RU2507268C1 - Система маркеров на основе группы генов микрорнк для диагностики немелкоклеточного рака легкого, включая плоскоклеточный рак и аденокарциному - Google Patents
Система маркеров на основе группы генов микрорнк для диагностики немелкоклеточного рака легкого, включая плоскоклеточный рак и аденокарциному Download PDFInfo
- Publication number
- RU2507268C1 RU2507268C1 RU2012142228/10A RU2012142228A RU2507268C1 RU 2507268 C1 RU2507268 C1 RU 2507268C1 RU 2012142228/10 A RU2012142228/10 A RU 2012142228/10A RU 2012142228 A RU2012142228 A RU 2012142228A RU 2507268 C1 RU2507268 C1 RU 2507268C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- mir
- adenocarcinoma
- lung cancer
- cell lung
- group
- Prior art date
Links
- 208000002154 non-small cell lung carcinoma Diseases 0.000 title claims abstract description 30
- 208000029729 tumor suppressor gene on chromosome 11 Diseases 0.000 title claims abstract description 30
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 29
- 208000009956 adenocarcinoma Diseases 0.000 title claims abstract description 7
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 title abstract description 9
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 title abstract description 8
- 108091070501 miRNA Proteins 0.000 title abstract description 5
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims abstract description 26
- 230000011987 methylation Effects 0.000 claims abstract description 17
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 claims abstract description 17
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 claims abstract description 14
- 108091093189 Mir-375 Proteins 0.000 claims abstract description 13
- 108091027966 Mir-137 Proteins 0.000 claims abstract description 10
- 108091064138 miR-129-2 stem-loop Proteins 0.000 claims abstract description 10
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims description 15
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 claims description 14
- 108091084619 miR-125b-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 7
- 206010041823 squamous cell carcinoma Diseases 0.000 claims description 5
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 abstract description 11
- 238000001514 detection method Methods 0.000 abstract description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 abstract description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 abstract description 4
- -1 miR-125bl Proteins 0.000 abstract description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 5
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 5
- 201000005243 lung squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 4
- 208000010507 Adenocarcinoma of Lung Diseases 0.000 description 3
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 3
- 208000000058 Anaplasia Diseases 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 201000005249 lung adenocarcinoma Diseases 0.000 description 3
- 238000000034 method Methods 0.000 description 3
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 3
- 208000005623 Carcinogenesis Diseases 0.000 description 2
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 2
- 108091030146 MiRBase Proteins 0.000 description 2
- 230000036952 cancer formation Effects 0.000 description 2
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 2
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 2
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 2
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 2
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 1
- LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-M Bisulfite Chemical compound OS([O-])=O LSNNMFCWUKXFEE-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000001333 Colorectal Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 108091029523 CpG island Proteins 0.000 description 1
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000016397 Methyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 108091080995 Mir-9/mir-79 microRNA precursor family Proteins 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical group NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000006718 epigenetic regulation Effects 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 208000037841 lung tumor Diseases 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 108091091360 miR-125b stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091089860 miR-148 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091074487 miR-34 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091092493 miR-34-1 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091059780 miR-34-2 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091055140 miR-574 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 108091047084 miR-9 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 238000002205 phenol-chloroform extraction Methods 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Изобретение относится к области медицины, в частности молекулярной биологии и онкологии, и касается системы маркеров, представляющую собой группу генов микроРНК: miR-129-2, miR-125b1, miR-137 и miR-375, для диагностики немелкоклеточного рака легкого, включая плоскоклеточный рак и аденокарциному. Выявление метилирования по крайней мере одного маркера из этой системы служит диагностическим признаком. Система маркеров позволяет выявить немелкоклеточный рак легкого на ранних клинических стадиях заболевания с высокой клинической чувствительностью и специфичностью. 4 табл., 3 пр.
Description
Система маркеров на основе группы генов микроРНК для диагностики немелкоклеточного рака легкого, включая плоскоклеточный рак и аденокарциному.
Настоящее изобретение относится к области биомедицины, в частности молекулярной и клинической онкологии и молекулярной биологии, и касается системы маркеров для диагностики немелкоклеточного рака легкого (НМРЛ), путем оценки статуса метилирования генов микроРНК: miR-129-2, miR-125bl, miR-137 и miR-375. Выявление метилирования, по крайней мере, одного гена из заявленной системы маркеров в предположительно пораженной раком ткани человека, по сравнению со здоровой тканью легкого служит диагностическим признаком НМРЛ. Заявленная система маркеров на основе генов микроРНК позволяет с высокой частотой и специфичностью диагностировать НМРЛ, а именно плоскоклеточный рак легкого (ПРЛ) и аденокарциному легкого (АК), в том числе на ранних стадиях.
Немелкоклеточный рак легкого (НМРЛ) - самый распространенный вид рака среди онкопатологий человека. Тяжесть заболевания и низкая выживаемость при раке легкого связаны, прежде всего, с поздним выявлением заболевания. При обнаружении опухолей легкого на 1-ой клинической стадии, уровень 5-летней выживаемости пациентов поднимается от 15% до 70%.
Отбор системы генов микроРНК, связанных с развитием опухолей и ассоциированных с CpG-островками, проводили с привлечением следующих баз данных: UCSC Genome Browser (hg 18 (http://genome.ucsc.edu/)), miRBase (http://www.mirbase.org/), MicroRNAdb (http://bioinfo.au.tsinghua.edu.cn/micrornadb/), miRDB (http://mirdb.org/cgi-bin/search.cgi), miRGen (http://www.diana.pcbi.upenn.edu/miRGen.html), TargetScan (http://www.targetscan.org/), miR2Disease Base (http://www.mir2disease.org/), miRWalk (http://www.ma.uni-heidelberg.de/apps/zmf/mirwalk/), CpGcluster (http://bioinfo2.ugr.es/CpGcluster/). Отобранные микроРНК находятся на участках хромосом, часто вовлеченных в онкогенез, или связанных с генами, вовлеченными в онкогенез. Оценка статуса метилирования генов miR-129-2, miR-125b, miR-137 и miR-375 при НМРЛ позволила на их основе составить систему маркеров для диагностики этого заболевания. Сведений о выявлении метилирования этих генов при НМРЛ в источниках информации не обнаружено.
В качестве ближайшего аналога заявляемой системы маркеров рассмотрим систему маркеров на основе группы генов микроРНК: miR-34, miR-148 и miR-9 (WO 2010020787). Диагностика рака легкого осуществляется путем выявления метилирования или снижения экспрессии хотя бы в одном маркере этой системы. Значения клинической чувствительности и специфичности для данной системы не приведены.
Известные значения клинической чувствительности и специфичности для диагностики НМРЛ составляют 82% и 77% соответственно (WO 2011146937), которые достигаются путем анализа уровней экспрессии системы маркеров на основе группы генов микроРНК: miR-1254 и miR-574-5p.
Задача заявляемого изобретения - расширить арсенал маркеров на основе генов микроРНК для диагностики немелкоклеточного рака легкого, включая плоскоклеточный рак и аденокарциному. Задача решена путем:
- разработки системы маркеров на основе группы генов микроРНК: miR-129-2, miR-125b1, miR-137 и miR-375 - для диагностики немелкоклеточного рака легкого, включая плоскоклеточный рак и аденокарциному, путем выявления метилирования, по крайней мере, у одного гена из этой группы.
Диагностику НМРЛ осуществляют по следующему методу.
Берут образцы ткани легкого у лиц, обследуемых для выявления онкологического заболевания или с установленным диагнозом. Выделение и очистку ДНК из образцов ткани легкого проводят методом фенол-хлороформенной экстракции. Качество и точную концентрацию ДНК определяют спектрофотометрически по соотношению оптической плотности при длинах волн 260 и 280 нм. Далее проводят бисульфитную конверсию ДНК с последующей метилспецифичной ПЦР (МС-ПЦР) [4]. Для анализа метилирования каждой микроРНК методом МС-ПЦР используют две пары праймеров, специфичных как к метилированному, так и к неметилированному аллелю (Таблица 1). Продукты МС-ПЦР разделяют электрофорезом в 2% агарозном геле либо в 10% полиакриламидном геле (при длине продукта ПЦР менее 160 н.п.). Далее анализируют на наличие или отсутствие продуктов МС-ПЦР для праймеров, специфичных к метилированному и неметилированному аллелю. В качестве контролей для неметилированных аллелей используют образцы ДНК из лейкоцитов крови здоровых доноров. В качестве позитивного контроля 100%-ого метилирования используют препараты ДНК из лейкоцитов, обработанные метилтрансферазой SssI («СибЭнзим», Новосибирск). Соответствие фрагментов МС-ПЦР исследуемым генам проверяют прямым секвенированием обеих цепей продуктов МС-ПЦР. Диагностику НМРЛ осуществляют по наличию метилирования, по крайней мере, у одного маркера системы.
Пример 1. Определение набора праймеров для гена микроРНК miR-375.
Подбор праймеров для МС-ПЦР гена микроРНК miR-375 осуществляют с помощью программы Methyl Primer Express v.1.0 (Applied Biosystems, USA) со следующими параметрами: размер ампликонов 100-200 пар оснований, от 4 до 7 CpG-динуклеотидов на пару праймеров, от 4 до 10 цитозиновых остатков, не входящих в CpG-динуклеотиды, разница в температурах плавления праймеров в паре не более 5 градусов. Первоначальные варианты пар праймеров проверены на образование димеров и вторичных структур с помощью программы Vector NTI v.10.0 (Invitrogen, USA). В результате получен заявляемый набор праймеров для гена микроРНК miR-375, который приведен в таблице 1.
Пример 2. Диагностика НМРЛ, включая ПРЛ и АК.
Для 39 пациентов с морфологически установленным диагнозом - НМРЛ, включая 26 пациентов с ПРЛ и 13 с АК, и 20-ти доноров, онкологически здоровых в анамнезе, проведен анализ метилирования заявляемой системы маркеров (таблица 2, 3). В случае ПРЛ диагноз подтвержден у 24 из 26 пациентов, что соответствует 92% случаев. В случае АК диагноз подтверждается для 11 из 13 пациентов, что соответствует 85% случаев (таблица 4). Причем заявляемая система маркеров позволяет диагностировать АК и ПРЛ на самых ранних клинических стадиях. Так, на I и II клинических стадиях АК выявляют в 78% случаев, а ПРЛ - в 89% случаев. На поздних клинических стадиях (III и IV) использование заявляемой системы маркеров позволяет выявить АК и ПРЛ в 100% случаев (таблица 4). Для 20 доноров заявляемая система выявляет метилирование в двух образцах хотя бы по одному маркеру, что соответствует 10% (таблица 3). На основании этих данных можно утверждать о возможности использовать заявляемую систему маркеров для диагностики НМРЛ, включая ПРЛ и АК.
Пример 3. Оценка чувствительности и специфичности заявляемой системы маркеров.
Важным свойством заявляемой системы маркеров является высокая клиническая чувствительность и специфичность при диагностике НМРЛ. Наличие метилирования, по крайней мере, у одного маркера системы генов микроРНК выявлена у 35 из 39 пациентов с НМРЛ (90% случаев) и у двух из 20 доноров, онкологически здоровых в анамнезе (10% случаев). На основании этих данных клиническая чувствительность и специфичность заявляемой системы маркеров, рассчитанная методом ROC-анализа, составляют 90% и 90% соответственно. Таким образом, заявляемая система маркеров позволяет диагностировать НМРЛ у пациентов истинно больных данным онкозаболеванием с высокой (в 90% случаев) клинической чувствительностью.
Заявляемая система маркеров для диагностики НМРЛ характеризуется следующим.
1. Обладает клинической чувствительностью 90% и специфичностью 90%, что превосходит известные значения: 82% и 77% (WO 2011146937).
2. Позволяет диагностировать два наиболее распространенных вида НМРЛ - плоскоклеточный рак и аденокарциному на самых ранних клинических стадиях с высокой клинической чувствительностью (до 90%) и специфичностью (до 90%).
3. Позволяет осуществить диагностику в стандартизованных условиях (таблица 1) с использованием недорогих приборов отечественного производства.
| Таблица 1. | ||
| Характеристика праймеров, условий5 и продуктов МС-ПЦР | ||
| Название гена и источник праймеров | Структура праймеров | Продукт ПЦР, п.н. |
| miR-129-21 | MF1:GATTTTAGTTCGTATTAATGAGTTGGCGGTTTC MR1:AACCCCGACTACAAAATCGCG |
210 |
| UF1:TGATTTTAGTTTGTATTAATGAGTTGGTGGTTTTG UR1:АССААССССААСТАСААААТСАСА | 210 | |
| miR-125b12 | MF2:TGGTGTATCGTTTTTTGTTTTC MR2:ACCCATTCGAAACGAAAC | 190 |
| UF2:ATTTGGTGTATTGTTTTTTGTTTTT UR2:СТСАСССАТТСААААСААААС |
190 | |
| miR-1373 | MF3:TTTTGATTTTTTTCGGTGAC MR3:TACCGCTAATACTCTCCTCG | 98 |
| UF3:TTTTTTGATTTTTTTTGGTGAT UR3:CTACCACTAATACTCTCCTCAA | 98 | |
| miR-3754 | MF4:TCGTTATCGTTATTTTAATCGTACG MR4:AAAAATTTCTATTCTAAACCACGAC |
200 |
| UF4:TGTTATTGTTATTTTAATTGTATGG UR4:AAAAATTTCTATTCTAAACCACAAC |
199 | |
| Примечания: 1[1] 2[2] 3[3] 4Подобраны авторами с использованием известных программ (Methyl Primer Express v.1.0, Vector NTI v.10.0 и т.п.) |
||
| Таблица 2. | ||||||||
| Сопоставление данных по метилированию генов, входящих в заявляемую систему маркеров, с клинико-гистологическими характеристиками образцов от 39 пациентов с НМРЛ | ||||||||
| № образца | Ген микроРНК | Клиническая стадия | Степень анаплазии | Возраст/Пол | Стадия по классификации TNM | |||
| miR-129-2 | miR-125b1 | miR-137 | miR-375 | |||||
| Аденокарцинома легкого | ||||||||
| 842 | + | + | - | + | IV | md | 72/M | T2N2M1 |
| 882 | + | - | - | - | III | Id | 36/M | T4N2M0 |
| 791 | + | + | + | + | III | Id | 54/Ж | T3N1M0 |
| 850 | + | + | + | + | III | md | 61/Ж | T2N2M0 |
| 895 | - | - | - | + | II | md | 50/Ж | T2N0M0 |
| 848 | + | + | + | - | I | md | 54/М | T2N0M0 |
| 835 | + | - | - | - | I | md | 55/М | T2N0M0 |
| 806 | - | - | - | - | I | md | 59/М | T2N0M0 |
| 854 | - | + | + | + | I | md | 61/Ж | T2N0M0 |
| 776 | + | - | + | + | I | md | 58/Ж | T1N0M0 |
| 804 | - | + | - | + | I | md | 68/Ж | T1N0M0 |
| 883 | - | + | - | - | I | hd | 47/Ж | T1N0M0 |
| 838 | - | - | - | - | I | hd | 70/Ж | T1N0M0 |
| Таблица 2. | ||||||||
| (продолжение) | ||||||||
| № образца | Ген микроРНК | Клиническая стадия | Степень анаплазии | Возраст/Пол | Стадия по классификации TNM | |||
| miR-129-2 | miR-125b1 | miR-137 | miR-375 | |||||
| Плоскоклеточный рак легкого | ||||||||
| 852 | + | + | + | + | III | Id | 77/M | T4N2M0 |
| 384 | - | - | + | + | III | Id | 67/M | T3N0M0 |
| 815 | - | + | - | - | III | md | 56/М | T3N2M0 |
| 831 | + | + | + | + | III | md | 65/М | T3N2M0 |
| 851 | - | + | - | + | III | md | 59/М | T2N2M0 |
| 391 | + | + | + | + | III | md | 67/М | T3N0M0 |
| 534 | + | + | - | + | III | md | 40/М | T3N1M0 |
| 833 | + | + | + | - | III | md | 59/М | T1N2M0 |
| 844 | - | + | + | + | II | Id | 62/М | T3N0M0 |
| 817 | + | + | - | + | II | Id | 58/М | T3N0M0 |
| 709 | - | + | - | + | II | Id | 39/М | T2N1M0 |
| 808 | + | - | - | + | II | Id | 63/М | T2N1M0 |
| 816 | - | + | - | + | II | md | 71/М | T2N1M0 |
| 830 | - | + | + | + | II | md | 47/Ж | T2N1M0 |
| 832 | - | - | - | + | II | md | 58/М | T2N1M0 |
| 378 | + | + | - | + | II | md | 64/М | T1N1M0 |
| № образца | Ген микроРНК | Клиническая стадия | Степень анаплазии | Возраст/Пол | Стадия по классификации TNM | |||
| miR-129-2 | miR-125b1 | miR-137 | miR-375 | |||||
| Плоскоклеточный рак легкого | ||||||||
| 587 | - | - | - | - | II | md | 45/Ж | T2N1M0 |
| 840 | - | + | - | - | II | md | 51/Ж | T3N0M0 |
| 847 | + | - | - | - | I | md-Id | 51/М | T2N0M0 |
| 856 | - | + | - | + | I | Id | 69/М | T2N0M0 |
| 819 | - | - | + | + | I | md | 67/Ж | T2N0M0 |
| 843 | + | + | + | - | I | md | 807М | T2N0M0 |
| 934 | - | - | + | - | I | md | 57/М | T2N0M0 |
| 855 | - | + | + | - | I | md | 69/М | T2N0M0 |
| 778 | - | - | - | - | I | hd | 67/М | T2N0M0 |
| 513 | + | + | - | + | I | hd | 62/М | T2N0M0 |
| Таблица 3. | ||||
| Данные по метилированию генов, входящих в заявляемую систему маркеров в образцах, выделенных из ткани легкого 20-ти доноров, онкологически здоровых в анамнезе | ||||
| № образца | Ген микроРНК | |||
| miR-129-2 | miR-125b1 | miR-137 | miR-375 | |
| Онкологически здоровые в анамнезе доноры (нормальная ткань легкого) | ||||
| 1 | - | - | - | - |
| 2 | - | - | - | - |
| 3 | - | - | - | - |
| 4 | - | - | - | - |
| 5 | - | - | - | - |
| 6 | - | - | - | - |
| 7 | - | - | - | - |
| 8 | - | - | - | - |
| 9 | - | - | - | - |
| 10 | - | - | - | - |
| 11 | - | - | - | - |
| 12 | - | - | - | - |
| 13 | - | - | - | - |
| 14 | - | - | - | - |
| 15 | - | - | - | - |
| 16 | - | - | - | - |
| 17 | - | - | - | - |
| 18 | - | - | - | - |
| 19 | - | + | - | + |
| 20 | - | - | - | + |
| Таблица 4. | |||
| Частота метилирования, чувствительность и специфичность заявляемой системы маркеров на разных клинических стадиях НМРЛ. | |||
| Пациенты с НМРЛ | Аденокарцинома легкого (АК) | Плоскоклеточный рак легкого (ПРЛ) | НМРЛ (АК + ПРЛ) |
| Тотально (I, II, III, IV клинические стадии) | 85% (11/13) | 92% (24/26) | 90% (35/39) |
| Только ранние клинические стадии (I, II) | 78% (7/9) | 89% (16/18) | 85% (23/27) |
| Только поздние клинические стадии (III, IV) | 100% (4/4) | 100% (8/8) | 100% (12/12) |
| Чувствительность | 85% | 92% | 90% |
| Специфичность | 90% | 90% | 90% |
Цитированные источники научно-технической информации
1. Bandres Е., Agirre X., Bitarte N., Ramirez N., Zarate R., Roman-Gomez J., Prosper F., Garcia-Foncillas J. 2009. Epigenetic regulation of microRNA expression in colorectal cancer. Int J Cancer. 125, 2737-2743.
2. Ernesto Soto-Reyes, Rodrigo Gonzblez-Barrios, Fernanda Cisneros-Soberanis, Roberto Herrera-Goepfert, Vyctor Perez, David Cant, Diddier Prada, Clementina Castro, Felix Recillas-Targa and Luis A Herrera. Disruption of CTCF at the miR-125b1 locus in gynecological cancers. BMC Cancer. 2012-12:40.
3. Balaguer F., Link A., Lozano J.J., Cuatrecasas M., Nagasaka T., Boland R.C. and Goel A. Epigenetic silencing of miR-137 is an early event in colorectal carcinogenesis. Cancer Res. 2010 August 15; 70(16)-6609-6618.
4. Ходырев Д.С., Пронина И.В., Рыков С.В., Береснева Е.В., Фридман М.В., Казубская Т.П., Логинов В.И., Брага Э.А. 2012. Метилирование группы генов микроРНК вовлечено в регуляцию экспрессии генов-мишеней RAR-beta2 и NKIRAS1 при раке легкого. Молекулярная биология 46, 773-785.
Claims (1)
- Система маркеров на основе группы генов микроРНК для диагностики немелкоклеточного рака легкого, включая плоскоклеточный рак и аденокарциному, путем выявления метилирования, по крайней мере, одного маркера из этой группы, отличающаяся тем, что маркерами являются гены: miR-129-2, miR-125b1, miR-137 и miR-375.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2012142228/10A RU2507268C1 (ru) | 2012-10-04 | 2012-10-04 | Система маркеров на основе группы генов микрорнк для диагностики немелкоклеточного рака легкого, включая плоскоклеточный рак и аденокарциному |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2012142228/10A RU2507268C1 (ru) | 2012-10-04 | 2012-10-04 | Система маркеров на основе группы генов микрорнк для диагностики немелкоклеточного рака легкого, включая плоскоклеточный рак и аденокарциному |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2507268C1 true RU2507268C1 (ru) | 2014-02-20 |
Family
ID=50113281
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2012142228/10A RU2507268C1 (ru) | 2012-10-04 | 2012-10-04 | Система маркеров на основе группы генов микрорнк для диагностики немелкоклеточного рака легкого, включая плоскоклеточный рак и аденокарциному |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2507268C1 (ru) |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN104164484A (zh) * | 2014-06-09 | 2014-11-26 | 济南金域医学检验中心有限公司 | 检测miR-129-2甲基化的试剂在制备检测肺癌试剂盒中的应用 |
| RU2755651C1 (ru) * | 2020-12-21 | 2021-09-17 | федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный медицинский исследовательский центр имени академика Е.Н. Мешалкина» Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ «НМИЦ им. ак. Е.Н. Мешалкина» Минздрава России) | Аналитическая система для диагностики рака лёгкого при помощи свободных и ассоциированных с клетками крови циркулирующих микроРНК |
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2010020787A1 (en) * | 2008-08-22 | 2010-02-25 | Oncomethylome Sciences Sa | Diagnosis and treatment of tumours |
| EP2327800A1 (en) * | 2008-12-15 | 2011-06-01 | Micromedmark Biotech Co., Ltd | Non-small cell lung cancer detection marker, detection method thereof, related reagent kit and biochip |
| WO2011146937A1 (en) * | 2010-05-21 | 2011-11-24 | The Translational Genomics Research Institute | Methods and kits useful in diagnosing nsclc |
-
2012
- 2012-10-04 RU RU2012142228/10A patent/RU2507268C1/ru active
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2010020787A1 (en) * | 2008-08-22 | 2010-02-25 | Oncomethylome Sciences Sa | Diagnosis and treatment of tumours |
| EP2327800A1 (en) * | 2008-12-15 | 2011-06-01 | Micromedmark Biotech Co., Ltd | Non-small cell lung cancer detection marker, detection method thereof, related reagent kit and biochip |
| WO2011146937A1 (en) * | 2010-05-21 | 2011-11-24 | The Translational Genomics Research Institute | Methods and kits useful in diagnosing nsclc |
Non-Patent Citations (3)
| Title |
|---|
| KALENDAR R. ET AL, Java web tools for pcr, in silico pcr, and oligonucleotide assembly and analysis, journal Genomics, 03.05.2011, the whole document. * |
| TALI AVNIT-SAGI ET AL, Transcriptional mechanisms controlling miR-375 gene expression in the pancreas, Journals of diabetes research, Hindawi Publishing Corporation, 28.03.2012, the whole document. * |
| TALI AVNIT-SAGI ET AL, Transcriptional mechanisms controlling miR-375 gene expression in the pancreas, Journals of diabetes research, Hindawi Publishing Corporation, 28.03.2012, the whole document. KALENDAR R. ET AL, Java web tools for pcr, in silico pcr, and oligonucleotide assembly and analysis, journal Genomics, 03.05.2011, the whole document. * |
Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN104164484A (zh) * | 2014-06-09 | 2014-11-26 | 济南金域医学检验中心有限公司 | 检测miR-129-2甲基化的试剂在制备检测肺癌试剂盒中的应用 |
| CN104164484B (zh) * | 2014-06-09 | 2018-11-06 | 济南金域医学检验中心有限公司 | 检测miR-129-2甲基化的试剂在制备检测肺癌试剂盒中的应用 |
| RU2755651C1 (ru) * | 2020-12-21 | 2021-09-17 | федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный медицинский исследовательский центр имени академика Е.Н. Мешалкина» Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБУ «НМИЦ им. ак. Е.Н. Мешалкина» Минздрава России) | Аналитическая система для диагностики рака лёгкого при помощи свободных и ассоциированных с клетками крови циркулирующих микроРНК |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US20200255904A1 (en) | Dna methylation biomarkers for cancer diagnosing | |
| US7927805B2 (en) | Process for predicting the prognosis of squamous cell lung cancer | |
| CN110257494B (zh) | 一种获得中国人群个体年龄的方法、系统及扩增检测体系 | |
| CN110168108A (zh) | 血浆中稀少dna的去卷积和检测 | |
| EP3839070A1 (en) | Dna methylation-related marker for diagnosing tumor, and application thereof | |
| Rozitis et al. | The use of immunohistochemistry, fluorescence in situ hybridization, and emerging epigenetic markers in the diagnosis of malignant pleural mesothelioma (MPM): a review | |
| CA3162089A1 (en) | Biterminal dna fragment types in cell-free samples and uses thereof | |
| CA3182993A1 (en) | Detection and classification of human papillomavirus associated cancers | |
| Górnikiewicz et al. | Epigenetic basis of regeneration: analysis of genomic DNA methylation profiles in the MRL/MpJ mouse | |
| RU2507268C1 (ru) | Система маркеров на основе группы генов микрорнк для диагностики немелкоклеточного рака легкого, включая плоскоклеточный рак и аденокарциному | |
| Sui et al. | microRNA expression profile of peripheral blood mononuclear cells of Klinefelter syndrome | |
| KR101498640B1 (ko) | Dna 메틸화 마커를 이용한 체액 식별 방법, 체액 식별용 조성물 및 키트 | |
| Sanjabi et al. | Multi‐threshold and multi‐input DNA logic design style for profiling the microRNA biomarkers of real cancers | |
| KR102701683B1 (ko) | 폐암 진단용 dna 메틸화 마커 및 이의 용도 | |
| US12344898B2 (en) | Method for determining a head and neck squamous cell carcinoma | |
| RU2683251C1 (ru) | Способ диагностики светлоклеточного почечно-клеточного рака и способ прогнозирования метастазирования на основе группы генов микроРНК | |
| WO2022255944A2 (en) | Method for detection and quantification of methylated dna | |
| WO2023107570A1 (en) | Expression-weighted tumor mutational burden as an oncology biomarker | |
| Rani et al. | Role of DNA Methylation in the Pathogenesis of Skin Disorders: Mechanisms, Inhibitors of Methylation‐Related Enzyme, and Molecular Docking Studies | |
| RU2703399C1 (ru) | Способ для диагностики рака яичников на основе группы генов микроРНК | |
| RU2666911C2 (ru) | Способ для прогнозирования метастазирования рака яичников на основе группы генов микроРНК | |
| CN117660622B (zh) | 用于检测肺结节的甲基化分子标记物及其应用 | |
| CN103276095B (zh) | 焦磷酸测序法定量检测人dmbt1基因特异性位点甲基化水平的引物 | |
| US20250201344A1 (en) | Methods and systems for identifying an origin of a variant | |
| KR20250175126A (ko) | 변이체 대립유전자 빈도 분석을 통한 암 진단 방법 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PC43 | Official registration of the transfer of the exclusive right without contract for inventions |
Effective date: 20170327 |
|
| PD4A | Correction of name of patent owner |