку измеренное значение соответствовало рассчитанному значению, было подтверждено, что синтезированный конъюгат 1 представлял собой целевую разработанную последовательность двухцепочечной нуклеиновой кислоты с конъюгирующей молекулой L-9. Структура конъюгата 1 соответсвовала представленной в Формуле (403), последовательность конъюгированной миРНК соответствует последовательности конъюгата 1 (т. е. L10-siC5a1M1SP), как показано в таблице 3.The sense strand and the antisense strand were respectively dissolved in water for injection to obtain a 40 mg/ml solution, mixed in an equimolar ratio, heated at 50°C for 15 minutes, and then cooled at room temperature, resulting in an annealed product, and then lyophilized to obtain lyophilized powder. The conjugate was diluted to a concentration of 0.2 mg/mL with ultrapure water (prepared using a Milli-Q ultrapure water unit with a resistivity of 18.2 MΩ*cm (25°C)). Molecular weight was measured by liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS, instrument purchased from Waters Corp., model: LCT Premier). Since the measured value was consistent with the calculated value, it was confirmed that the synthesized conjugate 1 was the target designed double-stranded nucleic acid sequence with the conjugating molecule L-9. The structure of conjugate 1 corresponded to that presented in Formula (403), the sequence of the conjugated siRNA corresponded to the sequence of conjugate 1 (i.e., L10-siC5a1M1SP), as shown in Table 3.
Пример получения 2. Получение конъюгатов 2-8Preparation example 2. Preparation of conjugates 2-8
Конъюгаты 2-6, представленные в таблице 3, синтезировали тем же способом, как в Примере получения 1, и определяли молекулярные массы. Отличие заключалось в том, что последовательности смысловых цепей и антисмысловых цепей, использованные в синтезе, представляли собой последовательности, представленные в таблице 3, соответствующие смысловым цепям и антисмысловым цепям конъюгированных миРНК в конъюгате 2, конъюгате 3, конъюгате 4, конъюгате 5 или конъюгате 6, соответственно, и в результате получили конъюгаты 2-6, соответственно.Conjugates 2-6, presented in Table 3, were synthesized in the same way as in Preparation Example 1, and the molecular weights were determined. The difference was that the sense and antisense sequences used in the synthesis were the sequences presented in Table 3, corresponding to the sense and antisense strands of the conjugated siRNAs in conjugate 2, conjugate 3, conjugate 4, conjugate 5, or conjugate 6. respectively, resulting in conjugates 2-6, respectively.
Конъюгаты 7-8, представленные в таблице 3, синтезировали тем же способом, как в Примере получения 1, и определяли молекулярные массы. Отличие заключалось в том, что последовательности смысловых цепей и антисмысловых цепей, использованные в синтезе, представляли собой последовательности, представленные в таблице 3, соответствующие смысловым цепям и антисмысловым цепям конъюгированных миРНК в конъюгате 7 или конъюгате 8, соответственно, при этом антисмысловые цепи конъюгата 7 и конъюгата 8 не имеют 5’-фосфорной кислоты на первых нуклеотидах с их 5’-концов по сравнению с антисмысловой цепью конъюгата 1. Следовательно, в процессе получения антисмысловых цепей в соответствии с методом твердофазного амидофосфитного синтеза нет необходимости связывать мономер CPR-I после связывания последнего нуклеозидного мономера антисмысловой цепи, с получением конъюгатов 7-8, соответственно.Conjugates 7-8 shown in Table 3 were synthesized in the same manner as in Preparation Example 1, and the molecular weights were determined. The difference was that the sense and antisense sequences used in the synthesis were the sequences presented in Table 3, corresponding to the sense and antisense strands of the conjugated siRNAs in conjugate 7 or conjugate 8, respectively, with the antisense strands of conjugate 7 and conjugate 8 do not have a 5'-phosphoric acid on the first nucleotides at their 5' ends compared to the antisense strand of conjugate 1. Therefore, in the process of preparing antisense strands according to the solid-phase amidophosphite synthesis method, there is no need to bind the CPR-I monomer after binding the latter nucleoside monomer of the antisense chain, obtaining conjugates 7-8, respectively.
В таблице 3 перечислены номера конъюгатов и составы последовательностей миРНК.Table 3 lists the conjugate numbers and siRNA sequence compositions.
Таблица 3. Конъюгаты миРНКTable 3. siRNA conjugates
Пример получения 3. Синтез последовательности миРНКPreparation example 3. Synthesis of siRNA sequence
миРНК 1, представленную в таблице 4a, синтезировали тем же способом, как в Примере получения 1, с тем отличием, что:siRNA 1 shown in Table 4a was synthesized in the same way as in Preparation Example 1, with the difference that:
1) для смысловой цепи циклы начинали с использованием универсальной твердофазной подложки (твердофазные подложки NittoPhase®HL, загруженные UnyLinker™, Kinovate Life Sciences Inc.); и1) for the sense strand, cycles were started using a universal solid phase support (NittoPhase ® HL solid phase supports loaded with UnyLinker™, Kinovate Life Sciences Inc.); And
2) для антисмысловой цепи, по сравнению с последовательностью антисмысловой цепи миРНК, конъюгированной в конъюгате 1, первый нуклеотид на 5’-конце миРНК 1 не содержал 5’-фосфорную кислоту. Следовательно, в процессе получения антисмысловых цепей в соответствии с методом твердофазного амидофосфитного синтеза не было необходимости связывать мономер CPR-I после связывания последнего нуклеозидного мономера антисмысловой цепи.2) for the antisense strand, compared to the sequence of the antisense strand of siRNA conjugated in conjugate 1, the first nucleotide at the 5' end of siRNA 1 did not contain 5' phosphoric acid. Therefore, in the process of preparing antisense chains according to the solid-phase amidophosphite synthesis method, it was not necessary to bind the CPR-I monomer after binding the last nucleoside monomer of the antisense chain.
Таким образом была получена миРНК 1.Thus, siRNA 1 was obtained.
миРНК 2-6 синтезировали тем же способом, что и миРНК 1, с тем отличием, что последовательности смысловых цепей и антисмысловых цепей миРНК, используемых в синтезе, представляли собой последовательности, представленные в таблице 4, соответствующие смысловым цепям и антисмысловым цепям миРНК 2, миРНК 3, миРНК 4, миРНК 5 или миРНК 6, соответственно, и в результате получили миРНК 2-6, соответственно.miRNA 2-6 were synthesized in the same way as miRNA 1, with the difference that the sequences of the sense strands and antisense strands of the siRNA used in the synthesis were the sequences presented in Table 4, corresponding to the sense strands and antisense strands of siRNA 2, siRNA 3, miRNA 4, miRNA 5, or miRNA 6, respectively, resulting in miRNAs 2–6, respectively.
В таблице 4a перечислены номера миРНК и составы последовательностей миРНК.Table 4a lists the miRNA numbers and miRNA sequence compositions.
Таблица 4a. Последовательности миРНКTable 4a. miRNA sequences
Пример получения 4. Синтез конъюгатов Cy5-меченых миРНК и Cy5-меченых миРНКPreparation example 4. Synthesis of Cy5-labeled siRNA and Cy5-labeled siRNA conjugates
(4-1) Синтез Cy5-конъюгата 1 и Cy5-конъюгата 2(4-1) Synthesis of Cy5-conjugate 1 and Cy5-conjugate 2
Cy5-конъюгат 1, представленный в таблице 4b, синтезировали тем же способом, как в Примере получения 1, и определяли молекулярную массу. Отличие заключалось в том, что последовательности смысловой цепи и антисмысловой цепи, использованные в синтезе, представляли собой последовательности, представленные в таблице 4b, соответствующие смысловой цепи и антисмысловой цепи миРНК, конъюгированной в Cy5-конъюгате 1, при этом (1): флуоресцентная группа Cy5 была ковалентно связана с 5’-концом смысловой цепи миРНК, конъюгированной в Cy5-конъюгате 1. Следовательно, в процессе получения смысловой цепи в соответствии с методом твердофазного амидофосфитного синтеза, описанным на стадии (1-2) Примера получения 1, после связывания последнего нуклеозидного мономера смысловой цепи необходимо было связать мономер амидофосфитного производного Cy5 (приобретен у Shanghai HonGene Biotech, арт. № OP-057) с 5’-концом смысловой цепи посредством четырехстадийной реакции снятия защиты, сочетания, кэпирования и окисления; и (2) первый нуклеотид на 5’-конце миРНК, конъюгированной в Cy5-конъюгате 1, не содержал 5’-фосфорной кислоты; следовательно, в процессе получения антисмысловых цепей в соответствии с методом твердофазного амидофосфитного синтеза, описанным на стадии (1-3) Примера получения 1, не было необходимости связывать мономер CPR-I после связывания последнего нуклеозидного мономера антисмысловой цепи.Cy5 conjugate 1 shown in Table 4b was synthesized in the same manner as in Preparation Example 1, and the molecular weight was determined. The difference was that the sense strand and antisense strand sequences used in the synthesis were the sequences shown in Table 4b, corresponding to the sense strand and antisense strand of the siRNA conjugated in Cy5-conjugate 1, wherein (1): Cy5 fluorescent group was covalently linked to the 5' end of the siRNA sense strand conjugated in Cy5-conjugate 1. Therefore, in the process of preparing the sense strand according to the solid-phase amidophosphite synthesis method described in step (1-2) of Preparation Example 1, after binding the last nucleoside of the sense strand monomer, it was necessary to link the Cy5 amidophosphite derivative monomer (purchased from Shanghai HonGene Biotech, Part No. OP-057) to the 5' end of the sense strand through a four-step reaction of deprotection, coupling, capping, and oxidation; and (2) the first nucleotide at the 5′ end of the siRNA conjugated in Cy5-conjugate 1 did not contain 5′-phosphoric acid; therefore, in the process of preparing antisense chains according to the solid-phase amidophosphite synthesis method described in step (1-3) of Preparation Example 1, it was not necessary to bind the CPR-I monomer after binding the last nucleoside monomer of the antisense chain.
(мономер амидофосфитного производного Cy5)(monomer of amidophosphite derivative Cy5)
В процессе связывания мономера амидофосфитного производного Cy5 с 5’-концом смысловой цепи использовали те же условия проведения реакций снятия защиты, сочетания, кэпирования и окисления, как описано для синтеза смысловой цепи на стадии (1-2) Примера получения 1, и отличия заключались в том, что: 1) продолжительность проведения реакции снятия защиты была увеличена до 300 секунд; и 2) продолжительность проведения реакции сочетания Cy5 была увеличена до 900 секунд.In the process of binding the Cy5 amidophosphite derivative monomer to the 5' end of the sense strand, the same deprotection, coupling, capping and oxidation reaction conditions were used as described for the synthesis of the sense strand in step (1-2) of Preparation Example 1, and the differences were that: 1) the duration of the deprotection reaction was increased to 300 seconds; and 2) the duration of the Cy5 coupling reaction was increased to 900 seconds.
Затем, условия отщепления и снятия защиты со смысловой цепи были следующими: добавление синтезированной нуклеотидной последовательности, связанной с подложкой, в раствор AMA (смешанный раствор 40 мас.% водного раствора метиламина и 25 мас.% водного раствора аммиака в объемном отношении 1:1), где количество раствора AMA составляло 0,5 мл/мкмоль, проведение взаимодействия в течение 2 часов на водяной бане при 25°C, удаление оставшейся подложки фильтрацией и концентрирование супернатанта досуха в вакууме. Условия очистки и обессоливания смысловой цепи были такими же, как при синтезе смысловой цепи на стадии (1-2) в Примере получения 1. Затем остаток лиофилизировали с получением смысловой цепи Cy5-конъюгата 1.Then, the conditions for cleavage and deprotection of the sense strand were as follows: adding the synthesized nucleotide sequence bound to the support into the AMA solution (mixed solution of 40 wt.% aqueous methylamine solution and 25 wt.% aqueous ammonia solution in a 1:1 volume ratio) , where the amount of AMA solution was 0.5 ml/μmol, reacting for 2 hours in a water bath at 25°C, removing the remaining support by filtration and concentrating the supernatant to dryness in vacuum. The conditions for purification and desalting of the sense strand were the same as those for the synthesis of the sense strand in step (1-2) in Preparation Example 1. The residue was then lyophilized to obtain the sense strand of Cy5-conjugate 1.
Таким образом, был получен Cy5-конъюгат 1, и флуоресцентная группа Cy5 была ковалентно связана с 5’-концом смысловой цепи миРНК в составе конъюгата миРНК, которая имела последовательности смысловой цепи и антисмысловой цепи, представленные в таблице 4b, соответствующие Cy5-конъюгату 1.Thus, Cy5-conjugate 1 was obtained, and the Cy5 fluorescent group was covalently linked to the 5' end of the siRNA sense strand in the siRNA conjugate, which had the sense strand and antisense strand sequences shown in Table 4b, corresponding to Cy5-conjugate 1.
Cy5-конъюгат 2 получали тем же способом, что и Cy5-конъюгат 1, и определяли молекулярную массу. Отличие заключалось в том, что последовательности смысловых цепей и антисмысловых цепей, использованные в синтезе, представляли собой последовательности, представленные в таблице 4b, соответствующие смысловой цепи и антисмысловой цепи миРНК, конъюгированных в Cy5-конъюгате 2, соответственно, и в результате получили Cy5-конъюгат 2.Cy5-conjugate 2 was prepared in the same manner as Cy5-conjugate 1, and the molecular weight was determined. The difference was that the sense strand and antisense strand sequences used in the synthesis were the sequences shown in Table 4b, corresponding to the sense strand and antisense strand of the siRNA conjugated in Cy5-conjugate 2, respectively, resulting in the Cy5-conjugate 2.
(4-2) Синтез Cy5-миРНК 1 и Cy5-миРНК 2(4-2) Synthesis of Cy5-siRNA 1 and Cy5-siRNA 2
Cy5-миРНК 1 получали тем же способом, что и Cy5-конъюгат 1, и определяли молекулярную массу. Отличие заключалось в том, что циклы начинали с использованием универсальной твердофазной подложки (твердофазные подложки NittoPhase®HL, загруженные UnyLinker™, Kinovate Life Sciences Inc.), и в результате получили Cy5-миРНК 1.Cy5-siRNA 1 was prepared in the same manner as Cy5-conjugate 1, and the molecular weight was determined. The difference was that the runs were started using a universal solid-phase support (NittoPhase ® HL Solid-Phase Supports loaded with UnyLinker™, Kinovate Life Sciences Inc.) and resulted in Cy5-miRNA 1.
Cy5-миРНК 2 получали тем же способом, что и Cy5-миРНК 1, и определяли молекулярную массу. Отличие заключалось в том, что последовательности смысловых цепей и антисмысловых цепей, использованные в синтезе, представляли собой последовательности, представленные в таблице 4b, соответствующие смысловой цепи и антисмысловой цепи Cy5-миРНК, соответственно, и в результате получили Cy5-миРНК 2.Cy5-siRNA 2 was prepared in the same manner as Cy5-siRNA 1, and the molecular weight was determined. The difference was that the sequences of the sense strands and antisense strands used in the synthesis were the sequences shown in Table 4b, corresponding to the sense strand and antisense strand of Cy5-siRNA, respectively, resulting in Cy5-siRNA 2.
В таблице 4b перечислены номера и последовательности миРНК Cy5-конъюгата 1, Cy5-конъюгата 2, Cy5-миРНК 1 и Cy5-миРНК 2.Table 4b lists the siRNA numbers and sequences of Cy5-conjugate 1, Cy5-conjugate 2, Cy5-siRNA 1, and Cy5-siRNA 2.
Таблица 4b. Последовательности миРНК в конъюгатах Cy5-меченых миРНК и Cy5-меченых миРНКTable 4b. Sequences of siRNAs in conjugates of Cy5-labeled siRNAs and Cy5-labeled siRNAs
Экспериментальный пример 1. Определение IC50 конъюгата миРНК в отношении мРНК C5 в клетках HepG2Experimental Example 1: Determination of IC 50 of siRNA conjugate against C5 mRNA in HepG2 cells
Клетки HepG2 (приобретенные у Nanjing COBIOER Biotechnology Co., Ltd.) культивировали в полной среде H-DMEM (от компании HyClone), содержащей 10% фетальной бычьей сыворотки (FBS, от компании RMBIO) и 0,2 об.% пенициллин-стрептомицина (от компании HyClone), при 37°C в инкубаторе, содержащем 5% CO2/95% воздуха.HepG2 cells (purchased from Nanjing COBIOER Biotechnology Co., Ltd.) were cultured in complete H-DMEM (from HyClone) containing 10% fetal bovine serum (FBS, from RMBIO) and 0.2 vol% penicillin-streptomycin. (from HyClone), at 37°C in an incubator containing 5% CO 2 /95% air.
Клетки HepG2 высевали в 24-луночный планшет из расчета 7x104 клеток/лунка. Через 16 часов, когда конфлюэнтность клеток достигла 70-80%, из культуральных лунок аспирировали полную среду H-DMEM и добавляли в каждую лунку 500 мкл среды Opti-MEM (от компании GIBCO) для продолжения культивирования в течение 1,5 часов.HepG2 cells were seeded in a 24-well plate at a rate of 7x10 4 cells/well. After 16 hours, when the cells reached 70-80% confluency, complete H-DMEM medium was aspirated from the culture wells and 500 μl of Opti-MEM medium (from GIBCO) was added to each well to continue culture for 1.5 hours.
Из каждого из конъюгата 1, конъюгата 2, конъюгата 3, конъюгата 4, конъюгата 5, конъюгата 6, конъюгата 7 и конъюгата 8 готовили рабочие растворы конъюгата с 7 различными концентрациями, включавшими 20 мкМ, 5 мкМ, 1,25 мкМ, 0,313 мкМ, 0,0781 мкМ, 0,0195 мкМ и 0,0049 мкМ (в пересчете на миРНК), в обработанной ДЭПК (диэтилпирокарбонатом) воде, соответственно.From each of conjugate 1, conjugate 2, conjugate 3, conjugate 4, conjugate 5, conjugate 6, conjugate 7 and conjugate 8, working solutions of the conjugate were prepared with 7 different concentrations, including 20 μM, 5 μM, 1.25 μM, 0.313 μM, 0.0781 µM, 0.0195 µM and 0.0049 µM (in terms of siRNA), in DEPC (diethyl pyrocarbonate) treated water, respectively.
Для каждого конъюгата готовили раствор A1-A7, и каждый раствор содержал 3 мкл рабочего раствора конъюгата с 7 концентрациями, как показано выше, и 50 мкл среды Opti-MEM.For each conjugate, solution A1-A7 was prepared, and each solution contained 3 μl of conjugate working solution with 7 concentrations as shown above and 50 μl of Opti-MEM medium.
Отдельно готовили раствор B для каждого конъюгата, и каждый раствор B содержал 1 мкл Lipofectamine™ 2000 и 50 мкл среды Opti-MEM.Solution B was prepared separately for each conjugate, and each solution B contained 1 μl of Lipofectamine™ 2000 and 50 μl of Opti-MEM medium.
Для каждого конъюгата последовательно смешивали одну порцию раствора B с одной порцией раствора A1-A7, а затем инкубировали в течение 20 минут при комнатной температуре для получения трансфекционных комплексов X1-X7. Для каждого трансфекционного комплекса готовили две порции.For each conjugate, one portion of solution B was mixed sequentially with one portion of solution A1-A7, and then incubated for 20 minutes at room temperature to obtain transfection complexes X1-X7. Two portions were prepared for each transfection complex.
Одну порцию раствора B смешивали с 50 мкл среды Opti-MEM и инкубировали в течение 20 минут при комнатной температуре для получения трансфекционного комплекса X8. Готовили четыре порции трансфекционного комплекса.One portion of solution B was mixed with 50 μl of Opti-MEM medium and incubated for 20 minutes at room temperature to obtain the X8 transfection complex. Four portions of the transfection complex were prepared.
Трансфекционные комплексы X1-X7, соответствующие каждому из конъюгатов, добавляли в вышеуказанные культуральные лунки для культивирования клеток HepG2 из расчета 100 мкл/лунка и равномерно перемешивали с получением трансфекционных смесей с конечными концентрациями (в пересчете на миРНК) 100 нМ, 25 нМ, 6,25 нМ, 1,56 нМ, 0,391 нМ, 0,098 нМ и 0,024 нМ, соответственно. Два трансфекционных комплекса X1-X7 с одинаковой концентрацией добавляли в две разные культуральные лунки для получения трансфекционных смесей, содержащих конъюгаты, которые были помечены как тестовые группы 1-7.Transfection complexes X1-X7 corresponding to each of the conjugates were added to the above culture wells for culturing HepG2 cells at a rate of 100 μl/well and mixed evenly to obtain transfection mixtures with final concentrations (in terms of siRNA) of 100 nM, 25 nM, 6. 25 nM, 1.56 nM, 0.391 nM, 0.098 nM and 0.024 nM, respectively. Two transfection complexes X1-X7 at the same concentration were added to two different culture wells to obtain transfection mixtures containing conjugates that were labeled test groups 1-7.
В остальные четыре культуральные лунки добавляли одну порцию трансфекционного комплекса X8 из расчета 100 мкл/лунка для получения трансфекционной смеси без конъюгата, которая была помечена как контрольная группа.One portion of X8 transfection complex was added to the remaining four culture wells at a rate of 100 μl/well to obtain a transfection mixture without conjugate, which was labeled as the control group.
После инкубации трансфекционной смеси, содержащей конъюгат, и трансфекционной смеси без конъюгата с клетками в культуральных лунках в течение 4 часов в каждую лунку вносили добавку 1 мл полной среды H-DMEM, содержащей 20% FBS. 24-луночный планшет помещали в инкубатор, содержащий 5% CO2/95% воздуха, на 24 часа.After incubation of the transfection mixture containing the conjugate and the transfection mixture without the conjugate with cells in culture wells for 4 hours, 1 ml of complete H-DMEM containing 20% FBS was added to each well. The 24-well plate was placed in an incubator containing 5% CO 2 /95% air for 24 hours.
Затем использовали RNAVzol (приобретен у Vigorous Biotechnology Beijing Co., Ltd., арт. № N002) для выделения тотальной РНК из клеток в каждой лунке в соответствии с этапами процесса выделения тотальной РНК в инструкции по применению.Then, RNAVzol (purchased from Vigorous Biotechnology Beijing Co., Ltd., Item No. N002) was used to extract total RNA from the cells in each well according to the total RNA extraction process steps in the instructions for use.
В качестве матрицы для обратной транскрипции для клеток в каждой лунке брали 1 мкг тотальной РНК и использовали реагенты из набора для проведения обратной транскрипции Goldenstar™ RT6 cDNA Synthesis Kit (приобретен у Beijing Tsingke Biotechnology Co., Ltd., арт. № TSK301M), в котором в качестве праймера был выбран Goldenstar™ Oligo (dT)17, и готовили 20 мкл реакционной системы для обратной транскрипции в соответствии с этапами процесса проведения обратной транскрипции в инструкции к набору, для ревертирования тотальной РНК клеток из каждой лунки. Условия проведения реакции обратной транскрипции были следующими: реакционную систему для обратной транскрипции инкубировали при 50°C в течение 50 минут, затем инкубировали при 85°C в течение 5 минут и, наконец, инкубировали при 4°C в течение 30 секунд. После проведения реакции в реакционную систему для обратной транскрипции добавляли 80 мкл обработанной ДЭПК воды для получения раствора, содержащего кДНК.1 μg of total RNA was taken as a template for reverse transcription for cells in each well and reagents from the Goldenstar™ RT6 cDNA Synthesis Kit (purchased from Beijing Tsingke Biotechnology Co., Ltd., item no. TSK301M) were used. using Goldenstar™ Oligo (dT) 17 as the primer, and 20 μl of the reverse transcription reaction system was prepared according to the reverse transcription process steps in the kit instructions to reverse the total cell RNA from each well. The reverse transcription reaction conditions were as follows: the reverse transcription reaction system was incubated at 50°C for 50 minutes, then incubated at 85°C for 5 minutes, and finally incubated at 4°C for 30 seconds. After the reaction, 80 μL of DEPC-treated water was added to the reverse transcription reaction system to obtain a solution containing cDNA.
Для каждой реакционной системы для обратной транскрипции в качестве матрицы для кПЦР брали 5 мкл раствора, содержащего кДНК, и готовили 20 мкл реакционной системы для кПЦР, используя реагент из набора NovoStart® SYBR qPCR SuperMix Plus (приобретен у Novoprotein Science and Technology Co., Ltd., арт. № E096-01B), где последовательности ПЦР-праймеров для амплификации гена-мишени C5 и гена GAPDH внутреннего контроля представлены в таблице 5, и конечная концентрация каждого праймера составляла 0,25 мкМ. Реакционную систему для кПЦР помещали на прибор для проведения ПЦР в реальном времени StepOnePlus от ABI и проводили трехэтапный процесс амплификации. Процедура амплификации включала предварительную денатурацию при 95°С в течение 10 минут, затем денатурацию при 95°С в течение 30 секунд, отжиг при 60°С в течение 30 секунд и элонгацию при 72°С в течение 30 секунд. После 40-кратного повторения вышеуказанных процессов денатурации, отжига и элонгации был получен продукт W, содержащий амплифицированный ген-мишень C5 и ген GAPDH внутреннего контроля. Затем продукт W поочередно инкубировали при 95°C в течение 15 секунд, 60°C в течение 1 минуты и 95°C в течение 15 секунд. Кривые плавления гена-мишени C5 и гена GAPDH внутреннего контроля в продукте W регистрировали с помощью количественной ПЦР в реальном времени с флуоресцентным детектированием, и получали значения Ct (пороговое число циклов) для гена-мишени C5 и гена GAPDH внутреннего контроля.For each reverse transcription reaction system, 5 μL of solution containing cDNA was taken as a qPCR template, and 20 μL of qPCR reaction system was prepared using the reagent from the NovoStart ® SYBR qPCR SuperMix Plus kit (purchased from Novoprotein Science and Technology Co., Ltd ., art. No. E096-01B), where the sequences of PCR primers for amplification of the target gene C5 and the internal control GAPDH gene are presented in Table 5, and the final concentration of each primer was 0.25 μM. The qPCR reaction system was placed on ABI's StepOnePlus real-time PCR instrument and a three-step amplification process was performed. The amplification procedure included pre-denaturation at 95°C for 10 minutes, then denaturation at 95°C for 30 seconds, annealing at 60°C for 30 seconds, and elongation at 72°C for 30 seconds. After repeating the above denaturation, annealing, and elongation processes 40 times, product W was obtained containing the amplified C5 target gene and the internal control GAPDH gene. Product W was then alternately incubated at 95°C for 15 seconds, 60°C for 1 minute and 95°C for 15 seconds. The melting curves of the C5 target gene and the internal control GAPDH gene in product W were recorded by quantitative real-time PCR with fluorescence detection, and the Ct (cycle threshold) values for the C5 target gene and the internal control GAPDH gene were obtained.
Таблица 5. Последовательности праймеров для определенияTable 5. Primer sequences for detection
(SEQ ID NO: 387)GGTCGGAGTCAACGGATTT
(SEQ ID NO: 387)
(SEQ ID NO: 388)CCAGCATCGCCCCACTTGA
(SEQ ID NO: 388)
Сравнительный метод оценки Ct (ΔΔCt) использовали для относительной количественной оценки экспрессии гена-мишени C5 в каждой тестовой группе и контрольной группе. Метод расчета был следующим:The comparative Ct estimation method (ΔΔCt) was used to relative quantify C5 target gene expression in each test group and control group. The calculation method was as follows:
ΔCt (тестовая группа) = Ct (ген-мишень тестовой группы) - Ct (ген внутреннего контроля тестовой группы)ΔCt (test group) = Ct (target gene of the test group) - Ct (internal control gene of the test group)
ΔCt (контрольная группа) = Ct (ген-мишень контрольной группы) - Ct (ген внутреннего контроля контрольной группы)ΔCt (control group) = Ct (target gene of control group) - Ct (internal control gene of control group)
ΔΔCt (тестовая группа) = ΔCt (тестовая группа) - ΔCt (контрольная группа)ΔΔCt (test group) = ΔCt (test group) - ΔCt (control group)
ΔΔCt (контрольная группа) = ΔCt (контрольная группа) - ΔCt (среднее значение контрольной группы)ΔΔCt (control group) = ΔCt (control group) - ΔCt (control group mean)
где ΔCt (среднее значение контрольной группы) представляло собой среднее арифметическое значение ΔCt (контрольной группы) каждой из четырех культуральных лунок контрольной группы. Таким образом, каждая культуральная лунка каждой тестовой группы соответствовала одной ΔΔCt (тестовая группа), и каждая культуральная лунка контрольной группы соответствовала одной ΔΔCt (контрольная группа).where ΔCt (control group mean) was the arithmetic mean of the ΔCt (control group) value of each of the four culture wells of the control group. Thus, each culture well of each test group corresponded to one ΔΔCt (test group), and each culture well of the control group corresponded to one ΔΔCt (control group).
Уровень экспрессии мРНК C5 в тестовой группе нормировали относительно контрольной группы, где уровень экспрессии мРНК C5 в контрольной группе был принят за 100%.The level of C5 mRNA expression in the test group was normalized relative to the control group, where the level of C5 mRNA expression in the control group was taken as 100%.
Относительный уровень экспрессии мРНК C5 в тестовой группе = 2^ (-ΔΔCt (тестовая группа)) × 100%.Relative expression level of C5 mRNA in test group = 2^(-ΔΔCt(test group)) × 100%.
На основании относительного уровня экспрессии мРНК C5 в клетках HepG2, трансфицированных разными конъюгатами (конъюгаты 1-8), были получены кривые «доза-эффект» для конъюгатов 1-8, как показано на ФИГ. 1A-1H, путем аппроксимации трехпараметрической моделью «log(inhibitor) vs. response» с помощью программного обеспечения Graphpad 5.0, где логарифм (lg нМ) конечной концентрации конъюгата миРНК откладывали по оси абсцисс, а относительный уровень экспрессии (%) мРНК C5 откладывали по оси ординат, и каждая точка представляла собой среднее значение относительного уровня экспрессии мРНК C5 в двух культуральных лунках тестовой группы по сравнению с контрольной группой.Based on the relative expression levels of C5 mRNA in HepG2 cells transfected with different conjugates (conjugates 1-8), dose-response curves were generated for conjugates 1-8 as shown in FIG. 1A-1H, by approximation with a three-parameter model “log(inhibitor) vs. response" using Graphpad 5.0 software, where the logarithm (lg nM) of the final concentration of siRNA conjugate was plotted on the x-axis, and the relative expression level (%) of C5 mRNA was plotted on the y-axis, and each point represented the average value of the relative expression level of C5 mRNA in two culture wells of the test group compared to the control group.
IC50 каждого конъюгата в отношении мРНК C5 рассчитывали на основании функции, соответствующей аппроксимированной кривой «доза-эффект», где функция представляла собой следующую:The IC 50 of each conjugate against C5 mRNA was calculated based on the function corresponding to the fitted dose-response curve, where the function was as follows:
где:Where:
Y представляет собой относительный уровень экспрессии мРНК C5 тестовой группы,Y represents the relative expression level of C5 mRNA of the test group,
X представляет собой логарифм конечной концентрации конъюгата миРНК,X is the logarithm of the final siRNA conjugate concentration,
Bot представляет собой значение Y в нижней области плато,Bot represents the Y value in the lower plateau region,
Top представляет собой значение Y в верхней области плато, иTop represents the Y value at the top plateau region, and
X' представляет собой значение X, при котором Y представляет собой медианное значение между низом и верхом асимптоты, а HillSlope (угловой коэффициент Хилла) представляет собой наклон кривой при X', который в данном случае определен как -1.X' is the value of X where Y is the median value between the bottom and top of the asymptote, and HillSlope is the slope of the curve at X', which in this case is defined as -1.
На основе кривой «доза-эффект» и соответствующей функции было определено соответствующее значение X50, когда Y=50%, и было рассчитано значение IC50 каждого конъюгата, составившее 10^X50 (нМ).Based on the dose-response curve and the corresponding function, the corresponding X50 value when Y=50% was determined, and the IC50 value of each conjugate was calculated to be 10^ X50 (nM).
Значение IC50 в отношении мРНК C5 и значение R2 аппроксимированной кривой для каждого конъюгата обобщенно представлены в таблице 6.The IC 50 value for C5 mRNA and the curve fit R 2 value for each conjugate are summarized in Table 6.
Таблица 6. Значение IC50 в отношении мРНК C5 и значение R2 аппроксимированной кривой «доза-эффект» для конъюгата миРНКTable 6. IC 50 value for C5 mRNA and R 2 value of the fitted dose-response curve for the siRNA conjugate
Из результатов на ФИГ. 1A-1H и в таблице 6 выше можно видеть, что конъюгат миРНК согласно настоящему изобретению обладает высокой ингибирующей активностью в клетках гепатомы HepG2 in vitro, и IC50 составляет от 1,494 нМ до 9,688 нМ.From the results in FIG. 1A-1H and Table 6 above, it can be seen that the siRNA conjugate of the present invention has high inhibitory activity in HepG2 hepatoma cells in vitro, and the IC 50 ranges from 1.494 nM to 9.688 nM.
Экспериментальный пример 2. Распределение конъюгатов миРНК по различным органам мышей C57Experimental Example 2: Distribution of siRNA conjugates to various organs of C57 mice
Использовали 1 × раствор PBS для растворения соответственно Cy5-миРНК 1, Cy5-конъюгата 1, Cy5-миРНК 2 или Cy5-конъюгата 2 с получением раствора 0,6 мг/мл (в пересчете на миРНК).A 1× PBS solution was used to dissolve Cy5-siRNA 1, Cy5-conjugate 1, Cy5-siRNA 2, or Cy5-conjugate 2, respectively, to obtain a solution of 0.6 mg/ml (in terms of siRNA).
Десять самок мышей C57BL/6J возрастом 6-7 недель (приобретенных у Beijing Charles River Laboratory Animal Technology Co., Ltd., для краткости называемых мышами C57) случайным образом разделяли на группы, по две мыши в каждой группе, и подкожно вводили им соответственно 1 × PBS и раствор Cy5-миРНК 1, Cy5-конъюгата 1, Cy5-миРНК 2 или Cy5-конъюгата 2, полученный выше. Вводимые дозы для всех животных рассчитывали в соответствии с их массой тела, а объем введения составлял 5 мл/кг массы тела. В пересчете на миРНК вводимая доза для каждого животного составляла 3 мг/кг массы тела.Ten 6-7 week old female C57BL/6J mice (purchased from Beijing Charles River Laboratory Animal Technology Co., Ltd., called C57 mice for short) were randomly divided into groups, two mice in each group, and subcutaneously injected accordingly 1 × PBS and a solution of Cy5-siRNA 1, Cy5-conjugate 1, Cy5-siRNA 2 or Cy5-conjugate 2 obtained above. The administered doses for all animals were calculated according to their body weight, and the administration volume was 5 ml/kg body weight. In terms of siRNA, the administered dose for each animal was 3 mg/kg body weight.
Через 2 часа, 6 часов, 24 часа и 48 часов после введения мышей каждой группы помещали в систему оптической визуализации in vivo IVIS Lumina Series III для мелких животных. Мышам проводили ингаляционную анестезию изофлураном и под воздействием анестезии помещали их для визуализации in vivo животом вверх в систему оптической визуализации in vivo для мелких животных для динамического обнаружения сигналов флуоресценции Cy5 и отслеживания распределения Cy5-меченых миРНК или Cy5-меченых конъюгатов у живых животных. Только мыши, которым вводили Cy5-меченые конъюгаты, имели значительно повышенные флуоресцентные сигналы в области их печени, а мыши, которым вводили Cy5-меченые миРНК или 1 × PBS, не имели какого-либо флуоресцентного сигнала в области их печени.At 2 hours, 6 hours, 24 hours, and 48 hours after administration, mice in each group were placed in the IVIS Lumina Series III small animal in vivo optical imaging system. Mice were inhaled with isoflurane anesthesia and placed under anesthesia for in vivo imaging, belly up, in a small animal in vivo optical imaging system to dynamically detect Cy5 fluorescence signals and monitor the distribution of Cy5-labeled siRNAs or Cy5-labeled conjugates in live animals. Only mice injected with Cy5-labeled conjugates had significantly increased fluorescent signals in their liver region, and mice injected with Cy5-labeled siRNA or 1× PBS did not have any fluorescent signal in their liver region.
Через 48 часов всех мышей умерщвляли, и извлекали пять органов каждой мыши, включая сердце, легкие, печень, селезенку и почки, для флуоресцентной визуализации в IVIS Lumina Series III. Из каждой группы мышей выбирали одно животное и располагали его вышеупомянутые пять органов поочередно в продольном направлении. Органы мышей, которым вводили 1 × PBS, или Cy5-миРНК 1, или Cy5-конъюгат 1, фотографировали в одном и том же поле зрения, и результаты показаны на ФИГ. 2A. Органы мышей, которым вводили 1 × PBS и Cy5-миРНК 2 или Cy5-конъюгат 2, фотографировали в одном и том же поле зрения, и результаты показаны на ФИГ. 2B.After 48 hours, all mice were sacrificed, and five organs from each mouse, including the heart, lungs, liver, spleen, and kidneys, were removed for fluorescence imaging on the IVIS Lumina Series III. One animal was selected from each group of mice and its above-mentioned five organs were arranged alternately in the longitudinal direction. Organs from mice treated with 1× PBS or Cy5-siRNA 1 or Cy5-conjugate 1 were photographed in the same field of view, and the results are shown in FIG. 2A. Organs of mice injected with 1× PBS and Cy5-siRNA 2 or Cy5-conjugate 2 were photographed in the same field of view, and the results are shown in FIG. 2B.
Из ФИГ. 2A-2B можно видеть, что только Cy5-конъюгат 1 и Cy5-конъюгат 2 способны накапливаться в большом количестве в печени, и Cy5-конъюгат 1 и Cy5-конъюгат 2 в небольшом количестве накоплены в почке, но не накоплены в других органах, что свидетельствует о том, что конъюгат согласно настоящему изобретению способен эффективную доставлять миРНК непосредственно в печень. Кроме того, в сочетании с результатами на ФИГ. 1G (демонстрирующими, что конъюгат 7 обладает более высокой ингибирующей активностью in vitro) и ФИГ. 1F (демонстрирующими, что конъюгат 6 обладает более высокой ингибирующей активностью in vitro), это говорит о том, что конъюгат согласно настоящему изобретению способен специфично ингибировать экспрессию гена-мишени в печени.From FIG. 2A-2B, it can be seen that only Cy5-conjugate 1 and Cy5-conjugate 2 are able to accumulate in large quantities in the liver, and Cy5-conjugate 1 and Cy5-conjugate 2 accumulate in a small amount in the kidney, but do not accumulate in other organs, which indicates that the conjugate of the present invention is capable of efficiently delivering siRNA directly to the liver. Moreover, in combination with the results in FIG. 1G (showing that conjugate 7 has superior inhibitory activity in vitro) and FIG. 1F (demonstrating that conjugate 6 has higher inhibitory activity in vitro), this suggests that the conjugate of the present invention is capable of specifically inhibiting target gene expression in the liver.
Некоторые варианты осуществления настоящего изобретения подробно описаны выше, но настоящее изобретение не ограничено конкретными подробностями вышеописанных вариантов осуществления. Различные простые изменения технического решения согласно настоящему изобретению могут быть сделаны в пределах объема технической концепции настоящего изобретения, и эти простые изменения находятся в пределах объема настоящего изобретения.Some embodiments of the present invention have been described in detail above, but the present invention is not limited to the specific details of the above-described embodiments. Various simple changes to the technical solution according to the present invention can be made within the scope of the technical concept of the present invention, and these simple changes are within the scope of the present invention.
Кроме того, следует отметить, что все конкретные технические признаки, описанные в приведенных выше вариантах осуществления, могут комбинироваться любым подходящим образом, при условии, что это не приводит к противоречию. Чтобы избежать ненужного повторения, различные возможные варианты комбинирования дополнительно не будут описаны в настоящем описании.In addition, it should be noted that all of the specific technical features described in the above embodiments may be combined in any suitable manner, provided that this does not lead to conflict. To avoid unnecessary repetition, the various possible combinations will not be further described in the present specification.
Кроме того, различные варианты осуществления настоящего изобретения также могут быть реализованы в любой комбинации, при условии, что они не вступают в противоречие с сущностью настоящего изобретения, и такие комбинации также следует рассматривать как часть раскрытия настоящего изобретения.In addition, various embodiments of the present invention may also be implemented in any combination, provided that they do not conflict with the essence of the present invention, and such combinations should also be considered part of the disclosure of the present invention.
--->--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙLIST OF SEQUENCES
<110> SUZHOU RIBO LIFE SCIENCE CO., LTD.<110> SUZHOU RIBO LIFE SCIENCE CO., LTD.
<120> НУКЛЕИНОВАЯ КИСЛОТА, ФАРМАЦЕВТИЧЕСКАЯ КОМПОЗИЦИЯ И КОНЪЮГАТ, <120> NUCLEIC ACID, PHARMACEUTICAL COMPOSITION AND CONJUGATE,
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ И ПРИМЕНЕНИЕMETHOD OF OBTAINING AND APPLICATION
<130> DSP1V211765ZX<130> DSP1V211765ZX
<150> CN201910440575.8<150>CN201910440575.8
<151> 2019-05-24<151> 2019-05-24
<160> 388<160> 388
<170> PatentIn версии 3.5<170> PatentIn version 3.5
<210> 1<210> 1
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<221> misc_feature<221> misc_feature
<223> n представляет собой Z1, и Z1 представляет собой A<223> n represents Z1, and Z1 represents A
<400> 1<400> 1
cuucauucau acagacaan cuucauucau acagacaan
19 19
<210> 2<210> 2
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z2, и Z2 представляет собой U<223> n represents Z2, and Z2 represents U
<400> 2<400> 2
nuugucugua ugaaugaag nuugucugua ugaaugaag
19 19
<210> 3<210> 3
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z3, и Z3 выбран из A, U, G или C<223> n is Z3, and Z3 is selected from A, U, G or C
<400> 3<400> 3
cuucauucau acagacaan cuucauucau acagacaan
19 19
<210> 4<210> 4
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z4, Z4 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z4, Z4 represents a nucleotide,
комплементарный Z3, и Z3 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z3, and Z3 is selected from A, U, G or C
<400> 4<400> 4
nuugucugua ugaaugaag nuugucugua ugaaugaag
19 19
<210> 5<210> 5
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z3, и Z3 выбран из A, U, G или C<223> n is Z3, and Z3 is selected from A, U, G or C
<400> 5<400> 5
cuucauucau acagacaan cuucauucau acagacaan
19 19
<210> 6<210> 6
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z4, Z4 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z4, Z4 represents a nucleotide,
комплементарный Z3, и Z3 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z3, and Z3 is selected from A, U, G or C
<400> 6<400> 6
nuugucugua ugaaugaaga g nuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 7<210> 7
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (21)..(21)<222> (21)..(21)
<223> n представляет собой Z3, и Z3 выбран из A, U, G или C<223> n is Z3, and Z3 is selected from A, U, G or C
<400> 7<400> 7
uucuucauuc auacagacaa n uucuucauucauacagacaa n
21 21
<210> 8<210> 8
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<221> misc_feature<221> misc_feature
<223> n представляет собой Z4, Z4 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z4, Z4 represents a nucleotide,
комплементарный Z3, и Z3 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z3, and Z3 is selected from A, U, G or C
<400> 8<400> 8
nuugucugua ugaaugaaga gaa nuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 9<210> 9
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 9<400> 9
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 10<210> 10
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 10<400> 10
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 11<210> 11
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 11<400> 11
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 12<210> 12
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 12<400> 12
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 13<210> 13
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 13<400> 13
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 14<210> 14
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 14<400> 14
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 15<210> 15
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 15<400> 15
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 16<210> 16
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 16<400> 16
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 17<210> 17
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 17<400> 17
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 18<210> 18
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 18<400> 18
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 19<210> 19
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 19<400> 19
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 20<210> 20
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 20<400> 20
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 21<210> 21
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 21<400> 21
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 22<210> 22
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 22<400> 22
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 23<210> 23
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 23<400> 23
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 24<210> 24
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 24<400> 24
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 25<210> 25
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 25<400> 25
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 26<210> 26
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 26<400> 26
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 27<210> 27
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 27<400> 27
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 28<210> 28
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 28<400> 28
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 29<210> 29
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 29<400> 29
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 30<210> 30
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 30<400> 30
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 31<210> 31
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 31<400> 31
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 32<210> 32
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 32<400> 32
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 33<210> 33
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 33<400> 33
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 34<210> 34
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 34<400> 34
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 35<210> 35
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 35<400> 35
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 36<210> 36
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 36<400> 36
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 37<210> 37
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 37<400> 37
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 38<210> 38
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 38<400> 38
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 39<210> 39
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 39<400> 39
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 40<210> 40
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 40<400> 40
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 41<210> 41
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 41<400> 41
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 42<210> 42
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 42<400> 42
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 43<210> 43
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 43<400> 43
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 44<210> 44
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 44<400> 44
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 45<210> 45
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 45<400> 45
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 46<210> 46
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 46<400> 46
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 47<210> 47
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 47<400> 47
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 48<210> 48
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 48<400> 48
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 49<210> 49
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 49<400> 49
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 50<210> 50
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 50<400> 50
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 51<210> 51
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 51<400> 51
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 52<210> 52
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 52<400> 52
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 53<210> 53
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 53<400> 53
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 54<210> 54
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 54<400> 54
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 55<210> 55
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 55<400> 55
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 56<210> 56
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 56<400> 56
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 57<210> 57
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 57<400> 57
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 58<210> 58
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 58<400> 58
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 59<210> 59
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 59<400> 59
cucuucauuc auacagacaa a cucuucauucauacagacaaa
21 21
<210> 60<210> 60
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 60<400> 60
uuugucugua ugaaugaaga gaa uuugucugua ugaaugaaga gaa
23 23
<210> 61<210> 61
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> N представляет собой Z5, и Z5 представляет собой A<223>N is Z5, and Z5 is A
<400> 61<400> 61
cuacaguuua gaagauuun cuacaguuua gaagauuun
19 19
<210> 62<210> 62
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z6, и Z6 представляет собой U<223>n is Z6, and Z6 is U
<400> 62<400> 62
naaaucuucu aaacuguag naaaucuucu aaacuguag
19 19
<210> 63<210> 63
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z7, и Z7 выбран из A, U, G или C<223> n represents Z7, and Z7 is selected from A, U, G or C
<400> 63<400> 63
cuacaguuua gaagauuun cuacaguuua gaagauuun
19 19
<210> 64<210> 64
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z8, Z8 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z8, Z8 represents a nucleotide,
комплементарный Z8, и Z7 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z8, and Z7 selected from A, U, G or C
<400> 64<400> 64
naaaucuucu aaacuguag naaaucuucu aaacuguag
19 19
<210> 65<210> 65
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z7, и Z7 выбран из A, U, G или C<223> n represents Z7, and Z7 is selected from A, U, G or C
<400> 65<400> 65
cuacaguuua gaagauuun cuacaguuua gaagauuun
19 19
<210> 66<210> 66
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z8, Z8 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z8, Z8 represents a nucleotide,
комплементарный Z8, и Z7 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z8, and Z7 selected from A, U, G or C
<400> 66<400> 66
naaaucuucu aaacuguagu a naaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 67<210> 67
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (21)..(21)<222> (21)..(21)
<223> n представляет собой Z7, и Z7 выбран из A, U, G или C<223> n represents Z7, and Z7 is selected from A, U, G or C
<400> 67<400> 67
uacuacaguu uagaagauuu n uacuacaguu uagaagauuu n
21 21
<210> 68<210> 68
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z8, Z8 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z8, Z8 represents a nucleotide,
комплементарный Z8, и Z7 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z8, and Z7 selected from A, U, G or C
<400> 68<400> 68
naaaucuucu aaacuguagu aug naaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 69<210> 69
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 69<400> 69
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 70<210> 70
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 70<400> 70
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 71<210> 71
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 71<400> 71
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 72<210> 72
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 72<400> 72
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 73<210> 73
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 73<400> 73
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 74<210> 74
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 74<400> 74
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 75<210> 75
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 75<400> 75
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 76<210> 76
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 76<400> 76
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 77<210> 77
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 77<400> 77
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 78<210> 78
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 78<400> 78
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 79<210> 79
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 79<400> 79
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 80<210> 80
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 80<400> 80
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 81<210> 81
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 81<400> 81
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 82<210> 82
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 82<400> 82
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 83<210> 83
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 83<400> 83
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 84<210> 84
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 84<400> 84
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 85<210> 85
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 85<400> 85
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 86<210> 86
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 86<400> 86
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 87<210> 87
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 87<400> 87
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 88<210> 88
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 88<400> 88
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 89<210> 89
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 89<400> 89
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 90<210> 90
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 90<400> 90
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 91<210> 91
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 91<400> 91
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 92<210> 92
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 92<400> 92
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 93<210> 93
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 93<400> 93
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 94<210> 94
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 94<400> 94
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 95<210> 95
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 95<400> 95
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 96<210> 96
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 96<400> 96
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 97<210> 97
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 97<400> 97
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 98<210> 98
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 98<400> 98
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 99<210> 99
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 99<400> 99
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 100<210> 100
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 100<400> 100
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 101<210> 101
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 101<400> 101
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 102<210> 102
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 102<400> 102
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 103<210> 103
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 103<400> 103
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 104<210> 104
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 104<400> 104
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 105<210> 105
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 105<400> 105
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 106<210> 106
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 106<400> 106
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 107<210> 107
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 107<400> 107
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 108<210> 108
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 108<400> 108
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 109<210> 109
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 109<400> 109
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 110<210> 110
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 110<400> 110
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 111<210> 111
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 111<400> 111
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 112<210> 112
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 112<400> 112
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 113<210> 113
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 113<400> 113
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 114<210> 114
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 114<400> 114
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 115<210> 115
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 115<400> 115
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 116<210> 116
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 116<400> 116
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 117<210> 117
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 117<400> 117
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 118<210> 118
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 118<400> 118
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 119<210> 119
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 119<400> 119
uacuacaguu uagaagauuu a uacuacaguu uagaagauuu a
21 21
<210> 120<210> 120
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 120<400> 120
uaaaucuucu aaacuguagu aug uaaaucuucu aaacuguagu aug
23 23
<210> 121<210> 121
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z9, и Z9 представляет собой A<223> n represents Z9, and Z9 represents A
<400> 121<400> 121
ggaagguuac cgagcaaun ggaagguuac cgagcaaun
19 19
<210> 122<210> 122
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z10, и Z10 представляет собой U<223> n represents Z10, and Z10 represents U
<400> 122<400> 122
nauugcucgg uaaccuucc nauugcucgg uaaccuucc
19 19
<210> 123<210> 123
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z11, и Z11 выбран из A, U, G или C<223> n is Z11, and Z11 is selected from A, U, G or C
<400> 123<400> 123
ggaagguuac cgagcaaun ggaagguuac cgagcaaun
19 19
<210> 124<210> 124
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> N представляет собой Z12, Z12 представляет собой нуклеотид, <223> N represents Z12, Z12 represents a nucleotide,
комплементарный Z11, и Z11 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z11, and Z11 is selected from A, U, G or C
<400> 124<400> 124
nauugcucgg uaaccuucc nauugcucgg uaaccuucc
19 19
<210> 125<210> 125
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z11, и Z11 выбран из A, U, G или C<223> n is Z11, and Z11 is selected from A, U, G or C
<400> 125<400> 125
ggaagguuac cgagcaaun ggaagguuac cgagcaaun
19 19
<210> 126<210> 126
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> N представляет собой Z12, Z12 представляет собой нуклеотид, <223> N represents Z12, Z12 represents a nucleotide,
комплементарный Z11, и Z11 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z11, and Z11 is selected from A, U, G or C
<400> 126<400> 126
nauugcucgg uaaccuuccc u nauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 127<210> 127
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (21)..(21)<222> (21)..(21)
<223> n представляет собой Z11, и Z11 выбран из A, U, G или C<223> n is Z11, and Z11 is selected from A, U, G or C
<400> 127<400> 127
agggaagguu accgagcaau n agggaagguu acgagcaau n
21 21
<210> 128<210> 128
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> N представляет собой Z12, Z12 представляет собой нуклеотид, <223> N represents Z12, Z12 represents a nucleotide,
комплементарный Z11, и Z11 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z11, and Z11 is selected from A, U, G or C
<400> 128<400> 128
nauugcucgg uaaccuuccc ugg nauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 129<210> 129
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 129<400> 129
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 130<210> 130
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 130<400> 130
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 131<210> 131
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 131<400> 131
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 132<210> 132
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 132<400> 132
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 133<210> 133
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 133<400> 133
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 134<210> 134
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 134<400> 134
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 135<210> 135
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 135<400> 135
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 136<210> 136
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 136<400> 136
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 137<210> 137
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 137<400> 137
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 138<210> 138
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 138<400> 138
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 139<210> 139
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 139<400> 139
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 140<210> 140
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 140<400> 140
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 141<210> 141
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 141<400> 141
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 142<210> 142
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 142<400> 142
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 143<210> 143
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 143<400> 143
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 144<210> 144
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 144<400> 144
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 145<210> 145
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 145<400> 145
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 146<210> 146
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 146<400> 146
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 147<210> 147
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 147<400> 147
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 148<210> 148
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 148<400> 148
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 149<210> 149
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 149<400> 149
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 150<210> 150
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 150<400> 150
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 151<210> 151
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 151<400> 151
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 152<210> 152
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 152<400> 152
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 153<210> 153
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 153<400> 153
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 154<210> 154
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 154<400> 154
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 155<210> 155
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 155<400> 155
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 156<210> 156
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 156<400> 156
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 157<210> 157
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 157<400> 157
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 158<210> 158
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 158<400> 158
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 159<210> 159
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 159<400> 159
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 160<210> 160
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 160<400> 160
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 161<210> 161
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 161<400> 161
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 162<210> 162
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 162<400> 162
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 163<210> 163
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 163<400> 163
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 164<210> 164
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 164<400> 164
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 165<210> 165
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 165<400> 165
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 166<210> 166
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 166<400> 166
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 167<210> 167
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 167<400> 167
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 168<210> 168
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 168<400> 168
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 169<210> 169
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 169<400> 169
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 170<210> 170
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 170<400> 170
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 171<210> 171
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 171<400> 171
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 172<210> 172
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 172<400> 172
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 173<210> 173
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 173<400> 173
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 174<210> 174
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 174<400> 174
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 175<210> 175
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 175<400> 175
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 176<210> 176
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 176<400> 176
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 177<210> 177
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 177<400> 177
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 178<210> 178
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 178<400> 178
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 179<210> 179
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 179<400> 179
agggaagguu accgagcaau a agggaagguu acgagcaau a
21 21
<210> 180<210> 180
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 180<400> 180
uauugcucgg uaaccuuccc ugg uauugcucgg uaaccuuccc ugg
23 23
<210> 181<210> 181
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> N представляет собой Z13, и Z13 представляет собой A<223> N is Z13, and Z13 is A
<400> 181<400> 181
agaacagaca gcagaauun agaacagaca gcagaauun
19 19
<210> 182<210> 182
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> N представляет собой Z14, и Z14 представляет собой U<223> N represents Z14, and Z14 represents U
<400> 182<400> 182
naauucugcu gucuguucu naauucugcu gucuguucu
19 19
<210> 183<210> 183
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z15, и Z15 выбран из A, U, G или C<223> n represents Z15, and Z15 is selected from A, U, G or C
<400> 183<400> 183
agaacagaca gcagaauun agaacagaca gcagaauun
19 19
<210> 184<210> 184
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> N представляет собой Z16, Z16 представляет собой нуклеотид, <223> N represents Z16, Z16 represents a nucleotide,
комплементарный Z15, и Z15 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z15, and Z15 selected from A, U, G or C
<400> 184<400> 184
naauucugcu gucuguucu naauucugcu gucuguucu
19 19
<210> 185<210> 185
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z15, и Z15 выбран из A, U, G или C<223> n represents Z15, and Z15 is selected from A, U, G or C
<400> 185<400> 185
agaacagaca gcagaauun agaacagaca gcagaauun
19 19
<210> 186<210> 186
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> N представляет собой Z16, Z16 представляет собой нуклеотид, <223> N represents Z16, Z16 represents a nucleotide,
комплементарный Z15, и Z15 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z15, and Z15 selected from A, U, G or C
<400> 186<400> 186
naauucugcu gucuguucuc c naauucugcu gucuguucuc c
21 21
<210> 187<210> 187
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (21)..(21)<222> (21)..(21)
<223> n представляет собой Z15, и Z15 выбран из A, U, G или C<223> n represents Z15, and Z15 is selected from A, U, G or C
<400> 187<400> 187
ggagaacaga cagcagaauu n ggagaacaga cagcagaauu n
21 21
<210> 188<210> 188
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> N представляет собой Z16, Z16 представляет собой нуклеотид, <223> N represents Z16, Z16 represents a nucleotide,
комплементарный Z15, и Z15 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z15, and Z15 selected from A, U, G or C
<400> 188<400> 188
naauucugcu gucuguucuc cug naauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 189<210> 189
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 189<400> 189
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 190<210> 190
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 190<400> 190
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 191<210> 191
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 191<400> 191
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 192<210> 192
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 192<400> 192
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 193<210> 193
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 193<400> 193
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 194<210> 194
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 194<400> 194
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 195<210> 195
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 195<400> 195
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 196<210> 196
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 196<400> 196
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 197<210> 197
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 197<400> 197
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 198<210> 198
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 198<400> 198
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 199<210> 199
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 199<400> 199
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 200<210> 200
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 200<400> 200
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 201<210> 201
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 201<400> 201
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 202<210> 202
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 202<400> 202
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 203<210> 203
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 203<400> 203
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 204<210> 204
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 204<400> 204
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 205<210> 205
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 205<400> 205
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 206<210> 206
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 206<400> 206
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 207<210> 207
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 207<400> 207
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 208<210> 208
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 208<400> 208
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 209<210> 209
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 209<400> 209
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 210<210> 210
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 210<400> 210
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 211<210> 211
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 211<400> 211
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 212<210> 212
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 212<400> 212
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 213<210> 213
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 213<400> 213
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 214<210> 214
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 214<400> 214
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 215<210> 215
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 215<400> 215
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 216<210> 216
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 216<400> 216
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 217<210> 217
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 217<400> 217
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 218<210> 218
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 218<400> 218
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 219<210> 219
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 219<400> 219
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 220<210> 220
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 220<400> 220
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 221<210> 221
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 221<400> 221
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 222<210> 222
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 222<400> 222
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 223<210> 223
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 223<400> 223
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 224<210> 224
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 224<400> 224
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 225<210> 225
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 225<400> 225
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 226<210> 226
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 226<400> 226
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 227<210> 227
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 227<400> 227
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 228<210> 228
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 228<400> 228
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 229<210> 229
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 229<400> 229
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 230<210> 230
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 230<400> 230
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 231<210> 231
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 231<400> 231
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 232<210> 232
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 232<400> 232
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 233<210> 233
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 233<400> 233
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 234<210> 234
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 234<400> 234
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 235<210> 235
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 235<400> 235
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 236<210> 236
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 236<400> 236
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 237<210> 237
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 237<400> 237
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 238<210> 238
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 238<400> 238
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 239<210> 239
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 239<400> 239
ggagaacaga cagcagaauu a ggagaacaga cagcagaauu a
21 21
<210> 240<210> 240
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 240<400> 240
uaauucugcu gucuguucuc cug uaauucugcu gucuguucuc cug
23 23
<210> 241<210> 241
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z17, и Z17 представляет собой A<223>n is Z17, and Z17 is A
<400> 241<400> 241
ccaagaagaa cgcugcaan ccaagaagaa cgcugcaan
19 19
<210> 242<210> 242
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z18, и Z18 представляет собой U<223> n represents Z18, and Z18 represents U
<400> 242<400> 242
nuugcagcgu ucuucuugg nuugcagcgu ucuucuugg
19 19
<210> 243<210> 243
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z19, и Z19 выбран из A, U, G или C<223> n is Z19, and Z19 is selected from A, U, G or C
<400> 243<400> 243
ccaagaagaa cgcugcaan ccaagaagaa cgcugcaan
19 19
<210> 244<210> 244
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z20, Z20 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z20, Z20 represents a nucleotide,
комплементарный Z19, и Z19 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z19, and Z19 selected from A, U, G or C
<400> 244<400> 244
nuugcagcgu ucuucuugg nuugcagcgu ucuucuugg
19 19
<210> 245<210> 245
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z19, и Z19 выбран из A, U, G или C<223> n is Z19, and Z19 is selected from A, U, G or C
<400> 245<400> 245
ccaagaagaa cgcugcaan ccaagaagaa cgcugcaan
19 19
<210> 246<210> 246
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z20, Z20 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z20, Z20 represents a nucleotide,
комплементарный Z19, и Z19 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z19, and Z19 selected from A, U, G or C
<400> 246<400> 246
nuugcagcgu ucuucuuggc c nuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 247<210> 247
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (21)..(21)<222> (21)..(21)
<223> n представляет собой Z19, и Z19 выбран из A, U, G или C<223> n is Z19, and Z19 is selected from A, U, G or C
<400> 247<400> 247
ggccaagaag aacgcugcaa n ggccaagaag aacgcugcaa n
21 21
<210> 248<210> 248
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z20, Z20 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z20, Z20 represents a nucleotide,
комплементарный Z19, и Z19 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z19, and Z19 selected from A, U, G or C
<400> 248<400> 248
nuugcagcgu ucuucuuggc cug nuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 249<210> 249
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 249<400> 249
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 250<210> 250
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 250<400> 250
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 251<210> 251
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 251<400> 251
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 252<210> 252
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 252<400> 252
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 253<210> 253
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 253<400> 253
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 254<210> 254
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 254<400> 254
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 255<210> 255
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 255<400> 255
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 256<210> 256
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 256<400> 256
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 257<210> 257
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 257<400> 257
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 258<210> 258
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 258<400> 258
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 259<210> 259
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 259<400> 259
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 260<210> 260
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 260<400> 260
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 261<210> 261
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 261<400> 261
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 262<210> 262
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 262<400> 262
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 263<210> 263
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 263<400> 263
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 264<210> 264
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 264<400> 264
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 265<210> 265
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 265<400> 265
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 266<210> 266
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 266<400> 266
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 267<210> 267
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 267<400> 267
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 268<210> 268
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 268<400> 268
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 269<210> 269
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 269<400> 269
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 270<210> 270
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 270<400> 270
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 271<210> 271
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 271<400> 271
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 272<210> 272
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 272<400> 272
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 273<210> 273
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 273<400> 273
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 274<210> 274
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 274<400> 274
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 275<210> 275
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 275<400> 275
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 276<210> 276
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 276<400> 276
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 277<210> 277
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 277<400> 277
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 278<210> 278
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 278<400> 278
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 279<210> 279
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 279<400> 279
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 280<210> 280
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 280<400> 280
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 281<210> 281
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 281<400> 281
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 282<210> 282
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 282<400> 282
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 283<210> 283
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 283<400> 283
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 284<210> 284
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 284<400> 284
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 285<210> 285
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 285<400> 285
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 286<210> 286
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 286<400> 286
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 287<210> 287
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 287<400> 287
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 288<210> 288
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 288<400> 288
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 289<210> 289
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 289<400> 289
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 290<210> 290
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 290<400> 290
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 291<210> 291
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 291<400> 291
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 292<210> 292
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 292<400> 292
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 293<210> 293
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 293<400> 293
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 294<210> 294
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 294<400> 294
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 295<210> 295
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 295<400> 295
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 296<210> 296
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 296<400> 296
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 297<210> 297
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 297<400> 297
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 298<210> 298
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 298<400> 298
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 299<210> 299
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 299<400> 299
ggccaagaag aacgcugcaa a ggccaagaag aacgcugcaa a
21 21
<210> 300<210> 300
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 300<400> 300
uuugcagcgu ucuucuuggc cug uuugcagcgu ucuucuuggc cug
23 23
<210> 301<210> 301
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z21, и Z21 представляет собой A<223> n represents Z21, and Z21 represents A
<400> 301<400> 301
ccaguaagca agccagaan ccaguaagca agccagaan
19 19
<210> 302<210> 302
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z22, и Z22 представляет собой U<223> n represents Z22, and Z22 represents U
<400> 302<400> 302
nuucuggcuu gcuuacugg nuucuggcuu gcuuacugg
19 19
<210> 303<210> 303
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z23, и Z23 выбран из A, U, G или C<223>n is Z23, and Z23 is selected from A, U, G or C
<400> 303<400> 303
ccaguaagca agccagaan ccaguaagca agccagaan
19 19
<210> 304<210> 304
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z24, Z24 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z24, Z24 represents a nucleotide,
комплементарный Z23, и Z23 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z23, and Z23 is selected from A, U, G or C
<400> 304<400> 304
nuucuggcuu gcuuacugg nuucuggcuu gcuuacugg
19 19
<210> 305<210> 305
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (19)..(19)<222> (19)..(19)
<223> n представляет собой Z23, и Z23 выбран из A, U, G или C<223>n is Z23, and Z23 is selected from A, U, G or C
<400> 305<400> 305
ccaguaagca agccagaan ccaguaagca agccagaan
19 19
<210> 306<210> 306
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z24, Z24 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z24, Z24 represents a nucleotide,
комплементарный Z23, и Z23 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z23, and Z23 is selected from A, U, G or C
<400> 306<400> 306
nuucuggcuu gcuuacuggu a nuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 307<210> 307
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (21)..(21)<222> (21)..(21)
<223> n представляет собой Z23, и Z23 выбран из A, U, G или C<223>n is Z23, and Z23 is selected from A, U, G or C
<400> 307<400> 307
uaccaguaag caagccagaa n uaccaguaag caagccagaa n
21 21
<210> 308<210> 308
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> n представляет собой Z24, Z24 представляет собой нуклеотид, <223> n represents Z24, Z24 represents a nucleotide,
комплементарный Z23, и Z23 выбран из A, U, G или Ccomplementary to Z23, and Z23 is selected from A, U, G or C
<400> 308<400> 308
nuucuggcuu gcuuacuggu aac nuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 309<210> 309
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 309<400> 309
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 310<210> 310
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 310<400> 310
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 311<210> 311
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 311<400> 311
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 312<210> 312
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 312<400> 312
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 313<210> 313
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 313<400> 313
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 314<210> 314
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 314<400> 314
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 315<210> 315
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 315<400> 315
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 316<210> 316
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 316<400> 316
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 317<210> 317
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 317<400> 317
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 318<210> 318
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 318<400> 318
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 319<210> 319
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 319<400> 319
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 320<210> 320
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 320<400> 320
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 321<210> 321
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 321<400> 321
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 322<210> 322
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 322<400> 322
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 323<210> 323
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 323<400> 323
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 324<210> 324
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 324<400> 324
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 325<210> 325
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 325<400> 325
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 326<210> 326
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 326<400> 326
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 327<210> 327
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 327<400> 327
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 328<210> 328
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 328<400> 328
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 329<210> 329
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 329<400> 329
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 330<210> 330
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 330<400> 330
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 331<210> 331
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 331<400> 331
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 332<210> 332
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 332<400> 332
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 333<210> 333
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 333<400> 333
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 334<210> 334
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 334<400> 334
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 335<210> 335
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 335<400> 335
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 336<210> 336
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 336<400> 336
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 337<210> 337
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 337<400> 337
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 338<210> 338
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 338<400> 338
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 339<210> 339
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 339<400> 339
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 340<210> 340
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 340<400> 340
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 341<210> 341
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 341<400> 341
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 342<210> 342
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 342<400> 342
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 343<210> 343
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 343<400> 343
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 344<210> 344
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 344<400> 344
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 345<210> 345
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 345<400> 345
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 346<210> 346
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 346<400> 346
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 347<210> 347
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 347<400> 347
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 348<210> 348
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 348<400> 348
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 349<210> 349
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 349<400> 349
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 350<210> 350
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 350<400> 350
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 351<210> 351
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 351<400> 351
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 352<210> 352
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 352<400> 352
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 353<210> 353
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 353<400> 353
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 354<210> 354
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 354<400> 354
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 355<210> 355
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 355<400> 355
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 356<210> 356
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 356<400> 356
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 357<210> 357
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 357<400> 357
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 358<210> 358
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 358<400> 358
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 359<210> 359
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 359<400> 359
uaccaguaag caagccagaa a uaccaguaag caagccagaa a
21 21
<210> 360<210> 360
<211> 23<211> 23
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 360<400> 360
uuucuggcuu gcuuacuggu aac uuucuggcuu gcuuacuggu aac
23 23
<210> 361<210> 361
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 361<400> 361
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 362<210> 362
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 362<400> 362
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 363<210> 363
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 363<400> 363
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 364<210> 364
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 364<400> 364
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 365<210> 365
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 365<400> 365
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 366<210> 366
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 366<400> 366
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 367<210> 367
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 367<400> 367
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 368<210> 368
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 368<400> 368
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 369<210> 369
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 369<400> 369
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 370<210> 370
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 370<400> 370
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 371<210> 371
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 371<400> 371
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 372<210> 372
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 372<400> 372
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 373<210> 373
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 373<400> 373
cuucauucau acagacaaa cuucauucau acagacaaa
19 19
<210> 374<210> 374
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 374<400> 374
uuugucugua ugaaugaaga g uuugucugua ugaaugaaga g
21 21
<210> 375<210> 375
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 375<400> 375
cuacaguuua gaagauuua cuacaguuua gaagauuua
19 19
<210> 376<210> 376
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 376<400> 376
uaaaucuucu aaacuguagu a uaaaucuucu aaacuguagu a
21 21
<210> 377<210> 377
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 377<400> 377
ggaagguuac cgagcaaua ggaagguuac cgagcaaua
19 19
<210> 378<210> 378
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 378<400> 378
uauugcucgg uaaccuuccc u uauugcucgg uaaccuuccc u
21 21
<210> 379<210> 379
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 379<400> 379
agaacagaca gcagaauua agaacagaca gcagaauua
19 19
<210> 380<210> 380
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 380<400> 380
uaauucugcu gucuguucuc c uaauucugcu gucuguucucc
21 21
<210> 381<210> 381
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 381<400> 381
ccaagaagaa cgcugcaaa ccaagaagaa cgcugcaaa
19 19
<210> 382<210> 382
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 382<400> 382
uuugcagcgu ucuucuuggc c uuugcagcgu ucuucuuggc c
21 21
<210> 383<210> 383
<211> 19<211> 19
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 383<400> 383
ccaguaagca agccagaaa ccaguaagca agccagaaa
19 19
<210> 384<210> 384
<211> 21<211> 21
<212> РНК<212> RNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> миРНК<223> siRNA
<400> 384<400> 384
uuucuggcuu gcuuacuggu a uuucuggcuu gcuuacuggu a
21 21
<210> 385<210> 385
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Праймер<223> Primer
<400> 385<400> 385
atcaggccag ggaaggttac atcaggccag ggaaggttac
20 20
<210> 386<210> 386
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Праймер<223> Primer
<400> 386<400> 386
tcgggatgaa ggaaccatgt tcgggatgaa ggaaccatgt
20 20
<210> 387<210> 387
<211> 19<211> 19
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Праймер<223> Primer
<400> 387<400> 387
ggtcggagtc aacggattt ggtcggagtc aacggattt
19 19
<210> 388<210> 388
<211> 19<211> 19
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Праймер<223> Primer
<400> 388<400> 388
ccagcatcgc cccacttga ccagcatcgc cccacttga
19 19
<---<---
Claims (601)
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201910440575.8 | 2019-05-24 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2021134268A RU2021134268A (en) | 2023-06-26 |
| RU2816898C2 true RU2816898C2 (en) | 2024-04-08 |
Family
ID=
Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EA201591707A1 (en) * | 2013-03-14 | 2016-03-31 | Элнилэм Фармасьютикалз, Инк. | COMPOSITIONS OF IRNC COMPONENT COMPONENT C5 AND METHODS OF THEIR APPLICATION |
| WO2016201301A1 (en) * | 2015-06-12 | 2016-12-15 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Complement component c5 irna compositions and methods of use thereof |
| WO2017178656A1 (en) * | 2016-04-14 | 2017-10-19 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | TRITYL-MONO-GalNAc COMPOUNDS AND THEIR USE |
| WO2018013525A1 (en) * | 2016-07-11 | 2018-01-18 | Translate Bio Ma, Inc. | Nucleic acid conjugates and uses thereof |
Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EA201591707A1 (en) * | 2013-03-14 | 2016-03-31 | Элнилэм Фармасьютикалз, Инк. | COMPOSITIONS OF IRNC COMPONENT COMPONENT C5 AND METHODS OF THEIR APPLICATION |
| WO2016201301A1 (en) * | 2015-06-12 | 2016-12-15 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Complement component c5 irna compositions and methods of use thereof |
| WO2017178656A1 (en) * | 2016-04-14 | 2017-10-19 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | TRITYL-MONO-GalNAc COMPOUNDS AND THEIR USE |
| WO2018013525A1 (en) * | 2016-07-11 | 2018-01-18 | Translate Bio Ma, Inc. | Nucleic acid conjugates and uses thereof |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US20240382514A1 (en) | Nucleic acid, composition and conjugate containing same, and preparation method and use thereof | |
| US12084661B2 (en) | Nucleic acid, composition and conjugate comprising the same, and preparation method and use thereof | |
| JP7261494B2 (en) | Nucleic acids, compositions and complexes containing said nucleic acids, preparation methods and uses | |
| JP7613751B2 (en) | Nucleic acids, drug compositions and complexes and methods of preparation and use | |
| EP3903830A1 (en) | Nucleic acid, composition and conjugate containing nucleic acid, preparation method therefor and use thereof | |
| WO2020135581A1 (en) | Nucleic acid, composition and conjugate containing nucleic acid, preparation method therefor and use thereof | |
| EP3978609A1 (en) | Nucleic acid, pharmaceutical composition, conjugate, preparation method, and use | |
| EP3992290A1 (en) | Nucleic acid, pharmaceutical composition and conjugate, preparation method therefor and use thereof | |
| WO2020147847A1 (en) | Nucleic acid, composition and conjugate containing nucleic acid, preparation method, and use | |
| EP3974533A1 (en) | Nucleic acid, pharmaceutical composition, conjugate, preparation method, and use | |
| EP3974529A1 (en) | Nucleic acid, pharmaceutical composition, conjugate, preparation method, and use | |
| RU2816898C2 (en) | Nucleic acid, pharmaceutical composition and conjugate, method of production and use | |
| RU2828679C2 (en) | Nucleic acid, pharmaceutical composition, conjugate, method of production and use | |
| RU2782211C2 (en) | Nucleic acid, composition and conjugate containing it, as well as method for their production and use |