RU2849866C1 - T-cell receptors, restricted by hla class i, against ras with mutation g12d - Google Patents
T-cell receptors, restricted by hla class i, against ras with mutation g12dInfo
- Publication number
- RU2849866C1 RU2849866C1 RU2022124004A RU2022124004A RU2849866C1 RU 2849866 C1 RU2849866 C1 RU 2849866C1 RU 2022124004 A RU2022124004 A RU 2022124004A RU 2022124004 A RU2022124004 A RU 2022124004A RU 2849866 C1 RU2849866 C1 RU 2849866C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- seq
- leu
- amino acid
- ser
- acid sequence
- Prior art date
Links
Abstract
Description
Перекрестная ссылка на родственную заявкуCross-reference to a related application
[0001] Данная патентная заявка заявляет приоритет по первоначальной патентной заявке США №62/975544, поданной 12 февраля 2020 года, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.[0001] This patent application claims priority to U.S. Patent Application No. 62/975,544, filed February 12, 2020, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Утверждение относительно исследования или разработки, финансируемых из федерального бюджетаStatement regarding federally funded research or development
[0002] Данное изобретение было создано при поддержке правительства под номером проекта ZIABC010984 национальными институтами здравоохранения, национальным институтом онкологии. Государство имеет определенные права в данном изобретении.[0002] This invention was developed with the support of the government under project number ZIABC010984 by the National Institutes of Health, National Cancer Institute. The state has certain rights in this invention.
Включение посредством ссылки материала, представленного в электронной формеIncorporation by reference of material presented in electronic form
[0003] В данный документ посредством ссылки во всей своей полноте включен машиночитаемый перечень нуклеотидных/аминокислотных последовательностей, поданный наряду с этим и идентифицированный следующим образом: один (текстовый) файл, размером 114961 байт ASCII, с названием «751506_ST25.txt», датированный 29 января 2021 года.[0003] The machine-readable listing of nucleotide/amino acid sequences filed herewith and identified as follows is incorporated by reference in its entirety herein: one (text) file, 114961 bytes ASCII, named "751506_ST25.txt", dated January 29, 2021.
Предшествующий уровень техникиPrior art
[0004] Некоторые виды рака могут иметь очень ограниченные варианты лечения, в частности, когда рак становится метастатическим и неоперабельным. Несмотря на прогресс в видах лечения, таких как, например, хирургическое вмешательство, химиотерапия и лучевая терапия, прогноз в случае многих видов рака, таких как, например, рак поджелудочной железы, колоректальных рак, рак легкого, рак эндометрия, рак яичника и рак предстательной железы, может быть неблагоприятным. Соответственно, существует неудовлетворенная потребность в дополнительных видах лечения рака.[0004] Some cancers may have very limited treatment options, particularly when the cancer becomes metastatic and inoperable. Despite advances in treatments such as surgery, chemotherapy, and radiation therapy, the prognosis for many cancers, such as pancreatic cancer, colorectal cancer, lung cancer, endometrial cancer, ovarian cancer, and prostate cancer, can be poor. Accordingly, there is an unmet need for additional cancer treatments.
Краткое изложение сущности изобретенияBrief summary of the invention
[0005] Согласно одному воплощению изобретения предложен выделенный или очищенный Т-клеточный рецептор (TCR - от англ. Т cell receptor), содержащий аминокислотные последовательности (a) SEQ ID NO: 1-3, (b) SEQ ID NO: 4-6 или (с) SEQ ID NO: 1-6, где TCR обладает антигенной специфичностью в отношении аминокислотной последовательности мутантного человеческого RAS с заменой глицина в положении 12 аспарагиновой кислотной, презентируемой молекулой человеческого лейкоцитарного антигена (HLA - от англ. human leukocyte antigen) класса I, где данная аминокислотная последовательность мутантного человеческого RAS представляет собой аминокислотную последовательность мутантного человеческого гомолога вирусного онкогена саркомы крыс Кирстен (KRAS - от англ. Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog), мутантного человеческого гомолога вирусного онкогена саркомы крыс Харви (HRAS - от англ. Harvey rat sarcoma viral oncogene homolog) или мутантного человеческого гомолога вирусного онкогена нейробластомы RAS (NRAS - от англ. Neuroblastoma rat sarcoma viral oncogene homolog), и где положение 12 определяется с учетом человеческого белка KRAS дикого типа, человеческого белка HRAS дикого типа или человеческого белка NRAS дикого типа, соответственно.[0005] According to one embodiment of the invention, there is provided an isolated or purified T cell receptor (TCR) comprising the amino acid sequences of (a) SEQ ID NO: 1-3, (b) SEQ ID NO: 4-6, or (c) SEQ ID NO: 1-6, wherein the TCR has antigen specificity for the amino acid sequence of a mutant human RAS with a glycine substitution at position 12 with aspartic acid, presented by a class I human leukocyte antigen (HLA) molecule, wherein the amino acid sequence of the mutant human RAS is the amino acid sequence of a mutant human Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog (KRAS), a mutant human Harvey rat sarcoma viral oncogene homolog (HRAS), or a mutant human Harvey rat sarcoma viral oncogene homolog) or a mutant human homolog of the neuroblastoma rat sarcoma viral oncogene RAS (NRAS - from English Neuroblastoma rat sarcoma viral oncogene homolog), and where position 12 is determined taking into account the wild-type human KRAS protein, wild-type human HRAS protein, or wild-type human NRAS protein, respectively.
[0006] Согласно еще одному воплощению изобретения предложен выделенный или очищенный полипептид, содержащий функциональную часть TCR по изобретению, где функциональная часть содержит следующие аминокислотные последовательности: (а) все из SEQ ID NO: 1-3, (b) все из SEQ ID NO: 4-6 или (с) все из SEQ ID NO: 1-6.[0006] According to another embodiment of the invention, there is provided an isolated or purified polypeptide comprising a functional portion of a TCR of the invention, wherein the functional portion comprises the following amino acid sequences: (a) all of SEQ ID NOs: 1-3, (b) all of SEQ ID NOs: 4-6, or (c) all of SEQ ID NOs: 1-6.
[0007] Согласно еще одному воплощению изобретения предложен выделенный или очищенный белок, содержащий первую полипептидную цепь, содержащую аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1-3, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 4-6.[0007] According to another embodiment of the invention, there is provided an isolated or purified protein comprising a first polypeptide chain comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 1-3 and a second polypeptide chain comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 4-6.
[0008] Согласно воплощениям изобретения дополнительно предложены нуклеиновые кислоты, рекомбинантные экспрессионные векторы, клетки-хозяева, популяции клеток и фармацевтические композиции, относящиеся к TCR, полипептидам и белкам по изобретению.[0008] According to embodiments of the invention, nucleic acids, recombinant expression vectors, host cells, cell populations and pharmaceutical compositions related to the TCRs, polypeptides and proteins of the invention are further provided.
[0009] Согласно воплощению изобретения предложена выделенная или очищенная нуклеиновая кислота, содержащая, от 5' к 3', первую последовательность нуклеиновой кислоты и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, где первая и вторая нуклеотидная последовательность, соответственно, кодируют аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 7 и 8; 51 и 8; 7 и 52; 51 и 52; 8 и 7; 8 и 51; 52 и 7; 52 и 51; 21 и 22; 53 и 22; 21 и 54; 53 и 54; 22 и 21; 22 и 53; 54 и 21; 54 и 53; 23 и 24; 55 и 24; 23 и 56; 55 и 56; 24 и 23; 24 и 55; 56 и 23; 56 и 55; 32 и 33; 33 и 32; 59 и 60; 60 и 59; 34 и 35; 35 и 34; 61 и 62; 62 и 61; 36 и 37; 37 и 36; 63 и 64; 64 и 63; 40 и 41; 57 и 41; 40 и 58; 57 и 58; 41 и 40; 41 и 57; 58 и 40; 58 и 57; 42 и 43; 43 и 42; 65 и 66; или 66 и 65.[0009] According to an embodiment of the invention, there is provided an isolated or purified nucleic acid comprising, from 5' to 3', a first nucleic acid sequence and a second nucleic acid sequence, wherein the first and second nucleotide sequences, respectively, encode the amino acid sequences of SEQ ID NO: 7 and 8; 51 and 8; 7 and 52; 51 and 52; 8 and 7; 8 and 51; 52 and 7; 52 and 51; 21 and 22; 53 and 22; 21 and 54; 53 and 54; 22 and 21; 22 and 53; 54 and 21; 54 and 53; 23 and 24; 55 and 24; 23 and 56; 55 and 56; 24 and 23; 24 and 55; 56 and 23; 56 and 55; 32 and 33; 33 and 32; 59 and 60; 60 and 59; 34 and 35; 35 and 34; 61 and 62; 62 and 61; 36 and 37; 37 and 36; 63 and 64; 64 and 63; 40 and 41; 57 and 41; 40 and 58; 57 and 58; 41 and 40; 41 and 57; 58 and 40; 58 and 57; 42 and 43; 43 and 42; 65 and 66; or 66 and 65.
[0010] Способы выявления наличия рака у млекопитающего, способы лечения или предупреждения рака у млекопитающего, способы индукции иммунного ответа на рак у млекопитающего, способы получения клетки-хозяина, экспрессирующей TCR, который обладает антигенной специфичностью в отношении пептида (SEQ ID NO: 29), и способы получения TCR, полипептидов и белков по изобретению дополнительно предложены согласно воплощениям изобретения.[0010] Methods for detecting the presence of cancer in a mammal, methods for treating or preventing cancer in a mammal, methods for inducing an immune response to cancer in a mammal, methods for producing a host cell expressing a TCR that has antigen specificity for a peptide (SEQ ID NO: 29), and methods for producing TCRs, polypeptides and proteins of the invention are further provided according to embodiments of the invention.
[0011] Дополнительные воплощения представляют собой такие, как описано в данном документе.[0011] Additional embodiments are as described herein.
Краткое описание нескольких представлений графического(их) материала(ов)Brief description of several representations of graphic material(s)
[0012] Фиг. 1А-1В: TIL скрининг на реактивность в отношении KRAS G12D. Фиг. 1А представляет собой график, показывающий измерение ELISPOT (от англ. Enzyme-Linked ImmunoSpot - метод иммуноферментных пятен) секреции IFN-γ (от англ. interferon gamma - интерферон гамма) (число пятен на 3е4 клеток). Фиг. 1В представляет собой график, показывающий результаты анализа на основе проточной цитометрии экспрессии 4-1 ВВ и ОХ40 (% 4-1 ВВ+/ОХ40+), измеряемой после совместного культивирования эффекторных клеток с клетками-мишенями. Эффекторные клетки представляли собой TIL из фрагментов опухоли Пациента 4373 F4, F5, F6, F8, F9 и F10. Клетки-мишени (аутологичные DC (от англ. dendritic cell - дендритная клетка)) подвергали электропорации мРНК с использованием тандемного минигена (TMG - от англ. tandem minigene), кодирующего 12 мутаций RAS (G12D- G12V- G12C- G12A- G12S-G13D- G13R- G13V-Q61R- Q61L- Q61K-Q61H) (SEQ ID NO: 49) (незакрашенные круги) или последовательности эпитопов RAS дикого типа (WT) (WT G12+G13+Q61) (SEQ ID NO: 48) (закрашенные круги); аутологичные DC, загруженные длинным пептидом G12 WT (LP - от англ. long peptide) (SEQ ID NO: 27) (закрашенные квадраты); G12D Mut LP (SEQ ID NO: 26) (незакрашенные квадраты); или минимальным эпитопом (ME) А11/А02 - смесь равной концентрации трех пептидных последовательностей: KLVWGADGV (SEQ ID NO: 50), WGADGVGK (SEQ ID NO: 28), WVGADGVGK (SEQ ID NO: 29) (закрашенные треугольники). В качестве отрицательных контролей, аутологичные клетки DC культивировали отдельно (только TIL) (ромбы) или совместно культивировали с: диметилсульфоксидом (ДМСО) (незакрашенные треугольники). В качестве положительного контроля TIL растет в присутствии материала - магнитных шариков с антителами против СD3/против CD28 (ThermoFisher) (звездочки).[0012] Fig. 1A-1B: TIL screening for KRAS G12D reactivity. Fig. 1A is a graph showing the ELISPOT measurement of IFN-γ secretion (number of spots per 3e4 cells). Fig. 1B is a graph showing the results of flow cytometry analysis of 4-1 BB and OX40 expression (% 4-1 BB+/OX40+) measured after co-culture of effector cells with target cells. The effector cells were TILs from Patient 4373 tumor fragments F4, F5, F6, F8, F9, and F10. Target cells (autologous DCs) were electroporated with mRNA using a tandem minigene (TMG) encoding 12 RAS mutations (G12D- G12V- G12C- G12A- G12S-G13D- G13R- G13V-Q61R- Q61L- Q61K-Q61H) (SEQ ID NO: 49) (open circles) or wild-type (WT) RAS epitope sequences (WT G12+G13+Q61) (SEQ ID NO: 48) (filled circles); autologous DCs loaded with the long peptide G12 WT (LP) (SEQ ID NO: 27) (filled squares); G12D Mut LP (SEQ ID NO: 26) (open squares); or the minimal epitope (ME) A11/A02 - a mixture of equal concentrations of three peptide sequences: KLVWGADGV (SEQ ID NO: 50), WGADGVGK (SEQ ID NO: 28), WVGADGVGK (SEQ ID NO: 29) (filled triangles). As negative controls, autologous DC cells were cultured alone (TIL only) (diamonds) or co-cultured with dimethyl sulfoxide (DMSO) (open triangles). As a positive control, TIL grew in the presence of the material - magnetic beads with anti-CD3/anti-CD28 antibodies (ThermoFisher) (asterisks).
[0013] Фиг. 2 представляет собой график, показывающий процент клеток, экспрессирующих 4-1 ВВ и ОХ40 после совместного культивирования эффекторных клеток с клетками-мишенями. Эффекторные клетки представляли собой аутологичные PBL (от англ. peripheral blood lymphocyte - лимфоцит периферической крови) Пациента 4373, трансдуцированные (i) одной из двух последовательностей TCR (TCR1 или TCR2), полученных способом секвенирования одиночной клетки из реактивных TIL (показано на Фиг. 1), которые, как подозревали, являлись G12D RAS-реактивными, или (ii) HLA-A11-рестриктированными, мышиными TCR против KRAS G12D (положительный контроль) (mTCR), или (iii) не трансдуцированные PBL (-). Клетки-мишени представляли собой: клеточную линию COS HLA-A2 (незакрашенные круги), клеточную линию COS HLA-A2-G12D (закрашенные круги), клеточную линию COS HLA-A11 (незакрашенные треугольники) или клеточную линию COS HLA-A11-G12D (закрашенные треугольники) или только Т-клетки (без клеток-мишеней) (-).[0013] Fig. 2 is a graph showing the percentage of cells expressing 4-1 BB and OX40 after co-culture of effector cells with target cells. The effector cells were autologous PBLs from Patient 4373 transduced with (i) one of two TCR sequences (TCR1 or TCR2) obtained by single-cell sequencing from reactive TILs (shown in Fig. 1) suspected to be G12D RAS-reactive, or (ii) HLA-A11-restricted, murine anti-KRAS G12D TCR (positive control) (mTCR), or (iii) untransduced PBLs (-). Target cells were: COS HLA-A2 cell line (open circles), COS HLA-A2-G12D cell line (filled circles), COS HLA-A11 cell line (open triangles), or COS HLA-A11-G12D cell line (filled triangles), or T cells only (no target cells) (-).
[0014] Фиг. 3А-3В: 4373 TCR-трансдуцированные PBL, тестируемые в отношении реактивности в отношении KRAS G12D. Фиг. 3А представляет собой график, показывающий измерение ELISPOT секреции IFN-γ (число пятен на 3е4 клеток). Фиг. 3В представляет собой график, показывающий результаты анализа на основе проточной цитометрии экспрессии 4-1 ВВ и ОХ40 (% 4-1 ВВ+/ОХ40+) CD8 отсортированных клеток, измеренные после совместного культивирования эффекторных клеток с клетками-мишенями. Эффекторные клетки представляли собой аутологичные CD8+PBL Пациента 4373, трансдуцированные ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим (i) 4373 TCR 1 и 2, которые, как подозревают, являются G12D RAS-реактивными (с вариабельными областями человека); (ii) HLA-A11-рестриктированный, мышиный TCR против KRAS G12D Примера 1; или (iii) зеленый флуоресцентный белок (GFP - от англ. green fluorescent protein) (контроль). Клетки, трансдуцированные пустым вектором, служили в качестве дополнительного контроля (Mock Td). Клетки-мишени представляли собой аутологичные дендритные клетки (DC), трансфицированные мРНК полноразмерным (FL) геном, который был или геном KRAS WT (незакрашенные круги), или FL геном с мутацией KRAS G12D (закрашенные круги); аутологичные DC, загруженные пептидом, который представлял собой WT KRAS LP (незакрашенные треугольники) или G12D Mut KRAS LP (закрашенные треугольники) или загруженные минимальным эпитопом KRAS (ME): ME A02 WT (незакрашенные ромбы); ME A02 G12D (закрашенные ромбы); смесью ME HLA-A11 WT (незакрашенные квадраты); или смесью ME HLA-A11 G12D (закрашенные квадраты). В качестве контроля трансдуцированные клетки культивировали отдельно (только Т-клетки) (звездочки) или культивировали с ДМСО (звезды) или материалом - магнитными шариками с антителами против CD28/против CD3 (шестиугольники).[0014] Fig. 3A-3B: 4373 TCR-transduced PBL tested for KRAS G12D reactivity. Fig. 3A is a graph showing the ELISPOT measurement of IFN-γ secretion (number of spots per 3e4 cells). Fig. 3B is a graph showing the results of a flow cytometry analysis of 4-1 BB and OX40 expression (% 4-1 BB+/OX40+) of CD8 sorted cells measured after co-culture of effector cells with target cells. The effector cells were autologous CD8+ PBL from Patient 4373 transduced with a retroviral expression vector encoding (i) 4373 TCRs 1 and 2, which are suspected to be G12D RAS-reactive (with human variable regions); (ii) the HLA-A11-restricted, murine anti-KRAS G12D TCR of Example 1; or (iii) green fluorescent protein (GFP) (control). Cells transduced with empty vector served as an additional control (Mock Td). Target cells were autologous dendritic cells (DCs) transfected with mRNA for the full-length (FL) gene, which was either the KRAS WT gene (open circles) or the FL gene with the KRAS G12D mutation (filled circles); autologous DCs loaded with a peptide that was WT KRAS LP (open triangles) or G12D Mut KRAS LP (filled triangles), or loaded with a minimal KRAS epitope (ME): ME A02 WT (open diamonds); ME A02 G12D (filled diamonds); a mixture of ME HLA-A11 WT (open squares); or a mixture of ME HLA-A11 G12D (filled squares). As controls, transduced cells were cultured alone (T cells only) (asterisks) or cultured with DMSO (stars) or the material—magnetic beads with anti-CD28/anti-CD3 antibodies (hexagons).
[0015] Фиг. 4А-4С: тестирование авидности TCR в отношении аутологичных DC, загруженных титрованием ME: Фиг. 4А представляет собой график, показывающий результаты по секреции IFN-γ ELISPOT (число пятен на 3е4 клеток). Фиг. 4В и 4С представляют собой графики, показывающие результаты анализа на основе проточной цитометрии экспрессии 4-1 ВВ и ОХ40 (% 4-1 ВВ+/ОХ40+) (4 В) в случае CD8 отсортированных и в отношении CD4 отсортированных mTCR-позитивных PBL (4С), измеренные после совместного культивирования эффекторных клеток с клетками-мишенями. Эффекторные клетки представляли собой аутологичные PBL Пациента 4373, трансдуцированные ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 2 (с вариабельными областями человека). Клетки-мишени представляли собой аутологичные DC Пациента 4373, загруженные следующими пептидами в показанных концентрациях: мутантный минимальный эпитоп-пептид с 10 аминокислотными остатками (VWGADGVGK) (SEQ ID NO: 29) (незакрашенные круги) или минимальный эпитоп-пептид WT с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 31) (закрашенные круги).[0015] Fig. 4A-4C: TCR avidity testing against autologous DCs loaded with ME titration: Fig. 4A is a graph showing the results of IFN-γ secretion ELISPOT (number of spots per 3e4 cells). Fig. 4B and 4C are graphs showing the results of flow cytometry analysis of 4-1 BB and OX40 expression (% 4-1 BB+/OX40+) (4B) in CD8 sorted and in CD4 sorted mTCR-positive PBL (4C), measured after co-culture of effector cells with target cells. Effector cells were autologous PBL from Patient 4373 transduced with a retroviral expression vector encoding the G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 2 (with human variable regions). Target cells were autologous DC from Patient 4373 loaded with the following peptides at the concentrations shown: mutant 10-amino acid residue minimal epitope peptide (VWGADGVGK) (SEQ ID NO: 29) (open circles) or WT 10-amino acid residue minimal epitope peptide (SEQ ID NO: 31) (filled circles).
[0016] Фиг. 5А-5С: тестирование авидности TCR в отношении линии аутологичных клеток COS-A11, загруженных титрованием ME: Фиг. 5А представляет собой график, показывающий результаты по секреции IFN-γ ELISPOT (число пятен на 3е4 клеток). Фиг. 5В и 5С представляют собой графики, показывающие результаты анализа на основе проточной цитометрии экспрессии 4-1 ВВ и ОХ40 (% 4-1 ВВ+/ОХ40+) в случае CD8 отсортированных (5 В) и в случае CD4 отсортированных mTCR-позитивных PBL (5С), измеренные после совместного культивирования эффекторных клеток с клетками-мишенями. Эффекторные клетки представляли собой аутологичные PBL Пациента 4373, трансдуцированные ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 2 (с человеческими вариабельными областями). Клетки-мишени представляли собой аутологичные DC Пациента 4373, загруженные следующими пептидами в показанных концентрациях: мутантный минимальный пептид - эпитоп с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 29) (незакрашенные круги) или минимальный пептид - эпитоп WT с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 31) (закрашенные круги).[0016] Fig. 5A-5C: TCR avidity testing against the autologous COS-A11 cell line loaded with ME titration: Fig. 5A is a graph showing the results of IFN-γ secretion ELISPOT (number of spots per 3e4 cells). Fig. 5B and 5C are graphs showing the results of flow cytometry analysis of 4-1 BB and OX40 expression (% 4-1 BB+/OX40+) in CD8 sorted (5B) and CD4 sorted mTCR-positive PBL (5C), measured after co-culture of effector cells with target cells. Effector cells were autologous PBL from Patient 4373 transduced with a retroviral expression vector encoding the G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 2 (with human variable regions). Target cells were autologous DC from Patient 4373 loaded with the following peptides at the concentrations shown: mutant minimal peptide - 10-amino acid residue epitope (SEQ ID NO: 29) (open circles) or minimal peptide - WT epitope with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 31) (filled circles).
Подробное описание изобретенияDetailed description of the invention
[0017] Белки семейства RAS принадлежат к большому семейству малых ГТФаза. Не будучи связанными конкретной теорией или механизмом, полагают, что, являясь мутантными, белки RAS могут участвовать в передачи сигнала рано в онкогенезе многих раковых заболеваний человека. Замена одной единственной аминокислоты может активировать белок. Мутантный белковый продукт RAS может быть конститутивно активирован. Мутантные белки RAS могут экспрессироваться в любом многообразии раковых заболеваний человека, таких как, например, рак поджелудочной железы (например, карцинома поджелудочной железы), коло ректальный рак, рак легкого (например, аденокарцинома легкого), рак эндометрия, рак яичника (например, эпителиальный рак яичника) и рак предстательной железы. Белки семейства RAS человека включают KRAS, HRAS и NRAS.[0017] The RAS family proteins belong to a large family of small GTPases. Without being bound by a specific theory or mechanism, it is believed that, when mutant, RAS proteins may participate in signaling early in the oncogenesis of many human cancers. A single amino acid substitution can activate the protein. A mutant RAS protein product can be constitutively activated. Mutant RAS proteins can be expressed in any variety of human cancers, such as, for example, pancreatic cancer (e.g., pancreatic carcinoma), colorectal cancer, lung cancer (e.g., lung adenocarcinoma), endometrial cancer, ovarian cancer (e.g., epithelial ovarian cancer), and prostate cancer. Human RAS family proteins include KRAS, HRAS, and NRAS.
[0018] KRAS также называется ГТФазой KRas, вирусным онкогеном саркомы крыс Кирстен V-Ki-Ras2 или KRAS2. Существуют два варианта транскрипта KRAS: вариант KRAS А и вариант KRAS В. Вариант KRAS А дикого типа (WT) имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9. Вариант KRAS В WT имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10. Далее в данном документе, ссылки на «KRAS» (мутантный или немутантный (WT)) относятся как к варианту А, так и варианту В, если особым образом не указано иное. При активации мутантный KRAS связывается с гуанозин-5'-трифосфатом (ГТФ) и превращает ГТФ в гуанозин-5'-дифосфат (ГДФ).[0018] KRAS is also called KRas GTPase, Kirsten rat sarcoma viral oncogene V-Ki-Ras2, or KRAS2. There are two variants of the KRAS transcript: KRAS variant A and KRAS variant B. The wild-type (WT) KRAS variant A has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9. The WT KRAS variant B has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10. Hereinafter, references to "KRAS" (mutant or non-mutant (WT)) refer to both variant A and variant B unless specifically stated otherwise. When activated, mutant KRAS binds to guanosine 5'-triphosphate (GTP) and converts GTP to guanosine 5'-diphosphate (GDP).
[0019] HRAS представляет собой еще один член семейства белков RAS. HRAS также называют вирусным онкобелком саркомы крыс Харви, гомологом вирусного онкогена саркомы крыс Харви V-Ha-Ras или белком, связывающим малые ГТФ, семейства Ras H-Ras. HRAS WT имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11.[0019] HRAS is another member of the RAS protein family. HRAS is also known as Harvey rat sarcoma viral oncoprotein, Harvey rat sarcoma viral oncogene homolog V-Ha-Ras, or small GTP-binding protein of the Ras family H-Ras. HRAS WT has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 11.
[0020] NRAS является еще одним членом семейства белков RAS. NRAS также называют ГТФазой NRas, гомологом вирусного онкогена нейробластомы RAS V-Ras или NRAS1. NRAS WT имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12.[0020] NRAS is another member of the RAS protein family. NRAS is also known as NRas GTPase, neuroblastoma viral oncogene RAS homolog V-Ras, or NRAS1. NRAS WT has the amino acid sequence SEQ ID NO: 12.
[0021] Согласно одному воплощению предложен выделенный или очищенный TCR, где TCR обладает антигенной специфичностью в отношении аминокислотной последовательности мутантного человеческого RAS с заменой глицина в положении 12 аспарагиновой кислотой, где аминокислотная последовательность мутантного человеческого RAS представляет собой аминокислотную последовательность мутантного человеческого KRAS, мутантного человеческого HRAS или мутантного человеческого NRAS, и где положение 12 определяется, исходя из белка человеческого KRAS WT, человеческого HRAS WT или человеческого NRAS WT, соответственно. Далее в данном документе, ссылки на «TCR» также относятся к функциональным частям и функциональным вариантам TCR, если не указано иное.[0021] According to one embodiment, an isolated or purified TCR is provided, wherein the TCR has antigen specificity for the amino acid sequence of a mutant human RAS with a glycine substitution at position 12 with aspartic acid, wherein the amino acid sequence of the mutant human RAS is the amino acid sequence of a mutant human KRAS, a mutant human HRAS, or a mutant human NRAS, and wherein position 12 is determined based on a human KRAS WT, human HRAS WT, or human NRAS WT protein, respectively. Hereinafter, references to "TCR" also refer to functional portions and functional variants of a TCR, unless otherwise stated.
[0022] Аминокислотная последовательность мутантного человеческого RAS может представлять собой аминокислотную последовательность мутантного человеческого KRAS, аминокислотную последовательность мутантного человеческого HRAS или аминокислотную последовательность мутантного человеческого NRAS. Каждая из аминокислотных последовательностей человеческого белка KRAS, NRAS и HRAS WT имеет длину 188 или 189 аминокислотных остатков и имеет высокую степень идентичности друг с другом. Например, аминокислотная последовательность человеческого белка NRAS WT на 86,8% идентична аминокислотной последовательности человеческого белка KRAS WT. Аминокислотные остатки 1-86 человеческого белка NRAS WT и человеческого белка KRAS WT идентичны на 100%. Аминокислотная последовательность человеческого белка HRAS WT на 86,3% идентична аминокислотной последовательности человеческого белка KRAS WT. Аминокислотные остатки 1-94 человеческого белка HRAS WT и человеческого белка KRAS WT идентичны на 100%. Далее в данном документе, ссылки на «RAS» (мутантный или немутантный (WT)) в совокупности относятся к KRAS, HRAS и NRAS, если не указано иное.[0022] The amino acid sequence of the mutant human RAS may be the amino acid sequence of the mutant human KRAS, the amino acid sequence of the mutant human HRAS, or the amino acid sequence of the mutant human NRAS. Each of the amino acid sequences of the human KRAS, NRAS, and WT HRAS proteins is 188 or 189 amino acid residues long and has a high degree of identity with each other. For example, the amino acid sequence of the human NRAS WT protein is 86.8% identical to the amino acid sequence of the human KRAS WT protein. Amino acid residues 1-86 of the human NRAS WT protein and the human KRAS WT protein are 100% identical. The amino acid sequence of the human HRAS WT protein is 86.3% identical to the amino acid sequence of the human KRAS WT protein. Amino acid residues 1-94 of the human HRAS WT protein and the human KRAS WT protein are 100% identical. Hereafter, references to "RAS" (mutant or non-mutant (WT)) collectively refer to KRAS, HRAS, and NRAS unless otherwise specified.
[0023] В одном воплощении изобретения аминокислотная последовательность мутантного человеческого RAS включает аминокислотную последовательность человеческого RAS с заменой глицина в положении 12 аспарагиновой кислотой, где положение 12 определяется с учетом соответствующего белка RAS WT. Белок RAS WT может представлять собой любой из белка KRAS WT (SEQ ID NO: 9 или 10), белка HRAS WT (SEQ ID NO: 11) или белка NRAS WT (SEQ ID NO: 12), поскольку, как объясняется выше, аминокислотные остатки 1-86 человеческого белка NRAS WT и человеческого белка KRAS WT идентичны на 100%, и аминокислотные остатки 1-94 человеческого белка HRAS WT и человеческого белка KRAS WT идентичны на 100%. Соответственно, аминокислотный остаток в положении 12 каждого из белков KRAS WT, HRAS WT и NRAS WT является одним и тем же, а именно, глицином.[0023] In one embodiment of the invention, the amino acid sequence of the mutant human RAS comprises the amino acid sequence of human RAS with a substitution of glycine at position 12 with aspartic acid, wherein position 12 is determined taking into account the corresponding WT RAS protein. The WT RAS protein may be any of the WT KRAS protein (SEQ ID NO: 9 or 10), the WT HRAS protein (SEQ ID NO: 11), or the WT NRAS protein (SEQ ID NO: 12), since, as explained above, amino acid residues 1-86 of the WT human NRAS protein and the WT human KRAS protein are 100% identical, and amino acid residues 1-94 of the WT human HRAS protein and the WT human KRAS protein are 100% identical. Accordingly, the amino acid residue at position 12 of each of the WT KRAS, WT HRAS, and WT NRAS proteins is the same, namely, glycine.
[0024] Аминокислотная последовательность мутантного человеческого RAS имеет замену глицина в положении 12 аспарагиновой кислотой. В связи с этим, согласно воплощениям изобретения предложены TCR с антигенной специфичностью в отношении аминокислотной последовательности любого человеческого белка RAS, полипептида или пептида с мутацией G12D.[0024] The amino acid sequence of the mutant human RAS has a substitution of glycine at position 12 with aspartic acid. In this regard, embodiments of the invention provide TCRs with antigen specificity for the amino acid sequence of any human RAS protein, polypeptide, or peptide with the G12D mutation.
[0025] Мутации и замены RAS определяются в данном документе, исходя из аминокислотной последовательности соответствующего белка RAS WT. Таким образом, мутации и замены RAS описаны в данном документе, исходя из аминокислотного остатка, находящегося в конкретном положении в белке RAS WT (а именно, положении 12) с последующим номером положения, за которым следует аминокислотный остаток, которым заменен тот остаток в конкретной обсуждаемой мутации или замене. Аминокислотная последовательность RAS (например, пептид RAS) может содержать меньше, чем все из аминокислотных остатков полноразмерного белка RAS WT. Соответственно, положение 12 определено в данном документе с учетом полноразмерного белка RAS WT (а именно, любая из SEQ ID NO: 9-12), исходя из предположения, что фактическое положение соответствующего остатка в конкретном примере аминокислотной последовательности RAS может отличаться. Когда положения представляют собой такие, как определено любой из SEQ ID NO: 9-12, термин «G12» относится к глицину, обычно находящемуся в положении 12 любой из SEQ ID NO: 9-12, и «G12D» указывает на то, что глицин, обычно находящийся в положении 12 любой из SEQ ID NO: 9-12, заменен аспарагиновой кислотой. Например, когда конкретный пример аминокислотной последовательности RAS представляет собой, например, WVGAGGVGK (SEQ ID NO: 31) (иллюстративный пептид KRAS WT, соответствующий смежным аминокислотным остаткам 7-16 SEQ ID NO: 9), «G12D» относится к замене подчеркнутого глицина в SEQ ID NO: 31 аспарагиновой кислотой, даже при том, что фактическое положение подчеркнутого глицина в SEQ ID NO: 31 представляет собой 6. Аминокислотные последовательности RAS человека с мутацией G12D в данном документе называются «G12D RAS».[0025] RAS mutations and substitutions are defined herein based on the amino acid sequence of the corresponding WT RAS protein. Thus, RAS mutations and substitutions are described herein based on the amino acid residue located at a particular position in the WT RAS protein (namely, position 12) followed by a position number, followed by the amino acid residue that replaces that residue in the particular mutation or substitution being discussed. An amino acid sequence of RAS (e.g., a RAS peptide) may contain fewer than all of the amino acid residues of the full-length WT RAS protein. Accordingly, position 12 is defined herein based on the full-length WT RAS protein (namely, any of SEQ ID NOs: 9-12), with the understanding that the actual position of the corresponding residue in a particular example of an RAS amino acid sequence may differ. When the positions are as defined by any of SEQ ID NOs: 9-12, the term "G12" refers to the glycine typically found at position 12 of any of SEQ ID NOs: 9-12, and "G12D" indicates that the glycine typically found at position 12 of any of SEQ ID NOs: 9-12 is replaced by aspartic acid. For example, when a particular example of an amino acid sequence of RAS is, for example, WVGAGGVGK (SEQ ID NO: 31) (an illustrative WT KRAS peptide corresponding to contiguous amino acid residues 7-16 of SEQ ID NO: 9), "G12D" refers to the replacement of the underlined glycine in SEQ ID NO: 31 with aspartic acid, even though the actual position of the underlined glycine in SEQ ID NO: 31 is 6. Amino acid sequences of human RAS with the G12D mutation are referred to herein as "G12D RAS".
[0026] Примеры полноразмерных белков RAS с мутацией G12D изложены ниже в Таблице 1.[0026] Examples of full-length RAS proteins with the G12D mutation are shown below in Table 1.
[0027] В одном воплощении изобретения TCR обладает антигенной специфичностью в отношении пептида RAS с мутацией G12D, описанной выше, где пептид G12D RAS имеет любую длину. В одном воплощении изобретения пептид G12D RAS имеет любую длину, подходящую для связывания с любой из молекул HLA Класса I, описанных в данном документе. Например, TCR может обладать антигенной специфичностью в отношении пептида RAS с мутацией G12D, причем пептид RAS имеет длину от примерно 9 до примерно 10 аминокислотных остатков. Пептид G12D RAS может содержать любые смежные аминокислотные остатки мутантного белка RAS, которые включают мутацию G12D. В одном воплощении изобретения TCR может обладать антигенной специфичностью в отношении пептида RAS с мутацией G12D, причем мутантный пептид RAS имеет длину примерно 9 аминокислотных остатков или примерно 10 аминокислотных остатков. Примеры конкретных пептидов, каждый с мутацией G12D, которые могут распознаваться TCR по изобретению, представляют собой 9-mer (SEQ ID NO: 28) и 10-mer (SEQ ID NO: 29). В одном воплощении изобретения TCR обладает антигенной специфичностью в отношении мутантной человеческой аминокислотной последовательности RAS SEQ ID NO: 29. В одном воплощении изобретения TCR не обладает антигенной специфичностью в отношении аминокислотной последовательности человеческого RAS дикого типа WGAGGVGK (SEQ ID NO: 30) или 10-mer (SEQ ID NO: 31).[0027] In one embodiment of the invention, the TCR has antigen specificity for a RAS peptide with the G12D mutation described above, wherein the RAS G12D peptide is of any length. In one embodiment of the invention, the RAS G12D peptide is of any length suitable for binding to any of the HLA Class I molecules described herein. For example, the TCR may have antigen specificity for a RAS peptide with the G12D mutation, wherein the RAS peptide is from about 9 to about 10 amino acid residues in length. The RAS G12D peptide may comprise any contiguous amino acid residues of a mutant RAS protein that include the G12D mutation. In one embodiment of the invention, the TCR may have antigen specificity for a RAS peptide with the G12D mutation, wherein the mutant RAS peptide is about 9 amino acid residues in length or about 10 amino acid residues in length. Examples of specific peptides, each with a G12D mutation, that can be recognized by the TCR of the invention are 9-mer (SEQ ID NO: 28) and 10-mer (SEQ ID NO: 29). In one embodiment of the invention, the TCR has antigen specificity for the mutant human RAS amino acid sequence of SEQ ID NO: 29. In one embodiment of the invention, the TCR does not have antigen specificity for the wild-type human RAS amino acid sequence WGAGGVGK (SEQ ID NO: 30) or 10-mer (SEQ ID NO: 31).
[0028] В одном воплощении изобретения TCR по изобретению могут распознавать G12D RAS, презентируемый молекулой HLA Класса I. В связи с этим, TCR может вызывать иммунный ответ при связывании с G12D RAS в контексте молекулы HLA Класса I. TCR по изобретению могут распознавать G12D RAS, который презентирован молекулой HLA Класса I, и могут связываться с молекулой HLA класса I помимо G12D RAS.[0028] In one embodiment of the invention, the TCRs of the invention can recognize G12D RAS presented by an HLA Class I molecule. In this regard, the TCR can elicit an immune response when binding to G12D RAS in the context of an HLA Class I molecule. The TCRs of the invention can recognize G12D RAS that is presented by an HLA Class I molecule and can bind to an HLA Class I molecule in addition to G12D RAS.
[0029] В одном воплощении изобретения молекула HLA Класса I представляет собой молекулу HLA-A. Молекула HLA-A представляет собой гетеродимер цепи α и микроглобулина β2. Цепь α HLA-A может кодироваться геном HLA-A. Микроглобулин β2 связывается нековалентно с доменами α1, α2 и α3 цепи α с построением комплекса HLA-A. Молекула HLA-A может представлять собой любую молекулу HLA-A. В одном воплощении изобретения молекула HLA Класса I представляет собой молекулу HLA-A11. Молекула HLA-A11 может представлять собой молекулу HLA-A11. Примеры молекул HLA-A11 могут включать, но не ограничиваются молекулами, кодируемыми аллелями HLA-А*11:01, HLA-А*11:02, HLA-А*11:03 или HLA-А*11:04. Предпочтительно, молекула HLA Класса I кодируется аллелью HLA-А*11:01.[0029] In one embodiment of the invention, the HLA Class I molecule is an HLA-A molecule. The HLA-A molecule is a heterodimer of the α chain and β2 microglobulin. The α chain of HLA-A may be encoded by the HLA-A gene. β2 microglobulin binds non-covalently to the α1, α2, and α3 domains of the α chain to form an HLA-A complex. The HLA-A molecule may be any HLA-A molecule. In one embodiment of the invention, the HLA Class I molecule is an HLA-A11 molecule. The HLA-A11 molecule may be an HLA-A11 molecule. Examples of HLA-A11 molecules may include, but are not limited to, molecules encoded by the HLA-A*11:01, HLA-A*11:02, HLA-A*11:03, or HLA-A*11:04 alleles. Preferably, the HLA Class I molecule is encoded by the HLA-A*11:01 allele.
[0030] TCR по изобретению могут обеспечивать любое одно или более из множества преимуществ, включая то, когда экспрессируются клетками, используемыми для адоптивного переноса клеток. G12D RAS экспрессируется раковыми клетками и не экспрессируется нормальными, нераковыми клетками. Не будучи связанными конкретной теорией или механизмом, полагают, что TCR по изобретению преимущественно нацелены на разрушение раковых клеток при минимизации или устранении разрушения нормальных, нераковых клеток, с уменьшением, таким образом, токсичности. Кроме того, поскольку мутация G12D, по всей вероятности, встречается на ранних стадиях опухолеобразования, мутация G12D RAS может экспрессироваться по существу во всех раковых клетках пациента. TCR по изобретению могут, преимущественно, успешно лечить или предупреждать G12D RAS-позитивные раковые заболевания, которые не отвечают на другие типы лечения, такие как, например, химиотерапия, хирургическое вмешательство или лучевая терапия. Кроме того, TCR по изобретению могут обеспечивать высокоавидное распознавание G12D RAS, которое может обеспечивать способность распознавать неманипулированные опухолевые клетки (например, опухолевые клетки, которые не обрабатывали интерфероном (IFN)-γ, трансфицированные вектором, кодирующим один или оба из G12D RAS и HLA-А*11:01, в которые под действием импульса вводили пептид G12D RAS или их комбинацию). Мутации KRAS обнаружены в примерно 70% рака поджелудочной железы, 36% колоректального рака и 20% рака легкого. Чаще всего, мутации встречаются в кодоне 12 (кодирующем глицин, G). Мутация KRAS G12D обнаружена в примерно 36% и примерно 12% пациентов с раком поджелудочной железы и коло ректальным раком, соответственно. Кроме того, аллель HLA-А*11:01 экспрессируется у приблизительно 14% и приблизительно 9% кавказских и испанских этнических групп, соответственно. Аллель HLA-А*11:01 экспрессируется вплоть до примерно 45% азиатских этнических групп в Соединенных Штатах Америки. Соответственно, TCR по изобретению могут увеличивать число пациентов с раком, подходящих для иммунотерапии, с включением тех пациентов, которые экспрессируют аллель HLA-А*11:01, которые не могут подходить для иммунотерапии, с использованием TCR, которые распознают RAS, презентируемый другими молекулами МНС (от англ. major histocompatibility complex - главный комплекс гистосовместимости). Кроме того, TCR, полипептиды и белки по изобретению содержат аминокислотные последовательности человеческих гипервариабельных областей (CDR - от англ. complementarity determining region) и вариабельных областей, которые могут уменьшить риск отторжения иммунной системой человека, по сравнению с, например, TCR, полипептидами и белками, содержащими аминокислотные последовательности мышиных CDR и вариабельных областей.[0030] The TCRs of the invention may provide any one or more of a variety of advantages, including when expressed by cells used for adoptive cell transfer. G12D RAS is expressed by cancer cells and is not expressed by normal, non-cancerous cells. Without being bound by a particular theory or mechanism, it is believed that the TCRs of the invention advantageously target the destruction of cancer cells while minimizing or eliminating the destruction of normal, non-cancerous cells, thereby reducing toxicity. Furthermore, since the G12D mutation is likely to occur early in tumorigenesis, the G12D RAS mutation may be expressed in substantially all of a patient's cancer cells. The TCRs of the invention may advantageously successfully treat or prevent G12D RAS-positive cancers that are unresponsive to other types of treatment, such as, for example, chemotherapy, surgery, or radiation therapy. Furthermore, the TCRs of the invention can provide high-avidity recognition of G12D RAS, which may provide the ability to recognize unmanipulated tumor cells (e.g., tumor cells that have not been treated with interferon (IFN)-γ, transfected with a vector encoding one or both of G12D RAS and HLA-A*11:01, and pulsed with a G12D RAS peptide or a combination thereof). KRAS mutations are found in approximately 70% of pancreatic cancer, 36% of colorectal cancer, and 20% of lung cancer. The most common mutation is codon 12 (encoding glycine, G). The KRAS G12D mutation is found in approximately 36% and approximately 12% of patients with pancreatic cancer and colorectal cancer, respectively. Furthermore, the HLA-A*11:01 allele is expressed in approximately 14% and approximately 9% of Caucasian and Hispanic ethnic groups, respectively. The HLA-A*11:01 allele is expressed in up to approximately 45% of Asian ethnic groups in the United States. Accordingly, the TCRs of the invention can increase the number of cancer patients eligible for immunotherapy by including those patients expressing the HLA-A*11:01 allele who may not be eligible for immunotherapy using TCRs that recognize RAS presented by other MHC (major histocompatibility complex) molecules. In addition, the TCRs, polypeptides and proteins of the invention contain amino acid sequences of human complementarity determining regions (CDRs) and variable regions, which can reduce the risk of rejection by the human immune system, compared to, for example, TCRs, polypeptides and proteins containing amino acid sequences of mouse CDRs and variable regions.
[0031] Фраза «антигенная специфичность», в том виде, в котором она используется в данном документе, означает, что TCR может специфично связываться с и иммунологически распознавать G12D RAS с высокой авидностью. Например, считается, что TCR может обладать «антигенной специфичностью» в отношении G12D RAS, если примерно от 1 × 104 до примерно 1 × 105 Т-клеток, экспрессирующих TCR, секретируют по меньшей мере примерно 200 пг/мл или больше (например, 200 пг/мл или больше, 300 пг/мл или больше, 400 пг/мл или больше, 500 г/мл или больше, 600 пг/мл или больше, 700 пг/мл или больше, 1000 пг/мл или больше, 5000 пг/мл или больше, 7000 пг/мл или больше, 10000 пг/мл или больше, 20000 пг/мл или больше или интервал, определенный любыми двумя из приведенных выше значений) IFN-γ при совместном культивировании с (а) антиген-негативными клетками-мишенями, позитивными в отношении молекулы HLA Класса I, в которые под действием импульса вводили низкую концентрацию пептида G12D RAS (например, от примерно 0,05 нг/мл до примерно 10 нг/мл, 1 нг/мл, 2 нг/мл, 5 нг/мл, 8 нг/мл, 10 нг/мл или интервал, определенный любыми двумя из приведенных выше значений), или (b) антиген-негативными клетками-мишенями, позитивными в отношении молекулы HLA Класса I, в которые вводили нуклеотидную последовательность, кодирующую G12D RAS, таким образом, чтобы клетка-мишень экспрессировала G12D RAS. Клетки, экспрессирующие TCR по изобретению, могут также секретировать IFN-γ при совместном культивировании с антиген-негативными клетками-мишенями, позитивными в отношении молекулы HLA Класса I, в которые под действием импульса вводили высокие концентрации пептида G12D RAS. Молекула HLA Класса I может представлять собой любую из молекул HLA Класса I, описанных в данном документе (например, молекулу HLA-А*11:01).[0031] The phrase "antigen specificity," as used herein, means that the TCR can specifically bind to and immunologically recognize G12D RAS with high avidity. For example, a TCR is considered to have “antigen specificity” for G12D RAS if about 1 x 10 4 to about 1 x 10 5 T cells expressing the TCR secrete at least about 200 pg/mL or more (e.g., 200 pg/mL or more, 300 pg/mL or more, 400 pg/mL or more, 500 pg/mL or more, 600 pg/mL or more, 700 pg/mL or more, 1,000 pg/mL or more, 5,000 pg/mL or more, 7,000 pg/mL or more, 10,000 pg/mL or more, 20,000 pg/mL or more, or a range defined by any two of the above values) of IFN-γ when co-cultured. with (a) antigen-negative target cells positive for an HLA Class I molecule that have been pulsed with a low concentration of a G12D RAS peptide (e.g., from about 0.05 ng/ml to about 10 ng/ml, 1 ng/ml, 2 ng/ml, 5 ng/ml, 8 ng/ml, 10 ng/ml, or a range defined by any two of the above values), or (b) antigen-negative target cells positive for an HLA Class I molecule that have been pulsed with a nucleotide sequence encoding a G12D RAS such that the target cell expresses a G12D RAS. Cells expressing the TCR of the invention can also secrete IFN-γ when co-cultured with antigen-negative target cells positive for an HLA Class I molecule that have been pulsed with high concentrations of the RAS G12D peptide. The HLA Class I molecule can be any of the HLA Class I molecules described herein (e.g., the HLA-A*11:01 molecule).
[0032] В качестве альтернативы или дополнительно, считается, что TCR может обладать «антигенной специфичностью» в отношении G12D RAS, если Т-клетки, экспрессирующие TCR, секретируют по меньшей мере в два раза больше (например, в пять раз) IFN-γ при совместном культивировании с (а) антиген-негативными клетками-мишенями, позитивными в отношении молекулы HLA Класса I, в которые под действием импульса вводили низкую концентрацию пептида G12D RAS, или (b) антиген-негативными клетками-мишенями, позитивными в отношении молекулы HLA Класса I, в которые вводили нуклеотидную последовательность, кодирующую G12D RAS, таким образом, что клетка-мишень экспрессирует G12D RAS, по сравнению с количеством IFN-γ, экспрессируемым отрицательным контролем. Отрицательный контроль может представлять собой, например, (i) Т-клетки, экспрессирующие TCR, совместно культивируемые с (а) антиген-негативными клетками-мишенями, позитивными в отношении молекулы HLA Класса I, в которые под действием импульса вводили такую же концентрацию нерелевантного пептида (например, какого-то другого пептида с последовательностью, отличной от пептида G12D RAS), или (b) антиген-негативными клетками-мишенями, позитивными в отношении молекулы HLA Класса I, в которые вводили нуклеотидную последовательность, кодирующую нерелевантный пептид, таким образом, что клетка-мишень экспрессирует нерелевантный пептид, или (ii) нетрансдуцированные Т-клетки (например, происходящие из РВМС (от англ. human peripheral blood mononuclear cell -мононуклеарная клетка периферической крови человека), которые не экспрессируют TCR), совместно культивируемые с (а) клетками-мишенями, негативными в отношении антигена, позитивными в отношении молекулы HLA Класса I, в которые под действием импульса вводили такую же концентрацию пептида G12D RAS, или (b) клетками-мишенями, негативными в отношении антигена, позитивными в отношении молекулы HLA Класса I, в которые введена нуклеотидная последовательность, кодирующая G12D RAS, таким образом, что клетка-мишень экспрессирует G12D RAS. Молекула HLA Класса I, экспрессируемая клетками-мишенями отрицательного контроля, могла быть такой же молекулой HLA Класса I, экспрессируемой клетками-мишенями, которые совместно культивируют с тестируемыми Т-клетками. Молекула HLA Класса I может представлять собой любую из молекул HLA Класса I, описанных в данном документе (например, молекула HLA-А*11:01). Секрецию IFN-γ можно измерять способами, известными в данной области, такими как, например, твердофазный иммуноферментный анализ (ELISA - от англ. enzyme-linked immunosorbent assay).[0032] Alternatively, or in addition, a TCR is considered to have "antigen specificity" for G12D RAS if T cells expressing the TCR secrete at least twofold (e.g., fivefold) more IFN-γ when co-cultured with (a) antigen-negative target cells positive for an HLA Class I molecule that have been pulsed with a low concentration of a G12D RAS peptide, or (b) antigen-negative target cells positive for an HLA Class I molecule that have been pulsed with a nucleotide sequence encoding G12D RAS, such that the target cell expresses G12D RAS, compared to the amount of IFN-γ expressed by the negative control. A negative control may be, for example, (i) TCR-expressing T cells co-cultured with (a) antigen-negative target cells positive for an HLA Class I molecule that have been pulsed with the same concentration of an irrelevant peptide (e.g., some other peptide with a sequence different from the G12D RAS peptide), or (b) antigen-negative target cells positive for an HLA Class I molecule that have been pulsed with a nucleotide sequence encoding an irrelevant peptide such that the target cell expresses the irrelevant peptide, or (ii) untransduced T cells (e.g., those derived from PBMCs, which do not express the TCR) co-cultured with (a) target cells (b) antigen-negative, HLA Class I molecule-positive target cells pulsed with the same concentration of G12D RAS peptide, or (c) antigen-negative, HLA Class I molecule-positive target cells pulsed with a nucleotide sequence encoding G12D RAS such that the target cell expresses G12D RAS. The HLA Class I molecule expressed by the negative control target cells could be the same HLA Class I molecule expressed by the target cells co-cultured with the test T cells. The HLA Class I molecule may be any of the HLA Class I molecules described herein (e.g., an HLA-A*11:01 molecule). IFN-γ secretion can be measured by methods known in the art, such as enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA).
[0033] В качестве альтернативы или дополнительно, считается, что TCR может обладать «антигенной активностью» в отношении G12D RAS, если по меньшей мере в два раза большее (например, в пять раз) число Т-клеток, экспрессирующих TCR, секретируют IFN-γ при совместной культивации с (а) антиген-негативными клетками-мишенями, позитивными в отношении молекулы HLA Класса I, в которые под действием импульса вводили низкую концентрацию пептида G12D RAS, или (b) антиген-негативными клетками-мишенями, позитивными в отношении молекулы HLA Класса I, в которые вводили нуклеотидную последовательность, кодирующую G12D RAS, таким образом, чтобы клетка-мишень экспрессировала G12D RAS, по сравнению с числом Т-клеток отрицательного контроля, которые секретируют IFN-γ. Молекула HLA Класса I, концентрация пептида и отрицательный контроль могут представлять собой такие, как описано в данном документе, в отношении других аспектов изобретения. Число клеток, секретирующих IFN-γ, может быть измерено способами, известными в данной области, такими как, например, ELISPOT.[0033] Alternatively, or in addition, a TCR is considered to have "antigenic activity" for G12D RAS if at least two-fold (e.g., five-fold) more T cells expressing the TCR secrete IFN-γ when co-cultured with (a) antigen-negative target cells positive for an HLA Class I molecule that have been pulsed with a low concentration of a G12D RAS peptide, or (b) antigen-negative target cells positive for an HLA Class I molecule that have been pulsed with a nucleotide sequence encoding G12D RAS such that the target cell expresses G12D RAS, compared to the number of negative control T cells that secrete IFN-γ. The HLA Class I molecule, peptide concentration, and negative control may be as described herein with respect to other aspects of the invention. The number of IFN-γ-secreting cells may be measured by methods known in the art, such as, for example, ELISPOT.
[0034] В качестве альтернативы или дополнительно, считается, что TCR может обладать «антигенной активностью» в отношении G12D RAS, если Т-клетки, экспрессирующие TCR, осуществляют повышающую регуляцию экспрессии одного или более маркеров активации Т-клеток, как измерено, например, посредством проточной цитометрии после стимуляции клетками-мишенями, экспрессирующими G12D RAS. Примеры маркеров активации Т-клеток включают 4-1 ВВ, ОХ40, CD107a, CD69 и цитокины, которые подвергаются повышающей регуляции при антигенной стимуляции (например, фактор некроза опухоли (TNF - от англ. tumor necrosis factor), интерлейкин (IL)-2, и т.д.).[0034] Alternatively, or in addition, a TCR is considered to have "antigenic activity" with respect to G12D RAS if T cells expressing the TCR upregulate the expression of one or more markers of T cell activation, as measured, for example, by flow cytometry after stimulation with target cells expressing G12D RAS. Examples of markers of T cell activation include 4-1 BB, OX40, CD107a, CD69, and cytokines that are upregulated upon antigenic stimulation (e.g., tumor necrosis factor (TNF), interleukin (IL)-2, etc.).
[0035] Согласно воплощению изобретения предложен TCR, содержащий два полипептида (например, полипептидные цепи), такие как цепь альфа (α) TCR, цепь бета (β) TCR, цепь гамма (γ) TCR, цепь дельта (5) TCR или их комбинацию. Полипептиды TCR по изобретению могут содержать любую аминокислотную последовательность, при условии, что TCR обладает антигенной специфичностью в отношении G12D RAS. В некоторых воплощениях TCR не встречается в природе.[0035] According to an embodiment of the invention, there is provided a TCR comprising two polypeptides (e.g., polypeptide chains), such as a TCR alpha (α) chain, a TCR beta (β) chain, a TCR gamma (γ) chain, a TCR delta (β) chain, or a combination thereof. The TCR polypeptides of the invention may comprise any amino acid sequence, provided that the TCR has antigen specificity for G12D RAS. In some embodiments, the TCR is not naturally occurring.
[0036] В одном воплощении изобретения TCR содержит две полипептидные цепи, каждая из которых содержит вариабельную область, содержащую гипервариабельную область (CDR)1, CDR2, и CDR3 TCR. В одном воплощении изобретения TCR содержит первую полипептидную цепь, содержащую CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 (CDR1 цепи α 4373 TCR), CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2 (CDR2 цепи α 4373 TCR), и CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3 (CDR3 цепи α 4373 TCR), и вторую полипептидную цепь, содержащую CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4 (CDR1 цепи β 4373 TCR), CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 5 (CDR2 цепи β 4373 TCR) и CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6 (CDR3 цепи β 4373 TCR).[0036] In one embodiment of the invention, the TCR comprises two polypeptide chains, each of which comprises a variable region comprising a complementarity determining region (CDR)1, CDR2, and CDR3 of the TCR. In one embodiment of the invention, the TCR comprises a first polypeptide chain comprising a CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 (CDR1 of the α 4373 TCR chain), a CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 (CDR2 of the α 4373 TCR chain), and a CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 (CDR3 of the α 4373 TCR chain), and a second polypeptide chain comprising a CDR1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4 (CDR1 of the β 4373 TCR chain), a CDR2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 (CDR2 of the β 4373 TCR chain) and a CDR3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 (CDR3 of the β 4373 TCR chain).
[0037] В связи с этим, TCR по изобретению может содержать любую одну или более из аминокислотных последовательностей, выбранных из любой из SEQ ID NO: 1-6. В одном воплощении изобретения TCR содержит следующие аминокислотные последовательности: (а) все из SEQ ID NO: 1-3, (b) все из SEQ ID NO: 4-6 или (с) все из SEQ ID NO: 1-6. В особенно предпочтительном воплощении TCR содержит аминокислотные последовательности всех из SEQ ID NO: 1-6.[0037] In this regard, the TCR of the invention may comprise any one or more amino acid sequences selected from any of SEQ ID NOs: 1-6. In one embodiment of the invention, the TCR comprises the following amino acid sequences: (a) all of SEQ ID NOs: 1-3, (b) all of SEQ ID NOs: 4-6, or (c) all of SEQ ID NOs: 1-6. In a particularly preferred embodiment, the TCR comprises the amino acid sequences of all of SEQ ID NOs: 1-6.
[0038] CDR3 SEQ ID NO: 3 или 6, а именно, цепи α или цепи β или обеих, могут дополнительно содержать цистеин, непосредственно N-концевой в отношении первой аминокислоты CDR, или фенилаланин, непосредственно С-концевой в отношении последней аминокислоты, или и то и другое.[0038] CDR3 of SEQ ID NO: 3 or 6, namely, the α chain or the β chain or both, may further comprise a cysteine immediately N-terminal to the first amino acid of the CDR, or a phenylalanine immediately C-terminal to the last amino acid, or both.
[0039] В одном воплощении изобретения TCR содержит аминокислотную последовательность вариабельной области TCR, содержащую CDR, изложенные выше. В связи с этим, TCR может, например, содержать аминокислотную последовательность: SEQ ID NO: 7 (вариабельная область цепи α 4373 TCR с N-концевым сигнальным пептидом дикого типа); SEQ ID NO: 51 (вариабельная область цепи α 4373 TCR с N-концевым сигнальным пептидом варианта); SEQ ID NO: 8 (вариабельная область цепи β 4373 TCR с N-концевым сигнальным пептидом варианта); SEQ ID NO: 52 (вариабельная область цепи β 4373 TCR с N-концевым сигнальным пептидом дикого типа); SEQ ID NO: 32 (вариабельная область цепи α 4373 TCR без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством IMGT); SEQ ID NO: 33 (вариабельная область цепи β 4373 TCR без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством IMGT); SEQ ID NO: 59 (вариабельная область цепи α 4373 TCR без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством SignalP); SEQ ID NO: 60 (вариабельная область цепи β 4373 TCR без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством SignalP); обе SEQ ID NO: 7 и 8; обе SEQ ID NO: 7 и 52; обе SEQ ID NO: 51 и 8; обе SEQ ID NO: 51 и 52; обе SEQ ID NO: 32 и 33 или обе SEQ ID NO: 59 и 60. Предпочтительно, TCR содержит следующие аминокислотные последовательности: (i) обе SEQ ID NO: 7 и 8, (ii) обе SEQ ID NO: 51 и 52 или (iii) обе SEQ ID NO: 32 и 33.[0039] In one embodiment of the invention, the TCR comprises an amino acid sequence of a TCR variable region comprising the CDRs set forth above. In this regard, the TCR may, for example, comprise the amino acid sequence of: SEQ ID NO: 7 (variable region of the α4373 TCR chain with the N-terminal signal peptide of the wild type); SEQ ID NO: 51 (variable region of the α4373 TCR chain with the N-terminal signal peptide of the variant); SEQ ID NO: 8 (variable region of the β4373 TCR chain with the N-terminal signal peptide of the variant); SEQ ID NO: 52 (variable region of the β4373 TCR chain with the N-terminal signal peptide of the wild type); SEQ ID NO: 32 (4373 TCR α chain variable region without N-terminal signal peptide, predicted by IMGT); SEQ ID NO: 33 (4373 TCR β chain variable region without N-terminal signal peptide, predicted by IMGT); SEQ ID NO: 59 (4373 TCR α chain variable region without N-terminal signal peptide, predicted by SignalP); SEQ ID NO: 60 (4373 TCR β chain variable region without N-terminal signal peptide, predicted by SignalP); both SEQ ID NOs: 7 and 8; both SEQ ID NOs: 7 and 52; both SEQ ID NOs: 51 and 8; both SEQ ID NOs: 51 and 52; both SEQ ID NOs: 32 and 33, or both SEQ ID NOs: 59 and 60. Preferably, the TCR comprises the following amino acid sequences: (i) both SEQ ID NOs: 7 and 8, (ii) both SEQ ID NOs: 51 and 52, or (iii) both SEQ ID NOs: 32 and 33.
[0040] TCR по изобретению могут дополнительно содержать константную область цепи α и константную область цепи β. Константная область может происходить из любого подходящего вида, такого как, например, человек или мышь. В одном воплощении изобретения TCR дополнительно содержит мышиные константные области цепи α и β или человеческие константные области цепи α и β. В том виде, в котором он используется в данном документе, термин «мышиный» или «человеческий», когда речь идет о TCR или любом компоненте TCR, описанном в данном документе (например, CDR, вариабельная область, константная область, цепь α и/или цепь β), означает TCR (или его компонент), который происходит из мыши или человека, соответственно, а именно, TCR (или его компонент), который происходил из или, одновременно, экспрессировался мышиной Т-клеткой или человеческой Т-клеткой, соответственно.[0040] The TCRs of the invention may further comprise an α chain constant region and a β chain constant region. The constant region may be from any suitable species, such as, for example, a human or a mouse. In one embodiment of the invention, the TCR further comprises murine α and β chain constant regions or human α and β chain constant regions. As used herein, the term "mouse" or "human" when referring to a TCR or any component of a TCR described herein (e.g., a CDR, variable region, constant region, α chain and/or β chain) means a TCR (or component thereof) that is from a mouse or a human, respectively, namely, a TCR (or component thereof) that is derived from or was simultaneously expressed by a murine T cell or a human T cell, respectively.
[0041] Согласно одному воплощению изобретения предложен химерный TCR, содержащий человеческую вариабельную область и мышиную константную область, где TCR обладает антигенной специфичностью в отношении аминокислотной последовательности мутантного человеческого RAS с заменой глицина в положении 12 аспарагиновой кислотой, презентированного молекулой HLA Класса I. Мышиная константная область может обеспечивать одно или более преимуществ. Например, мышиная константная область может уменьшать ошибочное спаривание TCR по изобретению с эндогенными TCR клетки-хозяина, в которую вводят TCR по изобретению. В качестве альтернативы или дополнительно, мышиная константная область может повышать уровень экспрессии TCR по изобретению, по сравнению с таким же TCR с человеческой константной областью. Химерный TCR может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19 (мышиная константная область цепи α WT), SEQ ID NO: 20 (мышиная константная область цепи β WT) или как SEQ ID NO: 19, так и 20. Предпочтительно, TCR по изобретению содержит аминокислотные последовательности обеих SEQ ID NO: 19 и 20. Химерный TCR может содержать любые из мышиных константных областей, описанных в данном документе, в комбинации с любой из областей CDR, как описано в данном документе, в отношении других аспектов изобретения. В связи с этим, TCR, например, может содержать следующие аминокислотные последовательности: (а) все из SEQ ID NO: 1-3 и 19; (b) все из SEQ ID NO: 4-6 и 20; или (с) все из SEQ ID NO: 1-6 и 19-20. В еще одном воплощении изобретения химерный TCR может содержать любую из мышиных константных областей, описанных в данном документе, в комбинации с любой из вариабельных областей, описанных в данном документе, относительно других аспектов изобретения. В связи с этим, TCR, например, может содержать следующие аминокислотные последовательности: (i) обе из SEQ ID NO: 7 и 19; (ii) обе из SEQ ID NO: 51 и 19; (iii) обе из SEQ ID NO: 8 и 20; (iv) обе из SEQ ID NO: 52 и 20; (v) обе из SEQ ID NO: 7-8 и 19-20 или (iv) обе из SEQ ID NO: 51-52 и 19-20.[0041] According to one embodiment of the invention, there is provided a chimeric TCR comprising a human variable region and a murine constant region, wherein the TCR has antigen specificity for the amino acid sequence of a mutant human RAS with a substitution of glycine at position 12 with aspartic acid, presented by an HLA Class I molecule. The murine constant region may provide one or more advantages. For example, the murine constant region may reduce mispairing of the TCR of the invention with endogenous TCRs of a host cell into which the TCR of the invention is introduced. Alternatively or additionally, the murine constant region may increase the expression level of the TCR of the invention, compared to the same TCR with a human constant region. A chimeric TCR may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19 (mouse WT α chain constant region), SEQ ID NO: 20 (mouse WT β chain constant region), or both SEQ ID NO: 19 and 20. Preferably, the TCR of the invention comprises the amino acid sequences of both SEQ ID NO: 19 and 20. The chimeric TCR may comprise any of the mouse constant regions described herein in combination with any of the CDR regions as described herein in relation to other aspects of the invention. In this regard, the TCR may, for example, comprise the following amino acid sequences: (a) all of SEQ ID NO: 1-3 and 19; (b) all of SEQ ID NO: 4-6 and 20; or (c) all of SEQ ID NO: 1-6 and 19-20. In another embodiment of the invention, the chimeric TCR may comprise any of the murine constant regions described herein in combination with any of the variable regions described herein in relation to other aspects of the invention. In this regard, the TCR may, for example, comprise the following amino acid sequences: (i) both of SEQ ID NOs: 7 and 19; (ii) both of SEQ ID NOs: 51 and 19; (iii) both of SEQ ID NOs: 8 and 20; (iv) both of SEQ ID NOs: 52 and 20; (v) both of SEQ ID NOs: 7-8 and 19-20, or (iv) both of SEQ ID NOs: 51-52 and 19-20.
[0042] В одном воплощении изобретения TCR содержит цепь α, содержащую вариабельную область и константную область, и цепь β, содержащую вариабельную область и константную область. В связи с этим, TCR, например, может содержать (а) цепь α, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21 (цепь α 4373 TCR с N-концевым сигнальным пептидом дикого типа), где: (i) X в положении 193 SEQ ID NO: 21 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 257 SEQ ID NO: 21 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 259 SEQ ID NO: 21 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 260 SEQ ID NO: 21 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (b) цепь α, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53 (цепь α 4373 TCR с N-концевым сигнальным пептидом варианта), где: (i) X в положении 193 SEQ ID NO: 53 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 257 SEQ ID NO: 53 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 259 SEQ ID NO: 53 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 260 SEQ ID NO: 53 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (с) цепь β, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22 (цепь β 4373 TCR с N-концевым сигнальным пептидом варианта), где X в положении 191 SEQ ID NO: 22 представляет собой Ser или Cys; (d) цепь β, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54 (цепь β 4373 TCR с N-концевым сигнальным пептидом дикого типа), где X в положении 191 SEQ ID NO: 54 представляет собой Ser или Cys; (е) обе (а) и (с), (а) и (d), (b) и (с) или (b) и (d); (f) цепь α, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34 (цепь α 4373 TCR без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством IMGT), где: (i) X в положении 165 SEQ ID NO: 34 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 229 SEQ ID NO: 34 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 231 SEQ ID NO: 34 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 232 SEQ ID NO: 34 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (g) цепь β, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35 (цепь β 4373 TCR без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством IMGT), где X в положении 172 SEQ ID NO: 35 представляет собой Ser или Cys; (h) цепь α, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61 (цепь α 4373 TCR без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством SignalP), где: (i) X в положении 172 SEQ ID NO: 61 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 236 SEQ ID NO: 61 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 238 SEQ ID NO: 61 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 239 SEQ ID NO: 61 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (i) цепь β, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62 (цепь β 4373 TCR без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством SignalP), где X в положении 170 SEQ ID NO: 62 представляет собой Ser или Суэ; или (j), как (f), так и (g), или обе (h) и (i).[0042] In one embodiment of the invention, the TCR comprises an α chain comprising a variable region and a constant region, and a β chain comprising a variable region and a constant region. In this regard, the TCR may, for example, comprise (a) an α chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21 (the 4373 TCR α chain with a wild-type N-terminal signal peptide), wherein: (i) X at position 193 of SEQ ID NO: 21 is Thr or Cys; (ii) X at position 257 of SEQ ID NO: 21 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (iii) X at position 259 of SEQ ID NO: 21 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) X at position 260 of SEQ ID NO: 21 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (b) an α chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 53 (4373 TCR α chain with variant N-terminal signal peptide), wherein: (i) X at position 193 of SEQ ID NO: 53 is Thr or Cys; (ii) X at position 257 of SEQ ID NO: 53 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (iii) X at position 259 of SEQ ID NO: 53 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) X at position 260 of SEQ ID NO: 53 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (c) a β chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22 (4373 TCR β chain with variant N-terminal signal peptide), wherein X at position 191 of SEQ ID NO: 22 is Ser or Cys; (d) a β chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54 (4373 TCR β chain with wild-type N-terminal signal peptide), wherein X at position 191 of SEQ ID NO: 54 is Ser or Cys; (e) both (a) and (c), (a) and (d), (b) and (c), or (b) and (d); (f) an α chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 34 (the 4373 TCR α chain without the N-terminal signal peptide predicted by IMGT), wherein: (i) the X at position 165 of SEQ ID NO: 34 is Thr or Cys; (ii) the X at position 229 of SEQ ID NO: 34 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (iii) the X at position 231 of SEQ ID NO: 34 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) the X at position 232 of SEQ ID NO: 34 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (g) a β chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 35 (the 4373 TCR β chain without the N-terminal signal peptide predicted by IMGT), wherein X at position 172 of SEQ ID NO: 35 is Ser or Cys; (h) an α chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61 (the 4373 TCR α chain without the N-terminal signal peptide predicted by SignalP), wherein: (i) the X at position 172 of SEQ ID NO: 61 is Thr or Cys; (ii) the X at position 236 of SEQ ID NO: 61 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (iii) X at position 238 of SEQ ID NO: 61 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) X at position 239 of SEQ ID NO: 61 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (i) a β chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 62 (the 4373 TCR β chain without the N-terminal signal peptide predicted by SignalP), wherein X at position 170 of SEQ ID NO: 62 is Ser or Sue; or (j), both (f) and (g), or both (h) and (i).
[0043] В еще одном воплощении изобретения TCR содержит аминокислотную(ые) последовательность(и): SEQ ID NO: 23 (цепь α 4373 TCR с мышиной константной областью WT и N-концевым сигнальным пептидом WT), SEQ ID NO: 55 (мышиная константная область дикого типа цепи α 4373 TCR и N-концевой сигнальный пептид варианта), SEQ ID NO: 24 (цепь β 4373 TCR с мышиной константной областью дикого типа и N-концевым сигнальным пептидом варианта), SEQ ID NO: 56 (цепь β 4373 TCR с мышиной константной областью WT и N-концевым сигнальным пептидом дикого типа), SEQ ID NO: 36 (цепь α 4373 TCR с мышиной константной областью WT и без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством IMGT), SEQ ID NO: 37 (цепь β 4373 TCR с мышиной константной областью WT и без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством IMGT), SEQ ID NO: 63 (цепь α 4373 TCR с мышиной константной областью WT и без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством SignalP), SEQ ID NO: 64 (цепь β 4373 TCR с мышиной константной областью WT и без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством SignalP), обе из SEQ ID NO: 23 и 24, обе из SEQ ID NO: 55 и 24, обе из SEQ ID NO: 23 и 56, обе из SEQ ID NO: 55 и 56, обе из SEQ ID NO: 36 и 37 или обе из SEQ ID NO: 63 и 64.[0043] In another embodiment of the invention, the TCR comprises the amino acid sequence(s): SEQ ID NO: 23 (α4373 TCR chain with WT mouse constant region and WT N-terminal signal peptide), SEQ ID NO: 55 (wild-type mouse constant region of the α4373 TCR chain and variant N-terminal signal peptide), SEQ ID NO: 24 (β4373 TCR chain with wild-type mouse constant region and variant N-terminal signal peptide), SEQ ID NO: 56 (β4373 TCR chain with WT mouse constant region and wild-type N-terminal signal peptide), SEQ ID NO: 36 (α4373 TCR chain with WT mouse constant region and without N-terminal signal peptide, predicted by IMGT), SEQ ID NO: 37 (β4373 TCR chain with mouse WT constant region and without N-terminal signal peptide, predicted by IMGT), SEQ ID NO: 63 (α4373 TCR chain with mouse WT constant region and without N-terminal signal peptide, predicted by SignalP), SEQ ID NO: 64 (β4373 TCR chain with mouse WT constant region and without N-terminal signal peptide, predicted by SignalP), both of SEQ ID NOs: 23 and 24, both of SEQ ID NOs: 55 and 24, both of SEQ ID NOs: 23 and 56, both of SEQ ID NOs: 55 and 56, both of SEQ ID NOs: 36 and 37, or both of SEQ ID NOs: 63 and 64.
[0044] В одном воплощении изобретения TCR содержит константную область с заменой. В связи с этим, TCR, например, может содержать аминокислотную последовательность любого из TCR, описанных в данном документе, с одной, двумя, тремя или четырьмя аминокислотными заменами в константной области одной из или обеих цепей α и β. Предпочтительно, TCR содержит мышиную константную область с одной, двумя, тремя или четырьмя аминокислотными заменами в мышиной константной области одной из или обеих цепей α и β. В особенно предпочтительном воплощении TCR содержит мышиную константную область с одной, двумя, тремя или четырьмя заменами аминокислот в мышиной константной области цепи α и одну замену аминокислоты в мышиной константной области цепи β. В некоторых воплощениях TCR, содержащие константную область с заменой, преимущественно обеспечивают одно или более из повышенного распознавания G12D RAS+ мишеней, повышенного уровня экспрессии клеткой-хозяином, уменьшенного ошибочного спаривания с эндогенными TCR и повышенной противоопухолевой активности, по сравнению с исходным TCR, содержащим константную область без замены (дикого типа). В целом, аминокислотные последовательности с заменой мышиных константных областей цепей аир TCR, SEQ ID NO: 17 и 18, соответственно, соответствуют всем или частям мышиных аминокислотных последовательностей константных областей без замен SEQ ID NO: 19 и 20, соответственно, причем SEQ ID NO: 17 имеет одну, две, три или четыре замены аминокислоты, по сравнению с SEQ ID NO: 19, и SEQ ID NO: 18 имеет одну замену аминокислоты, по сравнению с SEQ ID NO: 20. В связи с этим, согласно воплощению изобретения предложен TCR, содержащий аминокислотные последовательности (a) SEQ ID NO: 17 (константная область цепи α), где (i) X в положении 48 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 112 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 114 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 115 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (b) SEQ ID NO: 18 (константная область цепи β), где X в положении 57 представляет собой Ser или Cys; или (с) обе из SEQ ID NO: 17 и 18. В одном воплощении изобретения TCR, содержащий SEQ ID NO: 17, не содержит SEQ ID NO: 19 (мышиная константная области без замены цепи α). В одном воплощении изобретения TCR, содержащий SEQ ID NO: 18, не содержит SEQ ID NO: 20 (мышиная константная области без замены цепи β).[0044] In one embodiment of the invention, the TCR comprises a constant region with a substitution. In this regard, the TCR, for example, may comprise the amino acid sequence of any of the TCRs described herein with one, two, three or four amino acid substitutions in the constant region of one or both of the α and β chains. Preferably, the TCR comprises a murine constant region with one, two, three or four amino acid substitutions in the murine constant region of one or both of the α and β chains. In a particularly preferred embodiment, the TCR comprises a murine constant region with one, two, three or four amino acid substitutions in the murine constant region of the α chain and one amino acid substitution in the murine constant region of the β chain. In some embodiments, TCRs containing the constant region with the substitution advantageously provide one or more of increased recognition of G12D RAS + targets, increased host cell expression levels, reduced mismatch with endogenous TCRs, and increased anti-tumor activity, compared to a parental TCR containing the constant region without the substitution (wild type). In general, the amino acid sequences with substitution of the mouse constant regions of the ai TCR chains, SEQ ID NO: 17 and 18, respectively, correspond to all or parts of the mouse amino acid sequences of the constant regions without substitutions of SEQ ID NO: 19 and 20, respectively, wherein SEQ ID NO: 17 has one, two, three or four amino acid substitutions compared to SEQ ID NO: 19, and SEQ ID NO: 18 has one amino acid substitution compared to SEQ ID NO: 20. In connection with this, according to an embodiment of the invention there is provided a TCR comprising the amino acid sequences of (a) SEQ ID NO: 17 (the constant region of the α chain), wherein (i) X at position 48 is Thr or Cys; (ii) X at position 112 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met or Trp; (iii) X at position 114 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) X at position 115 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (b) SEQ ID NO: 18 (β chain constant region), wherein X at position 57 is Ser or Cys; or (c) both of SEQ ID NOs: 17 and 18. In one embodiment of the invention, a TCR comprising SEQ ID NO: 17 does not comprise SEQ ID NO: 19 (mouse constant region without α chain substitution). In one embodiment of the invention, a TCR comprising SEQ ID NO: 18 does not comprise SEQ ID NO: 20 (mouse constant region without β chain substitution).
[0045] Первая аминокислота любой из мышиных константных областей альфа, описанных в данном документе, могут отличаться от N, как предоставлено в SEQ ID NO: 17 и 19. Например, в любой конструкции TCR, полипептиде, белке и т.д., как описано в данном документе, данная первая аминокислота может кодироваться сплит-кодоном (имеющим нуклеотиды как от вариабельной области, так и константной области), таким образом, что любая из мышиных константных областей альфа может иметь отличную аминокислоту в том положении. Аналогично, первая аминокислота любой из мышиных константных областей бета, описанных в данном документе, могут отличаться от Е, как предоставлено в SEQ ID NO: 18 и 20, например, данная первая аминокислота может кодироваться сплит-кодоном.[0045] The first amino acid of any of the mouse alpha constant regions described herein may differ from N, as provided in SEQ ID NOs: 17 and 19. For example, in any TCR construct, polypeptide, protein, etc., as described herein, this first amino acid may be encoded by a split codon (having nucleotides from both the variable region and the constant region), such that any of the mouse alpha constant regions may have a different amino acid at that position. Similarly, the first amino acid of any of the mouse beta constant regions described herein may differ from E, as provided in SEQ ID NOs: 18 and 20, for example, this first amino acid may be encoded by a split codon.
[0046] В одном воплощении изобретения константная область с заменой включает цистеиновые замены в константной области одной из или обеих цепей α и β с обеспечением TCR с цистеиновой заменой. Противоположенные цистеины в цепях α и β обеспечивают дисульфидную связь, которая связывает константные области цепей α и β TCR с заменой друг с другом и которая не представлена в TCR, содержащем мышиные константные области без замены. В связи с этим, TCR, например, может представлять собой TCR с цистеиновой заменой, в котором один или оба из нативного Thr в положении 48 (Thr48) SEQ ID NO: 19 и нативного Ser в положении 57 (Ser57) SEQ ID NO: 20 может(гут) быть заменен(ы) Cys. Предпочтительно, оба из нативного Thr48 SEQ ID NO: 19 и нативного Ser57 SEQ ID NO: 20 заменены Cys. Примеры последовательностей константных областей TCR с цистеиновой заменой изложены в Таблице 2. В одном воплощении изобретения TCR с цистеиновой заменой содержит (i) SEQ ID NO: 17, (ii) SEQ ID NO: 18 или (iii) обе из SEQ ID NO: 17 и 18, где обе из SEQ ID NO: 17 и 18 представляют собой такие, как определено в Таблице 2. TCR с цистеиновой заменой по изобретению может включать константную область с заменой помимо любой из CDR или вариабельных областей, описанных в данном документе.[0046] In one embodiment of the invention, the substituted constant region comprises cysteine substitutions in the constant region of one or both of the α and β chains to provide a cysteine-substituted TCR. Opposite cysteines in the α and β chains provide a disulfide bond that links the constant regions of the substituted α and β chains of the TCR to each other and which is not present in a TCR comprising murine constant regions without the substitution. In this regard, the TCR, for example, can be a cysteine-substituted TCR in which one or both of the native Thr at position 48 (Thr48) of SEQ ID NO: 19 and the native Ser at position 57 (Ser57) of SEQ ID NO: 20 can be replaced with Cys. Preferably, both of the native Thr48 of SEQ ID NO: 19 and the native Ser57 of SEQ ID NO: 20 are replaced with Cys. Exemplary sequences of constant regions of cysteine-substituted TCRs are set forth in Table 2. In one embodiment of the invention, a cysteine-substituted TCR comprises (i) SEQ ID NO: 17, (ii) SEQ ID NO: 18, or (iii) both of SEQ ID NOs: 17 and 18, where both of SEQ ID NOs: 17 and 18 are as defined in Table 2. A cysteine-substituted TCR of the invention may include a substituted constant region in addition to any of the CDRs or variable regions described herein.
[0047] В одном воплощении изобретения химерный TCR с цистеиновой заменой содержит полно размерную цепь α и полноразмерную цепь β. Примеры последовательностей цепи α и цепи β химерного TCR с цистеиновой заменой изложены в Таблице 2. В одном воплощении изобретения TCR содержит (i) SEQ ID NO: 21, (ii) SEQ ID NO: 53, (iii) SEQ ID NO: 22, (iv) SEQ ID NO: 54, (v) SEQ ID NO: 34, (vi) SEQ ID NO: 35, (vii) SEQ ID NO: 61, (viii) SEQ ID NO: 62, (ix) обе из SEQ ID NO: 21 и 22, (x) обе из SEQ ID NO: 53 и 22, (xi) обе из SEQ ID NO: 21 и 54, (xii) обе из SEQ ID NO: 53 и 54, (xiii) обе из SEQ ID NO: 34 и 35, или (xiv) обе из SEQ ID NO: 61 и 62, где все из SEQ ID NO: 21-22, 34-35, 53, 54, 61 и 62 представляют собой такие, как определено в Таблице 2.[0047] In one embodiment of the invention, the chimeric TCR with a cysteine substitution comprises a full-length α chain and a full-length β chain. Examples of α chain and β chain sequences of a chimeric TCR with a cysteine substitution are set out in Table 2. In one embodiment of the invention, the TCR comprises (i) SEQ ID NO: 21, (ii) SEQ ID NO: 53, (iii) SEQ ID NO: 22, (iv) SEQ ID NO: 54, (v) SEQ ID NO: 34, (vi) SEQ ID NO: 35, (vii) SEQ ID NO: 61, (viii) SEQ ID NO: 62, (ix) both of SEQ ID NOs: 21 and 22, (x) both of SEQ ID NOs: 53 and 22, (xi) both of SEQ ID NOs: 21 and 54, (xii) both of SEQ ID NOs: 53 and 54, (xiii) both of SEQ ID NOs: 34 and 35, or (xiv) both of SEQ ID NO: 61 and 62, wherein all of SEQ ID NO: 21-22, 34-35, 53, 54, 61, and 62 are as defined in Table 2.
[0048] В одном воплощении изобретения аминокислотная последовательность с заменой включает замены одной, двух или трех аминокислот в трансмембранном (ТМ) домене константной области цепи α гидрофобной аминокислотой с предоставлением TCR с заменой гидрофобной аминокислотой (также называемого в данном документе «LVL-модифицированным TCR»). Замена(ы) гидрофобной аминокислотой в ТМ домене TCR может(гут) увеличивать гидрофобность домена ТМ TCR, по сравнению с TCR, который не имеет замены(ен) гидрофобной аминокислотой в ТМ домене. В связи с этим, TCR представляет собой LVL-модифицированный TCR, в котором одна, две или три из нативных Ser112, Met114 и Gly115 SEQ ID NO: 19 могут, независимо, быть заменены Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; предпочтительно Leu, Ile или Val; и нативный Ser57 SEQ ID NO: 20 может быть заменен Cys. Предпочтительно, все три из нативных Ser112, Met114 и Gly115 SEQ ID NO: 19 могут, независимо, быть заменены Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; предпочтительно Leu, Ile или Val. В одном воплощении изобретения LVL-модифицированный TCR содержит (i) SEQ ID NO: 17, (ii) SEQ ID NO: 18 или (iii) обе SEQ ID NO: 17 и 18, где обе SEQ ID NO: 17 и 18 представляют собой такие, как определено в Таблице 3. LVL-модифицированные TCR по изобретению могут включать константную область с заменой помимо любой из CDR или вариабельных областей, описанных в данном документе.[0048] In one embodiment of the invention, the substitution amino acid sequence comprises substitutions of one, two, or three amino acids in the transmembrane (TM) domain of the α chain constant region with a hydrophobic amino acid to provide a TCR with a hydrophobic amino acid substitution (also referred to herein as an "LVL-modified TCR"). The hydrophobic amino acid substitution(s) in the TM domain of the TCR may increase the hydrophobicity of the TM domain of the TCR, compared to a TCR that does not have the hydrophobic amino acid substitution(s) in the TM domain. In this regard, the TCR is an LVL-modified TCR in which one, two, or three of the native Ser112, Met114, and Gly115 of SEQ ID NO: 19 may, independently, be replaced with Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; preferably Leu, Ile, or Val; and native Ser57 of SEQ ID NO: 20 may be replaced with Cys. Preferably, all three of native Ser112, Met114 and Gly115 of SEQ ID NO: 19 may, independently, be replaced with Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met or Trp; preferably Leu, Ile or Val. In one embodiment of the invention, the LVL-modified TCR comprises (i) SEQ ID NO: 17, (ii) SEQ ID NO: 18 or (iii) both SEQ ID NOs: 17 and 18, wherein both SEQ ID NOs: 17 and 18 are as defined in Table 3. The LVL-modified TCRs of the invention may include a constant region with a substitution in addition to any of the CDRs or variable regions described herein.
[0049] В одном воплощении изобретения LVL-модифицированный TCR содержит полноразмерную цепь α и полноразмерную цепь β. Примеры последовательностей цепи α и цепи β LVL-модифицированного TCR изложены в Таблице 3. В одном воплощении изобретения LVL-модифицированный TCR содержит (i) SEQ ID NO: 21, (ii) SEQ ID NO: 53, (iii) SEQ ID NO: 22, (iv) SEQ ID NO: 54, (v) SEQ ID NO: 34, (vi) SEQ ID NO: 35, (vii) SEQ ID NO: 61, (viii) SEQ ID NO: 62, (ix) обе из SEQ ID NO: 21 и 22, (x) обе из SEQ ID NO: 53 и 22, (xi) обе из SEQ ID NO: 21 и 54, (xii) обе из SEQ ID NO: 53 и 54, (xiii) обе из SEQ ID NO: 34 и 35 или (xiv) обе из SEQ ID NO: 61 и 62, где все из SEQ ID NO: 21-22, 34-35, 53, 54, 61 и 62 представляют собой такие, как определено в Таблице 3.[0049] In one embodiment of the invention, the LVL-modified TCR comprises a full-length α chain and a full-length β chain. Examples of sequences of the α chain and the β chain of the LVL-modified TCR are set out in Table 3. In one embodiment of the invention, the LVL-modified TCR comprises (i) SEQ ID NO: 21, (ii) SEQ ID NO: 53, (iii) SEQ ID NO: 22, (iv) SEQ ID NO: 54, (v) SEQ ID NO: 34, (vi) SEQ ID NO: 35, (vii) SEQ ID NO: 61, (viii) SEQ ID NO: 62, (ix) both of SEQ ID NOs: 21 and 22, (x) both of SEQ ID NOs: 53 and 22, (xi) both of SEQ ID NOs: 21 and 54, (xii) both of SEQ ID NOs: 53 and 54, (xiii) both of SEQ ID NOs: 34 and 35, or (xiv) both of SEQ ID NO: 61 and 62, wherein all of SEQ ID NO: 21-22, 34-35, 53, 54, 61, and 62 are as defined in Table 3.
[0050] В одном воплощении изобретения аминокислотная последовательность с заменой включает цистеиновые замены в константной области одной из или обеих цепей α и β в комбинации с заменой(ами) одной, двух или трех аминокислот в трансмембранном (ТМ) домене константной области цепи α гидрофобной аминокислотой (также называемый в данном документе «LVL-модифицированным TCR с цистеиновой заменой»). В связи с этим, TCR представляет собой LVL-модифицированный, химерный TCR с цистеиновой заменой, в котором нативный Thr48 SEQ ID NO: 19 заменен Cys; один, два или три из нативных Ser112, Met114 и Gly115 SEQ ID NO: 19, независимо, заменены Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; предпочтительно, Leu, Ile или Val; и нативный Ser57 SEQ ID NO: 20 заменен Cys. Предпочтительно все три из нативных Ser112, Met114 и Gly115 SEQ ID NO: 19 могут, независимо, быть заменены Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; предпочтительно, Leu, Ile или Val. В одном воплощении изобретения LVL-модифицированный TCR с цистеиновой заменой содержит (i) SEQ ID NO: 17, (ii) SEQ ID NO: 18 или (iii) обе из SEQ ID NO: 17 и 18, где обе SEQ ID NO: 17 и 18 представляют собой такие, как определено в Таблице 4. LVL-модифицированные TCR с цистеиновой заменой по изобретению могут включать константную область с заменой помимо любой из CDR или вариабельных областей, описанных в данном документе.[0050] In one embodiment of the invention, the substitution amino acid sequence comprises cysteine substitutions in the constant region of one or both of the α and β chains in combination with the substitution(s) of one, two, or three amino acids in the transmembrane (TM) domain of the α chain constant region with a hydrophobic amino acid (also referred to herein as an "LVL-modified cysteine substitution TCR"). In this regard, the TCR is an LVL-modified, chimeric cysteine substitution TCR in which native Thr48 of SEQ ID NO: 19 is replaced with Cys; one, two, or three of native Ser112, Met114, and Gly115 of SEQ ID NO: 19, independently, are replaced by Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; preferably, Leu, Ile, or Val; and native Ser57 of SEQ ID NO: 20 is replaced with Cys. Preferably, all three of native Ser112, Met114 and Gly115 of SEQ ID NO: 19 may, independently, be replaced with Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met or Trp; preferably, Leu, Ile or Val. In one embodiment of the invention, the cysteine substitution LVL-modified TCR comprises (i) SEQ ID NO: 17, (ii) SEQ ID NO: 18 or (iii) both of SEQ ID NOs: 17 and 18, wherein both SEQ ID NOs: 17 and 18 are as defined in Table 4. The cysteine substitution LVL-modified TCRs of the invention may include a constant region with a substitution in addition to any of the CDRs or variable regions described herein.
[0051] В одном воплощении LVL-модифицированный TCR с цистеиновой заменой содержит полноразмерную цепь α и полноразмерную цепь β. В одном воплощении изобретения LVL-модифицированный TCR с цистеиновой заменой содержит (i) SEQ ID NO: 21, (ii) SEQ ID NO: 53, (iii) SEQ ID NO: 22, (iv) SEQ ID NO: 54, (v) SEQ ID NO: 34, (vi) SEQ ID NO: 35, (vii) SEQ ID NO: 61, (viii) SEQ ID NO: 62, (ix) обе из SEQ ID NO: 21 и 22, (x) обе из SEQ ID NO: 53 и 22, (xi) обе из SEQ ID NO: 21 и 54, (xii) обе из SEQ ID NO: 53 и 54, (xiii) обе из SEQ ID NO: 34 и 35 или (xiv) обе из SEQ ID NO: 61 и 62, где все из SEQ ID NO: 21-22, 34-35, 53, 54, 61 и 62 представляют собой такие, как определено в Таблице 4.[0051] In one embodiment, the LVL-modified cysteine substitution TCR comprises a full-length α chain and a full-length β chain. In one embodiment of the invention, the LVL-modified TCR with a cysteine substitution comprises (i) SEQ ID NO: 21, (ii) SEQ ID NO: 53, (iii) SEQ ID NO: 22, (iv) SEQ ID NO: 54, (v) SEQ ID NO: 34, (vi) SEQ ID NO: 35, (vii) SEQ ID NO: 61, (viii) SEQ ID NO: 62, (ix) both of SEQ ID NOs: 21 and 22, (x) both of SEQ ID NOs: 53 and 22, (xi) both of SEQ ID NOs: 21 and 54, (xii) both of SEQ ID NOs: 53 and 54, (xiii) both of SEQ ID NOs: 34 and 35, or (xiv) both of SEQ ID NOs: 61 and 62, wherein all of SEQ ID NOs: 21-22, 34-35, 53, 54, 61 and 62 are as defined in Table 4.
[0052] В одном воплощении изобретения LVL-модифицированный TCR с цистеиновой заменой содержит: (a) SEQ ID NO: 38 (константная область цепи α LVL-модифицированного TCR с цистеиновой заменой); (b) SEQ ID NO: 39 (константная область цепи β LVL-модифицированного TCR с цистеиновой заменой); (с) SEQ ID NO: 40 (цепь α LVL-модифицированного 4373 TCR с цистеиновой заменой с N-концевой сигнальной последовательностью дикого типа); (d) SEQ ID NO: 41 (цепь β LVL-модифицированного 4373 TCR с цистеиновой заменой с N-концевой сигнальной последовательностью варианта); (е) SEQ ID NO: 42 (цепь α LVL-модифицированного 4373 TCR с цистеиновой заменой без N-концевой сигнальной последовательности, предсказанная посредством IMGT); (f) SEQ ID NO: 43 (цепь β LVL-модифицированного 4373 TCR с цистеиновой заменой без N-концевой сигнальной последовательности, предсказанная посредством IMGT); (g) SEQ ID NO: 65 (цепь α LVL-модифицированного 4373 TCR с цистеиновой заменой без N-концевой сигнальной последовательности, предсказанная посредством SignalP); (h) SEQ ID NO: 66 (цепь β LVL-модифицированного 4373 TCR с цистеиновой заменой без N-концевой сигнальной последовательности, предсказанной SignalP); (i) SEQ ID NO: 57 (цепь α LVL-модифицированного 4373 TCR с цистеиновой заменой с N-концевой сигнальной последовательностью варианта); (j) SEQ ID NO: 58 (цепь β LVL-модифицированного 4373 TCR с цистеиновой заменой с N-концевой сигнальной последовательностью дикого типа); (k) обе (а) и (b); (I) обе (с) и (d); (m) обе (е) и (f); (n) обе (g) и (h); или (о) обе (i) и (j).[0052] In one embodiment of the invention, the LVL-modified TCR with a cysteine substitution comprises: (a) SEQ ID NO: 38 (LVL-modified TCR α chain constant region with a cysteine substitution); (b) SEQ ID NO: 39 (LVL-modified TCR β chain constant region with a cysteine substitution); (c) SEQ ID NO: 40 (LVL-modified 4373 TCR α chain with a wild-type N-terminal signal sequence); (d) SEQ ID NO: 41 (LVL-modified 4373 TCR β chain with a variant N-terminal signal sequence); (e) SEQ ID NO: 42 (α chain of LVL-modified 4373 TCR with cysteine substitution without N-terminal signal sequence predicted by IMGT); (f) SEQ ID NO: 43 (β chain of LVL-modified 4373 TCR with cysteine substitution without N-terminal signal sequence predicted by IMGT); (g) SEQ ID NO: 65 (α chain of LVL-modified 4373 TCR with cysteine substitution without N-terminal signal sequence predicted by SignalP); (h) SEQ ID NO: 66 (β chain of LVL-modified 4373 TCR with cysteine substitution without N-terminal signal sequence predicted by SignalP); (i) SEQ ID NO: 57 (α chain of LVL-modified 4373 TCR with cysteine substitution variant N-terminal signal sequence); (j) SEQ ID NO: 58 (β chain of LVL-modified 4373 TCR with cysteine substitution wild-type N-terminal signal sequence); (k) both (a) and (b); (i) both (c) and (d); (m) both (e) and (f); (n) both (g) and (h); or (o) both (i) and (j).
[0053] Также согласно изобретению предложен полипептид, содержащий функциональную часть любого из TCR, описанных в данном документе. Термин «полипептид», в том виде, в котором он используется в данном документе, включает олигопептиды и относится к одной цепи аминокислот, соединенных одной или более пептидными связями.[0053] Also provided according to the invention is a polypeptide comprising a functional portion of any of the TCRs described herein. The term "polypeptide," as used herein, includes oligopeptides and refers to a single chain of amino acids linked by one or more peptide bonds.
[0054] В отношении полипептидов по изобретению функциональная часть может представлять собой любую часть, содержащую смежные аминокислоты TCR, частью которого она является, при условии, что функциональная часть специфично связывается с G12D RAS. Термин «функциональная часть» при использовании в отношении TCR относится к любой части или фрагменту TCR по изобретению, чья часть или фрагмент сохраняет биологическую активность TCR, частью которого она является (исходный TCR). Функциональные части охватывают, например, данные части TCR, которые сохраняют способность специфично связываться с G12D RAS (например, в контексте молекулы HLA-А*11:01), или выявлять, лечить или предупреждать рак в похожей степени, в такой же степени или в большей степени, по сравнению с исходным TCR. В отношении исходного TCR, функциональная часть может содержать, например, примерно, 10%, примерно 25%, примерно 30%, примерно 50%, примерно 68%, примерно 80%, примерно 90%, примерно 95% или более исходного TCR.[0054] With respect to the polypeptides of the invention, a functional portion may be any portion that contains contiguous amino acids of the TCR of which it is a part, so long as the functional portion specifically binds to G12D RAS. The term "functional portion," when used in relation to a TCR, refers to any portion or fragment of a TCR of the invention whose portion or fragment retains the biological activity of the TCR of which it is a part (the parent TCR). Functional portions include, for example, those portions of the TCR that retain the ability to specifically bind to G12D RAS (e.g., in the context of the HLA-A*11:01 molecule), or to detect, treat, or prevent cancer to a similar, equal, or greater extent than the parent TCR. With respect to the original TCR, the functional portion may comprise, for example, about 10%, about 25%, about 30%, about 50%, about 68%, about 80%, about 90%, about 95% or more of the original TCR.
[0055] Функциональная часть может содержать дополнительные аминокислоты на N- или С-конце части или на обоих концах, дополнительные аминокислоты, которые не обнаружены в аминокислотной последовательности исходного TCR. Желательно, дополнительные аминокислоты не препятствуют биологической функции функциональной части, например, специфичному связыванию с G12D RAS; и/или обладанию способностью выявлять рак, лечить или предупреждать рак, и т.д. Более желательно, дополнительные аминокислоты усиливают биологическую активность, по сравнению с биологической активностью исходного TCR.[0055] The functional portion may comprise additional amino acids at the N- or C-terminus of the portion, or at both ends, additional amino acids that are not found in the amino acid sequence of the parent TCR. Desirably, the additional amino acids do not interfere with the biological function of the functional portion, such as specific binding to G12D RAS; and/or having the ability to detect cancer, treat or prevent cancer, etc. More desirably, the additional amino acids enhance the biological activity, compared to the biological activity of the parent TCR.
[0056] Полипептид может содержать функциональную часть любой из или обеих цепей α и β TCR по изобретению, такую как функциональная часть, содержащая одну или более из CDR1, CDR2 и CDR3 вариабельной(ых) области(ей) цепи α и/или цепь β TCR по изобретению. В одном воплощении изобретения полипептид может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 (CDR1 цепи α), SEQ ID NO: 2 (CDR2 цепи α), SEQ ID NO: 3 (CDR3 цепи α), SEQ ID NO: 4 (CDR1 цепи β), SEQ ID NO: 5 (CDR2 цепи β), SEQ ID NO: 6 (CDR3 цепи β) или их комбинацию.[0056] The polypeptide may comprise a functional portion of either or both of the α and β chains of the TCR of the invention, such as a functional portion comprising one or more of CDR1, CDR2, and CDR3 of the variable region(s) of the α chain and/or the β chain of the TCR of the invention. In one embodiment of the invention, the polypeptide may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 (CDR1 of the α chain), SEQ ID NO: 2 (CDR2 of the α chain), SEQ ID NO: 3 (CDR3 of the α chain), SEQ ID NO: 4 (CDR1 of the β chain), SEQ ID NO: 5 (CDR2 of the β chain), SEQ ID NO: 6 (CDR3 of the β chain), or a combination thereof.
[0057] В связи с этим, полипептид по изобретению может содержать любую одну или более из аминокислотных последовательностей, выбранных из любой из SEQ ID NO: 1-6. В одном воплощении изобретения TCR содержит следующие аминокислотные последовательности: (а) все из SEQ ID NO: 1-3, (b) все из SEQ ID NO: 4-6 или (с) все из SEQ ID NO: 1-6. В предпочтительном воплощении полипептид содержит аминокислотные последовательности всех из SEQ ID NO: 1-6. CDR3 SEQ ID NO: 3 или 6, а именно, цепи α или цепи β или обеих, может дополнительно содержать цистеин, непосредственно N-концевой в отношении первой аминокислоты CDR, или фенилаланин, непосредственно С-концевой в отношении конечной аминокислоты, или оба.[0057] In this regard, the polypeptide of the invention may comprise any one or more amino acid sequences selected from any one of SEQ ID NOs: 1-6. In one embodiment of the invention, the TCR comprises the following amino acid sequences: (a) all of SEQ ID NOs: 1-3, (b) all of SEQ ID NOs: 4-6, or (c) all of SEQ ID NOs: 1-6. In a preferred embodiment, the polypeptide comprises the amino acid sequences of all of SEQ ID NOs: 1-6. CDR3 of SEQ ID NO: 3 or 6, namely, the α chain or the β chain or both, may further comprise a cysteine immediately N-terminal to the first amino acid of the CDR, or a phenylalanine immediately C-terminal to the final amino acid, or both.
[0058] В одном воплощении изобретения полипептид по изобретению может содержать, например, вариабельную область TCR по изобретению, содержащую комбинацию областей CDR, изложенных выше. В связи с этим, полипептид может содержать аминокислотную последовательность (i) SEQ ID NO: 7 (вариабельная область цепи α с N-концевой сигнальной последовательностью дикого типа), (ii) SEQ ID NO: 51 (вариабельная область цепи α 4373 TCR с N-концевой сигнальной последовательностью варианта); (iii) SEQ ID NO: 8 (вариабельная область цепи β с N-концевой сигнальной последовательностью варианта), (iv) SEQ ID NO: 52 (вариабельная область цепи β с N-концевой сигнальной последовательностью дикого типа), (v) обе из SEQ ID NO: 7 и 8; (vi) обе из SEQ ID NO: 51 и 8, (vii) обе из SEQ ID NO: 7 и 52, или (viii) обе из SEQ ID NO: 51 и 52, (ix) SEQ ID NO: 32 (вариабельная область цепи α без N-концевой сигнальной последовательности, предсказанная посредством IMGT), (х) SEQ ID NO: 33 (вариабельная область цепи β без N-концевой сигнальной последовательности, предсказанная посредством IMGT), (xi) SEQ ID NO: 59 (вариабельная область цепи α 4373 TCR без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством SignalP); (xii) SEQ ID NO: 60 (вариабельная область цепи β 4373 TCR без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством SignalP); (xiii) обе из SEQ ID NO: 32 и 33 или обе из SEQ ID NO: 59 и 60. Предпочтительно, полипептид содержит следующие аминокислотные последовательности: (i) обе из SEQ ID NO: 7 и 8, (ii) обе из SEQ ID NO: 51 и 52, (iii) обе из SEQ ID NO: 32 и 33 или (iv) обе из SEQ ID NO: 59 и 60.[0058] In one embodiment of the invention, a polypeptide of the invention may comprise, for example, a TCR variable region of the invention comprising a combination of the CDR regions set forth above. In this regard, the polypeptide may comprise the amino acid sequence of (i) SEQ ID NO: 7 (α chain variable region with wild-type N-terminal signal sequence), (ii) SEQ ID NO: 51 (4373 TCR α chain variable region with variant N-terminal signal sequence); (iii) SEQ ID NO: 8 (β chain variable region with variant N-terminal signal sequence), (iv) SEQ ID NO: 52 (β chain variable region with wild-type N-terminal signal sequence), (v) both of SEQ ID NOs: 7 and 8; (vi) both of SEQ ID NOs: 51 and 8, (vii) both of SEQ ID NOs: 7 and 52, or (viii) both of SEQ ID NOs: 51 and 52, (ix) SEQ ID NO: 32 (the α chain variable region without the N-terminal signal sequence, predicted by IMGT), (x) SEQ ID NO: 33 (the β chain variable region without the N-terminal signal sequence, predicted by IMGT), (xi) SEQ ID NO: 59 (the 4373 TCR α chain variable region without the N-terminal signal peptide, predicted by SignalP); (xii) SEQ ID NO: 60 (the 4373 TCR β chain variable region without the N-terminal signal peptide, predicted by SignalP); (xiii) both of SEQ ID NO: 32 and 33 or both of SEQ ID NO: 59 and 60. Preferably, the polypeptide comprises the following amino acid sequences: (i) both of SEQ ID NO: 7 and 8, (ii) both of SEQ ID NO: 51 and 52, (iii) both of SEQ ID NO: 32 and 33, or (iv) both of SEQ ID NO: 59 and 60.
[0059] В одном воплощении изобретения полипептид по изобретению может дополнительно содержать константную область TCR по изобретению, изложенную выше. В связи с этим, полипептид может дополнительно содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19 (мышиная константная область WT цепи α), SEQ ID NO: 20 (мышиная константная область WT цепи β), SEQ ID NO: 17 (мышиная константная область с заменой цепи α), SEQ ID NO: 18 (мышиная константная область с заменой цепи β), SEQ ID NO: 38 (константная область цепи α LVL-модифицированного TCR с цистеиновой заменой); SEQ ID NO: 39 (константная область цепи β LVL-модифицированного TCR с цистеиновой заменой); обе SEQ ID NO: 19 и 20, обе SEQ ID NO: 17 и 18 или обе SEQ ID NO: 38 и 39. Предпочтительно, полипептид дополнительно содержит аминокислотные последовательности обеих из SEQ ID NO: 17 и 18, обеих из SEQ ID NO: 19 и 20 или обеих из SEQ ID NO: 38 и 39 в комбинации с любой из областей CDR или вариабельных областей, описанных в данном документе, относительно других аспектов изобретения. В одном воплощении изобретения одна или обе из SEQ ID NO: 17 и 18 полипептида представляют собой такие, как определено в любой из Таблиц 2-4. Константные области цепи α, предоставленные в данном документе, показаны с N-концевым аспарагином. В некоторых воплощениях N-концевая аминокислота константных областей цепи α, описанных в данном документе, представляет собой аспарагиновую кислоту.[0059] In one embodiment of the invention, the polypeptide of the invention may further comprise a TCR constant region of the invention as set forth above. In this regard, the polypeptide may further comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19 (WT mouse α chain constant region), SEQ ID NO: 20 (WT mouse β chain constant region), SEQ ID NO: 17 (mouse α chain substitution constant region), SEQ ID NO: 18 (mouse β chain substitution constant region), SEQ ID NO: 38 (LVL-modified TCR α chain constant region with cysteine substitution); SEQ ID NO: 39 (LVL-modified TCR β chain constant region with cysteine substitution); both SEQ ID NOs: 19 and 20, both SEQ ID NOs: 17 and 18, or both SEQ ID NOs: 38 and 39. Preferably, the polypeptide further comprises the amino acid sequences of both SEQ ID NOs: 17 and 18, both SEQ ID NOs: 19 and 20, or both SEQ ID NOs: 38 and 39 in combination with any of the CDR regions or variable regions described herein, in relation to other aspects of the invention. In one embodiment of the invention, one or both of SEQ ID NOs: 17 and 18 of the polypeptide are as defined in any of Tables 2-4. The α chain constant regions provided herein are shown with an N-terminal asparagine. In some embodiments, the N-terminal amino acid of the α chain constant regions described herein is aspartic acid.
[0060] В одном воплощении изобретения полипептид по изобретению может содержать полную длину цепи α или β TCR, описанного в данном документе. В связи с этим, полипептид по изобретению может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 66, обе из SEQ ID NO: 21-22, обе из SEQ ID NO: 21 и 54, обе из SEQ ID NO: 53 и 22, обе из SEQ ID NO: 53 и 54, обе из SEQ ID NO: 23-24, обе из SEQ ID NO: 55 и 24, обе из SEQ ID NO: 23 и 54, обе из SEQ ID NO: 55 и 54, обе из SEQ ID NO: 34-35, обе из SEQ ID NO: 36-37, обе из SEQ ID NO: 40-41, обе из SEQ ID NO: 57 и 41, обе из SEQ ID NO: 40-58, обе из SEQ ID NO: 57-58, обе из SEQ ID NO: 42-43, обе из SEQ ID NO: 61 и 62, обе из SEQ ID NO: 63 и 64 или обе из SEQ ID NO: 65 и 66. В качестве альтернативы, полипептид по изобретению может содержать обе цепи TCR, описанные в данном документе.[0060] In one embodiment of the invention, the polypeptide of the invention may comprise the full length chain of an α or β TCR described herein. In this regard, the polypeptide of the invention may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 66, both of SEQ ID NO: 21-22, both of SEQ ID NOs: 21 and 54, both of SEQ ID NOs: 53 and 22, both of SEQ ID NOs: 53 and 54, both of SEQ ID NOs: 23-24, both of SEQ ID NOs: 55 and 24, both of SEQ ID NOs: 23 and 54, both of SEQ ID NOs: 55 and 54, both of SEQ ID NO: 34-35, both from SEQ ID NO: 36-37, both from SEQ ID NO: 40-41, both from SEQ ID NO: 57 and 41, both from SEQ ID NO: 40-58, both from SEQ ID NO: 57-58, both from SEQ ID NO: 42-43, both from SEQ ID NO: 61 and 62, both from SEQ ID NO: 63 and 64 or both of SEQ ID NO: 65 and 66. Alternatively, the polypeptide of the invention may comprise both TCR chains described herein.
[0061] Например, полипептид по изобретению может содержать (а) аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, где: (i) X в положении 193 SEQ ID NO: 21 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 257 SEQ ID NO: 21 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 259 SEQ ID NO: 21 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 260 SEQ ID NO: 21 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (b) аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53, где: (i) Хв положении 193 SEQ ID NO: 53 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 257 SEQ ID NO: 53 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 259 SEQ ID NO: 53 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 260 SEQ ID NO: 53 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (с) аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, где X в положении 191 SEQ ID NO: 22 представляет собой Ser или Cys; (d) аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, где X в положении 191 SEQ ID NO: 54 представляет собой Ser или Cys; (е) обе (а) и (с), (а) и (d), (b) и (с) или (b) и (d); (f) аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34, где: (i) X в положении 165 SEQ ID NO: 34 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 229 SEQ ID NO: 34 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 231 SEQ ID NO: 34 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 232 SEQ ID NO: 34 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (g) аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, где X в положении 172 SEQ ID NO: 35 представляет собой Ser или Cys; (h) аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61, где: (i) X в положении 172 SEQ ID NO: 61 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 236 of SEQ ID NO: 61 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 238 SEQ ID NO: 61 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 239 SEQ ID NO: 61 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (i) аминокислотную последовательность SEQ ID NO:62, где X в положении 170 SEQ ID NO: 62 представляет собой Ser или Cys; (j) обе (f) и (g) или обе (h) и (i); (k) SEQ ID NO: 40; (I) SEQ ID NO: 57; (m) SEQ ID NO: 41; (n) SEQ ID NO: 58; (o) SEQ ID NO: 42; (p) SEQ ID NO: 43; (q) SEQ ID NO: 65; (r) SEQ ID NO: 66; (s) both (k) и (m); (t) обе (I) и (m); (u) обе (k) и (n); (v) обе (I) и (n); (w) обе (о) и (p); или (x) обе (q) и (r). В одном воплощении изобретения любая одна или более из SEQ ID NO: 21-22, 34-35, 53, 54, 61 и 62 полипептида представляют собой такие, как определено в любой из Таблиц 2-4.[0061] For example, a polypeptide of the invention may comprise (a) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, wherein: (i) the X at position 193 of SEQ ID NO: 21 is Thr or Cys; (ii) the X at position 257 of SEQ ID NO: 21 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (iii) the X at position 259 of SEQ ID NO: 21 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) the X at position 260 of SEQ ID NO: 21 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (b) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 53, wherein: (i) the X at position 193 of SEQ ID NO: 53 is Thr or Cys; (ii) X at position 257 of SEQ ID NO: 53 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (iii) X at position 259 of SEQ ID NO: 53 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) X at position 260 of SEQ ID NO: 53 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (c) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22, wherein X at position 191 of SEQ ID NO: 22 is Ser or Cys; (d) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, wherein X at position 191 of SEQ ID NO: 54 is Ser or Cys; (e) both (a) and (c), (a) and (d), (b) and (c), or (b) and (d); (f) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 34, wherein: (i) X at position 165 of SEQ ID NO: 34 is Thr or Cys; (ii) X at position 229 of SEQ ID NO: 34 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (iii) X at position 231 of SEQ ID NO: 34 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) X at position 232 of SEQ ID NO: 34 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (g) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 35, wherein X at position 172 of SEQ ID NO: 35 is Ser or Cys; (h) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61, wherein: (i) X at position 172 of SEQ ID NO: 61 is Thr or Cys; (ii) X at position 236 of SEQ ID NO: 61 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (iii) X at position 238 of SEQ ID NO: 61 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) X at position 239 of SEQ ID NO: 61 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (i) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 62, wherein X at position 170 of SEQ ID NO: 62 is Ser or Cys; (j) both (f) and (g) or both (h) and (i); (k) SEQ ID NO: 40; (I) SEQ ID NO: 57; (m) SEQ ID NO: 41; (n) SEQ ID NO: 58; (o) SEQ ID NO: 42; (p) SEQ ID NO: 43; (q) SEQ ID NO: 65; (r) SEQ ID NO: 66; (s) both (k) and (m); (t) both (I) and (m); (u) both (k) and (n); (v) both (I) and (n); (w) both (o) and (p); or (x) both (q) and (r). In one embodiment of the invention, any one or more of SEQ ID NOs: 21-22, 34-35, 53, 54, 61 and 62 polypeptides are as defined in any of Tables 2-4.
[0062] Согласно изобретению дополнительно предложен белок, содержащий по меньшей мере один из полипептидов, описанных в данном документе. Под «белком» подразумевается молекула, содержащая одну или более полипептидных цепей.[0062] The invention further provides a protein comprising at least one of the polypeptides described herein. By "protein" is meant a molecule comprising one or more polypeptide chains.
[0063] В одном воплощении белок по изобретению может содержать первую полипептидную цепь, содержащую аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 1-3, и вторую полипептидную цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4-6. CDR3 SEQ ID NO: 3 или 6, а именно, цепи α или цепи β или обеих, могут дополнительно содержать цистеин, непосредственно N-концевой в отношении первой аминокислоты CDR, или фенилаланин, непосредственно С-концевой в отношении конечной аминокислоты, или оба.[0063] In one embodiment, the protein of the invention may comprise a first polypeptide chain comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 1-3 and a second polypeptide chain comprising the amino acid sequence of SEQ ID NOs: 4-6. CDR3 of SEQ ID NO: 3 or 6, namely, the α chain or the β chain or both, may further comprise a cysteine immediately N-terminal to the first amino acid of the CDR, or a phenylalanine immediately C-terminal to the final amino acid, or both.
[0064] В еще одном воплощении изобретения (i) первая полипептидная цепь белка может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7 и вторая полипептидная цепь может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8; (ii) первая полипептидная цепь белка может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51 и вторая полипептидная цепь может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8; (iii) первая полипептидная цепь белка может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7 и вторая полипептидная цепь может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52; (iv) первая полипептидная цепь белка может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51 и вторая полипептидная цепь может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52; (v) первая полипептидная цепь белка может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32 и вторая полипептидная цепь может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33 или (vi) первая полипептидная цепь белка может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59 и вторая полипептидная цепь может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60.[0064] In another embodiment of the invention, (i) the first polypeptide chain of the protein may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 and the second polypeptide chain may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8; (ii) the first polypeptide chain of the protein may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51 and the second polypeptide chain may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8; (iii) the first polypeptide chain of the protein may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 and the second polypeptide chain may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52; (iv) the first polypeptide chain of the protein may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51 and the second polypeptide chain may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52; (v) the first polypeptide chain of the protein may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 32 and the second polypeptide chain may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 33 or (vi) the first polypeptide chain of the protein may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59 and the second polypeptide chain may comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60.
[0065] Белок по изобретению может дополнительно содержать любую из константных областей, описанный в данном документе, в отношении других аспектов изобретения. В связи с этим, в одном воплощении изобретения (i) первая полипептидная цепь может дополнительно содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17 и вторая полипептидная цепь может дополнительно содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18; (ii) первая полипептидная цепь может дополнительно содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19 и вторая полипептидная цепь может дополнительно содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; или (ii) первая полипептидная цепь может дополнительно содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38 и вторая полипептидная цепь может дополнительно содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39. В одном воплощении изобретения одна или обе из SEQ ID NO: 17 и 18 белка представляют собой такие, как определено в любой из Таблиц 2-4.[0065] The protein of the invention may further comprise any of the constant regions described herein in relation to other aspects of the invention. Accordingly, in one embodiment of the invention, (i) the first polypeptide chain may further comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17 and the second polypeptide chain may further comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18; (ii) the first polypeptide chain may further comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19 and the second polypeptide chain may further comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20; or (ii) the first polypeptide chain may further comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38 and the second polypeptide chain may further comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 39. In one embodiment of the invention, one or both of SEQ ID NOs: 17 and 18 of the protein are as defined in any of Tables 2-4.
[0066] В качестве альтернативы или дополнительно, белок по изобретению может содержать следующее: (а) первая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, где: (i) X в положении 193 SEQ ID NO: 21 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 257 SEQ ID NO: 21 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 259 SEQ ID NO: 21 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 260 SEQ ID NO: 21 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (b) первая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53, где: (i) X в положении 193 SEQ ID NO: 53 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 257 of SEQ ID NO: 53 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 259 SEQ ID NO: 53 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 260 SEQ ID NO: 53 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (с) вторая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, где X в положении 191 SEQ ID NO: 22 представляет собой Ser или Cys; (d) вторая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, где X в положении 191 SEQ ID NO: 54 представляет собой Ser или Cys; (е) обе (а) и (с), (а) и (d), (b) и (с) или (b) и (d); (f) первая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34, где: (i) X в положении 165 SEQ ID NO: 34 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 229 SEQ ID NO: 34 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 231 SEQ ID NO: 34 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe или Trp; и (iv) X в положении 232 SEQ ID NO: 34 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (g) вторая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, где X в положении 172 SEQ ID NO: 35 представляет собой Ser или Cys; (h) первая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61, где: (i) X в положении 172 SEQ ID NO: 61 представляет собой Thr или Cys; (ii) X в положении 236 SEQ ID NO: 61 представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (iii) X в положении 238 SEQ ID NO: 61 представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; и (iv) X в положении 239 SEQ ID NO: 61 представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp; (i) вторая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62 (цепь β 4373 TCR без N-концевого сигнального пептида, предсказанная посредством SignalP), где X в положении 170 SEQ ID NO: 62 представляет собой Ser или Cys или (j) обе (f) или обе (h) и (i) и; (k) первая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; (k) первая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57; (m) вторая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41; (n) вторая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58; (о) первая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42; (р) вторая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43; (р) первая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 65; (q) вторая полипептидная цепь содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66; (s) обе (k) и (m); (t) обе (I) и (m); (u) обе (k) и (n); (v) обе (m) и (n); (w) обе (о) и (p) или обе (q) и (r). В одном воплощении изобретения одни или более из SEQ ID NO: 21-22, 34-35, 53, 54, 61 и 62 представляют собой такие, как определено в любой одной из Таблиц 2-4.[0066] Alternatively or additionally, a protein of the invention may comprise the following: (a) the first polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, wherein: (i) X at position 193 of SEQ ID NO: 21 is Thr or Cys; (ii) X at position 257 of SEQ ID NO: 21 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (iii) X at position 259 of SEQ ID NO: 21 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) X at position 260 of SEQ ID NO: 21 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (b) the first polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 53, wherein: (i) X at position 193 of SEQ ID NO: 53 is Thr or Cys; (ii) X at position 257 of SEQ ID NO: 53 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met or Trp; (iii) X at position 259 of SEQ ID NO: 53 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe or Trp; and (iv) X at position 260 of SEQ ID NO: 53 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met or Trp; (c) the second polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22, wherein X at position 191 of SEQ ID NO: 22 is Ser or Cys; (d) the second polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, wherein X at position 191 of SEQ ID NO: 54 is Ser or Cys; (e) both of (a) and (c), (a) and (d), (b) and (c), or (b) and (d); (f) the first polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 34, wherein: (i) X at position 165 of SEQ ID NO: 34 is Thr or Cys; (ii) X at position 229 of SEQ ID NO: 34 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (iii) X at position 231 of SEQ ID NO: 34 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) X at position 232 of SEQ ID NO: 34 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (g) the second polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 35, wherein X at position 172 of SEQ ID NO: 35 is Ser or Cys; (h) the first polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61, wherein: (i) X at position 172 of SEQ ID NO: 61 is Thr or Cys; (ii) X at position 236 of SEQ ID NO: 61 is Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp; (iii) X at position 238 of SEQ ID NO: 61 is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp; and (iv) X at position 239 of SEQ ID NO: 61 is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met or Trp; (i) the second polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 62 (TCR β4373 chain without the N-terminal signal peptide, predicted by SignalP), wherein X at position 170 of SEQ ID NO: 62 is Ser or Cys or (j) both (f) or both (h) and (i) and; (k) the first polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40; (k) the first polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 57; (m) the second polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 41; (n) the second polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58; (o) the first polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42; (p) the second polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43; (p) the first polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 65; (q) the second polypeptide chain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 66; (s) both (k) and (m); (t) both (l) and (m); (u) both (k) and (n); (v) both (m) and (n); (w) both (o) and (p) or both (q) and (r). In one embodiment of the invention, one or more of SEQ ID NOs: 21-22, 34-35, 53, 54, 61 and 62 are as defined in any one of Tables 2-4.
[0067] Белок по изобретению может представлять собой TCR. В качестве альтернативы, если, например, белок содержит одну полипептидную цепь, содержащую аминокислотные последовательности обеих SEQ ID NO: 23 и 24, обеих SEQ ID NO: 55 и 24, обеих SEQ ID NO: 23 и 56, обеих SEQ ID NO: 55 и 56, обеих SEQ ID NO: 21 и 22, обеих SEQ ID NO: 53 и 22, обеих SEQ ID NO: 21 и 54, обеих SEQ ID NO: 53 и 54, или, если первая и/или вторая полипептидная(ые) цепь(и) белка дополнительно содержит(ат) другие аминокислотные последовательности, например, аминокислотную последовательность, кодирующую иммуноглобулин или его часть, тогда белок по изобретению может представлять собой слитый белок. В связи с этим, согласно изобретению также предложен слитый белок, содержащий по меньшей мере один из полипептидов по изобретению, описанных в данном документе, вместе с о меньшей мере одним другим полипептидом. Другой полипептид может существовать в виде отдельного полипептида слитого белка или может существовать в виде полипептида, который экспрессируется в рамке (в тандеме) с одним из полипептидов по изобретению, описанных в данном документе. Другой полипептид может кодировать любую пептидную или белковую молекулу или ее часть, включая иммуноглобулин, CD3, CD4, CD8, молекулу МНС, молекулу CD1, например, CD1a, CD1b, CD1c, CD1d, и т.д., но, не ограничиваясь ими.[0067] The protein of the invention may be a TCR. Alternatively, if, for example, the protein comprises one polypeptide chain comprising the amino acid sequences of both SEQ ID NOs: 23 and 24, both SEQ ID NOs: 55 and 24, both SEQ ID NOs: 23 and 56, both SEQ ID NOs: 55 and 56, both SEQ ID NOs: 21 and 22, both SEQ ID NOs: 53 and 22, both SEQ ID NOs: 21 and 54, both SEQ ID NOs: 53 and 54, or if the first and/or second polypeptide chain(s) of the protein further comprise other amino acid sequences, such as an amino acid sequence encoding an immunoglobulin or a portion thereof, then the protein of the invention may be a fusion protein. In this regard, the invention also provides a fusion protein comprising at least one of the polypeptides of the invention described herein, together with at least one other polypeptide. The other polypeptide may exist as a separate polypeptide of the fusion protein or may exist as a polypeptide that is expressed in frame (in tandem) with one of the polypeptides of the invention described herein. The other polypeptide may encode any peptide or protein molecule or part thereof, including, but not limited to, an immunoglobulin, CD3, CD4, CD8, an MHC molecule, a CD1 molecule, such as CD1a, CD1b, CD1c, CD1d, etc.
[0068] Слитый белок может содержать одну или более копий полипептида по изобретению и/или одну или более копий другого полипептида. Например, слитый-белок может содержать 1, 2, 3, 4, 5 или больше копий полипептида по изобретению и/или другого полипептида. Подходящие способы получения слитых белков известны в данной области и включают, например, способы генной инженерии.[0068] A fusion protein may comprise one or more copies of a polypeptide of the invention and/or one or more copies of another polypeptide. For example, a fusion protein may comprise 1, 2, 3, 4, 5 or more copies of a polypeptide of the invention and/or another polypeptide. Suitable methods for producing fusion proteins are known in the art and include, for example, genetic engineering methods.
[0069] В некоторых воплощениях изобретения TCR, полипептиды и белки по изобретению могут экспрессироваться в виде одиночного белка, содержащего линкерный пептид, связывающий цепь α и цепь β. В связи с этим, TCR, полипептиды и белки по изобретению могут дополнительно содержать линкерный пептид. Линкерный пептид может преимущественно облегчать экспрессию рекомбинантного TCR, полипептида и/или белка в клетке-хозяине. Линкерный полипептид может содержать любую подходящую аминокислотную последовательность. Линкерный пептид может представлять собой расщепляемый линкерный пептид. Например, линкерный пептид может представлять собой линкер фурин-SGSG-P2A, содержащий аминокислотную последовательность RAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENPGP (SEQ ID NO: 25). При экспрессии конструкции, включающей линкерный пептид, клеткой-хозяином, линкерный пептид может быть расщеплен, приводя к получению разделенных цепей α и β. В одном воплощении изобретения TCR, полипептид или белок может содержать аминокислотную последовательность, содержащую полноразмерную цепь α, полноразмерную цепь β и линкерный пептид, размещенный между цепями α и β, например, цепь α - линкер - цепь β или цепь β-линкер- цепь α.[0069] In some embodiments of the invention, the TCRs, polypeptides, and proteins of the invention can be expressed as a single protein comprising a linker peptide linking the α chain and the β chain. In this regard, the TCRs, polypeptides, and proteins of the invention can further comprise a linker peptide. The linker peptide can advantageously facilitate expression of the recombinant TCR, polypeptide, and/or protein in a host cell. The linker polypeptide can comprise any suitable amino acid sequence. The linker peptide can be a cleavable linker peptide. For example, the linker peptide can be a furin-SGSG-P2A linker comprising the amino acid sequence RAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENPGP (SEQ ID NO: 25). When a construct comprising a linker peptide is expressed by a host cell, the linker peptide may be cleaved, resulting in separated α and β chains. In one embodiment of the invention, a TCR, polypeptide, or protein may comprise an amino acid sequence comprising a full-length α chain, a full-length β chain, and a linker peptide located between the α and β chains, such as α chain-linker-β chain or β chain-linker-α chain.
[0070] В одном воплощении изобретения TCR, полипептид или белок может содержать аминокислотную последовательность, как изложено в SEQ ID NO: 47, содержащую, от N-конца к С-концу, цепь β, линкер (SEQ ID NO:25) и цепь α. Вариант содержит вариабельную область цепи β (с сигнальным пептидом варианта), как изложено в SEQ ID NO: 8, и модифицированный константный домен β, как изложено в SEQ ID NO: 39. Полноразмерная цепь β варианта изложена в SEQ ID NO: 41. Вариант также содержит вариабельную область цепи α (с сигнальным пептидом дикого типа), как изложено в SEQ ID NO: 7, и модифицированный константный домен α, как изложено в SEQ ID NO: 38. Полноразмерная цепь α варианта изложена в SEQ ID NO: 40.[0070] In one embodiment of the invention, a TCR, polypeptide, or protein may comprise an amino acid sequence as set forth in SEQ ID NO: 47, comprising, from N-terminus to C-terminus, a β chain, a linker (SEQ ID NO: 25), and an α chain. The variant comprises a β chain variable region (with a variant signal peptide) as set forth in SEQ ID NO: 8 and a modified β constant domain as set forth in SEQ ID NO: 39. The full-length β chain of the variant is set forth in SEQ ID NO: 41. The variant also comprises an α chain variable region (with a wild-type signal peptide) as set forth in SEQ ID NO: 7 and a modified α constant domain as set forth in SEQ ID NO: 38. The full-length α chain of the variant is set forth in SEQ ID NO: 40.
[0071] В еще одном воплощении изобретения TCR, полипептид или белок может содержать аминокислотную последовательность, как изложено в SEQ ID NO: 67, содержащую, от N-конца к С-концу, цепь α, линкер (SEQ ID NO: 25) и цепь β. Вариант содержит вариабельную область цепи α (с сигнальным пептидом варианта), как изложено в SEQ ID NO: 51, и модифицированный константный домен α, как изложено в SEQ ID NO: 38. Полноразмерная цепь α варианта изложена в SEQ ID NO: 57. Вариант также содержит вариабельную область цепи β (с сигнальным пептидом дикого типа), как изложено в SEQ ID NO: 52, и модифицированный константный домен β, как изложено в SEQ ID NO: 39. Полноразмерная цепь β варианта изложена в SEQ ID NO: 58.[0071] In another embodiment of the invention, the TCR, polypeptide or protein may comprise an amino acid sequence as set forth in SEQ ID NO: 67, comprising, from N-terminus to C-terminus, an α chain, a linker (SEQ ID NO: 25) and a β chain. The variant comprises an α chain variable region (with a variant signal peptide) as set forth in SEQ ID NO: 51 and a modified α constant domain as set forth in SEQ ID NO: 38. The full-length α chain of the variant is set forth in SEQ ID NO: 57. The variant also comprises a β chain variable region (with a wild-type signal peptide) as set forth in SEQ ID NO: 52 and a modified β constant domain as set forth in SEQ ID NO: 39. The full-length β chain of the variant is set forth in SEQ ID NO: 58.
[0072] В некоторых воплощениях TCR, полипептид или белок, раскрытый в данном документе, содержит цепь α и/или цепь β, как раскрыто в данном документе, содержащую сигнальный пептид. В некоторых воплощениях последовательность сигнального пептида любой из цепей α и/или цепей β, раскрытых в данном документе, содержит остаток аланина или гистидина, используемый вместо остатка дикого типа в положении 2.[0072] In some embodiments, the TCR, polypeptide, or protein disclosed herein comprises an α chain and/or a β chain as disclosed herein, comprising a signal peptide. In some embodiments, the signal peptide sequence of any of the α chains and/or β chains disclosed herein comprises an alanine or histidine residue used in place of the wild-type residue at position 2.
[0073] В некоторых воплощениях TCR, полипептид или белок, раскрытый в данном документе, содержит зрелую версию цепи α и/или цепи β, как раскрыто в данном документе, которая не имеет сигнального пептида. Последовательность сигнального пептида или зрелой формы цепи α и/или цепи β может быть реализована в соответствии с любым способом, известным в данной области, включая IMGT и SignalP.[0073] In some embodiments, the TCR, polypeptide, or protein disclosed herein comprises a mature version of the α chain and/or β chain as disclosed herein that does not have a signal peptide. The signal peptide sequence or the mature form of the α chain and/or β chain can be implemented according to any method known in the art, including IMGT and SignalP.
[0074] Белок по изобретению может представлять собой рекомбинантное антитело или его антигенсвязывающую часть, содержащее по меньшей мере один из полипептидов по изобретению, раскрытых в данном документе. В том виде, в котором он используется в данном документе, термин «рекомбинантное антитело» относится к рекомбинантному (например, генетически сконструированному) белку, содержащему по меньшей мере один из полипептидов по изобретению и полипептидную цепь αнтитела или его антигенсвязывающей части. Полипептид антитела или его антигенсвязывающей части может представлять собой тяжелую цепь, легкую цепь, вариабельную или константную область тяжелой или легкой цепи, одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv - от англ. chain variable fragment) или фрагмент Fc, Fab или F(ab)2' антитела и т.д. Полипептидная цепь αнтитела или его антигенсвязывающей части может существовать в виде отдельного полипептида рекомбинантного антитела. В качестве альтернативы полипептидная цепь антитела или его антигенсвязывающей части может существовать в виде полипептида, который экспрессируется в рамке (в тандеме) с полипептидом по изобретению. Полипептид антитела или его антигенсвязывающей части может представлять собой полипептид любого антитела или любого фрагмента антитела, включая любое из антител и фрагментов антител, описанных в данном документе.[0074] The protein of the invention may be a recombinant antibody or an antigen-binding portion thereof that comprises at least one of the polypeptides of the invention disclosed herein. As used herein, the term "recombinant antibody" refers to a recombinant (e.g., genetically engineered) protein that comprises at least one of the polypeptides of the invention and a polypeptide chain of an α-antibody or an antigen-binding portion thereof. The polypeptide of the antibody or an antigen-binding portion thereof may be a heavy chain, a light chain, a variable or constant region of a heavy or light chain, a single-chain variable fragment (scFv), or an Fc, Fab, or F(ab) 2 ' fragment of an antibody, etc. The polypeptide chain of the α-antibody or an antigen-binding portion thereof may exist as a separate polypeptide of the recombinant antibody. Alternatively, the polypeptide chain of the antibody or antigen-binding portion thereof may exist as a polypeptide that is expressed in frame (in tandem) with the polypeptide of the invention. The polypeptide of the antibody or antigen-binding portion thereof may be a polypeptide of any antibody or any antibody fragment, including any of the antibodies and antibody fragments described herein.
[0075] В объеме данного изобретения включены функциональные варианты TCR, полипептидов или белков по изобретению, описанных в данном документе. Термин «функциональный вариант», в том виде, в котором он используется в данном документе, относится к TCR, полипептиду или белку, обладающему существенной или значимой идентичностью или сходством последовательностей с исходным TCR, полипептидом или белком, функциональный вариант которого сохраняет биологическую активность TCR, полипептида или белка, чьим вариантом он является. Функциональные варианты охватывают, например, те варианты TCR, полипептида или белка, описанные в данном документе (исходные TCR, полипептид или белок), которые сохраняют способность к специфичному связыванию с G12D RAS, в отношении которого исходный TCR обладает антигенной специфичностью или с которым специфично связывается исходный полипептид или белок, в похожей степени, в той же степени или в большей степени, чем исходный TCR, полипептид или белок. В отношении исходного TCR, полипептида или белка, функциональный вариант может, например, быть на по меньшей мере примерно 30%, примерно 50%, примерно 75%, примерно 80%, примерно 90%, примерно 95%, примерно 96%, примерно 97%, примерно 98%, примерно 99% или более идентичен по аминокислотной последовательности исходному TCR, полипептиду или белку, соответственно.[0075] Included within the scope of the present invention are functional variants of the TCRs, polypeptides, or proteins of the invention described herein. The term "functional variant," as used herein, refers to a TCR, polypeptide, or protein that has substantial or significant sequence identity or similarity to a parent TCR, polypeptide, or protein, the functional variant of which retains the biological activity of the TCR, polypeptide, or protein of which it is a variant. Functional variants include, for example, those variants of the TCR, polypeptide, or protein described herein (the parent TCR, polypeptide, or protein) that retain the ability to specifically bind to the G12D RAS for which the parent TCR has antigen specificity or to which the parent polypeptide or protein specifically binds, to a similar degree, to the same degree, or to a greater degree than the parent TCR, polypeptide, or protein. With respect to the parent TCR, polypeptide, or protein, the functional variant may, for example, be at least about 30%, about 50%, about 75%, about 80%, about 90%, about 95%, about 96%, about 97%, about 98%, about 99%, or more identical in amino acid sequence to the parent TCR, polypeptide, or protein, respectively.
[0076] Функциональный вариант может, например, содержать аминокислотную последовательность исходного TCR, полипептида или белка с по меньшей мере одной консервативной заменой аминокислоты. Консервативные замены аминокислот известны в данной области и включают замены аминокислот, в которых одна аминокислота, обладающая определенными физическими и/или химическими свойствами, заменена другой аминокислотой, которая обладает такими же химическими или физическими свойствами. Например, консервативная замена аминокислоты может представлять собой кислую аминокислоту, заменяющую другую кислую аминокислоту (например, Asp или Glu), аминокислоту с неполярной боковой цепью, заменяющую другую аминокислоту с неполярной боковой цепью (например, Ala, Gly, Val, Ile, Leu, Met, Phe, Pro, Trp, Val и т.д.), основную аминокислоту, заменяющую другую основную аминокислоту (Lys, Arg и т.д.), аминокислоту с полярной боковой цепью, заменяющую другую аминокислоту с полярной боковой цепью (Asn, Cys, Gin, Ser, Thr, Tyr, и т.д.), и т.д.[0076] A functional variant may, for example, comprise an amino acid sequence of a parent TCR, polypeptide, or protein with at least one conservative amino acid substitution. Conservative amino acid substitutions are known in the art and include amino acid substitutions in which one amino acid having certain physical and/or chemical properties is replaced by another amino acid that has the same chemical or physical properties. For example, a conservative amino acid substitution may be an acidic amino acid replacing another acidic amino acid (e.g., Asp or Glu), an amino acid with a non-polar side chain replacing another amino acid with a non-polar side chain (e.g., Ala, Gly, Val, Ile, Leu, Met, Phe, Pro, Trp, Val, etc.), a basic amino acid replacing another basic amino acid (Lys, Arg, etc.), an amino acid with a polar side chain replacing another amino acid with a polar side chain (Asn, Cys, Gin, Ser, Thr, Tyr, etc.), etc.
[0077] В качестве альтернативы или дополнительно, функциональные варианты могут содержать аминокислотную последовательность исходного TCR, полипептида или белка с по меньшей мере одной неконсервативной заменой аминокислоты. В данном случае предпочтительно, чтобы неконсервативная замена аминокислоты не затрагивала или не ингибировала биологическую активность функционального варианта. Предпочтительно, неконсервативная замена аминокислоты усиливает биологическую активность функционального варианта, таким образом, что биологическая активность функционального варианта повышается, по сравнению с исходным TCR, полипептидом или белком.[0077] Alternatively or additionally, functional variants may comprise an amino acid sequence of the parent TCR, polypeptide, or protein with at least one non-conservative amino acid substitution. In this case, it is preferred that the non-conservative amino acid substitution does not affect or inhibit the biological activity of the functional variant. Preferably, the non-conservative amino acid substitution enhances the biological activity of the functional variant, such that the biological activity of the functional variant is increased, compared to the parent TCR, polypeptide, or protein.
[0078] Каждый сигнальный пептид TCR, полипептидов, белков, функциональных вариантов и функциональных частей, описанных в данном документе, при наличии, может представлять собой любой подходящий сигнальный пептид TCR, при условии, что TCR, полипептид, белок или функциональный вариант экспрессируется и обладает антигенной специфичностью в отношении аминокислотной последовательности мутантного человеческого RAS с заменой глицина в положении 12 аспарагиновой кислотой, презентированной молекулой HLA Класса I.[0078] Each TCR signal peptide, polypeptide, protein, functional variant, and functional portion described herein, if present, may be any suitable TCR signal peptide, so long as the TCR, polypeptide, protein, or functional variant is expressed and has antigen specificity for the amino acid sequence of a mutant human RAS with a substitution of glycine at position 12 with aspartic acid, presented by an HLA Class I molecule.
[0079] TCR, полипептид или белок может по существу состоять из заданной аминокислотной последовательности и последовательностей, описанных в данном документе, таким образом, что другие компоненты TCR, полипептида или белка, например, другие аминокислоты, существенно не меняют биологическую активность TCR, полипептида или белка. В связи с этим, TCR, полипептид или белок по изобретению может, например, по существу состоять из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 66, обеих SEQ ID NO: 21-22, обеих SEQ ID NO: 53 и 22, обеих SEQ ID NO: 21 и 54, обеих SEQ ID NO: 53 и 54, обеих SEQ ID NO: 23-24, обеих SEQ ID NO: 55 и 24, обеих SEQ ID NO: 23 и 54, обеих SEQ ID NO: 55 и 56, обеих SEQ ID NO: 34-35, обеих SEQ ID NO: 61-62, обеих SEQ ID NO: 36-37, обеих SEQ ID NO: 63-64, обеих SEQ ID NO: 40-41, обеих SEQ ID NO: 57 и 41, обеих SEQ ID NO: 40 и 58, обеих SEQ ID NO: 57 и 58, обеих SEQ ID NO: 42-43 или обеих SEQ ID NO: 65-66. Также, например, TCR, полипептиды или белки по изобретению могут состоять по существу из аминокислотной(ых) последовательности(ей) (i) SEQ ID NO: 7, (ii) SEQ ID NO: 51, (iii) SEQ ID NO: 8, (iv) SEQ ID NO: 52, (v) SEQ ID NO: 32, (vi) SEQ ID NO: 33 (vii) SEQ ID NO: 59 или (viii) SEQ ID NO: 60. Кроме того, TCR, полипептиды или белки по изобретению могут состоять по существу из следующих аминокислотных последовательностей: (а) любая одна или более из SEQ ID NO: 1-6; (b) все из SEQ ID NO: 1-3; (с) все из SEQ ID NO: 4-6; или (d) все из SEQ ID NO: 1-6.[0079] The TCR, polypeptide, or protein may consist essentially of a given amino acid sequence and the sequences described herein, such that other components of the TCR, polypeptide, or protein, such as other amino acids, do not substantially alter the biological activity of the TCR, polypeptide, or protein. In this regard, the TCR, polypeptide or protein of the invention may, for example, consist essentially of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 66, both SEQ ID NOs: 21-22, both SEQ ID NOs: 53 and 22, both SEQ ID NOs: 21 and 54, both SEQ ID NOs: 53 and 54, both SEQ ID NOs: 23-24, both SEQ ID NOs: 55 and 24, both SEQ ID NOs: 23 and 54, both SEQ ID NOs: 55 and 56, both SEQ ID NOs: 34-35, both SEQ ID NOs: 61-62, both SEQ ID NOs: 36-37, both SEQ ID NOs: 63-64, both SEQ ID NOs: 40-41, both SEQ ID NOs: 57 and 41, both SEQ ID NOs: 40 and 58, both SEQ ID NOs: 57 and 58, both SEQ ID NOs: 42-43, or both SEQ ID NOs: 65-66. Also, for example, the TCRs, polypeptides, or proteins of the invention can consist essentially of the amino acid sequence(s) of (i) SEQ ID NO: 7, (ii) SEQ ID NO: 51, (iii) SEQ ID NO: 8, (iv) SEQ ID NO: 52, (v) SEQ ID NO: 32, (vi) SEQ ID NO: 33 (vii) SEQ ID NO: 59, or (viii) SEQ ID NO: 60. Furthermore, the TCRs, polypeptides, or proteins of the invention can consist essentially of the following amino acid sequences: (a) any one or more of SEQ ID NOs: 1-6; (b) all of SEQ ID NOs: 1-3; (c) all of SEQ ID NOs: 4-6; or (d) all of SEQ ID NOs: 1-6.
[0080] TCR, полипептиды и белки по изобретению могут иметь любую длину, а именно, могут содержать любое число аминокислот, при условии, что TCR, полипептиды или белки сохраняют свою биологическую активность, например, способность к специфичному связыванию с G12D RAS; выявлению рака у млекопитающего; или лечению или предупреждению рака у млекопитающего и т.д. Например, длина полипептида может находиться в интервале от примерно 50 до примерно 5000 аминокислот, как например, примерно 50, примерно 70, примерно 75, примерно 100, примерно 125, примерно 150, примерно 175, примерно 200, примерно 300, примерно 400, примерно 500, примерно 600, примерно 700, примерно 800, примерно 900, примерно 1000 или более аминокислот в длину. В данном отношении, полипептиды по изобретению также включают олигопептиды.[0080] The TCRs, polypeptides, and proteins of the invention may be of any length, namely, may contain any number of amino acids, so long as the TCRs, polypeptides, or proteins retain their biological activity, such as the ability to specifically bind to the G12D RAS; detect cancer in a mammal; or treat or prevent cancer in a mammal, etc. For example, the length of a polypeptide may be in the range of about 50 to about 5,000 amino acids, such as about 50, about 70, about 75, about 100, about 125, about 150, about 175, about 200, about 300, about 400, about 500, about 600, about 700, about 800, about 900, about 1000 or more amino acids in length. In this regard, the polypeptides of the invention also include oligopeptides.
[0081] TCR, полипептиды и белки по изобретению могут содержать синтетические аминокислоты вместо одной или более встречающихся в природе аминокислот. Такие синтетические аминокислоты известны в данной области и включают, например, аминоциклогексанкарбоновую кислоту, норлейцин, α-амино-n-декановую кислоту, гомосерин, S-ацетиламинометилцистеин, транс-3- и транс-4-гидроксипролин, 4-аминофенилаланин, 4-нитрофенилаланин, 4-хлорфенилаланин, 4-карбоксифенилаланин, β-фенилсерин, β-гидроксифенилаланин, фенилглицин, α-нафтилаланин, циклогексилаланин, циклогексилглицин, индолин-2-карбоновую кислоту, 1,2,3,4-тетрагидроизохинолин-3-карбоновую кислоту, аминомалоновую кислоту, моноамид аминомалоновой кислоты, N'-бензил-N'-метиллизин, N',N'-дибензиллизин, 6-гидроксилизин, орнитин, α-аминоциклопентанкарбоновую кислоту, α-аминоциклогексанкарбоновую кислоту, α-аминоциклогептанкарбоновую кислоту, α-(2-амино-2-норборнан)-карбоновую кислоту, α,γ-диаминомасляную кислоту, α,β-диаминопропионовую кислоту, гомофенилаланин и α-трет-бутил глицин.[0081] The TCRs, polypeptides and proteins of the invention may comprise synthetic amino acids in place of one or more naturally occurring amino acids. Such synthetic amino acids are known in the art and include, for example, aminocyclohexanecarboxylic acid, norleucine, α-amino-n-decanoic acid, homoserine, S-acetylaminomethylcysteine, trans-3- and trans-4-hydroxyproline, 4-aminophenylalanine, 4-nitrophenylalanine, 4-chlorophenylalanine, 4-carboxyphenylalanine, β-phenylserine, β-hydroxyphenylalanine, phenylglycine, α-naphthylalanine, cyclohexylalanine, cyclohexylglycine, indoline-2-carboxylic acid, 1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxylic acid, aminomalonic acid, aminomalonic acid monoamide, N'-benzyl-N'-methyllysine, N',N'-dibenzyllysine, 6-hydroxylysine, ornithine, α-aminocyclopentanecarboxylic acid, α-aminocyclohexanecarboxylic acid, α-aminocycloheptanecarboxylic acid, α-(2-amino-2-norbornane)-carboxylic acid, α,γ-diaminobutyric acid, α,β-diaminopropionic acid, homophenylalanine and α-tert-butylglycine.
[0082] TCR, полипептиды и белки по изобретению могут, например, быть гликозилированы, амидированы, карбоксилированы, фосфорилированы, этерифицированы, N-ацилированы, циклизированы посредством, например, дисульфидного мостика, или превращены в соль присоединения кислоты и/или возможно димеризованы или полимеризованы или конъюгированы.[0082] The TCRs, polypeptides and proteins of the invention may, for example, be glycosylated, amidated, carboxylated, phosphorylated, esterified, N-acylated, cyclized via, for example, a disulfide bridge, or converted into an acid addition salt and/or optionally dimerized or polymerized or conjugated.
[0083] TCR, полипептид и/или белок по изобретению может быть получен способами, известными в данной области, такими как, например, синтез de novo. Кроме того, полипептиды и белки могут быть рекомбинантно получены с использованием нуклеиновых кислот, описанных в данном документе, используя стандартные способы генной инженерии. См., например, Green and Sambrook, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 4th ed., Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY (2012). В качестве альтернативы, TCR, полипептиды и/или белки, описанные в данном документе, могут быть коммерчески синтезированы любой из множества коммерческих организаций. В данном отношении, TCR, полипептиды и белки по изобретению могут быть синтетическими, рекомбинантными, выделенными и/или очищенными. Согласно одному воплощению изобретения предложен выделенный или очищенный TCR, полипептид или белок, кодируемый любой из нуклеиновых кислот или векторов, описанных в данном документе, относительно других аспектов изобретения. Согласно еще одному воплощению изобретения предложен выделенный или очищенный TCR, полипептид или белок, который получен в результате экспрессии любой их нуклеиновых кислот или векторов, описанных в данном документе в отношении других аспектов изобретения, в клетке. Согласно еще одному воплощению изобретения предложен способ получения любого из TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе, причем способ включает культивирование любой из клеток-хозяев или популяций клеток-хозяев, описанных в данном документе, таким образом, что получают TCR, полипептид или белок.[0083] The TCR, polypeptide, and/or protein of the invention can be produced by methods known in the art, such as, for example, de novo synthesis. In addition, the polypeptides and proteins can be recombinantly produced using the nucleic acids described herein using standard genetic engineering techniques. See, for example, Green and Sambrook, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 4th ed., Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY (2012). Alternatively, the TCR, polypeptides, and/or proteins described herein can be commercially synthesized by any of a variety of commercial organizations. In this regard, the TCR, polypeptides, and proteins of the invention can be synthetic, recombinant, isolated, and/or purified. According to one embodiment, the invention provides an isolated or purified TCR, polypeptide, or protein encoded by any of the nucleic acids or vectors described herein, relative to other aspects of the invention. According to another embodiment of the invention, there is provided an isolated or purified TCR, polypeptide, or protein obtained by expressing any of the nucleic acids or vectors described herein in relation to other aspects of the invention in a cell. According to another embodiment of the invention, there is provided a method for producing any of the TCRs, polypeptides, or proteins described herein, wherein the method comprises culturing any of the host cells or populations of host cells described herein such that the TCR, polypeptide, or protein is obtained.
[0084] В объем изобретения включены конъюгаты, например, биоконъюгаты, содержащие любой из TCR, полипептидов или белков (включая любую из их функциональных частей или вариантов), нуклеиновых кислот, рекомбинантных экспрессионных векторов, клеток-хозяев, популяций клеток-хозяев или антител или их антигенсвязывающих частей по изобретению. Конъюгаты, а также способы синтеза конъюгатов в общем известны в данной области.[0084] The invention includes conjugates, such as bioconjugates, comprising any of the TCRs, polypeptides or proteins (including any of their functional portions or variants), nucleic acids, recombinant expression vectors, host cells, host cell populations, or antibodies or antigen-binding portions thereof, of the invention. Conjugates, as well as methods for synthesizing conjugates, are generally known in the art.
[0085] Согласно одному воплощению изобретения предложена нуклеиновая кислота, содержащая нуклеотидную последовательность, кодирующую любой из TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе. Термин «нуклеиновая кислота», в том виде, в котором он используется в данном документе, включает «полинуклеотид», «олигонуклеотид» и «молекулу нуклеиновой кислоты» и обычно означает полимер ДНК или РНК, который может быть одноцепочечным или двухцепочечным, который может содержать природные, неприродные или измененные нуклеотиды, и который может содержать природную, неприродную или измененную межнуклеотидную связь, такую как фосфорамидатная связь или фосфортиоатная связь, вместо фосфодиэфира, обнаруженного между нуклеотидами немодифицированного олигонуклеотида. В одном воплощении нуклеиновая кислота содержит комплементарную ДНК (кДНК). Обычно предпочтительно, чтобы нуклеиновая кислота не содержала никаких вставок, делеций, инверсий и/или замен. Однако, может быть подходящим в некоторых примерах, как описано в данном документе, чтобы нуклеиновая кислота содержала одну или более вставок, делеций, инверсий и/или замен.[0085] According to one embodiment of the invention, there is provided a nucleic acid comprising a nucleotide sequence encoding any of the TCRs, polypeptides, or proteins described herein. The term "nucleic acid," as used herein, includes "polynucleotide," "oligonucleotide," and "nucleic acid molecule," and generally refers to a DNA or RNA polymer that may be single-stranded or double-stranded, that may contain natural, non-natural, or modified nucleotides, and that may contain a natural, non-natural, or modified internucleotide linkage, such as a phosphoramidate linkage or a phosphorothioate linkage, in place of the phosphodiester found between nucleotides of an unmodified oligonucleotide. In one embodiment, the nucleic acid comprises complementary DNA (cDNA). It is generally preferred that the nucleic acid does not contain any insertions, deletions, inversions, and/or substitutions. However, it may be appropriate in some examples, as described herein, for the nucleic acid to contain one or more insertions, deletions, inversions and/or substitutions.
[0086] Предпочтительно, нуклеиновые кислоты по изобретению являются рекомбинантными. В том виде, в котором он используется в данном документе, термин «рекомбинантный» относится к (i) молекулам, которые конструируют за пределами живых клеток посредством присоединения сегментов природных или синтетических нуклеиновых кислот к молекулам нуклеиновой кислоты, которые могут реплицироваться в живой клетке, или (ii) молекулам, которые получены в результате репликации молекул, описанных выше в (i). В целях данного документа, репликация может представлять собой репликацию in vitro или репликацию in vivo.[0086] Preferably, the nucleic acids of the invention are recombinant. As used herein, the term "recombinant" refers to (i) molecules that are constructed outside of living cells by joining segments of natural or synthetic nucleic acids to nucleic acid molecules that can replicate in a living cell, or (ii) molecules that are obtained by replication of the molecules described in (i) above. For the purposes of this document, replication may be in vitro replication or in vivo replication.
[0087] В одном воплощении изобретения нуклеиновая кислота содержит нуклеотидную последовательность (i) SEQ ID NO: 44 (нуклеотидная последовательность, кодирующая вариабельную область цепи α 4373 TCR), (ii) нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 45, кодирующую вариабельную область цепи β 4373 TCR, или (iii) обе из SEQ ID NO: 44-45.[0087] In one embodiment of the invention, the nucleic acid comprises the nucleotide sequence of (i) SEQ ID NO: 44 (the nucleotide sequence encoding the variable region of the α chain of the TCR), (ii) the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 45 encoding the variable region of the β chain of the TCR, or (iii) both of SEQ ID NO: 44-45.
[0088] Нуклеиновые кислоты могут быть сконструированы на основе химического синтеза и/или ферментативных реакций лигирования с использованием способов, известных в данном документе. См. выше, например, Green and Sambrook et al. Например, нуклеиновая кислота может быть химически синтезирована с использованием встречающихся в природе нуклеотидов или по-разному модифицированных нуклеотидов, сконструированных для повышения биологической стабильности молекул или для увеличения физической стабильности дуплекса, образованного при гибридизации (например, производные фосфортиоата и акридин-замещенные нуклеотиды). Примеры модифицированных нуклеотидов, которые могут быть использованы для образования нуклеиновых кислот, включают, но не ограничиваются нижеследующим: 5-фторурацил, 5-бромурацил, 5-хлорурацил, 5-йодурацил, гипоксантин, ксантин, 4-ацетилцитозин, 5-(карбоксигидроксиметил) урацил, 5-карбоксиметиламинометил-2-тиоуридин, 5-карбоксиметиламинометилурацил, дигидроурацил, β-D-галактозилквеозин, инозин, N6-изопентениладенин, 1-метилгуанин, 1-метилинозин, 2,2-диметилгуанин, 2-метиладенин, 2-метилгуанин, 3-метилцитозин, 5-метилцитозин, N6-замещенный аденин, 7-метилгуанин, 5-метиламинометилурацил, 5-метоксиаминометил-2-тиоурацил, β-D-маннозилквеозин, 5'-метоксикарбоксиметилурацил, 5-метоксиурацил, 2-метилтио-N6-изопентениладенин, урацил-5-оксиуксусная кислота (v), вибутоксозин, псевдоурацил, квеозин, 2-тиоцитозин, 5-метил-2-тиоурацил, 2-тиоурацил, 4-тиоурацил, 5-метилурацил, сложный метиловый эфир урацил-5-оксиуксусной кислоты, 3-(3-амино-3-N-2-карбоксипропил) урацил и 2,6-диаминопурин. В качестве альтернативы одна или более из нуклеиновых кислот по изобретению можно приобрести у любой из множества коммерческих организаций.[0088] Nucleic acids can be engineered based on chemical synthesis and/or enzymatic ligation reactions using methods known herein. See, e.g., Green and Sambrook et al. supra. For example, a nucleic acid can be chemically synthesized using naturally occurring nucleotides or variously modified nucleotides designed to enhance the biological stability of the molecules or to increase the physical stability of the duplex formed upon hybridization (e.g., phosphorothioate derivatives and acridine-substituted nucleotides). Examples of modified nucleotides that can be used to form nucleic acids include, but are not limited to, 5-fluorouracil, 5-bromouracil, 5-chlorouracil, 5-iodouracil, hypoxanthine, xanthine, 4-acetylcytosine, 5-(carboxyhydroxymethyl)uracil, 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine, 5-carboxymethylaminomethyluracil, dihydrouracil, β-D-galactosylqueosin, inosine, N 6 -isopentenyladenine, 1-methylguanine, 1-methylinosine, 2,2-dimethylguanine, 2-methyladenine, 2-methylguanine, 3-methylcytosine, 5-methylcytosine, N 6 -substituted adenine, 7-methylguanine, 5-methylaminomethyluracil, 5-methoxyaminomethyl-2-thiouracil, β-D-mannosyl queosine, 5'-methoxycarboxymethyluracil, 5-methoxyuracil, 2-methylthio-N 6 -isopentenyladenine, uracil-5-hydroxyacetic acid (v), vibutoxosine, pseudouracil, queosine, 2-thiocytosine, 5-methyl-2-thiouracil, 2-thiouracil, 4-thiouracil, 5-methyluracil, uracil-5-hydroxyacetic acid methyl ester, 3-(3-amino-3-N-2-carboxypropyl) uracil, and 2,6-diaminopurine. Alternatively, one or more of the nucleic acids of the invention can be purchased from any of a variety of commercial organizations.
[0089] Нуклеиновая кислота может содержать любую нуклеотидную последовательность, которая кодирует любой из TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе. В одном воплощении изобретения нуклеиновая кислота содержит нуклеотидную последовательность с оптимизированными кодонами, кодирующую любой из TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе. Без связывания какой-либо конкретной теорией или механизмом, полагают, что оптимизация кодонов нуклеотидной последовательности повышает эффективность трансляции транскриптов мРНК. Оптимизация кодонов нуклеотидной последовательности может включать замену нативного кодона другим кодоном, который кодирует ту же аминокислоту, но может транслироваться тРНК, которая более легко доступна в клетке, с повышением, таким образом, эффективности трансляции. Оптимизация нуклеотидной последовательности может также уменьшать вторичные структуры мРНК, которые будут мешать трансляции, с повышением, таким образом, эффективности трансляции.[0089] The nucleic acid may comprise any nucleotide sequence that encodes any of the TCRs, polypeptides, or proteins described herein. In one embodiment of the invention, the nucleic acid comprises a codon-optimized nucleotide sequence encoding any of the TCRs, polypeptides, or proteins described herein. Without being bound by any particular theory or mechanism, it is believed that codon optimization of the nucleotide sequence increases the translation efficiency of mRNA transcripts. Codon optimization of the nucleotide sequence may include replacing a native codon with another codon that encodes the same amino acid, but can be translated by tRNA that is more readily available in the cell, thereby increasing translation efficiency. Optimization of the nucleotide sequence may also reduce secondary structures of mRNA that would interfere with translation, thereby increasing translation efficiency.
[0090] Согласно изобретению также предложена нуклеиновая кислота, содержащая нуклеотидную последовательность, которая комплементарна нуклеотидной последовательности любой из нуклеиновых кислот, описанных в данном документе, или нуклеотидную последовательность, которая гибридизуется в жестких условиях с нуклеотидной последовательностью любой из нуклеиновых кислот, описанных в данном документе.[0090] The invention also provides a nucleic acid comprising a nucleotide sequence that is complementary to the nucleotide sequence of any of the nucleic acids described herein, or a nucleotide sequence that hybridizes under stringent conditions to the nucleotide sequence of any of the nucleic acids described herein.
[0091] Нуклеотидная последовательность, которая гибридизуется в жестких условиях, предпочтительно гибридизуется в условиях высокой жесткости. Под фразой «условия высокой жесткости» подразумевается, что нуклеотидная последовательность специфично гибридизуется с целевой последовательностью (нуклеотидной последовательностью любой из нуклеиновых кислот, описанных в данном документе) в количестве, которое заметно сильнее, чем при неспецифичной гибридизации. Условия высокой жесткости включают условия, которые будут отличать полинуклеотид с точной комплементарной последовательностью или полинуклеотид, содержащий только несколько разрозненных ошибок спаривания, от случайной последовательности, которая, как оказалось, имеет несколько маленьких областей (например, 3-10 оснований), которые совпадали с нуклеотидной последовательностью. Такие маленькие области комплементарности легче плавятся, чем полноразмерный комплемент из 14-17 или более оснований, и гибридизация в условиях высокой жесткости делает их легко различимыми. Условия относительно высокой жесткости будут включать, например, низкосолевые и/или высокотемпературные условия, как например, обеспеченные примерно 0,02-0,1 М NaCl или эквивалентом, при температурах примерно 50-70°С. Такие условия высокой жесткости допускают мало, если вообще допускают, ошибок спаривания между нуклеотидной последовательностью и матрицей или целевой цепью, и особенно подходят для выявления экспрессии любого из TCR по изобретению. Обычно следует принимать во внимание, что условия могут становиться более жесткими в результате добавления увеличивающихся количеств формамида.[0091] A nucleotide sequence that hybridizes under stringent conditions preferentially hybridizes under high stringency conditions. By "high stringency conditions" is meant that the nucleotide sequence specifically hybridizes to a target sequence (the nucleotide sequence of any of the nucleic acids described herein) in an amount that is noticeably stronger than non-specific hybridization. High stringency conditions include conditions that will distinguish a polynucleotide with an exact complementary sequence or a polynucleotide containing only a few scattered mismatches from a random sequence that happens to have several small regions (e.g., 3-10 bases) that match the nucleotide sequence. Such small regions of complementarity are more easily melted than a full-length complement of 14-17 or more bases, and hybridization under high stringency conditions makes them easily distinguishable. Relatively high-stringency conditions will include, for example, low-salt and/or high-temperature conditions, such as those provided with approximately 0.02-0.1 M NaCl or equivalent, at temperatures of approximately 50-70°C. Such high-stringency conditions allow for few, if any, mismatches between the nucleotide sequence and the template or target strand and are particularly suitable for detecting the expression of any of the TCRs of the invention. It will generally be appreciated that conditions can be made more stringent by adding increasing amounts of formamide.
[0092] Согласно изобретению также предложена нуклеиновая кислота, содержащая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на примерно 70% или более, например, примерно 80%, примерно 90%, примерно 91%, примерно 92%, примерно 93%, примерно 94%, примерно 95%, примерно 96%, примерно 97%, примерно 98% или примерно 99% идентична любой из нуклеиновых кислот, описанных в данном документе. В связи с этим, нуклеиновая кислота может по существу состоять из любых нуклеотидных последовательностей, описанных в данном документе.[0092] The invention also provides a nucleic acid comprising a nucleotide sequence that is at least about 70% or more, such as about 80%, about 90%, about 91%, about 92%, about 93%, about 94%, about 95%, about 96%, about 97%, about 98%, or about 99% identical to any of the nucleic acids described herein. In this regard, the nucleic acid may consist essentially of any of the nucleotide sequences described herein.
[0093] Согласно одному воплощению изобретения предложена выделенная или очищенная нуклеиновая кислота, содержащая, от 5' к 3', первую последовательность нуклеиновой кислоты и вторую нуклеотидную последовательность, где первая и вторая нуклеотидная последовательность, соответственно, кодируют аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 7 и 8; 51 и 8; 7 и 52; 51 и 52; 8 и 7; 8 и 51; 52 и 7; 52 и 51; 21 и 22; 21 и 54; 53 и 22; 53 и 54; 22 и 21; 54 и 21; 22 и 53; 54 и 53; 23 и 24; 55 и 24; 23 и 56; 55 и 56; 24 и 23; 24 и 55; 56 и 55; 56 и 23; 32 и 33; 33 и 32; 59 и 60; 60 и 59; 34 и 35; 35 и 34; 61 и 62; 62 и 61; 36 и 37; 37 и 36; 63 и 64; 64 и 63; 40 и 41; 57 и 41; 40 и 58; 57 и 58; 41 и 40; 41 и 57; 58 и 40; 58 и 57; 42 и 43; 43 и 42; 65 и 66; или 66 и 65.[0093] According to one embodiment of the invention, there is provided an isolated or purified nucleic acid comprising, from 5' to 3', a first nucleic acid sequence and a second nucleotide sequence, wherein the first and second nucleotide sequences, respectively, encode the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 7 and 8; 51 and 8; 7 and 52; 51 and 52; 8 and 7; 8 and 51; 52 and 7; 52 and 51; 21 and 22; 21 and 54; 53 and 22; 53 and 54; 22 and 21; 54 and 21; 22 and 53; 54 and 53; 23 and 24; 55 and 24; 23 and 56; 55 and 56; 24 and 23; 24 and 55; 56 and 55; 56 and 23; 32 and 33; 33 and 32; 59 and 60; 60 and 59; 34 and 35; 35 and 34; 61 and 62; 62 and 61; 36 and 37; 37 and 36; 63 and 64; 64 and 63; 40 and 41; 57 and 41; 40 and 58; 57 and 58; 41 and 40; 41 and 57; 58 and 40; 58 and 57; 42 and 43; 43 and 42; 65 and 66; or 66 and 65.
[0094] В одном воплощении изобретения выделенная или очищенная нуклеиновая кислота дополнительно содержит третью нуклеотидную последовательность, размещенную между первой и второй нуклеотидной последовательностью, где третья нуклеотидная последовательность кодирует расщепляемый линкерный пептид. В воплощении изобретения расщепляемый линкерный пептид содержит аминокислотную последовательность RAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENPGP (SEQ ID NO: 25).[0094] In one embodiment of the invention, the isolated or purified nucleic acid further comprises a third nucleotide sequence located between the first and second nucleotide sequences, wherein the third nucleotide sequence encodes a cleavable linker peptide. In an embodiment of the invention, the cleavable linker peptide comprises the amino acid sequence RAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENPGP (SEQ ID NO: 25).
[0095] Нуклеиновые кислоты по изобретению могут быть включены в рекомбинантный экспрессионный вектор. В этом отношении, согласно изобретению предложен рекомбинантный экспрессионный вектор, содержащий любую из нуклеиновых кислот по изобретению. В одном воплощении изобретения рекомбинантный экспрессионный вектор содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую цепь α, цепь β и линкерный пептид.[0095] The nucleic acids of the invention can be included in a recombinant expression vector. In this regard, the invention provides a recombinant expression vector comprising any of the nucleic acids of the invention. In one embodiment of the invention, the recombinant expression vector comprises a nucleotide sequence encoding an α chain, a β chain, and a linker peptide.
[0096] В целях данного документа, термин «рекомбинантный экспрессионный вектор» обозначает конструкцию генетически модифицированного олигонуклеотида или полинуклеотид а, которая делает возможной экспрессию мРНК, белка, полипептида или пептида клеткой-хозяином, когда конструкция содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую мРНК, белок, полипептид или пептид, и вектор приводится в контакт с клеткой в условиях, достаточных для экспрессии мРНК, белка, полипептида или пептида в клетке. Векторы по изобретению не встречаются в природе как единое целое. Однако, части векторов могут встречаться в природе. Рекомбинантные экспрессионные векторы по изобретению могут содержать любой тип нуклеотида, включая, но, не ограничиваясь ДНК и РНК, которые могут являться одноцепочечными или двухцепочечными, синтезированными или полученными отчасти из природных источников, и которые могут содержать природные, неприродные или измененные нуклеотиды. Рекомбинантные экспрессионные векторы могут содержать встречающиеся в природе, не встречающиеся в природе межнуклеотидные связи или оба типа связей. Предпочтительно, не встречающиеся в природе или измененные нуклеотиды или межнуклеотидные связи не препятствуют транскрипции или репликации вектора.[0096] For the purposes of this document, the term "recombinant expression vector" refers to a genetically modified oligonucleotide or polynucleotide construct that allows for the expression of an mRNA, protein, polypeptide, or peptide by a host cell, wherein the construct comprises a nucleotide sequence encoding the mRNA, protein, polypeptide, or peptide, and the vector is contacted with the cell under conditions sufficient to express the mRNA, protein, polypeptide, or peptide in the cell. The vectors of the invention do not occur in nature as a whole. However, parts of the vectors may occur in nature. The recombinant expression vectors of the invention may contain any type of nucleotide, including, but not limited to, DNA and RNA, which may be single-stranded or double-stranded, synthesized or obtained in part from natural sources, and which may contain natural, non-natural, or altered nucleotides. Recombinant expression vectors may contain naturally occurring, non-naturally occurring internucleotide linkages, or both. Preferably, non-naturally occurring or altered nucleotides or internucleotide linkages do not interfere with vector transcription or replication.
[0097] Рекомбинантный экспрессионный вектор по изобретению может представлять собой любой подходящий рекомбинантный экспрессионный вектор и может быть использован для трансформации или трансфекции любой подходящей клетки-хозяина. Подходящие векторы включают векторы, сконструированные для наработки и размножения или для экспрессии или и того и другого, такие как плазмиды и вирусы. Вектор может быть выбран из серии pUC (Fermentas Life Sciences), серии pBluescript (Stratagene, LaJolla, CA), серии pET (Novagen, Madison, WT), серии pGEX (Pharmacia Biotech, Uppsala, Швеция) и серии pEX (Clontech, Palo Alto, CA). Также можно использовать векторы на основе бактериофагов, такие как λGT10, λGT11, λZap11 (Stratagene), λEMBL4 и λNM1149. Примеры экспрессионных векторов растений включают pBI01, pBI101.2, pBI101.3, pBI121 и pBIN19 (Clontech). Примеры экспрессионных векторов животных включают pEUK-CI, рМАМ и рМАМпео (Clontech). Предпочтительно рекомбинантный экспрессионный вектор представляет собой вирусный вектор, например, ретровирусный вектор. В особенно предпочтительном воплощении рекомбинантный экспрессионный вектор представляет собой вектор MSGV1. В одном воплощении изобретения рекомбинантный экспрессионный вектор представляет собой транспозон или лентивирусный вектор.[0097] The recombinant expression vector of the invention may be any suitable recombinant expression vector and may be used to transform or transfect any suitable host cell. Suitable vectors include vectors designed for production and propagation or for expression, or both, such as plasmids and viruses. The vector may be selected from the pUC series (Fermentas Life Sciences), the pBluescript series (Stratagene, LaJolla, CA), the pET series (Novagen, Madison, WT), the pGEX series (Pharmacia Biotech, Uppsala, Sweden), and the pEX series (Clontech, Palo Alto, CA). Bacteriophage-based vectors such as λGT10, λGT11, λZap11 (Stratagene), λEMBL4, and λNM1149 may also be used. Examples of plant expression vectors include pBI01, pBI101.2, pBI101.3, pBI121, and pBIN19 (Clontech). Examples of animal expression vectors include pEUK-CI, pMAM, and pMAMneo (Clontech). Preferably, the recombinant expression vector is a viral vector, such as a retroviral vector. In a particularly preferred embodiment, the recombinant expression vector is the MSGV1 vector. In one embodiment of the invention, the recombinant expression vector is a transposon or a lentiviral vector.
[0098] Рекомбинантные экспрессионные векторы по изобретению могут быть получены, используя стандартные методики генной инженерии, описанные, например, в Green and Sambrook et al., см. выше. Конструкции экспрессионных векторов, которые являются кольцевыми или линейными, могут быть получены содержащими систему репликации, являющуюся функциональной в прокариотической или эукариотической клетке-хозяине. Системы репликации могут происходить, например, из ColEI, 2 μ плазмизы, λ, SV40, вируса папилломы крупного рогатого скота и т.п.[0098] Recombinant expression vectors of the invention can be prepared using standard genetic engineering techniques, such as those described in Green and Sambrook et al., supra. Expression vector constructs, which are circular or linear, can be prepared to contain a replication system that is functional in a prokaryotic or eukaryotic host cell. Replication systems can be derived from, for example, ColEI, 2 μ plasmidase, λ, SV40, bovine papillomavirus, and the like.
[0099] Желательно, чтобы рекомбинантный экспрессионный вектор содержал регуляторные последовательности, такие как старт- и стоп-кодоны транскрипции и трансляции, которые специфичны в отношении типа клетки-хозяина (например, бактерия, гриб, растение или животное), в которую должен быть введен вектор, исходя из конкретного случая и принимая во внимание то, основан ли вектор на ДНК или РНК.[0099] It is desirable that the recombinant expression vector contain regulatory sequences, such as transcription and translation start and stop codons, that are specific to the type of host cell (e.g., bacterium, fungus, plant, or animal) into which the vector is to be introduced, depending on the particular case and taking into account whether the vector is DNA or RNA based.
[0100] Рекомбинантный экспрессионный вектор может включать один или более маркерных генов, которые делают возможной селекцию трансформированных или трансфицированных клеток-хозяев. Маркерные гены включают устойчивость к биоциду, например, устойчивость к антибиотикам, тяжелым металлам и т.д., дополнение в ауксотрофной клетке-хозяине для обеспечения прототрофности и т.д. Подходящие маркерные гены для экспрессионных векторов по изобретению включают, например, гены устойчивости к неомицину/G418, гены устойчивости к гигромицину, гены устойчивости к гистидинолу, гены устойчивости к тетрациклину и гены устойчивости к ампициллину.[0100] The recombinant expression vector may include one or more marker genes that allow selection of transformed or transfected host cells. Marker genes include biocide resistance, such as resistance to antibiotics, heavy metals, etc., complementation in an auxotrophic host cell to ensure prototrophy, etc. Suitable marker genes for expression vectors of the invention include, for example, neomycin/G418 resistance genes, hygromycin resistance genes, histidinol resistance genes, tetracycline resistance genes, and ampicillin resistance genes.
[0101] Рекомбинантный экспрессионный вектор может содержать нативный или ненативный промотор, функционально связанный с нуклеотидной последовательностью, кодирующей TCR, полипептид или белок, или с нуклеотидной последовательностью, которая комплементарна или которая гибридизуется с нуклеотидной последовательностью, кодирующей TCR, полипептид или белок. Отбор промоторов, например, сильных, слабых, индуцибельных, тканеспецифичных и специфичных в отношении стадии развития, находится в компетенции обычного специалиста в данной области. Аналогично, объединение нуклеотидной последовательности с промотором также находится в компетенции специалиста. Промотор может представлять собой невирусный промотор или вирусный промотор, например, промотор цитомегаловируса (CMV - от англ. cytomegalovirus), промотор SV40, промотор RSV и промотор, обнаруженный в длинном концевом повторе вируса стволовых клеток мыши.[0101] A recombinant expression vector may comprise a native or non-native promoter operably linked to a nucleotide sequence encoding a TCR, polypeptide, or protein, or to a nucleotide sequence that is complementary to or that hybridizes with a nucleotide sequence encoding a TCR, polypeptide, or protein. The selection of promoters, such as strong, weak, inducible, tissue-specific, and developmental stage-specific, is within the skill of one of ordinary skill in the art. Similarly, the association of a nucleotide sequence with a promoter is also within the skill of one of ordinary skill in the art. The promoter may be a non-viral promoter or a viral promoter, such as the cytomegalovirus (CMV) promoter, the SV40 promoter, the RSV promoter, and the promoter found in the mouse stem cell virus long terminal repeat.
[0102] Рекомбинантные экспрессионные векторы по изобретению могут быть сконструированы или для временной экспрессии, или для стабильной экспрессии или для того и другого. Кроме того, рекомбинантные экспрессионные векторы могут быть сделаны для конститутивной экспрессии или для индуцибельной экспрессии.[0102] Recombinant expression vectors of the invention can be designed for either transient expression or stable expression, or both. Furthermore, recombinant expression vectors can be made for constitutive expression or inducible expression.
[0103] Кроме того, рекомбинантные экспрессионные векторы могут быть сделаны таким образом, чтобы они включали ген самоубийства. В том виде, в котором он используется в данном документе, термин «ген самоубийства» относится к гену, который вызывает гибель клетки, экспрессирующей данный ген самоубийства. Ген самоубийства может представлять собой ген, который придает клетке, в которой экспрессируется данный ген, чувствительность к агенту, например, лекарственному средству, и вызывает гибель клетки, когда клетка контактирует с или подвергается воздействию данного агента. Гены самоубийства известны в данной области и включают, например, ген тимидинкиназы (ТК - от англ. thymidine kinase) вируса простого герпеса (HSV- от англ. herpes simplex virus), систему генов цитозиндеаминазы, пуриннуклеозидфосфорилазы, нитроредуктазы и индуцибельной каспазы 9.[0103] Furthermore, recombinant expression vectors can be made to include a suicide gene. As used herein, the term "suicide gene" refers to a gene that causes the death of a cell expressing the suicide gene. The suicide gene can be a gene that confers sensitivity to an agent, such as a drug, on a cell expressing the gene and causes the cell to die when the cell contacts or is exposed to the agent. Suicide genes are known in the art and include, for example, the herpes simplex virus (HSV) thymidine kinase (TK) gene, the cytosine deaminase gene system, the purine nucleoside phosphorylase gene system, the nitroreductase gene system, and the inducible caspase 9 gene system.
[0104] Согласно другому воплощению изобретения дополнительно предложена клетка-хозяин, содержащая любой из рекомбинантных экспрессионных векторов, описанных в данном документе. В том виде, в котором он используется в данном документе, термин «клетка-хозяин» относится к любому типу клетки, который может содержать рекомбинантный экспрессионный вектор по изобретению. Клетка-хозяин может представлять собой эукариотическую клетку, например, растения, животного, грибов или водорослей, или может представлять собой прокариотическую клетку, например, бактерий или простейших. Клетка-хозяин может представлять собой культивируемую клетку или первичную клетку, то есть выделенную непосредственно из организма, например, человека или мыши. Клетка-хозяин может представлять собой адгезивную клетку или суспензионную клетку, то есть клетку, которая растет в суспензии. Подходящие клетки-хозяева известны в данной области и включают, например, клетки Е. coli DH5a, клетки яичника китайского хомяка, клетки VERO мартышки, клетки COS, клетки НЕК293 и т.п. В целях амплификации или репликации рекомбинантного экспрессиоиного вектора клетка-хозяин предпочтительно представляет собой прокариотическую клетку, например, клетку DH5α. В целях получения рекомбинантного TCR, полипептида или белка, клетка-хозяин предпочтительно представляет собой клетку млекопитающего. Наиболее предпочтительно, клетка-хозяин представляет собой клетку человека. В то время как клетка-хозяин может быть клеткой любого типа, может происходить из любого типа ткани и может находиться на любой стадии развития, клетка-хозяин предпочтительно представляет собой лимфоцит периферической крови (PBL - от англ. peripheral blood lymphocyte) или мононуклеарную клетку периферической крови (РВМС). Более предпочтительно, клетка-хозяин представляет собой Т-клетку. В одном воплощении изобретения клетка-хозяин представляет собой человеческий лимфоцит. В одном воплощении изобретения клетка-хозяин выбрана из группы, состоящей из Т-клетки, Т-клетки-естественного киллера (NKT - от англ. natural killer Т cell), инвариантной Т-клетки-естественного киллера (iNKT) и естественного киллера (NK- от англ. natural killer). Согласно еще одному воплощению изобретения предложен способ получения клетки-хозяина, экспрессирующей TCR, который обладает антигенной специфичностью в отношении пептида (SEQ ID NO: 29), причем способ включает приведение клетки в констакт с любым из векторов, описанных в данном документе, в условиях, которые делают возможным введение вектора в клетку.[0104] According to another embodiment of the invention, there is further provided a host cell comprising any of the recombinant expression vectors described herein. As used herein, the term "host cell" refers to any type of cell that can contain a recombinant expression vector of the invention. The host cell may be a eukaryotic cell, such as a plant, animal, fungal, or algal cell, or may be a prokaryotic cell, such as a bacterium or protozoa. The host cell may be a cultured cell or a primary cell, i.e., isolated directly from an organism, such as a human or a mouse. The host cell may be an adherent cell or a suspension cell, i.e., a cell that grows in suspension. Suitable host cells are known in the art and include, for example, E. coli DH5a cells, Chinese hamster ovary cells, monkey VERO cells, COS cells, HEK293 cells, and the like. For the purpose of amplifying or replicating a recombinant expression vector, the host cell is preferably a prokaryotic cell, such as a DH5α cell. For the purpose of producing a recombinant TCR, polypeptide, or protein, the host cell is preferably a mammalian cell. Most preferably, the host cell is a human cell. While the host cell can be any cell type, can be from any tissue type, and can be at any stage of development, the host cell is preferably a peripheral blood lymphocyte (PBL) or a peripheral blood mononuclear cell (PBMC). More preferably, the host cell is a T cell. In one embodiment of the invention, the host cell is a human lymphocyte. In one embodiment of the invention, the host cell is selected from the group consisting of a T cell, a natural killer T cell (NKT), an invariant natural killer T cell (iNKT), and a natural killer (NK). According to another embodiment of the invention, a method for producing a host cell expressing a TCR that has antigen specificity for a peptide is provided. (SEQ ID NO: 29), wherein the method comprises contacting a cell with any of the vectors described herein under conditions that allow the vector to be introduced into the cell.
[0105] В целях данного документа Т-клетка может представлять собой любую Т-клетку, такую как культивируемая Т-клетка, например, первичная Т-клетка или Т-клетка из культивируемой линии Т-клеток, например, Jurkat, SupT1 и т.д., или Т-клетку, полученную от млекопитающего. В случае получения от млекопитающего Т-клетка может быть получена из многих источников, включая, но, не ограничиваясь кровью, костным мозгом, лимфатическим узлом, тимусом или другими тканями или жидкостями. Т-клетки могут быть также обогащены или очищены. Предпочтительно, Т-клетка представляет собой Т-клетку человека. Т-клетка может быть любого типа Т-клетки и может находиться на любой стадии развития, включая CD4+/CD8+ дважды позитивные Т-клетки, CD4+ Т-хелперы, например, клетки Th1 и Th2, CD4+ Т-клетки, CD8+ Т-клетки (например, цитотоксические Т-клетки), опухоль-инфильтрирующие лимфоциты (TIL), Т-клетки памяти (например, центральные Т-клетки памяти и эффекторные Т-клетки памяти), интактные Т-клетки и т.п., но, не ограничиваясь ими.[0105] For the purposes of this document, the T cell may be any T cell, such as a cultured T cell, for example, a primary T cell or a T cell from a cultured T cell line, for example, Jurkat, SupT1, etc., or a T cell obtained from a mammal. If obtained from a mammal, the T cell may be obtained from many sources, including, but not limited to, blood, bone marrow, lymph node, thymus, or other tissues or fluids. T cells may also be enriched or purified. Preferably, the T cell is a human T cell. The T cell may be any type of T cell and may be at any stage of development, including, but not limited to, CD4 + /CD8 + double-positive T cells, CD4 + T helper cells such as Th1 and Th2 cells, CD4 + T cells, CD8 + T cells (e.g., cytotoxic T cells), tumor-infiltrating lymphocytes (TILs), memory T cells (e.g., central memory T cells and effector memory T cells), naive T cells, etc.
[0106] Также согласно изобретению предложена популяция клеток, содержащая по меньшей мере одну клетку-хозяина, описанную в данном документе. Популяция клеток может представлять собой гетерогенную популяцию, содержащую клетку-хозяина, содержащую любой из описанных рекомбинантных экспрессионный векторов, помимо по меньшей мере одной другой клетки, например, клетки-хозяина (например, Т-клетки), которая не содержит никакого из рекомбинантных экспрессионных векторов, или клетки, отличной от Т-клетки, например, В-клетки, макрофага, нейтрофила, эритроцита, гепатоцита, эндотелиальной клетки, эпителиальной клетки, мышечной клетки, клетки головного мозга и т.д. В качестве альтернативы, популяция клеток может представлять собой по существу однородную популяцию, где популяция содержит в основном клетки-хозяева (например, по существу состоящие из), содержащие рекомбинантный экспрессионный вектор. Популяция также может представлять собой клональную популяцию клеток, в которой все клетки популяции представляют собой клоны одной единственной клетки-хозяина, содержащей рекомбинантный экспрессионный вектор, таким образом, что все клетки популяции содержат рекомбинантный экспрессионный вектор. В одном воплощении изобретения популяция клеток представляет собой клональную популяцию, содержащую клетки-хозяева, содержащие рекомбинантный экспрессионный вектор, как описано в данном документе.[0106] Also provided according to the invention is a population of cells comprising at least one host cell described herein. The population of cells can be a heterogeneous population comprising a host cell comprising any of the described recombinant expression vectors, in addition to at least one other cell, for example, a host cell (e.g., a T cell) that does not comprise any of the recombinant expression vectors, or a cell other than a T cell, for example, a B cell, a macrophage, a neutrophil, a erythrocyte, a hepatocyte, an endothelial cell, an epithelial cell, a muscle cell, a brain cell, etc. Alternatively, the population of cells can be a substantially homogeneous population, wherein the population comprises primarily host cells (e.g., consisting essentially of) comprising a recombinant expression vector. The population may also be a clonal population of cells, in which all cells in the population are clones of a single host cell containing the recombinant expression vector, such that all cells in the population contain the recombinant expression vector. In one embodiment of the invention, the population of cells is a clonal population comprising host cells containing the recombinant expression vector, as described herein.
[0107] В одном воплощении изобретения число клеток в популяции может быстро увеличиваться. Увеличение числа Т-клеток может осуществляться любым из целого ряда способов, известных в данной области, как описано, например, в патенте США 8034334; патенте США 8383099; публикации патентной заявки США №2012/0244133; Dudley et al., J. Immunother., 26:332-42 (2003); и Riddell et al., J. Immunol. Methods, 128:189-201 (1990). В одном воплощении увеличение числа Т-клеток осуществляют посредством культивирования Т-клеток с антителом ОКТЗ, IL-2 и фидерными РВМС (например, облученными аллогенными РВМС).[0107] In one embodiment of the invention, the number of cells in a population can be rapidly expanded. The expansion of the number of T cells can be accomplished by any of a variety of methods known in the art, as described, for example, in U.S. Patent 8,034,334; U.S. Patent 8,383,099; U.S. Patent Application Publication No. 2012/0244133; Dudley et al., J. Immunother., 26:332-42 (2003); and Riddell et al., J. Immunol. Methods, 128:189-201 (1990). In one embodiment, the expansion of the number of T cells is accomplished by culturing the T cells with OKT3 antibody, IL-2, and feeder PBMCs (e.g., irradiated allogeneic PBMCs).
[0108] TCR, полипептиды, белки, нуклеиновые кислоты, рекомбинантные экспрессионные векторы и клетки-хозяева (включая их популяции) по изобретению могут быть выделены и/или очищены. Термин «выделенный», в том виде, в котором он используется в данном документе, означает удаленный из его природной окружающей среды. Термин «очищенный», в том виде, в котором он используется в данном документе, означает с повышенной чистотой, где «чистота» является относительным термином и не обязательно понимается как абсолютная чистота. Например, чистота может составлять по меньшей мере примерно 50%, может быть больше чем примерно 60%, примерно 70%, примерно 80%, примерно 90%, примерно 95% или может составлять примерно 100%.[0108] TCRs, polypeptides, proteins, nucleic acids, recombinant expression vectors, and host cells (including populations thereof) of the invention may be isolated and/or purified. The term "isolated," as used herein, means removed from its natural environment. The term "purified," as used herein, means with increased purity, where "purity" is a relative term and is not necessarily understood as absolute purity. For example, purity may be at least about 50%, may be greater than about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, about 95%, or may be about 100%.
[0109] TCR, полипептиды, белки, нуклеиновые кислоты, рекомбинантные экспрессионные векторы и клетки-хозяева (включая их популяции) по изобретению, все из которых далее в данном документе в совокупности называются «TCR материалами по изобретению», могут быть приготовлены в композиции, такой как фармацевтическая композиция. В связи с этим, согласно изобретению предложена фармацевтическая композиция, содержащая любой из TCR, полипептидов, белков, нуклеиновых кислот, экспрессионных векторов и клеток-хозяев (включая их популяции), описанных в данном документе, и фармацевтически приемлемый носитель. Фармацевтические композиции по изобретению, содержащие любой из TCR материалов по изобретению, могут содержать более одного TCR материала по изобретению, например, полипептид и нуклеиновую кислоту, или два или более разных TCR. В качестве альтернативы, фармацевтическая композиция может содержать TCR материал по изобретению в комбинации с другим(и) фармацевтически активным(и) агентом(ами) или лекарственным(и) средством(ами), таким(и) как химиотерапевтический агент, например, аспарагиназа, бусульфан, карбоплатин, цисплатин, даунорубицин, доксорубицин, фторурацил, гемцитабин, гидроксимочевина, метотрексат, паклитаксел, ритуксимаб, винбластин, винкристин и т.д.[0109] The TCRs, polypeptides, proteins, nucleic acids, recombinant expression vectors, and host cells (including populations thereof) of the invention, all of which are hereinafter collectively referred to as "TCR materials of the invention," can be formulated in a composition, such as a pharmaceutical composition. Accordingly, the invention provides a pharmaceutical composition comprising any of the TCRs, polypeptides, proteins, nucleic acids, expression vectors, and host cells (including populations thereof) described herein and a pharmaceutically acceptable carrier. Pharmaceutical compositions of the invention comprising any of the TCR materials of the invention may comprise more than one TCR material of the invention, such as a polypeptide and a nucleic acid, or two or more different TCRs. Alternatively, the pharmaceutical composition may comprise the TCR material of the invention in combination with other pharmaceutically active agent(s) or drug(s), such as a chemotherapeutic agent, for example, asparaginase, busulfan, carboplatin, cisplatin, daunorubicin, doxorubicin, fluorouracil, gemcitabine, hydroxyurea, methotrexate, paclitaxel, rituximab, vinblastine, vincristine, etc.
[0110] Предпочтительно, носитель представляет собой фармацевтически приемлемый носитель. В отношении фармацевтических композиций носитель может представлять собой любой из носителей, традиционно используемых для конкретного рассматриваемого TCR материала по изобретению. Способы получения вводимых композиций известны или очевидны специалистам в данной области и описаны более подробно, например, в Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 22nd Ed., Pharmaceutical Press (2012). Предпочтительно, чтобы фармацевтически приемлемый носитель представлял собой носитель, который не обладает вредными побочными эффектами или токсичностью в применяемых условиях.[0110] Preferably, the carrier is a pharmaceutically acceptable carrier. With respect to pharmaceutical compositions, the carrier may be any of the carriers conventionally used for the particular TCR material of the invention under consideration. Methods for preparing the administered compositions are known or obvious to those skilled in the art and are described in more detail, for example, in Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 22nd Ed., Pharmaceutical Press (2012). Preferably, the pharmaceutically acceptable carrier is one that does not have deleterious side effects or toxicity under the conditions of use.
[0111] Выбор носителя будет определяться отчасти конкретным TCR материалом по изобретению, а также конкретным способом, используемым для введения TCR материала по изобретению. Соответственно, существует множество подходящих препаратов фармацевтической композиции по изобретению. Подходящие препараты могут включать любой из препаратов для парентерального, подкожного, внутривенного, внутримышечного, внутриартериального, интратекального, внутриопухолевого или внутрибрюшинного введения. Более чем один путь может быть использован для введения TCR материалов по изобретению, и, в определенных примерах, конкретный путь может обеспечивать более немедленную и более эффективную реакцию, чем в случае другого пути.[0111] The choice of carrier will be determined in part by the particular TCR material of the invention, as well as the particular route used to administer the TCR material of the invention. Accordingly, there are a variety of suitable formulations of the pharmaceutical composition of the invention. Suitable formulations may include any of those for parenteral, subcutaneous, intravenous, intramuscular, intraarterial, intrathecal, intratumoral, or intraperitoneal administration. More than one route may be used to administer the TCR materials of the invention, and, in certain examples, a particular route may provide a more immediate and more effective response than another route.
[0112] Предпочтительно, TCR материал по изобретению вводят посредством инъекции, например, внутривенно. Когда TCR материал по изобретению представляет собой клетку-хозяина (или ее популяцию), экспрессирующую TCR по изобретению, фармацевтически приемлемый носитель для клеток для инъекции может включать любой изотонический носитель, такой как, например, нормальный физиологический раствор (примерно 0,90 масс./об.% NaCl в воде, примерно 300 мосмоль/л NaCl в воде или примерно 9,0 г NaCl на литр воды), раствор электролита NORMOSOL R (Abbott, Chicago, IL), PLASMA-LYTE A (Baxter, Deerfield, IL), примерно 5%-ную декстрозу в воде или Рингера-лактат. В одном воплощении фармацевтически приемлемый носитель дополняют человеческим сывороточным альбумином.[0112] Preferably, the TCR material of the invention is administered by injection, such as intravenously. When the TCR material of the invention is a host cell (or population thereof) expressing the TCR of the invention, the pharmaceutically acceptable carrier for the cells for injection may include any isotonic carrier, such as, for example, normal saline (about 0.90% w/v NaCl in water, about 300 mOsm/L NaCl in water, or about 9.0 g NaCl per liter of water), NORMOSOL R electrolyte solution (Abbott, Chicago, IL), PLASMA-LYTE A (Baxter, Deerfield, IL), about 5% dextrose in water, or Ringer's lactate. In one embodiment, the pharmaceutically acceptable carrier is supplemented with human serum albumin.
[0113] В целях изобретения количество или доза (например, число клеток, когда TCR материал по изобретению представляет собой одну или более клеток) вводимого TCR материала по изобретению должны быть достаточными для эффекта, например, терапевтического или профилактического ответа, у субъекта или животного за разумный период времени. Например, доза TCR материала по изобретению должна быть достаточной для связывания с раковым антигеном (например, G12D RAS) или выявления, лечения или предупреждения рака за период от примерно 2 часов или больше, например, от 12 до 24 или более часов, с момента введения. В конкретных воплощениях период времени мог бы быть даже больше. Доза будет определяться эффективностью конкретного TCR материала по изобретению и состоянием животного (например, человека), а также массой тела данного животного (например, человека), подлежащего лечению.[0113] For the purposes of the invention, the amount or dose (e.g., the number of cells when the TCR material of the invention is one or more cells) of the TCR material of the invention administered should be sufficient to produce an effect, e.g., a therapeutic or prophylactic response, in a subject or animal within a reasonable period of time. For example, the dose of the TCR material of the invention should be sufficient to bind to a cancer antigen (e.g., G12D RAS) or detect, treat, or prevent cancer within a period of about 2 hours or more, such as 12 to 24 hours or more, from the time of administration. In specific embodiments, the time period could be even longer. The dose will be determined by the potency of the particular TCR material of the invention and the condition of the animal (e.g., a human), as well as the body weight of the animal (e.g., a human) being treated.
[0114] Многие анализы для определения вводимой дозы известны в данной области. В целях изобретения анализ, который включает сравнение степени, до которой лизируются клетки-мишени или секретируется IFN-γ Т-клетками, экспрессирующими TCR, полипептид или белок по изобретению при введении данной дозы таких Т-клеток млекопитающему у целого ряда млекопитающих, каждому из которых дается разная доза Т-клеток, можно было использовать для определения исходной дозы, подлежащей введению млекопитающему. Степень, до которой лизируются клетки-мишени или секретируется IFN-γ при введении определенной дозы, можно анализировать способами, известными в данной области.[0114] Many assays for determining the dose to be administered are known in the art. For purposes of the invention, an assay that involves comparing the extent to which target cells are lysed or IFN-γ is secreted by T cells expressing the TCR, polypeptide, or protein of the invention when a given dose of such T cells is administered to a mammal across a variety of mammals, each of which is given a different dose of T cells, could be used to determine the initial dose to be administered to the mammal. The extent to which target cells are lysed or IFN-γ is secreted when a given dose is administered can be analyzed by methods known in the art.
[0115] Доза TCR материала по изобретению также будет определяться существованием, природой и степенью любых вредных побочных эффектов, которые могут сопутствовать введению конкретного TCR материала по изобретению. Обычно, лечащий врач будет принимать решение относительно дозировки TCR материала по изобретению, посредством которой лечить каждого отдельного пациента, учитывая множество факторов, таких как возраст, масса тела, общее состояние здоровья, рацион, пол, TCR материал по изобретению, подлежащий введению, способ введения и тяжесть рака, подлежащего лечению. В одном воплощении, в котором TCR материал по изобретению представляет собой популяцию клеток, число клеток, вводимых за инфузию, может варьировать, например, от примерно 1 × 106 до примерно 1 × 1012 клеток или больше. В конкретных воплощениях можно вводить меньше чем 1 × 106 клеток.[0115] The dosage of the TCR material of the invention will also be determined by the existence, nature, and extent of any adverse side effects that may accompany the administration of the particular TCR material of the invention. Typically, the treating physician will decide on the dosage of the TCR material of the invention with which to treat each individual patient, taking into account a variety of factors, such as age, body weight, general health, diet, gender, the TCR material of the invention to be administered, the route of administration, and the severity of the cancer to be treated. In one embodiment, in which the TCR material of the invention is a population of cells, the number of cells administered per infusion can vary, for example, from about 1 x 10 6 to about 1 x 10 12 cells or more. In certain embodiments, less than 1 x 10 6 cells can be administered.
[0116] Одному из обычных специалистов в данной области будет сразу понятно, что TCR материалы по изобретению могут быть модифицированы множеством путей, таким образом, чтобы терапевтическая или профилактическая эффективность TCR материалов по изобретению увеличивалась посредством данной модификации. Например, TCR материалы по изобретению могут быть конъюгированы или прямо, или опосредовано через мостик с химиотерапевтическим агентом. В данной области известно практическое применение конъюгации соединений с химиотерапевтическим агентом. Один из обычных специалистов в данной области признает, что сайты на TCR материалах по изобретению, которые не являются необходимыми для функции TCR материалов по изобретению, являются сайтами, подходящими для присоединения мостика и/или химиотерапевтического агента, при условии, что мостик и/или химиотерапевтический агент, будучи присоединенным(и) к TCR материалам по изобретению, не препятствует(ют) функции TCR материалов по изобретению, то есть способности связываться с G12D RAS или выявлять, лечить или предупреждать рак.[0116] One of ordinary skill in the art will readily appreciate that the TCR materials of the invention can be modified in a variety of ways such that the therapeutic or prophylactic efficacy of the TCR materials of the invention is enhanced by the modification. For example, the TCR materials of the invention can be conjugated either directly or indirectly through a bridge to a chemotherapeutic agent. The practical application of conjugating compounds to a chemotherapeutic agent is known in the art. One of ordinary skill in the art will recognize that sites on the TCR materials of the invention that are not necessary for the function of the TCR materials of the invention are sites suitable for attachment of a bridge and/or a chemotherapeutic agent, provided that the bridge and/or chemotherapeutic agent, when attached to the TCR materials of the invention, does not interfere with the function of the TCR materials of the invention, i.e., the ability to bind to G12D RAS or to detect, treat, or prevent cancer.
[0117] Предполагается, что фармацевтические композиции, TCR, полипептиды, белки, нуклеиновые кислоты, рекомбинантные экспрессионные векторы, клетки-хозяева и популяции клеток по изобретению могут быть использованы в способах лечения или предупреждения рака. Без привязки к конкретной теории, полагают, что TCR по изобретению специфично связываются с G12D RAS, таким образом, что TCR (или родственный полипептид или белок по изобретению), при экспрессии клеткой, способен опосредовать иммунный ответ на клетку-мишень, экспрессирующую G12D RAS. В этой связи, согласно одному воплощению изобретения предложен способ лечения или предупреждения рака у млекопитающего, включающий введение млекопитающему любой из фармацевтических композиций, TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе, любой нуклеиновой кислоты или рекомбинантного экспрессионного вектора, содержащего нуклеотидную последовательность, кодирующую любой из TCR, полипептидов, белков, описанных в данном документе, или любой клетки-хозяина или популяции клеток, содержащих рекомбинантный вектор, который кодирует любой из TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе, в количестве, эффективном для лечения или предупреждения рака у млекопитающего.[0117] It is contemplated that the pharmaceutical compositions, TCRs, polypeptides, proteins, nucleic acids, recombinant expression vectors, host cells, and cell populations of the invention can be used in methods for treating or preventing cancer. Without being bound by a particular theory, it is believed that the TCRs of the invention specifically bind to G12D RAS such that the TCR (or a related polypeptide or protein of the invention), when expressed by a cell, is capable of mediating an immune response to a target cell expressing G12D RAS. In this regard, according to one embodiment of the invention, there is provided a method for treating or preventing cancer in a mammal, comprising administering to the mammal any of the pharmaceutical compositions, TCRs, polypeptides or proteins described herein, any nucleic acid or recombinant expression vector comprising a nucleotide sequence encoding any of the TCRs, polypeptides, proteins described herein, or any host cell or population of cells comprising a recombinant vector that encodes any of the TCRs, polypeptides or proteins described herein, in an amount effective for treating or preventing cancer in the mammal.
[0118] Согласно одному воплощению изобретения предложен способ индукции иммунного ответа на рак у млекопитающего, включающий введение млекопитающему любой из фармацевтических композиций, TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе, любой нуклеиновой кислоты или рекомбинантного экспрессионного вектора, содержащего нуклеотидную последовательность, кодирующую любой из TCR, полипептидов, белков, описанных в данном документе, или любой клетки-хозяина или популяции клеток, содержащих рекомбинантный вектор, который кодирует любой из TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе, в количестве, эффективном для индукции иммунного ответа на раку млекопитающего.[0118] According to one embodiment of the invention, there is provided a method for inducing an immune response to a cancer in a mammal, comprising administering to the mammal any of the pharmaceutical compositions, TCRs, polypeptides, or proteins described herein, any nucleic acid or recombinant expression vector comprising a nucleotide sequence encoding any of the TCRs, polypeptides, proteins described herein, or any host cell or population of cells comprising a recombinant vector that encodes any of the TCRs, polypeptides, or proteins described herein, in an amount effective to induce an immune response to a cancer in the mammal.
[0119] Согласно одному воплощению изобретения предложена любая из фармацевтических композиций, TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе, любая нуклеиновая кислота или рекомбинантный экспрессионный вектор, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую любой из TCR, полипептидов, белков, описанных в данном документе, или любая клетка-хозяин или популяция клеток, содержащих рекомбинантный вектор, который кодирует любой из TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе, для применения в лечении или предупреждении рака у млекопитающего.[0119] According to one embodiment of the invention, there is provided any of the pharmaceutical compositions, TCRs, polypeptides, or proteins described herein, any nucleic acid or recombinant expression vector comprising a nucleotide sequence encoding any of the TCRs, polypeptides, proteins described herein, or any host cell or population of cells comprising a recombinant vector that encodes any of the TCRs, polypeptides, or proteins described herein, for use in the treatment or prevention of cancer in a mammal.
[0120] Согласно одному воплощению изобретения предложена любая из фармацевтических композиций, TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе, любая нуклеиновая кислота или рекомбинантный экспрессионный вектор, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую любой из TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе, или любая клетка-хозяин или популяция клеток, содержащих рекомбинантный вектор, который кодирует любой из TCR, полипептидов или белков, описанных в данном документе, для применения в индукции иммунного ответа на раку млекопитающего.[0120] According to one embodiment of the invention, there is provided any of the pharmaceutical compositions, TCRs, polypeptides, or proteins described herein, any nucleic acid or recombinant expression vector comprising a nucleotide sequence encoding any of the TCRs, polypeptides, or proteins described herein, or any host cell or population of cells comprising a recombinant vector that encodes any of the TCRs, polypeptides, or proteins described herein, for use in inducing an immune response to cancer in a mammal.
[0121] Термины «лечить» и «предупреждать», а также слова, происходящие от них, в том виде, в котором они используются в данном документе, не обязательно подразумевают 100%-ое или полное вылечивание или предупреждение. Вернее, существуют варьирующие степени лечения или предупреждения, которые обычный специалист в данной области расценивает как приносящие возможную пользу или терапевтический эффект. В связи с этим, способы по изобретению могут обеспечивать любое количество любого уровня лечения или предупреждения рака у млекопитающего. Кроме того, лечение или предупреждение, предложенные согласно способу по изобретению, могут включать лечение или предупреждение одного или более состояний или симптомов рака, подлежащего лечению или предупреждению. Например, лечение или предупреждение может включать стимулирование регресса опухоли. Кроме того, в целях данного документа, термин «предупреждение» может охватывать задержку начала рака или его симптома или состояния. В качестве альтернативы или дополнительно, термин «предупреждение» может охватывать предупреждение или задержку рецидива рака или его симптома или состояния.[0121] The terms "treat" and "prevent," and words derived from them, as used herein, do not necessarily imply a 100% or complete cure or prevention. Rather, there are varying degrees of treatment or prevention that one of ordinary skill in the art would recognize as providing potential benefit or therapeutic effect. Accordingly, the methods of the invention may provide any number of any level of treatment or prevention of cancer in a mammal. Furthermore, the treatment or prevention provided by the method of the invention may include treating or preventing one or more conditions or symptoms of the cancer being treated or prevented. For example, treatment or prevention may include promoting tumor regression. Furthermore, for the purposes of this document, the term "prevention" may encompass delaying the onset of cancer or a symptom or condition thereof. Alternatively or additionally, the term "prevention" may encompass preventing or delaying the recurrence of cancer or a symptom or condition thereof.
[0122] Также согласно воплощению изобретения предложен способ выявления наличия рака у млекопитающего. Способ включает (i) приведение образца, содержащего одну или более клеток от млекопитающего, в контакт с любым из TCR, полипептидов, белков, нуклеиновых кислот, рекомбинантных экспрессионных векторов, клеток-хозяев, популяций клеток или фармацевтических композиций по изобретению, описанных в данном документе, с образованием, вследствие этого, комплекса, и (ii) выявление данного комплекса, где выявление комплекса свидетельствует о наличии рака у млекопитающего.[0122] Also according to an embodiment of the invention, a method for detecting the presence of cancer in a mammal is provided. The method comprises (i) contacting a sample containing one or more cells from the mammal with any of the TCRs, polypeptides, proteins, nucleic acids, recombinant expression vectors, host cells, cell populations, or pharmaceutical compositions of the invention described herein, thereby forming a complex, and (ii) detecting the complex, wherein detection of the complex indicates the presence of cancer in the mammal.
[0123] Относительно способа выявления рака у млекопитающего по изобретению, образец клеток может представлять собой образец, содержащий цельные клетки, их лизаты или фракцию лизатов цельных клеток, например, ядерную или цитоплазматическую фракцию, фракцию общего белка или фракцию нуклеиновой кислоты.[0123] With respect to the method for detecting cancer in a mammal according to the invention, the cell sample may be a sample containing whole cells, lysates thereof, or a fraction of whole cell lysates, such as a nuclear or cytoplasmic fraction, a total protein fraction, or a nucleic acid fraction.
[0124] В целях способа выявления рака по изобретению, приведение в контакт может происходить in vitro или in vivo в отношении млекопитающего. Предпочтительно, приведение в контакт происходит in vitro.[0124] For the purposes of the method for detecting cancer according to the invention, contacting may occur in vitro or in vivo with respect to a mammal. Preferably, contacting occurs in vitro.
[0125] Кроме того, выявление комплекса может происходить посредством любого числа путей, известных в данной области. Например, TCR, полипептиды, белки, нуклеиновые кислоты, рекомбинантные экспрессионные векторы, клетки-хозяева или популяции клеток по изобретению, описанные в данном документе, могут быть мечены выявляемой меткой, такой как, например, радиоизотоп, флуорофор (например, флуоресцеин изотиоцианат (FITC - от англ. fluorescein isothiocyanate), фикоэритрин (РЕ - от англ. phycoerythrin)), фермент (например, щелочная фосфатаза, пероксидаза хрена) и элементарные частицы (например, частицы золота).[0125] Furthermore, detection of the complex can occur through any number of routes known in the art. For example, the TCRs, polypeptides, proteins, nucleic acids, recombinant expression vectors, host cells, or cell populations of the invention described herein can be labeled with a detectable label, such as, for example, a radioisotope, a fluorophore (e.g., fluorescein isothiocyanate (FITC), phycoerythrin (PE)), an enzyme (e.g., alkaline phosphatase, horseradish peroxidase), and elemental particles (e.g., gold particles).
[0126] В целях способов по изобретению, в которых вводят клетки-хозяева или популяции клеток, клетки могут представлять собой клетки, которые являются аллогенными или аутологичными в отношении млекопитающего. Предпочтительно, клетки являются аутологичными в отношении млекопитающего.[0126] For the purposes of the methods of the invention in which host cells or cell populations are administered, the cells may be cells that are allogeneic or autologous with respect to the mammal. Preferably, the cells are autologous with respect to the mammal.
[0127] В отношении способов по изобретению рак может представлять собой любой рак, включая, например, любой из следующих видов рака: острый лимфоцитарный рак, острый миелоидный лейкоз, альвеолярная рабдомиосаркома, рак кости, рак головного мозга, рак молочной железы, рак ануса, анального канала или прямой кишки, рак глаза, рак внутрипеченочного желчного протока, рак суставов, рак шеи, желчного пузыря или плевры, рак носа, носовой полости или среднего уха, рак ротовой полости, рак влагалища, рак вульвы, хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический миелоидный рак, рак толстой кишки, коло ректальный рак, рак эндометрия, рак пищевода, рак шейки матки, карциноидная опухоль желудочно-кишечного тракта, глиома, лимфома Ходжкина, рак гортаноглотки, рак почки, рак гортани, рак печени, рак легкого, злокачественная мезотелиома, меланома, множественная миелома, рак носоглотки, неходжкинская лимфома, рак ротоглотки, рак яичника, рак пениса, рак поджелудочной железы, брюшины, сальника и рак брыжейки тонкой кишки, рак глотки, рак предстательной железы, рак прямой кишки, рак почки, рак кожи, рак тонкой кишки, рак мягкой ткани, рак желудка, рак яичка, рак щитовидной железы, рак матки, рак мочеточника и рак мочевого пузыря. Предпочтительный рак представляет собой рак поджелудочной железы, колоректальный рак, рак легкого, эндометрия, яичника или предстательной железы. Предпочтительно, рак легкого представляет собой аденокарциному легкого, рак яичника представляет собой рак эпителия яичника, и рак поджелудочной железы представляет собой аденокарциному поджелудочной железы. В одном воплощении изобретения при раке экспрессируется аминокислотная последовательность мутантного человеческого RAS с заменой глицина в положении 12 на аспарагиновую кислоту, где аминокислотная последовательность мутантного человеческого RAS представляет собой аминокислотную последовательность мутантного человеческого KRAS, мутантного человеческого HRAS или мутантного человеческого NRAS, и где положение 12 определено, исходя из человеческого KRAS WT, человеческого HRAS WT или человеческого NRAS WT, соответственно. Мутантный человеческий KRAS, мутантный человеческий HRAS и мутантный человеческий NRAS, экспрессируемый при раке, может представлять собой такой, как определено в данном документе, в отношении других аспектов изобретения.[0127] With respect to the methods of the invention, the cancer can be any cancer, including, for example, any of the following cancers: acute lymphocytic cancer, acute myeloid leukemia, alveolar rhabdomyosarcoma, bone cancer, brain cancer, breast cancer, cancer of the anus, anal canal, or rectum, eye cancer, intrahepatic bile duct cancer, joint cancer, cancer of the neck, gallbladder, or pleura, cancer of the nose, nasal cavity, or middle ear, oral cancer, vaginal cancer, vulvar cancer, chronic lymphocytic leukemia, chronic myeloid cancer, colon cancer, colorectal cancer, endometrial cancer, esophageal cancer, cervical cancer, gastrointestinal carcinoid tumor, glioma, Hodgkin's lymphoma, hypopharyngeal cancer, kidney cancer, laryngeal cancer, liver cancer, lung cancer, malignant mesothelioma, Melanoma, multiple myeloma, nasopharyngeal cancer, non-Hodgkin's lymphoma, oropharyngeal cancer, ovarian cancer, penile cancer, pancreatic cancer, peritoneal cancer, omental cancer, mesenteric cancer, pharyngeal cancer, prostate cancer, rectal cancer, kidney cancer, skin cancer, small bowel cancer, soft tissue cancer, stomach cancer, testicular cancer, thyroid cancer, uterine cancer, ureteral cancer, and bladder cancer. Preferred cancers are pancreatic cancer, colorectal cancer, lung cancer, endometrial cancer, ovarian cancer, or prostate cancer. Preferably, lung cancer is lung adenocarcinoma, ovarian cancer is ovarian epithelial cancer, and pancreatic cancer is pancreatic adenocarcinoma. In one embodiment of the invention, the amino acid sequence of mutant human RAS with a glycine substitution at position 12 for aspartic acid is expressed in cancer, wherein the amino acid sequence of mutant human RAS is the amino acid sequence of mutant human KRAS, mutant human HRAS, or mutant human NRAS, and wherein position 12 is determined based on human KRAS WT, human HRAS WT, or human NRAS WT, respectively. Mutant human KRAS, mutant human HRAS, and mutant human NRAS expressed in cancer may be as defined herein in relation to other aspects of the invention.
[0128] Млекопитающее, на которое ссылаются в способах по изобретению, может представлять собой любое млекопитающее. В том виде, в котором он используется в данном документе, термин «млекопитающее» относится к любому млекопитающему, включая млекопитающих отряда Rodentia, таких как мыши и хомяки, и млекопитающих отряда Logomorpha, таких как кролики, но, не ограничиваясь ими. Предпочтительным является то, чтобы млекопитающие происходили из отряда Carnivora, включая Felines (кошки) и Canines (собаки). Более предпочтительно, чтобы млекопитающие происходили из отряда Artiodactyla, включая Bovines (коровы) и Swines (свиньи), или из отряда Perssodactyla, включая Equines (лошади). Наиболее предпочтительно, чтобы млекопитающие принадлежали к отряду Primates, Ceboids или Simoids (обезьяны) или к отряду Anthropoids (человек и человекообразные обезьяны). Особенно предпочтительным млекопитающим является человек.[0128] The mammal referred to in the methods of the invention may be any mammal. As used herein, the term "mammal" refers to any mammal, including, but not limited to, mammals of the order Rodentia, such as mice and hamsters, and mammals of the order Logomorpha, such as rabbits. Preferably, the mammals are from the order Carnivora, including Felines (cats) and Canines (dogs). More preferably, the mammals are from the order Artiodactyla, including Bovines (cows) and Swines (pigs), or from the order Perssodactyla, including Equines (horses). Most preferably, the mammals belong to the order Primates, Ceboids, or Simoids (monkeys), or to the order Anthropoids (humans and great apes). The most preferred mammal is man.
[0129] Будет отмечено, что вышесказанное представляет собой лишь примеры воплощений. Другие иллюстративные воплощения очевидны из полноты описания в данном документе. Также специалисту в данной области будет понятно, что каждое из данных воплощений можно использовать в разных комбинациях с другими воплощениями, предоставленными в данном документе.[0129] It will be noted that the above represents only exemplary embodiments. Other illustrative embodiments will be apparent from the complete description herein. It will also be understood by one skilled in the art that each of these embodiments can be used in various combinations with other embodiments provided herein.
[0130] Следующие примеры дополнительно иллюстрируют изобретение, но, конечно, никоим образом не должны рассматриваться как ограничивающие его объем.[0130] The following examples further illustrate the invention, but should, of course, in no way be considered as limiting its scope.
Пример 1Example 1
[0131] Данный пример демонстрирует выделение TCR, обладающего антигенной специфичностью в отношении человеческого KRAS с мутацией G12D.[0131] This example demonstrates the isolation of a TCR with antigen specificity for human KRAS with the G12D mutation.
[0132] Рак эндометрия Пациента 4373 прогрессировал после лечения аутологичными PBL, трансдуцированными мышиным TCR, обладающим антигенной специфичностью в отношении HLA-A11-рестриктированного, человеческого RAS G12D. TIL пациента подвергали скринингу в отношении реактивности в отношении KRAS G12D, как изложено ниже. TIL из фрагментов опухоли номер F4, F5, F6, F8, F9 и F10 совместно культивировали со следующими клетками-мишенями:[0132] Patient 4373's endometrial cancer progressed after treatment with autologous PBL transduced with a mouse TCR with antigen specificity for HLA-A11-restricted human RAS G12D. The patient's TILs were screened for reactivity to KRAS G12D as described below. TILs from tumor fragments F4, F5, F6, F8, F9, and F10 were co-cultured with the following target cells:
- 4373 аутологичные DC мРНК, трансфицированные тандемным минигеном (TMG), кодирующим пептид TMG KRAS (WT) дикого типа:- 4373 autologous DC mRNA transfected with a tandem minigene (TMG) encoding the wild-type KRAS (WT) TMG peptide:
- 4373 аутологичные DC мРНК, трансфицированные TMG, кодирующим мутантный пептид KRAS (Mut):- 4373 autologous DC mRNA transfected with TMG encoding the mutant KRAS peptide (Mut):
- длинный пептид G12 WT KRAS (LP) (SEQ ID NO: 27);- long peptide G12 WT KRAS (LP) (SEQ ID NO: 27);
- G12D Mut KRAS LP (SEQ ID NO: 26); или- G12D Mut KRAS LP (SEQ ID NO: 26); or
- минимальный эпитоп KRAS (ME) A11 (G12D 9mer+10mer) + (SEQ ID NO: 28 и 29).- minimal epitope of KRAS (ME) A11 (G12D 9mer+10mer) + (SEQ ID NO: 28 and 29).
[0133] В качестве контролей трансдуцированные клетки культивировали отдельно (только TIL) или совместно культивировали с диметилсульфоксидом (ДМСО) или материалом - магнитными шариками с антителами против СОЗ/против CD28.[0133] As controls, transduced cells were cultured alone (TILs only) or co-cultured with dimethyl sulfoxide (DMSO) or anti-CD28/anti-COD magnetic bead material.
[0134] Секрецию интерферона-гамма (IFN-γ) после сокультивирования измеряли посредством метода иммуноферментных пятен (ELISpot). Результаты показаны на Фиг. 1А. Процент клеток, экспрессирующих 4-1 ВВ и ОХ40, измеряли посредством анализа проточной цитометрии. Результаты показаны на Фиг. 1В. Как показано на Фиг. 1А-1В, TIL с реактивностью против G12D выявляли во фрагменте опухоли F8.[0134] Interferon-gamma (IFN-γ) secretion after co-culture was measured by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISpot). The results are shown in Fig. 1A. The percentage of cells expressing 4-1 BB and OX40 was measured by flow cytometry analysis. The results are shown in Fig. 1B. As shown in Figs. 1A-1B, TILs with anti-G12D reactivity were detected in the F8 tumor fragment.
[0135] TIL из фрагмента опухоли F8 разделяли на образцы одиночных клеток. TCR с антигенной специфичностью в отношении человеческого KRAS с мутацией G12D, презентированного HLA-A11, выделяли из TIL. Для определения последовательности реактивного 4373 TCR, реактивные TIL сортировали посредством сортировки клеток с активированной флуоресценцией (FACS - от англ. fluorescence-activated cell sorting) на основе повышающей регуляции маркера активации Т-клеток, 4-1 ВВ. Затем, клетки лизировали, и транскрипты TCR секвенировали по Сенгеру. Аминокислотные последовательности вариабельных областей цепей аир 4373 TCR показаны в Таблице 5. CDR подчеркнуты.[0135] TILs from the F8 tumor fragment were separated into single-cell samples. TCR with antigen specificity for human KRAS with the G12D mutation presented by HLA-A11 was isolated from the TILs. To determine the sequence of the reactive 4373 TCR, reactive TILs were sorted by fluorescence-activated cell sorting (FACS) based on the upregulation of the T cell activation marker 4-1BB. The cells were then lysed, and the TCR transcripts were sequenced by Sanger. The amino acid sequences of the variable regions of the ai 4373 TCR chains are shown in Table 5. CDRs are underlined.
Пример 2Example 2
[0136] Данный пример демонстрирует способ получения ретро вирусного вектора, содержащего нуклеотидную последовательность, кодирующую человеческий TCR против G12D Примера 1 с модифицированными мышиными константными областями.[0136] This example demonstrates a method for producing a retroviral vector containing a nucleotide sequence encoding the human anti-G12D TCR of Example 1 with modified murine constant regions.
[0137] Последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая человеческий G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 1 и включающая LVL-модифицированную мышиную константную область с цистеиновой заменой, клонировали в ретровирусный экспрессионный вектор. Мышиная константная область цепи α содержала аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, где X в положении 48 представляет собой Cys, X в положении 112 представляет собой Leu, X в положении 114 представляет собой Ile, и X в положении 115 представляет собой Val (SEQ ID NO: 38). Полученная полноразмерная цепь α содержала аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40. Константная область цепи β содержала аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18, где X в положении 57 представляет собой Cys (SEQ ID NO: 39). Полученная полноразмерная цепь β содержала аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41. Линкер, содержащий аминокислотную последовательность (SEQ ID NO: 25), располагался между константной областью цепи α и вариабельной областью цепи β. Вектор содержал экспрессионную кассету, содержащую нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 46 (нуклеотидную последовательность с оптимизированными кодонами, кодирующую, от 5'-конца к 3'-концу: цепь β TCR, линкер, цепь α TCR), которая кодировала аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 47 (аминокислотная последовательность, содержащая, от N-конца к С-концу, цепь β TCR, линкер, цепь α TCR).[0137] A nucleic acid sequence encoding the human G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 1 and comprising an LVL-modified mouse constant region with a cysteine substitution was cloned into a retroviral expression vector. The mouse α chain constant region comprised the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17, wherein X at position 48 is Cys, X at position 112 is Leu, X at position 114 is Ile, and X at position 115 is Val (SEQ ID NO: 38). The resulting full-length α chain comprised the amino acid sequence of SEQ ID NO: 40. The β chain constant region comprised the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18, wherein X at position 57 is Cys (SEQ ID NO: 39). The resulting full-length β chain contained the amino acid sequence of SEQ ID NO: 41. The linker containing the amino acid sequence (SEQ ID NO: 25), was located between the constant region of the α chain and the variable region of the β chain. The vector contained an expression cassette containing the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 46 (codon-optimized nucleotide sequence encoding, from 5' to 3': TCR β chain, linker, TCR α chain), which encoded the amino acid sequence of SEQ ID NO: 47 (amino acid sequence comprising, from N-terminus to C-terminus, TCR β chain, linker, TCR α chain).
Пример 3Example 3
[0138] Данный пример демонстрирует, что TCR против G12D Примера 2 (с вариабельными областями человека) обеспечивает ту же или лучшую реактивность, как и мышиный TCR против G12D Примера 1.[0138] This example demonstrates that the anti-G12D TCR of Example 2 (with human variable regions) provides the same or better reactivity as the mouse anti-G12D TCR of Example 1.
[0139] CD8+аутологичные PBL пациента 4373 трансдуцировали ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим (i) G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 2 (с человеческими вариабельными областями) (также называемый в данном документе «TCR2»), (ii) второй TCR (называемый в данном документе «TCR1»), который также получали посредством секвенирования одиночной клетки реактивных TIL, показанный на Фиг. 1, или (iii) HLA-A11-рестриктированный, мышиный TCR против KRAS G12D Примера 1 (контроль). Реактивность CD8+ трансдуцированных клеток тестировали после совместного культивирования со следующими клетками-мишенями:[0139] CD8+ autologous PBLs from patient 4373 were transduced with a retroviral expression vector encoding (i) the G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 2 (with human variable regions) (also referred to herein as "TCR2"), (ii) a second TCR (referred to herein as "TCR1"), which was also obtained by single-cell sequencing of the reactive TILs shown in Fig. 1, or (iii) the HLA-A11-restricted, murine anti-KRAS G12D TCR of Example 1 (control). The reactivity of the CD8+ transduced cells was tested after co-culture with the following target cells:
- COS HLA-A2 трансдуцированные клетки,- COS HLA-A2 transduced cells,
- клеточная линия COS HLA-A2-G12 WT KRAS,- cell line COS HLA-A2-G12 WT KRAS,
- COS HLA-A11 трансдуцированные клетки,- COS HLA-A11 transduced cells,
- клеточная линия COS HLA-A11-G12D или- cell line COS HLA-A11-G12D or
- только Т-клетки (отсутствие клеток-мишеней) (-).- T cells only (no target cells) (-).
[0140] Измеряли процент клеток, экспрессирующих 4-1 ВВ и ОХ40, после совместной культивации с клетками-мишенями. Результаты показаны на Фиг. 2. Трансдуцированные клетки также подвергались экспериментам по титрованию на минимальный эпитоп HLA-A11.[0140] The percentage of cells expressing 4-1 BB and OX40 was measured after co-culture with target cells. The results are shown in Fig. 2. Transduced cells were also subjected to titration experiments for a minimal HLA-A11 epitope.
[0141] В отдельном эксперименте аутологичные CD8+ PBL Пациента 4373 трансдуцировали ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим (i) G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 2 (с человеческими вариабельными областями), (ii) TCR1, (iii) HLA-A11-рестриктированный, мышиный TCR против KRAS G12D Примера 1, или (iv) GFP. Клетки, трансдуцированные пустым вектором («Моек Td» (Td представляет собой Трансдукцию)), служили дополнительным контролем. Реактивность CD8+ трансдуцированных клеток анализировали после совместного культивирования со следующими клетками-мишенями:[0141] In a separate experiment, autologous CD8+ PBL from Patient 4373 were transduced with a retroviral expression vector encoding (i) the G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 2 (with human variable regions), (ii) TCR1, (iii) the HLA-A11-restricted, murine anti-KRAS G12D TCR of Example 1, or (iv) GFP. Cells transduced with empty vector ("Moek Td" (Td stands for Transduction)) served as an additional control. The reactivity of CD8+ transduced cells was analyzed after co-culture with the following target cells:
- аутологичные дендритные клетки (DC), трансдуцированные полноразмерным (FL- от англ. full length) геном WT KRAS;- autologous dendritic cells (DC) transduced with the full-length (FL) WT KRAS gene;
- аутологичные DC, трансдуцированные геном FL KRAS с мутацией G12D;- autologous DC transduced with the FL KRAS gene with the G12D mutation;
- аутологичные DC, трансдуцированные WT KRAS LP (SEQ ID NO: 27);- autologous DC transduced with WT KRAS LP (SEQ ID NO: 27);
- аутологичные DC, трансдуцированные G12D Mut KRAS LP (SEQ ID NO: 26);- autologous DC transduced with G12D Mut KRAS LP (SEQ ID NO: 26);
- минимальный эпитоп KRAS (ME) A02 WT;- minimal epitope of KRAS (ME) A02 WT;
- ME A02 G12D (SEQ ID NO: 50);- ME A02 G12D (SEQ ID NO: 50);
- смесь ME HLA-A11 WT (смесь пептидов WT 9-mer SEQ ID NO: 30 и WT 10-MER SEQ ID NO: 31); или- a mixture of ME HLA-A11 WT (a mixture of peptides WT 9-mer SEQ ID NO: 30 and WT 10-MER SEQ ID NO: 31); or
- смесь ME HLA-A11 G12D (смесь пептидов G12D 9-mer SEQ ID NO: 28 и G12D 10-MER SEQ ID NO: 29).- mixture of ME HLA-A11 G12D (mixture of peptides G12D 9-mer SEQ ID NO: 28 and G12D 10-MER SEQ ID NO: 29).
[0142] В качестве контроля, трансдуцированные клетки культивировали отдельно (только Т-клетки) или совместно культивировали с ДМСО или материалом - магнитными шариками с антителами против С028/против CD3. Секрецию IFN-γ измеряли посредством ELISpot. Результаты показаны на Фиг. 3А и в Таблице 6. Измеряли процент клеток, экспрессирующих 4-1 ВВ и ОХ40. Результаты показаны на Фиг. 3В.[0142] As a control, transduced cells were cultured alone (T cells only) or co-cultured with DMSO or anti-CD28/anti-CD3 magnetic bead material. IFN-γ secretion was measured by ELISpot. The results are shown in Fig. 3A and Table 6. The percentage of cells expressing 4-1BB and OX40 was measured. The results are shown in Fig. 3B.
[0143] В отдельном эксперименте аутологичные PBL Пациента 4373 трансдуцировали ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим (i) G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 2 (с человеческими вариабельными областями) или (ii) HLA-A11-рестриктированный, мышиный TCR против KRAS G12D Примера 1.[0143] In a separate experiment, autologous PBLs from Patient 4373 were transduced with a retroviral expression vector encoding (i) the G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 2 (with human variable regions) or (ii) the HLA-A11-restricted, murine anti-KRAS G12D TCR of Example 1.
[0144] Аутологичные DC загружали следующими пептидами в концентрациях, показанных в Таблице 7: мутантный пептид минимальный эпитоп (ME) с 9 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 28), мутантный пептид минимальный эпитоп с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 29), пептид минимальный эпитоп WT с 9 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 30) или пептид минимальный эпитоп WT с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 31). Секрецию IFN-γ измеряли посредством ELISpot. Результаты показаны в Таблице 7.[0144] Autologous DCs were loaded with the following peptides at the concentrations shown in Table 7: mutant peptide minimal epitope (ME) with 9 amino acid residues (SEQ ID NO: 28), mutant peptide minimal epitope with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 29), minimal WT epitope peptide with 9 amino acid residues (SEQ ID NO: 30) or a minimal WT epitope peptide with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 31). IFN-γ secretion was measured by ELISpot. The results are shown in Table 7.
[0145] Как показано на Фиг. 2-3В и в Таблицах 6-7, TCR против G12D Примера 2 (с человеческими вариабельными областями) обеспечивал такую же или лучшую реактивность, по сравнению с мышиным TCR против G12D Примера 1.[0145] As shown in Fig. 2-3B and Tables 6-7, the anti-G12D TCR of Example 2 (with human variable regions) provided the same or better reactivity compared to the anti-G12D mouse TCR of Example 1.
Пример 4Example 4
[0146] Данный пример демонстрирует, что PBL, трансдуцированные TCR против G12D Примера 2 (с человеческими вариабельными областями), специфично распознают HLA-A11-рестриктированные G12D с высокой авидностью.[0146] This example demonstrates that PBLs transduced with the TCR against G12D of Example 2 (with human variable regions) specifically recognize HLA-A11-restricted G12Ds with high avidity.
[0147] Аутологичные PBL Пациента 4373 трансдуцировали ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 2 (с человеческими вариабельными областями).[0147] Autologous PBLs from Patient 4373 were transduced with a retroviral expression vector encoding the G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 2 (with human variable regions).
[0148] Аутологичные DC загружали следующими пептидами в концентрациях, показанных на Фиг. 4А: мутантный пептид минимальной эпитоп с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 29) или пептид минимальный эпитоп WT с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 31). Секрецию IFN-γ измеряли посредством ELISpot. Результаты показаны на Фиг. 4А.[0148] Autologous DCs were loaded with the following peptides at the concentrations shown in Fig. 4A: 10 amino acid residue minimal epitope mutant peptide (SEQ ID NO: 29) or a minimal WT epitope peptide with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 31). IFN-γ secretion was measured by ELISpot. The results are shown in Fig. 4A.
Пример 5Example 5
[0149] Данный пример демонстрирует, что CD8+PBL, трансдуцированные TCR против G12D Примера 2 (с человеческими вариабельными областями), специфично распознает HLA-A11-рестриктированный G12D с высокой авидностью.[0149] This example demonstrates that CD8+ PBL transduced with the TCR against G12D of Example 2 (with human variable regions) specifically recognizes HLA-A11-restricted G12D with high avidity.
[0150] Аутологичные CD8+ PBL Пациента 4373 трансдуцировали ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 2 (с человеческими вариабельными областями).[0150] Autologous CD8+ PBLs from Patient 4373 were transduced with a retroviral expression vector encoding the G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 2 (with human variable regions).
[0151] Аутологичные DC загружали следующими пептидами в концентрациях, показанных на Фиг. 4В: мутантный пептид минимальный эпитоп с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 29) или пептид минимальный эпитоп WT с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 31). Экспрессию 4-1 ВВ и ОХ40 измеряли посредством FACS. Результаты показаны на Фиг. 4В.[0151] Autologous DCs were loaded with the following peptides at the concentrations shown in Fig. 4B: mutant peptide minimal epitope with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 29) or a minimal WT epitope peptide with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 31). Expression of 4-1 BB and OX40 was measured by FACS. The results are shown in Fig. 4B.
Пример 6Example 6
[0152] Данный пример демонстрирует, что CD4+ PBL, трансдуцированные TCR против G12D Примера 2 (с человеческими вариабельными областями), специфично распознают HLA-A11-рестриктированные G12D с высокой авидностью.[0152] This example demonstrates that CD4+ PBL transduced with the TCR against G12D of Example 2 (with human variable regions) specifically recognize HLA-A11-restricted G12D with high avidity.
[0153] Аутологичные CD4+ PBL Пациента 4373 трансдуцировали ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 2 (с человеческими вариабельными областями).[0153] Autologous CD4+ PBLs from Patient 4373 were transduced with a retroviral expression vector encoding the G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 2 (with human variable regions).
[0154] Аутологичные DC загружали следующими пептидами в концентрациях, показанных на Фиг. 4С: мутантный пептид минимальный эпитоп с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 29) или пептид минимальный эпитоп WT с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 31). Экспрессию 4-1 ВВ и ОХ40 измеряли посредством FACS. Результаты показаны на Фиг. 4С.[0154] Autologous DCs were loaded with the following peptides at the concentrations shown in Fig. 4C: mutant peptide minimal epitope with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 29) or a minimal WT epitope peptide with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 31). Expression of 4-1 BB and OX40 was measured by FACS. The results are shown in Fig. 4C.
Пример 7Example 7
[0155] Данный пример демонстрирует, что CD8+PBL, трансдуцированные TCR против G12D Примера 2 (с человеческими вариабельными областями), специфично распознают HLA-A11-рестриктированный G12D с высокой авидностью.[0155] This example demonstrates that CD8+ PBL transduced with the TCR against G12D of Example 2 (with human variable regions) specifically recognize HLA-A11-restricted G12D with high avidity.
[0156] Аутологичные CD8+ PBL Пациента 4373 трансдуцировали ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 2 (с человеческими вариабельными областями).[0156] Autologous CD8+ PBLs from Patient 4373 were transduced with a retroviral expression vector encoding the G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 2 (with human variable regions).
[0157] Клетки COS загружали следующими пептидами в концентрациях, показанных на Фиг. 5А: мутантный пептид минимальный эпитоп с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 29) или пептид минимальный эпитоп WT с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 31). Секрецию IFN-γ измеряли посредством ELISpot. Результаты показаны на Фиг. 5А.[0157] COS cells were loaded with the following peptides at the concentrations shown in Fig. 5A: mutant peptide minimal epitope with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 29) or a minimal WT epitope peptide with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 31). IFN-γ secretion was measured by ELISpot. The results are shown in Fig. 5A.
Пример 8Example 8
[0158] Данный пример демонстрирует, что CD8+ PBL, трансдуцированные TCR против G12D Примера 2 (с человеческими вариабельными областями), специфично распознают HLA-A11-рестриктированные G12D с высокой авидностью.[0158] This example demonstrates that CD8+ PBL transduced with the TCR against G12D of Example 2 (with human variable regions) specifically recognize HLA-A11-restricted G12D with high avidity.
[0159] Аутологичные CD8+ PBL Пациента 4373 трансдуцировали ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 2 (с человеческими вариабельными областями).[0159] Autologous CD8+ PBLs from Patient 4373 were transduced with a retroviral expression vector encoding the G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 2 (with human variable regions).
[0160] Клетки COS трансдуцировали HLA-A11 и загружали следующими пептидами в концентрациях, показанных на Фиг. 5В: мутантный пептид минимальный эпитоп с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 29) или пептид минимальный эпитоп WT с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 31). Экспрессию 4-1 ВВ и ОХ40 измеряли посредством FACS. Результаты показаны на Фиг. 5В.[0160] COS cells were transduced with HLA-A11 and loaded with the following peptides at the concentrations shown in Fig. 5B: mutant peptide minimal epitope with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 29) or a minimal WT epitope peptide with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 31). Expression of 4-1 BB and OX40 was measured by FACS. The results are shown in Fig. 5B.
Пример 9Example 9
[0161] Данный пример демонстрирует, что CD4+ PBL, трансдуцированные TCR против G12D Примера 2 (с человеческими вариабельными областями), специфично распознают HLA-A11-рестриктированный G12D с высокой авидностью.[0161] This example demonstrates that CD4+ PBL transduced with the TCR against G12D of Example 2 (with human variable regions) specifically recognize HLA-A11-restricted G12D with high avidity.
[0162] Аутологичные CD4+ PBL пациента 4373 трансдуцировали ретровирусным экспрессионным вектором, кодирующим G12D RAS-реактивный 4373 TCR Примера 2 (с человеческими вариабельными областями).[0162] Autologous CD4+ PBL from patient 4373 were transduced with a retroviral expression vector encoding the G12D RAS-reactive 4373 TCR of Example 2 (with human variable regions).
[0163] Клетки COS загружали следующими пептидами в концентрациях, показанных на Фиг. 5С: мутантный пептид минимальный эпитоп с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 29) или пептид минимальный эпитоп WT с 10 аминокислотными остатками (SEQ ID NO: 31). Экспрессию 4-1 ВВ и ОХ40 измеряли посредством FACS. Результаты показаны на Фиг. 5С.[0163] COS cells were loaded with the following peptides at the concentrations shown in Fig. 5C: mutant peptide minimal epitope with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 29) or a minimal WT epitope peptide with 10 amino acid residues (SEQ ID NO: 31). Expression of 4-1 BB and OX40 was measured by FACS. The results are shown in Fig. 5C.
[0164] Все ссылки, включая публикации, патентные заявки и патенты, процитированные в данном документе, включены в данный документ посредством ссылки в равной мере, как если бы каждая ссылка была отдельно и конкретно указана включенной посредством ссылки и была изложена в данном документе во всей своей полноте.[0164] All references, including publications, patent applications, and patents, cited in this document are herein incorporated by reference to the same extent as if each reference were individually and specifically indicated to be incorporated by reference and were set forth herein in its entirety.
[0165] Применение терминов в единственном числе и «по меньшей мере один» и похожих объектов ссылки в контексте описания изобретения (особенно в контексте следующей формулы изобретения) следует истолковывать как охватывающее и термины в единственном числе и термины во множественном числе, если в данном документе не указано иное или оно явно не противоречит контексту. Применение термина «по меньшей мере один» с последующим перечислением одного или более пунктов (например, «по меньшей мере один из А и В») следует истолковывать как означающее один пункт, выбранный из перечисленных пунктов (А или В), или любую комбинацию двух или более из перечисленных пунктов (А или В), если в данном документе не указано иное или оно явно не противоречит контексту. Термины «содержащий», «имеющий», «включающий» и «содержащий» следует истолковывать как открытые термины (то есть, означающие «включающий, но не ограниченный…»), если не указано иное. Раскрытие диапазонов значений в данном документе предназначено только для того, чтобы служить в качестве сокращенного способа ссылки в отдельности на каждое отдельное значение, попадающее в данный диапазон, если в данном документе не указано иное, и каждое отдельное значение включено в описание изобретения, как если бы оно было по отдельности перечислено в данном документе. Все способы, описанные в данном документе, можно осуществлять в любом подходящем порядке, если в данном документе не указано иное или иначе нет явных противоречий контексту. Применение всех возможных примеров или вводных слов перед примером (например, «такой как»), предоставленных в данном документе, предназначено только для лучшего освещения изобретения и не накладывает ограничения на объем изобретения, если не заявлено иное. Язык в описании изобретения не следует истолковывать как указывающий на какой-либо незаявленный элемент в качестве существенного для практического осуществления изобретения.[0165] The use of the terms "at least one" and "a" and similar references in the context of the description of the invention (especially in the context of the following claims) shall be construed as encompassing both the singular and the plural unless otherwise indicated herein or clearly contradicted by the context. The use of the term "at least one" followed by a listing of one or more items (e.g., "at least one of A and B") shall be construed as meaning a single item selected from the listed items (A or B) or any combination of two or more of the listed items (A or B), unless otherwise indicated herein or clearly contradicted by the context. The terms "comprising," "having," "including," and "comprising" shall be construed as open-ended terms (i.e., meaning "including, but not limited to...") unless otherwise indicated herein. The disclosure of ranges of values in this document is intended only to serve as a shortcut for individually referring to each individual value falling within the range, unless otherwise indicated herein, and each individual value is included in the description of the invention as if it were individually listed herein. All methods described in this document can be performed in any suitable order unless otherwise indicated herein or otherwise clearly contradicted by context. The use of all possible examples or introductory words before an example (e.g., "such as") provided in this document is intended only to better illuminate the invention and does not impose a limitation on the scope of the invention unless otherwise stated. Language in the description of the invention should not be construed as indicating any unclaimed element as essential to the practice of the invention.
[0166] Предпочтительные воплощения данного изобретения описаны в данном документе, включая наилучший способ, известный авторам изобретения, для осуществления изобретения. Изменения данных предпочтительных воплощений могут стать очевидными обычным специалистам в данной области при чтении изложенного выше описания. Авторы изобретения ожидают, что специалисты в данной области будут использовать такие изменения в соответствующих случаях, и авторы изобретения намерены осуществлять на практике данное изобретение иначе, чем конкретно описано в данном документе. Соответственно, данное изобретение включает все модификации и эквиваленты предмета, перечисленные в формуле изобретения, приложенной к данному документу, как разрешено применяемым законом. Кроме того, любая комбинация описанных выше элементов во всех их возможных вариантах охвачена изобретением, если в данном документе не указано иное или она иначе явно не противоречит контексту.[0166] Preferred embodiments of the present invention are described herein, including the best mode known to the inventors for carrying out the invention. Variations from these preferred embodiments may become apparent to those of ordinary skill in the art upon reading the foregoing description. The inventors expect that those skilled in the art will employ such variations where appropriate, and the inventors intend to practice the present invention otherwise than as specifically described herein. Accordingly, the present invention includes all modifications and equivalents of the subject matter recited in the claims appended hereto, as permitted by applicable law. Furthermore, any combination of the above-described elements in all their possible variations is encompassed by the invention unless otherwise indicated herein or otherwise clearly contradicted by context.
--->--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙSEQUENCE LIST
<110> ДЗЕ ЮНАЙТЕД СТЕЙТС OФ АМЕРИКА, ЭЗ РЕПРЕЗЕНТЕД БАЙ ДЗЕ <110> DZE UNITED STATES OF AMERICA, EZ REPRESENTED BY DZE
СЕКРЕТАРИ, ДЕПАРТМЕНТ ОФ ХЕЛС ЭНД ХЬЮМАН СЁРВИСЕЗSECRETARY, DEPARTMENT OF HEALTH AND HUMAN SERVICES
<120> T-КЛЕТОЧНЫЕ РЕЦЕПТОРЫ, РЕСТРИКТИРОВАННЫЕ ПО HLA КЛАССА I, ПРОТИВ<120> HLA CLASS I RESTRICTED T-CELL RECEPTORS AGAINST
RAS С МУТАЦИЕЙ G12DRAS WITH G12D MUTATION
<130> 751506<130> 751506
<150> US 62/975,544<150> US 62/975,544
<151> 2020-02-12<151> 2020-02-12
<160> 67 <160> 67
<170> PatentIn version 3.5<170> PatentIn version 3.5
<210> 1<210> 1
<211> 6<211> 6
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 1<400> 1
Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Asn Thr Ala Phe Asp Tyr
1 5 1 5
<210> 2<210> 2
<211> 7<211> 7
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 2<400> 2
Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu
1 5 1 5
<210> 3<210> 3
<211> 16<211> 16
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 3<400> 3
Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Tyr
1 5 10 15 1 5 10 15
<210> 4<210> 4
<211> 5<211> 5
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 4<400> 4
Ser Gly His Arg Ser Ser Gly His Arg Ser
1 5 1 5
<210> 5<210> 5
<211> 6<211> 6
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 5<400> 5
Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Tyr Phe Ser Glu Thr Gln
1 5 1 5
<210> 6<210> 6
<211> 14<211> 14
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 6<400> 6
Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe
1 5 10 1 5 10
<210> 7<210> 7
<211> 145<211> 145
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 7<400> 7
Met Asp Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu Met Asp Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val
20 25 30 20 25 30
Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile
35 40 45 35 40 45
Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr
50 55 60 50 55 60
Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys
85 90 95 85 90 95
Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp
100 105 110 100 105 110
Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp
130 135 140 130 135 140
Pro Pro
145 145
<210> 8<210> 8
<211> 134<211> 134
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 8<400> 8
Met Ala Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Met Ala Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys
20 25 30 20 25 30
Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His
35 40 45 35 40 45
Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe
50 55 60 50 55 60
Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn
85 90 95 85 90 95
Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser
100 105 110 100 105 110
Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Arg Leu Thr Val Leu Thr Arg Leu Thr Val Leu
130 130
<210> 9<210> 9
<211> 189<211> 189
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 9<400> 9
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr
20 25 30 20 25 30
Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly
35 40 45 35 40 45
Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr
50 55 60 50 55 60
Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys
65 70 75 80 65 70 75 80
Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr
85 90 95 85 90 95
Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val
100 105 110 100 105 110
Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys
115 120 125 115 120 125
Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Lys Thr Arg Gln Arg Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val Ser Ala Lys Thr Arg Gln Arg Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Leu Lys Lys Ile Ser Lys Glu Glu Lys Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Leu Lys Lys Ile Ser Lys Glu Glu Lys
165 170 175 165 170 175
Thr Pro Gly Cys Val Lys Ile Lys Lys Cys Ile Ile Met Thr Pro Gly Cys Val Lys Ile Lys Lys Cys Ile Ile Met
180 185 180 185
<210> 10<210> 10
<211> 188<211> 188
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 10<400> 10
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr
20 25 30 20 25 30
Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly
35 40 45 35 40 45
Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr
50 55 60 50 55 60
Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys
65 70 75 80 65 70 75 80
Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr
85 90 95 85 90 95
Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val
100 105 110 100 105 110
Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys
115 120 125 115 120 125
Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Asp Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Asp Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Glu Ile Arg Lys His Lys Glu Lys Met Ser Lys Asp Gly Lys Lys Arg Glu Ile Arg Lys His Lys Glu Lys Met Ser Lys Asp Gly Lys Lys
165 170 175 165 170 175
Lys Lys Lys Lys Ser Lys Thr Lys Cys Val Ile Met Lys Lys Lys Lys Ser Lys Thr Lys Cys Val Ile Met
180 185 180 185
<210> 11<210> 11
<211> 189<211> 189
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 11<400> 11
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr
20 25 30 20 25 30
Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly
35 40 45 35 40 45
Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr
50 55 60 50 55 60
Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys
65 70 75 80 65 70 75 80
Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His Gln Tyr Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His Gln Tyr
85 90 95 85 90 95
Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val
100 105 110 100 105 110
Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Ala Ala Arg Thr Val Glu Ser Arg Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Ala Ala Arg Thr Val Glu Ser Arg
115 120 125 115 120 125
Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Tyr Ile Glu Thr Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Tyr Ile Glu Thr
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Glu Ile Arg Gln His Lys Leu Arg Lys Leu Asn Pro Pro Asp Glu Arg Glu Ile Arg Gln His Lys Leu Arg Lys Leu Asn Pro Pro Asp Glu
165 170 175 165 170 175
Ser Gly Pro Gly Cys Met Ser Cys Lys Cys Val Leu Ser Ser Gly Pro Gly Cys Met Ser Cys Lys Cys Val Leu Ser
180 185 180 185
<210> 12<210> 12
<211> 189<211> 189
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 12<400> 12
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr
20 25 30 20 25 30
Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly
35 40 45 35 40 45
Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr
50 55 60 50 55 60
Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys
65 70 75 80 65 70 75 80
Val Phe Ala Ile Asn Asn Ser Lys Ser Phe Ala Asp Ile Asn Leu Tyr Val Phe Ala Ile Asn Asn Ser Lys Ser Phe Ala Asp Ile Asn Leu Tyr
85 90 95 85 90 95
Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val
100 105 110 100 105 110
Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Thr Arg Thr Val Asp Thr Lys Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Thr Arg Thr Val Asp Thr Lys
115 120 125 115 120 125
Gln Ala His Glu Leu Ala Lys Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr Gln Ala His Glu Leu Ala Lys Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Met Lys Lys Leu Asn Ser Ser Asp Asp Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Met Lys Lys Leu Asn Ser Ser Asp Asp
165 170 175 165 170 175
Gly Thr Gln Gly Cys Met Gly Leu Pro Cys Val Val Met Gly Thr Gln Gly Cys Met Gly Leu Pro Cys Val Val Met
180 185 180 185
<210> 13<210> 13
<211> 189<211> 189
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 13<400> 13
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr
20 25 30 20 25 30
Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly
35 40 45 35 40 45
Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr
50 55 60 50 55 60
Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys
65 70 75 80 65 70 75 80
Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr
85 90 95 85 90 95
Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val
100 105 110 100 105 110
Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys
115 120 125 115 120 125
Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Lys Thr Arg Gln Arg Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val Ser Ala Lys Thr Arg Gln Arg Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Leu Lys Lys Ile Ser Lys Glu Glu Lys Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Leu Lys Lys Ile Ser Lys Glu Glu Lys
165 170 175 165 170 175
Thr Pro Gly Cys Val Lys Ile Lys Lys Cys Ile Ile Met Thr Pro Gly Cys Val Lys Ile Lys Lys Cys Ile Ile Met
180 185 180 185
<210> 14<210> 14
<211> 188<211> 188
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 14<400> 14
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr
20 25 30 20 25 30
Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly
35 40 45 35 40 45
Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr
50 55 60 50 55 60
Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys
65 70 75 80 65 70 75 80
Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His His Tyr
85 90 95 85 90 95
Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Glu Asp Val Pro Met Val
100 105 110 100 105 110
Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Ser Arg Thr Val Asp Thr Lys
115 120 125 115 120 125
Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Asp Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Asp Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Glu Ile Arg Lys His Lys Glu Lys Met Ser Lys Asp Gly Lys Lys Arg Glu Ile Arg Lys His Lys Glu Lys Met Ser Lys Asp Gly Lys Lys
165 170 175 165 170 175
Lys Lys Lys Lys Ser Lys Thr Lys Cys Val Ile Met Lys Lys Lys Lys Ser Lys Thr Lys Cys Val Ile Met
180 185 180 185
<210> 15<210> 15
<211> 189<211> 189
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 15<400> 15
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr
20 25 30 20 25 30
Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly
35 40 45 35 40 45
Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr
50 55 60 50 55 60
Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys
65 70 75 80 65 70 75 80
Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His Gln Tyr Val Phe Ala Ile Asn Asn Thr Lys Ser Phe Glu Asp Ile His Gln Tyr
85 90 95 85 90 95
Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val
100 105 110 100 105 110
Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Ala Ala Arg Thr Val Glu Ser Arg Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Ala Ala Arg Thr Val Glu Ser Arg
115 120 125 115 120 125
Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Tyr Ile Glu Thr Gln Ala Gln Asp Leu Ala Arg Ser Tyr Gly Ile Pro Tyr Ile Glu Thr
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Glu Ile Arg Gln His Lys Leu Arg Lys Leu Asn Pro Pro Asp Glu Arg Glu Ile Arg Gln His Lys Leu Arg Lys Leu Asn Pro Pro Asp Glu
165 170 175 165 170 175
Ser Gly Pro Gly Cys Met Ser Cys Lys Cys Val Leu Ser Ser Gly Pro Gly Cys Met Ser Cys Lys Cys Val Leu Ser
180 185 180 185
<210> 16<210> 16
<211> 189<211> 189
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 16<400> 16
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Asn His Phe Val Asp Glu Tyr
20 25 30 20 25 30
Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly Asp Pro Thr Ile Glu Asp Ser Tyr Arg Lys Gln Val Val Ile Asp Gly
35 40 45 35 40 45
Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Tyr
50 55 60 50 55 60
Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Thr Gly Glu Gly Phe Leu Cys
65 70 75 80 65 70 75 80
Val Phe Ala Ile Asn Asn Ser Lys Ser Phe Ala Asp Ile Asn Leu Tyr Val Phe Ala Ile Asn Asn Ser Lys Ser Phe Ala Asp Ile Asn Leu Tyr
85 90 95 85 90 95
Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val Arg Glu Gln Ile Lys Arg Val Lys Asp Ser Asp Asp Val Pro Met Val
100 105 110 100 105 110
Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Thr Arg Thr Val Asp Thr Lys Leu Val Gly Asn Lys Cys Asp Leu Pro Thr Arg Thr Val Asp Thr Lys
115 120 125 115 120 125
Gln Ala His Glu Leu Ala Lys Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr Gln Ala His Glu Leu Ala Lys Ser Tyr Gly Ile Pro Phe Ile Glu Thr
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val Ser Ala Lys Thr Arg Gln Gly Val Glu Asp Ala Phe Tyr Thr Leu Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Met Lys Lys Leu Asn Ser Ser Asp Asp Arg Glu Ile Arg Gln Tyr Arg Met Lys Lys Leu Asn Ser Ser Asp Asp
165 170 175 165 170 175
Gly Thr Gln Gly Cys Met Gly Leu Pro Cys Val Val Met Gly Thr Gln Gly Cys Met Gly Leu Pro Cys Val Val Met
180 185 180 185
<210> 17<210> 17
<211> 137<211> 137
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (48)..(48)<222> (48)..(48)
<223> Xaa представляет собой Thr или Cys<223> Xaa is Thr or Cys
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (112)..(112)<222> (112)..(112)
<223> Xaa представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp<223> Xaa represents Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (114)..(114)<222> (114)..(114)
<223> Xaa представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, или Trp<223> Xaa is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (115)..(115)<222> (115)..(115)
<223> Xaa представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp<223> Xaa is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp
<400> 17<400> 17
Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile
20 25 30 20 25 30
Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Xaa Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Xaa
35 40 45 35 40 45
Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala
50 55 60 50 55 60
Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Xaa Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Xaa
100 105 110 100 105 110
Val Xaa Xaa Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Val Xaa Xaa Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu
115 120 125 115 120 125
Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
130 135 130 135
<210> 18<210> 18
<211> 173<211> 173
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (57)..(57)<222> (57)..(57)
<223> Xaa представляет собой Ser или Cys<223> Xaa is Ser or Cys
<400> 18<400> 18
Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu
20 25 30 20 25 30
Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn
35 40 45 35 40 45
Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Xaa Thr Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Xaa Thr Asp Pro Gln Ala Tyr Lys
50 55 60 50 55 60
Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala
65 70 75 80 65 70 75 80
Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe
85 90 95 85 90 95
His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys Pro His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys Pro
100 105 110 100 105 110
Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly
115 120 125 115 120 125
Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu
130 135 140 130 135 140
Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser
145 150 155 160 145 150 155 160
Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser
165 170 165 170
<210> 19<210> 19
<211> 137<211> 137
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Mus musculus<213> Mus musculus
<400> 19<400> 19
Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile
20 25 30 20 25 30
Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Thr Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Thr
35 40 45 35 40 45
Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala
50 55 60 50 55 60
Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Ser Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Ser
100 105 110 100 105 110
Val Met Gly Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Val Met Gly Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu
115 120 125 115 120 125
Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
130 135 130 135
<210> 20<210> 20
<211> 173<211> 173
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Mus musculus<213> Mus musculus
<400> 20<400> 20
Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu
20 25 30 20 25 30
Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn
35 40 45 35 40 45
Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Ala Tyr Lys
50 55 60 50 55 60
Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala
65 70 75 80 65 70 75 80
Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe
85 90 95 85 90 95
His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys Pro His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys Pro
100 105 110 100 105 110
Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly
115 120 125 115 120 125
Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu
130 135 140 130 135 140
Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser
145 150 155 160 145 150 155 160
Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser
165 170 165 170
<210> 21<210> 21
<211> 282<211> 282
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (193)..(193)<222> (193) .. (193)
<223> Xaa представляет собой Thr или Cys<223> Xaa is Thr or Cys
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (257)..(257)<222> (257)..(257)
<223> Xaa представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp<223> Xaa represents Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (259)..(259)<222> (259)..(259)
<223> Xaa представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, или Trp<223> Xaa is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (260)..(260)<222> (260)..(260)
<223> Xaa представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp<223> Xaa is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp
<400> 21<400> 21
Met Asp Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu Met Asp Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val
20 25 30 20 25 30
Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile
35 40 45 35 40 45
Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr
50 55 60 50 55 60
Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys
85 90 95 85 90 95
Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp
100 105 110 100 105 110
Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp
130 135 140 130 135 140
Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln
165 170 175 165 170 175
Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys
180 185 190 180 185 190
Xaa Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Xaa Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu
210 215 220 210 215 220
Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu
245 250 255 245 250 255
Xaa Val Xaa Xaa Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Xaa Val Xaa Xaa Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn
260 265 270 260 265 270
Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
275 280 275 280
<210> 22<210> 22
<211> 307<211> 307
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (191)..(191)<222> (191)..(191)
<223> Xaa представляет собой Ser или Cys<223> Xaa is Ser or Cys
<400> 22<400> 22
Met Ala Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Met Ala Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys
20 25 30 20 25 30
Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His
35 40 45 35 40 45
Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe
50 55 60 50 55 60
Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn
85 90 95 85 90 95
Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser
100 105 110 100 105 110
Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys
130 135 140 130 135 140
Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys
145 150 155 160 145 150 155 160
Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu
165 170 175 165 170 175
Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Xaa Thr Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Xaa Thr
180 185 190 180 185 190
Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser
195 200 205 195 200 205
Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe
210 215 220 210 215 220
Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro
225 230 235 240 225 230 235 240
Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp
245 250 255 245 250 255
Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val
260 265 270 260 265 270
Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu
275 280 285 275 280 285
Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg
290 295 300 290 295 300
Lys Asn Ser Lys Asn Ser
305 305
<210> 23<210> 23
<211> 282<211> 282
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 23<400> 23
Met Asp Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu Met Asp Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val
20 25 30 20 25 30
Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile
35 40 45 35 40 45
Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr
50 55 60 50 55 60
Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys
85 90 95 85 90 95
Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp
100 105 110 100 105 110
Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp
130 135 140 130 135 140
Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln
165 170 175 165 170 175
Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys
180 185 190 180 185 190
Thr Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Thr Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu
210 215 220 210 215 220
Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu
245 250 255 245 250 255
Ser Val Met Gly Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Ser Val Met Gly Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn
260 265 270 260 265 270
Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
275 280 275 280
<210> 24<210> 24
<211> 307<211> 307
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 24<400> 24
Met Ala Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Met Ala Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys
20 25 30 20 25 30
Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His
35 40 45 35 40 45
Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe
50 55 60 50 55 60
Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn
85 90 95 85 90 95
Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser
100 105 110 100 105 110
Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys
130 135 140 130 135 140
Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys
145 150 155 160 145 150 155 160
Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu
165 170 175 165 170 175
Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr
180 185 190 180 185 190
Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser
195 200 205 195 200 205
Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe
210 215 220 210 215 220
Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro
225 230 235 240 225 230 235 240
Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp
245 250 255 245 250 255
Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val
260 265 270 260 265 270
Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu
275 280 285 275 280 285
Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg
290 295 300 290 295 300
Lys Asn Ser Lys Asn Ser
305 305
<210> 25<210> 25
<211> 27<211> 27
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 25<400> 25
Arg Ala Lys Arg Ser Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Arg Ala Lys Arg Ser Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro
20 25 20 25
<210> 26<210> 26
<211> 24<211> 24
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 26<400> 26
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile
20 20
<210> 27<210> 27
<211> 24<211> 24
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 27<400> 27
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile
20 20
<210> 28<210> 28
<211> 9<211> 9
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 28<400> 28
Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys
1 5 1 5
<210> 29<210> 29
<211> 10<211> 10
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 29<400> 29
Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys
1 5 10 1 5 10
<210> 30<210> 30
<211> 9<211> 9
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 30<400> 30
Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys
1 5 1 5
<210> 31<210> 31
<211> 10<211> 10
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 31<400> 31
Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys
1 5 10 1 5 10
<210> 32<210> 32
<211> 117<211> 117
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 32<400> 32
Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile
50 55 60 50 55 60
Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn
85 90 95 85 90 95
His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln
100 105 110 100 105 110
Leu Thr Val Trp Pro Leu Thr Val Trp Pro
115 115
<210> 33<210> 33
<211> 115<211> 115
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 33<400> 33
Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val
20 25 30 20 25 30
Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu
35 40 45 35 40 45
Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala
85 90 95 85 90 95
Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu
100 105 110 100 105 110
Thr Val Leu Thr Val Leu
115 115
<210> 34<210> 34
<211> 254<211> 254
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (165)..(165)<222> (165)..(165)
<223> Xaa представляет собой Thr или Cys<223> Xaa is Thr or Cys
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (229)..(229)<222> (229)..(229)
<223> Xaa представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp<223> Xaa represents Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (231)..(231)<222> (231)..(231)
<223> Xaa представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, или Trp<223> Xaa is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (232)..(232)<222> (232)..(232)
<223> Xaa представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp<223> Xaa is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp
<400> 34<400> 34
Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile
50 55 60 50 55 60
Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn
85 90 95 85 90 95
His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln
100 105 110 100 105 110
Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln
115 120 125 115 120 125
Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp
130 135 140 130 135 140
Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe
145 150 155 160 145 150 155 160
Ile Thr Asp Lys Xaa Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Ile Thr Asp Lys Xaa Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser
165 170 175 165 170 175
Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp
180 185 190 180 185 190
Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys
195 200 205 195 200 205
Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn
210 215 220 210 215 220
Phe Gln Asn Leu Xaa Val Xaa Xaa Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Phe Gln Asn Leu Xaa Val Xaa Xaa Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val
225 230 235 240 225 230 235 240
Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
245 250 245 250
<210> 35<210> 35
<211> 288<211> 288
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (172)..(172)<222> (172)..(172)
<223> Xaa представляет собой Ser или Cys<223> Xaa is Ser or Cys
<400> 35<400> 35
Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val
20 25 30 20 25 30
Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu
35 40 45 35 40 45
Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala
85 90 95 85 90 95
Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu
100 105 110 100 105 110
Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu
115 120 125 115 120 125
Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu
130 135 140 130 135 140
Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp
145 150 155 160 145 150 155 160
Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Xaa Thr Asp Pro Gln Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Xaa Thr Asp Pro Gln
165 170 175 165 170 175
Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg
180 185 190 180 185 190
Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln
195 200 205 195 200 205
Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser
210 215 220 210 215 220
Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala
225 230 235 240 225 230 235 240
Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala
245 250 255 245 250 255
Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val
260 265 270 260 265 270
Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser
275 280 285 275 280 285
<210> 36<210> 36
<211> 254<211> 254
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 36<400> 36
Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile
50 55 60 50 55 60
Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn
85 90 95 85 90 95
His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln
100 105 110 100 105 110
Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln
115 120 125 115 120 125
Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp
130 135 140 130 135 140
Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe
145 150 155 160 145 150 155 160
Ile Thr Asp Lys Thr Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Ile Thr Asp Lys Thr Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser
165 170 175 165 170 175
Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp
180 185 190 180 185 190
Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys
195 200 205 195 200 205
Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn
210 215 220 210 215 220
Phe Gln Asn Leu Ser Val Met Gly Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Phe Gln Asn Leu Ser Val Met Gly Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val
225 230 235 240 225 230 235 240
Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
245 250 245 250
<210> 37<210> 37
<211> 288<211> 288
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 37<400> 37
Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val
20 25 30 20 25 30
Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu
35 40 45 35 40 45
Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala
85 90 95 85 90 95
Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu
100 105 110 100 105 110
Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu
115 120 125 115 120 125
Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu
130 135 140 130 135 140
Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp
145 150 155 160 145 150 155 160
Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln
165 170 175 165 170 175
Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg
180 185 190 180 185 190
Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln
195 200 205 195 200 205
Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser
210 215 220 210 215 220
Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala
225 230 235 240 225 230 235 240
Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala
245 250 255 245 250 255
Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val
260 265 270 260 265 270
Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser
275 280 285 275 280 285
<210> 38<210> 38
<211> 137<211> 137
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 38<400> 38
Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile
20 25 30 20 25 30
Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Cys Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Cys
35 40 45 35 40 45
Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala
50 55 60 50 55 60
Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Leu Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Leu
100 105 110 100 105 110
Val Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Val Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu
115 120 125 115 120 125
Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
130 135 130 135
<210> 39<210> 39
<211> 173<211> 173
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 39<400> 39
Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu
20 25 30 20 25 30
Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn
35 40 45 35 40 45
Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Ala Tyr Lys
50 55 60 50 55 60
Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala
65 70 75 80 65 70 75 80
Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe
85 90 95 85 90 95
His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys Pro His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys Pro
100 105 110 100 105 110
Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly
115 120 125 115 120 125
Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu
130 135 140 130 135 140
Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser
145 150 155 160 145 150 155 160
Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser
165 170 165 170
<210> 40<210> 40
<211> 282<211> 282
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 40<400> 40
Met Asp Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu Met Asp Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val
20 25 30 20 25 30
Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile
35 40 45 35 40 45
Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr
50 55 60 50 55 60
Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys
85 90 95 85 90 95
Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp
100 105 110 100 105 110
Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp
130 135 140 130 135 140
Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln
165 170 175 165 170 175
Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys
180 185 190 180 185 190
Cys Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Cys Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu
210 215 220 210 215 220
Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu
245 250 255 245 250 255
Leu Val Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Val Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn
260 265 270 260 265 270
Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
275 280 275 280
<210> 41<210> 41
<211> 307<211> 307
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 41<400> 41
Met Ala Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Met Ala Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys
20 25 30 20 25 30
Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His
35 40 45 35 40 45
Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe
50 55 60 50 55 60
Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn
85 90 95 85 90 95
Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser
100 105 110 100 105 110
Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys
130 135 140 130 135 140
Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys
145 150 155 160 145 150 155 160
Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu
165 170 175 165 170 175
Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr
180 185 190 180 185 190
Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser
195 200 205 195 200 205
Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe
210 215 220 210 215 220
Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro
225 230 235 240 225 230 235 240
Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp
245 250 255 245 250 255
Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val
260 265 270 260 265 270
Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu
275 280 285 275 280 285
Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg
290 295 300 290 295 300
Lys Asn Ser Lys Asn Ser
305 305
<210> 42<210> 42
<211> 254<211> 254
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 42<400> 42
Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile
50 55 60 50 55 60
Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser
65 70 75 80 65 70 75 80
Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn
85 90 95 85 90 95
His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln
100 105 110 100 105 110
Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln
115 120 125 115 120 125
Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp
130 135 140 130 135 140
Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe
145 150 155 160 145 150 155 160
Ile Thr Asp Lys Cys Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Ile Thr Asp Lys Cys Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser
165 170 175 165 170 175
Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp
180 185 190 180 185 190
Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys
195 200 205 195 200 205
Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn
210 215 220 210 215 220
Phe Gln Asn Leu Leu Val Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Phe Gln Asn Leu Leu Val Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val
225 230 235 240 225 230 235 240
Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
245 250 245 250
<210> 43<210> 43
<211> 288<211> 288
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 43<400> 43
Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val
20 25 30 20 25 30
Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu
35 40 45 35 40 45
Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala
85 90 95 85 90 95
Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu
100 105 110 100 105 110
Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu
115 120 125 115 120 125
Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu
130 135 140 130 135 140
Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp
145 150 155 160 145 150 155 160
Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln
165 170 175 165 170 175
Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg
180 185 190 180 185 190
Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln
195 200 205 195 200 205
Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser
210 215 220 210 215 220
Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala
225 230 235 240 225 230 235 240
Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala
245 250 255 245 250 255
Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val
260 265 270 260 265 270
Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser
275 280 285 275 280 285
<210> 44<210> 44
<211> 435<211> 435
<212> ДНК<212> DNA
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 44<400> 44
atggacaaga tcctgggcgc ctcttttctg gtgctgtggc tgcagctgtg ctgggtgtcc 60atggacaaga tcctgggcgc ctcttttctg gtgctgtggc tgcagctgtg ctgggtgtcc 60
ggacagcaga aggagaagtc tgatcagcag caggtgaagc agtctcccca gagcctgatc 120ggacagcaga aggagaagtc tgatcagcag caggtgaagc agtctcccca gagcctgatc 120
gtgcagaagg gcggcatcag catcatcaac tgtgcctacg agaataccgc cttcgattac 180gtgcagaagg gcggcatcag catcatcaac tgtgcctacg agaataccgc cttcgattac 180
tttccctggt atcagcagtt cccaggcaag ggacccgccc tgctgatcgc aatcaggcct 240tttccctggt atcagcagtt cccaggcaag ggacccgccc tgctgatcgc aatcaggcct 240
gacgtgagcg agaagaagga gggccgcttc acaatcagct ttaataagtc cgccaagcag 300gacgtgagcg agaagaagga gggccgcttc acaatcagct ttaataagtc cgccaagcag 300
ttctccctgc acatcatgga cagccagccc ggcgattccg ccacctactt ttgtgcagca 360ttctccctgc acatcatgga cagccagccc ggcgattccg ccacctactt ttgtgcagca 360
gaggcaggaa accacagggg ctccacactg ggccggctgt atttcggcag aggcacccag 420gaggcaggaa accacagggg ctccacactg ggccggctgt atttcggcag aggcacccag 420
ctgacagtgt ggcct 435ctgacagtgt ggcct 435
<210> 45<210> 45
<211> 402<211> 402
<212> ДНК<212> DNA
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 45<400> 45
atggcctcca ggctgctgtg ctgggtgctg ctgtgcctgc tgggagcagg accagtgaag 60atggcctcca ggctgctgtg ctgggtgctg ctgtgcctgc tgggagcagg accagtgaag 60
gcaggcgtga cccagacacc taggtacctg atcaagaccc gcggccagca ggtgacactg 120gcaggcgtga cccagacacc taggtacctg atcaagaccc gcggccagca ggtgacactg 120
tcttgcagcc caatcagcgg ccaccgctcc gtgtcttggt accagcagac cccaggacag 180tcttgcagcc caatcagcgg ccaccgctcc gtgtcttggt accagcagac cccaggacag 180
ggcctgcagt tcctgtttga gtatttctcc gagacacaga ggaacaaggg caatttccct 240ggcctgcagt tcctgtttga gtatttctcc gagacacaga ggaacaaggg caatttccct 240
ggccggtttt ctggcagaca gtttagcaac tcccgctctg agatgaacgt gagcaccctg 300ggccggtttt ctggcagaca gtttagcaac tcccgctctg agatgaacgt gagcaccctg 300
gagctgggcg atagcgccct gtacctgtgc gccagctccc tggccgcagg aggctatttc 360gagctgggcg atagcgccct gtacctgtgc gccagctccc tggccgcagg aggctatttc 360
aacgagcagt tctttggacc aggaaccagg ctgacagtgc tg 402aacgagcagt tctttggacc aggaaccagg ctgacagtgc tg 402
<210> 46<210> 46
<211> 1859<211> 1859
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 46<400> 46
ccatggcctc caggctgctg tgctgggtgc tgctgtgcct gctgggagca ggaccagtga 60ccatggcctc caggctgctg tgctgggtgc tgctgtgcct gctgggagca ggaccagtga 60
aggcaggcgt gacccagaca cctaggtacc tgatcaagac ccgcggccag caggtgacac 120aggcaggcgt gacccagaca cctaggtacc tgatcaagac ccgcggccag caggtgacac 120
tgtcttgcag cccaatcagc ggccaccgct ccgtgtcttg gtaccagcag accccaggac 180tgtcttgcag cccaatcagc ggccaccgct ccgtgtcttg gtaccagcag accccaggac 180
agggcctgca gttcctgttt gagtatttct ccgagacaca gaggaacaag ggcaatttcc 240agggcctgca gttcctgttt gagtatttct ccgagacaca gaggaacaag ggcaatttcc 240
ctggccggtt ttctggcaga cagtttagca actcccgctc tgagatgaac gtgagcaccc 300ctggccggtt ttctggcaga cagtttagca actcccgctc tgagatgaac gtgagcaccc 300
tggagctggg cgatagcgcc ctgtacctgt gcgccagctc cctggccgca ggaggctatt 360tggagctggg cgatagcgcc ctgtacctgt gcgccagctc cctggccgca ggaggctatt 360
tcaacgagca gttctttgga ccaggaacca ggctgacagt gctggaggac ctgagaaatg 420tcaacgagca gttctttgga ccaggaacca ggctgacagt gctggaggac ctgagaaatg 420
tgaccccccc taaggtgtcc ctgtttgagc cttctaaggc cgagatcgcc aacaagcaga 480tgaccccccc taaggtgtcc ctgtttgagc cttctaaggc cgagatcgcc aacaagcaga 480
aggccaccct ggtgtgcctg gcaaggggct tctttccaga tcacgtggag ctgagctggt 540aggccaccct ggtgtgcctg gcaaggggct tctttccaga tcacgtggag ctgagctggt 540
gggtgaatgg caaggaggtg cactccggcg tgtgcaccga cccacaggcc tacaaggaga 600gggtgaatgg caaggaggtg cactccggcg tgtgcaccga cccacaggcc tacaaggaga 600
gcaactactc ctattgtctg tctagccggc tgagagtgtc cgccacattc tggcacaacc 660gcaactactc ctattgtctg tctagccggc tgagagtgtc cgccacattc tggcacaacc 660
caaggaatca cttccgctgc caggtgcagt ttcacggcct gagcgaggag gataagtggc 720caaggaatca cttccgctgc caggtgcagt ttcacggcct gagcgaggag gataagtggc 720
cagagggctc cccaaagcca gtgacccaga atatctctgc cgaggcatgg ggaagggcag 780cagagggctc cccaaagcca gtgacccaga atatctctgc cgaggcatgg ggaagggcag 780
actgtggaat caccagcgcc tcctatcagc agggcgtgct gagcgccaca atcctgtacg 840actgtggaat caccagcgcc tcctatcagc agggcgtgct gagcgccaca atcctgtacg 840
agatcctgct gggcaaggcc accctgtatg ccgtgctggt gtccacactg gtggtcatgg 900agatcctgct gggcaaggcc accctgtatg ccgtgctggt gtccacactg gtggtcatgg 900
ctatggtgaa gagaaagaac tctagggcaa agcggagcgg aagcggagca accaatttca 960ctatggtgaa gagaaagaac tctagggcaa agcggagcgg aagcggagca accaatttca 960
gcctgctgaa gcaggcaggc gatgtggagg agaaccctgg accaatggac aagatcctgg 1020gcctgctgaa gcaggcaggc gatgtggagg agaaccctgg accaatggac aagatcctgg 1020
gcgcctcttt tctggtgctg tggctgcagc tgtgctgggt gtccggacag cagaaggaga 1080gcgcctcttt tctggtgctg tggctgcagc tgtgctgggt gtccggacag cagaaggaga 1080
agtctgatca gcagcaggtg aagcagtctc cccagagcct gatcgtgcag aagggcggca 1140agtctgatca gcagcaggtg aagcagtctc cccagagcct gatcgtgcag aagggcggca 1140
tcagcatcat caactgtgcc tacgagaata ccgccttcga ttactttccc tggtatcagc 1200tcagcatcat caactgtgcc tacgagaata ccgccttcga ttactttccc tggtatcagc 1200
agttcccagg caagggaccc gccctgctga tcgcaatcag gcctgacgtg agcgagaaga 1260agttcccagg caagggaccc gccctgctga tcgcaatcag gcctgacgtg agcgagaaga 1260
aggagggccg cttcacaatc agctttaata agtccgccaa gcagttctcc ctgcacatca 1320aggagggccg cttcacaatc agctttaata agtccgccaa gcagttctcc ctgcacatca 1320
tggacagcca gcccggcgat tccgccacct acttttgtgc agcagaggca ggaaaccaca 1380tggacagcca gcccggcgat tccgccacct acttttgtgc agcagaggca ggaaaccaca 1380
ggggctccac actgggccgg ctgtatttcg gcagaggcac ccagctgaca gtgtggccta 1440ggggctccac actgggccgg ctgtatttcg gcagaggcac ccagctgaca gtgtggccta 1440
acatccagaa tcccgagcct gccgtgtacc agctgaagga cccaagatcc caggattcta 1500acatccagaa tcccgagcct gccgtgtacc agctgaagga cccaagatcc caggattcta 1500
ccctgtgcct gttcacagac tttgattctc agatcaatgt gcctaagaca atggagagcg 1560ccctgtgcct gttcacagac tttgattctc agatcaatgt gcctaagaca atggagagcg 1560
gcacctttat cacagacaag tgcgtgctgg acatgaaggc tatggactcc aagtctaacg 1620gcacctttat cacagacaag tgcgtgctgg acatgaaggc tatggactcc aagtctaacg 1620
gcgccatcgc ctggtctaat cagaccagct tcacatgcca ggatatcttt aaggagacaa 1680gcgccatcgc ctggtctaat cagaccagct tcacatgcca ggatatcttt aaggagacaa 1680
acgccacata tccttcctct gacgtgccat gtgatgccac cctgacagag aagagcttcg 1740acgccacata tccttcctct gacgtgccat gtgatgccac cctgacagag aagagcttcg 1740
agacagacat gaacctgaat tttcagaacc tgctggtcat cgtgctgcgg atcctgctgc 1800agacagacat gaacctgaat tttcagaacc tgctggtcat cgtgctgcgg atcctgctgc 1800
tgaaggtggc cggcttcaat ctgctgatga cactgagact gtggagctcc tgagaattc 1859tgaaggtggc cggcttcaat ctgctgatga cactgagact gtggagctcc tgagaattc 1859
<210> 47<210> 47
<211> 616<211> 616
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 47<400> 47
Met Ala Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Met Ala Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys
20 25 30 20 25 30
Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His
35 40 45 35 40 45
Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe
50 55 60 50 55 60
Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn
85 90 95 85 90 95
Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser
100 105 110 100 105 110
Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys
130 135 140 130 135 140
Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys
145 150 155 160 145 150 155 160
Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu
165 170 175 165 170 175
Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr
180 185 190 180 185 190
Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser
195 200 205 195 200 205
Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe
210 215 220 210 215 220
Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro
225 230 235 240 225 230 235 240
Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp
245 250 255 245 250 255
Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val
260 265 270 260 265 270
Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu
275 280 285 275 280 285
Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg
290 295 300 290 295 300
Lys Asn Ser Arg Ala Lys Arg Ser Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Lys Asn Ser Arg Ala Lys Arg Ser Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser
305 310 315 320 305 310 315 320
Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Asp Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Asp
325 330 335 325 330 335
Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu Cys Trp Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu Cys Trp
340 345 350 340 345 350
Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Lys Gln Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Lys Gln
355 360 365 355 360 365
Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Ile Asn Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Ile Asn
370 375 380 370 375 380
Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Gln Gln
385 390 395 400 385 390 395 400
Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val
405 410 415 405 410 415
Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Ser Ala Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Ser Ala
420 425 430 420 425 430
Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala
435 440 445 435 440 445
Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu
450 455 460 450 455 460
Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Pro Asn Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Pro Asn
465 470 475 480 465 470 475 480
Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Ser Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Ser
485 490 495 485 490 495
Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Asn Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Asn
500 505 510 500 505 510
Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Cys Val Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Cys Val
515 520 525 515 520 525
Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Trp Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Trp
530 535 540 530 535 540
Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Asn
545 550 555 560 545 550 555 560
Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Glu Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Glu
565 570 575 565 570 575
Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Leu Val Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Leu Val
580 585 590 580 585 590
Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu
595 600 605 595 600 605
Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
610 615 610 615
<210> 48<210> 48
<211> 74<211> 74
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 48<400> 48
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val
20 25 30 20 25 30
Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Val Gly Ala Gly Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Gln Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu Gln Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Gln Glu Glu
50 55 60 50 55 60
Tyr Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Tyr Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg
65 70 65 70
<210> 49<210> 49
<211> 295<211> 295
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 49<400> 49
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Gly Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val
20 25 30 20 25 30
Val Gly Ala Val Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Val Gly Ala Val Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Cys Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Cys Gly Val Gly Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val
65 70 75 80 65 70 75 80
Val Gly Ala Ala Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Val Gly Ala Ala Gly Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile
85 90 95 85 90 95
Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Ser Gly Val Gly Lys Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Ser Gly Val Gly Lys
100 105 110 100 105 110
Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val
115 120 125 115 120 125
Val Gly Ala Gly Asp Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Val Gly Ala Gly Asp Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile
130 135 140 130 135 140
Gln Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Arg Val Gly Gln Met Thr Glu Tyr Lys Leu Val Val Val Gly Ala Gly Arg Val Gly
145 150 155 160 145 150 155 160
Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Met Thr Glu Tyr Lys Leu Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln Leu Ile Gln Met Thr Glu Tyr Lys Leu
165 170 175 165 170 175
Val Val Val Gly Ala Gly Val Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln Val Val Val Gly Ala Gly Val Val Gly Lys Ser Ala Leu Thr Ile Gln
180 185 190 180 185 190
Leu Ile Gln Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Arg Leu Ile Gln Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Arg
195 200 205 195 200 205
Glu Glu Tyr Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Glu Thr Cys Leu Glu Glu Tyr Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Glu Thr Cys Leu
210 215 220 210 215 220
Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Leu Glu Glu Tyr Ser Ala Met Arg Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly Leu Glu Glu Tyr Ser Ala Met Arg
225 230 235 240 225 230 235 240
Asp Gln Tyr Met Arg Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Asp Gln Tyr Met Arg Glu Thr Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala
245 250 255 245 250 255
Gly Lys Glu Glu Tyr Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Glu Thr Gly Lys Glu Glu Tyr Ser Ala Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Glu Thr
260 265 270 260 265 270
Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly His Glu Glu Tyr Ser Ala Cys Leu Leu Asp Ile Leu Asp Thr Ala Gly His Glu Glu Tyr Ser Ala
275 280 285 275 280 285
Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg Met Arg Asp Gln Tyr Met Arg
290 295 290 295
<210> 50<210> 50
<211> 10<211> 10
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 50<400> 50
Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val Lys Leu Val Val Val Gly Ala Asp Gly Val
1 5 10 1 5 10
<210> 51<210> 51
<211> 145<211> 145
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 51<400> 51
Met Ala Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu Met Ala Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val
20 25 30 20 25 30
Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile
35 40 45 35 40 45
Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr
50 55 60 50 55 60
Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys
85 90 95 85 90 95
Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp
100 105 110 100 105 110
Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp
130 135 140 130 135 140
Pro Pro
145 145
<210> 52<210> 52
<211> 134<211> 134
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 52<400> 52
Met Gly Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Met Gly Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys
20 25 30 20 25 30
Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His
35 40 45 35 40 45
Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe
50 55 60 50 55 60
Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn
85 90 95 85 90 95
Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser
100 105 110 100 105 110
Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Arg Leu Thr Val Leu Thr Arg Leu Thr Val Leu
130 130
<210> 53<210> 53
<211> 282<211> 282
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (193)..(193)<222> (193) .. (193)
<223> Xaa представляет собой Thr или Cys<223> Xaa is Thr or Cys
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (257)..(257)<222> (257)..(257)
<223> Xaa представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp<223> Xaa represents Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (259)..(259)<222> (259)..(259)
<223> Xaa представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, или Trp<223> Xaa is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (260)..(260)<222> (260)..(260)
<223> Xaa представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp<223> Xaa is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp
<400> 53<400> 53
Met Ala Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu Met Ala Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val
20 25 30 20 25 30
Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile
35 40 45 35 40 45
Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr
50 55 60 50 55 60
Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys
85 90 95 85 90 95
Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp
100 105 110 100 105 110
Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp
130 135 140 130 135 140
Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln
165 170 175 165 170 175
Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys
180 185 190 180 185 190
Xaa Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Xaa Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu
210 215 220 210 215 220
Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu
245 250 255 245 250 255
Xaa Val Xaa Xaa Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Xaa Val Xaa Xaa Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn
260 265 270 260 265 270
Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
275 280 275 280
<210> 54<210> 54
<211> 307<211> 307
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (191)..(191)<222> (191)..(191)
<223> Xaa представляет собой Ser или Cys<223> Xaa is Ser or Cys
<400> 54<400> 54
Met Gly Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Met Gly Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys
20 25 30 20 25 30
Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His
35 40 45 35 40 45
Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe
50 55 60 50 55 60
Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn
85 90 95 85 90 95
Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser
100 105 110 100 105 110
Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys
130 135 140 130 135 140
Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys
145 150 155 160 145 150 155 160
Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu
165 170 175 165 170 175
Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Xaa Thr Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Xaa Thr
180 185 190 180 185 190
Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser
195 200 205 195 200 205
Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe
210 215 220 210 215 220
Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro
225 230 235 240 225 230 235 240
Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp
245 250 255 245 250 255
Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val
260 265 270 260 265 270
Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu
275 280 285 275 280 285
Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg
290 295 300 290 295 300
Lys Asn Ser Lys Asn Ser
305 305
<210> 55<210> 55
<211> 282<211> 282
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 55<400> 55
Met Ala Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu Met Ala Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val
20 25 30 20 25 30
Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile
35 40 45 35 40 45
Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr
50 55 60 50 55 60
Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys
85 90 95 85 90 95
Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp
100 105 110 100 105 110
Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp
130 135 140 130 135 140
Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln
165 170 175 165 170 175
Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys
180 185 190 180 185 190
Thr Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Thr Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu
210 215 220 210 215 220
Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu
245 250 255 245 250 255
Ser Val Met Gly Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Ser Val Met Gly Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn
260 265 270 260 265 270
Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
275 280 275 280
<210> 56<210> 56
<211> 307<211> 307
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 56<400> 56
Met Gly Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Met Gly Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys
20 25 30 20 25 30
Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His
35 40 45 35 40 45
Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe
50 55 60 50 55 60
Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn
85 90 95 85 90 95
Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser
100 105 110 100 105 110
Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys
130 135 140 130 135 140
Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys
145 150 155 160 145 150 155 160
Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu
165 170 175 165 170 175
Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr
180 185 190 180 185 190
Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser
195 200 205 195 200 205
Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe
210 215 220 210 215 220
Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro
225 230 235 240 225 230 235 240
Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp
245 250 255 245 250 255
Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val
260 265 270 260 265 270
Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu
275 280 285 275 280 285
Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg
290 295 300 290 295 300
Lys Asn Ser Lys Asn Ser
305 305
<210> 57<210> 57
<211> 282<211> 282
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 57<400> 57
Met Ala Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu Met Ala Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val
20 25 30 20 25 30
Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile
35 40 45 35 40 45
Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr
50 55 60 50 55 60
Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys
85 90 95 85 90 95
Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp
100 105 110 100 105 110
Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp
130 135 140 130 135 140
Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln
165 170 175 165 170 175
Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys
180 185 190 180 185 190
Cys Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Cys Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu
210 215 220 210 215 220
Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu
245 250 255 245 250 255
Leu Val Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Val Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn
260 265 270 260 265 270
Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
275 280 275 280
<210> 58<210> 58
<211> 307<211> 307
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 58<400> 58
Met Gly Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Met Gly Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys
20 25 30 20 25 30
Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His
35 40 45 35 40 45
Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe
50 55 60 50 55 60
Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn
85 90 95 85 90 95
Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser
100 105 110 100 105 110
Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys
130 135 140 130 135 140
Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys
145 150 155 160 145 150 155 160
Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu
165 170 175 165 170 175
Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr
180 185 190 180 185 190
Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser
195 200 205 195 200 205
Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe
210 215 220 210 215 220
Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro
225 230 235 240 225 230 235 240
Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp
245 250 255 245 250 255
Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val
260 265 270 260 265 270
Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu
275 280 285 275 280 285
Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg
290 295 300 290 295 300
Lys Asn Ser Lys Asn Ser
305 305
<210> 59<210> 59
<211> 124<211> 124
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 59<400> 59
Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr
20 25 30 20 25 30
Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly
35 40 45 35 40 45
Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys
50 55 60 50 55 60
Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe
65 70 75 80 65 70 75 80
Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe
85 90 95 85 90 95
Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu
100 105 110 100 105 110
Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Pro Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Pro
115 120 115 120
<210> 60<210> 60
<211> 113<211> 113
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 60<400> 60
Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Ser Trp Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Ser Trp
20 25 30 20 25 30
Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Tyr Phe Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Tyr Phe
35 40 45 35 40 45
Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Ser Gly Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Leu Glu Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Leu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly
85 90 95 85 90 95
Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val
100 105 110 100 105 110
Leu Leu
<210> 61<210> 61
<211> 261<211> 261
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (172)..(172)<222> (172)..(172)
<223> Xaa представляет собой Thr или Cys<223> Xaa is Thr or Cys
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (236)..(236)<222> (236)..(236)
<223> Xaa представляет собой Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp<223> Xaa represents Ser, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (238)..(238)<222> (238)..(238)
<223> Xaa представляет собой Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, или Trp<223> Xaa is Met, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, or Trp
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (239)..(239)<222> (239)..(239)
<223> Xaa представляет собой Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met или Trp<223> Xaa is Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Met, or Trp
<400> 61<400> 61
Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr
20 25 30 20 25 30
Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly
35 40 45 35 40 45
Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys
50 55 60 50 55 60
Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe
65 70 75 80 65 70 75 80
Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe
85 90 95 85 90 95
Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu
100 105 110 100 105 110
Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn
115 120 125 115 120 125
Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser
130 135 140 130 135 140
Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys
145 150 155 160 145 150 155 160
Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Xaa Val Leu Asp Met Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Xaa Val Leu Asp Met
165 170 175 165 170 175
Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln
180 185 190 180 185 190
Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr
195 200 205 195 200 205
Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe
210 215 220 210 215 220
Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Xaa Val Xaa Xaa Leu Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Xaa Val Xaa Xaa Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu
245 250 255 245 250 255
Arg Leu Trp Ser Ser Arg Leu Trp Ser Ser
260 260
<210> 62<210> 62
<211> 286<211> 286
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<220><220>
<221> MISC_FEATURE<221> MISC_FEATURE
<222> (170)..(170)<222> (170)..(170)
<223> Xaa представляет собой Ser или Cys<223> Xaa is Ser or Cys
<400> 62<400> 62
Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Ser Trp Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Ser Trp
20 25 30 20 25 30
Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Tyr Phe Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Tyr Phe
35 40 45 35 40 45
Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Ser Gly Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Leu Glu Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Leu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly
85 90 95 85 90 95
Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val
100 105 110 100 105 110
Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu
115 120 125 115 120 125
Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys
130 135 140 130 135 140
Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Xaa Thr Asp Pro Gln Ala Tyr Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Xaa Thr Asp Pro Gln Ala Tyr
165 170 175 165 170 175
Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln
195 200 205 195 200 205
Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys
210 215 220 210 215 220
Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys
225 230 235 240 225 230 235 240
Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile
245 250 255 245 250 255
Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val
260 265 270 260 265 270
Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser
275 280 285 275 280 285
<210> 63<210> 63
<211> 261<211> 261
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 63<400> 63
Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr
20 25 30 20 25 30
Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly
35 40 45 35 40 45
Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys
50 55 60 50 55 60
Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe
65 70 75 80 65 70 75 80
Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe
85 90 95 85 90 95
Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu
100 105 110 100 105 110
Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn
115 120 125 115 120 125
Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser
130 135 140 130 135 140
Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys
145 150 155 160 145 150 155 160
Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Thr Val Leu Asp Met Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Thr Val Leu Asp Met
165 170 175 165 170 175
Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln
180 185 190 180 185 190
Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr
195 200 205 195 200 205
Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe
210 215 220 210 215 220
Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Met Gly Leu Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Met Gly Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu
245 250 255 245 250 255
Arg Leu Trp Ser Ser Arg Leu Trp Ser Ser
260 260
<210> 64<210> 64
<211> 286<211> 286
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 64<400> 64
Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Ser Trp Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Ser Trp
20 25 30 20 25 30
Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Tyr Phe Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Tyr Phe
35 40 45 35 40 45
Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Ser Gly Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Leu Glu Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Leu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly
85 90 95 85 90 95
Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val
100 105 110 100 105 110
Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu
115 120 125 115 120 125
Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys
130 135 140 130 135 140
Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Ala Tyr Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Ala Tyr
165 170 175 165 170 175
Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln
195 200 205 195 200 205
Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys
210 215 220 210 215 220
Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys
225 230 235 240 225 230 235 240
Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile
245 250 255 245 250 255
Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val
260 265 270 260 265 270
Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser
275 280 285 275 280 285
<210> 65<210> 65
<211> 261<211> 261
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 65<400> 65
Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Lys Gln Ser Pro Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Ile Asn Cys Ala Tyr
20 25 30 20 25 30
Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Gln Gln Phe Pro Gly
35 40 45 35 40 45
Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Asp Val Ser Glu Lys
50 55 60 50 55 60
Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Ser Ala Lys Gln Phe
65 70 75 80 65 70 75 80
Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Thr Tyr Phe
85 90 95 85 90 95
Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Thr Leu Gly Arg Leu
100 105 110 100 105 110
Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Pro Asn Ile Gln Asn
115 120 125 115 120 125
Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Arg Ser Gln Asp Ser
130 135 140 130 135 140
Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Ile Asn Val Pro Lys
145 150 155 160 145 150 155 160
Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Cys Val Leu Asp Met Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Cys Val Leu Asp Met
165 170 175 165 170 175
Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Ala Trp Ser Asn Gln
180 185 190 180 185 190
Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Thr Asn Ala Thr Tyr
195 200 205 195 200 205
Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Glu Lys Ser Phe
210 215 220 210 215 220
Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Leu Val Ile Val Leu Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Leu Val Ile Val Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu
245 250 255 245 250 255
Arg Leu Trp Ser Ser Arg Leu Trp Ser Ser
260 260
<210> 66<210> 66
<211> 286<211> 286
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 66<400> 66
Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln Gly Val Thr Gln Thr Pro Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Ser Trp Val Thr Leu Ser Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Ser Trp
20 25 30 20 25 30
Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Tyr Phe Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Tyr Phe
35 40 45 35 40 45
Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Ser Gly Ser Glu Thr Gln Arg Asn Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Leu Glu Arg Gln Phe Ser Asn Ser Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Leu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly
85 90 95 85 90 95
Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val
100 105 110 100 105 110
Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu Leu Glu Asp Leu Arg Asn Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu
115 120 125 115 120 125
Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Pro Ser Lys Ala Glu Ile Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys
130 135 140 130 135 140
Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Leu Ala Arg Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Ala Tyr Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Ala Tyr
165 170 175 165 170 175
Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser
180 185 190 180 185 190
Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Ala Thr Phe Trp His Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln
195 200 205 195 200 205
Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys Phe His Gly Leu Ser Glu Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys
210 215 220 210 215 220
Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Pro Val Thr Gln Asn Ile Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys
225 230 235 240 225 230 235 240
Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Gly Ile Thr Ser Ala Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile
245 250 255 245 250 255
Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val
260 265 270 260 265 270
Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser Ser Thr Leu Val Val Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser
275 280 285 275 280 285
<210> 67<210> 67
<211> 616<211> 616
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Синтетический<223> Synthetic
<400> 67<400> 67
Met Ala Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu Met Ala Lys Ile Leu Gly Ala Ser Phe Leu Val Leu Trp Leu Gln Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val Cys Trp Val Ser Gly Gln Gln Lys Glu Lys Ser Asp Gln Gln Gln Val
20 25 30 20 25 30
Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile Lys Gln Ser Pro Gln Ser Leu Ile Val Gln Lys Gly Gly Ile Ser Ile
35 40 45 35 40 45
Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr Ile Asn Cys Ala Tyr Glu Asn Thr Ala Phe Asp Tyr Phe Pro Trp Tyr
50 55 60 50 55 60
Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro Gln Gln Phe Pro Gly Lys Gly Pro Ala Leu Leu Ile Ala Ile Arg Pro
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys Asp Val Ser Glu Lys Lys Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Phe Asn Lys
85 90 95 85 90 95
Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp Ser Ala Lys Gln Phe Ser Leu His Ile Met Asp Ser Gln Pro Gly Asp
100 105 110 100 105 110
Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser Ser Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Ala Glu Ala Gly Asn His Arg Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp Thr Leu Gly Arg Leu Tyr Phe Gly Arg Gly Thr Gln Leu Thr Val Trp
130 135 140 130 135 140
Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro Pro Asn Ile Gln Asn Pro Glu Pro Ala Val Tyr Gln Leu Lys Asp Pro
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Arg Ser Gln Asp Ser Thr Leu Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln
165 170 175 165 170 175
Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys Ile Asn Val Pro Lys Thr Met Glu Ser Gly Thr Phe Ile Thr Asp Lys
180 185 190 180 185 190
Cys Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile Cys Val Leu Asp Met Lys Ala Met Asp Ser Lys Ser Asn Gly Ala Ile
195 200 205 195 200 205
Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu Ala Trp Ser Asn Gln Thr Ser Phe Thr Cys Gln Asp Ile Phe Lys Glu
210 215 220 210 215 220
Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu Thr Asn Ala Thr Tyr Pro Ser Ser Asp Val Pro Cys Asp Ala Thr Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Thr Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Met Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu
245 250 255 245 250 255
Leu Val Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Val Ile Val Leu Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn
260 265 270 260 265 270
Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Arg Ala Lys Arg Ser Gly Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser Arg Ala Lys Arg Ser Gly
275 280 285 275 280 285
Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu
290 295 300 290 295 300
Glu Asn Pro Gly Pro Met Gly Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu Glu Asn Pro Gly Pro Met Gly Ser Arg Leu Leu Cys Trp Val Leu Leu
305 310 315 320 305 310 315 320
Cys Leu Leu Gly Ala Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Cys Leu Leu Gly Ala Gly Pro Val Lys Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro
325 330 335 325 330 335
Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser Arg Tyr Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Ser Cys Ser
340 345 350 340 345 350
Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly Pro Ile Ser Gly His Arg Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln Thr Pro Gly
355 360 365 355 360 365
Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn Gln Gly Leu Gln Phe Leu Phe Glu Tyr Phe Ser Glu Thr Gln Arg Asn
370 375 380 370 375 380
Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser Lys Gly Asn Phe Pro Gly Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Ser Asn Ser
385 390 395 400 385 390 395 400
Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Arg Ser Glu Met Asn Val Ser Thr Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu
405 410 415 405 410 415
Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Ala Ala Gly Gly Tyr Phe Asn Glu Gln
420 425 430 420 425 430
Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn Phe Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Thr Val Leu Glu Asp Leu Arg Asn
435 440 445 435 440 445
Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile Val Thr Pro Pro Lys Val Ser Leu Phe Glu Pro Ser Lys Ala Glu Ile
450 455 460 450 455 460
Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe Ala Asn Lys Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ala Arg Gly Phe Phe
465 470 475 480 465 470 475 480
Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His
485 490 495 485 490 495
Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Ala Tyr Lys Glu Ser Asn Tyr Ser
500 505 510 500 505 510
Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp His Asn
515 520 525 515 520 525
Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu Pro Arg Asn His Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe His Gly Leu Ser Glu
530 535 540 530 535 540
Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile Glu Asp Lys Trp Pro Glu Gly Ser Pro Lys Pro Val Thr Gln Asn Ile
545 550 555 560 545 550 555 560
Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly Ile Thr Ser Ala Ser
565 570 575 565 570 575
Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu
580 585 590 580 585 590
Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Thr Leu Val Val Met
595 600 605 595 600 605
Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser Ala Met Val Lys Arg Lys Asn Ser
610 615 610 615
<---<---
Claims (229)
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US62/975,544 | 2020-02-12 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2849866C1 true RU2849866C1 (en) | 2025-10-30 |
Family
ID=
Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN108395479A (en) * | 2017-02-06 | 2018-08-14 | 高军 | A kind of T cell receptor in relation to KRAS gene mutation |
| WO2019112941A1 (en) * | 2017-12-04 | 2019-06-13 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Hla class i-restricted t cell receptors against mutated ras |
Patent Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN108395479A (en) * | 2017-02-06 | 2018-08-14 | 高军 | A kind of T cell receptor in relation to KRAS gene mutation |
| WO2019112941A1 (en) * | 2017-12-04 | 2019-06-13 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Hla class i-restricted t cell receptors against mutated ras |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| В. А. Горбунова, Данные исследований при КRAS- и RAS-немутированном (диком) типе колоректального рака, Онкологическая колопроктология, 2015, т. 5, no. 1, стр. 26-36. * |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP7620676B2 (en) | HLA class I restricted T cell receptor for mutant RAS | |
| US20230080742A1 (en) | Hla class i-restricted t cell receptors against ras with g12d mutation | |
| US20230159614A1 (en) | Hla class ii-restricted t cell receptors against ras with g12v mutation | |
| JP2025114614A (en) | HLA class II-restricted T cell receptor for RAS with G12R mutation | |
| US20230272038A1 (en) | Hla class ii-restricted drb t cell receptors against ras with g12d mutation | |
| US20230365649A1 (en) | Hla class ii-restricted dq t cell receptors against ras with g13d mutation | |
| US20230257440A1 (en) | Hla class ii-restricted drb t cell receptors against ras with g12v mutation | |
| RU2849866C1 (en) | T-cell receptors, restricted by hla class i, against ras with mutation g12d | |
| TWI900528B (en) | Hla class i-restricted t cell receptors against ras with g12d mutation | |
| US20240190940A1 (en) | Hla class i-restricted t cell receptors against ras with q61k mutation | |
| TWI902755B (en) | Hla class i-restricted t cell receptors against ras with g12v mutation | |
| TW202140535A (en) | Hla class i-restricted t cell receptors against ras with g12v mutation |