RU2712895C1 - Способ идентификации бактерий acinetobacter nosocomialis - Google Patents
Способ идентификации бактерий acinetobacter nosocomialis Download PDFInfo
- Publication number
- RU2712895C1 RU2712895C1 RU2019129885A RU2019129885A RU2712895C1 RU 2712895 C1 RU2712895 C1 RU 2712895C1 RU 2019129885 A RU2019129885 A RU 2019129885A RU 2019129885 A RU2019129885 A RU 2019129885A RU 2712895 C1 RU2712895 C1 RU 2712895C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- bacteria
- nosocomialis
- acinetobacter
- species
- urea
- Prior art date
Links
- 241001528221 Acinetobacter nosocomialis Species 0.000 title claims abstract description 39
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 31
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 title claims description 13
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims abstract description 23
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 20
- 108010046334 Urease Proteins 0.000 claims abstract description 20
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 claims abstract description 17
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract description 15
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims abstract description 12
- BELBBZDIHDAJOR-UHFFFAOYSA-N Phenolsulfonephthalein Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1C1(C=2C=CC(O)=CC=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 BELBBZDIHDAJOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 9
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 claims abstract description 7
- 238000011534 incubation Methods 0.000 claims abstract description 7
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 7
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 claims abstract description 6
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 claims abstract description 4
- 239000002609 medium Substances 0.000 claims description 33
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 17
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 14
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 claims description 13
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 claims description 13
- KIDHWZJUCRJVML-UHFFFAOYSA-N putrescine Chemical compound NCCCCN KIDHWZJUCRJVML-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- KQTIIICEAUMSDG-UHFFFAOYSA-N tricarballylic acid Chemical compound OC(=O)CC(C(O)=O)CC(O)=O KQTIIICEAUMSDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims description 9
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 7
- 229960002885 histidine Drugs 0.000 claims description 7
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 claims description 7
- 229960003531 phenolsulfonphthalein Drugs 0.000 claims description 7
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 claims description 6
- 239000005700 Putrescine Substances 0.000 claims description 6
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 6
- 239000008272 agar Substances 0.000 claims description 6
- 239000000463 material Substances 0.000 claims description 6
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N L-arginine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 5
- 229930064664 L-arginine Natural products 0.000 claims description 5
- 235000014852 L-arginine Nutrition 0.000 claims description 5
- 108090000913 Nitrate Reductases Proteins 0.000 claims description 5
- 239000012670 alkaline solution Substances 0.000 claims description 5
- 240000007651 Rubus glaucus Species 0.000 claims description 4
- 235000011034 Rubus glaucus Nutrition 0.000 claims description 4
- 235000009122 Rubus idaeus Nutrition 0.000 claims description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 claims description 4
- 230000001590 oxidative effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 claims description 3
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 claims description 3
- 235000011552 Rhamnus crocea Nutrition 0.000 claims description 2
- 241000759263 Ventia crocea Species 0.000 claims description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-HWQSCIPKSA-N L-arabinopyranose Chemical compound O[C@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-HWQSCIPKSA-N 0.000 claims 1
- 241000588626 Acinetobacter baumannii Species 0.000 abstract description 21
- 241000588624 Acinetobacter calcoaceticus Species 0.000 abstract description 14
- 239000007836 KH2PO4 Substances 0.000 abstract 1
- BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L disodium hydrogen phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].OP([O-])([O-])=O BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L 0.000 abstract 1
- 229910000397 disodium phosphate Inorganic materials 0.000 abstract 1
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 abstract 1
- GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M potassium dihydrogen phosphate Chemical compound [K+].OP(O)([O-])=O GNSKLFRGEWLPPA-UHFFFAOYSA-M 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 25
- 241000589291 Acinetobacter Species 0.000 description 10
- 238000001840 matrix-assisted laser desorption--ionisation time-of-flight mass spectrometry Methods 0.000 description 8
- 241000229113 Acinetobacter pittii Species 0.000 description 7
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 6
- 241000588772 Morganella morganii Species 0.000 description 6
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 6
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 6
- SRBFZHDQGSBBOR-SOOFDHNKSA-N D-ribopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 5
- 102000016938 Catalase Human genes 0.000 description 4
- 108010053835 Catalase Proteins 0.000 description 4
- NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N Histamine Chemical compound NCCC1=CN=CN1 NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- UCMIRNVEIXFBKS-UHFFFAOYSA-N beta-alanine Chemical compound NCCC(O)=O UCMIRNVEIXFBKS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 4
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 4
- JOOXCMJARBKPKM-UHFFFAOYSA-M 4-oxopentanoate Chemical compound CC(=O)CCC([O-])=O JOOXCMJARBKPKM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 3
- 229940018560 citraconate Drugs 0.000 description 3
- HNEGQIOMVPPMNR-IHWYPQMZSA-N citraconic acid Chemical compound OC(=O)C(/C)=C\C(O)=O HNEGQIOMVPPMNR-IHWYPQMZSA-N 0.000 description 3
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 3
- 229940058352 levulinate Drugs 0.000 description 3
- 238000000816 matrix-assisted laser desorption--ionisation Methods 0.000 description 3
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 3
- 101150090202 rpoB gene Proteins 0.000 description 3
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 3
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 3
- BJEPYKJPYRNKOW-UWTATZPHSA-N (R)-malic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-UWTATZPHSA-N 0.000 description 2
- WXTMDXOMEHJXQO-UHFFFAOYSA-N 2,5-dihydroxybenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC(O)=CC=C1O WXTMDXOMEHJXQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QDGAVODICPCDMU-UHFFFAOYSA-N 2-amino-3-[3-[bis(2-chloroethyl)amino]phenyl]propanoic acid Chemical compound OC(=O)C(N)CC1=CC=CC(N(CCCl)CCCl)=C1 QDGAVODICPCDMU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- -1 DL-4-aminobutyrate Chemical compound 0.000 description 2
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 2
- AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N L-Ornithine Chemical compound NCCC[C@H](N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-L L-tartrate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-L 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-M Lactate Chemical compound CC(O)C([O-])=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-L Malonate Chemical compound [O-]C(=O)CC([O-])=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- IPBVNPXQWQGGJP-UHFFFAOYSA-N acetic acid phenyl ester Natural products CC(=O)OC1=CC=CC=C1 IPBVNPXQWQGGJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N aldehydo-D-ribose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 230000000721 bacterilogical effect Effects 0.000 description 2
- 229940000635 beta-alanine Drugs 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 230000000747 cardiac effect Effects 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 239000012568 clinical material Substances 0.000 description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 2
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 2
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 2
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 2
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 2
- JFCQEDHGNNZCLN-UHFFFAOYSA-N glutaric acid Chemical compound OC(=O)CCCC(O)=O JFCQEDHGNNZCLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960001340 histamine Drugs 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 2
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 2
- 239000007793 ph indicator Substances 0.000 description 2
- 229940049953 phenylacetate Drugs 0.000 description 2
- WLJVXDMOQOGPHL-UHFFFAOYSA-N phenylacetic acid Chemical compound OC(=O)CC1=CC=CC=C1 WLJVXDMOQOGPHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 2
- 238000009331 sowing Methods 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 2
- SUUWYOYAXFUOLX-ZBRNBAAYSA-N (2s)-2-aminobutanedioic acid;(2s)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O.OC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N SUUWYOYAXFUOLX-ZBRNBAAYSA-N 0.000 description 1
- FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-M 4-hydroxybenzoate Chemical compound OC1=CC=C(C([O-])=O)C=C1 FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 235000005956 Cosmos caudatus Nutrition 0.000 description 1
- RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-M D-gluconate Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C([O-])=O RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-M 0.000 description 1
- 238000007399 DNA isolation Methods 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 206010018910 Haemolysis Diseases 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 229930195714 L-glutamate Natural products 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 239000004395 L-leucine Substances 0.000 description 1
- 235000019454 L-leucine Nutrition 0.000 description 1
- AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N Orn-delta-NH2 Natural products NCCCC(N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 239000005662 Paraffin oil Substances 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 239000008186 active pharmaceutical agent Substances 0.000 description 1
- WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-L adipate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCCCC([O-])=O WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 241001148470 aerobic bacillus Species 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940009098 aspartate Drugs 0.000 description 1
- 229940067597 azelate Drugs 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 229940050390 benzoate Drugs 0.000 description 1
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 239000006161 blood agar Substances 0.000 description 1
- 230000002490 cerebral effect Effects 0.000 description 1
- 210000004720 cerebrum Anatomy 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 229940001468 citrate Drugs 0.000 description 1
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 1
- 238000003795 desorption Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 description 1
- 229940114119 gentisate Drugs 0.000 description 1
- 230000008588 hemolysis Effects 0.000 description 1
- 239000012456 homogeneous solution Substances 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960003136 leucine Drugs 0.000 description 1
- 239000002075 main ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 239000007003 mineral medium Substances 0.000 description 1
- 238000007479 molecular analysis Methods 0.000 description 1
- 229940076266 morganella morganii Drugs 0.000 description 1
- 239000004570 mortar (masonry) Substances 0.000 description 1
- BDJRBEYXGGNYIS-UHFFFAOYSA-N nonanedioic acid Chemical compound OC(=O)CCCCCCCC(O)=O BDJRBEYXGGNYIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960003104 ornithine Drugs 0.000 description 1
- 229910052573 porcelain Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000001269 time-of-flight mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- GTZCVFVGUGFEME-HNQUOIGGSA-N trans-aconitic acid Chemical compound OC(=O)C\C(C(O)=O)=C/C(O)=O GTZCVFVGUGFEME-HNQUOIGGSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
- C12N1/205—Bacterial isolates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/04—Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Изобретение относится к биотехнологии. Способ идентификации бактерий Acinetobacter nosocomialis предусматривает предварительный отбор культуры бактерий для исследования с совокупностью фенотипических признаков комплекса Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii, посев ее в 0,1 мл среды, содержащей мочевину, Na2HPО4, КН2РО4, NaCl, 0,4% водно-щелочной раствор фенолового красного и дистиллированную воду в заданных соотношениях. Проводят аэробную инкубацию при 37°С в течение 3 ч с последующей идентификацией Acinetobacter nosocomialis по выявлению уреазы быстрой активности. Изобретение позволяет упростить способ и повысить точность идентификации бактерий A. nosocomialis. 2 табл., 1 пр.
Description
Изобретение относится к области биотехнологии. Может быть использовано при бактериологических исследованиях по идентификации бактерий комплекса Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii, включающего вид A. nosocomialis, а также в производстве питательных сред для этих исследований.
Известен способ идентификации видов рода Acinetobacter фенотипическими тестами (Gerner-Smidt P., Tjernberg I., Ursing J. Reliability of phenotypic tests for identification of Acinetobacter species. J. Clin. Microbiol. 1991, vol. 29, no.2; pp. 277-282. https://jim.asm.Org/content/jcm/29/2/277.full.pdf). Чистые культуры бактерий изучали тестами на рост при 30°С, 37°С, 41°С, 44°С в сердечно-мозговом бульоне (Дифко). Оксидацию глюкозы выявляли в пробирках со средой Хью-Лейфсона. Гидролиз желатина определяли в пробирках по классической методике. Гемолиз изучали на кровяном агаре с 5% крови овец и человека. Ассимиляционные тесты проводили в жидкой среде, содержащей минеральную основу и источник углерода в концентрации 0,1%. Использовали 18 источников углерода: DL-лактат, DL-4-аминобутират, транс-аконитат, цитрат, глутарат, аспартат, аделат, бета-аланин, L-гистидин, D-малат, малонат, гистамин, фенилацетат, L-фенилаланин, левулинат, цитраконат, 4-гидроксибензоат, L-тартрат. Все реакции учитывали визуально через 1-2 дня, тесты ассимиляции и гидролиз желатины до 6 суток. Далее штаммы идентифицировали по специальной компьютерной программе на соответствие определенному геновиду. Было установлено, что только у 78% штаммов (из 181 штаммов) правильно определен вид. Фенотипически правильно идентифицированы 10% штаммов геновида 1, 65% штаммов геновида 3; геновид 13 (ныне A.nosocomialis) ошибочно определен как другой геновид у 8 штаммов и не идентифицирован у остальных 7 штаммов. Геновиды 1, 2, 3, 13 имеют близкое фенотипическое сходство и их невозможно дифференцировать до вида. В связи с этим было предложено объединить геновиды 1, 2, 3, 13 в комплекс A. calcoaceticus - A. baumannii (комплекс АСВ) и завершать идентификацию ацинетобактеров в диагностических лабораториях выявлением этого комплекса.
Известен также способ фенотипической идентификации видов комплекса A. calcoaceticus - A. baumannii, в том числе A. nosocomialis (Nemec A., Krizova L., Maixnerova M., van der Reijden T.J.K., Deschaght P., Passet V., Vaneechoutte M., Brisse S., Dijkshoorn L. Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp.nov. (formerly Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp.nov. (formerly Acinetobacter genomic species 13 TU). Research in Microbiology. 2011, vol. 162, no.2; pp. 393-404. https://doi.org/l0.1016/j.resmic.2011.02.006). Чистые культуры бактерий комплекса АСВ изучали тестами на рост при 37°С, 41°С, 44°С в сердечно-мозговом бульоне (Оксоид). Окисление и кислотообразование на глюкозе исследовали на среде Хью-Лейфсона. Тесты утилизации выполняли в жидкой минеральной среде с добавлением 0,1% источника углерода при 30°С. Использовали 35 источников углерода: этанол, D-глюкозу, адипат, бета-аланин, L-арабинозу, L-аргинин, L-аспартат, азелат, бензоат, цитраконат, цитрат, гентизат, глутарат, D-глюконат, L-глутамат, гистамин, L-гистидин, DL-лактат, L-лейцин, левулинат, малонат, D-малат, L-орнитин, L-фенилаланин, фенилацетат, путресцин, трикарбаллилик кислота, D-рибоза, L-тартрат. Фенотипический анализ проводили также с помощью тест-системы API 20 NF (bio Merieux, Франция). Исследования проводили при 30°С с учетом результатов через 2 суток. Исследования показали, что виды бактерий комплекса АСВ четко отделены от других видов ацинетобактеров. Однако, виды комплекса АСВ имеют близкое фенотипическое сходство. Только по некоторым признакам выявлено неравномерное распределение: рост при 44°С наиболее характерен для видов A. baumannii и геновида 13TU; частота положительных результатов среди геноваров 3, 13TU, A. baumannii, A. calcoaceticus по утилизации левулината-5%, 5%, 24%, 91% соответственно; утилизации цитраконата - 0, 0, 40%, 0 соответственно. Нет ни одного признака, который отличается у 100% штаммов вида от других видов. Учитывая медицинскую значимость бактерий были предложены названия новых видов Acinetobacter pitii (ранее (геновид 3) и Acinetobacter nosocomialis ранее геновид 13TU).
Известно, что наиболее точным методом идентификации видов Acinetobacter, в том числе вида A. nosocomialis, является молекулярный метод частичного секвенирования гена rpoB (Park G.N., Kang H.S., Kim H.R., Jung В. К., Kim D.H., Chang K.S. A comparison of genospecies of clinical isolates in the Acinetobacter spp.complex obtained from hospitalized patiens in Busan, Korea. Biomed Sci Letters; 2019, vol. 25. no. 1; pp. 40-53. https://doi.org/l0.15616/BSL.2019.25.1.40 https://www.e-sciencecentral.org/articles/SC000034422). Исследуемый клинический изолят инкубируют в сердечно-мозговом бульоне при 37°С в течение 18 ч. Геномную ДНК бактерий изолята экстрагируют с использованием набора для выделения ДНК Accuprep (Bioneer, Daejeon, Korea) в соответствии инструкцией производителя. Извлеченную ДНК хранят при -20°С до дальнейшего анализа. ПЦР амплификацию участка гена для секвенирования проводят с использованием олигонуклеотидных специфических праймеров для необходимого участка гена rpoВ. ПНР проводят в заданном оптимальном режиме. Продукты ПЦР анализируют электрофорезом в 1,5% агарозном геле с бромидом этидия и визуализируют в УФ свете. Амплифицированную геномную ДНК в геле очищают с использованием комплекта для очистки геля Accuprep (Bioneer, Daejeon, Korea). Очищенные продукты ПЦР секвенируют с помощью службы секвенирования, которая использует профессиональную установку молекулярного анализа (Cosmo GENTECH Inc., Seul, Korea). После секвенирования ДНК последовательности сравнивают с эталонными данными в базе данных Genbank с использованием Basic Local Aligument Search Tool (BLAST) для идентификации вида. Достоинством способа является его точность: в данном исследовании все 123 изученных штаммов A.baumannii, A. nosocomialis, A. pittii, A. calcoaceticus были идентифицированы до вида правильно. Однако, способ сложный, трудоемкий и требует специального оснащения.
Известен также способ идентификации видов бактерий, в том числе A. nosocomialis, с использованием фенотипического метода матрично-активированной лазерной десорбции/ионизации с время пролетной масс-спектрометрией (MALDI - TOF MS). Объектом исследования являются чистые культуры микроорганизмов (часть колонии бактерий), а также клинический материал (кровь, моча), которые исследуют согласно инструкции по применению масс-спектрометром Microflex с базой данных MALDI Biotyper (Bruker Daltonics Inc., Германия). Уровень идентификации бактерий трактуется по критериям, указанным в инструкции: score 2300-3000 высокая вероятность идентификации вида; 2000-2299 надежная идентификация рода, вероятная идентификация вида; 1700-1999 вероятная идентификация рода, 0000-1699 ненадежная идентификация. При наличии в базе данных представителей A. baumannii, A. nosocomialis, A. pittii, A. calcoaceticus обеспечивается быстрая и точная идентификация этих видов (Espinal P., Seifert Н., Dijks-hoorn L., Vila J., Roka I. Rapid and accurate identification of genomic species from the Acinetobacter baumannii (Ab) group by MALDI-TOF MS. Clin. Microbiol. Infect. 2012, vol. 18. no. 11: pp. 1097-1103. https://doi:10.1111/j.1469-0691.2011.03696.x). Однако, в некоторых случаях отмечали ошибки в идентификации A. nosocomialis, что потребовало корректировки состава матрицы в протоколе ведения исследования масс-спектрометром Microflex с базой данных MALDI Biotyper (Sedo О., Nemec A., Krizova L., Kacalova M., Zdrahal Z. Improvement of MALDI-TOF MS profiling for the differentiation of species with in the Acinetobacter calcoaceticus - A. baumannii complex. Syst. Appl. Microbiol. 2013, vol. 36, no. 8; pp. 572-578. https://doi:10.1016/j.syapm.2013.08.001).
Прототипом заявляемого способа нами избран способ фенотипической идентификации видов комплекса A. calcoaceticus- A.baumannii, в том числе A. nosocomialis, по статье Nemec A, et al. (Nemec A., Krizova L., Maixnerova M., van der Reijden T.J.K., Deschaght P., Passet V., Vaneechoutte ML, Brisse S., Dijkshoorn L. Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp.nov. (formerly Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 13TU). Research in Microbiology. 2011, vol. 162, no. 2; pp. 393-404. https://doi.org/10.1016/j.resmic.2011.02.006), так как он содержит наиболее полную характеристику фенотипических признаков A. nosocomialis и других видов комплекса АСВ и наиболее близок заявляемому способу по совокупности существенных признаков.
Недостатком прототипного способа является сложность исследования, вследствие применения многочисленных фенотипических тестов, и невозможность точной идентификации вида A. nosocomialis.
Эти же недостатки имеет аналог по статье Gerner-Smidt P. et al.
Недостатком аналога, основанного на секвенировании участков гена rpoВ, является сложность исследования, ввиду его многоэтапности и использования специальных приборов.
Недостатком аналога, основанного на применении метода MALDI - TOF масс-спектрометрии, является необходимость сложного прибора и недостаточная точность, в некоторых случаях, идентификации A. nosocomialis.
Целью изобретения является упрощение и повышение точности исследования по идентификации бактерий вида A. nosocomialis.
В соответствии с изобретением решение указанной технической задачи достигается тем, что после предварительного отбора материала, подлежащего исследованию, - чистой культуры грамотрицательных коккобактерий, растущих при 37°С и 44°С, аэробов, неподвижных, оксидазо-отрицательных, каталазо-положительных; не ферментирующих, но окисляющих D-глюкозу с образованием кислоты; не имеющих нитратредуктазы; утилизирующих в качестве единственного источника углерода этанол, L-аргинин, L-гистидин, L-арабинозу, путресцин, трикарбаллиловую кислоту; не утилизирующих D-глюкозу; засевают исследуемую суточную агаровую культуру бактерий по полной петле (диаметром 2 мм) в лунку планшета с 0,1 мл питательной среды, содержащей мочевину (СAS по 57-13-6), Na2HPO4, KH2РO4, NaCl, индикатор феноловый красный, воду дистиллированную при следующем содержании ингредиентов: мочевина 10,0 - !5,0 г, Na2HPO4 1,1 г, KH2РО4 1,1 г, NaCl 5,0 г; 0,4% водно-щелочной раствор фенолового красного 5,0 мл, вода дистиллированная 1 л, при этом мочевину вносят после стерилизации всех остальных ингредиентов при 121°С в течение 20 мин, рН 7,0±0,1; инкубируют посевы в аэробных условиях при 37°С; определяют принадлежность бактерий к виду A. nosocomialis по времени изменения исходного желтого цвета среды в красный или малиновый при окончательном учете выявления уреазы быстрой активности по изменению окраски среды через 3 ч инкубации посевов бактерий. Примечание: 1. Приготовление 0,4% водно-щелочного раствора фенолового красного - вносят в фарфоровую ступку 0,1 г порошка фенолового красного; 5,7 мл 0,2% раствора NaOH, воду дистиллированную до 25 мл, растирают до гомогенного раствора темно-красной окраски, который сразу используют (не хранят). 2. Бактериологический контроль качества питательной среды заявляемого способа проводят при изготовлении и применении среды; суточные агаровые культуры контрольных штаммов A. nosocomialis или Morganella morganii (положительный контроль) и A. baumannii или Escherichia coli (отрицательный контроль) засевают по одной петле (диаметром 2 мм) в 0,1 мл питательной среды в лунках планшета, инкубируют аэробно при 37°С в течение 3 ч, учитывают результат: питательная среда пригодна к использованию, если в лунке с A. nosocomialis (или М. morganii) она пробрела малиновую окраску, при этом в лунках с A.baumannii (или Е. coli) и в лунке без посева бактерий сохраняется исходный цвет среды.
Отличительный существенный признак способа - окончательный учет выявления уреазы быстрой активности по изменению окраски питательной среды проводят через 3 ч инкубации посева бактерий. Этот признак выявляет особый вариант уреазы бактерий - уреазу быстрой активности. Этот признак не применялся в прототипе и аналогах. Более того, уреазный тест не использовался в прототипе и аналогах при фенотипической характеристике всех видов ацинетобактеров комплекса АСВ. Его пригодность для идентификации A. nosocomialis не очевидна и требовала изучения всех видов ацинетобактеров комплекса АСВ. Нами были изучены 85 штаммов A. baumannii, 21 штамм A. nosocomialis, 10 штаммов A. pittii, 2 штамма A. calcoaceticus комплекса АСВ, видовая принадлежность которых была установлена методом MALDI - TOF MS. Было установлено, что все штаммы A. nosocomialis (100%) имели уреазу быстрой активности, которая выявлялась через 3 ч аэробной инкубации посевов при 37°С (таблица 1). У A. baumannii выявлен только 1 штамм (1,17%) с уреазой быстрой активности; у A. pittii, A. calcoaceticus она не выявлена (таблица 2). Часть штаммов A. baumannii (17,6%) и 1 штамм A. calcoaceticus имели уреазу низкой активности, которая выявлялась через 8-24 ч инкубации посевов (таблица 2). Эта уреаза низкой активности не имеет таксономического значения и не пригодна для идентификации ацинетобактеров. Отличительный существенный признак непосредственно определяет решение поставленной технической задачи - упрощения и повышения точности исследования по идентификации бактерий A. nosocomialis, так как простое визуальное выявление уреазы быстрой активности позволяет с высокой точностью отличать 100% штаммов A. nosocomialis от всех остальных изученных видов комплекса АСВ (A. baumannii, A. pittii, A. calcoaceticus), что ранее было невозможно фенотипическими тестами без применения сложных приборов метода MALDI-TOF MS. Это доказательство механизма достижения технического результата представлено впервые в материалах данной заявки.
Существенным признаком способа является предварительный отбор материала, подлежащего исследованию, - чистой культуры грамотрицательных коккобактерий, растущих при 37°С и 44°С, аэробов, неподвижных, оксидазо-отрицательных, каталазо-положительных; не ферментирующих, но окисляющих глюкозу с образованием кислоты; не имеющих нитратредуктазы; утилизирующих в качестве единственного источника углерода этанол, L-аргинин, L-гистидин, L-арабинозу, путресцин, трикарбаллиловую кислоту; не утилизирующие D-глюкозу, что устанавливает принадлежность ее к ацинетобактерам комплекса АСВ.
Существенными признаками способа являются также использование питательной среды определенного состава для выявления уреазы, аэробные условия культивирования бактерий, температурный режим, визуальное выявление уреазы по изменению окраски рН-индикатора щелочными продуктами гидролиза мочевины. Содержание ингредиентов питательной среды установлено нами экспериментально: оптимальное количество мочевины 10,0-15,0 г/л, она самостерилизована, вносить ее следует после стерилизации всех остальных ингредиентов среды при 121°С в течение 20 мин, соотношение солей Na2HPO4 1,1 г/л и KH2РO4 1,1 г/л определяет оптимальную для уреазы рН 7,0±0,1. Аэробные условия культивирования определяются принадлежностью ацинетобактеров к аэробным бактериям (не следует выращивать посевы ацинетобактеров на среде с мочевиной под слоем вазелинового масла). Оптимальная температура культивирования ацинетобактеров комплекса АСВ на среде с мочевиной 37°С. Для визуального учета гидролиза мочевины уреазой целесообразно использовать рН-индикатор 0,4% водно-щелочной раствор фенолового красного 5 мл/л.
Примеры, подтверждающие возможность осуществления способа
Пример 1. Исследуемый материал - чистая культура клинического изолята бактерий, выделенная из мочи больного, у которой предварительно выявлена совокупность признаков: грамотрицательные коккобактерий, растут при 37°С и 44°С, аэробы, неподвижные, оксидазо-отрицательные, каталазо-положительные; не ферментируют, но окисляют D-глюкозу с образованием кислоты; не имеют нитратредуктазы; утилизируют в качестве единственного источника углерода этанол, L-аргинин, L-гистидин, L-арабинозу, путресцин, трикарбаллиловую кислоту; не утилизируют D-глюкозу. Суточную агаровую исследуемого штамма вносят полной петлей (диаметром 2 мм) в 0,1 мл питательной среды с мочевиной заявляемого способа в лунке планшета. Таким же образом засевают в отдельные лунки суточные культуры контрольных штаммов A. nosocomialis или М. morganii (положительный контроль) и A.baumannii или Е. coli (отрицательный контроль), одну лунку со средой не засевают (один контроль используют для всех штаммов, исследуемых в данный день). Посевы выращивают аэробно при 37°С в течение 3 ч, после чего учитывают результат: изменение исходной желтой окраски среды в красную в лунке с посевом исследуемого штамма бактерий указывает на выявление уреазы быстрой активности и принадлежность бактерий к виду A. nosocomialis, при этом такой же результат отмечается в лунке положительного контроля, а в лунках отрицательного контроля и без посева бактерий среда сохраняет исходную окраску. Контрольная видовая идентификация исследуемого штамма бактерий методом MALDI - TOF масс-спектрометрии с использованием базы данных MALDI Biotyper (Bruker Daltonics Inc., Германия) подтвердила принадлежность бактерий к виду A. nosocomialis.
Примечание к примеру 1. Методика приготовления питательной среды с мочевиной заявляемого способа. В 1 л дистиллированной воды вносят, г/л: Na2HPO4 1,1; KH2РО4 1,1; NaCl 5,0; 0,4% водно-щелочной раствор фенолового красного 5 мл, стерилизуют при 121°С 20 мин, затем добавляют 10,0 г самостерилизованной мочевины (CAS по 57-13-6), разливают во флаконы. Среда прозрачная, желтой окраски, пригодна к использованию в течение 30 суток при хранении от 4°С до 8°С. Контроль питательной среды: контрольные штаммы бактерий - клинический штамм A. nosocomialis, имеющий уреазу быстрой активности, или штамм М. morganii (положительный контроль); клинический штамм A. baumannii, не имеющий уреазы быстрой активности, или штамм Е. coli (отрицательный контроль). Суточные агаровые культуры контрольных штаммов засевают по полной петле (диаметром 2 мм) в лунки планшета с 0,1 мл исследуемой среды заявляемого способа, одну лунку со средой не засевают. Посевы инкубируют аэробно при 37°С в течение 3 ч, затем учитывают результат. Питательная среда пригодна к использованию, если в лунке с посевом A. nosocomialis или М. morganii исходная желтая окраска среды изменилась в малиновую, а в лунках с A. baumannii или Е. coli и без посева бактерий сохранилась исходная окраска среды.
Пример 2. Исследуемый материал - чистая культура бактерий, выделенных из реки Невы, у которых предварительно была выявлена совокупность признаков: грамотрицательные коккобактерий, растут при 37°С и 44°С, аэробы, неподвижные, оксидазо-отрицательные, каталазо-положительные, не ферментируют, но окисляют D-глюкозу с образованием кислоты; не имеют нитратредуктазы; утилизируют в качестве единственного источника углерода этанол, L-аргинин, L-гистидин, L-арабинозу, путресцин, трикарбаллиловую кислоту; не утилизируют D-глюкозу. Суточную агаровую культуру исследуемого штамма вносят полной петлей (диаметром 2 мм) в лунку планшета с 0,1 мл питательной среды заявляемого способа, содержащую мочевину 15,0 г/л и остальные ингредиенты по примечанию к примеру 1. Таким же образом засевают в отдельные лунки контрольные штаммы A. nosocomialis или М. morganii (положительный контроль) и A. baumannii или Е. coli (отрицательный контроль), одну лунку со средой не засевают. Посевы инкубируют при 37°С в течение 3 ч, после чего учитывают результат: изменение исходной желтой окраски среды в малиновую в лунке с посевом исследуемого штамма бактерий указывает на выявление уреазы быстрой активности и принадлежность бактерий к виду A. nosocomialis, при этом такой же результат отмечается в лунке положительного контроля, а в лунках отрицательного контроля и без посева бактерий среда сохраняет исходную окраску. Контрольная видовая идентификация исследуемого штамма бактерий методом MALDI - TOF масс-спектрометрии подтвердила его вид - A. nosocomialis.
Таким образом, при всех предельных концентрациях основного ингредиента питательной среды заявляемого способа (мочевина 10,0-15,0 г/л) получены четкие, точные результаты идентификации вида A. nosocomialis у бактерий, выделенных из клинического материала и внешней среды.
Claims (3)
- Способ идентификации бактерий Acinetobacter nosocomialis, включающий предварительный отбор материала, подлежащего исследованию, чистой культуры грамотрицательных коккобактерий, растущих при 37°С и 44°С, аэробов, оксидазоотрицательных, каталазоположительных; не ферментирующих, но окисляющих D-глюкозу с образованием кислоты, не имеющих нитратредуктазы; утилизирующих в качестве единственного источника углерода этанол, L-аргинин, L-гистидин, L-арабинозу, путресцин, трикарбаллиловую кислоту; не утилизирующих D-глюкозу; посев исследуемой суточной агаровой культуры бактерий полной петлей в лунку планшета с 0,1 мл питательной среды, содержащей мочевину, Na2HPO4, KH2PO4, NaCl, индикатор феноловый красный, воду дистиллированную; инкубацию посевов в аэробных условиях при 37°С; определение принадлежности бактерий к виду A. nosocomialis по времени изменения исходного желтого цвета питательной среды в красный или малиновый, отличающийся тем, что окончательный учет выявления уреазы быстрой активности по изменению окраски питательной среды проводят через 3 ч инкубации посева бактерий, при следующем содержании ингредиентов, г:
-
мочевина СAS 57-13-6 10,0-15,0 Na2HPO4 1,1 КН2РO4 1,1 NaCl 5,0 феноловый красный 0,4% водно-щелочной раствор 5,0 мл вода дистиллированная 1 л, - при этом мочевину вносят после стерилизации всех остальных ингредиентов при 121°С в течение 20 мин, рН 7,0±0,1.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2019129885A RU2712895C1 (ru) | 2019-09-23 | 2019-09-23 | Способ идентификации бактерий acinetobacter nosocomialis |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2019129885A RU2712895C1 (ru) | 2019-09-23 | 2019-09-23 | Способ идентификации бактерий acinetobacter nosocomialis |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2712895C1 true RU2712895C1 (ru) | 2020-01-31 |
Family
ID=69625104
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2019129885A RU2712895C1 (ru) | 2019-09-23 | 2019-09-23 | Способ идентификации бактерий acinetobacter nosocomialis |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2712895C1 (ru) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2787267C1 (ru) * | 2022-04-07 | 2023-01-09 | Евгений Петрович Сиволодский | Способ идентификации биовара бактерий acinetobacter baumannii bv. tryptophandestruens |
Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2435845C1 (ru) * | 2010-10-12 | 2011-12-10 | Евгений Петрович Сиволодский | СПОСОБ ВЫДЕЛЕНИЯ И ИДЕНТИФИКАЦИИ БАКТЕРИЙ РОДА Shewanella |
| RU2660567C1 (ru) * | 2017-08-29 | 2018-07-06 | Евгений Петрович Сиволодский | Способ выделения и идентификации бактерий комплекса acinetobacter calcoaceticus - acinetobacter baumannii |
-
2019
- 2019-09-23 RU RU2019129885A patent/RU2712895C1/ru active
Patent Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2435845C1 (ru) * | 2010-10-12 | 2011-12-10 | Евгений Петрович Сиволодский | СПОСОБ ВЫДЕЛЕНИЯ И ИДЕНТИФИКАЦИИ БАКТЕРИЙ РОДА Shewanella |
| RU2660567C1 (ru) * | 2017-08-29 | 2018-07-06 | Евгений Петрович Сиволодский | Способ выделения и идентификации бактерий комплекса acinetobacter calcoaceticus - acinetobacter baumannii |
Non-Patent Citations (3)
| Title |
|---|
| NEMEC A., KRIZOVA L., et.al., Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus - Acinetobacter baumannii complex with the of Acinetobacter pittii sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic sp. 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic sp. 13TU), Research in Microbiology, 2011, v. 162. p. 393-404. * |
| PETER GERNER - SMIDT, INGELA TJERNBERG et.al., Reliability of phenotypic tests for identification of Acinetobacter sp., Journal of Clinical Microbiology, 1991, v.29, N 2, p. 277-282 * |
| PETER GERNER - SMIDT, INGELA TJERNBERG et.al., Reliability of phenotypic tests for identification of Acinetobacter sp., Journal of Clinical Microbiology, 1991, v.29, N 2, p. 277-282. * |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2787267C1 (ru) * | 2022-04-07 | 2023-01-09 | Евгений Петрович Сиволодский | Способ идентификации биовара бактерий acinetobacter baumannii bv. tryptophandestruens |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN113249499B (zh) | 一种伤寒沙门氏菌的检测试剂盒、其制备方法及其应用 | |
| CN110714090B (zh) | 一种检测血浆中血流感染病原体游离核酸的试剂盒 | |
| CN110878343A (zh) | 一种用于遗传性耳聋致病基因SLC26A4突变快速检测的Cpf1试剂盒及其检测方法 | |
| US10174386B2 (en) | Method of quantitatively analyzing microorganism targeting rRNA | |
| EP2902479A1 (en) | Culture medium for food poisoning bacteria, and method for detecting food poisoning bacteria | |
| JP2005160491A (ja) | 各種カンジダ種の培養と特異的同定用培地、及び分析方法 | |
| US20170088882A1 (en) | Carrier for detecting foodborne-illness-causing bacteria, kit for detecting foodborne-illness-causing bacteria, method for detecting foodborne-illness-causing bacteria, and pcr reaction solution for foodborne-illness-causing bacteria | |
| Oldham et al. | Methods for detection and identification of beer-spoilage microbes | |
| US20220396825A1 (en) | Method for preparing sequencing library | |
| RU2712895C1 (ru) | Способ идентификации бактерий acinetobacter nosocomialis | |
| WO2000031292A1 (en) | Method for counting living cells | |
| Schubert et al. | Quantitative detection of agar-cultivated and rhizotron-grown Piloderma croceum Erikss. & Hjortst. by ITS1-based fluorescent PCR | |
| JP3926071B2 (ja) | ヒスタミンの定量法及び定量用試薬 | |
| CN109554441A (zh) | 一种通过扩增16S rDNA保守区序列检测细菌的方法 | |
| Al-obaidi et al. | Molecular Screening for luxs and pm1Virulence Genes of Proteus mirabilis Isolated from Iraqi Urinary Tract Infection Patients | |
| KR101752274B1 (ko) | 장출혈성 대장균의 시가독소 유전자형 stx1 및 stx2를 동시에 판별하기 위한 고감도 실시간 다중 등온증폭반응용 프라이머 세트 및 이를 이용한 장출혈성 대장균의 시가독소 유전자형의 판별 방법 | |
| RU2849183C1 (ru) | Способ идентификации бактерий Achromobacter xylosoxidans | |
| AU2003226729A1 (en) | Method for the identification of microorganisms by means of in situ hybridization and flow cytometry | |
| KR20190048034A (ko) | 안정동위원소 표지 핵산을 내부표준물질로 활용하는 핵산 정량 방법 및 이의 용도 | |
| CN107523620A (zh) | 包含产ndm耐药菌的pcr检测试剂盒及其应用 | |
| Ivors et al. | Survey of fungal diversity in mushroom compost using sequences of PCR-amplified genes encoding 18S ribosomal RNA | |
| JP5823390B2 (ja) | 新規ニトロレダクターゼ酵素基質 | |
| JP2006238838A (ja) | 菌の生存を検定する方法 | |
| RU2835848C1 (ru) | Способ фенотипической идентификации бактерий acinetobacter seifertii | |
| CN114196768B (zh) | 用于鉴别铜绿假单胞菌血清群的特异性分子靶标及其快速检测方法 |