RU2723008C9 - Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use - Google Patents
Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use Download PDFInfo
- Publication number
- RU2723008C9 RU2723008C9 RU2020116437A RU2020116437A RU2723008C9 RU 2723008 C9 RU2723008 C9 RU 2723008C9 RU 2020116437 A RU2020116437 A RU 2020116437A RU 2020116437 A RU2020116437 A RU 2020116437A RU 2723008 C9 RU2723008 C9 RU 2723008C9
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- cov
- sars
- virus
- rbd
- protein
- Prior art date
Links
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 title claims abstract description 109
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 title claims abstract description 100
- 238000012360 testing method Methods 0.000 title claims abstract description 77
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 48
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 title claims abstract description 25
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 title claims description 20
- 241000700605 Viruses Species 0.000 title abstract description 24
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title description 30
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title description 20
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title description 14
- 241001678559 COVID-19 virus Species 0.000 claims abstract description 137
- 108091005634 SARS-CoV-2 receptor-binding domains Proteins 0.000 claims abstract description 91
- 208000025721 COVID-19 Diseases 0.000 claims abstract description 39
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims abstract description 33
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims abstract description 31
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims abstract description 26
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims abstract description 19
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims abstract description 19
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 claims abstract description 19
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims abstract description 16
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 11
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 claims abstract description 9
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 claims abstract description 8
- 238000011097 chromatography purification Methods 0.000 claims abstract description 7
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 claims abstract description 7
- GRRNUXAQVGOGFE-UHFFFAOYSA-N Hygromycin-B Natural products OC1C(NC)CC(N)C(O)C1OC1C2OC3(C(C(O)C(O)C(C(N)CO)O3)O)OC2C(O)C(CO)O1 GRRNUXAQVGOGFE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 6
- GRRNUXAQVGOGFE-NZSRVPFOSA-N hygromycin B Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](NC)C[C@@H](N)[C@H](O)[C@H]1O[C@H]1[C@H]2O[C@@]3([C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](C(N)CO)O3)O)O[C@H]2[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 GRRNUXAQVGOGFE-NZSRVPFOSA-N 0.000 claims abstract description 6
- 229940097277 hygromycin b Drugs 0.000 claims abstract description 6
- 238000005070 sampling Methods 0.000 claims abstract description 6
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 claims abstract description 5
- 238000001638 lipofection Methods 0.000 claims abstract description 4
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 claims abstract description 3
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 claims description 77
- 239000000243 solution Substances 0.000 claims description 67
- 238000011534 incubation Methods 0.000 claims description 48
- 239000013642 negative control Substances 0.000 claims description 35
- 238000003756 stirring Methods 0.000 claims description 28
- 238000010790 dilution Methods 0.000 claims description 26
- 239000012895 dilution Substances 0.000 claims description 26
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 25
- 239000013641 positive control Substances 0.000 claims description 24
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 23
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 claims description 20
- 238000005406 washing Methods 0.000 claims description 20
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 19
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 18
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 claims description 15
- 239000000872 buffer Substances 0.000 claims description 11
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 claims description 8
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 claims description 8
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 claims description 7
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- YRNWIFYIFSBPAU-UHFFFAOYSA-N 4-[4-(dimethylamino)phenyl]-n,n-dimethylaniline Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC=C1C1=CC=C(N(C)C)C=C1 YRNWIFYIFSBPAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 claims description 4
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 4
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 4
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 claims description 4
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 claims description 4
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 abstract description 17
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 abstract description 17
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 abstract description 9
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 abstract description 9
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 7
- 230000010473 stable expression Effects 0.000 abstract description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 62
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 32
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 18
- 229940096437 Protein S Drugs 0.000 description 13
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 12
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000012224 working solution Substances 0.000 description 12
- 102000029301 Protein S Human genes 0.000 description 10
- 108010066124 Protein S Proteins 0.000 description 10
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 10
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 241000315672 SARS coronavirus Species 0.000 description 9
- 238000011161 development Methods 0.000 description 9
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 8
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 241000711573 Coronaviridae Species 0.000 description 7
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 7
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 7
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 7
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 7
- 201000003176 Severe Acute Respiratory Syndrome Diseases 0.000 description 6
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 6
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 6
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 6
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 6
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 6
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 6
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 6
- 230000000120 cytopathologic effect Effects 0.000 description 5
- 239000013024 dilution buffer Substances 0.000 description 5
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 5
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 5
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 5
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 5
- 230000001932 seasonal effect Effects 0.000 description 5
- 102100035765 Angiotensin-converting enzyme 2 Human genes 0.000 description 4
- 108090000975 Angiotensin-converting enzyme 2 Proteins 0.000 description 4
- 102100031673 Corneodesmosin Human genes 0.000 description 4
- 101710139375 Corneodesmosin Proteins 0.000 description 4
- 238000010835 comparative analysis Methods 0.000 description 4
- 239000012531 culture fluid Substances 0.000 description 4
- 229940098197 human immunoglobulin g Drugs 0.000 description 4
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 4
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 4
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 4
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 4
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 4
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241001428935 Human coronavirus OC43 Species 0.000 description 3
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 3
- 101710198474 Spike protein Proteins 0.000 description 3
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 3
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 3
- 230000010530 Virus Neutralization Effects 0.000 description 3
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 3
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 3
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 3
- 108700010904 coronavirus proteins Proteins 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 3
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 3
- 230000036541 health Effects 0.000 description 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 3
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 3
- 238000010079 rubber tapping Methods 0.000 description 3
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 3
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 3
- WXTMDXOMEHJXQO-UHFFFAOYSA-N 2,5-dihydroxybenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC(O)=CC=C1O WXTMDXOMEHJXQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N Ammonium bicarbonate Chemical compound [NH4+].OC([O-])=O ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910000013 Ammonium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- 241000494545 Cordyline virus 2 Species 0.000 description 2
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 2
- PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N Nickel Chemical compound [Ni] PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002390 adhesive tape Substances 0.000 description 2
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 2
- 238000001261 affinity purification Methods 0.000 description 2
- 235000012538 ammonium bicarbonate Nutrition 0.000 description 2
- 239000001099 ammonium carbonate Substances 0.000 description 2
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 2
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 2
- 239000011888 foil Substances 0.000 description 2
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 2
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 2
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 2
- 238000000816 matrix-assisted laser desorption--ionisation Methods 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 2
- 230000002611 ovarian Effects 0.000 description 2
- 230000002085 persistent effect Effects 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 2
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 238000010183 spectrum analysis Methods 0.000 description 2
- IGXNPQWXIRIGBF-KEOOTSPTSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoic acid Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 IGXNPQWXIRIGBF-KEOOTSPTSA-N 0.000 description 1
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000009304 Acute Kidney Injury Diseases 0.000 description 1
- 206010001052 Acute respiratory distress syndrome Diseases 0.000 description 1
- KUDREHRZRIVKHS-UWJYBYFXSA-N Ala-Asp-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O KUDREHRZRIVKHS-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- NBTGEURICRTMGL-WHFBIAKZSA-N Ala-Gly-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NBTGEURICRTMGL-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- VRTOMXFZHGWHIJ-KZVJFYERSA-N Ala-Thr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O VRTOMXFZHGWHIJ-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- JSHVMZANPXCDTL-GMOBBJLQSA-N Arg-Asp-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O JSHVMZANPXCDTL-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 1
- JCAISGGAOQXEHJ-ZPFDUUQYSA-N Arg-Gln-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N JCAISGGAOQXEHJ-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- GXXWTNKNFFKTJB-NAKRPEOUSA-N Arg-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXXWTNKNFFKTJB-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- LXMKTIZAGIBQRX-HRCADAONSA-N Arg-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O LXMKTIZAGIBQRX-HRCADAONSA-N 0.000 description 1
- LLQIAIUAKGNOSE-NHCYSSNCSA-N Arg-Val-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N LLQIAIUAKGNOSE-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- DQTIWTULBGLJBL-DCAQKATOSA-N Asn-Arg-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N DQTIWTULBGLJBL-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- SQZIAWGBBUSSPJ-ZKWXMUAHSA-N Asn-Cys-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N SQZIAWGBBUSSPJ-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- OOWSBIOUKIUWLO-RCOVLWMOSA-N Asn-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O OOWSBIOUKIUWLO-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- IBLAOXSULLECQZ-IUKAMOBKSA-N Asn-Ile-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O IBLAOXSULLECQZ-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 1
- BXUHCIXDSWRSBS-CIUDSAMLSA-N Asn-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BXUHCIXDSWRSBS-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- FODVBOKTYKYRFJ-CIUDSAMLSA-N Asn-Lys-Cys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N FODVBOKTYKYRFJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- REQUGIWGOGSOEZ-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ser-Asn Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)C(=O)N REQUGIWGOGSOEZ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- DATSKXOXPUAOLK-KKUMJFAQSA-N Asn-Tyr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DATSKXOXPUAOLK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- SVFOIXMRMLROHO-SRVKXCTJSA-N Asp-Asp-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 SVFOIXMRMLROHO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YDJVIBMKAMQPPP-LAEOZQHASA-N Asp-Glu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O YDJVIBMKAMQPPP-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- AITKTFCQOBRJTG-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N AITKTFCQOBRJTG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 206010007556 Cardiac failure acute Diseases 0.000 description 1
- 208000031229 Cardiomyopathies Diseases 0.000 description 1
- 241000282552 Chlorocebus aethiops Species 0.000 description 1
- 108010061994 Coronavirus Spike Glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 206010011224 Cough Diseases 0.000 description 1
- 208000028399 Critical Illness Diseases 0.000 description 1
- HPZAJRPYUIHDIN-BZSNNMDCSA-N Cys-Tyr-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CS)N HPZAJRPYUIHDIN-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 208000000059 Dyspnea Diseases 0.000 description 1
- 206010013975 Dyspnoeas Diseases 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- UWMDGPFFTKDUIY-HJGDQZAQSA-N Gln-Pro-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UWMDGPFFTKDUIY-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- LURCIJSJAKFCRO-QWRGUYRKSA-N Gly-Asn-Tyr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O LURCIJSJAKFCRO-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- PEZZSFLFXXFUQD-XPUUQOCRSA-N Gly-Cys-Val Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O PEZZSFLFXXFUQD-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- MTBIKIMYHUWBRX-QWRGUYRKSA-N Gly-Phe-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)CN MTBIKIMYHUWBRX-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- NWOSHVVPKDQKKT-RYUDHWBXSA-N Gly-Tyr-Gln Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O NWOSHVVPKDQKKT-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- SYOJVRNQCXYEOV-XVKPBYJWSA-N Gly-Val-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SYOJVRNQCXYEOV-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101001106322 Homo sapiens Rho GTPase-activating protein 7 Proteins 0.000 description 1
- 241000701024 Human betaherpesvirus 5 Species 0.000 description 1
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 1
- VSZALHITQINTGC-GHCJXIJMSA-N Ile-Ala-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N VSZALHITQINTGC-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- WZPIKDWQVRTATP-SYWGBEHUSA-N Ile-Ala-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)CC)C(O)=O)=CNC2=C1 WZPIKDWQVRTATP-SYWGBEHUSA-N 0.000 description 1
- QLRMMMQNCWBNPQ-QXEWZRGKSA-N Ile-Arg-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)NCC(=O)O)N QLRMMMQNCWBNPQ-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- GNXGAVNTVNOCLL-SIUGBPQLSA-N Ile-Tyr-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N GNXGAVNTVNOCLL-SIUGBPQLSA-N 0.000 description 1
- 102000011782 Keratins Human genes 0.000 description 1
- 108010076876 Keratins Proteins 0.000 description 1
- UGTHTQWIQKEDEH-BQBZGAKWSA-N L-alanyl-L-prolylglycine zwitterion Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O UGTHTQWIQKEDEH-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 1
- HUEBCHPSXSQUGN-GARJFASQSA-N Leu-Cys-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N HUEBCHPSXSQUGN-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- PBGDOSARRIJMEV-DLOVCJGASA-N Leu-His-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O PBGDOSARRIJMEV-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- WUHBLPVELFTPQK-KKUMJFAQSA-N Leu-Tyr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WUHBLPVELFTPQK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- YQFZRHYZLARWDY-IHRRRGAJSA-N Leu-Val-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN YQFZRHYZLARWDY-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- NJNRBRKHOWSGMN-SRVKXCTJSA-N Lys-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O NJNRBRKHOWSGMN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YPLVCBKEPJPBDQ-MELADBBJSA-N Lys-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N YPLVCBKEPJPBDQ-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 208000025370 Middle East respiratory syndrome Diseases 0.000 description 1
- 101100537098 Mus musculus Alyref gene Proteins 0.000 description 1
- 101100269674 Mus musculus Alyref2 gene Proteins 0.000 description 1
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N N-L-cysteinyl-L-phenylalanine Natural products SCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UHRNIXJAGGLKHP-DLOVCJGASA-N Phe-Ala-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UHRNIXJAGGLKHP-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- YYRCPTVAPLQRNC-ULQDDVLXSA-N Phe-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 YYRCPTVAPLQRNC-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- KJJROSNFBRWPHS-JYJNAYRXSA-N Phe-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KJJROSNFBRWPHS-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- ZLGQEBCCANLYRA-RYUDHWBXSA-N Phe-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZLGQEBCCANLYRA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- CJAHQEZWDZNSJO-KKUMJFAQSA-N Phe-Lys-Cys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 CJAHQEZWDZNSJO-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- IAOZOFPONWDXNT-IXOXFDKPSA-N Phe-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IAOZOFPONWDXNT-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- JHSRGEODDALISP-XVSYOHENSA-N Phe-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O JHSRGEODDALISP-XVSYOHENSA-N 0.000 description 1
- 102000045595 Phosphoprotein Phosphatases Human genes 0.000 description 1
- 108700019535 Phosphoprotein Phosphatases Proteins 0.000 description 1
- 206010035664 Pneumonia Diseases 0.000 description 1
- 229920002873 Polyethylenimine Polymers 0.000 description 1
- HFZNNDWPHBRNPV-KZVJFYERSA-N Pro-Ala-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HFZNNDWPHBRNPV-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- LUGOKRWYNMDGTD-FXQIFTODSA-N Pro-Cys-Asn Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O LUGOKRWYNMDGTD-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- GURGCNUWVSDYTP-SRVKXCTJSA-N Pro-Leu-Gln Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O GURGCNUWVSDYTP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- DWGFLKQSGRUQTI-IHRRRGAJSA-N Pro-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 DWGFLKQSGRUQTI-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- JIWJRKNYLSHONY-KKUMJFAQSA-N Pro-Phe-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O JIWJRKNYLSHONY-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- IURWWZYKYPEANQ-HJGDQZAQSA-N Pro-Thr-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IURWWZYKYPEANQ-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- ZYJMLBCDFPIGNL-JYJNAYRXSA-N Pro-Tyr-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(O)=O ZYJMLBCDFPIGNL-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 description 1
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 1
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 1
- 208000033626 Renal failure acute Diseases 0.000 description 1
- 208000013616 Respiratory Distress Syndrome Diseases 0.000 description 1
- 206010057190 Respiratory tract infections Diseases 0.000 description 1
- 102100021446 Rho GTPase-activating protein 7 Human genes 0.000 description 1
- 208000037847 SARS-CoV-2-infection Diseases 0.000 description 1
- 241000555745 Sciuridae Species 0.000 description 1
- 206010040070 Septic Shock Diseases 0.000 description 1
- YQHZVYJAGWMHES-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ala-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YQHZVYJAGWMHES-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- FIDMVVBUOCMMJG-CIUDSAMLSA-N Ser-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO FIDMVVBUOCMMJG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- DOSZISJPMCYEHT-NAKRPEOUSA-N Ser-Ile-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O DOSZISJPMCYEHT-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- PMCMLDNPAZUYGI-DCAQKATOSA-N Ser-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O PMCMLDNPAZUYGI-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- QMCDMHWAKMUGJE-IHRRRGAJSA-N Ser-Phe-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QMCDMHWAKMUGJE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- FLONGDPORFIVQW-XGEHTFHBSA-N Ser-Pro-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CO FLONGDPORFIVQW-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- SQHKXWODKJDZRC-LKXGYXEUSA-N Ser-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SQHKXWODKJDZRC-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- KKKVOZNCLALMPV-XKBZYTNZSA-N Ser-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KKKVOZNCLALMPV-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 1
- 229910000831 Steel Inorganic materials 0.000 description 1
- MPUMPERGHHJGRP-WEDXCCLWSA-N Thr-Gly-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MPUMPERGHHJGRP-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- 108020004440 Thymidine kinase Proteins 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FBVGQXJIXFZKSQ-GMVOTWDCSA-N Tyr-Ala-Trp Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N FBVGQXJIXFZKSQ-GMVOTWDCSA-N 0.000 description 1
- ADBDQGBDNUTRDB-ULQDDVLXSA-N Tyr-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O ADBDQGBDNUTRDB-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- NSTPFWRAIDTNGH-BZSNNMDCSA-N Tyr-Asn-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O NSTPFWRAIDTNGH-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- NOOMDULIORCDNF-IRXDYDNUSA-N Tyr-Gly-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O NOOMDULIORCDNF-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 1
- CTDPLKMBVALCGN-JSGCOSHPSA-N Tyr-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O CTDPLKMBVALCGN-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- QGFPYRPIUXBYGR-YDHLFZDLSA-N Val-Asn-Phe Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N QGFPYRPIUXBYGR-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- FPCIBLUVDNXPJO-XPUUQOCRSA-N Val-Cys-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O FPCIBLUVDNXPJO-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- BTWMICVCQLKKNR-DCAQKATOSA-N Val-Leu-Ser Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O BTWMICVCQLKKNR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- NZGOVKLVQNOEKP-YDHLFZDLSA-N Val-Phe-Asn Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N NZGOVKLVQNOEKP-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- QPJSIBAOZBVELU-BPNCWPANSA-N Val-Tyr-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N QPJSIBAOZBVELU-BPNCWPANSA-N 0.000 description 1
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 1
- 201000011040 acute kidney failure Diseases 0.000 description 1
- 208000012998 acute renal failure Diseases 0.000 description 1
- 206010001053 acute respiratory failure Diseases 0.000 description 1
- 239000002313 adhesive film Substances 0.000 description 1
- 201000000028 adult respiratory distress syndrome Diseases 0.000 description 1
- 108010024078 alanyl-glycyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 108010069020 alanyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 101150095908 apex1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010072041 arginyl-glycyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 230000002358 autolytic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 description 1
- 125000003460 beta-lactamyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003124 biologic agent Substances 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000005779 cell damage Effects 0.000 description 1
- 208000037887 cell injury Diseases 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 108010069495 cysteinyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000011033 desalting Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 238000011067 equilibration Methods 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 239000004023 fresh frozen plasma Substances 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 230000001524 infective effect Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 1
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 238000000386 microscopy Methods 0.000 description 1
- 229910052759 nickel Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 230000007065 protein hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 201000004193 respiratory failure Diseases 0.000 description 1
- 239000012723 sample buffer Substances 0.000 description 1
- 239000012047 saturated solution Substances 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 230000036303 septic shock Effects 0.000 description 1
- 208000013220 shortness of breath Diseases 0.000 description 1
- 239000002594 sorbent Substances 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 description 1
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 description 1
- 239000012128 staining reagent Substances 0.000 description 1
- 239000010959 steel Substances 0.000 description 1
- 229940031626 subunit vaccine Drugs 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 238000002636 symptomatic treatment Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 229910001428 transition metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 1
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 1
- 210000003501 vero cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/14—Extraction; Separation; Purification
- C07K1/16—Extraction; Separation; Purification by chromatography
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/14—Extraction; Separation; Purification
- C07K1/36—Extraction; Separation; Purification by a combination of two or more processes of different types
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
- C07K14/08—RNA viruses
- C07K14/165—Coronaviridae, e.g. avian infectious bronchitis virus
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/08—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses
- C07K16/10—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses from RNA viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Область техникиTechnology area
Изобретение относится к биотехнологии и касается создания нового штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцирующего рекомбинантный белок - рецептор-связывающий домен (RBD) вируса SARS-CoV-2, который может быть использован для диагностических целей.The invention relates to biotechnology and relates to the creation of a new strain of Chinese hamster ovary cells CHO-S-RBD, producing a recombinant protein - receptor-binding domain (RBD) of the SARS-CoV-2 virus, which can be used for diagnostic purposes.
Уровень техникиState of the art
В конце 2019 года в Китайской Народной Республике (КНР) произошла вспышка новой инфекции с эпицентром в городе Ухань (провинция Хубэй). Через некоторое время был обнаружен возбудитель данной инфекции, которым оказался неизвестный ранее коронавирус, получивший название SARS-CoV-2. В течение нескольких месяцев SARS-CoV-2 распространился по всему миру, став причиной пандемии, затронувшей более 200 стран. К 1 мая 2020 года количество заболевших превысило 3 млн человек, а количество погибших - 220 тыс. человек. При этом прогнозируется дальнейший рост заболеваемости и смертности, поскольку в большинстве стран эпидемия еще не достигла своего пика.At the end of 2019, an outbreak of a new infection occurred in the People's Republic of China (PRC) with an epicenter in Wuhan city (Hubei province). After some time, the causative agent of this infection was discovered, which turned out to be a previously unknown coronavirus, called SARS-CoV-2. Within a few months, SARS-CoV-2 spread around the world, causing a pandemic affecting more than 200 countries. By May 1, 2020, the number of cases exceeded 3 million people, and the death toll was 220 thousand people. At the same time, a further increase in morbidity and mortality is predicted, since in most countries the epidemic has not yet reached its peak.
SARS-CoV-2 вызывает потенциально тяжелую острую респираторную инфекцию, которая получила название COVID-19. Для данного заболевания характерно наличие таких клинических симптомов, как повышение температуры тела (более чем в 90% случаев); кашель - сухой или с небольшим количеством мокроты (более чем в 80% случаев); отдышка (в 55% случаев); утомляемость (в 44% случаев); ощущение заложенности в грудной клетке (более чем в 20% случаев). Наиболее тяжелыми осложнениями COVID-19 являются пневмония, острый респираторный дистресс-синдром, острая дыхательная недостаточность, острая сердечная недостаточность, острая почечная недостаточность, септический шок, кардиомиопатии, и др.SARS-CoV-2 causes a potentially severe acute respiratory infection called COVID-19. This disease is characterized by the presence of such clinical symptoms as fever (more than 90% of cases); cough - dry or with a small amount of sputum (more than 80% of cases); shortness of breath (in 55% of cases); fatigue (in 44% of cases); a feeling of congestion in the chest (more than 20% of cases). The most severe complications of COVID-19 are pneumonia, acute respiratory distress syndrome, acute respiratory failure, acute heart failure, acute renal failure, septic shock, cardiomyopathies, etc.
В настоящее время не зарегистрировано специфических средств лечения и профилактики COVID-19. В основном производится симптоматическое лечение. 1 апреля 2020 года Департамент здравоохранения Москвы издал приказ «О внедрении технологии использования свежезамороженной плазмы от доноров-реконвалесцентов COVID-19» для лечения пациентов с COVID-19 в терминальной стадии заболевания.Currently, there are no specific drugs for the treatment and prevention of COVID-19. Mostly symptomatic treatment is performed. On April 1, 2020, the Moscow Department of Health issued an order "On the introduction of the technology for using fresh frozen plasma from COVID-19 convalescent donors" for the treatment of patients with COVID-19 in the terminal stage of the disease.
Реконвалесценты - это люди, организм которых успешно справился с заболеванием, и они выздоровели без осложнений. Это произошло, в частности, и потому, что их иммунная система выработала антитела, которые нейтрализуют вирус.Если ввести плазму крови реконвалесцентов, которая содержит такие антитела, другим пациентам, это может смягчить течение их болезни.Reconvalescents are people whose body successfully coped with the disease, and they recovered without complications. This happened, in part, because their immune system produced antibodies that neutralize the virus. If convalescent blood plasma containing such antibodies is injected into other patients, this can mitigate the course of their illness.
Однако, не все образцы плазмы реконвалесцентов содержат одинаковое количество вируснейтрализующих антител. Поэтому актуальным вопросом является разработка метода, который позволил бы проводить масштабный скрининг плазмы и сывороток крови доноров-реконвалесцентов COVID-19 с целью отбора наиболее перспективных для терапии образцов.However, not all convalescent plasma samples contain the same amount of virus neutralizing antibodies. Therefore, an urgent issue is the development of a method that would allow large-scale screening of plasma and blood serum of COVID-19 convalescent donors in order to select the most promising samples for therapy.
Известен способ оценки сыворотки реконвалесцентов путем определения титра вируснейтрализующих антител (Ch. Shen et al. Treatment of 5 Critically Ill Patients With COVID-19 With Convalescent Plasma. JAMA. 2020;323(16):1582-1589. doi:10.1001). Данный способ основан на том, что к клеткам Vero (клетки почки африканской зеленой мартышки) добавляют образцы сыворотки крови в различных разведениях и одновременно с этим заражают их коронавирусом SARS-CoV-2. Далее клетки инкубируют 37°С, 5% СО2 в течение 5 дней, затем оценивают цитопатическое действие вируса. Результат представляют как титр вируснейтрализующих антител (самое большое разведение сыворотки, которое показало ингибирующую активность SARS-CoV-2). К недостатком данного способа можно отнести длительный срок постановки анализа (5 дней) и необходимость придерживаться правил работы с патогенными биологическими агентами (ПБА) II группы патогенности. Все это влечет за собой низкую производительность и высокую себестоимость данного анализа.There is a known method for assessing the serum of convalescents by determining the titer of neutralizing antibodies (Ch. Shen et al. Treatment of 5 Critically Ill Patients With COVID-19 With Convalescent Plasma. JAMA. 2020; 323 (16): 1582-1589. Doi: 10.1001). This method is based on the fact that blood serum samples in various dilutions are added to Vero cells (kidney cells of the African green monkey) and at the same time they are infected with the SARS-CoV-2 coronavirus. Then the cells are incubated at 37 ° C, 5% CO 2 for 5 days, then the cytopathic effect of the virus is assessed. The result is presented as the titer of neutralizing antibodies (the largest serum dilution that showed the inhibitory activity of SARS-CoV-2). The disadvantage of this method is the long term of the analysis (5 days) and the need to adhere to the rules for working with pathogenic biological agents (PBA) of the II pathogenicity group. All this entails low productivity and high cost of this analysis.
Кроме того, известен способ оценки плазмы реконвалесцентов путем определения титра вируснейтрализующих антител, в котором вместо коронавируса используются псевдотипированные лентивирусные частицы (PsV) (F.Wu Neutralizing antibody responses to SARS-CoV-2 in a COVID-19 recovered patient cohort and their implications, medRxiv 2020.03.30.20047365). Данный способ включает в себя культивирование клеток 293Т/АСЕ2, к которым добавляют образцы сыворотки крови в различных разведениях и одновременно с этим вносят PsV, содержащие ген люциферазы. Через 48 часов оценивают активность люциферазы стандартным набором (Promega). Результат представляют как титр вируснейтрализующих антител (самое большое разведение сыворотки, при добавлении которого активность люциферазы уменьшается на 50%). Недостатками данного способа являются длительность процесса (48 часов), трудоемкость, необходимость в дорогом оборудовании и высококвалифицированном персонале.In addition, there is a known method for assessing the plasma of convalescents by determining the titer of neutralizing antibodies, in which pseudotyped lentiviral particles (PsV) are used instead of coronavirus (F.Wu Neutralizing antibody responses to SARS-CoV-2 in a COVID-19 recovered patient cohort and their implications, medRxiv 2020.03.30.20047365). This method includes culturing 293T / ACE2 cells, to which blood serum samples are added in various dilutions and at the same time PsV containing the luciferase gene is introduced. After 48 hours, the luciferase activity is assessed with a standard kit (Promega). The result is presented as the titer of neutralizing antibodies (the largest serum dilution, when added, the luciferase activity decreases by 50%). The disadvantages of this method are the duration of the process (48 hours), labor intensity, the need for expensive equipment and highly qualified personnel.
Из литературных данных известно, что рецептор-связывающий домен (RBD) белка S коронавируса SARS-CoV, является основной мишенью для вируснейтрализующих антител. В публикации Z. Cao et al. Potent and persistent antibody responses against the receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein in recovered patients. Virol J 7, 299 (2010)) описан способ обнаружения антител к RBD в сыворотке крови пациентов, перенесших инфекцию SARS-CoV. Способ реализуется следующим образом: к адсорбированному в лунках планшета RBD-His добавляют серию разведений образцов сывороток пациентов и контрольные образцы. Связавшиеся с RBD антитела детектируют с помощью вторичных антител, конъюгированных с пероксидазой хрена (HRP). Затем добавляют субстрат для HRP и оценивают титр антител к RBD. Данный способ как наиболее близкий к заявляемому был выбран за прототип. Недостатком данного способа является то, что он не позволяет детектировать антитела к коронавирусу SARS-CoV-2 в плазме крови реконвалесцентов COVID-19.It is known from the literature that the receptor-binding domain (RBD) of the S protein of the SARS-CoV coronavirus is the main target for neutralizing antibodies. In a publication by Z. Cao et al. Potent and persistent antibody responses against the receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein in recovered patients. Virol J 7, 299 (2010)) describes a method for detecting antibodies to RBD in the blood serum of patients with SARS-CoV infection. The method is implemented as follows: a series of dilutions of patient serum samples and control samples are added to the RBD-His adsorbed in the plate wells. Antibodies bound to RBD are detected using secondary antibodies conjugated to horseradish peroxidase (HRP). Then add substrate for HRP and estimate the titer of antibodies to RBD. This method, as the closest to the claimed one, was chosen as a prototype. The disadvantage of this method is that it does not allow the detection of antibodies to the SARS-CoV-2 coronavirus in the blood plasma of COVID-19 convalescents.
Таким образом, в настоящее время существует потребность в разработке быстрого способа анализа сыворотки и плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для определения образцов наиболее перспективных для терапии пациентов с COVID-19.Thus, there is currently a need to develop a rapid method for analyzing the serum and plasma of COVID-19 convalescents to determine the most promising samples for therapy of patients with COVID-19.
Раскрытие изобретения.Disclosure of the invention.
Задачей заявленного изобретения является создание эффективной тест-системы и способа для быстрого анализа сыворотки и плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для определения образцов сывороток и плазмы крови наиболее перспективных для терапии пациентов с COVID-19, а также способа для быстрого анализа сыворотки и плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2.The objective of the claimed invention is to create an effective test system and method for rapid analysis of serum and blood plasma of COVID-19 convalescents to determine the most promising serum and plasma samples for the therapy of patients with COVID-19, as well as a method for rapid analysis of human serum and plasma to determine the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus.
Технический результат представляет собой получение быстрой и эффективной тест системы для определения наиболее перспективных образцов сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2.The technical result is to obtain a fast and effective test system for determining the most promising serum or plasma samples of COVID-19 convalescents for the treatment of patients infected with SARS-CoV-2.
Технический результат заключается в сокращении времени и упрощении процедуры анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2.The technical result consists in reducing the time and simplifying the procedure for analyzing the serum or blood plasma of COVID-19 convalescents for the selection of samples of the most promising for therapy of patients infected with SARS-CoV-2.
Технический результат также представляет собой высокую и стабильную экспрессию рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2.The technical result also represents a high and stable expression of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus.
Кроме того, технический результат заключается в неожиданно проявленном эффекте для анализа сыворотки и плазмы крови человека на наличие антител к вирусу SARS-CoV-2 отсутствии ложноположительных результатов у пациентов перенесших заболевание.In addition, the technical result consists in an unexpectedly manifested effect for the analysis of human serum and plasma for the presence of antibodies to the SARS-CoV-2 virus, the absence of false positive results in patients who have undergone the disease.
Технический результат достигается за счет разработки генетическая конструкции для экспрессии рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, включающий SEQ ID NO:1The technical result is achieved by developing a genetic construct for the expression of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, including SEQ ID NO: 1
Также технический результат достигается за разработки штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцента рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, содержащего генетическую конструкцию, включающую SEQ ID NO:1Also, the technical result is achieved for the development of the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD, the producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, containing the genetic construct comprising SEQ ID NO: 1
Также технический результат достигается за счет разработки способа получения штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, включающий:Also, the technical result is achieved through the development of a method for obtaining a strain of cells of the ovary of the Chinese hamster CHO-S-RBD, including:
- получение генетической конструкции, включающей SEQ ID NO:1;- obtaining a genetic construct comprising SEQ ID NO: 1;
- введение указанной генетической конструкции в клетки путем липофекции;- introduction of the specified genetic construct into cells by lipofection;
- селекцию клеток на антибиотике Hygromycin B.- cell selection for the antibiotic Hygromycin B.
Также технический результат достигается за счет разработки рекомбинантного белока RBD вируса SARS-CoV-2 для выявления антител к SARS-CoV-2, имеющий SEQ ID NO:2, являющийся продуктом штамма клеток яичника китайского хомячка.Also, the technical result is achieved through the development of a recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus for detecting antibodies to SARS-CoV-2, having SEQ ID NO: 2, which is the product of a Chinese hamster ovary cell strain.
Также технический результат достигается за счет разработки способа получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, включающего:Also, the technical result is achieved through the development of a method for producing the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, including:
- культивирование штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD;- cultivation of the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD;
- хроматографическую очистку рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 из культуральной среды штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD;- chromatographic purification of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus from the culture medium of the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD;
- подтверждение получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, имеющего SEQ ID NO:2.- confirmation of the receipt of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2.
Также технический результат достигается за счет разработки тест-системы для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека, представляющей собой набор реагентов, включающий:Also, the technical result is achieved through the development of a test system for the enzyme immunoassay of human serum or plasma, which is a set of reagents, including:
- планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2;- plate for enzyme immunoassay with adsorbed in the wells of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2;
- положительный контроль, включающий инактивированный образец сыворотки крови человека, содержащий IgG к белку RBD вируса SARS-CoV-2;- a positive control comprising an inactivated human serum sample containing IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus;
- отрицательный контроль, представляющий собой инактивированный образец сыворотки крови человека, не содержащий IgG к белку RBD вируса SARS-CoV-2;- negative control, which is an inactivated human serum sample that does not contain IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus;
- конъюгат, содержащий 20-кратный концентрат моноклональных мышиных антител к IgG человека, конъюгированных с пероксидазой хрена;- a conjugate containing a 20-fold concentrate of monoclonal mouse antibodies to human IgG, conjugated with horseradish peroxidase;
- 25-кратный концентрат промывочного буфера, содержащий концентрат фосфатно-солевого буфера с Твином 20 для промывания планшетов;- 25x Wash Buffer Concentrate containing PBS concentrate with Tween 20 for washing plates;
- буфер для разведения сыворотки или плазмы и указанного конъюгата;- buffer for dilution of serum or plasma and the specified conjugate;
- раствор хромогена, содержащий раствор тетраметилбензидина;- a chromogen solution containing a tetramethylbenzidine solution;
- раствор субстрата, содержащий раствор перекиси водорода;- a substrate solution containing a solution of hydrogen peroxide;
- стоп-реагент.- stop reagent.
Также технический результат достигается за счет разработки способа для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2, включающий применение тест-системы, где:Also, the technical result is achieved by developing a method for analyzing serum or blood plasma of COVID-19 convalescents for sampling the most promising patients for therapy with SARS-CoV-2 infection, including the use of a test system, where:
- в лунки планшета для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2 вносят положительный контроль, отрицательный контроль, а также вносят предварительно разведенные испытуемые образцы сывороток или плазмы крови человека;- in the wells of the plate for enzyme-linked immunosorbent assay with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, which has SEQ ID NO: 2, adsorbed in the wells, add a positive control, a negative control, and also add previously diluted test samples of human serum or plasma;
- проводят инкубацию указанных образцов при температуре от +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- incubation of these samples is carried out at a temperature from + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour;
- промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution;
- вносят 1-кратный раствор конъюгата с последующей инкубацией при температуре +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- 1-fold conjugate solution is introduced, followed by incubation at a temperature of + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour;
- промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution;
- вносят хромоген-субстратный раствор в каждую лунку с инкубацией в течение 15 минут в темном месте при температуре от +15°С до +25°С;- introduce a chromogen-substrate solution into each well with incubation for 15 minutes in a dark place at a temperature of + 15 ° C to + 25 ° C;
- останавливают пероксидазную реакцию путем добавления в каждую лунку стоп-реагента;- stop the peroxidase reaction by adding a stop reagent to each well;
- измеряют оптическую плотность на спектрофотометре в каждой лунке при длине волны 450 нм;- measure the optical density on a spectrophotometer in each well at a wavelength of 450 nm;
- проводят интерпретацию результатов.- carry out the interpretation of the results.
Также технический результат достигается за счет разработки способа для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2, включающий применение тест-системы, в соответствии с которым:Also, the technical result is achieved through the development of a method for analyzing serum or plasma of human blood for determining the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus, including the use of a test system, in accordance with which:
- в лунки планшета для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2 вносят положительный контроль, отрицательный контроль, а также вносят серии 2-кратных разведений испытуемых образцов сывороток или плазмы крови человека;- in the wells of the plate for enzyme-linked immunosorbent assay with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, which has SEQ ID NO: 2, adsorbed in the wells, make a positive control, a negative control, and also make a series of 2-fold dilutions of the tested samples of human serum or plasma;
- проводят инкубацию указанных образцов при температуре от +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- incubation of these samples is carried out at a temperature from + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour;
- промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution;
- вносят 1-кратный раствор конъюгата с последующей инкубацией при температуре +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа;- 1-fold conjugate solution is introduced, followed by incubation at a temperature of + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour;
- промывают лунки не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера;- wash the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution;
- вносят хромоген-субстратный раствор в каждую лунку с инкубацией в течение 15 минут в темном месте при температуре от +15°С до +25°С;- introduce a chromogen-substrate solution into each well with incubation for 15 minutes in a dark place at a temperature of + 15 ° C to + 25 ° C;
- останавливают пероксидазную реакцию путем добавления в каждую лунку стоп-реагента;- stop the peroxidase reaction by adding a stop reagent to each well;
- измеряют оптическую плотность на спектрофотометре в каждой лунке при длине волны 450 нм;- measure the optical density on a spectrophotometer in each well at a wavelength of 450 nm;
- проводят интерпретацию результатов.- carry out the interpretation of the results.
Также технический результат достигается за счет разработки способа для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2 (вариант 1).Also, the technical result is achieved through the development of a method for analyzing the serum or blood plasma of COVID-19 convalescents for sampling the most promising for therapy of patients infected with SARS-CoV-2 (option 1).
Также технический результат достигается за счет разработки способа для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS - CoV-2 (вариант 2).Also, the technical result is achieved by developing a method for analyzing human serum or plasma to determine the titer of antibodies to the SARS virus - CoV-2 (option 2).
Сущность заявленной группы изобретений поясняется чертежами, где на фиг. 1-4 представлены результаты исследования.The essence of the claimed group of inventions is illustrated by drawings, where Fig. 1-4 show the results of the study.
Осуществление изобретенияImplementation of the invention
Краткое описание фигурBrief description of figures
На фиг. 1 представлено схематическое изображение генетической конструкции для экспрессии рецептор-связывающего домена (RBD) вируса SARS-CoV2, гдеFIG. 1 is a schematic representation of a genetic construct for the expression of the receptor binding domain (RBD) of the SARS-CoV2 virus, where
SP - сигнальный пептид, обеспечивающий секрецию белка в культуральную жидкость;SP is a signal peptide that ensures protein secretion into the culture fluid;
RBD - рецептор-связывающий домен RBD вируса SARS-CoV2;RBD - receptor-binding domain RBD virus SARS-CoV2;
His-tag - гистидиновая метка, обеспечивающая очистку белка методом аффинной хроматографии.His-tag is a histidine tag that provides protein purification by affinity chromatography.
На фиг. 2 представлена схема плазмидного вектора р1-RBD-CoV-2, гдеFIG. 2 shows a diagram of the plasmid vector p1-RBD-CoV-2, where
CMV- промотор/энхансер ранних генов цитомегаловируса человека;CMV - promoter / enhancer of early genes of human cytomegalovirus;
генетическая конструкция - разработанная генетическая конструкция SEQ ID NO:1, экспрессирующая рецептор-связывающий домен (RBD) вируса SARS-CoV2;genetic construct - the developed genetic construct SEQ ID NO: 1, expressing the receptor-binding domain (RBD) of the SARS-CoV2 virus;
poly(A) - сигнал полиаденилирования;poly (A) - polyadenylation signal;
EBV ori - последовательность начала репликации вируса Эпштейна-Барра;EBV ori - sequence of the beginning of replication of the Epstein-Barr virus;
AmpR promoter - промотор гена устойчивости к ампициллину;AmpR promoter - Ampicillin resistance gene promoter;
Amp - ген устойчивости к ампициллину, который кодирует фермент β-лактамазу, который расщепляет β-лактамное кольцо ампициллина и некоторых других антибиотиков;Amp - ampicillin resistance gene, which encodes the β-lactamase enzyme, which cleaves the β-lactam ring of ampicillin and some other antibiotics;
ori - последовательность начала репликации;ori - replication start sequence;
TK promoter - промотор гена тимидинкиназы вируса простого герпеса человека;TK promoter - human herpes simplex virus thymidine kinase gene promoter;
HygroВ - ген устойчивости к Hygromicin B, который кодирует фермент фосфатазу, которая инактивирует этот антибиотик путем его фосфорилирования.HygroB is a gene for resistance to Hygromicin B, which encodes the enzyme phosphatase, which inactivates this antibiotic by phosphorylation.
HindIII, XhoI - сайты узнавания для соответствующих рестриктаз.HindIII, XhoI - recognition sites for the corresponding restriction enzymes.
На фиг. 3 представлена электрофореграмма белкового препарата RBD после аффинной очистки, гдеFIG. 3 shows an electropherogram of the RBD protein preparation after affinity purification, where
М - маркер молекулярного веса;M - molecular weight marker;
1.- образец белка RBD 0.75 мкг/мкл;1.- sample of RBD protein 0.75 μg / μl;
2.- образец белка RBD 1 мкг/мкл;2.- sample of
3.- образец белка RBD 0.5 мкг/мкл;3.- sample of RBD protein 0.5 μg / μl;
4.- образец белка RBD 0.25 мкг/мкл.4.- sample of RBD protein 0.25 μg / μl.
На фиг. 4 представлены результаты масс спектрального анализа белкового препарата RBD после аффинной очистки, гдеFIG. 4 shows the results of mass spectral analysis of the RBD protein preparation after affinity purification, where
[М]+- распределение молекулярных масс однозарядного иона;[M] + - distribution of molecular weights of a singly charged ion;
[М]2+- распределение молекулярных масс двузарядного иона.[M] 2 + - distribution of molecular weights of a doubly charged ion.
В экспериментальных исследованиях установлено, что большинство антител, обладающих вируснейтрализующей активностью в отношении вида коронавируcов (MERS, SARS и др.) специфически связываются с различными эпитопами рецептор-связывающего домена белка S (spike) (Hofmann H. et al. S protein of severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus mediates entry into hepatoma cell lines and is targeted by neutralizing antibodies in infected patients. Journal of Virology. 2004, 78(12):6134-42; He Y. Receptor-binding domain of severe acute respiratory syndrome coronavirus spike protein contains multiple conformation-dependent epitopes that induce highly potent neutralizing antibodies. Journal of Immunology. 2005, 174(8):4908-15; He Y. Receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein induces highly potent neutralizing antibodies: implication for developing subunit vaccine. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004, 324(2):773-81.). Установлено, что нейтрализующей активностью обладают антитела, препятствующие связыванию белка S вируса SARS-CoV-2 с рецептором ангиотензин-превращающий фермент 2 (ACE2) на клетках человека. Рецептор-связывающий домен (RBD) является структурным доменом белка S, образующим сайт связывания с рецептором ACE2, поэтому антитела способные связываться с белком RBD могут блокировать контакт с рецептором и, как следствие, препятствовать проникновению вируса в клетки человека. Поэтому введение сыворотки или плазмы доноров-реконвалесцентов COVID-19, содержащей антитела к белку RBD вируса SARS-CoV-2, пациентам с COVID-19 является перспективным средством терапии.Experimental studies have shown that most antibodies with virus-neutralizing activity against the type of coronavirus (MERS, SARS, etc.) specifically bind to various epitopes of the receptor-binding domain of protein S (spike) (Hofmann H. et al. S protein of severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus mediates entry into hepatoma cell lines and is targeted by neutralizing antibodies in infected patients.Journal of Virology. 2004, 78 (12): 6134-42; He Y. Receptor-binding domain of severe acute respiratory syndrome coronavirus spike protein contains multiple conformation-dependent epitopes that induce highly potent neutralizing antibodies. Journal of Immunology. 2005, 174 (8): 4908-15; He Y. Receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein induces highly potent neutralizing antibodies: implication for developing subunit vaccine Biochem Biophys Res Commun 2004, 324 (2): 773-81). It has been found that antibodies that prevent the binding of the SARS-CoV-2 virus S protein to the angiotensin converting enzyme 2 (ACE2) receptor on human cells have neutralizing activity. The receptor binding domain (RBD) is a structural domain of protein S, which forms a binding site for the ACE2 receptor; therefore, antibodies capable of binding to the RBD protein can block contact with the receptor and, as a result, prevent the virus from entering human cells. Therefore, the administration of serum or plasma from COVID-19 convalescent donors, containing antibodies to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, to patients with COVID-19 is a promising therapy.
Таким образом, анализ сыворотки или плазмы крови доноров-реконвалесцентов COVID-19 на наличие антител к белку RBD вируса SARS-CoV-2 позволит отбирать наиболее перспективные образцы сыворотки или плазмы, которые обладают терапевтическим эффектом.Thus, the analysis of the serum or blood plasma of COVID-19 convalescent donors for the presence of antibodies to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus will make it possible to select the most promising serum or plasma samples that have a therapeutic effect.
В результате проведенной работы была создана генетическая конструкция для экспрессии рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, включающая SEQ ID NO:1.As a result of this work, a genetic construct was created for the expression of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, including SEQ ID NO: 1.
Данная конструкция включает лидерный пептид тяжелой цепи иммуноглобулина G человека слитый с геном RBD вируса SARS-CoV-2 и гистидиновой меткой.This construct comprises a human immunoglobulin G heavy chain leader peptide fused to the RBD gene of the SARS-CoV-2 virus and a histidine tag.
Лидерные пептиды - это сигнальные последовательности, которые играют центральную роль в нацеливании и транслокации почти всех секретируемых белков и многих интегральных мембранных белков как у прокариот, так и у эукариот. От выбора сигнального пептида напрямую зависит секреция рекомбинантного белка. Использование лидерного пептида тяжелой цепи иммуноглобулина G человека позволяет обеспечить высокие уровни продукции рекомбинантного белка RBD в культуральную среду.Leader peptides are signal sequences that play a central role in targeting and translocation of almost all secreted proteins and many integral membrane proteins in both prokaryotes and eukaryotes. The secretion of the recombinant protein directly depends on the choice of the signal peptide. The use of the leader peptide of the heavy chain of human immunoglobulin G allows for high levels of production of the recombinant RBD protein into the culture medium.
Гистидиновая метка - это нуклеотидная последовательность, кодирующая 6 аминокислотных остатков гистидина. Данная метка необходима для последующей очистки белка на иммобилизованных металл-аффинных сорбентах. В данном методе используется способность гистидина связываться с хелатным ионом переходного металла, таким, как никель (Ni2+). Главными преимуществами использования гистидиновой метки является ее небольшой размер, легкость синтеза и отсутствие влияния на функции белка, его специфическую активность и структуру.A histidine tag is a nucleotide sequence that encodes 6 amino acid residues of histidine. This label is required for subsequent protein purification on immobilized metal-affinity sorbents. This method exploits the ability of histidine to bind to a chelated transition metal ion such as nickel (Ni2 +). The main advantages of using a histidine tag are its small size, ease of synthesis and no effect on the function of the protein, its specific activity and structure.
Кроме того, в результате проведенной работы была создан штамм клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, содержащий генетическую конструкцию, включающую SEQ ID NO:1 и разработан способ его получения, включающий: получение генетической конструкции, включающей SEQ ID NO:1; введение указанной генетической конструкции в клетки путем липофекции; селекцию клеток на антибиотике Hygromycin B.In addition, as a result of the work carried out, a strain of Chinese hamster ovary cells CHO-S-RBD was created, a producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, containing a genetic construct including SEQ ID NO: 1 and a method for its production was developed, including: obtaining a genetic construct comprising SEQ ID NO: 1; introduction of the specified genetic construct into cells by lipofection; cell selection for the antibiotic Hygromycin B.
Также, был создан рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 для выявления антител к SARS-CoV-2, имеющий SEQ ID NO:2 и способ его получения, включающий: культивирование штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD; хроматографическую очистку рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 из культуральной среды штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD; подтверждение получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, имеющего SEQ ID NO:2.Also, a recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus was created for detecting antibodies to SARS-CoV-2, having SEQ ID NO: 2 and a method for its production, including: culturing a Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD; chromatographic purification of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus from the culture medium of the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD; confirmation of the receipt of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2.
Кроме того, была создана тест-система для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека, представляющая собой набор реагентов, включающий: планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2; положительный контроль, включающий инактивированный образец сыворотки крови человека, содержащий IgG к белку RBD вируса SARS-CoV-2; отрицательный контроль, представляющий собой инактивированный образец сыворотки крови человека, не содержащий IgG к белку RBD вируса SARS-CoV-2; конъюгат, содержащий 20-кратный концентрат моноклональных мышиных антител к IgG человека, конъюгированных с пероксидазой хрена; 25-кратный концентрат промывочного буфера, содержащий концентрат фосфатно-солевого буфера с Твином 20 для промывания планшетов; буфер для разведения сыворотки или плазмы и указанного конъюгата; раствор хромогена, содержащий раствор тетраметилбензидина; раствор субстрата, содержащий раствор перекиси водорода; стоп-реагент.In addition, a test system was created for the enzyme immunoassay of human serum or blood plasma, which is a set of reagents, including: a plate for enzyme immunoassay with adsorbed in the wells of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus having SEQ ID NO: 2; a positive control comprising an inactivated human serum sample containing IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus; negative control, which is an inactivated human serum sample that does not contain IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus; a conjugate containing a 20-fold concentrate of monoclonal mouse antibodies to human IgG, conjugated with horseradish peroxidase; 25x wash buffer concentrate containing PBS concentrate with Tween 20 to wash plates; buffer for dilution of serum or plasma and the specified conjugate; a chromogen solution containing a tetramethylbenzidine solution; a substrate solution containing a hydrogen peroxide solution; stop reagent.
Также был разработан способ для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2, включающий: внесение в лунки планшета для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2 положительного контроля, отрицательного контроля, а также предварительно разведенных испытуемых образцов сывороток или плазмы крови человека; проведение инкубации указанных образцов при температуре от +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа; промывку лунок не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера; внесение 1-кратного раствора конъюгата с последующей инкубацией при температуре +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа; промывку лунок не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера; внесение хромоген-субстратного раствора в каждую лунку с инкубацией в течение 15 минут в темном месте при температуре от +15°С до +25°С; остановку пероксидазной реакции путем добавления в каждую лунку стоп-реагента; измерение оптической плотности на спектрофотометре в каждой лунке при длине волны 450 нм; проведение интерпретации результатов.A method was also developed for the analysis of serum or blood plasma of COVID-19 convalescents for the selection of samples of the most promising for therapy of patients infected with SARS-CoV-2, including: introducing into the wells of an enzyme-linked immunosorbent assay plate with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV virus adsorbed in the wells -2, having SEQ ID NO: 2 positive control, negative control, and previously diluted test samples of human serum or plasma; incubation of these samples at temperatures from + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; washing the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; introduction of a 1-fold conjugate solution followed by incubation at a temperature of + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; washing the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; adding a chromogen-substrate solution to each well with incubation for 15 minutes in a dark place at a temperature of + 15 ° C to + 25 ° C; stopping the peroxidase reaction by adding a stop reagent to each well; measuring optical density on a spectrophotometer in each well at a wavelength of 450 nm; interpretation of results.
Особенностью данного способа для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 является то, что для интерпретации результатов, исследуемый образец сыворотки или плазмы крови человека сравнивают с отсекающим значением оптической плотности Cut off, которое вычисляют по формуле:A feature of this method for the analysis of serum or blood plasma of COVID-19 convalescents is that, to interpret the results, the analyzed human serum or plasma sample is compared with the cutoff value of the optical density Cut off, which is calculated by the formula:
Cut off=А450К- ср+3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed +3 x SD A 450 K - ,
где Cut off - отсекающие значения оптической плотности,where Cut off - cutoff values of optical density,
А450К- ср - cреднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем,A 450 K - cf. - the average value of optical density in the wells with negative control,
SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля,SD А 450 К - - the standard deviation of the optical density values of the negative control,
при этом образец считают положительным, если после проведения анализа оптическая плотность в лунках планшета с опытным образцом при длине волны 450 нм в 2,5 раза превышает отсекающие значения оптической плотности Cut off.the sample is considered positive if, after the analysis, the optical density in the wells of the plate with the experimental sample at a wavelength of 450 nm is 2.5 times higher than the cutoff values of the optical density Cut off.
Также был разработан способ для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2, включающий: внесение в лунки планшета для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2, имеющим SEQ ID NO:2 положительного контроля, отрицательного контроля, а также серии 2-кратных разведений испытуемых образцов сывороток или плазмы крови человека; проведение инкубации указанных образцов при температуре от +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа; промывку лунок не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера; внесение 1-кратного раствора конъюгата с последующей инкубацией при температуре +36°С до +38°С при перемешивании со скоростью 300 (±50) об/минуту не менее 1 часа; промывку лунок не менее 3 раз 1-кратным раствором промывочного буфера; внесение хромоген-субстратного раствора в каждую лунку с инкубацией в течение 15 минут в темном месте при температуре от +15°С до +25°С; остановку пероксидазной реакции путем добавления в каждую лунку стоп-реагента; измерение оптической плотности на спектрофотометре в каждой лунке при длине волны 450 нм; проведение интерпретации результатов.Also, a method was developed for the analysis of human serum or plasma to determine the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus, including: adding to the wells of the plate for enzyme-linked immunosorbent assay with the recombinant RBD protein of SARS-CoV-2 virus adsorbed in the wells having SEQ ID NO : 2 positive control, negative control, and a series of 2-fold dilutions of the tested samples of human serum or plasma; incubation of these samples at temperatures from + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; washing the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; introduction of a 1-fold conjugate solution followed by incubation at a temperature of + 36 ° C to + 38 ° C with stirring at a speed of 300 (± 50) rpm for at least 1 hour; washing the wells at least 3 times with 1 x wash buffer solution; adding a chromogen-substrate solution to each well with incubation for 15 minutes in a dark place at a temperature from + 15 ° С to + 25 ° С; stopping the peroxidase reaction by adding a stop reagent to each well; measuring optical density on a spectrophotometer in each well at a wavelength of 450 nm; interpretation of results.
Особенностью данного способа для анализа сыворотки или плазмы крови человека является то, что при интерпретации результатов, исследуемый образец сыворотки или плазмы крови человека сравнивают со значением оптической плотности Cut off, которое вычисляют по формулеA feature of this method for the analysis of human serum or plasma is that, when interpreting the results, the analyzed sample of human serum or plasma is compared with the value of the optical density Cut off, which is calculated by the formula
Cut off=А450К- ср+3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed +3 x SD A 450 K - ,
где Cut off - отсекающие значения оптической плотности,where Cut off - cutoff values of optical density,
А450К- ср - cреднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем,A 450 K - cf. - the average value of optical density in the wells with negative control,
SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля,SD А 450 К - - the standard deviation of the optical density values of the negative control,
при этом титр антител определяют как наибольшее разведение образца сыворотки или плазмы крови человека, при анализе которого получают оптическую плотность при длине волны 450 нм в 2 раза превышающую отсекающие значения оптической плотности Cut off.the titer of antibodies is determined as the highest dilution of a sample of human serum or plasma, in the analysis of which the optical density at a wavelength of 450 nm is 2 times higher than the cutoff values of the optical density Cut off.
Осуществление изобретения подтверждается следующими примерами.The implementation of the invention is confirmed by the following examples.
Пример 1. Разработка дизайна генетической конструкции, содержащей лидерный пептид тяжелой цепи иммуноглобулина G человека, ген RBD вируса SARS-CoV-2 и гистидиновую меткуExample 1. Development of the design of a genetic construct containing the leader peptide of the heavy chain of human immunoglobulin G, the RBD gene of the SARS-CoV-2 virus and a histidine tag
На первом этапе работы авторы разработали дизайн генетической конструкции, позволяющей эффективно экспрессировать рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 в клетках млекопитающих и выполнять его хроматографическую очистку.At the first stage of the work, the authors developed a design of a genetic construct that allows efficient expression of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus in mammalian cells and its chromatographic purification.
Для этого был выбран ген рецептор-связывающего домена (RBD) белка S коронавируса SARS-CoV-2, слитый с сигнальным пептидом тяжелой цепи иммуноглобулина G человека, обеспечивающий секрецию белка в культуральную жидкость и гистидиновой меткой для очистки рекомбинантного белка методом аффинной хроматографии. Таким образом, была разработана генетическая конструкция SEQ ID NO:1.For this, the gene for the receptor-binding domain (RBD) of the protein S of the SARS-CoV-2 coronavirus was selected, fused with the signal peptide of the heavy chain of human immunoglobulin G, which ensures the secretion of the protein into the culture fluid and a histidine tag for purification of the recombinant protein by affinity chromatography. Thus, the genetic construct SEQ ID NO: 1 was developed.
Схема генетической конструкции и представлена на Фиг. 1. Разработанная генетическая конструкция была синтезирована в ЗАО «Евроген». Таким образом, была получена конструкция pAL-TA-RBD-CoV-2.A schematic of the genetic construct is shown in FIG. 1. The developed genetic construct was synthesized at ZAO Evrogen. Thus, the pAL-TA-RBD-CoV-2 construct was obtained.
Далее с помощью методов генной инженерии разработанная генетическая конструкция из pAL-TA-RBD-CoV-2 была клонирована с использованием эндонуклеаз рестрикции HindIII и XhoI в плазмидный вектор для эписомальной экспрессии в клеточных линиях млекопитающих, и полученная плазмида была названа p1-RBD-CoV-2 (Фиг. 2). Далее полученную плазмиду нарабатывали в препаративных количествах и очищали при помощи коммерческого набора Plasmid Midiprep 2.0 (Евроген /кат.№BC124).Then, using genetic engineering methods, the developed genetic construct from pAL-TA-RBD-CoV-2 was cloned using restriction endonucleases HindIII and XhoI into a plasmid vector for episomal expression in mammalian cell lines, and the resulting plasmid was named p1-RBD-CoV- 2 (Fig. 2). Then the resulting plasmid was produced in preparative quantities and purified using a commercial kit Plasmid Midiprep 2.0 (Evrogen / cat. # BC124).
Таким образом, в результате проведенной работы была получена плазмида p1-RBD-CoV-2, обеспечивающая экспрессию гена RBD вируса SARS-CoV-2.Thus, as a result of this work, the p1-RBD-CoV-2 plasmid was obtained, which provides expression of the RBD gene of the SARS-CoV-2 virus.
Пример 2. Получение штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцента рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2Example 2. Obtaining a strain of Chinese hamster ovary cells CHO-S-RBD, producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus
Штамм клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 был получен на основе клеточной линии CHO-S. Это коммерческая клеточная линия на основе клеток яичника китайского хомячка СНО, адаптированная к культивированию в плотной суспензии в специальной культуральной среде для повышенной экспрессии белка.The Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD, the producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, was obtained on the basis of the CHO-S cell line. This is a commercial cell line based on Chinese hamster ovary cells CHO, adapted for cultivation in dense suspension in a special culture medium for increased protein expression.
Клетки CHO-S культивировали в шейкер-инкубаторе при 5% содержания CO2, 80%-ной влажности и скорости качания 120 об/мин в питательной среде HyClone HyCell TransFx-C transfection media (GE Healthcare, США) с добавлением 8 мМ глутамина (ПанЭко, Россия), до достижения плотности 2*106 кл/мл 1 литр суспензии. Далее полученную суспензию трансфицировали плазмидным вектором p1-RBD-CoV-2, содержащим генетическую конструкцию SEQ ID NO:1, при помощи 1 мг/мл реагента Polyethylenimine (Polyscience, США) согласно инструкции производителя. Затем в течение 2 недель проводили селекцию трансфицированных клеток на антибиотике гигромицин Б. Данный антибиотик был выбран, поскольку плазмидный вектор p1-RBD-CoV-2 содержит ген устойчивости к антибиотику Hygromycin B.CHO-S cells were cultured in an incubator shaker at 5% CO2 content, 80% humidity, and a rocking speed of 120 rpm in HyClone HyCell TransFx-C transfection media (GE Healthcare, USA) supplemented with 8 mM glutamine (PanEco , Russia), until a density of 2 * 10 6 cells /
Таким образом, в результате проведенной работы впервые был получен штамм клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2. При этом продукция указанного белка составляет от 5 мг/л до 10 мг/л.Thus, as a result of this work, a strain of Chinese hamster ovary cells CHO-S-RBD, a producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, was obtained for the first time. In this case, the production of the specified protein ranges from 5 mg / l to 10 mg / l.
Пример 3. Способ получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 с помощью созданного штамма-продуцентаExample 3. A method of obtaining a recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus using the created producer strain
Разработанный способ получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2 включает следующие этапы:The developed method for producing the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 SEQ ID NO: 2 includes the following steps:
1) культивирование штамма-продуцента рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2;1) cultivation of the strain-producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus;
2) отбор культуральной среды;2) selection of the culture medium;
3) хроматографическую очистку рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2;3) chromatographic purification of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus;
4) подтверждение подлинности полученного рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2.4) confirmation of the authenticity of the obtained recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus.
Культивирование клеток штамма-продуцента проводили в течение 7 дней в Шейкер-инкубаторе Multitron (Infors HT, Швейцария) при 5% содержания CO2, 80%-ной влажности и скорости качания 120 об/мин. Ежедневно определяли выживаемость клеток в суспензии при помощи счетчика клеток TC20 Automated Cell Counter (Bio-Rad, США). По истечении 7 дней культивирования клеточную суспензию осаждали центрифугированием 5000 об/мин. Культуральную жидкость осветляли при помощи фильтрации через шприцевые фильтры Millipore Express (PES) HP 0.45 мкм (Merckmillipore, Германия).The cultivation of the cells of the producer strain was carried out for 7 days in a Multitron shaker-incubator (Infors HT, Switzerland) at 5% CO2 content, 80% humidity and a rocking speed of 120 rpm. The viability of cells in suspension was determined daily using a TC20 Automated Cell Counter (Bio-Rad, USA). After 7 days of cultivation, the cell suspension was precipitated by centrifugation at 5000 rpm. The culture fluid was clarified by filtration through Millipore Express (PES) HP 0.45 μm syringe filters (Merckmillipore, Germany).
Далее проводили хроматографическую очистку белка из осветленной культуральной жидкости на приборе AKTA start (GE Healthcare, США). К прибору подключали хроматографическую колонку HisTag HP protein purification column (5 мл) и уравновешивали буфером (20 мМ фосфат натрия, 500 мМ хлорид натрия, 20 мМ иммидазол, рН=7.4). Далее осветленную культуральную жидкость (100 мл) разбавляли в несколько раз буфером (20 мМ фосфат натрия, 500 мМ хлорид натрия, 20 мМ иммидазол, рН=7.4) и наносили на уравновешенную колонку со скоростью 5 мл/мин. После окончания нанесения, колонку промывали 100 мл буфера (20 мМ фосфат натрия, 500 мМ хлорид натрия, 20 мМ иммидазол, рН=7.4) со скоростью 5 мл/мин. После окончания промывки связавшийся белок элюировали с колонки буфером (20 мМ фосфат натрия, 500 мМ хлорид натрия, 500 мМ иммидазол, рН=7.4) со скоростью 1 мл/мин. Так проводили 10 очисток по 100 мл. Фракции после очистки замораживали при температуре -20°С. Фракции после первичной очистки размораживали при комнатной температуре и концентрировали при помощи центрифужных концентраторов Amicon Ultra -50, -10K (Millipore, Ирландия) до концентрации белка 1-2 мг/мл. Концентрацию белка измеряли при помощи спектрофотометра Nanodrop 2000c. Далее колонку HiTrap desalting column уравновешивали буфером (20 мМ фосфат натрия, 150 мМ хлорид натрия) на скорости 5 мл/мин. После уравновешивания скорость потока снижали до 1 мл/мин. Препарат с концентрацией 1-2 мг/мл наносили на колонку через шприц в объеме 1 мл. Собирали первый пик по UV280 соответствующий целевому рекомбинантному белку RBD. Суммарно проводили 5-10 циклов очистки. Полученные после второй стадии очистки фракции препарата объединяли и измеряли концентрацию белка на спектрофотометре Nanodrop 2000c. Далее препарат доводили буфером (20 мМ фосфат натрия, 150 мМ хлорид натрия) до концентрации 1 мг/мл, разливали по 1 мл и хранили при температуре -20°С.Then, the protein was chromatographed from the clarified culture liquid on an AKTA start device (GE Healthcare, USA). A HisTag HP protein purification column (5 ml) was connected to the instrument and equilibrated with a buffer (20 mM sodium phosphate, 500 mM sodium chloride, 20 mM imidazole, pH = 7.4). Then, the clarified culture fluid (100 ml) was diluted several times with a buffer (20 mM sodium phosphate, 500 mM sodium chloride, 20 mM imidazole, pH = 7.4) and applied to the equilibrated column at a rate of 5 ml / min. After the end of the application, the column was washed with 100 ml of buffer (20 mM sodium phosphate, 500 mM sodium chloride, 20 mM imidazole, pH = 7.4) at a rate of 5 ml / min. After the end of washing, the bound protein was eluted from the column with a buffer (20 mM sodium phosphate, 500 mM sodium chloride, 500 mM imidazole, pH = 7.4) at a rate of 1 ml / min. So 10 purifications of 100 ml were carried out. After purification, the fractions were frozen at -20 ° C. Fractions after primary purification were thawed at room temperature and concentrated using Amicon Ultra -50, -10K centrifuge concentrators (Millipore, Ireland) to a protein concentration of 1-2 mg / ml. Protein concentration was measured using a Nanodrop 2000c spectrophotometer. Then the HiTrap desalting column was equilibrated with a buffer (20 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride) at a rate of 5 ml / min. After equilibration, the flow rate was reduced to 1 ml / min. The drug with a concentration of 1-2 mg / ml was applied to the column through a syringe in a volume of 1 ml. Collected a first peak at UV280 corresponding to the target recombinant RBD protein. A total of 5-10 cleaning cycles were carried out. The drug fractions obtained after the second stage of purification were combined, and the protein concentration was measured on a Nanodrop 2000c spectrophotometer. Then the preparation was adjusted with a buffer (20 mM sodium phosphate, 150 mM sodium chloride) to a concentration of 1 mg / ml, poured in 1 ml each and stored at -20 ° C.
Выход рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 после хроматографической очистки составил от 5 мг до 10 мг с литра культуральной среды (по результатам трех независимых экспериментов). Что является показателем эффективности разработанного способа получения, так как белки коронавируса относятся к группе сложнополучаемых в традиционных системах бактериальной экспрессии.The yield of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus after chromatographic purification was from 5 mg to 10 mg per liter of culture medium (according to the results of three independent experiments). This is an indicator of the effectiveness of the developed production method, since coronavirus proteins belong to the group of difficult to obtain in traditional bacterial expression systems.
Подтверждение подлинности полученного рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 проводили при помощи белкового электрофореза в полиакриламидном геле, а также масс-спектрометрического анализа.Confirmation of the authenticity of the obtained recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus was carried out using protein polyacrylamide gel electrophoresis, as well as mass spectrometric analysis.
Для проведения белкового электрофореза готовили 12%-ный разделяющий полиакриламидный гель и 6%-ный фокусирующий полиакриламидный гель. Образцы очищенного рекомбинантного белка RBD разводили до различной концентрации (1 мкг/мкл, 0.75 мкг/мл, 0.5 мкг/мкл, 0.25 мкг/мл) буфером образца с содержанием В-меркаптоэтанола. Далее образцы прогревали при температуре 98°С в течении 5 мин и вносили в гель. Электрофорез проводили в камере Mini-Protean Tetra Cell (Bio-Rad, США, кат.№165-8000). Далее гель окрашивали реагентом EZBlue™ Gel Staining Reagent (Sigma-Aldrich, США, кат.№G1041) и проявляли при помощи гель-документирующей системы Gel Doc EZ system (Bio-Rad, США). Результаты электрофореграммы представлены на Фиг. 3.For the protein electrophoresis, a 12% separating polyacrylamide gel and a 6% focusing polyacrylamide gel were prepared. Samples of the purified recombinant RBD protein were diluted to various concentrations (1 μg / μl, 0.75 μg / ml, 0.5 μg / μl, 0.25 μg / ml) with sample buffer containing B-mercaptoethanol. Then the samples were heated at a temperature of 98 ° С for 5 min and added to the gel. Electrophoresis was carried out in a Mini-Protean Tetra Cell (Bio-Rad, USA, cat # 165-8000). Next, the gel was stained with EZBlue ™ Gel Staining Reagent (Sigma-Aldrich, USA, cat # G1041) and developed using the Gel Doc EZ system (Bio-Rad, USA). The results of the electrophoretogram are shown in FIG. 3.
По результатам электрофореграммы подвижность рекомбинантного белка RBD в денатурирующих условиях соответствовала ≈30 кДа, что обусловлено его гликозилированием (масса аминокислотной последовательности без учета гликозилирования составляет около 25 кДа). Таким образом, при первичном анализе препарата были подтверждена его ожидаемая молекулярная масса.According to the results of electropherogram, the mobility of the recombinant RBD protein under denaturing conditions corresponded to ≈30 kDa, which is due to its glycosylation (the mass of the amino acid sequence without taking into account glycosylation is about 25 kDa). Thus, during the initial analysis of the drug, its expected molecular weight was confirmed.
Более детальное подтверждение подлинности препарата осуществляли при помощи масс-спектрометрического анализа по следующей схеме:A more detailed confirmation of the authenticity of the drug was carried out using mass spectrometric analysis according to the following scheme:
1. Гидролиз белка трипсином в растворе1. Protein hydrolysis with trypsin in solution
25 мкг рекомбинантного белка RBD растворяли в 20 mM бикарбонате аммония и добавляли до 100 мкл 25 мМ бикарбоната аммония (рH 8,3). В полученную реакционную смесь добавляли последовательно 1 мкл 1 M ДТТ и 10 мкл 110 mM йодацетамида. После проведения реакции (56°С, 30 мин в темноте) к смеси добавляли 4 мкл 1 M ДТТ для нейтрализации не связавшегося иодацетамида. К оставшейся части добавляли только трипсин, при этом, в обоих случаях соотношение белок: фермент составляло 25: 1. Реакцию вели при 37°С в течение 17 ч. Полученную реакционную смесь высушивали досуха с помощью вакуумного концентратора (Savant SPD121P, Thermo Scientific, США) и растворяли в 20 мкл 0,1% муравьиной кислоты. Образец обессоливали на колонках, содержащих обращено фазовую мембрану (аналог С18), образец элюировали 90% раствором ацетонитрила в воде. Для нанесения брали 4 мкл образца в 90% ацетонитриле и смешивали их с 1 мкл насыщенного раствора 2,5-дигидроксибензойной кислоты в 30%-ном растворе ацетонитрила, содержащем 0,5% ледяной уксусной кислоты по объему, на стальной мишени, которую затем подсушивали на воздухе при комнатной температуре.25 μg of recombinant RBD protein was dissolved in 20 mM ammonium bicarbonate and added to 100 μl of 25 mM ammonium bicarbonate (pH 8.3). To the resulting reaction mixture was added sequentially 1 μl of 1 M DTT and 10 μl of 110 mM iodoacetamide. After the reaction (56 ° С, 30 min in the dark), 4 μL of 1 M DTT was added to the mixture to neutralize unbound iodoacetamide. Only trypsin was added to the remainder; in both cases, the protein: enzyme ratio was 25: 1. The reaction was carried out at 37 ° C for 17 h. The resulting reaction mixture was dried to dryness using a vacuum concentrator (Savant SPD121P, Thermo Scientific, USA ) and dissolved in 20 μl of 0.1% formic acid. The sample was desalted on columns containing a reversed phase membrane (analogue C18), the sample was eluted with a 90% solution of acetonitrile in water. For application, 4 μl of a sample in 90% acetonitrile was taken and mixed with 1 μl of a saturated solution of 2,5-dihydroxybenzoic acid in a 30% acetonitrile solution containing 0.5% glacial acetic acid by volume on a steel target, which was then dried in air at room temperature.
2. MALDI-масс-спектрометрический анализ2. MALDI mass spectrometric analysis
Анализ пептидов проводили на время-пролетном MALDI-масс-спектрометре Ultraflextreme («Bruker Daltonics», Германия). Детектирование положительных ионов проводили в режиме рефлектрона при напряжениях: на ионном источнике IS1 – 20,12 кВ, IS2 – 17,82 кВ; на линзах – 7,47 кВ, рефлектроне Ref1 – 21,07 кВ, Ref2 – 10,80 кВ. Ионы детектировали в диапазоне m/z от 650 до 5000 Th. В качестве внутреннего стандарта использовали пики автолитических фрагментов трипсина и кератина, которые исключались из окончательных списков детектируемых масс.Peptides were analyzed on an Ultraflextreme time-of-flight MALDI mass spectrometer (Bruker Daltonics, Germany). Positive ions were detected in the reflectron mode at voltages: at the IS1 ion source - 20.12 kV, IS2 - 17.82 kV; on lenses - 7.47 kV, Ref1 - 21.07 kV, Ref2 - 10.80 kV. Ions were detected in the m / z range from 650 to 5000 Th. Peaks of autolytic fragments of trypsin and keratin, which were excluded from the final lists of detectable masses, were used as an internal standard.
3. Анализ данных масс-спектрометрии3. Analysis of mass spectrometry data
Обработка масс-спектров проводилась с помощью программного обеспечения Flex Analysis 3.4 (Bruker Daltonik GMBH, Германия). К масс-спектрам применялись сглаживание по алгоритму Savizky Golay (ширина 0,2 m/z, 1 цикл), и вычитание базовой линии согласно алгоритму TopHat. Использовались следующие параметры детекции пиков: алгоритм детекции пиков - SNAP2, соотношение сигнал/шум - 3, максимальное число пиков в спектре - 500). Поиск и идентификация белков методом «пептидного отпечатка» («peptide mass fingerprint») осуществляли с помощью программного комплекса Proteinscape (версия 4, «Bruker Daltonik GMBH, Германия), использовались следующие параметры поиска: точность определения массы - 50 ppm; возможные посттрансляционные модификации - окисление метионина, гистидина, триптофана.Mass spectra were processed using Flex Analysis 3.4 software (Bruker Daltonik GMBH, Germany). The mass spectra were smoothed according to the Savizky Golay algorithm (width 0.2 m / z, 1 cycle), and baseline subtraction according to the TopHat algorithm. The following peak detection parameters were used: the peak detection algorithm was SNAP2, the signal-to-noise ratio was 3, the maximum number of peaks in the spectrum was 500). The search and identification of proteins by the “peptide mass fingerprint” method was carried out using the Proteinscape software package (
В результате масс-спектрального анализа было продемонстрировано, что рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 присутствует в растворе в виде одно и двухзарядного иона, и имеет молекулярную массу 31 кДа, что четко коррелирует с данными электрофореза (Фиг. 4).As a result of mass spectral analysis, it was demonstrated that the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus is present in solution in the form of single and double charged ions, and has a molecular weight of 31 kDa, which clearly correlates with the data of electrophoresis (Fig. 4).
Результаты исследования рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 при помощи белкового электрофореза в полиакриламидном геле, а также масс-спектрометрического анализа убедительно доказали его подлинность.The results of the study of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus using protein electrophoresis in polyacrylamide gel, as well as mass spectrometric analysis, have convincingly proved its authenticity.
Таким образом, в результате проведенной работы впервые был получен рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2. Данный белок образует стабильную складчатую структуру.Thus, as a result of this work, the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus SEQ ID NO: 2 was obtained for the first time. This protein forms a stable folded structure.
Пример 5. Тест-система для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека с использованием рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2Example 5. Test system for enzyme immunoassay of human serum or plasma using the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus
Авторами впервые была создана тест-система на основе иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека, в которой рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2, полученный с помощью штамма клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцента рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 (примеры 1-3), является мишенью для антител, выявляемых в крови реконвалесцентов COVID-19.The authors were the first to create a test system based on an enzyme-linked immunosorbent assay of human serum or plasma, in which the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus SEQ ID NO: 2, obtained using the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD, a producer of recombinant the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus (examples 1-3) is a target for antibodies detected in the blood of COVID-19 convalescents.
Тест-система представляет собой набор реагентов, включающий:The test system is a set of reagents that includes:
1) планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2 2 SEQ ID NO:2;1) plate for enzyme immunoassay with adsorbed in the wells of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2
2) положительный контроль, включающий инактивированный образец сыворотки крови человека, содержащий IgG к белку RBD коронавируса SARS-CoV-2;2) a positive control comprising an inactivated human serum sample containing IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 coronavirus;
3) отрицательный контроль, представляющий собой инактивированный образец сыворотки крови человека, не содержащий IgG к белку RBD коронавируса SARS-CoV-2;3) a negative control, which is an inactivated human serum sample that does not contain IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 coronavirus;
4) конъюгат, содержащий 20-кратный концентрат моноклональных мышиных антител к IgG человека, конъюгированных с пероксидазой хрена;4) a conjugate containing a 20-fold concentrate of monoclonal mouse antibodies to human IgG, conjugated with horseradish peroxidase;
5) 25-кратный концентрат промывочного буфера, содержащий концентрат фосфатно-солевого буфера с Твином 20 для промывания планшетов;5) 25-fold wash buffer concentrate containing PBS concentrate with Tween 20 for washing plates;
6) буфер для разведения, содержащий буферный раствор для разведения сыворотки или плазмы и конъюгата;6) a dilution buffer containing a buffer solution for diluting serum or plasma and the conjugate;
7) раствор хромогена, содержащий раствор тетраметилбензидина;7) a chromogen solution containing a tetramethylbenzidine solution;
8) раствор субстрата, содержащий раствор перекиси водорода;8) a substrate solution containing a solution of hydrogen peroxide;
9) стоп-реагент, содержащий 1 М раствор серной кислоты.9) stop reagent containing 1 M sulfuric acid solution.
Пример 6. Способ применения тест-системы для иммуноферментного анализа для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2Example 6. A method of using a test system for an enzyme-linked immunosorbent assay for the analysis of serum or blood plasma of COVID-19 convalescents for sampling the most promising for therapy of patients infected with SARS-CoV-2
В данном примере описан способ использования разработанной тест-системы для иммуноферментного анализа (описанной в примере 5) для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов, наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2.This example describes a method of using the developed test system for enzyme-linked immunosorbent assay (described in example 5) for the analysis of serum or blood plasma of COVID-19 convalescents to select samples that are most promising for the therapy of patients infected with SARS-CoV-2.
Наиболее перспективными для терапии являются образцы сыворотки или плазмы крови, которые содержат вируснейтрализующие антитела. Из литературных данных известно, что белок RBD коронавирусов является одной из основных мишеней для вируснейтрализующих антител Z. Cao et al. Potent and persistent antibody responses against the receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein in recovered patients. Virol J 7, 299 (2010)).The most promising for therapy are serum or blood plasma samples that contain virus-neutralizing antibodies. It is known from the literature that the RBD protein of coronaviruses is one of the main targets for virus neutralizing antibodies Z. Cao et al. Potent and persistent antibody responses against the receptor-binding domain of SARS-CoV spike protein in recovered patients. Virol J 7, 299 (2010)).
В данном исследовании был проведен сравнительный анализ 218 образцов реконвалесцентной плазмы и сыворотки крови пациентов, перенесших COVID-19. Каждый образец был исследован с помощью разработанной тест-системы для иммуноферментного анализа (описанной в примере 5) и проанализирован на наличие вируснейтрализующих антител (ВНА) методом прямой вируснейтрализации вируса SARS-CoV-2 на культуре клеток.In this study, a comparative analysis of 218 samples of convalescent plasma and blood serum from patients undergoing COVID-19 was carried out. Each sample was examined using the developed test system for enzyme-linked immunosorbent assay (described in example 5) and analyzed for the presence of virus-neutralizing antibodies (BHA) by direct virus neutralization of the SARS-CoV-2 virus in cell culture.
Иммуноферментный анализ с использованием разработанной тест-системы был проведен согласно следующему протоколу.The enzyme-linked immunosorbent assay using the developed test system was carried out according to the following protocol.
1. Приготовление рабочих растворов1. Preparation of working solutions
Для приготовления рабочего раствора буфера для промывания планшетов концентрат промывочного буфера развести в 25 раз дистиллированной водой.To prepare the working buffer solution for plate washing, dilute the wash buffer concentrate 25 times with distilled water.
Для приготовления рабочего раствора конъюгата, конъюгат развести в 20 раз буфером для разведения и тщательно перемешать пипетированием (раствор готовили непосредственно перед использованием).To prepare a working solution of the conjugate, dilute the conjugate 20 times with dilution buffer and mix thoroughly by pipetting (the solution was prepared immediately before use).
Для приготовления рабочего хромоген-субстратного раствора к 1,0 мл раствора хромогена добавить 9,0 мл раствора субстрата и тщательно перемешать (раствор готовить непосредственно перед использованием, хранению не подлежит).To prepare a working chromogen-substrate solution, add 9.0 ml of a substrate solution to 1.0 ml of a chromogen solution and mix thoroughly (the solution must be prepared immediately before use, it cannot be stored).
1. Проведение анализа.1. Analysis.
1.1 Внести контрольные и испытуемые образцы сывороток.1.1 Add control and test serum samples.
Освободить планшет из упаковки и внести в 2 повторах по 100 мкл положительного контроля, а также в 2 повторах по 100 мкл отрицательного контроля.Unpack the plate and add 100 μl positive control in 2 repetitions and 100 μl negative control in 2 replicates.
В остальные лунки планшета внести по 90 мкл буфера для разведения, а затем добавить по 10 мкл, предварительно разведенных в 20 раз испытуемых образцов (по две лунки на каждый образец).Add 90 μl of dilution buffer to the remaining wells of the plate, and then add 10 μl of the test samples previously diluted 20 times (two wells for each sample).
Планшет заклеить пленкой и выдержать в течение 1 ч при температуре от +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Cover the tablet with foil and incubate for 1 hour at a temperature of + 37 ° C with stirring at a speed of 300 rpm.
2.2 Промывание.2.2 Washing.
После окончания инкубации удалить жидкость из лунок и промыть планшет 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов, на автоматическом промывочном устройстве или вручную, доверху заполняя лунки (по 300 мкл/лунку). Затем жидкость окончательно удалить и подсушить планшет постукиванием по сложенной в несколько слоев фильтровальной бумаге.After the end of incubation, remove the liquid from the wells and wash the
2. 3 Внесение конъюгата.2. 3 Introduction of the conjugate.
В каждую лунку внести по 100 мкл рабочего раствора конъюгата моноклональных антител, планшет закрыть липкой пленкой и инкубировать в течение 1 часа при температуре +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Add 100 μl of the working solution of the conjugate of monoclonal antibodies to each well, cover the plate with adhesive tape and incubate for 1 hour at + 37 ° C with stirring at 300 rpm.
2.4 Промывание.2.4 Rinsing.
После окончания инкубации промыть планшет 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов.After the end of incubation, wash the
2.5 Внесение хромоген-субстратного раствора.2.5 Adding chromogen-substrate solution.
В каждую лунку внести по 100 мкл хромоген-субстратного раствора и инкубировать в течение 15 минут в темном месте при температуре от +20°С.Add 100 μl of chromogen-substrate solution to each well and incubate for 15 minutes in a dark place at a temperature of + 20 ° C.
2.6 Остановка пероксидазной реакции.2.6 Stopping the peroxidase reaction.
Остановить реакцию добавлением в каждую лунку по 50 мкл стоп-реагента (1 М раствор серной кислоты) и провести учет результатов на спектрофотометре в течение 10 мин после остановки реакции.Stop the reaction by adding 50 μl of stop reagent (1 M sulfuric acid solution) to each well and record the results on a spectrophotometer within 10 minutes after stopping the reaction.
2.8. Регистрация результатов2.8. Registration of results
Измерить величину оптической плотности субстратной смеси на спектрофотометре с вертикальным лучом при длине волны 450 нм (А450) в течение 10 мин после остановки реакции.Measure the optical density of the substrate mixture on a spectrophotometer with a vertical beam at a wavelength of 450 nm (A 450 ) within 10 minutes after stopping the reaction.
Вычислить среднее арифметическое значение оптической плотности отрицательного (А450К-) и положительного (А450К+) контролей по формулам 1 и 2.Calculate the arithmetic mean of the optical density of the negative (A 450 K - ) and positive (A 450 K + ) controls according to
А450 К- ср=(А450 К- 1+А450А К- 2)/2 (1),A 450 K - cf = (A 450 K - 1 + A 450 A K - 2 ) / 2 (1),
гдеWhere
- А450 К- 1 - значение оптической плотности пробы 1 отрицательного контроля;- A 450 K - 1 - the optical density of the
- А450 К- 2 - значение оптической плотности пробы 2 отрицательного контроля,- A 450 K - 2 - the value of the optical density of the
А450 К+ ср=(А450 К+ 1+А450А К+ 2)/2 (2)A 450 K + sr = (A 450 K + 1 + A 450 A K + 2 ) / 2 (2)
гдеWhere
- А450 К+ 1 - значение оптической плотности пробы 1 положительного контроля;- A 450 K + 1 - the optical density of the
- А450 К+ 2 - значение оптической плотности пробы 2 положительного контроля.- A 450 K + 2 - the optical density of the
Вычислить среднее значение А450 для каждой опытной пробы (А450ОПср) по формуле 3:Calculate the average A 450 for each test sample (A 450 OP cf ) according to formula 3:
А450ОПср=(А450ОП1+А450ОП2)/2 (3)A 450 OP av = (A 450 OP 1 + A 450 OP 2 ) / 2 (3)
гдеWhere
- А450ОП1 - значение оптической плотности пробы 1;- A 450 OP 1 - the value of the optical density of the
- А450ОП2 - значение оптической плотности пробы 2.- A 450 OP 2 - the value of the optical density of the
При этом результаты измерения, полученные на контрольных образцах, должны удовлетворять следующим требованиям:In this case, the measurement results obtained on control samples must meet the following requirements:
1. Среднее значение оптической плотности в лунках с положительным контролем (А450К+ ср) - не менее 0,6;1. The average value of optical density in the wells with a positive control (A 450 K + cf ) - not less than 0.6;
2. Значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем (А450К- ср) - менее 0,2.2. The value of optical density in the wells with negative control (A 450 K - sr ) is less than 0.2.
При получении иных показателей исследование необходимо повторить.If other indicators are obtained, the study must be repeated.
2.9 Интерпретация результатов.2.9 Interpretation of results.
Для интерпретации результатов вычисляют отсекающие значения оптической плотности А450 (Cut off).To interpret the results, calculate the cutoff values of the absorbance A 450 (Cut off).
Значение Cut off вычисляют по формуле:The Cut off value is calculated by the formula:
Cut off=А450К- ср+3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed +3 x SD A 450 K - ,
гдеWhere
- SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля.- SD А 450 К - is the standard deviation of the optical density values of the negative control.
Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считается положительным, если А450ОПср выше, чем значение Cut off в 2,5 раза.The analyzed serum or blood plasma sample is considered positive if A 450 OD cp is 2.5 times higher than the Cut off value.
Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считается отрицательным, если А450ОПср не превышает значение Cut off в 2,5 раза.The analyzed serum or blood plasma sample is considered negative if A 450 OD cf does not exceed the Cut off value by 2.5 times.
Реакцию вируснейтрализации ставили в варианте: постоянная доза вируса - разведения сыворотки или плазмы крови.The virus neutralization reaction was set in the variant: constant dose of the virus - dilution of serum or blood plasma.
В лунки планшета вносили 2-кратные разведения сыворотки или плазмы крови, начиная с разведения 1/20 до 1/1280 в объеме 50 мкл/лунку в 3 повторах.In the wells of the plate, 2-fold dilutions of serum or blood plasma were made, starting with a dilution of 1/20 to 1/1280 in a volume of 50 μl / well in 3 repetitions.
В отдельные лунки вносят контрольные образцы:Control samples are added to individual wells:
- разведения контрольной плазмы с известным титром ВНА по 50 мкл/лунку (контроль проведения) в 3 повторах.- dilutions of control plasma with a known BHA titer at 50 μl / well (control of conduction) in 3 repetitions.
- по 50 мкл контрольной негативной плазмы (не обладающей вируснейтрализующей активностью) в разведении 1/20, в 3 повторах (контроль плазмы).- 50 μl of control negative plasma (not possessing virus neutralizing activity) in a dilution of 1/20, in 3 repetitions (control plasma).
- по 100 мкл ростовой среды в 3 повторах (РС) (контроль клеток).- 100 μl of growth medium in 3 repetitions (RS) (control of cells).
- по 50 мкл РС и 50 мкл вируссодержащей суспензии с концентрацией 2000 TCID(tissue culture infective dose 50/мл (контроль дозы вируса) в 3 повторах.- 50 μl of PC and 50 μl of vaccinated suspension with a concentration of 2000 TCID (tissue culture infective dose 50 / ml (control of the virus dose) in 3 repetitions.
Далее во все лунки, кроме контроля клеток, вносили по 50 мкл вируссодержащей суспензии с концентрацией 2000 TCID50/мл.Then, 50 μl of vaccinated suspension with a concentration of 2000 TCID50 / ml was added to all wells, except for the control of cells.
В качестве контроля вирусной активности (Контроль вируса) в отдельные лунки планшета вносили разведения вируссодержащей суспензии (внутренний контроль вносимых доз вируса при исследования нейтрализующей активности плазмы).As a control of viral activity (Control of the virus), dilutions of a vaccinated suspension were introduced into individual wells of the plate (internal control of the introduced doses of the virus when studying the neutralizing activity of plasma).
Далее планшет инкубировали в атмосфере 5% CO2 при 37°С в течение 60 минут.Then the plate was incubated in an atmosphere of 5% CO2 at 37 ° C for 60 minutes.
Затем во все лунки планшета инокулировали по 20000 клеток Vero E6 в объеме 100 мкл/лунку (концентрация клеток 2×105 клеток/мл) в свежеприготовленной РС. Планшеты с клетками инкубировали в атмосфере 5% CO2 при 37°С в течение 96 часов до полного проявления цитопатического действия вируса в вирусном контроле в ожидаемом диапазоне.Then, 20,000 Vero E6 cells were inoculated into all wells of the plate in a volume of 100 μl / well (
Оценку вирусной продукции по цитопатическому действию (ЦПД) осуществляли на основе анализа жизнеспособности клеток при помощи микроскопирования, с целью визуального определения границы вирусного повреждения клеток.Evaluation of viral production by cytopathic action (CPE) was carried out on the basis of analysis of cell viability using microscopy, in order to visually determine the border of viral cell damage.
Вируснейтрализующую активность плазмы/сыворотки оценивали визуально под микроскопом через 96 часов после инфицирования по ингибированию ЦПД вируса в культуре клеток Vero E6. Каждое из разведений плазмы/сыворотки испытывали в трех параллельных лунках. Результатом исследования являлось заключение о нейтрализации цитопатического действия вируса в культуре клеток Vero E6 при воздействии плазмы/сыворотки крови. За титр ВНА исследуемой плазмы/сыворотки принимали высшее ее разведение, при котором происходит подавление цитопатического действия в 2 лунках из 3.Virus neutralizing activity of plasma / serum was assessed visually under a microscope 96 hours after infection by inhibition of the CPP virus in a Vero E6 cell culture. Each of the plasma / serum dilutions was tested in three parallel wells. The result of the study was the conclusion about the neutralization of the cytopathic effect of the virus in the culture of Vero E6 cells when exposed to blood plasma / serum. The BHA titer of the studied plasma / serum was taken as its highest dilution, at which the cytopathic effect was suppressed in 2 out of 3 wells.
Результаты сравнительного анализа образцов сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 с помощью двух методов: иммуноферментного анализа на антитела к рекомбинантному белку RBD с помощью разработанной тест-системы и на наличие вируснейтрализующих антител (ВНА) методом прямой вируснейтрализации коронавируса SARS-CoV-2 на культуре клеток представлены в таблице 1. Результаты зависимости оптической плотности (OD450) образца при разведении в 200 раз от титра ВНА распределились следующим образом (Таблица 2).Results of a comparative analysis of serum or plasma samples of COVID-19 convalescents using two methods: enzyme immunoassay for antibodies to the recombinant RBD protein using a developed test system and for the presence of neutralizing antibodies (VNA) by direct virus neutralization of SARS-CoV-2 coronavirus in culture cells are presented in Table 1. The results of the dependence of the optical density (OD450) of the sample at a dilution of 200 times on the BHA titer were distributed as follows (Table 2).
Таблица 1. Результаты сравнительного анализа образцов плазмы и сыворотки крови реконвалесцентов COVID-19Table 1. Results of a comparative analysis of plasma and serum samples of COVID-19 convalescents
Таблица 2. Распределение зависимости оптической плотности (OD450) образца при разведении в 200 раз от титра ВНА.Table 2. Distribution of the dependence of the optical density (OD450) of the sample when diluted 200 times on the BHA titer.
Таким образом, в результате проведенных исследований установлено, что диагностическая чувствительность разработанной тест-системы для анализа сыворотки или плазмы крови пациентов, перенесших COVID-19 и обладающих вируснейтрализующей активностью (титр 1/64 и выше), составляет от 96,8%. Установлена корреляция между уровнем оптической плотности (OD450) образца при разведении в 200 раз от титра ВНА, представленная в таблице 2. А время проведения анализ составляет 2,5 часа.Thus, as a result of the conducted studies, it was found that the diagnostic sensitivity of the developed test system for the analysis of serum or blood plasma of patients who have undergone COVID-19 and have a neutralizing activity (
Пример 7. Способ применения разработанной тест-системы для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2Example 7. Method of using the developed test system for the analysis of human serum or plasma to determine the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus
В данном примере описан способ применения разработанной тест-системы (пример 5) для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2.This example describes a method of using the developed test system (example 5) for analyzing human serum or plasma to determine the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus.
Для исследования было отобрано 10 образцов плазмы и сыворотки крови реконвалесцентов COVID-19.For the study, 10 samples of plasma and serum of COVID-19 convalescents were taken.
Иммуноферментный анализ с использованием разработанной тест системы был проведен согласно следующему протоколу.Immunoassay using the developed test system was carried out according to the following protocol.
1. Приготовление рабочих растворов.1. Preparation of working solutions.
Для приготовления рабочего раствора буфера для промывания планшетов концентрат промывочного буфера развести в 25 раз дистиллированной водой.To prepare the working buffer solution for plate washing, dilute the wash buffer concentrate 25 times with distilled water.
Для приготовления рабочего раствора конъюгата, конъюгат развести в 20 раз буфером для разведения и тщательно перемешать пипетированием (раствор готовили непосредственно перед использованием).To prepare a working solution of the conjugate, dilute the conjugate 20 times with dilution buffer and mix thoroughly by pipetting (the solution was prepared immediately before use).
Для приготовления рабочего хромоген-субстратного раствора к 1,0 мл раствора хромогена добавить 9,0 мл раствора субстрата и тщательно перемешать. (раствор готовить непосредственно перед использованием, хранению не подлежит).To prepare a working chromogen-substrate solution, add 9.0 ml of a substrate solution to 1.0 ml of a chromogen solution and mix thoroughly. (the solution must be prepared immediately before use; it cannot be stored).
2. Проведение анализа.2. Analysis.
2.1 Внести контрольные и испытуемые образцы сывороток2.1 Add control and test serum samples
Освободить планшет из упаковки и внести в 2 повторах по 100 мкл положительного контроля, а также в 2 повторах по 100 мкл отрицательного контроля.Unpack the plate and add 100 μl positive control in 2 repetitions and 100 μl negative control in 2 replicates.
В остальные лунки планшета внести серию двукратных разведений исследуемых образцов (по два повтора на каждый образец).Add a series of two-fold dilutions of the test samples to the rest of the plate wells (two replicates for each sample).
Планшет заклеить пленкой и выдержать в течение 1 ч при температуре от +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Cover the tablet with foil and incubate for 1 hour at a temperature of + 37 ° C with stirring at a speed of 300 rpm.
2.2 Промывание.2.2 Washing.
После окончания инкубации удалить жидкость из лунок и промыть планшет 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов, на автоматическом промывочном устройстве или вручную, доверху заполняя лунки (по 300 мкл/лунку). Затем жидкость окончательно удалить и подсушить планшет постукиванием по сложенной в несколько слоев фильтровальной бумаге.After the end of incubation, remove the liquid from the wells and wash the
2. 3 Внесение конъюгата.2. 3 Introduction of the conjugate.
В каждую лунку внести по 100 мкл рабочего раствора конъюгата моноклональных антител, планшет закрыть липкой пленкой и инкубировать в течение 1 часа при температуре +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Add 100 μl of the working solution of the conjugate of monoclonal antibodies to each well, cover the plate with adhesive tape and incubate for 1 hour at + 37 ° C with stirring at 300 rpm.
2.4 Промывание.2.4 Rinsing.
После окончания инкубации промыть планшет 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов.After the end of incubation, wash the
2.5 Внесение хромоген-субстратного раствора.2.5 Adding chromogen-substrate solution.
В каждую лунку внести по 100 мкл хромоген-субстратного раствора и инкубировать в течение 15 минут в темном месте при температуре от +20°С.Add 100 μl of chromogen-substrate solution to each well and incubate for 15 minutes in a dark place at a temperature of + 20 ° C.
2.6 Остановка пероксидазной реакции.2.6 Stopping the peroxidase reaction.
Остановить реакцию добавлением в каждую лунку по 50 мкл стоп-реагента (1М раствор серной кислоты) и провести учет результатов на спектрофотометре в течение 10 мин после остановки реакции.Stop the reaction by adding 50 μl of stop reagent (1M sulfuric acid solution) to each well and record the results on a spectrophotometer within 10 minutes after stopping the reaction.
2.8. Регистрация результатов2.8. Registration of results
Измерить величину оптической плотности субстратной смеси на спектрофотометре с вертикальным лучом при длине волны 450 нм (А450) в течение 10 мин после остановки реакции.Measure the optical density of the substrate mixture on a spectrophotometer with a vertical beam at a wavelength of 450 nm (A 450 ) within 10 minutes after stopping the reaction.
Вычислить среднее арифметическое значение оптической плотности отрицательного (А450К-) и положительного (А450К+) контролей по формулам 1 и 2.Calculate the arithmetic mean of the optical density of the negative (A 450 K - ) and positive (A 450 K + ) controls according to
А450К- ср=(А450К- 1+А450А К- 2)/2 (1)A 450 K - cf = (A 450 K - 1 + A 450 A K - 2 ) / 2 (1)
гдеWhere
- А450К- 1 - значение оптической плотности пробы 1 отрицательного контроля,- A 450 K - 1 - the optical density of the
- А450К- 2 - значение оптической плотности пробы 2 отрицательного контроля.- A 450 K - 2 - the value of the optical density of the
А450К+ ср=(А450К+ 1+А450А К+ 2)/2 (2)A 450 K + sr = (A 450 K + 1 + A 450 A K + 2 ) / 2 (2)
гдеWhere
- А450К+ 1 - значение оптической плотности пробы 1 положительного контроля,- A 450 K + 1 - the optical density of the
- А450К+ 2 - значение оптической плотности пробы 2 положительного контроля.- A 450 K + 2 - the optical density of the
Вычислить среднее значение А450 для каждой опытной пробы (А450ОПср) по формуле 3:Calculate the average A 450 for each test sample (A 450 OP cf ) according to formula 3:
А450ОПср=(А450ОП1+А450ОП2)/2 (3)A 450 OP av = (A 450 OP 1 + A 450 OP 2 ) / 2 (3)
гдеWhere
- А450ОП1 - значение оптической плотности пробы 1,- A 450 OP 1 - the value of the optical density of the
- А450ОП2 - значение оптической плотности пробы 2.- A 450 OP 2 - the value of the optical density of the
При этом результаты измерения, полученные на контрольных образцах, должны удовлетворять следующим требованиям:In this case, the measurement results obtained on control samples must meet the following requirements:
1. Среднее значение оптической плотности в лунках с положительным контролем (А450К+ ср) - не менее 0,6;1. The average value of optical density in the wells with a positive control (A 450 K + cf ) - not less than 0.6;
2. Среднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем (А450К- ср) - менее 0,2.2. The average value of optical density in the wells with negative control (A 450 K - cf. ) is less than 0.2.
При получении иных показателей исследование необходимо повторить.If other indicators are obtained, the study must be repeated.
2.9 Интерпретация результатов.2.9 Interpretation of results.
Для интерпретации результатов вычисляют отсекающие значения оптической плотности А450 (Cut off).To interpret the results, calculate the cutoff values of the absorbance A 450 (Cut off).
Значение Cut off вычисляют по формуле:The Cut off value is calculated by the formula:
Cut off=А450К- ср+3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed +3 x SD A 450 K - ,
гдеWhere
- SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля.- SD А 450 К - is the standard deviation of the optical density values of the negative control.
Титр антител вычисляли как последнее разведение образца, в котором А450ОПср выше, чем значение Cut off в 2 разаThe antibody titer was calculated as the last dilution of the sample, in which A 450 OD cp is 2 times higher than the Cut off value
Результаты проведенного исследования представлены в таблице 3.The results of the study are presented in Table 3.
Таблица 3. Титры антител к RBD в образцах плазмы и сыворотки крови реконвалесцентов COVID-19Table 3. Antibody titers to RBD in plasma and serum samples of COVID-19 convalescents
Таким образом, результаты проведенного исследования, доказывают, что разработанная тест-система может быть использована для анализа сыворотки или плазмы крови человека для определения титра антител к вирусу SARS-CoV-2.Thus, the results of the study prove that the developed test system can be used for the analysis of human serum or plasma to determine the titer of antibodies to the SARS-CoV-2 virus.
Специалисту среднего уровня понятно, что данная тест система может также использоваться для детекции антител к белку RBD вируса SARS-CoV-2 в сыворотке или плазме крови людей, для оценки напряженности иммунного ответа после введения вакцины, содержащей своем составе рецептор-связывающий домен RBD вируса SARS-CoV-2 или его ген.An average specialist understands that this test system can also be used to detect antibodies to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus in serum or plasma of humans, to assess the strength of the immune response after administration of a vaccine containing the RBD receptor-binding domain of the SARS virus -CoV-2 or its gene.
Пример 8 Сравнение тест-систем для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека с различными вариантами адсорбированных белков коронавируса по их способности неспецифически определять антитела против сезонного коронавируса человека ОС43.Example 8 Comparison of test systems for enzyme-linked immunosorbent assay of human serum or blood plasma with different variants of adsorbed coronavirus proteins according to their ability to nonspecifically detect antibodies against seasonal human coronavirus OC43.
Задача данного эксперимента заключалась в сравнении нескольких тест-систем для иммуноферментного анализа, основанных на использовании рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 (разработанная тест-система), или рекомбинантного полноразмерного белка S вируса SARS-CoV-2, или разрушенного вируса SARS-CoV-2, по их способности неспецифически связываться с антителами к сезонному коронавирусу ОС43, который циркулирует в популяции человека.The purpose of this experiment was to compare several test systems for enzyme immunoassay based on the use of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus (developed test system), or the recombinant full-length protein S of the SARS-CoV-2 virus, or the destroyed SARS virus. CoV-2, by their ability to nonspecifically bind to antibodies to the seasonal OS43 coronavirus, which circulates in the human population.
На первом этапе полноразмерный белок S вируса SARS-CoV-2, или вирус SARS-CoV-2, инактивированный нагреванием при температуре 56°С в течении 30 мин и разрушенный воздействием УЗ (в течение 1 минуты на ультразвуковом гомогенизаторе soniprep 150 Plus, MSE), наносили в лунки планшетов для иммуноферментного анализа в концентрации 10 мкг/мл в 100 мкл и адсорбировали ночь при температуре +4°С.At the first stage, the full-length protein S of the SARS-CoV-2 virus, or the SARS-CoV-2 virus, inactivated by heating at 56 ° C for 30 minutes and destroyed by ultrasound (within 1 minute on an ultrasonic homogenizer soniprep 150 Plus, MSE) was applied to the wells of plates for enzyme-linked immunosorbent assay at a concentration of 10 μg / ml in 100 μl and adsorbed overnight at + 4 ° C.
Таким образом, к началу эксперимента было подготовлено 3 планшета:Thus, 3 plates were prepared by the beginning of the experiment:
1. планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2 2 SEQ ID NO:2, являющийся частью разработанной тест-системы (пример 5);1. plate for enzyme immunoassay with adsorbed in the wells of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2
2. планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках полноразмерным белком S вируса SARS-CoV-2;2. plate for enzyme immunoassay with adsorbed in the wells full-length protein S of the SARS-CoV-2 virus;
3. планшет для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках вирусом SARS-CoV-2, инактивированным нагреванием и разрушенным с помощью ультразвука.3. plate for enzyme-linked immunosorbent assay with SARS-CoV-2 virus adsorbed in the wells, inactivated by heat and destroyed by ultrasound.
Затем подготовили рабочие растворы необходимые для анализа (тест-система пример 5).Then we prepared working solutions required for analysis (test system example 5).
Для приготовления рабочего раствора буфера для промывания планшетов концентрат промывочного буфера развести в 25 раз дистиллированной водой.To prepare the working buffer solution for plate washing, dilute the wash buffer concentrate 25 times with distilled water.
Для приготовления рабочего раствора конъюгата, конъюгат развести в 20 раз буфером для разведения и тщательно перемешать пипетированием (раствор готовили непосредственно перед использованием).To prepare a working solution of the conjugate, dilute the conjugate 20 times with dilution buffer and mix thoroughly by pipetting (the solution was prepared immediately before use).
Для приготовления рабочего хромоген-субстратного раствора к 1,0 мл раствора хромогена добавить 9,0 мл раствора субстрата и тщательно перемешать (раствор готовить непосредственно перед использованием, хранению не подлежит).To prepare a working chromogen-substrate solution, add 9.0 ml of a substrate solution to 1.0 ml of a chromogen solution and mix thoroughly (the solution must be prepared immediately before use, it cannot be stored).
Далее в лунки каждого из 3 планшетов нанесли:Further, in the wells of each of the 3 plates were applied:
1) положительный контроль, включающий инактивированный образец сыворотки крови человека, содержащий IgG к белку RBD коронавируса SARS-CoV-2 (тест-система, пример 5) в 2 повторах по 100 мкл;1) a positive control, including an inactivated human serum sample containing IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 coronavirus (test system, example 5) in 2 repetitions of 100 μl;
2) отрицательный контроль, представляющий собой инактивированный образец сыворотки крови человека, не содержащий IgG к белку RBD коронавируса SARS-CoV-2 (тест-система, пример 5) в 2 повторах по 100 мкл;2) a negative control, which is an inactivated human serum sample that does not contain IgG to the RBD protein of the SARS-CoV-2 coronavirus (test system, example 5) in 2 replicates of 100 μl each;
3) образцы сыворотки крови пациентов, которые перенесли заболевание, вызванное сезонным коронавирусом ОС43, но при этом не болели COVID-19 (10 образцов), разведенные в 200 раз в 2 повторах по 100 мкл.3) blood serum samples from patients who have suffered a disease caused by the seasonal coronavirus OS43, but did not have COVID-19 (10 samples), diluted 200 times in 2 repetitions of 100 μl.
Далее все планшеты заклеили пленкой и выдержали в течение 1 ч при температуре +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Then all the plates were sealed with a film and kept for 1 hour at a temperature of + 37 ° C with stirring at a speed of 300 rpm.
После окончания инкубации удалили жидкость из лунок и промыли планшеты 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов. Затем жидкость окончательно удалили и подсушили планшеты постукиванием по сложенной в несколько слоев фильтровальной бумаге.After the end of the incubation, the liquid was removed from the wells and the plates were washed 4 times with working buffer solution for plate washing. Then the liquid was finally removed and the plates were dried by tapping on filter paper folded in several layers.
Далее в каждую лунку внесли по 100 мкл рабочего раствора конъюгата моноклональных антител, планшеты закрыли липкой пленкой и инкубировали в течение 1 часа при температуре +37°С при перемешивании со скоростью 300 об/минуту.Then, 100 μl of the working solution of the conjugate of monoclonal antibodies was added to each well, the plates were covered with an adhesive film and incubated for 1 hour at a temperature of + 37 ° C with stirring at a speed of 300 rpm.
После окончания инкубации промыли планшеты 4 раза рабочим раствором буфера для промывания планшетов.After the end of the incubation, the plates were washed 4 times with the working solution of the plate washing buffer.
Затем в каждую лунку всех 3 планшетов внесли по 100 мкл хромоген-субстратного раствора и инкубировали в течение 15 минут в темном месте при температуре от 20°СThen, 100 μl of chromogen-substrate solution was added to each well of all 3 plates and incubated for 15 minutes in a dark place at a temperature of 20 ° C
После этого остановили реакцию добавлением в каждую лунку по 50 мкл стоп-реагента (1М раствор серной кислоты) и провели учет результатов на спектрофотометре в течение 10 мин после остановки реакции.After that, the reaction was stopped by adding 50 μl of stop reagent (1M sulfuric acid solution) to each well, and the results were recorded on a spectrophotometer within 10 minutes after stopping the reaction.
Далее измерили величину оптической плотности субстратной смеси на спектрофотометре с вертикальным лучом при длине волны 450 нм (А450) в течение 10 мин после остановки реакции.Next, the optical density of the substrate mixture was measured on a spectrophotometer with a vertical beam at a wavelength of 450 nm (A 450 ) within 10 minutes after stopping the reaction.
Вычислили среднее арифметическое значение оптической плотности отрицательного (А450К-) и положительного (А450К+) контролей для каждого планшета по формулам 1 и 2.Calculated the arithmetic mean of the optical density of the negative (A 450 K - ) and positive (A 450 K + ) controls for each plate according to
А450 К- ср=(А450 К- 1+А450А К- 2)/2 (1)A 450 K - cf = (A 450 K - 1 + A 450 A K - 2 ) / 2 (1)
гдеWhere
- А450 К- 1 - значение оптической плотности пробы 1 отрицательного контроля,- A 450 K - 1 - the optical density of the
- А450 К- 2 - значение оптической плотности пробы 2 отрицательного контроля.- A 450 K - 2 - the value of the optical density of the
А450 К+ ср=(А450 К+ 1+А450А К+ 2)/2 (2)A 450 K + sr = (A 450 K + 1 + A 450 A K + 2 ) / 2 (2)
гдеWhere
- А450 К+ 1 - значение оптической плотности пробы 1 положительного контроля,- A 450 K + 1 - the optical density of the
- А450 К+ 2 - значение оптической плотности пробы 2 положительного контроля.- A 450 K + 2 - the optical density of the
Вычислили среднее значение А450 для каждой опытной пробы (А450ОПср) по формуле 3:Calculated the average A 450 for each test sample (A 450 OP cf ) according to the formula 3:
А450ОПср=(А450ОП1+А450ОП2)/2 (3)A 450 OP av = (A 450 OP 1 + A 450 OP 2 ) / 2 (3)
гдеWhere
- А450 ОП1 - значение оптической плотности пробы 1,- A 450 OP 1 - the value of the optical density of the
- А450 ОП2 - значение оптической плотности пробы 2. - A 450 OP 2 - the value of the optical density of the
Для интерпретации результатов вычислили отсекающие значения оптической плотности А450 (Cut off).To interpret the results, the cutoff values of the absorbance A 450 (Cut off) were calculated.
Значение Cut off вычислили по формуле:The Cut off value was calculated by the formula:
Cut off=А450К- ср+3 х SD А450К-,Cut off = A 450 K - Wed +3 x SD A 450 K - ,
гдеWhere
- SD А450К- - среднеквадратичное отклонение значений оптической плотности отрицательного контроля.- SD А 450 К - is the standard deviation of the optical density values of the negative control.
Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считался положительным, если А450ОПср выше, чем значение Cut off в 2,5 раза.The analyzed serum or blood plasma sample was considered positive if A 450 OD cp is 2.5 times higher than the Cut off value.
Для планшета с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2 2 SEQ ID NO:2:For the plate with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2
Среднее значение оптической плотности в лунках с положительным контролем (А450К+ ср) составило 1,960.The mean optical density in the positive control wells (A 450 K + cf ) was 1.960.
Среднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем (А450К- ср) составило 0,052.The average optical density in the wells with negative control (A 450 K - cf. ) was 0.052.
Средние значения оптической плотности позволяют говорить о том, что исследование прошло успешно и его результаты достоверны.The average values of optical density allow us to say that the study was successful and its results are reliable.
Значение Cut off составляет:Cut off value is:
Cut off=0,052+3 х 0,0000125=0,052038Cut off = 0.052 + 3 x 0.0000125 = 0.052038
В данном тесте исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считался положительным, если А450ОПср было выше, чем значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,052038=0,13).In this test, the studied serum or plasma sample was considered positive if A 450 OD cp was 2.5 times higher than the Cut off value (2.5 * 0.052038 = 0.13).
Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считается отрицательным, если А450ОПср не превышало значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,052038=0,13).A test serum or blood plasma sample is considered negative if A 450 OD cf did not exceed the Cut off value by 2.5 times (2.5 * 0.052038 = 0.13).
Для планшета с адсорбированным в лунках полноразмерным белком S вируса SARS-CoV-2:For a plate with SARS-CoV-2 full-length protein S adsorbed in the wells:
Среднее значение оптической плотности в лунках с положительным контролем (А450К+ ср) составило 2,008.The mean optical density in the positive control wells (A 450 K + cf ) was 2.008.
Среднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем (А450К- ср) составило 0,064.The average optical density in the wells with negative control (A 450 K - cf. ) was 0.064.
Средние значения оптической плотности позволяют говорить о том, что исследование прошло успешно и его результаты достоверны.The average values of optical density allow us to say that the study was successful and its results are reliable.
Значение Cut off составляет:Cut off value is:
Cut off=0,064+3 х 0,0001805=0,064542Cut off = 0.064 + 3 x 0.0001805 = 0.064542
В данном тесте исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считался положительным, если А450ОПср было выше, чем значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,064542=0,16).In this test, the studied serum or plasma sample was considered positive if A 450 OD cp was 2.5 times higher than the Cut off value (2.5 * 0.064542 = 0.16).
Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считается отрицательным, если А450ОПср не превышало значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,064542=0,16).The test sample of serum or blood plasma is considered negative if A 450 OD cf did not exceed the Cut off value by 2.5 times (2.5 * 0.064542 = 0.16).
Для планшета с адсорбированным в лунках вирусом SARS-CoV-2, инактивированным нагреванием и разрушенным с помощью ультразвука:For a plate with SARS-CoV-2 virus adsorbed in wells, inactivated by heat and destroyed by ultrasound:
Среднее значение оптической плотности в лунках с положительным контролем (А450К+ ср) составило 2,081The average optical density in the wells with a positive control (A 450 K + cf ) was 2.081
Среднее значение оптической плотности в лунках с отрицательным контролем (А450К- ср) составило 0,061.The average optical density in the wells with negative control (A 450 K - cf. ) was 0.061.
Средние значения оптической плотности позволяют говорить о том, что исследование прошло успешно и его результаты достоверны.The average values of optical density allow us to say that the study was successful and its results are reliable.
Значение Cut off составляет:Cut off value is:
Cut off=0,061+3 х 0,0001325=0,0613975.Cut off = 0.061 + 3 x 0.0001325 = 0.0613975.
В данном тесте исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считался положительным, если А450ОПср было выше, чем значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,0613975=0,15).In this test, the studied serum or plasma sample was considered positive if A 450 OD cf was 2.5 times higher than the Cut off value (2.5 * 0.0613975 = 0.15).
Исследуемый образец сыворотки или плазмы крови считается отрицательным, если А450ОПср не превышало значение Cut off в 2,5 раза (2,5*0,0613975=0,15).The test serum or blood plasma sample is considered negative if A 450 OD cf did not exceed the Cut off value by 2.5 times (2.5 * 0.0613975 = 0.15).
Полученные результаты представлены в таблице 4.The results are shown in Table 4.
Таблица 4. Средняя оптическая плотность опытных и контрольных образцов, полученная в результате проведения сравнительного анализа тест-систем для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека с различными вариантами адсорбированных белков коронавируса по их способности неспецифически определять антитела против сезонного коронавируса человека ОС43.Table 4. Average optical density of experimental and control samples obtained as a result of comparative analysis of test systems for enzyme immunoassay of human serum or plasma with different variants of adsorbed coronavirus proteins by their ability to nonspecifically detect antibodies against seasonal human coronavirus OC43.
Таблица 4Table 4
Неожиданно было выявлено, что использование разработанной тест-системы для иммуноферментного анализа с адсорбированным в лунках рекомбинантным белком RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2 (тест-система по примеру 5) для анализа сыворотки и плазмы крови человека на наличие антител к вирусу SARS-CoV-2 не дает ложноположительных результатов у пациентов перенесших заболевание, вызванное сезонным коронавирусом человека ОС43, тогда как при использовании тест-системы для иммуноферментного анализа сыворотки и плазмы крови человека с адсорбированным в лунках полноразмерным белком S наблюдалось 30% ложноположительных результатов, а при использовании тест-системы для иммуноферментного анализа сыворотки и плазмы крови человека с адсорбированным в лунках вирусом SARS-CoV-2, инактивированным нагреванием и разрушенным с помощью ультразвука наблюдалось 50% ложноположительных результатов.It was unexpectedly found that the use of the developed test system for enzyme-linked immunosorbent assay with the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus SEQ ID NO: 2 (test system according to example 5) adsorbed in the wells for the analysis of human serum and plasma for the presence of antibodies to the SARS-CoV-2 virus does not give false positive results in patients who have undergone a disease caused by the seasonal human coronavirus OC43, whereas when using a test system for enzyme immunoassay of human serum and plasma with full-size protein S adsorbed in the wells, 30% of false-positive results were observed, and when using a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human serum and blood plasma with SARS-CoV-2 virus adsorbed in the wells, inactivated by heating and destroyed by ultrasound, 50% of false positive results were observed.
Результаты проведенного исследования можно объяснить тем, что полученный авторами рекомбинантный белок RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2 имеет низкий процент гомологии с вирус-связывающим доменом белка S вируса ОС43. Таким образом, использование рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 SEQ ID NO:2 (по сравнению с полноразмерным белком S вируса SARS-CoV-2 или разрушенным вирусом SARS-CoV-2) в тест-системе для иммуноферментного анализа сыворотки и плазмы крови человека для определения антител к вирусу SARS-CoV-2 приведет к получению более точных и достоверных результатов.The results of the study can be explained by the fact that the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus SEQ ID NO: 2 obtained by the authors has a low percentage of homology with the virus-binding domain of the OC43 virus S protein. Thus, the use of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus SEQ ID NO: 2 (compared to the full-length protein S of the SARS-CoV-2 virus or the destroyed SARS-CoV-2 virus) in the test system for enzyme immunoassay of serum and plasma human blood for the determination of antibodies to the SARS-CoV-2 virus will lead to more accurate and reliable results.
Пример 9. Оценка результатов, полученных при использовании тест-системы для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека в различных экспериментальных условиях.Example 9. Evaluation of the results obtained when using the test system for enzyme immunoassay of human serum or plasma in various experimental conditions.
В данном исследовании использовали тест-систему для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека (пример 5), в качестве исследуемого образца выбрали плазму крови человека с известным титром антител против белка RBD вируса SARS-CoV-2 (1:512). Была проведена серия экспериментов, в которых анализ титра антител против белка RBD вируса SARS-CoV-2 проводился по протоколу, описанному в примере 7, за исключением 1 параметра, который был изменен.In this study, we used a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human serum or plasma (example 5); as a test sample, we chose human blood plasma with a known titer of antibodies against the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus (1: 512). A series of experiments was carried out in which the analysis of the antibody titer against the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus was carried out according to the protocol described in example 7, with the exception of 1 parameter, which was changed.
Эксперимент №1. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7 (контроль).
Эксперимент №2. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +36°С.
Эксперимент №3. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +38°С.
Эксперимент №4. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации с конъюгатом, которая составила +36°С.
Эксперимент №5. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации с конъюгатом, которая составила +38°С.Experiment # 5. The study was performed according to the protocol described in example 7, except for the incubation temperature with the conjugate, which was + 38 ° C.
Эксперимент №6. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации с хромогеном, которая составила +15°С.Experiment # 6. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the incubation temperature with the chromogen, which was + 15 ° C.
Эксперимент №7. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +25°С.Experiment # 7. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the incubation temperature of the test samples, which was + 25 ° C.
Эксперимент №8. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме скорости перемешивания при инкубации исследуемых образцов, которая составила 250 оборотов/минуту.Experiment # 8. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the stirring speed during incubation of the test samples, which was 250 rpm.
Эксперимент №9. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме скорости перемешивания при инкубации исследуемых образцов, которая составила 350 оборотов/минуту.Experiment # 9. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the stirring speed during incubation of the test samples, which was 350 rpm.
Эксперимент №10. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме скорости перемешивания при инкубации с конъюгатом, которая составила 250 оборотов/минуту.Experiment # 10. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the stirring speed during incubation with the conjugate, which was 250 rpm.
Эксперимент №11. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 7, кроме скорости перемешивания при инкубации с конъюгатом, которая составила 350 оборотов/минуту.Experiment 11. The study was carried out according to the protocol described in example 7, except for the stirring speed during incubation with the conjugate, which was 350 rpm.
Полученные результаты представлены в таблице 5.The results are shown in Table 5.
Таблица 5. Титр антител к белку RBD вируса SARS-CoV-2, полученный в экспериментах №1-11Table 5. The titer of antibodies to the RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, obtained in experiments No. 1-11
IgG к
белку
RBDTiter
IgG to
squirrel
RBD
Как видно из представленных данных, изменение температуры, скорости перемешивания при инкубации с исследуемыми образцами и антителами, а также температуры при инкубации с хромогеном в указанном диапазоне значений, не влияет на полученный результат.As can be seen from the presented data, a change in temperature, stirring rate during incubation with the test samples and antibodies, as well as temperature during incubation with a chromogen in the specified range of values, does not affect the result obtained.
Кроме того, была проведена серия экспериментов, в котором разработанная тест система (пример 5) использовалась для анализа сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для отбора образцов, наиболее перспективных для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2. Эксперименты проводили по протоколу, описанному в примере 6, за исключением 1 параметра, который был изменен.In addition, a series of experiments was carried out in which the developed test system (example 5) was used to analyze the serum or blood plasma of COVID-19 convalescents to select samples that are most promising for the therapy of patients infected with SARS-CoV-2. The experiments were carried out according to the protocol described in example 6, with the exception of 1 parameter, which was changed.
Эксперимент №12. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6 (контроль).Experiment # 12. The study was carried out according to the protocol described in example 6 (control).
Эксперимент №13. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +36°С.Experiment 13. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature of the test samples, which was + 36 ° C.
Эксперимент №14. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +38°С.Experiment # 14. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature of the test samples, which was + 38 ° C.
Эксперимент №15. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации с конъюгатом, которая составила +36°С.Experiment 15. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature with the conjugate, which was + 36 ° C.
Эксперимент №16. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации с конъюгатом, которая составила +38°С.Experiment # 16. The study was performed according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature with the conjugate, which was + 38 ° C.
Эксперимент №17. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации с хромогеном, которая составила +15°С.Experiment # 17. The study was performed according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature with the chromogen, which was + 15 ° C.
Эксперимент №18. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме температуры инкубации исследуемых образцов, которая составила +25°С.Experiment # 18. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the incubation temperature of the test samples, which was + 25 ° C.
Эксперимент №19. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме скорости перемешивания при инкубации исследуемых образцов, которая составила 250 оборотов/минуту.Experiment # 19. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the stirring speed during incubation of the test samples, which was 250 rpm.
Эксперимент №20. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме скорости перемешивания при инкубации исследуемых образцов, которая составила 350 оборотов/минуту.Experiment # 20. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the stirring speed during incubation of the test samples, which was 350 rpm.
Эксперимент №21. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме скорости перемешивания при инкубации с конъюгатом, которая составила 250 оборотов/минуту.Experiment # 21. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the stirring speed during incubation with the conjugate, which was 250 rpm.
Эксперимент №22. Исследование выполнено по протоколу, описанному в примере 6, кроме скорости перемешивания при инкубации с конъюгатом, которая составила 350 оборотов/минуту.Experiment # 22. The study was carried out according to the protocol described in example 6, except for the stirring speed during incubation with the conjugate, which was 350 rpm.
Полученные результаты представлены в таблице 6.The results are shown in Table 6.
Таблица 6. Среднее значение оптической плотности опытного образца (A450ОПср) при длине волны 450 нм, полученное в серии экспериментов №12-22Table 6. The average value of the optical density of the test sample (A 450 OD av ) at a wavelength of 450 nm, obtained in a series of experiments No. 12-22
Как видно из представленных данных, изменение температуры, скорости перемешивания при инкубации с исследуемыми образцами и антителами, а также температуры при инкубации с хромогеном в указанном диапазоне значений, не влияет на полученный результат. А время проведения анализ составляет 2,5 часа.As can be seen from the presented data, a change in temperature, stirring rate during incubation with the test samples and antibodies, as well as temperature during incubation with a chromogen in the specified range of values, does not affect the result obtained. And the analysis time is 2.5 hours.
Таким образом, разработаны генетическая конструкция для экспрессии рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, штамм клеток яичника китайского хомячка CHO-S-RBD, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2 и способ его получения, а также тест-система для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека, которая позволяет быстро и эффективно проводить тест для определения наиболее перспективных образцов сыворотки или плазмы крови реконвалесцентов COVID-19 для терапии пациентов, инфицированных SARS-CoV-2.Thus, a genetic construct has been developed for the expression of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus, the Chinese hamster ovary cell strain CHO-S-RBD, the producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus and a method for its production, as well as a test system for an enzyme-linked immunosorbent assay for human serum or plasma, which allows a quick and effective test to determine the most promising serum or plasma samples of COVID-19 convalescents for the treatment of patients infected with SARS-CoV-2.
--->--->
Перечень последовательностейSequence listing
SEQ ID NO:1SEQ ID NO: 1
<110> ФГБУ "НИЦЭМ им. Н.Ф.Гамалеи" Минздрава России<110> FGBU "NITsEM named after N.F. Gamaleya" of the Ministry of Health of Russia
<120> Способ получения штамма клеток яичника китайского хомячка, продуцента<120> Method for producing a Chinese hamster ovary cell strain, producer
рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, штамм клеток яичникаrecombinant protein RBD of SARS-CoV-2 virus, ovarian cell strain
китайского хомячка, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2,Chinese hamster, producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus,
способ получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, тест-системаmethod for producing recombinant RBD protein of SARS-CoV-2 virus, test system
для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека и ееfor enzyme immunoassay of human serum or plasma and its
применениеapplication
<160> 1<160> 1
<170> BISSAP1.3.6<170> BISSAP1.3.6
<210> 1<210> 1
<211> 765<211> 765
<212> DNA<212> DNA
<213> SARS-CoV-2<213> SARS-CoV-2
<400> 1<400> 1
atgggctgga gcttgatcct tctgttcctg gttgctgtgg ccaccagagt gctgtctcgg 60atgggctgga gcttgatcct tctgttcctg gttgctgtgg ccaccagagt gctgtctcgg 60
gtgcagccca ccgaatccat cgtgcggttc cccaatatca ccaatctgtg ccccttcggc 120gtgcagccca ccgaatccat cgtgcggttc cccaatatca ccaatctgtg ccccttcggc 120
gaggtgttca atgccaccag attcgcctct gtgtacgcct ggaaccggaa gcggatcagc 180gaggtgttca atgccaccag attcgcctct gtgtacgcct ggaaccggaa gcggatcagc 180
aattgcgtgg ccgactactc cgtgctgtac aactccgcca gcttcagcac cttcaagtgc 240aattgcgtgg ccgactactc cgtgctgtac aactccgcca gcttcagcac cttcaagtgc 240
tacggcgtgt cccctaccaa gctgaacgac ctgtgcttca caaacgtgta cgccgacagc 300tacggcgtgt cccctaccaa gctgaacgac ctgtgcttca caaacgtgta cgccgacagc 300
ttcgtgatcc ggggagatga agtgcggcag attgcccctg gacagacagg caagatcgcc 360ttcgtgatcc ggggagatga agtgcggcag attgcccctg gacagacagg caagatcgcc 360
gactacaact acaagctgcc cgacgacttc accggctgtg tgattgcctg gaacagcaac 420gactacaact acaagctgcc cgacgacttc accggctgtg tgattgcctg gaacagcaac 420
aacctggact ccaaagtcgg cggcaactac aattacctgt accggctgtt ccggaagtcc 480aacctggact ccaaagtcgg cggcaactac aattacctgt accggctgtt ccggaagtcc 480
aatctgaagc ccttcgagcg ggacatctcc accgagatct atcaggccgg cagcacccct 540aatctgaagc ccttcgagcg ggacatctcc accgagatct atcaggccgg cagcacccct 540
tgtaacggcg tggaaggctt caactgctac ttcccactgc agtcctacgg ctttcagccc 600tgtaacggcg tggaaggctt caactgctac ttcccactgc agtcctacgg ctttcagccc 600
acaaatggcg tgggctatca gccctacaga gtggtggtgc tgagcttcga actgctgcat 660acaaatggcg tgggctatca gccctacaga gtggtggtgc tgagcttcga actgctgcat 660
gcccctgcca cagtgtgcgg ccctaagaaa agcaccaatc tcgtgaagaa caaatgcgtg 720gcccctgcca cagtgtgcgg ccctaagaaa agcaccaatc tcgtgaagaa caaatgcgtg 720
aacttcgcgg ccgcacatca ccaccatcac catcatcatt gataa 765aacttcgcgg ccgcacatca ccaccatcac catcatcatt gataa 765
SEQ ID NO:2SEQ ID NO: 2
<110> ФГБУ "НИЦЭМ им. Н.Ф.Гамалеи" Минздрава России<110> FGBU "NITsEM named after N.F. Gamaleya" of the Ministry of Health of Russia
<120> Способ получения штамма клеток яичника китайского хомячка, продуцента<120> Method for producing a Chinese hamster ovary cell strain, producer
рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, штамм клеток яичникаrecombinant protein RBD of SARS-CoV-2 virus, ovarian cell strain
китайского хомячка, продуцент рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2,Chinese hamster, producer of the recombinant RBD protein of the SARS-CoV-2 virus,
способ получения рекомбинантного белка RBD вируса SARS-CoV-2, тест-системаmethod for producing recombinant RBD protein of SARS-CoV-2 virus, test system
для иммуноферментного анализа сыворотки или плазмы крови человека и ееfor enzyme immunoassay of human serum or plasma and its
применениеapplication
<160> 1<160> 1
<170> BISSAP1.3.6<170> BISSAP1.3.6
<210> 2<210> 2
<211> 229<211> 229
<212> PRT<212> PRT
<213> SARS-CoV-2<213> SARS-CoV-2
<400> 2<400> 2
Arg Val Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr Asn Arg Val Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr Asn
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala Ser Val Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala Ser Val
20 25 30 20 25 30
Tyr Ala Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr Ser Tyr Ala Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr Ser
35 40 45 35 40 45
Val Leu Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly Val Val Leu Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly Val
50 55 60 50 55 60
Ser Pro Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn Val Tyr Ala Asp Ser Pro Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn Val Tyr Ala Asp
65 70 75 80 65 70 75 80
Ser Phe Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly Gln Ser Phe Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly Gln
85 90 95 85 90 95
Thr Gly Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro Asp Asp Phe Thr Thr Gly Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro Asp Asp Phe Thr
100 105 110 100 105 110
Gly Cys Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys Val Gly Gly Cys Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys Val Gly
115 120 125 115 120 125
Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn Leu Lys Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn Leu Lys
130 135 140 130 135 140
Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly Ser Thr Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly Ser Thr
145 150 155 160 145 150 155 160
Pro Cys Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu Gln Ser Pro Cys Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu Gln Ser
165 170 175 165 170 175
Tyr Gly Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val Tyr Gly Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val
180 185 190 180 185 190
Val Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly Val Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly
195 200 205 195 200 205
Pro Lys Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys Val Asn Phe His Pro Lys Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys Val Asn Phe His
210 215 220 210 215 220
His His His His His His His His His His
225 225
<---<---
Claims (55)
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2020116437A RU2723008C9 (en) | 2020-05-19 | 2020-05-19 | Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use |
| PCT/RU2021/000295 WO2021246910A1 (en) | 2020-05-19 | 2021-07-09 | Sars-cov-2 virus rbd recombinant protein and method for producing same |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2020116437A RU2723008C9 (en) | 2020-05-19 | 2020-05-19 | Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2723008C1 RU2723008C1 (en) | 2020-06-08 |
| RU2723008C9 true RU2723008C9 (en) | 2021-02-09 |
Family
ID=71067974
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2020116437A RU2723008C9 (en) | 2020-05-19 | 2020-05-19 | Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2723008C9 (en) |
| WO (1) | WO2021246910A1 (en) |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2023128813A1 (en) * | 2021-12-30 | 2023-07-06 | Общество с ограниченной ответственностью "Бетувакс" | Antigens for inducing immunity against the sars-cov-2 virus and gene constructs for the expression thereof |
| RU2802825C2 (en) * | 2021-12-30 | 2023-09-04 | Общество с ограниченной ответственностью "Бетувакс" | Gene construct for the expression of recombinant proteins based on the segment of the sars-cov-2 s-protein, including rbd and sd1, fused with the fc fragment of igg, a method of obtaining recombinant proteins, antigens and antigenic compositions for the induction of long-term antibody and cellular immunity against sars-co-2 |
Families Citing this family (30)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN113801206B (en) * | 2020-06-15 | 2024-07-02 | 上海市公共卫生临床中心 | Method for inducing anti-new coronavirus neutralizing antibodies using receptor recognition domain |
| CN111733141B (en) * | 2020-06-19 | 2022-02-18 | 清华大学深圳国际研究生院 | Hybridoma cell capable of secreting monoclonal antibody against novel coronavirus N protein, monoclonal antibody and application |
| CN111732655B (en) * | 2020-07-01 | 2021-10-22 | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 | A fully human monoclonal antibody targeting RBD with high neutralizing activity against SARS-CoV-2 and its application |
| WO2022000845A1 (en) * | 2020-07-01 | 2022-01-06 | 江苏省疾病预防控制中心(江苏省公共卫生研究院) | Recombinant protein vaccine for preventing sars-cov-2 and preparation method therefor |
| RU2730897C1 (en) * | 2020-07-01 | 2020-08-26 | Федеральное государственное бюджетное учреждение науки институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) | Method of using recombinant proteins sars-cov-2 as part of a test system for elisa test with determining igm, igg, iga class antibody levels in blood serum/plasma of covid-19 patients |
| CN111978394B (en) * | 2020-07-13 | 2021-05-11 | 珠海龄值生物科技有限公司 | Preparation method of polyclonal preparation for COVID-19 patient specific immunotherapy |
| RU2746520C1 (en) * | 2020-07-27 | 2021-04-14 | Дмитрий Сергеевич Цопов | Determination of von willebrand factor activity as method for laboratory diagnosis of severity of sars-cov-2 infection |
| RU2733832C1 (en) * | 2020-07-28 | 2020-10-07 | Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) | Artificial gene stbl_rbd_trm_sc2, coding a bicistronic structure formed by the sars-cov-2 coronavirus glycoprotein s receptor-binding domain sequences, transmembrane region, p2a-peptide and glycoprotein g vsv, recombinant plasmid pstem-rvsv-stbl_rbd_trm_sc2, providing expression of artificial gene, and a recombinant strain of vesicular stomatitis virus rvsv-stbl_rbd_trm_sc2, used to create a vaccine against sars-cov-2 coronavirus |
| RU2733834C1 (en) * | 2020-07-28 | 2020-10-07 | Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) | Artificial ectos_sc2 gene encoding an ectodomain of the sars-cov-2 coronavirus s glycoprotein with a c-terminal trimerization domain, a recombinant plasmid pstem-rvsv-ectos_sc2, which provides expression of the artificial gene, and a recombinant strain of vesicular stomatitis virus rvsv-ectos_sc2, used to create a vaccine against sars-cov-2 coronavirus |
| EP4198043A1 (en) * | 2020-08-14 | 2023-06-21 | Instituto Butantan | Method for producing an antigen corresponding to the inactivated sars-cov-2 virus, antigen corresponding to the inactivated sars-cov-2 virus, antigenic composition, kits, and uses thereof |
| CN111925440B (en) * | 2020-08-19 | 2022-09-09 | 重庆医科大学 | New coronavirus RBD specific monoclonal antibody and application |
| CN115925899B (en) * | 2020-08-19 | 2025-01-28 | 重庆医科大学 | Novel coronavirus RBD-specific monoclonal antibodies and their applications |
| CN117069832B (en) * | 2020-08-19 | 2024-08-20 | 重庆医科大学 | New coronavirus RBD specific monoclonal antibody and application |
| CN114933650B (en) * | 2020-08-19 | 2025-01-24 | 重庆医科大学 | Novel coronavirus RBD-specific monoclonal antibodies and their applications |
| CN114920833B (en) * | 2020-08-19 | 2023-10-17 | 重庆医科大学 | New coronavirus RBD specific monoclonal antibody and application |
| CN111925442B (en) * | 2020-08-19 | 2022-10-11 | 重庆医科大学 | New coronavirus RBD specific monoclonal antibody and application |
| CN115925897B (en) * | 2020-08-19 | 2024-11-15 | 重庆医科大学 | Novel coronavirus RBD specific monoclonal antibody and application |
| CN111925439A (en) * | 2020-08-19 | 2020-11-13 | 重庆医科大学 | Method for rapidly screening new coronavirus RBD (radial basis function) specific fully human neutralizing monoclonal antibody |
| CN115304671B (en) * | 2020-08-19 | 2023-10-17 | 重庆医科大学 | New coronavirus RBD-specific monoclonal antibodies and their applications |
| CN117003862B (en) * | 2020-08-19 | 2024-08-20 | 重庆医科大学 | SARS-CoV-2 RBD-specific monoclonal antibodies and their applications |
| AU2021331947A1 (en) * | 2020-08-28 | 2023-05-04 | Joint Stock Company "Biocad" | Aav5-based vaccine against sars-cov-2 |
| CN112666348A (en) * | 2020-10-27 | 2021-04-16 | 山西高等创新研究院 | Detection proteome of novel coronavirus SARS-CoV-2 and application thereof |
| RU2760301C1 (en) * | 2020-12-21 | 2021-11-23 | Закрытое Акционерное Общество "Биокад" | Aav5-based vaccine for induction of specific immunity to sars-cov-2 virus and/or prevention of coronavirus infection caused by sars-cov-2 |
| CN113030483B (en) * | 2021-02-25 | 2024-04-02 | 山东省大健康精准医疗产业技术研究院 | Novel coronavirus neutralizing antibody ELISA detection kit and application thereof |
| RU2760090C1 (en) * | 2021-03-15 | 2021-11-22 | Зубейда Маратовна Мирхайдарова | Method for treating postcovid syndrome by alloplant biomaterial |
| RU2752862C1 (en) * | 2021-04-09 | 2021-08-11 | Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) | Strain of hcov-19/russia/omsk-202118-1707/2020 of sars-cov-2 coronavirus, immunosorbent containing purified whole virion antigen obtained on basis of specified strain and isa test system for detecting antibodies of classes m, g and a to sars coronavirus-cov-2 using specified immunosorbent |
| CN114057894B (en) * | 2021-06-18 | 2022-08-05 | 国药中生生物技术研究院有限公司 | Novel recombinant coronavirus RBD trimer protein vaccine capable of generating broad-spectrum cross-neutralization activity, and preparation method and application thereof |
| RU2754930C1 (en) * | 2021-07-05 | 2021-09-08 | Общество с ограниченной ответственностью "Эс Джи" | Recombinant plasmid pvnv-gl-rbdind, providing synthesis and secretion of recombinant receptor-binding domain (rbd) of sars-cov-2 coronavirus line b.1.617 in mammalian cells |
| RU2761879C1 (en) * | 2021-07-27 | 2021-12-13 | Закрытое Акционерное Общество "Биокад" | VACCINE BASED ON AAV5 FOR THE INDUCTION OF SPECIFIC IMMUNITY TO THE SARS-CoV-2 VIRUS AND/OR THE PREVENTION OF CORONAVIRUS INFECTION CAUSED BY SARS-CoV-2 |
| CN119677767A (en) * | 2022-06-10 | 2025-03-21 | 别图瓦克斯股份公司 | Hybrid genes for producing recombinant RBD antigens |
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2253870C1 (en) * | 2004-04-26 | 2005-06-10 | Общество с ограниченной ответственностью Научно-производственное объединение "Диагностические системы" | Recombinant proteins containing diagnosis significant coronavirus protein antigen epitope (sars-cov), assosiated with grievous acute respiratory syndrome, and sequences of synthetic genes encoding sars-cov |
| US20170096455A1 (en) * | 2014-03-20 | 2017-04-06 | The University Of North Carolina At Chapel Hill | Methods and compositions for chimeric coronavirus spike proteins |
| CN106928326B (en) * | 2015-12-31 | 2019-12-24 | 中国科学院微生物研究所 | A coronavirus vaccine based on dimerized receptor binding domain subunits |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN1884303A (en) * | 2005-06-20 | 2006-12-27 | 中国医学科学院基础医学研究所 | SARS-CoV virus structural protein infusion protein and its high yield expression and purification and uses |
| RU2325655C9 (en) * | 2006-08-10 | 2008-11-27 | Общество с ограниченной ответственностью Научно-производственное объединение "Диагностические системы" | Immune-enzyme test system for hepatitis b virus surface antigen detection and method of hepatitis b virus surface antigen detection |
| RU2615447C1 (en) * | 2015-11-13 | 2017-04-04 | Федеральное государственное унитарное предприятие "Государственный научно-исследовательский институт особо чистых биопрепаратов" Федерального медико-биологического агентства | Human interleukin-7 encoding synthetic dna, expression vector containing this dna (versions), human interleukin-7 producing strain, and method for human interleukin-7 production |
| CN111088283B (en) * | 2020-03-20 | 2020-06-23 | 苏州奥特铭医药科技有限公司 | mVSV viral vector, viral vector vaccine thereof and mVSV-mediated novel coronary pneumonia vaccine |
-
2020
- 2020-05-19 RU RU2020116437A patent/RU2723008C9/en active
-
2021
- 2021-07-09 WO PCT/RU2021/000295 patent/WO2021246910A1/en not_active Ceased
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2253870C1 (en) * | 2004-04-26 | 2005-06-10 | Общество с ограниченной ответственностью Научно-производственное объединение "Диагностические системы" | Recombinant proteins containing diagnosis significant coronavirus protein antigen epitope (sars-cov), assosiated with grievous acute respiratory syndrome, and sequences of synthetic genes encoding sars-cov |
| US20170096455A1 (en) * | 2014-03-20 | 2017-04-06 | The University Of North Carolina At Chapel Hill | Methods and compositions for chimeric coronavirus spike proteins |
| CN106928326B (en) * | 2015-12-31 | 2019-12-24 | 中国科学院微生物研究所 | A coronavirus vaccine based on dimerized receptor binding domain subunits |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2023128813A1 (en) * | 2021-12-30 | 2023-07-06 | Общество с ограниченной ответственностью "Бетувакс" | Antigens for inducing immunity against the sars-cov-2 virus and gene constructs for the expression thereof |
| RU2802825C2 (en) * | 2021-12-30 | 2023-09-04 | Общество с ограниченной ответственностью "Бетувакс" | Gene construct for the expression of recombinant proteins based on the segment of the sars-cov-2 s-protein, including rbd and sd1, fused with the fc fragment of igg, a method of obtaining recombinant proteins, antigens and antigenic compositions for the induction of long-term antibody and cellular immunity against sars-co-2 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2021246910A8 (en) | 2022-02-03 |
| RU2723008C1 (en) | 2020-06-08 |
| WO2021246910A1 (en) | 2021-12-09 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2723008C9 (en) | Method for producing chinese hamster ovary cell strain, producer of sars-cov-2 virus recombinant rbd protein, chinese hamster ovary cell strain, producer of recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, method of producing recombinant rbd protein of sars-cov-2 virus, a test system for enzyme-linked immunosorbent assay of human blood serum or plasma and its use | |
| CN111781354B (en) | Novel coronavirus neutralizing antibody titer detection ELISA kit | |
| CN113009154B (en) | Novel one-step method coronavirus neutralizing antibody magnetic microsphere detection kit and application thereof | |
| CN113009153B (en) | New coronavirus neutralizing antibody detection kit based on magnetic particle chemiluminescence and application thereof | |
| CN112409496B (en) | A fusion protein for transmembrane expression of novel coronavirus antigen S2, recombinant vector, recombinant dendritic cell and application thereof | |
| Figueiredo et al. | Evaluation of an enzyme-linked immunosorbent assay based on Araraquara virus recombinant nucleocapsid protein | |
| Rump et al. | Dual ELISA using SARS-CoV-2 nucleocapsid protein produced in E. coli and CHO cells reveals epitope masking by N-glycosylation | |
| CN113447651A (en) | Method and kit for screening inhibitor of SARS-CoV virus and its application | |
| CN112285348B (en) | Electrochemical luminescence immunoassay kit for antigen protein expressed by new coronavirus vaccine | |
| Hornsleth et al. | Detection of respiratory syncytial virus in nasopharyngeal secretions by ELISA: comparison with fluorescent antibody technique | |
| US9139617B2 (en) | Method for detecting antibody against SITH-1 in biological sample | |
| CN111896744B (en) | Goat echinococcus antibody ELISA detection kit and preparation method and application thereof | |
| CN113024640B (en) | Epitope peptide antigen detection neutralizing antibody kit based on screening of binding domain of RBD and ACE2 receptor of new coronavirus | |
| WO2021170090A1 (en) | Sars-cov-2 virus detection method and detection kit | |
| CN112300252B (en) | Prediction of 2019-nCoV coronavirus nucleocapsid protein epitope polypeptide and application of polypeptide in detection | |
| KR20080012449A (en) | SARS Diagnosis Using Nucleocapsid or Spike Proteins | |
| US7919256B2 (en) | Method for detecting Borna disease virus infection | |
| CN114371286A (en) | Kit for detecting neutralizing antibody of new coronavirus and preparation method thereof | |
| Li et al. | Development of a rapid neutralizing antibody test for SARS-CoV-2 and its application for neutralizing antibody screening and vaccinated serum testing | |
| Li et al. | The HIV-1 matrix protein p17 activates the transcription factors c-Myc and CREB in human B cells. | |
| CN119120482B (en) | Application of E3 ubiquitin ligase RNF181 gene expression inhibitor in preparation of medicines for preventing and/or treating HSV-1 virus infection | |
| CN110456078A (en) | Protein for detecting sheep MVV and the infectious diseases caused by it, its reagent and kit | |
| RU2838919C1 (en) | Recombinant plasmid dna pmbp-puuv_n, providing synthesis and secretion of fusion protein mbp-puuv_n in escherichia coli cells, strain escherichia coli krx/pmbp-puuv_n, producing said protein, used to produce recombinant protein puuv_n used for diagnosis of hemorrhagic fever with renal syndrome | |
| US20120129195A1 (en) | Method of quick laboratory diagnosis if illnesses based on the discovery of specific proteins and equipment for its implementation | |
| KR100264341B1 (en) | Acquired Immunodeficiency Virus Type I-10 Antigens |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| QB4A | Licence on use of patent |
Free format text: LICENCE FORMERLY AGREED ON 20200819 Effective date: 20200819 |
|
| TH4A | Reissue of patent specification | ||
| TC4A | Change in inventorship |
Effective date: 20210218 |