RU2411948C1 - Medication for inhibiting human enzyme poly(adp-ribose)polymerase-1 - Google Patents
Medication for inhibiting human enzyme poly(adp-ribose)polymerase-1 Download PDFInfo
- Publication number
- RU2411948C1 RU2411948C1 RU2009138650/04A RU2009138650A RU2411948C1 RU 2411948 C1 RU2411948 C1 RU 2411948C1 RU 2009138650/04 A RU2009138650/04 A RU 2009138650/04A RU 2009138650 A RU2009138650 A RU 2009138650A RU 2411948 C1 RU2411948 C1 RU 2411948C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- rib
- adp
- ribose
- thd
- parp
- Prior art date
Links
- 101001113483 Homo sapiens Poly [ADP-ribose] polymerase 1 Proteins 0.000 title claims abstract description 31
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 title claims abstract description 10
- 239000003814 drug Substances 0.000 title abstract description 11
- 229940079593 drug Drugs 0.000 title abstract description 8
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims abstract description 4
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 claims abstract description 3
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 claims description 12
- 150000002772 monosaccharides Chemical group 0.000 claims description 8
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 14
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 abstract description 3
- 125000001483 monosaccharide substituent group Chemical group 0.000 abstract 1
- GQPLMRYTRLFLPF-UHFFFAOYSA-N nitrous oxide Inorganic materials [O-][N+]#N GQPLMRYTRLFLPF-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 29
- 102100023712 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 Human genes 0.000 description 27
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 26
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 21
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 16
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 13
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 13
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 12
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 11
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N Guanine Natural products O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 10
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 9
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 9
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 9
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 8
- VEPTXBCIDSFGBF-UHFFFAOYSA-M tetrabutylazanium;fluoride;trihydrate Chemical compound O.O.O.[F-].CCCC[N+](CCCC)(CCCC)CCCC VEPTXBCIDSFGBF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 8
- 0 C[C@]1(*)O[C@](*)(CO)C(*)*1* Chemical compound C[C@]1(*)O[C@](*)(CO)C(*)*1* 0.000 description 7
- 238000000034 method Methods 0.000 description 7
- 230000009471 action Effects 0.000 description 6
- -1 fluoride ions Chemical class 0.000 description 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 5
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 5
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 5
- 102100037373 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease Human genes 0.000 description 4
- 101000806846 Homo sapiens DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease Proteins 0.000 description 4
- BAWFJGJZGIEFAR-NNYOXOHSSA-O NAD(+) Chemical compound NC(=O)C1=CC=C[N+]([C@H]2[C@@H]([C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]3[C@H]([C@@H](O)[C@@H](O3)N3C4=NC=NC(N)=C4N=C3)O)O2)O)=C1 BAWFJGJZGIEFAR-NNYOXOHSSA-O 0.000 description 4
- 108091026813 Poly(ADPribose) Proteins 0.000 description 4
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 4
- 125000003236 benzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)=O 0.000 description 4
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 4
- 230000008569 process Effects 0.000 description 4
- 239000012047 saturated solution Substances 0.000 description 4
- FPGGTKZVZWFYPV-UHFFFAOYSA-M tetrabutylammonium fluoride Chemical compound [F-].CCCC[N+](CCCC)(CCCC)CCCC FPGGTKZVZWFYPV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran Natural products C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000005730 ADP ribosylation Effects 0.000 description 3
- SRBFZHDQGSBBOR-SOOFDHNKSA-N D-ribopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010061844 Poly(ADP-ribose) Polymerases Proteins 0.000 description 3
- 102000012338 Poly(ADP-ribose) Polymerases Human genes 0.000 description 3
- 229920000776 Poly(Adenosine diphosphate-ribose) polymerase Polymers 0.000 description 3
- 229910021627 Tin(IV) chloride Inorganic materials 0.000 description 3
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical class O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- GCZABPLTDYVJMP-CBUXHAPBSA-N [(2r,3r,4r,5s)-5-acetyloxy-3,4-dibenzoyloxyoxolan-2-yl]methyl benzoate Chemical compound C([C@H]1O[C@H]([C@@H]([C@@H]1OC(=O)C=1C=CC=CC=1)OC(=O)C=1C=CC=CC=1)OC(=O)C)OC(=O)C1=CC=CC=C1 GCZABPLTDYVJMP-CBUXHAPBSA-N 0.000 description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 3
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 3
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229950006238 nadide Drugs 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HPGGPRDJHPYFRM-UHFFFAOYSA-J tin(iv) chloride Chemical compound Cl[Sn](Cl)(Cl)Cl HPGGPRDJHPYFRM-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 3
- WSLDOOZREJYCGB-UHFFFAOYSA-N 1,2-Dichloroethane Chemical compound ClCCCl WSLDOOZREJYCGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DARXFPLZEZMZTP-YTFSRNRJSA-N 1-[(2r,4s,5r)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO[Si](C=2C=CC=CC=2)(C=2C=CC=CC=2)C(C)(C)C)[C@@H](O)C1 DARXFPLZEZMZTP-YTFSRNRJSA-N 0.000 description 2
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- DFPAKSUCGFBDDF-UHFFFAOYSA-N Nicotinamide Chemical compound NC(=O)C1=CC=CN=C1 DFPAKSUCGFBDDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000004989 O-glycosylation Effects 0.000 description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 2
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical class O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 2
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical group 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 2
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 239000006225 natural substrate Substances 0.000 description 2
- 239000012299 nitrogen atmosphere Substances 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IKHXAQXDRKSBCU-MROZADKFSA-N (2r,3r,4r)-5-amino-2,3,4-trihydroxypentanal Chemical compound NC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O IKHXAQXDRKSBCU-MROZADKFSA-N 0.000 description 1
- NTYZLKZZBRSAPT-MHJQXXNXSA-N 2-amino-9-[(2r,3r,4r,5r)-3-[(2s,3r,4s,5r)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]oxy-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-3h-purin-6-one Chemical compound O([C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C=NC=2C(=O)N=C(NC=21)N)[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O NTYZLKZZBRSAPT-MHJQXXNXSA-N 0.000 description 1
- WDRISBUVHBMJEF-MROZADKFSA-N 5-deoxy-D-ribose Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O WDRISBUVHBMJEF-MROZADKFSA-N 0.000 description 1
- LWLIVJMDZNGANV-XMICXJGFSA-N CC(C(C)[C@H](OC(C)=O)OC1)[C@@H]1OC(C)=O Chemical compound CC(C(C)[C@H](OC(C)=O)OC1)[C@@H]1OC(C)=O LWLIVJMDZNGANV-XMICXJGFSA-N 0.000 description 1
- BEXVYNXHWXSHEN-TVVDDFTJSA-N CC(C1C)[C@@H](CO)O[C@H]1O Chemical compound CC(C1C)[C@@H](CO)O[C@H]1O BEXVYNXHWXSHEN-TVVDDFTJSA-N 0.000 description 1
- HPBWVHZWLQVJBS-GRWLLNARSA-N CC(C1C)[C@@H](COC(c2ccccc2)=O)O[C@H]1OC(C)=O Chemical compound CC(C1C)[C@@H](COC(c2ccccc2)=O)O[C@H]1OC(C)=O HPBWVHZWLQVJBS-GRWLLNARSA-N 0.000 description 1
- QLMLPLYPWYXCLG-KIFFQIORSA-N C[C@@H]([C@@H](CO)O[C@H]1O)C1O Chemical compound C[C@@H]([C@@H](CO)O[C@H]1O)C1O QLMLPLYPWYXCLG-KIFFQIORSA-N 0.000 description 1
- 108010077544 Chromatin Proteins 0.000 description 1
- 230000033616 DNA repair Effects 0.000 description 1
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 101710180995 Endonuclease 1 Proteins 0.000 description 1
- 206010056474 Erythrosis Diseases 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N Heparin Chemical compound OC1C(NC(=O)C)C(O)OC(COS(O)(=O)=O)C1OC1C(OS(O)(=O)=O)C(O)C(OC2C(C(OS(O)(=O)=O)C(OC3C(C(O)C(O)C(O3)C(O)=O)OS(O)(=O)=O)C(CO)O2)NS(O)(=O)=O)C(C(O)=O)O1 HTTJABKRGRZYRN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SRBFZHDQGSBBOR-OWMBCFKOSA-N L-ribopyranose Chemical compound O[C@H]1COC(O)[C@@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-OWMBCFKOSA-N 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 239000012661 PARP inhibitor Substances 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940121906 Poly ADP ribose polymerase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 208000006011 Stroke Diseases 0.000 description 1
- 102000006943 Uracil-DNA Glycosidase Human genes 0.000 description 1
- 108010072685 Uracil-DNA Glycosidase Proteins 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 description 1
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 1
- 239000003443 antiviral agent Substances 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010003246 arthritis Diseases 0.000 description 1
- 230000033590 base-excision repair Effects 0.000 description 1
- PXXJHWLDUBFPOL-UHFFFAOYSA-N benzamidine Chemical compound NC(=N)C1=CC=CC=C1 PXXJHWLDUBFPOL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 1
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 210000003483 chromatin Anatomy 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 238000000978 circular dichroism spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 206010009887 colitis Diseases 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000006846 excision repair Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 229960002897 heparin Drugs 0.000 description 1
- 229920000669 heparin Polymers 0.000 description 1
- 150000002391 heterocyclic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 208000028867 ischemia Diseases 0.000 description 1
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 1
- 230000000155 isotopic effect Effects 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 229960003966 nicotinamide Drugs 0.000 description 1
- 235000005152 nicotinamide Nutrition 0.000 description 1
- 239000011570 nicotinamide Substances 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical group [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 230000005731 poly ADP ribosylation Effects 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 239000002342 ribonucleoside Substances 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 229910000033 sodium borohydride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000012279 sodium borohydride Substances 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 1
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 1
Images
Landscapes
- Saccharide Compounds (AREA)
Abstract
Description
Изобретение относится к молекулярной биологии, биохимии и биотехнологии, конкретно к средствам для ингибирования фермента поли(АДФ-рибозо)полимеразы-1 человека, представляющим собой производные нуклеозидов общей формулы (I),The invention relates to molecular biology, biochemistry and biotechnology, specifically to means for inhibiting the enzyme poly (ADP-ribose) polymerase-1 person, which are derivatives of nucleosides of the general formula (I),
где Х - Н или OR1, один или два из заместителей R1, R2, R3 - моносахаридные остатки, остальные - протоны водорода; В - азотистое основание, присоединенное в α- или β-положении.where X is H or OR 1 , one or two of the substituents R 1 , R 2 , R 3 are monosaccharide residues, the rest are hydrogen protons; B is a nitrogenous base attached in the α or β position.
В последние годы ведутся активные поиски ингибиторов фермента поли(АДФ-рибозо)полимеразы-1 (ПАРП-1), который рассматривается как перспективный фермент-мишень для создания лекарственных препаратов для лечения инсульта, ишемии, диабета, артритов, колитов и других воспалительных заболеваний. Ингибиторы ПАРП-1 также могут быть использованы как потенциальные противораковые и противовирусные агенты [N.J.Curtin. Expert Rev Mol Med. 7, 1-20 (2005); P.Jagtap, C.Szabό. Nat. Rev. Drug Discov. 4, 421-440 (2005)].In recent years, active searches have been made for inhibitors of the poly (ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) enzyme, which is considered as a promising target enzyme for the development of drugs for the treatment of stroke, ischemia, diabetes, arthritis, colitis and other inflammatory diseases. PARP-1 inhibitors can also be used as potential anticancer and antiviral agents [N.J. Curtin. Expert Rev Mol Med. 7, 1-20 (2005); P. Jagtap, C. Szabό. Nat. Rev. Drug Discov. 4, 421-440 (2005)].
Поли-АДФ-рибозилирование - посттрансляционная модификация белков в эукариотических клетках. Процесс катализируется поли(АДФ-рибозо)полимеразами (ПАРП). Эти ферменты осуществляют превращение никотинамид-адениндинуклеотида (НАД+) в полимер, поли(АДФ-рибозу), с высвобождением никотинамида. В обзорах [D.D'Amours, et al. Biochem J. 342, 249-268 (1999); P.O.Hassa, et al., Microbiol. Mol. Biol. Rev. 70, 789-829 (2006)] рассматривается многообразная биологическая роль поли(АДФ-рибозы). Известно, что она вовлечена в процессы модуляции структуры хроматина, репликации, транскрипции, репарации ДНК (главным образом, процесс эксцизионной репарации оснований), дифференцировки клеток и клеточной гибели. Детальное изучение внутриклеточных функций поли(АДФ-рибозы) продолжается и в настоящее время.Poly-ADP-ribosylation - post-translational modification of proteins in eukaryotic cells. The process is catalyzed by poly (ADP-ribose) polymerases (PARP). These enzymes convert nicotinamide adenine dinucleotide (NAD + ) into a polymer, poly (ADP-ribose), to release nicotinamide. In reviews [D.D'Amours, et al. Biochem J. 342, 249-268 (1999); POHassa, et al., Microbiol. Mol. Biol. Rev. 70, 789-829 (2006)] discusses the diverse biological role of poly (ADP-ribose). It is known that it is involved in the modulation of chromatin structure, replication, transcription, DNA repair (mainly, the process of excision repair of bases), cell differentiation and cell death. A detailed study of the intracellular functions of poly (ADP-ribose) continues to this day.
В настоящее время клинические испытания проходят шесть ингибиторов ПАРП-1, относящихся к циклическим аминам [Leal A.P.; et al., PARP inhibitors: New partners in the therapy of cancer and inflammatory diseases, Free Radic. Biol. Med. (2009), doi:10.1016/j.freeradbiomed.2009.04.008]. Эти соединения являются узкоспецифичными препаратами, которые предполагается использовать для лечения конкретных видов новообразований, в то время как для других заболеваний, связанных с функционированием ПАРП-1, лекарств-ингибиторов ПАРП-1 пока не существует.Currently, six PARP-1 inhibitors related to cyclic amines are undergoing clinical trials [Leal A.P .; et al., PARP inhibitors: New partners in the therapy of cancer and inflammatory diseases, Free Radic. Biol. Med. (2009), doi: 10.1016 / j.freeradbiomed.2009.04.008]. These compounds are highly specific drugs that are supposed to be used to treat specific types of neoplasms, while for other diseases associated with the functioning of PARP-1, PARP-1 inhibitor drugs do not yet exist.
К недостаткам существующих ингибиторов ПАРП-1 в первую очередь следует отнести плохую растворимость гетероциклических соединений в воде, а также небольшое время жизни их в организме. В последнее время появляются данные о водорастворимых ингибиторах ПАРП-1 [напр., H.Nakajima, et al., J. Pharmacol. Exp.Therapeutics. 312:472-481, (2005)]. Хотя такие соединения обладают хорошими фармакокинетическими свойствами, их цитотоксичность не изучена.The disadvantages of existing PARP-1 inhibitors include, first of all, the poor solubility of heterocyclic compounds in water, as well as their short lifetime. Recently, there has been evidence of water-soluble PARP-1 inhibitors [eg, H. Nakajima, et al., J. Pharmacol. Exp.Therapeutics. 312: 472-481, (2005)]. Although such compounds have good pharmacokinetic properties, their cytotoxicity has not been studied.
Наиболее ближайшими к заявляемому средству для ингибирования ПАРП-1 - прототипом, являются рибонуклеозиды и 2'-дезоксинуклеозиды общей формулы (II)The closest to the claimed tool for inhibiting PARP-1 - the prototype are ribonucleosides and 2'-deoxynucleosides of the general formula (II)
где X - атом водорода или ОН-группа.where X is a hydrogen atom or an OH group.
К недостаткам прототипа относится то, что природные нуклеозиды являются структурными элементами нуклеиновых кислот и участвуют в многочисленных процессах в клетке, что исключает специфичность их воздействия на определенный фермент, а также низкая эффективность (IС50 составляет около 1 мМ) [Preiss et al., 1971, FEBS Lett., 19, 244-246].The disadvantages of the prototype include the fact that natural nucleosides are structural elements of nucleic acids and participate in numerous processes in the cell, which excludes the specificity of their effects on a particular enzyme, as well as low efficiency (IC 50 is about 1 mm) [Preiss et al., 1971 , FEBS Lett., 19, 244-246].
Технической задачей изобретения является создание более эффективных и специфичных ингибиторов ПАРП-1 на основе нуклеозидов, содержащих дополнительные моносахаридные остатки, присоединенные к рибозе через O-гликозидную связь.An object of the invention is the creation of more effective and specific inhibitors of PARP-1 based on nucleosides containing additional monosaccharide residues attached to ribose via an O-glycosidic bond.
Поставленная техническая задача решается предлагаемыми соединениями общей формулы (I), представляющими собой нуклеозиды, содержащие дополнительные моносахаридные остатки, присоединенные к рибозе О-гликозидной связью, в качестве средства для ингибирования поли(АДФ-рибозо)полимеразы-1 человека (ПАРП-1).The stated technical problem is solved by the proposed compounds of general formula (I), which are nucleosides containing additional monosaccharide residues attached to ribose by an O-glycosidic bond, as a means for inhibiting human poly (ADP-riboso) polymerase-1 (PARP-1).
Предлагаемые соединения получают известным способом, описанным в [E.V.Efimtseva, et al., Current Organic Chemistry, 11, No 4, 337-354 (2007)]. Метод синтеза заключается в конденсации небольшого избытка полностью ацилированного моносахарида с частично защищенными нуклеозидами, имеющими одну свободную гидроксильную группу, в присутствии тетрахлорида олова. O-гликозилирование протекает стереоспецифично с образованием β-гликозидной связи.The proposed compounds are prepared in a known manner described in [E.V. Efimtseva, et al., Current Organic Chemistry, 11, No. 4, 337-354 (2007)]. The synthesis method consists in condensing a small excess of a fully acylated monosaccharide with partially protected nucleosides having one free hydroxyl group in the presence of tin tetrachloride. O-glycosylation proceeds stereospecifically with the formation of a β-glycosidic bond.
На фиг.1 представлена схема синтеза предлагаемых соединений, где R1=1,1,3,3-O-тетра-изопропилдисилоксан-1,3-диил; R2=O-трет-бутилдифенилсилил; В=Ura, Thy, CytBz, AdeBz, GuaiBu; B'=Ura, Thy, Cyt, Ade, Gua; a - SnCl4, ClСH2CH2Cl, 0°C; b - деблокирование, Bu4NF/THF; 5 M NH3/MeOH. R=H, OH.Figure 1 presents the synthesis scheme of the proposed compounds, where R 1 = 1,1,3,3-O-tetra-isopropyl disiloxane-1,3-diyl; R 2 = O-tert-butyl diphenylsilyl; B = Ura, Thy, Cyt Bz , Ade Bz , Gua iBu ; B '= Ura, Thy, Cyt, Ade, Gua; a - SnCl 4 , ClCH 2 CH 2 Cl, 0 ° C; b - release, Bu 4 NF / THF; 5 M NH 3 / MeOH. R = H, OH.
В частном случае, в качестве примеров на фиг.1 представлены 1-O-ацетил-2,3,5-три-(9-бензоил-β-D-рибофураноза (соединение i) и 1,2,3,5-тетра-O-ацетил-β-D-рибопираноза (соединение ii). В реакции O-гликозилирования также использовались и другие ацилированные моносахариды: D-арабиноза, L-арабиноза, 5-амино-5-дезоксирибоза и D-эритроза.In the particular case, as examples, figure 1 presents 1-O-acetyl-2,3,5-tri- (9-benzoyl-β-D-ribofuranose (compound i) and 1,2,3,5-tetra -O-acetyl-β-D-ribopyranose (compound ii) Other acylated monosaccharides were also used in the O-glycosylation reaction: D-arabinose, L-arabinose, 5-amino-5-deoxyribose and D-erythrosis.
Структура и чистота полученных соединений подтверждались данными ЯМР-, УФ-, КД-спектроскопии и масс-спектрометрии.The structure and purity of the obtained compounds were confirmed by NMR, UV, CD spectroscopy and mass spectrometry.
Ниже приводятся конкретные примеры реализации заявляемого технического решения.The following are specific examples of the implementation of the proposed technical solution.
Пример 1. Синтез 2'-О-β-D-рибофуранозилтимидина (1 на фиг.1)Example 1. Synthesis of 2'-O-β-D-ribofuranosylthymidine (1 in figure 1)
На первом этапе синтеза осуществляли конденсацию N6-бензоил-3',5'-(1,1,3,3-O-тетра-изопропилдисилоксан-1,3-диил(ТIРDS))тимина (Markiewicz et al., 1986; CPNAC unit 2.4) и 1-O-ацетил-2,3,5-три-O-бензоил-β-D-рибофуранозы в присутствии тетрахлорида олова в 1,2-дихлорэтане при 0°С. Для того чтобы повысить выход целевых нуклеозидов и упростить процедуру их выделения, реакцию гликозилирования проводили в атмосфере азота, без доступа влаги воздуха.At the first stage of the synthesis, N 6 -benzoyl-3 ', 5' - (1,1,3,3-O-tetra-isopropyldisiloxane-1,3-diyl (TIPDS)) thymine was condensed (Markiewicz et al., 1986; CPNAC unit 2.4) and 1-O-acetyl-2,3,5-tri-O-benzoyl-β-D-ribofuranose in the presence of tin tetrachloride in 1,2-dichloroethane at 0 ° C. In order to increase the yield of target nucleosides and simplify the procedure for their isolation, the glycosylation reaction was carried out in a nitrogen atmosphere, without access to air moisture.
Вторым этапом синтеза удаляли защитные группы с 3'- и 5'-положений полученного соединения действием фторид-ионов (тетрабутиламмония фторида тригидрата, TBAF). Реакцию проводили в 0,5 М растворе TBAF в тетрагидрофуране в течение 20-30 мин, при комнатной температуре.The second synthesis step removed the protective groups from the 3'- and 5'-positions of the obtained compound by the action of fluoride ions (tetrabutylammonium fluoride trihydrate, TBAF). The reaction was carried out in a 0.5 M solution of TBAF in tetrahydrofuran for 20-30 minutes, at room temperature.
На последнем этапе производили удаление бензоильных защитных групп с дополнительного сахарного остатка при помощи 5 М раствора аммиака в метаноле (полунасыщенный раствор при 0°С). Реакция полностью проходила за 2-3 дня при комнатной температуре.At the last stage, benzoyl protective groups were removed from the additional sugar residue using a 5 M solution of ammonia in methanol (semi-saturated solution at 0 ° C). The reaction completely took place in 2-3 days at room temperature.
Характеристики полученного соединения: Тпл 236-237°С (этанол). Rf 0.16 (8:2 v/v СН2Сl2/МеОН). [α]20 D-52° (с 0.82, вода). УФ (рН 1-7): λmах 269 nm (ε9400); (рН 13): λmах 262 nm (ε7100). Масс-спектр: (C15H22N2O10+Н). Вычислено 391.1352. Найдено 391.1362. 1Н ЯМР (400 МГц, D2O): 7.66 кв (1H, J6,CH3=1.2, Н-6, Thy), 6.03 д (1H, J1',2' = 5.5, Н-1', Thd), 5.12 с (1H, Н-1', Rib), 4.44 дд (1H, J2',3'=5.5, H-2', Thd), 4.38 дд (1H, J3',4'=4.7, Н-3', Thd), 4.14 дд (1H, J2',3'=4.7, J3',4'=6.7, Н-3', Rib), 4.13 дд (1H, H-2', Rib), 4.11 ддд (1H, J4',5'a=3.1, J4',5'b=4.5, H-4', Urd), 3.99 ддд (1H, J4',5'a=3.6, J4'5'b=6.7, H-4', Rib), 3.88 дд (1H, J5'a,5'b=-12.7, H-5'a, Thd), 3.81 дд (1H, H-5'b, Urd), 3.71 дд (1H, J5'a,5'b=-12.1, H-5'a, Rib), 3.44 дд (1H, H-5'b, Rib), 1.91 д (1H, Ме-5). 13С ЯМР (D2O): 167.28 (С-4), 152.71 (С-2), 138.49 (С-6), 112.82 (С-5), 107.71 (С-1', Rib), 88.50 (С-1', Thd), 85.60 (С-4', Thd), 83.88 (С-4', Rib), 79.17 (С-2', Thd), 75.32 (С-2', Rib), 71.74 (С-3', Rib), 69.32 (C-3', Thd), 64.03 (С-5', Rib), 61.71 (С-5', Thd), 12.47 (Ме-5).Characteristics of the obtained compound: mp 236-237 ° C (ethanol). R f 0.16 (8: 2 v / v CH 2 Cl 2 / MeOH). [α] 20 D -52 ° (c 0.82, water). UV (pH 1-7): λ max 269 nm (ε9400); (pH 13): λ max 262 nm (ε7100). Mass spectrum: (C 15 H 22 N 2 O 10 + H). Calculated 391.1352. Found 391.1362. 1 H NMR (400 MHz, D 2 O): 7.66 q (1H, J 6, CH 3 = 1.2, H-6, Thy), 6.03 d (1 H, J 1 ', 2' = 5.5, H-1 ', Thd), 5.12 s (1H, H-1 ', Rib), 4.44 dd (1H, J 2', 3 ' = 5.5, H-2', Thd), 4.38 dd (1H, J 3 ', 4' = 4.7, H-3 ', Thd), 4.14 dd (1H, H-2', 1H, J 2 ', 3' = 4.7, J 3 ', 4' = 6.7, H-3 ', Rib), 4.13 dd (1H, H-2' , Rib), 4.11 ddd (1H, J 4 ', 5'a = 3.1, J 4', 5'b = 4.5, H-4 ', Urd), 3.99 ddd (1H, J 4', 5'a = 3.6, J 4'5'b = 6.7, H-4 ', Rib), 3.88 dd (1H, J 5'a, 5'b = -12.7, H-5'a, Thd), 3.81 dd (1H, H-5'b, Urd), 3.71 dd (1H, J 5'a, 5'b = -12.1, H-5'a, Rib), 3.44 dd (1H, H-5'b, Rib), 1.91 d (1H, Me-5). 13 C NMR (D 2 O): 167.28 (C-4), 152.71 (C-2), 138.49 (C-6), 112.82 (C-5), 107.71 (C-1 ', Rib), 88.50 (C -1 ', Thd), 85.60 (С-4', Thd), 83.88 (С-4 ', Rib), 79.17 (С-2', Thd), 75.32 (С-2 ', Rib), 71.74 (С -3 ', Rib), 69.32 (C-3', Thd), 64.03 (C-5 ', Rib), 61.71 (C-5', Thd), 12.47 (Me-5).
Пример 2. Синтез 2'-O-β-D-рибофуранозилгуанозина (2 на фиг.1)Example 2. Synthesis of 2'-O-β-D-ribofuranosylguanosine (2 in FIG. 1)
На первом этапе синтеза осуществляли конденсацию N6-бензоил-3',5'-(1,1,3,3-O-тетра-изопропилдисилоксан-1,3-диил(ТIРDS))гуанина (Markiewicz et al., 1986; CPNAC unit 2.4) и 1-O-ацетил-2,3,5-три-O-бензоил-β-D-рибофуранозы в присутствии тетрахлорида олова в 1,2-дихлорэтане при 0°С. Для того чтобы повысить выход целевых нуклеозидов и упростить процедуру их выделения, реакцию гликозилирования проводили в атмосфере азота, без доступа влаги воздуха.At the first stage of the synthesis, N 6 -benzoyl-3 ', 5' - (1,1,3,3-O-tetra-isopropyldisiloxane-1,3-diyl (TIPDS)) guanine was condensed (Markiewicz et al., 1986; CPNAC unit 2.4) and 1-O-acetyl-2,3,5-tri-O-benzoyl-β-D-ribofuranose in the presence of tin tetrachloride in 1,2-dichloroethane at 0 ° C. In order to increase the yield of target nucleosides and simplify the procedure for their isolation, the glycosylation reaction was carried out in a nitrogen atmosphere, without access to air moisture.
Вторым этапом синтеза удаляли защитные группы с 3'- и 5'-положений полученного соединения действием фторид-ионов (тетрабутиламмония фторида тригидрата, TBAF). Реакцию проводили в 0,5 М растворе TBAF в тетрагидрофуране в течение 20-30 мин, при комнатной температуре.The second synthesis step removed the protective groups from the 3'- and 5'-positions of the obtained compound by the action of fluoride ions (tetrabutylammonium fluoride trihydrate, TBAF). The reaction was carried out in a 0.5 M solution of TBAF in tetrahydrofuran for 20-30 minutes, at room temperature.
На последнем этапе производили удаление бензоильных защитных групп с дополнительного сахарного остатка при помощи 5 М раствора аммиака в метаноле (полунасыщенный раствор при 0°С). Реакция полностью проходила за 2-3 дня при комнатной температуре.At the last stage, benzoyl protective groups were removed from the additional sugar residue using a 5 M solution of ammonia in methanol (semi-saturated solution at 0 ° C). The reaction completely took place in 2-3 days at room temperature.
9-(2-O-β-D-рибофуранозил-β-D-рибофуранозил)-гуанин (1В=Gua). Тпл 215-216°С (EtOH). Rf 0.09 (8:2 v/v CH2Cl2/МеОН). [α]20 D -75° (с 0.92, вода). УФ (рН 1): λmах 257 nm (ε 10800); (рН 7): λmах 254 nm (ε 12000); (pH 13): λmах 263 nm (ε 10000). Масс-спектр: (C15H21N5O9+Н). Вычислено 416.1417. Найдено 416.1413. 1Н ЯМР (400 МГц, D2O): 8.03 с (1Н, Н-6, Gua), 6.01 д (1Н, J1',2'=6.3, Н-1', Guo), 5,12 д (1Н, J1',2'=0.8, Н-1', Rib), 4.81 дд (1Н, J2',3'=5.3, Н-2', Guo), 4.56 дд (1Н, J3',4'=3.3, H-3', Guo), 4.26 ддд (1Н, J4',5'а=3.1, J4',5'b=4.1, H-4', Guo), 4.17 дд (1Н, J2',3'=4.6, H-2', Rib), 4.08 дд (1Н, J3',4'=7.3, H-3', Rib), 3.92 ддд (1Н, J4',5'a=3.8, J4',5'b=6.8, H-4', Rib), 3.91 дд (1Н, J5'a,5'b=-12.8, H-5'a, Guo), 3.85 дд (1Н, H-5'b, Guo), 3.47 дд (1Н, J5'a,5'b=-11.9, H-5'a, Rib), 3.01 дд (1Н, H-5'b, Rib). 13С ЯМР (D2O): 159.89 (C-6), 154.86 (C-2), 150.85 (C-4), 139.28 (C-8), 117.67 (C-5), 107.18 (С-1', Rib), 87.52 (С-1', Guo), 87.03 (C-4', Guo), 83.80 (C-4', Rib), 78.98 (C-2', Guo), 75.37 (C-2', Rib), 72.06 (C-3', Rib), 69.96 (C-3', Guo), 64.02 (C-5', Rib), 62.41 (C-5', Guo).9- (2-O-β-D-ribofuranosyl-β-D-ribofuranosyl) guanine (1B = Gua). Mp 215-216 ° C (EtOH). R f 0.09 (8: 2 v / v CH 2 Cl 2 / MeOH). [α] 20 D -75 ° (c 0.92, water). UV (pH 1): λ max 257 nm (ε 10800); (pH 7): λ max 254 nm (ε 12000); (pH 13): λ max 263 nm (ε 10000). Mass spectrum: (C 15 H 21 N 5 O 9 + H). Calculated 416.1417. Found 416.1413. 1 H NMR (400 MHz, D 2 O): 8.03 s (1H, H-6, Gua), 6.01 d (1H, J 1 ', 2' = 6.3, H-1 ', Guo), 5.12 d (1H, J 1 ', 2' = 0.8, H-1 ', Rib), 4.81 dd (1H, J 2', 3 ' = 5.3, H-2', Guo), 4.56 dd (1H, J 3 ' , 4 ' = 3.3, H-3', Guo), 4.26 ddd (1H, J 4 ', 5'a = 3.1, J 4', 5'b = 4.1, H-4 ', Guo), 4.17 dd ( 1H, J 2 ', 3' = 4.6, H-2 ', Rib), 4.08 dd (1H, J 3', 4 ' = 7.3, H-3', Rib), 3.92 ddd (1H, J 4 ', 5'a = 3.8, J 4 ', 5'b = 6.8, H-4', Rib), 3.91 dd (1H, J 5'a, 5'b = -12.8, H-5'a, Guo), 3.85 dd (1H, H-5'b, Guo), 3.47 dd (1H, J 5'a, 5'b = -11.9, H-5'a, Rib), 3.01 dd (1H, H-5'b , Rib). 13 C NMR (D 2 O): 159.89 (C-6), 154.86 (C-2), 150.85 (C-4), 139.28 (C-8), 117.67 (C-5), 107.18 (C-1 ' , Rib), 87.52 (C-1 ', Guo), 87.03 (C-4', Guo), 83.80 (C-4 ', Rib), 78.98 (C-2', Guo), 75.37 (C-2 ' , Rib), 72.06 (C-3 ', Rib), 69.96 (C-3', Guo), 64.02 (C-5 ', Rib), 62.41 (C-5', Guo).
Пример 3. Синтез 3'-O-β-D-рибофуранозил-2'-дезокситимидина (3 на фиг.1)Example 3. Synthesis of 3'-O-β-D-ribofuranosyl-2'-deoxythymidine (3 in FIG. 1)
На первом этапе проводили конденсацию 5'-O-трет-бутилдифенилсилил-тимидина с 1-O-ацетил-2,3,5-три-O-бензоил-β-D-рибофуранозой.At the first stage, 5'-O-tert-butyl diphenylsilyl-thymidine was condensed with 1-O-acetyl-2,3,5-tri-O-benzoyl-β-D-ribofuranose.
Вторым этапом синтеза удаляли защитные группы с 5'-положения нуклеозида действием фторид-ионов (тетрабутиламмония фторида тригидрата, Bu4NFх3Н2O). Реакцию проводили в 0,5 М растворе Bu4NF в тетрагидрофуране в течение 20-30 мин, при комнатной температуре.The second synthesis step removed the protective groups from the 5'-position of the nucleoside by the action of fluoride ions (tetrabutylammonium fluoride trihydrate, Bu 4 NFх3Н 2 O). The reaction was carried out in a 0.5 M solution of Bu 4 NF in tetrahydrofuran for 20-30 minutes, at room temperature.
Затем проводили удаление бензоильных защитных групп с дополнительного углеводного остатка при помощи 5 М раствора аммиака в метаноле (полунасыщенный раствор при 0°С). Реакция полностью проходила за 2-3 дня при комнатной температуре.Then, the benzoyl protective groups were removed from the additional carbohydrate residue using a 5 M solution of ammonia in methanol (semi-saturated solution at 0 ° С). The reaction completely took place in 2-3 days at room temperature.
Характеристики полученного соединения: Rf 0.42 (8:2 v/v СН2Сl2/ЕtOН). [α]20 D-28° (с 1.0, Н2О). УФ (рН 1-7): λmax 267 нм (ε 9600); (рН 13): λmax 267 nm (ε 7400). Масс-спектр: (C15H22N2O9+Н). Вычислено 375.1404. Найдено 375.1419. 1Н ЯМР (400 МГц, D2O): 7.50 д (1Н, J6,5=1,2 Гц, Н-6), 6.11 т (1Н, J1',2'a=J1',2'b=6.8 Гц, Н-1' Thd), 4.99 с (1Н, Н-1' Rib), 4.33 м (1Н, Н-3' Thd), 4.10 дд (1Н, J3',2'=4.8 Гц, J3',4'=6.3 Гц, Н-3' Rib), 4.01-3.87 м (3Н, Н-4', 5'а, 5'b Thd), 3.76-3.65 м (3Н, Н-2', 4', 5'а Rib), 3.57 дд (1Н, J5'b,4'=6.6, J5'b,5'a=-12.4 Гц, H-5'b Rib), 2.50-2.12 м (2Н, Н-2'а, 2'b Thd), 1.76 дд (3Н, Ме-5). 13С ЯМР (D2O): 167.48 (С-4), 152.69 (С-2), 138.41 (С-6), 112.44 (С-5), 107.64 (С-1' Rib), 86.22 (С-1' Thd), 85.73 (С-4' Thd), 83.96 (C-4' Rib), 78.55 (C-3' Thd), 75.63 (С-2' Rib), 71.82 (C-3' Rib), 63.88 (С-5' Rib), 62.33 (С-5' Thd), 38.33 (С-2' Thd), 12.60 (Ме-5).Characteristics of the obtained compound: R f 0.42 (8: 2 v / v CH 2 Cl 2 / EtOH). [α] 20 D -28 ° (s 1.0, H 2 O). UV (pH 1-7): λ max 267 nm (ε 9600); (pH 13): λ max 267 nm (ε 7400). Mass spectrum: (C 15 H 22 N 2 O 9 + H). Calculated 375.1404. Found 375.1419. 1 H NMR (400 MHz, D 2 O): 7.50 d (1H, J 6.5 = 1.2 Hz, H-6), 6.11 t (1H, J 1 ', 2'a = J 1', 2 'b = 6.8 Hz, H-1' Thd), 4.99 s (1H, H-1 'Rib), 4.33 m (1H, H-3' Thd), 4.10 dd (1H, J 3 ', 2' = 4.8 Hz, J 3 ', 4' = 6.3 Hz, N-3 'Rib), 4.01-3.87 m (3Н, Н-4', 5'а, 5'b Thd), 3.76-3.65 m (3Н, Н- 2 ', 4', 5'a Rib), 3.57 dd (1H, J 5'b, 4 ' = 6.6, J 5'b, 5'a = -12.4 Hz, H-5'b Rib), 2.50- 2.12 m (2H, H-2'a, 2'b Thd), 1.76 dd (3H, Me-5). 13 C NMR (D 2 O): 167.48 (C-4), 152.69 (C-2), 138.41 (C-6), 112.44 (C-5), 107.64 (C-1 'Rib), 86.22 (C- 1 'Thd), 85.73 (C-4' Thd), 83.96 (C-4 'Rib), 78.55 (C-3' Thd), 75.63 (C-2 'Rib), 71.82 (C-3' Rib), 63.88 (C-5 'Rib), 62.33 (C-5' Thd), 38.33 (C-2 'Thd), 12.60 (Me-5).
Пример 4. Синтез 3'-O-β-D-рибопиранозил-2'-дезокситимидина (5 на фиг.1)Example 4. Synthesis of 3'-O-β-D-ribopyranosyl-2'-deoxythymidine (5 in FIG. 1)
На первом этапе проводили конденсацию 5'-O-трет-бутилдифенилсилил-тимидина с 1-O-ацетил-2,3,5-три-O-бензоил-β-D-рибопиранозой.At the first stage, 5'-O-tert-butyl diphenylsilyl-thymidine was condensed with 1-O-acetyl-2,3,5-tri-O-benzoyl-β-D-ribopyranose.
Вторым этапом синтеза удаляли защитные группы с 5'-положения нуклеозида действием фторид-ионов (тетрабутиламмония фторида тригидрата, Вu4NFx3Н2О). Реакцию проводили в 0,5 М растворе Bu4NF в тетрагидрофуране в течение 20-30 мин, при комнатной температуре.The second stage of the synthesis removed the protective groups from the 5'-position of the nucleoside by the action of fluoride ions (tetrabutylammonium fluoride trihydrate, Bu 4 NFx3Н 2 О). The reaction was carried out in a 0.5 M solution of Bu 4 NF in tetrahydrofuran for 20-30 minutes, at room temperature.
Затем проводили удаление бензоильных защитных групп с дополнительного углеводного остатка при помощи 5 М раствора аммиака в метаноле (полунасыщенный раствор при 0°С). Реакция полностью проходила за 2-3 дня при комнатной температуре.Then, the benzoyl protective groups were removed from the additional carbohydrate residue using a 5 M solution of ammonia in methanol (semi-saturated solution at 0 ° С). The reaction completely took place in 2-3 days at room temperature.
Характеристики полученного 3'-O-β-D-рибопиранозил-2'-дезокситимидина: Тпл 126-128°С. [а]D-40.7° (с 0.73, вода). УФ (рН 1-7): λmax 267 nm (ε 9400); (рН 13): λmax 267 nm (ε 7100).Characteristics of the obtained 3'-O-β-D-ribopyranosyl-2'-deoxythymidine: T PL 126-128 ° C. [a] D -40.7 ° (c 0.73, water). UV (pH 1-7): λ max 267 nm (ε 9400); (pH 13): λ max 267 nm (ε 7100).
Масс-спектр: (C15H22N5O9+H). Вычислено 375.1404. Найдено 375.1380. 1Н ЯМР (D2O): 7.55 к (1Н, J6,5=1.0 Гц, Н-6), 6.18 дд (1Н, J1',2'a=6.2 Гц, J1',2'b=7.3 Гц, Н-1' Thd), 4.77 д (1Н, J1'2'=5.5 Гц, Н-1' Rib), 4.41 ддд (1Н, J3',2a'=3.6 Гц, J3',2'b'=6.8 Гц, J3',4'=2.5 Гц, Н-3' Thd), 4.09 м (1Н, H-4' Thd), 4.00 т (1Н, J3',2'=J3',4'=2.9 Гц, Н-3', Rib), 3.85-3.53 м (6Н, H-5'a,5'b Thd, H-2',4',5'a,5'b Rib), 2.44 ддд (1Н, J2'a,2'b=-14.1 Гц, H-2'a Thd), 2.32 ддд (1Н, H-2'b Thd), 1.80 д (3Н, Ме-5). 13С ЯМР (D2O): 166.90 (С-4), 152.10 (С-2), 137.84 (С-6), 111.91 (С-5), 100.55 (С-1' Rib), 85.70 (С-1' Thd), 85.22 (С-4' Thd), 78.69 (С-3' Thd), 70.61 (С-2' Rib), 68.40 (С-3' Rib), 68.03 (С-4' Rib), 63.87 (С-5' Thd), 61.76 (С-5' Rib), 37.59 (С-2' Thd), 12.00 (Ме-5).Mass spectrum: (C 15 H 22 N 5 O 9 + H). Calculated 375.1404. Found 375.1380. 1 H NMR (D 2 O): 7.55 q (1H, J 6.5 = 1.0 Hz, H-6), 6.18 dd (1H, J 1 ', 2'a = 6.2 Hz, J 1', 2'b = 7.3 Hz, H-1 'Thd), 4.77 dd (1H, J 1'2' = 5.5 Hz, H-1 'Rib), 4.41 ddd (1H, J 3', 2a ' = 3.6 Hz, J 3' , 2'b ' = 6.8 Hz, J 3', 4 ' = 2.5 Hz, H-3' Thd), 4.09 m (1H, H-4 'Thd), 4.00 t (1H, J 3', 2 ' = J 3 ', 4' = 2.9 Hz, H-3 ', Rib), 3.85-3.53 m (6H, H-5'a, 5'b Thd, H-2', 4 ', 5'a, 5' b Rib), 2.44 ddd (1H, J 2'a, 2'b = -14.1 Hz, H-2'a Thd), 2.32 ddd (1H, H-2'b Thd), 1.80 d (3H, Me- 5). 13 C NMR (D 2 O): 166.90 (C-4), 152.10 (C-2), 137.84 (C-6), 111.91 (C-5), 100.55 (C-1 'Rib), 85.70 (C- 1 'Thd), 85.22 (C-4' Thd), 78.69 (C-3 'Thd), 70.61 (C-2' Rib), 68.40 (C-3 'Rib), 68.03 (C-4' Rib), 63.87 (C-5 'Thd), 61.76 (C-5' Rib), 37.59 (C-2 'Thd), 12.00 (Me-5).
Пример 5. Исследование влияния нуклеозидов с дополнительными моносахаридными остатками на активность ПАРП-1Example 5. The study of the effect of nucleosides with additional monosaccharide residues on the activity of PARP-1
Рекомбинантная поли(АДФ-рибоза)-полимераза 1 человека (КФ 2.4.2.30) была экспрессирована в системе Escherichia coli (штамм BL21 DE3 (pLys E)). Синтез ПАРП-1 индуцировали добавлением IPTG до 1 мМ, далее клеточную культуру инкубировали в течение 3 ч при 37°С. Затем клетки осаждали центрифугированием и полученный осадок суспендировали в буфере, содержавшем 50 мМ Tris-HCl, рН 8,0, 10%-ный глицерин, 1 мМ β-меркаптоэтанол, 1 мМ PMSF, 1 мМ бензамидин (буфер A), AntPrt-Coctail в количестве, рекомендованном производителем, и 2 М NaCl. Клетки разрушали ультразвуком. Дальнейшая схема очистки включала ряд последовательных хроматографий с использованием Ni-NTA (элюция 250 мМ имидазолом в буфере А), гепарин-сефарозы (элюция линейным градиентом NaCl (0,1-0,8 М) в буфере А) и одноцепочечной ДНК-целлюлозы (элюция линейным градиентом NaCl (0,1-1 М) в буфере А). Чистоту полученных препаратов ПАРП-1 контролировали на всех стадиях очистки с помощью электрофореза по методу Лэммли [Laemmli, U.K. (1970) Nature, 227, 680-685]. Диализ конечного препарата проводили против буфера А, содержавшего 0,1 M NaCl. Конечный препарат хранили в аликвотах по 20 мкл при -70°С.Human recombinant poly (ADP-ribose) polymerase 1 (EC 2.4.2.30) was expressed in the Escherichia coli system (strain BL21 DE3 (pLys E)). Synthesis of PARP-1 was induced by the addition of IPTG to 1 mM, then the cell culture was incubated for 3 hours at 37 ° C. The cells were then pelleted by centrifugation and the resulting pellet was suspended in a buffer containing 50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 10% glycerol, 1 mM β-mercaptoethanol, 1 mM PMSF, 1 mM benzamidine (buffer A), AntPrt-Coctail in the amount recommended by the manufacturer, and 2 M NaCl. Cells were destroyed by ultrasound. A further purification scheme included a series of sequential chromatographies using Ni-NTA (elution with 250 mM imidazole in buffer A), heparin sepharose (elution with a linear gradient of NaCl (0.1-0.8 M) in buffer A), and single-stranded DNA cellulose ( elution with a linear gradient of NaCl (0.1-1 M) in buffer A). The purity of the obtained PARP-1 preparations was monitored at all stages of purification using electrophoresis according to the Laemmli method [Laemmli, U.K. (1970) Nature, 227, 680-685]. Dialysis of the final preparation was carried out against buffer A containing 0.1 M NaCl. The final preparation was stored in aliquots of 20 μl at -70 ° C.
В качестве тест-системы для определения ингибирующих свойств соединений использована реакция автополи(АДФ-рибозил)ирования, катализируемая ПАРП-1. Условия проведения реакции: 50 мМ Трис-HCl, рН 8.0, 20 мМ MgCl2, 150 мМ NaCl, 7 мМ β-меркаптоэтанол, активированная ДНК 2°А260/мл, степень активации 25%, 0,3°мМ [3Н] НАД+ (изотопное разбавление 1:1000) при температуре 37°С. Концентрация потенциальных ингибиторов варьировалась в пределах от 10 нМ до 1 мМ. Реакцию запускали добавлением ПАРП-1 до конечной концентрации 500 нМ и останавливали нанесением на бумажные фильтры Whatman 1, пропитанные 5% ТХУ, через 30 сек. Фильтры отмывали в 5% ТХУ 4-кратно, затем удаляли ТХУ 90% этанолом. Фильтры сушили на воздухе.As a test system for determining the inhibitory properties of the compounds, the autopoly (ADP-ribosylation) reaction catalyzed by PARP-1 was used. Reaction conditions: 50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 20 mM MgCl 2 , 150 mM NaCl, 7 mM β-mercaptoethanol, activated
Обсчет включения радиоактивности в кислотонерастворимый продукт проводили на сцинтилляционном счетчике QuantaSmart в толуольном сцинтилляторе. Детекция радиоактивномеченого продукта проводилась на линейном участке зависимости скорости от времени реакции при концентрации природного субстрата НАД, равной Km. В качестве показателя эффективности ингибирования использовали значение IC50. Значение IC50 представляет собой концентрацию испытуемого соединения, которая вызывает 50% снижение активности ПАРП-1. Расчет значений IС50 проводили с помощью программы OriginPro 7.0.The inclusion of radioactivity in an acid-insoluble product was calculated on a QuantaSmart scintillation counter in a toluene scintillator. The detection of the radiolabeled product was carried out on a linear plot of the dependence of the rate on the reaction time at a concentration of the natural substrate NAD equal to Km. An IC 50 value was used as an indicator of inhibition efficiency. The IC 50 value represents the concentration of the test compound, which causes a 50% decrease in PARP-1 activity. Calculation of IC 50 values was performed using the OriginPro 7.0 software.
На фиг.2 приведена типичная кривая зависимости скорости реакции автополи(АДФ-рибозил)ирования от концентрации ингибитора (3'Rib-α-dAde, (7) на фиг.1).Figure 2 shows a typical curve of the dependence of the reaction rate of auto-field (ADP-ribosylation) on the concentration of inhibitor (3'Rib-α-dAde, (7) in figure 1).
Из фиг.2 видно, что скорость включения радиоактивности в кислотонерастворимый продукт падает с увеличением концентрации ингибитора.Figure 2 shows that the rate of incorporation of radioactivity into an acid-insoluble product decreases with increasing concentration of the inhibitor.
Соединения, использованные в качестве ингибиторов ПАРП-1, перечислены в таблице.Compounds used as PARP-1 inhibitors are listed in the table.
Из таблицы видно, что наиболее эффективными ингибиторами ПАРП-1 среди нуклеозидов с дополнительными моносахаридными остатками являются производные тимидина. Тимидиновые производные ингибируют фермент со значениями IС50 от 0,2 мМ до 0,05 мМ, что в 5-20 раз меньше, чем у прототипа. Высокую ингибирующую активность проявили также 3-O-β-D-рибофуранозил-2-дезокси-α-D-аденозин (IС50 0,2 мМ, что в 5 раз меньше, чем у прототипа), и 9-(2-O-β-D-рибофуранозил-β-D-рибофуранозил)-гуанин (IС50 0,5 мМ, что в два раза меньше, чем у прототипа), и 9-(3-O-β-D-рибофуранозил-β-D-рибофуранозил)-цитозин (IС50 0,6 мМ, что в 1,7 раза меньше, чем у прототипа).The table shows that the most effective PARP-1 inhibitors among nucleosides with additional monosaccharide residues are thymidine derivatives. Thymidine derivatives inhibit the enzyme with IC 50 values from 0.2 mm to 0.05 mm, which is 5-20 times less than that of the prototype. High inhibitory activity was also shown by 3-O-β-D-ribofuranosyl-2-deoxy-α-D-adenosine (IC 50 0.2 mm, which is 5 times less than that of the prototype), and 9- (2-O β-D-ribofuranosyl-β-D-ribofuranosyl) guanine (IC 50 0.5 mM, which is two times less than that of the prototype), and 9- (3-O-β-D-ribofuranosyl-β- D-ribofuranosyl) -cytosine (IC 50 0.6 mm, which is 1.7 times less than that of the prototype).
В таблице не приведены соединения урацила, которые не оказывали ингибирующего действия на ПАРП-1 ни в одной конфигурации сахарной части молекулы.The table does not show the uracil compounds that did not inhibit PARP-1 in any configuration of the sugar part of the molecule.
Пример 6. Исследование специфичности ингибирования ПАРП-1 предлагаемыми соединениямиExample 6. The study of the specificity of inhibition of PARP-1 of the proposed compounds
Для оценки специфичности ингибирования ПАРП-1 предлагаемыми соединениями исследовали влияние этих соединений на два других фермента - участника эксцизионной репарации оснований (ЭРО): ДНК-полимеразу β (β-пол) и апуриновую/апиримидиновую эндонуклеазу 1 (АРЕ-1).To assess the specificity of PARP-1 inhibition by the proposed compounds, we studied the effect of these compounds on two other enzymes - a participant in base excision repair (ERO): β DNA polymerase (β-floor) and apurine / apyrimidine endonuclease 1 (ARE-1).
β-Пол - фермент ЭРО, участвующий как в короткозаплаточном пути (встраивание одного нуклеотида и удаление 5'-дезоксирибозофосфатного остатка), так и в длиннозаплаточном (включение первого нуклеотида, а по некоторым данным и ресинтез более протяженного участка) [Podlutsky A.J. et al., EMBO J. 2001. V.20. P.1477-1482; Matsumoto Y., et al., Science. 1995. V.269 P.699-702; Sobol R.W., et al., Nature. 1996. V.379. P.183-186]. Были исследованы ингибирующие свойства всех приведенных в таблице производных нуклеозидов (в концентрации 1 мМ) на активность β-пол в реакции синтеза ДНК с использованием активированной ДНК (смесь двухцепочечных ДНК с брешами различного размера). Установлено, что исследованные соединения не оказывали существенного влияния на активность β-пол (активность фермента в присутствии ингибиторов составляла 80-105% от контрольной). Отсутствие ингибирования β-пол этими соединениями указывает на их специфичность по отношению ПАРП-1.β-Paul is an ERO enzyme involved both in the short-patched pathway (insertion of one nucleotide and removal of the 5'-deoxyribose phosphate residue), and in the long-patched (inclusion of the first nucleotide, and, according to some data, resynthesis of a longer region) [Podlutsky A.J. et al., EMBO J. 2001. V.20. P.1477-1482; Matsumoto Y., et al., Science. 1995. V.269 P.699-702; Sobol R.W., et al., Nature. 1996. V.379. P.183-186]. We studied the inhibitory properties of all the nucleoside derivatives listed in the table (at a concentration of 1 mM) on β-floor activity in DNA synthesis using activated DNA (a mixture of double-stranded DNA with gaps of various sizes). It was found that the studied compounds did not significantly affect β-floor activity (enzyme activity in the presence of inhibitors was 80-105% of the control). The absence of β-floor inhibition by these compounds indicates their specificity for PARP-1.
Влияние предлагаемых соединений на активность АРЕ-1 оценивали на примере 3'RibdThy (3), наиболее эффективного из всех перечисленных в таблице ингибиторов ПАРП-1. АРЕ-1 является основным белком клеток человека, ответственным за процессинг АП-сайтов [Wilson 3rd D.M., Barsky D. Mutat. Res. 2001. V.485. P.283-307]. Действие АРЕ-1 на поврежденную ДНК предшествует действию β-пол, предоставляя последней дуплекс с одноцепочечным разрывом, содержащим 3'-гидроксил и 5'-рибозофосфат для последующего удаления 5'-рибозофосфата и заполнения бреши.The effect of the proposed compounds on the activity of APE-1 was evaluated using 3'RibdThy (3) as the most effective of all PARP-1 inhibitors listed in the table. APE-1 is the main protein of human cells responsible for the processing of AP sites [
Активность АРЕ-1 тестировали в присутствии 32-мерного дуплекса, содержащего АП-сайт в 16-м положении. Для получения этого субстрата сплавляли 32-мерный олигонуклеотид, радиоактивномеченый по 5'-концу и содержащий остаток dUMP в средине цепи, с комплементарной ему цепью. АП-сайт генерировали непосредственно перед экспериментом, удаляя остатки урацила за счет активности урацил-ДНК-гликозилазы. Отбирали аликвоты реакционных смесей и обрабатывали их боргидридом натрия, что делает нерасщепленные АП-сайты устойчивыми в процессе дальнейшего разделения продуктов реакции в полиакриламидном геле.APE-1 activity was tested in the presence of a 32-dimensional duplex containing the AP site at the 16th position. To obtain this substrate, a 32-dimensional oligonucleotide fused at the 5'-end and containing the dUMP residue in the middle of the chain, complementary to it, was fused. The AP site was generated immediately before the experiment, removing residues of uracil due to the activity of uracil DNA glycosylase. Aliquots of the reaction mixtures were taken and treated with sodium borohydride, which makes the uncleaved AP sites stable during the further separation of the reaction products in a polyacrylamide gel.
Установлено, что 3'RibdThy не влиял на активность АРЕ-1 в концентрации 1 мМ, что указывает на специфичность этого ингибитора по отношению к ПАРП-1. Все исследованные соединения осуществляют избирательное ингибирование поли(АDP-рибоз)илирования, не затрагивая ключевые этапы процесса эксцизионной репарации оснований.It was found that 3'RibdThy did not affect the activity of APE-1 at a concentration of 1 mM, which indicates the specificity of this inhibitor with respect to PARP-1. All studied compounds carry out selective inhibition of poly (ADP-ribose) -lation, without affecting the key stages of the process of excision base repair.
Таким образом, предлагаемые соединения оказывают эффективное специфическое ингибирующее действие на фермент ПАРП-1, являясь дешевыми и доступными соединениями, расширяют арсенал специфических ингибиторов данного фермента и могут быть использованы для создания лекарственных препаратов, применимых в клинической медицине.Thus, the proposed compounds have an effective specific inhibitory effect on the PARP-1 enzyme, being cheap and affordable compounds, expand the arsenal of specific inhibitors of this enzyme and can be used to create drugs that are applicable in clinical medicine.
Claims (1)
где Х - Н или OR1; один или два из заместителей R1, R2, R3 - моносахаридные остатки, остальные - протоны водорода; В - азотистое основание, присоединенное в α- или β-положении. The agent for inhibiting the enzyme poly (ADP-ribose) polymerase-1 person, which is a derivative of nucleosides of the General formula (I)
where X is H or OR 1 ; one or two of the substituents R 1 , R 2 , R 3 are monosaccharide residues, the rest are hydrogen protons; B is a nitrogenous base attached in the α or β position.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2009138650/04A RU2411948C1 (en) | 2009-10-19 | 2009-10-19 | Medication for inhibiting human enzyme poly(adp-ribose)polymerase-1 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2009138650/04A RU2411948C1 (en) | 2009-10-19 | 2009-10-19 | Medication for inhibiting human enzyme poly(adp-ribose)polymerase-1 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2411948C1 true RU2411948C1 (en) | 2011-02-20 |
Family
ID=46309962
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2009138650/04A RU2411948C1 (en) | 2009-10-19 | 2009-10-19 | Medication for inhibiting human enzyme poly(adp-ribose)polymerase-1 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2411948C1 (en) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2559873C2 (en) * | 2011-04-27 | 2015-08-20 | Федеральное Государственное Бюджетное Учреждение Науки Институт Молекулярной Биологии Им. В.А. Энгельгардта Российской Академии Наук (Имб Ран) | Mimetics of poly (adp-ribose) and process for producing thereof |
Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2215004C2 (en) * | 1997-07-16 | 2003-10-27 | Ново Нордиск А/С | Condensed derivative of 1,2,4-thiadiazine, pharmaceutical composition and method for preparing medicine |
-
2009
- 2009-10-19 RU RU2009138650/04A patent/RU2411948C1/en not_active IP Right Cessation
Patent Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2215004C2 (en) * | 1997-07-16 | 2003-10-27 | Ново Нордиск А/С | Condensed derivative of 1,2,4-thiadiazine, pharmaceutical composition and method for preparing medicine |
Non-Patent Citations (3)
| Title |
|---|
| DATABASE BEILSTEIN [ONLINE], * |
| STN ON THE WEB, БД CAPLUS; AN 98:11117. STN ON THE WEB, БД CASREACT; AN 110:8130. STN ON THE WEB; * |
| WO 2005/000300 A1 (VERNALIS CAMBRIDGE LTD [GB] et al), 06.01.2005. WO 03/055860 A1 (RIBOTARGETS LTD [GB] et al), 10.07.2003. DATABASE BEILSTEIN [ONLINE], * |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2559873C2 (en) * | 2011-04-27 | 2015-08-20 | Федеральное Государственное Бюджетное Учреждение Науки Институт Молекулярной Биологии Им. В.А. Энгельгардта Российской Академии Наук (Имб Ран) | Mimetics of poly (adp-ribose) and process for producing thereof |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| AU2018256647C1 (en) | A method for the site-specific enzymatic labelling of nucleic acids in vitro by incorporation of unnatural nucleotides | |
| CA2459347C (en) | Locked nucleic acid (lna) compositions and uses thereof | |
| EP1970445B1 (en) | Method for nucleic acid replication and novel artificial base pairs | |
| US6140496A (en) | Precursors for deoxyribonucleotides containing non-standard nucleosides | |
| US8377644B2 (en) | 2′-arabino-fluorooligonucleotide N3′→P5′ phosphoramidates: their synthesis and use | |
| Ni et al. | Review of α-nucleosides: from discovery, synthesis to properties and potential applications | |
| Marquez et al. | Zebularine: a unique molecule for an epigenetically based strategy in cancer chemotherapy. The magic of its chemistry and biology | |
| KR20030061792A (en) | Nucleoside derivatives | |
| Gimisis et al. | Isolation, characterization, and independent synthesis of guanine oxidation products | |
| EP0595826A1 (en) | 2'-fluoro-2-substituted adeninyl arabinosides as anti-cancer agents | |
| EP1214331B1 (en) | 2-azapurine compounds and their use | |
| Shigeura et al. | Structure-activity relationship of some purine 3'-deoxyribonucleosides | |
| EP1753774A2 (en) | 2"-nitrobenzyl-modified ribonucleotides | |
| Ingale et al. | Glycosylation of pyrrolo [2, 3-d] pyrimidines with 1-O-acetyl-2, 3, 5-tri-O-benzoyl-β-d-ribofuranose: substituents and protecting groups effecting the synthesis of 7-deazapurine ribonucleosides | |
| Ohno et al. | Synthesis of photocaged 6-O-(2-nitrobenzyl) guanosine and 4-O-(2-nitrobenzyl) uridine triphosphates for photocontrol of the RNA transcription reaction | |
| RU2411948C1 (en) | Medication for inhibiting human enzyme poly(adp-ribose)polymerase-1 | |
| Sugiyama et al. | 2‐Aza‐2′‐deoxyadenosine: Synthesis, Base‐Pairing Selectivity, and Stacking Properties of Oligonucleotides | |
| Seela et al. | Advances in the Synthesis of 7-Deazapurine-Pyrrolo [2, 3-d] pyrimidine 2'-Deoxyribonucleosides Including D-and L-Enantiomers, Fluoro Derivatives and 2', 3'-Dideoxyribonucleosides | |
| Hassan et al. | 6-Methylpurine derived sugar modified nucleosides: Synthesis and evaluation of their substrate activity with purine nucleoside phosphorylases | |
| Liu et al. | Guanine and 8-Azaguanine in Anomeric DNA Hybrid Base Pairs: Stability, Fluorescence Sensing, and Efficient Mismatch Discrimination with α-d-Nucleosides | |
| Kitamura et al. | Synthesis of cationic glucosamino nucleic acids for stabilizing oligonucleotides | |
| Marx et al. | Probing DNA polymerase function with synthetic nucleotides | |
| Dyrkheeva et al. | Excision of Carbohydrate-Modified dNMP Analogues from DNA 3'end by Human Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease 1 (APE1) and Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1 (TDP1) | |
| Mieczkowski et al. | Potential and perspectives of cyclonucleosides | |
| RU2836333C1 (en) | Method of producing cladribine by enzymatic transglycosylation of 2-chloro-6-azidopurine with successive two-step conversion of azido group |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20171020 |