[go: up one dir, main page]

RU2723008C9 - Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use - Google Patents

Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use Download PDF

Info

Publication number
RU2723008C9
RU2723008C9 RU2020116437A RU2020116437A RU2723008C9 RU 2723008 C9 RU2723008 C9 RU 2723008C9 RU 2020116437 A RU2020116437 A RU 2020116437A RU 2020116437 A RU2020116437 A RU 2020116437A RU 2723008 C9 RU2723008 C9 RU 2723008C9
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
cov
sars
virus
rbd
protein
Prior art date
Application number
RU2020116437A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2723008C1 (en
Inventor
Дмитрий Викторович Щебляков
Ильяс Булатович Есмагамбетов
Денис Юрьевич Логунов
Артем Алексеевич Деркаев
Павел Вячеславович Симакин
Фатима Магометовна Ижаева
Алина Шахмировна Джаруллаева
Ольга Вадимовна Зубкова
Татьяна Андреевна Ожаровская
Инна Вадимовна Должикова
Амир Ильдарович Тухватулин
Наталья Михайловна Тухватулина
Ирина Алексеевна Фаворская
Борис Савельевич Народицкий
Александр Леонидович Гинцбург
Original Assignee
федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации filed Critical федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Priority to RU2020116437A priority Critical patent/RU2723008C9/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2723008C1 publication Critical patent/RU2723008C1/en
Publication of RU2723008C9 publication Critical patent/RU2723008C9/en
Priority to PCT/RU2021/000295 priority patent/WO2021246910A1/en

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K1/00General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
    • C07K1/14Extraction; Separation; Purification
    • C07K1/16Extraction; Separation; Purification by chromatography
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K1/00General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
    • C07K1/14Extraction; Separation; Purification
    • C07K1/36Extraction; Separation; Purification by a combination of two or more processes of different types
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • C07K14/08RNA viruses
    • C07K14/165Coronaviridae, e.g. avian infectious bronchitis virus
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/08Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses
    • C07K16/10Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses from RNA viruses
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

FIELD: biotechnology.
SUBSTANCE: genetic construct for expression of recombinant protein RBD of virus SARS-CoV-2, strain of cells of Chinese hamster ovary CHO-S-RBD producing recombinant protein – receptor-binding domain (RBD) of SARS-CoV-2 virus, which can be used for diagnostic purposes. Described is a method of producing a Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD from a producer of recombinant RBD protein SARS-CoV-2 containing a genetic construct comprising SEQ ID NO: 1; introducing said genetic construct into cells by lipofection; selection of cells on antibiotic Hygromycin B. A Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD, a producer of recombinant RBD protein SARS-CoV-2 virus, is created. Method of producing recombinant protein RBD of virus SARS-CoV-2 including: cultivation of Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD; chromatographic purification of recombinant protein RBD of SARS-CoV-2 virus from culture medium of Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD; confirmation of obtaining of recombinant RBD virus SARS-CoV-2 virus. A recombinant RBD protein SARS-CoV-2 for detecting antibodies to SARS-CoV-2 is created. Test system is created for enzyme immunoassay of human serum or plasma. There is developed a method for serum or blood plasma analysis of convalescent COVID-19 for sampling the most promising for therapy of patients infected with SARS-CoV-2. A method of analyzing blood serum or human blood plasma for determining titre of antibodies to virus SARS-CoV-2 is developed.
EFFECT: invention provides a fast and effective test system for determining the most promising serum or blood plasma samples of convalescent COVID-19 for therapy of patients infected with SARS-CoV-2; invention enables to reduce the time and simplifies the procedure for analyzing serum or blood plasma of convalescent COVID-19 for sampling the most promising for therapy of patients infected with SARS-CoV-2; invention enables high and stable expression of recombinant RBD protein SARS-CoV-2.
10 cl, 4 dwg, 6 tbl, 8 ex

Description

Область техникиTechnology area

Изобретение относится к биотехнологии и касается создания нового штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцирующего рекомбинантный белок - рецептор-связывающий домен (RBD) вируса SARS-CoV-2, который может быть использован для диагностических целей.The invention relates to biotechnology and relates to the creation of a new strain of Chinese hamster ovary cells CHO-S-RBD, producing a recombinant protein - receptor-binding domain (RBD) of the SARS-CoV-2 virus, which can be used for diagnostic purposes.

Уровень техникиState of the art

В конце 2019 года в Китайской Народной Республике (КНР) произошла вспышка новой инфекции с эпицентром в городе Ухань (провинция Хубэй). Через некоторое время был обнаружен возбудитель данной инфекции, которым оказался неизвестный ранее коронавирус, получивший название SARS-CoV-2. В течение нескольких месяцев SARS-CoV-2 распространился по всему миру, став причиной пандемии, затронувшей более 200 стран. К 1 мая 2020 года количество заболевших превысило 3 млн человек, а количество погибших - 220 тыс. человек. При этом прогнозируется дальнейший рост заболеваемости и смертности, поскольку в большинстве стран эпидемия еще не достигла своего пика.At the end of 2019, an outbreak of a new infection occurred in the People's Republic of China (PRC) with an epicenter in Wuhan city (Hubei province). After some time, the causative agent of this infection was discovered, which turned out to be a previously unknown coronavirus, called SARS-CoV-2. Within a few months, SARS-CoV-2 spread around the world, causing a pandemic affecting more than 200 countries. By May 1, 2020, the number of cases exceeded 3 million people, and the death toll was 220 thousand people. At the same time, a further increase in morbidity and mortality is predicted, since in most countries the epidemic has not yet reached its peak.

SARS-CoV-2 вызывает потенциально тяжелую острую респираторную инфекцию, которая получила название COVID-19. Для данного заболевания характерно наличие таких клинических симптомов, как повышение температуры тела (более чем в 90% случаев); кашель - сухой или с небольшим количеством мокроты (более чем в 80% случаев); отдышка (в 55% случаев); утомляемость (в 44% случаев); ощущение заложенности в грудной клетке (более чем в 20% случаев). Наиболее тяжелыми осложнениями COVID-19 являются пневмония, острый респираторный дистресс-синдром, острая дыхательная недостаточность, острая сердечная недостаточность, острая почечная недостаточность, септический шок, кардиомиопатии, и др.SARS-CoV-2 causes a potentially severe acute respiratory infection called COVID-19. This disease is characterized by the presence of such clinical symptoms as fever (more than 90% of cases); cough - dry or with a small amount of sputum (more than 80% of cases); shortness of breath (in 55% of cases); fatigue (in 44% of cases); a feeling of congestion in the chest (more than 20% of cases). The most severe complications of COVID-19 are pneumonia, acute respiratory distress syndrome, acute respiratory failure, acute heart failure, acute renal failure, septic shock, cardiomyopathies, etc.

В настоящее время не зарегистрировано специфических средств лечения и профилактики COVID-19. В основном производится симптоматическое лечение. 1 апреля 2020 года Департамент здравоохранения Москвы издал приказ «О внедрении технологии использования свежезамороженной плазмы от доноров-реконвалесцентов COVID-19» для лечения пациентов с COVID-19 в терминальной стадии заболевания.Currently, there are no specific drugs for the treatment and prevention of COVID-19. Mostly symptomatic treatment is performed. On April 1, 2020, the Moscow Department of Health issued an order "On the introduction of the technology for using fresh frozen plasma from COVID-19 convalescent donors" for the treatment of patients with COVID-19 in the terminal stage of the disease.

Реконвалесценты - это люди, организм которых успешно справился с заболеванием, и они выздоровели без осложнений. Это произошло, в частности, и потому, что их иммунная система выработала антитела, которые нейтрализуют вирус.Если ввести плазму крови реконвалесцентов, которая содержит такие антитела, другим пациентам, это может смягчить течение их болезни.Reconvalescents are people whose body successfully coped with the disease, and they recovered without complications. This happened, in part, because their immune system produced antibodies that neutralize the virus. If convalescent blood plasma containing such antibodies is injected into other patients, this can mitigate the course of their illness.

Однако, не все образцы плазмы реконвалесцентов содержат одинаковое количество вируснейтрализующих антител. Поэтому актуальным вопросом является разработка метода, который позволил бы проводить масштабный скрининг плазмы и сывороток крови доноров-реконвалесцентов COVID-19 с целью отбора наиболее перспективных для терапии образцов.However, not all convalescent plasma samples contain the same amount of virus neutralizing antibodies. Therefore, an urgent issue is the development of a method that would allow large-scale screening of plasma and blood serum of COVID-19 convalescent donors in order to select the most promising samples for therapy.

Известен способ оценки сыворотки реконвалесцентов путем определения титра вируснейтрализующих антител (Ch. Shen et al. Treatment of 5 Critically Ill Patients With COVID-19 With Convalescent Plasma. JAMA. 2020;323(16):1582-1589. doi:10.1001). Данный способ основан на том, что к клеткам Vero (клетки почки африканской зеленой мартышки) добавляют образцы сыворотки крови в различных разведениях и одновременно с этим заражают их коронавирусом SARS-CoV-2. Далее клетки инкубируют 37°С, 5% СО2 в течение 5 дней, затем оценивают цитопатическое действие вируса. Результат представляют как титр вируснейтрализующих антител (самое большое разведение сыворотки, которое показало ингибирующую активность SARS-CoV-2). К недостатком данного способа можно отнести длительный срок постановки анализа (5 дней) и необходимость придерживаться правил работы с патогенными биологическими агентами (ПБА) II группы патогенности. Все это влечет за собой низкую производительность и высокую себестоимость данного анализа.There is a known method for assessing the serum of convalescents by determining the titer of neutralizing antibodies (Ch. Shen et al. Treatment of 5 Critically Ill Patients With COVID-19 With Convalescent Plasma. JAMA. 2020; 323 (16): 1582-1589. Doi: 10.1001). This method is based on the fact that blood serum samples in various dilutions are added to Vero cells (kidney cells of the African green monkey) and at the same time they are infected with the SARS-CoV-2 coronavirus. Then the cells are incubated at 37 ° C, 5% CO 2 for 5 days, then the cytopathic effect of the virus is assessed. The result is presented as the titer of neutralizing antibodies (the largest serum dilution that showed the inhibitory activity of SARS-CoV-2). The disadvantage of this method is the long term of the analysis (5 days) and the need to adhere to the rules for working with pathogenic biological agents (PBA) of the II pathogenicity group. All this entails low productivity and high cost of this analysis.

Кроме того, известен способ оценки плазмы реконвалесцентов путем определения титра вируснейтрализующих антител, в котором вместо коронавируса используются псевдотипированные лентивирусные частицы (PsV) (F.Wu Neutralizing antibody responses to SARS-CoV-2 in a COVID-19 recovered patient cohort and their implications, medRxiv 2020.03.30.20047365). Данный способ включает в себя культивирование клеток 293Т/АСЕ2, к которым добавляют образцы сыворотки крови в различных разведениях и одновременно с этим вносят PsV, содержащие ген люциферазы. Через 48 часов оценивают активность люциферазы стандартным набором (Promega). Результат представляют как титр вируснейтрализующих антител (самое большое разведение сыворотки, при добавлении которого активность люциферазы уменьшается на 50%). Недостатками данного способа являются длительность процесса (48 часов), трудоемкость, необходимость в дорогом оборудовании и высококвалифицированном персонале.In addition, there is a known method for assessing the plasma of convalescents by determining the titer of neutralizing antibodies, in which pseudotyped lentiviral particles (PsV) are used instead of coronavirus (F.Wu Neutralizing antibody responses to SARS-CoV-2 in a COVID-19 recovered patient cohort and their implications, medRxiv 2020.03.30.20047365). This method includes culturing 293T / ACE2 cells, to which blood serum samples are added in various dilutions and at the same time PsV containing the luciferase gene is introduced. After 48 hours, the luciferase activity is assessed with a standard kit (Promega). The result is presented as the titer of neutralizing antibodies (the largest serum dilution, when added, the luciferase activity decreases by 50%). The disadvantages of this method are the duration of the process (48 hours), labor intensity, the need for expensive equipment and highly qualified personnel.

Из литературных данных известно, что рецептор-связывающий домен (RBD) белка S коронавируса SARS-CoV, является основной мишенью для вируснейтрализующих антител. В публикации Z. Cao et al. Potent and persistent antibody responses against the receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein in recovered patients. Virol J 7, 299 (2010)) описан способ обнаружения антител к RBD в сыворотке крови пациентов, перенесших инфекцию SARS-CoV. Способ реализуется следующим образом: к адсорбированному в лунках планшета RBD-His добавляют серию разведений образцов сывороток пациентов и контрольные образцы. Связавшиеся с RBD антитела детектируют с помощью вторичных антител, конъюгированных с пероксидазой хрена (HRP). Затем добавляют субстрат для HRP и оценивают титр антител к RBD. Данный способ как наиболее близкий к заявляемому был выбран за прототип. Недостатком данного способа является то, что он не позволяет детектировать антитела к коронавирусу SARS-CoV-2 в плазме крови реконвалесцентов COVID-19.It is known from the literature that the receptor-binding domain (RBD) of the S protein of the SARS-CoV coronavirus is the main target for neutralizing antibodies. In a publication by Z. Cao et al. Potent and persistent antibody responses against the receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein in recovered patients. Virol J 7, 299 (2010)) describes a method for detecting antibodies to RBD in the blood serum of patients with SARS-CoV infection. The method is implemented as follows: a series of dilutions of patient serum samples and control samples are added to the RBD-His adsorbed in the plate wells. Antibodies bound to RBD are detected using secondary antibodies conjugated to horseradish peroxidase (HRP). Then add substrate for HRP and estimate the titer of antibodies to RBD. This method, as the closest to the claimed one, was chosen as a prototype. The disadvantage of this method is that it does not allow the detection of antibodies to the SARS-CoV-2 coronavirus in the blood plasma of COVID-19 convalescents.

Таким образом, в настоящее время существует потребность в разработке быстрого способа анализа сыворотки и плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для определения образцов наиболее перспективных для терапии пациентов с COVID-19.Thus, there is currently a need to develop a rapid method for analyzing the serum and plasma of COVID-19 convalescents to determine the most promising samples for therapy of patients with COVID-19.

Раскрытие изобретения.Disclosure of the invention.

Задачей заявленного изобретения является создание эффективной тест-системы и способа для быстрого анализа сыворотки и плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для определения образцов сывороток и плазмы крови наиболее перспективных для терапии пациентов с COVID-19, а также способа для быстрого анализа сыворотки и плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2.The objective of the claimed invention is to create an effective test system and method for rapid analysis of serum and blood plasma of COVID-19 convalescents to determine the most promising serum and plasma samples for the therapy of patients with COVID-19, as well as a method for rapid analysis of human serum and plasma to determine the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus.

Технический результат представляет собой получение быстрой и эффективной тест системы для определения наиболее перспективных образцов сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2.The technical result is to obtain a fast and effective test system for determining the most promising serum or plasma samples of COVID-19 convalescents for the treatment of patients infected with SARS-CoV-2.

Технический результат заключается в сокращении времени и упрощении процедуры анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2.The technical result consists in reducing the time and simplifying the procedure for analyzing the serum or blood plasma of COVID-19 convalescents for the selection of samples of the most promising for therapy of patients infected with SARS-CoV-2.

Технический результат также представляет собой высокую и стабильную экспрессию рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2.The technical result also represents a high and stable expression of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus.

Кроме того, технический результат заключается в неожиданно проявленном эффекте для анализа сыворотки и плазмы крови человека на наличие антител к вирусу SARS-CoV-2 отсутствии ложноположительных результатов у пациентов перенесших заболевание.In addition, the technical result consists in an unexpectedly manifested effect for the analysis of human serum and plasma for the presence of antibodies to the SARS-CoV-2 virus, the absence of false positive results in patients who have undergone the disease.

Технический результат достигается за счет разработки генетическая конструкции для экспрессии рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, включающий SEQ ID NO:1The technical result is achieved by developing a genetic construct for the expression of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, including SEQ ID NO: 1

Также технический результат достигается за разработки штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцента рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, содержащего генетическую конструкцию, включающую SEQ ID NO:1Also, the technical result is achieved for the development of the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD, the producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, containing the genetic construct comprising SEQ ID NO: 1

Также технический результат достигается за счет разработки способа получения штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, включающий:Also, the technical result is achieved through the development of a method for obtaining a strain of cells of the ovary of the Chinese hamster CHO-S-RBD, including:

- получение генетической конструкции, включающей SEQ ID NO:1;- obtaining a genetic construct comprising SEQ ID NO: 1;

- введение указанной генетической конструкции в клетки путем липофекции;- introduction of the specified genetic construct into cells by lipofection;

- селекцию клеток на антибиотике Hygromycin B.- cell selection for the antibiotic Hygromycin B.

Также технический результат достигается за счет разработки рекомбинантного белока RBD вируса SARS-CoV-2 для выявления антител к SARS-CoV-2, имеющий SEQ ID NO:2, являющийся продуктом штамма клеток яичника китайского хомячка.Also, the technical result is achieved through the development of a recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus for detecting antibodies to SARS-CoV-2, having SEQ ID NO: 2, which is the product of a Chinese hamster ovary cell strain.

Также технический результат достигается за счет разработки способа получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, включающего:Also, the technical result is achieved through the development of a method for producing the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, including:

- культивирование штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD;- cultivation of the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD;

- хроматографическую очистку рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 из культуральной среды штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD;- chromatographic purification of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus from the culture medium of the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD;

- подтверждение получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, имеющего SEQ ID NO:2.- confirmation of the receipt of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2.

Также технический результат достигается за счет разработки тест-системы для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека, представляющей собой набор реагентов, включающий:Also, the technical result is achieved through the development of a test system for the enzyme immunoassay of human serum or plasma, which is a set of reagents, including:

- планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2;- plate for enzyme immunoassay with adsorbed in the wells of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2;

- положительный контроль, включающий инактивированный образец сыворотки крови человека, содержащий IgG к белку RBD вируса SARS-CoV-2;- a positive control comprising an inactivated human serum sample containing IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus;

- отрицательный контроль, представляющий собой инактивированный образец сыворотки крови человека, не содержащий IgG к белку RBD вируса SARS-CoV-2;- negative control, which is an inactivated human serum sample that does not contain IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus;

- конъюгат, содержащий 20-кратный концентрат моноклональных мышиных антител к IgG человека, конъюгированных с пероксидазой хрена;- a conjugate containing a 20-fold concentrate of monoclonal mouse antibodies to human IgG, conjugated with horseradish peroxidase;

- 25-кратный концентрат промывочного буфера, содержащий концентрат фосфатно-солевого буфера с Твином 20 для промывания планшетов;- 25x Wash Buffer Concentrate containing PBS concentrate with Tween 20 for washing plates;

- буфер для разведения сыворотки или плазмы и указанного конъюгата;- buffer for dilution of serum or plasma and the specified conjugate;

- раствор хромогена, содержащий раствор тетраметилбензидина;- a chromogen solution containing a tetramethylbenzidine solution;

- раствор субстрата, содержащий раствор перекиси водорода;- a substrate solution containing a solution of hydrogen peroxide;

- стоп-реагент.- stop reagent.

Также технический результат достигается за счет разработки способа для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2, включающий применение тест-системы, где:Also, the technical result is achieved by developing a method for analyzing serum or blood plasma of COVID-19 convalescents for sampling the most promising patients for therapy with SARS-CoV-2 infection, including the use of a test system, where:

- в лунки планшета для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2 вносят положительный контроль, отрицательный контроль, а также вносят предварительно разведенные испытуемые образцы сывороток или плазмы крови человека;- in the wells of the plate for enzyme-linked immunosorbent assay with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, which has SEQ ID NO: 2, adsorbed in the wells, add a positive control, a negative control, and also add previously diluted test samples of human serum or plasma;

- проводят инкубацию указанных образцов при температуре от +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- incubation of these samples is carried out at a temperature from + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour;

- промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution;

- вносят 1-кратный раствор конъюгата с последующей инкубацией при температуре +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- 1-fold conjugate solution is introduced, followed by incubation at a temperature of + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour;

- промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution;

- вносят хромоген-субстратный раствор в каждую лунку с инкубацией в течение 15 минут в темном месте при температуре от +15°С до +25°С;- introduce a chromogen-substrate solution into each well with incubation for 15 minutes in a dark place at a temperature of + 15 ° C to + 25 ° C;

- останавливают пероксидазную реакцию путем добавления в каждую лунку стоп-реагента;- stop the peroxidase reaction by adding a stop reagent to each well;

- измеряют оптическую плотность на спектрофотометре в каждой лунке при длине волны 450 нм;- measure the optical density on a spectrophotometer in each well at a wavelength of 450 nm;

- проводят интерпретацию результатов.- carry out the interpretation of the results.

Также технический результат достигается за счет разработки способа для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2, включающий применение тест-системы, в соответствии с которым:Also, the technical result is achieved through the development of a method for analyzing serum or plasma of human blood for determining the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus, including the use of a test system, in accordance with which:

- в лунки планшета для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2 вносят положительный контроль, отрицательный контроль, а также вносят серии 2-кратных разведений испытуемых образцов сывороток или плазмы крови человека;- in the wells of the plate for enzyme-linked immunosorbent assay with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, which has SEQ ID NO: 2, adsorbed in the wells, make a positive control, a negative control, and also make a series of 2-fold dilutions of the tested samples of human serum or plasma;

- проводят инкубацию указанных образцов при температуре от +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- incubation of these samples is carried out at a temperature from + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour;

- промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution;

- вносят 1-кратный раствор конъюгата с последующей инкубацией при температуре +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- 1-fold conjugate solution is introduced, followed by incubation at a temperature of + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour;

- промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution;

- вносят хромоген-субстратный раствор в каждую лунку с инкубацией в течение 15 минут в темном месте при температуре от +15°С до +25°С;- introduce a chromogen-substrate solution into each well with incubation for 15 minutes in a dark place at a temperature of + 15 ° C to + 25 ° C;

- останавливают пероксидазную реакцию путем добавления в каждую лунку стоп-реагента;- stop the peroxidase reaction by adding a stop reagent to each well;

- измеряют оптическую плотность на спектрофотометре в каждой лунке при длине волны 450 нм;- measure the optical density on a spectrophotometer in each well at a wavelength of 450 nm;

- проводят интерпретацию результатов.- carry out the interpretation of the results.

Также технический результат достигается за счет разработки способа для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2 (вариант 1).Also, the technical result is achieved through the development of a method for analyzing the serum or blood plasma of COVID-19 convalescents for sampling the most promising for therapy of patients infected with SARS-CoV-2 (option 1).

Также технический результат достигается за счет разработки способа для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS - CoV-2 (вариант 2).Also, the technical result is achieved by developing a method for analyzing human serum or plasma to determine the titer of antibodies to the SARS virus - CoV-2 (option 2).

Сущность заявленной группы изобретений поясняется чертежами, где на фиг. 1-4 представлены результаты исследования.The essence of the claimed group of inventions is illustrated by drawings, where Fig. 1-4 show the results of the study.

Осуществление изобретенияImplementation of the invention

Краткое описание фигурBrief description of figures

На фиг. 1 представлено схематическое изображение генетической конструкции для экспрессии рецептор-связывающего домена (RBD) вируса SARS-CoV2, гдеFIG. 1 is a schematic representation of a genetic construct for the expression of the receptor binding domain (RBD) of the SARS-CoV2 virus, where

SP - сигнальный пептид, обеспечивающий секрецию белка в культуральную жидкость;SP is a signal peptide that ensures protein secretion into the culture fluid;

RBD - рецептор-связывающий домен RBD вируса SARS-CoV2;RBD - receptor-binding domain RBD virus SARS-CoV2;

His-tag - гистидиновая метка, обеспечивающая очистку белка методом аффинной хроматографии.His-tag is a histidine tag that provides protein purification by affinity chromatography.

На фиг. 2 представлена схема плазмидного вектора р1-RBD-CoV-2, гдеFIG. 2 shows a diagram of the plasmid vector p1-RBD-CoV-2, where

CMV- промотор/энхансер ранних генов цитомегаловируса человека;CMV - promoter / enhancer of early genes of human cytomegalovirus;

генетическая конструкция - разработанная генетическая конструкция SEQ ID NO:1, экспрессирующая рецептор-связывающий домен (RBD) вируса SARS-CoV2;genetic construct - the developed genetic construct SEQ ID NO: 1, expressing the receptor-binding domain (RBD) of the SARS-CoV2 virus;

poly(A) - сигнал полиаденилирования;poly (A) - polyadenylation signal;

EBV ori - последовательность начала репликации вируса Эпштейна-Барра;EBV ori - sequence of the beginning of replication of the Epstein-Barr virus;

AmpR promoter - промотор гена устойчивости к ампициллину;AmpR promoter - Ampicillin resistance gene promoter;

Amp - ген устойчивости к ампициллину, который кодирует фермент β-лактамазу, который расщепляет β-лактамное кольцо ампициллина и некоторых других антибиотиков;Amp - ampicillin resistance gene, which encodes the β-lactamase enzyme, which cleaves the β-lactam ring of ampicillin and some other antibiotics;

ori - последовательность начала репликации;ori - replication start sequence;

TK promoter - промотор гена тимидинкиназы вируса простого герпеса человека;TK promoter - human herpes simplex virus thymidine kinase gene promoter;

HygroВ - ген устойчивости к Hygromicin B, который кодирует фермент фосфатазу, которая инактивирует этот антибиотик путем его фосфорилирования.HygroB is a gene for resistance to Hygromicin B, which encodes the enzyme phosphatase, which inactivates this antibiotic by phosphorylation.

HindIII, XhoI - сайты узнавания для соответствующих рестриктаз.HindIII, XhoI - recognition sites for the corresponding restriction enzymes.

На фиг. 3 представлена электрофореграмма белкового препарата RBD после аффинной очистки, гдеFIG. 3 shows an electropherogram of the RBD protein preparation after affinity purification, where

М - маркер молекулярного веса;M - molecular weight marker;

1.- образец белка RBD 0.75 мкг/мкл;1.- sample of RBD protein 0.75 μg / μl;

2.- образец белка RBD 1 мкг/мкл;2.- sample of RBD protein 1 μg / μl;

3.- образец белка RBD 0.5 мкг/мкл;3.- sample of RBD protein 0.5 μg / μl;

4.- образец белка RBD 0.25 мкг/мкл.4.- sample of RBD protein 0.25 μg / μl.

На фиг. 4 представлены результаты масс спектрального анализа белкового препарата RBD после аффинной очистки, гдеFIG. 4 shows the results of mass spectral analysis of the RBD protein preparation after affinity purification, where

[М]+- распределение молекулярных масс однозарядного иона;[M] + - distribution of molecular weights of a singly charged ion;

[М]2+- распределение молекулярных масс двузарядного иона.[M] 2 + - distribution of molecular weights of a doubly charged ion.

В экспериментальных исследованиях установлено, что большинство антител, обладающих вируснейтрализующей активностью в отношении вида коронавируcов (MERS, SARS и др.) специфически связываются с различными эпитопами рецептор-связывающего домена белка S (spike) (Hofmann H. et al. S protein of severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus mediates entry into hepatoma cell lines and is targeted by neutralizing antibodies in infected patients. Journal of Virology. 2004, 78(12):6134-42; He Y. Receptor-binding domain of severe acute respiratory syndrome coronavirus spike protein contains multiple conformation-dependent epitopes that induce highly potent neutralizing antibodies. Journal of Immunology. 2005, 174(8):4908-15; He Y. Receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein induces highly potent neutralizing antibodies: implication for developing subunit vaccine. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004, 324(2):773-81.). Установлено, что нейтрализующей активностью обладают антитела, препятствующие связыванию белка S вируса SARS-CoV-2 с рецептором ангиотензин-превращающий фермент 2 (ACE2) на клетках человека. Рецептор-связывающий домен (RBD) является структурным доменом белка S, образующим сайт связывания с рецептором ACE2, поэтому антитела способные связываться с белком RBD могут блокировать контакт с рецептором и, как следствие, препятствовать проникновению вируса в клетки человека. Поэтому введение сыворотки или плазмы доноров-реконвалесцентов COVID-19, содержащей антитела к белку RBD вируса SARS-CoV-2, пациентам с COVID-19 является перспективным средством терапии.Experimental studies have shown that most antibodies with virus-neutralizing activity against the type of coronavirus (MERS, SARS, etc.) specifically bind to various epitopes of the receptor-binding domain of protein S (spike) (Hofmann H. et al. S protein of severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus mediates entry into hepatoma cell lines and is targeted by neutralizing antibodies in infected patients.Journal of Virology. 2004, 78 (12): 6134-42; He Y. Receptor-binding domain of severe acute respiratory syndrome coronavirus spike protein contains multiple conformation-dependent epitopes that induce highly potent neutralizing antibodies. Journal of Immunology. 2005, 174 (8): 4908-15; He Y. Receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein induces highly potent neutralizing antibodies: implication for developing subunit vaccine Biochem Biophys Res Commun 2004, 324 (2): 773-81). It has been found that antibodies that prevent the binding of the SARS-CoV-2 virus S protein to the angiotensin converting enzyme 2 (ACE2) receptor on human cells have neutralizing activity. The receptor binding domain (RBD) is a structural domain of protein S, which forms a binding site for the ACE2 receptor; therefore, antibodies capable of binding to the RBD protein can block contact with the receptor and, as a result, prevent the virus from entering human cells. Therefore, the administration of serum or plasma from COVID-19 convalescent donors, containing antibodies to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, to patients with COVID-19 is a promising therapy.

Таким образом, анализ сыворотки или плазмы крови доноров-реконвалесцентов COVID-19 на наличие антител к белку RBD вируса SARS-CoV-2 позволит отбирать наиболее перспективные образцы сыворотки или плазмы, которые обладают терапевтическим эффектом.Thus, the analysis of the serum or blood plasma of COVID-19 convalescent donors for the presence of antibodies to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus will make it possible to select the most promising serum or plasma samples that have a therapeutic effect.

В результате проведенной работы была создана генетическая конструкция для экспрессии рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, включающая SEQ ID NO:1.As a result of this work, a genetic construct was created for the expression of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, including SEQ ID NO: 1.

Данная конструкция включает лидерный пептид тяжелой цепи иммуноглобулина G человека слитый с геном RBD вируса SARS-CoV-2 и гистидиновой меткой.This construct comprises a human immunoglobulin G heavy chain leader peptide fused to the RBD gene of the SARS-CoV-2 virus and a histidine tag.

Лидерные пептиды - это сигнальные последовательности, которые играют центральную роль в нацеливании и транслокации почти всех секретируемых белков и многих интегральных мембранных белков как у прокариот, так и у эукариот. От выбора сигнального пептида напрямую зависит секреция рекомбинантного белка. Использование лидерного пептида тяжелой цепи иммуноглобулина G человека позволяет обеспечить высокие уровни продукции рекомбинантного белка RBD в культуральную среду.Leader peptides are signal sequences that play a central role in targeting and translocation of almost all secreted proteins and many integral membrane proteins in both prokaryotes and eukaryotes. The secretion of the recombinant protein directly depends on the choice of the signal peptide. The use of the leader peptide of the heavy chain of human immunoglobulin G allows for high levels of production of the recombinant RBD protein into the culture medium.

Гистидиновая метка - это нуклеотидная последовательность, кодирующая 6 аминокислотных остатков гистидина. Данная метка необходима для последующей очистки белка на иммобилизованных металл-аффинных сорбентах. В данном методе используется способность гистидина связываться с хелатным ионом переходного металла, таким, как никель (Ni2+). Главными преимуществами использования гистидиновой метки является ее небольшой размер, легкость синтеза и отсутствие влияния на функции белка, его специфическую активность и структуру.A histidine tag is a nucleotide sequence that encodes 6 amino acid residues of histidine. This label is required for subsequent protein purification on immobilized metal-affinity sorbents. This method exploits the ability of histidine to bind to a chelated transition metal ion such as nickel (Ni2 +). The main advantages of using a histidine tag are its small size, ease of synthesis and no effect on the function of the protein, its specific activity and structure.

Кроме того, в результате проведенной работы была создан штамм клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, содержащий генетическую конструкцию, включающую SEQ ID NO:1 и разработан способ его получения, включающий: получение генетической конструкции, включающей SEQ ID NO:1; введение указанной генетической конструкции в клетки путем липофекции; селекцию клеток на антибиотике Hygromycin B.In addition, as a result of the work carried out, a strain of Chinese hamster ovary cells CHO-S-RBD was created, a producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, containing a genetic construct including SEQ ID NO: 1 and a method for its production was developed, including: obtaining a genetic construct comprising SEQ ID NO: 1; introduction of the specified genetic construct into cells by lipofection; cell selection for the antibiotic Hygromycin B.

Также, был создан рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 для выявления антител к SARS-CoV-2, имеющий SEQ ID NO:2 и способ его получения, включающий: культивирование штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD; хроматографическую очистку рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 из культуральной среды штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD; подтверждение получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, имеющего SEQ ID NO:2.Also, a recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus was created for detecting antibodies to SARS-CoV-2, having SEQ ID NO: 2 and a method for its production, including: culturing a Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD; chromatographic purification of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus from the culture medium of the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD; confirmation of the receipt of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2.

Кроме того, была создана тест-система для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека, представляющая собой набор реагентов, включающий: планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2; положительный контроль, включающий инактивированный образец сыворотки крови человека, содержащий IgG к белку RBD вируса SARS-CoV-2; отрицательный контроль, представляющий собой инактивированный образец сыворотки крови человека, не содержащий IgG к белку RBD вируса SARS-CoV-2; конъюгат, содержащий 20-кратный концентрат моноклональных мышиных антител к IgG человека, конъюгированных с пероксидазой хрена; 25-кратный концентрат промывочного буфера, содержащий концентрат фосфатно-солевого буфера с Твином 20 для промывания планшетов; буфер для разведения сыворотки или плазмы и указанного конъюгата; раствор хромогена, содержащий раствор тетраметилбензидина; раствор субстрата, содержащий раствор перекиси водорода; стоп-реагент.In addition, a test system was created for the enzyme immunoassay of human serum or blood plasma, which is a set of reagents, including: a plate for enzyme immunoassay with adsorbed in the wells of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2; a positive control comprising an inactivated human serum sample containing IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus; negative control, which is an inactivated human serum sample that does not contain IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus; a conjugate containing a 20-fold concentrate of monoclonal mouse antibodies to human IgG, conjugated with horseradish peroxidase; 25x wash buffer concentrate containing PBS concentrate with Tween 20 to wash plates; buffer for dilution of serum or plasma and the specified conjugate; a chromogen solution containing a tetramethylbenzidine solution; a substrate solution containing a hydrogen peroxide solution; stop reagent.

Также был разработан способ для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2, включающий: внесение в лунки планшета для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2 положительного контроля, отрицательного контроля, а также предварительно разведенных испытуемых образцов сывороток или плазмы крови человека; проведение инкубации указанных образцов при температуре от +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа; промывку лунок не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера; внесение 1-кратного раствора конъюгата с последующей инкубацией при температуре +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа; промывку лунок не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера; внесение хромоген-субстратного раствора в каждую лунку с инкубацией в течение 15 минут в темном месте при температуре от +15°С до +25°С; остановку пероксидазной реакции путем добавления в каждую лунку стоп-реагента; измерение оптической плотности на спектрофотометре в каждой лунке при длине волны 450 нм; проведение интерпретации результатов.A method was also developed for the analysis of serum or blood plasma of COVID-19 convalescents for the selection of samples of the most promising for therapy of patients infected with SARS-CoV-2, including: introducing into the wells of an enzyme-linked immunosorbent assay plate with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV virus adsorbed in the wells -2, having SEQ ID NO: 2 positive control, negative control, and previously diluted test samples of human serum or plasma; incubation of these samples at temperatures from + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; washing the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; introduction of a 1-fold conjugate solution followed by incubation at a temperature of + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; washing the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; adding a chromogen-substrate solution to each well with incubation for 15 minutes in a dark place at a temperature of + 15 ° C to + 25 ° C; stopping the peroxidase reaction by adding a stop reagent to each well; measuring optical density on a spectrophotometer in each well at a wavelength of 450 nm; interpretation of results.

Особенностью данного способа для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 является то, что для интерпретации результатов, исследуемый образец сыворотки или плазмы крови человека сравнивают с отсекающим значением оптической плотности Cut off, которое вычисляют по формуле:A feature of this method for the analysis of serum or blood plasma of COVID-19 convalescents is that, to interpret the results, the analyzed human serum or plasma sample is compared with the cutoff value of the optical density Cut off, which is calculated by the formula:

Cut off=А450К- ср+3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed +3 x SD A 450 K - ,

где Cut off - отсекающие значения оптической плотности,where Cut off - cutoff values of optical density,

А450К- ср - cреднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем,A 450 K - cf. - the average value of optical density in the wells with negative control,

SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля,SD А 450 К - - the standard deviation of the optical density values of the negative control,

при этом образец считают положительным, если после проведения анализа оптическая плотность в лунках планшета с опытным образцом при длине волны 450 нм в 2,5 раза превышает отсекающие значения оптической плотности Cut off.the sample is considered positive if, after the analysis, the optical density in the wells of the plate with the experimental sample at a wavelength of 450 nm is 2.5 times higher than the cutoff values of the optical density Cut off.

Также был разработан способ для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2, включающий: внесение в лунки планшета для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2 положительного контроля, отрицательного контроля, а также серии 2-кратных разведений испытуемых образцов сывороток или плазмы крови человека; проведение инкубации указанных образцов при температуре от +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа; промывку лунок не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера; внесение 1-кратного раствора конъюгата с последующей инкубацией при температуре +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа; промывку лунок не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера; внесение хромоген-субстратного раствора в каждую лунку с инкубацией в течение 15 минут в темном месте при температуре от +15°С до +25°С; остановку пероксидазной реакции путем добавления в каждую лунку стоп-реагента; измерение оптической плотности на спектрофотометре в каждой лунке при длине волны 450 нм; проведение интерпретации результатов.Also, a method was developed for the analysis of human serum or plasma to determine the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus, including: adding to the wells of the plate for enzyme-linked immunosorbent assay with the recombinant RBD protein of SARS-CoV-2 virus adsorbed in the wells having SEQ ID NO : 2 positive control, negative control, and a series of 2-fold dilutions of the tested samples of human serum or plasma; incubation of these samples at temperatures from + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; washing the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; introduction of a 1-fold conjugate solution followed by incubation at a temperature of + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; washing the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; adding a chromogen-substrate solution to each well with incubation for 15 minutes in a dark place at a temperature from + 15 ° С to + 25 ° С; stopping the peroxidase reaction by adding a stop reagent to each well; measuring optical density on a spectrophotometer in each well at a wavelength of 450 nm; interpretation of results.

Особенностью данного способа для анализа сыворотки или плазмы крови человека является то, что при интерпретации результатов, исследуемый образец сыворотки или плазмы крови человека сравнивают со значением оптической плотности Cut off, которое вычисляют по формулеA feature of this method for the analysis of human serum or plasma is that, when interpreting the results, the analyzed sample of human serum or plasma is compared with the value of the optical density Cut off, which is calculated by the formula

Cut off=А450К- ср+3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed +3 x SD A 450 K - ,

где Cut off - отсекающие значения оптической плотности,where Cut off - cutoff values of optical density,

А450К- ср - cреднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем,A 450 K - cf. - the average value of optical density in the wells with negative control,

SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля,SD А 450 К - - the standard deviation of the optical density values of the negative control,

при этом титр антител определяют как наибольшее разведение образца сыворотки или плазмы крови человека, при анализе которого получают оптическую плотность при длине волны 450 нм в 2 раза превышающую отсекающие значения оптической плотности Cut off.the titer of antibodies is determined as the highest dilution of a sample of human serum or plasma, in the analysis of which the optical density at a wavelength of 450 nm is 2 times higher than the cutoff values of the optical density Cut off.

Осуществление изобретения подтверждается следующими примерами.The implementation of the invention is confirmed by the following examples.

Пример 1. Разработка дизайна генетической конструкции, содержащей лидерный пептид тяжелой цепи иммуноглобулина G человека, ген RBD вируса SARS-CoV-2 и гистидиновую меткуExample 1. Development of the design of a genetic construct containing the leader peptide of the heavy chain of human immunoglobulin G, the RBD gene of the SARS-CoV-2 virus and a histidine tag

На первом этапе работы авторы разработали дизайн генетической конструкции, позволяющей эффективно экспрессировать рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 в клетках млекопитающих и выполнять его хроматографическую очистку.At the first stage of the work, the authors developed a design of a genetic construct that allows efficient expression of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus in mammalian cells and its chromatographic purification.

Для этого был выбран ген рецептор-связывающего домена (RBD) белка S коронавируса SARS-CoV-2, слитый с сигнальным пептидом тяжелой цепи иммуноглобулина G человека, обеспечивающий секрецию белка в культуральную жидкость и гистидиновой меткой для очистки рекомбинантного белка методом аффинной хроматографии. Таким образом, была разработана генетическая конструкция SEQ ID NO:1.For this, the gene for the receptor-binding domain (RBD) of the protein S of the SARS-CoV-2 coronavirus was selected, fused with the signal peptide of the heavy chain of human immunoglobulin G, which ensures the secretion of the protein into the culture fluid and a histidine tag for purification of the recombinant protein by affinity chromatography. Thus, the genetic construct SEQ ID NO: 1 was developed.

Схема генетической конструкции и представлена на Фиг. 1. Разработанная генетическая конструкция была синтезирована в ЗАО «Евроген». Таким образом, была получена конструкция pAL-TA-RBD-CoV-2.A schematic of the genetic construct is shown in FIG. 1. The developed genetic construct was synthesized at ZAO Evrogen. Thus, the pAL-TA-RBD-CoV-2 construct was obtained.

Далее с помощью методов генной инженерии разработанная генетическая конструкция из pAL-TA-RBD-CoV-2 была клонирована с использованием эндонуклеаз рестрикции HindIII и XhoI в плазмидный вектор для эписомальной экспрессии в клеточных линиях млекопитающих, и полученная плазмида была названа p1-RBD-CoV-2 (Фиг. 2). Далее полученную плазмиду нарабатывали в препаративных количествах и очищали при помощи коммерческого набора Plasmid Midiprep 2.0 (Евроген /кат.№BC124).Then, using genetic engineering methods, the developed genetic construct from pAL-TA-RBD-CoV-2 was cloned using restriction endonucleases HindIII and XhoI into a plasmid vector for episomal expression in mammalian cell lines, and the resulting plasmid was named p1-RBD-CoV- 2 (Fig. 2). Then the resulting plasmid was produced in preparative quantities and purified using a commercial kit Plasmid Midiprep 2.0 (Evrogen / cat. # BC124).

Таким образом, в результате проведенной работы была получена плазмида p1-RBD-CoV-2, обеспечивающая экспрессию гена RBD вируса SARS-CoV-2.Thus, as a result of this work, the p1-RBD-CoV-2 plasmid was obtained, which provides expression of the RBD gene of the SARS-CoV-2 virus.

Пример 2. Получение штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцента рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2Example 2. Obtaining a strain of Chinese hamster ovary cells CHO-S-RBD, producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus

Штамм клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 был получен на основе клеточной линии CHO-S. Это коммерческая клеточная линия на основе клеток яичника китайского хомячка СНО, адаптированная к культивированию в плотной суспензии в специальной культуральной среде для повышенной экспрессии белка.The Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD, the producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, was obtained on the basis of the CHO-S cell line. This is a commercial cell line based on Chinese hamster ovary cells CHO, adapted for cultivation in dense suspension in a special culture medium for increased protein expression.

Клетки CHO-S культивировали в шейкер-инкубаторе при 5% содержания CO2, 80%-ной влажности и скорости качания 120 об/мин в питательной среде HyClone HyCell TransFx-C transfection media (GE Healthcare, США) с добавлением 8 мМ глутамина (ПанЭко, Россия), до достижения плотности 2*106 кл/мл 1 литр суспензии. Далее полученную суспензию трансфицировали плазмидным вектором p1-RBD-CoV-2, содержащим генетическую конструкцию SEQ ID NO:1, при помощи 1 мг/мл реагента Polyethylenimine (Polyscience, США) согласно инструкции производителя. Затем в течение 2 недель проводили селекцию трансфицированных клеток на антибиотике гигромицин Б. Данный антибиотик был выбран, поскольку плазмидный вектор p1-RBD-CoV-2 содержит ген устойчивости к антибиотику Hygromycin B.CHO-S cells were cultured in an incubator shaker at 5% CO2 content, 80% humidity, and a rocking speed of 120 rpm in HyClone HyCell TransFx-C transfection media (GE Healthcare, USA) supplemented with 8 mM glutamine (PanEco , Russia), until a density of 2 * 10 6 cells / ml 1 liter of suspension is reached. Next, the resulting suspension was transfected with the plasmid vector p1-RBD-CoV-2 containing the genetic construct SEQ ID NO: 1 using 1 mg / ml Polyethylenimine reagent (Polyscience, USA) according to the manufacturer's instructions. Then, for 2 weeks, the transfected cells were selected for the antibiotic hygromycin B.This antibiotic was chosen because the plasmid vector p1-RBD-CoV-2 contains the gene for resistance to the antibiotic Hygromycin B.

Таким образом, в результате проведенной работы впервые был получен штамм клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2. При этом продукция указанного белка составляет от 5 мг/л до 10 мг/л.Thus, as a result of this work, a strain of Chinese hamster ovary cells CHO-S-RBD, a producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, was obtained for the first time. In this case, the production of the specified protein ranges from 5 mg / l to 10 mg / l.

Пример 3. Способ получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 с помощью созданного штамма-продуцентаExample 3. A method of obtaining a recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus using the created producer strain

Разработанный способ получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2 включает следующие этапы:The developed method for producing the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 SEQ ID NO: 2 includes the following steps:

1) культивирование штамма-продуцента рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2;1) cultivation of the strain-producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus;

2) отбор культуральной среды;2) selection of the culture medium;

3) хроматографическую очистку рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2;3) chromatographic purification of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus;

4) подтверждение подлинности полученного рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2.4) confirmation of the authenticity of the obtained recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus.

Культивирование клеток штамма-продуцента проводили в течение 7 дней в Шейкер-инкубаторе Multitron (Infors HT, Швейцария) при 5% содержания CO2, 80%-ной влажности и скорости качания 120 об/мин. Ежедневно определяли выживаемость клеток в суспензии при помощи счетчика клеток TC20 Automated Cell Counter (Bio-Rad, США). По истечении 7 дней культивирования клеточную суспензию осаждали центрифугированием 5000 об/мин. Культуральную жидкость осветляли при помощи фильтрации через шприцевые фильтры Millipore Express (PES) HP 0.45 мкм (Merckmillipore, Германия).The cultivation of the cells of the producer strain was carried out for 7 days in a Multitron shaker-incubator (Infors HT, Switzerland) at 5% CO2 content, 80% humidity and a rocking speed of 120 rpm. The viability of cells in suspension was determined daily using a TC20 Automated Cell Counter (Bio-Rad, USA). After 7 days of cultivation, the cell suspension was precipitated by centrifugation at 5000 rpm. The culture fluid was clarified by filtration through Millipore Express (PES) HP 0.45 μm syringe filters (Merckmillipore, Germany).

Далее проводили хроматографическую очистку белка из осветленной культуральной жидкости на приборе AKTA start (GE Healthcare, США). К прибору подключали хроматографическую колонку HisTag HP protein purification column (5 мл) и уравновешивали буфером (20 мМ фосфат натрия, 500 мМ хлорид натрия, 20 мМ иммидазол, рН=7.4). Далее осветленную культуральную жидкость (100 мл) разбавляли в несколько раз буфером (20 мМ фосфат натрия, 500 мМ хлорид натрия, 20 мМ иммидазол, рН=7.4) и наносили на уравновешенную колонку со скоростью 5 мл/мин. После окончания нанесения, колонку промывали 100 мл буфера (20 мМ фосфат натрия, 500 мМ хлорид натрия, 20 мМ иммидазол, рН=7.4) со скоростью 5 мл/мин. После окончания промывки связавшийся белок элюировали с колонки буфером (20 мМ фосфат натрия, 500 мМ хлорид натрия, 500 мМ иммидазол, рН=7.4) со скоростью 1 мл/мин. Так проводили 10 очисток по 100 мл. Фракции после очистки замораживали при температуре -20°С. Фракции после первичной очистки размораживали при комнатной температуре и концентрировали при помощи центрифужных концентраторов Amicon Ultra -50, -10K (Millipore, Ирландия) до концентрации белка 1-2 мг/мл. Концентрацию белка измеряли при помощи спектрофотометра Nanodrop 2000c. Далее колонку HiTrap desalting column уравновешивали буфером (20 мМ фосфат натрия, 150 мМ хлорид натрия) на скорости 5 мл/мин. После уравновешивания скорость потока снижали до 1 мл/мин. Препарат с концентрацией 1-2 мг/мл наносили на колонку через шприц в объеме 1 мл. Собирали первый пик по UV280 соответствующий целевому рекомбинантному белку RBD. Суммарно проводили 5-10 циклов очистки. Полученные после второй стадии очистки фракции препарата объединяли и измеряли концентрацию белка на спектрофотометре Nanodrop 2000c. Далее препарат доводили буфером (20 мМ фосфат натрия, 150 мМ хлорид натрия) до концентрации 1 мг/мл, разливали по 1 мл и хранили при температуре -20°С.Then, the protein was chromatographed from the clarified culture liquid on an AKTA start device (GE Healthcare, USA). A HisTag HP protein purification column (5 ml) was connected to the instrument and equilibrated with a buffer (20 mM sodium phosphate, 500 mM sodium chloride, 20 mM imidazole, pH = 7.4). Then, the clarified culture fluid (100 ml) was diluted several times with a buffer (20 mM sodium phosphate, 500 mM sodium chloride, 20 mM imidazole, pH = 7.4) and applied to the equilibrated column at a rate of 5 ml / min. After the end of the application, the column was washed with 100 ml of buffer (20 mM sodium phosphate, 500 mM sodium chloride, 20 mM imidazole, pH = 7.4) at a rate of 5 ml / min. After the end of washing, the bound protein was eluted from the column with a buffer (20 mM sodium phosphate, 500 mM sodium chloride, 500 mM imidazole, pH = 7.4) at a rate of 1 ml / min. So 10 purifications of 100 ml were carried out. After purification, the fractions were frozen at -20 ° C. Fractions after primary purification were thawed at room temperature and concentrated using Amicon Ultra -50, -10K centrifuge concentrators (Millipore, Ireland) to a protein concentration of 1-2 mg / ml. Protein concentration was measured using a Nanodrop 2000c spectrophotometer. Then the HiTrap desalting column was equilibrated with a buffer (20 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride) at a rate of 5 ml / min. After equilibration, the flow rate was reduced to 1 ml / min. The drug with a concentration of 1-2 mg / ml was applied to the column through a syringe in a volume of 1 ml. Collected a first peak at UV280 corresponding to the target recombinant RBD protein. A total of 5-10 cleaning cycles were carried out. The drug fractions obtained after the second stage of purification were combined, and the protein concentration was measured on a Nanodrop 2000c spectrophotometer. Then the preparation was adjusted with a buffer (20 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride) to a concentration of 1 mg / ml, poured in 1 ml each and stored at -20 ° C.

Выход рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 после хроматографической очистки составил от 5 мг до 10 мг с литра культуральной среды (по результатам трех независимых экспериментов). Что является показателем эффективности разработанного способа получения, так как белки коронавируса относятся к группе сложнополучаемых в традиционных системах бактериальной экспрессии.The yield of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus after chromatographic purification was from 5 mg to 10 mg per liter of culture medium (according to the results of three independent experiments). This is an indicator of the effectiveness of the developed production method, since coronavirus proteins belong to the group of difficult to obtain in traditional bacterial expression systems.

Подтверждение подлинности полученного рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 проводили при помощи белкового электрофореза в полиакриламидном геле, а также масс-спектрометрического анализа.Confirmation of the authenticity of the obtained recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus was carried out using protein polyacrylamide gel electrophoresis, as well as mass spectrometric analysis.

Для проведения белкового электрофореза готовили 12%-ный разделяющий полиакриламидный гель и 6%-ный фокусирующий полиакриламидный гель. Образцы очищенного рекомбинантного белка RBD разводили до различной концентрации (1 мкг/мкл, 0.75 мкг/мл, 0.5 мкг/мкл, 0.25 мкг/мл) буфером образца с содержанием В-меркаптоэтанола. Далее образцы прогревали при температуре 98°С в течении 5 мин и вносили в гель. Электрофорез проводили в камере Mini-Protean Tetra Cell (Bio-Rad, США, кат.№165-8000). Далее гель окрашивали реагентом EZBlue™ Gel Staining Reagent (Sigma-Aldrich, США, кат.№G1041) и проявляли при помощи гель-документирующей системы Gel Doc EZ system (Bio-Rad, США). Результаты электрофореграммы представлены на Фиг. 3.For the protein electrophoresis, a 12% separating polyacrylamide gel and a 6% focusing polyacrylamide gel were prepared. Samples of the purified recombinant RBD protein were diluted to various concentrations (1 μg / μl, 0.75 μg / ml, 0.5 μg / μl, 0.25 μg / ml) with sample buffer containing B-mercaptoethanol. Then the samples were heated at a temperature of 98 ° С for 5 min and added to the gel. Electrophoresis was carried out in a Mini-Protean Tetra Cell (Bio-Rad, USA, cat # 165-8000). Next, the gel was stained with EZBlue ™ Gel Staining Reagent (Sigma-Aldrich, USA, cat # G1041) and developed using the Gel Doc EZ system (Bio-Rad, USA). The results of the electrophoretogram are shown in FIG. 3.

По результатам электрофореграммы подвижность рекомбинантного белка RBD в денатурирующих условиях соответствовала ≈30 кДа, что обусловлено его гликозилированием (масса аминокислотной последовательности без учета гликозилирования составляет около 25 кДа). Таким образом, при первичном анализе препарата были подтверждена его ожидаемая молекулярная масса.According to the results of electropherogram, the mobility of the recombinant RBD protein under denaturing conditions corresponded to ≈30 kDa, which is due to its glycosylation (the mass of the amino acid sequence without taking into account glycosylation is about 25 kDa). Thus, during the initial analysis of the drug, its expected molecular weight was confirmed.

Более детальное подтверждение подлинности препарата осуществляли при помощи масс-спектрометрического анализа по следующей схеме:A more detailed confirmation of the authenticity of the drug was carried out using mass spectrometric analysis according to the following scheme:

1. Гидролиз белка трипсином в растворе1. Protein hydrolysis with trypsin in solution

25 мкг рекомбинантного белка RBD растворяли в 20 mM бикарбонате аммония и добавляли до 100 мкл 25 мМ бикарбоната аммония (рH 8,3). В полученную реакционную смесь добавляли последовательно 1 мкл 1 M ДТТ и 10 мкл 110 mM йодацетамида. После проведения реакции (56°С, 30 мин в темноте) к смеси добавляли 4 мкл 1 M ДТТ для нейтрализации не связавшегося иодацетамида. К оставшейся части добавляли только трипсин, при этом, в обоих случаях соотношение белок: фермент составляло 25: 1. Реакцию вели при 37°С в течение 17 ч. Полученную реакционную смесь высушивали досуха с помощью вакуумного концентратора (Savant SPD121P, Thermo Scientific, США) и растворяли в 20 мкл 0,1% муравьиной кислоты. Образец обессоливали на колонках, содержащих обращено фазовую мембрану (аналог С18), образец элюировали 90% раствором ацетонитрила в воде. Для нанесения брали 4 мкл образца в 90% ацетонитриле и смешивали их с 1 мкл насыщенного раствора 2,5-дигидроксибензойной кислоты в 30%-ном растворе ацетонитрила, содержащем 0,5% ледяной уксусной кислоты по объему, на стальной мишени, которую затем подсушивали на воздухе при комнатной температуре.25 μg of recombinant RBD protein was dissolved in 20 mM ammonium bicarbonate and added to 100 μl of 25 mM ammonium bicarbonate (pH 8.3). To the resulting reaction mixture was added sequentially 1 μl of 1 M DTT and 10 μl of 110 mM iodoacetamide. After the reaction (56 ° С, 30 min in the dark), 4 μL of 1 M DTT was added to the mixture to neutralize unbound iodoacetamide. Only trypsin was added to the remainder; in both cases, the protein: enzyme ratio was 25: 1. The reaction was carried out at 37 ° C for 17 h. The resulting reaction mixture was dried to dryness using a vacuum concentrator (Savant SPD121P, Thermo Scientific, USA ) and dissolved in 20 μl of 0.1% formic acid. The sample was desalted on columns containing a reversed phase membrane (analogue C18), the sample was eluted with a 90% solution of acetonitrile in water. For application, 4 μl of a sample in 90% acetonitrile was taken and mixed with 1 μl of a saturated solution of 2,5-dihydroxybenzoic acid in a 30% acetonitrile solution containing 0.5% glacial acetic acid by volume on a steel target, which was then dried in air at room temperature.

2. MALDI-масс-спектрометрический анализ2. MALDI mass spectrometric analysis

Анализ пептидов проводили на время-пролетном MALDI-масс-спектрометре Ultraflextreme («Bruker Daltonics», Германия). Детектирование положительных ионов проводили в режиме рефлектрона при напряжениях: на ионном источнике IS1 – 20,12 кВ, IS2 – 17,82 кВ; на линзах – 7,47 кВ, рефлектроне Ref1 – 21,07 кВ, Ref2 – 10,80 кВ. Ионы детектировали в диапазоне m/z от 650 до 5000 Th. В качестве внутреннего стандарта использовали пики автолитических фрагментов трипсина и кератина, которые исключались из окончательных списков детектируемых масс.Peptides were analyzed on an Ultraflextreme time-of-flight MALDI mass spectrometer (Bruker Daltonics, Germany). Positive ions were detected in the reflectron mode at voltages: at the IS1 ion source - 20.12 kV, IS2 - 17.82 kV; on lenses - 7.47 kV, Ref1 - 21.07 kV, Ref2 - 10.80 kV. Ions were detected in the m / z range from 650 to 5000 Th. Peaks of autolytic fragments of trypsin and keratin, which were excluded from the final lists of detectable masses, were used as an internal standard.

3. Анализ данных масс-спектрометрии3. Analysis of mass spectrometry data

Обработка масс-спектров проводилась с помощью программного обеспечения Flex Analysis 3.4 (Bruker Daltonik GMBH, Германия). К масс-спектрам применялись сглаживание по алгоритму Savizky Golay (ширина 0,2 m/z, 1 цикл), и вычитание базовой линии согласно алгоритму TopHat. Использовались следующие параметры детекции пиков: алгоритм детекции пиков - SNAP2, соотношение сигнал/шум - 3, максимальное число пиков в спектре - 500). Поиск и идентификация белков методом «пептидного отпечатка» («peptide mass fingerprint») осуществляли с помощью программного комплекса Proteinscape (версия 4, «Bruker Daltonik GMBH, Германия), использовались следующие параметры поиска: точность определения массы - 50 ppm; возможные посттрансляционные модификации - окисление метионина, гистидина, триптофана.Mass spectra were processed using Flex Analysis 3.4 software (Bruker Daltonik GMBH, Germany). The mass spectra were smoothed according to the Savizky Golay algorithm (width 0.2 m / z, 1 cycle), and baseline subtraction according to the TopHat algorithm. The following peak detection parameters were used: the peak detection algorithm was SNAP2, the signal-to-noise ratio was 3, the maximum number of peaks in the spectrum was 500). The search and identification of proteins by the “peptide mass fingerprint” method was carried out using the Proteinscape software package (version 4, “Bruker Daltonik GMBH, Germany), the following search parameters were used: accuracy of mass determination - 50 ppm; possible post-translational modifications - oxidation of methionine, histidine, tryptophan.

В результате масс-спектрального анализа было продемонстрировано, что рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 присутствует в растворе в виде одно и двухзарядного иона, и имеет молекулярную массу 31 кДа, что четко коррелирует с данными электрофореза (Фиг. 4).As a result of mass spectral analysis, it was demonstrated that the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus is present in solution in the form of single and double charged ions, and has a molecular weight of 31 kDa, which clearly correlates with the data of electrophoresis (Fig. 4).

Результаты исследования рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 при помощи белкового электрофореза в полиакриламидном геле, а также масс-спектрометрического анализа убедительно доказали его подлинность.The results of the study of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus using protein electrophoresis in polyacrylamide gel, as well as mass spectrometric analysis, have convincingly proved its authenticity.

Таким образом, в результате проведенной работы впервые был получен рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2. Данный белок образует стабильную складчатую структуру.Thus, as a result of this work, the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus SEQ ID NO: 2 was obtained for the first time. This protein forms a stable folded structure.

Пример 5. Тест-система для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека с использованием рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2Example 5. Test system for enzyme immunoassay of human serum or plasma using the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus

Авторами впервые была создана тест-система на основе иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека, в которой рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2, полученный с помощью штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцента рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 (примеры 1-3), является мишенью для антител, выявляемых в крови реконвалесцентов COVID-19.The authors were the first to create a test system based on an enzyme-linked immunosorbent assay of human serum or plasma, in which the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus SEQ ID NO: 2, obtained using the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD, a producer of recombinant the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus (examples 1-3) is a target for antibodies detected in the blood of COVID-19 convalescents.

Тест-система представляет собой набор реагентов, включающий:The test system is a set of reagents that includes:

1) планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2 2 SEQ ID NO:2;1) plate for enzyme immunoassay with adsorbed in the wells of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus 2 SEQ ID NO: 2;

2) положительный контроль, включающий инактивированный образец сыворотки крови человека, содержащий IgG к белку RBD коронавируса SARS-CoV-2;2) a positive control comprising an inactivated human serum sample containing IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 coronavirus;

3) отрицательный контроль, представляющий собой инактивированный образец сыворотки крови человека, не содержащий IgG к белку RBD коронавируса SARS-CoV-2;3) a negative control, which is an inactivated human serum sample that does not contain IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 coronavirus;

4) конъюгат, содержащий 20-кратный концентрат моноклональных мышиных антител к IgG человека, конъюгированных с пероксидазой хрена;4) a conjugate containing a 20-fold concentrate of monoclonal mouse antibodies to human IgG, conjugated with horseradish peroxidase;

5) 25-кратный концентрат промывочного буфера, содержащий концентрат фосфатно-солевого буфера с Твином 20 для промывания планшетов;5) 25-fold wash buffer concentrate containing PBS concentrate with Tween 20 for washing plates;

6) буфер для разведения, содержащий буферный раствор для разведения сыворотки или плазмы и конъюгата;6) a dilution buffer containing a buffer solution for diluting serum or plasma and the conjugate;

7) раствор хромогена, содержащий раствор тетраметилбензидина;7) a chromogen solution containing a tetramethylbenzidine solution;

8) раствор субстрата, содержащий раствор перекиси водорода;8) a substrate solution containing a solution of hydrogen peroxide;

9) стоп-реагент, содержащий 1 М раствор серной кислоты.9) stop reagent containing 1 M sulfuric acid solution.

Пример 6. Способ применения тест-системы для иммуноферментного анализа для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2Example 6. A method of using a test system for an enzyme-linked immunosorbent assay for the analysis of serum or blood plasma of COVID-19 convalescents for sampling the most promising for therapy of patients infected with SARS-CoV-2

В данном примере описан способ использования разработанной тест-системы для иммуноферментного анализа (описанной в примере 5) для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов, наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2.This example describes a method of using the developed test system for enzyme-linked immunosorbent assay (described in example 5) for the analysis of serum or blood plasma of COVID-19 convalescents to select samples that are most promising for the therapy of patients infected with SARS-CoV-2.

Наиболее перспективными для терапии являются образцы сыворотки или плазмы крови, которые содержат вируснейтрализующие антитела. Из литературных данных известно, что белок RBD коронавирусов является одной из основных мишеней для вируснейтрализующих антител Z. Cao et al. Potent and persistent antibody responses against the receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein in recovered patients. Virol J 7, 299 (2010)).The most promising for therapy are serum or blood plasma samples that contain virus-neutralizing antibodies. It is known from the literature that the RBD protein of coronaviruses is one of the main targets for virus neutralizing antibodies Z. Cao et al. Potent and persistent antibody responses against the receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein in recovered patients. Virol J 7, 299 (2010)).

В данном исследовании был проведен сравнительный анализ 218 образцов реконвалесцентной плазмы и сыворотки крови пациентов, перенесших COVID-19. Каждый образец был исследован с помощью разработанной тест-системы для иммуноферментного анализа (описанной в примере 5) и проанализирован на наличие вируснейтрализующих антител (ВНА) методом прямой вируснейтрализации вируса SARS-CoV-2 на культуре клеток.In this study, a comparative analysis of 218 samples of convalescent plasma and blood serum from patients undergoing COVID-19 was carried out. Each sample was examined using the developed test system for enzyme-linked immunosorbent assay (described in example 5) and analyzed for the presence of virus-neutralizing antibodies (BHA) by direct virus neutralization of the SARS-CoV-2 virus in cell culture.

Иммуноферментный анализ с использованием разработанной тест-системы был проведен согласно следующему протоколу.The enzyme-linked immunosorbent assay using the developed test system was carried out according to the following protocol.

1. Приготовление рабочих растворов1. Preparation of working solutions

Для приготовления рабочего раствора буфера для промывания планшетов концентрат промывочного буфера развести в 25 раз дистиллированной водой.To prepare the working buffer solution for plate washing, dilute the wash buffer concentrate 25 times with distilled water.

Для приготовления рабочего раствора конъюгата, конъюгат развести в 20 раз буфером для разведения и тщательно перемешать пипетированием (раствор готовили непосредственно перед использованием).To prepare a working solution of the conjugate, dilute the conjugate 20 times with dilution buffer and mix thoroughly by pipetting (the solution was prepared immediately before use).

Для приготовления рабочего хромоген-субстратного раствора к 1,0 мл раствора хромогена добавить 9,0 мл раствора субстрата и тщательно перемешать (раствор готовить непосредственно перед использованием, хранению не подлежит).To prepare a working chromogen-substrate solution, add 9.0 ml of a substrate solution to 1.0 ml of a chromogen solution and mix thoroughly (the solution must be prepared immediately before use, it cannot be stored).

1. Проведение анализа.1. Analysis.

1.1 Внести контрольные и испытуемые образцы сывороток.1.1 Add control and test serum samples.

Освободить планшет из упаковки и внести в 2 повторах по 100 мкл положительного контроля, а также в 2 повторах по 100 мкл отрицательного контроля.Unpack the plate and add 100 μl positive control in 2 repetitions and 100 μl negative control in 2 replicates.

В остальные лунки планшета внести по 90 мкл буфера для разведения, а затем добавить по 10 мкл, предварительно разведенных в 20 раз испытуемых образцов (по две лунки на каждый образец).Add 90 μl of dilution buffer to the remaining wells of the plate, and then add 10 μl of the test samples previously diluted 20 times (two wells for each sample).

Планшет заклеить пленкой и выдержать в течение 1 ч при температуре от +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Cover the tablet with foil and incubate for 1 hour at a temperature of + 37 ° C with stirring at a speed of 300 rpm.

2.2 Промывание.2.2 Washing.

После окончания инкубации удалить жидкость из лунок и промыть планшет 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов, на автоматическом промывочном устройстве или вручную, доверху заполняя лунки (по 300 мкл/лунку). Затем жидкость окончательно удалить и подсушить планшет постукиванием по сложенной в несколько слоев фильтровальной бумаге.After the end of incubation, remove the liquid from the wells and wash the plate 4 times with a working solution of buffer for plate washing, on an automatic washing device or manually, filling the wells to the top (300 µl / well). Then finally remove the liquid and dry the plate by tapping on the filter paper folded in several layers.

2. 3 Внесение конъюгата.2. 3 Introduction of the conjugate.

В каждую лунку внести по 100 мкл рабочего раствора конъюгата моноклональных антител, планшет закрыть липкой пленкой и инкубировать в течение 1 часа при температуре +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Add 100 μl of the working solution of the conjugate of monoclonal antibodies to each well, cover the plate with adhesive tape and incubate for 1 hour at + 37 ° C with stirring at 300 rpm.

2.4 Промывание.2.4 Rinsing.

После окончания инкубации промыть планшет 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов.After the end of incubation, wash the plate 4 times with working buffer solution for plate washing.

2.5 Внесение хромоген-субстратного раствора.2.5 Adding chromogen-substrate solution.

В каждую лунку внести по 100 мкл хромоген-субстратного раствора и инкубировать в течение 15 минут в темном месте при температуре от +20°С.Add 100 μl of chromogen-substrate solution to each well and incubate for 15 minutes in a dark place at a temperature of + 20 ° C.

2.6 Остановка пероксидазной реакции.2.6 Stopping the peroxidase reaction.

Остановить реакцию добавлением в каждую лунку по 50 мкл стоп-реагента (1 М раствор серной кислоты) и провести учет результатов на спектрофотометре в течение 10 мин после остановки реакции.Stop the reaction by adding 50 μl of stop reagent (1 M sulfuric acid solution) to each well and record the results on a spectrophotometer within 10 minutes after stopping the reaction.

2.8. Регистрация результатов2.8. Registration of results

Измерить величину оптической плотности субстратной смеси на спектрофотометре с вертикальным лучом при длине волны 450 нм (А450) в течение 10 мин после остановки реакции.Measure the optical density of the substrate mixture on a spectrophotometer with a vertical beam at a wavelength of 450 nm (A 450 ) within 10 minutes after stopping the reaction.

Вычислить среднее арифметическое значение оптической плотности отрицательного (А450К-) и положительного (А450К+) контролей по формулам 1 и 2.Calculate the arithmetic mean of the optical density of the negative (A 450 K - ) and positive (A 450 K + ) controls according to formulas 1 and 2.

А450 К- ср=(А450 К- 1450А К- 2)/2 (1),A 450 K - cf = (A 450 K - 1 + A 450 A K - 2 ) / 2 (1),

гдеWhere

- А450 К- 1 - значение оптической плотности пробы 1 отрицательного контроля;- A 450 K - 1 - the optical density of the sample 1 negative control;

- А450 К- 2 - значение оптической плотности пробы 2 отрицательного контроля,- A 450 K - 2 - the value of the optical density of the sample 2 of the negative control,

А450 К+ ср=(А450 К+ 1450А К+ 2)/2 (2)A 450 K + sr = (A 450 K + 1 + A 450 A K + 2 ) / 2 (2)

гдеWhere

- А450 К+ 1 - значение оптической плотности пробы 1 положительного контроля;- A 450 K + 1 - the optical density of the sample 1 positive control;

- А450 К+ 2 - значение оптической плотности пробы 2 положительного контроля.- A 450 K + 2 - the optical density of the sample 2 of the positive control.

Вычислить среднее значение А450 для каждой опытной пробы (А450ОПср) по формуле 3:Calculate the average A 450 for each test sample (A 450 OP cf ) according to formula 3:

А450ОПср=(А450ОП1450ОП2)/2 (3)A 450 OP av = (A 450 OP 1 + A 450 OP 2 ) / 2 (3)

гдеWhere

- А450ОП1 - значение оптической плотности пробы 1;- A 450 OP 1 - the value of the optical density of the sample 1;

- А450ОП2 - значение оптической плотности пробы 2.- A 450 OP 2 - the value of the optical density of the sample 2.

При этом результаты измерения, полученные на контрольных образцах, должны удовлетворять следующим требованиям:In this case, the measurement results obtained on control samples must meet the following requirements:

1. Среднее значение оптической плотности в лунках с положительным контролем (А450К+ ср) - не менее 0,6;1. The average value of optical density in the wells with a positive control (A 450 K + cf ) - not less than 0.6;

2. Значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем (А450К- ср) - менее 0,2.2. The value of optical density in the wells with negative control (A 450 K - sr ) is less than 0.2.

При получении иных показателей исследование необходимо повторить.If other indicators are obtained, the study must be repeated.

2.9 Интерпретация результатов.2.9 Interpretation of results.

Для интерпретации результатов вычисляют отсекающие значения оптической плотности А450 (Cut off).To interpret the results, calculate the cutoff values of the absorbance A 450 (Cut off).

Значение Cut off вычисляют по формуле:The Cut off value is calculated by the formula:

Cut off=А450К- ср+3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed +3 x SD A 450 K - ,

гдеWhere

- SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля.- SD А 450 К - is the standard deviation of the optical density values of the negative control.

Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считается положительным, если А450ОПср выше, чем значение Cut off в 2,5 раза.The analyzed serum or blood plasma sample is considered positive if A 450 OD cp is 2.5 times higher than the Cut off value.

Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считается отрицательным, если А450ОПср не превышает значение Cut off в 2,5 раза.The analyzed serum or blood plasma sample is considered negative if A 450 OD cf does not exceed the Cut off value by 2.5 times.

Реакцию вируснейтрализации ставили в варианте: постоянная доза вируса - разведения сыворотки или плазмы крови.The virus neutralization reaction was set in the variant: constant dose of the virus - dilution of serum or blood plasma.

В лунки планшета вносили 2-кратные разведения сыворотки или плазмы крови, начиная с разведения 1/20 до 1/1280 в объеме 50 мкл/лунку в 3 повторах.In the wells of the plate, 2-fold dilutions of serum or blood plasma were made, starting with a dilution of 1/20 to 1/1280 in a volume of 50 μl / well in 3 repetitions.

В отдельные лунки вносят контрольные образцы:Control samples are added to individual wells:

- разведения контрольной плазмы с известным титром ВНА по 50 мкл/лунку (контроль проведения) в 3 повторах.- dilutions of control plasma with a known BHA titer at 50 μl / well (control of conduction) in 3 repetitions.

- по 50 мкл контрольной негативной плазмы (не обладающей вируснейтрализующей активностью) в разведении 1/20, в 3 повторах (контроль плазмы).- 50 μl of control negative plasma (not possessing virus neutralizing activity) in a dilution of 1/20, in 3 repetitions (control plasma).

- по 100 мкл ростовой среды в 3 повторах (РС) (контроль клеток).- 100 μl of growth medium in 3 repetitions (RS) (control of cells).

- по 50 мкл РС и 50 мкл вируссодержащей суспензии с концентрацией 2000 TCID(tissue culture infective dose 50/мл (контроль дозы вируса) в 3 повторах.- 50 μl of PC and 50 μl of vaccinated suspension with a concentration of 2000 TCID (tissue culture infective dose 50 / ml (control of the virus dose) in 3 repetitions.

Далее во все лунки, кроме контроля клеток, вносили по 50 мкл вируссодержащей суспензии с концентрацией 2000 TCID50/мл.Then, 50 μl of vaccinated suspension with a concentration of 2000 TCID50 / ml was added to all wells, except for the control of cells.

В качестве контроля вирусной активности (Контроль вируса) в отдельные лунки планшета вносили разведения вируссодержащей суспензии (внутренний контроль вносимых доз вируса при исследования нейтрализующей активности плазмы).As a control of viral activity (Control of the virus), dilutions of a vaccinated suspension were introduced into individual wells of the plate (internal control of the introduced doses of the virus when studying the neutralizing activity of plasma).

Далее планшет инкубировали в атмосфере 5% CO2 при 37°С в течение 60 минут.Then the plate was incubated in an atmosphere of 5% CO2 at 37 ° C for 60 minutes.

Затем во все лунки планшета инокулировали по 20000 клеток Vero E6 в объеме 100 мкл/лунку (концентрация клеток 2×105 клеток/мл) в свежеприготовленной РС. Планшеты с клетками инкубировали в атмосфере 5% CO2 при 37°С в течение 96 часов до полного проявления цитопатического действия вируса в вирусном контроле в ожидаемом диапазоне.Then, 20,000 Vero E6 cells were inoculated into all wells of the plate in a volume of 100 μl / well (cell concentration 2 × 10 5 cells / ml) in freshly prepared PC. Plates with cells were incubated in an atmosphere of 5% CO2 at 37 ° C for 96 hours until the full manifestation of the cytopathic effect of the virus in the viral control in the expected range.

Оценку вирусной продукции по цитопатическому действию (ЦПД) осуществляли на основе анализа жизнеспособности клеток при помощи микроскопирования, с целью визуального определения границы вирусного повреждения клеток.Evaluation of viral production by cytopathic action (CPE) was carried out on the basis of analysis of cell viability using microscopy, in order to visually determine the border of viral cell damage.

Вируснейтрализующую активность плазмы/сыворотки оценивали визуально под микроскопом через 96 часов после инфицирования по ингибированию ЦПД вируса в культуре клеток Vero E6. Каждое из разведений плазмы/сыворотки испытывали в трех параллельных лунках. Результатом исследования являлось заключение о нейтрализации цитопатического действия вируса в культуре клеток Vero E6 при воздействии плазмы/сыворотки крови. За титр ВНА исследуемой плазмы/сыворотки принимали высшее ее разведение, при котором происходит подавление цитопатического действия в 2 лунках из 3.Virus neutralizing activity of plasma / serum was assessed visually under a microscope 96 hours after infection by inhibition of the CPP virus in a Vero E6 cell culture. Each of the plasma / serum dilutions was tested in three parallel wells. The result of the study was the conclusion about the neutralization of the cytopathic effect of the virus in the culture of Vero E6 cells when exposed to blood plasma / serum. The BHA titer of the studied plasma / serum was taken as its highest dilution, at which the cytopathic effect was suppressed in 2 out of 3 wells.

Результаты сравнительного анализа образцов сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 с помощью двух методов: иммуноферментного анализа на антитела к рекомбинантному белку RBD с помощью разработанной тест-системы и на наличие вируснейтрализующих антител (ВНА) методом прямой вируснейтрализации коронавируса SARS-CoV-2 на культуре клеток представлены в таблице 1. Результаты зависимости оптической плотности (OD450) образца при разведении в 200 раз от титра ВНА распределились следующим образом (Таблица 2).Results of a comparative analysis of serum or plasma samples of COVID-19 convalescents using two methods: enzyme immunoassay for antibodies to the recombinant RBD protein using a developed test system and for the presence of neutralizing antibodies (VNA) by direct virus neutralization of SARS-CoV-2 coronavirus in culture cells are presented in Table 1. The results of the dependence of the optical density (OD450) of the sample at a dilution of 200 times on the BHA titer were distributed as follows (Table 2).

Таблица 1. Результаты сравнительного анализа образцов плазмы и сыворотки крови реконвалесцентов COVID-19Table 1. Results of a comparative analysis of plasma and serum samples of COVID-19 convalescents

No. Титр вируснейтрализующих антител, 1/Virus neutralizing antibody titer, 1 / Значение оптической плотности образца при разведении в 200 раз (OD450)Optical density of the sample at 200 times dilution (OD450) 1one 320320 2,872.87 22 12801280 2,852.85 33 320320 2,782.78 44 12801280 2,752.75 5five 640640 2,722.72 66 640640 2,702.70 77 128128 2,342.34 88 10241024 2,262.26 99 4040 2,022.02 10ten 128128 1,931.93 11eleven 512512 1,881.88 1212 640640 1,871.87 13thirteen 4040 1,831.83 1414 10241024 1,801.80 15fifteen 320320 1,761.76 1616 8080 1,751.75 1717 320320 1,741.74 18eighteen 320320 1,741.74 1919 128128 1,691.69 2020 128128 1,561.56 2121 160160 1,561.56 2222 128128 1,511.51 2323 320320 1,491.49 2424 160160 1,471.47 2525 10241024 1,461.46 2626 8080 1,451.45 2727 4040 1,431.43 2828 8080 1,431.43 2929 8080 1,421.42 30thirty 10241024 1,421.42 3131 160160 1,341.34 3232 256256 1,391.39 3333 12801280 1,381.38 3434 6464 1,331.33 3535 160160 1,321.32 3636 320320 1,321.32 3737 160160 1,301.30 3838 8080 1,171.17 3939 160160 1,161.16 4040 256256 1,151.15 4141 128128 1,141.14 4242 128128 1,131.13 4343 160160 1,121.12 4444 160160 1,101.10 4545 1616 1,091.09 4646 256256 1,091.09 4747 160160 1,081.08 4848 256256 1,081.08 4949 640640 1,061.06 50fifty 256256 1,061.06 5151 320320 1,051.05 5252 8080 1,051.05 5353 256256 1,041.04 5454 160160 1,031.03 5555 128128 1,021.02 5656 128128 1,001.00 5757 6464 0,990.99 5858 4040 0,980.98 5959 2020 0,970.97 6060 6464 0,970.97 6161 4040 0,970.97 6262 512512 0,950.95 6363 256256 0,940.94 6464 3232 0,930.93 6565 4040 0,910.91 6666 4040 0,890.89 6767 2020 0,850.85 6868 2020 0,840.84 6969 8080 0,840.84 7070 128128 0,830.83 7171 1616 0,820.82 7272 6464 0,820.82 7373 6464 0,810.81 7474 256256 0,810.81 7575 320320 0,800.80 7676 4040 0,780.78 7777 128128 0,780.78 7878 2020 0,780.78 7979 1616 0,780.78 8080 2020 0,750.75 8181 256256 0,740.74 8282 256256 0,740.74 8383 1616 0,720.72 8484 2020 0,720.72 8585 2020 0,720.72 8686 6464 0,720.72 8787 2020 0,710.71 8888 2020 0,710.71 8989 1616 0,700.70 9090 4040 0,700.70 9191 2020 0,680.68 9292 10241024 0,680.68 9393 3232 0,680.68 9494 8080 0,680.68 9595 2020 0,650.65 9696 1616 0,650.65 9797 2020 0,640.64 9898 6464 0,640.64 9999 2020 0,640.64 100one hundred 2020 0,630.63 101101 1616 0,630.63 102102 4040 0,630.63 103103 3232 0,620.62 104104 2020 0,620.62 105105 2020 0,610.61 106106 6464 0,610.61 107107 4040 0,600.60 108108 3232 0,600.60 109109 640640 0,590.59 110110 6464 0,590.59 111111 4040 0,570.57 112112 2020 0,570.57 113113 2020 0,570.57 114114 2020 0,560.56 115115 128128 0,550.55 116116 3232 0,550.55 117117 320320 0,540.54 118118 6464 0,520.52 119119 1616 0,510.51 120120 256256 0,510.51 121121 2020 0,510.51 122122 2020 0,510.51 123123 6464 0,500.50 124124 1616 0,500.50 125125 2020 0,500.50 126126 6464 0,490.49 127127 8080 0,490.49 128128 2020 0,480.48 129129 3232 0,480.48 130130 2020 0,460.46 131131 1616 0,450.45 132132 2020 0,450.45 133133 640640 0,450.45 134134 2020 0,440.44 135135 2020 0,440.44 136136 8080 0,440.44 137137 2020 0,430.43 138138 6464 0,430.43 139139 2020 0,420.42 140140 2020 0,420.42 141141 2020 0,420.42 142142 2020 0,410.41 143143 2020 0,410.41 144144 8080 0,410.41 145145 2020 0,390.39 146146 160160 0,390.39 147147 2020 0,380.38 148148 1616 0,380.38 149149 160160 0,350.35 150150 3232 0,350.35 151151 2020 0,350.35 152152 3232 0,350.35 153153 2020 0,340.34 154154 1616 0,330.33 155155 2020 0,320.32 156156 1616 0,320.32 157157 1616 0,320.32 158158 3232 0,320.32 159159 1616 0,320.32 160160 1616 0,310.31 161161 1616 0,310.31 162162 2020 0,300.30 163163 2020 0,300.30 164164 3232 0,300.30 165165 1616 0,300.30 166166 3232 0,290.29 167167 3232 0,270.27 168168 128128 0,270.27 169169 3232 0,270.27 170170 2020 0,260.26 171171 1616 0,260.26 172172 6464 0,250.25 173173 2020 0,240.24 174174 3232 0,240.24 175175 3232 0,230.23 176176 1616 0,230.23 177177 1616 0,220.22 178178 1616 0,210.21 179179 1616 0,210.21 180180 3232 0,210.21 181181 1616 0,210.21 182182 1616 0,210.21 183183 2020 0,210.21 184184 2020 0,200.20 185185 1616 0,200.20 186186 3232 0,200.20 187187 1616 0,190.19 188188 10241024 0,190.19 189189 1616 0,190.19 190190 4040 0,180.18 191191 1616 0,180.18 192192 2020 0,180.18 193193 1616 0,180.18 194194 1616 0,180.18 195195 1616 0,170.17 196196 1616 0,160.16 197197 3232 0,160.16 198198 1616 0,150.15 199199 3232 0,140.14 200200 1616 0,130.13 201201 1616 0,130.13 202202 3232 0,130.13 203203 3232 0,130.13 204204 00 0,130.13 205205 1616 0,120.12 206206 3232 0,120.12 207207 6464 0,120.12 208208 3232 0,110.11 209209 1616 0,110.11 210210 00 0,100.10 211211 1616 0,080.08 212212 1616 0,080.08 213213 1616 0,080.08 214214 3232 0,070.07 215215 160160 0,070.07 216216 128128 0,070.07 217217 1616 0,070.07 218218 00 0,060.06

Таблица 2. Распределение зависимости оптической плотности (OD450) образца при разведении в 200 раз от титра ВНА.Table 2. Distribution of the dependence of the optical density (OD450) of the sample when diluted 200 times on the BHA titer.

Значение оптической плотности образца при разведении в 200 раз (OD450)Optical density of the sample at 200 times dilution (OD450) Титр ВНА от 1/64 и вышеVNA titer from 1/64 and above Титр ВНА ниже 1/64BHA titer below 1/64 1,1 - 2,81.1 - 2.8 94%94% 6%6% 0,72 - 10.72 - 1 65%65% 35%35% 0,3-0,70.3-0.7 29%29% 71%71% До 0,2Up to 0.2 3,8%3.8% 96,296.2

Таким образом, в результате проведенных исследований установлено, что диагностическая чувствительность разработанной тест-системы для анализа сыворотки или плазмы крови пациентов, перенесших COVID-19 и обладающих вируснейтрализующей активностью (титр 1/64 и выше), составляет от 96,8%. Установлена корреляция между уровнем оптической плотности (OD450) образца при разведении в 200 раз от титра ВНА, представленная в таблице 2. А время проведения анализ составляет 2,5 часа.Thus, as a result of the conducted studies, it was found that the diagnostic sensitivity of the developed test system for the analysis of serum or blood plasma of patients who have undergone COVID-19 and have a neutralizing activity (titer 1/64 and higher) is from 96.8%. A correlation was established between the level of optical density (OD450) of the sample when diluted 200 times from the BHA titer, presented in Table 2. And the analysis time is 2.5 hours.

Пример 7. Способ применения разработанной тест-системы для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2Example 7. Method of using the developed test system for the analysis of human serum or plasma to determine the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus

В данном примере описан способ применения разработанной тест-системы (пример 5) для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2.This example describes a method of using the developed test system (example 5) for analyzing human serum or plasma to determine the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus.

Для исследования было отобрано 10 образцов плазмы и сыворотки крови реконвалесцентов COVID-19.For the study, 10 samples of plasma and serum of COVID-19 convalescents were taken.

Иммуноферментный анализ с использованием разработанной тест системы был проведен согласно следующему протоколу.Immunoassay using the developed test system was carried out according to the following protocol.

1. Приготовление рабочих растворов.1. Preparation of working solutions.

Для приготовления рабочего раствора буфера для промывания планшетов концентрат промывочного буфера развести в 25 раз дистиллированной водой.To prepare the working buffer solution for plate washing, dilute the wash buffer concentrate 25 times with distilled water.

Для приготовления рабочего раствора конъюгата, конъюгат развести в 20 раз буфером для разведения и тщательно перемешать пипетированием (раствор готовили непосредственно перед использованием).To prepare a working solution of the conjugate, dilute the conjugate 20 times with dilution buffer and mix thoroughly by pipetting (the solution was prepared immediately before use).

Для приготовления рабочего хромоген-субстратного раствора к 1,0 мл раствора хромогена добавить 9,0 мл раствора субстрата и тщательно перемешать. (раствор готовить непосредственно перед использованием, хранению не подлежит).To prepare a working chromogen-substrate solution, add 9.0 ml of a substrate solution to 1.0 ml of a chromogen solution and mix thoroughly. (the solution must be prepared immediately before use; it cannot be stored).

2. Проведение анализа.2. Analysis.

2.1 Внести контрольные и испытуемые образцы сывороток2.1 Add control and test serum samples

Освободить планшет из упаковки и внести в 2 повторах по 100 мкл положительного контроля, а также в 2 повторах по 100 мкл отрицательного контроля.Unpack the plate and add 100 μl positive control in 2 repetitions and 100 μl negative control in 2 replicates.

В остальные лунки планшета внести серию двукратных разведений исследуемых образцов (по два повтора на каждый образец).Add a series of two-fold dilutions of the test samples to the rest of the plate wells (two replicates for each sample).

Планшет заклеить пленкой и выдержать в течение 1 ч при температуре от +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Cover the tablet with foil and incubate for 1 hour at a temperature of + 37 ° C with stirring at a speed of 300 rpm.

2.2 Промывание.2.2 Washing.

После окончания инкубации удалить жидкость из лунок и промыть планшет 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов, на автоматическом промывочном устройстве или вручную, доверху заполняя лунки (по 300 мкл/лунку). Затем жидкость окончательно удалить и подсушить планшет постукиванием по сложенной в несколько слоев фильтровальной бумаге.After the end of incubation, remove the liquid from the wells and wash the plate 4 times with a working solution of buffer for plate washing, on an automatic washing device or manually, filling the wells to the top (300 µl / well). Then finally remove the liquid and dry the plate by tapping on the filter paper folded in several layers.

2. 3 Внесение конъюгата.2. 3 Introduction of the conjugate.

В каждую лунку внести по 100 мкл рабочего раствора конъюгата моноклональных антител, планшет закрыть липкой пленкой и инкубировать в течение 1 часа при температуре +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Add 100 μl of the working solution of the conjugate of monoclonal antibodies to each well, cover the plate with adhesive tape and incubate for 1 hour at + 37 ° C with stirring at 300 rpm.

2.4 Промывание.2.4 Rinsing.

После окончания инкубации промыть планшет 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов.After the end of incubation, wash the plate 4 times with working buffer solution for plate washing.

2.5 Внесение хромоген-субстратного раствора.2.5 Adding chromogen-substrate solution.

В каждую лунку внести по 100 мкл хромоген-субстратного раствора и инкубировать в течение 15 минут в темном месте при температуре от +20°С.Add 100 μl of chromogen-substrate solution to each well and incubate for 15 minutes in a dark place at a temperature of + 20 ° C.

2.6 Остановка пероксидазной реакции.2.6 Stopping the peroxidase reaction.

Остановить реакцию добавлением в каждую лунку по 50 мкл стоп-реагента (1М раствор серной кислоты) и провести учет результатов на спектрофотометре в течение 10 мин после остановки реакции.Stop the reaction by adding 50 μl of stop reagent (1M sulfuric acid solution) to each well and record the results on a spectrophotometer within 10 minutes after stopping the reaction.

2.8. Регистрация результатов2.8. Registration of results

Измерить величину оптической плотности субстратной смеси на спектрофотометре с вертикальным лучом при длине волны 450 нм (А450) в течение 10 мин после остановки реакции.Measure the optical density of the substrate mixture on a spectrophotometer with a vertical beam at a wavelength of 450 nm (A 450 ) within 10 minutes after stopping the reaction.

Вычислить среднее арифметическое значение оптической плотности отрицательного (А450К-) и положительного (А450К+) контролей по формулам 1 и 2.Calculate the arithmetic mean of the optical density of the negative (A 450 K - ) and positive (A 450 K + ) controls according to formulas 1 and 2.

А450К- ср=(А450К- 1450А К- 2)/2 (1)A 450 K - cf = (A 450 K - 1 + A 450 A K - 2 ) / 2 (1)

гдеWhere

- А450К- 1 - значение оптической плотности пробы 1 отрицательного контроля,- A 450 K - 1 - the optical density of the sample 1 negative control,

- А450К- 2 - значение оптической плотности пробы 2 отрицательного контроля.- A 450 K - 2 - the value of the optical density of the sample 2 of the negative control.

А450К+ ср=(А450К+ 1450А К+ 2)/2 (2)A 450 K + sr = (A 450 K + 1 + A 450 A K + 2 ) / 2 (2)

гдеWhere

- А450К+ 1 - значение оптической плотности пробы 1 положительного контроля,- A 450 K + 1 - the optical density of the sample 1 of the positive control,

- А450К+ 2 - значение оптической плотности пробы 2 положительного контроля.- A 450 K + 2 - the optical density of the sample 2 of the positive control.

Вычислить среднее значение А450 для каждой опытной пробы (А450ОПср) по формуле 3:Calculate the average A 450 for each test sample (A 450 OP cf ) according to formula 3:

А450ОПср=(А450ОП1450ОП2)/2 (3)A 450 OP av = (A 450 OP 1 + A 450 OP 2 ) / 2 (3)

гдеWhere

- А450ОП1 - значение оптической плотности пробы 1,- A 450 OP 1 - the value of the optical density of the sample 1,

- А450ОП2 - значение оптической плотности пробы 2.- A 450 OP 2 - the value of the optical density of the sample 2.

При этом результаты измерения, полученные на контрольных образцах, должны удовлетворять следующим требованиям:In this case, the measurement results obtained on control samples must meet the following requirements:

1. Среднее значение оптической плотности в лунках с положительным контролем (А450К+ ср) - не менее 0,6;1. The average value of optical density in the wells with a positive control (A 450 K + cf ) - not less than 0.6;

2. Среднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем (А450К- ср) - менее 0,2.2. The average value of optical density in the wells with negative control (A 450 K - cf. ) is less than 0.2.

При получении иных показателей исследование необходимо повторить.If other indicators are obtained, the study must be repeated.

2.9 Интерпретация результатов.2.9 Interpretation of results.

Для интерпретации результатов вычисляют отсекающие значения оптической плотности А450 (Cut off).To interpret the results, calculate the cutoff values of the absorbance A 450 (Cut off).

Значение Cut off вычисляют по формуле:The Cut off value is calculated by the formula:

Cut off=А450К- ср+3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed +3 x SD A 450 K - ,

гдеWhere

- SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля.- SD А 450 К - is the standard deviation of the optical density values of the negative control.

Титр антител вычисляли как последнее разведение образца, в котором А450ОПср выше, чем значение Cut off в 2 разаThe antibody titer was calculated as the last dilution of the sample, in which A 450 OD cp is 2 times higher than the Cut off value

Результаты проведенного исследования представлены в таблице 3.The results of the study are presented in Table 3.

Таблица 3. Титры антител к RBD в образцах плазмы и сыворотки крови реконвалесцентов COVID-19Table 3. Antibody titers to RBD in plasma and serum samples of COVID-19 convalescents

Номер пациентаPatient number Титр антител к RBDAntibody titer to RBD 1one 1:5121: 512 22 1:2561: 256 33 1:641:64 44 1:321:32 5five 1:2561: 256 66 1:1281: 128 77 1:5121: 512 88 1:2561: 256 99 1:1281: 128 10ten 1:2561: 256

Таким образом, результаты проведенного исследования, доказывают, что разработанная тест-система может быть использована для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2.Thus, the results of the study prove that the developed test system can be used for the analysis of human serum or plasma to determine the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus.

Специалисту среднего уровня понятно, что данная тест система может также использоваться для детекции антител к белку RBD вируса SARS-CoV-2 в сыворотке или плазме крови людей, для оценки напряженности иммунного ответа после введения вакцины, содержащей своем составе рецептор-связывающий домен RBD вируса SARS-CoV-2 или его ген.An average specialist understands that this test system can also be used to detect antibodies to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus in serum or plasma of humans, to assess the strength of the immune response after administration of a vaccine containing the RBD receptor-binding domain of the SARS virus -CoV-2 or its gene.

Пример 8 Сравнение тест-систем для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека с различными вариантами адсорбированных белков коронавируса по их способности неспецифически определять антитела против сезонного коронавируса человека ОС43.Example 8 Comparison of test systems for enzyme-linked immunosorbent assay of human serum or blood plasma with different variants of adsorbed coronavirus proteins according to their ability to nonspecifically detect antibodies against seasonal human coronavirus OC43.

Задача данного эксперимента заключалась в сравнении нескольких тест-систем для иммуноферментного анализа, основанных на использовании рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 (разработанная тест-система), или рекомбинантного полноразмерного белка S вируса SARS-CoV-2, или разрушенного вируса SARS-CoV-2, по их способности неспецифически связываться с антителами к сезонному коронавирусу ОС43, который циркулирует в популяции человека.The purpose of this experiment was to compare several test systems for enzyme immunoassay based on the use of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus (developed test system), or the recombinant full-length protein S of the SARS-CoV-2 virus, or the destroyed SARS virus. CoV-2, by their ability to nonspecifically bind to antibodies to the seasonal OS43 coronavirus, which circulates in the human population.

На первом этапе полноразмерный белок S вируса SARS-CoV-2, или вирус SARS-CoV-2, инактивированный нагреванием при температуре 56°С в течении 30 мин и разрушенный воздействием УЗ (в течение 1 минуты на ультразвуковом гомогенизаторе soniprep 150 Plus, MSE), наносили в лунки планшетов для иммуноферментного анализа в концентрации 10 мкг/мл в 100 мкл и адсорбировали ночь при температуре +4°С.At the first stage, the full-length protein S of the SARS-CoV-2 virus, or the SARS-CoV-2 virus, inactivated by heating at 56 ° C for 30 minutes and destroyed by ultrasound (within 1 minute on an ultrasonic homogenizer soniprep 150 Plus, MSE) was applied to the wells of plates for enzyme-linked immunosorbent assay at a concentration of 10 μg / ml in 100 μl and adsorbed overnight at + 4 ° C.

Таким образом, к началу эксперимента было подготовлено 3 планшета:Thus, 3 plates were prepared by the beginning of the experiment:

1. планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2 2 SEQ ID NO:2, являющийся частью разработанной тест-системы (пример 5);1. plate for enzyme immunoassay with adsorbed in the wells of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus 2 SEQ ID NO: 2, which is part of the developed test system (example 5);

2. планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках полноразмерным белком S вируса SARS-CoV-2;2. plate for enzyme immunoassay with adsorbed in the wells full-length protein S of the SARS-CoV-2 virus;

3. планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках вирусом SARS-CoV-2, инактивированным нагреванием и разрушенным с помощью ультразвука.3. plate for enzyme-linked immunosorbent assay with SARS-CoV-2 virus adsorbed in the wells, inactivated by heat and destroyed by ultrasound.

Затем подготовили рабочие растворы необходимые для анализа (тест-система пример 5).Then we prepared working solutions required for analysis (test system example 5).

Для приготовления рабочего раствора буфера для промывания планшетов концентрат промывочного буфера развести в 25 раз дистиллированной водой.To prepare the working buffer solution for plate washing, dilute the wash buffer concentrate 25 times with distilled water.

Для приготовления рабочего раствора конъюгата, конъюгат развести в 20 раз буфером для разведения и тщательно перемешать пипетированием (раствор готовили непосредственно перед использованием).To prepare a working solution of the conjugate, dilute the conjugate 20 times with dilution buffer and mix thoroughly by pipetting (the solution was prepared immediately before use).

Для приготовления рабочего хромоген-субстратного раствора к 1,0 мл раствора хромогена добавить 9,0 мл раствора субстрата и тщательно перемешать (раствор готовить непосредственно перед использованием, хранению не подлежит).To prepare a working chromogen-substrate solution, add 9.0 ml of a substrate solution to 1.0 ml of a chromogen solution and mix thoroughly (the solution must be prepared immediately before use, it cannot be stored).

Далее в лунки каждого из 3 планшетов нанесли:Further, in the wells of each of the 3 plates were applied:

1) положительный контроль, включающий инактивированный образец сыворотки крови человека, содержащий IgG к белку RBD коронавируса SARS-CoV-2 (тест-система, пример 5) в 2 повторах по 100 мкл;1) a positive control, including an inactivated human serum sample containing IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 coronavirus (test system, example 5) in 2 repetitions of 100 μl;

2) отрицательный контроль, представляющий собой инактивированный образец сыворотки крови человека, не содержащий IgG к белку RBD коронавируса SARS-CoV-2 (тест-система, пример 5) в 2 повторах по 100 мкл;2) a negative control, which is an inactivated human serum sample that does not contain IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 coronavirus (test system, example 5) in 2 replicates of 100 μl each;

3) образцы сыворотки крови пациентов, которые перенесли заболевание, вызванное сезонным коронавирусом ОС43, но при этом не болели COVID-19 (10 образцов), разведенные в 200 раз в 2 повторах по 100 мкл.3) blood serum samples from patients who have suffered a disease caused by the seasonal coronavirus OS43, but did not have COVID-19 (10 samples), diluted 200 times in 2 repetitions of 100 μl.

Далее все планшеты заклеили пленкой и выдержали в течение 1 ч при температуре +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Then all the plates were sealed with a film and kept for 1 hour at a temperature of + 37 ° C with stirring at a speed of 300 rpm.

После окончания инкубации удалили жидкость из лунок и промыли планшеты 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов. Затем жидкость окончательно удалили и подсушили планшеты постукиванием по сложенной в несколько слоев фильтровальной бумаге.After the end of the incubation, the liquid was removed from the wells and the plates were washed 4 times with working buffer solution for plate washing. Then the liquid was finally removed and the plates were dried by tapping on filter paper folded in several layers.

Далее в каждую лунку внесли по 100 мкл рабочего раствора конъюгата моноклональных антител, планшеты закрыли липкой пленкой и инкубировали в течение 1 часа при температуре +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Then, 100 μl of the working solution of the conjugate of monoclonal antibodies was added to each well, the plates were covered with an adhesive film and incubated for 1 hour at a temperature of + 37 ° C with stirring at a speed of 300 rpm.

После окончания инкубации промыли планшеты 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов.After the end of the incubation, the plates were washed 4 times with the working solution of the plate washing buffer.

Затем в каждую лунку всех 3 планшетов внесли по 100 мкл хромоген-субстратного раствора и инкубировали в течение 15 минут в темном месте при температуре от 20°СThen, 100 μl of chromogen-substrate solution was added to each well of all 3 plates and incubated for 15 minutes in a dark place at a temperature of 20 ° C

После этого остановили реакцию добавлением в каждую лунку по 50 мкл стоп-реагента (1М раствор серной кислоты) и провели учет результатов на спектрофотометре в течение 10 мин после остановки реакции.After that, the reaction was stopped by adding 50 μl of stop reagent (1M sulfuric acid solution) to each well, and the results were recorded on a spectrophotometer within 10 minutes after stopping the reaction.

Далее измерили величину оптической плотности субстратной смеси на спектрофотометре с вертикальным лучом при длине волны 450 нм (А450) в течение 10 мин после остановки реакции.Next, the optical density of the substrate mixture was measured on a spectrophotometer with a vertical beam at a wavelength of 450 nm (A 450 ) within 10 minutes after stopping the reaction.

Вычислили среднее арифметическое значение оптической плотности отрицательного (А450К-) и положительного (А450К+) контролей для каждого планшета по формулам 1 и 2.Calculated the arithmetic mean of the optical density of the negative (A 450 K - ) and positive (A 450 K + ) controls for each plate according to formulas 1 and 2.

А450 К- ср=(А450 К- 1450А К- 2)/2 (1)A 450 K - cf = (A 450 K - 1 + A 450 A K - 2 ) / 2 (1)

гдеWhere

- А450 К- 1 - значение оптической плотности пробы 1 отрицательного контроля,- A 450 K - 1 - the optical density of the sample 1 negative control,

- А450 К- 2 - значение оптической плотности пробы 2 отрицательного контроля.- A 450 K - 2 - the value of the optical density of the sample 2 of the negative control.

А450 К+ ср=(А450 К+ 1450А К+ 2)/2 (2)A 450 K + sr = (A 450 K + 1 + A 450 A K + 2 ) / 2 (2)

гдеWhere

- А450 К+ 1 - значение оптической плотности пробы 1 положительного контроля,- A 450 K + 1 - the optical density of the sample 1 of the positive control,

- А450 К+ 2 - значение оптической плотности пробы 2 положительного контроля.- A 450 K + 2 - the optical density of the sample 2 of the positive control.

Вычислили среднее значение А450 для каждой опытной пробы (А450ОПср) по формуле 3:Calculated the average A 450 for each test sample (A 450 OP cf ) according to the formula 3:

А450ОПср=(А450ОП1450ОП2)/2 (3)A 450 OP av = (A 450 OP 1 + A 450 OP 2 ) / 2 (3)

гдеWhere

- А450 ОП1 - значение оптической плотности пробы 1,- A 450 OP 1 - the value of the optical density of the sample 1,

- А450 ОП2 - значение оптической плотности пробы 2. - A 450 OP 2 - the value of the optical density of the sample 2.

Для интерпретации результатов вычислили отсекающие значения оптической плотности А450 (Cut off).To interpret the results, the cutoff values of the absorbance A 450 (Cut off) were calculated.

Значение Cut off вычислили по формуле:The Cut off value was calculated by the formula:

Cut off=А450К- ср+3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed +3 x SD A 450 K - ,

гдеWhere

- SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля.- SD А 450 К - is the standard deviation of the optical density values of the negative control.

Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считался положительным, если А450ОПср выше, чем значение Cut off в 2,5 раза.The analyzed serum or blood plasma sample was considered positive if A 450 OD cp is 2.5 times higher than the Cut off value.

Для планшета с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2 2 SEQ ID NO:2:For the plate with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus 2 SEQ ID NO: 2 adsorbed in the wells:

Среднее значение оптической плотности в лунках с положительным контролем (А450К+ ср) составило 1,960.The mean optical density in the positive control wells (A 450 K + cf ) was 1.960.

Среднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем (А450К- ср) составило 0,052.The average optical density in the wells with negative control (A 450 K - cf. ) was 0.052.

Средние значения оптической плотности позволяют говорить о том, что исследование прошло успешно и его результаты достоверны.The average values of optical density allow us to say that the study was successful and its results are reliable.

Значение Cut off составляет:Cut off value is:

Cut off=0,052+3 х 0,0000125=0,052038Cut off = 0.052 + 3 x 0.0000125 = 0.052038

В данном тесте исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считался положительным, если А450ОПср было выше, чем значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,052038=0,13).In this test, the studied serum or plasma sample was considered positive if A 450 OD cp was 2.5 times higher than the Cut off value (2.5 * 0.052038 = 0.13).

Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считается отрицательным, если А450ОПср не превышало значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,052038=0,13).A test serum or blood plasma sample is considered negative if A 450 OD cf did not exceed the Cut off value by 2.5 times (2.5 * 0.052038 = 0.13).

Для планшета с адсорбированным в лунках полноразмерным белком S вируса SARS-CoV-2:For a plate with SARS-CoV-2 full-length protein S adsorbed in the wells:

Среднее значение оптической плотности в лунках с положительным контролем (А450К+ ср) составило 2,008.The mean optical density in the positive control wells (A 450 K + cf ) was 2.008.

Среднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем (А450К- ср) составило 0,064.The average optical density in the wells with negative control (A 450 K - cf. ) was 0.064.

Средние значения оптической плотности позволяют говорить о том, что исследование прошло успешно и его результаты достоверны.The average values of optical density allow us to say that the study was successful and its results are reliable.

Значение Cut off составляет:Cut off value is:

Cut off=0,064+3 х 0,0001805=0,064542Cut off = 0.064 + 3 x 0.0001805 = 0.064542

В данном тесте исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считался положительным, если А450ОПср было выше, чем значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,064542=0,16).In this test, the studied serum or plasma sample was considered positive if A 450 OD cp was 2.5 times higher than the Cut off value (2.5 * 0.064542 = 0.16).

Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считается отрицательным, если А450ОПср не превышало значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,064542=0,16).The test sample of serum or blood plasma is considered negative if A 450 OD cf did not exceed the Cut off value by 2.5 times (2.5 * 0.064542 = 0.16).

Для планшета с адсорбированным в лунках вирусом SARS-CoV-2, инактивированным нагреванием и разрушенным с помощью ультразвука:For a plate with SARS-CoV-2 virus adsorbed in wells, inactivated by heat and destroyed by ultrasound:

Среднее значение оптической плотности в лунках с положительным контролем (А450К+ ср) составило 2,081The average optical density in the wells with a positive control (A 450 K + cf ) was 2.081

Среднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем (А450К- ср) составило 0,061.The average optical density in the wells with negative control (A 450 K - cf. ) was 0.061.

Средние значения оптической плотности позволяют говорить о том, что исследование прошло успешно и его результаты достоверны.The average values of optical density allow us to say that the study was successful and its results are reliable.

Значение Cut off составляет:Cut off value is:

Cut off=0,061+3 х 0,0001325=0,0613975.Cut off = 0.061 + 3 x 0.0001325 = 0.0613975.

В данном тесте исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считался положительным, если А450ОПср было выше, чем значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,0613975=0,15).In this test, the studied serum or plasma sample was considered positive if A 450 OD cf was 2.5 times higher than the Cut off value (2.5 * 0.0613975 = 0.15).

Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считается отрицательным, если А450ОПср не превышало значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,0613975=0,15).The test serum or blood plasma sample is considered negative if A 450 OD cf did not exceed the Cut off value by 2.5 times (2.5 * 0.0613975 = 0.15).

Полученные результаты представлены в таблице 4.The results are shown in Table 4.

Таблица 4. Средняя оптическая плотность опытных и контрольных образцов, полученная в результате проведения сравнительного анализа тест-систем для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека с различными вариантами адсорбированных белков коронавируса по их способности неспецифически определять антитела против сезонного коронавируса человека ОС43.Table 4. Average optical density of experimental and control samples obtained as a result of comparative analysis of test systems for enzyme immunoassay of human serum or plasma with different variants of adsorbed coronavirus proteins by their ability to nonspecifically detect antibodies against seasonal human coronavirus OC43.

Таблица 4Table 4

Исследуемый образецTest sample RBDRBD Полноразмерный белок SFull-length protein S Вирус SARS-CoV-2SARS-CoV-2 virus 1one 0,0550.055 0,1590.159 0,1320.132 22 0,0600.060 0,4930.493 0,5190.519 33 0,0530.053 0,1520.152 0,4140.414 44 0,0540.054 0,1420.142 0,1170.117 5five 0,0550.055 0,2680.268 0,4360.436 66 0,0550.055 0,1430.143 0,1340.134 77 0,0480.048 0,0650.065 0,1360.136 88 0,0480.048 0,3510.351 0,5810.581 99 0,0490.049 0,1300.130 0,0900.090 10ten 0,0490.049 0,1590.159 0,2810.281 K-K- 0,0520.052 0,0640.064 0,0610.061 K+K + 1,9601,960 2,0082.008 2,0812.081

Неожиданно было выявлено, что использование разработанной тест-системы для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2 (тест-система по примеру 5) для анализа сыворотки и плазмы крови человека на наличие антител к вирусу SARS-CoV-2 не дает ложноположительных результатов у пациентов перенесших заболевание, вызванное сезонным коронавирусом человека ОС43, тогда как при использовании тест-системы для иммуноферментного анализа сыворотки и плазмы крови человека с адсорбированным в лунках полноразмерным белком S наблюдалось 30% ложноположительных результатов, а при использовании тест-системы для иммуноферментного анализа сыворотки и плазмы крови человека с адсорбированным в лунках вирусом SARS-CoV-2, инактивированным нагреванием и разрушенным с помощью ультразвука наблюдалось 50% ложноположительных результатов.It was unexpectedly found that the use of the developed test system for enzyme-linked immunosorbent assay with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus SEQ ID NO: 2 (test system according to example 5) adsorbed in the wells for the analysis of human serum and plasma for the presence of antibodies to the SARS-CoV-2 virus does not give false positive results in patients who have undergone a disease caused by the seasonal human coronavirus OC43, whereas when using a test system for enzyme immunoassay of human serum and plasma with full-size protein S adsorbed in the wells, 30% of false-positive results were observed, and when using a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human serum and blood plasma with SARS-CoV-2 virus adsorbed in the wells, inactivated by heating and destroyed by ultrasound, 50% of false positive results were observed.

Результаты проведенного исследования можно объяснить тем, что полученный авторами рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2 имеет низкий процент гомологии с вирус-связывающим доменом белка S вируса ОС43. Таким образом, использование рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2 (по сравнению с полноразмерным белком S вируса SARS-CoV-2 или разрушенным вирусом SARS-CoV-2) в тест-системе для иммуноферментного анализа сыворотки и плазмы крови человека для определения антител к вирусу SARS-CoV-2 приведет к получению более точных и достоверных результатов.The results of the study can be explained by the fact that the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus SEQ ID NO: 2 obtained by the authors has a low percentage of homology with the virus-binding domain of the OC43 virus S protein. Thus, the use of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus SEQ ID NO: 2 (compared to the full-length protein S of the SARS-CoV-2 virus or the destroyed SARS-CoV-2 virus) in the test system for enzyme immunoassay of serum and plasma human blood for the determination of antibodies to the SARS-CoV-2 virus will lead to more accurate and reliable results.

Пример 9. Оценка результатов, полученных при использовании тест-системы для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека в различных экспериментальных условиях.Example 9. Evaluation of the results obtained when using the test system for enzyme immunoassay of human serum or plasma in various experimental conditions.

В данном исследовании использовали тест-систему для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека (пример 5), в качестве исследуемого образца выбрали плазму крови человека с известным титром антител против белка RBD вируса SARS-CoV-2 (1:512). Была проведена серия экспериментов, в которых анализ титра антител против белка RBD вируса SARS-CoV-2 проводился по протоколу, описанному в примере 7, за исключением 1 параметра, который был изменен.In this study, we used a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human serum or plasma (example 5); as a test sample, we chose human blood plasma with a known titer of antibodies against the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus (1: 512). A series of experiments was carried out in which the analysis of the antibody titer against the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus was carried out according to the protocol described in example 7, with the exception of 1 parameter, which was changed.

Эксперимент №1. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7 (контроль).Experiment # 1. The study was carried out according to the protocol described in example 7 (control).

Эксперимент №2. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +36°С.Experiment # 2. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the incubation temperature of the test samples, which was + 36 ° C.

Эксперимент №3. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +38°С.Experiment # 3. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the incubation temperature of the test samples, which was + 38 ° C.

Эксперимент №4. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации с конъюгатом, которая составила +36°С.Experiment # 4. The study was performed according to the protocol described in example 7, except for the incubation temperature with the conjugate, which was + 36 ° C.

Эксперимент №5. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации с конъюгатом, которая составила +38°С.Experiment # 5. The study was performed according to the protocol described in example 7, except for the incubation temperature with the conjugate, which was + 38 ° C.

Эксперимент №6. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации с хромогеном, которая составила +15°С.Experiment # 6. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the incubation temperature with the chromogen, which was + 15 ° C.

Эксперимент №7. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +25°С.Experiment # 7. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the incubation temperature of the test samples, which was + 25 ° C.

Эксперимент №8. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме скорости перемешивания при инкубации исследуемых образцов, которая составила 250 оборотов/минуту.Experiment # 8. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the stirring speed during incubation of the test samples, which was 250 rpm.

Эксперимент №9. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме скорости перемешивания при инкубации исследуемых образцов, которая составила 350 оборотов/минуту.Experiment # 9. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the stirring speed during incubation of the test samples, which was 350 rpm.

Эксперимент №10. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме скорости перемешивания при инкубации с конъюгатом, которая составила 250 оборотов/минуту.Experiment # 10. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the stirring speed during incubation with the conjugate, which was 250 rpm.

Эксперимент №11. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме скорости перемешивания при инкубации с конъюгатом, которая составила 350 оборотов/минуту.Experiment 11. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the stirring speed during incubation with the conjugate, which was 350 rpm.

Полученные результаты представлены в таблице 5.The results are shown in Table 5.

Таблица 5. Титр антител к белку RBD вируса SARS-CoV-2, полученный в экспериментах №1-11Table 5. The titer of antibodies to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, obtained in experiments No. 1-11

Эксперимент №Experiment # 1one 22 33 44 5five 66 77 88 99 10ten 11eleven Титр
IgG к
белку
RBD
Titer
IgG to
squirrel
RBD
1:5121: 512 1:5121: 512 1:5121: 512 1:5121: 512 1:5121: 512 1:5121: 512 1:5121: 512 1:5121: 512 1:5121: 512 1:5121: 512 1:5121: 512

Как видно из представленных данных, изменение температуры, скорости перемешивания при инкубации с исследуемыми образцами и антителами, а также температуры при инкубации с хромогеном в указанном диапазоне значений, не влияет на полученный результат.As can be seen from the presented data, a change in temperature, stirring rate during incubation with the test samples and antibodies, as well as temperature during incubation with a chromogen in the specified range of values, does not affect the result obtained.

Кроме того, была проведена серия экспериментов, в котором разработанная тест система (пример 5) использовалась для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов, наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2. Эксперименты проводили по протоколу, описанному в примере 6, за исключением 1 параметра, который был изменен.In addition, a series of experiments was carried out in which the developed test system (example 5) was used to analyze the serum or blood plasma of COVID-19 convalescents to select samples that are most promising for the therapy of patients infected with SARS-CoV-2. The experiments were carried out according to the protocol described in example 6, with the exception of 1 parameter, which was changed.

Эксперимент №12. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6 (контроль).Experiment # 12. The study was carried out according to the protocol described in example 6 (control).

Эксперимент №13. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +36°С.Experiment 13. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature of the test samples, which was + 36 ° C.

Эксперимент №14. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +38°С.Experiment # 14. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature of the test samples, which was + 38 ° C.

Эксперимент №15. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации с конъюгатом, которая составила +36°С.Experiment 15. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature with the conjugate, which was + 36 ° C.

Эксперимент №16. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации с конъюгатом, которая составила +38°С.Experiment # 16. The study was performed according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature with the conjugate, which was + 38 ° C.

Эксперимент №17. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации с хромогеном, которая составила +15°С.Experiment # 17. The study was performed according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature with the chromogen, which was + 15 ° C.

Эксперимент №18. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +25°С.Experiment # 18. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature of the test samples, which was + 25 ° C.

Эксперимент №19. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме скорости перемешивания при инкубации исследуемых образцов, которая составила 250 оборотов/минуту.Experiment # 19. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the stirring speed during incubation of the test samples, which was 250 rpm.

Эксперимент №20. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме скорости перемешивания при инкубации исследуемых образцов, которая составила 350 оборотов/минуту.Experiment # 20. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the stirring speed during incubation of the test samples, which was 350 rpm.

Эксперимент №21. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме скорости перемешивания при инкубации с конъюгатом, которая составила 250 оборотов/минуту.Experiment # 21. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the stirring speed during incubation with the conjugate, which was 250 rpm.

Эксперимент №22. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме скорости перемешивания при инкубации с конъюгатом, которая составила 350 оборотов/минуту.Experiment # 22. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the stirring speed during incubation with the conjugate, which was 350 rpm.

Полученные результаты представлены в таблице 6.The results are shown in Table 6.

Таблица 6. Среднее значение оптической плотности опытного образца (A450ОПср) при длине волны 450 нм, полученное в серии экспериментов №12-22Table 6. The average value of the optical density of the test sample (A 450 OD av ) at a wavelength of 450 nm, obtained in a series of experiments No. 12-22

Эксперимент №Experiment # 1212 13thirteen 1414 15fifteen 1616 1717 18eighteen 1919 2020 2121 2222 A450 A 450 1,691.69 1,691.69 1,691.69 1,691.69 1,691.69 1,691.69 1,691.69 1,691.69 1,691.69 1,691.69 1,691.69

Как видно из представленных данных, изменение температуры, скорости перемешивания при инкубации с исследуемыми образцами и антителами, а также температуры при инкубации с хромогеном в указанном диапазоне значений, не влияет на полученный результат. А время проведения анализ составляет 2,5 часа.As can be seen from the presented data, a change in temperature, stirring rate during incubation with the test samples and antibodies, as well as temperature during incubation with a chromogen in the specified range of values, does not affect the result obtained. And the analysis time is 2.5 hours.

Таким образом, разработаны генетическая конструкция для экспрессии рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, штамм клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 и способ его получения, а также тест-система для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека, которая позволяет быстро и эффективно проводить тест для определения наиболее перспективных образцов сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2.Thus, a genetic construct has been developed for the expression of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD, the producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus and a method for its production, as well as a test system for an enzyme-linked immunosorbent assay for human serum or plasma, which allows a quick and effective test to determine the most promising serum or plasma samples of COVID-19 convalescents for the treatment of patients infected with SARS-CoV-2.

--->--->

Перечень последовательностейSequence listing

SEQ ID NO:1SEQ ID NO: 1

<110> ФГБУ "НИЦЭМ им. Н.Ф.Гамалеи" Минздрава России<110> FGBU "NITsEM named after N.F. Gamaleya" of the Ministry of Health of Russia

<120> Способ получения штамма клеток яичника китайского хомячка, продуцента<120> Method for producing a Chinese hamster ovary cell strain, producer

рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, штамм клеток яичникаrecombinant protein RBD of SARS-CoV-2 virus, ovarian cell strain

китайского хомячка, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2,Chinese hamster, producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus,

способ получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, тест-системаmethod for producing recombinant RBD protein of SARS-CoV-2 virus, test system

для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека и ееfor enzyme immunoassay of human serum or plasma and its

применениеapplication

<160> 1<160> 1

<170> BISSAP1.3.6<170> BISSAP1.3.6

<210> 1<210> 1

<211> 765<211> 765

<212> DNA<212> DNA

<213> SARS-CoV-2<213> SARS-CoV-2

<400> 1<400> 1

atgggctgga gcttgatcct tctgttcctg gttgctgtgg ccaccagagt gctgtctcgg 60atgggctgga gcttgatcct tctgttcctg gttgctgtgg ccaccagagt gctgtctcgg 60

gtgcagccca ccgaatccat cgtgcggttc cccaatatca ccaatctgtg ccccttcggc 120gtgcagccca ccgaatccat cgtgcggttc cccaatatca ccaatctgtg ccccttcggc 120

gaggtgttca atgccaccag attcgcctct gtgtacgcct ggaaccggaa gcggatcagc 180gaggtgttca atgccaccag attcgcctct gtgtacgcct ggaaccggaa gcggatcagc 180

aattgcgtgg ccgactactc cgtgctgtac aactccgcca gcttcagcac cttcaagtgc 240aattgcgtgg ccgactactc cgtgctgtac aactccgcca gcttcagcac cttcaagtgc 240

tacggcgtgt cccctaccaa gctgaacgac ctgtgcttca caaacgtgta cgccgacagc 300tacggcgtgt cccctaccaa gctgaacgac ctgtgcttca caaacgtgta cgccgacagc 300

ttcgtgatcc ggggagatga agtgcggcag attgcccctg gacagacagg caagatcgcc 360ttcgtgatcc ggggagatga agtgcggcag attgcccctg gacagacagg caagatcgcc 360

gactacaact acaagctgcc cgacgacttc accggctgtg tgattgcctg gaacagcaac 420gactacaact acaagctgcc cgacgacttc accggctgtg tgattgcctg gaacagcaac 420

aacctggact ccaaagtcgg cggcaactac aattacctgt accggctgtt ccggaagtcc 480aacctggact ccaaagtcgg cggcaactac aattacctgt accggctgtt ccggaagtcc 480

aatctgaagc ccttcgagcg ggacatctcc accgagatct atcaggccgg cagcacccct 540aatctgaagc ccttcgagcg ggacatctcc accgagatct atcaggccgg cagcacccct 540

tgtaacggcg tggaaggctt caactgctac ttcccactgc agtcctacgg ctttcagccc 600tgtaacggcg tggaaggctt caactgctac ttcccactgc agtcctacgg ctttcagccc 600

acaaatggcg tgggctatca gccctacaga gtggtggtgc tgagcttcga actgctgcat 660acaaatggcg tgggctatca gccctacaga gtggtggtgc tgagcttcga actgctgcat 660

gcccctgcca cagtgtgcgg ccctaagaaa agcaccaatc tcgtgaagaa caaatgcgtg 720gcccctgcca cagtgtgcgg ccctaagaaa agcaccaatc tcgtgaagaa caaatgcgtg 720

aacttcgcgg ccgcacatca ccaccatcac catcatcatt gataa 765aacttcgcgg ccgcacatca ccaccatcac catcatcatt gataa 765

SEQ ID NO:2SEQ ID NO: 2

<110> ФГБУ "НИЦЭМ им. Н.Ф.Гамалеи" Минздрава России<110> FGBU "NITsEM named after N.F. Gamaleya" of the Ministry of Health of Russia

<120> Способ получения штамма клеток яичника китайского хомячка, продуцента<120> Method for producing a Chinese hamster ovary cell strain, producer

рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, штамм клеток яичникаrecombinant protein RBD of SARS-CoV-2 virus, ovarian cell strain

китайского хомячка, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2,Chinese hamster, producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus,

способ получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, тест-системаmethod for producing recombinant RBD protein of SARS-CoV-2 virus, test system

для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека и ееfor enzyme immunoassay of human serum or plasma and its

применениеapplication

<160> 1<160> 1

<170> BISSAP1.3.6<170> BISSAP1.3.6

<210> 2<210> 2

<211> 229<211> 229

<212> PRT<212> PRT

<213> SARS-CoV-2<213> SARS-CoV-2

<400> 2<400> 2

Arg Val Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr Asn Arg Val Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr Asn

1 5 10 15 1 5 10 15

Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala Ser Val Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala Ser Val

20 25 30 20 25 30

Tyr Ala Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr Ser Tyr Ala Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr Ser

35 40 45 35 40 45

Val Leu Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly Val Val Leu Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly Val

50 55 60 50 55 60

Ser Pro Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn Val Tyr Ala Asp Ser Pro Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn Val Tyr Ala Asp

65 70 75 80 65 70 75 80

Ser Phe Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly Gln Ser Phe Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly Gln

85 90 95 85 90 95

Thr Gly Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro Asp Asp Phe Thr Thr Gly Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro Asp Asp Phe Thr

100 105 110 100 105 110

Gly Cys Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys Val Gly Gly Cys Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys Val Gly

115 120 125 115 120 125

Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn Leu Lys Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn Leu Lys

130 135 140 130 135 140

Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly Ser Thr Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly Ser Thr

145 150 155 160 145 150 155 160

Pro Cys Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu Gln Ser Pro Cys Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu Gln Ser

165 170 175 165 170 175

Tyr Gly Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val Tyr Gly Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val

180 185 190 180 185 190

Val Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly Val Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly

195 200 205 195 200 205

Pro Lys Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys Val Asn Phe His Pro Lys Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys Val Asn Phe His

210 215 220 210 215 220

His His His His His His His His His His

225 225

<---<---

Claims (55)

1. Генетическая конструкция для экспрессии рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, включающая SEQ ID NO:1.1. Genetic construct for expression of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, comprising SEQ ID NO: 1. 2. Штамм клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, содержащий генетическую конструкцию, включающую SEQ ID NO:1.2. The strain of cells of the ovary of the Chinese hamster CHO-S-RBD, the producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, containing the genetic construct comprising SEQ ID NO: 1. 3. Способ получения штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD по п. 2, включающий:3. A method of obtaining a Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD according to claim 2, including: - получение генетической конструкции, включающей SEQ ID NO:1;- obtaining a genetic construct comprising SEQ ID NO: 1; - введение указанной генетической конструкции в клетки путем липофекции;- introduction of the specified genetic construct into cells by lipofection; - селекцию клеток на антибиотике Hygromycin B.- cell selection for the antibiotic Hygromycin B. 4. Рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 для выявления антител к SARS-CoV-2, имеющий SEQ ID NO:2, являющийся продуктом штамма по п. 2.4. Recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus for detecting antibodies to SARS-CoV-2, having SEQ ID NO: 2, which is the product of the strain according to claim 2. 5. Способ получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 по п. 4, включающий:5. A method of obtaining a recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus according to claim 4, including: - культивирование штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD по п. 2;- cultivation of the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD according to claim 2; - хроматографическую очистку рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 из культуральной среды штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD;- chromatographic purification of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus from the culture medium of the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD; - подтверждение получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, имеющего SEQ ID NO:2.- confirmation of the receipt of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2. 6. Тест-система для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека, представляющая собой набор реагентов, включающий:6. Test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human serum or plasma, which is a set of reagents, including: - планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2;- plate for enzyme immunoassay with adsorbed in the wells of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2; - положительный контроль, включающий инактивированный образец сыворотки крови человека, содержащий IgG к белку RBD вируса SARS-CoV-2;- a positive control comprising an inactivated human serum sample containing IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus; - отрицательный контроль, представляющий собой инактивированный образец сыворотки крови человека, не содержащий IgG к белку RBD вируса SARS-CoV-2;- negative control, which is an inactivated human serum sample that does not contain IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus; - конъюгат, содержащий 20-кратный концентрат моноклональных мышиных антител к IgG человека, конъюгированных с пероксидазой хрена;- a conjugate containing a 20-fold concentrate of monoclonal mouse antibodies to human IgG, conjugated with horseradish peroxidase; - 25-кратный концентрат промывочного буфера, содержащий концентрат фосфатно-солевого буфера с Твином 20 для промывания планшетов;- 25x Wash Buffer Concentrate containing PBS concentrate with Tween 20 for washing plates; - буфер для разведения сыворотки или плазмы и указанного конъюгата;- buffer for dilution of serum or plasma and the specified conjugate; - раствор хромогена, содержащий раствор тетраметилбензидина;- a chromogen solution containing a tetramethylbenzidine solution; - раствор субстрата, содержащий раствор перекиси водорода;- a substrate solution containing a solution of hydrogen peroxide; - стоп-реагент.- stop reagent. 7. Способ для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2, включающий применение тест-системы по п. 6, где:7. A method for analyzing serum or blood plasma of COVID-19 convalescents for sampling the most promising for therapy of patients infected with SARS-CoV-2, including the use of a test system according to claim 6, where: - в лунки планшета для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2, вносят положительный контроль, отрицательный контроль, а также вносят предварительно разведенные испытуемые образцы сывороток или плазмы крови человека;- into the wells of the plate for enzyme-linked immunosorbent assay with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2 adsorbed in the wells, make a positive control, a negative control, and also add previously diluted test samples of human serum or plasma; - проводят инкубацию указанных образцов при температуре от +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- incubation of these samples is carried out at a temperature from + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; - промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; - вносят 1-кратный раствор конъюгата с последующей инкубацией при температуре +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- 1-fold conjugate solution is introduced, followed by incubation at a temperature of + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; - промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; - вносят хромоген-субстратный раствор в каждую лунку с инкубацией в течение 15 минут в темном месте при температуре от +15°С до +25°С;- introduce a chromogen-substrate solution into each well with incubation for 15 minutes in a dark place at a temperature of + 15 ° C to + 25 ° C; - останавливают пероксидазную реакцию путем добавления в каждую лунку стоп-реагента;- stop the peroxidase reaction by adding a stop reagent to each well; - измеряют оптическую плотность на спектрофотометре в каждой лунке при длине волны 450 нм;- measure the optical density on a spectrophotometer in each well at a wavelength of 450 nm; - проводят интерпретацию результатов.- carry out the interpretation of the results. 8. Способ для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2, включающий применение тест-системы по п. 6, в соответствии с которым:8. A method for analyzing serum or plasma of human blood to determine the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus, comprising the use of the test system according to claim 6, in accordance with which: - в лунки планшета для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2, вносят положительный контроль, отрицательный контроль, а также вносят серии 2-кратных разведений испытуемых образцов сывороток или плазмы крови человека;- in the wells of the plate for enzyme-linked immunosorbent assay with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2 adsorbed in the wells, make a positive control, a negative control, and also make a series of 2-fold dilutions of the tested samples of human serum or plasma ; - проводят инкубацию указанных образцов при температуре от +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- incubation of these samples is carried out at a temperature from + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; - промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; - вносят 1-кратный раствор конъюгата с последующей инкубацией при температуре +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- 1-fold conjugate solution is introduced, followed by incubation at a temperature of + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; - промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; - вносят хромоген-субстратный раствор в каждую лунку с инкубацией в течение 15 минут в темном месте при температуре от +15ºС до +25ºС;- add a chromogen-substrate solution to each well with incubation for 15 minutes in a dark place at a temperature from + 15 ° C to + 25 ° C; - останавливают пероксидазную реакцию путем добавления в каждую лунку стоп-реагента;- stop the peroxidase reaction by adding a stop reagent to each well; - измеряют оптическую плотность на спектрофотометре в каждой лунке при длине волны 450 нм;- measure the optical density on a spectrophotometer in each well at a wavelength of 450 nm; - проводят интерпретацию результатов.- carry out the interpretation of the results. 9. Способ по п. 7, в котором для интерпретации результатов, исследуемый образец сыворотки или плазмы крови человека сравнивают с отсекающим значением оптической плотности Cut off, которое вычисляют по формуле9. The method according to claim 7, in which to interpret the results, the analyzed human serum or plasma sample is compared with the cutoff value of the optical density Cut off, which is calculated by the formula Cut off = А450К- ср + 3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed + 3 x SD A 450 K - , где: Where: Cut off - отсекающие значения оптической плотности,Cut off - cutoff values of optical density, А450К- ср - cреднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем,A 450 K - cf. - the average value of optical density in the wells with negative control, SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля,SD А 450 К - - the standard deviation of the optical density values of the negative control, при этом образец считают положительным, если после проведения анализа оптическая плотность в лунках планшета с опытным образцом при длине волны 450 нм в 2,5 раза превышает отсекающие значения оптической плотности Cut off.the sample is considered positive if, after the analysis, the optical density in the wells of the plate with the experimental sample at a wavelength of 450 nm is 2.5 times higher than the cutoff values of the optical density Cut off. 10. Способ по п. 8, в котором при интерпретации результатов, исследуемый образец сыворотки или плазмы крови человека сравнивают со значением оптической плотности Cut off, которое вычисляют по формуле10. The method according to claim 8, in which, when interpreting the results, the analyzed human serum or plasma sample is compared with the optical density value Cut off, which is calculated by the formula Cut off = А450К- ср + 3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed + 3 x SD A 450 K - , где: Where: Cut off - отсекающие значения оптической плотности,Cut off - cutoff values of optical density, А450К- ср - cреднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем,A 450 K - cf. - the average value of optical density in the wells with negative control, SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля,SD А 450 К - - the standard deviation of the optical density values of the negative control, при этом титр антител определяют как наибольшее разведение образца сыворотки или плазмы крови человека, при анализе которого получают оптическую плотность при длине волны 450 нм, в 2 раза превышающую отсекающие значения оптической плотности Cut off.the titer of antibodies is determined as the highest dilution of a sample of human serum or plasma, in the analysis of which the optical density is obtained at a wavelength of 450 nm, which is 2 times higher than the cut off values of the optical density Cut off.
RU2020116437A 2020-05-19 2020-05-19 Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use RU2723008C9 (en)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2020116437A RU2723008C9 (en) 2020-05-19 2020-05-19 Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use
PCT/RU2021/000295 WO2021246910A1 (en) 2020-05-19 2021-07-09 Sars-cov-2 virus rbd recombinant protein and method for producing same

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2020116437A RU2723008C9 (en) 2020-05-19 2020-05-19 Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2723008C1 RU2723008C1 (en) 2020-06-08
RU2723008C9 true RU2723008C9 (en) 2021-02-09

Family

ID=71067974

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2020116437A RU2723008C9 (en) 2020-05-19 2020-05-19 Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use

Country Status (2)

Country Link
RU (1) RU2723008C9 (en)
WO (1) WO2021246910A1 (en)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2023128813A1 (en) * 2021-12-30 2023-07-06 Общество с ограниченной ответственностью "Бетувакс" Antigens for inducing immunity against the sars-cov-2 virus and gene constructs for the expression thereof
RU2802825C2 (en) * 2021-12-30 2023-09-04 Общество с ограниченной ответственностью "Бетувакс" Gene construct for the expression of recombinant proteins based on the segment of the sars-cov-2 s-protein, including rbd and sd1, fused with the fc fragment of igg, a method of obtaining recombinant proteins, antigens and antigenic compositions for the induction of long-term antibody and cellular immunity against sars-co-2

Families Citing this family (30)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113801206B (en) * 2020-06-15 2024-07-02 上海市公共卫生临床中心 Method for inducing anti-new coronavirus neutralizing antibodies using receptor recognition domain
CN111733141B (en) * 2020-06-19 2022-02-18 清华大学深圳国际研究生院 Hybridoma cell capable of secreting monoclonal antibody against novel coronavirus N protein, monoclonal antibody and application
CN111732655B (en) * 2020-07-01 2021-10-22 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 A fully human monoclonal antibody targeting RBD with high neutralizing activity against SARS-CoV-2 and its application
WO2022000845A1 (en) * 2020-07-01 2022-01-06 江苏省疾病预防控制中心(江苏省公共卫生研究院) Recombinant protein vaccine for preventing sars-cov-2 and preparation method therefor
RU2730897C1 (en) * 2020-07-01 2020-08-26 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) Method of using recombinant proteins sars-cov-2 as part of a test system for elisa test with determining igm, igg, iga class antibody levels in blood serum/plasma of covid-19 patients
CN111978394B (en) * 2020-07-13 2021-05-11 珠海龄值生物科技有限公司 Preparation method of polyclonal preparation for COVID-19 patient specific immunotherapy
RU2746520C1 (en) * 2020-07-27 2021-04-14 Дмитрий Сергеевич Цопов Determination of von willebrand factor activity as method for laboratory diagnosis of severity of sars-cov-2 infection
RU2733832C1 (en) * 2020-07-28 2020-10-07 Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) Artificial gene stbl_rbd_trm_sc2, coding a bicistronic structure formed by the sars-cov-2 coronavirus glycoprotein s receptor-binding domain sequences, transmembrane region, p2a-peptide and glycoprotein g vsv, recombinant plasmid pstem-rvsv-stbl_rbd_trm_sc2, providing expression of artificial gene, and a recombinant strain of vesicular stomatitis virus rvsv-stbl_rbd_trm_sc2, used to create a vaccine against sars-cov-2 coronavirus
RU2733834C1 (en) * 2020-07-28 2020-10-07 Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) Artificial ectos_sc2 gene encoding an ectodomain of the sars-cov-2 coronavirus s glycoprotein with a c-terminal trimerization domain, a recombinant plasmid pstem-rvsv-ectos_sc2, which provides expression of the artificial gene, and a recombinant strain of vesicular stomatitis virus rvsv-ectos_sc2, used to create a vaccine against sars-cov-2 coronavirus
EP4198043A1 (en) * 2020-08-14 2023-06-21 Instituto Butantan Method for producing an antigen corresponding to the inactivated sars-cov-2 virus, antigen corresponding to the inactivated sars-cov-2 virus, antigenic composition, kits, and uses thereof
CN111925440B (en) * 2020-08-19 2022-09-09 重庆医科大学 New coronavirus RBD specific monoclonal antibody and application
CN115925899B (en) * 2020-08-19 2025-01-28 重庆医科大学 Novel coronavirus RBD-specific monoclonal antibodies and their applications
CN117069832B (en) * 2020-08-19 2024-08-20 重庆医科大学 New coronavirus RBD specific monoclonal antibody and application
CN114933650B (en) * 2020-08-19 2025-01-24 重庆医科大学 Novel coronavirus RBD-specific monoclonal antibodies and their applications
CN114920833B (en) * 2020-08-19 2023-10-17 重庆医科大学 New coronavirus RBD specific monoclonal antibody and application
CN111925442B (en) * 2020-08-19 2022-10-11 重庆医科大学 New coronavirus RBD specific monoclonal antibody and application
CN115925897B (en) * 2020-08-19 2024-11-15 重庆医科大学 Novel coronavirus RBD specific monoclonal antibody and application
CN111925439A (en) * 2020-08-19 2020-11-13 重庆医科大学 Method for rapidly screening new coronavirus RBD (radial basis function) specific fully human neutralizing monoclonal antibody
CN115304671B (en) * 2020-08-19 2023-10-17 重庆医科大学 New coronavirus RBD-specific monoclonal antibodies and their applications
CN117003862B (en) * 2020-08-19 2024-08-20 重庆医科大学 SARS-CoV-2 RBD-specific monoclonal antibodies and their applications
AU2021331947A1 (en) * 2020-08-28 2023-05-04 Joint Stock Company "Biocad" Aav5-based vaccine against sars-cov-2
CN112666348A (en) * 2020-10-27 2021-04-16 山西高等创新研究院 Detection proteome of novel coronavirus SARS-CoV-2 and application thereof
RU2760301C1 (en) * 2020-12-21 2021-11-23 Закрытое Акционерное Общество "Биокад" Aav5-based vaccine for induction of specific immunity to sars-cov-2 virus and/or prevention of coronavirus infection caused by sars-cov-2
CN113030483B (en) * 2021-02-25 2024-04-02 山东省大健康精准医疗产业技术研究院 Novel coronavirus neutralizing antibody ELISA detection kit and application thereof
RU2760090C1 (en) * 2021-03-15 2021-11-22 Зубейда Маратовна Мирхайдарова Method for treating postcovid syndrome by alloplant biomaterial
RU2752862C1 (en) * 2021-04-09 2021-08-11 Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) Strain of hcov-19/russia/omsk-202118-1707/2020 of sars-cov-2 coronavirus, immunosorbent containing purified whole virion antigen obtained on basis of specified strain and isa test system for detecting antibodies of classes m, g and a to sars coronavirus-cov-2 using specified immunosorbent
CN114057894B (en) * 2021-06-18 2022-08-05 国药中生生物技术研究院有限公司 Novel recombinant coronavirus RBD trimer protein vaccine capable of generating broad-spectrum cross-neutralization activity, and preparation method and application thereof
RU2754930C1 (en) * 2021-07-05 2021-09-08 Общество с ограниченной ответственностью "Эс Джи" Recombinant plasmid pvnv-gl-rbdind, providing synthesis and secretion of recombinant receptor-binding domain (rbd) of sars-cov-2 coronavirus line b.1.617 in mammalian cells
RU2761879C1 (en) * 2021-07-27 2021-12-13 Закрытое Акционерное Общество "Биокад" VACCINE BASED ON AAV5 FOR THE INDUCTION OF SPECIFIC IMMUNITY TO THE SARS-CoV-2 VIRUS AND/OR THE PREVENTION OF CORONAVIRUS INFECTION CAUSED BY SARS-CoV-2
CN119677767A (en) * 2022-06-10 2025-03-21 别图瓦克斯股份公司 Hybrid genes for producing recombinant RBD antigens

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2253870C1 (en) * 2004-04-26 2005-06-10 Общество с ограниченной ответственностью Научно-производственное объединение "Диагностические системы" Recombinant proteins containing diagnosis significant coronavirus protein antigen epitope (sars-cov), assosiated with grievous acute respiratory syndrome, and sequences of synthetic genes encoding sars-cov
US20170096455A1 (en) * 2014-03-20 2017-04-06 The University Of North Carolina At Chapel Hill Methods and compositions for chimeric coronavirus spike proteins
CN106928326B (en) * 2015-12-31 2019-12-24 中国科学院微生物研究所 A coronavirus vaccine based on dimerized receptor binding domain subunits

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1884303A (en) * 2005-06-20 2006-12-27 中国医学科学院基础医学研究所 SARS-CoV virus structural protein infusion protein and its high yield expression and purification and uses
RU2325655C9 (en) * 2006-08-10 2008-11-27 Общество с ограниченной ответственностью Научно-производственное объединение "Диагностические системы" Immune-enzyme test system for hepatitis b virus surface antigen detection and method of hepatitis b virus surface antigen detection
RU2615447C1 (en) * 2015-11-13 2017-04-04 Федеральное государственное унитарное предприятие "Государственный научно-исследовательский институт особо чистых биопрепаратов" Федерального медико-биологического агентства Human interleukin-7 encoding synthetic dna, expression vector containing this dna (versions), human interleukin-7 producing strain, and method for human interleukin-7 production
CN111088283B (en) * 2020-03-20 2020-06-23 苏州奥特铭医药科技有限公司 mVSV viral vector, viral vector vaccine thereof and mVSV-mediated novel coronary pneumonia vaccine

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2253870C1 (en) * 2004-04-26 2005-06-10 Общество с ограниченной ответственностью Научно-производственное объединение "Диагностические системы" Recombinant proteins containing diagnosis significant coronavirus protein antigen epitope (sars-cov), assosiated with grievous acute respiratory syndrome, and sequences of synthetic genes encoding sars-cov
US20170096455A1 (en) * 2014-03-20 2017-04-06 The University Of North Carolina At Chapel Hill Methods and compositions for chimeric coronavirus spike proteins
CN106928326B (en) * 2015-12-31 2019-12-24 中国科学院微生物研究所 A coronavirus vaccine based on dimerized receptor binding domain subunits

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2023128813A1 (en) * 2021-12-30 2023-07-06 Общество с ограниченной ответственностью "Бетувакс" Antigens for inducing immunity against the sars-cov-2 virus and gene constructs for the expression thereof
RU2802825C2 (en) * 2021-12-30 2023-09-04 Общество с ограниченной ответственностью "Бетувакс" Gene construct for the expression of recombinant proteins based on the segment of the sars-cov-2 s-protein, including rbd and sd1, fused with the fc fragment of igg, a method of obtaining recombinant proteins, antigens and antigenic compositions for the induction of long-term antibody and cellular immunity against sars-co-2

Also Published As

Publication number Publication date
WO2021246910A8 (en) 2022-02-03
RU2723008C1 (en) 2020-06-08
WO2021246910A1 (en) 2021-12-09

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2723008C9 (en) Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use
CN111781354B (en) Novel coronavirus neutralizing antibody titer detection ELISA kit
CN113009154B (en) Novel one-step method coronavirus neutralizing antibody magnetic microsphere detection kit and application thereof
CN113009153B (en) New coronavirus neutralizing antibody detection kit based on magnetic particle chemiluminescence and application thereof
CN112409496B (en) A fusion protein for transmembrane expression of novel coronavirus antigen S2, recombinant vector, recombinant dendritic cell and application thereof
Figueiredo et al. Evaluation of an enzyme-linked immunosorbent assay based on Araraquara virus recombinant nucleocapsid protein
Rump et al. Dual ELISA using SARS-CoV-2 nucleocapsid protein produced in E. coli and CHO cells reveals epitope masking by N-glycosylation
CN113447651A (en) Method and kit for screening inhibitor of SARS-CoV virus and its application
CN112285348B (en) Electrochemical luminescence immunoassay kit for antigen protein expressed by new coronavirus vaccine
Hornsleth et al. Detection of respiratory syncytial virus in nasopharyngeal secretions by ELISA: comparison with fluorescent antibody technique
US9139617B2 (en) Method for detecting antibody against SITH-1 in biological sample
CN111896744B (en) Goat echinococcus antibody ELISA detection kit and preparation method and application thereof
CN113024640B (en) Epitope peptide antigen detection neutralizing antibody kit based on screening of binding domain of RBD and ACE2 receptor of new coronavirus
WO2021170090A1 (en) Sars-cov-2 virus detection method and detection kit
CN112300252B (en) Prediction of 2019-nCoV coronavirus nucleocapsid protein epitope polypeptide and application of polypeptide in detection
KR20080012449A (en) SARS Diagnosis Using Nucleocapsid or Spike Proteins
US7919256B2 (en) Method for detecting Borna disease virus infection
CN114371286A (en) Kit for detecting neutralizing antibody of new coronavirus and preparation method thereof
Li et al. Development of a rapid neutralizing antibody test for SARS-CoV-2 and its application for neutralizing antibody screening and vaccinated serum testing
Li et al. The HIV-1 matrix protein p17 activates the transcription factors c-Myc and CREB in human B cells.
CN119120482B (en) Application of E3 ubiquitin ligase RNF181 gene expression inhibitor in preparation of medicines for preventing and/or treating HSV-1 virus infection
CN110456078A (en) Protein for detecting sheep MVV and the infectious diseases caused by it, its reagent and kit
RU2838919C1 (en) Recombinant plasmid dna pmbp-puuv_n, providing synthesis and secretion of fusion protein mbp-puuv_n in escherichia coli cells, strain escherichia coli krx/pmbp-puuv_n, producing said protein, used to produce recombinant protein puuv_n used for diagnosis of hemorrhagic fever with renal syndrome
US20120129195A1 (en) Method of quick laboratory diagnosis if illnesses based on the discovery of specific proteins and equipment for its implementation
KR100264341B1 (en) Acquired Immunodeficiency Virus Type I-10 Antigens

Legal Events

Date Code Title Description
QB4A Licence on use of patent

Free format text: LICENCE FORMERLY AGREED ON 20200819

Effective date: 20200819

TH4A Reissue of patent specification
TC4A Change in inventorship

Effective date: 20210218