[go: up one dir, main page]

RU2844751C1 - Средство генной терапии на основе csrp3 (богатого цистеином и глицином белка 3) - Google Patents

Средство генной терапии на основе csrp3 (богатого цистеином и глицином белка 3)

Info

Publication number
RU2844751C1
RU2844751C1 RU2023104389A RU2023104389A RU2844751C1 RU 2844751 C1 RU2844751 C1 RU 2844751C1 RU 2023104389 A RU2023104389 A RU 2023104389A RU 2023104389 A RU2023104389 A RU 2023104389A RU 2844751 C1 RU2844751 C1 RU 2844751C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
gly
polynucleotide
ser
pro
asn
Prior art date
Application number
RU2023104389A
Other languages
English (en)
Inventor
Кристофер Дин ХЕРЦОГ
Честер Биттенкорт САКРАМЕНТО
Радж ПРАБХАКАР
Дэвид Рикс
Original Assignee
Спейскрафт Севен, Ллк
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Спейскрафт Севен, Ллк filed Critical Спейскрафт Севен, Ллк
Application granted granted Critical
Publication of RU2844751C1 publication Critical patent/RU2844751C1/ru

Links

Abstract

Настоящее изобретение относится к области биотехнологии и может быть использовано в медицине. Изобретение раскрывает генетическую конструкцию, способную увеличивать экспрессию мышечного белка LIM (MLP), содержащую кодирующий данный белок полинуклеотид, функционально связанную с промотором, специфичным для клеток миокарда, например MHCK7 или HTNNT2. Изобретение применимо в генной терапии заболеваний, связанных с дефицитом белка CSRP3 вследствие дефектов в кодирующем его гене, например, при сердечной недостаточности, различных видах кардиомиопатии и др. 7 н. и 63 з.п. ф-лы, 5 ил., 6 табл., 5 пр.

Description

ПЕРЕКРЕСТНАЯ ССЫЛКА НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИ
Настоящая заявка испрашивает приоритет на основании заявки на патент США № 63/061727, поданной 5 августа 2020 года, содержание которой включено в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.
ЗАЯВЛЕНИЕ ОТНОСИТЕЛЬНО ПЕРЕЧНЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
Перечень последовательностей, связанный с настоящей заявкой, представлен в текстовом формате вместо бумажной копии и включен посредством ссылки в описание в данном документе. Текстовый файл, содержащий перечень последовательностей, имеет следующее название: ROPA_020_01WO_ST25.txt. Текстовый файл имеет размер приблизительно 120 КБ, создан 3 августа 2021 года и подан в электронном виде через EFS-Web.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
Ген богатого цистеином и глицином белка 3 (CSRP3) кодирует мышечный белок LIM (MLP). Генетические дефекты в CSRP3 ассоциированы с аутосомно-доминантной кардиомиопатией, как гипертрофической кардиомиопатией (HCM), так и дилатационной кардиомиопатией (DCM), поскольку аутосомно-доминантные мутации в разных доменах белка связаны с разными фенотипами. Мутации с утратой функции, которые снижают уровни MLP, могут вызывать неправильную локализацию белка и опосредованную протеасомами деградацию, что приводит к нарушению нормальных сигнальных путей в сердечной и скелетной мышцах. Изменения уровней или внутриклеточной локализации MLP также связаны со скелетными миопатиями, в том числе плече-лопаточно-лицевой мышечной дистрофией, немалиновой миопатией и поясно-конечностной мышечной дистрофией типа 2В. У больных поясно-конечностной мышечной дистрофией типа 2А, мышечной дистрофией Дюшенна и дерматомиозитом были выявлены изменения уровней изоформы белка MLP-b или нарушение регуляции соотношения MLP:MLP-b.
У пациентов с CSRP3 проявляются различные симптомы в зависимости от конкретной мутации, но общие симптомы включают обструктивную HCM или DCM, гипертрофию желудочков (с межжелудочковой перегородкой в диапазоне 14—32 мм), желудочковую тахикардию, непереносимость физической нагрузки, стенокардию. Обычно имеют место умеренные оценки в баллах I-II по шкале NYHA (Нью-Йоркской кардиологической ассоциации). Внезапная сердечная смерть была отмечена, например, в семье, несущей мутацию C58G. В одном исследовании большинство носителей C58G, которым проводили биопсии мышц, при поступлении жаловались на миалгии и судороги при физической нагрузке.
Существует неудовлетворенная потребность в терапии связанных с CSRP3 заболеваний или нарушений. В данном документе представлено решение данной потребности с помощью средств генной терапии.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Настоящее изобретение в целом относится к средству генной терапии заболевания или нарушения, например сердечного заболевания или нарушения, с применением вектора, экспрессирующего MLP или его функциональный вариант.
В одном аспекте в настоящем изобретении предусмотрен полинуклеотид, содержащий кассету экспрессии и необязательно фланкирующие инвертированные концевые повторы (ITR) аденоассоциированного вируса (AAV), где полинуклеотид содержит полинуклеотидную последовательность, кодирующую мышечный белок LIM (MLP) или его функциональный вариант, функционально связанный с промотором.
В некоторых вариантах осуществления промотор представляет собой специфичный для сердца промотор.
В некоторых вариантах осуществления промотор представляет собой специфичный для мышц промотор.
В некоторых вариантах осуществления промотор представляет собой специфичный для кардиомиоцитов промотор.
В некоторых вариантах осуществления промотор представляет собой промотор MHCK7.
В некоторых вариантах осуществления промотор MHCK7 характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 31.
В некоторых вариантах осуществления промотор представляет собой промотор сердечного тропонина T (hTNNT2).
В некоторых вариантах осуществления промотор hTNNT2 характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 32.
В некоторых вариантах осуществления кассета экспрессии содержит экзон 1 гена сердечного тропонина Т (hTNNT2), где необязательно промотор hTNNT2 и экзон 1 совместно характеризуются по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 32.
В некоторых вариантах осуществления промотор представляет собой убиквитарный промотор, необязательно промотор CMV или промотор CAG.
В некоторых вариантах осуществления кассета экспрессии содержит полиА-сигнал.
В некоторых вариантах осуществления полиА-сигнал представляет собой полиА гормона роста человека (hGH).
В некоторых вариантах осуществления кассета экспрессии содержит посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита сурка (WPRE), необязательно WPRE(x).
В некоторых вариантах осуществления мышечный белок LIM (MLP) или его функциональный вариант представляет собой MLP.
В некоторых вариантах осуществления MLP представляет собой MLP человека.
В некоторых вариантах осуществления MLP представляет собой изоформу А MLP.
В некоторых вариантах осуществления MLP характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 1.
В некоторых вариантах осуществления MLP представляет собой изоформу B MLP.
В некоторых вариантах осуществления MLP характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 2.
В некоторых вариантах осуществления MLP характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 3.
В некоторых вариантах осуществления MLP характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 4.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотидная последовательность, кодирующая MLP, представляет собой полинуклеотид богатого цистеином и глицином белка 3 (CSRP3).
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид CSRP3 представляет собой полинуклеотид CSRP3 человека.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотидная последовательность, кодирующая MLP, характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 5.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотидная последовательность, кодирующая MLP, характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 7.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид содержит по меньшей мере приблизительно 2,4 т. о., не более чем приблизительно 2,6 т. о. или от приблизительно 2,4 т. о. до приблизительно 2,6 т. о.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид содержит по меньшей мере приблизительно 3,0 т. о., не более чем приблизительно 3,3 т. о. или от приблизительно 3,0 т. о. до приблизительно 3,3 т. о.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид содержит по меньшей мере приблизительно 2,4 т. о., по меньшей мере приблизительно 2,6 т. о., по меньшей мере приблизительно 3,0 т. о., по меньшей мере приблизительно 3,3 т. о., по меньшей мере приблизительно 3,5 т. о., по меньшей мере приблизительно 3,7 т. о., по меньшей мере приблизительно 3,9 т. о., по меньшей мере приблизительно 4,1 т. о. или по меньшей мере приблизительно 4,3 т. о.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид содержит по меньшей мере приблизительно 2,6 т. о., по меньшей мере приблизительно 3,0 т. о., не более чем приблизительно 3,3 т. о., не более чем приблизительно 3,5 т. о., не более чем приблизительно 3,7 т. о., не более чем приблизительно 3,9 т. о., не более приблизительно 4,1 т. о., не более чем приблизительно 4,3 т. о. или не более чем приблизительно 4,5 т. о.
В некоторых вариантах осуществления кассета экспрессии характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 8-11.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 12-15.
В некоторых вариантах осуществления кассета экспрессии фланкирована 5′- и 3′-инвертированными концевыми повторами (ITR), необязательно ITR из AAV2, необязательно ITR, которые характеризуются по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 20-26.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид является самокомплементарным.
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид содержит кассету экспрессии и последовательность, обратно комплементарную кассете экспрессии.
В некоторых вариантах осуществления кассета экспрессии и последовательность, обратно комплементарная кассете экспрессии, фланкированы 5′- и 3′-инвертированными концевыми повторами (ITR), необязательно ITR из AAV2, необязательно ITR, которые характеризуются по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 23 или SEQ ID NO: 26.
В другом аспекте в настоящем изобретении предусмотрен вектор генной терапии, содержащий полинуклеотид по настоящему изобретению.
В некоторых вариантах осуществления вектор генной терапии представляет собой рекомбинантный вектор на основе аденоассоциированного вируса (rAAV).
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV представляет собой AAV9 или его функциональный вариант.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV содержит капсидный белок, который характеризуется 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 77.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV представляет собой AAVrh10 или его функциональный вариант.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV содержит капсидный белок, который характеризуется 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 79.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV представляет собой AAV6 или его функциональный вариант.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV содержит капсидный белок, который характеризуется 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 78.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV представляет собой AAVrh74 или его функциональный вариант.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV содержит капсидный белок, который характеризуется 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 80.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV представляет собой самокомплементарный вектор на основе AAV.
В другом аспекте в настоящем изобретением предусмотрен способ лечения и/или предупреждения заболевания или нарушения у нуждающегося в этом субъекта, предусматривающий введение субъекту вектора по настоящему изобретению.
В некоторых вариантах осуществления заболевание или нарушение представляет собой нарушение сердечной деятельности.
В некоторых вариантах осуществления заболевание или нарушение представляет собой сердечную недостаточность.
В некоторых вариантах осуществления заболевание или нарушение представляет собой гипертрофическую кардиомиопатию.
В некоторых вариантах осуществления заболевание или нарушение представляет собой дилатационную кардиомиопатию.
В некоторых вариантах осуществления субъектом является млекопитающее.
В некоторых вариантах осуществления субъектом является примат.
В некоторых вариантах осуществления субъектом является человек.
В некоторых вариантах осуществления субъект имеет мутацию в гене CSRP3, которая обуславливает аминокислотную замену, выбранную из C58G, L44P, S54R, E55G и/или K69R, относительно CSRP3 человека, кодирующего MLP человека, имеющий последовательность под SEQ ID NO: 1.
В некоторых вариантах осуществления вектор вводят посредством внутривенной инъекции, внутрисердечной инъекции, внутрисердечной инфузии и/или катетеризации сердца.
В некоторых вариантах осуществления введение увеличивает экспрессию MLP на по меньшей мере приблизительно 5%.
В некоторых вариантах осуществления введение увеличивает экспрессию MLP на по меньшей мере приблизительно 30%.
В некоторых вариантах осуществления введение увеличивает экспрессию MLP на по меньшей мере приблизительно 70%.
В некоторых вариантах осуществления введение увеличивает экспрессию MLP на величину от приблизительно 5% до приблизительно 10%.
В некоторых вариантах осуществления введение увеличивает экспрессию MLP на величину от приблизительно 30% до приблизительно 50%.
В некоторых вариантах осуществления введение увеличивает экспрессию MLP на величину от приблизительно 70% до приблизительно 100%.
В некоторых вариантах осуществления способ позволяет лечить и/или предупреждать заболевание или нарушение.
В другом аспекте в настоящем изобретении предусмотрена фармацевтическая композиция, содержащая вектор по настоящему изобретению.
В другом аспекте в настоящем изобретении предусмотрен набор, содержащий вектор или фармацевтическую композицию по настоящему изобретению и необязательно инструкции по применению.
В другом аспекте в настоящем изобретении предусмотрено применение композиции по настоящему изобретению при лечении заболевания или нарушения, необязательно, в соответствии с любым из раскрытых в данном документе способов.
В другом аспекте в настоящем изобретении предусмотрена композиция по настоящему изобретению для применения при лечении заболевания или нарушения, необязательно в соответствии с любым из способов, раскрытых в данном документе.
В другом аспекте в настоящем изобретении предусмотрен способ экспрессии мышечного белка LIM (MLP) или его функционального варианта, предусматривающий приведение клетки в контакт с вектором по настоящему изобретению.
В некоторых вариантах осуществления клетка представляет собой кардиомиоцит.
В некоторых вариантах осуществления кардиомиоцит представляет собой кардиомиоцит человека.
В некоторых вариантах осуществления промотор представляет собой промотор MHCK7, и где уровень экспрессии MLP по меньшей мере в 2 раза превышает уровень экспрессии MLP в клетке, трансдуцированной вектором с промотором hTNNT2.
В некоторых вариантах осуществления промотор представляет собой промотор MHCK7, и где уровень экспрессии MLP в 2-10 раз превышает уровень экспрессии MLP в клетке, трансдуцированной вектором с промотором hTNNT2.
В нижеследующем подробном описании раскрыты различные другие аспекты и варианты осуществления. Настоящее изобретение ограничено исключительно прилагаемой формулой изобретения.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ
На фиг. 1 представлена векторная диаграмма неограничивающего примера векторного генома. Полная полинуклеотидная последовательность векторного генома представлена под SEQ ID NO: 12. Заглавная часть представляет собой кассету экспрессии (SEQ ID NO: 8).
На фиг. 2 представлена векторная диаграмма неограничивающего примера векторного генома. Полная полинуклеотидная последовательность векторного генома представлена под SEQ ID NO: 13. Заглавная часть представляет собой кассету экспрессии (SEQ ID NO: 9).
На фиг. 3 представлена векторная диаграмма неограничивающего примера векторного генома. Полная полинуклеотидная последовательность векторного генома представлена под SEQ ID NO: 14. Заглавная часть представляет собой кассету экспрессии (SEQ ID NO: 10).
На фиг. 4 представлена векторная диаграмма неограничивающего примера векторного генома. Полная полинуклеотидная последовательность векторного генома представлена под SEQ ID NO: 15. Заглавная часть представляет собой кассету экспрессии (SEQ ID NO: 11).
На фиг. 5А представлена экспрессия CSRP3 в трансдуцированных CHO-Lec2.
На фиг. 5B представлена экспрессия CSRP3 в трансдуцированных кардиомиоцитах (линия дифференцированных клеток AC16 — Sigma-Aldrich®, № по кат. SCC109). Клетки трансдуцировали посредством MOI 3E5 из каждого вектора; спустя 6 суток собирали клеточные лизаты и проводили вестерн-блоттинг с применением поликлонального антитела к CSRP3 (Thermo-Fisher® PA5-29155 1:1000).
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ НАСТОЯЩЕГО ИЗОБРЕТЕНИЯ
В настоящем изобретении предусмотрены векторы генной терапии для CSPRP3, которые доставляют полинуклеотид, кодирующий MLP, а также способ применения и другие композиции и способы. Лечение связанного с CSPRP3 нарушения осложняется аутосомно-доминантным характером большинства форм связанных с CSPRP3 нарушений и факторами, свидетельствующими о том, что уровень экспрессии белка и баланс между изоформами MLP имеют решающее значение для нормальной функции у здоровых субъектов. Более того, успешность генной терапии сердца нельзя спрогнозировать. Кардиомиоциты являются особенно сложным типом клеток при использовании генной терапии. Раскрытые в данном документе композиции и способы позволяют решить данную проблему.
Определения
Заголовки разделов предназначены только для организационных целей и не должны истолковываться как ограничивающие описываемый предмет изобретения конкретными аспектами или вариантами осуществления.
Если не указано иное, все используемые в данном документе технические и научные термины имеют то же значение, которое обычно понимается специалистом в области техники, к которой относится настоящее изобретение. Ниже описаны подходящие способы и материалы, хотя при осуществлении настоящего изобретения на практике можно применять способы и материалы, схожие или эквивалентные описанным в данном документе. Все публикации, патентные заявки, патенты и другие источники, упомянутые в данном документе, прямо включены посредством ссылки во всей своей полноте. В случаях спора настоящее описание, в том числе определения, будет иметь преимущественную силу. Кроме того, описанные в данном документе материалы, способы и примеры носят исключительно иллюстративный характер и не предназначены для ограничения.
Все упомянутые в данном документе публикации и патенты во всей своей полноте включены в данный документ посредством ссылки, как если бы каждая отдельная публикация или патент были специально и отдельно указаны как включенные посредством ссылки. В случае спора данная заявка, в том числе любые приведенные в данном документе определения, будет иметь преимущественную силу. Тем не менее, упоминание любого литературного источника, статьи, публикации, патента, патентной публикации и патентной заявки, цитируемых в данном документе, не является и не должно восприниматься как признание или любая форма предположения о том, что они представляют собой действительный предшествующий уровень техники или являются частью общего знания в любой стране мира.
В настоящем описании любой диапазон концентраций, процентный диапазон, диапазон соотношений или диапазон целых чисел следует понимать как включающий значение любого целого числа в указанном диапазоне и, при необходимости, его долей (например, одну десятую и одну сотую доли целого числа), если не указано иное. Термин «приблизительно», когда он непосредственно предшествует числу или цифре, означает, что данное число или данная цифра находится в диапазоне плюс или минус 10%. Следует понимать, что используемые в данном документе термины в форме единственного числа относятся к «одному или нескольким» из перечисленных компонентов, если не указано иное. Использование альтернативы (например, «или») следует понимать как означающее либо одну, либо обе, либо любую комбинацию альтернатив. Термин «и/или» следует понимать как означающий либо одну, либо обе альтернативы. Используемые в данном документе термины «включать» и «содержать» используют как синонимы.
Используемые в данном документе термины «идентичность» и «идентичный» относятся в части полипептидной или полинуклеотидной последовательности к проценту точно совпадающих остатков в результатах выравнивания такой «запрашиваемой» последовательности с «рассматриваемой» последовательностью, таких как результаты выравнивания, полученные с помощью алгоритма BLAST. Идентичность вычисляют, если не указано иное, по всей длине рассматриваемой последовательности. Таким образом, запрашиваемая последовательность «характеризуется по меньшей мере x% идентичностью» с рассматриваемой последовательностью, если при выравнивании запрашиваемой последовательности с рассматриваемой последовательностью по меньшей мере x% (округленных в меньшую сторону) остатков в рассматриваемой последовательности выровнены как точное совпадение с соответствующим остатком в запрашиваемой последовательности. Если рассматриваемая последовательность имеет варьируемые положения (например, остатки, обозначенные X), совпадением считают выравнивание с любым остатком в запрашиваемой последовательности.
Используемый в данном документе термин «вектор на основе AAV» или «вектор на основе rAAV» относится к рекомбинантному вектору, содержащему один или несколько представляющих интерес полинуклеотидов (или трансгенов), которые фланкированы последовательностями концевых повторов AAV (ITR). Такие векторы на основе AAV могут быть реплицированы и упакованы в инфекционные вирусные частицы, если они присутствуют в клетке-хозяине, которая была трансфицирована плазмидой, кодирующей и экспрессирующей продукты генов rep и cap. Альтернативно, векторы на основе AAV могут быть упакованы в инфекционные частицы с помощью клетки-хозяина, которая была стабильно сконструирована для экспрессии генов rep и cap.
Используемый в данном документе термин «вирион AAV», или «вирусная частица AAV», или «векторная частица AAV» относится к вирусной частице, состоящей по меньшей мере из одного капсидного белка AAV и инкапсулированного полинуклеотидного вектора на основе AAV. В контексте данного документа, если частица содержит гетерологичный полинуклеотид (т. е. полинуклеотид, отличный от генома AAV дикого типа, такой как трансген, подлежащий доставке в клетку млекопитающего), ее обычно называют «векторной частицей AAV» или просто «вектором на основе AAV». Таким образом, получение векторной частицы AAV обязательно включает получение вектора на основе AAV, поскольку такой вектор содержится внутри векторной частицы AAV.
Используемый в данном документе термин «промотор» относится к полинуклеотидной последовательности, способной стимулировать инициацию транскрипции РНК с полинуклеотида в эукариотической клетке.
Используемый в данном документе термин «векторный геном» относится к полинуклеотидной последовательности, упакованной вектором (например, вирионом rAAV), включающей фланкирующие последовательности (в AAV — инвертированные концевые повторы). Термины «кассета экспрессии» и «полинуклеотидная кассета» относятся к части векторного генома между фланкирующими последовательностями ITR. «Кассета экспрессии» подразумевает, что векторный геном содержит по меньшей мере один ген, кодирующий генный продукт, функционально связанный с элементом, управляющим экспрессией (например, промотором).
Используемый в данном документе термин «нуждающийся пациент» или «нуждающийся субъект» относится к пациенту или субъекту, подверженному риску развития или страдающему от заболевания, нарушения или патологического состояния, которое поддается лечению или облегчению с помощью рекомбинантного вектора генной терапии или системы редактирования генов, раскрытых в данном документе. Нуждающийся пациент или субъект может, например, быть пациентом или субъектом, у которого диагностировано ассоциированное с сердцем нарушение. У субъекта может быть мутация в гене CSRP3 или делеция всего или части гена CSRP3 или регуляторных последовательностей гена, что вызывает аберрантную экспрессию белка MLP. Термины «субъект» и «пациент» используют в данном документе взаимозаменяемо. Субъект, которого лечат описанными в данном документе способами, может быть взрослым или ребенком. Субъекты могут различаться по возрасту.
Используемый в данном документе термин «вариант» или «функциональный вариант» относится взаимозаменяемо к белку, который имеет одну или несколько аминокислотных замен, вставок или делеций по сравнению с исходным белком, который сохраняет одну или несколько требуемых активностей исходного белка.
Используемый в данном документе термин «генетическое нарушение» относится к частичной или полной утрате функции или аберрантной активности гена. Например, субъект может страдать от генетического нарушения экспрессии или функции гена CSRP3, которое снижает экспрессию или приводит к утрате или аберрантной функции белка MLP по меньшей мере в некоторых клетках (например, клетках сердца) субъекта.
Используемый в данном документе термин «лечение» относится к облегчению одного или нескольких симптомов заболевания или нарушения. Термин «предупреждение» относится к задержке или прерыванию проявления одного или нескольких симптомов заболевания или нарушения или к замедлению прогрессирования связанного с CSRP3 заболевания или нарушения, например, гипертрофической кардиомиопатии (HCM), дилатационной кардиомиопатии (DCM) или скелетной миопатии.
[100]
Белок MLP или полинуклеотид
В настоящем изобретении предусмотрены композиции и способы применения, относящиеся к молекуле мышечного белка LIM (MLP). Известно, что с гипертрофической кардиомиопатией (HCM) или дилатационной кардиомиопатией (DCM) связаны различные мутации в CSRP3. Были обнаружены как наследственные, так и de novo мутации. В некоторых случаях гетерозиготной миссенс-мутации достаточно для того, чтобы вызвать заболевание.
Полипептидная последовательность MLP выглядит следующим образом:
MPNWGGGAKCGACEKTVYHAEEIQCNGRSFHKTCFHCMACRKALDSTTVAAHESEIYCKVCYGRRYGPKGIGYGQGAGCLSTDTGEHLGLQFQQSPKPARSVTTSNPSKFTAKFGESEKCPRCGKSVYAAEKVMGGGKPWHKTCFRCAICGKSLESTNVTDKDGELYCKVCYAKNFGPTGIGFGGLTQQVEKKE
(SEQ ID NO: 1).
Вторая изоформа MLP имеет следующую полипептидную последовательность: MPNWGGGAKCGACEKTVYHAEEIQCNGRSFHKTCFHCSPQSRHAQLPPATLPNSLRSLESPRSALDVASQSMLLRRLWEVASLGTRPVSAVPSVGRVWSPQMSLTKMGNFIAKFAMPKILAPRVLGLEALHNKWKRKNEEVRRFSDFLRA
(SEQ ID NO: 2).
Другая изоформа MLP имеет следующую полипептидную последовательность:
MPNWGGGAKCGACEKTVYHAEEIQCNGRSFHKTCFHCLC
(SEQ ID NO: 3).
Другая изоформа MLP имеет следующую полипептидную последовательность:
MPNWGGGAKCGACEKTVYHAEEIQCNGRSFHKTCFHCTLAQDLFPLCHLWEESGVHKC
(SEQ ID NO: 4).
В некоторых вариантах осуществления белок MLP содержит полипептидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична любой из SEQ ID NO: 1-4.
В некоторых вариантах осуществления настоящим изобретением предусмотрен вирион рекомбинантного аденоассоциированного вируса (rAAV), содержащий капсид и векторный геном, где векторный геном содержит полинуклеотидную последовательность, кодирующую MLP или его функциональный вариант, функционально связанную с промотором. В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрен вирион рекомбинантного аденоассоциированного вируса (rAAV), содержащий капсид и векторный геном, где векторный геном содержит полинуклеотидную последовательность, кодирующую MLP, функционально связанную с промотором. Полинуклеотид, кодирующий MLP, может содержать полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична
ATGCCAAACTGGGGCGGAGGCGCAAAATGTGGAGCCTGTGAAAAGACCGTCTACCATGCAGAAGAAATCCAGTGCAATGGAAGGAGTTTCCACAAGACGTGTTTCCACTGCATGGCCTGCAGGAAGGCTCTTGACAGCACGACAGTCGCGGCTCATGAGTCGGAGATCTACTGCAAGGTGTGCTATGGGCGCAGATATGGCCCCAAAGGGATCGGGTATGGACAAGGCGCTGGCTGTCTCAGCACAGACACGGGCGAGCATCTCGGCCTGCAGTTCCAACAGTCCCCAAAGCCGGCACGCTCAGTTACCACCAGCAACCCTTCCAAATTCACTGCGAAGTTTGGAGAGTCCGAGAAGTGCCCTCGATGTGGCAAGTCAGTCTATGCTGCTGAGAAGGTTATGGGAGGTGGCAAGCCTTGGCACAAGACCTGTTTCCGCTGTGCCATCTGTGGGAAGAGTCTGGAGTCCACAAATGTCACTGACAAAGATGGGGAACTTTATTGCAAAGTTTGCTATGCCAAAAATTTTGGCCCCACGGGTATTGGGTTTGGAGGCCTTACACAACAAGTGGAAAAGAAAGAA
(SEQ ID NO: 5).
Необязательно полинуклеотидная последовательность, кодирующая векторный геном, может содержать последовательность Козак, в том числе без ограничения GCCACCATGG (SEQ ID NO: 6). Последовательность Козак может перекрываться с полинуклеотидной последовательностью, кодирующей белок MLP или его функциональный вариант. Например, векторный геном может содержать полинуклеотидную последовательность (с подчеркнутой последовательностью Козак), которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична
gccaccATGCCAAACTGGGGCGGAGGCGCAAAATGTGGAGCCTGTGAAAAGACCGTCTACCATGCAGAAGAAATCCAGTGCAATGGAAGGAGTTTCCACAAGACGTGTTTCCACTGCATGGCCTGCAGGAAGGCTCTTGACAGCACGACAGTCGCGGCTCATGAGTCGGAGATCTACTGCAAGGTGTGCTATGGGCGCAGATATGGCCCCAAAGGGATCGGGTATGGACAAGGCGCTGGCTGTCTCAGCACAGACACGGGCGAGCATCTCGGCCTGCAGTTCCAACAGTCCCCAAAGCCGGCACGCTCAGTTACCACCAGCAACCCTTCCAAATTCACTGCGAAGTTTGGAGAGTCCGAGAAGTGCCCTCGATGTGGCAAGTCAGTCTATGCTGCTGAGAAGGTTATGGGAGGTGGCAAGCCTTGGCACAAGACCTGTTTCCGCTGTGCCATCTGTGGGAAGAGTCTGGAGTCCACAAATGTCACTGACAAAGATGGGGAACTTTATTGCAAAGTTTGCTATGCCAAAAATTTTGGCCCCACGGGTATTGGGTTTGGAGGCCTTACACAACAAGTGGAAAAGAAAGAA
(SEQ ID NO: 7).
В некоторых вариантах осуществления последовательность Козак представляет собой альтернативную последовательность Козак, содержащую или состоящую из любой из следующих:
(gcc)gccRccAUGG (SEQ ID NO: 16);
(gcc)gccRccAUGC (SEQ ID NO: 17);
AGNNAUGN;
ANNAUGG;
ANNAUGC;
ACCAUGG;
ACCAUGC;
GACACCAUGG (SEQ ID NO: 18) и
GACACCAUGC (SEQ ID NO: 19).
В некоторых вариантах осуществления векторный геном не содержит последовательности Козак.
Векторный геном
Вирионы AAV по настоящему изобретению содержат векторный геном. Векторный геном может содержать кассету экспрессии (или полинуклеотидную кассету для задач по редактированию генов без потребности в экспрессии полинуклеотидной последовательности). Можно применять любые подходящие инвертированные концевые повторы (ITR). ITR могут относиться к тому же серотипу, что и капсид, или к другому серотипу (например, можно применять ITR из AAV2).
В некоторых вариантах осуществления 5' ITR содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична
CCTGCAGGCAGCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCT
(SEQ ID NO: 20).
В некоторых вариантах осуществления 5' ITR содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична
GCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTTGTAGTTAATGATTAACCCGCCATGCTACTTATCTACGTA
(SEQ ID NO: 21).
В некоторых вариантах осуществления 5' ITR содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична
CTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTTGTAGTTAATGATTAACCCGCCATGCTACTTATCTACGTA
(SEQ ID NO: 22).
В некоторых вариантах осуществления 5' ITR содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична
Ttggccactccctctctgcgcgctcgctcgctcactgaggccgcccgggcaaagcccgggcgtcgggcgacctttggtcgcccggcctcagtgagcgagcgagcgcgcagagagggagtggccaactccatcactaggggttcct
(SEQ ID NO: 23).
В некоторых вариантах осуществления 3' ITR содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична
AGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGCTGCCTGCAGG
(SEQ ID NO: 24).
В некоторых вариантах осуществления 3' ITR содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична
TACGTAGATAAGTAGCATGGCGGGTTAATCATTAACTACAAGGAACCCCTAGTGATGGAGTTGGCCACTCCCTCTCTGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGGGCGACCAAAGGTCGCCCGACGCCCGGGCTTTGCCCGGGCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGC
(SEQ ID NO: 25).
В некоторых вариантах осуществления 3' ITR содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична
aggaacccctagtgatggagactccctctctgcgcgctcgctcgctcactgaggccgggcgaccaaaggtcgcccgacgcccgggctttgcccgggcggcctcagtgagcgagcgagcgcgcagagagggagt
(SEQ ID NO: 26).
В некоторых вариантах осуществления векторный геном содержит одну или несколько последовательностей-наполнителей, которые, например, на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичны
GCGGCAATTCAGTCGATAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGATTTAAATACGCGCTCTCTTAAGGTAGCCCCGGGACGCGTCAATTGACTACAAACCGAGTATCTGCAGAGGGCCCTGCGTATG (SEQ ID NO: 27);
CTTCTGAGGCGGAAAGAACCAGATCCTCTCTTAAGGTAGCATCGAGATTTAAATTAGGGATAACAGGGTAATGGCGCGGGCCGC (SEQ ID NO: 28) или
GTTACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACATTTCTGCTCACTGCAACCTCCTCCTCCCTGGGTTC (SEQ ID NO: 29).
Промоторы
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотидная последовательность, кодирующая белок MLP или его функциональный вариант, функционально связана с промотором.
В настоящем изобретении предусмотрено применение различных промоторов. К промоторам, применимым в вариантах осуществления настоящего изобретения, относятся без ограничения промотор цитомегаловируса (CMV), промотор гена фосфоглицераткиназы (PGK) или промоторная последовательность, состоящая из энхансера CMV и частей промотора гена бета-актина курицы и гена бета-глобина кролика (CAG). В некоторых случаях промотор может представлять собой синтетический промотор. Иллюстративные синтетические промоторы представлены в Schlabach et al. PNAS USA. 107(6):2538–43 (2010). В некоторых вариантах осуществления промотор содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична
ACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGG
(SEQ ID NO: 30).
В некоторых вариантах осуществления полинуклеотидная последовательность, кодирующая белок MLP или его функциональный вариант, функционально связана с индуцируемым промотором. Индуцируемый промотор может быть сконфигурирован таким образом, чтобы обуславливать транскрипционную экспрессию или не обуславливать транскрипционную экспрессию полинуклеотидной последовательности в ответ на добавление или накопление средства или в ответ на удаление, разложение или разведение средства. Средство может представлять собой лекарственное средство. Средство может представлять собой тетрациклин или одно из его производных, в том числе без ограничения доксициклин. В некоторых случаях индуцируемый промотор представляет собой промотор tet-on, промотор tet-off, химически регулируемый промотор, физически регулируемый промотор (т. е. промотор, который реагирует на присутствие или отсутствие света или на низкую или высокую температуру). К индуцируемым промоторам относятся промоторы, индуцируемые ионами тяжелых металлов (такие как промотор вируса опухоли молочной железы мыши (mMTV) или различные промоторы гена гормона роста), и промоторы из фага Т7, которые активны в присутствии РНК-полимеразы Т7. Данный перечень индуцируемых промоторов не является ограничивающим.
В некоторых случаях промотор представляет собой тканеспецифичный промотор, такой как промотор, способный управлять экспрессией в клетке сердца в большей степени, чем в клетке, отличной от клетки сердца. В некоторых вариантах осуществления тканеспецифичный промотор выбран из любых различных промоторов, специфичных для клеток сердца, в том числе без ограничения десмина (Des), тяжелой цепи альфа-миозина (α-MHC), легкой цепи 2 миозина (MLC-2), сердечного тропонина С (cTnC), сердечного тропонина Т (hTNNT2), мышечной креатинкиназы (СК) и комбинаций данных промоторных/энхансерных областей, таких как MHCK7. В некоторых случаях промотор представляет собой убиквитарный промотор. «Убиквитарный промотор» относится к промотору, который не является тканеспецифичным в экспериментальных или клинических условиях. В некоторых случаях убиквитарный промотор представляет собой любой из промоторов CMV, CAG, UBC, PGK, EF1-альфа, GAPDH, SV40, HBV, бета-актина курицы и бета-актина человека.
В некоторых вариантах осуществления промоторная последовательность выбрана из таблицы 3. В некоторых вариантах осуществления промотор содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична любой из SEQ ID NO: 31—51.
Таблица 3
ПРОМОТОР ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ SEQ ID NO:
MHCK7 ACCCTTCAGATTAAAAATAACTGAGGTAAGGGCCTGGGTAGGGGAGGTGGTGTGAGACGCTCCTGTCTCTCCTCTATCTGCCCATCGGCCCTTTGGGGAGGAGGAATGTGCCCAAGGACTAAAAAAAGGCCATGGAGCCAGAGGGGCGAGGGCAACAGACCTTTCATGGGCAAACCTTGGGGCCCTGCTGTCTAGCATGCCCCACTACGGGTCTAGGCTGCCCATGTAAGGAGGCAAGGCCTGGGGACACCCGAGATGCCTGGTTATAATTAACCCAGACATGTGGCTGCCCCCCCCCCCCCAACACCTGCTGCCTCTAAAAATAACCCTGTCCCTGGTGGATCCCCTGCATGCGAAGATCTTCGAACAAGGCTGTGGGGGACTGAGGGCAGGCTGTAACAGGCTTGGGGGCCAGGGCTTATACGTGCCTGGGACTCCCAAAGTATTACTGTTCCATGTTCCCGGCGAAGGGCCAGCTGTCCCCCGCCAGCTAGACTCAGCACTTAGTTTAGGAACCAGTGAGCAAGTCAGCCCTTGGGGCAGCCCATACAAGGCCATGGGGCTGGGCAAGCTGCACGCCTGGGTCCGGGGTGGGCACGGTGCCCGGGCAACGAGCTGAAAGCTCATCTGCTCTCAGGGGCCCCTCCCTGGGGACAGCCCCTCCTGGCTAGTCACACCCTGTAGGCTCCTCTATATAACCCAGGGGCACAGGGGCTGCCCTCATTCTACCACCACCTCCACAGCACAGACAGACACTCAGGAGCCAGCCAG 31
Промотор сердечного тропонина Т человека (без экзона 1)
hTnnT2 / HTNNT2
CTCAGTCCATTAGGAGCCAGTAGCCTGGAAGATGTCTTTACCCCCAGCATCAGTTCAAGTGGAGCAGCACATAACTCTTGCCCTCTGCCTTCCAAGATTCTGGTGCTGAGACTTATGGAGTGTCTTGGAGGTTGCCTTCTGCCCCCCAACCCTGCTCCCAGCTGGCCCTCCCAGGCCTGGGTTGCTGGCCTCTGCTTTATCAGGATTCTCAAGAGGGACAGCTGGTTTATGTTGCATGACTGTTCCCTGCATATCTGCTCTGGTTTTAAATAGCTTATCTGAGCAGCTGGAGGACCACATGGGCTTATATGGCGTGGGGTACATGTTCCTGTAGCCTTGTCCCTGGCACCTGCCAAAATAGCAGCCAACACCCCCCACCCCCACCGCCATCCCCCTGCCCCACCCGTCCCCTGTCGCACATTCCTCCCTCCGCAGGGCTGGCTCACCAGGCCCCAGCCCACATGCCTGCTTAAAGCCCTCTCCATCCTCTGCCTCACCCAGT 33
Промотор сердечного тропонина Т человека (с экзоном 1, подчеркнут)
hTnnT2 / HTNNT2
CTCAGTCCATTAGGAGCCAGTAGCCTGGAAGATGTCTTTACCCCCAGCATCAGTTCAAGTGGAGCAGCACATAACTCTTGCCCTCTGCCTTCCAAGATTCTGGTGCTGAGACTTATGGAGTGTCTTGGAGGTTGCCTTCTGCCCCCCAACCCTGCTCCCAGCTGGCCCTCCCAGGCCTGGGTTGCTGGCCTCTGCTTTATCAGGATTCTCAAGAGGGACAGCTGGTTTATGTTGCATGACTGTTCCCTGCATATCTGCTCTGGTTTTAAATAGCTTATCTGAGCAGCTGGAGGACCACATGGGCTTATATGGCGTGGGGTACATGTTCCTGTAGCCTTGTCCCTGGCACCTGCCAAAATAGCAGCCAACACCCCCCACCCCCACCGCCATCCCCCTGCCCCACCCGTCCCCTGTCGCACATTCCTCCCTCCGCAGGGCTGGCTCACCAGGCCCCAGCCCACATGCCTGCTTAAAGCCCTCTCCATCCTCTGCCTCACCCAGTCCCCGCTGAGACTGAGCAGACGCCTCCAGGATCTGTCGGCAG 32
Промотор тяжелой цепи α-сердечного миозина мыши (αMHC) GGTACCGGATCCTGCAAGGTCACACAAGGGTCTCCACCCACCAGGTGCCCTAGTCTCAATTTCAGTTTCCATGCCTTGTTCTCACAATGCTGGCCTCCCCAGAGCTAATTTGGACTTTGTTTTTATTTCAAAAGGGCCTGAATGAGGAGTAGATCTTGTGCTACCCAGCTCTAAGGGTGCCCGTGAAGCCCTCAGACCTGGAGCCTTTGCAACAGCCCTTTAGGTGGAAGCAGAATAAAGCAATTTTCCTTAAAGCCAAAATCCTGCCTCTAGACTCTTCTTCTCTGACCTCGGTCCCTGGGCTCTAGGGTGGGGAGGTGGGGCTTGGAAGAAGAAGGTGGGGAAGTGGCAAAAGCCGATCCCTAGGGCCCTGTGAAGTTCGGAGCCTTCCCTGTACAGCACTGGCTCATAGATCCTCCTCCAGCCAAACATAGCAAGAAGTGATACCTCCTTTGTGACTTCCCCAGGCCCAGTACCTGTCAGGTTGAAACAGGATTTAGAGAAGCCTCTGAACTCACCTGAACTCTGAAGCTCATCCACCAAGCAAGCACCTAGGTGCCACTGCTAGTTAGTATCCTACGCTGATAATATGCAGAGCTGGGCCACAGAAGTCCTGGGGTGTAGGAACTGACCAGTGACTTTTCAGTCGGCAAAGGTATGACCCCCTCAGCAGATGTAGTAATGTCCCCTTAGATCCCATCCCAGGCAGGTCTCTAAGAGGACATGGGATGAGAGATGTAGTCATGTGGCATTCCAAACACAGCTATCCACAGTGTCCCTTGCCCCTTCCACTTAGCCAGGAGGACAGTAACCTTAGCCTATCTTTCTTCCTCCCCATCCTCCCAGGACACACCCCCTGGTCTGCAGTATTCATTTCTTCCTTCACGTCCCCTCTGTGACTTCCATTTGCAAGGCTTTTGACCTCTGCAGCTGCTGGAAGATAGAGTTTGGCCCTAGGTGTGGCAAGCCATCTCAAGAGAAAGCAGACAACAGGGGGACCAGATTTTGGAAGGATCAGGAACTAAATCACTGGCGGGCCTGGGGGTAGAAAAAAGAGTGAGTGAGTCCGCTCCAGCTAAGCCAAGCTAGTCCCCGAGATACTCTGCCACAGCTGGGCTGCTCGGGGTAGCTTTAGGAATGTGGGTCTGAAAGACAATGGGATTGGAAGACATCTCTTTGAGTCTCCCCTCAACCCCACCTACAGACACACTCGTGTGTGGCCAGACTCCTGTTCAACAGCCCTCTGTGTTCTGACCACTGAGCTAGGCAACCAGAGCATGGGCCCTGTGCTGAGGATGAAGAGTTGGTTACCAATAGCAAAAACAGCAGGGGAGGGAGAACAGAGAACGAAATAAGGAAGGAAGAAGGAAAGGCCAGTCAATCAGATGCAGTCAGAAGAGATGGGAAGCCAACACACAGCTTGAGCAGAGGAAACAGAAAAGGGAGAGATTCTGGGCATAAGGAGGCCACAGAAAGAAGAGCCCAGGCCCCCCAAGTCTCCTCTTTATACCCTCATCCCGTCTCCCAATTAAGCCCACTCTTCTTCCTAGATCAGACCTGAGCTGCAGCGAAGAGACCCGTAGGGAGGATCACACTGGATGAAGGAGATGTGTGGAGAAGTCCAGGGAACCTAAGAGCCAGAGCCTAAAAGAGCAAGAGATAAAGGTGCTTCAAAGGTGGCCAGGCTGTGCACACAGAGGGTCGAGGACTGGTGGTAGAGCCTCAAGATAAGGATGATGCTCAGAATGGGCGGGGGGGGGGATTCTGGGGGGGGGAGAGAGAAGGTGAGAAGGAGCCTGGAACAGAGAATCTGGAAGCGCTGGAAACGATACCATAAAGGGAAGAACCCAGGCTACCTTTAGATGTAAATCATGAAAGACAGGGAGAAGGGAAGCTGGAGAGAGTAGAAGGACCCCGGGGCAAGACATTGAAGCAAGGACAAGCCAGGTTGAGCGCTCCGTGAAATCAGCCTGCTGAAGGCAGAGCCCTGGTATGAGCACCAGAACAGCAGAGGCTAGGGTTAATGTCGAGACAGGGAACAGAAGGTAGACACAGGAACAGACAGAGACGGGGGAGCCAGGTAACAAAGGAATGGTCCTTCTCACCTGTGGCCAGAGCGTCCATCTGTGTCCACATACTCTAGAATGTTCATCAGACTGCAGGGCTGGCTTGGGAGGCAGCTGGAAAGAGTATGTGAGAGCCAGGGGAGACAAGGGGGCCTAGGAAAGGAAGAAGAGGGCAAACCAGGCCACACAAGAGGGCAGAGCCCAGAACTGAGTTAACTCCTTCCTTGTTGCATCTTCCATAGGAGGCAGTGGGAACTCTGTGACCACCATCCCCCATGAGCCCCCACTACCCATACCAAGTTTGGCCTGAGTGGCATTCTAGGTTCCCTGAGGACAGAGCCTGGCCTTTGTCTCTTGGACCTGACCCAAGCTGACCCAATGTTCTCAGTACCTTATCATGCCCTCAAGAGCTTGAGAACCAGGCAGTGACATATTAGGCCATGGGCTAACCCTGGAGCTTGCACACAGGAGCCTCAAGTGACCTCCAGGGACACAGCTGCAGACAGGTGGCCTTTATCCCCAAAGAGCAACCATTTGGCATAGGTGGCTGCAAATGGGAATGCAAGGTTGAATCAGGTCCCTTCAAGAATACTGCATGCAAGACCTAAGACCCCTGGAGAGAGGGGTATGCTCCTGCCCCCACCCACCATAAGGGGAGTGAACTATCCTAGGGGGCTGGCGACCTTGGGGAGACACCACATTACTGAGAGTGCTGAGCCCAGAAAAACTGACCGCCCTGTGTCCTGCCCACCTCCACACTCTAGAGCTATATTGAGAGGTGACAGTAGATAGGGTGGGAGCTGGTAGCAGGGAGAGTGTTCCTGGGTGTGAGGGTGTAGGGGAAAGCCAGAGCAGGGGAGTCTGGCTTTGTCTCCTGAACACAATGTCTACTTAGTTATAACAGGCATGACCTGCTAAAGACCCAACATCTACGACCTCTGAAAAGACAGCAGCCCTGGAGGACAGGGGTTGTCTCTGAGCCTTGGGTGCTTGATGGTGCCACAAAGGAGGGCATGAGTGTGAGTATAAGGCCCCAGGAGCGTTAGAGAAGGGCACTTGGGAAGGGGTCAGTCTGCAGAGCCCCTATCCATGGAATCTGGAGCCTGGGGCCAACTGGTGTAAATCTCTGGGCCTGCCAGGCATTCAAAGCAGCACCTGCATCCTCTGGCAGCCTGGGGAGGCGGAAGGGAGCAACCCCCCACTTATACCCTTTCTCCCTCAGCCCCAGGATTAACACCTCTGGCCTTCCCCCTTCCCACCTCCCATCAGGAGTGGAGGGTTGCAGAGGGAGGGTAAAAACCTACATGTCCAAACATCATGGTGCACGATATATGGATCAGTATGTGTAGAGGCAAGAAAGGAAATCTGCAGGCTTAACTGGGTTAATGTGTAAAGTCTGTGTGCATGTGTGTGTGTCTGACTGAAAACGGGCATGGCTGTGCAGCTGTTCAGTTCTGTGCGTGAGGTTACCAGACTGCAGGTTTGTGTGTAAATTGCCCAAGGCAAAGTGGGTGAATCCCTTCCATGGTTTAAAGAGATTGGATGATGGCCTGCATCTCAAGGACCATGGAAAATAGAATGGACACTCTATATGTGTCTCTAAGCTAAGGTAGCAAGGTCTTTGGAGGACACCTGTCTAGAGATGTGGGCAACAGAGACTACAGACAGTATCTGTACAGAGTAAGGAGAGAGAGGAGGGGGTGTAGAATTCTCTTACTATCAAAGGGAAACTGAGTCGTGCACCTGCAAAGTGGATGCTCTCCCTAGACATCATGACTTTGTCTCTGGGGAGCCAGCACTGTGGAACTTCAGGTCTGAGAGAGTAGGAGGCTCCCCTCAGCCTGAAGCTATGCAGATAGCCAGGGTTGAAAGGGGGAAGGGAGAGCCTGGGATGGGAGCTTGTGTGTTGGAGGCAGGGGACAGATATTAAGCCTGGAAGAGAAGGTGACCCTTACCCAGTTGTTCAACTCACCCTTCAGATTAAAAATAACTGAGGTAAGGGCCTGGGTAGGGGAGGTGGTGTGAGACGCTCCTGTCTCTCCTCTATCTGCCCATCGGCCCTTTGGGGAGGAGGAATGTGCCCAAGGACTAAAAAAAGGCCATGGAGCCAGAGGGGCGAGGGCAACAGACCTTTCATGGGCAAACCTTGGGGCCCTGCTGTCCTCCTGTCACCTCCAGAGCCAAGGGATCAAAGGAGGAGGAGCCAGGACAGGAGGGAAGTGGGAGGGAGGGTCCCAGCAGAGGACTCCAAATTTAGGCAGCAGGCATATGGGATGGGATATAAAGGGGCTGGAGCACTGAGAGCTGTCAGAGATTTCTCCAACCCAGGTAAGAGGGAGTTTCGGGTGGGGGCTCTTCACCCACACCAGACCTCTCCCCACCTAGAAGGAAACTGCCTTTCCTGGAAGTGGGGTTCAGGCCGGTCAGAGATCTGACAGGGTGGCCTTCCACCAGCCTGGGAAGTTCTCAGTGGCAGGAGGTTTCCACAAGAAACACTGGATGCCCCTTCCCTTACGCTGTCTTCTCCATCTTCCTCCTGGGGATGCTCCTCCCCGTCTTGGTTTATCTTGGCTCTTCGTCTTCAGCAAGATTTGCCCTGTGCTGTCCACTCCATCTTTCTCTACTGTCTCCGTGCCTTGCCTTGCCTTCTTGCGTGTCCTTCCTTTCCACCCATTTCTCACTTCACCTTTTCTCCCCTTCTCATTTGTATTCATCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTCCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTGTGTCAGAGTGCTGAGAATCACACCTGGGGTTCCCACCCTTATGTAAACAATCTTCCAGTGAGCCACAGCTTCAGTGCTGCTGGGTGCTCTCTTACCTTCCTCACCCCCTGGCTTGTCCTGTTCCATCCTGGTCAGGATCTCTAGATTGGTCTCCCAGCCTCTGCTACTCCTCTTCCTGCCTGTTCCTCTCTCTGTCCAGCTGCGCCACTGTGGTGCCTCGTTCCAGCTGTGGTCCACATTCTTCAGGATTCTCTGAAAAGTTAACCAGGTGAGAATGTTTCCCCTGTAGACAGCAGATCACGATTCTCCCGGAAGTCAGGCTTCCAGCCCTCTCTTTCTCTGCCCAGCTGCCCGGCACTCTTAGCAAACCTCAGGCACCCTTACCCCACATAGACCTCTGACAGAGAAGCAGGCACTTTACATGGAGTCCTGGTGGGAGAGCCATAGGCTACGGTGTAAAAGAGGCAGGGAAGTGGTGGTGTAGGAAAGTCAGGACTTCACATAGAAGCCTAGCCCACACCAGAAATGACAGACAGATCCCTCCTATCTCCCCCATAAGAGTTTGAGTCGACCCGCGGCCCCGAATTG 34
Промотор сердечного тропонина Т курицы (cTnT) GGGATAAAAGCAGTCTGGGCTTTCACATGACAGCATCTGGGGCTGCGGCAGAGGGTCGGGTCCGAAGCGCTGCCTTATCAGCGTCCCCAGCCCTGGGAGGTGACAGCTGGCTGGCTTGTGTCAGCCCCTCGGGCACTCACGTATCTCCGTCCGACGGGTTTAAAATAGCAAAACTCTGAGGCCACACAATAGCTTGGGCTTATATGGGCTCCTGTGGGGGAAGGGGGAGCACGGAGGGGGCCGGGGCCGCTGCTGCCAAAATAGCAGCTCACAAGTGTTGCATTCCTCTCTGGGCGCCGGGCACATTCCTGCTGGCTCTGCCCGCCCCGGGGTGGGCGCCGGGGGGACCTTAAAGCCTCTGCCCCCCAAGGAGCCCTTCCCAGACAGCCGCCGGCACCCACCGCTCCGTGGGA 35
Креатинкиназа М человека (hCKM) CTCTCAGCCCTGGAAGTCCTTGCTCACAGCCGAGGCGCCGAGAGCGCTTGCTCTGCCCAGATCTGCGCGAGTCTGGCGCCCGCGCTCTGAACGGCGTCGCTGCCCAGCCCCCTTCCCCGGGAGGTGGGAGCGGCCACCCAGGGCCCCGTGGCTGCCCTTGTAAGGAGGCGAGGCCCGAGGACACCCGAGACGCCCGGTTATAATTAACCAGGACACGTGGCGAACCCCCCTCCAACACCTGCCCCCGAACCCCCCCATACCCAGCGCCTCGGGTCTCGGCCTTTGCGGCAGAGGAGACAGCAAAGCGCCCTCTAAAAATAACTCCTTTCCCGGCGACCGAGACCCTCCCTGTCCCCCGCACAGCGGAAATCTCCCAGTGGCACCGAGGGGGCGAGGGTTAAGTGGGGGGGAGGGTGACCACCGCCTCCCACCCTTGCCCTGAGTTTGAATCTCTCCAACTCAGCCAGCCTCAGTTTCCCCTCCACTCAGTCCCTAGGAGGAAGGGGCGCCCAAGCGCGGGTTTCTGGGGTTAGACTGCCCTCCATTGCAATTGGTCCTTCTCCCGGCCTCTGCTTCCTCCAGCTCACAGGGTATCTGCTCCTCCTGGAGCCACACCTTGGTTCCCCGAGGTGCCGCTGGGACTCGGGTAGGGGTGAGGGCCCAGGGGGCACAGGGGGAGCCGAGGGCCACAGGAAGGGCTGGTGGCTGAAGGAGACTCAGGGGCCAGGGGACGGTGGCTTCTACGTGCTTGGGACGTTCCCAGCCACCGTCCCATGTTCCCGGCGGGGGGCCAGCTGTCCCCACCGCCAGCCCAACTCAGCACTTGGTCAGGGTATCAGCTTGGTGGGGGGGCGTGAGCCCAGCCCCTGGGGCGGCTCAGCCCATACAAGGCCATGGGGCTGGGCGCAAAGCATGCCTGGGTTCAGGGTGGGTATGGTGCGGGAGCAGGGAGGTGAGAGGCTCAGCTGCCCTCCAGAACTCCTCCCTGGGGACAACCCCTCCCAGCCAATAGCACAGCCTAGGTCCCCCTATATAAGGCCACGGCTGCTGGCCCTTCCTTTGGGTCAGTGTCACCTCCAGGATACAGACA 36
Бета-актин человека (HuBa) GCCCAGCACCCCAAGGCGGCCAACGCCAAAACTCTCCCTCCTCCTCTTCCTCAATCTCGCTCTCGCTCTTTTTTTTTTTCGCAAAAGGAGGGGAGAGGGGGTAAAAAAATGCTGCACTGTGCGGCGAAGCCGGTGAGTGAGCGGCGCGGGGCCAATCAGCGTGCGCCGTTCCGAAAGTTGCCTTTTATGGCTCGAGCGGCCGCGGCGGCGCCCTATAAAACCCAGCGGCGCGACGCGCCACCACCGCCGAGTC 37
Бета-актин курицы (CBA) GGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGA 38
Цитомегаловирус (CMV) TGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACACCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAATAACCCCGCCCCGTTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTCGTTTAGTGAACCG 39
Цитомегаловирус (CMV) (вторая версия) TAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTGGTTTAGTGAACCGT 40
Цитомегаловирус (CMV) (третья версия) CGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTGATGCGGTTTTGGCAGTACATCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAACAACTCCGCCCCATTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCT 41
Промотор CAG (первая версия) ACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGG 42
Промотор CAG (вторая версия) CGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCG 43
EF1-альфа человека (EF1-α) CAACCTTTGGAGCTAAGCCAGCAATGGTAGAGGGAAGATTCTGCACGTCCCTTCCAGGCGGCCTCCCCGTCACCACCCCCCCCAACCCGCCCCGACCGGAGCTGAGAGTAATTCATACAAAAGGACTCGCCCCTGCCTTGGGGAATCCCAGGGACCGTCGTTAAACTCCCACTAACGTAGAACCCAGAGATCGCTGCGTTCCCGCCCCCTCACCCGCCCGCTCTCGTCATCACTGAGGTGGAGAATAGCATGCGTGAGGCTCCGGTGCCCGTCAGTGGGCAGAGCGCACATCGCCCACAGTCCCCGAGAAGTTGGGGGGAGGGGTCGGCAATTGAACGGGTGCCTAGAGAAGGTGGCGCGGGGTAAACTGGGAAAGTGATGTCGTGTACTGGCTCCGCCTTTTTCCCGAGGGTGGGGGAGAACCGTATATAAGTGCAGTAGTCGCCGTGAACGTT 44
Синапсин1 (Syn) человека, короткая версия AGTGCAAGTGGGTTTTAGGACCAGGATGAGGCGGGGTGGGGGTGCCTACCTGACGACCGACCCCGACCCACTGGACAAGCACCCAACCCCCATTCCCCAAATTGCGCATCCCCTATCAGAGAGGGGGAGGGGAAACAGGATGCGGCGAGGCGCGTGCGCACTGCCAGCTTCAGCACCGCGGACAGTGCCTTCGCCCCCGCCTGGCGGCGCGCGCCACCGCCGCCTCAGCACTGAAGGCGCGCTGACGTCACTCGCCGGTCCCCCGCAAACTCCCCTTCCCGGCCACCTTGGTCGCGTCCGCGCCGCCGCCGGCCCAGCCGGACCGCACCACGCGAGGCGCGAGATAGGGGGGCACGGGCGCGACCATCTGCGCTGCGGCGCCGGCGACTCAGCGCTGCCTC 45
Синапсин1 (Syn) человека с 3′ удлинением AGTGCAAGTGGGTTTTAGGACCAGGATGAGGCGGGGTGGGGGTGCCTACCTGACGACCGACCCCGACCCACTGGACAAGCACCCAACCCCCATTCCCCAAATTGCGCATCCCCTATCAGAGAGGGGGAGGGGAAACAGGATGCGGCGAGGCGCGTGCGCACTGCCAGCTTCAGCACCGCGGACAGTGCCTTCGCCCCCGCCTGGCGGCGCGCGCCACCGCCGCCTCAGCACTGAAGGCGCGCTGACGTCACTCGCCGGTCCCCCGCAAACTCCCCTTCCCGGCCACCTTGGTCGCGTCCGCGCCGCCGCCGGCCCAGCCGGACCGCACCACGCGAGGCGCGAGATAGGGGGGCACGGGCGCGACCATCTGCGCTGCGGCGCCGGCGACTCAGCGCTGCCTCAGTCTGCGGTGGGCAGCGGAGGAGTCGTGTCGTGCCTGAGAGCGCAG 46
Синапсин1 (Syn) человека с 5′ удлинением CTGCAGAGGGCCCTGCGTATGAGTGCAAGTGGGTTTTAGGACCAGGATGAGGCGGGGTGGGGGTGCCTACCTGACGACCGACCCCGACCCACTGGACAAGCACCCAACCCCCATTCCCCAAATTGCGCATCCCCTATCAGAGAGGGGGAGGGGAAACAGGATGCGGCGAGGCGCGTGCGCACTGCCAGCTTCAGCACCGCGGACAGTGCCTTCGCCCCCGCCTGGCGGCGCGCGCCACCGCCGCCTCAGCACTGAAGGCGCGCTGACGTCACTCGCCGGTCCCCCGCAAACTCCCCTTCCCGGCCACCTTGGTCGCGTCCGCGCCGCCGCCGGCCCAGCCGGACCGCACCACGCGAGGCGCGAGATAGGGGGGCACGGGCGCGACCATCTGCGCTGCGGCGCCGGCGACTCAGCGCTGCCTC 47
CamKIIa человека (CaMKIIa) ACTTGTGGACAAAGTTTGCTCTATTCCACCTCCTCCAGGCCCTCCTTGGGTCCATCACCCCAGGGGTGCTGGGTCCATCCCACCCCCAGGCCCACACAGGCTTGCAGTATTGTGTGCGGTATGGTCAGGGCGTCCGAGAGCAGGTTTCGCAGTGGAAGGCAGGCAGGTGTTGGGGAGGCAGTTACCGGGGCAACGGGAACAGGGCGTTTTGGAGGTGGTTGCCATGGGGACCTGGATGCTGACGAAGGCTCGCGAGGCTGTGAGCAGCCACAGTGCCCTGC 48
Промотор eSYN GACATTGATTATTGACTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGCTGCAGAGGGCCCTGCGTATGAGTGCAAGTGGGTTTTAGGACCAGGATGAGGCGGGGTGGGGGTGCCTACCTGACGACCGACCCCGACCCACTGGACAAGCACCCAACCCCCATTCCCCAAATTGCGCATCCCCTATCAGAGAGGGGGAGGGGAAACAGGATGCGGCGAGGCGCGTCGCGACTGCCAGCTTCAGCACCGCGGACAGTGCCTTCGCCCCCGCCTGGCGGCGCGCGCCACCGCCGCCTCAGCACTGAAGGCGCGCTGACGTCACTCGCCGGTCCCCCGCAAACTCCCCTTCCCGGCCACCTTGGTCGCGTCCGCGCCGCCGCCGGCCCAGCCGGACCGCACCACGCGAGGCGCGAGATAGGGGGGCACGGGCGCGACCATCTGCGCTGCGGCGCCGGCGACTCAGCGCTGCCTCAGTCTGCGGTGGGCAGCGGAGGAGTCGTGTCGTGCCTGAGAGCGCAGG 49
В предпочтительном варианте осуществления векторный геном содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентична SEQ ID NO: 31. В предпочтительном варианте осуществления векторный геном содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентична SEQ ID NO: 32. В предпочтительном варианте осуществления векторный геном содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентична SEQ ID NO: 33.
Дополнительными иллюстративными примерами промоторов являются поздний промотор SV40 из обезьяньего вируса 40, энхансерный/промоторный элемент полиэдра бакуловируса, промотор гена тимидинкиназы вируса простого герпеса (HSV tk), предранний промотор цитомегаловируса (CMV) и различные ретровирусные промоторы, в том числе LTR-элементы. Известно большое разнообразие других промоторов, и они общедоступны в данной области техники, а последовательности многих таких промоторов доступны в базах данных последовательностей, таких как база данных GenBank.
Другие регуляторные элементы
В некоторых случаях векторы по настоящему изобретению дополнительно содержат один или несколько регуляторных элементов, выбранных из группы, состоящей из энхансера, интрона, поли-А-сигнала, последовательности, кодирующей пептид 2А, WPRE (посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита Вудчака) и HPRE (посттранскрипционный регуляторный элемент гепатита В).
В некоторых вариантах осуществления вектор содержит энхансер CMV.
В определенных вариантах осуществления векторы содержат один или несколько энхансеров. В отдельных вариантах осуществления энхансер представляет собой энхансерную последовательность CMV, энхансерную последовательность GAPDH, энхансерную последовательность гена β-актина или энхансерную последовательность EF1-α. Вышеизложенные последовательности известны в данной области техники. Например, последовательность предраннего (IE) энхансера CMV является следующей:
ACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCA
(SEQ ID NO: 50).
В определенных вариантах осуществления векторы содержат один или несколько интронов. В отдельных вариантах осуществления интрон представляет собой последовательность интрона глобина кролика, последовательность интрона β-актина курицы, последовательность синтетического интрона, последовательность интрона SV40 или последовательность интрона EF1-α.
В определенных вариантах осуществления векторы содержат полиA-последовательность. В отдельных вариантах осуществления полиА-последовательность представляет собой полиА-последовательность глобина кролика, полиА-последовательность гормона роста человека, полиА-последовательность гормона роста крупного рогатого скота, полиА-последовательность PGK, полиА-последовательность SV40 или полиА-последовательность ТК. В некоторых вариантах осуществления поли-А-сигнал может представлять собой сигнал полиаденилирования гормона роста крупного рогатого скота (bGHpA).
В определенных вариантах осуществления векторы содержат один или несколько элементов, стабилизирующих транскрипт. В отдельных вариантах осуществления элемент, стабилизирующий транскрипт, представляет собой последовательность WPRE, последовательность HPRE, область прикрепления к ядерному скелету, 3'-UTR или 5'-UTR. В отдельных вариантах осуществления векторы содержат как 5'-UTR, так и 3'-UTR.
В некоторых вариантах осуществления вектор содержит 5'-нетранслируемую область (UTR), выбранную из таблицы 4. В некоторых вариантах осуществления векторный геном содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична любой из SEQ ID NO: 51—61.
Таблица 4
5'-НЕТРАНСЛИРУЕМАЯ ОБЛАСТЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ SEQ ID NO:
Экзон/интрон бета-актина человека CGCGTCCGCCCGCGAGCACAGAGCCTCGCCTTTGCCGATCCGCCGCCCGTCCACACCCGCCGCCAGGTAAGCCCGGCCAGCCGACCGGGGCATGCGGCCGCGGCCCTTCGCCCGTGCAGAGCCGCCGTCTGGGCCGCAGCGGGGGGCGCATGGGGCGGAACCGGACCGCCGTGGGGGGCGCGGGAGAAGCCCCTGGGCCTCCGGAGATGGGGGACACCCCACGCCAGTTCGCAGGCGCGAGGCCGCGCTCGGGCGGGCGCGCTCCGGGGGTGCCGCTCTCGGGGCGGGGGCAACCGGCGGGGTCTTTGTCTGAGCCGGGCTCTTGCCAATGGGGATCGCACGGTGGGCGCGGCGTAGCCCCCGTCAGGCCCGGTGGGGGCTGGGGCGCCATGCGCGTGCGCGCTGGTCCTTTGGGCGCTAACTGCGTGCGCGCTGGGAATTGGCGCTAATTGCGCGTGCGCGCTGGGACTCAATGGCGCTAATCGCGCGTGCGTTCTGGGGCCCGGGCGCTTGCGCCACTTCCTGCCCGAGCCGCTGGCGCCCGAGGGTGTGGCCGCTGCGTGCGCGCGCGCGACCCGGTCGCTGTTTGAACCGGGCGGAGGCGGGGCTGGCGCCCGGTTGGGAGGGGGTTGGGGCCTGGCTTCCTGCCGCGCGCCGCGGGGACGCCTCCGACCAGTGTTTGCCTTTTATGGTAATAACGCGGCCGGCCCGGCTTCCTTTGTCCCCAATCTGGGCGCGCGCCGGCGCCCCCTGGCGGCCTAAGGACTCGGCGCGCCGGAAGTGGCCAGGGCGGCAGCGGCTGCTCTTGGCGGCCCCGAGGTGACTATAGCCTTCTTTTGTGTCTTGATAGTTCGCCAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGCTGTCTCATCATTTTGGCAAAGAATTC 51
Экзон/интрон бета-актина курицы + интрон глобина кролика GTCGCTGCGCGCTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCTCCTCCGGGCTGTAATTAGCGCTTGGTTTAATGACGGCTTGTTTCTTTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTGAGGGGCTCCGGGAGGGCCCTTTGTGCGGGGGGAGCGGCTCGGGGGGTGCGTGCGTGTGTGTGTGCGTGGGGAGCGCCGCGTGCGGCTCCGCGCTGCCCGGCGGCTGTGAGCGCTGCGGGCGCGGCGCGGGGCTTTGTGCGCTCCGCAGTGTGCGCGAGGGGAGCGCGGCCGGGGGCGGTGCCCCGCGGTGCGGGGGGGGCTGCGAGGGGAACAAAGGCTGCGTGCGGGGTGTGTGCGTGGGGGGGTGAGCAGGGGGTGTGGGCGCGTCGGTCGGGCTGCAACCCCCCCTGCACCCCCCTCCCCGAGTTGCTGAGCACGGCCCGGCTTCGGGTGCGGGGCTCCGTACGGGGCGTGGCGCGGGGCTCGCCGTGCCGGGCGGGGGGTGGCGGCAGGTGGGGGTGCCGGGCGGGGCGGGGCCGCCTCGGGCCGGGGAGGGCTCGGGGGAGGGGCGCGGCGGCCCCCGGAGCGCCGGCGGCTGTCGAGGCGCGGCGAGCCGCAGCCATTGCCTTTTATGGTAATCGTGCGAGAGGGCGCAGGGACTTCCTTTGTCCCAAATCTGTGCGGAGCCGAAATCTGGGAGGCGCCGCCGCACCCCCTCTAGCGGGCGCGGGGCGAAGCGGTGCGGCGCCGGCAGGAAGGAAATGGGCGGGGAGGGCCTTCGTGCGTCGCCGCGCCGCCGTCCCCTTCTCCCTCTCCAGCCTCGGGGCTGTCCGCGGGGGGACGGCTGCCTTCGGGGGGGACGGGGCAGGGCGGGGTTCGGCTTCTGGCGTGTGACCGGCGGCTCTAGAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTTATTGTGCTGTCTCATCATTTTGGCAAAGAATTC 52
Последовательность химерного интрона GGTAAGTTTAGTCTTTTTGTCTTTTATTTCAGGTCCCGGATCCGGTGGTGGTGCAAATCAAAGAACTGCTCCTCAGTGGATGTTGCCTTTACTTCTAGGCCTGTACGGAAGTGTTACTTCTGCTCTAAAAGCTGCGGAATTGTACCCGC 53
5'-UTR-Syn1 Hs AGTCTGCGGTGGGCAGCGGAGGAGTCGTGTCGTGCCTGAGAGCGCAGCTGTGCTCCTGGGCACCGCGCAGTCCGCCCCCGCGGCTCCTGGCCAGACCACCCCTAGGACCCCCTGCCCCAAGTCGCA 54
IE экзон CMV TCAGATCGCCTGGAGAGGCCATCCACGCTGTTTTGACCTCCATAGTGGACACCGGGACCGATCCAGCCTCCGCGGCCGGGAACGGTGCATTGGAACGCGGATTCCCCGTGCCAAGAGTGAC 55
TPL-eMLP (аденовирусный энхансерный элемент) CTCACTCTCTTCCGCATCGCTGTCTGCGAGGGCCAGCTGTTGGGCTCGCGGTTGAGGACAAACTCTTCGCGGTCTTTCCAGTACTCTTGGATCGGAAACCCGTCGGCCTCCGAACGGTACTCCGCCACCGAGGGACCTGAGCGAGTCCGCATCGACCGGATCGGAAAACCTCTCGAGAAAGGCGTCTAACCAGTCACAGTCGCAAGGTAGGCTGAGCACCGTGGCGGGCGGCAGCGGGTGGCGGTCGGGGTTGTTTCTGGCGGAGGTGCTGCTGATGATGTAATTAAAGTAGGCGGTCTTGAGACGGCGGATGGTCGAGGTGAGGTGTGGCAGGCTTGAGATCCAGCTGTTGGGGTGAGTACTCCCTCTCAAAAGCGGGCATTACTTCTGCGCTAAGATTGTCAGTTTCCAAAAACGAGGAGGATTTGATATTCACCTGGCCCGATCTGGCCATACACTTGAGTGACAATGACATCCACTTTGCCTTTCTCTCCACAGGTGTCCACTCCCAG 56
Интрон/экзон Ef1-α человека CTTTTTCGCAACGGGTTTGCCGCCAGAACACAGGTAAGTGCCGTGTGTGGTTCCCGCGGGCCTGGCCTCTTTACGGGTTATGGCCCTTGCGTGCCTTGAATTACTTCCACCTGGCTCCAGTACGTGATTCTTGATCCCGAGCTGGAGCCAGGGGCGGGCCTTGCGCTTTAGGAGCCCCTTCGCCTCGTGCTTGAGTTGAGGCCTGGCCTGGGCGCTGGGGCCGCCGCGTGCGAATCTGGTGGCACCTTCGCGCCTGTCTCGCTGCTTTCGATAAGTCTCTAGCCATTTAAAATTTTTGATGACGTGCTGCGACGCTTTTTTTCTGGCAAGATAGTCTTGTAAATGCGGGCCAGGATCTGCACACTGGTATTTCGGTTTTTGGGCCCGCGGCCGGCGACGGGGCCCGTGCGTCCCAGCGCACATGTTCGGCGAGGCGGGGCCTGCGAGCGCGGCCACCGAGAATCGGACGGGGGTAGTCTCAAGCTGGCCGGCCTGCTCTGGTGCCTGGCCTCGCGCCGCCGTGTATCGCCCCGCCCTGGGCGGCAAGGCTGGCCCGGTCGGCACCAGTTGCGTGAGCGGAAAGATGGCCGCTTCCCGGCCCTGCTCCAGGGGGCTCAAAATGGAGGACGCGGCGCTCGGGAGAGCGGGCGGGTGAGTCACCCACACAAAGGAAAAGGGCCTTTCCGTCCTCAGCCGTCGCTTCATGTGACTCCACGGAGTACCGGGCGCCGTCCAGGCACCTCGATTAGTTCTGGAGCTTTTGGAGTACGTCGTCTTTAGGTTGGGGGGAGGGGTTTTATGCGATGGAGTTTCCCCACACTGAGTGGGTGGAGACTGAAGTTAGGCCAGCTTGGCACTTGATGTAATTCTCCTTGGAATTTGGCCTTTTTGAGTTTGGATCTTGGTTCATTCTCAAGCCTCAGACAGTGGTTCAAAGTTTTTTTCTTCCATTTCAG 57
Интрон A EF1-α человека GTAAGTGCCGTGTGTGGTTCCCGCGGGCCTGGCCTCTTTACGGGTTATGGCCCTTGCGTGCCTTGAATTACTTCCACCTGGCTGCAGTACGTGATTCTTGATCCCGAGCTTCGGGTTGGAAGTGGGTGGGAGAGTTCGAGGCCTTGCGCTTAAGGAGCCCCTTCGCCTCGTGCTTGAGTTGAGGCCTGGCCTGGGCGCTGGGGCCGCCGCGTGCGAATCTGGTGGCACCTTCGCGCCTGTCTCGCTGCTTTCGATAAGTCTCTAGCCATTTAAAATTTTTGATGACCTGCTGCGACGCTTTTTTTCTGGCAAGATAGTCTTGTAAATGCGGGCCAAGATCTGCACACTGGTATTTCGGTTTTTGGGGCCGCGGGCGGCGACGGGGCCCGTGCGTCCCAGCGCACATGTTCGGCGAGGCGGGGCCTGCGAGCGCGGCCACCGAGAATCGGACGGGGGTAGTCTCAAGCTGGCCGGCCTGCTCTGGTGCCTGGCCTCGCGCCGCCGTGTATCGCCCCGCCCTGGGCGGCAAGGCTGGCCCGGTCGGCACCAGTTGCGTGAGCGGAAAGATGGCCGCTTCCCGGCCCTGCTGCAGGGAGCTCAAAATGGAGGACGCGGCGCTCGGGAGAGCGGGCGGGTGAGTCACCCACACAAAGGAAAAGGGCCTTTCCGTCCTCAGCCGTCGCTTCATGTGACTCCACGGAGTACCGGGCGCCGTCCAGGCACCTCGATTAGTTCTCGAGCTTTTGGAGTACGTCGTCTTTAGGTTGGGGGGAGGGGTTTTATGCGATGGAGTTTCCCCACACTGAGTGGGTGGAGACTGAAGTTAGGCCAGCTTGGCACTTGATGTAATTCTCCTTGGAATTTGCCCTTTTTGAGTTTGGATCTTGGTTCATTCTCAAGCCTCAGACAGTGGTTCAAAGTTTTTTTCTTCCATTTCAG 58
5’-UTR CamKIIa человека TCAGAAGCCCCGGGCTCGTCAGTCAAACCGGTTCTCTGTTTGCACTCGGCAGCACGGGCAGGCAAGTGGTCCCTAGGTTCGGG 59
Интрон Β-глобина GTGAGTCTATGGGACCCTTGATGTTTTCTTTCCCCTTCTTTTCTATGGTTAAGTTCATGTCATAGGAAGGGGAGAAGTAACAGGGTACACATATTGACCAAATCAGGGTAATTTTGCATTTGTAATTTTAAAAAATGCTTTCTTCTTTTAATATACTTTTTTGTTTATCTTATTTCTAATACTTTCCCTAATCTCTTTCTTTCAGGGCAATAATGATACAATGTATCATGCCTCTTTGCACCATTCTAAAGAATAACAGTGATAATTTCTGGGTTAAGGCAATAGCAATATTTCTGCATATAAATATTTCTGCATATAAATTGTAACTGATGTAAGAGGTTTCATATTGCTAATAGCAGCTACAATCCAGCTACCATTCTGCTTTTATTTTATGGTTGGGATAAGGCTGGATTATTCTGAGTCCAAGCTAGGCCCTTTTGCTAATCATGTTCATACCTCTTATCTTCCTCCCACAG 60
Интрон SV40 TCTAGAGGATCCGGTACTCGAGGAACTGAAAAACCAGAAAGTTAACTGGTAAGTTTAGTCTTTTTGTCTTTTATTTCAGGTCCCGGATCCGGTGGTGGTGCAAATCAAAGAACTGCTCCTCAGTGGATGTTGCCTTTACTTCTAGGCCTGTACGGAAGTGTTACTTCTGCTCTAAAAGCTGCGGAATTGTACCCGC 61
В некоторых вариантах осуществления вектор содержит 3'-нетранслируемую область, выбранную из таблицы 5. В некоторых вариантах осуществления векторный геном содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична любой из SEQ ID NO: 62—70.
Таблица 5
3'-НЕТРАНСЛИРУЕМАЯ ОБЛАСТЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ SEQ ID NO:
WPRE(x) (мутантный регуляторный элемент гепатита сурков — версия 1) AATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTATCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTGGTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAATCATCGTCCTTTCCTTGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGGCCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGC 62
WPRE(x) (мутантный регуляторный элемент гепатита сурков — версия 2) TCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTATCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTGGTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAATCATCGTCCTTTCCTTGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGGCCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCA 63
WPRE(x) (мутантный регуляторный элемент гепатита сурков — версия 3) TTCCTGTTAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTATCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTGGTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCGCGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGGCCTCTTCCGCCTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCCATGTATCTTTTTCACCTGTGCCTTGTTTTTGCCTGTGTTCCGCGTCCTACTTTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGGCGGCTTTGGGGCATGGACATAGATCCCTATAAAGAATTTGGTTCATCTTATCAGTTGTTGAATTTTCTTCCTTTGGAC 64
CAAX TGTGTGATAATG 65
EES CTGTTCTCATCACATCATATCAAGGTTATATACCATCAATATTGCCACAGATGTTACTTAGCCTTTTAATATTTCTCTAATTTAGTGTATATGCAATGATAGTTCTCTGATTTCTGAGATTGAGTTTCTCATGTGTAATGATTATTTAGAGTTTCTCTTTCATCTGTTCAAATTTTTGTCTAGTTTTATTTTTTACTGATTTGTAAGACTTCTTTTTATAATCTGCATATTACAATTCTCTTTACTGGGGTGTTGCAAATATTTTCTGTCATTCTATGGCCTGACTTTTCTTAATGGTTTTTTAATTTTAAAAATAAGTCTTAATATTCATGCAATCTAATTAACAATCTTTTCTTTGTGGTTAGGACTTTGAGTCATAAGAAATTTTTCTCTACACTGAAGTCATGATGGCATGCTTCTATATTATTTTCTAAAAGATTTAAAGTTTTGCCTTCTCCATTTAGACTTATAATTCACTGGAATTTTTTTGTGTGTATGGTATGACATATGGGTTCCCTTTTATTTTTTACATATAAATATATTTCCCTGTTTTTCTAAAAAAGAAAAAGATCATCATTTTCCCATTGTAAAATGCCATATTTTTTTCATAGGTCACTTACATATATCAATGGGTCTGTTTCTGAGCTCTACTCTATTTTATCAGCCTCACTGTCTATCCCCACACATCTCATGCTTTGCTCTAAATCTTGATATTTAGTGGAACATTCTTTCCCATTTTGTTCTACAAGAATATTTTTGTTATTGTCTTTGGGCTTTCTATATACATTTTGAAATGAGGTTGACAAGTTA 66
HPRE ATAACAGGCCTATTGATTGGAAAGTTTGTCAACGAATTGTGGGTCTTTTGGGGTTTGCTGCCCCTTTTACGCAATGTGGATATCCTGCTTTAATGCCTTTATATGCATGTATACAAGCAAAACAGGCTTTTACTTTCTCGCCAACTTACAAGGCCTTTCTCAGTAAACAGTATATGACCCTTTACCCCGTTGCTCGGCAACGGCCTGGTCTGTGCCAAGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCTTGGCCATAGGCCATCAGCGCATGCGTGGAACCTTTGTGTCTCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACTCCTAGCCGCTTGTTTTGCTCGCAGCAGGTCTGGAGCAAACCTCATCGGGACCGACAATTCTGTCGTACTCTCCCGCAAGTATACATCGTTTCCATGGCTGCTAGGCTGTGCTGCCAACTGGATCCTGCGCGGGACGTCCTTTGTTTACGTCCCGTCGGCGCTGAATCCCGCGGACGACCCCTCCCGGGGCCGCTTGGGGCTCTACCGCCCGCTTCTCCGTCTGCCGTACCGTCCGACCACGGGGCGCACCTCTCTTTACGCGGACTCCCCGTCTGTGCCTTCTCATCTGCCGGACCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGCACGTCGCATGGAGGCCACCGTGAACGCCCACCGGAACCTGCCCAAGGTCTTGCATAAGAGGACTCTTGGACTTTCAGCAATGTCATC 67
R2V17 (энхансерный элемент, полученный из HepB) TTCCTGTAAACAGGCCTATTGATTGGAAAGTTTGTCAACGAATTGTGGGTCTTTTGGGGTTTGCTGCCCCTTTTACGCAATGTGGATATCCTGCTTTAATGCCTTTATATGCATGTATACAAGCAAAACAGGCTTTTACTTTCTCGCCAACTTACAAGGCCTTTCTCAGTAAACAGTATATGACCCTTTACCCCGTTGCTCGGCAACGGCCTGGTCTGTGCCAAGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCTTGGCCATAGGCCATCAGCGCATGCGTGGAACCTTTGTGTCTCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACTCCTAGCCGCTTGTTTTGCTCGCAGCTGGACTGGAGCAAACCTCATCGGGACCGACAATTCTGTCGTACTCTCCCGCAAGCACTCACCGTTTCCGCGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGGCCTCTTCCGCCTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCCATGTATCTTTTTCACCTGTGCCTTGTTTTTGCCTGTGTTCCGCGTCCTACTTTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGGCGGCTTTGGGGCATGGACATAGATCCCTATAAAGAATTTGGTTCATCTTATCAGTTGTTGAATTTTCTTCCTTTGGAC 68
3’-UTR (глобина) GCTGGAGCCTCGGTAGCCGTTCCTCCTGCCCGCTGGGCCTCCCAACGGGCCCTCCTCCCCTCCTTGCACCGGCCCTTCCTGGTCTTTGAATAAA 69
WPRE(r) ATTCGAGCATCTTACCGCCATTTATTCCCATATTTGTTCTGTTTTTCTTGATTTGGGTATACATTTAAATGTTAATAAAACAAAATGGTGGGGCAATCATTTACATTTTTAGGGATATGTAATTACTAGTTCAGGTGTATTGCCACAAGACAAACATGTTAAGAAACTTTCCCGTTATTTACGCTCTGTTCCTGTTAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGATATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTGTGTGGATATGCTGCTTTAATGCCTCTGTATCATGCTATTGCTTCCCGTACGGCTTTCGTTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCCGTCAACGTGGCGTGGTGTGCTCTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGCTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAACTCCTTTCTGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCGATCGCCACGGCAGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTAGGTTGCTGGGCACTGATAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGGGCC 70
В некоторых вариантах осуществления вектор содержит сигнал полиаденилирования (полиА), выбранный из таблицы 6. В некоторых вариантах осуществления полиА-сигнал содержит полинуклеотидную последовательность, которая на по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична любой из SEQ ID NO: 71—75.
Таблица 6
УЧАСТОК ПОЛИ-АДЕНИЛИРОВАНИЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ SEQ ID NO:
Глобин кролика (pAGlobin-Oc) TGGCTAATAAAGGAAATTTATTTTCATTGCAATAGTGTGTTGGAATTTTTTGTGTCTCTCACTCGGAAGAACATATGGGAGGGCAAATCATTTAAAACATCAGAATGAGTATTTGGTTTAGAGTTTGGCAACATATGCCCATATGCTGGCTGCCATGAACAAAGGTTGGCTATAAAGAGGTCATCAGTATATGAAACAGCCCCCTGCTGTCCATTCCTTATTCCATAGAAAAGCCTTGACTTGAGGTTAGATTTTTTTTATATTTTGTTTTGTGTTATTTTTTTCTTTAACATCCCTAAAATTTTCCTTACATGTTTTACTAGCCAGATTTTTCCTCCTCTCCTGACTACTCCCAGTCATAGCTGTCCCTCTTCTCTTATGGAGATC 71
Гормон роста крупного рогатого скота (pAGH-Bt — версия 1) TTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAATACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGGGTACCCAGGTGCTGAAGAATTGACCCGGTTCCTCCTGGG 72
Гормон роста крупного рогатого скота (pAGH-Bt — версия 2) TTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGGGTACCCAGGTGCTGAAGAATTGACCCGGTTCCTCCTGGG 73
Гормон роста крупного рогатого скота (pAGH-Bt — версия 3) CTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGG 74
Гормон роста человека (pAGH-Hs) CTGCCCGGGTGGCATCCCTGTGACCCCTCCCCAGTGCCTCTCCTGGCCCTGGAAGTTGCCACTCCAGTGCCCACCAGCCTTGTCCTAATAAAATTAAGTTGCATCATTTTGTCTGACTAGGTGTCCTTCTATAATATTATGGGGTGGAGGGGGGTGGTATGGAGCAAGGGGCCCAAGTTGGGAAGAAACCTGTAGGGCCTGC 75
Иллюстративные векторные геномы изображены на фиг. 1—4 и представлены под SEQ ID NO: 12—15. Кассета экспрессии каждой последовательности, выделенная заглавными буквами, представлена под SEQ ID NO: 8—11. В некоторых вариантах осуществления векторный геном содержит, фактически состоит из или состоит из полинуклеотидной последовательности, которая характеризуется по меньшей мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 8—11, необязательно с последовательностями ITR в нижнем регистре или без них. Кодирующая последовательность выделена заглавными буквами.
Вектор на основе аденоассоциированного вируса
Аденоассоциированный вирус (AAV) представляет собой парвовирус с дефицитом репликации, одноцепочечный ДНК-геном которого имеет длину приблизительно 4,7 т. о., включая два инвертированных концевых повтора (ITR) длиной ~145 нуклеотидов. Существует несколько известных вариантов AAV, которые также иногда называют серотипами при классификации по антигенным эпитопам. Известны нуклеотидные последовательности геномов серотипов AAV. Например, полный геном AAV-1 представлен в GenBank под номером доступа NC_002077; полный геном AAV-2 представлен в GenBank под номером доступа NC_001401 и Srivastava et al., J. Virol., 45: 555-564 (1983); полный геном AAV-3 представлен в GenBank под номером доступа NC_1829; полный геном AAV-4 представлен в GenBank под номером доступа NC_001829; геном AAV-5 предоставлен в GenBank под номером доступа AF085716; полный геном AAV-6 представлен в GenBank под номером доступа NC_00 1862; по меньшей мере, части геномов AAV-7 и AAV-8 представлены в GenBank под номерами доступа AX753246 и AX753249 соответственно; геном AAV-9 представлен в Gao et al., J. Virol., 78: 6381-6388 (2004); геном AAV-10 представлен в Mol. Ther., 13(1): 67-76 (2006); а геном AAV-11 представлен в Virology, 330(2): 375-383 (2004). Последовательность генома AAVrh.74 представлена в патенте США 9434928, включенном в данный документ посредством ссылки. Цис-действующие последовательности, направляющие репликацию вирусной ДНК (rep), инкапсуляцию/упаковку и интеграцию хромосом клетки-хозяина, содержатся в ITR AAV. Три промотора AAV (названные p5, p19 и p40 по причине их относительного местоположения на карте) управляют экспрессией двух внутренних открытых рамок считывания AAV, кодирующих гены rep и cap. Два промотора rep (p5 и p19) в сочетании с дифференциальным сплайсингом одного интрона AAV (в нуклеотидах 2107 и 2227) приводят к продуцированию четырех белков rep (rep78, rep68, rep52 и rep40) из гена rep. Белки rep обладают множеством ферментативных свойств, которые в конечном итоге ответственны за репликацию вирусного генома. Ген cap экспрессируется под контролем промотора р40 и кодирует три капсидных белка: VP1, VP2 и VP3. Альтернативный сплайсинг и неконсенсусные участки начала трансляции ответственны за продукцию трех родственных капсидных белков. Единственный консенсусный участок полиаденилирования расположен в положении 95 карты генома AAV. Жизненный цикл и генетика AAV рассмотрены в Muzyczka, Current Topics in Microbiology and Immunology, 158: 97-129 (1992).
AAV обладает уникальными признаками, которые делают его привлекательным в качестве вектора для доставки чужеродной ДНК в клетки, например, при генной терапии. Инфекция AAV клеток в культуре не является цитопатической, а естественная инфекция людей и других животных протекает без проявлений и симптомов. Более того, AAV инфицирует многие клетки млекопитающих, что делает возможным нацеливание на множество различных тканей в условиях in vivo. Более того, AAV трансдуцирует медленно делящиеся и неделящиеся клетки и может сохраняться фактически в течение всего времени жизни этих клеток в виде транскрипционно-активной ядерной эписомы (внехромосомного элемента). Провирусный геном AAV вставляют в виде клонированной ДНК в плазмиды, что делает возможным построение рекомбинантных геномов. Кроме того, поскольку сигналы, направляющие репликацию AAV и инкапсуляцию генома, содержатся в ITR генома AAV, некоторые или все внутренние примерно 4,3 т. о. генома (кодирующие репликационные и структурные капсидные белки, rep-cap) можно заменить на чужеродную ДНК. Для получения векторов на основе AAV белки rep и cap могут быть представлены в транс-ориентации. Еще одним важным признаком AAV является то, что это чрезвычайно стабильный и активный вирус. Он легко выдерживает условия, используемые для инактивации аденовируса (от 56° до 65°C в течение нескольких часов), что делает менее критичным хранение AAV в холоде. AAV можно даже лиофилизировать. Наконец, инфицированные AAV клетки не устойчивы к суперинфекции.
Вирусные векторы для доставки генов, применимые при реализации на практике настоящего изобретения, можно построить с применением методологий, хорошо известных в области молекулярной биологии. Как правило, вирусные векторы, несущие трансгены, собирают из полинуклеотидов, кодирующих трансген, подходящих регуляторных элементов и элементов, необходимых для продукции вирусных белков, которые опосредуют трансдукцию клеток. Такие рекомбинантные вирусы можно получить с помощью методик, известных в данной области техники, например, путем трансфекции упаковывающих клеток или временной трансфекции хелперными плазмидами или вирусами. Типичные примеры клеток, упаковывающих вирус, включают без ограничения клетки HeLa, клетки SF9 (необязательно с бакуловирусным хелперным вектором), клетки 293 и т. д. Для получения векторов на основе AAV можно применять герпесвирусную систему, как описано в US20170218395A1. Подробные протоколы получения таких дефектных по репликации рекомбинантных вирусов можно найти, например, в WO95/14785, WO96/22378, патенте США № 5882877, патенте США № 6013516, патенте США № 4861719, патенте США № 5278056 и WO94/19478, полное содержание каждого из которых включено в данный документ посредством ссылки.
Векторы AAV, применимые при реализации на практике настоящего изобретения, можно упаковать в вирионы AAV (вирусные частицы) с применением различных систем, в том числе аденовирусных и систем без хелперов. Стандартные способы в биологии AAV включают способы, описанные Kwon и Schaffer. Pharm Res. (2008) 25(3):489-99; Wu et al. Mol. Ther. (2006) 14(3):316-27. Burger et al. Mol. Ther. (2004) 10(2):302-17; Grimm et al. Curr Gene Ther. (2003) 3(4):281-304; Deyle DR, Russell DW. Curr Opin Mol Ther. (2009) 11(4):442-447; McCarty et al. Gene Ther. (2001) 8(16):1248-54; и Duan et al. Mol Ther. (2001) 4(4):383-91. Системы без хелперов включали системы, описанные в US 6004797; US 7588772 и US 7094604;
ДНК AAV в геномах rAAV может происходить из любого варианта или серотипа AAV, для которого может быть получен рекомбинантный вирус, включая без ограничения следующие варианты или серотипы AAV: AAV-1, AAV-2, AAV-3, AAV-4, AAV-5, AAV-6, AAV-7, AAV-8, AAV-9, AAV- 10, AAV-11, AAV- 12, AAV-13 и AAVrh10. Получение псевдотипированного rAAV раскрыто, например, в WO 01/83692. Также предусмотрены другие типы вариантов rAAV, например, rAAV с мутациями в капсиде. См., например, Marsic et al., Molecular Therapy, 22(11): 1900-1909 (2014). Нуклеотидные последовательности геномов различных серотипов AAV известны из уровня техники.
В некоторых случаях rAAV содержит самокомплементарный геном. Как определено в данном документе, rAAV, содержащий «самокомплементарный» или «двухцепочечный» геном, относится к rAAV, который был сконструирован таким образом, что кодирующая область rAAV сконфигурирована для образования внутримолекулярной матрицы двухцепочечной ДНК, как описано в McCarty et al. Self-complementary recombinant adeno-associated virus (scAAV) vectors promote efficient transduction independently of DNA synthesis. Gene Therapy. 8 (16): 1248-54 (2001). В некоторых случаях в настоящем изобретении предусмотрено применение rAAV, содержащего самокомплементарный геном, поскольку при инфицировании (таком как трансдукция), а не при ожидании клеточно-опосредованного синтеза второй цепи генома rAAV, две комплементарные половины scAAV будут связываться с образованием одной единицы двухцепочечной ДНК (dsDNA), готовой к немедленной репликации и транскрипции. Следует понимать, что вместо полной кодирующей емкости, имеющей место у rAAV (4,7—6 т. о.), rAAV, содержащий самокомплементарный геном, может содержать лишь приблизительно половину данного количества (≈2,4 т. о.).
В других случаях вектор на основе rAAV содержит одноцепочечный геном. Как определено в данном документе, «отдельный стандартный» геном относится к геному, который не является самокомплементарным. В большинстве случаев нерекомбинантные AAV имеют одноцепочечные ДНК-геномы. Были некоторые указания на то, что для достижения эффективной трансдукции клеток rAAV должны представлять собой scAAV. Однако в настоящем изобретении предусмотрены векторы на основе rAAV, которые могут иметь одноцепочечные геномы, а не самокомплементарные геномы, при том понимании, что для получения оптимальной транскрипции гена в целевых клетках могут быть полезны и другие генетические модификации вектора на основе rAAV. В некоторых случаях настоящее изобретение относится к одноцепочечным векторам на основе rAAV, способным к эффективному переносу генов в передний сегмент глаза мыши. См. Wang et al. Single stranded adeno-associated virus achieves efficient gene transfer to anterior segment in the mouse eye. PLoS ONE 12(8): e0182473 (2017).
В некоторых случаях вектор на основе rAAV относится к серотипу AAV1, AAV2, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, AAV12, AAV13, AAVrh10 или AAVrh74. Получение псевдотипированного rAAV раскрыто, например, в WO 01/83692. Также предусмотрены другие типы вариантов rAAV, например, rAAV с мутациями в капсиде. См., например, Marsic et al., Molecular Therapy, 22(11): 1900-1909 (2014). В некоторых случаях вектор на основе rAAV относится к серотипу AAV9. В некоторых вариантах осуществления указанный вектор на основе rAAV относится к серотипу AAV9 и содержит одноцепочечный геном. В некоторых вариантах осуществления указанный вектор на основе rAAV относится к серотипу AAV9 и содержит самокомплементарный геном. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV содержит последовательности инвертированных концевых повторов (ITR) из AAV2. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV содержит геном AAV2, так что вектор на основе rAAV представляет собой вектор на основе AAV-2/9, вектор на основе AAV-2/6 или вектор на основе AAV-2/8.
Полноразмерные последовательности и последовательности капсидных генов для большинства известных AAV представлены в патенте США № 8524446, который включен в данный документ во всей своей полноте.
Векторы на основе AAV могут содержать последовательность AAV дикого типа или они могут содержать одну или несколько модификаций в последовательности AAV дикого типа. В определенных вариантах осуществления вектор на основе AAV содержит одну или несколько аминокислотных модификаций, например, замены, делеции или вставки в капсидном белке, например, VP1, VP2 и/или VP3. В отдельных вариантах осуществления модификация обеспечивает снижение иммуногенности при введении вектора на основе AAV субъекту.
Капсидные белки rAAV можно модифицировать таким образом, чтобы rAAV был нацелен на конкретную представляющую интерес целевую ткань, такую как эндотелиальные клетки или, более конкретно, эндотелиальные верхушечные клетки. В некоторых вариантах осуществления rAAV вводят непосредственно во внутрижелудочковое пространство субъекта.
В некоторых вариантах осуществления вирион rAAV представляет собой вирион rAAV AAV2. Капсид может представлять собой капсид AAV2 или его функциональный вариант. В некоторых вариантах осуществления капсид AAV2 характеризуется по меньшей мере 98%, 99% или 100% идентичностью с эталонным капсидом AAV2, например,
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNRQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
(SEQ ID NO: 76).
В некоторых вариантах осуществления вирион rAAV представляет собой вирион rAAV AAV9. Капсид может представлять собой капсид AAV9 или его функциональный вариант. В некоторых вариантах осуществления капсид AAV9 характеризуется по меньшей мере 98%, 99% или 100% идентичностью с эталонным капсидом AAV9, например,
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWALKPGAPQPKANQQHQDNARGLVLPGYKYLGPGNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRLLEPLGLVEEAAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSAGIGKSGAQPAKKRLNFGQTGDTESVPDPQPIGEPPAAPSGVGSLTMASGGGAPVADNNEGADGVGSSSGNWHCDSQWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNSTSGGSSNDNAYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTDNNGVKTIANNLTSTVQVFTDSDYQLPYVLGSAHEGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNDGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFQFSYEFENVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSKTINGSGQNQQTLKFSVAGPSNMAVQGRNYIPGPSYRQQRVSTTVTQNNNSEFAWPGASSWALNGRNSLMNPGPAMASHKEGEDRFFPLSGSLIFGKQGTGRDNVDADKVMITNEEEIKTTNPVATESYGQVATNHQSAQAQAQTGWVQNQGILPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGMKHPPPQILIKNTPVPADPPTAFNKDKLNSFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSNNVEFAVNTEGVYSEPRPIGTRYLTRNL
(SEQ ID NO: 77).
В некоторых вариантах осуществления вирион rAAV представляет собой вирион rAAV AAV6. Капсид может представлять собой капсид AAV9 или его функциональный вариант. В некоторых вариантах осуществления капсид AAV6 характеризуется по меньшей мере 98%, 99% или 100% идентичностью с эталонным капсидом AAV6, например,
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPFGLVEEGAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSSGIGKTGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPLGEPPATPAAVGPTTMASGGGAPMADNNEGADGVGNASGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSASTGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTTNDGVTTIANNLTSTVQVFSDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLNRTQNQSGSAQNKDLLFSRGSPAGMSVQPKNWLPGPCYRQQRVSKTKTDNNNSNFTWTGASKYNLNGRESIINPGTAMASHKDDKDKFFPMSGVMIFGKESAGASNTALDNVMITDEEEIKATNPVATERFGTVAVNLQSSSTDPATGDVHVMGALPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPPAEFSATKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEVQYTSNYAKSANVDFTVDNNGLYTEPRPIGTRYLTRPL
(SEQ ID NO: 78).
В некоторых вариантах осуществления вирион rAAV представляет собой вирион rAAV AAVrh.10. Капсид может представлять собой капсид AAV9 или его функциональный вариант. В некоторых вариантах осуществления капсид AAVrh.10 характеризуется по меньшей мере 98%, 99% или 100% идентичностью с эталонным капсидом AAVrh.10, например,
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWDLKPGAPKPKANQQKQDDGRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLRYNHADAEFQERLQEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEGAKTAPGKKRPVEPSPQRSPDSSTGIGKKGQQPAKKRLNFGQTGDSESVPDPQPIGEPPAGPSGLGSGTMAAGGGAPMADNNEGADGVGSSSGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNGTSGGSTNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNEGTKTIANNLTSTIQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFEFSYQFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQSTGGTAGTQQLLFSQAGPNNMSAQAKNWLPGPCYRQQRVSTTLSQNNNSNFAWTGATKYHLNGRDSLVNPGVAMATHKDDEERFFPSSGVLMFGKQGAGKDNVDYSSVMLTSEEEIKTTNPVATEQYGVVADNLQQQNAAPIVGAVNSQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPADPPTTFSQAKLASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSTNVDFAVNTDGTYSEPRPIGTRYLTRNL
(SEQ ID NO: 79).
В некоторых вариантах осуществления капсидный белок кодируется полинуклеотидом, поставляемым на плазмиде в транс-положении к плазмиде-переносчику. Полинуклеотидная последовательность гена cap из AAVrh74 дикого типа выглядит следующим образом:
последовательность, кодирующая капсид AAVrh74 (SEQ ID NO: 80)
ATGGCTGCCGATGGTTATCTTCCAGATTGGCTCGAGGACAACCTCTCTGAGGGCATTCGCGAGTGGTGGGACCTGAAACCTGGAGCCCCGAAACCCAAAGCCAACCAGCAAAAGCAGGACAACGGCCGGGGTCTGGTGCTTCCTGGCTACAAGTACCTCGGACCCTTCAACGGACTCGACAAGGGGGAGCCCGTCAACGCGGCGGACGCAGCGGCCCTCGAGCACGACAAGGCCTACGACCAGCAGCTCCAAGCGGGTGACAATCCGTACCTGCGGTATAATCACGCCGACGCCGAGTTTCAGGAGCGTCTGCAAGAAGATACGTCTTTTGGGGGCAACCTCGGGCGCGCAGTCTTCCAGGCCAAAAAGCGGGTTCTCGAACCTCTGGGCCTGGTTGAATCGCCGGTTAAGACGGCTCCTGGAAAGAAGAGACCGGTAGAGCCATCACCCCAGCGCTCTCCAGACTCCTCTACGGGCATCGGCAAGAAAGGCCAGCAGCCCGCAAAAAAGAGACTCAATTTTGGGCAGACTGGCGACTCAGAGTCAGTCCCCGACCCTCAACCAATCGGAGAACCACCAGCAGGCCCCTCTGGTCTGGGATCTGGTACAATGGCTGCAGGCGGTGGCGCTCCAATGGCAGACAATAACGAAGGCGCCGACGGAGTGGGTAGTTCCTCAGGAAATTGGCATTGCGATTCCACATGGCTGGGCGACAGAGTCATCACCACCAGCACCCGCACCTGGGCCCTGCCCACCTACAACAACCACCTCTACAAGCAAATCTCCAACGGGACCTCGGGAGGAAGCACCAACGACAACACCTACTTCGGCTACAGCACCCCCTGGGGGTATTTTGACTTCAACAGATTCCACTGCCACTTTTCACCACGTGACTGGCAGCGACTCATCAACAACAACTGGGGATTCCGGCCCAAGAGGCTCAACTTCAAGCTCTTCAACATCCAAGTCAAGGAGGTCACGCAGAATGAAGGCACCAAGACCATCGCCAATAACCTTACCAGCACGATTCAGGTCTTTACGGACTCGGAATACCAGCTCCCGTACGTGCTCGGCTCGGCGCACCAGGGCTGCCTGCCTCCGTTCCCGGCGGACGTCTTCATGATTCCTCAGTACGGGTACCTGACTCTGAACAATGGCAGTCAGGCTGTGGGCCGGTCGTCCTTCTACTGCCTGGAGTACTTTCCTTCTCAAATGCTGAGAACGGGCAACAACTTTGAATTCAGCTACAACTTCGAGGACGTGCCCTTCCACAGCAGCTACGCGCACAGCCAGAGCCTGGACCGGCTGATGAACCCTCTCATCGACCAGTACTTGTACTACCTGTCCCGGACTCAAAGCACGGGCGGTACTGCAGGAACTCAGCAGTTGCTATTTTCTCAGGCCGGGCCTAACAACATGTCGGCTCAGGCCAAGAACTGGCTACCCGGTCCCTGCTACCGGCAGCAACGCGTCTCCACGACACTGTCGCAGAACAACAACAGCAACTTTGCCTGGACGGGTGCCACCAAGTATCATCTGAATGGCAGAGACTCTCTGGTGAATCCTGGCGTTGCCATGGCTACCCACAAGGACGACGAAGAGCGATTTTTTCCATCCAGCGGAGTCTTAATGTTTGGGAAACAGGGAGCTGGAAAAGACAACGTGGACTATAGCAGCGTGATGCTAACCAGCGAGGAAGAAATAAAGACCACCAACCCAGTGGCCACAGAACAGTACGGCGTGGTGGCCGATAACCTGCAACAGCAAAACGCCGCTCCTATTGTAGGGGCCGTCAATAGTCAAGGAGCCTTACCTGGCATGGTGTGGCAGAACCGGGACGTGTACCTGCAGGGTCCCATCTGGGCCAAGATTCCTCATACGGACGGCAACTTTCATCCCTCGCCGCTGATGGGAGGCTTTGGACTGAAGCATCCGCCTCCTCAGATCCTGATTAAAAACACACCTGTTCCCGCGGATCCTCCGACCACCTTCAATCAGGCCAAGCTGGCTTCTTTCATCACGCAGTACAGTACCGGCCAGGTCAGCGTGGAGATCGAGTGGGAGCTGCAGAAGGAGAACAGCAAACGCTGGAACCCAGAGATTCAGTACACTTCCAACTACTACAAATCTACAAATGTGGACTTTGCTGTCAATACTGAGGGTACTTATTCCGAGCCTCGCCCCATTGGCACCCGTTACCTCACCCGTAATCTGTAA.
В настоящем изобретении дополнительно предусмотрены белковые последовательности для VP1, VP2 и VP3 AAVrh74, включая SEQ ID NO: 2-4, и их гомологи или функциональные варианты.
VP1 AAVrh74 (SEQ ID NO: 81)
MAAGGGAPMADNNEGADGVGSSSGNWHCDSTWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNGTSGGSTNDNTYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNEGTKTIANNLTSTIQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFEFSYNFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQSTGGTAGTQQLLFSQAGPNNMSAQAKNWLPGPCYRQQRVSTTLSQNNNSNFAWTGATKYHLNGRDSLVNPGVAMATHKDDEERFFPSSGVLMFGKQGAGKDNVDYSSVMLTSEEEIKTTNPVATEQYGVVADNLQQQNAAPIVGAVNSQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPADPPTTFNQAKLASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSTNVDFAVNTEGTYSEPRPIGTRYLTRNL.
VP2 AAVrh74 (SEQ ID NO: 82)
STIQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFEFSYNFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQSTGGTAGTQQLLFSQAGPNNMSAQAKNWLPGPCYRQQRVSTTLSQNNNSNFAWTGATKYHLNGRDSLVNPGVAMATHKDDEERFFPSSGVLMFGKQGAGKDNVDYSSVMLTSEEEIKTTNPVATEQYGVVADNLQQQNAAPIVGAVNSQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPADPPTTFNQAKLASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSTNVDFAVNTEGTYSEPRPIGTRYLTRNL.
VP3 AAVrh74 (SEQ ID NO: 83)
RTGNNFEFSYNFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTQSTGGTAGTQQLLFSQAGPNNMSAQAKNWLPGPCYRQQRVSTTLSQNNNSNFAWTGATKYHLNGRDSLVNPGVAMATHKDDEERFFPSSGVLMFGKQGAGKDNVDYSSVMLTSEEEIKTTNPVATEQYGVVADNLQQQNAAPIVGAVNSQGALPGMVWQNRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPADPPTTFNQAKLASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSTNVDFAVNTEGTYSEPRPIGTRYLTRNL.
В определенных случаях капсид AAVrh74 содержит аминокислотную последовательность, представленную под SEQ ID NO: 2. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV содержит полипептид, который содержит, или по сути состоит, или дополнительно состоит из последовательности, которая, например, на по меньшей мере 65%, на по меньшей мере 70%, на по меньшей мере 75%, на по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88% или 89%, чаще на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97 %, 98%, 99% или более идентична аминокислотной последовательности VP1 AAVrh74, представленной под SEQ ID NO: 2. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV содержит полипептид, который содержит, или по сути состоит, или дополнительно состоит из последовательности, которая, например, на по меньшей мере 65%, на по меньшей мере 70%, на по меньшей мере 75%, на по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88% или 89%, чаще на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97 %, 98%, 99% или более идентична аминокислотной последовательности VP2 AAVrh74, представленной под SEQ ID NO: 3. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе rAAV содержит полипептид, который содержит, или по сути состоит, или дополнительно состоит из последовательности, которая, например, на по меньшей мере 65%, на по меньшей мере 70%, на по меньшей мере 75%, на по меньшей мере 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88% или 89%, чаще на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97 %, 98%, 99% или более идентична аминокислотной последовательности VP3 AAVrh74, представленной под SEQ ID NO: 4.
В некоторых вариантах осуществления вирион rAAV представляет собой вирион rAAV AAV-PHP.B или его нейтрофический вариант, такой как без ограничения один из вариантов, описанных в международных патентных публикациях №№ WO 2015/038958 A1 и WO 2017/100671 A1. Например, капсид AAV может содержать по меньшей мере 4 смежные аминокислоты из последовательности TLAVPFK (SEQ ID NO: 85) или KFPVALT (SEQ ID NO: 86), например, вставленные между последовательностями, кодирующими аминокислоты 588 и 589 в AAV9.
Капсид может представлять собой капсид AAV-PHP.B или его функциональный вариант. В некоторых вариантах осуществления капсид AAV-PHP.B характеризуется по меньшей мере 98%, 99% или 100% идентичностью с эталонным капсидом AAV-PHP.B, например,
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWALKPGAPQPKANQQHQDNARGLVLPGYKYLGPGNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRLLEPLGLVEEAAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSAGIGKSGAQPAKKRLNFGQTGDTESVPDPQPIGEPPAAPSGVGSLTMASGGGAPVADNNEGADGVGSSSGNWHCDSQWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNSTSGGSSNDNAYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTDNNGVKTIANNLTSTVQVFTDSDYQLPYVLGSAHEGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNDGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFQFSYEFENVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTINGSGQNQQTLKFSVAGPSNMAVQGRNYIPGPSYRQQRVSTTVTQNNNSEFAWPGASSWALNGRNSLMNPGPAMASHKEGEDRFFPLSGSLIFGKQGTGRDNVDADKVMITNEEEIKTTNPVATESYGQVATNHQSAQTLAVPFKAQAQTGWVQNQGILPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGMKHPPPQILIKNTPVPADPPTAFNKDKLNSFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSNNVEFAVNTEGVYSEPRPIGTRYLTRNL
(SEQ ID NO: 84).
Дополнительные капсиды AAV, применяемые в вирионах rAAV по настоящему изобретению, включают капсиды, раскрытые в патентных публикациях №№ WO 2009/012176 A2 и WO 2015/168666 A2.
Не ограничиваясь какой-либо теорией, авторами настоящего изобретения было определено, что вектор на основе AAV9, AAVrh.74 или вектор на основе AAVrh.10 будет придавать вектору требуемый тропизм в отношении сердца. Не ограничиваясь какой-либо теорией, авторами настоящего изобретения дополнительно было определено, что вектор на основе AAV9, AAVrh.74 или вектор на основе AAVrh.10 может обеспечивать требуемую специфичность в отношении клеток сердца.
Фармацевтические композиции и наборы
В одном аспекте в настоящем изобретении предусмотрены фармацевтические композиции, содержащие вирион rAAV по настоящему изобретению и один или несколько фармацевтически приемлемых носителей, разбавителей или вспомогательных веществ.
С целью введения, например путем инъекции, можно использовать различные растворы, такие как стерильные водные растворы. Такие водные растворы при необходимости можно забуферить, а жидкий разбавитель сначала сделать изотоническим с помощью солевого раствора или глюкозы. Растворы rAAV в виде свободной кислоты (ДНК содержит кислые фосфатные группы) или фармакологически приемлемой соли можно получить в воде, соответствующим образом смешанной с поверхностно-активным веществом, таким как полоксамер 188, например, в концентрации 0,001% или 0,01%. Дисперсию rAAV также можно получить в глицерине, жидких полиэтиленгликолях и их смесях, а также в маслах. При обычных условиях хранения и применения данные препараты содержат консервант для предупреждения роста микроорганизмов. В этой связи все используемые стерильные водные среды могут быть легко получены стандартными методиками, хорошо известными специалистам в данной области техники.
Фармацевтические формы, пригодные для инъекционного применения, включают без ограничения стерильные водные растворы или дисперсии и стерильные порошки для немедленного приготовления стерильных инъекционных растворов или дисперсий. Во всех случаях форма является стерильной и должна быть жидкой до такой степени, чтобы существовала возможность ее легкого введения шприцем. Она должна быть стабильной в условиях производства и хранения и должна быть защищена от загрязняющего действия микроорганизмов, таких как бактерии и грибки. Носителем может быть растворитель или дисперсионная среда, содержащая, например, воду, этанол, полиол (например, глицерин, пропиленгликоль, жидкий полиэтиленгликоль и др.), их подходящие смеси и растительные масла. Надлежащую текучесть можно поддерживать, например, за счет применения покрытия, такого как лецитин, за счет поддержания требуемого размера частиц в случае дисперсии и за счет применения поверхностно-активных веществ. Предупредить действие микроорганизмов можно с помощью различных противобактериальных и противогрибковых средств, например парабенов, хлорбутанола, фенола, сорбиновой кислоты, тимеросала и др. Во многих случаях предпочтительным будет включение придающих изотоничность средств, например, сахаров или хлорида натрия. Пролонгированное всасывание инъекционных композиций может быть достигнуто за счет применения средств, замедляющих всасывание, например, моностеарата алюминия и желатина.
Стерильные инъекционные растворы можно получить путем включения rAAV в требуемом количестве в соответствующий растворитель с различными другими перечисленными выше ингредиентами, при необходимости, с последующей стерилизацией фильтрацией. Как правило, дисперсии получают путем включения простерилизованного активного ингредиента в стерильную среду-носитель, которая содержит основную дисперсионную среду и необходимые другие ингредиенты из перечисленных выше. В случае стерильных порошков для получения стерильных инъекционных растворов предпочтительными способами приготовления являются вакуумная сушка и методика лиофилизации, которые позволяют получить порошок активного ингредиента плюс любой дополнительный необходимый ингредиент из его раствора, предварительно простерилизованного фильтрацией.
В другом аспекте настоящее изобретение предусматривает набор, содержащий вирион rAAV по настоящему изобретению и инструкции по применению.
Способы применения
В одном аспекте в настоящем изобретении предусмотрен способ повышения активности MLP в клетке, предусматривающий приведение клетки в контакт с rAAV по настоящему изобретению. В другом аспекте в настоящем изобретении предусмотрен способ повышения активности MLP у субъекта, предусматривающий введение rAAV по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления клетка и/или субъект имеют дефицит уровней экспрессии матричной РНК CSRP3 или белка MLP и/или активности и/или имеют мутацию с утратой функции в CSRP3. Клетка может представлять собой клетку сердца, например, кардиомиоцит.
В некоторых вариантах осуществления способ способствует выживанию сердечной клетки, например кардиомиоцита, в культуре клеток и/или в условиях in vivo. В некоторых вариантах осуществления способ стимулирует и/или восстанавливает функцию сердца.
Способы лечения
В другом аспекте в настоящем изобретении предусмотрен способ лечения заболевания или нарушения у нуждающегося в этом субъекта, предусматривающий введение субъекту эффективного количества вириона rAAV по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления заболевание или нарушение представляет собой заболевание или нарушение сердечной деятельности. К иллюстративным нарушениям сердечной деятельности относятся сердечная недостаточность, гипертрофическая кардиомиопатия и дилатационная кардиомиопатия. В некоторых вариантах осуществления субъект страдает генетическим нарушением экспрессии или функции CSRP3. В некоторых вариантах осуществления заболевание или нарушение представляет собой HCM или DCM. В некоторых вариантах осуществления заболевание или нарушение представляет собой наследственную гипертрофическую кардиомиопатию-12 (CMH12). В некоторых вариантах осуществления заболевание или нарушение представляет собой дилатационную кардиомиопатию-1М (CMD1M). В некоторых вариантах осуществления заболевание или нарушение представляет собой скелетную миотрофию. В некоторых вариантах осуществления заболевание или нарушение представляет собой плече-лопаточно-лицевую мышечную дистрофию, немалиновую миопатию или поясно-конечностную мышечную дистрофию типа 2B. В некоторых вариантах осуществления заболевание или нарушение представляет собой поясно-конечностную мышечную дистрофию типа 2А, мышечную дистрофию Дюшенна или дерматомиозит.
AAV-опосредованная доставка белка MLP в сердце может увеличить продолжительность жизни, предупредить или ослабить дегенерацию клеток сердца, сердечную недостаточность, рубцевание, снижение фракции выброса, аритмию, стенокардию, обструктивную HCM или DCM, гипертрофию желудочков (IVS: диапазон 14-32 мм), желудочковую тахикардию, легкие I-II балла по NYHA, непереносимость физической нагрузки, стенокардию (боль в груди), внезапную сердечную смерть, миалгии и судороги при физической нагрузке.
Описанные в данном документе способы могут обеспечивать эффективное биораспределение в сердце. Они могут приводить к устойчивой экспрессии во всех или значительной части клеток сердца, например, кардиомиоцитах. Примечательно, что раскрытые в данном документе способы могут обеспечивать длительную экспрессию белка MLP на протяжении всей жизни субъекта после введения вектора на основе AAV.
В настоящем изобретении также предусмотрены различные виды комбинированной терапии. В частности, предусмотрены комбинации способов по настоящему изобретению со стандартными средствами лечения (например, кортикостероидами или препаратами для местного снижения давления), а также комбинации с новыми средствами терапии. В некоторых случаях субъекта можно лечить стероидом и/или комбинацией иммунодепрессантов для предупреждения или снижения иммунного ответа на введение описанного в данном документе rAAV.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят в дозе, составляющей от приблизительно 1×1012 до 5×1014 векторных геномов (вг) вектора на основе AAV, на килограмм (кг) общей массы тела субъекта (вг/кг). В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят в дозе, составляющей от приблизительно 1×1013 до 5×1014 вг/кг. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят в дозе, составляющей от приблизительно 5×1013 до 3×1014 вг/кг. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят в дозе, составляющей от приблизительно 5×1013 до 1×1014 вг/кг. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят в дозе, составляющей менее чем приблизительно 1×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 7×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 1×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 7×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 1×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 7×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 1×1015 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1015 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1015 вг/кг или менее чем приблизительно 7×1015 вг/кг.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят в дозе, составляющей приблизительно 1×1012 вг/кг, приблизительно 3×1012 вг/кг, приблизительно 5×1012 вг/кг, приблизительно 7×1012 вг/кг, приблизительно 1×1013 вг/кг, приблизительно 3×1013 вг/кг, приблизительно 5×1013 вг/кг, приблизительно 7×1013 вг/кг, приблизительно 1×1014 вг/кг, приблизительно 3×1014 вг/кг, приблизительно 5×1014 вг/кг, приблизительно 7×1014 вг/кг, приблизительно 1×1015 вг/кг, приблизительно 3×1015 вг/кг, приблизительно 5×1015 вг/кг или приблизительно 7×1015 вг/кг.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят в дозе 1×1012 вг/кг, 3×1012 вг/кг, 5×1012 вг/кг, 7×1012 вг/кг, 1×1013 вг/кг, 3×1013 вг/кг, 5×1013 вг/кг, 7×1013 вг/кг, 1×1014 вг/кг, 3×1014 вг/кг, 5×1014 вг/кг, 7×1014 вг/кг, 1×1015 вг/кг, 3×1015 вг/кг, 5×1015 вг/кг или 7×1015 вг/кг.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят системно в дозе, составляющей от приблизительно 1×1012 до 5×1014 векторных геномов (вг) вектора на основе AAV, на килограмм (кг) общей массы тела субъекта (вг/кг). В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят системно в дозе, составляющей от приблизительно 1×1013 до 5×1014 вг/кг. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят системно в дозе, составляющей от приблизительно 5×1013 до 3×1014 вг/кг. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят системно в дозе, составляющей от приблизительно 5×1013 до 1×1014 вг/кг. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят системно в дозе, составляющей менее чем приблизительно 1×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 7×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 1×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 7×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 1×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 7×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 1×1015 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1015 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1015 вг/кг или менее чем приблизительно 7×1015 вг/кг.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят системно в дозе, составляющей приблизительно 1×1012 вг/кг, приблизительно 3×1012 вг/кг, приблизительно 5×1012 вг/кг, приблизительно 7×1012 вг/кг, приблизительно 1×1013 вг/кг, приблизительно 3×1013 вг/кг, приблизительно 5×1013 вг/кг, приблизительно 7×1013 вг/кг, приблизительно 1×1014 вг/кг, приблизительно 3×1014 вг/кг, приблизительно 5×1014 вг/кг, приблизительно 7×1014 вг/кг, приблизительно 1×1015 вг/кг, приблизительно 3×1015 вг/кг, приблизительно 5×1015 вг/кг или приблизительно 7×1015 вг/кг.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят системно в дозе 1×1012 вг/кг, 3×1012 вг/кг, 5×1012 вг/кг, 7×1012 вг/кг, 1×1013 вг/кг, 3×1013 вг/кг, 5×1013 вг/кг, 7×1013 вг/кг, 1×1014 вг/кг, 3×1014 вг/кг, 5×1014 вг/кг, 7×1014 вг/кг, 1×1015 вг/кг, 3×1015 вг/кг, 5×1015 вг/кг или 7×1015 вг/кг.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят внутривенно в дозе, составляющей от приблизительно 1×1012 до 5×1014 векторных геномов (вг) вектора на основе AAV, на килограмм (кг) общей массы тела субъекта (вг/кг). В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят внутривенно в дозе, составляющей от приблизительно 1×1013 до 5×1014 вг/кг. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят внутривенно в дозе, составляющей от приблизительно 5×1013 до 3×1014 вг/кг. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят внутривенно в дозе, составляющей от приблизительно 5×1013 до 1×1014 вг/кг. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят внутривенно в дозе, составляющей менее чем приблизительно 1×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 7×1012 вг/кг, менее чем приблизительно 1×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 7×1013 вг/кг, менее чем приблизительно 1×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 7×1014 вг/кг, менее чем приблизительно 1×1015 вг/кг, менее чем приблизительно 3×1015 вг/кг, менее чем приблизительно 5×1015 вг/кг или менее чем приблизительно 7×1015 вг/кг.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят внутривенно в дозе, составляющей приблизительно 1×1012 вг/кг, приблизительно 3×1012 вг/кг, приблизительно 5×1012 вг/кг, приблизительно 7×1012 вг/кг, приблизительно 1×1013 вг/кг, приблизительно 3×1013 вг/кг, приблизительно 5×1013 вг/кг, приблизительно 7×1013 вг/кг, приблизительно 1×1014 вг/кг, приблизительно 3×1014 вг/кг, приблизительно 5×1014 вг/кг, приблизительно 7×1014 вг/кг, приблизительно 1×1015 вг/кг, приблизительно 3×1015 вг/кг, приблизительно 5×1015 вг/кг или приблизительно 7×1015 вг/кг.
В некоторых вариантах осуществления вектор на основе AAV вводят внутривенно в дозе, составляющей 1×1012 вг/кг, 3×1012 вг/кг, 5×1012 вг/кг, 7×1012 вг/кг, 1×1013 вг/кг, 3×1013 вг/кг, 5×1013 вг/кг, 7×1013 вг/кг, 1×1014 вг/кг, 3×1014 вг/кг, 5×1014 вг/кг, 7×1014 вг/кг, 1×1015 вг/кг, 3×1015 вг/кг, 5×1015 вг/кг или 7×1015 вг/кг.
Доказательства функционального улучшения, клинической пользы или эффективности у пациентов могут быть выявлены по изменению согласно функциональной классификации Нью-Йоркской кардиологической ассоциации (класс NYHA), в патологической электрокардиограмме, конечно-диастолическом/конечно-систолическом диаметре левого желудочка, максимальной толщине межжелудочковой стенки, максимальной толщине задней стенки, частоте пика Е и пика А, пиковой ранней и пиковой поздней скорости трансмитриального наполнения, ранней диастолической и поздней диастолической доплеровской скорости в тканях, артериальной гипертонии и степени сердечной гипертрофии. Дополнительная гистология миокарда позволит выявить AAV-опосредованный полезный эффект MLP, что будет видно по снижению гипертрофии кардиомиоцитов, уменьшению массива миоцитов и уменьшению интерстициального и периваскулярного фиброза и рубцевания по сравнению с исходным уровнем или контрольными пациентами с соответствующим заболеванием.
Введение композиций
Введение эффективной дозы композиций можно осуществлять стандартными в данной области путями, включая без ограничения системную, местную, прямую инъекцию, внутривенное, внутрисердечное введение. В некоторых случаях введение включает системную, местную, прямую инъекцию, внутривенную, внутрисердечную инъекцию. Введение можно осуществлять путем катетеризации сердца.
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрено местное введение и системное введение эффективной дозы rAAV и композиций по настоящему изобретению. Например, системное введение может быть введением в систему кровообращения, так чтобы воздействие происходило на весь организм. Системное введение включает парентеральное введение посредством инъекции, инфузии или имплантации. Пути введения раскрытых в данном документе композиций включают внутривенное («IV») введение, внутрибрюшинное («IP») введение, внутримышечное («IM») введение, введение в очаг поражения или подкожное («SC») введение или имплантацию устройства с медленным высвобождением, например, мини-осмотической помпы, депо-состава и т. д. В некоторых вариантах осуществления способы по настоящему изобретению предусматривают введение вектора на основе AAV по настоящему изобретению или содержащей его фармацевтической композиции посредством внутривенного, внутримышечного, внутриартериального, внутрипочечного, внутриуретрального, внутрисердечного, внутрикоронарного, внутримиокардиального, внутрикожного, эпидурального, подкожного, внутрибрюшинного, внутрижелудочкового, ионофоретического или внутричерепного введения.
В частности, введение rAAV по настоящему изобретению можно осуществлять с помощью любого физического способа, который позволит транспортировать рекомбинантный вектор на основе rAAV в целевую ткань животного. Введение включает без ограничения инъекцию в сердце.
В некоторых вариантах осуществления способы по настоящему изобретению предусматривает внутрисердечную доставку. Инфузию можно проводить с помощью специальной канюли, катетера, шприца/иглы с применением инфузионной помпы. Введение может предусматривать доставку эффективного количества вириона rAAV или фармацевтической композиции, содержащей вирион rAAV, в сердце. Это можно осуществить, например, посредством внутривенного, внутримышечного, внутриартериального, внутрипочечного, внутриуретрального, внутрисердечного, внутрикоронарного, внутримиокардиального, внутрикожного, эпидурального, подкожного, внутрибрюшинного, внутрижелудочкового, ионофоретического или внутричерепного введения. Композиции по настоящему изобретению дополнительно можно вводить внутривенно.
Раскрытый в данном документе способ лечения позволяет уменьшить и/или предупредить один или несколько симптомов, в том числе без ограничения гипертрофию желудочков, желудочковую тахикардию, умеренные I-II балла по NYHA, непереносимость физической нагрузки и стенокардию.
ПРИМЕРЫ
Пример 1. Доклиническая биоактивность и эффективность
Векторы, проиллюстрированные на фиг. 1-4, тестируют в условиях in vitro с применением культивируемых кардиомиоцитов (например, кардиомиоцитов с индуцированными плюрипотентными стволовыми клетками, iPSC-CM). Экспрессию MLP оценивают с помощью иммунофлуоресценции и вестерн-блоттинга. Анализы фосфорилирования позволяют выявить снижение аутофосфорилирования протеинкиназы C-альфа (PKC-A).
Выбранные векторы тестируют в условиях in vivo с применением дефицитных по MLP или мутантных по MLP мышиных моделей кардиомиопатии (например, модели с включением C58G (KI) или модели с KI W4R). Эффективность определяют путем измерения фракции выброса левого желудочка (LVEF) и/или конечно-диастолического размера левого желудочка (LVED) с помощью эхокардиографии, снижения общей массы сердца (например, нормализованной по длине большеберцовой кости), инвазивных гемодинамических оценок работы левого желудочка на dP/dtmax, dP/dtmin и константы релаксации Tau или уменьшения гипертрофии левого и/или правого желудочка при гистологической оценке. Дополнительно, эффективность в условиях in vivo на мышиной модели оценивают путем измерения биомаркеров, в том числе без ограничения экспрессии гена предсердного натрийуретического фактора (Nppa), экспрессии гена натрийуретического пептида головного мозга (Nppb) и экспрессии белка тяжелой цепи бета-миозина. Физиологическую эффективность определяют путем тестирования активности протеинкиназы С-альфа (PKC-A), фосфорилирования MLP в сердце, убиквитин-зависимой деградации белков протеасомой. В случае векторов на основе AAV наблюдается нормализация или смягчение состояния в ответ на лечение.
Пример 2. Экспрессия белка в кардиомиоцитах человека
Векторы, проиллюстрированные на фиг. 1-4, тестировали в условиях in vitro с применением контрольной линии клеток (CHO-Lec2; фиг. 5A) и культивируемых кардиомиоцитов (линии дифференцированных клеток AC16; фиг. 5B). Экспрессию мышечного белка LIM (MLP; белок, кодируемый CSRP3) оценивали с помощью вестерн-блоттинга.
На фиг. 5А представлена экспрессия CSRP3 в трансдуцированных CHO-Lec2. На фиг. 5B представлена экспрессия CSRP3 в трансдуцированных кардиомиоцитах (линия дифференцированных клеток AC16 - Sigma-Aldrich®, № по кат. SCC109). Клетки трансдуцировали посредством MOI 3E5 из каждого вектора; спустя 6 суток собирали клеточные лизаты и проводили вестерн-блоттинг с применением поликлонального антитела к CSRP3 (Thermo-Fisher® PA5-29155 1:1000).
Экспрессия белка MLP трансгена CSRP3 выше при использовании промотора MHCK7, чем при использовании промотора hTNNT2 («hTnT»). Оба серотипа AAV9 и AAVrh74 вектора на основе AAV способны трансдуцировать клеточную линию кардиомиоцитов. Исходя из данных, приведенных на фиг. 5B, экспрессия белка MLP очевидно выше с вектором на основе AAVrh74, чем с вектором на основе AAV9.
--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> Спейскрафт Севен, ЛЛСИ
<120> СРЕДСТВО ГЕННОЙ ТЕРАПИИ НА ОСНОВЕ CSRP3 (БОГАТОГО ЦИСТЕИНОМ И ГЛИЦИНОМ
БЕЛКА 3)
<130> ROPA-020/01WO 329592-22266
<150> US 63/061727
<151> 2020-08-05
<160> 86
<170> PatentIn версия 3.5
<210> 1
<211> 194
<212> БЕЛОК
<213> Homo sapiens
<400> 1
Met Pro Asn Trp Gly Gly Gly Ala Lys Cys Gly Ala Cys Glu Lys Thr
1 5 10 15
Val Tyr His Ala Glu Glu Ile Gln Cys Asn Gly Arg Ser Phe His Lys
20 25 30
Thr Cys Phe His Cys Met Ala Cys Arg Lys Ala Leu Asp Ser Thr Thr
35 40 45
Val Ala Ala His Glu Ser Glu Ile Tyr Cys Lys Val Cys Tyr Gly Arg
50 55 60
Arg Tyr Gly Pro Lys Gly Ile Gly Tyr Gly Gln Gly Ala Gly Cys Leu
65 70 75 80
Ser Thr Asp Thr Gly Glu His Leu Gly Leu Gln Phe Gln Gln Ser Pro
85 90 95
Lys Pro Ala Arg Ser Val Thr Thr Ser Asn Pro Ser Lys Phe Thr Ala
100 105 110
Lys Phe Gly Glu Ser Glu Lys Cys Pro Arg Cys Gly Lys Ser Val Tyr
115 120 125
Ala Ala Glu Lys Val Met Gly Gly Gly Lys Pro Trp His Lys Thr Cys
130 135 140
Phe Arg Cys Ala Ile Cys Gly Lys Ser Leu Glu Ser Thr Asn Val Thr
145 150 155 160
Asp Lys Asp Gly Glu Leu Tyr Cys Lys Val Cys Tyr Ala Lys Asn Phe
165 170 175
Gly Pro Thr Gly Ile Gly Phe Gly Gly Leu Thr Gln Gln Val Glu Lys
180 185 190
Lys Glu
<210> 2
<211> 150
<212> БЕЛОК
<213> Homo sapiens
<400> 2
Met Pro Asn Trp Gly Gly Gly Ala Lys Cys Gly Ala Cys Glu Lys Thr
1 5 10 15
Val Tyr His Ala Glu Glu Ile Gln Cys Asn Gly Arg Ser Phe His Lys
20 25 30
Thr Cys Phe His Cys Ser Pro Gln Ser Arg His Ala Gln Leu Pro Pro
35 40 45
Ala Thr Leu Pro Asn Ser Leu Arg Ser Leu Glu Ser Pro Arg Ser Ala
50 55 60
Leu Asp Val Ala Ser Gln Ser Met Leu Leu Arg Arg Leu Trp Glu Val
65 70 75 80
Ala Ser Leu Gly Thr Arg Pro Val Ser Ala Val Pro Ser Val Gly Arg
85 90 95
Val Trp Ser Pro Gln Met Ser Leu Thr Lys Met Gly Asn Phe Ile Ala
100 105 110
Lys Phe Ala Met Pro Lys Ile Leu Ala Pro Arg Val Leu Gly Leu Glu
115 120 125
Ala Leu His Asn Lys Trp Lys Arg Lys Asn Glu Glu Val Arg Arg Phe
130 135 140
Ser Asp Phe Leu Arg Ala
145 150
<210> 3
<211> 39
<212> БЕЛОК
<213> Homo sapiens
<400> 3
Met Pro Asn Trp Gly Gly Gly Ala Lys Cys Gly Ala Cys Glu Lys Thr
1 5 10 15
Val Tyr His Ala Glu Glu Ile Gln Cys Asn Gly Arg Ser Phe His Lys
20 25 30
Thr Cys Phe His Cys Leu Cys
35
<210> 4
<211> 58
<212> БЕЛОК
<213> Homo sapiens
<400> 4
Met Pro Asn Trp Gly Gly Gly Ala Lys Cys Gly Ala Cys Glu Lys Thr
1 5 10 15
Val Tyr His Ala Glu Glu Ile Gln Cys Asn Gly Arg Ser Phe His Lys
20 25 30
Thr Cys Phe His Cys Thr Leu Ala Gln Asp Leu Phe Pro Leu Cys His
35 40 45
Leu Trp Glu Glu Ser Gly Val His Lys Cys
50 55
<210> 5
<211> 582
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 5
atgccaaact ggggcggagg cgcaaaatgt ggagcctgtg aaaagaccgt ctaccatgca 60
gaagaaatcc agtgcaatgg aaggagtttc cacaagacgt gtttccactg catggcctgc 120
aggaaggctc ttgacagcac gacagtcgcg gctcatgagt cggagatcta ctgcaaggtg 180
tgctatgggc gcagatatgg ccccaaaggg atcgggtatg gacaaggcgc tggctgtctc 240
agcacagaca cgggcgagca tctcggcctg cagttccaac agtccccaaa gccggcacgc 300
tcagttacca ccagcaaccc ttccaaattc actgcgaagt ttggagagtc cgagaagtgc 360
cctcgatgtg gcaagtcagt ctatgctgct gagaaggtta tgggaggtgg caagccttgg 420
cacaagacct gtttccgctg tgccatctgt gggaagagtc tggagtccac aaatgtcact 480
gacaaagatg gggaacttta ttgcaaagtt tgctatgcca aaaattttgg ccccacgggt 540
attgggtttg gaggccttac acaacaagtg gaaaagaaag aa 582
<210> 6
<211> 10
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Мотив последовательности Козак
<400> 6
gccaccatgg 10
<210> 7
<211> 588
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Полинуклеотид, кодирующий MLP с последовательностью Козак
<400> 7
gccaccatgc caaactgggg cggaggcgca aaatgtggag cctgtgaaaa gaccgtctac 60
catgcagaag aaatccagtg caatggaagg agtttccaca agacgtgttt ccactgcatg 120
gcctgcagga aggctcttga cagcacgaca gtcgcggctc atgagtcgga gatctactgc 180
aaggtgtgct atgggcgcag atatggcccc aaagggatcg ggtatggaca aggcgctggc 240
tgtctcagca cagacacggg cgagcatctc ggcctgcagt tccaacagtc cccaaagccg 300
gcacgctcag ttaccaccag caacccttcc aaattcactg cgaagtttgg agagtccgag 360
aagtgccctc gatgtggcaa gtcagtctat gctgctgaga aggttatggg aggtggcaag 420
ccttggcaca agacctgttt ccgctgtgcc atctgtggga agagtctgga gtccacaaat 480
gtcactgaca aagatgggga actttattgc aaagtttgct atgccaaaaa ttttggcccc 540
acgggtattg ggtttggagg ccttacacaa caagtggaaa agaaagaa 588
<210> 8
<211> 2152
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории – кассета экспрессии MHCK7-CSRP3
<400> 8
acccttcaga ttaaaaataa ctgaggtaag ggcctgggta ggggaggtgg tgtgagacgc 60
tcctgtctct cctctatctg cccatcggcc ctttggggag gaggaatgtg cccaaggact 120
aaaaaaaggc catggagcca gaggggcgag ggcaacagac ctttcatggg caaaccttgg 180
ggccctgctg tctagcatgc cccactacgg gtctaggctg cccatgtaag gaggcaaggc 240
ctggggacac ccgagatgcc tggttataat taacccagac atgtggctgc cccccccccc 300
ccaacacctg ctgcctctaa aaataaccct gtccctggtg gatcccctgc atgcgaagat 360
cttcgaacaa ggctgtgggg gactgagggc aggctgtaac aggcttgggg gccagggctt 420
atacgtgcct gggactccca aagtattact gttccatgtt cccggcgaag ggccagctgt 480
cccccgccag ctagactcag cacttagttt aggaaccagt gagcaagtca gcccttgggg 540
cagcccatac aaggccatgg ggctgggcaa gctgcacgcc tgggtccggg gtgggcacgg 600
tgcccgggca acgagctgaa agctcatctg ctctcagggg cccctccctg gggacagccc 660
ctcctggcta gtcacaccct gtaggctcct ctatataacc caggggcaca ggggctgccc 720
tcattctacc accacctcca cagcacagac agacactcag gagccagcca ggccaccatg 780
ccaaactggg gcggaggcgc aaaatgtgga gcctgtgaaa agaccgtcta ccatgcagaa 840
gaaatccagt gcaatggaag gagtttccac aagacgtgtt tccactgcat ggcctgcagg 900
aaggctcttg acagcacgac agtcgcggct catgagtcgg agatctactg caaggtgtgc 960
tatgggcgca gatatggccc caaagggatc gggtatggac aaggcgctgg ctgtctcagc 1020
acagacacgg gcgagcatct cggcctgcag ttccaacagt ccccaaagcc ggcacgctca 1080
gttaccacca gcaacccttc caaattcact gcgaagtttg gagagtccga gaagtgccct 1140
cgatgtggca agtcagtcta tgctgctgag aaggttatgg gaggtggcaa gccttggcac 1200
aagacctgtt tccgctgtgc catctgtggg aagagtctgg agtccacaaa tgtcactgac 1260
aaagatgggg aactttattg caaagtttgc tatgccaaaa attttggccc cacgggtatt 1320
gggtttggag gccttacaca acaagtggaa aagaaagaat gatcaacctc tggattacaa 1380
aatttgtgaa agattgactg gtattcttaa ctatgttgct ccttttacgc tatgtggata 1440
cgctgcttta atgcctttgt atcatgctat tgcttcccgt atggctttca ttttctcctc 1500
cttgtataaa tcctggttgc tgtctcttta tgaggagttg tggcccgttg tcaggcaacg 1560
tggcgtggtg tgcactgtgt ttgctgacgc aacccccact ggttggggca ttgccaccac 1620
ctgtcagctc ctttccggga ctttcgcttt ccccctccct attgccacgg cggaactcat 1680
cgccgcctgc cttgcccgct gctggacagg ggctcggctg ttgggcactg acaattccgt 1740
ggtgttgtcg gggaaatcat cgtcctttcc ttggctgctc gcctgtgttg ccacctggat 1800
tctgcgcggg acgtccttct gctacgtccc ttcggccctc aatccagcgg accttccttc 1860
ccgcggcctg ctgccggctc tgcggcctct tccgcgtctt cgccttcgcc ctcagacgag 1920
tcggatctcc ctttgggccg cctccccgca ctgcccgggt ggcatccctg tgacccctcc 1980
ccagtgcctc tcctggccct ggaagttgcc actccagtgc ccaccagcct tgtcctaata 2040
aaattaagtt gcatcatttt gtctgactag gtgtccttct ataatattat ggggtggagg 2100
ggggtggtat ggagcaaggg gcccaagttg ggaagaaacc tgtagggcct gc 2152
<210> 9
<211> 1925
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории – кассета экспрессии hTnT-CSRP3
<400> 9
ctcagtccat taggagccag tagcctggaa gatgtcttta cccccagcat cagttcaagt 60
ggagcagcac ataactcttg ccctctgcct tccaagattc tggtgctgag acttatggag 120
tgtcttggag gttgccttct gccccccaac cctgctccca gctggccctc ccaggcctgg 180
gttgctggcc tctgctttat caggattctc aagagggaca gctggtttat gttgcatgac 240
tgttccctgc atatctgctc tggttttaaa tagcttatct gagcagctgg aggaccacat 300
gggcttatat ggcgtggggt acatgttcct gtagccttgt ccctggcacc tgccaaaata 360
gcagccaaca ccccccaccc ccaccgccat ccccctgccc cacccgtccc ctgtcgcaca 420
ttcctccctc cgcagggctg gctcaccagg ccccagccca catgcctgct taaagccctc 480
tccatcctct gcctcaccca gtccccgctg agactgagca gacgcctcca ggatctgtcg 540
gcaggccacc atgccaaact ggggcggagg cgcaaaatgt ggagcctgtg aaaagaccgt 600
ctaccatgca gaagaaatcc agtgcaatgg aaggagtttc cacaagacgt gtttccactg 660
catggcctgc aggaaggctc ttgacagcac gacagtcgcg gctcatgagt cggagatcta 720
ctgcaaggtg tgctatgggc gcagatatgg ccccaaaggg atcgggtatg gacaaggcgc 780
tggctgtctc agcacagaca cgggcgagca tctcggcctg cagttccaac agtccccaaa 840
gccggcacgc tcagttacca ccagcaaccc ttccaaattc actgcgaagt ttggagagtc 900
cgagaagtgc cctcgatgtg gcaagtcagt ctatgctgct gagaaggtta tgggaggtgg 960
caagccttgg cacaagacct gtttccgctg tgccatctgt gggaagagtc tggagtccac 1020
aaatgtcact gacaaagatg gggaacttta ttgcaaagtt tgctatgcca aaaattttgg 1080
ccccacgggt attgggtttg gaggccttac acaacaagtg gaaaagaaag aatgatcaac 1140
ctctggatta caaaatttgt gaaagattga ctggtattct taactatgtt gctcctttta 1200
cgctatgtgg atacgctgct ttaatgcctt tgtatcatgc tattgcttcc cgtatggctt 1260
tcattttctc ctccttgtat aaatcctggt tgctgtctct ttatgaggag ttgtggcccg 1320
ttgtcaggca acgtggcgtg gtgtgcactg tgtttgctga cgcaaccccc actggttggg 1380
gcattgccac cacctgtcag ctcctttccg ggactttcgc tttccccctc cctattgcca 1440
cggcggaact catcgccgcc tgccttgccc gctgctggac aggggctcgg ctgttgggca 1500
ctgacaattc cgtggtgttg tcggggaaat catcgtcctt tccttggctg ctcgcctgtg 1560
ttgccacctg gattctgcgc gggacgtcct tctgctacgt cccttcggcc ctcaatccag 1620
cggaccttcc ttcccgcggc ctgctgccgg ctctgcggcc tcttccgcgt cttcgccttc 1680
gccctcagac gagtcggatc tccctttggg ccgcctcccc gcactgcccg ggtggcatcc 1740
ctgtgacccc tccccagtgc ctctcctggc cctggaagtt gccactccag tgcccaccag 1800
ccttgtccta ataaaattaa gttgcatcat tttgtctgac taggtgtcct tctataatat 1860
tatggggtgg aggggggtgg tatggagcaa ggggcccaag ttgggaagaa acctgtaggg 1920
cctgc 1925
<210> 10
<211> 2152
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории – кассета экспрессии MHCK7-CSRP3
<400> 10
acccttcaga ttaaaaataa ctgaggtaag ggcctgggta ggggaggtgg tgtgagacgc 60
tcctgtctct cctctatctg cccatcggcc ctttggggag gaggaatgtg cccaaggact 120
aaaaaaaggc catggagcca gaggggcgag ggcaacagac ctttcatggg caaaccttgg 180
ggccctgctg tctagcatgc cccactacgg gtctaggctg cccatgtaag gaggcaaggc 240
ctggggacac ccgagatgcc tggttataat taacccagac atgtggctgc cccccccccc 300
ccaacacctg ctgcctctaa aaataaccct gtccctggtg gatcccctgc atgcgaagat 360
cttcgaacaa ggctgtgggg gactgagggc aggctgtaac aggcttgggg gccagggctt 420
atacgtgcct gggactccca aagtattact gttccatgtt cccggcgaag ggccagctgt 480
cccccgccag ctagactcag cacttagttt aggaaccagt gagcaagtca gcccttgggg 540
cagcccatac aaggccatgg ggctgggcaa gctgcacgcc tgggtccggg gtgggcacgg 600
tgcccgggca acgagctgaa agctcatctg ctctcagggg cccctccctg gggacagccc 660
ctcctggcta gtcacaccct gtaggctcct ctatataacc caggggcaca ggggctgccc 720
tcattctacc accacctcca cagcacagac agacactcag gagccagcca ggccaccatg 780
cccaattggg gtggaggagc taaatgtgga gcttgtgaaa aaacagttta tcatgctgaa 840
gaaattcaat gtaatggaag atcttttcat aaaacatgtt ttcattgtat ggcttgtaga 900
aaagcacttg attctacaac tgttgcagca catgaaagtg aaatctattg taaagtatgt 960
tatggaagaa gatatggacc aaaaggaatt ggatatggac aaggagcagg atgtctttct 1020
acagatactg gagaacattt gggattgcaa tttcaacaaa gtcctaaacc agctagatct 1080
gttacaacaa gtaatccatc aaaatttact gctaaatttg gagaatccga aaaatgtcct 1140
agatgtggaa aatcagtata tgctgctgaa aaagttatgg gaggtggaaa accatggcat 1200
aagacatgtt ttagatgtgc aatttgtggt aaatctttgg aatctacaaa tgttacagat 1260
aaagatggag aattgtattg taaagtttgt tatgctaaaa attttggacc tacaggtata 1320
ggatttggag gtttgacaca acaagttgaa aaaaaagaat gatcaacctc tggattacaa 1380
aatttgtgaa agattgactg gtattcttaa ctatgttgct ccttttacgc tatgtggata 1440
cgctgcttta atgcctttgt atcatgctat tgcttcccgt atggctttca ttttctcctc 1500
cttgtataaa tcctggttgc tgtctcttta tgaggagttg tggcccgttg tcaggcaacg 1560
tggcgtggtg tgcactgtgt ttgctgacgc aacccccact ggttggggca ttgccaccac 1620
ctgtcagctc ctttccggga ctttcgcttt ccccctccct attgccacgg cggaactcat 1680
cgccgcctgc cttgcccgct gctggacagg ggctcggctg ttgggcactg acaattccgt 1740
ggtgttgtcg gggaaatcat cgtcctttcc ttggctgctc gcctgtgttg ccacctggat 1800
tctgcgcggg acgtccttct gctacgtccc ttcggccctc aatccagcgg accttccttc 1860
ccgcggcctg ctgccggctc tgcggcctct tccgcgtctt cgccttcgcc ctcagacgag 1920
tcggatctcc ctttgggccg cctccccgca ctgcccgggt ggcatccctg tgacccctcc 1980
ccagtgcctc tcctggccct ggaagttgcc actccagtgc ccaccagcct tgtcctaata 2040
aaattaagtt gcatcatttt gtctgactag gtgtccttct ataatattat ggggtggagg 2100
ggggtggtat ggagcaaggg gcccaagttg ggaagaaacc tgtagggcct gc 2152
<210> 11
<211> 1925
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - hTnT-CSRP3 кодон-оптимизированная кассета
экспрессии
<400> 11
ctcagtccat taggagccag tagcctggaa gatgtcttta cccccagcat cagttcaagt 60
ggagcagcac ataactcttg ccctctgcct tccaagattc tggtgctgag acttatggag 120
tgtcttggag gttgccttct gccccccaac cctgctccca gctggccctc ccaggcctgg 180
gttgctggcc tctgctttat caggattctc aagagggaca gctggtttat gttgcatgac 240
tgttccctgc atatctgctc tggttttaaa tagcttatct gagcagctgg aggaccacat 300
gggcttatat ggcgtggggt acatgttcct gtagccttgt ccctggcacc tgccaaaata 360
gcagccaaca ccccccaccc ccaccgccat ccccctgccc cacccgtccc ctgtcgcaca 420
ttcctccctc cgcagggctg gctcaccagg ccccagccca catgcctgct taaagccctc 480
tccatcctct gcctcaccca gtccccgctg agactgagca gacgcctcca ggatctgtcg 540
gcaggccacc atgcccaatt ggggtggagg agctaaatgt ggagcttgtg aaaaaacagt 600
ttatcatgct gaagaaattc aatgtaatgg aagatctttt cataaaacat gttttcattg 660
tatggcttgt agaaaagcac ttgattctac aactgttgca gcacatgaaa gtgaaatcta 720
ttgtaaagta tgttatggaa gaagatatgg accaaaagga attggatatg gacaaggagc 780
aggatgtctt tctacagata ctggagaaca tttgggattg caatttcaac aaagtcctaa 840
accagctaga tctgttacaa caagtaatcc atcaaaattt actgctaaat ttggagaatc 900
cgaaaaatgt cctagatgtg gaaaatcagt atatgctgct gaaaaagtta tgggaggtgg 960
aaaaccatgg cataagacat gttttagatg tgcaatttgt ggtaaatctt tggaatctac 1020
aaatgttaca gataaagatg gagaattgta ttgtaaagtt tgttatgcta aaaattttgg 1080
acctacaggt ataggatttg gaggtttgac acaacaagtt gaaaaaaaag aatgatcaac 1140
ctctggatta caaaatttgt gaaagattga ctggtattct taactatgtt gctcctttta 1200
cgctatgtgg atacgctgct ttaatgcctt tgtatcatgc tattgcttcc cgtatggctt 1260
tcattttctc ctccttgtat aaatcctggt tgctgtctct ttatgaggag ttgtggcccg 1320
ttgtcaggca acgtggcgtg gtgtgcactg tgtttgctga cgcaaccccc actggttggg 1380
gcattgccac cacctgtcag ctcctttccg ggactttcgc tttccccctc cctattgcca 1440
cggcggaact catcgccgcc tgccttgccc gctgctggac aggggctcgg ctgttgggca 1500
ctgacaattc cgtggtgttg tcggggaaat catcgtcctt tccttggctg ctcgcctgtg 1560
ttgccacctg gattctgcgc gggacgtcct tctgctacgt cccttcggcc ctcaatccag 1620
cggaccttcc ttcccgcggc ctgctgccgg ctctgcggcc tcttccgcgt cttcgccttc 1680
gccctcagac gagtcggatc tccctttggg ccgcctcccc gcactgcccg ggtggcatcc 1740
ctgtgacccc tccccagtgc ctctcctggc cctggaagtt gccactccag tgcccaccag 1800
ccttgtccta ataaaattaa gttgcatcat tttgtctgac taggtgtcct tctataatat 1860
tatggggtgg aggggggtgg tatggagcaa ggggcccaag ttgggaagaa acctgtaggg 1920
cctgc 1925
<210> 12
<211> 2430
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории – полная полинуклеотидная последовательность
векторного геном
<400> 12
ttggccactc cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg ccgcccgggc aaagcccggg 60
cgtcgggcga cctttggtcg cccggcctca gtgagcgagc gagcgcgcag agagggagtg 120
gccaactcca tcactagggg ttcctaccct tcagattaaa aataactgag gtaagggcct 180
gggtagggga ggtggtgtga gacgctcctg tctctcctct atctgcccat cggccctttg 240
gggaggagga atgtgcccaa ggactaaaaa aaggccatgg agccagaggg gcgagggcaa 300
cagacctttc atgggcaaac cttggggccc tgctgtctag catgccccac tacgggtcta 360
ggctgcccat gtaaggaggc aaggcctggg gacacccgag atgcctggtt ataattaacc 420
cagacatgtg gctgcccccc cccccccaac acctgctgcc tctaaaaata accctgtccc 480
tggtggatcc cctgcatgcg aagatcttcg aacaaggctg tgggggactg agggcaggct 540
gtaacaggct tgggggccag ggcttatacg tgcctgggac tcccaaagta ttactgttcc 600
atgttcccgg cgaagggcca gctgtccccc gccagctaga ctcagcactt agtttaggaa 660
ccagtgagca agtcagccct tggggcagcc catacaaggc catggggctg ggcaagctgc 720
acgcctgggt ccggggtggg cacggtgccc gggcaacgag ctgaaagctc atctgctctc 780
aggggcccct ccctggggac agcccctcct ggctagtcac accctgtagg ctcctctata 840
taacccaggg gcacaggggc tgccctcatt ctaccaccac ctccacagca cagacagaca 900
ctcaggagcc agccaggcca ccatgccaaa ctggggcgga ggcgcaaaat gtggagcctg 960
tgaaaagacc gtctaccatg cagaagaaat ccagtgcaat ggaaggagtt tccacaagac 1020
gtgtttccac tgcatggcct gcaggaaggc tcttgacagc acgacagtcg cggctcatga 1080
gtcggagatc tactgcaagg tgtgctatgg gcgcagatat ggccccaaag ggatcgggta 1140
tggacaaggc gctggctgtc tcagcacaga cacgggcgag catctcggcc tgcagttcca 1200
acagtcccca aagccggcac gctcagttac caccagcaac ccttccaaat tcactgcgaa 1260
gtttggagag tccgagaagt gccctcgatg tggcaagtca gtctatgctg ctgagaaggt 1320
tatgggaggt ggcaagcctt ggcacaagac ctgtttccgc tgtgccatct gtgggaagag 1380
tctggagtcc acaaatgtca ctgacaaaga tggggaactt tattgcaaag tttgctatgc 1440
caaaaatttt ggccccacgg gtattgggtt tggaggcctt acacaacaag tggaaaagaa 1500
agaatgatca acctctggat tacaaaattt gtgaaagatt gactggtatt cttaactatg 1560
ttgctccttt tacgctatgt ggatacgctg ctttaatgcc tttgtatcat gctattgctt 1620
cccgtatggc tttcattttc tcctccttgt ataaatcctg gttgctgtct ctttatgagg 1680
agttgtggcc cgttgtcagg caacgtggcg tggtgtgcac tgtgtttgct gacgcaaccc 1740
ccactggttg gggcattgcc accacctgtc agctcctttc cgggactttc gctttccccc 1800
tccctattgc cacggcggaa ctcatcgccg cctgccttgc ccgctgctgg acaggggctc 1860
ggctgttggg cactgacaat tccgtggtgt tgtcggggaa atcatcgtcc tttccttggc 1920
tgctcgcctg tgttgccacc tggattctgc gcgggacgtc cttctgctac gtcccttcgg 1980
ccctcaatcc agcggacctt ccttcccgcg gcctgctgcc ggctctgcgg cctcttccgc 2040
gtcttcgcct tcgccctcag acgagtcgga tctccctttg ggccgcctcc ccgcactgcc 2100
cgggtggcat ccctgtgacc cctccccagt gcctctcctg gccctggaag ttgccactcc 2160
agtgcccacc agccttgtcc taataaaatt aagttgcatc attttgtctg actaggtgtc 2220
cttctataat attatggggt ggaggggggt ggtatggagc aaggggccca agttgggaag 2280
aaacctgtag ggcctgcagg aacccctagt gatggagact ccctctctgc gcgctcgctc 2340
gctcactgag gccgggcgac caaaggtcgc ccgacgcccg ggctttgccc gggcggcctc 2400
agtgagcgag cgagcgcgca gagagggagt 2430
<210> 13
<211> 2203
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - полная полинуклеотидная последовательность
векторного генома
<400> 13
ttggccactc cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg ccgcccgggc aaagcccggg 60
cgtcgggcga cctttggtcg cccggcctca gtgagcgagc gagcgcgcag agagggagtg 120
gccaactcca tcactagggg ttcctctcag tccattagga gccagtagcc tggaagatgt 180
ctttaccccc agcatcagtt caagtggagc agcacataac tcttgccctc tgccttccaa 240
gattctggtg ctgagactta tggagtgtct tggaggttgc cttctgcccc ccaaccctgc 300
tcccagctgg ccctcccagg cctgggttgc tggcctctgc tttatcagga ttctcaagag 360
ggacagctgg tttatgttgc atgactgttc cctgcatatc tgctctggtt ttaaatagct 420
tatctgagca gctggaggac cacatgggct tatatggcgt ggggtacatg ttcctgtagc 480
cttgtccctg gcacctgcca aaatagcagc caacaccccc cacccccacc gccatccccc 540
tgccccaccc gtcccctgtc gcacattcct ccctccgcag ggctggctca ccaggcccca 600
gcccacatgc ctgcttaaag ccctctccat cctctgcctc acccagtccc cgctgagact 660
gagcagacgc ctccaggatc tgtcggcagg ccaccatgcc aaactggggc ggaggcgcaa 720
aatgtggagc ctgtgaaaag accgtctacc atgcagaaga aatccagtgc aatggaagga 780
gtttccacaa gacgtgtttc cactgcatgg cctgcaggaa ggctcttgac agcacgacag 840
tcgcggctca tgagtcggag atctactgca aggtgtgcta tgggcgcaga tatggcccca 900
aagggatcgg gtatggacaa ggcgctggct gtctcagcac agacacgggc gagcatctcg 960
gcctgcagtt ccaacagtcc ccaaagccgg cacgctcagt taccaccagc aacccttcca 1020
aattcactgc gaagtttgga gagtccgaga agtgccctcg atgtggcaag tcagtctatg 1080
ctgctgagaa ggttatggga ggtggcaagc cttggcacaa gacctgtttc cgctgtgcca 1140
tctgtgggaa gagtctggag tccacaaatg tcactgacaa agatggggaa ctttattgca 1200
aagtttgcta tgccaaaaat tttggcccca cgggtattgg gtttggaggc cttacacaac 1260
aagtggaaaa gaaagaatga tcaacctctg gattacaaaa tttgtgaaag attgactggt 1320
attcttaact atgttgctcc ttttacgcta tgtggatacg ctgctttaat gcctttgtat 1380
catgctattg cttcccgtat ggctttcatt ttctcctcct tgtataaatc ctggttgctg 1440
tctctttatg aggagttgtg gcccgttgtc aggcaacgtg gcgtggtgtg cactgtgttt 1500
gctgacgcaa cccccactgg ttggggcatt gccaccacct gtcagctcct ttccgggact 1560
ttcgctttcc ccctccctat tgccacggcg gaactcatcg ccgcctgcct tgcccgctgc 1620
tggacagggg ctcggctgtt gggcactgac aattccgtgg tgttgtcggg gaaatcatcg 1680
tcctttcctt ggctgctcgc ctgtgttgcc acctggattc tgcgcgggac gtccttctgc 1740
tacgtccctt cggccctcaa tccagcggac cttccttccc gcggcctgct gccggctctg 1800
cggcctcttc cgcgtcttcg ccttcgccct cagacgagtc ggatctccct ttgggccgcc 1860
tccccgcact gcccgggtgg catccctgtg acccctcccc agtgcctctc ctggccctgg 1920
aagttgccac tccagtgccc accagccttg tcctaataaa attaagttgc atcattttgt 1980
ctgactaggt gtccttctat aatattatgg ggtggagggg ggtggtatgg agcaaggggc 2040
ccaagttggg aagaaacctg tagggcctgc aggaacccct agtgatggag actccctctc 2100
tgcgcgctcg ctcgctcact gaggccgggc gaccaaaggt cgcccgacgc ccgggctttg 2160
cccgggcggc ctcagtgagc gagcgagcgc gcagagaggg agt 2203
<210> 14
<211> 2430
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - полная полинуклеотидная последовательность
векторного генома
<400> 14
ttggccactc cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg ccgcccgggc aaagcccggg 60
cgtcgggcga cctttggtcg cccggcctca gtgagcgagc gagcgcgcag agagggagtg 120
gccaactcca tcactagggg ttcctaccct tcagattaaa aataactgag gtaagggcct 180
gggtagggga ggtggtgtga gacgctcctg tctctcctct atctgcccat cggccctttg 240
gggaggagga atgtgcccaa ggactaaaaa aaggccatgg agccagaggg gcgagggcaa 300
cagacctttc atgggcaaac cttggggccc tgctgtctag catgccccac tacgggtcta 360
ggctgcccat gtaaggaggc aaggcctggg gacacccgag atgcctggtt ataattaacc 420
cagacatgtg gctgcccccc cccccccaac acctgctgcc tctaaaaata accctgtccc 480
tggtggatcc cctgcatgcg aagatcttcg aacaaggctg tgggggactg agggcaggct 540
gtaacaggct tgggggccag ggcttatacg tgcctgggac tcccaaagta ttactgttcc 600
atgttcccgg cgaagggcca gctgtccccc gccagctaga ctcagcactt agtttaggaa 660
ccagtgagca agtcagccct tggggcagcc catacaaggc catggggctg ggcaagctgc 720
acgcctgggt ccggggtggg cacggtgccc gggcaacgag ctgaaagctc atctgctctc 780
aggggcccct ccctggggac agcccctcct ggctagtcac accctgtagg ctcctctata 840
taacccaggg gcacaggggc tgccctcatt ctaccaccac ctccacagca cagacagaca 900
ctcaggagcc agccaggcca ccatgcccaa ttggggtgga ggagctaaat gtggagcttg 960
tgaaaaaaca gtttatcatg ctgaagaaat tcaatgtaat ggaagatctt ttcataaaac 1020
atgttttcat tgtatggctt gtagaaaagc acttgattct acaactgttg cagcacatga 1080
aagtgaaatc tattgtaaag tatgttatgg aagaagatat ggaccaaaag gaattggata 1140
tggacaagga gcaggatgtc tttctacaga tactggagaa catttgggat tgcaatttca 1200
acaaagtcct aaaccagcta gatctgttac aacaagtaat ccatcaaaat ttactgctaa 1260
atttggagaa tccgaaaaat gtcctagatg tggaaaatca gtatatgctg ctgaaaaagt 1320
tatgggaggt ggaaaaccat ggcataagac atgttttaga tgtgcaattt gtggtaaatc 1380
tttggaatct acaaatgtta cagataaaga tggagaattg tattgtaaag tttgttatgc 1440
taaaaatttt ggacctacag gtataggatt tggaggtttg acacaacaag ttgaaaaaaa 1500
agaatgatca acctctggat tacaaaattt gtgaaagatt gactggtatt cttaactatg 1560
ttgctccttt tacgctatgt ggatacgctg ctttaatgcc tttgtatcat gctattgctt 1620
cccgtatggc tttcattttc tcctccttgt ataaatcctg gttgctgtct ctttatgagg 1680
agttgtggcc cgttgtcagg caacgtggcg tggtgtgcac tgtgtttgct gacgcaaccc 1740
ccactggttg gggcattgcc accacctgtc agctcctttc cgggactttc gctttccccc 1800
tccctattgc cacggcggaa ctcatcgccg cctgccttgc ccgctgctgg acaggggctc 1860
ggctgttggg cactgacaat tccgtggtgt tgtcggggaa atcatcgtcc tttccttggc 1920
tgctcgcctg tgttgccacc tggattctgc gcgggacgtc cttctgctac gtcccttcgg 1980
ccctcaatcc agcggacctt ccttcccgcg gcctgctgcc ggctctgcgg cctcttccgc 2040
gtcttcgcct tcgccctcag acgagtcgga tctccctttg ggccgcctcc ccgcactgcc 2100
cgggtggcat ccctgtgacc cctccccagt gcctctcctg gccctggaag ttgccactcc 2160
agtgcccacc agccttgtcc taataaaatt aagttgcatc attttgtctg actaggtgtc 2220
cttctataat attatggggt ggaggggggt ggtatggagc aaggggccca agttgggaag 2280
aaacctgtag ggcctgcagg aacccctagt gatggagact ccctctctgc gcgctcgctc 2340
gctcactgag gccgggcgac caaaggtcgc ccgacgcccg ggctttgccc gggcggcctc 2400
agtgagcgag cgagcgcgca gagagggagt 2430
<210> 15
<211> 2203
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - полная полинуклеотидная последовательность
векторного генома
<400> 15
ttggccactc cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg ccgcccgggc aaagcccggg 60
cgtcgggcga cctttggtcg cccggcctca gtgagcgagc gagcgcgcag agagggagtg 120
gccaactcca tcactagggg ttcctctcag tccattagga gccagtagcc tggaagatgt 180
ctttaccccc agcatcagtt caagtggagc agcacataac tcttgccctc tgccttccaa 240
gattctggtg ctgagactta tggagtgtct tggaggttgc cttctgcccc ccaaccctgc 300
tcccagctgg ccctcccagg cctgggttgc tggcctctgc tttatcagga ttctcaagag 360
ggacagctgg tttatgttgc atgactgttc cctgcatatc tgctctggtt ttaaatagct 420
tatctgagca gctggaggac cacatgggct tatatggcgt ggggtacatg ttcctgtagc 480
cttgtccctg gcacctgcca aaatagcagc caacaccccc cacccccacc gccatccccc 540
tgccccaccc gtcccctgtc gcacattcct ccctccgcag ggctggctca ccaggcccca 600
gcccacatgc ctgcttaaag ccctctccat cctctgcctc acccagtccc cgctgagact 660
gagcagacgc ctccaggatc tgtcggcagg ccaccatgcc caattggggt ggaggagcta 720
aatgtggagc ttgtgaaaaa acagtttatc atgctgaaga aattcaatgt aatggaagat 780
cttttcataa aacatgtttt cattgtatgg cttgtagaaa agcacttgat tctacaactg 840
ttgcagcaca tgaaagtgaa atctattgta aagtatgtta tggaagaaga tatggaccaa 900
aaggaattgg atatggacaa ggagcaggat gtctttctac agatactgga gaacatttgg 960
gattgcaatt tcaacaaagt cctaaaccag ctagatctgt tacaacaagt aatccatcaa 1020
aatttactgc taaatttgga gaatccgaaa aatgtcctag atgtggaaaa tcagtatatg 1080
ctgctgaaaa agttatggga ggtggaaaac catggcataa gacatgtttt agatgtgcaa 1140
tttgtggtaa atctttggaa tctacaaatg ttacagataa agatggagaa ttgtattgta 1200
aagtttgtta tgctaaaaat tttggaccta caggtatagg atttggaggt ttgacacaac 1260
aagttgaaaa aaaagaatga tcaacctctg gattacaaaa tttgtgaaag attgactggt 1320
attcttaact atgttgctcc ttttacgcta tgtggatacg ctgctttaat gcctttgtat 1380
catgctattg cttcccgtat ggctttcatt ttctcctcct tgtataaatc ctggttgctg 1440
tctctttatg aggagttgtg gcccgttgtc aggcaacgtg gcgtggtgtg cactgtgttt 1500
gctgacgcaa cccccactgg ttggggcatt gccaccacct gtcagctcct ttccgggact 1560
ttcgctttcc ccctccctat tgccacggcg gaactcatcg ccgcctgcct tgcccgctgc 1620
tggacagggg ctcggctgtt gggcactgac aattccgtgg tgttgtcggg gaaatcatcg 1680
tcctttcctt ggctgctcgc ctgtgttgcc acctggattc tgcgcgggac gtccttctgc 1740
tacgtccctt cggccctcaa tccagcggac cttccttccc gcggcctgct gccggctctg 1800
cggcctcttc cgcgtcttcg ccttcgccct cagacgagtc ggatctccct ttgggccgcc 1860
tccccgcact gcccgggtgg catccctgtg acccctcccc agtgcctctc ctggccctgg 1920
aagttgccac tccagtgccc accagccttg tcctaataaa attaagttgc atcattttgt 1980
ctgactaggt gtccttctat aatattatgg ggtggagggg ggtggtatgg agcaaggggc 2040
ccaagttggg aagaaacctg tagggcctgc aggaacccct agtgatggag actccctctc 2100
tgcgcgctcg ctcgctcact gaggccgggc gaccaaaggt cgcccgacgc ccgggctttg 2160
cccgggcggc ctcagtgagc gagcgagcgc gcagagaggg agt 2203
<210> 16
<211> 13
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Мотив последовательности Козак
<400> 16
gccgccrcca ugg 13
<210> 17
<211> 13
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Мотив последовательности Козак
<400> 17
gccgccrcca ugc 13
<210> 18
<211> 10
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Мотив последовательности Козак
<400> 18
gacaccaugg 10
<210> 19
<211> 10
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Мотив последовательности Козак
<400> 19
gacaccaugc 10
<210> 20
<211> 141
<212> ДНК
<213> Аденоассоциированный вирус
<400> 20
cctgcaggca gctgcgcgct cgctcgctca ctgaggccgc ccgggcaaag cccgggcgtc 60
gggcgacctt tggtcgcccg gcctcagtga gcgagcgagc gcgcagagag ggagtggcca 120
actccatcac taggggttcc t 141
<210> 21
<211> 168
<212> ДНК
<213> Аденоассоциированный вирус 2
<400> 21
gcgcgctcgc tcgctcactg aggccgcccg ggcaaagccc gggcgtcggg cgacctttgg 60
tcgcccggcc tcagtgagcg agcgagcgcg cagagaggga gtggccaact ccatcactag 120
gggttccttg tagttaatga ttaacccgcc atgctactta tctacgta 168
<210> 22
<211> 170
<212> ДНК
<213> Аденоассоциированный вирус
<400> 22
ctgcgcgctc gctcgctcac tgaggccgcc cgggcaaagc ccgggcgtcg ggcgaccttt 60
ggtcgcccgg cctcagtgag cgagcgagcg cgcagagagg gagtggccaa ctccatcact 120
aggggttcct tgtagttaat gattaacccg ccatgctact tatctacgta 170
<210> 23
<211> 145
<212> ДНК
<213> Аденоассоциированный вирус
<400> 23
ttggccactc cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg ccgcccgggc aaagcccggg 60
cgtcgggcga cctttggtcg cccggcctca gtgagcgagc gagcgcgcag agagggagtg 120
gccaactcca tcactagggg ttcct 145
<210> 24
<211> 141
<212> ДНК
<213> Аденоассоциированный вирус
<400> 24
aggaacccct agtgatggag ttggccactc cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg 60
ccgggcgacc aaaggtcgcc cgacgcccgg gctttgcccg ggcggcctca gtgagcgagc 120
gagcgcgcag ctgcctgcag g 141
<210> 25
<211> 168
<212> ДНК
<213> Аденоассоциированный вирус 2
<400> 25
tacgtagata agtagcatgg cgggttaatc attaactaca aggaacccct agtgatggag 60
ttggccactc cctctctgcg cgctcgctcg ctcactgagg ccgggcgacc aaaggtcgcc 120
cgacgcccgg gctttgcccg ggcggcctca gtgagcgagc gagcgcgc 168
<210> 26
<211> 133
<212> ДНК
<213> Аденоассоциированный вирус 2
<400> 26
aggaacccct agtgatggag actccctctc tgcgcgctcg ctcgctcact gaggccgggc 60
gaccaaaggt cgcccgacgc ccgggctttg cccgggcggc ctcagtgagc gagcgagcgc 120
gcagagaggg agt 133
<210> 27
<211> 124
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - последовательность векторного наполнителя <400> 27
gcggcaattc agtcgataac tataacggtc ctaaggtagc gatttaaata cgcgctctct 60
taaggtagcc ccgggacgcg tcaattgact acaaaccgag tatctgcaga gggccctgcg 120
tatg 124
<210> 28
<211> 84
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - последовательность векторного наполнителя
<400> 28
cttctgaggc ggaaagaacc agatcctctc ttaaggtagc atcgagattt aaattaggga 60
taacagggta atggcgcggg ccgc 84
<210> 29
<211> 63
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - последовательность векторного наполнителя
<400> 29
gttacccagg ctggagtgca gtggcacatt tctgctcact gcaacctcct cctccctggg 60
ttc 63
<210> 30
<211> 573
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории – промотор CAG в части бетагерпесвируса человека 5
<400> 30
acttacggta aatggcccgc ctggctgacc gcccaacgac ccccgcccat tgacgtcaat 60
aatgacgtat gttcccatag taacgccaat agggactttc cattgacgtc aatgggtgga 120
gtatttacgg taaactgccc acttggcagt acatcaagtg tatcatatgc caagtacgcc 180
ccctattgac gtcaatgacg gtaaatggcc cgcctggcat tatgcccagt acatgacctt 240
atgggacttt cctacttggc agtacatcta cgtattagtc atcgctatta ccatggtcga 300
ggtgagcccc acgttctgct tcactctccc catctccccc ccctccccac ccccaatttt 360
gtatttattt attttttaat tattttgtgc agcgatgggg gcgggggggg ggggggcgcg 420
cgccaggcgg ggcggggcgg ggcgaggggc ggggcggggc gaggcggaga ggtgcggcgg 480
cagccaatca gagcggcgcg ctccgaaagt ttccttttat ggcgaggcgg cggcggcggc 540
ggccctataa aaagcgaagc gcgcggcggg cgg 573
<210> 31
<211> 771
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории – промотор MHCK7
<400> 31
acccttcaga ttaaaaataa ctgaggtaag ggcctgggta ggggaggtgg tgtgagacgc 60
tcctgtctct cctctatctg cccatcggcc ctttggggag gaggaatgtg cccaaggact 120
aaaaaaaggc catggagcca gaggggcgag ggcaacagac ctttcatggg caaaccttgg 180
ggccctgctg tctagcatgc cccactacgg gtctaggctg cccatgtaag gaggcaaggc 240
ctggggacac ccgagatgcc tggttataat taacccagac atgtggctgc cccccccccc 300
ccaacacctg ctgcctctaa aaataaccct gtccctggtg gatcccctgc atgcgaagat 360
cttcgaacaa ggctgtgggg gactgagggc aggctgtaac aggcttgggg gccagggctt 420
atacgtgcct gggactccca aagtattact gttccatgtt cccggcgaag ggccagctgt 480
cccccgccag ctagactcag cacttagttt aggaaccagt gagcaagtca gcccttgggg 540
cagcccatac aaggccatgg ggctgggcaa gctgcacgcc tgggtccggg gtgggcacgg 600
tgcccgggca acgagctgaa agctcatctg ctctcagggg cccctccctg gggacagccc 660
ctcctggcta gtcacaccct gtaggctcct ctatataacc caggggcaca ggggctgccc 720
tcattctacc accacctcca cagcacagac agacactcag gagccagcca g 771
<210> 32
<211> 544
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 32
ctcagtccat taggagccag tagcctggaa gatgtcttta cccccagcat cagttcaagt 60
ggagcagcac ataactcttg ccctctgcct tccaagattc tggtgctgag acttatggag 120
tgtcttggag gttgccttct gccccccaac cctgctccca gctggccctc ccaggcctgg 180
gttgctggcc tctgctttat caggattctc aagagggaca gctggtttat gttgcatgac 240
tgttccctgc atatctgctc tggttttaaa tagcttatct gagcagctgg aggaccacat 300
gggcttatat ggcgtggggt acatgttcct gtagccttgt ccctggcacc tgccaaaata 360
gcagccaaca ccccccaccc ccaccgccat ccccctgccc cacccgtccc ctgtcgcaca 420
ttcctccctc cgcagggctg gctcaccagg ccccagccca catgcctgct taaagccctc 480
tccatcctct gcctcaccca gtccccgctg agactgagca gacgcctcca ggatctgtcg 540
gcag 544
<210> 33
<211> 502
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 33
ctcagtccat taggagccag tagcctggaa gatgtcttta cccccagcat cagttcaagt 60
ggagcagcac ataactcttg ccctctgcct tccaagattc tggtgctgag acttatggag 120
tgtcttggag gttgccttct gccccccaac cctgctccca gctggccctc ccaggcctgg 180
gttgctggcc tctgctttat caggattctc aagagggaca gctggtttat gttgcatgac 240
tgttccctgc atatctgctc tggttttaaa tagcttatct gagcagctgg aggaccacat 300
gggcttatat ggcgtggggt acatgttcct gtagccttgt ccctggcacc tgccaaaata 360
gcagccaaca ccccccaccc ccaccgccat ccccctgccc cacccgtccc ctgtcgcaca 420
ttcctccctc cgcagggctg gctcaccagg ccccagccca catgcctgct taaagccctc 480
tccatcctct gcctcaccca gt 502
<210> 34
<211> 5464
<212> ДНК
<213> Mus musculus
<400> 34
ggtaccggat cctgcaaggt cacacaaggg tctccaccca ccaggtgccc tagtctcaat 60
ttcagtttcc atgccttgtt ctcacaatgc tggcctcccc agagctaatt tggactttgt 120
ttttatttca aaagggcctg aatgaggagt agatcttgtg ctacccagct ctaagggtgc 180
ccgtgaagcc ctcagacctg gagcctttgc aacagccctt taggtggaag cagaataaag 240
caattttcct taaagccaaa atcctgcctc tagactcttc ttctctgacc tcggtccctg 300
ggctctaggg tggggaggtg gggcttggaa gaagaaggtg gggaagtggc aaaagccgat 360
ccctagggcc ctgtgaagtt cggagccttc cctgtacagc actggctcat agatcctcct 420
ccagccaaac atagcaagaa gtgatacctc ctttgtgact tccccaggcc cagtacctgt 480
caggttgaaa caggatttag agaagcctct gaactcacct gaactctgaa gctcatccac 540
caagcaagca cctaggtgcc actgctagtt agtatcctac gctgataata tgcagagctg 600
ggccacagaa gtcctggggt gtaggaactg accagtgact tttcagtcgg caaaggtatg 660
accccctcag cagatgtagt aatgtcccct tagatcccat cccaggcagg tctctaagag 720
gacatgggat gagagatgta gtcatgtggc attccaaaca cagctatcca cagtgtccct 780
tgccccttcc acttagccag gaggacagta accttagcct atctttcttc ctccccatcc 840
tcccaggaca caccccctgg tctgcagtat tcatttcttc cttcacgtcc cctctgtgac 900
ttccatttgc aaggcttttg acctctgcag ctgctggaag atagagtttg gccctaggtg 960
tggcaagcca tctcaagaga aagcagacaa cagggggacc agattttgga aggatcagga 1020
actaaatcac tggcgggcct gggggtagaa aaaagagtga gtgagtccgc tccagctaag 1080
ccaagctagt ccccgagata ctctgccaca gctgggctgc tcggggtagc tttaggaatg 1140
tgggtctgaa agacaatggg attggaagac atctctttga gtctcccctc aaccccacct 1200
acagacacac tcgtgtgtgg ccagactcct gttcaacagc cctctgtgtt ctgaccactg 1260
agctaggcaa ccagagcatg ggccctgtgc tgaggatgaa gagttggtta ccaatagcaa 1320
aaacagcagg ggagggagaa cagagaacga aataaggaag gaagaaggaa aggccagtca 1380
atcagatgca gtcagaagag atgggaagcc aacacacagc ttgagcagag gaaacagaaa 1440
agggagagat tctgggcata aggaggccac agaaagaaga gcccaggccc cccaagtctc 1500
ctctttatac cctcatcccg tctcccaatt aagcccactc ttcttcctag atcagacctg 1560
agctgcagcg aagagacccg tagggaggat cacactggat gaaggagatg tgtggagaag 1620
tccagggaac ctaagagcca gagcctaaaa gagcaagaga taaaggtgct tcaaaggtgg 1680
ccaggctgtg cacacagagg gtcgaggact ggtggtagag cctcaagata aggatgatgc 1740
tcagaatggg cggggggggg gattctgggg gggggagaga gaaggtgaga aggagcctgg 1800
aacagagaat ctggaagcgc tggaaacgat accataaagg gaagaaccca ggctaccttt 1860
agatgtaaat catgaaagac agggagaagg gaagctggag agagtagaag gaccccgggg 1920
caagacattg aagcaaggac aagccaggtt gagcgctccg tgaaatcagc ctgctgaagg 1980
cagagccctg gtatgagcac cagaacagca gaggctaggg ttaatgtcga gacagggaac 2040
agaaggtaga cacaggaaca gacagagacg ggggagccag gtaacaaagg aatggtcctt 2100
ctcacctgtg gccagagcgt ccatctgtgt ccacatactc tagaatgttc atcagactgc 2160
agggctggct tgggaggcag ctggaaagag tatgtgagag ccaggggaga caagggggcc 2220
taggaaagga agaagagggc aaaccaggcc acacaagagg gcagagccca gaactgagtt 2280
aactccttcc ttgttgcatc ttccatagga ggcagtggga actctgtgac caccatcccc 2340
catgagcccc cactacccat accaagtttg gcctgagtgg cattctaggt tccctgagga 2400
cagagcctgg cctttgtctc ttggacctga cccaagctga cccaatgttc tcagtacctt 2460
atcatgccct caagagcttg agaaccaggc agtgacatat taggccatgg gctaaccctg 2520
gagcttgcac acaggagcct caagtgacct ccagggacac agctgcagac aggtggcctt 2580
tatccccaaa gagcaaccat ttggcatagg tggctgcaaa tgggaatgca aggttgaatc 2640
aggtcccttc aagaatactg catgcaagac ctaagacccc tggagagagg ggtatgctcc 2700
tgcccccacc caccataagg ggagtgaact atcctagggg gctggcgacc ttggggagac 2760
accacattac tgagagtgct gagcccagaa aaactgaccg ccctgtgtcc tgcccacctc 2820
cacactctag agctatattg agaggtgaca gtagataggg tgggagctgg tagcagggag 2880
agtgttcctg ggtgtgaggg tgtaggggaa agccagagca ggggagtctg gctttgtctc 2940
ctgaacacaa tgtctactta gttataacag gcatgacctg ctaaagaccc aacatctacg 3000
acctctgaaa agacagcagc cctggaggac aggggttgtc tctgagcctt gggtgcttga 3060
tggtgccaca aaggagggca tgagtgtgag tataaggccc caggagcgtt agagaagggc 3120
acttgggaag gggtcagtct gcagagcccc tatccatgga atctggagcc tggggccaac 3180
tggtgtaaat ctctgggcct gccaggcatt caaagcagca cctgcatcct ctggcagcct 3240
ggggaggcgg aagggagcaa ccccccactt ataccctttc tccctcagcc ccaggattaa 3300
cacctctggc cttccccctt cccacctccc atcaggagtg gagggttgca gagggagggt 3360
aaaaacctac atgtccaaac atcatggtgc acgatatatg gatcagtatg tgtagaggca 3420
agaaaggaaa tctgcaggct taactgggtt aatgtgtaaa gtctgtgtgc atgtgtgtgt 3480
gtctgactga aaacgggcat ggctgtgcag ctgttcagtt ctgtgcgtga ggttaccaga 3540
ctgcaggttt gtgtgtaaat tgcccaaggc aaagtgggtg aatcccttcc atggtttaaa 3600
gagattggat gatggcctgc atctcaagga ccatggaaaa tagaatggac actctatatg 3660
tgtctctaag ctaaggtagc aaggtctttg gaggacacct gtctagagat gtgggcaaca 3720
gagactacag acagtatctg tacagagtaa ggagagagag gagggggtgt agaattctct 3780
tactatcaaa gggaaactga gtcgtgcacc tgcaaagtgg atgctctccc tagacatcat 3840
gactttgtct ctggggagcc agcactgtgg aacttcaggt ctgagagagt aggaggctcc 3900
cctcagcctg aagctatgca gatagccagg gttgaaaggg ggaagggaga gcctgggatg 3960
ggagcttgtg tgttggaggc aggggacaga tattaagcct ggaagagaag gtgaccctta 4020
cccagttgtt caactcaccc ttcagattaa aaataactga ggtaagggcc tgggtagggg 4080
aggtggtgtg agacgctcct gtctctcctc tatctgccca tcggcccttt ggggaggagg 4140
aatgtgccca aggactaaaa aaaggccatg gagccagagg ggcgagggca acagaccttt 4200
catgggcaaa ccttggggcc ctgctgtcct cctgtcacct ccagagccaa gggatcaaag 4260
gaggaggagc caggacagga gggaagtggg agggagggtc ccagcagagg actccaaatt 4320
taggcagcag gcatatggga tgggatataa aggggctgga gcactgagag ctgtcagaga 4380
tttctccaac ccaggtaaga gggagtttcg ggtgggggct cttcacccac accagacctc 4440
tccccaccta gaaggaaact gcctttcctg gaagtggggt tcaggccggt cagagatctg 4500
acagggtggc cttccaccag cctgggaagt tctcagtggc aggaggtttc cacaagaaac 4560
actggatgcc ccttccctta cgctgtcttc tccatcttcc tcctggggat gctcctcccc 4620
gtcttggttt atcttggctc ttcgtcttca gcaagatttg ccctgtgctg tccactccat 4680
ctttctctac tgtctccgtg ccttgccttg ccttcttgcg tgtccttcct ttccacccat 4740
ttctcacttc accttttctc cccttctcat ttgtattcat ccttccttcc ttccttcctt 4800
ccttccttcc ttccttcctt ccttcctttc tcccttcctt ccttccttcc ttccttcctt 4860
ccttccttcc ttcctgtgtc agagtgctga gaatcacacc tggggttccc acccttatgt 4920
aaacaatctt ccagtgagcc acagcttcag tgctgctggg tgctctctta ccttcctcac 4980
cccctggctt gtcctgttcc atcctggtca ggatctctag attggtctcc cagcctctgc 5040
tactcctctt cctgcctgtt cctctctctg tccagctgcg ccactgtggt gcctcgttcc 5100
agctgtggtc cacattcttc aggattctct gaaaagttaa ccaggtgaga atgtttcccc 5160
tgtagacagc agatcacgat tctcccggaa gtcaggcttc cagccctctc tttctctgcc 5220
cagctgcccg gcactcttag caaacctcag gcacccttac cccacataga cctctgacag 5280
agaagcaggc actttacatg gagtcctggt gggagagcca taggctacgg tgtaaaagag 5340
gcagggaagt ggtggtgtag gaaagtcagg acttcacata gaagcctagc ccacaccaga 5400
aatgacagac agatccctcc tatctccccc ataagagttt gagtcgaccc gcggccccga 5460
attg 5464
<210> 35
<211> 413
<212> ДНК
<213> Gallus gallus
<400> 35
gggataaaag cagtctgggc tttcacatga cagcatctgg ggctgcggca gagggtcggg 60
tccgaagcgc tgccttatca gcgtccccag ccctgggagg tgacagctgg ctggcttgtg 120
tcagcccctc gggcactcac gtatctccgt ccgacgggtt taaaatagca aaactctgag 180
gccacacaat agcttgggct tatatgggct cctgtggggg aagggggagc acggaggggg 240
ccggggccgc tgctgccaaa atagcagctc acaagtgttg cattcctctc tgggcgccgg 300
gcacattcct gctggctctg cccgccccgg ggtgggcgcc ggggggacct taaagcctct 360
gccccccaag gagcccttcc cagacagccg ccggcaccca ccgctccgtg gga 413
<210> 36
<211> 1090
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 36
ctctcagccc tggaagtcct tgctcacagc cgaggcgccg agagcgcttg ctctgcccag 60
atctgcgcga gtctggcgcc cgcgctctga acggcgtcgc tgcccagccc ccttccccgg 120
gaggtgggag cggccaccca gggccccgtg gctgcccttg taaggaggcg aggcccgagg 180
acacccgaga cgcccggtta taattaacca ggacacgtgg cgaacccccc tccaacacct 240
gcccccgaac ccccccatac ccagcgcctc gggtctcggc ctttgcggca gaggagacag 300
caaagcgccc tctaaaaata actcctttcc cggcgaccga gaccctccct gtcccccgca 360
cagcggaaat ctcccagtgg caccgagggg gcgagggtta agtggggggg agggtgacca 420
ccgcctccca cccttgccct gagtttgaat ctctccaact cagccagcct cagtttcccc 480
tccactcagt ccctaggagg aaggggcgcc caagcgcggg tttctggggt tagactgccc 540
tccattgcaa ttggtccttc tcccggcctc tgcttcctcc agctcacagg gtatctgctc 600
ctcctggagc cacaccttgg ttccccgagg tgccgctggg actcgggtag gggtgagggc 660
ccagggggca cagggggagc cgagggccac aggaagggct ggtggctgaa ggagactcag 720
gggccagggg acggtggctt ctacgtgctt gggacgttcc cagccaccgt cccatgttcc 780
cggcgggggg ccagctgtcc ccaccgccag cccaactcag cacttggtca gggtatcagc 840
ttggtggggg ggcgtgagcc cagcccctgg ggcggctcag cccatacaag gccatggggc 900
tgggcgcaaa gcatgcctgg gttcagggtg ggtatggtgc gggagcaggg aggtgagagg 960
ctcagctgcc ctccagaact cctccctggg gacaacccct cccagccaat agcacagcct 1020
aggtccccct atataaggcc acggctgctg gcccttcctt tgggtcagtg tcacctccag 1080
gatacagaca 1090
<210> 37
<211> 253
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 37
gcccagcacc ccaaggcggc caacgccaaa actctccctc ctcctcttcc tcaatctcgc 60
tctcgctctt tttttttttc gcaaaaggag gggagagggg gtaaaaaaat gctgcactgt 120
gcggcgaagc cggtgagtga gcggcgcggg gccaatcagc gtgcgccgtt ccgaaagttg 180
ccttttatgg ctcgagcggc cgcggcggcg ccctataaaa cccagcggcg cgacgcgcca 240
ccaccgccga gtc 253
<210> 38
<211> 281
<212> ДНК
<213> Gallus gallus
<400> 38
ggtcgaggtg agccccacgt tctgcttcac tctccccatc tcccccccct ccccaccccc 60
aattttgtat ttatttattt tttaattatt ttgtgcagcg atgggggcgg gggggggggg 120
ggcgcgcgcc aggcggggcg gggcggggcg aggggcgggg cggggcgagg cggagaggtg 180
cggcggcagc caatcagagc ggcgcgctcc gaaagtttcc ttttatggcg aggcggcggc 240
ggcggcggcc ctataaaaag cgaagcgcgc ggcgggcggg a 281
<210> 39
<211> 220
<212> ДНК
<213> Бетагерпесвирус человека 5
<400> 39
tggtgatgcg gttttggcag tacaccaatg ggcgtggata gcggtttgac tcacggggat 60
ttccaagtct ccaccccatt gacgtcaatg ggagtttgtt ttggcaccaa aatcaacggg 120
actttccaaa atgtcgtaat aaccccgccc cgttgacgca aatgggcggt aggcgtgtac 180
ggtgggaggt ctatataagc agagctcgtt tagtgaaccg 220
<210> 40
<211> 583
<212> ДНК
<213> Бетагерпесвирус человека 5
<400> 40
tagttattaa tagtaatcaa ttacggggtc attagttcat agcccatata tggagttccg 60
cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt 120
gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca 180
atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt atcatatgcc 240
aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta 300
catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca tcgctattac 360
catggtgatg cggttttggc agtacatcaa tgggcgtgga tagcggtttg actcacgggg 420
atttccaagt ctccacccca ttgacgtcaa tgggagtttg ttttggcacc aaaatcaacg 480
ggactttcca aaatgtcgta acaactccgc cccattgacg caaatgggcg gtaggcgtgt 540
acggtgggag gtctatataa gcagagctgg tttagtgaac cgt 583
<210> 41
<211> 508
<212> ДНК
<213> Бетагерпесвирус человека 5
<400> 41
cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt 60
gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca 120
atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt atcatatgcc 180
aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta 240
catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca tcgctattac 300
catggtgatg cggttttggc agtacatcaa tgggcgtgga tagcggtttg actcacgggg 360
atttccaagt ctccacccca ttgacgtcaa tgggagtttg ttttggcacc aaaatcaacg 420
ggactttcca aaatgtcgta acaactccgc cccattgacg caaatgggcg gtaggcgtgt 480
acggtgggag gtctatataa gcagagct 508
<210> 42
<211> 573
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории – промотор CAG в части бетагерпесвируса человека 5
<400> 42
acttacggta aatggcccgc ctggctgacc gcccaacgac ccccgcccat tgacgtcaat 60
aatgacgtat gttcccatag taacgccaat agggactttc cattgacgtc aatgggtgga 120
gtatttacgg taaactgccc acttggcagt acatcaagtg tatcatatgc caagtacgcc 180
ccctattgac gtcaatgacg gtaaatggcc cgcctggcat tatgcccagt acatgacctt 240
atgggacttt cctacttggc agtacatcta cgtattagtc atcgctatta ccatggtcga 300
ggtgagcccc acgttctgct tcactctccc catctccccc ccctccccac ccccaatttt 360
gtatttattt attttttaat tattttgtgc agcgatgggg gcgggggggg ggggggcgcg 420
cgccaggcgg ggcggggcgg ggcgaggggc ggggcggggc gaggcggaga ggtgcggcgg 480
cagccaatca gagcggcgcg ctccgaaagt ttccttttat ggcgaggcgg cggcggcggc 540
ggccctataa aaagcgaagc gcgcggcggg cgg 573
<210> 43
<211> 580
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории – промотор CAG в части бетагерпесвируса человека 5
<400> 43
cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt 60
gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca 120
atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt atcatatgcc 180
aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta 240
catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca tcgctattac 300
catgtcgagg tgagccccac gttctgcttc actctcccca tctccccccc ctccccaccc 360
ccaattttgt atttatttat tttttaatta ttttgtgcag cgatgggggc gggggggggg 420
ggggcgcgcg ccaggcgggg cggggcgggg cgaggggcgg ggcggggcga ggcggagagg 480
tgcggcggca gccaatcaga gcggcgcgct ccgaaagttt ccttttatgg cgaggcggcg 540
gcggcggcgg ccctataaaa agcgaagcgc gcggcgggcg 580
<210> 44
<211> 455
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 44
caacctttgg agctaagcca gcaatggtag agggaagatt ctgcacgtcc cttccaggcg 60
gcctccccgt caccaccccc cccaacccgc cccgaccgga gctgagagta attcatacaa 120
aaggactcgc ccctgccttg gggaatccca gggaccgtcg ttaaactccc actaacgtag 180
aacccagaga tcgctgcgtt cccgccccct cacccgcccg ctctcgtcat cactgaggtg 240
gagaatagca tgcgtgaggc tccggtgccc gtcagtgggc agagcgcaca tcgcccacag 300
tccccgagaa gttgggggga ggggtcggca attgaacggg tgcctagaga aggtggcgcg 360
gggtaaactg ggaaagtgat gtcgtgtact ggctccgcct ttttcccgag ggtgggggag 420
aaccgtatat aagtgcagta gtcgccgtga acgtt 455
<210> 45
<211> 401
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 45
agtgcaagtg ggttttagga ccaggatgag gcggggtggg ggtgcctacc tgacgaccga 60
ccccgaccca ctggacaagc acccaacccc cattccccaa attgcgcatc ccctatcaga 120
gagggggagg ggaaacagga tgcggcgagg cgcgtgcgca ctgccagctt cagcaccgcg 180
gacagtgcct tcgcccccgc ctggcggcgc gcgccaccgc cgcctcagca ctgaaggcgc 240
gctgacgtca ctcgccggtc ccccgcaaac tccccttccc ggccaccttg gtcgcgtccg 300
cgccgccgcc ggcccagccg gaccgcacca cgcgaggcgc gagatagggg ggcacgggcg 360
cgaccatctg cgctgcggcg ccggcgactc agcgctgcct c 401
<210> 46
<211> 448
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 46
agtgcaagtg ggttttagga ccaggatgag gcggggtggg ggtgcctacc tgacgaccga 60
ccccgaccca ctggacaagc acccaacccc cattccccaa attgcgcatc ccctatcaga 120
gagggggagg ggaaacagga tgcggcgagg cgcgtgcgca ctgccagctt cagcaccgcg 180
gacagtgcct tcgcccccgc ctggcggcgc gcgccaccgc cgcctcagca ctgaaggcgc 240
gctgacgtca ctcgccggtc ccccgcaaac tccccttccc ggccaccttg gtcgcgtccg 300
cgccgccgcc ggcccagccg gaccgcacca cgcgaggcgc gagatagggg ggcacgggcg 360
cgaccatctg cgctgcggcg ccggcgactc agcgctgcct cagtctgcgg tgggcagcgg 420
aggagtcgtg tcgtgcctga gagcgcag 448
<210> 47
<211> 422
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 47
ctgcagaggg ccctgcgtat gagtgcaagt gggttttagg accaggatga ggcggggtgg 60
gggtgcctac ctgacgaccg accccgaccc actggacaag cacccaaccc ccattcccca 120
aattgcgcat cccctatcag agagggggag gggaaacagg atgcggcgag gcgcgtgcgc 180
actgccagct tcagcaccgc ggacagtgcc ttcgcccccg cctggcggcg cgcgccaccg 240
ccgcctcagc actgaaggcg cgctgacgtc actcgccggt cccccgcaaa ctccccttcc 300
cggccacctt ggtcgcgtcc gcgccgccgc cggcccagcc ggaccgcacc acgcgaggcg 360
cgagataggg gggcacgggc gcgaccatct gcgctgcggc gccggcgact cagcgctgcc 420
tc 422
<210> 48
<211> 281
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 48
acttgtggac aaagtttgct ctattccacc tcctccaggc cctccttggg tccatcaccc 60
caggggtgct gggtccatcc cacccccagg cccacacagg cttgcagtat tgtgtgcggt 120
atggtcaggg cgtccgagag caggtttcgc agtggaaggc aggcaggtgt tggggaggca 180
gttaccgggg caacgggaac agggcgtttt ggaggtggtt gccatgggga cctggatgct 240
gacgaaggct cgcgaggctg tgagcagcca cagtgccctg c 281
<210> 49
<211> 851
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории – полинуклеотид промотора eSYN
<400> 49
gacattgatt attgactagt tattaatagt aatcaattac ggggtcatta gttcatagcc 60
catatatgga gttccgcgtt acataactta cggtaaatgg cccgcctggc tgaccgccca 120
acgacccccg cccattgacg tcaataatga cgtatgttcc catagtaacg ccaataggga 180
ctttccattg acgtcaatgg gtggactatt tacggtaaac tgcccacttg gcagtacatc 240
aagtgtatca tatgccaagt acgcccccta ttgacgtcaa tgacggtaaa tggcccgcct 300
ggcattatgc ccagtacatg accttatggg actttcctac ttggcagtac atctacgtat 360
tagtcatcgc tattaccatg gctgcagagg gccctgcgta tgagtgcaag tgggttttag 420
gaccaggatg aggcggggtg ggggtgccta cctgacgacc gaccccgacc cactggacaa 480
gcacccaacc cccattcccc aaattgcgca tcccctatca gagaggggga ggggaaacag 540
gatgcggcga ggcgcgtcgc gactgccagc ttcagcaccg cggacagtgc cttcgccccc 600
gcctggcggc gcgcgccacc gccgcctcag cactgaaggc gcgctgacgt cactcgccgg 660
tcccccgcaa actccccttc ccggccacct tggtcgcgtc cgcgccgccg ccggcccagc 720
cggaccgcac cacgcgaggc gcgagatagg ggggcacggg cgcgaccatc tgcgctgcgg 780
cgccggcgac tcagcgctgc ctcagtctgc ggtgggcagc ggaggagtcg tgtcgtgcct 840
gagagcgcag g 851
<210> 50
<211> 304
<212> ДНК
<213> Бетагерпесвирус человека 5
<400> 50
cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc cccgcccatt 60
gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc attgacgtca 120
atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt atcatatgcc 180
aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt atgcccagta 240
catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca tcgctattac 300
catg 304
<210> 51
<211> 953
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 51
cgcgtccgcc cgcgagcaca gagcctcgcc tttgccgatc cgccgcccgt ccacacccgc 60
cgccaggtaa gcccggccag ccgaccgggg catgcggccg cggcccttcg cccgtgcaga 120
gccgccgtct gggccgcagc ggggggcgca tggggcggaa ccggaccgcc gtggggggcg 180
cgggagaagc ccctgggcct ccggagatgg gggacacccc acgccagttc gcaggcgcga 240
ggccgcgctc gggcgggcgc gctccggggg tgccgctctc ggggcggggg caaccggcgg 300
ggtctttgtc tgagccgggc tcttgccaat ggggatcgca cggtgggcgc ggcgtagccc 360
ccgtcaggcc cggtgggggc tggggcgcca tgcgcgtgcg cgctggtcct ttgggcgcta 420
actgcgtgcg cgctgggaat tggcgctaat tgcgcgtgcg cgctgggact caatggcgct 480
aatcgcgcgt gcgttctggg gcccgggcgc ttgcgccact tcctgcccga gccgctggcg 540
cccgagggtg tggccgctgc gtgcgcgcgc gcgacccggt cgctgtttga accgggcgga 600
ggcggggctg gcgcccggtt gggagggggt tggggcctgg cttcctgccg cgcgccgcgg 660
ggacgcctcc gaccagtgtt tgccttttat ggtaataacg cggccggccc ggcttccttt 720
gtccccaatc tgggcgcgcg ccggcgcccc ctggcggcct aaggactcgg cgcgccggaa 780
gtggccaggg cggcagcggc tgctcttggc ggccccgagg tgactatagc cttcttttgt 840
gtcttgatag ttcgccagcc tctgctaacc atgttcatgc cttcttcttt ttcctacagc 900
tcctgggcaa cgtgctggtt attgtgctgt ctcatcattt tggcaaagaa ttc 953
<210> 52
<211> 1068
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - Экзон/интрон бета-актина курицы плюс интрон
глобина кролика
<400> 52
gtcgctgcgc gctgccttcg ccccgtgccc cgctccgccg ccgcctcgcg ccgcccgccc 60
cggctctgac tgaccgcgtt actcccacag gtgagcgggc gggacggccc ttctcctccg 120
ggctgtaatt agcgcttggt ttaatgacgg cttgtttctt ttctgtggct gcgtgaaagc 180
cttgaggggc tccgggaggg ccctttgtgc ggggggagcg gctcgggggg tgcgtgcgtg 240
tgtgtgtgcg tggggagcgc cgcgtgcggc tccgcgctgc ccggcggctg tgagcgctgc 300
gggcgcggcg cggggctttg tgcgctccgc agtgtgcgcg aggggagcgc ggccgggggc 360
ggtgccccgc ggtgcggggg gggctgcgag gggaacaaag gctgcgtgcg gggtgtgtgc 420
gtgggggggt gagcaggggg tgtgggcgcg tcggtcgggc tgcaaccccc cctgcacccc 480
cctccccgag ttgctgagca cggcccggct tcgggtgcgg ggctccgtac ggggcgtggc 540
gcggggctcg ccgtgccggg cggggggtgg cggcaggtgg gggtgccggg cggggcgggg 600
ccgcctcggg ccggggaggg ctcgggggag gggcgcggcg gcccccggag cgccggcggc 660
tgtcgaggcg cggcgagccg cagccattgc cttttatggt aatcgtgcga gagggcgcag 720
ggacttcctt tgtcccaaat ctgtgcggag ccgaaatctg ggaggcgccg ccgcaccccc 780
tctagcgggc gcggggcgaa gcggtgcggc gccggcagga aggaaatggg cggggagggc 840
cttcgtgcgt cgccgcgccg ccgtcccctt ctccctctcc agcctcgggg ctgtccgcgg 900
ggggacggct gccttcgggg gggacggggc agggcggggt tcggcttctg gcgtgtgacc 960
ggcggctcta gagcctctgc taaccatgtt catgccttct tctttttcct acagctcctg 1020
ggcaacgtgc tggttattgt gctgtctcat cattttggca aagaattc 1068
<210> 53
<211> 149
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - последовательность химерного интрона
<400> 53
ggtaagttta gtctttttgt cttttatttc aggtcccgga tccggtggtg gtgcaaatca 60
aagaactgct cctcagtgga tgttgccttt acttctaggc ctgtacggaa gtgttacttc 120
tgctctaaaa gctgcggaat tgtacccgc 149
<210> 54
<211> 126
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 54
agtctgcggt gggcagcgga ggagtcgtgt cgtgcctgag agcgcagctg tgctcctggg 60
caccgcgcag tccgcccccg cggctcctgg ccagaccacc cctaggaccc cctgccccaa 120
gtcgca 126
<210> 55
<211> 121
<212> ДНК
<213> Бетагерпесвирус человека 5
<400> 55
tcagatcgcc tggagaggcc atccacgctg ttttgacctc catagtggac accgggaccg 60
atccagcctc cgcggccggg aacggtgcat tggaacgcgg attccccgtg ccaagagtga 120
c 121
<210> 56
<211> 512
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - энхансерный элемент, полученный из аденовируса
<400> 56
ctcactctct tccgcatcgc tgtctgcgag ggccagctgt tgggctcgcg gttgaggaca 60
aactcttcgc ggtctttcca gtactcttgg atcggaaacc cgtcggcctc cgaacggtac 120
tccgccaccg agggacctga gcgagtccgc atcgaccgga tcggaaaacc tctcgagaaa 180
ggcgtctaac cagtcacagt cgcaaggtag gctgagcacc gtggcgggcg gcagcgggtg 240
gcggtcgggg ttgtttctgg cggaggtgct gctgatgatg taattaaagt aggcggtctt 300
gagacggcgg atggtcgagg tgaggtgtgg caggcttgag atccagctgt tggggtgagt 360
actccctctc aaaagcgggc attacttctg cgctaagatt gtcagtttcc aaaaacgagg 420
aggatttgat attcacctgg cccgatctgg ccatacactt gagtgacaat gacatccact 480
ttgcctttct ctccacaggt gtccactccc ag 512
<210> 57
<211> 956
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 57
ctttttcgca acgggtttgc cgccagaaca caggtaagtg ccgtgtgtgg ttcccgcggg 60
cctggcctct ttacgggtta tggcccttgc gtgccttgaa ttacttccac ctggctccag 120
tacgtgattc ttgatcccga gctggagcca ggggcgggcc ttgcgcttta ggagcccctt 180
cgcctcgtgc ttgagttgag gcctggcctg ggcgctgggg ccgccgcgtg cgaatctggt 240
ggcaccttcg cgcctgtctc gctgctttcg ataagtctct agccatttaa aatttttgat 300
gacgtgctgc gacgcttttt ttctggcaag atagtcttgt aaatgcgggc caggatctgc 360
acactggtat ttcggttttt gggcccgcgg ccggcgacgg ggcccgtgcg tcccagcgca 420
catgttcggc gaggcggggc ctgcgagcgc ggccaccgag aatcggacgg gggtagtctc 480
aagctggccg gcctgctctg gtgcctggcc tcgcgccgcc gtgtatcgcc ccgccctggg 540
cggcaaggct ggcccggtcg gcaccagttg cgtgagcgga aagatggccg cttcccggcc 600
ctgctccagg gggctcaaaa tggaggacgc ggcgctcggg agagcgggcg ggtgagtcac 660
ccacacaaag gaaaagggcc tttccgtcct cagccgtcgc ttcatgtgac tccacggagt 720
accgggcgcc gtccaggcac ctcgattagt tctggagctt ttggagtacg tcgtctttag 780
gttgggggga ggggttttat gcgatggagt ttccccacac tgagtgggtg gagactgaag 840
ttaggccagc ttggcacttg atgtaattct ccttggaatt tggccttttt gagtttggat 900
cttggttcat tctcaagcct cagacagtgg ttcaaagttt ttttcttcca tttcag 956
<210> 58
<211> 939
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 58
gtaagtgccg tgtgtggttc ccgcgggcct ggcctcttta cgggttatgg cccttgcgtg 60
ccttgaatta cttccacctg gctgcagtac gtgattcttg atcccgagct tcgggttgga 120
agtgggtggg agagttcgag gccttgcgct taaggagccc cttcgcctcg tgcttgagtt 180
gaggcctggc ctgggcgctg gggccgccgc gtgcgaatct ggtggcacct tcgcgcctgt 240
ctcgctgctt tcgataagtc tctagccatt taaaattttt gatgacctgc tgcgacgctt 300
tttttctggc aagatagtct tgtaaatgcg ggccaagatc tgcacactgg tatttcggtt 360
tttggggccg cgggcggcga cggggcccgt gcgtcccagc gcacatgttc ggcgaggcgg 420
ggcctgcgag cgcggccacc gagaatcgga cgggggtagt ctcaagctgg ccggcctgct 480
ctggtgcctg gcctcgcgcc gccgtgtatc gccccgccct gggcggcaag gctggcccgg 540
tcggcaccag ttgcgtgagc ggaaagatgg ccgcttcccg gccctgctgc agggagctca 600
aaatggagga cgcggcgctc gggagagcgg gcgggtgagt cacccacaca aaggaaaagg 660
gcctttccgt cctcagccgt cgcttcatgt gactccacgg agtaccgggc gccgtccagg 720
cacctcgatt agttctcgag cttttggagt acgtcgtctt taggttgggg ggaggggttt 780
tatgcgatgg agtttcccca cactgagtgg gtggagactg aagttaggcc agcttggcac 840
ttgatgtaat tctccttgga atttgccctt tttgagtttg gatcttggtt cattctcaag 900
cctcagacag tggttcaaag tttttttctt ccatttcag 939
<210> 59
<211> 83
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 59
tcagaagccc cgggctcgtc agtcaaaccg gttctctgtt tgcactcggc agcacgggca 60
ggcaagtggt ccctaggttc ggg 83
<210> 60
<211> 476
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 60
gtgagtctat gggacccttg atgttttctt tccccttctt ttctatggtt aagttcatgt 60
cataggaagg ggagaagtaa cagggtacac atattgacca aatcagggta attttgcatt 120
tgtaatttta aaaaatgctt tcttctttta atatactttt ttgtttatct tatttctaat 180
actttcccta atctctttct ttcagggcaa taatgataca atgtatcatg cctctttgca 240
ccattctaaa gaataacagt gataatttct gggttaaggc aatagcaata tttctgcata 300
taaatatttc tgcatataaa ttgtaactga tgtaagaggt ttcatattgc taatagcagc 360
tacaatccag ctaccattct gcttttattt tatggttggg ataaggctgg attattctga 420
gtccaagcta ggcccttttg ctaatcatgt tcatacctct tatcttcctc ccacag 476
<210> 61
<211> 196
<212> ДНК
<213> вирус обезьян 40
<400> 61
tctagaggat ccggtactcg aggaactgaa aaaccagaaa gttaactggt aagtttagtc 60
tttttgtctt ttatttcagg tcccggatcc ggtggtggtg caaatcaaag aactgctcct 120
cagtggatgt tgcctttact tctaggcctg tacggaagtg ttacttctgc tctaaaagct 180
gcggaattgt acccgc 196
<210> 62
<211> 589
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - мутировавший регуляторный элемент гепатита сурка
<400> 62
aatcaacctc tggattacaa aatttgtgaa agattgactg gtattcttaa ctatgttgct 60
ccttttacgc tatgtggata cgctgcttta atgcctttgt atcatgctat tgcttcccgt 120
atggctttca ttttctcctc cttgtataaa tcctggttgc tgtctcttta tgaggagttg 180
tggcccgttg tcaggcaacg tggcgtggtg tgcactgtgt ttgctgacgc aacccccact 240
ggttggggca ttgccaccac ctgtcagctc ctttccggga ctttcgcttt ccccctccct 300
attgccacgg cggaactcat cgccgcctgc cttgcccgct gctggacagg ggctcggctg 360
ttgggcactg acaattccgt ggtgttgtcg gggaaatcat cgtcctttcc ttggctgctc 420
gcctgtgttg ccacctggat tctgcgcggg acgtccttct gctacgtccc ttcggccctc 480
aatccagcgg accttccttc ccgcggcctg ctgccggctc tgcggcctct tccgcgtctt 540
cgccttcgcc ctcagacgag tcggatctcc ctttgggccg cctccccgc 589
<210> 63
<211> 588
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - мутировавший регуляторный элемент гепатита сурка
<400> 63
tcaacctctg gattacaaaa tttgtgaaag attgactggt attcttaact atgttgctcc 60
ttttacgcta tgtggatacg ctgctttaat gcctttgtat catgctattg cttcccgtat 120
ggctttcatt ttctcctcct tgtataaatc ctggttgctg tctctttatg aggagttgtg 180
gcccgttgtc aggcaacgtg gcgtggtgtg cactgtgttt gctgacgcaa cccccactgg 240
ttggggcatt gccaccacct gtcagctcct ttccgggact ttcgctttcc ccctccctat 300
tgccacggcg gaactcatcg ccgcctgcct tgcccgctgc tggacagggg ctcggctgtt 360
gggcactgac aattccgtgg tgttgtcggg gaaatcatcg tcctttcctt ggctgctcgc 420
ctgtgttgcc acctggattc tgcgcgggac gtccttctgc tacgtccctt cggccctcaa 480
tccagcggac cttccttccc gcggcctgct gccggctctg cggcctcttc cgcgtcttcg 540
ccttcgccct cagacgagtc ggatctccct ttgggccgcc tccccgca 588
<210> 64
<211> 755
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - мутировавший регуляторный элемент гепатита сурка
<400> 64
ttcctgttaa tcaacctctg gattacaaaa tttgtgaaag attgactggt attcttaact 60
atgttgctcc ttttacgcta tgtggatacg ctgctttaat gcctttgtat catgctattg 120
cttcccgtat ggctttcatt ttctcctcct tgtataaatc ctggttgctg tctctttatg 180
aggagttgtg gcccgttgtc aggcaacgtg gcgtggtgtg cactgtgttt gctgacgcaa 240
cccccactgg ttggggcatt gccaccacct gtcagctcct ttccgggact ttcgctttcc 300
ccctccctat tgccacggcg gaactcatcg ccgcctgcct tgcccgctgc tggacagggg 360
ctcggctgtt gggcactgac aattccgtgg tgttgtcggg gaagctgacg tcctttccgc 420
ggctgctcgc ctgtgttgcc acctggattc tgcgcgggac gtccttctgc tacgtccctt 480
cggccctcaa tccagcggac cttccttccc gcggcctgct gccggctctg cggcctcttc 540
cgcctcttcg ccttcgccct cagacgagtc ggatctccct ttgggccgcc tccccgccca 600
tgtatctttt tcacctgtgc cttgtttttg cctgtgttcc gcgtcctact tttcaagcct 660
ccaagctgtg ccttgggcgg ctttggggca tggacataga tccctataaa gaatttggtt 720
catcttatca gttgttgaat tttcttcctt tggac 755
<210> 65
<211> 12
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Мотив CAAX
<400> 65
tgtgtgataa tg 12
<210> 66
<211> 810
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 66
ctgttctcat cacatcatat caaggttata taccatcaat attgccacag atgttactta 60
gccttttaat atttctctaa tttagtgtat atgcaatgat agttctctga tttctgagat 120
tgagtttctc atgtgtaatg attatttaga gtttctcttt catctgttca aatttttgtc 180
tagttttatt ttttactgat ttgtaagact tctttttata atctgcatat tacaattctc 240
tttactgggg tgttgcaaat attttctgtc attctatggc ctgacttttc ttaatggttt 300
tttaatttta aaaataagtc ttaatattca tgcaatctaa ttaacaatct tttctttgtg 360
gttaggactt tgagtcataa gaaatttttc tctacactga agtcatgatg gcatgcttct 420
atattatttt ctaaaagatt taaagttttg ccttctccat ttagacttat aattcactgg 480
aatttttttg tgtgtatggt atgacatatg ggttcccttt tattttttac atataaatat 540
atttccctgt ttttctaaaa aagaaaaaga tcatcatttt cccattgtaa aatgccatat 600
ttttttcata ggtcacttac atatatcaat gggtctgttt ctgagctcta ctctatttta 660
tcagcctcac tgtctatccc cacacatctc atgctttgct ctaaatcttg atatttagtg 720
gaacattctt tcccattttg ttctacaaga atatttttgt tattgtcttt gggctttcta 780
tatacatttt gaaatgaggt tgacaagtta 810
<210> 67
<211> 726
<212> ДНК
<213> Вирус гепатита B
<400> 67
ataacaggcc tattgattgg aaagtttgtc aacgaattgt gggtcttttg gggtttgctg 60
ccccttttac gcaatgtgga tatcctgctt taatgccttt atatgcatgt atacaagcaa 120
aacaggcttt tactttctcg ccaacttaca aggcctttct cagtaaacag tatatgaccc 180
tttaccccgt tgctcggcaa cggcctggtc tgtgccaagt gtttgctgac gcaaccccca 240
ctggttgggg cttggccata ggccatcagc gcatgcgtgg aacctttgtg tctcctctgc 300
cgatccatac tgcggaactc ctagccgctt gttttgctcg cagcaggtct ggagcaaacc 360
tcatcgggac cgacaattct gtcgtactct cccgcaagta tacatcgttt ccatggctgc 420
taggctgtgc tgccaactgg atcctgcgcg ggacgtcctt tgtttacgtc ccgtcggcgc 480
tgaatcccgc ggacgacccc tcccggggcc gcttggggct ctaccgcccg cttctccgtc 540
tgccgtaccg tccgaccacg gggcgcacct ctctttacgc ggactccccg tctgtgcctt 600
ctcatctgcc ggaccgtgtg cacttcgctt cacctctgca cgtcgcatgg aggccaccgt 660
gaacgcccac cggaacctgc ccaaggtctt gcataagagg actcttggac tttcagcaat 720
gtcatc 726
<210> 68
<211> 755
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Сделано в лаборатории - энхансерный элемент, полученный из HepB
<400> 68
ttcctgtaaa caggcctatt gattggaaag tttgtcaacg aattgtgggt cttttggggt 60
ttgctgcccc ttttacgcaa tgtggatatc ctgctttaat gcctttatat gcatgtatac 120
aagcaaaaca ggcttttact ttctcgccaa cttacaaggc ctttctcagt aaacagtata 180
tgacccttta ccccgttgct cggcaacggc ctggtctgtg ccaagtgttt gctgacgcaa 240
cccccactgg ttggggcttg gccataggcc atcagcgcat gcgtggaacc tttgtgtctc 300
ctctgccgat ccatactgcg gaactcctag ccgcttgttt tgctcgcagc tggactggag 360
caaacctcat cgggaccgac aattctgtcg tactctcccg caagcactca ccgtttccgc 420
ggctgctcgc ctgtgttgcc acctggattc tgcgcgggac gtccttctgc tacgtccctt 480
cggccctcaa tccagcggac cttccttccc gcggcctgct gccggctctg cggcctcttc 540
cgcctcttcg ccttcgccct cagacgagtc ggatctccct ttgggccgcc tccccgccca 600
tgtatctttt tcacctgtgc cttgtttttg cctgtgttcc gcgtcctact tttcaagcct 660
ccaagctgtg ccttgggcgg ctttggggca tggacataga tccctataaa gaatttggtt 720
catcttatca gttgttgaat tttcttcctt tggac 755
<210> 69
<211> 94
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 69
gctggagcct cggtagccgt tcctcctgcc cgctgggcct cccaacgggc cctcctcccc 60
tccttgcacc ggcccttcct ggtctttgaa taaa 94
<210> 70
<211> 596
<212> ДНК
<213> Вирус гепатита сурка
<400> 70
attcgagcat cttaccgcca tttattccca tatttgttct gtttttcttg atttgggtat 60
acatttaaat gttaataaaa caaaatggtg gggcaatcat ttacattttt agggatatgt 120
aattactagt tcaggtgtat tgccacaaga caaacatgtt aagaaacttt cccgttattt 180
acgctctgtt cctgttaatc aacctctgga ttacaaaatt tgtgaaagat tgactgatat 240
tcttaactat gttgctcctt ttacgctgtg tggatatgct gctttaatgc ctctgtatca 300
tgctattgct tcccgtacgg ctttcgtttt ctcctccttg tataaatcct ggttgctgtc 360
tctttatgag gagttgtggc ccgttgtccg tcaacgtggc gtggtgtgct ctgtgtttgc 420
tgacgcaacc cccactggct ggggcattgc caccacctgt caactccttt ctgggacttt 480
cgctttcccc ctcccgatcg ccacggcaga actcatcgcc gcctgccttg cccgctgctg 540
gacaggggct aggttgctgg gcactgataa ttccgtggtg ttgtcgggga agggcc 596
<210> 71
<211> 387
<212> ДНК
<213> Oryctolagus cuniculus
<400> 71
tggctaataa aggaaattta ttttcattgc aatagtgtgt tggaattttt tgtgtctctc 60
actcggaaga acatatggga gggcaaatca tttaaaacat cagaatgagt atttggttta 120
gagtttggca acatatgccc atatgctggc tgccatgaac aaaggttggc tataaagagg 180
tcatcagtat atgaaacagc cccctgctgt ccattcctta ttccatagaa aagccttgac 240
ttgaggttag atttttttta tattttgttt tgtgttattt ttttctttaa catccctaaa 300
attttcctta catgttttac tagccagatt tttcctcctc tcctgactac tcccagtcat 360
agctgtccct cttctcttat ggagatc 387
<210> 72
<211> 251
<212> ДНК
<213> Bos taurus
<400> 72
ttgccagcca tctgttgttt gcccctcccc cgtgccttcc ttgaccctgg aaggtgccac 60
tcccactgtc ctttcctaat aaaatgagga aattgcatcg cattgtctga gtaggtgtca 120
ttctattctg gggggtgggg tggggcagga cagcaagggg gaggattggg aatacaatag 180
caggcatgct ggggatgcgg tgggctctat gggtacccag gtgctgaaga attgacccgg 240
ttcctcctgg g 251
<210> 73
<211> 251
<212> ДНК
<213> Bos taurus
<400> 73
ttgccagcca tctgttgttt gcccctcccc cgtgccttcc ttgaccctgg aaggtgccac 60
tcccactgtc ctttcctaat aaaatgagga aattgcatcg cattgtctga gtaggtgtca 120
ttctattctg gggggtgggg tggggcagga cagcaagggg gaggattggg aagacaatag 180
caggcatgct ggggatgcgg tgggctctat gggtacccag gtgctgaaga attgacccgg 240
ttcctcctgg g 251
<210> 74
<211> 225
<212> ДНК
<213> Bos taurus
<400> 74
ctgtgccttc tagttgccag ccatctgttg tttgcccctc ccccgtgcct tccttgaccc 60
tggaaggtgc cactcccact gtcctttcct aataaaatga ggaaattgca tcgcattgtc 120
tgagtaggtg tcattctatt ctggggggtg gggtggggca ggacagcaag ggggaggatt 180
gggaagacaa tagcaggcat gctggggatg cggtgggctc tatgg 225
<210> 75
<211> 202
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<400> 75
ctgcccgggt ggcatccctg tgacccctcc ccagtgcctc tcctggccct ggaagttgcc 60
actccagtgc ccaccagcct tgtcctaata aaattaagtt gcatcatttt gtctgactag 120
gtgtccttct ataatattat ggggtggagg ggggtggtat ggagcaaggg gcccaagttg 180
ggaagaaacc tgtagggcct gc 202
<210> 76
<211> 735
<212> БЕЛОК
<213> Аденоассоциированный вирус 2
<400> 76
Met Ala Ala Asp Gly Tyr Leu Pro Asp Trp Leu Glu Asp Thr Leu Ser
1 5 10 15
Glu Gly Ile Arg Gln Trp Trp Lys Leu Lys Pro Gly Pro Pro Pro Pro
20 25 30
Lys Pro Ala Glu Arg His Lys Asp Asp Ser Arg Gly Leu Val Leu Pro
35 40 45
Gly Tyr Lys Tyr Leu Gly Pro Phe Asn Gly Leu Asp Lys Gly Glu Pro
50 55 60
Val Asn Glu Ala Asp Ala Ala Ala Leu Glu His Asp Lys Ala Tyr Asp
65 70 75 80
Arg Gln Leu Asp Ser Gly Asp Asn Pro Tyr Leu Lys Tyr Asn His Ala
85 90 95
Asp Ala Glu Phe Gln Glu Arg Leu Lys Glu Asp Thr Ser Phe Gly Gly
100 105 110
Asn Leu Gly Arg Ala Val Phe Gln Ala Lys Lys Arg Val Leu Glu Pro
115 120 125
Leu Gly Leu Val Glu Glu Pro Val Lys Thr Ala Pro Gly Lys Lys Arg
130 135 140
Pro Val Glu His Ser Pro Val Glu Pro Asp Ser Ser Ser Gly Thr Gly
145 150 155 160
Lys Ala Gly Gln Gln Pro Ala Arg Lys Arg Leu Asn Phe Gly Gln Thr
165 170 175
Gly Asp Ala Asp Ser Val Pro Asp Pro Gln Pro Leu Gly Gln Pro Pro
180 185 190
Ala Ala Pro Ser Gly Leu Gly Thr Asn Thr Met Ala Thr Gly Ser Gly
195 200 205
Ala Pro Met Ala Asp Asn Asn Glu Gly Ala Asp Gly Val Gly Asn Ser
210 215 220
Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Thr Trp Met Gly Asp Arg Val Ile
225 230 235 240
Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu Pro Thr Tyr Asn Asn His Leu
245 250 255
Tyr Lys Gln Ile Ser Ser Gln Ser Gly Ala Ser Asn Asp Asn His Tyr
260 265 270
Phe Gly Tyr Ser Thr Pro Trp Gly Tyr Phe Asp Phe Asn Arg Phe His
275 280 285
Cys His Phe Ser Pro Arg Asp Trp Gln Arg Leu Ile Asn Asn Asn Trp
290 295 300
Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn Phe Lys Leu Phe Asn Ile Gln Val
305 310 315 320
Lys Glu Val Thr Gln Asn Asp Gly Thr Thr Thr Ile Ala Asn Asn Leu
325 330 335
Thr Ser Thr Val Gln Val Phe Thr Asp Ser Glu Tyr Gln Leu Pro Tyr
340 345 350
Val Leu Gly Ser Ala His Gln Gly Cys Leu Pro Pro Phe Pro Ala Asp
355 360 365
Val Phe Met Val Pro Gln Tyr Gly Tyr Leu Thr Leu Asn Asn Gly Ser
370 375 380
Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr Cys Leu Glu Tyr Phe Pro Ser
385 390 395 400
Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe Thr Phe Ser Tyr Thr Phe Glu
405 410 415
Asp Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala His Ser Gln Ser Leu Asp Arg
420 425 430
Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu Tyr Tyr Leu Ser Arg Thr
435 440 445
Asn Thr Pro Ser Gly Thr Thr Thr Gln Ser Arg Leu Gln Phe Ser Gln
450 455 460
Ala Gly Ala Ser Asp Ile Arg Asp Gln Ser Arg Asn Trp Leu Pro Gly
465 470 475 480
Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Lys Thr Ser Ala Asp Asn Asn
485 490 495
Asn Ser Glu Tyr Ser Trp Thr Gly Ala Thr Lys Tyr His Leu Asn Gly
500 505 510
Arg Asp Ser Leu Val Asn Pro Gly Pro Ala Met Ala Ser His Lys Asp
515 520 525
Asp Glu Glu Lys Phe Phe Pro Gln Ser Gly Val Leu Ile Phe Gly Lys
530 535 540
Gln Gly Ser Glu Lys Thr Asn Val Asp Ile Glu Lys Val Met Ile Thr
545 550 555 560
Asp Glu Glu Glu Ile Arg Thr Thr Asn Pro Val Ala Thr Glu Gln Tyr
565 570 575
Gly Ser Val Ser Thr Asn Leu Gln Arg Gly Asn Arg Gln Ala Ala Thr
580 585 590
Ala Asp Val Asn Thr Gln Gly Val Leu Pro Gly Met Val Trp Gln Asp
595 600 605
Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp Ala Lys Ile Pro His Thr
610 615 620
Asp Gly His Phe His Pro Ser Pro Leu Met Gly Gly Phe Gly Leu Lys
625 630 635 640
His Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile Lys Asn Thr Pro Val Pro Ala Asn
645 650 655
Pro Ser Thr Thr Phe Ser Ala Ala Lys Phe Ala Ser Phe Ile Thr Gln
660 665 670
Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val Glu Ile Glu Trp Glu Leu Gln Lys
675 680 685
Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro Glu Ile Gln Tyr Thr Ser Asn Tyr
690 695 700
Asn Lys Ser Val Asn Val Asp Phe Thr Val Asp Thr Asn Gly Val Tyr
705 710 715 720
Ser Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr Leu Thr Arg Asn Leu
725 730 735
<210> 77
<211> 736
<212> БЕЛОК
<213> Аденоассоциированный вирус 9
<400> 77
Met Ala Ala Asp Gly Tyr Leu Pro Asp Trp Leu Glu Asp Asn Leu Ser
1 5 10 15
Glu Gly Ile Arg Glu Trp Trp Ala Leu Lys Pro Gly Ala Pro Gln Pro
20 25 30
Lys Ala Asn Gln Gln His Gln Asp Asn Ala Arg Gly Leu Val Leu Pro
35 40 45
Gly Tyr Lys Tyr Leu Gly Pro Gly Asn Gly Leu Asp Lys Gly Glu Pro
50 55 60
Val Asn Ala Ala Asp Ala Ala Ala Leu Glu His Asp Lys Ala Tyr Asp
65 70 75 80
Gln Gln Leu Lys Ala Gly Asp Asn Pro Tyr Leu Lys Tyr Asn His Ala
85 90 95
Asp Ala Glu Phe Gln Glu Arg Leu Lys Glu Asp Thr Ser Phe Gly Gly
100 105 110
Asn Leu Gly Arg Ala Val Phe Gln Ala Lys Lys Arg Leu Leu Glu Pro
115 120 125
Leu Gly Leu Val Glu Glu Ala Ala Lys Thr Ala Pro Gly Lys Lys Arg
130 135 140
Pro Val Glu Gln Ser Pro Gln Glu Pro Asp Ser Ser Ala Gly Ile Gly
145 150 155 160
Lys Ser Gly Ala Gln Pro Ala Lys Lys Arg Leu Asn Phe Gly Gln Thr
165 170 175
Gly Asp Thr Glu Ser Val Pro Asp Pro Gln Pro Ile Gly Glu Pro Pro
180 185 190
Ala Ala Pro Ser Gly Val Gly Ser Leu Thr Met Ala Ser Gly Gly Gly
195 200 205
Ala Pro Val Ala Asp Asn Asn Glu Gly Ala Asp Gly Val Gly Ser Ser
210 215 220
Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Gln Trp Leu Gly Asp Arg Val Ile
225 230 235 240
Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu Pro Thr Tyr Asn Asn His Leu
245 250 255
Tyr Lys Gln Ile Ser Asn Ser Thr Ser Gly Gly Ser Ser Asn Asp Asn
260 265 270
Ala Tyr Phe Gly Tyr Ser Thr Pro Trp Gly Tyr Phe Asp Phe Asn Arg
275 280 285
Phe His Cys His Phe Ser Pro Arg Asp Trp Gln Arg Leu Ile Asn Asn
290 295 300
Asn Trp Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn Phe Lys Leu Phe Asn Ile
305 310 315 320
Gln Val Lys Glu Val Thr Asp Asn Asn Gly Val Lys Thr Ile Ala Asn
325 330 335
Asn Leu Thr Ser Thr Val Gln Val Phe Thr Asp Ser Asp Tyr Gln Leu
340 345 350
Pro Tyr Val Leu Gly Ser Ala His Glu Gly Cys Leu Pro Pro Phe Pro
355 360 365
Ala Asp Val Phe Met Ile Pro Gln Tyr Gly Tyr Leu Thr Leu Asn Asp
370 375 380
Gly Ser Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr Cys Leu Glu Tyr Phe
385 390 395 400
Pro Ser Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe Gln Phe Ser Tyr Glu
405 410 415
Phe Glu Asn Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala His Ser Gln Ser Leu
420 425 430
Asp Arg Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu Tyr Tyr Leu Ser
435 440 445
Lys Thr Ile Asn Gly Ser Gly Gln Asn Gln Gln Thr Leu Lys Phe Ser
450 455 460
Val Ala Gly Pro Ser Asn Met Ala Val Gln Gly Arg Asn Tyr Ile Pro
465 470 475 480
Gly Pro Ser Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Thr Thr Val Thr Gln Asn
485 490 495
Asn Asn Ser Glu Phe Ala Trp Pro Gly Ala Ser Ser Trp Ala Leu Asn
500 505 510
Gly Arg Asn Ser Leu Met Asn Pro Gly Pro Ala Met Ala Ser His Lys
515 520 525
Glu Gly Glu Asp Arg Phe Phe Pro Leu Ser Gly Ser Leu Ile Phe Gly
530 535 540
Lys Gln Gly Thr Gly Arg Asp Asn Val Asp Ala Asp Lys Val Met Ile
545 550 555 560
Thr Asn Glu Glu Glu Ile Lys Thr Thr Asn Pro Val Ala Thr Glu Ser
565 570 575
Tyr Gly Gln Val Ala Thr Asn His Gln Ser Ala Gln Ala Gln Ala Gln
580 585 590
Thr Gly Trp Val Gln Asn Gln Gly Ile Leu Pro Gly Met Val Trp Gln
595 600 605
Asp Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp Ala Lys Ile Pro His
610 615 620
Thr Asp Gly Asn Phe His Pro Ser Pro Leu Met Gly Gly Phe Gly Met
625 630 635 640
Lys His Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile Lys Asn Thr Pro Val Pro Ala
645 650 655
Asp Pro Pro Thr Ala Phe Asn Lys Asp Lys Leu Asn Ser Phe Ile Thr
660 665 670
Gln Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val Glu Ile Glu Trp Glu Leu Gln
675 680 685
Lys Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro Glu Ile Gln Tyr Thr Ser Asn
690 695 700
Tyr Tyr Lys Ser Asn Asn Val Glu Phe Ala Val Asn Thr Glu Gly Val
705 710 715 720
Tyr Ser Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr Leu Thr Arg Asn Leu
725 730 735
<210> 78
<211> 736
<212> БЕЛОК
<213> Аденоассоциированный вирус 6
<400> 78
Met Ala Ala Asp Gly Tyr Leu Pro Asp Trp Leu Glu Asp Asn Leu Ser
1 5 10 15
Glu Gly Ile Arg Glu Trp Trp Asp Leu Lys Pro Gly Ala Pro Lys Pro
20 25 30
Lys Ala Asn Gln Gln Lys Gln Asp Asp Gly Arg Gly Leu Val Leu Pro
35 40 45
Gly Tyr Lys Tyr Leu Gly Pro Phe Asn Gly Leu Asp Lys Gly Glu Pro
50 55 60
Val Asn Ala Ala Asp Ala Ala Ala Leu Glu His Asp Lys Ala Tyr Asp
65 70 75 80
Gln Gln Leu Lys Ala Gly Asp Asn Pro Tyr Leu Arg Tyr Asn His Ala
85 90 95
Asp Ala Glu Phe Gln Glu Arg Leu Gln Glu Asp Thr Ser Phe Gly Gly
100 105 110
Asn Leu Gly Arg Ala Val Phe Gln Ala Lys Lys Arg Val Leu Glu Pro
115 120 125
Phe Gly Leu Val Glu Glu Gly Ala Lys Thr Ala Pro Gly Lys Lys Arg
130 135 140
Pro Val Glu Gln Ser Pro Gln Glu Pro Asp Ser Ser Ser Gly Ile Gly
145 150 155 160
Lys Thr Gly Gln Gln Pro Ala Lys Lys Arg Leu Asn Phe Gly Gln Thr
165 170 175
Gly Asp Ser Glu Ser Val Pro Asp Pro Gln Pro Leu Gly Glu Pro Pro
180 185 190
Ala Thr Pro Ala Ala Val Gly Pro Thr Thr Met Ala Ser Gly Gly Gly
195 200 205
Ala Pro Met Ala Asp Asn Asn Glu Gly Ala Asp Gly Val Gly Asn Ala
210 215 220
Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Thr Trp Leu Gly Asp Arg Val Ile
225 230 235 240
Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu Pro Thr Tyr Asn Asn His Leu
245 250 255
Tyr Lys Gln Ile Ser Ser Ala Ser Thr Gly Ala Ser Asn Asp Asn His
260 265 270
Tyr Phe Gly Tyr Ser Thr Pro Trp Gly Tyr Phe Asp Phe Asn Arg Phe
275 280 285
His Cys His Phe Ser Pro Arg Asp Trp Gln Arg Leu Ile Asn Asn Asn
290 295 300
Trp Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn Phe Lys Leu Phe Asn Ile Gln
305 310 315 320
Val Lys Glu Val Thr Thr Asn Asp Gly Val Thr Thr Ile Ala Asn Asn
325 330 335
Leu Thr Ser Thr Val Gln Val Phe Ser Asp Ser Glu Tyr Gln Leu Pro
340 345 350
Tyr Val Leu Gly Ser Ala His Gln Gly Cys Leu Pro Pro Phe Pro Ala
355 360 365
Asp Val Phe Met Ile Pro Gln Tyr Gly Tyr Leu Thr Leu Asn Asn Gly
370 375 380
Ser Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr Cys Leu Glu Tyr Phe Pro
385 390 395 400
Ser Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe Thr Phe Ser Tyr Thr Phe
405 410 415
Glu Asp Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala His Ser Gln Ser Leu Asp
420 425 430
Arg Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu Tyr Tyr Leu Asn Arg
435 440 445
Thr Gln Asn Gln Ser Gly Ser Ala Gln Asn Lys Asp Leu Leu Phe Ser
450 455 460
Arg Gly Ser Pro Ala Gly Met Ser Val Gln Pro Lys Asn Trp Leu Pro
465 470 475 480
Gly Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Lys Thr Lys Thr Asp Asn
485 490 495
Asn Asn Ser Asn Phe Thr Trp Thr Gly Ala Ser Lys Tyr Asn Leu Asn
500 505 510
Gly Arg Glu Ser Ile Ile Asn Pro Gly Thr Ala Met Ala Ser His Lys
515 520 525
Asp Asp Lys Asp Lys Phe Phe Pro Met Ser Gly Val Met Ile Phe Gly
530 535 540
Lys Glu Ser Ala Gly Ala Ser Asn Thr Ala Leu Asp Asn Val Met Ile
545 550 555 560
Thr Asp Glu Glu Glu Ile Lys Ala Thr Asn Pro Val Ala Thr Glu Arg
565 570 575
Phe Gly Thr Val Ala Val Asn Leu Gln Ser Ser Ser Thr Asp Pro Ala
580 585 590
Thr Gly Asp Val His Val Met Gly Ala Leu Pro Gly Met Val Trp Gln
595 600 605
Asp Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp Ala Lys Ile Pro His
610 615 620
Thr Asp Gly His Phe His Pro Ser Pro Leu Met Gly Gly Phe Gly Leu
625 630 635 640
Lys His Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile Lys Asn Thr Pro Val Pro Ala
645 650 655
Asn Pro Pro Ala Glu Phe Ser Ala Thr Lys Phe Ala Ser Phe Ile Thr
660 665 670
Gln Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val Glu Ile Glu Trp Glu Leu Gln
675 680 685
Lys Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro Glu Val Gln Tyr Thr Ser Asn
690 695 700
Tyr Ala Lys Ser Ala Asn Val Asp Phe Thr Val Asp Asn Asn Gly Leu
705 710 715 720
Tyr Thr Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr Leu Thr Arg Pro Leu
725 730 735
<210> 79
<211> 738
<212> БЕЛОК
<213> Аденоассоциированный вирус примата, отличного от человека
<400> 79
Met Ala Ala Asp Gly Tyr Leu Pro Asp Trp Leu Glu Asp Asn Leu Ser
1 5 10 15
Glu Gly Ile Arg Glu Trp Trp Asp Leu Lys Pro Gly Ala Pro Lys Pro
20 25 30
Lys Ala Asn Gln Gln Lys Gln Asp Asp Gly Arg Gly Leu Val Leu Pro
35 40 45
Gly Tyr Lys Tyr Leu Gly Pro Phe Asn Gly Leu Asp Lys Gly Glu Pro
50 55 60
Val Asn Ala Ala Asp Ala Ala Ala Leu Glu His Asp Lys Ala Tyr Asp
65 70 75 80
Gln Gln Leu Lys Ala Gly Asp Asn Pro Tyr Leu Arg Tyr Asn His Ala
85 90 95
Asp Ala Glu Phe Gln Glu Arg Leu Gln Glu Asp Thr Ser Phe Gly Gly
100 105 110
Asn Leu Gly Arg Ala Val Phe Gln Ala Lys Lys Arg Val Leu Glu Pro
115 120 125
Leu Gly Leu Val Glu Glu Gly Ala Lys Thr Ala Pro Gly Lys Lys Arg
130 135 140
Pro Val Glu Pro Ser Pro Gln Arg Ser Pro Asp Ser Ser Thr Gly Ile
145 150 155 160
Gly Lys Lys Gly Gln Gln Pro Ala Lys Lys Arg Leu Asn Phe Gly Gln
165 170 175
Thr Gly Asp Ser Glu Ser Val Pro Asp Pro Gln Pro Ile Gly Glu Pro
180 185 190
Pro Ala Gly Pro Ser Gly Leu Gly Ser Gly Thr Met Ala Ala Gly Gly
195 200 205
Gly Ala Pro Met Ala Asp Asn Asn Glu Gly Ala Asp Gly Val Gly Ser
210 215 220
Ser Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Thr Trp Leu Gly Asp Arg Val
225 230 235 240
Ile Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu Pro Thr Tyr Asn Asn His
245 250 255
Leu Tyr Lys Gln Ile Ser Asn Gly Thr Ser Gly Gly Ser Thr Asn Asp
260 265 270
Asn Thr Tyr Phe Gly Tyr Ser Thr Pro Trp Gly Tyr Phe Asp Phe Asn
275 280 285
Arg Phe His Cys His Phe Ser Pro Arg Asp Trp Gln Arg Leu Ile Asn
290 295 300
Asn Asn Trp Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn Phe Lys Leu Phe Asn
305 310 315 320
Ile Gln Val Lys Glu Val Thr Gln Asn Glu Gly Thr Lys Thr Ile Ala
325 330 335
Asn Asn Leu Thr Ser Thr Ile Gln Val Phe Thr Asp Ser Glu Tyr Gln
340 345 350
Leu Pro Tyr Val Leu Gly Ser Ala His Gln Gly Cys Leu Pro Pro Phe
355 360 365
Pro Ala Asp Val Phe Met Ile Pro Gln Tyr Gly Tyr Leu Thr Leu Asn
370 375 380
Asn Gly Ser Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr Cys Leu Glu Tyr
385 390 395 400
Phe Pro Ser Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe Glu Phe Ser Tyr
405 410 415
Gln Phe Glu Asp Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala His Ser Gln Ser
420 425 430
Leu Asp Arg Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu Tyr Tyr Leu
435 440 445
Ser Arg Thr Gln Ser Thr Gly Gly Thr Ala Gly Thr Gln Gln Leu Leu
450 455 460
Phe Ser Gln Ala Gly Pro Asn Asn Met Ser Ala Gln Ala Lys Asn Trp
465 470 475 480
Leu Pro Gly Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Thr Thr Leu Ser
485 490 495
Gln Asn Asn Asn Ser Asn Phe Ala Trp Thr Gly Ala Thr Lys Tyr His
500 505 510
Leu Asn Gly Arg Asp Ser Leu Val Asn Pro Gly Val Ala Met Ala Thr
515 520 525
His Lys Asp Asp Glu Glu Arg Phe Phe Pro Ser Ser Gly Val Leu Met
530 535 540
Phe Gly Lys Gln Gly Ala Gly Lys Asp Asn Val Asp Tyr Ser Ser Val
545 550 555 560
Met Leu Thr Ser Glu Glu Glu Ile Lys Thr Thr Asn Pro Val Ala Thr
565 570 575
Glu Gln Tyr Gly Val Val Ala Asp Asn Leu Gln Gln Gln Asn Ala Ala
580 585 590
Pro Ile Val Gly Ala Val Asn Ser Gln Gly Ala Leu Pro Gly Met Val
595 600 605
Trp Gln Asn Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp Ala Lys Ile
610 615 620
Pro His Thr Asp Gly Asn Phe His Pro Ser Pro Leu Met Gly Gly Phe
625 630 635 640
Gly Leu Lys His Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile Lys Asn Thr Pro Val
645 650 655
Pro Ala Asp Pro Pro Thr Thr Phe Ser Gln Ala Lys Leu Ala Ser Phe
660 665 670
Ile Thr Gln Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val Glu Ile Glu Trp Glu
675 680 685
Leu Gln Lys Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro Glu Ile Gln Tyr Thr
690 695 700
Ser Asn Tyr Tyr Lys Ser Thr Asn Val Asp Phe Ala Val Asn Thr Asp
705 710 715 720
Gly Thr Tyr Ser Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr Leu Thr Arg
725 730 735
Asn Leu
<210> 80
<211> 2217
<212> ДНК
<213> Аденоассоциированный вирус примата, отличного от человека
<400> 80
atggctgccg atggttatct tccagattgg ctcgaggaca acctctctga gggcattcgc 60
gagtggtggg acctgaaacc tggagccccg aaacccaaag ccaaccagca aaagcaggac 120
aacggccggg gtctggtgct tcctggctac aagtacctcg gacccttcaa cggactcgac 180
aagggggagc ccgtcaacgc ggcggacgca gcggccctcg agcacgacaa ggcctacgac 240
cagcagctcc aagcgggtga caatccgtac ctgcggtata atcacgccga cgccgagttt 300
caggagcgtc tgcaagaaga tacgtctttt gggggcaacc tcgggcgcgc agtcttccag 360
gccaaaaagc gggttctcga acctctgggc ctggttgaat cgccggttaa gacggctcct 420
ggaaagaaga gaccggtaga gccatcaccc cagcgctctc cagactcctc tacgggcatc 480
ggcaagaaag gccagcagcc cgcaaaaaag agactcaatt ttgggcagac tggcgactca 540
gagtcagtcc ccgaccctca accaatcgga gaaccaccag caggcccctc tggtctggga 600
tctggtacaa tggctgcagg cggtggcgct ccaatggcag acaataacga aggcgccgac 660
ggagtgggta gttcctcagg aaattggcat tgcgattcca catggctggg cgacagagtc 720
atcaccacca gcacccgcac ctgggccctg cccacctaca acaaccacct ctacaagcaa 780
atctccaacg ggacctcggg aggaagcacc aacgacaaca cctacttcgg ctacagcacc 840
ccctgggggt attttgactt caacagattc cactgccact tttcaccacg tgactggcag 900
cgactcatca acaacaactg gggattccgg cccaagaggc tcaacttcaa gctcttcaac 960
atccaagtca aggaggtcac gcagaatgaa ggcaccaaga ccatcgccaa taaccttacc 1020
agcacgattc aggtctttac ggactcggaa taccagctcc cgtacgtgct cggctcggcg 1080
caccagggct gcctgcctcc gttcccggcg gacgtcttca tgattcctca gtacgggtac 1140
ctgactctga acaatggcag tcaggctgtg ggccggtcgt ccttctactg cctggagtac 1200
tttccttctc aaatgctgag aacgggcaac aactttgaat tcagctacaa cttcgaggac 1260
gtgcccttcc acagcagcta cgcgcacagc cagagcctgg accggctgat gaaccctctc 1320
atcgaccagt acttgtacta cctgtcccgg actcaaagca cgggcggtac tgcaggaact 1380
cagcagttgc tattttctca ggccgggcct aacaacatgt cggctcaggc caagaactgg 1440
ctacccggtc cctgctaccg gcagcaacgc gtctccacga cactgtcgca gaacaacaac 1500
agcaactttg cctggacggg tgccaccaag tatcatctga atggcagaga ctctctggtg 1560
aatcctggcg ttgccatggc tacccacaag gacgacgaag agcgattttt tccatccagc 1620
ggagtcttaa tgtttgggaa acagggagct ggaaaagaca acgtggacta tagcagcgtg 1680
atgctaacca gcgaggaaga aataaagacc accaacccag tggccacaga acagtacggc 1740
gtggtggccg ataacctgca acagcaaaac gccgctccta ttgtaggggc cgtcaatagt 1800
caaggagcct tacctggcat ggtgtggcag aaccgggacg tgtacctgca gggtcccatc 1860
tgggccaaga ttcctcatac ggacggcaac tttcatccct cgccgctgat gggaggcttt 1920
ggactgaagc atccgcctcc tcagatcctg attaaaaaca cacctgttcc cgcggatcct 1980
ccgaccacct tcaatcaggc caagctggct tctttcatca cgcagtacag taccggccag 2040
gtcagcgtgg agatcgagtg ggagctgcag aaggagaaca gcaaacgctg gaacccagag 2100
attcagtaca cttccaacta ctacaaatct acaaatgtgg actttgctgt caatactgag 2160
ggtacttatt ccgagcctcg ccccattggc acccgttacc tcacccgtaa tctgtaa 2217
<210> 81
<211> 535
<212> БЕЛОК
<213> Аденоассоциированный вирус примата, отличного от человека
<400> 81
Met Ala Ala Gly Gly Gly Ala Pro Met Ala Asp Asn Asn Glu Gly Ala
1 5 10 15
Asp Gly Val Gly Ser Ser Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Thr Trp
20 25 30
Leu Gly Asp Arg Val Ile Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu Pro
35 40 45
Thr Tyr Asn Asn His Leu Tyr Lys Gln Ile Ser Asn Gly Thr Ser Gly
50 55 60
Gly Ser Thr Asn Asp Asn Thr Tyr Phe Gly Tyr Ser Thr Pro Trp Gly
65 70 75 80
Tyr Phe Asp Phe Asn Arg Phe His Cys His Phe Ser Pro Arg Asp Trp
85 90 95
Gln Arg Leu Ile Asn Asn Asn Trp Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn
100 105 110
Phe Lys Leu Phe Asn Ile Gln Val Lys Glu Val Thr Gln Asn Glu Gly
115 120 125
Thr Lys Thr Ile Ala Asn Asn Leu Thr Ser Thr Ile Gln Val Phe Thr
130 135 140
Asp Ser Glu Tyr Gln Leu Pro Tyr Val Leu Gly Ser Ala His Gln Gly
145 150 155 160
Cys Leu Pro Pro Phe Pro Ala Asp Val Phe Met Ile Pro Gln Tyr Gly
165 170 175
Tyr Leu Thr Leu Asn Asn Gly Ser Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe
180 185 190
Tyr Cys Leu Glu Tyr Phe Pro Ser Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn
195 200 205
Phe Glu Phe Ser Tyr Asn Phe Glu Asp Val Pro Phe His Ser Ser Tyr
210 215 220
Ala His Ser Gln Ser Leu Asp Arg Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln
225 230 235 240
Tyr Leu Tyr Tyr Leu Ser Arg Thr Gln Ser Thr Gly Gly Thr Ala Gly
245 250 255
Thr Gln Gln Leu Leu Phe Ser Gln Ala Gly Pro Asn Asn Met Ser Ala
260 265 270
Gln Ala Lys Asn Trp Leu Pro Gly Pro Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val
275 280 285
Ser Thr Thr Leu Ser Gln Asn Asn Asn Ser Asn Phe Ala Trp Thr Gly
290 295 300
Ala Thr Lys Tyr His Leu Asn Gly Arg Asp Ser Leu Val Asn Pro Gly
305 310 315 320
Val Ala Met Ala Thr His Lys Asp Asp Glu Glu Arg Phe Phe Pro Ser
325 330 335
Ser Gly Val Leu Met Phe Gly Lys Gln Gly Ala Gly Lys Asp Asn Val
340 345 350
Asp Tyr Ser Ser Val Met Leu Thr Ser Glu Glu Glu Ile Lys Thr Thr
355 360 365
Asn Pro Val Ala Thr Glu Gln Tyr Gly Val Val Ala Asp Asn Leu Gln
370 375 380
Gln Gln Asn Ala Ala Pro Ile Val Gly Ala Val Asn Ser Gln Gly Ala
385 390 395 400
Leu Pro Gly Met Val Trp Gln Asn Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro
405 410 415
Ile Trp Ala Lys Ile Pro His Thr Asp Gly Asn Phe His Pro Ser Pro
420 425 430
Leu Met Gly Gly Phe Gly Leu Lys His Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile
435 440 445
Lys Asn Thr Pro Val Pro Ala Asp Pro Pro Thr Thr Phe Asn Gln Ala
450 455 460
Lys Leu Ala Ser Phe Ile Thr Gln Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val
465 470 475 480
Glu Ile Glu Trp Glu Leu Gln Lys Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro
485 490 495
Glu Ile Gln Tyr Thr Ser Asn Tyr Tyr Lys Ser Thr Asn Val Asp Phe
500 505 510
Ala Val Asn Thr Glu Gly Thr Tyr Ser Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr
515 520 525
Arg Tyr Leu Thr Arg Asn Leu
530 535
<210> 82
<211> 398
<212> БЕЛОК
<213> Аденоассоциированный вирус примата, отличного от человека
<400> 82
Ser Thr Ile Gln Val Phe Thr Asp Ser Glu Tyr Gln Leu Pro Tyr Val
1 5 10 15
Leu Gly Ser Ala His Gln Gly Cys Leu Pro Pro Phe Pro Ala Asp Val
20 25 30
Phe Met Ile Pro Gln Tyr Gly Tyr Leu Thr Leu Asn Asn Gly Ser Gln
35 40 45
Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr Cys Leu Glu Tyr Phe Pro Ser Gln
50 55 60
Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe Glu Phe Ser Tyr Asn Phe Glu Asp
65 70 75 80
Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala His Ser Gln Ser Leu Asp Arg Leu
85 90 95
Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu Tyr Tyr Leu Ser Arg Thr Gln
100 105 110
Ser Thr Gly Gly Thr Ala Gly Thr Gln Gln Leu Leu Phe Ser Gln Ala
115 120 125
Gly Pro Asn Asn Met Ser Ala Gln Ala Lys Asn Trp Leu Pro Gly Pro
130 135 140
Cys Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Thr Thr Leu Ser Gln Asn Asn Asn
145 150 155 160
Ser Asn Phe Ala Trp Thr Gly Ala Thr Lys Tyr His Leu Asn Gly Arg
165 170 175
Asp Ser Leu Val Asn Pro Gly Val Ala Met Ala Thr His Lys Asp Asp
180 185 190
Glu Glu Arg Phe Phe Pro Ser Ser Gly Val Leu Met Phe Gly Lys Gln
195 200 205
Gly Ala Gly Lys Asp Asn Val Asp Tyr Ser Ser Val Met Leu Thr Ser
210 215 220
Glu Glu Glu Ile Lys Thr Thr Asn Pro Val Ala Thr Glu Gln Tyr Gly
225 230 235 240
Val Val Ala Asp Asn Leu Gln Gln Gln Asn Ala Ala Pro Ile Val Gly
245 250 255
Ala Val Asn Ser Gln Gly Ala Leu Pro Gly Met Val Trp Gln Asn Arg
260 265 270
Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp Ala Lys Ile Pro His Thr Asp
275 280 285
Gly Asn Phe His Pro Ser Pro Leu Met Gly Gly Phe Gly Leu Lys His
290 295 300
Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile Lys Asn Thr Pro Val Pro Ala Asp Pro
305 310 315 320
Pro Thr Thr Phe Asn Gln Ala Lys Leu Ala Ser Phe Ile Thr Gln Tyr
325 330 335
Ser Thr Gly Gln Val Ser Val Glu Ile Glu Trp Glu Leu Gln Lys Glu
340 345 350
Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro Glu Ile Gln Tyr Thr Ser Asn Tyr Tyr
355 360 365
Lys Ser Thr Asn Val Asp Phe Ala Val Asn Thr Glu Gly Thr Tyr Ser
370 375 380
Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr Leu Thr Arg Asn Leu
385 390 395
<210> 83
<211> 332
<212> БЕЛОК
<213> Аденоассоциированный вирус примата, отличного от человека
<400> 83
Arg Thr Gly Asn Asn Phe Glu Phe Ser Tyr Asn Phe Glu Asp Val Pro
1 5 10 15
Phe His Ser Ser Tyr Ala His Ser Gln Ser Leu Asp Arg Leu Met Asn
20 25 30
Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu Tyr Tyr Leu Ser Arg Thr Gln Ser Thr
35 40 45
Gly Gly Thr Ala Gly Thr Gln Gln Leu Leu Phe Ser Gln Ala Gly Pro
50 55 60
Asn Asn Met Ser Ala Gln Ala Lys Asn Trp Leu Pro Gly Pro Cys Tyr
65 70 75 80
Arg Gln Gln Arg Val Ser Thr Thr Leu Ser Gln Asn Asn Asn Ser Asn
85 90 95
Phe Ala Trp Thr Gly Ala Thr Lys Tyr His Leu Asn Gly Arg Asp Ser
100 105 110
Leu Val Asn Pro Gly Val Ala Met Ala Thr His Lys Asp Asp Glu Glu
115 120 125
Arg Phe Phe Pro Ser Ser Gly Val Leu Met Phe Gly Lys Gln Gly Ala
130 135 140
Gly Lys Asp Asn Val Asp Tyr Ser Ser Val Met Leu Thr Ser Glu Glu
145 150 155 160
Glu Ile Lys Thr Thr Asn Pro Val Ala Thr Glu Gln Tyr Gly Val Val
165 170 175
Ala Asp Asn Leu Gln Gln Gln Asn Ala Ala Pro Ile Val Gly Ala Val
180 185 190
Asn Ser Gln Gly Ala Leu Pro Gly Met Val Trp Gln Asn Arg Asp Val
195 200 205
Tyr Leu Gln Gly Pro Ile Trp Ala Lys Ile Pro His Thr Asp Gly Asn
210 215 220
Phe His Pro Ser Pro Leu Met Gly Gly Phe Gly Leu Lys His Pro Pro
225 230 235 240
Pro Gln Ile Leu Ile Lys Asn Thr Pro Val Pro Ala Asp Pro Pro Thr
245 250 255
Thr Phe Asn Gln Ala Lys Leu Ala Ser Phe Ile Thr Gln Tyr Ser Thr
260 265 270
Gly Gln Val Ser Val Glu Ile Glu Trp Glu Leu Gln Lys Glu Asn Ser
275 280 285
Lys Arg Trp Asn Pro Glu Ile Gln Tyr Thr Ser Asn Tyr Tyr Lys Ser
290 295 300
Thr Asn Val Asp Phe Ala Val Asn Thr Glu Gly Thr Tyr Ser Glu Pro
305 310 315 320
Arg Pro Ile Gly Thr Arg Tyr Leu Thr Arg Asn Leu
325 330
<210> 84
<211> 743
<212> БЕЛОК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Синтетическая конструкция – вариант AAV9
<400> 84
Met Ala Ala Asp Gly Tyr Leu Pro Asp Trp Leu Glu Asp Asn Leu Ser
1 5 10 15
Glu Gly Ile Arg Glu Trp Trp Ala Leu Lys Pro Gly Ala Pro Gln Pro
20 25 30
Lys Ala Asn Gln Gln His Gln Asp Asn Ala Arg Gly Leu Val Leu Pro
35 40 45
Gly Tyr Lys Tyr Leu Gly Pro Gly Asn Gly Leu Asp Lys Gly Glu Pro
50 55 60
Val Asn Ala Ala Asp Ala Ala Ala Leu Glu His Asp Lys Ala Tyr Asp
65 70 75 80
Gln Gln Leu Lys Ala Gly Asp Asn Pro Tyr Leu Lys Tyr Asn His Ala
85 90 95
Asp Ala Glu Phe Gln Glu Arg Leu Lys Glu Asp Thr Ser Phe Gly Gly
100 105 110
Asn Leu Gly Arg Ala Val Phe Gln Ala Lys Lys Arg Leu Leu Glu Pro
115 120 125
Leu Gly Leu Val Glu Glu Ala Ala Lys Thr Ala Pro Gly Lys Lys Arg
130 135 140
Pro Val Glu Gln Ser Pro Gln Glu Pro Asp Ser Ser Ala Gly Ile Gly
145 150 155 160
Lys Ser Gly Ala Gln Pro Ala Lys Lys Arg Leu Asn Phe Gly Gln Thr
165 170 175
Gly Asp Thr Glu Ser Val Pro Asp Pro Gln Pro Ile Gly Glu Pro Pro
180 185 190
Ala Ala Pro Ser Gly Val Gly Ser Leu Thr Met Ala Ser Gly Gly Gly
195 200 205
Ala Pro Val Ala Asp Asn Asn Glu Gly Ala Asp Gly Val Gly Ser Ser
210 215 220
Ser Gly Asn Trp His Cys Asp Ser Gln Trp Leu Gly Asp Arg Val Ile
225 230 235 240
Thr Thr Ser Thr Arg Thr Trp Ala Leu Pro Thr Tyr Asn Asn His Leu
245 250 255
Tyr Lys Gln Ile Ser Asn Ser Thr Ser Gly Gly Ser Ser Asn Asp Asn
260 265 270
Ala Tyr Phe Gly Tyr Ser Thr Pro Trp Gly Tyr Phe Asp Phe Asn Arg
275 280 285
Phe His Cys His Phe Ser Pro Arg Asp Trp Gln Arg Leu Ile Asn Asn
290 295 300
Asn Trp Gly Phe Arg Pro Lys Arg Leu Asn Phe Lys Leu Phe Asn Ile
305 310 315 320
Gln Val Lys Glu Val Thr Asp Asn Asn Gly Val Lys Thr Ile Ala Asn
325 330 335
Asn Leu Thr Ser Thr Val Gln Val Phe Thr Asp Ser Asp Tyr Gln Leu
340 345 350
Pro Tyr Val Leu Gly Ser Ala His Glu Gly Cys Leu Pro Pro Phe Pro
355 360 365
Ala Asp Val Phe Met Ile Pro Gln Tyr Gly Tyr Leu Thr Leu Asn Asp
370 375 380
Gly Ser Gln Ala Val Gly Arg Ser Ser Phe Tyr Cys Leu Glu Tyr Phe
385 390 395 400
Pro Ser Gln Met Leu Arg Thr Gly Asn Asn Phe Gln Phe Ser Tyr Glu
405 410 415
Phe Glu Asn Val Pro Phe His Ser Ser Tyr Ala His Ser Gln Ser Leu
420 425 430
Asp Arg Leu Met Asn Pro Leu Ile Asp Gln Tyr Leu Tyr Tyr Leu Ser
435 440 445
Arg Thr Ile Asn Gly Ser Gly Gln Asn Gln Gln Thr Leu Lys Phe Ser
450 455 460
Val Ala Gly Pro Ser Asn Met Ala Val Gln Gly Arg Asn Tyr Ile Pro
465 470 475 480
Gly Pro Ser Tyr Arg Gln Gln Arg Val Ser Thr Thr Val Thr Gln Asn
485 490 495
Asn Asn Ser Glu Phe Ala Trp Pro Gly Ala Ser Ser Trp Ala Leu Asn
500 505 510
Gly Arg Asn Ser Leu Met Asn Pro Gly Pro Ala Met Ala Ser His Lys
515 520 525
Glu Gly Glu Asp Arg Phe Phe Pro Leu Ser Gly Ser Leu Ile Phe Gly
530 535 540
Lys Gln Gly Thr Gly Arg Asp Asn Val Asp Ala Asp Lys Val Met Ile
545 550 555 560
Thr Asn Glu Glu Glu Ile Lys Thr Thr Asn Pro Val Ala Thr Glu Ser
565 570 575
Tyr Gly Gln Val Ala Thr Asn His Gln Ser Ala Gln Thr Leu Ala Val
580 585 590
Pro Phe Lys Ala Gln Ala Gln Thr Gly Trp Val Gln Asn Gln Gly Ile
595 600 605
Leu Pro Gly Met Val Trp Gln Asp Arg Asp Val Tyr Leu Gln Gly Pro
610 615 620
Ile Trp Ala Lys Ile Pro His Thr Asp Gly Asn Phe His Pro Ser Pro
625 630 635 640
Leu Met Gly Gly Phe Gly Met Lys His Pro Pro Pro Gln Ile Leu Ile
645 650 655
Lys Asn Thr Pro Val Pro Ala Asp Pro Pro Thr Ala Phe Asn Lys Asp
660 665 670
Lys Leu Asn Ser Phe Ile Thr Gln Tyr Ser Thr Gly Gln Val Ser Val
675 680 685
Glu Ile Glu Trp Glu Leu Gln Lys Glu Asn Ser Lys Arg Trp Asn Pro
690 695 700
Glu Ile Gln Tyr Thr Ser Asn Tyr Tyr Lys Ser Asn Asn Val Glu Phe
705 710 715 720
Ala Val Asn Thr Glu Gly Val Tyr Ser Glu Pro Arg Pro Ile Gly Thr
725 730 735
Arg Tyr Leu Thr Arg Asn Leu
740
<210> 85
<211> 7
<212> БЕЛОК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Пептидная вставка
<400> 85
Thr Leu Ala Val Pro Phe Lys
1 5
<210> 86
<211> 7
<212> БЕЛОК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> Пептидная вставка
<400> 86
Lys Phe Pro Val Ala Leu Thr
1 5
<---

Claims (70)

1. Полинуклеотид для увеличения экспрессии мышечного белка LIM (MLP), содержащий кассету экспрессии, где полинуклеотид содержит полинуклеотидную последовательность, кодирующую MLP, функционально связанную с промотором.
2. Полинуклеотид по п. 1, где промотор представляет собой специфичный для сердца промотор.
3. Полинуклеотид по п. 1 или 2, где промотор представляет собой специфичный для мышцы промотор.
4. Полинуклеотид по любому из пп. 1–3, где промотор представляет собой специфичный для кардиомиоцитов промотор.
5. Полинуклеотид по любому из пп. 1–4, где промотор представляет собой промотор MHCK7.
6. Полинуклеотид по п. 5, где промотор MHCK7 характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 31.
7. Полинуклеотид по любому из пп. 1–4, где промотор представляет собой промотор сердечного тропонина Т (hTNNT2).
8. Полинуклеотид по п. 7, где промотор hTNNT2 характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 32.
9. Полинуклеотид по любому из пп. 1–4, 7 или 8, где кассета экспрессии содержит экзон 1 гена сердечного тропонина Т (hTNNT2), где промотор hTNNT2 и экзон 1 совместно характеризуются по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 32.
10. Полинуклеотид по любому из пп. 1–4, где промотор представляет собой промотор CMV или промотор CAG.
11. Полинуклеотид по любому из пп. 1–10, где кассета экспрессии содержит полиА–сигнал.
12. Полинуклеотид по п. 11, где полиА–сигнал представляет собой полиА гормона роста человека (hGH).
13. Полинуклеотид по любому из пп. 1–12, где кассета экспрессии содержит посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита сурка (WPRE).
14. Полинуклеотид по п. 1, где MLP представляет собой MLP человека.
15. Полинуклеотид по п. 14, где MLP представляет собой изоформу А MLP.
16. Полинуклеотид по п. 14 или 15, где MLP характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 1.
17. Полинуклеотид по п. 14 или 16, где MLP представляет собой изоформу B MLP.
18. Полинуклеотид по п. 15 или 17, где MLP характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 2.
19. Полинуклеотид по п. 14, где MLP характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 3.
20. Полинуклеотид по п. 14, где MLP характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 4.
21. Полинуклеотид по любому из пп. 1–20, где полинуклеотидная последовательность, кодирующая MLP, представляет собой полинуклеотид богатого цистеином и глицином белка 3 (CSRP3).
22. Полинуклеотид по п. 21, где полинуклеотид CSRP3 представляет собой полинуклеотид CSRP3 человека.
23. Полинуклеотид по любому из пп. 1–22, где полинуклеотидная последовательность, кодирующая MLP, характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 5.
24. Полинуклеотид по любому из пп. 1–23, где полинуклеотидная последовательность, кодирующая MLP, характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с SEQ ID NO: 7.
25. Полинуклеотид по любому из пп. 1–24, где полинуклеотид содержит по меньшей мере приблизительно 2,4 т.о., не более чем приблизительно 2,6 т.о. или от приблизительно 2,4 т.о. до приблизительно 2,6 т.о.
26. Полинуклеотид по любому из пп. 1–25, где полинуклеотид содержит по меньшей мере приблизительно 3,0 т.о., не более чем приблизительно 3,3 т.о. или от приблизительно 3,0 т.о. до приблизительно 3,3 т.о.
27. Полинуклеотид по любому из пп. 1–26, где полинуклеотид содержит по меньшей мере приблизительно 2,4 т.о., по меньшей мере приблизительно 2,6 т.о., по меньшей мере приблизительно 3,0 т.о., по меньшей мере приблизительно 3,3 т.о., по меньшей мере приблизительно 3,5 т.о., по меньшей мере приблизительно 3,7 т.о., по меньшей мере приблизительно 3,9 т.о., по меньшей мере приблизительно 4,1 т.о. или по меньшей мере приблизительно 4,3 т.о.
28. Полинуклеотид по любому из пп. 1–27, где полинуклеотид содержит по меньшей мере приблизительно 2,6 т.о., по меньшей мере приблизительно 3,0 т.о., не более чем приблизительно 3,3 т.о., не более чем приблизительно 3,5 т.о., не более чем приблизительно 3,7 т.о., не более чем приблизительно 3,9 т.о., не более чем приблизительно 4,1 т.о., не более чем приблизительно 4,3 т.о. или не более чем приблизительно 4,5 т.о.
29. Полинуклеотид по любому из пп. 1–28, где кассета экспрессии характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 8–11.
30. Полинуклеотид по любому из пп. 1–29, где полинуклеотид характеризуется по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 12–15.
31. Полинуклеотид по любому из пп. 1–30, где кассета экспрессии фланкирована 5′– и 3′–AAV2 инвертированными концевыми повторами (ITR), где ITR характеризуются по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 20–26.
32. Полинуклеотид по любому из пп. 1–31, где полинуклеотид является самокомплементарным.
33. Полинуклеотид по любому из пп. 1–32, где полинуклеотид содержит кассету экспрессии и последовательность, обратно комплементарную кассете экспрессии.
34. Полинуклеотид по п. 33, где кассета экспрессии и последовательность, обратно комплементарная кассете экспрессии, фланкированы 5′– и 3′–AAV2 инвертированными концевыми повторами (ITR), где ITR характеризуются по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 23 или SEQ ID NO: 26.
35. Вектор генной терапии для увеличения экспрессии MLP, содержащий полинуклеотид по любому из пп. 1–34.
36. Вектор по п. 35, где вектор генной терапии представляет собой рекомбинантный вектор на основе аденоассоциированного вируса (rAAV).
37. Вектор по п. 36, где вектор на основе rAAV представляет собой AAV9.
38. Вектор по п. 37, где вектор на основе rAAV содержит капсидный белок, который характеризуется 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 77.
39. Вектор по п. 36, где вектор на основе rAAV представляет собой вектор AAVrh10.
40. Вектор по п. 39, где вектор на основе rAAV содержит капсидный белок, который характеризуется 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 79.
41. Вектор по п. 36, где вектор на основе rAAV представляет собой вектор AAV6.
42. Вектор по п. 41, где вектор на основе rAAV содержит капсидный белок, который характеризуется 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 78.
43. Вектор по п. 36, где вектор на основе rAAV представляет собой вектор AAVrh74.
44. Вектор по п. 43, где вектор на основе rAAV содержит капсидный белок, который характеризуется 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью с любой из SEQ ID NO: 80.
45. Вектор по любому из пп. 36–44, где вектор на основе rAAV представляет собой самокомплементарный вектор на основе AAV.
46. Способ лечения или предупреждения заболевания или нарушения у субъекта, имеющего или подозреваемого в наличии нарушения, ассоциированного с дефектами в CSRP3, включающий введение субъекту вектора по любому из пп. 35–45.
47. Способ по п. 46, где заболевание или нарушение представляет собой нарушение сердечной деятельности.
48. Способ по п. 46 или 47, где заболевание или нарушение представляет собой сердечную недостаточность.
49. Способ по любому из пп. 46–48, где заболевание или нарушение представляет собой гипертрофическую кардиомиопатию.
50. Способ по любому из пп. 46–48, где заболевание или нарушение представляет собой дилатационную кардиомиопатию.
51. Способ по любому из пп. 46–50, где субъектом является млекопитающее.
52. Способ по п. 51, где субъектом является примат.
53. Способ по п. 52, где субъектом является человек.
54. Способ по любому из пп. 46–53, где субъект имеет мутацию в гене CSRP3, которая обуславливает аминокислотную замену, выбранную из C58G, L44P, S54R, E55G и/или K69R, относительно CSRP3 человека, кодирующего MLP человека, имеющий последовательность под SEQ ID NO: 1.
55. Способ по любому из пп. 46–54, где вектор вводится посредством внутривенной инъекции, внутрисердечной инъекции, внутрисердечной инфузии и/или катетеризации сердца.
56. Способ по любому из пп. 46–55, где введение увеличивает экспрессию MLP на по меньшей мере приблизительно 5%.
57. Способ по любому из пп. 46–56, где введение увеличивает экспрессию MLP на по меньшей мере приблизительно 30%.
58. Способ по любому из пп. 46–57, где введение увеличивает экспрессию MLP на по меньшей мере приблизительно 70%.
59. Способ по любому из пп. 46–58, где введение увеличивает экспрессию MLP на величину от приблизительно 5% до приблизительно 10%.
60. Способ по любому из пп. 46–57, где введение увеличивает экспрессию MLP на величину от приблизительно 30% до приблизительно 50%.
61. Способ по любому из пп. 46–58, где введение увеличивает экспрессию MLP на величину от приблизительно 70% до приблизительно 100%.
62. Способ по любому из пп. 46–61, где способ обеспечивает лечение и/или предупреждение заболевания или нарушения.
63. Фармацевтическая композиция для увеличения экспрессии MLP, содержащая вектор по любому из пп. 35–45.
64. Набор для увеличения экспрессии MLP, содержащий вектор по любому из пп. 35–45 или фармацевтическую композицию по п. 63 и инструкции по применению.
65. Применение композиции по п. 63 в лечении заболевания или нарушения способом по любому из пп. 46–62.
66. Способ экспрессии мышечного белка LIM (MLP), включающий приведение клетки в контакт с вектором по любому из пп. 35–45.
67. Способ по п. 66, где клетка представляет собой кардиомиоцит.
68. Способ по п. 67, где кардиомиоцит представляет собой кардиомиоцит человека.
69. Способ по любому из пп. 66–68, где промотор представляет собой промотор MHCK7 и где уровень экспрессии MLP в по меньшей мере 2 раза превышает уровень экспрессии MLP в клетке, трансдуцированной вектором с промотором hTNNT2.
70. Способ по любому из пп. 66–68, где промотор представляет собой промотор MHCK7 и где уровень экспрессии MLP в 2–10 раз превышает уровень экспрессии MLP в клетке, трансдуцированной вектором с промотором hTNNT2.
RU2023104389A 2020-08-05 2021-08-03 Средство генной терапии на основе csrp3 (богатого цистеином и глицином белка 3) RU2844751C1 (ru)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US63/061,727 2020-08-05

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2844751C1 true RU2844751C1 (ru) 2025-08-05

Family

ID=

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019237067A1 (en) * 2018-06-08 2019-12-12 University Of Florida Research Foundation, Incorporated Aav cardiac gene therapy for cardiomyopathy

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019237067A1 (en) * 2018-06-08 2019-12-12 University Of Florida Research Foundation, Incorporated Aav cardiac gene therapy for cardiomyopathy

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
VAFIADAKI E. et al.: "Muscle Lim Protein: master regulator of cardiac and skeletal muscle function", Gene, 2015, v. 566 (1): 1-7. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR20230043869A (ko) Aav 벡터를 사용한 플라코필린-2(pkp2) 유전자 요법
KR20230042468A (ko) Csrp3 (시스테인 및 글리신 풍부 단백질 3) 유전자 요법
AU2019210034B2 (en) Closed-ended DNA vectors obtainable from cell-free synthesis and process for obtaining ceDNA vectors
US8298818B2 (en) Self-complementary adeno-associated virus having a truncated CMV-chicken β-actin promoter
KR20200051011A (ko) 변형된 폐쇄-종결된 dna(cedna)
KR20230043123A (ko) Glut1 발현을 위한 아데노-연관 바이러스 벡터 및 이의 사용
CN107466325A (zh) 多重载体系统及其应用
US20250269065A1 (en) B-cell lymphoma 2-associated anthanogene 3 (bag3) gene therapy using aav vector
KR20230039669A (ko) eEF1A2용 유전자 요법 벡터 및 이의 용도
KR20230019402A (ko) 프로그래뉼린 연관 신경변성 질환 또는 장애의 치료를 위한 아데노-연관 바이러스 (aav) 시스템
RU2742837C1 (ru) Кодон-оптимизированная нуклеиновая кислота, которая кодирует белок SMN1, и ее применение
KR20230003478A (ko) 비-바이러스성 dna 벡터 및 고셰 치료제 발현을 위한 이의 용도
RU2844751C1 (ru) Средство генной терапии на основе csrp3 (богатого цистеином и глицином белка 3)
JP7707081B2 (ja) 網膜細胞を標的とした最適化された遺伝子治療
KR20220007601A (ko) 치료제 투여를 위한 조성물 및 방법
RU2847339C1 (ru) ВЕКТОР ГЕННОЙ ТЕРАПИИ ДЛЯ eEF1A2 И ЕГО ПРИМЕНЕНИЕ
US20240376493A1 (en) Optimized ap4m1 polyneucleotides and expression cassettes and their use
RU2839898C2 (ru) Синергетическое действие SMN1 и miR-23a при лечении спинальной мышечной атрофии
RU2800026C2 (ru) МОДИФИЦИРОВАННАЯ ДНК С ЗАМКНУТЫМИ КОНЦАМИ (зкДНК)
US20250135037A1 (en) Codon-optimized smad7 gene therapy to treat and prevent muscle wasting and to enhance muscle mass
RU2816963C2 (ru) МОДИФИЦИРОВАННАЯ ДНК С ЗАМКНУТЫМИ КОНЦАМИ (зкДНК), СОДЕРЖАЩАЯ СИММЕТРИЧНЫЕ МОДИФИЦИРОВАННЫЕ ИНВЕРТИРОВАННЫЕ КОНЦЕВЫЕ ПОВТОРЫ
TW202246499A (zh) 以腺相關病毒(aav)為基礎的基因表現之調節
Konkalmatt et al. Chimeric and Rationally Designed Compact Promoters for Cardiomyocyte-Specific Gene Expression
CN117836420A (zh) 重组tert编码病毒基因组和运载体
EA047326B1 (ru) СИНЕРГЕТИЧЕСКОЕ ДЕЙСТВИЕ SMN1 И miR-23a ПРИ ЛЕЧЕНИИ СПИНАЛЬНОЙ МЫШЕЧНОЙ АТРОФИИ