RU2842292C1 - Способы лечения рака посредством введения ингибитора pd-1 - Google Patents

Abstract

Группа изобретений относится к онкологии, в частности к способам лечения или ингибирования роста опухоли у пациента с базальноклеточной карциномой (BCC). Способы предусматривают лечение пациента, страдающего раком, где пациент имеет опухоль с мутационной нагрузкой опухоли (TMB) более или равной 10 мутаций/Мб и является положительным по экспрессии главного комплекса гистосовместимости (MHC). В другом варианте способ предусматривает лечение пациента, который показал развитие заболевания на фоне терапии на основе ингибитора Hedgehog (HHI) или непереносимость к предшествующей терапии HHI. Пациенту вводят терапевтически эффективное количество анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, содержащего CDRs с SEQ ID NO: 3-8. Изобретения обеспечивают устойчивый ответ у пациентов, страдающих ВСС, включая неоперабельную местнораспространенную ВСС или метастатическую ВСС с прогрессированием заболевания на фоне терапии HHI или непереносимостью предшествующей терапии HHI. 3 н. и 23 з.п. ф-лы, 13 ил., 6 табл., 1 пр.

Description

Область техники настоящего изобретения

[0001] Настоящее изобретение в общем относится к способам лечения или ингибирования роста опухоли, предусматривающим отбор страдающего раком пациента, нуждающегося в этом, и введение пациенту терапевтически эффективного количества ингибитора белка программируемой смерти клеток 1 (PD-1).

Предшествующий уровень техники настоящего изобретения

[0002] Белок программируемой смерти клеток 1 (PD-1) (также известный как CD279) представляет собой белковый рецептор из 288 аминокислот, экспрессируемый на активированных Т-клетках и В-клетках, естественных клетках-киллерах и моноцитах. PD-1 является членом семейства CD28/CTLA-4 (цитотоксический Т-лимфоцитарный антиген)/ICOS (индуцируемый костимулятор) коингибирующих рецепторов Т-клеток (Chen et al., 2013, Nat. Rev. Immunol., 13:227-242). Основная функция PD-1 состоит в снижении иммунного ответа (Riley, 2009, Immunol. Rev., 229:114-125). PD-1 имеет два лиганда, PD-лиганд 1 (PD-L1) и PD-лиганд 2 (PD-L2). PD-L1 (CD274, В7Н1) широко экспрессируется как в лимфоидных, так и в нелимфоидных тканях, таких как Т-клетки CD4 и CD8, клетки линии макрофагов, периферические ткани, а также опухолевые клетки, инфицированные вирусом клетки и клетки аутоиммунных тканей. PD-L2 (CD273, B7-DC) имеет более ограниченную экспрессию, чем PD-L1, экспрессируясь на активированных дендритных клетках и макрофагах (Dong et al., 1999, Nature Med., 5(12):1365-1369). PD-L1 экспрессируется при большинстве видов рака человека, включая меланому, глиому, немелкоклеточный рак легких, плоскоклеточный рак головы и шеи, лейкоз, рак поджелудочной железы, почечно-клеточную карциному и гепатоцеллюлярную карциному, и может индуцироваться почти при всех видах рака (Zou, 2008, Nat. Rev. Immunol, 8:467-77). Связывание PD-1 с его лигандами приводит к снижению пролиферации Т-клеток и секреции цитокинов, что ставит под угрозу гуморальный и клеточный иммунный ответ при таких заболеваниях, как рак, вирусная инфекция и аутоиммунное заболевание. Блокаду связывания PD-1 с обратной иммуносупрессией изучали при аутоиммунной, вирусной и опухолевой иммунотерапии (Ribas 2012, NEJM 366:2517-2519, Watanabe et al., 2012, Clin. Dev. Immunol. Vol.2012, Article ID: 269756, Wang et al., 2013, J. Viral Hep., 20:27-39).

[0003] Костимулирующие и коингибирующие молекулы Т-клеток (в общем называемые косигнальными молекулами) играют решающую роль в регуляции активации, дифференцировки, эффекторной функции и выживания Т-клеток (Chen et al., 2013, Nat. Rev. Immunol., 13:227-242). После распознавания родственных комплексов пептид-МНС на антигенпрезентирующих клетках Т-клеточным рецептором косигнальные рецепторы совместно локализуются с Т-клеточными рецепторами в иммунном синапсе, где они взаимодействуют синергетическим образом с передачей сигналов Т-клеточного рецептора для стимулирования или ингибирования активации и функции Т-клеток (Flies et al., 2011, Yale J. Biol. Med., 84:409-421). Окончательный иммунный ответ регулируется балансом между костимулирующими и коингибирующими сигналами («иммунные контрольные точки») (Pardoll, 2012, Nature, 12:252-264). PD-1 действует как одна из таких «иммунных контрольных точек», опосредуя толерантность к периферическим Т-клеткам и предотвращая аутоиммунитет.PD-1 связывается с PD-L1 или PD-L2 и ингибирует активацию Т-клеток. Способность PD-1 ингибировать активацию Т-клеток используется хроническими вирусными инфекциями и опухолями для уклонения от иммунного ответа. При хронических вирусных инфекциях PD-1 сильно экспрессируется на вирусспецифических Т-клетках, и эти Т-клетки становятся «истощенными» с потерей эффекторных функций и пролиферативной способности (Freeman, 2008, PNAS, 105:10275-10276). PD-L1 экспрессируется в самых разных опухолях, и исследования на животных моделях показали, что PD-L1 в опухолях ингибирует активацию Т-клеток и лизис опухолевых клеток и может приводить к повышенной гибели опухолеспецифических Т-клеток. Система PD-1:PD-L1 также играет важную роль в индуцированном развитии Т-регуляторных (Treg) клеток и в поддержании функции Treg (Francisco et al., 2010, Immunol. Rev., 236:219-242).

[0004] Поскольку PD-1 играет важную роль в аутоиммунитете, противоопухолевом иммунитете и иммунитете к инфекциям, он является идеальной мишенью для иммунотерапии. Блокирование PD-1 антагонистами, включая моноклональные антитела, изучали при лечении рака и хронических вирусных инфекций (Sheridan 2012, Nat. Biotechnol., 30:729-730). Кроме того, блокада PD-1 является эффективным и хорошо переносимым подходом к стимуляции иммунного ответа и обеспечивает терапевтическое преимущество в отношении различных видов рака человека, включая меланому, почечно-клеточный рак (RCC) и немелкоклеточный рак легких (NSCLC) (Postow et al., 2015, J Clin Oncol, 33:1974-1982).

[0005] Моноклональные антитела против PD-1 известны в области техники и были описаны, например, в US 9987500, US 8008449, US 8168757, US 20110008369, US 20130017199, US 20130022595, WO 2006121168, WO 20091154335, WO 2012145493, WO 2013014668, WO 2009101611, EP 2262837 и ЕР 2504028. Цемиплимаб, например, представляет собой высокоаффинное, полностью человеческое шарнир-стабилизированное антитело IgG4P, направленное на рецептор PD-1, которое эффективно блокирует взаимодействие PD-1 с его лигандами PD-L1 и PD-L2.

[0006] Рак кожи является наиболее распространенным видом рака в Соединенных Штатах Америки (Guy et al., 2015, Am. J. Prev. Med., 48:183-87). По оценкам, в 2012 г. в США было диагностировано 5,4 миллиона случаев немеланомного рака кожи, включая базально-клеточную карциному и плоскоклеточную карциному (Rogers et al., 2015, JAMA Dermatol., 151(10):1081-86). Базальноклеточная карцинома (BCC) является наиболее распространенным раком кожи в Соединенных Штатах Америки, за ней следует плоско клеточный рак кожи (CSCC) (Karia et al., 2013, J. Am. Acad. Dermatol, 68:957-966). Фактически, BCC является наиболее распространенным злокачественным новообразованием человека во всем мире (Puig et al., 2015, Clin Transl Oncol, 17:497-503). Ультрафиолетовое облучение является основным фактором риска развития BCC (Wu et al., 2013, Am J Epidemiol, 178:890-7). Наиболее распространенным клиническим подтипом является узловая ВСС.Менее распространенными клиническими подтипами являются поверхностные, морфогенные (фиброзирующие) и фиброэпителиальные.

[0007] ВСС имеет одну из самых высоких мутационных нагрузок среди всех злокачественных новообразований человека (Chalmers et al., 2017, Genome Med, 9:34, Bonilla et al., 2016, Nat Genet, 48:398-406). Типы опухолей с высокой мутационной нагрузкой обычно более чувствительны к блокаде (McGranahan et al., 2016, Science, 351:1463-9, Rizvi et al., 2015, Science, 348:124-8, Le et al., 2017, Science, 357:409-13). Риск BCC в 10 раз выше у пациентов с трансплантацией солидных органов (и других групп с индуцированным или приобретенным отсутствием кожного иммунного надзора), что позволяет предположить, что адаптивные иммунные реакции особенно важны при этом заболевании (Euvrard et al., 2003, N Engl J Med, 348:1681-91).

[0008] Хирургическое вмешательство является лечебным вариантом для большинства пациентов, страдающих ВСС, но у небольшого процента пациентов развивается неоперабельное местнораспространенное или метастатическое заболевание, в совокупности называемое распространенной ВСС (Migden et al., 2018, Cancer Treat Rev, 64:1-10). Практически все BCC характеризуются аберрантной передачей сигналов по сигнальному пути hedgehog, чаще всего из-за случайной мутации с потерей функции в гене, кодирующем гомолог белка patched (РТСН), супрессор опухоли. Мутация РТСН приводит к потере patched -опосредованного ингибирование рецептора, связанного с G-белком, Smoothened (SMO), тем самым усиливая нисходящую передачу сигнала, которая приводит к неконтролируемой клеточной пролиферации (Sekulic et al., 2016, Cell, 164:831). Небольшой процент ВСС возникает в контексте аутосомно-доминантного заболевания, синдрома базальноклеточного невуса (NBCCS), также известного как синдром Горлина, при котором пациенты несут зародышевую мутацию в РТСН, что приводит к дерепрессии SMO (Athar et al., 2014, Cancer Res, 74:4967-4975).

[0009] Распознавание онкогенной роли SMO при ВСС привело к разработке висмодегиба и сонидегиба, перорально доступных ингибиторов SMO, в общем называемых ингибиторами Hedgehog (HHI). HHI, такие как висмодегиб и сонидегиб, одобрены для лечения местнораспространенной ВСС (laBCC) или метастатической ВСС (mBCC). В исследованиях фазы 2 висмодегиб и сонидегиб продемонстрировали частоту объективного ответа (ORR) от 30% до 60% при распространенной ВСС (Sekulic et al., 2012, N Engl J Med, 366:2171-9, Migden et al., 2015, Lancet Oncol, 16:716-28, Sekulic et al., 2017, BMC Cancer, 17:332, Dummer et al., 2020, Br J Dermatol, 182:1369-78). Однако у большинства пациентов наблюдается прогрессирование заболевания или непереносимость терапии HHI, и для этих пациентов не существует утвержденного варианта лечения второй линии (Sekulic et al., 2012, N Engl J Med, 366:2171-9, Change et al., 2012, Arch Dermatol, 148:1324-5). Более того, в дополнение к неблагоприятным побочным эффектам HHI было обнаружено, что у пациентов с прогрессированием на фоне одного HHI (висмодегиб) последующее лечение другим HHI (сонидегибом) не приводило к ингибированию опухоли (Danial et al 2016, Clin. Cancer Res. 22: 1325-29). He существует утвержденного средства для лечения ВСС у пациентов с прогрессированием заболевания на фоне терапии HHI или с непереносимостью предшествующей терапии HHI.

[0010] Факторы риска CSCC включают воздействие УФ-излучения, пожилой возраст и иммуносупрессию (Alam et al 2001, New Engl. J. Med. 344 (975-983), Madan 2010, Lancet 375: 673-685). Хотя подавляющее большинство индивидуумов с диагнозом CSCC или ВСС имеют очень благоприятный прогноз, CSCC имеет большую склонность к агрессивным рецидивам, чем ВСС. Индивидуумы с диагнозом CSCC, в отличие от индивидуумов с диагнозом ВСС, имеют повышенную смертность по сравнению с контрольной группой того же возраста (Rees et al 2015, Int. J. Cancer 137: 878-84).

[0011] Хирургическая резекция является центральным элементом клинического лечения CSCC. Основная цель состоит в полной резекции опухоли, а приемлемый косметический результат являются вторичной целью. Факторы, связанные с неблагоприятным прогнозом при CSCC, включают размер опухоли >2 см, глубину опухоли >2 мм, периневральную инвазию, иммуносупрессию хозяина и рецидивирующие поражения. Для небольшого процента пациентов, у которых развиваются неоперабельные местнорецидивирующие или метастатические заболевания, возможности лечения ограничены. Пациентам может быть назначена послеоперационная лучевая терапия. Химиотерапия не является привлекательным вариантом для многих пациентов из-за проблем с безопасностью и переносимостью.

[0012] Цемиплимаб представляет собой высокоаффинное, высокоэффективное человеческое шарнир-стабилизированное моноклональное антитело IgG4 против PD-1, одобренное для лечения пациентов с метастатическим CSCC или местнораспространенным CSCC, которые не являются кандидатами на лечебную хирургию или лечебное облучение (Migden et al., 2018, N Engl J Med, 379:341-51, Migden et al., 2020, Lancet Oncol, 21:294-305, Rischin et al., 2020, J Immunother Cancer, 8:e000775). В первом исследовании цемиплимаба на людях стабильный частичный ответ (PR) наблюдали у пациента с метастатической ВСС (mBCC ), получавшего цемиплимаб (Falchook et al., 2016, J Immunother Cancer, 4:70).

[0013] Существует потребность в безопасных и эффективных способах лечения пациентов, страдающих раком, включая неоперабельную местнораспространенную ВСС или метастатическую ВСС у пациентов с прогрессированием заболевания на фоне терапии HHI или непереносимостью предшествующей терапии HHI.

Краткое раскрытие настоящего изобретения

[0014] Согласно одному аспекту настоящее изобретение относится к способу лечения или ингибирования роста опухоли, предусматривающему: (а) отбор пациента, страдающего раком, где пациент имеет опухоль с мутационной нагрузкой опухоли (ТМВ) более или равной 10 мутаций/Мб, и где пациент не показывает понижающую регуляцию главного комплекса гистосовместимости (МНС), и (b) введение пациенту терапевтически эффективного количества ингибитора белка программируемой смерти клеток 1 (PD-1). Согласно некоторым вариантам осуществления раком является рак кожи, выбранный из базальноклеточной карциномы (ВСС), плоскоклеточного рака кожи (CSCC), карциномы Меркеля и меланомы. Согласно некоторым вариантам осуществления раком является ВСС. Согласно некоторым вариантам осуществления раком является метастатическая ВСС или неоперабельная местнораспространенная ВСС. Согласно некоторым вариантам осуществления по меньшей мере 35% опухолевых клеток являются положительными в отношении МНС. Согласно некоторым вариантам осуществления МНС представляет собой MHC-I. Согласно некоторым вариантам осуществления пациент показал развитие заболевания на фоне терапии на основе ингибитора Hedgehog (HHI) или непереносимость к предшествующей терапии HHI.

[0015] Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 вводят в качестве монотерапии. Согласно некоторым вариантам осуществления введение ингибитора PD-1 способствует регрессии опухоли, снижает нагрузку опухолевых клеток, снижает опухолевую массу и/или предотвращает рецидив опухоли у пациента. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 вводят в комбинации со вторым терапевтическим средством или терапией, выбранными из облучения, хирургического вмешательства, вакцинации против рака, имиквимода, противовирусного средства, фотодинамической терапии, терапии HHI (например, висмодегиб, сонидегиб), ингибитора PD-L1, ингибитора LAG3, ингибитора цитотоксического CTLA-4, агониста GITR, ингибитора TIM3, ингибитора BTLA, ингибитора TTGIT, ингибитора CD38, ингибитора CD47, ингибитора IDO, активатора CD28, антагониста VEGF, ингибитора Ang2, ингибитора TGFp, ингибитора EGFR, антитела против опухолеспецифического антигена, вакцины, GM-CSF, онколитического вируса, цитотоксина, химиотерапевтического средства, ингибитора IL-6R, ингибитора IL-4R, ингибитора IL-10, цитокина, конъюгата антитело-лекарственное средство, противовоспалительного лекарственного средства и пищевой добавки.

[0016] Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 выбирают из анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, анти-PD-L1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента и анти-PD-L2 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 выбирают из анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 представляет собой анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые включают вариабельную область тяжелой цепи (HCVR), включающую три определяющие комплементарность области тяжелой цепи (CDR) (HCDR1, HCDR2 и HCDR3), и вариабельную область легкой цепи (LCVR), включающую три CDR легкой цепи (LCDR1, LCDR2 и LCDR3), где HCDR1 имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 3, HCDR2 имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 4, HCDR3 имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 5, LCDR1 имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 6, LCDR2 имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 7, и LCDR3 имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 8. Согласно некоторым вариантам осуществления HCVR включает аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 1. Согласно некоторым вариантам осуществления LCVR включает аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 2. Согласно некоторым вариантам осуществления анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включают пару аминокислотных последовательностей HCVR/LCVR согласно SEQ ID NO: 1/2.

[0017] Согласно некоторым вариантам осуществления анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент включает тяжелую цепь и легкую цепь, где тяжелая цепь имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 9. Согласно некоторым вариантам осуществления анти-PD-1 антитело включает тяжелую цепь и легкую цепь, где легкая цепь имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 10. Согласно некоторым вариантам осуществления анти-PD-1 антитело включает тяжелую цепь и легкую цепь, где тяжелая цепь имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 9, и легкая цепь имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 10.

[0018] Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 представляет собой анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, включающие HCVR, имеющую идентичность последовательности 90% с SEQ ID NO: 1. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 представляет собой анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, включающие LCVR, имеющую идентичность последовательности 90% с SEQ ID NO: 2. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 представляет собой анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, включающие HCVR, имеющую идентичность последовательности 90% с SEQ ID NO: 1, и LCVR, имеющую идентичность последовательности 90% с SEQ ID NO: 2.

[0019] Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 представляет собой цемиплимаб или его биоэквивалент.Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 представляет собой анти-PD-1 антитело, выбранное из группы, состоящей из цемиплимаба, ниволумаба, пембролизумаба, пидилизумаба, MEDI0608, BI 754091, PF-06801591, спартализумаба, камрелизумаба, JNJ-63723283 и MCLA-134. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 представляет собой анти-PD-L1 антитело, выбранное из группы, состоящей из REGN3504, авелумаба, атезолизумаба, дурвалумаба, MDX-1105, LY3300054, FAZ053, STI-1014, СХ-072, KN035 и СК-301.

[0020] Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 вводят при дозе от 5 мг до 1500 мг.Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 вводят при дозе 200 мг, 250 мг, 350 мг, 600 мг, 700 мг или 1050 мг.Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 вводят при дозе от 1 мг/кг до 20 мг/кг массы тела пациента. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 вводят при дозе 1 мг/кг, 3 мг/кг или 10 мг/кг массы тела пациента. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 вводят в виде одной или нескольких доз, где каждую дозу вводят через две недели, три недели, четыре недели, пять недель или шесть недель после непосредственно предшествующей дозы. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 вводят внутривенно, подкожно или внутрибрюшинно.

[0021] Согласно другому аспекту настоящее изобретение относится к набору, содержащему ингибитор белка программируемой смерти клеток 1 (PD-1) в комбинации с письменными инструкциями для применения терапевтически эффективного количества ингибитора PD-1 для лечения или ингибирования роста опухоли у пациента, страдающего раком, где пациент имеет опухоль с мутационной нагрузкой опухоли (ТМВ) более или равной 10 мутаций/Мб, и где пациент не показывает понижающую регуляцию главного комплекса гистосовместимости (МНС).

[0022] Согласно другому аспекту настоящее изобретение относится к способу лечения или ингибирования роста опухоли, предусматривающему: (а) отбор пациента с опухолью базальноклеточной карциномы (ВСС), где пациент показал развитие заболевания на фоне терапии на основе ингибитора Hedgehog (HHI) или непереносимость к предшествующей терапии HHI, (b) сбор биопсии опухоли, (с) измерение мутационной нагрузки опухоли (ТМВ) биопсии опухоли, (d) измерение экспрессии главного комплекса гистосовместимости (MHC)-I в биопсии опухоли и (е) введение пациенту терапевтически эффективного количества ингибитора белка программируемой смерти клеток 1 (PD-1), если биопсия опухоли показывает ТМВ более или равную 10 мутаций/Мб, и если по меньшей мере 35% опухолевых клеток биопсии являются положительными в отношении экспрессии MHC-I.

[0023] Согласно другому аспекту настоящее изобретение относится к способу отбора пациента с опухолью базальноклеточной карциномы (ВСС) для лечения ингибитором белка программируемой смерти клеток 1 (PD-1), предусматривающему: (а) сбор биопсии опухоли ВСС, (b) измерение мутационной нагрузки опухоли (ТМВ) биопсии опухоли, (с) измерение экспрессии главного комплекса гистосовместимости (MHC)-I в биопсии опухоли и (d) отбор пациента для лечения ингибитором PD-1, если биопсия опухоли имеет ТМВ более или равную 10 мутаций/Мб, и положительную экспрессию MHC-I в по меньшей мере 35% опухолевых клеток.

[0024] Другие варианты осуществления настоящего изобретения станут очевидными из приведенного ниже подробного описания.

Краткое описание чертежей

[0025] На фиг. 1 приведены графики «дорожек бассейна», которые отображают ответ опухоли на цемиплимаб, включая как время до развития ответа, так и продолжительность ответа, у пациентов с местнораспространенной ВСС (laBCC), включенных в исследование, описанное в примере 1 в настоящем документе.

[0026] На фиг. 2 приведен график, показывающий общую выживаемость (OS) пациентов с laBCC, включенных в исследование, описанное в примере 1 в настоящем документе.

[0027] На фиг. 3 приведен график, показывающий выживаемость без прогрессирования (PFS) пациентов с laBCC, включенных в исследование, описанное в примере 1 в настоящем документе.

[0028] На фиг. 4 приведен график, показывающий продолжительность ответа пациентов с laBCC, включенных в исследование, описанное в примере 1 в настоящем документе.

[0029] На фиг. 5 приведен график, показывающий выживаемость без прогрессирования пациентов с laBCC, включенных в исследование, описанное в примере 1 в настоящем документе.

[0030] На фиг. 6 приведен график, показывающий общую выживаемость пациентов с laBCC, включенных в исследование, описанное в примере 1 в настоящем документе.

[0031] На фиг. 7 приведен график, показывающий клиническую активность цемиплимаба и мутационную нагрузку опухоли (ТМВ) у пациентов с laBCC, включенных в исследование, описанное в примере 1 в настоящем документе.

[0032] На фиг. 8 приведен график, показывающий ТМВ для пациентов с laBCC, которые достигли стойкого контроля над заболеванием, по сравнению с теми, кто не достиг этого, в связи с исследованием, описанным в примере 1 в настоящем документе.

[0033] На фиг. 9 приведен график, показывающий экспрессию MHC-I в опухолях до лечения у респондеров (R) и нереспондеров (NR), включая процент от общего количества опухолевых клеток у пациентов с laBCC с низкой (≤10 мутаций/Мб) или высокой (>10 мутаций/Мб) ТМВ, в связи с исследованием, описанным в примере 1 в настоящем документе.

[0034] На фиг. 10 приведен график, показывающий процент опухолевых клеток, положительных в отношении MHC-I, у пациентов с laBCC с порогом ТМВ при медиане ТМВ, равной 34,6 мутаций/Мб, в связи с исследованием, описанным в примере 1 в настоящем документе.

[0035] На фиг. 11 приведены графики «дорожек бассейна», отражающие ответ опухоли на цемиплимаб, включая время до развития ответа и продолжительность ответа, у пациентов с метастатической ВСС (mBCC), включенных в исследование, описанное в примере 1 в настоящем документе.

[0036] На фиг. 12 приведен график, показывающий кривую Каплана-Мейера (КМ) для общей выживаемости (OS) пациентов с mBCC , включенных в исследование, описанное в примере 1 в настоящем документе.

[0037] На фиг. 13 приведен график, показывающий кривую Каплана-Мейера (КМ) для выживаемости без прогрессирования (PFS) пациентов с mBCC , включенных в исследование, описанное в примере 1 в настоящем документе.

Подробное раскрытие настоящего изобретения

[0038] Следует понимать, что настоящее изобретение не ограничивается описанными конкретными способами и экспериментальными условиями, поскольку такие способы и условия могут варьироваться. Также следует понимать, что используемая в настоящем документе терминология предназначена только для целей описания конкретных вариантов осуществления и не предназначена для ограничения, и что объем настоящего раскрытия ограничен только прилагаемой формулой изобретения. Если не указано иное, все технические и научные термины, используемые в настоящем документе, имеют то же значение, которое обычно понимается специалистом в области техники, к которой относится настоящее раскрытие. Хотя любые способы и материалы, подобные или эквивалентные описанным в настоящем документе, могут быть использованы при практическом применении или тестировании настоящего изобретения, в настоящем документе описаны предпочтительные способы и материалы. Все публикации, упомянутые в настоящем документе, включены в настоящий документ посредством ссылки во всей своей полноте, если не указано иное.

[0039] Настоящее изобретение в целом относится к способам лечения или ингибирования роста опухоли, предусматривающим отбор страдающего раком пациента, нуждающегося в этом, и введение пациенту терапевтически эффективного количества ингибитора белка программируемой смерти клеток 1 (PD-1), где пациент показывает пороговые уровни как мутационной нагрузки опухоли (ТМВ), так и главного комплекса гистосовместимости (МНС). ТМВ представляет собой тип биомаркера, который отражает число мутаций на мегабазу (Мб) ДНК опухолевой ткани. МНС, который включает гены МНС класса I и МНС класса II, представляет собой другой тип биомаркеров, который связывает пептидные антигены и презентирует их на клеточной поверхности для распознавания Т-клетками. Как описано в настоящем документе, пациенты, страдающие раком, с высокой ТМВ и нормальным или высоким уровнем экспрессии МНС неожиданно более восприимчивы к терапевтическому лечению ингибитором PD-1.

[0040] Опухоли до лечения можно исследовать для определения экспрессии MHC-I с помощью иммуногистохимии (IHC) и для определения ТМВ. Как описано в настоящем документе, было показано, что понижающая регуляция МНС обеспечивает механизм уклонения от иммунитета даже у пациентов с высокой ТМВ (≥10 мутаций/Мб). Соответственно, путем специфического отбора пациентов с опухолями, которые, как было определено, имеют высокую ТМВ и уровень экспрессии МНС от нормального до высокого, таких пациентов можно более эффективно лечить ингибиторами PD-1. Согласно некоторым вариантам осуществления такие пациенты страдают местнораспространенной ВСС (laBCC). Согласно некоторым вариантам осуществления введение ингибитора PD-1 обеспечивает эффективный вариант лечения второй линии для пациентов с ВСС, которые показали прогрессирование заболевания на фоне терапии HHI или непереносимость предшествующей терапии HHI. Наоборот, согласно некоторым вариантам осуществления пациенты с опухолями, которые не соответствуют пороговым требованиям высокой ТМВ и уровней экспрессии МНС от нормального до высокого, могут получать лечение альтернативными терапиями (например, ингибитором PD-1 в комбинации с противоопухолевой терапией, такой как комбинация цемиплимаба и терапии HHI).

Способы лечения или ингибирования роста опухоли

[0041] Настоящее изобретение относится к способам лечения или ингибирования роста опухоли, предусматривающим отбор пациента, страдающего раком, где пациент показывает пороговые уровни как ТМВ, так и МНС, и введение пациенту, нуждающемуся в этом, антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые специфически связываются с PD-1, PD-L1 и/или PD-L2, или любого другого «ингибитора PD-1», как описано в настоящем документе. В настоящем раскрытии ссылки на конкретные анти-PD-1 антитела приведены для иллюстрации репрезентативного ингибитора PD-1 и не ограничивают объем раскрытия.

[0042] В контексте настоящего изобретения термины «лечение», «лечить» и т.п.означают облегчение или уменьшение тяжести по меньшей мере одного симптома или показания, устранение причины симптомов либо на временной, либо на постоянной основе, отсрочку или ингибирование роста опухоли, снижение нагрузки опухолевых клеток или опухолевой массы, стимуляцию регрессии опухоли, вызов сокращения, некроза и/или исчезновения опухоли, предотвращение рецидива опухоли, предотвращение или подавление метастазирования, подавление роста метастатической опухоли, устранение необходимости для облучения или хирургического вмешательства и/или увеличение продолжительности выживания субъекта. Согласно многим вариантам осуществления термины «опухоль», «поражение», «опухолевое поражение», «рак» и «злокачественное новообразование» используются взаимозаменяемо и относятся к одной или нескольким раковым опухолям.

[0043] В контексте настоящего изобретения выражение «субъект, нуждающийся в этом» означает человека или млекопитающего, отличного от человека, у которого проявляются один или несколько симптомов или признаков рака, и/или у которого диагностирован рак, включая солидную опухоль, и который нуждается в лечении этого. Согласно многим вариантам осуществления термин «субъект» может использоваться взаимозаменяемо с термином «пациент». Например, у субъекта-человека может быть диагностирована первичная или метастатическая опухоль и/или один или несколько симптомов или показаний, включая без ограничения необъяснимую потерю веса, общую слабость, постоянную усталость, потерю аппетита, лихорадку, ночную потливость, боль в костях, одышку, вздутие живота, боль/давление в груди, увеличение селезенки и повышение уровня биомаркера, связанного с раком (например, СА125). Выражение включает субъектов с первичными или установленными опухолями. Согласно конкретным вариантам осуществления выражение включает субъектов-людей, которые подлежат лечению и/или нуждаются в лечении солидной опухоли, например, рака толстой кишки, рака молочной железы, рака легких, рака предстательной железы, рака кожи (например, ВСС и CSCC), рака печени, рака костей, рака яичников, рака шейки матки, рака поджелудочной железы, рака головы и шеи и рака головного мозга. Термин охватывает субъектов с первичными или метастатическими опухолями (злокачественными распространенными новообразованиями). Согласно определенным вариантам осуществления выражение «субъект, нуждающийся в этом» включает пациентов с солидной опухолью, которая является резистентной или невосприимчивой к предшествующей терапии или неадекватно контролируемой предшествующей терапией (например, лечение противораковым средством). Например, выражение охватывает субъектов, которые получали лечение одной или несколькими линиями предшествующей терапии, как например, лечение химиотерапией (например, карбоплатином или доцетакселом). Согласно определенным вариантам осуществления выражение «субъект, нуждающийся в этом» включает пациентов с солидной опухолью, которые получали лечение одной или несколькими линиями предшествующей терапии, но у которых опухоль впоследствии рецидивировала или метастазировала. Например, пациенты с солидной опухолью, которые, возможно, получали лечение одним или несколькими противораковыми средствами, приводящее к регрессии опухоли, у которых, однако, впоследствии возникла резистентность опухоли к одному или нескольким противораковым средствам (например, рак, устойчивый к химиотерапии, рак, устойчивый к HHI), подлежат лечению способами согласно настоящему изобретению. Выражение также охватывает субъектов с солидной опухолью, для которых обычная противораковая терапия нецелесообразна, например, из-за токсических побочных эффектов. Например, выражение охватывает пациентов, которые получили один или несколько циклов HHI с токсическими побочными эффектами.

[0044] Согласно определенным вариантам осуществления выражение «субъект, нуждающийся в этом» охватывает субъектов с раком, которые показывают нормальный или повышенный уровень экспрессии МНС в опухолевой ткани. Согласно одному варианту осуществления способы согласно настоящему изобретению применяют для лечения пациентов, страдающих раком, где пациентов отбирают на основе того, что они не показывают экспрессию МНС с понижающей регуляцией в опухолевой ткани. Согласно определенным вариантам осуществления выражение «экспрессия МНС с понижающей регуляцией» относится к экспрессии МНС в менее 35% опухолевых клеток. Выражение МНС в опухолевых клетках определяют посредством анализов, которые известны в области техники, например, посредством анализа ELISA или анализа иммуногистохимии (MHC). Согласно определенным вариантам осуществления экспрессию МНС определяют путем количественного определения экспрессии РНК, например, путем гибридизации in situ или с помощью ОТ-ПЦР.

[0045] Согласно определенным вариантам осуществления выражение «субъект, нуждающийся в этом» охватывает субъектов, страдающих раком, которые имеют высокую мутационную нагрузку опухоли (ТМВ). В контексте настоящего изобретения высокая ТМВ относится к по меньшей мере 10 мутациям на мегабазу (Мб) ДНК из опухолевых клеток. Согласно некоторым вариантам осуществления высокая ТМВ относится к более 10 мутаций/Мб (например, 11, 12, 13, 14, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50 или более мутаций на Мб) в опухолевых клетках. Согласно одному варианту осуществления способы согласно настоящему изобретению применяют для лечения пациентов, страдающих раком, где пациентов отбирают на основе высокой ТМВ в опухолевой ткани пациента. ТМВ можно определить способами, которые известны в области техники, такими как секвенирование опухолевой ДНК с использованием высокопроизводительного способа секвенирования, например, секвенирования следующего поколения (NGS), или способа, основанного на NGS, (например, секвенирование всего генома, полноэкзомное секвенирование или комплексное геномное профилирование панелей генов рака). Согласно некоторым вариантам осуществления ТМВ относится к числу несинонимичных мутаций на мегабазу секвенированной ДНК.

[0046] Согласно определенным предпочтительным вариантам осуществления выражение «субъект, нуждающийся в этом» охватывает субъектов, страдающих раком, которые имеют высокую ТМВ и не показывают экспрессию МНС с понижающей регуляцией в опухолевой ткани. Согласно одному варианту осуществления способы согласно настоящему изобретению применяют для лечения пациентов, страдающих раком, где пациентов отбирают на основе того, что они имеют высокую ТМВ и не показывают экспрессию МНС с понижающей регуляцией в опухолевой ткани.

[0047] Согласно определенным вариантам осуществления способы согласно настоящему изобретению можно применять для лечения пациентов, которые показывают повышенные уровни одного или нескольких связанных с раком биомаркеров (например, PD-L1, СА125, СА19-9, простат-специфический антиген (PSA), лактатдегидрогеназа, KIT, карциноэмбриональный антиген, рецептор эпидермального фактора роста (EGFR), перестройка гена ALK). Согласно определенным вариантам осуществления способы согласно настоящему изобретению применяют для лечения пациентов, страдающих раком, где пациентов отбирают на основе по меньшей мере 1%, по меньшей мере 2%, по меньшей мере 5%, по меньшей мере 10%, по меньшей мере 20%, по меньшей мере 30%, по меньшей мере 40% или по меньшей мере 50% экспрессии PD-L1 в раковой ткани и/или иммунных клетках. Способы определения экспрессии PD-L1 в раковой ткани и/или иммунных клетках хорошо известны в области техники. Согласно определенным вариантам осуществления экспрессию PD-L1 в опухолевой ткани определяют с помощью любого анализа, известного в области техники, например, посредством анализа ELISA или анализа иммуногистохимии (IHC). См., например, WO 2016124558, WO 2016191751, US 20160305947. Согласно определенным вариантам осуществления экспрессию PD-L1 определяют путем количественного определения экспрессии РНК, например, путем гибридизации in situ или с помощью ОТ-ПЦР. Согласно определенным вариантам осуществления экспрессию PD-L1 определяют с помощью визуализации меченным анти-PD-Ll антителом, например, с помощью иммунопозитронно-эмиссионной томографии или iPET. См., например, van Dongen et al., Oncologist, 12(12): 1379-89 (2007), Boerman et al., J Nucl Med, 52:1171-72 (2011), US 20180161464.

[0048] Согласно определенным вариантам осуществления способы согласно настоящему изобретению применяют у субъекта, имеющего солидную опухоль. В контексте настоящего изобретения термин «солидная опухоль» относится к аномальной массе ткани, которая обычно не содержит кист или жидких участков. Солидные опухоли могут быть доброкачественными (не относящимися к раку) или злокачественными (рак). Для целей настоящего изобретения термин «солидная опухоль» означает злокачественную солидную опухоль. Этот термин охватывает различные типы солидных опухолей, названные по типам клеток, которые их образуют, а именно, саркомы, карциномы и лимфомы. Однако этот термин не охватывает лейкозы. Согласно различным вариантам осуществления термин «солидная опухоль» включает рак, возникающий из соединительной или поддерживающей ткани (например, кости или мышцы) (называемый саркомой), рак, возникающий из гландулоцитов и эпителиальных клеток организма, выстилающих ткани тела, (называемый карциномой) и рак лимфоидных органов, таких как лимфатические узлы, селезенка и тимус (называемые лимфомой). Лимфоидные клетки встречаются почти во всех тканях организма, поэтому лимфомы могут развиваться в самых разных органах. Согласно определенным вариантам осуществления термин «солидная опухоль» включает рак, включая без ограничения ВСС, CSCC, колоректальный рак, рак яичников, рак предстательной железы, рак молочной железы, рак головного мозга, рак шейки матки, рак мочевого пузыря, рак анального канала, рак матки, рак толстой кишки, рак печени, рак поджелудочной железы, рак легких, рак эндометрия, рак костей, рак яичка, рак кожи, рак почки, рак желудка, рак пищевода, рак головы и шеи, рак слюнных желез и миелому. Согласно определенным вариантам осуществления термин «солидная опухоль» включает рак, включая без ограничения гепатоцеллюлярную карциному, немелкоклеточный рак легкого, плоскоклеточный рак головы и шеи, базальноклеточную карциному, рак молочной железы, плоскоклеточный рак кожи, хондросаркому, ангиосаркому, холангиокарциному, саркому мягких тканей, колоректальный рак, меланому, карциному Меркеля и мультиформную глиобластому. Согласно определенным вариантам осуществления термин «солидная опухоль» включает более одного солидного опухолевого поражения, расположенных отдельно друг от друга, например, 2, более 2, более 5, более 10, более 15, более 20 или более 25 поражений у субъекта, нуждающегося в лечении. Согласно определенным вариантам осуществления более одного очага поражения расположены дистально друг от друга в одном и том же органе. Согласно определенным другим вариантам осуществления опухолевые поражения могут располагаться в разных органах.

[0049] Согласно определенным вариантам осуществления настоящее изобретение относится к способам лечения рака или подавления роста опухоли, включая без ограничения колоректальный рак, рак яичников, рак предстательной железы, рак молочной железы, рак головного мозга, рак шейки матки, рак мочевого пузыря, рак анального канала, рак матки, рак толстой кишки, рак печени, рак поджелудочной железы, рак легкого, рак эндометрия, рак костей, рак яичек, рак кожи (ВСС и CSCC), рак почки, рак желудка, рак пищевода, рак головы и шеи, рак слюнных желез и миелому. Согласно определенным вариантам осуществления настоящее изобретение относится к способам лечения или ингибирования роста рака кожи, включая без ограничения ВСС и CSCC. Согласно одному варианту осуществления субъект имеет высокую мутационную нагрузку опухоли (≥10 мутаций/Мб). Согласно одному варианту осуществления субъект не показывает экспрессию МНС с понижающей регуляцией. Согласно одному варианту осуществления субъект имеет высокую мутационную нагрузку опухоли (≥10 мутаций/Мб) и не показывает экспрессию МНС с понижающей регуляцией.

[0050] Согласно определенным вариантам осуществления настоящее изобретение относится к способам лечения распространенных солидных опухолей, включая без ограничения метастатическую ВСС, местнораспространенную ВСС, метастатический CSCC, местнораспространенный CSCC и любую распространенную солидную опухоль, невосприимчивую к терапии первой линии. Способы согласно этому аспекту предусматривают отбор пациента, страдающего раком, и введение терапевтически эффективного количества ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента). Согласно одному варианту осуществления субъект имеет высокую мутационную нагрузку опухоли (≥10 мутаций/Мб). Согласно одному варианту осуществления субъект не показывает экспрессию МНС с понижающей регуляцией. Согласно одному варианту осуществления субъект имеет высокую мутационную нагрузку опухоли (≥10 мутаций/Мб) и не показывает экспрессию МНС с понижающей регуляцией.

[0051] Согласно определенным вариантам осуществления способы предусматривают введение терапевтически эффективного количества ингибитора PD-1 в комбинации с противоопухолевой терапией. Противоопухолевая терапия включает без ограничения обычные противоопухолевые терапии, такие как химиотерапия, лучевая терапия, хирургическое вмешательство и другие, описанные в настоящем документе. Согласно одному варианту осуществления противоопухолевая терапия включает лучевую терапию. Согласно определенным вариантам осуществления одну или несколько доз ингибитора PD-1 вводят субъекту, нуждающемуся в этом, где каждую дозу вводят через 0,5, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 недель после непосредственно предшествующей дозы.

[0052] Способы согласно настоящему изобретению согласно определенным вариантам осуществления предусматривают введение субъекту терапевтически эффективного количества ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента) в комбинации со вторым терапевтическим средством или терапией. Второе терапевтическое средство или терапию можно вводить для повышения противоопухолевой эффективности, для уменьшения токсического действия одной или нескольких терапий и/или для снижения дозы одной или нескольких терапий. Согласно различным вариантам осуществления второе терапевтическое средство или терапия могут включать одно или несколько из облучения, хирургического вмешательства, вакцинации против рака, имиквимода, противовирусного средства (например, цидофовир), фото динамической терапии, терапии HHI (например, висмодегиб, сонидегиб), ингибитора лиганда белка программируемой смерти 1 (PD-L1) (например, анти-PD-L1 антитело), ингибитора гена активации лимфоцитов 3 (LAG3) (например, анти-LAG3 антитело), ингибитора цитотоксического Т-лимфоцит-ассоциированного белка 4 (CTLA-4) (например, ипилимумаб), агониста индуцируемого глюкокортикоидами рецептора фактора некроза опухоли (GITR) (например, анти-GITR антитело), ингибитор белка 3, содержащего Т-клеточный иммуноглобулин и муцин (TDVI3), ингибитора аттенюатора В- и Т-лимфоцитов (BTLA), ингибитора Т-клеточного иммунорецептора с Ig и 1ТГМ доменами (TIGIT), ингибитора CD38, ингибитора CD47, ингибитора индоламин-2,3-диоксигеназы (IDO), активатора CD28, антагониста фактора роста сосудистого эндотелия (VEGF) [например, «VEGF-Тгар», такой как афлиберцепт, или анти-VEGF антитело или его антигенсвязывающий фрагмент (например, бевацизумаб или ранибизумаб) или малая молекула киназного ингибитора рецептора VEGF (например, сунитиниб, сорафениб или пазопаниб)], ингибитора ангиопоэтина-2 (Ang2), ингибитора трансформирующего фактора роста бета (TGFp), ингибитора рецептора эпидермального фактора роста (EGFR), антитела против опухолеспецифического антигена [например, СА9, СА125, меланома-ассоциированного антигена 3 (MAGE3), карциноэмбрионального антигена (СЕА), виментина, опухоль-М2-РК, простат-специфического антигена (PSA), муцин-1, MART-1 и СА19-9], вакцины (например, бацилла Кальмета-Герена), гранулоцитарно-моноцитарного колониестимулирующего фактора (GM-CSF), онколитического вируса, цитотоксина, химиотерапевтического средства (например, пеметрексед, дакарбазин, темозоломид, циклофосфамид, доцетаксел, доксорубицин, даунорубицин, цисплатин, карбоплатин, гемцитабин, метотрексат, митоксантрон, оксалиплатин, паклитаксел, топотекан, иринотекан, винорелбин и винкристин), висмодегиба, сонидегиба, ингибитора IL-6R, ингибитора IL-4R, ингибитора IL-10, цитокина, такого как IL-2, IL-7, IL-12, IL-21 и IL-15, конъюгата антитела и лекарственного средства, противовоспалительного лекарственного средства, такого как корти ко стероид, нестероидного противовоспалительного лекарственного средства (NSAID) и пищевой добавки, такой как антиоксидант.

[0053] Согласно определенным вариантам осуществления настоящее изобретение относится к способам лечения рака или ингибирования роста опухоли с микросателлитной нестабильностью (MSI). В контексте настоящего изобретения термин «микросателлитная нестабильность», также известный как «MSI», относится к изменениям микросателлитных повторов в опухолевых клетках или генетической сверхмутабельности, вызванной недостаточной репарацией ошибок репликации ДНК. Микросателлиты, также известные как повторы простых последовательностей, представляют собой повторяющиеся последовательности ДНК, содержащие повторяющиеся единицы длиной от 1 до 6 пар оснований. Хотя длина микросателлитов сильно варьируется от человека к человеку и вносит свой вклад в ДНК-фингерпринт, у каждого человека есть микросателлиты установленной длины. MSI возникает из-за неспособности белков репарации ошибок репликации (MMR) исправить ошибку репликации ДНК. MSI включает полиморфизмы ДНК, в которых ошибки репликации различаются по длине, а не по последовательности. MSI включает мутации со сдвигом рамки считывания либо посредством вставок, либо делеций, либо гиперметилирования, что приводит к молчанию генов. В области техники известно, что микросателлитная нестабильность может приводить к раку толстой кишки, раку желудка, раку эндометрия, раку яичников, раку гепатобилиарного тракта, раку мочевыводящих путей, раку головного мозга и раку кожи. Настоящее изобретение относится к способам лечения рака с помощью MSI, причем способы предусматривают введение пациенту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента).

[0054] Согласно определенным вариантам осуществления настоящее изобретение относится к способам лечения, или замедления, или ингибирования роста опухоли. Согласно определенным вариантам осуществления настоящее изобретение относится к способам стимуляции регрессии опухоли. Согласно определенным вариантам осуществления настоящее изобретение относится к способам снижения нагрузки опухолевыми клетками или снижения опухолевой массы. Согласно определенным вариантам осуществления настоящее изобретение относится к способам предотвращения рецидива опухоли.

[0055] Согласно определенным вариантам осуществления способы согласно настоящему изобретению предусматривают введение терапевтически эффективного количества ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента) субъекту с распространенной солидной опухолью. Согласно одному варианту осуществления распространенной солидной опухолью является рак кожи. Согласно определенным другим вариантам осуществления распространенной солидной опухолью является ВСС или CSCC. Согласно одному варианту осуществления субъект не ответил на предшествующую терапию или показал рецидив после предшествующей терапии (например, HH1). Согласно одному варианту осуществления субъект имеет распространенную солидную опухоль, которая невосприимчива к химиотерапии первой линии. Согласно одному варианту осуществления субъект имеет высокую мутационную нагрузку опухоли (≥10 мутаций/Мб). Согласно одному варианту осуществления субъект не показывает экспрессию МНС с понижающей регуляцией. Согласно одному варианту осуществления субъект имеет высокую мутационную нагрузку опухоли (≥10 мутаций/Мб) и не показывает экспрессию МНС с понижающей регуляцией.

[0056] Согласно определенным вариантам осуществления способы согласно настоящему изобретению предусматривают введение терапевтически эффективного количества ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента) пациенту, страдающему метастатической ВСС или неоперабельной местнораспространенной ВСС, где пациент показал развитие заболевания на фоне терапии HHI или непереносимость предшествующей терапии HHI. Согласно одному варианту осуществления субъект имеет высокую мутационную нагрузку опухоли (≥10 мутаций/Мб). Согласно одному варианту осуществления субъект не показывает экспрессию МНС с понижающей регуляцией. Согласно одному варианту осуществления субъект имеет высокую мутационную нагрузку опухоли (≥10 мутаций/Мб) и не показывает экспрессию МНС с понижающей регуляцией.

[0057] Согласно одному аспекту настоящее изобретение относится к способам лечения или ингибирования роста опухоли, причем способы предусматривают: (а) отбор пациента, страдающего базальноклеточной карциномой (ВСС), где пациента отбирают на основе одного или нескольких из следующих признаков: (i) пациент имеет местнораспространенную ВСС, (ii) пациент имеет метастатическую ВСС, (iii) опухоль является неоперабельной, (iv) пациент ранее получал лечение по меньшей мере одной противоопухолевой терапией, (v) пациент ранее получал лечение и пациент показал прогрессирование ВСС на фоне лечения ингибитором пути Hedgehog (HHI) (например, висмодегиб, сонидегиб), (vi) пациент показывает непереносимость HHI, (vii) пациент страдает заболеванием, которое считается неоперабельным или не поддающимся хирургическому лечению, (viii) хирургическое вмешательство и/или облучение противопоказаны, (ix) пациент ранее получал лечение облучением, и опухоль устойчива или невосприимчива к облучению, (viii) пациент показывает ≥1%, ≥5% или ≥10% экспрессии PD-L1 в опухолевых клетках, (ix) хирургическое вмешательство и/или облучение противопоказаны, (х) пациент имеет высокую мутационную нагрузку опухоли, и (xi) пациент не показывает экспрессию МНС с понижающей регуляцией, и (b) введение терапевтически эффективного количества ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента) пациенту, нуждающемуся в этом.

[0058] Согласно одному варианту осуществления настоящее изобретение относится к введению ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента) для применения для лечения распространенных солидных опухолей у пациентов, которые ранее получали лечение другой противоопухолевой терапией, такой как HHI. Согласно одному варианту осуществления настоящее изобретение относится к введению ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента) для применения для лечения распространенных солидных опухолей, которые невосприимчивы к химиотерапии первой линии.

[0059] Согласно определенным вариантам осуществления способы согласно настоящему изобретению предусматривают введение субъекту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента), где введение ингибитора PD-1 приводит к повышенной общей выживаемости (OS) или выживаемости без прогрессирования (PFS) пациента по сравнению с пациентом, получавшим стандартное лечение (SOC) (например, химиотерапия, хирургическое вмешательство или облучение). Согласно определенным вариантам осуществления PFS увеличивается на по меньшей мере один месяц, по меньшей мере 2 месяца, по меньшей мере 3 месяца, по меньшей мере 4 месяца, по меньшей мере 5 месяцев, по меньшей мере 6 месяцев, по меньшей мере 7 месяцев, по меньшей мере 8 месяцев, по меньшей мере 9 месяцев, по меньшей мере 10 месяцев, по меньшей мере 11 месяцев, по меньшей мере 1 год, по меньшей мере 2 года или по меньшей мере 3 года по сравнению с пациентом, получавшим одну или несколько терапий SOC. Согласно определенным вариантам осуществления OS увеличивается на по меньшей мере один месяц, по меньшей мере 2 месяца, по меньшей мере 3 месяца, по меньшей мере 4 месяца, по меньшей мере 5 месяцев, по меньшей мере 6 месяцев, по меньшей мере 7 месяцев, по меньшей мере 8 месяцев, по меньшей мере 9 месяцев, по меньшей мере 10 месяцев, по меньшей мере 11 месяцев, по меньшей мере 1 год, по меньшей мере 2 года или по меньшей мере 3 года по сравнению с пациентом, получавшим одну или несколько терапий SOC.

[0060] Согласно определенным вариантам осуществления способы согласно настоящему изобретению предусматривают введение субъекту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента), где введение ингибитора PD-1 приводит к повышенной общей выживаемости (OS) или выживаемости без прогрессирования (PFS) пациента по сравнению с пациентом, который показывает экспрессию МНС с понижающей регуляцией (например, менее 35% опухолевых клеток являются положительными в отношении МНС) и низкую ТМВ (например, менее 10 мутаций/Мб). Согласно определенным вариантам осуществления PFS увеличивается на по меньшей мере один месяц, по меньшей мере 2 месяца, по меньшей мере 3 месяца, по меньшей мере 4 месяца, по меньшей мере 5 месяцев, по меньшей мере 6 месяцев, по меньшей мере 7 месяцев, по меньшей мере 8 месяцев, по меньшей мере 9 месяцев, по меньшей мере 10 месяцев, по меньшей мере 11 месяцев, по меньшей мере 1 год, по меньшей мере 2 года или по меньшей мере 3 года по сравнению с пациентом с МНС с понижающей регуляцией и низкой ТМВ. Согласно определенным вариантам осуществления OS увеличивается на по меньшей мере один месяц, по меньшей мере 2 месяца, по меньшей мере 3 месяца, по меньшей мере 4 месяца, по меньшей мере 5 месяцев, по меньшей мере 6 месяцев, по меньшей мере 7 месяцев, по меньшей мере 8 месяцев, по меньшей мере 9 месяцев, по меньшей мере 10 месяцев, по меньшей мере 11 месяцев, по меньшей мере 1 год, по меньшей мере 2 года или по меньшей мере 3 года по сравнению с пациентом с МНС с понижающей регуляцией и низкой ТМВ.

[0061] Настоящее изобретение относится к наборам, содержащим ингибитор PD-1 (например, анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент) для терапевтических применений, как описано в настоящем документе. Наборы, как правило, включают этикетку, указывающую на предназначенное применение содержимого набора, и инструкции по применению. В контексте настоящего изобретения термин «этикетка» охватывает любой письменный или записанный материал, предоставленный на наборе, внутри набора или вместе с ним, или иным образом сопровождающий набор. Соответственно, настоящее изобретение относится к набору для лечения субъекта, страдающего раком, причем набор содержит: (а) терапевтически эффективную дозу ингибитора анти-PD-1 антитела и (b) инструкции по применению ингибитора PD-1 в любом из способов, раскрытых в настоящем документе. Согласно определенным вариантам осуществления набор для лечения пациентов-людей содержит ингибитор PD-1, раскрытый в настоящем документе, например, цемиплимаб, ниволумаб или пембролизумаб. Согласно некоторым вариантам осуществления инструкции включают сбор биопсии опухоли пациента, определение уровня ТМВ и экспрессии МНС в биопсии опухоли и введение ингибитора PD-1, если биопсия опухоли показывает ТМВ более или равную 10 мутаций/Мб и экспрессию МНС в по меньшей мере 35% опухолевых клеток.

Ингибиторы PD-1

[0062] Способы, раскрытые в настоящем документе, предусматривают введение терапевтически эффективного количества ингибитора PD-1. В контексте настоящего изобретения «ингибитор PD-1» относится к любой молекуле, способной ингибировать, блокировать, отменять или препятствовать активности или экспрессии PD-1. Согласно некоторым вариантам осуществления ингибитор PD-1 может представлять собой антитело, малую молекулу, нуклеиновую кислоту, полипептид или их функциональный фрагмент или вариант.Неограничивающие примеры подходящих ингибиторов анти-PD-1 антител включают анти-PD-1 антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, анти-PD-L1 антитела и их антигенсвязывающие фрагменты, а также анти-PD-L2 антитела и их антигенсвязывающие фрагменты. Другие неограничивающие примеры подходящих ингибиторов PD-1 включают молекулы РНКи, такие как анти-PD-1 молекулы РНКи, анти-PD-L1 РНКи и анти-PD-L2 РНКи, антисмысловые молекулы, такие как анти-PD-1 антисмысловая РНК, анти-PD-Ll антисмысловая РНК и анти-PD-L2 антисмысловая РНК, а также доминантно-негативные белки, такие как доминантно-негативный белок PD-1, доминантно-негативный белок PD-L1 и доминантно-негативный белок PD-L2. Некоторые примеры вышеуказанных ингибиторов PD-1 описаны, например, в US 9308236, US 10011656 и US 20170290808, части которых, которые идентифицируют ингибиторы PD-1, включены в настоящий документ посредством ссылки.

[0063] Термин «антитело» в контексте настоящего изобретения относится к молекулам иммуноглобулина, состоящим из четырех полипептидных цепей, двух тяжелых (Н) цепей и двух легких (L) цепей, соединенных между собой дисульфидными связями (т.е., «полные молекулы антител), а также их мультимерам (например, IgM) или их антигенсвязывающий фрагментам. Каждая тяжелая цепь состоит из вариабельной области тяжелой цепи («HCVR» или «V_H») и константной области тяжелой цепи (состоит из доменов CH1, СН2 и СН3). Каждая легкая цепь состоит из вариабельной области легкой цепи («LCVR» или «V_L») и константной области легкой цепи (C_L). Области V_H и V_L могут быть дополнительно подразделены на области гипервариабельности, называемые определяющими комплементарность областями (CDR), перемежающиеся с более консервативными областями, называемыми каркасными областями (FR). Каждая V_H и V_L состоит из трех CDR и четырех FR, расположенных от амино-конца к карбокси-концу в следующем порядке: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. Согласно определенным вариантам осуществления FR антитела (или его антигенсвязывающего фрагмента) могут быть идентичны последовательностям зародышевой линии человека или могут быть модифицированы естественным или искусственным путем. Консенсусная аминокислотная последовательность может быть определена на основе параллельного анализа двух или более CDR. В контексте настоящего изобретения термин «антитело» также включает антигенсвязывающие фрагменты полных молекул антител.

[0064] В контексте настоящего изобретения термины «антигенсвязывающий фрагмент» антитела, «антигенсвязывающая часть» антитела и т.п. включают любой встречающийся в природе, получаемый ферментативным путем, синтетический или полученный посредством генной инженерии полипептид или гликопротеин, который специфически связывает антиген с образованием комплекса. Антигенсвязывающие фрагменты антитела могут быть получены, например, из полных молекул антител с использованием любых подходящих стандартных способов, таких как протеолитическое расщепление или способы рекомбинантной генной инженерии, включающие манипуляции с ДНК и экспрессию ДНК, кодирующей вариабельные и необязательно константные домены антитела. Такая ДНК известна и/или легкодоступна, например, из коммерческих источников, библиотек ДНК (включая, например, фаговые библиотеки антител) или может быть синтезирована. ДНК можно секвенировать и манипулировать с ней химическим путем или с использованием способов молекулярной биологии, например, для размещения одного или нескольких вариабельных и/или константных доменов в подходящей конфигурации или для введения кодонов, создания остатков цистеина, модификации, добавления или удаления аминокислот и т.д.

[0065] Неограничивающие примеры антигенавязывающих фрагментов включают: (i) Fab фрагменты, (ii) F(ab')2 фрагменты, (iii) Fd фрагменты, (iv) Fv фрагменты, (v) одноцепочечные Fv (scFv) молекулы, (vi) dAb фрагменты и (vii) минимальные единицы распознавания, состоящие из аминокислотных остатков, которые имитируют гипервариабельную область антитела (например, выделенную определяющую комплементарность область (CDR), такую как пептид CDR3), или пептид с ограниченной конформационной свободой FR3-CDR3-FR4. Другие сконструированные молекулы, такие как домен-специфические антитела, однодоменные антитела, антитела с удаленным доменом, химерные антитела, антитела с привитыми CDR, диатела, триантела, тетратела, минитела, нанотела (например, моновалентные нанотела, двухвалентные нанотела и т.д.), малые модульные иммунофармацевтические средства (SMIP) и вариабельные домены IgNAR акулы, также охватываются выражением «антигенсвязывающий фрагмент» в контексте настоящего изобретения.

[0066] Антигенсвязывающий фрагмент антитела в общем содержит по меньшей мере один вариабельный домен. Вариабельный домен может иметь любой размер или любой аминокислотный состав и в общем содержит по меньшей мере одну CDR, которая примыкает к рамке считывания с одной или нескольким каркасным последовательностям или находится в рамке считывания. В антигенсвязывающих фрагментах, имеющих домен V_H, связанный с доменом V_L, домены V_H и V_L могут быть расположены относительно друг друга в любом подходящем порядке. Например, вариабельная область может быть димерной и содержать димеры V_H-V_H, V_H-V_L или V_L-V_L. Альтернативно, антигенсвязывающий фрагмент антитела может содержать мономерный домен V_H или V_L.

[0067] Согласно определенным вариантам осуществления антигенсвязывающий фрагмент антитела может содержать по меньшей мере один вариабельный домен, ковалентно связанный по меньшей мере с одним константным доменом. Неограничивающие иллюстративные конфигурации вариабельных и константных доменов, которые могут быть обнаружены в антигенсвязывающем фрагменте антитела согласно настоящему изобретению, включают: (i) V_H-C_H1, (ii) V_H-C_H2, (iii) V_H-C_H3, (iv) V_H-C_H1-C_H2, (v) V_H-C_H1-C_H2-C_H3, (vi) V_H-C_H2-C_H3, (vii) V_H-C_L, (viii) V_L-C_H1, (ix) V_L-C_H2, (x) V_L-C_H3, (xi) V_L-C_H1-C_H2, (xii) V_L-C_H1-C_H2-C_H3, (xiii) V_L-C_H2-C_H3 и (xiv) V_L-C_L. В любой конфигурации вариабельного и константного доменов, включая любую из иллюстративных конфигураций, перечисленных выше, вариабельный и константный домены могут быть либо непосредственно связаны друг с другом, либо могут быть связаны посредством полной или частичной шарнирной или линкерной области. Шарнирная область может состоять по меньшей мере из 2 {например, 5, 10, 15, 20, 40, 60 или более) аминокислот, что приводит к гибкой или полугибкой связи между соседними вариабельными и/или константными доменами в одной полипептидной молекуле. Более того, антигенсвязывающий фрагмент антитела согласно настоящему изобретению может содержать гомодимер или гетеродимер (или другой мультимер) любой из перечисленных выше конфигураций вариабельного и константного доменов в нековалентной связи друг с другом и/или с одним или несколькими мономерными доменами V_H или V_L (например, посредством дисульфидной связи (связей)).

[0068] Антитела, применяемые в способах, раскрытых в настоящем документе, могут быть человеческими антителами. В контексте настоящего изобретения термин «человеческое антитело» относится к антителам, имеющим вариабельные и константные области, происходящие из последовательностей иммуноглобулина зародышевой линии человека. Человеческие антитела согласно настоящему изобретению, тем не менее, могут включать аминокислотные остатки, не кодируемые последовательностями иммуноглобулина зародышевой линии человека (например, мутации, введенные случайным или сайт-специфическим мутагенезом in vitro или соматической мутацией in vivo), например, в CDR и, в частности, CDR3. Однако термин «человеческое антитело» в контексте настоящего изобретения не включает антитела, в которых последовательности CDR, происходящие из зародышевой линии других видов млекопитающих, таких как мыши, были привиты к человеческим каркасным последовательностям.

[0069] Антитела, применяемые в способах, раскрытых в настоящем документе, могут быть рекомбинантными человеческими антителами. В контексте настоящего изобретения термин «рекомбинантное человеческое антитело» включает все человеческие антитела, которые получены, экспрессированы, созданы или выделены рекомбинантными способами, такие как антитела, экспрессированные с использованием рекомбинантного вектора экспрессии, трансфицированного в клетку-хозяин (описана далее ниже), антитела, выделенные из комбинаторной библиотеки рекомбинантных человеческих антител (описанных ниже), антитела, выделенные из животного (например, мыши), трансгенного в отношении генов иммуноглобулина человека (см., например, Taylor et al., 1992, Nucl. Acids Res., 20:6287-6295), или антитела, полученные, экспрессированные, созданные или выделенные любым другим способом, который предусматривает сплайсинг последовательностей гена иммуноглобулина человека с другими последовательностями ДНК. Такие рекомбинантные человеческие антитела имеют вариабельные и константные области, полученные из последовательностей иммуноглобулина зародышевой линии человека. Согласно определенным вариантам осуществления, однако, такие рекомбинантные человеческие антитела подвергают мутагенезу in vitro (или, когда используют животное, трансгенное в отношении последовательностей Ig человека, соматический мутагенез in vivo), и, таким образом, аминокислотные последовательности областей V_H и V_L рекомбинантных антител представляют собой последовательности, которые, хотя и получены из последовательностей V_H и V_L зародышевой линии человека и относятся к ним, могут не существовать в природе в наборе антител зародышевой линии человека in vivo.

Анти-PD-1 антитела и их антигенсвязывающие фрагменты

[0070] Согласно некоторым вариантам осуществления ингибиторы PD-1, применяемые в способах, раскрытых в настоящем документе, представляют собой антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, которые специфически связывают PD-1. Термин «специфически связывается» и т.п.означает, что антитело или его антигенсвязывающий фрагмент образуют комплекс с антигеном, который является относительно стабильным в физиологических условиях. Способы определения того, связывается ли антитело специфически с антигеном, хорошо известны в данной области техники и включают, например, равновесный диализ, поверхностный плазмонный резонанс и т.п. Например, антитело, которое «специфически связывает» PD-1, в контексте настоящего изобретения включает антитела, которые связывают PD-1 или его часть, с K_D менее приблизительно 500 нМ, менее приблизительно 300 нМ, менее приблизительно 200 нМ, менее приблизительно 100 нМ, менее приблизительно 90 нМ, менее приблизительно 80 нМ, менее приблизительно 70 нМ, менее приблизительно 60 нМ, менее приблизительно 50 нМ, менее приблизительно 40 нМ, менее приблизительно 30 нМ, менее приблизительно 20 нМ, менее приблизительно 10 нМ, менее приблизительно 5 нМ, менее приблизительно 4 нМ, менее приблизительно 3 нМ, менее приблизительно 2 нМ, менее приблизительно 1 нМ или менее приблизительно 0,5 нМ, как измерено в анализе поверхностного плазмонного резонанса. Выделенное антитело, которое специфически связывает человеческий PD-1, может, однако, иметь перекрестную реактивность с другими антигенами, такими как молекулы PD-1 других (отличных от человека) видов.

[0071] Согласно определенным иллюстративным вариантам осуществления анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельную область тяжелой цепи (HCVR), вариабельную область легкой цепи (LCVR) и/или определяющие комплементарность области (CDR), содержащие аминокислотные последовательности любого из анти-PD-1 антител, как представлено в US 9987500, который включен в настоящий документ посредством ссылки во всей своей полноте. Согласно определенным иллюстративным вариантам осуществления анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые можно использовать, в контексте настоящего изобретения содержат определяющие комплементарность области тяжелой цепи (HCDR) вариабельной области тяжелой цепи (HCVR), содержащей аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 1, и определяющие комплементарность области легкой цепи (LCDR) вариабельной области легкой цепи (LCVR), содержащей аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 2. Согласно определенным вариантам осуществления анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат три HCDR (HCDR1, HCDR2 и HCDR3) и три LCDR (LCDR1, LCDR2 и LCDR3), где HCDR1 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 3, HCDR2 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 4, HCDR3 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 5, LCDR1 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 6, LCDR2 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 7, и LCDR3 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 8. Согласно другим вариантам осуществления анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит HCVR, содержащую SEQ ID NO: 1, и LCVR, содержащую SEQ ID NO: 2. Согласно определенным вариантам осуществления способы согласно настоящему изобретению предусматривают применение анти-PD-1 антитела, где антитело содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9. Согласно некоторым вариантам осуществления анти-PD-1 антитело содержит легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10. Иллюстративное антитело, содержащее вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 1, и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 2, представляет собой полностью человеческое анти-PD-1 антитело, известное как цемиплимаб (также известное как REGN2810, LIBTAYO®).

[0072] Согласно определенным иллюстративным вариантам осуществления способы согласно настоящему изобретению предусматривают применение цемиплимаба или его биоэквивалента. В контексте настоящего изобретения термин «биоэквивалент» относится к анти-PD-1 антителам или PD-1-связывающим белкам или их фрагментам, которые являются фармацевтическими эквивалентами или фармацевтическими альтернативами, скорость и/или степень абсорбции которых не показывают значительных отличий от указанных эталонного антитела (например, цемиплимаба), при введении в той же молярной дозе в подобных экспериментальных условиях, либо в однократной, либо в многократной дозе. В контексте настоящего изобретения термин «биоэквивалент» включает антигенсвязывающие белки, которые связываются с PD-1 и не имеют клинически значимых отличий от цемиплимаба в отношении безопасности, чистоты и/или эффективности.

[0073] Согласно определенным вариантам осуществления настоящего изобретения анти-человеческий PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит HCVR, имеющую идентичность последовательности 90%, 95%, 98% или 99% с SEQ ID NO: 1.

[0074] Согласно определенным вариантам осуществления настоящего изобретения анти-человеческий PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит LCVR, имеющую идентичность последовательности 90%, 95%, 98% или 99% с SEQ ID NO: 2.

[0075] Согласно определенным вариантам осуществления настоящего изобретения анти-человеческий PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит HCVR, содержащую аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 1, имеющую не более 5 аминокислотных замен. Согласно определенным вариантам осуществления настоящего изобретения анти-человеческий PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит LCVR, содержащую аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 2, имеющую не более 2 аминокислотных замен.

[0076] Идентичность последовательности можно измерить способами, известными в области техники (например, GAP, BESTFIT и BLAST).

[0077] Настоящее изобретение также включает применение анти-PD-1 антител или их антигенсвязывающих фрагментов в способах лечения рака, где анти-PD-1 антитела или их антигенсвязывающие фрагменты содержат варианты любой из аминокислотных последовательностей HCVR, LCVR и/или CDR, раскрытых в настоящем документе, имеющие одну или несколько консервативных аминокислотных замен. Например, настоящее изобретение включает применение анти-PD-1 антител или их антигенсвязывающих фрагментов, имеющих аминокислотные последовательности HCVR, LCVR и/или CDR с, например, 10 или менее, 8 или менее, 6 или менее, 4 или менее и т.д. консервативными аминокислотными заменами относительно любой из аминокислотных последовательностей HCVR, LCVR и/или CDR, раскрытых в настоящем документе.

[0078] Другие анти-PD-1 антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, которые можно применять в контексте способов согласно настоящему изобретению, включают, например, антитела, упоминаемые и известные в области техники как ниволумаб, пембролизумаб, MEDI0608, пидилизумаб, BI 754091, спартализумаб (также известный как PDR001), камрелизумаб (также известный как SHR-1210), JNJ-63723283, MCLA-134, или любое из анти-PD-1 антител, изложенных в патентах США №6808710, 7488802, 8008449, 8168757, 8354509, 8609089, 8686119, 8779105, 8900587 и 9987500 и в патентных публикациях WO 2006/121168, WO 2009/114335. Части всех вышеупомянутых публикаций, которые идентифицируют анти-PD-1 антитела, включены в настоящий документ посредством ссылки.

[0079] Анти-PD-1 антитела, используемые в контексте способов согласно настоящему изобретению, могут иметь рН-зависимые характеристики связывания. Например, анти-PD-1 антитело для применения в способах согласно настоящему изобретению может проявлять сниженное связывание с PD-1 при кислотном значении рН по сравнению с нейтральным значении рН. Альтернативно, анти-PD-1-антитело согласно настоящему изобретению может проявлять усиленное связывание с его антигеном при кислотном значении рН по сравнению с нейтральным значением рН. Выражение «кислотное значение рН» включает значения рН менее приблизительно 6,2, например, приблизительно 6,0, 5,95, 5,9, 5,85, 5,8, 5,75, 5,7, 5,65, 5,6, 5,55, 5,5, 5,45, 5,4, 5,35, 5,3, 5,25, 5,2, 5,15, 5,1, 5,05, 5,0 или менее. В контексте настоящего изобретения выражение «нейтральное значение рН» означает значение рН от приблизительно 7,0 до приблизительно 7,4. Выражение «нейтральное значение рН» включает значения рН приблизительно 7,0, 7,05, 7,1, 7,15, 7,2, 7,25, 7,3, 7,35 и 7,4.

[0080] В определенных случаях «сниженное связывание с PD-1 при кислотном значении рН по сравнению с нейтральным значением рН» выражается в виде соотношения значения K_D антитела, связывающегося с PD-1 при кислотном значении рН, и значения K_D антитела, связывающегося с PD-1 при нейтральном значении рН, (или наоборот). Например, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент можно рассматривать как проявляющие «сниженное связывание с PD-1 при кислотном значении рН по сравнению с нейтральным значением рН» для целей настоящего изобретения, если антитело или его антигенсвязывающий фрагмент проявляют соотношение кислотной/нейтральной K_D приблизительно 3,0 или более. Согласно определенным иллюстративным вариантам изобретения соотношение кислотной/нейтральной K_D для антитела или антигенсвязывающего фрагмента согласно настоящему изобретению может составлять приблизительно 3,0, 3,5, 4,0, 4,5, 5,0, 5,5, 6,0, 6,5, 7,0, 7,5, 8,0, 8,5, 9,0, 9,5, 10,0, 10,5, 11,0, 11,5, 12,0, 12,5, 13,0, 13,5, 14,0, 14,5, 15,0, 20,0, 25,0, 30,0, 40,0, 50,0, 60,0, 70,0, 100,0 или более.

[0081] Антитела с рН-зависимыми характеристиками связывания могут быть получены, например, путем скрининга популяции антител на сниженное (или усиленное) связывание с конкретным антигеном при кислотном значении рН по сравнению с нейтральным значением рН. Кроме того, модификации антигенсвязывающего домена на уровне аминокислот могут приводить к антителам с рН-зависимыми характеристиками. Например, путем замены одной или нескольких аминокислот в антигенсвязывающем домене (например, в CDR) гистидиновым остатком можно получить антитело со сниженным связыванием антигена при кислотном значении рН по сравнению с нейтральным значением рН. В контексте настоящего изобретения выражение «кислотное значение рН» означает значение рН 6,0 или менее.

Анти-PD-L1 антитела и их антигенсвязывающие фрагменты

[0082] Согласно некоторым вариантам осуществления ингибиторы PD-1, применяемые в способах, раскрытых в настоящем документе, представляют собой антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, которые специфически связываются с PD-L1. Например, антитело, которое «специфически связывает» PD-L1, как применяется в контексте настоящего изобретения, включает антитела, которые связывают PD-L1 или его часть, с Kd приблизительно 1×10^-8 М или менее (например, меньшая K_D означает более сильное связывание). Анти-PD-L1 антитело с «высокой аффинностью» относится к моноклональным антителам (mAb), имеющим аффинность связывания с PD-L1, выраженную как K_D по меньшей мере 10^-8 М, предпочтительно 10^-9 М, более предпочтительно 10^-10 М, даже более предпочтительно 10^-11 М, даже более предпочтительно 10^-12 М, как измерено посредством поверхностного плазмонного резонанса, например, BIACORE™, или способа ELISA для определения аффиннности в растворе. Выделенное антитело, которое специфически связывает человеческий PD-L1, может, однако, иметь перекрестную реактивность с другими антигенами, такими как молекулы PD-L1 других (не относящихся к человеку) видов.

[0083] Согласно определенным иллюстративным вариантам осуществления анти-PD-L1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат вариабельную область тяжелой цепи (HCVR), вариабельную область легкой цепи (LCVR) и/или определяющие комплементарность области (CDR), содержащие аминокислотные последовательности любого из анти-PD-L1 антител, изложенных в US 9938345, который включен в настоящий документ посредством ссылки во всей своей полноте. Согласно определенным иллюстративным вариантам осуществления анти-PD-Ll антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые можно применять в контексте настоящего изобретения, содержат определяющие комплементарность области тяжелой цепи (HCDR) вариабельной области тяжелой цепи (HCVR), содержащей SEQ ID NO: 11, и определяющие комплементарность области легкой цепи (LCDR) вариабельной области легкой цепи (LCVR), содержащей SEQ ID NO: 12. Иллюстративное анти-PD-L1 антитело, содержащее HCVR согласно SEQ ID NO: 11 и LCVR согласно SEQ ID NO: 12, представляет собой REGN3504.

[0084] Согласно определенным вариантам осуществления настоящего изобретения анти-человеческий PD-L1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит HCVR, имеющую идентичность последовательности 90%, 95%, 98% или 99% с SEQ ID NO: 11. Согласно определенным вариантам осуществления настоящего изобретения античеловеческий PD-L1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит LCVR, имеющую идентичность последовательности 90%, 95%, 98% или 99% с SEQ ID NO: 12.

[0085] Согласно определенным вариантам осуществления настоящего изобретения анти-человеческий PD-L1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит HCVR, содержащую аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 11, имеющую не более 5 аминокислотных замен. Согласно определенным вариантам осуществления настоящего изобретения анти-человеческий PD-L1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит LCVR, содержащую аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 12, имеющую не более 2 аминокислотных замен.

[0086] Идентичность последовательности можно измерить способами, известными в области техники (например, GAP, BESTFIT и BLAST).

[0087] Настоящее изобретение также включает применение анти-PD-L1 антител в способах лечения рака, где анти-PD-Ll антитела содержат вариант любой из аминокислотных последовательностей HCVR, LCVR и/или CDR, раскрытых в настоящем документе, имеющих одну или несколько консервативных аминокислотных замен. Например, настоящее изобретение включает применение анти-PD-L1 антител, имеющих аминокислотные последовательности HCVR, LCVR и/или CDR, имеющие, например, 10 или менее, 8 или менее, 6 или менее, 4 или менее и т.д. консервативных аминокислотных замен относительно любой из аминокислотных последовательностей HCVR, LCVR и/или CDR, раскрытых в настоящем документе.

[0088] Другие анти-PD-L1 антитела, которые можно применять в контексте способов согласно настоящему изобретению, включают, например, антитела, упоминаемые и известные в области техники как MDX-1105, атезолизумаб (TECENTRIQ™), дурвалумаб (TMFTNZI™), авелумаб (BAVENCIO™), LY3300054, FAZ053, STI-1014, СХ-072, KN035 (Zhang et al., Cell Discovery, 3, 170004 (March 2017)), CK-301 (Gorelik et al., American Association for Cancer Research Annual Meeting (AACR), 2016-04-04 Abstract 4606) или любое из других анти-PD-L1 антител, раскрытых в патентных публикациях US 7943743, US 8217149, US 9402899, US 9624298, US 9938345, WO 2007/005874, WO 2010/077634, WO 2013/181452, WO 2013/181634, WO 2016/149201, WO 2017/034916 или EP 3177649. Части всех вышеупомянутых публикаций, которые идентифицируют анти-PD-L1 антитела, включены в настоящий документ посредством ссылки

Фармацевтические композиции и введение

[0089] Настоящее изобретение относится к терапевтическим фармацевтическим композициям, содержащим раскрытые в настоящем документе ингибиторы PD-1. Такие фармацевтические композиции могут быть составлены с подходящими фармацевтически приемлемыми носителями, вспомогательными веществами, буферами и другими агентами, которые обеспечивают подходящий перенос, доставку, переносимость и т.п.Множество подходящих составов можно найти в документе, известном всем химикам-фармацевтам Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Company, Easton, PA. Эти составы включают, например, порошки, пасты, мази, желе, воски, масла, липиды, везикулы, содержащие липиды (катионные или анионные) (такие как LIPOFECTIN™), конъюгаты ДНК, безводные абсорбирующие пасты, эмульсии типа масло-в-воде и вода-в-масле, эмульсии карбовакса (полиэтиленгликоли различной молекулярной массы), полутвердые гели и полутвердые смеси, содержащие карбовакс.См. также Powell et al., "Compendium of excipients for parenteral formulations" PDA, JPharm Sci Technol 52:238-311 (1998).

[0090] Доза ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента) может варьироваться в зависимости от возраста и размера субъекта, которому осуществляется введение, целевого заболевания, состояний, пути введения и т.п. Когда ингибитор PD-1 согласно настоящему изобретению применяют для лечения или ингибирования роста рака, может быть предпочтительно вводить ингибитор PD-1 в разовой дозе от приблизительно 0,1 до приблизительно 100 мг/кг массы тела. В зависимости от тяжести состояния можно корректировать частоту и продолжительность лечения. Согласно определенным вариантам осуществления ингибитор PD-1 согласно настоящему изобретению можно вводить в качестве начальной дозы по меньшей мере от приблизительно 0,1 мг до приблизительно 800 мг, от приблизительно 1 до приблизительно 1000 мг, от приблизительно 2 до приблизительно 1500 мг, от приблизительно 5 до приблизительно 800 мг, от приблизительно 5 до приблизительно 500 мг или от приблизительно 10 до приблизительно 400 мг.Согласно определенным вариантам осуществления за начальной дозой может следовать введение второй или множества последующих доз ингибитора PD-1 в количестве, которое может быть приблизительно таким же или меньшим, чем начальная доза, при этом последующие дозы разделены интервалом по меньшей мере от 1 дня до 3 дней, по меньшей мере она неделя, по меньшей мере 2 недели, по меньшей мере 3 недели, по меньшей мере 4 недели, по меньшей мере 5 недель, по меньшей мере 6 недель, по меньшей мере 7 недель, по меньшей мере 8 недель, по меньшей мере 9 недель, по меньшей мере 10 недель, по меньшей мере 12 недель или по меньшей мере 14 недель.

[0091] Известны различные системы доставки, которые могут быть использованы для введения фармацевтической композиции согласно настоящему изобретению, например, инкапсуляция в липосомы, микрочастицы, микрокапсулы, рекомбинантные клетки, способные экспрессировать мутантные вирусы, опосредованный рецепторами эндоцитоз (см., например, Wu et al. (1987) J. Biol. Chem. 262:4429-4432). Способы введения включают без ограничения внутрикожный, трансдермальный, внутримышечный, внутрибрюшинный, внутривенный, подкожный, интраназальный, эпидуральный и пероральный пути. Композицию можно вводить любым удобным путем, например, путем инфузии или болюсной инъекции, путем всасывания через эпителиальные или слизисто-кожные выстилки (например, слизистую оболочку полости рта, слизистую оболочку прямой кишки и кишечника и т.д.), и ее можно вводить вместе с другими биологически активными средствами. Фармацевтическая композиция также может быть доставлена в везикуле, в частности, в липосоме (см., например, Langer (1990) Science 249:1527-1533).

[0092] Применение наночастиц для доставки ингибитора PD-1 согласно настоящему изобретению также охватывается настоящим документом. Наночастицы, конъюгированные с антителами, можно применять как в терапевтических, так и в диагностических целях. Наночастицы, конъюгированные с антителами, и способы получения и применения подробно описаны в Arruebo et al., 2009, "Antibody-conjugated nanoparticles for biomedical applications," J. Nanomat., Vol.2009, Article ID 439389, 24 стр. Наночастицы могут быть разработаны и конъюгированы с антителами, содержащимися в фармацевтических композициях, для клеток- мишеней. Наночастицы для доставки лекарственного средства также описаны, например, в US 8257740 или US 8246995.

[0093] В определенных ситуациях фармацевтическая композиция может быть доставлена в системе с контролируемым высвобождением. Согласно одному варианту осуществления можно использовать насос. Согласно другому варианту осуществления можно использовать полимерные материалы. Согласно другому варианту осуществления система с контролируемым высвобождением может быть размещена вблизи мишени композиции, что требует только части системной дозы.

[0094] Препараты для инъекций могут включать лекарственные формы для внутривенных, подкожных, внутричерепных, внутрибрюшинных и внутримышечных инъекций, капельных вливаний и т.д. Эти препараты для инъекций могут быть получены общеизвестными способами.

[0095] Фармацевтическую композицию согласно настоящему изобретению можно вводить подкожно или внутривенно с помощью стандартной иглы и шприца. Кроме того, для подкожной доставки удобно применять шприц-ручку для доставки фармацевтической композиции согласно настоящему изобретению. Такое устройство шприц-ручка может быть многоразовым или одноразовым. В многоразовом устройстве шприц-ручка обычно используется сменный картридж, содержащий фармацевтическую композицию. Когда вся фармацевтическая композиция в картридже введена и картридж пуст, пустой картридж можно легко выбросить и заменить новым картриджем, содержащим фармацевтическую композицию. После этого устройство шприц-ручка можно использовать повторно. В одноразовом устройстве шприц-ручка нет сменного картриджа. Скорее одноразовое устройство шприц-ручка поставляется предварительно заполненным фармацевтической композицией, находящейся в резервуаре внутри устройства. Как только резервуар опорожняется от фармацевтической композиции, все устройство выбрасывают.

[0096] Предпочтительно фармацевтические композиции для перорального или парентерального применения, описанные выше, получают в виде лекарственных форм в стандартной дозе, соответствующей дозе активных ингредиентов. Такие лекарственные формы в стандартной дозе включают, например, таблетки, пилюли, капсулы, инъекции (ампулы), суппозитории и т.д. Количество содержащегося антитела в общем составляет от приблизительно 5 до приблизительно 1500 мг на лекарственную форму в стандартной дозе, особенно в форме для инъекции, предпочтительно антитело содержится в количестве от приблизительно 5 до приблизительно 300 мг и от приблизительно 10 до приблизительно 300 мг для других лекарственных форм.

[0097] Согласно определенным вариантам осуществления настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции или составу, содержащим терапевтическое количество ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента) и фармацевтически приемлемый носитель. Неограничивающие примеры фармацевтических композиций, содержащих анти-PD-1 антитело, которые можно использовать в контексте настоящего изобретения, раскрыты в US 2019/0040137.

Режимы введения

[0098] Согласно определенным вариантам осуществления способы, раскрытые в настоящем документе, предусматривают введение в опухоль субъекта, нуждающегося в этом, терапевтически эффективное количество ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента) в виде множества доз, например, как часть специфического терапевтического режима введения доз. Например, терапевтический режим введения доз может предусматривать введение одной или нескольких доз ингибитора PD-1 субъекту при частоте приблизительно один раз в день, один раз каждые два дня, один раз каждые три дня, один раз каждые четыре дня, один раз каждые пять дней, один раз каждые шесть дней, один раз в неделю, один раз каждые две недели, один раз каждые три недели, один раз каждые четыре недели, один раз каждые пять недель, один раз каждые шесть недель, один раз каждые восемь недель, один раз каждые двенадцать недель, один раз в месяц, один раз каждые два месяца, один раз каждые три месяца, один раз каждые четыре месяца, два раза в день, два раза каждые два дня, два раза каждые три дня, два раза каждые четыре дня, два раза каждые пять дней, два раза каждые шесть дней, два раза в неделю, два раза каждые две недели, два раза каждые три недели, два раза каждые четыре недели, два раза каждые пять недель, два раза каждые шесть недель, два раза каждые восемь недель, два раза каждые двенадцать недель, два раза в месяц, два раза каждые два месяца, два раза каждые три месяца, два раза каждые четыре месяца, три раза в день, три раза каждые два дня, три раза каждые три дня, три раза каждые четыре дня, три раза каждые пять дней, три раза каждые шесть дней, три раза в неделю, три раза каждые две недели, три раза каждые три недели, три раза каждые четыре недели, три раза каждые пять недель, три раза каждые шесть недель, три раза каждые восемь недель, три раза каждые двенадцать недель, три раза в месяц, три раза каждые два месяца, три раза каждые три месяца, три раза каждые четыре месяца или реже или по мере необходимости, пока не достигается терапевтический ответ.Согласно одному варианту осуществления одну или несколько доз ингибитора PD-1 вводят один раз каждые три недели.

[0099] Согласно определенным вариантам осуществления одну или несколько доз вводят в ходе по меньшей мере одного цикла лечения. Способы согласно этому аспекту предусматривают введение субъекту, нуждающемуся в этом, по меньшей мере одного цикла лечения, содержащего введение 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более доз ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента). Согласно одному варианту осуществления цикл лечения содержит 12 доз ингибитора PD-1. Согласно одному варианту осуществления цикл лечения содержит 24 доз ингибитора PD-1.

[00100] Согласно определенным вариантам осуществления одну или несколько доз ингибитора PD-1 вводят через 1-12 недель после непосредственно предшествующей дозы, например, через 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 недель после непосредственно предшествующей дозы.

Доза

[00101] Количество ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента), вводимое субъекту согласно способам, раскрытым в настоящем документе, в общем представляет собой терапевтически эффективное количество. В контексте настоящего изобретения термин «терапевтически эффективное количество» означает количество ингибитора PD-1, которое приводит к одному или нескольким из: (а) снижения тяжести или продолжительности симптома или признака рака, например, опухолевого поражения, (b) ингибирования роста опухоли или усиления некроза опухоли, сокращения опухоли и/или исчезновения опухоли, (с) задержки роста и развития опухоли, (d) ингибирования метастазирования опухоли, (е) предотвращения рецидива роста опухоли, (f) увеличения выживаемости субъекта, страдающего раком и/или (g) снижения использования или потребности в стандартной противораковой терапии (например, устранения необходимости в хирургическом вмешательстве или снижения или устранения использования химиотерапевтических или цитотоксических средств) по сравнению с субъектом, не получавшим лечение, или субъектом, получавшим лечение химиотерапией на основе платины или другой терапией SOC, такой как раскрытые в настоящем документе.

[00102] Согласно определенным вариантам осуществления терапевтически эффективное количество ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента) может составлять от приблизительно 0,05 мг до приблизительно 1500 мг, от приблизительно 1 мг до приблизительно 1050 мг, от приблизительно 1 мг до приблизительно 700 мг, от приблизительно 1 мг до приблизительно 600 мг, от приблизительно 10 мг до приблизительно 550 мг, от приблизительно 50 мг до приблизительно 400 мг, от приблизительно 75 мг до приблизительно 350 мг или от приблизительно 100 мг до приблизительно 300 мг антитела. Например, согласно различным вариантам осуществления количество ингибитора PD-1 составляет приблизительно 0,05 мг, приблизительно 0,1 мг, приблизительно 1,0 мг, приблизительно 1,5 мг, приблизительно 2,0 мг, приблизительно 5 мг, приблизительно 10 мг, приблизительно 15 мг, приблизительно 20 мг, приблизительно 30 мг, приблизительно 40 мг, приблизительно 50 мг, приблизительно 60 мг, приблизительно 70 мг, приблизительно 80 мг, приблизительно 90 мг, приблизительно 100 мг, приблизительно 110 мг, приблизительно 120 мг, приблизительно 130 мг, приблизительно 140 мг, приблизительно 150 мг, приблизительно 160 мг, приблизительно 170 мг, приблизительно 180 мг, приблизительно 190 мг, приблизительно 200 мг, приблизительно 210 мг, приблизительно 220 мг, приблизительно 230 мг, приблизительно 240 мг, приблизительно 250 мг, приблизительно 260 мг, приблизительно 270 мг, приблизительно 280 мг, приблизительно 290 мг, приблизительно 300 мг, приблизительно 310 мг, приблизительно 320 мг, приблизительно 330 мг, приблизительно 340 мг, приблизительно 350 мг, приблизительно 360 мг, приблизительно 370 мг, приблизительно 380 мг, приблизительно 390 мг, приблизительно 400 мг, приблизительно 410 мг, приблизительно 420 мг, приблизительно 430 мг, приблизительно 440 мг, приблизительно 450 мг, приблизительно 460 мг, приблизительно 470 мг, приблизительно 480 мг, приблизительно 490 мг, приблизительно 500 мг, приблизительно 510 мг, приблизительно 520 мг, приблизительно 530 мг, приблизительно 540 мг, приблизительно 550 мг, приблизительно 560 мг, приблизительно 570 мг, приблизительно 580 мг, приблизительно 590 мг, приблизительно 600 мг, приблизительно 610 мг, приблизительно 620 мг, приблизительно 630 мг, приблизительно 640 мг, приблизительно 650 мг, приблизительно 660 мг, приблизительно 670 мг, приблизительно 680 мг, приблизительно 690 мг, приблизительно 700 мг, приблизительно 710 мг, приблизительно 720 мг, приблизительно 730 мг, приблизительно 740 мг, приблизительно 750 мг, приблизительно 760 мг, приблизительно 770 мг, приблизительно 780 мг, приблизительно 790 мг, приблизительно 800 мг, приблизительно 810 мг, приблизительно 820 мг, приблизительно 830 мг, приблизительно 840 мг, приблизительно 850 мг, приблизительно 860 мг, приблизительно 870 мг, приблизительно 880 мг, приблизительно 890 мг, приблизительно 900 мг, приблизительно 910 мг, приблизительно 920 мг, приблизительно 930 мг, приблизительно 940 мг, приблизительно 950 мг, приблизительно 960 мг, приблизительно 970 мг, приблизительно 980 мг, приблизительно 990 мг, приблизительно 1000 мг, приблизительно 1010 мг, приблизительно 1020 мг, приблизительно 1030 мг, приблизительно 1040 мг, приблизительно 1050 мг, приблизительно 1060 мг, приблизительно 1070 мг, приблизительно 1080 мг, приблизительно 1090 мг, приблизительно 1100 мг, приблизительно 1110 мг, приблизительно 1120 мг, приблизительно ИЗО мг, приблизительно 1140 мг, приблизительно 1150 мг, приблизительно 1160 мг, приблизительно 1170 мг, приблизительно 1180 мг, приблизительно 1190 мг, приблизительно 1200 мг, приблизительно 1210 мг, приблизительно 1220 мг, приблизительно 1230 мг, приблизительно 1240 мг, приблизительно 1250 мг, приблизительно 1260 мг, приблизительно 1270 мг, приблизительно 1280 мг, приблизительно 1290 мг, приблизительно 1300 мг, приблизительно 1310 мг, приблизительно 1320 мг, приблизительно 1330 мг, приблизительно 1340 мг, приблизительно 1350 мг, приблизительно 1360 мг, приблизительно 1370 мг, приблизительно 1380 мг, приблизительно 1390 мг, приблизительно 1400 мг, приблизительно 1410 мг, приблизительно 1420 мг, приблизительно 1430 мг, приблизительно 1440 мг, приблизительно 1450 мг, приблизительно 1460 мг, приблизительно 1470 мг, приблизительно 1480 мг или приблизительно 1500 мг.

[00103] Количество ингибитора PD-1, содержащееся в индивидуальной дозе, может быть выражено в миллиграммах антитела на килограмм массы тела субъекта (т.е., мг/кг). Согласно определенным вариантам осуществления ингибитор PD-1, применяемый в способах, раскрытых в настоящем документе, можно вводить субъекту при от дозе приблизительно 0,0001 до приблизительно 100 мг/кг массы тела субъекта. Согласно определенным вариантам осуществления анти-PD-1 антитело можно вводить при дозе от приблизительно 0,1 мг/кг до приблизительно 20 мг/кг массы тела пациента. Согласно определенным вариантам осуществления способы согласно настоящему изобретению предусматривают введение ингибитора PD-1 (например, анти-PD-1 антитела или его антигенсвязывающего фрагмента) при дозе приблизительно от 1 мг/кг до 3 мг/кг, от 1 мг/кг до 5 мг/кг, от 1 мг/кг до 10 мг/кг, 1 мг/кг, 3 мг/кг, 5 мг/кг или 10 мг/кг массы тела пациента.

[00104] Согласно определенным вариантам осуществления каждая доза содержит 0,1-10 мг/кг (например, 0,3 мг/кг, 1 мг/кг, 3 мг/кг или 10 мг/кг) массы тела пациента. Согласно определенным другим вариантам осуществления каждая доза содержит 5-1500 мг ингибитора PD-1 (такого как анти-PD-1 антитело или его антигенсвязывающий фрагмент), например, 5, 10, 15, 20, 25, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250, 300, 350, 400, 450, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000, 1050, 1100, 1150, 1200, 1250, 1300, 1350, 1400, 1450, 1500 мг или более ингибитора PD-1.

Примеры

[00105] Следующие примеры приведены для того, чтобы предоставить специалистам в данной области техники полное раскрытие и описание того, как создать и использовать способы и композиции согласно настоящему изобретению, и не предназначены для ограничения объема того, что авторы настоящего изобретения считают своим изобретением. Подобным образом, раскрытие не ограничивается какими-либо конкретными предпочтительными вариантами осуществления, описанными в настоящем документе. Действительно, модификации и вариации вариантов осуществления могут быть очевидны специалистам в данной области техники после прочтения этого описания и могут быть выполнены без отклонения от его сущности и объема. Были предприняты усилия для обеспечения точности используемых чисел (например, количеств, температуры и т.д.), но следует учитывать некоторые экспериментальные ошибки и отклонения. Если не указано иное, части представляют собой части по массе, молекулярная масса представляет собой среднюю молекулярную массу, температура выражена в градусах Цельсия, комнатная температура составляет приблизительно 25°С, а давление равно атмосферному или близко к нему.

Пример 1. Клиническое испытание анти-PD-1 антитела на пациентах, страдающих ВСС, после терапии HHI

[00106] Это исследование представляет собой нерандомизированное двухгрупповое многоцентровое исследование фазы 2 цемиплимаба при дозе 350 мг, вводимой внутривенно (IV) каждые 3 недели (Q3W), у пациентов с распространенной ВСС, которые показали прогрессирование заболевания на фоне терапии HHI или непереносимость к предшествующей терапии HHI. Цемиплимаб представляет собой человеческое шарнир-стабилизированное моноклональное антитело IgG4 с высокой аффинностью к рецептору PD-1, которое эффективно блокирует взаимодействие PD-1 с PD-L1 и PD-L2. Цемиплимаб содержит тяжелую цепь, имеющую аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 9, и легкую цепь, имеющую аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 10, пару аминокислотных последовательностей HCVR/LCVR, содержащую SEQ ID NO: 1/2, и последовательности CDR тяжелой и легкой цепей (HCDR1, HCDR2, HCDR3, LCDR1, LCDR2, LCDR3), содержащие SEQ ID NO: 3-8, соответственно, как описано в настоящем документе. См. также US 9987500.

[00107] В исследовании участвовали 2 группы. Группа 1 включает пациентов с метастатической ВСС.Группа 2 включает пациентов с неоперабельной местнораспространенной ВСС. Все пациенты прошли процедуры скрининга для определения пригодности в течение 28 дней до первоначального введения цемиплимаба. Исследование не включало ни рандомизацию, ни плацебо-контроль.

[00108] После периода скрининга продолжительностью до 28 дней пациенты получали до 93 недель лечения. Каждый пациент получал цемиплимаб IV в дозе 350 мг каждые 3 недели. Время инфузии цемиплимаба составляло приблизительно 30 минут (±10 минут). Оценку опухоли проводили в конце каждого цикла лечения в течение 5 циклов лечения по 9 недель, за которыми следовали 4 цикла лечения по 12 недель. Исходные оценки включали цифровую медицинскую фотографию и рентгенологическую визуализацию (КТ или МРТ) всех пораженных участков. Обширные оценки безопасности проводили в 1-й день каждого цикла, при этом рутинные оценки безопасности проводили при каждом посещении для введения дозы цемиплимаба. Оценку безопасности проводили непрерывно с начала исследуемого лечения до 105 дней после последнего исследуемого лечения. Пациентов повторно оценивали на предмет ответа каждые 9 недель в циклах 1-5 и каждые 12 недель в циклах 6-9.

[00109] Пациент получал лечение до завершения 93-недельного периода лечения или до прогрессирования заболевания (PD), неприемлемой токсичности, отзыва согласия или подтвержденного полного ответа (CR). Пациенты с подтвержденным CR после как минимум 48 недель лечения могли принять решение о прекращении лечения и продолжении всех соответствующих оценок исследования (например, оценок эффективности). Для того, чтобы установить CR, требовалась биопсия регрессировавшего целевого поражения с регистрацией отрицательной гистологии.

Цели исследования

[00110] Основная цель исследования состояла в оценке частоты объективного ответа (ORR) для метастатической базальноклеточной карциномы (ВСС) (Группа 1) или неоперабельной местнораспространенной ВСС (Группа 2) при лечении монотерапией цемиплимаба у пациентов, показавших прогрессирование на фоне терапии ингибитором пути Hedgehog (HHI) или непереносимость предшествующей терапии HHI

[00111] Вторичные цели исследования включали оценку ORR, оценку продолжительности ответа, выживаемости без прогрессирования (PFS) и общей выживаемости (OS), оценку процента пациентов с полным объективным ответом (CR), оценку безопасности и переносимости цемиплимаба, оценку фармакокинетики (РК) цемиплимаба, оценку иммуногенности цемиплимаба и оценку влияния цемиплимаба на качество жизни с применением опросника для оценки качества жизни Европейской организации по исследованию и лечению рака Core 30 (EORTC QLQ-C30) и Skindex-16.

[00112] Поисковые цели исследования включали оценку прогностического потенциала и корреляции с клиническим ответом для представляющих интерес биомаркеров, включая без ограничения мутационную нагрузку опухоли.

Обоснование дизайна исследования

[00113] Базальноклеточные карциномы имеют высокую мутационную нагрузку, которая кодирует неоантигены для представления эффекторным Т-клеткам (Teff). Следовательно, ответ клеток Teff против ВСС будет вызван блокадой контрольной точки PD-1 с помощью цемиплимаба, достигая высокого ORR.

[00114] Несколько линий доказательств позволяют предположить, что ингибирование контрольной точки PD-1 может быть клинически выгодным для пациентов с распространенной ВСС. Во-первых, мутационная нагрузка при ВСС является одной из самых высоких среди всех злокачественных новообразований человека (Jayaraman et al., 2014, J Invest Dermatol, 134:213-220, Chalmers et al., 2016, AACR poster, abstract number 35762016, Bonilla et al., 2016, Nature Genetics, 48(4):398-406). Типы опухолей с высокой мутационной нагрузкой обычно более восприимчивы к блокаде PD-1, чем опухоли с низкой мутационной нагрузкой, и полагают, что это связано с образованием неоантигенов, которые могут распознаваться Teff (Le et al., 2015, NEnglJMed, 372(26):2509-20, McGranahan et al., 2016, Science, 351:1463-69, Rizvi et al., 2015, Science, 345:124-28). Во-вторых, пациенты с трансплантацией солидных органов имеют приблизительно в 10 раз более высокий риск ВСС, что позволяет предположить, что иммунный надзор имеет значение при этом заболевании (Euvrard et al., 2003, N Engl J Med, 348:1681-91). В-третьих, другие иммуномодуляторы обладают активностью против ВСС.Агонист Toll-подобного рецептора-7 (TLR-7) имиквимод является одобренным средством для лечения поверхностной ВСС (Gollnick et al., 2008, Eur J Dermatol, 18(6):677-82). Имеется отчет о случае ответа ВСС на ипилимумаб, ингибитор цитотоксического Т-лимфоцит-ассоциированного белка 4 (Mohan et al., 2016, JAAD Case Reports, 2:13-15). В недавнем отчете о клиническом случае стабилизация заболевания ранее прогрессировавшей метастатической ВСС была достигнута с помощью введения пембролизумаба не по назначению (Winkler et al., 2016, Br J Dermatol, 176(2):498-502).

[00115] Поскольку не существует стандарта лечения пациентов с ВСС, которые показали прогрессирование заболевания на фоне терапии HHI или непереносимость предшествующей терапии HHI, а метастатическое и местнораспространенное заболевание встречается относительно редко, было приемлемо оценивать эффективность с помощью нерандомизированных несравнительных исследований. Нерандомизированные несравнительные исследования, в которых первичными конечными точками были ORR, были одобрены как Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA), так и Европейским агентством по лекарственным средствам (ЕМА) при одобрении висмодегиба и сонидегиба при распространенной ВСС в исследовании ERIVANCE (Migden 2015) и BOLT (Sekulic 2012), соответственно. Частота объективных ответов является основной конечной точкой в описанном в настоящем документе исследовании.

[00116] Биопсии опухоли получали на исходном уровне и во время лечения у пациентов с местнораспространенными опухолями для того, чтобы получить представление о механизмах ответа и резистентности к лечению опухоли.

[00117] Решение проанализировать отдельные группы пациентов с метастатической (группа 1) и неоперабельной местнораспространенной (группа 2) ВСС основано на наблюдении более высокой частоты ответа при местнораспространенном заболевании по сравнению с метастатическим заболеваниям, как видно на основе данных исследований ингибиторов SMO против ВСС (Sekulic et al., 2012, N Engl J Med, 366:2171-9, Migden et al., 2015, Lancet Oncol, 16:716-28). Это наблюдение также было отмечено в литературном обзоре сообщенных наблюдений других системных терапий CSCC, который демонстрирует, что частота ответа на различные схемы химиотерапии, как правило, выше против распространенных первичных опухолей, которые являются местнораспространенными, чем против опухолей, которые метастазировали в лимфатические узлы или отдаленные внутренние органы (Nakamura et al., 2013, IntJ Clin Oncol, 18(3):506-09).

[00118] Обоснование включения пациентов с непереносимостью HHI заключается в том, что такие пациенты вряд ли будут иметь высокую вероятность объективного ответа при повторном назначении HHI. Поскольку объективный ответ, как правило, возникает до появления нежелательных явлений (НЯ), маловероятно, что пациенты, прервавшие лечение HHI из-за НЯ, получат объективный ответ при повторном применении.

Группы исследования

[00119] Группа Г. пациенты с метастатической ВСС. Эти пациенты должны иметь гистологическое подтверждение отдаленных метастаз ВСС (например, в легкие, печень, кости или лимфатические узлы). В группу 1 входят пациенты как с узловыми метастазами, так и с отдаленными метастазами.

[00120] Группа 2: пациенты с неоперабельной местнораспространенной ВСС.Эти пациенты должны иметь заболевание, которое считается неоперабельным, или иметь медицинские противопоказания к хирургическому вмешательству или облучению, или не достигать контроля заболевания с помощью этих способов лечения.

Исследуемая популяция

[00121] Пациенты с метастатической (группа 1) или неоперабельной местнораспространенной (группа 2) ВСС, которые показали прогрессирование заболевания на фоне терапии HHI или непереносимость к предшествующей терапии HHI.

[00122] Критерии включения: пациент должен соответствовать следующим критериям для включения в исследование: (1) гистологически подтвержденный диагноз инвазивной ВСС, включая следующие приемлемые гистологические подтипы ВСС: узловая, морфеаформная, метатипическая, поверхностная, микроузловая, инфильтративная, смешанная, базосквамозная, кератотическая, десмопластическая, (2) маловероятно, что пациенты получат пользу от дальнейшей терапии HHI из-за любого из следующего: (а) предшествующее прогрессирование заболевания на фоне терапии HHI или (b) непереносимость предшествующей терапии HHI, (с) нет большего улучшения, чем стабильное заболевание после 9 месяцев терапии HHI (исключая перерывы в лечении), (3) по меньшей мере 1 поражение, которое поддается измерению по критериям исследования (группа 1: максимальный диаметр ≥10 мм, группа 2: как максимальный диаметр, так и перпендикулярный диаметр ≥10 мм при измерении с помощью цифровой медицинской фотографии), (4) статус эффективности согласно шкале Восточной кооперативной онкологической группы (ECOG) ≤1, (5) не моложе 18 лет, (6) функция печени: (а) общий билирубин ≤1,5× верхней границы нормы (ULN) (или ≤3× TJLN, если метастазы в печень), (b) трансаминазы ≤3× ULN (или ≤5× ULN, если есть метастазы в печень), (с) щелочная фосфатаза (ALP) ≤2,5× ULN (или ≤5× ULN, если есть метастазы в печень или кости), (7) почечная функция: креатинин сыворотки ≤2× ULN или расчетный клиренс креатинина ≥35 мл/мин, (8) повышение уровня креатинфосфокиназы (СРК) ≤2 степени, (9) функция костного мозга: (а) гемоглобин ≥9,0 г/дл, (б) абсолютное количество нейтрофилов (ANC) ≥1,5 × 10⁹/л, (с) количество тромбоцитов ≥75 × 10⁹/л, (10) ожидаемая продолжительность жизни ≥12 недель, (11) согласие на предоставление архивного или вновь полученного опухолевого материала для центрального патологоанатомического исследования для подтверждения диагноза ВСС, (12) только группа 2 (неоперабельная местнораспространенная ВСС): пациенты должны согласиться на биопсию внешне видимых очагов ВСС на исходном уровне, в 1-й день цикла 22 (±3 рабочих дня), во время прогрессирования опухоли и в другие моменты времени, которые могут быть клинически показаны, (13) желание и возможность соблюдать посещения клиники и процедуры, связанные с исследованием, (14) информированное согласие до любых процедур скрининга, (15) только группа 2: пациенты должны считаться неоперабельными. Хирургическое вмешательство должно быть признано противопоказанным по мнению врача при дерматологическом обследовании, обследовании головы и шеи или обследовании пластического хирурга. Приемлемые противопоказания включают: (а) рецидив ВСС в одном и том же месте после 2 или более хирургических вмешательств и радикальная резекция рассматривается маловероятной, (b) ВСС со значительной местной инвазией, препятствующей полной резекции, (с) ВСС в анатомически сложных местах, при которых хирургическое вмешательство может привести к серьезному обезображиванию или дисфункции (например, удаление всей или части структуры лица, такой как нос, ухо или глаз, или необходимость ампутации конечности), (16) только группа 2: пациенты должны рассматриваться как не подходящие для лучевой терапии и должны соответствовать по меньшей мере 1 из следующих критериев: (а) ранее получали лучевую терапию по поводу ВСС, так что дальнейшая лучевая терапия превысит порог приемлемой кумулятивной дозы на онкологическое облучение, (b) опухоль вряд ли будет реагировать на терапию, (с) лучевая терапия считается противопоказанной, приемлемые противопоказания к лучевой терапии для пациентов, ранее не получавших лучевую терапию, включают: ВСС в анатомически сложных местах, для которых лучевая терапия будет связана с неприемлемым риском токсичности).

[00123] Критерии исключения: пациент, который соответствует любому из следующих критериев, исключается из исследования: (1) текущие или недавние (в течение 5 лет) признаки серьезного аутоиммунного заболевания, требующего лечения системными иммунодепрессантами, что может свидетельствовать о риске связанных с иммунной системой нежелательных явлений (irAE), за исключением: витилиго, детской астмы, которая была излечена, сахарного диабета 1 типа, остаточного гипотиреоза, требующего только заместительной гормональной терапии, или псориаза, не требующего системного лечения, (2) предшествующее лечение средством, которое блокирует путь PD-1/PD-L1, (3) предшествующее лечение другими системными иммуномодулирующими средствами менее чем за 28 дней до первой дозы цемиплимаба (например, терапевтические вакцины, лечение цитокинами или средства, нацеленные на цитотоксический Т-лимфоцит-ассоциированный антиген 4 (CTLA-4), 4-1ВВ (CD137) или ОХ-40), (4) метастазирование (метастазы) в головной мозг без лечения, которые можно считать активными, (5) дозы иммуносупрессивных корти ко стероидов (≥10 мг преднизолона в день или эквивалент) в течение 4 недель до первой дозы цемиплимаба, (6) активная инфекция, требующая терапии, включая положительные тесты на сывороточные антитела к вирус иммунодефицита человека (ВИЧ)-1 или ВИЧ-2, вирус гепатита В (HBV) или вирус гепатита С (HCV), (7) история пневмонии в течение последних 5 лет, (8) любое противораковое лечение, кроме лучевой терапии (химиотерапия, таргетная системная терапия, имиквимод, фотодинамической терапии), исследуемое или стандартное лечение в течение 30 дней после первоначального введения цемиплимаба или запланированное в течение периода исследования (пациенты, получающие бисфосфонаты или деносумаб, допускаются), (9) документированные аллергические реакции или острые реакции гиперчувствительности, связанные с лечением антителами в анамнезе, (10) пациенты с аллергией или повышенной чувствительностью к цемиплимабу или любому из вспомогательных веществ, (11) сопутствующее злокачественное новообразование, отличное от ВСС, и/или злокачественное новообразование, отличное от ВСС, в анамнезе в течение 3 лет после даты введения первой запланированной дозы цемиплимаба, за исключением опухолей с незначительным риском метастазирования или смерти, таких как адекватно пролеченный CSCC кожи, карцинома in situ шейки матки, или протоковая карцинома in situ молочной железы, или аденокарцинома предстательной железы на ранней стадии низкого риска (Т1-Т2а N0M0 и оценка по шкале Глисона <6 и PSA <10 нг/мл), для которых планом лечения является активное наблюдение, или аденокарцинома предстательной железы с только биохимическим рецидивом с задокументированным временем удвоения PSA >12 месяцев, для которой планом лечения является активное наблюдение (D'Amico 2005, Pham 2016), (12) любые острые или хронические психические проблемы, которые лишают пациента права на участие, (13) пациенты с трансплантацией солидных органов в анамнезе, (14) любое сопутствующее заболевание, результаты медицинского обследования, или метаболическая дисфункция, или отклонения клинических лабораторных анализов, которые делают пациента непригодным для участия, (15) отсутствие возможности пройти какую-либо рентгенологическую оценку ответа с контрастным усилением, (16) грудное вскармливание, (17) положительный сывороточный тест на беременность, (18) получение живых вакцин (в том числе аттенуированных) в течение 30 дней после первого исследуемого лечения, (19) женщины детородного возраста (WOCBP) или ведущие половую жизнь мужчины, которые не желают применять высокоэффективную контрацепцию до начальной дозы/начала первого лечения, во время исследования и в течение по меньшей мере 6 месяцев после последней дозы, (20) предшествующее лечение иделалисибом.

Исследуемое лечение

[00124] Немаскированный цемиплимаб поставляли в виде жидкости в стерильных одноразовых флаконах. Каждый флакон содержал цемиплимаб при концентрации 50 мг/мл. Цемиплимаб вводили в амбулаторных условиях в виде внутривенной инфузии в течение 30 минут (±10 минут). Каждому пациенту вводили дозу в виде фиксированной дозы 350 мг каждые 3 недели. Премедикацию для первой дозы цемиплимаба не проводили.

Сопутствующие лекарственные средства и процедуры

[00125] Во время участия в исследовании пациент не может получать какой-либо стандартный или исследуемый препарат для лечения опухоли помимо цемиплимаба в качестве монотерапии. Для пациентов с местнораспространенными целевыми поражениями, которые считались неоперабельными на исходном уровне, но впоследствии рассмотрены как операбельные в ходе исследования из-за реакции опухоли на цемиплимаб, может быть разрешена хирургическая операция с лечебной целью. Полагают, что пациенты с неоперабельной ВСС на исходном уровне, которая стала операбельными с четкими границами, показали PR. Лучевая терапия не является частью схемы исследования.

Конечные точки исследования

[00126] Первичной конечной точкой эффективности в этом исследовании является ORR, которую оценивали отдельно для пациентов с метастатической ВСС (группа 1) или неоперабельной местнораспространенной ВСС (группа 2). Для пациентов в группе 1 (метастатическая ВСС) ORR определяли по критериям оценки ответа при солидных опухолях (RECIST) версии 1.1 для висцеральных поражений или по модифицированным критериям ВОЗ для поражений кожи, или по комбинированным критериям ответа для пациентов с висцеральными и кожными поражениями. Критерии клинического ответа можно использовать для пациентов с внешне видимыми целевыми поражениями, если все метастатические поражения не поддаются измерению с помощью RECIST (что может произойти у пациентов с метастазами только в кости). Для пациентов 2-й группы (неоперабельная местнораспространенная ВСС) для определения ORR использовали клинические критерии. Составные критерии ответа использовали для пациентов с поражениями, которые поддавались измерению как по критериям клинического ответа, так и согласно RECIST 1.1.

[00127] Вторичными конечными точками являются: объективный ответ, продолжительность ответа, определяемая как время между первым измерением полного или частичного ответа и первой датой рецидива, или прогрессирования заболевания, или смерти, PFS, определяемая как время между началом лечения и первой датой рецидива, или прогрессирования заболевания, или смерти по любой причине, ОС, определяемая как время между началом лечения и смертью от любой причины, частота CR, изменение оценок результатов, о которых сообщают пациенты в опросниках EORTC QLQ-C30 и Skindex-16, нежелательные явления (НЯ), концентрации цемиплимаба в сыворотке крови, антитела против цемиплимаба, доля пациентов, достигших наилучшего ответа CR, время до ответа, определяемое как время между началом лечения и первым лучшим ответом полного или частичного ответа (в зависимости от того, что наступит раньше), а также безопасность и переносимость цемиплимаба. Вторичные конечные точки эффективности, DOR, PFS и OS, оценивали с использованием метода Каплана-Мейера (КМ).

[00128] Дополнительные вторичные показатели результата включали контроль заболевания, определяемый как доля пациентов с лучшим ответом полного ответа, частичного ответа, стабильного заболевания, или нечастичного ответа, или непрогрессирующего заболевания при первой оценке поддающейся оценке опухоли, запланированной на неделю 9 (определяется как 56 дней с учетом окон посещения в протоколе), и устойчивый контроль заболевания, определяемый как доля пациентов без прогрессирования заболевания в течение как минимум 182 дней.

[00129] Были запланированы следующие исследовательские анализы: связь между несинонимичной мутационной нагрузкой опухоли на исходном уровне и эффективностью цемиплимаба, фармакодинамические изменения, сравнение исходной биопсии и биопсии в ходе лечения: изменения в экспрессии мРНК опухоли, изменения количества TIL (Т-клетки CD8+, Т-клетки CD4+, Т-регуляторные клетки и, если позволяют ткани, другие подтипы, такие как В-клетки, клетки миелоидного происхождения, NK-клетки и т.д.) и описательные изменения в распределении TIL по отношению к опухолевой ткани и строме, изменение уровней экспрессии (мРНК и/или белка) PD-L1, GITR и LAG-3 и, возможно, других модуляторов контрольных точек, изменение числа и типа генетических мутаций в известных онкогенах и потенциальных опухолевых неоантигенах.

Критерии ответа

[00130] Полный ответ (CR): Исчезновение всех поражений-мишеней. Любые патологические лимфатические узлы (целевые или нецелевые) должны иметь уменьшение по короткой оси до <10 мм (<1 см).

[00131] Частичный ответ (PR): уменьшение суммы диаметров целевых поражений на по меньшей мере 30%, принимая в качестве эталона исходные суммарные диаметры.

[00132] Прогрессирующее заболевание (PD): Увеличение суммы диаметров целевых поражений на по меньшей мере 20%, принимая за эталон наименьшую сумму в исследовании (включая исходную сумму, если она является наименьшей в исследовании). Помимо относительного увеличения на 20%, сумма также должна демонстрировать абсолютное увеличение на по меньшей мере 5 мм (0,5 см).

[00133] Стабильное заболевание (SD): нет ни достаточного уменьшения, чтобы квалифицировать как PR, ни достаточного увеличения, чтобы квалифицировать как PD, принимая в качестве эталона наименьшие суммарные диаметры в ходе исследования.

Процедуры и оценки

[00134] Визуализация опухоли (компьютерная томография [КТ] или магнитно-резонансная томография [МРТ]) и цифровая медицинская фотография (для внешне видимых поражений) были выполнены для измерения опухолевой массы и характеристики профиля эффективности исследуемого лечения с использованием критериев ответа. Медицинское обследование, лабораторные тесты, основные показатели жизнедеятельности, электрокардиограмма (ЭКГ), тест на беременность для женщин детородного возраста, а также регистрацию нежелательных явлений и сопутствующих лекарственных средств выполняли для обеспечения безопасности пациентов и характеристики профилей безопасности исследуемого лечения. Другие оценки включали: образцы крови для РК, Образцы крови для оценки антител к цемиплимабу, биопсии опухолей, биомаркеры, оценки качества жизни.

[00135] Исходные оценки включали цифровую медицинскую фотографию и рентгенологическую визуализацию (компьютерную томографию [КТ] или магнитно-резонансную томографию) всех пораженных участков. КТ грудной клетки требовалось в период скрининга, чтобы исключить метастатическое заболевание. Для оценки опухоли в конце каждого цикла лечения предпочтительно проводили повторение одних и тех же фотографических и рентгенологических оценок, выполненных в начале исследования. Однако в тех случаях, когда исходная визуализация (фотография и радиология) показывала, что заболевание было всесторонне оценено одним способом (фотография или радиология), после исходной оценки могла быть только фотография (или радиология). Для того, чтобы установить CR, требовалась биопсия регрессировавшего целевого поражения с регистрацией отрицательной гистологии. Все ответы должны были быть подтверждены двумя отдельными оценками опухоли с интервалом по меньшей мере 4 недели. Если последняя оценка опухоли перед прекращением сбора данных была первым документальным подтверждением ответа, централизованно просматриваемая оценка опухоли после прекращения сбора данных позволяла подтвердить статус ответа. Нежелательные явления и отклонения лабораторных показателей классифицировали в соответствии с Общими терминологическими критериями нежелательных явлений Национального института рака, версия 4.03.

[00136] ORR определяли как CR+ частичный ответ (PR). После любого объективного ответа подтверждающую цифровую фотографию (и рентгенологическую визуализацию, если ее проводили как часть начальной оценки ответа) получали по меньшей мере через 4 недели после первоначального документирования объективного ответа.

[00137] Опухоли до лечения использовали для изучения потенциальных биомаркеров, включая экспрессию выбранных белков (PD-L1, главный комплекс гистосовместимости класса I [MHC-I]) с помощью иммуногистохимии (ШС) и мутационную нагрузку опухоли (ТМВ). Для того, чтобы объяснить потенциальные механизмы связи уклонения от иммунного надзора между процентом опухолевых клеток, положительных в отношении экспрессии MHC-I, и объективным ответом, проводили оценки в опухолях с высокой и низкой ТМВ (≥10 и <10 мутаций/Мб, соответственно). Оценка экспрессии MHC-I была основана на количественном анализе изображений, а процент положительных в отношении MHC-I результатов вычисляли как количество опухолевых клеток, положительных в отношении MHC-I, поделенное на общее количество опухолевых клеток, умноженное на 100.

Экспрессия PD-L1 и ТМВ

[00138] Уровень экспрессии PD-L1 оценивали с помощью иммуногистохимического анализа PD-L1 (ШС) 22С3 (Dako, Agilent, Santa Clara, CA) в фиксированных формалином образцах биопсии, залитых парафином (FFPE), полученных до терапии цемиплимабом. Уровень экспрессии количественно определяли как процент опухолевых клеток с обнаруживаемым окрашиванием мембраны PD-L1 (показатель пропорции опухоли [TPS]). Опухолевую мутационную нагрузку (ТМВ) оценивали в образцах ДНК, извлеченных из биопсий опухоли FFPE, с использованием аналитически валидированного TruSight Oncology 500 (Illumina Inc., San Diego, CA) для обнаружения однонуклеотидных вариантов (SNV), вставок и делеций (инделей) и изменения количества копий (CNV) в 500 генах и выбранных наборах генных перестроек. ТМВ вычисляли как общее количество соматических SNV и инделей в кодирующих областях генов-мишеней на мегабазу анализируемой геномной последовательности. Все соматические мутации отфильтровывали, чтобы исключить варианты зародышевой линии и онкогенного драйверного гена, согласно сравнениям общедоступных баз данных. Протокол анализа включал добавление нуклеотидных штрих-кодов уникального молекулярного идентификатора (UMI) во время создания библиотеки секвенирования. Обнаружение UMI использовали для идентификации прочтений последовательности из комплементарных цепей ДНК, чтобы уменьшить влияние артефактов дезаминирования ДНК FFPE на вызов мутационных вариантов.

Мультиплексный анализ IHC

[00139] Полностью автоматизированный мультиплексный анализ ШС проводили на платформе Ventana Discovery ULTRA (Ventana Medical Systems, Tucson, AZ) и как описано ранее (Zhang et al., 2017, Laboratory Investigation, 873-885). Проводили пять циклов последовательного применения первичных антител и вторичных антител, конъюгированных с пероксидазой хрена. Денатурацию нагреванием между каждым циклом для полного удаления связанных первичных и вторичных антител проводили для устранения последующей перекрестной реактивности. Это позволило использовать первичные антитела, вызванные у одного и того же вида.

[00140] Используемые флуоресцентные красители тщательно отбирали для обеспечения спектрального разделения и обеспечения оптимального окрашивания. Комбинацию и порядок применения первичного антитела и тирамид-флуорофора оптимизировали для обеспечения того, чтобы как эпитоп, так и флуорофор могли выдерживать повторяющиеся стадии тепловой денатурации.

[00141] Анализ оптимизировали для конкретных показаний опухоли. Определяли оптимальные концентрации каждого антитела, и их применяли в следующей последовательности и обнаруживали с помощью указанного флуорофора: (1) мышиное анти-MHCII (АВСАМ, Clone CR3/43) обнаруживали с помощью DISCOVERY Rhodamine 6G. Мышиное анти-PAN CK (Ventana, Clone АЕ1/АЕЗ/РСК26) обнаруживали с помощью DISCOVERY DCC, (2) кроличье анти-CD11c (АВАСМ, клон EP1347Y) обнаруживали с помощью DISCOVERY Rhodamine 610, (3) кроличье анти-MHCI (АВСАМ, Clone SP239) обнаруживали с помощью DISCOVERY Су5, (4) кроличье анти-В2М (АВСАМ, Clone EPR217520214) обнаруживали с помощью DISCOVERY FAM.

[00142] После окрашивания ткань контрастно окрашивали и покрывали покровным стеклом Invitrogen ProLong Gold Antifade Mountant с NucBlue. Визуализацию всего предметного стекла выполняли на Zeiss Axioscan, который был оснащен источником света Colibri и соответствующими фильтрами для визуализации этих специфических флуорофоров. Анализ изображений проводили с использованием программных модулей HALO Indica Labs (Indica Labs, Albuquerque, NM).

[00143] Долю МНС-положительных клеток в каждой области опухоли оценивали с помощью программного обеспечения для анализа изображений HALO. Области опухоли разграничивали, а отдельные клетки идентифицировали с помощью окрашивания Dapi. Общее количество опухолевых клеток определяли путем исследования клеток, положительных в отношении Dapi и рапСК. Затем вычисляли долю MHC-I-положительных опухолевых клеток как процент Dapi-panCK и МНС-1-положи тельных клеток от общего числа опухолевых клеток (Dapi и рапСК-положительных).

Результаты (группа 2): пациенты, страдающие местнораспространенной ВСС (laBCC)

[00144] Характеристики пациентов. Представленные в настоящем документе результаты основаны на 84 включенных пациентах с laBCC, 56 (66%) мужчин, средний возраст составлял 70 лет (диапазон 42-89 лет). Первичной локализацией опухоли были голова и шея у 75 (89%), туловище у семи (8%) и конечности у двух (2%) пациентов. См. Таблицу 1. На момент окончания сбора данных 19 пациентов продолжали лечение, 13 пациентов завершили запланированное лечение (93 недели) и 52 пациента прекратили лечение, в основном из-за прогрессирования заболевания (n=29). Среднее количество введенных доз составило 15 (диапазон 1-31). Средняя продолжительность воздействия составила 47 недель (2-94). Средняя продолжительность наблюдения составила 15 месяцев (диапазон 0,5-25). Зарегистрированные пациенты с laBCC показали прогрессирование на фоне терапии HHI или непереносимость предшествующей терапии HHI. Пациенты не были кандидатами на дальнейшую терапию HHI из-за прогрессирования заболевания, или непереносимости предшествующей терапии HHI, или наличия не более чем стабильного состояния после 9 месяцев терапии HHI, и имели по меньшей мере одно исходное поражение, которое можно было измерить цифровой медицинской фотографией в соответствии с модифицированными критериями ВОЗ или рентгенологической визуализацией (КТ или МРТ) в соответствии с критериями RECIST 1.1. Пациенты не были кандидатами на лечебную хирургию или лечебную лучевую терапию.

[00145] Клиническая эффективность: как показано в таблице 2, ORR составила 31% (95% доверительный интервал (CI) 21-42), включая пять (6%) CR. Медианное время о возникновения ответа составило 4,3 месяца (диапазон 4,2-7,2). Частоту контроля заболевания наблюдали у 67 из 84 пациентов, 80% (95% CI, 70-88), а частота стабильного контроля заболевания составила 60% (95% CI 48-70), как наблюдали у 50 пациентов. Медиана DOR не была достигнута на момент прекращения сбора данных. Оценки КМ для DOR через 6 и 12 месяцев составили 91% (95% CI, 68-98) и 85% (95% CI, 61-95), соответственно.

Данные представляют собой n (%, 95% CI), n (%), медиана (IQR) или диапазон (где указано). *Объективный ответ согласно независимому центральному обзору включает два частичных ответа, которые показаны при оценке опухоли до прекращения сбора данных и были подтверждены оценками опухоли, проведенными после прекращения сбора данных.

^aORR включает два частичных ответа, которые показаны при оценке опухоли до прекращения сбора данных и были подтверждены оценками опухоли, проведенными после прекращения сбора данных.

ORR наблюдали у 27 или 84 пациентов, 32% (95% CI, 22-43), включая пять (6%) полных ответов и 22 (26%) частичных ответов.

^bИз восьми пациентов, которые не подлежали оценке, у четырех не было никаких оценок опухоли после исходного уровня. У трех пациентов не было обнаружено поражений, поддающихся оценке ни с помощью фотографических, ни с помощью рентгенологических способов оценки. У одного пациента было второе целевое поражение, которое не отображалось после исходного уровня.

^сОпределяется как доля пациентов с CR, PR, SD или нет-PR/нет-PD при первой оценке поддающейся оценке опухоли, запланированной на 9-ю неделю (определяется как 56 дней с учетом окон посещения в протоколе).

^dПредставленные данные относятся к пациентам с подтвержденным полным или частичным ответом, продолжительность ответа вычисляли для всех пациентов с подтвержденным ответом до прекращения сбора данных.

[00146] На фиг. 1 приведены графики «дорожек бассейна», которые отображают как время до возникновения ответа, так и продолжительность ответа у 26 пациентов с местнораспространенной ВСС.На этом чертеже закрашенная стрелка указывает на то, что пациент все еще находится на лечении, а незакрашенная стрелка указывает на то, что пациент все еще находится на исследовании. Каждая горизонтальная полоса представляет одного пациента. Среди 26 пациентов с подтвержденным ответом на момент окончания сбора данных только у пяти были признаки последующего прогрессирования заболевания. Многие реакции со временем углубляются. Медиана оценки Каплана-Мейера (КМ) выживаемости без прогрессирования заболевания (PFS) составила 19 месяцев (95% доверительный интервал (DI), от 9 до не поддаются оценке). Оцененная согласно КМ вероятность PFS 12 месяцев составила 57% (95% DI 44-67), оцененная согласно КМ вероятность PFS 6 месяцев составила 76% (95% DI, 65-84). При анализе подгрупп эффективность была одинаковой независимо от исходных характеристик, включая причину прекращения предшествующей терапии HHI.

[00147] На фиг. 2 показано, что оцененная OS (месяцы) не была достигнута (95% CI, NE, NE), и вычисленная вероятность выживания 12 месяцев составила 92,3% (95% DI, 83,6, 96,5). На фиг. 3 показано, что вычисленная PFS (месяцы) составила 19,3 (95%, 8,6, NE). Вычисленная PFS 6 месяцев составила 76% (95% DI, 65 84), а вычисленная PFS 12 месяцев составила 56,5% (95% CI, 44,3, 67,0).

[00148] На фиг. 4 показано, что оценки КМ для продолжительности ответа через 6 и 12 месяцев составили 91% (95% CI 68-98) и 85% (95% CI 61-95), соответственно. На фиг. 5 показано, что оценка КМ для медианы PFS составила 17 месяцев (95% CI 10-19), вероятность PFS через 6 месяцев составила 85% (95% CI 74-91), а вероятность PFS через 12 месяцев составила 59% (95% CI 47-70).

[00149] На фиг. 6 показаны оценки ОС по КМ, при этом медиана ОС не была достигнута на момент прекращения сбора данных. По оценкам КМ, доля пациентов, живущих через 2 года, составила 80% (95% CI 63-90).

[00150] Таблица 3 показывает, что при анализе подгрупп клиническая активность была одинаковой независимо от исходных характеристик.

[00151] Биомаркеры: Исходные образцы опухолей оценивали на PD-L1 IHC у 50 (60%) из 84, на ТМВ у 56 (66%) из 84 пациентов и на IHC MHC-I у 44 (52%) из 84 пациентов. У некоторых пациентов с высоким ТМВ, у которых не было объективных ответов, уровень экспрессии MHC-I в опухолевых клетках был низким или отсутствовал. ORR составил 26% (95% CI, 13-43) у 35 пациентов с PD-L11% и 27% (95% CI, 8-55) у 15 пациентов с PD-L1 ≥1%, как показано в таблице. 4. Объективные ответы наблюдали у пациентов независимо от исходного уровня PD-L1.

[00152] Медиана ТМВ составила 58,2 мутаций/Мб и 23,5 мутаций/Мб среди ответивших (PR или CR) и неответивших пациентов, соответственно, как показано на фиг. 7. На этом чертеже показана ТМВ для респондеров (полный или частичный ответ) по сравнению с нереспондерами (стабильное заболевание, прогрессирующее заболевание или не поддающееся оценке). Линии в каждом прямоугольнике обозначают медиану, нижняя и верхняя границы прямоугольника обозначают нижний квартиль и верхний квартиль (IQR) соответственно, а верхние и нижние усы указывают максимальное (Q3+1,5*IQR) и минимальное (Q1 - 1,5*IQR) значения, соответственно. Отдельные пациенты обозначены незаштрихованными кружками. Открытые круги за усами являются исключениями.

[00153] Не все пациенты с опухолями с высокой ТМВ показали ответ на лечение, а некоторые пациенты с опухолями с низкой ТМВ показали ответ на лечение, как показано на фиг. 8. На этом чертеже показана ТМВ для пациентов, у которых был достигнут устойчивый контроль заболевания (пациенты без прогрессирования заболевания в течение по меньшей мере 182 дней) по сравнению с теми, у которых такой контроль не был достигнут. Линии в каждом прямоугольнике обозначают медиану, нижняя и верхняя границы прямоугольника обозначают нижний квартиль и верхний квартиль (IQR) соответственно, а верхние и нижние усы указывают максимальное (Q3 + 1,5*IQR) и минимальное (Q1 - 1,5*IQR) значения, соответственно. Отдельные пациенты обозначены незаштрихованными кружками. Открытые круги за усами являются исключениями.

[00154] При использовании порогового значения 10 мутаций/Мб 21 человек (9 респондеров, 12 нереспондеров) находились в группе с высокой ТМВ и имели поддающуюся оценке выборку для тестирования MHC-I. В этой группе с высокой ТМВ медиана доли опухолевых клеток, положительных в отношении экспрессии MHC-I, составляла 39% (Q1-Q3, 23-48%) и 5% (Q1-Q3, 3-12%) у респондеров и нереспондеров, соответственно. В группе с низкой ТМВ (<10 мутаций/Мб) доля опухолевых клеток, положительных в отношении МНС-I, составляла 77% у одного респондента и медиану 47% (Q1-Q3, 29-69%) среди четырех нереспондеров.

[00155] Эти результаты показаны на фиг. 9, на котором изображен 21 пациент (9 респондеров и 12 нереспондеров) в группе с высокой ТМВ (≥10 мутаций/Мб) и 5 пациентов (один респондер и четыре нереспондера) в группе с низкой ТМВ (<10 мутаций/Мб). Горизонтальная прерывистая линия указывает на порог клинически значимого изменения. В группе с высокой ТМВ (≥10 мутаций/Мб) респондеры показали медиану 38,6% опухолевых клеток MHC-I (+), а нереспондеры показали медиану 5,1% опухолевых клеток MHC-I (+) (фиг. 9).

[00156] Связь между экспрессией MHC-I и ORR также наблюдали, если высокую ТМВ определяли как превышающую общую медиану 34,6 мутаций/Мб, как показано на фиг. 10. На этом чертеже медиана ТМВ была выше у респондеров по сравнению с нереспондерами в группе с высокой ТМВ (>10 мутаций/Мб, фиг. 9). Эта общая тенденция сохранялась, когда высокую ТМВ определяли как превышающую медиану 34,6 мутаций/Мб. Также получили репрезентативные примеры положительного и отрицательного окрашивания MHC-I в образцах до лечения, полученных у исследуемых пациентов, включая пациента с полным ответом (ТМВ: 67,398 мутаций/Мб) и пациента с прогрессирующим заболеванием (ТМВ: 81,432 мутаций/Мб).

[00157] Нежелательные явления. Наиболее частыми нежелательными явлениями любой степени, независимо от функции, были утомляемость (30%), диарея (24%), зуд (21%) и астения (20%). НЯ≥3 степени возникали у 51% пациентов. Наиболее частыми НЯ степени ≥3, встречающимися у≥3 пациентов, были артериальная гипертензия (n=4, 5%) и утомляемость, инфекция мочевыводящих путей и нарушение зрения (каждое n=3, 4%). Четырнадцать пациентов (17%) прекратили лечение из-за НЯ.

[00158] Наиболее частые НЯ, связанные с лечением (TRAE), включали утомляемость (n=21, 25%), зуд (n=12, 14%) и астению (n=12, 14%). TRAE≥3 степени возникали у 20% пациентов. Наиболее частыми ТРАЕ степени ≥3 были утомляемость, колит, аутоиммунный колит и надпочечниковая недостаточность (n=2 каждого). Девять пациентов (11%) прекратили лечение из-за ТРАЕ.

[00159] Летальных исходов, связанных с лечением, не было. Сообщалось о трех случаях смерти из-за нежелательных явлений, возникших на фоне лечения, которые считали связанными с интеркуррентными медицинскими проблемами. Они включали женщину в возрасте 55 лет с новой внутричерепной саркомой, возникшей в результате трансформации известной менингиомы, мужчину в возрасте 85 лет с острой почечной недостаточностью на фоне подозрения на септическую пневмонию, и мужчину в возрасте 73 года с недостаточным питанием в анамнезе, умершего из-за кахексии.

[00160] Выявленные irAE имели место у 21 (25%) пациента. Наиболее частыми были гипотиреоз и иммуноассоциированный колит, возникшие у 8 (10%) и 5 (6%) пациентов соответственно. irAE были 3 степени у 10% (n=8) пациентов. Следующие irAE 3-й степени встречались у>1 пациента: иммуноассоциированный колит (n=3), надпочечниковая недостаточность (n=2). IRAE 4-й и 5-й степени отсутствовали.

Обсуждение

[00161] Исследования блокады иммунных контрольных точек при меланоме сопровождались демонстрацией того, что блокада PD-1/PD-L1 является высокоактивной терапией против распространенного CSCC и карциномы Меркеля (Barrios et al., J Am Acad Dermatol, May 2020). Для пациентов, страдающих laBCC, не существует эффективной терапии после терапии HHI первой линии. Базовое исследование, описанное выше, показывает клинически значимую противоопухолевую активность у пациентов, страдающих laBCC, в условиях второй линии (или более высокой). Изученная ORR центрально составляет 31% (95% DI, 21-42%). Вычисленная DOR превысила 1 год у 85% респондентов. Профиль безопасности соответствует тому, что известно для класса анти-PD-1/PD-L1.

[00162] Результаты настоящего исследования заполняют давний пробел в отношении отсутствия вариантов лечения пациентов, страдающих laBCC, после терапии HHI первой линии. Объективные ответы на терапию HHI наблюдаются приблизительно у половины пациентов, страдающих laBCC, но у большинства из них не достигается CR (Dummer et al., 2020, BrJDermatol, 182:1369-78, Sekulic etal., 2015, JAm Acad Dermatol, 72:1021-26 e8). Среди тех пациентов, которые ответили на терапию HHI, средняя продолжительность ответа составила 26 месяцев, что подчеркивает развитие резистентности к терапии HHI, ведущее к потере ответа (Sekulic et al., 2017, ВМС Cancer, 17:332, Dummer et al., 2020, Br J Dermatol, 182:1369-78). Токсичность класса HHI включает дисгевзию, мышечные спазмы и алопецию. Хотя токсичность была наиболее распространенной причиной прекращения лечения в крупнейших проспективных исследованиях висмодегиба (Basset-Seguin et al., 2017, Eur J Cancer, 86:334-48, Dreno et al., 2017, Lancet Oncol, 18:404-12), наиболее распространенной причиной прекращения предшествующей терапии HHI в текущем исследовании было прогрессирование заболевания. Таким образом, популяция пациентов, включенных в это исследование цемиплимаба, представляет собой очевидную неудовлетворенную потребность. Это первая демонстрация клинической пользы любой системной терапии у пациентов, страдающих laBCC, после HHI.

[00163] Клинически значимая эффективность цемиплимаба как при ВСС, так и при CSCC согласуется с общими клиническими и молекулярными характеристиками этих карцином на основе кераноцитов (Nehal et al., 2018, N Engl J Med, 379:363-74). Однако ORR в этом исследовании (31%) ниже, чем у пациентов с распространенным CSCC, получавших цемиплимаб (46%) (Rischin et al., 2020, J Immunother Cancer, 8:e000775). Исследование BCC относится к лечению в условиях второй линии (или выше), в то время как 66% (128/193) пациентов с распространенным CSCC получали цемиплимаб в качестве лечения в условиях первой линии. В условиях второй линии ORR для цемиплимаба при лечении распространенного CSCC составляла 42% (Rischin et al., 2020).

[00164] Кинетика ответа на цемиплимаб при ВСС медленнее, чем при CSCC. Среднее время до возникновения ответа составляет 2 месяца у пациентов с распространенным CSCC, получавших цемиплимаб (Rischin et al., 2020), но в этом исследовании оно составляет 4 месяца (диапазон от 2 до 13). Ответы на цемиплимаб при обоих типах опухолей демонстрируют устойчивость, что убедительно установлено при длительном наблюдении в исследовании CSCC. Некоторые PR превращаются в CR у пациентов с CSCC. При самом последнем обновлении базового исследования CSCC группа с самым длительным периодом наблюдения (группа 1, медиана наблюдения 19 месяцев) имела частоту CR 20% по сравнению с 7% во время первичного анализа, когда медиана периода наблюдения составил 8 месяцев (Rischin et al., 2020). В этом исследовании продолжается активное наблюдение за пациентами, страдающими laBCC, и некоторые из текущих PR могут превратиться в CR при продолжении наблюдения.

[00165] Медиана ТМВ была выше у респондеров, страдающих laBCC, чем у нереспондеров, получавших лечение цемиплимабом. Не все пациенты с высокой ТМВ показали ответ, что поднимает вопрос о том, как некоторые laBCC с высокой ТМВ могут уклоняться от иммунного ответа. Понижающая регуляция экспрессии MHC-I более характерна для ВСС, чем для CSCC (Walters et al., 2010, Clin Cancer Res, 14:3562-70), что побуждает к прямому исследованию этого механизма. Авторы настоящего изобретения обнаружили, что экспрессия MHC-I была значительно снижена у нереспондеров по сравнению с респондерами в подгруппе с высокой ТМВ. Хотя подавление MHC-I происходит при широком спектре видов рака, существуют отчеты о случаях и ретроспективные исследования, описывающие потенциально худшие клинические исходы при опухолях, которые с его понижающей регуляцией (Yoo et al., 2019, Sci Rep, 9:7680, Garrido et al., 2016, Curr Opin Immunol, 39:44-51), это первое описание понижающей регуляции MHC-I как механизма уклонения от иммунитета в ходе терапии против PD1 в проспективном клиническом исследовании любого типа солидной опухоли.

[00166] Возникает новая парадигма, согласно которой клиническая активность иммунотерапии наиболее высока при ее применении на ранних стадиях естественного течения рака (Topalian et al., 2020, Science, 367). Комбинация блокады PD-1 с HHI в условиях ВСС первой линии может быть подходящей для будущих клинических исследований. В доклинических исследованиях блокада передачи сигнала Smoothened может ингибировать образование иммунологического синапса (de la Roche et al., 2013, Science, 342:1247-50), a пилотное исследование комбинации висмодегиб + пембролизумаб не выявило аддитивной клинической активности (Chang et al., 2019, JAm Acad Dermatol, 80:564-66). Последовательная терапия (терапия HHI с последующей блокадой PD-1) может быть предпочтительнее, что согласуется с предварительными данными о том, что HHI нарушают иммунную привилегию при ВСС (Otsuka et al., 2015, J Dermatol Sci, 78:95-100).

[00167] В заключение, приведенные выше результаты показывают, что цемиплимаб является первым системным препаратом, демонстрирующим клиническую пользу, включая устойчивый ответ у пациентов, страдающих laBCC, в условиях второй линии (или более высокой) после терапии HHI с ORR 31% и оцененной вероятностью выживания 12 месяцев 92,3%.

Результаты (группа 1): пациенты, страдающие метастатической ВСС (mBCC )

[00168] Характеристики пациентов. Представленные в настоящем документе результаты основаны на данных о 28 пациентах, страдающих mBCC , включенных в исследование, включая пациентов, за которыми можно было наблюдать в течение приблизительно 57 недель, с получением ORR с 95% доверительным интервалом (CI). Из 28 пациентов, страдающих mBCC , 82,1% составляли мужчины, а средний возраст составлял 65,5 лет (диапазон 38-90 лет). См. Таблицу 5.

[00169] Клиническая эффективность. Как показано в Таблице 6, ORR составила 21,4% (95% DI, 8,3-41,0), у шести пациентов наблюдался частичный ответ.ORR по оценке исследователя составила 28,6% (95% CI, 13,2-48,7).

[00170] На фиг. 11 приведены графики «дорожек бассейна», которые отображают как время до возникновения ответа, так и продолжительность ответа у 6 пациентов с местнораспространенной ВСС. На этом чертеже закрашенная стрелка указывает на то, что пациент все еще находится на лечении, а незакрашенная стрелка указывает на то, что пациент все еще находится на исследовании. Каждая горизонтальная полоса представляет одного пациента. Частота контроля заболевания составила 67,9% (95% CI, 47,6-84,1). Частота стабильного контроля заболевания составила 46,4% (95% CI, 27,5-66,1). Среди респондеров медианное время возникновения ответа на ICR составило 3,2 месяца (диапазон, 2.1-10.5). Наблюдаемая продолжительность ответа (DOR) составила 9-23 месяца. Все шесть ответов наблюдали с продолжительностью по меньшей мере 8 месяцев, продолжительность ответа (DOR) составила 9-23 месяца. Все шесть ответов наблюдали с продолжительностью по меньшей мере 8 месяцев. Медиана DOR не была достигнута.

[00171] Как показано на фиг. 12, оценка согласно медиане Каплана-Мейера (КМ) для OS составила 25,7 месяца (95% CI, 19,5 - не подлежат оценке [NE]). Как показано на фиг. 13, оценка согласно медиане Каплана-Мейера (КМ) для PFS составила 8,3 месяца. (95% CI, 3,6-19,5).

[00172] Нежелательные явления, возникающие при лечении (ТЕЛЕ). ТЕАЕ любой степени развились у 26 (92,9%) пациентов. Наиболее распространенными ТЕАЕ независимо от функции были утомляемость (50,0%), диарея (35,7%), кожный зуд (25,0%), и запор (25,0%). ТЕАЕ≥3 степени наблюдали у 12 (42,9%) пациентов. Артериальная гипертензия (n=2) была единственным ТЕАЕ степени ≥3, независимо от функции, встречающихся у≥2 пациентов. ТЕАЕ, приведшие к летальному исходу, произошли у одного (3,6%) пациента, умершего от стафилококковой пневмонии, не связанной с исследуемым лечением. Связанные с лечением нежелательные явления (TRAE) любой степени тяжести наблюдали у 22 (78,6%) пациентов. Наиболее частыми ТЕАЕ, независимо от функции, были утомляемость (42,9%), зуд (25,0%) и артралгия (17,9%). ТЕАЕ ≥3 степени наблюдали у пяти (17,9%) пациентов. Имели место выявленные нежелательные явления, связанные с иммунитетом (irAE) любой степени тяжести у восьми (28,6%) пациентов. Наиболее часто выявляемыми IRAE независимо от функции были аутоиммунный гепатит, колит, гипотиреоз и пневмония (7,1% каждое). Идентифицированные irAE ≥3 степени наблюдали у одного (3,6%) пациента. Единственным выявленным irAE степени ≥3 был колит (3,6%).

[00173] В заключение, раскрытые в настоящем документе результаты показывают, что цемиплимаб является первым средством, обеспечивающим клинически значимую противоопухолевую активность, в том числе стабильные ответы, у пациентов, страдающих mBCC , после прогрессирования или непереносимости терапии HHI. Цемиплимаб хорошо переносится, и его профиль безопасности согласуется с предыдущими сообщениями о применении цемиплимаба при других типах опухолей. В сочетании с данными для группы laBCC эти результаты подтверждают высокую активность цемиплимаба при распространенных опухолях ВСС. Кроме того, ожидается, что введение цемиплимаба приводит к усиленной регрессии опухоли у пациентов с другими типами опухолей рака кожи, которые демонстрируют пороговые уровни экспрессии ТМВ и МНС, как обсуждается в настоящем документе, включая пациентов, которые показали прогрессирование заболевания на фоне терапии HHI или непереносимость терапии HHI, что позволяет таким пациентам достигать большего частичного ответа и полного ответа, а также значительно увеличить выживаемость без прогрессирования и общую частоту ответа по сравнению с пациентами с опухолями рака кожи, которые не проявляют пороговые уровни ТМВ и МНС, указанные в настоящем документе.

Ссылочные источники

[00174] 1. Puig S, Berrocal A. Management of high-risk and advanced basal cell carcinoma. Clin Transl Oncol 2015; 17:497-503.

[00175] 2. Wu S, Han J, Li W-Q, Li T, Qureshi AA. Basal-cell carcinoma incidence and associated risk factors in US women and men. Am J Epidemiol 2013; 178:890-97.

[00176] 3. Migden MR, Chang ALS, Dirix L, Stratigos AJ, Lear JT. Emerging trends in the treatment of advanced basal cell carcinoma. Cancer Treat Rev 2018; 64:1-10.

[00177] 4. Sekulic A, Migden MR, Ого AE, et al. Efficacy and safety of vismodegib in advanced basal-cell carcinoma. N Engl J Med 2012;366:2171-79.

[00178] 5. Migden MR, Guminski A, Gutzmer R, et al. Treatment with two different doses of sonidegib in patients with locally advanced or metastatic basal cell carcinoma (BOLT): a multicentre, randomised, double-blind phase 2 trial. Lancet Oncol 2015; 16:716-28.

[00179] 6. Sekulic A, Migden MR, Basset-Seguin N, et al. Long-term safety and efficacy of vismodegib in patients with advanced basal cell carcinoma: final update of the pivotal ERTVANCE BCC study. BMC Cancer 2017; 17:332.

[00180] 7. Dummer R, Guminksi A, Gutzmer R, et al. Long-term efficacy and safety of sonidegib in patients with advanced basal cell carcinoma: 42-month analysis of the phase II randomized, double-blind BOLT study. Br J Dermatol 2020;182:1369-78.

[00181] 8. Chang ALS, Oro AE. Initial assessment of tumor regrowth after vismodegib in advanced basal cell carcinoma. Arch Dermatol 2012;148:1324-25.

[00182] 9. Chalmers ZR, Connelly CF, Fabrizio D, et al. Analysis of 100,000 human cancer genomes reveals the landscape of tumor mutational burden. Genome Med 2017;9:34.

[00183] 10. Bonilla X, Parmentier L, King B, et al. Genomic analysis identifies new drivers and progression pathways in skin basal cell carcinoma. Nat Genet 2016;48:398-406.

[00184] 11. McGranahan N, Furness AJ, Rosenthal R, et al. Clonal neoantigens elicit T cell immunoreactivity and sensitivity to immune checkpoint blockade. Science 2016; 351:1463-69.

[00185] 12. Rizvi NA, Hellmann MD, Snyder A, et al. Cancer immunology. Mutational landscape determines sensitivity to PD-1 blockade in non-small cell lung cancer. Science 2015;348:124-28.

[00186] 13. Le DT, Durham JN, Smith KN, et al. Mismatch repair deficiency predicts response of solid tumors to PD-1 blockade. Science 2017; 357:409-13.

[00187] 14. Euvrard S, Kanitakis J, Claudy A. Skin cancers after organ transplantation. N EnglJ Med 2003; 348:1681-91.

[00188] 15. Migden MR, Rischin D, Schmults CD, et al. PD-1 blockade with cemiplimab in advanced cutaneous squamous-cell carcinoma. NEngl J Med 2018; 379:341-51.

[00189] 16. Migden MR, Khushalani N1, Chang ALS, et al. Cemiplimab in locally advanced cutaneous squamous cell carcinoma: results from an open-label, phase 2, single-arm trial. Lancet Oncol 2020; 21:294-305.

[00190] 17. Rischin D, Migden MR, Lim AM, et al. Phase 2 study of cemiplimab in patients with metastatic cutaneous squamous cell carcinoma: primary analysis of fixed-dosing, long-term outcome of weight-based dosing. J Immunother Cancer 2020;8:e000775.

[00191] 18. Falchook GS, Leidner R, Stankevich E, et al. Responses of metastatic basal cell and cutaneous squamous cell carcinomas to anti-PDl monoclonal antibody REGN2810. J Immunother Cancer 2016;4:70.

[00192] 19. Clopper С J, Pearson ES. The use of confidence or fiducial limits illustrated in the case of the binomial. Biometrika 1934; 26:404-13.

[00193] 20. Barrios DM, Do MH, Phillips GS, et al. CME Part I: Immune checkpoint inhibitors to treat cutaneous malignancies. J Am Acad Dermatol 2020.

[00194] 21. Sekulic A, Migden MR, Lewis K, et al. Pivotal ERIVANCE basal cell carcinoma (BCC) study: 12-month update of efficacy and safety of vismodegib in advanced BCC. J Am Acad Dermatol 2015; 72:1021-26 e8.

[00195] 22. Basset-Seguin N, Hauschild A, Kunstfeld R, et al. Vismodegib in patients with advanced basal cell carcinoma: primary analysis of STEVIE, an international, open-label trial. Eur J Cancer 2017; 86:334-48.

[00196] 23. Dreno B, Kunstfeld R, Hauschild A, et al. Two intermittent vismodegib dosing regimens in patients with multiple basal-cell carcinomas (MIKIE): a randomised, regimen-control led, double-blind, phase 2 trial. Lancet Oncol 2017; 18:404-12.

[00197] 24. Nehal KS, Bichakjian CK. Update on keratinocyte carcinomas. N Engl J Med 2018; 379:363-74.

[00198] 25. Walter A, Barysch MJ, Behnke S, et al. Cancer-testis antigens and immunosurveillance in human cutaneous squamous cell and basal cell carcinomas. Clin Cancer Res 2010; 14:3562-70.

[00199] 26. Yoo SH, Keam B, Ock CY, et al. Prognostic value of the association between MHC class I downregulation and PD-L1 upregulation in head and neck squamous cell carcinoma patients. Sci Rep 2019; 9:7680.

[00200] 27. Garrido F, Aptsiauri N, Doorduijn EM, Garcia Lora AM, van Hall T. The urgent need to recover MHC class I in cancers for effective immunotherapy. Curr Opin Immunol 2016; 39:44-51.

[00201] 28. Topalian SL, Taube JM, Pardoll DM. Neoadjuvant checkpoint blockade for cancer immunotherapy. Science 2020; 367.

[00202] 29. de la Roche M, Ritter AT, Angus KL, et al. Hedgehog signaling controls T cell killing at the immunological synapse. Science 2013; 342:1247-50.

[00203] 30. Chang ALS, Tran DC, Cannon JGD, et al. Pembrolizumab for advanced basal cell carcinoma: an investigator-initiated, proof-of-concept study. J Am Acad Dermatol 2019; 80:564-56.

[00204] 31. Otsuka A, Levesque MP, Dummer R, Kabashima K. Hedgehog signaling in basal cell carcinoma. J Dermatol Sci 2015; 78:95-100.

[00205] Объем настоящего раскрытия не должен ограничиваться конкретными вариантами осуществления, описанными в настоящем документе. Действительно, различные модификации настоящего изобретения в дополнение к тем, которые описаны в настоящем документе, станут очевидными для специалистов в данной области техники из приведенного выше описания и прилагаемых чертежей. Предполагается, что такие модификации входят в объем прилагаемой формулы изобретения.

--->

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

<110> Регенерон Фармасьютикалс Инк.

<120> СПОСОБЫ ЛЕЧЕНИЯ РАКА ПОСРЕДСТВОМ ВВЕДЕНИЯ ИНГИБИТОРА PD-1

<130> 179227.02202; 10844WO01

<160> 12

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 117

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> HCVR

<400> 1

Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Val Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Phe

20 25 30

Gly Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Gly Ile Ser Gly Gly Gly Arg Asp Thr Tyr Phe Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Gly Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Val Lys Trp Gly Asn Ile Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu

100 105 110

Val Thr Val Ser Ser

115

<210> 2

<211> 107

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> LCVR

<400> 2

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15

Asp Ser Ile Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Leu Ser Ile Asn Thr Phe

20 25 30

Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Asn Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Ala Ala Ser Ser Leu His Gly Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Arg Thr Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Ser Asn Thr Pro Phe

85 90 95

Thr Phe Gly Pro Gly Thr Val Val Asp Phe Arg

100 105

<210> 3

<211> 8

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> HCDR1

<400> 3

Gly Phe Thr Phe Ser Asn Phe Gly

1 5

<210> 4

<211> 8

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> HCDR2

<400> 4

Ile Ser Gly Gly Gly Arg Asp Thr

1 5

<210> 5

<211> 10

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> HCDR3

<400> 5

Val Lys Trp Gly Asn Ile Tyr Phe Asp Tyr

1 5 10

<210> 6

<211> 6

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> LCDR1

<400> 6

Leu Ser Ile Asn Thr Phe

1 5

<210> 7

<211> 3

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> LCDR2

<400> 7

Ala Ala Ser

1

<210> 8

<211> 9

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> LCDR3

<400> 8

Gln Gln Ser Ser Asn Thr Pro Phe Thr

1 5

<210> 9

<211> 444

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> HC 1-117; 118-444

<400> 9

Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Val Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Phe

20 25 30

Gly Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Gly Ile Ser Gly Gly Gly Arg Asp Thr Tyr Phe Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Gly Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Val Lys Trp Gly Asn Ile Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu

100 105 110

Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu

115 120 125

Ala Pro Cys Ser Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys

130 135 140

Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser

145 150 155 160

Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser

165 170 175

Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser

180 185 190

Leu Gly Thr Lys Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn

195 200 205

Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro

210 215 220

Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe

225 230 235 240

Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val

245 250 255

Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe

260 265 270

Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro

275 280 285

Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr

290 295 300

Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val

305 310 315 320

Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala

325 330 335

Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln

340 345 350

Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly

355 360 365

Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro

370 375 380

Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser

385 390 395 400

Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu

405 410 415

Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His

420 425 430

Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys

435 440

<210> 10

<211> 214

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> LC 1-108; 109-214

<400> 10

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly

1 5 10 15

Asp Ser Ile Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Leu Ser Ile Asn Thr Phe

20 25 30

Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Asn Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Ala Ala Ser Ser Leu His Gly Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Arg Thr Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Ser Asn Thr Pro Phe

85 90 95

Thr Phe Gly Pro Gly Thr Val Val Asp Phe Arg Arg Thr Val Ala Ala

100 105 110

Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly

115 120 125

Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala

130 135 140

Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln

145 150 155 160

Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser

165 170 175

Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr

180 185 190

Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser

195 200 205

Phe Asn Arg Gly Glu Cys

210

<210> 11

<211> 120

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> HCVR

<400> 11

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Arg Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr

20 25 30

Gly Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ser Gly Ile His Trp His Gly Lys Arg Thr Gly Tyr Ala Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Lys Ser Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Gly Glu Asp Thr Ala Leu Tyr His Cys

85 90 95

Val Arg Gly Gly Met Ser Thr Gly Asp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln

100 105 110

Gly Thr Leu Val Ile Val Ser Ser

115 120

<210> 12

<211> 108

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> LCVR

<400> 12

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly

1 5 10 15

Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Asn Ser Tyr

20 25 30

Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile

35 40 45

Tyr Val Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Asn Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Pro

85 90 95

Ile Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys

100 105

<---

Claims (36)

1. Способ лечения или ингибирования роста опухоли у пациента с базальноклеточной карциномой (BCC), где пациент имеет опухоль с мутационной нагрузкой опухоли (TMB) более или равной 10 мутаций/Мб, и где опухоль содержит клетки, которые являются положительными в отношении экспрессии главного комплекса гистосовместимости (MHC), предусматривающий введение пациенту терапевтически эффективного количества антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые специфически связываются с белком программируемой смерти клеток 1 (PD-1), где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат вариабельную область тяжелой цепи (HCVR), содержащую три определяющие комплементарность области тяжелой цепи (CDR) (HCDR1, HCDR2 и HCDR3), и вариабельную область легкой цепи (LCVR), содержащую три CDR легкой цепи (LCDR1, LCDR2 и LCDR3), где HCDR1 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 3, HCDR2 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 4, HCDR3 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 5, LCDR1 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 6, LCDR2 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 7 и LCDR3 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 8.

2. Способ по п. 1, где BBC представляет собой метастатическую BCC или неоперабельную местнораспространенную BCC.

3. Способ по п. 1 или 2, где по меньшей мере 35% опухолевых клеток являются положительными в отношении экспрессии MHC.

4. Способ по любому из пп. 1-3, где MHC представляет собой MHC-I.

5. Способ по любому из пп. 1-4, где пациент показал развитие заболевания на фоне терапии на основе ингибитора Hedgehog (HHI) или непереносимость к предшествующей терапии HHI.

6. Способ по любому из пп. 1-5, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент вводят в качестве монотерапии.

7. Способ по любому из пп. 1-6, где введение антитела или его антигенсвязывающего фрагмента способствует регрессии опухоли, снижает нагрузку опухолевых клеток, снижает опухолевую массу и/или предотвращает рецидив опухоли у пациента.

8. Способ по любому из пп. 1-7, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент вводят в комбинации со вторым терапевтическим средством или терапией, выбранными из облучения, хирургического вмешательства, вакцинации против рака, имиквимода, противовирусного средства, фотодинамической терапии, терапии HHI, ингибитора PD-L1, ингибитора LAG3, ингибитора цитотоксического CTLA-4, агониста GITR, ингибитора TIM3, ингибитора BTLA, ингибитора TIGIT, ингибитора CD38, ингибитора CD47, ингибитора IDO, активатора CD28, антагониста VEGF, ингибитора Ang2, ингибитора TGFβ, ингибитора EGFR, антитела против опухолеспецифического антигена, вакцины, GM-CSF, онколитического вируса, цитотоксина, химиотерапевтического средства, ингибитора IL-6R, ингибитора IL-4R, ингибитора IL-10, цитокина, конъюгата антитело-лекарственное средство, противовоспалительного лекарственного средства и пищевой добавки.

9. Способ по любому из пп. 1-8, где HCVR содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 1.

10. Способ по любому из пп. 1-8, где LCVR содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 2.

11. Способ по любому из пп. 1-8, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит пару аминокислотных последовательностей HCVR/LCVR согласно SEQ ID NO: 1/2.

12. Способ по любому из пп. 1-11, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит тяжелую цепь и легкую цепь, где тяжелая цепь имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 9.

13. Способ по любому из пп. 1-11, где антитело содержит тяжелую цепь и легкую цепь, где легкая цепь имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 10.

14. Способ по любому из пп. 1-11, где антитело содержит тяжелую цепь и легкую цепь, где тяжелая цепь имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 9, и легкая цепь имеет аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 10.

15. Способ по любому из пп. 1-8, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат HCVR, имеющую идентичность последовательности 90% с SEQ ID NO: 1.

16. Способ по любому из пп. 1-8, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат LCVR, имеющую идентичность последовательности 90% с SEQ ID NO: 2.

17. Способ по любому из пп. 1-8, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат HCVR, имеющую идентичность последовательности 90% с SEQ ID NO: 1, и LCVR, имеющую идентичность последовательности 90% с SEQ ID NO: 2.

18. Способ по любому из пп. 1-14, где антитело представляет собой цемиплимаб.

19. Способ по любому из пп. 1-18, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент вводят в дозе от 5 мг до 1500 мг.

20. Способ по любому из пп. 1-19, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент вводят в дозе 200 мг, 250 мг или 350 мг.

21. Способ по любому из пп. 1-18, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент вводят в дозе от 1 мг/кг до 20 мг/кг массы тела пациента.

22. Способ по любому из пп. 1-18, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент вводят в дозе 1 мг/кг, 3 мг/кг или 10 мг/кг массы тела пациента.

23. Способ по любому из пп. 1-22, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент вводят в виде одной или нескольких доз, где каждую дозу вводят через две недели, три недели, четыре недели, пять недель или шесть недель после непосредственно предшествующей дозы.

24. Способ по любому из пп. 1-23, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент вводят внутривенно, подкожно или внутрибрюшинно.

25. Способ лечения или ингибирования роста опухоли у пациента с опухолью базальноклеточной карциномы (BCC), где пациент показал развитие заболевания на фоне терапии на основе ингибитора Hedgehog (HHI) или непереносимость к предшествующей терапии HHI, предусматривающий:

(a) сбор биопсии опухоли,

(b) измерение мутационной нагрузки опухоли (TMB) биопсии опухоли,

(c) измерение экспрессии главного комплекса гистосовместимости (MHC)-I в биопсии опухоли и

(d) введение пациенту терапевтически эффективного количества антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые специфически связываются с белком программируемой смерти клеток 1 (PD-1), если биопсия опухоли показывает TMB более или равную 10 мутаций/Мб, и если по меньшей мере 35% опухолевых клеток биопсии являются положительными в отношении экспрессии MHC-I;

где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат вариабельную область тяжелой цепи (HCVR), содержащую три определяющие комплементарность области тяжелой цепи (CDR) (HCDR1, HCDR2 и HCDR3), и вариабельную область легкой цепи (LCVR), содержащую три CDR легкой цепи (LCDR1, LCDR2 и LCDR3), где HCDR1 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 3, HCDR2 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 4, HCDR3 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 5, LCDR1 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 6, LCDR2 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 7, и LCDR3 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 8.

26. Способ отбора пациента с опухолью базальноклеточной карциномы (BCC) для лечения антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, которые специфически связываются с белком программируемой смерти клеток 1 (PD-1), предусматривающий:

(a) сбор биопсии опухоли BCC,

(b) измерение мутационной нагрузки опухоли (TMB) биопсии опухоли,

(c) измерение экспрессии главного комплекса гистосовместимости (MHC)-I в биопсии опухоли и

(d) отбор пациента для лечения антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, если биопсия опухоли имеет TMB более или равную 10 мутаций/Мб и по меньшей мере 35% опухолевых клеток из биопсии являются положительными в отношении экспрессии MHC-I,

где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат вариабельную область тяжелой цепи (HCVR), содержащую три определяющие комплементарность области тяжелой цепи (CDR) (HCDR1, HCDR2 и HCDR3), и вариабельную область легкой цепи (LCVR), содержащую три CDR легкой цепи (LCDR1, LCDR2 и LCDR3), где HCDR1 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 3, HCDR2 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 4, HCDR3 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 5, LCDR1 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 6, LCDR2 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 7, и LCDR3 содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 8.