RU2575625C1 - STRAINS OF Lactobacillus plantarum AND Lactobacillus brevis SYNTHESISING GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID - Google Patents
STRAINS OF Lactobacillus plantarum AND Lactobacillus brevis SYNTHESISING GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID Download PDFInfo
- Publication number
- RU2575625C1 RU2575625C1 RU2014146212/10A RU2014146212A RU2575625C1 RU 2575625 C1 RU2575625 C1 RU 2575625C1 RU 2014146212/10 A RU2014146212/10 A RU 2014146212/10A RU 2014146212 A RU2014146212 A RU 2014146212A RU 2575625 C1 RU2575625 C1 RU 2575625C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- strains
- strain
- gaba
- sbjct
- query
- Prior art date
Links
- BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N gamma-aminobutyric acid Chemical compound NCCCC(O)=O BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims abstract description 118
- OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N (+/-)-DABA Natural products NCCC(N)C(O)=O OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims abstract description 60
- 229960003692 gamma aminobutyric acid Drugs 0.000 title claims abstract description 60
- 240000006024 Lactobacillus plantarum Species 0.000 title claims abstract description 36
- 240000001929 Lactobacillus brevis Species 0.000 title claims abstract description 28
- 235000013965 Lactobacillus plantarum Nutrition 0.000 title claims abstract description 10
- 229940072205 lactobacillus plantarum Drugs 0.000 title claims abstract description 10
- 235000013957 Lactobacillus brevis Nutrition 0.000 title claims abstract description 7
- 230000000529 probiotic effect Effects 0.000 claims abstract description 8
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 claims description 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 abstract description 13
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 abstract description 12
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 11
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 abstract description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 5
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 23
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 23
- 241000894007 species Species 0.000 description 20
- 241000186660 Lactobacillus Species 0.000 description 19
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 16
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 11
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 10
- 238000000034 method Methods 0.000 description 10
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 9
- 108091022930 Glutamate decarboxylase Proteins 0.000 description 9
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 9
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 8
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 8
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 8
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 8
- 108020004465 16S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 7
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 6
- ULGZDMOVFRHVEP-RWJQBGPGSA-N Erythromycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](C)C(=O)O[C@@H]([C@@]([C@H](O)[C@@H](C)C(=O)[C@H](C)C[C@@](C)(O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@H](C[C@@H](C)O2)N(C)C)O)[C@H]1C)(C)O)CC)[C@H]1C[C@@](C)(OC)[C@@H](O)[C@H](C)O1 ULGZDMOVFRHVEP-RWJQBGPGSA-N 0.000 description 6
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 6
- 230000003042 antagnostic effect Effects 0.000 description 6
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 6
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 6
- LPUQAYUQRXPFSQ-DFWYDOINSA-M monosodium L-glutamate Chemical compound [Na+].[O-]C(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O LPUQAYUQRXPFSQ-DFWYDOINSA-M 0.000 description 6
- 235000013923 monosodium glutamate Nutrition 0.000 description 6
- 239000006041 probiotic Substances 0.000 description 6
- 235000018291 probiotics Nutrition 0.000 description 6
- 241000866650 Lactobacillus paraplantarum Species 0.000 description 5
- 241000186684 Lactobacillus pentosus Species 0.000 description 5
- IJKVHSBPTUYDLN-UHFFFAOYSA-N dihydroxy(oxo)silane Chemical compound O[Si](O)=O IJKVHSBPTUYDLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 5
- 244000005709 gut microbiome Species 0.000 description 5
- 102000042567 non-coding RNA Human genes 0.000 description 5
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 5
- 241000819038 Chichester Species 0.000 description 4
- 102000008214 Glutamate decarboxylase Human genes 0.000 description 4
- 241000218588 Lactobacillus rhamnosus Species 0.000 description 4
- 101150118742 NP gene Proteins 0.000 description 4
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 4
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 4
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 4
- 230000008918 emotional behaviour Effects 0.000 description 4
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 4
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 4
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 4
- 101150079601 recA gene Proteins 0.000 description 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 4
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 4
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 4
- 208000019901 Anxiety disease Diseases 0.000 description 3
- 108091029795 Intergenic region Proteins 0.000 description 3
- 241000186679 Lactobacillus buchneri Species 0.000 description 3
- 244000199866 Lactobacillus casei Species 0.000 description 3
- 241000186840 Lactobacillus fermentum Species 0.000 description 3
- 241000962439 Lactobacillus mudanjiangensis Species 0.000 description 3
- 241000617441 Lactobacillus xiangfangensis Species 0.000 description 3
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 3
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 3
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 3
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 3
- 230000036506 anxiety Effects 0.000 description 3
- 101150026213 atpB gene Proteins 0.000 description 3
- 101150035600 atpD gene Proteins 0.000 description 3
- 101150038923 atpF gene Proteins 0.000 description 3
- 230000006399 behavior Effects 0.000 description 3
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 3
- 229960003276 erythromycin Drugs 0.000 description 3
- 230000037406 food intake Effects 0.000 description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 3
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 3
- 229940039696 lactobacillus Drugs 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 3
- 244000005706 microflora Species 0.000 description 3
- 239000004223 monosodium glutamate Substances 0.000 description 3
- 210000000653 nervous system Anatomy 0.000 description 3
- 239000002858 neurotransmitter agent Substances 0.000 description 3
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 3
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 229940073490 sodium glutamate Drugs 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 101100388543 Caenorhabditis elegans glt-1 gene Proteins 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 102000005915 GABA Receptors Human genes 0.000 description 2
- 108010005551 GABA Receptors Proteins 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N Histamine Chemical compound NCCC1=CN=CN1 NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- 241001492470 Lactobacillus brevis KB290 Species 0.000 description 2
- 241000208558 Lactobacillus fabifermentans Species 0.000 description 2
- 240000002605 Lactobacillus helveticus Species 0.000 description 2
- 241000186604 Lactobacillus reuteri Species 0.000 description 2
- OJMMVQQUTAEWLP-UHFFFAOYSA-N Lincomycin Natural products CN1CC(CCC)CC1C(=O)NC(C(C)O)C1C(O)C(O)C(O)C(SC)O1 OJMMVQQUTAEWLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 2
- 239000004104 Oleandomycin Substances 0.000 description 2
- RZPAKFUAFGMUPI-UHFFFAOYSA-N Oleandomycin Natural products O1C(C)C(O)C(OC)CC1OC1C(C)C(=O)OC(C)C(C)C(O)C(C)C(=O)C2(OC2)CC(C)C(OC2C(C(CC(C)O2)N(C)C)O)C1C RZPAKFUAFGMUPI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010093965 Polymyxin B Proteins 0.000 description 2
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 2
- 208000013738 Sleep Initiation and Maintenance disease Diseases 0.000 description 2
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 2
- 108010059993 Vancomycin Proteins 0.000 description 2
- MHLMRBVCMNDOCW-UHFFFAOYSA-N acetic acid;butan-1-ol;hydrate Chemical compound O.CC(O)=O.CCCCO MHLMRBVCMNDOCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960004821 amikacin Drugs 0.000 description 2
- LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N amikacin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](N)C[C@H]([C@@H]([C@H]1O)O[C@@H]1[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)NC(=O)[C@@H](O)CCN)[C@H]1O[C@H](CN)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N 0.000 description 2
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 2
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 2
- 230000003217 anti-cancerogenic effect Effects 0.000 description 2
- 229960004099 azithromycin Drugs 0.000 description 2
- MQTOSJVFKKJCRP-BICOPXKESA-N azithromycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](C)C(=O)O[C@@H]([C@@]([C@H](O)[C@@H](C)N(C)C[C@H](C)C[C@@](C)(O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@H](C[C@@H](C)O2)N(C)C)O)[C@H]1C)(C)O)CC)[C@H]1C[C@@](C)(OC)[C@@H](O)[C@H](C)O1 MQTOSJVFKKJCRP-BICOPXKESA-N 0.000 description 2
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 2
- JQXXHWHPUNPDRT-YOPQJBRCSA-N chembl1332716 Chemical compound O([C@](C1=O)(C)O\C=C/[C@@H]([C@H]([C@@H](OC(C)=O)[C@H](C)[C@H](O)[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)/C=C\C=C(C)/C(=O)NC=2C(O)=C3C(O)=C4C)C)OC)C4=C1C3=C(O)C=2\C=N\N1CCN(C)CC1 JQXXHWHPUNPDRT-YOPQJBRCSA-N 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 2
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 2
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 2
- 230000001332 colony forming effect Effects 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 2
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 230000003371 gabaergic effect Effects 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 2
- 206010022437 insomnia Diseases 0.000 description 2
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 2
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 2
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 2
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 2
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OJMMVQQUTAEWLP-KIDUDLJLSA-N lincomycin Chemical compound CN1C[C@H](CCC)C[C@H]1C(=O)N[C@H]([C@@H](C)O)[C@@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](SC)O1 OJMMVQQUTAEWLP-KIDUDLJLSA-N 0.000 description 2
- 229960005287 lincomycin Drugs 0.000 description 2
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 2
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 2
- 239000006872 mrs medium Substances 0.000 description 2
- FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N ninhydrin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C(O)(O)C(=O)C2=C1 FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 2
- 229960002351 oleandomycin Drugs 0.000 description 2
- RZPAKFUAFGMUPI-KGIGTXTPSA-N oleandomycin Chemical compound O1[C@@H](C)[C@H](O)[C@@H](OC)C[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](C)C(=O)O[C@H](C)[C@H](C)[C@H](O)[C@@H](C)C(=O)[C@]2(OC2)C[C@H](C)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@H](C[C@@H](C)O2)N(C)C)O)[C@H]1C RZPAKFUAFGMUPI-KGIGTXTPSA-N 0.000 description 2
- 235000019367 oleandomycin Nutrition 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 229920000024 polymyxin B Polymers 0.000 description 2
- 229960005266 polymyxin b Drugs 0.000 description 2
- LXNHXLLTXMVWPM-UHFFFAOYSA-N pyridoxine Chemical compound CC1=NC=C(CO)C(CO)=C1O LXNHXLLTXMVWPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960001225 rifampicin Drugs 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- QZAYGJVTTNCVMB-UHFFFAOYSA-N serotonin Chemical compound C1=C(O)C=C2C(CCN)=CNC2=C1 QZAYGJVTTNCVMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 239000011877 solvent mixture Substances 0.000 description 2
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 2
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 2
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 2
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 210000001186 vagus nerve Anatomy 0.000 description 2
- 229960003165 vancomycin Drugs 0.000 description 2
- MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-N vancomycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=C2C=C3C=C1OC1=CC=C(C=C1Cl)[C@@H](O)[C@H](C(N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H]3C(=O)N[C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](C3=CC(O)=CC(O)=C3C=3C(O)=CC=C1C=3)C(O)=O)=O)[C@H](O)C1=CC=C(C(=C1)Cl)O2)=O)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC)[C@H]1C[C@](C)(N)[C@H](O)[C@H](C)O1 MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-N 0.000 description 2
- MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N vancomycin Natural products O1C(C(=C2)Cl)=CC=C2C(O)C(C(NC(C2=CC(O)=CC(O)=C2C=2C(O)=CC=C3C=2)C(O)=O)=O)NC(=O)C3NC(=O)C2NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(CC(C)C)NC)C(O)C(C=C3Cl)=CC=C3OC3=CC2=CC1=C3OC1OC(CO)C(O)C(O)C1OC1CC(C)(N)C(O)C(C)O1 MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SFLSHLFXELFNJZ-QMMMGPOBSA-N (-)-norepinephrine Chemical compound NC[C@H](O)C1=CC=C(O)C(O)=C1 SFLSHLFXELFNJZ-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- SJZRECIVHVDYJC-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxybutyric acid Chemical compound OCCCC(O)=O SJZRECIVHVDYJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GMVPRGQOIOIIMI-DODZYUBVSA-N 7-[(1R,2R,3R)-3-hydroxy-2-[(3S)-3-hydroxyoct-1-enyl]-5-oxocyclopentyl]heptanoic acid Chemical compound CCCCC[C@H](O)C=C[C@H]1[C@H](O)CC(=O)[C@@H]1CCCCCCC(O)=O GMVPRGQOIOIIMI-DODZYUBVSA-N 0.000 description 1
- 208000007848 Alcoholism Diseases 0.000 description 1
- 206010003805 Autism Diseases 0.000 description 1
- 208000020706 Autistic disease Diseases 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 108010001478 Bacitracin Proteins 0.000 description 1
- 108010062877 Bacteriocins Proteins 0.000 description 1
- 241001608472 Bifidobacterium longum Species 0.000 description 1
- 241000222122 Candida albicans Species 0.000 description 1
- 206010009900 Colitis ulcerative Diseases 0.000 description 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 102000004300 GABA-A Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108090000839 GABA-A Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000017934 GABA-B receptor Human genes 0.000 description 1
- 108060003377 GABA-B receptor Proteins 0.000 description 1
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 1
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010020575 Hyperammonaemia Diseases 0.000 description 1
- 241000588747 Klebsiella pneumoniae Species 0.000 description 1
- 229930195714 L-glutamate Natural products 0.000 description 1
- 240000001046 Lactobacillus acidophilus Species 0.000 description 1
- 235000013956 Lactobacillus acidophilus Nutrition 0.000 description 1
- 241000186673 Lactobacillus delbrueckii Species 0.000 description 1
- 241000186606 Lactobacillus gasseri Species 0.000 description 1
- 240000000696 Lactobacillus helveticus R0052 Species 0.000 description 1
- 235000005877 Lactobacillus helveticus R0052 Nutrition 0.000 description 1
- 241000186605 Lactobacillus paracasei Species 0.000 description 1
- 235000010271 Lactobacillus plantarum subsp plantarum ST III Nutrition 0.000 description 1
- 241000787126 Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III Species 0.000 description 1
- 241000186612 Lactobacillus sakei Species 0.000 description 1
- 241000186869 Lactobacillus salivarius Species 0.000 description 1
- 241000110060 Lactobacillus zymae Species 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 241000736262 Microbiota Species 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 208000012902 Nervous system disease Diseases 0.000 description 1
- 208000025966 Neurological disease Diseases 0.000 description 1
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 1
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 1
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 241000607760 Shigella sonnei Species 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 1
- 201000006704 Ulcerative Colitis Diseases 0.000 description 1
- OIPILFWXSMYKGL-UHFFFAOYSA-N acetylcholine Chemical compound CC(=O)OCC[N+](C)(C)C OIPILFWXSMYKGL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004373 acetylcholine Drugs 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 230000008484 agonism Effects 0.000 description 1
- 201000007930 alcohol dependence Diseases 0.000 description 1
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 description 1
- 150000001370 alpha-amino acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 235000008206 alpha-amino acids Nutrition 0.000 description 1
- VREFGVBLTWBCJP-UHFFFAOYSA-N alprazolam Chemical compound C12=CC(Cl)=CC=C2N2C(C)=NN=C2CN=C1C1=CC=CC=C1 VREFGVBLTWBCJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000008485 antagonism Effects 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 230000001430 anti-depressive effect Effects 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 230000002567 autonomic effect Effects 0.000 description 1
- 229960003071 bacitracin Drugs 0.000 description 1
- 229930184125 bacitracin Natural products 0.000 description 1
- CLKOFPXJLQSYAH-ABRJDSQDSA-N bacitracin A Chemical compound C1SC([C@@H](N)[C@@H](C)CC)=N[C@@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]1C(=O)N[C@H](CCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](CC=2C=CC=CC=2)C(=O)N[C@@H](CC=2N=CNC=2)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCCCC1 CLKOFPXJLQSYAH-ABRJDSQDSA-N 0.000 description 1
- 230000000721 bacterilogical effect Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 229940009291 bifidobacterium longum Drugs 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 230000036770 blood supply Effects 0.000 description 1
- 230000007177 brain activity Effects 0.000 description 1
- 230000004641 brain development Effects 0.000 description 1
- 235000021329 brown rice Nutrition 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 229940095731 candida albicans Drugs 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 1
- 230000030570 cellular localization Effects 0.000 description 1
- 241000902900 cellular organisms Species 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 230000003920 cognitive function Effects 0.000 description 1
- 239000007382 columbia agar Substances 0.000 description 1
- 235000014048 cultured milk product Nutrition 0.000 description 1
- 238000006114 decarboxylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 1
- 230000003001 depressive effect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- BABWHSBPEIVBBZ-UHFFFAOYSA-N diazete Chemical compound C1=CN=N1 BABWHSBPEIVBBZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000015872 dietary supplement Nutrition 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 239000002934 diuretic Substances 0.000 description 1
- 230000001882 diuretic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002996 emotional effect Effects 0.000 description 1
- 230000002124 endocrine Effects 0.000 description 1
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 230000006870 function Effects 0.000 description 1
- 235000013376 functional food Nutrition 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 235000021474 generally recognized As safe (food) Nutrition 0.000 description 1
- 235000021473 generally recognized as safe (food ingredients) Nutrition 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 230000009036 growth inhibition Effects 0.000 description 1
- 230000007773 growth pattern Effects 0.000 description 1
- 230000007149 gut brain axis pathway Effects 0.000 description 1
- 230000002949 hemolytic effect Effects 0.000 description 1
- 229960001340 histamine Drugs 0.000 description 1
- 230000003054 hormonal effect Effects 0.000 description 1
- 244000005702 human microbiome Species 0.000 description 1
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 description 1
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000003914 insulin secretion Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 1
- 210000004153 islets of langerhan Anatomy 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 235000021109 kimchi Nutrition 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940039695 lactobacillus acidophilus Drugs 0.000 description 1
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 238000007403 mPCR Methods 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 229940099596 manganese sulfate Drugs 0.000 description 1
- 235000007079 manganese sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011702 manganese sulphate Substances 0.000 description 1
- SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L manganese(II) sulfate Chemical compound [Mn+2].[O-]S([O-])(=O)=O SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 230000007151 microbiome gut brain axis Effects 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 1
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 210000005036 nerve Anatomy 0.000 description 1
- 210000001640 nerve ending Anatomy 0.000 description 1
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 1
- 230000000324 neuroprotective effect Effects 0.000 description 1
- 208000002154 non-small cell lung carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 229960002748 norepinephrine Drugs 0.000 description 1
- SFLSHLFXELFNJZ-UHFFFAOYSA-N norepinephrine Natural products NCC(O)C1=CC=C(O)C(O)=C1 SFLSHLFXELFNJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002417 nutraceutical Substances 0.000 description 1
- 235000021436 nutraceutical agent Nutrition 0.000 description 1
- 230000037324 pain perception Effects 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 230000035479 physiological effects, processes and functions Effects 0.000 description 1
- 229950008882 polysorbate Drugs 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 1
- 208000020016 psychiatric disease Diseases 0.000 description 1
- NGVDGCNFYWLIFO-UHFFFAOYSA-N pyridoxal 5'-phosphate Chemical compound CC1=NC=C(COP(O)(O)=O)C(C=O)=C1O NGVDGCNFYWLIFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000007682 pyridoxal 5'-phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011589 pyridoxal 5'-phosphate Substances 0.000 description 1
- RADKZDMFGJYCBB-UHFFFAOYSA-N pyridoxal hydrochloride Natural products CC1=NC=C(CO)C(C=O)=C1O RADKZDMFGJYCBB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011552 rat model Methods 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000002040 relaxant effect Effects 0.000 description 1
- 230000000241 respiratory effect Effects 0.000 description 1
- 230000003938 response to stress Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 229940076279 serotonin Drugs 0.000 description 1
- 229940115939 shigella sonnei Drugs 0.000 description 1
- 150000004666 short chain fatty acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000021391 short chain fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 230000007727 signaling mechanism Effects 0.000 description 1
- 208000019116 sleep disease Diseases 0.000 description 1
- 208000022925 sleep disturbance Diseases 0.000 description 1
- 230000004037 social stress Effects 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 230000009182 swimming Effects 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- YWYZEGXAUVWDED-UHFFFAOYSA-N triammonium citrate Chemical compound [NH4+].[NH4+].[NH4+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O YWYZEGXAUVWDED-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K tripotassium phosphate Chemical class [K+].[K+].[K+].[O-]P([O-])([O-])=O LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 1
- 208000029729 tumor suppressor gene on chromosome 11 Diseases 0.000 description 1
- 230000001515 vagal effect Effects 0.000 description 1
- 208000019553 vascular disease Diseases 0.000 description 1
- 235000008979 vitamin B4 Nutrition 0.000 description 1
- 235000019158 vitamin B6 Nutrition 0.000 description 1
- 239000011726 vitamin B6 Substances 0.000 description 1
- 229940011671 vitamin b6 Drugs 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
Images
Abstract
Description
Изобретение относится к фармакологии и медицине, в частности неврологии, и касается штаммов лактобацилл, способных синтезировать ГАМК, известную как релаксирующее средство, из ее предшественника глютаминовой кислоты с помощью фермента глутаматдекарбоксилазы. Штаммы могут быть использованы для получения препаратов, используемых в комплексном лечении нейродепрессивных состояний и сопутствующих заболеваний.The invention relates to pharmacology and medicine, in particular neurology, and relates to strains of lactobacilli capable of synthesizing GABA, known as a relaxing agent, from its precursor glutamic acid using the enzyme glutamate decarboxylase. Strains can be used to obtain drugs used in the complex treatment of neurodepressive conditions and concomitant diseases.
Уровень техникиState of the art
γ-Аминомасляная кислота (ГАМК, GABA; C4H9NO2) - аминокислота, важнейший нейромедиатор, участвующий в процессах торможения центральной нервной системы млекопитающих. Не является альфа-аминокислотой и не входит в состав белков. Действие ГАМК в ЦНС осуществляется путем ее взаимодействия со специфическими ГАМКергическими рецепторами (подразделяются на ГАМК-А- и ГАМК-Б-рецепторы), приводящего к ингибированию нервного импульса. Под влиянием ГАМК активируются также энергетические процессы мозга, повышается дыхательная активность тканей, улучшается утилизация мозгом глюкозы, улучшается кровоснабжение. За пределами нервной системы ГАМКергическая система была описана в различных тканях и органах тела человека (кишечнике, желудке, поджелудочной железе, почках, легких, печени и других).γ-Aminobutyric acid (GABA, GABA; C 4 H 9 NO 2 ) is an amino acid, the most important neurotransmitter involved in the inhibition of the central nervous system of mammals. It is not an alpha amino acid and is not a part of proteins. The action of GABA in the central nervous system is carried out by its interaction with specific GABAergic receptors (divided into GABA-A and GABA-B receptors), leading to inhibition of the nerve impulse. Under the influence of GABA, energy processes of the brain are also activated, tissue respiratory activity increases, brain utilization of glucose improves, and blood supply improves. Outside the nervous system, the GABAergic system has been described in various tissues and organs of the human body (intestines, stomach, pancreas, kidneys, lungs, liver, and others).
Гамма-аминомасляная кислота в организме образуется из другой аминокислоты, L-глутамата, с помощью фермента глутаматдекарбоксилазы (GAD, ЕС 4.1.15) в ходе необратимой реакции альфа-декарбоксилирования; кофактором является пиридоксаль 5′-фосфат (активная форма витамина В6).Gamma-aminobutyric acid in the body is formed from another amino acid, L-glutamate, using the enzyme glutamate decarboxylase (GAD, EC 4.1.15) during the irreversible alpha decarboxylation reaction; pyridoxal 5′-phosphate (the active form of vitamin B6) is a cofactor.
ГАМК обнаружена у растений, животных, микроорганизмов (бактерий, грибов, дрожжей).GABA was found in plants, animals, microorganisms (bacteria, fungi, yeast).
ГАМК способствует секреции инсулина клетками поджелудочной железы (Adeghate, Ponery, 2002, GABA in the endocrine pancreas: cellular localization and function in normal and diabetic rats. Tussue Cell, 34, 1-6), снижает давление, имеет диуретический и транквилизационный эффект (Jakobs et al, 1993, Inherited disorders of GABA metabolism. J. Inherit. Metab. Dis., 16, 704-715; Wong et al., 2003, GABA, gamma-hydroxybutyric acid, and neurological disease. Ann. Neurol, 54, suppl 6, S3-S12). Есть данные о том, что ГАМК способствует лечению бессоницы, депрессии, вегетативных расстройств (Okado et al., Effect of the defatted rice germ enriched with GABA for sleeplessness, depression, autonomic disorder by oral administration, 2000, Nippon Shokuhin Kagaku Kaishi, 47, 596-603; Chuang et al., 2011, Antidepressant effect of GABA-rich Monascus-fermented product on forced swimming rat model, J Agric Food Chem, 59, 3027-3034), симптомов хронической алкогольной зависимости (Oh et al., 2003, Germinated brown rice extract shows a nutraceutical effect in the recovery of chronic alcohol-related symptoms, JMedFood 6, 115-121), стимулирует иммунные клетки, имеет антиканцерогенные свойства (Al-Wadei et al., 2012, Social stress promotes and γ-aminobutyric acid inhibits tumor growth in mouse models of non small cell lung cancer, Cancer Prev Res (Phila), 5, 189-196). Наиболее выраженным является действие ГАМК на заболевания нервной системы.GABA promotes insulin secretion by pancreatic cells (Adeghate, Ponery, 2002, GABA in the endocrine pancreas: cellular localization and function in normal and diabetic rats. Tussue Cell, 34, 1-6), reduces pressure, has a diuretic and tranquilization effect (Jakobs et al, 1993, Inherited disorders of GABA metabolism. J. Inherit. Metab. Dis., 16, 704-715; Wong et al., 2003, GABA, gamma-hydroxybutyric acid, and neurological disease. Ann. Neurol, 54,
Огромную роль в жизнедеятельности организма человека играет микробиом, совокупность населяющих его микроорганизмов (преимущественно бактерий). Наиболее сложным по общему числу микроорганизмов и числу составляющих его видов является микробиом кишечника. Совокупность микроорганизмов, населяющих кишечник, выполняет многочисленные функции: участвует в переваривании пищи, подавляет патогенную микрофлору, проявляет антиканцерогенные и иммуномодулирующие свойства и является частью т.н. оси кишечник - мозг (gut - brain axis) (Young, 2012, The intestinal microbiota in health and disease, Curr Opin Gastroenterol, 28:63-9; Cryan and O′Mahony, 2011, The microbiome-gut-brain axis: from bowel to behavior. Neurogastroenterol Motil., 23:187-92). Населяющие ЖКТ бактерии выделяют ряд низкомолекулярных веществ, которые являются нейромедиаторами и гормоноподобными веществами, действующими в первую очередь на нервные окончания в ЖКТ и предающими сигналы в ЦНС. К таким веществам относятся ацетилхолин и другие холины, серотонин, норадреналин, гистамин и другие амины, жирные кислоты с короткими цепями, ГАМК (Roshchina, 2010, Evolutionary Considerations of Neurotransmitters in Microbial, Plant, and Animal Cells, In: Microbial Endocrinology, p. 17-52). Такими связями микробиоты и ЦНС занимается новая область науки - микробная эндокринология. (Clarke et al., 2014, Gut microbiota: the neglected endocrine organ, Mol Endocrinol., 28:1221-38).A huge role in the life of the human body is played by the microbiome, the totality of microorganisms that inhabit it (mainly bacteria). The most complex in the total number of microorganisms and the number of species that make up it is the intestinal microbiome. The set of microorganisms inhabiting the intestine performs numerous functions: it participates in the digestion of food, inhibits pathogenic microflora, exhibits anticarcinogenic and immunomodulating properties, and is part of the so-called gut - brain axis (Young, 2012, The intestinal microbiota in health and disease, Curr Opin Gastroenterol, 28: 63-9; Cryan and O′Mahony, 2011, The microbiome-gut-brain axis: from bowel to behavior. Neurogastroenterol Motil., 23: 187-92). The bacteria that inhabit the gastrointestinal tract secrete a number of low molecular weight substances, which are neurotransmitters and hormone-like substances that act primarily on nerve endings in the digestive tract and transmit signals to the central nervous system. Such substances include acetylcholine and other cholines, serotonin, norepinephrine, histamine and other amines, short chain fatty acids, GABA (Roshchina, 2010, Evolutionary Considerations of Neurotransmitters in Microbial, Plant, and Animal Cells, In: Microbial Endocrinology, p. 17-52). These relationships of microbiota and the central nervous system are engaged in a new field of science - microbial endocrinology. (Clarke et al., 2014, Gut microbiota: the neglected endocrine organ, Mol Endocrinol., 28: 1221-38).
Влияние кишечной микробиоты на эмоциональное поведение, восприятие боли, сигнальные механизмы, реакцию на стресс у животных, преимущественно грызунов, показано неоднократно (Bravo et al, 2011; Ingestion of Lactobacillus strain regulates emotional behavior and central GABA receptor expression in a mouse via the vagus nerve, Proc Natl Acad Sci USA, 108:16050-5; Diaz et al., 2011, Normal gut microbiota modulates brain development and behavior, Proc Natl Acad Sci USA, 108:3047-52). Эти данные позволяют предполагать, что аналогичный эффект кишечная микробиота может проявлять в организме человека, влияя на его эмоциональное поведение и течение психических заболеваний, что и было показано в ряде работ (Finegold et al., 2002, Gastrointestinal microflora studies in late-onset autism. Clin Infect Dis., 35(Suppl 1):S6-S16; Messaoudi et al., 2011, Assessment of psychotropic-like properties of a probiotic formulation (Lactobacillus helveticus R0052 and Bifidobacterium longum R0175) in rats and human subjects, Br J Nutr, 105:755-764; Tillisch et al., 2013, Consumption of fermented milk product with probiotic modulates brain activity. Gastroenterology, 144, 1394-1401).The effects of intestinal microbiota on emotional behavior, pain perception, signaling mechanisms, and stress responses in animals, mainly rodents, have been shown repeatedly (Bravo et al, 2011; Ingestion of Lactobacillus strain regulates emotional behavior and central GABA receptor expression in a mouse via the vagus nerve , Proc Natl Acad Sci USA, 108: 16050-5; Diaz et al., 2011, Normal gut microbiota modulates brain development and behavior, Proc Natl Acad Sci USA, 108: 3047-52). These data suggest that the intestinal microbiota can exhibit a similar effect in the human body, affecting its emotional behavior and the course of mental illness, as was shown in a number of works (Finegold et al., 2002, Gastrointestinal microflora studies in late-onset autism. Clin Infect Dis., 35 (Suppl 1): S6-S16; Messaoudi et al., 2011, Assessment of psychotropic-like properties of a probiotic formulation (Lactobacillus helveticus R0052 and Bifidobacterium longum R0175) in rats and human subjects, Br J Nutr 105: 755-764; Tillisch et al., 2013, Consumption of fermented milk product with probiotic modulates brain activity. Gastroenterology, 144, 1394-1401).
Лактобактерии обнаруживаются практически во всех отделах тела человека: ЖКТ, коже, вагинальной полости. В отличие от подавляющего большинства бактерий микробиоты человека лактобактерии являются культивируемыми организмами и хорошо изучены генетически. Лактобактерии являются пробиотическими микроорганизмами и считаются безопасными (GRAS - generally regaded as safe), они широко используются в функциональных пищевых продуктах, биологически активных добавках, лекарственных средствах. Пробиотики, и лактобактерии в частности, все чаще используются в комбинированном лечении начальных стадий различных заболеваний (язвенного колита, синдрома воспаленного кишечника, аллергических заболеваний). Преимуществами использования пробиотиков в качестве лекарственных средств является их относительная безвредность и физиологичность по сравнению с химическими препаратами и возможность подбора конкретного препарата - вплоть до индивидуальной терапии - для лечения одного и того же заболевания у разных пациентов.Lactobacilli are found in almost all parts of the human body: the gastrointestinal tract, skin, and vaginal cavity. Unlike the vast majority of bacteria, human microbiota of lactobacilli are cultivated organisms and are well studied genetically. Lactobacilli are probiotic microorganisms and are considered safe (GRAS - generally regaded as safe), they are widely used in functional foods, dietary supplements, and medicines. Probiotics, and lactobacilli in particular, are increasingly used in the combined treatment of the initial stages of various diseases (ulcerative colitis, inflammatory bowel syndrome, allergic diseases). The advantages of using probiotics as medicines are their relative harmlessness and physiology compared to chemical drugs and the possibility of selecting a specific drug - up to individual therapy - for treating the same disease in different patients.
Синтез ГАМК показан у ряда лактобацил, преимущественно у L. brevis (Li et al., 2008, A high gamma-aminobutyric acid-producing Lactobacillus brevis isolated from Chinese traditional paocai, Annales Microbiol., 58, 649-653; Seo et al., 2013, Expression and characterization of a glutamate decarboxylase from Lactobacillus brevis 877G producing gamma-aminobutyric acid, Biosci. Biotechnol. Biochem., 77:853-856; патенты WO 2013107913, 2013 г., KR 20140100370, 2013; KR 20140048488, 2012), у некоторых штаммов L. plantarum (патенты KR 20140087518, 2012 г., KR 20120007917, 2010 г.), а также у L. paracasei, L. buchneri, L. helveticus, L. delbrueckii, L. reuteri, L. zymae (см. обзор Li, Cao, 2010, Lactic acid bacterial cell factories for gamma-aminobutyric acid, Amino Acids, 39:1107-1116).GABA synthesis has been shown in a number of lactobacilli, mainly in L. brevis (Li et al., 2008, A high gamma-aminobutyric acid-producing Lactobacillus brevis isolated from Chinese traditional paocai, Annales Microbiol., 58, 649-653; Seo et al. , 2013, Expression and characterization of a glutamate decarboxylase from Lactobacillus brevis 877G producing gamma-aminobutyric acid, Biosci. Biotechnol. Biochem., 77: 853-856; patents WO 2013107913, 2013, KR 20140100370, 2013; KR 20140048488, 2012; ), in some strains of L. plantarum (patents KR 20140087518, 2012, KR 20120007917, 2010), as well as in L. paracasei, L. buchneri, L. helveticus, L. delbrueckii, L. reuteri, L. zymae (see review Li, Cao, 2010, Lactic acid bacterial cell factories for gamma-aminobutyric acid, Amino Acids, 39: 1107-1116).
Введение лактобацилл перорально животным (мышам и крысам) снижает состояние тревоги, регулирует эмоциональное состояние и обцессивно-компусивное поведение (Luo et al., 2014, Ingestion of Lactobacillus strain reduces anxiety and improves cognitive function in the hyperammonemia rat, Sci China Life Sci. 57:327-35; Perez-Burgos et al., 2013, Psychoactive bacteria Lactobacillus rhamnosus (JB-1) elicits rapid frequency facilitation in vagal afferents, Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 304:G211-20;The administration of lactobacilli orally to animals (mice and rats) reduces anxiety, regulates emotional state and compulsive-compulsive behavior (Luo et al., 2014, Ingestion of Lactobacillus strain reduces anxiety and improves cognitive function in the hyperammonemia rat, Sci China Life Sci. 57 : 327-35; Perez-Burgos et al., 2013, Psychoactive bacteria Lactobacillus rhamnosus (JB-1) elicits rapid frequency facilitation in vagal afferents, Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 304: G211-20;
Показана связь между продукцией ГАМК лактобактериями и их действием на нервную систему (Cho et al., 2007, Production of gamma-aminobutyric acid (GABA) by Lactobacillus buchneri isolated from kimchi and its neuroprotective effect on neuronal cells, J Microbiol Biotechnol., 2007, 17:104-9; Bravo et al., 2011, Ingestion of Lactobacillus strain regulates emotional behavior and central GABA receptor expression in a mouse via the vagus nerve, Proceedings of the National Academy of Sciences of the US America, 108:16050-16055).A relationship has been shown between the production of GABA lactobacilli and their effect on the nervous system (Cho et al., 2007, Production of gamma-aminobutyric acid (GABA) by Lactobacillus buchneri isolated from kimchi and its neuroprotective effect on neuronal cells, J Microbiol Biotechnol., 2007, 17: 104-9; Bravo et al., 2011, Ingestion of Lactobacillus strain regulates emotional behavior and central GABA receptor expression in a mouse via the vagus nerve, Proceedings of the National Academy of Sciences of the US America, 108: 16050-16055 )
На данный момент лекарственные препараты на основе лактобактерий, направленные на комплексное лечение нейродепрессивных сосотояний (тревоги, нарушений сна, депрессии и др.) отсутствуют. Есть отдельные зарубежные работы, предлагающие штаммы лактобактерий для таких целей (Barrett et al., 2012, γ-Aminobutyric acid production by culturable bacteria from the human intestine, J Appl Microbiol., 113:411-7; патент WO 2013107913, Stanton et al, 2013, Gaba-producing culturable bacteria derived from the human gastrointestinal tract). Описанные в них штаммы являются ближайшим аналогом изобретения.At the moment, there are no drugs based on lactobacilli aimed at the complex treatment of neurodepressive conditions (anxiety, sleep disturbances, depression, etc.). There are some foreign works that offer strains of lactobacilli for such purposes (Barrett et al., 2012, γ-Aminobutyric acid production by culturable bacteria from the human intestine, J Appl Microbiol., 113: 411-7; patent WO 2013107913, Stanton et al , 2013, Gaba-producing culturable bacteria derived from the human gastrointestinal tract). The strains described therein are the closest analogue of the invention.
Мы полагаем, что разработка таких штаммов и препаратов на их основе необходимы. В России необходимы препараты на основе российских штаммов лактобацилл, адаптированных для российской популяции, с учетом происхождения штамма (т.е. выделенные из ЖКТ людей - жителей центрального региона России). Депонируемые штаммы отличаются от всех описанных ранее тем, что они 1. выделены из ЖКТ именно жителей центрального региона России; 2.имеют отличную от других штаммов последовательность гена глутаматдекарбоксилазы (см. ниже).We believe that the development of such strains and preparations based on them are necessary. In Russia, preparations are needed based on Russian strains of lactobacilli adapted for the Russian population, taking into account the origin of the strain (i.e., people isolated from the gastrointestinal tract - residents of the central region of Russia). Deposited strains differ from all the previously described strains in that they 1. are isolated from the gastrointestinal tract of the inhabitants of the central region of Russia; 2. have a glutamate decarboxylase gene sequence different from other strains (see below).
Раскрытие изобретенияDisclosure of invention
Задачей настоящего изобретения является поиск и отбор штаммов лактобацилл, выделенных из организма людей - жителей центрального региона России, обладающих пробиотическими свойствами и способных синтезировать и выделять в среду ГАМК.The objective of the present invention is the search and selection of strains of lactobacilli isolated from the body of people - residents of the central region of Russia, with probiotic properties and capable of synthesizing and secreting GABA into the environment.
Отбор штаммов.The selection of strains.
Была проверена коллекция штаммов лактобацилл, состоящая из видов L. rhamnosus, L. fermentum, L. brevis, L. casei, L. plantarum, L. helveticus, L. salivarius, L. sakei, L. reuteri, L. mucosa, L. crispatus, L. buchneri, L. gasseri, L. delbrieckii, всего 100 штаммов, на наличие ГАМК в культуральной среде. Штаммы выращивали в среде MRS с 1% глутамата натрия и определяли наличие ГАМК методом тонкослойной хромотографии на пластинах на стеклянной подложке Silica gel 60 F254 (Merck). Количество образуемой ГАМК определяли методом двумерного сканирования пластинок на денситометре Shimadzu. Синтез ГАМК был установлен у штаммов L. plantarum и L. brevis (см пример 1). Были отобраны два штамма, принадлежащие к этим видам, имеющие достаточно высокий уровень синтеза ГАМК и характеризующиеся рядом пробиотических свойств - Lactobacillus brevis 15f и Lactobacillus plantarum 90sk.A collection of lactobacilli strains was examined, consisting of the species L. rhamnosus, L. fermentum, L. brevis, L. casei, L. plantarum, L. helveticus, L. salivarius, L. sakei, L. reuteri, L. mucosa, L crispatus, L. buchneri, L. gasseri, L. delbrieckii, a total of 100 strains, for the presence of GABA in the culture medium. The strains were grown in MRS medium with 1% sodium glutamate and the presence of GABA was determined by thin layer chromatography on plates on a glass
Штамм L. brevis 15f выделен в 2010 г. в г. Твери из фекалий здоровой девушки в возрасте 19 лет.The strain L. brevis 15f was isolated in 2010 in the city of Tver from the feces of a healthy girl at the age of 19 years.
Штамм L. plantarum 90sk выделен в 2011 г. в г. Твери из кишечного биоптата женщины 56 лет.The strain L. plantarum 90sk was isolated in 2011 in Tver from an intestinal biopsy of a 56-year-old woman.
Штаммы охарактеризованы в соответствии с требованиями по биобезопасности, опубликованными в Фармакопейной статье «Пробиотики для медицинского применения» Министерства здравоохранения Российской Федерации (Государственный стандарт качества лекарственных средств).The strains are characterized in accordance with the requirements for biosafety published in the Pharmacopoeia article “Probiotics for medical use” of the Ministry of Health of the Russian Federation (State standard for the quality of medicines).
Штаммы депонированы в ВКПМ (г. Москва) в октябре 2014 г., коллекционные номераThe strains were deposited in VKPM (Moscow) in October 2014, collection numbers
Для L. brevis 15f - В-12077For L. brevis 15f - B-12077
Для L. plantarum 90sk - В-12076For L. plantarum 90sk - B-12076
Определение видовой принадлежности патентуемых штаммов.Determination of species affiliation of patentable strains.
Определение видовой принадлежности штамма L. brevis 15st было проведено по нуклеотидной последовательности гена 16S РНК. Штамм был идентифицирован как L. brevis, см. пример 2.The species affiliation of the strain L. brevis 15st was determined by the nucleotide sequence of the 16S RNA gene. The strain was identified as L. brevis, see example 2.
Определение видовой принадлежности штамма L. plantarum 90sk проводили: 1. по нуклеотидной последовательности гена 16S рибосомной РНК; 2. с помощью видоспецифических праймеров, сделанных по гену recA; 3. с помощью видоспецифических праймеров и НП межгенного района, предшествующего первому гену оперона F0F1 синтазы atpB. Штамм был идентифицирован как L. plantarum, см. пример 3.The species affiliation of the strain L. plantarum 90sk was determined: 1. by the nucleotide sequence of the 16S ribosomal RNA gene; 2. using species-specific primers made on the recA gene; 3. using species-specific primers and NP of the intergenic region preceding the first gene of the operon F0F1 synthase atpB. The strain was identified as L. plantarum, see example 3.
Культурально-морфологические особенности штаммов:Cultural and morphological features of the strains:
По данным свойствам оба штамма неотличимы друг от друга.According to these properties, both strains are indistinguishable from each other.
Морфологические и тинкториальные свойства: грамположительные бесспоровые палочки короткие и длинные (2-5 мкм) с закругленными концами, некоторые расположены в цепочку.Morphological and tinctorial properties: gram-positive, non-spore rods are short and long (2-5 microns) with rounded ends, some are arranged in a chain.
Выросшие колонии имели следующие культуральные свойства: колонии S-формы 1-2 мм, выпуклые, гладкие, светло-желтого или белого цвета с ровными краями. При культивировании в жидкой среде MRS в течение 22-24 ч происходит равномерное помутнение среды по всему ее объему, кроме зоны аэробиоза, с образованием осадка.The grown colonies had the following cultural properties: S-shaped colonies of 1-2 mm, convex, smooth, light yellow or white with even edges. When cultured in liquid MRS for 22-24 hours, a uniform turbidity of the medium occurs over its entire volume, except for the aerobiosis zone, with the formation of a precipitate.
Способ, условия и состав сред для размножения штаммов.The method, conditions and composition of the media for the propagation of strains.
Штаммы культивировали на жидкой и агаризованной средах MRS (Himedia) в течении 24-48 час. Состав среды MRS на 1 литр в граммах: протеозопептон - 10,0; мясной экстракт - 10,0; дрожжевой экстракт - 5,0; глюкоза - 20,0; полисорбат 80-1,0; цитрат аммония - 2,0; ацетат натрия - 5,0; сульфат магния - 0,1; сульфат марганца - 0,05; фосфат калия двузамещенный - 2,0. pH (при 25°С) 6,5. Культивирование осуществляли как в анаэробных условиях с использованием анаэростата и системы GasPak+, так и в аэробном режиме. Температура инкубации 37°С.The strains were cultured on liquid and agar medium MRS (Himedia) for 24-48 hours. The composition of the MRS medium per 1 liter in grams: proteozopeptone - 10.0; meat extract - 10.0; yeast extract - 5.0; glucose - 20.0; polysorbate 80-1.0; ammonium citrate - 2.0; sodium acetate - 5.0; magnesium sulfate - 0.1; manganese sulfate - 0.05; disubstituted potassium phosphate - 2.0. pH (at 25 ° C) 6.5. Cultivation was carried out both under anaerobic conditions using an anaerostat and the GasPak + system, and in aerobic mode. The incubation temperature is 37 ° C.
Активность (продуктивность) штаммов.Activity (productivity) of strains.
В MRS-бульоне продуктивность штаммов достигала 109 кл/мл.In MRS broth, strain productivity reached 10 9 cells / ml.
Антагонистическое действие на бактериальные и дрожжевые тест-культуры выявляли методом агаровых слоев на бактериальных тест-штаммах: Staphylococcus aureus АТСС 25923, Pseudomonas aeruginosa АТСС 27853, Shigella sonnei I фазы 941, Bacillus subtillis 534, Escherichia coli 25922, Klebsiella pneumoniae K1 5054, Candida albicans ATCC 885-653. Штамм L. plantarum 90sk проявлял во всех случаях высокую антагонистическую активность, штамм L. brevis 15st - среднюю и низкую (см. пример 4).The antagonistic effect on bacterial and yeast test culture detected by agar layers on bacterial test strains: Staphylococcus aureus ATCC 25923, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Shigella sonnei I phase 941, Bacillus subtillis 534, Escherichia coli 25922, Klebsiella pneumoniae K 1 5054, Candida albicans ATCC 885-653. The strain L. plantarum 90sk showed high antagonistic activity in all cases, the strain L. brevis 15st - medium and low (see example 4).
У обоих штаммов выявлено отсутствие гемолитической, протеолитической, летициназной, ДНК-ной и РНК-ной активностей.Both strains showed a lack of hemolytic, proteolytic, leticinase, DNA and RNA activity.
Устойчивость (чувствительность) к антибиотикам.Resistance (sensitivity) to antibiotics.
Штамм L. brevis 15f устойчив к канамицину, амикацину, полимиксину В, бацитрацину, ванкомицину, стрептомицину, линкомицину, промежуточно устойчив к ампициллину, тетрациклину, чувствителен к рифампицину, хлорамфениколу, азитромицину, олеандомицину, эритромицину, гентамицину, неомицину. Штамм L. plantarum 90sk устойчив к канамицину, гентамицину, стрептомицину, неомицину, амикацину, линкомицину, полимиксину В, ванкомицину, промежуточно устойчив к ампициллину, азитромицину, олеандомицину, чувствителен к рифампицину, хлорамфениколу, тетрациклину, эритромицину. Устойчивость не связана с генами, расположенными на мобильных генетических элементах.The strain L. brevis 15f is resistant to kanamycin, amikacin, polymyxin B, bacitracin, vancomycin, streptomycin, lincomycin, intermediate resistant to ampicillin, tetracycline, sensitive to rifampicin, chloramphenicol, azithromycin, oleandomycin, erythromycin, erythromycin, erythromycin. The strain L. plantarum 90sk is resistant to kanamycin, gentamicin, streptomycin, neomycin, amikacin, lincomycin, polymyxin B, vancomycin, intermediate resistant to ampicillin, azithromycin, oleandomycin, sensitive to rifampicin, chloramphenicol, tetracycline,. Resistance is not related to genes located on mobile genetic elements.
Продукты, синтезируемые штаммами:Products synthesized by strains:
При выращивании в питательном бульоне MRS с 1% глутамата натрия патентуемые штаммы синтезируют и секретируют в среду ГАМК. Максимальное количество ГАМК в этих условиях обнаруживается при 80-90 часах инкубации (3-3,7 суток) и достигает 770 мг/мл для L. brevis 15f и 220 мг/мл для L. plantarum 90sk (см. примеры 5, 6).When grown in nutrient broth MRS with 1% monosodium glutamate, patented strains are synthesized and secreted into GABA medium. The maximum amount of GABA under these conditions is detected at 80-90 hours of incubation (3-3.7 days) and reaches 770 mg / ml for L. brevis 15f and 220 mg / ml for L. plantarum 90sk (see examples 5, 6) .
Гены глутаматдекарбоксилазы у патентуемых штаммов.Glutamate decarboxylase genes in patentable strains.
У патентуемых штаммов было установлено наличие генов gad (глютаматдекарбоксилазы) и определена нуклеотидная последовательность генов (см. пример 7). Нуклеотидная последовательность генов gad у патентуемых штаммов отличалась от таковой для всех генов gad, депонированных в GenBank, и была уникальной (см. пример 7).In patentable strains, the presence of gad (glutamate decarboxylase) genes was established and the nucleotide sequence of the genes was determined (see Example 7). The nucleotide sequence of gad genes in patentable strains was different from that for all gad genes deposited in GenBank and was unique (see Example 7).
Таким образом, способность штаммов Lactobacillus brevis 15f и Lactobacillus plantarum 90sk продуцировать ГАМК, антагонистическая активность по отношению к патогенной и условно-патогенной микрофлоре, отсутствие протеазной и др. активностей делают возможным использование штаммов по отдельности и в составе различных смесей бактериальных штаммов при производстве лекарственных средств в виде лиофилизированных препаратов, капсул, жидких культур и других аналогичных средств для лечения вегето-сосудистых расстройств и депрессивных состояний. Штаммы отличны от всех описанных ранее штаммов L. plantarum и L. brevis, продуцирующих ГАМК, т.к. выделены из организма людей - жителей центрального региона Российской Федерации и имеют уникальную последовательность генов gad.Thus, the ability of strains of Lactobacillus brevis 15f and Lactobacillus plantarum 90sk to produce GABA, antagonistic activity against pathogenic and conditionally pathogenic microflora, the absence of protease and other activities make it possible to use the strains separately and as part of various mixtures of bacterial strains in the manufacture of medicines in the form of lyophilized preparations, capsules, liquid cultures and other similar agents for the treatment of vegetative-vascular disorders and depressive conditions. The strains are different from all the previously described strains of L. plantarum and L. brevis producing GABA, because isolated from the body of people - residents of the central region of the Russian Federation and have a unique sequence of gad genes.
Примеры по характеристике получения и свойствам штаммов L. brevis 15f и L. plantarum 90sk по настоящему изобретению.Examples on the characteristics of the preparation and properties of the strains L. brevis 15f and L. plantarum 90sk of the present invention.
Пример 1.Example 1
Отбор штаммов, продуцирующих ГАМК.The selection of strains producing GABA.
Пример 2.Example 2
Определение видовой принадлежности штамма L. brevis 15fDetermination of the species affiliation of strain L. brevis 15f
Использовали стандартные праймеры 27f (AGAGTTTGATCCTGGCTCAG) и 1492r (GGTTACCTTGTTACGACTT); (Lane, D.J. 1991. 16S/23S rRNA sequencing. In: Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics, pp. 115-175. Edited by E. Stackebrandt & M. Goodfellow. Chichester: Wiley). Ген состоит из 1563 пн; определяли НП 500 пн (с 46 по 545).Used standard primers 27f (AGAGTTTGATCCTGGCTCAG) and 1492r (GGTTACCTTGTTACGACTT); (Lane, D.J. 1991. 16S / 23S rRNA sequencing. In: Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics, pp. 115-175. Edited by E. Stackebrandt & M. Goodfellow. Chichester: Wiley). The gene consists of 1563 bp;
Пример 3.Example 3
Определение видовой принадлежности штамма Lactobacillus plantarum 90skDetermination of the species affiliation of the strain Lactobacillus plantarum 90sk
1. Для определения вида по нуклеотидной последовательности гена 16S РНК использовали стандартные праймеры 27f (AGAGTTTGATCCTGGCTCAG) и 1492r (GGTTACCTTGTTACGACTT) (Lane, D.J. 1991. 16S/23S rRNA sequencing. In: Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics, pp. 115-175. Edited by E. Stackebrandt & M. Goodfellow. Chichester: Wiley). Ген состоит из 1519 пн; определяли НП 1450 нуклеотидов, с 19 по 1468.1. To determine the species from the 16S RNA gene nucleotide sequence, standard primers 27f (AGAGTTTGATCCTGGCTCAG) and 1492r (GGTTACCTTGTTACGACTT) (Lane, DJ 1991. 16S / 23S rRNA sequencing. In: Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics 115, pp. Edited by E. Stackebrandt & M. Goodfellow. Chichester: Wiley). The gene consists of 1519 bp; NPs of 1450 nucleotides were determined, from 19 to 1468.
по этим данным штамм 90sk неотличим от видов L. plantarum, L. pentosus, L. paraplantarum. С видами L. fabifermentans и L. xiangfangensis он имеет 99% идентичности по НП гена 16S рибосомной РНК, однако различие составляет 10 и более пар нуклеотидов на исследуемый фрагмент, тогда как отличия внутри вида составляют 1-2 пары нуклеотидов. С видом L. mudanjiangensis имеет 98% идентичности, различия обнаруживаются более чем по 30 пн. С видами L. xiangfangensis и L. mudanjiangensis гомологична только часть рассматриваемой нуклеотидной последовательности (1411/1429 и 1405/1437 пар нуклеотидов соответственно).according to these data, strain 90sk is indistinguishable from the species L. plantarum, L. pentosus, L. paraplantarum. With species L. fabifermentans and L. xiangfangensis, it has 99% identity with respect to the 16S ribosomal RNA gene NP, however, the difference is 10 or more pairs of nucleotides per fragment, while the differences within the species are 1-2 pairs of nucleotides. With the species L. mudanjiangensis has 98% identity, differences are found in more than 30 bp. With species L. xiangfangensis and L. mudanjiangensis, only part of the nucleotide sequence under consideration is homologous (1411/1429 and 1405/1437 nucleotides, respectively).
2. Для уточнения идентификации штамма 90sk и более точного отнесения его к одному из близкородственных видов L. plantarum, L. paraplantarum, и L. pentosus, мы провели идентификацию с помощью видоспецифических F-праймеров, сделанных по гену recA: paraF (5′-GTC АСА GGC ATT ACG AAA AC-3′), pentF (5′-CAG TGG CGC GGT TGA TAT C-3′), planF (5′-CCG TTT ATG CGG AAC ACC TA-3′) и общего для них R-праймера pREV (5′-TCG GGA TTA CCA AAC АТС AC-3′), (Torrianiet al. 2001. Differentiation of Lactobacillus plantarum, L. pentosus, and L. paraplantarum by recA gene sequence analysis and multiplex PCR assay with recA gene-derived primers. Appl. Env. Microbiol. 67, 3450-3454).2. To clarify the identification of strain 90sk and to more accurately classify it as one of the closely related species L. plantarum, L. paraplantarum, and L. pentosus, we identified using species-specific F primers made using the recA: paraF gene (5′- GTC ACA GGC ATT ACG AAA AC-3 ′), pentF (5′-CAG TGG CGC GGT TGA TAT C-3 ′), planF (5′-CCG TTT ATG CGG AAC ACC TA-3 ′) and their common R primer pREV (5′-TCG GGA TTA CCA AAC ATS AC-3 ′), (Torrianiet al. 2001. Differentiation of Lactobacillus plantarum, L. pentosus, and L. paraplantarum by recA gene sequence analysis and multiplex PCR assay with recA gene -derived primers. Appl. Env. Microbiol. 67, 3450-3454).
По этому тесту штамм 90sk достоверно отличен от видов L. paraplantarum и L. pentosus и принадлежит к виду L. plantarum.According to this test, strain 90sk is significantly different from L. paraplantarum and L. pentosus species and belongs to the species L. plantarum.
3. Помимо гена 16S рРНК мы используем в работе видоспецифические праймеры и НП межгенного района, предшествующего первому гену оперона F0F1 синтазы atpB3. In addition to the 16S rRNA gene, we use species-specific primers and NPs of the intergenic region, which precedes the first gene of the operon F0F1 synthase atpB
[Патент Ru 2508406 "Метод видовой идентификации лактобацилл L. casei/paracasei, L. fermentum, L. plantarum, L. rhamnosus" AHO «НИЦ «БИОАН» 2012 г.]. Праймеры F0F1Lp1-F (5′-CAAGTCACAATTACTGAGATG-3′) и F0F1Lp-R (5′-TTCAGTTCAGTGGTCTAGCA-3′).[Patent Ru 2508406 "Method for the species identification of lactobacilli L. casei / paracasei, L. fermentum, L. plantarum, L. rhamnosus" AHO "SIC" BIOAN "2012]. Primers F0F1Lp1-F (5′-CAAGTCACAATTACTGAGATG-3 ′) and F0F1Lp-R (5′-TTCAGTTCAGTGGTCTAGCA-3 ′).
Для штамма 90sk эта последовательность выглядит так:For strain 90sk, this sequence looks like this:
Внутри вида L. plantarum различия в последовательности не превышают 1 нуклеотида на последовательность (256 пн). Идентичность с соответствующей НП штаммов L. pentosus составляет менее 92%. Для видов L. paraplantarum, L. fabifermentans гомологичных последовательностей в геномах не обнаруживается.Within the species L. plantarum, differences in the sequence do not exceed 1 nucleotide per sequence (256 bp). The identity with the corresponding NP of L. pentosus strains is less than 92%. For species L. paraplantarum, L. fabifermentans homologous sequences in the genomes are not detected.
Севенированные геномы видов L. xiangfangensis и L. mudanjiangensis в базе данных отсутствуют, сравнение с данными видами невозможно.The isolated genomes of L. xiangfangensis and L. mudanjiangensis species are not available in the database; comparison with these species is impossible.
Таким образом, штамм 90sk относится к виду L. plantarum.Thus, strain 90sk belongs to the species L. plantarum.
Пример 4.Example 4
Синтез ГАМК штаммом L. plantarum 90sk.GABA synthesis by L. plantarum 90sk strain.
Опыт проводили в обычной ростовой среде для лактобактерий MRS, в которую добавляли 1% глютамата натрия - предшественника ГАМК. Синтез и количество ГАМК определяли методом тонкослойной хроматографии на пластинах Silica gel 60 F254 (Merck) и двумерного сканирования пластинок на денситометре Shimadzu. Перед нанесением на пластинку пробы разводили в 10 раз. 2 мкл культуры наносили на пластинку, использовали смесь растворителей н-бутанол-уксусная кислота-вода 4:1:1; в общую смесь добавляли 0,2% нингидрина. После разделения фракций нагревали пластинку при 70°С в течении 10 минут для проявления пятен. Результаты представлены на рис. 1. На рис. 2 представлены графики роста культуры штамма L. plantarum 90sk и продукции ГАМК.The experiment was carried out in a usual growth medium for MRS lactobacilli, to which 1% sodium glutamate, a precursor of GABA, was added. The synthesis and amount of GABA was determined by thin layer chromatography on
Пример 5.Example 5
Синтез ГАМК штаммом L. brevis 15st.GABA synthesis by strain L. brevis 15st.
Опыт проводили в обычной ростовой среде для лактобактерий MRS, в которую добавляли 1% глютамата натрия - предшественника ГАМК. Синтез и количество ГАМК определяли методом тонкослойной хроматографии на пластинах Silica gel 60 F254 (Merck) и двумерного сканирования пластинок на денситометре Shimadzu. Перед нанесением на пластинку пробы разводили в 10 раз. 2 мкл культуры наносили на пластинку, использовали смесь растворителей н-бутанол-уксусная кислота-вода 4:1:1; в общую смесь добавляли 0,2% нингидрина. После разделения фракций нагревали пластинку при 70°С в течении 10 минут для проявления пятен. Результаты представлены на рис. 3. На рис. 4 представлены графики роста культуры штамма L. brevis 15f и продукции ГАМК.The experiment was carried out in a usual growth medium for MRS lactobacilli, to which 1% sodium glutamate, a precursor of GABA, was added. The synthesis and amount of GABA was determined by thin layer chromatography on
Пример 6.Example 6
Определение антагонистической активности штаммов.Determination of antagonistic activity of strains.
Антагонистическую активность определяли при помощи модификации метода отсроченного антагонизма в агаре (Muriana P.M., Klaenhammer T.R. 1987. Conjugal transfer of plasmid-encoded determinants for bacteriocin production and immunity in Lactobacillus acidophilus 88. Appl. Environ. Microbiol. 53, 553-560). Для этого на поверхность плотной питательной среды MRS-aгар бактериологической петлей бляшками с диаметром 15 мм засевали 24 часовые культуры лактобактерий и культивировали 24 часа при 37°С в анаэробных условиях. После культивирования круглым металлическим пробойником с диаметром 16 мм удаляли фрагмент агара с выросшими бактериями. Затем на подготовленные таким образом чашки наносили 5,5 мл расплавленной и остуженной до 50°С полужидкой (0,5% агара) среды Columbia agar, в которую предварительно вносили 0,1 мл суточной культуры индикаторного штамма. После 18-часовой инкубации при 37°С измеряли величину зон задержки роста от края удаленной бляшки до края роста индикаторных штаммов. Исследования по определению антагонистической активности по отношению к индикаторным штаммам микроорганизмов повторяли три раза. Из полученных данных вычисляли среднюю величину. Полученные результаты представлены в таблице 4.Antagonistic activity was determined by modification of the method of delayed agar agonism (Muriana P. M., Klaenhammer T. R. 1987. Conjugal transfer of plasmid-encoded determinants for bacteriocin production and immunity in
Степень антагонизма определяли по следующим критериям:The degree of antagonism was determined by the following criteria:
10 мм и менее - низкая,10 mm or less - low
10-20 мм - средняя,10-20 mm - medium
21 мм и более - высокая.21 mm and more - high.
Р - резистентность.P is resistance.
Пример 7.Example 7
Нуклеотидная последовательность gad-генов (генов глютаматдекарбоксилазы) патентуемых штаммов.The nucleotide sequence of gad genes (glutamate decarboxylase genes) of the patented strains.
Ген gad L. plantarum 90skGene gad L. plantarum 90sk
Для определения НП были использованы праймерыPrimers were used to determine NP
Выравнивание нуклеотидной последовательности с наиболее близким по НП геном штамма Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III gb|CP002222.1| (nucleotide BLAST).Alignment of the nucleotide sequence with the closest NP gene of the strain of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III gb | CP002222.1 | (nucleotide BLAST).
Ген gad L. brevis 15fGene gad L. brevis 15f
Для определения НП были использованы праймерыPrimers were used to determine NP
Выравнивание нуклеотидной последовательности гена с наиболее близким по НП геном штамма Lactobacillus brevis КВ290 из GenBank dbj|АР012167.1| (nucleotide BLAST)Alignment of the nucleotide sequence of the gene with the closest NP gene of the Lactobacillus brevis strain KB290 from GenBank dbj | AP012167.1 | (nucleotide BLAST)
Краткое описание чертежей (рисунков)Brief description of drawings (drawings)
Рис. 1. Динамика синтеза гамма-аминомасляной кислоты штаммом L. plantarum 90sk.Fig. 1. The dynamics of the synthesis of gamma-aminobutyric acid strain L. plantarum 90sk.
Контрольные пробы: позиции 1-3 - ГАМК 1-0,5-0,25 мг/мл; позиция 4: глютамат натрия (Глт - 1 мг/мл); позиция 5: смесь питательной среды MRS и ГАМК. Позиции 6-19 - культуры штамма L. plantarum 90sk, выращенные разное время; время роста культур в часах указано под рисунком.Control samples: positions 1-3 - GABA 1-0.5-0.25 mg / ml; position 4: monosodium glutamate (Glt - 1 mg / ml); position 5: a mixture of nutrient medium MRS and GABA. Positions 6-19 - cultures of the strain L. plantarum 90sk, grown at different times; the crop growth time in hours is indicated below the figure.
Рис. 2. Характер роста штамма L. plantarum 90sk (синтез ГАМК, KOE). Количество синтезированной ГАМК определялось методом тонкослойной хроматографии на пластинах Silica gel 60 F254 (Merck) и двумерного сканирования пластинок на денситометре Shimadzu. Число колониеобразующих единиц бактерий (КОЕ) определяли высевом разведений бактериальной культуры на твердую среду MRS.Fig. 2. The growth pattern of the strain L. plantarum 90sk (synthesis of GABA, KOE). The amount of synthesized GABA was determined by thin layer chromatography on
Рис. 3. Динамика синтеза гамма-аминомасляной кислоты штаммом L. brevis 15st.Fig. 3. The dynamics of the synthesis of gamma-aminobutyric acid strain L. brevis 15st.
Контрольные пробы: позиции 1-3 - ГАМК 1-0,5-0,25 мг/мл; позиция 4: глютамат натрия (Глт - 1 мг/мл); позиция 5: смесь питательной среды MRS и ГАМК. Позиции 6-19 - культуры штамма L. brevis 15f, выращенные разное время; время роста культур в часах указано под рисунком.Control samples: positions 1-3 - GABA 1-0.5-0.25 mg / ml; position 4: monosodium glutamate (Glt - 1 mg / ml); position 5: a mixture of nutrient medium MRS and GABA. Positions 6-19 - cultures of strain L. brevis 15f, grown at different times; the crop growth time in hours is indicated below the figure.
Рис. 4. Характер роста штамма L. brevis 15st (синтез ГАМК, KOE). Количество синтезированной ГАМК определялось методом тонкослойной хроматографии на пластинах Silica gel 60 F254 (Merck) и двумерного сканирования пластинок на денситометре Shimadzu. Число колониеобразующих единиц бактерий (КОЕ) определяли высевом разведений бактериальной культуры на твердую среду MRS.Fig. 4. The nature of the growth of strain L. brevis 15st (synthesis of GABA, KOE). The amount of synthesized GABA was determined by thin layer chromatography on
Пример 2.Example 2
Определение видовой принадлежности штамма L.brevis 15fDetermination of the species affiliation of strain L.brevis 15f
Использовали стандартные праймеры 27f (AGAGTTTGATCCTGGCTCAG) и 1492r (GGTTACCTTGTTACGACTT); (Lane, D. J. 1991. 16S/23S rRNA sequencing. In: Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics, pp. 115-175. Edited by E. Stackebrandt & M. Goodfellow. Chichester: Wiley). Ген состоит из 1563 пн; определяли НП 500 пн (с 46 по 545). Used standard primers 27f (AGAGTTTGATCCTGGCTCAG) and 1492r (GGTTACCTTGTTACGACTT); (Lane, D. J. 1991. 16S / 23S rRNA sequencing. In: Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics, pp. 115-175. Edited by E. Stackebrandt & M. Goodfellow. Chichester: Wiley). The gene consists of 1563 bp;
ATACATGCAAGTCGAACGAGCTTCCGTTGAATGACGTGCTTGCACTGATTTTAACAATGAAGCGAGTGGCGAACTGGTGAGTAACACGTGGGAAATCTGCCCAGAAGCAGGGGATAACACTTGGAAACAGGTGCTAATACCGTATAACAACAAAATCCGCATGGATTTTGTTTGAAAGGTGGCTTCGGCTATCACTTCTGGATGATCCCGCGGCGTATTAGTTAGTTGGTGAGGTAAAGGCCCACCAAGACGATGATACGTAGCCGACCTGAGAGGGTAATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGAAAGTCTGATGGAGCAATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGGTTTCGGCTCGTAAAACTCTGTTGTTAAAGAAGAACACCTTTGAGAGTAACTGTTCAAGGGTTGACGGTATTTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCATACATGCAAGTCGAACGAGCTTCCGTTGAATGACGTGCTTGCACTGATTTTAACAATGAAGCGAGTGGCGAACTGGTGAGTAACACGTGGGAAATCTGCCCAGAAGCAGGGGATAACACTTGGAAACAGGTGCTAATACCGTATAACAACAAAATCCGCATGGATTTTGTTTGAAAGGTGGCTTCGGCTATCACTTCTGGATGATCCCGCGGCGTATTAGTTAGTTGGTGAGGTAAAGGCCCACCAAGACGATGATACGTAGCCGACCTGAGAGGGTAATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGAAAGTCTGATGGAGCAATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGGTTTCGGCTCGTAAAACTCTGTTGTTAAAGAAGAACACCTTTGAGAGTAACTGTTCAAGGGTTGACGGTATTTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCC
Пример 3.Example 3
Определение видовой принадлежности штамма Lactobacillus plantarum 90skDetermination of the species affiliation of the strain Lactobacillus plantarum 90sk
1. Для определения вида по нуклеотидной последовательности гена 16S РНК использовали стандартные праймеры 27f (AGAGTTTGATCCTGGCTCAG) и 1492r (GGTTACCTTGTTACGACTT) (Lane, D. J. 1991. 16S/23S rRNA sequencing. In: Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics, pp. 115-175. Edited by E. Stackebrandt & M. Goodfellow. Chichester: Wiley). Ген состоит из 1519 пн; определяли НП 1450 нуклеотидов, с 19 по 1468. 1 . To determine the species from the 16S RNA gene nucleotide sequence, standard primers 27f (AGAGTTTGATCCTGGCTCAG) and 1492r (GGTTACCTTGTTACGACTT) were used (Lane, DJ 1991. 16S / 23S rRNA sequencing. In: Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics, pp. 115. E. Stackebrandt & M. Goodfellow. Chichester: Wiley). The gene consists of 1519 bp; NPs of 1450 nucleotides were determined, from 19 to 1468.
GCCTAATACATGCAAGTCGAACGAACTCTGGTATTGATTGGTGCTTGCATCATGATTTACATTTGAGTGAGTGGCGAACTGGTGAGTAACACGTGGGAAACCTGCCCAGAAGCGGGGGATAACACCTGGAAACAGATGCTAATACCGCATAACAACTTGGACCGCATGGTCCGAGCTTGAAAGATGGCTTCGGCTATCACTTTTGGATGGTCCCGCGGCGTATTAGCTAGATGGTGGGGTAACGGCTCACCATGGCAATGATACGTAGCCGACCTGAGAGGGTAATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGAAAGTCTGATGGAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGAAGGGTTTCGGCTCGTAAAACTCTGTTGTTAAAGAAGAACATATCTGAGAGTAACTGTTCAGGTATTGACGGTATTTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGGCGGTTTTTTAAGTCTGATGTGAAAGCCTTCGGCTCAACCGAAGAAGTGCATCGGAAACTGGGAAACTTGAGTGCAGAAGAGGACAGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTGTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGTATGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCATACCGTAAACGATGAATGCTAAGTGTTGGAGGGTTTCCGCCCTTCAGTGCTGCAGCTAACGCATTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCTACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATACTATGCAAATCTAAGAGATTAGACGTTCCCTTCGGGGACATGGATACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATTATCAGTTGCCAGCATTAAGTTGGGCACTCTGGTGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGATGGTACAACGAGTTGCGAACTCGCGAGAGTAAGCTAATCTCTTAAAGCCATTCTCAGTTCGGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAGTTTGTAACACCCAAAGTCGGTGGGGTAACCTTTTAGGAACCAGCCGCCTAAGGCCTAATACATGCAAGTCGAACGAACTCTGGTATTGATTGGTGCTTGCATCATGATTTACATTTGAGTGAGTGGCGAACTGGTGAGTAACACGTGGGAAACCTGCCCAGAAGCGGGGGATAACACCTGGAAACAGATGCTAATACCGCATAACAACTTGGACCGCATGGTCCGAGCTTGAAAGATGGCTTCGGCTATCACTTTTGGATGGTCCCGCGGCGTATTAGCTAGATGGTGGGGTAACGGCTCACCATGGCAATGATACGTAGCCGACCTGAGAGGGTAATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGAAAGTCTGATGGAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGAAGGGTTTCGGCTCGTAAAACTCTGTTGTTAAAGAAGAACATATCTGAGAGTAACTGTTCAGGTATTGACGGTATTTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGGCGGTTTTTTAAGTCTGATGTGAAAGCCTTCGGCTCAACCGAAGAAGTGCATCGGAAACTGGGAAACTTGAGTGCAGAAGAGGACAGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTGTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGTATGGGTAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCATACCGTAAACGATGAATGCTAAGTGTTGGAGGGTTTCCGCCCTTCAGTGCTGCAGCTAACGCATTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCTACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATACTATGCAAATCTAAGAGATTAG ACGTTCCCTTCGGGGACATGGATACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATTATCAGTTGCCAGCATTAAGTTGGGCACTCTGGTGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGATGGTACAACGAGTTGCGAACTCGCGAGAGTAAGCTAATCTCTTAAAGCCATTCTCAGTTCGGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAGTTTGTAACACCCAAAGTCGGTGGGGTAACCTTTTAGGAACCAGCCGCCTAAG
3. Помимо гена 16S рРНК мы используем в работе видоспецифические праймеры и НП межгенного района, предшествующего первому гену оперона F0F1 синтазы atpB 3. In addition to the 16S rRNA gene, we use species-specific primers and NPs of the intergenic region, which precedes the first gene of the operon F0F1 synthase atpB
[Патент Ru 2508406 “Метод видовой идентификации лактобацилл L.casei/paracasei, L.fermentum, L.plantarum, L.rhamnosus” АНО «НИЦ «БИОАН» 2012 г.]. Праймеры F0F1Lpl-F (5'-CAAGTCACAATTACTGAGATG-3') и F0F1Lp-R (5'- TTCAGTTCAGTGGTCTAGCA -3').[Ru Patent 2508406 "Method of identifying species of lactobacilli L.casei / paracasei, L.fermentum, L.plantarum, L.rhamnosus" ELN "NIC" biota "2012 g of. ]. Primers F0F1Lpl-F (5'-CAAGTCACAATTACTGAGATG-3 ') and F0F1Lp-R (5'-TTCAGTTCAGTGGTCTAGCA -3').
Для штамма 90sk эта последовательность выглядит так:For strain 90sk, this sequence looks like this:
GCCGTCATTGCGCGTGCCAAGAATGAAAATAAAGTCAAAATAATGAAAATCCAACGATTTGAAAGCTTAATGAAAGCTTGATATTGTTGGATTTTTATTGATTGACGAAATGTTGAAATTATTTTGAATTTTTTCGACGGTGGTGGTATTATTACCTTTGTATTTTGATTAGGGGTGTCTCTAATCTACCATTTCAGGTTACGATAAAATTGACGTTGACTAGCTCAAAGGTTAAGGTTATCGTAGCACCGAAATTAAAGGAAAGAGGTGATATTCAGCCGTCATTGCGCGTGCCAAGAATGAAAATAAAGTCAAAATAATGAAAATCCAACGATTTGAAAGCTTAATGAAAGCTTGATATTGTTGGATTTTTATTGATTGACGAAATGTTGAAATTATTTTGAATTTTTTCGACGGTGGTGGTATTATTACCTTTGTATTTTGATTAGGGGTGTCTCTAATCTACCATTTCAGGTTACGATAAAATTGACGTTGACTAGCTCAAAGGTTAAGGTTATCGTAGCACCGAAATTAAAGGAAAGAGGTGATATTCA
Пример 7.Example 7
Нуклеотидная последовательность gad-генов (генов глютаматдекарбоксилазы) патентуемых штаммов.The nucleotide sequence of gad genes (glutamate decarboxylase genes) of the patented strains.
Ген gad L.plantarum 90skGene gad L.plantarum 90sk
Для определения НП были использованы праймерыPrimers were used to determine NP
GDLp1-F CCTGTTATCACCTCGTGCTA; GDLp1-R TTGAATCTCGCGGTAACCGT;GDLp1-F CCTGTTATCACCTCGTGCTA; GDLp1-R TTGAATCTCGCGGTAACCGT;
GDLp2-F ATGGGCATCACTTATACCGG; GDLp2-R CACCAAGCTTTGCTATCCAC.GDLp2-F ATGGGCATCACTTATACCGG; GDLp2-R CACCAAGCTTTGCTATCCAC.
НП1NP1
ATGGCAATGTTATACGGTAAACACAATCATGAAGCTGAAGAATACTTGGAACCAGTCTTTGGTGCGCCTTCTGAACAACATGATCTTCCTAAGTATCGGTTACCAAAGCATTCATTATCCCCTCGAGAAGCCGATCGCTTAGTTCGTGATGAATTATTAGATGAAGGCAATTCACGACTGAACCTGGCAACTTTTTGTCAGACCTATATGGAACCCGAAGCCGTTGAATTGATGAAGGATACGCTGGCTAAGAATGCCATCGACAAATCTGAGTACCCCCGCACGGCCGAGATTGAAAATCGGTGTGTGAACATTATTGCCAATCTGTGGCACGCACCTGATGACGAACACTTTACGGGTACCTCTACGATTGGCTCCTCTGAAGCTTGTATGTTAGGCGGTTTAGCAATGAAATTCGCCTGGCGTAAACGCGCTCAAGCGGCAGGTTTAGATCTGAATGCCCATCGACCTAACCTCGTTATTTCGGCTGGCTATCAAGTTTGCTGGGAAAAGTTTTGTGTCTACTGGGACGTTGACATGCACGTGGTCCCAATGGATGAGCAACACATGGCCCTTGACGTTAACCACGTCTTAGACTACGTGGACGAATACACAATTGGTATCGTCGGTATCATGGGCATCACTTATACCGGTCAATATGACGACCTAGCCGCACTCGATAAGGTCGTTACTCACTACAATCATCAGCATCCCAAATTACCAGTCTACATTCACGTTGACGCAGCGTCAGGTGGCTTCTATACCCCATTTATTGAGCCGCAACTCATCTGGGACTTCCGGTTGGCTAACGTCGTTTCGATCAACGCCTCCGGGCACAAGTACGGTTTAGTTTATCCCGGGGTCGGCTGGGTCGTTTGGCGTGATCGTCAGTTTTTACCGCCAGAATTAGTCTTCAAAGTTAGTTATTTAGGTGGGGAGTTGCCGACAATGGCGATCAATTTCTCACATAGTGCAGCCCAGCTCATTGGACAATACTATAATTTCATTCGCTTTGGTATGGGCGGTTACCGCGAGATTCAAACAAAGACTCACGATGTTGCCCGCTACCTGGCAGCCGCTCTGGATAAAGTTGGTGAGTTTAAGATGATCAATAACGGACACCAACTCCCCCTGATTTGTTACCAACTAGCCCCGCGCGAAGATCGTGAATGGACCCTTTATGATTTATCGGATCGCCTATTAATGAACGGTTGGCAAGTACCAACGTATCCTTTACCTGCTAATCTGGAACAACAAGTCATCCAACGAATCGTCGTTCGGGCTGACTTTGGCATGAATATGGCCCACGATTTCATGGATGACCTGACCAAGGCTGTCCATGACTTAAACCACGCCCACATTGTCTATCATCATGACGCGGCACCTAAGAAATACGGATTCACACACTGAATGGCAATGTTATACGGTAAACACAATCATGAAGCTGAAGAATACTTGGAACCAGTCTTTGGTGCGCCTTCTGAACAACATGATCTTCCTAAGTATCGGTTACCAAAGCATTCATTATCCCCTCGAGAAGCCGATCGCTTAGTTCGTGATGAATTATTAGATGAAGGCAATTCACGACTGAACCTGGCAACTTTTTGTCAGACCTATATGGAACCCGAAGCCGTTGAATTGATGAAGGATACGCTGGCTAAGAATGCCATCGACAAATCTGAGTACCCCCGCACGGCCGAGATTGAAAATCGGTGTGTGAACATTATTGCCAATCTGTGGCACGCACCTGATGACGAACACTTTACGGGTACCTCTACGATTGGCTCCTCTGAAGCTTGTATGTTAGGCGGTTTAGCAATGAAATTCGCCTGGCGTAAACGCGCTCAAGCGGCAGGTTTAGATCTGAATGCCCATCGACCTAACCTCGTTATTTCGGCTGGCTATCAAGTTTGCTGGGAAAAGTTTTGTGTCTACTGGGACGTTGACATGCACGTGGTCCCAATGGATGAGCAACACATGGCCCTTGACGTTAACCACGTCTTAGACTACGTGGACGAATACACAATTGGTATCGTCGGTATCATGGGCATCACTTATACCGGTCAATATGACGACCTAGCCGCACTCGATAAGGTCGTTACTCACTACAATCATCAGCATCCCAAATTACCAGTCTACATTCACGTTGACGCAGCGTCAGGTGGCTTCTATACCCCATTTATTGAGCCGCAACTCATCTGGGACTTCCGGTTGGCTAACGTCGTTTCGATCAACGCCTCCGGGCACAAGTACGGTTTAGTTTATCCCGGGGTCGGCTGGGTCGTTTGGCGTGATCGTCAGTTTTTACCGCCAGAATTAGTCTTCAAAGTTAGTTATTTAGGTGGGGAGTTGCCGACAATGGCGATCAATTTCTCACATAGTGCAGCCCAGCTCATTGGACAATACTATA ATTTCATTCGCTTTGGTATGGGCGGTTACCGCGAGATTCAAACAAAGACTCACGATGTTGCCCGCTACCTGGCAGCCGCTCTGGATAAAGTTGGTGAGTTTAAGATGATCAATAACGGACACCAACTCCCCCTGATTTGTTACCAACTAGCCCCGCGCGAAGATCGTGAATGGACCCTTTATGATTTATCGGATCGCCTATTAATGAACGGTTGGCAAGTACCAACGTATCCTTTACCTGCTAATCTGGAACAACAAGTCATCCAACGAATCGTCGTTCGGGCTGACTTTGGCATGAATATGGCCCACGATTTCATGGATGACCTGACCAAGGCTGTCCATGACTTAAACCACGCCCACATTGTCTATCATCATGACGCGGCACCTAAGAAATACGGATTCACACACTGA
Выравнивание нуклеотидной последовательности с наиболее близким по НП геном штамма Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III gb|CP002222.1| (nucleotide BLAST). Alignmentthe nucleotide sequence with the closest NP gene of the strainLactobacillus plantarum subsp.plantarum ST-III gb | CP002222.1 | (nucleotide BLAST).
Query 1 ATGGCAATGTTATACGGTAAACACAATCATGAAGCTGAAGAATACTTGGAACCAGTCTTT 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2998620 ATGGCAATGTTATACGGTAAACACAATCATGAAGCTGAAGAATACTTGGAACCAGTCTTT 2998679Sbjct 2998620 ATGGCAATGTTATACGGTAAACACAATCATGAAGCTGAAGAATACTTGGAACCAGTCTTT 2998679
Query 61 GGTGCGCCTTCTGAACAACATGATCTTCCTAAGTATCGGTTACCAAAGCATTCATTATCC 120Query 61
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2998680 GGTGCGCCTTCTGAACAACATGATCTTCCTAAGTATCGGTTACCAAAGCATTCATTATCC 2998739Sbjct 2998680 GGTGCGCCTTCTGAACAACATGATCTTCCTAAGTATCGGTTACCAAAGCATTCATTATCC 2998739
Query 121 CCTCGAGAAGCCGATCGCTTAGTTCGTGATGAATTATTAGATGAAGGCAATTCACGACTG 180Query 121
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2998740 CCTCGAGAAGCCGATCGCTTAGTTCGTGATGAATTATTAGATGAAGGCAATTCACGACTG 2998799Sbjct 2998740 CCTCGAGAAGCCGATCGCTTAGTTCGTGATGAATTATTAGATGAAGGCAATTCACGACTG 2998799
Query 181 AACCTGGCAACTTTTTGTCAGACCTATATGGAACCCGAAGCCGTTGAATTGATGAAGGAT 240Query 181 AACCTGGCAACTTTTTGTCAGACCTATATGGAACCCGAAGCCGTTGAATTGATGAAGGAT 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2998800 AACCTGGCAACTTTTTGTCAGACCTATATGGAACCCGAAGCCGTTGAATTGATGAAGGAT 2998859Sbjct 2998800 AACCTGGCAACTTTTTTGTCAGACCTATATGGAACCCGAAGCCGTTGAATTGATGAAGGAT 2998859
Query 241 ACGCTGGCTAAGAATGCCATCGACAAATCTGAGTACCCCCGCACGGCCGAGATTGAAAAT 300Query 241
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2998860 ACGCTGGCTAAGAATGCCATCGACAAATCTGAGTACCCCCGCACGGCCGAGATTGAAAAT 2998919Sbjct 2998860 ACGCTGGCTAAGAATGCCATCGACAAATCTGAGTACCCCCGCACGGCCGAGATTGAAAAT 2998919
Query 301 CGGTGTGTGAACATTATTGCCAATCTGTGGCACGCACCTGATGACGAACACTTTACGGGT 360Query 301 CGGTGTGTGAACATTATTGCCAATCTGTGGCACGCACCTGATGACGAACACTTTACGGGT 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2998920 CGGTGTGTGAACATTATTGCCAATCTGTGGCACGCACCTGATGACGAACACTTTACGGGT 2998979Sbjct 2998920 CGGTGTGTGAACATTATTGCCAATCTGTGGCACGCACCTGATGACGAACACTTTACGGGT 2998979
Query 361 ACCTCTACGATTGGCTCCTCTGAAGCTTGTATGTTAGGCGGTTTAGCAATGAAATTCGCC 420Query 361 ACCTCTACGATTGGCTCCTCTGAAGCTTGTATGTTAGGCGGTTTAGCAATGAAATTCGCC 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2998980 ACCTCTACGATTGGCTCCTCTGAAGCTTGTATGTTAGGCGGTTTAGCAATGAAATTCGCC 2999039Sbjct 2998980 ACCTCTACGATTGGCTCCTCTGAAGCTTGTATGTTAGGCGGTTTAGCAATGAAATTCGCC 2999039
Query 421 TGGCGTAAACGCGCTCAAGCGGCAGGTTTAGATCTGAATGCCCATCGACCTAACCTCGTT 480Query 421 TGGCGTAAACGCGCTCAAGCGGCAGGTTTAGATCTGAATGCCCATCGACCTAACCTCGTT 480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999040 TGGCGTAAACGCGCTCAAGCGGCAGGTTTAGATCTGAATGCCCATCGACCTAACCTCGTT 2999099Sbjct 2999040 TGGCGTAAACGCGCTCAAGCGGCAGGTTTAGATCTGAATGCCCATCGACCTAACCTCGTT 2999099
Query 481 ATTTCGGCTGGCTATCAAGTTTGCTGGGAAAAGTTTTGTGTCTACTGGGACGTTGACATG 540Query 481 ATTTCGGCTGGCTATCAAGTTTTGCTGGGAAAAGTTTTGTGTCTACTGGGACGTTGACATG 540
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999100 ATTTCGGCTGGCTATCAAGTTTGCTGGGAAAAGTTTTGTGTCTACTGGGACGTTGACATG 2999159Sbjct 2999100 ATTTCGGCTGGCTATCAAGTTTGCTGGGAAAAGTTTTTTGTCTACTGGGACGTTGACATG 2999159
Query 541 CACGTGGTCCCAATGGATGAGCAACACATGGCCCTTGACGTTAACCACGTCTTAGACTAC 600Query 541
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2999160 CACGTGGTCCCAATGGATGAGCAACACATGGTCCTTGACGTTAACCACGTCTTAGACTAC 2999219Sbjct 2999160 CACGTGGTCCCAATGGATGAGCAACACATGGTCCTTGACGTTAACCACGTCTTAGACTAC 2999219
Query 601 GTGGACGAATACACAATTGGTATCGTCGGTATCATGGGCATCACTTATACCGGTCAATAT 660Query 601 GTGGACGAATACACAATTGGTATCGTCGGTATCATGGGCATCACTTATACCGGTCAATAT 660
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999220 GTGGACGAATACACAATTGGTATCGTCGGTATCATGGGCATCACTTATACCGGTCAATAT 2999279Sbjct 2999220 GTGGACGAATACACAATTGGTATCGTCGGTATCATGGGCATCACTTATACCGGTCAATAT 2999279
Query 661 GACGACCTAGCCGCACTCGATAAGGTCGTTACTCACTACAATCATCAGCATCCCAAATTA 720Query 661 GACGACCTAGCCGCACTCGATAAGGTCGTTACTCACTACAATCATCAGCATCCCAAATTA 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999280 GACGACCTAGCCGCACTCGATAAGGTCGTTACTCACTACAATCATCAGCATCCCAAATTA 2999339Sbjct 2999280 GACGACCTAGCCGCACTCGATAAGGTCGTTACTCACTACAATCATCAGCATCCCAAATTA 2999339
Query 721 CCAGTCTACATTCACGTTGACGCAGCGTCAGGTGGCTTCTATACCCCATTTATTGAGCCG 780Query 721 CCAGTCTACATTCACGTTGACGCAGCGTCAGGTGGCTTCTATACCCCATTTATTGAGCCG 780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999340 CCAGTCTACATTCACGTTGACGCAGCGTCAGGTGGCTTCTATACCCCATTTATTGAGCCG 2999399Sbjct 2999340 CCAGTCTACATTCACGTTGACGCAGCGTCAGGTGGCTTCTATACCCCATTTATTGAGCCG 2999399
Query 781 CAACTCATCTGGGACTTCCGGTTGGCTAACGTCGTTTCGATCAACGCCTCCGGGCACAAG 840Query 781 CAACTCATCTGGGACTTCCGGTTGGCTAACGTCGTTTCGATCAACGCCTCCGGGCACAAG 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999400 CAACTCATCTGGGACTTCCGGTTGGCTAACGTCGTTTCGATCAACGCCTCCGGGCACAAG 2999459Sbjct 2999400 CAACTCATCTGGGACTTCCGGTTGGCTAACGTCGTTTCGATCAACGCCTCCGGGCACAAG 2999459
Query 841 TACGGTTTAGTTTATCCCGGGGTCGGCTGGGTCGTTTGGCGTGATCGTCAGTTTTTACCG 900Query 841
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999460 TACGGTTTAGTTTATCCCGGGGTCGGCTGGGTCGTTTGGCGTGATCGTCAGTTTTTACCG 2999519Sbjct 2999460 TACGGTTTAGTTTTATCCCGGGGTCGGCTGGGTCGTTTGGCGTGATCGTCAGTTTTTACCG 2999519
Query 901 CCAGAATTAGTCTTCAAAGTTAGTTATTTAGGTGGGGAGTTGCCGACAATGGCGATCAAT 960Query 901 CCAGAATTAGTCTTCAAAGTTAGTTATTTAGGTGGGGAGTTGCCGACAATGGCGATCAAT 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2999520 CCAGAATTAGTCTTCAAAGTTAGTTATTTAGGTGGGGAGTTGCCGACAATGGCGATCAAC 2999579Sbjct 2999520 CCAGAATTAGTCTTCAAAGTTAGTTATTTAGGTGGGGAGTTGCCGACAATGGCGATCAAC 2999579
Query 961 TTCTCACATAGTGCAGCCCAGCTCATTGGACAATACTATAATTTCATTCGCTTTGGTATG 1020Query 961 TTCTCACATAGTGCAGCCCAGCTCATTGGACAATACTATAATTTCATTCGCTTTGGTATG 1020
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999580 TTCTCACATAGTGCAGCCCAGCTCATTGGACAATACTATAATTTCATTCGCTTTGGTATG 2999639Sbjct 2999580 TTCTCACATAGTGCAGCCCAGCTCATTGGACAATACTATAATTTCATTCGCTTTGGTATG 2999639
Query 1021 GGCGGTTACCGCGAGATTCAAACAAAGACTCACGATGTTGCCCGCTACCTGGCAGCCGCT 1080Query 1021 GGCGGTTACCGCGAGATTCAAACAAAGACTCACGATGTTGCCCGCTACCTGGCAGCCGCT 1080
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2999640 GACGGTTACCGCGAGATTCAAACAAAGACTCACGATGTTGCCCGCTACCTGGCAGCCGCT 2999699Sbjct 2999640 GACGGTTACCGCGAGATTCAAACAAAGACTCACGATGTTGCCCGCTACCTGGCAGCCGCT 2999699
Query 1081 CTGGATAAAGTTGGTGAGTTTAAGATGATCAATAACGGACACCAACTCCCCCTGATTTGT 1140Query 1081 CTGGATAAAGTTGGTGAGTTTAAGATGATCAATAACGGACACCAACTCCCCCTGATTTGT 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999700 CTGGATAAAGTTGGTGAGTTTAAGATGATCAATAACGGACACCAACTCCCCCTGATTTGT 2999759Sbjct 2999700 CTGGATAAAGTTGGTGAGTTTAAGATGATCAATAACGGACACCAACTCCCCCTGATTTGT 2999759
Query 1141 TACCAACTAGCCCCGCGCGAAGATCGTGAATGGACCCTTTATGATTTATCGGATCGCCTA 1200Query 1141 TACCAACTAGCCCCGCGCGAAGATCGTGAATGGACCCTTTATGATTTATCGGATCGCCTA 1200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999760 TACCAACTAGCCCCGCGCGAAGATCGTGAATGGACCCTTTATGATTTATCGGATCGCCTA 2999819Sbjct 2999760 TACCAACTAGCCCCGCGCGAAGATCGTGAATGGACCCTTTATGATTTATCGGATCGCCTA 2999819
Query 1201 TTAATGAACGGTTGGCAAGTACCAACGTATCCTTTACCTGCTAATCTGGAACAACAAGTC 1260Query 1201 TTAATGAACGGTTGGCAAGTACCAACGTATCCTTTACCTGCTAATCTGGAACAACAAGTC 1260
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999820 TTAATGAACGGTTGGCAAGTACCAACGTATCCTTTACCTGCTAATCTGGAACAACAAGTC 2999879Sbjct 2999820 TTAATGAACGGTTGGCAAGTACCAACGTATCCTTTACCTGCTAATCTGGAACAACAAGTC 2999879
Query 1261 ATCCAACGAATCGTCGTTCGGGCTGACTTTGGCATGAATATGGCCCACGATTTCATGGAT 1320Query 1261 ATCCAACGAATCGTCGTTCGGGCTGACTTTGGCATGAATATGGCCCACGATTTCATGGAT 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999880 ATCCAACGAATCGTCGTTCGGGCTGACTTTGGCATGAATATGGCCCACGATTTCATGGAT 2999939Sbjct 2999880 ATCCAACGAATCGTCGTTCGGGCTGACTTTGGCATGAATATGGCCCACGATTTCATGGAT 2999939
Query 1321 GACCTGACCAAGGCTGTCCATGACTTAAACCACGCCCACATTGTCTATCATCATGACGCG 1380Query 1321 GACCTGACCAAGGCTGTCCATGACTTAAACCACGCCCACATTGTCTATCATCATGACGCG 1380
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2999940 GACCTGACCAAGGCTGTCCATGACTTAAACCACGCCCACATTGTCTATCATCATGACGCG 2999999Sbjct 2999940 GACCTGACCAAGGCTGTCCATGACTTAAACCACGCCCACATTGTCTATCATCATGACGCG 2999999
Query 1381 GCACCTAAGAAATACGGATTCACACACTGA 1410Query 1381 GCACCTAAGAAATACGGATTCACACACTGA 1410
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000000 GCACCTAAGAAATACGGATTCACACACTGA 3000029Sbjct 3,000,000 GCACCTAAGAAATACGGATTCACACACTGA 3000029
Ген gad L.brevis 15fGene gad L.brevis 15f
Для определения НП были использованы праймеры Primers were used to determine NP
GDLb1-F TGAGTGCCTTTGTGGTCATG; GDLb1-R TGTTGTGCCGCCAAACAATC;GDLb1-F TGAGTGCCTTTGTGGTCATG; GDLb1-R TGTTGTGCCGCCAAACAATC;
GDLb2-F CTAGATAACCTCGTGACCGA; GDLb2-R TGGGCATTGCCAATGTGCAA.GDLb2-F CTAGATAACCTCGTGACCGA; GDLb2-R TGGGCATTGCCAATGTGCAA.
НП2NP2
ATGAATAAAAACGATCAGGAAACACAGCAGATGATTAATAATGTGGATTTAGAAAAAACGTTTTTAGGCAGTGTCGAAGCCGGACAATCCTTACCTACCAATACATTACCAAATGATCCCATGGCACCGGATGTTGCCGCTCAATTGGTGGAACACTATCGTTTAAATGAAGCCAAGGCTAATCAAAATCTGGCGACCTTCTGTACCACGCAAATGGAACCGCAAGCCGACGAATTAATGAAGAACGCGTTGAATACCAATGCGATTGATAAATCGGAATACCCTAAGACCGCGGCAATGGAAAATTACTGTGTCAGCATGATTGCTCACCTATGGGGAATTCCTGACAATGAAAAGATTTACGATGATTTCATTGGGACCTCAACGGTAGGTTCTTCTGAAGGATGTATGTTAGGCGGCTTGGCGCTGCTACATAGTTGGAAGCACCGGGCCAAGGCAGCTGGATTTGATATTGAAGACCTGCATAGCCACAAGCCCAACTTGGTCATCATGTCAGGTTACCAAGTCGTTTGGGAAAAGTTCTGTACCTACTGGAATGTCGAGATGCGCCAAGTGCCGATTAATGGTGACCAGGTTTCCTTAGATATGGATCATGTGATGGATTACGTTGATGAAAATACGATTGGGATTATCGGAATTGAGGGCATTACGTACACAGGCTCCGTTGATGATATTCAAATGCTAGATAACCTCGTGACCGAATATAACAAGACCGCGACGATGCCGGTACGGATTCACGTTGATGCTGCCTTTGGTGGTCTGTTCGCGCCGTTCGTCGATGGCTTTAACCCGTGGGACTTCCGGTTGAAGAACGTGGTTTCCATTAACGTTTCGGGCCATAAATACGGGATGGTTTACCCTGGGTTGGGGTGGATTGTTTGGCGGCACAACACGGCTGATATTTTACCCGCAGAAATGCGATTTCAAGTGCCATATCTAGGTAAGACCGTTGATTCAATCGCCATTAACTTCTCGCACAGTGGTGCCCATATCAGTGCACAATACTACAATTTCATTCGATTTGGATTATCAGGTTACAAGACGATCATGCAAAATGTTCGGAAGGTGTCATTGAAGCTGACGGCGGCTCTGAAAACGTATGGGATTTTCGATATTTTAGTTGATGGGTCACAGCTACCAATTAACTGTTGGAAACTAGCGGACGATGCGCCGGTTGGTTGGACGTTGTATGATTTGAAGTCCGAGTTGGCTAAGTATGGTTGGCAAGTTCCGGCTTATCCACTGCCAAAGAATCGCGACGATGTGACAATTAGCCGGATCGTGGTGCGCCCATCCATGACCATGACGATTGCCGATGATTTCTTGGATGATTTGAAATTAGCGATTGATGGATTAAATCACACATTTGGCGTGACGACCACCGTTGATCAAGATAACAAGACCACCGTTCGGAGTTAAATGAATAAAAACGATCAGGAAACACAGCAGATGATTAATAATGTGGATTTAGAAAAAACGTTTTTAGGCAGTGTCGAAGCCGGACAATCCTTACCTACCAATACATTACCAAATGATCCCATGGCACCGGATGTTGCCGCTCAATTGGTGGAACACTATCGTTTAAATGAAGCCAAGGCTAATCAAAATCTGGCGACCTTCTGTACCACGCAAATGGAACCGCAAGCCGACGAATTAATGAAGAACGCGTTGAATACCAATGCGATTGATAAATCGGAATACCCTAAGACCGCGGCAATGGAAAATTACTGTGTCAGCATGATTGCTCACCTATGGGGAATTCCTGACAATGAAAAGATTTACGATGATTTCATTGGGACCTCAACGGTAGGTTCTTCTGAAGGATGTATGTTAGGCGGCTTGGCGCTGCTACATAGTTGGAAGCACCGGGCCAAGGCAGCTGGATTTGATATTGAAGACCTGCATAGCCACAAGCCCAACTTGGTCATCATGTCAGGTTACCAAGTCGTTTGGGAAAAGTTCTGTACCTACTGGAATGTCGAGATGCGCCAAGTGCCGATTAATGGTGACCAGGTTTCCTTAGATATGGATCATGTGATGGATTACGTTGATGAAAATACGATTGGGATTATCGGAATTGAGGGCATTACGTACACAGGCTCCGTTGATGATATTCAAATGCTAGATAACCTCGTGACCGAATATAACAAGACCGCGACGATGCCGGTACGGATTCACGTTGATGCTGCCTTTGGTGGTCTGTTCGCGCCGTTCGTCGATGGCTTTAACCCGTGGGACTTCCGGTTGAAGAACGTGGTTTCCATTAACGTTTCGGGCCATAAATACGGGATGGTTTACCCTGGGTTGGGGTGGATTGTTTGGCGGCACAACACGGCTGATATTTTACCCGCAGAAATGCGATTTCAAGTGCCATATCTAGGTAAGACCGTTGATTCAATCGCCATTAACTTCTCGCACA GTGGTGCCCATATCAGTGCACAATACTACAATTTCATTCGATTTGGATTATCAGGTTACAAGACGATCATGCAAAATGTTCGGAAGGTGTCATTGAAGCTGACGGCGGCTCTGAAAACGTATGGGATTTTCGATATTTTAGTTGATGGGTCACAGCTACCAATTAACTGTTGGAAACTAGCGGACGATGCGCCGGTTGGTTGGACGTTGTATGATTTGAAGTCCGAGTTGGCTAAGTATGGTTGGCAAGTTCCGGCTTATCCACTGCCAAAGAATCGCGACGATGTGACAATTAGCCGGATCGTGGTGCGCCCATCCATGACCATGACGATTGCCGATGATTTCTTGGATGATTTGAAATTAGCGATTGATGGATTAAATCACACATTTGGCGTGACGACCACCGTTGATCAAGATAACAAGACCACCGTTCGGAGTTAA
Выравнивание нуклеотидной последовательности гена с наиболее близким по НП геном штамма Lactobacillus brevis KB290 из GenBank dbj|AP012167.1| (nucleotide BLAST) Alignment of the nucleotide sequence of the gene with the closest NP gene of the Lactobacillus brevis KB290 strain from GenBank dbj | AP012167.1 | (nucleotide BLAST)
Query 1 ATGAATAAAAACGATCAGGAAACACAGCAGATGATTAATAATGTGGATTTAGAAAAAACG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 68817 ATGAATAAAAACGATCAGGAAACACAGCAGATGATTAATAATGTGGATTTAGAAAAAACG 68876Sbjct 68817 ATGAATAAAAACGATCAGGAAACACAGCAGATGATTAATAATGTGGATTTAGAAAAAAAACG 68876
Query 61 TTTTTAGGCAGTGTCGAAGCCGGACAATCCTTACCTACCAATACATTACCAAATGATCCC 120Query 61
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 68877 TTTTTAGGCAGTGTCGAAGCCGGGCAATCCTTACCCACCAATACATTACCAGATGATCCC 68936Sbjct 68877 TTTTTAGGCAGTGTCGAAGCCGGGCAATCCTTACCCACCAATACATTACCAGATGATCCC 68936
Query 121 ATGGCACCGGATGTTGCCGCTCAATTGGTGGAACACTATCGTTTAAATGAAGCCAAGGCT 180Query 121
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 68937 ATGGCACCGGATGTTGCCGCTCAATTGGTGGAACACTATCGTTTAAATGAAGCCAAGGCT 68996Sbjct 68937 ATGGCACCGGATGTTGCCGCTCAATTGGTGGAACACTATCGTTTAAATGAAGCCAAGGCT 68996
Query 181 AATCAAAATCTGGCGACCTTCTGTACCACGCAAATGGAACCGCAAGCCGACGAATTAATG 240Query 181 AATCAAAATCTGGCGACCTTCTGTACCACGCAAATGGAACCGCAAGCCGACGAATTAATG 240
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 68997 AATCAAAACCTAGCGACCTTCTGTACCACGCAAATGGAACCACAAGCCGATGAATTAATG 69056Sbjct 68997 AATCAAAACCTAGCGACCTTCTGTACCACGCAAATGGAACCACAAGCCGATGAATTAATG 69056
Query 241 AAGAACGCGTTGAATACCAATGCGATTGATAAATCGGAATACCCTAAGACCGCGGCAATG 300Query 241
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 69057 AAGAACGCGTTGAATACCAATGCGATTGATAAATCGGAATACCCTAAGACCGCGGCAATG 69116Sbjct 69057 AAGAACGCGTTGAATACCAATGCGATTGATAAATCGGAATACCCTAAGACCGCGGCAATG 69116
Query 301 GAAAATTACTGTGTCAGCATGATTGCTCACCTATGGGGAATTCCTGACAATGAAAAGATT 360Query 301 GAAAATTACTGTGTCAGCATGATTGCTCACCTATGGGGAATTCCTGACAATGAAAAGATT 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 69117 GAAAATTACTGTGTCAGCATGATTGCTCACCTATGGGGAATTCCTGACAATGAAAAGATT 69176Sbjct 69117 GAAAATTACTGTGTCAGCATGATTGCTCACCTATGGGGAATTCCTGACAATGAAAAGATT 69176
Query 361 TACGATGATTTCATTGGGACCTCAACGGTAGGTTCTTCTGAAGGATGTATGTTAGGCGGC 420Query 361 TACGATGATTTCATTGGGACCTCAACGGTAGGTTCTTCTGAAGGATGTATGTTAGGCGGC 420
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69177 TACGATGATTTCATTGGGACCTCAACTGTAGGTTCTTCTGAAGGATGTATGTTAGGCGGC 69236Sbjct 69177 TACGATGATTTCATTGGGACCTCAACTGTAGGTTCTTCTGAAGGATGTATGTTAGGCGGC 69236
Query 421 TTGGCGCTGCTACATAGTTGGAAGCACCGGGCCAAGGCAGCTGGATTTGATATTGAAGAC 480Query 421 TTGGCGCTGCTACATAGTTGGAGAGCACCGGGCCAAGGCAGCTGGATTTGATATTGAAGAC 480
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 69237 TTGGCGCTACTACATAGTTGGAAGCACCGGGCCAAGGCAGCTGGTTTTGATATTGAAGAC 69296Sbjct 69237 TTGGCGCTACTACATAGTTGGAGAGCACCGGGCCAAGGCAGCTGGTTTTGATATTGAAGAC 69296
Query 481 CTGCATAGCCACAAGCCCAACTTGGTCATCATGTCAGGTTACCAAGTCGTTTGGGAAAAG 540Query 481 CTGCATAGCCACAAGCCCAACTTGGTCATCATGTCAGGTTACCAAGTCGTTTGGGAAAAG 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 69297 CTGCATAGCCACAAGCCCAACTTGGTCATCATGTCAGGTTACCAAGTTGTTTGGGAAAAG 69356Sbjct 69297 CTGCATAGCCACAAGCCCAACTTGGTCATCATGTCAGGTTACCAAGTTGTTTGGGAAAAG 69356
Query 541 TTCTGTACCTACTGGAATGTCGAGATGCGCCAAGTGCCGATTAATGGTGACCAGGTTTCC 600Query 541
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 69357 TTCTGTACCTATTGGAATGTCGAGATGCGCCAAGTGCCAATTAATGGTGACCAAGTTTCC 69416Sbjct 69357 TTCTGTACCTATTGGAATGTCGAGATGCGCCAAGTGCCAATTAATGGTGACCAAGTTTCC 69416
Query 601 TTAGATATGGATCATGTGATGGATTACGTTGATGAAAATACGATTGGGATTATCGGAATT 660Query 601 TTAGATATGGATCATGTGATGGATTACGTTGATGAAAATACGATTGGGATTATCGGAATT 660
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69417 TTAGATATGGATCATGTGATGGATTATGTTGATGAAAATACGATTGGGATTATCGGAATT 69476Sbjct 69417 TTAGATATGGATCATGTGATGGATTATGTTGATGAAAATACGATTGGGATTATCGGAATT 69476
Query 661 GAGGGCATTACGTACACAGGCTCCGTTGATGATATTCAAATGCTAGATAACCTCGTGACC 720Query 661 GAGGGCATTACGTACACAGGCTCCGTTGATGATATTCAAATGCTAGATAACCTCGTGACC 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 69477 GAGGGCATTACGTACACAGGCTCCGTTGATGATATTCAAACGCTAGATAACCTCGTGACC 69536Sbjct 69477 GAGGGCATTACGTACACAGGCTCCGTTGATGATATTCAAACGCTAGATAACCTCGTGACC 69536
Query 721 GAATATAACAAGACCGCGACGATGCCGGTACGGATTCACGTTGATGCTGCCTTTGGTGGT 780Query 721 GAATATAACAAGACCGCGACGATGCCGGTACGGATTCACGTTGATGCTGCCTTTGGTGGT 780
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69537 GAATATAATAAGACCGCGACGATGCCGGTACGGATTCACGTTGATGCTGCCTTTGGTGGC 69596Sbjct 69537 GAATATAATAAGACCGCGACGATGCCGGTACGGATTCACGTTGATGCTGCCTTTGGTGGC 69596
Query 781 CTGTTCGCGCCGTTCGTCGATGGCTTTAACCCGTGGGACTTCCGGTTGAAGAACGTGGTT 840Query 781 CTGTTCGCGCCGTTCGTCGATGGCTTTAACCCGTGGGACTTCCGGTTGAAGAACGTGGTT 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 69597 CTGTTCGCGCCGTTCGTCGATGGCTTTAACCCGTGGGACTTCCGGTTGAAGAACGTGGTT 69656Sbjct 69597 CTGTTCGCGCCGTTCGTCGATGGCTTTAACCCGTGGGACTTCCGGTTGAAGAACGTGGTT 69656
Query 841 TCCATTAACGTTTCGGGCCATAAATACGGGATGGTTTACCCTGGGTTGGGGTGGATTGTT 900Query 841
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69657 TCCATTAACGTTTCGGGCCATAAGTACGGGATGGTTTACCCTGGGTTGGGGTGGATTGTT 69716Sbjct 69657 TCCATTAACGTTTCGGGCCATAAGTACGGGATGGTTTACCCTGGGTTGGGGTGGATTGTT 69716
Query 901 TGGCGGCACAACACGGCTGATATTTTACCCGCAGAAATGCGATTTCAAGTGCCATATCTA 960Query 901 TGGCGGCACAACACGGCTGATATTTTACCCGCAGAAATGCGATTTCAAGTGCCATATCTA 960
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 69717 TGGCGGCACAACACGGCTGATATTTTACCCGCAGAAATGCGATTCCAAGTGCCATATCTA 69776Sbjct 69717 TGGCGGCACAACACGGCTGATATTTTACCCGCAGAAATGCGATTCCAAGTGCCATATCTA 69776
Query 961 GGTAAGACCGTTGATTCAATCGCCATTAACTTCTCGCACAGTGGTGCCCATATCAGTGCA 1020Query 961 GGTAAGACCGTTGATTCAATCGCCATTAACTTCTCGCACAGTGGTGCCCATATCAGTGCA 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69777 GGTAAGACCGTTGATTCAATCGCCATTAACTTCTCACACAGTGGTGCCCATATCAGTGCG 69836Sbjct 69777 GGTAAGACCGTTGATTCAATCGCCATTAACTTCTCACACAGTGGTGCCCATATCAGTGCG 69836
Query 1021 CAATACTACAATTTCATTCGATTTGGATTATCAGGTTACAAGACGATCATGCAAAATGTT 1080Query 1021 CAATACTACAATTTCATTCGATTTGGATTATCAGGTTACAAGACGATCATGCAAAATGTT 1080
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 69837 CAATACTACAATTTCATTCGATTTGGATTATCAGGTTACAAGACGATCATGCAAAATGTT 69896Sbjct 69837 CAATACTACAATTTCATTCGATTTGGATTATCAGGTTACAAGACGATCATGCAAAATGTT 69896
Query 1081 CGGAAGGTGTCATTGAAGCTGACGGCGGCTCTGAAAACGTATGGGATTTTCGATATTTTA 1140Query 1081 CGGAAGGTGTCATTGAAGCTGACGGCGGCTCTGAAAACGTATGGGATTTTCGATATTTTA 1140
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69897 CGGAAGGTGTCATTGAAGCTGACGGCAGCTCTGAAAACGTATGGGATTTTCGATATTTTA 69956Sbjct 69897 CGGAAGGTGTCATTGAAGCTGACGGCAGCTCTGAAAACGTATGGGATTTTCGATATTTTA 69956
Query 1141 GTTGATGGGTCACAGCTACCAATTAACTGTTGGAAACTAGCGGACGATGCGCCGGTTGGT 1200Query 1141 GTTGATGGGTCACAGCTACCAATTAACTGTTGGAAACTAGCGGACGATGCGCCGGTTGGT 1200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 69957 GTTGATGGGTCACAGCTACCAATTAACTGTTGGAAACTAGCGGACGATGCGCCGGTTGGT 70016Sbjct 69957 GTTGATGGGTCACAGCTACCAATTAACTGTTGGAAACTAGCGGACGATGCGCCGGTTGGT 70016
Query 1201 TGGACGTTGTATGATTTGAAGTCCGAGTTGGCTAAGTATGGTTGGCAAGTTCCGGCTTAT 1260Query 1201 TGGACGTTGTATGATTTGAAGTCCGAGTTGGCTAAGTATGGTTGGCAAGTTCCGGCTTAT 1260
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 70017 TGGACGTTATATGATTTGGAGTCCGAGTTGGCTAAGTATGGTTGGCAAGTTCCGGCATAT 70076Sbjct 70017 TGGACGTTATATGATTTGGAGTCCGAGTTGGCTAAGTATGGTTGGCAAGTTCCGGCATAT 70076
Query 1261 CCACTGCCAAAGAATCGCGACGATGTGACAATTAGCCGGATCGTGGTGCGCCCATCCATG 1320Query 1261 CCACTGCCAAAGAATCGCGACGATGTGACAATTAGCCGGATCGTGGTGCGCCCATCCATG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 70077 CCACTGCCAAAGAATCGCGACGATGTGACAATTAGCCGGATCGTGGTACGCCCATCCATG 70136Sbjct 70077 CCACTGCCAAAGAATCGCGACGATGTGACAATTAGCCGGATCGTGGTACGCCCATCCATG 70136
Query 1321 ACCATGACGATTGCCGATGATTTCTTGGATGATTTGAAATTAGCGATTGATGGATTAAAT 1380Query 1321 ACCATGACGATTGCCGATGATTTCTTGGATGATTTGAAATTAGCGATTGATGGATTAAAT 1380
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 70137 ACCATGACGATTGCCGATGATTTCTTGGATGATTTGAAATTAGCGATTGATGGATTAAAT 70196Sbjct 70137 ACCATGACGATTGCCGATGATTTCTTGGATGATTTGAAATTAGCGATTGATGGATTAAAT 70196
Query 1381 CACACATTTGGCGTGACGACCACCGTTGATCAAGATAACAAGACCACCGTTCGGAGTTAA 1440Query 1381 CACACATTTGGCGTGACGACCACCGTTGATCAAGATAACAAGACCACCGTTCGGAGTTAA 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 70197 CACACATTTGGCGTGACGACCACCGTTGATCAAAATAACAAGACCACCGTTCGAAGTTAA 70256Sbjct 70197 CACACATTTGGCGTGACGACCACCGTTGATCAAAATAACAAGACCACCGTTCGAAGTTAA 70256
Claims (2)
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2575625C1 true RU2575625C1 (en) | 2016-02-20 |
Family
ID=
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN113337428A (en) * | 2021-06-03 | 2021-09-03 | 海南大学 | Lactobacillus plantarum HNU082 and application thereof |
| CN117511779A (en) * | 2023-10-26 | 2024-02-06 | 青岛诺森生物技术有限责任公司 | A strain of Lactobacillus plantarum NSL0101 that improves sleep quality and its application |
Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2143002C1 (en) * | 1997-12-24 | 1999-12-20 | Акционерное общество открытого типа "Мосагроген" | METHOD OF γ-AMINOBUTYRIC ACID PRODUCING |
| WO2013107913A1 (en) * | 2012-01-19 | 2013-07-25 | University College Cork - National University Of Ireland, Cork | Gaba-producing culturable bacteria derived from the human gastrointestinal tract |
Patent Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2143002C1 (en) * | 1997-12-24 | 1999-12-20 | Акционерное общество открытого типа "Мосагроген" | METHOD OF γ-AMINOBUTYRIC ACID PRODUCING |
| WO2013107913A1 (en) * | 2012-01-19 | 2013-07-25 | University College Cork - National University Of Ireland, Cork | Gaba-producing culturable bacteria derived from the human gastrointestinal tract |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN113337428A (en) * | 2021-06-03 | 2021-09-03 | 海南大学 | Lactobacillus plantarum HNU082 and application thereof |
| CN117511779A (en) * | 2023-10-26 | 2024-02-06 | 青岛诺森生物技术有限责任公司 | A strain of Lactobacillus plantarum NSL0101 that improves sleep quality and its application |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Nath et al. | In vitro screening of probiotic properties of Lactobacillus plantarum isolated from fermented milk product | |
| CA2779597C (en) | A bifidobacterium strain | |
| AU2018341753B2 (en) | Novel lactic acid bacteria and use thereof | |
| CN112534043A (en) | Lactobacillus paracasei strain and application thereof | |
| CN109310715A (en) | Probiotic preparations for sports performance | |
| Li et al. | Novel vitamin B12-producing Enterococcus spp. and preliminary in vitro evaluation of probiotic potentials | |
| BR112012011315B1 (en) | Formulation comprising probiotic bifidobacteria strain | |
| JP2008507991A (en) | Lactobacillus rhamnosus with reduced body fat and food containing it {LACOTABILLUSRAMAMUSUSWITHBODY-FATREDUCINGACTIVITYANDFOODSCONTAININGTHEM} | |
| JP2008511312A (en) | Lactobacillus plantarum with reduced body fat and food containing it (LACOTABASILLUSPLANTARUMITWIBODY-FATREDUCINGAACTIVITYANDTHEFOODSCONTAININGTHEM) | |
| CN111212575A (en) | Composition for muscle gain | |
| CN112384611A (en) | Lactobacillus crispatus KBL693 strain and application thereof | |
| KR102368628B1 (en) | Composition for Type IV Allergy | |
| WO2021157435A1 (en) | Sleep-promoting composition and foods, drugs, and feeds containing said composition | |
| JP2023033532A (en) | Composition for making skeletal muscle slow-twitch | |
| JP2024161120A (en) | Sleep-promoting composition and food, medicine, and feed containing the composition | |
| CN119842568A (en) | Isolated mucin-philin akkermansia, compositions comprising same and use thereof for anti-aging and/or anti-oxidation | |
| CN113337440A (en) | Lactobacillus salivarius MG-587 and application thereof | |
| US9259019B2 (en) | Bifidobacteriumstrain | |
| JP6531893B2 (en) | Follicular helper T cell enhancer | |
| Barman et al. | Isolation of New Strains of Lactic Acid Bacteria from the Vaginal Microbiome of Postmenopausal Women and their Probiotic Characteristics | |
| EP1541672A1 (en) | Composition for promoting the proliferation of lactobacillus casei subsp. casei | |
| Amatachaya et al. | Gamma-aminobutyric Acid (GABA) Producing Probiotic Lactiplantibacillus Pentosus Isolated from Fermented Spider Plant (Pak Sian Dong) in Thailand. | |
| CN103037877A (en) | Agent for controlling the increase and decrease of lactobacillus bifidus in colon | |
| KR102368626B1 (en) | Composition for Type I Allergy | |
| RU2575625C1 (en) | STRAINS OF Lactobacillus plantarum AND Lactobacillus brevis SYNTHESISING GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID |