RU2841244C2 - Chimeric antigen receptors and ways of use thereof - Google Patents
Chimeric antigen receptors and ways of use thereof Download PDFInfo
- Publication number
- RU2841244C2 RU2841244C2 RU2022117055A RU2022117055A RU2841244C2 RU 2841244 C2 RU2841244 C2 RU 2841244C2 RU 2022117055 A RU2022117055 A RU 2022117055A RU 2022117055 A RU2022117055 A RU 2022117055A RU 2841244 C2 RU2841244 C2 RU 2841244C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- car
- seq
- acid sequence
- cells
- nucleic acid
- Prior art date
Links
Images
Abstract
Description
ПЕРЕКРЕСТНАЯ ССЫЛКА НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИCROSS-REFERENCE TO RELATED APPLICATIONS
Настоящая заявка испрашивает приоритет на основании заявки на патент США с регистрационным номером 62/940509, поданной 26 ноября 2019 года, содержание которой включено в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.This application claims priority to U.S. Patent Application Ser. No. 62/940,509, filed November 26, 2019, the contents of which are incorporated herein by reference in their entirety.
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙSEQUENCE LIST
Настоящая заявка содержит перечень последовательностей, который был подан в электронном виде в формате ASCII и настоящим включен посредством ссылки во всей своей полноте. Указанная копия в формате ASCII, созданная 24 ноября 2020 года, имеет название N2067-7166WO_SL.txt, и ее размер составляет 598194 байта.This application contains a sequence listing that was filed electronically in ASCII format and is hereby incorporated by reference in its entirety. The ASCII copy created on November 24, 2020 is named N2067-7166WO_SL.txt and is 598,194 bytes in size.
ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ, К КОТОРОЙ ОТНОСИТСЯ ИЗОБРЕТЕНИЕFIELD OF TECHNOLOGY TO WHICH THE INVENTION RELATES
Настоящее изобретение относится в общем к иммунным эффекторным клеткам (например, T-клеткам или NK-клеткам), сконструированным таким образом, что они экспрессируют химерный антигенный рецептор (CAR), а также к композициям на их основе и путям их применения.The present invention relates generally to immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) engineered to express a chimeric antigen receptor (CAR), as well as compositions thereof and routes of use thereof.
ПРЕДПОСЫЛКИ ИЗОБРЕТЕНИЯBACKGROUND OF THE INVENTION
Терапия на основе адоптивного переноса клеток (ACT) с использованием Т-клеток, в особенности T-клеток, трансдуцированных с помощью химерных антигенных рецепторов (CAR), показала перспективность в нескольких исследованиях в отношении гематологического рака. Существует потребность в способах и процессах для улучшения получения терапевтического продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR, повышения качества продукта и доведения до максимума терапевтической эффективности продукта.Adoptive cell transfer (ACT) therapy using T cells, particularly chimeric antigen receptor (CAR)-transduced T cells, has shown promise in several studies in hematological cancers. There is a need for methods and processes to improve the production of CAR-expressing cell-based therapeutic product, enhance product quality, and maximize the therapeutic efficacy of the product.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯESSENCE OF THE INVENTION
В одном аспекте в настоящем изобретении описана клетка, например, иммунная клетка, например, T-клетка или NK-клетка, содержащая первый антигенсвязывающий домен и второй антигенсвязывающий домен. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен представляет собой домен, связывающий BCMA. В некоторых вариантах осуществления домен, связывающий BCMA, содержит последовательность, связывающую BCMA, раскрытую в данном документе, например, последовательность CDR, VH, VL или scFv, раскрытую в таблицах 3-15, 19, 20, 22, 26 и 31. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен представляет собой домен, связывающий CD19. В некоторых вариантах осуществления домен, связывающий CD19, содержит последовательность, связывающую CD19, раскрытую в данном документе, например, последовательность CDR, VH, VL или scFv, раскрытую в таблицах 2, 19, 22 и 31.In one aspect, the present invention features a cell, e.g., an immune cell, e.g., a T cell or an NK cell, comprising a first antigen-binding domain and a second antigen-binding domain. In some embodiments, the first antigen-binding domain is a BCMA-binding domain. In some embodiments, the BCMA-binding domain comprises a BCMA-binding sequence disclosed herein, e.g., a CDR, VH, VL, or scFv sequence disclosed in Tables 3-15, 19, 20, 22, 26, and 31. In some embodiments, the second antigen-binding domain is a CD19-binding domain. In some embodiments, the CD19-binding domain comprises a CD19-binding sequence disclosed herein, e.g., a CDR, VH, VL, or scFv sequence disclosed in Tables 2, 19, 22, and 31.
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрена клетка, содержащая (a) первый антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий BCMA, где домен, связывающий BCMA, содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую определяющую комплементарность область 1 тяжелой цепи (CDR1 HC), определяющую комплементарность область 2 тяжелой цепи (CDR2 HC) и определяющую комплементарность область 3 тяжелой цепи (CDR3 HC), и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую определяющую комплементарность область 1 легкой цепи (CDR1 LC), определяющую комплементарность область 2 легкой цепи (CDR2 LC) и определяющую комплементарность область 3 легкой цепи (CDR3 LC), где CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под (i) SEQ ID NO: 86, 130, 88, 95, 131 и 132 соответственно; (ii) SEQ ID NO: 44, 45, 84, 54, 55 и 56 соответственно или (iii) SEQ ID NO: 179, 180, 181, 147, 182 и 183 соответственно; и (b) второй антигенсвязывающий домен. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен и второй антигенсвязывающий домен расположены в двух химерных антигенных рецепторах (CAR). В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен и второй антигенсвязывающий домен расположены в одном CAR.In some embodiments, the present invention provides a cell comprising (a) a first antigen-binding domain that is a BCMA binding domain, wherein the BCMA binding domain comprises a heavy chain variable region (VH) comprising a heavy chain complementarity determining region 1 (CDR1 HC), a heavy chain complementarity determining region 2 (CDR2 HC), and a heavy chain complementarity determining region 3 (CDR3 HC), and a light chain variable region (VL) comprising a light chain complementarity determining region 1 (CDR1 LC), a light chain complementarity determining region 2 (CDR2 LC), and a light chain complementarity determining region 3 (CDR3 LC), wherein CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of (i) SEQ ID NOs: 86, 130, 88, 95, 131, and 132, respectively; (ii) SEQ ID NOs: 44, 45, 84, 54, 55, and 56, respectively; or (iii) SEQ ID NOs: 179, 180, 181, 147, 182, and 183, respectively; and (b) a second antigen-binding domain. In some embodiments, the first antigen-binding domain and the second antigen-binding domain are located in two chimeric antigen receptors (CARs). In some embodiments, the first antigen-binding domain and the second antigen-binding domain are located in a single CAR.
В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 86, 130, 88, 95, 131 и 132 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 86, 87, 88, 95, 96 и 97 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 86, 109, 88, 95, 114 и 115 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 86, 109, 88, 95, 114 и 97 соответственно. В некоторых вариантах осуществления VH содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 93 или 112 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VH кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 260, 94 или 113 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VL содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 102, 118 или 124 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VL кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 261, 103, 119 или 125 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VH и VL содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 93 и 102 соответственно. В некоторых вариантах осуществления VH и VL содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 112 и 118 соответственно. В некоторых вариантах осуществления VH и VL содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 112 и 124 соответственно. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен содержит одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv), содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 105, 120 или 126 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 253, 106, 121 или 127 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен расположен в первом CAR. В некоторых вариантах осуществления первый CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 107, 226, 122 или 128 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый CAR кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 259, 258, 108, 123 или 129 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 86, 130, 88, 95, 131, and 132, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 86, 87, 88, 95, 96, and 97, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 86, 109, 88, 95, 114, and 115, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 86, 109, 88, 95, 114, and 97, respectively. In some embodiments, VH comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 93 or 112, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, VH is encoded by a nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 260, 94, or 113, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, VL comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 102, 118, or 124, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, VL is encoded by a nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 261, 103, 119, or 125, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, VH and VL comprise the amino acid sequences of SEQ ID NO: 93 and 102, respectively. In some embodiments, VH and VL comprise the amino acid sequences of SEQ ID NO: 112 and 118, respectively. In some embodiments, VH and VL comprise the amino acid sequences of SEQ ID NO: 112 and 124, respectively. In some embodiments, the first antigen-binding domain comprises a single-chain variable fragment (scFv) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 105, 120, or 126, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first antigen-binding domain is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 253, 106, 121, or 127, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first antigen-binding domain is located in a first CAR. In some embodiments, the first CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107, 226, 122, or 128, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first CAR is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 259, 258, 108, 123, or 129, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 44, 45, 84, 54, 55 и 56 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 44, 45, 76, 54, 55 и 56 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 44, 45, 46, 54, 55 и 56 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 44, 45, 68, 54, 55 и 56 соответственно. В некоторых вариантах осуществления VH содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 78, 52 или 70 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VH кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 79, 53 или 71 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VL содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 61 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VL кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 62 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VH и VL содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 78 и 61 соответственно. В некоторых вариантах осуществления VH и VL содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 52 и 61 соответственно. В некоторых вариантах осуществления VH и VL содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 70 и 61 соответственно. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен содержит одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv), содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 80, 64 или 72 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 81, 65 или 73 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен расположен в первом CAR. В некоторых вариантах осуществления первый CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 224, 82, 66 или 74 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый CAR кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 83, 67 или 75 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 44, 45, 84, 54, 55, and 56, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 44, 45, 76, 54, 55, and 56, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 44, 45, 46, 54, 55, and 56, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 44, 45, 68, 54, 55, and 56, respectively. In some embodiments, VH comprises the amino acid sequence of SEQ ID NOs: 78, 52, or 70, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, VH is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NOs: 79, 53, or 71, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, VL comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 61 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, VL is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 62 or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, VH and VL comprise the amino acid sequences of SEQ ID NO: 78 and 61, respectively. In some embodiments, VH and VL comprise the amino acid sequences of SEQ ID NO: 52 and 61, respectively. In some embodiments, VH and VL comprise the amino acid sequences of SEQ ID NO: 70 and 61, respectively. In some embodiments, the first antigen-binding domain comprises a single-chain variable fragment (scFv) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 80, 64, or 72, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first antigen-binding domain is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 81, 65, or 73, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first antigen-binding domain is located in a first CAR. In some embodiments, the first CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 224, 82, 66, or 74, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first CAR is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 83, 67, or 75, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 179, 180, 181, 147, 182 и 183 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 137, 138, 139, 147, 148 и 149 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 160, 161, 162, 147, 170 и 171 соответственно. В некоторых вариантах осуществления VH содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 145 или 168 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VH кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 146 или 169 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VL содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 154 или 173 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VL кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 155 или 174 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления VH и VL содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 145 и 154 соответственно. В некоторых вариантах осуществления VH и VL содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 168 и 173 соответственно. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен содержит одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv), содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 156 или 175 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 157 или 176 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен расположен в первом CAR. В некоторых вариантах осуществления первый CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 158 или 177 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый CAR кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 159 или 178 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 179, 180, 181, 147, 182, and 183, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 137, 138, 139, 147, 148, and 149, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 160, 161, 162, 147, 170, and 171, respectively. In some embodiments, VH comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 145 or 168, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, VH is encoded by a nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 146 or 169, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, VL comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 154 or 173, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the VL is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 155 or 174, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the VH and VL comprise the amino acid sequences of SEQ ID NO: 145 and 154, respectively. In some embodiments, the VH and VL comprise the amino acid sequences of SEQ ID NO: 168 and 173, respectively. In some embodiments, the first antigen-binding domain comprises a single-chain variable fragment (scFv) comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 156 or 175, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first antigen-binding domain is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 157 or 176, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first antigen-binding domain is located in a first CAR. In some embodiments, the first CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 158 or 177, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first CAR is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 159 or 178, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена клетка, содержащая (a) первый антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий BCMA, где домен, связывающий BCMA, содержит (i) VH, содержащую CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC последовательности, связывающей BCMA, представленные в таблице 20 или 26, и VL, содержащую CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC последовательности, связывающей BCMA, представленные в таблице 20 или 26, где VH и VL соединены линкером, содержащим аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 243; (ii) VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 239 и 242 соответственно, где VH и VL соединены линкером, содержащим аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 243; или (iii) scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 200; и (b) второй антигенсвязывающий домен. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен и второй антигенсвязывающий домен расположены в двух химерных антигенных рецепторах (CAR). В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен и второй антигенсвязывающий домен расположены в одном CAR. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен связывается с антигеном, выбранным из CD19, CD5, CD10, CD20, CD21, CD22, CD23, CD24, CD25, CD27, CD30, CD34, CD37, CD38, CD40, CD53, CD69, CD72, CD73, CD74, CD75, CD77, CD79a, CD79b, CD80, CD81, CD82, CD83, CD84, CD85, CD86, CD123, CD135, CD138, CD179, CD269, Flt3, ROR1, FcRn5, FcRn2, CS-1, CXCR4, 5, 7, IL-7/3R, IL7/4/3R или IL4R, где В-клеточный антиген необязательно выбран из CD19, CD20, CD22, FcRn5, FcRn2, CS-1, CD138, CD123, CD33, CD34, CLL-1, рецептора фолиевой кислоты бета или FLT3. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен связывается с CD19. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен связывается с антигеном, выбранным из EGFRvIII, мезотелина, GD2, Tn-антигена, sTn-антигена, Tn-O-гликопептидов, sTn-O-гликопептидов, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, легумана, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, антигена Y системы Льюис, CD24, PDGFR-бета, SSEA-4, рецептора фолиевой кислоты альфа, ERBB (например, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, эфрина B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-ацетил-GD2, рецептора фолиевой кислоты бета, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, легумаина, E6 или E7 HPV, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, полисиаловой кислоты, Fos-родственного антигена, эластазы нейтрофилов, TRP-2, CYP1B1, белка спермы 17, бета-субъединицы хорионического гонадотропина человека, AFP, тиреоглобулина, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, обратной транскриптазы теломеразы человека, кишечной карбоксилэстеразы, мутантного варианта hsp 70-2, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4 или пептида любого из этих антигенов, презентированного на MHC.In some embodiments, provided herein is a cell comprising (a) a first antigen-binding domain that is a BCMA binding domain, wherein the BCMA binding domain comprises (i) a VH comprising the HC CDR1, HC CDR2, and HC CDR3 of a BCMA binding sequence set forth in Table 20 or 26, and a VL comprising the LC CDR1, LC CDR2, and LC CDR3 of a BCMA binding sequence set forth in Table 20 or 26, wherein the VH and VL are connected by a linker comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 243; (ii) a VH and VL comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 239 and 242, respectively, wherein the VH and VL are connected by a linker comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 243; or (iii) an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 200; and (b) a second antigen-binding domain. In some embodiments, the first antigen-binding domain and the second antigen-binding domain are located in two chimeric antigen receptors (CARs). In some embodiments, the first antigen-binding domain and the second antigen-binding domain are located in a single CAR. In some embodiments, the second antigen-binding domain binds to an antigen selected from CD19, CD5, CD10, CD20, CD21, CD22, CD23, CD24, CD25, CD27, CD30, CD34, CD37, CD38, CD40, CD53, CD69, CD72, CD73, CD74, CD75, CD77, CD79a, CD79b, CD80, CD81, CD82, CD83, CD84, CD85, CD86, CD123, CD135, CD138, CD179, CD269, Flt3, ROR1, FcRn5, FcRn2, CS-1, CXCR4, 5, 7, IL-7/3R, IL7/4/3R, or IL4R, wherein the B cell antigen is optionally selected from CD19, CD20, CD22, FcRn5, FcRn2, CS-1, CD138, CD123, CD33, CD34, CLL-1, folate receptor beta, or FLT3. In some embodiments, the second antigen-binding domain binds to CD19. In some embodiments, the second antigen-binding domain binds to an antigen selected from EGFRvIII, mesothelin, GD2, Tn antigen, sTn antigen, Tn-O-glycopeptides, sTn-O-glycopeptides, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, leguman, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, Lewis Y antigen, CD24, PDGFR-beta, SSEA-4, folate receptor alpha, ERBB (e.g., ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, ephrin B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-acetyl-GD2, receptor folate beta, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, legumain, HPV E6 or E7, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, polysialic acid, Fos-related antigen, neutrophil elastase, TRP-2, CYP1B1, sperm protein 17, human chorionic gonadotropin beta, AFP, thyroglobulin, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, human telomerase reverse transcriptase, intestinal carboxylesterase, hsp 70-2 mutant, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4 or a peptide of any of these antigens presented on MHC.
В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен связывается с CD19. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен содержит CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и/или CDR3 LC последовательности, связывающей CD19, представленные в таблице 19 или таблице 22, например, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 295 и 245-249 соответственно. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен содержит VH и/или VL последовательности, связывающей CD19, представленные в таблице 19 или таблице 22, например, VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 250 и 251 соответственно или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен содержит scFv последовательности, связывающей CD19, представленный в таблице 19 или таблице 22, например, scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 211 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен расположен во втором CAR, где CAR включает в себя CAR с последовательностью, связывающей CD19, представленный в таблице 19 или таблице 22, например, CAR, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 225 или 229 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, the second antigen binding domain binds to CD19. In some embodiments, the second antigen binding domain comprises CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC and/or CDR3 LC of a CD19 binding sequence set forth in Table 19 or Table 22, such as CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC and CDR3 LC comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 295 and 245-249, respectively. In some embodiments, the second antigen-binding domain comprises a VH and/or VL of a CD19 binding sequence shown in Table 19 or Table 22, such as a VH and VL comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 250 and 251, respectively, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the second antigen-binding domain comprises an scFv of a CD19 binding sequence shown in Table 19 or Table 22, such as an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 211 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the second antigen-binding domain is located in a second CAR, wherein the CAR comprises a CAR with a CD19 binding sequence shown in Table 19 or Table 22, such as a CAR comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225 or 229 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен содержит CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR LC, содержащие аминокислотные последовательности под (a) SEQ ID NO: 86, 87, 88, 95, 96 и 97 соответственно; (b) SEQ ID NO: 44, 45, 76, 54, 55 и 56 соответственно или (c) SEQ ID NO: 44, 45, 46, 54, 55 и 56 соответственно. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен содержит CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 295 и 245-249 соответственно. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен содержит VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под (a) SEQ ID NO: 93 и 102 соответственно; (b) SEQ ID NO: 78 и 61 соответственно или (c) SEQ ID NO: 52 и 61 соответственно. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен содержит VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 250 и 251 соответственно. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен содержит scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 105, 80 или 64. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен содержит scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 211. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 253, 106, 81 или 65. В некоторых вариантах осуществления второй антигенсвязывающий домен кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 212.In some embodiments, the first antigen-binding domain comprises CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR LC comprising the amino acid sequences of (a) SEQ ID NOs: 86, 87, 88, 95, 96, and 97, respectively; (b) SEQ ID NOs: 44, 45, 76, 54, 55, and 56, respectively; or (c) SEQ ID NOs: 44, 45, 46, 54, 55, and 56, respectively. In some embodiments, the second antigen-binding domain comprises CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 295 and 245-249, respectively. In some embodiments, the first antigen-binding domain comprises a VH and VL comprising the amino acid sequences of (a) SEQ ID NO: 93 and 102, respectively; (b) SEQ ID NO: 78 and 61, respectively; or (c) SEQ ID NO: 52 and 61, respectively. In some embodiments, the second antigen-binding domain comprises a VH and VL comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 250 and 251, respectively. In some embodiments, the first antigen-binding domain comprises an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 105, 80, or 64. In some embodiments, the second antigen-binding domain comprises an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 211. In some embodiments, the first antigen-binding domain is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 253, 106, 81, or 65. In some embodiments, the second antigen-binding domain is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 212.
В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен расположен в первом CAR, а второй антигенсвязывающий домен расположен во втором CAR. В некоторых вариантах осуществления первый CAR дополнительно содержит первый трансмембранный домен и первый внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления второй CAR дополнительно содержит второй трансмембранный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен.In some embodiments, the first antigen-binding domain is located in a first CAR and the second antigen-binding domain is located in a second CAR. In some embodiments, the first CAR further comprises a first transmembrane domain and a first intracellular signaling domain. In some embodiments, the second CAR further comprises a second transmembrane domain and a second intracellular signaling domain.
В некоторых вариантах осуществления первый CAR кодируется первой последовательностью нуклеиновой кислоты, а второй CAR кодируется второй последовательностью нуклеиновой кислоты, где первая и вторая последовательности нуклеиновой кислоты расположены в отдельных молекулах нуклеиновой кислоты.In some embodiments, the first CAR is encoded by a first nucleic acid sequence and the second CAR is encoded by a second nucleic acid sequence, wherein the first and second nucleic acid sequences are located on separate nucleic acid molecules.
В некоторых вариантах осуществления первый CAR кодируется первой последовательностью нуклеиновой кислоты, а второй CAR кодируется второй последовательностью нуклеиновой кислоты, где первая и вторая последовательности нуклеиновой кислоты расположены в одной молекуле нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления отдельная молекула нуклеиновой кислоты имеет следующую конфигурацию в ориентации 5'-3': последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая первый антигенсвязывающий домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая первый трансмембранный домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая первый внутриклеточный сигнальный домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая линкер - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая второй антигенсвязывающий домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая второй трансмембранный домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая второй внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления отдельная молекула нуклеиновой кислоты имеет следующую конфигурацию в ориентации 5'-3': последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая второй антигенсвязывающий домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая второй трансмембранный домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая второй внутриклеточный сигнальный домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая линкер - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая первый антигенсвязывающий домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая первый трансмембранный домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая первый внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления линкер содержит сайт саморасщепления. В некоторых вариантах осуществления линкер содержит сайт P2A, сайт Т2A, сайт Е2A или сайт F2A. В некоторых вариантах осуществления линкер содержит сайт P2A. В некоторых вариантах осуществления линкер кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 209 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления линкер содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 208 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления отдельная молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 215, 217, 219, 221 или 223 или последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления отдельная молекула нуклеиновой кислоты кодирует аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 214, 216, 218, 220 или 222 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, a first CAR is encoded by a first nucleic acid sequence and a second CAR is encoded by a second nucleic acid sequence, wherein the first and second nucleic acid sequences are located on a single nucleic acid molecule. In some embodiments, a single nucleic acid molecule has the following configuration in a 5'-3' orientation: a nucleic acid sequence encoding a first antigen-binding domain - a nucleic acid sequence encoding a first transmembrane domain - a nucleic acid sequence encoding a first intracellular signaling domain - a nucleic acid sequence encoding a linker - a nucleic acid sequence encoding a second antigen-binding domain - a nucleic acid sequence encoding a second transmembrane domain - a nucleic acid sequence encoding a second intracellular signaling domain. In some embodiments, the individual nucleic acid molecule has the following configuration in a 5'-3' orientation: a nucleic acid sequence encoding a second antigen-binding domain - a nucleic acid sequence encoding a second transmembrane domain - a nucleic acid sequence encoding a second intracellular signaling domain - a nucleic acid sequence encoding a linker - a nucleic acid sequence encoding a first antigen-binding domain - a nucleic acid sequence encoding a first transmembrane domain - a nucleic acid sequence encoding a first intracellular signaling domain. In some embodiments, the linker comprises a self-cleavage site. In some embodiments, the linker comprises a P2A site, a T2A site, an E2A site, or an F2A site. In some embodiments, the linker comprises a P2A site. In some embodiments, the linker is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 209 or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the linker comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 208 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the individual nucleic acid molecule comprises the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 215, 217, 219, 221, or 223 or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, a single nucleic acid molecule encodes an amino acid sequence of SEQ ID NO: 214, 216, 218, 220, or 222, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен и второй антигенсвязывающий домен расположены в одном CAR, где CAR дополнительно содержит трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен содержит первую VH (VH1) и первую VL (VL1), а второй антигенсвязывающий домен содержит вторую VH (VH2) и вторую VL (VL2). В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH2 - необязательно линкер 1 ("L1") - VL1 - необязательно линкер 2 ("L2") - VH1 - необязательно линкер 3 ("L3") - VL2. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH1 - необязательно L1 - VH2 - необязательно L2 - VL2 - необязательно L3 - VL1. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VH2. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VH2. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VL2. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL1 - необязательно L1 - VH2 - необязательно L2 - VL2 - необязательно L3 - VH1. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VH1. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VL1. В некоторых вариантах осуществления VH1 и VL1 содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 93 и 102 соответственно (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления VH1 и VL1 содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 333 и 334 соответственно (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления VH1 и VL1 содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 78 и 61 соответственно (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления VH1 и VL1 содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 335 и 336 соответственно (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления VH2 и VL2 содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 250 и 251 соответственно (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления VH2 и VL2 содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 331 и 332 соответственно (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления L1 или L3 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 5 (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней). В некоторых вариантах осуществления L2 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 63 (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней). В некоторых вариантах осуществления CAR содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 321-330, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ней. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 339-348, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ней.In some embodiments, the first antigen-binding domain and the second antigen-binding domain are located in a single CAR, wherein the CAR further comprises a transmembrane domain and an intracellular signaling domain. In some embodiments, the first antigen-binding domain comprises a first VH (VH1) and a first VL (VL1), and the second antigen-binding domain comprises a second VH (VH2) and a second VL (VL2). In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH2 - optionally Linker 1 ("L1") - VL1 - optionally Linker 2 ("L2") - VH1 - optionally Linker 3 ("L3") - VL2. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH1 - optionally L1 - VH2 - optionally L2 - VL2 - optionally L3 - VL1. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL2 - optionally L1 - VL1 - optionally L2 - VH1 - optionally L3 - VH2. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL2 - optionally L1 - VH1 - optionally L2 - VL1 - optionally L3 - VH2. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH2 - optionally L1 - VH1 - optionally L2 - VL1 - optionally L3 - VL2. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL1 - optionally L1 - VH2 - optionally L2 - VL2 - optionally L3 - VH1. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL1 - optional L1 - VL2 - optional L2 - VH2 - optional L3 - VH1. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH1 - optional L1 - VL2 - optional L2 - VH2 - optional L3 - VL1. In some embodiments VH1 and VL1 comprise the amino acid sequences of SEQ ID NO: 93 and 102, respectively (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments VH1 and VL1 comprise the amino acid sequences of SEQ ID NO: 333 and 334, respectively (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments VH1 and VL1 comprise the amino acid sequences of SEQ ID NO: 78 and 61, respectively (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments VH1 and VL1 comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 335 and 336, respectively (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, VH2 and VL2 comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 250 and 251, respectively (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, VH2 and VL2 comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 331 and 332, respectively (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, L1 or L3 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, L2 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63 (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the CAR comprises an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 321-330, or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the CAR comprises an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 339-348, or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления CAR кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей следующую конфигурацию в ориентации 5'-3': последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая первый антигенсвязывающий домен - необязательно последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая линкер - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая второй антигенсвязывающий домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая трансмембранный домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления CAR кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, имеющей следующую конфигурацию в ориентации 5'-3': последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая второй антигенсвязывающий домен - необязательно последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая линкер - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая первый антигенсвязывающий домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая трансмембранный домен - последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая внутриклеточный сигнальный домен.In some embodiments, CAR is encoded by a nucleic acid molecule having the following configuration in 5'-3' orientation: a nucleic acid sequence encoding a first antigen-binding domain - optionally a nucleic acid sequence encoding a linker - a nucleic acid sequence encoding a second antigen-binding domain - a nucleic acid sequence encoding a transmembrane domain - a nucleic acid sequence encoding an intracellular signaling domain. In some embodiments CAR is encoded by a nucleic acid molecule having the following configuration in 5'-3' orientation: a nucleic acid sequence encoding a second antigen-binding domain - optionally a nucleic acid sequence encoding a linker - a nucleic acid sequence encoding a first antigen-binding domain - a nucleic acid sequence encoding a transmembrane domain - a nucleic acid sequence encoding an intracellular signaling domain.
В некоторых вариантах осуществления CAR имеет следующую конфигурацию в ориентации от N- до C-конца: первый антигенсвязывающий домен - необязательно линкер - второй антигенсвязывающий домен - трансмембранный домен - внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления CAR имеет следующую конфигурацию в ориентации от N- до C-конца: второй антигенсвязывающий домен - необязательно линкер - первый антигенсвязывающий домен - трансмембранный домен - внутриклеточный сигнальный домен.In some embodiments, the CAR has the following configuration in N- to C-terminal orientation: a first antigen-binding domain - optionally a linker - a second antigen-binding domain - a transmembrane domain - an intracellular signaling domain. In some embodiments, the CAR has the following configuration in N- to C-terminal orientation: second antigen-binding domain - optionally a linker - first antigen-binding domain - transmembrane domain - intracellular signaling domain.
В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен или второй антигенсвязывающий домен содержит VH и VL. В некоторых вариантах осуществления VH и VL соединены линкером. В некоторых вариантах осуществления линкер содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 5, 63, 104 или 243 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, the first antigen-binding domain or the second antigen-binding domain comprises VH and VL. In some embodiments, the VH and VL are connected by a linker. In some embodiments, the linker comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5, 63, 104, or 243, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен, первый трансмембранный домен или второй трансмембранный домен включает в себя трансмембранный домен белка, выбранного из альфа-, бета- или дзета-цепи T-клеточного рецептора, CD28, CD3-эпсилон, CD45, CD4, CD5, CD8, CD9, CD16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD134, CD137 или CD154. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен, первый трансмембранный домен или второй трансмембранный домен содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 6 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен, первый трансмембранный домен или второй трансмембранный домен кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 17 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, the transmembrane domain, the first transmembrane domain, or the second transmembrane domain comprises a transmembrane domain of a protein selected from the alpha, beta, or zeta chain of a T cell receptor, CD28, CD3 epsilon, CD45, CD4, CD5, CD8, CD9, CD16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD134, CD137, or CD154. In some embodiments, the transmembrane domain, the first transmembrane domain, or the second transmembrane domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the transmembrane domain, the first transmembrane domain or the second transmembrane domain is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 17 or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95% or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления первый антигенсвязывающий домен или второй антигенсвязывающий домен соединены с трансмембранным доменом, первым трансмембранным доменом или вторым трансмембранным доменом с помощью шарнирной области (например, первой или второй шарнирной области). В некоторых вариантах осуществления шарнирная область содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 2, 3 или 4 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления шарнирная область кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 13, 14 или 15 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления шарнирная область и трансмембранный домен содержат аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 202 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления шарнирная область и трансмембранный домен кодируются последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 203 или 213 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, the first antigen-binding domain or the second antigen-binding domain is connected to the transmembrane domain, the first transmembrane domain, or the second transmembrane domain by a hinge region (e.g., a first or second hinge region). In some embodiments, the hinge region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, 3, or 4, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the hinge region is encoded by a nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 13, 14, or 15, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the hinge region and the transmembrane domain comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 202 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the hinge region and the transmembrane domain are encoded by a nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 203 or 213 or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95% or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен, первый внутриклеточный сигнальный домен или второй внутриклеточный сигнальный домен содержит первичный сигнальный домен (например, первый или второй первичный сигнальный домен). В некоторых вариантах осуществления первичный сигнальный домен предусматривает функциональный сигнальный домен, полученный из CD3-дзета, TCR-дзета, FcR-гамма, FcR-бета, CD3-гамма, CD3-дельта, CD3-эпсилон, CD5, CD22, CD79a, CD79b, CD278 (ICOS), FcεRI, DAP10, DAP12 или CD66d. В некоторых вариантах осуществления первичный сигнальный домен содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 9 или 10 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первичный сигнальный домен кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 20, 21 или 205 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен, первый внутриклеточный сигнальный домен или второй внутриклеточный сигнальный домен содержит костимулирующий сигнальный домен (например, первый или второй костимулирующий сигнальный домен). В некоторых вариантах осуществления костимулирующий сигнальный домен предусматривает функциональный сигнальный домен, полученный из молекулы MHC I класса, белкового рецептора TNF, иммуноглобулиноподобного белка, рецептора цитокина, интегрина, сигнальной молекулы активации лимфоцитов (белка SLAM), активирующего рецептора NK-клеток, BTLA, лиганда Toll-подобного рецептора, OX40, CD2, CD7, CD27, CD28, CD30, CD40, CDS, ICAM-1, 4-1BB (CD137), B7-H3, ICOS (CD278), GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-альфа, CD8-бета, IL2R-бета, IL2R-гамма, IL7R-альфа, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a, CD28-OX40, CD28-4-1BB или лиганда, который специфично связывается с CD83. В некоторых вариантах осуществления костимулирующий сигнальный домен содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 7 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления костимулирующий сигнальный домен кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 18 или 204 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен, первый внутриклеточный сигнальный домен или второй внутриклеточный сигнальный домен содержит функциональный сигнальный домен, полученный из 4-1BB, и функциональный сигнальный домен, полученный из CD3-дзета. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен, первый внутриклеточный сигнальный домен или второй внутриклеточный сигнальный домен содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 7 (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней) и аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 9 или 10 (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней). В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен, первый внутриклеточный сигнальный домен или второй внутриклеточный сигнальный домен содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 7 и аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 9 или 10.In some embodiments, the intracellular signaling domain, the first intracellular signaling domain, or the second intracellular signaling domain comprises a primary signaling domain (e.g., a first or second primary signaling domain). In some embodiments the primary signaling domain provides a functional signaling domain derived from CD3zeta, TCRzeta, FcRgamma, FcRbeta, CD3gamma, CD3delta, CD3epsilon, CD5, CD22, CD79a, CD79b, CD278 (ICOS), FcεRI, DAP10, DAP12, or CD66d. In some embodiments, the primary signaling domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9 or 10 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the primary signaling domain is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 20, 21, or 205, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the intracellular signaling domain, the first intracellular signaling domain, or the second intracellular signaling domain comprises a costimulatory signaling domain (e.g., a first or second costimulatory signaling domain). In some embodiments, the costimulatory signaling domain provides a functional signaling domain derived from a class I MHC molecule, a TNF protein receptor, an immunoglobulin-like protein, a cytokine receptor, an integrin, a signaling lymphocyte activation molecule (SLAM protein), an NK cell activating receptor, BTLA, a Toll-like receptor ligand, OX40, CD2, CD7, CD27, CD28, CD30, CD40, CDS, ICAM-1, 4-1BB (CD137), B7-H3, ICOS (CD278), GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-alpha, CD8-beta, IL2R-beta, IL2R-gamma, IL7R-alpha, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a, CD28-OX40, CD28-4-1BB, or a ligand that specifically binds to CD83. In some embodiments, the costimulatory signaling domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the costimulatory signaling domain is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 18 or 204 or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the intracellular signaling domain, the first intracellular signaling domain, or the second intracellular signaling domain comprises a functional signaling domain derived from 4-1BB and a functional signaling domain derived from CD3zeta. In some embodiments, the intracellular signaling domain, the first intracellular signaling domain, or the second intracellular signaling domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto) and the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9 or 10 (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the intracellular signaling domain, the first intracellular signaling domain, or the second intracellular signaling domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 and the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9 or 10.
В некоторых вариантах осуществления CAR, первый CAR или второй CAR дополнительно содержат лидерную последовательность (например, первую или вторую лидерную последовательность). В некоторых вариантах осуществления лидерная последовательность предусматривает аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления лидерная последовательность кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 199 или 210 или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, the CAR, the first CAR, or the second CAR further comprises a leader sequence (e.g., a first or second leader sequence). In some embodiments, the leader sequence comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the leader sequence is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 199 or 210 or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления первая лидерная последовательность и вторая лидерная последовательность кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%). В некоторых вариантах осуществления первая шарнирная область и вторая шарнирная область кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%). В некоторых вариантах осуществления первый трансмембранный домен и второй трансмембранный домен кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%). В некоторых вариантах осуществления первый внутриклеточный сигнальный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%). В некоторых вариантах осуществления первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%). В некоторых вариантах осуществления первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%). В некоторых вариантах осуществления первая лидерная последовательность и вторая лидерная последовательность предусматривают одинаковые аминокислотные последовательности (например, первая лидерная последовательность и вторая лидерная последовательность предусматривают аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней). В некоторых вариантах осуществления первая лидерная последовательность и вторая лидерная последовательность предусматривают разные аминокислотные последовательности. В некоторых вариантах осуществления первая шарнирная область и вторая шарнирная область содержат одинаковые аминокислотные последовательности (например, первая шарнирная область и вторая шарнирная область содержат аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 2 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней). В некоторых вариантах осуществления первая шарнирная область и вторая шарнирная область содержат разные аминокислотные последовательности. В некоторых вариантах осуществления первый трансмембранный домен и второй трансмембранный домен содержат одинаковые аминокислотные последовательности (например, первый трансмембранный домен и второй трансмембранный домен содержат аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 6 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней). В некоторых вариантах осуществления первый трансмембранный домен и второй трансмембранный домен содержат разные аминокислотные последовательности. В некоторых вариантах осуществления первый внутриклеточный сигнальный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен содержат одинаковые аминокислотные последовательности. В некоторых вариантах осуществления первый внутриклеточный сигнальный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен содержат разные аминокислотные последовательности. В некоторых вариантах осуществления первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен содержат одинаковые аминокислотные последовательности (например, первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен содержат аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 10 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней). В некоторых вариантах осуществления первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен содержат разные аминокислотные последовательности. В некоторых вариантах осуществления первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен содержат одинаковые аминокислотные последовательности (например, первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен содержат аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 7 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней). В некоторых вариантах осуществления первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен содержат разные аминокислотные последовательности (например, первый и второй костимулирующие сигнальные домены содержат последовательность костимулирующего домена 4-1BB и последовательность костимулирующего домена CD28 соответственно или содержат последовательность костимулирующего домена CD28 и последовательность костимулирующего домена 4-1BB соответственно). В некоторых вариантах осуществления первая лидерная последовательность и вторая лидерная последовательность кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 199 и 210 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления первая лидерная последовательность и вторая лидерная последовательность кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 210 и 199 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления первая шарнирная область и вторая шарнирная область кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 337 и 13 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления первая шарнирная область и вторая шарнирная область кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 13 и 337 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления первый трансмембранный домен и второй трансмембранный домен кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 338 и 17 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления первый трансмембранный домен и второй трансмембранный домен кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 17 и 338 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 204 и 18 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 18 и 204 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 205 и 21 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними). В некоторых вариантах осуществления первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 21 и 205 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними).In some embodiments, the first leader sequence and the second leader sequence are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%). In some embodiments, the first hinge region and the second hinge region are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%). In some embodiments, the first transmembrane domain and the second transmembrane domain are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%). In some embodiments, the first intracellular signaling domain and the second intracellular signaling domain are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%). In some embodiments, the first primary signaling domain and the second primary signaling domain are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%). In some embodiments, the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%). In some embodiments, the first leader sequence and the second leader sequence provide the same amino acid sequences (e.g., the first leader sequence and the second leader sequence provide the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first leader sequence and the second leader sequence provide different amino acid sequences. In some embodiments, the first hinge region and the second hinge region comprise the same amino acid sequences (e.g., the first hinge region and the second hinge region comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first hinge region and the second hinge region comprise different amino acid sequences. In some embodiments, the first transmembrane domain and the second transmembrane domain comprise the same amino acid sequences (e.g., the first transmembrane domain and the second transmembrane domain comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first transmembrane domain and the second transmembrane domain comprise different amino acid sequences. In some embodiments, the first intracellular signaling domain and the second intracellular signaling domain comprise the same amino acid sequences. In some embodiments, the first intracellular signaling domain and the second intracellular signaling domain comprise different amino acid sequences. In some embodiments, the first primary signaling domain and the second primary signaling domain comprise the same amino acid sequence (e.g., the first primary signaling domain and the second primary signaling domain comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first primary signaling domain and the second primary signaling domain comprise different amino acid sequences. In some embodiments, the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain comprise the same amino acid sequence (e.g., the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain comprise different amino acid sequences (e.g., the first and second costimulatory signaling domains comprise a 4-1BB costimulatory domain sequence and a CD28 costimulatory domain sequence, respectively, or comprise a CD28 costimulatory domain sequence and a 4-1BB costimulatory domain sequence, respectively). In some embodiments, the first leader sequence and the second leader sequence are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NOs: 199 and 210, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first leader sequence and the second leader sequence are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NOs: 210 and 199, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first hinge region and the second hinge region are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NOs: 337 and 13, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first hinge region and the second hinge region are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NO: 13 and 337, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first transmembrane domain and the second transmembrane domain are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NO: 338 and 17, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first transmembrane domain and the second transmembrane domain are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NOs: 17 and 338, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NOs: 204 and 18, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain are encoded by nucleic acid sequences of SEQ ID NOs: 18 and 204, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first primary signaling domain and the second primary signaling domain are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NOs: 205 and 21, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the first primary signaling domain and the second primary signaling domain are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NO: 21 and 205, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto).
В некоторых вариантах осуществления CAR, первый CAR или второй CAR кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, содержащей посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита лесных сурков (WPRE).In some embodiments, the CAR, the first CAR or the second CAR is encoded by a nucleic acid molecule comprising a woodchuck hepatitis virus post-transcriptional regulatory element (WPRE).
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена молекула нуклеиновой кислоты, содержащая (a) первую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую первый антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий BCMA, где домен, связывающий BCMA, содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую определяющую комплементарность область 1 тяжелой цепи (CDR1 HC), определяющую комплементарность область 2 тяжелой цепи (CDR2 HC) и определяющую комплементарность область 3 тяжелой цепи (CDR3 HC), и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую определяющую комплементарность область 1 легкой цепи (CDR1 LC), определяющую комплементарность область 2 легкой цепи (CDR2 LC) и определяющую комплементарность область 3 легкой цепи (CDR3 LC), где CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под (i) SEQ ID NO: 86, 130, 88, 95, 131 и 132 соответственно; (ii) SEQ ID NO: 44, 45, 84, 54, 55 и 56 соответственно или (iii) SEQ ID NO: 179, 180, 181, 147, 182 и 183 соответственно; и (b) вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую второй антигенсвязывающий домен.In some embodiments, provided herein is a nucleic acid molecule comprising (a) a first nucleic acid sequence encoding a first antigen-binding domain that is a BCMA binding domain, wherein the BCMA binding domain comprises a heavy chain variable region (VH) comprising a heavy chain complementarity determining region 1 (CDR1 HC), a heavy chain complementarity determining region 2 (CDR2 HC), and a heavy chain complementarity determining region 3 (CDR3 HC), and a light chain variable region (VL) comprising a light chain complementarity determining region 1 (CDR1 LC), a light chain complementarity determining region 2 (CDR2 LC), and a light chain complementarity determining region 3 (CDR3 LC), wherein CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of (i) SEQ ID NO: 86, 130, 88, 95, 131 and 132, respectively; (ii) SEQ ID NO: 44, 45, 84, 54, 55 and 56, respectively, or (iii) SEQ ID NO: 179, 180, 181, 147, 182 and 183, respectively; and (b) a second nucleic acid sequence encoding a second antigen-binding domain.
В некоторых вариантах осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты предусматривает первую молекулу нуклеиновой кислоты и вторую молекулу нуклеиновой кислоты, которые являются отдельными молекулами нуклеиновой кислоты, и где первая последовательность нуклеиновой кислоты расположена в первой молекуле нуклеиновой кислоты, а вторая последовательность нуклеиновой кислоты расположена во второй молекуле нуклеиновой кислоты.In some embodiments, the isolated nucleic acid molecule comprises a first nucleic acid molecule and a second nucleic acid molecule that are separate nucleic acid molecules, and wherein the first nucleic acid sequence is located in the first nucleic acid molecule and the second nucleic acid sequence is located in the second nucleic acid molecule.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена молекула нуклеиновой кислоты, содержащая (a) первую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую первый антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий BCMA, где домен, связывающий BCMA, содержит (i) VH, содержащую CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC последовательности, связывающей BCMA, представленные в таблице 20 или 26, и VL, содержащую CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC последовательности, связывающей BCMA, представленные в таблице 20 или 26, где VH и VL соединены линкером, содержащим аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 243; (ii) VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 239 и 242 соответственно, где VH и VL соединены линкером, содержащим аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 243; или (iii) scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 200; и (b) вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую второй антигенсвязывающий домен.In some embodiments, provided herein is a nucleic acid molecule comprising (a) a first nucleic acid sequence encoding a first antigen-binding domain that is a BCMA binding domain, wherein the BCMA binding domain comprises (i) a VH comprising HC CDR1, HC CDR2, and HC CDR3 of a BCMA binding sequence set forth in Table 20 or 26, and a VL comprising LC CDR1, LC CDR2, and LC CDR3 of a BCMA binding sequence set forth in Table 20 or 26, wherein the VH and VL are connected by a linker comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 243; (ii) VH and VL comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 239 and 242, respectively, wherein VH and VL are connected by a linker comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 243; or (iii) an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 200; and (b) a second nucleic acid sequence encoding a second antigen-binding domain.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена молекула нуклеиновой кислоты, содержащая первую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую первый CAR, и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую второй CAR, где первый CAR содержит первый антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий BCMA, первый трансмембранный домен и первый внутриклеточный сигнальный домен, и где второй CAR содержит второй антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий CD19, второй трансмембранный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен, где (i) первый антигенсвязывающий домен содержит CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR LC, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 86, 87, 88, 95, 96 и 97 соответственно, и второй антигенсвязывающий домен содержит CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR LC, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 295 и 245-249 соответственно; (ii) первый антигенсвязывающий домен содержит VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 93 и 102 соответственно, и второй антигенсвязывающий домен содержит VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 250 и 251 соответственно; (iii) первый антигенсвязывающий домен содержит scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 105, и второй антигенсвязывающий домен содержит scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 211; (iv) первый CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 107 или 226, и второй CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 225 или 229; или (v) выделенная молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 271.In some embodiments, provided herein is a nucleic acid molecule comprising a first nucleic acid sequence encoding a first CAR and a second nucleic acid sequence encoding a second CAR, wherein the first CAR comprises a first antigen-binding domain that is a BCMA binding domain, a first transmembrane domain, and a first intracellular signaling domain, and wherein the second CAR comprises a second antigen-binding domain that is a CD19 binding domain, a second transmembrane domain, and a second intracellular signaling domain, wherein (i) the first antigen-binding domain comprises CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR LC comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 86, 87, 88, 95, 96, and 97, respectively, and the second antigen-binding domain comprises CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC and CDR LC comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 295 and 245-249, respectively; (ii) the first antigen-binding domain comprises a VH and VL comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 93 and 102, respectively, and the second antigen-binding domain comprises a VH and VL comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 250 and 251, respectively; (iii) the first antigen-binding domain comprises an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 105, and the second antigen-binding domain comprises an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 211; (iv) the first CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107 or 226, and the second CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225 or 229; or (v) the isolated nucleic acid molecule comprises the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 271.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена молекула нуклеиновой кислоты, содержащая первую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую первый CAR, и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую второй CAR, где первый CAR содержит первый антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий BCMA, первый трансмембранный домен и первый внутриклеточный сигнальный домен, и где второй CAR содержит второй антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий CD19, второй трансмембранный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен, где (i) первый антигенсвязывающий домен содержит CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR LC, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 44, 45, 76, 54, 55 и 56 соответственно, второй антигенсвязывающий домен содержит CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 295 и 245-249 соответственно; (ii) первый антигенсвязывающий домен содержит VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 78 и 61 соответственно, и второй антигенсвязывающий домен содержит VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 250 и 251 соответственно; (iii) первый антигенсвязывающий домен содержит scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 80, и второй антигенсвязывающий домен содержит scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 211; (iv) первый CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 82 или 224, и второй CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 225 или 229; или (v) выделенная молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 215.In some embodiments, provided herein is a nucleic acid molecule comprising a first nucleic acid sequence encoding a first CAR and a second nucleic acid sequence encoding a second CAR, wherein the first CAR comprises a first antigen-binding domain that is a BCMA binding domain, a first transmembrane domain, and a first intracellular signaling domain, and wherein the second CAR comprises a second antigen-binding domain that is a CD19 binding domain, a second transmembrane domain, and a second intracellular signaling domain, wherein (i) the first antigen-binding domain comprises CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR LC comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 44, 45, 76, 54, 55, and 56, respectively, the second antigen-binding domain comprises CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC and CDR3 LC comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 295 and 245-249, respectively; (ii) the first antigen-binding domain comprises a VH and VL comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 78 and 61, respectively, and the second antigen-binding domain comprises a VH and VL comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 250 and 251, respectively; (iii) the first antigen-binding domain comprises an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 80, and the second antigen-binding domain comprises an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 211; (iv) the first CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 82 or 224, and the second CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225 or 229; or (v) the isolated nucleic acid molecule comprises the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 215.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена молекула полипептида, кодируемая молекулой нуклеиновой кислоты, раскрытой в данном документе.In some embodiments, provided herein is a polypeptide molecule encoded by a nucleic acid molecule disclosed herein.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрен CAR, где CAR содержит (a) первый антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий BCMA, где домен, связывающий BCMA, содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую определяющую комплементарность область 1 тяжелой цепи (CDR1 HC), определяющую комплементарность область 2 тяжелой цепи (CDR2 HC) и определяющую комплементарность область 3 тяжелой цепи (CDR3 HC), и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую определяющую комплементарность область 1 легкой цепи (CDR1 LC), определяющую комплементарность область 2 легкой цепи (CDR2 LC) и определяющую комплементарность область 3 легкой цепи (CDR3 LC), где CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под (i) SEQ ID NO: 86, 130, 88, 95, 131 и 132 соответственно; (ii) SEQ ID NO: 44, 45, 84, 54, 55 и 56 соответственно или (iii) SEQ ID NO: 179, 180, 181, 147, 182 и 183 соответственно; и (b) второй антигенсвязывающий домен.In some embodiments, provided herein is a CAR, wherein the CAR comprises (a) a first antigen-binding domain that is a BCMA binding domain, wherein the BCMA binding domain comprises a heavy chain variable region (VH) comprising a heavy chain complementarity determining region 1 (CDR1 HC), a heavy chain complementarity determining region 2 (CDR2 HC), and a heavy chain complementarity determining region 3 (CDR3 HC), and a light chain variable region (VL) comprising a light chain complementarity determining region 1 (CDR1 LC), a light chain complementarity determining region 2 (CDR2 LC), and a light chain complementarity determining region 3 (CDR3 LC), wherein CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of (i) SEQ ID NOs: 86, 130, 88, 95, 131 and 132, respectively; (ii) SEQ ID NOs: 44, 45, 84, 54, 55 and 56, respectively, or (iii) SEQ ID NOs: 179, 180, 181, 147, 182 and 183, respectively; and (b) a second antigen-binding domain.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрен CAR, где CAR содержит (a) первый антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий BCMA, где домен, связывающий BCMA, содержит (i) VH, содержащую CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC последовательности, связывающей BCMA, представленные в таблице 20 или 26, и VL, содержащую CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC последовательности, связывающей BCMA, представленные в таблице 20 или 26, где VH и VL соединены линкером, содержащим аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 243; (ii) VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 239 и 242 соответственно, где VH и VL соединены линкером, содержащим аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 243; или (iii) scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 200; и (b) второй антигенсвязывающий домен.In some embodiments, provided herein is a CAR, wherein the CAR comprises (a) a first antigen binding domain that is a BCMA binding domain, wherein the BCMA binding domain comprises (i) a VH comprising the HC CDR1, HC CDR2, and HC CDR3 of a BCMA binding sequence set forth in Table 20 or 26, and a VL comprising the LC CDR1, LC CDR2, and LC CDR3 of a BCMA binding sequence set forth in Table 20 or 26, wherein the VH and VL are connected by a linker comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 243; (ii) a VH and VL comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 239 and 242, respectively, wherein the VH and VL are connected by a linker comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 243; or (iii) an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 200; and (b) a second antigen-binding domain.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрен вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты, раскрытую в данном документе, или молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления вектор выбран из ДНК-вектора, РНК-вектора, плазмиды, лентивирусного вектора, аденовирусного вектора или ретровирусного вектора. В некоторых вариантах осуществления вектор содержит промотор EF-1, содержащий последовательность нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 11.In some embodiments, provided herein is a vector comprising a nucleic acid molecule disclosed herein or a nucleic acid molecule encoding a CAR disclosed herein. In some embodiments, the vector is selected from a DNA vector, an RNA vector, a plasmid, a lentiviral vector, an adenoviral vector, or a retroviral vector. In some embodiments, the vector comprises an EF-1 promoter comprising the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 11.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена клетка, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты, раскрытую в данном документе, молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR, раскрытый в данном документе, полипептид, раскрытый в данном документе, CAR, раскрытый в данном документе, или вектор, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления клетка представляет собой T-клетку или NK-клетку.In some embodiments, provided herein is a cell comprising a nucleic acid molecule disclosed herein, a nucleic acid molecule encoding a CAR disclosed herein, a polypeptide disclosed herein, a CAR disclosed herein, or a vector disclosed herein. In some embodiments, the cell is a T cell or an NK cell.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыт способ получения клетки, включающий трансдукцию клетки вектором, раскрытым в данном документе, где клетка необязательно представляет собой T-клетку или NK-клетку. В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыт способ получения РНК-сконструированной клетки, включающий введение РНК, транскрибированной in vitro, или синтетической РНК в клетку, где РНК содержит молекулу нуклеиновой кислоты, раскрытую в данном документе, молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления клетка представляет собой T-клетку или NK-клетку.In some embodiments, disclosed herein is a method of producing a cell comprising transducing the cell with a vector disclosed herein, wherein the cell is optionally a T cell or an NK cell. In some embodiments, disclosed herein is a method of producing an RNA engineered cell comprising introducing in vitro transcribed RNA or synthetic RNA into a cell, wherein the RNA comprises a nucleic acid molecule disclosed herein, a nucleic acid molecule encoding a CAR disclosed herein. In some embodiments, the cell is a T cell or an NK cell.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыт способ получения популяции клеток (например, T-клеток), которые экспрессируют химерный антигенный рецептор (CAR), при этом способ включает (i) приведение популяции клеток (например, T-клеток, например, T-клеток, выделенных из замороженного или свежего продукта лейкафереза) в контакт (например, связывание) со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток; (ii) приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, раскрытой в данном документе, или молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, раскрытый в данном документе, за счет чего обеспечивается получение популяции клеток (например, T-клеток), содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, и (iii) сбор популяции клеток (например, T-клеток) для хранения (например, повторного составления популяции клеток в среде для криоконсервации) или введения, где:In some embodiments, disclosed herein is a method for producing a population of cells (e.g., T cells) that express a chimeric antigen receptor (CAR), the method comprising (i) contacting the population of cells (e.g., T cells, e.g., T cells isolated from a frozen or fresh leukapheresis product) with (e.g., binding) an agent that stimulates a CD3/TCR complex and/or an agent that stimulates a costimulatory molecule on the surface of the cells; (ii) contacting the population of cells (e.g., T cells) with a nucleic acid molecule as disclosed herein or a nucleic acid molecule encoding a CAR as disclosed herein, thereby producing a population of cells (e.g., T cells) comprising the nucleic acid molecule, and (iii) collecting the population of cells (e.g., T cells) for storage (e.g., reconstituting the population of cells in a cryopreservation medium) or administration, wherein:
(a) стадию (ii) проводят вместе со стадией (i) или не позже чем через 20 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 12, 13, 14, 15, 16, 17 или 18 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 18 часов после начала стадии (i), и(a) step (ii) is carried out together with step (i) or not later than 20 hours after the start of step (i), such as not later than 12, 13, 14, 15, 16, 17 or 18 hours after the start of step (i), such as not later than 18 hours after the start of step (i), and
стадию (iii) проводят не позже чем через 30 (например, 26) часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 24 часа после начала стадии (i),step (iii) is carried out no later than 30 (e.g. 26) hours after the start of step (i), such as no later than 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 or 30 hours after the start of step (i), such as no later than 24 hours after the start of step (i),
(b) стадию (ii) проводят вместе со стадией (i) или не позже чем через 20 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 12, 13, 14, 15, 16, 17 или 18 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 18 часов после начала стадии (i), и(b) step (ii) is carried out together with step (i) or not later than 20 hours after the start of step (i), such as not later than 12, 13, 14, 15, 16, 17 or 18 hours after the start of step (i), such as not later than 18 hours after the start of step (i), and
стадию (iii) проводят не позже чем через 30 часов после начала стадии (ii), например, не позже чем через 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 часов после начала стадии (ii), илиstep (iii) is carried out no later than 30 hours after the start of step (ii), for example, no later than 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 or 30 hours after the start of step (ii), or
(c) популяция клеток из стадии (iii) не является размножившейся или является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 или 40%, например, на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (i),(c) the population of cells from step (iii) is not expanded or is expanded by an increase in number of no more than 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 or 40%, such as no more than 10%, such as as assessed by the number of living cells, compared to the population of cells at the start of step (i),
где молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) необязательно находится в вирусном векторе, где молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) необязательно представляет собой молекулу РНК в вирусном векторе, где стадия (ii) необязательно включает трансдукцию популяции клеток (например, T-клеток) с помощью вирусного вектора, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR.wherein the nucleic acid molecule in step (ii) is optionally in a viral vector, wherein the nucleic acid molecule in step (ii) is optionally an RNA molecule in a viral vector, wherein step (ii) optionally comprises transducing a population of cells (e.g. T cells) with a viral vector containing a nucleic acid molecule encoding a CAR.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыт способ получения популяции клеток (например, T-клеток), которые экспрессируют химерный антигенный рецептор (CAR), при этом способ включает (1) приведение популяции клеток (например, T-клеток, например, T-клеток, выделенных из замороженного продукта лейкафереза) в контакт с цитокином, выбранным из IL-2, IL-7, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21, IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra) или их комбинации, (2) приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, раскрытой в данном документе, или молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, раскрытый в данном документе, за счет чего обеспечивается получение популяции клеток (например, T-клеток), содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, и (3) сбор популяции клеток (например, T-клеток) для хранения (например, повторного составления популяции клеток в среде для криоконсервации) или введения, где:In some embodiments, disclosed herein is a method for producing a population of cells (e.g., T cells) that express a chimeric antigen receptor (CAR), the method comprising (1) contacting the population of cells (e.g., T cells, e.g., T cells isolated from a frozen leukapheresis product) with a cytokine selected from IL-2, IL-7, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21, IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra), or a combination thereof, (2) contacting the population of cells (e.g., T cells) with a nucleic acid molecule as disclosed herein or a nucleic acid molecule encoding a CAR as disclosed herein, thereby producing a population of cells (e.g., T cells) comprising the nucleic acid molecule, and (3) collecting the population of cells (e.g., T cells) for storage (e.g. repopulation of cells in cryopreservation medium) or administration where:
(a) стадию (2) проводят вместе со стадией (1) или не позже чем через 5 часов после начала стадии (1), например, не позже чем через 1, 2, 3, 4 или 5 часов после начала стадии (1), и(a) step (2) is carried out together with step (1) or not later than 5 hours after the start of step (1), for example not later than 1, 2, 3, 4 or 5 hours after the start of step (1), and
стадию (3) проводят не позже чем через 26 часов после начала стадии (1), например, не позже чем через 22, 23 или 24 часа после начала стадии (1), например, не позже чем через 24 часа после начала стадии (1), илиstage (3) is carried out no later than 26 hours after the start of stage (1), for example, no later than 22, 23 or 24 hours after the start of stage (1), for example, no later than 24 hours after the start of stage (1), or
(b) популяция клеток из стадии (3) не является размножившейся или является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 или 40%, например, на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (1),(b) the population of cells from step (3) is not expanded or is expanded by an increase in number of no more than 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 or 40%, such as no more than 10%, such as as assessed by the number of living cells, compared to the population of cells at the start of step (1),
где молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) необязательно находится в вирусном векторе, где молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) необязательно представляет собой молекулу РНК в вирусном векторе, где стадия (ii) необязательно включает трансдукцию популяции клеток (например, T-клеток) с помощью вирусного вектора, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR.wherein the nucleic acid molecule in step (2) is optionally in a viral vector, wherein the nucleic acid molecule in step (ii) is optionally an RNA molecule in a viral vector, wherein step (ii) optionally comprises transducing a population of cells (e.g. T cells) with a viral vector containing a nucleic acid molecule encoding a CAR.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыта популяция клеток, сконструированных таким образом, что они экспрессируют CAR ("популяция клеток, экспрессирующих CAR"), при этом указанная популяция предусматривает: (a) приблизительно такую же процентную долю необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ T-клеток, по сравнению с процентной долей необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (b) изменение количества необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ T-клеток, находящееся в пределах от приблизительно 5% до приблизительно 10%, например, по сравнению с процентной долей необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (c) увеличенную процентную долю необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ T-клеток, например, увеличенную в по меньшей мере 1,2, 1,4, 1,6, 1,8, 2,0, 2,2, 2,4, 2,6, 2,8 или 3 раза, по сравнению с процентной долей необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (d) приблизительно такую же процентную долю центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, по сравнению с процентной долей центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (e) изменение количества центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, находящееся в пределах от приблизительно 5% до приблизительно 10%, по сравнению с процентной долей центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (f) уменьшенную процентную долю центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, например, уменьшенную на по меньшей мере 20, 25, 30, 35, 40, 45 или 50%, по сравнению с процентной долей центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (g) приблизительно такую же процентную долю стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, по сравнению с процентной долей стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (h) изменение количества стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, находящееся в пределах от приблизительно 5% до приблизительно 10%, по сравнению с процентной долей стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; или (i) увеличенную процентную долю стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, по сравнению с процентной долей стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR. В некоторых вариантах осуществления популяция содержит клетку, раскрытую в данном документе. В некоторых вариантах осуществления популяция содержит клетку, содержащую двойной CAR или CAR в формате диатела, раскрытые в данном документе. В некоторых вариантах осуществления популяция содержит клетку, содержащую (a) первый антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий BCMA, где домен, связывающий BCMA, содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую определяющую комплементарность область 1 тяжелой цепи (CDR1 HC), определяющую комплементарность область 2 тяжелой цепи (CDR2 HC) и определяющую комплементарность область 3 тяжелой цепи (CDR3 HC), и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую определяющую комплементарность область 1 легкой цепи (CDR1 LC), определяющую комплементарность область 2 легкой цепи (CDR2 LC) и определяющую комплементарность область 3 легкой цепи (CDR3 LC), где CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под (i) SEQ ID NO: 86, 130, 88, 95, 131 и 132 соответственно; (ii) SEQ ID NO: 44, 45, 84, 54, 55 и 56 соответственно или (iii) SEQ ID NO: 179, 180, 181, 147, 182 и 183 соответственно; и (b) второй антигенсвязывающий домен.In some embodiments, disclosed herein is a population of cells engineered to express a CAR ("CAR-expressing population of cells"), wherein the population comprises: (a) about the same percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RO- CCR7+ T cells, compared to the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RO- CCR7+ cells, in the same population of cells prior to being engineered to express a CAR; (b) a change in the number of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RO- CCR7+ T cells, of from about 5% to about 10%, such as compared to the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RO- CCR7+ T cells, in the same population of cells before they were engineered to express the CAR; (c) an increased percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RO- CCR7+ T cells, such as increased by at least 1.2, 1.4, 1.6, 1.8, 2.0, 2.2, 2.4, 2.6, 2.8, or 3-fold, compared to the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RO- CCR7+ T cells, in the same population of cells prior to engineering them to express the CAR; (d) approximately the same percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, compared to the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, in the same population of cells before they were engineered to express the CAR; (e) a change in the number of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, of from about 5% to about 10% compared to the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, in the same population of cells before they were engineered to express the CAR; (f) a reduced percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, such as reduced by at least 20, 25, 30, 35, 40, 45 or 50%, compared to the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, in the same population of cells before they were engineered to express the CAR; (g) approximately the same percentage of memory T stem cells, e.g., CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, compared to the percentage of memory T stem cells, e.g., CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the same cell population before they were engineered to express the CAR; (h) a change in the number of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, of between about 5% and about 10%, compared to the percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the same population of cells prior to their engineering to express the CAR; or (i) an increased percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, compared to the percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the same population of cells before they were engineered to express a CAR. In some embodiments, the population comprises a cell as disclosed herein. In some embodiments, the population comprises a cell comprising a dual CAR or a diabody format CAR as disclosed herein. In some embodiments, the population comprises a cell comprising (a) a first antigen-binding domain that is a BCMA binding domain, wherein the BCMA binding domain comprises a heavy chain variable region (VH) comprising a heavy chain complementarity determining region 1 (CDR1 HC), a heavy chain complementarity determining region 2 (CDR2 HC), and a heavy chain complementarity determining region 3 (CDR3 HC), and a light chain variable region (VL) comprising a light chain complementarity determining region 1 (CDR1 LC), a light chain complementarity determining region 2 (CDR2 LC), and a light chain complementarity determining region 3 (CDR3 LC), wherein CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of (i) SEQ ID NO: 1 ID NO: 86, 130, 88, 95, 131 and 132, respectively; (ii) SEQ ID NO: 44, 45, 84, 54, 55 and 56, respectively, or (iii) SEQ ID NO: 179, 180, 181, 147, 182 and 183, respectively; and (b) a second antigen-binding domain.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыта фармацевтическая композиция, содержащая клетку, раскрытую в данном документе, или популяцию клеток, раскрытую в данном документе, и фармацевтически приемлемый носитель.In some embodiments, disclosed herein is a pharmaceutical composition comprising a cell disclosed herein or a population of cells disclosed herein and a pharmaceutically acceptable carrier.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток получают посредством способа, раскрытого в данном документе. В некоторых вариантах осуществления популяция содержит:In some embodiments, the population of cells is obtained by a method disclosed herein. In some embodiments, the population comprises:
(a) первую популяцию клеток, содержащих CAR для BCMA, но не CAR для CD19;(a) the first population of cells containing CAR for BCMA but not CAR for CD19;
(b) вторую популяцию клеток, содержащих CAR для CD19, но не CAR для BCMA; и(b) a second population of cells containing a CAR for CD19 but not a CAR for BCMA; and
(c) третью популяцию клеток, содержащих как CAR для BCMA, так и CAR для CD19.(c) a third population of cells containing both CAR for BCMA and CAR for CD19.
В некоторых вариантах осуществления:In some embodiments:
(i) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях;(i) the total number of viable cells in the combined second and third populations is less than or equal to approximately 110% (e.g., less than or equal to approximately 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations;
(ii) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000% , 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях; и/или(ii) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the combined second and third populations; and/or
(iii) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 5% (например, больше или равняется приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90%) от общего количества жизнеспособных клеток в популяции.(iii) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to approximately 5% (e.g., greater than or equal to approximately 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, or 90%) of the total number of viable cells in the population.
В некоторых вариантах осуществления популяция дополнительно содержит четвертую популяцию клеток, которые не содержат CAR.In some embodiments, the population further comprises a fourth population of cells that do not contain CAR.
В некоторых вариантах осуществления:In some embodiments:
(i) общее количество жизнеспособных клеток во второй популяции меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях;(i) the total number of viable cells in the second population is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations;
(ii) общее количество жизнеспособных клеток во второй популяции меньше или равняется от приблизительно 45% до приблизительно 50% (например, приблизительно 47%); от приблизительно 50 до приблизительно 55% (например, приблизительно 53%); от приблизительно 60% до приблизительно 65% (например, приблизительно 63%) или от приблизительно 80 до приблизительно 85% (например, приблизительно 82%) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях.(ii) the total number of viable cells in the second population is less than or equal to from about 45% to about 50% (e.g., about 47%); from about 50% to about 55% (e.g., about 53%); from about 60% to about 65% (e.g., about 63%); or from about 80% to about 85% (e.g., about 82%) of the total number of viable cells in the combined first and third populations.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыт способ обеспечения противоопухолевого иммунитета у субъекта, включающий введение субъекту эффективного количества клетки, раскрытой в данном документе, популяции клеток, раскрытых в данном документе, или фармацевтической композиции, раскрытой в данном документе. В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыт способ лечения субъекта, у которого имеется заболевание, ассоциированное с экспрессией BCMA, включающий введение субъекту эффективного количества клетки, раскрытой в данном документе, популяции клеток, раскрытой в данном документе, или фармацевтической композиции, раскрытой в данном документе. В некоторых вариантах осуществления заболевание, ассоциированное с экспрессией BCMA, представляет собой (i) рак, или злокачественное новообразование, или предраковое состояние, выбранное из одного или нескольких из миелодисплазии, миелодиспластического синдрома или предлейкоза, или (ii) не связанное с раком показание, ассоциированное с экспрессией BCMA. В некоторых вариантах осуществления заболевание представляет собой гематологический рак или солидный рак. В некоторых вариантах осуществления заболевание выбрано из острого лейкоза, B-клеточного острого лимфоидного лейкоза ("BALL"), T-клеточного острого лимфоидного лейкоза ("TALL"), острого лимфоидного лейкоза (ALL), хронического миелогенного лейкоза (CML), хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), B-клеточного пролимфоцитарного лейкоза, новообразования из бластных плазмоцитоидных дендритных клеток, лимфомы Беркитта, диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомы, фолликулярной лимфомы, волосатоклеточного лейкоза, мелкоклеточной или крупноклеточной фолликулярной лимфомы, злокачественных лимфопролиферативных состояний, MALT-лимфомы, мантийноклеточной лимфомы, лимфомы из клеток маргинальной зоны, множественной миеломы, миелодисплазии и миелодиспластического синдрома, неходжкинской лимфомы, плазмобластной лимфомы, новообразования из плазмоцитоидных дендритных клеток, макроглобулинемии Вальденстрема, рака предстательной железы (например, кастрационнорезистентного или резистентного к терапии рака предстательной железы или метастатического рака предстательной железы), рака поджелудочной железы, рака легкого, нарушения пролиферации плазматических клеток (например, бессимптомной миеломы ("тлеющей" множественной миеломы или вялотекущей миеломы), моноклональной гаммапатии неустановленной этиологии (MGUS), макроглобулинемии Вальденстрема, плазмоцитомы (например, плазмоклеточной дискразии, солитарной миеломы, солитарной плазмоцитомы, экстрамедуллярной плазмоцитомы и множественной плазмоцитомы), системного амилоидоза в форме амилоидоза легких цепей или POEMS-синдрома (также известного как синдром Кроу-Фукаса, болезнь Такатсуки и PEP-синдром)) или их комбинации. В некоторых вариантах осуществления заболевание представляет собой множественную миелому.In some embodiments, disclosed herein is a method of providing anti-tumor immunity in a subject comprising administering to the subject an effective amount of a cell disclosed herein, a population of cells disclosed herein, or a pharmaceutical composition disclosed herein. In some embodiments, disclosed herein is a method of treating a subject having a disease associated with BCMA expression comprising administering to the subject an effective amount of a cell disclosed herein, a population of cells disclosed herein, or a pharmaceutical composition disclosed herein. In some embodiments, the disease associated with BCMA expression is (i) cancer or a malignancy or a precancerous condition selected from one or more of myelodysplasia, myelodysplastic syndrome, or preleukemia, or (ii) a non-cancer indication associated with BCMA expression. In some embodiments, the disease is a hematological cancer or a solid cancer. In some embodiments, the disease is selected from acute leukemia, B-cell acute lymphoid leukemia ("BALL"), T-cell acute lymphoid leukemia ("TALL"), acute lymphoid leukemia (ALL), chronic myelogenous leukemia (CML), chronic lymphocytic leukemia (CLL), B-cell prolymphocytic leukemia, blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Burkitt's lymphoma, diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, hairy cell leukemia, small cell or large cell follicular lymphoma, malignant lymphoproliferative conditions, MALT lymphoma, mantle cell lymphoma, marginal zone cell lymphoma, multiple myeloma, myelodysplasia and myelodysplastic syndrome, non-Hodgkin's lymphoma, plasmablastic lymphoma, plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Waldenstrom's macroglobulinemia, prostate cancer (e.g., castration-resistant or therapy-resistant prostate cancer or metastatic prostate cancer), pancreatic cancer, lung cancer, plasma cell proliferative disorders (e.g., asymptomatic myeloma ("smoldering" multiple myeloma or smoldering myeloma), monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS), Waldenstrom's macroglobulinemia, plasmacytoma (e.g., plasma cell dyscrasia, solitary myeloma, solitary plasmacytoma, extramedullary plasmacytoma, and multiple plasmacytoma), systemic amyloidosis in the form of light chain amyloidosis or POEMS syndrome (also known as POEMS syndrome) Crowe-Fukasa, Takatsuki disease, and PEP syndrome)) or combinations thereof. In some embodiments, the disease is multiple myeloma.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток или фармацевтическую композицию вводят субъекту в дозе от приблизительно 1×106 до приблизительно 1×108 (например, от приблизительно 2×106 до приблизительно 5×107, от приблизительно 5×106 до приблизительно 2×107, от приблизительно 1×106 до приблизительно 1×107, от приблизительно 1×107 до приблизительно 1×108, от приблизительно 1×106 до приблизительно 3×106, от приблизительно 2×106 до приблизительно 4×106, от приблизительно 3×106 до приблизительно 5×106, от приблизительно 4×106 до приблизительно 6×106, от приблизительно 5×106 до приблизительно 7×106, от приблизительно 6×106 до приблизительно 8×106, от приблизительно 7×106 до приблизительно 9×106, от приблизительно 8×106 до приблизительно 1×107, от приблизительно 9×106 до приблизительно 2×107, от приблизительно 1×107 до приблизительно 3×107, от приблизительно 2×107 до приблизительно 4×107, от приблизительно 3×107 до приблизительно 5×107, от приблизительно 4×107 до приблизительно 6×107, от приблизительно 5×107 до приблизительно 7×107, от приблизительно 6×107 до приблизительно 8×107, от приблизительно 7×107 до приблизительно 9×107, от приблизительно 8×107 до приблизительно 1×108, приблизительно 1×106, приблизительно 2×106, приблизительно 3×106, приблизительно 4×106, приблизительно 5×106, приблизительно 6×106, приблизительно 7×106, приблизительно 8×106, приблизительно 9×106, приблизительно 1×107, приблизительно 2×107, приблизительно 3×107, приблизительно 4×107, приблизительно 5×107, приблизительно 6×107, приблизительно 7×107, приблизительно 8×107, приблизительно 9×107 или приблизительно 1×108) CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток). В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток или фармацевтическую композицию вводят субъекту в дозе от приблизительно 5×106 до приблизительно 2×107 CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток).In some embodiments, the population of cells or pharmaceutical composition is administered to the subject at a dose of from about 1×10 6 to about 1×10 8 (e.g., from about 2×10 6 to about 5×10 7 , from about 5×10 6 to about 2×10 7 , from about 1×10 6 to about 1×10 7 , from about 1×10 7 to about 1×10 8 , from about 1×10 6 to about 3×10 6 , from about 2×10 6 to about 4×10 6 , from about 3×10 6 to about 5×10 6 , from about 4×10 6 to about 6×10 6 , from about 5×10 6 to about 7×10 6 , from about 6×10 6 to about 8×10 6 , from about 7×10 6 to about 9×10 6 , from about 8×10 6 to about 1×10 7 , from about 9×10 6 to about 2×10 7 , from about 1×10 7 to about 3×10 7 , from about 2×10 7 to about 4×10 7 , from about 3×10 7 to about 5×10 7 , from about 4×10 7 to about 6×10 7 , from about 5×10 7 to about 7×10 7 , from about 6×10 7 to about 8×10 7 , from about 7×10 7 to about 9×10 7 , from about 8×10 7 to about 1×10 8 , about 1×10 6 , about 2×10 6 , about 3×10 6 , about 4×10 6 , about 5×10 6 , about 6×10 6 , about 7×10 6 , about 8×10 6 , about 9×10 6 , about 1×10 7 , about 2×10 7 , about 3×10 7 , about 4×10 7 , about 5×10 7 , about 6×10 7 , about 7×10 7 , about 8×10 7 , about 9×10 7 or about 1×10 8 ) CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells). In some embodiments, the population of cells or pharmaceutical composition is administered to the subject at a dose of from about 5×10 6 to about 2×10 7 CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells).
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток или фармацевтическую композицию вводят субъекту в одной или нескольких (например, 2, 3, 4 или больше) дозах. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток или фармацевтическую композицию вводят субъекту в двух дозах. В некоторых вариантах осуществления одна или несколько доз включают первую дозу и вторую дозу, где количество CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) в первой дозе больше количества, равняется количеству или меньше количества CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) во второй дозе.In some embodiments, the population of cells or the pharmaceutical composition is administered to the subject in one or more (e.g., 2, 3, 4, or more) doses. In some embodiments, the population of cells or the pharmaceutical composition is administered to the subject in two doses. In some embodiments, the one or more doses comprise a first dose and a second dose, wherein the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the first dose is greater than, equal to, or less than the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the second dose.
В некоторых вариантах осуществления одна или несколько доз включают первую дозу и вторую дозу, где:In some embodiments, the one or more doses comprise a first dose and a second dose, wherein:
(a) первая доза содержит от приблизительно 1×106 до приблизительно 1×107 (например, от приблизительно 2×106 до приблизительно 8×106, от приблизительно 4×106 до приблизительно 6×106, от приблизительно 1×106 до приблизительно 5×106, от приблизительно 5×106 до приблизительно 1×107, от приблизительно 1×106 до приблизительно 3×106, от приблизительно 2×106 до приблизительно 4×106, от приблизительно 3×106 до приблизительно 5×106, от приблизительно 4×106 до приблизительно 6×106, от приблизительно 5×106 до приблизительно 7×106, от приблизительно 6×106 до приблизительно 8×106, от приблизительно 7×106 до приблизительно 9×106, от приблизительно 8×106 до приблизительно 1×107, приблизительно 1×106, приблизительно 2×106, приблизительно 3×106, приблизительно 4×106, приблизительно 5×106, приблизительно 6×106, приблизительно 7×106, приблизительно 8×106, приблизительно 9×106 или приблизительно 1×107) жизнеспособных CAR-положительных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток);(a) the first dose comprises from about 1×10 6 to about 1×10 7 (e.g., from about 2×10 6 to about 8×10 6 , from about 4×10 6 to about 6×10 6 , from about 1×10 6 to about 5×10 6 , from about 5×10 6 to about 1×10 7 , from about 1×10 6 to about 3×10 6 , from about 2×10 6 to about 4×10 6 , from about 3×10 6 to about 5×10 6 , from about 4×10 6 to about 6×10 6 , from about 5×10 6 to about 7×10 6 , from about 6×10 6 to about 8×10 6 , from about 7×10 6 to about 9×10 6 , from about 8×10 6 to about 1×10 7 , about 1×10 6 , about 2×10 6 , about 3×10 6 , about 4×10 6 , about 5×10 6 , about 6×10 6 , about 7×10 6 , about 8×10 6 , about 9×10 6 , or about 1×10 7 ) of viable CAR-positive cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells);
(b) вторая доза содержит от приблизительно 1×107 до приблизительно 1×108 (например, от приблизительно 2×107 до приблизительно 8×107, от приблизительно 4×107 до приблизительно 6×107, от приблизительно 1×107 до приблизительно 5×107, от приблизительно 5×107 до приблизительно 1×108, от приблизительно 1×107 до приблизительно 3×107, от приблизительно 2×107 до приблизительно 4×107, от приблизительно 3×107 до приблизительно 5×107, от приблизительно 4×107 до приблизительно 6×107, от приблизительно 5×107 до приблизительно 7×107, от приблизительно 6×107 до приблизительно 8×107, от приблизительно 7×107 до приблизительно 9×107, от приблизительно 8×107 до приблизительно 1×108, приблизительно 1×107, приблизительно 2×107, приблизительно 3×107, приблизительно 4×107, приблизительно 5×107, приблизительно 6×107, приблизительно 7×107, приблизительно 8×107, приблизительно 9×107 или приблизительно 1×108) CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток);(b) the second dose comprises from about 1×10 7 to about 1×10 8 (e.g., from about 2×10 7 to about 8×10 7 , from about 4×10 7 to about 6×10 7 , from about 1×10 7 to about 5×10 7 , from about 5×10 7 to about 1×10 8 , from about 1×10 7 to about 3×10 7 , from about 2×10 7 to about 4×10 7 , from about 3×10 7 to about 5×10 7 , from about 4×10 7 to about 6×10 7 , from about 5×10 7 to about 7×10 7 , from about 6×10 7 to about 8×10 7 , from about 7×10 7 to about 9×10 7 , from about 8×10 7 to about 1×10 8 , about 1×10 7 , about 2×10 7 , about 3×10 7 , about 4×10 7 , about 5×10 7 , about 6×10 7 , about 7×10 7 , about 8×10 7 , about 9×10 7 or about 1×10 8 ) CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells);
(c) количество CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) в первой дозе составляет не более чем 1/X, где X равняется 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100, от количества CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) во второй дозе; и/или(c) the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the first dose is no more than 1/X, where X is 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, or 100, of the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the second dose; and/or
(d) количество CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) в первой дозе составляет от приблизительно 1% до 100% (например, от приблизительно 10% до приблизительно 90%, от приблизительно 20% до приблизительно 80%, от приблизительно 30% до приблизительно 70%, от приблизительно 40% до приблизительно 60%, от приблизительно 10% до приблизительно 50%, от приблизительно 50% до приблизительно 90%, от приблизительно 10% до приблизительно 30%, от приблизительно 20% до приблизительно 40%, от приблизительно 30% до приблизительно 50%, от приблизительно 50% до приблизительно 70%, от приблизительно 60% до приблизительно 80% или от приблизительно 70% до приблизительно 90%) от количества CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) во второй дозе.(d) the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the first dose is from about 1% to 100% (e.g., from about 10% to about 90%, from about 20% to about 80%, from about 30% to about 70%, from about 40% to about 60%, from about 10% to about 50%, from about 50% to about 90%, from about 10% to about 30%, from about 20% to about 40%, from about 30% to about 50%, from about 50% to about 70%, from about 60% to about 80%, or from about 70% to about 90%) of the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the second dose.
В некоторых вариантах осуществления первая доза содержит приблизительно 5×106 жизнеспособных CAR-положительных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток). В некоторых вариантах осуществления вторая доза содержит приблизительно 1×107 или приблизительно 2×107 жизнеспособных CAR-положительных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток).In some embodiments, the first dose comprises about 5×10 6 viable CAR-positive cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells). In some embodiments, the second dose comprises about 1×10 7 or about 2×10 7 viable CAR-positive cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells).
В некоторых вариантах осуществления способ дополнительно включает введение субъекту второго терапевтического средства. В некоторых вариантах осуществления второе терапевтическое средство выбрано из (i) ингибитора PD-1, где ингибитор PD-1 необязательно выбран из группы, состоящей из PDR001, ниволумаба, пембролизумаба, пидилизумаба, MEDI0680, REGN2810, TSR-042, PF-06801591 и AMP-224; (ii) ингибитора PD-L1, где ингибитор PD-L1 необязательно выбран из группы, состоящей из FAZ053, атезолизумаба, авелумаба, дурвалумаба и BMS-936559; (iii) ингибитора LAG-3, где ингибитор LAG-3 необязательно выбран из группы, состоящей из LAG525, BMS-986016, TSR-033, MK-4280 и REGN3767; (iv) ингибитора TIM-3, где ингибитор TIM-3 необязательно выбран из группы, состоящей из MBG453, TSR-022 и LY3321367; (v) ингибитора CTLA-4, где ингибитор CTLA-4 необязательно представляет собой ипилимумаб или тремелимумаб; (vi) полипептида интерлейкина-15 (IL-15), полипептида альфа-субъединицы рецептора интерлейкина-15 (IL-15Ra) или комбинации как полипептида IL-15, так и полипептида IL-15Ra, например, hetIL-15; (vii) полипептида интерлейкина-12 (IL-12); или (viii) ингибитора mTOR, где ингибитор mTOR необязательно представляет собой RAD001 или рапамицин.In some embodiments, the method further comprises administering to the subject a second therapeutic agent. In some embodiments, the second therapeutic agent is selected from (i) a PD-1 inhibitor, wherein the PD-1 inhibitor is optionally selected from the group consisting of PDR001, nivolumab, pembrolizumab, pidilizumab, MEDI0680, REGN2810, TSR-042, PF-06801591, and AMP-224; (ii) a PD-L1 inhibitor, wherein the PD-L1 inhibitor is optionally selected from the group consisting of FAZ053, atezolizumab, avelumab, durvalumab, and BMS-936559; (iii) a LAG-3 inhibitor, wherein the LAG-3 inhibitor is optionally selected from the group consisting of LAG525, BMS-986016, TSR-033, MK-4280 and REGN3767; (iv) a TIM-3 inhibitor, wherein the TIM-3 inhibitor is optionally selected from the group consisting of MBG453, TSR-022 and LY3321367; (v) a CTLA-4 inhibitor, wherein the CTLA-4 inhibitor is optionally ipilimumab or tremelimumab; (vi) an interleukin-15 (IL-15) polypeptide, an interleukin-15 receptor alpha subunit (IL-15Ra) polypeptide, or a combination of both an IL-15 polypeptide and an IL-15Ra polypeptide, such as hetIL-15; (vii) an interleukin-12 (IL-12) polypeptide; or (viii) an mTOR inhibitor, wherein the mTOR inhibitor is optionally RAD001 or rapamycin.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена клетка, содержащая (a) первый CAR, содержащий первый антигенсвязывающий домен, который связывается с первым антигеном, первый трансмембранный домен и первый внутриклеточный сигнальный домен (например, первый первичный сигнальный домен и/или первый костимулирующий сигнальный домен), где первый CAR необязательно дополнительно содержит первую лидерную последовательность и/или первую шарнирную область; и (b) второй CAR, содержащий второй антигенсвязывающий домен, который связывается со вторым антигеном, второй трансмембранный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен (например, второй первичный сигнальный домен и/или второй костимулирующий сигнальный домен), где второй CAR необязательно дополнительно содержит вторую лидерную последовательность и/или вторую шарнирную область, где (i) первая лидерная последовательность и вторая лидерная последовательность кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%), где первая и вторая лидерные последовательности необязательно содержат одинаковые аминокислотные последовательности; (ii) первая шарнирная область и вторая шарнирная область кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%), где первая и вторая шарнирные области необязательно содержат одинаковые аминокислотные последовательности; (iii) первый трансмембранный домен и второй трансмембранный домен кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%), где первый и второй трансмембранные домены необязательно содержат одинаковые аминокислотные последовательности; и/или (iv) первый внутриклеточный сигнальный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%), где необязательно первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%) и/или первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%).In some embodiments, provided herein is a cell comprising (a) a first CAR comprising a first antigen-binding domain that binds to a first antigen, a first transmembrane domain, and a first intracellular signaling domain (e.g., a first primary signaling domain and/or a first costimulatory signaling domain), wherein the first CAR optionally further comprises a first leader sequence and/or a first hinge region; and (b) a second CAR comprising a second antigen-binding domain that binds a second antigen, a second transmembrane domain, and a second intracellular signaling domain (e.g., a second primary signaling domain and/or a second costimulatory signaling domain), wherein the second CAR optionally further comprises a second leader sequence and/or a second hinge region, wherein (i) the first leader sequence and the second leader sequence are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%), wherein the first and second leader sequences optionally comprise the same amino acid sequences; (ii) the first hinge region and the second hinge region are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%), wherein the first and second hinge regions optionally comprise the same amino acid sequences; (iii) the first transmembrane domain and the second transmembrane domain are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%), wherein the first and second transmembrane domains optionally comprise the same amino acid sequences; and/or (iv) the first intracellular signaling domain and the second intracellular signaling domain are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%), wherein optionally the first primary signaling domain and the second primary signaling domain are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%) and/or the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%).
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена молекула нуклеиновой кислоты, содержащая (a) первую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую первый CAR, где первый CAR содержит первый антигенсвязывающий домен, который связывается с первым антигеном, первый трансмембранный домен и первый внутриклеточный сигнальный домен (например, первый первичный сигнальный домен и/или первый костимулирующий сигнальный домен), где первый CAR необязательно дополнительно содержит первую лидерную последовательность и/или первую шарнирную область; и (b) вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую второй CAR, где второй CAR содержит второй антигенсвязывающий домен, который связывается со вторым антигеном, второй трансмембранный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен (например, второй первичный сигнальный домен и/или второй костимулирующий сигнальный домен), где второй CAR необязательно дополнительно содержит вторую лидерную последовательность и/или вторую шарнирную область, где (i) первая лидерная последовательность и вторая лидерная последовательность кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%), где первая и вторая лидерные последовательности необязательно содержат одинаковые аминокислотные последовательности; (ii) первая шарнирная область и вторая шарнирная область кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%), где первая и вторая шарнирные области необязательно содержат одинаковые аминокислотные последовательности; (iii) первый трансмембранный домен и второй трансмембранный домен кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%), где первый и второй трансмембранные домены необязательно содержат одинаковые аминокислотные последовательности; и/или (iv) первый внутриклеточный сигнальный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен кодируются разными последовательностями нуклеиновой кислоты (например, отличающимися на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 100%), где первый внутриклеточный сигнальный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен необязательно содержат одинаковые аминокислотные последовательности.In some embodiments, provided herein is a nucleic acid molecule comprising (a) a first nucleic acid sequence encoding a first CAR, wherein the first CAR comprises a first antigen-binding domain that binds a first antigen, a first transmembrane domain, and a first intracellular signaling domain (e.g., a first primary signaling domain and/or a first costimulatory signaling domain), wherein the first CAR optionally further comprises a first leader sequence and/or a first hinge region; and (b) a second nucleic acid sequence encoding a second CAR, wherein the second CAR comprises a second antigen-binding domain that binds a second antigen, a second transmembrane domain, and a second intracellular signaling domain (e.g., a second primary signaling domain and/or a second costimulatory signaling domain), wherein the second CAR optionally further comprises a second leader sequence and/or a second hinge region, wherein (i) the first leader sequence and the second leader sequence are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%), wherein the first and second leader sequences optionally comprise the same amino acid sequences; (ii) the first hinge region and the second hinge region are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%), wherein the first and second hinge regions optionally comprise the same amino acid sequences; (iii) the first transmembrane domain and the second transmembrane domain are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%), wherein the first and second transmembrane domains optionally comprise the same amino acid sequences; and/or (iv) the first intracellular signaling domain and the second intracellular signaling domain are encoded by different nucleic acid sequences (e.g., differing by at least 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 100%), wherein the first intracellular signaling domain and the second intracellular signaling domain optionally comprise the same amino acid sequences.
В некоторых вариантах осуществления первая и вторая лидерные последовательности содержат одинаковые аминокислотные последовательности. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что такая молекула нуклеиновой кислоты демонстрирует меньшую рекомбинацию, чем в остальном сходная молекула нуклеиновой кислоты, в которой первая лидерная последовательность и вторая лидерная последовательность кодируются одинаковыми последовательностями нуклеиновой кислоты.In some embodiments, the first and second leader sequences comprise the same amino acid sequences. Without being bound by any theory, it is believed that such a nucleic acid molecule exhibits less recombination than an otherwise similar nucleic acid molecule in which the first leader sequence and the second leader sequence are encoded by the same nucleic acid sequences.
В некоторых вариантах осуществления первая и вторая шарнирные области содержат одинаковые аминокислотные последовательности. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что такая молекула нуклеиновой кислоты демонстрирует меньшую рекомбинацию, чем в остальном сходная молекула нуклеиновой кислоты, в которой первая шарнирная область и вторая шарнирная область кодируются одинаковыми последовательностями нуклеиновой кислоты.In some embodiments, the first and second hinge regions comprise the same amino acid sequences. Without being limited by theory, it is believed that such a nucleic acid molecule exhibits less recombination than an otherwise similar nucleic acid molecule in which the first hinge region and the second hinge region are encoded by the same nucleic acid sequences.
В некоторых вариантах осуществления первый и второй трансмембранные домены содержат одинаковые аминокислотные последовательности. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что такая молекула нуклеиновой кислоты демонстрирует меньшую рекомбинацию, чем в остальном сходная молекула нуклеиновой кислоты, в которой первый трансмембранный домен и второй трансмембранный домен кодируются одинаковыми последовательностями нуклеиновой кислоты.In some embodiments, the first and second transmembrane domains comprise the same amino acid sequences. Without being limited by theory, it is believed that such a nucleic acid molecule exhibits less recombination than an otherwise similar nucleic acid molecule in which the first transmembrane domain and the second transmembrane domain are encoded by the same nucleic acid sequences.
В некоторых вариантах осуществления первый внутриклеточный сигнальный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен содержат одинаковые аминокислотные последовательности. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что такая молекула нуклеиновой кислоты демонстрирует меньшую рекомбинацию, чем в остальном сходная молекула нуклеиновой кислоты, в которой первый внутриклеточный сигнальный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен кодируются одинаковыми последовательностями нуклеиновой кислоты.In some embodiments, the first intracellular signaling domain and the second intracellular signaling domain comprise the same amino acid sequences. Without being limited by theory, it is believed that such a nucleic acid molecule exhibits less recombination than an otherwise similar nucleic acid molecule in which the first intracellular signaling domain and the second intracellular signaling domain are encoded by the same nucleic acid sequences.
В некоторых вариантах осуществления первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен содержат одинаковые аминокислотные последовательности. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что такая молекула нуклеиновой кислоты демонстрирует меньшую рекомбинацию, чем в остальном сходная молекула нуклеиновой кислоты, в которой первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен кодируются одинаковыми последовательностями нуклеиновой кислоты.In some embodiments, the first primary signaling domain and the second primary signaling domain comprise the same amino acid sequences. Without being limited by theory, it is believed that such a nucleic acid molecule exhibits less recombination than an otherwise similar nucleic acid molecule in which the first primary signaling domain and the second primary signaling domain are encoded by the same nucleic acid sequences.
В некоторых вариантах осуществления первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен содержат разные аминокислотные последовательности.In some embodiments, the first primary signaling domain and the second primary signaling domain comprise different amino acid sequences.
В некоторых вариантах осуществления первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен содержат одинаковые аминокислотные последовательности. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что такая молекула нуклеиновой кислоты демонстрирует меньшую рекомбинацию, чем в остальном сходная молекула нуклеиновой кислоты, в которой первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен кодируются одинаковыми последовательностями нуклеиновой кислоты.In some embodiments, the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain comprise the same amino acid sequences. Without being limited by theory, it is believed that such a nucleic acid molecule exhibits less recombination than an otherwise similar nucleic acid molecule in which the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain are encoded by the same nucleic acid sequences.
В некоторых вариантах осуществления первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен содержат разные аминокислотные последовательности (например, первый и второй костимулирующие сигнальные домены содержат последовательность костимулирующего домена 4-1BB и последовательность костимулирующего домена CD28 соответственно или содержат последовательность костимулирующего домена CD28 и последовательность костимулирующего домена 4-1BB соответственно).In some embodiments, the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain comprise different amino acid sequences (e.g., the first and second costimulatory signaling domains comprise a 4-1BB costimulatory domain sequence and a CD28 costimulatory domain sequence, respectively, or comprise a CD28 costimulatory domain sequence and a 4-1BB costimulatory domain sequence, respectively).
В некоторых вариантах осуществления первая лидерная последовательность и вторая лидерная последовательность содержат аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первая лидерная последовательность и вторая лидерная последовательность кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 199 и 210 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними) или SEQ ID NO: 210 и 199 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними).In some embodiments, the first leader sequence and the second leader sequence comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first leader sequence and the second leader sequence are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NO: 199 and 210, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto) or SEQ ID NO: 210 and 199, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto).
В некоторых вариантах осуществления первая шарнирная область и вторая шарнирная область содержат аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 2 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первая шарнирная область и вторая шарнирная область кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 337 и 13 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними) или SEQ ID NO: 13 и 337 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними).In some embodiments, the first hinge region and the second hinge region comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first hinge region and the second hinge region are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NOs: 337 and 13, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto) or SEQ ID NOs: 13 and 337, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto).
В некоторых вариантах осуществления первый трансмембранный домен и второй трансмембранный домен содержат аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 6 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый трансмембранный домен и второй трансмембранный домен кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 338 и 17 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними) или SEQ ID NO: 17 и 338 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними).In some embodiments, the first transmembrane domain and the second transmembrane domain comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first transmembrane domain and the second transmembrane domain are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NOs: 338 and 17, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto) or SEQ ID NOs: 17 and 338, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto).
В некоторых вариантах осуществления первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен содержат аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 7 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый костимулирующий сигнальный домен и второй костимулирующий сигнальный домен кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 204 и 18 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними) или SEQ ID NO: 18 и 204 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними).In some embodiments, the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first costimulatory signaling domain and the second costimulatory signaling domain are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NOs: 204 and 18, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto) or SEQ ID NOs: 18 and 204, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto).
В некоторых вариантах осуществления первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен содержат аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 10 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления первый первичный сигнальный домен и второй первичный сигнальный домен кодируются последовательностями нуклеиновой кислоты, содержащими SEQ ID NO: 205 и 21 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними) или SEQ ID NO: 21 и 205 соответственно (или последовательностью нуклеиновой кислоты, характеризующейся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними).In some embodiments, the first primary signaling domain and the second primary signaling domain comprise the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the first primary signaling domain and the second primary signaling domain are encoded by nucleic acid sequences comprising SEQ ID NO: 205 and 21, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto) or SEQ ID NO: 21 and 205, respectively (or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto).
В некоторых вариантах осуществления первый и второй антигены являются разными. В некоторых вариантах осуществления первый или второй антиген выбран из BCMA, CD19, CD5, CD10, CD20, CD21, CD22, CD23, CD24, CD25, CD27, CD30, CD34, CD37, CD38, CD40, CD53, CD69, CD72, CD73, CD74, CD75, CD77, CD79a, CD79b, CD80, CD81, CD82, CD83, CD84, CD85, CD86, CD123, CD135, CD138, CD179, CD269, Flt3, ROR1, FcRn5, FcRn2, CS-1, CXCR4, 5, 7, IL-7/3R, IL7/4/3R или IL4R, где В-клеточный антиген необязательно выбран из CD19, CD20, CD22, FcRn5, FcRn2, CS-1, CD138, CD123, CD33, CD34, CLL-1, рецептора фолиевой кислоты бета, FLT3, EGFRvIII, мезотелина, GD2, Tn-антигена, sTn-антигена, Tn-O-гликопептидов, sTn-O-гликопептидов, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, легумана, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, антигена Y системы Льюис, CD24, PDGFR-бета, SSEA-4, рецептора фолиевой кислоты альфа, ERBB (например, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, эфрина B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-ацетил-GD2, рецептора фолиевой кислоты бета, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, легумаина, E6 или E7 HPV, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, полисиаловой кислоты, Fos-родственного антигена, эластазы нейтрофилов, TRP-2, CYP1B1, белка спермы 17, бета-субъединицы хорионического гонадотропина человека, AFP, тиреоглобулина, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, обратной транскриптазы теломеразы человека, кишечной карбоксилэстеразы, мутантного варианта hsp 70-2, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4 или пептида любого из этих антигенов, презентированного на MHC. В некоторых вариантах осуществления первый или второй антигенсвязывающий домен содержит CDR, VH, VL или scFv, раскрытые в данном документе, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними.In some embodiments, the first and second antigens are different. In some embodiments, the first or second antigen is selected from BCMA, CD19, CD5, CD10, CD20, CD21, CD22, CD23, CD24, CD25, CD27, CD30, CD34, CD37, CD38, CD40, CD53, CD69, CD72, CD73, CD74, CD75, CD77, CD79a, CD79b, CD80, CD81, CD82, CD83, CD84, CD85, CD86, CD123, CD135, CD138, CD179, CD269, Flt3, ROR1, FcRn5, FcRn2, CS-1, CXCR4, 5, 7, IL-7/3R, IL7/4/3R, or IL4R, wherein the B cell antigen is optionally selected from CD19, CD20, CD22, FcRn5, FcRn2, CS-1, CD138, CD123, CD33, CD34, CLL-1, folate receptor beta, FLT3, EGFRvIII, mesothelin, GD2, Tn antigen, sTn antigen, Tn-O-glycopeptides, sTn-O-glycopeptides, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, leguman, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, Lewis Y antigen, CD24, PDGFR-beta, SSEA-4, folate receptor alpha, ERBB (eg, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, ephrin B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-acetyl-GD2, folate receptor beta, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, legumain, HPV E6 or E7, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, polysialic acid, Fos-related antigen, neutrophil elastase, TRP-2, CYP1B1, sperm protein 17, human chorionic gonadotropin beta, AFP, thyroglobulin, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, human telomerase reverse transcriptase, intestinal carboxylesterase, hsp 70-2 mutant, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4, or a peptide of any of these antigens presented on MHC. In some embodiments, the first or second antigen-binding domain comprises a CDR, VH, VL, or scFv disclosed herein, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрен CAR, содержащий первую VH (VH1), первую VL (VL1), вторую VH (VH2), вторую VL (VL2), трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен, где VH1 и VL1 связываются с первым антигеном, а VH2 и VL2 связываются со вторым антигеном. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH1 - необязательно линкер 1 ("L1") - VH2 - необязательно линкер 2 ("L2") - VL2 - необязательно линкер 3 ("L3") - VL1. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VL1. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL1 - необязательно L1 - VH2 - необязательно L2 - VL2 - необязательно L3 - VH1. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VH1. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VL2. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VL2. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VH2. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VH2. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH1 - линкер 1 ("L1") - VH2 - линкер 2 ("L2") - VL2 - линкер 3 ("L3") - VL1. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH1 - L1 - VL2 - L2 - VH2 - L3 - VL1. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL1 - L1 - VH2 - L2 - VL2 - L3 - VH1. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL1 - L1 - VL2 - L2 - VH2 - L3 - VH1. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH2 - L1 - VH1 - L2 - VL1 - L3 - VL2. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH2 - L1 - VL1 - L2 - VH1 - L3 - VL2. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL2 - L1 - VH1 - L2 - VL1 - L3 - VH2. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VL2 - L1 - VL1 - L2 - VH1 - L3 - VH2. В некоторых вариантах осуществления L1 или L3 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 5 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления L2 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 63 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления CAR имеет следующую конфигурацию от N-конца до C-конца: (i) VH1 - необязательно линкер 1 ("L1") - VH2 - необязательно линкер 2 ("L2") - VL2 - необязательно линкер 3 ("L3") - VL1 - необязательно шарнирная область - трансмембранный домен - внутриклеточный сигнальный домен; (ii) VH1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VL1 - необязательно шарнирная область - трансмембранный домен - внутриклеточный сигнальный домен; (iii) VL1 - необязательно L1 - VH2 - необязательно L2 - VL2 - необязательно L3 - VH1 - необязательно шарнирная область - трансмембранный домен - внутриклеточный сигнальный домен; (iv) VL1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VH1 - необязательно шарнирная область - трансмембранный домен - внутриклеточный сигнальный домен; (v) VH2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VL2 - необязательно шарнирная область - трансмембранный домен - внутриклеточный сигнальный домен; (vi) VH2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VL2 - необязательно шарнирная область - трансмембранный домен - внутриклеточный сигнальный домен; (vii) VL2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VH2 - необязательно шарнирная область - трансмембранный домен - внутриклеточный сигнальный домен; или (viii) VL2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VH2 - необязательно шарнирная область - трансмембранный домен - внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления первый и второй антигены являются разными. В некоторых вариантах осуществления первый или второй антиген выбран из BCMA, CD19, CD5, CD10, CD20, CD21, CD22, CD23, CD24, CD25, CD27, CD30, CD34, CD37, CD38, CD40, CD53, CD69, CD72, CD73, CD74, CD75, CD77, CD79a, CD79b, CD80, CD81, CD82, CD83, CD84, CD85, CD86, CD123, CD135, CD138, CD179, CD269, Flt3, ROR1, FcRn5, FcRn2, CS-1, CXCR4, 5, 7, IL-7/3R, IL7/4/3R или IL4R, где В-клеточный антиген необязательно выбран из CD19, CD20, CD22, FcRn5, FcRn2, CS-1, CD138, CD123, CD33, CD34, CLL-1, рецептора фолиевой кислоты бета, FLT3, EGFRvIII, мезотелина, GD2, Tn-антигена, sTn-антигена, Tn-O-гликопептидов, sTn-O-гликопептидов, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, легумана, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, антигена Y системы Льюис, CD24, PDGFR-бета, SSEA-4, рецептора фолиевой кислоты альфа, ERBB (например, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, эфрина B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-ацетил-GD2, рецептора фолиевой кислоты бета, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, легумаина, E6 или E7 HPV, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, полисиаловой кислоты, Fos-родственного антигена, эластазы нейтрофилов, TRP-2, CYP1B1, белка спермы 17, бета-субъединицы хорионического гонадотропина человека, AFP, тиреоглобулина, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, обратной транскриптазы теломеразы человека, кишечной карбоксилэстеразы, мутантного варианта hsp 70-2, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4 или пептида любого из этих антигенов, презентированного на MHC. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 или VL2 содержат последовательность CDR, VH или VL, раскрытую в данном документе, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления шарнирная область, трансмембранный домен или внутриклеточный сигнальный домен (например, первичный сигнальный домен и/или костимулирующий сигнальный домен) содержат последовательность шарнирной области, последовательность трансмембранного домена или последовательность внутриклеточного сигнального домена (например, последовательность первичного сигнального домена и/или последовательность костимулирующего сигнального домена), раскрытую в данном документе, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, provided herein is a CAR comprising a first VH (VH1), a first VL (VL1), a second VH (VH2), a second VL (VL2), a transmembrane domain, and an intracellular signaling domain, wherein VH1 and VL1 bind a first antigen and VH2 and VL2 bind a second antigen. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH1 - optionally Linker 1 ("L1") - VH2 - optionally Linker 2 ("L2") - VL2 - optionally Linker 3 ("L3") - VL1. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH1 - optionally L1 - VL2 - optionally L2 - VH2 - optionally L3 - VL1. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL1 - optionally L1 - VH2 - optionally L2 - VL2 - optionally L3 - VH1. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL1 - optionally L1 - VL2 - optionally L2 - VH2 - optionally L3 - VH1. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH2 - optionally L1 - VH1 - optionally L2 - VL1 - optionally L3 - VL2. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH2 - optionally L1 - VL1 - optionally L2 - VH1 - optionally L3 - VL2. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL2 - optionally L1 - VH1 - optionally L2 - VL1 - optionally L3 - VH2. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL2 - optionally L1 - VL1 - optionally L2 - VH1 - optionally L3 - VH2. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH1 - Linker 1 ("L1") - VH2 - Linker 2 ("L2") - VL2 - Linker 3 ("L3") - VL1. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH1 - L1 - VL2 - L2 - VH2 - L3 - VL1. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL1 - L1 - VH2 - L2 - VL2 - L3 - VH1. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL1 - L1 - VL2 - L2 - VH2 - L3 - VH1. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH2 - L1 - VH1 - L2 - VL1 - L3 - VL2. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH2 - L1 - VL1 - L2 - VH1 - L3 - VL2. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL2 - L1 - VH1 - L2 - VL1 - L3 - VH2. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VL2 - L1 - VL1 - L2 - VH1 - L3 - VH2. In some embodiments, L1 or L3 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, L2 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the CAR has the following configuration from N-terminus to C-terminus: (i) VH1 - optionally linker 1 ("L1") - VH2 - optionally linker 2 ("L2") - VL2 - optionally linker 3 ("L3") - VL1 - optionally hinge region - transmembrane domain - intracellular signaling domain; (ii) VH1 - optionally L1 - VL2 - optionally L2 - VH2 - optionally L3 - VL1 - optionally hinge region - transmembrane domain - intracellular signaling domain; (iii) VL1 - optionally L1 - VH2 - optionally L2 - VL2 - optionally L3 - VH1 - optionally hinge region - transmembrane domain - intracellular signaling domain; (iv) VL1 - optional L1 - VL2 - optional L2 - VH2 - optional L3 - VH1 - optional hinge region - transmembrane domain - intracellular signaling domain; (v) VH2 - optional L1 - VH1 - optional L2 - VL1 - optional L3 - VL2 - optional hinge region - transmembrane domain - intracellular signaling domain; (vi) VH2 - optional L1 - VL1 - optional L2 - VH1 - optional L3 - VL2 - optional hinge region - transmembrane domain - intracellular signaling domain; (vii) VL2 - optional L1 - VH1 - optional L2 - VL1 - optional L3 - VH2 - optional hinge region - transmembrane domain - intracellular signaling domain; or (viii) VL2 - optionally L1 - VL1 - optionally L2 - VH1 - optionally L3 - VH2 - optionally hinge region - transmembrane domain - intracellular signaling domain. In some embodiments, the first and second antigens are different. In some embodiments, the first or second antigen is selected from BCMA, CD19, CD5, CD10, CD20, CD21, CD22, CD23, CD24, CD25, CD27, CD30, CD34, CD37, CD38, CD40, CD53, CD69, CD72, CD73, CD74, CD75, CD77, CD79a, CD79b, CD80, CD81, CD82, CD83, CD84, CD85, CD86, CD123, CD135, CD138, CD179, CD269, Flt3, ROR1, FcRn5, FcRn2, CS-1, CXCR4, 5, 7, IL-7/3R, IL7/4/3R, or IL4R, wherein the B cell antigen is optionally selected from CD19, CD20, CD22, FcRn5, FcRn2, CS-1, CD138, CD123, CD33, CD34, CLL-1, folate receptor beta, FLT3, EGFRvIII, mesothelin, GD2, Tn antigen, sTn antigen, Tn-O-glycopeptides, sTn-O-glycopeptides, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, leguman, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, Lewis Y antigen, CD24, PDGFR-beta, SSEA-4, folate receptor alpha, ERBB (eg, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, ephrin B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-acetyl-GD2, folate receptor beta, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, legumain, HPV E6 or E7, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, polysialic acid, Fos-related antigen, neutrophil elastase, TRP-2, CYP1B1, sperm protein 17, human chorionic gonadotropin beta, AFP, thyroglobulin, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, human telomerase reverse transcriptase, intestinal carboxylesterase, hsp 70-2 mutant, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4, or a peptide of any of these antigens presented on MHC. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, or VL2 comprises a CDR, VH, or VL sequence disclosed herein, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the hinge region, transmembrane domain, or intracellular signaling domain (e.g., primary signaling domain and/or costimulatory signaling domain) comprises a hinge region sequence, transmembrane domain sequence, or intracellular signaling domain sequence (e.g., primary signaling domain sequence and/or costimulatory signaling domain sequence) disclosed herein, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрен вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена клетка, содержащая CAR, раскрытый в данном документе, молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе, или вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена фармацевтическая композиция, которая содержит клетку, содержащую CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе, и фармацевтически приемлемый носитель. В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыт способ получения клетки, содержащей CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыт способ лечения субъекта, например, субъекта с раком, с применением клетки, содержащей CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе.In some embodiments, provided herein is a nucleic acid molecule encoding a CAR in diabody format as disclosed herein. In some embodiments, provided herein is a vector comprising a nucleic acid molecule encoding a CAR in diabody format as disclosed herein. In some embodiments, provided herein is a cell comprising a CAR as disclosed herein, a nucleic acid molecule encoding a CAR in diabody format as disclosed herein, or a vector comprising a nucleic acid molecule encoding a CAR in diabody format as disclosed herein. In some embodiments, provided herein is a pharmaceutical composition that comprises a cell comprising a CAR in diabody format as disclosed herein and a pharmaceutically acceptable carrier. In some embodiments, provided herein is a method for producing a cell comprising a CAR in diabody format as disclosed herein. In some embodiments, disclosed herein is a method of treating a subject, such as a subject with cancer, using a cell comprising a CAR in a diabody format as disclosed herein.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к способам получения иммунных эффекторных клеток (например, T-клеток или NK-клеток), сконструированных таким образом, что они экспрессируют CAR, и композиций, полученных с применением таких способов. Способы, раскрытые в данном документе (например, способ ARM или способ с использованием цитокинов, раскрытый в данном документе), можно применять для получения клеток, экспрессирующих двойные CAR или CAR в формате диатела, раскрытые в данном документе. Также раскрыты способы применения таких композиций для лечения заболевания, например, рака, у субъекта.In some embodiments, the present invention relates to methods for producing immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) engineered to express CARs and compositions produced using such methods. The methods disclosed herein (e.g., the ARM method or the cytokine method disclosed herein) can be used to produce cells expressing the dual CARs or diabody format CARs disclosed herein. Also disclosed are methods for using such compositions to treat a disease, e.g., cancer, in a subject.
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении описан способ получения популяции клеток (например, T-клеток), которые экспрессируют химерный антигенный рецептор (CAR), при этом способ включает: (i) приведение популяции клеток (например, T-клеток, например, T-клеток, выделенных из замороженного или свежего продукта лейкафереза) в контакт (например, связывание) со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток; (ii) приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты (например, молекулой ДНК или РНК), кодирующей CAR, за счет чего обеспечивается получение популяции клеток (например, T-клеток), содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, и (iii) сбор популяции клеток (например, T-клеток) для хранения (например, повторного составления популяции клеток в среде для криоконсервации) или введения, где: (a) стадию (ii) проводят вместе со стадией (i) или не позже чем через 20 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 12, 13, 14, 15, 16, 17 или 18 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 18 часов после начала стадии (i), и стадию (iii) проводят не позже чем через 26 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 22, 23, 24 или 25 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 24 часа после начала стадии (i); (b) стадию (ii) проводят вместе со стадией (i) или не позже чем через 20 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 12, 13, 14, 15, 16, 17 или 18 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 18 часов после начала стадии (i), и стадию (iii) проводят не позже чем через 30 часов после начала стадии (ii), например, не позже чем через 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 часов после начала стадии (ii); или (c) популяция клеток из стадии (iii) не является размножившейся или является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, или 40%, например, на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) представляет собой молекулу ДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) представляет собой молекулу РНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) находится в вирусном векторе, например, в вирусном векторе, выбранном из лентивирусного вектора, аденовирусного вектора или ретровирусного вектора. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) находится в невирусном векторе. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) находится в плазмиде. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) не находится в каком-либо векторе. В некоторых вариантах осуществления стадия (ii) включает трансдукцию популяции клеток (например, T-клеток) c помощью вирусного вектора, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR. В некоторых вариантах осуществления стадию (ii) проводят вместе со стадией (i). В некоторых вариантах осуществления стадию (ii) проводят не позже чем через 20 часов после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления стадию (ii) проводят не позже чем через 12, 13, 14, 15, 16, 17 или 18 часов после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления стадию (ii) проводят не позже чем через 18 часов после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления стадию (iii) проводят не позже чем через 26 часов после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления стадию (iii) проводят не позже чем через 22, 23, 24 или 25 часов после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления стадию (iii) проводят не позже чем через 24 часа после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления стадию (iii) проводят не позже чем через 30 часов после начала стадии (ii). В некоторых вариантах осуществления стадию (iii) проводят не позже чем через 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 часов после начала стадии (ii). В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая CAR, представляет собой молекулу нуклеиновой кислоты, раскрытую в данном документе. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит первую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую первый CAR, и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую второй CAR. В некоторых вариантах осуществления первая и вторая последовательности нуклеиновой кислоты расположены в одной молекуле нуклеиновой кислоты, например, где первая последовательность нуклеиновой кислоты и вторая последовательность нуклеиновой кислоты разделены третьей последовательностью нуклеиновой кислоты, кодирующей сайт саморасщепления (например, сайт P2A, сайт Т2A, сайт Е2A или сайт F2A). В некоторых вариантах осуществления первая и вторая последовательности нуклеиновой кислоты расположены в отдельных молекулах нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR, где CAR содержит первую VH (VH1), первую VL (VL1), вторую VH (VH2), вторую VL (VL2), трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен, где VH1 и VL1 связываются с первым антигеном, а VH2 и VL2 связываются со вторым антигеном, где VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH1 - необязательно линкер 1 ("L1") - VH2 - необязательно линкер 2 ("L2") - VL2 - необязательно линкер 3 ("L3") - VL1, VH1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VL1, VL1 - необязательно L1 - VH2 - необязательно L2 - VL2 - необязательно L3 - VH1, VL1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VH1, VH2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VL2, VH2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VL2, VL2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VH2 или VL2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VH2.In some embodiments, the present invention provides a method of producing a population of cells (e.g., T cells) that express a chimeric antigen receptor (CAR), the method comprising: (i) contacting the population of cells (e.g., T cells, e.g., T cells isolated from a frozen or fresh leukapheresis product) with (e.g., binding to) an agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or an agent that stimulates a costimulatory molecule on the surface of the cells; (ii) contacting a population of cells (e.g., T cells) with a nucleic acid molecule (e.g., a DNA or RNA molecule) encoding a CAR, thereby producing a population of cells (e.g., T cells) containing the nucleic acid molecule, and (iii) collecting the population of cells (e.g., T cells) for storage (e.g., reconstituting the population of cells in a cryopreservation medium) or administration, wherein: (a) step (ii) is performed in conjunction with step (i) or no later than 20 hours after the start of step (i), such as no later than 12, 13, 14, 15, 16, 17, or 18 hours after the start of step (i), such as no later than 18 hours after the start of step (i), and step (iii) is performed no later than 26 hours after the start of step (i), such as no later than 22, 23, 24, or 25 hours after the start of step (i), for example, not later than 24 hours after the start of step (i); (b) step (ii) is carried out together with step (i) or not later than 20 hours after the start of step (i), for example not later than 12, 13, 14, 15, 16, 17 or 18 hours after the start of step (i), for example not later than 18 hours after the start of step (i), and step (iii) is carried out not later than 30 hours after the start of step (ii), for example not later than 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 or 30 hours after the start of step (ii); or (c) the population of cells from step (iii) is not expanded or is expanded by an increase in number of no more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40%, such as no more than 10%, such as as assessed by the number of live cells, compared to the population of cells at the beginning of step (i). In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (ii) is a DNA molecule. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (ii) is an RNA molecule. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (ii) is in a viral vector, such as a viral vector selected from a lentiviral vector, an adenoviral vector, or a retroviral vector. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (ii) is in a non-viral vector. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (ii) is in a plasmid. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (ii) is not in any vector. In some embodiments, step (ii) comprises transducing a population of cells (e.g., T cells) with a viral vector comprising a nucleic acid molecule encoding a CAR. In some embodiments, step (ii) is performed together with step (i). In some embodiments, step (ii) is performed no later than 20 hours after the start of step (i). In some embodiments, step (ii) is performed no later than 12, 13, 14, 15, 16, 17, or 18 hours after the start of step (i). In some embodiments, step (ii) is performed no later than 18 hours after the start of step (i). In some embodiments, step (iii) is performed no later than 26 hours after the start of step (i). In some embodiments, step (iii) is performed no later than 22, 23, 24, or 25 hours after the start of step (i). In some embodiments, step (iii) is performed no later than 24 hours after the start of step (i). In some embodiments, step (iii) is performed no later than 30 hours after the start of step (ii). In some embodiments, step (iii) is performed no later than 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, or 30 hours after the start of step (ii). In some embodiments, the nucleic acid molecule encoding the CAR is a nucleic acid molecule as disclosed herein. In some embodiments, the nucleic acid molecule comprises a first nucleic acid sequence encoding a first CAR and a second nucleic acid sequence encoding a second CAR. In some embodiments, the first and second nucleic acid sequences are located on a single nucleic acid molecule, such as where the first nucleic acid sequence and the second nucleic acid sequence are separated by a third nucleic acid sequence encoding a self-cleavage site (e.g., a P2A site, a T2A site, an E2A site, or an F2A site). In some embodiments, the first and second nucleic acid sequences are located on separate nucleic acid molecules. In some embodiments, the nucleic acid molecule comprises a nucleic acid sequence encoding a CAR, wherein the CAR comprises a first VH (VH1), a first VL (VL1), a second VH (VH2), a second VL (VL2), a transmembrane domain, and an intracellular signaling domain, wherein VH1 and VL1 bind a first antigen and VH2 and VL2 bind a second antigen, wherein VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH1 - optional Linker 1 ("L1") - VH2 - optional Linker 2 ("L2") - VL2 - optional Linker 3 ("L3") - VL1, VH1 - optional L1 - VL2 - optional L2 - VH2 - optional L3 - VL1, VL1 - optional L1 - VH2 - optional L2 - VL2 - optional L3 - VH1, VL1 - optional L1 - VL2 - optional L2 - VH2 - optional L3 - VH1, VH2 - optional L1 - VH1 - optional L2 - VL1 - optional L3 - VL2, VH2 - optional L1 - VL1 - optional L2 - VH1 - optional L3 - VL2, VL2 - optional L1 - VH1 - optional L2 - VL1 - optional L3 - VH2 or VL2 - optional L1 - VL1 - optional L2 - VH1 - optional L3 - VH2.
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) не является размножившейся. В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, или 40%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) является размножившейся с увеличением численности на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (i).In some embodiments, the cell population of step (iii) is not expanded. In some embodiments, the cell population of step (iii) is expanded by an increase in abundance of no more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40%, such as as measured by the number of living cells, compared to the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the cell population of step (iii) is expanded by an increase in abundance of no more than 10%, such as as measured by the number of living cells, compared to the cell population at the beginning of step (i).
В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит первую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую первый CAR, и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую второй CAR, где первая и вторая последовательности нуклеиновой кислоты расположены в отдельных молекулах нуклеиновой кислоты.In some embodiments, the nucleic acid molecule comprises a first nucleic acid sequence encoding a first CAR and a second nucleic acid sequence encoding a second CAR, wherein the first and second nucleic acid sequences are located on separate nucleic acid molecules.
В некоторых вариантах осуществления первая и вторая молекулы нуклеиновой кислоты находятся в отдельных вирусных векторах, и при этом стадия (ii) включает трансдукцию популяции клеток (например, Т-клеток) с помощью первого вирусного вектора, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую первый CAR, и второго вирусного вектора, содержащего вторую молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую второй CAR.In some embodiments, the first and second nucleic acid molecules are in separate viral vectors, and wherein step (ii) comprises transducing a population of cells (e.g., T cells) with a first viral vector comprising a nucleic acid molecule encoding a first CAR and a second viral vector comprising a second nucleic acid molecule encoding a second CAR.
В некоторых вариантах осуществления первый CAR содержит домен, связывающий BCMA (например, CAR для BCMA), а второй CAR содержит домен, связывающий CD19 (например, CAR для CD19).In some embodiments, the first CAR comprises a BCMA binding domain (e.g., a BCMA CAR) and the second CAR comprises a CD19 binding domain (e.g., a CD19 CAR).
В некоторых вариантах осуществления на стадии (ii) популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором при множественности заражения (MOI), которая больше, равняется или меньше MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором. В некоторых вариантах осуществления на стадии (ii) популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором при множественности заражения (MOI), которая больше MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором.In some embodiments, in step (ii), the population of cells is contacted with the first viral vector at a multiplicity of infection (MOI) that is greater than, equal to, or less than the MOI at which the population of cells is contacted with the second viral vector. In some embodiments, in step (ii), the population of cells is contacted with the first viral vector at a multiplicity of infection (MOI) that is greater than the MOI at which the population of cells is contacted with the second viral vector.
В некоторых вариантах осуществления на стадии (ii) популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором при первой MOI и со вторым вирусным вектором при второй MOI, так что полученная в результате популяция клеток содержит первую популяцию клеток, которые содержат CAR для BCMA, но не CAR для CD19, вторую популяцию клеток, которые содержат CAR для CD19, но не CAR для BCMA, и третью популяцию клеток, которые содержат как CAR для BCMA, так и CAR для CD19, где:In some embodiments, in step (ii), the population of cells is contacted with a first viral vector at a first MOI and with a second viral vector at a second MOI, such that the resulting population of cells comprises a first population of cells that contain a CAR for BCMA but not a CAR for CD19, a second population of cells that contain a CAR for CD19 but not a CAR for BCMA, and a third population of cells that contain both a CAR for BCMA and a CAR for CD19, where:
(a) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(a) the total number of viable cells in the combined second and third populations is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(b) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000% , 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(b) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the combined second and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(c) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 5% (например, больше или равняется приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90%) от общего количества жизнеспособных клеток в полученной в результате популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(c) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 5% (e.g., greater than or equal to about 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, or 90%) of the total number of viable cells in the resulting population, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(d) общее количество жизнеспособных клеток во второй популяции меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10; или(d) the total number of viable cells in the second population is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10; or
(e) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000% , 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток во второй популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10. В некоторых вариантах осуществления на стадии (ii) популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором при MOI, например, MOI, которая достаточно ниже, чем MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором, так что в полученной в результате популяции клеток:(e) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000%, or more) of the total number of viable cells in the second population, e.g., as determined by the method described in Example 10. In some embodiments, step (ii) comprises contacting the population of cells with a second viral vector at an MOI, e.g., an MOI that is sufficiently lower than the MOI at which the population of cells is contacted with the first viral vector, such that the resulting population of cells:
(a) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(a) the total number of viable cells in the combined second and third populations is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(b) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(b) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the combined second and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(c) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 5% (например, больше или равняется приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90%) от общего количества жизнеспособных клеток в полученной в результате популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(c) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 5% (e.g., greater than or equal to about 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, or 90%) of the total number of viable cells in the resulting population, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(d) общее количество жизнеспособных клеток во второй популяции меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10; или(d) the total number of viable cells in the second population is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10; or
(e) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток во второй популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10.(e) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the second population, e.g., when determined by the method described in Example 10.
В некоторых вариантах осуществления на стадии (ii) популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором при первой MOI и популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором при второй MOI, так что полученная в результате популяция клеток содержит:In some embodiments, in step (ii), the population of cells is contacted with a first viral vector at a first MOI and the population of cells is contacted with a second viral vector at a second MOI, such that the resulting population of cells comprises:
(a) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(a) the total number of viable cells in the combined second and third populations is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(b) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000% , 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(b) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the combined second and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(c) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 5% (например, больше или равняется приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90%) от общего количества жизнеспособных клеток в полученной в результате популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(c) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 5% (e.g., greater than or equal to about 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, or 90%) of the total number of viable cells in the resulting population, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(d) общее количество жизнеспособных клеток во второй популяции меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10; или(d) the total number of viable cells in the second population is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10; or
(e) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток во второй популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10.(e) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the second population, e.g., when determined by the method described in Example 10.
В некоторых вариантах осуществления на стадии (ii) популяцию клеток приводят в контакт с:In some embodiments, in step (ii), the population of cells is contacted with:
(a) первым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 1 до приблизительно 10 (например, от приблизительно 2 до приблизительно 9, от приблизительно 3 до приблизительно 8, от приблизительно 4 до приблизительно 7, от приблизительно 5 до приблизительно 6, от приблизительно 1 до приблизительно 8, от приблизительно 1 до приблизительно 6, от приблизительно 1 до приблизительно 4, от приблизительно 8 до приблизительно 10, от приблизительно 6 до приблизительно 10, от приблизительно 4 до приблизительно 10, от приблизительно 1 до приблизительно 3, от приблизительно 2 до приблизительно 4, от приблизительно 3 до приблизительно 5, от приблизительно 4 до приблизительно 6, от приблизительно 5 до приблизительно 7, от приблизительно 6 до приблизительно 8, от приблизительно 7 до приблизительно до приблизительно 9, от приблизительно 8 до приблизительно 10, от приблизительно 2,5 до приблизительно 5, приблизительно 1, приблизительно 2, приблизительно 3, приблизительно 4, приблизительно 5, приблизительно 6, приблизительно 7, приблизительно 8, приблизительно 9 или приблизительно 10);(a) a first viral vector at an MOI of from about 1 to about 10 (e.g., from about 2 to about 9, from about 3 to about 8, from about 4 to about 7, from about 5 to about 6, from about 1 to about 8, from about 1 to about 6, from about 1 to about 4, from about 8 to about 10, from about 6 to about 10, from about 4 to about 10, from about 1 to about 3, from about 2 to about 4, from about 3 to about 5, from about 4 to about 6, from about 5 to about 7, from about 6 to about 8, from about 7 to about 9, from about 8 to about 10, from about 2.5 to about 5, about 1, about 2, about 3, about 4, about 5, about 6, about 7, about 8, about 9, or about 10);
(b) вторым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 0,1 до приблизительно 5 (например, от приблизительно 0,2 до приблизительно 4, от приблизительно 0,3 до приблизительно 3, от приблизительно 0,4 до приблизительно 2, от приблизительно 0,5 до приблизительно 1, от приблизительно 0,6 до приблизительно 0,9, от приблизительно 0,7 до приблизительно 0,8, от приблизительно 0,1 до приблизительно 4, от приблизительно 0,1 до приблизительно 3, от приблизительно 0,1 до приблизительно 2, от приблизительно 0,1 до приблизительно 1, от приблизительно 0,1 до приблизительно 0,5, от приблизительно 4 до приблизительно 5, от приблизительно 3 до приблизительно 5, от приблизительно 2 до приблизительно 5, от приблизительно 1 до приблизительно 5, от приблизительно 0,5 до приблизительно 5, от приблизительно 0,2 до приблизительно 5, от приблизительно 0,1 до приблизительно 0,5, от приблизительно 0,2 до приблизительно 1, от приблизительно 0,5 до приблизительно 2, от приблизительно 1 до приблизительно 3, от приблизительно 2 до приблизительно 4, от приблизительно 3 до приблизительно 5, от приблизительно 0,5 до приблизительно 1, приблизительно 0,1, приблизительно 0,2, приблизительно 0,3, приблизительно 0,4, приблизительно 0,5, приблизительно 0,6, приблизительно 0,7, приблизительно 0,8, приблизительно 0,9, приблизительно 1, приблизительно 2, приблизительно 3, приблизительно 4 или приблизительно 5);(b) a second viral vector at an MOI of from about 0.1 to about 5 (e.g., from about 0.2 to about 4, from about 0.3 to about 3, from about 0.4 to about 2, from about 0.5 to about 1, from about 0.6 to about 0.9, from about 0.7 to about 0.8, from about 0.1 to about 4, from about 0.1 to about 3, from about 0.1 to about 2, from about 0.1 to about 1, from about 0.1 to about 0.5, from about 4 to about 5, from about 3 to about 5, from about 2 to about 5, from about 1 to about 5, from about 0.5 to about 5, from about 0.2 to about 5, from about 0.1 to about 0.5, from about 0.2 to about 1, from about 0.5 up to about 2, from about 1 to about 3, from about 2 to about 4, from about 3 to about 5, from about 0.5 to about 1, about 0.1, about 0.2, about 0.3, about 0.4, about 0.5, about 0.6, about 0.7, about 0.8, about 0.9, about 1, about 2, about 3, about 4, or about 5);
(c) первым вирусным вектором при MOI, составляющей по меньшей мере приблизительно 10% (например, по меньшей мере приблизительно 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90%) от MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором, или в по меньшей мере приблизительно 1 раз (например, в по меньшей мере приблизительно 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, или 100 раз, например, от приблизительно 2 до приблизительно 50 раз, от приблизительно 3 до 20 раз, от приблизительно 5 до приблизительно 15 раз или от приблизительно 8 до приблизительно 10 раз) выше нее; и/или(c) a first viral vector at an MOI that is at least about 10% (e.g., at least about 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, or 90%) of the MOI at which the population of cells is contacted with a second viral vector, or at least about 1-fold (e.g., at least about 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, or 100-fold, such as about 2 to about 50-fold, about 3 to 20-fold, about 5 to about 15-fold, or about 8 to about 10-fold) greater therefrom; and/or
(d) вторым вирусным вектором при MOI, которая составляет не более чем 1/X, где X равняется 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 15, 20, 30, 40, 50, 60, 70. 80, 90, или 100, от MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором.(d) a second viral vector at an MOI that is no more than 1/X, where X is 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 15, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, or 100, of the MOI at which the cell population is contacted with the first viral vector.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 2,5 до приблизительно 5. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 0,5 до приблизительно 1,0. В некоторых вариантах осуществления MOI для первого вирусного вектора в от приблизительно 8 до приблизительно 10 раз выше, чем MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором. В некоторых вариантах осуществления MOI для второго вирусного вектора составляет не более чем 1/X, где X равняется 6, 8, 10 или 12, от MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором.In some embodiments, the population of cells is contacted with the first viral vector at an MOI of about 2.5 to about 5. In some embodiments, the population of cells is contacted with the second viral vector at an MOI of about 0.5 to about 1.0. In some embodiments, the MOI for the first viral vector is about 8 to about 10 times higher than the MOI at which the population of cells is contacted with the second viral vector. In some embodiments, the MOI for the second viral vector is no more than 1/X, where X is 6, 8, 10, or 12, of the MOI at which the population of cells is contacted with the first viral vector.
В некоторых вариантах осуществления на стадии (ii) популяцию клеток приводят в контакт с:In some embodiments, in step (ii), the population of cells is contacted with:
(a) первым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 4 до приблизительно 5 (например, приблизительно 4,75); и/или(a) a first viral vector at an MOI of from about 4 to about 5 (e.g., about 4.75); and/or
(b) вторым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 0,2 до приблизительно 1 (например, приблизительно 0,5).(b) a second viral vector at an MOI of from about 0.2 to about 1 (e.g., about 0.5).
В некоторых вариантах осуществления на стадии (ii) популяция клеток содержит от приблизительно 1×108 до приблизительно 5×109 (например, от приблизительно 2×108 до приблизительно 2×109 или от приблизительно 4×108 до приблизительно 1×109) всех жизнеспособных клеток. В некоторых вариантах осуществления клетки суспендированы в культуре при концентрации, составляющей от приблизительно 1×106 до приблизительно 1 ×107 (например, от приблизительно 2×106 до приблизительно 5 ×106 или от приблизительно 3×106 до приблизительно 4 ×106) жизнеспособных клеток/мл.In some embodiments, in step (ii), the population of cells comprises from about 1×10 8 to about 5×10 9 (e.g., from about 2×10 8 to about 2×10 9 or from about 4×10 8 to about 1×10 9 ) total viable cells. In some embodiments, the cells are suspended in culture at a concentration of from about 1×10 6 to about 1×10 7 (e.g., from about 2×10 6 to about 5×10 6 or from about 3×10 6 to about 4×10 6 ) viable cells/mL.
В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, представляет собой средство, которое стимулирует CD3. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, представляет собой средство, которое стимулирует CD28, ICOS, CD27, HVEM, LIGHT, CD40, 4-1BB, OX40, DR3, GITR, CD30, TIM1, CD2, CD226 или любую их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, представляет собой средство, которое стимулирует CD28. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, выбрано из антитела (например, однодоменного антитела (например, антитела из одного вариабельного домена тяжелой цепи), пептитела, Fab-фрагмента или scFv), малой молекулы или лиганда (например, существующего в природе, рекомбинантного или химерного лиганда). В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, выбрано из антитела (например, однодоменного антитела (например, антитела из одного вариабельного домена тяжелой цепи), пептитела, Fab-фрагмента или scFv), малой молекулы или лиганда (например, существующего в природе, рекомбинантного или химерного лиганда). В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, не содержит гранулу. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, не содержит гранулу. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, содержит антитело к CD3. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, содержит антитело к CD28. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, содержит антитело к CD3, ковалентно присоединенное к коллоидной полимерной наноматрице. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, содержит антитело к CD28, ковалентно присоединенное к коллоидной полимерной наноматрице. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, содержат TransAct™ для T-клеток.In some embodiments, an agent that stimulates a CD3/TCR complex is an agent that stimulates CD3. In some embodiments, an agent that stimulates a costimulatory molecule is an agent that stimulates CD28, ICOS, CD27, HVEM, LIGHT, CD40, 4-1BB, OX40, DR3, GITR, CD30, TIM1, CD2, CD226, or any combination thereof. In some embodiments, an agent that stimulates a costimulatory molecule is an agent that stimulates CD28. In some embodiments, an agent that stimulates a CD3/TCR complex is selected from an antibody (e.g., a single domain antibody (e.g., a single heavy chain variable domain antibody), a peptibody, a Fab fragment, or an scFv), a small molecule, or a ligand (e.g., a naturally occurring, recombinant, or chimeric ligand). In some embodiments, the agent that stimulates a costimulatory molecule is selected from an antibody (e.g., a single domain antibody (e.g., a single heavy chain variable domain antibody), a peptibody, a Fab fragment, or an scFv), a small molecule, or a ligand (e.g., a naturally occurring, recombinant, or chimeric ligand). In some embodiments, the agent that stimulates a CD3/TCR complex does not comprise a bead. In some embodiments, the agent that stimulates a costimulatory molecule does not comprise a bead. In some embodiments, the agent that stimulates a CD3/TCR complex comprises an anti-CD3 antibody. In some embodiments, the agent that stimulates a costimulatory molecule comprises an anti-CD28 antibody. In some embodiments, the agent that stimulates a CD3/TCR complex comprises an anti-CD3 antibody covalently attached to a colloidal polymeric nanomatrix. In some embodiments, the agent that stimulates the costimulatory molecule comprises an antibody to CD28 covalently attached to a colloidal polymer nanomatrix. In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex and the agent that stimulates the costimulatory molecule comprise TransAct™ for T cells.
В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, не содержит гидрогель. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, не содержит гидрогель. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, не содержит альгинат. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, не содержит альгинат.In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex does not contain a hydrogel. In some embodiments, the agent that stimulates the costimulatory molecule does not contain a hydrogel. In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex does not contain an alginate. In some embodiments, the agent that stimulates the costimulatory molecule does not contain an alginate.
В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, содержит гидрогель. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, содержит гидрогель. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, содержит альгинат. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, содержит альгинат. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, или средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, содержат MagCloudz™ от Quad Technologies.In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex comprises a hydrogel. In some embodiments, the agent that stimulates the costimulatory molecule comprises a hydrogel. In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex comprises an alginate. In some embodiments, the agent that stimulates the costimulatory molecule comprises an alginate. In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex or the agent that stimulates the costimulatory molecule comprises MagCloudz™ from Quad Technologies.
В некоторых вариантах осуществления стадия (i) обеспечивает увеличение процентной доли клеток, экспрессирующих CAR, в популяции клеток из стадии (iii), например, популяция клеток из стадии (iii) демонстрирует более высокую процентную долю клеток, экспрессирующих CAR (например, на по меньшей мере 10, 20, 30, 40, 50 или 60% выше), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа без стадии (i).In some embodiments, step (i) provides an increase in the percentage of cells expressing the CAR in the cell population of step (iii), such that the cell population of step (iii) exhibits a higher percentage of cells expressing the CAR (e.g., at least 10, 20, 30, 40, 50, or 60% higher) compared to cells obtained by an otherwise similar method without step (i).
В некоторых вариантах осуществления процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (iii) является такой же, как процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ клеток, в популяции клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (iii) отличается на не более чем 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12% от процентной доли необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ клеток, в популяции клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (iii) отличается на не более чем 5 или 10% от процентной доли необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ клеток, в популяции клеток в начале стадии (i).In some embodiments, the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells, in the cell population of step (iii) is the same as the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ cells, in the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells, in the cell population of step (iii) differs by no more than 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12% from the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ cells, in the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells, in the cell population of step (iii) is no more than 5% or 10% different from the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ cells, in the cell population at the beginning of step (i).
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) демонстрирует более высокую процентную долю необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ Т-клеток (например, на по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35 или 40% выше), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) демонстрирует более высокую процентную долю необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ Т-клеток (например, на по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35 или 40% выше), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней.In some embodiments, the population of cells from step (iii) exhibits a higher percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells (e.g., at least 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40% higher), compared to cells obtained by an otherwise similar method wherein step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i). In some embodiments, the population of cells from step (iii) exhibits a higher percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells (e.g., at least 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40% higher), compared to cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the population of cells (e.g. T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days.
В некоторых вариантах осуществления процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных Т-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток из стадии (iii) является такой же, как процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток из стадии (iii) отличается на не более чем 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12% от процентной доли центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток из стадии (iii) отличается на не более чем 5 или 10% от процентной доли центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток в начале стадии (i).In some embodiments, the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population of step (iii) is the same as the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population of step (iii) differs by no more than 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12% from the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population of step (iii) differs by no more than 5% or 10% from the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population at the beginning of step (i).
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) демонстрирует более низкую процентную долю центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти (например, на по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35 или 40% ниже), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) демонстрирует более низкую процентную долю центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти (например, на по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35 или 40% ниже), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней.In some embodiments, the population of cells from step (iii) exhibits a lower percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells (e.g., at least 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40% lower), compared to cells obtained by an otherwise similar method wherein step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i). In some embodiments, the population of cells from step (iii) exhibits a lower percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells (e.g., at least 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40% lower), compared to cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the population of cells (e.g., T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days.
В некоторых вариантах осуществления процентная доля стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (iii) является увеличенной по сравнению с процентной долей стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, в популяции клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления процентная доля стволовых T-клеток памяти, экспрессирующих CAR, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, экспрессирующих CAR, в популяции клеток из стадии (iii) является увеличенной по сравнению с процентной долей стволовых T-клеток памяти, экспрессирующих CAR, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, экспрессирующих CAR, в популяции клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления процентная доля стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (iii) является более высокой, чем процентная доля стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, среди клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления процентная доля стволовых T-клеток памяти, экспрессирующих CAR, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, экспрессирующих CAR, в популяции клеток из стадии (iii) является более высокой, чем процентная доля стволовых T-клеток памяти, экспрессирующих CAR, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, экспрессирующих CAR, среди клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления процентная доля стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (iii) является более высокой, чем процентная доля стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, среди клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней. В некоторых вариантах осуществления процентная доля стволовых T-клеток памяти, экспрессирующих CAR, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, экспрессирующих CAR, в популяции клеток из стадии (iii) является более высокой, чем процентная доля стволовых T-клеток памяти, экспрессирующих CAR, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, экспрессирующих CAR, среди клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней.In some embodiments, the percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the cell population of step (iii) is increased compared to the percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the percentage of CAR-expressing memory T stem cells, such as CAR-expressing CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the cell population of step (iii) is increased compared to the percentage of CAR-expressing memory T stem cells, such as CAR-expressing CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the population of cells from step (iii) is higher than the percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, among cells obtained by an otherwise similar method wherein step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i). In some embodiments, the percentage of CAR-expressing memory T stem cells, such as CAR-expressing CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the population of cells from step (iii) is higher than the percentage of CAR-expressing memory T stem cells, such as CAR-expressing CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, among cells obtained by an otherwise similar method wherein step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i). In some embodiments, the percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the population of cells from step (iii) is higher than the percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, among cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the population of cells (e.g. T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8 or 9 days. In some embodiments, the percentage of CAR-expressing memory T stem cells, such as CAR-expressing CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the cell population of step (iii) is higher than the percentage of CAR-expressing memory T stem cells, such as CAR-expressing CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the cell population (e.g. T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8 or 9 days.
В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) для популяции клеток из стадии (iii) является приблизительно таким же, как медианный балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) для популяции клеток в начале стадии (i), или отличается от него на не более чем (например, увеличен на не более чем) приблизительно 25, 50, 75, 100 или 125%. В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) для популяции клеток из стадии (iii) является более низким (например, на по меньшей мере приблизительно 100, 150, 200, 250 или 300% ниже), чем медианный балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) для клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) для популяции клеток из стадии (iii) является более низким (например, на по меньшей мере приблизительно 100, 150, 200, 250 или 300% ниже), чем медианный балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) для клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней. В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) для популяции клеток из стадии (iii) является приблизительно таким же, как медианный балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) для популяции клеток в начале стадии (i), или отличается от него на не более чем (например, увеличен на не более чем) приблизительно 25, 50, 100, 150 или 200%. В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) для популяции клеток из стадии (iii) является более низким (например, на по меньшей мере приблизительно 50, 100, 125, 150 или 175% ниже), чем медианный балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) для клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) для популяции клеток из стадии (iii) является более низким (например, на по меньшей мере приблизительно 50, 100, 125, 150 или 175% ниже), чем медианный балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) для клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней. В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) для популяции клеток из стадии (iii) является приблизительно таким же, как медианный балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) для популяции клеток в начале стадии (i), или отличается от него на не более чем (например, увеличен на не более чем) приблизительно 25, 50, 100, 150, 200 или 250%. В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) для популяции клеток из стадии (iii) является более низким (например, на по меньшей мере приблизительно 50, 100 или 125% ниже), чем медианный балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) для клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) для популяции клеток из стадии (iii) является более низким (например, на по меньшей мере приблизительно 50, 100 или 125% ниже), чем медианный балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) для клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней. В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые при гипоксии) для популяции клеток из стадии (iii) является приблизительно таким же, как медианный балл набора генов (активируемые при гипоксии) для популяции клеток в начале стадии (i), или отличается от него на не более чем (например, увеличен на не более чем) приблизительно 125, 150, 175 или 200%. В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые при гипоксии) для популяции клеток из стадии (iii) является более низким (например, на по меньшей мере приблизительно 40, 50, 60, 70 или 80% ниже), чем медианный балл набора генов (активируемые при гипоксии) для клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые при гипоксии) для популяции клеток из стадии (iii) является более низким (например, на по меньшей мере приблизительно 40, 50, 60, 70 или 80% ниже), чем медианный балл набора генов (активируемые при гипоксии) для клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней. В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые при аутофагии) для популяции клеток из стадии (iii) является приблизительно таким же, как медианный балл набора генов (активируемые при аутофагии) для популяции клеток в начале стадии (i), или отличается от него на не более чем (например, увеличен на не более чем) приблизительно 180, 190, 200 или 210%. В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые при аутофагии) для популяции клеток из стадии (iii) является более низким (например, на по меньшей мере приблизительно 20, 30 или 40% ниже), чем медианный балл набора генов (активируемые при аутофагии) для клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления медианный балл набора генов (активируемые при аутофагии) для популяции клеток из стадии (iii) является более низким (например, на по меньшей мере 20, 30 или 40% ниже), чем медианный балл набора генов (активируемые при аутофагии) для клеток, полученных посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней.In some embodiments, the median gene set score (upregulated in TEM relative to downregulated in TSCM) for the cell population from step (iii) is approximately the same as, or differs from, the median gene set score (upregulated in TEM relative to downregulated in TSCM) for the cell population at the beginning of step (i) by no more than (e.g., increased by no more than) about 25, 50, 75, 100, or 125%. In some embodiments, the median gene set score (upregulated in TEM relative to downregulated in TSCM) for the population of cells from step (iii) is lower (e.g., at least about 100, 150, 200, 250, or 300% lower) than the median gene set score (upregulated in TEM relative to downregulated in TSCM) for cells obtained by an otherwise similar method wherein step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i). In some embodiments, the median gene set score (upregulated in TEMs relative to downregulated in TSCM) for the cell population of step (iii) is lower (e.g., at least about 100, 150, 200, 250, or 300% lower) than the median gene set score (upregulated in TEMs relative to downregulated in TSCM) for cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the cell population (e.g., T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days. In some embodiments, the median gene set score (upregulated in Tregs relative to downregulated in Teff) for the cell population from step (iii) is approximately the same as, or differs from, by no more than (e.g., increased by no more than) about 25, 50, 100, 150, or 200%. In some embodiments, the median gene set score (upregulated in Tregs relative to downregulated in Teff) for the population of cells from step (iii) is lower (e.g., at least about 50, 100, 125, 150, or 175% lower) than the median gene set score (upregulated in Tregs relative to downregulated in Teff) for cells obtained by an otherwise similar method wherein step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i). In some embodiments, the median gene set score (upregulated in Tregs relative to downregulated in Teff) for the cell population of step (iii) is lower (e.g., at least about 50, 100, 125, 150, or 175% lower) than the median gene set score (upregulated in Tregs relative to downregulated in Teff) for cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the cell population (e.g., T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days. In some embodiments, the median gene set score (repressed in stemness) for the population of cells from step (iii) is approximately the same as, or differs from, the median gene set score (repressed in stemness) for the population of cells at the beginning of step (i) by no more than (e.g., increased by no more than) about 25, 50, 100, 150, 200, or 250%. In some embodiments, the median gene set score (repressed in stemness) for the population of cells from step (iii) is lower (e.g., at least about 50, 100, or 125% lower) than the median gene set score (repressed in stemness) for cells obtained by an otherwise similar method wherein step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i). In some embodiments, the median gene set score (repressed in stemness) for the population of cells from step (iii) is lower (such as at least about 50, 100, or 125% lower) than the median gene set score (repressed in stemness) for cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the population of cells (e.g., T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days. In some embodiments, the median gene set score (hypoxia-activated) for the population of cells from step (iii) is about the same as, or different from, (such as increased by, about 125, 150, 175, or 200%) the median gene set score (hypoxia-activated) for the population of cells at the beginning of step (i). In some embodiments, the median gene set score (hypoxia upregulated) for the population of cells from step (iii) is lower (e.g., at least about 40, 50, 60, 70, or 80% lower) than the median gene set score (hypoxia upregulated) for cells obtained by an otherwise similar method wherein step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i). In some embodiments, the median gene set score (activated by hypoxia) for the population of cells from step (iii) is lower (such as at least about 40, 50, 60, 70, or 80% lower) than the median gene set score (activated by hypoxia) for cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the population of cells (e.g., T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days. In some embodiments, the median gene set score (activated by autophagy) for the population of cells from step (iii) is about the same as, or differs from, by no more than (such as increased by no more than) about 180, 190, 200, or 210%. In some embodiments, the median gene set score (activated by autophagy) for the population of cells from step (iii) is lower (e.g., at least about 20, 30, or 40% lower) than the median gene set score (activated by autophagy) for cells obtained by an otherwise similar method wherein step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i). In some embodiments, the median gene set score (activated by autophagy) for the population of cells from step (iii) is lower (e.g., at least 20, 30, or 40% lower) than the median gene set score (activated by autophagy) for cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the population of cells (e.g., T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days.
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) после инкубирования с клеткой, экспрессирующей антиген, распознаваемый CAR, секретирует IL-2 на более высоком уровне (например, в по меньшей мере 2, 4, 6, 8, 10, 12 или 14 раз более высоком), чем клетки, полученные посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i), или клетки, полученные посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней.In some embodiments, the population of cells from step (iii), after incubation with a cell expressing an antigen recognized by the CAR, secretes IL-2 at a higher level (e.g., at least 2, 4, 6, 8, 10, 12, or 14 times higher) than cells obtained by an otherwise similar process wherein step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i), or cells obtained by an otherwise similar process that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the population of cells (e.g., T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days.
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) после введения in vivo персистирует дольше или размножается на более высоком уровне (например, на по меньшей мере 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, или 90% более высоком) по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) после введения in vivo персистирует дольше или размножается на более высоком уровне (например, на по меньшей мере 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, или 90% более высоком) по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней.In some embodiments, the population of cells from step (iii) after administration in vivo persists longer or expands at a higher level (e.g., at least 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, or 90% higher) compared to cells obtained by an otherwise similar method in which step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i). In some embodiments, the population of cells from step (iii) after administration in vivo persists longer or expands at a higher level (e.g., at least 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, or 90% higher) compared to cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the population of cells (e.g., T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days.
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) после введения in vivo демонстрирует более сильную противоопухолевую активность (например, более сильную противоопухолевую активность при низкой дозе, например, дозе, составляющей не более 0,15×106, 0,2×106, 0,25×106 или 0,3×106 жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR), чем клетки, полученные посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (iii) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (i), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (i), или клетки, полученные посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (ii) и перед стадией (iii) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней.In some embodiments, the population of cells from step (iii), upon administration in vivo, exhibits more potent anti-tumor activity (e.g., more potent anti-tumor activity at a low dose, e.g., a dose of no more than 0.15× 106 , 0.2× 106 , 0.25× 106 , or 0.3× 106 viable CAR-expressing cells) than cells obtained by an otherwise similar method wherein step (iii) is performed more than 26 hours after the start of step (i), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (i), or cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (ii) and before step (iii), expanding the population of cells (e.g., T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8 or 9 days.
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) не является размножившейся, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) является уменьшенной по сравнению с количеством живых клеток в популяции клеток в начале стадии (i), например, согласно оценке по количеству живых клеток. В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, или 40%, например, на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) не является размножившейся или является размножившейся за менее чем 0,5, 1, 1,5 или 2 часа, например, менее чем 1 или 1,5 часа, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (i).In some embodiments, the cell population of step (iii) is not expanded, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the cell population of step (iii) is reduced compared to the number of living cells in the cell population at the beginning of step (i), such as as assessed by the number of living cells. In some embodiments, the cell population of step (iii) is expanded with an increase in number by no more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40%, such as no more than 10%, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the population of cells from step (iii) is not expanded or is expanded in less than 0.5, 1, 1.5, or 2 hours, such as less than 1 or 1.5 hours, compared to the population of cells at the start of step (i).
В некоторых вариантах осуществления стадии (i) и (ii) проводят в средах для клеток (например, бессывороточных средах), содержащих IL-2, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra), ингибитор LSD1 или ингибитор MALT1. В некоторых вариантах осуществления стадии (i) и (ii) проводят в средах для клеток (например, бессывороточных средах), содержащих IL-7, IL-21 или их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления стадии (i) и (ii) проводят в средах для клеток (например, бессывороточных средах), содержащих IL-2, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21, IL-7, IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra), ингибитор LSD1, ингибитор MALT1 или их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления стадию (i) проводят в средах для клеток (например, бессывороточных средах), содержащих IL-2, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra), ингибитор LSD1 или ингибитор MALT1. В некоторых вариантах осуществления стадию (ii) проводят в средах для клеток (например, бессывороточных средах), содержащих IL-2, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra), ингибитор LSD1 или ингибитор MALT1. В некоторых вариантах осуществления стадию (i) проводят в средах для клеток (например, бессывороточных средах), содержащих IL-7, IL-21 или их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления стадию (ii) проводят в средах для клеток (например, бессывороточных средах), содержащих IL-7, IL-21 или их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления стадию (i) проводят в средах для клеток (например, бессывороточных средах), содержащих IL-2, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21, IL-7, IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra), ингибитор LSD1, ингибитор MALT1 или их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления стадию (ii) проводят в средах для клеток (например, бессывороточных средах), содержащих IL-2, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21, IL-7, IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra), ингибитор LSD1, ингибитор MALT1 или их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления среда для клеток представляет собой бессывороточную среду, содержащую заменитель сыворотки. В некоторых вариантах осуществления заменитель сыворотки представляет собой заменитель сыворотки для иммунных клеток (ICSR) CTS™.In some embodiments, steps (i) and (ii) are performed in cell media (e.g., serum-free media) comprising IL-2, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra), an LSD1 inhibitor, or a MALT1 inhibitor. In some embodiments, steps (i) and (ii) are performed in cell media (e.g., serum-free media) comprising IL-7, IL-21, or a combination thereof. In some embodiments, steps (i) and (ii) are performed in cell media (e.g., serum-free media) comprising IL-2, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21, IL-7, IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra), an LSD1 inhibitor, a MALT1 inhibitor, or a combination thereof. In some embodiments, step (i) is performed in cell media (e.g., serum-free media) comprising IL-2, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra), an LSD1 inhibitor, or a MALT1 inhibitor. In some embodiments, step (ii) is performed in cell media (e.g., serum-free media) comprising IL-2, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra), an LSD1 inhibitor, or a MALT1 inhibitor. In some embodiments, step (i) is performed in cell media (e.g., serum-free media) comprising IL-7, IL-21, or a combination thereof. In some embodiments, step (ii) is performed in cell media (e.g., serum-free media) comprising IL-7, IL-21, or a combination thereof. In some embodiments, step (i) is performed in cell media (e.g., serum-free media) comprising IL-2, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21, IL-7, IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra), an LSD1 inhibitor, a MALT1 inhibitor, or a combination thereof. In some embodiments, step (ii) is performed in cell media (e.g., serum-free media) comprising IL-2, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21, IL-7, IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra), an LSD1 inhibitor, a MALT1 inhibitor, or a combination thereof. In some embodiments, the cell media is a serum-free medium comprising a serum substitute. In some embodiments, the serum substitute is CTS™ Immune Cell Serum Replacement (ICSR).
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные способы дополнительно включают перед стадией (i) (iv) получение свежего продукта лейкафереза (или альтернативного источника гемопоэтической ткани, такого как свежий продукт, представляющий собой цельную кровь, свежий продукт, представляющий собой костный мозг, или свежий продукт, полученный в результате биопсии или удаления опухоли или органа (например, свежий продукт, полученный в результате тимэктомии)), от организации, например, лаборатории, больницы или учреждения здравоохранения.In some embodiments, the above methods further comprise, prior to step (i) (iv), obtaining fresh leukapheresis product (or an alternative source of hematopoietic tissue, such as fresh whole blood product, fresh bone marrow product, or fresh tumor or organ biopsy or removal product (e.g., fresh thymectomy product)), from an organization, such as a laboratory, hospital, or healthcare facility.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные способы дополнительно включают перед стадией (i) (v) выделение популяции клеток (например, T-клеток, например, CD8+ и/или CD4+ T-клеток), приводимых в контакт на стадии (i), из свежего продукта лейкафереза (или альтернативного источника гемопоэтической ткани, такого как свежий продукт, представляющий собой цельную кровь, свежий продукт, представляющий собой костный мозг, или свежий продукт, полученный в результате биопсии или удаления опухоли или органа (например, свежий продукт, полученный в результате тимэктомии)). В некоторых вариантах осуществления стадию (iii) проводят не позже чем через 35 часов после начала стадии (v), например, не позже чем через 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34 или 35 часов после начала стадии (v), например, не позже чем через 30 часов после начала стадии (v). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) не является размножившейся или является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 или 40%, например, на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в конце стадии (v).In some embodiments, the above methods further comprise, prior to step (i) (v), isolating the population of cells (e.g., T cells, e.g., CD8+ and/or CD4+ T cells) contacted in step (i) from a fresh leukapheresis product (or an alternative source of hematopoietic tissue, such as a fresh whole blood product, a fresh bone marrow product, or a fresh tumor or organ biopsy or removal product (e.g., a fresh thymectomy product)). In some embodiments, step (iii) is performed no later than 35 hours after the start of step (v), such as no later than 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, or 35 hours after the start of step (v), such as no later than 30 hours after the start of step (v). In some embodiments, the cell population of step (iii) is not expanded or is expanded by an increase in number of no more than 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 or 40%, such as no more than 10%, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population at the end of step (v).
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные способы дополнительно включают перед стадией (i) получение криоконсервированных T-клеток, выделенных из продукта лейкафереза (или альтернативного источника гемопоэтической ткани, как, например, криоконсервированных T-клеток, выделенных из цельной крови, костного мозга или продукта, полученного в результате биопсии или удаления опухоли или органа (например, тимэктомии)), от организации, например, лаборатории, больницы или учреждения здравоохранения.In some embodiments, the above methods further comprise, prior to step (i), obtaining cryopreserved T cells isolated from the leukapheresis product (or an alternative source of hematopoietic tissue, such as cryopreserved T cells isolated from whole blood, bone marrow, or a product obtained from a biopsy or removal of a tumor or organ (e.g., thymectomy)), from an organization, such as a laboratory, hospital, or healthcare facility.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные способы дополнительно включают перед стадией (i) (iv) получение криоконсервированного продукта лейкафереза (или альтернативного источника гемопоэтической ткани, такого как криоконсервированный продукт, представляющий собой цельную кровь, криоконсервированный продукт, представляющий собой костный мозг, или криоконсервированный продукт, полученный в результате биопсии или удаления опухоли или органа (например, криоконсервированный продукт, полученный в результате тимэктомии)), от организации, например, лаборатории, больницы или учреждения здравоохранения.In some embodiments, the above methods further comprise, prior to step (i) (iv), obtaining a cryopreserved leukapheresis product (or an alternative source of hematopoietic tissue, such as a cryopreserved product of whole blood, a cryopreserved product of bone marrow, or a cryopreserved product obtained from a biopsy or removal of a tumor or organ (e.g., a cryopreserved product obtained from a thymectomy)), from an organization, such as a laboratory, hospital, or healthcare facility.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные способы дополнительно включают перед стадией (i) (v) выделение популяции клеток (например, T-клеток, например, CD8+ и/или CD4+ T-клеток), приводимых в контакт на стадии (i), из криоконсервированного продукта лейкафереза (или альтернативного источника гемопоэтической ткани, такого как криоконсервированный продукт, представляющий собой цельную кровь, криоконсервированный продукт, представляющий собой костный мозг, или криоконсервированный продукт, полученный в результате биопсии или удаления опухоли или органа (например, криоконсервированный продукт, полученный в результате тимэктомии)). В некоторых вариантах осуществления стадию (iii) проводят не позже чем через 35 часов после начала стадии (v), например, не позже чем через 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34 или 35 часов после начала стадии (v), например, не позже чем через 30 часов после начала стадии (v). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) не является размножившейся или является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 или 40%, например, на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в конце стадии (v).In some embodiments, the above methods further comprise, prior to step (i) (v), isolating the population of cells (e.g., T cells, e.g., CD8+ and/or CD4+ T cells) contacted in step (i) from the cryopreserved leukapheresis product (or an alternative source of hematopoietic tissue, such as a cryopreserved product comprising whole blood, a cryopreserved product comprising bone marrow, or a cryopreserved product obtained from a biopsy or removal of a tumor or organ (e.g., a cryopreserved product obtained from a thymectomy)). In some embodiments, step (iii) is performed no later than 35 hours after the start of step (v), such as no later than 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34 or 35 hours after the start of step (v), such as no later than 30 hours after the start of step (v). In some embodiments, the cell population of step (iii) is not expanded or is expanded by no more than 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 or 40%, such as no more than 10%, such as as assessed by the number of live cells, compared to the cell population at the end of step (v).
В некоторых вариантах осуществления клетки из стадии (iii) культивируют в течение от приблизительно двух до приблизительно четырех дней, например, приблизительно трех дней (например, приблизительно 72 часов после сбора), перед измерением уровня экспрессии CAR в их части (например, перед измерением процентной доли жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR, в их части, например, перед измерением процентной доли жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR для BCMA, в их части). В некоторых вариантах осуществления измерение экспрессии CAR осуществляют через приблизительно 4 дня (например, 96 часов) после стадии (ii). В некоторых вариантах осуществления уровень экспрессии CAR измеряют посредством проточной цитометрии.In some embodiments, the cells of step (iii) are cultured for about two to about four days, such as about three days (e.g., about 72 hours after harvest), before measuring the level of CAR expression in a portion thereof (e.g., before measuring the percentage of viable cells expressing the CAR in a portion thereof, such as before measuring the percentage of viable cells expressing the CAR for BCMA in a portion thereof). In some embodiments, measuring CAR expression is performed about 4 days (e.g., 96 hours) after step (ii). In some embodiments, the level of CAR expression is measured by flow cytometry.
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении описан способ получения популяции клеток (например, T-клеток), которые экспрессируют химерный антигенный рецептор (CAR), при этом способ включает (1) приведение популяции клеток (например, T-клеток, например, T-клеток, выделенных из замороженного продукта лейкафереза) в контакт с цитокином, выбранным из IL-2, IL-7, IL-15, IL-21, IL-6 или их комбинации, (2) приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты (например, молекулой ДНК или РНК), кодирующей CAR, за счет чего обеспечивается получение популяции клеток (например, T-клеток), содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, и (3) сбор популяции клеток (например, T-клеток) для хранения (например, повторного составления популяции клеток в среде для криоконсервации) или введения, где (a) стадию (2) проводят вместе со стадией (1) или не позже чем через 5 часов после начала стадии (1), например, не позже чем через 1, 2, 3, 4 или 5 часов после начала стадии (1), и стадию (3) проводят не позже чем через 26 часов после начала стадии (1), например, не позже чем через 22, 23, 24 или 25 часов после начала стадии (1), например, не позже чем через 24 часа после начала стадии (1), или (b) популяция клеток из стадии (3) не является размножившейся или является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 или 40%, например, на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) представляет собой молекулу ДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) представляет собой молекулу РНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) находится в вирусном векторе, например, в вирусном векторе, выбранном из лентивирусного вектора, аденовирусного вектора или ретровирусного вектора. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) находится в невирусном векторе. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) находится в плазмиде. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) не находится в каком-либо векторе. В некоторых вариантах осуществления стадия (2) включает трансдукцию популяции клеток (например, T-клеток) c помощью вирусного вектора, содержащего молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая CAR, представляет собой молекулу нуклеиновой кислоты, раскрытую в данном документе. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит первую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую первый CAR, и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую второй CAR. В некоторых вариантах осуществления первая и вторая последовательности нуклеиновой кислоты расположены в одной молекуле нуклеиновой кислоты, например, где первая последовательность нуклеиновой кислоты и вторая последовательность нуклеиновой кислоты разделены третьей последовательностью нуклеиновой кислоты, кодирующей сайт саморасщепления (например, сайт P2A, сайт Т2A, сайт Е2A или сайт F2A). В некоторых вариантах осуществления первая и вторая последовательности нуклеиновой кислоты расположены в отдельных молекулах нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR, где CAR содержит первую VH (VH1), первую VL (VL1), вторую VH (VH2), вторую VL (VL2), трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен, где VH1 и VL1 связываются с первым антигеном, а VH2 и VL2 связываются со вторым антигеном, где VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH1 - необязательно линкер 1 ("L1") - VH2 - необязательно линкер 2 ("L2") - VL2 - необязательно линкер 3 ("L3") - VL1, VH1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VL1, VL1 - необязательно L1 - VH2 - необязательно L2 - VL2 - необязательно L3 - VH1, VL1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VH1, VH2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VL2, VH2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VL2, VL2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VH2 или VL2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VH2.In some embodiments, the invention features a method of producing a population of cells (e.g., T cells) that express a chimeric antigen receptor (CAR), the method comprising (1) contacting the population of cells (e.g., T cells, e.g., T cells isolated from a frozen leukapheresis product) with a cytokine selected from IL-2, IL-7, IL-15, IL-21, IL-6, or a combination thereof, (2) contacting the population of cells (e.g., T cells) with a nucleic acid molecule (e.g., a DNA or RNA molecule) encoding the CAR, thereby producing a population of cells (e.g., T cells) comprising the nucleic acid molecule, and (3) collecting the population of cells (e.g., T cells) for storage (e.g., reconstituting the population of cells in cryopreservation medium) or administration, wherein (a) step (2) is performed together with step (1) or no later than 5 hours after the start of step (1), such as no later than 1, 2, 3, 4 or 5 hours after the start of step (1), and step (3) is performed no later than 26 hours after the start of step (1), such as no later than 22, 23, 24 or 25 hours after the start of step (1), such as no later than 24 hours after the start of step (1), or (b) the cell population of step (3) is not expanded or is expanded by no more than 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 or 40%, such as no more than 10%, such as as assessed by the number of live cells, compared to the cell population at the start of step (1). In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is a DNA molecule. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is an RNA molecule. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is in a viral vector, such as a viral vector selected from a lentiviral vector, an adenoviral vector, or a retroviral vector. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is in a non-viral vector. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is in a plasmid. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is not in any vector. In some embodiments, step (2) involves transducing a population of cells (e.g., T cells) with a viral vector comprising a nucleic acid molecule encoding a CAR. In some embodiments, the nucleic acid molecule encoding a CAR is a nucleic acid molecule as disclosed herein. In some embodiments, the nucleic acid molecule comprises a first nucleic acid sequence encoding a first CAR and a second nucleic acid sequence encoding a second CAR. In some embodiments, the first and second nucleic acid sequences are located on a single nucleic acid molecule, such as where the first nucleic acid sequence and the second nucleic acid sequence are separated by a third nucleic acid sequence encoding a self-cleavage site (e.g., a P2A site, a T2A site, an E2A site, or an F2A site). In some embodiments, the first and second nucleic acid sequences are located on separate nucleic acid molecules. In some embodiments, the nucleic acid molecule comprises a nucleic acid sequence encoding a CAR, wherein the CAR comprises a first VH (VH1), a first VL (VL1), a second VH (VH2), a second VL (VL2), a transmembrane domain, and an intracellular signaling domain, wherein VH1 and VL1 bind a first antigen and VH2 and VL2 bind a second antigen, wherein VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH1 - optional Linker 1 ("L1") - VH2 - optional Linker 2 ("L2") - VL2 - optional Linker 3 ("L3") - VL1, VH1 - optional L1 - VL2 - optional L2 - VH2 - optional L3 - VL1, VL1 - optional L1 - VH2 - optional L2 - VL2 - optional L3 - VH1, VL1 - optional L1 - VL2 - optional L2 - VH2 - optional L3 - VH1, VH2 - optional L1 - VH1 - optional L2 - VL1 - optional L3 - VL2, VH2 - optional L1 - VL1 - optional L2 - VH1 - optional L3 - VL2, VL2 - optional L1 - VH1 - optional L2 - VL1 - optional L3 - VH2 or VL2 - optional L1 - VL1 - optional L2 - VH1 - optional L3 - VH2.
В некоторых вариантах осуществления стадию (2) проводят вместе со стадией (1). В некоторых вариантах осуществления стадию (2) проводят не позже чем через 5 часов после начала стадии (1). В некоторых вариантах осуществления стадию (2) проводят не позже чем через 1, 2, 3, 4 или 5 часов после начала стадии (1). В некоторых вариантах осуществления стадию (3) проводят не позже чем через 26 часов после начала стадии (1). В некоторых вариантах осуществления стадию (3) проводят не позже чем через 22, 23, 24 или 25 часов после начала стадии (1). В некоторых вариантах осуществления стадию (3) проводят не позже чем через 24 часа после начала стадии (1).In some embodiments, step (2) is performed together with step (1). In some embodiments, step (2) is performed no later than 5 hours after the start of step (1). In some embodiments, step (2) is performed no later than 1, 2, 3, 4, or 5 hours after the start of step (1). In some embodiments, step (3) is performed no later than 26 hours after the start of step (1). In some embodiments, step (3) is performed no later than 22, 23, 24, or 25 hours after the start of step (1). In some embodiments, step (3) is performed no later than 24 hours after the start of step (1).
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) не является размножившейся, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, или 40%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) является размножившейся с увеличением численности на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (1).In some embodiments, the cell population of step (3) is not expanded, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the cell population of step (3) is expanded by an increase in abundance of no more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40%, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the cell population of step (3) is expanded by an increase in abundance of no more than 10%, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population at the beginning of step (1).
В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-2. В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-7. В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-21. В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra). В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-2 и IL-7. В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-2 и IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-2 и IL-21. В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-2 и IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra). В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-7 и IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-7 и IL-21. В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-7 и IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra). В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) и IL-21. В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) и IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra). В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-21 и IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra). В некоторых вариантах осуществления стадия (1) включает приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с IL-7, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) и IL-21.In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-2. In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-7. In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-21. In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra). In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-2 and IL-7. In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-2 and IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-2 and IL-21. In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-2 and IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra). In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-7 and IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-7 and IL-21. In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-7 and IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra). In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) and IL-21. In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) and IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra). In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-21 and IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra). In some embodiments, step (1) comprises contacting a population of cells (e.g., T cells) with IL-7, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) and IL-21.
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) демонстрирует более высокую процентную долю необученных клеток среди клеток, экспрессирующих CAR (например, на по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35 или 40% выше), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает приведение популяции клеток в контакт, например, с антителом к CD3.In some embodiments, the population of cells from step (3) exhibits a higher percentage of naive cells among the cells expressing the CAR (e.g., at least 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40% higher) compared to cells obtained by an otherwise similar method that further comprises contacting the population of cells with, e.g., an anti-CD3 antibody.
В некоторых вариантах осуществления процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (3) является такой же, как процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ клеток, в популяции клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (3) отличается на не более чем 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12% от процентной доли необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ клеток, в популяции клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (3) отличается на не более чем 5 или 10% от процентной доли необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ клеток, в популяции клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (3) является увеличенной по сравнению с процентной долей необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ клеток, в популяции клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (3) увеличена на по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20% по сравнению с процентной долей необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ клеток, в популяции клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток, в популяции клеток из стадии (3) увеличена на по меньшей мере 10 или 20% по сравнению с процентной долей необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ клеток, в популяции клеток в начале стадии (1).In some embodiments, the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells, in the cell population from step (3) is the same as the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ cells, in the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells, in the cell population of step (3) differs by no more than 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12% from the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ cells, in the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells, in the cell population of step (3) is no more than 5% or 10% different from the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ cells, in the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells, in the cell population of step (3) is increased compared to the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ cells, in the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells, in the cell population of step (3) is increased by at least 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, or 20% compared to the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ cells, in the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells, in the cell population of step (3) is increased by at least 10% or 20% compared to the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ cells, in the cell population at the beginning of step (1).
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) демонстрирует более высокую процентную долю необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ Т-клеток (например, на по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35 или 40% выше), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (3) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (1), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (1). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) демонстрирует более высокую процентную долю необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток (например, на по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35 или 40% выше), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (2) и перед стадией (3) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней.In some embodiments, the population of cells from step (3) exhibits a higher percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells (e.g., at least 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40% higher), compared to cells obtained by an otherwise similar method wherein step (3) is performed more than 26 hours after the start of step (1), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (1). In some embodiments, the population of cells from step (3) exhibits a higher percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells (e.g., at least 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40% higher), compared to cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (2) and before step (3), expanding the population of cells (e.g. T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days.
В некоторых вариантах осуществления процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных Т-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток из стадии (3) является такой же, как процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток из стадии (3) отличается на не более чем 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12% от процентной доли центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток из стадии (3) отличается на не более чем 5 или 10% от процентной доли центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток из стадии (3) является уменьшенной по сравнению с процентной долей центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток из стадии (3) уменьшена на по меньшей мере 10 или 20% по сравнению с процентной долей центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток из стадии (3) уменьшена на по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20% по сравнению с процентной долей центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток в начале стадии (1).In some embodiments, the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population of step (3) is the same as the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population of step (3) differs by no more than 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12% from the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population of step (3) differs by no more than 5% or 10% from the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population at the beginning of step (i). In some embodiments, the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population of step (3) is reduced compared to the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population of step (3) is reduced by at least 10% or 20% compared to the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population of step (3) is reduced by at least 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 or 20% compared to the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells, in the cell population at the beginning of step (1).
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) демонстрирует более низкую процентную долю центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти (например, на по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35 или 40% ниже), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (3) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (1), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (1). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) демонстрирует более низкую процентную долю центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти (например, на по меньшей мере 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35 или 40% ниже), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (2) и перед стадией (3) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней.In some embodiments, the population of cells from step (3) exhibits a lower percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells (e.g., at least 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40% lower), compared to cells obtained by an otherwise similar method wherein step (3) is performed more than 26 hours after the start of step (1), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (1). In some embodiments, the population of cells from step (3) exhibits a lower percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CD95+ central memory T cells (e.g., at least 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40% lower), compared to cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (2) and before step (3), expanding the population of cells (e.g., T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days.
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) после введения in vivo персистирует дольше или размножается на более высоком уровне (например, на по меньшей мере 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, или 90% более высоком) по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, в котором стадию (3) проводят через более чем 26 часов после начала стадии (1), например, через более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней после начала стадии (1). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) после введения in vivo персистирует дольше или размножается на более высоком уровне (например, на по меньшей мере 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, или 90% более высоком) по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает после стадии (2) и перед стадией (3) размножение популяции клеток (например, T-клеток) in vitro в течение более чем 3 дней, например, в течение 5, 6, 7, 8 или 9 дней.In some embodiments, the population of cells from step (3) after administration in vivo persists longer or expands at a higher level (e.g., at least 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, or 90% higher) compared to cells obtained by an otherwise similar method in which step (3) is performed more than 26 hours after the start of step (1), such as more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days after the start of step (1). In some embodiments, the population of cells from step (3) after administration in vivo persists longer or expands at a higher level (e.g., at least 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, or 90% higher) compared to cells obtained by an otherwise similar method that further comprises, after step (2) and before step (3), expanding the population of cells (e.g., T cells) in vitro for more than 3 days, such as for 5, 6, 7, 8, or 9 days.
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) не является размножившейся, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, или 40%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) является размножившейся с увеличением численности на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления количество живых клеток в популяции клеток из стадии (3) является уменьшенным по сравнению с количеством живых клеток в популяции клеток в начале стадии (1), например, согласно оценке по количеству живых клеток.In some embodiments, the cell population of step (3) is not expanded, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the cell population of step (3) is expanded by an increase in abundance of no more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, or 40%, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the cell population of step (3) is expanded by an increase in abundance of no more than 10%, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population at the beginning of step (1). In some embodiments, the number of living cells in the cell population from step (3) is reduced compared to the number of living cells in the cell population at the beginning of step (1), such as as assessed by the number of living cells.
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) не является размножившейся по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (1), например, согласно оценке по количеству живых клеток. В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (3) является размножившейся за менее чем 0,5, 1, 1,5 или 2 часа, например, менее чем 1 или 1,5 часа, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (1).In some embodiments, the cell population of step (3) is not expanded compared to the cell population at the beginning of step (1), for example, as assessed by the number of living cells. In some embodiments, the cell population of step (3) is expanded in less than 0.5, 1, 1.5, or 2 hours, for example, less than 1 or 1.5 hours, compared to the cell population at the beginning of step (1).
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток не приводят в контакт in vitro со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, или, в случае приведения в контакт, продолжительность стадии приведения в контакт составляет менее 2 часов, например, не более 1 или 1,5 часа. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, представляет собой средство, которое стимулирует CD3 (например, антитело к CD3). В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, представляет собой средство, которое стимулирует CD28, ICOS, CD27, HVEM, LIGHT, CD40, 4-1BB, OX40, DR3, GITR, CD30, TIM1, CD2, CD226 или любую их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, представляет собой средство, которое стимулирует CD28. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, или средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, выбрано из антитела (например, однодоменного антитела (например, антитела из одного вариабельного домена тяжелой цепи), пептитела, Fab-фрагмента или scFv), малой молекулы или лиганда (например, существующего в природе, рекомбинантного или химерного лиганда).In some embodiments, the cell population is not contacted in vitro with an agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or an agent that stimulates a costimulatory molecule on the cell surface, or if contacted, the duration of the contacting step is less than 2 hours, such as no more than 1 or 1.5 hours. In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex is an agent that stimulates CD3 (e.g., an anti-CD3 antibody). In some embodiments, the agent that stimulates a costimulatory molecule is an agent that stimulates CD28, ICOS, CD27, HVEM, LIGHT, CD40, 4-1BB, OX40, DR3, GITR, CD30, TIM1, CD2, CD226, or any combination thereof. In some embodiments, the agent that stimulates a costimulatory molecule is an agent that stimulates CD28. In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex or the agent that stimulates the costimulatory molecule is selected from an antibody (e.g., a single domain antibody (e.g., a single heavy chain variable domain antibody), a peptibody, a Fab fragment, or an scFv), a small molecule, or a ligand (e.g., a naturally occurring, recombinant, or chimeric ligand).
В некоторых вариантах осуществления стадии (1) и/или (2) проводят в средах для клеток, содержащих не более 5, 4, 3, 2, 1 или 0% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления стадии (1) и/или (2) проводят в средах для клеток, содержащих не более 2% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления стадии (1) и/или (2) проводят в средах для клеток, содержащих приблизительно 2% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления стадии (1) и/или (2) проводят в средах для клеток, содержащих ингибитор LSD1 или ингибитор MALT1. В некоторых вариантах осуществления стадию (1) проводят в средах для клеток, содержащих не более 5, 4, 3, 2, 1 или 0% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления стадию (1) проводят в средах для клеток, содержащих не более 2% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления стадию (1) проводят в средах для клеток, содержащих приблизительно 2% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления стадию (2) проводят в средах для клеток, содержащих не более 5, 4, 3, 2, 1 или 0% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления стадию (2) проводят в средах для клеток, содержащих не более 2% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления стадию (2) проводят в средах для клеток, содержащих приблизительно 2% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления стадию (1) проводят в средах для клеток, содержащих ингибитор LSD1 или ингибитор MALT1. В некоторых вариантах осуществления стадию (2) проводят в средах для клеток, содержащих ингибитор LSD1 или ингибитор MALT1.In some embodiments, steps (1) and/or (2) are performed in cell media containing no more than 5, 4, 3, 2, 1, or 0% serum. In some embodiments, steps (1) and/or (2) are performed in cell media containing no more than 2% serum. In some embodiments, steps (1) and/or (2) are performed in cell media containing about 2% serum. In some embodiments, steps (1) and/or (2) are performed in cell media containing an LSD1 inhibitor or a MALT1 inhibitor. In some embodiments, step (1) is performed in cell media containing no more than 5, 4, 3, 2, 1, or 0% serum. In some embodiments, step (1) is performed in cell media containing no more than 2% serum. In some embodiments, step (1) is performed in cell media containing about 2% serum. In some embodiments, step (2) is performed in cell media containing no more than 5, 4, 3, 2, 1, or 0% serum. In some embodiments, step (2) is performed in cell media containing no more than 2% serum. In some embodiments, step (2) is performed in cell media containing about 2% serum. In some embodiments, step (1) is performed in cell media containing an LSD1 inhibitor or a MALT1 inhibitor. In some embodiments, step (2) is performed in cell media containing an LSD1 inhibitor or a MALT1 inhibitor.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные способы дополнительно включают перед стадией (i) (iv) получение свежего продукта лейкафереза (или альтернативного источника гемопоэтической ткани, такого как свежий продукт, представляющий собой цельную кровь, свежий продукт, представляющий собой костный мозг, или свежий продукт, полученный в результате биопсии или удаления опухоли или органа (например, свежий продукт, полученный в результате тимэктомии)), от организации, например, лаборатории, больницы или учреждения здравоохранения.In some embodiments, the above methods further comprise, prior to step (i) (iv), obtaining fresh leukapheresis product (or an alternative source of hematopoietic tissue, such as fresh whole blood product, fresh bone marrow product, or fresh tumor or organ biopsy or removal product (e.g., fresh thymectomy product)), from an organization, such as a laboratory, hospital, or healthcare facility.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные способы дополнительно включают перед стадией (i) (v) выделение популяции клеток (например, T-клеток, например, CD8+ и/или CD4+ T-клеток), приводимых в контакт на стадии (i), из свежего продукта лейкафереза (или альтернативного источника гемопоэтической ткани, такого как свежий продукт, представляющий собой цельную кровь, свежий продукт, представляющий собой костный мозг, или свежий продукт, полученный в результате биопсии или удаления опухоли или органа (например, свежий продукт, полученный в результате тимэктомии)). В некоторых вариантах осуществления стадию (iii) проводят не позже чем через 35 часов после начала стадии (v), например, не позже чем через 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34 или 35 часов после начала стадии (v), например, не позже чем через 30 часов после начала стадии (v). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) не является размножившейся или является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 или 40%, например, на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в конце стадии (v).In some embodiments, the above methods further comprise, prior to step (i) (v), isolating the population of cells (e.g., T cells, e.g., CD8+ and/or CD4+ T cells) contacted in step (i) from a fresh leukapheresis product (or an alternative source of hematopoietic tissue, such as a fresh whole blood product, a fresh bone marrow product, or a fresh tumor or organ biopsy or removal product (e.g., a fresh thymectomy product)). In some embodiments, step (iii) is performed no later than 35 hours after the start of step (v), such as no later than 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, or 35 hours after the start of step (v), such as no later than 30 hours after the start of step (v). In some embodiments, the cell population of step (iii) is not expanded or is expanded by an increase in number of no more than 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 or 40%, such as no more than 10%, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population at the end of step (v).
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные способы дополнительно включают перед стадией (i) получение криоконсервированных T-клеток, выделенных из продукта лейкафереза (или альтернативного источника гемопоэтической ткани, как, например, криоконсервированных T-клеток, выделенных из цельной крови, костного мозга или продукта, полученного в результате биопсии или удаления опухоли или органа (например, тимэктомии)), от организации, например, лаборатории, больницы или учреждения здравоохранения.In some embodiments, the above methods further comprise, prior to step (i), obtaining cryopreserved T cells isolated from the leukapheresis product (or an alternative source of hematopoietic tissue, such as cryopreserved T cells isolated from whole blood, bone marrow, or a product obtained from a biopsy or removal of a tumor or organ (e.g., thymectomy)), from an organization, such as a laboratory, hospital, or healthcare facility.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные способы дополнительно включают перед стадией (i) (iv) получение криоконсервированного продукта лейкафереза (или альтернативного источника гемопоэтической ткани, такого как криоконсервированный продукт, представляющий собой цельную кровь, криоконсервированный продукт, представляющий собой костный мозг, или криоконсервированный продукт, полученный в результате биопсии или удаления опухоли или органа (например, криоконсервированный продукт, полученный в результате тимэктомии)), от организации, например, лаборатории, больницы или учреждения здравоохранения.In some embodiments, the above methods further comprise, prior to step (i) (iv), obtaining a cryopreserved leukapheresis product (or an alternative source of hematopoietic tissue, such as a cryopreserved product of whole blood, a cryopreserved product of bone marrow, or a cryopreserved product obtained from a biopsy or removal of a tumor or organ (e.g., a cryopreserved product obtained from a thymectomy)), from an organization, such as a laboratory, hospital, or healthcare facility.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанные способы дополнительно включают перед стадией (i) (v) выделение популяции клеток (например, T-клеток, например, CD8+ и/или CD4+ T-клеток), приводимых в контакт на стадии (i), из криоконсервированного продукта лейкафереза (или альтернативного источника гемопоэтической ткани, такого как криоконсервированный продукт, представляющий собой цельную кровь, криоконсервированный продукт, представляющий собой костный мозг, или криоконсервированный продукт, полученный в результате биопсии или удаления опухоли или органа (например, криоконсервированный продукт, полученный в результате тимэктомии)). В некоторых вариантах осуществления стадию (iii) проводят не позже чем через 35 часов после начала стадии (v), например, не позже чем через 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34 или 35 часов после начала стадии (v), например, не позже чем через 30 часов после начала стадии (v). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток из стадии (iii) не является размножившейся или является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 или 40%, например, на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в конце стадии (v).In some embodiments, the above methods further comprise, prior to step (i) (v), isolating the population of cells (e.g., T cells, e.g., CD8+ and/or CD4+ T cells) contacted in step (i) from the cryopreserved leukapheresis product (or an alternative source of hematopoietic tissue, such as a cryopreserved product comprising whole blood, a cryopreserved product comprising bone marrow, or a cryopreserved product obtained from a biopsy or removal of a tumor or organ (e.g., a cryopreserved product obtained from a thymectomy)). In some embodiments, step (iii) is performed no later than 35 hours after the start of step (v), such as no later than 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34 or 35 hours after the start of step (v), such as no later than 30 hours after the start of step (v). In some embodiments, the cell population of step (iii) is not expanded or is expanded by no more than 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 or 40%, such as no more than 10%, such as as assessed by the number of live cells, compared to the cell population at the end of step (v).
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток в начале стадии (i) или стадии (1) была обогащена клетками, экспрессирующими IL6R (например, клетками, которые являются положительными по IL6Rα и/или IL6Rβ). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток в начале стадии (i) или стадии (1) содержит не менее 40, 45, 50, 55, 60, 65 или 70% клеток, экспрессирующих IL6R (например, клеток, которые являются положительными по IL6Rα и/или IL6Rβ).In some embodiments, the cell population at the beginning of step (i) or step (1) is enriched in IL6R expressing cells (e.g., cells that are IL6Rα and/or IL6Rβ positive). In some embodiments, the cell population at the beginning of step (i) or step (1) comprises at least 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, or 70% IL6R expressing cells (e.g., cells that are IL6Rα and/or IL6Rβ positive).
В некоторых вариантах осуществления стадии (i) и (ii) или стадии (1) и (2) проводят в средах для клеток, содержащих IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). В некоторых вариантах осуществления IL-15 увеличивает способность популяции клеток к размножению, например, спустя 10, 15, 20 или 25 дней. В некоторых вариантах осуществления IL-15 увеличивает процентную долю клеток, экспрессирующих IL6Rβ, в популяции клеток.In some embodiments, steps (i) and (ii) or steps (1) and (2) are performed in cell media containing IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). In some embodiments, IL-15 increases the ability of a cell population to proliferate, such as after 10, 15, 20, or 25 days. In some embodiments, IL-15 increases the percentage of IL6Rβ-expressing cells in a cell population.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанных способов способы осуществляют в закрытой системе. В некоторых вариантах осуществления все из отделения, активации, трансдукции, инкубирования и промывания Т-клеток проводят в закрытой системе. В некоторых вариантах осуществления вышеуказанных способов способы осуществляют в отдельных устройствах. В некоторых вариантах осуществления отделение, активацию, трансдукцию, инкубирование и промывание Т-клеток проводят в отдельных устройствах.In some embodiments of the above methods, the methods are performed in a closed system. In some embodiments, all of the separation, activation, transduction, incubation, and washing of the T cells are performed in a closed system. In some embodiments of the above methods, the methods are performed in separate devices. In some embodiments, the separation, activation, transduction, incubation, and washing of the T cells are performed in separate devices.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанных способов способы дополнительно включают добавление вспомогательного вещества или реагента, усиливающего трансдукцию, в среду для культивирования клеток для повышения эффективности трансдукции. В некоторых вариантах осуществления вспомогательное вещество или реагент, усиливающий трансдукцию, содержит катионный полимер. В некоторых вариантах осуществления вспомогательное вещество или реагент, усиливающий трансдукцию, выбраны из LentiBOOST™ (Sirion Biotech), вектофусина-1, F108, бромида гексадиметрина (полибрена), PEA, Pluronic F68, Pluronic F127, Synperonic или LentiTrans™. В некоторых вариантах осуществления вспомогательное вещество представляет собой LentiBOOST™ (Sirion Biotech).In some embodiments of the above methods, the methods further comprise adding an adjuvant or transduction enhancing reagent to the cell culture medium to enhance transduction efficiency. In some embodiments, the adjuvant or transduction enhancing reagent comprises a cationic polymer. In some embodiments, the adjuvant or transduction enhancing reagent is selected from LentiBOOST™ (Sirion Biotech), Vectofusin-1, F108, Hexadimethrine Bromide (Polybrene), PEA, Pluronic F68, Pluronic F127, Synperonic, or LentiTrans™. In some embodiments, the adjuvant is LentiBOOST™ (Sirion Biotech).
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанных способов трансдукция популяции клеток (например, T-клеток) c помощью вирусного вектора включает воздействие на популяцию клеток и вирусный вектор центробежной силы в условиях, при которых повышается эффективность трансдукции. В одном варианте осуществления клетки трансдуцируют путем спинокуляции.In some embodiments of the above methods, transducing a population of cells (e.g., T cells) with a viral vector comprises exposing the population of cells and the viral vector to centrifugal force under conditions that enhance transduction efficiency. In one embodiment, the cells are transduced by spinoculation.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанных способов клетки (например, T-клетки) активируют и трансдуцируют в колбе для культивирования клеток, содержащей газопроницаемую мембрану в основании, которая предоставляет возможность работы с большими объемами сред без существенного нарушения газообмена. В некоторых вариантах осуществления рост клеток достигается путем предоставления доступа, например, по существу непрерывного доступа, к питательным веществам посредством конвекции.In some embodiments of the above methods, cells (e.g., T cells) are activated and transduced in a cell culture flask containing a gas-permeable membrane at the base that allows for handling large volumes of media without significantly disrupting gas exchange. In some embodiments, cell growth is achieved by providing access, e.g., substantially continuous access, to nutrients via convection.
В некоторых вариантах осуществления вышеуказанных способов CAR содержит антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен.In some embodiments of the above methods, the CAR comprises an antigen-binding domain, a transmembrane domain, and an intracellular signaling domain.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен связывается с антигеном, выбранным из CD19, CD20, CD22, BCMA, мезотелина, EGFRvIII, GD2, Tn-антигена, sTn-антигена, Tn-O-гликопептидов, sTn-O-гликопептидов, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, легумана, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, антигена Y системы Льюис, CD24, PDGFR-бета, SSEA-4, рецептора фолиевой кислоты альфа, ERBB (например, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, эфрина B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-ацетил-GD2, рецептора фолиевой кислоты бета, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, легумаина, E6 или E7 HPV, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, полисиаловой кислоты, Fos-родственного антигена, эластазы нейтрофилов, TRP-2, CYP1B1, белка спермы 17, бета-субъединицы хорионического гонадотропина человека, AFP, тиреоглобулина, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, обратной транскриптазы теломеразы человека, кишечной карбоксилэстеразы, мутантного варианта hsp 70-2, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4 или пептида любого из этих антигенов, презентированного на MHC. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит последовательность CDR, VH, VL, scFv или CAR, раскрытую в данном документе. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит VH и VL, где VH и VL соединены линкером, где линкер необязательно содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 63 или 104.In some embodiments, the antigen binding domain binds to an antigen selected from CD19, CD20, CD22, BCMA, mesothelin, EGFRvIII, GD2, Tn antigen, sTn antigen, Tn-O-glycopeptides, sTn-O-glycopeptides, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, leguman, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, Lewis Y antigen, CD24, PDGFR-beta, SSEA-4, folate receptor alpha, ERBB (e.g., ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, ephrin B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-acetyl-GD2, folate receptor beta, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, legumain, HPV E6 or E7, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, polysialic acid, Fos-related antigen, neutrophil elastase, TRP-2, CYP1B1, sperm protein 17, human chorionic gonadotropin beta, AFP, thyroglobulin, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, human telomerase reverse transcriptase, intestinal carboxylesterase, hsp 70-2 mutant, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4, or a peptide of any of these antigens presented on MHC. In some embodiments, the antigen-binding domain comprises a CDR, VH, VL, scFv, or CAR sequence disclosed herein. In some embodiments, the antigen-binding domain comprises a VH and VL, wherein the VH and VL are connected by a linker, wherein the linker optionally comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63 or 104.
В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен включает в себя трансмембранный домен белка, выбранного из альфа-, бета- или дзета-цепи T-клеточного рецептора, CD28, CD3-эпсилон, CD45, CD4, CD5, CD8, CD9, CD16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD134, CD137 и CD154. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен включает в себя трансмембранный домен CD8. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 6 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую трансмембранный домен, где последовательность нуклеиновой кислоты включает в себя последовательность нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 17 или последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, the transmembrane domain comprises a transmembrane domain of a protein selected from a T cell receptor alpha, beta, or zeta chain, CD28, CD3 epsilon, CD45, CD4, CD5, CD8, CD9, CD16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD134, CD137, and CD154. In some embodiments, the transmembrane domain comprises a CD8 transmembrane domain. In some embodiments, the transmembrane domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the nucleic acid molecule comprises a nucleic acid sequence encoding a transmembrane domain, wherein the nucleic acid sequence comprises the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 17 or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен соединен с трансмембранным доменом с помощью шарнирной области. В некоторых вариантах осуществления шарнирная область содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 2, 3 или 4 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую шарнирную область, где последовательность нуклеиновой кислоты включает в себя последовательность нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 13, 14 или 15 или последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, the antigen-binding domain is connected to the transmembrane domain by a hinge region. In some embodiments, the hinge region comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, 3, or 4, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the nucleic acid molecule comprises a nucleic acid sequence encoding a hinge region, wherein the nucleic acid sequence comprises the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 13, 14, or 15, or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен содержит первичный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления первичный сигнальный домен предусматривает функциональный сигнальный домен, полученный из CD3-дзета, TCR-дзета, FcR-гамма, FcR-бета, CD3-гамма, CD3-дельта, CD3-эпсилон, CD5, CD22, CD79a, CD79b, CD278 (ICOS), FcεRI, DAP10, DAP12 или CD66d. В некоторых вариантах осуществления первичный сигнальный домен предусматривает функциональный сигнальный домен, полученный из CD3-дзета. В некоторых вариантах осуществления первичный сигнальный домен содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 9 или 10 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую первичный сигнальный домен, где последовательность нуклеиновой кислоты включает в себя последовательность нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 20 или 21 или последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, the intracellular signaling domain comprises a primary signaling domain. In some embodiments, the primary signaling domain provides a functional signaling domain derived from CD3zeta, TCRzeta, FcRgamma, FcRbeta, CD3gamma, CD3delta, CD3epsilon, CD5, CD22, CD79a, CD79b, CD278 (ICOS), FcεRI, DAP10, DAP12, or CD66d. In some embodiments, the primary signaling domain provides a functional signaling domain derived from CD3zeta. In some embodiments, the primary signaling domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9 or 10, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the nucleic acid molecule comprises a nucleic acid sequence encoding a primary signaling domain, wherein the nucleic acid sequence comprises the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 20 or 21 or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен содержит костимулирующий сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления костимулирующий сигнальный домен предусматривает функциональный сигнальный домен, полученный из молекулы MHC I класса, белкового рецептора TNF, иммуноглобулиноподобного белка, рецептора цитокина, интегрина, сигнальной молекулы активации лимфоцитов (белка SLAM), активирующего рецептора NK-клеток, BTLA, лиганда Toll-подобного рецептора, OX40, CD2, CD7, CD27, CD28, CD30, CD40, CDS, ICAM-1, 4-1BB (CD137), B7-H3, ICOS (CD278), GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-альфа, CD8-бета, IL2R-бета, IL2R-гамма, IL7R-альфа, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a, CD28-OX40, CD28-4-1BB или лиганда, который специфично связывается с CD83. В некоторых вариантах осуществления костимулирующий сигнальный домен предусматривает функциональный сигнальный домен, полученный из 4-1BB. В некоторых вариантах осуществления костимулирующий сигнальный домен содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 7 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую костимулирующий сигнальный домен, где последовательность нуклеиновой кислоты включает в себя последовательность нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 18 или последовательность нуклеиновой кислоты, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней.In some embodiments, the intracellular signaling domain comprises a costimulatory signaling domain. In some embodiments, the costimulatory signaling domain provides a functional signaling domain derived from a class I MHC molecule, a TNF protein receptor, an immunoglobulin-like protein, a cytokine receptor, an integrin, a signaling lymphocyte activation molecule (SLAM protein), an NK cell activating receptor, BTLA, a Toll-like receptor ligand, OX40, CD2, CD7, CD27, CD28, CD30, CD40, CDS, ICAM-1, 4-1BB (CD137), B7-H3, ICOS (CD278), GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-alpha, CD8-beta, IL2R-beta, IL2R-gamma, IL7R-alpha, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a, CD28-OX40, CD28-4-1BB, or a ligand that specifically binds to CD83. In some embodiments, the costimulatory signaling domain provides a functional signaling domain derived from 4-1BB. In some embodiments, the costimulatory signaling domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the nucleic acid molecule comprises a nucleic acid sequence encoding a costimulatory signaling domain, wherein the nucleic acid sequence comprises the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 18 or a nucleic acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен предусматривает функциональный сигнальный домен, полученный из 4-1BB, и функциональный сигнальный домен, полученный из CD3-дзета. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 7 (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней) и аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 9 или 10 (или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней). В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 7 и аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 9 или 10.In some embodiments, the intracellular signaling domain comprises a functional signaling domain derived from 4-1BB and a functional signaling domain derived from CD3zeta. In some embodiments, the intracellular signaling domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto) and the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9 or 10 (or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In some embodiments, the intracellular signaling domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 and the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9 or 10.
В некоторых вариантах осуществления CAR дополнительно содержит лидерную последовательность, предусматривающую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 1.In some embodiments, the CAR further comprises a leader sequence comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении описана популяция клеток, экспрессирующих CAR (например, аутологичных или аллогенных T-клеток или NK-клеток, экспрессирующих CAR), полученных посредством любого из вышеуказанных способов или любого другого способа, раскрытого в данном документе. В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыта фармацевтическая композиция, содержащая популяцию клеток, экспрессирующих CAR, раскрытую в данном документе, и фармацевтически приемлемый носитель.In some embodiments, the present invention describes a population of CAR-expressing cells (e.g., autologous or allogeneic T cells or NK cells expressing a CAR) obtained by any of the above methods or any other method disclosed herein. In some embodiments, disclosed herein is a pharmaceutical composition comprising a population of CAR-expressing cells disclosed herein and a pharmaceutically acceptable carrier.
В некоторых вариантах осуществления популяция содержит:In some embodiments, the population comprises:
(a) первую популяцию клеток, содержащих CAR для BCMA, но не CAR для CD19;(a) the first population of cells containing CAR for BCMA but not CAR for CD19;
(b) вторую популяцию клеток, содержащих CAR для CD19, но не CAR для BCMA; и(b) a second population of cells containing a CAR for CD19 but not a CAR for BCMA; and
(c) третью популяцию клеток, содержащих как CAR для BCMA, так и CAR для CD19.(c) a third population of cells containing both CAR for BCMA and CAR for CD19.
В некоторых вариантах осуществления:In some embodiments:
(i) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях;(i) the total number of viable cells in the combined second and third populations is less than or equal to approximately 110% (e.g., less than or equal to approximately 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations;
(ii) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000% , 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях; и/или(ii) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the combined second and third populations; and/or
(iii) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 5% (например, больше или равняется приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90%) от общего количества жизнеспособных клеток в популяции.(iii) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to approximately 5% (e.g., greater than or equal to approximately 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, or 90%) of the total number of viable cells in the population.
В некоторых вариантах осуществления популяция дополнительно содержит четвертую популяцию клеток, которые не содержат CAR.In some embodiments, the population further comprises a fourth population of cells that do not contain CAR.
В некоторых вариантах осуществления:In some embodiments:
(i) общее количество жизнеспособных клеток во второй популяции меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях;(i) the total number of viable cells in the second population is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations;
(ii) общее количество жизнеспособных клеток во второй популяции меньше или равняется от приблизительно 45% до приблизительно 50% (например, приблизительно 47%); от приблизительно 50 до приблизительно 55% (например, приблизительно 53%); от приблизительно 60% до приблизительно 65% (например, приблизительно 63%) или от приблизительно 80 до приблизительно 85% (например, приблизительно 82%) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях.(ii) the total number of viable cells in the second population is less than or equal to from about 45% to about 50% (e.g., about 47%); from about 50% to about 55% (e.g., about 53%); from about 60% to about 65% (e.g., about 63%); or from about 80% to about 85% (e.g., about 82%) of the total number of viable cells in the combined first and third populations.
В некоторых вариантах осуществления в конечном продукте на основе клеток с CAR, изготовленном с использованием способов, описанных в данном документе, общее количество гранул (например, гранул с антителами к CD4, гранул с антителами к CD8 и/или гранул TransAct) составляет не более 0,04, 0,05, 0,06, 0,07, 0,08, 0,09, 0,1, 0,2, 0,3, 0,4 или 0,5% от общего количества гранул, добавляемых в ходе способа изготовления.In some embodiments, in the final CAR cell product manufactured using the methods described herein, the total amount of beads (e.g., anti-CD4 beads, anti-CD8 beads, and/or TransAct beads) is no more than 0.04, 0.05, 0.06, 0.07, 0.08, 0.09, 0.1, 0.2, 0.3, 0.4, or 0.5% of the total amount of beads added during the manufacturing method.
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении описана популяция клеток, экспрессирующих CAR (например, аутологичных или аллогенных T-клеток или NK-клеток, экспрессирующих CAR), предусматривающая одну или несколько из следующих характеристик: (a) приблизительно такую же процентную долю необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ T-клеток, по сравнению с процентной долей необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (b) изменение количества необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ T-клеток, находящееся в пределах от приблизительно 5% до приблизительно 10%, например, по сравнению с процентной долей необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (c) увеличенную процентную долю необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ T-клеток, например, увеличенную в по меньшей мере 1,2, 1,4, 1,6, 1,8, 2,0, 2,2, 2,4, 2,6, 2,8 или 3 раза, по сравнению с процентной долей необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RO- CCR7+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (d) приблизительно такую же процентную долю центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, по сравнению с процентной долей центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (e) изменение количества центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, находящееся в пределах от приблизительно 5% до приблизительно 10%, по сравнению с процентной долей центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (f) уменьшенную процентную долю центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, например, уменьшенную на по меньшей мере 20, 25, 30, 35, 40, 45 или 50%, по сравнению с процентной долей центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CCR7+ CD45RO+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (g) приблизительно такую же процентную долю стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, по сравнению с процентной долей стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; (h) изменение количества стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, находящееся в пределах от приблизительно 5% до приблизительно 10%, по сравнению с процентной долей стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR; или (i) увеличенную процентную долю стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, по сравнению с процентной долей стволовых T-клеток памяти, например, CD45RA+ CD95+ рецептор IL-2 β+ CCR7+ CD62L+ T-клеток, в той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR.In some embodiments, the present invention features a population of cells expressing a CAR (e.g., autologous or allogeneic T cells or NK cells expressing a CAR) comprising one or more of the following characteristics: (a) about the same percentage of naive cells, e.g., naive T cells, e.g., CD45RO- CCR7+ T cells, compared to the percentage of naive cells, e.g., naive T cells, e.g., CD45RO- CCR7+ cells, in the same population of cells before they were engineered to express a CAR; (b) a change in the number of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RO- CCR7+ T cells, of from about 5% to about 10%, such as compared to the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RO- CCR7+ T cells, in the same population of cells before they were engineered to express the CAR; (c) an increased percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RO- CCR7+ T cells, such as increased by at least 1.2, 1.4, 1.6, 1.8, 2.0, 2.2, 2.4, 2.6, 2.8, or 3-fold, compared to the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RO- CCR7+ T cells, in the same population of cells prior to engineering them to express the CAR; (d) approximately the same percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, compared to the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, in the same population of cells before they were engineered to express the CAR; (e) a change in the number of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, of from about 5% to about 10% compared to the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, in the same population of cells before they were engineered to express the CAR; (f) a reduced percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, such as reduced by at least 20, 25, 30, 35, 40, 45 or 50%, compared to the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as CCR7+ CD45RO+ T cells, in the same population of cells before they were engineered to express the CAR; (g) approximately the same percentage of memory T stem cells, e.g., CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, compared to the percentage of memory T stem cells, e.g., CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the same cell population before they were engineered to express the CAR; (h) a change in the number of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, of between about 5% and about 10%, compared to the percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the same population of cells prior to their engineering to express the CAR; or (i) an increased percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, compared to the percentage of memory T stem cells, such as CD45RA+ CD95+ IL-2 receptor β+ CCR7+ CD62L+ T cells, in the same population of cells before they were engineered to express the CAR.
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении описана популяция клеток, экспрессирующих CAR (например, аутологичных или аллогенных T-клеток или NK-клеток, экспрессирующих CAR), где (a) медианный балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) для популяции клеток является приблизительно таким же, как медианный балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) для той же популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR, или отличается от него на не более чем (например, увеличен на не более чем) приблизительно 25, 50, 75, 100 или 125%; (b) медианный балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) для популяции клеток является приблизительно таким же, как медианный балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) для популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR, или отличается от него на не более чем (например, увеличен на не более чем) приблизительно 25, 50, 100, 150 или 200%; (c) медианный балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) для популяции клеток является приблизительно таким же, как медианный балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) для популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR, или отличается от него на не более чем (например, увеличен на не более чем) приблизительно 25, 50, 100, 150, 200 или 250%; (d) медианный балл набора генов (активируемые при гипоксии) для популяции клеток является приблизительно таким же, как медианный балл набора генов (активируемые при гипоксии) для популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR, или отличается от него на не более чем (например, увеличен на не более чем) приблизительно 125, 150, 175 или 200%; или (e) медианный балл набора генов (активируемые при аутофагии) для популяции клеток является приблизительно таким же, как медианный балл набора генов (активируемые при аутофагии) для популяции клеток до их конструирования таким образом, чтобы они экспрессировали CAR, или отличается от него на не более чем (например, увеличен на не более чем) приблизительно 180, 190, 200 или 210%.In some embodiments, the present invention features a population of cells expressing a CAR (e.g., autologous or allogeneic T cells or NK cells expressing a CAR), wherein (a) the median gene set score (upregulated in TEMs relative to downregulated in TSCM) for the population of cells is approximately the same as, or different from (e.g., increased by) about 25, 50, 75, 100, or 125%; (b) the median gene set score (upregulated in Tregs relative to downregulated in Teff) for the population of cells is approximately the same as, or differs from, the median gene set score (upregulated in Tregs relative to downregulated in Teff) for the population of cells prior to being engineered to express the CAR by no more than about 25, 50, 100, 150, or 200%; (c) the median gene set score (downregulated in stemness) for the population of cells is approximately the same as, or differs from, the median gene set score (downregulated in stemness) for the population of cells prior to being engineered to express the CAR by no more than about 25, 50, 100, 150, 200, or 250%; (d) the median gene set score (activated by hypoxia) for the population of cells is approximately the same as, or differs from, the median gene set score (activated by hypoxia) for the population of cells prior to being engineered to express the CAR by at most (e.g., increased by at most) about 125, 150, 175, or 200%; or (e) the median gene set score (activated by autophagy) for the population of cells is approximately the same as, or differs from, the median gene set score (activated by autophagy) for the population of cells prior to being engineered to express the CAR by at most (e.g., increased by at most) about 180, 190, 200, or 210%.
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении описан способ усиления иммунного ответа у субъекта, включающий введение субъекту популяции клеток, экспрессирующих CAR, раскрытой в данном документе, или фармацевтической композиции, раскрытой в данном документе, за счет чего обеспечивается усиление иммунного ответа у субъекта.In some embodiments, the present invention describes a method for enhancing an immune response in a subject, comprising administering to the subject a population of cells expressing a CAR disclosed herein or a pharmaceutical composition disclosed herein, thereby enhancing the immune response in the subject.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыт способ лечения рака у субъекта, включающий введение субъекту популяции клеток, экспрессирующих CAR, раскрытой в данном документе, или фармацевтической композиции, раскрытой в данном документе, за счет чего обеспечивается лечение рака у субъекта. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой солидный рак, например, выбранный из одного или нескольких из мезотелиомы, злокачественной мезотелиомы плевры, немелкоклеточного рака легкого, мелкоклеточного рака легкого, плоскоклеточного рака легкого, крупноклеточного рака легкого, рака поджелудочной железы, протоковой аденокарциномы поджелудочной железы, аденокарциномы пищевода, рака молочной железы, глиобластомы, рака яичника, колоректального рака, рака предстательной железы, рака шейки матки, рака кожи, меланомы, рака почки, рака печени, рака головного мозга, тимомы, саркомы, карциномы, рака матки, рака почки, рака желудочно-кишечного тракта, уротелиального рака, рака глотки, рака головы и шеи, рака прямой кишки, рака пищевода или рака мочевого пузыря или их метастазов. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой гемобластоз, например, выбранный из хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), мантийноклеточной лимфомы (MCL), множественной миеломы, острого лимфоидного лейкоза (ALL), лимфомы Ходжкина, B-клеточного острого лимфоидного лейкоза (BALL), T-клеточного острого лимфоидного лейкоза (TALL), мелкоклеточного лимфоцитарного лейкоза (SLL), B-клеточного пролимфоцитарного лейкоза, новообразования из бластных плазмоцитоидных дендритных клеток, лимфомы Беркитта, диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы (DLBCL), DLBCL, ассоциированной с хроническим воспалением, хронического миелоидного лейкоза, миелопролиферативных новообразований, фолликулярной лимфомы, педиатрической фолликулярной лимфомы, волосатоклеточного лейкоза, мелкоклеточной или крупноклеточной фолликулярной лимфомы, злокачественных лимфопролиферативных состояний, MALT-лимфомы (экстранодальной лимфомы из клеток маргинальной зоны из лимфоидной ткани слизистых оболочек), лимфомы из клеток маргинальной зоны, миелодисплазии, миелодиспластического синдрома, неходжкинской лимфомы, плазмобластной лимфомы, новообразования из плазмоцитоидных дендритных клеток, макроглобулинемии Вальденстрема, лимфомы из клеток маргинальной зоны селезенки, лимфомы/лейкоза селезенки, диффузной мелкоклеточной B-клеточной лимфомы красной пульпы селезенки, варианта волосатоклеточного лейкоза, лимфоплазмоцитарной лимфомы, болезни тяжелых цепей, плазмоклеточной миеломы, солитарной плазмоцитомы кости, внекостной плазмоцитомы, нодулярной лимфомы из клеток маргинальной зоны, педиатрической нодулярной лимфомы из клеток маргинальной зоны, первичной кожной лимфомы из клеток центра фолликула, лимфоматоидного гранулематоза, первичной медиастинальной (тимической) крупноклеточной B-клеточной лимфомы, внутрисосудистой крупноклеточной B-клеточной лимфомы, ALK+ крупноклеточной B-клеточной лимфомы, крупноклеточной B-клеточной лимфомы, возникающей при HHV8-ассоциированной многоочаговой болезни Кастлемана, первичной выпотной лимфомы, B-клеточной лимфомы, острого миелоидного лейкоза (AML) или неклассифицируемой лимфомы.In some embodiments, disclosed herein is a method of treating cancer in a subject comprising administering to the subject a population of cells expressing a CAR disclosed herein or a pharmaceutical composition disclosed herein, thereby treating the cancer in the subject. In some embodiments, the cancer is a solid cancer, such as one or more of mesothelioma, malignant pleural mesothelioma, non-small cell lung cancer, small cell lung cancer, squamous cell lung cancer, large cell lung cancer, pancreatic cancer, pancreatic ductal adenocarcinoma, esophageal adenocarcinoma, breast cancer, glioblastoma, ovarian cancer, colorectal cancer, prostate cancer, cervical cancer, skin cancer, melanoma, kidney cancer, liver cancer, brain cancer, thymoma, sarcoma, carcinoma, uterine cancer, kidney cancer, gastrointestinal cancer, urothelial cancer, pharyngeal cancer, head and neck cancer, rectal cancer, esophageal cancer, or bladder cancer or metastases thereof. In some embodiments, the cancer is a hematological malignancy, such as one selected from chronic lymphocytic leukemia (CLL), mantle cell lymphoma (MCL), multiple myeloma, acute lymphoid leukemia (ALL), Hodgkin's lymphoma, B-cell acute lymphoid leukemia (BALL), T-cell acute lymphoid leukemia (TALL), small lymphocytic leukemia (SLL), B-cell prolymphocytic leukemia, blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Burkitt's lymphoma, diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), DLBCL associated with chronic inflammation, chronic myeloid leukemia, myeloproliferative neoplasms, follicular lymphoma, pediatric follicular lymphoma, hairy cell leukemia, small cell or large cell follicular lymphoma, malignant lymphoproliferative disorders, MALT lymphoma (extranodal mucosal lymphoid tissue marginal zone lymphoma), marginal zone cell lymphoma, myelodysplasia, myelodysplastic syndrome, non-Hodgkin's lymphoma, plasmablastic lymphoma, plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Waldenstrom's macroglobulinemia, splenic marginal zone cell lymphoma, splenic lymphoma/leukemia, diffuse small B-cell lymphoma of the splenic red pulp, variant hairy cell leukemia, lymphoplasmacytic lymphoma, heavy chain disease, plasma cell myeloma, solitary plasmacytoma of bone, extraosseous plasmacytoma, nodular marginal zone cell lymphoma, pediatric nodular marginal zone cell lymphoma, primary cutaneous follicular center cell lymphoma, lymphomatoid granulomatosis, primary mediastinal (thymic) large B-cell lymphoma, intravascular large B-cell lymphoma, ALK+ large B-cell lymphoma, large B-cell lymphoma arising in HHV8-associated multicentric Castleman disease, primary effusion lymphoma, B-cell lymphoma, acute myeloid leukemia (AML), or unclassifiable lymphoma.
В некоторых вариантах осуществления способ дополнительно включает введение субъекту второго терапевтического средства. В некоторых вариантах осуществления второе терапевтическое средство представляет собой противораковое терапевтическое средство, например, средство химиотерапии, лучевой терапии или иммунорегуляторной терапии. В некоторых вариантах осуществления второе терапевтическое средство представляет собой IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)).In some embodiments, the method further comprises administering to the subject a second therapeutic agent. In some embodiments, the second therapeutic agent is an anti-cancer therapeutic agent, such as a chemotherapy, radiation therapy, or immunoregulatory therapy. In some embodiments, the second therapeutic agent is IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)).
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена выделенная клетка или популяция клеток, полученная посредством способа, описанного в данном документе, предусматривающая одну или несколько клеток, содержащих:In some embodiments, provided herein is an isolated cell or population of cells obtained by a method described herein, comprising one or more cells comprising:
(a) первую молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую первый CAR, который содержит домен, связывающий BCMA, первый трансмембранный домен и первый внутриклеточный сигнальный домен, где домен, связывающий BCMA, содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую определяющую комплементарность область 1 тяжелой цепи (CDR1 HC), определяющую комплементарность область 2 тяжелой цепи (CDR2 HC) и определяющую комплементарность область 3 тяжелой цепи (CDR3 HC), и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую определяющую комплементарность область 1 легкой цепи (CDR1 LC), определяющую комплементарность область 2 легкой цепи (CDR2 LC) и определяющую комплементарность область 3 легкой цепи (CDR3 LC), где CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 86, 87, 88, 95, 96 и 97 соответственно; и(a) a first nucleic acid molecule encoding a first CAR that comprises a BCMA binding domain, a first transmembrane domain and a first intracellular signalling domain, wherein the BCMA binding domain comprises a heavy chain variable region (VH) comprising a heavy chain complementarity determining region 1 (CDR1 HC), a heavy chain complementarity determining region 2 (CDR2 HC) and a heavy chain complementarity determining region 3 (CDR3 HC), and a light chain variable region (VL) comprising a light chain complementarity determining region 1 (CDR1 LC), a light chain complementarity determining region 2 (CDR2 LC) and a light chain complementarity determining region 3 (CDR3 LC), wherein CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC and CDR3 LCs contain amino acid sequences of SEQ ID NOs: 86, 87, 88, 95, 96 and 97, respectively; and
(b) вторую молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую второй CAR, который содержит домен, связывающий CD19, второй трансмембранный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен, где домен, связывающий CD19, содержит VH, содержащую CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC, и VL, содержащую CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC, где CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 295, 304 и 297-300 соответственно.(b) a second nucleic acid molecule encoding a second CAR that comprises a CD19 binding domain, a second transmembrane domain and a second intracellular signaling domain, wherein the CD19 binding domain comprises a VH comprising CDR1 HC, CDR2 HC and CDR3 HC, and a VL comprising CDR1 LC, CDR2 LC and CDR3 LC, wherein CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 295, 304 and 297-300, respectively.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена выделенная клетка, содержащая:In some embodiments, provided herein is an isolated cell comprising:
(a) первую молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую первый CAR, который содержит домен, связывающий BCMA, первый трансмембранный домен и первый внутриклеточный сигнальный домен, где домен, связывающий BCMA, содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую определяющую комплементарность область 1 тяжелой цепи (CDR1 HC), определяющую комплементарность область 2 тяжелой цепи (CDR2 HC) и определяющую комплементарность область 3 тяжелой цепи (CDR3 HC), и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую определяющую комплементарность область 1 легкой цепи (CDR1 LC), определяющую комплементарность область 2 легкой цепи (CDR2 LC) и определяющую комплементарность область 3 легкой цепи (CDR3 LC), где CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 86, 87, 88, 95, 96 и 97 соответственно; и(a) a first nucleic acid molecule encoding a first CAR that comprises a BCMA binding domain, a first transmembrane domain and a first intracellular signalling domain, wherein the BCMA binding domain comprises a heavy chain variable region (VH) comprising a heavy chain complementarity determining region 1 (CDR1 HC), a heavy chain complementarity determining region 2 (CDR2 HC) and a heavy chain complementarity determining region 3 (CDR3 HC), and a light chain variable region (VL) comprising a light chain complementarity determining region 1 (CDR1 LC), a light chain complementarity determining region 2 (CDR2 LC) and a light chain complementarity determining region 3 (CDR3 LC), wherein CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC and CDR3 LCs contain amino acid sequences of SEQ ID NOs: 86, 87, 88, 95, 96 and 97, respectively; and
(b) вторую молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую второй CAR, который содержит домен, связывающий CD19, второй трансмембранный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен, где домен, связывающий CD19, содержит VH, содержащую CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC, и VL, содержащую CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC, где CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 295, 304 и 297-300 соответственно.(b) a second nucleic acid molecule encoding a second CAR that comprises a CD19 binding domain, a second transmembrane domain and a second intracellular signaling domain, wherein the CD19 binding domain comprises a VH comprising CDR1 HC, CDR2 HC and CDR3 HC, and a VL comprising CDR1 LC, CDR2 LC and CDR3 LC, wherein CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 295, 304 and 297-300, respectively.
В некоторых вариантах осуществления VH и VL домена, связывающего BCMA, содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 93 и 102 соответственно. В некоторых вариантах осуществления VH и VL домена, связывающего CD19, содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 250 и 251 соответственно. В некоторых вариантах осуществления VH и VL домена, связывающего BCMA, содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 93 и 102 соответственно, а VH и VL домена, связывающего CD19, содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 250 и 251 соответственно. В некоторых вариантах осуществления домен, связывающий BCMA, содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 105. В некоторых вариантах осуществления домен, связывающий CD19, содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 293. В некоторых вариантах осуществления домен, связывающий BCMA, содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 105, а домен, связывающий CD19, содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 293. В некоторых вариантах осуществления первый CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 107. В некоторых вариантах осуществления второй CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 225. В некоторых вариантах осуществления первый CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 107; и второй CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 225. В некоторых вариантах осуществления первый CAR кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 259, 258 или 416. В некоторых вариантах осуществления второй CAR кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 417, 355, 356 или 354. В некоторых вариантах осуществления первый CAR кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 259, 258 или 416, и второй CAR кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 417, 355, 356 или 354.In some embodiments, the VH and VL of the BCMA binding domain comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 93 and 102, respectively. In some embodiments, the VH and VL of the CD19 binding domain comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 250 and 251, respectively. In some embodiments, the VH and VL of the BCMA binding domain comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 93 and 102, respectively, and the VH and VL of the CD19 binding domain comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 250 and 251, respectively. In some embodiments, the BCMA binding domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 105. In some embodiments, the CD19 binding domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 293. In some embodiments, the BCMA binding domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 105 and the CD19 binding domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 293. In some embodiments, the first CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107. In some embodiments, the second CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225. In some embodiments, the first CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107; and the second CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225. In some embodiments, the first CAR is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 259, 258, or 416. In some embodiments, the second CAR is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 417, 355, 356, or 354. In some embodiments, the first CAR is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 259, 258, or 416, and the second CAR is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 417, 355, 356, or 354.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена фармацевтическая композиция, содержащая клетку или популяцию клеток, описанные в данном документе.In some embodiments, provided herein is a pharmaceutical composition comprising a cell or population of cells described herein.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрен способ обеспечения противоопухолевого иммунитета у субъекта или лечения субъекта, у которого имеется заболевание, ассоциированное с экспрессией BCMA, включающий введение субъекту эффективного количества клетки или популяции клеток или фармацевтической композиции, описанных в данном документе.In some embodiments, provided herein is a method of providing anti-tumor immunity in a subject or treating a subject having a disease associated with BCMA expression, comprising administering to the subject an effective amount of a cell or population of cells or a pharmaceutical composition described herein.
В некоторых вариантах осуществления заболевание, ассоциированное с экспрессией BCMA, представляет собой гематологический рак или солидный рак, например, гематологический рак или солидный рак, описанный в данном документе.In some embodiments, the disease associated with BCMA expression is a hematological cancer or a solid cancer, such as a hematological cancer or a solid cancer described herein.
В некоторых вариантах осуществления заболевание выбрано из острого лейкоза, B-клеточного острого лимфоидного лейкоза ("BALL"), T-клеточного острого лимфоидного лейкоза ("TALL"), острого лимфоидного лейкоза (ALL), хронического миелогенного лейкоза (CML), хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), B-клеточного пролимфоцитарного лейкоза, новообразования из бластных плазмоцитоидных дендритных клеток, лимфомы Беркитта, диффузной крупноклеточной B-клеточной лимфомы, фолликулярной лимфомы, волосатоклеточного лейкоза, мелкоклеточной или крупноклеточной фолликулярной лимфомы, злокачественных лимфопролиферативных состояний, MALT-лимфомы, мантийноклеточной лимфомы, лимфомы из клеток маргинальной зоны, множественной миеломы, миелодисплазии и миелодиспластического синдрома, неходжкинской лимфомы, плазмобластной лимфомы, новообразования из плазмоцитоидных дендритных клеток, макроглобулинемии Вальденстрема, рака предстательной железы (например, кастрационнорезистентного или резистентного к терапии рака предстательной железы или метастатического рака предстательной железы), рака поджелудочной железы, рака легкого, нарушения пролиферации плазматических клеток (например, бессимптомной миеломы ("тлеющей" множественной миеломы или вялотекущей миеломы), моноклональной гаммапатии неустановленной этиологии (MGUS), макроглобулинемии Вальденстрема, плазмоцитомы (например, плазмоклеточной дискразии, солитарной миеломы, солитарной плазмоцитомы, экстрамедуллярной плазмоцитомы и множественной плазмоцитомы), системного амилоидоза в форме амилоидоза легких цепей или POEMS-синдрома (также известного как синдром Кроу-Фукаса, болезнь Такатсуки и PEP-синдром)) или их комбинации.In some embodiments, the disease is selected from acute leukemia, B-cell acute lymphoid leukemia ("BALL"), T-cell acute lymphoid leukemia ("TALL"), acute lymphoid leukemia (ALL), chronic myelogenous leukemia (CML), chronic lymphocytic leukemia (CLL), B-cell prolymphocytic leukemia, blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Burkitt's lymphoma, diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, hairy cell leukemia, small cell or large cell follicular lymphoma, malignant lymphoproliferative conditions, MALT lymphoma, mantle cell lymphoma, marginal zone cell lymphoma, multiple myeloma, myelodysplasia and myelodysplastic syndrome, non-Hodgkin's lymphoma, plasmablastic lymphoma, plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Waldenstrom's macroglobulinemia, prostate cancer (e.g., castration-resistant or therapy-resistant prostate cancer or metastatic prostate cancer), pancreatic cancer, lung cancer, plasma cell proliferative disorders (e.g., asymptomatic myeloma ("smoldering" multiple myeloma or smoldering myeloma), monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS), Waldenstrom's macroglobulinemia, plasmacytoma (e.g., plasma cell dyscrasia, solitary myeloma, solitary plasmacytoma, extramedullary plasmacytoma, and multiple plasmacytoma), systemic amyloidosis in the form of light chain amyloidosis or POEMS syndrome (also known as POEMS syndrome) Crowe-Fukasa, Takatsuki disease and PEP syndrome)) or their combinations.
В некоторых вариантах осуществления заболевание представляет собой множественную миелому.In some embodiments, the disease is multiple myeloma.
Хотя при осуществлении на практике или тестировании настоящего изобретения можно применять способы и материалы, аналогичные или эквивалентные описанным в данном документе, ниже описываются подходящие способы и материалы. Все публикации, патентные заявки, патенты и другие литературные источники (например, идентификационные номера последовательностей в базах данных), упоминаемые в данном документе, включены посредством ссылки во всей своей полноте. Например, все последовательности из GenBank, Unigene и Entrez, упоминаемые в данном документе, например, в любой таблице в данном документе, включены посредством ссылки. Если для одного гена или белка представлены ссылки на несколько номеров доступа последовательностей, охватываются все варианты последовательности.Although methods and materials similar or equivalent to those described herein can be used in the practice or testing of the present invention, suitable methods and materials are described below. All publications, patent applications, patents, and other literature references (e.g., sequence identification numbers in databases) cited herein are incorporated by reference in their entireties. For example, all sequences from GenBank, Unigene, and Entrez cited herein, such as in any table herein, are incorporated by reference. Where multiple sequence accession numbers are referenced for a single gene or protein, all sequence variants are covered.
Кроме того, материалы, способы и примеры являются исключительно иллюстративными и не предполагаются как ограничивающие. Заголовки, подзаголовки или пронумерованные или обозначенные буквами элементы, например, (a) (b) (i) и т. д., представлены исключительно для удобства прочтения. Использование заголовков или пронумерованных или обозначенных буквами элементов в данном документе не требует того, чтобы стадии или элементы проводились в алфавитном порядке, или того, чтобы стадии или элементы обязательно были отделены друг от друга. Другие признаки, цели и преимущества настоящего изобретения будут очевидны из описания и графических материалов, а также из формулы изобретения.In addition, the materials, methods and examples are illustrative only and are not intended to be limiting. Headings, subheadings or numbered or lettered elements, such as (a) (b) (i), etc., are provided solely for ease of reading. The use of headings or numbered or lettered elements in this document does not require that the steps or elements be in alphabetical order or that the steps or elements are necessarily separated from each other. Other features, objects and advantages of the present invention will be apparent from the description and drawings, as well as from the claims.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВBRIEF DESCRIPTION OF GRAPHIC MATERIALS
Фиг. 1A-1H. Анализ в репортерных клетках Jurkat с NFAT-люциферазой (JNL) с помощью автоматической системы применяли для тестирования функции CAR для BCMA. Клоны CAR оценивали в анализе в репортерных клетках JNL в отношении антигензависимой активности. Клетки JNL, содержащие указанные клоны CAR, или нетрансдуцированные клетки JNL (UTD) совместно культивировали со средой в отдельности (фиг. 1G и 1H) или с линиями клеток-мишеней (KMS11 в качестве BCMA-положительной линии клеток (фиг. 1A и 1C) и NALM6 в качестве BCMA-отрицательной линии клеток (фиг. 1E и 1F)) при различных соотношениях, и активность люциферазы измеряли в виде интенсивности люминесценции. Клоны считались активными, если интенсивность люминесценции в 2 раза превышала уровень в клетках UTD в присутствии клеток, экспрессирующих антиген. Регистрируемый показатель люминесценции является прямой мерой стимуляции CAR. Фиг. 1B и 1D представляют собой графики, на которых показан уровень экспрессии CAR для ВСМА на клетках JNL, выявленный с помощью проточной цитометрии с использованием рекомбинантного (r)BCMA_Fc-AF647 человека. Платформа 1x или 2x указывала на 40000 клеток H293 или 80000 клеток H293, высеянных для продуцирования вируса. Fig. 1A-1H . Jurkat NFAT-luciferase reporter cell assay (JNL) with an automated system was used to test the function of CAR for BCMA. CAR clones were evaluated in the JNL reporter cell assay for antigen-dependent activity. JNL cells containing the indicated CAR clones or untransduced JNL cells (UTD) were co-cultured with medium alone (Fig. 1G and 1H) or with target cell lines (KMS11 as a BCMA-positive cell line (Fig. 1A and 1C) and NALM6 as a BCMA-negative cell line (Fig. 1E and 1F)) at different ratios, and luciferase activity was measured as luminescence intensity. Clones were considered active if the luminescence intensity was 2-fold higher than that of UTD cells in the presence of antigen-expressing cells. The luminescence reading is a direct measure of CAR stimulation. Fig. 1B and 1D are graphs showing the expression level of BCMA CAR on JNL cells as determined by flow cytometry using recombinant human (r)BCMA_Fc-AF647. The 1x or 2x platform indicated 40,000 H293 cells or 80,000 H293 cells seeded for virus production.
Фиг. 2. Уровень экспрессии CAR для BCMA на первичных Т-клетках человека. Клетки окрашивали реагентом rBCMA_Fc-AF647 человека и анализировали с помощью проточной цитометрии. Процентная доля CAR+ клеток и MFI показаны на графике для дня 5 и дня 9 культивирования клеток. Данные обобщены в таблице 27, которая включает титр вируса, достигнутый для соответствующих CAR. Fig. 2 . Expression level of CAR for BCMA on primary human T cells. Cells were stained with human rBCMA_Fc-AF647 reagent and analyzed by flow cytometry. The percentage of CAR+ cells and MFI are plotted for
Фиг. 3A-3C. Способность Т-клеток, экспрессирующих указанные CAR, опосредовать лизис клеток и продуцирование цитокинов оценивали в отношении линии клеток-мишеней KMS11, экспрессирующих люциферазу светлячков (KMS11-luc). Фиг. 3A. CAR-T-клетки совместно культивировали с клетками-мишенями KMS11-luc при указанных соотношениях E:T. % уничтожения клеток определяли по разнице в сигнале люциферазы между клетками-мишенями без эффекторных Т-клеток (контроль) и с эффекторными Т-клетками (эксперимент), выраженной в виде процента от контроля. UTD представляет нетрансдуцированные Т-клетки. Фиг. 3B. Фоновый уровень уничтожения наблюдался для BCMA-отрицательной линии NALM6. Фиг. 3C. Уровень IFNγ измеряли с помощью MSD в надосадочных жидкостях, собранных через 24 часа из этих систем совместного культивирования при соотношении Е:Т 2,5. Все данные выражены в виде среднего значения +/- стандартное отклонение. Fig. 3A-3C. The ability of T cells expressing the indicated CARs to mediate cell lysis and cytokine production was assessed against the firefly luciferase-expressing KMS11 cell line (KMS11-luc). Fig. 3A. CAR T cells were co-cultured with KMS11-luc target cells at the indicated E:T ratios. % cell killing was determined by the difference in luciferase signal between target cells without effector T cells (control) and with effector T cells (experiment), expressed as a percentage of control. UTD represents untransduced T cells. Fig. 3B. Background killing was observed for the BCMA-negative NALM6 cell line. Fig. 3C. IFNγ levels were measured by MSD in supernatants collected after 24 h from these co-culture systems at an E:T ratio of 2.5. All data are expressed as mean +/- standard deviation.
Фиг. 4A-4C. Экспрессия CAR в Т-клетках, трансдуцированных при MOI=5 (титр вируса определен по первому CAR, экспрессируемому в клетках SupT1). На фиг. 4A представлена таблица, в которой обобщены % CAR19, % CAR для BCMA, % дважды положительных, % только CAR19 и % только CAR для BCMA для различных конструкций. На фиг. 4B представлен ряд графиков проточной цитометрии, на которых показано окрашивание клеток для выявления поверхностной экспрессии CAR для BCMA (ось x) и поверхностной экспрессии CAR для CD19 (ось y). На фиг. 4C представлена пара столбчатых диаграмм, на которых показана MFI для CAR для BCMA (верхняя панель) и MFI для CAR для CD19 (нижняя панель). Fig. 4A-4C. CAR expression in T cells transduced at an MOI of 5 (virus titer was determined by the first CAR expressed in SupT1 cells). Fig. 4A is a table summarizing % CAR19, % CAR for BCMA, % double positive, % CAR19 only, and % CAR for BCMA only for the different constructs. Fig. 4B is a series of flow cytometry plots showing cell staining for BCMA CAR surface expression (x-axis) and CD19 CAR surface expression (y-axis). Fig. 4C is a pair of bar graphs showing MFI for BCMA CAR (upper panel) and MFI for CD19 CAR (lower panel).
Фиг. 5A-5C. Анализ уничтожения in vitro с использованием CAR-T-клеток в день 8. На фиг. 5A-5C представлен ряд графиков, на которых показан % уничтожения BCMA-положительных клеток KMS11, CD19-положительных клеток Nalm6 или BCMA/CD19-отрицательных клеток соответственно при указанных соотношениях E:T. Fig. 5A-5C: In vitro killing assay using CAR-T cells at
Фиг. 6A-6D. Анализ продуцирования цитокинов in vitro с использованием CAR-T-клеток в день 8. На фиг. 6A-6D представлен ряд столбчатых диаграмм, на которых показано продуцирование IFN-гамма CAR-T-клетками при совместном культивировании с BCMA-положительными клетками KMS11 или CD19-положительными клетками Nalm6. Fig. 6A-6D: In vitro cytokine production assay using CAR-T cells at
Фиг. 7A-7C. Индивидуальная экспрессия CAR в клетках, изготовленных с использованием способа ARM. На фиг. 7A-7B представлены гистограммы, на которых показан паттерн экспрессии как CAR для BCMA, так и CAR для CD19 через 24 часа или 72 часа после трансдукции первичных Т-клеток человека, изготовленных с использованием способа ARM. В исследованиях использовали MOI, составляющую 1, исходя из титра в SupT1, определенного по экспрессии вышерасположенного CAR. На каждой из фиг. 7A и 7B левая часть представляет собой панель гистограмм, на которых показано окрашивание с использованием rBCMA-Fc, а правая часть представляет собой панель гистограмм, на которых показано окрашивание с использованием антиидиотипического антитела, связывающегося с CAR для CD19. Конструкции № 244 ("c244") и № 245 ("c245") представляют собой моно-CAR для CD19 и моно-CAR для BCMA соответственно. На фиг. 7C представлена панель графиков проточной цитометрии, на которых показан паттерн экспрессии CAR для BCMA и CD19 через 72 часа после трансдукции первичных Т-клеток человека с использованием MOI, составляющей 1, исходя из титра для вышерасположенного CAR. Fig. 7A-7C. Individual CAR expression in cells made using the ARM method. Fig. 7A-7B are histograms showing the expression pattern of both the BCMA CAR and the CD19 CAR at 24 hours or 72 hours after transduction of primary human T cells made using the ARM method. The studies used an MOI of 1 based on the titer in SupT1 determined by the expression of the upstream CAR. In each of Fig. 7A and 7B, the left panel is a panel of histograms showing staining using rBCMA-Fc, and the right panel is a panel of histograms showing staining using an anti-idiotype antibody that binds to the CD19 CAR. Constructs #244 (“c244”) and #245 (“c245”) are a mono-CAR for CD19 and a mono-CAR for BCMA, respectively. Figure 7C is a panel of flow cytometry plots showing the expression pattern of the CAR for BCMA and CD19 72 hours after transduction of primary human T cells using an MOI of 1 based on the titer of the upstream CAR.
Фиг. 8A-8C. Противоопухолевая активность in vivo конструкции № 236 ("c236") и конструкции № 238 ("c238") с использованием трех мышиных моделей: модели диссеминированной множественной миеломы из KMS-11 (BCMA+ CD19-), экспрессирующей репортерный ген люциферазы (KMS11-Luc) (фиг. 8A), ксенотрансплантатной мышиной модели из Nalm6-Luc (CD19+BCMA-) (фиг. 8B) и смешанной модели из 95% клеток KMS-luc и 5% клеток NALM6-Luc (фиг. 8C). Опухолевая нагрузка выражена в виде люминесценции всего тела (фотонов/с) и изображена в виде среднего значения опухолевой нагрузки+SEM. В день 7 или 8 после инокуляции опухоли мышей обрабатывали с помощью c236 и c238 в обозначенных дозах BCMA-CAR+ или CD19-CAR+ Т-клеток (приблизительное количество жизнеспособных CAR+ Т-клеток), как показано в таблице 30. Среда-носитель (PBS) и нетрансдуцированные Т-клетки (UTD) служили в качестве отрицательных контролей. Также в качестве контролей использовали моно-CAR для BCMA PI61 и моно-CAR для CD19 CTL119. Fig. 8A-8C. In vivo antitumor activity of construct #236 ("c236") and construct #238 ("c238") using three mouse models: a KMS-11 (BCMA+ CD19-) disseminated multiple myeloma model expressing a luciferase reporter gene (KMS11-Luc) (Fig. 8A), a Nalm6-Luc (CD19+BCMA-) xenograft mouse model (Fig. 8B), and a mixed model of 95% KMS-luc cells and 5% NALM6-Luc cells (Fig. 8C). Tumor burden is expressed as whole body luminescence (photons/s) and is depicted as mean tumor burden+SEM. On
Фиг. 9A-9C. Потеря массы тела, индуцированная реакцией "трансплантат против хозяина". У всех мышей индивидуально отслеживали потерю массы тела, что является регистрируемым показателем X-GvHD, путем измерения массы тела с течением времени. Массу тела (BWT) наносили на график в виде % изменения относительно исходного уровня. Fig. 9A-9C. Graft-versus-host disease-induced body weight loss. All mice were individually monitored for body weight loss, a detectable marker of X-GvHD, by measuring body weight over time. Body weight (BWT) was plotted as % change from baseline.
Фиг. 10A-10C. Размножение CD3+ Т-клеток периферической крови in vivo анализировали с помощью проточной цитометрии в течение вплоть до 4 недель после инфузии. Fig. 10A-10C: In vivo expansion of peripheral blood CD3+ T cells was analyzed by flow cytometry for up to 4 weeks after infusion.
Фиг. 11A-11C. Размножение CAR+ Т-клеток in vivo (процентную долю BCMA-CAR+) анализировали с помощью проточной цитометрии в течение вплоть до 4 недель после инфузии. Fig. 11A-11C. Expansion of CAR+ T cellsin vivo(percentage of BCMA-CAR+) was analyzed by flow cytometry for up to 4 weeks after infusion.
Фиг. 12A-12C. Размножение CAR+ Т-клеток in vivo (показатели количества дважды CAR+) анализировали с помощью проточной цитометрии в течение вплоть до 4 недель после инфузии. Fig. 12A-12C. Expansion of CAR+ T cellsin vivo(CAR+ double counts) were analyzed by flow cytometry for up to 4 weeks post-infusion.
Фиг. 13A-13C. Кинетические показатели IFNγ в плазме крови in vivo. Уровни IFNγ в плазме крови во всех трех мышиных моделях при обработке с помощью c236 и c238, а также моно-CAR в качестве контролей в соответствующих дозах CAR-T наносили на графики. У мышей отбирали кровь, и уровень цитокинов в плазме крови измеряли посредством MSD-анализа. Fig. 13A-13C.Kinetic plasma IFNγ levelsin vivo. Plasma IFNγ levels in all three mouse models treated with c236 and c238, as well as mono-CAR controls at the corresponding CAR-T doses, were plotted. Mice were bled and plasma cytokine levels were measured by MSD assay.
Фиг. 14A и 14B. Эффективность in vivo и размножение клеток у клеток, полученных с использованием 236 и c238, в ксенотрансплантатной мышиной модели множественной миеломы. Фиг. 14A. Мышам NSG инъецировали линию клеток множественной миеломы KMS11, которые экспрессировали репортерный ген люциферазы. Опухолевая нагрузка выражена в виде люминесценции всего тела (фотонов/с) и изображена в виде среднего значения опухолевой нагрузки+SEM. В день 8 после инокуляции опухоли мышей обрабатывали с помощью c236 и c238 в дозе 9e4 дважды BCMA/CD19-CAR+ T-клеток (приблизительное количество жизнеспособных CAR+ Т-клеток). Среда-носитель (PBS) и нетрансдуцированные Т-клетки (UTD) служили в качестве отрицательных контролей. Фиг. 14B. Размножение CAR+ Т-клеток периферической крови анализировали с помощью проточной цитометрии в течение вплоть до 4 недель после инфузии. Размножение дважды BCMA/CD19-CAR+ T-клеток наблюдалось в группах Rx CAR-T c236 и c238. Fig. 14A and 14B . In vivo potency and cell expansion of 236- and c238-derived cells in a xenograft mouse model of multiple myeloma. Fig. 14A . NSG mice were injected with the KMS11 multiple myeloma cell line that expressed a luciferase reporter gene. Tumor burden is expressed as whole-body luminescence (photons/s) and shown as mean tumor burden+SEM. On
Фиг. 15A и 15B. Экспрессия CAR в клетках, изготовленных с использованием способа ARM. Графики проточной цитометрии, на которых показана экспрессия CAR для BCMA и CD19 в дважды положительных клетках через 96 часов (фиг. 15A) и 7 дней (фиг. 15B) после добавления вируса к первичным Т-клеткам человека, изготовленным с использованием способа ARM. В исследованиях использовали MOI, составляющую 2, исходя из титра в SupT1, определенного по экспрессии CAR в дважды положительных клетках (положительных по клонам PI61 или R1G5 и CTL119), выявленной с помощью антиидиотипического антитела, связывающегося с CAR для CD19, и рекомбинантного BCMA_Fc (AF647), связывающегося с PI61 или R1G5. Моно-BCMA-CAR-T PI61 и R1G5, а также моно-CD19-CAR-T CTL119 служили в качестве контролей. Fig. 15A and 15B . CAR expression in cells made using the ARM method. Flow cytometry plots showing CAR expression for BCMA and CD19 in double-positive cells 96 hours (Fig. 15A) and 7 days (Fig. 15B) after virus addition to human primary T cells made using the ARM method. Studies used an MOI of 2 based on the titer in SupT1 determined by CAR expression in double-positive cells (PI61 or R1G5 and CTL119 clones positive) detected with an anti-idiotype antibody binding to the CD19 CAR and recombinant BCMA_Fc (AF647) binding to PI61 or R1G5. Mono-BCMA-CAR-T PI61 and R1G5, as well as mono-CD19-CAR-T CTL119 served as controls.
Фиг. 16. Экспрессия CAR в день 7 в способе ТМ с использованием MOI, составляющей 5. Графики проточной цитометрии, на которых показана экспрессия CAR для BCMA и CD19 в дважды положительных клетках через 7 дней после добавления вируса к первичным Т-клеткам человека, изготовленным с использованием способа TM. В исследованиях использовали MOI, составляющую 5, исходя из титра в SupT1, определенного по экспрессии CAR в дважды положительных клетках (положительных по клонам PI61 или R1G5 и CTL119), выявленной с помощью антиидиотипического антитела, связывающегося с CAR для CD19, и рекомбинантного BCMA_Fc (AF647), связывающегося с PI61 или R1G5. Fig. 16 . CAR expression at
Фиг. 17A и 17B. Специфичное уничтожение in vitro опухолевых клеток, экспрессирующих BCMA или CD19, Т-клетками, сконструированными с использованием конструкций CAR для BCMA и CAR для CD19 в формате диатела. Способность Т-клеток, экспрессирующих клоны PI61/CTL119, опосредовать лизис клеток оценивали в отношении линии клеток-мишеней KMS11-Luc или NALM6-Luc. CAR-Т-клетки совместно культивировали с BCMA+ клетками-мишенями KMS-11-luc или BCMA- клетками-мишенями NALM6-Luc при указанных соотношениях E:T в течение 20 часов, и в качестве косвенного показателя лизиса клеток-мишеней измеряли % уничтожения клеток, определяемый по разнице в сигнале люциферазы между клетками-мишенями без эффекторных Т-клеток (контроль) и с эффекторными Т-клетками (эксперимент), выраженной в виде процента от контроля. UTD представляет нетрансдуцированные Т-клетки. Моноварианты PI61 или CTL119 служили в качестве контролей. Fig. 17A and 17B . Specific killing of BCMA- or CD19-expressing tumor cells in vitro by T cells engineered with BCMA and CD19 CAR constructs in a diabody format. The ability of T cells expressing PI61/CTL119 clones to mediate cell lysis was assessed against the KMS11-Luc or NALM6-Luc target cell line. CAR T cells were co-cultured with BCMA+ KMS-11-luc target cells or BCMA− NALM6-Luc target cells at the indicated E:T ratios for 20 h, and % cell killing, defined as the difference in luciferase signal between target cells without effector T cells (control) and with effector T cells (experiment), expressed as a percentage of control, was measured as a surrogate for target cell lysis. UTD represents untransduced T cells. PI61 or CTL119 monovariants served as controls.
Фиг. 18A и 18B. Продуцирование цитокинов Т-клетками, сконструированными с использованием конструкций CAR для BCMA и CAR для CD19 в формате диатела, в ответ на опухолевые клетки, экспрессирующие BCMA или CD19. Уровни IFNγ (фиг. 18A) и IL-2 (фиг. 18B) измеряли с помощью MSD в надосадочных жидкостях совместной культуры из анализа уничтожения при соотношении 1,25:1. Fig. 18A and 18B . Cytokine production by T cells engineered with BCMA and CD19 CAR constructs in diabody format in response to BCMA- or CD19-expressing tumor cells. IFNγ (Fig. 18A) and IL-2 (Fig. 18B) levels were measured by MSD in co-culture supernatants from the 1.25:1 killing assay.
Фиг. 19. Процентные доли дважды CAR-положительной популяции, положительной по CAR для BCMA популяции и положительной по CAR для CD19 популяции в день 4. Fig. 19 . Percentages of double CAR-positive population, CAR-positive BCMA population, and CAR-positive CD19 population at
Фиг. 20. Графики проточной цитометрии, на которых показано окрашивание клеток с помощью rBCMA-Fc и антиидиотипического антитела, которое связывается с CAR для CD19. Fig. 20 . Flow cytometry graphs showing cell staining with rBCMA-Fc and an anti-idiotype antibody that binds to the CD19 CAR.
Фиг. 21. Процентные доли общих CAR-положительных популяций в день 4 и день 7 в указанных условиях. Fig. 21 . Percentages of total CAR-positive populations at
Фиг. 22. Показатели количества клеток (левая панель) и процентная доля живых клеток (правая панель) в дни 0, 1, 3 и 7 в указанных условиях. Fig. 22 . Cell counts (left panel) and percentage of viable cells (right panel) at
Фиг. 23A, 23B и 23C. Данные секвенирования РНК одиночных клеток для исходных клеток (фиг. 23A), клеток дня 1 (фиг. 23B) и клеток дня 9 (фиг. 23C). Графики "n генов" демонстрируют количество экспрессируемых генов на клетку. Графики "n UMI" демонстрируют количество уникальных молекулярных идентификаторов (UMI) на клетку. Fig. 23A, 23B, and 23C. Single-cell RNA-seq data for parental cells (Fig. 23A),
Фиг. 24A, 24B, 24C и 24D. Графики, построенные методом нелинейного снижения размерности и визуализации многомерных переменных (TSNE), на которых сравниваются исходные клетки (фиг. 24A), клетки дня 1 (фиг. 24B) и клетки дня 9 (фиг. 24C) в отношении сигнатуры пролиферации, которую определяли на основании экспрессии генов CCNB1, CCND1, CCNE1, PLK1 и MKI67. Каждая точка представляет собой клетку в рассматриваемом образце. Клетки, показанные светло-серым цветом, не экспрессируют гены, отвечающие за пролиферацию, тогда как клетки, заштрихованные темным цветом, экспрессируют один или несколько генов, отвечающих за пролиферацию. Фиг. 24D представляет собой скрипичный график, на котором показано распределение баллов набора генов для набора генов, состоящего из генов, которые характеризуют покоящееся состояние T-клеток, относительно таковых, которые характеризуют активированное состояние T-клеток, для клеток дня 1, клеток дня 9 и исходных клеток. На фиг. 24D более высокий балл набора генов (активируемые в покоящемся состоянии относительно подавляемых в активированном состоянии) указывает на увеличение выраженности фенотипа покоящихся Т-клеток, тогда как более низкий балл набора генов (активируемые в покоящемся состоянии относительно подавляемых в активированном состоянии) указывает на увеличение выраженности фенотипа активированных T-клеток. Исходные клетки в целом были в большинстве своем в покоящемся состоянии по сравнению с клетками дня 9 и дня 1. Клетки дня 1 демонстрируют наиболее высокий балл набора генов, отвечающих за активацию. Fig. 24A, 24B, 24C, and 24D. Nonlinear dimensionality reduction and multivariate visualization (TSNE) plots comparing baseline (Fig. 24A), day 1 (Fig. 24B), and day 9 (Fig. 24C) cells for a proliferation signature determined by the expression of CCNB1 , CCND1 , CCNE1 , PLK1 , and MKI67 genes. Each dot represents a cell in the sample. Cells shown in light gray do not express proliferative genes, whereas cells shaded in dark express one or more proliferative genes. Fig. 24D is a violin plot showing the distribution of gene set scores for the gene set consisting of genes that characterize the resting state of T cells relative to those that characterize the activated state of T cells for
Фиг. 25A, 25B, 25C, 25D и 25E. Анализ наборов генов для исходных клеток, клеток дня 1 и клеток дня 9. На фиг. 25A более высокий балл набора генов для набора генов "активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM" указывает на увеличение выраженности фенотипа эффекторных Т-клеток памяти (TEM) в рассматриваемом образце, тогда как более низкий балл набора генов указывает на увеличение выраженности фенотипа стволовых T-клеток памяти (TSCM). На фиг. 25B более высокий балл набора генов для набора генов "активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff" указывает на увеличение выраженности фенотипа регуляторных Т-клеток (Treg), тогда как более низкий балл набора генов указывает на увеличение выраженности фенотипа эффектoрных Т-клеток (Teff). На фиг. 25C более низкий балл набора генов для набора генов "подавляемые в состоянии стволовости" указывает на увеличение выраженности фенотипа стволовости. На фиг. 25D более высокий балл набора генов для набора генов "активируемые при гипоксии" указывает на увеличение выраженности фенотипа, характерного для гипоксии. На фиг. 25E более высокий балл набора генов для набора генов "активируемые при аутофагии" указывает на увеличение выраженности фенотипа, характерного для аутофагии. Клетки дня 1 выглядели похожими на исходные клетки в отношении сигнатуры памяти, подобия стволовым клеткам и дифференцировки. Клетки дня 9 в то же время демонстрируют более высокую степень выраженности метаболического стресса. Fig. 25A, 25B, 25C, 25D, and 25E. Gene set analysis for baseline,
Фиг. 26A, 26B и 26C. Анализ генов в кластерах исходных клеток. Фиг. 26A-26C представляют собой скрипичные графики, на которых показаны баллы наборов генов из анализа наборов генов в четырех кластерах исходных клеток. Каждая точка, лежащая на скрипичных графиках на фиг. 26A-26C, представляет балл набора генов в клетке. На фиг. 26A более высокий балл набора генов для набора генов "активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff" указывает на увеличение выраженности фенотипа Treg-клеток, тогда как более низкий балл набора генов для набора генов "активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff" указывает на увеличение выраженности фенотипа Teff-клеток. На фиг. 26B более высокий балл набора генов для набора генов "постепенно активируемые при дифференцировке в клетки памяти" указывает на увеличение выраженности фенотипа поздних Т-клеток памяти, тогда как более низкий балл набора генов для набора генов "постепенно активируемые при дифференцировке в клетки памяти" указывает на увеличение выраженности фенотипа ранних Т-клеток памяти. На фиг. 26C более высокий балл набора генов для набора генов "активируемые в TEM относительно подавляемых в TN" указывает на увеличение выраженности фенотипа эффекторных Т-клеток памяти, тогда как более низкий балл набора генов для набора генов "активируемые в TEM относительно подавляемых в TN" указывает на увеличение выраженности фенотипа необученных Т-клеток памяти. Показано, что клетки в кластере 3 находились в состоянии поздних, более дифференцированных Т-клеток памяти по сравнению с клетками в кластере 1 и кластере 2, которые находились в состоянии ранних, менее дифференцированных Т-клеток памяти. Кластер 0, по-видимому, соответствует промежуточному состоянию Т-клеток. Взятые вместе, эти данные демонстрируют, что среди исходных клеток имеется значительный уровень гетерогенности. Figs. 26A, 26B, and 26C. Gene set analysis in parent cell clusters. Figs. 26A through 26C are violin plots showing gene set scores from gene set analysis in the four parent cell clusters. Each point lying on the violin plots in Figs. 26A through 26C represents a gene set score in a cell. In Fig. 26A, a higher gene set score for the gene set "upregulated in Tregs relative to downregulated in Teff" indicates an increase in the expression of the Treg cell phenotype, whereas a lower gene set score for the gene set "upregulated in Tregs relative to downregulated in Teff" indicates an increase in the expression of the Teff cell phenotype. In Fig. 26B, a higher gene set score for the "gradually activated upon differentiation into memory cells" gene set indicates an increase in the late memory T cell phenotype, whereas a lower gene set score for the "gradually activated upon differentiation into memory cells" gene set indicates an increase in the early memory T cell phenotype. In Fig. 26C, a higher gene set score for the "activated in TEM relative to suppressed in TN" gene set indicates an increase in the effector memory T cell phenotype, whereas a lower gene set score for the "activated in TEM relative to suppressed in TN" gene set indicates an increase in the naive memory T cell phenotype. Cells in
Фиг. 27A, 27B и 27C. Секвенирование TCR и измерение разнообразия клонотипов. Клетки дня 9 характеризовались более плосковершинным распределением частот клонотипов (более высоким разнообразием). Fig. 27A, 27B and 27C. TCR sequencing and measurement of clonotype diversity.
Фиг. 28A и 28B. Анализы методом проточной цитометрии для определения экспрессии CAR в дни 4 и 7 после трансдукции. Анализы методом проточной цитометрии для CAR-T-клеток, полученных путем котрансдукции клеток с помощью векторов, кодирующих CAR для BCMA и CD19, при разных комбинациях MOI с использованием способа ARM в 24-луночном планшете. Фиг. 28A. Графики проточной цитометрии, на которых показана экспрессия моно-CAR для BCMA, моно-CAR для CD19 и CAR в дважды+ клетках в дни 4 и 7 после трансдукции в условиях четырех разных MOI в дополнение к контролям (UTD и одиночный вектор). Фиг. 28B. Количественное оценивание субпопуляций в CAR+ популяциях, включающих общую популяцию BCMA-CAR+ Т-клеток, общую популяцию CD19-CAR+ Т-клеток, а также общую популяцию CAR+ Т-клеток (сумму двух групп моно-CAR+ Т-клеток и дважды CAR+ Т-клеток) при каждом условии, как описано на фиг. 28A. Приведенные данные являются иллюстративными для Т-клеток от трех доноров с согласующимися результатами. Процентные доли CAR+ клеток гейтированы по популяции живых CD3+ T-клеток. Fig. 28A and 28B . Flow cytometry analyses to determine CAR expression at
Фиг. 29. Анализы методом проточной цитометрии для определения экспрессии CAR в день 4 после трансдукции. Анализы методом проточной цитометрии конечных продуктов в виде коктейля CAR-T с двойным нацеливанием, моно-BCMA-CAR-T и моно-CD19-CAR-T в отношении экспрессии CAR в день 4 после трансдукции. Небольшие аликвоты каждого продукта, собранные через 24 часа, повторно культивировали в течение трех дней перед окрашиванием в ходе проточной цитометрии. Fig. 29 . Flow cytometric analyses of CAR expression at
Фиг. 30A, 30B, 30C, 30D и 30E. Эффективность in vivo CAR-T с двойной специфичностью по сравнению с моно-BCMA-CAR-T и CD19-CAR-T в ксенотрансплантатных моделях. Мышам NSG инъецировали линии клеток, экспрессирующие репортерный ген люциферазы (KMS-11, или Nalm-6, или смесь обоих с 5% Nalm-6-luc). Опухолевая нагрузка выражена в виде люминесценции всего тела (фотонов/с) и изображена в виде среднего значения опухолевой нагрузки+SEM. В день 7 или 8 после инокуляции опухоли мышей обрабатывали с помощью коктейля CAR-T с двойным нацеливанием, BCMA-CAR-T или CD19-CAR-T в соответствующих дозах (приблизительное количество жизнеспособных CAR+ Т-клеток). Среда-носитель (PBS) и нетрансдуцированные Т-клетки (UTD) служили в качестве отрицательных контролей. N=5 мышей для всех групп. BCMA-CAR-T и CD19-CAR-T служили в качестве соответствующих контролей при использовании наивысшего уровня дозы. Все эксперименты завершали в день 23 после введения CAR-T. Fig. 30A, 30B, 30C, 30D, and 30E . In vivo efficacy of dual-targeting CAR-T compared to mono-BCMA-CAR-T and CD19-CAR-T in xenograft models. NSG mice were injected with cell lines expressing a luciferase reporter gene (KMS-11, or Nalm-6, or a mixture of both with 5% Nalm-6-luc). Tumor burden is expressed as whole-body luminescence (photons/s) and depicted as mean tumor burden+SEM. On
Фиг. 31. На фиг. 31 представлена столбчатая диаграмма, на которой показан % моно-CD19-CAR+ клеток, % моно-BCMA-CAR+ клеток и % дважды BCMA/CD19-CAR+ клеток в день 4 после трансдукции (день 3 после сбора). Fig. 31 . Fig. 31 is a bar graph showing % mono-CD19-CAR+ cells, % mono-BCMA-CAR+ cells, and % double BCMA/CD19-CAR+ cells at
Фиг. 32. Определение характеристик субпопуляций T-клеток. На фиг. 32 представлен график, на котором показан % CD4+ Т-клеток, CD8+ Т-клеток, необученных Т-клеток (Tn), центральных Т-клеток памяти (Tcm), эффекторных Т-клеток памяти (Tem) и эффекторных Т-клеток памяти, реэкспрессирующих CD45RA (TEMRA), в исходном материале, материале после обогащения и в материале после сбора в день 1. Fig. 32 . Characterization of T cell subsets. Fig. 32 is a graph showing the % of CD4+ T cells, CD8+ T cells, naive T cells (Tn), central memory T cells (Tcm), effector memory T cells (Tem), and effector memory T cells re-expressing CD45RA (TEMRA) in the starting material, enrichment material, and
Фиг. 33A и 33B. Кинетические показатели IFNγ в плазме крови мышей, обработанных клеточным продуктом на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19, BCMA-CAR-T и CD19-CAR-T. Животных обрабатывали с помощью PBS, UTD, клеточного продукта на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19, BCMA-CAR-T или CD19-CAR-T в соответствующих дозах CAR-T. У мышей отбирали кровь, и уровень цитокинов в плазме крови измеряли посредством MSD-анализа. Fig. 33A and 33B . Kinetics of IFNγ in plasma of mice treated with BCMA/CD19 dual-specific CAR-T, BCMA-CAR-T, and CD19-CAR-T. Animals were treated with PBS, UTD, BCMA/CD19 dual-specific CAR-T, BCMA-CAR-T, or CD19-CAR-T at the corresponding CAR-T doses. Mice were bled and plasma cytokine levels were measured by MSD assay.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕDETAILED DESCRIPTION
ОпределенияDefinitions
Если не указано иное, то все технические и научные термины, используемые в данном документе, имеют то же значение, которое обычно понятно специалисту средней квалификации в области техники, к которой относится настоящее изобретение.Unless otherwise defined, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which this invention pertains.
Форма единственного числа относится к одному или нескольким (т. e. по меньшей мере одному) грамматическим объектам настоящей заявки. В качестве примера, "элемент" означает один элемент или несколько элементов.The singular form refers to one or more (i.e. at least one) grammatical entities of the present application. As an example, "element" means one element or several elements.
Подразумевается, что термин "приблизительно" в отношении измеряемой величины, такой как количество, временной промежуток и т. п., охватывает отклонения на ± 20%, или в некоторых случаях на ± 10%, или в некоторых случаях на ± 5%, или в некоторых случаях на ± 1%, или в некоторых случаях на ± 0,1% от указанного значения, поскольку такие отклонения являются допустимыми для осуществления раскрытых способов.It is intended that the term "approximately" with respect to a measurand such as a quantity, a time period, etc., covers deviations of ±20%, or in some cases ±10%, or in some cases ±5%, or in some cases ±1%, or in some cases ±0.1% from the stated value, as long as such deviations are acceptable for carrying out the disclosed methods.
Композиции и способы по настоящему изобретению охватывают полипептиды и нуклеиновые кислоты, имеющие указанные последовательности или последовательности, по существу идентичные им или сходные с ними, например, последовательности, идентичные указанной последовательности на по меньшей мере 85%, 90% или 95% или больше. Применительно к аминокислотной последовательности термин "по существу идентичная" используется в данном документе для обозначения первой аминокислотной последовательности, которая содержит достаточное или минимальное количество аминокислотных остатков, которые i) идентичны аминокислотным остаткам во второй аминокислотной последовательности после их выравнивания или ii) являются их консервативными заменами, так что первая и вторая аминокислотные последовательности могут иметь общий структурный домен и/или характеризоваться общей функциональной активностью, например, аминокислотные последовательности, которые содержат общий структурный домен, характеризуются по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичностью с эталонной последовательностью, например, последовательностью, представленной в данном документе.The compositions and methods of the present invention encompass polypeptides and nucleic acids having the said sequences or sequences substantially identical or similar thereto, for example, sequences that are at least 85%, 90%, or 95% or more identical to said sequence. When used with respect to an amino acid sequence, the term "substantially identical" is used herein to refer to a first amino acid sequence that comprises a sufficient or minimum number of amino acid residues that are i) identical to amino acid residues in a second amino acid sequence after alignment thereof or ii) are conservative substitutions thereof, such that the first and second amino acid sequences can share a common structural domain and/or have a common functional activity, for example, amino acid sequences that share a common structural domain are at least about 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identical to a reference sequence, for example, the sequence presented in this document.
Применительно к нуклеотидной последовательности термин "по существу идентичная" используется в данном документе для обозначения первой последовательности нуклеиновой кислоты, которая содержит достаточное или минимальное количество нуклеотидов, которые идентичны нуклеотидам во второй последовательности нуклеиновой кислоты после их выравнивания, так что первая и вторая нуклеотидные последовательности кодируют полипептиды, характеризующиеся общей функциональной активностью, или кодируют общий структурный домен полипептидов или отвечают за общую функциональную активность полипептидов, например, нуклеотидные последовательности характеризуются по меньшей мере приблизительно 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичностью с эталонной последовательностью, например, последовательностью, представленной в данном документе.In relation to a nucleotide sequence, the term "substantially identical" is used herein to refer to a first nucleic acid sequence that comprises a sufficient or minimum number of nucleotides that are identical to nucleotides in a second nucleic acid sequence when aligned such that the first and second nucleotide sequences encode polypeptides that share a common functional activity, or encode a common structural domain of the polypeptides or are responsible for a common functional activity of the polypeptides, e.g., the nucleotide sequences are characterized by at least about 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity to a reference sequence, for example, the sequence presented in this document.
Термин "вариант" относится к полипептиду, который имеет аминокислотную последовательность, по существу идентичную эталонной аминокислотной последовательности, или кодируется по существу идентичной нуклеотидной последовательностью. В некоторых вариантах осуществления вариант представляет собой функциональный вариант.The term "variant" refers to a polypeptide that has an amino acid sequence that is substantially identical to a reference amino acid sequence or is encoded by a substantially identical nucleotide sequence. In some embodiments, the variant is a functional variant.
Термин "функциональный вариант" относится к полипептиду, который имеет аминокислотную последовательность, по существу идентичную эталонной аминокислотной последовательности, или кодируется по существу идентичной нуклеотидной последовательностью и способен характеризоваться одним или несколькими видами активности эталонной аминокислотной последовательности.The term "functional variant" refers to a polypeptide that has an amino acid sequence substantially identical to a reference amino acid sequence, or is encoded by a substantially identical nucleotide sequence, and is capable of exhibiting one or more activities of the reference amino acid sequence.
Термин "цитокин" (например, IL-2, IL-7, IL-15, IL-21 или IL-6) включает полноразмерный встречающийся в природе цитокин, его фрагмент или вариант, например, функциональный вариант (в том числе его фрагменты и функциональные варианты, характеризующиеся по меньшей мере 10%, 30%, 50% или 80% активности, например, иммуномодулирующей активности, встречающегося в природе цитокина). В некоторых вариантах осуществления цитокин имеет аминокислотную последовательность, которая по существу идентична (например, идентична на по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) встречающемуся в природе цитокину или кодируется нуклеотидной последовательностью, которая по существу идентична (например, идентична на по меньшей мере приблизительно 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%) встречающейся в природе нуклеотидной последовательности, кодирующей цитокин. В некоторых вариантах осуществления, как понятно из контекста, цитокин дополнительно содержит рецепторный домен, например, домен, представляющий собой рецептор цитокина (например, IL-15/IL-15R).The term "cytokine" (e.g., IL-2, IL-7, IL-15, IL-21, or IL-6) includes a full-length naturally occurring cytokine, a fragment, or a variant thereof, e.g., a functional variant (including fragments and functional variants thereof that have at least 10%, 30%, 50%, or 80% of the activity, e.g., immunomodulatory activity, of the naturally occurring cytokine). In some embodiments, the cytokine has an amino acid sequence that is substantially identical (e.g., at least about 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identical) to a naturally occurring cytokine or is encoded by a nucleotide sequence that is substantially identical (e.g., at least about 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identical) to a naturally occurring nucleotide sequence encoding a cytokine. In some embodiments, as is clear from the context, the cytokine further comprises a receptor domain, such as a domain that is a cytokine receptor (e.g., IL-15/IL-15R).
Используемый в данном документе термин "ВСМА" относится к антигену созревания В-клеток. BCMA (также известный как TNFRSF17, BCM или CD269) является представителем семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNFR) и преимущественно экспрессируется на терминально дифференцированных B-клетках, например, B-клетках памяти и плазматических клетках. Его лиганд называют B-клеточным активатором семейства TNF (BAFF) и лигандом, индуцирующим пролиферацию (APRIL). BCMA вовлечен в опосредование выживания плазматических клеток для поддержания долгосрочного гуморального иммунитета. Ген BCMA кодируется в хромосоме 16, продуцируя первичный мРНК-транскрипт длиной 994 нуклеотида (№ доступа в NCBI NM_001192.2), который кодирует белок из 184 аминокислот (NP_001183.2). Был описан второй антисмысловой транскрипт, происходящий из локуса BCMA, который может играть роль в регуляции экспрессии BCMA. (Laabi Y. et al., Nucleic Acids Res., 1994, 22:1147-1154). Были описаны дополнительные варианты транскрипта с неизвестным значением (Smirnova AS et al. Mol Immunol., 2008, 45(4):1179-1183). Была идентифицирована вторая изоформа, также известная как TV4 (идентификатор UniProt Q02223-2). Как используется в данном документе, "BCMA" включает белки, содержащие мутации, например, точечные мутации, фрагменты, вставки, делеции и сплайс-варианты полноразмерного BCMA дикого типа.As used herein, the term "BCMA" refers to B-cell maturation antigen. BCMA (also known as TNFRSF17, BCM, or CD269) is a member of the tumor necrosis factor receptor (TNFR) family and is predominantly expressed on terminally differentiated B cells, such as memory B cells and plasma cells. Its ligand is referred to as B-cell activator of the TNF family (BAFF) and proliferation-inducing ligand (APRIL). BCMA is involved in mediating plasma cell survival to maintain long-term humoral immunity. The BCMA gene is encoded on
Фраза "заболевание, ассоциированное с экспрессией BCMA" включает без ограничения заболевание, ассоциированное с клеткой, которая экспрессирует BCMA (например, BCMA дикого типа или мутантный BCMA), или состояние, ассоциированное с клеткой, которая экспрессирует BCMA (например, BCMA дикого типа или мутантный BCMA), в том числе, например, пролиферативные заболевания, такие как рак или злокачественное новообразование, или предраковое состояние, такое как миелодисплазия, миелодиспластический синдром или предлейкоз; или показание, не связанное с раком, ассоциированное с клеткой, которая экспрессирует BCMA (например, BCMA дикого типа или мутантный BCMA). Во избежание неоднозначности, заболевание, ассоциированное с экспрессией ВСМА, может включать состояние, ассоциированное с клеткой, которая в настоящее время не экспрессирует ВСМА, например, из-за того, что экспрессия ВСМА была подавлена, например, вследствие лечения молекулой, нацеливающейся на ВСМА, например, ингибитором ВСМА, описанным в данном документе, но которая в свое время экспрессировала ВСМА. В одном аспекте рак, ассоциированный с экспрессией ВСМА (например, ВСМА дикого типа или мутантного ВСМА), представляет собой гематологический рак. В одном аспекте гематологический рак представляет собой лейкоз или лимфому. В одном аспекте рак, ассоциированный с экспрессией ВСМА (например, ВСМА дикого типа или мутантного ВСМА), представляет собой злокачественное новообразование из дифференцированных плазматических В-клеток. В одном аспекте рак, ассоциированный с экспрессией BCMA (например, BCMA дикого типа или мутантного BCMA), включает формы рака и злокачественные новообразования, в том числе без ограничения, например, одну или несколько форм острого лейкоза, в том числе без ограничения, например, B-клеточный острый лимфоидный лейкоз ("BALL"), Т-клеточный острый лимфоидный лейкоз ("TALL"), острый лимфоидный лейкоз (ALL); одну или несколько форм хронического лейкоза, в том числе без ограничения, например, хронический миелогенный лейкоз (CML), хронический лимфоидный лейкоз (CLL). Дополнительные формы рака или гематологические состояния, ассоциированные с экспрессией BMCA (например, BCMA дикого типа или мутантного BCMA), включают без ограничения, например, В-клеточный пролимфоцитарный лейкоз, новообразование из бластных плазмоцитоидных дендритных клеток, лимфому Беркитта, диффузную крупноклеточную B-клеточную лимфому, фолликулярную лимфому, волосатоклеточный лейкоз, мелкоклеточную или крупноклеточную фолликулярную лимфому, злокачественные лимфопролиферативные состояния, MALT-лимфому, мантийноклеточную лимфому, лимфому из клеток маргинальной зоны, множественную миелому, миелодисплазию и миелодиспластический синдром, неходжкинскую лимфому, плазмобластную лимфому, новообразование из плазмоцитоидных дендритных клеток, макроглобулинемию Вальденстрема и "предлейкоз", который представляет собой разнообразную группу гематологических состояний, объединенных неэффективным образованием (или дисплазией) миелоидных клеток крови, и т. п. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой множественную миелому, лимфому Ходжкина, неходжкинскую лимфому или глиобластому. В ряде вариантов осуществления заболевание, ассоциированное с экспрессией ВСМА, включает нарушение пролиферации плазматических клеток, например, бессимптомную миелому ("тлеющую" множественную миелому или вялотекущую миелому), моноклональную гаммапатию неустановленной этиологии (MGUS), макроглобулинемию Вальденстрема, формы плазмоцитомы (например, дискразию плазматических клеток, солитарную миелому, солитарную плазмоцитому, экстрамедуллярную плазмоцитому и множественную плазмоцитому), системный амилоидоз в форме амилоидоза легких цепей и POEMS-синдром (также известный как синдром Кроу-Фукаса, болезнь Такатсуки и PEP-синдром). Дополнительные заболевания, ассоциированные с экспрессией BCMA (например, BCMA дикого типа или мутантного BCMA), включают без ограничения, например, атипичные и/или неклассические формы рака, злокачественные новообразования, предраковые состояния или пролиферативные заболевания, ассоциированные с экспрессией BCMA (например, BCMA дикого типа или мутантного BCMA), например, рак, описанный в данном документе, например, рак предстательной железы (например, кастрационнорезистентный или резистентный к терапии рак предстательной железы или метастатический рак предстательной железы), рак поджелудочной железы или рак легкого.The phrase "disease associated with BCMA expression" includes, but is not limited to, a disease associated with a cell that expresses BCMA (e.g., wild-type BCMA or mutant BCMA), or a condition associated with a cell that expresses BCMA (e.g., wild-type BCMA or mutant BCMA), including, for example, proliferative diseases such as cancer or malignancy, or a precancerous condition such as myelodysplasia, myelodysplastic syndrome, or preleukemia; or a non-cancer indication associated with a cell that expresses BCMA (e.g., wild-type BCMA or mutant BCMA). For the avoidance of doubt, a disease associated with BCMA expression may include a condition associated with a cell that does not currently express BCMA, such as because BCMA expression has been suppressed, such as by treatment with a molecule that targets BCMA, such as a BCMA inhibitor described herein, but which at one time expressed BCMA. In one aspect, a cancer associated with BCMA expression (e.g., wild-type or mutant BCMA) is a hematological cancer. In one aspect, the hematological cancer is leukemia or lymphoma. In one aspect, a cancer associated with BCMA expression (e.g., wild-type or mutant BCMA) is a malignancy of differentiated plasma B cells. In one aspect, a cancer associated with the expression of BCMA (e.g., wild-type BCMA or mutant BCMA) includes forms of cancer and malignancy, including but not limited to, for example, one or more forms of acute leukemia, including but not limited to, for example, B-cell acute lymphoid leukemia ("BALL"), T-cell acute lymphoid leukemia ("TALL"), acute lymphoid leukemia (ALL); one or more forms of chronic leukemia, including but not limited to, for example, chronic myelogenous leukemia (CML), chronic lymphocytic leukemia (CLL). Additional cancers or hematologic conditions associated with BMCA expression (e.g., wild-type or mutant BCMA) include, but are not limited to, e.g., B-cell prolymphocytic leukemia, blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Burkitt's lymphoma, diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, hairy cell leukemia, small cell or large cell follicular lymphoma, malignant lymphoproliferative conditions, MALT lymphoma, mantle cell lymphoma, marginal zone cell lymphoma, multiple myeloma, myelodysplasia and myelodysplastic syndrome, non-Hodgkin's lymphoma, plasmablastic lymphoma, plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Waldenstrom's macroglobulinemia, and "preleukemia," which is a diverse group of hematological conditions united by ineffective formation (or dysplasia) of myeloid blood cells, etc. In some embodiments, the cancer is multiple myeloma, Hodgkin's lymphoma, non-Hodgkin's lymphoma, or glioblastoma. In some embodiments, the disease associated with BCMA expression includes a plasma cell proliferative disorder such as silent myeloma ("smoldering" multiple myeloma or smoldering myeloma), monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS), Waldenstrom's macroglobulinemia, forms of plasmacytoma (e.g., plasma cell dyscrasia, solitary myeloma, solitary plasmacytoma, extramedullary plasmacytoma, and multiple plasmacytoma), systemic amyloidosis in the form of light chain amyloidosis, and POEMS syndrome (also known as Crowe-Fukasa syndrome, Takatsuki disease, and PEP syndrome). Additional diseases associated with the expression of BCMA (e.g., wild-type BCMA or mutant BCMA) include, but are not limited to, e.g., atypical and/or non-classical cancers, malignancies, precancerous conditions, or proliferative diseases associated with the expression of BCMA (e.g., wild-type BCMA or mutant BCMA), e.g., cancers described herein, e.g., prostate cancer (e.g., castration-resistant or therapy-resistant prostate cancer or metastatic prostate cancer), pancreatic cancer, or lung cancer.
Состояния, не связанные с раком, которые ассоциированы с ВСМА (например, ВСМА дикого типа или мутантным ВСМА), включают вирусные инфекции; например, вызванные HIV, грибковые инфекции, например, вызванные C. neoformans; аутоиммунное заболевание; например, ревматоидный артрит, системную красную волчанку (SLE или волчанку), пузырчатку обыкновенную и синдром Шегрена; воспалительное заболевание кишечника, неспецифический язвенный колит; аллоспецифический иммунный ответ, связанный с трансплантацией, нарушения, связанные с иммунитетом слизистых оболочек; и нежелательные иммунные ответы на биопрепараты (например, фактор VIII), при которых важен гуморальный иммунитет. В ряде вариантов осуществления показание, не связанное с раком, ассоциированное с экспрессией BCMA, включает без ограничения, например, аутоиммунное заболевание (например, волчанку), воспалительные нарушения (аллергию и астму) и трансплантацию. В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая опухолевый антиген, экспрессирует или в какое-либо время экспрессировала мРНК, кодирующую опухолевый антиген. В одном варианте осуществления клетка, экспрессирующая опухолевый антиген, продуцирует опухолевый антигенный белок (например, дикого типа или мутантный), и при этом опухолевый антигенный белок может присутствовать на нормальных уровнях или сниженных уровнях. В одном варианте осуществления клетка, экспрессирующая опухолевый антиген, в один момент времени продуцировала опухолевый антигенный белок на выявляемых уровнях, а затем по существу не продуцировала опухолевый антигенный белок на выявляемых уровнях.Non-cancer conditions that are associated with BCMA (e.g., wild-type BCMA or mutant BCMA) include viral infections; e.g., those caused by HIV, fungal infections, e.g., those caused by C. neoformans ; autoimmune disease; e.g., rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus (SLE or lupus), pemphigus vulgaris, and Sjogren's syndrome; inflammatory bowel disease, ulcerative colitis; allospecific immune response associated with transplantation, disorders associated with mucosal immunity; and adverse immune responses to biologics (e.g., factor VIII) in which humoral immunity is important. In some embodiments, a non-cancer indication associated with BCMA expression includes, but is not limited to, e.g., autoimmune disease (e.g., lupus), inflammatory disorders (allergy and asthma), and transplantation. In some embodiments, a cell expressing a tumor antigen expresses or has at some time expressed mRNA encoding a tumor antigen. In one embodiment, a cell expressing a tumor antigen produces a tumor antigen protein (e.g., wild-type or mutant), and wherein the tumor antigen protein may be present at normal levels or at reduced levels. In one embodiment, a cell expressing a tumor antigen produced a tumor antigen protein at detectable levels at one time, and then substantially did not produce a tumor antigen protein at detectable levels thereafter.
Термин "химерный антигенный рецептор" или в качестве альтернативы "CAR" или "молекула CAR" относится к рекомбинантной полипептидной конструкции, содержащей по меньшей мере внеклеточный антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и цитоплазматический сигнальный домен (также называемый в данном документе "внутриклеточным сигнальным доменом"), содержащий функциональный сигнальный домен, полученный из стимулирующей молекулы, определенной ниже. В некоторых вариантах осуществления домены в полипептидной конструкции CAR находятся в одной и той же полипептидной цепи, например, образуют химерный слитый белок. В некоторых вариантах осуществления домены в полипептидной конструкции CAR не являются смежными друг с другом, например, находятся в разных полипептидных цепях, например, как представлено в RCAR, описанном в данном документе.The term "chimeric antigen receptor" or alternatively "CAR" or "CAR molecule" refers to a recombinant polypeptide construct comprising at least an extracellular antigen binding domain, a transmembrane domain, and a cytoplasmic signaling domain (also referred to herein as an "intracellular signaling domain") comprising a functional signaling domain derived from a stimulatory molecule as defined below. In some embodiments, the domains in a CAR polypeptide construct are on the same polypeptide chain, e.g., forming a chimeric fusion protein. In some embodiments, the domains in a CAR polypeptide construct are not contiguous with one another, e.g., are on different polypeptide chains, e.g., as provided in the RCAR described herein.
В некоторых вариантах осуществления цитоплазматический сигнальный домен содержит первичный сигнальный домен (например, первичный сигнальный домен CD3-дзета). В некоторых вариантах осуществления цитоплазматический сигнальный домен дополнительно содержит один или несколько функциональных сигнальных доменов, полученных из по меньшей мере одной костимулирующей молекулы, определенной ниже. В некоторых вариантах осуществления костимулирующая молекула выбрана из 4-1BB (т. е. CD137), CD27, ICOS и/или CD28. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит химерный слитый белок, содержащий внеклеточный антигенраспознающий домен, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен, содержащий функциональный сигнальный домен, полученный из стимулирующей молекулы. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит химерный слитый белок, содержащий внеклеточный антигенраспознающий домен, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен, содержащий функциональный сигнальный домен, полученный из костимулирующей молекулы, и функциональный сигнальный домен, полученный из стимулирующей молекулы. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит химерный слитый белок, содержащий внеклеточный антигенраспознающий домен, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен, содержащий два функциональных сигнальных домена, полученных из одной или нескольких костимулирующих молекул, и функциональный сигнальный домен, полученный из стимулирующей молекулы. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит химерный слитый белок, содержащий внеклеточный антигенраспознающий домен, трансмембранный домен и внутриклеточный сигнальный домен, содержащий по меньшей мере два функциональных сигнальных домена, полученных из одной или нескольких костимулирующих молекул, и функциональный сигнальный домен, полученный из стимулирующей молекулы. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит необязательную лидерную последовательность на амино-конце (N-конце) слитого белка CAR. В некоторых вариантах осуществления CAR дополнительно содержит лидерную последовательность на N-конце внеклеточного антигенраспознающего домена, где лидерная последовательность необязательно отщепляется от антигенраспознающего домена (например, scFv) в ходе клеточного процессинга и локализации CAR в клеточной мембране.In some embodiments, the cytoplasmic signaling domain comprises a primary signaling domain (e.g., a CD3zeta primary signaling domain). In some embodiments, the cytoplasmic signaling domain further comprises one or more functional signaling domains derived from at least one costimulatory molecule, as defined below. In some embodiments, the costimulatory molecule is selected from 4-1BB (i.e., CD137), CD27, ICOS, and/or CD28. In some embodiments, the CAR comprises a chimeric fusion protein comprising an extracellular antigen recognition domain, a transmembrane domain, and an intracellular signaling domain comprising a functional signaling domain derived from a stimulatory molecule. In some embodiments, the CAR comprises a chimeric fusion protein comprising an extracellular antigen recognition domain, a transmembrane domain, and an intracellular signaling domain comprising a functional signaling domain derived from a costimulatory molecule and a functional signaling domain derived from a stimulatory molecule. In some embodiments, a CAR comprises a chimeric fusion protein comprising an extracellular antigen recognition domain, a transmembrane domain, and an intracellular signaling domain comprising two functional signaling domains derived from one or more costimulatory molecules and a functional signaling domain derived from a stimulatory molecule. In some embodiments, a CAR comprises a chimeric fusion protein comprising an extracellular antigen recognition domain, a transmembrane domain, and an intracellular signaling domain comprising at least two functional signaling domains derived from one or more costimulatory molecules and a functional signaling domain derived from a stimulatory molecule. In some embodiments, a CAR comprises an optional leader sequence at the amino terminus (N-terminus) of the CAR fusion protein. In some embodiments, the CAR further comprises a leader sequence at the N-terminus of the extracellular antigen recognition domain, wherein the leader sequence is optionally cleaved from the antigen recognition domain (e.g., scFv) during cellular processing and localization of the CAR to the cell membrane.
CAR, содержащий антигенсвязывающий домен (например, scFv, однодоменное антитело или TCR (например, связывающий домен альфа-цепи TCR или связывающий домен бета-цепи TCR)), который нацеливается на конкретный опухолевый маркер X, где X может быть опухолевым маркером, описанным в данном документе, также называется XCAR. Например, CAR, который содержит антигенсвязывающий домен, нацеливающийся на BCMA, называется CAR для BCMA. CAR может экспрессироваться в любой клетке, например, иммунной эффекторной клетке, описанной в данном документе (например, T-клетке или NK-клетке).A CAR comprising an antigen-binding domain (e.g., an scFv, a single-domain antibody, or a TCR (e.g., a TCR alpha chain binding domain or a TCR beta chain binding domain)) that targets a specific tumor marker X, where X may be a tumor marker described herein, is also referred to as an XCAR. For example, a CAR comprising an antigen-binding domain that targets BCMA is referred to as a CAR for BCMA. A CAR can be expressed in any cell, such as an immune effector cell described herein (e.g., a T cell or an NK cell).
Термин "сигнальный домен" относится к функциональной части белка, которая действует путем передачи информации внутри клетки для регуляции клеточной активности посредством определенных сигнальных путей, образуя вторичные мессенджеры или функционируя в качестве эффекторов путем ответа на такие мессенджеры.The term "signaling domain" refers to a functional portion of a protein that acts by transmitting information within a cell to regulate cellular activity through specific signaling pathways, forming second messengers, or functioning as effectors by responding to such messengers.
Используемый в данном документе термин "антитело" относится к последовательности белка или полипептида, полученной из молекулы иммуноглобулина, который специфично связывается с антигеном. Антитела могут являться поликлональными или моноклональными, многоцепочечными или одноцепочечными или интактными иммуноглобулинами и могут быть получены из природных источников или из рекомбинантных источников. Антитела могут являться тетрамерными молекулами иммуноглобулинов.As used herein, the term "antibody" refers to a protein or polypeptide sequence derived from an immunoglobulin molecule that specifically binds to an antigen. Antibodies may be polyclonal or monoclonal, multichain or single-chain or intact immunoglobulins, and may be obtained from natural sources or from recombinant sources. Antibodies may be tetrameric immunoglobulin molecules.
Термин "фрагмент антитела" относится к по меньшей мере одной части интактного антитела или его рекомбинантных вариантов и относится к антигенсвязывающему домену, например, антигенраспознающей вариабельной области интактного антитела, достаточной для обеспечения распознавания и специфичного связывания фрагмента антитела с мишенью, такой как антиген. Примеры фрагментов антител включают без ограничения Fab-, Fab'-, F(ab')2- и Fv-фрагменты, scFv-фрагменты антител, линейные антитела, однодоменные антитела, такие как sdAb (VL либо VH), VHH-домены верблюдовых и полиспецифические молекулы, образованные из фрагментов антител, такие как бивалентный фрагмент, содержащий два или более, например, два, Fab-фрагмента, соединенных дисульфидным мостиком в шарнирной области, или две или более, например, две, связанные выделенные CDR или другие эпитопсвязывающие фрагменты антитела. Фрагмент антитела также может быть включен в состав однодоменных антител, максиантител, миниантител, нанотел, интрател, диател, триател, тетрател, v-NAR и бис-scFv (см., например, Hollinger and Hudson, Nature Biotechnology 23:1126-1136, 2005). Фрагменты антитела также могут быть пересажены на каркасные структуры на основе полипептидов, таких как фибронектин III типа (Fn3) (см. патент США № 6703199, в котором описаны миниантитела на основе полипептида фибронектина).The term "antibody fragment" refers to at least one portion of an intact antibody or recombinant variants thereof and refers to an antigen-binding domain, e.g., an antigen-recognizing variable region of an intact antibody, sufficient to provide recognition and specific binding of the antibody fragment to a target, such as an antigen. Examples of antibody fragments include, but are not limited to, Fab, Fab', F(ab')2, and Fv fragments, scFv antibody fragments, linear antibodies, single-domain antibodies such as sdAbs (VL or VH), camelid VHH domains, and multispecific molecules formed from antibody fragments, such as a bivalent fragment comprising two or more, e.g., two, Fab fragments linked by a disulfide bridge at the hinge region, or two or more, e.g., two, linked isolated CDRs or other epitope-binding fragments of an antibody. The antibody fragment may also be incorporated into single-domain antibodies, maxibodies, minibodies, nanobodies, intrabodies, diabodies, triabodies, tetrabodies, v-NAR, and bis-scFv (see, e.g., Hollinger and Hudson, Nature Biotechnology 23:1126-1136, 2005). Antibody fragments may also be grafted onto polypeptide-based scaffolds such as fibronectin type III (Fn3) (see U.S. Patent No. 6,703,199, which describes fibronectin polypeptide-based minibodies).
Термин "scFv" относится к слитому белку, содержащему по меньшей мере один фрагмент антитела, содержащий вариабельную область легкой цепи, и по меньшей мере один фрагмент антитела, содержащий вариабельную область тяжелой цепи, где вариабельные области легкой и тяжелой цепи присоединены друг к другу в смежном положении посредством короткого гибкого полипептидного линкера и способны экспрессироваться в виде одноцепочечного полипептида, и где scFv сохраняет специфичность интактного антитела, из которого он получен. Если не указано иное, то scFv, как используется в данном документе, может иметь вариабельные VL- и VH-области, расположенные в любом порядке, например, относительно N-конца и С-конца полипептида scFv может содержать VL-линкер-VH или может содержать VH-линкер-VL. В некоторых вариантах осуществления scFv может содержать структуру NH2-VL-линкер-VH-COOH или NH2-VH-линкер-VL-COOH.The term "scFv" refers to a fusion protein comprising at least one antibody fragment comprising a light chain variable region and at least one antibody fragment comprising a heavy chain variable region, wherein the light and heavy chain variable regions are joined to each other in a contiguous position by a short flexible polypeptide linker and are capable of being expressed as a single chain polypeptide, and wherein the scFv retains the specificity of the intact antibody from which it is derived. Unless otherwise indicated, an scFv as used herein may have VL and VH variable regions arranged in any order, for example, relative to the N-terminus and C-terminus of the polypeptide, the scFv may comprise a VL-linker-VH or may comprise a VH-linker-VL. In some embodiments, the scFv may comprise the structure NH2 -V L -linker-V H -COOH or NH2- V H -linker-V L -COOH.
Термины "область, определяющая комплементарность" или "CDR", используемые в данном документе, относятся к последовательностям из аминокислот в вариабельных областях антитела, которые придают антигенную специфичность и аффинность связывания. Например, как правило, в каждой вариабельной области тяжелой цепи находятся три CDR (HCDR1, HCDR2 и HCDR3), и в каждой вариабельной области легкой цепи находятся три CDR (LCDR1, LCDR2 и LCDR3). Точные границы аминокислотной последовательности указанной CDR могут быть определены с использованием любой из ряда хорошо известных схем, в том числе описанных в Kabat et al. (1991), "Sequences of Proteins of Immunological Interest", 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (схема нумерации "по Kabat"), Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948 (схема нумерации "по Chothia") или их комбинации. Согласно комбинированной схеме нумерации по Kabat и Chothia в некоторых вариантах осуществления CDR соответствуют аминокислотным остаткам, которые являются частью CDR по Kabat, CDR по Chothia или как тех, так и других.The terms "complementarity determining region" or "CDR" as used herein refer to the amino acid sequences in the variable regions of an antibody that confer antigen specificity and binding affinity. For example, typically there are three CDRs (HCDR1, HCDR2, and HCDR3) in each variable region of the heavy chain, and three CDRs (LCDR1, LCDR2, and LCDR3) in each variable region of the light chain. The precise amino acid sequence boundaries of a given CDR may be determined using any of a number of well-known schemes, including those described in Kabat et al. (1991), "Sequences of Proteins of Immunological Interest," 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (Kabat numbering scheme), Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948 (Chothia numbering scheme), or a combination thereof. In the combined Kabat and Chothia numbering scheme, in some embodiments, the CDRs correspond to amino acid residues that are part of a Kabat CDR, a Chothia CDR, or both.
Часть композиции на основе CAR по настоящему изобретению, предусматривающая соответствующее антитело или фрагмент антитела, может существовать в различных формах, например, в которых антигенсвязывающий домен экспрессируется в виде части полипептидной цепи, в том числе, например, в виде фрагмента однодоменного антитела (sdAb), одноцепочечного антитела (scFv) или, например, человеческого или гуманизированного антитела (Harlow et al., 1999, в: Using Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY; Harlow et al., 1989, в: Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, New York; Houston et al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883; Bird et al., 1988, Science 242:423-426). В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен в композиции на основе CAR по настоящему изобретению содержит фрагмент антитела. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит фрагмент антитела, который содержит scFv.The portion of the CAR composition of the present invention comprising the corresponding antibody or antibody fragment can exist in various forms, for example, in which the antigen-binding domain is expressed as part of a polypeptide chain, including, for example, as a fragment of a single-domain antibody (sdAb), a single-chain antibody (scFv), or, for example, a human or humanized antibody (Harlow et al., 1999, in: Using Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY; Harlow et al., 1989, in: Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, New York; Houston et al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883; Bird et al., 1988, Science 242:423-426). In some embodiments, the antigen-binding domain in the CAR composition of the present invention comprises an antibody fragment. In some embodiments, the CAR comprises an antibody fragment that comprises an scFv.
Используемый в данном документе термин "связывающий домен" или "молекула антитела" (также называемые в данном документе связывающим доменом для мишени) относится к белку, например, к цепи иммуноглобулина или ее фрагменту, содержащему по меньшей мере одну последовательность вариабельного домена иммуноглобулина. Термин "связывающий домен" или "молекула антитела" охватывает антитела и фрагменты антител. В некоторых вариантах осуществления молекула антитела представляет собой молекулу полиспецифического антитела, например, она содержит множество последовательностей вариабельных доменов иммуноглобулина, причем первая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина из множества характеризуется специфичностью связывания с первым эпитопом, а вторая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина из множества характеризуется специфичностью связывания со вторым эпитопом. В некоторых вариантах осуществления молекула полиспецифического антитела представляет собой молекулу биспецифического антитела. Биспецифическое антитело характеризуется специфичностью в отношении не более чем двух антигенов. Молекула биспецифического антитела характеризуется наличием первой последовательности вариабельного домена иммуноглобулина, которая характеризуется специфичностью связывания с первым эпитопом, и второй последовательности вариабельного домена иммуноглобулина, которая характеризуется специфичностью связывания со вторым эпитопом.As used herein, the term "binding domain" or "antibody molecule" (also referred to herein as a binding domain for a target) refers to a protein, e.g., an immunoglobulin chain or fragment thereof, comprising at least one immunoglobulin variable domain sequence. The term "binding domain" or "antibody molecule" encompasses antibodies and antibody fragments. In some embodiments, the antibody molecule is a multispecific antibody molecule, e.g., it comprises a plurality of immunoglobulin variable domain sequences, wherein a first immunoglobulin variable domain sequence of the plurality has binding specificity for a first epitope, and a second immunoglobulin variable domain sequence of the plurality has binding specificity for a second epitope. In some embodiments, the multispecific antibody molecule is a bispecific antibody molecule. The bispecific antibody has specificity for no more than two antigens. The bispecific antibody molecule is characterized by the presence of a first sequence of the variable domain of the immunoglobulin, which is characterized by binding specificity to the first epitope, and a second sequence of the variable domain of the immunoglobulin, which is characterized by binding specificity to the second epitope.
Термины "биспецифическое антитело" и "биспецифические антитела" относятся к молекулам, в которых объединены антигенсвязывающие участки двух антител в пределах одной молекулы. Таким образом, биспецифическое антитело способно связывать два разных антигена одновременно или последовательно. Способы получения биспецифических антител хорошо известны из уровня техники. Различные форматы объединения двух антител также известны из уровня техники. Формы биспецифических антител по настоящему изобретению включают без ограничения диатело, одноцепочечное диатело, продукт димеризации Fab (Fab-Fab), Fab-scFv и тандемное антитело, как известно специалистам в данной области.The terms "bispecific antibody" and "bispecific antibodies" refer to molecules that combine the antigen-binding regions of two antibodies within a single molecule. Thus, a bispecific antibody is capable of binding two different antigens simultaneously or sequentially. Methods for producing bispecific antibodies are well known in the art. Various formats for combining two antibodies are also known in the art. Forms of bispecific antibodies of the present invention include, but are not limited to, diabody, single-chain diabody, Fab dimerization product (Fab-Fab), Fab-scFv, and tandem antibody, as known to those skilled in the art.
Термин "тяжелая цепь антитела" относится к большей из полипептидных цепей двух типов, присутствующих в молекулах антител в их встречающихся в природе конформациях, которая обычно определяет класс, к которому принадлежит антитело.The term "antibody heavy chain" refers to the larger of the two types of polypeptide chains present in antibody molecules in their naturally occurring conformations, which generally defines the class to which the antibody belongs.
Термин "легкая цепь антитела" относится к меньшей из полипептидных цепей двух типов, присутствующих в молекулах антител в их встречающихся в природе конформациях. Легкие каппа- (κ-) и лямбда- (λ-) цепи относятся к двум основным изотипам легких цепей антител.The term "antibody light chain" refers to the smaller of the two types of polypeptide chains present in antibody molecules in their naturally occurring conformations. Kappa (κ) and lambda (λ) light chains are the two major isotypes of antibody light chains.
Термин "рекомбинантное антитело" относится к антителу, образованному с помощью технологии рекомбинантных ДНК, такому как, например, антитело, экспрессируемое в бактериофаговой или дрожжевой системе экспрессии. Термин также следует истолковывать как означающий антитело, которое было образовано в результате синтеза молекулы ДНК, кодирующей антитело, при этом данная молекула ДНК экспрессирует белковое антитело или аминокислотную последовательность, определяющую антитело, где последовательность ДНК или аминокислотная последовательность были получены с помощью технологии рекомбинантных ДНК или аминокислотных последовательностей, доступной и хорошо известной из уровня техники.The term "recombinant antibody" refers to an antibody produced by recombinant DNA technology, such as, for example, an antibody expressed in a bacteriophage or yeast expression system. The term should also be construed as meaning an antibody that has been produced by synthesizing a DNA molecule encoding an antibody, wherein the DNA molecule expresses a protein antibody or an amino acid sequence defining an antibody, wherein the DNA sequence or amino acid sequence has been obtained by recombinant DNA or amino acid sequencing technology available and well known in the art.
Термин "антиген" или "Ag" относится к молекуле, которая вызывает иммунный ответ. Такой иммунный ответ может предусматривать продуцирование антител либо активацию специфических иммунокомпетентных клеток или как то, так и другое. Специалисту в данной области будет понятно, что любая макромолекула, в том числе практически все белки или пептиды, может служить в качестве антигена. Кроме того, антигены могут быть получены из рекомбинантной или геномной ДНК. Специалисту в данной области будет понятно, что любая ДНК, которая содержит нуклеотидную последовательность или частичную нуклеотидную последовательность, кодирующую белок, который вызывает иммунный ответ, тем самым кодирует "антиген", как этот термин используется в данном документе. Кроме того, специалисту в данной области будет понятно, что антиген не должен кодироваться исключительно полноразмерной нуклеотидной последовательностью гена. Очевидно, что настоящее изобретение включает без ограничения применение частичных нуклеотидных последовательностей более одного гена, и что эти нуклеотидные последовательности составлены в различных комбинациях для того, чтобы кодировать полипептиды, которые вызывают требуемый иммунный ответ. Более того, специалисту в данной области будет понятно, что антиген вообще не обязательно должен кодироваться "геном". Очевидно, что антиген может быть образован в результате синтеза, или может быть получен из биологического образца, или может представлять собой макромолекулу, отличную от полипептида. Такой биологический образец может включать без ограничения образец ткани, образец опухоли, клетку или жидкость с другими биологическими компонентами.The term "antigen" or "Ag" refers to a molecule that elicits an immune response. Such an immune response may involve the production of antibodies or the activation of specific immune cells, or both. One skilled in the art will appreciate that any macromolecule, including virtually all proteins or peptides, can serve as an antigen. Additionally, antigens may be derived from recombinant or genomic DNA. One skilled in the art will appreciate that any DNA that contains a nucleotide sequence or partial nucleotide sequence encoding a protein that elicits an immune response thereby encodes an "antigen," as that term is used herein. Additionally, one skilled in the art will appreciate that an antigen need not be encoded solely by the full-length nucleotide sequence of a gene. It is understood that the present invention includes, but is not limited to, the use of partial nucleotide sequences of more than one gene, and that these nucleotide sequences are arranged in various combinations to encode polypeptides that elicit a desired immune response. Moreover, one skilled in the art will appreciate that an antigen need not be encoded by a "gene" at all. It is understood that an antigen may be synthesized, or may be obtained from a biological sample, or may be a macromolecule other than a polypeptide. Such a biological sample may include, but is not limited to, a tissue sample, a tumor sample, a cell, or a fluid with other biological components.
Термины "противоопухолевый эффект" и "противораковый эффект" используются взаимозаменяемо и относятся к биологическому эффекту, который может проявляться различным образом, в том числе без ограничения, например, в виде уменьшения объема опухоли или объема ракового образования, уменьшения количества опухолевых клеток или раковых клеток, уменьшения количества метастазов, увеличения ожидаемой продолжительности жизни, уменьшения уровня пролиферации опухолевых клеток или пролиферации раковых клеток, уменьшения выживаемости опухолевых клеток или выживаемости раковых клеток или ослабления различных физиологических симптомов, ассоциированных с раковым состоянием. "Противоопухолевый эффект" или "противораковый эффект" также может проявляться в виде способности пептидов, полинуклеотидов, клеток и антител по настоящему изобретению в первую очередь предупреждать появление опухоли или рака.The terms "anti-tumor effect" and "anti-cancer effect" are used interchangeably and refer to a biological effect that can manifest itself in a variety of ways, including, but not limited to, for example, a reduction in tumor volume or cancer volume, a reduction in the number of tumor cells or cancer cells, a reduction in the number of metastases, an increase in life expectancy, a decrease in the level of tumor cell proliferation or cancer cell proliferation, a decrease in tumor cell survival or cancer cell survival, or an alleviation of various physiological symptoms associated with a cancerous condition. An "anti-tumor effect" or "anti-cancer effect" can also manifest itself in the ability of the peptides, polynucleotides, cells, and antibodies of the present invention to prevent the occurrence of a tumor or cancer in the first place.
Термин "аутологичный" относится к любому материалу, полученному от того же индивидуума, которому он позднее должен быть повторно введен.The term "autologous" refers to any material obtained from the same individual into which it is later to be reintroduced.
Термин "аллогенный" относится к любому материалу, полученному от другого животного того же вида, что и индивидуум, которому данный материал вводят. Говорят, что два или более индивидуума являются аллогенными по отношению друг к другу, если их гены в одном или нескольких локусах не являются идентичными. В некоторых вариантах осуществления аллогенный материал от индивидуумов одного и того же вида может характеризоваться степенью генетической разнородности, достаточной для их антигенного взаимодействия.The term "allogeneic" refers to any material obtained from another animal of the same species as the individual to which the material is administered. Two or more individuals are said to be allogeneic with respect to each other if their genes at one or more loci are not identical. In some embodiments, allogeneic material from individuals of the same species may have a degree of genetic diversity sufficient for them to interact antigenically.
Термин "ксеногенный" относится к трансплантату, полученному от животного другого вида.The term "xenogeneic" refers to a transplant obtained from an animal of another species.
Термин "аферез", используемый в данном документе, относится к признанному в данной области экстракорпоральному способу, при котором кровь донора или пациента отбирают у донора или пациента и пропускают через аппарат, который отделяет выбранные определенные составляющие компоненты, а остальную часть возвращает в кровоток донору или пациенту, например, посредством ретрансфузии. Таким образом, применительно к "образцу, полученному путем афереза" подразумевают образец, полученный с использованием афереза.The term "apheresis" as used herein refers to an art-recognized extracorporeal technique in which blood from a donor or patient is withdrawn from the donor or patient and passed through a machine that separates selected specific components and returns the remainder to the donor or patient's bloodstream, such as by retransfusion. Thus, when referring to an "apheresis specimen," it refers to a specimen obtained using apheresis.
Термин "рак" относится к заболеванию, которое характеризуется быстрым и неконтролируемым ростом аберрантных клеток. Раковые клетки могут распространяться локально или через кровоток и лимфатическую систему в другие части организма. Примеры различных форм рака описаны в данном документе и включают без ограничения рак молочной железы, рак предстательной железы, рак яичника, рак шейки матки, рак кожи, рак поджелудочной железы, колоректальный рак, рак почки, рак печени, рак головного мозга, лимфому, лейкоз, рак легкого и т. п. В некоторых вариантах осуществления формы рака, лечение которых осуществляют посредством способов, описанных в данном документе, включают множественную миелому, лимфому Ходжкина или неходжкинскую лимфому.The term "cancer" refers to a disease characterized by rapid and uncontrolled growth of aberrant cells. Cancer cells may spread locally or through the bloodstream and lymphatic system to other parts of the body. Examples of various forms of cancer are described herein and include, but are not limited to, breast cancer, prostate cancer, ovarian cancer, cervical cancer, skin cancer, pancreatic cancer, colorectal cancer, kidney cancer, liver cancer, brain cancer, lymphoma, leukemia, lung cancer, and the like. In some embodiments, cancers treated by the methods described herein include multiple myeloma, Hodgkin's lymphoma, or non-Hodgkin's lymphoma.
Термины "опухоль" и "рак" используются в данном документе взаимозаменяемо, например, оба термина охватывают солидные опухоли и опухоли жидких тканей, например, диффузные или циркулирующие. Используемый в данном документе термин "рак" или "опухоль" включает предзлокачественные, а также злокачественные формы рака и опухоли.The terms "tumor" and "cancer" are used interchangeably in this document, for example, both terms include solid tumors and tumors of liquid tissues, such as diffuse or circulating. As used in this document, the term "cancer" or "tumor" includes premalignant as well as malignant forms of cancer and tumors.
Используемый в данном документе термин "полученный из" указывает на взаимосвязь между первой и второй молекулами. Это обычно относится к структурному сходству между первой молекулой и второй молекулой и не имеет дополнительного значения или не включает ограничение способа или источника в отношении первой молекулы, которая получена из второй молекулы. Например, в случае с внутриклеточным сигнальным доменом, который получен из молекулы CD3-дзета, внутриклеточный сигнальный домен сохраняет структуру CD3-дзета в достаточной мере для того, чтобы обладать необходимой функцией, а именно способностью образовывать сигнал в подходящих условиях. Это не имеет дополнительного значения или не включает ограничение в отношении конкретного способа получения внутриклеточного сигнального домена, например, это не означает, что для обеспечения наличия внутриклеточного сигнального домена нужно начинать с последовательности CD3-дзета и удалять нежелательную последовательность или вводить мутации для получения внутриклеточного сигнального домена.As used herein, the term "derived from" refers to a relationship between the first and second molecules. This generally refers to a structural similarity between the first molecule and the second molecule and does not have the additional meaning or include a method or source limitation with respect to the first molecule being derived from the second molecule. For example, in the case of an intracellular signaling domain that is derived from a CD3-zeta molecule, the intracellular signaling domain retains the CD3-zeta structure sufficiently to have the desired function, namely the ability to generate a signal under suitable conditions. This does not have the additional meaning or include a limitation with respect to a particular method of obtaining the intracellular signaling domain, for example, it does not mean that in order to have an intracellular signaling domain, one must start with a CD3-zeta sequence and remove unwanted sequence or introduce mutations to obtain the intracellular signaling domain.
Термин "консервативные модификации последовательности" относится к аминокислотным модификациям, которые не оказывают значительного влияния на характеристики связывания антитела или фрагмента антитела, содержащего аминокислотную последовательность, или не изменяют их в значительной степени. Такие консервативные модификации включают аминокислотные замены, добавления и делеции. Модификации могут быть введены в антитело или фрагмент антитела по настоящему изобретению с помощью стандартных методик, известных из уровня техники, таких как сайт-направленный мутагенез и ПЦР-опосредованный мутагенез. Консервативные замены представляют собой замены, при которых аминокислотный остаток заменяется аминокислотным остатком, имеющим сходную боковую цепь. Семейства аминокислотных остатков, имеющих сходные боковые цепи, были определены в уровне техники. Эти семейства включают аминокислоты с основными боковыми цепями (например, лизин, аргинин, гистидин), кислыми боковыми цепями (например, аспарагиновая кислота, глутаминовая кислота), незаряженными полярными боковыми цепями (например, глицин, аспарагин, глутамин, серин, треонин, тирозин, цистеин, триптофан), неполярными боковыми цепями (например, аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, фенилаланин, метионин), бета-разветвленными боковыми цепями (например, треонин, валин, изолейцин) и ароматическими боковыми цепями (например, тирозин, фенилаланин, триптофан, гистидин). Таким образом, один или несколько аминокислотных остатков в CAR по настоящему изобретению могут быть заменены другими аминокислотными остатками из того же семейства боковых цепей, и измененный CAR можно протестировать с использованием функциональных анализов, описанных в данном документе.The term "conservative sequence modifications" refers to amino acid modifications that do not significantly affect or alter the binding properties of an antibody or antibody fragment comprising the amino acid sequence. Such conservative modifications include amino acid substitutions, additions and deletions. Modifications can be introduced into an antibody or antibody fragment of the present invention using standard techniques known in the art, such as site-directed mutagenesis and PCR-mediated mutagenesis. Conservative substitutions are substitutions in which an amino acid residue is replaced by an amino acid residue having a similar side chain. Families of amino acid residues having similar side chains have been defined in the art. These families include amino acids with basic side chains (e.g., lysine, arginine, histidine), acidic side chains (e.g., aspartic acid, glutamic acid), uncharged polar side chains (e.g., glycine, asparagine, glutamine, serine, threonine, tyrosine, cysteine, tryptophan), nonpolar side chains (e.g., alanine, valine, leucine, isoleucine, proline, phenylalanine, methionine), beta-branched side chains (e.g., threonine, valine, isoleucine), and aromatic side chains (e.g., tyrosine, phenylalanine, tryptophan, histidine). Thus, one or more amino acid residues in a CAR of the present invention can be replaced with other amino acid residues from the same side chain family, and the altered CAR can be tested using the functional assays described herein.
Термин "стимуляция" применительно к стимуляции стимулирующей и/или костимулирующей молекулой относится к ответу, например, первичному или вторичному ответу, индуцированному путем связывания стимулирующей молекулы (например, комплекса TCR/CD3) и/или костимулирующей молекулы (например, CD28 или 4-1BB) с ее когнатным лигандом, которое опосредует событие передачи сигнала, такое как без ограничения передача сигнала через комплекс TCR/CD3. Стимуляция может опосредовать изменение экспрессии определенных молекул и/или реорганизацию структур цитоскелета и т. п.The term "stimulation" when applied to stimulation by a stimulatory and/or costimulatory molecule refers to a response, such as a primary or secondary response, induced by binding of a stimulatory molecule (e.g., a TCR/CD3 complex) and/or a costimulatory molecule (e.g., CD28 or 4-1BB) to its cognate ligand that mediates a signaling event, such as, but not limited to, signaling through the TCR/CD3 complex. Stimulation may mediate a change in the expression of certain molecules and/or a reorganization of cytoskeletal structures, etc.
Термин "стимулирующая молекула" относится к молекуле, экспрессируемой Т-клеткой, которая обеспечивает первичную(первичные) цитоплазматическую(цитоплазматические) сигнальную(сигнальные) последовательность(последовательности), регулирующую(регулирующие) первичную активацию комплекса TCR стимулирующим образом в по меньшей мере некоторых аспектах сигнального пути T-клетки. В некоторых вариантах осуществления ITAM-содержащий домен в CAR воспроизводит передачу сигнала от первичного TCR независимо от эндогенных комплексов TCR. В некоторых вариантах осуществления первичный сигнал инициируется, например, путем связывания комплекса TCR/CD3 с молекулой МНС, нагруженной пептидом, и это приводит к опосредованию ответа Т-клеток, в том числе без ограничения пролиферации, активации, дифференцировки и т. п. Первичная цитоплазматическая сигнальная последовательность (также называемая "первичным сигнальным доменом"), которая действует стимулирующим образом, может содержать сигнальный мотив, известный как иммунорецепторный тирозиновый активирующий мотив или ITAM. Примеры ITAM-содержащей первичной цитоплазматической сигнальной последовательности, которая является особенно применимой в настоящем изобретении, включают без ограничения последовательности, полученные из TCR-дзета, FcR-гамма, FcR-бета, CD3-гамма, CD3-дельта, CD3-эпсилон, CD5, CD22, CD79a, CD79b, CD278 (также известного как "ICOS"), FcεRI и CD66d, DAP10 и DAP12. В конкретном CAR по настоящему изобретению внутриклеточный сигнальный домен в любом одном или нескольких CAR по настоящему изобретению содержит внутриклеточную сигнальную последовательность, например, первичную сигнальную последовательность CD3-дзета. Термин "антигенпрезентирующая клетка" или "APC" относится к клетке иммунной системы, такой как вспомогательная клетка (например, B-клетка, дендритная клетка и т. п.), которая представляет чужеродный антиген в комплексе с молекулами главного комплекса гистосовместимости (MHC) на своей поверхности. Т-клетки могут распознавать эти комплексы с помощью своих T-клеточных рецепторов (TCR). АРС процессируют антигены и презентируют их Т-клеткам.The term "stimulatory molecule" refers to a molecule expressed by a T cell that provides primary cytoplasmic signaling sequence(s) that regulates primary activation of the TCR complex in a stimulatory manner in at least some aspects of the T cell signaling pathway. In some embodiments, the ITAM-containing domain in a CAR recapitulates primary TCR signaling independent of endogenous TCR complexes. In some embodiments, the primary signal is initiated, for example, by binding of a TCR/CD3 complex to a peptide-loaded MHC molecule, and this results in mediation of a T cell response, including, but not limited to, proliferation, activation, differentiation, etc. The primary cytoplasmic signal sequence (also referred to as the "primary signaling domain"), which acts in a stimulatory manner, may comprise a signaling motif known as an immunoreceptor tyrosine-based activation motif or ITAM. Examples of an ITAM-containing primary cytoplasmic signal sequence that is particularly useful in the present invention include, but are not limited to, sequences derived from TCR zeta, FcR gamma, FcR beta, CD3 gamma, CD3 delta, CD3 epsilon, CD5, CD22, CD79a, CD79b, CD278 (also known as "ICOS"), FcεRI and CD66d, DAP10 and DAP12. In a particular CAR of the present invention, the intracellular signaling domain in any one or more CARs of the present invention comprises an intracellular signaling sequence, such as a CD3 zeta primary signaling sequence. The term "antigen-presenting cell" or "APC" refers to a cell of the immune system, such as a helper cell (e.g., B cell, dendritic cell, etc.), that presents a foreign antigen complexed with major histocompatibility complex (MHC) molecules on its surface. T cells can recognize these complexes through their T cell receptors (TCRs). APCs process the antigens and present them to T cells.
Используемый в данном документе термин "внутриклеточный сигнальный домен" относится к внутриклеточной части молекулы. В ряде вариантов осуществления внутриклеточный сигнальный домен передает сигнал эффекторной функции и направляет клетку на выполнение специализированной функции. Хотя может использоваться весь внутриклеточный сигнальный домен, во многих случаях отсутствует необходимость использовать всю цепь. В том случае, если используют усеченную часть внутриклеточного сигнального домена, такую усеченную часть можно использовать вместо интактной цепи, при условии, что она передает сигнал эффекторной функции. Таким образом, подразумевается, что термин "внутриклеточный сигнальный домен" включает любую усеченную часть внутриклеточного сигнального домена, достаточную для передачи сигнала эффекторной функции.As used herein, the term "intracellular signaling domain" refers to the intracellular portion of a molecule. In some embodiments, the intracellular signaling domain transmits a signal to an effector function and directs the cell to perform a specialized function. Although the entire intracellular signaling domain may be used, in many cases it is not necessary to use the entire chain. In the event that a truncated portion of the intracellular signaling domain is used, such a truncated portion may be used in place of the intact chain, so long as it transmits a signal to an effector function. Thus, the term "intracellular signaling domain" is intended to include any truncated portion of the intracellular signaling domain sufficient to transmit a signal to an effector function.
Внутриклеточный сигнальный домен образует сигнал, который способствует осуществлению иммунной эффекторной функции клеткой, содержащей CAR, например, CAR-T-клеткой. Примеры иммунной эффекторной функции, например, у CAR-T-клетки, включают цитолитическую активность и хелперную активность, в том числе секрецию цитокинов.The intracellular signaling domain generates a signal that promotes immune effector function by a cell containing a CAR, such as a CAR-T cell. Examples of immune effector function, such as in a CAR-T cell, include cytolytic activity and helper activity, including secretion of cytokines.
В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен может содержать первичный внутриклеточный сигнальный домен. Иллюстративные первичные внутриклеточные сигнальные домены включают домены, полученные из молекул, отвечающих за первичную стимуляцию или антигензависимую стимуляцию. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен может содержать костимулирующий внутриклеточный домен. Иллюстративные костимулирующие внутриклеточные сигнальные домены включают домены, полученные из молекул, отвечающих за костимулирующие сигналы или антигеннезависимую стимуляцию. Например, в случае с CAR-T первичный внутриклеточный сигнальный домен может содержать цитоплазматическую последовательность Т-клеточного рецептора, и костимулирующий внутриклеточный сигнальный домен может содержать цитоплазматическую последовательность корецептора или костимулирующей молекулы.In some embodiments, the intracellular signaling domain may comprise a primary intracellular signaling domain. Exemplary primary intracellular signaling domains include domains derived from molecules responsible for primary stimulation or antigen-dependent stimulation. In some embodiments, the intracellular signaling domain may comprise a costimulatory intracellular domain. Exemplary costimulatory intracellular signaling domains include domains derived from molecules responsible for costimulatory signals or antigen-independent stimulation. For example, in the case of CAR-T, the primary intracellular signaling domain may comprise a cytoplasmic sequence of a T cell receptor, and the costimulatory intracellular signaling domain may comprise a cytoplasmic sequence of a coreceptor or costimulatory molecule.
Первичный внутриклеточный сигнальный домен может содержать сигнальный мотив, который известен как иммунорецепторный тирозиновый активирующий мотив или ITAM. Примеры ITAM-содержащих первичных цитоплазматических сигнальных последовательностей включают без ограничения последовательности, полученные из CD3-дзета, FcR-гамма, FcR-бета, CD3-гамма, CD3-дельта, CD3-эпсилон, CD5, CD22, CD79a, CD79b, CD278 (также известного как "ICOS"), FcεRI, CD66d, DAP10 и DAP12.The primary intracellular signaling domain may contain a signaling motif known as an immunoreceptor tyrosine-based activation motif, or ITAM. Examples of ITAM-containing primary cytoplasmic signaling sequences include, but are not limited to, sequences derived from CD3-zeta, FcR-gamma, FcR-beta, CD3-gamma, CD3-delta, CD3-epsilon, CD5, CD22, CD79a, CD79b, CD278 (also known as "ICOS"), FcεRI, CD66d, DAP10, and DAP12.
Термин "дзета" или, в качестве альтернативы, "дзета-цепь", "CD3-дзета" или "TCR-дзета" относится к CD247. Под номером доступа Swiss-Prot P20963 представлены иллюстративные аминокислотные последовательности CD3-дзета человека. "Стимулирующий домен дзета" или, в качестве альтернативы, "стимулирующий домен CD3-дзета" или "стимулирующий домен TCR-дзета" относится к стимулирующему домену CD3-дзета или его варианту (например, молекуле, имеющей мутации, например, точечные мутации, фрагменты, вставки или делеции). В некоторых вариантах осуществления цитоплазматический домен дзета содержит остатки 52-164 из последовательности под номером доступа в GenBank BAG36664.1 или ее варианта (например, молекулы, имеющей мутации, например, точечные мутации, фрагменты, вставки или делеции). В некоторых вариантах осуществления "стимулирующий домен дзета" или "стимулирующий домен CD3-дзета" представляет собой последовательность, представленную под SEQ ID NO: 9 или 10, или ее вариант (например, молекулу, имеющую мутации, например, точечные мутации, фрагменты, вставки или делеции).The term "zeta" or alternatively "zeta chain", "CD3 zeta" or "TCR zeta" refers to CD247. Swiss-Prot Accession Number P20963 provides exemplary amino acid sequences of human CD3 zeta. "Zeta stimulatory domain" or alternatively "CD3 zeta stimulatory domain" or "TCR zeta stimulatory domain" refers to a CD3 zeta stimulatory domain or a variant thereof (e.g., a molecule having mutations, e.g., point mutations, fragments, insertions, or deletions). In some embodiments, the cytoplasmic zeta domain comprises residues 52-164 of the sequence of GenBank Accession Number BAG36664.1 or a variant thereof (e.g., a molecule having mutations, e.g., point mutations, fragments, insertions, or deletions). In some embodiments, the "zeta stimulatory domain" or "CD3 zeta stimulatory domain" is the sequence set forth in SEQ ID NO: 9 or 10, or a variant thereof (e.g., a molecule having mutations, such as point mutations, fragments, insertions, or deletions).
Термин "костимулирующая молекула" относится к когнатному партнеру по связыванию на Т-клетке, который специфично связывается с костимулирующим лигандом, за счет чего происходит опосредование костимулируемого ответа Т-клетки, такого как, без ограничения, пролиферация. Костимулирующие молекулы представляют собой молекулы клеточной поверхности, отличные от антигенных рецепторов или их лигандов, которые необходимы для эффективного иммунного ответа. Костимулирующие молекулы включают без ограничения молекулу MHC I класса, белковые рецепторы TNF, иммуноглобулиноподобные белки, рецепторы цитокинов, интегрины, сигнальные молекулы активации лимфоцитов (белки SLAM), активирующие рецепторы NK-клеток, BTLA, лиганд Toll-подобного рецептора, OX40, CD2, CD7, CD27, CD28, CD30, CD40, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), 4-1BB (CD137), B7-H3, CDS, ICAM-1, ICOS (CD278), GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-альфа, CD8-бета, IL2R-бета, IL2R-гамма, IL7R-альфа, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, LFA-1, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a, CD28-OX40, CD28-4-1BB и лиганд, который специфично связывается с CD83.The term "costimulatory molecule" refers to a cognate binding partner on a T cell that specifically binds to a costimulatory ligand, thereby mediating a costimulatory T cell response such as, but not limited to, proliferation. Costimulatory molecules are cell surface molecules other than antigen receptors or their ligands that are essential for an effective immune response. Costimulatory molecules include, but are not limited to, MHC class I molecule, TNF protein receptors, immunoglobulin-like proteins, cytokine receptors, integrins, signaling lymphocyte activation molecules (SLAM proteins), NK cell activating receptors, BTLA, Toll-like receptor ligand, OX40, CD2, CD7, CD27, CD28, CD30, CD40, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), 4-1BB (CD137), B7-H3, CDS, ICAM-1, ICOS (CD278), GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-alpha, CD8-beta, IL2R-beta, IL2R-gamma, IL7R-alpha, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, LFA-1, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a, CD28-OX40, CD28-4-1BB and a ligand that specifically binds to CD83.
Костимулирующий внутриклеточный сигнальный домен относится к внутриклеточной части костимулирующей молекулы.The costimulatory intracellular signaling domain refers to the intracellular portion of a costimulatory molecule.
Внутриклеточный сигнальный домен может содержать всю внутриклеточную часть или весь нативный внутриклеточный сигнальный домен молекулы, из которой он получен, или их функциональный фрагмент.The intracellular signaling domain may comprise the entire intracellular portion or the entire native intracellular signaling domain of the molecule from which it is derived, or a functional fragment thereof.
Термин "4-1BB" относится к CD137 или представителю 9 суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли. Под номером доступа Swiss-Prot P20963 представлены иллюстративные аминокислотные последовательности 4-1BB человека. "Кoстимулирующий домен 4-1BB" относится к костимулирующему домену 4-1BB или его варианту (например, молекуле, имеющей мутации, например, точечные мутации, фрагменты, вставки или делеции). В некоторых вариантах осуществления "костимулирующий домен 4-1BB" представляет собой последовательность, представленную под SEQ ID NO: 7, или ее вариант (например, молекулу, имеющую мутации, например, точечные мутации, фрагменты, вставки или делеции).The term "4-1BB" refers to CD137 or tumor necrosis factor
Используемый в данном документе термин "иммунная эффекторная клетка" относится к клетке, которая вовлечена в иммунный ответ, например, способствуя осуществлению иммунного эффекторного ответа. Примеры иммунных эффекторных клеток включают Т-клетки, например, альфа/бета-Т-клетки и гамма/дельта-Т-клетки, В-клетки, естественные клетки-киллеры (NK), естественные T-клетки-киллеры (NKT), тучные клетки и фагоциты миелоидного происхождения.As used herein, the term "immune effector cell" refers to a cell that is involved in an immune response, such as by facilitating an immune effector response. Examples of immune effector cells include T cells, such as alpha/beta T cells and gamma/delta T cells, B cells, natural killer (NK) cells, natural killer T (NKT) cells, mast cells, and myeloid-derived phagocytes.
Используемый в данном документе термин "иммунная эффекторная функция или иммунный эффекторный ответ" относится к функции или ответу, например, иммунной эффекторной клетки, которые усиливают иммунную атаку на клетку-мишень или способствуют ей. Например, иммунная эффекторная функция или ответ относятся к свойству T- или NK-клетки, которое способствует уничтожению или ингибированию роста или пролиферации клетки-мишени. В случае с Т-клеткой первичная стимуляция и костимуляция являются примерами иммунных эффекторных функции или ответа.As used herein, the term "immune effector function or immune effector response" refers to a function or response, such as that of an immune effector cell, that enhances or facilitates an immune attack on a target cell. For example, an immune effector function or response refers to a property of a T or NK cell that facilitates the killing or inhibition of the growth or proliferation of a target cell. In the case of a T cell, priming and costimulation are examples of immune effector functions or responses.
Термин "эффекторная функция" относится к специализированной функции клетки. Например, эффекторная функция Т-клетки может представлять собой цитолитическую активность или хелперную активность, в том числе секрецию цитокинов.The term "effector function" refers to a specialized function of a cell. For example, the effector function of a T cell may be cytolytic activity or helper activity, including secretion of cytokines.
Термин "кодирование" относится к внутренне присущему свойству специфических последовательностей нуклеотидов в полинуклеотиде, таком как ген, кДНК или мРНК, служить в качестве матриц для синтеза в ходе биологических процессов других полимеров и макромолекул, имеющих определенную последовательность нуклеотидов (т. е. рРНК, тРНК и мРНК) либо определенную последовательность аминокислот и биологические свойства, обусловленные ими. Таким образом, ген, кДНК или РНК кодирует белок, если в результате транскрипции и трансляции мРНК, соответствующей этому гену, в клетке или другой биологической системе продуцируется белок. Как кодирующая нить, нуклеотидная последовательность которой идентична последовательности мРНК и обычно представлена в перечнях последовательностей, так и некодирующая нить, используемая в качестве матрицы для транскрипции гена или кДНК, могут обозначаться как кодирующие белок или другой продукт данного гена или кДНК.The term "coding" refers to the intrinsic property of specific nucleotide sequences in a polynucleotide, such as a gene, cDNA, or mRNA, to serve as templates for the synthesis, in biological processes, of other polymers and macromolecules having the specified nucleotide sequence (i.e., rRNA, tRNA, and mRNA) or the specified amino acid sequence and the biological properties resulting therefrom. Thus, a gene, cDNA, or RNA encodes a protein if the protein is produced by transcription and translation of the mRNA corresponding to the gene in a cell or other biological system. Both the coding strand, the nucleotide sequence of which is identical to the mRNA sequence and is commonly represented in sequence listings, and the noncoding strand used as a template for transcription of a gene or cDNA may be referred to as encoding a protein or other product of the gene or cDNA.
Если не указано иное, то "нуклеотидная последовательность, кодирующая аминокислотную последовательность" включает все нуклеотидные последовательности, которые являются вырожденными вариантами друг друга и которые кодируют одну и ту же аминокислотную последовательность. Фраза "нуклеотидная последовательность, которая кодирует белок или РНК" может также включать интроны в той степени, в которой нуклеотидная последовательность, кодирующая белок, может в каком-либо варианте содержать интрон(интроны).Unless otherwise specified, "a nucleotide sequence encoding an amino acid sequence" includes all nucleotide sequences that are degenerate variants of each other and that encode the same amino acid sequence. The phrase "a nucleotide sequence that encodes a protein or RNA" may also include introns to the extent that a nucleotide sequence encoding a protein may, in some variant, contain an intron(s).
Термины "эффективное количество" или "терапевтически эффективное количество" используются в данном документе взаимозаменяемо и относятся к количеству соединения, состава, материала или композиции, описанных в данном документе, эффективному для достижения конкретного биологического результата.The terms "effective amount" or "therapeutically effective amount" are used interchangeably herein and refer to the amount of a compound, composition, material, or formulation described herein effective to achieve a particular biological result.
Термин "эндогенный" относится к любому материалу, полученному из организма, клетки, ткани или системы или продуцируемому внутри них.The term "endogenous" refers to any material derived from or produced within an organism, cell, tissue, or system.
Термин "экзогенный" относится к любому материалу, введенному в организм, клетку, ткань или систему или продуцируемому вне их.The term "exogenous" refers to any material introduced into or produced outside an organism, cell, tissue, or system.
Термин "экспрессия" относится к транскрипции и/или трансляции конкретной нуклеотидной последовательности. В некоторых вариантах осуществления экспрессия включает трансляцию мРНК, введенной в клетку.The term "expression" refers to the transcription and/or translation of a particular nucleotide sequence. In some embodiments, expression includes translation of mRNA introduced into a cell.
Термин "вектор для переноса" относится к композиции, которая содержит выделенную нуклеиновую кислоту и которую можно применять для доставки выделенной нуклеиновой кислоты внутрь клетки. Из уровня техники известны многочисленные векторы, в том числе без ограничения линейные полинуклеотиды, полинуклеотиды, ассоциированные с ионными или амфифильными соединениями, плазмиды и вирусы. Таким образом, термин "вектор для переноса" включает автономно реплицирующуюся плазмиду или вирус. Данный термин также следует толковать таким образом, что он дополнительно включает неплазмидные и невирусные соединения, которые содействуют переносу нуклеиновой кислоты в клетки, такие как, например, полилизиновое соединение, липосома и т. п. Примеры вирусных векторов для переноса включают без ограничения аденовирусные векторы, векторы на основе аденоассоциированного вируса, ретровирусные векторы, лентивирусные векторы и т. п.The term "transfer vector" refers to a composition that contains an isolated nucleic acid and that can be used to deliver the isolated nucleic acid into a cell. Numerous vectors are known in the art, including, but not limited to, linear polynucleotides, polynucleotides associated with ionic or amphiphilic compounds, plasmids, and viruses. Thus, the term "transfer vector" includes an autonomously replicating plasmid or virus. This term should also be interpreted in such a way that it additionally includes non-plasmid and non-viral compounds that facilitate the transfer of nucleic acid into cells, such as, for example, a polylysine compound, a liposome, etc. Examples of viral transfer vectors include, but are not limited to, adenovirus vectors, adeno-associated virus vectors, retroviral vectors, lentiviral vectors, etc.
Термин "экспрессионный вектор" относится к вектору, который содержит рекомбинантный полинуклеотид, содержащий последовательности, контролирующие экспрессию, функционально связанные с нуклеотидной последовательностью, которая должна экспрессироваться. Экспрессионный вектор содержит достаточное количество цис-действующих элементов для экспрессии; а другие элементы для экспрессии могут предоставляться клеткой-хозяином или в системе экспрессии in vitro. Экспрессионные векторы включают все векторы, известные из уровня техники, в том числе космиды, плазмиды (например, "голые" или содержащиеся в липосомах) и вирусы (например, лентивирусы, ретровирусы, аденовирусы и аденоассоциированные вирусы), в состав которых включен рекомбинантный полинуклеотид.The term "expression vector" refers to a vector that contains a recombinant polynucleotide containing expression control sequences operably linked to a nucleotide sequence to be expressed. The expression vector contains a sufficient number of cis-acting elements for expression; other elements for expression may be provided by the host cell or in an in vitro expression system. Expression vectors include all vectors known in the art, including cosmids, plasmids (e.g., naked or contained in liposomes), and viruses (e.g., lentiviruses, retroviruses, adenoviruses, and adeno-associated viruses) in which a recombinant polynucleotide is incorporated.
Термин "лентивирус" относится к роду из семейства Retroviridae. Лентивирусы являются уникальными среди ретровирусов в том, что способны инфицировать неделящиеся клетки; они могут доставлять значительное количество генетической информации в ДНК клетки-хозяина, поэтому они в качестве векторов являются одним из наиболее эффективных способов доставки генов. Все из HIV, SIV и FIV являются примерами лентивирусов.The term "lentivirus" refers to a genus of the Retroviridae family. Lentiviruses are unique among retroviruses in that they can infect non-dividing cells; they can deliver significant amounts of genetic information into the host cell's DNA, so as vectors they are one of the most efficient ways to deliver genes. HIV, SIV, and FIV are all examples of lentiviruses.
Термин "лентивирусный вектор" относится к вектору, полученному из по меньшей мере части генома лентивируса, в том числе, в частности, к самоинактивирующемуся лентивирусному вектору, представленному в Milone et al., Mol. Ther. 17(8): 1453-1464 (2009). Другие примеры лентивирусных векторов, которые можно использовать в клинической практике, включают без ограничения, например, технологию доставки генов LENTIVECTOR® от Oxford BioMedica, векторную систему LENTIMAX™ от Lentigen и т. п. Неклинические типы лентивирусных векторов также являются доступными и должны быть известны специалисту в данной области.The term "lentiviral vector" refers to a vector derived from at least a portion of a lentiviral genome, including, but not limited to, the self-inactivating lentiviral vector disclosed in Milone et al., Mol. Ther. 17(8):1453-1464 (2009). Other examples of lentiviral vectors that may be used in clinical practice include, but are not limited to, Oxford BioMedica's LENTIVECTOR® gene delivery technology, Lentigen's LENTIMAX™ vector system, and the like. Non-clinical types of lentiviral vectors are also available and should be known to one of skill in the art.
Термин "гомологичный" или "идентичность" относится к идентичности последовательностей субъединиц у двух полимерных молекул, например, двух молекул нуклеиновой кислоты, таких как две молекулы ДНК или две молекулы РНК, или двух молекул полипептидов. Если положение субъединицы в обеих из двух молекул занимает одна и та же мономерная субъединица, например, если положение в каждой из двух молекул ДНК занято аденином, то они являются гомологичными или идентичными по этому положению. Гомология между двумя последовательностями находится в прямой зависимости от количества совпадающих или гомологичных положений; например, если половина (например, пять положений в полимере длиной десять субъединиц) положений в двух последовательностях является гомологичной, то эти две последовательности являются гомологичными на 50%; если 90% положений (например, 9 из 10) являются совпадающими или гомологичными, то две последовательности являются гомологичными на 90%.The term "homologous" or "identity" refers to the identity of the subunit sequences of two polymer molecules, for example, two nucleic acid molecules such as two DNA molecules or two RNA molecules, or two polypeptide molecules. If a subunit position in both of the two molecules is occupied by the same monomeric subunit, for example, if a position in each of two DNA molecules is occupied by an adenine, then they are homologous or identical at that position. The homology between two sequences is directly proportional to the number of positions that match or are homologous; for example, if half (e.g., five positions in a ten-subunit polymer) of the positions in two sequences are homologous, then the two sequences are 50% homologous; if 90% of the positions (e.g., 9 out of 10) are matched or homologous, then the two sequences are 90% homologous.
"Гуманизированные" формы антител, отличных от человеческих (например, мышиных), представляют собой химерные иммуноглобулины, цепи иммуноглобулинов или их фрагменты (такие как Fv, Fab, Fab', F(ab')2 или другие антигенсвязывающие подпоследовательности антител), которые содержат минимальную последовательность, полученную из иммуноглобулина, отличного от человеческого. В большинстве случаев гуманизированные антитела и фрагменты данных антител представляют собой иммуноглобулины человека (реципиентное антитело или фрагмент антитела), в которых остатки из определяющей комплементарность области (CDR) реципиента заменены остатками из CDR вида, отличного от человека (донорного антитела), такого как мышь, крыса или кролик, обладающими требуемой специфичностью, аффинностью и емкостью. В некоторых случаях остатки каркасной области (FR) Fv иммуноглобулина человека заменены соответствующими остатками, отличными от человеческих. Кроме того, гуманизированное антитело/фрагмент антитела может содержать остатки, не обнаруживаемые ни в реципиентном антителе, ни в импортированных последовательностях CDR или каркасных областей. С помощью этих модификаций можно дополнительно улучшить и оптимизировать функциональные характеристики антитела или фрагмента антитела. Как правило, гуманизированное антитело или фрагмент этого антитела будет содержать по существу все из по меньшей мере одного и, как правило, двух, вариабельных доменов, в которых все или по существу все CDR-области соответствуют областям иммуноглобулина, отличного от человеческого, и все FR-области или их значительная часть представляют собой области с последовательностью иммуноглобулина человека. Гуманизированное антитело или фрагмент антитела также может содержать по меньшей мере часть константной области (Fc) иммуноглобулина, как правило, иммуноглобулина человека. Дополнительные подробности см. в Jones et al., Nature, 321: 522-525, 1986; Reichmann et al., Nature, 332: 323-329, 1988; Presta, Curr. Op. Struct. Biol., 2: 593-596, 1992."Humanized" forms of non-human (e.g., murine) antibodies are chimeric immunoglobulins, immunoglobulin chains, or fragments thereof (such as Fv, Fab, Fab', F(ab')2, or other antigen-binding subsequences of antibodies) that contain minimal sequence derived from a non-human immunoglobulin. In most cases, humanized antibodies and fragments of these antibodies are human immunoglobulins (the recipient antibody or antibody fragment) in which residues from the complementarity determining region (CDR) of the recipient have been replaced by residues from the CDR of a non-human species (the donor antibody), such as mouse, rat, or rabbit, having the desired specificity, affinity, and capacity. In some cases, residues of the framework region (FR) of the human Fv immunoglobulin are replaced by corresponding non-human residues. In addition, the humanized antibody/antibody fragment may comprise residues that are not found in either the recipient antibody or the imported CDR or framework sequences. These modifications can further improve and optimize the functional characteristics of the antibody or antibody fragment. Typically, a humanized antibody or antibody fragment will comprise substantially all of at least one, and typically two, variable domains in which all or substantially all of the CDR regions correspond to regions of a non-human immunoglobulin and all or a substantial portion of the FR regions are regions of a human immunoglobulin sequence. The humanized antibody or antibody fragment may also comprise at least a portion of the constant region (Fc) of an immunoglobulin, typically a human immunoglobulin. For further details, see Jones et al., Nature, 321: 522-525, 1986; Reichmann et al., Nature, 332: 323-329, 1988; Presta, Curr. Op. Struct. Biol., 2: 593-596, 1992.
"Полностью человеческий" относится к иммуноглобулину, такому как антитело или фрагмент антитела, где целая молекула имеет человеческое происхождение или состоит из аминокислотной последовательности, идентичной человеческой форме антитела или иммуноглобулина."Fully human" refers to an immunoglobulin, such as an antibody or antibody fragment, where the entire molecule is of human origin or consists of an amino acid sequence identical to the human form of the antibody or immunoglobulin.
Термин "выделенный" означает измененный относительно природного состояния или извлеченный из него. Например, нуклеиновая кислота или пептид, в природных условиях присутствующие в живом животном, не являются "выделенными", однако те же нуклеиновая кислота или пептид, частично или полностью отделенные от материалов, сопутствующих им в их природном состоянии, являются "выделенными". Выделенные нуклеиновая кислота или белок могут находиться в по существу очищенной форме или могут находиться в ненативной среде, такой как, например, клетка-хозяин.The term "isolated" means altered from or removed from its natural state. For example, a nucleic acid or peptide naturally present in a living animal is not "isolated," but the same nucleic acid or peptide partially or completely separated from materials accompanying it in its natural state is "isolated." An isolated nucleic acid or protein may be in a substantially purified form or may be in a non-native environment, such as a host cell.
В контексте настоящего изобретения используются следующие сокращения для общераспространенных оснований нуклеиновых кислот. "А" относится к аденозину, "С" относится к цитозину, "G" относится к гуанозину, "Т" относится к тимидину, и "U" относится к уридину.In the context of the present invention, the following abbreviations are used for common nucleic acid bases. "A" refers to adenosine, "C" refers to cytosine, "G" refers to guanosine, "T" refers to thymidine, and "U" refers to uridine.
Термин "функционально связанный" или "транскрипционный контроль" относится к функциональной связи между регуляторной последовательностью и гетерологичной последовательностью нуклеиновой кислоты, приводящей к экспрессии последней. Например, первая последовательность нуклеиновой кислоты функционально связана со второй последовательностью нуклеиновой кислоты в тех случаях, когда первая последовательность нуклеиновой кислоты размещена в функциональной взаимосвязи со второй последовательностью нуклеиновой кислоты. Например, промотор функционально связан с кодирующей последовательностью, если промотор влияет на транскрипцию или экспрессию кодирующей последовательности. Функционально связанные последовательности ДНК могут быть смежными друг с другом и, например, если необходимо соединить две области, кодирующие белок, находятся в одной и той же рамке считывания.The term "operably linked" or "transcriptional control" refers to a functional relationship between a regulatory sequence and a heterologous nucleic acid sequence that results in the expression of the latter. For example, a first nucleic acid sequence is operably linked to a second nucleic acid sequence when the first nucleic acid sequence is placed in a functional relationship with the second nucleic acid sequence. For example, a promoter is operably linked to a coding sequence when the promoter affects the transcription or expression of the coding sequence. The operably linked DNA sequences may be contiguous with each other and, for example, if it is necessary to connect two protein coding regions that are in the same reading frame.
Термин "парентеральное" введение иммуногенной композиции включает, например, методики подкожной (s.c.), внутривенной (i.v.), внутримышечной (i.m.) или внутригрудинной инъекции, внутриопухолевого введения или инфузии.The term "parenteral" administration of an immunogenic composition includes, for example, subcutaneous (s.c.), intravenous (i.v.), intramuscular (i.m.), or intrasternal injection, intratumoral administration, or infusion techniques.
Термин "нуклеиновая кислота", "молекула нуклеиновой кислоты", "полинуклеотид" или "молекула полинуклеотида" относится к дезоксирибонуклеиновым кислотам (ДНК) или рибонуклеиновым кислотам (РНК) и их полимерам в одно- или двухнитевой форме. Если специально не ограничено, то данный термин охватывает нуклеиновые кислоты, содержащие известные аналоги природных нуклеотидов, которые обладают свойствами связывания, сходными со свойствами эталонной нуклеиновой кислоты, и метаболизируются посредством механизма, сходного с механизмом для встречающихся в природе нуклеотидов. В некоторых вариантах осуществления "нуклеиновая кислота", "молекула нуклеиновой кислоты", "полинуклеотид" или "молекула полинуклеотида" предусматривает производное или аналог нуклеотида/нуклеозида. Если не указано иное, конкретная последовательность нуклеиновой кислоты также в неявной форме охватывает ее варианты с консервативными модификациями (например, с заменами вырожденными кодонами, например, консервативными заменами), аллели, ортологи, SNP и комплементарные последовательности, а также последовательность, указанную в явной форме. В частности, замены вырожденными кодонами, например, консервативные замены, можно осуществлять посредством образования последовательностей, в которых в третьем положении одного или нескольких выбранных (или всех) кодонов произведена замена любым из канонических оснований и/или остатками дезоксиинозина (Batzer et al., Nucleic Acid Res. 19:5081 (1991); Ohtsuka et al., J. Biol. Chem. 260:2605-2608 (1985); и Rossolini et al., Mol. Cell. Probes 8:91-98 (1994)).The term "nucleic acid", "nucleic acid molecule", "polynucleotide" or "polynucleotide molecule" refers to deoxyribonucleic acids (DNA) or ribonucleic acids (RNA) and polymers thereof in single- or double-stranded form. Unless specifically limited, the term encompasses nucleic acids comprising known analogs of natural nucleotides that have binding properties similar to those of the reference nucleic acid and are metabolized by a mechanism similar to that of naturally occurring nucleotides. In some embodiments, a "nucleic acid", "nucleic acid molecule", "polynucleotide" or "polynucleotide molecule" provides a nucleotide/nucleoside derivative or analog. Unless otherwise specified, a particular nucleic acid sequence also implicitly encompasses its variants with conservative modifications (e.g., with degenerate codon substitutions, e.g., conservative substitutions), alleles, orthologs, SNPs, and complementary sequences, as well as the sequence specified explicitly. In particular, degenerate codon substitutions, e.g., conservative substitutions, can be achieved by generating sequences in which the third position of one or more selected (or all) codons is substituted with any of the canonical bases and/or deoxyinosine residues (Batzer et al., Nucleic Acid Res. 19:5081 (1991); Ohtsuka et al., J. Biol. Chem. 260:2605-2608 (1985); and Rossolini et al., Mol. Cell. Probes 8:91-98 (1994)).
Термины "пептид", "полипептид" и "белок" используются взаимозаменяемо и относятся к соединению, состоящему из аминокислотных остатков, ковалентно связанных пептидными связями. Белок или пептид должен содержать по меньшей мере две аминокислоты, и не установлено ограничение на максимальное количество аминокислот, которые может содержать последовательность белка или пептида. Полипептиды включают любой пептид или белок, содержащий две или более аминокислоты, соединенные друг с другом пептидными связями. Используемый в данном документе термин относится как к коротким цепям, которые также обычно называются в уровне техники, например, пептидами, олигопептидами и олигомерами, так и к более длинным цепям, которые обычно называются в уровне техники белками, которых существует множество типов. "Полипептиды" включают, например, среди прочих, биологически активные фрагменты, по существу гомологичные полипептиды, олигопептиды, гомодимеры, гетеродимеры, варианты полипептидов, модифицированные полипептиды, производные, аналоги, слитые белки. Полипептид включает природный пептид, рекомбинантный пептид или их комбинацию.The terms "peptide", "polypeptide" and "protein" are used interchangeably and refer to a compound consisting of amino acid residues covalently linked by peptide bonds. A protein or peptide must contain at least two amino acids, and there is no limit on the maximum number of amino acids that a protein or peptide sequence may contain. Polypeptides include any peptide or protein containing two or more amino acids linked to each other by peptide bonds. As used herein, the term refers to both short chains, which are also commonly referred to in the art as, for example, peptides, oligopeptides and oligomers, and longer chains, which are commonly referred to in the art as proteins, of which there are many types. "Polypeptides" include, for example, but not limited to, biologically active fragments, substantially homologous polypeptides, oligopeptides, homodimers, heterodimers, polypeptide variants, modified polypeptides, derivatives, analogs, fusion proteins. The polypeptide includes a natural peptide, a recombinant peptide, or a combination of both.
Термин "промотор" относится к последовательности ДНК, распознаваемой синтетическим аппаратом клетки или введенным синтетическим аппаратом, которая необходима для инициации специфической транскрипции полинуклеотидной последовательности.The term "promoter" refers to a DNA sequence recognized by the cellular or introduced nucleotide apparatus that is required to initiate specific transcription of a polynucleotide sequence.
Термин "промоторная/регуляторная последовательность" относится к последовательности нуклеиновой кислоты, которая необходима для экспрессии продукта гена, функционально связанного с промоторной/регуляторной последовательностью. В некоторых случаях эта последовательность может являться коровой промоторной последовательностью, а в других случаях эта последовательность может также содержать энхансерную последовательность и другие регуляторные элементы, которые необходимы для экспрессии продукта гена. Например, промоторная/регуляторная последовательность может представлять собой последовательность, которая обеспечивает экспрессию продукта гена тканеспецифическим образом.The term "promoter/regulatory sequence" refers to a nucleic acid sequence that is necessary for the expression of a gene product operably linked to the promoter/regulatory sequence. In some cases, this sequence may be a core promoter sequence, and in other cases, the sequence may also contain an enhancer sequence and other regulatory elements that are necessary for the expression of the gene product. For example, a promoter/regulatory sequence may be a sequence that ensures the expression of a gene product in a tissue-specific manner.
Термин "конститутивный промотор" относится к нуклеотидной последовательности, которая, находясь в функциональной связи с полинуклеотидом, который кодирует или определяет продукт гена, обуславливает продуцирование продукта гена в клетке при большинстве или всех физиологических условиях клетки.The term "constitutive promoter" refers to a nucleotide sequence that, when in functional association with a polynucleotide that codes for or specifies a gene product, causes the production of the gene product in a cell under most or all physiological conditions of the cell.
Термин "индуцируемый промотор" относится к нуклеотидной последовательности, которая, находясь в функциональной связи с полинуклеотидом, который кодирует или определяет продукт гена, обуславливает продуцирование продукта гена в клетке по существу только в случае присутствия в клетке индуктора, который соответствует данному промотору.The term "inducible promoter" refers to a nucleotide sequence that, when in functional association with a polynucleotide that codes for or specifies a gene product, causes the production of the gene product in a cell substantially only when an inducer that corresponds to the promoter is present in the cell.
Термин "тканеспецифический промотор" относится к нуклеотидной последовательности, которая, находясь в функциональной связи с полинуклеотидом, который кодирует или определяет ген, обуславливает продуцирование продукта гена в клетке по существу только в том случае, если клетка является клеткой из того типа ткани, который соответствует данному промотору.The term "tissue-specific promoter" refers to a nucleotide sequence that, when in functional association with a polynucleotide that encodes or specifies a gene, causes the production of the gene product in a cell substantially only if the cell is a cell of the tissue type corresponding to the promoter.
Термины "антиген, ассоциированный с раком", "опухолевый антиген", "антиген, связанный с гиперпролиферативным нарушением" и "антиген, ассоциированный с гиперпролиферативным нарушением" взаимозаменяемо относятся к антигенам, которые являются общими для специфических гиперпролиферативных нарушений. В некоторых вариантах осуществления такие термины относятся к молекуле (как правило, белку, углеводу или липиду), которая экспрессируется на поверхности раковой клетки полностью либо в виде фрагмента (например, молекула MHC/пептид) и которая применима для предпочтительного нацеливания фармакологического средства на раковую клетку. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой маркер, экспрессируемый как нормальными клетками, так и раковыми клетками, например, маркер линии дифференцировки, например, CD19 на В-клетках. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой молекулу клеточной поверхности, которая в раковой клетке сверхэкспрессируется по сравнению с нормальной клеткой, например, характеризуется 1-кратной сверхэкспрессией, 2-кратной сверхэкспрессией, 3-кратной или большей сверхэкспрессией по сравнению с нормальной клеткой. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой молекулу клеточной поверхности, которая синтезируется в раковой клетке ненадлежащим образом, например, молекулу, которая содержит делеции, добавления или мутации по сравнению с молекулой, экспрессируемой на нормальной клетке. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген будет экспрессироваться исключительно на клеточной поверхности раковой клетки, полностью или в виде фрагмента (например, молекула MHC/пептид), и не будет синтезироваться или экспрессироваться на поверхности нормальной клетки. В некоторых вариантах осуществления антигены, связанные с гиперпролиферативным нарушением, по настоящему изобретению получены из раковых образований, включающих без ограничения первичную или метастатическую меланому, тимому, лимфому, саркому, рак легкого, рак печени, неходжкинскую лимфому, лимфому Ходжкина, формы лейкоза, рак матки, рак шейки матки, рак мочевого пузыря, рак почки и формы аденокарциномы, такие как рак молочной железы, рак предстательной железы (например, кастрационнорезистентный или резистентный к терапии рак предстательной железы или метастатический рак предстательной железы), рак яичника, рак поджелудочной железы и т. п., или нарушение пролиферации плазматических клеток, например, бессимптомную миелому ("тлеющую" множественную миелому или вялотекущую миелому), моноклональную гаммапатию неустановленной этиологии (MGUS), макроглобулинемию Вальденстрема, формы плазмоцитомы (например, плазмоклеточную дискразию, солитарную миелому, солитарную плазмоцитому, экстрамедуллярную плазмоцитому и множественную плазмоцитому), системный амилоидоз в форме амилоидоза легких цепей и POEMS-синдром (также известный как синдром Кроу-Фукаса, болезнь Такатсуки и PEP-синдром). В некоторых вариантах осуществления CAR по настоящему изобретению включают CAR, содержащие антигенсвязывающий домен (например, антитело или фрагмент антитела), который связывается с пептидом, презентируемым молекулой MHC. Обычно пептиды, происходящие из эндогенных белков, заполняют карманы молекул главного комплекса гистосовместимости (MHC) I класса и распознаются T-клеточными рецепторами (TCR) на CD8+ T-лимфоцитах. Комплексы молекул MHC I класса конститутивно экспрессируются всеми ядросодержащими клетками. При раке комплексы вирусоспецифический и/или опухолеспецифический пептид/молекула MHC представляют собой уникальный класс мишеней клеточной поверхности для иммунотерапии. Были описаны TCR-подобные антитела, нацеливающиеся на пептиды, происходящие из вирусных или опухолевых антигенов, в окружении человеческого лейкоцитарного антигена (HLA)-A1 или HLA-A2 (см., например, Sastry et al., J Virol. 2011 85(5):1935-1942; Sergeeva et al., Blood, 2011 117(16):4262-4272; Verma et al., J Immunol 2010 184(4):2156-2165; Willemsen et al., Gene Ther 2001 8(21) :1601-1608; Dao et al., Sci Transl Med 2013 5(176) :176ra33 ; Tassev et al., Cancer Gene Ther 2012 19(2):84-100). Например, TCR-подобное антитело можно идентифицировать при скрининге библиотеки, такой как фаг-дисплейная библиотека scFv человека.The terms "cancer-associated antigen," "tumor antigen," "hyperproliferative disorder-associated antigen," and "hyperproliferative disorder-associated antigen" interchangeably refer to antigens that are common to specific hyperproliferative disorders. In some embodiments, such terms refer to a molecule (typically a protein, carbohydrate, or lipid) that is expressed on the surface of a cancer cell in whole or as a fragment (e.g., an MHC molecule/peptide) and that is useful for preferentially targeting a pharmacologic agent to a cancer cell. In some embodiments, the tumor antigen is a marker expressed by both normal cells and cancer cells, such as a lineage marker, such as CD19 on B cells. In some embodiments, the tumor antigen is a cell surface molecule that is overexpressed in a cancer cell compared to a normal cell, such as 1-fold overexpression, 2-fold overexpression, 3-fold overexpression, or more than a normal cell. In some embodiments, the tumor antigen is a cell surface molecule that is inappropriately synthesized in a cancer cell, such as a molecule that contains deletions, additions, or mutations compared to the molecule expressed on a normal cell. In some embodiments, the tumor antigen will be expressed exclusively on the cell surface of a cancer cell, in whole or in part (e.g., an MHC molecule/peptide), and will not be synthesized or expressed on the surface of a normal cell. In some embodiments, the hyperproliferative disorder-associated antigens of the present invention are derived from cancers including, but not limited to, primary or metastatic melanoma, thymoma, lymphoma, sarcoma, lung cancer, liver cancer, non-Hodgkin's lymphoma, Hodgkin's lymphoma, forms of leukemia, uterine cancer, cervical cancer, bladder cancer, renal cancer, and forms of adenocarcinoma such as breast cancer, prostate cancer (e.g., castration-resistant or therapy-resistant prostate cancer or metastatic prostate cancer), ovarian cancer, pancreatic cancer, and the like, or a plasma cell proliferative disorder such as asymptomatic myeloma ("smoldering" multiple myeloma or smoldering myeloma), monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS), Waldenstrom's macroglobulinemia, forms of plasmacytomas (e.g., plasma cell dyscrasia, solitary myeloma, solitary plasmacytoma, extramedullary plasmacytoma, and multiple plasmacytoma), systemic amyloidosis in the form of light chain amyloidosis, and POEMS syndrome (also known as Crowe-Fukasa syndrome, Takatsuki disease, and PEP syndrome). In some embodiments, CARs of the present invention include CARs that comprise an antigen-binding domain (e.g., an antibody or antibody fragment) that binds to a peptide presented by an MHC molecule. Typically, peptides derived from endogenous proteins fill pockets of major histocompatibility complex (MHC) class I molecules and are recognized by T cell receptors (TCRs) on CD8+ T lymphocytes. MHC class I molecule complexes are constitutively expressed by all nucleated cells. In cancer, virus-specific and/or tumor-specific peptide/MHC molecule complexes represent a unique class of cell surface targets for immunotherapy. TCR-like antibodies targeting peptides derived from viral or tumor antigens in the human leukocyte antigen (HLA)-A1 or HLA-A2 frame have been described (see, e.g., Sastry et al., J Virol. 2011 85(5):1935–1942; Sergeeva et al., Blood, 2011 117(16):4262–4272; Verma et al., J Immunol 2010 184(4):2156–2165; Willemsen et al., Gene Ther 2001 8(21):1601–1608; Dao et al., Sci Transl Med 2013 5(176):176ra33; Tassev et al., Cancer Gene Ther 2012 19(2):84–100). For example, a TCR-like antibody can be identified by screening a library such as a human scFv phage display library.
Термины "антиген, обеспечивающий поддержание опухоли" или "антиген, обеспечивающий поддержание рака" взаимозаменяемо относятся к молекуле (как правило, белку, углеводу или липиду), которая экспрессируется на поверхности клетки, которая сама по себе не является раковой, но обеспечивает поддержание раковых клеток, например, путем способствования их росту или выживанию, например, устойчивости к иммунным клеткам. Иллюстративные клетки данного типа включают стромальные клетки и супрессорные клетки миелоидного происхождения (MDSC). Антиген, обеспечивающий поддержание опухоли, сам по себе не обязательно играет роль в поддержании опухолевых клеток, при условии, что антиген присутствует в клетке, которая обеспечивает поддержание раковых клеток.The terms "tumor maintenance antigen" or "cancer maintenance antigen" refer interchangeably to a molecule (usually a protein, carbohydrate, or lipid) that is expressed on the surface of a cell that is not itself cancerous but that provides maintenance to cancer cells, such as by promoting their growth or survival, such as resistance to immune cells. Exemplary cells of this type include stromal cells and myeloid-derived suppressor cells (MDSCs). A tumor maintenance antigen does not necessarily itself play a role in the maintenance of tumor cells, so long as the antigen is present in a cell that provides maintenance to cancer cells.
Термин "гибкий полипептидный линкер" или "линкер", используемый применительно к scFv, относится к пептидному линкеру, который состоит из аминокислот, таких как глициновые и/или сериновые остатки, используемые в отдельности или в комбинации, для связывания вариабельной области тяжелой цепи и вариабельной области легкой цепи друг с другом. В некоторых вариантах осуществления гибкий полипептидный линкер представляет собой линкер Gly/Ser и содержит аминокислотную последовательность (Gly-Gly-Gly-Ser)n, где n представляет собой положительное целое число, которое равняется или больше 1 (SEQ ID NO: 41). Например, n=1, n=2, n=3, n=4, n=5 и n=6, n=7, n=8, n=9 и n=10. В некоторых вариантах осуществления гибкие полипептидные линкеры включают без ограничения (Gly4Ser)4 (SEQ ID NO: 27) или (Gly4 Ser)3 (SEQ ID NO: 28). В некоторых вариантах осуществления линкеры содержат множественные повторы (Gly2Ser) (GlySer) или (Gly3Ser) (SEQ ID NO: 29). Также в объем настоящего изобретения включены линкеры, описанные в WO2012/138475, включенной в данный документ посредством ссылки.The term "flexible polypeptide linker" or "linker" as used in connection with scFv refers to a peptide linker that is comprised of amino acids, such as glycine and/or serine residues, used alone or in combination to link a heavy chain variable region and a light chain variable region to each other. In some embodiments, the flexible polypeptide linker is a Gly/Ser linker and comprises the amino acid sequence (Gly-Gly-Gly-Ser)n, wherein n is a positive integer that is equal to or greater than 1 (SEQ ID NO: 41). For example, n=1, n=2, n=3, n=4, n=5 and n=6, n=7, n=8, n=9 and n=10. In some embodiments, flexible polypeptide linkers include, but are not limited to, (Gly4Ser)4 (SEQ ID NO: 27) or (Gly4 Ser)3 (SEQ ID NO: 28). In some embodiments, linkers comprise multiple repeats of (Gly2Ser) (GlySer) or (Gly3Ser) (SEQ ID NO: 29). Also included within the scope of the present invention are the linkers described in WO2012/138475, incorporated herein by reference.
Как используется в данном документе, 5'-кэп (также называемый РНК-кэпом, 7-метилгуанозиновым РНК-кэпом или РНК-кэпом m7G) представляет собой модифицированный гуаниновый нуклеотид, который добавляется к "переднему", или 5'-концу, эукариотической матричной РНК вскоре после начала транскрипции. 5'-кэп состоит из концевой группы, которая связана с первым транскрибированным нуклеотидом. Его присутствие является критически важным для распознавания рибосомой и защиты от РНКаз. Добавление кэпа сопряжено с транскрипцией и происходит совместно с транскрипцией, так что каждое из этих событий влияет на другое. Вскоре после начала транскрипции 5'-конец синтезируемой мРНК связывается с кэп-синтезирующим комплексом, ассоциированным с РНК-полимеразой. Этот ферментативный комплекс катализирует химические реакции, которые необходимы для кэпирования мРНК. Синтез протекает в виде многоступенчатой биохимической реакции. Кэпирующий фрагмент можно модифицировать для модулирования функциональных свойств мРНК, таких как ее стабильность или эффективность трансляции.As used herein, the 5' cap (also called the RNA cap, 7-methylguanosine RNA cap, or m7G RNA cap) is a modified guanine nucleotide that is added to the "front," or 5' end, of eukaryotic messenger RNA shortly after transcription begins. The 5' cap consists of a terminal group that is linked to the first nucleotide transcribed. Its presence is critical for ribosome recognition and protection from RNases. Cap addition is coupled to transcription and occurs cooperatively with transcription, such that each event influences the other. Shortly after transcription begins, the 5' end of nascent mRNA binds to the RNA polymerase-associated cap synthesizing complex. This enzymatic complex catalyzes the chemical reactions required to cap the mRNA. Synthesis occurs as a multistep biochemical reaction. The capping moiety can be modified to modulate functional properties of the mRNA, such as its stability or translation efficiency.
Как используется в данном документе, "РНК, транскрибированная in vitro" относится к РНК, предпочтительно мРНК, которая была синтезирована in vitro. В некоторых вариантах осуществления РНК представляет собой мРНК. Обычно РНК, транскрибированная in vitro, образуется из вектора транскрипции in vitro. Вектор транскрипции in vitro содержит матрицу, используемую для образования РНК, транскрибированной in vitro.As used herein, "in vitro transcribed RNA" refers to RNA, preferably mRNA, that has been synthesized in vitro. In some embodiments, the RNA is mRNA. Typically, in vitro transcribed RNA is produced from an in vitro transcription vector. The in vitro transcription vector contains a template used to produce in vitro transcribed RNA.
Как используется в данном документе, "поли(А)" представляет собой последовательный ряд аденозиновых остатков, присоединенных путем полиаденилирования к мРНК. В некоторых вариантах осуществления конструкции для транзиентной экспрессии длина поли(А) составляет от 50 до 5000 (SEQ ID NO: 30). В некоторых вариантах осуществления длина поли(А) составляет более 64. В некоторых вариантах осуществления длина поли(А) составляет более 100. В некоторых вариантах осуществления длина поли(А) составляет более 300. В некоторых вариантах осуществления длина поли(А) составляет более 400. Последовательности поли(A) можно модифицировать с помощью химических средств или ферментов для модулирования функциональных свойств мРНК, таких как локализация, стабильность или эффективность трансляции.As used herein, "poly(A)" is a consecutive series of adenosine residues attached by polyadenylation to an mRNA. In some embodiments of a transient expression construct, the poly(A) length is from 50 to 5000 (SEQ ID NO: 30). In some embodiments, the poly(A) length is greater than 64. In some embodiments, the poly(A) length is greater than 100. In some embodiments, the poly(A) length is greater than 300. In some embodiments, the poly(A) length is greater than 400. Poly(A) sequences can be modified by chemical means or enzymes to modulate functional properties of mRNA, such as localization, stability, or translation efficiency.
Как используется в данном документе, "полиаденилирование" относится к ковалентной связи полиаденилилового фрагмента или его модифицированного варианта с молекулой матричной РНК. У эукариотических организмов большинство молекул матричной РНК (мРНК) являются полиаденилированными на 3'-конце. 3'-концевой поли(А)-хвост представляет собой длинную последовательность адениновых нуклеотидов (часто несколько сотен), добавленных к пре-мРНК под действием фермента полиаденилатполимеразы. У высших эукариот поли(А)-хвост добавляется к транскриптам, которые содержат определенную последовательность - сигнал полиаденилирования. Поли(А)-хвост и связанный с ним белок содействуют защите мРНК от разрушения экзонуклеазами. Полиаденилирование также важно для терминации транскрипции, экспорта мРНК из ядра и трансляции. Полиаденилирование происходит в ядре сразу после транскрипции ДНК в РНК, но дополнительно может также происходить позднее в цитоплазме. После терминации транскрипции цепь мРНК расщепляется под действием эндонуклеазного комплекса, ассоциированного с РНК-полимеразой. Сайт расщепления обычно характеризуется наличием последовательности оснований AAUAAA вблизи сайта расщепления. После того, как мРНК была расщеплена, к свободному 3'-концу в сайте расщепления добавляются аденозиновые остатки.As used herein, "polyadenylation" refers to the covalent attachment of a polyadenylyl moiety or a modified version thereof to a messenger RNA molecule. In eukaryotic organisms, most messenger RNA (mRNA) molecules are polyadenylated at the 3' end. The 3' poly(A) tail is a long sequence of adenine nucleotides (often several hundred) added to the pre-mRNA by the enzyme polyadenylate polymerase. In higher eukaryotes, the poly(A) tail is added to transcripts that contain a specific sequence, the polyadenylation signal. The poly(A) tail and its associated protein help protect the mRNA from degradation by exonucleases. Polyadenylation is also important for transcription termination, mRNA export from the nucleus, and translation. Polyadenylation occurs in the nucleus immediately after transcription of DNA into RNA, but may also occur later in the cytoplasm. Following transcription termination, the mRNA strand is cleaved by an endonuclease complex associated with RNA polymerase. The cleavage site is typically characterized by the presence of the base sequence AAUAAA near the cleavage site. After the mRNA has been cleaved, adenosine residues are added to the free 3' end at the cleavage site.
Как используется в данном документе, "транзиентный" относится к экспрессии неинтегрированного трансгена в течение периода нескольких часов, дней или недель, где период времени экспрессии является меньшим, чем период времени для экспрессии гена в случае, если он интегрирован в геном или содержится в стабильном плазмидном репликоне в клетке-хозяине.As used herein, "transient" refers to the expression of a non-integrated transgene over a period of hours, days, or weeks, where the expression time period is shorter than the time period for expression of the gene if it is integrated into the genome or contained in a stable plasmid replicon in a host cell.
Используемые в данном документе термины "лечить", "лечение" и "осуществление лечения" относятся к снижению или ослаблению прогрессирования, тяжести и/или продолжительности пролиферативного нарушения или ослаблению одного или нескольких симптомов (предпочтительно одного или нескольких различимых симптомов) пролиферативного нарушения в результате введения одного или нескольких средств терапии (например, одного или нескольких терапевтических средств, таких как CAR по настоящему изобретению). В конкретных вариантах осуществления термины "лечить", "лечение" и "осуществление лечения" относятся к ослаблению по меньшей мере одного измеряемого физического параметра пролиферативного нарушения, такого как рост опухоли, не обязательно различимого для пациента. В других вариантах осуществления термины "лечить", "лечение" и "осуществление лечения" относятся к ингибированию прогрессирования пролиферативного нарушения либо на физическом уровне, например, посредством стабилизации различимого симптома, либо на физиологическом уровне, например, посредством стабилизации физического параметра, либо как на одном, так и на другом уровнях. В других вариантах осуществления термины "лечить", "лечение" и "осуществление лечения" относятся к снижению или стабилизации размера опухоли или количества раковых клеток.As used herein, the terms "treat," "treating," and "treating" refer to reducing or ameliorating the progression, severity, and/or duration of a proliferative disorder or alleviating one or more symptoms (preferably one or more discernible symptoms) of a proliferative disorder by administering one or more therapies (e.g., one or more therapeutic agents, such as a CAR of the present invention). In particular embodiments, the terms "treat," "treating," and "treating" refer to alleviating at least one measurable physical parameter of a proliferative disorder, such as tumor growth, not necessarily discernible to a patient. In other embodiments, the terms "treat," "treating," and "treating" refer to inhibiting the progression of a proliferative disorder, either at a physical level, such as by stabilizing a discernible symptom, or at a physiological level, such as by stabilizing a physical parameter, or both. In other embodiments, the terms "treat," "treating," and "treating" refer to reducing or stabilizing the size of a tumor or the number of cancer cells.
Термин "путь передачи сигнала" относится к биохимической взаимосвязи между различными молекулами-переносчиками сигналов, которые играют роль в передаче сигнала от одной части клетки к другой части клетки. Фраза "рецептор клеточной поверхности" включает молекулы и комплексы молекул, способные принимать сигнал и передавать сигнал через мембрану клетки.The term "signal transduction pathway" refers to the biochemical relationship between the various signal carrier molecules that play a role in transmitting a signal from one part of a cell to another part of the cell. The phrase "cell surface receptor" includes molecules and complexes of molecules that are capable of receiving a signal and transmitting a signal across the cell membrane.
Термин "субъект" предполагает включение живых организмов, у которых можно вызвать иммунный ответ (например, млекопитающих, человека).The term "subject" is intended to include living organisms in which an immune response can be elicited (e.g. mammals, humans).
Термин "по существу очищенная клетка" относится к клетке, которая по сути свободна от других типов клеток. "По существу очищенная клетка" также относится к клетке, которая была отделена от других типов клеток, с которыми она обычно ассоциирована в своем встречающемся в природе состоянии. В некоторых случаях популяция по существу очищенных клеток относится к однородной популяции клеток. В других случаях данный термин просто относится к клетке, которая была отделена от клеток, с которыми она в природных условиях ассоциирована в своем природном состоянии. В некоторых вариантах осуществления клетки культивируют in vitro. В некоторых вариантах осуществления клетки не культивируют in vitro.The term "substantially purified cell" refers to a cell that is substantially free of other cell types. A "substantially purified cell" also refers to a cell that has been separated from other cell types with which it is normally associated in its naturally occurring state. In some cases, a population of substantially purified cells refers to a homogeneous population of cells. In other cases, the term simply refers to a cell that has been separated from the cells with which it is naturally associated in its natural state. In some embodiments, the cells are cultured in vitro. In some embodiments, the cells are not cultured in vitro.
Используемый в данном документе термин "терапевтический" означает лечение. Терапевтический эффект получают путем ослабления, подавления, ремиссии или устранения болезненного состояния.As used in this document, the term "therapeutic" means treatment. The therapeutic effect is obtained by alleviating, suppressing, remitting, or eliminating a disease state.
Используемый в данном документе термин "профилактика" означает предупреждение или профилактическое лечение заболевания или болезненного состояния.As used in this document, the term "prophylaxis" means the prevention or prophylactic treatment of a disease or condition.
Термины "трансфицированный", или "трансформированный", или "трансдуцированный" относятся к процессу, в ходе которого экзогенную нуклеиновую кислоту переносят или вводят в клетку-хозяина. "Трансфицированная", или "трансформированная", или "трансдуцированная" клетка представляет собой клетку, которая была подвергнута трансфекции, трансформации или трансдукции с помощью экзогенной нуклеиновой кислоты. Такая клетка включает первичную клетку субъекта и ее потомство.The terms "transfected" or "transformed" or "transduced" refer to a process by which an exogenous nucleic acid is transferred or introduced into a host cell. A "transfected" or "transformed" or "transduced" cell is one that has been transfected, transformed, or transduced with an exogenous nucleic acid. Such a cell includes the primary cell of the subject and its progeny.
Термин "специфично связывается" относится к антителу или лиганду, которые распознают своего когнатного белкового партнера по связыванию (например, стимулирующую и/или костимулирующую молекулу, присутствующую на Т-клетке), присутствующего в образце, и связываются с ним, но при этом это антитело или лиганд по существу не распознают или не связывают другие молекулы в образце.The term "specifically binds" refers to an antibody or ligand that recognizes and binds its cognate protein binding partner (e.g., a stimulatory and/or costimulatory molecule present on a T cell) present in a sample, but the antibody or ligand does not substantially recognize or bind other molecules in the sample.
Как используется в данном документе, "регулируемый химерный антигенный рецептор (RCAR)" относится к набору полипептидов, как правило, в простейших вариантах осуществления двух, которые, находясь в иммунной эффекторной клетке, наделяют клетку специфичностью в отношении клетки-мишени, как правило, раковой клетки, и образованием внутриклеточного сигнала. В некоторых вариантах осуществления RCAR содержит по меньшей мере внеклеточный антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и цитоплазматический сигнальный домен (также называемый в данном документе "внутриклеточным сигнальным доменом"), содержащий функциональный сигнальный домен, полученный из стимулирующей молекулы и/или костимулирующей молекулы, как определено в данном документе применительно к молекуле CAR. В некоторых вариантах осуществления полипептиды из набора в RCAR не являются смежными друг с другом, например, находятся в разных полипептидных цепях. В некоторых вариантах осуществления RCAR содержит димеризационный переключатель, который при наличии димеризационной молекулы может связывать полипептиды друг с другом, например, может связывать антигенсвязывающий домен с внутриклеточным сигнальным доменом. В некоторых вариантах осуществления RCAR экспрессируется в клетке (например, иммунной эффекторной клетке), описанной в данном документе, например, в клетке, экспрессирующей RCAR (также называемой в данном документе "RCARX-клеткой"). В некоторых вариантах осуществления RCARX-клетка представляет собой T-клетку и называется RCAR-T-клеткой. В некоторых вариантах осуществления RCARX-клетка представляет собой NK-клетку и называется RCAR-N-клеткой. RCAR может наделять клетку, экспрессирующую RCAR, специфичностью в отношении клетки-мишени, как правило, раковой клетки, и регулируемым образованием внутриклеточного сигнала или пролиферацией, что может оптимизировать иммуноэффекторное свойство клетки, экспрессирующей RCAR. В ряде вариантов осуществления клетка с RCAR по меньшей мере частично зависит от антигенсвязывающего домена в обеспечении специфичности в отношении клетки-мишени, которая содержит антиген, связываемый антигенсвязывающим доменом.As used herein, a "regulated chimeric antigen receptor (RCAR)" refers to a collection of polypeptides, typically two in the simplest embodiments, that when located in an immune effector cell, confers on the cell specificity for a target cell, typically a cancer cell, and the generation of an intracellular signal. In some embodiments, an RCAR comprises at least an extracellular antigen-binding domain, a transmembrane domain, and a cytoplasmic signaling domain (also referred to herein as an "intracellular signaling domain") comprising a functional signaling domain derived from a stimulatory molecule and/or a costimulatory molecule as defined herein with respect to a CAR molecule. In some embodiments, the polypeptides in a collection of an RCAR are not contiguous with one another, such as being on different polypeptide chains. In some embodiments, the RCAR comprises a dimerization switch that, when present, can link the polypeptides to each other, such as can link an antigen-binding domain to an intracellular signaling domain. In some embodiments, the RCAR is expressed in a cell (e.g., an immune effector cell) described herein, such as an RCAR-expressing cell (also referred to herein as an "RCARX cell"). In some embodiments, the RCARX cell is a T cell and is referred to as an RCAR-T cell. In some embodiments, the RCARX cell is an NK cell and is referred to as an RCAR-N cell. The RCAR can confer on the RCAR-expressing cell specificity for a target cell, typically a cancer cell, and regulated intracellular signal generation or proliferation, which can optimize the immune effector property of the RCAR-expressing cell. In some embodiments, the RCAR cell is at least partially dependent on the antigen-binding domain to provide specificity for a target cell that comprises an antigen bound by the antigen-binding domain.
Используемый в данном документе термин "мембранный якорь" или "домен прикрепления к мембране" относится к полипептиду или фрагменту, например, к миристоильной группе, достаточному для заякоривания внеклеточного или внутриклеточного домена на плазматической мембране.As used herein, the term "membrane anchor" or "membrane attachment domain" refers to a polypeptide or moiety, such as a myristoyl group, sufficient to anchor an extracellular or intracellular domain to the plasma membrane.
Используемый в данном документе термин "переключающий домен", например, в отношении RCAR, относится к объекту, обычно полипептидному объекту, который в присутствии димеризующей молекулы ассоциирует с другим переключающим доменом. Ассоциация приводит к функциональному связыванию первого объекта, связанного, например, слитого, с первым переключающим доменом, и второго объекта, связанного, например, слитого, со вторым переключающим доменом. Первый и второй переключающие домены в совокупности называются димеризационным переключателем. В ряде вариантов осуществления первый и второй переключающие домены являются одинаковыми, например, они являются полипептидами, имеющими одинаковую первичную аминокислотную последовательность, и в совокупности называются гомодимеризационным переключателем. В ряде вариантов осуществления первый и второй переключающие домены отличаются друг от друга, например, они являются полипептидами, имеющими разные первичные аминокислотные последовательности, и в совокупности называются гетеродимеризационным переключателем. В ряде вариантов осуществления переключатель является внутриклеточным. В ряде вариантов осуществления переключатель является внеклеточным. В ряде вариантов осуществления переключающий домен представляет собой полипептидный объект, например, объект на основе FKBP или FRB, а димеризующая молекула представляет собой малую молекулу, например, рапалог. В ряде вариантов осуществления переключающий домен представляет собой полипептидный объект, например, scFv, который связывает пептид myc, а димеризующая молекула представляет собой полипептид, его фрагмент или мультимер полипептида, например, лиганд myc или мультимеры лиганда myc, которые связываются с одним или несколькими scFv для myc. В ряде вариантов осуществления переключающий домен представляет собой полипептидный объект, например, рецептор для myc, а димеризующая молекула представляет собой антитело или его фрагменты, например, антитело к myc.As used herein, the term "switch domain," for example, in relation to RCAR, refers to an entity, typically a polypeptide entity, that associates with another switch domain in the presence of a dimerizing molecule. The association results in operative linkage of a first entity linked, for example, fused, to the first switch domain, and a second entity linked, for example, fused, to the second switch domain. The first and second switch domains are collectively referred to as a dimerization switch. In some embodiments, the first and second switch domains are the same, for example, they are polypeptides having the same primary amino acid sequence, and are collectively referred to as a homodimerization switch. In some embodiments, the first and second switch domains are different from each other, for example, they are polypeptides having different primary amino acid sequences, and are collectively referred to as a heterodimerization switch. In some embodiments, the switch is intracellular. In some embodiments, the switch is extracellular. In some embodiments, the switch domain is a polypeptide entity, such as an FKBP or FRB-based entity, and the dimerizing molecule is a small molecule, such as a rapalog. In some embodiments, the switch domain is a polypeptide entity, such as an scFv, that binds a myc peptide, and the dimerizing molecule is a polypeptide, a fragment thereof, or a polypeptide multimer, such as a myc ligand or myc ligand multimers that bind to one or more scFvs for myc. In some embodiments, the switch domain is a polypeptide entity, such as a receptor for myc, and the dimerizing molecule is an antibody or fragments thereof, such as an anti-myc antibody.
Используемый в данном документе термин "димеризующая молекула", например, в отношении RCAR, относится к молекуле, которая способствует ассоциации первого переключающего домена со вторым переключающим доменом. В ряде вариантов осуществления димеризующая молекула не встречается у субъекта в природе или не встречается в концентрациях, которые могут привести к значительной степени димеризации. В ряде вариантов осуществления димеризующая молекула представляет собой малую молекулу, например, рапамицин или рапалог, например, RAD001.As used herein, the term "dimerizing molecule," for example, in relation to RCAR, refers to a molecule that facilitates the association of a first switch domain with a second switch domain. In some embodiments, the dimerizing molecule does not naturally occur in the subject or does not occur at concentrations that can result in a significant degree of dimerization. In some embodiments, the dimerizing molecule is a small molecule, such as rapamycin or a rapalog, such as RAD001.
Термин "низкая доза, усиливающая иммунный ответ" при использовании в отношении ингибитора mTOR, например, аллостерического ингибитора mTOR, например, RAD001 или рапамицина, или каталитического ингибитора mTOR относится к дозе ингибитора mTOR, которая обеспечивает частичное, но не полное, ингибирование активности mTOR, например, согласно измерению по ингибированию активности киназы P70-S6. Способы оценивания активности mTOR, например, по ингибированию киназы P70-S6, обсуждаются в данном документе. Доза является недостаточной, чтобы вызвать полное подавление иммунитета, но достаточной для усиления иммунного ответа. В некоторых вариантах осуществления низкая доза, усиливающая иммунный ответ, ингибитора mTOR приводит к уменьшению количества PD-1-положительных Т-клеток и/или увеличению количества PD-1-отрицательных Т-клеток или увеличению соотношения PD-1-отрицательные Т-клетки/PD-1-положительные Т-клетки. В некоторых вариантах осуществления низкая доза, усиливающая иммунный ответ, ингибитора mTOR приводит к увеличению количества необученных Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления низкая доза, усиливающая иммунный ответ, ингибитора mTOR приводит к одному или нескольким из следующего:The term "low immune response enhancing dose" when used in relation to an mTOR inhibitor, such as an allosteric mTOR inhibitor, such as RAD001 or rapamycin, or a catalytic mTOR inhibitor, refers to a dose of the mTOR inhibitor that provides partial, but not complete, inhibition of mTOR activity, such as as measured by inhibition of P70-S6 kinase activity. Methods for assessing mTOR activity, such as by inhibition of P70-S6 kinase, are discussed herein. The dose is insufficient to cause complete immune suppression, but sufficient to enhance the immune response. In some embodiments, a low immune response enhancing dose of the mTOR inhibitor results in a decrease in PD-1 positive T cells and/or an increase in PD-1 negative T cells or an increase in the PD-1 negative T cell/PD-1 positive T cell ratio. In some embodiments, a low dose of an immune response enhancing mTOR inhibitor results in an increase in the number of naive T cells. In some embodiments, a low dose of an immune response enhancing mTOR inhibitor results in one or more of the following:
повышению экспрессии одного или нескольких из следующих маркеров: CD62Lвысокий, CD127высокий, CD27+ и BCL2, например, на Т-клетках памяти, например, на предшественниках Т-клеток памяти;increased expression of one or more of the following markers: CD62L high , CD127 high , CD27 + , and BCL2, e.g. on memory T cells, e.g. on memory T cell precursors;
снижению экспрессии KLRG1, например, на Т-клетках памяти, например, на предшественниках Т-клеток памяти; иdecreased expression of KLRG1, such as on memory T cells, such as on memory T cell precursors; and
увеличению количества предшественников Т-клеток памяти, например, клеток с любой из следующих характеристик или их комбинацией: повышенным уровнем CD62Lвысокий, повышенным уровнем CD127высокий, повышенным уровнем CD27+, сниженным уровнем KLRG1 и повышенным уровнем BCL2;increasing the number of memory T cell precursors, such as cells with any or a combination of the following characteristics: elevated CD62L high , elevated CD127 high , elevated CD27 + , decreased KLRG1, and elevated BCL2;
где любое из изменений, описанных выше, происходит, например, по меньшей мере транзиентно, например, по сравнению с субъектом, не получающим лечение.where any of the changes described above occurs, for example, at least transiently, for example, compared to a subject not receiving treatment.
Как используется в данном документе, "рефрактерный" относится к заболеванию, например, раку, которое не отвечает на лечение. В ряде вариантов осуществления рефрактерный рак может быть устойчивым к лечению до или в начале лечения. В других вариантах осуществления рефрактерный рак может стать устойчивым в ходе лечения. Рефрактерный рак также называют устойчивым раком.As used herein, "refractory" refers to a disease, such as cancer, that does not respond to treatment. In some embodiments, refractory cancer may be resistant to treatment before or at the start of treatment. In other embodiments, refractory cancer may become resistant during treatment. Refractory cancer is also referred to as resistant cancer.
Как используется в данном документе, "рецидивирующий" или "рецидив" относится к возвращению или повторному появлению заболевания (например, рака) или признаков и симптомов заболевания, такого как рак, после периода улучшения или восприимчивости, например, после предшествующего лечения с помощью терапии, например, противораковой терапии. Начальный период восприимчивости может предусматривать падение уровня раковых клеток ниже определенного порога, например, ниже 20%, 1%, 10%, 5%, 4%, 3%, 2% или 1%. Повторное появление может предусматривать возрастание уровня раковых клеток выше определенного порога, например, выше 20%, 1%, 10%, 5%, 4%, 3%, 2% или 1%. Например, применительно к B-ALL повторное появление может предусматривать, например, повторное появление бластных клеток в крови, костном мозге (> 5%) или любом экстрамедуллярном участке после достижения полного ответа. Полный ответ в данном контексте может предусматривать < 5% бластных клеток в BM. В более широком смысле в некоторых вариантах осуществления ответ (например, полный ответ или частичный ответ) может предусматривать отсутствие выявляемого MRD (минимального остаточного заболевания). В некоторых вариантах осуществления начальный период восприимчивости продолжается в течение по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5 или 6 дней; по меньшей мере 1, 2, 3 или 4 недель; по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 6, 8, 10 или 12 месяцев или по меньшей мере 1, 2, 3, 4 или 5 лет.As used herein, "recurrent" or "relapse" refers to the return or reappearance of a disease (e.g., cancer) or the signs and symptoms of a disease, such as cancer, after a period of improvement or responsiveness, such as following prior treatment with a therapy, such as an anti-cancer therapy. An initial responsiveness period may include a drop in cancer cell levels below a certain threshold, such as below 20%, 1%, 10%, 5%, 4%, 3%, 2%, or 1%. Reappearance may include an increase in cancer cell levels above a certain threshold, such as above 20%, 1%, 10%, 5%, 4%, 3%, 2%, or 1%. For example, in the context of B-ALL, reappearance may include, for example, the reappearance of blast cells in the blood, bone marrow (> 5%), or any extramedullary site after a complete response has been achieved. A complete response in this context may include <5% blast cells in the BM. More broadly, in some embodiments, a response (e.g., a complete response or a partial response) may include no detectable MRD (minimal residual disease). In some embodiments, the initial period of susceptibility lasts for at least 1, 2, 3, 4, 5, or 6 days; at least 1, 2, 3, or 4 weeks; at least 1, 2, 3, 4, 6, 8, 10, or 12 months; or at least 1, 2, 3, 4, or 5 years.
Диапазоны: во всем настоящем раскрытии различные варианты осуществления настоящего изобретения могут быть представлены в формате диапазонов. Следует понимать, что описание в формате диапазонов служит лишь для удобства и краткости и не должно рассматриваться как жесткое ограничение объема настоящего изобретения. Соответственно, описание диапазона следует рассматривать как конкретно раскрывающее все возможные поддиапазоны, а также отдельные числовые значения в пределах этого диапазона. Например, описание такого диапазона, как от 1 до 6, следует рассматривать как конкретно раскрывающее такие поддиапазоны, как от 1 до 3, от 1 до 4, от 1 до 5, от 2 до 4, от 2 до 6, от 3 до 6 и т. д., а также отдельные числа в пределах этого диапазона, например, 1, 2, 2,7, 3, 4, 5, 5,3 и 6. В качестве другого примера, такой диапазон, как 95-99% идентичность, включает что-либо с 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичностью и включает такие поддиапазоны, как 96-99%, 96-98%, 96-97%, 97-99%, 97-98% и 98-99% идентичность. Это применимо независимо от ширины диапазона.Ranges: Throughout this disclosure, various embodiments of the present invention may be presented in range format. It should be understood that a description in range format is for convenience and brevity only and should not be considered as an inflexible limitation on the scope of the present invention. Accordingly, a description of a range should be considered as specifically disclosing all possible subranges, as well as individual numerical values within that range. For example, a description of a range such as 1 to 6 should be considered to specifically disclose such sub-ranges as 1 to 3, 1 to 4, 1 to 5, 2 to 4, 2 to 6, 3 to 6, etc., as well as individual numbers within that range such as 1, 2, 2.7, 3, 4, 5, 5.3, and 6. As another example, a range such as 95-99% identity includes anything with 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity and includes such sub-ranges as 96-99%, 96-98%, 96-97%, 97-99%, 97-98%, and 98-99% identity. This applies regardless of the width of the range.
Используемый в данном документе термин "система редактирования генов" относится к системе, например, одной или нескольким молекулам, которые управляют изменением, например, делецией, и осуществляют его в одной или нескольких нуклеиновых кислотах в сайте геномной ДНК, на которую нацеливается указанная система, или рядом с ним. Системы редактирования генов известны из уровня техники и более подробно описаны ниже.As used herein, the term "gene editing system" refers to a system, such as one or more molecules, that direct and effect a change, such as a deletion, in one or more nucleic acids at or near a site in genomic DNA that is targeted by the system. Gene editing systems are known in the art and are described in more detail below.
Как используется в данном документе, вводимый "в комбинации" означает, что два (или более) различных средства для лечения доставляют субъекту в период, когда субъект страдает нарушением, например, два или более средства для лечения доставляют после того, как у субъекта было диагностировано нарушение, и до того, как нарушение было излечено или устранено или лечение было прекращено по другим причинам. В некоторых вариантах осуществления доставка одного средства для лечения по-прежнему происходит, когда начинается доставка второго, так что в отношении введения имеет место перекрывание. Это иногда упоминается в данном документе как "одновременная" или "параллельная" доставка. В других вариантах осуществления доставка одного средства для лечения заканчивается до начала доставки другого средства для лечения. В некоторых вариантах осуществления в любом из случаев лечение является более эффективным благодаря комбинированному введению. Например, второе средство для лечения является более эффективным, например, эквивалентный эффект наблюдается при меньшем количестве второго средства для лечения, или второе средство для лечения снижает интенсивность симптомов в большей степени, чем наблюдалось бы при введении второго средства для лечения в отсутствие первого средства для лечения, или аналогичная ситуация наблюдается с первым средством для лечения. В некоторых вариантах осуществления доставка является такой, при которой снижение интенсивности симптома или другого параметра, связанного с нарушением, является большим, чем наблюдалось бы при доставке одного средства для лечения в отсутствие другого. Эффект двух средств для лечения может быть частично аддитивным, полностью аддитивным или превышающим аддитивный. Доставка может быть такой, что эффект от первого доставленного средства для лечения все еще поддается выявлению при доставке второго.As used herein, administered "in combination" means that two (or more) different treatments are delivered to a subject during a period when the subject is suffering from a disorder, such as two or more treatments being delivered after the subject has been diagnosed with the disorder and before the disorder has been cured or eliminated or treatment has been discontinued for other reasons. In some embodiments, delivery of one treatment is still occurring when delivery of the second begins, such that there is an overlap in terms of administration. This is sometimes referred to herein as "simultaneous" or "parallel" delivery. In other embodiments, delivery of one treatment ends before delivery of the other treatment begins. In some embodiments, in either case, the treatment is more effective due to the combined administration. For example, the second treatment is more effective, such that an equivalent effect is observed with a smaller amount of the second treatment, or the second treatment reduces the intensity of symptoms to a greater extent than would be observed if the second treatment were administered in the absence of the first treatment, or a similar situation is observed with the first treatment. In some embodiments, the delivery is such that the reduction in the intensity of a symptom or other parameter associated with the disorder is greater than would be observed with the delivery of one treatment in the absence of the other. The effect of the two treatments may be partially additive, fully additive, or greater than additive. The delivery may be such that the effect of the first treatment delivered is still detectable with the delivery of the second.
Термины "истощение" или "истощать", используемые взаимозаменяемо в данном документе, относятся к уменьшению или снижению уровня или количества клетки, белка или макромолекулы в образце после осуществления процесса, например, стадии отбора, например, отрицательного отбора. Истощение может быть полным или частичным истощением по клетке, белку или макромолекуле. В некоторых вариантах осуществления истощение представляет собой по меньшей мере 1%, 2%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, или 99% уменьшение или снижение уровня или количества клетки, белка или макромолекулы по сравнению с уровнем или количеством клетки, белка или макромолекулы в образце перед осуществлением процесса.The terms "depletion" or "deplete" used interchangeably herein refer to a decrease or reduction in the level or amount of a cell, protein, or macromolecule in a sample after a process, such as a selection step, such as negative selection, has been performed. The depletion may be a complete or partial depletion of the cell, protein, or macromolecule. In some embodiments, the depletion is at least a 1%, 2%, 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% decrease or reduction in the level or amount of the cell, protein, or macromolecule compared to the level or amount of the cell, protein, or macromolecule in the sample before the process has been performed.
Как используется в данном документе, "необученная Т-клетка" относится к Т-клетке, которая является неопытной в отношении антигена. В некоторых вариантах осуществления Т-клетка, которая является неопытной в отношении антигена, встречалась со своим когнатным антигеном в тимусе, но не на периферии. В некоторых вариантах осуществления необученные Т-клетки являются предшественниками клеток памяти. В некоторых вариантах осуществления необученные Т-клетки экспрессируют как CD45RA, так и CCR7, но не экспрессируют CD45RO. В некоторых вариантах осуществления необученные Т-клетки могут характеризоваться экспрессией CD62L, CD27, CCR7, CD45RA, CD28 и CD127 и отсутствием CD95 или изоформы CD45RO. В некоторых вариантах осуществления необученные Т-клетки экспрессируют CD62L, рецептор IL-7 α, рецептор IL-6 и CD132, но не экспрессируют CD25, CD44, CD69 или CD45RO. В некоторых вариантах осуществления необученные Т-клетки экспрессируют CD45RA, CCR7 и CD62L и не экспрессируют CD95 или рецептор IL-2 β. В некоторых вариантах осуществления уровни экспрессии маркеров на поверхности оценивают с помощью проточной цитометрии.As used herein, a "naive T cell" refers to a T cell that is antigen-naive. In some embodiments, a T cell that is antigen-naive has encountered its cognate antigen in the thymus but not in the periphery. In some embodiments, naive T cells are precursors to memory cells. In some embodiments, naive T cells express both CD45RA and CCR7 but do not express CD45RO. In some embodiments, naive T cells may be characterized by expression of CD62L, CD27, CCR7, CD45RA, CD28, and CD127 and lack CD95 or the CD45RO isoform. In some embodiments, the naive T cells express CD62L, IL-7 receptor α, IL-6 receptor, and CD132, but do not express CD25, CD44, CD69, or CD45RO. In some embodiments, the naive T cells express CD45RA, CCR7, and CD62L, and do not express CD95 or IL-2 receptor β. In some embodiments, surface marker expression levels are assessed by flow cytometry.
Термин "центральные T-клетки памяти" относится к субпопуляции T-клеток, которые у людей являются CD45RO-положительными и экспрессируют CCR7. В некоторых вариантах осуществления центральные T-клетки памяти экспрессируют CD95. В некоторых вариантах осуществления центральные T-клетки памяти экспрессируют IL-2R, IL-7R и/или IL-15R. В некоторых вариантах осуществления центральные T-клетки памяти экспрессируют CD45RO, CD95, рецептор IL-2 β, CCR7 и CD62L. В некоторых вариантах осуществления уровни экспрессии маркеров на поверхности оценивают с помощью проточной цитометрии.The term "central memory T cells" refers to a subset of T cells that in humans are CD45RO positive and express CCR7. In some embodiments, central memory T cells express CD95. In some embodiments, central memory T cells express IL-2R, IL-7R, and/or IL-15R. In some embodiments, central memory T cells express CD45RO, CD95, IL-2 receptor β, CCR7, and CD62L. In some embodiments, surface marker expression levels are assessed by flow cytometry.
Термин "стволовые T-клетки памяти", "T-клетки памяти, представляющие собой стволовые клетки", "T-клетки памяти, подобные стволовым клеткам", "стволовые T-клетки, являющиеся клетками памяти", "стволовые клетки, являющиеся Т-клетками памяти", "клетки памяти, представляющие собой стволовые Т-клетки" или "TSCM-клетки" относится к субпопуляции T-клеток памяти со способностью, подобной таковой у стволовых клеток, например, способностью к самообновлению и/или с мультипотентным потенциалом преобразования в субпопуляции T-клеток памяти и/или эффектoрных Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления стволовые T-клетки памяти экспрессируют CD45RA, CD95, рецептор IL-2 β, CCR7 и CD62L. В некоторых вариантах осуществления уровни экспрессии маркеров на поверхности оценивают с помощью проточной цитометрии. В некоторых вариантах осуществления иллюстративные стволовые T-клетки памяти раскрыты в Gattinoni et al., Nat Med. 2017 January 06; 23(1): 18-27, включенной в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.The term "memory T stem cells", "memory T cells that are stem cells", "memory T cells that are like stem cells", "stem T cells that are memory cells", "stem cells that are memory T cells", "memory cells that are stem T cells" or "TSCM cells" refers to a subset of memory T cells with stem cell-like capabilities, such as self-renewal capabilities and/or multipotent potential to convert to memory T cell and/or effector T cell subsets. In some embodiments, the memory T stem cells express CD45RA, CD95, IL-2 receptor β, CCR7, and CD62L. In some embodiments, surface marker expression levels are assessed by flow cytometry. In some embodiments, exemplary memory T stem cells are disclosed in Gattinoni et al., Nat Med. 2017 January 06; 23(1): 18-27, incorporated herein by reference in its entirety.
Для ясности, если не указано иное, классификация клетки или популяции клеток в качестве "не экспрессирующих", или характеризующихся "отсутствием" определенного маркера, или являющихся "отрицательными в отношении" определенного маркера не обязательно может означать абсолютное отсутствие маркера. Специалист в данной области может без труда сравнить клетку с положительным и/или отрицательным контролем и/или установить предварительно определенное пороговое значение и классифицировать клетку или популяцию клеток в качестве не экспрессирующих или являющихся отрицательными в отношении маркера, если клетка характеризуется уровнем экспрессии ниже предварительно определенного порогового значения или популяция клеток характеризуется общим уровнем экспрессии ниже предварительно определенного порогового значения, с помощью традиционных способов выявления, например, с помощью проточной цитометрии, например, как описано в примерах в данном документе.For clarity, unless otherwise indicated, classification of a cell or population of cells as "non-expressing" or "absent" or "negative for" a particular marker may not necessarily mean the absolute absence of the marker. One of skill in the art can readily compare a cell to a positive and/or negative control and/or establish a predetermined threshold and classify a cell or population of cells as non-expressing or negative for the marker if the cell has an expression level below the predetermined threshold or the population of cells has an overall expression level below the predetermined threshold, using conventional detection methods, such as flow cytometry, such as described in the examples herein.
Используемый в данном документе термин "балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM)" для клетки относится к баллу, который отражает степень, в которой клетка демонстрирует фенотип эффектoрной Т-клетки памяти (TEM) по сравнению с фенотипом T-клетки памяти, представляющей собой стволовую клетку (TSCM). Более высокий балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) указывает на увеличение выраженности фенотипа TEM, тогда как более низкий балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) указывает на увеличение выраженности фенотипа TSCM. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) определяют путем измерения экспрессии одного или нескольких генов, которые активируются в TEM-клетках и/или подавляются в TSCM-клетках, например, одного или нескольких генов, выбранных из группы, состоящей из MXRA7, CLIC1, NAT13, TBC1D2B, GLCCI1, DUSP10, APOBEC3D, CACNB3, ANXA2P2, TPRG1, EOMES, MATK, ARHGAP10, ADAM8, MAN1A1, SLFN12L, SH2D2A, EIF2C4, CD58, MYO1F, RAB27B, ERN1, NPC1, NBEAL2, APOBEC3G, SYTL2, SLC4A4, PIK3AP1, PTGDR, MAF, PLEKHA5, ADRB2, PLXND1, GNAO1, THBS1, PPP2R2B, CYTH3, KLRF1, FLJ16686, AUTS2, PTPRM, GNLY и GFPT2. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) определяют для каждой клетки с помощью секвенирования РНК, например, секвенирования РНК одиночных клеток (scRNA-seq), что, например, проиллюстрировано в примере 7 в отношении фиг. 25A. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) рассчитывают с использованием среднего логарифмически нормализованного значения экспрессии гена для всех генов в наборе генов.As used herein, the term "gene set score (upregulated in TEM relative to downregulated in TSCM)" for a cell refers to a score that reflects the degree to which the cell exhibits an effector memory T cell (TEM) phenotype compared to a stem cell memory T cell (TSCM) phenotype. A higher gene set score (upregulated in TEM relative to downregulated in TSCM) indicates an increase in the expression of the TEM phenotype, whereas a lower gene set score (upregulated in TEM relative to downregulated in TSCM) indicates an increase in the expression of the TSCM phenotype. In some embodiments, the gene set score (upregulated in TEMs versus downregulated in TSCMs) is determined by measuring the expression of one or more genes that are upregulated in TEM cells and/or downregulated in TSCM cells, such as one or more genes selected from the group consisting of MXRA7, CLIC1, NAT13, TBC1D2B, GLCCI1, DUSP10, APOBEC3D, CACNB3, ANXA2P2, TPRG1, EOMES, MATK, ARHGAP10, ADAM8, MAN1A1, SLFN12L, SH2D2A, EIF2C4, CD58, MYO1F, RAB27B, ERN1, NPC1, NBEAL2, APOBEC3G, SYTL2, SLC4A4, PIK3AP1, PTGDR, MAF, PLEKHA5, ADRB2, PLXND1, GNAO1, THBS1, PPP2R2B, CYTH3, KLRF1, FLJ16686, AUTS2, PTPRM, GNLY, and GFPT2. In some embodiments, the gene set score (upregulated in TEMs relative to downregulated in TSCM) is determined for each cell using RNA sequencing, such as single cell RNA sequencing (scRNA-seq), as illustrated, for example, in Example 7 with respect to Fig. 25A. In some embodiments, the gene set score (upregulated in TEMs relative to downregulated in TSCM) is calculated using the average log-normalized gene expression value for all genes in the gene set.
Используемый в данном документе термин "балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff)" для клетки относится к баллу, который отражает степень, в которой клетка демонстрирует фенотип регуляторной Т-клетки (Treg) по сравнению с фенотипом эффекторной Т-клетки (Teff). Более высокий балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) указывает на увеличение выраженности фенотипа Treg, тогда как более низкий балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) указывает на увеличение выраженности фенотипа Teff. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) определяют путем измерения экспрессии одного или нескольких генов, которые активируются в Treg-клетках и/или подавляются в Teff-клетках, например, одного или нескольких генов, выбранных из группы, состоящей из C12orf75, SELPLG, SWAP70, RGS1, PRR11, SPATS2L, SPATS2L, TSHR, C14orf145, CASP8, SYT11, ACTN4, ANXA5, GLRX, HLA-DMB, PMCH, RAB11FIP1, IL32, FAM160B1, SHMT2, FRMD4B, CCR3, TNFRSF13B, NTNG2, CLDND1, BARD1, FCER1G, TYMS, ATP1B1, GJB6, FGL2, TK1, SLC2A8, CDKN2A, SKAP2, GPR55, CDCA7, S100A4, GDPD5, PMAIP1, ACOT9, CEP55, SGMS1, ADPRH, AKAP2, HDAC9, IKZF4, CARD17, VAV3, OBFC2A, ITGB1, CIITA, SETD7, HLA-DMA, CCR10, KIAA0101, SLC14A1, PTTG3P, DUSP10, FAM164A, PYHIN1, MYO1F, SLC1A4, MYBL2, PTTG1, RRM2, TP53INP1, CCR5, ST8SIA6, TOX, BFSP2, ITPRIPL1, NCAPH, HLA-DPB2, SYT4, NINJ2, FAM46C, CCR4, GBP5, C15orf53, LMCD1, MKI67, NUSAP1, PDE4A, E2F2, CD58, ARHGEF12, LOC100188949, FAS, HLA-DPB1, SELP, WEE1, HLA-DPA1, FCRL1, ICA1, CNTNAP1, OAS1, METTL7A, CCR6, HLA-DRB4, ANXA2P3, STAM, HLA-DQB2, LGALS1, ANXA2, PI16, DUSP4, LAYN, ANXA2P2, PTPLA, ANXA2P1, ZNF365, LAIR2, LOC541471, RASGRP4, BCAS1, UTS2, MIAT, PRDM1, SEMA3G, FAM129A, HPGD, NCF4, LGALS3, CEACAM4, JAKMIP1, TIGIT, HLA-DRA, IKZF2, HLA-DRB1, FANK1, RTKN2, TRIB1, FCRL3 и FOXP3. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) определяют с помощью секвенирования РНК, например, секвенирования РНК одиночных клеток (scRNA-seq), что, например, проиллюстрировано в примере 7 в отношении фиг. 25B. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) рассчитывают с использованием среднего логарифмически нормализованного значения экспрессии гена для всех генов в наборе генов.As used herein, the term "gene set score (up-regulated in Tregs versus down-regulated in Teff)" for a cell refers to a score that reflects the degree to which the cell exhibits a regulatory T cell (Treg) phenotype compared to an effector T cell (Teff) phenotype. A higher gene set score (up-regulated in Tregs versus down-regulated in Teff) indicates an increase in the expression of the Treg phenotype, whereas a lower gene set score (up-regulated in Tregs versus down-regulated in Teff) indicates an increase in the expression of the Teff phenotype. In some embodiments, the gene set score (upregulated in Tregs versus downregulated in Teffs) is determined by measuring the expression of one or more genes that are upregulated in Tregs and/or downregulated in Teffs, such as one or more genes selected from the group consisting of C12orf75, SELPLG, SWAP70, RGS1, PRR11, SPATS2L, SPATS2L, TSHR, C14orf145, CASP8, SYT11, ACTN4, ANXA5, GLRX, HLA-DMB, PMCH, RAB11FIP1, IL32, FAM160B1, SHMT2, FRMD4B, CCR3, TNFRSF13B, NTNG2, CLDND1, BARD1, FCER1G, TYMS, ATP1B1, GJB6, FGL2, TK1, SLC2A8, CDKN2A, SKAP2, GPR55, CDCA7, S100A4, GDPD5, PMAIP1, ACOT9, CEP55, SGMS1, ADPRH, AKAP2, HDAC9, IKZF4, CARD17, VAV3, OBFC2A, ITGB1, CIITA, SETD7, HLA-DMA, CCR10, KIAA0101, SLC14A1, PTTG3P, DUSP10, FAM164A, PYHIN1, MYO1F, SLC1A4, MYBL2, PTTG1, RRM2, TP53INP1, CCR5, ST8SIA6, TOX, BFSP2, ITPRIPL1, NCAPH, HLA-DPB2, SYT4, NINJ2, FAM46C, CCR4, GBP5, C15orf53, LMCD1, MKI67, NUSAP1, PDE4A, E2F2, CD58, ARHGEF12, LOC100188949, FAS, HLA-DPB1, SELP, WEE1, HLA-DPA1, FCRL1, ICA1, CNTNAP1, OAS1, METTL7A, CCR6, HLA-DRB4, ANXA2P3, STAM, HLA-DQB2, LGALS1, ANXA2, PI16, DUSP4, LAYN, ANXA2P2, PTPLA, ANXA2P1, ZNF365, LAIR2, LOC541471, RASGRP4, BCAS1, UTS2, MIAT, PRDM1, SEMA3G, FAM129A, HPGD, NCF4, LGALS3, CEACAM4, JAKMIP1, TIGIT, HLA-DRA, IKZF2, HLA-DRB1, FANK1, RTKN2, TRIB1, FCRL3, and FOXP3. In some embodiments, the gene set score (upregulated in Tregs versus downregulated in Teff) is determined using RNA sequencing, such as single cell RNA sequencing (scRNA-seq), as illustrated, for example, in Example 7 with respect to Fig. 25B. In some embodiments, the gene set score (upregulated in Tregs versus downregulated in Teff) is calculated using the average log-normalized gene expression value for all genes in the gene set.
Используемый в данном документе термин "балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости)" для клетки относится к баллу, который отражает степень, в которой клетка демонстрирует фенотип стволовости. Более низкий балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) указывает на увеличение выраженности фенотипа стволовости. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) определяют путем измерения экспрессии одного или нескольких генов, которые активируются в дифференцирующейся стволовой клетке, относительно генов, которые подавляются в гемопоэтической стволовой клетке, например, одного или нескольких генов, выбранных из группы, состоящей из ACE, BATF, CDK6, CHD2, ERCC2, HOXB4, MEOX1, SFRP1, SP7, SRF, TAL1 и XRCC5. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) определяют с помощью секвенирования РНК, например, секвенирования РНК одиночных клеток (scRNA-seq), как, например, проиллюстрировано в примере 7 в отношении фиг. 25C. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) рассчитывают с использованием среднего логарифмически нормализованного значения экспрессии гена для всех генов в наборе генов.As used herein, the term "stemness down-regulated gene set score" for a cell refers to a score that reflects the extent to which the cell exhibits a stemness phenotype. A lower stemness down-regulated gene set score indicates an increase in the expression of the stemness phenotype. In some embodiments, the stemness down-regulated gene set score is determined by measuring the expression of one or more genes that are up-regulated in a differentiating stem cell relative to genes that are down-regulated in a hematopoietic stem cell, such as one or more genes selected from the group consisting of ACE, BATF, CDK6, CHD2, ERCC2, HOXB4, MEOX1, SFRP1, SP7, SRF, TAL1, and XRCC5. In some embodiments, the score of a gene set (repressed in stemness) is determined using RNA sequencing, such as single cell RNA sequencing (scRNA-seq), such as illustrated in Example 7 with respect to Fig. 25C. In some embodiments, the score of a gene set (repressed in stemness) is calculated using the average log-normalized gene expression value for all genes in the gene set.
Используемый в данном документе термин "балл набора генов (активируемые при гипоксии)" для клетки относится к баллу, который отражает степень, в которой клетка демонстрирует фенотип, характерный для гипоксии. Более высокий балл набора генов (активируемые при гипоксии) указывает на увеличение выраженности фенотипа, характерного для гипоксии. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые при гипоксии) определяют путем измерения экспрессии одного или нескольких генов, которые активируются в клетках, подвергающихся гипоксии, например, одного или нескольких генов, выбранных из группы, состоящей из ABCB1, ACAT1, ADM, ADORA2B, AK2, AK3, ALDH1A1, ALDH1A3, ALDOA, ALDOC, ANGPT2, ANGPTL4, ANXA1, ANXA2, ANXA5, ARHGAP5, ARSE, ART1, BACE2, BATF3, BCL2L1, BCL2L2, BHLHE40, BHLHE41, BIK, BIRC2, BNIP3, BNIP3L, BPI, BTG1, C11orf2, C7orf68, CA12, CA9, CALD1, CCNG2, CCT6A, CD99, CDK1, CDKN1A, CDKN1B, CITED2, CLK1, CNOT7, COL4A5, COL5A1, COL5A2, COL5A3, CP, CTSD, CXCR4, D4S234E, DDIT3, DDIT4, 1-Dec, DKC1, DR1, EDN1, EDN2, EFNA1, EGF, EGR1, EIF4A3, ELF3, ELL2, ENG, ENO1, ENO3, ENPEP, EPO, ERRFI1, ETS1, F3, FABP5, FGF3, FKBP4, FLT1, FN1, FOS, FTL, GAPDH, GBE1, GLRX, GPI, GPRC5A, HAP1, HBP1, HDAC1, HDAC9, HERC3, HERPUD1, HGF, HIF1A, HK1, HK2, HLA-DQB1, HMOX1, HMOX2, HSPA5, HSPD1, HSPH1, HYOU1, ICAM1, ID2, IFI27, IGF2, IGFBP1, IGFBP2, IGFBP3, IGFBP5, IL6, IL8, INSIG1, IRF6, ITGA5, JUN, KDR, KRT14, KRT18, KRT19, LDHA, LDHB, LEP, LGALS1, LONP1, LOX, LRP1, MAP4, MET, MIF, MMP13, MMP2, MMP7, MPI, MT1L, MTL3P, MUC1, MXI1, NDRG1, NFIL3, NFKB1, NFKB2, NOS1, NOS2, NOS2P1, NOS2P2, NOS3, NR3C1, NR4A1, NT5E, ODC1, P4HA1, P4HA2, PAICS, PDGFB, PDK3, PFKFB1, PFKFB3, PFKFB4, PFKL, PGAM1, PGF, PGK1, PGK2, PGM1, PIM1, PIM2, PKM2, PLAU, PLAUR, PLIN2, PLOD2, PNN, PNP, POLM, PPARA, PPAT, PROK1, PSMA3, PSMD9, PTGS1, PTGS2, QSOX1, RBPJ, RELA, RIOK3, RNASEL, RPL36A, RRP9, SAT1, SERPINB2, SERPINE1, SGSM2, SIAH2, SIN3A, SIRPA, SLC16A1, SLC16A2, SLC20A1, SLC2A1, SLC2A3, SLC3A2, SLC6A10P, SLC6A16, SLC6A6, SLC6A8, SORL1, SPP1, SRSF6, SSSCA1, STC2, STRA13, SYT7, TBPL1, TCEAL1, TEK, TF, TFF3, TFRC, TGFA, TGFB1, TGFB3, TGFBI, TGM2, TH, THBS1, THBS2, TIMM17A, TNFAIP3, TP53, TPBG, TPD52, TPI1, TXN, TXNIP, UMPS, VEGFA, VEGFB, VEGFC, VIM, VPS11 и XRCC6. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые при гипоксии) определяют с помощью секвенирования РНК, например, секвенирования РНК одиночных клеток (scRNA-seq), как, например, проиллюстрировано в примере 7 в отношении фиг. 25D. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые при гипоксии) рассчитывают с использованием среднего логарифмически нормализованного значения экспрессии гена для всех генов в наборе генов.As used in this document, the term "hypoxia-activated gene set score" for a cell refers to a score that reflects the degree to which the cell exhibits a hypoxia-specific phenotype. A higher hypoxia-activated gene set score indicates an increase in the expression of the hypoxia-specific phenotype. In some embodiments, the gene set score (upregulated in hypoxia) is determined by measuring the expression of one or more genes that are upregulated in cells exposed to hypoxia, such as one or more genes selected from the group consisting of ABCB1, ACAT1, ADM, ADORA2B, AK2, AK3, ALDH1A1, ALDH1A3, ALDOA, ALDOC, ANGPT2, ANGPTL4, ANXA1, ANXA2, ANXA5, ARHGAP5, ARSE, ART1, BACE2, BATF3, BCL2L1, BCL2L2, BHLHE40, BHLHE41, BIK, BIRC2, BNIP3, BNIP3L, BPI, BTG1, C11orf2, C7orf68, CA12, CA9, CALD1, CCNG2, CCT6A, CD99, CDK1, CDKN1A, CDKN1B, CITED2, CLK1, CNOT7, COL4A5, COL5A1, COL5A2, COL5A3, CP, CTSD, CXCR4, D4S234E, DDIT3, DDIT4, 1-Dec, DKC1, DR1, EDN1, EDN2, EFNA1, EGF, EGR1, EIF4A3, ELF3, ELL2, ENG, ENO1, ENO3, ENPEP, EPO, ERRFI1, ETS1, F3, FABP5, FGF3, FKBP4, FLT1, FN1, FOS, FTL, GAPDH, GBE1, GLRX, GPI, GPRC5A, HAP1, HBP1, HDAC1, HDAC9, HERC3, HERPUD1, HGF, HIF1A, HK1, HK2, HLA-DQB1, HMOX1, HMOX2, HSPA5, HSPD1, HSPH1, HYOU1, ICAM1, ID2, IFI27, IGF2, IGFBP1, IGFBP2, IGFBP3, IGFBP5, IL6, IL8, INSIG1, IRF6, ITGA5, JUN, KDR, KRT14, KRT18, KRT19, LDHA, LDHB, LEP, LGALS1, LONP1, LOX, LRP1, MAP4, MET, MIF, MMP13, MMP2, MMP7, MPI, MT1L, MTL3P, MUC1, MXI1, NDRG1, NFIL3, NFKB1, NFKB2, NOS1, NOS2, NOS2P1, NOS2P2, NOS3, NR3C1, NR4A1, NT5E, ODC1, P4HA1, P4HA2, PAICS, PDGFB, PDK3, PFKFB1, PFKFB3, PFKFB4, PFKL, PGAM1, PGF, PGK1, PGK2, PGM1, PIM1, PIM2, PKM2, PLAU, PLAUR, PLIN2, PLOD2, PNN, PNP, POLM, PPARA, PPAT, PROK1, PSMA3, PSMD9, PTGS1, PTGS2, QSOX1, RBPJ, RELA, RIOK3, RNASEL, RPL36A, RRP9, SAT1, SERPINB2, SERPINE1, SGSM2, SIAH2, SIN3A, SIRPA, SLC16A1, SLC16A2, SLC20A1, SLC2A1, SLC2A3, SLC3A2, SLC6A10P, SLC6A16, SLC6A6, SLC6A8, SORL1, SPP1, SRSF6, SSSCA1, STC2, STRA13, SYT7, TBPL1, TCEAL1, TEK, TF, TFF3, TFRC, TGFA, TGFB1, TGFB3, TGFBI, TGM2, TH, THBS1, THBS2, TIMM17A, TNFAIP3, TP53, TPBG, TPD52, TPI1, TXN, TXNIP, UMPS, VEGFA, VEGFB, VEGFC, VIM, VPS11 and XRCC6. In some embodiments, the gene set score (upregulated in hypoxia) is determined using RNA sequencing, such as single cell RNA sequencing (scRNA-seq), such as illustrated in Example 7 with respect to Fig. 25D. In some embodiments, the gene set score (upregulated in hypoxia) is calculated using the average log-normalized gene expression value for all genes in the gene set.
Используемый в данном документе термин "балл набора генов (активируемые при аутофагии)" для клетки относится к баллу, который отражает степень, в которой клетка демонстрирует фенотип, характерный для аутофагии. Более высокий балл набора генов (активируемые при аутофагии) указывает на увеличение выраженности фенотипа, характерного для аутофагии. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые при аутофагии) определяют путем измерения экспрессии одного или нескольких генов, которые активируются в клетках, подвергающихся аутофагии, например, одного или нескольких генов, выбранных из группы, состоящей из ABL1, ACBD5, ACIN1, ACTRT1, ADAMTS7, AKR1E2, ALKBH5, ALPK1, AMBRA1, ANXA5, ANXA7, ARSB, ASB2, ATG10, ATG12, ATG13, ATG14, ATG16L1, ATG16L2, ATG2A, ATG2B, ATG3, ATG4A, ATG4B, ATG4C, ATG4D, ATG5, ATG7, ATG9A, ATG9B, ATP13A2, ATP1B1, ATPAF1-AS1, ATPIF1, BECN1, BECN1P1, BLOC1S1, BMP2KL, BNIP1, BNIP3, BOC, C11orf2, C11orf41, C12orf44, C12orf5, C14orf133, C1orf210, C5, C6orf106, C7orf59, C7orf68, C8orf59, C9orf72, CA7, CALCB, CALCOCO2, CAPS, CCDC36, CD163L1, CD93, CDC37, CDKN2A, CHAF1B, CHMP2A, CHMP2B, CHMP3, CHMP4A, CHMP4B, CHMP4C, CHMP6, CHST3, CISD2, CLDN7, CLEC16A, CLN3, CLVS1, COX8A, CPA3, CRNKL1, CSPG5, CTSA, CTSB, CTSD, CXCR7, DAP, DKKL1, DNAAF2, DPF3, DRAM1, DRAM2, DYNLL1, DYNLL2, DZANK1, EI24, EIF2S1, EPG5, EPM2A, FABP1, FAM125A, FAM131B, FAM134B, FAM13B, FAM176A, FAM176B, FAM48A, FANCC, FANCF, FANCL, FBXO7, FCGR3B, FGF14, FGF7, FGFBP1, FIS1, FNBP1L, FOXO1, FUNDC1, FUNDC2, FXR2, GABARAP, GABARAPL1, GABARAPL2, GABARAPL3, GABRA5, GDF5, GMIP, HAP1, HAPLN1, HBXIP, HCAR1, HDAC6, HGS, HIST1H3A, HIST1H3B, HIST1H3C, HIST1H3D, HIST1H3E, HIST1H3F, HIST1H3G, HIST1H3H, HIST1H3I, HIST1H3J, HK2, HMGB1, HPR, HSF2BP, HSP90AA1, HSPA8, IFI16, IPPK, IRGM, IST1, ITGB4, ITPKC, KCNK3, KCNQ1, KIAA0226, KIAA1324, KRCC1, KRT15, KRT73, LAMP1, LAMP2, LAMTOR1, LAMTOR2, LAMTOR3, LARP1B, LENG9, LGALS8, LIX1, LIX1L, LMCD1, LRRK2, LRSAM1, LSM4, MAP1A, MAP1LC3A, MAP1LC3B, MAP1LC3B2, MAP1LC3C, MAP1S, MAP2K1, MAP3K12, MARK2, MBD5, MDH1, MEX3C, MFN1, MFN2, MLST8, MRPS10, MRPS2, MSTN, MTERFD1, MTMR14, MTMR3, MTOR, MTSS1, MYH11, MYLK, MYOM1, NBR1, NDUFB9, NEFM, NHLRC1, NME2, NPC1, NR2C2, NRBF2, NTHL1, NUP93, OBSCN, OPTN, P2RX5, PACS2, PARK2, PARK7, PDK1, PDK4, PEX13, PEX3, PFKP, PGK2, PHF23, PHYHIP, PI4K2A, PIK3C3, PIK3CA, PIK3CB, PIK3R4, PINK1, PLEKHM1, PLOD2, PNPO, PPARGC1A, PPY, PRKAA1, PRKAA2, PRKAB1, PRKAB2, PRKAG1, PRKAG2, PRKAG3, PRKD2, PRKG1, PSEN1, PTPN22, RAB12, RAB1A, RAB1B, RAB23, RAB24, RAB33B, RAB39, RAB7A, RB1CC1, RBM18, REEP2, REP15, RFWD3, RGS19, RHEB, RIMS3, RNF185, RNF41, RPS27A, RPTOR, RRAGA, RRAGB, RRAGC, RRAGD, S100A8, S100A9, SCN1A, SERPINB10, SESN2, SFRP4, SH3GLB1, SIRT2, SLC1A3, SLC1A4, SLC22A3, SLC25A19, SLC35B3, SLC35C1, SLC37A4, SLC6A1, SLCO1A2, SMURF1, SNAP29, SNAPIN, SNF8, SNRPB, SNRPB2, SNRPD1, SNRPF, SNTG1, SNX14, SPATA18, SQSTM1, SRPX, STAM, STAM2, STAT2, STBD1, STK11, STK32A, STOM, STX12, STX17, SUPT3H, TBC1D17, TBC1D25, TBC1D5, TCIRG1, TEAD4, TECPR1, TECPR2, TFEB, TM9SF1, TMBIM6, TMEM203, TMEM208, TMEM39A, TMEM39B, TMEM59, TMEM74, TMEM93, TNIK, TOLLIP, TOMM20, TOMM22, TOMM40, TOMM5, TOMM6, TOMM7, TOMM70A, TP53INP1, TP53INP2, TRAPPC8, TREM1, TRIM17, TRIM5, TSG101, TXLNA, UBA52, UBB, UBC, UBQLN1, UBQLN2, UBQLN4, ULK1, ULK2, ULK3, USP10, USP13, USP30, UVRAG, VAMP7, VAMP8, VDAC1, VMP1, VPS11, VPS16, VPS18, VPS25, VPS28, VPS33A, VPS33B, VPS36, VPS37A, VPS37B, VPS37C, VPS37D, VPS39, VPS41, VPS4A, VPS4B, VTA1, VTI1A, VTI1B, WDFY3, WDR45, WDR45L, WIPI1, WIPI2, XBP1, YIPF1, ZCCHC17, ZFYVE1, ZKSCAN3, ZNF189, ZNF593 и ZNF681. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые при аутофагии) определяют с помощью секвенирования РНК, например, секвенирования РНК одиночных клеток (scRNA-seq), как, например, проиллюстрировано в примере 7 в отношении фиг. 25E. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые при аутофагии) рассчитывают с использованием среднего логарифмически нормализованного значения экспрессии гена для всех генов в наборе генов.As used herein, the term "autophagy-activated gene set score" for a cell refers to a score that reflects the degree to which the cell exhibits an autophagy-promoting phenotype. A higher autophagy-promoting gene set score indicates an increase in the expression of the autophagy-promoting phenotype. In some embodiments, the gene set score (activated during autophagy) is determined by measuring the expression of one or more genes that are activated in cells undergoing autophagy, such as one or more genes selected from the group consisting of ABL1, ACBD5, ACIN1, ACTRT1, ADAMTS7, AKR1E2, ALKBH5, ALPK1, AMBRA1, ANXA5, ANXA7, ARSB, ASB2, ATG10, ATG12, ATG13, ATG14, ATG16L1, ATG16L2, ATG2A, ATG2B, ATG3, ATG4A, ATG4B, ATG4C, ATG4D, ATG5, ATG7, ATG9A, ATG9B, ATP13A2, ATP1B1, ATPAF1-AS1, ATPIF1, BECN1, BECN1P1, BLOC1S1, BMP2KL, BNIP1, BNIP3, BOC, C11orf2, C11orf41, C12orf44, C12orf5, C14orf133, C1orf210, C5, C6orf106, C7orf59, C7orf68, C8orf59, C9orf72, CA7, CALCB, CALCOCO2, CAPS, CCDC36, CD163L1, CD93, CDC37, CDKN2A, CHAF1B, CHMP2A, CHMP2B, CHMP3, CHMP4A, CHMP4B, CHMP4C, CHMP6, CHST3, CISD2, CLDN7, CLEC16A, CLN3, CLVS1, COX8A, CPA3, CRNKL1, CSPG5, CTSA, CTSB, CTSD, CXCR7, DAP, DKKL1, DNAAF2, DPF3, DRAM1, DRAM2, DYNLL1, DYNLL2, DZANK1, EI24, EIF2S1, EPG5, EPM2A, FABP1, FAM125A, FAM131B, FAM134B, FAM13B, FAM176A, FAM176B, FAM48A, FANCC, FANCF, FANCL, FBXO7, FCGR3B, FGF14, FGF7, FGFBP1, FIS1, FNBP1L, FOXO1, FUNDC1, FUNDC2, FXR2, GABARAP, GABARAPL1, GABARAPL2, GABARAPL3, GABRA5, GDF5, GMIP, HAP1, HAPLN1, HBXIP, HCAR1, HDAC6, HGS, HIST1H3A, HIST1H3B, HIST1H3C, HIST1H3D, HIST1H3E, HIST1H3F, HIST1H3G, HIST1H3H, HIST1H3I, HIST1H3J, HK2, HMGB1, HPR, HSF2BP, HSP90AA1, HSPA8, IFI16, IPPK, IRGM, IST1, ITGB4, ITPKC, KCNK3, KCNQ1, KIAA0226, KIAA1324, KRCC1, KRT15, KRT73, LAMP1, LAMP2, LAMTOR1, LAMTOR2, LAMTOR3, LARP1B, LENG9, LGALS8, LIX1, LIX1L, LMCD1, LRRK2, LRSAM1, LSM4, MAP1A, MAP1LC3A, MAP1LC3B, MAP1LC3B2, MAP1LC3C, MAP1S, MAP2K1, MAP3K12, MARK2, MBD5, MDH1, MEX3C, MFN1, MFN2, MLST8, MRPS10, MRPS2, MSTN, MTERFD1, MTMR14, MTMR3, MTOR, MTSS1, MYH11, MYLK, MYOM1, NBR1, NDUFB9, NEFM, NHLRC1, NME2, NPC1, NR2C2, NRBF2, NTHL1, NUP93, OBSCN, OPTN, P2RX5, PACS2, PARK2, PARK7, PDK1, PDK4, PEX13, PEX3, PFKP, PGK2, PHF23, PHYHIP, PI4K2A, PIK3C3, PIK3CA, PIK3CB, PIK3R4, PINK1, PLEKHM1, PLOD2, PNPO, PPARGC1A, PPY, PRKAA1, PRKAA2, PRKAB1, PRKAB2, PRKAG1, PRKAG2, PRKAG3, PRKD2, PRKG1, PSEN1, PTPN22, RAB12, RAB1A, RAB1B, RAB23, RAB24, RAB33B, RAB39, RAB7A, RB1CC1, RBM18, REEP2, REP15, RFWD3, RGS19, RHEB, RIMS3, RNF185, RNF41, RPS27A, RPTOR, RRAGA, RRAGB, RRAGC, RRAGD, S100A8, S100A9, SCN1A, SERPINB10, SESN2, SFRP4, SH3GLB1, SIRT2, SLC1A3, SLC1A4, SLC22A3, SLC25A19, SLC35B3, SLC35C1, SLC37A4, SLC6A1, SLCO1A2, SMURF1, SNAP29, SNAPIN, SNF8, SNRPB, SNRPB2, SNRPD1, SNRPF, SNTG1, SNX14, SPATA18, SQSTM1, SRPX, STAM, STAM2, STAT2, STBD1, STK11, STK32A, STOM, STX12, STX17, SUPT3H, TBC1D17, TBC1D25, TBC1D5, TCIRG1, TEAD4, TECPR1, TECPR2, TFEB, TM9SF1, TMBIM6, TMEM203, TMEM208, TMEM39A, TMEM39B, TMEM59, TMEM74, TMEM93, TNIK, TOLLIP, TOMM20, TOMM22, TOMM40, TOMM5, TOMM6, TOMM7, TOMM70A, TP53INP1, TP53INP2, TRAPPC8, TREM1, TRIM17, TRIM5, TSG101, TXLNA, UBA52, UBB, UBC, UBQLN1, UBQLN2, UBQLN4, ULK1, ULK2, ULK3, USP10, USP13, USP30, UVRAG, VAMP7, VAMP8, VDAC1, VMP1, VPS11, VPS16, VPS18, VPS25, VPS28, VPS33A, VPS33B, VPS36, VPS37A, VPS37B, VPS37C, VPS37D, VPS39, VPS41, VPS4A, VPS4B, VTA1, VTI1A, VTI1B, WDFY3, WDR45, WDR45L, WIPI1, WIPI2, XBP1, YIPF1, ZCCHC17, ZFYVE1, ZKSCAN3, ZNF189, ZNF593, and ZNF681. In some embodiments, the gene set score (activated during autophagy) is determined by RNA sequencing, such as single cell RNA sequencing (scRNA-seq), such as illustrated in Example 7 with respect to Fig. 25E. In some embodiments, the gene set score (activated by autophagy) is calculated using the average log-normalized gene expression value for all genes in the gene set.
Используемый в данном документе термин "балл набора генов (активируемые в покоящемся состоянии относительно подавляемых в активированном состоянии)" для клетки относится к баллу, который отражает степень, в которой клетка демонстрирует фенотип покоящейся Т-клетки по сравнению с фенотипом активированной Т-клетки. Более высокий балл набора генов (активируемые в покоящемся состоянии относительно подавляемых в активированном состоянии) указывает на увеличение выраженности фенотипа покоящихся Т-клеток, тогда как более низкий балл набора генов (активируемые в покоящемся состоянии относительно подавляемых в активированном состоянии) указывает на увеличение выраженности фенотипа активированных T-клеток. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в покоящемся состоянии относительно подавляемых в активированном состоянии) определяют путем измерения экспрессии одного или нескольких генов, которые активируются в покоящихся T-клетках и/или подавляются в активированных T-клетках, например, одного или нескольких генов, выбранных из группы, состоящей из ABCA7, ABCF3, ACAP2, AMT, ANKH, ATF7IP2, ATG14, ATP1A1, ATXN7, ATXN7L3B, BCL7A, BEX4, BSDC1, BTG1, BTG2, BTN3A1, C11orf21, C19orf22, C21orf2, CAMK2G, CARS2, CCNL2, CD248, CD5, CD55, CEP164, CHKB, CLK1, CLK4, CTSL1, DBP, DCUN1D2, DENND1C, DGKD, DLG1, DUSP1, EAPP, ECE1, ECHDC2, ERBB2IP, FAM117A, FAM134B, FAM134C, FAM169A, FAM190B, FAU, FLJ10038, FOXJ2, FOXJ3, FOXL1, FOXO1, FXYD5, FYB, HLA-E, HSPA1L, HYAL2, ICAM2, IFIT5, IFITM1, IKBKB, IQSEC1, IRS4, KIAA0664L3, KIAA0748, KLF3, KLF9, KRT18, LEF1, LINC00342, LIPA, LIPT1, LLGL2, LMBR1L, LPAR2, LTBP3, LYPD3, LZTFL1, MANBA, MAP2K6, MAP3K1, MARCH8, MAU2, MGEA5, MMP8, MPO, MSL1, MSL3, MYH3, MYLIP, NAGPA, NDST2, NISCH, NKTR, NLRP1, NOSIP, NPIP, NUMA1, PAIP2B, PAPD7, PBXIP1, PCIF1, PI4KA, PLCL2, PLEKHA1, PLEKHF2, PNISR, PPFIBP2, PRKCA, PRKCZ, PRKD3, PRMT2, PTP4A3, PXN, RASA2, RASA3, RASGRP2, RBM38, REPIN1, RNF38, RNF44, ROR1, RPL30, RPL32, RPLP1, RPS20, RPS24, RPS27, RPS6, RPS9, RXRA, RYK, SCAND2, SEMA4C, SETD1B, SETD6, SETX, SF3B1, SH2B1, SLC2A4RG, SLC35E2B, SLC46A3, SMAGP, SMARCE1, SMPD1, SNPH, SP140L, SPATA6, SPG7, SREK1IP1, SRSF5, STAT5B, SVIL, SYF2, SYNJ2BP, TAF1C, TBC1D4, TCF20, TECTA, TES, TMEM127, TMEM159, TMEM30B, TMEM66, TMEM8B, TP53TG1, TPCN1, TRIM22, TRIM44, TSC1, TSC22D1, TSC22D3, TSPYL2, TTC9, TTN, UBE2G2, USP33, USP34, VAMP1, VILL, VIPR1, VPS13C, ZBED5, ZBTB25, ZBTB40, ZC3H3, ZFP161, ZFP36L1, ZFP36L2, ZHX2, ZMYM5, ZNF136, ZNF148, ZNF318, ZNF350, ZNF512B, ZNF609, ZNF652, ZNF83, ZNF862 и ZNF91. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в покоящемся состоянии относительно подавляемых в активированном состоянии) определяют с помощью секвенирования РНК, например, секвенирования РНК одиночных клеток (scRNA-seq), как, например, проиллюстрировано в примере 7 в отношении фиг. 24D. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в покоящемся состоянии относительно подавляемых в активированном состоянии) рассчитывают с использованием среднего логарифмически нормализованного значения экспрессии гена для всех генов в наборе генов.As used herein, the term "gene set score (activated in the resting state relative to repressed in the activated state)" for a cell refers to a score that reflects the degree to which the cell exhibits a resting T cell phenotype compared to an activated T cell phenotype. A higher gene set score (activated in the resting state relative to repressed in the activated state) indicates an increase in the expression of the resting T cell phenotype, whereas a lower gene set score (activated in the resting state relative to repressed in the activated state) indicates an increase in the expression of the activated T cell phenotype. In some embodiments, the gene set score (upregulated in the resting state versus downregulated in the activated state) is determined by measuring the expression of one or more genes that are upregulated in resting T cells and/or downregulated in activated T cells, such as one or more genes selected from the group consisting of ABCA7, ABCF3, ACAP2, AMT, ANKH, ATF7IP2, ATG14, ATP1A1, ATXN7, ATXN7L3B, BCL7A, BEX4, BSDC1, BTG1, BTG2, BTN3A1, C11orf21, C19orf22, C21orf2, CAMK2G, CARS2, CCNL2, CD248, CD5, CD55, CEP164, CHKB, CLK1, CLK4, CTSL1, DBP, DCUN1D2, DENND1C, DGKD, DLG1, DUSP1, EAPP, ECE1, ECHDC2, ERBB2IP, FAM117A, FAM134B, FAM134C, FAM169A, FAM190B, FAU, FLJ10038, FOXJ2, FOXJ3, FOXL1, FOXO1, FXYD5, FYB, HLA-E, HSPA1L, HYAL2, ICAM2, IFIT5, IFITM1, IKBKB, IQSEC1, IRS4, KIAA0664L3, KIAA0748, KLF3, KLF9, KRT18, LEF1, LINC00342, LIPA, LIPT1, LLGL2, LMBR1L, LPAR2, LTBP3, LYPD3, LZTFL1, MANBA, MAP2K6, MAP3K1, MARCH8, MAU2, MGEA5, MMP8, MPO, MSL1, MSL3, MYH3, MYLIP, NAGPA, NDST2, NISCH, NKTR, NLRP1, NOSIP, NPIP, NUMA1, PAIP2B, PAPD7, PBXIP1, PCIF1, PI4KA, PLCL2, PLEKHA1, PLEKHF2, PNISR, PPFIBP2, PRKCA, PRKCZ, PRKD3, PRMT2, PTP4A3, PXN, RASA2, RASA3, RASGRP2, RBM38, REPIN1, RNF38, RNF44, ROR1, RPL30, RPL32, RPLP1, RPS20, RPS24, RPS27, RPS6, RPS9, RXRA, RYK, SCAND2, SEMA4C, SETD1B, SETD6, SETX, SF3B1, SH2B1, SLC2A4RG, SLC35E2B, SLC46A3, SMAGP, SMARCE1, SMPD1, SNPH, SP140L, SPATA6, SPG7, SREK1IP1, SRSF5, STAT5B, SVIL, SYF2, SYNJ2BP, TAF1C, TBC1D4, TCF20, TECTA, TES, TMEM127, TMEM159, TMEM30B, TMEM66, TMEM8B, TP53TG1, TPCN1, TRIM22, TRIM44, TSC1, TSC22D1, TSC22D3, TSPYL2, TTC9, TTN, UBE2G2, USP33, USP34, VAMP1, VILL, VIPR1, VPS13C, ZBED5, ZBTB25, ZBTB40, ZC3H3, ZFP161, ZFP36L1, ZFP36L2, ZHX2, ZMYM5, ZNF136, ZNF148, ZNF318, ZNF350, ZNF512B, ZNF609, ZNF652, ZNF83, ZNF862, and ZNF91. In some embodiments, the gene set score (upregulated in the quiescent state versus downregulated in the activated state) is determined by RNA sequencing, such as single cell RNA sequencing (scRNA-seq), such as illustrated in Example 7 with respect to Fig. 24D. In some embodiments, the gene set score (activated in the quiescent state relative to repressed in the activated state) is calculated using the average log-normalized gene expression value for all genes in the gene set.
Используемый в данном документе термин "балл набора генов (постепенно активируемые при дифференцировке в клетки памяти)" для клетки относится к баллу, который отражает стадию дифференцировки в клетки памяти. Более высокий балл набора генов (постепенно активируемые при дифференцировке в клетки памяти) указывает на увеличение выраженности фенотипа поздних Т-клеток памяти, тогда как более низкий балл набора генов (постепенно активируемые при дифференцировке в клетки памяти) указывает на увеличение выраженности фенотипа ранних Т-клеток памяти. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые при аутофагии) определяют путем измерения экспрессии одного или нескольких генов, которые активируются в ходе дифференцировки в клетки памяти, например, одного или нескольких генов, выбранных из группы, состоящей из MTCH2, RAB6C, KIAA0195, SETD2, C2orf24, NRD1, GNA13, COPA, SELT, TNIP1, CBFA2T2, LRP10, PRKCI, BRE, ANKS1A, PNPLA6, ARL6IP1, WDFY1, MAPK1, GPR153, SHKBP1, MAP1LC3B2, PIP4K2A, HCN3, GTPBP1, TLN1, C4orf34, KIF3B, TCIRG1, PPP3CA, ATG4D, TYMP, TRAF6, C17orf76, WIPF1, FAM108A1, MYL6, NRM, SPCS2, GGT3P, GALK1, CLIP4, ARL4C, YWHAQ, LPCAT4, ATG2A, IDS, TBC1D5, DMPK, ST6GALNAC6, REEP5, ABHD6, KIAA0247, EMB, TSEN54, SPIRE2, PIWIL4, ZSCAN22, ICAM1, CHD9, LPIN2, SETD8, ZC3H12A, ULBP3, IL15RA, HLA-DQB2, LCP1, CHP, RUNX3, TMEM43, REEP4, MEF2D, ABL1, TMEM39A, PCBP4, PLCD1, CHST12, RASGRP1, C1orf58, C11orf63, C6orf129, FHOD1, DKFZp434F142, PIK3CG, ITPR3, BTG3, C4orf50, CNNM3, IFI16, AK1, CDK2AP1, REL, BCL2L1, MVD, TTC39C, PLEKHA2, FKBP11, EML4, FANCA, CDCA4, FUCA2, MFSD10, TBCD, CAPN2, IQGAP1, CHST11, PIK3R1, MYO5A, KIR2DL3, DLG3, MXD4, RALGDS, S1PR5, WSB2, CCR3, TIPARP, SP140, CD151, SOX13, KRTAP5-2, NF1, PEA15, PARP8, RNF166, UEVLD, LIMK1, CACNB1, TMX4, SLC6A6, LBA1, SV2A, LLGL2, IRF1, PPP2R5C, CD99, RAPGEF1, PPP4R1, OSBPL7, FOXP4, SLA2, TBC1D2B, ST7, JAZF1, GGA2, PI4K2A, CD68, LPGAT1, STX11, ZAK, FAM160B1, RORA, C8orf80, APOBEC3F, TGFBI, DNAJC1, GPR114, LRP8, CD69, CMIP, NAT13, TGFB1, FLJ00049, ANTXR2, NR4A3, IL12RB1, NTNG2, RDX, MLLT4, GPRIN3, ADCY9, CD300A, SCD5, ABI3, PTPN22, LGALS1, SYTL3, BMPR1A, TBK1, PMAIP1, RASGEF1A, GCNT1, GABARAPL1, STOM, CALHM2, ABCA2, PPP1R16B, SYNE2, PAM, C12orf75, CLCF1, MXRA7, APOBEC3C, CLSTN3, ACOT9, HIP1, LAG3, TNFAIP3, DCBLD1, KLF6, CACNB3, RNF19A, RAB27A, FADS3, DLG5, APOBEC3D, TNFRSF1B, ACTN4, TBKBP1, ATXN1, ARAP2, ARHGEF12, FAM53B, MAN1A1, FAM38A, PLXNC1, GRLF1, SRGN, HLA-DRB5, B4GALT5, WIPI1, PTPRJ, SLFN11, DUSP2, ANXA5, AHNAK, NEO1, CLIC1, EIF2C4, MAP3K5, IL2RB, PLEKHG1, MYO6, GTDC1, EDARADD, GALM, TARP, ADAM8, MSC, HNRPLL, SYT11, ATP2B4, NHSL2, MATK, ARHGAP18, SLFN12L, SPATS2L, RAB27B, PIK3R3, TP53INP1, MBOAT1, GYG1, KATNAL1, FAM46C, ZC3HAV1L, ANXA2P2, CTNNA1, NPC1, C3AR1, CRIM1, SH2D2A, ERN1, YPEL1, TBX21, SLC1A4, FASLG, PHACTR2, GALNT3, ADRB2, PIK3AP1, TLR3, PLEKHA5, DUSP10, GNAO1, PTGDR, FRMD4B, ANXA2, EOMES, CADM1, MAF, TPRG1, NBEAL2, PPP2R2B, PELO, SLC4A4, KLRF1, FOSL2, RGS2, TGFBR3, PRF1, MYO1F, GAB3, C17orf66, MICAL2, CYTH3, TOX, HLA-DRA, SYNE1, WEE1, PYHIN1, F2R, PLD1, THBS1, CD58, FAS, NETO2, CXCR6, ST6GALNAC2, DUSP4, AUTS2, C1orf21, KLRG1, TNIP3, GZMA, PRR5L, PRDM1, ST8SIA6, PLXND1, PTPRM, GFPT2, MYBL1, SLAMF7, FLJ16686, GNLY, ZEB2, CST7, IL18RAP, CCL5, KLRD1 и KLRB1. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (постепенно активируемые при дифференцировке в клетки памяти) определяют с помощью секвенирования РНК, например, секвенирования РНК одиночных клеток (scRNA-seq), как, например, проиллюстрировано в примере 7 в отношении фиг. 26B. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (постепенно активируемые при дифференцировке в клетки памяти) рассчитывают с использованием среднего логарифмически нормализованного значения экспрессии гена для всех генов в наборе генов.As used in this document, the term "gene set (progressively upregulated upon differentiation into memory cells) score" for a cell refers to a score that reflects the stage of differentiation into memory cells. A higher gene set (progressively upregulated upon differentiation into memory cells) score indicates an increase in the expression of the late memory T cell phenotype, whereas a lower gene set (progressively upregulated upon differentiation into memory cells) score indicates an increase in the expression of the early memory T cell phenotype. In some embodiments, the gene set score (activated during autophagy) is determined by measuring the expression of one or more genes that are activated during differentiation into memory cells, such as one or more genes selected from the group consisting of MTCH2, RAB6C, KIAA0195, SETD2, C2orf24, NRD1, GNA13, COPA, SELT, TNIP1, CBFA2T2, LRP10, PRKCI, BRE, ANKS1A, PNPLA6, ARL6IP1, WDFY1, MAPK1, GPR153, SHKBP1, MAP1LC3B2, PIP4K2A, HCN3, GTPBP1, TLN1, C4orf34, KIF3B, TCIRG1, PPP3CA, ATG4D, TYMP, TRAF6, C17orf76, WIPF1, FAM108A1, MYL6, NRM, SPCS2, GGT3P, GALK1, CLIP4, ARL4C, YWHAQ, LPCAT4, ATG2A, IDS, TBC1D5, DMPK, ST6GALNAC6, REEP5, ABHD6, KIAA0247, EMB, TSEN54, SPIRE2, PIWIL4, ZSCAN22, ICAM1, CHD9, LPIN2, SETD8, ZC3H12A, ULBP3, IL15RA, HLA-DQB2, LCP1, CHP, RUNX3, TMEM43, REEP4, MEF2D, ABL1, TMEM39A, PCBP4, PLCD1, CHST12, RASGRP1, C1orf58, C11orf63, C6orf129, FHOD1, DKFZp434F142, PIK3CG, ITPR3, BTG3, C4orf50, CNNM3, IFI16, AK1, CDK2AP1, REL, BCL2L1, MVD, TTC39C, PLEKHA2, FKBP11, EML4, FANCA, CDCA4, FUCA2, MFSD10, TBCD, CAPN2, IQGAP1, CHST11, PIK3R1, MYO5A, KIR2DL3, DLG3, MXD4, RALGDS, S1PR5, WSB2, CCR3, TIPARP, SP140, CD151, SOX13, KRTAP5-2, NF1, PEA15, PARP8, RNF166, UEVLD, LIMK1, CACNB1, TMX4, SLC6A6, LBA1, SV2A, LLGL2, IRF1, PPP2R5C, CD99, RAPGEF1, PPP4R1, OSBPL7, FOXP4, SLA2, TBC1D2B, ST7, JAZF1, GGA2, PI4K2A, CD68, LPGAT1, STX11, ZAK, FAM160B1, RORA, C8orf80, APOBEC3F, TGFBI, DNAJC1, GPR114, LRP8, CD69, CMIP, NAT13, TGFB1, FLJ00049, ANTXR2, NR4A3, IL12RB1, NTNG2, RDX, MLLT4, GPRIN3, ADCY9, CD300A, SCD5, ABI3, PTPN22, LGALS1, SYTL3, BMPR1A, TBK1, PMAIP1, RASGEF1A, GCNT1, GABARAPL1, STOM, CALHM2, ABCA2, PPP1R16B, SYNE2, PAM, C12orf75, CLCF1, MXRA7, APOBEC3C, CLSTN3, ACOT9, HIP1, LAG3, TNFAIP3, DCBLD1, KLF6, CACNB3, RNF19A, RAB27A, FADS3, DLG5, APOBEC3D, TNFRSF1B, ACTN4, TBKBP1, ATXN1, ARAP2, ARHGEF12, FAM53B, MAN1A1, FAM38A, PLXNC1, GRLF1, SRGN, HLA-DRB5, B4GALT5, WIPI1, PTPRJ, SLFN11, DUSP2, ANXA5, AHNAK, NEO1, CLIC1, EIF2C4, MAP3K5, IL2RB, PLEKHG1, MYO6, GTDC1, EDARADD, GALM, TARP, ADAM8, MSC, HNRPLL, SYT11, ATP2B4, NHSL2, MATK, ARHGAP18, SLFN12L, SPATS2L, RAB27B, PIK3R3, TP53INP1, MBOAT1, GYG1, KATNAL1, FAM46C, ZC3HAV1L, ANXA2P2, CTNNA1, NPC1, C3AR1, CRIM1, SH2D2A, ERN1, YPEL1, TBX21, SLC1A4, FASLG, PHACTR2, GALNT3, ADRB2, PIK3AP1, TLR3, PLEKHA5, DUSP10, GNAO1, PTGDR, FRMD4B, ANXA2, EOMES, CADM1, MAF, TPRG1, NBEAL2, PPP2R2B, PELO, SLC4A4, KLRF1, FOSL2, RGS2, TGFBR3, PRF1, MYO1F, GAB3, C17orf66, MICAL2, CYTH3, TOX, HLA-DRA, SYNE1, WEE1, PYHIN1, F2R, PLD1, THBS1, CD58, FAS, NETO2, CXCR6, ST6GALNAC2, DUSP4, AUTS2, C1orf21, KLRG1, TNIP3, GZMA, PRR5L, PRDM1, ST8SIA6, PLXND1, PTPRM, GFPT2, MYBL1, SLAMF7, FLJ16686, GNLY, ZEB2, CST7, IL18RAP, CCL5, KLRD1, and KLRB1. In some embodiments, the gene set score (gradually upregulated upon differentiation into memory cells) is determined using RNA sequencing, such as single cell RNA sequencing (scRNA-seq), as illustrated, for example, in Example 7 with respect to Fig. 26B. In some embodiments, the gene set score (gradually upregulated upon differentiation into memory cells) is calculated using the average log-normalized gene expression value for all genes in the gene set.
Используемый в данном документе термин "балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TN)" для клетки относится к баллу, который отражает степень, в которой клетка демонстрирует фенотип эффекторной Т-клетки памяти (TEM) по сравнению с фенотипом необученной Т-клетки (TN). Более высокий балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TN) указывает на увеличение выраженности фенотипа TEM, тогда как более низкий балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TN) указывает на увеличение выраженности фенотипа TN. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TN) определяют путем измерения экспрессии одного или нескольких генов, которые активируются в TEM-клетках и/или подавляются в TN-клетках, например, одного или нескольких генов, выбранных из группы, состоящей из MYO5A, MXD4, STK3, S1PR5, GLCCI1, CCR3, SOX13, KRTAP5-2, PEA15, PARP8, RNF166, UEVLD, LIMK1, SLC6A6, SV2A, KPNA2, OSBPL7, ST7, GGA2, PI4K2A, CD68, ZAK, RORA, TGFBI, DNAJC1, JOSD1, ZFYVE28, LRP8, OSBPL3, CMIP, NAT13, TGFB1, ANTXR2, NR4A3, RDX, ADCY9, CHN1, CD300A, SCD5, PTPN22, LGALS1, RASGEF1A, GCNT1, GLUL, ABCA2, CLDND1, PAM, CLCF1, MXRA7, CLSTN3, ACOT9, METRNL, BMPR1A, LRIG1, APOBEC3G, CACNB3, RNF19A, RAB27A, FADS3, ACTN4, TBKBP1, FAM53B, MAN1A1, FAM38A, GRLF1, B4GALT5, WIPI1, DUSP2, ANXA5, AHNAK, CLIC1, MAP3K5, ST8SIA1, TARP, ADAM8, MATK, SLFN12L, PIK3R3, FAM46C, ANXA2P2, CTNNA1, NPC1, SH2D2A, ERN1, YPEL1, TBX21, STOM, PHACTR2, GBP5, ADRB2, PIK3AP1, DUSP10, PTGDR, EOMES, MAF, TPRG1, NBEAL2, NCAPH, SLC4A4, FOSL2, RGS2, TGFBR3, MYO1F, C17orf66, CYTH3, WEE1, PYHIN1, F2R, THBS1, CD58, AUTS2, FAM129A, TNIP3, GZMA, PRR5L, PRDM1, PLXND1, PTPRM, GFPT2, MYBL1, SLAMF7, ZEB2, CST7, CCL5, GZMK и KLRB1. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TN) определяют с помощью секвенирования РНК, например, секвенирования РНК одиночных клеток (scRNA-seq), как, например, проиллюстрировано в примере 7 в отношении фиг. 26C. В некоторых вариантах осуществления балл набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TN) рассчитывают с использованием среднего логарифмически нормализованного значения экспрессии гена для всех генов в наборе генов.As used herein, the term "gene set score (upregulated in TEM relative to downregulated in TN)" for a cell refers to a score that reflects the degree to which the cell exhibits an effector memory T cell (TEM) phenotype compared to a naive T cell (TN) phenotype. A higher gene set score (upregulated in TEM relative to downregulated in TN) indicates an increase in the expression of the TEM phenotype, whereas a lower gene set score (upregulated in TEM relative to downregulated in TN) indicates an increase in the expression of the TN phenotype. In some embodiments, the gene set score (upregulated in TEMs versus downregulated in TNs) is determined by measuring the expression of one or more genes that are upregulated in TEM cells and/or downregulated in TN cells, such as one or more genes selected from the group consisting of MYO5A, MXD4, STK3, S1PR5, GLCCI1, CCR3, SOX13, KRTAP5-2, PEA15, PARP8, RNF166, UEVLD, LIMK1, SLC6A6, SV2A, KPNA2, OSBPL7, ST7, GGA2, PI4K2A, CD68, ZAK, RORA, TGFBI, DNAJC1, JOSD1, ZFYVE28, LRP8, OSBPL3, CMIP, NAT13, TGFB1, ANTXR2, NR4A3, RDX, ADCY9, CHN1, CD300A, SCD5, PTPN22, LGALS1, RASGEF1A, GCNT1, GLUL, ABCA2, CLDND1, PAM, CLCF1, MXRA7, CLSTN3, ACOT9, METRNL, BMPR1A, LRIG1, APOBEC3G, CACNB3, RNF19A, RAB27A, FADS3, ACTN4, TBKBP1, FAM53B, MAN1A1, FAM38A, GRLF1, B4GALT5, WIPI1, DUSP2, ANXA5, AHNAK, CLIC1, MAP3K5, ST8SIA1, TARP, ADAM8, MATK, SLFN12L, PIK3R3, FAM46C, ANXA2P2, CTNNA1, NPC1, SH2D2A, ERN1, YPEL1, TBX21, STOM, PHACTR2, GBP5, ADRB2, PIK3AP1, DUSP10, PTGDR, EOMES, MAF, TPRG1, NBEAL2, NCAPH, SLC4A4, FOSL2, RGS2, TGFBR3, MYO1F, C17orf66, CYTH3, WEE1, PYHIN1, F2R, THBS1, CD58, AUTS2, FAM129A, TNIP3, GZMA, PRR5L, PRDM1, PLXND1, PTPRM, GFPT2, MYBL1, SLAMF7, ZEB2, CST7, CCL5, GZMK and KLRB1. In some embodiments, the gene set score (upregulated in TEMs relative to downregulated in TNs) is determined using RNA sequencing, such as single cell RNA sequencing (scRNA-seq), such as illustrated in Example 7 with respect to Fig. 26C. In some embodiments, the gene set score (upregulated in TEMs relative to downregulated in TNs) is calculated using the average log-normalized gene expression value for all genes in the gene set.
Применительно к значениям балла набора генов (например, медианным значениям балла набора генов), если положительный балл набора генов уменьшить на 100%, получим значение 0. Если отрицательный балл набора генов увеличить на 100%, получим значение 0. Например, на фиг. 25A медианный балл набора генов для образца в день 1 составляет -0,084; медианный балл набора генов для образца в день 9 составляет 0,035; и медианный балл набора генов для исходного образца составляет -0,1. На фиг. 25A увеличение медианного балла набора генов для исходного образца на 100% приводит к получению значения балла набора генов, составляющего 0; и увеличение медианного балла набора генов для исходного образца на 200% приводит к получению значения балла набора генов, составляющего 0,1. На фиг. 25A уменьшение медианного балла набора генов для образца в день 9 на 100% приводит к получению значения балла набора генов, составляющего 0; и уменьшение медианного балла набора генов для образца в день 9 на 200% приводит к получению значения балла набора генов, составляющего -0,035.For gene set score values (e.g., median gene set score values), if the positive gene set score is decreased by 100%, the result is 0. If the negative gene set score is increased by 100%, the result is 0. For example, in Fig. 25A, the median gene set score for the sample on
Используемый в данном документе термин "гранула" относится к дискретной частице с твердой поверхностью, размер которой находится в пределах от примерно 0,1 мкм до нескольких миллиметров в диаметре. Гранулы могут быть сферическими (например, микросферы) или иметь неправильную форму. Гранулы могут содержать разнообразные материалы, включающие без ограничения парамагнитные материалы, керамику, пластик, стекло, полистирол, метилстирол, акриловые полимеры, титан, латекс, Sepharose™, целлюлозу, нейлон и т. п. В некоторых вариантах осуществления гранулы представляют собой относительно однородные сферические суперпарамагнитные полистирольные гранулы диаметром приблизительно 4,5 мкм, например, покрытые смесью антител к CD3 (например, CD3-эпсилон) и CD28, например, ковалентно связанные с ней. В некоторых вариантах осуществления гранулы представляют собой Dynabeads®. В некоторых вариантах осуществления как антитела к CD3, так и антитела к CD28, связаны с одной и той же гранулой, имитируя стимуляцию T-клетки антигенпрезентирующими клетками. Свойство Dynabeads® и применение Dynabeads® для выделения и размножения клеток хорошо известны из уровня техники, например, см., Neurauter et al., Cell isolation and expansion using Dynabeads, Adv Biochem Eng Biotechnol. 2007;106:41-73, включенную в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.As used herein, the term "bead" refers to a discrete particle with a solid surface that ranges in size from about 0.1 μm to several millimeters in diameter. The beads may be spherical (e.g., microspheres) or irregularly shaped. The beads may comprise a variety of materials, including, but not limited to, paramagnetic materials, ceramics, plastic, glass, polystyrene, methylstyrene, acrylic polymers, titanium, latex, Sepharose™, cellulose, nylon, and the like. In some embodiments, the beads are relatively uniform spherical superparamagnetic polystyrene beads of approximately 4.5 μm in diameter, e.g., coated with a mixture of antibodies to CD3 (e.g., CD3 epsilon) and CD28, e.g., covalently linked thereto. In some embodiments, the beads are Dynabeads®. In some embodiments, both the anti-CD3 antibody and the anti-CD28 antibody are bound to the same bead, mimicking T cell stimulation by antigen-presenting cells. The property of Dynabeads® and the use of Dynabeads® for isolating and expanding cells are well known in the art, e.g., see, Neurauter et al., Cell isolation and expansion using Dynabeads , Adv Biochem Eng Biotechnol. 2007;106:41-73, incorporated herein by reference in its entirety.
Используемый в данном документе термин "наноматрица" относится к наноструктуре, содержащей матрицу из подвижных полимерных цепей. Размер наноматрицы составляет от 1 до 500 нм, например, от 10 до 200 нм. В некоторых вариантах осуществления матрица из подвижных полимерных цепей присоединена к одному или нескольким агонистам, которые передают сигналы активации к T-клеткам, например, агонистам, представляющим собой антитела к CD3 и/или антитела к CD28. В некоторых вариантах осуществления наноматрица предусматривает коллоидную полимерную наноматрицу, присоединенную, например, ковалентно присоединенную, к агонисту одной или нескольких стимулирующих молекул и/или агонисту одной или нескольких костимулирующих молекул. В некоторых вариантах осуществления агонист одной или нескольких стимулирующих молекул представляет собой агонист CD3 (например, агонистическое антитело к CD3). В некоторых вариантах осуществления агонист одной или нескольких костимулирующих молекул представляет собой агонист CD28 (например, агонистическое антитело к CD28). В некоторых вариантах осуществления наноматрица характеризуется отсутствием твердой поверхности, например, в качестве точки присоединения агонистов, таких как антитела к CD3 и/или антитела к CD28. В некоторых вариантах осуществления наноматрица представляет собой наноматрицу, раскрытую в WO2014/048920A1 или предоставляемую в наборе MACS® GMP TransAct™ для T-клеток от Miltenyi Biotec GmbH, включенных в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. MACS® GMP TransAct™ для T-клеток состоит из коллоидной полимерной наноматрицы, ковалентно присоединенной к гуманизированным рекомбинантным агонистическим антителам к CD3 и CD28 человека.As used herein, the term "nanomatrix" refers to a nanostructure comprising an array of flexible polymer chains. The nanomatrix has a size of 1 to 500 nm, such as 10 to 200 nm. In some embodiments, the array of flexible polymer chains is attached to one or more agonists that transmit activation signals to T cells, such as agonists that are anti-CD3 antibodies and/or anti-CD28 antibodies. In some embodiments, the nanomatrix comprises a colloidal polymer nanomatrix attached, such as covalently attached, to an agonist of one or more stimulatory molecules and/or an agonist of one or more costimulatory molecules. In some embodiments, the agonist of the one or more stimulatory molecules is a CD3 agonist (e.g., an agonist antibody to CD3). In some embodiments, the agonist of one or more costimulatory molecules is a CD28 agonist (e.g., an anti-CD28 agonist antibody). In some embodiments, the nanomatrix is characterized by the absence of a solid surface, such as a point of attachment for agonists such as anti-CD3 antibodies and/or anti-CD28 antibodies. In some embodiments, the nanomatrix is the nanomatrix disclosed in WO2014/048920A1 or provided in the MACS® GMP TransAct™ T-Cell Kit from Miltenyi Biotec GmbH, incorporated herein by reference in their entirety. The MACS® GMP TransAct™ T-Cell Kit consists of a colloidal polymeric nanomatrix covalently attached to humanized recombinant anti-human CD3 and anti-human CD28 agonist antibodies.
Ниже более подробно описаны различные варианты осуществления композиций и способов, представленных в данном документе. Дополнительные определения изложены по всему тексту настоящего описания.Various embodiments of the compositions and methods presented herein are described in more detail below. Additional definitions are set forth throughout the text of this description.
ОписаниеDescription
В данном документе предусмотрены композиции и способы применения для лечения заболевания, такого как рак, с помощью клеток, экспрессирующих один или несколько химерных антигенных рецепторов (CAR). В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрена клетка (например, иммунная эффекторная клетка, например, T-клетка или NK-клетка), сконструированная таким образом, что она экспрессирует один или несколько CAR, где CAR-T-клетка ("CAR-T") или CAR-NK-клетка демонстрирует противоопухолевое свойство.Provided herein are compositions and methods for use in treating a disease, such as cancer, using cells expressing one or more chimeric antigen receptors (CARs). In some embodiments, the present invention provides a cell (e.g., an immune effector cell, such as a T cell or NK cell) engineered to express one or more CARs, wherein the CAR-T cell ("CAR-T") or CAR-NK cell exhibits an anti-tumor property.
В некоторых вариантах осуществления клетка экспрессирует по меньшей мере два CAR. В некоторых вариантах осуществления клетка экспрессирует первый CAR, который связывается с первым антигеном, и второй CAR, который связывается со вторым антигеном. В некоторых вариантах осуществления первый антиген и второй антиген являются разными. В некоторых вариантах осуществления первый антиген представляет собой BCMA. В некоторых вариантах осуществления первый CAR представляет собой CAR для BCMA, содержащий последовательность CDR, VH, VL, scFv или CAR, раскрытую в данном документе, например, последовательность, раскрытую в таблицах 3-15, 19, 20, 22 и 26, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней, например, CAR для BCMA, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления второй антиген представляет собой CD19. В некоторых вариантах осуществления второй антиген представляет собой CAR для CD19, содержащий последовательность CDR, VH, VL, scFv или CAR, раскрытую в данном документе, например, последовательность, раскрытую в таблицах 2, 19 и 22, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней, например, CAR для CD19, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления первый CAR и второй CAR экспрессируются последовательностями нуклеиновой кислоты, расположенными в одной молекуле нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая первый CAR, и последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая второй CAR, разделены последовательностью нуклеиновой кислоты, кодирующей сайт саморасщепления, например, сайт P2A, сайт Т2A, сайт Е2A или сайт F2A. В некоторых вариантах осуществления клетка представляет собой клетку, экспрессирующую двойные CAR, раскрытые в данном документе. В некоторых вариантах осуществления первый CAR и второй CAR экспрессируются последовательностями нуклеиновой кислоты, расположенными в отдельных молекулах нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления клетка сконструирована с использованием системы котрансдукции, раскрытой в данном документе.In some embodiments, the cell expresses at least two CARs. In some embodiments, the cell expresses a first CAR that binds a first antigen and a second CAR that binds a second antigen. In some embodiments, the first antigen and the second antigen are different. In some embodiments, the first antigen is BCMA. In some embodiments, the first CAR is a CAR for BCMA that comprises a CDR, VH, VL, scFv, or CAR sequence disclosed herein, such as a sequence disclosed in Tables 3-15, 19, 20, 22, and 26, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto, such as a CAR for BCMA disclosed herein. In some embodiments, the second antigen is CD19. In some embodiments, the second antigen is a CD19 CAR comprising a CDR, VH, VL, scFv, or CAR sequence disclosed herein, such as a sequence disclosed in Tables 2, 19, and 22, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto, such as a CD19 CAR disclosed herein. In some embodiments, the first CAR and the second CAR are expressed by nucleic acid sequences located on a single nucleic acid molecule. In some embodiments, the nucleic acid sequence encoding the first CAR and the nucleic acid sequence encoding the second CAR are separated by a nucleic acid sequence encoding a self-cleavage site, such as a P2A site, a T2A site, an E2A site, or an F2A site. In some embodiments, the cell is a cell expressing dual CARs disclosed herein. In some embodiments, the first CAR and the second CAR are expressed by nucleic acid sequences located on separate nucleic acid molecules. In some embodiments, the cell is engineered using the cotransduction system disclosed herein.
В некоторых вариантах осуществления клетка экспрессирует CAR, который связывается с первым антигеном и вторым антигеном. В некоторых вариантах осуществления CAR представляет собой CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит связывающий домен, который содержит первую VH (VH1), первую VL (VL1), вторую VH (VH2) и вторую VL (VL2). В некоторых вариантах осуществления VH1 и VL1 связываются с первым антигеном, а VH2 и VL2 связываются со вторым антигеном. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 и VL2 расположены в следующей конфигурации от N-конца до C-конца: VH1 - необязательно линкер 1 ("L1") - VH2 - необязательно линкер 2 ("L2") - VL2 - необязательно линкер 3 ("L3") - VL1, VH1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VL1, VL1 - необязательно L1 - VH2 - необязательно L2 - VL2 - необязательно L3 - VH1, VL1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VH1, VH2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VL2, VH2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VL2, VL2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VH2 или VL2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VH2.In some embodiments, the cell expresses a CAR that binds to a first antigen and a second antigen. In some embodiments, the CAR is a diabody format CAR disclosed herein. In some embodiments, the CAR comprises a binding domain that comprises a first VH (VH1), a first VL (VL1), a second VH (VH2), and a second VL (VL2). In some embodiments, VH1 and VL1 bind to the first antigen, and VH2 and VL2 bind to the second antigen. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, and VL2 are arranged in the following configuration from N-terminus to C-terminus: VH1 - optionally Linker 1 ("L1") - VH2 - optionally Linker 2 ("L2") - VL2 - optionally Linker 3 ("L3") - VL1, VH1 - optionally L1 - VL2 - optionally L2 - VH2 - optionally L3 - VL1, VL1 - optionally L1 - VH2 - optionally L2 - VL2 - optionally L3 - VH1, VL1 - optionally L1 - VL2 - optionally L2 - VH2 - optionally L3 - VH1, VH2 - optionally L1 - VH1 - optionally L2 - VL1 - optionally L3 - VL2, VH2 - optionally L1 - VL1 - optionally L2 - VH1 - optionally L3 - VL2, VL2 - optional L1 - VH1 - optional L2 - VL1 - optional L3 - VH2 or VL2 - optional L1 - VL1 - optional L2 - VH1 - optional L3 - VH2.
В некоторых вариантах осуществления в CAR по настоящему изобретению антигенсвязывающий домен объединен с внутриклеточной сигнальной молекулой. Например, в некоторых вариантах осуществления внутриклеточная сигнальная молекула содержит без ограничения дзета-цепь CD3, сигнальные модули 4-1BB и CD28 и их комбинации.In some embodiments, in a CAR of the present invention, the antigen-binding domain is combined with an intracellular signaling molecule. For example, in some embodiments, the intracellular signaling molecule comprises, but is not limited to, the CD3 zeta chain, the 4-1BB and CD28 signaling modules, and combinations thereof.
Кроме того, в настоящем изобретении предусмотрены композиции на основе CAR и их применение в лекарственных препаратах или способах лечения, среди прочих заболеваний, рака, или любого злокачественного новообразования, или аутоиммунных заболеваний.In addition, the present invention provides CAR-based compositions and their use in medicaments or methods for treating, among other diseases, cancer or any malignant neoplasm, or autoimmune diseases.
Химерный антигенный рецептор (CAR)Chimeric antigen receptor (CAR)
В настоящем изобретении предусмотрены иммунные эффекторные клетки (например, T-клетки, NK-клетки), сконструированные таким образом, что они содержат один или несколько CAR, которые направляют иммунные эффекторные клетки на раковое образование. Это достигается с помощью антигенсвязывающего домена в CAR, который является специфичным в отношении антигена, ассоциированного с раком. Существует два класса антигенов, ассоциированных с раком (опухолевых антигенов), на которые могут нацеливаться CAR, описанные в данном документе: (1) антигены, ассоциированные с раком, которые экспрессируются на поверхности раковых клеток; и (2) антигены, ассоциированные с раком, которые сами по себе являются внутриклеточными, однако фрагменты (пептиды) такого антигена презентируются на поверхности раковых клеток с помощью MHC (главного комплекса гистосовместимости).The present invention provides immune effector cells (e.g., T cells, NK cells) engineered to contain one or more CARs that direct the immune effector cells to a cancer. This is achieved by an antigen-binding domain in the CAR that is specific for a cancer-associated antigen. There are two classes of cancer-associated antigens (tumor antigens) that can be targeted by the CARs described herein: (1) cancer-associated antigens that are expressed on the surface of cancer cells; and (2) cancer-associated antigens that are intracellular in themselves, but fragments (peptides) of such an antigen are presented on the surface of cancer cells by the MHC (major histocompatibility complex).
Соответственно, иммунная эффекторная клетка, например, полученная посредством способа, описанного в данном документе, может быть сконструирована таким образом, чтобы она содержала CAR, нацеливающийся на один из следующих антигенов, ассоциированных с раком (опухолевых антигенов): CD19, CD123, CD22, CD30, CD171, CS-1, CLL-1, CD33, EGFRvIII, GD2, GD3, BCMA, Ag Tn, PSMA, ROR1, FLT3, FAP, TAG72, CD38, CD44v6, CEA, EPCAM, B7H3, KIT, IL-13Ra2, мезотелин, IL-11Ra, PSCA, VEGFR2, антиген Y системы Льюис, CD24, PDGFR-бета, PRSS21, SSEA-4, CD20, рецептор фолиевой кислоты альфа, ERBB2 (Her2/neu), MUC1, EGFR, NCAM, простазу, PAP, ELF2M, эфрин B2, рецептор IGF-I, CAIX, LMP2, gp100, bcr-abl, тирозиназу, EphA2, фукозил-GM1, sLe, GM3, TGS5, HMWMAA, o-ацетил-GD2, рецептор фолиевой кислоты бета, TEM1/CD248, TEM7R, CLDN6, TSHR, GPRC5D, CXORF61, CD97, CD179a, ALK, полисиаловую кислоту, PLAC1, GloboH, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, GPR20, LY6K, OR51E2, TARP, WT1, NY-ESO-1, LAGE-1a, легумаин, E6 и E7 HPV, MAGE-A1, MAGE A1, ETV6-AML, белок спермы 17, XAGE1, Tie 2, MAD-CT-1, MAD-CT-2, Fos-родственный антиген 1, p53, мутантный p53, простеин, сурвивин и теломеразу, PCTA-1/галектин 8, MelanA/MART1, мутантный Ras, hTERT, антигены саркомы с точечными разрывами при транслокации, ML-IAP, ERG (продукт слитого гена TMPRSS2-ETS), NA17, PAX3, андрогеновый рецептор, циклин B1, MYCN, RhoC, TRP-2, CYP1B1, BORIS, SART3, PAX5, OY-TES1, LCK, AKAP-4, SSX2, RAGE-1, обратную транскриптазу теломеразы человека, RU1, RU2, кишечную карбоксилэстеразу и мутантный вариант hsp70-2.Accordingly, an immune effector cell, such as one obtained by the method described herein, can be engineered to comprise a CAR that targets one of the following cancer-associated antigens (tumor antigens): CD19, CD123, CD22, CD30, CD171, CS-1, CLL-1, CD33, EGFRvIII, GD2, GD3, BCMA, Ag Tn, PSMA, ROR1, FLT3, FAP, TAG72, CD38, CD44v6, CEA, EPCAM, B7H3, KIT, IL-13Ra2, mesothelin, IL-11Ra, PSCA, VEGFR2, Lewis antigen Y, CD24, PDGFR-beta, PRSS21, SSEA-4, CD20, folate receptor alpha, ERBB2 (Her2/neu), MUC1, EGFR, NCAM, prostasis, PAP, ELF2M, ephrin B2, IGF-I receptor, CAIX, LMP2, gp100, bcr-abl, tyrosinase, EphA2, fucosyl-GM1, sLe, GM3, TGS5, HMWMAA, o-acetyl-GD2, folate receptor beta, TEM1/CD248, TEM7R, CLDN6, TSHR, GPRC5D, CXORF61, CD97, CD179a, ALK, polysialic acid, PLAC1, GloboH, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, GPR20, LY6K, OR51E2, TARP, WT1, NY-ESO-1, LAGE-1a, legumain, HPV E6 and E7, MAGE-A1, MAGE A1, ETV6-AML, sperm protein 17, XAGE1, Tie 2, MAD-CT-1, MAD-CT-2, Fos-related antigen 1, p53, mutant p53, prostein, survivin and telomerase, PCTA-1/galectin 8, MelanA/MART1, mutant Ras, hTERT, sarcoma breakpoint translocation antigens, ML-IAP, ERG (TMPRSS2-ETS fusion product), NA17, PAX3, androgen receptor, cyclin B1, MYCN, RhoC, TRP-2, CYP1B1, BORIS, SART3, PAX5, OY-TES1, LCK, AKAP-4, SSX2, RAGE-1, reverse transcriptase inhibitor human telomerase transcriptase, RU1, RU2, intestinal carboxylesterase and a mutant version of hsp70-2.
Последовательности из неограничивающих примеров различных компонентов, которые могут быть частью молекулы CAR, описанной в данном документе, перечислены в таблице 1, где "а. к." обозначает аминокислоты, а "н. к." обозначает нуклеиновые кислоты, которые кодируют соответствующий пептид.Sequences of non-limiting examples of various components that may be part of a CAR molecule described herein are listed in Table 1 , where "a. a." refers to amino acids and "n. a." refers to nucleic acids that encode the corresponding peptide.
(н. к.)EF-1α gene promoter
(n.k.)
(с мутацией Q/K)CD3-zeta (a.k.)
(with Q/K mutation)
(с мутацией Q/K)CD3-zeta (n.c.)
(with Q/K mutation)
(эталонная последовательность NM_000734.3 в NCBI)CD3-zeta (a.k.)
(reference sequence NM_000734.3 in NCBI)
(эталонная последовательность NM_000734.3 в NCBI)CD3-zeta (n.c.)
(reference sequence NM_000734.3 in NCBI)
Эта последовательность может охватывать 50-5000 адениновых оснований.(A) 5000
This sequence can span 50-5000 adenine bases.
Эта последовательность может охватывать 50-5000 тиминовых оснований.(T) 5000
This sequence can span 50-5000 thymine bases.
Эта последовательность может охватывать 100-5000 адениновых оснований. (A) 5000
This sequence can span 100-5000 adenine bases.
Эта последовательность может охватывать 100-400 адениновых оснований. (A) 400
This sequence can span 100-400 adenine bases.
Эта последовательность может охватывать 50-2000 адениновых оснований.(A) 2000
This sequence can span 50-2000 adenine bases.
(ECD PD1 подчеркнут)PD-1-based CAR (n.c.)
(ECD PD1 underlined)
(ECD PD1 подчеркнут)PD-1-based CAR with signal sequence (a.k.a.)
(ECD PD1 underlined)
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит внеклеточный домен или его противолигандсвязывающий фрагмент из молекулы, которая связывает противолиганд на поверхности клетки-мишени.In some embodiments, the antigen-binding domain comprises an extracellular domain or an anti-ligand-binding fragment thereof from a molecule that binds an anti-ligand on the surface of a target cell.
Иммунные эффекторные клетки могут содержать рекомбинантную ДНК-конструкцию, содержащую последовательности, кодирующие CAR, где CAR содержит антигенсвязывающий домен (например, антитело или фрагмент антитела, TCR или фрагмент TCR), который специфично связывается с опухолевым антигеном, например, опухолевым антигеном, описанным в данном документе, и внутриклеточный сигнальный домен. Внутриклеточный сигнальный домен может содержать костимулирующий сигнальный домен и/или первичный сигнальный домен, например, дзета-цепь. Как описано в другом месте, способы, описанные в данном документе, могут включать трансдукцию клетки, например, из популяции, истощенной по регуляторным T-клеткам, с помощью нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, например, CAR, описанный в данном документе.The immune effector cells may comprise a recombinant DNA construct comprising sequences encoding a CAR, wherein the CAR comprises an antigen-binding domain (e.g., an antibody or antibody fragment, a TCR or TCR fragment) that specifically binds to a tumor antigen, e.g., a tumor antigen described herein, and an intracellular signaling domain. The intracellular signaling domain may comprise a costimulatory signaling domain and/or a primary signaling domain, e.g., a zeta chain. As described elsewhere, the methods described herein may involve transducing a cell, e.g., from a population depleted of regulatory T cells, with a nucleic acid encoding a CAR, e.g., a CAR described herein.
В некоторых вариантах осуществления CAR содержит scFv-домен, где перед scFv может располагаться необязательная лидерная последовательность, такая как представленная под SEQ ID NO: 1, и за ней может располагаться необязательная последовательность шарнирной области, такая как представленная под SEQ ID NO: 2, или SEQ ID NO: 36, или SEQ ID NO: 38, трансмембранная область, такая как представленная под SEQ ID NO: 6, внутриклеточный сигнальный домен, который содержит SEQ ID NO: 7 или SEQ ID NO: 16, и последовательность CD3-дзета, которая содержит SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO: 10, например, где домены являются смежными и находятся в одной и той же рамке считывания, образуя единый слитый белок.In some embodiments, the CAR comprises an scFv domain, wherein the scFv may be preceded by an optional leader sequence, such as that set forth in SEQ ID NO: 1, and may be followed by an optional hinge region sequence, such as that set forth in SEQ ID NO: 2, or SEQ ID NO: 36, or SEQ ID NO: 38, a transmembrane region, such as that set forth in SEQ ID NO: 6, an intracellular signaling domain that comprises SEQ ID NO: 7 or SEQ ID NO: 16, and a CD3 zeta sequence that comprises SEQ ID NO: 9 or SEQ ID NO: 10, for example, wherein the domains are contiguous and in the same reading frame to form a single fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления иллюстративные конструкции CAR содержат необязательную лидерную последовательность (например, лидерную последовательность, описанную в данном документе), внеклеточный антигенсвязывающий домен (например, антигенсвязывающий домен, описанный в данном документе), шарнирную область (например, шарнирную область, описанную в данном документе), трансмембранный домен (например, трансмембранный домен, описанный в данном документе) и внутриклеточный стимулирующий домен (например, внутриклеточный стимулирующий домен, описанный в данном документе). В некоторых вариантах осуществления иллюстративная конструкция CAR содержит необязательную лидерную последовательность (например, лидерную последовательность, описанную в данном документе), внеклеточный антигенсвязывающий домен (например, антигенсвязывающий домен, описанный в данном документе), шарнирную область (например, шарнирную область, описанную в данном документе), трансмембранный домен (например, трансмембранный домен, описанный в данном документе), внутриклеточный костимулирующий сигнальный домен (например, костимулирующий сигнальный домен, описанный в данном документе) и/или внутриклеточный первичный сигнальный домен (например, первичный сигнальный домен, описанный в данном документе).In some embodiments, exemplary CAR constructs comprise an optional leader sequence (e.g., a leader sequence described herein), an extracellular antigen-binding domain (e.g., an antigen-binding domain described herein), a hinge region (e.g., a hinge region described herein), a transmembrane domain (e.g., a transmembrane domain described herein), and an intracellular stimulatory domain (e.g., an intracellular stimulatory domain described herein). In some embodiments, an exemplary CAR construct comprises an optional leader sequence (e.g., a leader sequence described herein), an extracellular antigen-binding domain (e.g., an antigen-binding domain described herein), a hinge region (e.g., a hinge region described herein), a transmembrane domain (e.g., a transmembrane domain described herein), an intracellular costimulatory signaling domain (e.g., a costimulatory signaling domain described herein), and/or an intracellular primary signaling domain (e.g., a primary signaling domain described herein).
Иллюстративная лидерная последовательность представлена под SEQ ID NO: 1. Следующие иллюстративные лидерные последовательности включают представленные под SEQ ID NO: 351 или кодируются представленными под SEQ ID NO: 352 или 353. Иллюстративная последовательность шарнирной области/спейсера представлена под SEQ ID NO: 2, или SEQ ID NO: 36, или SEQ ID NO: 38. Иллюстративная последовательность трансмембранного домена представлена под SEQ ID NO: 6. Иллюстративная последовательность внутриклеточного сигнального домена белка 4-1BB представлена под SEQ ID NO: 7. Иллюстративная последовательность внутриклеточного сигнального домена CD27 представлена под SEQ ID NO:16. Иллюстративная последовательность домена CD3-дзета представлена под SEQ ID NO: 9 или SEQ ID NO:10.An exemplary leader sequence is set forth as SEQ ID NO: 1. Further exemplary leader sequences include those set forth as SEQ ID NO: 351 or encoded by those set forth as SEQ ID NO: 352 or 353. An exemplary hinge/spacer sequence is set forth as SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 36 or SEQ ID NO: 38. An exemplary transmembrane domain sequence is set forth as SEQ ID NO: 6. An exemplary intracellular signaling domain sequence of the 4-1BB protein is set forth as SEQ ID NO: 7. An exemplary intracellular signaling domain sequence of CD27 is set forth as SEQ ID NO: 16. An exemplary CD3-zeta domain sequence is set forth as SEQ ID NO: 9 or SEQ ID NO: 10.
В некоторых вариантах осуществления иммунная эффектoрная клетка содержит рекомбинантную конструкцию нуклеиновой кислоты, содержащую молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR, где молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую антигенсвязывающий домен, где последовательность является смежной с последовательностью нуклеиновой кислоты, кодирующей внутриклеточный сигнальный домен, и находится с ней в одной и той же рамке считывания. Иллюстративный внутриклеточный сигнальный домен, который может использоваться в CAR, включает без ограничения один или несколько внутриклеточных сигнальных доменов, например, CD3-дзета, CD28, CD27, 4-1BB и т. п. В некоторых случаях CAR может содержать любую комбинацию из CD3-дзета, CD28, 4-1BB и т. п.In some embodiments, the immune effector cell comprises a recombinant nucleic acid construct comprising a nucleic acid molecule encoding a CAR, wherein the nucleic acid molecule comprises a nucleic acid sequence encoding an antigen-binding domain, wherein the sequence is contiguous with and in the same reading frame as a nucleic acid sequence encoding an intracellular signaling domain. An exemplary intracellular signaling domain that can be used in a CAR includes, but is not limited to, one or more intracellular signaling domains such as CD3-zeta, CD28, CD27, 4-1BB, etc. In some cases, a CAR can comprise any combination of CD3-zeta, CD28, 4-1BB, etc.
Последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующие требуемые молекулы, можно получить с помощью рекомбинантных способов, известных из уровня техники, как, например, путем скрининга библиотек из клеток, экспрессирующих молекулу нуклеиновой кислоты, путем получения молекулы нуклеиновой кислоты из вектора, о котором известно, что он ее содержит, или путем непосредственного выделения из клеток и тканей, содержащих ее, с помощью стандартных методик. В качестве альтернативы нуклеиновая кислота, представляющая интерес, может быть получена путем синтеза, а не клонирования.Nucleic acid sequences encoding the desired molecules can be obtained by recombinant methods known in the art, such as by screening libraries of cells expressing the nucleic acid molecule, by obtaining the nucleic acid molecule from a vector known to contain it, or by direct isolation from cells and tissues containing it using standard techniques. Alternatively, the nucleic acid of interest can be obtained by synthesis rather than cloning.
Нуклеиновые кислоты, кодирующие CAR, можно вводить в иммунные эффекторные клетки с помощью, например, ретровирусных или лентивирусных векторных конструкций.Nucleic acids encoding CARs can be introduced into immune effector cells using, for example, retroviral or lentiviral vector constructs.
Нуклеиновые кислоты, кодирующие CAR, также можно вводить в иммунную эффекторную клетку с помощью, например, РНК-конструкции, которая может быть непосредственно введена в клетку путем трансфекции. Способ получения мРНК для применения в трансфекции включает обеспечение транскрипции in vitro (IVT) матрицы с использованием специально разработанных праймеров с последующим добавлением поли(А) с получением конструкции, содержащей последовательности 3'- и 5'-нетранслируемых областей ("UTR") (например, 3'- и/или 5'-UTR, описанных в данном документе), 5'-кэп (например, 5'-кэп, описанный в данном документе) и/или участок внутренней посадки рибосомы (IRES) (например, IRES, описанный в данном документе), нуклеиновую кислоту, которая должна экспрессироваться, и поли(A)-хвост, как правило, длиной 50-2000 оснований (например, описанный в примерах, например, под SEQ ID NO: 35). С помощью РНК, полученной таким образом, можно эффективно трансфицировать различные типы клеток. В некоторых вариантах осуществления матрица содержит последовательности для CAR. В некоторых вариантах осуществления вектор на основе РНК, кодирующей CAR, вводят путем трансдукции в клетку, например, T-клетку, с помощью электропорации.Nucleic acids encoding a CAR can also be introduced into an immune effector cell using, for example, an RNA construct that can be directly introduced into the cell by transfection. A method for producing mRNA for use in transfection comprises providing for in vitro transcription (IVT) of a template using specially designed primers, followed by the addition of poly(A) to produce a construct comprising 3' and 5' untranslated region ("UTR") sequences (e.g., the 3' and/or 5' UTRs described herein), a 5' cap (e.g., the 5' cap described herein), and/or an internal ribosome entry site (IRES) (e.g., the IRES described herein), the nucleic acid to be expressed, and a poly(A) tail, typically 50-2000 bases in length (e.g., as described in the examples, e.g., under SEQ ID NO: 35). The RNA obtained in this manner can be efficiently transfected into various cell types. In some embodiments, the template comprises sequences for a CAR. In some embodiments, the RNA-based vector encoding the CAR is introduced by transduction into a cell, such as a T cell, using electroporation.
Антигенсвязывающий доменAntigen binding domain
В некоторых вариантах осуществления множество иммунных эффекторных клеток, например, популяция, истощенная по регуляторным T-клеткам, содержит нуклеиновую кислоту, кодирующую CAR, которая содержит специфичный в отношении мишени связывающий элемент, иначе называемый антигенсвязывающим доменом. Выбор связывающего элемента зависит от типа и количества лигандов, которые определяют поверхность клетки-мишени. Например, антигенсвязывающий домен может быть выбран таким образом, чтобы он распознавал лиганд, который выступает в качестве маркера клеточной поверхности на клетках-мишенях, ассоциированных с конкретным болезненным состоянием. Таким образом, примеры маркеров клеточной поверхности, которые могут выступать в качестве лигандов для антигенсвязывающего домена в CAR, описанного в данном документе, включают маркеры, ассоциированные с вирусными, бактериальными и паразитарными инфекциями, аутоиммунным заболеванием и раковыми клетками.In some embodiments, a plurality of immune effector cells, such as a population depleted of regulatory T cells, comprise a nucleic acid encoding a CAR that comprises a target-specific binding element, otherwise referred to as an antigen-binding domain. The choice of binding element depends on the type and number of ligands that define the surface of the target cell. For example, the antigen-binding domain can be selected such that it recognizes a ligand that serves as a cell surface marker on target cells associated with a particular disease state. Thus, examples of cell surface markers that can serve as ligands for the antigen-binding domain in a CAR described herein include markers associated with viral, bacterial and parasitic infections, autoimmune disease and cancer cells.
В некоторых вариантах осуществления часть CAR, содержащая антигенсвязывающий домен, содержит антигенсвязывающий домен, который нацеливается на опухолевый антиген, например, на опухолевый антиген, описанный в данном документе.In some embodiments, the antigen-binding domain portion of the CAR comprises an antigen-binding domain that targets a tumor antigen, such as a tumor antigen described herein.
Антигенсвязывающий домен может представлять собой любой домен, который связывается с антигеном, в том числе без ограничения моноклональное антитело, поликлональное антитело, рекомбинантное антитело, антитело человека, гуманизированное антитело и их функциональный фрагмент, в том числе без ограничения однодоменное антитело, такое как вариабельный домен тяжелой цепи (VH), вариабельный домен легкой цепи (VL) и вариабельный домен (VHH) нанотела верблюдовых, а также альтернативную каркасную структуру, которая, как известно из уровня техники, функционирует в качестве антигенсвязывающего домена, такую как рекомбинантный фибронектиновый домен, T-клеточный рецептор (TCR) или его фрагмент, например, одноцепочечный TCR, и т. п. В некоторых случаях целесообразно, чтобы антигенсвязывающий домен был получен из того же вида, в организме которого в конечном итоге будет применяться CAR. Например, для применения у людей может быть целесообразно, чтобы антигенсвязывающий домен CAR содержал человеческие или гуманизированные остатки в антигенсвязывающем домене антитела или фрагмента антитела.The antigen-binding domain may be any domain that binds to an antigen, including but not limited to a monoclonal antibody, a polyclonal antibody, a recombinant antibody, a human antibody, a humanized antibody, and a functional fragment thereof, including but not limited to a single-domain antibody such as a variable heavy chain (VH) domain, a variable light chain (VL) domain, and a variable domain (VHH) of a camelid nanobody, as well as an alternative framework structure that is known in the art to function as an antigen-binding domain, such as a recombinant fibronectin domain, a T-cell receptor (TCR), or a fragment thereof, such as a single-chain TCR, etc. In some cases, it is desirable that the antigen-binding domain is derived from the same species in which the CAR will ultimately be used. For example, for use in humans, it may be desirable for the antigen-binding domain of a CAR to comprise human or humanized residues in the antigen-binding domain of an antibody or antibody fragment.
CAR для CD19CAR for CD19
В некоторых вариантах осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, представляет собой клетку, экспрессирующую CAR для CD19 (например, клетку, экспрессирующую CAR, который связывается с CD19 человека).In some embodiments, a cell expressing a CAR described herein is a cell expressing a CAR for CD19 (e.g., a cell expressing a CAR that binds to human CD19).
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен CAR для CD19 характеризуется такой же или сходной специфичностью связывания по сравнению с scFv-фрагментом FMC63, описанным в Nicholson et al. Mol. Immun. 34 (16-17): 1157-1165 (1997). В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен CAR для CD19 включает в себя scFv-фрагмент, описанный в Nicholson et al. Mol. Immun. 34 (16-17): 1157-1165 (1997).In some embodiments, the antigen-binding domain of a CD19 CAR has the same or similar binding specificity as the FMC63 scFv fragment described in Nicholson et al. Mol. Immun. 34(16-17):1157-1165 (1997). In some embodiments, the antigen-binding domain of a CD19 CAR comprises the scFv fragment described in Nicholson et al. Mol. Immun . 34(16-17):1157-1165 (1997).
В некоторых вариантах осуществления CAR для CD19 содержит антигенсвязывающий домен (например, гуманизированный антигенсвязывающий домен) согласно таблице 3 из WO2014/153270, включенной в данный документ посредством ссылки. В WO2014/153270 также описаны способы анализа связывания и эффективности различных конструкций CAR.In some embodiments, a CD19 CAR comprises an antigen binding domain (e.g., a humanized antigen binding domain) according to Table 3 of WO2014/153270, incorporated herein by reference. WO2014/153270 also describes methods for analyzing the binding and efficacy of various CAR constructs.
В некоторых вариантах осуществления исходная последовательность scFv мыши представляет собой конструкцию CAR19, представленную в публикации согласно PCT WO2012/079000 (включенной в данный документ посредством ссылки). В некоторых вариантах осуществления домен, связывающий CD19, представляет собой scFv, описанный в WO2012/079000.In some embodiments, the parent sequence of the mouse scFv is the CAR19 construct disclosed in PCT publication WO2012/079000 (incorporated herein by reference). In some embodiments, the CD19 binding domain is the scFv described in WO2012/079000.
В некоторых вариантах осуществления молекула CAR содержит последовательность слитого полипептида, представленную под SEQ ID NO: 12 в публикации согласно PCT WO2012/079000, в которой представлен scFv-фрагмент мышиного происхождения, который специфично связывается с CD19 человека.In some embodiments, the CAR molecule comprises a fusion polypeptide sequence as set forth in SEQ ID NO: 12 of PCT publication WO2012/079000, which provides a murine-derived scFv fragment that specifically binds to human CD19.
В некоторых вариантах осуществления CAR для CD19 содержит аминокислотную последовательность, представленную под SEQ ID NO: 12 в публикации согласно PCT WO2012/079000.In some embodiments, a CAR for CD19 comprises the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 12 of PCT publication WO2012/079000.
В некоторых вариантах осуществления аминокислотная последовательность представляет собойIn some embodiments, the amino acid sequence is
Diqmtqttsslsaslgdrvtiscrasqdiskylnwyqqkpdgtvklliyhtsrlhsgvpsrfsgsgsgtdysltisnleqediatyfcqqgntlpytfgggtkleitggggsggggsggggsevklqesgpglvapsqslsvtctvsgvslpdygvswirqpprkglewlgviwgsettyynsalksrltiikdnsksqvflkmnslqtddtaiyycakhyyyggsyamdywgqgtsvtvsstttpaprpptpaptiasqplslrpeacrpaaggavhtrgldfacdiyiwaplagtcgvlllslvitlyckrgrkkllyifkqpfmrpvqttqeedgcscrfpeeeeggcelrvkfsrsadapaykqgqnqlynelnlgrreeydvldkrrgrdpemggkprrknpqeglynelqkdkmaeayseigmkgerrrgkghdglyqglstatkdtydalhmqalppr (SEQ ID NO: 292), или последовательность, по существу гомологичную ей.Diqmtqttsslsaslgdrvtiscrasqdiskylnwyqqkpdgtvklliyhtsrlhsgvpsrfsgsgsgtdysltisnleqediatyfcqqgntlpytfgggtkleitggggsgggg sggggsevklqesgpglvapsqslsvtctvsgvslpdygvswirqpprkglewlgviwgsettyynsalksrltiikdnsksqvflkmnslqtddtaiyycakhyyyggsyamdyw gqgtsvtvsstttpaprpptpaptiasqplslrpeacrpaaggavhtrgldfacdiyiwaplagtcgvlllslvitlyckrgrkkllyifkqpfmrpvqttqeedgcscrfpeeee ggcelrvkfsrsadapaykqgqnqlynelnlgrreeydvldkrrgrdpemggkprrknpqeglynelqkdkmaeayseigmkgerrrgkghdglyqglstatkdtydalhmqalppr (SEQ ID NO: 292), or a sequence substantially homologous thereto.
В некоторых вариантах осуществления CAR для CD19 имеет обозначение согласно USAN тисагенлеклейсел-T. В ряде вариантов осуществления CTL019 получают посредством генной модификации T-клеток, опосредованной стабильной вставкой путем трансдукции с помощью самоинактивирующегося лентивирусного (LV) вектора, дефектного по репликации, содержащего трансген CTL019 под контролем промотора гена EF-1-альфа. CTL019 может представлять собой смесь положительных и отрицательных по трансгену Т-клеток, которые доставляются субъекту, исходя из процентной доли Т-клеток, положительных по трансгену.In some embodiments, the CD19 CAR has the USAN designation tisagenlecleucel-T. In some embodiments, CTL019 is produced by gene modification of T cells mediated by stable insertion by transduction with a replication-defective, self-inactivating lentiviral (LV) vector comprising the CTL019 transgene under the control of the EF-1 alpha gene promoter. CTL019 may be a mixture of transgene-positive and -negative T cells that are delivered to the subject based on the percentage of transgene-positive T cells.
В других вариантах осуществления CAR для CD19 содержит антигенсвязывающий домен (например, гуманизированный антигенсвязывающий домен) согласно таблице 3 из WO2014/153270, включенной в данный документ посредством ссылки.In other embodiments, a CAR for CD19 comprises an antigen binding domain (e.g., a humanized antigen binding domain) according to Table 3 of WO2014/153270, incorporated herein by reference.
Гуманизация антитела к CD19 мыши необходима для клинических условий, когда специфические для мышей остатки могут индуцировать ответ с образованием антител человека к антигенам мыши (HAMA) у пациентов, которые получают лечение с помощью CART19, т. е. лечение с помощью T-клеток, трансдуцированных конструкцией CAR19. Получение, определение характеристик и эффективность гуманизированных последовательностей CAR для CD19 описаны в международной заявке WO2014/153270, включенной в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте, включая примеры 1-5 (стр. 115-159).Humanization of the anti-mouse CD19 antibody is required for clinical settings where mouse-specific moieties can induce a human anti-mouse antibody (HAMA) response in patients receiving CART19 therapy, i.e., treatment with T cells transduced with a CAR19 construct. The production, characterization, and performance of humanized CD19 CAR sequences are described in International Application WO2014/153270, incorporated herein by reference in its entirety, including Examples 1-5 (pp. 115-159).
В некоторых вариантах осуществления молекула CAR представляет собой гуманизированный CAR для CD19, содержащий следующую аминокислотную последовательность: eivmtqspatlslspgeratlscrasqdiskylnwyqqkpgqaprlliyhtsrlhsgiparfsgsgsgtdytltisslqpedfavyfcqqgntlpytfgqgtkleikggggsggggsggggsqvqlqesgpglvkpsetlsltctvsgvslpdygvswirqppgkglewigviwgsettyyqsslksrvtiskdnsknqvslklssvtaadtavyycakhyyyggsyamdywgqgtlvtvss (SEQ ID NO: 293)In some embodiments, the CAR molecule is a humanized CAR for CD19 comprising the following amino acid sequence: eivmtqspatlslspgeratlscrasqdiskylnwyqqkpgqaprlliyhtsrlhsgiparfsgsgsgtdytltisslqpedfavyfcqqgntlpytfgqgtkleikggggsggggsggggsqvqlqesgpglvkpsetlsltctvsgvslpdygvswirqppgkglewigviwgsettyyqsslksrvtiskdnsknqvslklssvtaadtavyycakhyyyggsyamdywgqgtlvtvss (SEQ ID NO: 293)
В некоторых вариантах осуществления молекула CAR представляет собой гуманизированный CAR для CD19, содержащий следующую аминокислотную последовательность:In some embodiments, the CAR molecule is a humanized CAR for CD19 comprising the following amino acid sequence:
eivmtqspatlslspgeratlscrasqdiskylnwyqqkpgqaprlliyhtsrlhsgiparfsgsgsgtdytltisslqpedfavyfcqqgntlpytfgqgtkleikggggsggggsggggsqvqlqesgpglvkpsetlsltctvsgvslpdygvswirqppgkglewigviwgsettyyqsslksrvtiskdnsknqvslklssvtaadtavyycakhyyyggsyamdywgqgtlvtvsstttpaprpptpaptiasqplslrpeacrpaaggavhtrgldfacdiyiwaplagtcgvlllslvitlyckrgrkkllyifkqpfmrpvqttqeedgcscrfpeeeeggcelrvkfsrsadapaykqgqnqlynelnlgrreeydvldkrrgrdpemggkprrknpqeglynelqkdkmaeayseigmkgerrrgkghdglyqglstatkdtydalhmqalppr (sEQ ID NO: 294)eivmtqspatlslspgeratlscrasqdiskylnwyqqkpgqaprlliyhtsrlhsgiparfsgsgsgtdytltisslqpedfavyfcqqgntlpytfgqgtkleikggggsgggg sggggsqvqlqesgpglvkpsetlsltctvsgvslpdygvswirqppgkglewigviwgsettyyqsslksrvtiskdnsknqvslklssvtaadtavyycakhyyyggsyamdyw gqgtlvtvsstttpaprpptpaptiasqplslrpeacrpaaggavhtrgldfacdiyiwaplagtcgvlllslvitlyckrgrkkllyifkqpfmrpvqttqeedgcscrfpeeee ggcelrvkfsrsadapaykqgqnqlynelnlgrreeydvldkrrgrdpemggkprrknpqeglynelqkdkmaeayseigmkgerrrgkghdglyqglstatkdtydalhmqalppr (sEQ ID NO: 294)
В некоторых вариантах осуществления молекула CAR представляет собой гуманизированный CAR для CD19, содержащий следующую аминокислотную последовательность:In some embodiments, the CAR molecule is a humanized CAR for CD19 comprising the following amino acid sequence:
MALPVTALLLPLALLLHAARPEIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 349) MALPVTALLLPLALLLHAARP EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGG SGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYW GQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEE GGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 349)
В некоторых вариантах осуществления молекула CAR представляет собой гуманизированный CAR для CD19, содержащий следующую аминокислотную последовательность:In some embodiments, the CAR molecule is a humanized CAR for CD19 comprising the following amino acid sequence:
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 350)EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGG SGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYW GQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEE GGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 350)
В соответствии с настоящим изобретением можно применять любой известный CAR для CD19, например, антигенсвязывающий домен для CD19 из любого известного CAR для CD19. Например, CAR для CD19 LG-740 описан в патенте США № 8399645; патенте США № 7446190; Xu et al., Leuk Lymphoma. 2013 54(2):255-260(2012); Cruz et al., Blood 122(17):2965-2973 (2013); Brentjens et al., Blood, 118(18):4817-4828 (2011); Kochenderfer et al., Blood 116(20):4099-102 (2010); Kochenderfer et al., Blood 122 (25):4129-39 (2013) и 16th Annu Meet Am Soc Gen Cell Ther (ASGCT) (May 15-18, Salt Lake City) 2013, Abst 10.Any known CD19 CAR can be used in accordance with the present invention, for example, a CD19 antigen-binding domain of any known CD19 CAR. For example, the CD19 CAR LG-740 is described in U.S. Patent No. 8,399,645; U.S. Patent No. 7,446,190; Xu et al., Leuk Lymphoma. 2013 54(2):255-260(2012); Cruz et al., Blood 122(17):2965-2973 (2013); Brentjens et al., Blood, 118(18):4817-4828 (2011); Kochenderfer et al., Blood 116(20):4099-102 (2010); Kochenderfer et al., Blood 122 (25):4129-39 (2013) and 16th Annu Meet Am Soc Gen Cell Ther (ASGCT) (May 15-18, Salt Lake City) 2013,
Иллюстративные CAR для CD19 включают CAR для CD19, описанный в данном документе, или CAR для CD19, описанный в Xu et al. Blood 123.24(2014):3750-9; Kochenderfer et al. Blood 122.25(2013):4129-39, Cruz et al. Blood 122.17(2013):2965-73, NCT00586391, NCT01087294, NCT02456350, NCT00840853, NCT02659943, NCT02650999, NCT02640209, NCT01747486, NCT02546739, NCT02656147, NCT02772198, NCT00709033, NCT02081937, NCT00924326, NCT02735083, NCT02794246, NCT02746952, NCT01593696, NCT02134262, NCT01853631, NCT02443831, NCT02277522, NCT02348216, NCT02614066, NCT02030834, NCT02624258, NCT02625480, NCT02030847, NCT02644655, NCT02349698, NCT02813837, NCT02050347, NCT01683279, NCT02529813, NCT02537977, NCT02799550, NCT02672501, NCT02819583, NCT02028455, NCT01840566, NCT01318317, NCT01864889, NCT02706405, NCT01475058, NCT01430390, NCT02146924, NCT02051257, NCT02431988, NCT01815749, NCT02153580, NCT01865617, NCT02208362, NCT02685670, NCT02535364, NCT02631044, NCT02728882, NCT02735291, NCT01860937, NCT02822326, NCT02737085, NCT02465983, NCT02132624, NCT02782351, NCT01493453, NCT02652910, NCT02247609, NCT01029366, NCT01626495, NCT02721407, NCT01044069, NCT00422383, NCT01680991, NCT02794961 или NCT02456207, каждый из которых включен в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.Illustrative CD19 CARs include the CD19 CAR described herein or the CD19 CAR described in Xu et al. Blood 123.24(2014):3750-9; Kochenderfer et al. Blood 122.25(2013):4129-39, Cruz et al. Blood 122.17(2013):2965-73, NCT00586391, NCT01087294, NCT02456350, NCT00840853, NCT02659943, NCT02650999, NCT02640209, NCT01747486, NCT02546739, NCT02656147, NCT02772198, NCT00709033, NCT02081937, NCT00924326, NCT02735083, NCT02794246, NCT02746952, NCT01593696, NCT02134262, NCT01853631, NCT02443831, NCT02277522, NCT02348216, NCT02614066, NCT02030834, NCT02624258, NCT02625480, NCT02030847, NCT02644655, NCT02349698, NCT02813837, NCT02050347, NCT01683279, NCT02529813, NCT02537977, NCT02799550, NCT02672501, NCT02819583, NCT02028455, NCT01840566, NCT01318317, NCT01864889, NCT02706405, NCT01475058, NCT01430390, NCT02146924, NCT02051257, NCT02431988, NCT01815749, NCT02153580, NCT01865617, NCT02208362, NCT02685670, NCT02535364, NCT02631044, NCT02728882, NCT02735291, NCT01860937, NCT02822326, NCT02737085, NCT02465983, NCT02132624, NCT02782351, NCT01493453, NCT02652910, NCT02247609, NCT01029366, NCT01626495, NCT02721407, NCT01044069, NCT00422383, NCT01680991, NCT02794961, or NCT02456207, each of which is incorporated herein by reference in its entirety.
В некоторых вариантах осуществления CAR для CD19 содержат последовательность, например, CDR, VH, VL, scFv или полную последовательность CAR, раскрытую в таблице 2, или последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ней.In some embodiments, the CD19 CAR comprises a sequence, such as a CDR, VH, VL, scFv, or the entire CAR sequence disclosed in Table 2, or a sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto.
полная аминокислотная последовательность; сигнальный пептид подчеркнутCAR 2A -
complete amino acid sequence; signal peptide underlined
аминокислотная последовательность; сигнальный пептид отсутствуетCAR 2A -
amino acid sequence; signal peptide absent
CAR для BCMACAR for BCMA
В некоторых вариантах осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, представляет собой клетку, экспрессирующую CAR для BCMA (например, клетку, экспрессирующую CAR, который связывается с BCMA человека). Иллюстративные CAR для BCMA могут включать последовательности, раскрытые в таблице 1 или 16 из WO2016/014565, включенной в данный документ посредством ссылки. Конструкция CAR для BCMA может содержать необязательную лидерную последовательность; необязательный шарнирный домен, например, шарнирный домен CD8; трансмембранный домен, например, трансмембранный домен CD8; внутриклеточный домен, например, внутриклеточный домен 4-1BB; и функциональный сигнальный домен, например, домен CD3-дзета. В определенных вариантах осуществления домены являются смежными и находятся в одной и той же рамке считывания, образуя единый слитый белок. В других вариантах осуществления домены находятся в отдельных полипептидах, как, например, в молекуле RCAR, описанной в данном документе.In some embodiments, a cell expressing a CAR described herein is a cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a cell expressing a CAR that binds to human BCMA). Exemplary CARs for BCMA can include the sequences disclosed in Table 1 or 16 of WO2016/014565, incorporated herein by reference. A CAR construct for BCMA can comprise an optional leader sequence; an optional hinge domain, e.g., a CD8 hinge domain; a transmembrane domain, e.g., a CD8 transmembrane domain; an intracellular domain, e.g., a 4-1BB intracellular domain; and a functional signaling domain, e.g., a CD3-zeta domain. In certain embodiments, the domains are contiguous and in the same reading frame, forming a single fusion protein. In other embodiments, the domains are in separate polypeptides, such as in the RCAR molecule described herein.
В некоторых вариантах осуществления молекула CAR для BCMA содержит одну или несколько CDR, VH, VL, scFv или полноразмерных последовательностей BCMA-1, BCMA-2, BCMA-3, BCMA-4, BCMA-5, BCMA-6, BCMA-7, BCMA-8, BCMA-9, BCMA-10, BCMA-11, BCMA-12, BCMA-13, BCMA-14, BCMA-15, 149362, 149363, 149364, 149365, 149366, 149367, 149368, 149369, BCMA_EBB-C1978-A4, BCMA_EBB-C1978-G1, BCMA_EBB-C1979-C1, BCMA_EBB-C1978-C7, BCMA_EBB-C1978-D10, BCMA_EBB-C1979-C12, BCMA_EBB-C1980-G4, BCMA_EBB-C1980-D2, BCMA_EBB-C1978-A10, BCMA_EBB-C1978-D4, BCMA_EBB-C1980-A2, BCMA_EBB-C1981-C3, BCMA_EBB-C1978-G4, A7D12.2, C11D5.3, C12A3.2 или C13F12.1, раскрытых в WO2016/014565, или последовательность, по существу (например, на 95-99%) идентичную им.In some embodiments, a CAR molecule for BCMA comprises one or more CDRs, VH, VL, scFv, or full-length sequences of BCMA-1, BCMA-2, BCMA-3, BCMA-4, BCMA-5, BCMA-6, BCMA-7, BCMA-8, BCMA-9, BCMA-10, BCMA-11, BCMA-12, BCMA-13, BCMA-14, BCMA-15, 149362, 149363, 149364, 149365, 149366, 149367, 149368, 149369, BCMA_EBB-C1978-A4, BCMA_EBB-C1978-G1, BCMA_EBB-C1979-C1, BCMA_EBB-C1978-C7, BCMA_EBB-C1978-D10, BCMA_EBB-C1979-C12, BCMA_EBB-C1980-G4, BCMA_EBB-C1980-D2, BCMA_EBB-C1978-A10, BCMA_EBB-C1978-D4, BCMA_EBB-C1980-A2, BCMA_EBB-C1981-C3, BCMA_EBB-C1978-G4, A7D12.2, C11D5.3, C12A3.2 or C13F12.1 disclosed in WO2016/014565, or a sequence substantially (e.g. 95-99%) identical thereto.
Дополнительные иллюстративные последовательности, нацеливающиеся на BCMA, которые можно использовать в конструкциях CAR для BCMA, раскрыты в WO 2017/021450, WO 2017/011804, WO 2017/025038, WO 2016/090327, WO 2016/130598, WO 2016/210293, WO 2016/090320, WO 2016/014789, WO 2016/094304, WO 2016/154055, WO 2015/166073, WO 2015/188119, WO 2015/158671, US 9243058, US 8920776, US 9273141, US 7083785, US 9034324, US 2007/0049735, US 2015/0284467, US 2015/0051266, US 2015/0344844, US 2016/0131655, US 2016/0297884, US 2016/0297885, US 2017/0051308, US 2017/0051252, US 2017/0051252, WO 2016/020332, WO 2016/087531, WO 2016/079177, WO 2015/172800, WO 2017/008169, US 9340621, US 2013/0273055, US 2016/0176973, US 2015/0368351, US 2017/0051068, US 2016/0368988 и US 2015/0232557, включенных в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. В некоторых вариантах осуществления дополнительные иллюстративные конструкции CAR для BCMA получают с использованием последовательностей VH и VL из публикации согласно PCT WO2012/0163805 (содержание которой включено в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте).Additional exemplary BCMA targeting sequences that can be used in BCMA CAR constructs are disclosed in WO 2017/021450, WO 2017/011804, WO 2017/025038, WO 2016/090327, WO 2016/130598, WO 2016/210293, WO 2016/090320, WO 2016/014789, WO 2016/094304, WO 2016/154055, WO 2015/166073, WO 2015/188119, WO 2015/158671, US 9243058, US 8920776, US 9273141, US 7083785, US 9034324, US 2007/0049735, US 2015/0284467, US 2015/0051266, US 2015/0344844,
В некоторых вариантах осуществления CAR для BCMA содержат последовательность, например, CDR, VH, VL, scFv или полную последовательность CAR, раскрытую в таблицах 3-15, или последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ней. В одном аспекте антигенсвязывающий домен содержит антитело человека или фрагмент антитела человека. В некоторых вариантах осуществления человеческий домен, связывающий BCMA, содержит одну или несколько (например, все три) из CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC человеческого домена, связывающего BCMA, описанного в данном документе (например, в таблицах 3-15), и/или одну или несколько (например, все три) из CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC человеческого домена, связывающего BCMA, описанного в данном документе (например, в таблицах 3-15). В некоторых вариантах осуществления человеческий домен, связывающий BCMA, содержит VL человека, описанную в данном документе (например, в таблицах 3, 7, 11, 11a и 12), и/или VH человека, описанную в данном документе (например, в таблицах 3, 7, 11, 11a и 12). В некоторых вариантах осуществления домен, связывающий BCMA, представляет собой scFv, содержащий VL и VH с аминокислотной последовательностью из таблиц 3, 7, 11, 11a и 12. В некоторых вариантах осуществления домен, связывающий BCMA (например, scFv), содержит: VL, содержащую аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере одну, две или три модификации (например, замены, например, консервативные замены), но не более 30, 20 или 10 модификаций (например, замен, например, консервативных замен) аминокислотной последовательности, представленной в таблицах 3, 7, 11, 11a и 12, или последовательность с 95-99% идентичностью с аминокислотной последовательностью из таблиц 3, 7, 11, 11a и 12; и/или VH, содержащую аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере одну, две или три модификации (например, замены, например, консервативные замены), но не более 30, 20 или 10 модификаций (например, замен, например, консервативных замен) аминокислотной последовательности, представленной в таблицах 3, 7, 11, 11a и 12, или последовательность с 95-99% идентичностью с аминокислотной последовательностью из таблиц 3, 7, 11, 11a и 12.In some embodiments, CARs for BCMA comprise a sequence, e.g., a CDR, VH, VL, scFv, or the entire CAR sequence disclosed in Tables 3-15, or a sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto. In one aspect, the antigen-binding domain comprises a human antibody or a human antibody fragment. In some embodiments, the human BCMA binding domain comprises one or more (e.g., all three) of CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC of the human BCMA binding domain described herein (e.g., Tables 3-15) and/or one or more (e.g., all three) of CDR1 HC, CDR2 HC, and CDR3 HC of the human BCMA binding domain described herein (e.g., Tables 3-15). In some embodiments, the human BCMA binding domain comprises a human VL as described herein (e.g., in Tables 3, 7, 11, 11a, and 12) and/or a human VH as described herein (e.g., in Tables 3, 7, 11, 11a, and 12). In some embodiments, the BCMA binding domain is an scFv comprising a VL and VH with an amino acid sequence from Tables 3, 7, 11, 11a, and 12. In some embodiments, the BCMA binding domain (e.g., scFv) comprises: a VL comprising an amino acid sequence having at least one, two, or three modifications (e.g., substitutions, e.g., conservative substitutions), but no more than 30, 20, or 10 modifications (e.g., substitutions, e.g., conservative substitutions) of the amino acid sequence presented in Tables 3, 7, 11, 11a, and 12, or a sequence with 95-99% identity to the amino acid sequence of Tables 3, 7, 11, 11a, and 12; and/or a VH comprising an amino acid sequence having at least one, two or three modifications (e.g. substitutions, e.g. conservative substitutions), but not more than 30, 20 or 10 modifications (e.g. substitutions, e.g. conservative substitutions) of the amino acid sequence presented in Tables 3, 7, 11, 11a and 12, or a sequence with 95-99% identity to the amino acid sequence from Tables 3, 7, 11, 11a and 12.
описаниеName/
description
описаниеName/
description
описаниеName/
description
В некоторых вариантах осуществления человеческий домен, связывающий BCMA, содержит CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC.In some embodiments, the human BCMA binding domain comprises CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC.
В определенных вариантах осуществления молекула CAR, описанная в данном документе, или домен, связывающий BCMA, описанный в данном документе, содержат:In certain embodiments, a CAR molecule described herein or a BCMA binding domain described herein comprises:
(1) одну, две или три CDR легкой цепи (LC), выбранные из(1) one, two, or three light chain (LC) CDRs selected from
(i) CDR1 LC под SEQ ID NO: 54, CDR2 LC под SEQ ID NO: 55 и CDR3 LC под SEQ ID NO: 56; и/или(i) CDR1 LC of SEQ ID NO: 54, CDR2 LC of SEQ ID NO: 55 and CDR3 LC of SEQ ID NO: 56; and/or
(2) одну, две или три CDR тяжелой цепи (HC) из любой из следующих:(2) one, two, or three heavy chain (HC) CDRs from any of the following:
(i) CDR1 HC под SEQ ID NO: 44, CDR2 HC под SEQ ID NO: 45 и CDR3 HC под SEQ ID NO: 84; (ii) CDR1 HC под SEQ ID NO: 44, CDR2 HC под SEQ ID NO: 45 и CDR3 HC под SEQ ID NO: 46; (iii) CDR1 HC под SEQ ID NO: 44, CDR2 HC под SEQ ID NO: 45 и CDR3 HC под SEQ ID NO: 68 или (iv) CDR1 HC под SEQ ID NO: 44, CDR2 HC под SEQ ID NO: 45 и CDR3 HC под SEQ ID NO: 76.(i) CDR1 HC of SEQ ID NO: 44, CDR2 HC of SEQ ID NO: 45 and CDR3 HC of SEQ ID NO: 84; (ii) CDR1 HC of SEQ ID NO: 44, CDR2 HC of SEQ ID NO: 45 and CDR3 HC of SEQ ID NO: 46; (iii) CDR1 HC under SEQ ID NO: 44, CDR2 HC under SEQ ID NO: 45 and CDR3 HC under SEQ ID NO: 68 or (iv) CDR1 HC under SEQ ID NO: 44, CDR2 HC under SEQ ID NO: 45 and CDR3 HC under SEQ ID NO: 76.
В определенных вариантах осуществления молекула CAR, описанная в данном документе, или домен, связывающий BCMA, описанный в данном документе, содержат:In certain embodiments, a CAR molecule described herein or a BCMA binding domain described herein comprises:
(1) одну, две или три CDR легкой цепи (LC) из любой из следующих:(1) one, two, or three light chain (LC) CDRs from any of the following:
(i) CDR1 LC под SEQ ID NO: 95, CDR2 LC под SEQ ID NO: 131 и CDR3 LC под SEQ ID NO: 132; (ii) CDR1 LC под SEQ ID NO: 95, CDR2 LC под SEQ ID NO: 96 и CDR3 LC под SEQ ID NO: 97; (iii) CDR1 LC под SEQ ID NO: 95, CDR2 LC под SEQ ID NO: 114 и CDR3 LC под SEQ ID NO: 115 или (iv) CDR1 LC под SEQ ID NO: 95, CDR2 LC под SEQ ID NO: 114 и CDR3 LC под SEQ ID NO: 97; и/или(i) CDR1 LC under SEQ ID NO: 95, CDR2 LC under SEQ ID NO: 131 and CDR3 LC under SEQ ID NO: 132; (ii) CDR1 LC of SEQ ID NO: 95, CDR2 LC of SEQ ID NO: 96 and CDR3 LC of SEQ ID NO: 97; (iii) CDR1 LC under SEQ ID NO: 95, CDR2 LC under SEQ ID NO: 114 and CDR3 LC under SEQ ID NO: 115 or (iv) CDR1 LC under SEQ ID NO: 95, CDR2 LC under SEQ ID NO: 114 and CDR3 LC under SEQ ID NO: 97; and/or
(2) одну, две или три CDR тяжелой цепи (HC) из любой из следующих:(2) one, two, or three heavy chain (HC) CDRs from any of the following:
(i) CDR1 HC под SEQ ID NO: 86, CDR2 HC под SEQ ID NO: 130 и CDR3 HC под SEQ ID NO: 88; (ii) CDR1 HC под SEQ ID NO: 86, CDR2 HC под SEQ ID NO: 87 и CDR3 HC под SEQ ID NO: 88 или (iii) CDR1 HC под SEQ ID NO: 86, CDR2 HC под SEQ ID NO: 109 и CDR3 HC под SEQ ID NO: 88.(i) CDR1 HC of SEQ ID NO: 86, CDR2 HC of SEQ ID NO: 130 and CDR3 HC of SEQ ID NO: 88; (ii) CDR1 HC under SEQ ID NO: 86, CDR2 HC under SEQ ID NO: 87 and CDR3 HC under SEQ ID NO: 88 or (iii) CDR1 HC under SEQ ID NO: 86, CDR2 HC under SEQ ID NO: 109 and CDR3 HC under SEQ ID NO: 88.
В определенных вариантах осуществления молекула CAR, описанная в данном документе, или домен, связывающий BCMA, описанный в данном документе, содержат:In certain embodiments, a CAR molecule described herein or a BCMA binding domain described herein comprises:
(1) одну, две или три CDR легкой цепи (LC) из любой из следующих:(1) one, two, or three light chain (LC) CDRs from any of the following:
(i) CDR1 LC под SEQ ID NO: 147, CDR2 LC под SEQ ID NO: 182 и CDR3 LC под SEQ ID NO: 183; (ii) CDR1 LC под SEQ ID NO: 147, CDR2 LC под SEQ ID NO: 148 и CDR3 LC под SEQ ID NO: 149 или (iii) CDR1 LC под SEQ ID NO: 147, CDR2 LC под SEQ ID NO: 170 и CDR3 LC под SEQ ID NO: 171; и/или(i) CDR1 LC of SEQ ID NO: 147, CDR2 LC of SEQ ID NO: 182 and CDR3 LC of SEQ ID NO: 183; (ii) CDR1 LC under SEQ ID NO: 147, CDR2 LC under SEQ ID NO: 148 and CDR3 LC under SEQ ID NO: 149 or (iii) CDR1 LC under SEQ ID NO: 147, CDR2 LC under SEQ ID NO: 170 and CDR3 LC under SEQ ID NO: 171; and/or
(2) одну, две или три CDR тяжелой цепи (HC) из любой из следующих:(2) one, two, or three heavy chain (HC) CDRs from any of the following:
(i) CDR1 HC под SEQ ID NO: 179, CDR2 HC под SEQ ID NO: 180 и CDR3 HC под SEQ ID NO: 181; (ii) CDR1 HC под SEQ ID NO: 137, CDR2 HC под SEQ ID NO: 138 и CDR3 HC под SEQ ID NO: 139 или (iii) CDR1 HC под SEQ ID NO: 160, CDR2 HC под SEQ ID NO: 161 и CDR3 HC под SEQ ID NO: 162.(i) CDR1 HC of SEQ ID NO: 179, CDR2 HC of SEQ ID NO: 180 and CDR3 HC of SEQ ID NO: 181; (ii) CDR1 HC under SEQ ID NO: 137, CDR2 HC under SEQ ID NO: 138 and CDR3 HC under SEQ ID NO: 139 or (iii) CDR1 HC under SEQ ID NO: 160, CDR2 HC under SEQ ID NO: 161 and CDR3 HC under SEQ ID NO: 162.
В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 44, 45, 84, 54, 55 и 56 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 44, 45, 46, 54, 55 и 56 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 44, 45, 68, 54, 55 и 56 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 44, 45, 76, 54, 55 и 56 соответственно.In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 44, 45, 84, 54, 55, and 56, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 44, 45, 46, 54, 55, and 56, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 44, 45, 68, 54, 55, and 56, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 44, 45, 76, 54, 55, and 56, respectively.
В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 47, 48, 84, 57, 58 и 59 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 47, 48, 46, 57, 58 и 59 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 47, 48, 68, 57, 58 и 59 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 47, 48, 76, 57, 58 и 59 соответственно.In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 47, 48, 84, 57, 58, and 59, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 47, 48, 46, 57, 58, and 59, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 47, 48, 68, 57, 58, and 59, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 47, 48, 76, 57, 58, and 59, respectively.
В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 49, 50, 85, 60, 58 и 56 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 49, 50, 51, 60, 58 и 56 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 49, 50, 69, 60, 58 и 56 соответственно. В некоторых вариантах осуществления CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC содержат аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 49, 50, 77, 60, 58 и 56 соответственно.In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 49, 50, 85, 60, 58, and 56, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 49, 50, 51, 60, 58, and 56, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 49, 50, 69, 60, 58, and 56, respectively. In some embodiments, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprise the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 49, 50, 77, 60, 58, and 56, respectively.
В некоторых вариантах осуществления человеческий домен, связывающий BCMA, содержит scFv, содержащий VH (например, VH, описанную в данном документе) и VL (например, VL, описанную в данном документе). В некоторых вариантах осуществления VH присоединена к VL посредством линкера, например, линкера, описанного в данном документе, например, линкера, описанного в таблице 1. В некоторых вариантах осуществления человеческий домен, связывающий BCMA, содержит линкер (Gly4-Ser)n, где n равняется 1, 2, 3, 4, 5 или 6, предпочтительно 3 или 4 (SEQ ID NO: 26). Вариабельная область легкой цепи и вариабельная область тяжелой цепи scFv могут быть представлены, например, в любой из следующих ориентаций: вариабельная область легкой цепи-линкер-вариабельная область тяжелой цепи или вариабельная область тяжелой цепи-линкер-вариабельная область легкой цепи.In some embodiments, the human BCMA binding domain comprises an scFv comprising a VH (e.g., a VH described herein) and a VL (e.g., a VL described herein). In some embodiments, the VH is attached to the VL via a linker, e.g., a linker described herein, e.g., a linker described in Table 1. In some embodiments, the human BCMA binding domain comprises a (Gly 4 -Ser)n linker, wherein n is 1, 2, 3, 4, 5, or 6, preferably 3 or 4 (SEQ ID NO: 26). The light chain variable region and the heavy chain variable region of the scFv can be presented, for example, in any of the following orientations: light chain variable region-linker-heavy chain variable region or heavy chain variable region-linker-light chain variable region.
В некоторых вариантах осуществления домен, связывающий BCMA, представляет собой фрагмент, например, одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv). В некоторых вариантах осуществления домен, связывающий BCMA, представляет собой Fv, Fab (Fab')2 или бифункциональное (например, биспецифическое) гибридное антитело (например, Lanzavecchia et al., Eur. J. Immunol. 17, 105 (1987)). В некоторых вариантах осуществления антитела и их фрагменты по настоящему изобретению связываются c белком BCMA с аффинностью дикого типа или усиленной аффинностью.In some embodiments, the BCMA binding domain is a fragment, such as a single chain variable fragment (scFv). In some embodiments, the BCMA binding domain is an Fv, a Fab (Fab')2, or a bifunctional (e.g., bispecific) hybrid antibody (e.g., Lanzavecchia et al., Eur. J. Immunol. 17, 105 (1987)). In some embodiments, the antibodies and fragments thereof of the present invention bind to the BCMA protein with wild-type or enhanced affinity.
В некоторых случаях scFv можно получить в соответствии со способом, известным из уровня техники (см., например, Bird et al., (1988) Science 242:423-426 и Huston et al., (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883). Молекулы scFv можно получить путем связывания VH- и VL-областей друг с другом с помощью гибких полипептидных линкеров. Молекулы scFv содержат линкер (например, линкер Ser-Gly) с оптимизированными длиной и/или аминокислотным составом. Длина линкера может сильно влиять на укладку и взаимодействие вариабельных областей scFv. В действительности, если используют короткий полипептидный линкер (например, длиной 5-10 аминокислот), то внутрицепочечное сворачивание предотвращается. Межцепочечное сворачивание также необходимо для объединения двух вариабельных областей вместе с образованием функционального эпитопсвязывающего участка. Примеры ориентации и размера линкеров см., например, в Hollinger et al. 1993 Proc Natl Acad. Sci. U.S.A. 90:6444-6448, публикациях заявок на патент США №№ 2005/0100543, 2005/0175606, 2007/0014794 и публикациях согласно PCT №№ WO2006/020258 и WO2007/024715, включенных в данный документ посредством ссылки.In some cases, scFv can be prepared according to a method known in the art (see, for example, Bird et al., (1988) Science 242:423-426 and Huston et al., (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883). scFv molecules can be prepared by linking the VH and VL regions to each other using flexible polypeptide linkers. scFv molecules contain a linker (e.g., a Ser-Gly linker) with optimized length and/or amino acid composition. The length of the linker can greatly influence the folding and interaction of the variable regions of scFv. Indeed, if a short polypeptide linker (e.g. 5-10 amino acids long) is used, intrachain folding is prevented. Interchain folding is also necessary to bring the two variable regions together to form a functional epitope-binding site. For examples of linker orientation and size, see, e.g., Hollinger et al. 1993 Proc Natl Acad. Sci. U.S.A. 90:6444-6448, U.S. Patent Application Publication Nos. 2005/0100543, 2005/0175606, 2007/0014794, and PCT Publication Nos. WO2006/020258 and WO2007/024715, incorporated herein by reference.
ScFv может содержать линкер из по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, или больше аминокислотных остатков между его VL- и VH-областями. Линкерная последовательность может содержать любую встречающуюся в природе аминокислоту. В некоторых вариантах осуществления линкерная последовательность содержит аминокислоты глицин и серин. В некоторых вариантах осуществления линкерная последовательность содержит группы глициновых и сериновых повторов, таких как (Gly4Ser)n, где n представляет собой положительное целое число, которое равняется или больше 1 (SEQ ID NO: 25). В некоторых вариантах осуществления линкер может представлять собой (Gly4Ser)4 (SEQ ID NO: 27) или (Gly4Ser)3(SEQ ID NO: 28). При изменении длины линкера может сохраняться или усиливаться активность, что приводит к улучшению эффективности в исследованиях активности.The scFv may comprise a linker of at least 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, or more amino acid residues between its VL and VH regions. The linker sequence may comprise any naturally occurring amino acid. In some embodiments, the linker sequence comprises the amino acids glycine and serine. In some embodiments, the linker sequence comprises groups of glycine and serine repeats, such as (Gly 4 Ser)n, wherein n is a positive integer that is equal to or greater than 1 (SEQ ID NO: 25). In some embodiments, the linker may be (Gly 4 Ser) 4 (SEQ ID NO: 27) or (Gly 4 Ser) 3 (SEQ ID NO: 28). By changing the length of the linker, activity may be maintained or enhanced, resulting in improved performance in activity assays.
CAR для CD20CAR for CD20
В некоторых вариантах осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, представляет собой клетку, экспрессирующую CAR для CD20 (например, клетку, экспрессирующую CAR, который связывается с CD20 человека). В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая CAR для CD20, содержит антигенсвязывающий домен согласно WO2016164731 и WO2018067992, включенным в данный документ посредством ссылки. Иллюстративные последовательности, связывающие CD20, или последовательности CAR для CD20 раскрыты, например, в таблицах 1-5 из WO2018067992. В некоторых вариантах осуществления CAR для CD20 содержит CDR, вариабельную область, scFv или полноразмерную последовательность CAR для CD20, раскрытую в WO2018067992 или WO2016164731.In some embodiments, a cell expressing a CAR described herein is a cell expressing a CD20 CAR (e.g., a cell expressing a CAR that binds to human CD20). In some embodiments, a cell expressing a CD20 CAR comprises an antigen-binding domain of WO2016164731 and WO2018067992, incorporated herein by reference. Exemplary CD20 binding sequences or CD20 CAR sequences are disclosed, e.g., in Tables 1-5 of WO2018067992. In some embodiments, a CD20 CAR comprises a CDR, variable region, scFv, or full-length CD20 CAR sequence disclosed in WO2018067992 or WO2016164731.
CAR для CD22CAR for CD22
В некоторых вариантах осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, представляет собой клетку, экспрессирующую CAR для CD22 (например, клетку, экспрессирующую CAR, который связывается с CD22 человека). В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая CAR для CD22, содержит антигенсвязывающий домен согласно WO2016164731 и WO2018067992, включенным в данный документ посредством ссылки. Иллюстративные последовательности, связывающие CD22, или последовательности CAR для CD22 раскрыты в, например, таблицах 6A, 6B, 7A, 7B, 7C, 8A, 8B, 9A, 9B, 10A и 10B согласно WO2016164731 и таблицах 6-10 согласно WO2018067992. В некоторых вариантах осуществления последовательность CAR для CD22 содержит CDR, вариабельную область, scFv или полноразмерную последовательность CAR для CD22, раскрытую в WO2018067992 или WO2016164731.In some embodiments, a cell expressing a CAR described herein is a cell expressing a CD22 CAR (e.g., a cell expressing a CAR that binds to human CD22). In some embodiments, a cell expressing a CD22 CAR comprises an antigen-binding domain of WO2016164731 and WO2018067992, incorporated herein by reference. Exemplary CD22 binding sequences or CD22 CAR sequences are disclosed in, e.g., Tables 6A, 6B, 7A, 7B, 7C, 8A, 8B, 9A, 9B, 10A, and 10B of WO2016164731 and Tables 6-10 of WO2018067992. In some embodiments, the CD22 CAR sequence comprises a CDR, variable region, scFv, or full-length CD22 CAR sequence disclosed in WO2018067992 or WO2016164731.
В ряде вариантов осуществления молекула CAR содержит антигенсвязывающий домен, который связывается с CD22 (CAR для CD22). В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен нацеливается на CD22 человека. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит последовательность одноцепочечного Fv, описанного в данном документе.In some embodiments, the CAR molecule comprises an antigen-binding domain that binds to CD22 (a CD22 CAR). In some embodiments, the antigen-binding domain targets human CD22. In some embodiments, the antigen-binding domain comprises a single-chain Fv sequence as described herein.
Последовательности CAR для CD22 человека представлены ниже. В некоторых вариантах осуществления CAR для CD22 человека представляет собой CAR22-65.Sequences of the CAR for human CD22 are provided below. In some embodiments, the CAR for human CD22 is CAR22-65.
Последовательность scFv CAR для CD22 человекаSequence of scFv CAR for human CD22
EVQLQQSGPGLVKPSQTLSLTCAISGDSMLSNSDTWNWIRQSPSRGLEWLGRTYHRSTWYDDYASSVRGRVSINVDTSKNQYSLQLNAVTPEDTGVYYCARVRLQDGNSWSDAFDVWGQGTMVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSQSALTQPASASGSPGQSVTISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSYTSSSTLYVFGTGTQLTVL (SEQ ID NO: 285)EVQLQQSGPGLVKPSQTLSLTCAISGDSMLSNSDTWNWIRQSPSRGLEWLGRTYHRSTWYDDYASSVRGRVSINVDTSKNQYSLQLNAVTPEDTGVYYCARVRLQDGNSWSDAFDVWGQGTMVTVS SGGGGSGGGGSGGGGSQSALTQPASASGSPGQSVTISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSYTSSSTLYVFGTGTQLTVL (SEQ ID NO: 285)
Вариабельная область тяжелой цепи CAR для CD22 человекаHuman CD22 CAR heavy chain variable region
EVQLQQSGPGLVKPSQTLSLTCAISGDSMLSNSDTWNWIRQSPSRGLEWLGRTYHRSTWYDDYASSVRGRVSINVDTSKNQYSLQLNAVTPEDTGVYYCARVRLQDGNSWSDAFDVWGQGTMVTVSS (SEQ ID NO 286)EVQLQQSGPGLVKPSQTLSLTCAISGDSMLSNSDTWNWIRQSPSRGLEWLGRTYHRSTWYDDYASSVRGRVSINVDTSKNQYSLQLNAVTPEDTGVYYCARVRLQDGNSWSDAFDVWGQGTMVTVSS (SEQ ID NO 286)
Вариабельная область легкой цепи CAR для CD22 человекаHuman CD22 CAR light chain variable region
QSALTQPASASGSPGQSVTISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSYTSSSTLYVFGTGTQLTVL (SEQ ID NO 287)QSALTQPASASGSPGQSVTISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSYTSSSTLYVFGTGTQLTVL (SEQ ID NO 287)
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC с любыми аминокислотными последовательностями тяжелой цепи связывающего домена, перечисленными в таблице 16. В ряде вариантов осуществления антигенсвязывающий домен дополнительно содержит CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC. В ряде вариантов осуществления антигенсвязывающий домен содержит аминокислотные последовательности CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC, перечисленные в таблице 17.In some embodiments, the antigen binding domain comprises CDR1 HC, CDR2 HC, and CDR3 HC with any of the heavy chain binding domain amino acid sequences listed in Table 16. In some embodiments, the antigen binding domain further comprises CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC. In some embodiments, the antigen binding domain comprises the CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC amino acid sequences listed in Table 17 .
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит одну, две или все из CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC с любыми аминокислотными последовательностями легкой цепи связывающего домена, перечисленными в таблице 17, и одну, две или все из CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC с любыми аминокислотными последовательностями тяжелой цепи связывающего домена, перечисленными в таблице 16.In some embodiments, the antigen binding domain comprises one, two, or all of CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC with any of the light chain binding domain amino acid sequences listed in Table 17 , and one, two, or all of CDR1 HC, CDR2 HC, and CDR3 HC with any of the heavy chain binding domain amino acid sequences listed in Table 16 .
В некоторых вариантах осуществления CDR определены в соответствии со схемой нумерации по Kabat, схемой нумерации по Chothia или их комбинацией.In some embodiments, the CDRs are defined according to the Kabat numbering scheme, the Chothia numbering scheme, or a combination thereof.
Порядок, в котором VL- и VH-домены представлены в scFv, может варьироваться (т. е. в ориентации VL-VH или VH-VL), и при этом любое количество из одной, двух, трех или четырех копий субъединиц "G4S" (SEQ ID NO: 25), где каждая субъединица содержит последовательность GGGGS (SEQ ID NO: 25) (например, (G4S)3 (SEQ ID NO: 28) или (G4S)4 (SEQ ID NO: 27)), может соединять вариабельные домены для создания целого scFv-домена. В качестве альтернативы конструкция CAR может содержать, например, линкер, содержащий последовательность GSTSGSGKPGSGEGSTKG (SEQ ID NO: 43). В качестве альтернативы конструкция CAR может содержать, например, линкер содержащий последовательность LAEAAAK (SEQ ID NO: 308). В одном варианте осуществления конструкция CAR не содержит линкер между VL- и VH-доменами.The order in which the VL and VH domains are presented in the scFv may vary (i.e., in a VL-VH or VH-VL orientation), and any number of one, two, three, or four copies of "G4S" subunits (SEQ ID NO: 25), wherein each subunit comprises the sequence GGGGS (SEQ ID NO: 25) (e.g., (G4S) 3 (SEQ ID NO: 28) or (G4S) 4 (SEQ ID NO: 27)), may connect the variable domains to create an entire scFv domain. Alternatively, the CAR construct may comprise, for example, a linker comprising the sequence GSTSGSGKPGSGEGSTKG (SEQ ID NO: 43). Alternatively, the CAR construct may comprise, for example, a linker comprising the sequence LAEAAAK (SEQ ID NO: 308). In one embodiment, the CAR construct does not comprise a linker between the VL and VH domains.
Все эти клоны содержали изменение остатка Q/K в сигнальном домене костимулирующего домена, полученного из дзета-цепи CD3.All of these clones contained a Q/K residue alteration in the signaling domain of the costimulatory domain derived from the CD3 zeta chain.
CAR для EGFRCAR for EGFR
В некоторых вариантах осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, представляет собой клетку, экспрессирующую CAR для EGFR (например, клетку, экспрессирующую CAR, который связывается с EGFR человека). В некоторых вариантах осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, представляет собой клетку, экспрессирующую CAR для EGFRvIII (например, клетку, экспрессирующую CAR, который связывается с EGFRvIII человека). Иллюстративные CAR для EGFRvIII могут содержать последовательности, раскрытые в WO2014/130657, например, в таблице 2 из WO2014/130657, включенной в данный документ посредством ссылки.In some embodiments, a cell expressing a CAR described herein is a cell expressing a CAR for EGFR (e.g., a cell expressing a CAR that binds to human EGFR). In some embodiments, a cell expressing a CAR described herein is a cell expressing a CAR for EGFRvIII (e.g., a cell expressing a CAR that binds to human EGFRvIII). Exemplary CARs for EGFRvIII may comprise the sequences disclosed in WO2014/130657, such as Table 2 of WO2014/130657, incorporated herein by reference.
Иллюстративные последовательности, связывающие EGFRvIII, или последовательности CAR для EGFR могут содержать CDR, вариабельную область, scFv или полноразмерную последовательность CAR из CAR для EGFR, раскрытого в WO2014/130657.Exemplary EGFRvIII binding sequences or EGFR CAR sequences may comprise a CDR, variable region, scFv, or full-length CAR sequence from the EGFR CAR disclosed in WO2014/130657.
CAR для мезотелинаCAR for mesothelin
В некоторых вариантах осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, представляет собой клетку, экспрессирующую CAR для мезотелина (например, клетку, экспрессирующую CAR, который связывается с мезотелином человека). Иллюстративные CAR для мезотелина могут содержать последовательности, раскрытые в WO2015090230 и WO2017112741, например, в таблицах 2, 3, 4 и 5 из WO2017112741, включенных в данный документ посредством ссылки.In some embodiments, a cell expressing a CAR described herein is a cell expressing a CAR for mesothelin (e.g., a cell expressing a CAR that binds to human mesothelin). Exemplary CARs for mesothelin may comprise the sequences disclosed in WO2015090230 and WO2017112741, such as Tables 2, 3, 4, and 5 of WO2017112741, incorporated herein by reference.
Другие иллюстративные CAROther illustrative CARs
В других вариантах осуществления клетки, экспрессирующие CAR, могут специфично связываться с CD123, например, могут содержать молекулу CAR (например, любую из CAR1-CAR8) или антигенсвязывающий домен согласно таблицам 1-2 из WO 2014/130635, включенной в данный документ посредством ссылки. Аминокислотные последовательности молекул и антигенсвязывающих доменов CAR для CD123 (например, содержащих одну, две, три CDR VH и одну, две, три CDR VL согласно Kabat или Chothia) и нуклеотидные последовательности, кодирующие их, указаны в WO 2014/130635. В других вариантах осуществления клетки, экспрессирующие CAR, могут специфично связываться с CD123, например, могут содержать молекулу CAR (например, любую из молекул от CAR123-1 до CAR123-4 и от hzCAR123-1 до hzCAR123-32) или ее антигенсвязывающий домен согласно таблицам 2, 6 и 9 из WO2016/028896, включенной в данный документ посредством ссылки. Аминокислотные последовательности молекул и антигенсвязывающих доменов CAR для CD123 (например, содержащих одну, две, три CDR VH и одну, две, три CDR VL согласно Kabat или Chothia) и нуклеотидные последовательности, кодирующие их, указаны в WO2016/028896.In other embodiments, the cells expressing the CAR may specifically bind to CD123, such as may comprise a CAR molecule (e.g., any of CAR1-CAR8) or an antigen binding domain according to Tables 1-2 of WO 2014/130635, incorporated herein by reference. The amino acid sequences of CAR molecules and antigen binding domains for CD123 (e.g., comprising one, two, three VH CDRs and one, two, three VL CDRs according to Kabat or Chothia) and the nucleotide sequences encoding them are set forth in WO 2014/130635. In other embodiments, the cells expressing the CAR may specifically bind to CD123, such as may comprise a CAR molecule (e.g., any of CAR123-1 to CAR123-4 and hzCAR123-1 to hzCAR123-32) or antigen binding domain thereof according to Tables 2, 6, and 9 of WO2016/028896, incorporated herein by reference. The amino acid sequences of CAR molecules and antigen binding domains for CD123 (e.g., comprising one, two, three VH CDRs and one, two, three VL CDRs according to Kabat or Chothia) and the nucleotide sequences encoding them are set forth in WO2016/028896.
В некоторых вариантах осуществления молекула CAR предусматривает CAR для CLL1, описанный в данном документе, например, CAR для CLL1, описанный в US2016/0051651A1, включенной в данный документ посредством ссылки. В ряде вариантов осуществления CAR для CLL1 содержит аминокислотную последовательность или имеет нуклеотидную последовательность, показанные в US2016/0051651A1, включенной в данный документ посредством ссылки. В других вариантах осуществления клетки, экспрессирующие CAR, могут специфично связываться с CLL-1, например, могут содержать молекулу CAR или антигенсвязывающий домен согласно таблице 2 из WO2016/014535, включенной в данный документ посредством ссылки. Аминокислотные последовательности молекул и антигенсвязывающих доменов CAR для CLL-1 (например, содержащих одну, две, три CDR VH и одну, две, три CDR VL согласно Kabat или Chothia) и нуклеотидные последовательности, кодирующие их, указаны в WO2016/014535.In some embodiments, the CAR molecule provides a CLL1 CAR described herein, such as a CLL1 CAR described in US2016/0051651A1, incorporated herein by reference. In some embodiments, the CLL1 CAR comprises an amino acid sequence or has a nucleotide sequence shown in US2016/0051651A1, incorporated herein by reference. In other embodiments, cells expressing the CAR may specifically bind to CLL-1, such as may comprise a CAR molecule or an antigen binding domain according to Table 2 of WO2016/014535, incorporated herein by reference. Amino acid sequences of CAR molecules and antigen-binding domains for CLL-1 (e.g. comprising one, two, three VH CDRs and one, two, three VL CDRs according to Kabat or Chothia) and nucleotide sequences encoding them are disclosed in WO2016/014535.
В некоторых вариантах осуществления молекула CAR предусматривает CAR для CD33, описанный в данном документе, например, CAR для CD33, описанный в US2016/0096892A1, включенной в данный документ посредством ссылки. В ряде вариантов осуществления CAR для CD33 содержит аминокислотную последовательность или имеет нуклеотидную последовательность, показанные в US2016/0096892A1, включенной в данный документ посредством ссылки. В других вариантах осуществления клетки, экспрессирующие CAR, могут специфично связываться с CD33, например, могут содержать молекулу CAR (например, любую из молекул от CAR33-1 до CAR-33-9) или антигенсвязывающий домен согласно таблице 2 или 9 из WO2016/014576, включенной в данный документ посредством ссылки. Аминокислотные последовательности молекул и антигенсвязывающих доменов CAR для CD33 (например, содержащих одну, две, три CDR VH и одну, две, три CDR VL согласно Kabat или Chothia) и нуклеотидные последовательности, кодирующие их, указаны в WO2016/014576.In some embodiments, the CAR molecule provides a CD33 CAR described herein, such as a CD33 CAR described in US2016/0096892A1, incorporated herein by reference. In some embodiments, the CD33 CAR comprises an amino acid sequence or has a nucleotide sequence as shown in US2016/0096892A1, incorporated herein by reference. In other embodiments, cells expressing the CAR may specifically bind to CD33, such as may comprise a CAR molecule (e.g., any of CAR33-1 to CAR-33-9) or an antigen binding domain according to Table 2 or 9 of WO2016/014576, incorporated herein by reference. Amino acid sequences of CAR molecules and antigen-binding domains for CD33 (e.g. comprising one, two, three VH CDRs and one, two, three VL CDRs according to Kabat or Chothia) and nucleotide sequences encoding them are disclosed in WO2016/014576.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит одну, две, три (например, все три) CDR тяжелой цепи - CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC - из антитела, описанного в данном документе (например, антитела, описанного в WO2015/142675, US-2015-0283178-A1, US-2016-0046724-A1, US2014/0322212A1, US2016/0068601A1, US2016/0051651A1, US2016/0096892A1, US2014/0322275A1 или WO2015/090230, включенных в данный документ посредством ссылки), и/или одну, две, три (например, все три) CDR легкой цепи - CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC - из антитела, описанного в данном документе (например, антитела, описанного в WO2015/142675, US-2015-0283178-A1, US-2016-0046724-A1, US2014/0322212A1, US2016/0068601A1, US2016/0051651A1, US2016/0096892A1, US2014/0322275A1 или WO2015/090230, включенных в данный документ посредством ссылки). В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит вариабельную область тяжелой цепи и/или вариабельную область легкой цепи антитела, указанного выше.In some embodiments, the antigen binding domain comprises one, two, three (e.g., all three) heavy chain CDRs - CDR1 HC, CDR2 HC, and CDR3 HC - from an antibody described herein (e.g., an antibody described in WO2015/142675, US-2015-0283178-A1, US-2016-0046724-A1, US2014/0322212A1, US2016/0068601A1, US2016/0051651A1, US2016/0096892A1, US2014/0322275A1, or WO2015/090230, all incorporated herein by reference) and/or one, two, three (e.g., all three) light chain CDRs - CDR1 LC, CDR2 LC and CDR3 LC - from an antibody described herein (e.g., an antibody described in WO2015/142675, US-2015-0283178-A1, US-2016-0046724-A1, US2014/0322212A1, US2016/0068601A1, US2016/0051651A1, US2016/0096892A1, US2014/0322275A1, or WO2015/090230, incorporated herein by reference). In some embodiments, the antigen-binding domain comprises a heavy chain variable region and/or a light chain variable region of an antibody as defined above.
В ряде вариантов осуществления антигенсвязывающий домен представляет собой антигенсвязывающий домен, описанный в WO2015/142675, US-2015-0283178-A1, US-2016-0046724-A1, US2014/0322212A1, US2016/0068601A1, US2016/0051651A1, US2016/0096892A1, US2014/0322275A1 или WO2015/090230, включенных в данный документ посредством ссылки.In some embodiments, the antigen binding domain is an antigen binding domain described in WO2015/142675, US-2015-0283178-A1, US-2016-0046724-A1, US2014/0322212A1, US2016/0068601A1, US2016/0051651A1, US2016/0096892A1, US2014/0322275A1, or WO2015/090230, incorporated herein by reference.
В ряде вариантов осуществления антигенсвязывающий домен нацеливается на BCMA и описан в US-2016-0046724-A1. В ряде вариантов осуществления антигенсвязывающий домен нацеливается на CD19 и описан в US-2015-0283178-A1. В ряде вариантов осуществления антигенсвязывающий домен нацеливается на CD123 и описан в US2014/0322212A1, US2016/0068601A1. В ряде вариантов осуществления антигенсвязывающий домен нацеливается на CLL1 и описан в US2016/0051651A1. В ряде вариантов осуществления антигенсвязывающий домен нацеливается на CD33 и описан в US2016/0096892A1.In some embodiments, the antigen binding domain targets BCMA and is described in US-2016-0046724-A1. In some embodiments, the antigen binding domain targets CD19 and is described in US-2015-0283178-A1. In some embodiments, the antigen binding domain targets CD123 and is described in US2014/0322212A1, US2016/0068601A1. In some embodiments, the antigen binding domain targets CLL1 and is described in US2016/0051651A1. In some embodiments, the antigen binding domain targets CD33 and is described in US2016/0096892A1.
Иллюстративные антигены-мишени, на которые можно нацеливаться с помощью клеток, экспрессирующих CAR, включают без ограничения, среди прочих, CD19, CD123, EGFRvIII, CD33, мезотелин, BCMA и GFR-альфа 4, описанные, например, в WO2014/153270, WO 2014/130635, WO2016/028896, WO 2014/130657, WO2016/014576, WO 2015/090230, WO2016/014565, WO2016/014535 и WO2016/025880, каждая из которых включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.Exemplary target antigens that can be targeted by CAR expressing cells include, but are not limited to, CD19, CD123, EGFRvIII, CD33, mesothelin, BCMA, and GFR-
В других вариантах осуществления клетки, экспрессирующие CAR, могут специфично связываться с GFR-альфа 4, например, могут содержать молекулу CAR или антигенсвязывающий домен согласно таблице 2 из WO2016/025880, включенной в данный документ посредством ссылки. Аминокислотные последовательности молекул и антигенсвязывающих доменов CAR для GFR-альфа 4 (например, содержащих одну, две, три CDR VH и одну, две, три CDR VL согласно Kabat или Chothia) и нуклеотидные последовательности, кодирующие их, указаны в WO2016/025880.In other embodiments, the cells expressing the CAR may specifically bind to
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен любой из молекул CAR, описанных в данном документе (например, для любого из CD19, CD123, EGFRvIII, CD33, мезотелина, BCMA и GFR-альфа 4), содержит одну, две, три (например, все три) CDR тяжелой цепи - CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC - из антитела, указанного выше, и/или одну, две, три (например, все три) CDR легкой цепи - CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC - из антигенсвязывающего домена, указанного выше. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит вариабельную область тяжелой цепи и/или вариабельную область легкой цепи антитела, указанного или описанного выше.In some embodiments, the antigen-binding domain of any of the CAR molecules described herein (e.g., for any of CD19, CD123, EGFRvIII, CD33, mesothelin, BCMA, and GFR-alpha 4) comprises one, two, three (e.g., all three) heavy chain CDRs - CDR1 HC, CDR2 HC, and CDR3 HC - from an antibody described above and/or one, two, three (e.g., all three) light chain CDRs - CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC - from an antigen-binding domain described above. In some embodiments, the antigen-binding domain comprises a heavy chain variable region and/or a light chain variable region of an antibody described or referenced above.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит одну, две, три (например, все три) CDR тяжелой цепи - CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC - из антитела, указанного выше, и/или одну, две, три (например, все три) CDR легкой цепи - CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC - из антитела, указанного выше. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит вариабельную область тяжелой цепи и/или вариабельную область легкой цепи антитела, указанного или описанного выше.In some embodiments, the antigen-binding domain comprises one, two, three (e.g., all three) heavy chain CDRs - CDR1 HC, CDR2 HC, and CDR3 HC - of an antibody as defined above and/or one, two, three (e.g., all three) light chain CDRs - CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC - of an antibody as defined above. In some embodiments, the antigen-binding domain comprises a heavy chain variable region and/or a light chain variable region of an antibody as defined or described above.
В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген представляет собой опухолевый антиген, описанный в международной заявке WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, включенной в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. В некоторых вариантах осуществления опухолевый антиген выбран из одного или нескольких из CD19; CD123; CD22; CD30; CD171; CS-1 (также называемого CD2 субпопуляции 1, CRACC, SLAMF7, CD319 и 19A24); молекулы 1, подобной лектинам С-типа (CLL-1 или CLECL1); CD33; варианта III рецептора эпидермального фактора роста (EGFRvIII); ганглиозида G2 (GD2); ганглиозида GD3 (aNeu5Ac(2-8)aNeu5Ac(2-3)bDGalp(1-4)bDGlcp(1-1)Cer); антигена созревания В-клеток (BCMA), являющегося представителем семейства рецепторов TNF; Tn-антигена ((Ag Tn) или (GalNAcα-Ser/Thr)); простатического специфического мембранного антигена (PSMA); орфанного рецептора 1, подобного рецепторной тирозинкиназе (ROR1); Fms-подобной тирозинкиназы 3 (FLT3); опухолеассоциированного гликопротеина 72 (TAG72); CD38; CD44v6; раково-эмбрионального антигена (СЕА); молекулы адгезии эпителиальных клеток (ЕРСАМ); В7Н3 (CD276); KIT (CD117); альфа-2-субъединицы рецептора интерлейкина-13 (IL-13Ra2 или CD213A2); мезотелина; альфа-субъединицы рецептора интерлейкина 11 (IL-11Ra); антигена стволовых клеток предстательной железы (PSCA); сериновой протеазы 21 (тестизина или PRSS21); рецептора 2 фактора роста эндотелия сосудов (VEGFR2); антигена системы Льюис (Y); CD24; рецептора фактора роста тромбоцитов бета-типа (PDGFR-бета); стадиеспецифического эмбрионального антигена 4 (SSEA-4); CD20; рецептора фолиевой кислоты альфа; рецепторной тирозинпротеинкиназы ERBB2 (Her2/neu); муцина 1, ассоциированного с клеточной поверхностью (MUC1); рецептора эпидермального фактора роста (EGFR); молекулы адгезии нервных клеток (NCAM); простазы; простатической кислой фосфатазы (РАР); мутантного фактора элонгации 2 (ELF2M); эфрина В2; белка активации фибробластов альфа (FAP); рецептора инсулиноподобного фактора роста 1 (рецептора IGF-I), карбоангидразы IX (CAIX); субъединицы бета-типа 9 протеасомы (просомы, мультикаталитической протеазы) (LMP2); гликопротеина 100 (gp100); онкогенного слитого белка, состоящего из кластерного региона точечных разрывов (BCR) и гомолога 1 онкогена вируса лейкоза мышей Абельсона (Abl) (bcr-abl); тирозиназы; рецептора 2 эфрина А-типа (EphA2); фукозил-GM1; молекулы адгезии, представляющей собой сиалилированный антиген системы Льюис (sLe); ганглиозида GM3 (aNeu5Ac(2-3)bDGalp(1-4)bDGlcp(1-1)Cer); трансглутаминазы 5 (TGS5); высокомолекулярного антигена, ассоциированного с меланомой (HMWMAA); ганглиозида о-ацетил-GD2 (OAcGD2); рецептора фолиевой кислоты бета; опухолевого эндотелиального маркера 1 (TEM1/CD248); белка, родственного опухолевому эндотелиальному маркеру 7 (TEM7R); клаудина 6 (CLDN6); рецептора тиреотропного гормона (TSHR); представителя D группы 5 класса С рецепторов, сопряженных с G-белками (GPRC5D); белка, кодируемого открытой рамкой считывания 61 X-хромосомы (CXORF61); CD97; CD179a; киназы анапластической лимфомы (ALK); полисиаловой кислоты; плацентоспецифического белка 1 (PLAC1); гексасахаридной части гликоцерамида globoH (GloboH); дифференцировочного антигена молочной железы (NY-BR-1); уроплакина 2 (UPK2); клеточного рецептора 1 вируса гепатита A (HAVCR1); бета-3-адренорецептора (ADRB3); паннексина 3 (PANX3); рецептора 20, сопряженного с G-белком (GPR20); антигена локуса K9 комплекса лимфоцитарных антигенов 6 (LY6K); обонятельного рецептора 51Е2 (OR51E2); белка, кодируемого альтернативной рамкой считывания гена TCR-гамма (TARP); белка опухоли Вильмса (WT1); раково-тестикулярного антигена 1 (NY-ESO-1); раково-тестикулярного антигена 2 (LAGE-1a); антигена 1, ассоциированного с меланомой (MAGE-A1); белка, кодируемого транслокационным вариантом 6 гена ETS, локализованным в р-плече 12 хромосомы (ETV6-AML); белка спермы 17 (SPA17); представителя 1А семейства X-антигенов (XAGE1); ангиопоэтин-связывающего рецептора клеточной поверхности 2 (TIE-2); раково-тестикулярного антигена меланомы 1 (MAD-CT-1); раково-тестикулярного антигена меланомы 2 (MAD-CT-2); Fos-родственного антигена 1; опухолевого белка р53 (р53); мутантного р53; простеина; сурвивина; теломеразы; опухолевого антигена 1 карциномы предстательной железы (РСТА-1 или галектина 8), антигена меланомы 1, распознаваемого Т-клетками (MelanA или MART1); мутантного антигена саркомы крыс (Ras); обратной транскриптазы теломеразы человека (hTERT); антигена саркомы с точечными разрывами при транслокации; меланомного ингибитора апоптоза (ML-IAP); ERG (продукта слитого гена трансмембранной сериновой протеазы 2 (TMPRSS2) и ETS); N-ацетилглюкозаминилтрансферазы V (NA17); белка с парным box-доменом Рах-3 (РАХЗ); андрогенового рецептора; циклина В1; нейробластомного гомолога онкогена вируса миелоцитоматоза птиц v-myc (MYCN); представителя С семейства гомологов Ras (RhoC); белка 2, родственного тирозиназе (TRP-2); цитохрома Р450 1В1 (CYP1B1); белка, подобного CCCTC-связывающему фактору (белку с "цинковыми пальцами") (BORIS или "брата регулятора импринтированных сайтов"), антигена плоскоклеточной карциномы 3, распознаваемого Т-клетками (SART3); белка с парным box-доменом Рах-5 (РАХ5); проакрозин-связывающего белка sp32 (OY-TES1); лимфоцитоспецифической протеинтирозинкиназы (LCK); якорного белка 4 киназы A (AKAP-4); антигена 2 синовиальной саркомы с точечным разрывом в X-хромосоме (SSX2); рецептора конечных продуктов гликирования (RAGE-1); почечного убиквитарного белка 1 (RU1); почечного убиквитарного белка 2 (RU2); легумаина; Е6 вируса папилломы человека (Е6 HPV); Е7 вируса папилломы человека (Е7 HPV); кишечной карбоксилэстеразы; мутантного белка теплового шока 70-2 (мутантного варианта hsp70-2); CD79a; CD79b; CD72; иммуноглобулиноподобного рецептора 1, ассоциированного с лейкоцитами (LAIR1); рецептора Fc-фрагмента IgA (FCAR или CD89); представителя 2 подсемейства А лейкоцитарных иммуноглобулиноподобных рецепторов (LILRA2); представителя f семейства белков, подобных молекулам CD300 (CD300LF); представителя А семейства 12 лектиновых доменов С-типа (CLEC12A); антигена 2 стромальных клеток костного мозга (BST2); белка 2, подобного муциноподобному рецептору гормона, содержащего EGF-подобный модуль (EMR2); лимфоцитарного антигена 75 (LY75); глипикана-3 (GPC3); антигена 5, подобного Fc-рецептору (FCRL5); и полипептида 1, подобного иммуноглобулину лямбда (IGLL1).In some embodiments, the tumor antigen is a tumor antigen as described in International Application WO2015/142675, filed March 13, 2015, incorporated herein by reference in its entirety. In some embodiments, the tumor antigen is selected from one or more of CD19; CD123; CD22; CD30; CD171; CS-1 (also referred to as CD2 subset 1, CRACC, SLAMF7, CD319, and 19A24); C-type lectin-like molecule 1 (CLL-1 or CLECL1); CD33; epidermal growth factor receptor variant III (EGFRvIII); ganglioside G2 (GD2); ganglioside GD3 (aNeu5Ac(2-8)aNeu5Ac(2-3)bDGalp(1-4)bDGlcp(1-1)Cer); B-cell maturation antigen (BCMA), which is a member of the TNF receptor family; Tn antigen ((Ag Tn) or (GalNAcα-Ser/Thr)); prostate-specific membrane antigen (PSMA); orphan receptor 1, similar to receptor tyrosine kinase 1 (ROR1); Fms-like tyrosine kinase 3 (FLT3); tumor-associated glycoprotein 72 (TAG72); CD38; CD44v6; carcinoembryonic antigen (CEA); epithelial cell adhesion molecule (EPCAM); B7H3 (CD276); KIT (CD117); Interleukin-13 receptor alpha-2 subunit (IL-13Ra2 or CD213A2); mesothelin; interleukin 11 receptor alpha subunit (IL-11Ra); prostate stem cell antigen (PSCA); serine protease 21 (testisin or PRSS21); vascular endothelial growth factor receptor 2 (VEGFR2); Lewis system antigen (Y); CD24; platelet-derived growth factor receptor beta (PDGFR-beta); stage-specific embryonic antigen 4 (SSEA-4); CD20; folate receptor alpha; receptor tyrosine protein kinase ERBB2 (Her2/neu); cell surface-associated mucin 1 (MUC1); epidermal growth factor receptor (EGFR); neural cell adhesion molecule (NCAM); prostasis; Prostatic acid phosphatase (PAP); elongation factor 2 mutant (ELF2M); ephrin B2; fibroblast activation protein alpha (FAP); insulin-like growth factor 1 receptor (IGF-I receptor), carbonic anhydrase IX (CAIX); proteasome (prosome, multicatalytic protease) beta-type 9 subunit (LMP2); glycoprotein 100 (gp100); oncogenic fusion protein of breakpoint cluster region (BCR) and Abelson murine leukemia virus oncogene homolog 1 (Abl) (bcr-abl); tyrosinase; ephrin A-type receptor 2 (EphA2); fucosyl-GM1; sialylated Lewis antigen (sLe) adhesion molecule; GM3 ganglioside (aNeu5Ac(2-3)bDGalp(1-4)bDGlcp(1-1)Cer); transglutaminase 5 (TGS5); high molecular weight melanoma-associated antigen (HMWMAA); o-acetyl-GD2 ganglioside (OAcGD2); folate receptor beta; tumor endothelial marker 1 (TEM1/CD248); tumor endothelial marker-related protein 7 (TEM7R); claudin 6 (CLDN6); thyroid stimulating hormone receptor (TSHR); group C protein-coupled receptor 5 member D (GPRC5D); X chromosome open reading frame 61 protein encoded by CXORF61; CD97; CD179a; anaplastic lymphoma kinase (ALK); polysialic acid; placenta-specific protein 1 (PLAC1); hexasaccharide portion of glycoceramide globoH (GloboH); mammary gland differentiation antigen (NY-BR-1); uroplakin 2 (UPK2); hepatitis A virus cellular receptor 1 (HAVCR1); beta-3-adrenergic receptor (ADRB3); pannexin 3 (PANX3); G protein-coupled receptor 20 (GPR20); lymphocyte antigen complex 6 locus K9 antigen (LY6K); olfactory receptor 51E2 (OR51E2); TCR-gamma alternative reading frame–encoded protein (TARP); Wilms tumor protein (WT1); cancer-testicular antigen 1 (NY-ESO-1); cancer-testicular antigen 2 (LAGE-1a); melanoma-associated antigen 1 (MAGE-A1); protein encoded by the ETS translocation variant 6, localized to the p-arm of chromosome 12 (ETV6-AML); sperm protein 17 (SPA17); X-antigen family member 1A (XAGE1); angiopoietin-binding receptor-cell surface 2 (TIE-2); melanoma cancer-testicular antigen 1 (MAD-CT-1); melanoma cancer-testicular antigen 2 (MAD-CT-2); Fos-related antigen 1; tumor protein p53 (p53); mutant p53; prostein; survivin; telomerase; Prostate carcinoma tumor antigen 1 (PCTA-1 or galectin 8), melanoma antigen 1 recognized by T cells (MelanA or MART1); mutant rat sarcoma antigen (Ras); human telomerase reverse transcriptase (hTERT); breakpoint translocation sarcoma antigen; melanoma inhibitor of apoptosis (ML-IAP); ERG (fusion product of the transmembrane serine protease 2 gene (TMPRSS2) and ETS); N-acetylglucosaminyltransferase V (NA17); Pax paired-box protein 3 (PAX3); androgen receptor; cyclin B1; neuroblastoma homolog of avian myelocytomatosis virus oncogene v-myc (MYCN); Ras homolog family member C (RhoC); Tyrosinase-related protein 2 (TRP-2); Cytochrome P450 1B1 (CYP1B1); Zinc finger protein CCCTC-binding factor-like protein (BORIS or brother regulator of imprinted sites), Squamous cell carcinoma antigen recognized by T cells 3 (SART3); Pax paired box domain protein 5 (PAX5); Proacrosin-binding protein sp32 (OY-TES1); Lymphocyte-specific protein tyrosine kinase (LCK); Kinase A anchor protein 4 (AKAP-4); Synovial sarcoma X-linked breakpoint antigen 2 (SSX2); Receptor for advanced glycation end products (RAGE-1); Renal ubiquitin protein 1 (RU1); Renal ubiquitin protein 2 (RU2); legumain; human papillomavirus E6 (HPV E6); human papillomavirus E7 (HPV E7); intestinal carboxylesterase; mutant heat shock protein 70-2 (mutant variant of hsp70-2); CD79a; CD79b; CD72; leukocyte-associated immunoglobulin-like receptor 1 (LAIR1); IgA Fc fragment receptor (FCAR or CD89); leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 2 (LILRA2); CD300 molecule-like protein f family member (CD300LF); C-type lectin domain family 12 member A (CLEC12A); bone marrow stromal cell antigen 2 (BST2); hormone receptor mucin-like protein containing EGF-like module 2 (EMR2); lymphocyte antigen 75 (LY75); glypican-3 (GPC3); Fc receptor-like antigen 5 (FCRL5); and immunoglobulin lambda-like polypeptide 1 (IGLL1).
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит одну, две, три (например, все три) CDR тяжелой цепи - CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC - из антитела, указанного выше, и/или одну, две, три (например, все три) CDR легкой цепи - CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC - из антитела, указанного выше. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит вариабельную область тяжелой цепи и/или вариабельную область легкой цепи антитела, указанного или описанного выше.In some embodiments, the antigen-binding domain comprises one, two, three (e.g., all three) heavy chain CDRs - CDR1 HC, CDR2 HC, and CDR3 HC - of an antibody as defined above and/or one, two, three (e.g., all three) light chain CDRs - CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC - of an antibody as defined above. In some embodiments, the antigen-binding domain comprises a heavy chain variable region and/or a light chain variable region of an antibody as defined or described above.
В некоторых вариантах осуществления домен, связывающий опухолевый антиген, представляет собой фрагмент, например, одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv). В некоторых вариантах осуществления связывающий домен для антигена, ассоциированного с раком, описанного в данном документе, представляет собой Fv, Fab (Fab')2 или бифункциональное (например, биспецифическое) гибридное антитело (например, Lanzavecchia et al., Eur. J. Immunol. 17, 105 (1987)). В некоторых вариантах осуществления антитела и их фрагменты по настоящему изобретению связываются с белком, представляющим собой антиген, ассоциированный с раком, описанный в данном документе, с аффинностью дикого типа или усиленной аффинностью.In some embodiments, the tumor antigen binding domain is a fragment, such as a single chain variable fragment (scFv). In some embodiments, the binding domain for a cancer associated antigen described herein is an Fv, a Fab (Fab')2, or a bifunctional (e.g., bispecific) chimeric antibody (e.g., Lanzavecchia et al., Eur. J. Immunol. 17, 105 (1987)). In some embodiments, the antibodies and fragments thereof of the present invention bind to a protein that is a cancer associated antigen described herein with wild-type or enhanced affinity.
В некоторых случаях scFv можно получить согласно способу, известному из уровня техники (см., например, Bird et al. (1988) Science 242:423-426 и Huston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883). Молекулы scFv можно получить путем связывания VH- и VL-областей друг с другом с помощью гибких полипептидных линкеров. Молекулы scFv содержат линкер (например, линкер Ser-Gly) с оптимизированными длиной и/или аминокислотным составом. Длина линкера может сильно влиять на укладку и взаимодействие вариабельных областей scFv. В действительности, если используют короткий полипептидный линкер (например, длиной 5-10 аминокислот), то внутрицепочечное сворачивание предотвращается. Межцепочечное сворачивание также необходимо для объединения двух вариабельных областей вместе с образованием функционального эпитопсвязывающего участка. Примеры ориентации и размера линкеров см., например, в Hollinger et al. 1993 Proc Natl Acad. Sci. U.S.A. 90:6444-6448, публикациях заявок на патент США №№ 2005/0100543, 2005/0175606, 2007/0014794 и публикациях согласно PCT №№ WO2006/020258 и WO2007/024715, которые включены в данный документ посредством ссылки.In some cases, scFv can be prepared according to a method known in the art (see, for example, Bird et al. (1988) Science 242:423-426 and Huston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883). scFv molecules can be prepared by linking the VH and VL regions to each other using flexible polypeptide linkers. scFv molecules contain a linker (e.g., a Ser-Gly linker) with optimized length and/or amino acid composition. The length of the linker can greatly influence the folding and interaction of the variable regions of scFv. Indeed, if a short polypeptide linker (e.g. 5-10 amino acids long) is used, intrachain folding is prevented. Interchain folding is also necessary to bring the two variable regions together to form a functional epitope-binding site. For examples of linker orientation and size, see, e.g., Hollinger et al. 1993 Proc Natl Acad. Sci. U.S.A. 90:6444-6448, U.S. Patent Application Publication Nos. 2005/0100543, 2005/0175606, 2007/0014794, and PCT Publication Nos. WO2006/020258 and WO2007/024715, which are incorporated herein by reference.
ScFv может содержать линкер из по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, или больше аминокислотных остатков между его VL- и VH-областями. Линкерная последовательность может содержать любую встречающуюся в природе аминокислоту. В некоторых вариантах осуществления линкерная последовательность содержит аминокислоты глицин и серин. В некоторых вариантах осуществления линкерная последовательность содержит группы глициновых и сериновых повторов, таких как (Gly4Ser)n, где n представляет собой положительное целое число, которое равняется или больше 1 (SEQ ID NO: 25). В некоторых вариантах осуществления линкер может представлять собой (Gly4Ser)4 (SEQ ID NO: 27) или (Gly4Ser)3(SEQ ID NO: 28). При изменении длины линкера может сохраняться или усиливаться активность, что приводит к улучшению эффективности в исследованиях активности.The scFv may comprise a linker of at least 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, or more amino acid residues between its VL and VH regions. The linker sequence may comprise any naturally occurring amino acid. In some embodiments, the linker sequence comprises the amino acids glycine and serine. In some embodiments, the linker sequence comprises groups of glycine and serine repeats, such as (Gly 4 Ser)n, wherein n is a positive integer that is equal to or greater than 1 (SEQ ID NO: 25). In some embodiments, the linker may be (Gly 4 Ser) 4 (SEQ ID NO: 27) or (Gly 4 Ser) 3 (SEQ ID NO: 28). By changing the length of the linker, activity may be maintained or enhanced, resulting in improved performance in activity assays.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен представляет собой T-клеточный рецептор ("TCR") или его фрагмент, например, одноцепочечный TCR (scTCR). Способы получения таких TCR известны из уровня техники. См., например, Willemsen RA et al, Gene Therapy 7: 1369-1377 (2000); Zhang T et al, Cancer Gene Ther 11: 487-496 (2004); Aggen et al, Gene Ther. 19(4):365-74 (2012) (литературные источники включены в данный документ во всей своей полноте). Например, может быть сконструирован scTCR, который содержит гены Vα и Vβ из клона Т-клеток, связанные с помощью линкера (например, гибкого пептида). Данный подход является весьма применимым для мишени, ассоциированной с раком, которая сама по себе является внутриклеточной, однако фрагмент такого антигена (пептида) презентируется на поверхности раковых клеток с помощью MHC.In some embodiments, the antigen-binding domain is a T cell receptor ("TCR") or a fragment thereof, e.g., a single-chain TCR (scTCR). Methods for producing such TCRs are known in the art. See, e.g., Willemsen RA et al, Gene Therapy 7: 1369-1377 (2000); Zhang T et al, Cancer Gene Ther 11: 487-496 (2004); Aggen et al, Gene Ther. 19(4):365-74 (2012) (the references are incorporated herein in their entireties). For example, an scTCR can be engineered that comprises the Vα and Vβ genes from a T cell clone linked by a linker (e.g., a flexible peptide). This approach is very applicable for a cancer-associated target, which is itself intracellular, but a fragment of such an antigen (peptide) is presented on the surface of cancer cells using MHC.
Трансмембранный доменTransmembrane domain
Что касается трансмембранного домена, в различных вариантах осуществления CAR можно разработать таким образом, чтобы он содержал трансмембранный домен, присоединенный к внеклеточному домену CAR. Трансмембранный домен может содержать одну или несколько дополнительных аминокислот, прилегающих к трансмембранной области, например, одну или несколько аминокислот, относящихся к внеклеточной области белка, из которого получен трансмембранный домен (например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 и вплоть до 15 аминокислот внеклеточной области), и/или одну или несколько дополнительных аминокислот, относящихся к внутриклеточной области белка, из которого получен трансмембранный домен (например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 и вплоть до 15 аминокислот внутриклеточной области). В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен представляет собой домен, ассоциированный с одним из остальных используемых доменов CAR. В некоторых случаях трансмембранный домен можно выбрать или модифицировать с помощью аминокислотной замены, чтобы избежать связывания таких доменов с трансмембранными доменами тех же или других поверхностных мембранных белков, например, чтобы свести к минимуму взаимодействия с другими элементами рецепторного комплекса. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен способен к гомодимеризации с другим CAR на поверхности клетки, экспрессирующей CAR, например, CAR-T-клетки. В некоторых вариантах осуществления аминокислотную последовательность трансмембранного домена можно модифицировать или подвергнуть замене таким образом, чтобы свести к минимуму взаимодействия со связывающими доменами нативного партнера по связыванию, присутствующего в той же клетке, экспрессирующей CAR, например, CAR-T.With respect to the transmembrane domain, in various embodiments, the CAR can be designed to comprise a transmembrane domain attached to an extracellular domain of the CAR. The transmembrane domain can comprise one or more additional amino acids adjacent to the transmembrane region, such as one or more amino acids related to the extracellular region of the protein from which the transmembrane domain is derived (e.g., 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, and up to 15 amino acids of the extracellular region), and/or one or more additional amino acids related to the intracellular region of the protein from which the transmembrane domain is derived (e.g., 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, and up to 15 amino acids of the intracellular region). In some embodiments, the transmembrane domain is a domain associated with one of the remaining domains of the CAR used. In some cases, the transmembrane domain may be selected or modified by an amino acid substitution to avoid association of such domains with transmembrane domains of the same or other surface membrane proteins, for example, to minimize interactions with other elements of the receptor complex. In some embodiments, the transmembrane domain is capable of homodimerization with another CAR on the surface of a cell expressing the CAR, for example, a CAR-T cell. In some embodiments, the amino acid sequence of the transmembrane domain may be modified or substituted in a manner that minimizes interactions with the binding domains of a native binding partner present in the same cell expressing the CAR, for example, a CAR-T.
Трансмембранный домен может быть получен из природного либо из рекомбинантного источника. Если источник является природным, то домен может быть получен из любого мембраносвязанного или трансмембранного белка. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен способен передавать сигнал внутриклеточному(внутриклеточным) домену(доменам) всякий раз, когда CAR связался с мишенью. Трансмембранный домен, особенно применимый в настоящем изобретении, может содержать по меньшей мере трансмембранную(трансмембранные) область(области), например, альфа-, бета- или дзета-цепи Т-клеточного рецептора, CD28, CD3-эпсилон, CD45, CD4, CD5, CD8 (например, CD8-альфа, CD8-бета), CD9, CD16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD134, CD137, CD154. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен может содержать по меньшей мере трансмембранную(трансмембранные) область(области) костимулирующей молекулы, например, молекулы MHC I класса, белковых рецепторов TNF, иммуноглобулиноподобных белков, рецепторов цитокинов, интегринов, сигнальных молекул активации лимфоцитов (белков SLAM), активирующих рецепторов NK-клеток, BTLA, лиганда Toll-подобного рецептора, OX40, CD2, CD7, CD27, CD28, CD30, CD40, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), 4-1BB (CD137), B7-H3, CDS, ICAM-1, ICOS (CD278), GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-альфа, CD8-бета, IL2R-бета, IL2R-гамма, IL7R-альфа, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, LFA-1, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a и лиганда, который специфично связывается с CD83.The transmembrane domain may be obtained from a natural or recombinant source. If the source is natural, the domain may be obtained from any membrane-bound or transmembrane protein. In some embodiments, the transmembrane domain is capable of transmitting a signal to the intracellular domain(s) whenever the CAR has bound to a target. A transmembrane domain particularly useful in the present invention may comprise at least a transmembrane region(s) such as the alpha, beta or zeta chains of a T cell receptor, CD28, CD3epsilon, CD45, CD4, CD5, CD8 (e.g., CD8alpha, CD8beta), CD9, CD16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD134, CD137, CD154. In some embodiments, the transmembrane domain may comprise at least the transmembrane region(s) of a costimulatory molecule, such as an MHC class I molecule, TNF protein receptors, immunoglobulin-like proteins, cytokine receptors, integrins, signaling lymphocyte activation molecules (SLAM proteins), NK cell activating receptors, BTLA, Toll-like receptor ligand, OX40, CD2, CD7, CD27, CD28, CD30, CD40, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), 4-1BB (CD137), B7-H3, CDS, ICAM-1, ICOS (CD278), GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-alpha, CD8-beta, IL2R-beta, IL2R-gamma, IL7R-alpha, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, LFA-1, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a and a ligand that specifically binds to CD83.
В некоторых случаях трансмембранный домен может быть присоединен к внеклеточной области CAR, например, антигенсвязывающему домену CAR, с помощью шарнирной области, например, шарнирной области из белка человека. Например, в некоторых вариантах осуществления шарнирная область может представлять собой шарнирную область Ig (иммуноглобулина) человека, например, шарнирную область IgG4 или шарнирную область CD8a. В некоторых вариантах осуществления шарнирная область или спейсер содержат аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 2 (например, состоят из нее). В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен содержит трансмембранный домен под SEQ ID NO: 6 (например, состоит из него).In some cases, the transmembrane domain may be attached to an extracellular region of the CAR, such as an antigen-binding domain of the CAR, via a hinge region, such as a hinge region from a human protein. For example, in some embodiments, the hinge region may be a human Ig (immunoglobulin) hinge region, such as an IgG4 hinge region or a CD8a hinge region. In some embodiments, the hinge region or spacer comprises (e.g., consists of) the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2. In some embodiments, the transmembrane domain comprises (e.g., consists of) the transmembrane domain of SEQ ID NO: 6.
В некоторых вариантах осуществления шарнирная область или спейсер включают шарнирную область IgG4. Например, в некоторых вариантах осуществления шарнирная область или спейсер включают шарнирную область под SEQ ID NO: 3. В некоторых вариантах осуществления шарнирная область или спейсер включают шарнирную область, кодируемую нуклеотидной последовательностью под SEQ ID NO: 14.In some embodiments, the hinge region or spacer comprises an IgG4 hinge region. For example, in some embodiments, the hinge region or spacer comprises the hinge region of SEQ ID NO: 3. In some embodiments, the hinge region or spacer comprises a hinge region encoded by the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14.
В некоторых вариантах осуществления шарнирная область или спейсер включают шарнирную область IgD. Например, в некоторых вариантах осуществления шарнирная область или спейсер включают шарнирную область с аминокислотной последовательностью под SEQ ID NO: 4. В некоторых вариантах осуществления шарнирная область или спейсер включают шарнирную область, кодируемую нуклеотидной последовательностью под SEQ ID NO: 15.In some embodiments, the hinge region or spacer comprises an IgD hinge region. For example, in some embodiments, the hinge region or spacer comprises a hinge region with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4. In some embodiments, the hinge region or spacer comprises a hinge region encoded by the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15.
В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен может быть рекомбинантным, и в этом случае он будет содержать главным образом гидрофобные остатки, такие как лейцин и валин. В некоторых вариантах осуществления на каждом конце рекомбинантного трансмембранного домена может находиться триплет из фенилаланина, триптофана и валина.In some embodiments, the transmembrane domain may be recombinant, in which case it will contain primarily hydrophobic residues such as leucine and valine. In some embodiments, at each end of the recombinant transmembrane domain, there may be a triplet of phenylalanine, tryptophan, and valine.
Короткий олиго- или полипептидный линкер длиной от 2 до 10 аминокислот необязательно может образовывать связь между трансмембранным доменом и цитоплазматической областью CAR. Глицин-сериновый дублет является особенно подходящим линкером. Например, в некоторых вариантах осуществления линкер содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 5. В некоторых вариантах осуществления линкер кодируется нуклеотидной последовательностью под SEQ ID NO: 16.A short oligo- or polypeptide linker of 2 to 10 amino acids in length may optionally form a link between the transmembrane domain and the cytoplasmic region of the CAR. A glycine-serine doublet is a particularly suitable linker. For example, in some embodiments, the linker comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5. In some embodiments, the linker is encoded by the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16.
В некоторых вариантах осуществления шарнирная область или спейсер включают в себя шарнирную область KIR2DS2.In some embodiments, the hinge region or spacer comprises a KIR2DS2 hinge region.
Цитоплазматический доменCytoplasmic domain
Цитоплазматические домен или область CAR по настоящему изобретению содержат внутриклеточный сигнальный домен. Внутриклеточный сигнальный домен обычно отвечает за активацию по меньшей мере одной из нормальных эффекторных функций иммунной клетки, в которую был введен CAR.The cytoplasmic domain or region of the CAR of the present invention comprises an intracellular signaling domain. The intracellular signaling domain is typically responsible for activating at least one of the normal effector functions of the immune cell into which the CAR has been introduced.
Примеры внутриклеточных сигнальных доменов для применения в CAR по настоящему изобретению включают цитоплазматические последовательности Т-клеточного рецептора (TCR) и корецепторов, которые действуют совместно с инициированием передачи сигнала после вступления в контакт с антигенным рецептором, а также любое производное или вариант этих последовательностей и любую рекомбинантную последовательность, которая обладает такими же функциональными способностями.Examples of intracellular signaling domains for use in the CAR of the present invention include cytoplasmic sequences of the T cell receptor (TCR) and co-receptors that act in concert to initiate signaling upon engagement with an antigen receptor, as well as any derivative or variant of these sequences and any recombinant sequence that has the same functional capabilities.
Известно, что сигналы, образуемые при участии только TCR, являются недостаточными для полной активации Т-клетки, и что также необходим вторичный и/или костимулирующий сигнал. Таким образом, можно сказать, что активация Т-клеток опосредуется двумя различными классами цитоплазматических сигнальных последовательностей: теми, которые инициируют антигензависимую первичную активацию посредством TCR (первичные внутриклеточные сигнальные домены), и теми, которые действуют антигеннезависимым образом, передавая вторичный или костимулирующий сигнал (вторичный цитоплазматический домен, например, костимулирующий домен).It is known that signals generated by the TCR alone are insufficient for full T cell activation and that a secondary and/or costimulatory signal is also required. Thus, it can be said that T cell activation is mediated by two distinct classes of cytoplasmic signaling sequences: those that initiate antigen-dependent primary activation via the TCR (primary intracellular signaling domains) and those that act in an antigen-independent manner to transmit a secondary or costimulatory signal (secondary cytoplasmic domain, e.g., costimulatory domain).
Первичный сигнальный домен регулирует первичную активацию комплекса TCR стимулирующим образом либо ингибирующим образом. Первичные внутриклеточные сигнальные домены, которые действуют стимулирующим образом, могут содержать сигнальные мотивы, известные как иммунорецепторные тирозиновые активирующие мотивы или ITAM.The primary signaling domain regulates the primary activation of the TCR complex in a stimulatory or inhibitory manner. Primary intracellular signaling domains that act in a stimulatory manner may contain signaling motifs known as immunoreceptor tyrosine-based activation motifs or ITAMs.
Примеры ITAM-содержащих первичных внутриклеточных сигнальных доменов, которые являются особенно применимыми в настоящем изобретении, включают домены из TCR-дзета, FcR-гамма, FcR-бета, CD3-гамма, CD3-дельта, CD3-эпсилон, CD5, CD22, CD79a, CD79b, CD278 (также известного как "ICOS"), FcεRI, DAP10, DAP12 и CD66d. В некоторых вариантах осуществления CAR по настоящему изобретению содержит внутриклеточный сигнальный домен, например, первичный сигнальный домен CD3-дзета.Examples of ITAM-containing primary intracellular signaling domains that are particularly useful in the present invention include domains from TCR zeta, FcR gamma, FcR beta, CD3 gamma, CD3 delta, CD3 epsilon, CD5, CD22, CD79a, CD79b, CD278 (also known as "ICOS"), FcεRI, DAP10, DAP12, and CD66d. In some embodiments, a CAR of the present invention comprises an intracellular signaling domain, such as a CD3 zeta primary signaling domain.
В некоторых вариантах осуществления первичный сигнальный домен содержит модифицированный домен ITAM, например, мутантный домен ITAM, который обладает измененной (например, повышенной или пониженной) активностью по сравнению с нативным доменом ITAM. В некоторых вариантах осуществления первичный сигнальный домен содержит модифицированный ITAM-содержащий первичный внутриклеточный сигнальный домен, например, оптимизированный и/или усеченный ITAM-содержащий первичный внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления первичный сигнальный домен содержит один, два, три, четыре или больше мотивов ITAM.In some embodiments, the primary signaling domain comprises a modified ITAM domain, such as a mutant ITAM domain that has altered (e.g., increased or decreased) activity compared to a native ITAM domain. In some embodiments, the primary signaling domain comprises a modified ITAM-containing primary intracellular signaling domain, such as an optimized and/or truncated ITAM-containing primary intracellular signaling domain. In some embodiments, the primary signaling domain comprises one, two, three, four, or more ITAM motifs.
Дополнительные примеры молекул, содержащих первичный внутриклеточный сигнальный домен, являющихся особенно применимыми в настоящем изобретении, включают молекулы DAP10, DAP12 и CD32.Further examples of primary intracellular signaling domain-containing molecules that are particularly useful in the present invention include DAP10, DAP12 and CD32 molecules.
Внутриклеточный сигнальный домен CAR может содержать первичный сигнальный домен, например, сигнальный домен CD3-дзета, в отдельности или в комбинации с любым(любыми) другим(другими) требуемым(требуемыми) внутриклеточным(внутриклеточными) сигнальным(сигнальными) доменом(доменами), применимым(применимыми) в качестве составной части CAR по настоящему изобретению. Например, внутриклеточный сигнальный домен CAR может содержать первичный сигнальный домен, например, часть дзета-цепи CD3, и костимулирующий сигнальный домен. Костимулирующий сигнальный домен относится к части CAR, содержащей внутриклеточный домен костимулирующей молекулы. Костимулирующая молекула представляет собой молекулу клеточной поверхности, отличную от антигенного рецептора или его лигандов, которая необходима для эффективного ответа лимфоцитов на антиген. Примеры такой молекулы включают молекулу MHC I класса, белковые рецепторы TNF, иммуноглобулиноподобные белки, рецепторы цитокинов, интегрины, сигнальные молекулы активации лимфоцитов (белки SLAM), активирующие рецепторы NK-клеток, BTLA, лиганд Toll-подобного рецептора, OX40, CD2, CD7, CD27, CD28, CD30, CD40, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), 4-1BB (CD137), B7-H3, CDS, ICAM-1, ICOS (CD278), GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-альфа, CD8-бета, IL2R-бета, IL2R-гамма, IL7R-альфа, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, LFA-1, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a и лиганд, который специфично связывается с CD83, и т. п. Например, было продемонстрировано, что костимуляция с помощью CD27 усиливает размножение, эффекторную функцию и выживание CAR-T-клеток человека in vitro и усиливает персистенцию и противоопухолевую активность T-клеток человека in vivo (Song et al. Blood. 2012; 119(3):696-706). Внутриклеточные сигнальные последовательности в цитоплазматической части CAR по настоящему изобретению могут быть связаны друг с другом в случайном или установленном порядке. Короткий олиго- или полипептидный линкер, например, длиной от 2 до 10 аминокислот (например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 аминокислот) необязательно может образовывать связь между внутриклеточными сигнальными последовательностями. В некоторых вариантах осуществления в качестве подходящего линкера может применяться глицин-сериновый дублет. В некоторых вариантах осуществления в качестве подходящего линкера может применяться одна аминокислота, например, аланин, глицин.The intracellular signaling domain of the CAR may comprise a primary signaling domain, such as a CD3 zeta signaling domain, alone or in combination with any other desired intracellular signaling domain(s) useful as part of the CAR of the present invention. For example, the intracellular signaling domain of the CAR may comprise a primary signaling domain, such as a portion of the CD3 zeta chain, and a costimulatory signaling domain. The costimulatory signaling domain refers to the portion of the CAR that comprises the intracellular domain of a costimulatory molecule. A costimulatory molecule is a cell surface molecule, other than an antigen receptor or its ligands, that is necessary for an effective lymphocyte response to an antigen. Examples of such a molecule include MHC class I molecule, TNF protein receptors, immunoglobulin-like proteins, cytokine receptors, integrins, signaling lymphocyte activation molecules (SLAM proteins), NK cell activating receptors, BTLA, Toll-like receptor ligand, OX40, CD2, CD7, CD27, CD28, CD30, CD40, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), 4-1BB (CD137), B7-H3, CDS, ICAM-1, ICOS (CD278), GITR, BAFFR, LIGHT, HVEM (LIGHTR), KIRDS2, SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD19, CD4, CD8-alpha, CD8-beta, IL2R-beta, IL2R-gamma, IL7R-alpha, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, LFA-1, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a and a ligand that specifically binds to CD83, etc. For example, costimulation with CD27 has been demonstrated to enhance the expansion, effector function and survival of human CAR T cells in vitro and enhance the persistence and antitumor activity of human T cells in vivo (Song et al. Blood. 2012; 119(3):696-706). The intracellular signal sequences in the cytoplasmic portion of the CAR of the present invention may be linked to each other in a random or fixed order. A short oligo- or polypeptide linker, for example, 2 to 10 amino acids in length (e.g., 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, or 10 amino acids) may optionally form a link between the intracellular signal sequences. In some embodiments, a glycine-serine doublet may be used as a suitable linker. In some embodiments, a single amino acid, such as alanine, glycine, may be used as a suitable linker.
В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен разработан таким образом, что он содержит два или более, например, 2, 3, 4, 5 или более, костимулирующих сигнальных доменов. В некоторых вариантах осуществления два или более, например, 2, 3, 4, 5 или более, костимулирующих сигнальных доменов разделены линкерной молекулой, например, линкерной молекулой, описанной в данном документе. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен содержит два костимулирующих сигнальных домена. В некоторых вариантах осуществления линкерная молекула представляет собой глициновый остаток. В некоторых вариантах осуществления линкер представляет собой аланиновый остаток.In some embodiments, the intracellular signaling domain is designed to comprise two or more, such as 2, 3, 4, 5, or more, costimulatory signaling domains. In some embodiments, the two or more, such as 2, 3, 4, 5, or more, costimulatory signaling domains are separated by a linker molecule, such as a linker molecule described herein. In some embodiments, the intracellular signaling domain comprises two costimulatory signaling domains. In some embodiments, the linker molecule is a glycine residue. In some embodiments, the linker is an alanine residue.
В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен разработан таким образом, что он содержит сигнальный домен CD3-дзета и сигнальный домен CD28. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен разработан таким образом, что он содержит сигнальный домен CD3-дзета и сигнальный домен 4-1BB. В некоторых вариантах осуществления сигнальный домен 4-1BB представляет собой сигнальный домен под SEQ ID NO: 7. В некоторых вариантах осуществления сигнальный домен CD3-дзета представляет собой сигнальный домен под SEQ ID NO: 9 (мутантный CD3-дзета) или SEQ ID NO: 10 (CD3-дзета человека дикого типа).In some embodiments, the intracellular signaling domain is designed to comprise a CD3-zeta signaling domain and a CD28 signaling domain. In some embodiments, the intracellular signaling domain is designed to comprise a CD3-zeta signaling domain and a 4-1BB signaling domain. In some embodiments, the 4-1BB signaling domain is the signaling domain of SEQ ID NO: 7. In some embodiments, the CD3-zeta signaling domain is the signaling domain of SEQ ID NO: 9 (mutant CD3-zeta) or SEQ ID NO: 10 (wild-type human CD3-zeta).
В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен разработан таким образом, что он содержит сигнальный домен CD3-дзета и сигнальный домен CD27. В некоторых вариантах осуществления сигнальный домен CD27 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 8. В некоторых вариантах осуществления сигнальный домен CD27 кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 19.In some embodiments, the intracellular signaling domain is designed to comprise a CD3-zeta signaling domain and a CD27 signaling domain. In some embodiments, the CD27 signaling domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8. In some embodiments, the CD27 signaling domain is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 19.
В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный домен разработан таким образом, что он содержит сигнальный домен CD3-дзета и сигнальный домен CD28. В некоторых вариантах осуществления сигнальный домен CD28 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 36. В некоторых вариантах осуществления сигнальный домен CD28 кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 37.In some embodiments, the intracellular domain is designed to comprise a CD3-zeta signaling domain and a CD28 signaling domain. In some embodiments, the CD28 signaling domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 36. In some embodiments, the CD28 signaling domain is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 37.
В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный домен разработан таким образом, что он содержит сигнальный домен CD3-дзета и сигнальный домен ICOS. В некоторых вариантах осуществления сигнальный домен ICOS содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 38. В некоторых вариантах осуществления сигнальный домен ICOS кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 39.In some embodiments, the intracellular domain is designed to comprise a CD3-zeta signaling domain and an ICOS signaling domain. In some embodiments, the ICOS signaling domain comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 38. In some embodiments, the ICOS signaling domain is encoded by the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 39.
Конфигурации CARCAR Configurations
Двойные CARDouble CARs
В одном варианте осуществления иммунная клетка (например, T-клетка или NK-клетка) экспрессирует два CAR, например, первый CAR, который связывается с первым антигеном, и второй CAR, который связывается со вторым антигеном. В одном варианте осуществления первый антиген и второй антиген являются разными. В одном варианте осуществления первый или второй антиген выбран из антигена, экспрессируемого на B-клетках, антигена, экспрессируемого на клетках острого миелоидного лейкоза, или антигена на клетках солидной опухоли. В одном варианте осуществления первый или второй антиген выбран из CD10, CD19, CD20, CD22, CD34, CD123, BCMA, FLT-3, ROR1, CD79b, CD179b, CD79a, CD34, CLL-1, рецептора фолиевой кислоты бета, FLT3, EGFRvIII, мезотелина, EGFRvIII, GD2, Tn-антигена, sTn-антигена, Tn-O-гликопептидов, sTn-O-гликопептидов, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, легумана, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, антигена Y системы Льюис, CD24, PDGFR-бета, SSEA-4, рецептора фолиевой кислоты альфа, ERBB (например, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, эфрина B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-ацетил-GD2, рецептора фолиевой кислоты бета, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, легумаина, E6 или E7 HPV, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, полисиаловой кислоты, Fos-родственного антигена, эластазы нейтрофилов, TRP-2, CYP1B1, белка спермы 17, бета-субъединицы хорионического гонадотропина человека, AFP, тиреоглобулина, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, обратной транскриптазы теломеразы человека, кишечной карбоксилэстеразы, мутантного варианта hsp 70-2, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4 или пептида любого из этих антигенов, презентированного на MHC.In one embodiment, an immune cell (e.g., a T cell or an NK cell) expresses two CARs, such as a first CAR that binds to a first antigen and a second CAR that binds to a second antigen. In one embodiment, the first antigen and the second antigen are different. In one embodiment, the first or second antigen is selected from an antigen expressed on B cells, an antigen expressed on acute myeloid leukemia cells, or an antigen on solid tumor cells. In one embodiment, the first or second antigen is selected from CD10, CD19, CD20, CD22, CD34, CD123, BCMA, FLT-3, ROR1, CD79b, CD179b, CD79a, CD34, CLL-1, folate receptor beta, FLT3, EGFRvIII, mesothelin, EGFRvIII, GD2, Tn antigen, sTn antigen, Tn-O-glycopeptides, sTn-O-glycopeptides, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, leguman, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, Lewis Y antigen, CD24, PDGFR-beta, SSEA-4, folate receptor alpha, ERBB (eg, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, ephrin B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-acetyl-GD2, folate receptor beta, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, legumain, HPV E6 or E7, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, polysialic acid, Fos-related antigen, neutrophil elastase, TRP-2, CYP1B1, sperm protein 17, human chorionic gonadotropin beta, AFP, thyroglobulin, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, human telomerase reverse transcriptase, intestinal carboxylesterase, mutant hsp 70-2, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4, or a peptide of any of these antigens presented on MHC.
В одном варианте осуществления первый антиген представляет собой CD19. В одном варианте осуществления второй антиген не представляет собой CD19. В одном варианте осуществления второй антиген представляет собой антиген, раскрытый в данном документе, который не представляет собой CD19.In one embodiment, the first antigen is CD19. In one embodiment, the second antigen is not CD19. In one embodiment, the second antigen is an antigen disclosed herein that is not CD19.
В одном варианте осуществления первый антиген представляет собой BCMA. В одном варианте осуществления второй антиген не представляет собой BCMA. В одном варианте осуществления второй антиген представляет собой антиген, раскрытый в данном документе, который не представляет собой BCMA. В одном варианте осуществления второй антиген выбран из антигена, экспрессируемого на B-клетках, антигена, экспрессируемого на клетках острого миелоидного лейкоза, или антигена на клетках солидной опухоли. В одном варианте осуществления второй антиген выбран из CD10, CD19, CD20, CD22, CD34, CD123, FLT-3, ROR1, CD79b, CD179b, CD79a, CD34, CLL-1, рецептора фолиевой кислоты бета, FLT3, EGFRvIII, мезотелина, EGFRvIII, GD2, Tn-антигена, sTn-антигена, Tn-O-гликопептидов, sTn-O-гликопептидов, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, легумана, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, антигена Y системы Льюис, CD24, PDGFR-бета, SSEA-4, рецептора фолиевой кислоты альфа, ERBB (например, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, эфрина B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-ацетил-GD2, рецептора фолиевой кислоты бета, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, легумаина, E6 или E7 HPV, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, полисиаловой кислоты, Fos-родственного антигена, эластазы нейтрофилов, TRP-2, CYP1B1, белка спермы 17, бета-субъединицы хорионического гонадотропина человека, AFP, тиреоглобулина, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, обратной транскриптазы теломеразы человека, кишечной карбоксилэстеразы, мутантного варианта hsp 70-2, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4 или пептида любого из этих антигенов, презентированного на MHC. В одном варианте осуществления первый антиген представляет собой BCMA, а второй антиген представляет собой CD19.In one embodiment, the first antigen is BCMA. In one embodiment, the second antigen is not BCMA. In one embodiment, the second antigen is an antigen disclosed herein that is not BCMA. In one embodiment, the second antigen is selected from an antigen expressed on B cells, an antigen expressed on acute myeloid leukemia cells, or an antigen on solid tumor cells. In one embodiment, the second antigen is selected from CD10, CD19, CD20, CD22, CD34, CD123, FLT-3, ROR1, CD79b, CD179b, CD79a, CD34, CLL-1, folate receptor beta, FLT3, EGFRvIII, mesothelin, EGFRvIII, GD2, Tn antigen, sTn antigen, Tn-O-glycopeptides, sTn-O-glycopeptides, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, leguman, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, Lewis Y antigen, CD24, PDGFR-beta, SSEA-4, folate receptor alpha, ERBB (eg, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, ephrin B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-acetyl-GD2, folate receptor beta, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, legumain, HPV E6 or E7, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, polysialic acid, Fos-related antigen, neutrophil elastase, TRP-2, CYP1B1, sperm protein 17, human chorionic gonadotropin beta, AFP, thyroglobulin, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, human telomerase reverse transcriptase, intestinal carboxylesterase, mutant variant hsp 70-2, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4, or a peptide of any of these antigens presented on MHC. In one embodiment, the first antigen is BCMA and the second antigen is CD19.
В одном варианте осуществления первый CAR кодируется первой последовательностью нуклеиновой кислоты. В одном варианте осуществления второй CAR кодируется второй последовательностью нуклеиновой кислоты. В одном варианте осуществления первая и вторая последовательности нуклеиновой кислоты расположены в одной молекуле нуклеиновой кислоты. В одном варианте осуществления первая и вторая последовательности нуклеиновой кислоты расположены в отдельных молекулах нуклеиновой кислоты. В одном варианте осуществления молекула нуклеиновой кислоты или молекулы нуклеиновой кислоты представляют собой молекулы ДНК или РНК. В ряде вариантов осуществления первая и вторая последовательности нуклеиновой кислоты находятся в одинаковой ориентации, например, транскрипция первой и второй последовательностей нуклеиновой кислоты происходит в одном и том же направлении. В ряде вариантов осуществления первая и вторая последовательности нуклеиновой кислоты находятся в разных ориентациях. В ряде вариантов осуществления один промотор контролирует экспрессию первой и второй последовательностей нуклеиновой кислоты. В ряде вариантов осуществления нуклеиновая кислота, кодирующая сайт расщепления протеазами (такой как сайт расщепления T2A, P2A, E2A или F2A), находится между первой и второй последовательностями нуклеиновой кислоты. В ряде вариантов осуществления сайт расщепления протеазами размещен таким образом, что клетка может экспрессировать слитый белок, содержащий первый CAR и второй CAR, и слитый белок впоследствии подвергается процессингу посредством протеолитического расщепления с образованием двух пептидов. В некоторых вариантах осуществления первая последовательность нуклеиновой кислоты расположена выше второй последовательности нуклеиновой кислоты, или вторая последовательность нуклеиновой кислоты расположена выше первой последовательности нуклеиновой кислоты. В ряде вариантов осуществления первый промотор контролирует экспрессию первой последовательности нуклеиновой кислоты, а второй промотор контролирует экспрессию второй последовательности нуклеиновой кислоты. В ряде вариантов осуществления молекула нуклеиновой кислоты представляет собой плазмиду. В ряде вариантов осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит вирусный элемент упаковки. В ряде вариантов осуществления иммунная клетка может содержать протеазу (например, эндогенную или экзогенную протеазу), которая расщепляет сайт расщепления T2A, P2A, E2A или F2A.In one embodiment, the first CAR is encoded by a first nucleic acid sequence. In one embodiment, the second CAR is encoded by a second nucleic acid sequence. In one embodiment, the first and second nucleic acid sequences are located on a single nucleic acid molecule. In one embodiment, the first and second nucleic acid sequences are located on separate nucleic acid molecules. In one embodiment, the nucleic acid molecule or molecules are DNA or RNA molecules. In some embodiments, the first and second nucleic acid sequences are in the same orientation, such that transcription of the first and second nucleic acid sequences occurs in the same direction. In some embodiments, the first and second nucleic acid sequences are in different orientations. In some embodiments, a single promoter controls expression of the first and second nucleic acid sequences. In some embodiments, a nucleic acid encoding a protease cleavage site (such as a T2A, P2A, E2A, or F2A cleavage site) is located between the first and second nucleic acid sequences. In some embodiments, the protease cleavage site is positioned such that the cell can express a fusion protein comprising a first CAR and a second CAR, and the fusion protein is subsequently processed by proteolytic cleavage to form two peptides. In some embodiments, the first nucleic acid sequence is located upstream of the second nucleic acid sequence, or the second nucleic acid sequence is located upstream of the first nucleic acid sequence. In some embodiments, the first promoter controls expression of the first nucleic acid sequence, and the second promoter controls expression of the second nucleic acid sequence. In some embodiments, the nucleic acid molecule is a plasmid. In some embodiments, the nucleic acid molecule comprises a viral packaging element. In some embodiments, the immune cell may comprise a protease (e.g., an endogenous or exogenous protease) that cleaves a T2A, P2A, E2A, or F2A cleavage site.
В одном варианте осуществления первый CAR содержит первый антигенсвязывающий домен, а второй CAR содержит второй антигенсвязывающий домен. В одном варианте осуществления первый или второй антигенсвязывающий домен содержит CDR, VH, VL или scFv, раскрытые в данном документе, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними. В одном варианте осуществления первый или второй антигенсвязывающий домен содержит CDR, VH, VL или scFv антигенсвязывающего домена для BCMA, раскрытого в данном документе (например, аминокислотную последовательность, раскрытую в таблицах 3-15, 19, 20, 22 и 26, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней). В одном варианте осуществления первый или второй антигенсвязывающий домен содержит CDR, VH, VL или scFv антигенсвязывающего домена для CD19, раскрытого в данном документе (например, аминокислотную последовательность, раскрытую в таблицах 2, 19 и 22, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней).In one embodiment, the first CAR comprises a first antigen-binding domain and the second CAR comprises a second antigen-binding domain. In one embodiment, the first or second antigen-binding domain comprises a CDR, VH, VL, or scFv disclosed herein, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In one embodiment, the first or second antigen-binding domain comprises a CDR, VH, VL, or scFv of an antigen-binding domain for BCMA disclosed herein (e.g., an amino acid sequence disclosed in Tables 3-15, 19, 20, 22, and 26, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto). In one embodiment, the first or second antigen-binding domain comprises a CDR, VH, VL, or scFv of an antigen-binding domain for CD19 disclosed herein (e.g., an amino acid sequence disclosed in Tables 2, 19, and 22, or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto).
В одном варианте осуществления первый антиген представляет собой BCMA, а второй антиген представляет собой CD19. В одном варианте осуществления иммунная клетка (например, T-клетка или NK-клетка) экспрессирует CAR для BCMA, например, CAR для BCMA, описанный в данном документе, и CAR для CD19, например, CAR для CD19, описанный в данном документе. В одном варианте осуществления иммунная клетка (например, T-клетка или NK-клетка) содержит первую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR для BCMA, например, CAR для BCMA, описанный в данном документе, и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR для CD19, например, CAR для CD19, описанный в данном документе. В таблице 19 показаны иллюстративные аминокислотные последовательности и последовательности нуклеиновой кислоты конструкций двойных CAR.In one embodiment, the first antigen is BCMA and the second antigen is CD19. In one embodiment, the immune cell (e.g., a T cell or NK cell) expresses a CAR for BCMA, such as a CAR for BCMA described herein, and a CAR for CD19, such as a CAR for CD19 described herein. In one embodiment, the immune cell (e.g., a T cell or NK cell) comprises a first nucleic acid sequence encoding a CAR for BCMA, such as a CAR for BCMA described herein, and a second nucleic acid sequence encoding a CAR for CD19, such as a CAR for CD19 described herein. Table 19 shows exemplary amino acid sequences and nucleic acid sequences of dual CAR constructs.
(в плече CAR для BCMA)Signal peptide
(in the CAR arm for BCMA)
(в плече CAR для BCMA)Hinge region and transmembrane domain
(in the CAR arm for BCMA)
(в плече CAR для BCMA)Hinge area
(in the CAR arm for BCMA)
(в плече CAR для BCMA)Transmembrane domain
(in the CAR arm for BCMA)
(в плече CAR для BCMA)4-1BB
(in the CAR arm for BCMA)
(в плече CAR для BCMA)CD3-zeta
(in the CAR arm for BCMA)
(в плече CAR для CD19)Signal peptide
(in the CAR arm for CD19)
(в плече CAR для CD19)Hinge region and transmembrane domain
(in CAR arm for CD19)
(в плече CAR для CD19)Hinge area
(in CAR arm for CD19)
(в плече CAR для CD19)Transmembrane domain
(in CAR arm for CD19)
(в плече CAR для CD19)4-1BB
(in CAR arm for CD19)
(в плече CAR для CD19)CD3-zeta
(in CAR arm for CD19)
R1G5-P2A-duCD19.1Predicted proteins obtained from
R1G5-P2A-duCD19.1
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARREWWGESWLFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPLTFGQGTKVEIKTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGSGATNFSLLKQAGDVEENPG (SEQ ID NO: 224)
Плечо CAR для CD19:
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 225)CAR Shoulder for BCMA:
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARREWWGESWLFDYWGQGTLVTVSSGG GGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPLTFGQGTKVE IKTTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADA PAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGSGATNFSLLKQAGDVEENPG (SEQ ID NO: 224)
CAR Shoulder for CD19:
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGG SGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYW GQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEE GGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 225)
PI61-P2A-duCD19.1Predicted proteins obtained from
PI61-P2A-duCD19.1
QVQLQESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSSYGMHWVRQAPGKGLEWVAVISYDGSNKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCGGSGYALHDDYYGLDVWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSQSALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSYTSSSTLYVFGSGTKVTVLTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGSGATNFSLLKQAGDVEENPG (SEQ ID NO: 226)
Плечо CAR для CD19:
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 225)CAR Shoulder for BCMA:
QVQLQESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFFSSYGMHWVRQAPGKGLEWVAVISYDGSNKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCGGSGYALHDDYYGLDVWGQGTLVTVSS GGGGSGGGGSGGGGSQSALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSNRPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSYTSSSTLYVFGSGTKV TVLTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSAD APAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGSGATNFSLLKQAGDVEENPG (SEQ ID NO: 226)
CAR Shoulder for CD19:
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGG SGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYW GQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEE GGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 225)
R1B6-P2A-duCD19.1Predicted proteins obtained from
R1B6-P2A-duCD19.1
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARREWVPYDVSWYFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPLTFGQGTKVEIKTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGSGATNFSLLKQAGDVEENPG (SEQ ID NO: 227)
Плечо CAR для CD19:
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 225)CAR Shoulder for BCMA:
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARREWVPYDVSWYFDYWGQGTLVTVSS GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPLTFGQGTKV EIKTTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSAD APAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGSGATNFSLLKQAGDVEENPG (SEQ ID NO: 227)
CAR Shoulder for CD19:
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGG SGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYW GQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEE GGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 225)
duBCMA.4-P2A-duCD19.1Predicted proteins obtained from
duBCMA.4-P2A-duCD19.1
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAVSGFALSNHGMSWVRRAPGKGLEWVSGIVYSGSTYYAASVKGRFTISRDNSRNTLYLQMNSLRPEDTAIYYCSAHGGESDVWGQGTTVTVSSASGGGGSGGGGSGGGGSDIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPYTFGQGTKVEIKTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGSGATNFSLLKQAGDVEENPG (SEQ ID NO: 228)
Плечо CAR для CD19:
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 225)CAR Shoulder for BCMA:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAVSGFALSNHGMSWVRRAPGKGLEWVSGIVYSGSTYYAASVKGRFTISRDNSRNTLYLQMNSLRPEDTAIYYCSAHGGESDVWGQGTTVTVSSASGGG GSGGGGSGGGGSDIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPYTFGQGTKVEIKTT TPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPA YQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGSGATNFSLLKQAGDVEENPG (SEQ ID NO: 228)
CAR Shoulder for CD19:
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGG SGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYW GQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEE GGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 225)
duCD19.1-P2A-duBCMA.4Predicted proteins obtained from
duCD19.1-P2A-duBCMA.4
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGSGATNFSLLKQAGDVEENPG (SEQ ID NO: 229)
Плечо CAR для BCMA:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAVSGFALSNHGMSWVRRAPGKGLEWVSGIVYSGSTYYAASVKGRFTISRDNSRNTLYLQMNSLRPEDTAIYYCSAHGGESDVWGQGTTVTVSSASGGGGSGGGGSGGGGSDIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPYTFGQGTKVEIKTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 230)CAR Shoulder for CD19:
EIVMTQSPATLSLSPGERATLSCRASQDISKYLNWYQQKPGQAPRLLIYHTSRLHSGIPARFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFAVYFCQQGNTLPYTFGQGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGG SQVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPGKGLEWIGVIWGSETTYYQSSLKSRVTISKDNSKNQVSLKLSSVTAADTAVYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTLVTVSST TTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAP AYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGSGATNFSLLKQAGDVEENPG (SEQ ID NO: 229)
CAR Shoulder for BCMA:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAVSGFALSNHGMSWVRRAPGKGLEWVSGIVYSGSTYYAASVKGRFTISRDNSRNTLYLQMNSLRPEDTAIYYCSAHGGESDVWGQGTTVTVSS ASGGGGSGGGGSGGGGSDIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPYTFG QGTKVEIKTTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEG GCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR (SEQ ID NO: 230)
описаниеName/
description
В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыта выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая первую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую первый полипептид CAR, и вторую последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую второй полипептид CAR, где первый полипептид CAR содержит первый антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий BCMA (например, человеческий домен, связывающий BCMA), первый трансмембранный домен и первый внутриклеточный сигнальный домен, и где второй полипептид CAR содержит второй антигенсвязывающий домен, который представляет собой домен, связывающий CD19, второй трансмембранный домен и второй внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления первый полипептид CAR содержит VH, содержащую CDR1 HC, CDR2 HC и CDR3 HC последовательности, связывающей BCMA, представленные в таблице 20 или 26, и VL, содержащую CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC последовательности, связывающей BCMA, представленные в таблице 20 или 26, где VH и VL соединены линкером, содержащим аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 243. В определенном варианте осуществления первый полипептид CAR содержит VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 239 и 242 соответственно, где VH и VL соединены линкером, содержащим аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 243. В определенном варианте осуществления первый полипептид CAR содержит scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 200. В определенном варианте осуществления первый полипептид CAR содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 230 или 228. В некоторых вариантах осуществления второй полипептид CAR содержит CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и/или CDR3 LC последовательности, связывающей CD19, представленные в таблице 19 или таблице 22 (например, CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC и CDR3 LC, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 295 и 245-249 соответственно). В некоторых вариантах осуществления второй полипептид CAR содержит VH и/или VL последовательности, связывающей CD19, представленные в таблице 19 или таблице 22 (например, VH и VL, содержащие аминокислотные последовательности под SEQ ID NO: 250 и 251 соответственно), или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ними. В некоторых вариантах осуществления второй полипептид CAR содержит scFv последовательности, связывающей CD19, представленный в таблице 19 или таблице 22 (например, scFv, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 211), или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ним. В некоторых вариантах осуществления второй полипептид CAR включает в себя полипептид CAR с последовательностью, связывающей CD19, представленный в таблице 19 или таблице 22 (например, полипептид CAR, содержащий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 225 или 229), или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ним. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты содержит последовательность нуклеиновой кислоты под SEQ ID NO: 221 или 223. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты кодирует аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 220 или 222 с сигнальным пептидом или без сигнального пептида под SEQ ID NO: 1.In some embodiments, disclosed herein is an isolated nucleic acid molecule comprising a first nucleic acid sequence encoding a first CAR polypeptide and a second nucleic acid sequence encoding a second CAR polypeptide, wherein the first CAR polypeptide comprises a first antigen-binding domain that is a BCMA binding domain (e.g., a human BCMA binding domain), a first transmembrane domain, and a first intracellular signaling domain, and wherein the second CAR polypeptide comprises a second antigen-binding domain that is a CD19 binding domain, a second transmembrane domain, and a second intracellular signaling domain. In some embodiments, the first CAR polypeptide comprises a VH comprising the HC CDR1, HC CDR2, and HC CDR3 of a BCMA binding sequence set forth in Table 20 or 26, and a VL comprising the LC CDR1, LC CDR2, and LC CDR3 of a BCMA binding sequence set forth in Table 20 or 26, wherein the VH and VL are connected by a linker comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 243. In a certain embodiment, the first CAR polypeptide comprises a VH and VL comprising the amino acid sequences of SEQ ID NO: 239 and 242, respectively, wherein the VH and VL are connected by a linker comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 243. In a certain embodiment, the first CAR polypeptide comprises an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 200. In a certain embodiment, the first CAR polypeptide comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 230 or 228. In some embodiments, the second CAR polypeptide comprises a CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and/or CDR3 LC of a CD19 binding sequence set forth in Table 19 or Table 22 (e.g., CDR1 HC, CDR2 HC, CDR3 HC, CDR1 LC, CDR2 LC, and CDR3 LC comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 295 and 245-249, respectively). In some embodiments, the second CAR polypeptide comprises a VH and/or VL of the CD19 binding sequence set forth in Table 19 or Table 22 (e.g., a VH and VL comprising the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 250 and 251, respectively), or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the second CAR polypeptide comprises a scFv of the CD19 binding sequence set forth in Table 19 or Table 22 (e.g., an scFv comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 211), or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the second CAR polypeptide comprises a CAR polypeptide with a CD19 binding sequence shown in Table 19 or Table 22 (e.g., a CAR polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225 or 229), or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, the nucleic acid molecule comprises the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 221 or 223. In some embodiments, the nucleic acid molecule encodes the amino acid sequence of SEQ ID NO: 220 or 222 with or without the signal peptide of SEQ ID NO: 1.
Полиспецифические CARPolyspecific CARs
В одном варианте осуществления CAR по настоящему изобретению представляет собой полиспецифический CAR. В одном варианте осуществления полиспецифический CAR представляет собой биспецифический CAR. В одном варианте осуществления биспецифический CAR содержит антигенсвязывающий домен, который представляет собой молекулу биспецифического антитела. Биспецифическое антитело характеризуется специфичностью в отношении не более чем двух антигенов. Молекула биспецифического антитела характеризуется наличием первой последовательности вариабельного домена иммуноглобулина, которая характеризуется специфичностью связывания с первым эпитопом, и второй последовательности вариабельного домена иммуноглобулина, которая характеризуется специфичностью связывания со вторым эпитопом. В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы находятся на одном и том же антигене, например, на одном и том же белке (или субъединице мультимерного белка). В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы перекрываются. В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы не перекрываются. В одном варианте осуществления первый и второй эпитопы находятся на разных антигенах, например, на разных белках (или на разных субъединицах мультимерного белка). В одном варианте осуществления молекула биспецифического антитела содержит последовательность вариабельного домена тяжелой цепи и последовательность вариабельного домена легкой цепи, которые характеризуются специфичностью связывания с первым эпитопом, и последовательность вариабельного домена тяжелой цепи и последовательность вариабельного домена легкой цепи, которые характеризуются специфичностью связывания со вторым эпитопом. В одном варианте осуществления молекула биспецифического антитела содержит полуантитело, характеризующееся специфичностью связывания с первым эпитопом, и полуантитело, характеризующееся специфичностью связывания со вторым эпитопом. В одном варианте осуществления молекула биспецифического антитела содержит полуантитело или его фрагмент, характеризующиеся специфичностью связывания с первым эпитопом, и полуантитело или его фрагмент, характеризующиеся специфичностью связывания со вторым эпитопом. В одном варианте осуществления молекула биспецифического антитела содержит scFv или его фрагмент, характеризующиеся специфичностью связывания с первым эпитопом, и scFv или его фрагмент, характеризующиеся специфичностью связывания со вторым эпитопом.In one embodiment, a CAR of the present invention is a multispecific CAR. In one embodiment, the multispecific CAR is a bispecific CAR. In one embodiment, the bispecific CAR comprises an antigen-binding domain that is a bispecific antibody molecule. The bispecific antibody is specific for up to two antigens. The bispecific antibody molecule is characterized by having a first immunoglobulin variable domain sequence that has binding specificity for a first epitope and a second immunoglobulin variable domain sequence that has binding specificity for a second epitope. In one embodiment, the first and second epitopes are on the same antigen, such as on the same protein (or subunit of a multimeric protein). In one embodiment, the first and second epitopes overlap. In one embodiment, the first and second epitopes do not overlap. In one embodiment, the first and second epitopes are on different antigens, such as on different proteins (or on different subunits of a multimeric protein). In one embodiment, the bispecific antibody molecule comprises a heavy chain variable domain sequence and a light chain variable domain sequence that have binding specificity for a first epitope, and a heavy chain variable domain sequence and a light chain variable domain sequence that have binding specificity for a second epitope. In one embodiment, the bispecific antibody molecule comprises a half-antibody that has binding specificity for a first epitope and a half-antibody that has binding specificity for a second epitope. In one embodiment, the bispecific antibody molecule comprises a half-antibody or fragment thereof that has binding specificity for a first epitope and a half-antibody or fragment thereof that has binding specificity for a second epitope. In one embodiment, the bispecific antibody molecule comprises an scFv or fragment thereof characterized by binding specificity to a first epitope and an scFv or fragment thereof characterized by binding specificity to a second epitope.
В некоторых вариантах осуществления CAR по настоящему изобретению содержит антигенсвязывающий домен, который представляет собой молекулу полиспецифического (например, биспецифического или триспецифического) антитела. Протоколы получения молекул биспецифических или гетеродимерных антител известны из уровня техники, включая без ограничения, например, подход "выступ во впадину", как описано, например, в US 5731168; спаривание Fc с использованием направленного электростатического взаимодействия, как описано, например, в WO 09/089004, WO 06/106905 и WO 2010/129304; образование гетеродимеров путем конструирования доменов с обменом нитей (SEED), как описано, например, в WO 07/110205; обмен Fab-фрагментами, как описано, например, в WO 08/119353, WO 2011/131746 и WO 2013/060867; двойные конъюгаты антител, например, получаемые путем сшивания антител с образованием биспецифической структуры с помощью гетеробифункционального реагента, содержащего реакционноспособную аминогруппу и реакционноспособную сульфгидрильную группу, как описано, например, в US 4433059; детерминанты биспецифических антител, получаемые путем рекомбинации полуантител (пары тяжелая-легкая цепь или Fab) из разных антител посредством цикла восстановления и окисления дисульфидных связей между двумя тяжелыми цепями, как описано, например, в US 4444878; трифункциональные антитела, например, три Fab'-фрагмента, сшитые с помощью реакционноспособных сульфгидрильных групп, как описано, например, в US5273743; биосинтетические связывающие белки, например, пары scFv, сшитых на С-концевых хвостах, предпочтительно посредством химической сшивки с помощью дисульфидных связей или реакционноспособных аминогрупп, как описано, например, в US5534254; бифункциональные антитела, например, Fab-фрагменты с различной специфичностью связывания, димеризованные с помощью лейциновых "застежек" (например, c-fos и c-jun), заменивших константный домен, как описано, например, в US5582996; биспецифические и олигоспецифические моно- и олиговалентные рецепторы, например, VH-CH1-области двух антител (два Fab-фрагмента), связанные полипептидным спейсером между CH1-областью одного антитела и VH-областью другого антитела, обычно с ассоциированными легкими цепями, как описано, например, в US5591828; биспецифические конъюгаты ДНК-антитело, например, получаемые путем сшивки антител или Fab-фрагментов двухнитевым фрагментом ДНК, как описано, например, в US5635602; биспецифические слитые белки, например, экспрессионную конструкцию, содержащую два scFv с гидрофильным спиральным пептидным линкером между ними и полную константную область, как описано, например, в US5637481; поливалентные и полиспецифические связывающие белки, например, димеры полипептидов, имеющие первый домен со связывающей областью вариабельной области тяжелой цепи Ig и второй домен со связывающей областью вариабельной области легкой цепи Ig, как правило, называемые диателами (также охватываются структуры более высокого порядка для создания биспецифических, триспецифических или тетраспецифических молекул, как описано, например, в US5837242; конструкции миниантител со связанными VL- и VH-цепями, дополнительно соединенными пептидными спейсерами с шарнирной областью и СН3-областью антитела, которые могут быть димеризованы с образованием биспецифических/поливалентных молекул, как описано, например, в US5837821; VH- и VL-домены, связанные коротким пептидным линкером (например, из 5 или 10 аминокислот) или вовсе не имеющие линкера, в любой ориентации, которые могут образовывать димеры с образованием биспецифических диател; тримеры и тетрамеры, как описано, например, в US5844094; нить из VH-доменов (или VL-доменов у представителей семейства), соединенных пептидными связями со сшиваемыми группами на С-конце, дополнительно ассоциированных с VL-доменами с образованием последовательно соединенных Fv (или scFv), как описано, например, в US5864019; и одноцепочечные связывающие полипептиды как с VH-, так и с VL-доменами, связанными пептидным линкером, объединенные в поливалентные структуры посредством нековалентной или химической сшивки с образованием, например, гомобивалентных, гетеробивалентных, тривалентных и тетравалентных структур с использованием формата как типа scFv, так и типа диатела, как описано, например, в US5869620. Дополнительные иллюстративные полиспецифические и биспецифические молекулы и способы их получения можно найти, например, в US 5910573, US 5932448, US 5959083, US 5989830, US 6005079, US 6239259, US 6294353, US 6333396, US 6476198, US 6511663, US 6670453, US 6743896, US 6809185, US 6833441, US 7129330, US 7183076, US 7521056, US 7527787, US 7534866, US 7612181, US 2002004587 A1, US 2002076406 A1, US 2002103345 A1, US 2003207346 A1, US 2003211078 A1, US 2004219643 A1, US 2004220388 A1, US 2004242847 A1, US 2005003403 A1, US 2005004352 A1, US 2005069552 A1, US 2005079170 A1, US 2005100543 A1, US 2005136049 A1, US 2005136051 A1, US 2005163782 A1, US 2005266425 A1, US 2006083747 A1, US 2006120960 A1, US 2006204493 A1, US 2006263367 A1, US 2007004909 A1, US 2007087381 A1, US 2007128150 A1, US 2007141049 A1, US 2007154901 A1, US 2007274985 A1, US 2008050370 A1, US 2008069820 A1, US 2008152645 A1, US 2008171855 A1, US 2008241884 A1, US 2008254512 A1, US 2008260738 A1, US 2009130106 A1, US 2009148905 A1, US 2009155275 A1, US 2009162359 A1, US 2009162360 A1, US 2009175851 A1, US 2009175867 A1, US 2009232811 A1, US 2009234105 A1, US 2009263392 A1, US 2009274649 A1, EP 346087 A2, WO 0006605 A2, WO 02072635 A2, WO 04081051 A1, WO 06020258 A2, WO 2007044887 A2, WO 2007095338 A2, WO 2007137760 A2, WO 2008119353 A1, WO 2009021754 A2, WO 2009068630 A1, WO 9103493 A1, WO 9323537 A1, WO 9409131 A1, WO 9412625 A2, WO 9509917 A1, WO 9637621 A2, WO 9964460 A1. Содержание вышеупомянутых заявок включено в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.In some embodiments, a CAR of the present invention comprises an antigen-binding domain that is a multispecific (e.g., (bispecific or trispecific) antibodies. Protocols for producing bispecific or heterodimeric antibody molecules are known in the art, including, but not limited to, for example, the knob-into-hole approach as described, For example, in US 5731168; Fc pairing using directed electrostatic interaction as described, For example, in WO 09/089004, WO 06/106905 and WO 2010/129304; the formation of heterodimers by strand exchange domain engineering (SEED) as described, For example, in WO 07/110205; Fab fragment exchange as described, For example, in WO 08/119353, WO 2011/131746 and WO 2013/060867; dual antibody conjugates, For example, obtained by crosslinking antibodies to form a bispecific structure using a heterobifunctional reagent containing a reactive amino group and a reactive sulfhydryl group, as described, for example, in US 4,433,059; bispecific antibody determinants obtained by recombination of half-antibodies (heavy-light chain or Fab pairs) from different antibodies through a cycle of reduction and oxidation of disulfide bonds between the two heavy chains, as described, For example, in US 4444878; trifunctional antibodies, For example, three Fab' fragments cross-linked via reactive sulfhydryl groups as described, For example, in US5273743; biosynthetic binding proteins, For example, pairs of scFv cross-linked at the C-terminal tails, preferably by chemical cross-linking via disulfide bonds or reactive amino groups as described, For example, in US5534254; bifunctional antibodies, For example, Fab fragments with different binding specificities dimerized by leucine zippers (For example, c-fos and c-jun), replacing the constant domain as described, for example, in US5582996; bispecific and oligospecific mono- and oligovalent receptors, For example, VH-CH1 regions of two antibodies (two Fab fragments) linked by a polypeptide spacer between the CH1 region of one antibody and the VH region of the other antibody, typically with associated light chains as described, For example, in US5591828; bispecific DNA-antibody conjugates, For example, obtained by cross-linking antibodies or Fab fragments with a double-stranded DNA fragment as described, For example, in US5635602; bispecific fusion proteins, For example, an expression construct comprising two scFvs with a hydrophilic helical peptide linker between them and the entire constant region as described, For example, in US5637481; multivalent and multispecific binding proteins, For example, dimers of polypeptides having a first domain with a binding region of the variable region of an Ig heavy chain and a second domain with a binding region of the variable region of an Ig light chain, generally referred to as diabodies (higher order structures to create bispecific, trispecific or tetraspecific molecules are also encompassed, as described, for example, in US5837242; miniantibody constructs with linked VL and VH chains further linked by peptide spacers to the hinge region and CH3 region of the antibody, which can dimerize to form bispecific/multivalent molecules, as described, For example, in US5837821; VH and VL domains linked by a short peptide linker (For example, of 5 or 10 amino acids) or no linker at all, in any orientation, which can form dimers to form bispecific diabodies; trimers and tetramers, as described, For example, in US5844094; a strand of VH domains (or VL domains in family members) linked by peptide bonds with crosslinkable groups at the C-terminus, further associated with VL domains to form sequentially linked Fv (or scFv), as described, For example, in US5864019; and single-chain binding polypeptides with both VH and VL domains linked by a peptide linker, combined into multivalent structures by non-covalent or chemical cross-linking to form, For example, homobivalent, heterobivalent, trivalent and tetravalent structures using both scFv-type and diabody-type formats as described, For example, in US5869620. Additional exemplary polyspecific and bispecific molecules and methods for making them can be found, for example, in US 5,910,573, US 5,932,448, US 5,959,083, US 5,989,830, US 6,005,079, US 6,239,259, US 6,294,353, US 6,333,396, US 6,476,198, US 6,511,663, US 6,670,453, US 6,743,896, US 6,809,185, US 6,833,441, US 7,129,330, US 7,183,076, US 7,521,056, US 7,527,787, US 7,534,866, US 7,612,181, US 2002,004,587 A1, US 2002076406 A1, US 2002103345 A1, US 2003207346 A1, US 2003211078 A1, US 2004219643 A1, US 2004220388 A1, US 2004242847 A1, US 2005003403 A1, US 2005004352 A1, US 2005069552 A1, US 2005079170 A1, US 2005100543 A1, US 2005136049 A1, US 2005136051 A1, US 2005163782 A1, US 2005266425 A1, US 2006083747 A1, US 2006120960 A1, US 2006204493 A1, US 2006263367 A1, US 2007004909 A1, US 2007087381 A1, US 2007128150 A1, US 2007141049 A1, US 2007154901 A1, US 2007274985 A1, US 2008050370 A1, US 2008069820 A1, US 2008152645 A1, US 2008171855 A1, US 2008241884 A1, US 2008254512 A1, US 2008260738 A1, US 2009130106 A1, US 2009148905 A1, US 2009155275 A1, US 2009162359 A1, US 2009162360 A1, US 2009175851 A1, US 2009175867 A1, US 2009232811 A1, US 2009234105 A1, US 2009263392 A1, US 2009274649 A1, EP 346087 A2, WO 0006605 A2, WO 02072635 A2, WO 04081051 A1, WO 06020258 A2, WO 2007044887 A2, WO 2007095338 A2, WO 2007137760 A2, WO 2008119353 A1, WO 2009021754 A2, WO 2009068630 A1, WO 9103493 A1, WO 9323537 A1, WO 9409131 A1, WO 9412625 A2, WO 9509917 A1, WO 9637621 A2, WO 9964460 A1. The contents of the above-mentioned applications are incorporated herein by reference in their entirety.
В каждом антителе или фрагменте антитела (например, scFv) в молекуле биспецифического антитела VH может находиться выше или ниже VL. В некоторых вариантах осуществления вышерасположенные антитело или фрагмент антитела (например, scFv) имеют такую организацию, при которой их VH (VH1) расположена выше их VL (VL1), а нижерасположенные антитело или фрагмент антитела (например, scFv) имеют такую организацию, при которой их VL (VL2) расположена выше их VH (VH2), так что молекула биспецифического антитела в целом имеет организацию VH1-VL1-VL2-VH2. В других вариантах осуществления вышерасположенные антитело или фрагмент антитела (например, scFv) имеют такую организацию, при которой их VL (VL1) расположена выше их VH (VH1), а нижерасположенные антитело или фрагмент антитела (например, scFv) имеют такую организацию, при которой их VH (VH2) расположена выше их VL (VL2), так что молекула биспецифического антитела в целом имеет организацию VL1-VH1-VH2-VL2. Линкер необязательно располагается между двумя антителами или фрагментами антител (например, scFv), например, между VL1 и VL2, если конструкция имеет организацию VH1-VL1-VL2-VH2, или между VH1 и VH2, если конструкция имеет организацию VL1-VH1-VH2-VL2. Линкер может представлять собой линкер, описанный в данном документе, например, линкер (Gly4-Ser)n, где n равняется 1, 2, 3, 4, 5 или 6, предпочтительно 4 (SEQ ID NO: 26). Обычно линкер между двумя scFv должен иметь достаточную длину для предотвращения неправильного спаривания между доменами двух scFv. Линкер необязательно располагается между VL и VH первого scFv. Линкер необязательно располагается между VL и VH второго scFv. В конструкциях, которые имеют несколько линкеров, любые два или более линкера могут быть одинаковыми или разными. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления биспецифический CAR содержит VL, VH и необязательно один или несколько линкеров в виде организации, описанной в данном документе.In each antibody or antibody fragment (e.g., scFv) in the bispecific antibody molecule, the VH may be located upstream or downstream of the VL. In some embodiments, the upstream antibody or antibody fragment (e.g., scFv) has an organization such that its VH (VH 1 ) is located upstream of its VL (VL 1 ), and the downstream antibody or antibody fragment (e.g., scFv) has an organization such that its VL (VL 2 ) is located upstream of its VH (VH 2 ), such that the bispecific antibody molecule as a whole has an organization of VH 1 -VL 1 -VL 2 -VH 2 . In other embodiments, the upstream antibody or antibody fragment (e.g., scFv) has an organization such that its VL (VL 1 ) is located above its VH (VH 1 ), and the downstream antibody or antibody fragment (e.g., scFv) has an organization such that its VH (VH 2 ) is located above its VL (VL 2 ), such that the bispecific antibody molecule as a whole has an organization of VL 1 -VH 1 -VH 2 -VL 2 . The linker is optionally located between two antibodies or antibody fragments (e.g., scFv), such as between VL 1 and VL 2 if the construct has an organization of VH 1 -VL 1 -VL 2 -VH 2 , or between VH 1 and VH 2 if the construct has an organization of VL 1 -VH 1 -VH 2 -VL 2 . The linker may be a linker as described herein, such as a (Gly 4 -Ser)n linker, wherein n is 1, 2, 3, 4, 5 or 6, preferably 4 (SEQ ID NO: 26). Typically, the linker between two scFvs should be of sufficient length to prevent mispairing between the domains of the two scFvs. The linker is optionally located between the VL and VH of the first scFv. The linker is optionally located between the VL and VH of the second scFv. In constructs that have multiple linkers, any two or more linkers may be the same or different. Accordingly, in some embodiments, the bispecific CAR comprises a VL, a VH and optionally one or more linkers in an organization as described herein.
В одном аспекте молекула биспецифического антитела характеризуется наличием первой последовательности вариабельного домена иммуноглобулина, например, scFv, которая характеризуется специфичностью связывания с BCMA, например, содержит scFv, описанный в данном документе, или содержит CDR легкой цепи и/или CDR тяжелой цепи из scFv для BCMA, описанного в данном документе, и второй последовательности вариабельного домена иммуноглобулина, которая характеризуется специфичностью связывания со вторым эпитопом на другом антигене. В одном аспекте вторая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина характеризуется специфичностью связывания с антигеном, экспрессируемым на клетках AML, например, антигеном, отличным от BCMA. Например, вторая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина характеризуется специфичностью связывания с CD123. В качестве другого примера вторая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина характеризуется специфичностью связывания с CLL-1. В качестве другого примера вторая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина характеризуется специфичностью связывания с CD34. В качестве другого примера вторая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина характеризуется специфичностью связывания с FLT3. Например, вторая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина характеризуется специфичностью связывания с рецептором фолиевой кислоты бета. В некоторых аспектах вторая последовательность вариабельного домена иммуноглобулина характеризуется специфичностью связывания с антигеном, экспрессируемым на B-клетках, например, CD10, CD19, CD20, CD22, CD34, CD123, FLT-3, ROR1, CD79b, CD179b или CD79a.In one aspect, the bispecific antibody molecule is characterized by having a first immunoglobulin variable domain sequence, e.g., an scFv, that has binding specificity for BCMA, e.g., comprises an scFv described herein or comprises a light chain CDR and/or a heavy chain CDR of an scFv for BCMA described herein, and a second immunoglobulin variable domain sequence that has binding specificity for a second epitope on a different antigen. In one aspect, the second immunoglobulin variable domain sequence has binding specificity for an antigen expressed on AML cells, e.g., an antigen other than BCMA. For example, the second immunoglobulin variable domain sequence has binding specificity for CD123. As another example, the second immunoglobulin variable domain sequence has binding specificity for CLL-1. As another example, the second immunoglobulin variable domain sequence is characterized by binding specificity to CD34. As another example, the second immunoglobulin variable domain sequence is characterized by binding specificity to FLT3. For example, the second immunoglobulin variable domain sequence is characterized by binding specificity to the folate receptor beta. In some aspects, the second immunoglobulin variable domain sequence is characterized by binding specificity to an antigen expressed on B cells, such as CD10, CD19, CD20, CD22, CD34, CD123, FLT-3, ROR1, CD79b, CD179b, or CD79a.
CAR в формате диателаCAR in diatel format
В некоторых вариантах осуществления CAR по настоящему изобретению представляет собой биспецифический CAR. В некоторых вариантах осуществления CAR по настоящему изобретению представляет собой CAR в формате диатела. В некоторых вариантах осуществления CAR в формате диатела содержит антигенсвязывающий домен, который связывается с первым антигеном и вторым антигеном. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит VH1, VL1, VH2 и VL2, где VH1 и VL1 связываются с первым антигеном, а VH2 и VL2 связываются со вторым антигеном. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH1 - необязательно линкер 1 ("L1") - VH2 - необязательно линкер 2 ("L2") - VL2 - необязательно линкер 3 ("L3") - VL1 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VL1 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL1 - необязательно L1 - VH2 - необязательно L2 - VL2 - необязательно L3 - VH1 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL1 - необязательно L1 - VL2 - необязательно L2 - VH2 - необязательно L3 - VH1 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VL2 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VL2 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL2 - необязательно L1 - VH1 - необязательно L2 - VL1 - необязательно L3 - VH2 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL2 - необязательно L1 - VL1 - необязательно L2 - VH1 - необязательно L3 - VH2 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH1 - линкер 1 ("L1") - VH2 - линкер 2 ("L2") - VL2 - линкер 3 ("L3") - VL1 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH1 - L1 - VL2 - L2 - VH2 - L3 - VL1 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL1 - L1 - VH2 - L2 - VL2 - L3 - VH1 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL1 - L1 - VL2 - L2 - VH2 - L3 - VH1 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH2 - L1 - VH1 - L2 - VL1 - L3 - VL2 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH2 - L1 - VL1 - L2 - VH1 - L3 - VL2 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL2 - L1 - VH1 - L2 - VL1 - L3 - VH2 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL2 - L1 - VL1 - L2 - VH1 - L3 - VH2 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления вариабельные области слиты с помощью линкера, содержащего аминокислотную последовательность GGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 5). В некоторых вариантах осуществления вариабельные области слиты с помощью линкера, содержащего аминокислотную последовательность GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 63). В некоторых вариантах осуществления L1 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 5. В некоторых вариантах осуществления L2 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 63. В некоторых вариантах осуществления L3 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 5. В некоторых вариантах осуществления VH1, VL1, VH2 или VL2 содержат последовательность CDR, VH или VL, раскрытую в данном документе, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью последовательности с ней. В некоторых вариантах осуществления диатело, раскрытое в данном документе, содержит сконструированный дисульфидный мостик, например, для стабилизации диатела и/или для содействия правильному спариванию VH и VL. В некоторых вариантах осуществления сконструированный дисульфидный мостик находится между вариабельной областью, которая расположена наиболее проксимально относительно шарнирной области (например, областью VH или VL, которая расположена наиболее проксимально относительно шарнирной области), и ее соответствующим партнером по спариванию (например, соответствующей VL или соответствующей VH).In some embodiments, a CAR of the present invention is a bispecific CAR. In some embodiments, a CAR of the present invention is a diabody format CAR. In some embodiments, a diabody format CAR comprises an antigen-binding domain that binds a first antigen and a second antigen. In some embodiments, the antigen-binding domain comprises VH1, VL1, VH2, and VL2, wherein VH1 and VL1 bind the first antigen and VH2 and VL2 bind the second antigen. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VH1-optionally Linker 1 ("L1")-VH2-optionally Linker 2 ("L2")-VL2-optionally Linker 3 ("L3")-VL1 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has a VH1 - optionally L1 - VL2 - optionally L2 - VH2 - optionally L3 - VL1 organization from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has a VL1 - optionally L1 - VH2 - optionally L2 - VL2 - optionally L3 - VH1 organization from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has a VL1 - optionally L1 - VL2 - optionally L2 - VH2 - optionally L3 - VH1 organization from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has a VH2 - optionally L1 - VH1 - optionally L2 - VL1 - optionally L3 - VL2 organization from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VH2 - optionally L1 - VL1 - optionally L2 - VH1 - optionally L3 - VL2 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VL2 - optionally L1 - VH1 - optionally L2 - VL1 - optionally L3 - VH2 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VL2 - optionally L1 - VL1 - optionally L2 - VH1 - optionally L3 - VH2 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VH1 - linker 1 ("L1") - VH2 - linker 2 ("L2") - VL2 - linker 3 ("L3") - VL1 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has a VH1-L1-VL2-L2-VH2-L3-VL1 organization from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has a VL1-L1-VH2-L2-VL2-L3-VH1 organization from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has a VL1-L1-VL2-L2-VH2-L3-VH1 organization from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has a VH2-L1-VH1-L2-VL1-L3-VL2 organization from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has a VH2-L1-VL1-L2-VH1-L3-VL2 organization from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has a VL2-L1-VH1-L2-VL1-L3-VH2 organization from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has a VL2-L1-VL1-L2-VH1-L3-VH2 organization from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the variable regions are fused by a linker comprising the amino acid sequence GGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 5). In some embodiments, the variable regions are fused by a linker comprising the amino acid sequence GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 63). In some embodiments, L1 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5. In some embodiments, L2 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63. In some embodiments, L3 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5. In some embodiments, VH1, VL1, VH2, or VL2 comprises a CDR, VH, or VL sequence disclosed herein or an amino acid sequence having at least about 85%, 90%, 95%, or 99% sequence identity thereto. In some embodiments, a diabody disclosed herein comprises an engineered disulfide bridge, such as to stabilize the diabody and/or to promote proper pairing of the VH and VL. In some embodiments, the engineered disulfide bridge is between the variable region that is located most proximal to the hinge region (e.g., the VH or VL region that is located most proximal to the hinge region) and its corresponding pairing partner (e.g., the corresponding VL or the corresponding VH).
В некоторых вариантах осуществления первый антиген и второй антиген являются разными. В некоторых вариантах осуществления первый или второй антиген выбран из антигена, экспрессируемого на B-клетках, антигена, экспрессируемого на клетках острого миелоидного лейкоза, или антигена на клетках солидной опухоли. В некоторых вариантах осуществления первый или второй антиген выбран из CD10, CD19, CD20, CD22, CD34, CD123, BCMA, FLT-3, ROR1, CD79b, CD179b, CD79a, CD34, CLL-1, рецептора фолиевой кислоты бета, FLT3, EGFRvIII, мезотелина, EGFRvIII, GD2, Tn-антигена, sTn-антигена, Tn-O-гликопептидов, sTn-O-гликопептидов, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, легумана, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, антигена Y системы Льюис, CD24, PDGFR-бета, SSEA-4, рецептора фолиевой кислоты альфа, ERBB (например, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, эфрина B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-ацетил-GD2, рецептора фолиевой кислоты бета, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, легумаина, E6 или E7 HPV, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, полисиаловой кислоты, Fos-родственного антигена, эластазы нейтрофилов, TRP-2, CYP1B1, белка спермы 17, бета-субъединицы хорионического гонадотропина человека, AFP, тиреоглобулина, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, обратной транскриптазы теломеразы человека, кишечной карбоксилэстеразы, мутантного варианта hsp 70-2, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4 или пептида любого из этих антигенов, презентированного на MHC.In some embodiments, the first antigen and the second antigen are different. In some embodiments, the first or second antigen is selected from an antigen expressed on B cells, an antigen expressed on acute myeloid leukemia cells, or an antigen on solid tumor cells. In some embodiments, the first or second antigen is selected from CD10, CD19, CD20, CD22, CD34, CD123, BCMA, FLT-3, ROR1, CD79b, CD179b, CD79a, CD34, CLL-1, folate receptor beta, FLT3, EGFRvIII, mesothelin, EGFRvIII, GD2, Tn antigen, sTn antigen, Tn-O-glycopeptides, sTn-O-glycopeptides, PSMA, CD97, TAG72, CD44v6, CEA, EPCAM, KIT, IL-13Ra2, leguman, GD3, CD171, IL-11Ra, PSCA, MAD-CT-1, MAD-CT-2, VEGFR2, Lewis Y antigen, CD24, PDGFR-beta, SSEA-4, folate receptor alpha, ERBB (eg, ERBB2), Her2/neu, MUC1, EGFR, NCAM, ephrin B2, CAIX, LMP2, sLe, HMWMAA, o-acetyl-GD2, folate receptor beta, TEM1/CD248, TEM7R, FAP, legumain, HPV E6 or E7, ML-IAP, CLDN6, TSHR, GPRC5D, ALK, polysialic acid, Fos-related antigen, neutrophil elastase, TRP-2, CYP1B1, sperm protein 17, human chorionic gonadotropin beta, AFP, thyroglobulin, PLAC1, globoH, RAGE1, MN-CA IX, human telomerase reverse transcriptase, intestinal carboxylesterase, mutant hsp 70-2, NA-17, NY-BR-1, UPK2, HAVCR1, ADRB3, PANX3, NY-ESO-1, GPR20, Ly6k, OR51E2, TARP, GFRα4, or a peptide of any of these antigens presented on MHC.
В некоторых вариантах осуществления первый антиген представляет собой BCMA, а второй антиген представляет собой CD19. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит антигенсвязывающий домен, который связывается с BCMA и CD19. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит VH1 и VL1, которые связываются с BCMA ("VH для BCMA" и "VL для BCMA"), а также VH2 и VL2, которые связываются с CD19 ("VH для CD19" и "VL для CD19"). В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH для BCMA - необязательно линкер 1 ("L1") - VH для CD19 - необязательно линкер 2 ("L2") - VL для CD19 - необязательно линкер 3 ("L3") - VL для BCMA от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH для BCMA - необязательно L1 - VL для CD19 - необязательно L2 - VH для CD19 - необязательно L3 - VL для BCMA от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL для BCMA - необязательно L1 - VH для CD19 - необязательно L2 - VL для CD19 - необязательно L3 - VH для BCMA от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL для BCMA - необязательно L1 - VL для CD19 - необязательно L2 - VH для CD19 - необязательно L3 - VH для BCMA от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH для CD19 - необязательно L1 - VH для BCMA - необязательно L2 - VL для BCMA - необязательно L3 - VL для CD19 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH для CD19 - необязательно L1 - VL для BCMA - необязательно L2 - VH для BCMA - необязательно L3 - VL для CD19 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL для CD19 - необязательно L1 - VH для BCMA - необязательно L2 - VL для BCMA - необязательно L3 - VH для CD19 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL для CD19 - необязательно L1 - VL для BCMA - необязательно L2 - VH для BCMA - необязательно L3 - VH для CD19 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH для BCMA - линкер 1 ("L1") - VH для CD19 - линкер 2 ("L2") - VL для CD19 - линкер 3 ("L3") - VL для BCMA от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH для BCMA - L1 - VL для CD19 - L2 - VH для CD19 - L3 - VL для BCMA от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL для BCMA - L1 - VH для CD19 - L2 - VL для CD19 - L3 - VH для BCMA от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL для BCMA - L1 - VL для CD19 - L2 - VH для CD19 - L3 - VH для BCMA от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH для CD19 - L1 - VH для BCMA - L2 - VL для BCMA - L3 - VL для CD19 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VH для CD19 - L1 - VL для BCMA - L2 - VH для BCMA - L3 - VL для CD19 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL для CD19 - L1 - VH для BCMA - L2 - VL для BCMA - L3 - VH для CD19 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен имеет организацию VL для CD19 - L1 - VL для BCMA - L2 - VH для BCMA - L3 - VH для CD19 от N-конца до C-конца. В некоторых вариантах осуществления вариабельные области слиты с помощью линкера, содержащего аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 5 или 63 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ней. В некоторых вариантах осуществления L1 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 5. В некоторых вариантах осуществления L2 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 63. В некоторых вариантах осуществления L3 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 5.In some embodiments, the first antigen is BCMA and the second antigen is CD19. In some embodiments, the CAR comprises an antigen-binding domain that binds to BCMA and CD19. In some embodiments, the antigen-binding domain comprises VH 1 and VL 1 that bind to BCMA ("VH for BCMA" and "VL for BCMA") and VH 2 and VL 2 that bind to CD19 ("VH for CD19" and "VL for CD19"). In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VH for BCMA-optionally Linker 1 ("L1")-VH for CD19-optionally Linker 2 ("L2")-VL for CD19-optionally Linker 3 ("L3")-VL for BCMA from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VH for BCMA - optionally L1 - VL for CD19 - optionally L2 - VH for CD19 - optionally L3 - VL for BCMA from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VL for BCMA - optionally L1 - VH for CD19 - optionally L2 - VL for CD19 - optionally L3 - VH for BCMA from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VL for BCMA - optionally L1 - VL for CD19 - optionally L2 - VH for CD19 - optionally L3 - VH for BCMA from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VH for CD19 - optionally L1 - VH for BCMA - optionally L2 - VL for BCMA - optionally L3 - VL for CD19 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VH for CD19 - optionally L1 - VL for BCMA - optionally L2 - VH for BCMA - optionally L3 - VL for CD19 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VL for CD19 - optionally L1 - VH for BCMA - optionally L2 - VL for BCMA - optionally L3 - VH for CD19 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VL for CD19 - optionally L1 - VL for BCMA - optionally L2 - VH for BCMA - optionally L3 - VH for CD19 from N-terminus to C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VH for BCMA - Linker 1 ("L1") - VH for CD19 - Linker 2 ("L2") - VL for CD19 - Linker 3 ("L3") - VL for BCMA from N-terminus to C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VH for BCMA - L1 - VL for CD19 - L2 - VH for CD19 - L3 - VL for BCMA from N-terminus to C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VL for BCMA - L1 - VH for CD19 - L2 - VL for CD19 - L3 - VH for BCMA from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VL for BCMA - L1 - VL for CD19 - L2 - VH for CD19 - L3 - VH for BCMA from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VH for CD19 - L1 - VH for BCMA - L2 - VL for BCMA - L3 - VL for CD19 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VH for CD19 - L1 - VL for BCMA - L2 - VH for BCMA - L3 - VL for CD19 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VL for CD19-L1-VH for BCMA-L2-VL for BCMA-L3-VH for CD19 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the antigen-binding domain has an organization of VL for CD19-L1-VL for BCMA-L2-VH for BCMA-L3-VH for CD19 from the N-terminus to the C-terminus. In some embodiments, the variable regions are fused by a linker comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5 or 63 or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto. In some embodiments, L1 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5. In some embodiments, L2 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63. In some embodiments, L3 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 5.
В некоторых вариантах осуществления VH для BCMA содержит последовательности CDR или VH, раскрытые в данном документе, например, последовательности CDR или VH, раскрытые в таблицах 3-15, 19, 20, 22, 26 и 31, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ними. В некоторых вариантах осуществления VL для BCMA содержит последовательности CDR или VL, раскрытые в данном документе, например, последовательности CDR или VL, раскрытые в таблицах 3-15, 19, 20, 22, 26 и 31, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ними. В некоторых вариантах осуществления VH для CD19 содержит последовательности CDR или VH, раскрытые в данном документе, например, последовательности CDR или VH, раскрытые в таблицах 2, 19, 22 и 31, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ними. В некоторых вариантах осуществления VL для CD19 содержит последовательности CDR или VL, раскрытые в данном документе, например, последовательности CDR или VL, раскрытые в таблицах 2, 19, 22 и 31, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ними.In some embodiments, the VH for BCMA comprises the CDR or VH sequences disclosed herein, such as the CDR or VH sequences disclosed in Tables 3-15, 19, 20, 22, 26, and 31, or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto. In some embodiments, the VL for BCMA comprises the CDR or VL sequences disclosed herein, such as the CDR or VL sequences disclosed in Tables 3-15, 19, 20, 22, 26, and 31, or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto. In some embodiments, the VH for CD19 comprises the CDR or VH sequences disclosed herein, such as the CDR or VH sequences disclosed in Tables 2, 19, 22, and 31, or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto. In some embodiments, the VL for CD19 comprises the CDR or VL sequences disclosed herein, such as the CDR or VL sequences disclosed in Tables 2, 19, 22, and 31, or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto.
В некоторых вариантах осуществления CAR, например, CAR в формате диатела, дополнительно содержит шарнирную область, трансмембранный домен и/или внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления шарнирная область включает в себя шарнирную область CD8. В некоторых вариантах осуществления шарнирная область содержит последовательность шарнирной области, раскрытую в данном документе, например, аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 2 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ней. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен включает в себя трансмембранный домен CD8. В некоторых вариантах осуществления трансмембранный домен содержит последовательность трансмембранного домена, раскрытую в данном документе, например, аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 6 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ней. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен включает в себя внутриклеточный домен 4-1BB. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен содержит последовательность костимулирующего сигнального домена, раскрытую в данном документе, например, аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 7 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ней. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен включает в себя внутриклеточный домен CD3. В некоторых вариантах осуществления внутриклеточный сигнальный домен содержит последовательность первичного сигнального домена, раскрытую в данном документе, например, аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 9 или 10 или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ней.In some embodiments, a CAR, e.g., a diabody format CAR, further comprises a hinge region, a transmembrane domain, and/or an intracellular signaling domain. In some embodiments, the hinge region comprises a CD8 hinge region. In some embodiments, the hinge region comprises a hinge region sequence disclosed herein, e.g., the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto. In some embodiments, the transmembrane domain comprises a CD8 transmembrane domain. In some embodiments, the transmembrane domain comprises a transmembrane domain sequence disclosed herein, e.g., the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6 or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto. In some embodiments, the intracellular signaling domain comprises the 4-1BB intracellular domain. In some embodiments, the intracellular signaling domain comprises a costimulatory signaling domain sequence disclosed herein, such as the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto. In some embodiments, the intracellular signaling domain comprises the CD3 intracellular domain. In some embodiments, the intracellular signaling domain comprises a primary signaling domain sequence disclosed herein, such as the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9 or 10 or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto.
Иллюстративные последовательности диател раскрыты в таблице 31. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит антигенсвязывающий домен, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 321-330, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ней. В некоторых вариантах осуществления CAR содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 339-348, или аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичностью с ней.Exemplary diabody sequences are disclosed in Table 31. In some embodiments, a CAR comprises an antigen-binding domain comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 321-330, or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto. In some embodiments, a CAR comprises an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 339-348, or an amino acid sequence having at least about 80%, 85%, 90%, 95%, or 99% identity thereto.
Химерный TCRChimeric TCR
В одном аспекте антитела и фрагменты антител по настоящему изобретению могут быть пересажены на один или несколько константных доменов цепи Т-клеточного рецептора ("TCR"), например, альфа-цепи TCR или бета-цепи TCR, с созданием химерного TCR. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что химерные TCR будут передавать сигналы через комплекс TCR при связывании антигена. Например, scFv, раскрытый в данном документе, можно пересадить на константный домен, например, на по меньшей мере часть внеклеточного константного домена, трансмембранного домена и цитоплазматического домена, цепи TCR, например, альфа-цепи TCR и/или бета-цепи TCR. В качестве другого примера, фрагмент антитела, например, VL-домен, описанный в данном документе, можно пересадить на константный домен альфа-цепи TCR, и фрагмент антитела, например, VH-домен, описанный в данном документе, можно пересадить на константный домен бета-цепи TCR (или в качестве альтернативы VL-домен можно пересадить на константный домен бета-цепи TCR, а VH-домен можно пересадить на альфа-цепь TCR). В качестве другого примера CDR антитела или фрагмента антитела, например, CDR антитела или фрагмента антитела, описанного в данном документе, можно пересадить на альфа- и/или бета-цепь TCR для создания химерного TCR. Например, раскрытые в данном документе LCDR можно пересадить на вариабельный домен альфа-цепи TCR, а раскрытые в данном документе HCDR можно пересадить на вариабельный домен бета-цепи TCR или наоборот. Такие химерные TCR можно получить посредством способов, известных из уровня техники (например, Willemsen RA et al, Gene Therapy 2000; 7: 1369-1377; Zhang T et al, Cancer Gene Ther 2004; 11: 487-496; Aggen et al, Gene Ther. 2012 Apr;19(4):365-74).In one aspect, the antibodies and antibody fragments of the present invention can be grafted onto one or more constant domains of a T cell receptor ("TCR") chain, such as a TCR alpha chain or a TCR beta chain, to create a chimeric TCR. Without being limited by theory, it is believed that chimeric TCRs will signal through the TCR complex upon antigen binding. For example, an scFv disclosed herein can be grafted onto a constant domain, such as at least a portion of an extracellular constant domain, a transmembrane domain, and a cytoplasmic domain, of a TCR chain, such as a TCR alpha chain and/or a TCR beta chain. As another example, an antibody fragment, such as the VL domain described herein, can be grafted onto the constant domain of a TCR alpha chain, and an antibody fragment, such as the VH domain described herein, can be grafted onto the constant domain of a TCR beta chain (or, alternatively, the VL domain can be grafted onto the constant domain of a TCR beta chain and the VH domain can be grafted onto the alpha chain of a TCR). As another example, a CDR of an antibody or antibody fragment, such as a CDR of an antibody or antibody fragment described herein, can be grafted onto the alpha and/or beta chain of a TCR to create a chimeric TCR. For example, the LCDRs disclosed herein can be grafted onto the variable domain of a TCR alpha chain, and the HCDRs disclosed herein can be grafted onto the variable domain of a TCR beta chain, or vice versa. Such chimeric TCRs can be generated by methods known in the art (e.g., Willemsen RA et al,
Дополнительные варианты осуществленияAdditional embodiments
В одном аспекте описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, может дополнительно содержать второй CAR, например, второй CAR, который содержит другой антигенсвязывающий домен, например, для той же мишени (BCMA) или другой мишени (например, CD19, CD20 или CS-1 или других мишеней множественной миеломы, например, легкой каппа-цепи, CD138, антигена Y системы Льюис или CD38 (Garfall et al., Discovery Medicine, 2014, 17(91):37-46)). В одном варианте осуществления клетка, экспрессирующая CAR, содержит первый CAR, который нацеливается на первый антиген и содержит внутриклеточный сигнальный домен, имеющий костимулирующий сигнальный домен, а не первичный сигнальный домен, и второй CAR, который нацеливается на второй, другой, антиген и содержит внутриклеточный сигнальный домен, имеющий первичный сигнальный домен, а не костимулирующий сигнальный домен. Без ограничения какой-либо теорией, размещение костимулирующего сигнального домена, например, 4-1BB, CD28, CD27 или OX-40, в первом CAR и первичного сигнального домена, например, CD3-дзета, во втором CAR может ограничивать активность CAR клетками, в которых экспрессируются обе мишени. В одном варианте осуществления клетка, экспрессирующая CAR, содержит первый CAR для BCMA, который содержит домен, связывающий BCMA, трансмембранный домен и костимулирующий домен, и второй CAR, который нацеливается на антиген, отличный от BCMA (например, антиген, экспрессируемый на клетках лейкоза или лимфомы, например, CD19, CD20, CS-1, легкую каппа-цепь, CD139, антиген Y системы Льюиса или CD38), и содержит антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и первичный сигнальный домен. В другом варианте осуществления клетка, экспрессирующая CAR, содержит первый CAR для BCMA, который содержит домен, связывающий BCMA, трансмембранный домен и первичный сигнальный домен, и второй CAR, который нацеливается на антиген, отличный от BCMA (например, антиген, экспрессируемый на клетках лейкоза или лимфомы, например, CD19, CD20, CS-1, легкую каппа-цепь, CD139, антиген Y системы Льюис или CD38), и содержит антигенсвязывающий домен для антигена, трансмембранный домен и костимулирующий сигнальный домен. В одном варианте осуществления клетка, экспрессирующая CAR, содержит CAR для BCMA, описанный в данном документе, и CAR, который нацеливается на CD19 (CAR для CD19).In one aspect, a cell expressing a CAR as described herein may further comprise a second CAR, such as a second CAR that comprises a different antigen binding domain, such as for the same target (BCMA) or a different target (e.g., CD19, CD20, or CS-1 or other multiple myeloma targets, such as kappa light chain, CD138, Lewis Y antigen, or CD38 (Garfall et al., Discovery Medicine, 2014, 17(91):37-46)). In one embodiment, a cell expressing a CAR comprises a first CAR that targets a first antigen and comprises an intracellular signaling domain that has a costimulatory signaling domain but not a primary signaling domain, and a second CAR that targets a second, different antigen and comprises an intracellular signaling domain that has a primary signaling domain but not a costimulatory signaling domain. Without being limited by theory, the placement of a costimulatory signaling domain, such as 4-1BB, CD28, CD27, or OX-40, in a first CAR and a primary signaling domain, such as CD3 zeta, in a second CAR can limit the activity of the CAR to cells that express both targets. In one embodiment, a cell expressing a CAR comprises a first CAR for BCMA that comprises a BCMA binding domain, a transmembrane domain, and a costimulatory domain, and a second CAR that targets an antigen other than BCMA (e.g., an antigen expressed on leukemia or lymphoma cells, such as CD19, CD20, CS-1, kappa light chain, CD139, Lewis antigen Y, or CD38) and comprises an antigen binding domain, a transmembrane domain, and a primary signaling domain. In another embodiment, a cell expressing a CAR comprises a first CAR for BCMA that comprises a BCMA binding domain, a transmembrane domain, and a primary signaling domain, and a second CAR that targets an antigen other than BCMA (e.g., an antigen expressed on leukemia or lymphoma cells, such as CD19, CD20, CS-1, kappa light chain, CD139, Lewis antigen Y, or CD38) and comprises an antigen binding domain for the antigen, a transmembrane domain, and a costimulatory signaling domain. In one embodiment, a cell expressing a CAR comprises a CAR for BCMA described herein and a CAR that targets CD19 (a CD19 CAR).
В одном варианте осуществления клетка, экспрессирующая CAR, содержит CAR для BCMA, описанный в данном документе, и ингибирующий CAR. В одном варианте осуществления ингибирующий CAR содержит антигенсвязывающий домен, который связывает антиген, обнаруживаемый на нормальных клетках, но не на раковых клетках. В одном варианте осуществления ингибирующий CAR содержит антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и внутриклеточный домен ингибирующей молекулы. Например, внутриклеточный домен ингибирующего CAR может представлять собой внутриклеточный домен PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекулы MHC I класса, молекулы MHC II класса, GAL9, аденозина и TGFR-бета.In one embodiment, a cell expressing a CAR comprises a CAR for BCMA described herein and an inhibitory CAR. In one embodiment, the inhibitory CAR comprises an antigen-binding domain that binds an antigen found on normal cells but not on cancer cells. In one embodiment, the inhibitory CAR comprises an antigen-binding domain, a transmembrane domain, and an intracellular domain of an inhibitory molecule. For example, the intracellular domain of an inhibitory CAR can be the intracellular domain of PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (e.g., CEACAM-1, CEACAM-3, and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, MHC class I molecules, MHC class II molecules, GAL9, adenosine, and TGFR-beta.
В одном варианте осуществления в случае, если клетка, экспрессирующая CAR содержит два или более различных CAR, то антигенсвязывающие домены различных CAR могут быть такими, что антигенсвязывающие домены не взаимодействуют друг с другом. Например, клетка, экспрессирующая первый и второй CAR, может иметь антигенсвязывающий домен первого CAR, например, в качестве фрагмента, например, scFv, который не ассоциирует с антигенсвязывающим доменом второго CAR, например, антигенсвязывающий домен второго CAR представляет собой VHH.In one embodiment, if a cell expressing a CAR comprises two or more different CARs, the antigen binding domains of the different CARs may be such that the antigen binding domains do not interact with each other. For example, a cell expressing a first and a second CAR may have an antigen binding domain of the first CAR, for example, as a fragment, for example, an scFv, that does not associate with the antigen binding domain of the second CAR, for example, the antigen binding domain of the second CAR is VHH.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит однодоменные антигенсвязывающие (SDAB) молекулы, в том числе молекулы, в которых определяющие комплементарность области являются частью однодоменного полипептида. Примеры включают без ограничения вариабельные домены тяжелых цепей, связывающие молекулы, в природных условиях лишенные легких цепей, отдельные домены, полученные из традиционных 4-цепочечных антител, сконструированные домены и однодоменные каркасные структуры, отличные от полученных из антител. Молекулы SDAB могут являться любыми молекулами, известными из уровня техники, или любыми однодоменными молекулами, которые будут известны в будущем. Молекулы SDAB могут быть получены из любых видов, в том числе без ограничения из мыши, человека, верблюда, ламы, миноги, рыбы, акулы, козы, кролика и быка. Этот термин также охватывает встречающиеся в природе молекулы однодоменных антител из видов, отличных от Camelidae и акул.In some embodiments, the antigen-binding domain comprises single-domain antigen-binding (SDAB) molecules, including molecules in which the complementarity-determining regions are part of a single-domain polypeptide. Examples include, but are not limited to, variable domains of heavy chains, binding molecules naturally lacking light chains, individual domains derived from traditional 4-chain antibodies, engineered domains, and single-domain frameworks other than those derived from antibodies. SDAB molecules may be any molecule known in the art or any single-domain molecule that is later known. SDAB molecules may be derived from any species, including, but not limited to, mouse, human, camel, llama, lamprey, fish, shark, goat, rabbit, and bovine. The term also encompasses naturally occurring single-domain antibody molecules from species other than Camelidae and sharks.
В одном аспекте молекула SDAB может быть получена из вариабельной области иммуноглобулина, обнаруживаемого у рыб, как, например, та, которая получена из изотипа иммуноглобулина, известного как новый антигенный рецептор (NAR), обнаруживаемого в сыворотке крови акулы. Способы получения однодоменных молекул, получаемых из вариабельной области NAR ("IgNAR"), описаны в WO 03/014161 и Streltsov (2005) Protein Sci. 14:2901-2909.In one aspect, the SDAB molecule can be derived from a variable region of an immunoglobulin found in fish, such as that derived from an immunoglobulin isotype known as a novel antigen receptor (NAR) found in shark serum. Methods for producing single-domain molecules derived from the variable region of a NAR ("IgNAR") are described in WO 03/014161 and Streltsov (2005) Protein Sci. 14:2901-2909.
Согласно другому аспекту молекула SDAB представляет собой встречающуюся в природе однодоменную антигенсвязывающую молекулу, известную как тяжелая цепь, лишенная легких цепей. Такие однодоменные молекулы раскрыты, например, в WO 9404678 и Hamers-Casterman, C. et al. (1993) Nature 363:446-448. В целях ясности этот вариабельный домен, полученный из молекулы тяжелой цепи, в природных условиях лишенной легкой цепи, именуется в данном документе как VHH или нанотело, чтобы отличать его от традиционного VH четырехцепочечных иммуноглобулинов. Такая молекула VHH может быть получена из видов Camelidae, например, из верблюда, ламы, дромадера, альпаки и гуанако. Другие виды, помимо Camelidae, могут продуцировать молекулы тяжелых цепей, в природных условиях лишенные легкой цепи; такие VHH входят в объем настоящего изобретения.According to another aspect, the SDAB molecule is a naturally occurring single-domain antigen-binding molecule known as a light chain-less heavy chain. Such single-domain molecules are disclosed, for example, in WO 9404678 and Hamers-Casterman, C. et al. (1993) Nature 363:446-448. For the sake of clarity, this variable domain obtained from a light chain-less heavy chain molecule is referred to herein as a VHH or nanobody to distinguish it from the traditional four-chain immunoglobulin VH. Such a VHH molecule may be obtained from Camelidae species, such as camel, llama, dromedary, alpaca, and guanaco. Other species besides Camelidae may produce light chain-less heavy chain molecules; such VHHs are within the scope of the present invention.
Молекулы SDAB могут быть рекомбинантными, с пересаженными CDR, гуманизированными, камелизированными, деиммунизированными и/или образованными in vitro (например, отобранными с помощью фагового дисплея).SDAB molecules can be recombinant, CDR-grafted, humanized, camelized, deimmunized, and/or generated in vitro (e.g., selected by phage display).
Также было обнаружено, что в клетках, имеющих множество химерных рецепторов, встроенных в мембрану, содержащих антигенсвязывающий домен, взаимодействия между антигенсвязывающими доменами рецепторов могут быть нежелательными, например, поскольку они ингибируют способность одного или нескольких антигенсвязывающих доменов связываться с их когнатными антигенами. Соответственно, в данном документе раскрыты клетки, имеющие первый и второй не встречающиеся в природе химерные рецепторы, встроенные в мембрану, содержащие антигенсвязывающие домены, для которых сведены к минимуму такие взаимодействия. Также в данном документе раскрыты нуклеиновые кислоты, кодирующие первый и второй не встречающиеся в природе химерные рецепторы, встроенные в мембрану, содержащие антигенсвязывающие домены, для которых сведены к минимуму такие взаимодействия, а также способы получения и применения таких клеток и нуклеиновых кислот. В одном варианте осуществления антигенсвязывающий домен одного из указанного первого и указанного второго не встречающихся в природе химерных рецепторов, встроенных в мембрану, содержит scFv, а другой содержит одиночный VH-домен, например, одиночный VH-домен верблюдовых, акулы или миноги или одиночный VH-домен, полученный из последовательности человека или мыши.It has also been found that in cells having a plurality of membrane-embedded chimeric receptors comprising an antigen-binding domain, interactions between the antigen-binding domains of the receptors may be undesirable, for example, because they inhibit the ability of one or more antigen-binding domains to bind their cognate antigens. Accordingly, cells having first and second non-naturally occurring membrane-embedded chimeric receptors comprising antigen-binding domains for which such interactions are minimized are disclosed herein. Nucleic acids encoding first and second non-naturally occurring membrane-embedded chimeric receptors comprising antigen-binding domains for which such interactions are minimized are also disclosed herein, as well as methods for producing and using such cells and nucleic acids. In one embodiment, the antigen binding domain of one of said first and said second non-naturally occurring membrane-integrated chimeric receptors comprises an scFv and the other comprises a single VH domain, such as a single VH domain of camelid, shark or lamprey or a single VH domain derived from a human or mouse sequence.
В некоторых вариантах осуществления в заявляемом изобретении предусмотрены первый и второй CAR, где антигенсвязывающий домен одного из указанного первого CAR и указанного второго CAR не содержит вариабельный домен легкой цепи и вариабельный домен тяжелой цепи. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из указанного первого CAR и указанного второго CAR представляет собой scFv, а другой не представляет собой scFv. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из указанного первого CAR и указанного второго CAR содержит одиночный VH-домен, например, одиночный VH-домен верблюдовых, акулы или миноги или одиночный VH-домен, полученный из последовательности человека или мыши. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из указанного первого CAR и указанного второго CAR содержит нанотело. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из указанного первого CAR и указанного второго CAR содержит VHH-домен верблюдовых.In some embodiments, the claimed invention provides a first and a second CAR, wherein the antigen-binding domain of one of said first CAR and said second CAR does not comprise a light chain variable domain and a heavy chain variable domain. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of said first CAR and said second CAR is an scFv, and the other is not an scFv. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of said first CAR and said second CAR comprises a single VH domain, such as a single VH domain of camelids, sharks or lampreys, or a single VH domain derived from a human or mouse sequence. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of said first CAR and said second CAR comprises a nanobody. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of said first CAR and said second CAR comprises a camelid VHH domain.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из указанного первого CAR и указанного второго CAR содержит scFv, а другой содержит одиночный VH-домен, например, одиночный VH-домен верблюдовых, акулы или миноги или одиночный VH-домен, полученный из последовательности человека или мыши. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из указанного первого CAR и указанного второго CAR содержит scFv, а другой содержит нанотело. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из указанного первого CAR и указанного второго CAR содержит scFv, а другой содержит VHH-домен верблюдовых.In some embodiments, the antigen-binding domain of one of said first CAR and said second CAR comprises an scFv and the other comprises a single VH domain, such as a single VH domain of camelids, sharks or lampreys or a single VH domain derived from a human or mouse sequence. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of said first CAR and said second CAR comprises an scFv and the other comprises a nanobody. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of said first CAR and said second CAR comprises an scFv and the other comprises a camelid VHH domain.
В некоторых вариантах осуществления связывание антигенсвязывающего домена указанного первого CAR, при наличии его на поверхности клетки, со своим когнатным антигеном существенно не снижается благодаря наличию указанного второго CAR. В некоторых вариантах осуществления связывание антигенсвязывающего домена указанного первого CAR со своим когнатным антигеном в присутствии указанного второго CAR составляет 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% от связывания антигенсвязывающего домена указанного первого CAR со своим когнатным антигеном в отсутствие указанного второго CAR.In some embodiments, the binding of the antigen-binding domain of said first CAR, when present on the surface of a cell, to its cognate antigen is not substantially reduced by the presence of said second CAR. In some embodiments, the binding of the antigen-binding domain of said first CAR to its cognate antigen in the presence of said second CAR is 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% of the binding of the antigen-binding domain of said first CAR to its cognate antigen in the absence of said second CAR.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающие домены указанного первого CAR и указанного второго CAR при наличии их на поверхности клетки ассоциируют друг с другом в меньшей степени, чем в случае, если бы они оба являлись антигенсвязывающими доменами scFv. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающие домены указанного первого CAR и указанного второго CAR ассоциируют друг с другом в на 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% меньшей степени, чем в случае, если бы они оба являлись антигенсвязывающими доменами scFv.In some embodiments, the antigen-binding domains of said first CAR and said second CAR, when present on the surface of a cell, associate with each other to a lesser extent than if they were both antigen-binding domains of an scFv. In some embodiments, the antigen-binding domains of said first CAR and said second CAR associate with each other to a lesser extent than if they were both antigen-binding domains of an scFv.
В другом аспекте описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, может дополнительно экспрессировать другое средство, например, средство, которое усиливает активность клетки, экспрессирующей CAR. Например, в одном варианте осуществления средство может представлять собой средство, которое ингибирует ингибирующую молекулу, например, средство, описанное в данном документе. Ингибирующие молекулы, например, PD1, в некоторых вариантах осуществления могут снижать способность клетки, экспрессирующей CAR, осуществлять иммунный эффекторный ответ. Примеры ингибирующих молекул включают PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекулу MHC I класса, молекулу MHC II класса, GAL9, аденозин и TGFR-бета. В одном варианте осуществления средство, которое ингибирует ингибирующую молекулу, содержит первый полипептид, например, ингибирующую молекулу, ассоциированный со вторым полипептидом, который обеспечивает положительный сигнал для клетки, например, с внутриклеточным сигнальным доменом, описанным в данном документе. В одном варианте осуществления средство содержит первый полипептид, например, из ингибирующей молекулы, такой как PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекула MHC I класса, молекула MHC II класса, GAL9, аденозин и TGFR-бета или фрагмент любого из них (например, по меньшей мере часть внеклеточного домена любого из них), и второй полипептид, который представляет собой внутриклеточный сигнальный домен, описанный в данном документе (например, содержащий костимулирующий домен (например, 4-1BB, CD27, ICOS или CD28, например, описанный в данном документе) и/или первичный сигнальный домен (например, сигнальный домен CD3-дзета, описанный в данном документе). В одном варианте осуществления средство содержит первый полипептид из PD1 или его фрагмента (например, по меньшей мере часть внеклеточного домена PD1) и второй полипептид, представляющий собой внутриклеточный сигнальный домен, описанный в данном документе (например, сигнальный домен CD28, описанный в данном документе, и/или сигнальный домен CD3-дзета, описанный в данном документе). В ряде вариантов осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, содержит переключающий костимулирующий рецептор, например, описанный в WO 2013/019615, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. PD1 является ингибирующим представителем семейства рецепторов CD28, которое также включает CD28, CTLA-4, ICOS и BTLA. PD-1 экспрессируется на активированных B-клетках, T-клетках и миелоидных клетках (Agata et al. 1996 Int. Immunol 8:765-75). Было показано, что два лиганда PD1 - PD-L1 и PD-L2 - подавляют активацию Т-клеток при связывании с PD1 (Freeman et al. 2000 J Exp Med 192:1027-34; Latchman et al. 2001 Nat Immunol 2:261-8; Carter et al. 2002 Eur J Immunol 32:634-43). PD-L1 является широко распространенным при различных формах рака у человека (Dong et al. 2003 J Mol Med 81:281-7; Blank et al. 2005 Cancer Immunol. Immunother 54:307-314; Konishi et al. 2004 Clin Cancer Res 10:5094). Иммуносупрессию можно устранить путем ингибирования локального взаимодействия PD1 с PD-L1.In another aspect, a CAR-expressing cell described herein may further express another agent, such as an agent that enhances the activity of a CAR-expressing cell. For example, in one embodiment, the agent may be an agent that inhibits an inhibitory molecule, such as an agent described herein. Inhibitory molecules, such as PD1, in some embodiments may reduce the ability of a CAR-expressing cell to mount an immune effector response. Examples of inhibitory molecules include PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (e.g., CEACAM-1, CEACAM-3, and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, MHC class I molecule, MHC class II molecule, GAL9, adenosine, and TGFR-beta. In one embodiment, an agent that inhibits an inhibitory molecule comprises a first polypeptide, e.g., an inhibitory molecule, associated with a second polypeptide that provides a positive signal to a cell, e.g., an intracellular signaling domain as described herein. In one embodiment, the agent comprises a first polypeptide, e.g., from an inhibitory molecule such as PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (e.g., CEACAM-1, CEACAM-3, and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, an MHC class I molecule, an MHC class II molecule, GAL9, adenosine, and TGFR-beta, or a fragment of any of them (e.g., at least a portion of the extracellular domain of any of them), and a second polypeptide that is an intracellular signaling domain as described herein (e.g., comprising a costimulatory domain (e.g., 4-1BB, CD27, ICOS, or CD28, e.g., as described herein) and/or a primary signaling domain (e.g., the CD3-zeta signaling domain described herein). In one embodiment, the agent comprises a first polypeptide of PD1 or a fragment thereof (e.g., at least a portion of the extracellular domain of PD1) and a second polypeptide that is an intracellular signaling domain described herein (e.g., the CD28 signaling domain described herein and/or the CD3-zeta signaling domain described herein). In some embodiments, a cell expressing a CAR described herein comprises a switch co-stimulatory receptor, e.g., as described in WO 2013/019615, which is incorporated herein by reference in its entirety. PD1 is an inhibitory member of the CD28 receptor family, which also includes CD28, CTLA-4, ICOS, and BTLA. PD-1 is expressed on activated B cells, T cells, and myeloid cells (Agata et al. 1996 Int. Immunol 8:765–75). Two PD1 ligands, PD-L1 and PD-L2, have been shown to suppress T cell activation when bound to PD1 (Freeman et al. 2000 J Exp Med 192:1027–34; Latchman et al. 2001 Nat Immunol 2:261–8; Carter et al. 2002 Eur J Immunol 32:634–43). PD-L1 is highly expressed in a variety of human cancers (Dong et al. 2003 J Mol Med 81:281–7; Blank et al. 2005 Cancer Immunol. Immunother 54:307–314; Konishi et al. 2004 Clin Cancer Res 10:5094). Immunosuppression can be reversed by inhibiting local interaction of PD1 with PD-L1.
В одном варианте осуществления средство, содержащее внеклеточный домен (ECD) ингибирующей молекулы, например, белка 1 запрограммированной гибели клеток (PD1), может быть слито с трансмембранным доменом и внутриклеточными сигнальными доменами, такими как 4-1BB и CD3-дзета (также называется в данном документе CAR на основе PD1). В одном варианте осуществления CAR на основе PD1 при применении в комбинациях с CAR для BCMA, описанным в данном документе, улучшает персистенцию клетки, экспрессирующей CAR, например, T-клетки или NK-клетки. В одном варианте осуществления CAR представляет собой CAR на основе PD1, содержащий внеклеточный домен PD1, указанный подчеркиванием в SEQ ID NO: 24. В одном варианте осуществления CAR на основе PD1 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 24.In one embodiment, an agent comprising an extracellular domain (ECD) of an inhibitory molecule, such as programmed cell death protein 1 (PD1), can be fused to a transmembrane domain and intracellular signaling domains, such as 4-1BB and CD3-zeta (also referred to herein as a PD1-based CAR). In one embodiment, the PD1-based CAR, when used in combinations with the BCMA CAR described herein, improves the persistence of a cell expressing the CAR, such as a T cell or NK cell. In one embodiment, the CAR is a PD1-based CAR comprising the extracellular domain of PD1 indicated by underlining in SEQ ID NO: 24. In one embodiment, the PD1-based CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 24.
В одном варианте осуществления CAR на основе PD1 содержит аминокислотную последовательность, представленную ниже (SEQ ID NO: 22).In one embodiment, a PD1-based CAR comprises the amino acid sequence shown below (SEQ ID NO: 22).
В одном варианте осуществления средство содержит последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR на основе PD1, например, CAR на основе PD1, описанный в данном документе. В одном варианте осуществления последовательность нуклеиновой кислоты для CAR на основе PD1 представлена под SEQ ID NO: 23, при этом ECD PD1 подчеркнут.In one embodiment, the agent comprises a nucleic acid sequence encoding a PD1-based CAR, such as a PD1-based CAR described herein. In one embodiment, the nucleic acid sequence for a PD1-based CAR is set forth as SEQ ID NO: 23, with the PD1 ECD underlined.
В другом аспекте в настоящем изобретении предусмотрена популяция клеток, экспрессирующих CAR, например, CAR-T-клеток или NK-клеток, экспрессирующих CAR. В некоторых вариантах осуществления популяция клеток, экспрессирующих CAR, содержит смесь клеток, экспрессирующих различные CAR. Например, в одном варианте осуществления популяция клеток, экспрессирующих CAR (например, CAR-T-клеток или NK-клеток, экспрессирующих CAR), может содержать первую клетку, экспрессирующую CAR, имеющий домен, связывающий BCMA, описанный в данном документе, и вторую клетку, экспрессирующую CAR, имеющий другой домен, связывающий BCMA, например, домен, связывающий BCMA, описанный в данном документе, который отличается от домена, связывающего BCMA, в CAR, экспрессируемом первой клеткой. В качестве другого примера, популяция клеток, экспрессирующих CAR, может содержать первую клетку, экспрессирующую CAR, который содержит домен, связывающий BCMA, например, описанный в данном документе, и вторую клетку, экспрессирующую CAR, который содержит антигенсвязывающий домен для мишени, отличной от BCMA (например, CD19, CD20, CS-1, легкой каппа-цепи, CD139, антигена Y системы Льюис или CD38). В одном варианте осуществления популяция клеток, экспрессирующих CAR, содержит первую клетку, экспрессирующую CAR, содержащий домен, связывающий BCMA, например, описанный в данном документе, и вторую клетку, экспрессирующую CAR, содержащий антигенсвязывающий домен, нацеливающийся на CD19 (CAR для CD19). В одном варианте осуществления популяция клеток, экспрессирующих CAR, содержит, например, первую клетку, экспрессирующую CAR, который содержит первичный внутриклеточный сигнальный домен, и вторую клетку, экспрессирующую CAR, который содержит вторичный сигнальный домен.In another aspect, the present invention provides a population of cells expressing a CAR, such as CAR-T cells or NK cells expressing a CAR. In some embodiments, the population of cells expressing a CAR comprises a mixture of cells expressing different CARs. For example, in one embodiment, a population of cells expressing a CAR (e.g., CAR-T cells or NK cells expressing a CAR) can comprise a first cell expressing a CAR having a BCMA binding domain described herein and a second cell expressing a CAR having a different BCMA binding domain, such as a BCMA binding domain described herein that is different from the BCMA binding domain of the CAR expressed by the first cell. As another example, a population of cells expressing a CAR can comprise a first cell expressing a CAR that comprises a BCMA binding domain, such as those described herein, and a second cell expressing a CAR that comprises an antigen-binding domain for a target other than BCMA (e.g., CD19, CD20, CS-1, kappa light chain, CD139, Lewis antigen Y, or CD38). In one embodiment, the population of cells expressing a CAR comprises a first cell expressing a CAR that comprises a BCMA binding domain, such as those described herein, and a second cell expressing a CAR that comprises an antigen-binding domain that targets CD19 (a CD19 CAR). In one embodiment, the population of cells expressing a CAR comprises, for example, a first cell expressing a CAR that comprises a primary intracellular signaling domain and a second cell expressing a CAR that comprises a secondary signaling domain.
В другом аспекте в настоящем изобретении предусмотрена популяция клеток, где по меньшей мере одна клетка в популяции экспрессирует CAR, имеющий домен, связывающий BCMA, описанный в данном документе, и вторая клетка экспрессирует другое средство, например, средство, которое усиливает активность клетки, экспрессирующей CAR. Например, в одном варианте осуществления средство может представлять собой средство, которое ингибирует ингибирующую молекулу. Ингибирующие молекулы, например, могут в некоторых вариантах осуществления снижать способность клетки, экспрессирующей CAR, осуществлять иммунный эффекторный ответ. Примеры ингибирующих молекул включают PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекулу MHC I класса, молекулу MHC II класса, GAL9, аденозин и TGFR-бета. В одном варианте осуществления средство, которое ингибирует ингибирующую молекулу, содержит первый полипептид, например, ингибирующую молекулу, ассоциированный со вторым полипептидом, который обеспечивает положительный сигнал для клетки, например, с внутриклеточным сигнальным доменом, описанным в данном документе. В одном варианте осуществления средство содержит первый полипептид, например, из ингибирующей молекулы, такой как PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекула MHC I класса, молекула MHC II класса, GAL9, аденозин и TGFR-бета или фрагмент любого из них (например, по меньшей мере часть внеклеточного домена любого из них), и второй полипептид, который представляет собой внутриклеточный сигнальный домен, описанный в данном документе (например, содержащий костимулирующий домен (например, 4-1BB, CD27, ICOS или CD28, например, описанный в данном документе) и/или первичный сигнальный домен (например, сигнальный домен CD3-дзета, описанный в данном документе). В одном варианте осуществления средство содержит первый полипептид из PD1 или его фрагмента (например, по меньшей мере часть внеклеточного домена PD1) и второй полипептид, представляющий собой внутриклеточный сигнальный домен, описанный в данном документе (например, сигнальный домен CD28, описанный в данном документе, и/или сигнальный домен CD3-дзета, описанный в данном документе).In another aspect, the present invention provides a population of cells, wherein at least one cell in the population expresses a CAR having a BCMA binding domain as described herein, and a second cell expresses another agent, such as an agent that enhances the activity of a cell expressing the CAR. For example, in one embodiment, the agent may be an agent that inhibits an inhibitory molecule. Inhibitory molecules, for example, may, in some embodiments, reduce the ability of a cell expressing a CAR to mount an immune effector response. Examples of inhibitory molecules include PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (e.g., CEACAM-1, CEACAM-3, and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, MHC class I molecule, MHC class II molecule, GAL9, adenosine, and TGFR-beta. In one embodiment, an agent that inhibits an inhibitory molecule comprises a first polypeptide, e.g., an inhibitory molecule, associated with a second polypeptide that provides a positive signal to a cell, e.g., an intracellular signaling domain as described herein. In one embodiment, the agent comprises a first polypeptide, e.g., from an inhibitory molecule such as PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (e.g., CEACAM-1, CEACAM-3, and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, an MHC class I molecule, an MHC class II molecule, GAL9, adenosine, and TGFR-beta, or a fragment of any of them (e.g., at least a portion of the extracellular domain of any of them), and a second polypeptide that is an intracellular signaling domain as described herein (e.g., comprising a costimulatory domain (e.g., 4-1BB, CD27, ICOS or CD28, e.g., as described herein) and/or a primary signaling domain (e.g., the CD3-zeta signaling domain described herein). In one embodiment, the agent comprises a first polypeptide of PD1 or a fragment thereof (e.g., at least a portion of the extracellular domain of PD1) and a second polypeptide that is an intracellular signaling domain described herein (e.g., the CD28 signaling domain described herein and/or the CD3-zeta signaling domain described herein).
В одном аспекте в настоящем изобретении предусмотрены способы, включающие введение популяции клеток, экспрессирующих CAR (например, CAR-T-клеток или NK-клеток, экспрессирующих CAR), например, смеси клеток, экспрессирующих различные CAR, в комбинации с другим средством, например, ингибитором киназы, таким как ингибитор киназы, описанный в данном документе. В другом аспекте в настоящем изобретении предусмотрены способы, включающие введение популяции клеток, где по меньшей мере одна клетка в популяции экспрессирует CAR, имеющий антигенсвязывающий домен для антигена, ассоциированного с раком, описанного в данном документе, и вторую клетку, экспрессирующую другое средство, например, средство, которое усиливает активность клетки, экспрессирующей CAR, в комбинации с другим средством, например, ингибитором киназы, таким как ингибитор киназы, описанный в данном документе.In one aspect, the present invention provides methods comprising administering a population of cells expressing a CAR (e.g., CAR T cells or NK cells expressing a CAR), e.g., a mixture of cells expressing different CARs, in combination with another agent, e.g., a kinase inhibitor, such as a kinase inhibitor described herein. In another aspect, the present invention provides methods comprising administering a population of cells, wherein at least one cell in the population expresses a CAR having an antigen-binding domain for a cancer-associated antigen described herein, and a second cell expressing another agent, e.g., an agent that enhances the activity of a cell expressing the CAR, in combination with the other agent, e.g., a kinase inhibitor, such as a kinase inhibitor described herein.
CAR, содержащие рецепторы естественных клеток-киллеров (NKR)CARs containing natural killer cell receptors (NKRs)
В одном варианте осуществления молекула CAR, описанная в данном документе, содержит один или несколько компонентов рецептора естественных клеток-киллеров (NKR), образуя тем самым NKR-CAR. Компонент NKR может представлять собой трансмембранный домен, шарнирный домен или цитоплазматический домен любого из следующих рецепторов естественных клеток-киллеров: иммуноглобулиноподобного рецептора клеток-киллеров (KIR), например, KIR2DL1, KIR2DL2/L3, KIR2DL4, KIR2DL5A, KIR2DL5B, KIR2DS1, KIR2DS2, KIR2DS3, KIR2DS4, DIR2DS5, KIR3DL1/S1, KIR3DL2, KIR3DL3, KIR2DP1 и KIR3DP1; рецептора естественной цитотоксичности (NCR), например, NKp30, NKp44, NKp46; семейства рецепторов иммунных клеток, являющихся сигнальными молекулами активации лимфоцитов (SLAM), например, CD48, CD229, 2B4, CD84, NTB-A, CRACC, BLAME и CD2F-10; Fc-рецептора (FcR), например, CD16 и CD64; и рецепторов Ly49, например, LY49A, LY49C. Молекулы NKR-CAR, описанные в данном документе, могут взаимодействовать с адапторной молекулой или внутриклеточным сигнальным доменом, например, DAP12. Иллюстративные конфигурации и последовательности молекул CAR, содержащих компоненты NKR, описаны в международной публикации № WO2014/145252, содержание которой включено в данный документ посредством ссылки.In one embodiment, a CAR molecule described herein comprises one or more natural killer cell receptor (NKR) components, thereby forming an NKR CAR. The NKR component can be a transmembrane domain, a hinge domain, or a cytoplasmic domain of any of the following natural killer cell receptors: an immunoglobulin-like killer cell receptor (KIR), e.g., KIR2DL1, KIR2DL2/L3, KIR2DL4, KIR2DL5A, KIR2DL5B, KIR2DS1, KIR2DS2, KIR2DS3, KIR2DS4, DIR2DS5, KIR3DL1/S1, KIR3DL2, KIR3DL3, KIR2DP1, and KIR3DP1; a natural cytotoxicity receptor (NCR), e.g., NKp30, NKp44, NKp46; the signaling lymphocyte activation molecule (SLAM) family of immune cell receptors, such as CD48, CD229, 2B4, CD84, NTB-A, CRACC, BLAME, and CD2F-10; the Fc receptor (FcR), such as CD16 and CD64; and the Ly49 receptors, such as LY49A, LY49C. The NKR CAR molecules described herein can interact with an adaptor molecule or an intracellular signaling domain, such as DAP12. Exemplary configurations and sequences of CAR molecules comprising NKR components are described in International Publication No. WO2014/145252, the contents of which are incorporated herein by reference.
Каркасные структуры, отличные от антителScaffold structures other than antibodies
В ряде вариантов осуществления антигенсвязывающий домен содержит каркасную структуру, отличную от антитела, например, фибронектин, анкирин, доменное антитело, липокалин, малое модульное иммунофармацевтическое средство, максиантитело, белок A или аффилин. Каркасная структура, отличная от антитела, обладает способностью связываться с антигеном-мишенью на клетке. В ряде вариантов осуществления антигенсвязывающий домен представляет собой полипептид или его фрагмент из встречающегося в природе белка, экспрессируемого на клетке. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит каркасную структуру, отличную от антитела. Можно использовать большое разнообразие каркасных структур, отличных от антител, при условии, что полученный в результате полипептид содержит по меньшей мере одну связывающую область, которая специфично связывается с антигеном-мишенью на клетке-мишени.In some embodiments, the antigen-binding domain comprises a framework other than an antibody, such as fibronectin, ankyrin, a domain antibody, lipocalin, a small modular immunopharmaceutical, a maxibody, protein A, or an affilin. The framework other than an antibody has the ability to bind to a target antigen on a cell. In some embodiments, the antigen-binding domain is a polypeptide or fragment thereof from a naturally occurring protein expressed on a cell. In some embodiments, the antigen-binding domain comprises a framework other than an antibody. A wide variety of frameworks other than antibodies can be used, so long as the resulting polypeptide contains at least one binding region that specifically binds to a target antigen on a target cell.
Каркасные структуры, отличные от антител, включают фибронектин (Novartis, Массачусетс), анкирин (Molecular Partners AG, Цюрих, Швейцария), доменные антитела (Domantis, Ltd., Кембридж, Массачусетс и Ablynx NV, Звейнарде, Бельгия), липокалин (Pieris Proteolab AG, Фрайзинг, Германия), малые модульные иммунофармацевтические средства (Trubion Pharmaceuticals Inc., Сиэтл, Вашингтон), максиантитела (Avidia, Inc., Маунтин-Вью, Калифорния), белок A (Affibody AG, Швеция) и аффилин (гамма-кристаллин или убиквитин) (Scil Proteins GmbH, Галле, Германия).Non-antibody scaffolds include fibronectin (Novartis, MA), ankyrin (Molecular Partners AG, Zurich, Switzerland), domain antibodies (Domantis, Ltd., Cambridge, MA and Ablynx NV, Zwijnaarde, Belgium), lipocalin (Pieris Proteolab AG, Freising, Germany), small modular immunopharmaceuticals (Trubion Pharmaceuticals Inc., Seattle, WA), maxi antibodies (Avidia, Inc., Mountain View, CA), protein A (Affibody AG, Sweden), and affilin (gamma-crystallin or ubiquitin) (Scil Proteins GmbH, Halle, Germany).
Стратегии регуляции химерных антигенных рецепторовStrategies for regulation of chimeric antigen receptors
Существует множество путей, которыми можно регулировать формы активности CAR. В некоторых вариантах осуществления регулируемый CAR (RCAR), в котором можно контролировать активность CAR, является желательным для оптимизации безопасности и эффективности CAR-терапии. Например, индуцирование апоптоза с помощью, например, каспазы, слитой с димеризационным доменом (см., например, Di et al., N Engl. J. Med. 2011 Nov. 3; 365(18):1673-1683), можно применять в качестве защитного переключателя в CAR-терапии по настоящему изобретению. В другом примере клетки, экспрессирующие CAR, могут также экспрессировать молекулу индуцируемой каспазы-9 (iCaspase-9), которая при введении димеризующего лекарственного средства (например, римидуцида (также называемого AP1903 (Bellicum Pharmaceuticals) или AP20187 (Ariad)) приводит к активации каспазы-9 и апоптозу клеток. Молекула iCaspase-9 содержит связывающий домен для химического индуктора димеризации (CID), который опосредует димеризацию в присутствии CID. Это приводит к индуцируемому и селективному истощению по клеткам, экспрессирующим CAR. В некоторых случаях молекула iCaspase-9 кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, отдельной от вектора(векторов), кодирующего(кодирующих) CAR. В некоторых случаях молекула iCaspase-9 кодируется той же молекулой нуклеиновой кислоты, что и вектор, кодирующий CAR. iCaspase-9 может обеспечивать защитное переключение для избежания возможной токсичности клеток, экспрессирующих CAR. См., например, Song et al. Cancer Gene Ther. 2008; 15(10):667-75; Clinical Trial Id. № NCT02107963; и Di Stasi et al. N. Engl. J. Med. 2011; 365:1673-83.There are multiple ways in which CAR activity patterns can be regulated. In some embodiments, a regulated CAR (RCAR), in which CAR activity can be controlled, is desirable to optimize the safety and efficacy of CAR therapy. For example, induction of apoptosis using, for example, a caspase fused to a dimerization domain (see, for example, Di et al., N Engl. J. Med. 2011 Nov. 3; 365(18):1673-1683), can be used as a safety switch in the CAR therapy of the present invention. In another example, cells expressing a CAR may also express an inducible caspase-9 (iCaspase-9) molecule that, upon administration of a dimerizing drug (e.g., rimiducid (also called AP1903 (Bellicum Pharmaceuticals) or AP20187 (Ariad)) results in caspase-9 activation and cell apoptosis. The iCaspase-9 molecule contains a chemical inducer of dimerization (CID) binding domain that mediates dimerization in the presence of CID. This results in inducible and selective depletion of CAR-expressing cells. In some cases, the iCaspase-9 molecule is encoded by a nucleic acid molecule separate from the vector(s) encoding the CAR. In some cases, the iCaspase-9 molecule is encoded by the same nucleic acid molecule as the vector encoding the CAR. iCaspase-9 may provide a protective switch to avoid potential toxicity in CAR-expressing cells. See, e.g., Song et al. Cancer Gene Ther. 2008; 15(10):667–75; Clinical Trial Id. No. NCT02107963; and Di Stasi et al. N. Engl. J. Med. 2011; 365:1673–83.
Альтернативные стратегии регуляции средства CAR-терапии по настоящему изобретению включают использование малых молекул или антител, которые деактивируют или выключают активность CAR, например, путем удаления клеток, экспрессирующих CAR, например, путем индукции антителозависимой клеточноопосредованной цитотоксичности (ADCC). Например, клетки, экспрессирующие CAR, описанные в данном документе, могут также экспрессировать антиген, который распознается молекулами, способными индуцировать гибель клеток, например, ADCC или комплемент-индуцированную гибель клеток. Например, клетки, экспрессирующие CAR, описанные в данном документе, также могут экспрессировать рецептор, на который могут нацеливаться антитело или фрагмент антитела. Примеры таких рецепторов включают EpCAM, VEGFR, интегрины (например, интегрины ανβ3, α4, αΙ¾β3, α4β7, α5β1, ανβ3, αν), представителей суперсемейства рецепторов TNF (например, TRAIL-R1 , TRAIL-R2), рецептор PDGF, рецептор интерферона, рецептор фолиевой кислоты, GPNMB, ICAM-1, HLA-DR, CEA, CA-125, MUC1, TAG-72, рецептор IL-6, 5T4, GD2, GD3, CD2, CD3, CD4, CD5, CD1 1, CD1 1 a/LFA-1, CD15, CD18/ITGB2, CD19, CD20, CD22, CD23/рецептор IgE, CD25, CD28, CD30, CD33, CD38, CD40, CD41, CD44, CD51, CD52, CD62L, CD74, CD80, CD125, CD147/базиджин, CD152/CTLA-4, CD154/CD40L, CD195/CCR5, CD319/SLAMF7 и EGFR и их усеченные варианты (например, варианты, в которых сохраняются один или несколько внеклеточных эпитопов, но отсутствуют одна или несколько областей в цитоплазматическом домене). Например, клетки, экспрессирующие CAR, описанные в данном документе, также могут экспрессировать усеченный рецептор эпидермального фактора роста (EGFR), у которого отсутствует способность к передаче сигнала, но сохраняется эпитоп, распознаваемый молекулами, способными индуцировать ADCC, например, цетуксимабом (ERBITUX®), так что введение цетуксимаба индуцирует ADCC и последующее истощение популяции клеток, экспрессирующих CAR (см., например, WO2011/056894 и Jonnalagadda et al., Gene Ther. 2013; 20(8)853-860). Другая стратегия предусматривает обеспечение экспрессии высококомпактного маркерного/"суицидального" гена, в котором объединены эпитопы-мишени обоих из антигенов CD32 и CD20 в клетках, экспрессирующих CAR, описанных в данном документе, которые связываются с ритуксимабом, что приводит к избирательному истощению популяции клеток, экспрессирующих CAR, например, посредством ADCC (см., например, Philip et al., Blood. 2014; 124(8)1277-1287). Другие способы истощения популяции клеток, экспрессирующих CAR, описанных в данном документе, включают введение CAMPATH® - моноклонального антитела к CD52, которое избирательно связывается со зрелыми лимфоцитами, например, клетками, экспрессирующими CAR, и направляет их на разрушение, например, посредством индукции ADCC. В других вариантах осуществления на клетки, экспрессирующие CAR, можно осуществлять избирательное нацеливание с помощью лиганда CAR, например, антиидиотипического антитела. В некоторых вариантах осуществления антиидиотипическое антитело может обуславливать активность эффекторных клеток, например, формы активности ADCC или ADC, за счет чего обеспечивается снижение количества клеток, экспрессирующих CAR. В других вариантах осуществления лиганд CAR, например, антиидиотипическое антитело, может быть связан со средством, которое индуцирует уничтожение клеток, например, токсином, за счет чего обеспечивается снижение количества клеток, экспрессирующих CAR. В качестве альтернативы молекулы CAR сами по себе могут быть представлены в такой конфигурации, при которой активность можно регулировать, например, путем включения или выключения, как описано ниже.Alternative strategies for regulating the CAR therapy of the present invention include the use of small molecules or antibodies that deactivate or turn off CAR activity, such as by removing cells expressing the CAR, such as by inducing antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC). For example, cells expressing the CAR described herein may also express an antigen that is recognized by molecules capable of inducing cell death, such as ADCC or complement-induced cell death. For example, cells expressing the CAR described herein may also express a receptor that can be targeted by an antibody or antibody fragment. Examples of such receptors include EpCAM, VEGFR, integrins (e.g., ανβ3, α4, αΙ¾β3, α4β7, α5β1, ανβ3, αν integrins), members of the TNF receptor superfamily (e.g., TRAIL-R1, TRAIL-R2), PDGF receptor, interferon receptor, folate receptor, GPNMB, ICAM-1, HLA-DR, CEA, CA-125, MUC1, TAG-72, IL-6 receptor, 5T4, GD2, GD3, CD2, CD3, CD4, CD5,
В некоторых вариантах осуществления RCAR содержит набор полипептидов, как правило, в простейших вариантах осуществления два, в которых составляющие стандартного CAR, описанного в данном документе, например, антигенсвязывающий домен и внутриклеточный сигнальный домен, разделены на отдельные полипептиды или компоненты. В некоторых вариантах осуществления набор полипептидов содержит димеризационный переключатель, который при наличии димеризующей молекулы может связывать полипептиды друг с другом, например, может связывать антигенсвязывающий домен с внутриклеточным сигнальным доменом. Дополнительное описание и иллюстративные конфигурации таких регулируемых CAR предусмотрены в данном документе и в международной публикации № WO 2015/090229, включенной в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.In some embodiments, an RCAR comprises a set of polypeptides, typically two in the simplest embodiments, in which the components of a standard CAR described herein, such as an antigen-binding domain and an intracellular signaling domain, are separated into separate polypeptides or components. In some embodiments, the set of polypeptides comprises a dimerization switch that, in the presence of a dimerization molecule, can link the polypeptides to each other, such as can link the antigen-binding domain to the intracellular signaling domain. Further description and exemplary configurations of such regulable CARs are provided herein and in International Publication No. WO 2015/090229, incorporated herein by reference in its entirety.
В одном варианте осуществления RCAR содержит два полипептида или компонента: 1) внутриклеточный сигнальный компонент, содержащий внутриклеточный сигнальный домен, например, первичный внутриклеточный сигнальный домен, описанный в данном документе, и первый переключающий домен; 2) антигенсвязывающий компонент, содержащий антигенсвязывающий домен, например, который нацеливается на опухолевый антиген, описанный в данном документе, и второй переключающий домен. RCAR необязательно содержит трансмембранный домен, описанный в данном документе. В одном варианте осуществления трансмембранный домен может быть расположен во внутриклеточном сигнальном компоненте, в антигенсвязывающем компоненте или в них обоих. (Если не указано иное, то при описании в данном документе компонентов или элементов RCAR порядок может быть таким, как предусмотрено, но также включены и другие порядки. Другими словами, в одном варианте осуществления порядок является таким, как изложено в тексте, но в других вариантах осуществления порядок может быть другим. Например, порядок элементов с одной стороны от трансмембранной области может отличаться от примера, например, размещение переключающего домена относительно внутриклеточного сигнального домена может быть другим, например, обратным).In one embodiment, the RCAR comprises two polypeptides or components: 1) an intracellular signaling component comprising an intracellular signaling domain, e.g., a primary intracellular signaling domain as described herein, and a first switch domain; 2) an antigen-binding component comprising an antigen-binding domain, e.g., that targets a tumor antigen as described herein, and a second switch domain. The RCAR optionally comprises a transmembrane domain as described herein. In one embodiment, the transmembrane domain can be located in the intracellular signaling component, the antigen-binding component, or both. (Unless otherwise indicated, when describing components or elements of an RCAR herein, the order may be as provided, but other orders are also included. In other words, in one embodiment, the order is as set forth in the text, but in other embodiments, the order may be different. For example, the order of elements on one side of the transmembrane region may differ from the example, for example, the placement of the switch domain relative to the intracellular signaling domain may be different, such as reversed.)
В одном варианте осуществления первый и второй переключающий домены могут образовывать внутриклеточный или внеклеточный димеризационный переключатель. В одном варианте осуществления димеризационный переключатель может представлять собой гомодимеризационный переключатель, например, если первый и второй переключающие домены являются одинаковыми, или гетеродимеризационный переключатель, например, если первый и второй переключающие домены отличаются друг от друга.In one embodiment, the first and second switch domains may form an intracellular or extracellular dimerization switch. In one embodiment, the dimerization switch may be a homodimerization switch, such as if the first and second switch domains are the same, or a heterodimerization switch, such as if the first and second switch domains are different from each other.
В ряде вариантов осуществления RCAR может содержать "мультипереключатель". Мультипереключатель может содержать гетеродимеризационные переключающие домены или гомодимеризационные переключающие домены. Мультипереключатель содержит множество, например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10, переключающих доменов отдельно в первом компоненте, например, антигенсвязывающем компоненте, и втором компоненте, например, внутриклеточном сигнальном компоненте. В одном варианте осуществления первый компонент может содержать множество первых переключающих доменов, например, переключающих доменов на основе FKBP, и второй компонент может содержать множество вторых переключающих доменов, например, переключающих доменов на основе FRB. В одном варианте осуществления первый компонент может содержать первый и второй переключающий домен, например, переключающий домен на основе FKBP и переключающий домен на основе FRB, и второй компонент может содержать первый и второй переключающий домен, например, переключающий домен на основе FKBP и переключающий домен на основе FRB.In some embodiments, an RCAR may comprise a "multi-switch." The multi-switch may comprise heterodimerization switch domains or homodimerization switch domains. The multi-switch comprises a plurality, such as 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, or 10, switch domains separately in a first component, such as an antigen-binding component, and a second component, such as an intracellular signaling component. In one embodiment, the first component may comprise a plurality of first switch domains, such as FKBP-based switch domains, and the second component may comprise a plurality of second switch domains, such as FRB-based switch domains. In one embodiment, the first component may comprise a first and a second switch domain, such as an FKBP-based switch domain and an FRB-based switch domain, and the second component may comprise a first and a second switch domain, such as an FKBP-based switch domain and an FRB-based switch domain.
В одном варианте осуществления внутриклеточный сигнальный компонент содержит один или несколько внутриклеточных сигнальных доменов, например, первичный внутриклеточный сигнальный домен и один или несколько костимулирующих сигнальных доменов.In one embodiment, the intracellular signaling component comprises one or more intracellular signaling domains, such as a primary intracellular signaling domain and one or more costimulatory signaling domains.
В одном варианте осуществления антигенсвязывающий компонент может содержать один или несколько внутриклеточных сигнальных доменов, например, один или несколько костимулирующих сигнальных доменов. В одном варианте осуществления антигенсвязывающий компонент содержит множество, например, 2 или 3, костимулирующих сигнальных доменов, описанных в данном документе, например, выбранных из 4-1BB, CD28, CD27, ICOS и OX40, и в ряде вариантов осуществления первичный внутриклеточный сигнальный домен отсутствует. В одном варианте осуществления антигенсвязывающий компонент содержит следующие костимулирующие сигнальные домены в направлении от внеклеточного к внутриклеточному пространству: 4-1BB-CD27; 4-1BB-CD27; CD27-4-1BB; 4-1BB-CD28; CD28-4-1BB; OX40-CD28; CD28-OX40; CD28-4-1BB или 4-1BB-CD28. В таких вариантах осуществления внутриклеточный связывающий компонент содержит домен CD3-дзета. В одном таком варианте осуществления RCAR содержит (1) антигенсвязывающий компонент, содержащий антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и два костимулирующих домена, а также первый переключающий домен; и (2) внутриклеточный сигнальный домен, содержащий трансмембранный домен или домен прикрепления к мембране и по меньшей мере один первичный внутриклеточный сигнальный домен и второй переключающий домен.In one embodiment, the antigen-binding component may comprise one or more intracellular signaling domains, such as one or more costimulatory signaling domains. In one embodiment, the antigen-binding component comprises a plurality, such as 2 or 3, costimulatory signaling domains described herein, such as selected from 4-1BB, CD28, CD27, ICOS, and OX40, and in some embodiments, the primary intracellular signaling domain is absent. In one embodiment, the antigen-binding component comprises the following costimulatory signaling domains in the extracellular to intracellular direction: 4-1BB-CD27; 4-1BB-CD27; CD27-4-1BB; 4-1BB-CD28; CD28-4-1BB; OX40-CD28; CD28-OX40; CD28-4-1BB, or 4-1BB-CD28. In such embodiments, the intracellular binding component comprises a CD3 zeta domain. In one such embodiment, the RCAR comprises (1) an antigen binding component comprising an antigen binding domain, a transmembrane domain, and two costimulatory domains, as well as a first switch domain; and (2) an intracellular signaling domain comprising a transmembrane or membrane anchoring domain and at least one primary intracellular signaling domain and a second switch domain.
В одном варианте осуществления представлены RCAR, где антигенсвязывающий компонент не прикреплен к поверхности CAR-клетки. Это дает возможность клетке, имеющей внутриклеточный сигнальный компонент, успешно соединяться с одним или несколькими антигенсвязывающими доменами без трансформации клетки последовательностью, которая кодирует антигенсвязывающий компонент. В таких вариантах осуществления RCAR содержит 1) внутриклеточный сигнальный компонент, содержащий первый переключающий домен, трансмембранный домен, внутриклеточный сигнальный домен, например, первичный внутриклеточный сигнальный домен, и первый переключающий домен; и 2) антигенсвязывающий компонент, содержащий антигенсвязывающий домен и второй переключающий домен, где антигенсвязывающий компонент не содержит трансмембранный домен или домен прикрепления к мембране и необязательно не содержит внутриклеточный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления RCAR может дополнительно содержать 3) второй антигенсвязывающий компонент, содержащий второй антигенсвязывающий домен, например, второй антигенсвязывающий домен, который связывает антиген, отличный от того, который связывается антигенсвязывающим доменом; и второй переключающий домен.In one embodiment, RCARs are provided wherein the antigen-binding component is not attached to the surface of the CAR cell. This allows a cell having an intracellular signaling component to successfully bind to one or more antigen-binding domains without transforming the cell with a sequence that encodes the antigen-binding component. In such embodiments, the RCAR comprises 1) an intracellular signaling component comprising a first switch domain, a transmembrane domain, an intracellular signaling domain, e.g., a primary intracellular signaling domain, and a first switch domain; and 2) an antigen-binding component comprising an antigen-binding domain and a second switch domain, wherein the antigen-binding component does not comprise a transmembrane or membrane anchor domain and optionally does not comprise an intracellular signaling domain. In some embodiments, the RCAR may further comprise 3) a second antigen-binding component comprising a second antigen-binding domain, e.g., a second antigen-binding domain that binds an antigen different from that bound by the antigen-binding domain; and a second switch domain.
Также в данном документе предусмотрены RCAR, где антигенсвязывающий компонент обладает способностью к биспецифической активации и нацеливанию. В таком варианте осуществления антигенсвязывающий компонент может содержать множество, например, 2, 3, 4 или 5, антигенсвязывающих доменов, например, scFv, где каждый антигенсвязывающий домен связывается с антигеном-мишенью, например, с разными антигенами или одним тем же антигеном, например, с одним и тем же или разными эпитопами на одном и том же антигене. В одном варианте осуществления множество антигенсвязывающих доменов находятся в тандеме, и между каждыми двумя следующими друг за другом антигенсвязывающими доменами необязательно располагается линкер или шарнирная область. Подходящие линкеры и шарнирные области описаны в данном документе.Also provided herein are RCARs wherein the antigen-binding component has bispecific activation and targeting capability. In such an embodiment, the antigen-binding component may comprise a plurality, such as 2, 3, 4, or 5, antigen-binding domains, such as an scFv, wherein each antigen-binding domain binds to a target antigen, such as different antigens or the same antigen, such as the same or different epitopes on the same antigen. In one embodiment, the plurality of antigen-binding domains are in tandem, and a linker or hinge region is optionally located between every two consecutive antigen-binding domains. Suitable linkers and hinge regions are described herein.
В одном варианте осуществления представлены RCAR, имеющие конфигурацию, которая обеспечивает переключение пролиферации. В таком варианте осуществления RCAR содержит 1) внутриклеточный сигнальный компонент, содержащий необязательно трансмембранный домен или домен прикрепления к мембране; один или несколько костимулирующих сигнальных доменов, например, выбранных из 4-1BB, CD28, CD27, ICOS и OX40, и переключающий домен; и 2) антигенсвязывающий компонент, содержащий антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и первичный внутриклеточный сигнальный домен, например, домен CD3-дзета, где антигенсвязывающий компонент не содержит переключающий домен или не содержит переключающий домен, который димеризуется с переключающим доменом во внутриклеточном сигнальном компоненте. В одном варианте осуществления антигенсвязывающий компонент не содержит костимулирующий сигнальный домен. В одном варианте осуществления внутриклеточный сигнальный компонент содержит переключающий домен из гомодимеризационного переключателя. В одном варианте осуществления внутриклеточный сигнальный компонент содержит первый переключающий домен из гетеродимеризационного переключателя, и RCAR содержит второй внутриклеточный сигнальный компонент, который содержит второй переключающий домен из гетеродимеризационного переключателя. В таких вариантах осуществления второй внутриклеточный сигнальный компонент содержит те же внутриклеточные сигнальные домены, что и внутриклеточный сигнальный компонент. В одном варианте осуществления димеризационный переключатель является внутриклеточным. В одном варианте осуществления димеризационный переключатель является внеклеточным.In one embodiment, RCARs are provided that have a configuration that provides a proliferation switch. In such an embodiment, the RCAR comprises 1) an intracellular signaling component optionally comprising a transmembrane domain or a membrane anchor domain; one or more costimulatory signaling domains, such as those selected from 4-1BB, CD28, CD27, ICOS, and OX40, and a switch domain; and 2) an antigen-binding component comprising an antigen-binding domain, a transmembrane domain, and a primary intracellular signaling domain, such as a CD3-zeta domain, wherein the antigen-binding component does not comprise a switch domain or does not comprise a switch domain that dimerizes with a switch domain in the intracellular signaling component. In one embodiment, the antigen-binding component does not comprise a costimulatory signaling domain. In one embodiment, the intracellular signaling component comprises a switch domain from a homodimerization switch. In one embodiment, the intracellular signaling component comprises a first switch domain of a heterodimerization switch, and the RCAR comprises a second intracellular signaling component that comprises a second switch domain of the heterodimerization switch. In such embodiments, the second intracellular signaling component comprises the same intracellular signaling domains as the intracellular signaling component. In one embodiment, the dimerization switch is intracellular. In one embodiment, the dimerization switch is extracellular.
В любой из конфигураций RCAR, описанных в данном документе, первый и второй переключающие домены содержат переключатель на основе FKBP-FRB, как описано в данном документе.In any of the RCAR configurations described herein, the first and second switching domains comprise an FKBP-FRB based switch as described herein.
Также в данном документе предусмотрены клетки, содержащие RCAR, описанный в данном документе. Любая клетка, сконструированная таким образом, что она экспрессирует RCAR, может применяться в качестве RCARX-клетки. В одном варианте осуществления RCARX-клетка представляет собой T-клетку и называется RCAR-T-клеткой. В одном варианте осуществления RCARX-клетка представляет собой NK-клетку и называется RCAR-N-клеткой.Also provided herein are cells comprising the RCAR described herein. Any cell engineered to express RCAR can be used as an RCARX cell. In one embodiment, the RCARX cell is a T cell and is referred to as an RCAR-T cell. In one embodiment, the RCARX cell is an NK cell and is referred to as an RCAR-N cell.
Также в данном документе предусмотрены нуклеиновые кислоты и векторы, содержащие последовательности, кодирующие RCAR. Последовательности, кодирующие различные составляющие RCAR, могут быть расположены в одной и той же молекуле нуклеиновой кислоты, например, в одних и тех же плазмиде или векторе, например, в вирусном векторе, например, лентивирусном векторе. В одном варианте осуществления (i) последовательность, кодирующая антигенсвязывающий компонент, и (ii) последовательность, кодирующая внутриклеточный сигнальный компонент, могут находиться в одной и той же нуклеиновой кислоте, например, векторе. Продуцирование соответствующих белков может быть достигнуто, например, путем применения отдельных промоторов или путем применения продукта бицистронной транскрипции (что может приводить к продуцированию двух белков путем расщепления одного продукта трансляции или путем трансляции двух отдельных белковых продуктов). В одном варианте осуществления последовательность, кодирующая расщепляемый пептид, например, последовательность P2A или F2А, располагается между (i) и (ii). В одном варианте осуществления последовательность, кодирующая IRES, например, IRES EMCV или EV71, располагается между (i) и (ii). В этих вариантах осуществления (i) и (ii) транскрибируются в виде одной РНК. В одном варианте осуществления первый промотор функционально связан с (i), и второй промотор функционально связан с (ii), так что (i) и (ii) транскрибируются в виде отдельных мРНК.Also provided herein are nucleic acids and vectors comprising sequences encoding an RCAR. Sequences encoding different components of an RCAR may be located on the same nucleic acid molecule, such as the same plasmid or vector, such as a viral vector, such as a lentiviral vector. In one embodiment, (i) a sequence encoding an antigen-binding component and (ii) a sequence encoding an intracellular signaling component may be located on the same nucleic acid, such as a vector. Production of the respective proteins may be achieved, such as by using separate promoters or by using a bicistronic transcription product (which may result in the production of two proteins by cleavage of a single translation product or by translation of two separate protein products). In one embodiment, a sequence encoding a cleavable peptide, such as a P2A or F2A sequence, is located between (i) and (ii). In one embodiment, the sequence encoding an IRES, such as an EMCV or EV71 IRES, is located between (i) and (ii). In these embodiments, (i) and (ii) are transcribed as a single RNA. In one embodiment, the first promoter is operably linked to (i) and the second promoter is operably linked to (ii), such that (i) and (ii) are transcribed as separate mRNAs.
В качестве альтернативы последовательности, кодирующие различные составляющие RCAR, могут быть расположены в разных молекулах нуклеиновой кислоты, например, в разных плазмидах или векторах, например, в вирусных векторах, например, в лентивирусных векторах. Например, (i) последовательность, кодирующая антигенсвязывающий компонент, может находиться в первой нуклеиновой кислоте, например, в первом векторе, и (ii) последовательность, кодирующая внутриклеточный сигнальный компонент, может находиться во второй нуклеиновой кислоте, например, во втором векторе.Alternatively, the sequences encoding the different components of the RCAR may be located in different nucleic acid molecules, such as in different plasmids or vectors, such as in viral vectors, such as in lentiviral vectors. For example, (i) the sequence encoding the antigen-binding component may be located in a first nucleic acid, such as in a first vector, and (ii) the sequence encoding the intracellular signaling component may be located in a second nucleic acid, such as in a second vector.
Димеризационные переключателиDimerization switches
Димеризационные переключатели могут быть нековалентными или ковалентными. В нековалентном димеризационном переключателе димеризующая молекула способствует нековалентному взаимодействию между переключающими доменами. В ковалентном димеризационном переключателе димеризующая молекула способствует ковалентному взаимодействию между переключающими доменами.Dimerization switches can be noncovalent or covalent. In a noncovalent dimerization switch, the dimerizing molecule facilitates a noncovalent interaction between the switching domains. In a covalent dimerization switch, the dimerizing molecule facilitates a covalent interaction between the switching domains.
В одном варианте осуществления RCAR содержит димеризационный переключатель на основе FKBP/FRAP или FKBP/FRB. FKBP12 (FKBP или FK506-связывающий белок) является широко распространенным цитоплазматическим белком, который служит в качестве исходной внутриклеточной мишени для рапамицина - природного продукта, представляющего собой иммуносупрессивное лекарственное средство. Рапамицин связывается с FKBP и с большим гомологом PI3K, представляющим собой FRAP (RAFT, mTOR). FRB является частью FRAP из 93 аминокислот, которая является достаточной для связывания комплекса FKBP-рапамицин (Chen, J., Zheng, X. F., Brown, E. J. & Schreiber, S. L. (1995) Identification of an 11-kDa FKBP12-rapamycin-binding domain within the 289-kDa FKBP12-rapamycin-associated protein and characterization of a critical serine residue. Proc Natl Acad Sci U S A 92: 4947-51).In one embodiment, the RCAR comprises a FKBP/FRAP or FKBP/FRB-based dimerization switch. FKBP12 (FKBP or FK506-binding protein) is a widely distributed cytoplasmic protein that serves as the initial intracellular target of rapamycin, a natural product immunosuppressive drug. Rapamycin binds to FKBP and to the large PI3K homolog FRAP (RAFT, mTOR). FRB is the 93-amino acid portion of FRAP that is sufficient to bind the FKBP-rapamycin complex (Chen, J., Zheng, XF, Brown, EJ & Schreiber, SL (1995) Identification of an 11-kDa FKBP12-rapamycin-binding domain within the 289-kDa FKBP12-rapamycin-associated protein and characterization of a critical serine residue . Proc Natl Acad Sci USA 92: 4947–51).
В ряде вариантов осуществления для переключателя на основе FKBP/FRAP, например, на основе FKBP/FRB, может применяться димеризующая молекула, например, рапамицин или аналог рапамицина.In some embodiments, a dimerizing molecule, such as rapamycin or a rapamycin analog, may be used for a FKBP/FRAP-based switch, such as a FKBP/FRB-based switch.
Иллюстративная аминокислотная последовательность FKBP является следующей:An illustrative amino acid sequence of FKBP is as follows:
D V P D Y A S L G G P S S P K K K R K V S R G V Q V E T I S P G D G R T F P K R G Q T C V V H Y T G M L E D G K K F D S S R D R N K P F K F M L G K Q E V I R G W E E G V A Q M S V G Q R A K L T I S P D Y A Y G A T G H P G I I P P H A T L V F D V E L L K L E T S Y (SEQ ID NO: 275)D V P D Y A S L G G P S S P K K K R K V S R G V Q V E T I S P G D G R T F P K R G Q T C V V H Y T G M L E D G K K F D S S R D R N K P F K F M L G K Q E V I R G W E E G V A Q M S V G Q R A K L T I S P D Y A Y G A T G H P G I I P P H A T L V F D V E L L K L E T S Y (SEQ ID NO: 275)
В ряде вариантов осуществления переключающий домен на основе FKBP может содержать фрагмент FKBP, обладающий способностью связываться с FRB или его фрагментом или аналогом в присутствии рапамицина или рапалога. В одном варианте осуществления переключающий домен на основе FKBP содержит следующую аминокислотную последовательность:In some embodiments, the FKBP-based switch domain may comprise a fragment of FKBP that has the ability to bind to FRB or a fragment or analog thereof in the presence of rapamycin or rapalog. In one embodiment, the FKBP-based switch domain comprises the following amino acid sequence:
V Q V E T I S P G D G R T F P K R G Q T C V V H Y T G M L E D G K K F D S S R D R N K P F K F M L G K Q E V I R G W E E G V A Q M S V G Q R A K L T I S P D Y A Y G A T G H P G I I P P H A T L V F D V E L L K L E T S (SEQ ID NO: 276)V Q V E T I S P G D G R T F P K R G Q T C V V H Y T G M L E D G K K F D S S R D R N K P F K F M L G K Q E V I R G W E E G V A Q M S V G Q R A K L T I S P D Y A Y G A T G H P G I I P P H A T L V F D V E L L K L E T S (SEQ ID NO: 276)
Аминокислотная последовательность FRB является следующей:The amino acid sequence of FRB is as follows:
ILWHEMWHEG LEEASRLYFG ERNVKGMFEV LEPLHAMMER GPQTLKETSF NQAYGRDLME AQEWCRKYMK SGNVKDLTQA WDLYYHVFRR ISK (SEQ ID NO: 277)ILWHEMWHEG LEEASRLYFG ERNVKGMFEV LEPLHAMMER GPQTLKETSF NQAYGRDLME AQEWCRKYMK SGNVKDLTQA WDLYYHVFRR ISK (SEQ ID NO: 277)
Используемый в данном документе термин "переключатель на основе FKBP/FRAP, например, на основе FKBP/FRB" относится к димеризационному переключателю, содержащему первый переключающий домен, который содержит фрагмент FKBP или его аналог, обладающий способностью связываться с FRB или его фрагментом или аналогом в присутствии рапамицина или рапалога, например, RAD001, и характеризующийся по меньшей мере 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичностью с последовательностью FKBP под SEQ ID NO: 275 или 276 или отличающийся не более чем 30, 25, 20, 15, 10, 5, 4, 3, 2 или 1 аминокислотным остатком от нее; и второй переключающий домен, который содержит фрагмент FKBP или его аналог, обладающий способностью связываться с FRB или его фрагментом или аналогом в присутствии рапамицина или рапалога и характеризующийся по меньшей мере 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичностью с последовательностью FRB под SEQ ID NO: 277 или отличающийся не более чем 30, 25, 20, 15, 10, 5, 4, 3, 2 или 1 аминокислотным остатком от нее. В одном варианте осуществления RCAR, описанный в данном документе, содержит один переключающий домен, содержащий аминокислотные остатки, раскрытые под SEQ ID NO: 275 (или SEQ ID NO: 276), и один переключающий домен, содержащий аминокислотные остатки, раскрытые под SEQ ID NO: 277.As used herein, the term "FKBP/FRAP-based switch, e.g. FKBP/FRB-based" refers to a dimerization switch comprising a first switch domain that comprises a fragment of FKBP or an analog thereof that is capable of binding to FRB or a fragment or analog thereof in the presence of rapamycin or a rapalog, e.g. RAD001, and is characterized by at least 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, or 99% identity to the FKBP sequence of SEQ ID NO: 275 or 276 or differs by no more than 30, 25, 20, 15, 10, 5, 4, 3, 2, or 1 amino acid residue therefrom; and a second switch domain that comprises a fragment of FKBP or an analog thereof that has the ability to bind to FRB or a fragment or analog thereof in the presence of rapamycin or a rapalog and is characterized by at least 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, or 99% identity to the FRB sequence of SEQ ID NO: 277 or differs by no more than 30, 25, 20, 15, 10, 5, 4, 3, 2, or 1 amino acid residue therefrom. In one embodiment, the RCAR described herein comprises one switch domain comprising the amino acid residues disclosed in SEQ ID NO: 275 (or SEQ ID NO: 276) and one switch domain comprising the amino acid residues disclosed in SEQ ID NO: 277.
В ряде вариантов осуществления димеризационный переключатель на основе FKBP/FRB содержит модифицированный переключающий домен на основе FRB, который демонстрирует измененное, например, улучшенное, образование комплекса между переключающим доменом на основе FRB, например, модифицированным переключающим доменом на основе FRB, переключающим доменом на основе FKBP и димеризующей молекулой, например, рапамицином или рапалогом, например, RAD001. В одном варианте осуществления модифицированный переключающий домен на основе FRB содержит одну или несколько мутаций, например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или больше, выбранных из мутаций в аминокислотных положениях L2031, E2032, S2035, R2036, F2039, G2040, T2098, W2101, D2102, Y2105 и F2108, где аминокислота дикого типа в результате мутации заменяется любой другой встречающейся в природе аминокислотой. В одном варианте осуществления мутантный FRB содержит мутацию в E2032, где E2032 в результате мутации заменяется фенилаланином (E2032F), метионином (E2032M), аргинином (E2032R), валином (E2032V), тирозином (E2032Y), изолейцином (E2032I), например, в SEQ ID NO: 278, или лейцином (E2032L), например, в SEQ ID NO: 279. В одном варианте осуществления мутантный FRB содержит мутацию в T2098, где T2098 в результате мутации заменяется фенилаланином (T2098F) или лейцином (T2098L), например, в SEQ ID NO: 280. В одном варианте осуществления мутантный FRB содержит мутацию в E2032 и в T2098, где E2032 в результате мутации заменяется любой аминокислотой, и где T2098 в результате мутации заменяется любой аминокислотой, например, в SEQ ID NO: 281. В одном варианте осуществления мутантный FRB содержит мутацию E2032I и T2098L, например, в SEQ ID NO: 282. В одном варианте осуществления мутантный FRB содержит мутацию E2032L и T2098L, например, в SEQ ID NO: 283.In some embodiments, the FKBP/FRB-based dimerization switch comprises a modified FRB-based switch domain that exhibits altered, e.g., improved, complex formation between the FRB-based switch domain, e.g., a modified FRB-based switch domain, the FKBP-based switch domain, and a dimerizing molecule, e.g., rapamycin or a rapalog, e.g., RAD001. In one embodiment, the modified FRB-based switch domain comprises one or more mutations, such as 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or more, selected from mutations at amino acid positions L2031, E2032, S2035, R2036, F2039, G2040, T2098, W2101, D2102, Y2105 and F2108, wherein the wild-type amino acid is mutated to any other naturally occurring amino acid. In one embodiment, the mutant FRB comprises a mutation at E2032, wherein E2032 is mutated to phenylalanine (E2032F), methionine (E2032M), arginine (E2032R), valine (E2032V), tyrosine (E2032Y), isoleucine (E2032I), such as in SEQ ID NO: 278, or leucine (E2032L), such as in SEQ ID NO: 279. In one embodiment, the mutant FRB comprises a mutation at T2098, wherein T2098 is mutated to phenylalanine (T2098F) or leucine (T2098L), such as in SEQ ID NO: 280. In one embodiment, the mutant FRB comprises a mutation at E2032 and at T2098, wherein E2032 is mutated to is replaced by any amino acid, and wherein T2098 is mutated to any amino acid, such as in SEQ ID NO: 281. In one embodiment, the mutant FRB comprises the mutation E2032I and T2098L, such as in SEQ ID NO: 282. In one embodiment, the mutant FRB comprises the mutation E2032L and T2098L, such as in SEQ ID NO: 283.
E2032L, T2098LMutant form
E2032L, T2098L
Другие подходящие димеризационные переключатели включают димеризационный переключатель на основе GyrB-GyrB, димеризационный переключатель на основе гиббереллина, димеризационный переключатель на основе метки/связывающего средства и димеризационный переключатель на основе галогеновой метки/SNAP-метки. В соответствии с указаниями, представленными в данном документе, такие переключатели и подходящие димеризующие молекулы будут очевидны специалисту средней квалификации.Other suitable dimerization switches include a GyrB-GyrB based dimerization switch, a gibberellin based dimerization switch, a tag/binding agent based dimerization switch, and a halogen tag/SNAP tag based dimerization switch. Such switches and suitable dimerizing molecules will be apparent to one of ordinary skill in the art given the teachings provided herein.
Димеризующая молекулаDimerizing molecule
Ассоциации между переключающими доменами способствует димеризующая молекула. В присутствии димеризующей молекулы взаимодействие или ассоциация между переключающими доменами обеспечивает передачу сигнала между полипептидом, ассоциированным, например, слитым, с первым переключающим доменом, и полипептидом, ассоциированным, например, слитым, со вторым переключающим доменом. В присутствии неограничивающих уровней димеризующей молекулы передача сигнала усиливается в 1,1, 1,2, 1,3, 1,4, 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 5, 10, 50, 100 раз, например, при измерении в системе, описанной в данном документе.The association between the switch domains is facilitated by a dimerizing molecule. In the presence of the dimerizing molecule, the interaction or association between the switch domains provides for signal transmission between the polypeptide associated, for example, fused, with the first switch domain and the polypeptide associated, for example, fused, with the second switch domain. In the presence of non-limiting levels of the dimerizing molecule, signal transmission is enhanced by 1.1, 1.2, 1.3, 1.4, 1.5, 1.6, 1.7, 1.8, 1.9, 2, 5, 10, 50, 100 times, for example, when measured in the system described herein.
Рапамицин и аналоги рапамицина (иногда называемые рапалогами), например, RAD001, могут применяться в качестве димеризующих молекул в димеризационном переключателе на основе FKBP/FRB, описанном в данном документе. В одном варианте осуществления димеризующая молекула может быть выбрана из рапамицина (сиролимуса), RAD001 (эверолимуса), зотаролимуса, темсиролимуса, AP-23573 (ридафоролимуса), биолимуса и AP21967. Дополнительные аналоги рапамицина, подходящие для применения с димеризационными переключателями на основе FKBP/FRB, далее описываются в разделе под названием "Виды комбинированной терапии" или в подразделе под названием "Комбинация с низкой дозой, усиливающей иммунный ответ, ингибитора mTOR".Rapamycin and rapamycin analogs (sometimes referred to as rapalogs), such as RAD001, can be used as dimerizing molecules in the FKBP/FRB-based dimerization switch described herein. In one embodiment, the dimerizing molecule can be selected from rapamycin (sirolimus), RAD001 (everolimus), zotarolimus, temsirolimus, AP-23573 (ridaforolimus), biolimus, and AP21967. Additional rapamycin analogs suitable for use with FKBP/FRB-based dimerization switches are further described in the section entitled "Types of Combination Therapies" or in the subsection entitled "Combination with a Low-Dose Immune Response-Enhanced MTOR Inhibitor."
Разделенный CARSplit CAR
В некоторых вариантах осуществления в клетке, экспрессирующей CAR, используется разделенный CAR. Подход с разделенным CAR более подробно описан в публикациях WO2014/055442 и WO2014/055657, включенных в данный документ посредством ссылки. Вкратце, система разделенного CAR содержит клетку, экспрессирующую первый CAR, имеющий первый антигенсвязывающий домен и костимулирующий домен (например, 4-1BB), и эта клетка также экспрессирует второй CAR, имеющий второй антигенсвязывающий домен и внутриклеточный сигнальный домен (например, CD3-дзета). Когда клетка встречается с первым антигеном, то активируется костимулирующий домен, и клетка пролиферирует. Когда клетка встречается со вторым антигеном, то активируется внутриклеточный сигнальный домен, и запускается активность уничтожения клеток. Таким образом, клетка, экспрессирующая CAR, полностью активируется только в присутствии обоих антигенов. В ряде вариантов осуществления первый антигенсвязывающий домен распознает BCMA, например, содержит антигенсвязывающий домен, описанный в данном документе, и второй антигенсвязывающий домен распознает антиген, экспрессируемый на клетках острого миелоидного лейкоза, например, CD123, CLL-1, CD34, FLT3 или рецептор фолиевой кислоты бета. В ряде вариантов осуществления первый антигенсвязывающий домен распознает BCMA, например, содержит антигенсвязывающий домен, описанный в данном документе, и второй антигенсвязывающий домен распознает антиген, экспрессируемый на B-клетках, например, CD10, CD19, CD20, CD22, CD34, CD123, FLT-3, ROR1, CD79b, CD179b или CD79a.In some embodiments, a cell expressing a CAR uses a split CAR. The split CAR approach is described in more detail in WO2014/055442 and WO2014/055657, incorporated herein by reference. Briefly, a split CAR system comprises a cell expressing a first CAR having a first antigen-binding domain and a costimulatory domain (e.g., 4-1BB), and the cell also expresses a second CAR having a second antigen-binding domain and an intracellular signaling domain (e.g., CD3-zeta). When the cell encounters the first antigen, the costimulatory domain is activated and the cell proliferates. When the cell encounters the second antigen, the intracellular signaling domain is activated and cell killing activity is triggered. Thus, a cell expressing a CAR is only fully activated in the presence of both antigens. In some embodiments, the first antigen-binding domain recognizes BCMA, such as comprising an antigen-binding domain as described herein, and the second antigen-binding domain recognizes an antigen expressed on acute myeloid leukemia cells, such as CD123, CLL-1, CD34, FLT3, or folate receptor beta. In some embodiments, the first antigen-binding domain recognizes BCMA, such as comprising an antigen-binding domain as described herein, and the second antigen-binding domain recognizes an antigen expressed on B cells, such as CD10, CD19, CD20, CD22, CD34, CD123, FLT-3, ROR1, CD79b, CD179b, or CD79a.
Совместная экспрессия CAR с другими молекулами или средствамиCo-expression of CAR with other molecules or agents
Совместная экспрессия второго CARCo-expression of a second CAR
В некоторых вариантах осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, может дополнительно содержать второй CAR, например, второй CAR, который содержит другой антигенсвязывающий домен, например, для той же мишени (например, CD19) или другой мишени (например, для мишени, отличной от CD19, например, мишени, описанной в данном документе). В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая CAR, содержит первый CAR, который нацеливается на первый антиген и содержит внутриклеточный сигнальный домен, имеющий костимулирующий сигнальный домен, но не первичный сигнальный домен, и второй CAR, который нацеливается на второй, другой, антиген и содержит внутриклеточный сигнальный домен, имеющий первичный сигнальный домен, но не костимулирующий сигнальный домен. Размещение костимулирующего сигнального домена, например, 4-1BB, CD28, CD27, OX-40 или ICOS, в первом CAR и первичного сигнального домена, например, CD3-дзета, во втором CAR может ограничивать активность CAR клетками, в которых экспрессируются обе мишени. В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая CAR, содержит первый CAR, который содержит антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и костимулирующий домен, и второй CAR, который нацеливается на другой антиген и содержит антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и первичный сигнальный домен. В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая CAR, содержит первый CAR, который содержит антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и первичный сигнальный домен, и второй CAR, который нацеливается на другой антиген и содержит антигенсвязывающий домен для антигена, трансмембранный домен и костимулирующий сигнальный домен.In some embodiments, a cell expressing a CAR described herein may further comprise a second CAR, such as a second CAR that comprises a different antigen-binding domain, such as for the same target (e.g., CD19) or a different target (e.g., a target other than CD19, such as a target described herein). In some embodiments, a cell expressing a CAR comprises a first CAR that targets a first antigen and comprises an intracellular signaling domain that has a costimulatory signaling domain but not a primary signaling domain, and a second CAR that targets a second, different antigen and comprises an intracellular signaling domain that has a primary signaling domain but not a costimulatory signaling domain. The placement of a costimulatory signaling domain, such as 4-1BB, CD28, CD27, OX-40, or ICOS, in a first CAR and a primary signaling domain, such as CD3-zeta, in a second CAR can restrict CAR activity to cells that express both targets. In some embodiments, a cell expressing a CAR comprises a first CAR that comprises an antigen-binding domain, a transmembrane domain, and a costimulatory domain, and a second CAR that targets another antigen and comprises an antigen-binding domain, a transmembrane domain, and a primary signaling domain. In some embodiments, a cell expressing a CAR comprises a first CAR that comprises an antigen-binding domain, a transmembrane domain, and a primary signaling domain, and a second CAR that targets another antigen and comprises an antigen-binding domain for an antigen, a transmembrane domain, and a costimulatory signaling domain.
В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая CAR, содержит XCAR, описанный в данном документе, и ингибирующий CAR. В некоторых вариантах осуществления ингибирующий CAR содержит антигенсвязывающий домен, который связывается с антигеном, обнаруживаемым на нормальных клетках, но не на раковых клетках, например, на нормальных клетках, которые также экспрессируют X. В некоторых вариантах осуществления ингибирующий CAR содержит антигенсвязывающий домен, трансмембранный домен и внутриклеточный домен ингибирующей молекулы. Например, внутриклеточный домен ингибирующего CAR может представлять собой внутриклеточный домен PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекулы MHC I класса, молекулы MHC II класса, GAL9, аденозина и TGF (например, TGF-бета).In some embodiments, a cell expressing a CAR comprises an XCAR as described herein and an inhibitory CAR. In some embodiments, the inhibitory CAR comprises an antigen-binding domain that binds to an antigen found on normal cells but not on cancer cells, such as normal cells that also express X. In some embodiments, the inhibitory CAR comprises an antigen-binding domain, a transmembrane domain, and an intracellular domain of an inhibitory molecule. For example, the intracellular domain of the inhibitory CAR can be the intracellular domain of PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (CEACAM-1, CEACAM-3 and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, MHC class I molecules, MHC class II molecules, GAL9, adenosine, and TGF (e.g., TGF-beta).
В некоторых вариантах осуществления в случае, если клетка, экспрессирующая CAR, содержит два или более различных CAR, то антигенсвязывающие домены различных CAR могут быть такими, что антигенсвязывающие домены не взаимодействуют друг с другом. Например, клетка, экспрессирующая первый и второй CAR, может иметь антигенсвязывающий домен первого CAR, например, в качестве фрагмента, например, scFv, который не ассоциирует с антигенсвязывающим доменом второго CAR, например, антигенсвязывающий домен второго CAR представляет собой VHH.In some embodiments, if a cell expressing a CAR comprises two or more different CARs, the antigen-binding domains of the different CARs may be such that the antigen-binding domains do not interact with each other. For example, a cell expressing a first and a second CAR may have an antigen-binding domain of the first CAR, for example, as a fragment, for example, an scFv, that does not associate with the antigen-binding domain of the second CAR, for example, the antigen-binding domain of the second CAR is VHH.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен содержит однодоменные антигенсвязывающие (SDAB) молекулы, в том числе молекулы, в которых определяющие комплементарность области являются частью однодоменного полипептида. Примеры включают без ограничения вариабельные домены тяжелых цепей, связывающие молекулы, в природных условиях лишенные легких цепей, отдельные домены, полученные из традиционных 4-цепочечных антител, сконструированные домены и однодоменные каркасные структуры, отличные от полученных из антител. Молекулы SDAB могут являться любыми молекулами, известными из уровня техники, или любыми однодоменными молекулами, которые будут известны в будущем. Молекулы SDAB могут быть получены из любых видов, в том числе без ограничения из мыши, человека, верблюда, ламы, миноги, рыбы, акулы, козы, кролика и быка. Этот термин также охватывает встречающиеся в природе молекулы однодоменных антител из видов, отличных от Camelidae и акул.In some embodiments, the antigen-binding domain comprises single-domain antigen-binding (SDAB) molecules, including molecules in which the complementarity-determining regions are part of a single-domain polypeptide. Examples include, but are not limited to, variable domains of heavy chains, binding molecules naturally lacking light chains, individual domains derived from traditional 4-chain antibodies, engineered domains, and single-domain frameworks other than those derived from antibodies. SDAB molecules may be any molecule known in the art or any single-domain molecule that is later known. SDAB molecules may be derived from any species, including, but not limited to, mouse, human, camel, llama, lamprey, fish, shark, goat, rabbit, and bovine. The term also encompasses naturally occurring single-domain antibody molecules from species other than Camelidae and sharks.
В некоторых вариантах осуществления молекула SDAB может быть получена из вариабельной области иммуноглобулина, обнаруживаемого у рыб, как, например, та, которая получена из изотипа иммуноглобулина, известного как новый антигенный рецептор (NAR), обнаруживаемого в сыворотке крови акулы. Способы получения однодоменных молекул, получаемых из вариабельной области NAR ("IgNAR"), описаны в WO 03/014161 и Streltsov (2005) Protein Sci. 14:2901-2909.In some embodiments, the SDAB molecule may be derived from a variable region of an immunoglobulin found in fish, such as that derived from an immunoglobulin isotype known as novel antigen receptor (NAR) found in shark serum. Methods for producing single-domain molecules derived from the variable region of a NAR ("IgNAR") are described in WO 03/014161 and Streltsov (2005) Protein Sci. 14:2901-2909.
В некоторых вариантах осуществления молекула SDAB представляет собой встречающуюся в природе однодоменную антигенсвязывающую молекулу, известную как тяжелая цепь, лишенная легких цепей. Такие однодоменные молекулы раскрыты, например, в WO 9404678 и Hamers-Casterman, C. et al. (1993) Nature 363:446-448. В целях ясности этот вариабельный домен, полученный из молекулы тяжелой цепи, в природных условиях лишенной легкой цепи, именуется в данном документе как VHH или нанотело, чтобы отличать его от традиционного VH четырехцепочечных иммуноглобулинов. Такая молекула VHH может быть получена из видов Camelidae, например, из верблюда, ламы, дромадера, альпаки и гуанако. Другие виды, помимо Camelidae, могут продуцировать молекулы тяжелых цепей, в природных условиях лишенные легкой цепи; такие VHH входят в объем настоящего изобретения.In some embodiments, the SDAB molecule is a naturally occurring single-domain antigen-binding molecule known as a light chain-less heavy chain. Such single-domain molecules are disclosed, for example, in WO 9404678 and Hamers-Casterman, C. et al. (1993) Nature 363:446-448. For clarity, this variable domain derived from a light chain-less heavy chain molecule is referred to herein as a VHH or nanobody to distinguish it from the traditional four-chain immunoglobulin VH. Such a VHH molecule may be derived from Camelidae species, such as camel, llama, dromedary, alpaca, and guanaco. Species other than Camelidae may produce light chain-less heavy chain molecules; such VHHs are within the scope of the present invention.
Молекулы SDAB могут быть рекомбинантными, с пересаженными CDR, гуманизированными, камелизированными, деиммунизированными и/или образованными in vitro (например, отобранными с помощью фагового дисплея).SDAB molecules can be recombinant, CDR-grafted, humanized, camelized, deimmunized, and/or generated in vitro (e.g., selected by phage display).
Также было обнаружено, что в клетках, имеющих множество химерных рецепторов, встроенных в мембрану, содержащих антигенсвязывающий домен, взаимодействия между антигенсвязывающими доменами рецепторов могут быть нежелательными, например, поскольку они ингибируют способность одного или нескольких антигенсвязывающих доменов связываться с их когнатными антигенами. Соответственно, в данном документе раскрыты клетки, имеющие первый и второй не встречающиеся в природе химерные рецепторы, встроенные в мембрану, содержащие антигенсвязывающие домены, для которых сведены к минимуму такие взаимодействия. Также в данном документе раскрыты нуклеиновые кислоты, кодирующие первый и второй не встречающиеся в природе химерные рецепторы, встроенные в мембрану, содержащие антигенсвязывающие домены, для которых сведены к минимуму такие взаимодействия, а также способы получения и применения таких клеток и нуклеиновых кислот. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из первого и второго не встречающихся в природе химерных рецепторов, встроенных в мембрану, содержит scFv, а другой содержит одиночный VH-домен, например, одиночный VH-домен верблюдовых, акулы или миноги или одиночный VH-домен, полученный из последовательности человека или мыши.It has also been found that in cells having a plurality of membrane-embedded chimeric receptors comprising an antigen-binding domain, interactions between the antigen-binding domains of the receptors may be undesirable, for example, because they inhibit the ability of one or more antigen-binding domains to bind their cognate antigens. Accordingly, cells having first and second non-naturally occurring membrane-embedded chimeric receptors comprising antigen-binding domains for which such interactions are minimized are disclosed herein. Nucleic acids encoding first and second non-naturally occurring membrane-embedded chimeric receptors comprising antigen-binding domains for which such interactions are minimized are also disclosed herein, as well as methods for producing and using such cells and nucleic acids. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of the first and second membrane-integrated non-naturally occurring chimeric receptors comprises an scFv and the other comprises a single VH domain, such as a single VH domain from a camelid, shark or lamprey, or a single VH domain derived from a human or mouse sequence.
В некоторых вариантах осуществления композиция, описанная в данном документе, содержит первый и второй CAR, где антигенсвязывающий домен одного из первого и второго CAR не содержит вариабельный домен легкой цепи и вариабельный домен тяжелой цепи. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из первого и второго CAR представляет собой scFv, а другой не представляет собой scFv. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из первого и второго CAR содержит одиночный VH-домен, например, одиночный VH-домен верблюдовых, акулы или миноги или одиночный VH-домен, полученный из последовательности человека или мыши. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из первого и второго CAR содержит нанотело. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из первого и второго CAR содержит VHH-домен верблюдовых.In some embodiments, the composition described herein comprises a first and a second CAR, wherein the antigen-binding domain of one of the first and second CARs does not comprise a light chain variable domain and a heavy chain variable domain. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of the first and second CARs is an scFv and the other is not an scFv. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of the first and second CARs comprises a single VH domain, such as a single camelid, shark or lamprey VH domain, or a single VH domain derived from a human or mouse sequence. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of the first and second CARs comprises a nanobody. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of the first and second CARs comprises a camelid VHH domain.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из первого и второго CAR содержит scFv, а другой содержит одиночный VH-домен, например, одиночный VH-домен верблюдовых, акулы или миноги или одиночный VH-домен, полученный из последовательности человека или мыши. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из первого и второго CAR содержит scFv, а другой содержит нанотело. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен одного из первого и второго CAR содержит scFv, а другой содержит VHH-домен верблюдовых.In some embodiments, the antigen-binding domain of one of the first and second CARs comprises an scFv and the other comprises a single VH domain, such as a single VH domain of camelids, sharks or lampreys, or a single VH domain derived from a human or mouse sequence. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of the first and second CARs comprises an scFv and the other comprises a nanobody. In some embodiments, the antigen-binding domain of one of the first and second CARs comprises an scFv and the other comprises a camelid VHH domain.
В некоторых вариантах осуществления связывание антигенсвязывающего домена первого CAR, при наличии его на поверхности клетки, со своим когнатным антигеном существенно не снижается благодаря наличию второго CAR. В некоторых вариантах осуществления связывание антигенсвязывающего домена первого CAR со своим когнатным антигеном в присутствии второго CAR составляет по меньшей мере 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, например, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, от связывания антигенсвязывающего домена первого CAR со своим когнатным антигеном в отсутствие второго CAR.In some embodiments, the binding of the antigen-binding domain of the first CAR, when present on the cell surface, to its cognate antigen is not substantially reduced by the presence of the second CAR. In some embodiments, the binding of the antigen-binding domain of the first CAR to its cognate antigen in the presence of the second CAR is at least 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99%, such as 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99%, of the binding of the antigen-binding domain of the first CAR to its cognate antigen in the absence of the second CAR.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающие домены первого и второго CAR при наличии их на поверхности клетки ассоциируют друг с другом в меньшей степени, чем в случае, если бы они оба являлись антигенсвязывающими scFv-доменами. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающие домены первого и второго CAR ассоциируют друг с другом в степени, на по меньшей мере 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% меньшей, например, на 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% меньшей, чем в случае, если бы они оба являлись антигенсвязывающими scFv-доменами.In some embodiments, the antigen-binding domains of the first and second CARs, when present on the cell surface, associate with each other to a lesser extent than if they were both scFv antigen-binding domains. In some embodiments, the antigen-binding domains of the first and second CARs associate with each other to a lesser extent, such as 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% less, such as 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% less, than if they were both scFv antigen-binding domains.
Совместная экспрессия средства, усиливающего активность CARCo-expression of a CAR activity enhancing agent
В некоторых вариантах осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, может дополнительно экспрессировать другое средство, например, средство, усиливающее активность или приспособленность клетки, экспрессирующей CAR.In some embodiments, a CAR-expressing cell described herein may further express another agent, such as an agent that enhances the activity or fitness of the CAR-expressing cell.
Например, в некоторых вариантах осуществления данное средство может представлять собой средство, ингибирующее молекулу, которая модулирует или регулирует, например, ингибирует, Т-клеточную функцию. В некоторых вариантах осуществления молекула, которая модулирует или регулирует Т-клеточную функцию, представляет собой ингибирующую молекулу. Ингибирующие молекулы, например, PD1, в некоторых вариантах осуществления могут снижать способность клеток, экспрессирующих CAR, осуществлять иммунный эффекторный ответ. Примеры ингибирующих молекул включают PD1, PD-L1, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекулу MHC I класса, молекулу MHC II класса, GAL9, аденозин или TGF-бета.For example, in some embodiments, the agent may be an agent that inhibits a molecule that modulates or regulates, e.g., inhibits, T cell function. In some embodiments, a molecule that modulates or regulates T cell function is an inhibitory molecule. Inhibitory molecules, e.g., PD1, in some embodiments may reduce the ability of CAR-expressing cells to mount an immune effector response. Examples of inhibitory molecules include PD1, PD-L1, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, MHC class I molecule, MHC class II molecule, GAL9, adenosine, or TGF-beta.
В ряде вариантов осуществления средство, например, ингибирующую нуклеиновую кислоту, например, dsRNA, например, siRNA или shRNA; или, например, ингибирующие белок или систему, например, короткие палиндромные повторы, регулярно расположенные группами (CRISPR), эффекторную нуклеазу, подобную активаторам транскрипции (TALEN), или эндонуклеазу с "цинковыми пальцами" (ZFN), например, описанные в данном документе, можно применять для ингибирования экспрессии молекулы, которая модулирует или регулирует, например, ингибирует, Т-клеточную функцию в клетке, экспрессирующей CAR. В некоторых вариантах осуществления средство представляет собой shRNA, например, shRNA, описанную в данном документе. В некоторых вариантах осуществления средство, которое модулирует или регулирует, например, ингибирует, Т-клеточную функцию, ингибируется в клетке, экспрессирующей CAR. Например, молекула dsRNA, ингибирующая экспрессию молекулы, которая модулирует или регулирует, например, ингибирует, Т-клеточную функцию, связана с нуклеиновой кислотой, которая кодирует компонент, например, все компоненты, CAR.In some embodiments, an agent, e.g., an inhibitory nucleic acid, e.g., a dsRNA, e.g., a siRNA or shRNA; or, e.g., an inhibitory protein or system, e.g., a clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR), a transcription activator-like effector nuclease (TALEN), or a zinc finger endonuclease (ZFN), e.g., as described herein, can be used to inhibit the expression of a molecule that modulates or regulates, e.g., inhibits, T cell function in a cell expressing a CAR. In some embodiments, the agent is an shRNA, e.g., an shRNA described herein. In some embodiments, an agent that modulates or regulates, e.g., inhibits, T cell function is inhibited in a cell expressing a CAR. For example, a dsRNA molecule that inhibits the expression of a molecule that modulates or regulates, e.g., inhibits, T cell function is linked to a nucleic acid that encodes a component, e.g., all components, of a CAR.
В некоторых вариантах осуществления средство, которое ингибирует ингибирующую молекулу, содержит первый полипептид, например, ингибирующую молекулу, ассоциированный со вторым полипептидом, который обеспечивает положительный сигнал для клетки, например, внутриклеточный сигнальный домен, описанный в данном документе. В некоторых вариантах осуществления средство содержит первый полипептид, например, из ингибирующей молекулы, такой как PD1, PD-L1, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекула MHC I класса, молекула MHC II класса, GAL9, аденозин или TGF-бета или фрагмент любого из них (например, по меньшей мере часть внеклеточного домена любого из них), и второй полипептид, который представляет собой внутриклеточный сигнальный домен, описанный в данном документе (например, содержащий костимулирующий домен (например, 4-1BB, CD27 или CD28, например, описанные в данном документе) и/или первичный сигнальный домен (например, сигнальный домен CD3-дзета, описанный в данном документе). В некоторых вариантах осуществления средство содержит первый полипептид из PD1 или его фрагмента (например, по меньшей мере часть внеклеточного домена PD1) и второй полипептид, представляющий собой внутриклеточный сигнальный домен, описанный в данном документе (например, сигнальный домен CD28, описанный в данном документе, и/или сигнальный домен CD3-дзета, описанный в данном документе). PD1 является ингибирующим представителем семейства рецепторов CD28, которое также включает CD28, CTLA-4, ICOS и BTLA. PD-1 экспрессируется на активированных B-клетках, T-клетках и миелоидных клетках (Agata et al. 1996 Int. Immunol 8:765-75). Было показано, что два лиганда PD1 - PD-L1 и PD-L2 - подавляют активацию Т-клеток при связывании с PD1 (Freeman et al. 2000 J Exp Med 192:1027-34; Latchman et al. 2001 Nat Immunol 2:261-8; Carter et al. 2002 Eur J Immunol 32:634-43). PD-L1 является широко распространенным при различных формах рака у человека (Dong et al. 2003 J Mol Med 81:281-7; Blank et al. 2005 Cancer Immunol. Immunother 54:307-314; Konishi et al. 2004 Clin Cancer Res 10:5094). Иммуносупрессию можно устранить путем ингибирования локального взаимодействия PD1 с PD-L1.In some embodiments, an agent that inhibits an inhibitory molecule comprises a first polypeptide, such as an inhibitory molecule, associated with a second polypeptide that provides a positive signal to the cell, such as an intracellular signaling domain as described herein. In some embodiments, the agent comprises a first polypeptide, e.g., from an inhibitory molecule such as PD1, PD-L1, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, an MHC class I molecule, an MHC class II molecule, GAL9, adenosine, or TGF-beta, or a fragment of any of them (e.g., at least a portion of the extracellular domain of any of them), and a second polypeptide that is an intracellular signaling domain as described herein (e.g., comprising a costimulatory domain (e.g., 4-1BB, CD27, or CD28, e.g., as described herein) and/or a primary signaling domain (e.g., a signaling domain CD3-zeta as described herein). In some embodiments, the agent comprises a first polypeptide of PD1 or a fragment thereof (e.g., at least a portion of the extracellular domain of PD1) and a second polypeptide that is an intracellular signaling domain as described herein (e.g., the CD28 signaling domain as described herein and/or the CD3-zeta signaling domain as described herein). PD1 is an inhibitory member of the CD28 receptor family, which also includes CD28, CTLA-4, ICOS, and BTLA. PD-1 is expressed on activated B cells, T cells, and myeloid cells (Agata et al. 1996 Int. Immunol 8:765-75). Two PD1 ligands, PD-L1 and PD-L2, have been shown to suppress T cell activation when bound to PD1 (Freeman et al. 2000 J Exp Med 192:1027-34; Latchman et al. 2001 Nat Immunol 2:261-8; Carter et al. 2002 Eur J Immunol 32:634-43). PD-L1 is widely expressed in various human cancers (Dong et al. 2003 J Mol Med 81:281-7; Blank et al. 2005 Cancer Immunol. Immunother 54:307-314; Konishi et al. 2004 Clin Cancer Res 10:5094). Immunosuppression can be reversed by inhibiting the local interaction of PD1 with PD-L1.
В некоторых вариантах осуществления средство, содержащее внеклеточный домен (ECD) ингибирующей молекулы, например, белка 1 запрограммированной гибели клеток (PD1), может быть слито с трансмембранным доменом и внутриклеточными сигнальными доменами, такими как 4-1BB и CD3-дзета (также называется в данном документе CAR на основе PD1). В некоторых вариантах осуществления CAR на основе PD1 при применении в комбинациях с XCAR, описанным в данном документе, улучшает персистенцию Т-клетки. В некоторых вариантах осуществления CAR представляет собой CAR на основе PD1, содержащий внеклеточный домен PD1, указанный подчеркиванием в SEQ ID NO: 24. В некоторых вариантах осуществления CAR на основе PD1 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 24.In some embodiments, an agent comprising an extracellular domain (ECD) of an inhibitory molecule, such as programmed cell death protein 1 (PD1), can be fused to a transmembrane domain and intracellular signaling domains, such as 4-1BB and CD3-zeta (also referred to herein as a PD1-based CAR). In some embodiments, a PD1-based CAR, when used in combinations with an XCAR described herein, improves T cell persistence. In some embodiments, the CAR is a PD1-based CAR comprising the extracellular domain of PD1 indicated by underlining in SEQ ID NO: 24. In some embodiments, a PD1-based CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 24.
В некоторых вариантах осуществления CAR на основе PD1 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 22.In some embodiments, a PD1-based CAR comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22.
В некоторых вариантах осуществления средство содержит последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR на основе PD1, например, CAR на основе PD1, описанный в данном документе. В некоторых вариантах осуществления последовательность нуклеиновой кислоты для CAR на основе PD1 представлена под SEQ ID NO: 23, при этом ECD PD1 подчеркнут.In some embodiments, the agent comprises a nucleic acid sequence encoding a PD1-based CAR, such as a PD1-based CAR described herein. In some embodiments, the nucleic acid sequence for a PD1-based CAR is set forth as SEQ ID NO: 23, with the PD1 ECD underlined.
В другом примере в некоторых вариантах осуществления средство, которое усиливает активность клетки, экспрессирующей CAR, может представлять собой костимулирующую молекулу или лиганд костимулирующей молекулы. Примеры костимулирующих молекул включают молекулу MHC I класса, BTLA и лиганд Toll-подобного рецептора, а также OX40, CD27, CD28, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278) и 4-1BB (CD137). Дополнительные примеры таких костимулирующих молекул включают CDS, ICAM-1, GITR, BAFFR, HVEM (LIGHTR), SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD160, CD19, CD4, CD8-альфа, CD8-бета, IL2R-бета, IL2R-гамма, IL7R-альфа, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, LFA-1, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a и лиганд, который специфично связывается с CD83, например, описанные в данном документе. Примеры лигандов костимулирующих молекул включают CD80, CD86, CD40L, ICOSL, CD70, OX40L, 4-1BBL, GITRL и LIGHT. В ряде вариантов осуществления лиганд костимулирующей молекулы является лигандом костимулирующей молекулы, отличной от костимулирующей молекулы, домен которой используется в CAR. В ряде вариантов осуществления лиганд костимулирующей молекулы является лигандом той же костимулирующей молекулы, что и костимулирующая молекула, домен которой используется в CAR. В некоторых вариантах осуществления лиганд костимулирующей молекулы представляет собой 4-1BBL. В одном варианте осуществления лиганд костимулирующей молекулы представляет собой CD80 или CD86. В некоторых вариантах осуществления лиганд костимулирующей молекулы представляет собой CD70. В ряде вариантов осуществления описанная в данном документе иммунная эффекторная клетка, экспрессирующая CAR, может быть дополнительно сконструирована таким образом, чтобы она экспрессировала одну или несколько дополнительных костимулирующих молекул или лигандов костимулирующих молекул.In another example, in some embodiments, an agent that enhances the activity of a cell expressing a CAR can be a costimulatory molecule or a ligand of a costimulatory molecule. Examples of costimulatory molecules include an MHC class I molecule, BTLA, and a Toll-like receptor ligand, as well as OX40, CD27, CD28, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), and 4-1BB (CD137). Additional examples of such costimulatory molecules include CDS, ICAM-1, GITR, BAFFR, HVEM (LIGHTR), SLAMF7, NKp80 (KLRF1), NKp44, NKp30, NKp46, CD160, CD19, CD4, CD8-alpha, CD8-beta, IL2R-beta, IL2R-gamma, IL7R-alpha, ITGA4, VLA1, CD49a, ITGA4, IA4, CD49D, ITGA6, VLA-6, CD49f, ITGAD, CD11d, ITGAE, CD103, ITGAL, CD11a, LFA-1, ITGAM, CD11b, ITGAX, CD11c, ITGB1, CD29, ITGB2, CD18, LFA-1, ITGB7, NKG2D, NKG2C, TNFR2, TRANCE/RANKL, DNAM1 (CD226), SLAMF4 (CD244, 2B4), CD84, CD96 (Tactile), CEACAM1, CRTAM, Ly9 (CD229), CD160 (BY55), PSGL1, CD100 (SEMA4D), CD69, SLAMF6 (NTB-A, Ly108), SLAM (SLAMF1, CD150, IPO-3), BLAME (SLAMF8), SELPLG (CD162), LTBR, LAT, GADS, SLP-76, PAG/Cbp, CD19a and a ligand that specifically binds to CD83, such as those described herein. Examples of costimulatory molecule ligands include CD80, CD86, CD40L, ICOSL, CD70, OX40L, 4-1BBL, GITRL, and LIGHT. In some embodiments, the costimulatory molecule ligand is a ligand for a costimulatory molecule that is different from the costimulatory molecule whose domain is used in the CAR. In some embodiments, the costimulatory molecule ligand is a ligand for the same costimulatory molecule as the costimulatory molecule whose domain is used in the CAR. In some embodiments, the costimulatory molecule ligand is 4-1BBL. In one embodiment, the costimulatory molecule ligand is CD80 or CD86. In some embodiments, the costimulatory molecule ligand is CD70. In some embodiments, the CAR-expressing immune effector cell described herein may be further engineered to express one or more additional costimulatory molecules or costimulatory molecule ligands.
Совместная экспрессия CAR с рецептором хемокинаCo-expression of CAR with chemokine receptor
В ряде вариантов осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, например, клетка, экспрессирующая CAR для CD19, дополнительно содержит молекулу рецептора хемокина. Трансгенная экспрессия рецепторов хемокинов CCR2b или CXCR2 в Т-клетках усиливает их миграцию к солидным опухолям, секретирующим CCL2 или CXCL1, в том числе к меланоме и нейробластоме (Craddock et al., J Immunother. 2010 Oct; 33(8):780-8 и Kershaw et al., Hum Gene Ther. 2002 Nov 1; 13(16):1971-80). Таким образом, не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что рецепторы хемокинов, экспрессируемые в клетках, экспрессирующих CAR, которые распознают хемокины, секретируемые опухолями, например, солидными опухолями, могут улучшать "хоминг" клетки, экспрессирующей CAR, в опухоль, содействовать инфильтрации клетки, экспрессирующей CAR, в опухоль и усиливать противоопухолевую эффективность клетки, экспрессирующей CAR. Молекула рецептора хемокина может содержать встречающийся в природе или рекомбинантный рецептор хемокина или его хемокинсвязывающий фрагмент. Молекула рецептора хемокина, подходящая для экспрессии в клетке, экспрессирующей CAR (например, CAR-Tx), описанной в данном документе, включает рецептор хемокина CXC (например, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6 или CXCR7), рецептор хемокина CC (например, CCR1, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CCR10 или CCR11), рецептор хемокина CX3C (например, CX3CR1), рецептор хемокина XC (например, XCR1) или их хемокинсвязывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления молекулу рецептора хемокина, которая должна экспрессироваться вместе с CAR, описанным в данном документе, выбирают с учетом хемокина(хемокинов), секретируемых опухолью. В некоторых вариантах осуществления описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, дополнительно содержит, например, экспрессирует, рецептор CCR2b или рецептор CXCR2. В некоторых вариантах осуществления CAR, описанный в данном документе, и молекула рецептора хемокина находятся в одном и том же векторе или находятся в двух разных векторах. В ряде вариантов осуществления, в которых CAR, описанный в данном документе, и молекула рецептора хемокина находятся в одном и том же векторе, CAR и молекула рецептора хемокина находятся под контролем двух разных промоторов или находятся под контролем одного и того же промотора.In some embodiments, a cell expressing a CAR, such as a cell expressing a CD19 CAR, described herein further comprises a chemokine receptor molecule. Transgenic expression of the chemokine receptors CCR2b or CXCR2 in T cells enhances their migration to solid tumors secreting CCL2 or CXCL1, including melanoma and neuroblastoma (Craddock et al., J Immunother . 2010 Oct; 33(8):780-8 and Kershaw et al., Hum Gene Ther . 2002
Конструкции нуклеиновых кислот, кодирующие CARNucleic acid constructs encoding CAR
В настоящем изобретении также предусмотрена иммунная эффекторная клетка, например, полученная посредством способа, описанного в данном документе, которая содержит молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую одну или несколько конструкций CAR, описанных в данном документе. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты представлена в виде транскрипта, представляющего собой матричную РНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты представлена в виде ДНК-конструкции.The present invention also provides an immune effector cell, such as one produced by a method described herein, that comprises a nucleic acid molecule encoding one or more CAR constructs described herein. In some embodiments, the nucleic acid molecule is in the form of a transcript that is messenger RNA. In some embodiments, the nucleic acid molecule is in the form of a DNA construct.
Молекулы нуклеиновой кислоты, описанные в данном документе, могут представлять собой молекулу ДНК, молекулу РНК или их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты представляет собой мРНК, кодирующую полипептид CAR, описанный в данном документе. В других вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты представляет собой вектор, который содержит любую из вышеуказанных молекул нуклеиновой кислоты.The nucleic acid molecules described herein may be a DNA molecule, an RNA molecule, or a combination thereof. In some embodiments, the nucleic acid molecule is mRNA encoding a CAR polypeptide described herein. In other embodiments, the nucleic acid molecule is a vector that contains any of the above nucleic acid molecules.
В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен CAR по настоящему изобретению (например, scFv) кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, последовательность которой была кодон-оптимизирована для экспрессии в клетке млекопитающего. В некоторых вариантах осуществления целая конструкция CAR по настоящему изобретению кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, целая последовательность которой была кодон-оптимизирована для экспрессии в клетке млекопитающего. Оптимизация кодонов относится к обнаружению того, что частота встречаемости синонимичных кодонов (т. е. кодонов, кодирующих одну и ту же аминокислоту) в кодирующей ДНК смещена у разных видов. Такая вырожденность кодонов обеспечивает возможность кодирования идентичного полипептида различными нуклеотидными последовательностями. Из уровня техники известны различные способы оптимизации кодонов, и они включают, например, способы, раскрытые по меньшей мере в патентах США №№ 5786464 и 6114148.In some embodiments, the antigen-binding domain of a CAR of the invention (e.g., an scFv) is encoded by a nucleic acid molecule whose sequence has been codon-optimized for expression in a mammalian cell. In some embodiments, the entire CAR construct of the invention is encoded by a nucleic acid molecule whose entire sequence has been codon-optimized for expression in a mammalian cell. Codon optimization refers to the discovery that the frequency of synonymous codons (i.e., codons encoding the same amino acid) in the coding DNA is biased between species. Such codon degeneracy allows for the encoding of the identical polypeptide by different nucleotide sequences. Various methods for codon optimization are known in the art and include, for example, those disclosed in at least U.S. Patent Nos. 5,786,464 and 6,114,148.
Соответственно, в некоторых вариантах осуществления иммунная эффекторная клетка, например, полученная посредством способа, описанного в данном документе, содержит молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую химерный антигенный рецептор (CAR), где CAR содержит антигенсвязывающий домен, который связывается с опухолевым антигеном, описанным в данном документе, трансмембранный домен (например, трансмембранный домен, описанный в данном документе) и внутриклеточный сигнальный домен (например, внутриклеточный сигнальный домен, описанный в данном документе), содержащий стимулирующий домен, например, костимулирующий сигнальный домен (например, костимулирующий сигнальный домен, описанный в данном документе), и/или первичный сигнальный домен (например, первичный сигнальный домен, описанный в данном документе, например, дзета-цепь, описанную в данном документе).Accordingly, in some embodiments, an immune effector cell, such as one produced by a method described herein, comprises a nucleic acid molecule encoding a chimeric antigen receptor (CAR), wherein the CAR comprises an antigen-binding domain that binds to a tumor antigen described herein, a transmembrane domain (e.g., a transmembrane domain described herein), and an intracellular signaling domain (e.g., an intracellular signaling domain described herein) comprising a stimulatory domain, such as a costimulatory signaling domain (e.g., a costimulatory signaling domain described herein), and/or a primary signaling domain (e.g., a primary signaling domain described herein, such as a zeta chain described herein).
В настоящем изобретении также предусмотрены векторы, в которые вставлена молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая CAR, например, молекула нуклеиновой кислоты, описанная в данном документе. Векторы, полученные из ретровирусов, таких как лентивирус, являются подходящими инструментами для достижения долгосрочного переноса генов, поскольку они обеспечивают долгосрочную стабильную интеграцию трансгена и его размножение в дочерних клетках. Лентивирусные векторы обладают дополнительным преимуществом по сравнению с векторами, полученными из онкоретровирусов, таких как вирусы лейкоза мышей, заключающимся в том, что ими можно трансдуцировать непролиферирующие клетки, такие как гепатоциты. Они также обладают дополнительным преимуществом низкой иммуногенности. Ретровирусный вектор также может представлять собой, например, гамма-ретровирусный вектор. Гамма-ретровирусный вектор может содержать, например, промотор, сигнал упаковки (ψ), сайт связывания праймера (PBS), один или несколько (например, два) длинных концевых повторов (LTR) и трансген, представляющий интерес, например, ген, кодирующий CAR. В гамма-ретровирусном векторе могут отсутствовать структурные гены вирусов, такие как gag, pol и env. Иллюстративные гамма-ретровирусные векторы включают вирус лейкоза мышей (MLV), вирус некроза селезенки (SFFV) и вирус миелопролиферативной саркомы (MPSV), а также векторы, полученные из них. Другие гамма-ретровирусные векторы описаны, например, в Tobias Maetzig et al., "Gammaretroviral Vectors: Biology, Technology and Application" Viruses. 2011 Jun; 3(6): 677-713.The present invention also provides vectors into which a nucleic acid molecule encoding a CAR, such as a nucleic acid molecule as described herein, is inserted. Vectors derived from retroviruses, such as lentivirus, are suitable tools for achieving long-term gene transfer, since they provide for long-term stable integration of the transgene and its propagation in daughter cells. Lentiviral vectors have an additional advantage over vectors derived from oncoretroviruses, such as murine leukemia viruses, in that they can transduce non-proliferating cells, such as hepatocytes. They also have the additional advantage of low immunogenicity. The retroviral vector can also be, for example, a gamma-retroviral vector. A gamma retroviral vector may comprise, for example, a promoter, a packaging signal (ψ), a primer binding site (PBS), one or more (e.g., two) long terminal repeats (LTRs), and a transgene of interest, such as a gene encoding a CAR. A gamma retroviral vector may lack viral structural genes such as gag, pol, and env. Exemplary gamma retroviral vectors include murine leukemia virus (MLV), spleen necrosis virus (SFFV), and myeloproliferative sarcoma virus (MPSV), and vectors derived therefrom. Other gamma retroviral vectors are described, for example, in Tobias Maetzig et al., "Gammaretroviral Vectors: Biology, Technology and Application" Viruses. 2011 Jun; 3(6): 677-713.
В некоторых вариантах осуществления вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую требуемый CAR, представляет собой аденовирусный вектор (A5/35). В некоторых вариантах осуществления экспрессии нуклеиновых кислот, кодирующих CAR, можно достичь с помощью транспозонов, таких как "спящая красавица", CRISPR, CAS9 и нуклеазы с "цинковыми пальцами". См. ниже June et al. 2009, Nature Reviews Immunology 9.10: 704-716, включенную в данный документ посредством ссылки.In some embodiments, the vector comprising a nucleic acid encoding the desired CAR is an adenovirus vector (A5/35). In some embodiments, expression of nucleic acids encoding CARs can be achieved using transposons such as sleeping beauty, CRISPR, CAS9, and zinc finger nucleases. See below, June et al. 2009, Nature Reviews Immunology 9.10: 704-716, incorporated herein by reference.
Вкратце, экспрессия природных или синтетических нуклеиновых кислот, кодирующих CAR, как правило, достигается путем образования функциональной связи нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид CAR или его части, с промотором и включения конструкции в состав экспрессионного вектора. Векторы могут подходить для репликации и интеграции у эукариот. Типичные клонирующие векторы содержат терминаторы транскрипции и трансляции, последовательности инициации и промоторы, применимые для регуляции экспрессии необходимой последовательности нуклеиновой кислоты.Briefly, expression of natural or synthetic CAR-encoding nucleic acids is typically achieved by operably linking a nucleic acid encoding a CAR polypeptide or portion thereof to a promoter and incorporating the construct into an expression vector. Vectors may be suitable for replication and integration in eukaryotes. Typical cloning vectors contain transcriptional and translational terminators, initiation sequences, and promoters useful for regulating expression of the desired nucleic acid sequence.
Нуклеиновую кислоту можно клонировать в векторы множества типов. Например, нуклеиновую кислоту можно клонировать в вектор, включающий без ограничения плазмиду, фагмиду, производное фага, вирус животных и космиду. Векторы, представляющие особый интерес, включают экспрессионные векторы, репликационные векторы, векторы для образования зондов и векторы для секвенирования.Nucleic acid can be cloned into a variety of vector types. For example, nucleic acid can be cloned into a vector including, but not limited to, a plasmid, a phagemid, a phage derivative, an animal virus, and a cosmid. Vectors of particular interest include expression vectors, replication vectors, probe vectors, and sequencing vectors.
Кроме того, экспрессионный вектор может предоставляться клетке в форме вирусного вектора. Технология вирусных векторов хорошо известна из уровня техники и описана, например, в Sambrook et al., 2012, MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, тома 1-4, Cold Spring Harbor Press, Нью-Йорк, и в других руководствах по вирусологии и молекулярной биологии. Вирусы, применимые в качестве векторов, включают без ограничения ретровирусы, аденовирусы, аденоассоциированные вирусы, герпесвирусы и лентивирусы. Как правило, подходящий вектор содержит точку начала репликации, функционирующую в по меньшей мере одном организме, промоторную последовательность, подходящие сайты для эндонуклеаз рестрикции и один или несколько селектируемых маркеров (например, из WO 01/96584; WO 01/29058 и патента США № 6326193).In addition, the expression vector can be provided to the cell in the form of a viral vector. Viral vector technology is well known in the art and is described, for example, in Sambrook et al., 2012, MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, volumes 1-4, Cold Spring Harbor Press, New York, and other textbooks on virology and molecular biology. Viruses useful as vectors include, but are not limited to, retroviruses, adenoviruses, adeno-associated viruses, herpesviruses, and lentiviruses. Typically, a suitable vector comprises an origin of replication functional in at least one organism, a promoter sequence, suitable restriction endonuclease sites, and one or more selectable markers (e.g., from WO 01/96584; WO 01/29058 and U.S. Patent No. 6,326,193).
Для переноса генов в клетки млекопитающих был разработан целый ряд систем на основе вирусов. Например, ретровирусы обеспечивают удобную платформу для систем доставки генов. Выбранный ген можно вставить в вектор и упаковать в ретровирусные частицы с помощью методик, известных из уровня техники. Затем рекомбинантный вирус можно выделить и доставить в клетки субъекта in vivo либо ex vivo. Из уровня техники известен целый ряд ретровирусных систем. В некоторых вариантах осуществления применяются аденовирусные векторы. Из уровня техники известен целый ряд аденовирусных векторов. В некоторых вариантах осуществления применяются лентивирусные векторы.A number of virus-based systems have been developed for gene transfer into mammalian cells. For example, retroviruses provide a convenient platform for gene delivery systems. The selected gene can be inserted into a vector and packaged into retroviral particles using techniques known in the art. The recombinant virus can then be isolated and delivered to the subject's cells in vivo or ex vivo. A number of retroviral systems are known in the art. In some embodiments, adenoviral vectors are used. A number of adenoviral vectors are known in the art. In some embodiments, lentiviral vectors are used.
Дополнительные промоторные элементы, например, энхансеры, регулируют частоту инициации транскрипции. Как правило, они расположены в области на 30-110 п. о. выше сайта начала транскрипции, хотя было показано, что ряд промоторов также содержит функциональные элементы ниже сайта начала транскрипции. Расстояние между промоторными элементами часто является гибким, так что промоторная функция сохраняется при инверсии элементов или их перемещении друг относительно друга. В промоторе гена тимидинкиназы (tk) расстояние между промоторными элементами можно увеличить до 50 п. о., прежде чем активность начнет снижаться. В зависимости от промотора оказывается, что отдельные элементы могут функционировать для активации транскрипции совместно либо независимо. Иллюстративные промоторы включают промоторы генов IE CMV, EF-1α, убиквитина С или фосфоглицераткиназы (PGK).Additional promoter elements, such as enhancers, regulate the frequency of transcription initiation. They are typically located in a region 30-110 bp upstream of the transcription start site, although a number of promoters have been shown to also contain functional elements downstream of the transcription start site. The spacing between promoter elements is often flexible, so that promoter function is maintained when the elements are inverted or moved relative to each other. In the thymidine kinase (tk) gene promoter, the spacing between promoter elements can be increased to 50 bp before activity begins to decline. Depending on the promoter, it appears that individual elements can function together or independently to activate transcription. Exemplary promoters include those of the CMV IE, EF-1α, ubiquitin C, or phosphoglycerate kinase (PGK) genes.
Примером промотора, который способен обеспечивать экспрессию молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, в Т-клетке млекопитающего, является промотор EF1a. Нативный промотор EF1a управляет экспрессией альфа-субъединицы комплекса фактора элонгации-1, который отвечает за ферментативную доставку аминоацил-тРНК к рибосоме. Промотор EF1a широко использовался в экспрессионных плазмидах для млекопитающих, и было показано, что он эффективно управляет экспрессией CAR с молекул нуклеиновой кислоты, клонированных в лентивирусный вектор. См., например, Milone et al., Mol. Ther. 17(8): 1453-1464 (2009). В некоторых вариантах осуществления промотор EF1a содержит последовательность, представленную в примерах.An example of a promoter that is capable of driving expression of a nucleic acid molecule encoding a CAR in a mammalian T cell is the EF1a promoter. The native EF1a promoter drives expression of the alpha subunit of the elongation factor-1 complex, which is responsible for the enzymatic delivery of aminoacyl-tRNA to the ribosome. The EF1a promoter has been widely used in mammalian expression plasmids and has been shown to efficiently drive expression of CAR from nucleic acid molecules cloned into a lentiviral vector. See, e.g., Milone et al., Mol. Ther. 17(8): 1453-1464 (2009). In some embodiments, the EF1a promoter comprises a sequence as set forth in the examples.
Другим примером промотора является последовательность немедленно-раннего промотора цитомегаловируса (CMV). Эта промоторная последовательность является последовательностью сильного конститутивного промотора, способного управлять экспрессией любой полинуклеотидной последовательности, функционально связанной с ней, на высоких уровнях. Однако можно также использовать последовательности других конститутивных промоторов, в том числе без ограничения раннего промотора вируса обезьян 40 (SV40), промотора вируса опухоли молочной железы мышей (MMTV), промотора длинного концевого повтора (LTR) вируса иммунодефицита человека (HIV), промотора MoMuLV, промотора вируса лейкоза птиц, немедленно-раннего промотора вируса Эпштейна-Барр, промотора вируса саркомы Рауса, а также промоторы генов человека, такие как, без ограничения, промотор гена актина, промотор гена миозина, промотор гена фактора элонгации-1α, промотор гена гемоглобина и промотор гена креатинкиназы. Кроме того, настоящее изобретение не должно ограничиваться использованием конститутивных промоторов. Индуцируемые промоторы также рассматриваются как часть настоящего изобретения. Использование индуцируемого промотора обеспечивает наличие молекулярного переключателя, способного включать экспрессию полинуклеотидной последовательности, с которой он функционально связан, если такая экспрессия требуется, или отключать экспрессию, если экспрессия не требуется. Примеры индуцируемых промоторов включают без ограничения металлотионеин-индуцируемый промотор, глюкокортикоид-индуцируемый промотор, прогестерон-индуцируемый промотор и тетрациклин-индуцируемый промотор.Another example of a promoter is the cytomegalovirus (CMV) immediate early promoter sequence. This promoter sequence is a strong constitutive promoter sequence capable of driving the expression of any polynucleotide sequence operably linked to it at high levels. However, other constitutive promoter sequences can also be used, including, but not limited to, the simian virus 40 (SV40) early promoter, the murine mammary tumor virus (MMTV) promoter, the human immunodeficiency virus (HIV) long terminal repeat (LTR) promoter, the MoMuLV promoter, the avian leukemia virus promoter, the Epstein-Barr virus immediate early promoter, the Rous sarcoma virus promoter, and human gene promoters such as, but not limited to, the actin gene promoter, the myosin gene promoter, the elongation factor-1α gene promoter, the hemoglobin gene promoter, and the creatine kinase gene promoter. Furthermore, the present invention should not be limited to the use of constitutive promoters. Inducible promoters are also considered part of the present invention. The use of an inducible promoter provides a molecular switch capable of turning on the expression of a polynucleotide sequence to which it is operably linked if such expression is desired, or turning off the expression if expression is not desired. Examples of inducible promoters include, but are not limited to, a metallothionein-inducible promoter, a glucocorticoid-inducible promoter, a progesterone-inducible promoter, and a tetracycline-inducible promoter.
Другим примером промотора является промотор гена фосфоглицераткиназы (PGK). В ряде вариантов осуществления может быть необходим усеченный промотор гена PGK (например, промотор гена PGK с одной или несколькими, например, 1, 2, 5, 10, 100, 200, 300 или 400, делециями нуклеотидов по сравнению с последовательностью промотора гена PGK дикого типа).Another example of a promoter is the phosphoglycerate kinase (PGK) gene promoter. In some embodiments, a truncated PGK gene promoter may be desired (e.g., a PGK gene promoter with one or more, e.g., 1, 2, 5, 10, 100, 200, 300, or 400, nucleotide deletions compared to the wild-type PGK gene promoter sequence).
Нуклеотидные последовательности иллюстративных промоторов гена PGK представлены ниже.The nucleotide sequences of illustrative PGK gene promoters are shown below.
Промотор гена PGK WT:PGK WT gene promoter:
ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGGCGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGCGCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGCGACGGTAACGAGGGACCGCGACAGGCAGACGCTCCCATGATCACTCTGCACGCCGAAGGCAAATAGTGCAGGCCGTGCGGCGCTTGGCGTTCCTTGGAAGGGCTGAATCCCCGCCTCGTCCTTCGCAGCGGCCCCCCGGGTGTTCCCATCGCCGCTTCTAGGCCCACTGCGACGCTTGCCTGCACTTCTTACACGCTCTGGGTCCCAGCCGCGGCGACGCAAAGGGCCTTGGTGCGGGTCTCGTCGGCGCAGGGACGCGTTTGGGTCCCGACGGAACCTTTTCCGCGTTGGGGTTGGGGCACCATAAGCT (SEQ ID NO: 190)ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGG CGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGCGCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGCGACGGTAACGAGGGACCGCGACAGGCAGACGCTCCCATGATCACTCTGC ACGCCGAAGGCAAATAGTGCAGGCCGTGCGGCGCTTGGCGTTCCTTGGAAGGGCTGAATCCCCGCCTCGTCCTTCGCAGCGGCCCCCCGGGTGTTCCCATCGCCGCTTCTAGGCCCACTGCGACGCTTGC CTGCACTTCTTACACGCTCTGGGTCCCAGCCGCGGCGACGCAAAGGGCCTTGGTGCGGGTCTCGTCGGCGCAGGGACGCGTTTGGGTCCCGACGGAACCTTTTCCGGTTGGGGTTGGGGCACCATAAGCT (SEQ ID NO: 190)
Иллюстративные усеченные промоторы гена PGK:Illustrative truncated PGK gene promoters:
PGK100:PGK100:
ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTG (SEQ ID NO: 198)ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTG (SEQ ID NO: 198)
PGK200:PGK200:
ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGGCGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGCGCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGCGACGGTAACG (SEQ ID NO: 191)ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGGCGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGCGCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGACGGTAACG (SEQ ID NO: 191)
PGK300:PGK300:
ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGGCGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGCGCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGCGACGGTAACGAGGGACCGCGACAGGCAGACGCTCCCATGATCACTCTGCACGCCGAAGGCAAATAGTGCAGGCCGTGCGGCGCTTGGCGTTCCTTGGAAGGGCTGAATCCCCG (SEQ ID NO: 192)ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGGCGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGC GCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGACGGTAACGAGGGACCGCGACAGGCAGACGCTCCCATGATCACTCTGCACGCCGAAGGCAAATAGTGCAGGCCGTGCGGCGCTTGGCGTTCCTTGGAAGGGCTGAATCCCCG (SEQ ID NO: 192)
PGK400:PGK400:
ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGGCGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGCGCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGCGACGGTAACGAGGGACCGCGACAGGCAGACGCTCCCATGATCACTCTGCACGCCGAAGGCAAATAGTGCAGGCCGTGCGGCGCTTGGCGTTCCTTGGAAGGGCTGAATCCCCGCCTCGTCCTTCGCAGCGGCCCCCCGGGTGTTCCCATCGCCGCTTCTAGGCCCACTGCGACGCTTGCCTGCACTTCTTACACGCTCTGGGTCCCAGCCG (SEQ ID NO: 193)ACCCCTCTCTCCAGCCACTAAGCCAGTTGCTCCCTCGGCTGACGGCTGCACGCGAGGCCTCCGAACGTCTTACGCCTTGTGGCGCGCCCGTCCTTGTCCCGGGTGTGATGGCGGGGTGTGGGGCGGAGGGCGTGGCGGGGAAGGGCCGGCGACGAGAGCCGCGCGGGACGACTCGTCGGCGATAACCGGTGTCGGGTAGCGCCAGCCGCGC GACGGTAACGAGGGACCGCGACAGGCAGACGCTCCCATGATCACTCTGCACGCCGAAGGCAAATAGTGCAGGCCGTGCGGCGCTTGGCGTTCCTTGGAAGGGCTGAATCCCCGCCTCGTCCTTCGCAGCGGCCCCCCGGGTGTTCCCATCGCCGCTTCTAGGCCCACTGCGAACGCTTGCCTGCACTTCTTACACGCTCTGGGTCCCAGCCG (SEQ ID NO: 193)
Вектор также может содержать, например, сигнальную последовательность, содействующую секреции, сигнал полиаденилирования и терминатор транскрипции (например, из гена бычьего гормона роста (BGH)), элемент, обеспечивающий возможность эписомальной репликации и репликации у прокариот (например, точку начала репликации SV40 и ColE1 или другие, известные из уровня техники), и/или элементы для обеспечения возможности осуществления отбора (например, ген устойчивости к ампициллину и/или маркер устойчивости к зеоцину).The vector may also contain, for example, a secretion promoting signal sequence, a polyadenylation signal and a transcription terminator (e.g. from the bovine growth hormone (BGH) gene), an element enabling episomal and prokaryotic replication (e.g. the SV40 and ColE1 replication origin or others known in the art), and/or elements enabling selection (e.g. an ampicillin resistance gene and/or a zeocin resistance marker).
Для оценки экспрессии полипептида CAR или его частей экспрессионный вектор, который должен быть введен в клетку, также может содержать селектируемый маркерный ген или репортерный ген либо их оба для облегчения идентификации и отбора экспрессирующих клеток из популяции клеток, в отношении которых стремились провести трансфекцию или инфицирование посредством вирусных векторов. В некоторых вариантах осуществления селектируемый маркер может переноситься на отдельном фрагменте ДНК и использоваться в процедуре котрансфекции. Как селектируемые маркеры, так и репортерные гены могут быть фланкированы соответствующими регуляторными последовательностями для обеспечения экспрессии в клетках-хозяевах. Применимые селектируемые маркеры включают, например, гены устойчивости к антибиотикам, такие как neo и т. п.To assess the expression of the CAR polypeptide or portions thereof, the expression vector to be introduced into the cell may also contain a selectable marker gene or a reporter gene, or both, to facilitate the identification and selection of expressing cells from the population of cells that were sought to be transfected or infected by the viral vectors. In some embodiments, the selectable marker may be carried on a separate DNA fragment and used in a co-transfection procedure. Both selectable markers and reporter genes may be flanked by appropriate regulatory sequences to ensure expression in host cells. Useful selectable markers include, for example, antibiotic resistance genes such as neo, etc.
Репортерные гены используют для идентификации потенциально трансфицированных клеток и для оценивания функциональных свойств регуляторных последовательностей. Как правило, репортерный ген представляет собой ген, который отсутствует или не экспрессируется в организме- или ткани-реципиенте и который кодирует полипептид, экспрессия которого проявляется в некотором легко выявляемом свойстве, например, ферментативной активности. Экспрессию репортерного гена анализируют в подходящее время после введения ДНК в клетки-реципиенты. Подходящие репортерные гены могут включать гены, кодирующие люциферазу, бета-галактозидазу, хлорамфениколацетилтрансферазу, секретируемую щелочную фосфатазу, или ген зеленого флуоресцентного белка (например, Ui-Tei et al., 2000 FEBS Letters 479: 79-82). Подходящие системы экспрессии хорошо известны и могут быть получены с помощью известных методик или приобретены коммерческим путем. Как правило, конструкцию с минимальной 5'-фланкирующей областью, демонстрирующую наивысший уровень экспрессии репортерного гена, идентифицируют как промотор. Такие промоторные области могут быть связаны с репортерным геном и использоваться для оценивания средств в отношении способности к модулированию транскрипции, управляемой промотором.Reporter genes are used to identify potentially transfected cells and to assess the functional properties of regulatory sequences. Typically, a reporter gene is a gene that is absent or not expressed in the recipient organism or tissue and that encodes a polypeptide whose expression results in some readily detectable property, such as enzymatic activity. Expression of the reporter gene is assayed at an appropriate time after introduction of the DNA into the recipient cells. Suitable reporter genes may include genes encoding luciferase, beta-galactosidase, chloramphenicol acetyltransferase, secreted alkaline phosphatase, or the green fluorescent protein gene (e.g., Ui-Tei et al., 2000 FEBS Letters 479: 79-82). Suitable expression systems are well known and can be prepared by known techniques or purchased commercially. Typically, the construct with the minimal 5' flanking region that exhibits the highest level of reporter gene expression is identified as a promoter. Such promoter regions can be linked to a reporter gene and used to evaluate agents for their ability to modulate promoter-driven transcription.
В ряде вариантов осуществления вектор может содержать две или более последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующие CAR, например, CAR, описанный в данном документе, например, CAR для CD19, и второй CAR, например, ингибирующий CAR или CAR, который специфично связывается с антигеном, отличным от CD19. В таких вариантах осуществления две или более последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующие CAR, кодируются одной молекулой нуклеиновой кислоты в одной и той же рамке считывания и в виде одной полипептидной цепи. В некоторых вариантах осуществления два или более CAR могут, например, быть разделены одним или несколькими сайтами расщепления пептидов (например, сайтом саморасщепления или субстратом для внутриклеточной протеазы). Примеры сайтов расщепления пептидов включают сайты T2A, P2A, E2A или F2A.In some embodiments, the vector may comprise two or more nucleic acid sequences encoding a CAR, such as a CAR described herein, such as a CD19 CAR, and a second CAR, such as an inhibitory CAR or a CAR that specifically binds to an antigen other than CD19. In such embodiments, the two or more nucleic acid sequences encoding the CAR are encoded by a single nucleic acid molecule in the same reading frame and as a single polypeptide chain. In some embodiments, the two or more CARs may, for example, be separated by one or more peptide cleavage sites (e.g., a self-cleavage site or a substrate for an intracellular protease). Examples of peptide cleavage sites include T2A, P2A, E2A, or F2A sites.
Способы введения генов в клетку и обеспечения их экспрессии в ней известны из уровня техники. Что касается экспрессионного вектора, то вектор можно легко ввести в клетку-хозяина, например, клетку млекопитающего, бактерии, дрожжей или насекомого, любым способом, например, способом, известным из уровня техники. Например, экспрессионный вектор можно перенести в клетку-хозяина физическим, химическим или биологическим способом.Methods for introducing genes into a cell and providing their expression in it are known in the art. As for the expression vector, the vector can be easily introduced into the host cell, for example, a mammalian cell, a bacterium, a yeast or an insect, by any method, for example, a method known in the art. For example, the expression vector can be transferred into the host cell by a physical, chemical or biological method.
Физические способы введения полинуклеотида в клетку-хозяина включают осаждение фосфатом кальция, липофекцию, бомбардировку частицами, микроинъекцию, электропорацию и т. п. Способы получения клеток, содержащих векторы и/или экзогенные нуклеиновые кислоты, хорошо известны из уровня техники. См., например, Sambrook et al., 2012, MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, тома 1-4, Cold Spring Harbor Press, Нью-Йорк. Подходящим способом введения полинуклеотида в клетку-хозяина является трансфекция с использованием фосфата кальция.Physical methods for introducing a polynucleotide into a host cell include calcium phosphate precipitation, lipofection, particle bombardment, microinjection, electroporation, etc. Methods for producing cells containing vectors and/or exogenous nucleic acids are well known in the art. See, for example, Sambrook et al., 2012, MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, volumes 1-4, Cold Spring Harbor Press, New York. A suitable method for introducing a polynucleotide into a host cell is calcium phosphate transfection.
Биологические способы введения полинуклеотида, представляющего интерес, в клетку-хозяина включают использование векторов на основе ДНК и РНК. Вирусные векторы, и особенно ретровирусные векторы, стали наиболее широко применяемым способом вставки генов в клетки млекопитающего, например, человека. Другие вирусные векторы могут быть получены из лентивируса, поксвирусов, вируса простого герпеса I типа, аденовирусов и аденоассоциированных вирусов и т. п. См., например, патенты США №№ 5350674 и 5585362.Biological methods for introducing a polynucleotide of interest into a host cell include the use of DNA and RNA vectors. Viral vectors, and particularly retroviral vectors, have become the most widely used method for inserting genes into mammalian cells, such as humans. Other viral vectors may be derived from lentivirus, poxviruses, herpes simplex virus type I, adenoviruses and adeno-associated viruses, etc. See, for example, U.S. Patent Nos. 5,350,674 and 5,585,362.
Химические средства для введения полинуклеотида в клетку-хозяина включают коллоидные дисперсные системы, такие как макромолекулярные комплексы, нанокапсулы, микросферы, гранулы и липидные системы, в том числе эмульсии типа "масло в воде", мицеллы, смешанные мицеллы и липосомы. Иллюстративной коллоидной системой для применения в качестве средства для доставки in vitro и in vivo является липосома (например, искусственная мембранная везикула). Из уровня техники доступны другие способы целенаправленной доставки нуклеиновых кислот, такие как доставка полинуклеотидов с помощью нацеливающихся наночастиц или другой подходящей системы доставки субмикронного размера.Chemical means for introducing a polynucleotide into a host cell include colloidal dispersed systems such as macromolecular complexes, nanocapsules, microspheres, granules and lipid systems including oil-in-water emulsions, micelles, mixed micelles and liposomes. An exemplary colloidal system for use as a delivery vehicle in vitro and in vivo is a liposome (e.g., an artificial membrane vesicle). Other methods for targeted delivery of nucleic acids are available from the art, such as delivery of polynucleotides using targeting nanoparticles or another suitable submicron delivery system.
В случае использования системы доставки, отличной от вирусной, иллюстративным средством для доставки является липосома. Для введения нуклеиновых кислот в клетку-хозяина (in vitro, ex vivo или in vivo) предполагается применение липидных составов. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновая кислота может быть ассоциирована с липидом. Нуклеиновая кислота, ассоциированная с липидом, может быть инкапсулированной в водной внутренней части липосомы, помещенной в липидный бислой липосомы, присоединенной к липосоме посредством связывающей молекулы, которая ассоциирована как с липосомой, так и с олигонуклеотидом, захваченной в липосому, образовывать комплекс с липосомой, быть диспергированной в растворе, содержащем липид, смешанной с липидом, объединенной с липидом, содержаться в виде суспензии в липиде, содержаться в мицелле или образовывать комплекс с ней или иным образом быть ассоциированной с липидом. Композиции для ассоциации на основе липидов, липидов/ДНК или липидов/экспрессионного вектора не ограничиваются какой-либо конкретной структурой в растворе. Например, они могут присутствовать в бислойной структуре, в виде мицелл или в "сжатой" структуре. Они также могут быть просто помещены в раствор, при этом по возможности образуют агрегаты, которые не являются однородными по размеру или форме. Липиды представляют собой жирные вещества, которые могут являться встречающимися в природе или синтетическими липидами. Например, липиды включают жировые капли, которые встречаются в природе в цитоплазме, а также класс соединений, который содержит длинноцепочечные алифатические углеводороды и их производные, такие как жирные кислоты, спирты, амины, аминоспирты и альдегиды.In case of using a delivery system other than a virus, an exemplary delivery vehicle is a liposome. For introduction of nucleic acids into a host cell (in vitro, ex vivo or in vivo) use of lipid formulations is contemplated. In some embodiments, the nucleic acid can be associated with a lipid. The nucleic acid associated with a lipid can be encapsulated in the aqueous interior of a liposome, placed in a lipid bilayer of a liposome, attached to a liposome via a linking molecule that is associated with both the liposome and the oligonucleotide, entrapped in a liposome, complexed with a liposome, dispersed in a solution containing a lipid, mixed with a lipid, combined with a lipid, contained as a suspension in a lipid, contained in or complexed with a micelle, or otherwise associated with a lipid. Lipid, lipid/DNA or lipid/expression vector based association compositions are not limited to any particular structure in solution. For example, they may be present in a bilayer structure, as micelles or in a "squeezed" structure. They may also simply be placed in solution, possibly forming aggregates that are not uniform in size or shape. Lipids are fatty substances that may be naturally occurring or synthetic lipids. For example, lipids include lipid droplets that occur naturally in the cytoplasm, as well as a class of compounds that contains long-chain aliphatic hydrocarbons and their derivatives, such as fatty acids, alcohols, amines, amino alcohols and aldehydes.
Подходящие для применения липиды можно получить из коммерческих источников. Например, димиристилфосфатидилхолин ("DMPC") можно получить от Sigma, Сент-Луис, Миссури; дицетилфосфат ("DCP") можно получить от K & K Laboratories (Плейнвью, Нью-Йорк); холестерин ("Choi") можно получить от Calbiochem-Behring; димиристилфосфатидилглицерин ("DMPG") и другие липиды можно получить от Avanti Polar Lipids, Inc. (Бирмингем, Алабама). Исходные растворы липидов в хлороформе или хлороформе/метаноле можно хранить при температуре приблизительно -20°C. Хлороформ используется в качестве единственного растворителя, поскольку он испаряется легче, чем метанол. "Липосома" является общим термином, охватывающим различные одно- и мультиламеллярные липидные носители, образованные путем формирования замкнутых липидных бислоев или агрегатов. Липосомы можно охарактеризовать как имеющие везикулярные структуры с фосфолипидной бислойной мембраной и внутренней водной средой. Мультиламеллярные липосомы имеют несколько липидных слоев, разделенных водной средой. Они образуются самопроизвольно при суспендировании фосфолипидов в избытке водного раствора. Липидные компоненты подвергаются самореорганизации перед образованием замкнутых структур и захватывают воду и растворенные вещества между липидными бислоями (Ghosh et al., 1991, Glycobiology 5: 505-10). Однако также охватываются композиции, которые в растворе имеют структуры, отличные от нормальной везикулярной структуры. Например, липиды могут принимать вид мицеллярной структуры или просто существовать в виде неоднородных агрегатов липидных молекул. Также предполагаются комплексы липофектамин-нуклеиновая кислота.Suitable lipids can be obtained from commercial sources. For example, dimyristyl phosphatidylcholine ("DMPC") is available from Sigma, St. Louis, MO; dicetyl phosphate ("DCP") is available from K & K Laboratories (Plainview, NY); cholesterol ("Choi") is available from Calbiochem-Behring; dimyristyl phosphatidylglycerol ("DMPG") and other lipids are available from Avanti Polar Lipids, Inc. (Birmingham, AL). Stock solutions of lipids in chloroform or chloroform/methanol can be stored at approximately -20°C. Chloroform is used as the sole solvent because it evaporates more readily than methanol. "Liposome" is a general term encompassing a variety of unilamellar and multilamellar lipid carriers formed by the formation of closed lipid bilayers or aggregates. Liposomes can be characterized as having vesicular structures with a phospholipid bilayer membrane and an internal aqueous environment. Multilamellar liposomes have several lipid layers separated by an aqueous environment. They are formed spontaneously by suspending phospholipids in excess aqueous solution. The lipid components undergo self-reorganization before forming closed structures and entrap water and solutes between the lipid bilayers (Ghosh et al., 1991, Glycobiology 5: 505-10). However, compositions that have structures in solution that differ from the normal vesicular structure are also encompassed. For example, lipids may adopt a micellar structure or simply exist as heterogeneous aggregates of lipid molecules. Lipofectamine-nucleic acid complexes are also proposed.
Чтобы подтвердить присутствие последовательности рекомбинантной нуклеиновой кислоты в клетке-хозяине, можно проводить различные анализы, независимо от способа, применяемого для введения экзогенных нуклеиновых кислот в клетку-хозяина, или иного воздействия ингибитора по настоящему изобретению на клетку. Такие анализы включают, например, "молекулярно-биологические" анализы, хорошо известные специалистам в данной области, такие как саузерн- и нозерн-блоттинг, ОТ-ПЦР и ПЦР; "биохимические" анализы, такие как выявление присутствия или отсутствия конкретного пептида, например, с помощью иммунологических способов (ELISA и вестерн-блоттинга) или с помощью описанных в данном документе анализов, для идентификации средств, находящихся в пределах объема настоящего изобретения.In order to confirm the presence of a recombinant nucleic acid sequence in a host cell, various assays can be carried out, regardless of the method used to introduce exogenous nucleic acids into the host cell or otherwise expose the cell to an inhibitor of the present invention. Such assays include, for example, "molecular biological" assays well known to those skilled in the art, such as Southern and Northern blotting, RT-PCR and PCR; "biochemical" assays, such as detecting the presence or absence of a particular peptide, for example, by immunological methods (ELISA and Western blotting) or by the assays described herein, to identify agents within the scope of the present invention.
Трансфекция РНКRNA transfection
В данном документе раскрыты способы получения РНК, транскрибированной in vitro, кодирующей CAR. РНК, кодирующая CAR, и способы ее применения описаны, например, в абзацах 553-570 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.Disclosed herein are methods for producing in vitro transcribed RNA encoding a CAR. CAR encoding RNA and methods for using the CAR are described, for example, in paragraphs 553-570 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Иммунная эффектoрная клетка может содержать CAR, кодируемый матричной РНК (мРНК). В некоторых вариантах осуществления мРНК, кодирующую CAR, описанную в данном документе, вводят в иммунную эффекторную клетку, например, полученную посредством способа, описанного в данном документе, для получения клетки, экспрессирующей CAR.The immune effector cell may comprise a CAR encoded by messenger RNA (mRNA). In some embodiments, mRNA encoding a CAR described herein is introduced into an immune effector cell, such as one produced by a method described herein, to produce a cell expressing the CAR.
В некоторых вариантах осуществления РНК, транскрибированную in vitro, кодирующую CAR, можно вводить в клетку в форме транзиентной трансфекции. РНК получают путем транскрипции in vitro с использованием матрицы, полученной посредством полимеразной цепной реакции (ПЦР). ДНК, представляющая интерес, из любого источника может быть непосредственно преобразована с помощью ПЦР в матрицу для синтеза мРНК in vitro с использованием соответствующих праймеров и РНК-полимеразы. Источником ДНК может быть, например, геномная ДНК, плазмидная ДНК, фаговая ДНК, кДНК, синтетическая последовательность ДНК или любой другой подходящий источник ДНК. Требуемая матрица для транскрипции in vitro представляет собой CAR, описанный в данном документе. Например, матрица для РНК, кодирующей CAR, содержит внеклеточную область, содержащую одноцепочечный вариабельный домен антитела к опухолеассоциированному антигену, описанный в данном документе; шарнирную область (например, шарнирную область, описанную в данном документе), трансмембранный домен (например, трансмембранный домен, описанный в данном документе, такой как трансмембранный домен CD8a) и цитоплазматическую область, которая содержит внутриклеточный сигнальный домен, например, внутриклеточный сигнальный домен, описанный в данном документе, например, содержащий сигнальный домен CD3-дзета и сигнальный домен 4-1BB.In some embodiments, in vitro transcribed RNA encoding a CAR can be introduced into a cell in the form of transient transfection. The RNA is produced by in vitro transcription using a template generated by polymerase chain reaction (PCR). DNA of interest from any source can be directly converted by PCR into a template for in vitro mRNA synthesis using appropriate primers and RNA polymerase. The source of DNA can be, for example, genomic DNA, plasmid DNA, phage DNA, cDNA, a synthetic DNA sequence, or any other suitable source of DNA. The desired template for in vitro transcription is a CAR as described herein. For example, a template for RNA encoding a CAR comprises an extracellular region comprising a single-chain variable domain of an antibody to a tumor-associated antigen as described herein; a hinge region (e.g., a hinge region described herein), a transmembrane domain (e.g., a transmembrane domain described herein, such as a CD8a transmembrane domain), and a cytoplasmic region that contains an intracellular signaling domain, e.g., an intracellular signaling domain described herein, e.g., comprising a CD3-zeta signaling domain and a 4-1BB signaling domain.
В некоторых вариантах осуществления ДНК, подлежащая применению в ПЦР, содержит открытую рамку считывания. ДНК может быть получена из встречающейся в природе последовательности ДНК из генома организма. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновая кислота может содержать некоторые или все из 5'- и/или 3'-нетранслируемых областей (UTR). Нуклеиновая кислота может содержать экзоны и интроны. В некоторых вариантах осуществления ДНК, подлежащая применению в ПЦР, представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты человека. В некоторых вариантах осуществления ДНК, подлежащая применению в ПЦР, представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты человека, содержащую 5'- и 3'-UTR. В качестве альтернативы ДНК может представлять собой искусственную последовательность ДНК, которая обычно не экспрессируется у встречающегося в природе организма. Иллюстративная искусственная последовательность ДНК представляет собой последовательность, которая содержит части генов, лигированные друг с другом с образованием открытой рамки считывания, которая кодирует слитый белок. Части ДНК, лигированные друг с другом, могут быть получены из одного организма или из более чем одного организма.In some embodiments, the DNA to be used in the PCR comprises an open reading frame. The DNA may be derived from a naturally occurring DNA sequence from the genome of an organism. In some embodiments, the nucleic acid may comprise some or all of the 5' and/or 3' untranslated regions (UTRs). The nucleic acid may comprise exons and introns. In some embodiments, the DNA to be used in the PCR is a human nucleic acid sequence. In some embodiments, the DNA to be used in the PCR is a human nucleic acid sequence comprising a 5' and 3' UTR. Alternatively, the DNA may be an artificial DNA sequence that is not normally expressed in a naturally occurring organism. An exemplary artificial DNA sequence is one that comprises portions of genes ligated together to form an open reading frame that encodes a fusion protein. The DNA pieces ligated together may be from one organism or from more than one organism.
ПЦР применяют для получения матрицы, предназначенной для транскрипции in vitro мРНК, которая применяется для трансфекции. Способы осуществления ПЦР хорошо известны из уровня техники. Праймеры для применения в ПЦР разрабатывают таким образом, чтобы они имели области, по существу комплементарные областям ДНК, подлежащей применению в качестве матрицы для ПЦР. Используемый в данном документе термин "по существу комплементарные" относится к последовательностям нуклеотидов, где большинство или все основания в последовательности праймера являются комплементарными, или одно или несколько оснований являются некомплементарными или несовпадающими. По существу комплементарные последовательности способны отжигаться или гибридизироваться с предполагаемой ДНК-мишенью в условиях отжига, используемых для ПЦР. Праймеры можно разрабатывать таким образом, чтобы они были по существу комплементарными любой части ДНК-матрицы. Например, праймеры можно разрабатывать таким образом, чтобы обеспечить амплификацию части нуклеиновой кислоты, которая обычно транскрибируется в клетках (открытой рамки считывания), включающей 5'- и 3'-UTR. Праймеры также можно разрабатывать таким образом, чтобы обеспечить амплификацию части нуклеиновой кислоты, которая кодирует конкретный домен, представляющий интерес. В некоторых вариантах осуществления праймеры разработаны таким образом, что они обеспечивают амплификацию кодирующей области кДНК человека, в том числе 5'- и 3'-UTR целиком или их частей. Праймеры, применимые для ПЦР, могут быть получены посредством способов синтеза, которые хорошо известны из уровня техники. "Прямые праймеры" представляют собой праймеры, которые содержат область из нуклеотидов, по существу комплементарных нуклеотидам в ДНК-матрице, которые расположены выше последовательности ДНК, подлежащей амплификации. "Вышерасположенный" используется в данном документе для обозначения местоположения в 5'-направлении от последовательности ДНК, подлежащей амплификации, относительно кодирующей нити. "Обратные праймеры" представляют собой праймеры, которые содержат области из нуклеотидов, по существу комплементарных нуклеотидам в двухнитевой ДНК-матрице, которые расположены ниже последовательности ДНК, подлежащей амплификации. "Нижерасположенный" используется в данном документе для обозначения местоположения в 3'-направлении от последовательности ДНК, подлежащей амплификации, относительно кодирующей нити.PCR is used to produce a template for in vitro transcription of mRNA that is used for transfection. Methods for performing PCR are well known in the art. Primers for use in PCR are designed to have regions that are substantially complementary to regions of DNA to be used as a template for PCR. As used herein, the term "substantially complementary" refers to nucleotide sequences wherein most or all of the bases in the primer sequence are complementary or one or more bases are non-complementary or mismatched. Substantially complementary sequences are capable of annealing or hybridizing to the intended target DNA under the annealing conditions used for PCR. Primers can be designed to be substantially complementary to any portion of the template DNA. For example, primers can be designed to amplify a portion of a nucleic acid that is normally transcribed in cells (open reading frame), including the 5' and 3' UTR. Primers can also be designed to amplify a portion of a nucleic acid that encodes a particular domain of interest. In some embodiments, primers are designed to amplify a coding region of human cDNA, including all or portions of the 5' and 3' UTR. Primers useful for PCR can be prepared by synthetic methods that are well known in the art. "Forward primers" are primers that contain a region of nucleotides that are substantially complementary to nucleotides in the template DNA that are located upstream of the DNA sequence to be amplified. "Upstream" is used herein to refer to a location in the 5' direction from the DNA sequence to be amplified relative to the coding strand. "Reverse primers" are primers that contain regions of nucleotides that are substantially complementary to nucleotides in the double-stranded DNA template that are located downstream of the DNA sequence to be amplified. "Downstream" is used herein to refer to a location in the 3' direction from the DNA sequence to be amplified relative to the coding strand.
В способах, раскрытых в данном документе, может применяться любая ДНК-полимераза, применимая для ПЦР. Реагенты и полимераза являются коммерчески доступными из ряда источников.The methods disclosed herein may employ any DNA polymerase suitable for PCR. The reagents and polymerase are commercially available from a number of sources.
Также можно использовать химические структуры, которые могут способствовать стабильности и/или эффективности трансляции. РНК в ряде вариантов осуществления содержит 5'- и 3'-UTR. В некоторых вариантах осуществления длина 5'-UTR составляет от одного до 3000 нуклеотидов. Длину последовательностей 5'- и 3'-UTR, которые подлежат добавлению к кодирующей области, можно изменять с помощью различных способов, включая без ограничения разработку праймеров для ПЦР, которые отжигаются с различными областями UTR. Используя данный подход, специалист средней квалификации в данной области может модифицировать длину 5'- и 3'-UTR, необходимую для достижения оптимальной эффективности трансляции после трансфекции транскрибированной РНК.Chemical structures that can promote stability and/or translation efficiency can also be used. The RNA in some embodiments comprises a 5' and 3' UTR. In some embodiments, the length of the 5' UTR is from one to 3000 nucleotides. The length of the 5' and 3' UTR sequences to be added to the coding region can be varied by various methods, including, but not limited to, designing PCR primers that anneal to different regions of the UTR. Using this approach, one of ordinary skill in the art can modify the length of the 5' and 3' UTR as needed to achieve optimal translation efficiency after transfection of the transcribed RNA.
5'- и 3'-UTR могут представлять собой встречающиеся в природе эндогенные 5'- и 3'-UTR для нуклеиновой кислоты, представляющей интерес. В качестве альтернативы последовательности UTR, которые не являются эндогенными для нуклеиновой кислоты, представляющей интерес, могут быть добавлены путем включения последовательностей UTR в состав прямого и обратного праймеров или с помощью любых других модификаций матрицы. Использование последовательностей UTR, которые не являются эндогенными для нуклеиновой кислоты, представляющей интерес, может быть применимым для модификации стабильности и/или эффективности трансляции РНК. Например, известно, что AU-богатые элементы в последовательностях 3'-UTR могут уменьшать стабильность мРНК. Следовательно, 3'-UTR могут быть выбраны или разработаны таким образом, чтобы они увеличивали стабильность транскрибированной РНК, исходя из свойств UTR, которые хорошо известны из уровня техники.The 5' and 3' UTRs may be naturally occurring endogenous 5' and 3' UTRs for the nucleic acid of interest. Alternatively, UTR sequences that are not endogenous to the nucleic acid of interest may be added by incorporating UTR sequences into the forward and reverse primers or by any other modifications to the template. The use of UTR sequences that are not endogenous to the nucleic acid of interest may be useful for modifying the stability and/or translation efficiency of RNA. For example, it is known that AU-rich elements in 3' UTR sequences can decrease mRNA stability. Therefore, 3' UTRs may be selected or designed to increase the stability of transcribed RNA based on the properties of UTRs that are well known in the art.
В некоторых вариантах осуществления 5'-UTR может содержать последовательность Козак из эндогенной нуклеиновой кислоты В качестве альтернативы, если 5'-UTR, которая не является эндогенной для нуклеиновой кислоты, представляющей интерес, добавляют с помощью ПЦР, как описано выше, консенсусная последовательность Козак может быть видоизменена путем добавления последовательности 5'-UTR. Последовательности Козак могут увеличивать эффективность трансляции некоторых РНК-транскриптов, но, по-видимому, они не являются необходимыми для обеспечения эффективной трансляции всех РНК. Требование наличия последовательностей Козак для многих мРНК известно из уровня техники. В других вариантах осуществления 5'-UTR может представлять собой 5'-UTR из РНК-содержащего вируса, РНК-геном которого является стабильным в клетках. В других вариантах осуществления можно использовать различные аналоги нуклеотидов в 3'- или 5'-UTR, чтобы воспрепятствовать разрушению мРНК под действием экзонуклеаз.In some embodiments, the 5' UTR may comprise a Kozak sequence from an endogenous nucleic acid. Alternatively, if a 5' UTR that is not endogenous to the nucleic acid of interest is added by PCR as described above, the Kozak consensus sequence may be modified by adding the 5' UTR sequence. Kozak sequences may increase the translation efficiency of some RNA transcripts, but do not appear to be necessary to ensure efficient translation of all RNAs. The requirement for Kozak sequences for many mRNAs is known in the art. In other embodiments, the 5' UTR may be the 5' UTR from an RNA virus whose RNA genome is stable in cells. In other embodiments, different nucleotide analogs in the 3' or 5' UTR may be used to prevent mRNA from being destroyed by exonucleases.
Для обеспечения синтеза РНК с ДНК-матрицы без необходимости клонирования гена промотор транскрипции должен быть присоединен к ДНК-матрице выше последовательности, подлежащей транскрипции. Если последовательность, которая функционирует в качестве промотора для РНК-полимеразы, добавляют к 5'-концу прямого праймера, то промотор для РНК-полимеразы включается в состав продукта ПЦР выше открытой рамки считывания, которая подлежит транскрипции. В некоторых вариантах осуществления промотор представляет собой промотор для полимеразы Т7, как описано в другом разделе в данном документе. Другие применимые промоторы включают без ограничения промоторы для РНК-полимераз Т3 и SP6. Консенсусные нуклеотидные последовательности для промоторов T7, T3 и SP6 известны из уровня техники.To allow RNA synthesis from a DNA template without the need for gene cloning, a transcription promoter must be added to the DNA template upstream of the sequence to be transcribed. If a sequence that functions as a promoter for RNA polymerase is added to the 5' end of the forward primer, the promoter for RNA polymerase is included in the PCR product upstream of the open reading frame to be transcribed. In some embodiments, the promoter is a promoter for T7 polymerase, as described elsewhere herein. Other useful promoters include, but are not limited to, promoters for T3 and SP6 RNA polymerases. Consensus nucleotide sequences for T7, T3, and SP6 promoters are known in the art.
В некоторых вариантах осуществления мРНК содержит как кэп на 5'-конце, так и 3'-поли(А)-хвост, которые определяют связывание с рибосомой, инициацию трансляции и стабильность мРНК в клетке. На кольцевой ДНК-матрице, например, плазмидной ДНК, РНК-полимераза продуцирует длинный конкатемерный продукт, который не подходит для экспрессии в эукариотических клетках. Транскрипция плазмидной ДНК, линеаризованной на конце 3'-UTR, приводит к образованию мРНК нормального размера, которая не является эффективной для трансфекции у эукариот даже в случае ее полиаденилирования после транскрипции.In some embodiments, the mRNA contains both a 5' cap and a 3' poly(A) tail, which determine ribosome binding, translation initiation, and mRNA stability in the cell. On a circular DNA template, such as plasmid DNA, RNA polymerase produces a long concatemeric product that is not suitable for expression in eukaryotic cells. Transcription of plasmid DNA linearized at the 3' UTR end results in normal-sized mRNA that is not effective for transfection in eukaryotes, even if polyadenylated after transcription.
На линейной ДНК-матрице РНК-полимераза фага Т7 может удлинять 3'-конец транскрипта за пределы последнего основания матрицы (Schenborn and Mierendorf, Nuc Acids Res., 13:6223-36 (1985); Nacheva and Berzal-Herranz, Eur. J. Biochem., 270:1485-65 (2003).On a linear DNA template, phage T7 RNA polymerase can extend the 3' end of the transcript beyond the last base of the template (Schenborn and Mierendorf, Nuc Acids Res., 13:6223-36 (1985); Nacheva and Berzal-Herranz, Eur. J. Biochem., 270:1485-65 (2003).
Традиционный способ интеграции отрезков поли(А)/(Т) в ДНК-матрицу представляет собой молекулярное клонирование. Однако последовательность поли(А)/(Т), интегрированная в плазмидную ДНК, может обуславливать нестабильность плазмиды, вследствие чего плазмидные ДНК-матрицы, полученные из бактериальных клеток, зачастую сильно засорены делециями и другими аберрациями. Это приводит к тому, что процедуры клонирования являются не только трудоемкими и времязатратными, но зачастую и ненадежными. Поэтому существует большая потребность в способе, который позволяет конструировать ДНК-матрицы с отрезками поли(А)/(Т) на 3'-конце без клонирования.The traditional method of integrating poly(A)/(T) stretches into DNA template is molecular cloning. However, the poly(A)/(T) sequence integrated into plasmid DNA may cause plasmid instability, as a result of which plasmid DNA templates obtained from bacterial cells are often heavily contaminated with deletions and other aberrations. This results in cloning procedures being not only laborious and time-consuming, but also often unreliable. Therefore, there is a great need for a method that allows the construction of DNA templates with poly(A)/(T) stretches at the 3' end without cloning.
Сегмент поли(A)/(T) в транскрипционной ДНК-матрице можно получить в ходе ПЦР с применением обратного праймера, содержащего поли(T)-хвост, такой как хвост из 100 T (SEQ ID NO: 31) (размер может составлять 50-5000 T (SEQ ID NO: 32)) или после ПЦР с помощью любого другого способа, в том числе без ограничения лигирования или рекомбинации ДНК in vitro. Поли(А)-хвосты также обеспечивают стабильность РНК и уменьшают их разрушение. Как правило, длина поли(А)-хвоста положительно коррелирует со стабильностью транскрибированной РНК. В некоторых вариантах осуществления длина поли(А)-хвоста составляет от 100 до 5000 аденозиновых остатков (например, SEQ ID NO: 33).The poly(A)/(T) segment in the transcription DNA template can be obtained by PCR using a reverse primer containing a poly(T) tail, such as a 100 T tail (SEQ ID NO: 31) (the size can be 50-5000 T (SEQ ID NO: 32)) or after PCR using any other method, including, but not limited to, in vitro DNA ligation or recombination. Poly(A) tails also provide RNA stability and reduce their degradation. Typically, the length of the poly(A) tail is positively correlated with the stability of the transcribed RNA. In some embodiments, the length of the poly(A) tail is from 100 to 5000 adenosine residues (e.g., SEQ ID NO: 33).
Поли(А)-хвосты РНК могут быть дополнительно удлинены после транскрипции in vitro путем использования поли(А)-полимеразы, такой как поли(А)-полимераза Е. coli (E-PAP). В некоторых вариантах осуществления увеличение длины поли(А)-хвоста от 100 нуклеотидов до 300-400 нуклеотидов (SEQ ID NO: 34) дает в результате приблизительно двукратное увеличение эффективности трансляции РНК. Кроме того, присоединение различных химических групп к 3'-концу может увеличивать стабильность мРНК. Такое присоединение может включать присоединение модифицированных/искусственных нуклеотидов, аптамеров и других соединений. Например, в состав поли(А)-хвоста с помощью поли(А)-полимеразы могут быть включены аналоги ATP. Аналоги ATP могут дополнительно увеличивать стабильность РНК.Poly(A) tails of RNA can be further extended after in vitro transcription by using a poly(A) polymerase, such as E. coli poly(A) polymerase (E-PAP). In some embodiments, increasing the length of the poly(A) tail from 100 nucleotides to 300-400 nucleotides (SEQ ID NO: 34) results in an approximately two-fold increase in RNA translation efficiency. Additionally, addition of various chemical groups to the 3' end can increase mRNA stability. Such addition can include addition of modified/artificial nucleotides, aptamers, and other compounds. For example, ATP analogs can be incorporated into the poly(A) tail using poly(A) polymerase. ATP analogs can further increase RNA stability.
5'-кэп-структуры также обеспечивают стабильность молекул РНК. В некоторых вариантах осуществления РНК, полученные посредством способов, раскрытых в данном документе, содержат 5'-кэп. Наличие 5'-кэпа обеспечивают с помощью методик, известных из уровня техники и описанных в данном документе (Cougot, et al., Trends in Biochem. Sci., 29:436-444 (2001); Stepinski, et al., RNA, 7:1468-95 (2001); Elango, et al., Biochim. Biophys. Res. Commun., 330:958-966 (2005)).5' cap structures also provide stability to RNA molecules. In some embodiments, RNAs produced by the methods disclosed herein contain a 5' cap. The presence of a 5' cap is achieved using techniques known in the art and described herein (Cougot, et al., Trends in Biochem. Sci., 29:436-444 (2001); Stepinski, et al., RNA, 7:1468-95 (2001); Elango, et al., Biochim. Biophys. Res. Commun., 330:958-966 (2005)).
РНК, полученные посредством способов, раскрытых в данном документе, также могут содержать последовательность участка внутренней посадки рибосомы (IRES). Последовательность IRES может быть любой вирусной, хромосомной или искусственно разработанной последовательностью, которая инициирует кэп-независимое связывание рибосомы с мРНК и содействует инициации трансляции. Могут быть включены любые растворенные вещества, подходящие для электропорации клеток, которые могут включать факторы, содействующие проникновению в клетку и жизнеспособности клеток, такие как сахара, пептиды, липиды, белки, антиоксиданты и поверхностно-активные вещества.RNAs produced by the methods disclosed herein may also contain an internal ribosome entry site (IRES) sequence. The IRES sequence may be any viral, chromosomal, or artificially designed sequence that initiates cap-independent ribosome binding to mRNA and promotes translation initiation. Any solutes suitable for cell electroporation may be included, which may include factors that promote cell entry and cell viability, such as sugars, peptides, lipids, proteins, antioxidants, and surfactants.
РНК можно вводить в клетки-мишени с помощью любого из целого ряда различных способов, например, коммерчески доступных способов, которые включают без ограничения электропорацию (Amaxa Nucleofector-II (Amaxa Biosystems, Кельн, Германия)), ECM 830 (BTX) (Harvard Instruments, Бостон, Массачусетс) или Gene Pulser II (BioRad, Денвер, Колорадо), Multiporator (Eppendorf, Гамбург, Германия)), трансфекцию, опосредованную катионными липосомами, с применением липофекции, инкапсуляцию в полимеры, трансфекцию, опосредованную пептидами, или биобаллистические системы доставки частиц, такие как "генные пушки" (см., например, Nishikawa, et al. Hum Gene Ther., 12(8):861-70 (2001).RNA can be introduced into target cells by any of a number of different methods, such as commercially available methods that include, but are not limited to, electroporation (Amaxa Nucleofector-II (Amaxa Biosystems, Cologne, Germany)), ECM 830 (BTX) (Harvard Instruments, Boston, MA) or Gene Pulser II (BioRad, Denver, CO), Multiporator (Eppendorf, Hamburg, Germany)), cationic liposome-mediated transfection using lipofection, encapsulation in polymers, peptide-mediated transfection, or biolistic particle delivery systems such as "gene guns" (see, e.g., Nishikawa, et al. Hum Gene Ther., 12(8):861-70 (2001).
Невирусные способы доставкиNon-viral delivery methods
В некоторых вариантах осуществления можно применять невирусные способы для доставки нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, описанный в данном документе, в клетку, или ткань, или организм субъекта.In some embodiments, non-viral methods can be used to deliver a nucleic acid encoding a CAR described herein into a cell or tissue or organism of a subject.
В некоторых вариантах осуществления невирусный способ включает применение транспозона (также называемого мобильным генетическим элементом). В некоторых вариантах осуществления транспозон представляет собой фрагмент ДНК, который может самостоятельно вставляться в определенное местоположение в геноме, например, фрагмент ДНК, который способен к саморепликации и вставке своей копии в геном, или фрагмент ДНК, который с помощью сплайсинга может быть вырезан из более длинной нуклеиновой кислоты и вставлен в другое место в геноме. Например, транспозон содержит последовательность ДНК, состоящую из инвертированных повторов, фланкирующих гены для транспозиции.In some embodiments, the non-viral method includes using a transposon (also called a mobile genetic element). In some embodiments, a transposon is a DNA fragment that can self-insert itself into a specific location in the genome, such as a DNA fragment that is capable of self-replication and inserting a copy of itself into the genome, or a DNA fragment that can be cut from a longer nucleic acid by splicing and inserted into another location in the genome. For example, a transposon comprises a DNA sequence consisting of inverted repeats flanking genes for transposition.
Иллюстративные способы доставки нуклеиновой кислоты с применением транспозона включают транспозонную систему "спящая красавица" (SBTS) и транспозонную систему piggyBac™ (PB). См., например, Aronovich et al. Hum. Mol. Genet. 20.R1(2011):R14-20; Singh et al. Cancer Res. 15(2008):2961-2971; Huang et al. Mol. Ther. 16(2008):580-589; Grabundzija et al. Mol. Ther. 18(2010):1200-1209; Kebriaei et al. Blood. 122.21(2013):166; Williams. Molecular Therapy 16.9(2008):1515-16; Bell et al. Nat. Protoc. 2.12(2007):3153-65; и Ding et al. Cell. 122.3(2005):473-83, все из которых включены в данный документ посредством ссылки.Exemplary transposon-based nucleic acid delivery methods include the sleeping beauty transposon system (SBTS) and the piggyBac™ (PB) transposon system. See, e.g., Aronovich et al. Hum. Mol. Genet. 20.R1(2011):R14–20; Singh et al. Cancer Res. 15(2008):2961–2971; Huang et al. Mol. Ther. 16(2008):580–589; Grabundzija et al. Mol. Ther. 18(2010):1200–1209; Kebriaei et al. Blood. 122.21(2013):166; Williams. Molecular Therapy 16.9(2008):1515–16; Bell et al. Nat. Protoc. 2.12(2007):3153–65; and Ding et al. Cell. 122.3(2005):473–83, all of which are incorporated herein by reference.
SBTS содержит два компонента: 1) транспозон, содержащий трансген, и 2) источник фермента транспозазы. Транспозаза может обеспечивать перенос транспозона из плазмиды-носителя (или другой донорной ДНК) в целевую ДНК, такую как хромосома/геном клетки-хозяина. Например, транспозаза связывается с плазмидой-носителем/донорной ДНК, вырезает транспозон (в том числе трансген(трансгены)) из плазмиды и вставляет его в геном клетки-хозяина. См., например, Aronovich et al. выше.SBTS contains two components: 1) a transposon containing a transgene, and 2) a source of the transposase enzyme. The transposase can mediate the transfer of a transposon from a carrier plasmid (or other donor DNA) to a target DNA, such as a host cell chromosome/genome. For example, the transposase binds to the carrier/donor DNA, excises the transposon (including the transgene(s)) from the plasmid, and inserts it into the host cell genome. See, e.g., Aronovich et al. higher.
Иллюстративные транспозоны включают транспозон на основе pT2. См., например, Grabundzija et al. Nucleic Acids Res. 41.3(2013):1829-47 и Singh et al. Cancer Res. 68.8(2008): 2961-2971, все из которых включены в данный документ посредством ссылки. Иллюстративные транспозазы включают транспозазу типа Tc1/mariner, например, транспозазу SB10 или транспозазу SB11 (гиперактивную транспозазу, которая может экспрессироваться, например, под контролем промотора цитомегаловируса). См., например, Aronovich et al.; Kebriaei et al. и Grabundzija et al., все из которых включены в данный документ посредством ссылки.Exemplary transposons include the pT2-based transposon. See, e.g., Grabundzija et al. Nucleic Acids Res. 41.3(2013):1829-47 and Singh et al. Cancer Res. 68.8(2008):2961-2971, all of which are incorporated herein by reference. Exemplary transposases include a Tc1/mariner-type transposase, such as the SB10 transposase or the SB11 transposase (a hyperactive transposase that can be expressed, for example, under the control of the cytomegalovirus promoter). See, e.g., Aronovich et al.; Kebriaei et al. and Grabundzija et al., all of which are incorporated herein by reference.
Применение SBTS обеспечивает эффективную интеграцию и экспрессию трансгена, например, нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, описанный в данном документе. В данном документе представлены способы получения клетки, например, T-клетки или NK-клетки, которая стабильно экспрессирует CAR, описанный в данном документе, например, с применением транспозонной системы, такой как SBTS.The use of SBTS enables efficient integration and expression of a transgene, such as a nucleic acid encoding a CAR described herein. The present document provides methods for producing a cell, such as a T cell or NK cell, that stably expresses a CAR described herein, such as using a transposon system such as SBTS.
В соответствии со способами, описанными в данном документе, в некоторых вариантах осуществления одна или несколько нуклеиновых кислот, например, плазмид, содержащих компоненты SBTS, доставляются в клетку (например, T- или NK-клетку). Например, нуклеиновая(нуклеиновые) кислота(кислоты) доставляются с помощью стандартных способов доставки нуклеиновых кислот (например, плазмидной ДНК), например, с помощью описанных в данном документе способов, например, электропорации, трансфекции или липофекции. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновая кислота содержит транспозон, содержащий трансген, например, нуклеиновую кислоту, кодирующую CAR, описанный в данном документе. В некоторых вариантах осуществления нуклеиновая кислота содержит транспозон, содержащий трансген (например, нуклеиновую кислоту, кодирующую CAR, описанный в данном документе), а также последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую фермент транспозазу. В других вариантах осуществления представлена система с двумя нуклеиновыми кислотами, например, система с двумя плазмидами, например, где первая плазмида содержит транспозон, содержащий трансген, а вторая плазмида содержит последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую фермент транспозазу. Например, первая и вторая нуклеиновые кислоты совместно доставляются в клетку-хозяина.According to the methods described herein, in some embodiments, one or more nucleic acids, e.g., plasmids containing SBTS components, are delivered to a cell (e.g., a T or NK cell). For example, the nucleic acid(s) are(are) delivered using standard nucleic acid (e.g., plasmid DNA) delivery methods, such as those described herein, such as electroporation, transfection, or lipofection. In some embodiments, the nucleic acid comprises a transposon comprising a transgene, such as a nucleic acid encoding a CAR as described herein. In some embodiments, the nucleic acid comprises a transposon comprising a transgene (e.g., a nucleic acid encoding a CAR as described herein), and a nucleic acid sequence encoding a transposase enzyme. In other embodiments, a two nucleic acid system is provided, such as a two plasmid system, such as where the first plasmid contains a transposon containing a transgene and the second plasmid contains a nucleic acid sequence encoding a transposase enzyme. For example, the first and second nucleic acids are co-delivered to the host cell.
В некоторых вариантах осуществления клетки, например, T- или NK-клетки, которые экспрессируют CAR, описанный в данном документе, получают с помощью комбинации вставки гена с помощью SBTS и генетического редактирования с помощью нуклеазы (например, нуклеаз с "цинковыми пальцами" (ZFN), эффекторных нуклеаз, подобных активаторам транскрипции (TALEN), системы CRISPR/Cas или сконструированных мегануклеаз, представляющих собой реконструированные хоминг-эндонуклеазы).In some embodiments, cells, such as T or NK cells, that express a CAR described herein are produced by a combination of gene insertion using SBTS and genetic editing using a nuclease (e.g., zinc finger nucleases (ZFNs), transcription activator-like effector nucleases (TALENs), the CRISPR/Cas system, or engineered meganucleases that are reshaped homing endonucleases).
В некоторых вариантах осуществления применение невирусного способа доставки делает возможным перепрограммирование клеток, например, Т- или NK-клеток, и прямую инфузию клеток в организм субъекта. Преимущества невирусных векторов включают без ограничения простоту и относительно низкую стоимость получения достаточных количеств, необходимых для удовлетворения требованиям популяции пациентов, стабильность при хранении и отсутствие иммуногенности.In some embodiments, the use of a non-viral delivery method allows for reprogramming of cells, such as T or NK cells, and direct infusion of the cells into a subject. Advantages of non-viral vectors include, but are not limited to, ease and relatively low cost of producing sufficient quantities to meet the requirements of a patient population, stability upon storage, and lack of immunogenicity.
Способы изготовления/полученияMethods of production/obtaining
В настоящем изобретении также предусмотрены способы получения клетки, раскрытой в данном документе, например, способы конструирования T-клетки или NK-клетки таким образом, чтобы она экспрессировала молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую одну или несколько конструкций CAR, описанных в данном документе. В некоторых вариантах осуществления способы изготовления, раскрытые в данном документе, применяют для изготовления клетки, содержащей молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую два CAR, раскрытых в данном документе (например, CAR для BCMA и CAR для CD19, раскрытые в данном документе). В некоторых вариантах осуществления способы изготовления, раскрытые в данном документе, применяют для изготовления клетки, содержащей молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе, например, CAR для BCMA/CD19 в формате диатела, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления способы изготовления, раскрытые в данном документе, применяют для изготовления клетки, содержащей две молекулы нуклеиновой кислоты, каждая из которых кодирует CAR, раскрытый в данном документе (например, одну молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR для BCMA, и одну молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR для CD19). В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена популяция клеток (например, иммунных эффектoрных клеток, например, T-клеток или NK-клеток), полученных посредством любого из способов изготовления, описанных в данном документе.The present invention also provides methods for making a cell as disclosed herein, such as methods for engineering a T cell or NK cell to express a nucleic acid molecule encoding one or more CAR constructs as disclosed herein. In some embodiments, the manufacturing methods disclosed herein are used to make a cell comprising a nucleic acid molecule encoding two CARs as disclosed herein (e.g., a BCMA CAR and a CD19 CAR as disclosed herein). In some embodiments, the manufacturing methods disclosed herein are used to make a cell comprising a nucleic acid molecule encoding a CAR in diabody format as disclosed herein, such as a BCMA/CD19 CAR in diabody format as disclosed herein. In some embodiments, the manufacturing methods disclosed herein are used to manufacture a cell comprising two nucleic acid molecules, each encoding a CAR disclosed herein (e.g., one nucleic acid molecule encoding a CAR for BCMA and one nucleic acid molecule encoding a CAR for CD19). In some embodiments, provided herein is a population of cells (e.g., immune effector cells, such as T cells or NK cells) produced by any of the manufacturing methods described herein.
Способ с использованием активацииMethod using activation
В некоторых вариантах осуществления посредством способов, раскрытых в данном документе, можно изготавливать иммунные эффектoрные клетки, сконструированные таким образом, что они экспрессируют один или несколько CAR, за менее чем 24 часа. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что способы, предусмотренные в данном документе, обеспечивают сохранение недифференцированного фенотипа T-клеток, таких как необученные Т-клетки, в ходе способа изготовления. Такие клетки, экспрессирующие CAR, с недифференцированным фенотипом могут персистировать дольше и/или размножаться лучше in vivo после инфузии. В некоторых вариантах осуществления CAR-T-клетки, полученные посредством способов изготовления, предусмотренных в данном документе, содержат более высокую процентную долю T-клеток памяти, представляющих собой стволовые клетки, по сравнению с CAR-T-клетками, полученными посредством способа традиционного изготовления, например, согласно измерению с помощью scRNA-seq (например, согласно измерению посредством способов, описанных в примере 7 в отношении фиг. 25A). В некоторых вариантах осуществления CAR-T-клетки, полученные посредством способов изготовления, предусмотренных в данном документе, содержат более высокую процентную долю эффекторных T-клеток по сравнению с CAR-T-клетками, полученными посредством способа традиционного изготовления, например, согласно измерению с помощью scRNA-seq (например, согласно измерению посредством способов, описанных в примере 7 в отношении фиг. 25B). В некоторых вариантах осуществления CAR-T-клетки, полученные посредством способов изготовления, предусмотренных в данном документе, лучше сохраняют стволовость T-клеток по сравнению с CAR-T-клетками, полученными посредством способа традиционного изготовления, например, согласно измерению с помощью scRNA-seq (например, согласно измерению посредством способов, описанных в примере 7 в отношении фиг. 25C). В некоторых вариантах осуществления CAR-T-клетки, полученные посредством способов изготовления, предусмотренных в данном документе, демонстрируют более низкий уровень гипоксии по сравнению с CAR-T-клетками, полученными посредством способа традиционного изготовления, например, согласно измерению с помощью scRNA-seq (например, согласно измерению посредством способов, описанных в примере 7 в отношении фиг. 25D). В некоторых вариантах осуществления CAR-T-клетки, полученные посредством способов изготовления, предусмотренных в данном документе, демонстрируют более низкий уровень аутофагии по сравнению с CAR-T-клетками, полученными посредством способа традиционного изготовления, например, согласно измерению с помощью scRNA-seq (например, согласно измерению посредством способов, описанных в примере 7 в отношении фиг. 25E). В некоторых вариантах осуществления иммунные эффекторные клетки конструируют таким образом, чтобы они содержали молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую два CAR, раскрытых в данном документе (например, CAR для BCMA и CAR для CD19, раскрытые в данном документе). В некоторых вариантах осуществления иммунные эффекторные клетки конструируют таким образом, чтобы они содержали молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе, например, CAR для BCMA/CD19 в формате диатела, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления иммунные эффекторные клетки конструируют таким образом, чтобы они содержали две молекулы нуклеиновой кислоты, каждая из которых кодирует CAR, раскрытый в данном документе (например, одну молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR для BCMA, и одну молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR для CD19).In some embodiments, the methods disclosed herein can produce immune effector cells engineered to express one or more CARs in less than 24 hours. Without being bound by theory, it is believed that the methods provided herein allow the undifferentiated phenotype of T cells, such as naive T cells, to be maintained during the manufacturing process. Such CAR-expressing cells with an undifferentiated phenotype can persist longer and/or expand better in vivo after infusion. In some embodiments, CAR T cells produced by the manufacturing methods provided herein contain a higher percentage of memory T cells that are stem cells compared to CAR T cells produced by a traditional manufacturing process, such as as measured by scRNA-seq (e.g., as measured by the methods described in Example 7 with respect to Fig. 25A). In some embodiments, CAR-T cells produced by the manufacturing methods provided herein comprise a higher percentage of effector T cells compared to CAR-T cells produced by a traditional manufacturing method, such as as measured by scRNA-seq (e.g., as measured by the methods described in Example 7 with respect to Fig. 25B). In some embodiments, CAR-T cells produced by the manufacturing methods provided herein better retain T cell stemness compared to CAR-T cells produced by a traditional manufacturing method, such as as measured by scRNA-seq (e.g., as measured by the methods described in Example 7 with respect to Fig. 25C). In some embodiments, CAR-T cells produced by the manufacturing methods provided herein exhibit a lower level of hypoxia compared to CAR-T cells produced by a traditional manufacturing method, such as as measured by scRNA-seq (e.g., as measured by the methods described in Example 7 with respect to Fig. 25D). In some embodiments, CAR-T cells produced by the manufacturing methods provided herein exhibit a lower level of autophagy compared to CAR-T cells produced by a traditional manufacturing method, such as as measured by scRNA-seq (e.g., as measured by the methods described in Example 7 with respect to Fig. 25E). In some embodiments, the immune effector cells are engineered to comprise a nucleic acid molecule encoding two CARs disclosed herein (e.g., a BCMA CAR and a CD19 CAR disclosed herein). In some embodiments, the immune effector cells are engineered to comprise a nucleic acid molecule encoding a CAR in a diabody format as disclosed herein, such as a CAR for BCMA/CD19 in a diabody format as disclosed herein. In some embodiments, the immune effector cells are engineered to comprise two nucleic acid molecules, each encoding a CAR as disclosed herein (e.g., one nucleic acid molecule encoding a CAR for BCMA and one nucleic acid molecule encoding a CAR for CD19).
В некоторых вариантах осуществления способы, раскрытые в данном документе, не предусматривают применение гранулы, такой как Dynabeads® (например, Dynabeads® с антителами к CD3/CD28), и не предусматривают стадию удаления гранул. В некоторых вариантах осуществления CAR-T-клетки, изготовленные посредством способов, раскрытых в данном документе, можно вводить субъекту при минимальном размножении ex vivo, например, в течение менее 1 дня, менее 12 часов, менее 8 часов, менее 6 часов, менее 4 часов, менее 3 часов, менее 2 часов, менее 1 часа или без размножения ex vivo. Соответственно, способы, описанные в данном документе, предусматривают способ быстрого изготовления для получения улучшенных продуктов на основе клеток, экспрессирующих CAR, для применения в лечении заболевания у субъекта.In some embodiments, the methods disclosed herein do not involve the use of a bead, such as Dynabeads® (e.g., Dynabeads® with CD3/CD28 antibodies), and do not involve the step of removing the beads. In some embodiments, CAR T cells made by the methods disclosed herein can be administered to a subject with minimal ex vivo expansion, such as in less than 1 day, less than 12 hours, less than 8 hours, less than 6 hours, less than 4 hours, less than 3 hours, less than 2 hours, less than 1 hour, or without ex vivo expansion. Accordingly, the methods described herein provide a rapid manufacturing method for producing improved CAR-expressing cell products for use in treating a disease in a subject.
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрены способы получения популяции клеток (например, T-клеток), которые экспрессируют химерный антигенный рецептор (CAR) (например, один или несколько CAR, например, два CAR), включающие (i) приведение популяции клеток (например, T-клеток, например, T-клеток, выделенных из замороженного или свежего продукта лейкафереза) в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток; (ii) приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты (например, молекулой ДНК или РНК), кодирующими CAR, за счет чего обеспечивается получение популяции клеток (например, T-клеток), содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, и (iii) сбор популяции клеток (например, T-клеток) для хранения (например, повторного составления популяции клеток в среде для криоконсервации) или введения, где (a) стадию (ii) проводят вместе со стадией (i) или не позже чем через 20 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 12, 13, 14, 15, 16, 17 или 18 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 18 часов после начала стадии (i), и стадию (iii) проводят не позже чем через 26 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 22, 23 или 24 часа после начала стадии (i), например, не позже чем через 24 часа после начала стадии (i); (b) стадию (ii) проводят вместе со стадией (i) или не позже чем через 20 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 12, 13, 14, 15, 16, 17 или 18 часов после начала стадии (i), например, не позже чем через 18 часов после начала стадии (i), и стадию (iii) проводят не позже чем через 30 часов после начала стадии (ii), например, не позже чем через 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 часов после начала стадии (ii); или (c) популяция клеток из стадии (iii) не является размножившейся или является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 или 40%, например, на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (i). В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) представляет собой молекулу ДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) представляет собой молекулу РНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) находится в вирусном векторе, например, в вирусном векторе, выбранном из лентивирусного вектора, аденовирусного вектора или ретровирусного вектора. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) находится в невирусном векторе. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) находится в плазмиде. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (ii) не находится в каком-либо векторе. В некоторых вариантах осуществления стадия (ii) включает трансдукцию популяции клеток (например, T-клеток) c помощью вирусного(вирусных) вектора(векторов), содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR.In some embodiments, the present invention provides methods for producing a population of cells (e.g., T cells) that express a chimeric antigen receptor (CAR) (e.g., one or more CARs, e.g., two CARs) comprising (i) contacting the population of cells (e.g., T cells, e.g., T cells isolated from a frozen or fresh leukapheresis product) with an agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or an agent that stimulates a costimulatory molecule on the surface of the cells; (ii) contacting a population of cells (e.g., T cells) with a nucleic acid molecule(s) (e.g., a DNA or RNA molecule) encoding a CAR, thereby producing a population of cells (e.g., T cells) comprising the nucleic acid molecule, and (iii) collecting the population of cells (e.g., T cells) for storage (e.g., reconstituting the population of cells in a cryopreservation medium) or administration, wherein (a) step (ii) is performed in conjunction with step (i) or no later than 20 hours after the start of step (i), such as no later than 12, 13, 14, 15, 16, 17, or 18 hours after the start of step (i), such as no later than 18 hours after the start of step (i), and step (iii) is performed no later than 26 hours after the start of step (i), such as no later than 22, 23, or 24 hours after the start of step (i), for example, not later than 24 hours after the start of step (i); (b) step (ii) is carried out together with step (i) or not later than 20 hours after the start of step (i), for example not later than 12, 13, 14, 15, 16, 17 or 18 hours after the start of step (i), for example not later than 18 hours after the start of step (i), and step (iii) is carried out not later than 30 hours after the start of step (ii), for example not later than 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 or 30 hours after the start of step (ii); or (c) the population of cells from step (iii) is not expanded or is expanded by an increase in number of no more than 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 or 40%, such as no more than 10%, such as as assessed by the number of live cells, compared to the population of cells at the beginning of step (i). In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (ii) is a DNA molecule. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (ii) is an RNA molecule. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (ii) is in a viral vector, such as a viral vector selected from a lentiviral vector, an adenoviral vector or a retroviral vector. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (ii) is in a non-viral vector. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (ii) is in a plasmid. In some embodiments, the nucleic acid molecule in step (ii) is not in any vector. In some embodiments, step (ii) comprises transducing a population of cells (e.g., T cells) with a viral vector(s) containing a nucleic acid molecule encoding a CAR.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток (например, T-клеток) собирают из образца, полученного путем афереза (например, образца, полученного путем лейкафереза) у субъекта.In some embodiments, a population of cells (e.g., T cells) is collected from a sample obtained by apheresis (e.g., a sample obtained by leukapheresis) from a subject.
В некоторых вариантах осуществления образец, полученный путем афереза (например, образец, полученный путем лейкафереза), собирают у субъекта и транспортируют в виде замороженного образца (например, криоконсервированного образца) в учреждение, осуществляющее изготовление клеток. Затем замороженный образец, полученный путем афереза, размораживают, и T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) отбирают из образца, полученного путем афереза, например, с помощью устройства для сортировки клеток (например, устройства CliniMACS® Prodigy®). Отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) затем высевают для изготовления CAR-T посредством способа с использованием активации, описанного в данном документе. В некоторых вариантах осуществления отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) подвергают одному или нескольким циклам замораживания-размораживания перед высеванием для изготовления CAR-T.In some embodiments, an apheresis sample (e.g., a leukapheresis sample) is collected from a subject and transported as a frozen sample (e.g., a cryopreserved sample) to a cell manufacturing facility. The frozen apheresis sample is then thawed and T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are isolated from the apheresis sample, such as using a cell sorting device (e.g., a CliniMACS® Prodigy® device). The isolated T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are then seeded to manufacture CAR-T using the activation-based method described herein. In some embodiments, selected T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are subjected to one or more freeze-thaw cycles prior to seeding to make CAR-T.
В некоторых вариантах осуществления образец, полученный путем афереза (например, образец, полученный путем лейкафереза), собирают у субъекта и транспортируют в виде свежего продукта (например, незамороженного продукта) в учреждение, осуществляющее изготовление клеток. T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) отбирают из образца, полученного путем афереза, например, с помощью устройства для сортировки клеток (например, устройства CliniMACS® Prodigy®). Отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) затем высевают для изготовления CAR-T посредством способа с использованием активации, описанного в данном документе. В некоторых вариантах осуществления отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) подвергают одному или нескольким циклам замораживания-размораживания перед высеванием для изготовления CAR-T.In some embodiments, an apheresis sample (e.g., a leukapheresis sample) is collected from a subject and transported as a fresh product (e.g., a non-frozen product) to a cell manufacturing facility. T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are selected from the apheresis sample, such as using a cell sorting device (e.g., a CliniMACS® Prodigy® device). The selected T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are then seeded to make CAR-T using the activation-based method described herein. In some embodiments, the selected T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are subjected to one or more freeze-thaw cycles prior to seeding to make CAR-T.
В некоторых вариантах осуществления у субъекта собирают образец, полученный путем афереза (например, образец, полученный путем лейкафереза). T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) отбирают из образца, полученного путем афереза, например, с помощью устройства для сортировки клеток (например, устройства CliniMACS® Prodigy®). Отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) затем транспортируют в виде замороженного образца (например, криоконсервированного образца) в учреждение, осуществляющее изготовление клеток. Отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) впоследствии размораживают и высевают для изготовления CAR-T посредством способа с использованием активации, описанного в данном документе.In some embodiments, an apheresis sample (e.g., a leukapheresis sample) is collected from a subject. T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are collected from the apheresis sample, such as using a cell sorting device (e.g., a CliniMACS® Prodigy® device). The collected T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are then transported as a frozen sample (e.g., a cryopreserved sample) to a cell manufacturing facility. The collected T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are subsequently thawed and seeded to manufacture CAR-T using the activation-based method described herein.
В некоторых вариантах осуществления клетки (например, T-клетки) приводят в контакт с антителами к CD3 и антителами к CD28 в течение, например, 12 часов с последующей трансдукцией с помощью вектора (например, лентивирусного вектора) (например, одного или нескольких векторов), кодирующего CAR (например, один или несколько CAR). Через 24 часа после начала культивирования клетки промывают и составляют для хранения или введения.In some embodiments, cells (e.g., T cells) are contacted with anti-CD3 antibodies and anti-CD28 antibodies for, e.g., 12 hours, followed by transduction with a vector (e.g., a lentiviral vector) (e.g., one or more vectors) encoding a CAR (e.g., one or more CARs). After 24 hours of culture, the cells are washed and formulated for storage or administration.
Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что кратковременная стимуляция CD3 и CD28 может способствовать эффективной трансдукции самообновляющихся T-клеток. По сравнению с традиционными подходами к изготовлению CAR-T способ с использованием активации, предусмотренный в данном документе, не предусматривает продолжительного размножения ex vivo. Подобно способу с использованием цитокинов, способ с использованием активации, предусмотренный в данном документе, также обеспечивает сохранение недифференцированных T-клеток в ходе изготовления CAR-T.Without being bound by theory, it is believed that short-term stimulation of CD3 and CD28 may facilitate efficient transduction of self-renewing T cells. Compared to traditional approaches to CAR-T fabrication, the activation-based method provided herein does not require prolonged ex vivo expansion. Similar to the cytokine-based method, the activation-based method provided herein also preserves undifferentiated T cells during CAR-T fabrication.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток.In some embodiments, the cell population is contacted with an agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or an agent that stimulates a costimulatory molecule on the cell surface.
В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, представляет собой средство, которое стимулирует CD3. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, представляет собой средство, которое стимулирует CD28, ICOS, CD27, HVEM, LIGHT, CD40, 4-1BB, OX40, DR3, GITR, CD30, TIM1, CD2, CD226 или любую их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, представляет собой средство, которое стимулирует CD28. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, выбрано из антитела (например, однодоменного антитела (например, антитела из одного вариабельного домена тяжелой цепи), пептитела, Fab-фрагмента или scFv), малой молекулы или лиганда (например, существующего в природе, рекомбинантного или химерного лиганда). В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, представляет собой антитело. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, представляет собой антитело к CD3. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, выбрано из антитела (например, однодоменного антитела (например, антитела из одного вариабельного домена тяжелой цепи), пептитела, Fab-фрагмента или scFv), малой молекулы или лиганда (например, существующего в природе, рекомбинантного или химерного лиганда). В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, представляет собой антитело. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, представляет собой антитело к CD28. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, или средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, не содержит гранулу. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, содержит антитело к CD3, ковалентно присоединенное к коллоидной полимерной наноматрице. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, содержит антитело к CD28, ковалентно присоединенное к коллоидной полимерной наноматрице. В некоторых вариантах осуществления средство, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и средство, которое стимулирует костимулирующую молекулу, содержат TransAct™ для T-клеток.In some embodiments, an agent that stimulates a CD3/TCR complex is an agent that stimulates CD3. In some embodiments, an agent that stimulates a costimulatory molecule is an agent that stimulates CD28, ICOS, CD27, HVEM, LIGHT, CD40, 4-1BB, OX40, DR3, GITR, CD30, TIM1, CD2, CD226, or any combination thereof. In some embodiments, an agent that stimulates a costimulatory molecule is an agent that stimulates CD28. In some embodiments, an agent that stimulates a CD3/TCR complex is selected from an antibody (e.g., a single domain antibody (e.g., a single heavy chain variable domain antibody), a peptibody, a Fab fragment, or an scFv), a small molecule, or a ligand (e.g., a naturally occurring, recombinant, or chimeric ligand). In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex is an antibody. In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex is an anti-CD3 antibody. In some embodiments, the agent that stimulates the costimulatory molecule is selected from an antibody (e.g., a single domain antibody (e.g., a single heavy chain variable domain antibody), a peptibody, a Fab fragment, or an scFv), a small molecule, or a ligand (e.g., a naturally occurring, recombinant, or chimeric ligand). In some embodiments, the agent that stimulates the costimulatory molecule is an antibody. In some embodiments, the agent that stimulates the costimulatory molecule is an anti-CD28 antibody. In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex or the agent that stimulates the costimulatory molecule does not comprise a bead. In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex comprises an anti-CD3 antibody covalently attached to a colloidal polymeric nanomatrix. In some embodiments, the agent that stimulates the costimulatory molecule comprises an anti-CD28 antibody covalently attached to a colloidal polymeric nanomatrix. In some embodiments, the agent that stimulates the CD3/TCR complex and the agent that stimulates the costimulatory molecule comprise TransAct™ for T cells.
В некоторых вариантах осуществления матрица содержит полимерный, например, биоразлагаемый или биосовместимый, инертный материал, например, который является нетоксичным для клеток, или состоит из такого материала. В некоторых вариантах осуществления матрица состоит из гидрофильных полимерных цепей, которые достигают максимальной подвижности в водном растворе благодаря гидратации цепей. В некоторых вариантах осуществления подвижная матрица может состоять из композиций на основе коллагена, очищенных белков, очищенных пептидов, полисахаридов, гликозаминогликанов или внеклеточного матрикса. Полисахарид может включать, например, простые эфиры целлюлозы, крахмал, аравийскую камедь, агарoзу, декстран, хитозан, гиалуроновую кислоту, пектины, ксантан, гуаровую камедь или альгинат. Другие полимеры могут включать сложные полиэфиры, простые полиэфиры, полиакрилаты, полиакриламиды, полиамины, полиэтиленимины, полимеры поликватерниумы, полифосфазены, поливиниловые спирты, поливинилацетаты, поливинилпирролидоны, блок-сополимеры или полиуретаны. В некоторых вариантах осуществления подвижная матрица представляет собой полимер декстран.In some embodiments, the matrix comprises a polymeric, such as biodegradable or biocompatible, inert material, such as one that is non-toxic to cells, or consists of such a material. In some embodiments, the matrix consists of hydrophilic polymer chains that achieve maximum mobility in an aqueous solution due to chain hydration. In some embodiments, the mobile matrix can consist of collagen-based compositions, purified proteins, purified peptides, polysaccharides, glycosaminoglycans, or an extracellular matrix. The polysaccharide can include, for example, cellulose ethers, starch, acacia, agarose, dextran, chitosan, hyaluronic acid, pectins, xanthan, guar gum, or alginate. Other polymers may include polyesters, polyethers, polyacrylates, polyacrylamides, polyamines, polyethyleneimines, polyquaternium polymers, polyphosphazenes, polyvinyl alcohols, polyvinyl acetates, polyvinylpyrrolidones, block copolymers, or polyurethanes. In some embodiments, the mobile matrix is a dextran polymer.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты (например, одной или несколькими молекулами нуклеиновой кислоты), кодирующей CAR (например, один или несколько CAR). В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток трансдуцируют с помощью молекулы ДНК (например, одной или нескольких молекул ДНК), кодирующей CAR (например, один или несколько CAR).In some embodiments, the population of cells is contacted with a nucleic acid molecule (e.g., one or more nucleic acid molecules) encoding a CAR (e.g., one or more CARs). In some embodiments, the population of cells is transduced with a DNA molecule (e.g., one or more DNA molecules) encoding a CAR (e.g., one or more CARs).
В некоторых вариантах осуществления в случае котрансдукции двумя молекулами нуклеиновой кислоты (например, лентивирусными векторами), каждая из которых кодирует CAR, раскрытый в данном документе (например, одной молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR для BCMA, и одной молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR для CD19, раскрытые в данном документе), каждый из векторов, содержащих молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие CAR, можно добавлять в реакционную смесь (например, содержащую популяцию клеток) при различной множественности заражения (MOI).In some embodiments, when co-transducing with two nucleic acid molecules (e.g., lentiviral vectors) each encoding a CAR disclosed herein (e.g., one nucleic acid molecule encoding a CAR for BCMA and one nucleic acid molecule encoding a CAR for CD19, disclosed herein), each of the vectors containing the nucleic acid molecules encoding the CARs can be added to a reaction mixture (e.g., containing a population of cells) at a different multiplicity of infection (MOI).
Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что в некоторых вариантах осуществления с использование различных MOI для векторов, содержащих молекулы нуклеиновой кислоты, которые кодируют различные молекулы CAR, может влиять на конечный состав клеточной популяции. Например, в случае котрансдукции лентивирусным вектором, кодирующим CAR для BCMA, и лентивирусным вектором, кодирующим CAR для CD19, можно использовать различные MOI для доведения до максимума процента моно-BCMA-CAR-Т-клеток и CAR-Т-клеток с двойной специфичностью к BCMA/CD19 с получением при этом меньшего количества моно-CD19-CAR-T-клеток и нетрансдуцированных клеток.Without being limited by theory, it is believed that in some embodiments, using different MOIs for vectors containing nucleic acid molecules that encode different CAR molecules can affect the final composition of the cell population. For example, in the case of cotransduction with a lentiviral vector encoding a CAR for BCMA and a lentiviral vector encoding a CAR for CD19, different MOIs can be used to maximize the percentage of mono-BCMA CAR T cells and BCMA/CD19 dual-specific CAR T cells while producing fewer mono-CD19 CAR T cells and untransduced cells.
В некоторых вариантах осуществления в случае котрансдукции лентивирусным вектором, кодирующим CAR для BCMA, и лентивирусным вектором, кодирующим CAR для CD19, популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором при множественности заражения (MOI), которая больше, равняется или меньше MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором при множественности заражения (MOI), которая больше MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором.In some embodiments, in the case of cotransduction with a lentiviral vector encoding a CAR for BCMA and a lentiviral vector encoding a CAR for CD19, the population of cells is contacted with the first viral vector at a multiplicity of infection (MOI) that is greater than, equal to, or less than the MOI at which the population of cells is contacted with the second viral vector. In some embodiments, the population of cells is contacted with the first viral vector at a multiplicity of infection (MOI) that is greater than the MOI at which the population of cells is contacted with the second viral vector.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором при первой MOI и со вторым вирусным вектором при второй MOI, так что полученная в результате популяция клеток содержит первую популяцию клеток, которые содержат CAR для BCMA, но не CAR для CD19, вторую популяцию клеток, которые содержат CAR для CD19, но не CAR для BCMA, и третью популяцию клеток, которые содержат как CAR для BCMA, так и CAR для CD19, где:In some embodiments, the population of cells is contacted with a first viral vector at a first MOI and with a second viral vector at a second MOI, such that the resulting population of cells comprises a first population of cells that contain a CAR for BCMA but not a CAR for CD19, a second population of cells that contain a CAR for CD19 but not a CAR for BCMA, and a third population of cells that contain both a CAR for BCMA and a CAR for CD19, where:
(a) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(a) the total number of viable cells in the combined second and third populations is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(b) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000% , 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(b) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the combined second and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(c) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 5% (например, больше или равняется приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90%) от общего количества жизнеспособных клеток в полученной в результате популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(c) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 5% (e.g., greater than or equal to about 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, or 90%) of the total number of viable cells in the resulting population, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(d) общее количество жизнеспособных клеток во второй популяции меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10; или(d) the total number of viable cells in the second population is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10; or
(e) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000% , 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток во второй популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10.(e) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the second population, e.g., when determined by the method described in Example 10.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором при MOI, например, MOI, которая достаточно ниже, чем MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором, так что в полученной в результате популяции клеток:In some embodiments, the population of cells is contacted with a second viral vector at an MOI, such as an MOI that is sufficiently lower than the MOI at which the population of cells is contacted with the first viral vector, such that the resulting population of cells:
(a) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(a) the total number of viable cells in the combined second and third populations is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(b) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(b) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the combined second and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(c) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 5% (например, больше или равняется приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90%) от общего количества жизнеспособных клеток в полученной в результате популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(c) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 5% (e.g., greater than or equal to about 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, or 90%) of the total number of viable cells in the resulting population, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(d) общее количество жизнеспособных клеток во второй популяции меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10; или(d) the total number of viable cells in the second population is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10; or
(e) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток во второй популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10.(e) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the second population, e.g., when determined by the method described in Example 10.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором при первой MOI и популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором при второй MOI, так что полученная в результате популяция клеток содержит:In some embodiments, the population of cells is contacted with a first viral vector at a first MOI and the population of cells is contacted with a second viral vector at a second MOI, such that the resulting population of cells comprises:
(a) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(a) the total number of viable cells in the combined second and third populations is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(b) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000% , 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(b) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the combined second and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(c) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 5% (например, больше или равняется приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90%) от общего количества жизнеспособных клеток в полученной в результате популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10;(c) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 5% (e.g., greater than or equal to about 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, or 90%) of the total number of viable cells in the resulting population, e.g., when determined by the method described in Example 10;
(d) общее количество жизнеспособных клеток во второй популяции меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10; или(d) the total number of viable cells in the second population is less than or equal to about 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations, e.g., when determined by the method described in Example 10; or
(e) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток во второй популяции, например, при определении посредством способа, описанного в примере 10.(e) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the second population, e.g., when determined by the method described in Example 10.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт сIn some embodiments, the population of cells is contacted with
(a) первым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 1 до приблизительно 10 (например, от приблизительно 2 до приблизительно 9, от приблизительно 3 до приблизительно 8, от приблизительно 4 до приблизительно 7, от приблизительно 5 до приблизительно 6, от приблизительно 1 до приблизительно 8, от приблизительно 1 до приблизительно 6, от приблизительно 1 до приблизительно 4, от приблизительно 8 до приблизительно 10, от приблизительно 6 до приблизительно 10, от приблизительно 4 до приблизительно 10, от приблизительно 1 до приблизительно 3, от приблизительно 2 до приблизительно 4, от приблизительно 3 до приблизительно 5, от приблизительно 4 до приблизительно 6, от приблизительно 5 до приблизительно 7, от приблизительно 6 до приблизительно 8, от приблизительно 7 до приблизительно до приблизительно 9, от приблизительно 8 до приблизительно 10, от приблизительно 2,5 до приблизительно 5, приблизительно 1, приблизительно 2, приблизительно 3, приблизительно 4, приблизительно 5, приблизительно 6, приблизительно 7, приблизительно 8, приблизительно 9 или приблизительно 10);(a) a first viral vector at an MOI of from about 1 to about 10 (e.g., from about 2 to about 9, from about 3 to about 8, from about 4 to about 7, from about 5 to about 6, from about 1 to about 8, from about 1 to about 6, from about 1 to about 4, from about 8 to about 10, from about 6 to about 10, from about 4 to about 10, from about 1 to about 3, from about 2 to about 4, from about 3 to about 5, from about 4 to about 6, from about 5 to about 7, from about 6 to about 8, from about 7 to about 9, from about 8 to about 10, from about 2.5 to about 5, about 1, about 2, about 3, about 4, about 5, about 6, about 7, about 8, about 9, or about 10);
(b) вторым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 0,1 до приблизительно 5 (например, от приблизительно 0,2 до приблизительно 4, от приблизительно 0,3 до приблизительно 3, от приблизительно 0,4 до приблизительно 2, от приблизительно 0,5 до приблизительно 1, от приблизительно 0,6 до приблизительно 0,9, от приблизительно 0,7 до приблизительно 0,8, от приблизительно 0,1 до приблизительно 4, от приблизительно 0,1 до приблизительно 3, от приблизительно 0,1 до приблизительно 2, от приблизительно 0,1 до приблизительно 1, от приблизительно 0,1 до приблизительно 0,5, от приблизительно 4 до приблизительно 5, от приблизительно 3 до приблизительно 5, от приблизительно 2 до приблизительно 5, от приблизительно 1 до приблизительно 5, от приблизительно 0,5 до приблизительно 5, от приблизительно 0,2 до приблизительно 5, от приблизительно 0,1 до приблизительно 0,5, от приблизительно 0,2 до приблизительно 1, от приблизительно 0,5 до приблизительно 2, от приблизительно 1 до приблизительно 3, от приблизительно 2 до приблизительно 4, от приблизительно 3 до приблизительно 5, от приблизительно 0,5 до приблизительно 1, приблизительно 0,1, приблизительно 0,2, приблизительно 0,3, приблизительно 0,4, приблизительно 0,5, приблизительно 0,6, приблизительно 0,7, приблизительно 0,8, приблизительно 0,9, приблизительно 1, приблизительно 2, приблизительно 3, приблизительно 4 или приблизительно 5);(b) a second viral vector at an MOI of from about 0.1 to about 5 (e.g., from about 0.2 to about 4, from about 0.3 to about 3, from about 0.4 to about 2, from about 0.5 to about 1, from about 0.6 to about 0.9, from about 0.7 to about 0.8, from about 0.1 to about 4, from about 0.1 to about 3, from about 0.1 to about 2, from about 0.1 to about 1, from about 0.1 to about 0.5, from about 4 to about 5, from about 3 to about 5, from about 2 to about 5, from about 1 to about 5, from about 0.5 to about 5, from about 0.2 to about 5, from about 0.1 to about 0.5, from about 0.2 to about 1, from about 0.5 up to about 2, from about 1 to about 3, from about 2 to about 4, from about 3 to about 5, from about 0.5 to about 1, about 0.1, about 0.2, about 0.3, about 0.4, about 0.5, about 0.6, about 0.7, about 0.8, about 0.9, about 1, about 2, about 3, about 4, or about 5);
(c) первым вирусным вектором при MOI, составляющей по меньшей мере приблизительно 10% (например, по меньшей мере приблизительно 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90%) от MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором, или в по меньшей мере приблизительно 1 раз (например, в по меньшей мере приблизительно 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, или 100 раз, например, от приблизительно 2 до приблизительно 50 раз, от приблизительно 3 до 20 раз, от приблизительно 5 до приблизительно 15 раз или от приблизительно 8 до приблизительно 10 раз) выше нее; и/или(c) a first viral vector at an MOI that is at least about 10% (e.g., at least about 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, or 90%) of the MOI at which the population of cells is contacted with a second viral vector, or at least about 1-fold (e.g., at least about 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, or 100-fold, such as about 2 to about 50-fold, about 3 to 20-fold, about 5 to about 15-fold, or about 8 to about 10-fold) greater therefrom; and/or
(d) вторым вирусным вектором при MOI, которая составляет не более чем 1/X, где X равняется 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 15, 20, 30, 40, 50, 60, 70. 80, 90, или 100, от MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором.(d) a second viral vector at an MOI that is no more than 1/X, where X is 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 15, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, or 100, of the MOI at which the cell population is contacted with the first viral vector.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 2,5 до приблизительно 5. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 0,5 до приблизительно 1,0. В некоторых вариантах осуществления MOI для первого вирусного вектора в от приблизительно 8 до приблизительно 10 раз выше, чем MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт со вторым вирусным вектором. В некоторых вариантах осуществления MOI для второго вирусного вектора составляет не более чем 1/X, где X равняется 6, 8, 10 или 12, от MOI, при которой популяцию клеток приводят в контакт с первым вирусным вектором.In some embodiments, the population of cells is contacted with the first viral vector at an MOI of about 2.5 to about 5. In some embodiments, the population of cells is contacted with the second viral vector at an MOI of about 0.5 to about 1.0. In some embodiments, the MOI for the first viral vector is about 8 to about 10 times higher than the MOI at which the population of cells is contacted with the second viral vector. In some embodiments, the MOI for the second viral vector is no more than 1/X, where X is 6, 8, 10, or 12, of the MOI at which the population of cells is contacted with the first viral vector.
В некоторых вариантах осуществления на стадии (ii) популяцию клеток приводят в контакт с:In some embodiments, in step (ii), the population of cells is contacted with:
(a) первым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 4 до приблизительно 5 (например, приблизительно 4,75); и/или(a) a first viral vector at an MOI of from about 4 to about 5 (e.g., about 4.75); and/or
(b) вторым вирусным вектором при MOI, составляющей от приблизительно 0,2 до приблизительно 1 (например, приблизительно 0,5).(b) a second viral vector at an MOI of from about 0.2 to about 1 (e.g., about 0.5).
В некоторых вариантах осуществления на стадии (ii) популяция клеток содержит от приблизительно 1×108 до приблизительно 5×109 (например, от приблизительно 2×108 до приблизительно 2×109 или от приблизительно 4×108 до приблизительно 1×109) всех жизнеспособных клеток. В некоторых вариантах осуществления клетки суспендированы в культуре при концентрации, составляющей от приблизительно 1×106 до приблизительно 1 ×107 (например, от приблизительно 2×106 до приблизительно 5 ×106 или от приблизительно 3×106 до приблизительно 4 ×106) жизнеспособных клеток/мл.In some embodiments, in step (ii), the population of cells comprises from about 1×10 8 to about 5×10 9 (e.g., from about 2×10 8 to about 2×10 9 or from about 4×10 8 to about 1×10 9 ) total viable cells. In some embodiments, the cells are suspended in culture at a concentration of from about 1×10 6 to about 1×10 7 (e.g., from about 2×10 6 to about 5×10 6 or from about 3×10 6 to about 4×10 6 ) viable cells/mL.
Точную MOI, используемую для каждого вектора, можно корректировать или определять на основании ряда факторов, включающих без ограничения свойства партии вирусного вектора, характеристики клеток, подлежащих трансдукции, и эффективность трансдукции. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит одновременно с приведением популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, 18, 17, 16, 15, 14, 13, 12, 11, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1, или 0,5 часа после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 20 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 19 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 18 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 17 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 16 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 15 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 14 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 14 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 13 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 12 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 11 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 10 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 9 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 8 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 7 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 6 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 5 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 4 часа после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 3 часа после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, происходит не позже чем через 2 часа после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 1 час после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты, кодирующей(кодирующими) CAR, происходит не позже чем через 30 минут после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. The precise MOI used for each vector can be adjusted or determined based on a number of factors, including, but not limited to, the properties of the viral vector batch, the characteristics of the cells to be transduced, and the transduction efficiency. In some embodiments, contacting the cell population with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs simultaneously with contacting the cell population with an agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or an agent that stimulates a costimulatory molecule on the cell surface, as described above. In some embodiments, contacting the cell population with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, 18, 17, 16, 15, 14, 13, 12, 11, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1, or 0.5 hours after the start of contacting the cell population with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates a costimulatory molecule on the cell surface, as described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 20 hours after the start of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 19 hours after the start of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above. In some embodiments, contacting the cell population with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 18 hours after the initiation of contacting the cell population with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above. In some embodiments, contacting the cell population with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 17 hours after the initiation of contacting the cell population with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above. In some embodiments, contacting the cell population with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 16 hours after the initiation of contacting the cell population with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above. In some embodiments, contacting the cell population with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 15 hours after the initiation of contacting the cell population with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 14 hours after the initiation of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 14 hours after the initiation of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 13 hours after the start of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 12 hours after the start of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 11 hours after the start of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 10 hours after the start of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above. In some embodiments, contacting the cell population with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 9 hours after the initiation of contacting the cell population with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above. In some embodiments, contacting the cell population with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 8 hours after the initiation of contacting the cell population with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above. In some embodiments, contacting the cell population with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 7 hours after the initiation of contacting the cell population with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above. In some embodiments, contacting the cell population with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 6 hours after the initiation of contacting the cell population with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 5 hours after the start of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 4 hours after the start of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above. In some embodiments, contacting the population of cells with a nucleic acid molecule(s) encoding a CAR occurs no later than 3 hours after the start of contacting the population of cells with an agent that stimulates a CD3/TCR complex and/or an agent that stimulates a costimulatory molecule on the surface of cells, as described above. In some embodiments, contacting the population of cells with a nucleic acid molecule encoding a CAR occurs no later than 2 hours after the start of contacting the population of cells with an agent that stimulates a CD3/TCR complex and/or an agent that stimulates a costimulatory molecule on the surface of cells, as described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 1 hour after the start of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above. In some embodiments, contacting the population of cells with the nucleic acid molecule(s) encoding the CAR occurs no later than 30 minutes after the start of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения.In some embodiments, the cell population is collected for storage or administration.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 72, 60, 48, 36, 32, 31, 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, или 18 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 26 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 25 часов после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 24 часа после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 23 часа после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 22 часа после начала приведения популяции клеток в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше.In some embodiments, the population of cells is collected for storage or administration no later than 72, 60, 48, 36, 32, 31, 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, or 18 hours after the initiation of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above. In some embodiments, the population of cells is collected for storage or administration no later than 26 hours after the initiation of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of the cells described above. In some embodiments, the population of cells is collected for storage or administration no later than 25 hours after the initiation of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of cells described above. In some embodiments, the population of cells is collected for storage or administration no later than 24 hours after the initiation of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of cells described above. In some embodiments, the population of cells is collected for storage or administration no later than 23 hours after the initiation of contacting the population of cells with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the surface of cells described above. In some embodiments, the cell population is collected for storage or administration no later than 22 hours after the cell population is first exposed to the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток не размножают ex vivo.In some embodiments, the cell population is not expanded ex vivo.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, или 60%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 5%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 15%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 20%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 25%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 30%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 35%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 40%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток, описанными выше.In some embodiments, the cell population is expanded to an increase in number of no more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, or 60%, such as as assessed by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates a costimulatory molecule on the surface of the cells, as described above. In some embodiments, the cell population is expanded by no more than 5% increase in number, such as as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface, as described above. In some embodiments, the cell population is expanded by no more than 10% increase in number, such as as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface, as described above. In some embodiments, the cell population is expanded by no more than 15% increase in number, such as as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface, as described above. In some embodiments, the cell population is expanded by no more than 20% increase in number, for example, as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface, as described above. In some embodiments, the cell population is expanded by no more than 25% increase in number, for example, as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface, as described above. In some embodiments, the cell population is expanded by no more than 30% increase in number, for example, as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface, as described above. In some embodiments, the cell population is expanded to an increase in number of no more than 35%, for example, as measured by the number of living cells, compared to the cell population before it was contacted with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above. In some embodiments, the cell population is expanded to an increase in number of no more than 40%, for example, as measured by the number of living cells, compared to the cell population before it was contacted with the agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or the agent that stimulates the costimulatory molecule on the cell surface described above.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают в течение не более чем 1, 1,5, 2, 2,5, 3, 3,5, 4, 4,5, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 16, 20, 24, 36, или 48 часов, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше.In some embodiments, the cell population is expanded for no more than 1, 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5, 4, 4.5, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 16, 20, 24, 36, or 48 hours, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population before it was exposed to one or more cytokines described above.
В некоторых вариантах осуществления способ с использованием активации осуществляют в бессывороточных средах для клеток. В некоторых вариантах осуществления способ с использованием активации осуществляют в средах для клеток, содержащих один или несколько цитокинов, выбранных из IL-2, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) или IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra). В некоторых вариантах осуществления hetIL-15 содержит аминокислотную последовательность NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTSITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSTVTTAGVTPQPESLSPSGKEPAASSPSSNNTAATTAAIVPGSQLMPSKSPSTGTTEISSHESSHGTPSQTTAKNWELTASASHQPPGVYPQG (SEQ ID NO: 309). В некоторых вариантах осуществления hetIL-15 содержит аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере приблизительно 70, 75, 80, 85, 90, 95 или 99% идентичностью с SEQ ID NO: 309. В некоторых вариантах осуществления способ с использованием активации осуществляют в средах для клеток, содержащих ингибитор LSD1. В некоторых вариантах осуществления способ с использованием активации осуществляют в средах для клеток, содержащих ингибитор MALT1. В некоторых вариантах осуществления бессывороточные среды для клеток содержат заменитель сыворотки. В некоторых вариантах осуществления заменитель сыворотки представляет собой заменитель сыворотки для иммунных клеток (ICSR) CTS™. В некоторых вариантах осуществления уровень ICSR может составлять, например, вплоть до 5%, например, приблизительно 1%, 2%, 3%, 4% или 5%. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что применение сред для клеток, например, сред для быстрого изготовления, показанных в таблице 21 или таблице 25, содержащих ICSR, например, 2% ICSR, может обеспечивать улучшение жизнеспособности клеток в ходе способа изготовления, описанного в данном документе.In some embodiments, the method using activation is performed in serum-free cell media. In some embodiments, the method using activation is performed in cell media containing one or more cytokines selected from IL-2, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) or IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra). In some embodiments, hetIL-15 comprises the amino acid sequence NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTSITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSTVTTAGVTPQPESLSPSGKEPAASSPSSNNTAATTAAIVPGSQLMPSKSPSTGTTEISSHESSHGTPSQTTAKNWELTASASHQPPGVYPQG (SEQ ID NO: 309). In some embodiments, hetIL-15 comprises an amino acid sequence having at least about 70, 75, 80, 85, 90, 95, or 99% identity to SEQ ID NO: 309. In some embodiments, the method using activation is performed in cell media comprising an LSD1 inhibitor. In some embodiments, the method using activation is performed in cell media comprising a MALT1 inhibitor. In some embodiments, the serum-free cell media comprises a serum substitute. In some embodiments, the serum substitute is CTS™ Immune Cell Serum Replacer (ICSR). In some embodiments, the ICSR level can be, for example, up to 5%, such as about 1%, 2%, 3%, 4%, or 5%. Without being limited by theory, it is believed that the use of cell media, such as the rapid media shown in Table 21 or Table 25, containing ICSR, such as 2% ICSR, may provide improved cell viability during the manufacturing process described herein.
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрены способы получения популяции клеток (например, T-клеток), которые экспрессируют химерный антигенный рецептор (CAR), включающие (a) получение образца, полученного путем афереза (например, свежего или криоконсервированного образца, полученного путем лейкафереза), собранного у субъекта; (b) отбор T-клеток из образца, полученного путем афереза (например, с помощью отрицательного отбора, положительного отбора или отбора без гранул); (c) высевание выделенных T-клеток при, например, от 1×106 до 1×07 клеток/мл; (d) приведение T-клеток в контакт со средством, которое стимулирует T-клетки, например, средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR, и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток (например, приведение T-клеток в контакт с антителом к CD3 и/или антителом к CD28, например, приведение T-клеток в контакт с TransAct); (e) приведение T-клеток в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты (например, молекулой ДНК или РНК), кодирующей(кодирующими) CAR (например, приведение T-клеток в контакт с вирусом, содержащим молекулу(молекулы) нуклеиновой кислоты, кодирующую(кодирующие) CAR), в течение, например, 6-48 часов, например, 20-28 часов; и (f) промывание и сбор T-клеток для хранения (например, повторного составления T-клеток в среде для криоконсервации) или введения. В некоторых вариантах осуществления стадию (f) проводят не позже чем через 30 часов после начала стадии (d) или (e), например, не позже чем через 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 или 30 часов после начала стадии (d) или (e).In some embodiments, the present invention provides methods for producing a population of cells (e.g., T cells) that express a chimeric antigen receptor (CAR), comprising (a) obtaining an apheresis sample (e.g., a fresh or cryopreserved leukapheresis sample) collected from a subject; (b) selecting T cells from the apheresis sample (e.g., using negative selection, positive selection, or bead-free selection); (c) seeding the isolated T cells at, e.g., 1×10 6 to 1×0 7 cells/mL; (d) contacting the T cells with an agent that stimulates the T cells, such as an agent that stimulates the CD3/TCR complex and/or an agent that stimulates a costimulatory molecule on the surface of the cells (e.g. contacting the T cells with an anti-CD3 antibody and/or an anti-CD28 antibody, such as contacting the T cells with TransAct); (e) contacting the T cells with a nucleic acid molecule(s) (e.g. a DNA or RNA molecule) encoding the CAR (e.g. contacting the T cells with a virus containing a nucleic acid molecule(s) encoding the CAR) for, such as 6-48 hours, such as 20-28 hours; and (f) washing and collecting the T cells for storage (e.g. reconstitution of the T cells in cryopreservation medium) or administration. In some embodiments, step (f) is performed no later than 30 hours after the start of step (d) or (e), such as no later than 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, or 30 hours after the start of step (d) or (e).
В некоторых вариантах осуществления в данном документе предусмотрена популяция клеток (например, иммунных эффекторных клеток, например, Т-клеток или NK-клеток), полученных посредством любого из способов изготовления, описанных в данном документе (например, способа с использованием активации, описанного в данном документе).In some embodiments, provided herein is a population of cells (e.g., immune effector cells, such as T cells or NK cells) produced by any of the manufacturing methods described herein (e.g., a method using activation described herein).
В некоторых вариантах осуществления процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток, в популяции клеток в конце способа изготовления (например, в конце способа с использованием цитокинов или способа с использованием активации, описанных в данном документе) (1) является такой же, (2) отличается, например, на не более чем 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, или 15%, или (3) является увеличенной, например, на по меньшей мере 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25%, по сравнению с процентной долей необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ клеток, в популяции клеток в начале способа изготовления (например, в начале способа с использованием цитокинов или способа с использованием активации, описанных в данном документе). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток в конце способа изготовления (например, в конце способа с использованием цитокинов или способа с использованием активации, описанных в данном документе) демонстрирует более высокую процентную долю необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток (например, на по меньшей мере 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, или 50% выше), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, продолжительность которого составляет, например, более 26 часов (например, продолжительность которого составляет более 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней) или который предусматривает размножение популяции клеток in vitro в течение, например, более чем 3 дней (например, размножение популяции клеток in vitro в течение 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, или 15 дней).In some embodiments, the percentage of naive cells, e.g., naive T cells, e.g., CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells, in the cell population at the end of the method of manufacture (e.g., at the end of the cytokine-using method or the activation-using method described herein) (1) is the same, (2) is different, e.g., by no more than 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, or 15%, or (3) is increased, e.g., by at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, or 25%, compared to the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ cells, in a population of cells at the start of a manufacturing method (e.g., at the start of a cytokine-based method or an activation-based method described herein). In some embodiments, the cell population at the end of the manufacturing method (e.g., the end of the cytokine-based method or the activation-based method described herein) exhibits a higher percentage of naive cells, e.g., naive T cells, e.g., CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells (e.g., at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, or 50% higher), compared to cells obtained by an otherwise similar method that lasts, e.g., more than 26 hours (e.g., lasts more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days) or that involves expanding the cell population in vitro for, for example, more than 3 days (e.g., expansion of a cell population in vitro for 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, or 15 days).
В некоторых вариантах осуществления процентная доля необученных клеток, например, необученных Т-клеток, например, CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T-клеток, в популяции клеток в конце способа изготовления (например, в конце способа с использованием цитокинов или способа с использованием активации, описанных в данном документе) составляет не менее 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55 или 60%.In some embodiments, the percentage of naive cells, such as naive T cells, such as CD45RA+ CD45RO- CCR7+ T cells, in the cell population at the end of the manufacturing method (e.g., at the end of the cytokine-based method or the activation-based method described herein) is at least 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, or 60%.
В некоторых вариантах осуществления процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток в конце способа изготовления (например, в конце способа с использованием цитокинов или способа с использованием активации, описанных в данном документе) (1) является такой же, (2) отличается, например, на не более чем 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, или 15%, или (3) является уменьшенной, например, на по меньшей мере 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, или 25%, по сравнению с процентной долей центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти, в популяции клеток в начале способа изготовления (например, в начале способа с использованием цитокинов или способа с использованием активации, описанных в данном документе). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток в конце способа изготовления (например, в конце способа с использованием цитокинов или способа с использованием активации, описанных в данном документе) демонстрирует более низкую процентную долю центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, CD95+ центральных Т-клеток памяти (например, на по меньшей мере 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, или 50% ниже), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, продолжительность которого составляет, например, более 26 часов (например, продолжительность которого составляет более 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней) или который предусматривает размножение популяции клеток in vitro в течение, например, более чем 3 дней (например, размножение популяции клеток in vitro в течение 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, или 15 дней).In some embodiments, the percentage of central memory cells, e.g. central memory T cells, e.g. CD95+ central memory T cells, in the cell population at the end of the method of manufacture (e.g., at the end of the method using cytokines or the method using activation described herein) (1) is the same, (2) is different, e.g., by no more than 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, or 15%, or (3) is reduced, e.g., by at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, or 25%, compared to the percentage of central memory cells, e.g. central T cells memory, such as CD95+ central memory T cells, in a population of cells at the start of the manufacturing method (e.g., at the start of the cytokine-based method or the activation-based method described herein). In some embodiments, the cell population at the end of the method of manufacture (e.g., the end of the cytokine-based method or the activation-based method described herein) exhibits a lower percentage of central memory cells, e.g., central memory T cells, e.g., CD95+ central memory T cells (e.g., at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, or 50% lower), compared to cells obtained by an otherwise similar method that lasts, e.g., more than 26 hours (e.g., lasts more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days) or that involves expanding the cell population in vitro for, e.g., more than 3 days (e.g., expanding a cell population in vitro for 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, or 15 days).
В некоторых вариантах осуществления процентная доля центральных клеток памяти, например, центральных T-клеток памяти, например, центральных CD95+ Т-клеток памяти, в популяции клеток в конце способа изготовления (например, в конце способа с использованием цитокинов или способа с использованием активации, описанных в данном документе) составляет не более 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75 или 80%.In some embodiments, the percentage of central memory cells, such as central memory T cells, such as central memory CD95+ T cells, in the cell population at the end of the manufacturing method (e.g., at the end of the cytokine-based method or the activation-based method described herein) is no more than 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, or 80%.
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток в конце способа изготовления (например, в конце способа с использованием цитокинов или способа с использованием активации, описанных в данном документе) после введения in vivo персистирует дольше или размножается на более высоком уровне (например, на по меньшей мере 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, или 90% более высоком) по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, продолжительность которого составляет, например, более 26 часов (например, продолжительность которого составляет более 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 дней) или который предусматривает размножение популяции клеток in vitro в течение, например, более чем 3 дней (например, размножение популяции клеток in vitro в течение 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, или 15 дней).In some embodiments, the cell population at the end of the method of manufacture (e.g., at the end of the cytokine-based method or the activation-based method described herein) after in vivo administration persists longer or expands at a higher level (e.g., at least 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, or 90% higher) than cells produced by an otherwise similar method that lasts, e.g., more than 26 hours (e.g., lasts more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, or 12 days) or that involves expanding the cell population in vitro for, e.g., more than 3 days (e.g., expanding the cell population in vitro for 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, or 15 days).
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток была обогащена клетками, экспрессирующими IL6R (например, клетками, которые являются положительными по IL6Rα и/или IL6Rβ), до начала способа изготовления (например, до начала способа с использованием цитокинов или способа с использованием активации, описанных в данном документе). В некоторых вариантах осуществления популяция клеток содержит, например, не менее 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75 или 80% клеток, экспрессирующих IL6R (например, клеток, которые являются положительными по IL6Rα и/или IL6Rβ), в начале способа изготовления (например, в начале способа с использованием цитокинов или способа с использованием активации, описанных в данном документе).In some embodiments, the cell population is enriched in IL6R expressing cells (e.g., cells that are positive for IL6Rα and/or IL6Rβ) prior to the start of the manufacturing method (e.g., prior to the start of the cytokine method or the activation method described herein). In some embodiments, the cell population comprises, e.g., at least 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, or 80% IL6R expressing cells (e.g., cells that are positive for IL6Rα and/or IL6Rβ) at the start of the manufacturing method (e.g., at the start of the cytokine method or the activation method described herein).
Способ с использованием цитокиновMethod using cytokines
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрены способы получения популяции клеток (например, T-клеток), которые экспрессируют химерный антигенный рецептор (CAR) (например, один или несколько CAR, например, два CAR), включающие (1) приведение популяции клеток в контакт с цитокином, выбранным из IL-2, IL-7, IL-15, IL-21, IL-6 или их комбинации, (2) приведение популяции клеток (например, T-клеток) в контакт с молекулой(молекулами) нуклеиновой кислоты (например, молекулой ДНК или РНК), кодирующей(кодирующими) CAR, за счет чего обеспечивается получение популяции клеток (например, T-клеток), содержащих молекулу нуклеиновой кислоты, и (3) сбор популяции клеток (например, T-клеток) для хранения (например, повторного составления популяции клеток в среде для криоконсервации) или введения, где (a) стадию (2) проводят вместе со стадией (1) или не позже чем через 5 часов после начала стадии (1), например, не позже чем через 1, 2, 3, 4 или 5 часов после начала стадии (1), и стадию (3) проводят не позже чем через 26 часов после начала стадии (1), например, не позже чем через 22, 23 или 24 часа после начала стадии (1), например, не позже чем через 24 часа после начала стадии (1), или (b) популяция клеток из стадии (3) не является размножившейся или является размножившейся с увеличением численности на не более чем 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 или 40%, например, на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток в начале стадии (1). В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) представляет собой молекулу ДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) представляет собой молекулу РНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) находится в вирусном векторе, например, в вирусном векторе, выбранном из лентивирусного вектора, аденовирусного вектора или ретровирусного вектора. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) находится в невирусном векторе. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) находится в плазмиде. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты на стадии (2) не находится в каком-либо векторе. В некоторых вариантах осуществления стадия (2) включает трансдукцию популяции клеток (например, T-клеток) c помощью вирусного вектора, содержащего молекулу(молекулы) нуклеиновой кислоты, кодирующую(кодирующие) CAR. В некоторых вариантах осуществления клетки конструируют таким образом, чтобы они содержали молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую два CAR, раскрытых в данном документе (например, CAR для BCMA и CAR для CD19, раскрытые в данном документе). В некоторых вариантах осуществления клетки конструируют таким образом, чтобы они содержали молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе, например, CAR для BCMA/CD19 в формате диатела, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления клетки конструируют таким образом, чтобы они содержали две молекулы нуклеиновой кислоты, каждая из которых кодирует CAR, раскрытый в данном документе (например, одну молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR для BCMA, и одну молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую CAR для CD19).In some embodiments, the invention provides methods for producing a population of cells (e.g., T cells) that express a chimeric antigen receptor (CAR) (e.g., one or more CARs, such as two CARs), comprising (1) contacting the population of cells with a cytokine selected from IL-2, IL-7, IL-15, IL-21, IL-6, or a combination thereof, (2) contacting the population of cells (e.g., T cells) with a nucleic acid molecule(s) (e.g., a DNA or RNA molecule) encoding(s) the CAR, thereby producing a population of cells (e.g., T cells) comprising the nucleic acid molecule, and (3) harvesting the population of cells (e.g., T cells) for storage (e.g., reconstituting the population of cells in cryopreservation medium) or administration, wherein (a) step (2) is performed concurrently with step (1) or within 5 hours after the start of step (1), such as no later than 1, 2, 3, 4 or 5 hours after the start of step (1), and step (3) is performed no later than 26 hours after the start of step (1), such as no later than 22, 23 or 24 hours after the start of step (1), such as no later than 24 hours after the start of step (1), or (b) the cell population of step (3) is not expanded or is expanded by no more than 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 or 40%, such as no more than 10%, such as as assessed by the number of live cells, compared to the cell population at the start of step (1). In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is a DNA molecule. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is an RNA molecule. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is in a viral vector, such as a viral vector selected from a lentiviral vector, an adenoviral vector, or a retroviral vector. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is in a non-viral vector. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is in a plasmid. In some embodiments, the nucleic acid molecule of step (2) is not in any vector. In some embodiments, step (2) involves transducing a population of cells (e.g., T cells) with a viral vector comprising a nucleic acid molecule(s) encoding a CAR. In some embodiments, the cells are engineered to comprise a nucleic acid molecule encoding two CARs disclosed herein (e.g., a BCMA CAR and a CD19 CAR disclosed herein). In some embodiments, the cells are engineered to contain a nucleic acid molecule encoding a CAR in a diabody format disclosed herein, such as a CAR for BCMA/CD19 in a diabody format disclosed herein. In some embodiments, the cells are engineered to contain two nucleic acid molecules, each encoding a CAR disclosed herein (e.g., one nucleic acid molecule encoding a CAR for BCMA and one nucleic acid molecule encoding a CAR for CD19).
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток (например, T-клеток) собирают из образца, полученного путем афереза (например, образца, полученного путем лейкафереза) у субъекта.In some embodiments, a population of cells (e.g., T cells) is collected from a sample obtained by apheresis (e.g., a sample obtained by leukapheresis) from a subject.
В некоторых вариантах осуществления образец, полученный путем афереза (например, образец, полученный путем лейкафереза), собирают у субъекта и транспортируют в виде замороженного образца (например, криоконсервированного образца) в учреждение, осуществляющее изготовление клеток. Затем замороженный образец, полученный путем афереза, размораживают, и T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) отбирают из образца, полученного путем афереза, например, с помощью устройства для сортировки клеток (например, устройства CliniMACS® Prodigy®). Отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) затем высевают для изготовления CAR-T посредством способа с использованием цитокинов, описанного в данном документе. В некоторых вариантах осуществления в конце способа с использованием цитокинов CAR-T-клетки криоконсервируют и впоследствии размораживают и вводят субъекту. В некоторых вариантах осуществления отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) подвергают одному или нескольким циклам замораживания-размораживания перед высеванием для изготовления CAR-T.In some embodiments, an apheresis sample (e.g., a leukapheresis sample) is collected from a subject and transported as a frozen sample (e.g., a cryopreserved sample) to a cell manufacturing facility. The frozen apheresis sample is then thawed and T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are collected from the apheresis sample, such as using a cell sorting device (e.g., a CliniMACS® Prodigy® device). The collected T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are then seeded to manufacture CAR-T using the cytokine-based method described herein. In some embodiments, at the end of the cytokine-based method, the CAR-T cells are cryopreserved and subsequently thawed and administered to the subject. In some embodiments, selected T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are subjected to one or more freeze-thaw cycles prior to seeding to make CAR-T.
В некоторых вариантах осуществления образец, полученный путем афереза (например, образец, полученный путем лейкафереза), собирают у субъекта и транспортируют в виде свежего продукта (например, незамороженного продукта) в учреждение, осуществляющее изготовление клеток. T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) отбирают из образца, полученного путем афереза, например, с помощью устройства для сортировки клеток (например, устройства CliniMACS® Prodigy®). Отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) затем высевают для изготовления CAR-T посредством способа с использованием цитокинов, описанного в данном документе. В некоторых вариантах осуществления отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) подвергают одному или нескольким циклам замораживания-размораживания перед высеванием для изготовления CAR-T.In some embodiments, an apheresis sample (e.g., a leukapheresis sample) is collected from a subject and transported as a fresh product (e.g., a non-frozen product) to a cell manufacturing facility. T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are isolated from the apheresis sample, such as by a cell sorting device (e.g., a CliniMACS® Prodigy® device). The selected T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are then seeded to manufacture CAR-T using the cytokine-based method described herein. In some embodiments, the selected T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are subjected to one or more freeze-thaw cycles prior to seeding to manufacture CAR-T.
В некоторых вариантах осуществления у субъекта собирают образец, полученный путем афереза (например, образец, полученный путем лейкафереза). T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) отбирают из образца, полученного путем афереза, например, с помощью устройства для сортировки клеток (например, устройства CliniMACS® Prodigy®). Отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) затем транспортируют в виде замороженного образца (например, криоконсервированного образца) в учреждение, осуществляющее изготовление клеток. Отобранные T-клетки (например, CD4+ T-клетки и/или CD8+ T-клетки) впоследствии размораживают и высевают для изготовления CAR-T посредством способа с использованием цитокинов, описанного в данном документе.In some embodiments, an apheresis sample (e.g., a leukapheresis sample) is collected from a subject. T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are collected from the apheresis sample, such as using a cell sorting device (e.g., a CliniMACS® Prodigy® device). The collected T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are then transported as a frozen sample (e.g., a cryopreserved sample) to a cell manufacturing facility. The collected T cells (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) are subsequently thawed and seeded for CAR-T manufacturing using the cytokine-based method described herein.
В некоторых вариантах осуществления после высевания клеток (например, T-клеток) к клеткам добавляют один или несколько цитокинов (например, один или несколько цитокинов, выбранных из IL-2, IL-7, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21 или IL-6 (например, IL-6/sIL-6R)), а также вектор (например, лентивирусный вектор) (например, один или несколько векторов), кодирующий CAR (например, один или несколько CAR). После инкубирования в течение 20-24 часов клетки промывают и составляют для хранения или введения.In some embodiments, after seeding the cells (e.g., T cells), one or more cytokines (e.g., one or more cytokines selected from IL-2, IL-7, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21, or IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6R)) and a vector (e.g., a lentiviral vector) (e.g., one or more vectors) encoding a CAR (e.g., one or more CARs) are added to the cells. After incubation for 20-24 hours, the cells are washed and formulated for storage or administration.
В отличие от традиционных подходов к изготовлению CAR-T, способ с использованием цитокинов, предусмотренный в данном документе, не предусматривает стимуляцию CD3 и/или CD28 или размножение Т-клеток ex vivo. T-клетки, которые приводятся в контакт с антителами к CD3 и антителами к CD28 и которые интенсивно размножаются ex vivo, склонны демонстрировать дифференцировку в направлении фенотипа центральных клеток памяти. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что способ с использованием цитокинов, предусмотренный в данном документе, обеспечивает сохранение или увеличение выраженности недифференцированного фенотипа T-клеток в ходе изготовления CAR-T, обеспечивая при этом получение продукта на основе CAR-T, который может дольше персистировать после инфузии субъекту.Unlike traditional approaches to making CAR-T, the cytokine-based method provided herein does not involve CD3 and/or CD28 stimulation or ex vivo expansion of T cells. T cells that are exposed to anti-CD3 antibodies and anti-CD28 antibodies and that are expanded ex vivo tend to differentiate toward a central memory cell phenotype. Without wishing to be bound by any theory, it is believed that the cytokine-based method provided herein maintains or enhances the expression of the undifferentiated T cell phenotype during CAR-T manufacturing, while providing a CAR-T product that can persist longer after infusion into a subject.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с одним или несколькими цитокинами (например, одним или несколькими цитокинами, выбранными из IL-2, IL-7, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21 или IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra).In some embodiments, the population of cells is contacted with one or more cytokines (e.g., one or more cytokines selected from IL-2, IL-7, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)), IL-21, or IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra).
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-2. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-7. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-21. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra). В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-2 и IL-7. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-2 и IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-2 и IL-21. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-2 и IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra). В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-7 и IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-7 и IL-21. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-7 и IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra). В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) и IL-21. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) и IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra). В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-21 и IL-6 (например, IL-6/sIL-6Ra). В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с IL-7, IL-15 (например, hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) и IL-21. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток дополнительно приводят в контакт с ингибитором LSD1. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток дополнительно приводят в контакт с ингибитором MALT1.In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-2. In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-7. In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-21. In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra). In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-2 and IL-7. In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-2 and IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-2 and IL-21. In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-2 and IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra). In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-7 and IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)). In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-7 and IL-21. In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-7 and IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra). In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) and IL-21. In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) and IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra). In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-21 and IL-6 (e.g., IL-6/sIL-6Ra). In some embodiments, the population of cells is contacted with IL-7, IL-15 (e.g., hetIL-15 (IL15/sIL-15Ra)) and IL-21. In some embodiments, the population of cells is further contacted with an LSD1 inhibitor. In some embodiments, the population of cells is further contacted with a MALT1 inhibitor.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290 или 300 ед/мл IL-2. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 нг/мл IL-7. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 нг/мл IL-15.In some embodiments, the population of cells is contacted with 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, or 300 U/mL of IL-2. In some embodiments, the population of cells is contacted with 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, or 20 ng/ml of IL-7. In some embodiments, the population of cells is contacted with 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, or 20 ng/ml of IL-15.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты (например, одной или несколькими молекулами нуклеиновой кислоты), кодирующей CAR (например, один или несколько CAR). В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток трансдуцируют с помощью молекулы ДНК (например, одной или нескольких молекул ДНК), кодирующей CAR (например, один или несколько CAR).In some embodiments, the population of cells is contacted with a nucleic acid molecule (e.g., one or more nucleic acid molecules) encoding a CAR (e.g., one or more CARs). In some embodiments, the population of cells is transduced with a DNA molecule (e.g., one or more DNA molecules) encoding a CAR (e.g., one or more CARs).
В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, происходит одновременно с приведением популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, происходит не позже чем через 1, 1,5, 2, 2,5, 3, 3,5, 4, 4,5, 5, 5,5, 6, 6,5, 7, 7,5, 8, 8,5, 9, 9,5 или 10 часов после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, происходит не позже чем через 5 часов после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, происходит не позже чем через 4 часа после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, происходит не позже чем через 3 часа после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, происходит не позже чем через 2 часа после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления приведение популяции клеток в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, происходит не позже чем через 1 час после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше.In some embodiments, contacting the population of cells with a nucleic acid molecule encoding a CAR occurs simultaneously with contacting the population of cells with one or more cytokines described above. In some embodiments, contacting the population of cells with a nucleic acid molecule encoding a CAR occurs no later than 1, 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5, 4, 4.5, 5, 5.5, 6, 6.5, 7, 7.5, 8, 8.5, 9, 9.5, or 10 hours after the start of contacting the population of cells with the one or more cytokines described above. In some embodiments, contacting the population of cells with a nucleic acid molecule encoding a CAR occurs no later than 5 hours after the start of contacting the population of cells with the one or more cytokines described above. In some embodiments, contacting the population of cells with a nucleic acid molecule encoding a CAR occurs no later than 4 hours after the start of contacting the population of cells with one or more cytokines described above. In some embodiments, contacting the population of cells with a nucleic acid molecule encoding a CAR occurs no later than 3 hours after the start of contacting the population of cells with one or more cytokines described above. In some embodiments, contacting the population of cells with a nucleic acid molecule encoding a CAR occurs no later than 2 hours after the start of contacting the population of cells with one or more cytokines described above. In some embodiments, contacting the population of cells with a nucleic acid molecule encoding a CAR occurs no later than 1 hour after the start of contacting the population of cells with one or more cytokines described above.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения.In some embodiments, the cell population is collected for storage or administration.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 72, 60, 48, 36, 32, 31, 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, или 18 часов после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 26 часов после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 25 часов после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 24 часа после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 23 часа после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток собирают для хранения или введения не позже чем через 22 часа после начала приведения популяции клеток в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше.In some embodiments, the population of cells is collected for storage or administration no later than 72, 60, 48, 36, 32, 31, 30, 29, 28, 27, 26, 25, 24, 23, 22, 21, 20, 19, or 18 hours after the initiation of contacting the population of cells with one or more cytokines described above. In some embodiments, the population of cells is collected for storage or administration no later than 26 hours after the initiation of contacting the population of cells with one or more cytokines described above. In some embodiments, the population of cells is collected for storage or administration no later than 25 hours after the initiation of contacting the population of cells with one or more cytokines described above. In some embodiments, the population of cells is collected for storage or administration no later than 24 hours after the initiation of contacting the population of cells with one or more cytokines described above. In some embodiments, the cell population is collected for storage or administration no later than 23 hours after the cell population is first contacted with one or more cytokines described above. In some embodiments, the cell population is collected for storage or administration no later than 22 hours after the cell population is first contacted with one or more cytokines described above.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток не размножают ex vivo.In some embodiments, the cell population is not expanded ex vivo.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, или 60%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 5%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 10%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 15%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 20%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 25%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 30%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 35%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше. В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают с увеличением численности на не более чем 40%, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше.In some embodiments, the cell population is expanded to an increase in number by no more than 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, or 60%, for example, as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with one or more cytokines described above. In some embodiments, the cell population is expanded to an increase in number by no more than 5%, for example, as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with one or more cytokines described above. In some embodiments, the cell population is expanded by no more than 10% increase in number, for example, as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with one or more cytokines described above. In some embodiments, the cell population is expanded by no more than 15% increase in number, for example, as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with one or more cytokines described above. In some embodiments, the cell population is expanded by no more than 20% increase in number, for example, as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with one or more cytokines described above. In some embodiments, the cell population is expanded by no more than 25% increase in number, for example, as measured by the number of live cells, compared to the cell population before it was contacted with one or more cytokines described above. In some embodiments, the cell population is expanded to increase in number by no more than 30%, for example, as measured by the number of living cells, compared to the cell population before it was contacted with one or more cytokines described above. In some embodiments, the cell population is expanded to increase in number by no more than 35%, for example, as measured by the number of living cells, compared to the cell population before it was contacted with one or more cytokines described above. In some embodiments, the cell population is expanded to increase in number by no more than 40%, for example, as measured by the number of living cells, compared to the cell population before it was contacted with one or more cytokines described above.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток размножают в течение не более чем 1, 1,5, 2, 2,5, 3, 3,5, 4, 4,5, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 16, 20, 24, 36, или 48 часов, например, согласно оценке по количеству живых клеток, по сравнению с популяцией клеток до ее приведения в контакт с одним или несколькими цитокинами, описанными выше.In some embodiments, the cell population is expanded for no more than 1, 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5, 4, 4.5, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 16, 20, 24, 36, or 48 hours, such as as assessed by the number of living cells, compared to the cell population before it was exposed to one or more cytokines described above.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток не приводят в контакт in vitro со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR (например, антителом к CD3), и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток (например, антителом к CD28), или, в случае приведения в контакт, продолжительность стадии приведения в контакт составляет менее 1, 1,5, 2, 2,5, 3, 3,5, 4, 4,5 или 5 часов.In some embodiments, the cell population is not contacted in vitro with an agent that stimulates the CD3/TCR complex (e.g., an anti-CD3 antibody) and/or an agent that stimulates a costimulatory molecule on the cell surface (e.g., an anti-CD28 antibody), or, if contacted, the duration of the contacting step is less than 1, 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5, 4, 4.5, or 5 hours.
В некоторых вариантах осуществления популяцию клеток приводят в контакт in vitro со средством, которое стимулирует комплекс CD3/TCR (например, антителом к CD3), и/или средством, которое стимулирует костимулирующую молекулу на поверхности клеток (например, антителом к CD28), в течение 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27 или 28 часов.In some embodiments, the cell population is contacted in vitro with an agent that stimulates the CD3/TCR complex (e.g., an anti-CD3 antibody) and/or an agent that stimulates a costimulatory molecule on the cell surface (e.g., an anti-CD28 antibody) for 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, or 28 hours.
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток, изготовленная посредством способа с использованием цитокинов, предусмотренного в данном документе, демонстрирует более высокую процентную долю необученных клеток среди клеток, экспрессирующих CAR (например, на по меньшей мере 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, или 60% выше), по сравнению с клетками, полученными посредством в остальном аналогичного способа, который дополнительно включает приведение популяции клеток в контакт, например, со средством, которое связывает комплекс CD3/TCR (например, антителом к CD3), и/или средством, которое связывает костимулирующую молекулу на поверхности клеток (например, антителом к CD28).In some embodiments, a population of cells produced by a cytokine-using method provided herein exhibits a higher percentage of naive cells among CAR-expressing cells (e.g., at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, or 60% higher) compared to cells produced by an otherwise similar method that further comprises contacting the population of cells with, e.g., an agent that binds a CD3/TCR complex (e.g., an anti-CD3 antibody) and/or an agent that binds a costimulatory molecule on the surface of cells (e.g., an anti-CD28 antibody).
В некоторых вариантах осуществления способ с использованием цитокинов в данном документе осуществляют в средах для клеток, содержащих не более 0, 0,5, 1, 1,5, 2, 2,5, 3, 3,5, 4, 4,5, 5, 5,5, 6, 6,5, 7, 7,5 или 8% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления способ с использованием цитокинов, предусмотренный в данном документе, осуществляют в средах для клеток, содержащих ингибитор LSD1, ингибитор MALT1 или их комбинацию.In some embodiments, the method using cytokines herein is performed in cell media containing no more than 0, 0.5, 1, 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5, 4, 4.5, 5, 5.5, 6, 6.5, 7, 7.5, or 8% serum. In some embodiments, the method using cytokines provided herein is performed in cell media containing an LSD1 inhibitor, a MALT1 inhibitor, or a combination thereof.
Дополнительные иллюстративные способы изготовленияAdditional illustrative manufacturing methods
В некоторых вариантах осуществления клетки, например, Т-клетки или NK клетки, активируют, например, с использованием Dynabeads®, покрытых антителами к CD3/антителами к CD28, приводят в контакт с одной или несколькими молекулами нуклеиновой кислоты, кодирующими CAR (например, один или несколько CAR), а затем размножают in vitro в течение, например, 7, 8, 9, 10 или 11 дней. В некоторых вариантах осуществления клетки, например, Т-клетки или NK-клетки, отбирают из свежего или криоконсервированного образца, полученного путем лейкафереза, например, с помощью положительного или отрицательного отбора. В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты (например, одной или несколькими молекулами нуклеиновой кислоты), кодирующей CAR (например, один или несколько CAR). В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей два CAR, раскрытых в данном документе (например, CAR для BCMA и CAR для CD19). В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с двумя молекулами нуклеиновой кислоты, одна из которых экспрессирует первый CAR (например, CAR для BCMA), а другая экспрессирует второй CAR (например, CAR для CD19). В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR в формате диатела (например, CAR для BCMA/CD19 в формате диатела, раскрытый в данном документе).In some embodiments, cells, such as T cells or NK cells, are activated, such as using anti-CD3/anti-CD28 antibody-coated Dynabeads®, contacted with one or more nucleic acid molecules encoding a CAR (e.g., one or more CARs), and then expanded in vitro for, such as, 7, 8, 9, 10, or 11 days. In some embodiments, cells, such as T cells or NK cells, are selected from a fresh or cryopreserved sample obtained by leukapheresis, such as by positive or negative selection. In some embodiments, the cells are contacted with a nucleic acid molecule (e.g., one or more nucleic acid molecules) encoding a CAR (e.g., one or more CARs). In some embodiments, the cells are contacted with a nucleic acid molecule encoding two CARs disclosed herein (e.g., a CAR for BCMA and a CAR for CD19). In some embodiments, the cells are contacted with two nucleic acid molecules, one expressing a first CAR (e.g., a CAR for BCMA) and the other expressing a second CAR (e.g., a CAR for CD19). In some embodiments, the cells are contacted with a nucleic acid molecule encoding a CAR in diabody format (e.g., a CAR for BCMA/CD19 in diabody format disclosed herein).
ЭлютриацияElutriation
В некоторых вариантах осуществления способы, описанные в данном документе, включают способ элютриации, с помощью которого удаляют нежелательные клетки, например, моноциты и бластные клетки, что в результате приводит к улучшенному обогащению требуемыми иммунными эффектoрными клетками, подходящими для экспрессии CAR. В одном варианте осуществления способ элютриации, описанный в данном документе, оптимизирован для обогащения требуемыми иммунными эффектoрными клетками, подходящими для экспрессии CAR, из ранее замороженного образца, например, размороженного образца. В некоторых вариантах осуществления способ элютриации, описанный в данном документе, обеспечивает получение клеток с улучшенной чистотой по сравнению с получением клеток, собранных согласно протоколам элютриации, известным из уровня техники. В некоторых вариантах осуществления способ элютриации, описанный в данном документе, включает использование оптимизированной вязкости исходного образца, например, образца клеток, например, размороженного образца клеток, путем разбавления определенными изотоническими растворами (например, PBS), а также использование оптимизированной комбинации скоростей потока и объема собираемого материала для каждой фракции, собираемой с помощью устройства для элютриации. Иллюстративные способы элютриации, которые можно применять в настоящем изобретении, описаны на страницах 48-51 в WO 2017/117112, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.In some embodiments, the methods described herein include an elutriation method that removes unwanted cells, such as monocytes and blast cells, resulting in improved enrichment of desired immune effector cells suitable for CAR expression. In one embodiment, the elutriation method described herein is optimized for enrichment of desired immune effector cells suitable for CAR expression from a previously frozen sample, such as a thawed sample. In some embodiments, the elutriation method described herein provides cells with improved purity compared to cells collected according to elutriation protocols known in the art. In some embodiments, the elutriation method described herein includes using an optimized viscosity of the starting sample, such as a cell sample, such as a thawed cell sample, by dilution with certain isotonic solutions (e.g., PBS), and using an optimized combination of flow rates and collection volumes for each fraction collected by the elutriation device. Exemplary elutriation methods that can be used in the present invention are described on pages 48-51 of WO 2017/117112, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Центрифугирование в градиенте плотностиDensity gradient centrifugation
Изготовление продукта для адоптивной клеточной терапии требует обработки требуемых клеток, например, иммунных эффекторных клеток, для отделения от сложной смеси клеток крови и элементов крови, присутствующих в исходных материалах периферической крови, полученных путем афереза. Образцы лимфоцитов периферической крови были успешно выделены с помощью центрифугирования в градиенте плотности в растворе Ficoll. Однако Ficoll не является предпочтительным реагентом для выделения клеток для терапевтического применения, поскольку Ficoll не пригоден для клинического применения. Кроме того, Ficoll содержит гликоль, который обладает токсичным потенциалом для клеток. Кроме того, при центрифугировании в градиенте плотности Ficoll размороженных продуктов афереза после криоконсервации получают неоптимальный продукт на основе T-клеток, например, как описано в примерах в данном документе. Например, в препаратах клеток, выделенных посредством центрифугирования в градиенте плотности в растворе Ficoll, наблюдалась утрата Т-клеток в конечном продукте с относительным увеличением количества клеток, отличных от T-клеток, особенно нежелательных B-клеток, бластных клеток и моноцитов.The manufacture of an adoptive cell therapy product requires the processing of the desired cells, such as immune effector cells, from the complex mixture of blood cells and blood elements present in the starting peripheral blood materials obtained by apheresis. Peripheral blood lymphocyte samples have been successfully isolated by density gradient centrifugation in Ficoll solution. However, Ficoll is not the preferred reagent for isolating cells for therapeutic use because Ficoll is not suitable for clinical use. In addition, Ficoll contains glycol, which has the potential to be toxic to cells. In addition, Ficoll density gradient centrifugation of thawed apheresis products after cryopreservation produces a suboptimal T cell product, such as described in the examples herein. For example, in cell preparations isolated by density gradient centrifugation in Ficoll solution, a loss of T cells was observed in the final product with a relative increase in non-T cell cells, particularly undesirable B cells, blast cells, and monocytes.
Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что иммунные эффектoрные клетки, например, T-клетки, обезвоживаются во время криоконсервации, становясь более плотными, чем свежие клетки. Не ограничиваясь какой-либо теорией, также полагают, что иммунные эффектoрные клетки, например, T-клетки, остаются более плотными дольше, чем другие клетки крови, и, таким образом, легче утрачиваются при разделении в градиенте плотности Ficoll по сравнению с другими клетками. Соответственно, не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что среда с плотностью, превышающей плотность Ficoll, будет обеспечивать улучшенное выделение требуемых иммунных эффектoрных клеток по сравнению с Ficoll или другими средами с такой же плотностью, как у Ficoll, например, 1,077 г/мл.Without wishing to be bound by theory, it is believed that immune effector cells, such as T cells, dehydrate during cryopreservation, becoming denser than fresh cells. Without wishing to be bound by theory, it is also believed that immune effector cells, such as T cells, remain denser longer than other blood cells, and are thus more easily lost during Ficoll density gradient separation than other cells. Accordingly, without wishing to be bound by theory, it is believed that medium with a density greater than that of Ficoll will provide improved recovery of the desired immune effector cells compared to Ficoll or other media with a similar density to Ficoll, such as 1.077 g/mL.
В некоторых вариантах осуществления способ центрифугирования в градиенте плотности, описанный в данном документе, включает применение среды с градиентом плотности, содержащей йодиксанол. В некоторых вариантах осуществления среда с градиентом плотности содержит приблизительно 60% йодиксанола в воде.In some embodiments, the density gradient centrifugation method described herein includes using a density gradient medium containing iodixanol. In some embodiments, the density gradient medium comprises about 60% iodixanol in water.
В некоторых вариантах осуществления способ центрифугирования в градиенте плотности, описанный в данном документе, включает применение среды с градиентом плотности, характеризующейся плотностью, превышающей плотность Ficoll. В некоторых вариантах осуществления способ центрифугирования в градиенте плотности, описанный в данном документе, включает применение среды с градиентом плотности, характеризующейся плотностью более 1,077 г/мл, например, более 1,077 г/мл, более 1,1 г/мл, более 1,15 г/мл, более 1,2 г/мл, более 1,25 г/мл, более 1,3 г/мл, более 1,31 г/мл. В некоторых вариантах осуществления среда с градиентом плотности характеризуется плотностью, составляющей приблизительно 1,32 г/мл.In some embodiments, the method of density gradient centrifugation described herein includes using a density gradient medium having a density greater than the density of Ficoll. In some embodiments, the method of density gradient centrifugation described herein includes using a density gradient medium having a density greater than 1.077 g/mL, such as greater than 1.077 g/mL, greater than 1.1 g/mL, greater than 1.15 g/mL, greater than 1.2 g/mL, greater than 1.25 g/mL, greater than 1.3 g/mL, greater than 1.31 g/mL. In some embodiments, the density gradient medium has a density of about 1.32 g/mL.
Дополнительные варианты осуществления центрифугирования в градиенте плотности описаны на страницах 51-53 в WO 2017/117112, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.Further embodiments of density gradient centrifugation are described on pages 51-53 of WO 2017/117112, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Обогащение посредством отбораEnrichment through selection
В данном документе предусмотрены способы отбора конкретных клеток для обеспечения улучшения обогащения требуемыми иммунными эффектoрными клетками, подходящими для экспрессии CAR. В некоторых вариантах осуществления отбор включает положительный отбор, например, отбор по требуемым иммунным эффектoрным клеткам. В некоторых вариантах осуществления отбор включает отрицательный отбор, например, отбор по нежелательным клеткам, например, удаление нежелательных клеток. В ряде вариантов осуществления способы положительного или отрицательного отбора, описанные в данном документе, проводят в условиях потока, например, с помощью проточного устройства, например, проточного устройства, описанного в данном документе. Иллюстративные способы положительного и отрицательного отбора описаны на страницах 53-57 в WO 2017/117112, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. Способы отбора можно проводить в условиях потока, например, с помощью проточного устройства, также называемого системой для обработки клеток, для дополнительного обогащения препарата клеток требуемыми иммунными эффектoрными клетками, например, T-клетками, подходящими для экспрессии CAR. Иллюстративные проточные устройства описаны на страницах 57-70 в WO 2017/117112, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. Иллюстративные способы разделения клеток и удаления гранул описаны на страницах 70-78 в WO 2017/117112, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.Provided herein are methods for selecting specific cells to provide improved enrichment of desired immune effector cells suitable for CAR expression. In some embodiments, the selection comprises positive selection, such as selection for desired immune effector cells. In some embodiments, the selection comprises negative selection, such as selection for unwanted cells, such as removal of unwanted cells. In some embodiments, the positive or negative selection methods described herein are performed under flow conditions, such as with a flow device, such as the flow device described herein. Exemplary positive and negative selection methods are described on pages 53-57 of WO 2017/117112, which is incorporated herein by reference in its entirety. The selection methods can be carried out under flow conditions, such as using a flow device, also referred to as a cell processing system, to further enrich the cell preparation with the desired immune effector cells, such as T cells suitable for expressing CAR. Exemplary flow devices are described on pages 57-70 of WO 2017/117112, which is incorporated herein by reference in its entirety. Exemplary methods for separating cells and removing beads are described on pages 70-78 of WO 2017/117112, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Процедуры отбора не ограничиваются теми, которые описаны на страницах 57-70 в WO 2017/117112. Можно применять отрицательный отбор Т-клеток путем удаления нежелательных клеток с помощью гранул с антителами к CD19, CD14 и CD26 от Miltenyi в комбинации с колоночной технологией (CliniMACS® Plus или CliniMACS® Prodigy®) или положительный отбор Т-клеток с помощью комбинации гранул с антителами к CD4 и CD8 от Miltenyi и колоночной технологии (CliniMACS® Plus или CliniMACS® Prodigy®). В качестве альтернативы можно применять бесколоночную технологию с гранулами с высвобождаемыми антителами к CD3 (GE Healthcare).Selection procedures are not limited to those described on pages 57-70 of WO 2017/117112. Negative selection of T cells by removing unwanted cells using Miltenyi beads with CD19, CD14 and CD26 antibodies in combination with column technology (CliniMACS® Plus or CliniMACS® Prodigy®) or positive selection of T cells using a combination of Miltenyi beads with CD4 and CD8 antibodies and column technology (CliniMACS® Plus or CliniMACS® Prodigy®) can be used. Alternatively, column-free technology with beads with releasable CD3 antibodies (GE Healthcare) can be used.
Кроме того, можно также применять технологии без использования гранул, такие как устройства ThermoGenesis серии X.Additionally, pellet-free technologies such as the ThermoGenesis X-Series devices can also be used.
Пути клинического примененияRoutes of clinical application
Все способы в данном документе можно осуществлять согласно клиническим стандартам надлежащей производственной практики (cGMP).All methods in this document can be performed according to clinical good manufacturing practice (cGMP) standards.
Способы можно применять для очистки, обогащения, сбора, промывания, концентрирования клеток или для замены сред для клеток, в частности в ходе сбора необработанных исходных материалов (в частности клеток) в начале способа изготовления, а также в ходе способа изготовления для отбора или размножения клеток для клеточной терапии.The methods can be used for purifying, enriching, collecting, washing, concentrating cells or for replacing media for cells, in particular during the collection of raw starting materials (in particular cells) at the beginning of the manufacturing method, as well as during the manufacturing method for selecting or expanding cells for cell therapy.
Клетки могут включать любое множество клеток. Клетки могут относиться к одному и тому же типу клеток или представлять собой смесь типов клеток. Кроме того, клетки могут быть получены от одного донора, такого как аутологичный донор или один аллогенный донор, для клеточной терапии. Клетки можно получать от пациентов с помощью, например, лейкафереза или афереза. Клетки могут включать T-клетки, например, могут включать популяцию, которая содержит более 50% T-клеток, более 60% T-клеток, более 70% T-клеток, более 80% T-клеток или 90% T-клеток.The cells may include any plurality of cells. The cells may be of the same cell type or a mixture of cell types. Additionally, the cells may be obtained from a single donor, such as an autologous donor or a single allogeneic donor, for cell therapy. The cells may be obtained from patients by, for example, leukapheresis or apheresis. The cells may include T cells, for example, may include a population that is greater than 50% T cells, greater than 60% T cells, greater than 70% T cells, greater than 80% T cells, or 90% T cells.
Способы отбора могут быть особенно применимыми для отбора клеток перед культивированием и размножением. Например, можно применять парамагнитные частицы, покрытые антителами к CD3 и/или к CD28, для отбора T-клеток для размножения или для введения нуклеиновой кислоты, кодирующей химерный антигенный рецептор (CAR) или другой белок. Такой способ используют для получения T-клеток CTL019 для лечения острого лимфобластного лейкоза (ALL).Selection methods may be particularly useful for selecting cells prior to culture and expansion. For example, paramagnetic particles coated with antibodies to CD3 and/or CD28 may be used to select T cells for expansion or to introduce a nucleic acid encoding a chimeric antigen receptor (CAR) or other protein. Such a method is used to generate CTL019 T cells for the treatment of acute lymphoblastic leukemia (ALL).
Способы и модули для удаления гранул, раскрытые в данном документе, могут быть особенно применимыми при изготовлении клеток для клеточной терапии, например, при очистке клеток до или после культивирования и размножения. Например, парамагнитные частицы, покрытые антителами к CD3 и/или к CD28, можно применять для селективного размножения T-клеток, например, тех T-клеток, которые являются или будут модифицированными посредством введения нуклеиновой кислоты, кодирующей химерный антигенный рецептор (CAR) или другой белок, таким образом, чтобы CAR экспрессировался T-клетками. В ходе изготовления таких T-клеток способы или модули для удаления гранул можно применять для отделения T-клеток от парамагнитных частиц. Такой способ или модуль для удаления гранул применяют для получения, например, T-клеток CTL019 для лечения острого лимфобластного лейкоза (ALL).The bead removal methods and modules disclosed herein may be particularly useful in the production of cells for cell therapy, such as in the purification of cells before or after culture and expansion. For example, paramagnetic particles coated with anti-CD3 and/or anti-CD28 antibodies may be used to selectively expand T cells, such as those T cells that are or will be modified by the introduction of a nucleic acid encoding a chimeric antigen receptor (CAR) or other protein such that the CAR is expressed by the T cells. During the production of such T cells, bead removal methods or modules may be used to separate the T cells from the paramagnetic particles. Such a bead removal method or module is used to produce, for example, CTL019 T cells for the treatment of acute lymphoblastic leukemia (ALL).
В одном таком способе, проиллюстрированном в данном документе в качестве примера, клетки, например, T-клетки, собирают у донора (например, пациента, подлежащего лечению с помощью продукта на основе аутологичных Т-клеток с химерным антигенным рецептором) посредством афереза (например, лейкафереза). Собранные клетки затем можно необязательно очищать, например, с помощью стадии элютриации или с помощью положительного или отрицательного отбора клеток-мишеней (например, T-клеток). Парамагнитные частицы, например, парамагнитные частицы, покрытые антителами к CD3/антителами к CD28, можно затем добавлять к популяции клеток для размножения T-клеток. Способ также может включать стадию трансдукции, где в клетку вводят нуклеиновую кислоту, кодирующую один или несколько требуемых белков, например, CAR, например, CAR, который нацеливается на CD19. Нуклеиновая кислота может быть введена в лентивирусный вектор. Клетки, например, клетки, трансдуцированные лентивирусным вектором, затем можно размножать в течение периода нескольких дней, например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или больше дней, например, в присутствии подходящей среды. После размножения можно применять способы/модули для удаления гранул, раскрытые в данном документе, для отделения требуемых T-клеток от парамагнитных частиц. Способ может включать одну или несколько стадий удаления гранул согласно способам по настоящему изобретению. Клетки, от которых были удалены гранулы, затем можно составлять для введения пациенту. Примеры CAR-T-клеток и их изготовление дополнительно описаны, например, в WO2012/079000, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. Системы и способы по настоящему изобретению можно применять для любых способов разделения клеток/очистки клеток/удаления гранул от клеток, описанных в WO2012/079000 или связанных с ней заявках. Дополнительные способы изготовления CAR-T описаны, например, в WO2016109410 и WO2017117112, которые включены в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.In one such method, illustrated by way of example herein, cells, such as T cells, are collected from a donor (e.g., a patient to be treated with an autologous chimeric antigen receptor T cell product) by apheresis (e.g., leukapheresis). The collected cells may then optionally be purified, such as by an elutriation step or by positive or negative selection of target cells (e.g., T cells). Paramagnetic particles, such as anti-CD3/anti-CD28 coated paramagnetic particles, may then be added to the cell population to expand the T cells. The method may also include a transduction step wherein a nucleic acid encoding one or more desired proteins, such as a CAR, such as a CAR that targets CD19, is introduced into the cell. The nucleic acid may be introduced into a lentiviral vector. The cells, such as cells transduced with a lentiviral vector, can then be expanded over a period of several days, such as 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or more days, such as in the presence of a suitable medium. Following expansion, the bead removal methods/modules disclosed herein can be used to separate the desired T cells from the paramagnetic particles. The method can include one or more bead removal steps according to the methods of the present invention. The bead-removed cells can then be formulated for administration to a patient. Examples of CAR-T cells and their manufacture are further described, such as WO2012/079000, which is incorporated herein by reference in its entirety. The systems and methods of the present invention can be used for any of the cell separation/cell purification/bead removal methods from cells described in WO2012/079000 or related applications. Additional methods for making CAR-T are described, for example, in WO2016109410 and WO2017117112, which are incorporated herein by reference in their entireties.
Системы и способы, описанные в данном документе, могут аналогичным образом обеспечивать благоприятный эффект для других продуктов для клеточной терапии, обеспечивая уменьшение потерь требуемых клеток, уменьшение степени повреждения клеток и более надежное удаление магнитных и любых непарамагнитных частиц от клеток с меньшим воздействием химических средств или его отсутствием по сравнению с традиционными системами и способами.The systems and methods described herein may similarly provide a beneficial effect for other cell therapy products by providing a reduction in the loss of desired cells, a reduction in the extent of cell damage, and a more reliable removal of magnetic and any non-paramagnetic particles from cells with less or no chemical exposure compared to traditional systems and methods.
Хотя только иллюстративные варианты осуществления настоящего изобретения конкретно описаны выше, будет понятно, что возможны модификации и видоизменения таких примеров без отступления от сущности и подразумеваемого объема настоящего изобретения. Например, магнитные модули и системы, содержащие их, можно организовывать и применять в разнообразных конфигурациях в дополнение к тем, что описаны. Кроме этого, также можно использовать немагнитные модули. Кроме того, системы и способы могут включать дополнительные компоненты и стадии, которые не описаны конкретно в данном документе. Например, способы могут включать первичную обработку, где жидкость сначала вносят в компонент для удаления пузырей и уменьшения противодействия движению суспензии клеток или буфера. Кроме того, варианты осуществления могут включать только часть систем, описанных в данном документе, для применения со способами, описанными в данном документе. Например, варианты осуществления могут относиться к одноразовым модулям, рукавам и т. д., применимым внутри неодноразового оборудования с образованием целостной системы, способной отделять клетки или удалять гранулы от клеток с получением продукта на основе клеток.Although only illustrative embodiments of the present invention have been specifically described above, it will be understood that modifications and variations of such examples are possible without departing from the spirit and intended scope of the present invention. For example, magnetic modules and systems containing them can be arranged and used in a variety of configurations in addition to those described. In addition, non-magnetic modules can also be used. In addition, systems and methods can include additional components and steps that are not specifically described herein. For example, the methods can include a primary treatment where a liquid is first introduced into a component to remove bubbles and reduce resistance to movement of the cell suspension or buffer. In addition, embodiments can include only a portion of the systems described herein for use with the methods described herein. For example, embodiments can relate to disposable modules, sleeves, etc., usable within non-disposable equipment to form an integral system capable of separating cells or removing beads from cells to produce a cell-based product.
Дополнительные способы и процессы изготовления, которые можно применять в комбинации с настоящим изобретением, были описаны в уровне техники. Например, на страницах 86-91 в WO 2017/117112 описаны улучшенные стадии промывания и улучшенный способ изготовления.Additional manufacturing methods and processes that can be used in combination with the present invention have been described in the prior art. For example, improved washing steps and an improved manufacturing method are described on pages 86-91 of WO 2017/117112.
Источники иммунных эффекторных клетокSources of immune effector cells
В этом разделе предусмотрены дополнительные способы или стадии для получения исходного образца, содержащего требуемые иммунные эффекторные клетки, выделения и обработки требуемых иммунных эффекторных клеток, например, T-клеток, и удаления нежелательных материалов, например, нежелательных клеток. Дополнительные способы или стадии, описанные в этом разделе, можно применять в комбинации с любым из элютриации, центрифугирования в градиенте плотности, отбора в условиях потока или улучшенной стадии промывания, описанных в предыдущих разделах.This section provides additional methods or steps for obtaining a source sample containing the desired immune effector cells, isolating and processing the desired immune effector cells, such as T cells, and removing unwanted materials, such as unwanted cells. The additional methods or steps described in this section can be used in combination with any of the elutriation, density gradient centrifugation, flow selection, or enhanced washing step described in the previous sections.
Источник клеток, например, T-клеток или естественных клеток-киллеров (NK), можно получить от субъекта. Примеры субъектов включают людей, обезьян, шимпанзе, собак, кошек, мышей, крыс и их трансгенные формы. Т-клетки можно получить из ряда источников, в том числе из мононуклеарных клеток периферической крови, костного мозга, ткани лимфатических узлов, пуповинной крови, ткани тимуса, ткани из очага инфекции, асцита, плеврального выпота, ткани селезенки и опухолей.A source of cells, such as T cells or natural killer (NK) cells, may be obtained from a subject. Examples of subjects include humans, monkeys, chimpanzees, dogs, cats, mice, rats, and transgenic forms thereof. T cells may be obtained from a variety of sources, including peripheral blood mononuclear cells, bone marrow, lymph node tissue, cord blood, thymus tissue, tissue from a site of infection, ascites, pleural effusion, spleen tissue, and tumors.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения иммунные эффекторные клетки, например, Т-клетки, можно получать из единицы крови, собранной у субъекта, с помощью любого количества методик, известных специалисту в данной области, и любого из способов, раскрытых в данном документе, при любой комбинации их стадий. В некоторых вариантах осуществления клетки из циркулирующей крови организма индивидуума получают путем афереза. Продукт афереза обычно содержит лимфоциты, в том числе Т-клетки, моноциты, гранулоциты, В-клетки, другие ядросодержащие лейкоциты, эритроциты и тромбоциты. В некоторых вариантах осуществления клетки, собранные путем афереза, можно промыть, чтобы удалить фракцию плазмы крови и необязательно поместить клетки в соответствующий буфер или среду для последующих стадий обработки. В некоторых вариантах осуществления клетки промывают фосфатно-солевым буферным раствором (PBS). В некоторых вариантах осуществления в растворе для промывания отсутствует кальций и может отсутствовать магний или могут отсутствовать многие, если не все, двухвалентные катионы. В некоторых вариантах осуществления клетки промывают с использованием улучшенной стадии промывания, описанной в данном документе.In some embodiments of the present invention, immune effector cells, such as T cells, can be obtained from a unit of blood collected from a subject using any number of techniques known to those skilled in the art and any of the methods disclosed herein, in any combination of steps thereof. In some embodiments, cells are obtained from circulating blood of an individual by apheresis. The apheresis product typically contains lymphocytes, including T cells, monocytes, granulocytes, B cells, other nucleated leukocytes, red blood cells, and platelets. In some embodiments, the cells collected by apheresis can be washed to remove the plasma fraction and optionally place the cells in an appropriate buffer or medium for subsequent processing steps. In some embodiments, the cells are washed with phosphate buffered saline (PBS). In some embodiments, the wash solution is free of calcium and may be free of magnesium or may be free of many, if not all, divalent cations. In some embodiments, the cells are washed using the improved washing step described herein.
Начальные стадии активации в отсутствие кальция могут приводить к усиленной активации. Как будет очевидно для специалистов средней квалификации в данной области, стадию промывания можно осуществлять посредством способов, известных специалистам в данной области, как, например, с помощью полуавтоматической "проточной" центрифуги (например, устройства для обработки клеток Cobe 2991, CytoMate™ от Baxter или Cell Saver 5 от Haemonetics), Cell Saver Elite от Haemonetics (Sepax или Sefia от GE Healthcare) или устройства, в котором используется технология фильтрации на вращающейся мембране (LOVO от Fresenius Kabi), в соответствии с инструкциями производителя. После промывания клетки можно ресуспендировать в различных биосовместимых буферах, таких как, например, PBS, не содержащий Ca и не содержащий Mg, PlasmaLyte A, PBS-EDTA, дополненный человеческим сывороточным альбумином (HSA), или другой солевой раствор с буфером или без него. В качестве альтернативы нежелательные компоненты из образца, полученного путем афереза, можно удалить, и клетки можно ресуспендировать непосредственно в культуральной среде.The initial steps of activation in the absence of calcium may result in enhanced activation. As will be apparent to those of ordinary skill in the art, the washing step can be accomplished by methods known to those skilled in the art, such as using a semiautomated "flow-through" centrifuge (e.g., Cobe 2991 cell processor, CytoMate™ from Baxter, or
В некоторых вариантах осуществления требуемые иммунные эффекторные клетки, например, Т-клетки, выделяют из лимфоцитов периферической крови путем лизиса эритроцитов и истощения по моноцитам, например, посредством центрифугирования в градиенте PERCOLL™ или посредством противоточного элютриационного центрифугирования.In some embodiments, the desired immune effector cells, such as T cells, are isolated from peripheral blood lymphocytes by lysis of red blood cells and depletion of monocytes, such as by PERCOLL™ gradient centrifugation or by countercurrent elutriation centrifugation.
Способы, описанные в данном документе, могут включать, например, отбор конкретной субпопуляции иммунных эффекторных клеток, например, Т-клеток, которая представляет собой популяцию клеток, истощенную по регуляторным Т-клеткам, например, с истощением по CD25+ клеткам или истощением по CD25высокий клеткам, с помощью, например, методики отрицательного отбора, например, описанной в данном документе. В некоторых вариантах осуществления популяция клеток, истощенная по регуляторным T-клеткам, содержит менее 30%, 25%, 20%, 15%, 10%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1% CD25+ клеток или CD25высокий клеток.The methods described herein may include, for example, selecting a specific subpopulation of immune effector cells, for example, T cells, that is a population of cells depleted of regulatory T cells, for example, depleted of CD25+ cells or depleted of CD25high cells, using, for example, a negative selection technique, for example, as described herein. In some embodiments, the population of cells depleted of regulatory T cells comprises less than 30%, 25%, 20%, 15%, 10%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1% CD25+ cells or CD25high cells.
В некоторых вариантах осуществления регуляторные T-клетки, например, CD25+ T-клетки или CD25высокий Т-клетки, удаляют из популяции с помощью антитела к CD25 или его фрагмента или CD25-связывающего лиганда, например, IL-2. В некоторых вариантах осуществления антитело к CD25 или его фрагмент или CD25-связывающий лиганд конъюгированы с субстратом, например, гранулой, или иным образом покрывают субстрат, например, гранулу. В некоторых вариантах осуществления антитело к CD25 или его фрагмент конъюгированы с субстратом, описанным в данном документе.In some embodiments, regulatory T cells, such as CD25+ T cells or CD25 high T cells, are removed from the population using an anti-CD25 antibody or fragment thereof or a CD25-binding ligand, such as IL-2. In some embodiments, the anti-CD25 antibody or fragment thereof or the CD25-binding ligand is conjugated to a substrate, such as a bead, or otherwise coated with a substrate, such as a bead. In some embodiments, the anti-CD25 antibody or fragment thereof is conjugated to a substrate as described herein.
В некоторых вариантах осуществления регуляторные T-клетки, например, CD25+ T-клетки или CD25высокий Т-клетки, удаляют из популяции с помощью реагента для истощения по CD25 от Miltenyi™. В некоторых вариантах осуществления соотношение клеток и реагента для истощения по CD25 составляет 1e7 клеток на 20 мкл, или 1e7 клеток на 15 мкл, или 1e7 клеток на 10 мкл, или 1e7 клеток на 5 мкл, или 1e7 клеток на 2,5 мкл, или 1e7 клеток на 1,25 мкл. В некоторых вариантах осуществления, например, для регуляторных Т-клеток используют более 500 миллионов клеток/мл. В некоторых вариантах осуществления используют концентрацию клеток, составляющую 600, 700, 800 или 900 миллионов клеток/мл.In some embodiments, regulatory T cells, such as CD25+ T cells or CD25 high T cells, are removed from the population using Miltenyi™ CD25 Depletion Reagent. In some embodiments, the ratio of cells to CD25 Depletion Reagent is 1e7 cells per 20 μl, or 1e7 cells per 15 μl, or 1e7 cells per 10 μl, or 1e7 cells per 5 μl, or 1e7 cells per 2.5 μl, or 1e7 cells per 1.25 μl. In some embodiments, for example, for regulatory T cells, greater than 500 million cells/mL are used. In some embodiments, a cell concentration of 600, 700, 800, or 900 million cells/mL is used.
В некоторых вариантах осуществления популяция иммунных эффекторных клеток, подлежащая истощению, содержит приблизительно 6×109 CD25+ T-клеток. В некоторых вариантах осуществления популяция иммунных эффекторных клеток, подлежащая истощению, содержит от приблизительно 1×109 до 1×1010 CD25+ Т-клеток, включая любое целочисленное значение в этом промежутке. В некоторых вариантах осуществления полученная в результате популяция, истощенная по регуляторным T-клеткам, содержит 2×109 регуляторных T-клеток, например, CD25+ клеток или CD25высокий клеток, или меньше (например, 1×109, 5×108, 1×108, 5×107, 1×107 или меньше регуляторных T-клеток). In some embodiments, the immune effector cell population to be depleted comprises about 6× 109 CD25+ T cells. In some embodiments, the immune effector cell population to be depleted comprises from about 1× 109 to 1× 1010 CD25+ T cells, including any integer value therebetween. In some embodiments, the resulting T regulatory cell depleted population comprises 2× 109 regulatory T cells, such as CD25+ cells or CD25high cells, or less (e.g., 1× 109 , 5× 108 , 1× 108 , 5× 107 , 1× 107 or less regulatory T cells).
В некоторых вариантах осуществления регуляторные T-клетки, например, CD25+ клетки или CD25высокий клетки, удаляют из популяции с помощью системы CliniMACS с набором трубок для истощения, таким как, например, трубки 162-01. В некоторых вариантах осуществления система CliniMACS работает с установленными параметрами истощения, например, такими как DEPLETION2.1.In some embodiments, regulatory T cells, such as CD25+ cells or CD25 high cells, are removed from the population using the CliniMACS system with a set of depletion tubes, such as, for example, 162-01 tubes. In some embodiments, the CliniMACS system operates with established depletion parameters, such as, for example, DEPLETION2.1.
Не ограничиваясь конкретной теорией, полагают, что при уменьшении уровня отрицательных регуляторов иммунных клеток (например, уменьшении количества нежелательных иммунных клеток, например, Treg-клеток) у субъекта до афереза или в ходе изготовления продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR, значительно снижается риск рецидива у субъекта. Например, способы истощения по Treg-клеткам известны из уровня техники. Способы уменьшения количества Treg-клеток включают без ограничения применение циклофосфамида, антитела к GITR (антитела к GITR, описанного в данном документе), реагента для истощения по CD25 и их комбинаций.Without being limited by a particular theory, it is believed that by reducing the level of negative regulators of immune cells (e.g., reducing the number of unwanted immune cells, such as Treg cells) in a subject prior to apheresis or during the manufacture of a CAR-expressing cell product, the risk of relapse in the subject is significantly reduced. For example, methods of depleting Treg cells are known in the art. Methods of depleting Treg cells include, but are not limited to, cyclophosphamide, an anti-GITR antibody (the anti-GITR antibody described herein), a CD25 depletion reagent, and combinations thereof.
В некоторых вариантах осуществления способы изготовления включают снижение количества (например, истощение популяции) Treg-клеток перед изготовлением клетки, экспрессирующей CAR. Например, способы изготовления включают приведение образца, например, образца, полученного путем афереза, в контакт с антителом к GITR и/или антителом к CD25 (или его фрагментом или CD25-связывающим лигандом), например, для истощения по Treg-клеткам перед изготовлением продукта на основе клеток (например, T-клеток, NK-клеток), экспрессирующих CAR.In some embodiments, the manufacturing methods comprise reducing the number (e.g., depleting the population) of Treg cells prior to manufacturing the CAR-expressing cell. For example, the manufacturing methods comprise contacting a sample, e.g., a sample obtained by apheresis, with an anti-GITR antibody and/or an anti-CD25 antibody (or fragment thereof or CD25-binding ligand), e.g., to deplete Treg cells prior to manufacturing the CAR-expressing cell product (e.g., T cells, NK cells).
Не ограничиваясь конкретной теорией, полагают, что при уменьшении уровня отрицательных регуляторов иммунных клеток (например, уменьшении количества нежелательных иммунных клеток, например, Treg-клеток) у субъекта до афереза или в ходе изготовления продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR, может снижаться риск рецидива у субъекта. В некоторых вариантах осуществления субъект получает предварительное лечение с помощью одного или нескольких средств терапии, которые обеспечивают снижение количества Treg-клеток, перед сбором клеток для изготовления продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR, за счет чего обеспечивается снижение риска рецидива у субъекта при лечении с помощью клеток, экспрессирующих CAR. В некоторых вариантах осуществления способы уменьшения количества Treg-клеток включают без ограничения введение субъекту одного или нескольких из циклофосфамида, антитела к GITR, реагента для истощения по CD25 или их комбинации. В некоторых вариантах осуществления способы уменьшения количества Treg-клеток включают без ограничения введение субъекту одного или нескольких из циклофосфамида, антитела к GITR, реагента для истощения по CD25 или их комбинации. Введение одного или нескольких из циклофосфамида, антитела к GITR, реагента для истощения по CD25 или их комбинации может происходить до, во время или после инфузии продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR. Введение одного или нескольких из циклофосфамида, антитела к GITR, реагента для истощения по CD25 или их комбинации может происходить до, во время или после инфузии продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR.Without being limited by a particular theory, it is believed that by reducing the level of negative regulators of immune cells (e.g., reducing the number of unwanted immune cells, such as Treg cells) in a subject prior to apheresis or during the manufacture of a CAR-expressing cell product, the risk of relapse in the subject may be reduced. In some embodiments, the subject is pretreated with one or more therapies that reduce the number of Treg cells prior to harvesting the cells for the manufacture of a CAR-expressing cell product, thereby reducing the risk of relapse in the subject when treated with CAR-expressing cells. In some embodiments, methods of reducing the number of Treg cells include, but are not limited to, administering to the subject one or more of cyclophosphamide, an anti-GITR antibody, a CD25 depletion reagent, or a combination thereof. In some embodiments, methods of reducing the number of Treg cells include, but are not limited to, administering to the subject one or more of cyclophosphamide, an anti-GITR antibody, a CD25 depletion reagent, or a combination thereof. Administration of one or more of cyclophosphamide, an anti-GITR antibody, a CD25 depletion reagent, or a combination thereof may occur before, during, or after infusion of the CAR-expressing cell-based product. Administration of one or more of cyclophosphamide, an anti-GITR antibody, a CD25 depletion reagent, or a combination thereof may occur before, during, or after infusion of the CAR-expressing cell-based product.
В некоторых вариантах осуществления способы изготовления включают снижение количества (например, истощение популяции) Treg-клеток перед изготовлением клетки, экспрессирующей CAR. Например, способы изготовления включают приведение образца, например, образца, полученного путем афереза, в контакт с антителом к GITR и/или антителом к CD25 (или его фрагментом или CD25-связывающим лигандом), например, для истощения по Treg-клеткам перед изготовлением продукта на основе клеток (например, T-клеток, NK-клеток), экспрессирующих CAR.In some embodiments, the manufacturing methods comprise reducing the number (e.g., depleting the population) of Treg cells prior to manufacturing the CAR-expressing cell. For example, the manufacturing methods comprise contacting a sample, e.g., a sample obtained by apheresis, with an anti-GITR antibody and/or an anti-CD25 antibody (or fragment thereof or CD25-binding ligand), e.g., to deplete Treg cells prior to manufacturing the CAR-expressing cell product (e.g., T cells, NK cells).
В некоторых вариантах осуществления субъект получает предварительное лечение с помощью циклофосфамида перед сбором клеток для изготовления продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR, за счет чего обеспечивается снижение риска рецидива у субъекта при лечении с помощью клеток, экспрессирующих CAR (например, лечении с помощью CTL019). В некоторых вариантах осуществления субъект получает предварительное лечение с помощью антитела к GITR перед сбором клеток для изготовления продукта на основе клеток (например, T-клеток или NK-клеток), экспрессирующих CAR, за счет чего обеспечивается снижение риска рецидива у субъекта при лечении с помощью клеток, экспрессирующих CAR.In some embodiments, the subject is pretreated with cyclophosphamide prior to harvesting the cells for the manufacture of a CAR-expressing cell product, thereby reducing the risk of relapse in the subject when treated with CAR-expressing cells (e.g., treatment with CTL019). In some embodiments, the subject is pretreated with an anti-GITR antibody prior to harvesting the cells for the manufacture of a CAR-expressing cell product (e.g., T cells or NK cells), thereby reducing the risk of relapse in the subject when treated with CAR-expressing cells.
В некоторых вариантах осуществления способ изготовления клеток, экспрессирующих CAR (например, T-клеток, NK-клеток), модифицируют для обеспечения истощения по Treg-клеткам перед изготовлением продукта на основе клеток (например, T-клеток, NK-клеток), экспрессирующих CAR (например, продукта CTL019). В некоторых вариантах осуществления истощение по CD25 применяют для истощения по Treg-клеткам перед изготовлением продукта на основе клеток (например, T-клеток или NK-клеток), экспрессирующих CAR (например, продукта CTL019).In some embodiments, a method for making CAR-expressing cells (e.g., T cells, NK cells) is modified to provide for depletion of Treg cells prior to making a CAR-expressing cell product (e.g., T cells, NK cells) (e.g., a CTL019 product). In some embodiments, CD25 depletion is used to deplete Treg cells prior to making a CAR-expressing cell product (e.g., T cells or NK cells) (e.g., a CTL019 product).
В некоторых вариантах осуществления популяция клеток, которая должна быть удалена, не представляет собой ни регуляторные Т-клетки, ни опухолевые клетки, а представляет собой клетки, которые в иных отношениях отрицательно влияют на размножение и/или функцию CAR-T-клеток, например, клетки, экспрессирующие CD14, CD11b, CD33, CD15 или другие маркеры, экспрессируемые потенциально иммуносупрессорными клетками. В некоторых вариантах осуществления предполагается, что такие клетки удаляют одновременно с регуляторными Т-клетками и/или опухолевыми клетками, или после указанного истощения, или в другом порядке.In some embodiments, the cell population to be removed is neither regulatory T cells nor tumor cells, but is cells that otherwise negatively affect the expansion and/or function of CAR T cells, such as cells expressing CD14, CD11b, CD33, CD15, or other markers expressed by potential immunosuppressive cells. In some embodiments, it is contemplated that such cells are removed simultaneously with the regulatory T cells and/or tumor cells, or after said depletion, or in another order.
Способы, описанные в данном документе, могут включать более одной стадии отбора, например, более одной стадии истощения. Обогащение популяции Т-клеток путем отрицательного отбора можно осуществлять, например, с помощью комбинации антител, направленных на поверхностные маркеры, уникальные для клеток, подвергаемых отрицательному отбору. Один из способов представляет собой сортировку и/или отбор клеток с помощью отрицательной магнитной иммуноадгезии или проточной цитометрии, в которых используется коктейль моноклональных антител, направленных на маркеры клеточной поверхности, присутствующие на клетках, подвергаемых отрицательному отбору. Например, для обогащения CD4+ клетками путем отрицательного отбора коктейль моноклональных антител может содержать антитела к CD14, CD20, CD11b, CD16, HLA-DR и CD8.The methods described herein may include more than one selection step, such as more than one depletion step. Enrichment of a T cell population by negative selection may be accomplished, for example, by using a combination of antibodies directed to surface markers unique to cells subject to negative selection. One method is cell sorting and/or selection by negative magnetic immunoadhesion or flow cytometry, which utilizes a cocktail of monoclonal antibodies directed to cell surface markers present on cells subject to negative selection. For example, to enrich CD4+ cells by negative selection, a cocktail of monoclonal antibodies may comprise antibodies to CD14, CD20, CD11b, CD16, HLA-DR, and CD8.
Способы, описанные в данном документе, могут дополнительно включать удаление из популяции клеток, экспрессирующих опухолевый антиген, например, опухолевый антиген, который не включает CD25, например, CD19, CD30, CD38, CD123, CD20, CD14 или CD11b, за счет чего обеспечивается получение популяции, истощенной по регуляторным Т-клеткам, например, истощенной по CD25+ клеткам или истощенной по CD25высокий клеткам и истощенной по клеткам с опухолевым антигеном, которая подходит для экспрессии CAR, например, CAR, описанного в данном документе. В некоторых вариантах осуществления клетки, экспрессирующие опухолевый антиген, удаляют одновременно с регуляторными Т-клетками, например, CD25+ клетками или CD25высокий клетками. Например, антитело к CD25 или его фрагмент и антитело к опухолевому антигену или его фрагмент могут быть присоединены к одному и тому же субстрату, например, грануле, который можно использовать для удаления клеток, или антитело к CD25 или его фрагмент или антитело к опухолевому антигену или его фрагмент могут быть присоединены к отдельным гранулам, смесь которых можно использовать для удаления клеток. В других вариантах осуществления удаление регуляторных Т-клеток, например, CD25+ клеток или CD25высокий клеток, и удаление клеток, экспрессирующих опухолевый антиген, является последовательным и может происходить, например, в любом порядке.The methods described herein may further comprise removing from the population cells expressing a tumor antigen, e.g., a tumor antigen that does not include CD25, e.g., CD19, CD30, CD38, CD123, CD20, CD14, or CD11b, thereby providing a population depleted of regulatory T cells, e.g., depleted of CD25+ cells or depleted of CD25high cells and depleted of cells with a tumor antigen, that is suitable for expressing a CAR, e.g., a CAR described herein. In some embodiments, cells expressing a tumor antigen are removed simultaneously with regulatory T cells, e.g., CD25+ cells or CD25high cells. For example, an anti-CD25 antibody or fragment thereof and an anti-tumor antigen antibody or fragment thereof may be attached to the same substrate, such as a bead, that can be used to remove cells, or an anti-CD25 antibody or fragment thereof or an anti-tumor antigen antibody or fragment thereof may be attached to separate beads, a mixture of which can be used to remove cells. In other embodiments, the removal of regulatory T cells, such as CD25+ cells or CD25 high cells, and the removal of cells expressing a tumor antigen are sequential and may occur, for example, in any order.
Также предусмотрены способы, которые включают удаление из популяции клеток, экспрессирующих ингибитор контрольной точки иммунного ответа, например, ингибитор контрольной точки иммунного ответа, описанный в данном документе, например, одного или нескольких из PD1+ клеток, LAG3+ клеток и TIM3+ клеток, за счет чего обеспечивается получение популяции, истощенной по регуляторным Т-клеткам, например, истощенной по CD25+ клеткам и истощенной по клеткам с ингибитором контрольной точки иммунного ответа, например, истощенной по PD1+, LAG3+ и/или TIM3+ клеткам. Иллюстративные ингибиторы контрольных точек иммунного ответа включают PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекулу MHC I класса, молекулу MHC II класса, GAL9, аденозин и TGF (например, TGF-бета), например, как описано в данном документе. В некоторых вариантах осуществления клетки, экспрессирующие ингибитор контрольной точки иммунного ответа, удаляют одновременно с регуляторными Т-клетками, например, CD25+ клетками или CD25высокий клетками. Например, антитело к CD25 или его фрагмент и антитело к ингибитору контрольной точки иммунного ответа или его фрагмент могут быть присоединены к одной и той же грануле, которую можно использовать для удаления клеток, или антитело к CD25 или его фрагмент и антитело к ингибитору контрольной точки иммунного ответа или его фрагмент могут быть присоединены к отдельным гранулам, смесь которых можно использовать для удаления клеток. В других вариантах осуществления удаление регуляторных Т-клеток, например, CD25+ клеток или CD25высокий клеток, и удаление клеток, экспрессирующих ингибитор контрольной точки иммунного ответа, является последовательным и может происходить, например, в любом порядке.Also provided are methods that include removing from a population of cells expressing an immune checkpoint inhibitor, e.g., an immune checkpoint inhibitor described herein, e.g., one or more of PD1+ cells, LAG3+ cells, and TIM3+ cells, thereby providing a population depleted of regulatory T cells, e.g., depleted of CD25+ cells, and depleted of cells with an immune checkpoint inhibitor, e.g., depleted of PD1+, LAG3+, and/or TIM3+ cells. Exemplary immune checkpoint inhibitors include PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (e.g., CEACAM-1, CEACAM-3, and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, MHC class I molecule, MHC class II molecule, GAL9, adenosine, and TGF (e.g., TGF-beta), such as described herein. In some embodiments, cells expressing an immune checkpoint inhibitor are co-depleted with regulatory T cells, such as CD25+ cells or CD25high cells. For example, an anti-CD25 antibody or fragment thereof and an anti-immune checkpoint inhibitor antibody or fragment thereof may be attached to the same bead that can be used to remove cells, or an anti-CD25 antibody or fragment thereof and an anti-immune checkpoint inhibitor antibody or fragment thereof may be attached to separate beads, a mixture of which can be used to remove cells. In other embodiments, the removal of regulatory T cells, such as CD25+ cells or CD25 high cells, and the removal of cells expressing an immune checkpoint inhibitor are sequential and may occur, for example, in any order.
Способы, описанные в данном документе, могут включать стадию положительного отбора. Например, Т-клетки можно выделять путем инкубирования с гранулами, конъюгированными с антителами к CD3/антителами к CD28 (например, 3×28), такими как Dynabeads® M-450 CD3/CD28 T, в течение периода времени, достаточного для положительного отбора требуемых Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления период времени составляет приблизительно 30 минут. В некоторых вариантах осуществления период времени находится в диапазоне от 30 минут до 36 часов или больше и включает все целочисленные значения в этом промежутке. В некоторых вариантах осуществления период времени составляет по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5 или 6 часов. В некоторых вариантах осуществления период времени составляет от 10 до 24 часов, например, 24 часа. Более длительное время инкубирования можно использовать для выделения Т-клеток в любой ситуации, при которой Т-клеток немного по сравнению с другими типами клеток, как, например, при выделении лимфоцитов, инфильтрирующих опухоль (TIL), из опухолевой ткани или у индивидуумов с ослабленным иммунитетом. Кроме того, при использовании более длительного времени инкубирования может увеличиваться эффективность захвата CD8+ Т-клеток. Таким образом, просто сокращая или удлиняя время, в течение которого Т-клетки имеют возможность связываться с гранулами с антителами к CD3/CD28, и/или увеличивая или уменьшая соотношение гранул и Т-клеток (как дополнительно описано в данном документе), можно предпочтительно осуществлять положительный или отрицательный отбор субпопуляций Т-клеток в начале культивирования или в другие моменты времени в ходе процесса. Кроме того, путем увеличения или уменьшения соотношения антител к CD3 и/или антител к CD28 на гранулах или другой поверхности можно предпочтительно осуществлять положительный или отрицательный отбор субпопуляций Т-клеток в начале культивирования или в другие необходимые моменты времени.The methods described herein may include a positive selection step. For example, T cells can be isolated by incubation with beads conjugated to anti-CD3 antibodies/anti-CD28 antibodies (e.g., 3x28), such as Dynabeads® M-450 CD3/CD28 T, for a period of time sufficient to positively select the desired T cells. In some embodiments, the period of time is about 30 minutes. In some embodiments, the period of time is between 30 minutes and 36 hours or more, and includes all integer values therebetween. In some embodiments, the period of time is at least 1, 2, 3, 4, 5, or 6 hours. In some embodiments, the period of time is between 10 and 24 hours, such as 24 hours. Longer incubation times can be used to isolate T cells in any situation in which T cells are few in number compared to other cell types, such as when isolating tumor infiltrating lymphocytes (TILs) from tumor tissue or from immunocompromised individuals. In addition, using longer incubation times can increase the efficiency of CD8+ T cell capture. Thus, by simply shortening or lengthening the time that T cells are able to bind to the anti-CD3/CD28 antibody beads and/or increasing or decreasing the ratio of beads to T cells (as further described herein), positive or negative selection of T cell subsets can be preferentially achieved at the start of the culture or at other time points during the process. In addition, by increasing or decreasing the ratio of anti-CD3 antibodies and/or anti-CD28 antibodies on the beads or other surface, positive or negative selection of T cell subsets can be preferentially achieved at the start of the culture or at other time points as desired.
В некоторых вариантах осуществления можно выбрать популяцию Т-клеток, которые экспрессируют один или несколько из IFNγ, TNFα, IL-17A, IL-2, IL-3, IL-4, GM-CSF, IL-10, IL-13, гранзима В и перфорина или других соответствующих молекул, например, других цитокинов. Способы скрининга в отношении клеточной экспрессии можно определить, например, посредством способов, описанных в публикации согласно PCT № WO 2013/126712.In some embodiments, a population of T cells that express one or more of IFNγ, TNFα, IL-17A, IL-2, IL-3, IL-4, GM-CSF, IL-10, IL-13, granzyme B and perforin or other relevant molecules, such as other cytokines, can be selected. Screening methods for cellular expression can be determined, for example, by the methods described in PCT Publication No. WO 2013/126712.
Для выделения необходимой популяции клеток путем положительного или отрицательного отбора можно варьировать концентрацию клеток и поверхность (например, частицы, такие как гранулы). В определенных аспектах может быть необходимым значительно уменьшить объем, в котором гранулы и клетки смешиваются друг с другом (например, увеличить концентрацию клеток), чтобы обеспечить максимальный контакт клеток и гранул. Например, в некоторых вариантах осуществления используют концентрацию, составляющую 10 миллиардов клеток/мл, 9 миллиардов/мл, 8 миллиардов/мл, 7 миллиардов/мл, 6 миллиардов/мл или 5 миллиардов/мл. В некоторых вариантах осуществления используют концентрацию, составляющую 1 миллиард клеток/мл. В некоторых вариантах осуществления используют концентрацию клеток, составляющую от 75, 80, 85, 90, 95 или 100 миллионов клеток/мл. В некоторых вариантах осуществления можно использовать концентрации, составляющие 125 или 150 миллионов клеток/мл.To isolate a desired cell population by positive or negative selection, the cell concentration and surface (e.g., particles such as beads) can be varied. In certain aspects, it may be necessary to significantly reduce the volume in which the beads and cells are mixed with each other (e.g., increase the cell concentration) to ensure maximum contact of the cells and beads. For example, in some embodiments, a concentration of 10 billion cells/mL, 9 billion/mL, 8 billion/mL, 7 billion/mL, 6 billion/mL, or 5 billion/mL is used. In some embodiments, a concentration of 1 billion cells/mL is used. In some embodiments, a cell concentration of 75, 80, 85, 90, 95, or 100 million cells/mL is used. In some embodiments, concentrations of 125 or 150 million cells/mL can be used.
Использование высоких концентраций может приводить к увеличению выхода клеток, активации клеток и размножения клеток. Кроме того, использование высоких концентраций клеток позволяет более эффективно захватывать клетки, которые могут характеризоваться слабой экспрессией антигенов-мишеней, представляющих интерес, такие как CD28-отрицательные Т-клетки, или клетки из образцов, в которых присутствует много опухолевых клеток (например, лейкозной крови, опухолевой ткани и т. д.). Такие популяции клеток могут иметь терапевтическую ценность, и может потребоваться их получение. Например, использование высокой концентрации клеток позволяет проводить более эффективный отбор CD8+ Т-клеток, которые обычно характеризуются более слабой экспрессией CD28.The use of high concentrations may result in increased cell yield, cell activation, and cell proliferation. In addition, the use of high cell concentrations may allow more efficient capture of cells that may have weak expression of the target antigens of interest, such as CD28-negative T cells, or cells from samples that contain many tumor cells (e.g., leukemia blood, tumor tissue, etc.). Such cell populations may have therapeutic value and may need to be recovered. For example, the use of high cell concentrations may allow more efficient selection of CD8+ T cells, which typically have weaker CD28 expression.
В некоторых вариантах осуществления может потребоваться использование более низких концентраций клеток. Благодаря значительному разбавлению смеси Т-клеток и поверхности (например, частиц, таких как гранулы) взаимодействие между частицами и клетками сводится к минимуму. При этом отбираются клетки, которые экспрессируют необходимые антигены, подлежащие связыванию с частицами, в высоких количествах. Например, CD4+ T-клетки экспрессируют CD28 на более высоких уровнях и захватываются в слабых концентрациях более эффективно, чем CD8+ T-клетки. В некоторых вариантах осуществления используемая концентрация клеток составляет 5×106/мл. В некоторых вариантах осуществления используемая концентрация может составлять от приблизительно 1×105/мл до 1×106/мл, включая любое целочисленное значение в этом промежутке.In some embodiments, it may be necessary to use lower concentrations of cells. By significantly diluting the mixture of T cells and a surface (e.g., particles such as beads), interactions between the particles and the cells are minimized. This selects for cells that express the desired antigens to be bound to the particles in high quantities. For example, CD4+ T cells express CD28 at higher levels and are captured at low concentrations more efficiently than CD8+ T cells. In some embodiments, the concentration of cells used is 5×10 6 /mL. In some embodiments, the concentration used may be from about 1×10 5 /mL to 1×10 6 /mL, including any integer value therebetween.
В некоторых вариантах осуществления клетки можно инкубировать на ротаторе в течение различных промежутков времени с различными скоростями при 2-10°C либо при комнатной температуре.In some embodiments, cells may be incubated on a rotator for varying periods of time at varying speeds at 2-10°C or at room temperature.
В некоторых вариантах осуществления множество иммунных эффекторных клеток в популяции не экспрессируют диацилглицеринкиназу (DGK), например, характеризуются дефицитом DGK. В некоторых вариантах осуществления множество иммунных эффекторных клеток в популяции не экспрессируют Ikaros, например, характеризуются дефицитом Ikaros. В некоторых вариантах осуществления множество иммунных эффекторных клеток в популяции не экспрессируют DGK и Ikaros, например, характеризуются дефицитом как DGK, так и Ikaros.In some embodiments, the plurality of immune effector cells in the population do not express diacylglycerol kinase (DGK), such as being deficient in DGK. In some embodiments, the plurality of immune effector cells in the population do not express Ikaros, such as being deficient in Ikaros. In some embodiments, the plurality of immune effector cells in the population do not express both DGK and Ikaros, such as being deficient in both DGK and Ikaros.
Т-клетки для стимуляции также можно замораживать после стадии промывания. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что стадия замораживания и последующего размораживания обеспечивает получение более однородного продукта за счет удаления гранулоцитов и в некоторой степени моноцитов из популяции клеток. После стадии промывания, на которой удаляют плазму крови и тромбоциты, клетки можно суспендировать в замораживающем растворе. Хотя многие замораживающие растворы и параметры для замораживания известны из уровня техники и будут применимыми в данном случае, один способ предусматривает использование PBS, содержащего 20% DMSO и 8% человеческий сывороточный альбумин, или культуральных сред, содержащих 10% декстран 40 в 5% декстрозе, 20% человеческий сывороточный альбумин и 7,5% DMSO или 31,25% PlasmaLyte-А, 31,25% раствор с 5% декстрозой в 0,45% NaCl, 10% декстран 40 в 5% декстрозе, 20% человеческий сывороточный альбумин и 7,5% DMSO, или других подходящих сред для замораживания клеток, содержащих, например, Hespan и PlasmaLyte A, и затем клетки замораживают до -80°C со скоростью 1° в минуту и хранят в паровой фазе в резервуаре для хранения жидкого азота. Можно применять другие способы контролируемого замораживания, а также неконтролируемого замораживания немедленно при -20°C или в жидком азоте.T cells for stimulation may also be frozen after a wash step. Without being bound by theory, it is believed that the freeze and thaw step provides a more homogeneous product by removing granulocytes and to some extent monocytes from the cell population. Following a wash step that removes plasma and platelets, the cells may be suspended in a freezing solution. Although many freezing solutions and freezing parameters are known in the art and will be applicable herein, one method involves using PBS containing 20% DMSO and 8% human serum albumin, or culture media containing 10
В некоторых вариантах осуществления криоконсервированные клетки размораживают и промывают, как описано в данном документе, и оставляют на один час при комнатной температуре перед активацией посредством способов по настоящему изобретению.In some embodiments, cryopreserved cells are thawed and washed as described herein and left for one hour at room temperature prior to activation using the methods of the present invention.
В контексте настоящего изобретения также предусмотрен сбор образцов крови или продукта афереза у субъекта в период времени до того, как могут понадобиться размножившиеся клетки, описанные в данном документе. Ввиду этого источник клеток, подлежащих размножению, можно собирать в любой необходимый момент времени, и необходимые клетки, такие как Т-клетки, можно выделять и замораживать для последующего применения в терапии с использованием иммунных эффекторных клеток для любых заболеваний или состояний, при которых будет благоприятной терапия с использованием иммунных эффекторных клеток, таких как описанные в данном документе. В некоторых вариантах осуществления образец крови или образец, полученный путем афереза, берут у в целом здорового субъекта. В некоторых вариантах осуществления образец крови или образец, полученный путем афереза, берут у в целом здорового субъекта, для которого существует риск развития заболевания, но у которого заболевание еще не развилось, и клетки, представляющие интерес, выделяют и замораживают для последующего применения. В некоторых вариантах осуществления Т-клетки можно размножать, замораживать и использовать позднее. В некоторых вариантах осуществления образцы собирают у пациента вскоре после диагностирования конкретного заболевания, описанного в данном документе, однако до проведения каких-либо видов лечения. В некоторых вариантах осуществления клетки выделяют из образца крови или продукта афереза у субъекта до осуществления какого-либо количества соответствующих способов лечения, в том числе без ограничения лечения такими средствами, как натализумаб, эфализумаб, противовирусные средства, химиотерапия, лучевая терапия, иммуносупрессивные средства, такие как циклоспорин, азатиоприн, метотрексат, микофенолат и FK506, антитела или другие иммунодеструктивные средства, такие как CAMPATH, антитела к CD3, цитоксан, флударабин, циклоспорин, FK506, рапамицин, микофеноловая кислота, стероиды, FR901228 и облучение.The present invention also provides for the collection of a blood sample or apheresis product from a subject at a time before the expanded cells described herein may be needed. As such, a source of cells to be expanded may be collected at any desired time, and the desired cells, such as T cells, may be isolated and frozen for subsequent use in immune effector cell therapy for any disease or condition that would benefit from immune effector cell therapy, such as those described herein. In some embodiments, the blood sample or apheresis sample is collected from a generally healthy subject. In some embodiments, the blood sample or apheresis sample is collected from a generally healthy subject who is at risk for developing a disease but has not yet developed the disease, and the cells of interest are isolated and frozen for subsequent use. In some embodiments, the T cells may be expanded, frozen, and used at a later date. In some embodiments, samples are collected from a patient shortly after diagnosis of a particular disease described herein, but prior to any treatments. In some embodiments, cells are isolated from a blood sample or apheresis product from a subject prior to any number of appropriate treatments, including but not limited to treatments such as natalizumab, efalizumab, antivirals, chemotherapy, radiation therapy, immunosuppressants such as cyclosporine, azathioprine, methotrexate, mycophenolate, and FK506, antibodies or other immunodestructive agents such as CAMPATH, anti-CD3 antibodies, cytoxan, fludarabine, cyclosporine, FK506, rapamycin, mycophenolic acid, steroids, FR901228, and radiation.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения Т-клетки получают от пациента непосредственно после лечения, при котором у субъекта остаются функциональные Т-клетки. В данном отношении наблюдалось, что после определенных видов лечения рака, в частности видов лечения лекарственными средствами, которые повреждают иммунную систему, вскоре после лечения в течение периода, когда пациенты обычно восстанавливаются после лечения, качество полученных Т-клеток может быть оптимальным или улучшенным в отношении их способности размножаться ex vivo. Аналогично, после манипуляций ex vivo с применением способов, описанных в данном документе, эти клетки могут находиться в состоянии, предпочтительном для улучшенного приживления и размножения in vivo. Таким образом, в контексте настоящего изобретения рассматривается сбор клеток крови, в том числе Т-клеток, дендритных клеток или других клеток гемопоэтической линии дифференцировки, во время этой фазы восстановления. Кроме того, в некоторых вариантах осуществления можно использовать мобилизацию (например, мобилизацию с помощью GM-CSF) и режимы кондиционирования для создания у субъекта состояния, благоприятного для репопуляции, рециркуляции, регенерации и/или размножения определенных типов клеток, особенно в течение определенного временного окна после терапии. Иллюстративные типы клеток включают Т-клетки, В-клетки, дендритные клетки и другие клетки иммунной системы.In some embodiments of the present invention, T cells are obtained from a patient immediately following a treatment whereby the subject retains functional T cells. In this regard, it has been observed that following certain cancer treatments, particularly treatments with drugs that damage the immune system, shortly after treatment during the period when patients are typically recovering from treatment, the quality of the T cells obtained may be optimal or improved in terms of their ability to proliferate ex vivo. Similarly, following ex vivo manipulation using the methods described herein, these cells may be in a state favorable for improved engraftment and expansion in vivo. Thus, in the context of the present invention, collecting blood cells, including T cells, dendritic cells or other cells of the hematopoietic lineage, during this recovery phase is contemplated. In addition, in some embodiments, mobilization (e.g., mobilization with GM-CSF) and conditioning regimens can be used to create a condition in a subject that is favorable for repopulation, recycling, regeneration, and/or expansion of certain cell types, especially during a certain time window after therapy. Exemplary cell types include T cells, B cells, dendritic cells, and other immune system cells.
В некоторых вариантах осуществления иммунные эффекторные клетки, экспрессирующие молекулу CAR, например, молекулу CAR, описанную в данном документе, получают от субъекта, который получил низкую дозу, усиливающую иммунный ответ, ингибитора mTOR. В некоторых вариантах осуществления популяцию иммунных эффекторных клеток, например, Т-клеток, подлежащих конструированию таким образом, чтобы они экспрессировали CAR, собирают спустя достаточное количество времени или после достаточного введения низкой дозы, усиливающей иммунный ответ, ингибитора mTOR, так чтобы уровень PD1-отрицательных иммунных эффекторных клеток, например, Т-клеток, или соотношение PD1-отрицательных иммунных эффекторных клеток, например, Т-клеток, и PD1-положительных иммунных эффекторных клеток, например, Т-клеток, у субъекта или в материале, собранном у субъекта, по меньшей мере транзиентно были повышены.In some embodiments, immune effector cells expressing a CAR molecule, e.g., a CAR molecule described herein, are obtained from a subject that has received a low dose, immune response enhancing mTOR inhibitor. In some embodiments, a population of immune effector cells, e.g., T cells, engineered to express a CAR are collected after a sufficient amount of time or after sufficient administration of a low dose, immune response enhancing mTOR inhibitor, such that the level of PD1-negative immune effector cells, e.g., T cells, or the ratio of PD1-negative immune effector cells, e.g., T cells, to PD1-positive immune effector cells, e.g., T cells, in the subject or in material collected from the subject is at least transiently increased.
В других вариантах осуществления популяция иммунных эффекторных клеток, например, Т-клеток, которые были сконструированы или будут сконструированы таким образом, чтобы они экспрессировали CAR, может быть обработана ex vivo путем приведения ее в контакт с таким количеством ингибитора mTOR, которое обеспечивает увеличение количества PD1-отрицательных иммунных эффекторных клеток, например, Т-клеток, или обеспечивает увеличение соотношения PD1-отрицательных иммунных эффекторных клеток, например, Т-клеток, и PD1-положительных иммунных эффекторных клеток, например, Т-клеток.In other embodiments, a population of immune effector cells, such as T cells, that have been or will be engineered to express a CAR can be treated ex vivo by contacting it with an amount of an mTOR inhibitor that provides an increase in the number of PD1-negative immune effector cells, such as T cells, or provides an increase in the ratio of PD1-negative immune effector cells, such as T cells, to PD1-positive immune effector cells, such as T cells.
Принято считать, что в способах применения можно использовать условия для культуральных сред, включающие человеческую сыворотку крови AB в концентрации 5% или меньше, например, 2%, и использовать известные условия и составы культуральных сред, например, описанные в Smith et al., "Ex vivo expansion of human T cells for adoptive immunotherapy using the novel Xeno-free CTS™ Immune Cell Serum Replacement" Clinical & Translational Immunology (2015) 4, e31; doi:10.1038/cti.2014.31.It is generally accepted that the methods of use may employ culture media conditions comprising human AB serum at a concentration of 5% or less, such as 2%, and employ known culture media conditions and compositions, such as those described in Smith et al., "Ex vivo expansion of human T cells for adoptive immunotherapy using the novel Xeno-free CTS™ Immune Cell Serum Replacement" Clinical & Translational Immunology (2015) 4, e31; doi:10.1038/cti.2014.31.
В некоторых вариантах осуществления в способах применения можно использовать условия среды, включающие по меньшей мере приблизительно 0,1%, 0,5%, 1,0%, 1,5%, 2%, 2,5%, 3%, 3,5%, 4%, 4,5%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9% или 10% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 0,5%-5%, приблизительно 0,5%-4,5%, приблизительно 0,5%-4%, приблизительно 0,5%-3,5%, приблизительно 0,5%-3%, приблизительно 0,5%-2,5%, приблизительно 0,5%-2%, приблизительно 0,5%-1,5%, приблизительно 0,5%-1,0%, приблизительно 1,0%-5%, приблизительно 1,5%-5%, приблизительно 2%-5%, приблизительно 2,5%-5%, приблизительно 3%-5%, приблизительно 3,5%-5%, приблизительно 4%-5% или приблизительно 4,5%-5% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 0,5% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 0,5% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 1% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 1,5% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 2% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 2,5% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 3% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 3,5% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 4% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 4,5% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления среда содержит приблизительно 5% сыворотки. В некоторых вариантах осуществления сыворотка предусматривает человеческую сыворотку, например, человеческую сыворотку AB. В некоторых вариантах осуществления сыворотка представляет собой человеческую сыворотку, которой предоставили возможность естественным образом свернуться после сбора, например, сыворотку после коагуляции (OTC). В некоторых вариантах осуществления сыворотка представляет собой человеческую сыворотку, полученную из плазмы крови. Сыворотку, полученную из плазмы крови, можно получить путем удаления фибрина из объединенной человеческой плазмы крови, собранной в присутствии антикоагулянта, например, цитрата натрия.In some embodiments, the methods of use may utilize medium conditions comprising at least about 0.1%, 0.5%, 1.0%, 1.5%, 2%, 2.5%, 3%, 3.5%, 4%, 4.5%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, or 10% serum. In some embodiments, the medium comprises about 0.5%-5%, about 0.5%-4.5%, about 0.5%-4%, about 0.5%-3.5%, about 0.5%-3%, about 0.5%-2.5%, about 0.5%-2%, about 0.5%-1.5%, about 0.5%-1.0%, about 1.0%-5%, about 1.5%-5%, about 2%-5%, about 2.5%-5%, about 3%-5%, about 3.5%-5%, about 4%-5%, or about 4.5%-5% serum. In some embodiments, the medium comprises about 0.5% serum. In some embodiments, the medium comprises about 0.5% serum. In some embodiments, the medium comprises about 1% serum. In some embodiments, the medium comprises about 1.5% serum. In some embodiments, the medium comprises about 2% serum. In some embodiments, the medium comprises about 2.5% serum. In some embodiments, the medium comprises about 3% serum. In some embodiments, the medium comprises about 3.5% serum. In some embodiments, the medium comprises about 4% serum. In some embodiments, the medium comprises about 4.5% serum. In some embodiments, the medium comprises about 5% serum. In some embodiments, the serum is human serum, such as human AB serum. In some embodiments, the serum is human serum that has been allowed to clot naturally after collection, such as over-the-counter (OTC) serum. In some embodiments, the serum is human plasma-derived serum. Plasma-derived serum can be obtained by removing fibrin from pooled human plasma collected in the presence of an anticoagulant, such as sodium citrate.
В некоторых вариантах осуществления в способах применения можно использовать условия для культуральных сред, включающие бессывороточную среду. В некоторых вариантах осуществления бессывороточная среда представляет собой OpTmizer™ CTS™ (LifeTech), ImmunoCult™ XF (Stemcell Technologies), CellGro™ (CellGenix), TexMacs™ (Miltenyi), Stemline™ (Sigma), Xvivo15™ (Lonza), PrimeXV® (Irvine Scientific) или StemXVivo® (R&D Systems). Бессывороточную среду можно дополнять имитатором сыворотки, таким как ICSR (заменитель сыворотки для иммунных клеток) от LifeTech. Уровень имитатора сыворотки (например, ICSR) может составлять, например, вплоть до 5%, например, приблизительно 1%, 2%, 3%, 4% или 5%. В некоторых вариантах осуществления бессывороточную среду можно дополнять сывороткой, например, человеческой сывороткой, например, человеческой сывороткой AB. В некоторых вариантах осуществления сыворотка представляет собой человеческую сыворотку, которой предоставили возможность естественным образом свернуться после сбора, например, сыворотку после коагуляции (OTC). В некоторых вариантах осуществления сыворотка представляет собой человеческую сыворотку, полученную из плазмы крови. Сыворотку, полученную из плазмы крови, можно получить путем удаления фибрина из объединенной человеческой плазмы крови, собранной в присутствии антикоагулянта, например, цитрата натрия.In some embodiments, the methods of use may utilize culture media conditions that include serum-free medium. In some embodiments, the serum-free medium is OpTmizer™ CTS™ (LifeTech), ImmunoCult™ XF (Stemcell Technologies), CellGro™ (CellGenix), TexMacs™ (Miltenyi), Stemline™ (Sigma), Xvivo15™ (Lonza), PrimeXV® (Irvine Scientific), or StemXVivo® (R&D Systems). The serum-free medium may be supplemented with a serum simulant, such as ICSR (Immune Cell Serum Replacer) from LifeTech. The level of serum simulant (e.g., ICSR) may be, for example, up to 5%, such as about 1%, 2%, 3%, 4%, or 5%. In some embodiments, the serum-free medium can be supplemented with serum, such as human serum, such as human AB serum. In some embodiments, the serum is human serum that has been allowed to clot naturally after collection, such as over-the-counter (OTC) serum. In some embodiments, the serum is human plasma-derived serum. Plasma-derived serum can be obtained by removing fibrin from pooled human plasma collected in the presence of an anticoagulant, such as sodium citrate.
В некоторых вариантах осуществления Т-клетки в популяции характеризуются дефицитом диацилглицеринкиназы (DGK). Клетки с дефицитом DGK включают клетки, которые не экспрессируют DGK в виде РНК или белка или характеризуются сниженной или ингибированной активностью DGK. Клетки с дефицитом DGK можно получить с помощью генетических подходов, например, путем введения средств для РНК-интерференции, например, siRNA, shRNA, miRNA, для снижения или предотвращения экспрессии DGK. В качестве альтернативы клетки с дефицитом DGK можно получить путем обработки ингибиторами DGK, описанными в данном документе.In some embodiments, the T cells in the population are deficient in diacylglycerol kinase (DGK). DGK-deficient cells include cells that do not express DGK as RNA or protein or have reduced or inhibited DGK activity. DGK-deficient cells can be generated using genetic approaches, such as by administering RNA interference agents, such as siRNA, shRNA, miRNA, to reduce or prevent DGK expression. Alternatively, DGK-deficient cells can be generated by treatment with the DGK inhibitors described herein.
В некоторых вариантах осуществления Т-клетки в популяции характеризуются дефицитом Ikaros. Клетки с дефицитом Ikaros включают клетки, которые не экспрессируют Ikaros в виде РНК или белка или характеризуются сниженной или ингибированной активностью Ikaros; клетки с дефицитом Ikaros можно получить с помощью генетических подходов, например, путем введения средств для РНК-интерференции, например, siRNA, shRNA, miRNA, для снижения или предотвращения экспрессии Ikaros. В качестве альтернативы клетки с дефицитом Ikaros можно получить путем обработки ингибиторами Ikaros, например, леналидомидом.In some embodiments, the T cells in the population are deficient in Ikaros. Ikaros-deficient cells include cells that do not express Ikaros as RNA or protein or have reduced or inhibited Ikaros activity; Ikaros-deficient cells can be produced by genetic approaches, such as by introducing RNA interference agents, such as siRNA, shRNA, miRNA, to reduce or prevent Ikaros expression. Alternatively, Ikaros-deficient cells can be produced by treatment with Ikaros inhibitors, such as lenalidomide.
В ряде вариантов осуществления популяция Т-клеток характеризуется дефицитом DGK и дефицитом Ikaros, например, в ней не происходит экспрессия DGK и Ikaros или она характеризуется сниженной или ингибированной активностью DGK и Ikaros. Такие клетки с дефицитом DGK и Ikaros можно получить любым из способов, описанных в данном документе.In some embodiments, the T cell population is DGK deficient and Ikaros deficient, such as lacking DGK and Ikaros expression or having reduced or inhibited DGK and Ikaros activity. Such DGK and Ikaros deficient cells can be obtained by any of the methods described herein.
В некоторых вариантах осуществления NK-клетки получают от субъекта. В некоторых вариантах осуществления NK-клетки представляют собой линию NK-клеток, например, линию клеток NK-92 (Conkwest).In some embodiments, the NK cells are obtained from a subject. In some embodiments, the NK cells are an NK cell line, such as an NK-92 cell line (Conkwest).
Аллогенные клетки, экспрессирующие CARAllogeneic CAR expressing cells
В ряде вариантов осуществления, описанных в данном документе, иммунная эффекторная клетка может представлять собой аллогенную иммунную эффекторную клетку, например, Т-клетку или NK-клетку. Например, клетка может представлять собой аллогенную Т-клетку, например, аллогенную Т-клетку, в которой отсутствует экспрессия функционального Т-клеточного рецептора (TCR) и/или человеческого лейкоцитарного антигена (HLA), например, HLA I класса и/или HLA II класса.In some embodiments described herein, the immune effector cell may be an allogeneic immune effector cell, such as a T cell or an NK cell. For example, the cell may be an allogeneic T cell, such as an allogeneic T cell that lacks expression of a functional T cell receptor (TCR) and/or a human leukocyte antigen (HLA), such as HLA class I and/or HLA class II.
T-клетку, в которой отсутствует функциональный TCR, можно, например, сконструировать таким образом, чтобы она вообще не экспрессировала функциональный TCR на своей поверхности, сконструировать таким образом, чтобы она не экспрессировала одну или несколько субъединиц, которые образуют функциональный TCR (например, сконструировать таким образом, чтобы она не экспрессировала (или демонстрировала сниженную экспрессию) TCR-альфа, TCR-бета, TCR-гамма, TCR-дельта, TCR-эпсилон и/или TCR-дзета), или сконструировать таким образом, чтобы она продуцировала очень небольшое количество функционального TCR на своей поверхности. В качестве альтернативы Т-клетка может экспрессировать существенно нарушенный TCR, например, посредством экспрессии мутантных или усеченных форм одной или нескольких субъединиц TCR. Термин "существенно нарушенный TCR" означает, что этот TCR не будет вызывать нежелательную иммунную реакцию у хозяина.A T cell that lacks a functional TCR may, for example, be engineered not to express a functional TCR on its surface at all, engineered not to express one or more of the subunits that form a functional TCR (e.g., engineered not to express (or to exhibit reduced expression of) TCR alpha, TCR beta, TCR gamma, TCR delta, TCR epsilon, and/or TCR zeta), or engineered to produce very little functional TCR on its surface. Alternatively, the T cell may express a substantially impaired TCR, such as by expressing mutant or truncated forms of one or more TCR subunits. The term "substantially impaired TCR" means that the TCR will not elicit an unwanted immune response in the host.
Т-клетку, описанную в данном документе, можно, например, сконструировать таким образом, чтобы она не экспрессировала функциональный HLA на своей поверхности. Например, Т-клетку, описанную в данном документе, можно сконструировать таким образом, чтобы экспрессия HLA, например, HLA I класса и/или HLA II класса, на поверхности клетки была подавлена. В некоторых вариантах осуществления подавление экспрессии HLA можно осуществлять путем снижения или устранения экспрессии бета-2-микроглобулина (B2M).A T cell as described herein can, for example, be engineered to not express functional HLA on its surface. For example, a T cell as described herein can be engineered to suppress expression of HLA, such as HLA class I and/or HLA class II, on the cell surface. In some embodiments, suppression of HLA expression can be accomplished by reducing or eliminating expression of beta-2 microglobulin (B2M).
В некоторых вариантах осуществления в Т-клетке может отсутствовать функциональный TCR и функциональный HLA, например, HLA I класса и/или HLA II класса.In some embodiments, the T cell may lack a functional TCR and a functional HLA, such as HLA class I and/or HLA class II.
Модифицированные Т-клетки, в которых отсутствует экспрессия функционального TCR и/или HLA, можно получить любым подходящим способом, в том числе путем нокаута или нокдауна одной или нескольких субъединиц TCR или HLA. Например, можно предусмотреть нокдаун TCR и/или HLA в Т-клетке с помощью siRNA, shRNA, коротких палиндромных повторов, регулярно расположенных группами (CRISPR), эффекторной нуклеазы, подобной активаторам транскрипции (TALEN), или эндонуклеазы с "цинковыми пальцами" (ZFN).Modified T cells that lack expression of a functional TCR and/or HLA can be produced by any suitable method, including by knocking out or knocking down one or more subunits of the TCR or HLA. For example, knocking down of the TCR and/or HLA in a T cell can be envisaged using siRNA, shRNA, clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR), transcription activator-like effector nuclease (TALEN), or zinc finger endonuclease (ZFN).
В некоторых вариантах осуществления аллогенная клетка может представлять собой клетку, в которой не экспрессируется или экспрессируется на низких уровнях ингибирующая молекула, например, благодаря любому способу, описанному в данном документе. Например, клетка может представлять собой клетку, в которой не экспрессируется или экспрессируется на низких уровнях ингибирующая молекула, например, молекула, которая может уменьшать способность клетки, экспрессирующей CAR, осуществлять иммунный эффекторный ответ. Примеры ингибирующих молекул включают PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекулу MHC I класса, молекулу MHC II класса, GAL9, аденозин и TGF (например, TGF-бета). Ингибирование ингибирующей молекулы, например, путем ингибирования на уровне ДНК, РНК или белка, может оптимизировать функциональные характеристики клетки, экспрессирующей CAR. В ряде вариантов осуществления можно применять ингибирующую нуклеиновую кислоту, например, ингибирующую нуклеиновую кислоту, например, dsRNA, например, siRNA или shRNA, короткие палиндромные повторы, регулярно расположенные группами (CRISPR), эффекторную нуклеазу, подобную активаторам транскрипции (TALEN), или эндонуклеазу с "цинковыми пальцами" (ZFN), например, описанные в данном документе.In some embodiments, the allogeneic cell may be a cell that does not express or expresses at low levels an inhibitory molecule, such as by any method described herein. For example, the cell may be a cell that does not express or expresses at low levels an inhibitory molecule, such as a molecule that can reduce the ability of a cell expressing a CAR to carry out an immune effector response. Examples of inhibitory molecules include PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (e.g., CEACAM-1, CEACAM-3, and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, MHC class I molecule, MHC class II molecule, GAL9, adenosine, and TGF (e.g., TGF-beta). Inhibition of an inhibitory molecule, such as by inhibition at the DNA, RNA, or protein level, can optimize the functional characteristics of a cell expressing a CAR. In some embodiments, an inhibitory nucleic acid may be used, such as an inhibitory nucleic acid such as a dsRNA, such as an siRNA or shRNA, a clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR), a transcription activator-like effector nuclease (TALEN), or a zinc finger endonuclease (ZFN), such as those described herein.
siRNA и shRNA для ингибирования TCR или HLAsiRNA and shRNA for TCR or HLA inhibition
В некоторых вариантах осуществления экспрессию TCR и/или экспрессию HLA можно ингибировать с помощью siRNA или shRNA, нацеливающихся на нуклеиновую кислоту, кодирующую TCR и/или HLA, и/или ингибирующую молекулу, описанную в данном документе (например, PD1, PD-L1, PD- L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекулу MHC I класса, молекулу MHC II класса, GAL9, аденозин и TGF-бета), в клетке, например, Т-клетке.In some embodiments, TCR expression and/or HLA expression can be inhibited by siRNA or shRNA targeting a nucleic acid encoding a TCR and/or HLA and/or an inhibitory molecule described herein (e.g., PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (e.g., CEACAM-1, CEACAM-3, and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, MHC class I molecule, MHC class II molecule, GAL9, adenosine, and TGF-beta) in a cell, such as a T cell.
Системы экспрессии для siRNA и shRNA и иллюстративные shRNA описаны, например, в абзацах 649 и 650 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена посредством ссылки во всей своей полноте.Expression systems for siRNA and shRNA and exemplary shRNAs are described, for example, in paragraphs 649 and 650 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated by reference in its entirety.
CRISPR для ингибирования TCR или HLACRISPR for TCR or HLA inhibition
Как используется в данном документе, "CRISPR", или "CRISPR для TCR и/или HLA", или "CRISPR для ингибирования TCR и/или HLA" относится к набору коротких палиндромных повторов, регулярно расположенных группами, или к системе, содержащей такой набор повторов. Как используется в данном документе, "Cas" относится к CRISPR-ассоциированному белку. Система "CRISPR/Cas" относится к системе, полученной из CRISPR и Cas, которую можно применять для сайленсинга или осуществления мутации гена TCR и/или HLA и/или ингибирующей молекулы, описанной в данном документе (например, PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекулы MHC I класса, молекулы MHC II класса, GAL9, аденозина и TGF-бета), в клетке, например, Т-клетке.As used herein, "CRISPR" or "CRISPR for TCR and/or HLA" or "CRISPR for inhibition of TCR and/or HLA" refers to a clustered regularly interspaced short palindromic repeat array or a system containing such a repeat array. As used herein, "Cas" refers to CRISPR-associated protein. The "CRISPR/Cas system" refers to a system derived from CRISPR and Cas that can be used to silence or mutate a TCR and/or HLA gene and/or an inhibitory molecule described herein (e.g., PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (e.g., CEACAM-1, CEACAM-3, and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, MHC class I molecules, MHC class II molecules, GAL9, adenosine, and TGF-beta) in a cell, such as a T cell.
Система CRISPR/Cas и пути ее применения описаны, например, в абзацах 651-658 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена посредством ссылки во всей своей полноте.The CRISPR/Cas system and its uses are described, for example, in paragraphs 651-658 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated by reference in its entirety.
TALEN для ингибирования TCR и/или HLATALENs for TCR and/or HLA inhibition
"TALEN", или "TALEN для HLA и/или TCR", или "TALEN для ингибирования HLA и/или TCR" относится к эффекторной нуклеазе, подобной активаторам транскрипции, представляющей собой искусственную нуклеазу, которую можно применять для редактирования гена HLA и/или TCR и/или ингибирующей молекулы, описанной в данном документе (например, PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекулы MHC I класса, молекулы MHC II класса, GAL9, аденозина и TGF-бета), в клетке, например, T-клетке."TALEN" or "TALEN for HLA and/or TCR" or "TALEN for inhibiting HLA and/or TCR" refers to a transcription activator-like effector nuclease, which is an artificial nuclease that can be used to edit an HLA and/or TCR gene and/or an inhibitory molecule described herein (e.g., PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (e.g., CEACAM-1, CEACAM-3, and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, MHC class I molecules, MHC class II molecules, GAL9, adenosine and TGF-beta) in a cell, such as a T cell.
TALEN и пути их применения описаны, например, в абзацах 659-665 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена посредством ссылки во всей своей полноте.TALENs and their uses are described, for example, in paragraphs 659-665 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated by reference in its entirety.
Нуклеаза с "цинковыми пальцами" для ингибирования HLA и/или TCRZinc finger nuclease for inhibition of HLA and/or TCR
"ZFN", или "нуклеаза с "цинковыми пальцами", или "ZFN для HLA и/или TCR", или "ZFN для ингибирования HLA и/или TCR" относится к нуклеазе с "цинковыми пальцами", представляющей собой искусственную нуклеазу, которую можно применять для редактирования гена HLA и/или TCR и/или ингибирующей молекулы, описанной в данном документе (например, PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (например, CEACAM-1, CEACAM-3 и/или CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 или CD270), KIR, A2aR, молекулы MHC I класса, молекулы MHC II класса, GAL9, аденозина и TGF-бета), в клетке, например, T-клетке."ZFN" or "zinc finger nuclease" or "ZFN for HLA and/or TCR" or "ZFN for inhibiting HLA and/or TCR" refers to a zinc finger nuclease, which is an artificial nuclease that can be used to edit an HLA and/or TCR gene and/or an inhibitory molecule described herein (e.g., PD1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, CEACAM (e.g., CEACAM-1, CEACAM-3, and/or CEACAM-5), LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4, CD80, CD86, B7-H3 (CD276), B7-H4 (VTCN1), HVEM (TNFRSF14 or CD270), KIR, A2aR, MHC class I molecules, MHC class II, GAL9, adenosine, and TGF-beta) in a cell, such as a T cell.
ZFN и пути их применения описаны, например, в абзацах 666-671 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена посредством ссылки во всей своей полноте.ZFNs and their uses are described, for example, in paragraphs 666-671 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated by reference in its entirety.
Экспрессия теломеразыTelomerase expression
Теломеры играют важнейшую роль в персистенции соматических клеток, и их длину поддерживает теломераза (TERT). Длина теломер в клетках CLL может быть очень короткой (Roth et al., "Significantly shorter telomeres in T-cells of patients with ZAP-70+/CD38 chronic lymphocytic leukaemia" British Journal of Haematology, 143, 383-386., August 28 2008) и может быть еще короче в изготовленных клетках, экспрессирующих CAR, например, клетках CART19, что ограничивает их потенциал размножения после адоптивного переноса пациенту. Экспрессия теломеразы может "спасти" клетки, экспрессирующие CAR, от репликативного истощения.Telomeres play a critical role in the persistence of somatic cells and their length is maintained by telomerase (TERT). Telomere length can be very short in CLL cells (Roth et al., "Significantly shorter telomeres in T-cells of patients with ZAP-70+/CD38 chronic lymphocytic leukaemia" British Journal of Haematology, 143, 383-386., August 28 2008) and can be even shorter in engineered CAR-expressing cells, such as CART19 cells, limiting their expansion potential after adoptive transfer into a patient. Telomerase expression can "rescue" CAR-expressing cells from replicative exhaustion.
Не ограничиваясь какой-либо конкретной теорией, полагают, что в некоторых вариантах осуществления для терапевтической Т-клетки характерна кратковременная персистенция в организме пациента ввиду укороченных теломер в Т-клетке; соответственно, трансфекция с использованием гена теломеразы может приводить к удлинению теломер в Т-клетке и улучшению персистенции Т-клетки в организме пациента. См. Carl June, "Adoptive T cell therapy for cancer in the clinic", Journal of Clinical Investigation, 117:1466-1476 (2007). Таким образом, в некоторых вариантах осуществления иммунная эффекторная клетка, например, Т-клетка, характеризуется эктопической экспрессией субъединицы теломеразы, например, каталитической субъединицы теломеразы, например, TERT, например, hTERT. В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрен способ получения клетки, экспрессирующей CAR, включающий приведение клетки в контакт с нуклеиновой кислотой, кодирующей субъединицу теломеразы, например, каталитическую субъединицу теломеразы, например, TERT, например, hTERT. Клетку можно приводить в контакт с нуклеиновой кислотой перед приведением в контакт с конструкцией, кодирующей CAR, одновременно с этим или после этого.Without wishing to be bound by any particular theory, it is believed that in some embodiments, a therapeutic T cell has short-term persistence in a patient due to shortened telomeres in the T cell; accordingly, transfection with a telomerase gene may result in lengthening of telomeres in the T cell and improved persistence of the T cell in the patient. See Carl June, "Adoptive T cell therapy for cancer in the clinic," Journal of Clinical Investigation, 117:1466-1476 (2007). Thus, in some embodiments, an immune effector cell, e.g., a T cell, has ectopic expression of a telomerase subunit, e.g., a telomerase catalytic subunit, e.g., TERT, e.g., hTERT. In some embodiments, the present invention provides a method of producing a cell expressing a CAR, comprising contacting the cell with a nucleic acid encoding a telomerase subunit, e.g., a telomerase catalytic subunit, e.g., TERT, e.g., hTERT. The cell may be contacted with the nucleic acid before, simultaneously with, or after contacting the construct encoding the CAR.
Экспрессия теломеразы может быть стабильной (например, нуклеиновая кислота может интегрироваться в геном клетки) или транзиентной (например, нуклеиновая кислота не интегрируется, и уровень экспрессии снижается спустя некоторый период времени, например, через несколько дней). Стабильная экспрессия может быть достигнута путем трансфекции или трансдукции клетки с помощью ДНК, кодирующей субъединицу теломеразы и селектируемый маркер, и отбора в отношении стабильных интегрантов. В качестве альтернативы или в комбинации, стабильная экспрессия может быть достигнута посредством сайт-специфической рекомбинации, например, с помощью системы Cre/Lox или FLP/FRT.Telomerase expression may be stable (e.g., the nucleic acid may integrate into the cell genome) or transient (e.g., the nucleic acid does not integrate and the expression level decreases after some period of time, such as a few days). Stable expression may be achieved by transfecting or transducing a cell with DNA encoding a telomerase subunit and a selectable marker and selecting for stable integrants. Alternatively or in combination, stable expression may be achieved by site-specific recombination, such as with the Cre/Lox or FLP/FRT system.
Транзиентная экспрессия может предусматривать трансфекцию или трансдукцию с помощью нуклеиновой кислоты, например, ДНК или РНК, такой как мРНК. В некоторых вариантах осуществления транзиентная трансфекция мРНК позволяет избежать генетической нестабильности, иногда связанной со стабильной трансфекцией TERT. Транзиентная экспрессия экзогенной теломеразной активности описана, например, в международной заявке WO2014/130909, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. В ряде вариантов осуществления трансфекцию субъединицы теломеразы с использованием мРНК проводят в соответствии с платформой Therapeutics™ на основе матричных РНК, коммерциализированной Moderna Therapeutics. Например, способ может представлять собой способ, описанный в патенте США № 8710200, 8822663, 8680069, 8754062, 8664194 или 8680069.Transient expression may involve transfection or transduction with a nucleic acid, such as DNA or RNA, such as mRNA. In some embodiments, transient transfection of mRNA avoids the genetic instability sometimes associated with stable transfection of TERT. Transient expression of exogenous telomerase activity is described, for example, in International Application WO2014/130909, which is incorporated herein by reference in its entirety. In some embodiments, transfection of the telomerase subunit using mRNA is performed in accordance with the messenger RNA Therapeutics™ platform commercialized by Moderna Therapeutics. For example, the method may be the method described in U.S. Patent Nos. 8,710,200, 8,822,663, 8,680,069, 8,754,062, 8,664,194, or 8,680,069.
В некоторых вариантах осуществления hTERT имеет аминокислотную последовательность с ID белка в GenBank AAC51724.1 (Meyerson et al., "hEST2, the Putative Human Telomerase Catalytic Subunit Gene, Is Up-Regulated in Tumor Cells and during Immortalization" Cell, том 90, выпуск 4, 22 августа 1997 г., страницы 785-795): MPRAPRCRAVRSLLRSHYREVLPLATFVRRLGPQGWRLVQRGDPAAFRALVAQCLVCVPWDARPPPAAPSFRQVSCLKELVARVLQRLCERGAKNVLAFGFALLDGARGGPPEAFTTSVRSYLPNTVTDALRGSGAWGLLLRRVGDDVLVHLLARCALFVLVAPSCAYQVCGPPLYQLGAATQARPPPHASGPRRRLGCERAWNHSVREAGVPLGLPAPGARRRGGSASRSLPLPKRPRRGAAPEPERTPVGQGSWAHPGRTRGPSDRGFCVVSPARPAEEATSLEGALSGTRHSHPSVGRQHHAGPPSTSRPPRPWDTPCPPVYAETKHFLYSSGDKEQLRPSFLLSSLRPSLTGARRLVETIFLGSRPWMPGTPRRLPRLPQRYWQMRPLFLELLGNHAQCPYGVLLKTHCPLRAAVTPAAGVCAREKPQGSVAAPEEEDTDPRRLVQLLRQHSSPWQVYGFVRACLRRLVPPGLWGSRHNERRFLRNTKKFISLGKHAKLSLQELTWKMSVRGCAWLRRSPGVGCVPAAEHRLREEILAKFLHWLMSVYVVELLRSFFYVTETTFQKNRLFFYRKSVWSKLQSIGIRQHLKRVQLRELSEAEVRQHREARPALLTSRLRFIPKPDGLRPIVNMDYVVGARTFRREKRAERLTSRVKALFSVLNYERARRPGLLGASVLGLDDIHRAWRTFVLRVRAQDPPPELYFVKVDVTGAYDTIPQDRLTEVIASIIKPQNTYCVRRYAVVQKAAHGHVRKAFKSHVSTLTDLQPYMRQFVAHLQETSPLRDAVVIEQSSSLNEASSGLFDVFLRFMCHHAVRIRGKSYVQCQGIPQGSILSTLLCSLCYGDMENKLFAGIRRDGLLLRLVDDFLLVTPHLTHAKTFLRTLVRGVPEYGCVVNLRKTVVNFPVEDEALGGTAFVQMPAHGLFPWCGLLLDTRTLEVQSDYSSYARTSIRASLTFNRGFKAGRNMRRKLFGVLRLKCHSLFLDLQVNSLQTVCTNIYKILLLQAYRFHACVLQLPFHQQVWKNPTFFLRVISDTASLCYSILKAKNAGMSLGAKGAAGPLPSEAVQWLCHQAFLLKLTRHRVTYVPLLGSLRTAQTQLSRKLPGTTLTALEAAANPALPSDFKTILD (SEQ ID NO: 284)In some embodiments, hTERT has the amino acid sequence of GenBank protein ID AAC51724.1 (Meyerson et al., "hEST2, the Putative Human Telomerase Catalytic Subunit Gene, Is Up-Regulated in Tumor Cells and during Immortalization," Cell,
В некоторых вариантах осуществления hTERT имеет последовательность, характеризующуюся по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичностью с последовательностью под SEQ ID NO: 284. В некоторых вариантах осуществления hТРЕТ имеет последовательность под SEQ ID NO: 284. В некоторых вариантах осуществления hTERT содержит делецию (например, размером не более 5, 10, 15, 20 или 30 аминокислот) на N-конце, С-конце или на них обоих. В некоторых вариантах осуществления hTERT содержит трансгенную аминокислотную последовательность (например, размером не более 5, 10, 15, 20 или 30 аминокислот) на N-конце, C-конце или на них обоих.In some embodiments, hTERT has a sequence that has at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity to the sequence of SEQ ID NO: 284. In some embodiments, hTERT has the sequence of SEQ ID NO: 284. In some embodiments, hTERT comprises a deletion (e.g., of no more than 5, 10, 15, 20, or 30 amino acids) at the N-terminus, the C-terminus, or both. In some embodiments, hTERT comprises a transgenic amino acid sequence (e.g., of no more than 5, 10, 15, 20, or 30 amino acids) at the N-terminus, the C-terminus, or both.
В некоторых вариантах осуществления hTERT кодируется последовательностью нуклеиновой кислоты под № доступа в GenBank AF018167 (Meyerson et al., "hEST2, the Putative Human Telomerase Catalytic Subunit Gene, Is Up-Regulated in Tumor Cells and during Immortalization" Cell, том 90, выпуск 4, 22 августа 1997 г., страницы 785-795).In some embodiments, hTERT is encoded by the nucleic acid sequence of GenBank Accession No. AF018167 (Meyerson et al., "hEST2, the Putative Human Telomerase Catalytic Subunit Gene, Is Up-Regulated in Tumor Cells and during Immortalization," Cell,
Активация и размножение иммунных эффекторных клеток (например, T-клеток)Activation and expansion of immune effector cells (eg, T cells)
Иммунные эффекторные клетки, такие как Т-клетки, полученные или обогащенные посредством способов, описанных в данном документе, можно активировать и размножать, как правило, посредством способов, описанных, например, в патентах США №№ 6352694; 6534055; 6905680; 6692964; 5858358; 6887466; 6905681; 7144575; 7067318; 7172869; 7232566; 7175843; 5883223; 6905874; 6797514; 6867041 и публикации заявки на патент США № 20060121005.Immune effector cells, such as T cells, obtained or enriched by the methods described herein can be activated and expanded, typically by the methods described in, for example, U.S. Patent Nos. 6,352,694; 6,534,055; 6,905,680; 6,692,964; 5,858,358; 6,887,466; 6,905,681; 7,144,575; 7,067,318; 7,172,869; 7,232,566; 7,175,843; 5,883,223; 6,905,874; 6,797,514; 6,867,041 and U.S. Patent Application Publication No. 20060121005.
Как правило, популяцию иммунных эффекторных клеток можно размножать путем приведения их в контакт с поверхностью, к которой присоединены средство, стимулирующее передачу сигнала, ассоциированного с комплексом CD3/TCR, и лиганд, стимулирующий костимулирующую молекулу на поверхности Т-клеток. В частности, популяции Т-клеток можно стимулировать, как описано в данном документе, как, например, путем приведения в контакт с антителом к CD3 или его антигенсвязывающим фрагментом или антителом к CD2, иммобилизованным на поверхности, или путем приведения в контакт с активатором протеинкиназы С (например, бриостатином) в сочетании с ионофором кальция. Для костимуляции вспомогательной молекулы на поверхности Т-клеток применяют лиганд, который связывает вспомогательную молекулу. Например, популяцию Т-клеток можно приводить в контакт с антителом к CD3 и антителом к CD28 в условиях, подходящих для стимуляции пролиферации Т-клеток. Для стимуляции пролиферации CD4+ T-клеток либо CD8+ T-клеток можно применять антитело к CD3 и антитело к CD28. Примеры антитела к CD28 включают 9.3, B-T3, XR-CD28 (Diaclone, Безансон, Франция), и их можно применять, равно как и другие способы, общеизвестные из уровня техники (Berg et al., Transplant Proc. 30(8):3975-3977, 1998; Haanen et al., J. Exp. Med. 190(9):1319-1328, 1999; Garland et al., J. Immunol Meth. 227(1-2):53-63, 1999).Typically, a population of immune effector cells can be expanded by contacting them with a surface to which are attached an agent that stimulates signaling associated with the CD3/TCR complex and a ligand that stimulates a costimulatory molecule on the surface of T cells. In particular, the populations of T cells can be stimulated as described herein, such as by contacting with an anti-CD3 antibody or an antigen-binding fragment thereof or an anti-CD2 antibody immobilized on a surface, or by contacting with a protein kinase C activator (e.g., bryostatin) in combination with a calcium ionophore. To costimulate an accessory molecule on the surface of T cells, a ligand that binds the accessory molecule is used. For example, a population of T cells can be contacted with an anti-CD3 antibody and an anti-CD28 antibody under conditions suitable for stimulating T cell proliferation. To stimulate the proliferation of CD4+ T cells or CD8+ T cells, an anti-CD3 antibody and an anti-CD28 antibody can be used. Examples of the anti-CD28 antibody include 9.3, B-T3, XR-CD28 (Diaclone, Besancon, France), and can be used as well as other methods generally known in the art (Berg et al., Transplant Proc. 30(8):3975-3977, 1998; Haanen et al., J. Exp. Med. 190(9):1319-1328, 1999; Garland et al., J. Immunol Meth. 227(1-2):53-63, 1999).
В некоторых вариантах осуществления первичный стимулирующий сигнал и костимулирующий сигнал для Т-клетки можно обеспечивать с помощью различных протоколов. Например, средства, обеспечивающие каждый сигнал, могут находиться в растворе или быть связаны с поверхностью. В случае, если они связаны с поверхностью, средства могут быть связаны с одной и той же поверхностью (т. е. в "цис"-расположении) или с отдельными поверхностями (т. е. в "транс"-расположении). В качестве альтернативы одно средство может быть связано с поверхностью, а другое средство может находиться в растворе. В некоторых вариантах осуществления средство, обеспечивающее костимулирующий сигнал, связано с клеточной поверхностью, а средство, обеспечивающее сигнал первичной активации, находится в растворе или связано с поверхностью. В некоторых вариантах осуществления оба средства могут находиться в растворе. В некоторых вариантах осуществления средства могут находиться в растворимой форме, а затем быть сшиты с поверхностью, такой как клетка, экспрессирующая Fc-рецепторы или антитело или другое связывающее средство, которое будет связываться с данными средствами. В этом отношении см., например, публикации заявок на патент США №№ 20040101519 и 20060034810 в том, что касается искусственных антигенпрезентирующих клеток (aAPC), которые предполагаются для применения в активации и размножении Т-клеток в настоящем изобретении.In some embodiments, the primary stimulatory signal and the costimulatory signal for a T cell can be provided using different protocols. For example, the agents providing each signal can be in solution or bound to a surface. If bound to a surface, the agents can be bound to the same surface (i.e., in a "cis" arrangement) or to separate surfaces (i.e., in a "trans" arrangement). Alternatively, one agent can be bound to a surface and the other agent can be in solution. In some embodiments, the agent providing the costimulatory signal is bound to a cell surface and the agent providing the primary activation signal is in solution or bound to a surface. In some embodiments, both agents can be in solution. In some embodiments, the agents can be in soluble form and then cross-linked to a surface, such as a cell expressing Fc receptors or an antibody or other binding agent that will bind to the agents. In this regard, see, for example, U.S. Patent Application Publication Nos. 20040101519 and 20060034810 regarding artificial antigen presenting cells (aAPCs) that are contemplated for use in activating and expanding T cells in the present invention.
В некоторых вариантах осуществления два средства иммобилизованы на гранулах: либо на одной и той же грануле, т. е. в "цис"-положении, либо на отдельных гранулах, т. е. в "транс"-положении. В качестве примера, средство, обеспечивающее сигнал первичной активации, представляет собой антитело к CD3 или его антигенсвязывающий фрагмент, а средство, обеспечивающее костимулирующий сигнал, представляет собой антитело к CD28 или его антигенсвязывающий фрагмент; и оба средства совместно иммобилизованы на одной и той же грануле в эквивалентных молекулярных количествах. В некоторых вариантах осуществления для размножения CD4+ T-клеток и роста T-клеток каждое антитело, связанное с гранулами, применяют в соотношении 1:1. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения используют такое соотношение антител к CD3:CD28, связанных с гранулами, при котором наблюдается увеличение интенсивности размножения Т-клеток по сравнению с размножением, наблюдаемым при использовании соотношения 1:1. В некоторых вариантах осуществления наблюдается увеличение в от приблизительно 1 до приблизительно 3 раз по сравнению с размножением, наблюдаемым при использовании соотношения 1:1. В некоторых вариантах осуществления соотношение антител к CD3:CD28, связанных с гранулами, находится в диапазоне от 100:1 до 1:100 и включает все целочисленные значения в этом промежутке. В некоторых вариантах осуществления с частицами связано больше антител к CD28, чем антител к CD3, т. е. соотношение антител к CD3:CD28 составляет меньше единицы. В некоторых вариантах осуществления соотношение антитела к CD28 и антитела к CD3, связанных с гранулами, составляет более чем 2:1. В некоторых вариантах осуществления антитела к CD3 и CD28, связанные с гранулами, применяют в соотношении 1:100. В некоторых вариантах осуществления антитела к CD3 и CD28, связанные с гранулами, применяют в соотношении 1:75. В некоторых вариантах осуществления антитела к CD3 и CD28, связанные с гранулами, применяют в соотношении 1:50. В некоторых вариантах осуществления антитела к CD3 и CD28, связанные с гранулами, применяют в соотношении 1:30. В некоторых вариантах осуществления антитела к CD3 и CD28, связанные с гранулами, применяют в соотношении 1:10. В некоторых вариантах осуществления антитела к CD3 и CD28, связанные с гранулами, применяют в соотношении 1:3. В некоторых вариантах осуществления антитела к CD3 и CD28, связанные с гранулами, применяют в соотношении 3:1.In some embodiments, the two agents are immobilized on the beads, either on the same bead, i.e., in the "cis" position, or on separate beads, i.e., in the "trans" position. As an example, the agent that provides the primary activation signal is an anti-CD3 antibody or antigen-binding fragment thereof, and the agent that provides the costimulatory signal is an anti-CD28 antibody or antigen-binding fragment thereof; and both agents are co-immobilized on the same bead in equivalent molecular amounts. In some embodiments, each antibody bound to the beads is used in a 1:1 ratio to expand CD4+ T cells and grow T cells. In some embodiments, the ratio of anti-CD3:CD28 antibodies bound to the beads is such that an increase in the rate of T cell expansion is observed compared to the expansion observed using a 1:1 ratio. In some embodiments, there is an increase of about 1 to about 3 times compared to the expansion observed using a 1:1 ratio. In some embodiments, the ratio of anti-CD3:CD28 antibodies bound to the beads is in the range of 100:1 to 1:100 and includes all integer values therebetween. In some embodiments, more anti-CD28 antibodies are bound to the particles than anti-CD3 antibodies, i.e., the ratio of CD3:CD28 antibodies is less than one. In some embodiments, the ratio of anti-CD28 antibody to anti-CD3 antibody bound to the beads is greater than 2:1. In some embodiments, the anti-CD3 and CD28 antibodies bound to the beads are used in a ratio of 1:100. In some embodiments, the anti-CD3 and CD28 antibodies bound to the beads are used in a ratio of 1:75. In some embodiments, the anti-CD3 and anti-CD28 antibodies bound to the beads are used in a ratio of 1:50. In some embodiments, the anti-CD3 and anti-CD28 antibodies bound to the beads are used in a ratio of 1:30. In some embodiments, the anti-CD3 and anti-CD28 antibodies bound to the beads are used in a ratio of 1:10. In some embodiments, the anti-CD3 and anti-CD28 antibodies bound to the beads are used in a ratio of 1:3. In some embodiments, the anti-CD3 and anti-CD28 antibodies bound to the beads are used in a ratio of 3:1.
Для стимуляции Т-клеток или других клеток-мишеней можно использовать соотношения частиц и клеток, составляющие от 1:500 до 500:1, с включением любых целочисленных значений в этом промежутке. Как будет очевидно для специалистов средней квалификации в данной области, соотношение частиц и клеток может зависеть от размера частиц относительно клетки-мишени. Например, гранулы небольшого размера могут связывать лишь немного клеток, тогда как более крупные гранулы могут связывать много клеток. В некоторых вариантах осуществления соотношение клеток и частиц находится в диапазоне от 1:100 до 100:1 и включает любые целочисленные значения в этом промежутке, и в некоторых вариантах осуществления соотношение составляет от 1:9 до 9:1 и включает любые целочисленные значения в этом промежутке, и его также можно использовать для стимуляции Т-клеток. Соотношение частиц, связанных с антителами к CD3 и антителами к CD28, и Т-клеток, которое приводит к стимуляции Т-клеток, может варьироваться, как отмечено выше, однако определенные подходящие значения включают 1:100, 1:50, 1:40, 1:30, 1:20, 1:10, 1:9, 1:8, 1:7, 1:6, 1:5, 1:4, 1:3, 1:2, 1:1, 2:1, 3:1, 4:1, 5:1, 6:1, 7:1, 8:1, 9:1, 10:1, и 15:1 , при этом одно подходящее соотношение составляет по меньшей мере 1:1 для частиц на Т-клетку. В некоторых вариантах осуществления используют соотношение частиц и клеток, составляющее 1:1 или меньше. В некоторых вариантах осуществления подходящее соотношение частицы:клетки составляет 1:5. В некоторых вариантах осуществления соотношение частиц и клеток можно варьировать в зависимости от дня стимуляции. Например, в некоторых вариантах осуществления соотношение частиц и клеток составляет от 1:1 до 10:1 в первый день, и после этого к клеткам ежедневно или раз в два дня добавляют дополнительные частицы в течение периода вплоть до 10 дней при конечных соотношениях от 1:1 до 1:10 (в расчете на количество клеток в день добавления). В некоторых вариантах осуществления соотношение частиц и клеток составляет 1:1 в первый день стимуляции и доводится до 1:5 в третий и пятый дни стимуляции. В некоторых вариантах осуществления частицы добавляют каждый день или раз в два дня до конечного соотношения 1:1 в первый день и 1:5 в третий и пятый дни стимуляции. В некоторых вариантах осуществления соотношение частиц и клеток составляет 2:1 в первый день стимуляции и доводится до 1:10 в третий и пятый дни стимуляции. В некоторых вариантах осуществления частицы добавляют каждый день или раз в два дня до конечного соотношения 1:1 в первый день и 1:10 в третий и пятый дни стимуляции. Специалисту в данной области будет понятно, что для использования в настоящем изобретении может подходить множество других соотношений. В частности, соотношения будут варьироваться в зависимости от размера частиц, а также от размера и типа клеток. В некоторых вариантах осуществления наиболее типичные соотношения для использования составляют примерно 1:1, 2:1 и 3:1 в первый день.For stimulation of T cells or other target cells, particle to cell ratios of 1:500 to 500:1, including any integer values in this range, can be used. As will be apparent to those of ordinary skill in the art, the particle to cell ratio can depend on the size of the particles relative to the target cell. For example, small beads can bind only a few cells, while larger beads can bind many cells. In some embodiments, the cell to particle ratio is in the range of 1:100 to 100:1 and includes any integer values in this range, and in some embodiments, the ratio is from 1:9 to 9:1 and includes any integer values in this range, and can also be used to stimulate T cells. The ratio of particles bound to anti-CD3 antibodies and anti-CD28 antibodies to T cells that results in stimulation of T cells may vary as noted above, but certain suitable values include 1:100, 1:50, 1:40, 1:30, 1:20, 1:10, 1:9, 1:8, 1:7, 1:6, 1:5, 1:4, 1:3, 1:2, 1:1, 2:1, 3:1, 4:1, 5:1, 6:1, 7:1, 8:1, 9:1, 10:1, and 15:1, with one suitable ratio being at least 1:1 for particles per T cell. In some embodiments, a particle to cell ratio of 1:1 or less is used. In some embodiments, a suitable particle:cell ratio is 1:5. In some embodiments, the particle to cell ratio can be varied depending on the day of stimulation. For example, in some embodiments, the particle to cell ratio is from 1:1 to 10:1 on the first day, and additional particles are added to the cells daily or every other day thereafter for up to 10 days at final ratios of 1:1 to 1:10 (based on the number of cells on the day of addition). In some embodiments, the particle to cell ratio is 1:1 on the first day of stimulation and is adjusted to 1:5 on the third and fifth days of stimulation. In some embodiments, the particles are added every day or every other day to a final ratio of 1:1 on the first day and 1:5 on the third and fifth days of stimulation. In some embodiments, the particle to cell ratio is 2:1 on the first day of stimulation and is adjusted to 1:10 on the third and fifth days of stimulation. In some embodiments, the particles are added every day or every other day to a final ratio of 1:1 on the first day and 1:10 on the third and fifth days of stimulation. One skilled in the art will understand that many other ratios may be suitable for use in the present invention. In particular, the ratios will vary depending on the size of the particles, as well as the size and type of cells. In some embodiments, the most typical ratios for use are about 1:1, 2:1 and 3:1 on the first day.
В некоторых вариантах осуществления клетки, такие как Т-клетки, объединяют с гранулами, покрытыми средством, впоследствии гранулы и клетки разделяют, а затем клетки культивируют. В некоторых вариантах осуществления гранулы, покрытые средством, и клетки не разделяют перед культивированием, а культивируют вместе. В некоторых вариантах осуществления гранулы и клетки вначале концентрируют путем приложения силы, такой как сила магнитного поля, что приводит к увеличению лигирования маркеров клеточной поверхности, за счет чего обеспечивается индукция стимуляции клеток.In some embodiments, cells such as T cells are combined with beads coated with an agent, the beads and cells are subsequently separated, and the cells are then cultured. In some embodiments, the beads coated with an agent and the cells are not separated before culturing, but are cultured together. In some embodiments, the beads and cells are first concentrated by applying a force, such as a magnetic force, which results in increased ligation of cell surface markers, thereby inducing cell stimulation.
В качестве примера, белки клеточной поверхности можно лигировать, обеспечивая возможность контакта парамагнитных гранул, к которым присоединены антитела к CD3 и антитела к CD28 (гранул 3 × 28), и Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления клетки (например, от 104 до 109 T-клеток) и гранулы (например, парамагнитные гранулы DYNABEADS® M-450 CD3/CD28 T в соотношении 1:1) объединяют в буфере, например, PBS (без двухвалентных катионов, таких как кальций и магний). Специалистам средней квалификации в данной области также будет очевидно, какую концентрацию клеток можно использовать. Например, клетка-мишень может очень редко встречаться в образце и составлять только 0,01% образца, или весь образец (т. е. 100%) может состоять из клетки-мишени, представляющей интерес. Соответственно, любое количество клеток находится в рамках контекста настоящего изобретения. В некоторых вариантах осуществления может потребоваться значительно уменьшить объем, в котором частицы и клетки смешивают друг с другом (т. е. увеличить концентрацию клеток), чтобы обеспечить максимальный контакт клеток и частиц. Например, в некоторых вариантах осуществления используют концентрацию, составляющую приблизительно 10 миллиардов клеток/мл, 9 миллиардов/мл, 8 миллиардов/мл, 7 миллиардов/мл, 6 миллиардов/мл, 5 миллиардов/мл или 2 миллиарда клеток/мл. В некоторых вариантах осуществления используют более 100 миллионов клеток/мл. В некоторых вариантах осуществления используют концентрацию клеток, составляющую 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45 или 50 миллионов клеток/мл. В некоторых вариантах осуществления используют концентрацию клеток, составляющую от 75, 80, 85, 90, 95 или 100 миллионов клеток/мл. В некоторых вариантах осуществления можно использовать концентрации, составляющие 125 или 150 миллионов клеток/мл. Использование высоких концентраций может приводить к увеличению выхода клеток, активации клеток и размножения клеток. Кроме того, использование высоких концентраций клеток позволяет более эффективно захватывать клетки, которые могут характеризоваться слабой экспрессией антигенов-мишеней, представляющих интерес, такие как CD28-отрицательные Т-клетки. Такие популяции клеток могут иметь терапевтическую ценность, и в некоторых вариантах осуществления может требоваться их получение. Например, использование высокой концентрации клеток позволяет проводить более эффективный отбор CD8+ Т-клеток, которые обычно характеризуются более слабой экспрессией CD28.As an example, cell surface proteins can be ligated by allowing paramagnetic beads to which anti-CD3 antibodies and anti-CD28 antibodies have been attached (3 x 28 beads) to come into contact with T cells. In some embodiments, cells (e.g., 10 4 to 10 9 T cells) and beads (e.g., DYNABEADS® M-450 CD3/CD28 T paramagnetic beads at a 1:1 ratio) are combined in a buffer, such as PBS (without divalent cations such as calcium and magnesium). Those of ordinary skill in the art will also appreciate what concentration of cells can be used. For example, a target cell may be very rare in a sample, comprising only 0.01% of the sample, or the entire sample (i.e., 100%) may consist of the target cell of interest. Accordingly, any number of cells are within the scope of the present invention. In some embodiments, it may be necessary to significantly reduce the volume in which the particles and cells are mixed together (i.e., increase the cell concentration) in order to ensure maximum contact of the cells and particles. For example, in some embodiments, a concentration of about 10 billion cells/mL, 9 billion/mL, 8 billion/mL, 7 billion/mL, 6 billion/mL, 5 billion/mL, or 2 billion cells/mL is used. In some embodiments, more than 100 million cells/mL are used. In some embodiments, a cell concentration of 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, or 50 million cells/mL is used. In some embodiments, a cell concentration of 75, 80, 85, 90, 95, or 100 million cells/mL is used. In some embodiments, concentrations of 125 or 150 million cells/mL can be used. The use of high concentrations can result in increased cell yield, cell activation, and cell expansion. In addition, the use of high cell concentrations allows for more efficient capture of cells that may have weak expression of target antigens of interest, such as CD28-negative T cells. Such cell populations may have therapeutic value and may require their production in some embodiments. For example, the use of a high cell concentration allows for more efficient selection of CD8+ T cells, which are typically characterized by weaker expression of CD28.
В некоторых вариантах осуществления клетки, трансдуцированные нуклеиновой кислотой, кодирующей CAR, например, CAR, описанный в данном документе, например, CAR для CD19, описанный в данном документе, размножают, например, посредством способа, описанного в данном документе. В некоторых вариантах осуществления клетки размножают в культуре в течение периода времени, который составляет от нескольких часов (например, приблизительно 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 18, 21 час) до приблизительно 14 дней (например, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 или 14 дней). В некоторых вариантах осуществления клетки размножают в течение периода от 4 до 9 дней. В некоторых вариантах осуществления клетки размножают в течение периода, который составляет 8 дней или меньше, например, 7, 6 или 5 дней. В некоторых вариантах осуществления клетки размножают в культуре в течение 5 дней, и полученные клетки являются более активными, чем те же самые клетки, размножаемые в культуре в течение 9 дней при тех же условиях культивирования. Активность можно определить, например, по различным Т-клеточным функциям, например, пролиферации, уничтожению клеток-мишеней, продуцированию цитокинов, активации, миграции, поверхностной экспрессии CAR, уровню CAR, определенному с помощью количественной ПЦР, или их комбинаций. В некоторых вариантах осуществления клетки, например, клетки с CAR для CD19, описанные в данном документе, размножаемые в течение 5 дней, демонстрируют по меньшей мере одно-, двух-, трех- или четырехкратное увеличение интенсивности удвоения клеток при стимуляции антигеном по сравнению с теми же клетками, размножаемыми в культуре в течение 9 дней при тех же условиях культивирования. В некоторых вариантах осуществления клетки, например, клетки, экспрессирующие CAR для CD19, описанные в данном документе, размножают в культуре в течение 5 дней, и полученные клетки демонстрируют более высокие уровни продуцирования провоспалительных цитокинов, например, уровни IFNγ и/или GM-CSF, по сравнению с теми же клетками, размножаемыми в культуре в течение 9 дней при тех же условиях культивирования. В некоторых вариантах осуществления клетки, например, клетки с CAR для CD19, описанные в данном документе, размножаемые в течение 5 дней, демонстрируют по меньшей мере одно-, двух-, трех-, четырех-, пяти-, десятикратное или большее повышение уровней продуцирования провоспалительных цитокинов в пг/мл, например, уровней IFNγ и/или GM-CSF, по сравнению с теми же клетками, размножаемыми в культуре в течение 9 дней при тех же условиях культивирования.In some embodiments, cells transduced with a nucleic acid encoding a CAR, e.g., a CAR described herein, e.g., a CD19 CAR described herein, are expanded, e.g., by a method described herein. In some embodiments, the cells are expanded in culture for a period of time that is from several hours (e.g., about 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 18, 21 hours) to about 14 days (e.g., 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, or 14 days). In some embodiments, the cells are expanded for a period of 4 to 9 days. In some embodiments, the cells are expanded for a period of 8 days or less, such as 7, 6, or 5 days. In some embodiments, the cells are expanded in culture for 5 days, and the resulting cells are more active than the same cells expanded in culture for 9 days under the same culture conditions. Activity can be determined, for example, by various T cell functions, such as proliferation, target cell killing, cytokine production, activation, migration, CAR surface expression, CAR level determined by quantitative PCR, or combinations thereof. In some embodiments, cells, such as the CD19 CAR cells described herein, expanded for 5 days exhibit at least a one-, two-, three-, or four-fold increase in cell doubling rate upon antigen stimulation compared to the same cells expanded in culture for 9 days under the same culture conditions. In some embodiments, cells, such as cells expressing a CD19 CAR described herein, are expanded in culture for 5 days and the resulting cells exhibit higher levels of proinflammatory cytokine production, such as IFNγ and/or GM-CSF levels, compared to the same cells expanded in culture for 9 days under the same culture conditions. In some embodiments, cells, such as cells with a CD19 CAR described herein, expanded for 5 days exhibit at least a one-, two-, three-, four-, five-, ten-fold, or greater increase in pg/mL levels of proinflammatory cytokine production, such as IFNγ and/or GM-CSF levels, compared to the same cells expanded in culture for 9 days under the same culture conditions.
Также могут потребоваться несколько циклов стимуляции, вследствие чего время культивирования Т-клеток может составлять 60 дней или больше. Условия, подходящие для культивирования Т-клеток, включают подходящие среды (например, минимальную питательную среду, α-MEM, среду RPMI 1640, AIM-V, DMEM, F-12 или X-vivo 15 (Lonza), X-Vivo 20, OpTmizer и IMDM), которые могут содержать факторы, необходимые для пролиферации и жизнеспособности, в том числе сыворотку (например, фетальную бычью или человеческую сыворотку), интерлейкин-2 (IL-2), инсулин, IFNγ, IL-4, IL-7, GM-CSF, IL-10, IL-12, IL-15, TGFβ и TNF-α или любые другие добавки для роста клеток, известные специалисту в данной области. Другие добавки для роста клеток включают без ограничения поверхностно-активное вещество, плазманат и восстановители, такие как N-ацетилцистеин и 2-меркаптоэтанол. Среды могут включать без ограничения RPMI 1640, AIM-V, DMEM, MEM, α-MEM, F-12, X-Vivo 15 и X-Vivo 20, OpTmizer и IMDM с добавлением аминокислот, пирувата натрия и витаминов, бессывороточные либо с добавлением соответствующего количества сыворотки (или плазмы крови), или определенного набора гормонов и/или количества цитокина(цитокинов), достаточных для роста и размножения Т-клеток. Антибиотики, например, пенициллин и стрептомицин, включают только в экспериментальные культуры, но не в культуры клеток, которые предназначены для инфузии субъекту. Клетки-мишени содержатся в условиях, необходимых для поддержания роста, например, при соответствующей температуре (например, 37°C) и атмосфере (например, воздух с 5% CO2).Several stimulation cycles may also be required, resulting in a T cell culture time of 60 days or more. Suitable conditions for culturing T cells include suitable media (e.g., minimal essential medium, α-MEM, RPMI 1640 medium, AIM-V, DMEM, F-12, or X-vivo 15 (Lonza), X-Vivo 20, OpTmizer, and IMDM) that may contain factors necessary for proliferation and viability, including serum (e.g., fetal bovine or human serum), interleukin-2 (IL-2), insulin, IFNγ, IL-4, IL-7, GM-CSF, IL-10, IL-12, IL-15, TGFβ, and TNF-α, or any other cell growth supplements known to one of skill in the art. Other cell growth supplements include, but are not limited to, surfactant, plasmanate, and reducing agents such as N-acetylcysteine and 2-mercaptoethanol. Media may include, but are not limited to, RPMI 1640, AIM-V, DMEM, MEM, α-MEM, F-12, X-Vivo 15 and X-Vivo 20, OpTmizer, and IMDM supplemented with amino acids, sodium pyruvate, and vitamins, serum-free, or supplemented with an appropriate amount of serum (or blood plasma), or a defined set of hormones and/or an amount of cytokine(s) sufficient to allow growth and expansion of T cells. Antibiotics such as penicillin and streptomycin are included only in experimental cultures and not in cell cultures that are intended for infusion into a subject. The target cells are maintained under conditions necessary to support growth, such as appropriate temperature (e.g. 37°C) and atmosphere (e.g. air with 5% CO 2 ).
В некоторых вариантах осуществления клетки размножают в подходящей среде (например, среде, описанной в данном документе), содержащей один или несколько интерлейкинов, которые приводят к по меньшей мере 200-кратному (например, к 200-кратному, 250-кратному, 300-кратному, 350-кратному) увеличению количества клеток в течение 14-дневного периода размножения, например, согласно измерению посредством способа, описанного в данном документе, такого как проточная цитометрия. В некоторых вариантах осуществления клетки размножают в присутствии IL-15 и/или IL-7 (например, IL-15 и IL-7).In some embodiments, the cells are expanded in a suitable medium (e.g., a medium described herein) containing one or more interleukins that result in at least a 200-fold (e.g., 200-fold, 250-fold, 300-fold, 350-fold) increase in cell number over a 14-day expansion period, e.g., as measured by a method described herein, such as flow cytometry. In some embodiments, the cells are expanded in the presence of IL-15 and/or IL-7 (e.g., IL-15 and IL-7).
В ряде вариантов осуществления способы, описанные в данном документе, например, способы изготовления клеток, экспрессирующих CAR, включают удаление регуляторных T-клеток, например, CD25+ T-клеток или CD25высокий Т-клеток, из популяции клеток, например, с помощью антитела к CD25 или его фрагмента или CD25-связывающего лиганда IL-2. Способы удаления регуляторных Т-клеток, например, CD25+ Т-клеток или CD25высокий Т-клеток, из популяции клеток описаны в данном документе. В ряде вариантов осуществления способы, например, способы изготовления, дополнительно включают приведение популяции клеток (например, популяции клеток, которая была истощена по регуляторным T-клеткам, таким как CD25+ T-клетки или CD25высокий Т-клетки; или популяции клеток, которая ранее была приведена в контакт с антителом к CD25, его фрагментом или CD25-связывающим лигандом) в контакт с IL-15 и/или IL-7. Например, популяцию клеток (например, популяцию, которая ранее была приведена в контакт с антителом к CD25, его фрагментом или CD25-связывающим лигандом) размножают в присутствии IL-15 и/или IL-7.In some embodiments, the methods described herein, e.g., methods of making cells expressing a CAR, comprise removing regulatory T cells, e.g., CD25+ T cells or CD25 high T cells, from a population of cells, e.g., using an anti-CD25 antibody or fragment thereof or a CD25-binding ligand of IL-2. Methods for removing regulatory T cells, e.g., CD25+ T cells or CD25 high T cells, from a population of cells are described herein. In some embodiments, the methods, e.g., methods of making, further comprise contacting the population of cells (e.g., a population of cells that has been depleted of regulatory T cells, such as CD25+ T cells or CD25 high T cells; or a population of cells that has previously been contacted with an anti-CD25 antibody, fragment thereof, or CD25-binding ligand) with IL-15 and/or IL-7. For example, a population of cells (e.g., a population that has previously been contacted with an anti-CD25 antibody, fragment thereof, or CD25-binding ligand) is expanded in the presence of IL-15 and/or IL-7.
В некоторых вариантах осуществления описанную в данном документе клетку, экспрессирующую CAR, приводят в контакт с композицией, содержащей полипептид интерлейкин-15 (IL-15), полипептид альфа-субъединицу рецептора интерлейкина-15 (IL-15Ra) или комбинацию как полипептида IL-15, так и полипептида IL-15Ra, например, hetIL-15, в ходе изготовления клетки, экспрессирующей CAR, например, ex vivo. В ряде вариантов осуществления описанную в данном документе клетку, экспрессирующую CAR, приводят в контакт с композицией, содержащей полипептид IL-15, в ходе изготовления клетки, экспрессирующей CAR, например, ex vivo. В ряде вариантов осуществления описанную в данном документе клетку, экспрессирующую CAR, приводят в контакт с композицией, содержащей комбинацию как полипептида IL-15, так и полипептида IL-15Ra, в ходе изготовления клетки, экспрессирующей CAR, например, ex vivo. В ряде вариантов осуществления описанную в данном документе клетку, экспрессирующую CAR, приводят в контакт с композицией, содержащей hetIL-15, в ходе изготовления клетки, экспрессирующей CAR, например, ex vivo.In some embodiments, a cell expressing a CAR as described herein is contacted with a composition comprising an interleukin-15 (IL-15) polypeptide, an interleukin-15 receptor alpha subunit (IL-15Ra) polypeptide, or a combination of both an IL-15 polypeptide and an IL-15Ra polypeptide, e.g., hetIL-15, during the manufacture of a cell expressing the CAR, e.g., ex vivo. In some embodiments, a cell expressing a CAR as described herein is contacted with a composition comprising an IL-15 polypeptide during the manufacture of a cell expressing the CAR, e.g., ex vivo. In some embodiments, a cell expressing a CAR as described herein is contacted with a composition comprising a combination of both an IL-15 polypeptide and an IL-15Ra polypeptide during the manufacture of a cell expressing the CAR, e.g., ex vivo. In some embodiments, a CAR-expressing cell described herein is contacted with a composition comprising hetIL-15 during the manufacture of the CAR-expressing cell, such as ex vivo.
В некоторых вариантах осуществления описанную в данном документе клетку, экспрессирующую CAR, приводят в контакт с композицией, содержащей hetIL-15, в ходе размножения ex vivo. В некоторых вариантах осуществления описанную в данном документе клетку, экспрессирующую CAR, приводят в контакт с композицией, содержащей полипептид IL-15, в ходе размножения ex vivo. В некоторых вариантах осуществления описанную в данном документе клетку, экспрессирующую CAR, приводят в контакт с композицией, содержащей как полипептид IL-15, так и полипептид IL-15Ra, в ходе размножения ex vivo. В некоторых вариантах осуществления приведение в контакт приводит к выживанию и пролиферации субпопуляции лимфоцитов, например, CD8+ T-клеток.In some embodiments, a cell expressing a CAR as described herein is contacted with a composition comprising hetIL-15 during ex vivo expansion. In some embodiments, a cell expressing a CAR as described herein is contacted with a composition comprising an IL-15 polypeptide during ex vivo expansion. In some embodiments, a cell expressing a CAR as described herein is contacted with a composition comprising both an IL-15 polypeptide and an IL-15Ra polypeptide during ex vivo expansion. In some embodiments, the contacting results in the survival and proliferation of a subset of lymphocytes, such as CD8+ T cells.
Т-клетки, которые подвергались стимуляции в течение разных периодов времени, могут демонстрировать разные характеристики. Например, в типичных препаратах крови или продуктах афереза мононуклеарных клеток периферической крови популяция Т-клеток-хелперов (TH, CD4+) превосходит по числу популяцию цитотоксических Т-клеток или Т-клеток-супрессоров (TC, CD8+). Размножение Т-клеток ex vivo путем стимуляции рецепторов CD3 и CD28 приводит к получению популяции Т-клеток, которая до приблизительно дней 8-9 состоит главным образом из ТН-клеток, тогда как после приблизительно дней 8-9 популяция Т-клеток содержит все более многочисленную популяцию TC-клеток. Соответственно, в зависимости от цели лечения может быть преимущественной инфузия субъекту популяции Т-клеток, содержащей главным образом ТН-клетки. Аналогично, если была выделена антигенспецифическая субпопуляция TC-клеток, то может быть целесообразным размножение этой субпопуляции в большей степени.T cells that have been stimulated for different periods of time may exhibit different characteristics. For example, in typical blood products or peripheral blood mononuclear cell apheresis products, the population of helper T cells (TH, CD4+) outnumbers the population of cytotoxic or suppressor T cells (TC, CD8+). Ex vivo expansion of T cells by stimulation of CD3 and CD28 receptors results in a T cell population that is composed primarily of TH cells until approximately days 8-9, whereas after approximately days 8-9 the T cell population contains an increasingly large population of TC cells. Accordingly, depending on the purpose of treatment, it may be advantageous to infuse a subject with a T cell population containing primarily TH cells. Similarly, if an antigen-specific subpopulation of TC cells has been isolated, it may be beneficial to expand this subpopulation to a greater extent.
Кроме того, в ходе процесса размножения клеток в дополнение к маркерам CD4 и CD8 в значительной степени, но по большей части воспроизводимо, варьируются уровни других фенотипических маркеров. Таким образом, подобная воспроизводимость дает возможность адаптировать продукт на основе активированных Т-клеток для конкретных целей.In addition, in addition to the CD4 and CD8 markers, other phenotypic markers vary significantly but largely reproducibly during the cell expansion process. This reproducibility therefore provides the opportunity to tailor an activated T cell product to specific purposes.
После конструирования CAR, описанного в данном документе, можно применять различные анализы для оценивания активности молекулы, такой как, без ограничения, способность Т-клеток размножаться после стимуляции антигеном, устойчивое размножение Т-клеток при отсутствии повторной стимуляции и формы противораковой активности, в соответствующих моделях in vitro и животных моделях. Анализы для оценивания эффектов CAR по настоящему изобретению описаны более подробно ниже.Once the CAR described herein has been constructed, various assays can be used to evaluate the activity of the molecule, such as, but not limited to, the ability of T cells to expand after antigen stimulation, sustained expansion of T cells in the absence of re-stimulation, and forms of anti-cancer activity, in appropriate in vitro and animal models. Assays for evaluating the effects of the CAR of the present invention are described in more detail below.
Вестерн-блот-анализ экспрессии CAR в первичных T-клетках можно применять для выявления присутствия мономеров и димеров, например, как описано в абзаце 695 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.Western blot analysis of CAR expression in primary T cells can be used to detect the presence of monomers and dimers, for example, as described in paragraph 695 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Размножение CAR+ Т-клеток in vitro после стимуляции антигеном можно измерить с помощью проточной цитометрии. Например, смесь CD4+ и CD8+ Т-клеток стимулируют с помощью aAPC с αCD3/αCD28, а затем трансдуцируют с помощью лентивирусных векторов, экспрессирующих GFP под контролем промоторов, подлежащих анализу. Иллюстративные промоторы включают промоторы генов IE CMV, EF-1α, убиквитина С или фосфоглицераткиназы (PGK). Флуоресценцию GFP оценивают с помощью проточной цитометрии в день 6 культивирования в субпопуляциях CD4+ и/или CD8+ T-клеток. См., например, Milone et al., Molecular Therapy 17(8): 1453-1464 (2009). В качестве альтернативы смесь CD4+ и CD8+ Т-клеток стимулируют с помощью магнитных гранул, покрытых αCD3/αCD28, в день 0 и трансдуцируют с помощью CAR в день 1 с применением бицистронного лентивирусного вектора, экспрессирующего CAR вместе с eGFP с использованием последовательности 2A для "проскока" рибосомы. Культуры повторно стимулируют клетками K562, положительными+ в отношении антигена, ассоциированного с раком, описанного в данном документе (K562, экспрессирующими антиген, ассоциированный с раком, описанный в данном документе), клетками K562 дикого типа (K562 дикого типа) либо клетками K562, экспрессирующими hCD32 и 4-1BBL в присутствии антитела к CD3 и антитела к CD28 (K562-BBL-3/28). Экзогенный IL-2 добавляют в культуры раз в два дня при 100 МЕ/мл. GFP+ Т-клетки подсчитывают с помощью проточной цитометрии с применением подсчета по гранулам. См., например, Milone et al., Molecular Therapy 17(8): 1453-1464 (2009).CAR Reproduction+T cellsin vitroafter stimulation with antigen can be measured using flow cytometry. For example, the CD4 mixture+and CD8+T cells were stimulated with aAPC with αCD3/αCD28 and then transduced with lentiviral vectors expressing GFP under the control of the promoters to be analyzed. Exemplary promoters include those of the CMV IE, EF-1α, ubiquitin C, or phosphoglycerate kinase (PGK) genes. GFP fluorescence was assessed by flow cytometry at
Также можно измерять уровень устойчивости размножения CAR+ T-клеток при отсутствии повторной стимуляции. См., например, Milone et al., Molecular Therapy 17(8): 1453-1464 (2009). Вкратце, измеряют средний объем Т-клеток (фл) в день 8 культивирования с использованием устройства для подсчета частиц Multisizer III или более поздней версии от Coulter, Cellometer Vision от Nexcelom или Scepter от Millipore или других устройств для подсчета клеток после стимуляции с помощью магнитных гранул, покрытых αCD3/αCD28, в день 0 и трансдукции с помощью указанного CAR в день 1.It is also possible to measure the level of resistance of CAR reproduction+T cells in the absence of re-stimulation. See, for example, Miloneet al., Molecular Therapy 17(8): 1453–1464 (2009). Briefly, mean T cell volume (fL) was measured on
Животные модели также можно использовать для измерения активности клеток, экспрессирующих CAR, например, как описано в абзаце 698 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.Animal models can also be used to measure the activity of CAR expressing cells, for example, as described in paragraph 698 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Дозозависимый ответ на лечение с помощью CAR можно оценивать, например, как описано в абзаце 699 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.The dose-dependent response to treatment with a CAR can be assessed, for example, as described in paragraph 699 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Оценка пролиферации клеток и продуцирования цитокинов была описана ранее, как описано в абзаце 700 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.The assessment of cell proliferation and cytokine production has been previously described as described in paragraph 700 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Цитотоксичность можно оценить с помощью стандартного анализа высвобождения 51Cr, например, как описано в абзаце 701 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. Также можно использовать альтернативные способы без применения радиоактивных изотопов.Cytotoxicity can be assessed using a standard 51Cr release assay, such as described in paragraph 701 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated herein by reference in its entirety. Alternative methods without the use of radioactive isotopes can also be used.
Цитотоксичность можно также оценить посредством измерения изменений электрического импеданса адгезивных клеток, например, с помощью анализатора клеток в реальном времени (RTCA) xCELLigence. В некоторых вариантах осуществления цитотоксичность измеряют в несколько моментов времени.Cytotoxicity can also be assessed by measuring changes in the electrical impedance of adherent cells, such as with an xCELLigence real-time cell analyzer (RTCA). In some embodiments, cytotoxicity is measured at multiple time points.
Для оценки специфической миграции и пролиферации CAR в моделях на животных, несущих опухоль, можно применять технологии визуализации, например, как описано в абзаце 702 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.To assess specific migration and proliferation of CAR in tumor-bearing animal models, imaging technologies can be used, such as those described in paragraph 702 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Также можно применять другие анализы, включая анализы, описанные в данном документе в разделе "Примеры", а также анализы, которые известны из уровня техники, для оценивания CAR, описанных в данном документе.Other assays, including those described in the Examples section of this document and assays known in the art, may also be used to evaluate the CARs described herein.
В качестве альтернативы или в комбинации со способами, раскрытыми в данном документе, раскрыты способы и композиции для одного или нескольких из выявления и/или количественного определения клеток, экспрессирующих CAR (например, in vitro или in vivo (например, клинического мониторинга)); размножения и/или активации иммунных клеток и/или CAR-специфического отбора, которые предусматривают применение лиганда CAR. В некоторых вариантах осуществления лиганд CAR представляет собой антитело, которое связывается с молекулой CAR, например, связывается с внеклеточным антигенсвязывающим доменом CAR (например, антитело, которое связывается с антигенсвязывающим доменом, например, антиидиотипическое антитело; или антитело, которое связывается с константной областью внеклеточного связывающего домена). В других вариантах осуществления лиганд CAR представляет собой молекулу антигена CAR (например, молекулу антигена CAR, описанную в данном документе).Alternatively or in combination with the methods disclosed herein, methods and compositions are disclosed for one or more of detecting and/or quantifying cells expressing a CAR (e.g., in vitro or in vivo (e.g., clinical monitoring)); expanding and/or activating immune cells; and/or CAR-specific selection that involve the use of a CAR ligand. In some embodiments, the CAR ligand is an antibody that binds to a CAR molecule, e.g., binds to an extracellular antigen-binding domain of a CAR (e.g., an antibody that binds to an antigen-binding domain, e.g., an anti-idiotype antibody; or an antibody that binds to a constant region of an extracellular binding domain). In other embodiments, the CAR ligand is a CAR antigen molecule (e.g., a CAR antigen molecule described herein).
В некоторых вариантах осуществления раскрыт способ выявления и/или количественного определения клеток, экспрессирующих CAR. Например, лиганд CAR можно применять для выявления и/или количественного определения клеток, экспрессирующих CAR, in vitro или in vivo (например, для клинического мониторинга клеток, экспрессирующих CAR, у пациента или введения доз пациенту). Способ включает:In some embodiments, a method for detecting and/or quantifying cells expressing a CAR is disclosed. For example, a CAR ligand can be used to detect and/or quantify cells expressing a CAR in vitro or in vivo (e.g., for clinical monitoring of CAR expressing cells in a patient or dosing a patient). The method includes:
получение лиганда CAR (необязательно меченого лиганда CAR, например, лиганда CAR, который содержит маркер, гранулу, радиоактивную или флуоресцентную метку);obtaining a CAR ligand (optionally a labeled CAR ligand, such as a CAR ligand that contains a marker, bead, radioactive or fluorescent label);
получение клетки, экспрессирующей CAR (например, получение образца, содержащего клетки, экспрессирующие CAR, такого как изготовленный образец или клинический образец);obtaining a cell expressing a CAR (e.g., obtaining a sample containing cells expressing a CAR, such as a manufactured sample or a clinical sample);
приведение клетки, экспрессирующей CAR, в контакт с лигандом CAR в условиях, при которых происходит связывание, за счет чего обеспечивается выявление уровня (например, количества) присутствующих клеток, экспрессирующих CAR. Связывание клетки, экспрессирующей CAR, с лигандом CAR можно выявлять с помощью стандартных методик, таких как FACS, ELISA и т. п.contacting a CAR-expressing cell with a CAR ligand under conditions that allow binding to occur, thereby detecting the level (e.g., quantity) of CAR-expressing cells present. Binding of a CAR-expressing cell to a CAR ligand can be detected using standard techniques such as FACS, ELISA, etc.
В некоторых вариантах осуществления раскрыт способ размножения и/или активации клеток (например, иммунных эффектoрных клеток). Способ включает:In some embodiments, a method for expanding and/or activating cells (e.g., immune effector cells) is disclosed. The method comprises:
получение клетки, экспрессирующей CAR (например, первой клетки, экспрессирующей CAR, или клетки, транзиентно экспрессирующей CAR);obtaining a cell expressing a CAR (e.g., a first cell expressing a CAR or a cell transiently expressing a CAR);
приведение указанной клетки, экспрессирующей CAR, в контакт с лигандом CAR (например, лигандом CAR, описанным в данном документе) в условиях, при которых происходит размножение и/или пролиферация иммунных клеток, за счет чего обеспечивается получение популяции активированных и/или размноженных клеток.contacting said CAR-expressing cell with a CAR ligand (e.g., a CAR ligand described herein) under conditions that cause immune cell expansion and/or proliferation, thereby providing a population of activated and/or expanded cells.
В определенных вариантах осуществления лиганд CAR присутствует на субстрате (например, является иммобилизованным на субстрате, например, не встречающемся в природе субстрате, или присоединенным к нему). В некоторых вариантах осуществления субстрат представляет собой неклеточный субстрат. Неклеточный субстрат может представлять собой твердую подложку, выбранную из, например, планшета (например, титрационного микропланшета), мембраны (например, нитроцеллюлозной мембраны), матрицы, чипа или гранулы. В ряде вариантов осуществления лиганд CAR присутствует в субстрате (например, на поверхности субстрата). Лиганд CAR может быть иммобилизован на субстрате, присоединен к нему или ковалентно или нековалентно ассоциирован (например, сшит) с ним. В некоторых вариантах осуществления лиганд CAR присоединен (например, ковалентно присоединен) к грануле. В вышеуказанных вариантах осуществления популяцию иммунных клеток можно размножать in vitro или ex vivo. Способ может дополнительно включать культивирование популяции иммунных клеток в присутствии лиганда молекулы CAR, например, посредством любого из способов, описанных в данном документе.In certain embodiments, the CAR ligand is present on a substrate (e.g., immobilized on or attached to a substrate, e.g., a non-naturally occurring substrate). In some embodiments, the substrate is a non-cellular substrate. The non-cellular substrate can be a solid support selected from, for example, a plate (e.g., a microtiter plate), a membrane (e.g., a nitrocellulose membrane), an array, a chip, or a bead. In some embodiments, the CAR ligand is present on the substrate (e.g., on the surface of the substrate). The CAR ligand can be immobilized on, attached to, or covalently or non-covalently associated (e.g., cross-linked) to the substrate. In some embodiments, the CAR ligand is attached (e.g., covalently attached) to a bead. In the above embodiments, the immune cell population can be expanded in vitro or ex vivo. The method may further comprise culturing the immune cell population in the presence of the CAR molecule ligand, such as by any of the methods described herein.
В других вариантах осуществления способ размножения и/или активации клеток дополнительно включает добавление второй стимулирующей молекулы, например, CD28. Например, лиганд CAR и вторая стимулирующая молекула могут быть иммобилизованы на субстрате, например, на одной или нескольких гранулах, за счет чего обеспечивается увеличение интенсивности размножения и/или активации клеток.In other embodiments, the method of cell proliferation and/or activation further comprises adding a second stimulatory molecule, such as CD28. For example, the CAR ligand and the second stimulatory molecule can be immobilized on a substrate, such as one or more beads, thereby increasing the rate of cell proliferation and/or activation.
В некоторых вариантах осуществления предусмотрен способ отбора клетки, экспрессирующей CAR, или обогащения такой клеткой. Способ включает приведение клетки, экспрессирующей CAR, в контакт с лигандом CAR, описанным в данном документе; и отбор клетки на основании связывания с лигандом CAR.In some embodiments, a method of selecting or enriching for a cell expressing a CAR is provided. The method comprises contacting a cell expressing a CAR with a CAR ligand described herein; and selecting the cell based on binding to the CAR ligand.
В еще нескольких других вариантах осуществления представлен способ истощения популяции, снижения количества и/или уничтожения клеток, экспрессирующих CAR. Способ включает приведение клетки, экспрессирующей CAR, в контакт с лигандом CAR, описанным в данном документе; и нацеливание на клетку на основании связывания с лигандом CAR, за счет чего обеспечивается снижение количества и/или уничтожение клеток, экспрессирующих CAR. В некоторых вариантах осуществления лиганд CAR связан с токсичным средством (например, токсином или лекарственным средством, разрушающим клетки). В некоторых вариантах осуществления антиидиотипическое антитело может обуславливать активность эффекторных клеток, например, формы активности ADCC или ADC.In yet other embodiments, a method for depleting, reducing the number of, and/or killing cells expressing a CAR is provided. The method comprises contacting a cell expressing a CAR with a CAR ligand as described herein; and targeting the cell based on binding to the CAR ligand, thereby reducing the number of and/or killing the cells expressing the CAR. In some embodiments, the CAR ligand is linked to a toxic agent (e.g., a toxin or a drug that is destructive to cells). In some embodiments, the anti-idiotype antibody may mediate effector cell activity, such as forms of ADCC or ADC activity.
Иллюстративные антитела к CAR, которые можно применять в способах, раскрытых в данном документе, описаны, например, в WO 2014/190273 и в Jena et al.,"Chimeric Antigen Receptor (CAR)-Specific Monoclonal Antibody to Detect CD19-Specific T cells in Clinical Trials", PLOS March 2013 8:3 e57838, содержание которых включено посредством ссылки.Illustrative CAR antibodies that may be used in the methods disclosed herein are described, for example, in WO 2014/190273 and in Jena et al., "Chimeric Antigen Receptor (CAR)-Specific Monoclonal Antibody to Detect CD19-Specific T cells in Clinical Trials," PLOS March 2013 8:3 e57838, the contents of which are incorporated by reference.
В некоторых вариантах осуществления композиции и способы в данном документе оптимизированы для конкретной субпопуляции Т-клеток, например, как описано в заявке на патент США с регистрационным № PCT/US2015/043219, поданной 31 июля 2015 года, содержание которой включено в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. В некоторых вариантах осуществления оптимизированные субпопуляции T-клеток проявляют повышенную персистенцию по сравнению с контрольной T-клеткой, например, T-клеткой другого типа (например, CD8+ или CD4+), экспрессирующей такую же конструкцию.In some embodiments, the compositions and methods herein are optimized for a particular T cell subset, such as described in U.S. Patent Application Ser. No. PCT/US2015/043219, filed July 31, 2015, the contents of which are incorporated herein by reference in its entirety. In some embodiments, the optimized T cell subsets exhibit increased persistence compared to a control T cell, such as a different T cell type (e.g., CD8+ or CD4+) expressing the same construct.
В некоторых вариантах осуществления CD4+ T-клетка содержит CAR, описанный в данном документе, при этом CAR содержит внутриклеточный сигнальный домен, подходящий для CD4+ T-клетки (например, оптимизированный для, например, приведения к ее повышенной персистенции), например, домен ICOS. В некоторых вариантах осуществления CD8+ T-клетка содержит CAR, описанный в данном документе, при этом CAR содержит внутриклеточный сигнальный домен, подходящий для CD8+ T-клетки (например, оптимизированный для, например, приведения к ее повышенной персистенции), например, домен 4-1BB, домен CD28 или другой костимулирующий домен, отличный от домена ICOS. В некоторых вариантах осуществления CAR, описанный в данном документе, содержит антигенсвязывающий домен, описанный в данном документе, например, представляет собой CAR, содержащий антигенсвязывающий домен.In some embodiments, the CD4+ T cell comprises a CAR as described herein, wherein the CAR comprises an intracellular signaling domain suitable for a CD4+ T cell (e.g., optimized to, e.g., cause its increased persistence), e.g., an ICOS domain. In some embodiments, the CD8+ T cell comprises a CAR as described herein, wherein the CAR comprises an intracellular signaling domain suitable for a CD8+ T cell (e.g., optimized to, e.g., cause its increased persistence), e.g., a 4-1BB domain, a CD28 domain, or another costimulatory domain other than an ICOS domain. In some embodiments, the CAR as described herein comprises an antigen-binding domain as described herein, e.g., is a CAR comprising an antigen-binding domain.
В некоторых вариантах осуществления в данном документе описан способ лечения субъекта, например, субъекта, у которого имеется рак. Способ включает введение указанному субъекту эффективного количества:In some embodiments, described herein is a method of treating a subject, such as a subject having cancer. The method comprises administering to said subject an effective amount of:
1) CD4+ T-клетки, содержащей CAR (CARCD4+), который содержит:1) CD4+ T cells containing CAR (CARCD4+), which contains:
антигенсвязывающий домен, например, антигенсвязывающий домен, описанный в данном документе;an antigen-binding domain, such as the antigen-binding domain described herein;
трансмембранный домен иtransmembrane domain and
внутриклеточный сигнальный домен, например, первый костимулирующий домен, например, домен ICOS; иan intracellular signaling domain, such as the first costimulatory domain, such as the ICOS domain; and
2) CD8+ T-клетки, содержащей CAR (CARCD8+), который содержит:2) CD8 + T cells containing CAR (CARCD8+), which contains:
антигенсвязывающий домен, например, антигенсвязывающий домен, описанный в данном документе;an antigen-binding domain, such as the antigen-binding domain described herein;
трансмембранный домен иtransmembrane domain and
внутриклеточный сигнальный домен, например, второй костимулирующий домен, например, домен 4-1BB, домен CD28 или другой костимулирующий домен, отличный от домена ICOS;an intracellular signaling domain, such as a second costimulatory domain, such as the 4-1BB domain, the CD28 domain, or another costimulatory domain other than the ICOS domain;
где CARCD4+ и CARCD8+ отличаются друг от друга.where CARCD4+ and CARCD8+ are different from each other.
Способ необязательно дополнительно включает введение:The method optionally further comprises administering:
3) второй CD8+ T-клетки, содержащей CAR (второй CARCD8+), который содержит:3) a second CD8+ T cell containing CAR (second CARCD8+), which contains:
антигенсвязывающий домен, например, антигенсвязывающий домен, описанный в данном документе;an antigen-binding domain, such as the antigen-binding domain described herein;
трансмембранный домен иtransmembrane domain and
внутриклеточный сигнальный домен, где второй CARCD8+ содержит внутриклеточный сигнальный домен, например, костимулирующий сигнальный домен, отсутствующий в CARCD8+, и необязательно не содержит сигнального домена ICOS.an intracellular signaling domain, wherein the second CARCD8+ comprises an intracellular signaling domain, such as a costimulatory signaling domain, that is absent from CARCD8+, and optionally lacks an ICOS signaling domain.
Способы доставки с помощью биополимеровDelivery methods using biopolymers
В некоторых вариантах осуществления одну или несколько клеток, экспрессирующих CAR, раскрытых в данном документе, можно вводить или доставлять субъекту посредством биополимерного каркаса, например, биополимерного имплантата. Биополимерные каркасы могут поддерживать или усиливать доставку, размножение и/или распространение клеток, экспрессирующих CAR, описанных в данном документе. Биополимерный каркас содержит биосовместимый (например, который по существу не индуцирует воспалительный или иммунный ответ) и/или биоразлагаемый полимер, который может быть встречающимся в природе или синтетическим. Иллюстративные биополимеры описаны, например, в абзацах 1004-1006 международной заявки WO2015/142675, поданной 13 марта 2015 года, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.In some embodiments, one or more CAR-expressing cells disclosed herein can be administered or delivered to a subject via a biopolymer scaffold, such as a biopolymer implant. Biopolymer scaffolds can support or enhance the delivery, expansion, and/or spread of the CAR-expressing cells described herein. The biopolymer scaffold comprises a biocompatible (e.g., that does not substantially induce an inflammatory or immune response) and/or biodegradable polymer, which can be naturally occurring or synthetic. Exemplary biopolymers are described, for example, in paragraphs 1004-1006 of international application WO2015/142675, filed March 13, 2015, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Фармацевтические композиции и средства для леченияPharmaceutical compositions and means for treatment
В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрен способ лечения пациента, включающий введение клеток, экспрессирующих CAR, полученных согласно описанному в данном документе, необязательно в комбинации с одним или несколькими другими видами терапии. В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрен способ лечения пациента, включающий введение реакционной смеси, содержащей клетки, экспрессирующие CAR, описанные в данном документе, необязательно в комбинации с одним или несколькими другими видами терапии. В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрен способ транспортировки или приема реакционной смеси, содержащей клетки, экспрессирующие CAR, описанные в данном документе. В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрен способ лечения пациента, включающий прием клетки, экспрессирующей CAR, которая была получена согласно описанному в данном документе, и дополнительно включающий введение клетки, экспрессирующей CAR, пациенту, необязательно в комбинации с одним или несколькими другими видами терапии. В некоторых вариантах осуществления в настоящем изобретении предусмотрен способ лечения пациента, включающий получение клетки, экспрессирующей CAR, описанной в данном документе, и дополнительно включающий введение клетки, экспрессирующей CAR, пациенту, необязательно в комбинации с одним или несколькими другими видами терапии. Другим видом терапии может быть, например, противораковая терапия, такая как химиотерапия.In some embodiments, the present invention provides a method of treating a patient, comprising administering cells expressing a CAR obtained as described herein, optionally in combination with one or more other therapies. In some embodiments, the present invention provides a method of treating a patient, comprising administering a reaction mixture comprising cells expressing a CAR described herein, optionally in combination with one or more other therapies. In some embodiments, the present invention provides a method of transporting or receiving a reaction mixture comprising cells expressing a CAR described herein. In some embodiments, the present invention provides a method of treating a patient, comprising receiving a cell expressing a CAR that has been obtained as described herein, and further comprising administering the cell expressing the CAR to the patient, optionally in combination with one or more other therapies. In some embodiments, the present invention provides a method of treating a patient, comprising obtaining a cell expressing a CAR described herein, and further comprising administering the cell expressing the CAR to the patient, optionally in combination with one or more other therapies. Another type of therapy might be, for example, anti-cancer therapy such as chemotherapy.
В некоторых вариантах осуществления клетки, экспрессирующие CAR, описанные в данном документе, вводят субъекту в комбинации с молекулой, которая обеспечивает уменьшение популяции Treg-клеток. Способы, которые обеспечивают уменьшение количества (например, приводят к истощению) Treg-клеток, известны из уровня техники и включают, например, истощение по CD25, введение циклофосфамида, модулирование функции GITR. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что снижение количества Treg-клеток у субъекта до афереза или до введения клетки, экспрессирующей CAR, описанной в данном документе, приводит к снижению количества нежелательных иммунных клеток (например, Treg) в микроокружении опухоли и снижению риска рецидива у субъекта.In some embodiments, the CAR-expressing cells described herein are administered to a subject in combination with a molecule that reduces the population of Treg cells. Methods that reduce the number of (e.g., deplete) Treg cells are known in the art and include, for example, CD25 depletion, administration of cyclophosphamide, modulation of GITR function. Without being limited by theory, it is believed that reducing the number of Treg cells in a subject prior to apheresis or prior to administration of a cell expressing a CAR described herein results in a reduction in the number of unwanted immune cells (e.g., Tregs) in the tumor microenvironment and a reduction in the risk of relapse in the subject.
В некоторых вариантах осуществления средство терапии, описанное в данном документе, например, клетку, экспрессирующую CAR, вводят субъекту в комбинации с молекулой, которая нацеливается на GITR и/или модулирует функции GITR, такой как антагонист GITR и/или антитело к GITR, которые обеспечивают истощение по регуляторным Т-клеткам (Treg). В ряде вариантов осуществления клетки, экспрессирующие CAR, описанные в данном документе, вводят субъекту в комбинации с циклофосфамидом. В некоторых вариантах осуществления молекулы, связывающие GITR, и/или молекулы, модулирующие функции GITR (например, агонист GITR и/или антитела к GITR, обеспечивающие истощение по Treg), вводят до введения клетки, экспрессирующей CAR. Например, в некоторых вариантах осуществления агонист GITR можно вводить до афереза клеток. В ряде вариантов осуществления циклофосфамид вводят субъекту до введения (например, до инфузии или повторной инфузии) клетки, экспрессирующей CAR, или до афереза клеток. В ряде вариантов осуществления циклофосфамид и антитело к GITR вводят субъекту до введения (например, инфузии или повторной инфузии) клетки, экспрессирующей CAR, или до афереза клеток. В некоторых вариантах осуществления у субъекта имеется рак (например, солидный рак или гематологический рак, такой как ALL или CLL). В некоторых вариантах осуществления у субъекта имеется CLL. В ряде вариантов осуществления у субъекта имеется ALL. В ряде вариантов осуществления у субъекта имеется солидный рак, например, солидный рак, описанный в данном документе. Иллюстративные агонисты GITR включают, например, слитые белки на основе GITR и антитела к GITR (например, бивалентные антитела к GITR), такие как, например, слитый белок на основе GITR, описанный в патенте США № 6111090, европейском патенте № 090505B1, патенте США № 8586023, публикациях согласно PCT №№ WO 2010/003118 и 2011/090754, или антитело к GITR, описанное, например, в патенте США № 7025962, европейском патенте № 1947183B1, патенте США № 7812135, патенте США № 8388967, патенте США № 8591886, европейском патенте № EP 1866339, публикации согласно PCT № WO 2011/028683, публикации согласно PCT № WO 2013/039954, публикации согласно PCT № WO2005/007190, публикации согласно PCT № WO 2007/133822, публикации согласно PCT № WO2005/055808, публикации согласно PCT № WO 99/40196, публикации согласно PCT № WO 2001/03720, публикации согласно PCT № WO99/20758, публикации согласно PCT № WO2006/083289, публикации согласно PCT № WO 2005/115451, патенте США № 7618632 и публикации согласно PCT № WO 2011/051726.In some embodiments, a therapy described herein, e.g., a cell expressing a CAR, is administered to a subject in combination with a molecule that targets GITR and/or modulates GITR function, such as a GITR antagonist and/or an anti-GITR antibody that provides for depletion of regulatory T cells (Treg). In some embodiments, cells expressing the CARs described herein are administered to a subject in combination with cyclophosphamide. In some embodiments, GITR binding molecules and/or molecules that modulate GITR function (e.g., a GITR agonist and/or an anti-GITR antibody that provides for depletion of Treg) are administered prior to administration of a cell expressing a CAR. For example, in some embodiments, a GITR agonist can be administered prior to apheresis of the cells. In some embodiments, cyclophosphamide is administered to the subject prior to administration (e.g., infusion or reinfusion) of a cell expressing a CAR or prior to apheresis of the cells. In some embodiments, cyclophosphamide and an anti-GITR antibody are administered to the subject prior to administration (e.g., infusion or reinfusion) of a cell expressing a CAR or prior to apheresis of the cells. In some embodiments, the subject has a cancer (e.g., a solid cancer or a hematological cancer such as ALL or CLL). In some embodiments, the subject has CLL. In some embodiments, the subject has ALL. In some embodiments, the subject has a solid cancer, such as a solid cancer described herein. Exemplary GITR agonists include, for example, GITR-based fusion proteins and anti-GITR antibodies (e.g., bivalent anti-GITR antibodies), such as, for example, the GITR-based fusion protein described in U.S. Patent No. 6,111,090, European Patent No. 090505B1, U.S. Patent No. 8,586,023, PCT Publication Nos. WO 2010/003118 and 2011/090754, or the anti-GITR antibody described in, for example, U.S. Patent No. 7,025,962, European Patent No. 1,947,183B1, U.S. Patent No. 7,812,135, U.S. Patent No. 8,388,967, U.S. Patent No. 8,591,886, European Patent No. EP 1,866,339, PCT Publication No. WO 2011/028683, PCT Publication No. WO 2013/039954, PCT Publication No. WO2005/007190, PCT Publication No. WO 2007/133822, PCT Publication No. WO2005/055808, PCT Publication No. WO 99/40196, PCT Publication No. WO 2001/03720, PCT Publication No. WO99/20758, PCT Publication No. WO2006/083289, PCT Publication No. WO 2005/115451, US Patent No. 7618632 and PCT Publication No. WO 2011/051726.
В некоторых вариантах осуществления описанную в данном документе клетку, экспрессирующую CAR, вводят субъекту в комбинации с агонистом GITR, например, агонистом GITR, описанным в данном документе. В некоторых вариантах осуществления агонист GITR вводят до введения клетки, экспрессирующей CAR. Например, в некоторых вариантах осуществления агонист GITR можно вводить до афереза клеток. В некоторых вариантах осуществления у субъекта имеется CLL.In some embodiments, a cell expressing a CAR described herein is administered to a subject in combination with a GITR agonist, such as a GITR agonist described herein. In some embodiments, the GITR agonist is administered prior to administration of the cell expressing the CAR. For example, in some embodiments, the GITR agonist can be administered prior to apheresis of the cells. In some embodiments, the subject has CLL.
Способы, описанные в данном документе, могут дополнительно включать составление клетки, экспрессирующей CAR, в виде фармацевтической композиции. Фармацевтические композиции могут содержать клетку, экспрессирующую CAR, например, множество клеток, экспрессирующих CAR, описанных в данном документе, в комбинации с одним или несколькими фармацевтически или физиологически приемлемыми носителями, разбавителями или наполнителями. Такие композиции могут содержать буферы, такие как нейтральный буферный солевой раствор, фосфатно-солевой буферный раствор и т. п.; углеводы, такие как глюкоза, манноза, сахароза или декстраны, маннит; белки; полипептиды или аминокислоты, такие как глицин; антиоксиданты; хелатообразующие средства, такие как EDTA или глутатион; адъюванты (например, гидроксид алюминия) и консерванты. Композиции можно составлять, например, для внутривенного введения.The methods described herein may further comprise formulating a cell expressing a CAR as a pharmaceutical composition. The pharmaceutical compositions may comprise a cell expressing a CAR, such as a plurality of CAR expressing cells described herein, in combination with one or more pharmaceutically or physiologically acceptable carriers, diluents or excipients. Such compositions may comprise buffers such as neutral buffered saline, phosphate buffered saline and the like; carbohydrates such as glucose, mannose, sucrose or dextrans, mannitol; proteins; polypeptides or amino acids such as glycine; antioxidants; chelating agents such as EDTA or glutathione; adjuvants (e.g., aluminum hydroxide) and preservatives. The compositions may be formulated, for example, for intravenous administration.
В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция по существу не содержит загрязнителя, например, выбранного из группы, состоящей из эндотоксина, микоплазмы, репликационно-компетентного лентивируса (RCL), p24, нуклеиновой кислоты VSV-G, gag HIV, остаточных количеств гранул, покрытых антителами к CD3/антителами к CD28, антител мыши, объединенной человеческой сыворотки, бычьего сывороточного альбумина, бычьей сыворотки, компонентов культуральных сред, клеточных или плазмидных компонентов для упаковки векторов, бактерии и гриба, например, в ней отсутствуют его поддающиеся выявлению уровни. В некоторых вариантах осуществления бактерия представляет собой по меньшей мере бактерию, выбранную из группы, состоящей из Alcaligenes faecalis, Candida albicans, Escherichia coli, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae и Streptococcus pyogenes группы A.In some embodiments, the pharmaceutical composition is substantially free of a contaminant, e.g., selected from the group consisting of endotoxin, mycoplasma, replication competent lentivirus (RCL), p24, VSV-G nucleic acid, HIV gag, residual amounts of anti-CD3 antibody/anti-CD28 antibody coated beads, mouse antibodies, pooled human serum, bovine serum albumin, bovine serum, culture media components, cellular or plasmid components for vector packaging, bacteria, and fungi, e.g., there are no detectable levels thereof. In some embodiments, the bacterium is at least a bacterium selected from the group consisting of Alcaligenes faecalis, Candida albicans, Escherichia coli, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, and Streptococcus pyogenes group A.
В случае, если указано "иммунологически эффективное количество", "эффективное противораковое количество", "количество, эффективное для ингибирования рака" или "терапевтическое количество", точное количество композиций, подлежащих введению, может быть определено врачом с учетом индивидуальных различий в возрасте, массе тела, размере опухоли, степени инфицирования или метастазирования и состояния пациента (субъекта). В целом, можно отметить, что фармацевтическую композицию, содержащую иммунные эффекторные клетки (например, T-клетки, NK-клетки), описанные в данном документе, можно вводить в дозе от 104 до 109 клеток/кг массы тела, в некоторых случаях от 105 до 106 клеток/кг массы тела, включая все целочисленные значения в пределах этих диапазонов. Композиции на основе Т-клеток можно также вводить несколько раз в этих дозах. Клетки можно вводить с помощью методик инфузии, которые являются общеизвестными в иммунотерапии (см., например, Rosenberg et al., New Eng. J. of Med. 319:1676, 1988).In the event that an "immunologically effective amount,""anti-cancer effective amount,""cancer inhibiting amount," or "therapeutic amount" is indicated, the exact amount of the compositions to be administered can be determined by a physician taking into account individual differences in age, body weight, tumor size, degree of infection or metastasis, and the condition of the patient (subject). In general, it can be noted that a pharmaceutical composition containing immune effector cells (e.g., T cells, NK cells) described herein can be administered at a dose of 10 4 to 10 9 cells/kg body weight, in some cases from 10 5 to 10 6 cells/kg body weight, including all integer values within these ranges. T-cell-based compositions can also be administered multiple times at these doses. Cells can be administered using infusion techniques that are well known in immunotherapy (see, e.g., Rosenberg et al., New Eng. J. of Med. 319:1676, 1988).
Иллюстративные фармацевтические композиции на основе BCMA/CD19-CAR-TIllustrative BCMA/CD19-CAR-T-based pharmaceutical compositions
В некоторых вариантах осуществления композицию на основе CAR-T-клеток с двойной специфичностью к BCMA/CD19 получают путем котрансдукции с помощью двух уникальных векторов. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления композиция на основе клеток содержит гетерогенную популяцию клеток. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе гетерогенных клеток включает нетрансдуцированные Т-клетки, моно-BCMA-специфичные CAR-Т-клетки, моно-CD19-специфичные CAR-Т-клетки и CAR-Т-клетки с двойной специфичностью, экспрессирующие как молекулы BCMA-специфичного CAR, так и молекулы CD19-специфичного CAR. Эти различные популяции клеток могут демонстрировать различные формы активности в контексте лечения заболевания у субъекта.In some embodiments, the BCMA/CD19 dual-specific CAR T cell composition is produced by co-transduction with two unique vectors. Accordingly, in some embodiments, the cell composition comprises a heterogeneous population of cells. In some embodiments, the heterogeneous cell composition comprises untransduced T cells, mono-BCMA-specific CAR T cells, mono-CD19-specific CAR T cells, and dual-specific CAR T cells expressing both BCMA-specific CAR molecules and CD19-specific CAR molecules. These different cell populations may exhibit different forms of activity in the context of treating a disease in a subject.
Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что в контексте лечения множественной миеломы, например, активация BCMA-специфичных CAR-T-клеток может быть основным фактором противоопухолевого ответа у пациентов, тогда как CD19-специфичная активность может играть роль в устранении менее распространенных CD19-положительных опухолевых клеток.Without being bound by theory, it is believed that in the context of multiple myeloma treatment, for example, activation of BCMA-specific CAR-T cells may be a major driver of anti-tumor response in patients, while CD19-specific activity may play a role in eliminating less common CD19-positive tumor cells.
В некоторых вариантах осуществления композицию на основе клеток можно оценивать для определения относительных процентных долей четырех различных клеточных популяций, например, для отбора композиции на основе клеток, содержащей более высокую процентную долю клеток с BCMA-специфичным CAR (например, клеток с моно-BCMA-специфичным CAR и клеток с двойным CAR для BCMA/CD19), чем клеток с моно-CD19-специфичным CAR.In some embodiments, the cell-based composition can be evaluated to determine the relative percentages of four different cell populations, such as to select a cell-based composition that contains a higher percentage of BCMA-specific CAR cells (e.g., mono-BCMA-specific CAR cells and dual BCMA/CD19 CAR cells) than mono-CD19-specific CAR cells.
В некоторых вариантах осуществления композиция на основе клеток содержит:In some embodiments, the cell-based composition comprises:
(a) первую популяцию клеток, содержащих CAR для BCMA, но не CAR для CD19;(a) the first population of cells containing CAR for BCMA but not CAR for CD19;
(b) вторую популяцию клеток, содержащих CAR для CD19, но не CAR для BCMA; и(b) a second population of cells containing a CAR for CD19 but not a CAR for BCMA; and
(c) третью популяцию клеток, содержащих как CAR для BCMA, так и CAR для CD19.(c) a third population of cells containing both CAR for BCMA and CAR for CD19.
В некоторых вариантах осуществления:In some embodiments:
(i) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях меньше или равняется приблизительно 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях;(i) the total number of viable cells in the combined second and third populations is less than or equal to approximately 110% (e.g., less than or equal to approximately 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% or less) of the total number of viable cells in the combined first and third populations;
(ii) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 90% (например, больше или равняется приблизительно 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000% , 5000, 10000% или больше) от общего количества жизнеспособных клеток в объединенных второй и третьей популяциях; и/или(ii) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to about 90% (e.g., greater than or equal to about 100%, 125%, 150%, 175%, 200%, 250%, 300%, 400%, 500%, 750%, 1000%, 2000%, 5000, 10000% or more) of the total number of viable cells in the combined second and third populations; and/or
(iii) общее количество жизнеспособных клеток в объединенных первой и третьей популяциях больше или равняется приблизительно 5% (например, больше или равняется приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80% или 90%) от общего количества жизнеспособных клеток в популяции.(iii) the total number of viable cells in the combined first and third populations is greater than or equal to approximately 5% (e.g., greater than or equal to approximately 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, or 90%) of the total number of viable cells in the population.
В некоторых вариантах осуществления композиция на основе клеток дополнительно содержит четвертую популяцию клеток, которые не содержат CAR. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе клеток содержит популяцию клеток с моно-CD19-специфичным CAR, численность которой меньше или равняется 110% (например, меньше или равняется приблизительно 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1% или меньше) от количества клеток с BCMA-специфичным CAR (например, общего количества клеток с моно-BCMA-специфичным CAR и клеток с двойным CAR для BCMA/CD19). В некоторых вариантах осуществления композиция на основе клеток содержит популяцию моно-CD19-CAR+ клеток, численность которой составляет от приблизительно 45% до приблизительно 50% (например, приблизительно 47%) от количества BCMA-специфичных CAR-Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе клеток содержит популяцию моно-CD19-CAR+ клеток, численность которой составляет от приблизительно 60% до приблизительно 65% (например, приблизительно 63%) от количества BCMA-специфичных CAR-Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе клеток содержит популяцию моно-CD19-CAR+ клеток, численность которой составляет от приблизительно 50% до приблизительно 55% (например, приблизительно 53%) от количества BCMA-специфичных CAR-Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления композиция на основе клеток содержит популяцию моно-CD19-CAR+ клеток, численность которой составляет приблизительно 82% от количества BCMA-специфичных CAR-Т-клеток.In some embodiments, the cell-based composition further comprises a fourth population of cells that do not comprise a CAR. In some embodiments, the cell-based composition comprises a population of cells with a mono-CD19-specific CAR that is less than or equal to 110% (e.g., less than or equal to about 105%, 100%, 90%, 80%, 70%, 60%, 50%, 40%, 30%, 20%, 10%, 5%, 1%, or less) of the number of cells with a BCMA-specific CAR (e.g., the total number of cells with a mono-BCMA-specific CAR and cells with a dual BCMA/CD19 CAR). In some embodiments, the cell-based composition comprises a population of mono CD19 CAR+ cells that is between about 45% to about 50% (such as about 47%) of the BCMA-specific CAR T cells. In some embodiments, the cell-based composition comprises a population of mono CD19 CAR+ cells that is between about 60% to about 65% (such as about 63%) of the BCMA-specific CAR T cells. In some embodiments, the cell-based composition comprises a population of mono CD19 CAR+ cells that is between about 50% to about 55% (such as about 53%) of the BCMA-specific CAR T cells. In some embodiments, the cell-based composition comprises a population of mono CD19 CAR+ cells that is about 82% of the BCMA-specific CAR T cells.
В некоторых вариантах осуществления композиция на основе клеток можно оценивать для определения процентной доли CAR-положительных жизнеспособных клеток для обеспечения достаточного введения дозы. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления композиция на основе клеток содержит популяцию клеток с BCMA-специфичным CAR (например, общее количество клеток с моно-BCMA-специфичным CAR и клеток с двойным CAR для BCMA/CD19), численность которой больше или равняется приблизительно 5% (например, больше или равняется приблизительно 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 99% или 100%) от общего количества жизнеспособных клеток в композиции на основе клеток.In some embodiments, the cell-based composition can be assessed to determine the percentage of CAR-positive viable cells to ensure sufficient dosing. Accordingly, in some embodiments, the cell-based composition comprises a population of BCMA-specific CAR cells (e.g., the total number of mono-BCMA-specific CAR cells and dual BCMA/CD19 CAR cells) that is greater than or equal to about 5% (e.g., greater than or equal to about 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 99%, or 100%) of the total number of viable cells in the cell-based composition.
В некоторых вариантах осуществления клетки с BCMA-специфичным CAR представляют собой BCMA-специфичные CAR-Т-клетки. В некоторых вариантах осуществления клетки с моно-BCMA-специфичным CAR представляют собой моно-BCMA-специфичные CAR-Т-клетки. В некоторых вариантах осуществления клетки с CD19-специфичным CAR представляют собой CD19-специфичные CAR-Т-клетки. В некоторых вариантах осуществления клетки с моно-CD19-специфичным CAR представляют собой моно-CD19-специфичные CAR-Т-клетки. В некоторых вариантах осуществления клетки с двойным CAR для BCMA/CD19 представляют собой CAR-Т-клетки с двойной специфичностью к BCMA/CD19.In some embodiments, the BCMA-specific CAR cells are BCMA-specific CAR T cells. In some embodiments, the mono-BCMA-specific CAR cells are mono-BCMA-specific CAR T cells. In some embodiments, the CD19-specific CAR cells are CD19-specific CAR T cells. In some embodiments, the mono-CD19-specific CAR cells are mono-CD19-specific CAR T cells. In some embodiments, the BCMA/CD19 dual CAR cells are BCMA/CD19 dual CAR T cells.
Введение дозAdministration of doses
В некоторых вариантах осуществления доза клеток с CAR (например, клеток с CAR для CD19) составляет приблизительно 1×106, 1,1×106, 2×106, 3,6×106, 5×106, 1×107, 1,8×107, 2×107, 5×107, 1×108, 2×108 или 5×108 клеток/кг. В некоторых вариантах осуществления доза клеток с CAR (например, клеток с CAR для CD19) составляет по меньшей мере приблизительно 1×106, 1,1×106, 2×106, 3,6×106, 5×106, 1×107, 1,8×107, 2×107, 5×107, 1×108, 2×108 или 5×108 клеток/кг. В некоторых вариантах осуществления доза клеток с CAR (например, клеток с CAR для CD19) составляет вплоть до приблизительно 1×106, 1,1×106, 2×106, 3,6×106, 5×106, 1×107, 1,8×107, 2×107, 5×107, 1×108, 2×108 или 5×108 клеток/кг. В некоторых вариантах осуществления доза клеток с CAR (например, клеток с CAR для CD19) составляет приблизительно 1,1×106-1,8×107 клеток/кг. В некоторых вариантах осуществления доза клеток с CAR (например, клеток с CAR для CD19) составляет приблизительно 1×107, 2×107, 5×107, 1×108, 2×108, 5×108, 1×109, 2×109 или 5×109 клеток. В некоторых вариантах осуществления доза клеток с CAR (например, клеток с CAR для CD19) составляет по меньшей мере приблизительно 1×107, 2×107, 5×107, 1×108, 2×108, 5×108, 1×109, 2×109 или 5×109 клеток. В некоторых вариантах осуществления доза клеток с CAR (например, клеток с CAR для CD19) составляет вплоть до приблизительно 1×107, 2×107, 5×107, 1×108, 2×108, 5×108, 1×109, 2×109 или 5×109 клеток.In some embodiments, the dosage of CAR cells (e.g., CD19 CAR cells) is about 1×10 6 , 1.1×10 6 , 2×10 6 , 3.6×10 6 , 5×10 6 , 1×10 7 , 1.8×10 7 , 2×10 7 , 5×10 7 , 1×10 8 , 2×10 8 or 5×10 8 cells/kg. In some embodiments, the dosage of CAR cells (e.g., CD19 CAR cells) is at least about 1×10 6 , 1.1×10 6 , 2×10 6 , 3.6×10 6 , 5×10 6 , 1×10 7 , 1.8×10 7 , 2×10 7 , 5×10 7 , 1×10 8 , 2× 10 8 or 5×10 8 cells/kg. In some embodiments, the dosage of CAR cells (e.g., CD19 CAR cells) is up to about 1×10 6 , 1.1×10 6 , 2×10 6 , 3.6×10 6 , 5×10 6 , 1×10 7 , 1.8×10 7 , 2×10 7 , 5×10 7 , 1×10 8 , 2×10 8 or 5×10 8 cells/kg. In some embodiments, the dosage of CAR cells (e.g., CD19 CAR cells) is about 1.1×10 6 -1.8×10 7 cells/kg. In some embodiments, the dosage of CAR cells (e.g., CD19 CAR cells) is about 1×10 7 , 2×10 7 , 5×10 7 , 1×10 8 , 2×10 8 , 5×10 8 , 1×10 9 , 2×10 9 , or 5×10 9 cells. In some embodiments, the dosage of CAR cells (e.g., CD19 CAR cells) is at least about 1×10 7 , 2×10 7 , 5×10 7 , 1×10 8 , 2×10 8 , 5×10 8 , 1×10 9 , 2×10 9 , or 5×10 9 cells. In some embodiments, the dosage of CAR cells (e.g., CD19 CAR cells) is up to about 1×10 7 , 2×10 7 , 5×10 7 , 1×10 8 , 2×10 8 , 5×10 8 , 1×10 9 , 2×10 9 , or 5×10 9 cells.
В некоторых вариантах осуществления субъекту может потребоваться введение активированных иммунных эффекторных клеток (например, T-клеток, NK-клеток), и тогда последовательно повторно берут кровь (или осуществляют аферез), активируют иммунные эффекторные клетки (например, T-клетки, NK-клетки) из нее и проводят повторную инфузию этих активированных и размноженных иммунных эффекторных клеток (например, T-клеток, NK-клеток) пациенту. Этот процесс можно осуществлять несколько раз каждые несколько недель. В некоторых вариантах осуществления иммунные эффекторные клетки (например, T-клетки, NK-клетки) можно активировать из отобранных образцов крови объемом от 10 куб. см до 400 куб. см. В некоторых вариантах осуществления иммунные эффекторные клетки (например, T-клетки, NK-клетки) активируют из отобранных образцов крови объемом 20 куб. см, 30 куб. см, 40 куб. см, 50 куб. см, 60 куб. см, 70 куб. см, 80 куб. см, 90 куб. см или 100 куб. см.In some embodiments, the subject may require the administration of activated immune effector cells (e.g., T cells, NK cells), and then sequentially repeat blood collection (or apheresis) is performed, the immune effector cells (e.g., T cells, NK cells) are activated from there, and the activated and expanded immune effector cells (e.g., T cells, NK cells) are reinfused into the patient. This process can be performed multiple times every few weeks. In some embodiments, the immune effector cells (e.g., T cells, NK cells) can be activated from collected blood samples of between 10 cc and 400 cc. In some embodiments, the immune effector cells (e.g., T cells, NK cells) are activated from collected blood samples of 20 cc, 30 cc, 40 cc, 50 cc, 60 cc, or 80 cc. cm, 70 cu. cm, 80 cu. cm, 90 cu. cm or 100 cc. cm.
Введение рассматриваемых композиций можно осуществлять любым удобным способом. Композиции, описанные в данном документе, можно вводить пациенту трансартериально, подкожно, внутрикожно, интратуморально, интранодально, интрамедуллярно, внутримышечно, с помощью внутривенной (i.v.) инъекции или внутрибрюшинно, например, с помощью внутрикожной или подкожной инъекции. Композиции на основе иммунных эффекторных клеток (например, T-клеток, NK-клеток) можно инъецировать непосредственно в опухоль, лимфатический узел или очаг инфекции.The compositions of the invention may be administered by any convenient route. The compositions described herein may be administered to a patient transarterially, subcutaneously, intradermally, intratumorally, intranodally, intramedullary, intramuscularly, by intravenous (i.v.) injection, or intraperitoneally, such as by intradermal or subcutaneous injection. Immune effector cell (e.g., T cell, NK cell) compositions may be injected directly into a tumor, lymph node, or site of infection.
Истощение популяции Т-клетокT cell population depletion
В некоторых вариантах осуществления способы, раскрытые в данном документе, дополнительно включают введение средства, обеспечивающего истощение популяции Т-клеток, после лечения с помощью клетки (например, иммунной эффектoрной клетки, описанной в данном документе), за счет чего обеспечивается снижение количества (например, истощение популяции) клеток, экспрессирующих CAR (например, клеток, экспрессирующих CAR для CD19). Такие средства, обеспечивающие истощение популяции Т-клеток, можно применять для эффективного истощения популяции клеток, экспрессирующих CAR (например, клеток, экспрессирующих CAR для CD19), для уменьшения токсичности. В некоторых вариантах осуществления клетки, экспрессирующие CAR, были изготовлены в соответствии со способом, описанным в данном документе, например, подвергнуты анализу (например, до или после трансфекции или трансдукции) в соответствии со способом, описанным в данном документе.In some embodiments, the methods disclosed herein further comprise administering a T cell depleting agent following treatment with a cell (e.g., an immune effector cell as described herein) that results in a reduction in (e.g., depletion of) CAR expressing cells (e.g., cells expressing a CAR for CD19). Such T cell depleting agents can be used to effectively deplete a CAR expressing cell population (e.g., cells expressing a CAR for CD19) to reduce toxicity. In some embodiments, the CAR expressing cells have been made according to a method as described herein, such as having been assayed (e.g., before or after transfection or transduction) according to a method as described herein.
В некоторых вариантах осуществления средство, обеспечивающее истощение популяции Т-клеток, вводят через одну, две, три, четыре или пять недель после введения клетки, например, популяции иммунных эффекторных клеток, описанной в данном документе.In some embodiments, the T cell depleting agent is administered one, two, three, four, or five weeks after administration of a cell, such as an immune effector cell population, as described herein.
В некоторых вариантах осуществления средство, обеспечивающее истощение популяции Т-клеток, представляет собой средство, которое обеспечивает истощение популяции Т-клеток, экспрессирующих CAR, например, посредством индукции антителозависимой клеточноопосредованной цитотоксичности(ADCC) и/или комплемент-индуцированной гибели клеток. Например, клетки, экспрессирующие CAR, описанные в данном документе, могут также экспрессировать антиген (например, антиген-мишень), который распознается молекулами, способными индуцировать гибель клеток, например, ADCC или комплемент-индуцированную гибель клеток. Например, клетки, экспрессирующие CAR, описанные в данном документе, также могут экспрессировать белок-мишень (например, рецептор), на который могут нацеливаться антитело или фрагмент антитела. Примеры таких белков-мишеней включают без ограничения EpCAM, VEGFR, интегрины (например, интегрины ανβ3, α4, αΙ3/4β3, α4β7, α5β1, ανβ3, αν), представителей суперсемейства рецепторов TNF (например, TRAIL-R1, TRAIL-R2), рецептор PDGF, рецептор интерферона, рецептор фолиевой кислоты, GPNMB, ICAM-1, HLA-DR, CEA, CA-125, MUC1, TAG-72, рецептор IL-6, 5T4, GD2, GD3, CD2, CD3, CD4, CD5, CD11, CD11a/LFA-1, CD15, CD18/ITGB2, CD19, CD20, CD22, CD23/рецептор IgE, CD25, CD28, CD30, CD33, CD38, CD40, CD41, CD44, CD51, CD52, CD62L, CD74, CD80, CD125, CD147/базиджин, CD152/CTLA-4, CD154/CD40L, CD195/CCR5, CD319/SLAMF7 и EGFR и их усеченные варианты (например, варианты, в которых сохраняются один или несколько внеклеточных эпитопов, но отсутствуют одной или нескольких областей в цитоплазматическом домене).In some embodiments, the agent that depletes a population of T cells is an agent that depletes a population of T cells that express a CAR, such as by inducing antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) and/or complement-induced cell death. For example, the cells expressing the CARs described herein can also express an antigen (e.g., a target antigen) that is recognized by molecules that are capable of inducing cell death, such as ADCC or complement-induced cell death. For example, the cells expressing the CARs described herein can also express a target protein (e.g., a receptor) that can be targeted by an antibody or antibody fragment. Examples of such target proteins include, but are not limited to, EpCAM, VEGFR, integrins (e.g., ανβ3, α4, αΙ3/4β3, α4β7, α5β1, ανβ3, αν integrins), members of the TNF receptor superfamily (e.g., TRAIL-R1, TRAIL-R2), PDGF receptor, interferon receptor, folate receptor, GPNMB, ICAM-1, HLA-DR, CEA, CA-125, MUC1, TAG-72, IL-6 receptor, 5T4, GD2, GD3, CD2, CD3, CD4, CD5, CD11, CD11a/LFA-1, CD15, CD18/ITGB2, CD19, CD20, CD22, CD23/receptor IgE, CD25, CD28, CD30, CD33, CD38, CD40, CD41, CD44, CD51, CD52, CD62L, CD74, CD80, CD125, CD147/basigin, CD152/CTLA-4, CD154/CD40L, CD195/CCR5, CD319/SLAMF7 and EGFR and truncated variants thereof (e.g., variants that retain one or more extracellular epitopes but lack one or more regions in the cytoplasmic domain).
В некоторых вариантах осуществления клетка, экспрессирующая CAR, совместно экспрессирует CAR и белок-мишень, например, естественным образом экспрессирует белок-мишень или сконструирована таким образом, что она экспрессирует белок-мишень. Например, клетка, например, популяция иммунных эффекторных клеток, может содержать нуклеиновую кислоту (например, вектор), содержащую нуклеиновую кислоту CAR (например, нуклеиновую кислоту CAR, описанную в данном документе) и нуклеиновую кислоту, кодирующую белок-мишень.In some embodiments, a cell expressing a CAR co-expresses a CAR and a target protein, such as naturally expressing the target protein or engineered to express the target protein. For example, a cell, such as a population of immune effector cells, can comprise a nucleic acid (e.g., a vector) comprising a CAR nucleic acid (e.g., a CAR nucleic acid described herein) and a nucleic acid encoding a target protein.
В некоторых вариантах осуществления средство, обеспечивающее истощение популяции Т-клеток, представляет собой ингибитор CD52, например, молекулу антитела к CD52, например, алемтузумаб.In some embodiments, the T cell depleting agent is a CD52 inhibitor, such as an anti-CD52 antibody molecule, such as alemtuzumab.
В других вариантах осуществления клетка, например, популяция иммунных эффекторных клеток, экспрессирует молекулу CAR, описанную в данном документе (например, CAR для CD19), и белок-мишень, распознаваемый средством, обеспечивающим истощение популяции Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления белок-мишень представляет собой CD20. В ряде вариантов осуществления, в которых белок-мишень представляет собой CD20, средство, обеспечивающее истощение популяции Т-клеток, представляет собой антитело к CD20, например, ритуксимаб.In other embodiments, a cell, such as a population of immune effector cells, expresses a CAR molecule described herein (e.g., a CD19 CAR) and a target protein recognized by a T cell depleting agent. In some embodiments, the target protein is CD20. In some embodiments in which the target protein is CD20, the T cell depleting agent is an anti-CD20 antibody, such as rituximab.
В дополнительных вариантах осуществления любого из вышеупомянутых способов способы дополнительно включают трансплантацию клетки, например, гемопоэтической стволовой клетки, или костного мозга в организм млекопитающего.In additional embodiments of any of the above methods, the methods further comprise transplanting a cell, such as a hematopoietic stem cell, or bone marrow into the mammal.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения описан способ подготовки млекопитающего перед трансплантацией клеток. Способ включает введение млекопитающему эффективного количества клетки, содержащей нуклеиновую кислоту или полипептид CAR, например, нуклеиновую кислоту или полипептид CAR для CD19. В некоторых вариантах осуществления трансплантация клеток представляет собой трансплантацию стволовых клеток, например, трансплантацию гемопоэтических стволовых клеток, или трансплантацию костного мозга. В других вариантах осуществления подготовка субъекта перед трансплантацией клеток включает снижение у субъекта количества клеток, экспрессирующих мишень, например, нормальных клеток, экспрессирующих CD19, или раковых клеток, экспрессирующих CD19.In some embodiments, the present invention provides a method for preparing a mammal for cell transplantation. The method comprises administering to the mammal an effective amount of a cell comprising a CAR nucleic acid or polypeptide, such as a CD19 CAR nucleic acid or polypeptide. In some embodiments, the cell transplantation is a stem cell transplantation, such as a hematopoietic stem cell transplantation or a bone marrow transplantation. In other embodiments, preparing a subject for cell transplantation comprises reducing the number of cells expressing a target in the subject, such as normal cells expressing CD19 or cancer cells expressing CD19.
Режим введения дозDosage regimen
В некоторых вариантах осуществления доза жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR (например, жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR для CD19, BCMA, CD20 или CD22), или фармацевтической композиции, содержащей указанные клетки содержит от приблизительно 1×106 до приблизительно 1×108 (например, от приблизительно 2×106 до приблизительно 5×107, от приблизительно 5×106 до приблизительно 2×107, от приблизительно 1×106 до приблизительно 1×107, от приблизительно 1×107 до приблизительно 1×108, от приблизительно 1×106 до приблизительно 3×106, от приблизительно 2×106 до приблизительно 4×106, от приблизительно 3×106 до приблизительно 5×106, от приблизительно 4×106 до приблизительно 6×106, от приблизительно 5×106 до приблизительно 7×106, от приблизительно 6×106 до приблизительно 8×106, от приблизительно 7×106 до приблизительно 9×106, от приблизительно 8×106 до приблизительно 1×107, от приблизительно 9×106 до приблизительно 2×107, от приблизительно 1×107 до приблизительно 3×107, от приблизительно 2×107 до приблизительно 4×107, от приблизительно 3×107 до приблизительно 5×107, от приблизительно 4×107 до приблизительно 6×107, от приблизительно 5×107 до приблизительно 7×107, от приблизительно 6×107 до приблизительно 8×107, от приблизительно 7×107 до приблизительно 9×107, от приблизительно 8×107 до приблизительно 1×108, приблизительно 1×106, приблизительно 2×106, приблизительно 3×106, приблизительно 4×106, приблизительно 5×106, приблизительно 6×106, приблизительно 7×106, приблизительно 8×106, приблизительно 9×106, приблизительно 1×107, приблизительно 2×107, приблизительно 3×107, приблизительно 4×107, приблизительно 5×107, приблизительно 6×107, приблизительно 7×107, приблизительно 8×107, приблизительно 9×107 или приблизительно 1×108) CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток). В некоторых вариантах осуществления доза жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR (например, жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR для CD19, BCMA, CD20 или CD22), составляет от приблизительно 0,5×106 жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR, до приблизительно 1,25×109 жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR (например, от 0,5×106 жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR, до 1,25×109 жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR). В некоторых вариантах осуществления доза жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR (например, жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR для CD19, BCMA, CD20 или CD22), составляет приблизительно 1×106, приблизительно 2,5×106, приблизительно 5×106, приблизительно 1,25×107, приблизительно 2,5×107, приблизительно 5×107, приблизительно 5,75×107 или приблизительно 8×107 жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR.In some embodiments, a dose of viable cells expressing a CAR (e.g., viable cells expressing a CAR for CD19, BCMA, CD20, or CD22) or a pharmaceutical composition comprising said cells comprises from about 1×10 6 to about 1×10 8 (e.g., from about 2×10 6 to about 5×10 7 , from about 5×10 6 to about 2×10 7 , from about 1×10 6 to about 1×10 7 , from about 1×10 7 to about 1×10 8 , from about 1×10 6 to about 3×10 6 , from about 2×10 6 to about 4×10 6 , from about 3×10 6 to about 5×10 6 , from about 4×10 6 to about 6×10 6 , from about 5×10 6 to about 7×10 6 , from about 6×10 6 to about 8×10 6 , from about 7×10 6 to about 9×10 6 , from about 8×10 6 to about 1×10 7 , from about 9×10 6 to about 2×10 7 , from about 1×10 7 to about 3×10 7 , from about 2×10 7 to about 4×10 7 , from about 3×10 7 to about 5×10 7 , from about 4×10 7 to about 6×10 7 , from about 5×10 7 to about 7×10 7 , from about 6×10 7 to about 8×10 7 , from about 7×10 7 to about 9×10 7 , from about 8×10 7 to about 1×10 8 , about 1×10 6 , about 2×10 6 , about 3×10 6 , about 4×10 6 , about 5×10 6 , about 6×10 6 , about 7×10 6 , about 8×10 6 , about 9×10 6 , about 1×10 7 , about 2×10 7 , about 3×10 7 , about 4×10 7 , about 5×10 7 , about 6×10 7 , about 7×10 7 , about 8×10 7 , about 9×10 7 or about 1×10 8 ) CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells). In some embodiments, the dose of viable cells expressing a CAR (e.g., viable cells expressing a CAR for CD19, BCMA, CD20, or CD22) is from about 0.5×10 6 viable cells expressing a CAR to about 1.25×10 9 viable cells expressing a CAR (e.g., from 0.5×10 6 viable cells expressing a CAR to 1.25×10 9 viable cells expressing a CAR). In some embodiments, the dose of viable cells expressing a CAR (e.g., viable cells expressing a CAR for CD19, BCMA, CD20, or CD22) is about 1×10 6 , about 2.5×10 6 , about 5×10 6 , about 1.25×10 7 , about 2.5×10 7 , about 5×10 7 , about 5.75×10 7 , or about 8×10 7 viable cells expressing a CAR.
В некоторых вариантах осуществления дозу рассчитывают на основании количества жизнеспособных BCMA-CAR+ T-клеток (например, клеток, положительных по одному CAR для BCMA, и клеток, положительных по двум CAR для BCMA+/CD19+), измеренном с помощью проточной цитометрии в день 4 (через 96 часов) после трансдукции (день 3 (через 72 часа) после сбора), как описано в данном документе. В некоторых вариантах осуществления доза жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR (например, клеточного продукта на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19), содержит от приблизительно 5×106 до приблизительно 2×107 CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток).In some embodiments, the dose is calculated based on the number of viable BCMA-CAR+ T cells (e.g., cells positive for a single CAR for BCMA and cells positive for dual CARs for BCMA+/CD19+) measured by flow cytometry at day 4 (96 hours) post-transduction (day 3 (72 hours) post-harvest), as described herein. In some embodiments, the dose of viable CAR-expressing cells (e.g., a BCMA/CD19 dual-specific CAR-T cell product) comprises from about 5× 106 to about 2× 107 CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells).
В некоторых вариантах осуществления дозу жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR (например, жизнеспособных клеток, экспрессирующих CAR для CD19, BCMA, CD20 или CD22), или фармацевтической композиции, содержащей указанные клетки, вводят субъекту в одной или нескольких (например, 2, 3, 4 или больше) дозах. В некоторых вариантах осуществления клетки или фармацевтическую композицию вводят субъекту в двух дозах. В некоторых вариантах осуществления одна или несколько доз включают первую дозу и вторую дозу, где количество CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) в первой дозе больше количества, равняется количеству или меньше количества CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) во второй дозе.In some embodiments, a dose of viable cells expressing a CAR (e.g., viable cells expressing a CAR for CD19, BCMA, CD20, or CD22) or a pharmaceutical composition comprising the cells is administered to the subject in one or more (e.g., 2, 3, 4, or more) doses. In some embodiments, the cells or pharmaceutical composition are administered to the subject in two doses. In some embodiments, the one or more doses comprise a first dose and a second dose, wherein the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the first dose is greater than, equal to, or less than the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the second dose.
В некоторых вариантах осуществления одна или несколько доз включают первую дозу и вторую дозу, где:In some embodiments, the one or more doses comprise a first dose and a second dose, wherein:
(a) первая доза содержит от приблизительно 1×106 до приблизительно 1×107 (например, от приблизительно 2×106 до приблизительно 8×106, от приблизительно 4×106 до приблизительно 6×106, от приблизительно 1×106 до приблизительно 5×106, от приблизительно 5×106 до приблизительно 1×107, от приблизительно 1×106 до приблизительно 3×106, от приблизительно 2×106 до приблизительно 4×106, от приблизительно 3×106 до приблизительно 5×106, от приблизительно 4×106 до приблизительно 6×106, от приблизительно 5×106 до приблизительно 7×106, от приблизительно 6×106 до приблизительно 8×106, от приблизительно 7×106 до приблизительно 9×106, от приблизительно 8×106 до приблизительно 1×107, приблизительно 1×106, приблизительно 2×106, приблизительно 3×106, приблизительно 4×106, приблизительно 5×106, приблизительно 6×106, приблизительно 7×106, приблизительно 8×106, приблизительно 9×106 или приблизительно 1×107) жизнеспособных CAR-положительных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток);(a) the first dose comprises from about 1×10 6 to about 1×10 7 (e.g., from about 2×10 6 to about 8×10 6 , from about 4×10 6 to about 6×10 6 , from about 1×10 6 to about 5×10 6 , from about 5×10 6 to about 1×10 7 , from about 1×10 6 to about 3×10 6 , from about 2×10 6 to about 4×10 6 , from about 3×10 6 to about 5×10 6 , from about 4×10 6 to about 6×10 6 , from about 5×10 6 to about 7×10 6 , from about 6×10 6 to about 8×10 6 , from about 7×10 6 to about 9×10 6 , from about 8×10 6 to about 1×10 7 , about 1×10 6 , about 2×10 6 , about 3×10 6 , about 4×10 6 , about 5×10 6 , about 6×10 6 , about 7×10 6 , about 8×10 6 , about 9×10 6 , or about 1×10 7 ) of viable CAR-positive cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells);
(b) вторая доза содержит от приблизительно 1×107 до приблизительно 1×108 (например, от приблизительно 2×107 до приблизительно 8×107, от приблизительно 4×107 до приблизительно 6×107, от приблизительно 1×107 до приблизительно 5×107, от приблизительно 5×107 до приблизительно 1×108, от приблизительно 1×107 до приблизительно 3×107, от приблизительно 2×107 до приблизительно 4×107, от приблизительно 3×107 до приблизительно 5×107, от приблизительно 4×107 до приблизительно 6×107, от приблизительно 5×107 до приблизительно 7×107, от приблизительно 6×107 до приблизительно 8×107, от приблизительно 7×107 до приблизительно 9×107, от приблизительно 8×107 до приблизительно 1×108, приблизительно 1×107, приблизительно 2×107, приблизительно 3×107, приблизительно 4×107, приблизительно 5×107, приблизительно 6×107, приблизительно 7×107, приблизительно 8×107, приблизительно 9×107 или приблизительно 1×108) CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток);(b) the second dose comprises from about 1×10 7 to about 1×10 8 (e.g., from about 2×10 7 to about 8×10 7 , from about 4×10 7 to about 6×10 7 , from about 1×10 7 to about 5×10 7 , from about 5×10 7 to about 1×10 8 , from about 1×10 7 to about 3×10 7 , from about 2×10 7 to about 4×10 7 , from about 3×10 7 to about 5×10 7 , from about 4×10 7 to about 6×10 7 , from about 5×10 7 to about 7×10 7 , from about 6×10 7 to about 8×10 7 , from about 7×10 7 to about 9×10 7 , from about 8×10 7 to about 1×10 8 , about 1×10 7 , about 2×10 7 , about 3×10 7 , about 4×10 7 , about 5×10 7 , about 6×10 7 , about 7×10 7 , about 8×10 7 , about 9×10 7 or about 1×10 8 ) CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells);
(c) количество CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) в первой дозе составляет не более чем 1/X, где X равняется 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100, от количества CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) во второй дозе; и/или(c) the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the first dose is no more than 1/X, where X is 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, or 100, of the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the second dose; and/or
(d) количество CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) в первой дозе составляет от приблизительно 1% до 100% (например, от приблизительно 10% до приблизительно 90%, от приблизительно 20% до приблизительно 80%, от приблизительно 30% до приблизительно 70%, от приблизительно 40% до приблизительно 60%, от приблизительно 10% до приблизительно 50%, от приблизительно 50% до приблизительно 90%, от приблизительно 10% до приблизительно 30%, от приблизительно 20% до приблизительно 40%, от приблизительно 30% до приблизительно 50%, от приблизительно 50% до приблизительно 70%, от приблизительно 60% до приблизительно 80% или от приблизительно 70% до приблизительно 90%) от количества CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток) во второй дозе.(d) the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the first dose is from about 1% to 100% (e.g., from about 10% to about 90%, from about 20% to about 80%, from about 30% to about 70%, from about 40% to about 60%, from about 10% to about 50%, from about 50% to about 90%, from about 10% to about 30%, from about 20% to about 40%, from about 30% to about 50%, from about 50% to about 70%, from about 60% to about 80%, or from about 70% to about 90%) of the number of CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells) in the second dose.
В некоторых вариантах осуществления первая доза содержит приблизительно 5×106 жизнеспособных CAR-положительных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток). В некоторых вариантах осуществления вторая доза содержит приблизительно 1×107 или приблизительно 2×107 жизнеспособных CAR-положительных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток).In some embodiments, the first dose comprises about 5×10 6 viable CAR-positive cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells). In some embodiments, the second dose comprises about 1×10 7 or about 2×10 7 viable CAR-positive cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells).
В некоторых вариантах осуществления доза CAR-положительных клеток может быть увеличена относительно начальной дозы при последующем введении. Например, пациент может получать начальную дозу, составляющую от приблизительно 1×106 до приблизительно 1×107 (например, приблизительно 5×106) жизнеспособных CAR-положительных клеток, и может получать вторую дозу, составляющую от приблизительно 1×107 до приблизительно 1×108 (например, приблизительно 1×107 или приблизительно 2×107) CAR-положительных жизнеспособных клеток (например, BCMA-CAR+ Т-клеток).In some embodiments, the dose of CAR-positive cells may be increased relative to the initial dose upon subsequent administration. For example, the patient may receive an initial dose of about 1 x 10 6 to about 1 x 10 7 (e.g., about 5 x 10 6 ) viable CAR-positive cells, and may receive a second dose of about 1 x 10 7 to about 1 x 10 8 (e.g., about 1 x 10 7 or about 2 x 10 7 ) CAR-positive viable cells (e.g., BCMA-CAR+ T cells).
Отбор пациентовPatient selection
В некоторых вариантах осуществления любого из способов лечения субъекта или композиции для применения, раскрытых в данном документе, у субъекта имеется рак, например, гематологический рак. В некоторых вариантах осуществления рак выбран из лимфоцитарного лейкоза (CLL), мантийноклеточной лимфомы (MCL), множественной миеломы, острого лимфоидного лейкоза (ALL), лимфомы Ходжкина, B-клеточного острого лимфоидного лейкоза (BALL), T-клеточного острого лимфоидного лейкоза (TALL), мелкоклеточного лимфоцитарного лейкоза (SLL), B-клеточного пролимфоцитарного лейкоза, новообразования из бластных плазмоцитоидных дендритных клеток, лимфомы Беркитта, диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомы (DLBCL), DLBCL, ассоциированной с хроническим воспалением, хронического миелоидного лейкоза, миелопролиферативных новообразований, фолликулярной лимфомы, педиатрической фолликулярной лимфомы, волосатоклеточного лейкоза, мелкоклеточной или крупноклеточной фолликулярной лимфомы, злокачественных лимфопролиферативных состояний, MALT-лимфомы (экстранодальной лимфомы из клеток маргинальной зоны из лимфоидной ткани слизистых оболочек), лимфомы из клеток маргинальной зоны, миелодисплазии, миелодиспластического синдрома, неходжкинской лимфомы, плазмобластной лимфомы, новообразования из плазмоцитоидных дендритных клеток, макроглобулинемии Вальденстрема, лимфомы из клеток маргинальной зоны селезенки, лимфомы/лейкоза селезенки, диффузной мелкоклеточной B-клеточной лимфомы красной пульпы селезенки, варианта волосатоклеточного лейкоза, лимфоплазмоцитарной лимфомы, болезни тяжелых цепей, плазмоклеточной миеломы, солитарной плазмоцитомы кости, внекостной плазмоцитомы, нодулярной лимфомы из клеток маргинальной зоны, педиатрической нодулярной лимфомы из клеток маргинальной зоны, первичной кожной лимфомы из клеток центра фолликула, лимфоматоидного гранулематоза, первичной медиастинальной (тимической) крупноклеточной B-клеточной лимфомы, внутрисосудистой крупноклеточной B-клеточной лимфомы, ALK+ крупноклеточной B-клеточной лимфомы, крупноклеточной B-клеточной лимфомы, возникающей при HHV8-ассоциированной многоочаговой болезни Кастлемана, первичной выпотной лимфомы, B-клеточной лимфомы, острого миелоидного лейкоза (AML) или неклассифицируемой лимфомы. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой рецидивирующий и/или рефрактерный рак.In some embodiments of any of the methods of treating a subject or composition for use disclosed herein, the subject has cancer, such as hematological cancer. In some embodiments, the cancer is selected from lymphocytic leukemia (CLL), mantle cell lymphoma (MCL), multiple myeloma, acute lymphoid leukemia (ALL), Hodgkin lymphoma, B-cell acute lymphoid leukemia (BALL), T-cell acute lymphoid leukemia (TALL), small lymphocytic leukemia (SLL), B-cell prolymphocytic leukemia, blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Burkitt's lymphoma, diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), DLBCL associated with chronic inflammation, chronic myeloid leukemia, myeloproliferative neoplasms, follicular lymphoma, pediatric follicular lymphoma, hairy cell leukemia, small cell or large cell follicular lymphoma, malignant lymphoproliferative conditions, MALT lymphoma (extranodal marginal zone cell lymphoma of mucosal lymphoid tissue), marginal zone cell lymphoma, myelodysplasia, myelodysplastic syndrome, non-Hodgkin's lymphoma, plasmablastic lymphoma, plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Waldenstrom's macroglobulinemia, splenic marginal zone cell lymphoma, splenic lymphoma/leukemia, diffuse small B-cell lymphoma of the splenic red pulp, variant hairy cell leukemia, lymphoplasmacytic lymphoma, heavy chain disease, plasma cell myeloma, solitary plasmacytoma of bone, extraosseous plasmacytoma, nodular marginal zone cell lymphoma, pediatric nodular marginal zone cell lymphoma, primary cutaneous follicular center cell lymphoma, lymphomatoid granulomatosis, primary mediastinal (thymic) large B-cell lymphoma, intravascular large B-cell lymphoma, ALK+ large B-cell lymphoma, large B-cell lymphoma arising in HHV8-associated multicentric Castleman disease, primary effusion lymphoma, B-cell lymphoma, acute myeloid leukemia (AML), or unclassifiable lymphoma. In some embodiments, the cancer is relapsed and/or refractory cancer.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов лечения субъекта или композиции для применения, раскрытых в данном документе, у субъекта имеется CLL или SLL В некоторых вариантах осуществления субъекту, у которого имеется CLL или SLL, ранее вводили средство терапии на основе ингибитора BTK, например, ибрутиниб, в течение по меньшей мере 1-12 месяцев, например, 6 месяцев. В некоторых вариантах осуществления средство терапии на основе ингибитора BTK, например, средство терапии ибрутиниб, представляет собой средство терапии второй линии. В некоторых вариантах осуществления у субъекта наблюдался частичный ответ или наблюдалась стабилизация заболевания в ответ на средство терапии на основе ингибитора BTK. В некоторых вариантах осуществления у субъекта не наблюдался ответ на средство терапии на основе ингибитора BTK. В некоторых вариантах осуществления у субъекта развилась устойчивость, например, развились мутации, придающие устойчивость к ибрутинибу. В некоторых вариантах осуществления мутации, придающие устойчивость к ибрутинибу, включают мутацию в гене, кодирующем BTK, и/или гене, кодирующем PLCg2. В некоторых вариантах осуществления субъект представляет собой взрослую особь, например, в возрасте по меньшей мере 18 лет.In some embodiments of any of the methods of treating a subject or composition for use disclosed herein, the subject has CLL or SLL. In some embodiments, a subject who has CLL or SLL has previously been administered a BTK inhibitor therapy, such as ibrutinib, for at least 1-12 months, such as 6 months. In some embodiments, the BTK inhibitor therapy, such as ibrutinib, is a second-line therapy. In some embodiments, the subject has had a partial response or has had stable disease in response to the BTK inhibitor therapy. In some embodiments, the subject has not responded to the BTK inhibitor therapy. In some embodiments, the subject has developed resistance, such as developed mutations that confer resistance to ibrutinib. In some embodiments, the mutations conferring resistance to ibrutinib include a mutation in the gene encoding BTK and/or the gene encoding PLCg2. In some embodiments, the subject is an adult, such as at least 18 years of age.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов лечения субъекта или композиции для применения, раскрытых в данном документе, у субъекта имеется DLBCL, например, рецидивирующая и/или рефрактерная DLBCL. В некоторых вариантах осуществления субъекту, у которого имеется DLBCL, например, рецидивирующая и/или рефрактерная DLBCL, ранее вводили по меньшей мере 2 линии средств химиотерапии, например, средство терапии на основе антитела к CD20 и/или средство химиотерапии на основе антрациклина. В некоторых вариантах осуществления субъект ранее получал средство терапии на основе стволовых клеток, например, средство терапии на основе аутологичных стволовых клеток, и у него не наблюдался ответ на указанное средство терапии на основе стволовых клеток. В некоторых вариантах осуществления субъект не соответствует критериям для применения средства терапии на основе стволовых клеток, например, средства терапии на основе аутологичных стволовых клеток. В некоторых вариантах осуществления субъект представляет собой взрослую особь, например, в возрасте по меньшей мере 18 лет.In some embodiments of any of the methods of treating a subject or composition for use disclosed herein, the subject has DLBCL, such as relapsed and/or refractory DLBCL. In some embodiments, the subject having DLBCL, such as relapsed and/or refractory DLBCL, has previously been administered at least 2 lines of chemotherapy, such as an anti-CD20 antibody therapy and/or an anthracycline chemotherapy. In some embodiments, the subject has previously received a stem cell therapy, such as an autologous stem cell therapy, and has not responded to the stem cell therapy. In some embodiments, the subject does not meet the criteria for a stem cell therapy, such as an autologous stem cell therapy. In some embodiments, the subject is an adult, such as at least 18 years of age.
Терапевтическое применениеTherapeutic use
Заболевания и/или нарушения, ассоциированные с ВСМАDiseases and/or disorders associated with MCVA
В одном аспекте в настоящем изобретении предусмотрены способы лечения заболевания, ассоциированного с экспрессией ВСМА. В одном аспекте в настоящем изобретении предусмотрены способы лечения заболевания, где часть опухоли является отрицательной по BCMA, а часть опухоли является положительной по BCMA. Например, CAR по настоящему изобретению является применимым для лечения субъектов, которые прошли лечение заболевания, ассоциированного с повышенной экспрессией BCMA, где у субъекта, прошедшего лечение при повышенных уровнях BCMA, проявляется заболевание, ассоциированное с повышенными уровнями BCMA. В ряде вариантов осуществления CAR по настоящему изобретению является применимым для лечения субъектов, которые прошли лечение заболевания, ассоциированного с экспрессией BCMA, где у субъекта, прошедшего лечение, связанное с экспрессией BCMA, проявляется заболевание, ассоциированное с экспрессией BCMA.In one aspect, the present invention provides methods for treating a disease associated with BCMA expression. In one aspect, the present invention provides methods for treating a disease wherein a portion of a tumor is BCMA negative and a portion of the tumor is BCMA positive. For example, a CAR of the present invention is useful for treating subjects who have undergone treatment for a disease associated with increased BCMA expression, wherein the subject who has undergone treatment for elevated BCMA levels exhibits a disease associated with elevated BCMA levels. In some embodiments, a CAR of the present invention is useful for treating subjects who have undergone treatment for a disease associated with BCMA expression, wherein the subject who has undergone treatment for a disease associated with BCMA expression exhibits a disease associated with BCMA expression.
В одном варианте осуществления в настоящем изобретении предусмотрены способы лечения заболевания, при котором BCMA экспрессируется как на нормальных клетках, так и на раковых клетках, но на нормальных клетках экспрессируется при более низких уровнях. В одном варианте осуществления способ дополнительно включает отбор CAR по настоящему изобретению, который связывается с такой аффинностью, которая позволяет CAR для ВСМА связывать и уничтожать раковые клетки, экспрессирующие ВСМА, но при этом уничтожать менее 30%, 25%, 20%, 15%, 10%, 5% или меньше нормальных клеток, экспрессирующих ВСМА, например, согласно определению с помощью анализа, описанного в данном документе. Например, можно применять анализ уничтожения, такой как проточная цитометрия с использованием CTL с Cr51. В одном варианте осуществления CAR для ВСМА имеет антигенсвязывающий домен, который характеризуется аффинностью связывания с KD в отношении антигена-мишени, составляющей от 10-4 М до 10-8 М, например, от 10-5 М до 10-7 М, например, 10-6 М или 10-7 М. В одном варианте осуществления антигенсвязывающий домен для ВСМА характеризуется аффинностью связывания, в по меньшей мере пять раз, 10 раз, 20 раз, 30 раз, 50 раз, 100 раз или 1000 раз меньшей, чем у эталонного антитела, например, антитела, описанного в данном документе.In one embodiment, the present invention provides methods for treating a disease in which BCMA is expressed on both normal cells and cancer cells, but is expressed at lower levels on normal cells. In one embodiment, the method further comprises selecting a CAR of the present invention that binds with an affinity that allows the CAR for BCMA to bind to and kill BCMA-expressing cancer cells, but to kill less than 30%, 25%, 20%, 15%, 10%, 5%, or less of the normal cells expressing BCMA, such as determined by an assay described herein. For example, a killing assay such as flow cytometry using Cr51 CTLs can be used. In one embodiment, a CAR for BCMA has an antigen-binding domain that has a binding affinity with a KD for a target antigen of from 10-4 M to 10-8 M, such as from 10-5 M to 10-7 M, such as 10-6 M or 10-7 M. In one embodiment, the antigen-binding domain for BCMA has a binding affinity that is at least five-fold, 10-fold, 20-fold, 30-fold, 50-fold, 100-fold, or 1000-fold lower than that of a reference antibody, such as an antibody described herein.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к вектору, содержащему CAR для ВСМА, функционально связанный с промотором для экспрессии в иммунных эффекторных клетках млекопитающего, например, T-клетках или NK-клетках. В одном аспекте в настоящем изобретении предусмотрена рекомбинантная иммунная эффектoрная клетка, например, T-клетка или NK-клетка, экспрессирующая CAR для BCMA, для применения в лечении опухолей, экспрессирующих BCMA, где рекомбинантная иммунная эффектoрная клетка (например, T-клетка или NK-клетка), экспрессирующая CAR для BCMA, называется клеткой, экспрессирующей CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-T-клеткой или NK-клеткой, экспрессирующей CAR для BCMA). В одном аспекте клетка, экспрессирующая CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-Т-клетка или NK-клетка, экспрессирующая CAR для BCMA), по настоящему изобретению способна вступать в контакт с опухолевой клеткой с по меньшей мере одним CAR для BCMA по настоящему изобретению, экспрессируемым на ее поверхности, так что клетка, экспрессирующая CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-Т-клетка или NK-клетка, экспрессирующая CAR для BCMA), нацеливается на опухолевую клетку, и рост опухоли ингибируется.In one aspect, the present invention relates to a vector comprising a CAR for BCMA operably linked to a promoter for expression in mammalian immune effector cells, e.g., T cells or NK cells. In one aspect, the present invention provides a recombinant immune effector cell, e.g., a T cell or NK cell, expressing a CAR for BCMA for use in the treatment of BCMA-expressing tumors, wherein the recombinant immune effector cell (e.g., a T cell or NK cell) expressing a CAR for BCMA is referred to as a cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a BCMA-CAR-T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA). In one aspect, a cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a BCMA CAR T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA) of the present invention is capable of contacting a tumor cell with at least one CAR for BCMA of the present invention expressed on its surface, such that the cell expressing the CAR for BCMA (e.g., a BCMA CAR T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA) targets the tumor cell and tumor growth is inhibited.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к способу ингибирования роста опухолевой клетки, экспрессирующей BCMA, включающий приведение опухолевой клетки в контакт с клеткой, экспрессирующей CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-T-клеткой или NK-клеткой, экспрессирующей CAR для BCMA), по настоящему изобретению, так что клетка, экспрессирующая CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-T-клетка или NK-клетка, экспрессирующая CAR для BCMA), активируется в ответ на антиген и нацеливается на раковую клетку, при этом рост опухоли ингибируется.In one aspect, the present invention relates to a method for inhibiting the growth of a tumor cell expressing BCMA, comprising contacting the tumor cell with a cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a BCMA CAR T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA) of the present invention, such that the cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a BCMA CAR T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA) is activated in response to an antigen and targets the cancer cell, wherein tumor growth is inhibited.
В одном аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения рака у субъекта. Способ включает введение субъекту клетки, экспрессирующей CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-T-клетки или NK-клетки, экспрессирующей CAR для BCMA), по настоящему изобретению, так что у субъекта осуществляется лечение рака. Примером рака, поддающегося лечению с помощью клетки, экспрессирующей CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-T-клетки или NK-клетки, экспрессирующей CAR для BCMA) по настоящему изобретению, является рак, ассоциированный с экспрессией BCMA.In one aspect, the present invention relates to a method of treating cancer in a subject. The method comprises administering to the subject a cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a BCMA CAR T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA) of the present invention, such that the subject is treated for cancer. An example of a cancer treatable with a cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a BCMA CAR T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA) of the present invention is a cancer associated with BCMA expression.
Настоящее изобретение включает тип клеточной терапии, где иммунные эффекторные клетки (например, T-клетки или NK-клетки) подвергнуты генетической модификации таким образом, что они экспрессируют химерный антигенный рецептор (CAR), и при этом клетку, экспрессирующую CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-T-клетку или NK-клетку, экспрессирующую CAR для BCMA), вводят посредством инфузии нуждающемуся в этом реципиенту. Введенная посредством инфузии клетка способна уничтожать опухолевые клетки у реципиента. В отличие от терапевтических средств на основе антител, CAR-модифицированные клетки, например, Т-клетки или NK-клетки, способны реплицироваться in vivo, что приводит в результате к долгосрочной персистенции, которая может обеспечивать устойчивый контроль опухоли. В различных аспектах клетки (например, T-клетки, NK-клетки), введенные пациенту, или их потомство персистируют у пациента в течение по меньшей мере четырех месяцев, пяти месяцев, шести месяцев, семи месяцев, восьми месяцев, девяти месяцев, десяти месяцев, одиннадцати месяцев, двенадцати месяцев, тринадцати месяцев, четырнадцати месяцев, пятнадцати месяцев, шестнадцати месяцев, семнадцати месяцев, восемнадцати месяцев, девятнадцати месяцев, двадцати месяцев, двадцати одного месяца, двадцати двух месяцев, двадцати трех месяцев, двух лет, трех лет, четырех лет или пяти лет после введения пациенту клетки (например, T-клетки или NK-клетки).The present invention includes a type of cell therapy wherein immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) are genetically modified to express a chimeric antigen receptor (CAR), and wherein a cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a BCMA-CAR-T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA) is administered by infusion to a recipient in need thereof. The infused cell is capable of killing tumor cells in the recipient. Unlike antibody-based therapeutics, CAR-modified cells, such as T cells or NK cells, are capable of replicating in vivo, resulting in long-term persistence that can provide durable tumor control. In various aspects, the cells (e.g., T cells, NK cells) administered to the patient, or their progeny, persist in the patient for at least four months, five months, six months, seven months, eight months, nine months, ten months, eleven months, twelve months, thirteen months, fourteen months, fifteen months, sixteen months, seventeen months, eighteen months, nineteen months, twenty months, twenty-one months, twenty-two months, twenty-three months, two years, three years, four years, or five years after the cell (e.g., T cells or NK cells) is administered to the patient.
Настоящее изобретение также включает тип клеточной терапии, при которой иммунные эффекторные клетки (например, Т-клетки или NK-клетки) модифицированы, например, с помощью РНК, транскрибированной in vitro, таким образом, что они транзиентно экспрессируют химерный антигенный рецептор (CAR), и иммунную эффекторную клетку (например, Т-клетку или NK-клетку) вводят посредством инфузии реципиенту, нуждающемуся в этом. Введенная посредством инфузии клетка способна уничтожать опухолевые клетки у реципиента. Таким образом, в различных аспектах иммунные эффекторные клетки (например, Т-клетки или NK-клетки), вводимые пациенту, присутствуют в течение менее одного месяца, например, в течение трех недель, двух недель, одной недели, после введения пациенту иммунной эффекторной клетки (например, Т-клетки или NK-клетки).The present invention also includes a type of cell therapy in which immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) are modified, for example, by in vitro transcribed RNA, so that they transiently express a chimeric antigen receptor (CAR), and the immune effector cell (e.g., T cell or NK cell) is administered by infusion to a recipient in need thereof. The infused cell is capable of killing tumor cells in the recipient. Thus, in various aspects, the immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) administered to a patient are present for less than one month, such as three weeks, two weeks, one week, after the immune effector cell (e.g., T cell or NK cell) is administered to the patient.
Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что противоопухолевый иммунный ответ, вызываемый CAR-модифицированными иммунными эффекторными клетками (например, T-клетками или NK-клетками), может быть активным или пассивным иммунным ответом или в качестве альтернативы может быть обусловлен прямым или непрямым иммунным ответом. В одном аспекте иммунные эффекторные клетки (например, Т-клетки или NK-клетки), трансдуцированные с помощью CAR, демонстрируют секрецию специфических провоспалительных цитокинов и сильную цитолитическую активность в ответ на опухолевые клетки человека, экспрессирующие ВСМА, противодействуют ингибированию со стороны растворимого ВСМА, опосредуют неспецифический цитолиз и опосредуют регрессию развившейся опухоли у человека. Например, опухолевые клетки, не содержащие антигена, в гетерогенной области опухоли, экспрессирующей ВСМА, могут быть восприимчивы к непрямому разрушению ВСМА-перенаправленными иммунными эффекторными клетками (например, Т-клетками или NK-клетками), которые ранее вступали в реакцию против соседних раковых клеток, положительных по антигену.Without being limited by theory, it is believed that the anti-tumor immune response elicited by CAR-modified immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) may be an active or passive immune response, or may alternatively be due to a direct or indirect immune response. In one aspect, CAR-transduced immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) exhibit secretion of specific proinflammatory cytokines and potent cytolytic activity in response to BCMA-expressing human tumor cells, counteract inhibition by soluble BCMA, mediate non-specific cytolysis, and mediate regression of established human tumors. For example, antigen-deficient tumor cells within a heterogeneous region of a BCMA-expressing tumor may be susceptible to indirect destruction by BCMA-redirected immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) that have previously reacted against adjacent antigen-positive cancer cells.
В одном аспекте полностью человеческие CAR-модифицированные иммунные эффекторные клетки (например, T-клетки или NK-клетки) по настоящему изобретению могут представлять собой тип вакцины для иммунизации ex vivo и/или терапии in vivo у млекопитающего. В одном аспекте млекопитающее является человеком.In one aspect, the fully human CAR-modified immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) of the present invention may be a type of vaccine for ex vivo immunization and/or in vivo therapy in a mammal. In one aspect, the mammal is a human.
Что касается иммунизации ex vivo, то перед введением клетки млекопитающему происходит по меньшей мере одно из следующих событий in vitro: i) размножение клеток, ii) введение нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, в клетки или iii) криоконсервация клеток.For ex vivo immunization, prior to administration of the cell to the mammal, at least one of the following events occurs in vitro: i) expansion of the cells, ii) introduction of the CAR-encoding nucleic acid into the cells, or iii) cryopreservation of the cells.
Процедуры ex vivo хорошо известны из уровня техники и более подробно обсуждаются ниже. Вкратце, клетки выделяют у млекопитающего (например, человека) и генетически модифицируют (т. е. трансдуцируют или трансфицируют in vitro) с помощью вектора, экспрессирующего CAR, раскрытый в данном документе. CAR-модифицированную клетку можно вводить реципиенту-млекопитающему для обеспечения терапевтически благоприятного эффекта. Реципиентом-млекопитающим может быть человек, и CAR-модифицированная клетка может быть аутологичной по отношению к реципиенту. В качестве альтернативы клетки могут быть аллогенными, сингенными или ксеногенными по отношению к реципиенту.Ex vivo procedures are well known in the art and are discussed in more detail below. Briefly, cells are isolated from a mammal (e.g., a human) and genetically modified (i.e., transduced or transfected in vitro) with a vector expressing a CAR disclosed herein. The CAR-modified cell can be administered to a mammalian recipient to provide a therapeutically beneficial effect. The mammalian recipient can be a human, and the CAR-modified cell can be autologous to the recipient. Alternatively, the cells can be allogeneic, syngeneic, or xenogeneic to the recipient.
Процедуру размножения ex vivo гемопоэтических стволовых клеток и клеток-предшественников, описанную в патенте США № 5199942, включенном в данный документ посредством ссылки, можно применять по отношению к клеткам по настоящему изобретению. Другие подходящие способы известны из уровня техники, поэтому настоящее изобретение не ограничивается каким-либо конкретным способом размножения клеток ex vivo. Вкратце, культивирование и размножение Т-клеток ex vivo включает (1) сбор CD34+ гемопоэтических стволовых клеток и клеток-предшественников млекопитающего из собранного материала периферической крови или эксплантатов костного мозга и (2) размножение таких клеток ex vivo. В дополнение к клеточным факторам роста, описанным в патенте США № 5199942, для культивирования и размножения клеток можно применять другие факторы, такие как flt3-L, IL-1, IL-3 и лиганд c-kit.The procedure for ex vivo expansion of hematopoietic stem and progenitor cells described in U.S. Patent No. 5,199,942, incorporated herein by reference, can be applied to the cells of the present invention. Other suitable methods are known in the art, so the present invention is not limited to any particular method for ex vivo cell expansion. Briefly, ex vivo culturing and expansion of T cells involves (1) collecting mammalian CD34+ hematopoietic stem and progenitor cells from pooled peripheral blood or bone marrow explants and (2) ex vivo expansion of such cells. In addition to the cellular growth factors described in U.S. Patent No. 5,199,942, other factors such as flt3-L, IL-1, IL-3, and c-kit ligand can be used to cultivate and expand the cells.
В дополнение к применению клеточной вакцины с целью иммунизации ex vivo, в настоящем изобретении также предусмотрены композиции и способы для иммунизации in vivo для того, чтобы вызвать иммунный ответ, направленный на антиген у пациента.In addition to the use of a cellular vaccine for ex vivo immunization, the present invention also provides compositions and methods for in vivo immunization to elicit an immune response directed to an antigen in a patient.
Как правило, клетки, активированные и размноженные так, как это описано в данном документе, можно использовать в лечении и предупреждении заболеваний, возникающих у индивидуумов с ослабленным иммунитетом. Например, CAR-модифицированные иммунные эффекторные клетки (например, Т-клетки или NK-клетки) по настоящему изобретению применяют в лечении заболеваний, нарушений и состояний, ассоциированных с экспрессией ВСМА. В некоторых аспектах клетки по настоящему изобретению применяют в лечении пациентов с риском развития заболеваний, нарушений и состояний, ассоциированных с экспрессией ВСМА. Таким образом, в настоящем изобретении предусмотрены способы лечения или предупреждения заболеваний, нарушений и состояний, ассоциированных с экспрессией ВСМА, включающие введение субъекту, нуждающемуся в этом, терапевтически эффективного количества CAR-модифицированных иммунных эффекторных клеток (например, Т-клеток или NK-клеток) по настоящему изобретению.In general, cells activated and expanded as described herein can be used in the treatment and prevention of diseases occurring in immunocompromised individuals. For example, CAR-modified immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) of the present invention are used in the treatment of diseases, disorders, and conditions associated with BCMA expression. In some aspects, the cells of the present invention are used in the treatment of patients at risk of developing diseases, disorders, and conditions associated with BCMA expression. Thus, the present invention provides methods for the treatment or prevention of diseases, disorders, and conditions associated with BCMA expression, comprising administering to a subject in need thereof a therapeutically effective amount of CAR-modified immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) of the present invention.
В одном аспекте клетки, экспрессирующие CAR (например, CAR-T-клетки или NK-клетки, экспрессирующие CAR), по настоящему изобретению можно применять для лечения пролиферативного заболевания, такого как рак или злокачественное новообразование, или предракового состояния, такого как миелодисплазия, миелодиспластический синдром или предлейкоз. В одном аспекте рак представляет собой гематологический рак. Состояния, связанные с гематологическими формами рака, представляют собой типы рака, такие как лейкоз и злокачественные лимфопролиферативные состояния, при которых поражается кровь, костный мозг и лимфатическая система. В одном аспекте гематологический рак представляет собой лейкоз или гематологическое заболевание. Примером заболевания или нарушения, ассоциированного с BCMA, является множественная миелома (также известная как MM) (см. Claudio et al., Blood. 2002, 100(6):2175-86; и Novak et al., Blood. 2004, 103(2):689-94). Множественная миелома, также известная как плазмоклеточная миелома или болезнь Калера, представляет собой рак, характеризующийся накоплением аномальных или злокачественных плазматических B-клеток в костном мозге. Часто раковые клетки внедряются в смежную кость, разрушая скелетные структуры, что приводит к боли в костях и переломам. Большинство случаев миеломы также характеризуются продуцированием парапротеина (также известного как M-белки или миеломные белки), который представляет собой аномальный иммуноглобулин, продуцируемый в избытке вследствие клональной пролиферации злокачественных плазматических клеток. Уровни парапротеина в сыворотке крови, составляющие более 30 г/л, являются диагностическим критерием множественной миеломы в соответствии с диагностическими критериями Международной группы по изучению множественной миеломы (IMWG) (см. Kyle et al. (2009), Leukemia. 23:3-9). Другие симптомы или признаки множественной миеломы включают снижение функции почек или почечную недостаточность, очаги поражения костей, анемию, гиперкальциемию и неврологические симптомы.In one aspect, the CAR-expressing cells (e.g., CAR-T cells or CAR-expressing NK cells) of the present invention can be used to treat a proliferative disease such as cancer or a malignancy, or a precancerous condition such as myelodysplasia, myelodysplastic syndrome, or preleukemia. In one aspect, the cancer is a hematological cancer. Conditions associated with hematological cancers are types of cancer such as leukemia and malignant lymphoproliferative conditions that affect the blood, bone marrow, and lymphatic system. In one aspect, the hematological cancer is leukemia or a hematological disorder. An example of a disease or disorder associated with BCMA is multiple myeloma (also known as MM) (see Claudio et al.,Blood. 2002, 100(6):2175-86; and Novak et al., Blood. 2004, 103(2):689-94). Multiple myeloma, also known as plasma cell myeloma or Kahler disease, is a cancer characterized by the accumulation of abnormal or malignant plasma B cells in the bone marrow. Often, the cancer cells invade adjacent bone, destroying skeletal structures and leading to bone pain and fractures. Most cases of myeloma are also characterized by the production of paraprotein (also known as M proteins or myeloma proteins), which is an abnormal immunoglobulin produced in excess by the clonal proliferation of malignant plasma cells. Serum paraprotein levels greater than 30 g/L are diagnostic of multiple myeloma according to the diagnostic criteria of the International Multiple Myeloma Study Group (IMWG) (see Kyle et al. (2009) Leukemia. 23:3-9). Other symptoms or signs of multiple myeloma include decreased kidney function or kidney failure, bone lesions, anemia, hypercalcemia, and neurologic symptoms.
Критерии для проведения различий между множественной миеломой и другими нарушениями пролиферации плазматических клеток были установлены Международной группой по изучению множественной миеломы (см. Kyle et al. (2009), Leukemia. 23:3-9). Должны удовлетворяться все три следующих критерия:Criteria for distinguishing between multiple myeloma and other plasma cell proliferative disorders have been established by the International Multiple Myeloma Study Group (see Kyle et al. (2009), Leukemia. 23:3-9). All three of the following criteria must be met:
- клональные плазматические клетки костного мозга ≥ 10%;- clonal plasma cells of bone marrow ≥ 10%;
- наличие моноклонального белка в сыворотке крови и/или моче (за исключением пациентов с истинной несекретирующей множественной миеломой);- the presence of a monoclonal protein in the blood serum and/or urine (except for patients with true non-secretory multiple myeloma);
- свидетельство поражения органов-мишеней, обусловленного лежащим в его основе нарушением пролиферации плазматических клеток, а именно:- evidence of damage to target organs caused by an underlying disorder of plasma cell proliferation, namely:
o гиперкальциемия: уровень кальция в сыворотке крови ≥ 11,5 мг/100 мл,o hypercalcemia: serum calcium level ≥ 11.5 mg/100 ml,
o почечная недостаточность: уровень креатинина в сыворотке крови > 1,73 ммоль/л,o renal failure: serum creatinine level > 1.73 mmol/l,
o анемия: нормохромная, нормоцитарная с величиной уровня гемоглобина, которая на > 2 г/100 мл ниже нижней границы нормы, или с величиной уровня гемоглобина < 10 г/100 мл,o anemia: normochromic, normocytic with a hemoglobin level that is > 2 g/100 ml below the lower limit of normal, or with a hemoglobin level < 10 g/100 ml,
o очаги поражения костей: очаги остеолитического поражения, тяжелая остеопения или патологические переломы.o bone lesions: osteolytic lesions, severe osteopenia or pathological fractures.
Другие нарушения пролиферации плазматических клеток, которые можно лечить с помощью композиций и способов, описанных в данном документе, включают без ограничения бессимптомную миелому ("тлеющую" множественную миелому или вялотекущую миелому), моноклональную гаммапатию неустановленной этиологии (MGUS), макроглобулинемию Вальденстрема, формы плазмоцитомы (например, плазмоклеточную дискразию, солитарную миелому, солитарную плазмоцитому, экстрамедуллярную плазмоцитому и множественную плазмоцитому), системный амилоидоз в форме амилоидоза легких цепей и POEMS-синдром (также известный как синдром Кроу-Фукаса, болезнь Такатсуки и PEP-синдром).Other plasma cell proliferative disorders that can be treated with the compositions and methods described herein include, but are not limited to, asymptomatic myeloma ("smoldering" multiple myeloma or smoldering myeloma), monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS), Waldenstrom's macroglobulinemia, forms of plasmacytoma (e.g., plasma cell dyscrasia, solitary myeloma, solitary plasmacytoma, extramedullary plasmacytoma, and multiple plasmacytoma), systemic amyloidosis in the form of light chain amyloidosis, and POEMS syndrome (also known as Crowe-Fukasa syndrome, Takatsuki disease, and PEP syndrome).
Для стадирования множественной миеломы используют две системы стадирования: Международную систему стадирования (ISS)(см. Greipp et al. (2005), J. Clin. Oncol. 23 (15):3412-3420) и систему стадирования по Дьюри-Сэлмону (DSS) (см. Durie et al. (1975), Cancer 36 (3): 842-854).There are two staging systems used to stage multiple myeloma: the International Staging System (ISS) (see Greipp et al. (2005), J. Clin. Oncol. 23 (15):3412–3420) and the Durie–Salmon staging system (DSS) (see Durie et al. (1975), Cancer 36 (3): 842-854).
Третья система стадирования множественной миеломы называется пересмотренной Международной системой стадирования (R-ISS) (см. Рalumbo A, Avet-Loiseau H, Oliva S, et al. Journal of clinical oncology: official journal of the American Society of Clinical Oncology 2015;33:2863-9, включенную в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте). Стадия I R-ISS включает стадию I ISS (уровень сывороточного β2-микроглобулина < 3,5 мг/л и уровень сывороточного альбумина ≥ 3,5 г/дл), отсутствие CA, соответствующих высокому риску [del(17p), и/или t(4;14), и/или t(14;16)], и уровень LDH в пределах нормы (меньше верхней границы нормального диапазона). Стадия III R-ISS включает стадию III ISS (уровень сывороточного β2-микроглобулина > 5,5 мг/л) и CA, соответствующие высокому риску, или высокий уровень LDH. Стадия II R-ISS включает все остальные возможные комбинации.The third staging system for multiple myeloma is called the Revised International Staging System (R-ISS) (see Рalumbo A, Avet-Loiseau H, Oliva S, et al. Journal of clinical oncology: official journal of the American Society of Clinical Oncology 2015;33:2863-9, incorporated herein by reference in its entirety). R-ISS stage I includes ISS stage I (serum β2-microglobulin < 3.5 mg/L and serum albumin ≥ 3.5 g/dL), no high-risk CA [del(17p) and/or t(4;14) and/or t(14;16)], and LDH within normal limits (less than the upper limit of the normal range). R-ISS stage III includes ISS stage III (serum β2-microglobulin > 5.5 mg/L) and high-risk CA or high LDH. Stage II R-ISS includes all other possible combinations.
Ответы у пациентов можно определить согласно критериям IMWG 2016, раскрытым в Kumar S, Paiva B, Anderson KC, et al. International Myeloma Working Group consensus criteria for response and minimal residual disease assessment in multiple myeloma. The Lancet Oncology;17(8):e328-e346, включенной в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.Patient responses can be defined according to the
Стандартное лечение множественной миеломы и ассоциированных заболеваний включает химиотерапию, трансплантацию стволовых клеток (аутологичную или аллогенную), лучевую терапию и другие виды лекарственной терапии. Лекарственные средства, часто применяемые для лечения миеломы, включают алкилирующие средства (например, бендамустин, циклофосфамид и мелфалан), ингибиторы протеасом (например, бортезомиб), кортикостероиды (например, дексаметазон и преднизон) и иммуномодуляторы (например, талидомид и леналидомид или Revlimid®) или любую их комбинацию. Лекарственные средства из группы бисфосфонатов также часто вводят в комбинации со стандартными средствами лечения MM для предупреждения потери костной ткани. Пациенты старше 65-70 лет являются маловероятными кандидатами на трансплантацию стволовых клеток. В некоторых случаях возможными вариантами лечения для пациентов младше 60 лет с субоптимальным ответом на первую трансплантацию являются двойные трансплантации аутологичных стволовых клеток. Композиции и способы по настоящему изобретению можно вводить в комбинации с любым из назначаемых в настоящее время средств лечения множественной миеломы.Standard treatment for multiple myeloma and related disorders includes chemotherapy, stem cell transplantation (autologous or allogeneic), radiation therapy, and other drug therapies. Drugs commonly used to treat myeloma include alkylating agents (eg, bendamustine, cyclophosphamide, and melphalan), proteasome inhibitors (eg, bortezomib), corticosteroids (eg, dexamethasone and prednisone), and immunomodulators (eg, thalidomide and lenalidomide or Revlimid®), or any combination of these. Bisphosphonate drugs are also often given in combination with standard MM treatments to prevent bone loss. Patients over 65 to 70 years of age are unlikely candidates for stem cell transplantation. In some cases, double autologous stem cell transplantations are possible treatment options for patients under 60 years of age with a suboptimal response to a first transplant. The compositions and methods of the present invention can be administered in combination with any of the currently prescribed treatments for multiple myeloma.
Другим примером заболевания или нарушения, ассоциированного с BCMA, является лимфома Ходжкина и неходжкинская лимфома (см. Chiu et al., Blood. 2007, 109(2):729-39; He et al., J Immunol. 2004, 172(5):3268-79).Another example of a disease or disorder associated with BCMA is Hodgkin lymphoma and non-Hodgkin lymphoma (see Chiu et al.,Blood. 2007, 109(2):729-39; He et al. J Immunol.2004, 172(5):3268-79).
Лимфома Ходжкина (HL), также известная как болезнь Ходжкина, представляет собой рак лимфатической системы, который происходит из белых кровяных телец или лимфоцитов. Аномальные клетки, которые образуют лимфому, называются клетками Рид-Штернберга. При лимфоме Ходжкина происходит распространение рака из одной группы лимфатических узлов в другую. Лимфому Ходжкина можно подразделить на четыре патологических подтипа на основании морфологических характеристик клеток Рид-Штернберга и клеточного состава вокруг клеток Рид-Штернберга (что определяют посредством биопсии лимфатических узлов): HL с нодулярным склерозом, смешанно-клеточный подтип, богатая лимфоцитами или с лимфоидным преобладанием, с лимфоидным истощением. Иногда лимфома Ходжкина также может представлять собой нодулярную лимфому Ходжкина с лимфоидным преобладанием или может быть неуточненной. Симптомы и признаки лимфомы Ходжкина включают безболезненное увеличение лимфатических узлов в области шеи, подмышечных впадин или паха, лихорадку, ночную потливость, потерю веса, утомляемость, кожный зуд или боль в животе.Hodgkin lymphoma (HL), also known as Hodgkin's disease, is a cancer of the lymphatic system that originates from white blood cells, or lymphocytes. The abnormal cells that form the lymphoma are called Reed-Sternberg cells. In Hodgkin lymphoma, cancer has spread from one group of lymph nodes to another. Hodgkin lymphoma can be divided into four pathological subtypes based on the morphologic characteristics of the Reed-Sternberg cells and the cellular composition around the Reed-Sternberg cells (determined by lymph node biopsy): HL with nodular sclerosis, mixed cell subtype, lymphocyte-rich or lymphocyte-predominant, and lymphocyte-depleted. Occasionally, Hodgkin lymphoma may also present as nodular lymphocyte-predominant Hodgkin lymphoma or may be unspecified. Symptoms and signs of Hodgkin lymphoma include painless swollen lymph nodes in the neck, armpits, or groin, fever, night sweats, weight loss, fatigue, itchy skin, or abdominal pain.
Неходжкинская лимфома (NHL) представляет собой группу разнообразных форм рака крови, которые включают любую разновидность лимфомы, отличную от лимфомы Ходжкина. Подтипы неходжкинской лимфомы классифицируют в основном по морфологическим характеристикам клеток, хромосомным аберрациям и поверхностным маркерам. Подтипы NHL (или NHL-ассоциированные формы рака) включают В-клеточные лимфомы, такие как, без ограничения, лимфома Беркитта, хронический лимфоцитарный В-клеточный лейкоз (B-CLL), пролимфоцитарный B-клеточный лейкоз (B-PLL), хронический лимфоцитарный лейкоз (CLL), диффузная крупноклеточная В-клеточная лимфома (DLBCL) (например, внутрисосудистая крупноклеточная B-клеточная лимфома и первичная медиастинальная B-клеточная лимфома), фолликулярная лимфома (например, лимфома из клеток центра фолликула, фолликулярная мелкоклеточная лимфома с расщепленными ядрами), волосатоклеточный лейкоз, B-клеточная лимфома высокой степени злокачественности (подобная лимфоме Беркитта), лимфоплазмоцитарная лимфома (макроглобулинемия Вальденстрема), мантийноклеточная лимфома, формы B-клеточной лимфомы из клеток маргинальной зоны (например, экстранодальная B-клеточная лимфома из клеток маргинальной зоны или лимфома из лимфоидной ткани слизистых оболочек (MALT), нодулярная В-клеточная лимфома из клеток маргинальной зоны и В-клеточная лимфома из клеток маргинальной зоны селезенки), плазмоцитома/миелома, B-лимфобластный лейкоз/лимфома из клеток-предшественников (PB-LBL/L), первичная лимфома центральной нервной системы (CNS), первичная внутриглазная лимфома, мелкоклеточная лимфоцитарная лимфома (SLL); и T-клеточные лимфомы, такие как, без ограничения, анапластическая крупноклеточная лимфома (ALCL), T-клеточная лимфома/лейкоз взрослых (например, "тлеющая", хроническая, острая и лимфоматозная), лимфангиома, ангиоиммунобластная Т-клеточная лимфома, формы T-клеточной лимфомы кожи (например, фунгоидный микоз, синдром Сезари и т. д.), внеузловая лимфома из естественных киллеров/T-клеток (назального типа), Т-клеточная лимфома кишечника энтеропатического типа, лейкоз из больших гранулярных лимфоцитов, T-лимфобластная лимфома/лейкоз из клеток-предшественников (T-LBL/L), T-клеточный хронический лимфоцитарный лейкоз/пролимфоцитарный лейкоз (T-CLL/PLL) и неуточненная периферическая T-клеточная лимфома. Симптомы и признаки лимфомы Ходжкина включают безболезненное увеличение лимфатических узлов в области шеи, подмышечных впадин или паха, лихорадку, ночную потливость, потерю веса, утомляемость, кожный зуд, боль в животе, кашель или боль в груди.Non-Hodgkin lymphoma (NHL) is a group of diverse blood cancers that includes any type of lymphoma other than Hodgkin lymphoma. Subtypes of NHL are classified primarily by cell morphologic characteristics, chromosomal aberrations, and surface markers. NHL subtypes (or NHL-associated cancers) include B-cell lymphomas such as, but not limited to, Burkitt lymphoma, chronic lymphocytic B-cell leukemia (B-CLL), prolymphocytic B-cell leukemia (B-PLL), chronic lymphocytic leukemia (CLL), diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) (e.g., intravascular large B-cell lymphoma and primary mediastinal B-cell lymphoma), follicular lymphoma (e.g., follicular center cell lymphoma, follicular small cleaved-nuclear lymphoma), hairy cell leukemia, high-grade B-cell lymphoma (Burkitt-like), lymphoplasmacytic lymphoma (Waldenstrom's macroglobulinemia), mantle cell lymphoma, forms of B-cell lymphoma marginal zone cell lymphoma (e.g. extranodal marginal zone cell B-cell lymphoma or mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma, nodular marginal zone cell B-cell lymphoma, and splenic marginal zone cell B-cell lymphoma), plasmacytoma/myeloma, progenitor B-lymphoblastic leukemia/lymphoma (PB-LBL/L), primary central nervous system (CNS) lymphoma, primary intraocular lymphoma, small lymphocytic lymphoma (SLL); and T-cell lymphomas such as, but not limited to, anaplastic large cell lymphoma (ALCL), adult T-cell lymphoma/leukemia (e.g., smoldering, chronic, acute, and lymphomatous), lymphangioma, angioimmunoblastic T-cell lymphoma, forms of cutaneous T-cell lymphoma (e.g., mycosis fungoides, Sezary syndrome, etc.), extranodal natural killer/T-cell lymphoma (nasal type), intestinal T-cell lymphoma of enteropathic type, large granular lymphocyte leukemia, T-lymphoblastic lymphoma/progenitor cell leukemia (T-LBL/L), T-cell chronic lymphocytic leukemia/prolymphocytic leukemia (T-CLL/PLL), and unspecified peripheral T-cell lymphoma. Symptoms and signs of Hodgkin lymphoma include painless swollen lymph nodes in the neck, armpits, or groin, fever, night sweats, weight loss, fatigue, itchy skin, abdominal pain, cough, or chest pain.
Стадирование лимфомы Ходжкина и неходжкинской лимфомы является одинаковым и относится к степени распространения раковых клеток в организме. На стадии I клетки лимфомы присутствуют в одной группе лимфатических узлов. На стадии II клетки лимфомы присутствуют в по меньшей мере двух группах лимфатических узлов, но обе группы расположены с одной стороны диафрагмы или в одной части ткани или органа, а лимфатические узлы рядом с этим органом с той же стороны диафрагмы. На стадии III клетки лимфомы присутствуют в лимфатических узлах с обеих сторон диафрагмы или в одной части ткани или органа рядом с этими группами лимфатических узлов или в селезенке. На стадии IV клетки лимфомы обнаруживаются в нескольких частях по меньшей мере одного органа или ткани, или клетки лимфомы присутствуют в органе и в лимфатических узлах с другой стороны диафрагмы. В дополнение к обозначению стадий римскими цифрами стадии также могут быть описаны буквами A, B, E и S, где A обозначает пациентов без симптомов, B обозначает пациентов с симптомами, E обозначает пациентов, у которых лимфома обнаружена в тканях вне лимфатической системы, а S обозначает пациентов, у которых лимфома обнаружена в селезенке.Staging of Hodgkin lymphoma and non-Hodgkin lymphoma is the same and refers to the extent to which the cancer cells have spread throughout the body. In stage I, lymphoma cells are present in one group of lymph nodes. In stage II, lymphoma cells are present in at least two groups of lymph nodes, but both groups are on the same side of the diaphragm or in the same piece of tissue or organ, and the lymph nodes next to that organ are on the same side of the diaphragm. In stage III, lymphoma cells are present in lymph nodes on both sides of the diaphragm or in the same piece of tissue or organ next to those lymph node groups or in the spleen. In stage IV, lymphoma cells are found in multiple parts of at least one organ or tissue, or lymphoma cells are present in an organ and in lymph nodes on the other side of the diaphragm. In addition to staging with Roman numerals, stages can also be described using the letters A, B, E, and S, where A denotes patients without symptoms, B denotes patients with symptoms, E denotes patients in whom lymphoma is found in tissues outside the lymphatic system, and S denotes patients in whom lymphoma is found in the spleen.
Лимфому Ходжкина обычно лечат с помощью лучевой терапии, химиотерапии или трансплантации гемопоэтических стволовых клеток. Наиболее распространенным средством терапии неходжкинской лимфомы является режим R-CHOP, который состоит из четырех различных химиотерапевтических препаратов (циклофосфамид, доксорубицин, винкристин и преднизолон) и ритуксимаба (Rituxan®). Другие средства терапии, обычно применяемые для лечения NHL, включают другие химиотерапевтические средства, лучевую терапию, трансплантацию стволовых клеток (аутологичную или аллогенную трансплантацию костного мозга) или биологическую терапию, такую как иммунотерапия. Другие примеры биологических терапевтических средств включают без ограничения ритуксимаб (Rituxan®), тозитумомаб (Bexxar®), эпратузумаб (LymphoCide®) и алемтузумаб (MabCampath®). Композиции и способы по настоящему изобретению можно вводить в комбинации с любым из назначаемых в настоящее время средств лечения лимфомы Ходжкина или неходжкинской лимфомы.Hodgkin lymphoma is typically treated with radiation therapy, chemotherapy, or hematopoietic stem cell transplant. The most common therapy for non-Hodgkin lymphoma is the R-CHOP regimen, which consists of four different chemotherapy drugs (cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine, and prednisone) and rituximab (Rituxan®). Other therapies commonly used to treat NHL include other chemotherapy drugs, radiation therapy, stem cell transplant (autologous or allogeneic bone marrow transplant), or biologic therapies such as immunotherapy. Other examples of biologic therapies include, but are not limited to, rituximab (Rituxan®), tositumomab (Bexxar®), epratuzumab (LymphoCide®), and alemtuzumab (MabCampath®). The compositions and methods of the present invention can be administered in combination with any of the currently prescribed treatments for Hodgkin's lymphoma or non-Hodgkin's lymphoma.
Также было установлено, что с экспрессией BCMA ассоциирована макроглобулинемия Вальденстрема (WM), также известная как лимфоплазмоцитарная лимфома (LPL) (см. Elsawa et al., Blood. 2006, 107(7):2882-8). Ранее считалось, что макроглобулинемия Вальденстрема является родственной по отношению к множественной миеломе, но совсем недавно ее классифицировали как подтип неходжкинской лимфомы. WM характеризуется неконтролируемой пролиферацией В-клеточных лимфоцитов, что приводит к анемии и продуцированию избыточных количеств парапротеина или иммуноглобулина М (IgM), который сгущает кровь и приводит к синдрому повышенной вязкости крови. Другие симптомы или признаки WM включают лихорадку, ночную потливость, утомляемость, анемию, потерю веса, лимфаденопатию или спленомегалию, нечеткость зрения, головокружение, носовые кровотечения, кровоточивость десен, нетипичные кровоподтеки, нарушение функции почек или почечную недостаточность, амилоидоз или периферическую нейропатию.Waldenstrom's macroglobulinemia (WM), also known as lymphoplasmacytic lymphoma (LPL), has also been found to be associated with BCMA expression (see Elsawa et al., Blood . 2006, 107(7):2882-8). Waldenstrom's macroglobulinemia was previously thought to be related to multiple myeloma, but has more recently been classified as a subtype of non-Hodgkin's lymphoma. WM is characterized by uncontrolled proliferation of B-cell lymphocytes, resulting in anemia and production of excess amounts of the paraprotein or immunoglobulin M (IgM), which thickens the blood and leads to hyperviscosity syndrome. Other symptoms or signs of WM include fever, night sweats, fatigue, anemia, weight loss, lymphadenopathy or splenomegaly, blurred vision, dizziness, nosebleeds, bleeding gums, unusual bruising, renal impairment or failure, amyloidosis, or peripheral neuropathy.
Стандартное лечение WM заключается в химиотерапии, в частности ритуксимабом (Rituxan®). Другие химиотерапевтические лекарственные средства, такие как хлорамбуцил (Leukeran®), циклофосфамид (Neosar®), флударабин (Fludara®), кладрибин (Leustatin®), винкристин и/или талидомид, можно применять в комбинации. Кортикостероиды, такие как преднизон, также можно вводить в комбинации с химиотерапией. Плазмаферез или замещение плазмы обычно применяют в ходе всего лечения пациента для облегчения некоторых симптомов посредством удаления парапротеина из крови. В некоторых случаях трансплантация стволовых клеток является вариантом лечения для некоторых пациентов.The standard treatment for WM is chemotherapy, particularly rituximab (Rituxan®). Other chemotherapy drugs such as chlorambucil (Leukeran®), cyclophosphamide (Neosar®), fludarabine (Fludara®), cladribine (Leustatin®), vincristine, and/or thalidomide may be used in combination. Corticosteroids such as prednisone may also be given in combination with chemotherapy. Plasmapheresis or plasma exchange is usually used throughout the patient's treatment to relieve some of the symptoms by removing the paraprotein from the blood. In some cases, stem cell transplantation is an option for some patients.
Другим примером заболевания или нарушения, ассоциированного с BCMA, является рак головного мозга. В частности, было установлено, что с экспрессией ВСМА ассоциирована астроцитома или глиобластома (см. Deshayes et al, Oncogene. 2004, 23(17):3005-12, Pelekanou et al., PLoS One. 2013, 8(12):e83250). Астроцитомы представляют собой опухоли, которые возникают из астроцитов, представляющих собой тип глиальных клеток в головном мозге. Глиобластома (также известная как мультиформная глиобластома или GBM) является наиболее злокачественной формой астроцитомы и считается наиболее поздней стадией рака головного мозга (стадией IV). Существуют два варианта глиобластомы: гигантоклеточная глиобластома и глиосаркома. Другие формы астроцитомы включают ювенильную пилоцитарную астроцитому (JPA), фибриллярную астроцитому, плеоморфную ксантоастроцитому (PXA), дисэмбриопластическую нейроэпителиальную опухоль (DNET) и анапластическую астроцитому (AA).Another example of a disease or disorder associated with BCMA is brain cancer. In particular, astrocytoma or glioblastoma has been found to be associated with BCMA expression (see Deshayes et al,Oncogene. 2004, 23(17):3005-12, Pelekanou et al. PLoS One. 2013, 8(12):e83250). Astrocytomas are tumors that arise from astrocytes, which are a type of glial cell in the brain. Glioblastoma (also known as glioblastoma multiforme or GBM) is the most malignant form of astrocytoma and is considered the most advanced stage of brain cancer (stage IV). There are two variants of glioblastoma: giant cell glioblastoma and gliosarcoma. Other forms of astrocytoma include juvenile pilocytic astrocytoma (JPA), fibrillary astrocytoma, pleomorphic xanthoastrocytoma (PXA), dysembryoplastic neuroepithelial tumor (DNET), and anaplastic astrocytoma (AA).
Симптомы или признаки, ассоциированные с глиобластомой или астроцитомой, включают повышенное давление в головном мозге, головные боли, эпилептические припадки, потерю памяти, изменения в поведении, нарушение движения или потерю чувствительности на одной стороне тела, речевую дисфункцию, когнитивные нарушения, нарушения зрения, тошноту, рвоту и слабость в руках или ногах.Symptoms or signs associated with glioblastoma or astrocytoma include increased pressure in the brain, headaches, seizures, memory loss, behavioral changes, movement or sensory loss on one side of the body, speech dysfunction, cognitive impairment, vision problems, nausea, vomiting, and weakness in the arms or legs.
Хирургическое удаление опухоли (или резекция) является стандартным лечением для удаления как можно большей части глиомы без повреждения или с минимальным повреждением окружающей нормальной ткани головного мозга. Лучевая терапия и/или химиотерапия часто применяются после хирургического вмешательства для подавления и замедления рецидивирующего заболевания, обусловленного любыми оставшимися раковыми клетками или сопутствующими очагами поражения. Лучевая терапия включает лучевую терапию всего головного мозга (традиционную дистанционную лучевую терапию), целенаправленную трехмерную конформную лучевую терапию и применение целенаправленно воздействующих радионуклидов. Химиотерапевтические средства, обычно применяемые для лечения глиобластомы, включают темозоломид, гефитиниб или эрлотиниб и цисплатин. Ингибиторы ангиогенеза, такие как бевацизумаб (Avastin®), также обычно применяются в комбинации с химиотерапией и/или лучевой терапией.Surgical removal of the tumor (or resection) is the standard treatment to remove as much of the glioma as possible with minimal or no damage to surrounding normal brain tissue. Radiation therapy and/or chemotherapy are often used after surgery to suppress and slow recurrent disease from any remaining cancer cells or associated lesions. Radiation therapy includes whole-brain radiation therapy (traditional external beam radiation therapy), targeted 3-D conformal radiation therapy, and targeted radionuclides. Chemotherapeutic agents commonly used to treat glioblastoma include temozolomide, gefitinib or erlotinib, and cisplatin. Angiogenesis inhibitors such as bevacizumab (Avastin®) are also commonly used in combination with chemotherapy and/or radiation.
Поддерживающее лечение также часто применяют для облегчения неврологических симптомов и улучшения неврологической функции и используют в комбинации с любым из средств терапии рака, описанных в данном документе. Основные поддерживающие средства включают противосудорожные средства и кортикостероиды. Таким образом, композиции и способы по настоящему изобретению можно применять в комбинации с любыми видами стандартного или поддерживающего лечения с целью лечения глиобластомы или астроцитомы.Maintenance therapy is also often used to alleviate neurological symptoms and improve neurological function and is used in combination with any of the cancer therapies described herein. Key maintenance agents include anticonvulsants and corticosteroids. Thus, the compositions and methods of the present invention can be used in combination with any type of standard or maintenance therapy for the treatment of glioblastoma or astrocytoma.
Заболевания и нарушения, не связанные с раком, но ассоциированные с экспрессией ВСМА, также можно лечить с помощью композиций и способов, раскрытых в данном документе. Примеры заболеваний и нарушений, не связанных с раком, ассоциированных с экспрессией BCMA, включают без ограничения вирусные инфекции, например, вызванные HIV; грибковые инфекции, например, вызванные C. neoformans; синдром раздраженного кишечника; неспецифический язвенный колит и нарушения, связанные с иммунитетом слизистых оболочек.Diseases and disorders not related to cancer but associated with BCMA expression can also be treated using the compositions and methods disclosed herein. Examples of diseases and disorders not related to cancer associated with BCMA expression include, but are not limited to, viral infections, such as those caused by HIV; fungal infections, such as those caused by C. neoformans ; irritable bowel syndrome; ulcerative colitis; and disorders related to mucosal immunity.
CAR-модифицированные иммунные эффекторные клетки (например, T-клетки или NK-клетки) по настоящему изобретению можно вводить отдельно либо в фармацевтической композиции в комбинации с разбавителями и/или другими компонентами, такими как IL-2 или другие цитокины, или популяциями клеток.The CAR-modified immune effector cells (e.g., T cells or NK cells) of the present invention can be administered alone or in a pharmaceutical composition in combination with diluents and/or other components, such as IL-2 or other cytokines, or cell populations.
В настоящем изобретении предусмотрены композиции и способы для лечения рака. В одном аспекте рак представляет собой гематологический рак, в том числе без ограничения гематологический рак, представляющий собой лейкоз или лимфому. В одном аспекте клетки, экспрессирующие CAR (например, CAR-T-клетки или NK-клетки, экспрессирующие CAR), по настоящему изобретению можно применять для лечения форм рака и злокачественных новообразований, таких как, без ограничения, например, формы острого лейкоза, в том числе без ограничения, например, B-клеточный острый лимфоидный лейкоз ("BALL"), T-клеточный острый лимфоидный лейкоз ("TALL"), острый лимфоидный лейкоз (ALL); одна или несколько форм хронического лейкоза, в том числе без ограничения, например, хронический миелогенный лейкоз (CML), хронический лимфоцитарный лейкоз (CLL); дополнительные формы гематологического рака или гематологические состояния, в том числе без ограничения, например, B-клеточный пролимфоцитарный лейкоз, новообразование из бластных плазмоцитоидных дендритных клеток, лимфома Беркитта, диффузная крупноклеточная В-клеточная лимфома, фолликулярная лимфома, волосатоклеточный лейкоз, мелкоклеточная или крупноклеточная фолликулярная лимфома, злокачественные лимфопролиферативные состояния, MALT-лимфома, мантийноклеточная лимфома, лимфома из клеток маргинальной зоны, множественная миелома, миелодисплазия и миелодиспластический синдром, неходжкинская лимфома, плазмобластная лимфома, новообразование из плазмоцитоидных дендритных клеток, макроглобулинемия Вальденстрема и "предлейкоз", который представляет собой разнообразную группу гематологических состояний, объединенных неэффективным образованием (или дисплазией) миелоидных клеток крови, и т. п. Кроме того, заболевание, ассоциированное с экспрессией ВСМА, включает без ограничения, например, атипичные и/или неклассические формы рака, злокачественные новообразования, предраковые состояния или пролиферативные заболевания, характеризующиеся экспрессией ВСМА.The present invention provides compositions and methods for treating cancer. In one aspect, the cancer is a hematological cancer, including but not limited to a hematological cancer that is leukemia or lymphoma. In one aspect, CAR expressing cells (e.g., CAR T cells or CAR expressing NK cells) of the present invention can be used to treat forms of cancer and malignancy, such as, but not limited to, for example, forms of acute leukemia, including but not limited to, for example, B-cell acute lymphoid leukemia ("BALL"), T-cell acute lymphoid leukemia ("TALL"), acute lymphoid leukemia (ALL); one or more forms of chronic leukemia, including but not limited to, for example, chronic myelogenous leukemia (CML), chronic lymphocytic leukemia (CLL); additional hematological cancers or conditions, including but not limited to, e.g., B-cell prolymphocytic leukemia, blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Burkitt lymphoma, diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, hairy cell leukemia, small cell or large cell follicular lymphoma, malignant lymphoproliferative disorders, MALT lymphoma, mantle cell lymphoma, marginal zone cell lymphoma, multiple myeloma, myelodysplasia and myelodysplastic syndrome, non-Hodgkin lymphoma, plasmablastic lymphoma, plasmacytoid dendritic cell neoplasm, Waldenstrom's macroglobulinemia, and "preleukemia," which is a diverse group of hematological conditions united by ineffective formation (or dysplasia) of myeloid blood cells, etc. In addition, a disease associated with the expression of BCMA includes, without limitation, for example, atypical and/or non-classical forms of cancer, malignant neoplasms, precancerous conditions or proliferative diseases characterized by the expression of BCMA.
В ряде вариантов осуществления композицию, описанную в данном документе, можно применять для лечения заболевания, включающего без ограничения нарушение пролиферации плазматических клеток, например, бессимптомную миелому ("тлеющую" множественную миелому или вялотекущую миелому), моноклональную гаммапатию неустановленной этиологии (MGUS), макроглобулинемию Вальденстрема, формы плазмоцитомы (например, дискразию плазматических клеток, солитарную миелому, солитарную плазмоцитому, экстрамедуллярную плазмоцитому и множественную плазмоцитому), системный амилоидоз в форме амилоидоза легких цепей и POEMS-синдром (также известный как синдром Кроу-Фукаса, болезнь Такатсуки и PEP-синдром).In some embodiments, the composition described herein can be used to treat a disease including, but not limited to, a plasma cell proliferative disorder, such as asymptomatic myeloma ("smoldering" multiple myeloma or smoldering myeloma), monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS), Waldenstrom's macroglobulinemia, forms of plasmacytoma (e.g., plasma cell dyscrasia, solitary myeloma, solitary plasmacytoma, extramedullary plasmacytoma, and multiple plasmacytoma), systemic amyloidosis in the form of light chain amyloidosis, and POEMS syndrome (also known as Crowe-Fukasa syndrome, Takatsuki disease, and PEP syndrome).
В ряде вариантов осуществления композицию, описанную в данном документе, можно применять для лечения заболевания, включающего без ограничения рак, например, рак, описанный в данном документе, например, рак предстательной железы (например, кастрационнорезистентный или резистентный к терапии рак предстательной железы или метастатический рак предстательной железы), рак поджелудочной железы или рак легкого.In some embodiments, a composition described herein can be used to treat a disease including, but not limited to, cancer, such as a cancer described herein, such as prostate cancer (e.g., castration-resistant or therapy-resistant prostate cancer or metastatic prostate cancer), pancreatic cancer, or lung cancer.
В настоящем изобретении также предусмотрены способы ингибирования пролиферации или уменьшения популяции клеток, экспрессирующих BCMA, при этом способы включают приведение популяции клеток, содержащей клетку, экспрессирующую BCMA, в контакт с клеткой, экспрессирующей CAR для BCMA (например, ВСМА-CAR-Т-клеткой или NK-клеткой, экспрессирующей CAR для BCMA), по настоящему изобретению, которая связывается с клеткой, экспрессирующей BCMA. В конкретном аспекте в настоящем изобретении предусмотрены способы ингибирования пролиферации или уменьшения популяции раковых клеток, экспрессирующих BCMA, при этом способы включают приведение популяции раковых клеток, экспрессирующих BCMA, в контакт с клеткой, экспрессирующей CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-T-клеткой или NK-клеткой, экспрессирующей CAR для BCMA), по настоящему изобретению, которая связывается с клеткой, экспрессирующей BCMA. В одном аспекте в настоящем изобретении представлены способы ингибирования пролиферации или уменьшения популяции раковых клеток, экспрессирующих BCMA, при этом способы включают приведение популяции раковых клеток, экспрессирующих BCMA, в контакт с клеткой, экспрессирующей CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-T-клеткой или NK-клеткой, экспрессирующей CAR для BCMA), по настоящему изобретению, которая связывается с клеткой, экспрессирующей BCMA. В некоторых аспектах клетка, экспрессирующая CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-T-клетка или NK-клетка, экспрессирующая CAR для BCMA), по настоящему изобретению обеспечивает снижение уровня, числа, количества или процентной доли клеток и/или раковых клеток на по меньшей мере 25%, по меньшей мере 30%, по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 65%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 95% или по меньшей мере 99% у субъекта с миелоидным лейкозом или другой формой рака, ассоциированного с клетками, экспрессирующими BCMA, или в соответствующей животной модели по сравнению с отрицательным контролем. В одном аспекте субъект является человеком.The present invention also provides methods for inhibiting the proliferation or reducing a population of cells expressing BCMA, the methods comprising contacting a population of cells comprising a cell expressing BCMA with a cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a BCMA CAR T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA) of the present invention that binds to the cell expressing BCMA. In a particular aspect, the present invention provides methods for inhibiting the proliferation or reducing a population of cancer cells expressing BCMA, the methods comprising contacting a population of cancer cells expressing BCMA with a cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a BCMA CAR T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA) of the present invention that binds to the cell expressing BCMA. In one aspect, the present invention provides methods for inhibiting the proliferation or reducing the population of cancer cells expressing BCMA, the methods comprising contacting the population of cancer cells expressing BCMA with a cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a BCMA CAR T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA) of the present invention that binds to the cell expressing BCMA. In some aspects, a cell expressing a CAR for BCMA (e.g., a BCMA CAR T cell or an NK cell expressing a CAR for BCMA) of the present invention provides a reduction in the level, number, quantity, or percentage of cells and/or cancer cells by at least 25%, at least 30%, at least 40%, at least 50%, at least 65%, at least 75%, at least 85%, at least 95%, or at least 99% in a subject with myeloid leukemia or other cancer associated with cells expressing BCMA, or in a corresponding animal model, compared to a negative control. In one aspect, the subject is a human.
В настоящем изобретении также предусмотрены способы предупреждения, лечения и/или контроля заболевания, ассоциированного с клетками, экспрессирующими BCMA (например, гематологического рака или атипичного рака, характеризующегося экспрессией BCMA), при этом способы включают введение субъекту, нуждающемуся в этом, клетки, экспрессирующей CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-T-клетки или NK-клетки, экспрессирующей CAR для BCMA), по настоящему изобретению, которая связывается с клеткой, экспрессирующей BCMA. В одном аспекте субъект является человеком. Неограничивающие примеры нарушений, ассоциированных с клетками, экспрессирующими ВСМА, включают вирусные или грибковые инфекции и нарушения, связанные с иммунитетом слизистых оболочек.The present invention also provides methods for preventing, treating and/or managing a disease associated with BCMA-expressing cells (e.g., a hematological cancer or an atypical cancer characterized by BCMA expression), wherein the methods comprise administering to a subject in need thereof a BCMA-expressing CAR-expressing cell (e.g., a BCMA-CAR-T cell or an NK cell expressing a CAR-expressing BCMA) of the present invention that binds to a BCMA-expressing cell. In one aspect, the subject is a human. Non-limiting examples of disorders associated with BCMA-expressing cells include viral or fungal infections and disorders associated with mucosal immunity.
В настоящем изобретении также предусмотрены способы предупреждения, лечения и/или контроля заболевания, ассоциированного с клетками, экспрессирующими BCMA, при этом способы включают введение субъекту, нуждающемуся в этом, клетки, экспрессирующей CAR для BCMA, (например, BCMA-CAR-T-клетки или NK-клетки, экспрессирующей CAR для BCMA), по настоящему изобретению, которая связывается с клеткой, экспрессирующей BCMA. В одном аспекте субъект является человеком.The present invention also provides methods for preventing, treating and/or managing a disease associated with BCMA-expressing cells, the methods comprising administering to a subject in need thereof a BCMA-expressing CAR cell (e.g., a BCMA-CAR-T cell or a BCMA-expressing CAR NK cell) of the present invention that binds to a BCMA-expressing cell. In one aspect, the subject is a human.
В настоящем изобретении предусмотрены способы предупреждения рецидива рака, ассоциированного с клетками, экспрессирующими BCMA, при этом способы включают введение субъекту, нуждающемуся в этом, клетки, экспрессирующей CAR для BCMA, (например, BCMA-CAR-T-клетки или NK-клетки, экспрессирующей CAR для BCMA), по настоящему изобретению, которая связывается с клеткой, экспрессирующей BCMA. В одном аспекте способы включают введение субъекту, нуждающемуся в этом, эффективного количества клетки, экспрессирующей CAR для BCMA (например, BCMA-CAR-T-клетки или NK-клетки, экспрессирующей CAR для BCMA), описанной в данном документе, которая связывается с клеткой, экспрессирующей BCMA, в комбинации с эффективным количеством другого средства терапии.The present invention provides methods for preventing the recurrence of a cancer associated with BCMA-expressing cells, the methods comprising administering to a subject in need thereof a BCMA-expressing CAR cell (e.g., a BCMA-CAR-T cell or an NK cell expressing a BCMA-carrier) of the present invention that binds to a BCMA-expressing cell. In one aspect, the methods comprise administering to a subject in need thereof an effective amount of a BCMA-expressing CAR cell (e.g., a BCMA-CAR-T cell or an NK cell expressing a BCMA-carrier) described herein that binds to a BCMA-expressing cell, in combination with an effective amount of another therapy.
Виды комбинированной терапииTypes of combination therapy
Описанную в данном документе клетку, экспрессирующую CAR, можно применять в комбинации с другими известными средствами и видами терапии. Описанную в данном документе клетку, экспрессирующую CAR, и по меньшей мере одно дополнительное терапевтическое средство можно вводить одновременно в одной и той же или отдельных композициях или последовательно. В случае последовательного введения описанную в данном документе клетку, экспрессирующую CAR, можно вводить первой, а дополнительное средство можно вводить вторым, или порядок введения может быть обратным. Средство CAR-терапии и/или другие терапевтические средства, процедуры или способы можно применять в периоды активного проявления нарушения или в период ремиссии или менее активного проявления заболевания. Средство CAR-терапии можно вводить перед другим средством лечения, параллельно со средством лечения, после средства лечения или во время ремиссии нарушения. При введении в комбинации средство CAR-терапии и дополнительное средство (например, второе или третье средство) или все из них можно вводить в количестве или дозе, которые являются более высокими, более низкими или такими же по сравнению с количеством или дозой каждого средства, применяемого отдельно, например, в качестве монотерапии. В некоторых вариантах осуществления вводимые количество или доза средства CAR-терапии, дополнительного средства (например, второго или третьего средства) или всех из них являются более низкими (например, на по меньшей мере 20%, по меньшей мере 30%, по меньшей мере 40% или по меньшей мере 50%), чем количество или доза каждого средства, применяемого отдельно, например, в качестве монотерапии. В других вариантах осуществления количество или доза средства CAR-терапии, дополнительного средства (например, второго или третьего средства) или всех из них, которые приводят к требуемому эффекту (например, лечению рака), являются более низкими (например, на по меньшей мере 20%, по меньшей мере 30%, по меньшей мере 40% или по меньшей мере 50% ниже), чем количество или доза каждого средства, применяемого отдельно, например, в качестве монотерапии, необходимые для достижения того же терапевтического эффекта. В следующих аспектах описанная в данном документе клетка, экспрессирующая CAR, может применяться в режиме лечения в комбинации с хирургическим вмешательством, химиотерапией, лучевой терапией, иммуносупрессивными средствами. Иллюстративные средства и виды терапии, которые можно применять в комбинации с клеткой, экспрессирующей CAR, описанной в данном документе, раскрыты на страницах 266-313 в WO2016164731, которая включена в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.The CAR-expressing cell described herein can be used in combination with other known agents and therapies. The CAR-expressing cell described herein and at least one additional therapeutic agent can be administered simultaneously in the same or separate compositions or sequentially. If administered sequentially, the CAR-expressing cell described herein can be administered first and the additional agent can be administered second, or the order of administration can be reversed. The CAR therapy and/or other therapeutic agents, procedures, or methods can be administered during periods of active disease expression or during periods of remission or less active disease expression. The CAR therapy can be administered before another therapy, concurrently with the therapy, after the therapy, or during remission of the disorder. When administered in combination, the CAR therapy and the additional agent (e.g., a second or third agent), or all of them, can be administered in an amount or dose that is higher, lower, or the same as the amount or dose of each agent administered alone, such as as a monotherapy. In some embodiments, the amount or dose of the CAR therapy, the additional agent (e.g., the second or third agent), or all of them administered is lower (e.g., at least 20%, at least 30%, at least 40%, or at least 50%) than the amount or dose of each agent administered alone, e.g., as a monotherapy. In other embodiments, the amount or dose of the CAR therapy, the additional agent (e.g., the second or third agent), or all of them that results in the desired effect (e.g., treating cancer) is lower (e.g., at least 20%, at least 30%, at least 40%, or at least 50% lower) than the amount or dose of each agent administered alone, e.g., as a monotherapy, required to achieve the same therapeutic effect. In further aspects, the CAR expressing cell described herein may be used in a treatment regimen in combination with surgery, chemotherapy, radiation therapy, immunosuppressive agents. Exemplary agents and therapies that may be used in combination with the CAR expressing cell described herein are disclosed on pages 266-313 of WO2016164731, which is incorporated herein by reference in its entirety.
Биомаркеры для оценивания эффективности CARBiomarkers for assessing CAR efficacy
В некоторых вариантах осуществления в данном документе раскрыт способ оценивания или мониторинга эффективности средства терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR (например, средства терапии на основе CAR для CD19 или BCMA), у субъекта (например, субъекта, у которого имеется рак, например, гематологический рак). Способ включает сбор данных о величине эффективности средства CAR-терапии, где указанная величина является показателем эффективности или пригодности средства терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR.In some embodiments, disclosed herein is a method for assessing or monitoring the efficacy of a CAR-expressing cell-based therapy (e.g., a CAR-based therapy for CD19 or BCMA) in a subject (e.g., a subject having a cancer, such as a hematological cancer). The method includes collecting data on the efficacy value of the CAR-therapy, wherein the efficacy value is indicative of the efficacy or suitability of the CAR-expressing cell-based therapy.
В ряде вариантов осуществления величина эффективности средства CAR-терапии у субъекта, у которого имеется CLL или SLL, включает показатель одного, двух, трех или всех из следующих параметров:In some embodiments, the efficacy value of a CAR therapy in a subject having CLL or SLL comprises an indicator of one, two, three, or all of the following parameters:
(i) мутации в гене, кодирующем BTK, в образце (например, образце, полученном путем афереза, или образце изготовленного продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR);(i) mutations in the gene encoding BTK in a sample (e.g., a sample obtained by apheresis or a sample of a manufactured product based on cells expressing CAR);
(ii) мутации в гене, кодирующем PLCg2, в образце (например, образце, полученном путем афереза, или образце изготовленного продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR);(ii) mutations in the gene encoding PLCg2 in a sample (e.g., a sample obtained by apheresis or a sample of a manufactured CAR-expressing cell product);
(iii) минимального остаточного заболевания, например, оцененного по уровню и/или активности CD8, CD4, CD3, CD5, CD19, CD20, CD22, CD43, CD79b, CD27, CD45RO, CD45RA, CCR7, CD95, LAG3, PD-1, TIM-3 и/или CD81; или оцененного с помощью глубокого секвенирования иммуноглобулинов; в образце (например, образце, полученном путем афереза, или образце опухоли от субъекта); или(iii) minimal residual disease, such as assessed by the level and/or activity of CD8, CD4, CD3, CD5, CD19, CD20, CD22, CD43, CD79b, CD27, CD45RO, CD45RA, CCR7, CD95, LAG3, PD-1, TIM-3, and/or CD81; or assessed by immunoglobulin deep sequencing; in a sample (e.g., an apheresis sample or a tumor sample from the subject); or
(iv) уровня или активности одного, двух, трех, четырех, пяти, шести, семи, восьми, девяти, десяти или всех из цитокинов, выбранных из IFN-g, IL-2, IL-4, IL-6, IL-8, IL-10, IL-15, TNF-a, IP-10, MCP1, MIP1a, в образце, например, образце, полученном путем афереза, от субъекта.(iv) the level or activity of one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten or all of the cytokines selected from IFN-g, IL-2, IL-4, IL-6, IL-8, IL-10, IL-15, TNF-a, IP-10, MCP1, MIP1a, in a sample, such as a sample obtained by apheresis, from a subject.
В ряде вариантов осуществления величина эффективности средства CAR-терапии у субъекта, у которого имеется DLBCL, например, рецидивирующая и/или рефрактерная DLBCL, включает показатель одного или обоих из следующих параметров:In some embodiments, the efficacy measure of a CAR therapy in a subject having DLBCL, such as relapsed and/or refractory DLBCL, comprises an indicator of one or both of the following parameters:
(i) минимального остаточного заболевания, например, оцененного по уровню и/или активности CD8, CD4, CAR19, CD3, CD27, CD45RO, CD45RA, CCR7, CD95, LAG3, PD-1 и/или TIM-3; или оцененного с помощью глубокого секвенирования иммуноглобулинов; в образце (например, образце, полученном путем афереза, или образце опухоли от субъекта); или(i) minimal residual disease, such as assessed by the level and/or activity of CD8, CD4, CAR19, CD3, CD27, CD45RO, CD45RA, CCR7, CD95, LAG3, PD-1 and/or TIM-3; or assessed by immunoglobulin deep sequencing; in a sample (e.g., an apheresis sample or a tumor sample from the subject); or
(ii) уровня или активности одного, двух, трех, четырех, пяти, шести, семи, восьми, девяти, десяти или всех из цитокинов, выбранных из IFN-g, IL-2, IL-4, IL-6, IL-8, IL-10, IL-15, TNF-a, IP-10, MCP1, MIP1a, в образце (например, образце, полученном путем афереза, от субъекта).(ii) the level or activity of one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten or all of the cytokines selected from IFN-g, IL-2, IL-4, IL-6, IL-8, IL-10, IL-15, TNF-a, IP-10, MCP1, MIP1a, in a sample (e.g., an apheresis sample from a subject).
В других вариантах осуществления величина эффективности средства CAR-терапии дополнительно включает показатель одного, двух, трех, четырех, пяти, шести или более (всех) из следующих параметров:In other embodiments, the efficacy value of the CAR therapy agent further comprises an indicator of one, two, three, four, five, six or more (all) of the following parameters:
(i) уровня или активности одного, двух, трех или более (например, всех) из покоящихся TEFF-клеток, покоящихся TREG-клеток, более молодых T-клеток (например, необученных Т-клеток (например, необученных CD4 или CD8 T-клеток, необученных гамма/дельта-T-клеток)), или стволовых T-клеток памяти (например, стволовых CD4 или CD8 T-клеток памяти или стволовых гамма/дельта-T-клеток памяти), или ранних T-клеток памяти или их комбинации в образце (например, образце, полученном путем афереза, или образце изготовленного продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR); (i) the level or activity of one, two, three or more (e.g., all) of the resting T EFF cells, resting T REG cells, younger T cells (e.g., naive T cells (e.g., naive CD4 or CD8 T cells, naive gamma/delta T cells)), or stem memory T cells (e.g., stem memory CD4 or CD8 T cells or stem memory gamma/delta T cells), or early memory T cells, or a combination thereof in a sample (e.g., a sample obtained by apheresis or a sample of a manufactured CAR-expressing cell product);
(ii) уровня или активности одного, двух, трех или более (например, всех) из активированных TEFF-клеток, активированных TREG-клеток, более старых T-клеток (например, более старых CD4 или CD8 клеток) или поздних T-клеток памяти или их комбинации в образце (например, образце, полученном путем афереза, или образце изготовленного продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR); (ii) the level or activity of one, two, three or more (e.g., all) of the activated T EFF cells, activated T REG cells, aged T cells (e.g., aged CD4 or CD8 cells), or late memory T cells, or a combination thereof, in a sample (e.g., a sample obtained by apheresis or a sample of a manufactured CAR-expressing cell product);
(iii) уровня или активности маркера истощения иммунных клеток, например, одного, двух или более ингибиторов контрольных точек иммунного ответа (например, PD-1, PD-L1, TIM-3, TIGIT и/или LAG-3), в образце (например, образце, полученном путем афереза, или образце изготовленного продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR). В некоторых вариантах осуществления иммунная клетка имеет фенотип истощения, например, совместно экспрессирует по меньшей мере два маркера истощения, например, совместно экспрессирует PD-1 и TIM-3. В других вариантах осуществления иммунная клетка имеет фенотип истощения, например, совместно экспрессирует по меньшей мере два маркера истощения, например, совместно экспрессирует PD-1 и LAG-3;(iii) a level or activity of an immune cell exhaustion marker, such as one, two or more immune checkpoint inhibitors (e.g., PD-1, PD-L1, TIM-3, TIGIT, and/or LAG-3), in a sample (e.g., an apheresis sample or a manufactured CAR-expressing cell product sample). In some embodiments, the immune cell has an exhaustion phenotype, such as co-expressing at least two exhaustion markers, such as co-expressing PD-1 and TIM-3. In other embodiments, the immune cell has an exhaustion phenotype, such as co-expressing at least two exhaustion markers, such as co-expressing PD-1 and LAG-3;
(iv) уровня или активности CD27 и/или CD45RO- (например, CD27+ CD45RO-) иммунных эффектoрных клеток, например, в популяции CD4+ или CD8+ Т-клеток, в образце (например, образце, полученном путем афереза, или образце изготовленного продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR);(iv) the level or activity of CD27 and/or CD45RO- (e.g., CD27+ CD45RO-) immune effector cells, e.g., in the CD4+ or CD8+ T cell population, in a sample (e.g., an apheresis sample or a manufactured CAR-expressing cell product sample);
(v) уровня или активности одного, двух, трех, четырех, пяти, шести, семи, восьми, девяти, десяти, одиннадцати или всех из биомаркеров, выбранных из CCL20, IL-17a, IL-6, PD-1, PD-L1, LAG-3, TIM-3, CD57, CD27, CD122, CD62L, KLRG1;(v) the level or activity of one, two, three, four, five, six, seven, eight, nine, ten, eleven or all of the biomarkers selected from CCL20, IL-17a, IL-6, PD-1, PD-L1, LAG-3, TIM-3, CD57, CD27, CD122, CD62L, KLRG1;
(vi) уровня или активности цитокинов (например, качества репертуара цитокинов) в образце продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR, например, образце продукта на основе клеток, экспрессирующих CLL-1; или(vi) the level or activity of cytokines (e.g., the quality of the cytokine repertoire) in a sample of a CAR-expressing cell-based product, such as a sample of a CLL-1-expressing cell-based product; or
(vii) эффективности трансдукции клетки, экспрессирующей CAR, в образце изготовленного продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR.(vii) the transduction efficiency of the CAR expressing cell in a sample of the manufactured CAR expressing cell based product.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, средство терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR, содержит множество (например, популяцию) иммунных эффекторных клеток, экспрессирующих CAR, например, множество (например, популяцию) T-клеток или NK-клеток или их комбинацию. В некоторых вариантах осуществления средство терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR, представляет собой средство терапии на основе CAR для CD19.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the CAR-expressing cell-based therapy comprises a plurality (e.g., a population) of CAR-expressing immune effector cells, such as a plurality (e.g., a population) of T cells or NK cells or a combination thereof. In some embodiments, the CAR-expressing cell-based therapy is a CD19 CAR-based therapy.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, показатель одного или нескольких параметров, раскрытых в данном документе, получают из образца, полученного путем афереза, взятого у субъекта. Образец, полученный путем афереза, можно оценить перед инфузией или повторной инфузией.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, a measure of one or more parameters disclosed herein is obtained from an apheresis sample taken from a subject. The apheresis sample can be assessed prior to infusion or reinfusion.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, показатель одного или нескольких параметров, раскрытых в данном документе, получают из образца опухоли, взятого у субъекта.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, a measure of one or more parameters disclosed herein is obtained from a tumor sample taken from a subject.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, показатель одного или нескольких параметров, раскрытых в данном документе, получают из образца изготовленного продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR, например, образца продукта на основе клеток, экспрессирующих CAR для CD19. Изготовленный продукт на основе клеток, экспрессирующих CAR, можно оценить перед инфузией или повторной инфузией.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, a measure of one or more parameters disclosed herein is obtained from a sample of a manufactured CAR-expressing cell product, such as a sample of a CD19 CAR-expressing cell product. The manufactured CAR-expressing cell product can be assessed prior to infusion or reinfusion.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, оценивание субъекта проводят перед получением, во время или после получения средства терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the subject is assessed prior to, during, or after receiving a CAR-expressing cell-based therapy.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, по показателю одного или нескольких параметров, раскрытых в данном документе, оценивается профиль одного или нескольких из экспрессии гена, проточной цитометрии или экспрессии белка.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, a profile of one or more of gene expression, flow cytometry, or protein expression is assessed based on one or more of the parameters disclosed herein.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, способ дополнительно включает идентификацию субъекта как пациента, отвечающего на лечение, пациента, не отвечающего на лечение, пациента с рецидивом или пациента без рецидива на основании показателя одного или нескольких из параметров, раскрытых в данном документе.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the method further comprises identifying the subject as a responder, a non-responder, a relapser, or a non-relapser based on a measure of one or more of the parameters disclosed herein.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов раскрытых в данном документе, пациент, отвечающий на лечение, например, пациент с полным ответом на лечение, имеет или идентифицирован как имеющий более высокую, например, статистически значимо более высокую процентную долю CD8+ T-клеток по сравнению с эталонным значением, например, процентной долей CD8+ T-клеток у пациента, не отвечающего на лечение.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, a patient who responds to treatment, such as a patient who has a complete response to treatment, has or is identified as having a higher, such as a statistically significantly higher, percentage of CD8+ T cells compared to a reference value, such as the percentage of CD8+ T cells in a patient who does not respond to treatment.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, пациент, отвечающий на лечение, например, пациент с полным ответом на лечение, имеет или идентифицирован как имеющий более высокую процентную долю CD27+ CD45RO- иммунных эффекторных клеток, например, в популяции CD8+, по сравнению с эталонным значением, например, количеством CD27+ CD45RO- иммунных эффекторных клеток у пациента, не отвечающего на лечение.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, a responding patient, such as a complete responder, has or is identified as having a higher percentage of CD27+ CD45RO- immune effector cells, such as in the CD8+ population, compared to a reference value, such as the number of CD27+ CD45RO- immune effector cells in a non-responding patient.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, пациент, отвечающий на лечение, например, пациент с полным ответом на лечение или пациент с частичным ответом на лечение, имеет или идентифицирован как имеющий более высокую, например, статистически значимо более высокую, процентную долю CD4+ T-клеток по сравнению с эталонным значением, например, процентной долей CD4+ T-клеток у пациента, не отвечающего на лечение.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, a patient who responds to treatment, such as a patient who has a complete response to treatment or a patient who has a partial response to treatment, has or is identified as having a higher, such as a statistically significantly higher, percentage of CD4+ T cells compared to a reference value, such as the percentage of CD4+ T cells in a patient who does not respond to treatment.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, пациент, отвечающий на лечение, например, пациент с полным ответом на лечение, имеет или идентифицирован как имеющий более высокую процентную долю одного, двух, трех или более (например, всех) из покоящихся TEFF-клеток, покоящихся TREG-клеток, более молодых T-клеток или ранних T-клеток памяти или их комбинации по сравнению с эталонным значением, например, количеством покоящихся TEFF-клеток, покоящихся TREG-клеток, более молодых T-клеток или ранних T-клеток памяти у пациента, не отвечающего на лечение.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, a responder to treatment, such as a complete responder, has or is identified as having a higher percentage of one, two, three or more (e.g., all) of the resting T EFF cells, resting T REG cells, younger T cells, or early memory T cells, or a combination thereof, compared to a reference value, such as the number of resting T EFF cells, resting T REG cells, younger T cells, or early memory T cells in a non-responder.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, пациент, не отвечающий на лечение, имеет или идентифицирован как имеющий более высокую процентную долю одного, двух, трех или более (например, всех) из активированных TEFF-клеток, активированных TREG-клеток, более старых T-клеток (например, более старых CD4 или CD8 клеток) или поздних T-клеток памяти или их комбинации по сравнению с эталонным значением, например, количеством активированных TEFF-клеток, активированных TREG-клеток, более старых T-клеток (например, более старых CD4 или CD8 клеток) или поздних T-клеток памяти у пациента, отвечающего на лечение.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the non-responding patient has or is identified as having a higher percentage of one, two, three or more (e.g., all) of the activated T EFF cells, activated T REG cells, older T cells (e.g., older CD4 or CD8 cells), or late memory T cells, or a combination thereof, compared to a reference value, such as the number of activated T EFF cells, activated T REG cells, older T cells (e.g., older CD4 or CD8 cells), or late memory T cells in a responding patient.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, пациент, не отвечающий на лечение, имеет или идентифицирован как имеющий более высокий процентный уровень маркера истощения иммунных клеток, например, одного, двух или более ингибиторов контрольных точек иммунного ответа (например, PD-1, PD-L1, TIM-3, TIGIT и/или LAG-3). В некоторых вариантах осуществления пациент, не отвечающий на лечение, имеет или идентифицирован как имеющий более высокую процентную долю иммунных эффекторных клеток, экспрессирующих PD-1, PD-L1 или LAG-3 (например, CD4+ T-клеток и/или CD8+ T-клеток) (например, CD4+ клеток и/или CD8+ T-клеток, экспрессирующих CAR), по сравнению с процентной долей иммунных эффекторных клеток, экспрессирующих PD-1 или LAG-3, у пациента, отвечающего на лечение.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the non-responding patient has or is identified as having a higher percentage of an immune cell exhaustion marker, such as one, two or more immune checkpoint inhibitors (e.g., PD-1, PD-L1, TIM-3, TIGIT and/or LAG-3). In some embodiments, the non-responding patient has or is identified as having a higher percentage of immune effector cells expressing PD-1, PD-L1 or LAG-3 (e.g., CD4+ T cells and/or CD8+ T cells) (e.g., CD4+ cells and/or CD8+ T cells expressing a CAR), compared to the percentage of immune effector cells expressing PD-1 or LAG-3 in the responding patient.
В некоторых вариантах осуществления пациент, не отвечающий на лечение, имеет или идентифицирован как имеющий более высокую процентную долю иммунных клеток, имеющих фенотип истощения, например, иммунных клеток, которые совместно экспрессируют по меньшей мере два маркера истощения, например, совместно экспрессируют PD-1, PD-L1 и/или TIM-3. В других вариантах осуществления пациент, не отвечающий на лечение, имеет или идентифицирован как имеющий более высокую процентную долю иммунных клеток, имеющих фенотип истощения, например, иммунных клеток, которые совместно экспрессируют по меньшей мере два маркера истощения, например, совместно экспрессируют PD-1 и LAG-3.In some embodiments, the non-responding patient has or is identified as having a higher percentage of immune cells having an exhaustion phenotype, such as immune cells that co-express at least two exhaustion markers, such as co-expressing PD-1, PD-L1, and/or TIM-3. In other embodiments, the non-responding patient has or is identified as having a higher percentage of immune cells having an exhaustion phenotype, such as immune cells that co-express at least two exhaustion markers, such as co-expressing PD-1 and LAG-3.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, пациент, не отвечающий на лечение, имеет или идентифицирован как имеющий более высокую процентную долю PD-1/PD-L1+/LAG-3+ клеток в популяции клеток, экспрессирующих CAR (например, популяции CLL-1-CAR+ клеток), по сравнению с пациентом, отвечающим на лечение (например, пациентом с полным ответом на лечение) с помощью средства терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR.In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the non-responding patient has or is identified as having a higher percentage of PD-1/PD-L1+/LAG-3+ cells in the population of CAR expressing cells (e.g., the population of CLL-1-CAR+ cells) compared to a responding patient (e.g., a complete responder) with a CAR expressing cell-based therapy.
В некоторых вариантах осуществления любого из способов, раскрытых в данном документе, у пациента, отвечающего на лечение (например, пациента с полным или частичным ответом на лечение), имеются один, два, три или больше (или все) из следующих профилей:In some embodiments of any of the methods disclosed herein, a patient responding to treatment (e.g., a patient with a complete or partial response to treatment) has one, two, three or more (or all) of the following profiles:
(i) имеется большее количество CD27+ иммунных эффекторных клеток по сравнению с эталонным значением, например, количеством CD27+ иммунных эффектoрных клеток у пациента, не отвечающего на лечение;(i) there is a higher number of CD27+ immune effector cells compared to a reference value, such as the number of CD27+ immune effector cells in a non-responding patient;
(ii) имеется большее количество CD8+ T-клеток по сравнению с эталонным значением, например, количеством CD8+ T-клеток у пациента, не отвечающего на лечение;(ii) there is a higher CD8+ T cell count compared to a reference value, such as the CD8+ T cell count in a non-responding patient;
(iii) имеется меньшее количество иммунных клеток, экспрессирующих один или несколько ингибиторов контрольных точек иммунного ответа, например, ингибиторов контрольных точек иммунного ответа, выбранных из PD-1, PD-L1, LAG-3, TIM-3 или KLRG-1 или их комбинации, по сравнению с эталонным значением, например, количеством клеток, экспрессирующих один или несколько ингибиторов контрольных точек иммунного ответа, у пациента, не отвечающего на лечение; или(iii) there is a lower number of immune cells expressing one or more immune checkpoint inhibitors, such as immune checkpoint inhibitors selected from PD-1, PD-L1, LAG-3, TIM-3 or KLRG-1 or a combination thereof, compared to a reference value, such as the number of cells expressing one or more immune checkpoint inhibitors in a non-responding patient; or
(iv) имеется большее количество одного, двух, трех, четырех или более (всех) из покоящихся TEFF-клеток, покоящихся TREG-клеток, необученных CD4 клеток, нестимулированных клеток памяти или ранних T-клеток памяти или их комбинации по сравнению с эталонным значением, например, количеством покоящихся TEFF-клеток, покоящихся TREG-клеток, необученных CD4 клеток, нестимулированных клеток памяти или ранних T-клеток памяти у пациента, не отвечающего на лечение.(iv) there is a greater number of one, two, three, four or more (all) of resting T EFF cells, resting T REG cells, naive CD4 cells, unstimulated memory cells or early memory T cells or a combination thereof compared to a reference value, such as the number of resting T EFF cells, resting T REG cells, naive CD4 cells, unstimulated memory cells or early memory T cells in a non-responding patient.
В ряде вариантов осуществления субъект, который является пациентом, отвечающим на лечение, пациентом, не отвечающим на лечение, пациентом с рецидивом или пациентом без рецидива, идентифицированным посредством способов, изложенных в данном документе, может быть подвергнут дополнительной оценке в соответствии с клиническими критериями. Например, пациент с полным ответом на лечение является субъектом или идентифицирован как субъект, у которого имеется заболевание, например, рак, у которого проявляется полный ответ на лечение, например, полная ремиссия. Полный ответ на лечение можно идентифицировать, например, с помощью NCCN Guidelines® или руководства, утвержденного на международном семинаре по хроническому лимфоцитарному лейкозу (iwCLL) 2018 года, как раскрыто в Hallek M et al., Blood (2018) 131:2745-2760 "iwCLL guidelines for diagnosis, indications for treatment, response assessment, and supportive management of CLL", полное содержание которого включено в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. Пациент с частичным ответом на лечение является субъектом или идентифицирован как субъект, у которого имеется заболевание, например, рак, у которого проявляется частичный ответ на лечение, например, частичная ремиссия. Частичный ответ можно идентифицировать, например, с помощью критериев NCCN Guidelines® или iwCLL 2018 года, как описано в данном документе. Пациент, не отвечающий на лечение, является субъектом или идентифицирован как субъект, у которого имеется заболевание, например, рак, у которого не проявляется ответ на лечение, например, у пациента наблюдается стабилизация заболевания или прогрессирование заболевания. Пациента, не отвечающего на лечение, можно идентифицировать, например, с помощью критериев NCCN Guidelines® или iwCLL 2018 года, как описано в данном документе.In some embodiments, a subject that is a responder, non-responder, relapsed, or non-relapsed patient identified by the methods set forth herein may be further evaluated according to clinical criteria. For example, a complete responder is or is identified as a subject that has a disease, such as cancer, that exhibits a complete response to treatment, such as a complete remission. A complete response can be identified, for example, using the NCCN Guidelines® or the 2018 International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia (iwCLL) guidelines as disclosed in Hallek M et al., Blood (2018) 131:2745-2760 "iwCLL guidelines for diagnosis, indications for treatment, response assessment, and supportive management of CLL," the entire contents of which are incorporated herein by reference in their entirety. A partial responder is a subject or identified as a subject who has a disease, such as cancer, that is showing a partial response to treatment, such as a partial remission. A partial response may be identified, for example, using the 2018 NCCN Guidelines® or iwCLL criteria, as described herein. A non-responder is a subject or identified as a subject who has a disease, such as cancer, that is not showing a response to treatment, such as the patient has stable disease or progression of disease. A non-responder may be identified, for example, using the 2018 NCCN Guidelines® or iwCLL criteria, as described herein.
В качестве альтернативы или в комбинации со способами, раскрытыми в данном документе, с учетом указанной величины осуществляется одно, два, три, четыре или более из следующего:Alternatively or in combination with the methods disclosed herein, taking into account the specified value, one, two, three, four or more of the following are performed:
введения, например, пациенту, отвечающему на лечение, или пациенту без рецидива средства терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR;administering, for example, to a responding patient or a non-relapsed patient, a CAR-expressing cell-based therapy;
введения измененных доз средства терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR;administration of altered doses of CAR cell-based therapy;
изменения схемы или периода введения средства терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR;changes in the schedule or timing of administration of the CAR cell-based therapy;
введения, например, пациенту, не отвечающему на лечение, или пациенту с частичным ответом на лечение дополнительного средства в комбинации со средством терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR, например, ингибитора контрольной точки иммунного ответа, например, ингибитора контрольной точки иммунного ответа, описанного в данном документе;administering, for example, to a non-responding patient or a patient with a partial response to treatment, an additional agent in combination with a CAR-expressing cell-based therapy, for example, an immune checkpoint inhibitor, for example, an immune checkpoint inhibitor described herein;
введения пациенту, не отвечающему на лечение, или пациенту с частичным ответом на лечение средства терапии, которое обеспечивает увеличение количества более молодых T-клеток у субъекта, перед проведением лечения с помощью средства терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR;administering to a non-responding patient or a patient with a partial response to treatment a therapy that provides an increase in the number of younger T cells in the subject, prior to treatment with a therapy based on cells expressing CAR;
модификации способа изготовления средства терапии на основе клеток, экспрессирующих CAR, например, обогащения более молодыми T-клетками перед введением нуклеиновой кислоты, кодирующей CAR, или увеличения эффективности трансдукции, например, у субъекта, идентифицированного как пациент, не отвечающий на лечение, или пациент с частичным ответом на лечение;modifications to the method of making a CAR-expressing cell-based therapy, such as enriching for younger T cells prior to administration of a CAR-encoding nucleic acid or increasing transduction efficiency, such as in a subject identified as a non-responder or a partial responder;
введения альтернативного средства терапии, например, пациенту, не отвечающему на лечение, или пациенту с частичным ответом на лечение, или пациенту с рецидивом; или,the introduction of an alternative therapy, for example, to a patient who is not responding to treatment, or to a patient who has had a partial response to treatment, or to a patient who has relapsed; or,
в случае, если субъект является пациентом, не отвечающим на лечение, или пациентом с рецидивом или идентифицирован в таковом качестве, уменьшения популяции TREG-клеток и/или уровня экспрессии генной сигнатуры TREG, например, посредством одного или нескольких из истощения по CD25, введения циклофосфамида, антитела к GITR или их комбинации.if the subject is a non-responder or relapsed patient or is identified as such, reducing the population TREG-cells and/or the level of expression of the T gene signatureREG, For example, via one or more of CD25 depletion, cyclophosphamide administration, anti-GITR antibody, or a combination thereof.
ПРИМЕРЫEXAMPLES
Настоящее изобретение дополнительно подробно описано посредством ссылки на следующие экспериментальные примеры. Эти примеры приведены лишь в целях иллюстрации и не предполагаются как ограничивающие, если не указано иное. Таким образом, настоящее изобретение никоим образом не следует истолковывать как ограниченное следующими примерами, а, наоборот, следует истолковывать как охватывающее все без исключения видоизменения, которые становятся очевидными как следствие идеи, приведенной в данном документе.The present invention is further described in detail by reference to the following experimental examples. These examples are provided for illustrative purposes only and are not intended to be limiting unless otherwise stated. Accordingly, the present invention should in no way be construed as limited by the following examples, but, on the contrary, should be construed as embracing any and all modifications that become apparent as a consequence of the teachings given herein.
Пример 1. Определение характеристик CAR для BCMA человека in vitroExample 1. In vitro characterization of CAR for human BCMA
Набор полностью человеческих одноцепочечных вариабельных фрагментов (scFv) клонировали в лентивирусные векторы экспрессии CAR с CD3-дзета-цепью и стимулирующими молекулами 4-1BB: R1B6, R1F2, R1G5, PI61, B61-10, B61-02, Hy03 и Hy52. Первоначально конструкции подвергали скринингу с помощью автоматизированного анализа в репортерных клетках с последующим отбором оптимальных клонов на основании экспрессии на первичных Т-клетках, а также количества и качества ответов с участием эффекторных Т-клеток ("BCMA-CAR-T" или "BCMA-CAR-T-клеток") в ответ на мишени, экспрессирующие BCMA ("BCMA+" или "BCMA-положительные"). Ответы с участием эффекторных T-клеток включают без ограничения размножение, пролиферацию, удвоение, продуцирование цитокинов и уничтожение клеток-мишеней или цитолитическую активность (дегрануляцию) у клеток.A panel of fully human single-chain variable fragments (scFv) were cloned into lentiviral CAR expression vectors with CD3 zeta chain and 4-1BB stimulatory molecules: R1B6, R1F2, R1G5, PI61, B61-10, B61-02, Hy03, and Hy52. Constructs were initially screened using an automated reporter cell assay, followed by selection of optimal clones based on expression on primary T cells and the quantity and quality of effector T cell responses (“BCMA-CAR-T” or “BCMA-CAR-T cells”) to BCMA-expressing targets (“BCMA+” or “BCMA-positive”). Responses involving effector T cells include, but are not limited to, expansion, proliferation, duplication, cytokine production, and target cell killing or cytolytic activity (degranulation) in cells.
Получение лентивирусного вектора, кодирующего CAR для BCMAProduction of a lentiviral vector encoding a CAR for BCMA
Все вышеуказанные лентивирусные векторы для переноса, кодирующие scFv, использовали для получения геномного материала, упакованного в псевдотипированные с VSVg лентивирусные частицы. ДНК лентивирусного вектора для переноса, кодирующую CAR, смешивали с тремя упаковочными компонентами VSVg, gag/pol и rev в комбинации с реагентом липофектамином для трансфекции клеток Lenti-X 293T (Clontech) с последующей заменой среды спустя 12-18 ч. Через 30 часов после замены среды среду собирали, фильтровали и хранили при -80°C.All the above lentiviral transfer vectors encoding scFv were used to generate genomic material packaged into VSVg pseudotyped lentiviral particles. The lentiviral transfer vector DNA encoding CAR was mixed with the three packaging components VSVg, gag/pol and rev in combination with lipofectamine reagent to transfect Lenti-X 293T cells (Clontech) followed by medium change after 12-18 h. After 30 h of medium change, the medium was collected, filtered and stored at -80°C.
JNL с CAR для BCMA и скрининговый анализ в репортерных клетках JNL с помощью автоматической системыJNL with CAR for BCMA and screening assay in JNL reporter cells using an automated system
Для анализа в репортерных клетках лентивирус, кодирующий CAR для BCMA, получали в клетках HEK293 при двух различных показателях плотности клеток (40000 клеток (1x H293) или 80000 клеток (2x H293)) в автоматизированном мелкомасштабном режиме в 96-луночных планшетах, при этом содержащую вирус надосадочную жидкость собирали через 48 часов после трансфекции и использовали в свежем виде без замораживания для трансдукции линии репортерных Т-клеток Jurkat. Линия репортерных клеток Jurkat с NFAT-люциферазой (JNL) получена на основе линии острого Т-клеточного лейкоза Jurkat. Линию модифицировали таким образом, чтобы она экспрессировала люциферазу под контролем элемента ответа на ядерный фактор активированных Т-клеток (NFAT). Для трансдукции с помощью CAR для BCMA 10000 клеток JNL/лунка 96-луночного планшета трансдуцировали 50 мкл свежей содержащей вирус надосадочной жидкости, отфильтрованной через фильтр на 45 мкм. Планшеты культивировали в течение 5 дней перед совместным культивированием с клетками-мишенями.For the reporter cell assay, lentivirus encoding the CAR for BCMA was produced in HEK293 cells at two different cell densities (40,000 cells (1x H293) or 80,000 cells (2x H293)) in an automated small-scale mode in 96-well plates, with the virus-containing supernatant collected 48 h post-transfection and used fresh without freezing to transduce the Jurkat reporter T cell line. The Jurkat NFAT-luciferase reporter cell line (JNL) is derived from the Jurkat acute T-cell leukemia cell line. The line was modified to express luciferase under the control of the nuclear factor of activated T (NFAT) response element. For transduction with BCMA CAR, 10,000 JNL cells/well of a 96-well plate were transduced with 50 μl of fresh virus-containing supernatant filtered through a 45 μm filter. Plates were cultured for 5 days before co-culture with target cells.
Для оценивания функциональной способности CAR для BCMA активировать клетки JNL их совместно культивировали с раковыми клетками-мишенями при различных соотношениях эффекторных клеток и клеток-мишеней (соотношениях E:T) для регистрации их активации путем количественного определения экспрессии люциферазы. Оценивали CAR R1B6, R1F2, R1G5, PI61, B61-10, B61-02, Hy03 и Hy52 на основе scFv. Клетки JNL с CAR для CD19 использовали в качестве контроля, специфичного для мишени, и среда в отдельности без клеток-мишеней служила в качестве отрицательного контроля.To evaluate the functional ability of BCMA CAR to activate JNL cells, they were co-cultured with target cancer cells at different effector to target cell ratios (E:T ratios) to detect their activation by quantifying luciferase expression. The scFv-based CARs R1B6, R1F2, R1G5, PI61, B61-10, B61-02, Hy03, and Hy52 were evaluated. JNL cells with CD19 CAR were used as a target-specific control, and medium alone without target cells served as a negative control.
Вышеупомянутые пятидневные трансдуцированные клетки JNL с CAR совместно культивировали с BCMA-положительной линией клеток множественной миеломы (MM) KMS11 или NALM6 - линией клеток острого лимфоцитарного лейкоза, служившей в качестве BCMA-отрицательного контроля. Оставшиеся CAR-Т-клетки JNL оценивали в отношении экспрессии CAR для BCMA с помощью проточной цитометрии. Совместные культуры подготавливали в 384-луночных планшетах при соотношениях эффекторов и мишеней (E:T), составляющих 4:1, 2:1, 1:1 и 0,5:1, и инкубировали в течение 24 часов, после чего количественно определяли экспрессию люциферазы по активированным CAR-Т-клеткам JNL с помощью системы анализа люциферазы Bright-Glo™ (Promega, Мэдисон, Висконсин). Количество света, испускаемого из каждой лунки (люминесценция), было прямым регистрируемым показателем активации JNL соответствующим CAR. Клетки JNL считались активированными, если уровень люминесценции равнялся уровню в клетках UTD или более чем в два раза превышал его. BCMA+ линия клеток KMS11 приводила к активации клеток JNL, экспрессирующих R1B6, R1F2, R1G5, PI61, B61-10, B61-02, Hy03 и Hy52 (фиг. 1A и 1C). Ни один из CAR для ВСМА не продемонстрировал активации BCMA-отрицательной линией NALM6 (фиг. 1E и 1F). Среда в отдельности без клеток-мишеней не активировала никакие из тестируемых JNL, трансдуцированных с помощью CAR (фиг. 1G и 1H). Анализы методом FACS продемонстрировали, что экспрессия CAR для BCMA в трансдуцированных JNL обнаруживалась в разной степени; % CAR обычно положительно коррелирует с активацией JNL клетками KMS11 для наиболее активных CAR-T JNL (фиг. 1B и 1D).The above 5-day-old CAR-transduced JNL cells were co-cultured with the BCMA-positive multiple myeloma (MM) cell line KMS11 or the NALM6 acute lymphocytic leukemia cell line, which served as a BCMA-negative control. The remaining JNL CAR T cells were assessed for BCMA CAR expression by flow cytometry. Co-cultures were prepared in 384-well plates at effector-to-target (E:T) ratios of 4:1, 2:1, 1:1, and 0.5:1 and incubated for 24 h, after which luciferase expression was quantified on activated JNL CAR T cells using the Bright-Glo™ Luciferase Assay System (Promega, Madison, WI). The amount of light emitted from each well (luminescence) was a direct measure of JNL activation by the respective CAR. JNL cells were considered activated if the luminescence level was equal to or greater than twice that of UTD cells. The BCMA+ cell line KMS11 activated JNL cells expressing R1B6, R1F2, R1G5, PI61, B61-10, B61-02, Hy03, and Hy52 (Fig. 1A and 1C). None of the BCMA CARs showed activation by the BCMA-negative NALM6 line (Fig. 1E and 1F). Medium alone without target cells did not activate any of the CAR-transduced JNL tested (Fig. 1G and 1H). FACS analyses demonstrated that CAR expression for BCMA was detected to varying degrees in transduced JNL; % CAR generally correlated positively with JNL activation by KMS11 cells for the most active CAR-T JNL (Fig. 1B and 1D).
Получение BCMA-CAR-T-клетокObtaining BCMA-CAR-T cells
Следующие 8 CAR были выбраны для анализа экспрессии, стабильности и эффективности CAR в первичных Т-клетках: R1B6, R1F2, R1G5, PI61, B61-10, B61-02, Hy03 и Hy52. BCMA-CAR-T-клетки получали, начиная с крови здоровых подвергнутых аферезу доноров, Т-клетки которых (CD4+ и CD8+ лимфоциты) были получены путем отрицательного отбора в отношении CD3+ Т-клеток. Эти клетки активировали путем добавления гранул с антителами к CD3/CD28 (Dynabeads® Human T-Expander CD3/CD28, Thermo Fisher Scientific) при соотношении 1:3 (T-клеток и гранул) в среде для T-клеток (RPMI-1640, 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сыворотки (FCS), 2 мM L-глутамина, 1x пенициллина/стрептомицина, 100 мкM заменимых аминокислот, 1 мM пирувата натрия, 10 мM HEPES и 55 мкM 2-меркаптоэтанола). T-клетки культивировали при 0,5×106 Т-клеток в 1 мл среды на лунку 24-луночного планшета при 37°C, 5% CO2. Через 24 часа, когда Т-клетки проходили бластообразование, Т-клетки трансдуцировали с помощью вируса, кодирующего CAR для BCMA, при множественности заражения (MOI), составляющей 5. Т-клетки начинали делиться с логарифмическим паттерном роста, который отслеживали путем измерения количества клеток на мл, и Т-клетки разбавляли свежей средой каждые два дня, от них удаляли гранулы, и их собирали для дальнейших анализов в день 9. Аликвоты Т-клеток окрашивали для измерения экспрессии CAR с помощью проточной цитометрии в дни 5 и 9 на FACS Fortessa (BD). Все BCMA-CAR-T-клетки были получены в условиях изготовления исследовательского уровня (т. е. не клинического уровня).The following 8 CARs were selected for analysis of CAR expression, stability, and potency in primary T cells: R1B6, R1F2, R1G5, PI61, B61-10, B61-02, Hy03, and Hy52. BCMA CAR T cells were generated starting from blood of healthy apheresis donors whose T cells (CD4+ and CD8+ lymphocytes) were obtained by negative selection for CD3+ T cells. These cells were activated by adding anti-CD3/CD28 beads (Dynabeads® Human T-Expander CD3/CD28, Thermo Fisher Scientific) at a ratio of 1:3 (T cells to beads) in T cell medium (RPMI-1640, 10% heat-inactivated fetal calf serum (FCS), 2 mM L-glutamine, 1x penicillin/streptomycin, 100 μM nonessential amino acids, 1 mM sodium pyruvate, 10 mM HEPES, and 55 μM 2-mercaptoethanol). T cells were cultured at 0.5 x 10 6 T cells in 1 ml medium per well of a 24-well plate at 37°C, 5% CO 2 . After 24 hours, when T cells had undergone blast formation, T cells were transduced with a virus encoding CAR for BCMA at a multiplicity of infection (MOI) of 5. T cells began dividing with a logarithmic growth pattern monitored by measuring the number of cells per ml, and T cells were diluted with fresh medium every two days, pelleted, and collected for further analysis on
Поверхностную экспрессию CAR для BCMA и ее стабильность оценивали путем измерения % CAR и MFI (средней интенсивности флуоресценции) в день 5 и день 9 с использованием анализов методом проточной цитометрии клеток, окрашенных с помощью rBCMA_Fc-AF647 (фиг. 2 и таблица 27). Экспрессия CAR для BCMA в конечном продукте в день 9 отличается для разных конструкций и находится в диапазоне от 18% до 42,4%, а MFI - от 672 до 5238. Конструкции из полученных из PALLAS клонов R1F2, R1B6 и R1G5 и гибридомного клона Hy03 демонстрировали потерю CAR от ~ 30% до 50% с дня 5 по день 9, тогда как PI61, B61-10 и -02, а также Hy52 были относительно стабильными с точки зрения процентного значения экспрессии CAR, хотя все конструкции CAR демонстрировали уменьшение MFI с дня 5 по день 9, что, вероятно, было обусловлено меньшим размером Т-клеток на их стадии покоя в день 9. Подсчет клеток в культурах CAR-Т-клеток указывал на отсутствие поддающегося выявлению отрицательного эффекта CAR для BCMA, несущего scFv человека, в отношении способности клеток нормально размножаться по сравнению с нетрансдуцированными Т-клетками ("UTD").Surface expression of CAR for BCMA and its stability were assessed by measuring %CAR and MFI (mean fluorescence intensity) at
Оценивание функциональных свойств T-клеток, перенаправленных с помощью CAR для BCMAEvaluation of functional properties of CAR-redirected T cells for BCMA
Для оценивания функциональных возможностей BCMA-CAR-T-клеток подготавливали совместные культуры с BCMA-положительными и BCMA-отрицательными линиями раковых клеток. CAR-T-клетки размораживали, подсчитывали и культивировали совместно с клетками-мишенями для регистрации их способностей к уничтожению и секреции цитокинов. Тестировали клоны CAR для BCMA R1B6, R1F2, R1G5, B61-02, B61-10, PI61, Hy03 и Hy52. Нетрансдуцированные Т-клетки (UTD) использовали в качестве контрольных ненацеливающихся Т-клеток.To assess the functionality of BCMA CAR T cells, co-cultures were prepared with BCMA-positive and BCMA-negative cancer cell lines. CAR T cells were thawed, counted, and co-cultured with target cells to record their killing and cytokine secretion capabilities. The BCMA CAR clones tested were R1B6, R1F2, R1G5, B61-02, B61-10, PI61, Hy03, and Hy52. Untransduced T cells (UTD) were used as control non-targeting T cells.
Уничтожение с помощью CAR-T-клеток осуществляли путем совместного культивирования CAR-T-клеток с клетками-мишенями KMS11-Luc и NALM6-Luc при различных соотношениях E:T в течение 20 часов. Популяции CAR-Т-клеток нормализовали по эквивалентным процентным долям CAR-положительных клеток перед посевом. Цитокин IFNγ измеряли в надосадочных жидкостях 20-часовых совместных культур CAR-T-клеток с клетками-мишенями при соотношении эффекторов и мишеней, составляющем 2,5:1, используя Meso Scale Discovery (MSD; Гейтерсберг, Мэриленд), и результаты для каждого цитокина рассчитывали в пг/мл с использованием известных стандартов. Все анализы выполняли в двух повторностях из одного источника донорских клеток. Данные об уничтожении показывают, что все клоны CAR для BCMA эффективно уничтожают раковые клетки KMS11 (фиг. 3A). Контрольные клетки-мишени NALM6 не уничтожались ни одним из этих BCMA-специфичных CAR (фиг. 3B). Также тестировали способность этих CAR продуцировать IFNγ при культивировании с KMS11 (фиг. 3C). CAR для BCMA R1F2, R1G5 и PI61 приводили к продуцированию наиболее высоких количеств IFNγ. Уровни цитокинов, продуцируемых BCMA-CAR-T после воздействия контрольных клеток NALM6, были низкими (фиг. 3C), что указывает на отсутствие неспецифической активации с помощью CAR для BCMA.CAR-T cell killing was performed by co-culture of CAR-T cells with KMS11-Luc and NALM6-Luc target cells at various E:T ratios for 20 h. CAR-T cell populations were normalized to equivalent percentages of CAR-positive cells before plating. The cytokine IFNγ was measured in supernatants of 20-h CAR-T cell co-cultures with target cells at an effector:target ratio of 2.5:1 using Meso Scale Discovery (MSD; Gaithersburg, MD), and results for each cytokine were calculated in pg/mL using known standards. All assays were performed in duplicate from a single donor cell source. Killing data showed that all BCMA CAR clones efficiently killed KMS11 cancer cells (Fig. 3A). Control NALM6 target cells were not killed by any of these BCMA-specific CARs (Fig. 3B). The ability of these CARs to produce IFNγ when cultured with KMS11 was also tested (Fig. 3C). BCMA CARs R1F2, R1G5, and PI61 resulted in the highest amounts of IFNγ. The levels of cytokines produced by BCMA CAR-Ts following exposure to control NALM6 cells were low (Fig. 3C), indicating a lack of non-specific activation by BCMA CARs.
ВыводыConclusions
Новые scFv, связывающие BCMA, тестировали в качестве составной части CAR-Т-клеток. Восемь CAR анализировали в анализе в репортерных клетках JNL, а также в первичных Т-клетках: R1B6, R1F2, R1G5, B61-02, B61-10, PI61, Hy03 и Hy52. Все восемь типов CAR-T-клеток демонстрировали уничтожение, специфичное для мишени. Т-клетки, экспрессирующие R1F2, R1G5 или PI61, продуцировали наиболее высокие количества IFNγ в присутствии клеток-мишеней. В целом, перенос CAR для ВСМА в первичные Т-клетки индуцировал реактивность CAR в отношении ВСМА, но не индуцировал нецелевую функцию.Novel BCMA-binding scFvs were tested as part of CAR T cells. Eight CARs were analyzed in JNL reporter assays as well as in primary T cells: R1B6, R1F2, R1G5, B61-02, B61-10, PI61, Hy03, and Hy52. All eight CAR T cell types demonstrated target-specific killing. T cells expressing R1F2, R1G5, or PI61 produced the highest amounts of IFNγ in the presence of target cells. Overall, transfer of BCMA CARs into primary T cells induced CAR reactivity to BCMA but did not induce off-target function.
Пример 2. Экспрессия двойных CAR и активность in vitro CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19Example 2. Dual CAR expression and in vitro activity of CAR-T with dual specificity to BCMA/CD19
Ряд бицистронных конструкций, содержащих две полные цепи CAR (химерного антигенного рецептора), одна из которых направлена на BCMA, а другая - на CD19, конструировали в лентивирусном векторе (таблица 28). Экспрессия CAR управляется промотором EF1-альфа. Такие CAR содержат ряд человеческих одноцепочечных вариабельных фрагментов (scFv), нацеливающихся на BCMA (duBCMA.4, PI61, R1G5 и R1B6). Во всех конструкциях использовался один и тот же сконструированный гуманизированный scFv, нацеливающийся на CD19. На N-конце каждого scFv сигнальный пептид, полученный из CD8-альфа, нацеливает CAR на секреторный путь. Предполагают, что такой сигнальный пептид будет отщепляться котрансляционно и поэтому будет отсутствовать в зрелой форме CAR, представляемой на поверхности клетки. На С-конце каждого scFv находится шарнирная область и трансмембранный домен CD8-альфа, слитый с внутриклеточным доменом 4-1BB, за которым следует внутриклеточный домен CD3-дзета. Между двумя CAR, точнее, между последней аминокислотой первого домена CD3-дзета и сигнальным пептидом последующего CAR, сконструирован линкер (GSG (SEQ ID NO: 206), за которым следует саморасщепляющийся пептид 2A из тешовируса-1 2A свиней (т. е. последовательность P2A). Можно использовать и другие линкеры и/или саморасщепляющиеся пептиды. Такая разработка позволяет экспрессировать два независимых CAR из одного мРНК-транскрипта. Последовательности ДНК, кодирующие области, перекрывающиеся между двумя CAR (сигнальный пептид, шарнирную область, трансмембранный домен, 4-1BB и CD3-дзета), отличаются друг от друга, чтобы свести к минимуму потенциальную рекомбинацию.A series of bicistronic constructs containing two complete CAR (chimeric antigen receptor) chains, one targeting BCMA and the other targeting CD19, were constructed in a lentiviral vector (Table 28). CAR expression is driven by the EF1alpha promoter. These CARs contain a series of human single-chain variable fragments (scFv) targeting BCMA (duBCMA.4, PI61, R1G5, and R1B6). All constructs used the same engineered humanized scFv targeting CD19. At the N-terminus of each scFv, a CD8alpha-derived signal peptide targets the CAR to the secretory pathway. This signal peptide is predicted to be cleaved cotranslationally and therefore will be absent from the mature form of the CAR displayed on the cell surface. At the C-terminus of each scFv is a hinge region and a CD8alpha transmembrane domain fused to a 4-1BB intracellular domain, followed by a CD3zeta intracellular domain. A linker (GSG (SEQ ID NO: 206)) was designed between the two CARs, more specifically between the last amino acid of the first CD3-zeta domain and the signal peptide of the subsequent CAR, followed by the self-cleaving peptide 2A from porcine teschovirus-1 2A (i.e., the P2A sequence). Other linkers and/or self-cleaving peptides can also be used. This design allows the expression of two independent CARs from a single mRNA transcript. The DNA sequences encoding the overlapping regions between the two CARs (signal peptide, hinge region, transmembrane domain, 4-1BB, and CD3-zeta) are different from each other to minimize potential recombination.
Конструкции использовали для получения векторного материала, который использовали для инфицирования первичных Т-клеток человека. Экспрессию CAR оценивали с помощью проточной цитометрии. Также измеряли количество и качество ответов с участием эффекторных Т-клеток ("CAR-T-клеток с двойной специфичностью к BCMA/CD19" или "Т-клеток") в ответ на экспрессирующие BCMA ("BCMA+" или "BCMA-положительные") и CD19+ опухоли-мишени. Ответы с участием эффекторных T-клеток включают без ограничения размножение, пролиферацию, удвоение, продуцирование цитокинов и уничтожение клеток-мишеней или цитолитическую активность (дегрануляцию) у клеток.The constructs were used to generate vector material that was used to infect primary human T cells. CAR expression was assessed by flow cytometry. The quantity and quality of effector T cell responses ("BCMA/CD19 dual-specific CAR T cells" or "T cells") to BCMA-expressing ("BCMA+" or "BCMA-positive") and CD19+ target tumors were also measured. Effector T cell responses include, but are not limited to, cell expansion, proliferation, duplication, cytokine production, and target cell killing or cytolytic activity (degranulation).
Получение лентивируса и определение титраObtaining lentivirus and determining titer
Пять конструкций, кодирующих двойные CAR для BCMA/CD19, описанные выше, использовали для получения геномного материала, упакованного в псевдотипированные с VSVg лентивирусные частицы. Две конструкции использовали в качестве контроля: одну, кодирующую моно-CAR, направленный против BCMA (duBCMA.4), и другую, кодирующую моно-CAR, направленный против CD19. Все семь конструкций конструировали в одном и том же каркасе плазмиды. Каждую из этих ДНК смешивали с тремя упаковочными компонентами VSVg, gag/pol и rev в комбинации с реагентом липофектамином для трансфекции клеток Lenti-X 293T (Clontech) с последующей заменой среды спустя 12-18 ч. Через 30 часов после замены среды среду собирали, фильтровали и хранили при -80°C.The five constructs encoding dual BCMA/CD19 CARs described above were used to generate genomic material packaged into VSVg-pseudotyped lentiviral particles. Two constructs were used as controls: one encoding a mono-CAR directed against BCMA (duBCMA.4) and one encoding a mono-CAR directed against CD19. All seven constructs were constructed in the same plasmid backbone. Each of these DNAs was mixed with the three packaging components VSVg, gag/pol and rev in combination with lipofectamine reagent to transfect Lenti-X 293T cells (Clontech) followed by a medium change 12-18 h later. Thirty hours after the medium change, the medium was collected, filtered and stored at -80°C.
Титр лентивируса определяли путем оценивания поверхностной экспрессии двойных CAR для BCMA/CD19 на трансдуцированных клетках Sup-T1 с использованием рекомбинантного белка BCMA человека с Fc-меткой, конъюгированного с Alexa-647 (BCMA-Fc), и антиидиотипического антитела к duCD19.1 (PE). Клетки Sup-T1 трансдуцировали с помощью содержащих вирус надосадочных жидкостей в 3-кратном серийном разведении с начальным разведением 1:3. Процентную долю клеток, экспрессирующих CAR (CAR+ клеток), оценивали спустя четыре дня. Титр вируса рассчитывали с использованием популяции, положительной по вышерасположенному CAR либо дважды положительной по CAR, согласно следующей формуле:Lentivirus titer was determined by assessing the surface expression of dual CARs for BCMA/CD19 on transduced Sup-T1 cells using Alexa-647-conjugated recombinant human BCMA protein with an Fc tag (BCMA-Fc) and an anti-idiotypic antibody to duCD19.1 (PE). Sup-T1 cells were transduced with virus-containing supernatants in 3-fold serial dilutions from a starting dilution of 1:3. The percentage of CAR-expressing cells (CAR+ cells) was assessed after four days. Viral titer was calculated using the upstream CAR-positive or double CAR-positive population according to the following formula:
(% CAR+) x (количество высеянных клеток Sup-T1) x (разведение) / (количество вируса (мл)).(% CAR+) x (number of Sup-T1 cells seeded) x (dilution) / (amount of virus (ml)).
Титр вируса рассчитывали по центральной точке наибольшего разведения в линейном диапазоне, дающем от 5 до 25% CAR+ клеток (таблица 29).The virus titer was calculated from the central point of the highest dilution in the linear range giving from 5 to 25% CAR+ cells (Table 29).
Получение BCMA/CD19-CAR-Т-клеток с использованием традиционного 10-дневного способа полученияProduction of BCMA/CD19 CAR T cells using the traditional 10-day production method
Получали CAR-Т-клетки с двойной специфичностью к BCMA/CD19, или моно-BCMA-, или моно-CD19-CAR-Т-клетки с использованием первичных Т-клеток человека (CD4+ и CD8+ лимфоцитов), полученных путем отрицательного отбора или положительного отбора с помощью Prodigy при обработке крови от здоровых подвергнутых аферезу доноров. Перед трансдукцией Т-клетки активировали с помощью гранул с антителами к CD3/CD28 (Dynabeads® Human T-Expander CD3/CD28, Thermo Fisher Scientific) при соотношении 1:3 (T-клеток и гранул) в среде для T-клеток (RPMI-1640, 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сыворотки (FCS), 2 мM L-глутамина, 1x пенициллина/стрептомицина, 100 мкM заменимых аминокислот, 1 мM пирувата натрия, 10 мM HEPES и 55 мкM 2-меркаптоэтанола). Клетки культивировали при плотности 0,5×106/мл среды на лунку в 24-луночном планшете при 37°C, 5% CO2. Через 24 часа, когда Т-клетки проходили бластообразование, их трансдуцировали с помощью вирусов при множественности заражения (MOI), составляющей 5, исходя из титра для вышерасположенного CAR. Т-клетки начинали делиться с логарифмическим паттерном роста, который отслеживали путем измерения количества клеток на мл, и Т-клетки разбавляли свежей средой каждые два дня, от них удаляли гранулы, и их собирали для дальнейших анализов в день 8 или позднее в зависимости от размера клеток. Аликвоты Т-клеток окрашивали для измерения экспрессии CAR с помощью проточной цитометрии в дни 7 или 8 на FACS Fortessa (BD).Dual-specific BCMA/CD19 CAR T cells or mono-BCMA or mono-CD19 CAR T cells were generated using primary human T cells (CD4+ and CD8+ lymphocytes) obtained by negative selection or positive selection with Prodigy in blood from healthy apheresis donors. Prior to transduction, T cells were activated with anti-CD3/CD28 beads (Dynabeads® Human T-Expander CD3/CD28, Thermo Fisher Scientific) at a 1:3 ratio (T cells to beads) in T cell medium (RPMI-1640, 10% heat-inactivated fetal calf serum (FCS), 2 mM L-glutamine, 1x penicillin/streptomycin, 100 μM nonessential amino acids, 1 mM sodium pyruvate, 10 mM HEPES, and 55 μM 2-mercaptoethanol). Cells were cultured at a density of 0.5 x 10 6 /mL medium per well in a 24-well plate at 37°C, 5% CO 2 . After 24 hours, when T cells had blasted, they were transduced with viruses at a multiplicity of infection (MOI) of 5 based on the titer of the upstream CAR. T cells began dividing in a logarithmic growth pattern monitored by measuring cells per ml, and T cells were diluted with fresh medium every two days, debeaded, and collected for further analysis at
Поверхностную экспрессию CAR для BCMA и CAR для CD19 оценивали путем измерения % CAR и MFI (средней интенсивности флуоресценции) в день 8 с использованием анализов методом проточной цитометрии клеток, окрашенных с помощью rBCMA_Fc-AF647 и антиидиотипического антитела к duCD19.1 (PE) (фиг. 4A-4C). Три вектора, кодирующие двойные CAR, содержащие R1G5, R1B6 или PI61, приводили к сходной процентной доле клеток, дважды положительных по CAR (~ 10%), при этом конструкция 236 (R1G5/duCD19.1) демонстрировала наиболее высокие уровни MFI для CAR для BMCA и CD19 (фиг. 4A). Моно-duCD19.1 (конструкция 244) демонстрирует наиболее высокую MFI для CAR19 среди различных конструкций (фиг. 4B).Surface expression of BCMA CAR and CD19 CAR was assessed by measuring % CAR and MFI (mean fluorescence intensity) at
Оценивание функциональных свойств продукта на основе Т-клеток, перенаправленных с помощью двойного CAR для BCMA/CD19, в D8 in vitro и in vivoEvaluation of the functional properties of a BCMA/CD19 dual CAR T cell product in D8 in vitro and in vivo
Для оценивания противоопухолевой эффективности каждого из CAR в CAR-T-клетках с двойной специфичностью к BCMA/CART подготавливали совместные культуры с BCMA-положительными (KMS11), CD19-положительными (NALM6) и BCMA/CD19-отрицательными линиями раковых клеток (CD19KO; полученная из NALM6). CAR-T-клетки размораживали, подсчитывали и культивировали совместно с клетками-мишенями для регистрации их способностей к уничтожению и секреции цитокинов. Нетрансдуцированные Т-клетки (UTD) использовали в качестве контрольных ненацеливающихся Т-клеток.To evaluate the antitumor efficacy of each CAR, BCMA/CART dual-specific CAR-T cells were cocultured with BCMA-positive (KMS11), CD19-positive (NALM6), and BCMA/CD19-negative cancer cell lines (CD19KO; derived from NALM6). CAR-T cells were thawed, counted, and cocultured with target cells to detect their killing and cytokine secretion capabilities. Untransduced T cells (UTD) were used as control non-targeting T cells.
Анализ цитотоксичности in vitro выполняли путем совместного культивирования CAR-T-клеток с клетками-мишенями, экспрессирующими люциферазу, при различных соотношениях E:T в течение 20 часов. Популяции CAR-T-клеток нормализовали по эквивалентным процентным долям CAR-положительных клеток перед посевом в соответствии с CAR, направленным на соответствующую опухоль (т. е. проводили нормализацию на основании CAR для BCMA, когда CAR-T культивировали совместно с клетками KMS11; и нормализацию на основании CAR19, когда CAR-T культивировали совместно с NALM6). Цитокин IFNγ измеряли в надосадочных жидкостях 20-часовых совместных культур, соответствующих целевому соотношению 1,25:1 или 2,5:1 (CAR-T-клетки:клетки-мишени), с использованием Meso Scale Discovery (MSD; Гейтерсберг, Мэриленд). Результаты рассчитывали в пг/мл с использованием известных стандартов. Все анализы выполняли в двух повторностях из одного источника донорских клеток. Данные об уничтожении показывают, что все двойные клоны CAR были эффективными в отношении BCMA-положительных клеток KMS11 и CD19-положительных клеток Nalm6 (фиг. 5A и 5B соответственно). В отношении BCMA/CD19-отрицательных опухолевых клеток наблюдался только фоновый уровень уничтожения (фиг. 5C). Способность этих клеток с двойными CAR продуцировать IFNγ при совместном культивировании с KMS11 или Nalm6 была сходной при оценке с использованием двух разных соотношений E:T (фиг. 6A-6D).In vitro cytotoxicity assays were performed by co-culture of CAR-T cells with luciferase-expressing target cells at various E:T ratios for 20 h. CAR-T cell populations were normalized to equivalent percentages of CAR-positive cells prior to seeding according to the CAR targeting the respective tumor (i.e., normalized to CAR for BCMA when CAR-T was co-cultured with KMS11 cells; and normalized to CAR19 when CAR-T was co-cultured with NALM6). The cytokine IFNγ was measured in supernatants of 20-h co-cultures corresponding to a target ratio of 1.25:1 or 2.5:1 (CAR-T:target cells) using Meso Scale Discovery (MSD; Gaithersburg, MD). Results were calculated in pg/mL using known standards. All assays were performed in duplicate from a single donor cell source. Killing data showed that all dual CAR clones were effective against BCMA-positive KMS11 cells and CD19-positive Nalm6 cells (Figs. 5A and 5B, respectively). Only background killing was observed against BCMA/CD19-negative tumor cells (Fig. 5C). The ability of these dual CAR cells to produce IFNγ when co-cultured with KMS11 or Nalm6 was similar when assessed using two different E:T ratios (Figs. 6A-6D).
Противоопухолевую активность этих CAR-T в D8 in vivo анализировали с использованием смешанной ксенотрансплантатной модели опухоли (5% Nalm6 и 95% KMS11) у мышей NSG.The antitumor activity of these CAR-Ts at D8 in vivo was analyzed using a mixed xenograft tumor model (5% Nalm6 and 95% KMS11) in NSG mice.
Получение и измерение CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19 дня 1 с использованием способа быстрого изготовления с активацией (ARM)Generation and Measurement of
В некоторых вариантах осуществления этот способ ARM начинали с замороженного или свежего продукта лейкафереза. После получения образца для подсчета и QC продукт соединяли с устройством для сортировки клеток (например, установленным набором устройства CliniMACS Prodigy) и запускали программу. Клетки промывали и инкубировали с микрогранулами, которые связываются с требуемыми поверхностными маркерами, такими как CD4 и CD8. Меченные гранулами клетки отбирали путем пропускания клеток через магнитную колонку. Выделенные клетки снова промывали, и среды для клеток заменяли буфером для разделения. Очищенные Т-клетки затем переносили в культуру либо криоконсервировали для последующего применения. Чистота выделенных T-клеток проходила стадию QC посредством оценки с помощью проточной цитометрии. Криоконсервированные клетки размораживали, промывали в предварительно нагретых средах для клеток и ресуспендировали в средах для клеток. Свежие клетки добавляли непосредственно в культуру. Клетки высевали в мембранные биореакторы при 0,4-1,2e6 клеток/см2 мембраны, добавляли активирующий реагент, такой как гранулы/полимеры, содержащие антитела к CD3/CD28, наночастицы или коллоидные наносистемы, и среды для клеток добавляли в конечном объеме 0,25-2 мл/см2 мембраны. Для исследования кинетических показателей экспрессии CAR in vitro использовали 24-луночный GRex. Использовали GRex 100, колбу или CentriCult для тестирования масштабируемости этого способа изготовления и для тестирования противоопухолевой эффективности in vivo. Во время посева клетки подвергали трансдукции с помощью лентивирусного вектора, кодирующего двойной CAR для BCMA/CD19, при множественности заражения (MOI), составляющей 1 или 2. MOI определяли на основании титра вируса, полученного в клетках SupT1, исходя из титра для CAR, сконструированного выше последовательности 2A. Через 24 часа клетки промывали для удаления ненужных реагентов перед окрашиванием для измерения уровня экспрессии CAR с помощью проточной цитометрии и повторно составляли в среде для криоконсервации в виде "продукта на основе CAR-T дня 1" для исследования in vivo. Во всех случаях аликвоту клеток собирали через 72 часа после трансдукции для измерения кинетических показателей экспрессии CAR in vitro. Ответы, обеспечиваемые CAR-T дня 1, включают без ограничения цитолитическую активность и размножение in vivo.In some embodiments, the ARM method was initiated with a frozen or fresh leukapheresis product. After obtaining a sample for counting and QC, the product was connected to a cell sorting device (e.g., a CliniMACS Prodigy device kit) and the program was started. The cells were washed and incubated with microbeads that bind to desired surface markers, such as CD4 and CD8. Bead-labeled cells were selected by passing the cells through a magnetic column. The isolated cells were washed again and the cell media was replaced with separation buffer. The purified T cells were then transferred to culture or cryopreserved for subsequent use. The purity of the isolated T cells was assessed by flow cytometry for a QC step. The cryopreserved cells were thawed, washed in pre-warmed cell media, and resuspended in cell media. Fresh cells were added directly to the culture. Cells were seeded in membrane bioreactors at 0.4-1.2e6 cells/ cm2 of membrane, an activating reagent such as beads/polymers containing CD3/CD28 antibodies, nanoparticles or colloidal nanosystems was added and cell media was added in a final volume of 0.25-2 ml/ cm2 of membrane. A 24-well GRex was used to study the kinetics of CAR expression in vitro . A
На фиг. 7A-7B показан паттерн экспрессии CAR как для BCMA, так и для CD19 через 24 часа и 72 часа после трансдукции первичных Т-клеток человека, изготовленных с использованием способа ARM, при использовании MOI, составляющей 1, исходя из титра в SupT1, определяемого по экспрессии только вышерасположенного CAR. Через двадцать четыре часа после трансдукции при анализе методом проточной цитометрии наблюдалось, что вся популяция живых CD3+ T-клеток смещалась вправо в разной степени (фиг. 7A). Этот паттерн экспрессии отличался от типичных гистограмм проточной цитометрии клеток, трансдуцированных таким образом, чтобы они экспрессировали CAR, где CAR-положительная популяция четко отделяется от отрицательной популяции. Эти данные позволяют предположить, что "псевдотрансдукция или транзиентная экспрессия" может быть выявлена с помощью реагента для окрашивания в проточной цитометрии rBCMA_Fc. Ранее сообщалось, что лентивирусная псевдотрансдукция наблюдалась от момента добавления вектора и до 24 часов в CD34+ клетках и вплоть до 72 часов в клетках 293 (Haas DL, et al. Mol Ther. 2000. 291: 71-80). Дефектный по интегразе лентивирусный вектор вызывал транзиентную экспрессию eGFP в течение вплоть до 10 дней в CD34+клетках и в течение вплоть до 14 дней в клетках 293. Хотя наблюдаемая экспрессия CAR в день 1 после трансдукции Т-клеток может потенциально объясняться псевдотрансдукцией, в день 3, однако, появлялись две четко выраженные популяции, одна из которых была положительной по rBCMA_Fc, а другая была положительной по антиидиотипическому антителу к duCD19.1 (фиг. 7B и фиг. 7C). Более того, 20-30% клеток были моно-BCMA-CAR-положительными (CD19-CAR-отрицательными) среди клеток, сконструированных с использованием двойных конструкций c235, c236, c237 и c238 (фиг. 7C). В целом, эти результаты демонстрируют, что оба CAR хорошо экспрессировались в системе CAR-T с двойной специфичностью при использовании R1G5, R1B6 и PI61 в комбинации с duCD19.1. 72 часа после вирусной трансдукции могут служить в качестве суррогатного момента времени для измерения экспрессии CAR для определения стратегии введения доз in vivo.Figures 7A-7B show the CAR expression pattern for both BCMA and CD19 at 24 and 72 hours post-transduction of primary human T cells made using the ARM method using an MOI of 1 based on the titer in SupT1 determined by expression of the upstream CAR alone. Twenty-four hours post-transduction, flow cytometric analysis showed that the entire live CD3+ T cell population was shifted to the right to varying degrees (Figure 7A). This expression pattern was in contrast to typical flow cytometric histograms of cells transduced to express CAR, where the CAR-positive population is clearly separated from the negative population. These data suggest that "pseudotransduction or transient expression" can be detected using the rBCMA_Fc flow cytometric staining reagent. It has been previously reported that lentiviral pseudotransduction was observed from vector addition for up to 24 hours in CD34+ cells and up to 72 hours in 293 cells (Haas DL, et al. Mol Ther. 2000. 291: 71-80). Integrase-deficient lentiviral vector induced transient eGFP expression for up to 10 days in CD34+ cells and for up to 14 days in 293 cells. Although the observed CAR expression on
Оценивание функциональных свойств in vivo BCMA-CAR-T дня 1, обработанных с помощью ARMEvaluation of in vivo functional properties of
CAR-T дня 1, полученные с помощью системы с использованием CentriCult или колбы, изучали в отношении их противоопухолевой активности in vivo с использованием трех мышиных моделей: модели диссеминированной множественной миеломы из KMS-11-luc (BCMA+ CD19-), ксенотрансплантатной мышиной модели из Nalm6-Luc (CD19+ BCMA-) и смешанной модели из 95% клеток KMS-luc и 5% клеток NALM6-Luc. Данное исследование in vivo имело три цели: (1) продемонстрировать эффективность плеч как для BCMA, так и для CD19 в CAR-T с двойной специфичностью; (2) сравнить смешанную модель (содержащую BCMA+ опухолевые клетки и CD19+ опухолевые клетки) с моделью множественной миеломы из KMS-11-luc (BCMA+ CD19-), чтобы понять потенциальную активацию CAR-T с двойной специфичностью посредством мишени CD19; и (3) протестировать CAR-T с двойной специфичностью в модели только из Nalm6 (CD19+ BCMA-), чтобы изучить активность плеча для CD19. Измерения методом BLI проводили дважды в неделю. Отбирали периферическую кровь в дни 6, 13, 20 и 27 для анализа методом проточной цитометрии. Плазму крови собирали в вышеуказанные дни, а также в день 2 для анализа цитокинов. План исследования и информация о дозах обобщены в таблице 30.
CAR-T с двойной специфичностью обеспечивали очистку от смешанных опухолей (BCMA+ CD19+) при дозе 5e4 и ингибировали, но не полностью устраняли, опухоли при дозе 1e4 на протяжении всего исследования (фиг. 8C). Ни PI61, ни CTL119 не могли контролировать смешанную опухоль (фиг. 8C). Обе двойные c236 и c238 демонстрировали сходную или более высокую эффективность по сравнению с их моноаналогами в моделях KMS11 и Nalm6 (фиг. 8A и 8B). В ходе исследования масса тела увеличивалась во всех трех моделях (фиг. 9A-9C). В конце исследования для KMS11 и NALM6 наблюдалось небольшое снижение, возможно, вследствие GVHD.Dual-specificity CAR-T cells cleared mixed tumors (BCMA+ CD19+) at 5e4 and inhibited, but did not completely eliminate, tumors at 1e4 throughout the study (Fig. 8C). Neither PI61 nor CTL119 could control mixed tumors (Fig. 8C). Both dual c236 and c238 cells demonstrated similar or greater efficacy than their single-specific counterparts in the KMS11 and Nalm6 models (Figs. 8A and 8B). Body weight increased in all three models over the course of the study (Figs. 9A–9C). At the end of the study, a slight decline was observed for KMS11 and NALM6, possibly due to GVHD.
Размножение Т-клеток происходило с дня 6 по день 20, а затем их численность выравнивалась с дня 20 по день 27 (фиг. 10A-10C). Размножение было связано с дозой во всех трех моделях (фиг. 11A-11C). Модель KMS11 демонстрировала в 3-4 раза более интенсивное размножение по сравнению со смешанной моделью при более высоких дозах (фиг. 10A и 10C). Двойные c236 и c238 демонстрировали более интенсивное размножение, чем моно-CAR-T (фиг. 10A-10C).T cell expansion occurred from
Общая процентная доля BCMA-CAR+ достигала пикового значения в день 13, а затем начинала уменьшаться до дня 27 включительно (фиг. 11A-11C). В смешанной модели группы 5e4 демонстрировали более низкие процентные доли BCMA-CAR+ по сравнению с группами 1e4 после дня 13 (фиг. 11C). Процентная доля дважды CAR+ была связана с притоком общей популяции CD3+ клеток, что могло быть возможным признаком GVHD. Размножение дважды BCMA/CD19-CAR+ T-клеток наблюдалось в группах Rx CAR-T c236 и c238 во всех трех моделях (фиг. 12A-12C).The overall BCMA-CAR+ percentage peaked at
Индукция IFNγ зависела от дозы во всех моделях (фиг. 13A-13C). Двойные конструкции при обеих дозах приводили к продуцированию в 3-4 раза большего количества IFNγ на пиковом уровне в смешанной модели, чем в модели с KMS11 в отдельности (фиг. 13A и 13C). Пик индукции наблюдался в течение 13 дней в большинстве групп во всех моделях (пики в день 20 и день 27 по всей вероятности были обусловлены GVHD) (фиг. 13A-13C).IFNγ induction was dose dependent in all models (Figs. 13A–13C). Dual constructs at both doses produced 3- to 4-fold more IFNγ at peak in the mixed model than in the KMS11 model alone (Figs. 13A and 13C). Peak induction was observed within 13 days in most groups in all models (peaks at
В отдельном исследовании CAR-T дня 1, полученные с помощью GRex 100 и 6-луночной системы GRex, изучали в отношении их противоопухолевой активности in vivo с использованием модели диссеминированной множественной миеломы из KMS-11-luc. Репортер люцифераза позволяет проводить мониторинг бремени заболевания посредством количественной биолюминесцентной визуализации (BLI). Вкратце, CAR-T дня 1, изготовленные согласно описанному выше, вводили мышам, несущим опухоль. Еженедельно отбирали образцы крови для измерения размножения CAR-T в периферической крови и анализировали с помощью проточной цитометрии. Т-клетки, сконструированные с использованием конструкции № 236 и конструкции № 238, демонстрировали сильную противоопухолевую активность (фиг. 14A) и хорошее размножение CAR-T (фиг. 14B) in vivo в модели KMS11 (BCMA+ CD19-).In a separate study,
Пример 3. Определение характеристик CAR-T в формате диателаExample 3. Characterization of CAR-T in diabody format
В данном примере описано определение характеристик CAR JL1 - JL10 в формате диатела. JL1 - JL8 представляют собой конструкции диател PI61/CTL119, а JL9 - JL10 представляют собой конструкции диател R1G5/CTL119. Информация о последовательностях JL1 - JL10 раскрыта в таблице 31.This example describes the characterization of CARs JL1 - JL10 in diabody format. JL1 - JL8 are PI61/CTL119 diabody constructs, and JL9 - JL10 are R1G5/CTL119 diabody constructs. Sequence information for JL1 - JL10 is disclosed in Table 31.
Получение и измерение CAR-T в формате диател к BCMA/CD19 дня 1 с использованием способа быстрого изготовления с активацией (ARM)Generation and Measurement of
В некоторых вариантах осуществления этот способ ARM начинали с замороженного или свежего продукта лейкафереза. После получения образца для подсчета и QC продукт соединяли с устройством для сортировки клеток (например, установленным набором устройства CliniMACS Prodigy) и запускали программу. Клетки промывали и инкубировали с микрогранулами, которые связываются с требуемыми поверхностными маркерами, такими как CD4 и CD8. Меченные гранулами клетки отбирали путем пропускания клеток через магнитную колонку. Выделенные клетки снова промывали, и среды для клеток заменяли буфером для разделения. Очищенные Т-клетки затем переносили в культуру либо криоконсервировали для последующего применения. Чистота выделенных T-клеток проходила стадию QC посредством оценки с помощью проточной цитометрии. Криоконсервированные клетки размораживали, промывали в предварительно нагретых средах для клеток и ресуспендировали в средах для клеток. Свежие клетки добавляли непосредственно в культуру. Аликвоты замороженной общей популяции выделенных Т-клеток размораживали на водяной бане при 37°C, помещали в Optimizer CM (среду Gibco Optimizer с добавлением+100 ед/мл IL2 человека) и центрифугировали в течение 5 минут при 1500 оборотах в минуту. Клетки подсчитывали и высевали в 24-луночный планшет при 3e6/мл, 1 мл/лунка. В каждую лунку добавляли TransAct при 1/100 (10 мкл/лунка).In some embodiments, the ARM method was initiated with a frozen or fresh leukapheresis product. After obtaining a sample for counting and QC, the product was connected to a cell sorting device (e.g., a CliniMACS Prodigy device kit) and the program was started. The cells were washed and incubated with microbeads that bind to desired surface markers, such as CD4 and CD8. Bead-labeled cells were selected by passing the cells through a magnetic column. The isolated cells were washed again and the cell media was replaced with separation buffer. The purified T cells were then transferred to culture or cryopreserved for subsequent use. The purity of the isolated T cells was assessed by flow cytometry for a QC step. The cryopreserved cells were thawed, washed in pre-warmed cell media, and resuspended in cell media. Fresh cells were added directly to the culture. Aliquots of frozen total T cell population isolated were thawed in a 37°C water bath, placed in Optimizer CM (Gibco Optimizer medium supplemented with 100 U/ml human IL2) and centrifuged for 5 min at 1500 rpm. Cells were counted and seeded into 24-well plates at 3e6/ml, 1 ml/well. TransAct was added to each well at 1/100 (10 µl/well).
Для исследования кинетических показателей экспрессии CAR in vitro в способе ARM использовали 24-луночный планшет. Во время посева клетки подвергали трансдукции с помощью лентивирусного вектора, кодирующего CAR для BCMA/CD19 в формате диатела, при множественности заражения (MOI), составляющей 2. MOI определяли на основании титра вируса, полученного в клетках SupT1, исходя из экспрессии CAR в дважды положительных клетках. После 24 часов в культуре клетки собирали и трижды промывали в PBS+1% HSA. Затем клетки подсчитывали и повторно высевали в 24-луночный планшет в конечном количестве 1e6/мл. Через 72 часа после повторного посева клетки собирали, подсчитывали, и из каждого образца отбирали аликвоту 5e5 клеток для анализа методом проточной цитометрии. Эту процедуру повторяли спустя 72 часа для момента времени, соответствующего дню седьмому.To study the kinetics of CAR expression in vitro, a 24-well plate was used in the ARM assay. At the time of seeding, cells were transduced with a lentiviral vector encoding the CAR for BCMA/CD19 in diabody format at a multiplicity of infection (MOI) of 2. The MOI was determined based on the virus titer obtained in SupT1 cells based on CAR expression in double-positive cells. After 24 h in culture, cells were harvested and washed three times in PBS+1% HSA. Cells were then counted and replated in a 24-well plate at a final number of 1e6/mL. Seventy-two hours after replating, cells were harvested, counted, and a 5e5 cell aliquot from each sample was removed for flow cytometric analysis. This procedure was repeated after 72 h for the
На фиг. 15A и 15B показан паттерн экспрессии CAR как для BCMA, так и для CD19 через 96 часов (фиг. 15A) или 7 дней (фиг. 15B) после добавления вируса, кодирующего диатело, в первичные Т-клетки человека, изготовленные с использованием способа ARM, при использовании MOI, составляющей 2. В целом, эти результаты демонстрируют, что оба CAR хорошо экспрессировались в системе CAR-T в формате диатела при использовании R1G5 или PI61 в комбинации с duCD19.1 в день 4 (фиг. 15A) или день 7 (фиг. 15B) после добавления вируса. JL1 - JL4, JL9 и JL10 демонстрировали линейную экспрессию CAR в дважды положительных клетках, тогда как JL5 - JL8 демонстрировали небольшое смещение в сторону CD19+ популяции, что может быть обусловлено различиями в связывании CAR с соответствующими реагентами для выявления. Здесь показаны данные одного из двух доноров.Figures 15A and 15B show the CAR expression pattern for both BCMA and CD19 96 hours (Figure 15A) or 7 days (Figure 15B) after addition of diabody-encoding virus to primary human T cells made using the ARM method using an MOI of 2. Overall, these results demonstrate that both CARs were well expressed in the diabody format CAR-T system using R1G5 or PI61 in combination with duCD19.1 at day 4 (Figure 15A) or day 7 (Figure 15B) after virus addition. JL1-JL4, JL9, and JL10 showed linear CAR expression in double-positive cells, while JL5-JL8 showed a slight bias toward the CD19+ population, which may be due to differences in CAR binding to the respective detection reagents. Shown here is data from one of two donors.
Получение CAR-T-клеток с использованием способа традиционного изготовленияProducing CAR-T cells using a traditional manufacturing method
Способ традиционного изготовления (TM) представляет собой способ, при котором Т-клетки размножают ex vivo в течение 8-9 дней после активации и трансдукции перед сбором. Обработанные в Prodigy Т-клетки ресуспендировали в теплой полной среде для Т-клеток RPMI (RPMI, 10% инактивированной нагреванием FBS, 2 мМ L-глутамина, 100 ед/мл пенициллина/стрептомицина, 1x NEAA, 1 мМ пирувата натрия, 10 мМ HEPES и 55 мкМ β-меркаптоэтанола) и высевали в 24-луночные планшеты при 0,5e6 клеток/мл на лунку. T-клетки инкубировали в течение ночи при 37°C с гранулами Human T-Expander CD3/CD28 при соотношении гранул и клеток, составляющем 3:1.The Traditional Manufacturing (TM) method is a method in which T cells are expanded ex vivo for 8-9 days after activation and transduction prior to harvest. Prodigy-treated T cells were resuspended in warm RPMI T cell complete medium (RPMI, 10% heat-inactivated FBS, 2 mM L-glutamine, 100 U/mL penicillin/streptomycin, 1x NEAA, 1 mM sodium pyruvate, 10 mM HEPES, and 55 μM β-mercaptoethanol) and seeded in 24-well plates at 0.5e 6 cells/mL per well. T cells were incubated overnight at 37°C with Human T-Expander CD3/CD28 beads at a bead to cell ratio of 3:1.
В день 1 добавляли лентивирусы при MOI, составляющей 5, исходя из титра в SUP-T1. Вирус не добавляли в нетрансдуцированный контроль (UTD). T-клетки инкубировали в течение ночи при 37°C с последующим добавлением 1 мл полной среды для Т-клеток на лунку, после чего их инкубировали в течение ночи при 37°C. В течение оставшихся шести дней размножения культуры T-клетки переносили в колбы для тканевых культур и разбавляли полной средой для Т-клеток каждые два дня, добиваясь концентрации 0,5e6 клеток/мл. Типичные коэффициенты разведения находились в диапазоне от 1:2 до 1:4 на протяжении фазы размножения.On
В день 7 от T-клеток удаляли гранулы, и их собирали и криоконсервировали в замораживающей среде CryoStor CS10, замораживали при -80°C в контейнерах для замораживания клеток CoolCell (BioCision) и переносили в LN2 на следующий день. Небольшие аликвоты T-клеток окрашивали для выявления экспрессии CAR. Одноцветные контроли были включены для компенсации. Образцы измеряли на проточном цитометре (BD LSRFortessa), и данные анализировали с помощью программного обеспечения FlowJo.On
На фиг. 16 показана экспрессия CAR в день 7 в способе ТМ с использованием MOI, составляющей 5. Продукты TM демонстрировали паттерн экспрессии, сходный с таковым у продуктов ARM (фиг. 15A, 15B и 16).Figure 16 shows CAR expression at
Анализ уничтожения in vitroIn vitro killing assay
Потенциал уничтожения Т-клеток, сконструированных с различными конструкциями диател, в ответ на клетки-мишени, экспрессирующие BCMA или CD19, оценивали путем инкубирования CAR-T-клеток с клетками-мишенями при соотношениях E:T с 2-кратными разведениями, начиная с 20:1. Количество клеток-мишеней фиксировали при 2,5×105 клеток/лунка, и клетки культивировали в 96-луночных плоскодонных планшетах. Эффекторные клетки представляли собой CAR-T-клетки, полученные посредством традиционного изготовления путем трансдукции Т-клеток с помощью диател. Клетки-мишени включают BCMA-положительные клетки KMS11-luc или BCMA-отрицательные клетки NALM6-luc. Для данного анализа % трансдукции CAR-T-клеток нормализовали путем добавления UTD к BCMA-CAR-T. Это позволяло проводить сравнение одного и того же количества CAR-T и одного и того же общего количества Т-клеток в каждом образце.The killing potential of T cells engineered with different diabody constructs in response to BCMA- or CD19-expressing target cells was assessed by incubating CAR-T cells with target cells at 2-fold dilutions of E:T ratios starting at 20:1. Target cell numbers were fixed at 2.5 x 105 cells/well and cells were cultured in 96-well flat-bottomed plates. Effector cells were CAR-T cells generated by conventional diabody-mediated T cell transduction manufacturing. Target cells included BCMA-positive KMS11-luc cells or BCMA-negative NALM6-luc cells. For this assay, % CAR-T cell transduction was normalized by adding UTD to BCMA-CAR-T. This allowed comparisons to be made between the same number of CAR-T and the same total number of T cells in each sample.
Потерю сигнала люциферазы в результате уничтожения клеток измеряли с использованием субстрата Bright-Glo через 16 часов после высевания клеток, а специфический лизис рассчитывали по следующей формуле:The loss of luciferase signal due to cell killing was measured using Bright-
специфичный лизис (%)=100 - (люминесценция образца/средняя максимальная люминесценция) * 100.specific lysis (%) = 100 - (sample luminescence/average maximum luminescence) * 100.
На фиг. 17A и 17B продемонстрирована способность различных диател PI61/CTL119 эффективно уничтожать специфические линии клеток-мишеней NALM-6 (CD19+, BCMA-) (фиг. 17A) или KMS-11 (CD19-, BCMA+) (фиг. 17B). Данные позволяют предположить, что клоны JL6, JL5, JL3 и JL8 в равной степени уничтожали оба типа клеток-мишеней.Figures 17A and 17B demonstrate the ability of different PI61/CTL119 diabodies to efficiently kill specific target cell lines NALM-6 (CD19+, BCMA-) (Figure 17A) or KMS-11 (CD19-, BCMA+) (Figure 17B). The data suggest that clones JL6, JL5, JL3, and JL8 killed both target cell types equally.
Анализ секреции цитокиновAnalysis of cytokine secretion
Собирали надосадочные жидкости из совместных культур (соотношение 1,25:1), использованных в вышеприведенном анализе уничтожения, после 20 часов инкубирования для использования в V-плексном анализе MSD с IFNγ и IL-2 человека. Наблюдалась разная величина специфичной для мишени индукции IFNγ или IL-2 клетками, трансдуцированными диателом, в ответ на стимуляцию клетками KMS11 или NALM6 (фиг. 18A и 18B). Клетки UTD не демонстрировали какую-либо неспецифичную секрецию IFNγ. в ответ на любые клетки-мишени (фиг. 18А). Сообразно результатам анализа уничтожения клоны JL6, JL5, JL3 и JL8 продуцировали больше цитокинов в ответ на клетки-мишени (фиг. 18A и 18B).Supernatants from the co-cultures (1.25:1 ratio) used in the above killing assay were collected after 20 h of incubation for use in the MSD V-plex assay with human IFNγ and IL-2. Different magnitudes of target-specific IFNγ or IL-2 induction were observed by diabody-transduced cells in response to stimulation with KMS11 or NALM6 cells (Fig. 18A and 18B). UTD cells did not show any non-specific IFNγ secretion in response to any target cells (Fig. 18A). Consistent with the killing assay results, clones JL6, JL5, JL3, and JL8 produced more cytokines in response to target cells (Fig. 18A and 18B).
Пример 4. Котрансдукция CAR для BCMA и CAR для CD19Example 4. Cotransduction of CAR for BCMA and CAR for CD19
Аликвоты замороженной общей популяции выделенных Т-клеток размораживали на водяной бане при 37°C, помещали в Optimizer CM (среду Gibco Optimizer с добавлением+100 ед/мл IL2 человека) и центрифугировали в течение 5 минут при 1500 оборотах в минуту. Клетки подсчитывали и высевали в 24-луночный планшет при 3e6/мл, 1 мл/лунка. В каждую лунку добавляли TransAct при 1/100 (10 мкл/лунка). Добавляли вирус при разных значениях множественности заражения (MOI), исходя из титра в SupT1 для PI61 либо титра, определенного с помощью qPCR, для CTL119. PI61 использовали при MOI, составляющей 2 или 1, и задействовали в паре с тремя разными MOI для CTL119: 1, 0,5 и 0,25. Добавляли моно-CAR при MOI, составляющей 1 или 2 для PI61 и 1 для CTL119, а также высевали контроль UTD. После 24 часов в культуре клетки собирали и трижды промывали в PBS+1% HSA. Затем клетки подсчитывали и повторно высевали в 24-луночный планшет в конечном количестве 1e6/мл.Aliquots of frozen total isolated T cells were thawed in a 37°C water bath, placed in Optimizer CM (Gibco Optimizer medium supplemented with 100 U/ml human IL2) and centrifuged for 5 min at 1500 rpm. Cells were counted and seeded into 24-well plates at 3e6/ml, 1 ml/well. TransAct was added to each well at 1/100 (10 μl/well). Virus was added at different multiplicities of infection (MOI) based on SupT1 titer for PI61 or qPCR titer for CTL119. PI61 was used at an MOI of 2 or 1 and paired with three different MOIs for CTL119: 1, 0.5, and 0.25. Mono-CAR was added at an MOI of 1 or 2 for PI61 and 1 for CTL119, and a UTD control was also plated. After 24 h in culture, cells were harvested and washed three times in PBS+1% HSA. Cells were then counted and replated in a 24-well plate at a final density of 1e6/ml.
Через 72 часа после повторного посева клетки собирали, подсчитывали, и из каждого образца отбирали аликвоту 5e5 клеток для анализа методом проточной цитометрии. Клетки окрашивали с помощью LIVE/DEAD Aqua (BV510) в течение 15 минут в 100 мкл/лунка и затем дважды промывали. Затем добавляли антитело к MM (таблица 32) в количестве 50 мкл/лунка в течение 25 минут при 4°C. Клетки промывали еще два раза, а затем фиксировали в течение 15 минут в 1,6% PFA в PBS, 100 мкл/лунка. После фиксации клетки промывали, как описано ранее, и ресуспендировали в конечном объеме 150 мкл/образец в буфере для проточной цитометрии. Для каждого образца получали 5e4 клеток в гейте по живым CD3-положительным клеткам на BD LSRFortessa (BD Biosciences, Сан-Хосе, Калифорния), и данные анализировали с использованием программного обеспечения FlowJo v.10 (Эшленд, Орегон). Эту процедуру повторяли спустя 72 часа для момента времени, соответствующего дню седьмому.After 72 hours of replating, cells were harvested, counted, and an aliquot of 5e5 cells from each sample was removed for flow cytometric analysis. Cells were stained with LIVE/DEAD Aqua (BV510) for 15 min at 100 μl/well and then washed twice. Anti-MM antibody (Table 32) was then added at 50 μl/well for 25 min at 4°C. Cells were washed two more times and then fixed for 15 min in 1.6% PFA in PBS, 100 μl/well. After fixation, cells were washed as described previously and resuspended in a final volume of 150 μl/sample in flow cytometry buffer. For each sample, 5e4 cells were gated for live CD3-positive cells on a BD LSRFortessa (BD Biosciences, San Jose, CA), and data were analyzed using FlowJo v.10 software (Ashland, OR). This procedure was repeated 72 hours later for the
DEADLIVE/
DEAD
В день четвертый после добавления вируса анализ методом проточной цитометрии показал значительно более высокие процентные доли моно-BCMA-CAR+ популяции по сравнению с CAR19-положительной популяцией и дважды CAR-положительной популяцией в условиях MOI, составляющей 2, в случае CAR для BCMA (фиг. 19 и 20). Эти результаты были согласующимися для обоих доноров. При добавлении PI61 при MOI, составляющей 1, наблюдалось хорошее титрование всех популяций (фиг. 19 и 20). CAR19+ популяция, а также дважды CAR+ популяция уменьшались по мере уменьшения MOI в случае CAR для CD19 с 1 до 0,25 (фиг. 19). BCMA-CAR+ популяция увеличивалась при добавлении меньшего количества вируса, кодирующего CTL119 (фиг. 19). Процентные доли общих CAR+ популяций коррелировали с общей MOI, добавленной в каждую лунку (фиг. 21). Процентные доли общих популяций с CAR для BCMA и с CAR19 также коррелировали. Все тенденции были стабильными с дня четвертого по день седьмой (фиг. 21). Жизнеспособность и скорости размножения не зависели от общей добавленной MOI (фиг. 22). Здесь показаны данные одного из четырех доноров.On
Пример 5. Описание способа быстрого изготовления с активацией (ARM)Example 5. Description of the method of rapid manufacturing with activation (ARM)
В некоторых вариантах осуществления CAR-T-клетки изготавливают с использованием непрерывного способа быстрого изготовления с активацией (ARM) в течение примерно 2 дней, что будет потенциально позволять получить большее количество менее дифференцированных Т-клеток (необученных T-клеток и TSCM-клеток (стволовых T-клеток центральной памяти)), подлежащих возвращению пациенту для размножения клеток in vivo. Короткий период времени изготовления позволяет T-клеткам с профилем ранней дифференцировки пролиферировать в организме до их требуемого конечного дифференцированного состояния, а не в сосуде для культивирования ex vivo.In some embodiments, CAR-T cells are manufactured using a continuous rapid activation manufacturing (ARM) process over about 2 days, which will potentially allow for the production of a larger number of less differentiated T cells (naive T cells and T SCM (central memory T stem cells)) to be returned to the patient for in vivo cell expansion. The short manufacturing time allows T cells with an early differentiation profile to proliferate in the body to their desired final differentiated state, rather than in an ex vivo culture vessel.
В некоторых вариантах осуществления CAR-T-клетки изготавливают с использованием криоконсервированного исходного материала, полученного путем лейкафереза, например, материала немобилизованной аутологичной периферической крови, полученного путем лейкафереза (LKPK). Криоконсервированный исходный материал подвергают стадиям обработки для обогащения Т-клетками в первый день получения (день 0) с помощью иммуномагнитной системы, содержащей антитела к CD4/CD8. Положительную фракцию затем высевают в сосуд для культивирования GRex, активируют с помощью системы, содержащей антитела к CD3/CD28 (TransAct), и в тот же день подвергают трансдукции с помощью лентивирусного вектора (LV), кодирующего CAR. На следующий день, спустя 20-28 часов трансдукции, T-клетки собирают, промывают четыре раза, составляют в замораживающей среде и затем замораживают с помощью программируемого криозамораживателя (CRF). От начала способа в день 0 до начала сбора на следующий день клетки культивируют в течение 20-28 часов с целевым временем культивирования, составляющем 24 часа после высевания в день 0.In some embodiments, CAR T cells are prepared using cryopreserved leukapheresis-derived starting material, such as unmobilized autologous peripheral blood leukapheresis (LKPK) material. The cryopreserved starting material is subjected to T cell enrichment processing steps on the first day of preparation (day 0) using an immunomagnetic system containing CD4/CD8 antibodies. The positive fraction is then seeded in a GRex culture vessel, activated using an anti-CD3/CD28 antibody system (TransAct), and transduced with a lentiviral vector (LV) encoding a CAR on the same day. The following day, after 20-28 hours of transduction, the T cells are harvested, washed four times, formulated in freezing medium, and then frozen using a programmable cryofreezer (CRF). From the start of the method on
Среды для дня 0 получали в соответствии с таблицей 21.
Криоконсервированный материал, полученный путем лейкафереза, размораживают. Размороженные клетки разбавляют с помощью буфера для способа быстрого изготовления (таблица 21) и промывают на устройстве CliniMACS® Prodigy®. Т-клетки отбирают с помощью микрогранул CliniMACS® с антителами к CD4 и CD8. После завершения программы отбора Т-клеток (примерно от 3 ч. 40 мин. до 4 ч. 40 мин.) мешок для повторного применения, содержащий клетки, суспендированные в среде для способа быстрого изготовления (таблица 21), переносят в пакет для переноса. Отбирают образец для оценки жизнеспособности и количества клеток. Данные о количестве и жизнеспособности клеток из положительной фракции в мешке используют для определения концентрации клеток при высевании в сосуд для культивирования для активации и трансдукции вектором.The cryopreserved material obtained by leukapheresis is thawed. Thawed cells are diluted with Rapid Method Buffer (Table 21) and washed on a CliniMACS® Prodigy® device. T cells are selected with CliniMACS® anti-CD4 and anti-CD8 beads. After completion of the T cell selection program (approximately 3
После положительного отбора T-клеток с помощью микрогранул CliniMACS® (с антителами к CD4 и CD8) клетки высевают в сосуд для культивирования G-Rex. После высевания клеток затем добавляют реагент для активации (TransAct) в сосуд для культивирования. Клетки затем подвергают трансдукции с помощью лентивирусного вектора, кодирующего CAR, при целевой MOI, составляющей 1,0 (0,8-1,2). После добавления вектора сосуд для культивирования транспортируют в инкубатор, где его инкубируют в течение целевого времени, составляющего 24 часа (рабочий диапазон 20-28 часов), при номинальной температуре 37°C (рабочий диапазон 36-38°C) при номинальных 5% CO2 (рабочий диапазон 4,5-5,5%). После инкубирования клетки промывают с помощью раствора для промывания собранного материала (таблица 21) четыре раза для удаления любого неинтегрировашегося вектора и остаточных вирусных частиц, а также любых других примесей, связанных со способом. Затем клетки элюируют, и отбирают образец для тестирования для подсчета количества и жизнеспособности клеток, и результаты используют для определения объема, требуемого для ресуспендирования клеток, для конечного составления с помощью CryoStor® CS10. Клетки затем центрифугируют с удалением раствора для промывания собранного материала, и приступают к их криоконсервации.Following positive selection of T cells using CliniMACS® microbeads (with CD4 and CD8 antibodies), cells are seeded into a G-Rex culture vessel. Following cell seeding, activating reagent (TransAct) is then added to the culture vessel. Cells are then transduced with a lentiviral vector encoding CAR at a target MOI of 1.0 (0.8-1.2). Following vector addition, the culture vessel is transported to an incubator where it is incubated for the target time of 24 hours (working range 20-28 hours) at a nominal temperature of 37°C (working range 36-38°C) under nominal 5% CO2 (working range 4.5-5.5%). Following incubation, the cells are washed with Harvest Wash Solution (Table 21) four times to remove any unintegrated vector and residual viral particles, as well as any other process-related contaminants. The cells are then eluted and a sample is collected for testing to quantify cell numbers and viability, and the results are used to determine the volume required to resuspend the cells for final compilation with the CryoStor® CS10. The cells are then centrifuged to remove Harvest Wash Solution and cryopreserved.
В некоторых вариантах осуществления CAR, экспрессируемый в CAR-T-клетках, связывается с CD19. В некоторых вариантах осуществления IL-2, применяемый в средах для способа быстрого изготовления (RM) (таблица 21), может быть заменен на IL-15, hetIL-15 (IL-15/sIL-15Ra), IL-6 или IL-6/sIL-6Ra.In some embodiments, the CAR expressed in the CAR-T cells binds to CD19. In some embodiments, IL-2 used in the rapid manufacturing (RM) media (Table 21) may be replaced with IL-15, hetIL-15 (IL-15/sIL-15Ra), IL-6, or IL-6/sIL-6Ra.
В некоторых вариантах осуществления CAR, экспрессируемый в CAR-T-клетках, связывается с BCMA. В некоторых вариантах осуществления IL-2, применяемый в средах для способа быстрого изготовления (RM) (таблица 21), может быть заменен на IL-15, hetIL-15 (IL-15/sIL-15Ra), IL-6 или IL-6/sIL-6Ra.In some embodiments, the CAR expressed in the CAR-T cells binds to BCMA. In some embodiments, IL-2 used in the rapid manufacturing method (RM) media (Table 21) may be replaced with IL-15, hetIL-15 (IL-15/sIL-15Ra), IL-6, or IL-6/sIL-6Ra.
В некоторых вариантах осуществления CAR-Т-клетки экспрессируют двойные CAR, раскрытые в данном документе, например, двойные CAR для BCMA/CD19, раскрытые в данном документе. В некоторых вариантах осуществления CAR-Т-клетки экспрессируют CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе, например, CAR для BCMA/CD19 в формате диатела, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления CAR-Т-клетки конструируют таким образом, чтобы они экспрессировали CAR для BCMA и CAR для CD19, с помощью котрансдукции, как раскрыто в данном документе.In some embodiments, the CAR T cells express dual CARs as disclosed herein, such as the dual BCMA/CD19 CARs disclosed herein. In some embodiments, the CAR T cells express a CAR in a diabody format as disclosed herein, such as a CAR in a diabody format as disclosed herein. In some embodiments, the CAR T cells are engineered to express a CAR for BCMA and a CAR for CD19, using cotransduction as disclosed herein.
Пример 6. Изготовление CAR-T-клеток с использованием способа быстрого изготовления с активацией (ARM)Example 6: Manufacturing CAR-T cells using the Activated Rapid Manufacturing (ARM) method
Способ ARM для получения CAR-T-клеток начинается с получения сред, как указано в таблице 25.The ARM method for producing CAR-T cells begins with the preparation of media as outlined in Table 25.
Криоконсервированный продукт лейкафереза используют в качестве исходного материала и обрабатывают для обогащения Т-клетками. Документация по аферезу при ее доступности используется для определения процентной доли Т-клеток. При отсутствии данных о процентной доле Т-клеток в документации по аферезу тестирование в сигнальном флаконе проводят на поступающих криоконсервированных продуктах лейкафереза с получением целевой процентной доли Т-клеток для афереза. Результаты для процентной доли Т-клеток определяют то, как много мешков размораживается в день 0 способа ARM.Cryopreserved leukapheresis product is used as starting material and processed for T cell enrichment. Apheresis documentation, when available, is used to determine the T cell percentage. If T cell percentage data is not available in the apheresis documentation, sentinel vial testing is performed on incoming cryopreserved leukapheresis products to obtain the target T cell percentage for apheresis. The T cell percentage results determine how many bags are thawed on
Криоконсервированный продукт лейкафереза размораживают, промывают и затем подвергают отбору Т-клеток и обогащению Т-клетками с использованием технологии на основе микрогранул CliniMACS®. Жизнеспособные ядросодержащие клетки (VNC) активируют с помощью TransAct (Miltenyi) и подвергают трансдукции с помощью лентивирусного вектора, кодирующего CAR. Жизнеспособные клетки, отобранные с помощью микрогранул Miltenyi, высевают на CentriCult в Prodigy®, который представляет собой инкубационную камеру без увлажнения. Находящиеся в культуре клетки суспендируют в среде для способа быстрого изготовления, которая представляет собой среду на основе OpTmizer™ CTS™, которая содержит добавку CTS™ (ThermoFisher), GlutaMAX, IL-2 и 2% заменитель сыворотки для иммунных клеток вместе с ее компонентами, способствующими активации и трансдукции Т-клеток. Лентивирусную трансдукцию проводят один раз в день высевания после добавления TransAct к разбавленным клеткам в культуральную среду. Лентивирусный вектор будут размораживать непосредственно перед применением в день высевания в течение вплоть до 30 минут при комнатной температуре.The cryopreserved leukapheresis product is thawed, washed, and then subjected to T cell selection and T cell enrichment using CliniMACS® bead technology. Viable nucleated cells (VNCs) are activated using TransAct (Miltenyi) and transduced with a lentiviral vector encoding a CAR. Viable cells selected using Miltenyi beads are plated on a CentriCult in Prodigy®, which is a non-humidified incubation chamber. The cells in culture are suspended in Rapid Process Medium, which is OpTmizer™ CTS™-based medium containing CTS™ Supplement (ThermoFisher), GlutaMAX, IL-2, and 2% Immune Cell Serum Replacer along with its components that promote T cell activation and transduction. Lentiviral transduction is performed once on the day of plating after adding TransAct to diluted cells in the culture medium. The lentiviral vector will be thawed immediately prior to use on the day of plating for up to 30 minutes at room temperature.
От начала способа в день 0 до начала промывания и сбора культуры CAR-T-клетки культивируют в течение 20-28 часов после высевания. После культивирования суспензию клеток подвергают двум промываниям культивируемого материала и одному промыванию собранного материала в камере CentriCult (Miltenyi Biotech).From the start of the method on
После промывания собранного материала на CliniMACS® Prodigy® в день 1 из суспензии клеток отбирают образцы для определения количества и жизнеспособности жизнеспособных клеток. Суспензию клеток затем переносят в центрифугу для осаждения вручную. Надосадочную жидкость удаляют, и клеточный осадок ресуспендируют в CS10 (BioLife Solution), что приводит к составлению продукта при конечной концентрации DMSO, составляющей ~ 10,0%. Количество жизнеспособных клеток составляют в конце сбора для введения дозы. Дозы затем распределяют в отдельные мешки для криоконсервации, и отбор аналитических образцов осуществляют в криофлаконы.Following washing of the harvested material on the CliniMACS® Prodigy® on
Криоконсервированные продукты хранятся в контролируемых резервуарах для хранения с LN2 в безопасной зоне с ограниченным доступом до окончательного выпуска и транспортировки.Cryopreserved products are stored in controlled LN2 storage tanks in a secure area with limited access until final release and transport.
В некоторых вариантах осуществления CAR-Т-клетки экспрессируют двойные CAR, раскрытые в данном документе, например, двойные CAR для BCMA/CD19, раскрытые в данном документе. В некоторых вариантах осуществления CAR-Т-клетки экспрессируют CAR в формате диатела, раскрытый в данном документе, например, CAR для BCMA/CD19 в формате диатела, раскрытый в данном документе. В некоторых вариантах осуществления CAR-Т-клетки конструируют таким образом, чтобы они экспрессировали CAR для BCMA и CAR для CD19, с помощью котрансдукции, как раскрыто в данном документе.In some embodiments, the CAR T cells express dual CARs as disclosed herein, such as the dual BCMA/CD19 CARs disclosed herein. In some embodiments, the CAR T cells express a CAR in a diabody format as disclosed herein, such as a CAR in a diabody format as disclosed herein. In some embodiments, the CAR T cells are engineered to express a CAR for BCMA and a CAR for CD19, using cotransduction as disclosed herein.
Пример 7. Изготовление CAR-Т-клеток, экспрессирующих CAR для BCMA и CAR для CD19Example 7. Production of CAR T cells expressing CAR for BCMA and CAR for CD19
Способ быстрого изготовления CAR-Т-клеток начинается с получения сред, как указано в таблице 33.The rapid CAR T cell production method begins with the preparation of media as outlined in Table 33.
Добавка CTS
ICSR
GlutaMAX
Восстановленный IL-2OpTmizer CTS
CTS Supplement
ICSR
GlutaMAX
Reconstituted IL-2
HSA CliniMACS buffer (PBS with EDTA)
HSA
HSA PBS (without Mg/Ca and EDTA)
HSA
Криоконсервированный продукт лейкафереза размораживают. Размороженные клетки разбавляют с помощью буфера для способа быстрого изготовления (таблица 33) и промывают на устройстве CliniMACS® Prodigy®. Т-клетки отбирают с помощью микрогранул CliniMACS® с антителами к CD4 и CD8. После завершения программы отбора Т-клеток (примерно от 3 ч. 40 мин. до 4 ч. 40 мин.) мешок для повторного применения будет содержать клетки, суспендированные в буфере для способа быстрого изготовления (таблица 33). Отбирают образец для оценки жизнеспособности и количества клеток. Данные о количестве и жизнеспособности клеток из положительной фракции в мешке используют для определения концентрации клеток при высевании в сосуд для культивирования для активации и трансдукции вектором.The cryopreserved leukapheresis product is thawed. Thawed cells are diluted with Rapid Method Buffer (Table 33) and washed on the CliniMACS® Prodigy® device. T cells are selected using CliniMACS® anti-CD4 and anti-CD8 beads. After completion of the T cell selection program (approximately 3
После положительного отбора Т-клеток с помощью микрогранул CliniMACS® (с антителами к CD4 и CD8) клетки высевают в сосуд для культивирования CentriCult в Prodigy® при целевом количестве 4,0×108-1,0×109 всех жизнеспособных клеток при целевой концентрации приблизительно 4,0×106 жизнеспособных клеток/мл. После высевания клеток затем добавляют реагент для активации (TransAct) в сосуд для культивирования.Following positive selection of T cells using CliniMACS® microbeads (with CD4 and CD8 antibodies), cells are seeded into a CentriCult culture vessel in Prodigy® at a target count of 4.0 x 108 - 1.0 x 109 total viable cells at a target concentration of approximately 4.0 x 106 viable cells/mL. After cell seeding, activation reagent (TransAct) is then added to the culture vessel.
Клетки затем подвергают трансдукции с помощью лентивирусного вектора, кодирующего CAR для BCMA, и лентивирусного вектора, кодирующего CAR для CD19. Объем вектора, который должен использоваться для трансдукции Т-клеток после положительного отбора, рассчитывают, исходя из целевой множественности заражения (MOI), составляющей 4,75 для лентивирусного вектора, кодирующего CAR для BCMA, и целевой MOI, составляющей 0,5 для лентивирусного вектора, кодирующего CAR для CD19.The cells are then transduced with a lentiviral vector encoding a CAR for BCMA and a lentiviral vector encoding a CAR for CD19. The volume of vector to be used for transduction of T cells following positive selection is calculated based on a target multiplicity of infection (MOI) of 4.75 for the lentiviral vector encoding a CAR for BCMA and a target MOI of 0.5 for the lentiviral vector encoding a CAR for CD19.
После инкубирования в течение целевого 24-часового периода (рабочий диапазон 20-28 часов) при температуре 37°C при номинальных 5% CO2 клетки обрабатывают для промывания собранного материала.After incubation for the target 24-hour period (working range 20-28 hours) at 37°C under nominal 5% CO2 , cells are processed to wash the harvested material.
После инкубирования клетки промывают с помощью раствора для промывания собранного материала (таблица 33) три раза для удаления любого неинтегрировашегося вектора и остаточных вирусных частиц, а также любых других примесей, связанных со способом. Затем клетки элюируют, и отбирают образец для тестирования для подсчета количества и жизнеспособности клеток, и результаты используют для определения объема, требуемого для ресуспендирования клеток, для конечного составления с помощью CryoStor® CS10. Клетки затем центрифугируют с удалением раствора для промывания собранного материала, и приступают к их криоконсервации.Following incubation, the cells are washed with Harvest Wash Solution (Table 33) three times to remove any unintegrated vector and residual viral particles, as well as any other process-related contaminants. The cells are then eluted and a sample is collected for testing to quantify cell numbers and viability, and the results are used to determine the volume required to resuspend the cells for final compilation with the CryoStor® CS10. The cells are then centrifuged to remove Harvest Wash Solution and cryopreserved.
Пример 8. Анализ генных сигнатур CAR-T-клеток, изготовленных с использованием способа ARMExample 8. Analysis of gene signatures of CAR-T cells manufactured using the ARM method
СпособыMethods
Секвенирование РНК одиночных клетокSingle cell RNA sequencing
Библиотеки для секвенирования РНК одиночных клеток создавали с помощью устройства 10X Genomics Chromium Controller и дополнительных наборов для конструирования библиотек.Single-cell RNA-sequencing libraries were generated using the 10X Genomics Chromium Controller and optional library construction kits.
Криоконсервированные клетки размораживали, подсчитывали и сортировали с помощью проточной цитометрии (если это необходимо для исследуемого вопроса) до загрузки в устройство 10X Genomics. Отдельные клетки загружали в капли, и осуществляли штрихкодирование РНК в отдельных каплях с помощью гранулы GemCode. Штрихкодированные РНК высвобождали из капель и преобразовывали в библиотеку секвенирования полного транскриптома, совместимую с Illumina.Cryopreserved cells were thawed, counted, and sorted by flow cytometry (if appropriate for the research question) prior to loading onto the 10X Genomics device. Single cells were loaded into droplets, and RNA was barcoded in individual droplets using a GemCode bead. Barcoded RNAs were released from the droplets and processed into an Illumina-compatible whole transcriptome sequencing library.
Созданные библиотеки секвенировали на устройстве Illumina HiSeq и анализировали с применением программного конвейера для анализа 10X Genomics и программного обеспечения Loupe Cell Browser.The generated libraries were sequenced on an Illumina HiSeq and analyzed using the 10X Genomics analysis pipeline and Loupe Cell Browser software.
Иммунологическое профилирование одиночных клетокSingle cell immunoprofiling
Созданные с помощью 10X Genomics библиотеки полного транскриптома одиночных клеток использовали в качестве опорного материала для осуществления профилирования и анализа репертуара иммунных клеток. Последовательности Т-клеточных рецепторов подвергали ПЦР-амплификации из 5'-библиотек секвенирования одиночных клеток Chromium и анализировали на устройстве для секвенирования Illumina.Whole transcriptome single cell libraries generated by 10X Genomics were used as a reference material for immune cell repertoire profiling and analysis. T cell receptor sequences were PCR amplified from Chromium 5' single cell sequencing libraries and analyzed on an Illumina sequencing machine.
Программный конвейер для анализаSoftware pipeline for analysis
Данные секвенирования РНК одиночных клеток обрабатывали с помощью программного конвейера для анализа Cell Ranger, начиная с файлов FASTQ. Подробное описание программного конвейера для анализа Cell Ranger можно найти на support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/pipelines/latest/what-is-cell-ranger. Общий программный конвейер включает выравнивание, фильтрацию, подсчет штрихкодов и подсчет UMI. Клеточные штрихкоды применяли для образования матриц на основе генов и штрихкодов, определения кластеров и осуществления анализа экспрессии генов. Данные о количественных показателях экспрессии генов нормализовали с помощью пакета Seurat Bioconductor. Клетки, которые имели менее 200 экспрессируемых генов, отбрасывали из анализа. Гены, которые экспрессировались только в 2 клетках или меньше, отбрасывали из анализа. Оставшиеся данные нормализовали с помощью способа логарифмической нормализации Seurat с использованием коэффициента пересчета, составляющего 10000. Данные масштабировали посредством регрессии по количеству выявленных молекул на клетку. Балл набора генов (балл для набора генов) рассчитывали, используя среднее логарифмически нормализованное значение экспрессии гена для всех генов в наборе генов. Каждое значение экспрессии гена нормализуют с помощью Z-оценки так, что среднее значение экспрессии гена среди образцов составляет 0, и стандартное отклонение составляет 1. Балл набора генов затем рассчитывают как среднее значение для нормализованных значений экспрессии гена в наборе генов. Иллюстративный расчет балла набора генов описан ниже.Single-cell RNA-seq data were processed using the Cell Ranger analysis pipeline starting from FASTQ files. A detailed description of the Cell Ranger analysis pipeline can be found at support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/pipelines/latest/what-is-cell-ranger. The overall pipeline includes alignment, filtering, barcode scoring, and UMI scoring. Cellular barcodes were used to generate gene-barcode matrices, define clusters, and perform gene expression analysis. Gene expression count data were normalized using Seurat Bioconductor. Cells with fewer than 200 expressed genes were discarded from analysis. Genes that were expressed in only 2 cells or fewer were discarded from analysis. The remaining data were normalized using the Seurat log normalization method using a conversion factor of 10,000. The data were scaled by regression on the number of molecules detected per cell. The gene set score (gene set score) was calculated using the average log-normalized gene expression value for all genes in the gene set. Each gene expression value was normalized using a Z-score such that the mean gene expression value across samples was 0 and the standard deviation was 1. The gene set score was then calculated as the average of the normalized gene expression values in the gene set. An illustrative calculation of the gene set score is described below.
Для данного примера расчета балла набора генов нормализованные значения экспрессии гена в двух (2) образцах для шести (6) генов представлены в таблице 23. Для целей данного иллюстративного расчета набор генов состоит из генов 1-4. Следовательно, оба из образцов 1 и 2 имеют балл набора генов, составляющий 0.For this example of gene set score calculation, the normalized gene expression values in two (2) samples for six (6) genes are presented in Table 23. For the purposes of this illustrative calculation, the gene set consists of genes 1-4. Therefore, both
Набор генов "активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM" включает следующие гены: MXRA7, CLIC1, NAT13, TBC1D2B, GLCCI1, DUSP10, APOBEC3D, CACNB3, ANXA2P2, TPRG1, EOMES, MATK, ARHGAP10, ADAM8, MAN1A1, SLFN12L, SH2D2A, EIF2C4, CD58, MYO1F, RAB27B, ERN1, NPC1, NBEAL2, APOBEC3G, SYTL2, SLC4A4, PIK3AP1, PTGDR, MAF, PLEKHA5, ADRB2, PLXND1, GNAO1, THBS1, PPP2R2B, CYTH3, KLRF1, FLJ16686, AUTS2, PTPRM, GNLY и GFPT2.The gene set "upregulated in TEM relative to downregulated in TSCM" includes the following genes: MXRA7, CLIC1, NAT13, TBC1D2B, GLCCI1, DUSP10, APOBEC3D, CACNB3, ANXA2P2, TPRG1, EOMES, MATK, ARHGAP10, ADAM8, MAN1A1, SLFN12L, SH2D2A, EIF2C4, CD58, MYO1F, RAB27B, ERN1, NPC1, NBEAL2, APOBEC3G, SYTL2, SLC4A4, PIK3AP1, PTGDR, MAF, PLEKHA5, ADRB2, PLXND1, GNAO1, THBS1, PPP2R2B, CYTH3, KLRF1, FLJ16686, AUTS2, PTPRM, GNLY and GFPT2.
Набор генов "активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff" включает следующие гены: C12orf75, SELPLG, SWAP70, RGS1, PRR11, SPATS2L, SPATS2L, TSHR, C14orf145, CASP8, SYT11, ACTN4, ANXA5, GLRX, HLA-DMB, PMCH, RAB11FIP1, IL32, FAM160B1, SHMT2, FRMD4B, CCR3, TNFRSF13B, NTNG2, CLDND1, BARD1, FCER1G, TYMS, ATP1B1, GJB6, FGL2, TK1, SLC2A8, CDKN2A, SKAP2, GPR55, CDCA7, S100A4, GDPD5, PMAIP1, ACOT9, CEP55, SGMS1, ADPRH, AKAP2, HDAC9, IKZF4, CARD17, VAV3, OBFC2A, ITGB1, CIITA, SETD7, HLA-DMA, CCR10, KIAA0101, SLC14A1, PTTG3P, DUSP10, FAM164A, PYHIN1, MYO1F, SLC1A4, MYBL2, PTTG1, RRM2, TP53INP1, CCR5, ST8SIA6, TOX, BFSP2, ITPRIPL1, NCAPH, HLA-DPB2, SYT4, NINJ2, FAM46C, CCR4, GBP5, C15orf53, LMCD1, MKI67, NUSAP1, PDE4A, E2F2, CD58, ARHGEF12, LOC100188949, FAS, HLA-DPB1, SELP, WEE1, HLA-DPA1, FCRL1, ICA1, CNTNAP1, OAS1, METTL7A, CCR6, HLA-DRB4, ANXA2P3, STAM, HLA-DQB2, LGALS1, ANXA2, PI16, DUSP4, LAYN, ANXA2P2, PTPLA, ANXA2P1, ZNF365, LAIR2, LOC541471, RASGRP4, BCAS1, UTS2, MIAT, PRDM1, SEMA3G, FAM129A, HPGD, NCF4, LGALS3, CEACAM4, JAKMIP1, TIGIT, HLA-DRA, IKZF2, HLA-DRB1, FANK1, RTKN2, TRIB1, FCRL3 и FOXP3.The gene set "upregulated in Tregs relative to downregulated in Teff" includes the following genes: C12orf75, SELPLG, SWAP70, RGS1, PRR11, SPATS2L, SPATS2L, TSHR, C14orf145, CASP8, SYT11, ACTN4, ANXA5, GLRX, HLA-DMB, PMCH, RAB11FIP1, IL32, FAM160B1, SHMT2, FRMD4B, CCR3, TNFRSF13B, NTNG2, CLDND1, BARD1, FCER1G, TYMS, ATP1B1, GJB6, FGL2, TK1, SLC2A8, CDKN2A, SKAP2, GPR55, CDCA7, S100A4, GDPD5, PMAIP1, ACOT9, CEP55, SGMS1, ADPRH, AKAP2, HDAC9, IKZF4, CARD17, VAV3, OBFC2A, ITGB1, CIITA, SETD7, HLA-DMA, CCR10, KIAA0101, SLC14A1, PTTG3P, DUSP10, FAM164A, PYHIN1, MYO1F, SLC1A4, MYBL2, PTTG1, RRM2, TP53INP1, CCR5, ST8SIA6, TOX, BFSP2, ITPRIPL1, NCAPH, HLA-DPB2, SYT4, NINJ2, FAM46C, CCR4, GBP5, C15orf53, LMCD1, MKI67, NUSAP1, PDE4A, E2F2, CD58, ARHGEF12, LOC100188949, FAS, HLA-DPB1, SELP, WEE1, HLA-DPA1, FCRL1, ICA1, CNTNAP1, OAS1, METTL7A, CCR6, HLA-DRB4, ANXA2P3, STAM, HLA-DQB2, LGALS1, ANXA2, PI16, DUSP4, LAYN, ANXA2P2, PTPLA, ANXA2P1, ZNF365, LAIR2, LOC541471, RASGRP4, BCAS1, UTS2, MIAT, PRDM1, SEMA3G, FAM129A, HPGD, NCF4, LGALS3, CEACAM4, JAKMIP1, TIGIT, HLA-DRA, IKZF2, HLA-DRB1, FANK1, RTKN2, TRIB1, FCRL3 and FOXP3.
Набор генов "подавляемые в состоянии стволовости" включает следующие гены: ACE, BATF, CDK6, CHD2, ERCC2, HOXB4, MEOX1, SFRP1, SP7, SRF, TAL1 и XRCC5.The set of genes "repressed in the stemness state" includes the following genes: ACE, BATF, CDK6, CHD2, ERCC2, HOXB4, MEOX1, SFRP1, SP7, SRF, TAL1 and XRCC5.
Набор генов "активируемые при гипоксии" включает следующие гены: ABCB1, ACAT1, ADM, ADORA2B, AK2, AK3, ALDH1A1, ALDH1A3, ALDOA, ALDOC, ANGPT2, ANGPTL4, ANXA1, ANXA2, ANXA5, ARHGAP5, ARSE, ART1, BACE2, BATF3, BCL2L1, BCL2L2, BHLHE40, BHLHE41, BIK, BIRC2, BNIP3, BNIP3L, BPI, BTG1, C11orf2, C7orf68, CA12, CA9, CALD1, CCNG2, CCT6A, CD99, CDK1, CDKN1A, CDKN1B, CITED2, CLK1, CNOT7, COL4A5, COL5A1, COL5A2, COL5A3, CP, CTSD, CXCR4, D4S234E, DDIT3, DDIT4, 1-Dec, DKC1, DR1, EDN1, EDN2, EFNA1, EGF, EGR1, EIF4A3, ELF3, ELL2, ENG, ENO1, ENO3, ENPEP, EPO, ERRFI1, ETS1, F3, FABP5, FGF3, FKBP4, FLT1, FN1, FOS, FTL, GAPDH, GBE1, GLRX, GPI, GPRC5A, HAP1, HBP1, HDAC1, HDAC9, HERC3, HERPUD1, HGF, HIF1A, HK1, HK2, HLA-DQB1, HMOX1, HMOX2, HSPA5, HSPD1, HSPH1, HYOU1, ICAM1, ID2, IFI27, IGF2, IGFBP1, IGFBP2, IGFBP3, IGFBP5, IL6, IL8, INSIG1, IRF6, ITGA5, JUN, KDR, KRT14, KRT18, KRT19, LDHA, LDHB, LEP, LGALS1, LONP1, LOX, LRP1, MAP4, MET, MIF, MMP13, MMP2, MMP7, MPI, MT1L, MTL3P, MUC1, MXI1, NDRG1, NFIL3, NFKB1, NFKB2, NOS1, NOS2, NOS2P1, NOS2P2, NOS3, NR3C1, NR4A1, NT5E, ODC1, P4HA1, P4HA2, PAICS, PDGFB, PDK3, PFKFB1, PFKFB3, PFKFB4, PFKL, PGAM1, PGF, PGK1, PGK2, PGM1, PIM1, PIM2, PKM2, PLAU, PLAUR, PLIN2, PLOD2, PNN, PNP, POLM, PPARA, PPAT, PROK1, PSMA3, PSMD9, PTGS1, PTGS2, QSOX1, RBPJ, RELA, RIOK3, RNASEL, RPL36A, RRP9, SAT1, SERPINB2, SERPINE1, SGSM2, SIAH2, SIN3A, SIRPA, SLC16A1, SLC16A2, SLC20A1, SLC2A1, SLC2A3, SLC3A2, SLC6A10P, SLC6A16, SLC6A6, SLC6A8, SORL1, SPP1, SRSF6, SSSCA1, STC2, STRA13, SYT7, TBPL1, TCEAL1, TEK, TF, TFF3, TFRC, TGFA, TGFB1, TGFB3, TGFBI, TGM2, TH, THBS1, THBS2, TIMM17A, TNFAIP3, TP53, TPBG, TPD52, TPI1, TXN, TXNIP, UMPS, VEGFA, VEGFB, VEGFC, VIM, VPS11 и XRCC6.The set of genes "activated in hypoxia" includes the following genes: ABCB1, ACAT1, ADM, ADORA2B, AK2, AK3, ALDH1A1, ALDH1A3, ALDOA, ALDOC, ANGPT2, ANGPTL4, ANXA1, ANXA2, ANXA5, ARHGAP5, ARSE, ART1, BACE2, BATF3, BCL2L1, BCL2L2, BHLHE40, BHLHE41, BIK, BIRC2, BNIP3, BNIP3L, BPI, BTG1, C11orf2, C7orf68, CA12, CA9, CALD1, CCNG2, CCT6A, CD99, CDK1, CDKN1A, CDKN1B, CITED2, CLK1, CNOT7, COL4A5, COL5A1, COL5A2, COL5A3, CP, CTSD, CXCR4, D4S234E, DDIT3, DDIT4, 1-Dec, DKC1, DR1, EDN1, EDN2, EFNA1, EGF, EGR1, EIF4A3, ELF3, ELL2, ENG, ENO1, ENO3, ENPEP, EPO, ERRFI1, ETS1, F3, FABP5, FGF3, FKBP4, FLT1, FN1, FOS, FTL, GAPDH, GBE1, GLRX, GPI, GPRC5A, HAP1, HBP1, HDAC1, HDAC9, HERC3, HERPUD1, HGF, HIF1A, HK1, HK2, HLA-DQB1, HMOX1, HMOX2, HSPA5, HSPD1, HSPH1, HYOU1, ICAM1, ID2, IFI27, IGF2, IGFBP1, IGFBP2, IGFBP3, IGFBP5, IL6, IL8, INSIG1, IRF6, ITGA5, JUN, KDR, KRT14, KRT18, KRT19, LDHA, LDHB, LEP, LGALS1, LONP1, LOX, LRP1, MAP4, MET, MIF, MMP13, MMP2, MMP7, MPI, MT1L, MTL3P, MUC1, MXI1, NDRG1, NFIL3, NFKB1, NFKB2, NOS1, NOS2, NOS2P1, NOS2P2, NOS3, NR3C1, NR4A1, NT5E, ODC1, P4HA1, P4HA2, PAICS, PDGFB, PDK3, PFKFB1, PFKFB3, PFKFB4, PFKL, PGAM1, PGF, PGK1, PGK2, PGM1, PIM1, PIM2, PKM2, PLAU, PLAUR, PLIN2, PLOD2, PNN, PNP, POLM, PPARA, PPAT, PROK1, PSMA3, PSMD9, PTGS1, PTGS2, QSOX1, RBPJ, RELA, RIOK3, RNASEL, RPL36A, RRP9, SAT1, SERPINB2, SERPINE1, SGSM2, SIAH2, SIN3A, SIRPA, SLC16A1, SLC16A2, SLC20A1, SLC2A1, SLC2A3, SLC3A2, SLC6A10P, SLC6A16, SLC6A6, SLC6A8, SORL1, SPP1, SRSF6, SSSCA1, STC2, STRA13, SYT7, TBPL1, TCEAL1, TEK, TF, TFF3, TFRC, TGFA, TGFB1, TGFB3, TGFBI, TGM2, TH, THBS1, THBS2, TIMM17A, TNFAIP3, TP53, TPBG, TPD52, TPI1, TXN, TXNIP, UMPS, VEGFA, VEGFB, VEGFC, VIM, VPS11 and XRCC6.
Набор генов "активируемые при аутофагии" включает следующие гены: ABL1, ACBD5, ACIN1, ACTRT1, ADAMTS7, AKR1E2, ALKBH5, ALPK1, AMBRA1, ANXA5, ANXA7, ARSB, ASB2, ATG10, ATG12, ATG13, ATG14, ATG16L1, ATG16L2, ATG2A, ATG2B, ATG3, ATG4A, ATG4B, ATG4C, ATG4D, ATG5, ATG7, ATG9A, ATG9B, ATP13A2, ATP1B1, ATPAF1-AS1, ATPIF1, BECN1, BECN1P1, BLOC1S1, BMP2KL, BNIP1, BNIP3, BOC, C11orf2, C11orf41, C12orf44, C12orf5, C14orf133, C1orf210, C5, C6orf106, C7orf59, C7orf68, C8orf59, C9orf72, CA7, CALCB, CALCOCO2, CAPS, CCDC36, CD163L1, CD93, CDC37, CDKN2A, CHAF1B, CHMP2A, CHMP2B, CHMP3, CHMP4A, CHMP4B, CHMP4C, CHMP6, CHST3, CISD2, CLDN7, CLEC16A, CLN3, CLVS1, COX8A, CPA3, CRNKL1, CSPG5, CTSA, CTSB, CTSD, CXCR7, DAP, DKKL1, DNAAF2, DPF3, DRAM1, DRAM2, DYNLL1, DYNLL2, DZANK1, EI24, EIF2S1, EPG5, EPM2A, FABP1, FAM125A, FAM131B, FAM134B, FAM13B, FAM176A, FAM176B, FAM48A, FANCC, FANCF, FANCL, FBXO7, FCGR3B, FGF14, FGF7, FGFBP1, FIS1, FNBP1L, FOXO1, FUNDC1, FUNDC2, FXR2, GABARAP, GABARAPL1, GABARAPL2, GABARAPL3, GABRA5, GDF5, GMIP, HAP1, HAPLN1, HBXIP, HCAR1, HDAC6, HGS, HIST1H3A, HIST1H3B, HIST1H3C, HIST1H3D, HIST1H3E, HIST1H3F, HIST1H3G, HIST1H3H, HIST1H3I, HIST1H3J, HK2, HMGB1, HPR, HSF2BP, HSP90AA1, HSPA8, IFI16, IPPK, IRGM, IST1, ITGB4, ITPKC, KCNK3, KCNQ1, KIAA0226, KIAA1324, KRCC1, KRT15, KRT73, LAMP1, LAMP2, LAMTOR1, LAMTOR2, LAMTOR3, LARP1B, LENG9, LGALS8, LIX1, LIX1L, LMCD1, LRRK2, LRSAM1, LSM4, MAP1A, MAP1LC3A, MAP1LC3B, MAP1LC3B2, MAP1LC3C, MAP1S, MAP2K1, MAP3K12, MARK2, MBD5, MDH1, MEX3C, MFN1, MFN2, MLST8, MRPS10, MRPS2, MSTN, MTERFD1, MTMR14, MTMR3, MTOR, MTSS1, MYH11, MYLK, MYOM1, NBR1, NDUFB9, NEFM, NHLRC1, NME2, NPC1, NR2C2, NRBF2, NTHL1, NUP93, OBSCN, OPTN, P2RX5, PACS2, PARK2, PARK7, PDK1, PDK4, PEX13, PEX3, PFKP, PGK2, PHF23, PHYHIP, PI4K2A, PIK3C3, PIK3CA, PIK3CB, PIK3R4, PINK1, PLEKHM1, PLOD2, PNPO, PPARGC1A, PPY, PRKAA1, PRKAA2, PRKAB1, PRKAB2, PRKAG1, PRKAG2, PRKAG3, PRKD2, PRKG1, PSEN1, PTPN22, RAB12, RAB1A, RAB1B, RAB23, RAB24, RAB33B, RAB39, RAB7A, RB1CC1, RBM18, REEP2, REP15, RFWD3, RGS19, RHEB, RIMS3, RNF185, RNF41, RPS27A, RPTOR, RRAGA, RRAGB, RRAGC, RRAGD, S100A8, S100A9, SCN1A, SERPINB10, SESN2, SFRP4, SH3GLB1, SIRT2, SLC1A3, SLC1A4, SLC22A3, SLC25A19, SLC35B3, SLC35C1, SLC37A4, SLC6A1, SLCO1A2, SMURF1, SNAP29, SNAPIN, SNF8, SNRPB, SNRPB2, SNRPD1, SNRPF, SNTG1, SNX14, SPATA18, SQSTM1, SRPX, STAM, STAM2, STAT2, STBD1, STK11, STK32A, STOM, STX12, STX17, SUPT3H, TBC1D17, TBC1D25, TBC1D5, TCIRG1, TEAD4, TECPR1, TECPR2, TFEB, TM9SF1, TMBIM6, TMEM203, TMEM208, TMEM39A, TMEM39B, TMEM59, TMEM74, TMEM93, TNIK, TOLLIP, TOMM20, TOMM22, TOMM40, TOMM5, TOMM6, TOMM7, TOMM70A, TP53INP1, TP53INP2, TRAPPC8, TREM1, TRIM17, TRIM5, TSG101, TXLNA, UBA52, UBB, UBC, UBQLN1, UBQLN2, UBQLN4, ULK1, ULK2, ULK3, USP10, USP13, USP30, UVRAG, VAMP7, VAMP8, VDAC1, VMP1, VPS11, VPS16, VPS18, VPS25, VPS28, VPS33A, VPS33B, VPS36, VPS37A, VPS37B, VPS37C, VPS37D, VPS39, VPS41, VPS4A, VPS4B, VTA1, VTI1A, VTI1B, WDFY3, WDR45, WDR45L, WIPI1, WIPI2, XBP1, YIPF1, ZCCHC17, ZFYVE1, ZKSCAN3, ZNF189, ZNF593 и ZNF681.The autophagy-activated gene set includes the following genes: ABL1, ACBD5, ACIN1, ACTRT1, ADAMTS7, AKR1E2, ALKBH5, ALPK1, AMBRA1, ANXA5, ANXA7, ARSB, ASB2, ATG10, ATG12, ATG13, ATG14, ATG16L1, ATG16L2, ATG2A, ATG2B, ATG3, ATG4A, ATG4B, ATG4C, ATG4D, ATG5, ATG7, ATG9A, ATG9B, ATP13A2, ATP1B1, ATPAF1-AS1, ATPIF1, BECN1, BECN1P1, BLOC1S1, BMP2KL, BNIP1, BNIP3, BOC, C11orf2, C11orf41, C12orf44, C12orf5, C14orf133, C1orf210, C5, C6orf106, C7orf59, C7orf68, C8orf59, C9orf72, CA7, CALCB, CALCOCO2, CAPS, CCDC36, CD163L1, CD93, CDC37, CDKN2A, CHAF1B, CHMP2A, CHMP2B, CHMP3, CHMP4A, CHMP4B, CHMP4C, CHMP6, CHST3, CISD2, CLDN7, CLEC16A, CLN3, CLVS1, COX8A, CPA3, CRNKL1, CSPG5, CTSA, CTSB, CTSD, CXCR7, DAP, DKKL1, DNAAF2, DPF3, DRAM1, DRAM2, DYNLL1, DYNLL2, DZANK1, EI24, EIF2S1, EPG5, EPM2A, FABP1, FAM125A, FAM131B, FAM134B, FAM13B, FAM176A, FAM176B, FAM48A, FANCC, FANCF, FANCL, FBXO7, FCGR3B, FGF14, FGF7, FGFBP1, FIS1, FNBP1L, FOXO1, FUNDC1, FUNDC2, FXR2, GABARAP, GABARAPL1, GABARAPL2, GABARAPL3, GABRA5, GDF5, GMIP, HAP1, HAPLN1, HBXIP, HCAR1, HDAC6, HGS, HIST1H3A, HIST1H3B, HIST1H3C, HIST1H3D, HIST1H3E, HIST1H3F, HIST1H3G, HIST1H3H, HIST1H3I, HIST1H3J, HK2, HMGB1, HPR, HSF2BP, HSP90AA1, HSPA8, IFI16, IPPK, IRGM, IST1, ITGB4, ITPKC, KCNK3, KCNQ1, KIAA0226, KIAA1324, KRCC1, KRT15, KRT73, LAMP1, LAMP2, LAMTOR1, LAMTOR2, LAMTOR3, LARP1B, LENG9, LGALS8, LIX1, LIX1L, LMCD1, LRRK2, LRSAM1, LSM4, MAP1A, MAP1LC3A, MAP1LC3B, MAP1LC3B2, MAP1LC3C, MAP1S, MAP2K1, MAP3K12, MARK2, MBD5, MDH1, MEX3C, MFN1, MFN2, MLST8, MRPS10, MRPS2, MSTN, MTERFD1, MTMR14, MTMR3, MTOR, MTSS1, MYH11, MYLK, MYOM1, NBR1, NDUFB9, NEFM, NHLRC1, NME2, NPC1, NR2C2, NRBF2, NTHL1, NUP93, OBSCN, OPTN, P2RX5, PACS2, PARK2, PARK7, PDK1, PDK4, PEX13, PEX3, PFKP, PGK2, PHF23, PHYHIP, PI4K2A, PIK3C3, PIK3CA, PIK3CB, PIK3R4, PINK1, PLEKHM1, PLOD2, PNPO, PPARGC1A, PPY, PRKAA1, PRKAA2, PRKAB1, PRKAB2, PRKAG1, PRKAG2, PRKAG3, PRKD2, PRKG1, PSEN1, PTPN22, RAB12, RAB1A, RAB1B, RAB23, RAB24, RAB33B, RAB39, RAB7A, RB1CC1, RBM18, REEP2, REP15, RFWD3, RGS19, RHEB, RIMS3, RNF185, RNF41, RPS27A, RPTOR, RRAGA, RRAGB, RRAGC, RRAGD, S100A8, S100A9, SCN1A, SERPINB10, SESN2, SFRP4, SH3GLB1, SIRT2, SLC1A3, SLC1A4, SLC22A3, SLC25A19, SLC35B3, SLC35C1, SLC37A4, SLC6A1, SLCO1A2, SMURF1, SNAP29, SNAPIN, SNF8, SNRPB, SNRPB2, SNRPD1, SNRPF, SNTG1, SNX14, SPATA18, SQSTM1, SRPX, STAM, STAM2, STAT2, STBD1, STK11, STK32A, STOM, STX12, STX17, SUPT3H, TBC1D17, TBC1D25, TBC1D5, TCIRG1, TEAD4, TECPR1, TECPR2, TFEB, TM9SF1, TMBIM6, TMEM203, TMEM208, TMEM39A, TMEM39B, TMEM59, TMEM74, TMEM93, TNIK, TOLLIP, TOMM20, TOMM22, TOMM40, TOMM5, TOMM6, TOMM7, TOMM70A, TP53INP1, TP53INP2, TRAPPC8, TREM1, TRIM17, TRIM5, TSG101, TXLNA, UBA52, UBB, UBC, UBQLN1, UBQLN2, UBQLN4, ULK1, ULK2, ULK3, USP10, USP13, USP30, UVRAG, VAMP7, VAMP8, VDAC1, VMP1, VPS11, VPS16, VPS18, VPS25, VPS28, VPS33A, VPS33B, VPS36, VPS37A, VPS37B, VPS37C, VPS37D, VPS39, VPS41, VPS4A, VPS4B, VTA1, VTI1A, VTI1B, WDFY3, WDR45, WDR45L, WIPI1, WIPI2, XBP1, YIPF1, ZCCHC17, ZFYVE1, ZKSCAN3, ZNF189, ZNF593 and ZNF681.
Набор генов "активируемые в покоящемся состоянии относительно подавляемых в активированном состоянии" включает следующие гены: ABCA7, ABCF3, ACAP2, AMT, ANKH, ATF7IP2, ATG14, ATP1A1, ATXN7, ATXN7L3B, BCL7A, BEX4, BSDC1, BTG1, BTG2, BTN3A1, C11orf21, C19orf22, C21orf2, CAMK2G, CARS2, CCNL2, CD248, CD5, CD55, CEP164, CHKB, CLK1, CLK4, CTSL1, DBP, DCUN1D2, DENND1C, DGKD, DLG1, DUSP1, EAPP, ECE1, ECHDC2, ERBB2IP, FAM117A, FAM134B, FAM134C, FAM169A, FAM190B, FAU, FLJ10038, FOXJ2, FOXJ3, FOXL1, FOXO1, FXYD5, FYB, HLA-E, HSPA1L, HYAL2, ICAM2, IFIT5, IFITM1, IKBKB, IQSEC1, IRS4, KIAA0664L3, KIAA0748, KLF3, KLF9, KRT18, LEF1, LINC00342, LIPA, LIPT1, LLGL2, LMBR1L, LPAR2, LTBP3, LYPD3, LZTFL1, MANBA, MAP2K6, MAP3K1, MARCH8, MAU2, MGEA5, MMP8, MPO, MSL1, MSL3, MYH3, MYLIP, NAGPA, NDST2, NISCH, NKTR, NLRP1, NOSIP, NPIP, NUMA1, PAIP2B, PAPD7, PBXIP1, PCIF1, PI4KA, PLCL2, PLEKHA1, PLEKHF2, PNISR, PPFIBP2, PRKCA, PRKCZ, PRKD3, PRMT2, PTP4A3, PXN, RASA2, RASA3, RASGRP2, RBM38, REPIN1, RNF38, RNF44, ROR1, RPL30, RPL32, RPLP1, RPS20, RPS24, RPS27, RPS6, RPS9, RXRA, RYK, SCAND2, SEMA4C, SETD1B, SETD6, SETX, SF3B1, SH2B1, SLC2A4RG, SLC35E2B, SLC46A3, SMAGP, SMARCE1, SMPD1, SNPH, SP140L, SPATA6, SPG7, SREK1IP1, SRSF5, STAT5B, SVIL, SYF2, SYNJ2BP, TAF1C, TBC1D4, TCF20, TECTA, TES, TMEM127, TMEM159, TMEM30B, TMEM66, TMEM8B, TP53TG1, TPCN1, TRIM22, TRIM44, TSC1, TSC22D1, TSC22D3, TSPYL2, TTC9, TTN, UBE2G2, USP33, USP34, VAMP1, VILL, VIPR1, VPS13C, ZBED5, ZBTB25, ZBTB40, ZC3H3, ZFP161, ZFP36L1, ZFP36L2, ZHX2, ZMYM5, ZNF136, ZNF148, ZNF318, ZNF350, ZNF512B, ZNF609, ZNF652, ZNF83, ZNF862 и ZNF91.The set of genes "upregulated in the resting state relative to downregulated in the activated state" includes the following genes: ABCA7, ABCF3, ACAP2, AMT, ANKH, ATF7IP2, ATG14, ATP1A1, ATXN7, ATXN7L3B, BCL7A, BEX4, BSDC1, BTG1, BTG2, BTN3A1, C11orf21, C19orf22, C21orf2, CAMK2G, CARS2, CCNL2, CD248, CD5, CD55, CEP164, CHKB, CLK1, CLK4, CTSL1, DBP, DCUN1D2, DENND1C, DGKD, DLG1, DUSP1, EAPP, ECE1, ECHDC2, ERBB2IP, FAM117A, FAM134B, FAM134C, FAM169A, FAM190B, FAU, FLJ10038, FOXJ2, FOXJ3, FOXL1, FOXO1, FXYD5, FYB, HLA-E, HSPA1L, HYAL2, ICAM2, IFIT5, IFITM1, IKBKB, IQSEC1, IRS4, KIAA0664L3, KIAA0748, KLF3, KLF9, KRT18, LEF1, LINC00342, LIPA, LIPT1, LLGL2, LMBR1L, LPAR2, LTBP3, LYPD3, LZTFL1, MANBA, MAP2K6, MAP3K1, MARCH8, MAU2, MGEA5, MMP8, MPO, MSL1, MSL3, MYH3, MYLIP, NAGPA, NDST2, NISCH, NKTR, NLRP1, NOSIP, NPIP, NUMA1, PAIP2B, PAPD7, PBXIP1, PCIF1, PI4KA, PLCL2, PLEKHA1, PLEKHF2, PNISR, PPFIBP2, PRKCA, PRKCZ, PRKD3, PRMT2, PTP4A3, PXN, RASA2, RASA3, RASGRP2, RBM38, REPIN1, RNF38, RNF44, ROR1, RPL30, RPL32, RPLP1, RPS20, RPS24, RPS27, RPS6, RPS9, RXRA, RYK, SCAND2, SEMA4C, SETD1B, SETD6, SETX, SF3B1, SH2B1, SLC2A4RG, SLC35E2B, SLC46A3, SMAGP, SMARCE1, SMPD1, SNPH, SP140L, SPATA6, SPG7, SREK1IP1, SRSF5, STAT5B, SVIL, SYF2, SYNJ2BP, TAF1C, TBC1D4, TCF20, TECTA, TES, TMEM127, TMEM159, TMEM30B, TMEM66, TMEM8B, TP53TG1, TPCN1, TRIM22, TRIM44, TSC1, TSC22D1, TSC22D3, TSPYL2, TTC9, TTN, UBE2G2, USP33, USP34, VAMP1, VILL, VIPR1, VPS13C, ZBED5, ZBTB25, ZBTB40, ZC3H3, ZFP161, ZFP36L1, ZFP36L2, ZHX2, ZMYM5, ZNF136, ZNF148, ZNF318, ZNF350, ZNF512B, ZNF609, ZNF652, ZNF83, ZNF862 and ZNF91.
Набор генов "постепенно активируемые при дифференцировке в клетки памяти" включает следующие гены: MTCH2, RAB6C, KIAA0195, SETD2, C2orf24, NRD1, GNA13, COPA, SELT, TNIP1, CBFA2T2, LRP10, PRKCI, BRE, ANKS1A, PNPLA6, ARL6IP1, WDFY1, MAPK1, GPR153, SHKBP1, MAP1LC3B2, PIP4K2A, HCN3, GTPBP1, TLN1, C4orf34, KIF3B, TCIRG1, PPP3CA, ATG4D, TYMP, TRAF6, C17orf76, WIPF1, FAM108A1, MYL6, NRM, SPCS2, GGT3P, GALK1, CLIP4, ARL4C, YWHAQ, LPCAT4, ATG2A, IDS, TBC1D5, DMPK, ST6GALNAC6, REEP5, ABHD6, KIAA0247, EMB, TSEN54, SPIRE2, PIWIL4, ZSCAN22, ICAM1, CHD9, LPIN2, SETD8, ZC3H12A, ULBP3, IL15RA, HLA-DQB2, LCP1, CHP, RUNX3, TMEM43, REEP4, MEF2D, ABL1, TMEM39A, PCBP4, PLCD1, CHST12, RASGRP1, C1orf58, C11orf63, C6orf129, FHOD1, DKFZp434F142, PIK3CG, ITPR3, BTG3, C4orf50, CNNM3, IFI16, AK1, CDK2AP1, REL, BCL2L1, MVD, TTC39C, PLEKHA2, FKBP11, EML4, FANCA, CDCA4, FUCA2, MFSD10, TBCD, CAPN2, IQGAP1, CHST11, PIK3R1, MYO5A, KIR2DL3, DLG3, MXD4, RALGDS, S1PR5, WSB2, CCR3, TIPARP, SP140, CD151, SOX13, KRTAP5-2, NF1, PEA15, PARP8, RNF166, UEVLD, LIMK1, CACNB1, TMX4, SLC6A6, LBA1, SV2A, LLGL2, IRF1, PPP2R5C, CD99, RAPGEF1, PPP4R1, OSBPL7, FOXP4, SLA2, TBC1D2B, ST7, JAZF1, GGA2, PI4K2A, CD68, LPGAT1, STX11, ZAK, FAM160B1, RORA, C8orf80, APOBEC3F, TGFBI, DNAJC1, GPR114, LRP8, CD69, CMIP, NAT13, TGFB1, FLJ00049, ANTXR2, NR4A3, IL12RB1, NTNG2, RDX, MLLT4, GPRIN3, ADCY9, CD300A, SCD5, ABI3, PTPN22, LGALS1, SYTL3, BMPR1A, TBK1, PMAIP1, RASGEF1A, GCNT1, GABARAPL1, STOM, CALHM2, ABCA2, PPP1R16B, SYNE2, PAM, C12orf75, CLCF1, MXRA7, APOBEC3C, CLSTN3, ACOT9, HIP1, LAG3, TNFAIP3, DCBLD1, KLF6, CACNB3, RNF19A, RAB27A, FADS3, DLG5, APOBEC3D, TNFRSF1B, ACTN4, TBKBP1, ATXN1, ARAP2, ARHGEF12, FAM53B, MAN1A1, FAM38A, PLXNC1, GRLF1, SRGN, HLA-DRB5, B4GALT5, WIPI1, PTPRJ, SLFN11, DUSP2, ANXA5, AHNAK, NEO1, CLIC1, EIF2C4, MAP3K5, IL2RB, PLEKHG1, MYO6, GTDC1, EDARADD, GALM, TARP, ADAM8, MSC, HNRPLL, SYT11, ATP2B4, NHSL2, MATK, ARHGAP18, SLFN12L, SPATS2L, RAB27B, PIK3R3, TP53INP1, MBOAT1, GYG1, KATNAL1, FAM46C, ZC3HAV1L, ANXA2P2, CTNNA1, NPC1, C3AR1, CRIM1, SH2D2A, ERN1, YPEL1, TBX21, SLC1A4, FASLG, PHACTR2, GALNT3, ADRB2, PIK3AP1, TLR3, PLEKHA5, DUSP10, GNAO1, PTGDR, FRMD4B, ANXA2, EOMES, CADM1, MAF, TPRG1, NBEAL2, PPP2R2B, PELO, SLC4A4, KLRF1, FOSL2, RGS2, TGFBR3, PRF1, MYO1F, GAB3, C17orf66, MICAL2, CYTH3, TOX, HLA-DRA, SYNE1, WEE1, PYHIN1, F2R, PLD1, THBS1, CD58, FAS, NETO2, CXCR6, ST6GALNAC2, DUSP4, AUTS2, C1orf21, KLRG1, TNIP3, GZMA, PRR5L, PRDM1, ST8SIA6, PLXND1, PTPRM, GFPT2, MYBL1, SLAMF7, FLJ16686, GNLY, ZEB2, CST7, IL18RAP, CCL5, KLRD1 и KLRB1.The set of genes "gradually activated during differentiation into memory cells" includes the following genes: MTCH2, RAB6C, KIAA0195, SETD2, C2orf24, NRD1, GNA13, COPA, SELT, TNIP1, CBFA2T2, LRP10, PRKCI, BRE, ANKS1A, PNPLA6, ARL6IP1, WDFY1, MAPK1, GPR153, SHKBP1, MAP1LC3B2, PIP4K2A, HCN3, GTPBP1, TLN1, C4orf34, KIF3B, TCIRG1, PPP3CA, ATG4D, TYMP, TRAF6, C17orf76, WIPF1, FAM108A1, MYL6, NRM, SPCS2, GGT3P, GALK1, CLIP4, ARL4C, YWHAQ, LPCAT4, ATG2A, IDS, TBC1D5, DMPK, ST6GALNAC6, REEP5, ABHD6, KIAA0247, EMB, TSEN54, SPIRE2, PIWIL4, ZSCAN22, ICAM1, CHD9, LPIN2, SETD8, ZC3H12A, ULBP3, IL15RA, HLA-DQB2, LCP1, CHP, RUNX3, TMEM43, REEP4, MEF2D, ABL1, TMEM39A, PCBP4, PLCD1, CHST12, RASGRP1, C1orf58, C11orf63, C6orf129, FHOD1, DKFZp434F142, PIK3CG, ITPR3, BTG3, C4orf50, CNNM3, IFI16, AK1, CDK2AP1, REL, BCL2L1, MVD, TTC39C, PLEKHA2, FKBP11, EML4, FANCA, CDCA4, FUCA2, MFSD10, TBCD, CAPN2, IQGAP1, CHST11, PIK3R1, MYO5A, KIR2DL3, DLG3, MXD4, RALGDS, S1PR5, WSB2, CCR3, TIPARP, SP140, CD151, SOX13, KRTAP5-2, NF1, PEA15, PARP8, RNF166, UEVLD, LIMK1, CACNB1, TMX4, SLC6A6, LBA1, SV2A, LLGL2, IRF1, PPP2R5C, CD99, RAPGEF1, PPP4R1, OSBPL7, FOXP4, SLA2, TBC1D2B, ST7, JAZF1, GGA2, PI4K2A, CD68, LPGAT1, STX11, ZAK, FAM160B1, RORA, C8orf80, APOBEC3F, TGFBI, DNAJC1, GPR114, LRP8, CD69, CMIP, NAT13, TGFB1, FLJ00049, ANTXR2, NR4A3, IL12RB1, NTNG2, RDX, MLLT4, GPRIN3, ADCY9, CD300A, SCD5, ABI3, PTPN22, LGALS1, SYTL3, BMPR1A, TBK1, PMAIP1, RASGEF1A, GCNT1, GABARAPL1, STOM, CALHM2, ABCA2, PPP1R16B, SYNE2, PAM, C12orf75, CLCF1, MXRA7, APOBEC3C, CLSTN3, ACOT9, HIP1, LAG3, TNFAIP3, DCBLD1, KLF6, CACNB3, RNF19A, RAB27A, FADS3, DLG5, APOBEC3D, TNFRSF1B, ACTN4, TBKBP1, ATXN1, ARAP2, ARHGEF12, FAM53B, MAN1A1, FAM38A, PLXNC1, GRLF1, SRGN, HLA-DRB5, B4GALT5, WIPI1, PTPRJ, SLFN11, DUSP2, ANXA5, AHNAK, NEO1, CLIC1, EIF2C4, MAP3K5, IL2RB, PLEKHG1, MYO6, GTDC1, EDARADD, GALM, TARP, ADAM8, MSC, HNRPLL, SYT11, ATP2B4, NHSL2, MATK, ARHGAP18, SLFN12L, SPATS2L, RAB27B, PIK3R3, TP53INP1, MBOAT1, GYG1, KATNAL1, FAM46C, ZC3HAV1L, ANXA2P2, CTNNA1, NPC1, C3AR1, CRIM1, SH2D2A, ERN1, YPEL1, TBX21, SLC1A4, FASLG, PHACTR2, GALNT3, ADRB2, PIK3AP1, TLR3, PLEKHA5, DUSP10, GNAO1, PTGDR, FRMD4B, ANXA2, EOMES, CADM1, MAF, TPRG1, NBEAL2, PPP2R2B, PELO, SLC4A4, KLRF1, FOSL2, RGS2, TGFBR3, PRF1, MYO1F, GAB3, C17orf66, MICAL2, CYTH3, TOX, HLA-DRA, SYNE1, WEE1, PYHIN1, F2R, PLD1, THBS1, CD58, FAS, NETO2, CXCR6, ST6GALNAC2, DUSP4, AUTS2, C1orf21, KLRG1, TNIP3, GZMA, PRR5L, PRDM1, ST8SIA6, PLXND1, PTPRM, GFPT2, MYBL1, SLAMF7, FLJ16686, GNLY, ZEB2, CST7, IL18RAP, CCL5, KLRD1 and KLRB1.
Набор генов "активируемые в TEM относительно подавляемых в TN" включает следующие гены: MYO5A, MXD4, STK3, S1PR5, GLCCI1, CCR3, SOX13, KRTAP5-2, PEA15, PARP8, RNF166, UEVLD, LIMK1, SLC6A6, SV2A, KPNA2, OSBPL7, ST7, GGA2, PI4K2A, CD68, ZAK, RORA, TGFBI, DNAJC1, JOSD1, ZFYVE28, LRP8, OSBPL3, CMIP, NAT13, TGFB1, ANTXR2, NR4A3, RDX, ADCY9, CHN1, CD300A, SCD5, PTPN22, LGALS1, RASGEF1A, GCNT1, GLUL, ABCA2, CLDND1, PAM, CLCF1, MXRA7, CLSTN3, ACOT9, METRNL, BMPR1A, LRIG1, APOBEC3G, CACNB3, RNF19A, RAB27A, FADS3, ACTN4, TBKBP1, FAM53B, MAN1A1, FAM38A, GRLF1, B4GALT5, WIPI1, DUSP2, ANXA5, AHNAK, CLIC1, MAP3K5, ST8SIA1, TARP, ADAM8, MATK, SLFN12L, PIK3R3, FAM46C, ANXA2P2, CTNNA1, NPC1, SH2D2A, ERN1, YPEL1, TBX21, STOM, PHACTR2, GBP5, ADRB2, PIK3AP1, DUSP10, PTGDR, EOMES, MAF, TPRG1, NBEAL2, NCAPH, SLC4A4, FOSL2, RGS2, TGFBR3, MYO1F, C17orf66, CYTH3, WEE1, PYHIN1, F2R, THBS1, CD58, AUTS2, FAM129A, TNIP3, GZMA, PRR5L, PRDM1, PLXND1, PTPRM, GFPT2, MYBL1, SLAMF7, ZEB2, CST7, CCL5, GZMK и KLRB1.The gene set "upregulated in TEM relative to downregulated in TN" includes the following genes: MYO5A, MXD4, STK3, S1PR5, GLCCI1, CCR3, SOX13, KRTAP5-2, PEA15, PARP8, RNF166, UEVLD, LIMK1, SLC6A6, SV2A, KPNA2, OSBPL7, ST7, GGA2, PI4K2A, CD68, ZAK, RORA, TGFBI, DNAJC1, JOSD1, ZFYVE28, LRP8, OSBPL3, CMIP, NAT13, TGFB1, ANTXR2, NR4A3, RDX, ADCY9, CHN1, CD300A, SCD5, PTPN22, LGALS1, RASGEF1A, GCNT1, GLUL, ABCA2, CLDND1, PAM, CLCF1, MXRA7, CLSTN3, ACOT9, METRNL, BMPR1A, LRIG1, APOBEC3G, CACNB3, RNF19A, RAB27A, FADS3, ACTN4, TBKBP1, FAM53B, MAN1A1, FAM38A, GRLF1, B4GALT5, WIPI1, DUSP2, ANXA5, AHNAK, CLIC1, MAP3K5, ST8SIA1, TARP, ADAM8, MATK, SLFN12L, PIK3R3, FAM46C, ANXA2P2, CTNNA1, NPC1, SH2D2A, ERN1, YPEL1, TBX21, STOM, PHACTR2, GBP5, ADRB2, PIK3AP1, DUSP10, PTGDR, EOMES, MAF, TPRG1, NBEAL2, NCAPH, SLC4A4, FOSL2, RGS2, TGFBR3, MYO1F, C17orf66, CYTH3, WEE1, PYHIN1, F2R, THBS1, CD58, AUTS2, FAM129A, TNIP3, GZMA, PRR5L, PRDM1, PLXND1, PTPRM, GFPT2, MYBL1, SLAMF7, ZEB2, CST7, CCL5, GZMK and KLRB1.
Другие наборы генов, описывающие аналогичные процессы и/или характеристики, могут также использоваться для определения характеристик фенотипов клеток, описанных выше.Other sets of genes describing similar processes and/or characteristics may also be used to define the characteristics of the cell phenotypes described above.
Использовали Cell Ranger VDJ для получения последовательностей и аннотаций VDJ одиночных клеток для каждой 5'-библиотеки одиночной клетки. Программное обеспечение Loupe Cell Browser и пакеты Bioconductor использовали для анализа и визуализации данных.Cell Ranger VDJ was used to obtain single-cell VDJ sequences and annotations for each single-cell 5' library. Loupe Cell Browser software and Bioconductor packages were used for data analysis and visualization.
РезультатыResults
Целью данного примера является сравнение состояния Т-клеток между очищенными T-клетками, которые выступали в качестве исходных клеток, CAR-T-клетками, изготовленными с использованием способа ARM (обозначенными как клетки "дня 1"), и CAR-T-клетками, изготовленными с использованием способа TM (обозначенными как клетки "дня 9"), с помощью секвенирования РНК одиночных клеток (scRNA-seq). Кроме того, проводили секвенирование TCR одиночных клеток (scTCR-seq) для исследования клональности и отслеживания дифференцировки клеток от исходного материала до материала после изготовления.The purpose of this example is to compare the T cell status between purified T cells that served as parental cells, CAR-T cells manufactured using the ARM method (referred to as "
Как показано на фиг. 23A-23C, исходные клетки характеризовались наименьшей экспрессией генов и UMI, что позволяет предположить, что такие клетки не были транскрипционно активными и находились в покоящемся состоянии. Клетки дня 1 и дня 9 экспрессировали больше генов, при этом клетки дня 9 были наиболее транскрипционно активными. Аналогичные результаты показаны на фиг. 24A-24D. Исходные клетки не экспрессировали гены, отвечающие за пролиферацию (фиг. 24A и 24D).As shown in Figs. 23A-23C, naive cells had the lowest gene expression and UMI, suggesting that these cells were not transcriptionally active and were in a quiescent state.
Дополнительные данные анализа набора генов показаны на фиг. 25A-25E. Разные популяции клеток сравнивали с использованием медианных баллов наборов генов. Клетки дня 1 и исходные клетки находились в более молодом состоянии, более подобном стволовым клеткам памяти (фиг. 25A-25C). На фиг. 25A значения медианного балла набора генов (активируемые в TEM относительно подавляемых в TSCM) для клеток дня 1, клеток дня 9 и исходных клеток составляют -0,084, 0,035 и -0,1 соответственно. На фиг. 25B значения медианного балла набора генов (активируемые в Treg относительно подавляемых в Teff) для клеток дня 1, клеток дня 9 и исходных клеток составляют -0,082, 0,087 и -0,071 соответственно. На фиг. 25C значения медианного балла набора генов (подавляемые в состоянии стволовости) для клеток дня 1, клеток дня 9 и исходных клеток составляют -0,062, 0,14 и -0,081 соответственно.Additional gene set analysis data are shown in Figs. 25A-25E. Different cell populations were compared using median gene set scores.
Кроме того, клетки дня 1 находились в более оптимальном метаболическом состоянии по сравнению с клетками дня 9 (фиг. 25D и 25E). На фиг. 25D значения медианного балла набора генов (активируемые при гипоксии) для клеток дня 1, клеток дня 9 и исходных клеток составляют 0,019, 0,11 и -0,096 соответственно. На фиг. 25E значения медианного балла набора генов (активируемые при аутофагии) для клеток дня 1, клеток дня 9 и исходных клеток составляют 0,066, 0,11 и -0,09 соответственно.In addition,
Исходные клетки включали четыре кластера, выделенные на основании экспрессии генов. Кластер 0 характеризуется высокой экспрессией LMNA, S100A4 и т. д. Кластер 1 характеризуется высокой экспрессией RP913, PRKCQ-AS1 и т. д. Кластер 2 характеризуется высокой экспрессией PR11-291B21.2, CD8B и т. д. Кластер 3 характеризуется высокой экспрессией NKG7, GZMH, CCL5, CST7, GNLY, FGFBP2, GZMA, CCL4, CTSW, CD8A и т. д. На графике, построенном методом нелинейного снижения размерности и визуализации многомерных переменных (TSNE), для исходных клеток кластер 3 отделялся от других клеток, и кластер 1 и кластер 2 было тяжело отличить.The original cells included four clusters based on gene expression.
В соответствии с анализом набора генов, показанным на фиг. 26A-26C, кластер 0 и кластер 3 были обогащены фенотипом регуляторных T-клеток по сравнению с кластером 1 и кластером 2, которые были обогащены фенотипом эффектoрных T-клеток. В кластере 3 преобладали поздние T-клетки памяти/эффектoрные T-клетки памяти (TEM), в кластере 1 и кластере 2 - ранние Т-клетки памяти и необученные Т-клетки, и кластер 0 находится посередине. Большинство исходных клеток находились в состоянии необученных и ранних Т-клеток памяти. Не ограничиваясь какой-либо теорией, полагают, что такие клетки могут проявлять себя лучше всего в ходе процедуры изготовления.According to the gene set analysis shown in Fig. 26A-26C,
Меньшая транскрипционная гетерогенность наблюдалась у клеток дня 1 и клеток дня 9 (данные не показаны).Less transcriptional heterogeneity was observed between
Как и исходная популяция, клетки дня 1 демонстрировали более крупный кластер ранних клеток памяти и менее крупный кластер поздних клеток памяти на графике TSNE. Это было сходно с тем, что наблюдалось с кластером 3 исходных клеток. В отличие от этого, клетки дня 9 не демонстрировали отдельных кластеров ранних клеток памяти на графике TSNE. Это означает, что ко дню 9 клетки стали более однородными.Like the original population,
Секвенировали TCR, и измеряли разнообразие клонотипов. В целом, три профиля клонотипов были очень плоскими - большинство клонов встречались только один раз (фиг. 27A-27C и таблица 24). Энтропия Шеннона в таблице 24 является мерой плосковершинности распределения. Преобладающими клонами в исходных клетках являлись поздние клетки памяти. График для клеток дня 1 выглядел сходно с графиком для исходных клеток, но начинал выравниваться. Ко дню 9 график для преобладающих клонов существенно выравнивался, и распределение было намного более плосковершинным. Показатель разнообразия был наиболее высоким в день 9, поскольку для клеток дня 9 наблюдалось намного более равномерное и плосковершинное распределение, чем для исходных клеток или клеток дня 1.The TCR was sequenced and clonotype diversity was measured. Overall, the three clonotype profiles were very flat, with most clones occurring only once (Figs. 27A–27C and Table 24). The Shannon entropy in Table 24 is a measure of the flatness of the distribution. The predominant clones in the parental cells were late memory cells. The plot for
Сводка результатовSummary of results
Наблюдались значительные отличия в состоянии Т-клеток между продуктами дня 1 и дня 9. Клетки дня 1 были намного более подобными исходным клеткам и характеризовались обогащением сигнатурами стволовости, что указывало на более эффективный продукт.Significant differences in T cell status were observed between
Пример 9. Котрансдукция CAR для BCMA и CAR для CD19, оценивание MOI и исследования эффективностиExample 9. Cotransduction of CAR for BCMA and CAR for CD19, MOI assessment and efficacy studies
В данном примере описано определение характеристик CAR-Т-клеток, полученных путем котрансдукции Т-клеток с помощью лентивирусного вектора, кодирующего CAR для BCMA, и лентивирусного вектора, кодирующего CAR для CD19. CAR для BCMA содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 107, а CAR для CD19 содержит аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 225.This example describes the characterization of CAR T cells generated by cotransducing T cells with a lentiviral vector encoding a CAR for BCMA and a lentiviral vector encoding a CAR for CD19. The CAR for BCMA comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 107, and the CAR for CD19 comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 225.
Получение клеток и трансдукция CARCell production and CAR transduction
Четыре разные комбинации MOI для CAR для BCMA и CD19 при трансдукции Т-клеток тестировали в формате 24-луночного планшета. Лентивирусный вектор, кодирующий CAR для BCMA, и лентивирусный вектор, кодирующий CAR для CD19, использовали при MOI, составляющей 5 и 1 соответственно (5/1 на фиг. 28A и 28B); 5 и 0,5 соответственно (5/0,5 на фиг. 28A и 28B); 2,5 и 1 соответственно (2,5/1 на фиг. 28A и 28B) или 2,5 и 0,5 соответственно (2,5/0,5 на фиг. 28A и 28B). Т-клетки, очищенные на Prodigy, высевали при 3e6/мл, 1 мл/лунка в 24-луночные планшеты, и добавляли векторы, кодирующие CAR как для BCMA, так и для CD19 при разных MOI, как указано выше. После высевания добавляли полимерную наноматрицу TransAct (Miltenyi Biotec), конъюгированную с агонистическими антителами к CD3 и к CD28. Клетки инкубировали в полной среде для Т-клеток OpTmizer, содержащей 100 МЕ/мл рекомбинантного IL-2 человека (Prometheus, Сан-Диего, Калифорния) и 2% ICRS (Life Technologies), при 37°C и 5% CO2 в течение 24 часов перед сбором.Four different MOI combinations for BCMA and CD19 CARs in T cell transduction were tested in a 24-well plate format. The lentiviral vector encoding the BCMA CAR and the lentiviral vector encoding the CD19 CAR were used at MOIs of 5 and 1, respectively (5/1 in Fig. 28A and 28B); 5 and 0.5, respectively (5/0.5 in Fig. 28A and 28B); 2.5 and 1, respectively (2.5/1 in Fig. 28A and 28B), or 2.5 and 0.5, respectively (2.5/0.5 in Fig. 28A and 28B). Prodigy purified T cells were seeded at 3e6 /ml, 1 ml/well in 24-well plates and vectors encoding CARs for both BCMA and CD19 were added at different MOIs as above. After seeding, TransAct polymer nanoarray (Miltenyi Biotec) conjugated with anti-CD3 and anti-CD28 agonist antibodies was added. Cells were incubated in OpTmizer complete T cell medium containing 100 IU/ml recombinant human IL-2 (Prometheus, San Diego, CA) and 2% ICRS (Life Technologies) at 37°C and 5% CO2 for 24 h prior to harvest.
Затем клетки трижды промывали 3-кратным объемом PBS+1% HAS. После культивирования и промывания собранного материала оценивали жизнеспособность и количество клеток, чтобы определить влияние титрования вектора на конечный продукт.The cells were then washed three times with 3x PBS+1% HAS. After culturing and washing the collected material, cell viability and number were assessed to determine the effect of vector titration on the final product.
Затем клетки повторно культивировали при 1×106 VNC/мл в 24-луночном планшете и инкубировали в течение еще 6 дней. Анализ методом FACS для оценки экспрессии CAR для BCMA проводили в дни 4 и 7 после трансдукции (дни 3 и 6 после сбора).Cells were then re-cultured at 1× 106 VNC/mL in a 24-well plate and incubated for an additional 6 days. FACS analysis to assess CAR expression for BCMA was performed on
Анализ экспрессии CARCAR expression analysis
Образцы измеряли на проточном цитометре (BD LSRFortessa), и данные анализировали с помощью программного обеспечения FlowJo. В способе ARM, поскольку CAR может не полностью интегрироваться и экспрессироваться ex vivo в течение 24 часов, 96 часов после добавления вируса могут служить в качестве суррогатного момента времени для определения стратегии введения доз in vitro и in vivo при стабильной экспрессии CAR. Ту же стратегию применяли для измерений коктейля CAR с двойным нацеливанием.Samples were measured on a flow cytometer (BD LSRFortessa) and data were analyzed using FlowJo software. In the ARM method, since CAR may not be fully integrated and expressed ex vivo for 24 hours, 96 hours after virus addition can serve as a surrogate time point to determine the in vitro and in vivo dosing strategy with stable CAR expression. The same strategy was used for dual-targeting CAR cocktail measurements.
Анализы методом FACS указывали на то, что котрансдукция Т-клеток с помощью CAR для BCMA и CD19 приводила к образованию трех разных CAR+ субпопуляций, и их относительные доли варьировались при тестировании четырех разных комбинаций MOI (фиг. 28A), что указывает на возможность успешного получения продукта на основе коктейля CAR-T путем котрансдукции CAR для BCMA и CD19. При MOI, составляющей 5/0,5, доля моно-BCMA-CAR+ (CD19-CAR-отрицательных) была наиболее высокой и составляла 20,7%, за ней следовала доля дважды CAR+, составляющая 16,2%, и моно-CD19-CAR+, составляющая 10,5%. Общая доля BCMA-CAR+, рассчитанная как % дважды CAR+ и моно-BCMA-CAR+, составляла 36,9%, а общая доля CD19-CAR+ составляла 26,7% (фиг. 28A и 28B). Оба из соотношений MOI, составляющих 2,5/0,5 и 2,5/1, приводили к намного более высокому % моно-CD19-CAR+, чем % дважды+ и % моно-BCMA-CAR+. Более того, % дважды CAR+ положительно коррелирует с показателем общего использования MOI (фиг. 28B). Общий % CAR+ является сходным между MOI, составляющей 5/1, и MOI, составляющей 5/0,5. Наблюдалось, что экспрессия CAR в каждой популяции была относительно стабильной с дня 4 по день 7 после трансдукции, в том числе в Т-клетках, трансдуцированных с помощью CAR для BCMA или CD19 (фиг. 28A и 28B). Данные были согласующимися для трех доноров. В некоторых вариантах осуществления использовали MOI, составляющую 4~5 для CAR для BCMA, и MOI, составляющую 0,5 для CAR для CD19, для котрансдукции с целью получения коктейля CAR-T с двойным нацеливанием.FACS analyses indicated that cotransduction of T cells with CARs for BCMA and CD19 resulted in three distinct CAR+ subsets, and their relative proportions varied across four different MOI combinations tested (Fig. 28A), indicating that a CAR-T cocktail product could be successfully generated by cotransducing CARs for BCMA and CD19. At an MOI of 5/0.5, the proportion of mono-BCMA-CAR+ (CD19-CAR-negative) was the highest at 20.7%, followed by double-CAR+ at 16.2% and mono-CD19-CAR+ at 10.5%. The total BCMA-CAR+ fraction, calculated as % double CAR+ and % mono-BCMA-CAR+, was 36.9%, and the total CD19-CAR+ fraction was 26.7% (Fig. 28A and 28B). Both the 2.5/0.5 and 2.5/1 MOI ratios resulted in a significantly higher % mono-CD19-CAR+ than % double+ and % mono-BCMA-CAR+. Moreover, % double CAR+ was positively correlated with the total MOI utilization rate (Fig. 28B). The total CAR+ % was similar between the 5/1 MOI and the 5/0.5 MOI. It was observed that CAR expression in each population was relatively stable from
Кроме того, эксперименты в крупномасштабном объеме проводили полностью на CliniMACS Prodigy от обогащения Т-клеток, посева Т-клеток, активации, трансдукции и культивирования до промывания собранного материала в CentriCult перед составлением и криоконсервацией. Использовали MOI, составляющую 4/0,5 или 4,75/0,5, для CAR для BCMA/CD19. В данном исследовании использовали плотность высевания 3e6/мл в общем объеме 250 мл для получения общего количества 7,5e8 клеток. Клетки собирали через 24 часа, промывали 3 раза с помощью PBS+1% HAS и криоконсервировали для последующего применения. Оставшиеся Т-клетки собирали для получения соответствующих контрольных групп UTD, BCMA-CAR-T и CD19-CAR-T. Отбирали аликвоту и повторно культивировали при 1e6/мл в 24-луночном планшете для анализов методом проточной цитометрии с целью оценки экспрессии BCMA-CAR в день 4 после трансдукции.Additionally, large scale experiments were performed entirely on the CliniMACS Prodigy from T cell enrichment, T cell seeding, activation, transduction and culture to harvest wash in CentriCult prior to formulation and cryopreservation. MOIs of 4/0.5 or 4.75/0.5 were used for BCMA/CD19 CARs. In this study, a seeding density of 3e6 /mL was used in a total volume of 250 mL to yield a total of 7.5e8 cells. Cells were harvested after 24 h, washed 3 times with PBS+1% HAS and cryopreserved for subsequent use. The remaining T cells were pooled to generate the respective UTD, BCMA-CAR-T and CD19-CAR-T controls. An aliquot was removed and recultured at 1e6 /ml in a 24-well plate for flow cytometric analysis to assess BCMA-CAR expression at
На фиг. 29 показано, что коктейль CAR-T с двойным нацеливанием содержал 11,8% моно-BCMA-CAR-Т-клеток, 4,31% CAR-Т-клеток с двойной специфичностью и ~ 9% моно-CD19-CAR-Т-клеток в день 4 после трансдукции. В данном исследовании общий % BCMA-CAR+, рассчитанный как % дважды CAR+ плюс % моно-BCMA-CAR+, составлял 16%; а общий % CD19-CAR+, рассчитанный как % дважды CAR+ плюс % моно-CD19-CAR+, составлял 13,4%.Figure 29 shows that the dual-targeting CAR-T cocktail contained 11.8% mono-BCMA CAR T cells, 4.31% dual-specificity CAR T cells, and ~9% mono-CD19 CAR T cells at
Активность коктейля CAR-T с двойным нацеливанием in vivo анализировали в трех ксенотрансплантатных мышиных моделях: 1) модели множественной миеломы из KMS-11-luc (эта модель, экспрессирующая BCMA, мечена репортерной люциферазной конструкцией, что позволяет отслеживать заболевание системно в костном мозге посредством биолюминесцентной визуализации); 2) смешанной модели опухоли, созданной путем смешивания 95% клеток миеломы KMS-11-luc с 5% CD19+ опухолевых клеток (например, Nalm-6-luc) для имитации гетерогенности у пациентов с ММ; и 3) модели Nalm-6-luc для оценивания специфичности нацеливания на CD19 и дополнительного размножения популяции дважды положительных CAR-T в коктейле CAR-T с двойным нацеливанием. BCMA-CAR-T и CD19-CAR-T служили в качестве контролей для их соответствующих моделей. Для расчета дозы CAR-T-клеток для моделей 1 и 2 измеряли общий % BCMA-CAR+ в день 4 после трансдукции, тогда как для модели 3 измеряли общий % CD19-CAR+ в день 4 после трансдукции. Доза UTD отражала наиболее высокую дозу общей популяции Т-клеток в соответствующем способе.The in vivo activity of a dual-targeting CAR-T cocktail was analyzed in three xenograft mouse models: 1) a KMS-11-luc multiple myeloma model (this BCMA-expressing model is labeled with a luciferase reporter construct, allowing the disease to be monitored systemically in the bone marrow via bioluminescent imaging); 2) a mixed tumor model created by mixing 95% KMS-11-luc myeloma cells with 5% CD19+ tumor cells (e.g., Nalm-6-luc) to mimic the heterogeneity in MM patients; and 3) a Nalm-6-luc model to assess the specificity of CD19 targeting and further expand the double-positive CAR-T population in the dual-targeting CAR-T cocktail. BCMA-CAR-T and CD19-CAR-T served as controls for their respective models. To calculate the CAR-T cell dose for
Кривые регрессии опухоли для всех групп в трех моделях показаны на фиг. 30A-E. В модели KMS-11-luc как коктейль CAR-T с двойным нацеливанием, так и BCMA-CAR-T индуцировали регрессию опухоли дозозависимым образом, как показано на фиг. 30A. При дозе 1e4 как коктейль CAR-T с двойным нацеливанием, так и BCMA-CAR-T демонстрировали отсроченное ингибирование опухоли со сходной скоростью, и оба они смогли обеспечить очистку от опухоли в конце исследования. Коктейль CAR-T с двойным нацеливанием продемонстрировал более эффективную очистку от опухоли, чем BCMA-CAR-T, при дозе 5e4, при этом коктейль CAR-T с двойным нацеливанием обеспечивал очистку от опухоли ко дню 14 после инфузии CAR-T, тогда как BCMA-CAR-T демонстрировал эффект, отсроченный на по меньшей мере одну неделю. В повторном исследовании с использованием остальных клеточных продуктов из той же партии, охватывающем более широкие диапазоны доз (1e4, 5e4, 1,5e5) (фиг. 30B), зависимость от дозы подтверждали при регрессии опухоли с помощью коктейля CAR-T с двойным нацеливанием. Кривые регрессии для коктейля CAR-T с двойным нацеливанием при 1,5e5, 5e4 и для BCMA-CAR-T при 1,5e5 накладываются друг на друга. BCMA-CAR-T при 5e4 смог устранить опухоль ко дню 14 после инфузии CAR-T у этой когорты мышей, несмотря на несколько более медленную регрессию опухоли, чем в случае с коктейлем CAR-T с двойным нацеливанием при той же дозе в течение 14 дней после инфузии CAR-T. При дозе 1е4 коктейль CAR-T с двойным нацеливанием демонстрировал лучшую эффективность, чем BCMA-CAR-T. Вкратце, с использованием модели KMS-11-luc было продемонстрировано, что коктейль CAR-T с двойным нацеливанием был способен специфично нацеливаться на BCMA, демонстрировал такую же активность, как BCMA-CAR-T, при уничтожении BCMA+ опухолевых клеток множественной миеломы и был даже более активным, чем BCMA-CAR-T, при более низких дозах. Tumor regression curves for all groups in the three models are shown in Figs. 30A-E. In the KMS-11-luc model, both the dual-targeting CAR-T cocktail and BCMA-CAR-T induced tumor regression in a dose-dependent manner, as shown in Fig. 30A. At the 1e 4 dose, both the dual-targeting CAR-T cocktail and BCMA-CAR-T demonstrated delayed tumor inhibition at a similar rate, and both were able to achieve tumor clearance at the end of the study. The dual-targeting CAR-T cocktail demonstrated more effective tumor clearance than BCMA-CAR-T at the 5e 4 dose, with the dual-targeting CAR-T cocktail achieving tumor clearance by
Далее эффективность коктейля CAR-T с двойным нацеливанием оценивали при наличии как BCMA, так и CD19 в "смешанной" модели, в которой клетки KMS-11-luc, смешанные с 5% клеток Nalm-6-luc, имплантировали мышам. В смешанной модели опухоли, как показано на фиг. 30C, только коктейль CAR-T с двойным нацеливанием при 5e4 и 1e4 демонстрировал частичное ингибирование опухоли дозозависимым образом, тогда как ни BCMA-CAR-T, ни CD19-CAR-T не показали никакого эффекта при дозе 5e4. В повторном исследовании, охватывающем группу с более высокой дозой, как показано на фиг. 30D, было продемонстрировано, что коктейль CAR-T с двойным нацеливанием при 1,5e5 был способен устранить смешанные опухоли ко дню 14 после инфузии CAR-T, и подавление опухоли было дозозависимым. В отличие от этого, BCMA-CAR-T и CD19-CAR-T при 1,5e5 демонстрировали лишь частичное ингибирование опухоли в этой смешанной модели при наличии как BCMA, так и CD19.Next, the efficacy of the dual-targeting CAR-T cocktail was assessed in the presence of both BCMA and CD19 in a “mixed” model in which KMS-11-luc cells mixed with 5% Nalm-6-luc cells were implanted in mice. In the mixed tumor model, as shown in Fig. 30C, only the dual-targeting CAR-T cocktail at 5e4 and 1e4 showed partial tumor inhibition in a dose-dependent manner, whereas neither BCMA-CAR-T nor CD19-CAR-T showed any effect at the 5e4 dose. In a replication study involving a higher dose group, as shown in Fig. 30D, it was demonstrated that the dual-targeting CAR-T cocktail at 1.5e5 was able to eradicate mixed tumors by
Наконец, модель Nalm-6-luc использовали для того, чтобы показать, может ли коктейль CAR-T с двойным нацеливанием специфично нацеливаться на CD19+ опухоль. Как показано на фиг. 30E, коктейль CAR-T с двойным нацеливанием также был способен устранять опухоли Nalm-6-luc дозозависимым образом, что было сравнимым с моно-CD19-CAR-T при более высокой дозе и было лучше, чем для моно-CD19-CAR-T при более низкой дозе.Finally, the Nalm-6-luc model was used to show whether the dual-targeting CAR-T cocktail could specifically target CD19+ tumors. As shown in Fig. 30E, the dual-targeting CAR-T cocktail was also able to eliminate Nalm-6-luc tumors in a dose-dependent manner that was comparable to mono-CD19-CAR-T at the higher dose and was better than mono-CD19-CAR-T at the lower dose.
Пример 10. Оценивание MOI для изготовления клеточного продукта на основе BCMA/CD19-CAR-TExample 10. MOI evaluation for manufacturing a BCMA/CD19-CAR-T cell product
Исходя из титра, определенного с помощью qPCR, проводили титрование вируса, кодирующего CAR для BCMA, для определения оптимального соотношения векторов, кодирующих CAR для BCMA/CAR для CD19. Вкратце, Т-клетки размораживали и ресуспендировали при плотности 3×106 VNC/мл или 6×106 VNC/мл. Для каждой тестируемой MOI 1 мл суспензии клеток высевали в 24-луночный планшет, подвергали трансдукции в момент времени 0 и инкубировали в течение 20-24 часов. Затем 1 мл каждой культуры вручную промывали с помощью 3×2 мл PBS+1% HSA. После культивирования и промывания собранного материала оценивали жизнеспособность и количество клеток, чтобы определить влияние титрования вектора на конечный продукт. Затем собранные клетки помещали в культуру при 1×106 VNC/мл и измеряли экспрессию CAR (для BCMA и для CD19) через 72 часа и 144 часа после сбора (в день 3 и день 6 после сбора (PH) (в день 4 и день 7 после трансдукции), таблица 34 и фиг. 31).Based on the titer determined by qPCR, titration of BCMA CAR-encoding virus was performed to determine the optimal BCMA CAR/CD19 CAR vector ratio. Briefly, T cells were thawed and resuspended at a density of 3 x 106 VNC/mL or 6 x 106 VNC/mL. For each MOI tested, 1 ml of the cell suspension was seeded into a 24-well plate, transduced at
CAR для BCMA/CAR для CD19MOI (TE/cell),
CAR for BCMA/CAR for CD19
День 3 PH День 6 PH% CAR (total population with CAR for BCMA = population with mono-BCMA-CAR + population with dual CAR for BCMA/CD19)
День 3 PH
День 6 PH% mono-CD19-CAR
В некоторых вариантах осуществления общее количество жизнеспособных BCMA-CAR+ Т-клеток, измеренное с помощью проточной цитометрии, в день 4 после трансдукции (или в день 3 после сбора) используют для расчетов, связанных с дозой. В некоторых вариантах осуществления Т-клетки высевают при плотности, составляющей приблизительно 4e6 VNC/мл, в CentriCult. В некоторых вариантах осуществления вектор, кодирующий CAR для BCMA, используют при MOI, составляющей 4,75, а вектор, кодирующий CAR для CD19, используют при MOI, составляющей 0,5.In some embodiments, the total number of viable BCMA-CAR+ T cells measured by flow cytometry at
В отдельном исследовании BCMA/CD19-CAR-Т-клетки изготавливали с использованием описанного выше подхода быстрого изготовления с котрансдукцией в большом масштабе в устройстве с автоматизированной закрытой системой CliniMACS Prodigy. Вкратце, процесс начинается с отбора Т-клеток из криоконсервированной лейкоцитарной массы. Т-клетки подвергают положительному отбору с помощью микрогранул с антителами к CD4 и CD8. После отбора Т-клетки элюируют в мешок для повторного применения, и образец отбирают для оценки концентрации, жизнеспособности и чистоты клеток. Затем клетки активируют и подвергают трансдукции с помощью лентивирусного вектора, кодирующего CAR для BCMA, и лентивирусного вектора, кодирующего CAR для CD19. Как показано на фиг. 32, субпопуляции Т-клеток в выходном материале из Prodigy не отличались от исходного материала для афереза.In a separate study, BCMA/CD19 CAR T cells were manufactured using the rapid co-transduction manufacturing approach described above at scale in a CliniMACS Prodigy automated closed system device. Briefly, the process begins with the selection of T cells from cryopreserved buffy coated cells. T cells are positively selected with anti-CD4 and anti-CD8 microbeads. Following selection, T cells are eluted into a reuse bag and a sample is collected for assessment of cell concentration, viability, and purity. Cells are then activated and transduced with a lentiviral vector encoding a CAR for BCMA and a lentiviral vector encoding a CAR for CD19. As shown in Fig. 32, the T cell subsets in the Prodigy output were indistinguishable from the apheresis input.
Пример 11. Дополнительное определение характеристик Т-клеток, сконструированных таким образом, что они экспрессируют CAR для BCMA и CAR для CD19Example 11. Further characterization of T cells engineered to express CAR for BCMA and CAR for CD19
В данном примере описано дополнительное определение характеристик клеточного продукта на основе BCMA/CD19-CAR-T, который получали, как описано в примере 9. Этот клеточный продукт содержит три разные CAR+ популяции: моно-BCMA-CAR-T-клетки, моно-CD19-CAR-T-клетки и дважды положительные BCMA/CD19-CAR-T-клетки. Кроме того, этот клеточный продукт также содержит популяцию нетрансдуцированных Т-клеток.This example describes further characterization of a BCMA/CD19-CAR-T cell product that was produced as described in Example 9. This cell product contains three different CAR+ populations: mono-BCMA-CAR-T cells, mono-CD19-CAR-T cells, and double-positive BCMA/CD19-CAR-T cells. In addition, this cell product also contains a population of untransduced T cells.
IFNγ в плазме крови мышей, обработанных с помощью клеточного продукта на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19 IFN γ in plasma of mice treated with a BCMA/CD19 dual-targeting CAR-T cell product
IFNγ является отличительным признаком активации CAR-T-клеток в ответ на связывание с мишенью. Кинетические показатели IFNγ в плазме крови анализировали в исследованиях in vivo, описанных в примере 9. Как показано на фиг. 33A и 33B, все группы, обработанные с помощью CAR-T, демонстрировали низкие уровни циркулирующего IFNγ (10-50 пг/мл) в день 2, а затем продолжающееся увеличение секреции IFNγ.IFNγ is a hallmark of CAR-T cell activation in response to target binding. Plasma IFNγ kinetics were analyzed in the in vivo studies described in Example 9. As shown in Figs. 33A and 33B, all CAR-T-treated groups demonstrated low levels of circulating IFNγ (10-50 pg/mL) at
Фармакокинетические показатели и метаболизм в неклинических исследованияхPharmacokinetic parameters and metabolism in non-clinical studies
Размножение клеточного продукта на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19 в периферической крови (содержащего моно-BCMA-, моно-CD19- и дважды положительные BCMA/CD19-CAR-T-клетки) анализировали с помощью проточной цитометрии в течение вплоть до 3 недель после инфузии и сравнивали с эталонным BCMA-CAR-T в модели KMS-11-luc. Во всех группах обработки с помощью CAR-T наблюдалось размножение как CD3+ Т-клеток, так и CAR+ Т-клеток. Для клеточного продукта на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19 в популяции дважды+ или моно-CAR+ T-клеток наблюдалось дозозависимое размножение клеток. На основании данных из двух исследований клеточный продукт на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19 демонстрировал несколько более интенсивное размножение CAR+ Т-клеток, нацеливающихся на BCMA, и общей популяции CAR+ Т-клеток по сравнению с BCMA-CAR-T.Peripheral blood expansion of the BCMA/CD19 dual-specific CAR-T cell product (comprising mono-BCMA, mono-CD19, and double-positive BCMA/CD19 CAR-T cells) was analyzed by flow cytometry for up to 3 weeks post-infusion and compared to the reference BCMA CAR-T in the KMS-11-luc model. Both CD3+ T cell and CAR+ T cell expansion were observed in all CAR-T treatment groups. Dose-dependent cell expansion was observed for the BCMA/CD19 dual-specific CAR-T cell product in the double-positive or mono-CAR+ T cell population. Based on data from two studies, the BCMA/CD19 dual-specificity CAR-T cell product demonstrated slightly greater expansion of BCMA-targeting CAR+ T cells and the total CAR+ T cell population compared with BCMA-CAR-T.
Антигензависимое размножение клеточного продукта на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19 демонстрировали путем оценки размножения CAR+ Т-клеток в трех моделях (KMS-11, Nalm-6 и смешанной). В ксенотрансплантатной модели KMS-11, экспрессирующей BCMA, интенсивно размножались дважды положительные BCMA/CD19- и моно-BCMA-CAR+ Т-клетки, тогда как в ксенотрансплантатной модели Nalm-6, экспрессирующей CD19, интенсивно размножались дважды положительные BCMA/CD19- и моно-CD19-CAR+ Т-клетки. Популяция дважды положительных CAR-T-клеток была способна размножаться при активации антигеном BCMA либо CD19 в отдельности. Начальные скорости размножения дважды положительных BCMA/CD19- и моно-BCMA-CAR+ Т-клеток были сопоставимыми в модели KMS-11, равно как и скорости размножения дважды CAR-положительных и моно-CD19-CAR+ Т-клеток в модели Nalm-6.Antigen-dependent expansion of the BCMA/CD19 dual-specificity CAR-T cell product was demonstrated by assessing CAR+ T cell expansion in three models (KMS-11, Nalm-6, and mixed). In the BCMA-expressing KMS-11 xenograft model, BCMA/CD19 double-positive and mono-BCMA-CAR+ T cells were extensively expanded, whereas in the CD19-expressing Nalm-6 xenograft model, BCMA/CD19 double-positive and mono-CD19-CAR+ T cells were extensively expanded. The double-positive CAR-T cell population was able to expand upon activation with either BCMA or CD19 antigen alone. The initial expansion rates of double-positive BCMA/CD19- and mono-BCMA-CAR+ T cells were comparable in the KMS-11 model, as were the expansion rates of double-CAR-positive and mono-CD19-CAR+ T cells in the Nalm-6 model.
ВыводыConclusions
Клеточный продукт на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19 представляет собой новый продукт на основе CAR-T-клеток с двойным нацеливанием на BCMA и на CD19, полученный с использованием способа быстрого изготовления, в котором сохраняется стволовость Т-клеток.The BCMA/CD19 Dual Specificity CAR-T Cell Product is a novel CAR-T cell product with dual targeting of BCMA and CD19, produced using a rapid manufacturing process that preserves T cell stemness.
В трех ксенотрансплантатных мышиных моделях (KMS-11, Nalm-6 и смешанной) клеточный продукт на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19 демонстрировал сильные фармакологические характеристики in vivo, контролируя рост опухоли, индуцируя размножение CAR-T и продуцирование цитокинов антигензависимым и дозозависимым образом.In three xenograft mouse models (KMS-11, Nalm-6 and mixed), the dual-specificity BCMA/CD19 CAR-T cell product demonstrated potent in vivo pharmacological properties by controlling tumor growth, inducing CAR-T expansion and cytokine production in an antigen-dependent and dose-dependent manner.
Устранение опухоли в смешанной модели достигалось при использовании клеточного продукта на основе CAR-T с двойным нацеливанием на BCMA/CD19, при этом регрессия опухоли увеличивалась дозозависимым образом. Ни моно-BCMA-CAR-T, ни моно-CD19-CAR-T не демонстрировали регрессию опухоли в смешанной модели. Кроме того, клеточный продукт на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19 демонстрировал обширное размножение CAR-T in vivo, тогда как дважды CAR-положительная популяция размножалась при активации с помощью BCMA либо CD19 в отдельности. В модели множественной миеломы из KMS-11-luc клеточный продукт на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19 демонстрировал улучшение контроля роста опухоли при более высоких тестируемых уровнях дозы и лучший контроль роста опухоли при более низком тестируемом уровне дозы по сравнению с BCMA-CAR-T.Tumor eradication in the mixed model was achieved with the BCMA/CD19 dual-targeting CAR-T cell product, with tumor regression increasing in a dose-dependent manner. Neither mono-BCMA-CAR-T nor mono-CD19-CAR-T demonstrated tumor regression in the mixed model. Furthermore, the BCMA/CD19 dual-targeting CAR-T cell product demonstrated extensive CAR-T expansion in vivo , whereas the dual-positive CAR-T population expanded when activated by either BCMA or CD19 alone. In the KMS-11-luc multiple myeloma model, the BCMA/CD19 dual-targeting CAR-T cell product demonstrated improved tumor growth control at higher dose levels tested and better tumor growth control at lower dose levels tested compared to BCMA-CAR-T.
Эти результаты подтверждают, что клеточный продукт на основе CAR-T с двойной специфичностью к BCMA/CD19 представляет собой CAR-T с двойным нацеливанием, который может изменить клинические исходы путем решения проблемы потенциального вклада BCMA-/CD19+ стволовых клеток/клеток-предшественников в рецидив множественной миеломы, потенциально обеспечивая более глубокие и более продолжительные ответы, чем CAR-T, изготовленные традиционным способом или нацеливающиеся на один антиген BCMA.These results confirm that the BCMA/CD19 dual-specificity CAR-T cell product is a dual-targeting CAR-T that has the potential to transform clinical outcomes by addressing the potential contribution of BCMA-/CD19+ stem/progenitor cells to multiple myeloma relapse, potentially providing deeper and more durable responses than conventionally manufactured CAR-Ts or those targeting a single BCMA antigen.
Пример 12. Клиническое испытание фазы I BCMA-CAR-Т-клеток, изготовленных с использованием способа ARMExample 12. Phase I clinical trial of BCMA CAR T cells manufactured using the ARM method
В данном примере описано открытое исследование фазы I для оценки безопасности и переносимости средства терапии на основе BCMA-CAR-T-клеток, изготовленного с использованием способа ARM, у взрослых пациентов с рецидивирующей и/или рефрактерной множественной миеломой.This example describes an open-label, phase I study to evaluate the safety and tolerability of a BCMA CAR T cell-based therapy manufactured using the ARM process in adult patients with relapsed and/or refractory multiple myeloma.
Первичные показатели исхода включают частоту встречаемости и характер форм ограничивающей дозу токсичности (DLT) в течение первых 28 дней после введения BCMA-CAR-T-клеток, а также частоту встречаемости и тяжесть нежелательных явлений (AE) и серьезных нежелательных явлений (SAE), в том числе изменений лабораторных показателей, ECG и показателей жизненно важных функций после введения BCMA-CAR-T-клеток.Primary outcome measures include the incidence and nature of dose-limiting toxicities (DLTs) within the first 28 days after BCMA-CAR-T cell administration, and the incidence and severity of adverse events (AEs) and serious adverse events (SAEs), including laboratory, ECG, and vital sign changes after BCMA-CAR-T cell administration.
Вторичные показатели исхода включают коэффициент успешности изготовления (определяемый как количество субъектов, получавших лечение в запланированной целевой дозе, деленное на общее количество субъектов, получавших лечение), ORR (долю субъектов с наилучшим общим ответом (BOR) sCR+CR+VGPR+PR в месяцы 3 и 6, определенную местным исследователем с использованием критериев IMWG (Kumar et al., Lancet Oncol. 2016 Aug;17(8): e328-e346, включенная в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте)), CRR (долю субъектов с BOR sCR+CR в месяц 3, определенную местным исследователем с использованием критериев IMWG), DOR согласно оценке местного исследователя (время от достижения sCR+CR+VGPR+PR до рецидива или смерти в связи с ММ), выявляемые с помощью qPCR концентрации трансгена CAR-T с течением времени в периферической крови и костном мозге, а также сводную информацию об уже имеющейся и индуцированной лечением иммуногенности (клеточной и гуморальной) средства терапии на основе BCMA-CAR-T-клеток.Secondary outcome measures include manufacturing success rate (defined as the number of subjects treated at the planned target dose divided by the total number of subjects treated), ORR (the proportion of subjects with best overall response (BOR) of sCR+CR+VGPR+PR at
Критерии включения являются следующими:The inclusion criteria are as follows:
субъекты с MM, у которых проявляется рецидив и/или рефрактерность к по меньшей мере 2 предшествующим режимам лечения, включая IMiD (например, леналидомид или помалидомид), ингибитор протеасом (например, бортезомиб, карфилзомиб) и одобренное антитело к CD38 (например, даратумумаб), при наличии таковых и у которых имеется документально подтвержденное свидетельство прогрессирования заболевания (согласно критериям IMWG);subjects with MM who have relapsed and/or are refractory to at least 2 prior treatment regimens, including an IMiD (eg, lenalidomide or pomalidomide), a proteasome inhibitor (eg, bortezomib, carfilzomib), and an approved anti-CD38 antibody (eg, daratumumab), if available, and who have documented evidence of disease progression (per IMWG criteria);
поддающееся измерению заболевание, определенное протоколом;measurable disease defined by the protocol;
показатель общего состояния по шкале ECOG, составляющий 0 или 1 на момент скрининга;ECOG performance status score of 0 or 1 at the time of screening;
надлежащие гематологические показатели иproper hematological parameters and
наличие материала, полученного путем лейкафереза из немобилизованных клеток, принятого для изготовления.the presence of material obtained by leukapheresis from unmobilized cells, accepted for manufacturing.
Критерии исключения являются следующими:The exclusion criteria are as follows:
предшествующее введение генетически модифицированного клеточного продукта, в том числе предшествующего средства терапии на основе BCMA-CAR-T. Пациенты, получавшие ранее биспецифические антитела или конъюгаты антитело-лекарственное средство (ADC), направленные на BCMA, не исключаются;prior administration of a genetically modified cell product, including prior BCMA-CAR-T-based therapy. Patients previously treated with bispecific antibodies or antibody-drug conjugates (ADCs) targeting BCMA are not excluded;
аутологичная HSCT в течение 6 недель до включения в исследование или любая предшествующая аллогенная трансплантация гемопоэтических стволовых клеток (HSCT) в анамнезе;autologous HSCT within 6 weeks prior to study inclusion or any previous allogeneic hematopoietic stem cell transplant (HSCT);
химиотерапия или любая сопутствующая противораковая терапия (кроме предписанной протоколом химиотерапии с лимфодеплецией (LD)) в течение 2 недель до афереза;chemotherapy or any concomitant anticancer therapy (except protocol-prescribed chemotherapy with lymphodepletion (LD)) within 2 weeks prior to apheresis;
лечение низкомолекулярными нацеленными антинеопластическими средствами в течение 2 недель до сбора продукта афереза или 5 периодов полужизни, в зависимости от того, какой срок является более коротким; иtreatment with small molecule targeted antineoplastic agents for 2 weeks prior to apheresis product collection or 5 half-lives, whichever is shorter; and
получение антител или иммунотерапевтических средств (кроме даратумумаба) в течение 4 недель до сбора продукта афереза. Даратумумаб в течение 3 недель до сбора продукта афереза.receipt of antibodies or immunotherapeutic agents (except daratumumab) within 4 weeks prior to apheresis collection. Daratumumab within 3 weeks prior to apheresis collection.
Пример 13. Оценивание BCMA/CD19-CAR-T в формате диателаExample 13. Evaluation of BCMA/CD19-CAR-T in diabody format
Эффективность элемента ответа на антиген CD19 в новых CAR-Т в формате одноцепочечного диатела оценивают с помощью модели NALM-6 с люциферазой. 1×106 клеток NALM-6-Luc имплантируют путем инъекции в боковую хвостовую вену в день -7 от введения дозы CAR-T. Измеряют массу тела, и дважды в неделю проводят биолюминесцентную визуализацию (BLI) in vivo для оценивания прогрессирования опухоли. Животных измеряют дважды в неделю, и после достижения опухолевой нагрузки, соответствующей фотонному потоку 3×106 (фотоны/секунда), животных рандомизировали в определенную группу (день -1). В день 0 CAR-Т в формате диатела извлекают из жидкого азота и размораживают для инъекции. 1×106 дважды CAR-положительных клеток инъецируют в боковую хвостовую вену. Экспериментальное оценивание проводят на протяжении нескольких недель, чтобы определить, какая конструкция обладает наилучшей функциональной эффективностью, путем оценивания уменьшения интенсивности в BLI с течением времени.The efficacy of the CD19 antigen response element in the novel single-chain diabody CAR T cells is assessed using the NALM-6 luciferase model. 1 x 10 6 NALM-6-Luc cells are implanted by injection into the lateral tail vein on day -7 of CAR-T dosing. Body weight is measured and in vivo bioluminescence imaging (BLI) is performed twice weekly to assess tumor progression. Animals are measured twice weekly and randomized to a specific group (day -1) after achieving a tumor burden corresponding to a photon flux of 3 x 10 6 (photons/second). On
ЭКВИВАЛЕНТЫEQUIVALENTS
Раскрытия всех без исключения патентов, заявок на патент и публикаций, цитируемых в данном документе, настоящим включены в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте. Несмотря на то, что настоящее изобретение было раскрыто со ссылкой на определенные варианты осуществления, очевидно, что дополнительные варианты осуществления и видоизменения настоящего изобретения могут быть разработаны другими специалистами в данной области без отступления от фактической сущности и объема настоящего изобретения. Предполагается, что прилагаемую формулу изобретения следует истолковывать как включающую все такие варианты осуществления и эквивалентные видоизменения.The disclosures of any and all patents, patent applications and publications cited herein are hereby incorporated by reference in their entirety. Although the present invention has been disclosed with reference to specific embodiments, it is apparent that additional embodiments and modifications of the present invention may be devised by others skilled in the art without departing from the true spirit and scope of the present invention. It is intended that the appended claims be construed as including all such embodiments and equivalent modifications.
--->--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙSEQUENCE LIST
<110> NOVARTIS AG<110> NOVARTIS AG
<120> ХИМЕРНЫЕ АНТИГЕННЫЕ РЕЦЕПТОРЫ И ПУТИ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ<120> CHIMERIC ANTIGEN RECEPTORS AND WAYS OF THEIR APPLICATION
<130> N2067-7166WO<130> N2067-7166WO
<140><140>
<141><141>
<150> 62/940,509<150> 62/940,509
<151> 2019-11-26<151> 2019-11-26
<160> 417<160> 417
<170> PatentIn версия 3.5<170> PatentIn version 3.5
<210> 1<210> 1
<211> 21<211> 21
<212> БЕЛОК<212> PROTEIN
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<221> источник<221> source
<223> /примечание="Описание искусственной последовательности:<223> /note="Description of artificial sequence:
синтетический пептид"synthetic peptide"
<400> 1<400> 1
Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu LeuMet Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Ala Ala Arg ProHis Ala Ala Arg Pro
20 20
<210> 2<210> 2
<211> 45<211> 45
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 2<400> 2
Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile AlaThr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala GlySer Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly
20 25 30 20 25 30
Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys AspGly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp
35 40 4535 40 45
<210> 3<210> 3
<211> 230<211> 230
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 3<400> 3
Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu PheGlu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp ThrLeu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr
20 25 30 20 25 30
Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp ValLeu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly ValSer Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val
50 55 60 50 55 60
Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn SerGlu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser
65 70 75 8065 70 75 80
Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp LeuThr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu
85 90 95 85 90 95
Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro SerAsn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ser
100 105 110 100 105 110
Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu ProSer Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro
115 120 125 115 120 125
Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn GlnGln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln
130 135 140 130 135 140
Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile AlaVal Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala
145 150 155 160145 150 155 160
Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr ThrVal Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr
165 170 175 165 170 175
Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg LeuPro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu
180 185 190 180 185 190
Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys SerThr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser
195 200 205 195 200 205
Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu SerVal Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser
210 215 220 210 215 220
Leu Ser Leu Gly Lys MetLeu Ser Leu Gly Lys Met
225 230225 230
<210> 4<210> 4
<211> 282<211> 282
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 4<400> 4
Arg Trp Pro Glu Ser Pro Lys Ala Gln Ala Ser Ser Val Pro Thr AlaArg Trp Pro Glu Ser Pro Lys Ala Gln Ala Ser Ser Val Pro Thr Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Pro Gln Ala Glu Gly Ser Leu Ala Lys Ala Thr Thr Ala Pro AlaGln Pro Gln Ala Glu Gly Ser Leu Ala Lys Ala Thr Thr Ala Pro Ala
20 25 30 20 25 30
Thr Thr Arg Asn Thr Gly Arg Gly Gly Glu Glu Lys Lys Lys Glu LysThr Thr Arg Asn Thr Gly Arg Gly Gly Glu Glu Lys Lys Lys Glu Lys
35 40 45 35 40 45
Glu Lys Glu Glu Gln Glu Glu Arg Glu Thr Lys Thr Pro Glu Cys ProGlu Lys Glu Glu Gln Glu Glu Arg Glu Thr Lys Thr Pro Glu Cys Pro
50 55 60 50 55 60
Ser His Thr Gln Pro Leu Gly Val Tyr Leu Leu Thr Pro Ala Val GlnSer His Thr Gln Pro Leu Gly Val Tyr Leu Leu Thr Pro Ala Val Gln
65 70 75 8065 70 75 80
Asp Leu Trp Leu Arg Asp Lys Ala Thr Phe Thr Cys Phe Val Val GlyAsp Leu Trp Leu Arg Asp Lys Ala Thr Phe Thr Cys Phe Val Val Gly
85 90 95 85 90 95
Ser Asp Leu Lys Asp Ala His Leu Thr Trp Glu Val Ala Gly Lys ValSer Asp Leu Lys Asp Ala His Leu Thr Trp Glu Val Ala Gly Lys Val
100 105 110 100 105 110
Pro Thr Gly Gly Val Glu Glu Gly Leu Leu Glu Arg His Ser Asn GlyPro Thr Gly Gly Val Glu Glu Gly Leu Leu Glu Arg His Ser Asn Gly
115 120 125 115 120 125
Ser Gln Ser Gln His Ser Arg Leu Thr Leu Pro Arg Ser Leu Trp AsnSer Gln Ser Gln His Ser Arg Leu Thr Leu Pro Arg Ser Leu Trp Asn
130 135 140 130 135 140
Ala Gly Thr Ser Val Thr Cys Thr Leu Asn His Pro Ser Leu Pro ProAla Gly Thr Ser Val Thr Cys Thr Leu Asn His Pro Ser Leu Pro Pro
145 150 155 160145 150 155 160
Gln Arg Leu Met Ala Leu Arg Glu Pro Ala Ala Gln Ala Pro Val LysGln Arg Leu Met Ala Leu Arg Glu Pro Ala Ala Gln Ala Pro Val Lys
165 170 175 165 170 175
Leu Ser Leu Asn Leu Leu Ala Ser Ser Asp Pro Pro Glu Ala Ala SerLeu Ser Leu Asn Leu Leu Ala Ser Ser Asp Pro Pro Glu Ala Ala Ser
180 185 190 180 185 190
Trp Leu Leu Cys Glu Val Ser Gly Phe Ser Pro Pro Asn Ile Leu LeuTrp Leu Leu Cys Glu Val Ser Gly Phe Ser Pro Pro Asn Ile Leu Leu
195 200 205 195 200 205
Met Trp Leu Glu Asp Gln Arg Glu Val Asn Thr Ser Gly Phe Ala ProMet Trp Leu Glu Asp Gln Arg Glu Val Asn Thr Ser Gly Phe Ala Pro
210 215 220 210 215 220
Ala Arg Pro Pro Pro Gln Pro Gly Ser Thr Thr Phe Trp Ala Trp SerAla Arg Pro Pro Pro Gln Pro Gly Ser Thr Thr Phe Trp Ala Trp Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Val Leu Arg Val Pro Ala Pro Pro Ser Pro Gln Pro Ala Thr Tyr ThrVal Leu Arg Val Pro Ala Pro Pro Ser Pro Gln Pro Ala Thr Tyr Thr
245 250 255 245 250 255
Cys Val Val Ser His Glu Asp Ser Arg Thr Leu Leu Asn Ala Ser ArgCys Val Val Ser His Glu Asp Ser Arg Thr Leu Leu Asn Ala Ser Arg
260 265 270 260 265 270
Ser Leu Glu Val Ser Tyr Val Thr Asp HisSer Leu Glu Val Ser Tyr Val Thr Asp His
275 280 275 280
<210> 5<210> 5
<211> 10<211> 10
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 5<400> 5
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 101 5 10
<210> 6<210> 6
<211> 24<211> 24
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 6<400> 6
Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu LeuIle Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysSer Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
20 20
<210> 7<210> 7
<211> 42<211> 42
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 7<400> 7
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
1 5 10 15 1 5 10 15
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
20 25 30 20 25 30
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu LeuPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu
35 40 35 40
<210> 8<210> 8
<211> 48<211> 48
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 8<400> 8
Gln Arg Arg Lys Tyr Arg Ser Asn Lys Gly Glu Ser Pro Val Glu ProGln Arg Arg Lys Tyr Arg Ser Asn Lys Gly Glu Ser Pro Val Glu Pro
1 5 10 15 1 5 10 15
Ala Glu Pro Cys Arg Tyr Ser Cys Pro Arg Glu Glu Glu Gly Ser ThrAla Glu Pro Cys Arg Tyr Ser Cys Pro Arg Glu Glu Glu Gly Ser Thr
20 25 30 20 25 30
Ile Pro Ile Gln Glu Asp Tyr Arg Lys Pro Glu Pro Ala Cys Ser ProIle Pro Ile Gln Glu Asp Tyr Arg Lys Pro Glu Pro Ala Cys Ser Pro
35 40 45 35 40 45
<210> 9<210> 9
<211> 112<211> 112
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 9<400> 9
Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln GlyArg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu TyrGln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr
20 25 30 20 25 30
Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly LysAsp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys
35 40 45 35 40 45
Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln LysPro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys
50 55 60 50 55 60
Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu ArgAsp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg
65 70 75 8065 70 75 80
Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr AlaArg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala
85 90 95 85 90 95
Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgThr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
100 105 110 100 105 110
<210> 10<210> 10
<211> 112<211> 112
<212> PRT<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 10<400> 10
Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln GlyArg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu TyrGln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr
20 25 30 20 25 30
Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly LysAsp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys
35 40 45 35 40 45
Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln LysPro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys
50 55 60 50 55 60
Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu ArgAsp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg
65 70 75 8065 70 75 80
Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr AlaArg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala
85 90 95 85 90 95
Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgThr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
100 105 110 100 105 110
<210> 11<210> 11
<211> 1184<211> 1184
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 11<400> 11
cgtgaggctc cggtgcccgt cagtgggcag agcgcacatc gcccacagtc cccgagaagt 60cgtgaggctc cggtgcccgt cagtgggcag agcgcacatc gcccacagtc cccgagaagt 60
tggggggagg ggtcggcaat tgaaccggtg cctagagaag gtggcgcggg gtaaactggg 120tggggggagg ggtcggcaat tgaaccggtg cctagagaag gtggcgcggg gtaaactggg 120
aaagtgatgt cgtgtactgg ctccgccttt ttcccgaggg tgggggagaa ccgtatataa 180aaagtgatgt cgtgtactgg ctccgccttt ttcccgaggg tggggggagaa ccgtatataa 180
gtgcagtagt cgccgtgaac gttctttttc gcaacgggtt tgccgccaga acacaggtaa 240gtgcagtagt cgccgtgaac gttctttttc gcaacgggtt tgccgccaga acacaggtaa 240
gtgccgtgtg tggttcccgc gggcctggcc tctttacggg ttatggccct tgcgtgcctt 300gtgccgtgtg tggttcccgc gggcctggcc tctttacggg ttatggccct tgcgtgcctt 300
gaattacttc cacctggctg cagtacgtga ttcttgatcc cgagcttcgg gttggaagtg 360gaattacttc cacctggctg cagtacgtga ttcttgatcc cgagcttcgg gttggaagtg 360
ggtgggagag ttcgaggcct tgcgcttaag gagccccttc gcctcgtgct tgagttgagg 420ggtggggagag ttcgaggcct tgcgcttaag gagccccttc gcctcgtgct tgagttgagg 420
cctggcctgg gcgctggggc cgccgcgtgc gaatctggtg gcaccttcgc gcctgtctcg 480cctggcctgg gcgctggggc cgccgcgtgc gaatctggtg gcaccttcgc gcctgtctcg 480
ctgctttcga taagtctcta gccatttaaa atttttgatg acctgctgcg acgctttttt 540ctgctttcga taagtctcta gccatttaaa atttttgatg acctgctgcg acgctttttt 540
tctggcaaga tagtcttgta aatgcgggcc aagatctgca cactggtatt tcggtttttg 600tctggcaaga tagtcttgta aatgcgggcc aagatctgca cactggtatt tcggtttttg 600
gggccgcggg cggcgacggg gcccgtgcgt cccagcgcac atgttcggcg aggcggggcc 660gggccgcggg cggcgacggg gcccgtgcgt cccagcgcac atgttcggcg aggcggggcc 660
tgcgagcgcg gccaccgaga atcggacggg ggtagtctca agctggccgg cctgctctgg 720tgcgagcgcg gccaccgaga atcggacggg ggtagtctca agctggccgg cctgctctgg 720
tgcctggcct cgcgccgccg tgtatcgccc cgccctgggc ggcaaggctg gcccggtcgg 780tgcctggcct cgcgccgccg tgtatcgccc cgccctgggc ggcaaggctg gcccggtcgg 780
caccagttgc gtgagcggaa agatggccgc ttcccggccc tgctgcaggg agctcaaaat 840caccagttgc gtgagcggaa agatggccgc ttcccggccc tgctgcaggg agctcaaaat 840
ggaggacgcg gcgctcggga gagcgggcgg gtgagtcacc cacacaaagg aaaagggcct 900ggagaggacgcg gcgctcggga gagcgggcgg gtgagtcacc cacacaaagg aaaagggcct 900
ttccgtcctc agccgtcgct tcatgtgact ccacggagta ccgggcgccg tccaggcacc 960ttccgtcctc agccgtcgct tcatgtgact ccacggagta ccgggcgccg tccaggcacc 960
tcgattagtt ctcgagcttt tggagtacgt cgtctttagg ttggggggag gggttttatg 1020tcgattagtt ctcgagcttt tggagtacgt cgtctttagg ttggggggag gggttttatg 1020
cgatggagtt tccccacact gagtgggtgg agactgaagt taggccagct tggcacttga 1080cgatggagtt tccccacact gagtgggtgg agactgaagt taggccagct tggcacttga 1080
tgtaattctc cttggaattt gccctttttg agtttggatc ttggttcatt ctcaagcctc 1140tgtaattctc cttggaattt gccctttttg agtttggatc ttggttcatt ctcaagcctc 1140
agacagtggt tcaaagtttt tttcttccat ttcaggtgtc gtga 1184agacagtggt tcaaagtttt tttcttccat ttcaggtgtc gtga 1184
<210> 12<210> 12
<211> 63<211> 63
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 12<400> 12
atggccctgc ctgtgacagc cctgctgctg cctctggctc tgctgctgca tgccgctaga 60atggccctgc ctgtgacagc cctgctgctg cctctggctc tgctgctgca tgccgctaga 60
ccc 63ccc 63
<210> 13<210> 13
<211> 135<211> 135
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 13<400> 13
accacgacgc cagcgccgcg accaccaaca ccggcgccca ccatcgcgtc gcagcccctg 60accacgacgc cagcgccgcg accaccaaca ccggcgccca ccatcgcgtc gcagcccctg 60
tccctgcgcc cagaggcgtg ccggccagcg gcggggggcg cagtgcacac gagggggctg 120tccctgcgcc cagaggcgtg ccggccagcg gcggggggcg cagtgcacac gagggggctg 120
gacttcgcct gtgat 135gacttcgcct gtgat 135
<210> 14<210> 14
<211> 690<211> 690
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 14<400> 14
gagagcaagt acggccctcc ctgcccccct tgccctgccc ccgagttcct gggcggaccc 60gagagcaagt acggccctcc ctgcccccct tgccctgccc ccgagttcct gggcggaccc 60
agcgtgttcc tgttcccccc caagcccaag gacaccctga tgatcagccg gacccccgag 120agcgtgttcc tgttcccccc caagcccaag gacaccctga tgatcagccg gacccccgag 120
gtgacctgtg tggtggtgga cgtgtcccag gaggaccccg aggtccagtt caactggtac 180gtgacctgtg tggtggtgga cgtgtcccag gaggaccccg aggtccagtt caactggtac 180
gtggacggcg tggaggtgca caacgccaag accaagcccc gggaggagca gttcaatagc 240gtggacggcg tggaggtgca caacgccaag accaagcccc gggaggagca gttcaatagc 240
acctaccggg tggtgtccgt gctgaccgtg ctgcaccagg actggctgaa cggcaaggaa 300acctaccggg tggtgtccgt gctgaccgtg ctgcaccagg actggctgaa cggcaaggaa 300
tacaagtgta aggtgtccaa caagggcctg cccagcagca tcgagaaaac catcagcaag 360tacaagtgta aggtgtccaa caagggcctg cccagcagca tcgagaaaac catcagcaag 360
gccaagggcc agcctcggga gccccaggtg tacaccctgc cccctagcca agaggagatg 420gccaagggcc agcctcggga gccccaggtg tacaccctgc cccctagcca agaggagatg 420
accaagaacc aggtgtccct gacctgcctg gtgaagggct tctaccccag cgacatcgcc 480accaagaacc aggtgtccct gacctgcctg gtgaagggct tctaccccag cgacatcgcc 480
gtggagtggg agagcaacgg ccagcccgag aacaactaca agaccacccc ccctgtgctg 540gtggagtggg agagcaacgg ccagcccgag aacaactaca agaccacccc ccctgtgctg 540
gacagcgacg gcagcttctt cctgtacagc cggctgaccg tggacaagag ccggtggcag 600gacagcgacg gcagcttctt cctgtacagc cggctgaccg tggacaagag ccggtggcag 600
gagggcaacg tctttagctg ctccgtgatg cacgaggccc tgcacaacca ctacacccag 660gagggcaacg tctttagctg ctccgtgatg cacgaggccc tgcacaacca ctacacccag 660
aagagcctga gcctgtccct gggcaagatg 690aagagcctga gcctgtccct gggcaagatg 690
<210> 15<210> 15
<211> 847<211> 847
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 15<400> 15
aggtggcccg aaagtcccaa ggcccaggca tctagtgttc ctactgcaca gccccaggca 60aggtggcccg aaagtcccaa ggcccaggca tctagtgttc ctactgcaca gccccaggca 60
gaaggcagcc tagccaaagc tactactgca cctgccacta cgcgcaatac tggccgtggc 120gaaggcagcc tagccaaagc tactactgca cctgccacta cgcgcaatac tggccgtggc 120
ggggaggaga agaaaaagga gaaagagaaa gaagaacagg aagagaggga gaccaagacc 180ggggaggaga agaaaaagga gaaagagaaa gaagaacagg aagagaggga gaccaagacc 180
cctgaatgtc catcccatac ccagccgctg ggcgtctatc tcttgactcc cgcagtacag 240cctgaatgtc catcccatac ccagccgctg ggcgtctatc tcttgactcc cgcagtacag 240
gacttgtggc ttagagataa ggccaccttt acatgtttcg tcgtgggctc tgacctgaag 300gacttgtggc ttagagataa ggccaccttt acatgtttcg tcgtgggctc tgacctgaag 300
gatgcccatt tgacttggga ggttgccgga aaggtaccca cagggggggt tgaggaaggg 360gatgcccatt tgacttggga ggttgccgga aaggtaccca cagggggggt tgaggaaggg 360
ttgctggagc gccattccaa tggctctcag agccagcact caagactcac ccttccgaga 420ttgctggagc gccattccaa tggctctcag agccagcact caagactcac ccttccgaga 420
tccctgtgga acgccgggac ctctgtcaca tgtactctaa atcatcctag cctgccccca 480tccctgtgga acgccgggac ctctgtcaca tgtactctaa atcatcctag cctgccccca 480
cagcgtctga tggcccttag agagccagcc gcccaggcac cagttaagct tagcctgaat 540cagcgtctga tggcccttag agagccagcc gcccaggcac cagttaagct tagcctgaat 540
ctgctcgcca gtagtgatcc cccagaggcc gccagctggc tcttatgcga agtgtccggc 600ctgctcgcca gtagtgatcc cccagaggcc gccagctggc tcttatgcga agtgtccggc 600
tttagcccgc ccaacatctt gctcatgtgg ctggaggacc agcgagaagt gaacaccagc 660tttagcccgc ccaacatctt gctcatgtgg ctggaggacc agcgagaagt gaacaccagc 660
ggcttcgctc cagcccggcc cccaccccag ccgggttcta ccacattctg ggcctggagt 720ggcttcgctc cagcccggcc cccaccccag ccgggttcta ccacattctg ggcctggagt 720
gtcttaaggg tcccagcacc acctagcccc cagccagcca catacacctg tgttgtgtcc 780gtcttaaggg tcccagcacc acctagcccc cagccagcca catacacctg tgttgtgtcc 780
catgaagata gcaggaccct gctaaatgct tctaggagtc tggaggtttc ctacgtgact 840catgaagata gcaggaccct gctaaatgct tctaggagtc tggaggtttc ctacgtgact 840
gaccatt 847gaccatt 847
<210> 16<210> 16
<211> 30<211> 30
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 16<400> 16
ggtggcggag gttctggagg tggaggttcc 30ggtggcggag gttctggagg tggaggttcc 30
<210> 17<210> 17
<211> 72<211> 72
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 17<400> 17
atctacatct gggcgccctt ggccgggact tgtggggtcc ttctcctgtc actggttatc 60atctacatct gggcgccctt ggccgggact tgtggggtcc ttctcctgtc actggttatc 60
accctttact gc 72accctttact gc 72
<210> 18<210> 18
<211> 126<211> 126
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 18<400> 18
aaacggggca gaaagaaact cctgtatata ttcaaacaac catttatgag accagtacaa 60aaacggggca gaaagaaact cctgtatata ttcaaacaac catttatgag accagtacaa 60
actactcaag aggaagatgg ctgtagctgc cgatttccag aagaagaaga aggaggatgt 120actactcaag aggaagatgg ctgtagctgc cgatttccag aagaagaaga aggaggatgt 120
gaactg 126gaactg 126
<210> 19<210> 19
<211> 123<211> 123
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 19<400> 19
aggagtaaga ggagcaggct cctgcacagt gactacatga acatgactcc ccgccgcccc 60aggagtaaga ggagcaggct cctgcacagt gactacatga acatgactcc ccgccgcccc 60
gggcccaccc gcaagcatta ccagccctat gccccaccac gcgacttcgc agcctatcgc 120gggcccaccc gcaagcatta ccagccctat gccccaccac gcgacttcgc agcctatcgc 120
tcc 123tcc 123
<210> 20<210> 20
<211> 336<211> 336
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 20<400> 20
agagtgaagt tcagcaggag cgcagacgcc cccgcgtaca agcagggcca gaaccagctc 60agagtgaagt tcagcaggag cgcagacgcc cccgcgtaca agcagggcca gaaccagctc 60
tataacgagc tcaatctagg acgaagagag gagtacgatg ttttggacaa gagacgtggc 120tataacgagc tcaatctagg acgaagagag gagtacgatg ttttggacaa gagacgtggc 120
cgggaccctg agatgggggg aaagccgaga aggaagaacc ctcaggaagg cctgtacaat 180cgggaccctg agatgggggg aaagccgaga aggaagaacc ctcaggaagg cctgtacaat 180
gaactgcaga aagataagat ggcggaggcc tacagtgaga ttgggatgaa aggcgagcgc 240gaactgcaga aagataagat ggcggaggcc tacagtgaga ttgggatgaa aggcgagcgc 240
cggaggggca aggggcacga tggcctttac cagggtctca gtacagccac caaggacacc 300cggaggggca aggggcacga tggcctttac cagggtctca gtacagccac caaggacacc 300
tacgacgccc ttcacatgca ggccctgccc cctcgc 336tacgacgccc ttcacatgca ggccctgccc cctcgc 336
<210> 21<210> 21
<211> 336<211> 336
<212> DNA<212> DNA
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 21<400> 21
agagtgaagt tcagcaggag cgcagacgcc cccgcgtacc agcagggcca gaaccagctc 60agagtgaagt tcagcaggag cgcagacgcc cccgcgtacc agcagggcca gaaccagctc 60
tataacgagc tcaatctagg acgaagagag gagtacgatg ttttggacaa gagacgtggc 120tataacgagc tcaatctagg acgaagagag gagtacgatg ttttggacaa gagacgtggc 120
cgggaccctg agatgggggg aaagccgaga aggaagaacc ctcaggaagg cctgtacaat 180cgggaccctg agatgggggg aaagccgaga aggaagaacc ctcaggaagg cctgtacaat 180
gaactgcaga aagataagat ggcggaggcc tacagtgaga ttgggatgaa aggcgagcgc 240gaactgcaga aagataagat ggcggaggcc tacagtgaga ttgggatgaa aggcgagcgc 240
cggaggggca aggggcacga tggcctttac cagggtctca gtacagccac caaggacacc 300cggaggggca aggggcacga tggcctttac cagggtctca gtacagccac caaggacacc 300
tacgacgccc ttcacatgca ggccctgccc cctcgc 336tacgacgccc ttcacatgca ggccctgccc cctcgc 336
<210> 22<210> 22
<211> 373<211> 373
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 22<400> 22
Pro Gly Trp Phe Leu Asp Ser Pro Asp Arg Pro Trp Asn Pro Pro ThrPro Gly Trp Phe Leu Asp Ser Pro Asp Arg Pro Trp Asn Pro Pro Thr
1 5 10 15 1 5 10 15
Phe Ser Pro Ala Leu Leu Val Val Thr Glu Gly Asp Asn Ala Thr PhePhe Ser Pro Ala Leu Leu Val Val Thr Glu Gly Asp Asn Ala Thr Phe
20 25 30 20 25 30
Thr Cys Ser Phe Ser Asn Thr Ser Glu Ser Phe Val Leu Asn Trp TyrThr Cys Ser Phe Ser Asn Thr Ser Glu Ser Phe Val Leu Asn Trp Tyr
35 40 45 35 40 45
Arg Met Ser Pro Ser Asn Gln Thr Asp Lys Leu Ala Ala Phe Pro GluArg Met Ser Pro Ser Asn Gln Thr Asp Lys Leu Ala Ala Phe Pro Glu
50 55 60 50 55 60
Asp Arg Ser Gln Pro Gly Gln Asp Cys Arg Phe Arg Val Thr Gln LeuAsp Arg Ser Gln Pro Gly Gln Asp Cys Arg Phe Arg Val Thr Gln Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Pro Asn Gly Arg Asp Phe His Met Ser Val Val Arg Ala Arg Arg AsnPro Asn Gly Arg Asp Phe His Met Ser Val Val Arg Ala Arg Arg Asn
85 90 95 85 90 95
Asp Ser Gly Thr Tyr Leu Cys Gly Ala Ile Ser Leu Ala Pro Lys AlaAsp Ser Gly Thr Tyr Leu Cys Gly Ala Ile Ser Leu Ala Pro Lys Ala
100 105 110 100 105 110
Gln Ile Lys Glu Ser Leu Arg Ala Glu Leu Arg Val Thr Glu Arg ArgGln Ile Lys Glu Ser Leu Arg Ala Glu Leu Arg Val Thr Glu Arg Arg
115 120 125 115 120 125
Ala Glu Val Pro Thr Ala His Pro Ser Pro Ser Pro Arg Pro Ala GlyAla Glu Val Pro Thr Ala His Pro Ser Pro Ser Pro Arg Pro Ala Gly
130 135 140 130 135 140
Gln Phe Gln Thr Leu Val Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro ThrGln Phe Gln Thr Leu Val Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr
145 150 155 160145 150 155 160
Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu AlaPro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala
165 170 175 165 170 175
Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp PheCys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe
180 185 190 180 185 190
Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly ValAla Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val
195 200 205 195 200 205
Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg LysLeu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys
210 215 220 210 215 220
Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln ThrLys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr
225 230 235 240225 230 235 240
Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu GluThr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu
245 250 255 245 250 255
Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala ProGly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro
260 265 270 260 265 270
Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu GlyAla Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly
275 280 285 275 280 285
Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp ProArg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro
290 295 300 290 295 300
Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu TyrGlu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr
305 310 315 320305 310 315 320
Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile GlyAsn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly
325 330 335 325 330 335
Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr GlnMet Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln
340 345 350 340 345 350
Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met GlnGly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln
355 360 365 355 360 365
Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu Pro Pro Arg
370 370
<210> 23<210> 23
<211> 1182<211> 1182
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 23<400> 23
atggccctcc ctgtcactgc cctgcttctc cccctcgcac tcctgctcca cgccgctaga 60atggccctcc ctgtcactgc cctgcttctc cccctcgcac tcctgctcca cgccgctaga 60
ccacccggat ggtttctgga ctctccggat cgcccgtgga atcccccaac cttctcaccg 120ccacccggat ggtttctgga ctctccggat cgcccgtgga atcccccaac cttctcaccg 120
gcactcttgg ttgtgactga gggcgataat gcgaccttca cgtgctcgtt ctccaacacc 180gcactcttgg ttgtgactga gggcgataat gcgaccttca cgtgctcgtt ctccaacacc 180
tccgaatcat tcgtgctgaa ctggtaccgc atgagcccgt caaaccagac cgacaagctc 240tccgaatcat tcgtgctgaa ctggtaccgc atgagcccgt caaaccagac cgacaagctc 240
gccgcgtttc cggaagatcg gtcgcaaccg ggacaggatt gtcggttccg cgtgactcaa 300gccgcgtttc cggaagatcg gtcgcaaccg ggacaggatt gtcggttccg cgtgactcaa 300
ctgccgaatg gcagagactt ccacatgagc gtggtccgcg ctaggcgaaa cgactccggg 360ctgccgaatg gcagagactt ccacatgagc gtggtccgcg ctaggcgaaa cgactccggg 360
acctacctgt gcggagccat ctcgctggcg cctaaggccc aaatcaaaga gagcttgagg 420acctacctgt gcggagccat ctcgctggcg cctaaggccc aaatcaaaga gagcttgagg 420
gccgaactga gagtgaccga gcgcagagct gaggtgccaa ctgcacatcc atccccatcg 480gccgaactga gagtgaccga gcgcagagct gaggtgccaa ctgcacatcc atccccatcg 480
cctcggcctg cggggcagtt tcagaccctg gtcacgacca ctccggcgcc gcgcccaccg 540cctcggcctg cggggcagtt tcagaccctg gtcacgacca ctccggcgcc gcgcccaccg 540
actccggccc caactatcgc gagccagccc ctgtcgctga ggccggaagc atgccgccct 600actccggccc caactatcgc gagccagccc ctgtcgctga ggccggaagc atgccgccct 600
gccgccggag gtgctgtgca tacccgggga ttggacttcg catgcgacat ctacatttgg 660gccgccggag gtgctgtgca tacccgggga ttggacttcg catgcgacat ctacatttgg 660
gctcctctcg ccggaacttg tggcgtgctc cttctgtccc tggtcatcac cctgtactgc 720gctcctctcg ccggaacttg tggcgtgctc cttctgtccc tggtcatcac cctgtactgc 720
aagcggggtc ggaaaaagct tctgtacatt ttcaagcagc ccttcatgag gcccgtgcaa 780aagcggggtc ggaaaaagct tctgtacatt ttcaagcagc ccttcatgag gcccgtgcaa 780
accacccagg aggaggacgg ttgctcctgc cggttccccg aagaggaaga aggaggttgc 840accacccagg aggaggacgg ttgctcctgc cggttccccg aagaggaaga aggaggttgc 840
gagctgcgcg tgaagttctc ccggagcgcc gacgcccccg cctataagca gggccagaac 900gagctgcgcg tgaagttctc ccggagcgcc gacgcccccg cctataagca gggccagaac 900
cagctgtaca acgaactgaa cctgggacgg cgggaagagt acgatgtgct ggacaagcgg 960cagctgtaca acgaactgaa cctgggacgg cgggaagagt acgatgtgct ggacaagcgg 960
cgcggccggg accccgaaat gggcgggaag cctagaagaa agaaccctca ggaaggcctg 1020cgcggccggg accccgaaat gggcgggaag cctagaagaa agaaccctca ggaaggcctg 1020
tataacgagc tgcagaagga caagatggcc gaggcctact ccgaaattgg gatgaaggga 1080tataacgagc tgcagaagga caagatggcc gaggcctact ccgaaattgg gatgaaggga 1080
gagcggcgga ggggaaaggg gcacgacggc ctgtaccaag gactgtccac cgccaccaag 1140gagcggcgga ggggaaaggg gcacgacggc ctgtaccaag gactgtccac cgccaccaag 1140
gacacatacg atgccctgca catgcaggcc cttccccctc gc 1182gacacatacg atgccctgca catgcaggcc cttccccctc gc 1182
<210> 24<210> 24
<211> 394<211> 394
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 24<400> 24
Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu LeuMet Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Ala Ala Arg Pro Pro Gly Trp Phe Leu Asp Ser Pro Asp Arg ProHis Ala Ala Arg Pro Pro Gly Trp Phe Leu Asp Ser Pro Asp Arg Pro
20 25 30 20 25 30
Trp Asn Pro Pro Thr Phe Ser Pro Ala Leu Leu Val Val Thr Glu GlyTrp Asn Pro Pro Thr Phe Ser Pro Ala Leu Leu Val Val Thr Glu Gly
35 40 45 35 40 45
Asp Asn Ala Thr Phe Thr Cys Ser Phe Ser Asn Thr Ser Glu Ser PheAsp Asn Ala Thr Phe Thr Cys Ser Phe Ser Asn Thr Ser Glu Ser Phe
50 55 60 50 55 60
Val Leu Asn Trp Tyr Arg Met Ser Pro Ser Asn Gln Thr Asp Lys LeuVal Leu Asn Trp Tyr Arg Met Ser Pro Ser Asn Gln Thr Asp Lys Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Ala Ala Phe Pro Glu Asp Arg Ser Gln Pro Gly Gln Asp Cys Arg PheAla Ala Phe Pro Glu Asp Arg Ser Gln Pro Gly Gln Asp Cys Arg Phe
85 90 95 85 90 95
Arg Val Thr Gln Leu Pro Asn Gly Arg Asp Phe His Met Ser Val ValArg Val Thr Gln Leu Pro Asn Gly Arg Asp Phe His Met Ser Val Val
100 105 110 100 105 110
Arg Ala Arg Arg Asn Asp Ser Gly Thr Tyr Leu Cys Gly Ala Ile SerArg Ala Arg Arg Asn Asp Ser Gly Thr Tyr Leu Cys Gly Ala Ile Ser
115 120 125 115 120 125
Leu Ala Pro Lys Ala Gln Ile Lys Glu Ser Leu Arg Ala Glu Leu ArgLeu Ala Pro Lys Ala Gln Ile Lys Glu Ser Leu Arg Ala Glu Leu Arg
130 135 140 130 135 140
Val Thr Glu Arg Arg Ala Glu Val Pro Thr Ala His Pro Ser Pro SerVal Thr Glu Arg Arg Ala Glu Val Pro Thr Ala His Pro Ser Pro Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Pro Arg Pro Ala Gly Gln Phe Gln Thr Leu Val Thr Thr Thr Pro AlaPro Arg Pro Ala Gly Gln Phe Gln Thr Leu Val Thr Thr Thr Pro Ala
165 170 175 165 170 175
Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu SerPro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser
180 185 190 180 185 190
Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His ThrLeu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr
195 200 205 195 200 205
Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu AlaArg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala
210 215 220 210 215 220
Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysGly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
225 230 235 240225 230 235 240
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
245 250 255 245 250 255
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
260 265 270 260 265 270
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser ArgPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg
275 280 285 275 280 285
Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr AsnSer Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn
290 295 300 290 295 300
Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys ArgGlu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg
305 310 315 320305 310 315 320
Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn ProArg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro
325 330 335 325 330 335
Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu AlaGln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala
340 345 350 340 345 350
Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly HisTyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His
355 360 365 355 360 365
Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr AspAsp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp
370 375 380 370 375 380
Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
385 390 385 390
<210> 25<210> 25
<211> 5<211> 5
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 25<400> 25
Gly Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Gly Ser
1 51 5
<210> 26<210> 26
<211> 30<211> 30
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(30)<222> (1)..(30)
<223> /note="This sequence may encompass 1-6 'Gly Gly Gly Gly Ser'<223> /note="This sequence may encompass 1-6 'Gly Gly Gly Gly Ser'
repeating units"repeating units"
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="See specification as filed for detailed description of<223> /note="See specification as filed for detailed description of
substitutions and preferred embodiments" substitutions and preferred embodiments"
<400> 26<400> 26
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlyGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
20 25 3020 25 30
<210> 27<210> 27
<211> 20<211> 20
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 27<400> 27
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlyGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Ser
2020
<210> 28<210> 28
<211> 15<211> 15
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 28<400> 28
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 10 151 5 10 15
<210> 29<210> 29
<211> 4<211> 4
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 29<400> 29
Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Ser
1 1
<210> 30<210> 30
<211> 5000<211> 5000
<212> RNA<212> RNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(5000)<222> (1)..(5000)
<223> /note="This sequence may encompass 50-5000 nucleotides"<223> /note="This sequence may encompass 50-5000 nucleotides"
<400> 30<400> 30
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 60aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 60
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 120aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 120
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 180aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 180
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 240aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 240
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 300aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 300
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 360aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 360
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 420aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 420
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 480aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 480
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 540aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 540
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 600aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 600
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 660aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 660
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 720aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 720
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 780aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 780
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 840aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 840
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 900aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 900
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 960aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 960
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1020aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1020
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1080aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1080
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1140aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1140
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1200aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1200
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1260aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1260
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1320aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1320
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1380aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1380
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1440aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1440
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1500aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1500
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1560aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1560
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1620aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1620
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1680aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1680
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1740aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1740
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1800aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1800
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1860aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1860
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1920aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1920
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1980aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1980
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2040aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2040
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2100aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2100
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2160aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2160
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2220aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2220
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2280aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2280
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2340aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2340
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2400aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2400
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2460aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2460
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2520aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2520
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2580aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2580
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2640aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2640
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2700aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2700
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2760aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2760
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2820aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2820
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2880aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2880
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2940aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2940
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3000aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3000
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3060aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3060
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3120aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3120
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3180aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3180
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3240aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3240
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3300aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3300
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3360aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3360
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3420aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3420
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3480aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3480
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3540aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3540
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3600aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3600
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3660aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3660
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3720aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3720
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3780aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3780
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3840aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3840
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3900aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3900
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3960aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3960
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4020aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4020
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4080aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4080
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4140aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4140
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4200aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4200
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4260aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4260
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4320aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4320
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4380aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4380
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4440aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4440
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4500aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4500
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4560aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4560
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4620aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4620
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4680aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4680
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4740aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4740
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4800aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4800
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4860aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4860
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4920aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4920
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4980aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4980
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 5000
<210> 31<210> 31
<211> 100<211> 100
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 31<400> 31
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 60tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 60
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 100tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 100
<210> 32<210> 32
<211> 5000<211> 5000
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(5000)<222> (1)..(5000)
<223> /note="This sequence may encompass 50-5000 nucleotides"<223> /note="This sequence may encompass 50-5000 nucleotides"
<400> 32<400> 32
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 60tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 60
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 120tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 120
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 180tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 180
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 240tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 240
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 300tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 300
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 360tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 360
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 420tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 420
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 480tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 480
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 540tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 540
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 600tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 600
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 660tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 660
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 720tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 720
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 780tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 780
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 840tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 840
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 900tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 900
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 960tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 960
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1020tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1020
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1080tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1080
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1140tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1140
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1200tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1200
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1260tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1260
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1320tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1320
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1380tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1380
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1440tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1440
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1500tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1500
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1560tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1560
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1620tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1620
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1680tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1680
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1740tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1740
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1800tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1800
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1860tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1860
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1920tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1920
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 1980tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 1980
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2040tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2040
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2100tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2100
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2160tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2160
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2220tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2220
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2280tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2280
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2340tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2340
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2400tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2400
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2460tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2460
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2520tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2520
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2580tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2580
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2640tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2640
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2700tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2700
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2760tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2760
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2820tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2820
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2880tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2880
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 2940tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 2940
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3000tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3000
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3060tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3060
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3120tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3120
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3180tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3180
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3240tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3240
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3300tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3300
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3360tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3360
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3420tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3420
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3480tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3480
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3540tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3540
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3600tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3600
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3660tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3660
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3720tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3720
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3780tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3780
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3840tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3840
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3900tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3900
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 3960tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 3960
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4020tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4020
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4080tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4080
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4140tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4140
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4200tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4200
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4260tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4260
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4320tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4320
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4380tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4380
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4440tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4440
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4500tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4500
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4560tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4560
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4620tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4620
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4680tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4680
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4740tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4740
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4800tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4800
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4860tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4860
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4920tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4920
tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt 4980tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttttttttt 4980
tttttttttt tttttttttt 5000
<210> 33<210> 33
<211> 5000<211> 5000
<212> RNA<212> RNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(5000)<222> (1)..(5000)
<223> /note="This sequence may encompass 100-5000 nucleotides"<223> /note="This sequence may encompass 100-5000 nucleotides"
<400> 33<400> 33
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 60aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 60
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 120aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 120
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 180aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 180
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 240aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 240
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 300aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 300
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 360aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 360
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 420aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 420
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 480aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 480
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 540aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 540
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 600aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 600
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 660aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 660
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 720aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 720
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 780aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 780
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 840aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 840
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 900aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 900
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 960aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 960
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1020aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1020
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1080aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1080
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1140aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1140
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1200aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1200
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1260aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1260
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1320aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1320
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1380aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1380
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1440aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1440
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1500aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1500
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1560aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1560
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1620aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1620
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1680aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1680
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1740aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1740
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1800aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1800
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1860aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1860
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1920aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1920
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1980aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1980
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2040aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2040
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2100aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2100
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2160aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2160
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2220aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2220
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2280aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2280
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2340aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2340
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2400aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2400
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2460aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2460
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2520aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2520
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2580aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2580
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2640aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2640
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2700aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2700
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2760aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2760
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2820aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2820
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2880aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2880
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2940aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2940
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3000aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3000
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3060aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3060
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3120aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3120
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3180aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3180
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3240aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3240
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3300aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3300
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3360aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3360
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3420aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3420
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3480aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3480
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3540aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3540
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3600aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3600
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3660aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3660
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3720aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3720
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3780aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3780
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3840aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3840
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3900aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3900
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3960aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3960
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4020aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4020
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4080aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4080
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4140aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4140
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4200aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4200
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4260aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4260
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4320aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4320
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4380aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4380
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4440aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4440
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4500aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4500
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4560aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4560
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4620aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4620
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4680aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4680
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4740aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4740
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4800aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4800
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4860aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4860
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4920aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4920
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4980aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 4980
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 5000
<210> 34<210> 34
<211> 400<211> 400
<212> RNA<212> RNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(400)<222> (1)..(400)
<223> /note="This sequence may encompass 100-400 nucleotides"<223> /note="This sequence may encompass 100-400 nucleotides"
<400> 34<400> 34
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 60aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 60
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 120aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 120
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 180aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 180
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 240aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 240
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 300aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 300
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 360aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 360
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 400aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 400
<210> 35<210> 35
<211> 2000<211> 2000
<212> RNA<212> RNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<220><220>
<221> misc_feature<221> misc_feature
<222> (1)..(2000)<222> (1)..(2000)
<223> /note="This sequence may encompass 50-2000 nucleotides"<223> /note="This sequence may encompass 50-2000 nucleotides"
<400> 35<400> 35
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 60aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 60
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 120aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 120
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 180aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 180
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 240aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 240
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 300aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 300
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 360aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 360
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 420aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 420
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 480aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 480
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 540aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 540
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 600aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 600
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 660aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 660
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 720aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 720
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 780aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 780
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 840aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 840
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 900aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 900
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 960aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 960
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1020aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1020
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1080aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1080
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1140aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1140
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1200aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1200
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1260aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1260
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1320aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1320
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1380aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1380
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1440aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1440
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1500aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1500
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1560aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1560
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1620aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1620
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1680aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1680
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1740aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1740
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1800aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1800
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1860aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1860
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1920aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1920
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1980aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1980
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2000
<210> 36<210> 36
<211> 41<211> 41
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 36<400> 36
Arg Ser Lys Arg Ser Arg Leu Leu His Ser Asp Tyr Met Asn Met ThrArg Ser Lys Arg Ser Arg Leu Leu His Ser Asp Tyr Met Asn Met Thr
1 5 10 15 1 5 10 15
Pro Arg Arg Pro Gly Pro Thr Arg Lys His Tyr Gln Pro Tyr Ala ProPro Arg Arg Pro Gly Pro Thr Arg Lys His Tyr Gln Pro Tyr Ala Pro
20 25 30 20 25 30
Pro Arg Asp Phe Ala Ala Tyr Arg SerPro Arg Asp Phe Ala Ala Tyr Arg Ser
35 40 35 40
<210> 37<210> 37
<211> 123<211> 123
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 37<400> 37
aggagtaaga ggagcaggct cctgcacagt gactacatga acatgactcc ccgccgcccc 60aggagtaaga ggagcaggct cctgcacagt gactacatga acatgactcc ccgccgcccc 60
gggcccaccc gcaagcatta ccagccctat gccccaccac gcgacttcgc agcctatcgc 120gggcccaccc gcaagcatta ccagccctat gccccaccac gcgacttcgc agcctatcgc 120
tcc 123tcc 123
<210> 38<210> 38
<211> 35<211> 35
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 38<400> 38
Thr Lys Lys Lys Tyr Ser Ser Ser Val His Asp Pro Asn Gly Glu TyrThr Lys Lys Lys Tyr Ser Ser Ser Val His Asp Pro Asn Gly Glu Tyr
1 5 10 15 1 5 10 15
Met Phe Met Arg Ala Val Asn Thr Ala Lys Lys Ser Arg Leu Thr AspMet Phe Met Arg Ala Val Asn Thr Ala Lys Lys Ser Arg Leu Thr Asp
20 25 30 20 25 30
Val Thr LeuVal Thr Leu
3535
<210> 39<210> 39
<211> 105<211> 105
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 39<400> 39
acaaaaaaga agtattcatc cagtgtgcac gaccctaacg gtgaatacat gttcatgaga 60acaaaaaaga agtattcatc cagtgtgcac gaccctaacg gtgaatacat gttcatgaga 60
gcagtgaaca cagccaaaaa atccagactc acagatgtga cccta 105gcagtgaaca cagccaaaaa atccagactc acagatgtga cccta 105
<210> 40<210> 40
<211> 30<211> 30
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 40<400> 40
ggtggcggag gttctggagg tgggggttcc 30ggtggcggag gttctggagg tggggggttcc 30
<210> 41<210> 41
<211> 4<211> 4
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 41<400> 41
Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Ser
1 1
<210> 42<210> 42
<211> 40<211> 40
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(40)<222> (1)..(40)
<223> /note="This sequence may encompass 1-10 'Gly Gly Gly Ser'<223> /note="This sequence may encompass 1-10 'Gly Gly Gly Ser'
repeating units"repeating units"
<400> 42<400> 42
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser
20 25 30 20 25 30
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser
35 4035 40
<210> 43<210> 43
<211> 18<211> 18
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 43<400> 43
Gly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser ThrGly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr
1 5 10 15 1 5 10 15
Lys GlyLys Gly
<210> 44<210> 44
<211> 5<211> 5
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 44<400> 44
Ser Tyr Ala Met SerSer Tyr Ala Met Ser
1 51 5
<210> 45<210> 45
<211> 17<211> 17
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 45<400> 45
Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val LysAla Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
GlyGly
<210> 46<210> 46
<211> 14<211> 14
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 46<400> 46
Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp TyrArg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 47<210> 47
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 47<400> 47
Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrGly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
1 5 1 5
<210> 48<210> 48
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 48<400> 48
Ser Gly Ser Gly Gly SerSer Gly Ser Gly Gly Ser
1 5 1 5
<210> 49<210> 49
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 49<400> 49
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr AlaGly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Ala
1 5 1 5
<210> 50<210> 50
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 50<400> 50
Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser ThrIle Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr
1 5 1 5
<210> 51<210> 51
<211> 16<211> 16
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 51<400> 51
Ala Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp TyrAla Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp Tyr
1 5 10 15 1 5 10 15
<210> 52<210> 52
<211> 123<211> 123
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 52<400> 52
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp TyrAla Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp Tyr
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 53<210> 53
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 53<400> 53
gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60
agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120
cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180
gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240
ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300
tgggtgccct acgatgtcag ctggtacttc gactactggg gacagggcac tctcgtgact 360tgggtgccct acgatgtcag ctggtacttc gactactggg gacagggcac tctcgtgact 360
gtgtcctcc 369gtgtcctcc 369
<210> 54<210> 54
<211> 11<211> 11
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 54<400> 54
Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu AsnArg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn
1 5 10 1 5 10
<210> 55<210> 55
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 55<400> 55
Ala Ala Ser Ser Leu Gln SerAla Ala Ser Ser Leu Gln Ser
1 5 1 5
<210> 56<210> 56
<211> 9<211> 9
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 56<400> 56
Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu ThrGln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr
1 5 1 5
<210> 57<210> 57
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 57<400> 57
Ser Gln Ser Ile Ser Ser TyrSer Gln Ser Ile Ser Ser Tyr
1 5 1 5
<210> 58<210> 58
<211> 3<211> 3
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 58<400> 58
Ala Ala SerAla Ala Ser
1 1
<210> 59<210> 59
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 59<400> 59
Ser Tyr Ser Thr Pro LeuSer Tyr Ser Thr Pro Leu
1 5 1 5
<210> 60<210> 60
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 60<400> 60
Gln Ser Ile Ser Ser TyrGln Ser Ile Ser Ser Tyr
1 5 1 5
<210> 61<210> 61
<211> 107<211> 107
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 61<400> 61
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val GlyAsp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser TyrAsp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser GlyTyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro LeuGlu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile LysThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 62<210> 62
<211> 321<211> 321
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 62<400> 62
gacattcaaa tgactcagtc cccgtcctcc ctctccgcct ccgtgggaga tcgcgtcacg 60gacattcaaa tgactcagtc cccgtcctcc ctctccgcct ccgtgggaga tcgcgtcacg 60
atcacgtgca gggccagcca gagcatctcc agctacctga actggtacca gcagaagcca 120atcacgtgca gggccagcca gagcatctcc agctacctga actggtacca gcagaagcca 120
gggaaggcac cgaagctcct gatctacgcc gctagctcgc tgcagtccgg cgtcccttca 180gggaaggcac cgaagctcct gatctacgcc gctagctcgc tgcagtccgg cgtcccttca 180
cggttctcgg gatcgggctc aggcaccgac ttcaccctga ccattagcag cctgcagccg 240cggttctcgg gatcgggctc aggcaccgac ttcaccctga ccattagcag cctgcagccg 240
gaggacttcg cgacatacta ctgtcagcag tcatactcca cccctctgac cttcggccaa 300gaggacttcg cgacatacta ctgtcagcag tcatactcca cccctctgac cttcggccaa 300
gggaccaaag tggagatcaa g 321gggaccaaag tggagatcaa g 321
<210> 63<210> 63
<211> 20<211> 20
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 63<400> 63
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlyGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Ser
2020
<210> 64<210> 64
<211> 250<211> 250
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 64<400> 64
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp TyrAla Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp Tyr
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser AspGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp
130 135 140 130 135 140
Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly AspIle Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp
145 150 155 160145 150 155 160
Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr LeuArg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu
165 170 175 165 170 175
Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile TyrAsn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr
180 185 190 180 185 190
Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly SerAla Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro GluGly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu
210 215 220 210 215 220
Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu ThrAsp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr
225 230 235 240225 230 235 240
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile LysPhe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
245 250245 250
<210> 65<210> 65
<211> 750<211> 750
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 65<400> 65
gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60
agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120
cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180
gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240
ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300
tgggtgccct acgatgtcag ctggtacttc gactactggg gacagggcac tctcgtgact 360tgggtgccct acgatgtcag ctggtacttc gactactggg gacagggcac tctcgtgact 360
gtgtcctccg gtggtggtgg atcggggggt ggtggttcgg gcggaggagg atctggagga 420gtgtcctccg gtggtggtgg atcggggggt ggtggttcgg gcggaggagg atctggagga 420
ggagggtcgg acattcaaat gactcagtcc ccgtcctccc tctccgcctc cgtgggagat 480ggagggtcgg acattcaaat gactcagtcc ccgtcctccc tctccgcctc cgtggggagat 480
cgcgtcacga tcacgtgcag ggccagccag agcatctcca gctacctgaa ctggtaccag 540cgcgtcacga tcacgtgcag ggccagccag agcatctcca gctacctgaa ctggtaccag 540
cagaagccag ggaaggcacc gaagctcctg atctacgccg ctagctcgct gcagtccggc 600cagaagccag ggaaggcacc gaagctcctg atctacgccg ctagctcgct gcagtccggc 600
gtcccttcac ggttctcggg atcgggctca ggcaccgact tcaccctgac cattagcagc 660gtcccttcac ggttctcggg atcgggctca ggcaccgact tcaccctgac cattagcagc 660
ctgcagccgg aggacttcgc gacatactac tgtcagcagt catactccac ccctctgacc 720ctgcagccgg aggacttcgc gacatactac tgtcagcagt catactccac ccctctgacc 720
ttcggccaag ggaccaaagt ggagatcaag 750ttcggccaag ggaccaaagt ggagatcaag 750
<210> 66<210> 66
<211> 473<211> 473
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 66<400> 66
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp TyrAla Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp Tyr
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser AspGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp
130 135 140 130 135 140
Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly AspIle Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp
145 150 155 160145 150 155 160
Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr LeuArg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu
165 170 175 165 170 175
Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile TyrAsn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr
180 185 190 180 185 190
Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly SerAla Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro GluGly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu
210 215 220 210 215 220
Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu ThrAsp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr
225 230 235 240225 230 235 240
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala ProPhe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro
245 250 255 245 250 255
Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser LeuArg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu
260 265 270 260 265 270
Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr ArgArg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg
275 280 285 275 280 285
Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala GlyGly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly
290 295 300 290 295 300
Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys LysThr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys
305 310 315 320305 310 315 320
Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met ArgArg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg
325 330 335 325 330 335
Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe ProPro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro
340 345 350 340 345 350
Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg SerGlu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser
355 360 365 355 360 365
Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn GluAla Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu
370 375 380 370 375 380
Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg ArgLeu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg
385 390 395 400385 390 395 400
Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro GlnGly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln
405 410 415 405 410 415
Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala TyrGlu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr
420 425 430 420 425 430
Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His AspSer Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp
435 440 445 435 440 445
Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp AlaGly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala
450 455 460 450 455 460
Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgLeu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
465 470 465 470
<210> 67<210> 67
<211> 1419<211> 1419
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 67<400> 67
gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60
agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120
cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180
gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240
ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300
tgggtgccct acgatgtcag ctggtacttc gactactggg gacagggcac tctcgtgact 360tgggtgccct acgatgtcag ctggtacttc gactactggg gacagggcac tctcgtgact 360
gtgtcctccg gtggtggtgg atcggggggt ggtggttcgg gcggaggagg atctggagga 420gtgtcctccg gtggtggtgg atcggggggt ggtggttcgg gcggaggagg atctggagga 420
ggagggtcgg acattcaaat gactcagtcc ccgtcctccc tctccgcctc cgtgggagat 480ggagggtcgg acattcaaat gactcagtcc ccgtcctccc tctccgcctc cgtggggagat 480
cgcgtcacga tcacgtgcag ggccagccag agcatctcca gctacctgaa ctggtaccag 540cgcgtcacga tcacgtgcag ggccagccag agcatctcca gctacctgaa ctggtaccag 540
cagaagccag ggaaggcacc gaagctcctg atctacgccg ctagctcgct gcagtccggc 600cagaagccag ggaaggcacc gaagctcctg atctacgccg ctagctcgct gcagtccggc 600
gtcccttcac ggttctcggg atcgggctca ggcaccgact tcaccctgac cattagcagc 660gtcccttcac ggttctcggg atcgggctca ggcaccgact tcaccctgac cattagcagc 660
ctgcagccgg aggacttcgc gacatactac tgtcagcagt catactccac ccctctgacc 720ctgcagccgg aggacttcgc gacatactac tgtcagcagt catactccac ccctctgacc 720
ttcggccaag ggaccaaagt ggagatcaag accactaccc cagcaccgag gccacccacc 780ttcggccaag ggaccaagt ggagatcaag accactaccc cagcaccgag gccacccacc 780
ccggctccta ccatcgcctc ccagcctctg tccctgcgtc cggaggcatg tagacccgca 840ccggctccta ccatcgcctc ccagcctctg tccctgcgtc cggaggcatg tagacccgca 840
gctggtgggg ccgtgcatac ccggggtctt gacttcgcct gcgatatcta catttgggcc 900gctggtgggg ccgtgcatac ccggggtctt gacttcgcct gcgatatcta catttgggcc 900
cctctggctg gtacttgcgg ggtcctgctg ctttcactcg tgatcactct ttactgtaag 960cctctggctg gtacttgcgg ggtcctgctg ctttcactcg tgatcactct ttactgtaag 960
cgcggtcgga agaagctgct gtacatcttt aagcaaccct tcatgaggcc tgtgcagact 1020cgcggtcgga agaagctgct gtacatcttt aagcaaccct tcatgaggcc tgtgcagact 1020
actcaagagg aggacggctg ttcatgccgg ttcccagagg aggaggaagg cggctgcgaa 1080actcaagagg aggacggctg ttcatgccgg ttcccagagg aggaggaagg cggctgcgaa 1080
ctgcgcgtga aattcagccg cagcgcagat gctccagcct accagcaggg gcagaaccag 1140ctgcgcgtga aattcagccg cagcgcagat gctccagcct accagcaggg gcagaaccag 1140
ctctacaacg aactcaatct tggtcggaga gaggagtacg acgtgctgga caagcggaga 1200ctctacaacg aactcaatct tggtcggaga gaggagtacg acgtgctgga caagcggaga 1200
ggacgggacc cagaaatggg cgggaagccg cgcagaaaga atccccaaga gggcctgtac 1260ggacgggacc cagaaatggg cgggaagccg cgcagaaaga atccccaaga gggcctgtac 1260
aacgagctcc aaaaggataa gatggcagaa gcctatagcg agattggtat gaaaggggaa 1320aacgagctcc aaaaggataa gatggcagaa gcctatagcg agattggtat gaaaggggaa 1320
cgcagaagag gcaaaggcca cgacggactg taccagggac tcagcaccgc caccaaggac 1380cgcagaagag gcaaaggcca cgacggactg taccagggac tcagcaccgc caccaaggac 1380
acctatgacg ctcttcacat gcaggccctg ccgcctcgg 1419acctatgacg ctcttcacat gcaggccctg ccgcctcgg 1419
<210> 68<210> 68
<211> 12<211> 12
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 68<400> 68
Arg Glu Trp Trp Tyr Asp Asp Trp Tyr Leu Asp TyrArg Glu Trp Trp Tyr Asp Asp Trp Tyr Leu Asp Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 69<210> 69
<211> 14<211> 14
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 69<400> 69
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Tyr Asp Asp Trp Tyr Leu Asp TyrAla Arg Arg Glu Trp Trp Tyr Asp Asp Trp Tyr Leu Asp Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 70<210> 70
<211> 121<211> 121
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 70<400> 70
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Tyr Asp Asp Trp Tyr Leu Asp Tyr Trp GlyAla Arg Arg Glu Trp Trp Tyr Asp Asp Trp Tyr Leu Asp Tyr Trp Gly
100 105 110 100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerGln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 71<210> 71
<211> 363<211> 363
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 71<400> 71
gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60
agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120
cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180
gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240
ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300
tggtggtacg acgattggta cctggactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360tggtggtacg acgattggta cctggactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360
tcc 363tcc 363
<210> 72<210> 72
<211> 248<211> 248
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 72<400> 72
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Tyr Asp Asp Trp Tyr Leu Asp Tyr Trp GlyAla Arg Arg Glu Trp Trp Tyr Asp Asp Trp Tyr Leu Asp Tyr Trp Gly
100 105 110 100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile GlnGly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln
130 135 140 130 135 140
Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg ValMet Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val
145 150 155 160145 150 155 160
Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn TrpThr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp
165 170 175 165 170 175
Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala AlaTyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala
180 185 190 180 185 190
Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly SerSer Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp PheGly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe
210 215 220 210 215 220
Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe GlyAla Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile LysGln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
245 245
<210> 73<210> 73
<211> 744<211> 744
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 73<400> 73
gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60
agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120
cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180
gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240
ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300
tggtggtacg acgattggta cctggactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360tggtggtacg acgattggta cctggactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360
tccggtggtg gtggatcggg gggtggtggt tcgggcggag gaggatctgg aggaggaggg 420tccggtggtg gtggatcggg gggtggtggt tcgggcggag gaggatctgg aggagggaggg 420
tcggacattc aaatgactca gtccccgtcc tccctctccg cctccgtggg agatcgcgtc 480tcggacattc aaatgactca gtccccgtcc tccctctccg cctccgtggg agatcgcgtc 480
acgatcacgt gcagggccag ccagagcatc tccagctacc tgaactggta ccagcagaag 540acgatcacgt gcagggccag ccagagcatc tccagctacc tgaactggta ccagcagaag 540
ccagggaagg caccgaagct cctgatctac gccgctagct cgctgcagtc cggcgtccct 600ccagggaagg caccgaagct cctgatctac gccgctagct cgctgcagtc cggcgtccct 600
tcacggttct cgggatcggg ctcaggcacc gacttcaccc tgaccattag cagcctgcag 660tcacggttct cgggatcggg ctcaggcacc gacttcaccc tgaccattag cagcctgcag 660
ccggaggact tcgcgacata ctactgtcag cagtcatact ccacccctct gaccttcggc 720ccggaggact tcgcgacata ctactgtcag cagtcatact ccacccctct gaccttcggc 720
caagggacca aagtggagat caag 744caagggacca aagtggagat caag 744
<210> 74<210> 74
<211> 471<211> 471
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 74<400> 74
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Tyr Asp Asp Trp Tyr Leu Asp Tyr Trp GlyAla Arg Arg Glu Trp Trp Tyr Asp Asp Trp Tyr Leu Asp Tyr Trp Gly
100 105 110 100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile GlnGly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln
130 135 140 130 135 140
Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg ValMet Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val
145 150 155 160145 150 155 160
Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn TrpThr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp
165 170 175 165 170 175
Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala AlaTyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala
180 185 190 180 185 190
Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly SerSer Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp PheGly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe
210 215 220 210 215 220
Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe GlyAla Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg ProGln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro
245 250 255 245 250 255
Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg ProPro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro
260 265 270 260 265 270
Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly LeuGlu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu
275 280 285 275 280 285
Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr CysAsp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys
290 295 300 290 295 300
Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg GlyGly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly
305 310 315 320305 310 315 320
Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro ValArg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val
325 330 335 325 330 335
Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu GluGln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu
340 345 350 340 345 350
Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala AspGlu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp
355 360 365 355 360 365
Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu AsnAla Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn
370 375 380 370 375 380
Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly ArgLeu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg
385 390 395 400385 390 395 400
Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu GlyAsp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly
405 410 415 405 410 415
Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser GluLeu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu
420 425 430 420 425 430
Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly LeuIle Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu
435 440 445 435 440 445
Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu HisTyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His
450 455 460 450 455 460
Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgMet Gln Ala Leu Pro Pro Arg
465 470 465 470
<210> 75<210> 75
<211> 1413<211> 1413
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 75<400> 75
gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60
agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120
cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180
gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240
ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300
tggtggtacg acgattggta cctggactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360tggtggtacg acgattggta cctggactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360
tccggtggtg gtggatcggg gggtggtggt tcgggcggag gaggatctgg aggaggaggg 420tccggtggtg gtggatcggg gggtggtggt tcgggcggag gaggatctgg aggagggaggg 420
tcggacattc aaatgactca gtccccgtcc tccctctccg cctccgtggg agatcgcgtc 480tcggacattc aaatgactca gtccccgtcc tccctctccg cctccgtggg agatcgcgtc 480
acgatcacgt gcagggccag ccagagcatc tccagctacc tgaactggta ccagcagaag 540acgatcacgt gcagggccag ccagagcatc tccagctacc tgaactggta ccagcagaag 540
ccagggaagg caccgaagct cctgatctac gccgctagct cgctgcagtc cggcgtccct 600ccagggaagg caccgaagct cctgatctac gccgctagct cgctgcagtc cggcgtccct 600
tcacggttct cgggatcggg ctcaggcacc gacttcaccc tgaccattag cagcctgcag 660tcacggttct cgggatcggg ctcaggcacc gacttcaccc tgaccattag cagcctgcag 660
ccggaggact tcgcgacata ctactgtcag cagtcatact ccacccctct gaccttcggc 720ccggaggact tcgcgacata ctactgtcag cagtcatact ccacccctct gaccttcggc 720
caagggacca aagtggagat caagaccact accccagcac cgaggccacc caccccggct 780caagggacca aagtggagat caagaccact accccagcac cgaggccacc caccccggct 780
cctaccatcg cctcccagcc tctgtccctg cgtccggagg catgtagacc cgcagctggt 840cctaccatcg cctcccagcc tctgtccctg cgtccggagg catgtagacc cgcagctggt 840
ggggccgtgc atacccgggg tcttgacttc gcctgcgata tctacatttg ggcccctctg 900ggggccgtgc atacccgggg tcttgacttc gcctgcgata tctacatttg ggcccctctg 900
gctggtactt gcggggtcct gctgctttca ctcgtgatca ctctttactg taagcgcggt 960gctggtactt gcggggtcct gctgctttca ctcgtgatca ctctttactg taagcgcggt 960
cggaagaagc tgctgtacat ctttaagcaa cccttcatga ggcctgtgca gactactcaa 1020cggaagaagc tgctgtacat ctttaagcaa cccttcatga ggcctgtgca gactactcaa 1020
gaggaggacg gctgttcatg ccggttccca gaggaggagg aaggcggctg cgaactgcgc 1080gaggaggacg gctgttcatg ccggttccca gaggaggagg aaggcggctg cgaactgcgc 1080
gtgaaattca gccgcagcgc agatgctcca gcctaccagc aggggcagaa ccagctctac 1140gtgaaattca gccgcagcgc agatgctcca gcctaccagc aggggcagaa ccagctctac 1140
aacgaactca atcttggtcg gagagaggag tacgacgtgc tggacaagcg gagaggacgg 1200aacgaactca atcttggtcg gagagaggag tacgacgtgc tggacaagcg gagaggacgg 1200
gacccagaaa tgggcgggaa gccgcgcaga aagaatcccc aagagggcct gtacaacgag 1260gacccagaaa tgggcgggaa gccgcgcaga aagaatcccc aagagggcct gtacaacgag 1260
ctccaaaagg ataagatggc agaagcctat agcgagattg gtatgaaagg ggaacgcaga 1320ctccaaaagg ataagatggc agaagcctat agcgagattg gtatgaaagg ggaacgcaga 1320
agaggcaaag gccacgacgg actgtaccag ggactcagca ccgccaccaa ggacacctat 1380agaggcaaag gccacgacgg actgtaccag ggactcagca ccgccaccaa ggacacctat 1380
gacgctcttc acatgcaggc cctgccgcct cgg 1413gacgctcttc acatgcaggc cctgccgcct cgg 1413
<210> 76<210> 76
<211> 12<211> 12
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 76<400> 76
Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp TyrArg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 77<210> 77
<211> 14<211> 14
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 77<400> 77
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp TyrAla Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 78<210> 78
<211> 121<211> 121
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 78<400> 78
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp GlyAla Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110 100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerGln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 79<210> 79
<211> 363<211> 363
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 79<400> 79
gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60
agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120
cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180
gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240
ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300
tggtggggag aaagctggct gttcgactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360tggtggggag aaagctggct gttcgactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360
tcc 363tcc 363
<210> 80<210> 80
<211> 248<211> 248
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 80<400> 80
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp GlyAla Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110 100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile GlnGly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln
130 135 140 130 135 140
Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg ValMet Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val
145 150 155 160145 150 155 160
Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn TrpThr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp
165 170 175 165 170 175
Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala AlaTyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala
180 185 190 180 185 190
Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly SerSer Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp PheGly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe
210 215 220 210 215 220
Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe GlyAla Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile LysGln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
245 245
<210> 81<210> 81
<211> 744<211> 744
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 81<400> 81
gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60
agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120
cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180
gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240
ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300
tggtggggag aaagctggct gttcgactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360tggtggggag aaagctggct gttcgactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360
tccggtggtg gtggatcggg gggtggtggt tcgggcggag gaggatctgg aggaggaggg 420tccggtggtg gtggatcggg gggtggtggt tcgggcggag gaggatctgg aggagggaggg 420
tcggacattc aaatgactca gtccccgtcc tccctctccg cctccgtggg agatcgcgtc 480tcggacattc aaatgactca gtccccgtcc tccctctccg cctccgtggg agatcgcgtc 480
acgatcacgt gcagggccag ccagagcatc tccagctacc tgaactggta ccagcagaag 540acgatcacgt gcagggccag ccagagcatc tccagctacc tgaactggta ccagcagaag 540
ccagggaagg caccgaagct cctgatctac gccgctagct cgctgcagtc cggcgtccct 600ccagggaagg caccgaagct cctgatctac gccgctagct cgctgcagtc cggcgtccct 600
tcacggttct cgggatcggg ctcaggcacc gacttcaccc tgaccattag cagcctgcag 660tcacggttct cgggatcggg ctcaggcacc gacttcaccc tgaccattag cagcctgcag 660
ccggaggact tcgcgacata ctactgtcag cagtcatact ccacccctct gaccttcggc 720ccggaggact tcgcgacata ctactgtcag cagtcatact ccacccctct gaccttcggc 720
caagggacca aagtggagat caag 744caagggacca aagtggagat caag 744
<210> 82<210> 82
<211> 471<211> 471
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 82<400> 82
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp GlyAla Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110 100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile GlnGly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln
130 135 140 130 135 140
Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg ValMet Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val
145 150 155 160145 150 155 160
Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn TrpThr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp
165 170 175 165 170 175
Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala AlaTyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala
180 185 190 180 185 190
Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly SerSer Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp PheGly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe
210 215 220 210 215 220
Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe GlyAla Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg ProGln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro
245 250 255 245 250 255
Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg ProPro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro
260 265 270 260 265 270
Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly LeuGlu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu
275 280 285 275 280 285
Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr CysAsp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys
290 295 300 290 295 300
Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg GlyGly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly
305 310 315 320305 310 315 320
Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro ValArg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val
325 330 335 325 330 335
Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu GluGln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu
340 345 350 340 345 350
Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala AspGlu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp
355 360 365 355 360 365
Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu AsnAla Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn
370 375 380 370 375 380
Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly ArgLeu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg
385 390 395 400385 390 395 400
Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu GlyAsp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly
405 410 415 405 410 415
Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser GluLeu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu
420 425 430 420 425 430
Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly LeuIle Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu
435 440 445 435 440 445
Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu HisTyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His
450 455 460 450 455 460
Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgMet Gln Ala Leu Pro Pro Arg
465 470 465 470
<210> 83<210> 83
<211> 1413<211> 1413
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 83<400> 83
gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60gaagtgcagt tgctggagtc aggcggagga ctggtgcagc ccggaggatc gcttcgcttg 60
agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120agctgcgcag cctcaggctt taccttctcc tcctacgcca tgtcctgggt cagacaggct 120
cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180cccgggaagg gactggaatg ggtgtccgcc attagcggtt ccggcggaag cacttactat 180
gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240gccgactctg tgaagggccg cttcactatc tcccgggaca actccaagaa caccctgtat 240
ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300ctccaaatga attccctgag ggccgaagat accgcggtgt actactgcgc tagacgggag 300
tggtggggag aaagctggct gttcgactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360tggtggggag aaagctggct gttcgactac tggggacagg gcactctcgt gactgtgtcc 360
tccggtggtg gtggatcggg gggtggtggt tcgggcggag gaggatctgg aggaggaggg 420tccggtggtg gtggatcggg gggtggtggt tcgggcggag gaggatctgg aggagggaggg 420
tcggacattc aaatgactca gtccccgtcc tccctctccg cctccgtggg agatcgcgtc 480tcggacattc aaatgactca gtccccgtcc tccctctccg cctccgtggg agatcgcgtc 480
acgatcacgt gcagggccag ccagagcatc tccagctacc tgaactggta ccagcagaag 540acgatcacgt gcagggccag ccagagcatc tccagctacc tgaactggta ccagcagaag 540
ccagggaagg caccgaagct cctgatctac gccgctagct cgctgcagtc cggcgtccct 600ccagggaagg caccgaagct cctgatctac gccgctagct cgctgcagtc cggcgtccct 600
tcacggttct cgggatcggg ctcaggcacc gacttcaccc tgaccattag cagcctgcag 660tcacggttct cgggatcggg ctcaggcacc gacttcaccc tgaccattag cagcctgcag 660
ccggaggact tcgcgacata ctactgtcag cagtcatact ccacccctct gaccttcggc 720ccggaggact tcgcgacata ctactgtcag cagtcatact ccacccctct gaccttcggc 720
caagggacca aagtggagat caagaccact accccagcac cgaggccacc caccccggct 780caagggacca aagtggagat caagaccact accccagcac cgaggccacc caccccggct 780
cctaccatcg cctcccagcc tctgtccctg cgtccggagg catgtagacc cgcagctggt 840cctaccatcg cctcccagcc tctgtccctg cgtccggagg catgtagacc cgcagctggt 840
ggggccgtgc atacccgggg tcttgacttc gcctgcgata tctacatttg ggcccctctg 900ggggccgtgc atacccgggg tcttgacttc gcctgcgata tctacatttg ggcccctctg 900
gctggtactt gcggggtcct gctgctttca ctcgtgatca ctctttactg taagcgcggt 960gctggtactt gcggggtcct gctgctttca ctcgtgatca ctctttactg taagcgcggt 960
cggaagaagc tgctgtacat ctttaagcaa cccttcatga ggcctgtgca gactactcaa 1020cggaagaagc tgctgtacat ctttaagcaa cccttcatga ggcctgtgca gactactcaa 1020
gaggaggacg gctgttcatg ccggttccca gaggaggagg aaggcggctg cgaactgcgc 1080gaggaggacg gctgttcatg ccggttccca gaggaggagg aaggcggctg cgaactgcgc 1080
gtgaaattca gccgcagcgc agatgctcca gcctaccagc aggggcagaa ccagctctac 1140gtgaaattca gccgcagcgc agatgctcca gcctaccagc aggggcagaa ccagctctac 1140
aacgaactca atcttggtcg gagagaggag tacgacgtgc tggacaagcg gagaggacgg 1200aacgaactca atcttggtcg gagagaggag tacgacgtgc tggacaagcg gagaggacgg 1200
gacccagaaa tgggcgggaa gccgcgcaga aagaatcccc aagagggcct gtacaacgag 1260gacccagaaa tgggcgggaa gccgcgcaga aagaatcccc aagagggcct gtacaacgag 1260
ctccaaaagg ataagatggc agaagcctat agcgagattg gtatgaaagg ggaacgcaga 1320ctccaaaagg ataagatggc agaagcctat agcgagattg gtatgaaagg ggaacgcaga 1320
agaggcaaag gccacgacgg actgtaccag ggactcagca ccgccaccaa ggacacctat 1380agaggcaaag gccacgacgg actgtaccag ggactcagca ccgccaccaa ggacacctat 1380
gacgctcttc acatgcaggc cctgccgcct cgg 1413gacgctcttc acatgcaggc cctgccgcct cgg 1413
<210> 84<210> 84
<211> 14<211> 14
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (4)..(4)<222> (4)..(4)
<223> /replace=" "<223> /replace=" "
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (5)..(5)<222> (5)..(5)
<223> /replace=" "<223> /replace=" "
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (6)..(6)<222> (6)..(6)
<223> /replace="Y"<223> /replace="Y"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (7)..(7)<222> (7)..(7)
<223> /replace="Y" or "D"<223> /replace="Y" or "D"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (8)..(8)<222> (8)..(8)
<223> /replace="D" or "V"<223> /replace="D" or "V"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (9)..(9)<222> (9)..(9)
<223> /replace="D"<223> /replace="D"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (11)..(11)<222> (11)..(11)
<223> /replace="Y"<223> /replace="Y"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (12)..(12)<222> (12)..(12)
<223> /replace="L"<223> /replace="L"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(14)<222> (1)..(14)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 84<400> 84
Arg Glu Trp Val Pro Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp TyrArg Glu Trp Val Pro Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 85<210> 85
<211> 16<211> 16
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (6)..(6)<222> (6)..(6)
<223> /replace=" "<223> /replace=" "
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (7)..(7)<222> (7)..(7)
<223> /replace=" "<223> /replace=" "
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (8)..(8)<222> (8)..(8)
<223> /replace="Y"<223> /replace="Y"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (9)..(9)<222> (9)..(9)
<223> /replace="Y" or "D"<223> /replace="Y" or "D"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (10)..(10)<222> (10)..(10)
<223> /replace="D" or "V"<223> /replace="D" or "V"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (11)..(11)<222> (11)..(11)
<223> /replace="D"<223> /replace="D"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (13)..(13)<222> (13)..(13)
<223> /replace="Y"<223> /replace="Y"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (14)..(14)<222> (14)..(14)
<223> /replace="L"<223> /replace="L"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(16)<222> (1)..(16)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 85<400> 85
Ala Arg Arg Glu Trp Val Pro Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp TyrAla Arg Arg Glu Trp Val Pro Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr
1 5 10 15 1 5 10 15
<210> 86<210> 86
<211> 5<211> 5
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 86<400> 86
Ser Tyr Gly Met HisSer Tyr Gly Met His
1 51 5
<210> 87<210> 87
<211> 17<211> 17
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 87<400> 87
Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val LysVal Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
GlyGly
<210> 88<210> 88
<211> 14<211> 14
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 88<400> 88
Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValSer Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
1 5 10 1 5 10
<210> 89<210> 89
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 89<400> 89
Ser Tyr Asp Gly Ser AsnSer Tyr Asp Gly Ser Asn
1 5 1 5
<210> 90<210> 90
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 90<400> 90
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr GlyGly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Gly
1 5 1 5
<210> 91<210> 91
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 91<400> 91
Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn LysIle Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys
1 5 1 5
<210> 92<210> 92
<211> 16<211> 16
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 92<400> 92
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
1 5 10 15 1 5 10 15
<210> 93<210> 93
<211> 123<211> 123
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 93<400> 93
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 94<210> 94
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 94<400> 94
caagtgcagc tgcaggaatc cggtggcgga gtcgtgcagc ctggaaggag cctgagactc 60caagtgcagc tgcaggaatc cggtggcgga gtcgtgcagc ctggaaggag cctgagactc 60
tcatgcgccg cgtcagggtt caccttttcc tcctacggga tgcattgggt cagacaggcc 120tcatgcgccg cgtcagggtt caccttttcc tcctacggga tgcattgggt cagacaggcc 120
cccggaaagg gactcgaatg ggtggctgtg atcagctacg acggctccaa caagtactac 180cccggaaagg gactcgaatg ggtggctgtg atcagctacg acggctccaa caagtactac 180
gccgactccg tgaaaggccg gttcactatc tcccgggaca actccaagaa cacgctgtat 240gccgactccg tgaaaggccg gttcactatc tcccgggaca actccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga attcactgcg cgcggaggat accgctgtgt actactgcgg tggctccggt 300ctgcaaatga attcactgcg cgcggaggat accgctgtgt actactgcgg tggctccggt 300
tacgccctgc acgatgacta ttacggcctt gacgtctggg gccagggaac cctcgtgact 360tacgccctgc acgatgacta ttacggcctt gacgtctggg gccagggaac cctcgtgact 360
gtgtccagc 369gtgtccagc 369
<210> 95<210> 95
<211> 14<211> 14
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 95<400> 95
Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val SerThr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser
1 5 10 1 5 10
<210> 96<210> 96
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 96<400> 96
Asp Val Ser Asn Arg Pro SerAsp Val Ser Asn Arg Pro Ser
1 5 1 5
<210> 97<210> 97
<211> 11<211> 11
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 97<400> 97
Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr ValSer Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr Val
1 5 10 1 5 10
<210> 98<210> 98
<211> 10<211> 10
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 98<400> 98
Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn TyrThr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr
1 5 101 5 10
<210> 99<210> 99
<211> 3<211> 3
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 99<400> 99
Asp Val SerAsp Val Ser
1 1
<210> 100<210> 100
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 100<400> 100
Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu TyrTyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr
1 5 1 5
<210> 101<210> 101
<211> 9<211> 9
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 101<400> 101
Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn TyrSer Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr
1 5 1 5
<210> 102<210> 102
<211> 111<211> 111
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 102<400> 102
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly GlnGln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly TyrSer Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuAsn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45 35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg PheMet Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly LeuSer Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser SerGln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95 85 90 95
Ser Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val LeuSer Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
100 105 110 100 105 110
<210> 103<210> 103
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 103<400> 103
cagagcgcac tgactcagcc ggcatccgtg tccggtagcc ccggacagtc gattaccatc 60cagagcgcac tgactcagcc ggcatccgtg tccggtagcc ccggacagtc gattaccatc 60
tcctgtaccg gcacctcctc cgacgtggga gggtacaact acgtgtcgtg gtaccagcag 120tcctgtaccg gcacctcctc cgacgtggga gggtacaact acgtgtcgtg gtaccagcag 120
cacccaggaa aggcccctaa gttgatgatc tacgatgtgt caaaccgccc gtctggagtc 180cacccaggaa aggcccctaa gttgatgatc tacgatgtgt caaaccgccc gtctggagtc 180
tccaaccggt tctccggctc caagtccggc aacaccgcca gcctgaccat tagcgggctg 240tccaaccggt tctccggctc caagtccggc aacaccgcca gcctgaccat tagcgggctg 240
caagccgagg atgaggccga ctactactgc tcgagctaca catcctcgag caccctctac 300caagccgagg atgaggccga ctactactgc tcgagctaca catcctcgag caccctctac 300
gtgttcggct cggggactaa ggtcaccgtg ctg 333gtgttcggct cggggactaa ggtcaccgtg ctg 333
<210> 104<210> 104
<211> 15<211> 15
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 104<400> 104
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 10 151 5 10 15
<210> 105<210> 105
<211> 249<211> 249
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 105<400> 105
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu Thr GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu Thr Gln
130 135 140 130 135 140
Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile Ser CysPro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile Ser Cys
145 150 155 160145 150 155 160
Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser Trp TyrThr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser Trp Tyr
165 170 175 165 170 175
Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp Val SerGln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp Val Ser
180 185 190 180 185 190
Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys Ser GlyAsn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys Ser Gly
195 200 205 195 200 205
Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp Glu AlaAsn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp Glu Ala
210 215 220 210 215 220
Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr Val PheAsp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr Val Phe
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val LeuGly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
245 245
<210> 106<210> 106
<211> 747<211> 747
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 106<400> 106
caagtgcagc tgcaggaatc cggtggcgga gtcgtgcagc ctggaaggag cctgagactc 60caagtgcagc tgcaggaatc cggtggcgga gtcgtgcagc ctggaaggag cctgagactc 60
tcatgcgccg cgtcagggtt caccttttcc tcctacggga tgcattgggt cagacaggcc 120tcatgcgccg cgtcagggtt caccttttcc tcctacggga tgcattgggt cagacaggcc 120
cccggaaagg gactcgaatg ggtggctgtg atcagctacg acggctccaa caagtactac 180cccggaaagg gactcgaatg ggtggctgtg atcagctacg acggctccaa caagtactac 180
gccgactccg tgaaaggccg gttcactatc tcccgggaca actccaagaa cacgctgtat 240gccgactccg tgaaaggccg gttcactatc tcccgggaca actccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga attcactgcg cgcggaggat accgctgtgt actactgcgg tggctccggt 300ctgcaaatga attcactgcg cgcggaggat accgctgtgt actactgcgg tggctccggt 300
tacgccctgc acgatgacta ttacggcctt gacgtctggg gccagggaac cctcgtgact 360tacgccctgc acgatgacta ttacggcctt gacgtctggg gccagggaac cctcgtgact 360
gtgtccagcg gtggaggagg ttcgggcgga ggaggatcag gagggggtgg atcgcagagc 420gtgtccagcg gtggaggagg ttcgggcgga ggagatcag gagggggtgg atcgcagagc 420
gcactgactc agccggcatc cgtgtccggt agccccggac agtcgattac catctcctgt 480gcactgactc agccggcatc cgtgtccggt agccccggac agtcgattac catctcctgt 480
accggcacct cctccgacgt gggagggtac aactacgtgt cgtggtacca gcagcaccca 540accggcacct cctccgacgt gggagggtac aactacgtgt cgtggtacca gcagcaccca 540
ggaaaggccc ctaagttgat gatctacgat gtgtcaaacc gcccgtctgg agtctccaac 600ggaaaggccc ctaagttgat gatctacgat gtgtcaaacc gcccgtctgg agtctccaac 600
cggttctccg gctccaagtc cggcaacacc gccagcctga ccattagcgg gctgcaagcc 660cggttctccg gctccaagtc cggcaacacc gccagcctga ccattagcgg gctgcaagcc 660
gaggatgagg ccgactacta ctgctcgagc tacacatcct cgagcaccct ctacgtgttc 720gaggatgagg ccgactacta ctgctcgagc tacacatcct cgagcaccct ctacgtgttc 720
ggctcgggga ctaaggtcac cgtgctg 747ggctcgggga ctaaggtcac cgtgctg 747
<210> 107<210> 107
<211> 472<211> 472
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 107<400> 107
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu Thr GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu Thr Gln
130 135 140 130 135 140
Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile Ser CysPro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile Ser Cys
145 150 155 160145 150 155 160
Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser Trp TyrThr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser Trp Tyr
165 170 175 165 170 175
Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp Val SerGln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp Val Ser
180 185 190 180 185 190
Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys Ser GlyAsn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys Ser Gly
195 200 205 195 200 205
Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp Glu AlaAsn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp Glu Ala
210 215 220 210 215 220
Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr Val PheAsp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr Val Phe
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr Thr Pro Ala Pro ArgGly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg
245 250 255 245 250 255
Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu ArgPro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg
260 265 270 260 265 270
Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg GlyPro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly
275 280 285 275 280 285
Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly ThrLeu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr
290 295 300 290 295 300
Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys ArgCys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg
305 310 315 320305 310 315 320
Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg ProGly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro
325 330 335 325 330 335
Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro GluVal Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu
340 345 350 340 345 350
Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser AlaGlu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala
355 360 365 355 360 365
Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu LeuAsp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu
370 375 380 370 375 380
Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg GlyAsn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln GluArg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu
405 410 415 405 410 415
Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr SerGly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser
420 425 430 420 425 430
Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp GlyGlu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly
435 440 445 435 440 445
Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala LeuLeu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu
450 455 460 450 455 460
His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgHis Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
465 470 465 470
<210> 108<210> 108
<211> 1416<211> 1416
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 108<400> 108
caagtgcagc tgcaggaatc cggtggcgga gtcgtgcagc ctggaaggag cctgagactc 60caagtgcagc tgcaggaatc cggtggcgga gtcgtgcagc ctggaaggag cctgagactc 60
tcatgcgccg cgtcagggtt caccttttcc tcctacggga tgcattgggt cagacaggcc 120tcatgcgccg cgtcagggtt caccttttcc tcctacggga tgcattgggt cagacaggcc 120
cccggaaagg gactcgaatg ggtggctgtg atcagctacg acggctccaa caagtactac 180cccggaaagg gactcgaatg ggtggctgtg atcagctacg acggctccaa caagtactac 180
gccgactccg tgaaaggccg gttcactatc tcccgggaca actccaagaa cacgctgtat 240gccgactccg tgaaaggccg gttcactatc tcccgggaca actccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga attcactgcg cgcggaggat accgctgtgt actactgcgg tggctccggt 300ctgcaaatga attcactgcg cgcggaggat accgctgtgt actactgcgg tggctccggt 300
tacgccctgc acgatgacta ttacggcctt gacgtctggg gccagggaac cctcgtgact 360tacgccctgc acgatgacta ttacggcctt gacgtctggg gccagggaac cctcgtgact 360
gtgtccagcg gtggaggagg ttcgggcgga ggaggatcag gagggggtgg atcgcagagc 420gtgtccagcg gtggaggagg ttcgggcgga ggagatcag gagggggtgg atcgcagagc 420
gcactgactc agccggcatc cgtgtccggt agccccggac agtcgattac catctcctgt 480gcactgactc agccggcatc cgtgtccggt agccccggac agtcgattac catctcctgt 480
accggcacct cctccgacgt gggagggtac aactacgtgt cgtggtacca gcagcaccca 540accggcacct cctccgacgt gggagggtac aactacgtgt cgtggtacca gcagcaccca 540
ggaaaggccc ctaagttgat gatctacgat gtgtcaaacc gcccgtctgg agtctccaac 600ggaaaggccc ctaagttgat gatctacgat gtgtcaaacc gcccgtctgg agtctccaac 600
cggttctccg gctccaagtc cggcaacacc gccagcctga ccattagcgg gctgcaagcc 660cggttctccg gctccaagtc cggcaacacc gccagcctga ccattagcgg gctgcaagcc 660
gaggatgagg ccgactacta ctgctcgagc tacacatcct cgagcaccct ctacgtgttc 720gaggatgagg ccgactacta ctgctcgagc tacacatcct cgagcaccct ctacgtgttc 720
ggctcgggga ctaaggtcac cgtgctgacc actaccccag caccgaggcc acccaccccg 780ggctcgggga ctaaggtcac cgtgctgacc actaccccag caccgaggcc acccaccccg 780
gctcctacca tcgcctccca gcctctgtcc ctgcgtccgg aggcatgtag acccgcagct 840gctcctacca tcgcctccca gcctctgtcc ctgcgtccgg aggcatgtag acccgcagct 840
ggtggggccg tgcatacccg gggtcttgac ttcgcctgcg atatctacat ttgggcccct 900ggtggggccg tgcatacccg gggtcttgac ttcgcctgcg atatctacat ttgggcccct 900
ctggctggta cttgcggggt cctgctgctt tcactcgtga tcactcttta ctgtaagcgc 960ctggctggta cttgcggggt cctgctgctt tcactcgtga tcactcttta ctgtaagcgc 960
ggtcggaaga agctgctgta catctttaag caacccttca tgaggcctgt gcagactact 1020ggtcggaaga agctgctgta catctttaag caacccttca tgaggcctgt gcagactact 1020
caagaggagg acggctgttc atgccggttc ccagaggagg aggaaggcgg ctgcgaactg 1080caagaggagg acggctgttc atgccggttc ccagaggagg aggaaggcgg ctgcgaactg 1080
cgcgtgaaat tcagccgcag cgcagatgct ccagcctacc agcaggggca gaaccagctc 1140cgcgtgaaat tcagccgcag cgcagatgct ccagcctacc agcaggggca gaaccagctc 1140
tacaacgaac tcaatcttgg tcggagagag gagtacgacg tgctggacaa gcggagagga 1200tacaacgaac tcaatcttgg tcggagagag gagtacgacg tgctggacaa gcggagagga 1200
cgggacccag aaatgggcgg gaagccgcgc agaaagaatc cccaagaggg cctgtacaac 1260cgggacccag aaatgggcgg gaagccgcgc agaaagaatc cccaagaggg cctgtacaac 1260
gagctccaaa aggataagat ggcagaagcc tatagcgaga ttggtatgaa aggggaacgc 1320gagctccaaa aggataagat ggcagaagcc tatagcgaga ttggtatgaa aggggaacgc 1320
agaagaggca aaggccacga cggactgtac cagggactca gcaccgccac caaggacacc 1380agaagaggca aaggccacga cggactgtac cagggactca gcaccgccac caaggacacc 1380
tatgacgctc ttcacatgca ggccctgccg cctcgg 1416tatgacgctc ttcacatgca ggccctgccg cctcgg 1416
<210> 109<210> 109
<211> 17<211> 17
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 109<400> 109
Val Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val LysVal Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
GlyGly
<210> 110<210> 110
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 110<400> 110
Ser Tyr Lys Gly Ser AsnSer Tyr Lys Gly Ser Asn
1 5 1 5
<210> 111<210> 111
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 111<400> 111
Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn LysIle Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys
1 5 1 5
<210> 112<210> 112
<211> 123<211> 123
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 112<400> 112
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 113<210> 113
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 113<400> 113
caagtgcagc ttgtcgaatc gggaggcgga gtggtgcagc ctggacgatc gctccggctc 60caagtgcagc ttgtcgaatc gggaggcgga gtggtgcagc ctggacgatc gctccggctc 60
tcatgtgccg cgagcggatt caccttctcg agctacggca tgcactgggt cagacaagcc 120tcatgtgccg cgagcggatt caccttctcg agctacggca tgcactgggt cagacaagcc 120
ccaggaaagg gcctggaatg ggtggctgtc atctcgtaca agggctcaaa caagtactac 180caggaaagg gcctggaatg ggtggctgtc atctcgtaca agggctcaaa caagtactac 180
gccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgata actccaagaa taccctctat 240gccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgata actccaagaa taccctctat 240
ctgcaaatga acagcctgag ggccgaggat actgcagtgt actactgcgg gggttcaggc 300ctgcaaatga acagcctgag ggccgaggat actgcagtgt actactgcgg gggttcaggc 300
tacgcgctgc acgacgacta ctacggattg gacgtctggg gccaaggaac tcttgtgacc 360tacgcgctgc acgacgacta ctacggattg gacgtctggg gccaaggaac tcttgtgacc 360
gtgtcctct 369gtgtcctct 369
<210> 114<210> 114
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 114<400> 114
Glu Val Ser Asn Arg Leu ArgGlu Val Ser Asn Arg Leu Arg
1 5 1 5
<210> 115<210> 115
<211> 11<211> 11
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 115<400> 115
Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Ala Leu Tyr ValSer Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Ala Leu Tyr Val
1 5 10 1 5 10
<210> 116<210> 116
<211> 3<211> 3
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 116<400> 116
Glu Val SerGlu Val Ser
1 1
<210> 117<210> 117
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 117<400> 117
Tyr Thr Ser Ser Ser Ala Leu TyrTyr Thr Ser Ser Ser Ala Leu Tyr
1 5 1 5
<210> 118<210> 118
<211> 111<211> 111
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 118<400> 118
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly GlnGln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly TyrSer Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuAsn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45 35 40 45
Met Ile Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg PheMet Ile Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly LeuSer Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser SerGln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95 85 90 95
Ser Ala Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val LeuSer Ala Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
100 105 110 100 105 110
<210> 119<210> 119
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 119<400> 119
cagagcgcgc tgactcagcc tgcctccgtg agcggttcgc cgggacagtc cattaccatt 60cagagcgcgc tgactcagcc tgcctccgtg agcggttcgc cgggacagtc cattaccatt 60
tcgtgcaccg ggacctcctc cgacgtggga ggctacaact acgtgtcctg gtaccagcag 120tcgtgcaccg ggacctcctc cgacgtggga ggctacaact acgtgtcctg gtaccagcag 120
catcccggaa aggccccgaa gctgatgatc tacgaagtgt cgaacagact gcggggagtc 180catcccggaa aggccccgaa gctgatgatc tacgaagtgt cgaacagact gcggggagtc 180
tccaaccgct tttccgggtc caagtccggc aacaccgcca gcctgaccat cagcgggctc 240tccaaccgct tttccggggtc caagtccggc aacaccgcca gcctgaccat cagcgggctc 240
caggcagaag atgaggctga ctattactgc tcctcctaca cgtcaagctc cgccctctac 300caggcagaag atgaggctga ctattactgc tcctcctaca cgtcaagctc cgccctctac 300
gtgttcgggt ccgggaccaa agtcactgtg ctg 333gtgttcgggt ccgggaccaa agtcactgtg ctg 333
<210> 120<210> 120
<211> 254<211> 254
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 120<400> 120
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln SerSer Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr AsnIle Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn
165 170 175 165 170 175
Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu MetTyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met
180 185 190 180 185 190
Ile Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg Phe SerIle Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu GlnGly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln
210 215 220 210 215 220
Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser SerAla Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Ala Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val LeuAla Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
245 250 245 250
<210> 121<210> 121
<211> 762<211> 762
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 121<400> 121
caagtgcagc ttgtcgaatc gggaggcgga gtggtgcagc ctggacgatc gctccggctc 60caagtgcagc ttgtcgaatc gggaggcgga gtggtgcagc ctggacgatc gctccggctc 60
tcatgtgccg cgagcggatt caccttctcg agctacggca tgcactgggt cagacaagcc 120tcatgtgccg cgagcggatt caccttctcg agctacggca tgcactgggt cagacaagcc 120
ccaggaaagg gcctggaatg ggtggctgtc atctcgtaca agggctcaaa caagtactac 180caggaaagg gcctggaatg ggtggctgtc atctcgtaca agggctcaaa caagtactac 180
gccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgata actccaagaa taccctctat 240gccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgata actccaagaa taccctctat 240
ctgcaaatga acagcctgag ggccgaggat actgcagtgt actactgcgg gggttcaggc 300ctgcaaatga acagcctgag ggccgaggat actgcagtgt actactgcgg gggttcaggc 300
tacgcgctgc acgacgacta ctacggattg gacgtctggg gccaaggaac tcttgtgacc 360tacgcgctgc acgacgacta ctacggattg gacgtctggg gccaaggaac tcttgtgacc 360
gtgtcctctg gtggaggcgg atcagggggt ggcggatctg ggggtggtgg ttccggggga 420gtgtcctctg gtggaggcgg atcaggggggt ggcggatctg ggggtggtgg ttccggggga 420
ggaggatcgc agagcgcgct gactcagcct gcctccgtga gcggttcgcc gggacagtcc 480ggaggatcgc agagcgcgct gactcagcct gcctccgtga gcggttcgcc gggacagtcc 480
attaccattt cgtgcaccgg gacctcctcc gacgtgggag gctacaacta cgtgtcctgg 540attaccattt cgtgcaccgg gacctcctcc gacgtgggag gctacaacta cgtgtcctgg 540
taccagcagc atcccggaaa ggccccgaag ctgatgatct acgaagtgtc gaacagactg 600taccagcagc atcccggaaa ggccccgaag ctgatgatct acgaagtgtc gaacagactg 600
cggggagtct ccaaccgctt ttccgggtcc aagtccggca acaccgccag cctgaccatc 660cggggagtct ccaaccgctt ttccgggtcc aagtccggca acaccgccag cctgaccatc 660
agcgggctcc aggcagaaga tgaggctgac tattactgct cctcctacac gtcaagctcc 720agcgggctcc aggcagaaga tgaggctgac tattactgct cctcctacac gtcaagctcc 720
gccctctacg tgttcgggtc cgggaccaaa gtcactgtgc tg 762gccctctacg tgttcgggtc cgggaccaaa gtcactgtgc tg 762
<210> 122<210> 122
<211> 477<211> 477
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 122<400> 122
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln SerSer Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr AsnIle Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn
165 170 175 165 170 175
Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu MetTyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met
180 185 190 180 185 190
Ile Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg Phe SerIle Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu GlnGly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln
210 215 220 210 215 220
Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser SerAla Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Ala Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr ThrAla Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr
245 250 255 245 250 255
Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser GlnThr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln
260 265 270 260 265 270
Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly AlaPro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala
275 280 285 275 280 285
Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp AlaVal His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala
290 295 300 290 295 300
Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile ThrPro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr
305 310 315 320305 310 315 320
Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys GlnLeu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln
325 330 335 325 330 335
Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys SerPro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser
340 345 350 340 345 350
Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val LysCys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys
355 360 365 355 360 365
Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn GlnPhe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln
370 375 380 370 375 380
Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val LeuLeu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu
385 390 395 400385 390 395 400
Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg ArgAsp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg
405 410 415 405 410 415
Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys MetLys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met
420 425 430 420 425 430
Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg GlyAla Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly
435 440 445 435 440 445
Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys AspLys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp
450 455 460 450 455 460
Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgThr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
465 470 475 465 470 475
<210> 123<210> 123
<211> 1431<211> 1431
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 123<400> 123
caagtgcagc ttgtcgaatc gggaggcgga gtggtgcagc ctggacgatc gctccggctc 60caagtgcagc ttgtcgaatc gggaggcgga gtggtgcagc ctggacgatc gctccggctc 60
tcatgtgccg cgagcggatt caccttctcg agctacggca tgcactgggt cagacaagcc 120tcatgtgccg cgagcggatt caccttctcg agctacggca tgcactgggt cagacaagcc 120
ccaggaaagg gcctggaatg ggtggctgtc atctcgtaca agggctcaaa caagtactac 180caggaaagg gcctggaatg ggtggctgtc atctcgtaca agggctcaaa caagtactac 180
gccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgata actccaagaa taccctctat 240gccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgata actccaagaa taccctctat 240
ctgcaaatga acagcctgag ggccgaggat actgcagtgt actactgcgg gggttcaggc 300ctgcaaatga acagcctgag ggccgaggat actgcagtgt actactgcgg gggttcaggc 300
tacgcgctgc acgacgacta ctacggattg gacgtctggg gccaaggaac tcttgtgacc 360tacgcgctgc acgacgacta ctacggattg gacgtctggg gccaaggaac tcttgtgacc 360
gtgtcctctg gtggaggcgg atcagggggt ggcggatctg ggggtggtgg ttccggggga 420gtgtcctctg gtggaggcgg atcaggggggt ggcggatctg ggggtggtgg ttccggggga 420
ggaggatcgc agagcgcgct gactcagcct gcctccgtga gcggttcgcc gggacagtcc 480ggaggatcgc agagcgcgct gactcagcct gcctccgtga gcggttcgcc gggacagtcc 480
attaccattt cgtgcaccgg gacctcctcc gacgtgggag gctacaacta cgtgtcctgg 540attaccattt cgtgcaccgg gacctcctcc gacgtgggag gctacaacta cgtgtcctgg 540
taccagcagc atcccggaaa ggccccgaag ctgatgatct acgaagtgtc gaacagactg 600taccagcagc atcccggaaa ggccccgaag ctgatgatct acgaagtgtc gaacagactg 600
cggggagtct ccaaccgctt ttccgggtcc aagtccggca acaccgccag cctgaccatc 660cggggagtct ccaaccgctt ttccggggtcc aagtccggca acaccgccag cctgaccatc 660
agcgggctcc aggcagaaga tgaggctgac tattactgct cctcctacac gtcaagctcc 720agcgggctcc aggcagaaga tgaggctgac tattactgct cctcctacac gtcaagctcc 720
gccctctacg tgttcgggtc cgggaccaaa gtcactgtgc tgaccactac cccagcaccg 780gccctctacg tgttcgggtc cgggaccaaa gtcactgtgc tgaccactac cccagcaccg 780
aggccaccca ccccggctcc taccatcgcc tcccagcctc tgtccctgcg tccggaggca 840aggccaccca ccccggctcc taccatcgcc tcccagcctc tgtccctgcg tccggaggca 840
tgtagacccg cagctggtgg ggccgtgcat acccggggtc ttgacttcgc ctgcgatatc 900tgtagacccg cagctggtgg ggccgtgcat acccggggtc ttgacttcgc ctgcgatatc 900
tacatttggg cccctctggc tggtacttgc ggggtcctgc tgctttcact cgtgatcact 960tacatttggg cccctctggc tggtacttgc ggggtcctgc tgctttcact cgtgatcact 960
ctttactgta agcgcggtcg gaagaagctg ctgtacatct ttaagcaacc cttcatgagg 1020ctttactgta agcgcggtcg gaagaagctg ctgtacatct ttaagcaacc cttcatgagg 1020
cctgtgcaga ctactcaaga ggaggacggc tgttcatgcc ggttcccaga ggaggaggaa 1080cctgtgcaga ctactcaaga ggagaggacggc tgttcatgcc ggttcccaga ggagggaggaa 1080
ggcggctgcg aactgcgcgt gaaattcagc cgcagcgcag atgctccagc ctaccagcag 1140ggcggctgcg aactgcgcgt gaaattcagc cgcagcgcag atgctccagc ctaccagcag 1140
gggcagaacc agctctacaa cgaactcaat cttggtcgga gagaggagta cgacgtgctg 1200gggcagaacc agctctacaa cgaactcaat cttggtcgga gagaggagta cgacgtgctg 1200
gacaagcgga gaggacggga cccagaaatg ggcgggaagc cgcgcagaaa gaatccccaa 1260gacaagcgga gaggacggga cccagaaatg ggcgggaagc cgcgcagaaa gaatccccaa 1260
gagggcctgt acaacgagct ccaaaaggat aagatggcag aagcctatag cgagattggt 1320gagggcctgt acaacgagct ccaaaaggat aagatggcag aagcctatag cgagattggt 1320
atgaaagggg aacgcagaag aggcaaaggc cacgacggac tgtaccaggg actcagcacc 1380atgaaagggg aacgcagaag aggcaaaggc cacgacggac tgtaccaggg actcagcacc 1380
gccaccaagg acacctatga cgctcttcac atgcaggccc tgccgcctcg g 1431gccaccaagg acacctatga cgctcttcac atgcaggccc tgccgcctcg g 1431
<210> 124<210> 124
<211> 111<211> 111
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 124<400> 124
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly GlnGln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly TyrSer Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuAsn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45 35 40 45
Met Ile Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg PheMet Ile Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly LeuSer Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser SerGln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95 85 90 95
Ser Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val LeuSer Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
100 105 110 100 105 110
<210> 125<210> 125
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 125<400> 125
cagagcgcgc tgactcagcc tgcctccgtg agcggttcgc cgggacagtc cattaccatt 60cagagcgcgc tgactcagcc tgcctccgtg agcggttcgc cgggacagtc cattaccatt 60
tcgtgcaccg ggacctcctc cgacgtggga ggctacaact acgtgtcctg gtaccagcag 120tcgtgcaccg ggacctcctc cgacgtggga ggctacaact acgtgtcctg gtaccagcag 120
catcccggaa aggccccgaa gctgatgatc tacgaagtgt cgaacagact gcggggagtc 180catcccggaa aggccccgaa gctgatgatc tacgaagtgt cgaacagact gcggggagtc 180
tccaaccgct tttccgggtc caagtccggc aacaccgcca gcctgaccat cagcgggctc 240tccaaccgct tttccggggtc caagtccggc aacaccgcca gcctgaccat cagcgggctc 240
caggcagaag atgaggctga ctattactgc tcctcctaca cgtcaagctc caccctctac 300caggcagaag atgaggctga ctattactgc tcctcctaca cgtcaagctc caccctctac 300
gtgttcgggt ccgggaccaa agtcactgtg ctg 333gtgttcgggt ccgggaccaa agtcactgtg ctg 333
<210> 126<210> 126
<211> 254<211> 254
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 126<400> 126
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln SerSer Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr AsnIle Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn
165 170 175 165 170 175
Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu MetTyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met
180 185 190 180 185 190
Ile Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg Phe SerIle Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu GlnGly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln
210 215 220 210 215 220
Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser SerAla Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val LeuThr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
245 250 245 250
<210> 127<210> 127
<211> 762<211> 762
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 127<400> 127
caagtgcagc ttgtcgaatc gggaggcgga gtggtgcagc ctggacgatc gctccggctc 60caagtgcagc ttgtcgaatc gggaggcgga gtggtgcagc ctggacgatc gctccggctc 60
tcatgtgccg cgagcggatt caccttctcg agctacggca tgcactgggt cagacaagcc 120tcatgtgccg cgagcggatt caccttctcg agctacggca tgcactgggt cagacaagcc 120
ccaggaaagg gcctggaatg ggtggctgtc atctcgtaca agggctcaaa caagtactac 180caggaaagg gcctggaatg ggtggctgtc atctcgtaca agggctcaaa caagtactac 180
gccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgata actccaagaa taccctctat 240gccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgata actccaagaa taccctctat 240
ctgcaaatga acagcctgag ggccgaggat actgcagtgt actactgcgg gggttcaggc 300ctgcaaatga acagcctgag ggccgaggat actgcagtgt actactgcgg gggttcaggc 300
tacgcgctgc acgacgacta ctacggattg gacgtctggg gccaaggaac tcttgtgacc 360tacgcgctgc acgacgacta ctacggattg gacgtctggg gccaaggaac tcttgtgacc 360
gtgtcctctg gtggaggcgg atcagggggt ggcggatctg ggggtggtgg ttccggggga 420gtgtcctctg gtggaggcgg atcaggggggt ggcggatctg ggggtggtgg ttccggggga 420
ggaggatcgc agagcgcgct gactcagcct gcctccgtga gcggttcgcc gggacagtcc 480ggaggatcgc agagcgcgct gactcagcct gcctccgtga gcggttcgcc gggacagtcc 480
attaccattt cgtgcaccgg gacctcctcc gacgtgggag gctacaacta cgtgtcctgg 540attaccattt cgtgcaccgg gacctcctcc gacgtgggag gctacaacta cgtgtcctgg 540
taccagcagc atcccggaaa ggccccgaag ctgatgatct acgaagtgtc gaacagactg 600taccagcagc atcccggaaa ggccccgaag ctgatgatct acgaagtgtc gaacagactg 600
cggggagtct ccaaccgctt ttccgggtcc aagtccggca acaccgccag cctgaccatc 660cggggagtct ccaaccgctt ttccggggtcc aagtccggca acaccgccag cctgaccatc 660
agcgggctcc aggcagaaga tgaggctgac tattactgct cctcctacac gtcaagctcc 720agcgggctcc aggcagaaga tgaggctgac tattactgct cctcctacac gtcaagctcc 720
accctctacg tgttcgggtc cgggaccaaa gtcactgtgc tg 762accctctacg tgttcgggtc cgggaccaaa gtcactgtgc tg 762
<210> 128<210> 128
<211> 477<211> 477
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 128<400> 128
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Lys Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
130 135 140 130 135 140
Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln SerSer Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr AsnIle Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn
165 170 175 165 170 175
Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu MetTyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met
180 185 190 180 185 190
Ile Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg Phe SerIle Tyr Glu Val Ser Asn Arg Leu Arg Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu GlnGly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln
210 215 220 210 215 220
Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser SerAla Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr ThrThr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr
245 250 255 245 250 255
Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser GlnThr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln
260 265 270 260 265 270
Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly AlaPro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala
275 280 285 275 280 285
Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp AlaVal His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala
290 295 300 290 295 300
Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile ThrPro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr
305 310 315 320305 310 315 320
Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys GlnLeu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln
325 330 335 325 330 335
Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys SerPro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser
340 345 350 340 345 350
Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val LysCys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys
355 360 365 355 360 365
Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn GlnPhe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln
370 375 380 370 375 380
Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val LeuLeu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu
385 390 395 400385 390 395 400
Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg ArgAsp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg
405 410 415 405 410 415
Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys MetLys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met
420 425 430 420 425 430
Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg GlyAla Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly
435 440 445 435 440 445
Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys AspLys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp
450 455 460 450 455 460
Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgThr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
465 470 475 465 470 475
<210> 129<210> 129
<211> 1431<211> 1431
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 129<400> 129
caagtgcagc ttgtcgaatc gggaggcgga gtggtgcagc ctggacgatc gctccggctc 60caagtgcagc ttgtcgaatc gggaggcgga gtggtgcagc ctggacgatc gctccggctc 60
tcatgtgccg cgagcggatt caccttctcg agctacggca tgcactgggt cagacaagcc 120tcatgtgccg cgagcggatt caccttctcg agctacggca tgcactgggt cagacaagcc 120
ccaggaaagg gcctggaatg ggtggctgtc atctcgtaca agggctcaaa caagtactac 180caggaaagg gcctggaatg ggtggctgtc atctcgtaca agggctcaaa caagtactac 180
gccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgata actccaagaa taccctctat 240gccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgata actccaagaa taccctctat 240
ctgcaaatga acagcctgag ggccgaggat actgcagtgt actactgcgg gggttcaggc 300ctgcaaatga acagcctgag ggccgaggat actgcagtgt actactgcgg gggttcaggc 300
tacgcgctgc acgacgacta ctacggattg gacgtctggg gccaaggaac tcttgtgacc 360tacgcgctgc acgacgacta ctacggattg gacgtctggg gccaaggaac tcttgtgacc 360
gtgtcctctg gtggaggcgg atcagggggt ggcggatctg ggggtggtgg ttccggggga 420gtgtcctctg gtggaggcgg atcaggggggt ggcggatctg ggggtggtgg ttccggggga 420
ggaggatcgc agagcgcgct gactcagcct gcctccgtga gcggttcgcc gggacagtcc 480ggaggatcgc agagcgcgct gactcagcct gcctccgtga gcggttcgcc gggacagtcc 480
attaccattt cgtgcaccgg gacctcctcc gacgtgggag gctacaacta cgtgtcctgg 540attaccattt cgtgcaccgg gacctcctcc gacgtgggag gctacaacta cgtgtcctgg 540
taccagcagc atcccggaaa ggccccgaag ctgatgatct acgaagtgtc gaacagactg 600taccagcagc atcccggaaa ggccccgaag ctgatgatct acgaagtgtc gaacagactg 600
cggggagtct ccaaccgctt ttccgggtcc aagtccggca acaccgccag cctgaccatc 660cggggagtct ccaaccgctt ttccgggtcc aagtccggca acaccgccag cctgaccatc 660
agcgggctcc aggcagaaga tgaggctgac tattactgct cctcctacac gtcaagctcc 720agcgggctcc aggcagaaga tgaggctgac tattactgct cctcctacac gtcaagctcc 720
accctctacg tgttcgggtc cgggaccaaa gtcactgtgc tgaccactac cccagcaccg 780accctctacg tgttcgggtc cgggaccaaa gtcactgtgc tgaccactac cccagcaccg 780
aggccaccca ccccggctcc taccatcgcc tcccagcctc tgtccctgcg tccggaggca 840aggccaccca ccccggctcc taccatcgcc tcccagcctc tgtccctgcg tccggaggca 840
tgtagacccg cagctggtgg ggccgtgcat acccggggtc ttgacttcgc ctgcgatatc 900tgtagacccg cagctggtgg ggccgtgcat acccggggtc ttgacttcgc ctgcgatatc 900
tacatttggg cccctctggc tggtacttgc ggggtcctgc tgctttcact cgtgatcact 960tacatttggg cccctctggc tggtacttgc ggggtcctgc tgctttcact cgtgatcact 960
ctttactgta agcgcggtcg gaagaagctg ctgtacatct ttaagcaacc cttcatgagg 1020ctttactgta agcgcggtcg gaagaagctg ctgtacatct ttaagcaacc cttcatgagg 1020
cctgtgcaga ctactcaaga ggaggacggc tgttcatgcc ggttcccaga ggaggaggaa 1080cctgtgcaga ctactcaaga ggagaggacggc tgttcatgcc ggttcccaga ggagggaggaa 1080
ggcggctgcg aactgcgcgt gaaattcagc cgcagcgcag atgctccagc ctaccagcag 1140ggcggctgcg aactgcgcgt gaaattcagc cgcagcgcag atgctccagc ctaccagcag 1140
gggcagaacc agctctacaa cgaactcaat cttggtcgga gagaggagta cgacgtgctg 1200gggcagaacc agctctacaa cgaactcaat cttggtcgga gagaggagta cgacgtgctg 1200
gacaagcgga gaggacggga cccagaaatg ggcgggaagc cgcgcagaaa gaatccccaa 1260gacaagcgga gaggacggga cccagaaatg ggcgggaagc cgcgcagaaa gaatccccaa 1260
gagggcctgt acaacgagct ccaaaaggat aagatggcag aagcctatag cgagattggt 1320gagggcctgt acaacgagct ccaaaaggat aagatggcag aagcctatag cgagattggt 1320
atgaaagggg aacgcagaag aggcaaaggc cacgacggac tgtaccaggg actcagcacc 1380atgaaagggg aacgcagaag aggcaaaggc cacgacggac tgtaccaggg actcagcacc 1380
gccaccaagg acacctatga cgctcttcac atgcaggccc tgccgcctcg g 1431gccaccaagg acacctatga cgctcttcac atgcaggccc tgccgcctcg g 1431
<210> 130<210> 130
<211> 17<211> 17
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (5)..(5)<222> (5)..(5)
<223> /replace="K"<223> /replace="K"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(17)<222> (1)..(17)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 130<400> 130
Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val LysVal Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
GlyGly
<210> 131<210> 131
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> /replace="E"<223> /replace="E"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (6)..(6)<222> (6)..(6)
<223> /replace="L"<223> /replace="L"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (7)..(7)<222> (7)..(7)
<223> /replace="R"<223> /replace="R"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(7)<222> (1)..(7)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 131<400> 131
Asp Val Ser Asn Arg Pro SerAsp Val Ser Asn Arg Pro Ser
1 5 1 5
<210> 132<210> 132
<211> 11<211> 11
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (8)..(8)<222> (8)..(8)
<223> /replace="A"<223> /replace="A"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(11)<222> (1)..(11)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 132<400> 132
Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr ValSer Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr Val
1 5 10 1 5 10
<210> 133<210> 133
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (3)..(3)<222> (3)..(3)
<223> /replace="K"<223> /replace="K"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(6)<222> (1)..(6)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 133<400> 133
Ser Tyr Asp Gly Ser AsnSer Tyr Asp Gly Ser Asn
1 5 1 5
<210> 134<210> 134
<211> 3<211> 3
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> /replace="E"<223> /replace="E"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(3)<222> (1)..(3)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 134<400> 134
Asp Val SerAsp Val Ser
1 1
<210> 135<210> 135
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (6)..(6)<222> (6)..(6)
<223> /replace="A"<223> /replace="A"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(8)<222> (1)..(8)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 135<400> 135
Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu TyrTyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr
1 5 1 5
<210> 136<210> 136
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (4)..(4)<222> (4)..(4)
<223> /replace="K"<223> /replace="K"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(8)<222> (1)..(8)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 136<400> 136
Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn LysIle Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys
1 5 1 5
<210> 137<210> 137
<211> 5<211> 5
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 137<400> 137
Gly Phe Trp Met SerGly Phe Trp Met Ser
1 51 5
<210> 138<210> 138
<211> 17<211> 17
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 138<400> 138
Asn Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Asp Ser Val ArgAsn Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Asp Ser Val Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
GlyGly
<210> 139<210> 139
<211> 9<211> 9
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 139<400> 139
Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp ValAla Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val
1 5 1 5
<210> 140<210> 140
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 140<400> 140
Gly Phe Thr Phe Ser Gly PheGly Phe Thr Phe Ser Gly Phe
1 5 1 5
<210> 141<210> 141
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 141<400> 141
Lys Gln Asp Gly Ser GluLys Gln Asp Gly Ser Glu
1 5 1 5
<210> 142<210> 142
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 142<400> 142
Gly Phe Thr Phe Ser Gly Phe TrpGly Phe Thr Phe Ser Gly Phe Trp
1 5 1 5
<210> 143<210> 143
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 143<400> 143
Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu LysIle Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys
1 5 1 5
<210> 144<210> 144
<211> 11<211> 11
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 144<400> 144
Ala Arg Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp ValAla Arg Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val
1 5 10 1 5 10
<210> 145<210> 145
<211> 118<211> 118
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 145<400> 145
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gly PheSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gly Phe
20 25 30 20 25 30
Trp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValTrp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Asn Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Asp Ser ValAla Asn Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu TyrArg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly ThrAla Arg Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110 100 105 110
Thr Val Thr Val Ser SerThr Val Thr Val Ser Ser
115 115
<210> 146<210> 146
<211> 354<211> 354
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 146<400> 146
gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtccagc ccggaggatc gctgcggctg 60gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtccagc ccggaggatc gctgcggctg 60
tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc ggcttctgga tgtcctgggt cagacaggca 120tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc ggcttctgga tgtcctgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg ggtggccaac atcaagcagg atggctccga gaagtactac 180ccgggaaagg gcctcgaatg ggtggccaac atcaagcagg atggctccga gaagtactac 180
gtcgactccg tgagaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240gtcgactccg tgagaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240
ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgcgccctt 300ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgcgccctt 300
gactactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagc 354gactactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagc 354
<210> 147<210> 147
<211> 17<211> 17
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 147<400> 147
Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr Tyr LeuArg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr Tyr Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
AspAsp
<210> 148<210> 148
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 148<400> 148
Thr Leu Ser Tyr Arg Ala SerThr Leu Ser Tyr Arg Ala Ser
1 5 1 5
<210> 149<210> 149
<211> 10<211> 10
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 149<400> 149
Thr Gln Arg Leu Glu Phe Pro Ser Ile ThrThr Gln Arg Leu Glu Phe Pro Ser Ile Thr
1 5 101 5 10
<210> 150<210> 150
<211> 13<211> 13
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 150<400> 150
Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr TyrSer Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 151<210> 151
<211> 3<211> 3
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 151<400> 151
Thr Leu SerThr Leu Ser
1 1
<210> 152<210> 152
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 152<400> 152
Arg Leu Glu Phe Pro Ser IleArg Leu Glu Phe Pro Ser Ile
1 5 1 5
<210> 153<210> 153
<211> 12<211> 12
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 153<400> 153
Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr TyrGln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 154<210> 154
<211> 114<211> 114
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 154<400> 154
Asp Ile Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro GlyAsp Ile Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp SerGlu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser
20 25 30 20 25 30
Asp Asp Gly Asn Thr Tyr Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly GlnAsp Asp Gly Asn Thr Tyr Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45 35 40 45
Ser Pro Arg Leu Leu Ile Tyr Thr Leu Ser Tyr Arg Ala Ser Gly ValSer Pro Arg Leu Leu Ile Tyr Thr Leu Ser Tyr Arg Ala Ser Gly Val
50 55 60 50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu LysPro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys
65 70 75 8065 70 75 80
Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Leu Tyr Tyr Cys Thr GlnIle Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Leu Tyr Tyr Cys Thr Gln
85 90 95 85 90 95
Arg Leu Glu Phe Pro Ser Ile Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu GluArg Leu Glu Phe Pro Ser Ile Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu
100 105 110 100 105 110
Ile LysIle Lys
<210> 155<210> 155
<211> 342<211> 342
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 155<400> 155
gatatcgtga tgacccagac tcccctgtcc ctgcctgtga ctcccggaga accagcctcc 60gatatcgtga tgacccagac tcccctgtcc ctgcctgtga ctcccggaga accagcctcc 60
atttcctgcc ggtcctccca gtccctgctg gacagcgacg acggcaacac ttacctggac 120atttcctgcc ggtcctccca gtccctgctg gacagcgacg acggcaacac ttacctggac 120
tggtacttgc agaagccggg ccaatcgcct cgcctgctga tctataccct gtcataccgg 180tggtacttgc agaagccggg ccaatcgcct cgcctgctga tctataccct gtcataccgg 180
gcctcaggag tgcctgaccg cttctcggga tcagggagcg ggaccgattt caccctgaaa 240gcctcaggag tgcctgaccg cttctcggga tcagggagcg ggaccgattt caccctgaaa 240
atttcccgag tggaagccga ggacgtcgga ctgtactact gcacccagcg cctcgaattc 300atttcccgag tggaagccga ggacgtcgga ctgtactact gcacccagcg cctcgaattc 300
ccgtcgatta cgtttggaca gggtacccgg cttgagatca ag 342ccgtcgatta cgtttggaca gggtacccgg cttgagatca ag 342
<210> 156<210> 156
<211> 252<211> 252
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 156<400> 156
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gly PheSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gly Phe
20 25 30 20 25 30
Trp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValTrp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Asn Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Asp Ser ValAla Asn Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu TyrArg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly ThrAla Arg Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110 100 105 110
Thr Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerThr Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Val Met Thr GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Val Met Thr Gln
130 135 140 130 135 140
Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile SerThr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr TyrCys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr Tyr
165 170 175 165 170 175
Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Arg Leu Leu IleLeu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Arg Leu Leu Ile
180 185 190 180 185 190
Tyr Thr Leu Ser Tyr Arg Ala Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser GlyTyr Thr Leu Ser Tyr Arg Ala Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly
195 200 205 195 200 205
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu AlaSer Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala
210 215 220 210 215 220
Glu Asp Val Gly Leu Tyr Tyr Cys Thr Gln Arg Leu Glu Phe Pro SerGlu Asp Val Gly Leu Tyr Tyr Cys Thr Gln Arg Leu Glu Phe Pro Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Ile Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile LysIle Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys
245 250 245 250
<210> 157<210> 157
<211> 756<211> 756
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 157<400> 157
gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtccagc ccggaggatc gctgcggctg 60gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtccagc ccggaggatc gctgcggctg 60
tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc ggcttctgga tgtcctgggt cagacaggca 120tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc ggcttctgga tgtcctgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg ggtggccaac atcaagcagg atggctccga gaagtactac 180ccgggaaagg gcctcgaatg ggtggccaac atcaagcagg atggctccga gaagtactac 180
gtcgactccg tgagaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240gtcgactccg tgagaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240
ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgcgccctt 300ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgcgccctt 300
gactactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagcggaggc 360gactactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagcggaggc 360
ggaggttcag ggggcggtgg atcaggcgga ggaggatcgg ggggtggtgg atcggatatc 420ggaggttcag ggggcggtgg atcaggcgga ggaggatcgg ggggtggtgg atcggatatc 420
gtgatgaccc agactcccct gtccctgcct gtgactcccg gagaaccagc ctccatttcc 480gtgatgaccc agactcccct gtccctgcct gtgactcccg gagaaccagc ctccatttcc 480
tgccggtcct cccagtccct gctggacagc gacgacggca acacttacct ggactggtac 540tgccggtcct cccagtccct gctggacagc gacgacggca acacttacct ggactggtac 540
ttgcagaagc cgggccaatc gcctcgcctg ctgatctata ccctgtcata ccgggcctca 600ttgcagaagc cgggccaatc gcctcgcctg ctgatctata ccctgtcata ccgggcctca 600
ggagtgcctg accgcttctc gggatcaggg agcgggaccg atttcaccct gaaaatttcc 660ggagtgcctg accgcttctc gggatcaggg agcgggaccg atttcaccct gaaaatttcc 660
cgagtggaag ccgaggacgt cggactgtac tactgcaccc agcgcctcga attcccgtcg 720cgagtggaag ccgaggacgt cggactgtac tactgcaccc agcgcctcga attcccgtcg 720
attacgtttg gacagggtac ccggcttgag atcaag 756attacgtttg gacagggtac ccggcttgag atcaag 756
<210> 158<210> 158
<211> 475<211> 475
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 158<400> 158
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gly PheSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gly Phe
20 25 30 20 25 30
Trp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValTrp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Asn Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Asp Ser ValAla Asn Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu TyrArg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly ThrAla Arg Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110 100 105 110
Thr Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerThr Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Val Met Thr GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Val Met Thr Gln
130 135 140 130 135 140
Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile SerThr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr TyrCys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr Tyr
165 170 175 165 170 175
Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Arg Leu Leu IleLeu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Arg Leu Leu Ile
180 185 190 180 185 190
Tyr Thr Leu Ser Tyr Arg Ala Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser GlyTyr Thr Leu Ser Tyr Arg Ala Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly
195 200 205 195 200 205
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu AlaSer Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala
210 215 220 210 215 220
Glu Asp Val Gly Leu Tyr Tyr Cys Thr Gln Arg Leu Glu Phe Pro SerGlu Asp Val Gly Leu Tyr Tyr Cys Thr Gln Arg Leu Glu Phe Pro Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Ile Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys Thr Thr Thr ProIle Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro
245 250 255 245 250 255
Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro LeuAla Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu
260 265 270 260 265 270
Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val HisSer Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His
275 280 285 275 280 285
Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro LeuThr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu
290 295 300 290 295 300
Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu TyrAla Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr
305 310 315 320305 310 315 320
Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro PheCys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe
325 330 335 325 330 335
Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys ArgMet Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg
340 345 350 340 345 350
Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe SerPhe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser
355 360 365 355 360 365
Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu TyrArg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr
370 375 380 370 375 380
Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp LysAsn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys
385 390 395 400385 390 395 400
Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys AsnArg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn
405 410 415 405 410 415
Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala GluPro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu
420 425 430 420 425 430
Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys GlyAla Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly
435 440 445 435 440 445
His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr TyrHis Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr
450 455 460 450 455 460
Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAsp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
465 470 475465 470 475
<210> 159<210> 159
<211> 1425<211> 1425
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 159<400> 159
gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtccagc ccggaggatc gctgcggctg 60gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtccagc ccggaggatc gctgcggctg 60
tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc ggcttctgga tgtcctgggt cagacaggca 120tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc ggcttctgga tgtcctgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg ggtggccaac atcaagcagg atggctccga gaagtactac 180ccgggaaagg gcctcgaatg ggtggccaac atcaagcagg atggctccga gaagtactac 180
gtcgactccg tgagaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240gtcgactccg tgagaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240
ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgcgccctt 300ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgcgccctt 300
gactactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagcggaggc 360gactactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagcggaggc 360
ggaggttcag ggggcggtgg atcaggcgga ggaggatcgg ggggtggtgg atcggatatc 420ggaggttcag ggggcggtgg atcaggcgga ggaggatcgg ggggtggtgg atcggatatc 420
gtgatgaccc agactcccct gtccctgcct gtgactcccg gagaaccagc ctccatttcc 480gtgatgaccc agactcccct gtccctgcct gtgactcccg gagaaccagc ctccatttcc 480
tgccggtcct cccagtccct gctggacagc gacgacggca acacttacct ggactggtac 540tgccggtcct cccagtccct gctggacagc gacgacggca acacttacct ggactggtac 540
ttgcagaagc cgggccaatc gcctcgcctg ctgatctata ccctgtcata ccgggcctca 600ttgcagaagc cgggccaatc gcctcgcctg ctgatctata ccctgtcata ccgggcctca 600
ggagtgcctg accgcttctc gggatcaggg agcgggaccg atttcaccct gaaaatttcc 660ggagtgcctg accgcttctc gggatcaggg agcgggaccg atttcaccct gaaaatttcc 660
cgagtggaag ccgaggacgt cggactgtac tactgcaccc agcgcctcga attcccgtcg 720cgagtggaag ccgaggacgt cggactgtac tactgcaccc agcgcctcga attcccgtcg 720
attacgtttg gacagggtac ccggcttgag atcaagacca ctaccccagc accgaggcca 780attacgtttg gacagggtac ccggcttgag atcaagacca ctaccccagc accgaggcca 780
cccaccccgg ctcctaccat cgcctcccag cctctgtccc tgcgtccgga ggcatgtaga 840cccaccccgg ctcctaccat cgcctcccag cctctgtccc tgcgtccgga ggcatgtaga 840
cccgcagctg gtggggccgt gcatacccgg ggtcttgact tcgcctgcga tatctacatt 900cccgcagctg gtggggccgt gcatacccgg ggtcttgact tcgcctgcga tatctacatt 900
tgggcccctc tggctggtac ttgcggggtc ctgctgcttt cactcgtgat cactctttac 960tgggcccctc tggctggtac ttgcggggtc ctgctgcttt cactcgtgat cactctttac 960
tgtaagcgcg gtcggaagaa gctgctgtac atctttaagc aacccttcat gaggcctgtg 1020tgtaagcgcg gtcggaagaa gctgctgtac atctttaagc aacccttcat gaggcctgtg 1020
cagactactc aagaggagga cggctgttca tgccggttcc cagaggagga ggaaggcggc 1080cagactactc aagaggagga cggctgttca tgccggttcc cagaggagga ggaaggcggc 1080
tgcgaactgc gcgtgaaatt cagccgcagc gcagatgctc cagcctacca gcaggggcag 1140tgcgaactgc gcgtgaaatt cagccgcagc gcagatgctc cagcctacca gcaggggcag 1140
aaccagctct acaacgaact caatcttggt cggagagagg agtacgacgt gctggacaag 1200aaccagctct acaacgaact caatcttggt cggagagagg agtacgacgt gctggacaag 1200
cggagaggac gggacccaga aatgggcggg aagccgcgca gaaagaatcc ccaagagggc 1260cggagaggac gggacccaga aatgggcggg aagccgcgca gaaagaatcc ccaagaggc 1260
ctgtacaacg agctccaaaa ggataagatg gcagaagcct atagcgagat tggtatgaaa 1320ctgtacaacg agctccaaaa ggataagatg gcagaagcct atagcgagat tggtatgaaa 1320
ggggaacgca gaagaggcaa aggccacgac ggactgtacc agggactcag caccgccacc 1380ggggaacgca gaagaggcaa aggccacgac ggactgtacc agggactcag caccgccacc 1380
aaggacacct atgacgctct tcacatgcag gccctgccgc ctcgg 1425aaggacacct atgacgctct tcacatgcag gccctgccgc ctcgg 1425
<210> 160<210> 160
<211> 5<211> 5
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 160<400> 160
Ser Phe Arg Met AsnSer Phe Arg Met Asn
1 51 5
<210> 161<210> 161
<211> 17<211> 17
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 161<400> 161
Ser Ile Ser Ser Ser Ser Ser Tyr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val LysSer Ile Ser Ser Ser Ser Ser Tyr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
GlyGly
<210> 162<210> 162
<211> 9<211> 9
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 162<400> 162
Trp Leu Ser Tyr Tyr Gly Met Asp ValTrp Leu Ser Tyr Tyr Gly Met Asp Val
1 5 1 5
<210> 163<210> 163
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 163<400> 163
Gly Phe Thr Phe Ser Ser PheGly Phe Thr Phe Ser Ser Phe
1 5 1 5
<210> 164<210> 164
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 164<400> 164
Ser Ser Ser Ser Ser TyrSer Ser Ser Ser Ser Tyr
1 5 1 5
<210> 165<210> 165
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 165<400> 165
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe ArgGly Phe Thr Phe Ser Ser Phe Arg
1 5 1 5
<210> 166<210> 166
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 166<400> 166
Ile Ser Ser Ser Ser Ser Tyr IleIle Ser Ser Ser Ser Ser Tyr Ile
1 5 1 5
<210> 167<210> 167
<211> 11<211> 11
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 167<400> 167
Ala Arg Trp Leu Ser Tyr Tyr Gly Met Asp ValAla Arg Trp Leu Ser Tyr Tyr Gly Met Asp Val
1 5 10 1 5 10
<210> 168<210> 168
<211> 118<211> 118
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 168<400> 168
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser PheSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe
20 25 30 20 25 30
Arg Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValArg Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ser Ile Ser Ser Ser Ser Ser Tyr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ser Ile Ser Ser Ser Ser Ser Tyr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Trp Leu Ser Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly ThrAla Arg Trp Leu Ser Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110 100 105 110
Thr Val Thr Val Ser SerThr Val Thr Val Ser Ser
115 115
<210> 169<210> 169
<211> 354<211> 354
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 169<400> 169
gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtcaagc ccggaggatc gctgcggctg 60gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtcaagc ccggaggatc gctgcggctg 60
tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc tcgttccgca tgaactgggt cagacaggca 120tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc tcgttccgca tgaactgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg ggtgtcctca atctcatcgt cctcgtccta catctactac 180ccgggaaagg gcctcgaatg ggtgtcctca atctcatcgt cctcgtccta catctactac 180
gccgactccg tgaaaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240gccgactccg tgaaaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240
ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgctggctt 300ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgctggctt 300
tcctactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagc 354tcctactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagc 354
<210> 170<210> 170
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 170<400> 170
Thr Leu Ser Phe Arg Ala SerThr Leu Ser Phe Arg Ala Ser
1 5 1 5
<210> 171<210> 171
<211> 9<211> 9
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 171<400> 171
Met Gln Arg Ile Gly Phe Pro Ile ThrMet Gln Arg Ile Gly Phe Pro Ile Thr
1 5 1 5
<210> 172<210> 172
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 172<400> 172
Arg Ile Gly Phe Pro IleArg Ile Gly Phe Pro Ile
1 5 1 5
<210> 173<210> 173
<211> 113<211> 113
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 173<400> 173
Asp Ile Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro GlyAsp Ile Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp SerGlu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser
20 25 30 20 25 30
Asp Asp Gly Asn Thr Tyr Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly GlnAsp Asp Gly Asn Thr Tyr Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45 35 40 45
Ser Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Thr Leu Ser Phe Arg Ala Ser Gly ValSer Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Thr Leu Ser Phe Arg Ala Ser Gly Val
50 55 60 50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu LysPro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys
65 70 75 8065 70 75 80
Ile Arg Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met GlnIle Arg Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln
85 90 95 85 90 95
Arg Ile Gly Phe Pro Ile Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu IleArg Ile Gly Phe Pro Ile Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile
100 105 110 100 105 110
LysLys
<210> 174<210> 174
<211> 339<211> 339
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 174<400> 174
gatatcgtga tgacccagac tcccctgtcc ctgcctgtga ctcccggaga accagcctcc 60gatatcgtga tgacccagac tcccctgtcc ctgcctgtga ctcccggaga accagcctcc 60
atttcctgcc ggtcctccca gtccctgctg gacagcgacg acggcaacac ttacctggac 120atttcctgcc ggtcctccca gtccctgctg gacagcgacg acggcaacac ttacctggac 120
tggtacttgc agaagccggg ccaatcgcct cagctgctga tctataccct gtcattccgg 180tggtacttgc agaagccggg ccaatcgcct cagctgctga tctataccct gtcattccgg 180
gcctcaggag tgcctgaccg cttctcggga tcagggagcg ggaccgattt caccctgaaa 240gcctcaggag tgcctgaccg cttctcggga tcagggagcg ggaccgattt caccctgaaa 240
attaggcgag tggaagccga ggacgtcgga gtgtactact gcatgcagcg catcggcttc 300attaggcgag tggaagccga ggacgtcgga gtgtactact gcatgcagcg catcggcttc 300
ccgattacgt ttggacaggg tacccggctt gagatcaag 339ccgattacgt ttggacaggg tacccggctt gagatcaag 339
<210> 175<210> 175
<211> 251<211> 251
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 175<400> 175
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser PheSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe
20 25 30 20 25 30
Arg Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValArg Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ser Ile Ser Ser Ser Ser Ser Tyr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ser Ile Ser Ser Ser Ser Ser Tyr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Trp Leu Ser Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly ThrAla Arg Trp Leu Ser Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110 100 105 110
Thr Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerThr Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Val Met Thr GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Val Met Thr Gln
130 135 140 130 135 140
Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile SerThr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr TyrCys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr Tyr
165 170 175 165 170 175
Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Gln Leu Leu IleLeu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Gln Leu Leu Ile
180 185 190 180 185 190
Tyr Thr Leu Ser Phe Arg Ala Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser GlyTyr Thr Leu Ser Phe Arg Ala Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly
195 200 205 195 200 205
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Arg Arg Val Glu AlaSer Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Arg Arg Val Glu Ala
210 215 220 210 215 220
Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Arg Ile Gly Phe Pro IleGlu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Arg Ile Gly Phe Pro Ile
225 230 235 240225 230 235 240
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile LysThr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys
245 250 245 250
<210> 176<210> 176
<211> 753<211> 753
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 176<400> 176
gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtcaagc ccggaggatc gctgcggctg 60gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtcaagc ccggaggatc gctgcggctg 60
tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc tcgttccgca tgaactgggt cagacaggca 120tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc tcgttccgca tgaactgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg ggtgtcctca atctcatcgt cctcgtccta catctactac 180ccgggaaagg gcctcgaatg ggtgtcctca atctcatcgt cctcgtccta catctactac 180
gccgactccg tgaaaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240gccgactccg tgaaaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240
ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgctggctt 300ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgctggctt 300
tcctactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagcggaggc 360tcctactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagcggaggc 360
ggaggttcag ggggcggtgg atcaggcgga ggaggatcgg ggggtggtgg atcggatatc 420ggaggttcag ggggcggtgg atcaggcgga ggaggatcgg ggggtggtgg atcggatatc 420
gtgatgaccc agactcccct gtccctgcct gtgactcccg gagaaccagc ctccatttcc 480gtgatgaccc agactcccct gtccctgcct gtgactcccg gagaaccagc ctccatttcc 480
tgccggtcct cccagtccct gctggacagc gacgacggca acacttacct ggactggtac 540tgccggtcct cccagtccct gctggacagc gacgacggca acacttacct ggactggtac 540
ttgcagaagc cgggccaatc gcctcagctg ctgatctata ccctgtcatt ccgggcctca 600ttgcagaagc cgggccaatc gcctcagctg ctgatctata ccctgtcatt ccgggcctca 600
ggagtgcctg accgcttctc gggatcaggg agcgggaccg atttcaccct gaaaattagg 660ggagtgcctg accgcttctc gggatcaggg agcgggaccg atttcaccct gaaaattagg 660
cgagtggaag ccgaggacgt cggagtgtac tactgcatgc agcgcatcgg cttcccgatt 720cgagtggaag ccgaggacgt cggagtgtac tactgcatgc agcgcatcgg cttcccgatt 720
acgtttggac agggtacccg gcttgagatc aag 753acgtttggac agggtacccg gcttgagatc aag 753
<210> 177<210> 177
<211> 474<211> 474
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 177<400> 177
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser PheSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe
20 25 30 20 25 30
Arg Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValArg Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ser Ile Ser Ser Ser Ser Ser Tyr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ser Ile Ser Ser Ser Ser Ser Tyr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Trp Leu Ser Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly ThrAla Arg Trp Leu Ser Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110 100 105 110
Thr Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerThr Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Val Met Thr GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Val Met Thr Gln
130 135 140 130 135 140
Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile SerThr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr TyrCys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr Tyr
165 170 175 165 170 175
Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Gln Leu Leu IleLeu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Gln Leu Leu Ile
180 185 190 180 185 190
Tyr Thr Leu Ser Phe Arg Ala Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser GlyTyr Thr Leu Ser Phe Arg Ala Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly
195 200 205 195 200 205
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Arg Arg Val Glu AlaSer Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Arg Arg Val Glu Ala
210 215 220 210 215 220
Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Arg Ile Gly Phe Pro IleGlu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Arg Ile Gly Phe Pro Ile
225 230 235 240225 230 235 240
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro AlaThr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala
245 250 255 245 250 255
Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu SerPro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser
260 265 270 260 265 270
Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His ThrLeu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr
275 280 285 275 280 285
Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu AlaArg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala
290 295 300 290 295 300
Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysGly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
305 310 315 320305 310 315 320
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
325 330 335 325 330 335
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
340 345 350 340 345 350
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser ArgPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg
355 360 365 355 360 365
Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr AsnSer Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn
370 375 380 370 375 380
Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys ArgGlu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg
385 390 395 400385 390 395 400
Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn ProArg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro
405 410 415 405 410 415
Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu AlaGln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala
420 425 430 420 425 430
Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly HisTyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His
435 440 445 435 440 445
Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr AspAsp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp
450 455 460 450 455 460
Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
465 470 465 470
<210> 178<210> 178
<211> 1422<211> 1422
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 178<400> 178
gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtcaagc ccggaggatc gctgcggctg 60gaagtgcaac tggtggagag cggtggaggg cttgtcaagc ccggaggatc gctgcggctg 60
tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc tcgttccgca tgaactgggt cagacaggca 120tcctgtgctg cgtccgggtt caccttctcc tcgttccgca tgaactgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg ggtgtcctca atctcatcgt cctcgtccta catctactac 180ccgggaaagg gcctcgaatg ggtgtcctca atctcatcgt cctcgtccta catctactac 180
gccgactccg tgaaaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240gccgactccg tgaaaggccg cttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctcgctgtac 240
ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgctggctt 300ctccaaatga atagcctcag ggcggaagat actgctgtgt attactgcgc acgctggctt 300
tcctactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagcggaggc 360tcctactacg gcatggacgt ctggggccaa gggaccactg tgaccgtgtc tagcggaggc 360
ggaggttcag ggggcggtgg atcaggcgga ggaggatcgg ggggtggtgg atcggatatc 420ggaggttcag ggggcggtgg atcaggcgga ggaggatcgg ggggtggtgg atcggatatc 420
gtgatgaccc agactcccct gtccctgcct gtgactcccg gagaaccagc ctccatttcc 480gtgatgaccc agactcccct gtccctgcct gtgactcccg gagaaccagc ctccatttcc 480
tgccggtcct cccagtccct gctggacagc gacgacggca acacttacct ggactggtac 540tgccggtcct cccagtccct gctggacagc gacgacggca acacttacct ggactggtac 540
ttgcagaagc cgggccaatc gcctcagctg ctgatctata ccctgtcatt ccgggcctca 600ttgcagaagc cgggccaatc gcctcagctg ctgatctata ccctgtcatt ccgggcctca 600
ggagtgcctg accgcttctc gggatcaggg agcgggaccg atttcaccct gaaaattagg 660ggagtgcctg accgcttctc gggatcaggg agcgggaccg atttcaccct gaaaattagg 660
cgagtggaag ccgaggacgt cggagtgtac tactgcatgc agcgcatcgg cttcccgatt 720cgagtggaag ccgaggacgt cggagtgtac tactgcatgc agcgcatcgg cttcccgatt 720
acgtttggac agggtacccg gcttgagatc aagaccacta ccccagcacc gaggccaccc 780acgtttggac agggtacccg gcttgagatc aagaccacta ccccagcacc gaggccaccc 780
accccggctc ctaccatcgc ctcccagcct ctgtccctgc gtccggaggc atgtagaccc 840accccggctc ctaccatcgc ctcccagcct ctgtccctgc gtccggaggc atgtagaccc 840
gcagctggtg gggccgtgca tacccggggt cttgacttcg cctgcgatat ctacatttgg 900gcagctggtg gggccgtgca tacccggggt cttgacttcg cctgcgatat ctacatttgg 900
gcccctctgg ctggtacttg cggggtcctg ctgctttcac tcgtgatcac tctttactgt 960gcccctctgg ctggtacttg cggggtcctg ctgctttcac tcgtgatcac tctttactgt 960
aagcgcggtc ggaagaagct gctgtacatc tttaagcaac ccttcatgag gcctgtgcag 1020aagcgcggtc ggaagaagct gctgtacatc tttaagcaac ccttcatgag gcctgtgcag 1020
actactcaag aggaggacgg ctgttcatgc cggttcccag aggaggagga aggcggctgc 1080actactcaag aggaggacgg ctgttcatgc cggttcccag aggaggagga aggcggctgc 1080
gaactgcgcg tgaaattcag ccgcagcgca gatgctccag cctaccagca ggggcagaac 1140gaactgcgcg tgaaattcag ccgcagcgca gatgctccag cctaccagca ggggcagaac 1140
cagctctaca acgaactcaa tcttggtcgg agagaggagt acgacgtgct ggacaagcgg 1200cagctctaca acgaactcaa tcttggtcgg agagaggagt acgacgtgct ggacaagcgg 1200
agaggacggg acccagaaat gggcgggaag ccgcgcagaa agaatcccca agagggcctg 1260agaggacggg acccagaaat gggcgggaag ccgcgcagaa agaatcccca agaggcctg 1260
tacaacgagc tccaaaagga taagatggca gaagcctata gcgagattgg tatgaaaggg 1320tacaacgagc tccaaaagga taagatggca gaagcctata gcgagattgg tatgaaaggg 1320
gaacgcagaa gaggcaaagg ccacgacgga ctgtaccagg gactcagcac cgccaccaag 1380gaacgcagaa gaggcaaagg ccacgacgga ctgtaccagg gactcagcac cgccaccaag 1380
gacacctatg acgctcttca catgcaggcc ctgccgcctc gg 1422gacacctatg acgctcttca catgcaggcc ctgccgcctc gg 1422
<210> 179<210> 179
<211> 5<211> 5
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (3)..(3)<222> (3)..(3)
<223> /replace="R"<223> /replace="R"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (5)..(5)<222> (5)..(5)
<223> /replace="N"<223> /replace="N"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(5)<222> (1)..(5)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 179<400> 179
Gly Phe Trp Met SerGly Phe Trp Met Ser
1 51 5
<210> 180<210> 180
<211> 17<211> 17
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (3)..(3)<222> (3)..(3)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (4)..(4)<222> (4)..(4)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (5)..(5)<222> (5)..(5)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (6)..(6)<222> (6)..(6)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (8)..(8)<222> (8)..(8)
<223> /replace="Y"<223> /replace="Y"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (9)..(9)<222> (9)..(9)
<223> /replace="I"<223> /replace="I"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (12)..(12)<222> (12)..(12)
<223> /replace="A"<223> /replace="A"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (16)..(16)<222> (16)..(16)
<223> /replace="K"<223> /replace="K"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(17)<222> (1)..(17)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 180<400> 180
Asn Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Asp Ser Val ArgAsn Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Asp Ser Val Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
GlyGly
<210> 181<210> 181
<211> 9<211> 9
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> /replace="W"<223> /replace="W"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (3)..(3)<222> (3)..(3)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(9)<222> (1)..(9)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 181<400> 181
Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp ValAla Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val
1 5 1 5
<210> 182<210> 182
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (4)..(4)<222> (4)..(4)
<223> /replace="F"<223> /replace="F"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(7)<222> (1)..(7)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 182<400> 182
Thr Leu Ser Tyr Arg Ala SerThr Leu Ser Tyr Arg Ala Ser
1 5 1 5
<210> 183<210> 183
<211> 10<211> 10
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> /replace="M"<223> /replace="M"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (4)..(4)<222> (4)..(4)
<223> /replace="I"<223> /replace="I"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (5)..(5)<222> (5)..(5)
<223> /replace="G"<223> /replace="G"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (8)..(8)<222> (8)..(8)
<223> /replace=" "<223> /replace=" "
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(10)<222> (1)..(10)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 183<400> 183
Thr Gln Arg Leu Glu Phe Pro Ser Ile ThrThr Gln Arg Leu Glu Phe Pro Ser Ile Thr
1 5 101 5 10
<210> 184<210> 184
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (6)..(6)<222> (6)..(6)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(7)<222> (1)..(7)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 184<400> 184
Gly Phe Thr Phe Ser Gly PheGly Phe Thr Phe Ser Gly Phe
1 5 1 5
<210> 185<210> 185
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (1)..(1)<222> (1)..(1)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (2)..(2)<222> (2)..(2)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> MOD_RES<221>MOD_RES
<222> (3)..(3)<222> (3)..(3)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (4)..(4)<222> (4)..(4)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (6)..(6)<222> (6)..(6)
<223> /replace="Y"<223> /replace="Y"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(6)<222> (1)..(6)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 185<400> 185
Lys Gln Asp Gly Ser GluLys Gln Asp Gly Ser Glu
1 5 1 5
<210> 186<210> 186
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (2)..(2)<222> (2)..(2)
<223> /replace="I"<223> /replace="I"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (3)..(3)<222> (3)..(3)
<223> /replace="G"<223> /replace="G"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (6)..(6)<222> (6)..(6)
<223> /replace=" "<223> /replace=" "
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(7)<222> (1)..(7)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 186<400> 186
Arg Leu Glu Phe Pro Ser IleArg Leu Glu Phe Pro Ser Ile
1 5 1 5
<210> 187<210> 187
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (6)..(6)<222> (6)..(6)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (8)..(8)<222> (8)..(8)
<223> /replace="R"<223> /replace="R"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(8)<222> (1)..(8)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 187<400> 187
Gly Phe Thr Phe Ser Gly Phe TrpGly Phe Thr Phe Ser Gly Phe Trp
1 5 1 5
<210> 188<210> 188
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (2)..(2)<222> (2)..(2)
<223> /replace="K"<223> /replace="K"
<220><220>
<221> MOD_RES<221>MOD_RES
<222> (3)..(3)<222> (3)..(3)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (4)..(4)<222> (4)..(4)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (5)..(5)<222> (5)..(5)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (7)..(7)<222> (7)..(7)
<223> /replace="Y"<223> /replace="Y"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (8)..(8)<222> (8)..(8)
<223> /replace="I"<223> /replace="I"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(8)<222> (1)..(8)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 188<400> 188
Ile Lys Gln Asp Gly Ser Glu LysIle Lys Gln Asp Gly Ser Glu Lys
1 5 1 5
<210> 189<210> 189
<211> 11<211> 11
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (3)..(3)<222> (3)..(3)
<223> /replace="W"<223> /replace="W"
<220><220>
<221> VARIANT<221> VARIANT
<222> (5)..(5)<222> (5)..(5)
<223> /replace="S"<223> /replace="S"
<220><220>
<221> SITE<221> SITE
<222> (1)..(11)<222> (1)..(11)
<223> /note="Variant residues given in the sequence have no<223> /note="Variant residues given in the sequence have no
preference with respect to those in the annotations preference with respect to those in the annotations
for variant positions"for variant positions"
<400> 189<400> 189
Ala Arg Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp ValAla Arg Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val
1 5 10 1 5 10
<210> 190<210> 190
<211> 521<211> 521
<212> DNA<212> DNA
<213> Unknown<213> Unknown
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Unknown:<223> /note="Description of Unknown:
PGK Promoter sequence"PGK Promoter sequence"
<400> 190<400> 190
acccctctct ccagccacta agccagttgc tccctcggct gacggctgca cgcgaggcct 60acccctctct ccagccacta agccagttgc tccctcggct gacggctgca cgcgaggcct 60
ccgaacgtct tacgccttgt ggcgcgcccg tccttgtccc gggtgtgatg gcggggtgtg 120ccgaacgtct tacgccttgt ggcgcgcccg tccttgtccc gggtgtgatg gcggggtgtg 120
gggcggaggg cgtggcgggg aagggccggc gacgagagcc gcgcgggacg actcgtcggc 180gggcggaggg cgtggcgggg aagggccggc gacgagagcc gcgcgggacg actcgtcggc 180
gataaccggt gtcgggtagc gccagccgcg cgacggtaac gagggaccgc gacaggcaga 240gataaccggt gtcgggtagc gccagccgcg cgacggtaac gagggaccgc gacaggcaga 240
cgctcccatg atcactctgc acgccgaagg caaatagtgc aggccgtgcg gcgcttggcg 300cgctcccatg atcactctgc acgccgaagg caaatagtgc aggccgtgcg gcgcttggcg 300
ttccttggaa gggctgaatc cccgcctcgt ccttcgcagc ggccccccgg gtgttcccat 360ttccttggaa gggctgaatc cccgcctcgt ccttcgcagc ggccccccgg gtgttcccat 360
cgccgcttct aggcccactg cgacgcttgc ctgcacttct tacacgctct gggtcccagc 420cgccgcttct aggcccactg cgacgcttgc ctgcacttct tacacgctct gggtcccagc 420
cgcggcgacg caaagggcct tggtgcgggt ctcgtcggcg cagggacgcg tttgggtccc 480cgcggcgacg caaagggcct tggtgcgggt ctcgtcggcg cagggacgcg tttgggtccc 480
gacggaacct tttccgcgtt ggggttgggg caccataagc t 521gacggaacct tttccgcgtt ggggttgggg caccataagc t 521
<210> 191<210> 191
<211> 221<211> 221
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 191<400> 191
acccctctct ccagccacta agccagttgc tccctcggct gacggctgca cgcgaggcct 60acccctctct ccagccacta agccagttgc tccctcggct gacggctgca cgcgaggcct 60
ccgaacgtct tacgccttgt ggcgcgcccg tccttgtccc gggtgtgatg gcggggtgtg 120ccgaacgtct tacgccttgt ggcgcgcccg tccttgtccc gggtgtgatg gcggggtgtg 120
gggcggaggg cgtggcgggg aagggccggc gacgagagcc gcgcgggacg actcgtcggc 180gggcggaggg cgtggcgggg aagggccggc gacgagagcc gcgcgggacg actcgtcggc 180
gataaccggt gtcgggtagc gccagccgcg cgacggtaac g 221gataaccggt gtcgggtagc gccagccgcg cgacggtaac g 221
<210> 192<210> 192
<211> 324<211> 324
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 192<400> 192
acccctctct ccagccacta agccagttgc tccctcggct gacggctgca cgcgaggcct 60acccctctct ccagccacta agccagttgc tccctcggct gacggctgca cgcgaggcct 60
ccgaacgtct tacgccttgt ggcgcgcccg tccttgtccc gggtgtgatg gcggggtgtg 120ccgaacgtct tacgccttgt ggcgcgcccg tccttgtccc gggtgtgatg gcggggtgtg 120
gggcggaggg cgtggcgggg aagggccggc gacgagagcc gcgcgggacg actcgtcggc 180gggcggaggg cgtggcgggg aagggccggc gacgagagcc gcgcgggacg actcgtcggc 180
gataaccggt gtcgggtagc gccagccgcg cgacggtaac gagggaccgc gacaggcaga 240gataaccggt gtcgggtagc gccagccgcg cgacggtaac gagggaccgc gacaggcaga 240
cgctcccatg atcactctgc acgccgaagg caaatagtgc aggccgtgcg gcgcttggcg 300cgctcccatg atcactctgc acgccgaagg caaatagtgc aggccgtgcg gcgcttggcg 300
ttccttggaa gggctgaatc cccg 324ttccttggaa gggctgaatc cccg 324
<210> 193<210> 193
<211> 422<211> 422
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 193<400> 193
acccctctct ccagccacta agccagttgc tccctcggct gacggctgca cgcgaggcct 60acccctctct ccagccacta agccagttgc tccctcggct gacggctgca cgcgaggcct 60
ccgaacgtct tacgccttgt ggcgcgcccg tccttgtccc gggtgtgatg gcggggtgtg 120ccgaacgtct tacgccttgt ggcgcgcccg tccttgtccc gggtgtgatg gcggggtgtg 120
gggcggaggg cgtggcgggg aagggccggc gacgagagcc gcgcgggacg actcgtcggc 180gggcggaggg cgtggcgggg aagggccggc gacgagagcc gcgcgggacg actcgtcggc 180
gataaccggt gtcgggtagc gccagccgcg cgacggtaac gagggaccgc gacaggcaga 240gataaccggt gtcgggtagc gccagccgcg cgacggtaac gagggaccgc gacaggcaga 240
cgctcccatg atcactctgc acgccgaagg caaatagtgc aggccgtgcg gcgcttggcg 300cgctcccatg atcactctgc acgccgaagg caaatagtgc aggccgtgcg gcgcttggcg 300
ttccttggaa gggctgaatc cccgcctcgt ccttcgcagc ggccccccgg gtgttcccat 360ttccttggaa gggctgaatc cccgcctcgt ccttcgcagc ggccccccgg gtgttcccat 360
cgccgcttct aggcccactg cgacgcttgc ctgcacttct tacacgctct gggtcccagc 420cgccgcttct aggcccactg cgacgcttgc ctgcacttct tacacgctct gggtcccagc 420
cg 422cg 422
<210> 194<210> 194
<400> 194<400> 194
000000
<210> 195<210> 195
<400> 195<400> 195
000000
<210> 196<210> 196
<400> 196<400> 196
000000
<210> 197<210> 197
<400> 197<400> 197
000000
<210> 198<210> 198
<211> 118<211> 118
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 198<400> 198
acccctctct ccagccacta agccagttgc tccctcggct gacggctgca cgcgaggcct 60acccctctct ccagccacta agccagttgc tccctcggct gacggctgca cgcgaggcct 60
ccgaacgtct tacgccttgt ggcgcgcccg tccttgtccc gggtgtgatg gcggggtg 118ccgaacgtct tacgccttgt ggcgcgcccg tccttgtccc gggtgtgatg gcggggtg 118
<210> 199<210> 199
<211> 63<211> 63
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 199<400> 199
atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60
ccc 63ccc 63
<210> 200<210> 200
<211> 239<211> 239
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 200<400> 200
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Phe Ala Leu Ser Asn HisSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Phe Ala Leu Ser Asn His
20 25 30 20 25 30
Gly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser Val LysSer Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser Val Lys
50 55 60 50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu Tyr LeuGly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys SerGln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ser
85 90 95 85 90 95
Ala His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val ThrAla His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110 100 105 110
Val Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlyVal Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu SerGly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser
130 135 140 130 135 140
Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln SerAla Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala ProIle Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro
165 170 175 165 170 175
Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro SerLys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile SerArg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
195 200 205 195 200 205
Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser TyrSer Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr
210 215 220 210 215 220
Ser Thr Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile LysSer Thr Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
225 230 235 225 230 235
<210> 201<210> 201
<211> 717<211> 717
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 201<400> 201
gaagtgcaat tggtggaatc agggggagga cttgtgcagc ctggaggatc gctgagactg 60gaagtgcaat tggtggaatc agggggagga cttgtgcagc ctggaggatc gctgagactg 60
tcatgtgccg tgtccggctt tgccctgtcc aaccacggga tgtcctgggt ccgccgcgcg 120tcatgtgccg tgtccggctt tgccctgtcc aaccacggga tgtcctgggt ccgccgcgcg 120
cctggaaagg gcctcgaatg ggtgtcgggt attgtgtaca gcggtagcac ctactatgcc 180cctggaaagg gcctcgaatg ggtgtcggggt attgtgtaca gcggtagcac ctactatgcc 180
gcatccgtga aggggagatt caccatcagc cgggacaact ccaggaacac tctgtacctc 240gcatccgtga aggggagatt caccatcagc cgggacaact ccadgaacac tctgtacctc 240
caaatgaatt cgctgaggcc agaggacact gccatctact actgctccgc gcatggcgga 300caaatgaatt cgctgaggcc agaggacact gccatctact actgctccgc gcatggcgga 300
gagtccgacg tctggggaca ggggaccacc gtgaccgtgt ctagcgcgtc cggcggaggc 360gagtccgacg tctggggaca ggggaccacc gtgaccgtgt ctagcgcgtc cggcggaggc 360
ggcagcgggg gtggtggttc agggggcggc ggatcggaca tccagctcac ccagtccccg 420ggcagcgggg gtggtggttc agggggcggc ggatcggaca tccagctcac ccagtccccg 420
agctcgctgt ccgcctccgt gggagatcgg gtcaccatca cgtgccgcgc cagccagtcg 480agctcgctgt ccgcctccgt gggagatcgg gtcaccatca cgtgccgcgc cagccagtcg 480
atttcctcct acctgaactg gtaccaacag aagcccggaa aagccccgaa gcttctcatc 540atttcctcct acctgaactg gtaccaacag aagcccggaa aagccccgaa gcttctcatc 540
tacgccgcct cgagcctgca gtcaggagtg ccctcacggt tctccggctc cggttccggt 600tacgccgcct cgagcctgca gtcaggagtg ccctcacggt tctccggctc cggttccggt 600
actgatttca ccctgaccat ttcctccctg caaccggagg acttcgctac ttactactgc 660actgatttca ccctgaccat ttcctccctg caaccggagg acttcgctac ttactactgc 660
cagcagtcgt actccacccc ctacactttc ggacaaggca ccaaggtcga aatcaag 717cagcagtcgt actccacccc ctacactttc ggacaaggca ccaaggtcga aatcaag 717
<210> 202<210> 202
<211> 69<211> 69
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 202<400> 202
Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile AlaThr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala GlySer Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly
20 25 30 20 25 30
Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr IleGly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile
35 40 45 35 40 45
Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu ValTrp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val
50 55 60 50 55 60
Ile Thr Leu Tyr CysIle Thr Leu Tyr Cys
65 65
<210> 203<210> 203
<211> 207<211> 207
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 203<400> 203
accactaccc cagcaccgag gccacccacc ccggctccta ccatcgcctc ccagcctctg 60accactaccc cagcaccgag gccacccacc ccggctccta ccatcgcctc ccagcctctg 60
tccctgcgtc cggaggcatg tagacccgca gctggtgggg ccgtgcatac ccggggtctt 120tccctgcgtc cggaggcatg tagacccgca gctggtgggg ccgtgcatac ccggggtctt 120
gacttcgcct gcgatatcta catttgggcc cctctggctg gtacttgcgg ggtcctgctg 180gacttcgcct gcgatatcta catttgggcc cctctggctg gtacttgcgg ggtcctgctg 180
ctttcactcg tgatcactct ttactgt 207ctttcactcg tgatcactct ttactgt 207
<210> 204<210> 204
<211> 126<211> 126
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 204<400> 204
aagcgcggtc ggaagaagct gctgtacatc tttaagcaac ccttcatgag gcctgtgcag 60aagcgcggtc ggaagaagct gctgtacatc tttaagcaac ccttcatgag gcctgtgcag 60
actactcaag aggaggacgg ctgttcatgc cggttcccag aggaggagga aggcggctgc 120actactcaag aggaggacgg ctgttcatgc cggttcccag aggaggagga aggcggctgc 120
gaactg 126gaactg 126
<210> 205<210> 205
<211> 336<211> 336
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 205<400> 205
cgcgtgaaat tcagccgcag cgcagatgct ccagcctacc agcaggggca gaaccagctc 60cgcgtgaaat tcagccgcag cgcagatgct ccagcctacc agcaggggca gaaccagctc 60
tacaacgaac tcaatcttgg tcggagagag gagtacgacg tgctggacaa gcggagagga 120tacaacgaac tcaatcttgg tcggagagag gagtacgacg tgctggacaa gcggagagga 120
cgggacccag aaatgggcgg gaagccgcgc agaaagaatc cccaagaggg cctgtacaac 180cgggacccag aaatgggcgg gaagccgcgc agaaagaatc cccaagaggg cctgtacaac 180
gagctccaaa aggataagat ggcagaagcc tatagcgaga ttggtatgaa aggggaacgc 240gagctccaaa aggataagat ggcagaagcc tatagcgaga ttggtatgaa aggggaacgc 240
agaagaggca aaggccacga cggactgtac cagggactca gcaccgccac caaggacacc 300agaagaggca aaggccacga cggactgtac cagggactca gcaccgccac caaggacacc 300
tatgacgctc ttcacatgca ggccctgccg cctcgg 336tatgacgctc ttcacatgca ggccctgccg cctcgg 336
<210> 206<210> 206
<211> 3<211> 3
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 206<400> 206
Gly Ser GlyGly Ser Gly
1 1
<210> 207<210> 207
<211> 9<211> 9
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 207<400> 207
ggaagcgga 9
<210> 208<210> 208
<211> 19<211> 19
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 208<400> 208
Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu AsnAla Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn
1 5 10 15 1 5 10 15
Pro Gly ProPro Gly Pro
<210> 209<210> 209
<211> 57<211> 57
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 209<400> 209
gctactaact tcagcctgct gaagcaggct ggagacgtgg aggagaaccc tggacct 57gctactaact tcagcctgct gaagcaggct ggagacgtgg aggagaaccc tggacct 57
<210> 210<210> 210
<211> 63<211> 63
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 210<400> 210
atggccttac cagtgaccgc cttgctcctg ccgctggcct tgctgctcca cgccgccagg 60atggccttac cagtgaccgc cttgctcctg ccgctggcct tgctgctcca cgccgccagg 60
ccg 63ccg 63
<210> 211<210> 211
<211> 242<211> 242
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 211<400> 211
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln GluGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu
115 120 125 115 120 125
Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr CysSer Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile ArgThr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg
145 150 155 160145 150 155 160
Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly SerGln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser
165 170 175 165 170 175
Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile SerGlu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser
180 185 190 180 185 190
Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val ThrLys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr
195 200 205 195 200 205
Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr GlyAla Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr ValGly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val
225 230 235 240225 230 235 240
Ser SerSer Ser
<210> 212<210> 212
<211> 726<211> 726
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 212<400> 212
gaaattgtga tgacccagtc acccgccact cttagccttt cacccggtga gcgcgcaacc 60gaaattgtga tgacccagtc acccgccact cttagccttt cacccggtga gcgcgcaacc 60
ctgtcttgca gagcctccca agacatctca aaatacctta attggtatca acagaagccc 120ctgtcttgca gagcctccca agacatctca aaatacctta attggtatca acagaagccc 120
ggacaggctc ctcgccttct gatctaccac accagccggc tccattctgg aatccctgcc 180ggacaggctc ctcgccttct gatctaccac accagccggc tccattctgg aatccctgcc 180
aggttcagcg gtagcggatc tgggaccgac tacaccctca ctatcagctc actgcagcca 240aggttcagcg gtagcggatc tgggaccgac tacaccctca ctatcagctc actgcagcca 240
gaggacttcg ctgtctattt ctgtcagcaa gggaacaccc tgccctacac ctttggacag 300gaggacttcg ctgtctattt ctgtcagcaa gggaacaccc tgccctacac ctttggacag 300
ggcaccaagc tcgagattaa aggtggaggt ggcagcggag gaggtgggtc cggcggtgga 360ggcaccaagc tcgagattaa aggtggaggt ggcagcggag gaggtgggtc cggcggtgga 360
ggaagccagg tccaactcca agaaagcgga ccgggtcttg tgaagccatc agaaactctt 420ggaagccagg tccaactcca agaaagcgga ccgggtcttg tgaagccatc agaaactctt 420
tcactgactt gtactgtgag cggagtgtct ctccccgatt acggggtgtc ttggatcaga 480tcactgactt gtactgtgag cggagtgtct ctccccgatt acggggtgtc ttggatcaga 480
cagccaccgg ggaagggtct ggaatggatt ggagtgattt ggggctctga gactacttac 540cagccaccgg ggaagggtct ggaatggatt ggagtgattt ggggctctga gactacttac 540
taccaatcat ccctcaagtc acgcgtcacc atctcaaagg acaactctaa gaatcaggtg 600taccaatcat ccctcaagtc acgcgtcacc atctcaaagg acaactctaa gaatcaggtg 600
tcactgaaac tgtcatctgt gaccgcagcc gacaccgccg tgtactattg cgctaagcat 660tcactgaaac tgtcatctgt gaccgcagcc gacaccgccg tgtactattg cgctaagcat 660
tactattatg gcgggagcta cgcaatggat tactggggac agggtactct ggtcaccgtg 720tactattatg gcgggagcta cgcaatggat tactggggac agggtactct ggtcaccgtg 720
tccagc 726tccagc 726
<210> 213<210> 213
<211> 207<211> 207
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 213<400> 213
accacgacgc cagcgccgcg accaccaaca ccggcgccca ccatcgcgtc gcagcccctg 60accacgacgc cagcgccgcg accaccaaca ccggcgccca
tccctgcgcc cagaggcgtg ccggccagcg gcggggggcg cagtgcacac gagggggctg 120tccctgcgcc cagaggcgtg ccggccagcg gcggggggcg cagtgcacac gagggggctg 120
gacttcgcct gtgatatcta catctgggcg cccttggccg ggacttgtgg ggtccttctc 180gacttcgcct gtgatatcta catctgggcg cccttggccg ggacttgtgg ggtccttctc 180
ctgtcactgg ttatcaccct ttactgc 207ctgtcactgg ttatcaccct ttactgc 207
<210> 214<210> 214
<211> 1000<211> 1000
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 214<400> 214
Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu LeuMet Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Ala Ala Arg Pro Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly LeuHis Ala Ala Arg Pro Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu
20 25 30 20 25 30
Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly PheVal Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe
35 40 45 35 40 45
Thr Phe Ser Ser Tyr Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly LysThr Phe Ser Ser Tyr Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys
50 55 60 50 55 60
Gly Leu Glu Trp Val Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr TyrGly Leu Glu Trp Val Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn SerTyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser
85 90 95 85 90 95
Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp ThrLys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr
100 105 110 100 105 110
Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp LeuAla Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu
115 120 125 115 120 125
Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly GlyPhe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly
130 135 140 130 135 140
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
145 150 155 160145 150 155 160
Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala SerGly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser
165 170 175 165 170 175
Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile SerVal Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser
180 185 190 180 185 190
Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuSer Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
195 200 205 195 200 205
Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg PheLeu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe
210 215 220 210 215 220
Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser LeuSer Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu
225 230 235 240225 230 235 240
Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser ThrGln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr
245 250 255 245 250 255
Pro Leu Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr ThrPro Leu Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr
260 265 270 260 265 270
Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln ProPro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro
275 280 285 275 280 285
Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala ValLeu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val
290 295 300 290 295 300
His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala ProHis Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro
305 310 315 320305 310 315 320
Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr LeuLeu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu
325 330 335 325 330 335
Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln ProTyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro
340 345 350 340 345 350
Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser CysPhe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys
355 360 365 355 360 365
Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys PheArg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe
370 375 380 370 375 380
Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln LeuSer Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu
385 390 395 400385 390 395 400
Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu AspTyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp
405 410 415 405 410 415
Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg LysLys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys
420 425 430 420 425 430
Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met AlaAsn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala
435 440 445 435 440 445
Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly LysGlu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys
450 455 460 450 455 460
Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp ThrGly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr
465 470 475 480465 470 475 480
Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly AlaTyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly Ala
485 490 495 485 490 495
Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn ProThr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro
500 505 510 500 505 510
Gly Pro Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala LeuGly Pro Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu
515 520 525 515 520 525
Leu Leu His Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro AlaLeu Leu His Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala
530 535 540 530 535 540
Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg AlaThr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala
545 550 555 560545 550 555 560
Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro GlySer Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly
565 570 575 565 570 575
Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser GlyGln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly
580 585 590 580 585 590
Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr LeuIle Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu
595 600 605 595 600 605
Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys GlnThr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln
610 615 620 610 615 620
Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu GluGln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu
625 630 635 640625 630 635 640
Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly GlyIle Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
645 650 655 645 650 655
Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro SerSer Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser
660 665 670 660 665 670
Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro AspGlu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp
675 680 685 675 680 685
Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu TrpTyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
690 695 700 690 695 700
Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser LeuIle Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu
705 710 715 720705 710 715 720
Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val SerLys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser
725 730 735 725 730 735
Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
740 745 750 740 745 750
Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp GlyAla Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly
755 760 765 755 760 765
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro ArgGln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg
770 775 780 770 775 780
Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu ArgPro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg
785 790 795 800785 790 795 800
Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg GlyPro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly
805 810 815 805 810 815
Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly ThrLeu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr
820 825 830 820 825 830
Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys ArgCys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg
835 840 845 835 840 845
Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg ProGly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro
850 855 860 850 855 860
Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro GluVal Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu
865 870 875 880865 870 875 880
Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser AlaGlu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala
885 890 895 885 890 895
Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu LeuAsp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu
900 905 910 900 905 910
Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg GlyAsn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly
915 920 925 915 920 925
Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln GluArg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu
930 935 940 930 935 940
Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr SerGly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser
945 950 955 960945 950 955 960
Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp GlyGlu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly
965 970 975 965 970 975
Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala LeuLeu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu
980 985 990 980 985 990
His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgHis Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
995 1000995 1000
<210> 215<210> 215
<211> 3000<211> 3000
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 215<400> 215
atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60
cccgaagtgc agttgctgga gtcaggcgga ggactggtgc agcccggagg atcgcttcgc 120cccgaagtgc agttgctgga gtcaggcgga ggactggtgc agcccggagg atcgcttcgc 120
ttgagctgcg cagcctcagg ctttaccttc tcctcctacg ccatgtcctg ggtcagacag 180ttgagctgcg cagcctcagg ctttaccttc tcctcctacg ccatgtcctg ggtcagacag 180
gctcccggga agggactgga atgggtgtcc gccattagcg gttccggcgg aagcacttac 240gctcccggga agggactgga atgggtgtcc gccattagcg gttccggcgg aagcacttac 240
tatgccgact ctgtgaaggg ccgcttcact atctcccggg acaactccaa gaacaccctg 300tatgccgact ctgtgaaggg ccgcttcact atctcccggg acaactccaa gaacaccctg 300
tatctccaaa tgaattccct gagggccgaa gataccgcgg tgtactactg cgctagacgg 360tatctccaaa tgaattccct gagggccgaa gataccgcgg tgtactactg cgctagacgg 360
gagtggtggg gagaaagctg gctgttcgac tactggggac agggcactct cgtgactgtg 420gagtggtggg gagaaagctg gctgttcgac tactggggac agggcactct cgtgactgtg 420
tcctccggtg gtggtggatc ggggggtggt ggttcgggcg gaggaggatc tggaggagga 480tcctccggtg gtggtggatc ggggggtggt ggttcggggcg gaggaggatc tggagggagga 480
gggtcggaca ttcaaatgac tcagtccccg tcctccctct ccgcctccgt gggagatcgc 540gggtcggaca ttcaaatgac tcagtccccg tcctccctct ccgcctccgt gggagatcgc 540
gtcacgatca cgtgcagggc cagccagagc atctccagct acctgaactg gtaccagcag 600gtcacgatca cgtgcagggc cagccagagc atctccagct acctgaactg gtaccagcag 600
aagccaggga aggcaccgaa gctcctgatc tacgccgcta gctcgctgca gtccggcgtc 660aagccaggga aggcaccgaa gctcctgatc tacgccgcta gctcgctgca gtccggcgtc 660
ccttcacggt tctcgggatc gggctcaggc accgacttca ccctgaccat tagcagcctg 720ccttcacggt tctcgggatc gggctcaggc accgacttca ccctgaccat tagcagcctg 720
cagccggagg acttcgcgac atactactgt cagcagtcat actccacccc tctgaccttc 780cagccggagg acttcgcgac atactactgt cagcagtcat actccacccc tctgaccttc 780
ggccaaggga ccaaagtgga gatcaagacc actaccccag caccgaggcc acccaccccg 840ggccaaggga ccaaagtgga gatcaagacc actaccccag caccgaggcc acccaccccg 840
gctcctacca tcgcctccca gcctctgtcc ctgcgtccgg aggcatgtag acccgcagct 900gctcctacca tcgcctccca gcctctgtcc ctgcgtccgg aggcatgtag acccgcagct 900
ggtggggccg tgcatacccg gggtcttgac ttcgcctgcg atatctacat ttgggcccct 960ggtggggccg tgcatacccg gggtcttgac ttcgcctgcg atatctacat ttgggcccct 960
ctggctggta cttgcggggt cctgctgctt tcactcgtga tcactcttta ctgtaagcgc 1020ctggctggta cttgcggggt cctgctgctt tcactcgtga tcactcttta ctgtaagcgc 1020
ggtcggaaga agctgctgta catctttaag caacccttca tgaggcctgt gcagactact 1080ggtcggaaga agctgctgta catctttaag caacccttca tgaggcctgt gcagactact 1080
caagaggagg acggctgttc atgccggttc ccagaggagg aggaaggcgg ctgcgaactg 1140caagaggagg acggctgttc atgccggttc ccagaggagg aggaaggcgg ctgcgaactg 1140
cgcgtgaaat tcagccgcag cgcagatgct ccagcctacc agcaggggca gaaccagctc 1200cgcgtgaaat tcagccgcag cgcagatgct ccagcctacc agcaggggca gaaccagctc 1200
tacaacgaac tcaatcttgg tcggagagag gagtacgacg tgctggacaa gcggagagga 1260tacaacgaac tcaatcttgg tcggagagag gagtacgacg tgctggacaa gcggagagga 1260
cgggacccag aaatgggcgg gaagccgcgc agaaagaatc cccaagaggg cctgtacaac 1320cgggacccag aaatgggcgg gaagccgcgc agaaagaatc cccaagaggg cctgtacaac 1320
gagctccaaa aggataagat ggcagaagcc tatagcgaga ttggtatgaa aggggaacgc 1380gagctccaaa aggataagat ggcagaagcc tatagcgaga ttggtatgaa aggggaacgc 1380
agaagaggca aaggccacga cggactgtac cagggactca gcaccgccac caaggacacc 1440agaagaggca aaggccacga cggactgtac cagggactca gcaccgccac caaggacacc 1440
tatgacgctc ttcacatgca ggccctgccg cctcggggaa gcggagctac taacttcagc 1500tatgacgctc ttcacatgca ggccctgccg cctcggggaa gcggagctac taacttcagc 1500
ctgctgaagc aggctggaga cgtggaggag aaccctggac ctatggcctt accagtgacc 1560ctgctgaagc aggctggaga cgtggaggag aaccctggac ctatggcctt accagtgacc 1560
gccttgctcc tgccgctggc cttgctgctc cacgccgcca ggccggaaat tgtgatgacc 1620gccttgctcc tgccgctggc cttgctgctc cacgccgcca ggccggaaat tgtgatgacc 1620
cagtcacccg ccactcttag cctttcaccc ggtgagcgcg caaccctgtc ttgcagagcc 1680cagtcacccg ccactcttag cctttcaccc ggtgagcgcg caaccctgtc ttgcagagcc 1680
tcccaagaca tctcaaaata ccttaattgg tatcaacaga agcccggaca ggctcctcgc 1740tcccaagaca tctcaaaata ccttaattgg tatcaacaga agcccggaca ggctcctcgc 1740
cttctgatct accacaccag ccggctccat tctggaatcc ctgccaggtt cagcggtagc 1800cttctgatct accacaccag ccggctccat tctggaatcc ctgccaggtt cagcggtagc 1800
ggatctggga ccgactacac cctcactatc agctcactgc agccagagga cttcgctgtc 1860ggatctggga ccgactacac cctcactatc agctcactgc agccagagga cttcgctgtc 1860
tatttctgtc agcaagggaa caccctgccc tacacctttg gacagggcac caagctcgag 1920tatttctgtc agcaagggaa caccctgccc tacacctttg gacagggcac caagctcgag 1920
attaaaggtg gaggtggcag cggaggaggt gggtccggcg gtggaggaag ccaggtccaa 1980attaaaggtg gaggtggcag cggaggaggt gggtccggcg gtggaggaag ccaggtccaa 1980
ctccaagaaa gcggaccggg tcttgtgaag ccatcagaaa ctctttcact gacttgtact 2040ctccaagaaa gcggaccggg tcttgtgaag ccatcagaaa ctctttcact gacttgtact 2040
gtgagcggag tgtctctccc cgattacggg gtgtcttgga tcagacagcc accggggaag 2100gtgagcggag tgtctctccc cgattacggg gtgtcttgga tcagacagcc accggggaag 2100
ggtctggaat ggattggagt gatttggggc tctgagacta cttactacca atcatccctc 2160ggtctggaat ggattggagt gatttggggc tctgagacta cttactacca atcatccctc 2160
aagtcacgcg tcaccatctc aaaggacaac tctaagaatc aggtgtcact gaaactgtca 2220aagtcacgcg tcaccatctc aaaggacaac tctaagaatc aggtgtcact gaaactgtca 2220
tctgtgaccg cagccgacac cgccgtgtac tattgcgcta agcattacta ttatggcggg 2280tctgtgaccg cagccgacac cgccgtgtac tattgcgcta agcattacta ttatggcggg 2280
agctacgcaa tggattactg gggacagggt actctggtca ccgtgtccag caccacgacg 2340agctacgcaa tggattactg gggacagggt actctggtca ccgtgtccag caccacgacg 2340
ccagcgccgc gaccaccaac accggcgccc accatcgcgt cgcagcccct gtccctgcgc 2400ccagcgccgc gaccaccaac accggcgccc accatcgcgt cgcagcccct gtccctgcgc 2400
ccagaggcgt gccggccagc ggcggggggc gcagtgcaca cgagggggct ggacttcgcc 2460ccagaggcgt gccggccagc ggcggggggc gcagtgcaca cgaggggct ggacttcgcc 2460
tgtgatatct acatctgggc gcccttggcc gggacttgtg gggtccttct cctgtcactg 2520tgtgatatct acatctgggc gcccttggcc gggacttgtg gggtccttct cctgtcactg 2520
gttatcaccc tttactgcaa acggggcaga aagaaactcc tgtatatatt caaacaacca 2580gttatcaccc tttactgcaa acggggcaga aagaaactcc tgtatatatt caaacaacca 2580
tttatgagac cagtacaaac tactcaagag gaagatggct gtagctgccg atttccagaa 2640tttatgagac cagtacaaac tactcaagag gaagatggct gtagctgccg atttccagaa 2640
gaagaagaag gaggatgtga actgagagtg aagttcagca ggagcgcaga cgcccccgcg 2700gaagaagaag gaggatgtga actgagagtg aagttcagca ggagcgcaga cgcccccgcg 2700
taccagcagg gccagaacca gctctataac gagctcaatc taggacgaag agaggagtac 2760taccagcagg gccagaacca gctctataac gagctcaatc taggacgaag agaggagtac 2760
gatgttttgg acaagagacg tggccgggac cctgagatgg ggggaaagcc gagaaggaag 2820gatgttttgg acaagagacg tggccgggac cctgagatgg ggggaaagcc gagaaggaag 2820
aaccctcagg aaggcctgta caatgaactg cagaaagata agatggcgga ggcctacagt 2880aaccctcagg aaggcctgta caatgaactg cagaaagata agatggcgga ggcctacagt 2880
gagattggga tgaaaggcga gcgccggagg ggcaaggggc acgatggcct ttaccagggt 2940gagattggga tgaaaggcga gcgccggagg ggcaaggggc acgatggcct ttaccagggt 2940
ctcagtacag ccaccaagga cacctacgac gcccttcaca tgcaggccct gccccctcgc 3000ctcagtacag ccaccaagga cacctacgac gcccttcaca tgcaggccct gccccctcgc 3000
<210> 216<210> 216
<211> 1001<211> 1001
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 216<400> 216
Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu LeuMet Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Ala Ala Arg Pro Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly ValHis Ala Ala Arg Pro Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val
20 25 30 20 25 30
Val Gln Pro Gly Arg Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly PheVal Gln Pro Gly Arg Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe
35 40 45 35 40 45
Thr Phe Ser Ser Tyr Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly LysThr Phe Ser Ser Tyr Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys
50 55 60 50 55 60
Gly Leu Glu Trp Val Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys TyrGly Leu Glu Trp Val Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn SerTyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser
85 90 95 85 90 95
Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp ThrLys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr
100 105 110 100 105 110
Ala Val Tyr Tyr Cys Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp TyrAla Val Tyr Tyr Cys Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr
115 120 125 115 120 125
Tyr Gly Leu Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTyr Gly Leu Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
130 135 140 130 135 140
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
145 150 155 160145 150 155 160
Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln SerSer Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser
165 170 175 165 170 175
Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr AsnIle Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn
180 185 190 180 185 190
Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu MetTyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met
195 200 205 195 200 205
Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe SerIle Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu GlnGly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln
225 230 235 240225 230 235 240
Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser SerAla Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser
245 250 255 245 250 255
Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr ThrThr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr
260 265 270 260 265 270
Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser GlnThr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln
275 280 285 275 280 285
Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly AlaPro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala
290 295 300 290 295 300
Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp AlaVal His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala
305 310 315 320305 310 315 320
Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile ThrPro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr
325 330 335 325 330 335
Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys GlnLeu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln
340 345 350 340 345 350
Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys SerPro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser
355 360 365 355 360 365
Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val LysCys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys
370 375 380 370 375 380
Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn GlnPhe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln
385 390 395 400385 390 395 400
Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val LeuLeu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu
405 410 415 405 410 415
Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg ArgAsp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg
420 425 430 420 425 430
Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys MetLys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met
435 440 445 435 440 445
Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg GlyAla Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly
450 455 460 450 455 460
Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys AspLys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp
465 470 475 480465 470 475 480
Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser GlyThr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly
485 490 495 485 490 495
Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu AsnAla Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn
500 505 510 500 505 510
Pro Gly Pro Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu AlaPro Gly Pro Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala
515 520 525 515 520 525
Leu Leu Leu His Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln Ser ProLeu Leu Leu His Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro
530 535 540 530 535 540
Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys ArgAla Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg
545 550 555 560545 550 555 560
Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys ProAla Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro
565 570 575 565 570 575
Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His SerGly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser
580 585 590 580 585 590
Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr ThrGly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr
595 600 605 595 600 605
Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe CysLeu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys
610 615 620 610 615 620
Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys LeuGln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu
625 630 635 640625 630 635 640
Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGlu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
645 650 655 645 650 655
Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys ProGly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro
660 665 670 660 665 670
Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu ProSer Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro
675 680 685 675 680 685
Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu GluAsp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu
690 695 700 690 695 700
Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser SerTrp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser
705 710 715 720705 710 715 720
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln ValLeu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val
725 730 735 725 730 735
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr TyrSer Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
740 745 750 740 745 750
Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr TrpCys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp
755 760 765 755 760 765
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala ProGly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro
770 775 780 770 775 780
Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser LeuArg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu
785 790 795 800785 790 795 800
Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr ArgArg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg
805 810 815 805 810 815
Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala GlyGly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly
820 825 830 820 825 830
Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys LysThr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys
835 840 845 835 840 845
Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met ArgArg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg
850 855 860 850 855 860
Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe ProPro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro
865 870 875 880865 870 875 880
Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg SerGlu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser
885 890 895 885 890 895
Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn GluAla Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu
900 905 910 900 905 910
Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg ArgLeu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg
915 920 925 915 920 925
Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro GlnGly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln
930 935 940 930 935 940
Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala TyrGlu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr
945 950 955 960945 950 955 960
Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His AspSer Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp
965 970 975 965 970 975
Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp AlaGly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala
980 985 990 980 985 990
Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgLeu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
995 1000 995 1000
<210> 217<210> 217
<211> 3003<211> 3003
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 217<400> 217
atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60
ccccaagtgc agctgcagga atccggtggc ggagtcgtgc agcctggaag gagcctgaga 120ccccaagtgc agctgcagga atccggtggc ggagtcgtgc agcctggaag gagcctgaga 120
ctctcatgcg ccgcgtcagg gttcaccttt tcctcctacg ggatgcattg ggtcagacag 180ctctcatgcg ccgcgtcagg gttcaccttt tcctcctacg ggatgcattg ggtcagacag 180
gcccccggaa agggactcga atgggtggct gtgatcagct acgacggctc caacaagtac 240gcccccggaa agggactcga atgggtggct gtgatcagct acgacggctc caacaagtac 240
tacgccgact ccgtgaaagg ccggttcact atctcccggg acaactccaa gaacacgctg 300tacgccgact ccgtgaaagg ccggttcact atctcccggg acaactccaa gaacacgctg 300
tatctgcaaa tgaattcact gcgcgcggag gataccgctg tgtactactg cggtggctcc 360tatctgcaaa tgaattcact gcgcgcggag gataccgctg tgtactactg cggtggctcc 360
ggttacgccc tgcacgatga ctattacggc cttgacgtct ggggccaggg aaccctcgtg 420ggttacgccc tgcacgatga ctattacggc cttgacgtct ggggccaggg aaccctcgtg 420
actgtgtcca gcggtggagg aggttcgggc ggaggaggat caggaggggg tggatcgcag 480actgtgtcca gcggtggagg aggttcgggc ggaggaggat caggaggggg tggatcgcag 480
agcgcactga ctcagccggc atccgtgtcc ggtagccccg gacagtcgat taccatctcc 540agcgcactga ctcagccggc atccgtgtcc ggtagccccg gacagtcgat taccatctcc 540
tgtaccggca cctcctccga cgtgggaggg tacaactacg tgtcgtggta ccagcagcac 600tgtaccggca cctcctccga cgtgggaggg tacaactacg tgtcgtggta ccagcagcac 600
ccaggaaagg cccctaagtt gatgatctac gatgtgtcaa accgcccgtc tggagtctcc 660caggaaagg cccctaagtt gatgatctac gatgtgtcaa accgcccgtc tggagtctcc 660
aaccggttct ccggctccaa gtccggcaac accgccagcc tgaccattag cgggctgcaa 720aaccggttct ccggctccaa gtccggcaac accgccagcc tgaccattag cgggctgcaa 720
gccgaggatg aggccgacta ctactgctcg agctacacat cctcgagcac cctctacgtg 780gccgaggatg aggccgacta ctactgctcg agctacacat cctcgagcac cctctacgtg 780
ttcggctcgg ggactaaggt caccgtgctg accactaccc cagcaccgag gccacccacc 840ttcggctcgg ggactaaggt caccgtgctg accactaccc cagcaccgag gccacccacc 840
ccggctccta ccatcgcctc ccagcctctg tccctgcgtc cggaggcatg tagacccgca 900ccggctccta ccatcgcctc ccagcctctg tccctgcgtc cggaggcatg tagacccgca 900
gctggtgggg ccgtgcatac ccggggtctt gacttcgcct gcgatatcta catttgggcc 960gctggtgggg ccgtgcatac ccggggtctt gacttcgcct gcgatatcta catttgggcc 960
cctctggctg gtacttgcgg ggtcctgctg ctttcactcg tgatcactct ttactgtaag 1020cctctggctg gtacttgcgg ggtcctgctg ctttcactcg tgatcactct ttactgtaag 1020
cgcggtcgga agaagctgct gtacatcttt aagcaaccct tcatgaggcc tgtgcagact 1080cgcggtcgga agaagctgct gtacatcttt aagcaaccct tcatgaggcc tgtgcagact 1080
actcaagagg aggacggctg ttcatgccgg ttcccagagg aggaggaagg cggctgcgaa 1140actcaagagg aggacggctg ttcatgccgg ttcccagagg aggaggaagg cggctgcgaa 1140
ctgcgcgtga aattcagccg cagcgcagat gctccagcct accagcaggg gcagaaccag 1200ctgcgcgtga aattcagccg cagcgcagat gctccagcct accagcaggg gcagaaccag 1200
ctctacaacg aactcaatct tggtcggaga gaggagtacg acgtgctgga caagcggaga 1260ctctacaacg aactcaatct tggtcggaga gaggagtacg acgtgctgga caagcggaga 1260
ggacgggacc cagaaatggg cgggaagccg cgcagaaaga atccccaaga gggcctgtac 1320ggacgggacc cagaaatggg cgggaagccg cgcagaaaga atccccaaga gggcctgtac 1320
aacgagctcc aaaaggataa gatggcagaa gcctatagcg agattggtat gaaaggggaa 1380aacgagctcc aaaaggataa gatggcagaa gcctatagcg agattggtat gaaaggggaa 1380
cgcagaagag gcaaaggcca cgacggactg taccagggac tcagcaccgc caccaaggac 1440cgcagaagag gcaaaggcca cgacggactg taccagggac tcagcaccgc caccaaggac 1440
acctatgacg ctcttcacat gcaggccctg ccgcctcggg gaagcggagc tactaacttc 1500acctatgacg ctcttcacat gcaggccctg ccgcctcggg gaagcggagc tactaacttc 1500
agcctgctga agcaggctgg agacgtggag gagaaccctg gacctatggc cttaccagtg 1560agcctgctga agcaggctgg agacgtggag gagaaccctg gacctatggc cttaccagtg 1560
accgccttgc tcctgccgct ggccttgctg ctccacgccg ccaggccgga aattgtgatg 1620accgccttgc tcctgccgct ggccttgctg ctccacgccg ccaggccgga aattgtgatg 1620
acccagtcac ccgccactct tagcctttca cccggtgagc gcgcaaccct gtcttgcaga 1680acccagtcac ccgccactct tagcctttca cccggtgagc gcgcaaccct gtcttgcaga 1680
gcctcccaag acatctcaaa ataccttaat tggtatcaac agaagcccgg acaggctcct 1740gcctcccaag acatctcaaa ataccttaat tggtatcaac agaagcccgg acaggctcct 1740
cgccttctga tctaccacac cagccggctc cattctggaa tccctgccag gttcagcggt 1800cgccttctga tctaccacac cagccggctc cattctggaa tccctgccag gttcagcggt 1800
agcggatctg ggaccgacta caccctcact atcagctcac tgcagccaga ggacttcgct 1860agcggatctg ggaccgacta caccctcact atcagctcac tgcagccaga ggacttcgct 1860
gtctatttct gtcagcaagg gaacaccctg ccctacacct ttggacaggg caccaagctc 1920gtctatttct gtcagcaagg gaacaccctg ccctacacct ttggacaggg caccaagctc 1920
gagattaaag gtggaggtgg cagcggagga ggtgggtccg gcggtggagg aagccaggtc 1980gagattaaag gtggaggtgg cagcggagga ggtgggtccg gcggtggagg aagccaggtc 1980
caactccaag aaagcggacc gggtcttgtg aagccatcag aaactctttc actgacttgt 2040caactccaag aaagcggacc gggtcttgtg aagccatcag aaactctttc actgacttgt 2040
actgtgagcg gagtgtctct ccccgattac ggggtgtctt ggatcagaca gccaccgggg 2100actgtgagcg gagtgtctct ccccgattac ggggtgtctt ggatcagaca gccaccgggg 2100
aagggtctgg aatggattgg agtgatttgg ggctctgaga ctacttacta ccaatcatcc 2160aagggtctgg aatggattgg agtgatttgg ggctctgaga ctacttacta ccaatcatcc 2160
ctcaagtcac gcgtcaccat ctcaaaggac aactctaaga atcaggtgtc actgaaactg 2220ctcaagtcac gcgtcaccat ctcaaaggac aactctaaga atcaggtgtc actgaaactg 2220
tcatctgtga ccgcagccga caccgccgtg tactattgcg ctaagcatta ctattatggc 2280tcatctgtga ccgcagccga caccgccgtg tactattgcg ctaagcatta ctattatggc 2280
gggagctacg caatggatta ctggggacag ggtactctgg tcaccgtgtc cagcaccacg 2340gggagctacg caatggatta ctggggacag ggtactctgg tcaccgtgtc cagcaccacg 2340
acgccagcgc cgcgaccacc aacaccggcg cccaccatcg cgtcgcagcc cctgtccctg 2400acgccagcgc cgcgaccacc aacaccggcg cccaccatcg cgtcgcagcc cctgtccctg 2400
cgcccagagg cgtgccggcc agcggcgggg ggcgcagtgc acacgagggg gctggacttc 2460cgcccagagg cgtgccggcc agcggcgggg ggcgcagtgc acacgagggg gctggacttc 2460
gcctgtgata tctacatctg ggcgcccttg gccgggactt gtggggtcct tctcctgtca 2520gcctgtgata tctacatctg ggcgcccttg gccgggactt gtggggtcct tctcctgtca 2520
ctggttatca ccctttactg caaacggggc agaaagaaac tcctgtatat attcaaacaa 2580ctggttatca ccctttactg caaacggggc agaaagaaac tcctgtatat attcaaacaa 2580
ccatttatga gaccagtaca aactactcaa gaggaagatg gctgtagctg ccgatttcca 2640ccatttatga gaccagtaca aactactcaa gaggaagatg gctgtagctg ccgatttcca 2640
gaagaagaag aaggaggatg tgaactgaga gtgaagttca gcaggagcgc agacgccccc 2700gaagaagaag aaggaggatg tgaactgaga gtgaagttca gcaggagcgc agacgccccc 2700
gcgtaccagc agggccagaa ccagctctat aacgagctca atctaggacg aagagaggag 2760gcgtaccagc agggccagaa ccagctctat aacgagctca atctaggacg aagagaggag 2760
tacgatgttt tggacaagag acgtggccgg gaccctgaga tggggggaaa gccgagaagg 2820tacgatgttt tggacaagag acgtggccgg gaccctgaga tggggggaaa gccgagaagg 2820
aagaaccctc aggaaggcct gtacaatgaa ctgcagaaag ataagatggc ggaggcctac 2880aagaaccctc aggaaggcct gtacaatgaa ctgcagaaag ataagatggc ggaggcctac 2880
agtgagattg ggatgaaagg cgagcgccgg aggggcaagg ggcacgatgg cctttaccag 2940agtgagattg ggatgaaagg cgagcgccgg aggggcaagg ggcacgatgg cctttaccag 2940
ggtctcagta cagccaccaa ggacacctac gacgcccttc acatgcaggc cctgccccct 3000ggtctcagta cagccaccaa ggacacctac gacgcccttc acatgcaggc cctgccccct 3000
cgc 3003cgc 3003
<210> 218<210> 218
<211> 1002<211> 1002
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 218<400> 218
Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu LeuMet Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Ala Ala Arg Pro Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly LeuHis Ala Ala Arg Pro Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu
20 25 30 20 25 30
Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly PheVal Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe
35 40 45 35 40 45
Thr Phe Ser Ser Tyr Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly LysThr Phe Ser Ser Tyr Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys
50 55 60 50 55 60
Gly Leu Glu Trp Val Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr TyrGly Leu Glu Trp Val Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn SerTyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser
85 90 95 85 90 95
Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp ThrLys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr
100 105 110 100 105 110
Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val SerAla Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser
115 120 125 115 120 125
Trp Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTrp Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
130 135 140 130 135 140
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlyGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
145 150 155 160145 150 155 160
Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu SerGly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser
165 170 175 165 170 175
Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln SerAla Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser
180 185 190 180 185 190
Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala ProIle Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro
195 200 205 195 200 205
Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro SerLys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser
210 215 220 210 215 220
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile SerArg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser TyrSer Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr
245 250 255 245 250 255
Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys ThrSer Thr Pro Leu Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr
260 265 270 260 265 270
Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala SerThr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser
275 280 285 275 280 285
Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly GlyGln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly
290 295 300 290 295 300
Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile TrpAla Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp
305 310 315 320305 310 315 320
Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val IleAla Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile
325 330 335 325 330 335
Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe LysThr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys
340 345 350 340 345 350
Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly CysGln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys
355 360 365 355 360 365
Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg ValSer Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val
370 375 380 370 375 380
Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln AsnLys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn
385 390 395 400385 390 395 400
Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp ValGln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val
405 410 415 405 410 415
Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro ArgLeu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg
420 425 430 420 425 430
Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp LysArg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys
435 440 445 435 440 445
Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg ArgMet Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg
450 455 460 450 455 460
Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr LysGly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys
465 470 475 480465 470 475 480
Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly SerAsp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser
485 490 495 485 490 495
Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu GluGly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu
500 505 510 500 505 510
Asn Pro Gly Pro Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro LeuAsn Pro Gly Pro Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu
515 520 525 515 520 525
Ala Leu Leu Leu His Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln SerAla Leu Leu Leu His Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln Ser
530 535 540 530 535 540
Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser CysPro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
545 550 555 560545 550 555 560
Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln LysArg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys
565 570 575 565 570 575
Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu HisPro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His
580 585 590 580 585 590
Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp TyrSer Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr
595 600 605 595 600 605
Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr PheThr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe
610 615 620 610 615 620
Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr LysCys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys
625 630 635 640625 630 635 640
Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyLeu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
645 650 655 645 650 655
Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val LysGly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys
660 665 670 660 665 670
Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser LeuPro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu
675 680 685 675 680 685
Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly LeuPro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu
690 695 700 690 695 700
Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln SerGlu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser
705 710 715 720705 710 715 720
Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn GlnSer Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln
725 730 735 725 730 735
Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val TyrVal Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr
740 745 750 740 745 750
Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrTyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
755 760 765 755 760 765
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro AlaTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala
770 775 780 770 775 780
Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu SerPro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser
785 790 795 800785 790 795 800
Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His ThrLeu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr
805 810 815 805 810 815
Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu AlaArg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala
820 825 830 820 825 830
Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysGly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
835 840 845 835 840 845
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
850 855 860 850 855 860
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
865 870 875 880865 870 875 880
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser ArgPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg
885 890 895 885 890 895
Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr AsnSer Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn
900 905 910 900 905 910
Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys ArgGlu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg
915 920 925 915 920 925
Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn ProArg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro
930 935 940 930 935 940
Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu AlaGln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala
945 950 955 960945 950 955 960
Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly HisTyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His
965 970 975 965 970 975
Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr AspAsp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp
980 985 990 980 985 990
Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
995 1000 995 1000
<210> 219<210> 219
<211> 3006<211> 3006
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 219<400> 219
atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60
cccgaagtgc agttgctgga gtcaggcgga ggactggtgc agcccggagg atcgcttcgc 120cccgaagtgc agttgctgga gtcaggcgga ggactggtgc agcccggagg atcgcttcgc 120
ttgagctgcg cagcctcagg ctttaccttc tcctcctacg ccatgtcctg ggtcagacag 180ttgagctgcg cagcctcagg ctttaccttc tcctcctacg ccatgtcctg ggtcagacag 180
gctcccggga agggactgga atgggtgtcc gccattagcg gttccggcgg aagcacttac 240gctcccggga agggactgga atgggtgtcc gccattagcg gttccggcgg aagcacttac 240
tatgccgact ctgtgaaggg ccgcttcact atctcccggg acaactccaa gaacaccctg 300tatgccgact ctgtgaaggg ccgcttcact atctcccggg acaactccaa gaacaccctg 300
tatctccaaa tgaattccct gagggccgaa gataccgcgg tgtactactg cgctagacgg 360tatctccaaa tgaattccct gagggccgaa gataccgcgg tgtactactg cgctagacgg 360
gagtgggtgc cctacgatgt cagctggtac ttcgactact ggggacaggg cactctcgtg 420gagtgggtgc cctacgatgt cagctggtac ttcgactact ggggacaggg cactctcgtg 420
actgtgtcct ccggtggtgg tggatcgggg ggtggtggtt cgggcggagg aggatctgga 480actgtgtcct ccggtggtgg tggatcgggg ggtggtggtt cgggcggagg aggatctgga 480
ggaggagggt cggacattca aatgactcag tccccgtcct ccctctccgc ctccgtggga 540ggagaggagt cggacattca aatgactcag tccccgtcct ccctctccgc ctccgtggga 540
gatcgcgtca cgatcacgtg cagggccagc cagagcatct ccagctacct gaactggtac 600gatcgcgtca cgatcacgtg cagggccagc cagagcatct ccagctacct gaactggtac 600
cagcagaagc cagggaaggc accgaagctc ctgatctacg ccgctagctc gctgcagtcc 660cagcagaagc cagggaaggc accgaagctc ctgatctacg ccgctagctc gctgcagtcc 660
ggcgtccctt cacggttctc gggatcgggc tcaggcaccg acttcaccct gaccattagc 720ggcgtccctt cacggttctc gggatcgggc tcaggcaccg acttcaccct gaccattagc 720
agcctgcagc cggaggactt cgcgacatac tactgtcagc agtcatactc cacccctctg 780agcctgcagc cggaggactt cgcgacatac tactgtcagc agtcatactc cacccctctg 780
accttcggcc aagggaccaa agtggagatc aagaccacta ccccagcacc gaggccaccc 840accttcggcc aagggaccaa agtggagatc aagaccacta ccccagcacc gaggccaccc 840
accccggctc ctaccatcgc ctcccagcct ctgtccctgc gtccggaggc atgtagaccc 900accccggctc ctaccatcgc ctcccagcct ctgtccctgc gtccggaggc atgtagaccc 900
gcagctggtg gggccgtgca tacccggggt cttgacttcg cctgcgatat ctacatttgg 960gcagctggtg gggccgtgca tacccggggt cttgacttcg cctgcgatat ctacatttgg 960
gcccctctgg ctggtacttg cggggtcctg ctgctttcac tcgtgatcac tctttactgt 1020gcccctctgg ctggtacttg cggggtcctg ctgctttcac tcgtgatcac tctttactgt 1020
aagcgcggtc ggaagaagct gctgtacatc tttaagcaac ccttcatgag gcctgtgcag 1080aagcgcggtc ggaagaagct gctgtacatc tttaagcaac ccttcatgag gcctgtgcag 1080
actactcaag aggaggacgg ctgttcatgc cggttcccag aggaggagga aggcggctgc 1140actactcaag aggaggacgg ctgttcatgc cggttcccag aggaggagga aggcggctgc 1140
gaactgcgcg tgaaattcag ccgcagcgca gatgctccag cctaccagca ggggcagaac 1200gaactgcgcg tgaaattcag ccgcagcgca gatgctccag cctaccagca ggggcagaac 1200
cagctctaca acgaactcaa tcttggtcgg agagaggagt acgacgtgct ggacaagcgg 1260cagctctaca acgaactcaa tcttggtcgg agagaggagt acgacgtgct ggacaagcgg 1260
agaggacggg acccagaaat gggcgggaag ccgcgcagaa agaatcccca agagggcctg 1320agaggacggg acccagaaat gggcgggaag ccgcgcagaa agaatcccca agaggcctg 1320
tacaacgagc tccaaaagga taagatggca gaagcctata gcgagattgg tatgaaaggg 1380tacaacgagc tccaaaagga taagatggca gaagcctata gcgagattgg tatgaaaggg 1380
gaacgcagaa gaggcaaagg ccacgacgga ctgtaccagg gactcagcac cgccaccaag 1440gaacgcagaa gaggcaaagg ccacgacgga ctgtaccagg gactcagcac cgccaccaag 1440
gacacctatg acgctcttca catgcaggcc ctgccgcctc ggggaagcgg agctactaac 1500gacacctatg acgctcttca catgcaggcc ctgccgcctc ggggaagcgg agctactaac 1500
ttcagcctgc tgaagcaggc tggagacgtg gaggagaacc ctggacctat ggccttacca 1560ttcagcctgc tgaagcaggc tggagacgtg gaggagaacc ctggacctat ggccttacca 1560
gtgaccgcct tgctcctgcc gctggccttg ctgctccacg ccgccaggcc ggaaattgtg 1620gtgaccgcct tgctcctgcc gctggccttg ctgctccacg ccgccaggcc ggaaattgtg 1620
atgacccagt cacccgccac tcttagcctt tcacccggtg agcgcgcaac cctgtcttgc 1680atgacccagt cacccgccac tcttagcctt tcacccggtg agcgcgcaac cctgtcttgc 1680
agagcctccc aagacatctc aaaatacctt aattggtatc aacagaagcc cggacaggct 1740agagcctccc aagacatctc aaaatacctt aattggtatc aacagaagcc cggacaggct 1740
cctcgccttc tgatctacca caccagccgg ctccattctg gaatccctgc caggttcagc 1800cctcgccttc tgatctacca caccagccgg ctccattctg gaatccctgc caggttcagc 1800
ggtagcggat ctgggaccga ctacaccctc actatcagct cactgcagcc agaggacttc 1860ggtagcggat ctgggaccga ctacaccctc actatcagct cactgcagcc agaggacttc 1860
gctgtctatt tctgtcagca agggaacacc ctgccctaca cctttggaca gggcaccaag 1920gctgtctatt tctgtcagca agggaacacc ctgccctaca cctttggaca gggcaccaag 1920
ctcgagatta aaggtggagg tggcagcgga ggaggtgggt ccggcggtgg aggaagccag 1980ctcgagatta aaggtggagg tggcagcgga ggaggtgggt ccggcggtgg aggaagccag 1980
gtccaactcc aagaaagcgg accgggtctt gtgaagccat cagaaactct ttcactgact 2040gtccaactcc aagaaagcgg accgggtctt gtgaagccat cagaaactct ttcactgact 2040
tgtactgtga gcggagtgtc tctccccgat tacggggtgt cttggatcag acagccaccg 2100tgtactgtga gcggagtgtc tctccccgat tacggggtgt cttggatcag acagccaccg 2100
gggaagggtc tggaatggat tggagtgatt tggggctctg agactactta ctaccaatca 2160gggaagggtc tggaatggat tggagtgatt tggggctctg agactactta ctaccaatca 2160
tccctcaagt cacgcgtcac catctcaaag gacaactcta agaatcaggt gtcactgaaa 2220tccctcaagt cacgcgtcac catctcaaag gacaactcta agaatcaggt gtcactgaaa 2220
ctgtcatctg tgaccgcagc cgacaccgcc gtgtactatt gcgctaagca ttactattat 2280ctgtcatctg tgaccgcagc cgacaccgcc gtgtactatt gcgctaagca ttactattat 2280
ggcgggagct acgcaatgga ttactgggga cagggtactc tggtcaccgt gtccagcacc 2340ggcgggagct acgcaatgga ttactgggga cagggtactc tggtcaccgt gtccagcacc 2340
acgacgccag cgccgcgacc accaacaccg gcgcccacca tcgcgtcgca gcccctgtcc 2400acgacgccag cgccgcgacc accaacaccg gcgcccacca tcgcgtcgca gcccctgtcc 2400
ctgcgcccag aggcgtgccg gccagcggcg gggggcgcag tgcacacgag ggggctggac 2460ctgcgcccag aggcgtgccg gccagcggcg gggggcgcag tgcacacgag ggggctggac 2460
ttcgcctgtg atatctacat ctgggcgccc ttggccggga cttgtggggt ccttctcctg 2520ttcgcctgtg atatctacat ctgggcgccc ttggccggga cttgtggggt ccttctcctg 2520
tcactggtta tcacccttta ctgcaaacgg ggcagaaaga aactcctgta tatattcaaa 2580tcactggtta tcacccttta ctgcaaacgg ggcagaaaga aactcctgta tatattcaaa 2580
caaccattta tgagaccagt acaaactact caagaggaag atggctgtag ctgccgattt 2640caaccattta tgagaccagt acaaactact caagaggaag atggctgtag ctgccgattt 2640
ccagaagaag aagaaggagg atgtgaactg agagtgaagt tcagcaggag cgcagacgcc 2700ccagaagaag aagaaggagg atgtgaactg agagtgaagt tcagcaggag cgcagacgcc 2700
cccgcgtacc agcagggcca gaaccagctc tataacgagc tcaatctagg acgaagagag 2760cccgcgtacc agcagggcca gaaccagctc tataacgagc tcaatctagg acgaagagag 2760
gagtacgatg ttttggacaa gagacgtggc cgggaccctg agatgggggg aaagccgaga 2820gagtacgatg ttttggacaa gagacgtggc cgggaccctg agatgggggg aaagccgaga 2820
aggaagaacc ctcaggaagg cctgtacaat gaactgcaga aagataagat ggcggaggcc 2880aggaagaacc ctcaggaagg cctgtacaat gaactgcaga aagataagat ggcggaggcc 2880
tacagtgaga ttgggatgaa aggcgagcgc cggaggggca aggggcacga tggcctttac 2940tacagtgaga ttgggatgaa aggcgagcgc cggaggggca aggggcacga tggcctttac 2940
cagggtctca gtacagccac caaggacacc tacgacgccc ttcacatgca ggccctgccc 3000cagggtctca gtacagccac caaggacacc tacgacgccc ttcacatgca ggccctgccc 3000
cctcgc 3006cctcgc 3006
<210> 220<210> 220
<211> 991<211> 991
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 220<400> 220
Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu LeuMet Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Ala Ala Arg Pro Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly LeuHis Ala Ala Arg Pro Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu
20 25 30 20 25 30
Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly PheVal Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Phe
35 40 45 35 40 45
Ala Leu Ser Asn His Gly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly LysAla Leu Ser Asn His Gly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys
50 55 60 50 55 60
Gly Leu Glu Trp Val Ser Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr TyrGly Leu Glu Trp Val Ser Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Ala Ala Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser ArgAla Ala Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg
85 90 95 85 90 95
Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr AlaAsn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala
100 105 110 100 105 110
Ile Tyr Tyr Cys Ser Ala His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly GlnIle Tyr Tyr Cys Ser Ala His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlyGly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
130 135 140 130 135 140
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln SerGly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr CysPro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys
165 170 175 165 170 175
Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln LysArg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys
180 185 190 180 185 190
Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu GlnPro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln
195 200 205 195 200 205
Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp PheSer Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe
210 215 220 210 215 220
Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr TyrThr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr
225 230 235 240225 230 235 240
Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr LysCys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys
245 250 255 245 250 255
Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro AlaVal Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala
260 265 270 260 265 270
Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys ArgPro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg
275 280 285 275 280 285
Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala CysPro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys
290 295 300 290 295 300
Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu LeuAsp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu
305 310 315 320305 310 315 320
Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys LeuLeu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu
325 330 335 325 330 335
Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr GlnLeu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln
340 345 350 340 345 350
Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly GlyGlu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly
355 360 365 355 360 365
Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala TyrCys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr
370 375 380 370 375 380
Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg ArgGln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg
385 390 395 400385 390 395 400
Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu MetGlu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met
405 410 415 405 410 415
Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn GluGly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu
420 425 430 420 425 430
Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met LysLeu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys
435 440 445 435 440 445
Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly LeuGly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu
450 455 460 450 455 460
Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala LeuSer Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu
465 470 475 480465 470 475 480
Pro Pro Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln AlaPro Pro Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala
485 490 495 485 490 495
Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Ala Leu Pro Val Thr AlaGly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Ala Leu Pro Val Thr Ala
500 505 510 500 505 510
Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu His Ala Ala Arg Pro Glu IleLeu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu His Ala Ala Arg Pro Glu Ile
515 520 525 515 520 525
Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu ArgVal Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg
530 535 540 530 535 540
Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu AsnAla Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn
545 550 555 560545 550 555 560
Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr HisTrp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His
565 570 575 565 570 575
Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser GlyThr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly
580 585 590 580 585 590
Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu AspSer Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp
595 600 605 595 600 605
Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr PhePhe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe
610 615 620 610 615 620
Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
625 630 635 640625 630 635 640
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser GlyGly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly
645 650 655 645 650 655
Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr ValPro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val
660 665 670 660 665 670
Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln ProSer Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro
675 680 685 675 680 685
Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu ThrPro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr
690 695 700 690 695 700
Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys AspThr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp
705 710 715 720705 710 715 720
Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala AlaAsn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala
725 730 735 725 730 735
Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly SerAsp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser
740 745 750 740 745 750
Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
755 760 765 755 760 765
Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile AlaThr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala
770 775 780 770 775 780
Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala GlySer Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly
785 790 795 800785 790 795 800
Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr IleGly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile
805 810 815 805 810 815
Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu ValTrp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val
820 825 830 820 825 830
Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile PheIle Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe
835 840 845 835 840 845
Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp GlyLys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly
850 855 860 850 855 860
Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu ArgCys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg
865 870 875 880865 870 875 880
Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly GlnVal Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln
885 890 895 885 890 895
Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr AspAsn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp
900 905 910 900 905 910
Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys ProVal Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro
915 920 925 915 920 925
Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys AspArg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp
930 935 940 930 935 940
Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg ArgLys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg
945 950 955 960945 950 955 960
Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala ThrArg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr
965 970 975 965 970 975
Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgLys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
980 985 990 980 985 990
<210> 221<210> 221
<211> 2973<211> 2973
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 221<400> 221
atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60
cccgaagtgc aattggtgga atcaggggga ggacttgtgc agcctggagg atcgctgaga 120cccgaagtgc aattggtgga atcaggggga ggacttgtgc agcctggagg atcgctgaga 120
ctgtcatgtg ccgtgtccgg ctttgccctg tccaaccacg ggatgtcctg ggtccgccgc 180ctgtcatgtg ccgtgtccgg ctttgccctg tccaaccacg ggatgtcctg ggtccgccgc 180
gcgcctggaa agggcctcga atgggtgtcg ggtattgtgt acagcggtag cacctactat 240gcgcctggaa agggcctcga atgggtgtcg ggtattgtgt acagcggtag cacctactat 240
gccgcatccg tgaaggggag attcaccatc agccgggaca actccaggaa cactctgtac 300gccgcatccg tgaaggggag attcaccatc agccgggaca actccaggaa cactctgtac 300
ctccaaatga attcgctgag gccagaggac actgccatct actactgctc cgcgcatggc 360ctccaaatga attcgctgag gccagaggac actgccatct actactgctc cgcgcatggc 360
ggagagtccg acgtctgggg acaggggacc accgtgaccg tgtctagcgc gtccggcgga 420ggagagtccg acgtctgggg acaggggacc accgtgaccg tgtctagcgc gtccggcgga 420
ggcggcagcg ggggtggtgg ttcagggggc ggcggatcgg acatccagct cacccagtcc 480ggcggcagcg ggggtggtgg ttcaggggggc ggcggatcgg acatccagct cacccagtcc 480
ccgagctcgc tgtccgcctc cgtgggagat cgggtcacca tcacgtgccg cgccagccag 540ccgagctcgc tgtccgcctc cgtgggagat cgggtcacca tcacgtgccg cgccagccag 540
tcgatttcct cctacctgaa ctggtaccaa cagaagcccg gaaaagcccc gaagcttctc 600tcgatttcct cctacctgaa ctggtaccaa cagaagcccg gaaaagcccc gaagcttctc 600
atctacgccg cctcgagcct gcagtcagga gtgccctcac ggttctccgg ctccggttcc 660atctacgccg cctcgagcct gcagtcagga gtgccctcac ggttctccgg ctccggttcc 660
ggtactgatt tcaccctgac catttcctcc ctgcaaccgg aggacttcgc tacttactac 720ggtactgatt tcaccctgac catttcctcc ctgcaaccgg aggacttcgc tacttactac 720
tgccagcagt cgtactccac cccctacact ttcggacaag gcaccaaggt cgaaatcaag 780tgccagcagt cgtactccac cccctacact ttcggacaag gcaccaaggt cgaaatcaag 780
accactaccc cagcaccgag gccacccacc ccggctccta ccatcgcctc ccagcctctg 840accactaccc cagcaccgag gccacccacc ccggctccta ccatcgcctc ccagcctctg 840
tccctgcgtc cggaggcatg tagacccgca gctggtgggg ccgtgcatac ccggggtctt 900tccctgcgtc cggaggcatg tagacccgca gctggtgggg ccgtgcatac ccggggtctt 900
gacttcgcct gcgatatcta catttgggcc cctctggctg gtacttgcgg ggtcctgctg 960gacttcgcct gcgatatcta catttggggcc cctctggctg gtacttgcgg ggtcctgctg 960
ctttcactcg tgatcactct ttactgtaag cgcggtcgga agaagctgct gtacatcttt 1020ctttcactcg tgatcactct ttactgtaag cgcggtcgga agaagctgct gtacatcttt 1020
aagcaaccct tcatgaggcc tgtgcagact actcaagagg aggacggctg ttcatgccgg 1080aagcaaccct tcatgaggcc tgtgcagact actcaagagg aggacggctg ttcatgccgg 1080
ttcccagagg aggaggaagg cggctgcgaa ctgcgcgtga aattcagccg cagcgcagat 1140ttcccagagg aggaggaagg cggctgcgaa ctgcgcgtga aattcagccg cagcgcagat 1140
gctccagcct accagcaggg gcagaaccag ctctacaacg aactcaatct tggtcggaga 1200gctccagcct accagcaggg gcagaaccag ctctacaacg aactcaatct tggtcggaga 1200
gaggagtacg acgtgctgga caagcggaga ggacgggacc cagaaatggg cgggaagccg 1260gaggagtacg acgtgctgga caagcggaga ggacgggacc cagaaatggg cgggaagccg 1260
cgcagaaaga atccccaaga gggcctgtac aacgagctcc aaaaggataa gatggcagaa 1320cgcagaaaga atccccaaga gggcctgtac aacgagctcc aaaaggataa gatggcagaa 1320
gcctatagcg agattggtat gaaaggggaa cgcagaagag gcaaaggcca cgacggactg 1380gcctatagcg agattggtat gaaaggggaa cgcagaagag gcaaaggcca cgacggactg 1380
taccagggac tcagcaccgc caccaaggac acctatgacg ctcttcacat gcaggccctg 1440taccagggac tcagcaccgc caccaaggac acctatgacg ctcttcacat gcaggccctg 1440
ccgcctcggg gaagcggagc tactaacttc agcctgctga agcaggctgg agacgtggag 1500ccgcctcggg gaagcggagc tactaacttc agcctgctga agcaggctgg agacgtggag 1500
gagaaccctg gacctatggc cttaccagtg accgccttgc tcctgccgct ggccttgctg 1560gagaaccctg gacctatggc cttaccagtg accgccttgc tcctgccgct ggccttgctg 1560
ctccacgccg ccaggccgga aattgtgatg acccagtcac ccgccactct tagcctttca 1620ctccacgccg ccaggccgga aattgtgatg acccagtcac ccgccactct tagcctttca 1620
cccggtgagc gcgcaaccct gtcttgcaga gcctcccaag acatctcaaa ataccttaat 1680cccggtgagc gcgcaaccct gtcttgcaga gcctcccaag acatctcaaa ataccttaat 1680
tggtatcaac agaagcccgg acaggctcct cgccttctga tctaccacac cagccggctc 1740tggtatcaac agaagcccgg acaggctcct cgccttctga tctaccacac cagccggctc 1740
cattctggaa tccctgccag gttcagcggt agcggatctg ggaccgacta caccctcact 1800cattctggaa tccctgccag gttcagcggt agcggatctg ggaccgacta caccctcact 1800
atcagctcac tgcagccaga ggacttcgct gtctatttct gtcagcaagg gaacaccctg 1860atcagctcac tgcagccaga ggacttcgct gtctatttct gtcagcaagg gaacaccctg 1860
ccctacacct ttggacaggg caccaagctc gagattaaag gtggaggtgg cagcggagga 1920ccctacacct ttggacaggg caccaagctc gagattaaag gtggaggtgg cagcggagga 1920
ggtgggtccg gcggtggagg aagccaggtc caactccaag aaagcggacc gggtcttgtg 1980ggtgggtccg gcggtggagg aagccaggtc caactccaag aaagcggacc gggtcttgtg 1980
aagccatcag aaactctttc actgacttgt actgtgagcg gagtgtctct ccccgattac 2040aagccatcag aaactctttc actgacttgt actgtgagcg gagtgtctct ccccgattac 2040
ggggtgtctt ggatcagaca gccaccgggg aagggtctgg aatggattgg agtgatttgg 2100ggggtgtctt ggatcagaca gccaccgggg aagggtctgg aatggattgg agtgatttgg 2100
ggctctgaga ctacttacta ccaatcatcc ctcaagtcac gcgtcaccat ctcaaaggac 2160ggctctgaga ctacttacta ccaatcatcc ctcaagtcac gcgtcaccat ctcaaaggac 2160
aactctaaga atcaggtgtc actgaaactg tcatctgtga ccgcagccga caccgccgtg 2220aactctaaga atcaggtgtc actgaaactg tcatctgtga ccgcagccga caccgccgtg 2220
tactattgcg ctaagcatta ctattatggc gggagctacg caatggatta ctggggacag 2280tactattgcg ctaagcatta ctattatggc gggagctacg caatggatta ctggggacag 2280
ggtactctgg tcaccgtgtc cagcaccacg acgccagcgc cgcgaccacc aacaccggcg 2340ggtactctgg tcaccgtgtc cagcaccacg acgccagcgc cgcgaccacc aacaccggcg 2340
cccaccatcg cgtcgcagcc cctgtccctg cgcccagagg cgtgccggcc agcggcgggg 2400cccaccatcg cgtcgcagcc cctgtccctg cgcccagagg cgtgccggcc agcggcgggg 2400
ggcgcagtgc acacgagggg gctggacttc gcctgtgata tctacatctg ggcgcccttg 2460ggcgcagtgc acacgagggg gctggacttc gcctgtgata tctacatctg ggcgcccttg 2460
gccgggactt gtggggtcct tctcctgtca ctggttatca ccctttactg caaacggggc 2520gccgggactt gtggggtcct tctcctgtca ctggttatca ccctttactg caaacggggc 2520
agaaagaaac tcctgtatat attcaaacaa ccatttatga gaccagtaca aactactcaa 2580agaaagaaac tcctgtatat attcaaacaa ccatttatga gaccagtaca aactactcaa 2580
gaggaagatg gctgtagctg ccgatttcca gaagaagaag aaggaggatg tgaactgaga 2640gaggaagatg gctgtagctg ccgatttcca gaagaagaag aaggaggatg tgaactgaga 2640
gtgaagttca gcaggagcgc agacgccccc gcgtaccagc agggccagaa ccagctctat 2700gtgaagttca gcaggagcgc agacgccccc gcgtaccagc agggccagaa ccagctctat 2700
aacgagctca atctaggacg aagagaggag tacgatgttt tggacaagag acgtggccgg 2760aacgagctca atctaggacg aagagaggag tacgatgttt tggacaagag acgtggccgg 2760
gaccctgaga tggggggaaa gccgagaagg aagaaccctc aggaaggcct gtacaatgaa 2820gaccctgaga tggggggaaa gccgagaagg aagaaccctc aggaaggcct gtacaatgaa 2820
ctgcagaaag ataagatggc ggaggcctac agtgagattg ggatgaaagg cgagcgccgg 2880ctgcagaaag ataagatggc ggaggcctac agtgagattg ggatgaaagg cgagcgccgg 2880
aggggcaagg ggcacgatgg cctttaccag ggtctcagta cagccaccaa ggacacctac 2940aggggcaagg ggcacgatgg cctttaccag ggtctcagta cagccaccaa ggacacctac 2940
gacgcccttc acatgcaggc cctgccccct cgc 2973gacgcccttc acatgcaggc cctgccccct cgc 2973
<210> 222<210> 222
<211> 991<211> 991
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 222<400> 222
Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu LeuMet Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr LeuHis Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu
20 25 30 20 25 30
Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser GlnSer Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln
35 40 45 35 40 45
Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln AlaAsp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala
50 55 60 50 55 60
Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile ProPro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr IleAla Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile
85 90 95 85 90 95
Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln GlySer Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly
100 105 110 100 105 110
Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile LysAsn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
130 135 140 130 135 140
Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu ThrVal Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr GlyLeu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly
165 170 175 165 170 175
Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile GlyVal Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly
180 185 190 180 185 190
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser
195 200 205 195 200 205
Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu LysArg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys
210 215 220 210 215 220
Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala LysLeu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys
225 230 235 240225 230 235 240
His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln GlyHis Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
245 250 255 245 250 255
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro ProThr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro
260 265 270 260 265 270
Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro GluThr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu
275 280 285 275 280 285
Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu AspAla Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp
290 295 300 290 295 300
Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys GlyPhe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly
305 310 315 320305 310 315 320
Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly ArgVal Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg
325 330 335 325 330 335
Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val GlnLys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln
340 345 350 340 345 350
Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu GluThr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu
355 360 365 355 360 365
Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp AlaGlu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala
370 375 380 370 375 380
Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn LeuPro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu
385 390 395 400385 390 395 400
Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg AspGly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp
405 410 415 405 410 415
Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly LeuPro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu
420 425 430 420 425 430
Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu IleTyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile
435 440 445 435 440 445
Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu TyrGly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr
450 455 460 450 455 460
Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His MetGln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met
465 470 475 480465 470 475 480
Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu LeuGln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu
485 490 495 485 490 495
Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Ala Leu ProLys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly Pro Met Ala Leu Pro
500 505 510 500 505 510
Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu His Ala Ala ArgVal Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu His Ala Ala Arg
515 520 525 515 520 525
Pro Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro GlyPro Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly
530 535 540 530 535 540
Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Phe Ala Leu Ser AsnGly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Phe Ala Leu Ser Asn
545 550 555 560545 550 555 560
His Gly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu TrpHis Gly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
565 570 575 565 570 575
Val Ser Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser ValVal Ser Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser Val
580 585 590 580 585 590
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu Tyr
595 600 605 595 600 605
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
610 615 620 610 615 620
Ser Ala His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr ValSer Ala His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val
625 630 635 640625 630 635 640
Thr Val Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerThr Val Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
645 650 655 645 650 655
Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser LeuGly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu
660 665 670 660 665 670
Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser GlnSer Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln
675 680 685 675 680 685
Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys AlaSer Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala
690 695 700 690 695 700
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val ProPro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro
705 710 715 720705 710 715 720
Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr IleSer Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile
725 730 735 725 730 735
Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln SerSer Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser
740 745 750 740 745 750
Tyr Ser Thr Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile LysTyr Ser Thr Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
755 760 765 755 760 765
Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile AlaThr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala
770 775 780 770 775 780
Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala GlySer Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly
785 790 795 800785 790 795 800
Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr IleGly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile
805 810 815 805 810 815
Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu ValTrp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val
820 825 830 820 825 830
Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile PheIle Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe
835 840 845 835 840 845
Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp GlyLys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly
850 855 860 850 855 860
Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu ArgCys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg
865 870 875 880865 870 875 880
Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly GlnVal Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln
885 890 895 885 890 895
Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr AspAsn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp
900 905 910 900 905 910
Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys ProVal Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro
915 920 925 915 920 925
Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys AspArg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp
930 935 940 930 935 940
Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg ArgLys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg
945 950 955 960945 950 955 960
Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala ThrArg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr
965 970 975 965 970 975
Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgLys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
980 985 990 980 985 990
<210> 223<210> 223
<211> 2973<211> 2973
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 223<400> 223
atggccttac cagtgaccgc cttgctcctg ccgctggcct tgctgctcca cgccgccagg 60atggccttac cagtgaccgc cttgctcctg ccgctggcct tgctgctcca cgccgccagg 60
ccggaaattg tgatgaccca gtcacccgcc actcttagcc tttcacccgg tgagcgcgca 120ccggaaattg tgatgaccca gtcacccgcc actcttagcc tttcacccgg tgagcgcgca 120
accctgtctt gcagagcctc ccaagacatc tcaaaatacc ttaattggta tcaacagaag 180accctgtctt gcagagcctc ccaagacatc tcaaaatacc ttaattggta tcaacagaag 180
cccggacagg ctcctcgcct tctgatctac cacaccagcc ggctccattc tggaatccct 240cccggacagg ctcctcgcct tctgatctac cacaccagcc ggctccattc tggaatccct 240
gccaggttca gcggtagcgg atctgggacc gactacaccc tcactatcag ctcactgcag 300gccaggttca gcggtagcgg atctgggacc gactacaccc tcactatcag ctcactgcag 300
ccagaggact tcgctgtcta tttctgtcag caagggaaca ccctgcccta cacctttgga 360ccagaggact tcgctgtcta tttctgtcag caagggaaca ccctgcccta cacctttgga 360
cagggcacca agctcgagat taaaggtgga ggtggcagcg gaggaggtgg gtccggcggt 420cagggcacca agctcgagat taaaggtgga ggtggcagcg gaggaggtgg gtccggcggt 420
ggaggaagcc aggtccaact ccaagaaagc ggaccgggtc ttgtgaagcc atcagaaact 480gggaggaagcc aggtccaact ccaagaaagc ggaccgggtc ttgtgaagcc atcagaaact 480
ctttcactga cttgtactgt gagcggagtg tctctccccg attacggggt gtcttggatc 540ctttcactga cttgtactgt gagcggagtg tctctccccg attacggggt gtcttggatc 540
agacagccac cggggaaggg tctggaatgg attggagtga tttggggctc tgagactact 600agacagccac cggggaaggg tctggaatgg attggagtga tttggggctc tgagactact 600
tactaccaat catccctcaa gtcacgcgtc accatctcaa aggacaactc taagaatcag 660tactaccaat catccctcaa gtcacgcgtc accatctcaa aggacaactc taagaatcag 660
gtgtcactga aactgtcatc tgtgaccgca gccgacaccg ccgtgtacta ttgcgctaag 720gtgtcactga aactgtcatc tgtgaccgca gccgacaccg ccgtgtacta ttgcgctaag 720
cattactatt atggcgggag ctacgcaatg gattactggg gacagggtac tctggtcacc 780cattactatt atggcgggag ctacgcaatg gattactggg gacagggtac tctggtcacc 780
gtgtccagca ccacgacgcc agcgccgcga ccaccaacac cggcgcccac catcgcgtcg 840gtgtccagca ccacgacgcc agcgccgcga ccaccaacac cggcgcccac catcgcgtcg 840
cagcccctgt ccctgcgccc agaggcgtgc cggccagcgg cggggggcgc agtgcacacg 900cagcccctgt ccctgcgccc agaggcgtgc cggccagcgg cggggggcgc agtgcacacg 900
agggggctgg acttcgcctg tgatatctac atctgggcgc ccttggccgg gacttgtggg 960aggggctgg acttcgcctg tgatatctac atctgggcgc ccttggccgg gacttgtggg 960
gtccttctcc tgtcactggt tatcaccctt tactgcaaac ggggcagaaa gaaactcctg 1020gtccttctcc tgtcactggt tatcaccctt tactgcaaac ggggcagaaa gaaactcctg 1020
tatatattca aacaaccatt tatgagacca gtacaaacta ctcaagagga agatggctgt 1080tatatattca aacaaccatt tatgagacca gtacaaacta ctcaagagga agatggctgt 1080
agctgccgat ttccagaaga agaagaagga ggatgtgaac tgagagtgaa gttcagcagg 1140agctgccgat ttccagaaga agaagaagga ggatgtgaac tgagagtgaa gttcagcagg 1140
agcgcagacg cccccgcgta ccagcagggc cagaaccagc tctataacga gctcaatcta 1200agcgcagacg cccccgcgta ccagcagggc cagaaccagc tctataacga gctcaatcta 1200
ggacgaagag aggagtacga tgttttggac aagagacgtg gccgggaccc tgagatgggg 1260ggacgaagag aggagtacga tgttttggac aagagacgtg gccgggaccc tgagatgggg 1260
ggaaagccga gaaggaagaa ccctcaggaa ggcctgtaca atgaactgca gaaagataag 1320ggaaagccga gaaggaagaa ccctcaggaa ggcctgtaca atgaactgca gaaagataag 1320
atggcggagg cctacagtga gattgggatg aaaggcgagc gccggagggg caaggggcac 1380atggcggagg cctacagtga gattgggatg aaaggcgagc gccggagggg caaggggcac 1380
gatggccttt accagggtct cagtacagcc accaaggaca cctacgacgc ccttcacatg 1440gatggccttt accagggtct cagtacagcc accaaggaca cctacgacgc ccttcacatg 1440
caggccctgc cccctcgcgg aagcggagct actaacttca gcctgctgaa gcaggctgga 1500caggccctgc cccctcgcgg aagcggagct actaacttca gcctgctgaa gcaggctgga 1500
gacgtggagg agaaccctgg acctatggcc ctccctgtca ccgccctgct gcttccgctg 1560gacgtggagg agaaccctgg acctatggcc ctccctgtca ccgccctgct gcttccgctg 1560
gctcttctgc tccacgccgc tcggcccgaa gtgcaattgg tggaatcagg gggaggactt 1620gctcttctgc tccacgccgc tcggcccgaa gtgcaattgg tggaatcagg gggaggactt 1620
gtgcagcctg gaggatcgct gagactgtca tgtgccgtgt ccggctttgc cctgtccaac 1680gtgcagcctg gaggatcgct gagactgtca tgtgccgtgt ccggctttgc cctgtccaac 1680
cacgggatgt cctgggtccg ccgcgcgcct ggaaagggcc tcgaatgggt gtcgggtatt 1740cacgggatgt cctgggtccg ccgcgcgcct ggaaagggcc tcgaatgggt gtcgggtatt 1740
gtgtacagcg gtagcaccta ctatgccgca tccgtgaagg ggagattcac catcagccgg 1800gtgtacagcg gtagcaccta ctatgccgca tccgtgaagg ggagattcac catcagccgg 1800
gacaactcca ggaacactct gtacctccaa atgaattcgc tgaggccaga ggacactgcc 1860gacaactcca ggaacactct gtacctccaa atgaattcgc tgaggccaga ggacactgcc 1860
atctactact gctccgcgca tggcggagag tccgacgtct ggggacaggg gaccaccgtg 1920atctactact gctccgcgca tggcggagag tccgacgtct ggggacaggg gaccaccgtg 1920
accgtgtcta gcgcgtccgg cggaggcggc agcgggggtg gtggttcagg gggcggcgga 1980accgtgtcta gcgcgtccgg cggaggcggc agcgggggtg gtggttcagg gggcggcgga 1980
tcggacatcc agctcaccca gtccccgagc tcgctgtccg cctccgtggg agatcgggtc 2040tcggacatcc agctcaccca gtccccgagc tcgctgtccg cctccgtggg agatcgggtc 2040
accatcacgt gccgcgccag ccagtcgatt tcctcctacc tgaactggta ccaacagaag 2100accatcacgt gccgcgccag ccagtcgatt tcctcctacc tgaactggta ccaacagaag 2100
cccggaaaag ccccgaagct tctcatctac gccgcctcga gcctgcagtc aggagtgccc 2160cccggaaaag ccccgaagct tctcatctac gccgcctcga gcctgcagtc aggagtgccc 2160
tcacggttct ccggctccgg ttccggtact gatttcaccc tgaccatttc ctccctgcaa 2220tcacggttct ccggctccgg ttccggtact gatttcaccc tgaccatttc ctccctgcaa 2220
ccggaggact tcgctactta ctactgccag cagtcgtact ccacccccta cactttcgga 2280ccggaggact tcgctactta ctactgccag cagtcgtact ccacccccta cactttcgga 2280
caaggcacca aggtcgaaat caagaccact accccagcac cgaggccacc caccccggct 2340caaggcacca aggtcgaaat caagaccact accccagcac cgaggccacc caccccggct 2340
cctaccatcg cctcccagcc tctgtccctg cgtccggagg catgtagacc cgcagctggt 2400cctaccatcg cctcccagcc tctgtccctg cgtccggagg catgtagacc cgcagctggt 2400
ggggccgtgc atacccgggg tcttgacttc gcctgcgata tctacatttg ggcccctctg 2460ggggccgtgc atacccgggg tcttgacttc gcctgcgata tctacatttg ggcccctctg 2460
gctggtactt gcggggtcct gctgctttca ctcgtgatca ctctttactg taagcgcggt 2520gctggtactt gcggggtcct gctgctttca ctcgtgatca ctctttactg taagcgcggt 2520
cggaagaagc tgctgtacat ctttaagcaa cccttcatga ggcctgtgca gactactcaa 2580cggaagaagc tgctgtacat ctttaagcaa cccttcatga ggcctgtgca gactactcaa 2580
gaggaggacg gctgttcatg ccggttccca gaggaggagg aaggcggctg cgaactgcgc 2640gaggaggacg gctgttcatg ccggttccca gaggaggagg aaggcggctg cgaactgcgc 2640
gtgaaattca gccgcagcgc agatgctcca gcctaccagc aggggcagaa ccagctctac 2700gtgaaattca gccgcagcgc agatgctcca gcctaccagc aggggcagaa ccagctctac 2700
aacgaactca atcttggtcg gagagaggag tacgacgtgc tggacaagcg gagaggacgg 2760aacgaactca atcttggtcg gagagaggag tacgacgtgc tggacaagcg gagaggacgg 2760
gacccagaaa tgggcgggaa gccgcgcaga aagaatcccc aagagggcct gtacaacgag 2820gacccagaaa tgggcgggaa gccgcgcaga aagaatcccc aagagggcct gtacaacgag 2820
ctccaaaagg ataagatggc agaagcctat agcgagattg gtatgaaagg ggaacgcaga 2880ctccaaaagg ataagatggc agaagcctat agcgagattg gtatgaaagg ggaacgcaga 2880
agaggcaaag gccacgacgg actgtaccag ggactcagca ccgccaccaa ggacacctat 2940agaggcaaag gccacgacgg actgtaccag ggactcagca ccgccaccaa ggacacctat 2940
gacgctcttc acatgcaggc cctgccgcct cgg 2973gacgctcttc acatgcaggc cctgccgcct cgg 2973
<210> 224<210> 224
<211> 492<211> 492
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 224<400> 224
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp GlyAla Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110 100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile GlnGly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln
130 135 140 130 135 140
Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg ValMet Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val
145 150 155 160145 150 155 160
Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn TrpThr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp
165 170 175 165 170 175
Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala AlaTyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala
180 185 190 180 185 190
Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly SerSer Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp PheGly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe
210 215 220 210 215 220
Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe GlyAla Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg ProGln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro
245 250 255 245 250 255
Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg ProPro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro
260 265 270 260 265 270
Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly LeuGlu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu
275 280 285 275 280 285
Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr CysAsp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys
290 295 300 290 295 300
Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg GlyGly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly
305 310 315 320305 310 315 320
Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro ValArg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val
325 330 335 325 330 335
Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu GluGln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu
340 345 350 340 345 350
Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala AspGlu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp
355 360 365 355 360 365
Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu AsnAla Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn
370 375 380 370 375 380
Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly ArgLeu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg
385 390 395 400385 390 395 400
Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu GlyAsp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly
405 410 415 405 410 415
Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser GluLeu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu
420 425 430 420 425 430
Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly LeuIle Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu
435 440 445 435 440 445
Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu HisTyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His
450 455 460 450 455 460
Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser LeuMet Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu
465 470 475 480465 470 475 480
Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro GlyLeu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly
485 490 485 490
<210> 225<210> 225
<211> 465<211> 465
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 225<400> 225
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln GluGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu
115 120 125 115 120 125
Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr CysSer Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile ArgThr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg
145 150 155 160145 150 155 160
Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly SerGln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser
165 170 175 165 170 175
Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile SerGlu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser
180 185 190 180 185 190
Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val ThrLys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr
195 200 205 195 200 205
Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr GlyAla Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr ValGly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val
225 230 235 240225 230 235 240
Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro ThrSer Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr
245 250 255 245 250 255
Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro AlaIle Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala
260 265 270 260 265 270
Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp IleAla Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile
275 280 285 275 280 285
Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu SerTyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser
290 295 300 290 295 300
Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu TyrLeu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr
305 310 315 320305 310 315 320
Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu GluIle Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu
325 330 335 325 330 335
Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys GluAsp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu
340 345 350 340 345 350
Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln GlnLeu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln
355 360 365 355 360 365
Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu GluGly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu
370 375 380 370 375 380
Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly GlyTyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu GlnLys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln
405 410 415 405 410 415
Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly GluLys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu
420 425 430 420 425 430
Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser ThrArg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr
435 440 445 435 440 445
Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro ProAla Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro
450 455 460 450 455 460
ArgArg
465465
<210> 226<210> 226
<211> 493<211> 493
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 226<400> 226
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu Thr GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu Thr Gln
130 135 140 130 135 140
Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile Ser CysPro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile Ser Cys
145 150 155 160145 150 155 160
Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser Trp TyrThr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser Trp Tyr
165 170 175 165 170 175
Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp Val SerGln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp Val Ser
180 185 190 180 185 190
Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys Ser GlyAsn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys Ser Gly
195 200 205 195 200 205
Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp Glu AlaAsn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp Glu Ala
210 215 220 210 215 220
Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr Val PheAsp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr Val Phe
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr Thr Pro Ala Pro ArgGly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg
245 250 255 245 250 255
Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu ArgPro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg
260 265 270 260 265 270
Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg GlyPro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly
275 280 285 275 280 285
Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly ThrLeu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr
290 295 300 290 295 300
Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys ArgCys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg
305 310 315 320305 310 315 320
Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg ProGly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro
325 330 335 325 330 335
Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro GluVal Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu
340 345 350 340 345 350
Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser AlaGlu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala
355 360 365 355 360 365
Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu LeuAsp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu
370 375 380 370 375 380
Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg GlyAsn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln GluArg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu
405 410 415 405 410 415
Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr SerGly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser
420 425 430 420 425 430
Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp GlyGlu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly
435 440 445 435 440 445
Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala LeuLeu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu
450 455 460 450 455 460
His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe SerHis Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser
465 470 475 480465 470 475 480
Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro GlyLeu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly
485 490 485 490
<210> 227<210> 227
<211> 494<211> 494
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 227<400> 227
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp TyrAla Arg Arg Glu Trp Val Pro Tyr Asp Val Ser Trp Tyr Phe Asp Tyr
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser AspGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp
130 135 140 130 135 140
Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly AspIle Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp
145 150 155 160145 150 155 160
Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr LeuArg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu
165 170 175 165 170 175
Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile TyrAsn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr
180 185 190 180 185 190
Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly SerAla Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser
195 200 205 195 200 205
Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro GluGly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu
210 215 220 210 215 220
Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu ThrAsp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr
225 230 235 240225 230 235 240
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala ProPhe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro
245 250 255 245 250 255
Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser LeuArg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu
260 265 270 260 265 270
Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr ArgArg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg
275 280 285 275 280 285
Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala GlyGly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly
290 295 300 290 295 300
Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys LysThr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys
305 310 315 320305 310 315 320
Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met ArgArg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg
325 330 335 325 330 335
Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe ProPro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro
340 345 350 340 345 350
Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg SerGlu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser
355 360 365 355 360 365
Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn GluAla Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu
370 375 380 370 375 380
Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg ArgLeu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg
385 390 395 400385 390 395 400
Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro GlnGly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln
405 410 415 405 410 415
Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala TyrGlu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr
420 425 430 420 425 430
Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His AspSer Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp
435 440 445 435 440 445
Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp AlaGly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala
450 455 460 450 455 460
Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn PheLeu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe
465 470 475 480465 470 475 480
Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro GlySer Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu Asn Pro Gly
485 490 485 490
<210> 228<210> 228
<211> 483<211> 483
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 228<400> 228
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Phe Ala Leu Ser Asn HisSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Phe Ala Leu Ser Asn His
20 25 30 20 25 30
Gly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser Val LysSer Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser Val Lys
50 55 60 50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu Tyr LeuGly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys SerGln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ser
85 90 95 85 90 95
Ala His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val ThrAla His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110 100 105 110
Val Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlyVal Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu SerGly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser
130 135 140 130 135 140
Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln SerAla Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala ProIle Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro
165 170 175 165 170 175
Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro SerLys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile SerArg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
195 200 205 195 200 205
Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser TyrSer Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr
210 215 220 210 215 220
Ser Thr Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys ThrSer Thr Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr
225 230 235 240225 230 235 240
Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala SerThr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser
245 250 255 245 250 255
Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly GlyGln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly
260 265 270 260 265 270
Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile TrpAla Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp
275 280 285 275 280 285
Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val IleAla Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile
290 295 300 290 295 300
Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe LysThr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys
305 310 315 320305 310 315 320
Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly CysGln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys
325 330 335 325 330 335
Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg ValSer Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val
340 345 350 340 345 350
Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln AsnLys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn
355 360 365 355 360 365
Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp ValGln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val
370 375 380 370 375 380
Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro ArgLeu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg
385 390 395 400385 390 395 400
Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp LysArg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys
405 410 415 405 410 415
Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg ArgMet Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg
420 425 430 420 425 430
Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr LysGly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys
435 440 445 435 440 445
Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly SerAsp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg Gly Ser
450 455 460 450 455 460
Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu GluGly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp Val Glu Glu
465 470 475 480465 470 475 480
Asn Pro GlyAsn Pro Gly
<210> 229<210> 229
<211> 486<211> 486
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 229<400> 229
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln GluGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu
115 120 125 115 120 125
Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr CysSer Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile ArgThr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg
145 150 155 160145 150 155 160
Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly SerGln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser
165 170 175 165 170 175
Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile SerGlu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser
180 185 190 180 185 190
Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val ThrLys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr
195 200 205 195 200 205
Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr GlyAla Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr ValGly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val
225 230 235 240225 230 235 240
Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro ThrSer Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr
245 250 255 245 250 255
Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro AlaIle Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala
260 265 270 260 265 270
Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp IleAla Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile
275 280 285 275 280 285
Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu SerTyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser
290 295 300 290 295 300
Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu TyrLeu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr
305 310 315 320305 310 315 320
Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu GluIle Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu
325 330 335 325 330 335
Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys GluAsp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu
340 345 350 340 345 350
Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln GlnLeu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln
355 360 365 355 360 365
Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu GluGly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu
370 375 380 370 375 380
Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly GlyTyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu GlnLys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln
405 410 415 405 410 415
Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly GluLys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu
420 425 430 420 425 430
Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser ThrArg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr
435 440 445 435 440 445
Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro ProAla Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro
450 455 460 450 455 460
Arg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly AspArg Gly Ser Gly Ala Thr Asn Phe Ser Leu Leu Lys Gln Ala Gly Asp
465 470 475 480465 470 475 480
Val Glu Glu Asn Pro GlyVal Glu Glu Asn Pro Gly
485 485
<210> 230<210> 230
<211> 462<211> 462
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 230<400> 230
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Phe Ala Leu Ser Asn HisSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Phe Ala Leu Ser Asn His
20 25 30 20 25 30
Gly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser Val LysSer Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser Val Lys
50 55 60 50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu Tyr LeuGly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys SerGln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ser
85 90 95 85 90 95
Ala His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val ThrAla His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110 100 105 110
Val Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlyVal Ser Ser Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu SerGly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser
130 135 140 130 135 140
Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln SerAla Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala ProIle Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro
165 170 175 165 170 175
Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro SerLys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile SerArg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
195 200 205 195 200 205
Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser TyrSer Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr
210 215 220 210 215 220
Ser Thr Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys ThrSer Thr Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Thr
225 230 235 240225 230 235 240
Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala SerThr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser
245 250 255 245 250 255
Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly GlyGln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly
260 265 270 260 265 270
Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile TrpAla Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp
275 280 285 275 280 285
Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val IleAla Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile
290 295 300 290 295 300
Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe LysThr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys
305 310 315 320305 310 315 320
Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly CysGln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys
325 330 335 325 330 335
Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg ValSer Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val
340 345 350 340 345 350
Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln AsnLys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn
355 360 365 355 360 365
Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp ValGln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val
370 375 380 370 375 380
Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro ArgLeu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg
385 390 395 400385 390 395 400
Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp LysArg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys
405 410 415 405 410 415
Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg ArgMet Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg
420 425 430 420 425 430
Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr LysGly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys
435 440 445 435 440 445
Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAsp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
450 455 460 450 455 460
<210> 231<210> 231
<211> 5<211> 5
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 231<400> 231
Asn His Gly Met SerAsn His Gly Met Ser
1 51 5
<210> 232<210> 232
<211> 16<211> 16
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 232<400> 232
Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser Val Lys GlyGly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser Val Lys Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
<210> 233<210> 233
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 233<400> 233
His Gly Gly Glu Ser Asp ValHis Gly Gly Glu Ser Asp Val
1 5 1 5
<210> 234<210> 234
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 234<400> 234
Gly Phe Ala Leu Ser Asn HisGly Phe Ala Leu Ser Asn His
1 5 1 5
<210> 235<210> 235
<211> 5<211> 5
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 235<400> 235
Val Tyr Ser Gly SerVal Tyr Ser Gly Ser
1 51 5
<210> 236<210> 236
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 236<400> 236
Gly Phe Ala Leu Ser Asn His GlyGly Phe Ala Leu Ser Asn His Gly
1 5 1 5
<210> 237<210> 237
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 237<400> 237
Ile Val Tyr Ser Gly Ser ThrIle Val Tyr Ser Gly Ser Thr
1 5 1 5
<210> 238<210> 238
<211> 9<211> 9
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 238<400> 238
Ser Ala His Gly Gly Glu Ser Asp ValSer Ala His Gly Gly Glu Ser Asp Val
1 5 1 5
<210> 239<210> 239
<211> 115<211> 115
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 239<400> 239
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Phe Ala Leu Ser Asn HisSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Phe Ala Leu Ser Asn His
20 25 30 20 25 30
Gly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser Val LysSer Gly Ile Val Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Ala Ser Val Lys
50 55 60 50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu Tyr LeuGly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys SerGln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ser
85 90 95 85 90 95
Ala His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val ThrAla His Gly Gly Glu Ser Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110 100 105 110
Val Ser SerVal Ser Ser
115115
<210> 240<210> 240
<211> 9<211> 9
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 240<400> 240
Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Tyr ThrGln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Tyr Thr
1 5 1 5
<210> 241<210> 241
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 241<400> 241
Ser Tyr Ser Thr Pro TyrSer Tyr Ser Thr Pro Tyr
1 5 1 5
<210> 242<210> 242
<211> 107<211> 107
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 242<400> 242
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val GlyAsp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser TyrAsp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser GlyTyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro TyrGlu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile LysThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 243<210> 243
<211> 17<211> 17
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 243<400> 243
Ala Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly GlyAla Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
SerSer
<210> 244<210> 244
<211> 10<211> 10
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 244<400> 244
Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val SerGly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser
1 5 101 5 10
<210> 245<210> 245
<211> 16<211> 16
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 245<400> 245
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15 1 5 10 15
<210> 246<210> 246
<211> 12<211> 12
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 246<400> 246
His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrHis Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 247<210> 247
<211> 11<211> 11
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 247<400> 247
Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu AsnArg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn
1 5 10 1 5 10
<210> 248<210> 248
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 248<400> 248
His Thr Ser Arg Leu His SerHis Thr Ser Arg Leu His Ser
1 5 1 5
<210> 249<210> 249
<211> 9<211> 9
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 249<400> 249
Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr ThrGln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr
1 5 1 5
<210> 250<210> 250
<211> 120<211> 120
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 250<400> 250
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120115 120
<210> 251<210> 251
<211> 107<211> 107
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 251<400> 251
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile LysThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 252<210> 252
<211> 63<211> 63
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 252<400> 252
atggccctcc ctgtcaccgc tctgttgctg ccgcttgctc tgctgctcca cgcagcgcga 60atggccctcc ctgtcaccgc tctgttgctg ccgcttgctc tgctgctcca cgcagcgcga 60
ccg 63ccg 63
<210> 253<210> 253
<211> 747<211> 747
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 253<400> 253
caggtacaat tgcaggagtc tggaggcggt gtggtgcaac ccggtcgcag cttgcgcctg 60caggtacaat tgcaggagtc tggaggcggt gtggtgcaac ccggtcgcag cttgcgcctg 60
agttgtgctg cgtctggatt tacattttca tcttacggaa tgcattgggt acgccaggca 120agttgtgctg cgtctggatt tacattttca tcttacggaa tgcattgggt acgccaggca 120
ccggggaaag gccttgaatg ggtggctgta atttcatacg atggttccaa caaatactat 180ccggggaaag gccttgaatg ggtggctgta atttcatacg atggttccaa caaatactat 180
gctgactcag tcaagggtcg atttacaatt agtcgggaca actccaagaa caccctttat 240gctgactcag tcaagggtcg atttacaatt agtcgggaca actccaagaa caccctttat 240
cttcaaatga attcccttag agcagaggat acggcggtct attactgtgg tggcagtggt 300cttcaaatga attcccttag agcagaggat acggcggtct attactgtgg tggcagtggt 300
tatgcacttc atgatgatta ctatggcttg gatgtctggg ggcaagggac gcttgtaact 360tatgcacttc atgatgatta ctatggcttg gatgtctggg ggcaagggac gcttgtaact 360
gtatcctctg gtggtggtgg tagtggtggg ggaggctccg gcggtggcgg ctctcaatct 420gtatcctctg gtggtggtgg tagtggtggg ggaggctccg gcggtggcgg ctctcaatct 420
gctctgactc aaccagcaag cgtatcaggg tcaccgggac agagtattac cataagttgc 480gctctgactc aaccagcaag cgtatcaggg tcaccgggac agagtattac cataagttgc 480
acggggacct ctagcgatgt aggggggtat aattatgtat cttggtatca acaacacccc 540acggggacct ctagcgatgt aggggggtat aattatgtat cttggtatca acaacacccc 540
gggaaagccc ctaaattgat gatctacgac gtgagcaatc gacctagtgg cgtatcaaat 600gggaaagccc ctaaattgat gatctacgac gtgagcaatc gacctagtgg cgtatcaaat 600
cgcttctctg gtagcaagag tgggaatacg gcgtccctta ctattagcgg attgcaagca 660cgcttctctg gtagcaagag tgggaatacg gcgtccctta ctattagcgg attgcaagca 660
gaagatgagg ccgattacta ctgcagctcc tatactagct cttctacatt gtacgtcttt 720gaagatgagg ccgattacta ctgcagctcc tatactagct cttctacatt gtacgtcttt 720
gggagcggaa caaaagtaac agtactc 747gggagcggaa caaaagtaac agtactc 747
<210> 254<210> 254
<211> 207<211> 207
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 254<400> 254
acaacaacac ctgccccgag accgcctaca ccagccccga ctattgccag ccagcctctg 60acaacaacac ctgccccgag accgcctaca ccagccccga ctattgccag ccagcctctg 60
agcctcaggc ctgaggcctg taggcccgca gcgggcggcg cagttcatac acggggcttg 120agcctcaggc ctgaggcctg taggcccgca gcgggcggcg cagttcatac acggggcttg 120
gatttcgctt gtgatattta tatttgggct cctttggcgg ggacatgtgg cgtgctgctt 180gatttcgctt gtgatattta tatttgggct cctttggcgg ggacatgtgg cgtgctgctt 180
ctgtcacttg ttattacact gtactgt 207ctgtcacttg ttattacact gtactgt 207
<210> 255<210> 255
<211> 126<211> 126
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 255<400> 255
aaacgcgggc gaaaaaaatt gctgtatatt tttaagcagc catttatgag gcccgttcag 60aaacgcgggc gaaaaaaatt gctgtatatt tttaagcagc catttatgag gcccgttcag 60
acgacgcagg aggaggacgg ttgctcttgc aggttcccag aagaggaaga agggggctgt 120acgacgcagg aggaggacgg ttgctcttgc aggttcccag aagaggaaga aggggctgt 120
gaattg 126gaattg 126
<210> 256<210> 256
<211> 336<211> 336
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 256<400> 256
cgggttaaat tttcaagatc cgcagacgct ccagcatacc aacagggaca aaaccaactc 60cgggttaaat tttcaagatc cgcagacgct ccagcatacc aacagggaca aaaccaactc 60
tataacgagc tgaatcttgg aagaagggag gaatatgatg tgctggataa acggcgcggt 120tataacgagc tgaatcttgg aagaagggag gaatatgatg tgctggataa acggcgcggt 120
agagatccgg agatgggcgg aaaaccaagg cgaaaaaacc ctcaggaggg actctacaac 180agagatccgg agatgggcgg aaaaccaagg cgaaaaaacc ctcaggaggg actctacaac 180
gaactgcaga aagacaaaat ggcggaggct tattccgaaa taggcatgaa gggcgagcgg 240gaactgcaga aagacaaaat ggcggaggct tattccgaaa taggcatgaa gggcgagcgg 240
aggcgaggga aagggcacga cggactgtat caaggcctct caaccgcgac taaggatacg 300aggcgaggga aagggcacga cggactgtat caaggcctct caaccgcgac taaggatacg 300
tacgacgccc tgcacatgca ggccctgcct ccgaga 336tacgacgccc tgcacatgca ggccctgcct ccgaga 336
<210> 257<210> 257
<211> 493<211> 493
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 257<400> 257
Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu LeuMet Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Ala Ala Arg Pro Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly ValHis Ala Ala Arg Pro Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val
20 25 30 20 25 30
Val Gln Pro Gly Arg Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly PheVal Gln Pro Gly Arg Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe
35 40 45 35 40 45
Thr Phe Ser Ser Tyr Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly LysThr Phe Ser Ser Tyr Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys
50 55 60 50 55 60
Gly Leu Glu Trp Val Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys TyrGly Leu Glu Trp Val Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn SerTyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser
85 90 95 85 90 95
Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp ThrLys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr
100 105 110 100 105 110
Ala Val Tyr Tyr Cys Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp TyrAla Val Tyr Tyr Cys Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr
115 120 125 115 120 125
Tyr Gly Leu Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTyr Gly Leu Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
130 135 140 130 135 140
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
145 150 155 160145 150 155 160
Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln SerSer Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser
165 170 175 165 170 175
Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr AsnIle Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn
180 185 190 180 185 190
Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu MetTyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met
195 200 205 195 200 205
Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe SerIle Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu GlnGly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln
225 230 235 240225 230 235 240
Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser SerAla Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser
245 250 255 245 250 255
Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr ThrThr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr
260 265 270 260 265 270
Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser GlnThr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln
275 280 285 275 280 285
Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly AlaPro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala
290 295 300 290 295 300
Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp AlaVal His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala
305 310 315 320305 310 315 320
Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile ThrPro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr
325 330 335 325 330 335
Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys GlnLeu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln
340 345 350 340 345 350
Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys SerPro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser
355 360 365 355 360 365
Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val LysCys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys
370 375 380 370 375 380
Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn GlnPhe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln
385 390 395 400385 390 395 400
Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val LeuLeu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu
405 410 415 405 410 415
Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg ArgAsp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg
420 425 430 420 425 430
Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys MetLys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met
435 440 445 435 440 445
Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg GlyAla Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly
450 455 460 450 455 460
Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys AspLys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp
465 470 475 480465 470 475 480
Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgThr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
485 490 485 490
<210> 258<210> 258
<211> 1479<211> 1479
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 258<400> 258
atggccctcc ctgtcaccgc tctgttgctg ccgcttgctc tgctgctcca cgcagcgcga 60atggccctcc ctgtcaccgc tctgttgctg ccgcttgctc tgctgctcca cgcagcgcga 60
ccgcaggtac aattgcagga gtctggaggc ggtgtggtgc aacccggtcg cagcttgcgc 120ccgcaggtac aattgcagga gtctggaggc ggtgtggtgc aacccggtcg cagcttgcgc 120
ctgagttgtg ctgcgtctgg atttacattt tcatcttacg gaatgcattg ggtacgccag 180ctgagttgtg ctgcgtctgg atttacattt tcatcttacg gaatgcattg ggtacgccag 180
gcaccgggga aaggccttga atgggtggct gtaatttcat acgatggttc caacaaatac 240gcaccgggga aaggccttga atgggtggct gtaatttcat acgatggttc caacaaatac 240
tatgctgact cagtcaaggg tcgatttaca attagtcggg acaactccaa gaacaccctt 300tatgctgact cagtcaaggg tcgatttaca attagtcggg acaactccaa gaacaccctt 300
tatcttcaaa tgaattccct tagagcagag gatacggcgg tctattactg tggtggcagt 360tatcttcaaa tgaattccct tagagcagag gatacggcgg tctattactg tggtggcagt 360
ggttatgcac ttcatgatga ttactatggc ttggatgtct gggggcaagg gacgcttgta 420ggttatgcac ttcatgatga ttactatggc ttggatgtct gggggcaagg gacgcttgta 420
actgtatcct ctggtggtgg tggtagtggt gggggaggct ccggcggtgg cggctctcaa 480actgtatcct ctggtggtgg tggtagtggt gggggaggct ccggcggtgg cggctctcaa 480
tctgctctga ctcaaccagc aagcgtatca gggtcaccgg gacagagtat taccataagt 540tctgctctga ctcaaccagc aagcgtatca gggtcaccgg gacagagtat taccataagt 540
tgcacgggga cctctagcga tgtagggggg tataattatg tatcttggta tcaacaacac 600tgcacgggga cctctagcga tgtagggggg tataattatg tatcttggta tcaacaacac 600
cccgggaaag cccctaaatt gatgatctac gacgtgagca atcgacctag tggcgtatca 660cccgggaaag cccctaaatt gatgatctac gacgtgagca atcgacctag tggcgtatca 660
aatcgcttct ctggtagcaa gagtgggaat acggcgtccc ttactattag cggattgcaa 720aatcgcttct ctggtagcaa gagtgggaat acggcgtccc ttactattag cggattgcaa 720
gcagaagatg aggccgatta ctactgcagc tcctatacta gctcttctac attgtacgtc 780gcagaagatg aggccgatta ctactgcagc tcctatacta gctcttctac attgtacgtc 780
tttgggagcg gaacaaaagt aacagtactc acaacaacac ctgccccgag accgcctaca 840tttgggagcg gaacaaaagt aacagtactc acaacaacac ctgccccgag accgcctaca 840
ccagccccga ctattgccag ccagcctctg agcctcaggc ctgaggcctg taggcccgca 900ccagccccga ctattgccag ccagcctctg agcctcaggc ctgaggcctg taggcccgca 900
gcgggcggcg cagttcatac acggggcttg gatttcgctt gtgatattta tatttgggct 960gcgggcggcg cagttcatac acggggcttg gatttcgctt gtgatattta tatttgggct 960
cctttggcgg ggacatgtgg cgtgctgctt ctgtcacttg ttattacact gtactgtaaa 1020cctttggcgg ggacatgtgg cgtgctgctt ctgtcacttg ttattacact gtactgtaaa 1020
cgcgggcgaa aaaaattgct gtatattttt aagcagccat ttatgaggcc cgttcagacg 1080cgcgggcgaa aaaaattgct gtatattttt aagcagccat ttatgaggcc cgttcagacg 1080
acgcaggagg aggacggttg ctcttgcagg ttcccagaag aggaagaagg gggctgtgaa 1140acgcaggagg aggacggttg ctcttgcagg ttcccagaag aggaagaagg gggctgtgaa 1140
ttgcgggtta aattttcaag atccgcagac gctccagcat accaacaggg acaaaaccaa 1200ttgcgggtta aattttcaag atccgcagac gctccagcat accaacaggg acaaaaccaa 1200
ctctataacg agctgaatct tggaagaagg gaggaatatg atgtgctgga taaacggcgc 1260ctctataacg agctgaatct tggaagaagg gaggaatatg atgtgctgga taaacggcgc 1260
ggtagagatc cggagatggg cggaaaacca aggcgaaaaa accctcagga gggactctac 1320ggtagagatc cggagatggg cggaaaacca aggcgaaaaa accctcagga gggactctac 1320
aacgaactgc agaaagacaa aatggcggag gcttattccg aaataggcat gaagggcgag 1380aacgaactgc agaaagacaa aatggcggag gcttattccg aaataggcat gaagggcgag 1380
cggaggcgag ggaaagggca cgacggactg tatcaaggcc tctcaaccgc gactaaggat 1440cggaggcgag ggaaagggca cgacggactg tatcaaggcc tctcaaccgc gactaaggat 1440
acgtacgacg ccctgcacat gcaggccctg cctccgaga 1479acgtacgacg ccctgcacat gcaggccctg cctccgaga 1479
<210> 259<210> 259
<211> 1416<211> 1416
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 259<400> 259
caggtacaat tgcaggagtc tggaggcggt gtggtgcaac ccggtcgcag cttgcgcctg 60caggtacaat tgcaggagtc tggaggcggt gtggtgcaac ccggtcgcag cttgcgcctg 60
agttgtgctg cgtctggatt tacattttca tcttacggaa tgcattgggt acgccaggca 120agttgtgctg cgtctggatt tacattttca tcttacggaa tgcattgggt acgccaggca 120
ccggggaaag gccttgaatg ggtggctgta atttcatacg atggttccaa caaatactat 180ccggggaaag gccttgaatg ggtggctgta atttcatacg atggttccaa caaatactat 180
gctgactcag tcaagggtcg atttacaatt agtcgggaca actccaagaa caccctttat 240gctgactcag tcaagggtcg atttacaatt agtcgggaca actccaagaa caccctttat 240
cttcaaatga attcccttag agcagaggat acggcggtct attactgtgg tggcagtggt 300cttcaaatga attcccttag agcagaggat acggcggtct attactgtgg tggcagtggt 300
tatgcacttc atgatgatta ctatggcttg gatgtctggg ggcaagggac gcttgtaact 360tatgcacttc atgatgatta ctatggcttg gatgtctggg ggcaagggac gcttgtaact 360
gtatcctctg gtggtggtgg tagtggtggg ggaggctccg gcggtggcgg ctctcaatct 420gtatcctctg gtggtggtgg tagtggtggg ggaggctccg gcggtggcgg ctctcaatct 420
gctctgactc aaccagcaag cgtatcaggg tcaccgggac agagtattac cataagttgc 480gctctgactc aaccagcaag cgtatcaggg tcaccgggac agagtattac cataagttgc 480
acggggacct ctagcgatgt aggggggtat aattatgtat cttggtatca acaacacccc 540acggggacct ctagcgatgt aggggggtat aattatgtat cttggtatca acaacacccc 540
gggaaagccc ctaaattgat gatctacgac gtgagcaatc gacctagtgg cgtatcaaat 600gggaaagccc ctaaattgat gatctacgac gtgagcaatc gacctagtgg cgtatcaaat 600
cgcttctctg gtagcaagag tgggaatacg gcgtccctta ctattagcgg attgcaagca 660cgcttctctg gtagcaagag tgggaatacg gcgtccctta ctattagcgg attgcaagca 660
gaagatgagg ccgattacta ctgcagctcc tatactagct cttctacatt gtacgtcttt 720gaagatgagg ccgattacta ctgcagctcc tatactagct cttctacatt gtacgtcttt 720
gggagcggaa caaaagtaac agtactcaca acaacacctg ccccgagacc gcctacacca 780gggagcggaa caaaagtaac agtactcaca acaacacctg ccccgagacc gcctacacca 780
gccccgacta ttgccagcca gcctctgagc ctcaggcctg aggcctgtag gcccgcagcg 840gccccgacta ttgccagcca gcctctgagc ctcaggcctg aggcctgtag gcccgcagcg 840
ggcggcgcag ttcatacacg gggcttggat ttcgcttgtg atatttatat ttgggctcct 900ggcggcgcag ttcatacacg gggcttggat ttcgcttgtg atatttatat ttgggctcct 900
ttggcgggga catgtggcgt gctgcttctg tcacttgtta ttacactgta ctgtaaacgc 960ttggcgggga catgtggcgt gctgcttctg tcacttgtta ttacactgta ctgtaaacgc 960
gggcgaaaaa aattgctgta tatttttaag cagccattta tgaggcccgt tcagacgacg 1020gggcgaaaaa aattgctgta tatttttaag cagccattta tgaggcccgt tcagacgacg 1020
caggaggagg acggttgctc ttgcaggttc ccagaagagg aagaaggggg ctgtgaattg 1080caggaggagg acggttgctc ttgcaggttc ccagaagagg aagaaggggg ctgtgaattg 1080
cgggttaaat tttcaagatc cgcagacgct ccagcatacc aacagggaca aaaccaactc 1140cgggttaaat tttcaagatc cgcagacgct ccagcatacc aacagggaca aaaccaactc 1140
tataacgagc tgaatcttgg aagaagggag gaatatgatg tgctggataa acggcgcggt 1200tataacgagc tgaatcttgg aagaagggag gaatatgatg tgctggataa acggcgcggt 1200
agagatccgg agatgggcgg aaaaccaagg cgaaaaaacc ctcaggaggg actctacaac 1260agagatccgg agatgggcgg aaaaccaagg cgaaaaaacc ctcaggaggg actctacaac 1260
gaactgcaga aagacaaaat ggcggaggct tattccgaaa taggcatgaa gggcgagcgg 1320gaactgcaga aagacaaaat ggcggaggct tattccgaaa taggcatgaa gggcgagcgg 1320
aggcgaggga aagggcacga cggactgtat caaggcctct caaccgcgac taaggatacg 1380aggcgaggga aagggcacga cggactgtat caaggcctct caaccgcgac taaggatacg 1380
tacgacgccc tgcacatgca ggccctgcct ccgaga 1416tacgacgccc tgcacatgca ggccctgcct ccgaga 1416
<210> 260<210> 260
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 260<400> 260
caggtacaat tgcaggagtc tggaggcggt gtggtgcaac ccggtcgcag cttgcgcctg 60caggtacaat tgcaggagtc tggaggcggt gtggtgcaac ccggtcgcag cttgcgcctg 60
agttgtgctg cgtctggatt tacattttca tcttacggaa tgcattgggt acgccaggca 120agttgtgctg cgtctggatt tacattttca tcttacggaa tgcattgggt acgccaggca 120
ccggggaaag gccttgaatg ggtggctgta atttcatacg atggttccaa caaatactat 180ccggggaaag gccttgaatg ggtggctgta atttcatacg atggttccaa caaatactat 180
gctgactcag tcaagggtcg atttacaatt agtcgggaca actccaagaa caccctttat 240gctgactcag tcaagggtcg atttacaatt agtcgggaca actccaagaa caccctttat 240
cttcaaatga attcccttag agcagaggat acggcggtct attactgtgg tggcagtggt 300cttcaaatga attcccttag agcagaggat acggcggtct attactgtgg tggcagtggt 300
tatgcacttc atgatgatta ctatggcttg gatgtctggg ggcaagggac gcttgtaact 360tatgcacttc atgatgatta ctatggcttg gatgtctggg ggcaagggac gcttgtaact 360
gtatcctct 369gtaccctct 369
<210> 261<210> 261
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 261<400> 261
caatctgctc tgactcaacc agcaagcgta tcagggtcac cgggacagag tattaccata 60caatctgctc tgactcaacc agcaagcgta tcagggtcac cgggacagag tattaccata 60
agttgcacgg ggacctctag cgatgtaggg gggtataatt atgtatcttg gtatcaacaa 120agttgcacgg ggacctctag cgatgtaggg gggtataatt atgtatcttg gtatcaacaa 120
caccccggga aagcccctaa attgatgatc tacgacgtga gcaatcgacc tagtggcgta 180caccccggga aagcccctaa attgatgatc tacgacgtga gcaatcgacc tagtggcgta 180
tcaaatcgct tctctggtag caagagtggg aatacggcgt cccttactat tagcggattg 240tcaaatcgct tctctggtag caagagtggg aatacggcgt cccttactat tagcggattg 240
caagcagaag atgaggccga ttactactgc agctcctata ctagctcttc tacattgtac 300caagcagaag atgaggccga ttactactgc agctcctata ctagctcttc tacattgtac 300
gtctttggga gcggaacaaa agtaacagta ctc 333gtctttggga gcggaacaaa agtaacagta ctc 333
<210> 262<210> 262
<211> 345<211> 345
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 262<400> 262
gaagtgcaat tggtggaatc agggggagga cttgtgcagc ctggaggatc gctgagactg 60gaagtgcaat tggtggaatc agggggagga cttgtgcagc ctggaggatc gctgagactg 60
tcatgtgccg tgtccggctt tgccctgtcc aaccacggga tgtcctgggt ccgccgcgcg 120tcatgtgccg tgtccggctt tgccctgtcc aaccacggga tgtcctgggt ccgccgcgcg 120
cctggaaagg gcctcgaatg ggtgtcgggt attgtgtaca gcggtagcac ctactatgcc 180cctggaaagg gcctcgaatg ggtgtcggggt attgtgtaca gcggtagcac ctactatgcc 180
gcatccgtga aggggagatt caccatcagc cgggacaact ccaggaacac tctgtacctc 240gcatccgtga aggggagatt caccatcagc cgggacaact ccadgaacac tctgtacctc 240
caaatgaatt cgctgaggcc agaggacact gccatctact actgctccgc gcatggcgga 300caaatgaatt cgctgaggcc agaggacact gccatctact actgctccgc gcatggcgga 300
gagtccgacg tctggggaca ggggaccacc gtgaccgtgt ctagc 345gagtccgacg tctggggaca ggggaccacc gtgaccgtgt ctagc 345
<210> 263<210> 263
<211> 321<211> 321
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 263<400> 263
gacatccagc tcacccagtc cccgagctcg ctgtccgcct ccgtgggaga tcgggtcacc 60gacatccagc tcacccagtc cccgagctcg ctgtccgcct ccgtgggaga tcgggtcacc 60
atcacgtgcc gcgccagcca gtcgatttcc tcctacctga actggtacca acagaagccc 120atcacgtgcc gcgccagcca gtcgatttcc tcctacctga actggtacca acagaagccc 120
ggaaaagccc cgaagcttct catctacgcc gcctcgagcc tgcagtcagg agtgccctca 180ggaaaagccc cgaagcttct catctacgcc gcctcgagcc tgcagtcagg agtgccctca 180
cggttctccg gctccggttc cggtactgat ttcaccctga ccatttcctc cctgcaaccg 240cggttctccg gctccggttc cggtactgat ttcaccctga ccatttcctc cctgcaaccg 240
gaggacttcg ctacttacta ctgccagcag tcgtactcca ccccctacac tttcggacaa 300gaggacttcg ctacttacta ctgccagcag tcgtactcca ccccctacac tttcggacaa 300
ggcaccaagg tcgaaatcaa g 321ggcaccaagg tcgaaatcaa g 321
<210> 264<210> 264
<400> 264<400> 264
000000
<210> 265<210> 265
<400> 265<400> 265
000000
<210> 266<210> 266
<400> 266<400> 266
000000
<210> 267<210> 267
<400> 267<400> 267
000000
<210> 268<210> 268
<400> 268<400> 268
000000
<210> 269<210> 269
<400> 269<400> 269
000000
<210> 270<210> 270
<400> 270<400> 270
000000
<210> 271<210> 271
<400> 271<400> 271
000000
<210> 272<210> 272
<400> 272<400> 272
000000
<210> 273<210> 273
<400> 273<400> 273
000000
<210> 274<210> 274
<400> 274<400> 274
000000
<210> 275<210> 275
<211> 132<211> 132
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 275<400> 275
Asp Val Pro Asp Tyr Ala Ser Leu Gly Gly Pro Ser Ser Pro Lys LysAsp Val Pro Asp Tyr Ala Ser Leu Gly Gly Pro Ser Ser Pro Lys Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Lys Arg Lys Val Ser Arg Gly Val Gln Val Glu Thr Ile Ser Pro GlyLys Arg Lys Val Ser Arg Gly Val Gln Val Glu Thr Ile Ser Pro Gly
20 25 30 20 25 30
Asp Gly Arg Thr Phe Pro Lys Arg Gly Gln Thr Cys Val Val His TyrAsp Gly Arg Thr Phe Pro Lys Arg Gly Gln Thr Cys Val Val His Tyr
35 40 45 35 40 45
Thr Gly Met Leu Glu Asp Gly Lys Lys Phe Asp Ser Ser Arg Asp ArgThr Gly Met Leu Glu Asp Gly Lys Lys Phe Asp Ser Ser Arg Asp Arg
50 55 60 50 55 60
Asn Lys Pro Phe Lys Phe Met Leu Gly Lys Gln Glu Val Ile Arg GlyAsn Lys Pro Phe Lys Phe Met Leu Gly Lys Gln Glu Val Ile Arg Gly
65 70 75 8065 70 75 80
Trp Glu Glu Gly Val Ala Gln Met Ser Val Gly Gln Arg Ala Lys LeuTrp Glu Glu Gly Val Ala Gln Met Ser Val Gly Gln Arg Ala Lys Leu
85 90 95 85 90 95
Thr Ile Ser Pro Asp Tyr Ala Tyr Gly Ala Thr Gly His Pro Gly IleThr Ile Ser Pro Asp Tyr Ala Tyr Gly Ala Thr Gly His Pro Gly Ile
100 105 110 100 105 110
Ile Pro Pro His Ala Thr Leu Val Phe Asp Val Glu Leu Leu Lys LeuIle Pro Pro His Ala Thr Leu Val Phe Asp Val Glu Leu Leu Lys Leu
115 120 125 115 120 125
Glu Thr Ser TyrGlu Thr Ser Tyr
130 130
<210> 276<210> 276
<211> 108<211> 108
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 276<400> 276
Val Gln Val Glu Thr Ile Ser Pro Gly Asp Gly Arg Thr Phe Pro LysVal Gln Val Glu Thr Ile Ser Pro Gly Asp Gly Arg Thr Phe Pro Lys
1 5 10 15 1 5 10 15
Arg Gly Gln Thr Cys Val Val His Tyr Thr Gly Met Leu Glu Asp GlyArg Gly Gln Thr Cys Val Val His Tyr Thr Gly Met Leu Glu Asp Gly
20 25 30 20 25 30
Lys Lys Phe Asp Ser Ser Arg Asp Arg Asn Lys Pro Phe Lys Phe MetLys Lys Phe Asp Ser Ser Arg Asp Arg Asn Lys Pro Phe Lys Phe Met
35 40 45 35 40 45
Leu Gly Lys Gln Glu Val Ile Arg Gly Trp Glu Glu Gly Val Ala GlnLeu Gly Lys Gln Glu Val Ile Arg Gly Trp Glu Glu Gly Val Ala Gln
50 55 60 50 55 60
Met Ser Val Gly Gln Arg Ala Lys Leu Thr Ile Ser Pro Asp Tyr AlaMet Ser Val Gly Gln Arg Ala Lys Leu Thr Ile Ser Pro Asp Tyr Ala
65 70 75 8065 70 75 80
Tyr Gly Ala Thr Gly His Pro Gly Ile Ile Pro Pro His Ala Thr LeuTyr Gly Ala Thr Gly His Pro Gly Ile Ile Pro Pro His Ala Thr Leu
85 90 95 85 90 95
Val Phe Asp Val Glu Leu Leu Lys Leu Glu Thr SerVal Phe Asp Val Glu Leu Leu Lys Leu Glu Thr Ser
100 105 100 105
<210> 277<210> 277
<211> 93<211> 93
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 277<400> 277
Ile Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Glu Glu Ala Ser ArgIle Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Glu Glu Ala Ser Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu GluLeu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu Glu
20 25 30 20 25 30
Pro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu ThrPro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu Thr
35 40 45 35 40 45
Ser Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu TrpSer Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu Trp
50 55 60 50 55 60
Cys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Thr Gln AlaCys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Thr Gln Ala
65 70 75 8065 70 75 80
Trp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser LysTrp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys
85 90 85 90
<210> 278<210> 278
<211> 95<211> 95
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 278<400> 278
Ile Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Ile Glu Ala Ser ArgIle Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Ile Glu Ala Ser Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu GluLeu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu Glu
20 25 30 20 25 30
Pro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu ThrPro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu Thr
35 40 45 35 40 45
Ser Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu TrpSer Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu Trp
50 55 60 50 55 60
Cys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Thr Gln AlaCys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Thr Gln Ala
65 70 75 8065 70 75 80
Trp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr SerTrp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr Ser
85 90 9585 90 95
<210> 279<210> 279
<211> 95<211> 95
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 279<400> 279
Ile Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Leu Glu Ala Ser ArgIle Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Leu Glu Ala Ser Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu GluLeu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu Glu
20 25 30 20 25 30
Pro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu ThrPro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu Thr
35 40 45 35 40 45
Ser Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu TrpSer Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu Trp
50 55 60 50 55 60
Cys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Thr Gln AlaCys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Thr Gln Ala
65 70 75 8065 70 75 80
Trp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr SerTrp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr Ser
85 90 9585 90 95
<210> 280<210> 280
<211> 95<211> 95
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 280<400> 280
Ile Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Glu Glu Ala Ser ArgIle Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Glu Glu Ala Ser Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu GluLeu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu Glu
20 25 30 20 25 30
Pro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu ThrPro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu Thr
35 40 45 35 40 45
Ser Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu TrpSer Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu Trp
50 55 60 50 55 60
Cys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Leu Gln AlaCys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Leu Gln Ala
65 70 75 8065 70 75 80
Trp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr SerTrp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr Ser
85 90 9585 90 95
<210> 281<210> 281
<211> 95<211> 95
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<220><220>
<221> MOD_RES<221>MOD_RES
<222> (12)..(12)<222> (12)..(12)
<223> Any amino acid<223> Any amino acid
<220><220>
<221> MOD_RES<221>MOD_RES
<222> (78)..(78)<222> (78)..(78)
<223> Any amino acid<223> Any amino acid
<400> 281<400> 281
Ile Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Xaa Glu Ala Ser ArgIle Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Xaa Glu Ala Ser Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu GluLeu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu Glu
20 25 30 20 25 30
Pro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu ThrPro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu Thr
35 40 45 35 40 45
Ser Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu TrpSer Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu Trp
50 55 60 50 55 60
Cys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Xaa Gln AlaCys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Xaa Gln Ala
65 70 75 8065 70 75 80
Trp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr SerTrp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr Ser
85 90 9585 90 95
<210> 282<210> 282
<211> 95<211> 95
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 282<400> 282
Ile Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Ile Glu Ala Ser ArgIle Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Ile Glu Ala Ser Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu GluLeu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu Glu
20 25 30 20 25 30
Pro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu ThrPro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu Thr
35 40 45 35 40 45
Ser Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu TrpSer Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu Trp
50 55 60 50 55 60
Cys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Leu Gln AlaCys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Leu Gln Ala
65 70 75 8065 70 75 80
Trp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr SerTrp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr Ser
85 90 9585 90 95
<210> 283<210> 283
<211> 95<211> 95
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 283<400> 283
Ile Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Leu Glu Ala Ser ArgIle Leu Trp His Glu Met Trp His Glu Gly Leu Leu Glu Ala Ser Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu GluLeu Tyr Phe Gly Glu Arg Asn Val Lys Gly Met Phe Glu Val Leu Glu
20 25 30 20 25 30
Pro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu ThrPro Leu His Ala Met Met Glu Arg Gly Pro Gln Thr Leu Lys Glu Thr
35 40 45 35 40 45
Ser Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu TrpSer Phe Asn Gln Ala Tyr Gly Arg Asp Leu Met Glu Ala Gln Glu Trp
50 55 60 50 55 60
Cys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Leu Gln AlaCys Arg Lys Tyr Met Lys Ser Gly Asn Val Lys Asp Leu Leu Gln Ala
65 70 75 8065 70 75 80
Trp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr SerTrp Asp Leu Tyr Tyr His Val Phe Arg Arg Ile Ser Lys Thr Ser
85 90 9585 90 95
<210> 284<210> 284
<211> 1132<211> 1132
<212> PRT<212> PRT
<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens
<400> 284<400> 284
Met Pro Arg Ala Pro Arg Cys Arg Ala Val Arg Ser Leu Leu Arg SerMet Pro Arg Ala Pro Arg Cys Arg Ala Val Arg Ser Leu Leu Arg Ser
1 5 10 15 1 5 10 15
His Tyr Arg Glu Val Leu Pro Leu Ala Thr Phe Val Arg Arg Leu GlyHis Tyr Arg Glu Val Leu Pro Leu Ala Thr Phe Val Arg Arg Leu Gly
20 25 30 20 25 30
Pro Gln Gly Trp Arg Leu Val Gln Arg Gly Asp Pro Ala Ala Phe ArgPro Gln Gly Trp Arg Leu Val Gln Arg Gly Asp Pro Ala Ala Phe Arg
35 40 45 35 40 45
Ala Leu Val Ala Gln Cys Leu Val Cys Val Pro Trp Asp Ala Arg ProAla Leu Val Ala Gln Cys Leu Val Cys Val Pro Trp Asp Ala Arg Pro
50 55 60 50 55 60
Pro Pro Ala Ala Pro Ser Phe Arg Gln Val Ser Cys Leu Lys Glu LeuPro Pro Ala Ala Pro Ser Phe Arg Gln Val Ser Cys Leu Lys Glu Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Val Ala Arg Val Leu Gln Arg Leu Cys Glu Arg Gly Ala Lys Asn ValVal Ala Arg Val Leu Gln Arg Leu Cys Glu Arg Gly Ala Lys Asn Val
85 90 95 85 90 95
Leu Ala Phe Gly Phe Ala Leu Leu Asp Gly Ala Arg Gly Gly Pro ProLeu Ala Phe Gly Phe Ala Leu Leu Asp Gly Ala Arg Gly Gly Pro Pro
100 105 110 100 105 110
Glu Ala Phe Thr Thr Ser Val Arg Ser Tyr Leu Pro Asn Thr Val ThrGlu Ala Phe Thr Thr Ser Val Arg Ser Tyr Leu Pro Asn Thr Val Thr
115 120 125 115 120 125
Asp Ala Leu Arg Gly Ser Gly Ala Trp Gly Leu Leu Leu Arg Arg ValAsp Ala Leu Arg Gly Ser Gly Ala Trp Gly Leu Leu Leu Arg Arg Val
130 135 140 130 135 140
Gly Asp Asp Val Leu Val His Leu Leu Ala Arg Cys Ala Leu Phe ValGly Asp Asp Val Leu Val His Leu Leu Ala Arg Cys Ala Leu Phe Val
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Val Ala Pro Ser Cys Ala Tyr Gln Val Cys Gly Pro Pro Leu TyrLeu Val Ala Pro Ser Cys Ala Tyr Gln Val Cys Gly Pro Pro Leu Tyr
165 170 175 165 170 175
Gln Leu Gly Ala Ala Thr Gln Ala Arg Pro Pro Pro His Ala Ser GlyGln Leu Gly Ala Ala Thr Gln Ala Arg Pro Pro Pro His Ala Ser Gly
180 185 190 180 185 190
Pro Arg Arg Arg Leu Gly Cys Glu Arg Ala Trp Asn His Ser Val ArgPro Arg Arg Arg Leu Gly Cys Glu Arg Ala Trp Asn His Ser Val Arg
195 200 205 195 200 205
Glu Ala Gly Val Pro Leu Gly Leu Pro Ala Pro Gly Ala Arg Arg ArgGlu Ala Gly Val Pro Leu Gly Leu Pro Ala Pro Gly Ala Arg Arg Arg
210 215 220 210 215 220
Gly Gly Ser Ala Ser Arg Ser Leu Pro Leu Pro Lys Arg Pro Arg ArgGly Gly Ser Ala Ser Arg Ser Leu Pro Leu Pro Lys Arg Pro Arg Arg
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Ala Ala Pro Glu Pro Glu Arg Thr Pro Val Gly Gln Gly Ser TrpGly Ala Ala Pro Glu Pro Glu Arg Thr Pro Val Gly Gln Gly Ser Trp
245 250 255 245 250 255
Ala His Pro Gly Arg Thr Arg Gly Pro Ser Asp Arg Gly Phe Cys ValAla His Pro Gly Arg Thr Arg Gly Pro Ser Asp Arg Gly Phe Cys Val
260 265 270 260 265 270
Val Ser Pro Ala Arg Pro Ala Glu Glu Ala Thr Ser Leu Glu Gly AlaVal Ser Pro Ala Arg Pro Ala Glu Glu Ala Thr Ser Leu Glu Gly Ala
275 280 285 275 280 285
Leu Ser Gly Thr Arg His Ser His Pro Ser Val Gly Arg Gln His HisLeu Ser Gly Thr Arg His Ser His Pro Ser Val Gly Arg Gln His His
290 295 300 290 295 300
Ala Gly Pro Pro Ser Thr Ser Arg Pro Pro Arg Pro Trp Asp Thr ProAla Gly Pro Pro Ser Thr Ser Arg Pro Pro Arg Pro Trp Asp Thr Pro
305 310 315 320305 310 315 320
Cys Pro Pro Val Tyr Ala Glu Thr Lys His Phe Leu Tyr Ser Ser GlyCys Pro Pro Val Tyr Ala Glu Thr Lys His Phe Leu Tyr Ser Ser Gly
325 330 335 325 330 335
Asp Lys Glu Gln Leu Arg Pro Ser Phe Leu Leu Ser Ser Leu Arg ProAsp Lys Glu Gln Leu Arg Pro Ser Phe Leu Leu Ser Ser Leu Arg Pro
340 345 350 340 345 350
Ser Leu Thr Gly Ala Arg Arg Leu Val Glu Thr Ile Phe Leu Gly SerSer Leu Thr Gly Ala Arg Arg Leu Val Glu Thr Ile Phe Leu Gly Ser
355 360 365 355 360 365
Arg Pro Trp Met Pro Gly Thr Pro Arg Arg Leu Pro Arg Leu Pro GlnArg Pro Trp Met Pro Gly Thr Pro Arg Arg Leu Pro Arg Leu Pro Gln
370 375 380 370 375 380
Arg Tyr Trp Gln Met Arg Pro Leu Phe Leu Glu Leu Leu Gly Asn HisArg Tyr Trp Gln Met Arg Pro Leu Phe Leu Glu Leu Leu Gly Asn His
385 390 395 400385 390 395 400
Ala Gln Cys Pro Tyr Gly Val Leu Leu Lys Thr His Cys Pro Leu ArgAla Gln Cys Pro Tyr Gly Val Leu Leu Lys Thr His Cys Pro Leu Arg
405 410 415 405 410 415
Ala Ala Val Thr Pro Ala Ala Gly Val Cys Ala Arg Glu Lys Pro GlnAla Ala Val Thr Pro Ala Ala Gly Val Cys Ala Arg Glu Lys Pro Gln
420 425 430 420 425 430
Gly Ser Val Ala Ala Pro Glu Glu Glu Asp Thr Asp Pro Arg Arg LeuGly Ser Val Ala Ala Pro Glu Glu Glu Asp Thr Asp Pro Arg Arg Leu
435 440 445 435 440 445
Val Gln Leu Leu Arg Gln His Ser Ser Pro Trp Gln Val Tyr Gly PheVal Gln Leu Leu Arg Gln His Ser Ser Pro Trp Gln Val Tyr Gly Phe
450 455 460 450 455 460
Val Arg Ala Cys Leu Arg Arg Leu Val Pro Pro Gly Leu Trp Gly SerVal Arg Ala Cys Leu Arg Arg Leu Val Pro Pro Gly Leu Trp Gly Ser
465 470 475 480465 470 475 480
Arg His Asn Glu Arg Arg Phe Leu Arg Asn Thr Lys Lys Phe Ile SerArg His Asn Glu Arg Arg Phe Leu Arg Asn Thr Lys Lys Phe Ile Ser
485 490 495 485 490 495
Leu Gly Lys His Ala Lys Leu Ser Leu Gln Glu Leu Thr Trp Lys MetLeu Gly Lys His Ala Lys Leu Ser Leu Gln Glu Leu Thr Trp Lys Met
500 505 510 500 505 510
Ser Val Arg Gly Cys Ala Trp Leu Arg Arg Ser Pro Gly Val Gly CysSer Val Arg Gly Cys Ala Trp Leu Arg Arg Ser Pro Gly Val Gly Cys
515 520 525 515 520 525
Val Pro Ala Ala Glu His Arg Leu Arg Glu Glu Ile Leu Ala Lys PheVal Pro Ala Ala Glu His Arg Leu Arg Glu Glu Ile Leu Ala Lys Phe
530 535 540 530 535 540
Leu His Trp Leu Met Ser Val Tyr Val Val Glu Leu Leu Arg Ser PheLeu His Trp Leu Met Ser Val Tyr Val Val Glu Leu Leu Arg Ser Phe
545 550 555 560545 550 555 560
Phe Tyr Val Thr Glu Thr Thr Phe Gln Lys Asn Arg Leu Phe Phe TyrPhe Tyr Val Thr Glu Thr Thr Phe Gln Lys Asn Arg Leu Phe Phe Tyr
565 570 575 565 570 575
Arg Lys Ser Val Trp Ser Lys Leu Gln Ser Ile Gly Ile Arg Gln HisArg Lys Ser Val Trp Ser Lys Leu Gln Ser Ile Gly Ile Arg Gln His
580 585 590 580 585 590
Leu Lys Arg Val Gln Leu Arg Glu Leu Ser Glu Ala Glu Val Arg GlnLeu Lys Arg Val Gln Leu Arg Glu Leu Ser Glu Ala Glu Val Arg Gln
595 600 605 595 600 605
His Arg Glu Ala Arg Pro Ala Leu Leu Thr Ser Arg Leu Arg Phe IleHis Arg Glu Ala Arg Pro Ala Leu Leu Thr Ser Arg Leu Arg Phe Ile
610 615 620 610 615 620
Pro Lys Pro Asp Gly Leu Arg Pro Ile Val Asn Met Asp Tyr Val ValPro Lys Pro Asp Gly Leu Arg Pro Ile Val Asn Met Asp Tyr Val Val
625 630 635 640625 630 635 640
Gly Ala Arg Thr Phe Arg Arg Glu Lys Arg Ala Glu Arg Leu Thr SerGly Ala Arg Thr Phe Arg Arg Glu Lys Arg Ala Glu Arg Leu Thr Ser
645 650 655 645 650 655
Arg Val Lys Ala Leu Phe Ser Val Leu Asn Tyr Glu Arg Ala Arg ArgArg Val Lys Ala Leu Phe Ser Val Leu Asn Tyr Glu Arg Ala Arg Arg
660 665 670 660 665 670
Pro Gly Leu Leu Gly Ala Ser Val Leu Gly Leu Asp Asp Ile His ArgPro Gly Leu Leu Gly Ala Ser Val Leu Gly Leu Asp Asp Ile His Arg
675 680 685 675 680 685
Ala Trp Arg Thr Phe Val Leu Arg Val Arg Ala Gln Asp Pro Pro ProAla Trp Arg Thr Phe Val Leu Arg Val Arg Ala Gln Asp Pro Pro Pro
690 695 700 690 695 700
Glu Leu Tyr Phe Val Lys Val Asp Val Thr Gly Ala Tyr Asp Thr IleGlu Leu Tyr Phe Val Lys Val Asp Val Thr Gly Ala Tyr Asp Thr Ile
705 710 715 720705 710 715 720
Pro Gln Asp Arg Leu Thr Glu Val Ile Ala Ser Ile Ile Lys Pro GlnPro Gln Asp Arg Leu Thr Glu Val Ile Ala Ser Ile Ile Lys Pro Gln
725 730 735 725 730 735
Asn Thr Tyr Cys Val Arg Arg Tyr Ala Val Val Gln Lys Ala Ala HisAsn Thr Tyr Cys Val Arg Arg Tyr Ala Val Val Gln Lys Ala Ala His
740 745 750 740 745 750
Gly His Val Arg Lys Ala Phe Lys Ser His Val Ser Thr Leu Thr AspGly His Val Arg Lys Ala Phe Lys Ser His Val Ser Thr Leu Thr Asp
755 760 765 755 760 765
Leu Gln Pro Tyr Met Arg Gln Phe Val Ala His Leu Gln Glu Thr SerLeu Gln Pro Tyr Met Arg Gln Phe Val Ala His Leu Gln Glu Thr Ser
770 775 780 770 775 780
Pro Leu Arg Asp Ala Val Val Ile Glu Gln Ser Ser Ser Leu Asn GluPro Leu Arg Asp Ala Val Val Ile Glu Gln Ser Ser Ser Leu Asn Glu
785 790 795 800785 790 795 800
Ala Ser Ser Gly Leu Phe Asp Val Phe Leu Arg Phe Met Cys His HisAla Ser Ser Gly Leu Phe Asp Val Phe Leu Arg Phe Met Cys His His
805 810 815 805 810 815
Ala Val Arg Ile Arg Gly Lys Ser Tyr Val Gln Cys Gln Gly Ile ProAla Val Arg Ile Arg Gly Lys Ser Tyr Val Gln Cys Gln Gly Ile Pro
820 825 830 820 825 830
Gln Gly Ser Ile Leu Ser Thr Leu Leu Cys Ser Leu Cys Tyr Gly AspGln Gly Ser Ile Leu Ser Thr Leu Leu Cys Ser Leu Cys Tyr Gly Asp
835 840 845 835 840 845
Met Glu Asn Lys Leu Phe Ala Gly Ile Arg Arg Asp Gly Leu Leu LeuMet Glu Asn Lys Leu Phe Ala Gly Ile Arg Arg Asp Gly Leu Leu Leu
850 855 860 850 855 860
Arg Leu Val Asp Asp Phe Leu Leu Val Thr Pro His Leu Thr His AlaArg Leu Val Asp Asp Phe Leu Leu Val Thr Pro His Leu Thr His Ala
865 870 875 880865 870 875 880
Lys Thr Phe Leu Arg Thr Leu Val Arg Gly Val Pro Glu Tyr Gly CysLys Thr Phe Leu Arg Thr Leu Val Arg Gly Val Pro Glu Tyr Gly Cys
885 890 895 885 890 895
Val Val Asn Leu Arg Lys Thr Val Val Asn Phe Pro Val Glu Asp GluVal Val Asn Leu Arg Lys Thr Val Val Asn Phe Pro Val Glu Asp Glu
900 905 910 900 905 910
Ala Leu Gly Gly Thr Ala Phe Val Gln Met Pro Ala His Gly Leu PheAla Leu Gly Gly Thr Ala Phe Val Gln Met Pro Ala His Gly Leu Phe
915 920 925 915 920 925
Pro Trp Cys Gly Leu Leu Leu Asp Thr Arg Thr Leu Glu Val Gln SerPro Trp Cys Gly Leu Leu Leu Asp Thr Arg Thr Leu Glu Val Gln Ser
930 935 940 930 935 940
Asp Tyr Ser Ser Tyr Ala Arg Thr Ser Ile Arg Ala Ser Leu Thr PheAsp Tyr Ser Ser Tyr Ala Arg Thr Ser Ile Arg Ala Ser Leu Thr Phe
945 950 955 960945 950 955 960
Asn Arg Gly Phe Lys Ala Gly Arg Asn Met Arg Arg Lys Leu Phe GlyAsn Arg Gly Phe Lys Ala Gly Arg Asn Met Arg Arg Lys Leu Phe Gly
965 970 975 965 970 975
Val Leu Arg Leu Lys Cys His Ser Leu Phe Leu Asp Leu Gln Val AsnVal Leu Arg Leu Lys Cys His Ser Leu Phe Leu Asp Leu Gln Val Asn
980 985 990 980 985 990
Ser Leu Gln Thr Val Cys Thr Asn Ile Tyr Lys Ile Leu Leu Leu GlnSer Leu Gln Thr Val Cys Thr Asn Ile Tyr Lys Ile Leu Leu Leu Gln
995 1000 1005 995 1000 1005
Ala Tyr Arg Phe His Ala Cys Val Leu Gln Leu Pro Phe His GlnAla Tyr Arg Phe His Ala Cys Val Leu Gln Leu Pro Phe His Gln
1010 1015 1020 1010 1015 1020
Gln Val Trp Lys Asn Pro Thr Phe Phe Leu Arg Val Ile Ser AspGln Val Trp Lys Asn Pro Thr Phe Phe Leu Arg Val Ile Ser Asp
1025 1030 1035 1025 1030 1035
Thr Ala Ser Leu Cys Tyr Ser Ile Leu Lys Ala Lys Asn Ala GlyThr Ala Ser Leu Cys Tyr Ser Ile Leu Lys Ala Lys Asn Ala Gly
1040 1045 1050 1040 1045 1050
Met Ser Leu Gly Ala Lys Gly Ala Ala Gly Pro Leu Pro Ser GluMet Ser Leu Gly Ala Lys Gly Ala Ala Gly Pro Leu Pro Ser Glu
1055 1060 1065 1055 1060 1065
Ala Val Gln Trp Leu Cys His Gln Ala Phe Leu Leu Lys Leu ThrAla Val Gln Trp Leu Cys His Gln Ala Phe Leu Leu Lys Leu Thr
1070 1075 1080 1070 1075 1080
Arg His Arg Val Thr Tyr Val Pro Leu Leu Gly Ser Leu Arg ThrArg His Arg Val Thr Tyr Val Pro Leu Leu Gly Ser Leu Arg Thr
1085 1090 1095 1085 1090 1095
Ala Gln Thr Gln Leu Ser Arg Lys Leu Pro Gly Thr Thr Leu ThrAla Gln Thr Gln Leu Ser Arg Lys Leu Pro Gly Thr Thr Leu Thr
1100 1105 1110 1100 1105 1110
Ala Leu Glu Ala Ala Ala Asn Pro Ala Leu Pro Ser Asp Phe LysAla Leu Glu Ala Ala Ala Asn Pro Ala Leu Pro Ser Asp Phe Lys
1115 1120 1125 1115 1120 1125
Thr Ile Leu AspTh Ile Leu Asp
1130 1130
<210> 285<210> 285
<211> 253<211> 253
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 285<400> 285
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GlnGlu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ala Ile Ser Gly Asp Ser Met Leu Ser AsnThr Leu Ser Leu Thr Cys Ala Ile Ser Gly Asp Ser Met Leu Ser Asn
20 25 30 20 25 30
Ser Asp Thr Trp Asn Trp Ile Arg Gln Ser Pro Ser Arg Gly Leu GluSer Asp Thr Trp Asn Trp Ile Arg Gln Ser Pro Ser Arg Gly Leu Glu
35 40 45 35 40 45
Trp Leu Gly Arg Thr Tyr His Arg Ser Thr Trp Tyr Asp Asp Tyr AlaTrp Leu Gly Arg Thr Tyr His Arg Ser Thr Trp Tyr Asp Asp Tyr Ala
50 55 60 50 55 60
Ser Ser Val Arg Gly Arg Val Ser Ile Asn Val Asp Thr Ser Lys AsnSer Ser Val Arg Gly Arg Val Ser Ile Asn Val Asp Thr Ser Lys Asn
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Tyr Ser Leu Gln Leu Asn Ala Val Thr Pro Glu Asp Thr Gly ValGln Tyr Ser Leu Gln Leu Asn Ala Val Thr Pro Glu Asp Thr Gly Val
85 90 95 85 90 95
Tyr Tyr Cys Ala Arg Val Arg Leu Gln Asp Gly Asn Ser Trp Ser AspTyr Tyr Cys Ala Arg Val Arg Leu Gln Asp Gly Asn Ser Trp Ser Asp
100 105 110 100 105 110
Ala Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser GlyAla Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln SerGly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser
130 135 140 130 135 140
Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Ala Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser ValAla Leu Thr Gln Pro Ala Ser Ala Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Val
145 150 155 160145 150 155 160
Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn TyrThr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr
165 170 175 165 170 175
Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met IleVal Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile
180 185 190 180 185 190
Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser GlyTyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly
195 200 205 195 200 205
Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln AlaSer Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala
210 215 220 210 215 220
Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser ThrGlu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr
225 230 235 240225 230 235 240
Leu Tyr Val Phe Gly Thr Gly Thr Gln Leu Thr Val LeuLeu Tyr Val Phe Gly Thr Gly Thr Gln Leu Thr Val Leu
245 250 245 250
<210> 286<210> 286
<211> 127<211> 127
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 286<400> 286
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GlnGlu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ala Ile Ser Gly Asp Ser Met Leu Ser AsnThr Leu Ser Leu Thr Cys Ala Ile Ser Gly Asp Ser Met Leu Ser Asn
20 25 30 20 25 30
Ser Asp Thr Trp Asn Trp Ile Arg Gln Ser Pro Ser Arg Gly Leu GluSer Asp Thr Trp Asn Trp Ile Arg Gln Ser Pro Ser Arg Gly Leu Glu
35 40 45 35 40 45
Trp Leu Gly Arg Thr Tyr His Arg Ser Thr Trp Tyr Asp Asp Tyr AlaTrp Leu Gly Arg Thr Tyr His Arg Ser Thr Trp Tyr Asp Asp Tyr Ala
50 55 60 50 55 60
Ser Ser Val Arg Gly Arg Val Ser Ile Asn Val Asp Thr Ser Lys AsnSer Ser Val Arg Gly Arg Val Ser Ile Asn Val Asp Thr Ser Lys Asn
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Tyr Ser Leu Gln Leu Asn Ala Val Thr Pro Glu Asp Thr Gly ValGln Tyr Ser Leu Gln Leu Asn Ala Val Thr Pro Glu Asp Thr Gly Val
85 90 95 85 90 95
Tyr Tyr Cys Ala Arg Val Arg Leu Gln Asp Gly Asn Ser Trp Ser AspTyr Tyr Cys Ala Arg Val Arg Leu Gln Asp Gly Asn Ser Trp Ser Asp
100 105 110 100 105 110
Ala Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser SerAla Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser
115 120 125 115 120 125
<210> 287<210> 287
<211> 111<211> 111
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 287<400> 287
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Ala Ser Gly Ser Pro Gly GlnGln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Ala Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly TyrSer Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuAsn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45 35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg PheMet Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly LeuSer Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser SerGln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95 85 90 95
Ser Thr Leu Tyr Val Phe Gly Thr Gly Thr Gln Leu Thr Val LeuSer Thr Leu Tyr Val Phe Gly Thr Gly Thr Gln Leu Thr Val Leu
100 105 110 100 105 110
<210> 288<210> 288
<211> 12<211> 12
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 288<400> 288
Gly Asp Ser Met Leu Ser Asn Ser Asp Thr Trp AsnGly Asp Ser Met Leu Ser Asn Ser Asp Thr Trp Asn
1 5 10 1 5 10
<210> 289<210> 289
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 289<400> 289
Ser Asn Ser Asp Thr Trp AsnSer Asn Ser Asp Thr Trp Asn
1 5 1 5
<210> 290<210> 290
<211> 18<211> 18
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 290<400> 290
Arg Thr Tyr His Arg Ser Thr Trp Tyr Asp Asp Tyr Ala Ser Ser ValArg Thr Tyr His Arg Ser Thr Trp Tyr Asp Asp Tyr Ala Ser Ser Val
1 5 10 15 1 5 10 15
Arg GlyArg Gly
<210> 291<210> 291
<211> 15<211> 15
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 291<400> 291
Val Arg Leu Gln Asp Gly Asn Ser Trp Ser Asp Ala Phe Asp ValVal Arg Leu Gln Asp Gly Asn Ser Trp Ser Asp Ala Phe Asp Val
1 5 10 151 5 10 15
<210> 292<210> 292
<211> 465<211> 465
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 292<400> 292
Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu GlyAsp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrAsp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu GlnSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Gln
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Lys Leu Gln GluGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Lys Leu Gln Glu
115 120 125 115 120 125
Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr CysSer Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile ArgThr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg
145 150 155 160145 150 155 160
Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly SerGln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser
165 170 175 165 170 175
Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile IleGlu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile
180 185 190 180 185 190
Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu GlnLys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln
195 200 205 195 200 205
Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr GlyThr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr ValGly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val
225 230 235 240225 230 235 240
Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro ThrSer Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr
245 250 255 245 250 255
Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro AlaIle Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala
260 265 270 260 265 270
Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp IleAla Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile
275 280 285 275 280 285
Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu SerTyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser
290 295 300 290 295 300
Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu TyrLeu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr
305 310 315 320305 310 315 320
Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu GluIle Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu
325 330 335 325 330 335
Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys GluAsp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu
340 345 350 340 345 350
Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys GlnLeu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln
355 360 365 355 360 365
Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu GluGly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu
370 375 380 370 375 380
Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly GlyTyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu GlnLys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln
405 410 415 405 410 415
Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly GluLys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu
420 425 430 420 425 430
Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser ThrArg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr
435 440 445 435 440 445
Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro ProAla Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro
450 455 460 450 455 460
ArgArg
465465
<210> 293<210> 293
<211> 242<211> 242
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 293<400> 293
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln GluGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu
115 120 125 115 120 125
Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr CysSer Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile ArgThr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg
145 150 155 160145 150 155 160
Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly SerGln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser
165 170 175 165 170 175
Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile SerGlu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser
180 185 190 180 185 190
Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val ThrLys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr
195 200 205 195 200 205
Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr GlyAla Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr ValGly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val
225 230 235 240225 230 235 240
Ser SerSer Ser
<210> 294<210> 294
<211> 465<211> 465
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 294<400> 294
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln GluGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu
115 120 125 115 120 125
Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr CysSer Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile ArgThr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg
145 150 155 160145 150 155 160
Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly SerGln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser
165 170 175 165 170 175
Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile SerGlu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser
180 185 190 180 185 190
Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val ThrLys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr
195 200 205 195 200 205
Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr GlyAla Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr ValGly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val
225 230 235 240225 230 235 240
Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro ThrSer Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr
245 250 255 245 250 255
Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro AlaIle Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala
260 265 270 260 265 270
Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp IleAla Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile
275 280 285 275 280 285
Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu SerTyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser
290 295 300 290 295 300
Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu TyrLeu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr
305 310 315 320305 310 315 320
Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu GluIle Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu
325 330 335 325 330 335
Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys GluAsp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu
340 345 350 340 345 350
Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys GlnLeu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln
355 360 365 355 360 365
Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu GluGly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu
370 375 380 370 375 380
Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly GlyTyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu GlnLys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln
405 410 415 405 410 415
Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly GluLys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu
420 425 430 420 425 430
Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser ThrArg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr
435 440 445 435 440 445
Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro ProAla Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro
450 455 460 450 455 460
ArgArg
465465
<210> 295<210> 295
<211> 5<211> 5
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 295<400> 295
Asp Tyr Gly Val SerAsp Tyr Gly Val Ser
1 51 5
<210> 296<210> 296
<211> 16<211> 16
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 296<400> 296
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser
1 5 10 15 1 5 10 15
<210> 297<210> 297
<211> 12<211> 12
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 297<400> 297
His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrHis Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 298<210> 298
<211> 11<211> 11
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 298<400> 298
Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu AsnArg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn
1 5 10 1 5 10
<210> 299<210> 299
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 299<400> 299
His Thr Ser Arg Leu His SerHis Thr Ser Arg Leu His Ser
1 5 1 5
<210> 300<210> 300
<211> 9<211> 9
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 300<400> 300
Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr ThrGln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr
1 5 1 5
<210> 301<210> 301
<211> 486<211> 486
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 301<400> 301
Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu LeuMet Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Ala Ala Arg Pro Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser LeuHis Ala Ala Arg Pro Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu
20 25 30 20 25 30
Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser GlnSer Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln
35 40 45 35 40 45
Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly ThrAsp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr
50 55 60 50 55 60
Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val ProVal Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr IleSer Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile
85 90 95 85 90 95
Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln GlySer Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly
100 105 110 100 105 110
Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile ThrAsn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GluGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu
130 135 140 130 135 140
Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln SerVal Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr GlyLeu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly
165 170 175 165 170 175
Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu GlyVal Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly
180 185 190 180 185 190
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser
195 200 205 195 200 205
Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu LysArg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys
210 215 220 210 215 220
Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala LysMet Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys
225 230 235 240225 230 235 240
His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln GlyHis Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
245 250 255 245 250 255
Thr Ser Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro ProThr Ser Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro
260 265 270 260 265 270
Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro GluThr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu
275 280 285 275 280 285
Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu AspAla Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp
290 295 300 290 295 300
Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys GlyPhe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly
305 310 315 320305 310 315 320
Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly ArgVal Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg
325 330 335 325 330 335
Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val GlnLys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln
340 345 350 340 345 350
Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu GluThr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu
355 360 365 355 360 365
Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp AlaGlu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala
370 375 380 370 375 380
Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn LeuPro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu
385 390 395 400385 390 395 400
Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg AspGly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp
405 410 415 405 410 415
Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly LeuPro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu
420 425 430 420 425 430
Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu IleTyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile
435 440 445 435 440 445
Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu TyrGly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr
450 455 460 450 455 460
Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His MetGln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met
465 470 475 480465 470 475 480
Gln Ala Leu Pro Pro ArgGln Ala Leu Pro Pro Arg
485 485
<210> 302<210> 302
<211> 1458<211> 1458
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 302<400> 302
atggccttac cagtgaccgc cttgctcctg ccgctggcct tgctgctcca cgccgccagg 60atggccttac cagtgaccgc cttgctcctg ccgctggcct tgctgctcca cgccgccagg 60
ccggacatcc agatgacaca gactacatcc tccctgtctg cctctctggg agacagagtc 120ccggacatcc agatgacaca gactacatcc tccctgtctg cctctctggg agacagagtc 120
accatcagtt gcagggcaag tcaggacatt agtaaatatt taaattggta tcagcagaaa 180accatcagtt gcagggcaag tcaggacatt agtaaatatt taaattggta tcagcagaaa 180
ccagatggaa ctgttaaact cctgatctac catacatcaa gattacactc aggagtccca 240ccagatggaa ctgttaaact cctgatctac catacatcaa gattacactc aggagtccca 240
tcaaggttca gtggcagtgg gtctggaaca gattattctc tcaccattag caacctggag 300tcaaggttca gtggcagtgg gtctggaaca gattattctc tcaccattag caacctggag 300
caagaagata ttgccactta cttttgccaa cagggtaata cgcttccgta cacgttcgga 360caagaagata ttgccactta cttttgccaa cagggtaata cgcttccgta cacgttcgga 360
ggggggacca agctggagat cacaggtggc ggtggctcgg gcggtggtgg gtcgggtggc 420ggggggacca agctggagat cacaggtggc ggtggctcgg gcggtggtgg gtcgggtggc 420
ggcggatctg aggtgaaact gcaggagtca ggacctggcc tggtggcgcc ctcacagagc 480ggcggatctg aggtgaaact gcaggagtca ggacctggcc tggtggcgcc ctcacagagc 480
ctgtccgtca catgcactgt ctcaggggtc tcattacccg actatggtgt aagctggatt 540ctgtccgtca catgcactgt ctcaggggtc tcattacccg actatggtgt aagctggatt 540
cgccagcctc cacgaaaggg tctggagtgg ctgggagtaa tatggggtag tgaaaccaca 600cgccagcctc cacgaaaggg tctggagtgg ctgggagtaa tatggggtag tgaaaccaca 600
tactataatt cagctctcaa atccagactg accatcatca aggacaactc caagagccaa 660tactataatt cagctctcaa atccagactg accatcatca aggacaactc caagagccaa 660
gttttcttaa aaatgaacag tctgcaaact gatgacacag ccatttacta ctgtgccaaa 720gttttcttaa aaatgaacag tctgcaaact gatgacacag ccatttacta ctgtgccaaa 720
cattattact acggtggtag ctatgctatg gactactggg gccaaggaac ctcagtcacc 780cattattact acggtggtag ctatgctatg gactactggg gccaaggaac ctcagtcacc 780
gtctcctcaa ccacgacgcc agcgccgcga ccaccaacac cggcgcccac catcgcgtcg 840gtctcctcaa ccacgacgcc agcgccgcga ccaccaacac cggcgcccac catcgcgtcg 840
cagcccctgt ccctgcgccc agaggcgtgc cggccagcgg cggggggcgc agtgcacacg 900cagcccctgt ccctgcgccc agaggcgtgc cggccagcgg cggggggcgc agtgcacacg 900
agggggctgg acttcgcctg tgatatctac atctgggcgc ccttggccgg gacttgtggg 960aggggctgg acttcgcctg tgatatctac atctgggcgc ccttggccgg gacttgtggg 960
gtccttctcc tgtcactggt tatcaccctt tactgcaaac ggggcagaaa gaaactcctg 1020gtccttctcc tgtcactggt tatcaccctt tactgcaaac ggggcagaaa gaaactcctg 1020
tatatattca aacaaccatt tatgagacca gtacaaacta ctcaagagga agatggctgt 1080tatatattca aacaaccatt tatgagacca gtacaaacta ctcaagagga agatggctgt 1080
agctgccgat ttccagaaga agaagaagga ggatgtgaac tgagagtgaa gttcagcagg 1140agctgccgat ttccagaaga agaagaagga ggatgtgaac tgagagtgaa gttcagcagg 1140
agcgcagacg cccccgcgta caagcagggc cagaaccagc tctataacga gctcaatcta 1200agcgcagacg cccccgcgta caagcagggc cagaaccagc tctataacga gctcaatcta 1200
ggacgaagag aggagtacga tgttttggac aagagacgtg gccgggaccc tgagatgggg 1260ggacgaagag aggagtacga tgttttggac aagagacgtg gccgggaccc tgagatgggg 1260
ggaaagccga gaaggaagaa ccctcaggaa ggcctgtaca atgaactgca gaaagataag 1320ggaaagccga gaaggaagaa ccctcaggaa ggcctgtaca atgaactgca gaaagataag 1320
atggcggagg cctacagtga gattgggatg aaaggcgagc gccggagggg caaggggcac 1380atggcggagg cctacagtga gattgggatg aaaggcgagc gccggagggg caaggggcac 1380
gatggccttt accagggtct cagtacagcc accaaggaca cctacgacgc ccttcacatg 1440gatggccttt accagggtct cagtacagcc accaaggaca cctacgacgc ccttcacatg 1440
caggccctgc cccctcgc 1458caggccctgc cccctcgc 1458
<210> 303<210> 303
<211> 242<211> 242
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 303<400> 303
Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu GlyAsp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrAsp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu GlnSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Gln
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Lys Leu Gln GluGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Lys Leu Gln Glu
115 120 125 115 120 125
Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr CysSer Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile ArgThr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg
145 150 155 160145 150 155 160
Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly SerGln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser
165 170 175 165 170 175
Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile IleGlu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile
180 185 190 180 185 190
Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu GlnLys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln
195 200 205 195 200 205
Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr GlyThr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr ValGly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val
225 230 235 240225 230 235 240
Ser SerSer Ser
<210> 304<210> 304
<211> 16<211> 16
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 304<400> 304
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15 1 5 10 15
<210> 305<210> 305
<211> 726<211> 726
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 305<400> 305
gaaattgtga tgacccagtc acccgccact cttagccttt cacccggtga gcgcgcaacc 60gaaattgtga tgacccagtc acccgccact cttagccttt cacccggtga gcgcgcaacc 60
ctgtcttgca gagcctccca agacatctca aaatacctta attggtatca acagaagccc 120ctgtcttgca gagcctccca agacatctca aaatacctta attggtatca acagaagccc 120
ggacaggctc ctcgccttct gatctaccac accagccggc tccattctgg aatccctgcc 180ggacaggctc ctcgccttct gatctaccac accagccggc tccattctgg aatccctgcc 180
aggttcagcg gtagcggatc tgggaccgac tacaccctca ctatcagctc actgcagcca 240aggttcagcg gtagcggatc tgggaccgac tacaccctca ctatcagctc actgcagcca 240
gaggacttcg ctgtctattt ctgtcagcaa gggaacaccc tgccctacac ctttggacag 300gaggacttcg ctgtctattt ctgtcagcaa gggaacaccc tgccctacac ctttggacag 300
ggcaccaagc tcgagattaa aggtggaggt ggcagcggag gaggtgggtc cggcggtgga 360ggcaccaagc tcgagattaa aggtggaggt ggcagcggag gaggtgggtc cggcggtgga 360
ggaagccagg tccaactcca agaaagcgga ccgggtcttg tgaagccatc agaaactctt 420ggaagccagg tccaactcca agaaagcgga ccgggtcttg tgaagccatc agaaactctt 420
tcactgactt gtactgtgag cggagtgtct ctccccgatt acggggtgtc ttggatcaga 480tcactgactt gtactgtgag cggagtgtct ctccccgatt acggggtgtc ttggatcaga 480
cagccaccgg ggaagggtct ggaatggatt ggagtgattt ggggctctga gactacttac 540cagccaccgg ggaagggtct ggaatggatt ggagtgattt ggggctctga gactacttac 540
taccaatcat ccctcaagtc acgcgtcacc atctcaaagg acaactctaa gaatcaggtg 600taccaatcat ccctcaagtc acgcgtcacc atctcaaagg acaactctaa gaatcaggtg 600
tcactgaaac tgtcatctgt gaccgcagcc gacaccgccg tgtactattg cgctaagcat 660tcactgaaac tgtcatctgt gaccgcagcc gacaccgccg tgtactattg cgctaagcat 660
tactattatg gcgggagcta cgcaatggat tactggggac agggtactct ggtcaccgtg 720tactattatg gcgggagcta cgcaatggat tactggggac agggtactct ggtcaccgtg 720
tccagc 726tccagc 726
<210> 306<210> 306
<211> 486<211> 486
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 306<400> 306
Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu LeuMet Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr LeuHis Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu
20 25 30 20 25 30
Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser GlnSer Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln
35 40 45 35 40 45
Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln AlaAsp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala
50 55 60 50 55 60
Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile ProPro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr IleAla Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile
85 90 95 85 90 95
Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln GlySer Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly
100 105 110 100 105 110
Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile LysAsn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
130 135 140 130 135 140
Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu ThrVal Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr GlyLeu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly
165 170 175 165 170 175
Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile GlyVal Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly
180 185 190 180 185 190
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser
195 200 205 195 200 205
Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu LysArg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys
210 215 220 210 215 220
Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala LysLeu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys
225 230 235 240225 230 235 240
His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln GlyHis Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
245 250 255 245 250 255
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro ProThr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro
260 265 270 260 265 270
Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro GluThr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu
275 280 285 275 280 285
Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu AspAla Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp
290 295 300 290 295 300
Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys GlyPhe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly
305 310 315 320305 310 315 320
Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly ArgVal Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg
325 330 335 325 330 335
Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val GlnLys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln
340 345 350 340 345 350
Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu GluThr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu
355 360 365 355 360 365
Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp AlaGlu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala
370 375 380 370 375 380
Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn LeuPro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu
385 390 395 400385 390 395 400
Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg AspGly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp
405 410 415 405 410 415
Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly LeuPro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu
420 425 430 420 425 430
Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu IleTyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile
435 440 445 435 440 445
Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu TyrGly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr
450 455 460 450 455 460
Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His MetGln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met
465 470 475 480465 470 475 480
Gln Ala Leu Pro Pro ArgGln Ala Leu Pro Pro Arg
485 485
<210> 307<210> 307
<211> 1458<211> 1458
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 307<400> 307
atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60
cccgaaattg tgatgaccca gtcacccgcc actcttagcc tttcacccgg tgagcgcgca 120cccgaaattg tgatgaccca gtcacccgcc actcttagcc tttcacccgg tgagcgcgca 120
accctgtctt gcagagcctc ccaagacatc tcaaaatacc ttaattggta tcaacagaag 180accctgtctt gcagagcctc ccaagacatc tcaaaatacc ttaattggta tcaacagaag 180
cccggacagg ctcctcgcct tctgatctac cacaccagcc ggctccattc tggaatccct 240cccggacagg ctcctcgcct tctgatctac cacaccagcc ggctccattc tggaatccct 240
gccaggttca gcggtagcgg atctgggacc gactacaccc tcactatcag ctcactgcag 300gccaggttca gcggtagcgg atctgggacc gactacaccc tcactatcag ctcactgcag 300
ccagaggact tcgctgtcta tttctgtcag caagggaaca ccctgcccta cacctttgga 360ccagaggact tcgctgtcta tttctgtcag caagggaaca ccctgcccta cacctttgga 360
cagggcacca agctcgagat taaaggtgga ggtggcagcg gaggaggtgg gtccggcggt 420cagggcacca agctcgagat taaaggtgga ggtggcagcg gaggaggtgg gtccggcggt 420
ggaggaagcc aggtccaact ccaagaaagc ggaccgggtc ttgtgaagcc atcagaaact 480gggaggaagcc aggtccaact ccaagaaagc ggaccgggtc ttgtgaagcc atcagaaact 480
ctttcactga cttgtactgt gagcggagtg tctctccccg attacggggt gtcttggatc 540ctttcactga cttgtactgt gagcggagtg tctctccccg attacggggt gtcttggatc 540
agacagccac cggggaaggg tctggaatgg attggagtga tttggggctc tgagactact 600agacagccac cggggaaggg tctggaatgg attggagtga tttggggctc tgagactact 600
tactaccaat catccctcaa gtcacgcgtc accatctcaa aggacaactc taagaatcag 660tactaccaat catccctcaa gtcacgcgtc accatctcaa aggacaactc taagaatcag 660
gtgtcactga aactgtcatc tgtgaccgca gccgacaccg ccgtgtacta ttgcgctaag 720gtgtcactga aactgtcatc tgtgaccgca gccgacaccg ccgtgtacta ttgcgctaag 720
cattactatt atggcgggag ctacgcaatg gattactggg gacagggtac tctggtcacc 780cattactatt atggcgggag ctacgcaatg gattactggg gacagggtac tctggtcacc 780
gtgtccagca ccactacccc agcaccgagg ccacccaccc cggctcctac catcgcctcc 840gtgtccagca ccactacccc agcaccgagg ccacccaccc cggctcctac catcgcctcc 840
cagcctctgt ccctgcgtcc ggaggcatgt agacccgcag ctggtggggc cgtgcatacc 900cagcctctgt ccctgcgtcc ggaggcatgt agacccgcag ctggtggggc cgtgcatacc 900
cggggtcttg acttcgcctg cgatatctac atttgggccc ctctggctgg tacttgcggg 960cggggtcttg acttcgcctg cgatatctac atttgggccc ctctggctgg tacttgcggg 960
gtcctgctgc tttcactcgt gatcactctt tactgtaagc gcggtcggaa gaagctgctg 1020gtcctgctgc tttcactcgt gatcactctt tactgtaagc gcggtcggaa gaagctgctg 1020
tacatcttta agcaaccctt catgaggcct gtgcagacta ctcaagagga ggacggctgt 1080tacatcttta agcaaccctt catgaggcct gtgcagacta ctcaagagga ggacggctgt 1080
tcatgccggt tcccagagga ggaggaaggc ggctgcgaac tgcgcgtgaa attcagccgc 1140tcatgccggt tcccagagga gggaggaaggc ggctgcgaac tgcgcgtgaa attcagccgc 1140
agcgcagatg ctccagccta caagcagggg cagaaccagc tctacaacga actcaatctt 1200agcgcagatg ctccagccta caagcagggg cagaaccagc tctacaacga actcaatctt 1200
ggtcggagag aggagtacga cgtgctggac aagcggagag gacgggaccc agaaatgggc 1260ggtcggagag aggagtacga cgtgctggac aagcggagag gacgggaccc agaaatgggc 1260
gggaagccgc gcagaaagaa tccccaagag ggcctgtaca acgagctcca aaaggataag 1320gggaagccgc gcagaaagaa tccccaagag ggcctgtaca acgagctcca aaaggataag 1320
atggcagaag cctatagcga gattggtatg aaaggggaac gcagaagagg caaaggccac 1380atggcagaag cctatagcga gattggtatg aaaggggaac gcagaagagg caaaggccac 1380
gacggactgt accagggact cagcaccgcc accaaggaca cctatgacgc tcttcacatg 1440gacggactgt accagggact cagcaccgcc accaaggaca cctatgacgc tcttcacatg 1440
caggccctgc cgcctcgg 1458caggccctgc cgcctcgg 1458
<210> 308<210> 308
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 308<400> 308
Leu Ala Glu Ala Ala Ala LysLeu Ala Glu Ala Ala Ala Lys
1 5 1 5
<210> 309<210> 309
<211> 284<211> 284
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 309<400> 309
Asn Trp Val Asn Val Ile Ser Asp Leu Lys Lys Ile Glu Asp Leu IleAsn Trp Val Asn Val Ile Ser Asp Leu Lys Lys Ile Glu Asp Leu Ile
1 5 10 15 1 5 10 15
Gln Ser Met His Ile Asp Ala Thr Leu Tyr Thr Glu Ser Asp Val HisGln Ser Met His Ile Asp Ala Thr Leu Tyr Thr Glu Ser Asp Val His
20 25 30 20 25 30
Pro Ser Cys Lys Val Thr Ala Met Lys Cys Phe Leu Leu Glu Leu GlnPro Ser Cys Lys Val Thr Ala Met Lys Cys Phe Leu Leu Glu Leu Gln
35 40 45 35 40 45
Val Ile Ser Leu Glu Ser Gly Asp Ala Ser Ile His Asp Thr Val GluVal Ile Ser Leu Glu Ser Gly Asp Ala Ser Ile His Asp Thr Val Glu
50 55 60 50 55 60
Asn Leu Ile Ile Leu Ala Asn Asn Ser Leu Ser Ser Asn Gly Asn ValAsn Leu Ile Ile Leu Ala Asn Asn Ser Leu Ser Ser Asn Gly Asn Val
65 70 75 8065 70 75 80
Thr Glu Ser Gly Cys Lys Glu Cys Glu Glu Leu Glu Glu Lys Asn IleThr Glu Ser Gly Cys Lys Glu Cys Glu Glu Leu Glu Glu Lys Asn Ile
85 90 95 85 90 95
Lys Glu Phe Leu Gln Ser Phe Val His Ile Val Gln Met Phe Ile AsnLys Glu Phe Leu Gln Ser Phe Val His Ile Val Gln Met Phe Ile Asn
100 105 110 100 105 110
Thr Ser Ile Thr Cys Pro Pro Pro Met Ser Val Glu His Ala Asp IleThr Ser Ile Thr Cys Pro Pro Pro Met Ser Val Glu His Ala Asp Ile
115 120 125 115 120 125
Trp Val Lys Ser Tyr Ser Leu Tyr Ser Arg Glu Arg Tyr Ile Cys AsnTrp Val Lys Ser Tyr Ser Leu Tyr Ser Arg Glu Arg Tyr Ile Cys Asn
130 135 140 130 135 140
Ser Gly Phe Lys Arg Lys Ala Gly Thr Ser Ser Leu Thr Glu Cys ValSer Gly Phe Lys Arg Lys Ala Gly Thr Ser Ser Leu Thr Glu Cys Val
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Asn Lys Ala Thr Asn Val Ala His Trp Thr Thr Pro Ser Leu LysLeu Asn Lys Ala Thr Asn Val Ala His Trp Thr Thr Pro Ser Leu Lys
165 170 175 165 170 175
Cys Ile Arg Asp Pro Ala Leu Val His Gln Arg Pro Ala Pro Pro SerCys Ile Arg Asp Pro Ala Leu Val His Gln Arg Pro Ala Pro Pro Ser
180 185 190 180 185 190
Thr Val Thr Thr Ala Gly Val Thr Pro Gln Pro Glu Ser Leu Ser ProThr Val Thr Thr Ala Gly Val Thr Pro Gln Pro Glu Ser Leu Ser Pro
195 200 205 195 200 205
Ser Gly Lys Glu Pro Ala Ala Ser Ser Pro Ser Ser Asn Asn Thr AlaSer Gly Lys Glu Pro Ala Ala Ser Ser Pro Ser Ser Asn Asn Thr Ala
210 215 220 210 215 220
Ala Thr Thr Ala Ala Ile Val Pro Gly Ser Gln Leu Met Pro Ser LysAla Thr Thr Ala Ala Ile Val Pro Gly Ser Gln Leu Met Pro Ser Lys
225 230 235 240225 230 235 240
Ser Pro Ser Thr Gly Thr Thr Glu Ile Ser Ser His Glu Ser Ser HisSer Pro Ser Thr Gly Thr Thr Glu Ile Ser Ser His Glu Ser Ser His
245 250 255 245 250 255
Gly Thr Pro Ser Gln Thr Thr Ala Lys Asn Trp Glu Leu Thr Ala SerGly Thr Pro Ser Gln Thr Thr Ala Lys Asn Trp Glu Leu Thr Ala Ser
260 265 270 260 265 270
Ala Ser His Gln Pro Pro Gly Val Tyr Pro Gln GlyAla Ser His Gln Pro Pro Gly Val Tyr Pro Gln Gly
275 280 275 280
<210> 310<210> 310
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 310<400> 310
Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrGly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
1 5 1 5
<210> 311<210> 311
<211> 5<211> 5
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 311<400> 311
Trp Gly Ser Glu ThrTrpGlySerGluThr
1 51 5
<210> 312<210> 312
<211> 8<211> 8
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 312<400> 312
Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr GlyGly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly
1 5 1 5
<210> 313<210> 313
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 313<400> 313
Ile Trp Gly Ser Glu Thr ThrIle Trp Gly Ser Glu Thr Thr
1 5 1 5
<210> 314<210> 314
<211> 14<211> 14
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 314<400> 314
Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrAla Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
1 5 10 1 5 10
<210> 315<210> 315
<211> 360<211> 360
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 315<400> 315
caggtccaac tccaagaaag cggaccgggt cttgtgaagc catcagaaac tctttcactg 60caggtccaac tccaagaaag cggaccgggt cttgtgaagc catcagaaac tctttcactg 60
acttgtactg tgagcggagt gtctctcccc gattacgggg tgtcttggat cagacagcca 120acttgtactg tgagcggagt gtctctcccc gattacgggg tgtcttggat cagacagcca 120
ccggggaagg gtctggaatg gattggagtg atttggggct ctgagactac ttactaccaa 180ccggggaagg gtctggaatg gattggagtg atttggggct ctgagactac ttactaccaa 180
tcatccctca agtcacgcgt caccatctca aaggacaact ctaagaatca ggtgtcactg 240tcatccctca agtcacgcgt caccatctca aaggacaact ctaagaatca ggtgtcactg 240
aaactgtcat ctgtgaccgc agccgacacc gccgtgtact attgcgctaa gcattactat 300aaactgtcat ctgtgaccgc agccgacacc gccgtgtact attgcgctaa gcattactat 300
tatggcggga gctacgcaat ggattactgg ggacagggta ctctggtcac cgtgtccagc 360tatggcggga gctacgcaat ggattactgg ggacagggta ctctggtcac cgtgtccagc 360
<210> 316<210> 316
<211> 7<211> 7
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 316<400> 316
Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrSer Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
1 5 1 5
<210> 317<210> 317
<211> 3<211> 3
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 317<400> 317
His Thr SerHis Thr Ser
1 1
<210> 318<210> 318
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 318<400> 318
Gly Asn Thr Leu Pro TyrGly Asn Thr Leu Pro Tyr
1 5 1 5
<210> 319<210> 319
<211> 6<211> 6
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 319<400> 319
Gln Asp Ile Ser Lys TyrGln Asp Ile Ser Lys Tyr
1 5 1 5
<210> 320<210> 320
<211> 321<211> 321
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 320<400> 320
gaaattgtga tgacccagtc acccgccact cttagccttt cacccggtga gcgcgcaacc 60gaaattgtga tgacccagtc acccgccact cttagccttt cacccggtga gcgcgcaacc 60
ctgtcttgca gagcctccca agacatctca aaatacctta attggtatca acagaagccc 120ctgtcttgca gagcctccca agacatctca aaatacctta attggtatca acagaagccc 120
ggacaggctc ctcgccttct gatctaccac accagccggc tccattctgg aatccctgcc 180ggacaggctc ctcgccttct gatctaccac accagccggc tccattctgg aatccctgcc 180
aggttcagcg gtagcggatc tgggaccgac tacaccctca ctatcagctc actgcagcca 240aggttcagcg gtagcggatc tgggaccgac tacaccctca ctatcagctc actgcagcca 240
gaggacttcg ctgtctattt ctgtcagcaa gggaacaccc tgccctacac ctttggacag 300gaggacttcg ctgtctattt ctgtcagcaa gggaacaccc tgccctacac ctttggacag 300
ggcaccaagc tcgagattaa a 321ggcaccaagc tcgagattaa a 321
<210> 321<210> 321
<211> 491<211> 491
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 321<400> 321
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser AlaGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala
115 120 125 115 120 125
Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile ThrLeu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr
130 135 140 130 135 140
Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr ValIle Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val
145 150 155 160145 150 155 160
Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile TyrSer Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr
165 170 175 165 170 175
Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly SerAsp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser
180 185 190 180 185 190
Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala GluLys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu
195 200 205 195 200 205
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr LeuAsp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu
210 215 220 210 215 220
Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly Gly Gly GlyTyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly Gly Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerSer Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
245 250 255 245 250 255
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
260 265 270 260 265 270
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
275 280 285 275 280 285
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
290 295 300 290 295 300
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
305 310 315 320305 310 315 320
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
325 330 335 325 330 335
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
340 345 350 340 345 350
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
355 360 365 355 360 365
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
370 375 380 370 375 380
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
405 410 415 405 410 415
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
420 425 430 420 425 430
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
435 440 445 435 440 445
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
450 455 460 450 455 460
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Thr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile LysThr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
485 490 485 490
<210> 322<210> 322
<211> 491<211> 491
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 322<400> 322
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
115 120 125 115 120 125
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
130 135 140 130 135 140
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
145 150 155 160145 150 155 160
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
165 170 175 165 170 175
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
180 185 190 180 185 190
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
195 200 205 195 200 205
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
210 215 220 210 215 220
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
245 250 255 245 250 255
Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln SerSer Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser
260 265 270 260 265 270
Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr AsnIle Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn
275 280 285 275 280 285
Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu MetTyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met
290 295 300 290 295 300
Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe SerIle Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser
305 310 315 320305 310 315 320
Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu GlnGly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln
325 330 335 325 330 335
Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser SerAla Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser
340 345 350 340 345 350
Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly GlyThr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly Gly
355 360 365 355 360 365
Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val LysGly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys
370 375 380 370 375 380
Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser LeuPro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu
385 390 395 400385 390 395 400
Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys LeuPro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu
405 410 415 405 410 415
Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln SerGlu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser
420 425 430 420 425 430
Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn GlnSer Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln
435 440 445 435 440 445
Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val TyrVal Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr
450 455 460 450 455 460
Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrTyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
485 490 485 490
<210> 323<210> 323
<211> 491<211> 491
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 323<400> 323
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val GlnGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln
115 120 125 115 120 125
Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg Ser Leu ArgLeu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg Ser Leu Arg
130 135 140 130 135 140
Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Gly Met HisLeu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Gly Met His
145 150 155 160145 150 155 160
Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala Val IleTrp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala Val Ile
165 170 175 165 170 175
Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly ArgSer Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg
180 185 190 180 185 190
Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln MetPhe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met
195 200 205 195 200 205
Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Gly Gly SerAsn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Gly Gly Ser
210 215 220 210 215 220
Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val Trp Gly GlnGly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val Trp Gly Gln
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
245 250 255 245 250 255
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala LeuGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu
260 265 270 260 265 270
Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr IleThr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile
275 280 285 275 280 285
Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val SerSer Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser
290 295 300 290 295 300
Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr AspTrp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp
305 310 315 320305 310 315 320
Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser LysVal Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys
325 330 335 325 330 335
Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu AspSer Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp
340 345 350 340 345 350
Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu TyrGlu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr
355 360 365 355 360 365
Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly Gly Gly Gly SerVal Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly Gly Gly Gly Ser
370 375 380 370 375 380
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
405 410 415 405 410 415
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
420 425 430 420 425 430
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
435 440 445 435 440 445
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
450 455 460 450 455 460
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Thr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile LysThr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
485 490 485 490
<210> 324<210> 324
<211> 491<211> 491
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 324<400> 324
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly GlnGln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly TyrSer Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
130 135 140 130 135 140
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuAsn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
145 150 155 160145 150 155 160
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg PheMet Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
165 170 175 165 170 175
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly LeuSer Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
180 185 190 180 185 190
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser SerGln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
195 200 205 195 200 205
Ser Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu GlySer Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val GlnGly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln
245 250 255 245 250 255
Pro Gly Arg Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr PhePro Gly Arg Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe
260 265 270 260 265 270
Ser Ser Tyr Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly LeuSer Ser Tyr Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu
275 280 285 275 280 285
Glu Trp Val Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr AlaGlu Trp Val Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala
290 295 300 290 295 300
Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys AsnAsp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn
305 310 315 320305 310 315 320
Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala ValThr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val
325 330 335 325 330 335
Tyr Tyr Cys Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr GlyTyr Tyr Cys Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly
340 345 350 340 345 350
Leu Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly GlyLeu Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly
355 360 365 355 360 365
Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val LysGly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys
370 375 380 370 375 380
Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser LeuPro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu
385 390 395 400385 390 395 400
Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys LeuPro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu
405 410 415 405 410 415
Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln SerGlu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser
420 425 430 420 425 430
Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn GlnSer Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln
435 440 445 435 440 445
Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val TyrVal Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr
450 455 460 450 455 460
Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrTyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
485 490 485 490
<210> 325<210> 325
<211> 491<211> 491
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 325<400> 325
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
130 135 140 130 135 140
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
165 170 175 165 170 175
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
180 185 190 180 185 190
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
195 200 205 195 200 205
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
210 215 220 210 215 220
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
245 250 255 245 250 255
Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu ThrVal Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr
260 265 270 260 265 270
Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr GlyLeu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly
275 280 285 275 280 285
Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile GlyVal Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly
290 295 300 290 295 300
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser
305 310 315 320305 310 315 320
Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu LysArg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys
325 330 335 325 330 335
Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala LysLeu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys
340 345 350 340 345 350
His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln GlyHis Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
355 360 365 355 360 365
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala LeuThr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu
370 375 380 370 375 380
Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr IleThr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile
385 390 395 400385 390 395 400
Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val SerSer Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser
405 410 415 405 410 415
Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr AspTrp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp
420 425 430 420 425 430
Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser LysVal Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys
435 440 445 435 440 445
Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu AspSer Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp
450 455 460 450 455 460
Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu TyrGlu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val LeuVal Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
485 490 485 490
<210> 326<210> 326
<211> 491<211> 491
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 326<400> 326
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly GlnGln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly TyrSer Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuAsn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45 35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg PheMet Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly LeuSer Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser SerGln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95 85 90 95
Ser Thr Leu Tyr Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu GlySer Thr Leu Tyr Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu ValGly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val
115 120 125 115 120 125
Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val SerLys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser
130 135 140 130 135 140
Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys GlyLeu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr GlnLeu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln
165 170 175 165 170 175
Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys AsnSer Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn
180 185 190 180 185 190
Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala ValGln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val
195 200 205 195 200 205
Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met AspTyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp
210 215 220 210 215 220
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly GlyTyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerSer Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
245 250 255 245 250 255
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
260 265 270 260 265 270
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
275 280 285 275 280 285
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
290 295 300 290 295 300
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
305 310 315 320305 310 315 320
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
325 330 335 325 330 335
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
340 345 350 340 345 350
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
355 360 365 355 360 365
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
370 375 380 370 375 380
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
385 390 395 400385 390 395 400
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
405 410 415 405 410 415
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
420 425 430 420 425 430
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
435 440 445 435 440 445
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
450 455 460 450 455 460
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
465 470 475 480465 470 475 480
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
485 490 485 490
<210> 327<210> 327
<211> 491<211> 491
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 327<400> 327
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
130 135 140 130 135 140
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
145 150 155 160145 150 155 160
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
165 170 175 165 170 175
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
180 185 190 180 185 190
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
195 200 205 195 200 205
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
210 215 220 210 215 220
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
245 250 255 245 250 255
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val MetGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met
260 265 270 260 265 270
Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala ThrThr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr
275 280 285 275 280 285
Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp TyrLeu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr
290 295 300 290 295 300
Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr SerGln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser
305 310 315 320305 310 315 320
Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser GlyArg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly
325 330 335 325 330 335
Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe AlaThr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala
340 345 350 340 345 350
Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly GlnVal Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln
355 360 365 355 360 365
Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala LeuGly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu
370 375 380 370 375 380
Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr IleThr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile
385 390 395 400385 390 395 400
Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val SerSer Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser
405 410 415 405 410 415
Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr AspTrp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp
420 425 430 420 425 430
Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser LysVal Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys
435 440 445 435 440 445
Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu AspSer Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp
450 455 460 450 455 460
Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu TyrGlu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val LeuVal Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
485 490 485 490
<210> 328<210> 328
<211> 491<211> 491
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 328<400> 328
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly GlnGln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly TyrSer Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuAsn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45 35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg PheMet Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly LeuSer Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser SerGln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95 85 90 95
Ser Thr Leu Tyr Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu GlySer Thr Leu Tyr Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu SerGly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser
115 120 125 115 120 125
Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln AspLeu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp
130 135 140 130 135 140
Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala ProIle Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro
145 150 155 160145 150 155 160
Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro AlaArg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala
165 170 175 165 170 175
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile SerArg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser
180 185 190 180 185 190
Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly AsnSer Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn
195 200 205 195 200 205
Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys GlyThr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val LysGly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys
245 250 255 245 250 255
Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser LeuPro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu
260 265 270 260 265 270
Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly LeuPro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu
275 280 285 275 280 285
Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln SerGlu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser
290 295 300 290 295 300
Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn GlnSer Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln
305 310 315 320305 310 315 320
Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val TyrVal Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr
325 330 335 325 330 335
Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrTyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
340 345 350 340 345 350
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
355 360 365 355 360 365
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
370 375 380 370 375 380
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
385 390 395 400385 390 395 400
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
405 410 415 405 410 415
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
420 425 430 420 425 430
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
435 440 445 435 440 445
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
450 455 460 450 455 460
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
465 470 475 480465 470 475 480
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
485 490 485 490
<210> 329<210> 329
<211> 485<211> 485
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 329<400> 329
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile GlnGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln
115 120 125 115 120 125
Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg ValMet Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val
130 135 140 130 135 140
Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn TrpThr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp
145 150 155 160145 150 155 160
Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala AlaTyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala
165 170 175 165 170 175
Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly SerSer Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser
180 185 190 180 185 190
Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp PheGly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe
195 200 205 195 200 205
Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe GlyAla Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly
210 215 220 210 215 220
Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Gln LeuGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Gln Leu
245 250 255 245 250 255
Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg LeuLeu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu
260 265 270 260 265 270
Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Ala Met Ser TrpSer Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Ala Met Ser Trp
275 280 285 275 280 285
Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser Ala Ile SerVal Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser Ala Ile Ser
290 295 300 290 295 300
Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg PheGly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe
305 310 315 320305 310 315 320
Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met AsnThr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn
325 330 335 325 330 335
Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Arg GluSer Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Arg Glu
340 345 350 340 345 350
Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr LeuTrp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu
355 360 365 355 360 365
Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr GlnVal Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln
370 375 380 370 375 380
Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu SerSer Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser
385 390 395 400385 390 395 400
Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln GlnCys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln
405 410 415 405 410 415
Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg LeuLys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu
420 425 430 420 425 430
His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr AspHis Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp
435 440 445 435 440 445
Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val TyrTyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr
450 455 460 450 455 460
Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Cys Gly ThrPhe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Cys Gly Thr
465 470 475 480465 470 475 480
Lys Leu Glu Ile LysLys Leu Glu Ile Lys
485485
<210> 330<210> 330
<211> 485<211> 485
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 330<400> 330
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp GlyAla Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110 100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu IleGln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile
115 120 125 115 120 125
Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu ArgVal Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg
130 135 140 130 135 140
Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu AsnAla Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn
145 150 155 160145 150 155 160
Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr HisTrp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His
165 170 175 165 170 175
Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser GlyThr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly
180 185 190 180 185 190
Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu AspSer Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp
195 200 205 195 200 205
Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr PhePhe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe
210 215 220 210 215 220
Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val GlnGly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln
245 250 255 245 250 255
Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu SerLeu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser
260 265 270 260 265 270
Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val SerLeu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser
275 280 285 275 280 285
Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val IleTrp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile
290 295 300 290 295 300
Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg ValTrp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val
305 310 315 320305 310 315 320
Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu SerThr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser
325 330 335 325 330 335
Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His TyrSer Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr
340 345 350 340 345 350
Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr LeuTyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu
355 360 365 355 360 365
Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr GlnVal Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln
370 375 380 370 375 380
Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile ThrSer Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr
385 390 395 400385 390 395 400
Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln GlnCys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln
405 410 415 405 410 415
Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser LeuLys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu
420 425 430 420 425 430
Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr AspGln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp
435 440 445 435 440 445
Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr TyrPhe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr
450 455 460 450 455 460
Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly Cys Gly ThrTyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly Cys Gly Thr
465 470 475 480465 470 475 480
Lys Val Glu Ile LysLys Val Glu Ile Lys
485485
<210> 331<210> 331
<211> 120<211> 120
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 331<400> 331
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120115 120
<210> 332<210> 332
<211> 107<211> 107
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 332<400> 332
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile LysThr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 333<210> 333
<211> 123<211> 123
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 333<400> 333
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 334<210> 334
<211> 111<211> 111
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 334<400> 334
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly GlnGln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly TyrSer Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuAsn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45 35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg PheMet Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly LeuSer Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser SerGln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95 85 90 95
Ser Thr Leu Tyr Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val LeuSer Thr Leu Tyr Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
100 105 110 100 105 110
<210> 335<210> 335
<211> 121<211> 121
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 335<400> 335
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp GlyAla Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110 100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser SerGln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 115 120
<210> 336<210> 336
<211> 107<211> 107
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 336<400> 336
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val GlyAsp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser TyrAsp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser GlyTyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro LeuGlu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Glu Ile LysThr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 100 105
<210> 337<210> 337
<211> 135<211> 135
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 337<400> 337
accactaccc cagcaccgag gccacccacc ccggctccta ccatcgcctc ccagcctctg 60accactaccc cagcaccgag gccacccacc ccggctccta ccatcgcctc ccagcctctg 60
tccctgcgtc cggaggcatg tagacccgca gctggtgggg ccgtgcatac ccggggtctt 120tccctgcgtc cggaggcatg tagacccgca gctggtgggg ccgtgcatac ccggggtctt 120
gacttcgcct gcgat 135gacttcgcct gcgat 135
<210> 338<210> 338
<211> 72<211> 72
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 338<400> 338
atctacattt gggcccctct ggctggtact tgcggggtcc tgctgctttc actcgtgatc 60atctacattt gggcccctct ggctggtact tgcggggtcc tgctgctttc actcgtgatc 60
actctttact gt 72actctttact gt 72
<210> 339<210> 339
<211> 714<211> 714
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 339<400> 339
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser AlaGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala
115 120 125 115 120 125
Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile ThrLeu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr
130 135 140 130 135 140
Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr ValIle Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val
145 150 155 160145 150 155 160
Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile TyrSer Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr
165 170 175 165 170 175
Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly SerAsp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser
180 185 190 180 185 190
Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala GluLys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu
195 200 205 195 200 205
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr LeuAsp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu
210 215 220 210 215 220
Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly Gly Gly GlyTyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly Gly Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerSer Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
245 250 255 245 250 255
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
260 265 270 260 265 270
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
275 280 285 275 280 285
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
290 295 300 290 295 300
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
305 310 315 320305 310 315 320
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
325 330 335 325 330 335
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
340 345 350 340 345 350
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
355 360 365 355 360 365
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
370 375 380 370 375 380
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
405 410 415 405 410 415
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
420 425 430 420 425 430
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
435 440 445 435 440 445
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
450 455 460 450 455 460
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Thr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro AlaThr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala
485 490 495 485 490 495
Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu SerPro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser
500 505 510 500 505 510
Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His ThrLeu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr
515 520 525 515 520 525
Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu AlaArg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala
530 535 540 530 535 540
Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysGly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
545 550 555 560545 550 555 560
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
565 570 575 565 570 575
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
580 585 590 580 585 590
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser ArgPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg
595 600 605 595 600 605
Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr AsnSer Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn
610 615 620 610 615 620
Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys ArgGlu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg
625 630 635 640625 630 635 640
Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn ProArg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro
645 650 655 645 650 655
Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu AlaGln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala
660 665 670 660 665 670
Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly HisTyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His
675 680 685 675 680 685
Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr AspAsp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp
690 695 700 690 695 700
Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
705 710 705 710
<210> 340<210> 340
<211> 714<211> 714
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 340<400> 340
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
115 120 125 115 120 125
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
130 135 140 130 135 140
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
145 150 155 160145 150 155 160
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
165 170 175 165 170 175
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
180 185 190 180 185 190
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
195 200 205 195 200 205
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
210 215 220 210 215 220
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
245 250 255 245 250 255
Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln SerSer Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser
260 265 270 260 265 270
Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr AsnIle Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn
275 280 285 275 280 285
Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu MetTyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met
290 295 300 290 295 300
Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe SerIle Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser
305 310 315 320305 310 315 320
Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu GlnGly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln
325 330 335 325 330 335
Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser SerAla Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser
340 345 350 340 345 350
Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly GlyThr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly Gly
355 360 365 355 360 365
Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val LysGly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys
370 375 380 370 375 380
Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser LeuPro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu
385 390 395 400385 390 395 400
Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys LeuPro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu
405 410 415 405 410 415
Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln SerGlu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser
420 425 430 420 425 430
Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn GlnSer Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln
435 440 445 435 440 445
Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val TyrVal Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr
450 455 460 450 455 460
Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrTyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro AlaTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala
485 490 495 485 490 495
Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu SerPro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser
500 505 510 500 505 510
Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His ThrLeu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr
515 520 525 515 520 525
Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu AlaArg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala
530 535 540 530 535 540
Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysGly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
545 550 555 560545 550 555 560
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
565 570 575 565 570 575
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
580 585 590 580 585 590
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser ArgPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg
595 600 605 595 600 605
Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr AsnSer Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn
610 615 620 610 615 620
Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys ArgGlu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg
625 630 635 640625 630 635 640
Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn ProArg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro
645 650 655 645 650 655
Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu AlaGln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala
660 665 670 660 665 670
Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly HisTyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His
675 680 685 675 680 685
Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr AspAsp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp
690 695 700 690 695 700
Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
705 710 705 710
<210> 341<210> 341
<211> 714<211> 714
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 341<400> 341
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val GlnGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln
115 120 125 115 120 125
Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg Ser Leu ArgLeu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg Ser Leu Arg
130 135 140 130 135 140
Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Gly Met HisLeu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Gly Met His
145 150 155 160145 150 155 160
Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala Val IleTrp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala Val Ile
165 170 175 165 170 175
Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly ArgSer Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg
180 185 190 180 185 190
Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln MetPhe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met
195 200 205 195 200 205
Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Gly Gly SerAsn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Gly Gly Ser
210 215 220 210 215 220
Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val Trp Gly GlnGly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val Trp Gly Gln
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
245 250 255 245 250 255
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala LeuGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu
260 265 270 260 265 270
Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr IleThr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile
275 280 285 275 280 285
Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val SerSer Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser
290 295 300 290 295 300
Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr AspTrp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp
305 310 315 320305 310 315 320
Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser LysVal Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys
325 330 335 325 330 335
Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu AspSer Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp
340 345 350 340 345 350
Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu TyrGlu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr
355 360 365 355 360 365
Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly Gly Gly Gly SerVal Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly Gly Gly Gly Ser
370 375 380 370 375 380
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
405 410 415 405 410 415
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
420 425 430 420 425 430
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
435 440 445 435 440 445
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
450 455 460 450 455 460
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Thr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro AlaThr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala
485 490 495 485 490 495
Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu SerPro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser
500 505 510 500 505 510
Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His ThrLeu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr
515 520 525 515 520 525
Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu AlaArg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala
530 535 540 530 535 540
Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysGly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
545 550 555 560545 550 555 560
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
565 570 575 565 570 575
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
580 585 590 580 585 590
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser ArgPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg
595 600 605 595 600 605
Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr AsnSer Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn
610 615 620 610 615 620
Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys ArgGlu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg
625 630 635 640625 630 635 640
Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn ProArg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro
645 650 655 645 650 655
Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu AlaGln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala
660 665 670 660 665 670
Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly HisTyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His
675 680 685 675 680 685
Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr AspAsp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp
690 695 700 690 695 700
Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
705 710 705 710
<210> 342<210> 342
<211> 714<211> 714
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 342<400> 342
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Cys Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly GlnGln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
115 120 125 115 120 125
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly TyrSer Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
130 135 140 130 135 140
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuAsn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
145 150 155 160145 150 155 160
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg PheMet Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
165 170 175 165 170 175
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly LeuSer Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
180 185 190 180 185 190
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser SerGln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
195 200 205 195 200 205
Ser Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu GlySer Thr Leu Tyr Val Phe Gly Ser Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val GlnGly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln
245 250 255 245 250 255
Pro Gly Arg Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr PhePro Gly Arg Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe
260 265 270 260 265 270
Ser Ser Tyr Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly LeuSer Ser Tyr Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu
275 280 285 275 280 285
Glu Trp Val Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr AlaGlu Trp Val Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala
290 295 300 290 295 300
Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys AsnAsp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn
305 310 315 320305 310 315 320
Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala ValThr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val
325 330 335 325 330 335
Tyr Tyr Cys Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr GlyTyr Tyr Cys Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly
340 345 350 340 345 350
Leu Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly GlyLeu Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly
355 360 365 355 360 365
Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val LysGly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys
370 375 380 370 375 380
Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser LeuPro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu
385 390 395 400385 390 395 400
Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys LeuPro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu
405 410 415 405 410 415
Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln SerGlu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser
420 425 430 420 425 430
Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn GlnSer Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln
435 440 445 435 440 445
Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val TyrVal Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr
450 455 460 450 455 460
Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrTyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro AlaTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala
485 490 495 485 490 495
Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu SerPro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser
500 505 510 500 505 510
Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His ThrLeu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr
515 520 525 515 520 525
Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu AlaArg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala
530 535 540 530 535 540
Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysGly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
545 550 555 560545 550 555 560
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
565 570 575 565 570 575
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
580 585 590 580 585 590
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser ArgPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg
595 600 605 595 600 605
Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr AsnSer Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn
610 615 620 610 615 620
Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys ArgGlu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg
625 630 635 640625 630 635 640
Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn ProArg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro
645 650 655 645 650 655
Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu AlaGln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala
660 665 670 660 665 670
Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly HisTyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His
675 680 685 675 680 685
Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr AspAsp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp
690 695 700 690 695 700
Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
705 710 705 710
<210> 343<210> 343
<211> 714<211> 714
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 343<400> 343
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
130 135 140 130 135 140
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
165 170 175 165 170 175
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
180 185 190 180 185 190
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
195 200 205 195 200 205
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
210 215 220 210 215 220
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
245 250 255 245 250 255
Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu ThrVal Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr
260 265 270 260 265 270
Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr GlyLeu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly
275 280 285 275 280 285
Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile GlyVal Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly
290 295 300 290 295 300
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser
305 310 315 320305 310 315 320
Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu LysArg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys
325 330 335 325 330 335
Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala LysLeu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys
340 345 350 340 345 350
His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln GlyHis Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
355 360 365 355 360 365
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala LeuThr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu
370 375 380 370 375 380
Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr IleThr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile
385 390 395 400385 390 395 400
Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val SerSer Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser
405 410 415 405 410 415
Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr AspTrp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp
420 425 430 420 425 430
Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser LysVal Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys
435 440 445 435 440 445
Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu AspSer Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp
450 455 460 450 455 460
Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu TyrGlu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr Thr Pro AlaVal Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr Thr Pro Ala
485 490 495 485 490 495
Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu SerPro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser
500 505 510 500 505 510
Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His ThrLeu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr
515 520 525 515 520 525
Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu AlaArg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala
530 535 540 530 535 540
Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysGly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
545 550 555 560545 550 555 560
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
565 570 575 565 570 575
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
580 585 590 580 585 590
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser ArgPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg
595 600 605 595 600 605
Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr AsnSer Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn
610 615 620 610 615 620
Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys ArgGlu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg
625 630 635 640625 630 635 640
Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn ProArg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro
645 650 655 645 650 655
Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu AlaGln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala
660 665 670 660 665 670
Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly HisTyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His
675 680 685 675 680 685
Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr AspAsp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp
690 695 700 690 695 700
Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
705 710 705 710
<210> 344<210> 344
<211> 714<211> 714
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 344<400> 344
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly GlnGln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly TyrSer Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuAsn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45 35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg PheMet Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly LeuSer Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser SerGln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95 85 90 95
Ser Thr Leu Tyr Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu GlySer Thr Leu Tyr Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu ValGly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val
115 120 125 115 120 125
Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val SerLys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser
130 135 140 130 135 140
Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys GlyLeu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr GlnLeu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln
165 170 175 165 170 175
Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys AsnSer Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn
180 185 190 180 185 190
Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala ValGln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val
195 200 205 195 200 205
Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met AspTyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp
210 215 220 210 215 220
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly GlyTyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly SerSer Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
245 250 255 245 250 255
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
260 265 270 260 265 270
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
275 280 285 275 280 285
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
290 295 300 290 295 300
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
305 310 315 320305 310 315 320
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
325 330 335 325 330 335
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
340 345 350 340 345 350
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
355 360 365 355 360 365
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
370 375 380 370 375 380
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
385 390 395 400385 390 395 400
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
405 410 415 405 410 415
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
420 425 430 420 425 430
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
435 440 445 435 440 445
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
450 455 460 450 455 460
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
465 470 475 480465 470 475 480
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro AlaTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala
485 490 495 485 490 495
Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu SerPro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser
500 505 510 500 505 510
Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His ThrLeu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr
515 520 525 515 520 525
Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu AlaArg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala
530 535 540 530 535 540
Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysGly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
545 550 555 560545 550 555 560
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
565 570 575 565 570 575
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
580 585 590 580 585 590
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser ArgPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg
595 600 605 595 600 605
Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr AsnSer Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn
610 615 620 610 615 620
Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys ArgGlu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg
625 630 635 640625 630 635 640
Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn ProArg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro
645 650 655 645 650 655
Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu AlaGln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala
660 665 670 660 665 670
Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly HisTyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His
675 680 685 675 680 685
Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr AspAsp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp
690 695 700 690 695 700
Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
705 710 705 710
<210> 345<210> 345
<211> 714<211> 714
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 345<400> 345
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110 100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120 125 115 120 125
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
130 135 140 130 135 140
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
145 150 155 160145 150 155 160
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
165 170 175 165 170 175
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
180 185 190 180 185 190
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
195 200 205 195 200 205
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
210 215 220 210 215 220
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
245 250 255 245 250 255
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val MetGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met
260 265 270 260 265 270
Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala ThrThr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr
275 280 285 275 280 285
Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp TyrLeu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr
290 295 300 290 295 300
Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr SerGln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser
305 310 315 320305 310 315 320
Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser GlyArg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly
325 330 335 325 330 335
Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe AlaThr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala
340 345 350 340 345 350
Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly GlnVal Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln
355 360 365 355 360 365
Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala LeuGly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gln Ser Ala Leu
370 375 380 370 375 380
Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr IleThr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln Ser Ile Thr Ile
385 390 395 400385 390 395 400
Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val SerSer Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser
405 410 415 405 410 415
Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr AspTrp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Met Ile Tyr Asp
420 425 430 420 425 430
Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser LysVal Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Ser Lys
435 440 445 435 440 445
Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu AspSer Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu Gln Ala Glu Asp
450 455 460 450 455 460
Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu TyrGlu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Tyr
465 470 475 480465 470 475 480
Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr Thr Pro AlaVal Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Thr Thr Thr Pro Ala
485 490 495 485 490 495
Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu SerPro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser
500 505 510 500 505 510
Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His ThrLeu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr
515 520 525 515 520 525
Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu AlaArg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala
530 535 540 530 535 540
Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysGly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
545 550 555 560545 550 555 560
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
565 570 575 565 570 575
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
580 585 590 580 585 590
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser ArgPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg
595 600 605 595 600 605
Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr AsnSer Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn
610 615 620 610 615 620
Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys ArgGlu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg
625 630 635 640625 630 635 640
Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn ProArg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro
645 650 655 645 650 655
Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu AlaGln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala
660 665 670 660 665 670
Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly HisTyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His
675 680 685 675 680 685
Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr AspAsp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp
690 695 700 690 695 700
Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
705 710 705 710
<210> 346<210> 346
<211> 714<211> 714
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 346<400> 346
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly GlnGln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly TyrSer Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30 20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys LeuAsn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45 35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg PheMet Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly LeuSer Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser SerGln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95 85 90 95
Ser Thr Leu Tyr Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu GlySer Thr Leu Tyr Val Phe Gly Cys Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Gly
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu SerGly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser
115 120 125 115 120 125
Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln AspLeu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp
130 135 140 130 135 140
Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala ProIle Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro
145 150 155 160145 150 155 160
Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro AlaArg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala
165 170 175 165 170 175
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile SerArg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser
180 185 190 180 185 190
Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly AsnSer Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn
195 200 205 195 200 205
Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys GlyThr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val LysGly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys
245 250 255 245 250 255
Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser LeuPro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu
260 265 270 260 265 270
Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly LeuPro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu
275 280 285 275 280 285
Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln SerGlu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser
290 295 300 290 295 300
Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn GlnSer Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln
305 310 315 320305 310 315 320
Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val TyrVal Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr
325 330 335 325 330 335
Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrTyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
340 345 350 340 345 350
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly SerTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
355 360 365 355 360 365
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly ArgGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
370 375 380 370 375 380
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
385 390 395 400385 390 395 400
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValGly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
405 410 415 405 410 415
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser ValAla Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
420 425 430 420 425 430
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
435 440 445 435 440 445
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
450 455 460 450 455 460
Gly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp ValGly Gly Ser Gly Tyr Ala Leu His Asp Asp Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
465 470 475 480465 470 475 480
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro AlaTrp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala
485 490 495 485 490 495
Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu SerPro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser
500 505 510 500 505 510
Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His ThrLeu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr
515 520 525 515 520 525
Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu AlaArg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala
530 535 540 530 535 540
Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr CysGly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
545 550 555 560545 550 555 560
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe MetLys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
565 570 575 565 570 575
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg PheArg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
580 585 590 580 585 590
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser ArgPro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg
595 600 605 595 600 605
Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr AsnSer Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn
610 615 620 610 615 620
Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys ArgGlu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg
625 630 635 640625 630 635 640
Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn ProArg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro
645 650 655 645 650 655
Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu AlaGln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala
660 665 670 660 665 670
Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly HisTyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His
675 680 685 675 680 685
Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr AspAsp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp
690 695 700 690 695 700
Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgAla Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
705 710 705 710
<210> 347<210> 347
<211> 708<211> 708
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 347<400> 347
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile GlnGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln
115 120 125 115 120 125
Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg ValMet Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val
130 135 140 130 135 140
Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn TrpThr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp
145 150 155 160145 150 155 160
Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala AlaTyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala
165 170 175 165 170 175
Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly SerSer Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser
180 185 190 180 185 190
Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp PheGly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe
195 200 205 195 200 205
Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe GlyAla Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly
210 215 220 210 215 220
Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Gln LeuGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Gln Leu
245 250 255 245 250 255
Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg LeuLeu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu
260 265 270 260 265 270
Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Ala Met Ser TrpSer Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Ala Met Ser Trp
275 280 285 275 280 285
Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser Ala Ile SerVal Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser Ala Ile Ser
290 295 300 290 295 300
Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg PheGly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe
305 310 315 320305 310 315 320
Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met AsnThr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn
325 330 335 325 330 335
Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Arg GluSer Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg Arg Glu
340 345 350 340 345 350
Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr LeuTrp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu
355 360 365 355 360 365
Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr GlnVal Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln
370 375 380 370 375 380
Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu SerSer Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser
385 390 395 400385 390 395 400
Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln GlnCys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln
405 410 415 405 410 415
Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg LeuLys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu
420 425 430 420 425 430
His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr AspHis Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp
435 440 445 435 440 445
Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val TyrTyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr
450 455 460 450 455 460
Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Cys Gly ThrPhe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Cys Gly Thr
465 470 475 480465 470 475 480
Lys Leu Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr ProLys Leu Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro
485 490 495 485 490 495
Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala CysAla Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys
500 505 510 500 505 510
Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe AlaArg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala
515 520 525 515 520 525
Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val LeuCys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu
530 535 540 530 535 540
Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys LysLeu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys
545 550 555 560545 550 555 560
Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr ThrLeu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr
565 570 575 565 570 575
Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu GlyGln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly
580 585 590 580 585 590
Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro AlaGly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala
595 600 605 595 600 605
Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly ArgTyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg
610 615 620 610 615 620
Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro GluArg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu
625 630 635 640625 630 635 640
Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr AsnMet Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn
645 650 655 645 650 655
Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly MetGlu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met
660 665 670 660 665 670
Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln GlyLys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly
675 680 685 675 680 685
Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln AlaLeu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala
690 695 700 690 695 700
Leu Pro Pro ArgLeu Pro Pro Arg
705 705
<210> 348<210> 348
<211> 708<211> 708
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 348<400> 348
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly GlyGlu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser TyrSer Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp ValAla Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Cys Leu Glu Trp Val
35 40 45 35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser ValSer Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu TyrLys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 8065 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr CysLeu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95 85 90 95
Ala Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp GlyAla Arg Arg Glu Trp Trp Gly Glu Ser Trp Leu Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110 100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu IleGln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile
115 120 125 115 120 125
Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu ArgVal Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg
130 135 140 130 135 140
Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu AsnAla Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn
145 150 155 160145 150 155 160
Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr HisTrp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His
165 170 175 165 170 175
Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser GlyThr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly
180 185 190 180 185 190
Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu AspSer Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp
195 200 205 195 200 205
Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr PhePhe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe
210 215 220 210 215 220
Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly GlyGly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val GlnGly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln
245 250 255 245 250 255
Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu SerLeu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser
260 265 270 260 265 270
Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val SerLeu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser
275 280 285 275 280 285
Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val IleTrp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile
290 295 300 290 295 300
Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg ValTrp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val
305 310 315 320305 310 315 320
Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu SerThr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser
325 330 335 325 330 335
Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His TyrSer Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr
340 345 350 340 345 350
Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr LeuTyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu
355 360 365 355 360 365
Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr GlnVal Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Ile Gln Met Thr Gln
370 375 380 370 375 380
Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile ThrSer Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr
385 390 395 400385 390 395 400
Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln GlnCys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln
405 410 415 405 410 415
Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser LeuLys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Ser Leu
420 425 430 420 425 430
Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr AspGln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp
435 440 445 435 440 445
Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr TyrPhe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr
450 455 460 450 455 460
Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly Cys Gly ThrTyr Cys Gln Gln Ser Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly Cys Gly Thr
465 470 475 480465 470 475 480
Lys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr ProLys Val Glu Ile Lys Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro
485 490 495 485 490 495
Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala CysAla Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys
500 505 510 500 505 510
Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe AlaArg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala
515 520 525 515 520 525
Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val LeuCys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu
530 535 540 530 535 540
Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys LysLeu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys
545 550 555 560545 550 555 560
Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr ThrLeu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr
565 570 575 565 570 575
Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu GlyGln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly
580 585 590 580 585 590
Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro AlaGly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala
595 600 605 595 600 605
Tyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly ArgTyr Lys Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg
610 615 620 610 615 620
Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro GluArg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu
625 630 635 640625 630 635 640
Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr AsnMet Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn
645 650 655 645 650 655
Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly MetGlu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met
660 665 670 660 665 670
Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln GlyLys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly
675 680 685 675 680 685
Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln AlaLeu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala
690 695 700 690 695 700
Leu Pro Pro ArgLeu Pro Pro Arg
705 705
<210> 349<210> 349
<211> 486<211> 486
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 349<400> 349
Met Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu LeuMet Ala Leu Pro Val Thr Ala Leu Leu Leu Pro Leu Ala Leu Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr LeuHis Ala Ala Arg Pro Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu
20 25 30 20 25 30
Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser GlnSer Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln
35 40 45 35 40 45
Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln AlaAsp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala
50 55 60 50 55 60
Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile ProPro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr IleAla Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile
85 90 95 85 90 95
Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln GlySer Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly
100 105 110 100 105 110
Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile LysAsn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
115 120 125 115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
130 135 140 130 135 140
Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu ThrVal Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr GlyLeu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly
165 170 175 165 170 175
Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile GlyVal Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly
180 185 190 180 185 190
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser
195 200 205 195 200 205
Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu LysArg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys
210 215 220 210 215 220
Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala LysLeu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys
225 230 235 240225 230 235 240
His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln GlyHis Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
245 250 255 245 250 255
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro ProThr Leu Val Thr Val Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro
260 265 270 260 265 270
Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro GluThr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu
275 280 285 275 280 285
Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu AspAla Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp
290 295 300 290 295 300
Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys GlyPhe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly
305 310 315 320305 310 315 320
Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly ArgVal Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg
325 330 335 325 330 335
Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val GlnLys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln
340 345 350 340 345 350
Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu GluThr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu
355 360 365 355 360 365
Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp AlaGlu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala
370 375 380 370 375 380
Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn LeuPro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu
385 390 395 400385 390 395 400
Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg AspGly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp
405 410 415 405 410 415
Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly LeuPro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu
420 425 430 420 425 430
Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu IleTyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile
435 440 445 435 440 445
Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu TyrGly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr
450 455 460 450 455 460
Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His MetGln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met
465 470 475 480465 470 475 480
Gln Ala Leu Pro Pro ArgGln Ala Leu Pro Pro Arg
485 485
<210> 350<210> 350
<211> 465<211> 465
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 350<400> 350
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln GluGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu
115 120 125 115 120 125
Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr CysSer Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile ArgThr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg
145 150 155 160145 150 155 160
Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly SerGln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser
165 170 175 165 170 175
Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile SerGlu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser
180 185 190 180 185 190
Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val ThrLys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr
195 200 205 195 200 205
Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr GlyAla Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr ValGly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val
225 230 235 240225 230 235 240
Ser Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro ThrSer Ser Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr
245 250 255 245 250 255
Ile Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro AlaIle Ala Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala
260 265 270 260 265 270
Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp IleAla Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile
275 280 285 275 280 285
Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu SerTyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser
290 295 300 290 295 300
Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu TyrLeu Val Ile Thr Leu Tyr Cys Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr
305 310 315 320305 310 315 320
Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu GluIle Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu
325 330 335 325 330 335
Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys GluAsp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu
340 345 350 340 345 350
Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln GlnLeu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln
355 360 365 355 360 365
Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu GluGly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu
370 375 380 370 375 380
Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly GlyTyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly
385 390 395 400385 390 395 400
Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu GlnLys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln
405 410 415 405 410 415
Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly GluLys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu
420 425 430 420 425 430
Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser ThrArg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr
435 440 445 435 440 445
Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro ProAla Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro
450 455 460 450 455 460
ArgArg
465465
<210> 351<210> 351
<211> 22<211> 22
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
peptide"peptide"
<400> 351<400> 351
Met Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His ProMet Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His Pro
1 5 10 15 1 5 10 15
Ala Phe Leu Leu Ile ProAla Phe Leu Leu Ile Pro
20 20
<210> 352<210> 352
<211> 66<211> 66
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 352<400> 352
atgcttctcc tggtgacaag ccttctgctc tgtgagttac cacacccagc attcctcctg 60atgcttctcc tggtgacaag ccttctgctc tgtgagttac cacaccagc attcctcctg 60
atccca 66atccca 66
<210> 353<210> 353
<211> 66<211> 66
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide"oligonucleotide"
<400> 353<400> 353
atgctgctgc tggtgaccag cctgctgctg tgcgagctgc cccaccccgc ctttctgctg 60atgctgctgc tggtgaccag cctgctgctg tgcgagctgc cccaccccgc ctttctgctg 60
atcccc 66atcccc 66
<210> 354<210> 354
<211> 1461<211> 1461
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 354<400> 354
atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60
cccgaaattg tgatgaccca gtcacccgcc actcttagcc tttcacccgg tgagcgcgca 120cccgaaattg tgatgaccca gtcacccgcc actcttagcc tttcacccgg tgagcgcgca 120
accctgtctt gcagagcctc ccaagacatc tcaaaatacc ttaattggta tcaacagaag 180accctgtctt gcagagcctc ccaagacatc tcaaaatacc ttaattggta tcaacagaag 180
cccggacagg ctcctcgcct tctgatctac cacaccagcc ggctccattc tggaatccct 240cccggacagg ctcctcgcct tctgatctac cacaccagcc ggctccattc tggaatccct 240
gccaggttca gcggtagcgg atctgggacc gactacaccc tcactatcag ctcactgcag 300gccaggttca gcggtagcgg atctgggacc gactacaccc tcactatcag ctcactgcag 300
ccagaggact tcgctgtcta tttctgtcag caagggaaca ccctgcccta cacctttgga 360ccagaggact tcgctgtcta tttctgtcag caagggaaca ccctgcccta cacctttgga 360
cagggcacca agctcgagat taaaggtgga ggtggcagcg gaggaggtgg gtccggcggt 420cagggcacca agctcgagat taaaggtgga ggtggcagcg gaggaggtgg gtccggcggt 420
ggaggaagcc aggtccaact ccaagaaagc ggaccgggtc ttgtgaagcc atcagaaact 480gggaggaagcc aggtccaact ccaagaaagc ggaccgggtc ttgtgaagcc atcagaaact 480
ctttcactga cttgtactgt gagcggagtg tctctccccg attacggggt gtcttggatc 540ctttcactga cttgtactgt gagcggagtg tctctccccg attacggggt gtcttggatc 540
agacagccac cggggaaggg tctggaatgg attggagtga tttggggctc tgagactact 600agacagccac cggggaaggg tctggaatgg attggagtga tttggggctc tgagactact 600
tactaccaat catccctcaa gtcacgcgtc accatctcaa aggacaactc taagaatcag 660tactaccaat catccctcaa gtcacgcgtc accatctcaa aggacaactc taagaatcag 660
gtgtcactga aactgtcatc tgtgaccgca gccgacaccg ccgtgtacta ttgcgctaag 720gtgtcactga aactgtcatc tgtgaccgca gccgacaccg ccgtgtacta ttgcgctaag 720
cattactatt atggcgggag ctacgcaatg gattactggg gacagggtac tctggtcacc 780cattactatt atggcgggag ctacgcaatg gattactggg gacagggtac tctggtcacc 780
gtgtccagca ccactacccc agcaccgagg ccacccaccc cggctcctac catcgcctcc 840gtgtccagca ccactacccc agcaccgagg ccacccaccc cggctcctac catcgcctcc 840
cagcctctgt ccctgcgtcc ggaggcatgt agacccgcag ctggtggggc cgtgcatacc 900cagcctctgt ccctgcgtcc ggaggcatgt agacccgcag ctggtggggc cgtgcatacc 900
cggggtcttg acttcgcctg cgatatctac atttgggccc ctctggctgg tacttgcggg 960cggggtcttg acttcgcctg cgatatctac atttgggccc ctctggctgg tacttgcggg 960
gtcctgctgc tttcactcgt gatcactctt tactgtaagc gcggtcggaa gaagctgctg 1020gtcctgctgc tttcactcgt gatcactctt tactgtaagc gcggtcggaa gaagctgctg 1020
tacatcttta agcaaccctt catgaggcct gtgcagacta ctcaagagga ggacggctgt 1080tacatcttta agcaaccctt catgaggcct gtgcagacta ctcaagagga ggacggctgt 1080
tcatgccggt tcccagagga ggaggaaggc ggctgcgaac tgcgcgtgaa attcagccgc 1140tcatgccggt tcccagagga gggaggaaggc ggctgcgaac tgcgcgtgaa attcagccgc 1140
agcgcagatg ctccagccta ccagcagggg cagaaccagc tctacaacga actcaatctt 1200agcgcagatg ctccagccta ccagcagggg cagaaccagc tctacaacga actcaatctt 1200
ggtcggagag aggagtacga cgtgctggac aagcggagag gacgggaccc agaaatgggc 1260ggtcggagag aggagtacga cgtgctggac aagcggagag gacgggaccc agaaatgggc 1260
gggaagccgc gcagaaagaa tccccaagag ggcctgtaca acgagctcca aaaggataag 1320gggaagccgc gcagaaagaa tccccaagag ggcctgtaca acgagctcca aaaggataag 1320
atggcagaag cctatagcga gattggtatg aaaggggaac gcagaagagg caaaggccac 1380atggcagaag cctatagcga gattggtatg aaaggggaac gcagaagagg caaaggccac 1380
gacggactgt accagggact cagcaccgcc accaaggaca cctatgacgc tcttcacatg 1440gacggactgt accagggact cagcaccgcc accaaggaca cctatgacgc tcttcacatg 1440
caggccctgc cgcctcggta a 1461caggccctgc cgcctcggta a 1461
<210> 355<210> 355
<211> 1458<211> 1458
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 355<400> 355
atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60atggccctcc ctgtcaccgc cctgctgctt ccgctggctc ttctgctcca cgccgctcgg 60
cccgaaattg tgatgaccca gtcacccgcc actcttagcc tttcacccgg tgagcgcgca 120cccgaaattg tgatgaccca gtcacccgcc actcttagcc tttcacccgg tgagcgcgca 120
accctgtctt gcagagcctc ccaagacatc tcaaaatacc ttaattggta tcaacagaag 180accctgtctt gcagagcctc ccaagacatc tcaaaatacc ttaattggta tcaacagaag 180
cccggacagg ctcctcgcct tctgatctac cacaccagcc ggctccattc tggaatccct 240cccggacagg ctcctcgcct tctgatctac cacaccagcc ggctccattc tggaatccct 240
gccaggttca gcggtagcgg atctgggacc gactacaccc tcactatcag ctcactgcag 300gccaggttca gcggtagcgg atctgggacc gactacaccc tcactatcag ctcactgcag 300
ccagaggact tcgctgtcta tttctgtcag caagggaaca ccctgcccta cacctttgga 360ccagaggact tcgctgtcta tttctgtcag caagggaaca ccctgcccta cacctttgga 360
cagggcacca agctcgagat taaaggtgga ggtggcagcg gaggaggtgg gtccggcggt 420cagggcacca agctcgagat taaaggtgga ggtggcagcg gaggaggtgg gtccggcggt 420
ggaggaagcc aggtccaact ccaagaaagc ggaccgggtc ttgtgaagcc atcagaaact 480gggaggaagcc aggtccaact ccaagaaagc ggaccgggtc ttgtgaagcc atcagaaact 480
ctttcactga cttgtactgt gagcggagtg tctctccccg attacggggt gtcttggatc 540ctttcactga cttgtactgt gagcggagtg tctctccccg attacggggt gtcttggatc 540
agacagccac cggggaaggg tctggaatgg attggagtga tttggggctc tgagactact 600agacagccac cggggaaggg tctggaatgg attggagtga tttggggctc tgagactact 600
tactaccaat catccctcaa gtcacgcgtc accatctcaa aggacaactc taagaatcag 660tactaccaat catccctcaa gtcacgcgtc accatctcaa aggacaactc taagaatcag 660
gtgtcactga aactgtcatc tgtgaccgca gccgacaccg ccgtgtacta ttgcgctaag 720gtgtcactga aactgtcatc tgtgaccgca gccgacaccg ccgtgtacta ttgcgctaag 720
cattactatt atggcgggag ctacgcaatg gattactggg gacagggtac tctggtcacc 780cattactatt atggcgggag ctacgcaatg gattactggg gacagggtac tctggtcacc 780
gtgtccagca ccactacccc agcaccgagg ccacccaccc cggctcctac catcgcctcc 840gtgtccagca ccactacccc agcaccgagg ccacccaccc cggctcctac catcgcctcc 840
cagcctctgt ccctgcgtcc ggaggcatgt agacccgcag ctggtggggc cgtgcatacc 900cagcctctgt ccctgcgtcc ggaggcatgt agacccgcag ctggtggggc cgtgcatacc 900
cggggtcttg acttcgcctg cgatatctac atttgggccc ctctggctgg tacttgcggg 960cggggtcttg acttcgcctg cgatatctac atttgggccc ctctggctgg tacttgcggg 960
gtcctgctgc tttcactcgt gatcactctt tactgtaagc gcggtcggaa gaagctgctg 1020gtcctgctgc tttcactcgt gatcactctt tactgtaagc gcggtcggaa gaagctgctg 1020
tacatcttta agcaaccctt catgaggcct gtgcagacta ctcaagagga ggacggctgt 1080tacatcttta agcaaccctt catgaggcct gtgcagacta ctcaagagga ggacggctgt 1080
tcatgccggt tcccagagga ggaggaaggc ggctgcgaac tgcgcgtgaa attcagccgc 1140tcatgccggt tcccagagga gggaggaaggc ggctgcgaac tgcgcgtgaa attcagccgc 1140
agcgcagatg ctccagccta ccagcagggg cagaaccagc tctacaacga actcaatctt 1200agcgcagatg ctccagccta ccagcagggg cagaaccagc tctacaacga actcaatctt 1200
ggtcggagag aggagtacga cgtgctggac aagcggagag gacgggaccc agaaatgggc 1260ggtcggagag aggagtacga cgtgctggac aagcggagag gacgggaccc agaaatgggc 1260
gggaagccgc gcagaaagaa tccccaagag ggcctgtaca acgagctcca aaaggataag 1320gggaagccgc gcagaaagaa tccccaagag ggcctgtaca acgagctcca aaaggataag 1320
atggcagaag cctatagcga gattggtatg aaaggggaac gcagaagagg caaaggccac 1380atggcagaag cctatagcga gattggtatg aaaggggaac gcagaagagg caaaggccac 1380
gacggactgt accagggact cagcaccgcc accaaggaca cctatgacgc tcttcacatg 1440gacggactgt accagggact cagcaccgcc accaaggaca cctatgacgc tcttcacatg 1440
caggccctgc cgcctcgg 1458caggccctgc cgcctcgg 1458
<210> 356<210> 356
<211> 1398<211> 1398
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 356<400> 356
gaaattgtga tgacccagtc acccgccact cttagccttt cacccggtga gcgcgcaacc 60gaaattgtga tgacccagtc acccgccact cttagccttt cacccggtga gcgcgcaacc 60
ctgtcttgca gagcctccca agacatctca aaatacctta attggtatca acagaagccc 120ctgtcttgca gagcctccca agacatctca aaatacctta attggtatca acagaagccc 120
ggacaggctc ctcgccttct gatctaccac accagccggc tccattctgg aatccctgcc 180ggacaggctc ctcgccttct gatctaccac accagccggc tccattctgg aatccctgcc 180
aggttcagcg gtagcggatc tgggaccgac tacaccctca ctatcagctc actgcagcca 240aggttcagcg gtagcggatc tgggaccgac tacaccctca ctatcagctc actgcagcca 240
gaggacttcg ctgtctattt ctgtcagcaa gggaacaccc tgccctacac ctttggacag 300gaggacttcg ctgtctattt ctgtcagcaa gggaacaccc tgccctacac ctttggacag 300
ggcaccaagc tcgagattaa aggtggaggt ggcagcggag gaggtgggtc cggcggtgga 360ggcaccaagc tcgagattaa aggtggaggt ggcagcggag gaggtgggtc cggcggtgga 360
ggaagccagg tccaactcca agaaagcgga ccgggtcttg tgaagccatc agaaactctt 420ggaagccagg tccaactcca agaaagcgga ccgggtcttg tgaagccatc agaaactctt 420
tcactgactt gtactgtgag cggagtgtct ctccccgatt acggggtgtc ttggatcaga 480tcactgactt gtactgtgag cggagtgtct ctccccgatt acggggtgtc ttggatcaga 480
cagccaccgg ggaagggtct ggaatggatt ggagtgattt ggggctctga gactacttac 540cagccaccgg ggaagggtct ggaatggatt ggagtgattt ggggctctga gactacttac 540
taccaatcat ccctcaagtc acgcgtcacc atctcaaagg acaactctaa gaatcaggtg 600taccaatcat ccctcaagtc acgcgtcacc atctcaaagg acaactctaa gaatcaggtg 600
tcactgaaac tgtcatctgt gaccgcagcc gacaccgccg tgtactattg cgctaagcat 660tcactgaaac tgtcatctgt gaccgcagcc gacaccgccg tgtactattg cgctaagcat 660
tactattatg gcgggagcta cgcaatggat tactggggac agggtactct ggtcaccgtg 720tactattatg gcgggagcta cgcaatggat tactggggac agggtactct ggtcaccgtg 720
tccagcacca ctaccccagc accgaggcca cccaccccgg ctcctaccat cgcctcccag 780tccagcacca ctaccccagc accgaggcca cccaccccgg ctcctaccat cgcctcccag 780
cctctgtccc tgcgtccgga ggcatgtaga cccgcagctg gtggggccgt gcatacccgg 840cctctgtccc tgcgtccgga ggcatgtaga cccgcagctg gtggggccgt gcatacccgg 840
ggtcttgact tcgcctgcga tatctacatt tgggcccctc tggctggtac ttgcggggtc 900ggtcttgact tcgcctgcga tatctacatt tgggcccctc tggctggtac ttgcggggtc 900
ctgctgcttt cactcgtgat cactctttac tgtaagcgcg gtcggaagaa gctgctgtac 960ctgctgcttt cactcgtgat cactctttac tgtaagcgcg gtcggaagaa gctgctgtac 960
atctttaagc aacccttcat gaggcctgtg cagactactc aagaggagga cggctgttca 1020atctttaagc aacccttcat gaggcctgtg cagactactc aagaggagga cggctgttca 1020
tgccggttcc cagaggagga ggaaggcggc tgcgaactgc gcgtgaaatt cagccgcagc 1080tgccggttcc cagaggagga ggaaggcggc tgcgaactgc gcgtgaaatt cagccgcagc 1080
gcagatgctc cagcctacca gcaggggcag aaccagctct acaacgaact caatcttggt 1140gcagatgctc cagcctacca gcaggggcag aaccagctct acaacgaact caatcttggt 1140
cggagagagg agtacgacgt gctggacaag cggagaggac gggacccaga aatgggcggg 1200cggagagagg agtacgacgt gctggacaag cggagaggac gggacccaga aatgggcggg 1200
aagccgcgca gaaagaatcc ccaagagggc ctgtacaacg agctccaaaa ggataagatg 1260aagccgcgca gaaagaatcc ccaagagggc ctgtacaacg agctccaaaa ggataagatg 1260
gcagaagcct atagcgagat tggtatgaaa ggggaacgca gaagaggcaa aggccacgac 1320gcagaagcct atagcgagat tggtatgaaa ggggaacgca gaagaggcaa aggccacgac 1320
ggactgtacc agggactcag caccgccacc aaggacacct atgacgctct tcacatgcag 1380ggactgtacc agggactcag caccgccacc aaggacacct atgacgctct tcacatgcag 1380
gccctgccgc ctcggtaa 1398gccctgccgc ctcggtaa 1398
<210> 357<210> 357
<211> 360<211> 360
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 357<400> 357
caggtccagc tgcaggaatc aggaccaggg ctggtgaaac ctagcgaaac tctgagtctg 60caggtccagc tgcaggaatc aggaccaggg ctggtgaaac ctagcgaaac tctgagtctg 60
acttgtaccg tctccggggt gtctctgcca gactacggcg tgagctggat cagacagccc 120acttgtaccg tctccggggt gtctctgcca gactacggcg tgagctggat cagacagccc 120
cctggcaagt gcctggagtg gatcggcgtg atctggggct ccgagaccac atactatcag 180cctggcaagt gcctggagtg gatcggcgtg atctggggct ccgagaccac atactatcag 180
agctccctga agtctcgggt gaccatctcc aaggacaact ctaagaatca ggtgagcctg 240agctccctga agtctcgggt gaccatctcc aaggacaact ctaagaatca ggtgagcctg 240
aagctgtcta gcgtgaccgc cgccgataca gccgtgtact attgtgccaa gcactactat 300aagctgtcta gcgtgaccgc cgccgataca gccgtgtact attgtgccaa gcactactat 300
tacggcggct cctatgccat ggattactgg ggccagggca ccctggtgac agtgtcctct 360tacggcggct cctatgccat ggattactgg ggccagggca ccctggtgac agtgtcctct 360
<210> 358<210> 358
<211> 360<211> 360
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 358<400> 358
caggtccagc tgcaggaatc cggcccagga ctggtgaagc ctagcgagac cctgtccctg 60caggtccagc tgcaggaatc cggcccagga ctggtgaagc ctagcgagac cctgtccctg 60
acctgcacag tgagcggcgt gtccctgccc gattacggcg tgagctggat cagacagccc 120acctgcacag tgagcggcgt gtccctgccc gattacggcg tgagctggat cagacagccc 120
cctggcaagt gtctggagtg gatcggcgtg atctggggct ctgagaccac atactatcag 180cctggcaagt gtctggagtg gatcggcgtg atctggggct ctgagaccac atactatcag 180
tcctctctga agagcagggt gaccatctct aaggacaaca gcaagaatca ggtgtccctg 240tcctctctga agagcagggt gaccatctct aaggacaaca gcaagaatca ggtgtccctg 240
aagctgagct ccgtgaccgc agcagataca gccgtgtact attgcgccaa gcactactat 300aagctgagct ccgtgaccgc agcagataca gccgtgtact attgcgccaa gcactactat 300
tacggcggct cctatgctat ggattattgg gggcagggca ctctggtcac tgtctcatca 360tacggcggct cctatgctat ggattattgg gggcagggca ctctggtcac tgtctcatca 360
<210> 359<210> 359
<211> 360<211> 360
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 359<400> 359
caggtgcagc tgcaggaatc tggacccgga ctggtgaaac ctagtgaaac tctgtctctg 60caggtgcagc tgcaggaatc tggacccgga ctggtgaaac ctagtgaaac tctgtctctg 60
acttgtaccg tctcaggggt ctcactgcca gactacggcg tgtcctggat cagacagccc 120acttgtaccg tctcaggggt ctcactgcca gactacggcg tgtcctggat cagacagccc 120
cctggcaagt gcctggagtg gatcggcgtg atctggggct ctgagaccac atactatcag 180cctggcaagt gcctggagtg gatcggcgtg atctggggct ctgagaccac atactatcag 180
agctccctga agagccgggt gaccatctcc aaggacaact ctaagaatca ggtgtccctg 240agctccctga agagccgggt gaccatctcc aaggacaact ctaagaatca ggtgtccctg 240
aagctgtcta gcgtgaccgc cgccgataca gccgtgtact attgtgccaa gcactactat 300aagctgtcta gcgtgaccgc cgccgataca gccgtgtact attgtgccaa gcactactat 300
tacggcggca gctatgccat ggattactgg ggccagggca ccctggtgac agtgtcctct 360tacggcggca gctatgccat ggattactgg ggccagggca ccctggtgac agtgtcctct 360
<210> 360<210> 360
<211> 360<211> 360
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 360<400> 360
caggtccagc tgcaggaaag cggcccagga ctggtgaagc ctagcgagac cctgtccctg 60caggtccagc tgcaggaaag cggcccagga ctggtgaagc ctagcgagac cctgtccctg 60
acctgcacag tgagcggcgt gtccctgcct gattacggcg tgtcctggat cagacagccc 120acctgcacag tgagcggcgt gtccctgcct gattacggcg tgtcctggat cagacagccc 120
cctggcaagt gtctggagtg gatcggcgtg atctggggct ccgagaccac atactatcag 180cctggcaagt gtctggagtg gatcggcgtg atctggggct ccgagaccac atactatcag 180
tcctctctga agtctagggt gacaatctct aaggacaaca gcaagaatca ggtgagcctg 240tcctctctga agtctagggt gacaatctct aaggacaaca gcaagaatca ggtgagcctg 240
aagctgagct ccgtgaccgc agcagataca gccgtgtact attgtgccaa gcactactat 300aagctgagct ccgtgaccgc agcagataca gccgtgtact attgtgccaa gcactactat 300
tacggcggct cttatgctat ggattattgg gggcagggca ctctggtcac tgtctcaagc 360tacggcggct cttatgctat ggattattgg gggcagggca ctctggtcac tgtctcaagc 360
<210> 361<210> 361
<211> 360<211> 360
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 361<400> 361
caggtgcagc tgcaggagag cggcccagga ctggtgaagc cttccgagac actgtctctg 60caggtgcagc tgcaggagag cggcccagga ctggtgaagc cttccgagac actgtctctg 60
acctgtacag tgagcggcgt gtccctgccc gactacggcg tgtcctggat cagacagcca 120acctgtacag tgagcggcgt gtccctgccc gactacggcg tgtcctggat cagacagcca 120
cctggcaagg gactggagtg gatcggcgtg atctggggca gcgagaccac atactatcag 180cctggcaagg gactggagtg gatcggcgtg atctggggca gcgagaccac atactatcag 180
agctccctga agtccagggt gaccatcagc aaggacaact ccaagaatca ggtgagcctg 240agctccctga agtccagggt gaccatcagc aaggacaact ccaagaatca ggtgagcctg 240
aagctgtcta gcgtgaccgc cgccgataca gccgtgtact attgcgccaa gcactactat 300aagctgtcta gcgtgaccgc cgccgataca gccgtgtact attgcgccaa gcactactat 300
tacggcggct cctatgccat ggattactgg ggccagggca ccctggtcac agtgtcctct 360tacggcggct cctatgccat ggattactgg ggccagggca ccctggtcac agtgtcctct 360
<210> 362<210> 362
<211> 360<211> 360
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 362<400> 362
caggtgcagc tgcaggagtc tggcccagga ctggtgaagc cttctgagac cctgagcctg 60caggtgcagc tgcaggagtc tggcccagga ctggtgaagc cttctgagac cctgagcctg 60
acctgcacag tgtccggcgt gtctctgccc gattacggcg tgtcctggat cagacagcca 120acctgcacag tgtccggcgt gtctctgccc gattacggcg tgtcctggat cagacagcca 120
cctggcaagg gactggagtg gatcggcgtg atctggggct ctgagaccac atactatcag 180cctggcaagg gactggagtg gatcggcgtg atctggggct ctgagaccac atactatcag 180
tctagcctga agagccgggt gacaatctcc aaggacaact ctaagaatca ggtgtccctg 240tctagcctga agagccgggt gacaatctcc aaggacaact ctaagaatca ggtgtccctg 240
aagctgtcct ctgtgaccgc cgccgataca gccgtgtact attgtgccaa gcactactat 300aagctgtcct ctgtgaccgc cgccgataca gccgtgtact attgtgccaa gcactactat 300
tacggcggca gctatgccat ggactactgg ggccagggca ccctggtgac agtgagctcc 360tacggcggca gctatgccat ggactactgg ggccagggca ccctggtgac agtgagctcc 360
<210> 363<210> 363
<211> 360<211> 360
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 363<400> 363
caggtgcagc tgcaggagtc tggcccagga ctggtgaagc cttctgagac cctgagcctg 60caggtgcagc tgcaggagtc tggcccagga ctggtgaagc cttctgagac cctgagcctg 60
acctgcacag tgagcggcgt gtccctgccc gattacggcg tgtcctggat cagacagcca 120acctgcacag tgagcggcgt gtccctgccc gattacggcg tgtcctggat cagacagcca 120
cctggcaagg gactggagtg gatcggcgtg atctggggca gcgagaccac atactatcag 180cctggcaagg gactggagtg gatcggcgtg atctggggca gcgagaccac atactatcag 180
tcctctctga agtccagggt gacaatctcc aaggacaact ctaagaatca ggtgagcctg 240tcctctctga agtccagggt gacaatctcc aaggacaact ctaagaatca ggtgagcctg 240
aagctgagct ccgtgaccgc agcagataca gccgtgtact attgcgccaa gcactactat 300aagctgagct ccgtgaccgc agcagataca gccgtgtact attgcgccaa gcactactat 300
tacggcggct cctatgccat ggactactgg ggccagggca ccctggtcac agtgtctagc 360tacggcggct cctatgccat ggactactgg ggccagggca ccctggtcac agtgtctagc 360
<210> 364<210> 364
<211> 360<211> 360
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 364<400> 364
caggtgcagc tgcaggagtc cggcccagga ctggtgaagc cttccgagac actgtctctg 60caggtgcagc tgcaggagtc cggcccagga ctggtgaagc cttccgagac actgtctctg 60
acctgtacag tgtccggcgt gtctctgccc gactacggcg tgagctggat cagacagcca 120acctgtacag tgtccggcgt gtctctgccc gactacggcg tgagctggat cagacagcca 120
cctggcaagg gactggagtg gatcggcgtg atctggggct ctgagaccac atactatcag 180cctggcaagg gactggagtg gatcggcgtg atctggggct ctgagaccac atactatcag 180
tcctctctga agagccgggt gaccatcagc aaggacaact ccaagaatca ggtgtccctg 240tcctctctga agagccgggt gaccatcagc aaggacaact ccaagaatca ggtgtccctg 240
aagctgagct ccgtgaccgc agcagataca gccgtgtact attgcgccaa gcactactat 300aagctgagct ccgtgaccgc agcagataca gccgtgtact attgcgccaa gcactactat 300
tacggcggca gctatgccat ggattactgg ggccagggca ccctggtgac agtgtctagc 360tacggcggca gctatgccat ggattactgg ggccagggca ccctggtgac agtgtctagc 360
<210> 365<210> 365
<211> 321<211> 321
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 365<400> 365
gagatcgtga tgacccagag cccagccaca ctgagcctgt ccccaggaga gagggccaca 60gagatcgtga tgacccagag cccagccaca ctgagcctgt ccccaggaga gagggccaca 60
ctgtcttgta gagccagcca ggatatctcc aagtatctga actggtacca gcagaagcct 120ctgtcttgta gagccagcca ggatatctcc aagtatctga actggtacca gcagaagcct 120
ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctagac tgcacagcgg catccctgcc 180ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctagac tgcacagcgg catccctgcc 180
aggttttctg gcagcggctc cggcacagac tataccctga caatctctag cctgcagcca 240aggttttctg gcagcggctc cggcacagac tataccctga caatctctag cctgcagcca 240
gaggatttcg ccgtgtactt ttgtcagcag ggcaatactc tgccatacac ctttggatgc 300gaggatttcg ccgtgtactt ttgtcagcag ggcaatactc tgccatacac ctttggatgc 300
ggaactaaac tggaaatcaa g 321ggaactaaac tggaaatcaa g 321
<210> 366<210> 366
<211> 321<211> 321
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 366<400> 366
gaaattgtga tgacccagtc ccccgctact ctgtctctgt cccccggaga acgggctact 60gaaattgtga tgacccagtc ccccgctact ctgtctctgt cccccggaga acgggctact 60
ctgtcttgtc gcgcttccca ggatattagc aagtacctga actggtatca gcagaagcca 120ctgtcttgtc gcgcttccca ggatattagc aagtacctga actggtatca gcagaagcca 120
ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctcgcc tgcacagcgg catccctgca 180ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctcgcc tgcacagcgg catccctgca 180
cggttctctg gcagcggctc cggcacagac tacaccctga caatcagctc cctgcagcct 240cggttctctg gcagcggctc cggcacagac tacaccctga caatcagctc cctgcagcct 240
gaggatttcg ccgtgtactt ttgccagcag ggcaataccc tgccatatac atttggctgt 300gaggatttcg ccgtgtactt ttgccagcag ggcaataccc tgccatatac atttggctgt 300
ggcaccaagc tggagatcaa g 321ggcaccaagc tggagatcaa g 321
<210> 367<210> 367
<211> 321<211> 321
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 367<400> 367
gagatcgtga tgacccagtc cccagccaca ctgagcctgt ccccaggaga gagggccacc 60gagatcgtga tgacccagtc cccagccaca ctgagcctgt ccccaggaga gagggccacc 60
ctgtcttgta gagccagcca ggatatctcc aagtatctga actggtacca gcagaagcct 120ctgtcttgta gagccagcca ggatatctcc aagtatctga actggtacca gcagaagcct 120
ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctagac tgcacagcgg catccctgcc 180ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctagac tgcacagcgg catccctgcc 180
aggttttctg gcagcggctc cggcacagac tataccctga caatctctag cctgcagcca 240aggttttctg gcagcggctc cggcacagac tataccctga caatctctag cctgcagcca 240
gaggatttcg ccgtgtactt ttgtcagcag ggaaatactc tgccatacac ctttggatgc 300gaggatttcg ccgtgtactt ttgtcagcag ggaaatactc tgccatacac ctttggatgc 300
ggaactaaac tggaaatcaa g 321ggaactaaac tggaaatcaa g 321
<210> 368<210> 368
<211> 321<211> 321
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 368<400> 368
gagattgtga tgacccagtc ccccgccacc ctgagtctga gccccggaga acgagctacc 60gagattgtga tgacccagtc ccccgccacc ctgagtctga gccccggaga acgagctacc 60
ctgagttgcc gagcttccca ggacatttcc aagtacctga actggtatca gcagaagcca 120ctgagttgcc gagcttccca ggacatttcc aagtacctga actggtatca gcagaagcca 120
ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctcgcc tgcacagcgg catcccagca 180ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctcgcc tgcacagcgg catcccagca 180
cggttctctg gcagcggctc cggcacagac tacaccctga caatcagctc cctgcagcct 240cggttctctg gcagcggctc cggcacagac tacaccctga caatcagctc cctgcagcct 240
gaggatttcg ccgtgtactt ttgccagcag ggcaataccc tgccatatac atttggctgt 300gaggatttcg ccgtgtactt ttgccagcag ggcaataccc tgccatatac atttggctgt 300
ggcaccaagc tggagatcaa g 321ggcaccaagc tggagatcaa g 321
<210> 369<210> 369
<211> 321<211> 321
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 369<400> 369
gagatcgtga tgacccagtc tccagccaca ctgtctctga gcccaggaga gagggccacc 60gagatcgtga tgacccagtc tccagccaca ctgtctctga gcccaggaga gagggccacc 60
ctgtcttgcc gcgccagcca ggatatctcc aagtatctga actggtacca gcagaagcca 120ctgtcttgcc gcgccagcca ggatatctcc aagtatctga actggtacca gcagaagcca 120
ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctcgcc tgcacagcgg catcccagca 180ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctcgcc tgcacagcgg catcccagca 180
cggttctccg gctctggcag cggcacagac tacaccctga caatctcctc tctgcagccc 240cggttctccg gctctggcag cggcacagac tacaccctga caatctcctc tctgcagccc 240
gaggatttcg ccgtgtattt ttgccagcag ggcaataccc tgccttacac atttggccag 300gaggatttcg ccgtgtattt ttgccagcag ggcaataccc tgccttacac atttggccag 300
ggcaccaagc tggagatcaa g 321ggcaccaagc tggagatcaa g 321
<210> 370<210> 370
<211> 321<211> 321
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 370<400> 370
gagatcgtga tgacccagag cccagccaca ctgagcctgt ccccaggaga gagggccacc 60gagatcgtga tgacccagag cccagccaca ctgagcctgt ccccaggaga gagggccacc 60
ctgagctgca gagcctccca ggatatctct aagtatctga actggtacca gcagaagcct 120ctgagctgca gagcctccca ggatatctct aagtatctga actggtacca gcagaagcct 120
ggacaggcac caaggctgct gatctaccac accagcagac tgcactccgg catccctgca 180ggacaggcac caaggctgct gatctaccac accagcagac tgcactccgg catccctgca 180
aggttctctg gcagcggctc cggcacagac tacaccctga caatctctag cctgcagcct 240aggttctctg gcagcggctc cggcacagac tacaccctga caatctctag cctgcagcct 240
gaggatttcg ccgtgtattt ttgtcagcag ggcaataccc tgccatacac atttggccag 300gaggatttcg ccgtgtattt ttgtcagcag ggcaataccc tgccatacac atttggccag 300
ggcaccaagc tggagatcaa g 321ggcaccaagc tggagatcaa g 321
<210> 371<210> 371
<211> 321<211> 321
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 371<400> 371
gagatcgtga tgacccagag cccagccaca ctgtctctga gcccaggaga gagggccacc 60gagatcgtga tgacccagag cccagccaca ctgtctctga gcccaggaga gagggccacc 60
ctgagctgtc gcgcctccca ggatatctct aagtatctga actggtacca gcagaagcca 120ctgagctgtc gcgcctccca ggatatctct aagtatctga actggtacca gcagaagcca 120
ggacaggcac caaggctgct gatctaccac accagccgcc tgcactccgg catcccagca 180ggacaggcac caaggctgct gatctaccac accagccgcc tgcactccgg catcccagca 180
cggttctccg gctctggcag cggcacagac tacaccctga caatctcctc tctgcagccc 240cggttctccg gctctggcag cggcacagac tacaccctga caatctcctc tctgcagccc 240
gaggatttcg ccgtgtattt ttgccagcag ggcaataccc tgccttacac atttggccag 300gaggatttcg ccgtgtattt ttgccagcag ggcaataccc tgccttacac atttggccag 300
ggcaccaagc tggagatcaa g 321ggcaccaagc tggagatcaa g 321
<210> 372<210> 372
<211> 321<211> 321
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 372<400> 372
gagatcgtga tgacccagtc tccagccaca ctgagcctgt ccccaggaga gagggccacc 60gagatcgtga tgacccagtc tccagccaca ctgagcctgt ccccaggaga gagggccacc 60
ctgtcttgca gagccagcca ggatatctcc aagtatctga actggtacca gcagaagcct 120ctgtcttgca gagccagcca ggatatctcc aagtatctga actggtacca gcagaagcct 120
ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctagac tgcacagcgg catcccagca 180ggacaggcac caaggctgct gatctaccac acctctagac tgcacagcgg catcccagca 180
aggttctctg gcagcggctc cggcacagac tacaccctga caatctctag cctgcagcct 240aggttctctg gcagcggctc cggcacagac tacaccctga caatctctag cctgcagcct 240
gaggatttcg ccgtgtattt ttgccagcag ggcaataccc tgccatacac atttggccag 300gaggatttcg ccgtgtattt ttgccagcag ggcaataccc tgccatacac atttggccag 300
ggcaccaagc tggagatcaa g 321ggcaccaagc tggagatcaa g 321
<210> 373<210> 373
<211> 242<211> 242
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 373<400> 373
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln GluGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu
115 120 125 115 120 125
Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr CysSer Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile ArgThr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg
145 150 155 160145 150 155 160
Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly SerGln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser
165 170 175 165 170 175
Glu Thr Thr Tyr Tyr Ser Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile SerGlu Thr Thr Tyr Tyr Ser Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser
180 185 190 180 185 190
Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val ThrLys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr
195 200 205 195 200 205
Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr GlyAla Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr ValGly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val
225 230 235 240225 230 235 240
Ser SerSer Ser
<210> 374<210> 374
<211> 242<211> 242
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 374<400> 374
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Ser Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Ser Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro AlaGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala
130 135 140 130 135 140
Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg AlaThr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala
145 150 155 160145 150 155 160
Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro GlySer Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly
165 170 175 165 170 175
Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser GlyGln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly
180 185 190 180 185 190
Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr LeuIle Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu
195 200 205 195 200 205
Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys GlnThr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln
210 215 220 210 215 220
Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu GluGln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu
225 230 235 240225 230 235 240
Ile LysIle Lys
<210> 375<210> 375
<211> 242<211> 242
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 375<400> 375
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro AlaGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala
130 135 140 130 135 140
Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg AlaThr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala
145 150 155 160145 150 155 160
Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro GlySer Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly
165 170 175 165 170 175
Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser GlyGln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly
180 185 190 180 185 190
Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr LeuIle Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu
195 200 205 195 200 205
Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys GlnThr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln
210 215 220 210 215 220
Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu GluGln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu
225 230 235 240225 230 235 240
Ile LysIle Lys
<210> 376<210> 376
<211> 247<211> 247
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 376<400> 376
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
115 120 125 115 120 125
Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu ThrVal Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr
130 135 140 130 135 140
Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr GlyLeu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly
145 150 155 160145 150 155 160
Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile GlyVal Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly
165 170 175 165 170 175
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Ser Ser Ser Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Ser Ser Ser Leu Lys Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu LysArg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys
195 200 205 195 200 205
Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala LysLeu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys
210 215 220 210 215 220
His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln GlyHis Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Thr Leu Val Thr Val Ser SerThr Leu Val Thr Val Ser Ser
245 245
<210> 377<210> 377
<211> 247<211> 247
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 377<400> 377
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
115 120 125 115 120 125
Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu ThrVal Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr
130 135 140 130 135 140
Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr GlyLeu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly
145 150 155 160145 150 155 160
Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile GlyVal Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly
165 170 175 165 170 175
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu LysArg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys
195 200 205 195 200 205
Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala LysLeu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys
210 215 220 210 215 220
His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln GlyHis Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Thr Leu Val Thr Val Ser SerThr Leu Val Thr Val Ser Ser
245 245
<210> 378<210> 378
<211> 247<211> 247
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 378<400> 378
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Ser Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Ser Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val MetGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met
130 135 140 130 135 140
Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala ThrThr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp TyrLeu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr
165 170 175 165 170 175
Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr SerGln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser GlyArg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly
195 200 205 195 200 205
Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe AlaThr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala
210 215 220 210 215 220
Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly GlnVal Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Thr Lys Leu Glu Ile LysGly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
245 245
<210> 379<210> 379
<211> 247<211> 247
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 379<400> 379
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Gln Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val MetGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met
130 135 140 130 135 140
Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala ThrThr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp TyrLeu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr
165 170 175 165 170 175
Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr SerGln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser GlyArg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly
195 200 205 195 200 205
Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe AlaThr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala
210 215 220 210 215 220
Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly GlnVal Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Thr Lys Leu Glu Ile LysGly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
245 245
<210> 380<210> 380
<211> 247<211> 247
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 380<400> 380
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser GlnGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln
115 120 125 115 120 125
Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu ThrVal Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr
130 135 140 130 135 140
Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr GlyLeu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly
145 150 155 160145 150 155 160
Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile GlyVal Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly
165 170 175 165 170 175
Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ser Leu Lys SerVal Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ser Leu Lys Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu LysArg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys
195 200 205 195 200 205
Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala LysLeu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys
210 215 220 210 215 220
His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln GlyHis Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
225 230 235 240225 230 235 240
Thr Leu Val Thr Val Ser SerThr Leu Val Thr Val Ser Ser
245 245
<210> 381<210> 381
<211> 247<211> 247
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 381<400> 381
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val MetGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met
130 135 140 130 135 140
Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala ThrThr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr
145 150 155 160145 150 155 160
Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp TyrLeu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr
165 170 175 165 170 175
Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr SerGln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser GlyArg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly
195 200 205 195 200 205
Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe AlaThr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala
210 215 220 210 215 220
Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly GlnVal Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln
225 230 235 240225 230 235 240
Gly Thr Lys Leu Glu Ile LysGly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
245 245
<210> 382<210> 382
<211> 242<211> 242
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 382<400> 382
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro GlyGlu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrGlu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln ProSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly SerThr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Gly Gly Gly Gly Ser
100 105 110 100 105 110
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln GluGly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gln Val Gln Leu Gln Glu
115 120 125 115 120 125
Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr CysSer Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu Thr Leu Ser Leu Thr Cys
130 135 140 130 135 140
Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile ArgThr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg
145 150 155 160145 150 155 160
Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly SerGln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly Val Ile Trp Gly Ser
165 170 175 165 170 175
Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile SerGlu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ser Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser
180 185 190 180 185 190
Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val ThrLys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr
195 200 205 195 200 205
Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr GlyAla Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly
210 215 220 210 215 220
Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr ValGly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val
225 230 235 240225 230 235 240
Ser SerSer Ser
<210> 383<210> 383
<211> 242<211> 242
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 383<400> 383
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser GluGln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp TyrThr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr
20 25 30 20 25 30
Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp IleGly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45 35 40 45
Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ser Leu LysGly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ser Leu Lys
50 55 60 50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser LeuSer Arg Val Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Lys Asn Gln Val Ser Leu
65 70 75 8065 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys AlaLys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95 85 90 95
Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly GlnLys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly GlyGly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro AlaGly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala
130 135 140 130 135 140
Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg AlaThr Leu Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala
145 150 155 160145 150 155 160
Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro GlySer Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly
165 170 175 165 170 175
Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser GlyGln Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly
180 185 190 180 185 190
Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr LeuIle Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu
195 200 205 195 200 205
Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys GlnThr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Phe Cys Gln
210 215 220 210 215 220
Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu GluGln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu
225 230 235 240225 230 235 240
Ile LysIle Lys
<210> 384<210> 384
<211> 1467<211> 1467
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 384<400> 384
atgcttctcc tggtgacaag ccttctgctc tgtgagttac cacacccagc attcctcctg 60atgcttctcc tggtgacaag ccttctgctc tgtgagttac cacaccagc attcctcctg 60
atcccagaca tccagatgac acagactaca tcctccctgt ctgcctctct gggagacaga 120atcccagaca tccagatgac acagactaca tcctccctgt ctgcctctct gggagacaga 120
gtcaccatca gttgcagggc aagtcaggac attagtaaat atttaaattg gtatcagcag 180gtcaccatca gttgcagggc aagtcaggac attagtaaat atttaaattg gtatcagcag 180
aaaccagatg gaactgttaa actcctgatc taccatacat caagattaca ctcaggagtc 240aaaccagatg gaactgttaa actcctgatc taccatacat caagattaca ctcaggagtc 240
ccatcaaggt tcagtggcag tgggtctgga acagattatt ctctcaccat tagcaacctg 300ccatcaaggt tcagtggcag tgggtctgga acagattatt ctctcaccat tagcaacctg 300
gagcaagaag atattgccac ttacttttgc caacagggta atacgcttcc gtacacgttc 360gagcaagaag atattgccac ttacttttgc caacagggta atacgcttcc gtacacgttc 360
ggagggggga ctaagttgga aataacaggc tccacctctg gatccggcaa gcccggatct 420ggagggggga ctaagttgga aataacaggc tccacctctg gatccggcaa gcccggatct 420
ggcgagggat ccaccaaggg cgaggtgaaa ctgcaggagt caggacctgg cctggtggcg 480ggcgagggat ccaccaaggg cgaggtgaaa ctgcaggagt caggacctgg cctggtggcg 480
ccctcacaga gcctgtccgt cacatgcact gtctcagggg tctcattacc cgactatggt 540ccctcacaga gcctgtccgt cacatgcact gtctcagggg tctcattacc cgactatggt 540
gtaagctgga ttcgccagcc tccacgaaag ggtctggagt ggctgggagt aatatggggt 600gtaagctgga ttcgccagcc tccacgaaag ggtctggagt ggctgggagt aatatggggt 600
agtgaaacca catactataa ttcagctctc aaatccagac tgaccatcat caaggacaac 660agtgaaacca catactataa ttcagctctc aaatccagac tgaccatcat caaggacaac 660
tccaagagcc aagttttctt aaaaatgaac agtctgcaaa ctgatgacac agccatttac 720tccaagagcc aagttttctt aaaaatgaac agtctgcaaa ctgatgacac agccatttac 720
tactgtgcca aacattatta ctacggtggt agctatgcta tggactactg gggtcaagga 780tactgtgcca aacattatta ctacggtggt agctatgcta tggactactg gggtcaagga 780
acctcagtca ccgtctcctc agcggccgca attgaagtta tgtatcctcc tccttaccta 840acctcagtca ccgtctcctc agcggccgca attgaagtta tgtatcctcc tccttaccta 840
gacaatgaga agagcaatgg aaccattatc catgtgaaag ggaaacacct ttgtccaagt 900gacaatgaga agagcaatgg aaccattatc catgtgaaag ggaaacacct ttgtccaagt 900
cccctatttc ccggaccttc taagcccttt tgggtgctgg tggtggttgg gggagtcctg 960cccctatttc ccggaccttc taagcccttt tgggtgctgg tggtggttgg gggagtcctg 960
gcttgctata gcttgctagt aacagtggcc tttattattt tctgggtgag gagtaagagg 1020gcttgctata gcttgctagt aacagtggcc tttattattt tctgggtgag gagtaagagg 1020
agcaggctcc tgcacagtga ctacatgaac atgactcccc gccgccccgg gcccacccgc 1080agcaggctcc tgcacagtga ctacatgaac atgactcccc gccgccccgg gcccacccgc 1080
aagcattacc agccctatgc cccaccacgc gacttcgcag cctatcgctc cagagtgaag 1140aagcattacc agccctatgc cccaccacgc gacttcgcag cctatcgctc cagagtgaag 1140
ttcagcagga gcgcagacgc ccccgcgtac cagcagggcc agaaccagct ctataacgag 1200ttcagcagga gcgcagacgc ccccgcgtac cagcaggggcc agaaccagct ctataacgag 1200
ctcaatctag gacgaagaga ggagtacgat gttttggaca agagacgtgg ccgggaccct 1260ctcaatctag gacgaagaga ggagtacgat gttttggaca agagacgtgg ccgggaccct 1260
gagatggggg gaaagccgag aaggaagaac cctcaggaag gcctgtacaa tgaactgcag 1320gagatggggg gaaagccgag aaggaagaac cctcaggaag gcctgtacaa tgaactgcag 1320
aaagataaga tggcggaggc ctacagtgag attgggatga aaggcgagcg ccggaggggc 1380aaagataaga tggcggaggc ctacagtgag attgggatga aaggcgagcg ccggaggggc 1380
aaggggcacg atggccttta ccagggtctc agtacagcca ccaaggacac ctacgacgcc 1440aaggggcacg atggccttta ccagggtctc agtacagcca ccaaggacac ctacgacgcc 1440
cttcacatgc aggccctgcc ccctcgc 1467cttcacatgc aggccctgcc ccctcgc 1467
<210> 385<210> 385
<211> 489<211> 489
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 385<400> 385
Met Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His ProMet Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His Pro
1 5 10 15 1 5 10 15
Ala Phe Leu Leu Ile Pro Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser SerAla Phe Leu Leu Ile Pro Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser
20 25 30 20 25 30
Leu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala SerLeu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser
35 40 45 35 40 45
Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp GlyGln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly
50 55 60 50 55 60
Thr Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly ValThr Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val
65 70 75 8065 70 75 80
Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu ThrPro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Ile Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln GlnIle Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu IleGly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile
115 120 125 115 120 125
Thr Gly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly SerThr Gly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser
130 135 140 130 135 140
Thr Lys Gly Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val AlaThr Lys Gly Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala
145 150 155 160145 150 155 160
Pro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser LeuPro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu
165 170 175 165 170 175
Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly LeuPro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu
180 185 190 180 185 190
Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn SerGlu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser
195 200 205 195 200 205
Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser GlnAla Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln
210 215 220 210 215 220
Val Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile TyrVal Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr
225 230 235 240225 230 235 240
Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrTyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
245 250 255 245 250 255
Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser Ala Ala Ala Ile GluTrp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser Ala Ala Ala Ile Glu
260 265 270 260 265 270
Val Met Tyr Pro Pro Pro Tyr Leu Asp Asn Glu Lys Ser Asn Gly ThrVal Met Tyr Pro Pro Pro Tyr Leu Asp Asn Glu Lys Ser Asn Gly Thr
275 280 285 275 280 285
Ile Ile His Val Lys Gly Lys His Leu Cys Pro Ser Pro Leu Phe ProIle Ile His Val Lys Gly Lys His Leu Cys Pro Ser Pro Leu Phe Pro
290 295 300 290 295 300
Gly Pro Ser Lys Pro Phe Trp Val Leu Val Val Val Gly Gly Val LeuGly Pro Ser Lys Pro Phe Trp Val Leu Val Val Val Gly Gly Val Leu
305 310 315 320305 310 315 320
Ala Cys Tyr Ser Leu Leu Val Thr Val Ala Phe Ile Ile Phe Trp ValAla Cys Tyr Ser Leu Leu Val Thr Val Ala Phe Ile Ile Phe Trp Val
325 330 335 325 330 335
Arg Ser Lys Arg Ser Arg Leu Leu His Ser Asp Tyr Met Asn Met ThrArg Ser Lys Arg Ser Arg Leu Leu His Ser Asp Tyr Met Asn Met Thr
340 345 350 340 345 350
Pro Arg Arg Pro Gly Pro Thr Arg Lys His Tyr Gln Pro Tyr Ala ProPro Arg Arg Pro Gly Pro Thr Arg Lys His Tyr Gln Pro Tyr Ala Pro
355 360 365 355 360 365
Pro Arg Asp Phe Ala Ala Tyr Arg Ser Arg Val Lys Phe Ser Arg SerPro Arg Asp Phe Ala Ala Tyr Arg Ser Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser
370 375 380 370 375 380
Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn GluAla Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu
385 390 395 400385 390 395 400
Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg ArgLeu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg
405 410 415 405 410 415
Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro GlnGly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln
420 425 430 420 425 430
Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala TyrGlu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr
435 440 445 435 440 445
Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His AspSer Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp
450 455 460 450 455 460
Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp AlaGly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala
465 470 475 480465 470 475 480
Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgLeu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
485 485
<210> 386<210> 386
<211> 801<211> 801
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 386<400> 386
atgcttctcc tggtgacaag ccttctgctc tgtgagttac cacacccagc attcctcctg 60atgcttctcc tggtgacaag ccttctgctc tgtgagttac cacaccagc attcctcctg 60
atcccagaca tccagatgac acagactaca tcctccctgt ctgcctctct gggagacaga 120atcccagaca tccagatgac acagactaca tcctccctgt ctgcctctct gggagacaga 120
gtcaccatca gttgcagggc aagtcaggac attagtaaat atttaaattg gtatcagcag 180gtcaccatca gttgcagggc aagtcaggac attagtaaat atttaaattg gtatcagcag 180
aaaccagatg gaactgttaa actcctgatc taccatacat caagattaca ctcaggagtc 240aaaccagatg gaactgttaa actcctgatc taccatacat caagattaca ctcaggagtc 240
ccatcaaggt tcagtggcag tgggtctgga acagattatt ctctcaccat tagcaacctg 300ccatcaaggt tcagtggcag tgggtctgga acagattatt ctctcaccat tagcaacctg 300
gagcaagaag atattgccac ttacttttgc caacagggta atacgcttcc gtacacgttc 360gagcaagaag atattgccac ttacttttgc caacagggta atacgcttcc gtacacgttc 360
ggagggggga ctaagttgga aataacaggc tccacctctg gatccggcaa gcccggatct 420ggagggggga ctaagttgga aataacaggc tccacctctg gatccggcaa gcccggatct 420
ggcgagggat ccaccaaggg cgaggtgaaa ctgcaggagt caggacctgg cctggtggcg 480ggcgagggat ccaccaaggg cgaggtgaaa ctgcaggagt caggacctgg cctggtggcg 480
ccctcacaga gcctgtccgt cacatgcact gtctcagggg tctcattacc cgactatggt 540ccctcacaga gcctgtccgt cacatgcact gtctcagggg tctcattacc cgactatggt 540
gtaagctgga ttcgccagcc tccacgaaag ggtctggagt ggctgggagt aatatggggt 600gtaagctgga ttcgccagcc tccacgaaag ggtctggagt ggctgggagt aatatggggt 600
agtgaaacca catactataa ttcagctctc aaatccagac tgaccatcat caaggacaac 660agtgaaacca catactataa ttcagctctc aaatccagac tgaccatcat caaggacaac 660
tccaagagcc aagttttctt aaaaatgaac agtctgcaaa ctgatgacac agccatttac 720tccaagagcc aagttttctt aaaaatgaac agtctgcaaa ctgatgacac agccatttac 720
tactgtgcca aacattatta ctacggtggt agctatgcta tggactactg gggtcaagga 780tactgtgcca aacattatta ctacggtggt agctatgcta tggactactg gggtcaagga 780
acctcagtca ccgtctcctc a 801acctcagtca ccgtctcctc a 801
<210> 387<210> 387
<211> 266<211> 266
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 387<400> 387
Met Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His ProMet Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His Pro
1 5 10 15 1 5 10 15
Ala Phe Leu Leu Ile Pro Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser SerAla Phe Leu Leu Ile Pro Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser
20 25 30 20 25 30
Leu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala SerLeu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser
35 40 45 35 40 45
Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp GlyGln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly
50 55 60 50 55 60
Thr Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly ValThr Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val
65 70 75 8065 70 75 80
Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu ThrPro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Ile Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln GlnIle Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu IleGly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile
115 120 125 115 120 125
Thr Gly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly SerThr Gly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser
130 135 140 130 135 140
Thr Lys Gly Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val AlaThr Lys Gly Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala
145 150 155 160145 150 155 160
Pro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser LeuPro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu
165 170 175 165 170 175
Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly LeuPro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu
180 185 190 180 185 190
Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn SerGlu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser
195 200 205 195 200 205
Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser GlnAla Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln
210 215 220 210 215 220
Val Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile TyrVal Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr
225 230 235 240225 230 235 240
Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrTyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
245 250 255 245 250 255
Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val SerTrp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser
260 265 260 265
<210> 388<210> 388
<211> 1401<211> 1401
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 388<400> 388
gacatccaga tgacacagac tacatcctcc ctgtctgcct ctctgggaga cagagtcacc 60gacatccaga tgacacagac tacatcctcc ctgtctgcct ctctgggaga cagagtcacc 60
atcagttgca gggcaagtca ggacattagt aaatatttaa attggtatca gcagaaacca 120atcagttgca gggcaagtca ggacattagt aaatatttaa attggtatca gcagaaacca 120
gatggaactg ttaaactcct gatctaccat acatcaagat tacactcagg agtcccatca 180gatggaactg ttaaactcct gatctaccat acatcaagat tacactcagg agtcccatca 180
aggttcagtg gcagtgggtc tggaacagat tattctctca ccattagcaa cctggagcaa 240aggttcagtg gcagtgggtc tggaacagat tattctctca ccattagcaa cctggagcaa 240
gaagatattg ccacttactt ttgccaacag ggtaatacgc ttccgtacac gttcggaggg 300gaagatattg ccacttactt ttgccaacag ggtaatacgc ttccgtacac gttcggaggg 300
gggactaagt tggaaataac aggctccacc tctggatccg gcaagcccgg atctggcgag 360gggactaagt tggaaataac aggctccacc tctggatccg gcaagcccgg atctggcgag 360
ggatccacca agggcgaggt gaaactgcag gagtcaggac ctggcctggt ggcgccctca 420ggatccacca agggcgaggt gaaactgcag gagtcaggac ctggcctggt ggcgccctca 420
cagagcctgt ccgtcacatg cactgtctca ggggtctcat tacccgacta tggtgtaagc 480cagagcctgt ccgtcacatg cactgtctca ggggtctcat tacccgacta tggtgtaagc 480
tggattcgcc agcctccacg aaagggtctg gagtggctgg gagtaatatg gggtagtgaa 540tggattcgcc agcctccacg aaagggtctg gagtggctgg gagtaatatg gggtagtgaa 540
accacatact ataattcagc tctcaaatcc agactgacca tcatcaagga caactccaag 600accacatact ataattcagc tctcaaatcc agactgacca tcatcaagga caactccaag 600
agccaagttt tcttaaaaat gaacagtctg caaactgatg acacagccat ttactactgt 660agccaagttt tcttaaaaat gaacagtctg caaactgatg acacagccat ttactactgt 660
gccaaacatt attactacgg tggtagctat gctatggact actggggtca aggaacctca 720gccaaacatt attactacgg tggtagctat gctatggact actggggtca aggaacctca 720
gtcaccgtct cctcagcggc cgcaattgaa gttatgtatc ctcctcctta cctagacaat 780gtcaccgtct cctcagcggc cgcaattgaa gttatgtatc ctcctcctta cctagacaat 780
gagaagagca atggaaccat tatccatgtg aaagggaaac acctttgtcc aagtccccta 840gagaagagca atggaaccat tatccatgtg aaagggaaac acctttgtcc aagtccccta 840
tttcccggac cttctaagcc cttttgggtg ctggtggtgg ttgggggagt cctggcttgc 900tttcccggac cttctaagcc cttttgggtg ctggtggtgg ttgggggagt cctggcttgc 900
tatagcttgc tagtaacagt ggcctttatt attttctggg tgaggagtaa gaggagcagg 960tatagcttgc tagtaacagt ggcctttatt attttctggg tgaggagtaa gaggagcagg 960
ctcctgcaca gtgactacat gaacatgact ccccgccgcc ccgggcccac ccgcaagcat 1020ctcctgcaca gtgactacat gaacatgact ccccgccgcc ccgggcccac ccgcaagcat 1020
taccagccct atgccccacc acgcgacttc gcagcctatc gctccagagt gaagttcagc 1080taccagccct atgccccacc acgcgacttc gcagcctatc gctccagagt gaagttcagc 1080
aggagcgcag acgcccccgc gtaccagcag ggccagaacc agctctataa cgagctcaat 1140aggagcgcag acgcccccgc gtaccagcag ggccagaacc agctctataa cgagctcaat 1140
ctaggacgaa gagaggagta cgatgttttg gacaagagac gtggccggga ccctgagatg 1200ctaggacgaa gagaggagta cgatgttttg gacaagagac gtggccggga ccctgagatg 1200
gggggaaagc cgagaaggaa gaaccctcag gaaggcctgt acaatgaact gcagaaagat 1260gggggaaagc cgagaaggaa gaaccctcag gaaggcctgt acaatgaact gcagaaagat 1260
aagatggcgg aggcctacag tgagattggg atgaaaggcg agcgccggag gggcaagggg 1320aagatggcgg aggcctacag tgagattggg atgaaaggcg agcgccggag gggcaagggg 1320
cacgatggcc tttaccaggg tctcagtaca gccaccaagg acacctacga cgcccttcac 1380cacgatggcc tttaccaggg tctcagtaca gccaccaagg acacctacga cgcccttcac 1380
atgcaggccc tgccccctcg c 1401atgcaggccc tgccccctcg c 1401
<210> 389<210> 389
<211> 467<211> 467
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 389<400> 389
Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu GlyAsp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrAsp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu GlnSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Gln
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Ser Thr Ser GlyThr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Ser Thr Ser Gly
100 105 110 100 105 110
Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr Lys Gly Glu Val LysSer Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr Lys Gly Glu Val Lys
115 120 125 115 120 125
Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu SerLeu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu Ser
130 135 140 130 135 140
Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val SerVal Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val IleTrp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val Ile
165 170 175 165 170 175
Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg LeuTrp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg Leu
180 185 190 180 185 190
Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met AsnThr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met Asn
195 200 205 195 200 205
Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His TyrSer Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr
210 215 220 210 215 220
Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr SerTyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Val Thr Val Ser Ser Ala Ala Ala Ile Glu Val Met Tyr Pro Pro ProVal Thr Val Ser Ser Ala Ala Ala Ile Glu Val Met Tyr Pro Pro Pro
245 250 255 245 250 255
Tyr Leu Asp Asn Glu Lys Ser Asn Gly Thr Ile Ile His Val Lys GlyTyr Leu Asp Asn Glu Lys Ser Asn Gly Thr Ile Ile His Val Lys Gly
260 265 270 260 265 270
Lys His Leu Cys Pro Ser Pro Leu Phe Pro Gly Pro Ser Lys Pro PheLys His Leu Cys Pro Ser Pro Leu Phe Pro Gly Pro Ser Lys Pro Phe
275 280 285 275 280 285
Trp Val Leu Val Val Val Gly Gly Val Leu Ala Cys Tyr Ser Leu LeuTrp Val Leu Val Val Val Gly Gly Val Leu Ala Cys Tyr Ser Leu Leu
290 295 300 290 295 300
Val Thr Val Ala Phe Ile Ile Phe Trp Val Arg Ser Lys Arg Ser ArgVal Thr Val Ala Phe Ile Ile Phe Trp Val Arg Ser Lys Arg Ser Arg
305 310 315 320305 310 315 320
Leu Leu His Ser Asp Tyr Met Asn Met Thr Pro Arg Arg Pro Gly ProLeu Leu His Ser Asp Tyr Met Asn Met Thr Pro Arg Arg Pro Gly Pro
325 330 335 325 330 335
Thr Arg Lys His Tyr Gln Pro Tyr Ala Pro Pro Arg Asp Phe Ala AlaThr Arg Lys His Tyr Gln Pro Tyr Ala Pro Pro Arg Asp Phe Ala Ala
340 345 350 340 345 350
Tyr Arg Ser Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala TyrTyr Arg Ser Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr
355 360 365 355 360 365
Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg ArgGln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg
370 375 380 370 375 380
Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu MetGlu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met
385 390 395 400385 390 395 400
Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn GluGly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu
405 410 415 405 410 415
Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met LysLeu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys
420 425 430 420 425 430
Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly LeuGly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu
435 440 445 435 440 445
Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala LeuSer Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu
450 455 460 450 455 460
Pro Pro ArgPro Pro Arg
465 465
<210> 390<210> 390
<211> 735<211> 735
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 390<400> 390
gacatccaga tgacacagac tacatcctcc ctgtctgcct ctctgggaga cagagtcacc 60gacatccaga tgacacagac tacatcctcc ctgtctgcct ctctgggaga cagagtcacc 60
atcagttgca gggcaagtca ggacattagt aaatatttaa attggtatca gcagaaacca 120atcagttgca gggcaagtca ggacattagt aaatatttaa attggtatca gcagaaacca 120
gatggaactg ttaaactcct gatctaccat acatcaagat tacactcagg agtcccatca 180gatggaactg ttaaactcct gatctaccat acatcaagat tacactcagg agtcccatca 180
aggttcagtg gcagtgggtc tggaacagat tattctctca ccattagcaa cctggagcaa 240aggttcagtg gcagtgggtc tggaacagat tattctctca ccattagcaa cctggagcaa 240
gaagatattg ccacttactt ttgccaacag ggtaatacgc ttccgtacac gttcggaggg 300gaagatattg ccacttactt ttgccaacag ggtaatacgc ttccgtacac gttcggaggg 300
gggactaagt tggaaataac aggctccacc tctggatccg gcaagcccgg atctggcgag 360gggactaagt tggaaataac aggctccacc tctggatccg gcaagcccgg atctggcgag 360
ggatccacca agggcgaggt gaaactgcag gagtcaggac ctggcctggt ggcgccctca 420ggatccacca agggcgaggt gaaactgcag gagtcaggac ctggcctggt ggcgccctca 420
cagagcctgt ccgtcacatg cactgtctca ggggtctcat tacccgacta tggtgtaagc 480cagagcctgt ccgtcacatg cactgtctca ggggtctcat tacccgacta tggtgtaagc 480
tggattcgcc agcctccacg aaagggtctg gagtggctgg gagtaatatg gggtagtgaa 540tggattcgcc agcctccacg aaagggtctg gagtggctgg gagtaatatg gggtagtgaa 540
accacatact ataattcagc tctcaaatcc agactgacca tcatcaagga caactccaag 600accacatact ataattcagc tctcaaatcc agactgacca tcatcaagga caactccaag 600
agccaagttt tcttaaaaat gaacagtctg caaactgatg acacagccat ttactactgt 660agccaagttt tcttaaaaat gaacagtctg caaactgatg acacagccat ttactactgt 660
gccaaacatt attactacgg tggtagctat gctatggact actggggtca aggaacctca 720gccaaacatt attactacgg tggtagctat gctatggact actggggtca aggaacctca 720
gtcaccgtct cctca 735gtcaccgtct cctca 735
<210> 391<210> 391
<211> 245<211> 245
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 391<400> 391
Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu GlyAsp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrAsp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu GlnSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Gln
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Ser Thr Ser GlyThr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Ser Thr Ser Gly
100 105 110 100 105 110
Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr Lys Gly Glu Val LysSer Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr Lys Gly Glu Val Lys
115 120 125 115 120 125
Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu SerLeu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu Ser
130 135 140 130 135 140
Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val SerVal Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val IleTrp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val Ile
165 170 175 165 170 175
Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg LeuTrp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg Leu
180 185 190 180 185 190
Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met AsnThr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met Asn
195 200 205 195 200 205
Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His TyrSer Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr
210 215 220 210 215 220
Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr SerTyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Val Thr Val Ser SerVal Thr Val Ser Ser
245245
<210> 392<210> 392
<211> 1383<211> 1383
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 392<400> 392
atgctgctgc tggtgaccag cctgctgctg tgcgagctgc cccaccccgc ctttctgctg 60atgctgctgc tggtgaccag cctgctgctg tgcgagctgc cccaccccgc ctttctgctg 60
atccccgaca tccagatgac ccagaccacc tccagcctga gcgccagcct gggcgaccgg 120atccccgaca tccagatgac ccagaccacc tccagcctga gcgccagcct gggcgaccgg 120
gtgaccatca gctgccgggc cagccaggac atcagcaagt acctgaactg gtatcagcag 180gtgaccatca gctgccgggc cagccaggac atcagcaagt acctgaactg gtatcagcag 180
aagcccgacg gcaccgtcaa gctgctgatc taccacacca gccggctgca cagcggcgtg 240aagcccgacg gcaccgtcaa gctgctgatc taccacacca gccggctgca cagcggcgtg 240
cccagccggt ttagcggcag cggctccggc accgactaca gcctgaccat ctccaacctg 300cccagccggt ttagcggcag cggctccggc accgactaca gcctgaccat ctccaacctg 300
gaacaggaag atatcgccac ctacttttgc cagcagggca acacactgcc ctacaccttt 360gaacaggaag atatcgccac ctacttttgc cagcagggca acacactgcc ctacaccttt 360
ggcggcggaa caaagctgga aatcaccggc agcacctccg gcagcggcaa gcctggcagc 420ggcggcggaa caaagctgga aatcaccggc agcacctccg gcagcggcaa gcctggcagc 420
ggcgagggca gcaccaaggg cgaggtgaag ctgcaggaaa gcggccctgg cctggtggcc 480ggcgagggca gcaccaaggg cgaggtgaag ctgcaggaaa gcggccctgg cctggtggcc 480
cccagccaga gcctgagcgt gacctgcacc gtgagcggcg tgagcctgcc cgactacggc 540cccagccaga gcctgagcgt gacctgcacc gtgagcggcg tgagcctgcc cgactacggc 540
gtgagctgga tccggcagcc ccccaggaag ggcctggaat ggctgggcgt gatctggggc 600gtgagctgga tccggcagcc ccccaggaag ggcctggaat ggctgggcgt gatctggggc 600
agcgagacca cctactacaa cagcgccctg aagagccggc tgaccatcat caaggacaac 660agcgagacca cctactacaa cagcgccctg aagagccggc tgaccatcat caaggacaac 660
agcaagagcc aggtgttcct gaagatgaac agcctgcaga ccgacgacac cgccatctac 720agcaagagcc aggtgttcct gaagatgaac agcctgcaga ccgacgacac cgccatctac 720
tactgcgcca agcactacta ctacggcggc agctacgcca tggactactg gggccagggc 780tactgcgcca agcactacta ctacggcggc agctacgcca tggactactg gggccagggc 780
accagcgtga ccgtgagcag cgaatctaag tacggaccgc cctgcccccc ttgccctatg 840accagcgtga ccgtgagcag cgaatctaag tacggaccgc cctgcccccc ttgccctatg 840
ttctgggtgc tggtggtggt cggaggcgtg ctggcctgct acagcctgct ggtcaccgtg 900ttctgggtgc tggtggtggt cggaggcgtg ctggcctgct acagcctgct ggtcaccgtg 900
gccttcatca tcttttgggt gaaacggggc agaaagaaac tcctgtatat attcaaacaa 960gccttcatca tcttttgggt gaaacggggc agaaagaaac tcctgtatat attcaaacaa 960
ccatttatga gaccagtaca aactactcaa gaggaagatg gctgtagctg ccgatttcca 1020ccatttatga gaccagtaca aactactcaa gaggaagatg gctgtagctg ccgatttcca 1020
gaagaagaag aaggaggatg tgaactgcgg gtgaagttca gcagaagcgc cgacgcccct 1080gaagaagaag aaggaggatg tgaactgcgg gtgaagttca gcagaagcgc cgacgcccct 1080
gcctaccagc agggccagaa tcagctgtac aacgagctga acctgggcag aagggaagag 1140gcctaccagc agggccagaa tcagctgtac aacgagctga acctgggcag aagggaagag 1140
tacgacgtcc tggataagcg gagaggccgg gaccctgaga tgggcggcaa gcctcggcgg 1200tacgacgtcc tggataagcg gagaggccgg gaccctgaga tgggcggcaa gcctcggcgg 1200
aagaaccccc aggaaggcct gtataacgaa ctgcagaaag acaagatggc cgaggcctac 1260aagaaccccc aggaaggcct gtataacgaa ctgcagaaag acaagatggc cgaggcctac 1260
agcgagatcg gcatgaaggg cgagcggagg cggggcaagg gccacgacgg cctgtatcag 1320agcgagatcg gcatgaaggg cgagcggagg cggggcaagg gccacgacgg cctgtatcag 1320
ggcctgtcca ccgccaccaa ggatacctac gacgccctgc acatgcaggc cctgccccca 1380ggcctgtcca ccgccaccaa ggatacctac gacgccctgc acatgcaggc cctgccccca 1380
agg 1383agg 1383
<210> 393<210> 393
<211> 461<211> 461
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 393<400> 393
Met Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His ProMet Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His Pro
1 5 10 15 1 5 10 15
Ala Phe Leu Leu Ile Pro Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser SerAla Phe Leu Leu Ile Pro Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser
20 25 30 20 25 30
Leu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala SerLeu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser
35 40 45 35 40 45
Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp GlyGln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly
50 55 60 50 55 60
Thr Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly ValThr Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val
65 70 75 8065 70 75 80
Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu ThrPro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Ile Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln GlnIle Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu IleGly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile
115 120 125 115 120 125
Thr Gly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly SerThr Gly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser
130 135 140 130 135 140
Thr Lys Gly Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val AlaThr Lys Gly Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala
145 150 155 160145 150 155 160
Pro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser LeuPro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu
165 170 175 165 170 175
Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly LeuPro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu
180 185 190 180 185 190
Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn SerGlu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser
195 200 205 195 200 205
Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser GlnAla Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln
210 215 220 210 215 220
Val Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile TyrVal Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr
225 230 235 240225 230 235 240
Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrTyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
245 250 255 245 250 255
Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser Glu Ser Lys Tyr GlyTrp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser Glu Ser Lys Tyr Gly
260 265 270 260 265 270
Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Met Phe Trp Val Leu Val Val Val GlyPro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Met Phe Trp Val Leu Val Val Val Gly
275 280 285 275 280 285
Gly Val Leu Ala Cys Tyr Ser Leu Leu Val Thr Val Ala Phe Ile IleGly Val Leu Ala Cys Tyr Ser Leu Leu Val Thr Val Ala Phe Ile Ile
290 295 300 290 295 300
Phe Trp Val Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys GlnPhe Trp Val Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln
305 310 315 320305 310 315 320
Pro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys SerPro Phe Met Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser
325 330 335 325 330 335
Cys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val LysCys Arg Phe Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys
340 345 350 340 345 350
Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn GlnPhe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln
355 360 365 355 360 365
Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val LeuLeu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu
370 375 380 370 375 380
Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg ArgAsp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg
385 390 395 400385 390 395 400
Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys MetLys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met
405 410 415 405 410 415
Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg GlyAla Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly
420 425 430 420 425 430
Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys AspLys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp
435 440 445 435 440 445
Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgThr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
450 455 460 450 455 460
<210> 394<210> 394
<211> 801<211> 801
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 394<400> 394
atgctgctgc tggtgaccag cctgctgctg tgcgagctgc cccaccccgc ctttctgctg 60atgctgctgc tggtgaccag cctgctgctg tgcgagctgc cccaccccgc ctttctgctg 60
atccccgaca tccagatgac ccagaccacc tccagcctga gcgccagcct gggcgaccgg 120atccccgaca tccagatgac ccagaccacc tccagcctga gcgccagcct gggcgaccgg 120
gtgaccatca gctgccgggc cagccaggac atcagcaagt acctgaactg gtatcagcag 180gtgaccatca gctgccgggc cagccaggac atcagcaagt acctgaactg gtatcagcag 180
aagcccgacg gcaccgtcaa gctgctgatc taccacacca gccggctgca cagcggcgtg 240aagcccgacg gcaccgtcaa gctgctgatc taccacacca gccggctgca cagcggcgtg 240
cccagccggt ttagcggcag cggctccggc accgactaca gcctgaccat ctccaacctg 300cccagccggt ttagcggcag cggctccggc accgactaca gcctgaccat ctccaacctg 300
gaacaggaag atatcgccac ctacttttgc cagcagggca acacactgcc ctacaccttt 360gaacaggaag atatcgccac ctacttttgc cagcagggca acacactgcc ctacaccttt 360
ggcggcggaa caaagctgga aatcaccggc agcacctccg gcagcggcaa gcctggcagc 420ggcggcggaa caaagctgga aatcaccggc agcacctccg gcagcggcaa gcctggcagc 420
ggcgagggca gcaccaaggg cgaggtgaag ctgcaggaaa gcggccctgg cctggtggcc 480ggcgagggca gcaccaaggg cgaggtgaag ctgcaggaaa gcggccctgg cctggtggcc 480
cccagccaga gcctgagcgt gacctgcacc gtgagcggcg tgagcctgcc cgactacggc 540cccagccaga gcctgagcgt gacctgcacc gtgagcggcg tgagcctgcc cgactacggc 540
gtgagctgga tccggcagcc ccccaggaag ggcctggaat ggctgggcgt gatctggggc 600gtgagctgga tccggcagcc ccccaggaag ggcctggaat ggctgggcgt gatctggggc 600
agcgagacca cctactacaa cagcgccctg aagagccggc tgaccatcat caaggacaac 660agcgagacca cctactacaa cagcgccctg aagagccggc tgaccatcat caaggacaac 660
agcaagagcc aggtgttcct gaagatgaac agcctgcaga ccgacgacac cgccatctac 720agcaagagcc aggtgttcct gaagatgaac agcctgcaga ccgacgacac cgccatctac 720
tactgcgcca agcactacta ctacggcggc agctacgcca tggactactg gggccagggc 780tactgcgcca agcactacta ctacggcggc agctacgcca tggactactg gggccagggc 780
accagcgtga ccgtgagcag c 801accagcgtga ccgtgagcag c 801
<210> 395<210> 395
<211> 267<211> 267
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 395<400> 395
Met Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His ProMet Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His Pro
1 5 10 15 1 5 10 15
Ala Phe Leu Leu Ile Pro Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser SerAla Phe Leu Leu Ile Pro Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser
20 25 30 20 25 30
Leu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala SerLeu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser
35 40 45 35 40 45
Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp GlyGln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly
50 55 60 50 55 60
Thr Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly ValThr Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val
65 70 75 8065 70 75 80
Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu ThrPro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr
85 90 95 85 90 95
Ile Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln GlnIle Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln
100 105 110 100 105 110
Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu IleGly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile
115 120 125 115 120 125
Thr Gly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly SerThr Gly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser
130 135 140 130 135 140
Thr Lys Gly Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val AlaThr Lys Gly Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala
145 150 155 160145 150 155 160
Pro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser LeuPro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu
165 170 175 165 170 175
Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly LeuPro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu
180 185 190 180 185 190
Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn SerGlu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser
195 200 205 195 200 205
Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser GlnAla Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln
210 215 220 210 215 220
Val Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile TyrVal Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr
225 230 235 240225 230 235 240
Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp TyrTyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr
245 250 255 245 250 255
Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser SerTrp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser
260 265 260 265
<210> 396<210> 396
<211> 1317<211> 1317
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 396<400> 396
gacatccaga tgacccagac cacctccagc ctgagcgcca gcctgggcga ccgggtgacc 60gacatccaga tgacccagac cacctccagc ctgagcgcca gcctgggcga ccgggtgacc 60
atcagctgcc gggccagcca ggacatcagc aagtacctga actggtatca gcagaagccc 120atcagctgcc gggccagcca ggacatcagc aagtacctga actggtatca gcagaagccc 120
gacggcaccg tcaagctgct gatctaccac accagccggc tgcacagcgg cgtgcccagc 180gacggcaccg tcaagctgct gatctaccac accagccggc tgcacagcgg cgtgcccagc 180
cggtttagcg gcagcggctc cggcaccgac tacagcctga ccatctccaa cctggaacag 240cggtttagcg gcagcggctc cggcaccgac tacagcctga ccatctccaa cctggaacag 240
gaagatatcg ccacctactt ttgccagcag ggcaacacac tgccctacac ctttggcggc 300gaagatatcg ccacctactt ttgccagcag ggcaacacac tgccctacac ctttggcggc 300
ggaacaaagc tggaaatcac cggcagcacc tccggcagcg gcaagcctgg cagcggcgag 360ggaacaaagc tggaaatcac cggcagcacc tccggcagcg gcaagcctgg cagcggcgag 360
ggcagcacca agggcgaggt gaagctgcag gaaagcggcc ctggcctggt ggcccccagc 420ggcagcacca agggcgaggt gaagctgcag gaaagcggcc ctggcctggt ggcccccagc 420
cagagcctga gcgtgacctg caccgtgagc ggcgtgagcc tgcccgacta cggcgtgagc 480cagagcctga gcgtgacctg caccgtgagc ggcgtgagcc tgcccgacta cggcgtgagc 480
tggatccggc agccccccag gaagggcctg gaatggctgg gcgtgatctg gggcagcgag 540tggatccggc agccccccag gaagggcctg gaatggctgg gcgtgatctg gggcagcgag 540
accacctact acaacagcgc cctgaagagc cggctgacca tcatcaagga caacagcaag 600accacctact acaacagcgc cctgaagagc cggctgacca tcatcaagga caacagcaag 600
agccaggtgt tcctgaagat gaacagcctg cagaccgacg acaccgccat ctactactgc 660agccaggtgt tcctgaagat gaacagcctg cagaccgacg acaccgccat ctactactgc 660
gccaagcact actactacgg cggcagctac gccatggact actggggcca gggcaccagc 720gccaagcact actactacgg cggcagctac gccatggact actggggcca gggcaccagc 720
gtgaccgtga gcagcgaatc taagtacgga ccgccctgcc ccccttgccc tatgttctgg 780gtgaccgtga gcagcgaatc taagtacgga ccgccctgcc ccccttgccc tatgttctgg 780
gtgctggtgg tggtcggagg cgtgctggcc tgctacagcc tgctggtcac cgtggccttc 840gtgctggtgg tggtcggagg cgtgctggcc tgctacagcc tgctggtcac cgtggccttc 840
atcatctttt gggtgaaacg gggcagaaag aaactcctgt atatattcaa acaaccattt 900atcatctttt gggtgaaacg gggcagaaag aaactcctgt atatattcaa acaaccattt 900
atgagaccag tacaaactac tcaagaggaa gatggctgta gctgccgatt tccagaagaa 960atgagaccag tacaaactac tcaagaggaa gatggctgta gctgccgatt tccagaagaa 960
gaagaaggag gatgtgaact gcgggtgaag ttcagcagaa gcgccgacgc ccctgcctac 1020gaagaaggag gatgtgaact gcgggtgaag ttcagcagaa gcgccgacgc ccctgcctac 1020
cagcagggcc agaatcagct gtacaacgag ctgaacctgg gcagaaggga agagtacgac 1080cagcaggggcc agaatcagct gtacaacgag ctgaacctgg gcagaaggga agagtacgac 1080
gtcctggata agcggagagg ccgggaccct gagatgggcg gcaagcctcg gcggaagaac 1140gtcctggata agcggagagg ccgggaccct gagatgggcg gcaagcctcg gcggaagaac 1140
ccccaggaag gcctgtataa cgaactgcag aaagacaaga tggccgaggc ctacagcgag 1200ccccaggaag gcctgtataa cgaactgcag aaagacaaga tggccgaggc ctacagcgag 1200
atcggcatga agggcgagcg gaggcggggc aagggccacg acggcctgta tcagggcctg 1260atcggcatga agggcgagcg gaggcggggc aagggccacg acggcctgta tcagggcctg 1260
tccaccgcca ccaaggatac ctacgacgcc ctgcacatgc aggccctgcc cccaagg 1317tccaccgcca ccaaggatac ctacgacgcc ctgcacatgc aggccctgcc cccaagg 1317
<210> 397<210> 397
<211> 439<211> 439
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 397<400> 397
Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu GlyAsp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrAsp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu GlnSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Gln
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Ser Thr Ser GlyThr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Ser Thr Ser Gly
100 105 110 100 105 110
Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr Lys Gly Glu Val LysSer Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr Lys Gly Glu Val Lys
115 120 125 115 120 125
Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu SerLeu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu Ser
130 135 140 130 135 140
Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val SerVal Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val IleTrp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val Ile
165 170 175 165 170 175
Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg LeuTrp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg Leu
180 185 190 180 185 190
Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met AsnThr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met Asn
195 200 205 195 200 205
Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His TyrSer Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr
210 215 220 210 215 220
Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr SerTyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Val Thr Val Ser Ser Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro CysVal Thr Val Ser Ser Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys
245 250 255 245 250 255
Pro Met Phe Trp Val Leu Val Val Val Gly Gly Val Leu Ala Cys TyrPro Met Phe Trp Val Leu Val Val Val Gly Gly Val Leu Ala Cys Tyr
260 265 270 260 265 270
Ser Leu Leu Val Thr Val Ala Phe Ile Ile Phe Trp Val Lys Arg GlySer Leu Leu Val Thr Val Ala Phe Ile Ile Phe Trp Val Lys Arg Gly
275 280 285 275 280 285
Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro ValArg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met Arg Pro Val
290 295 300 290 295 300
Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu GluGln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe Pro Glu Glu
305 310 315 320305 310 315 320
Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala AspGlu Glu Gly Gly Cys Glu Leu Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp
325 330 335 325 330 335
Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu AsnAla Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn
340 345 350 340 345 350
Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly ArgLeu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg
355 360 365 355 360 365
Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu GlyAsp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly
370 375 380 370 375 380
Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser GluLeu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu
385 390 395 400385 390 395 400
Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly LeuIle Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu
405 410 415 405 410 415
Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu HisTyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His
420 425 430 420 425 430
Met Gln Ala Leu Pro Pro ArgMet Gln Ala Leu Pro Pro Arg
435 435
<210> 398<210> 398
<211> 735<211> 735
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 398<400> 398
gacatccaga tgacccagac cacctccagc ctgagcgcca gcctgggcga ccgggtgacc 60gacatccaga tgacccagac cacctccagc ctgagcgcca gcctgggcga ccgggtgacc 60
atcagctgcc gggccagcca ggacatcagc aagtacctga actggtatca gcagaagccc 120atcagctgcc gggccagcca ggacatcagc aagtacctga actggtatca gcagaagccc 120
gacggcaccg tcaagctgct gatctaccac accagccggc tgcacagcgg cgtgcccagc 180gacggcaccg tcaagctgct gatctaccac accagccggc tgcacagcgg cgtgcccagc 180
cggtttagcg gcagcggctc cggcaccgac tacagcctga ccatctccaa cctggaacag 240cggtttagcg gcagcggctc cggcaccgac tacagcctga ccatctccaa cctggaacag 240
gaagatatcg ccacctactt ttgccagcag ggcaacacac tgccctacac ctttggcggc 300gaagatatcg ccacctactt ttgccagcag ggcaacacac tgccctacac ctttggcggc 300
ggaacaaagc tggaaatcac cggcagcacc tccggcagcg gcaagcctgg cagcggcgag 360ggaacaaagc tggaaatcac cggcagcacc tccggcagcg gcaagcctgg cagcggcgag 360
ggcagcacca agggcgaggt gaagctgcag gaaagcggcc ctggcctggt ggcccccagc 420ggcagcacca agggcgaggt gaagctgcag gaaagcggcc ctggcctggt ggcccccagc 420
cagagcctga gcgtgacctg caccgtgagc ggcgtgagcc tgcccgacta cggcgtgagc 480cagagcctga gcgtgacctg caccgtgagc ggcgtgagcc tgcccgacta cggcgtgagc 480
tggatccggc agccccccag gaagggcctg gaatggctgg gcgtgatctg gggcagcgag 540tggatccggc agccccccag gaagggcctg gaatggctgg gcgtgatctg gggcagcgag 540
accacctact acaacagcgc cctgaagagc cggctgacca tcatcaagga caacagcaag 600accacctact acaacagcgc cctgaagagc cggctgacca tcatcaagga caacagcaag 600
agccaggtgt tcctgaagat gaacagcctg cagaccgacg acaccgccat ctactactgc 660agccaggtgt tcctgaagat gaacagcctg cagaccgacg acaccgccat ctactactgc 660
gccaagcact actactacgg cggcagctac gccatggact actggggcca gggcaccagc 720gccaagcact actactacgg cggcagctac gccatggact actggggcca gggcaccagc 720
gtgaccgtga gcagc 735gtgaccgtga gcagc 735
<210> 399<210> 399
<211> 245<211> 245
<212> PRT<212> PRT
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polypeptide"polypeptide"
<400> 399<400> 399
Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu GlyAsp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys TyrAsp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr
20 25 30 20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu IleLeu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile
35 40 45 35 40 45
Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser GlyTyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60 50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu GlnSer Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Gln
65 70 75 8065 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro TyrGlu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr
85 90 95 85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Ser Thr Ser GlyThr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Ser Thr Ser Gly
100 105 110 100 105 110
Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr Lys Gly Glu Val LysSer Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr Lys Gly Glu Val Lys
115 120 125 115 120 125
Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu SerLeu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu Ser
130 135 140 130 135 140
Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val SerVal Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser
145 150 155 160145 150 155 160
Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val IleTrp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val Ile
165 170 175 165 170 175
Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg LeuTrp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg Leu
180 185 190 180 185 190
Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met AsnThr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met Asn
195 200 205 195 200 205
Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His TyrSer Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr
210 215 220 210 215 220
Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr SerTyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser
225 230 235 240225 230 235 240
Val Thr Val Ser SerVal Thr Val Ser Ser
245245
<210> 400<210> 400
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 400<400> 400
caggtgcagc tgcaggagtc cggcggcggc gtggtgcagc caggccggtc cctgagactg 60caggtgcagc tgcaggagtc cggcggcggc gtggtgcagc caggccggtc cctgagactg 60
tcttgtgccg ccagcggctt caccttttcc tcttatggca tgcactgggt gagacaggca 120tcttgtgccg ccagcggctt caccttttcc tcttatggca tgcactgggt gagacaggca 120
cctggcaagg gactggagtg ggtggccgtg atctcctacg acggctctaa caagtattac 180cctggcaagg gactggagtg ggtggccgtg atctcctacg acggctctaa caagtattac 180
gccgatagcg tgaagggcag gttcaccatc agccgcgaca actccaagaa tacactgtat 240gccgatagcg tgaagggcag gttcaccatc agccgcgaca actccaagaa tacactgtat 240
ctgcagatga atagcctgcg ggccgaggat accgccgtgt attactgcgg aggctccggc 300ctgcagatga atagcctgcg ggccgaggat accgccgtgt attactgcgg aggctccggc 300
tacgcactgc acgacgatta ttacggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtcaca 360tacgcactgc acgacgatta ttacggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtcaca 360
gtgagctcc 369gtgagctcc 369
<210> 401<210> 401
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 401<400> 401
caggtgcagc tgcaggagtc tggcggagga gtggtgcagc caggccggtc cctgagactg 60caggtgcagc tgcaggagtc tggcggagga gtggtgcagc caggccggtc cctgagactg 60
tcttgcgccg ccagcggctt cacattttct agctacggaa tgcactgggt gcgccaggca 120tcttgcgccg ccagcggctt cacattttct agctacggaa tgcactgggt gcgccaggca 120
cctggcaagg gactggagtg ggtggccgtg atctcctatg acggctctaa caagtactat 180cctggcaagg gactggagtg ggtggccgtg atctcctatg acggctctaa caagtactat 180
gccgattccg tgaagggcag gttcaccatc agccgcgaca actccaagaa tacactgtac 240gccgattccg tgaagggcag gttcaccatc agccgcgaca actccaagaa tacactgtac 240
ctgcagatga attccctgcg ggccgaggat accgccgtgt actattgtgg cggctctggc 300ctgcagatga attccctgcg ggccgaggat accgccgtgt actattgtgg cggctctggc 300
tatgccctgc acgacgatta ctatggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtgaca 360tatgccctgc acgacgatta ctatggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtgaca 360
gtgtcctct 369gtgtcctct 369
<210> 402<210> 402
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 402<400> 402
caggtgcagc tgcaggagtc tggcggagga gtggtgcagc caggccggag cctgagactg 60caggtgcagc tgcaggagtc tggcggagga gtggtgcagc caggccggag cctgagactg 60
tcctgcgccg cctctggctt cacctttagc tcctatggca tgcactgggt gagacaggca 120tcctgcgccg cctctggctt cacctttagc tcctatggca tgcactgggt gagacaggca 120
cctggcaagg gactggagtg ggtggccgtg atcagctacg acggctccaa caagtattac 180cctggcaagg gactggagtg ggtggccgtg atcagctacg acggctccaa caagtattac 180
gccgatagcg tgaagggcag gttcaccatc tctcgcgaca acagcaagaa tacactgtat 240gccgatagcg tgaagggcag gttcaccatc tctcgcgaca acagcaagaa tacactgtat 240
ctgcagatga attccctgcg ggccgaggat acagccgtgt attactgcgg aggcagcggc 300ctgcagatga attccctgcg ggccgaggat acagccgtgt attactgcgg aggcagcggc 300
tacgcactgc acgacgatta ttacggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtcaca 360tacgcactgc acgacgatta ttacggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtcaca 360
gtgtctagc 369gtgtctagc 369
<210> 403<210> 403
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 403<400> 403
caggtgcagc tgcaggagag cggcggcggc gtggtgcagc ccggccggtc tctgagactg 60caggtgcagc tgcaggagag cggcggcggc gtggtgcagc ccggccggtc tctgagactg 60
agctgtgccg cctccggctt cacctttagc tcctacggaa tgcactgggt gcgccaggca 120agctgtgccg cctccggctt cacctttagc tcctacggaa tgcactgggt gcgccaggca 120
cctggcaagg gactggagtg ggtggccgtg atctcttatg acggcagcaa caagtactat 180cctggcaagg gactggagtg ggtggccgtg atctcttatg acggcagcaa caagtactat 180
gccgatagcg tgaagggcag gttcaccatc tcccgcgaca actctaagaa tacactgtac 240gccgatagcg tgaagggcag gttcaccatc tcccgcgaca actctaagaa tacactgtac 240
ctgcagatga atagcctgcg ggccgaggat accgccgtgt actattgcgg aggctccggc 300ctgcagatga atagcctgcg ggccgaggat accgccgtgt actattgcgg aggctccggc 300
tatgcactgc acgacgatta ctatggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtgaca 360tatgcactgc acgacgatta ctatggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtgaca 360
gtgtctagc 369gtgtctagc 369
<210> 404<210> 404
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 404<400> 404
caggtccagc tgcaggagag tggggggggg gtcgtccagc ccggaagaag cctgagactg 60caggtccagc tgcaggagag tggggggggg gtcgtccagc ccggaagaag cctgagactg 60
tcatgtgccg catctgggtt tacttttagc tcctatggaa tgcactgggt gcgccaggca 120tcatgtgccg catctgggtt tacttttagc tcctatggaa tgcactgggt gcgccaggca 120
cctggcaagt gcctggagtg ggtggccgtg atctcctacg acggctctaa caagtactat 180cctggcaagt gcctggagtg ggtggccgtg atctcctacg acggctctaa caagtactat 180
gccgatagcg tgaagggccg gttcaccatc agcagagaca actccaagaa tacactgtat 240gccgatagcg tgaagggccg gttcaccatc agcagagaca actccaagaa tacactgtat 240
ctgcagatga attctctgcg ggccgaggat accgccgtgt actattgtgg aggctccggc 300ctgcagatga attctctgcg ggccgaggat accgccgtgt actattgtgg aggctccggc 300
tacgcactgc acgacgatta ctatggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtgaca 360tacgcactgc acgacgatta ctatggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtgaca 360
gtgtctagc 369gtgtctagc 369
<210> 405<210> 405
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 405<400> 405
caggtccagc tgcaggaatc cggcggagga gtggtgcagc caggccggtc tctgagactg 60caggtccagc tgcaggaatc cggcggagga gtggtgcagc caggccggtc tctgagactg 60
agctgcgccg cctccggctt cacattttcc tcttatggca tgcactgggt gagacaggcc 120agctgcgccg cctccggctt cacattttcc tcttatggca tgcactgggt gagacaggcc 120
cctggcaagt gtctggagtg ggtggccgtg atctcttacg acggcagcaa caagtattac 180cctggcaagt gtctggagtg ggtggccgtg atctcttacg acggcagcaa caagtattac 180
gccgatagcg tgaagggcag gttcaccatc tcccgcgaca actctaagaa tacactgtat 240gccgatagcg tgaagggcag gttcaccatc tcccgcgaca actctaagaa tacactgtat 240
ctgcagatga attccctgcg ggccgaggat accgccgtgt attactgcgg cggctctggc 300ctgcagatga attccctgcg ggccgaggat accgccgtgt attactgcgg cggctctggc 300
tacgccctgc acgacgacta ctatggactg gatgtctggg ggcagggcac actggtcact 360tacgccctgc acgacgacta ctatggactg gatgtctggg ggcagggcac actggtcact 360
gtctcttca 369gtctcttca 369
<210> 406<210> 406
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 406<400> 406
caggtccagc tgcaggaatc aggggggggg gtcgtccagc ccggaagaag tctgagactg 60caggtccagc tgcaggaatc aggggggggg gtcgtccagc ccggaagaag tctgagactg 60
tcatgtgccg catcagggtt tacctttagc tcctatggaa tgcactgggt gcgccaggca 120tcatgtgccg catcagggtt tacctttagc tcctatggaa tgcactgggt gcgccaggca 120
cctggcaagt gcctggagtg ggtggccgtg atctcctacg acggctctaa caagtactat 180cctggcaagt gcctggagtg ggtggccgtg atctcctacg acggctctaa caagtactat 180
gccgatagcg tgaagggccg gttcaccatc agcagagaca actccaagaa tacactgtat 240gccgatagcg tgaagggccg gttcaccatc agcagagaca actccaagaa tacactgtat 240
ctgcagatga attctctgcg ggccgaggat accgccgtgt actattgtgg aggctccggc 300ctgcagatga attctctgcg ggccgaggat accgccgtgt actattgtgg aggctccggc 300
tacgcactgc acgacgatta ctatggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtgaca 360tacgcactgc acgacgatta ctatggactg gacgtgtggg gacagggcac cctggtgaca 360
gtgtctagc 369gtgtctagc 369
<210> 407<210> 407
<211> 369<211> 369
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 407<400> 407
caggtccagc tgcaggaatc cggcggagga gtggtgcagc caggccggtc tctgagactg 60caggtccagc tgcaggaatc cggcggagga gtggtgcagc caggccggtc tctgagactg 60
agctgcgccg cctccggctt caccttttcc tcttatggca tgcactgggt gagacaggcc 120agctgcgccg cctccggctt caccttttcc tcttatggca tgcactgggt gagacaggcc 120
cctggcaagt gtctggagtg ggtggccgtg atctcttacg acggcagcaa caagtattac 180cctggcaagt gtctggagtg ggtggccgtg atctcttacg acggcagcaa caagtattac 180
gccgatagcg tgaagggcag gttcaccatc tcccgcgaca actctaagaa tacactgtat 240gccgatagcg tgaagggcag gttcaccatc tcccgcgaca actctaagaa tacactgtat 240
ctgcagatga attccctgcg ggccgaggat acagccgtgt attactgtgg cggctctggc 300ctgcagatga attccctgcg ggccgaggat acagccgtgt attactgtgg cggctctggc 300
tacgccctgc atgatgatta ttatggactg gatgtctggg ggcagggcac actggtcact 360tacgccctgc atgatgatta ttatggactg gatgtctggg ggcagggcac actggtcact 360
gtctcttcc 369gtctcttcc 369
<210> 408<210> 408
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 408<400> 408
cagtctgccc tgacccagcc agcaagcgtg tccggctctc ctggccagag catcacaatc 60cagtctgccc tgacccagcc agcaagcgtg tccggctctc ctggccagag catcacaatc 60
tcctgcaccg gcacaagctc cgacgtggga ggctataact acgtgagctg gtatcagcag 120tcctgcaccg gcacaagctc cgacgtggga ggctataact acgtgagctg gtatcagcag 120
cacccaggca aggcccccaa gctgatgatc tacgacgtga gcaacaggcc ttctggcgtg 180cacccaggca aggcccccaa gctgatgatc tacgacgtga gcaacaggcc ttctggcgtg 180
agcaatcgct tcagcggctc caagtctggc aataccgcct ctctgacaat cagcggcctg 240agcaatcgct tcagcggctc caagtctggc aataccgcct ctctgacaat cagcggcctg 240
caggcagagg acgaggcaga ttattactgc tctagctata cctcctctag cacactgtac 300caggcagagg acgaggcaga ttattactgc tctagctata cctcctctag cacactgtac 300
gtgtttggca gcggcaccaa ggtgacagtg ctg 333gtgtttggca gcggcaccaa ggtgacagtg ctg 333
<210> 409<210> 409
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 409<400> 409
cagagcgccc tgacccagcc agcatccgtg tctggcagcc caggccagtc tatcacaatc 60cagagcgccc tgacccagcc agcatccgtg tctggcagcc caggccagtc tatcacaatc 60
agctgcaccg gcacaagctc cgacgtggga ggctacaact atgtgagctg gtaccagcag 120agctgcaccg gcacaagctc cgacgtggga ggctacaact atgtgagctg gtaccagcag 120
caccctggca aggccccaaa gctgatgatc tatgacgtga gcaaccggcc atccggcgtg 180caccctggca aggccccaaa gctgatgatc tatgacgtga gcaaccggcc atccggcgtg 180
tctaatagat tctccggctc taagagcggc aataccgcct ccctgacaat ctctggcctg 240tctaatagat tctccggctc taagagcggc aataccgcct ccctgacaat ctctggcctg 240
caggcagagg acgaggcaga ttactattgt tctagctaca cctcctctag cacactgtac 300caggcagagg acgaggcaga ttactattgt tctagctaca cctcctctag cacactgtac 300
gtgttcggca gcggcaccaa ggtgacagtg ctg 333gtgttcggca gcggcaccaa ggtgacagtg ctg 333
<210> 410<210> 410
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 410<400> 410
cagtctgccc tgacccagcc agcaagcgtg tccggctctc ctggccagtc catcacaatc 60cagtctgccc tgacccagcc agcaagcgtg tccggctctc ctggccagtc catcacaatc 60
tcttgtaccg gcacatcctc tgacgtgggc ggctataact acgtgtcctg gtatcagcag 120tcttgtaccg gcacatcctc tgacgtgggc ggctataact acgtgtcctg gtatcagcag 120
cacccaggca aggcccccaa gctgatgatc tacgatgtga gcaacaggcc ttctggcgtg 180cacccaggca aggcccccaa gctgatgatc tacgatgtga gcaacaggcc ttctggcgtg 180
agcaatcgct tcagcggctc caagtctggc aataccgcca gcctgacaat ctccggcctg 240agcaatcgct tcagcggctc caagtctggc aataccgcca gcctgacaat ctccggcctg 240
caggcagagg acgaggcaga ttattactgc agctcctata cctctagctc cacactgtac 300caggcagagg acgaggcaga ttattactgc agctcctata cctctagctc cacactgtac 300
gtgtttggca gcggcaccaa ggtgacagtg ctg 333gtgtttggca gcggcaccaa ggtgacagtg ctg 333
<210> 411<210> 411
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 411<400> 411
cagagcgccc tgacccagcc agcatccgtg tctggcagcc caggccagtc catcacaatc 60cagagcgccc tgacccagcc agcatccgtg tctggcagcc caggccagtc catcacaatc 60
tcttgcaccg gcacatctag cgacgtgggc ggctacaact acgtgagctg gtaccagcag 120tcttgcaccg gcacatctag cgacgtgggc ggctacaact acgtgagctg gtaccagcag 120
caccctggca aggccccaaa gctgatgatc tatgatgtga gcaaccggcc ctccggcgtg 180caccctggca aggccccaaa gctgatgatc tatgatgtga gcaaccggcc ctccggcgtg 180
tctaatagat tctccggctc taagagcggc aataccgcca gcctgacaat ctccggcctg 240tctaatagat tctccggctc taagagcggc aataccgcca gcctgacaat ctccggcctg 240
caggcagagg acgaggcaga ttactattgc tcctcttaca ccagctcctc tacactgtac 300caggcagagg acgaggcaga ttactattgc tcctcttaca ccagctcctc tacactgtac 300
gtgttcggct ccggcaccaa ggtgacagtg ctg 333gtgttcggct ccggcaccaa ggtgacagtg ctg 333
<210> 412<210> 412
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 412<400> 412
cagtctgccc tgacccagcc tgcaagcgtg tccggctctc caggccagtc tatcacaatc 60cagtctgccc tgacccagcc tgcaagcgtg tccggctctc caggccagtc tatcacaatc 60
agctgtaccg gcacaagctc cgacgtgggc ggctataact acgtgagctg gtatcagcag 120agctgtaccg gcacaagctc cgacgtgggc ggctataact acgtgagctg gtatcagcag 120
caccctggca aggccccaaa gctgatgatc tacgacgtga gcaaccggcc ctctggcgtg 180caccctggca aggccccaaa gctgatgatc tacgacgtga gcaaccggcc ctctggcgtg 180
agcaatcggt tcagcggcag caagtctggc aataccgcct ccctgacaat ctctggcctg 240agcaatcggt tcagcggcag caagtctggc aataccgcct ccctgacaat ctctggcctg 240
caggcagagg acgaggcaga ttattactgt agcagttata cttcaagctc aaccctgtac 300caggcagagg acgaggcaga ttattactgt agcagttata cttcaagctc aaccctgtac 300
gtgtttggat gcggcactaa ggtcaccgtc ctg 333gtgtttggat gcggcactaa ggtcaccgtc ctg 333
<210> 413<210> 413
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 413<400> 413
cagtctgctc tgacccagcc cgcttccgtc tcagggtctc caggacagtc aattaccatt 60cagtctgctc tgacccagcc cgcttccgtc tcagggtctc caggacagtc aattaccatt 60
agttgcacag gcacctcatc cgatgtgggc ggctataact acgtgtcctg gtatcagcag 120agttgcacag gcacctcatc cgatgtgggc ggctataact acgtgtcctg gtatcagcag 120
cacccaggca aggcccccaa gctgatgatc tacgacgtga gcaacaggcc atctggcgtg 180cacccaggca aggcccccaa gctgatgatc tacgacgtga gcaacaggcc atctggcgtg 180
agcaatcgct tcagcggctc caagtctggc aataccgcca gcctgacaat ctccggcctg 240agcaatcgct tcagcggctc caagtctggc aataccgcca gcctgacaat ctccggcctg 240
caggcagagg acgaggcaga ttactattgc agctcctata cctctagctc cacactgtac 300caggcagagg acgaggcaga ttactattgc agctcctata cctctagctc cacactgtac 300
gtgtttggct gtggcaccaa ggtgacagtg ctg 333gtgtttggct gtggcaccaa ggtgacagtg ctg 333
<210> 414<210> 414
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 414<400> 414
cagtctgccc tgacccagcc tgcaagcgtg tccggctctc caggccagtc tatcacaatc 60cagtctgccc tgacccagcc tgcaagcgtg tccggctctc caggccagtc tatcacaatc 60
agctgtaccg gcacaagctc cgacgtgggc ggctataact acgtgagctg gtatcagcag 120agctgtaccg gcacaagctc cgacgtgggc ggctataact acgtgagctg gtatcagcag 120
caccctggca aggccccaaa gctgatgatc tacgacgtga gcaaccggcc ctctggcgtg 180caccctggca aggccccaaa gctgatgatc tacgacgtga gcaaccggcc ctctggcgtg 180
agcaatcggt tcagcggcag caagtctggc aataccgcct ccctgacaat ctctggcctg 240agcaatcggt tcagcggcag caagtctggc aataccgcct ccctgacaat ctctggcctg 240
caggcagagg acgaggcaga ttattactgt agctcctaca cttcttcaag cacactgtat 300caggcagagg acgaggcaga ttattactgt agctcctaca cttcttcaag cacactgtat 300
gtctttggat gcggaactaa ggtcactgtc ctg 333gtctttggat gcggaactaa ggtcactgtc ctg 333
<210> 415<210> 415
<211> 333<211> 333
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 415<400> 415
cagtctgctc tgacccagcc cgcttccgtc tcaggatctc caggacagtc tattacaatt 60cagtctgctc tgacccagcc cgcttccgtc tcaggatctc caggacagtc tattacaatt 60
agttgcacag gaacctcttc cgatgtgggc ggctataact acgtgtcctg gtatcagcag 120agttgcacag gaacctcttc cgatgtgggc ggctataact acgtgtcctg gtatcagcag 120
cacccaggca aggcccccaa gctgatgatc tacgacgtga gcaacaggcc ttctggcgtg 180cacccaggca aggcccccaa gctgatgatc tacgacgtga gcaacaggcc ttctggcgtg 180
agcaatcgct tcagcggctc caagtctggc aataccgcca gcctgacaat ctccggcctg 240agcaatcgct tcagcggctc caagtctggc aataccgcca gcctgacaat ctccggcctg 240
caggcagagg acgaggcaga ttactattgc agctcctata cctctagctc cacactgtac 300caggcagagg acgaggcaga ttactattgc agctcctata cctctagctc cacactgtac 300
gtgtttggct gtggcaccaa ggtgacagtg ctg 333gtgtttggct gtggcaccaa ggtgacagtg ctg 333
<210> 416<210> 416
<211> 1485<211> 1485
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 416<400> 416
atggccctcc ctgtcaccgc tctgttgctg ccgcttgctc tgctgctcca cgcagcgcga 60atggccctcc ctgtcaccgc tctgttgctg ccgcttgctc tgctgctcca cgcagcgcga 60
ccgcaggtac aattgcagga gtctggaggc ggtgtggtgc aacccggtcg cagcttgcgc 120ccgcaggtac aattgcagga gtctggaggc ggtgtggtgc aacccggtcg cagcttgcgc 120
ctgagttgtg ctgcgtctgg atttacattt tcatcttacg gaatgcattg ggtacgccag 180ctgagttgtg ctgcgtctgg atttacattt tcatcttacg gaatgcattg ggtacgccag 180
gcaccgggga aaggccttga atgggtggct gtaatttcat acgatggttc caacaaatac 240gcaccgggga aaggccttga atgggtggct gtaatttcat acgatggttc caacaaatac 240
tatgctgact cagtcaaggg tcgatttaca attagtcggg acaactccaa gaacaccctt 300tatgctgact cagtcaaggg tcgatttaca attagtcggg acaactccaa gaacaccctt 300
tatcttcaaa tgaattccct tagagcagag gatacggcgg tctattactg tggtggcagt 360tatcttcaaa tgaattccct tagagcagag gatacggcgg tctattactg tggtggcagt 360
ggttatgcac ttcatgatga ttactatggc ttggatgtct gggggcaagg gacgcttgta 420ggttatgcac ttcatgatga ttactatggc ttggatgtct gggggcaagg gacgcttgta 420
actgtatcct ctggtggtgg tggtagtggt gggggaggct ccggcggtgg cggctctcaa 480actgtatcct ctggtggtgg tggtagtggt gggggaggct ccggcggtgg cggctctcaa 480
tctgctctga ctcaaccagc aagcgtatca gggtcaccgg gacagagtat taccataagt 540tctgctctga ctcaaccagc aagcgtatca gggtcaccgg gacagagtat taccataagt 540
tgcacgggga cctctagcga tgtagggggg tataattatg tatcttggta tcaacaacac 600tgcacgggga cctctagcga tgtagggggg tataattatg tatcttggta tcaacaacac 600
cccgggaaag cccctaaatt gatgatctac gacgtgagca atcgacctag tggcgtatca 660cccgggaaag cccctaaatt gatgatctac gacgtgagca atcgacctag tggcgtatca 660
aatcgcttct ctggtagcaa gagtgggaat acggcgtccc ttactattag cggattgcaa 720aatcgcttct ctggtagcaa gagtgggaat acggcgtccc ttactattag cggattgcaa 720
gcagaagatg aggccgatta ctactgcagc tcctatacta gctcttctac attgtacgtc 780gcagaagatg aggccgatta ctactgcagc tcctatacta gctcttctac attgtacgtc 780
tttgggagcg gaacaaaagt aacagtactc acaacaacac ctgccccgag accgcctaca 840tttgggagcg gaacaaaagt aacagtactc acaacaacac ctgccccgag accgcctaca 840
ccagccccga ctattgccag ccagcctctg agcctcaggc ctgaggcctg taggcccgca 900ccagccccga ctattgccag ccagcctctg agcctcaggc ctgaggcctg taggcccgca 900
gcgggcggcg cagttcatac acggggcttg gatttcgctt gtgatattta tatttgggct 960gcgggcggcg cagttcatac acggggcttg gatttcgctt gtgatattta tatttgggct 960
cctttggcgg ggacatgtgg cgtgctgctt ctgtcacttg ttattacact gtactgtaaa 1020cctttggcgg ggacatgtgg cgtgctgctt ctgtcacttg ttattacact gtactgtaaa 1020
cgcgggcgaa aaaaattgct gtatattttt aagcagccat ttatgaggcc cgttcagacg 1080cgcgggcgaa aaaaattgct gtatattttt aagcagccat ttatgaggcc cgttcagacg 1080
acgcaggagg aggacggttg ctcttgcagg ttcccagaag aggaagaagg gggctgtgaa 1140acgcaggagg aggacggttg ctcttgcagg ttcccagaag aggaagaagg gggctgtgaa 1140
ttgcgggtta aattttcaag atccgcagac gctccagcat accaacaggg acaaaaccaa 1200ttgcgggtta aattttcaag atccgcagac gctccagcat accaacaggg acaaaaccaa 1200
ctctataacg agctgaatct tggaagaagg gaggaatatg atgtgctgga taaacggcgc 1260ctctataacg agctgaatct tggaagaagg gaggaatatg atgtgctgga taaacggcgc 1260
ggtagagatc cggagatggg cggaaaacca aggcgaaaaa accctcagga gggactctac 1320ggtagagatc cggagatggg cggaaaacca aggcgaaaaa accctcagga gggactctac 1320
aacgaactgc agaaagacaa aatggcggag gcttattccg aaataggcat gaagggcgag 1380aacgaactgc agaaagacaa aatggcggag gcttattccg aaataggcat gaagggcgag 1380
cggaggcgag ggaaagggca cgacggactg tatcaaggcc tctcaaccgc gactaaggat 1440cggaggcgag ggaaagggca cgacggactg tatcaaggcc tctcaaccgc gactaaggat 1440
acgtacgacg ccctgcacat gcaggccctg cctccgagat gataa 1485acgtacgacg ccctgcacat gcaggccctg cctccgagat gataa 1485
<210> 417<210> 417
<211> 1395<211> 1395
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<221> source<221> source
<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic<223> /note="Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide"polynucleotide"
<400> 417<400> 417
gaaattgtga tgacccagtc acccgccact cttagccttt cacccggtga gcgcgcaacc 60gaaattgtga tgacccagtc acccgccact cttagccttt cacccggtga gcgcgcaacc 60
ctgtcttgca gagcctccca agacatctca aaatacctta attggtatca acagaagccc 120ctgtcttgca gagcctccca agacatctca aaatacctta attggtatca acagaagccc 120
ggacaggctc ctcgccttct gatctaccac accagccggc tccattctgg aatccctgcc 180ggacaggctc ctcgccttct gatctaccac accagccggc tccattctgg aatccctgcc 180
aggttcagcg gtagcggatc tgggaccgac tacaccctca ctatcagctc actgcagcca 240aggttcagcg gtagcggatc tgggaccgac tacaccctca ctatcagctc actgcagcca 240
gaggacttcg ctgtctattt ctgtcagcaa gggaacaccc tgccctacac ctttggacag 300gaggacttcg ctgtctattt ctgtcagcaa gggaacaccc tgccctacac ctttggacag 300
ggcaccaagc tcgagattaa aggtggaggt ggcagcggag gaggtgggtc cggcggtgga 360ggcaccaagc tcgagattaa aggtggaggt ggcagcggag gaggtgggtc cggcggtgga 360
ggaagccagg tccaactcca agaaagcgga ccgggtcttg tgaagccatc agaaactctt 420ggaagccagg tccaactcca agaaagcgga ccgggtcttg tgaagccatc agaaactctt 420
tcactgactt gtactgtgag cggagtgtct ctccccgatt acggggtgtc ttggatcaga 480tcactgactt gtactgtgag cggagtgtct ctccccgatt acggggtgtc ttggatcaga 480
cagccaccgg ggaagggtct ggaatggatt ggagtgattt ggggctctga gactacttac 540cagccaccgg ggaagggtct ggaatggatt ggagtgattt ggggctctga gactacttac 540
taccaatcat ccctcaagtc acgcgtcacc atctcaaagg acaactctaa gaatcaggtg 600taccaatcat ccctcaagtc acgcgtcacc atctcaaagg acaactctaa gaatcaggtg 600
tcactgaaac tgtcatctgt gaccgcagcc gacaccgccg tgtactattg cgctaagcat 660tcactgaaac tgtcatctgt gaccgcagcc gacaccgccg tgtactattg cgctaagcat 660
tactattatg gcgggagcta cgcaatggat tactggggac agggtactct ggtcaccgtg 720tactattatg gcgggagcta cgcaatggat tactggggac agggtactct ggtcaccgtg 720
tccagcacca ctaccccagc accgaggcca cccaccccgg ctcctaccat cgcctcccag 780tccagcacca ctaccccagc accgaggcca cccaccccgg ctcctaccat cgcctcccag 780
cctctgtccc tgcgtccgga ggcatgtaga cccgcagctg gtggggccgt gcatacccgg 840cctctgtccc tgcgtccgga ggcatgtaga cccgcagctg gtggggccgt gcatacccgg 840
ggtcttgact tcgcctgcga tatctacatt tgggcccctc tggctggtac ttgcggggtc 900ggtcttgact tcgcctgcga tatctacatt tgggcccctc tggctggtac ttgcggggtc 900
ctgctgcttt cactcgtgat cactctttac tgtaagcgcg gtcggaagaa gctgctgtac 960ctgctgcttt cactcgtgat cactctttac tgtaagcgcg gtcggaagaa gctgctgtac 960
atctttaagc aacccttcat gaggcctgtg cagactactc aagaggagga cggctgttca 1020atctttaagc aacccttcat gaggcctgtg cagactactc aagaggagga cggctgttca 1020
tgccggttcc cagaggagga ggaaggcggc tgcgaactgc gcgtgaaatt cagccgcagc 1080tgccggttcc cagaggagga ggaaggcggc tgcgaactgc gcgtgaaatt cagccgcagc 1080
gcagatgctc cagcctacca gcaggggcag aaccagctct acaacgaact caatcttggt 1140gcagatgctc cagcctacca gcaggggcag aaccagctct acaacgaact caatcttggt 1140
cggagagagg agtacgacgt gctggacaag cggagaggac gggacccaga aatgggcggg 1200cggagagagg agtacgacgt gctggacaag cggagaggac gggacccaga aatgggcggg 1200
aagccgcgca gaaagaatcc ccaagagggc ctgtacaacg agctccaaaa ggataagatg 1260aagccgcgca gaaagaatcc ccaagagggc ctgtacaacg agctccaaaa ggataagatg 1260
gcagaagcct atagcgagat tggtatgaaa ggggaacgca gaagaggcaa aggccacgac 1320gcagaagcct atagcgagat tggtatgaaa ggggaacgca gaagaggcaa aggccacgac 1320
ggactgtacc agggactcag caccgccacc aaggacacct atgacgctct tcacatgcag 1380ggactgtacc agggactcag caccgccacc aaggacacct atgacgctct tcacatgcag 1380
gccctgccgc ctcgg 1395gccctgccgc ctcgg 1395
<---<---
Claims (143)
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US62/940,509 | 2019-11-26 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2022117055A RU2022117055A (en) | 2023-11-02 |
| RU2841244C2 true RU2841244C2 (en) | 2025-06-04 |
Family
ID=
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2018237022A1 (en) * | 2017-06-21 | 2018-12-27 | Icell Gene Therapeutics Llc | CHIMERIC ANTIGEN RECEPTORS (CARs), COMPOSITIONS AND METHODS THEREOF |
| WO2019089798A1 (en) * | 2017-10-31 | 2019-05-09 | Novartis Ag | Anti-car compositions and methods |
| RU2706582C2 (en) * | 2015-04-13 | 2019-11-19 | Пфайзер Инк. | Chimeric antigenic receptors aimed at antigen of aging of b-cells |
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2706582C2 (en) * | 2015-04-13 | 2019-11-19 | Пфайзер Инк. | Chimeric antigenic receptors aimed at antigen of aging of b-cells |
| WO2018237022A1 (en) * | 2017-06-21 | 2018-12-27 | Icell Gene Therapeutics Llc | CHIMERIC ANTIGEN RECEPTORS (CARs), COMPOSITIONS AND METHODS THEREOF |
| WO2019089798A1 (en) * | 2017-10-31 | 2019-05-09 | Novartis Ag | Anti-car compositions and methods |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| ZHILING YAN et al., A combination of humanised anti-CD19 and anti-BCMA CAR T cells in patients with relapsed or refractory multiple myeloma: a single-arm, phase 2 trial, The Lancet Haematology, Published online August 1, 2019, v. 6, Is. 10, p. e521-e529. * |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US12383601B2 (en) | Chimeric antigen receptors and uses thereof | |
| EP3844267B1 (en) | Methods of making chimeric antigen receptor-expressing cells | |
| US20230256017A1 (en) | Methods of making chimeric antigen receptor-expressing cells | |
| KR20220147109A (en) | Methods for making chimeric antigen receptor-expressing cells | |
| US20250000973A1 (en) | Methods of making chimeric antigen receptor-expressing cells | |
| JP2025531220A (en) | Treating autoimmune disorders using chimeric antigen receptor therapy | |
| RU2841244C2 (en) | Chimeric antigen receptors and ways of use thereof | |
| RU2822196C2 (en) | Methods of producing cells expressing chimeric antigen receptor | |
| TW202538050A (en) | Methods of making chimeric antigen receptor-expressing cells | |
| HK40048881B (en) | Methods of making chimeric antigen receptor-expressing cells | |
| HK40048881A (en) | Methods of making chimeric antigen receptor-expressing cells |