RU2326170C2 - Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы - Google Patents
Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы Download PDFInfo
- Publication number
- RU2326170C2 RU2326170C2 RU2002102452/13A RU2002102452A RU2326170C2 RU 2326170 C2 RU2326170 C2 RU 2326170C2 RU 2002102452/13 A RU2002102452/13 A RU 2002102452/13A RU 2002102452 A RU2002102452 A RU 2002102452A RU 2326170 C2 RU2326170 C2 RU 2326170C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acid
- acid molecule
- polypeptide
- seq
- activity
- Prior art date
Links
- 241000186226 Corynebacterium glutamicum Species 0.000 title claims abstract 7
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title abstract 3
- 108010067275 Phosphoenolpyruvate Sugar Phosphotransferase System Proteins 0.000 title abstract 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title abstract 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract 33
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract 31
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract 31
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract 24
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract 24
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract 24
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract 17
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 claims abstract 15
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 claims abstract 15
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims abstract 4
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract 3
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 claims abstract 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 15
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 15
- 101000623895 Bos taurus Mucin-15 Proteins 0.000 claims 14
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 claims 14
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 8
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims 8
- 241000186216 Corynebacterium Species 0.000 claims 7
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 7
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims 6
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims 6
- 241000186146 Brevibacterium Species 0.000 claims 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims 3
- 241000186145 Corynebacterium ammoniagenes Species 0.000 claims 2
- 241000186227 Corynebacterium diphtheriae Species 0.000 claims 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims 2
- 241000187561 Rhodococcus erythropolis Species 0.000 claims 2
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims 2
- 235000012539 Bacterium linens Nutrition 0.000 claims 1
- 241000186310 Brevibacterium linens Species 0.000 claims 1
- 241001517047 Corynebacterium acetoacidophilum Species 0.000 claims 1
- 241000234435 Lilium Species 0.000 claims 1
- 241000319304 [Brevibacterium] flavum Species 0.000 claims 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 claims 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 claims 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 claims 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 abstract 1
- 235000013681 dietary sucrose Nutrition 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 229960004793 sucrose Drugs 0.000 abstract 1
- 238000010998 test method Methods 0.000 abstract 1
Classifications
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/52—Improvements relating to the production of bulk chemicals using catalysts, e.g. selective catalysts
Landscapes
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Изобретение относится к биотехнологии. Описаны выделенные молекулы нуклеиновых кислот Corynebacterium glutamicum, которые кодируют полипептиды, обладающие активностью сахароза-специфического компонента II ABC. Изобретение относится также к рекомбинантным экспрессирующим векторам, содержащим описанные молекулы нуклеиновых кислот. Раскрыт способ получения клетки-хозяина, содержащей описанные экспрессирующие векторы. Данное изобретение касается также способа получения описанного полипептида при помощи культивирования указанной клетки-хозяина. Раскрыт способ диагностики Corynebacterium glutamicum у пациента, включающий обнаружение описанных молекул нуклеиновых кислот. Изобретение позволяет расширить ассортимент молекул нуклеиновых кислот, кодирующих белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы. 23 н. и 4 з.п. ф-лы, 4 табл.
Description
Claims (27)
1. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты Corynebacterium glutamicum, содержащая нуклеотидную последовательность SEQ ID NO:1, или комплементарная ей последовательность, где указанная молекула кодирует полипептид, обладающий активностью сахароза-специфического компонента II ABC.
2. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2 и обладающий активностью сахароза-специфического компонента II ABC, или комплементарная ей последовательность.
3. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая кодирует природный аллельный вариант полипептида, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2 и обладающего активностью сахароза-специфического компонента II ABC, или комплементарная ей последовательность.
4. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 50% идентична полноразмерной нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, или комплементарная ей последовательность, где указанная молекула нуклеиновой кислоты кодирует полипептид, обладающий активностью сахароза-специфического компонента II ABC.
5. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая фрагмент из по меньшей мере 15 последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, или комплементарная ей последовательность, где указанная молекула кодирует полипептид, обладающий активностью сахароза-специфического компонента II ABC.
6. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая в жестких условиях гибридизуется с молекулой нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-5.
7. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-6 и нуклеотидную последовательность, кодирующую гетерологичный полипептид.
8. Рекомбинантный вектор экспрессии, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-7 и одну или несколько регуляторных последовательностей.
9. Рекомбинантный вектор по п.8, который является плазмидой.
10. Способ получения рекомбинантной клетки-хозяина, включающий трансфецирование клетки-хозяина вектором экспрессии по пп.8-9.
11. Способ по п.10, где указанная клетка является микроорганизмом.
12. Способ по п.11, где указанная клетка принадлежит роду Corynebacterium или Brevibacterium.
13. Способ получения рекомбинантной клетки-хозяина, включающий трансфецирование клетки-хозяина молекулой нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность SEQ ID NO:1, где молекула нуклеиновой кислоты имеет одну или несколько модификаций нуклеиновой кислоты по сравнению с последовательностью, представленной в SEQ ID NO:1, и где молекула нуклеиновой кислоты кодирует полипептид, обладающий активностью сахароза-специфического компонента II ABC.
14. Способ получения рекомбинантной клетки-хозяина, включающий трансфецирование клетки-хозяина молекулой нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность SEQ ID NO:1, где регуляторная область молекулы нуклеиновой кислоты модифицирована относительно регуляторной области этой молекулы дикого типа, и где молекула нуклеиновой кислоты кодирует полипептид, обладающий активностью сахароза-специфического компонента II ABC.
15. Способ получения полипептида, включающий культивирование рекомбинантной клетки-хозяина, трансфецированной вектором по п.8, в подходящей культуральной среде с получением, таким образом, полипептида, обладающего активностью сахароза-специфического компонента II ABC.
16. Выделенный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2, где указанный полипептид обладает активностью сахароза-специфического компонента II ABC.
17. Выделенный полипептид, содержащий природный аллельный вариант полипептида, содержащего указанную аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2, где указанный природный аллельный вариант обладает активностью сахароза-специфического компонента II ABC.
18. Выделенный полипептид, который кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 50% идентична полноразмерной последовательности нуклеиновой кислоты SEQ ID NO:1, где указанный полипептид обладает активностью сахароза-специфического компонента II ABC.
19. Выделенный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 50% идентична полноразмерной аминокислотной последовательности SEQ ID NO:2, где указанный полипептид обладает активностью сахароза-специфического компонента II ABC.
20. Способ по п.12, где указанная клетка выбрана из группы, включающей Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium herculis, Corynebacterium, lilium, Corynebacterium acetoacidophilum, Corynebacterium acetoglutamicum, Corynebacterium acetophilum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium fujiokense, Corynebacterium nitrilophilus, Brevibacterium ammoniagenes, Brevibacterium butanicum, Brevibacterium divaricatum, Brevibacterium flavum, Brevibacterium healii, Brevibacterium ketoglutamicum, Brevibacterium ketosoreductum, Brevibacterium lactofermentum, Brevibacterium linens, Brevibacterium paraffinolyticum и штаммы, представленные в таблице 3.
21. Способ диагностики Corynebacterium diphtheriae у пациента, включающий обнаружение по меньшей мере одной молекулы нуклеиновой кислоты по пп.1-5 или по меньшей мере одной молекулы полипептида по пп.16-19, 22 или 24, то есть, проведение диагностики или определение активности Corynebacterium diphtheriae у пациента.
22. Выделенный полипептид, содержащий фрагмент аминокислотной последовательности SEQ ID NO:2, где указанный фрагмент сохраняет активность сахароза-специфического компонента II ABC.
23. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая фрагмент по меньшей мере из 15 последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, или комплементарная ей последовательность, где указанная молекула нуклеиновой кислоты может использоваться в качестве зонда.
24. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая нуклеиновую последовательность SEQ ID NO:1, где указанный полипептид обладает активностью сахароза-специфического компонента II ABC.
25. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая фрагмент по меньшей мере из 15 последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, или комплементарная ей последовательность, где указанная молекула нуклеиновой кислоты может использоваться в качестве антисмысловой молекулы.
26. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая фрагмент по меньшей мере из 15 последовательно расположенных нуклеотидов нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, или комплементарная ей последовательность, где указанная молекула нуклеиновой кислоты может использоваться в качестве праймера.
27. Выделенный полипептид по любому из пп.16-19, 22 или 24 дополнительно содержащий гетерологичные аминокислотные последовательности.
Applications Claiming Priority (7)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US14269199P | 1999-07-01 | 1999-07-01 | |
| US60/142,691 | 1999-07-01 | ||
| US15031099P | 1999-08-23 | 1999-08-23 | |
| US60/150,310 | 1999-08-23 | ||
| DE19942095.5 | 1999-09-03 | ||
| DE19942097 | 1999-09-03 | ||
| DE19942097.1 | 1999-09-03 |
Related Child Applications (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2005120503/13A Division RU2005120503A (ru) | 1999-07-01 | 2005-07-01 | Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы |
| RU2007110796/13A Division RU2007110796A (ru) | 1999-07-01 | 2007-03-23 | Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2002102452A RU2002102452A (ru) | 2003-08-20 |
| RU2326170C2 true RU2326170C2 (ru) | 2008-06-10 |
Family
ID=37760938
Family Applications (3)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2002102452/13A RU2326170C2 (ru) | 1999-07-01 | 2000-06-27 | Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы |
| RU2005120503/13A RU2005120503A (ru) | 1999-07-01 | 2005-07-01 | Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы |
| RU2007110796/13A RU2007110796A (ru) | 1999-07-01 | 2007-03-23 | Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы |
Family Applications After (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2005120503/13A RU2005120503A (ru) | 1999-07-01 | 2005-07-01 | Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы |
| RU2007110796/13A RU2007110796A (ru) | 1999-07-01 | 2007-03-23 | Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (3) | RU2326170C2 (ru) |
Families Citing this family (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2307169C1 (ru) * | 2006-07-27 | 2007-09-27 | Михаил Сергеевич Гельфанд | Способ исследования и прогнозирования пути биосинтеза метионина в родственных геномах коринебактерий |
| KR102006977B1 (ko) * | 2019-03-28 | 2019-08-05 | 씨제이제일제당 주식회사 | 변이형 포스포리보실피로포스페이트 아미도트랜스퍼라아제 및 이를 이용한 퓨린 뉴클레오티드 제조방법 |
Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2081173C1 (ru) * | 1990-02-28 | 1997-06-10 | Нитто Кемикал Индастри Ко., Лтд. | Фрагмент днк, кодирующий полипептид с активностью нитрилгидратазы, рекомбинантная плазмидная днк, кодирующая полипептид со свойствами нитрилгидратазы, штамм бактерий eshcerichia coli - продуцент полипептида со свойствами нитрилгидратазы, способ получения полипептида со свойствами нитрилгидратазы |
-
2000
- 2000-06-27 RU RU2002102452/13A patent/RU2326170C2/ru not_active IP Right Cessation
-
2005
- 2005-07-01 RU RU2005120503/13A patent/RU2005120503A/ru not_active Application Discontinuation
-
2007
- 2007-03-23 RU RU2007110796/13A patent/RU2007110796A/ru unknown
Patent Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2081173C1 (ru) * | 1990-02-28 | 1997-06-10 | Нитто Кемикал Индастри Ко., Лтд. | Фрагмент днк, кодирующий полипептид с активностью нитрилгидратазы, рекомбинантная плазмидная днк, кодирующая полипептид со свойствами нитрилгидратазы, штамм бактерий eshcerichia coli - продуцент полипептида со свойствами нитрилгидратазы, способ получения полипептида со свойствами нитрилгидратазы |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| LEE YK ET AL Nucleotioe sequence of the gene corynebacterioum glutamicum mannose ensyme II and analyses of the deduced protein sequence, fems microbiolocy LET. Vol.119, no. 1, 2, 1994, p.137-145. * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2007110796A (ru) | 2008-09-27 |
| RU2005120503A (ru) | 2007-01-10 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP7217250B2 (ja) | 新規なイソプロピルリンゴ酸シンターゼ変異体及びそれを用いたl-ロイシンの生産方法 | |
| Hoess et al. | Site-specific recombination functions of bacteriophage λ: DNA sequence of regulatory regions and overlapping structural genes for Int and Xis | |
| AU2018378011B2 (en) | IMP-producing microorganism and method of producing IMP using the same | |
| JP6020581B2 (ja) | タンパク質の分泌生産法 | |
| JP6064912B2 (ja) | タンパク質の分泌生産法 | |
| JP6136930B2 (ja) | タンパク質の分泌生産法 | |
| BR112019004161B1 (pt) | Molécula de ácido nucleico que possui uma atividade promotora, cassete de expressão gênica, vetor recombinante, micro-organismo recombinante do gênero corynebacterium e método de produzir um produto-alvo | |
| KR100221343B1 (ko) | 유전자 발현 조절 dna | |
| US6905819B1 (en) | Plasmid autonomously replicable in coryneform bacteria | |
| BR112017016301B1 (pt) | Promotor, sequência reguladora de expressão, vetor, célula hospedeira de microrganismo transformado e método de produção de um produto alvo | |
| FR2767337B1 (fr) | Sequences nucleiques de polypeptides exportes de mycobacteri es, vecteurs les comprenant et applications au diagnostic et a la prevention de la tuberculose | |
| JP2020523989A (ja) | 新規なポリペプチド及びそれを用いたオルニチン系産物の生産方法 | |
| RU2326170C2 (ru) | Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы | |
| RU2310686C2 (ru) | Гены corynebacterium glutamicum, кодирующие белки, участвующие в метаболизме углерода и продуцировании энергии | |
| WO2022241215A2 (en) | Adenoviral helper plasmid | |
| CN113136372B (zh) | 一种重组噬菌体的构建方法 | |
| RU2306339C2 (ru) | ГЕНЫ Corynebacterium glutamicum, КОДИРУЮЩИЕ БЕЛКИ МЕТАБОЛИЧЕСКИХ ПУТЕЙ | |
| WO2002010384A1 (en) | Genes encoding proteins capable of regenerating luciferin, recombinant dna and process for producing protein capable of regenerating luciferin | |
| RU2805253C1 (ru) | Новый модифицированный полипептид с ослабленной активностью цитратсинтазы и способ получения L-аминокислоты с его использованием | |
| WO2002010383A1 (en) | Genes encoding proteins capable of regenerating luciferin, recombinant dna and process for producing protein capable of regenerating luciferin | |
| CN116200363A (zh) | Taq酶突变体、其制备方法和应用 | |
| RU2002102452A (ru) | Гены CORYNEBACTERIUM GLUTAMICUM, кодирующие белки системы фосфоенолпируват-сахар-фосфотрансферазы | |
| BR112020001762A2 (pt) | variante de atp fosforribosiltransferase, polinucleotídeo, vetor, micro-organismo do gênero corynebacterium, e, método para produzir histidina. | |
| Rothberg | AN ANALYSIS OF THE POLIOVIRUS GENOME. | |
| RU94032791A (ru) | Фрагменты днк, рекомбинантная плазмидная днк и способ получения нитрил-гидратазы |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PC4A | Invention patent assignment |
Effective date: 20081118 |
|
| PC41 | Official registration of the transfer of exclusive right |
Effective date: 20160505 |
|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20190628 |