[go: up one dir, main page]

RU2315771C2 - Method for labeling phosphorylated peptides, method for selective adsorption of phosphorylated peptides, chelating compounds used in such methods, method for preparing chelating compounds and parent compounds for preparing chelating compounds - Google Patents

Method for labeling phosphorylated peptides, method for selective adsorption of phosphorylated peptides, chelating compounds used in such methods, method for preparing chelating compounds and parent compounds for preparing chelating compounds Download PDF

Info

Publication number
RU2315771C2
RU2315771C2 RU2005130481/04A RU2005130481A RU2315771C2 RU 2315771 C2 RU2315771 C2 RU 2315771C2 RU 2005130481/04 A RU2005130481/04 A RU 2005130481/04A RU 2005130481 A RU2005130481 A RU 2005130481A RU 2315771 C2 RU2315771 C2 RU 2315771C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
group
compound
solution
labeling
mmol
Prior art date
Application number
RU2005130481/04A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2005130481A (en
Inventor
Тохру КОИКЕ
Акихико КАВАСАКИ
Тацухиро КОБАСИ
Макото ТАКАХАГИ
Original Assignee
НАРД Инститьют, Лтд.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by НАРД Инститьют, Лтд. filed Critical НАРД Инститьют, Лтд.
Publication of RU2005130481A publication Critical patent/RU2005130481A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2315771C2 publication Critical patent/RU2315771C2/en

Links

Images

Landscapes

  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Heterocyclic Carbon Compounds Containing A Hetero Ring Having Oxygen Or Sulfur (AREA)

Abstract

FIELD: organic chemistry, peptides.
SUBSTANCE: invention proposes a method for labeling phosphorylated peptides, method for adsorption of phosphorylated peptides and compounds possessing high coordination capacity with respect to phosphorylated peptides that are used in such methods, and compounds used as parent substances. Chelating compound is represented by the formula (I):
Figure 00000003
wherein X represents linker group; Y represents fluorescent group or biotin as labeling group. Compound of the formula (I) provides easy detection and identification of phosphorylated peptide in a sample prepared from a living body.
EFFECT: improved methods of preparing and analysis.
13 cl, 9 dwg, 8 ex

Description

Область изобретенияField of Invention

Настоящее изобретение относится к способу мечения фосфорилированных пептидов, способу селективной адсорбции фосфорилированных пептидов, к комплексным соединениям, используемым в таких способах, к способу получения комплексных соединений и к соединениям, используемым в качестве исходных веществ в способе получения.The present invention relates to a method for labeling phosphorylated peptides, a method for selectively adsorbing phosphorylated peptides, to complex compounds used in such methods, to a method for producing complex compounds and to compounds used as starting materials in a preparation method.

Предпосылки изобретенияBACKGROUND OF THE INVENTION

Известны in vivo ферменты, содержащие сериновый, треониновый или тирозиновый остаток на специфическом участке, соответствующем активному центру или аллостерическому участку. Ферментативная активность таких ферментов регулируется фосфорилированием или дефосфорилированием гидроксильных групп в таких остатках ферментом, называемым киназой, и т.п. Также известны ферменты, ферментативная активность которых регулируется фосфорилированием или дефосфорилированием аминогруппы или иминогруппы лизина, аргинина или гистидина или карбоксильной группы аспарагиновых кислот или глутаминовых кислот. In vivo enzymes are known that contain a serine, threonine or tyrosine residue at a specific site corresponding to the active site or allosteric site. The enzymatic activity of such enzymes is regulated by phosphorylation or dephosphorylation of hydroxyl groups in such residues by an enzyme called kinase, etc. Enzymes are also known whose enzymatic activity is regulated by phosphorylation or dephosphorylation of the amino group or the imino group of lysine, arginine or histidine, or the carboxyl group of aspartic acids or glutamic acids.

Одним из примеров метаболических систем, регулируемых указанным выше фосфорилированием-дефосфорилированием, является система подавления синтеза гликогена и его разложения. Прежде всего, происходит регулирование пути активации такой метаболической системы процессами фосфорилирования-дефосфорилирования.One example of metabolic systems regulated by the above phosphorylation-dephosphorylation is a system for suppressing glycogen synthesis and its decomposition. First of all, there is a regulation of the activation pathway of such a metabolic system by phosphorylation-dephosphorylation processes.

Недавно проведенные исследования ясно показали, что фосфорилирование-дефосфорилирование играет существенную роль в связанных с заболеваниями метаболических системах.Recent studies have clearly shown that phosphorylation-dephosphorylation plays a significant role in disease-related metabolic systems.

Например, считается, что одной из причин клеточного карциногенеза является аномальное фосфорилирование-дефосфорилирование. Конкретно, развитие и остановка клеточного цикла регулируется фосфорилированием или дефосфорилированием различных ферментов, т.е. белков. Циклин и циклинзависимая киназа (CDK) являются релевантными факторами в фосфорилировании или дефосфорилировании. Если механизм, связанный с циклином и CDK, нарушен, фосфорилирование или дефосфорилирование может быть неконтролируемым, тем самым запускается механизм аномальной пролиферации клеток.For example, it is believed that one of the causes of cell carcinogenesis is abnormal phosphorylation-dephosphorylation. Specifically, the development and arrest of the cell cycle is regulated by phosphorylation or dephosphorylation of various enzymes, i.e. proteins. Cyclin and cyclin-dependent kinase (CDK) are relevant factors in phosphorylation or dephosphorylation. If the mechanism associated with cyclin and CDK is impaired, phosphorylation or dephosphorylation may be uncontrolled, thereby triggering the mechanism of abnormal cell proliferation.

Кроме того, известны факты, что протеинкиназа C связана с дегрануляцией гистамина, что является причиной аллергических заболеваний, таких как атопический дерматит и сенная лихорадка, и что фосфорилированный tau-белок является причиной нейрофибриллярного сплетения в мозге у пациентов с болезнью Альцгеймера.In addition, it is known that protein kinase C is associated with histamine degranulation, which causes allergic diseases such as atopic dermatitis and hay fever, and that phosphorylated tau protein causes neurofibrillary plexus in the brain in patients with Alzheimer's disease.

В свете вышеизложенного, понимание условий фосфорилирования-дефосфорилирования белков обеспечивает полезный инструмент для различных измерений не только при исследовании экспрессии генов в клетках живых тканей и определении ферментативной активности клеток, но также и в диагностике заболеваний или медицинском лечении.In light of the foregoing, an understanding of the phosphorylation-dephosphorylation conditions of proteins provides a useful tool for various measurements, not only in studying gene expression in living tissue cells and determining the enzymatic activity of cells, but also in the diagnosis of diseases or medical treatment.

Традиционные способы идентификации фосфорилированных белков или дефосфорилированных белков имеют разные недостатки.Conventional methods for identifying phosphorylated proteins or dephosphorylated proteins have various disadvantages.

Например, хотя ферментный иммуноанализ является предпочтительным для анализа образца мишеневого белка в очень малом количестве, очень трудно получить антитела мишеневого белка в достаточном количестве. Кроме того, в случае, когда уровень мишеневого белка составляет несколько кДа или ниже, невозможно получить антитела, надежно связывающиеся с сайтом в белке, где происходит фосфорилирование.For example, although enzyme immunoassay is preferable for analyzing a target protein sample in very small amounts, it is very difficult to obtain sufficient target protein antibodies. In addition, in the case when the level of the target protein is several kDa or lower, it is impossible to obtain antibodies that reliably bind to the site in the protein where phosphorylation occurs.

Предложен способ детекции белка, специфически связанного фосфорной кислотой, с использованием фосфорной кислоты, меченной радиоактивным изотопом 32P. Однако следует быть особо внимательным при обращении с радиоактивными изотопами, и необходимо соблюдать соответствующие правила введения и ликвидации жидких отходов радиоактивных изотопов.A method is proposed for detecting a protein specifically bound by phosphoric acid using phosphoric acid labeled with a radioactive isotope 32 P. However, special care should be taken when handling radioactive isotopes, and the relevant rules for the introduction and elimination of liquid radioactive isotope waste should be observed.

Предложена идея применения двумерного электрофореза с учетом того, что происходит дифференциация электрических зарядов между фосфорилированными белками и дефосфорилированными белками. Однако очень трудно определить полосу или пятно фосфорилированного или дефосфорилированного белка при анализе образца, полученного из живого организма, т.к. образец содержит множество белков. Кроме того, использование радиоактивного изотопа для определения полосы или пятна связано с вышеуказанными проблемами.The idea of using two-dimensional electrophoresis is proposed, taking into account the fact that differentiation of electric charges between phosphorylated proteins and dephosphorylated proteins occurs. However, it is very difficult to determine the band or spot of a phosphorylated or dephosphorylated protein when analyzing a sample obtained from a living organism, because The sample contains many proteins. In addition, the use of a radioactive isotope to determine a band or spot is associated with the above problems.

Документ Morio YASHIRO, et al. [Preparation and Study of Dinuclear Zinc(II) Complex for the Efficient Hydrolysis of the Phosphodiester Linkage in a Diribonucleotide], Journal of the Chemical Society, Chemical Communications, pp.1793-1794 (1995), раскрывает комплекс цинка. Комплекс цинка обладает такой функцией, что два цинковых иона в комплексе разлагают группу фосфорной кислоты, а именно сложного диэфира фосфорной кислоты, из динуклеотида. Однако комплекс цинка, как раскрыто в указанном документе, имеет просто функцию катализатора. Указанный документ не раскрывает способность комплекса цинка координировано связываться с группой фосфорной кислоты. Эксперименты, проведенные авторами изобретения, показали, что константа диссоциации комплекса цинка относительно группы фосфорной кислоты, расположенной между двумя нуклеозидами в виде сэндвича, а именно сложного диэфира фосфорной кислоты, чрезвычайно высока. Другими словами, комплекс цинка обладает низкой координационной способностью в отношении группы сложного диэфира фосфорной кислоты.Document Morio YASHIRO, et al. [Preparation and Study of Dinuclear Zinc (II) Complex for the Efficient Hydrolysis of the Phosphodiester Linkage in a Diribonucleotide], Journal of the Chemical Society, Chemical Communications, pp. 1793-1794 (1995), discloses a zinc complex. The zinc complex has such a function that two zinc ions in the complex decompose the phosphoric acid group, namely the phosphoric acid diester, from the dinucleotide. However, the zinc complex, as disclosed in this document, has a simple catalyst function. The specified document does not disclose the ability of the zinc complex to coordinate coordinated with the phosphoric acid group. The experiments conducted by the inventors showed that the dissociation constant of the zinc complex relative to the phosphoric acid group located between the two nucleosides in the form of a sandwich, namely a phosphoric acid diester, is extremely high. In other words, the zinc complex has a low coordination ability with respect to the phosphoric acid diester group.

Кроме того, документ Hidekazu ARII, et al. [A novel diiron complex as a functional model for hemerythrin], Journal of Inorganic Biochemistry, 82, pp.153-162 (2000), раскрывает комплекс железа, имеющий структуру, аналогичную комплексу цинка. Комплекс железа, однако, является продуктом, синтезированным как модель гемеритрина, а именно белка-носителя, несущего молекулы кислорода. Как и в случае с указанным выше документом, этот документ также не раскрывает и даже не содержит никаких отдаленных предположений относительно координационной связи комплекса железа с группой сложного моноэфира фосфорной кислоты.Also, Hidekazu ARII, et al. [A novel diiron complex as a functional model for hemerythrin], Journal of Inorganic Biochemistry, 82, pp. 153-162 (2000), discloses an iron complex having a structure similar to that of zinc. The iron complex, however, is a product synthesized as a model of hemeritrin, namely, a carrier protein that carries oxygen molecules. As in the case of the above document, this document also does not disclose and does not even contain any remote assumptions regarding the coordination relationship of the iron complex with the phosphoric acid monoester group.

Описание изобретенияDescription of the invention

В свете вышеизложенного целью настоящего изобретения является преодоление проблем предшествующего уровня техники. Еще одной целью настоящего изобретения является обеспечение способа мечения фосфорилированных пептидов, а именно белков, для более легкой детекции и способ селективной адсорбции фосфорилированных пептидов для очистки и т.п.In light of the foregoing, the aim of the present invention is to overcome the problems of the prior art. Another objective of the present invention is to provide a method for labeling phosphorylated peptides, namely proteins, for easier detection and a method for selectively adsorbing phosphorylated peptides for purification and the like.

Еще одной целью настоящего изобретения является обеспечение соединений, обладающих высокой координационной способностью в отношении фосфорилированных пептидов, которые можно использовать в способе мечения и в способе селективной адсорбции, способа получения соединений и соединений, являющихся исходными веществами, используемыми в способе получения.Another objective of the present invention is the provision of compounds with high coordination ability in relation to phosphorylated peptides that can be used in the method of labeling and in the method of selective adsorption, a method for producing compounds and compounds that are the starting materials used in the method of obtaining.

В соответствии с одним аспектом настоящего изобретения обеспечивается способ мечения фосфорилированного пептида комплексным соединением, представленным формулой (I):In accordance with one aspect of the present invention, there is provided a method for labeling a phosphorylated peptide with a complex compound represented by formula (I):

Figure 00000004
Figure 00000004

где X представляет собой линкерную группу и Y представляет собой группу мечения.where X represents a linker group and Y represents a tagging group.

В соответствии с другим аспектом настоящего изобретения обеспечивается способ селективной адсорбции фосфорилированного пептида с использованием указанного выше комплексного соединения.In accordance with another aspect of the present invention, there is provided a method for selectively adsorbing a phosphorylated peptide using the above complex compound.

В соответствии со следующим аспектом настоящего изобретения обеспечивается указанное выше комплексное соединение.In accordance with a further aspect of the present invention, the above complex compound is provided.

В соответствии со следующим аспектом настоящего изобретения обеспечивается способ получения соединения (I), включающий схему 1.In accordance with a further aspect of the present invention, there is provided a process for the preparation of compound (I) comprising Scheme 1.

Схема 1Scheme 1

Figure 00000005
Figure 00000005

где R1 и R2 каждый представляет собой реакционноспособную группу для образования линкерной группы X и Y представляет собой группу мечения.where R 1 and R 2 each represents a reactive group to form a linker group X and Y represents a labeling group.

В соответствии со следующим аспектом настоящего изобретения обеспечивается соединение, представленное формулой (II):In accordance with a further aspect of the present invention, there is provided a compound represented by formula (II):

Figure 00000006
Figure 00000006

где R1 представляет собой реакционноспособную группу, за исключением аминометильной группы, гидроксиметильной группы, аминогруппы и карбоксильной группы.where R 1 represents a reactive group, with the exception of the aminomethyl group, hydroxymethyl group, amino group and carboxyl group.

В соответствии со способом мечения по настоящему изобретению фосфорилированный пептид, а именно белок, может быть легко обнаружен. Таким образом, настоящее изобретение является полезным для диагностики заболеваний или т.п. с использованием образцов, полученных из живого организма или т.п.According to the labeling method of the present invention, a phosphorylated peptide, namely a protein, can be easily detected. Thus, the present invention is useful for diagnosing diseases or the like. using samples obtained from a living organism or the like.

Кроме того, поскольку соединение (I) по настоящему изобретению демонстрирует уникальную координационную связь с двумя гидроксигруппами в группе сложного моноэфира фосфорной кислоты или фосфорного иона, соединение (I) по настоящему изобретению является полезным в качестве соединения, которое можно использовать в способе по настоящему изобретению. Также соединение (I) по настоящему изобретению является полезным для очистки или концентрирования фосфорилированного пептида и получения химической информации о фосфорилированном пептиде.In addition, since compound (I) of the present invention exhibits a unique coordination bond with two hydroxy groups in the phosphoric acid monoester or phosphoric ion group, compound (I) of the present invention is useful as a compound that can be used in the method of the present invention. Also, compound (I) of the present invention is useful for purifying or concentrating a phosphorylated peptide and for obtaining chemical information on a phosphorylated peptide.

Эти и другие цели, признаки и преимущества настоящего изобретения будут более очевидны при прочтении представленного ниже подробного описания изобретения и прилагаемых чертежей.These and other objectives, features and advantages of the present invention will be more apparent upon reading the following detailed description of the invention and the accompanying drawings.

Краткое описание чертежейBrief Description of the Drawings

На фиг.1 представлен результат исследования комплекса цинка по настоящему изобретению, полученный с использованием масс-спектрометра MALDI-TOF.Figure 1 presents the result of a study of the zinc complex of the present invention, obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer.

На фиг.2 представлены гели для электрофореза, окрашенные комплексом цинка (A) по настоящему изобретению и другим традиционным красителем (B). Эта иллюстрация наглядно демонстрирует, что способом по настоящему изобретению можно идентифицировать только фосфорилированный пептид, тогда как при использовании традиционного способа окрашиваются все пептиды.Figure 2 shows the electrophoresis gels stained with the zinc complex (A) of the present invention and other traditional dye (B). This illustration clearly demonstrates that only the phosphorylated peptide can be identified by the method of the present invention, while using the traditional method, all peptides are stained.

На фиг.3 представлен результат исследования комплекса цинка по настоящему изобретению, полученный с использованием масс-спектрометра MALDI-TOF, а также представлена увеличенная картина некоторой области, которая получена в результате исследования.Figure 3 presents the result of the study of the zinc complex of the present invention, obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer, and also presents an enlarged picture of a certain area that is obtained as a result of the study.

На фиг.4 представлен результат исследования комплекса цинка по настоящему изобретению, полученный с использованием масс-спектрометра MALDI-TOF, а также представлена увеличенная картина некоторой области, полученная в результате исследования.Figure 4 presents the result of the study of the zinc complex of the present invention, obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer, and also presents an enlarged picture of a certain area obtained as a result of the study.

На фиг.5 представлен результат исследования, полученный с использованием масс-спектрометра MALDI-TOF, исходного соединения, используемого для получения соединения по настоящему изобретению, содержащего биотин в качестве группы мечения, а также представлена увеличенная картина некоторой области, полученная в результате исследования.Figure 5 presents the result of the study obtained using the MALDI-TOF mass spectrometer, the starting compound used to obtain the compound of the present invention containing biotin as a labeling group, and also shows an enlarged picture of a certain area obtained from the study.

На фиг.6 представлен результат исследования, полученный с использованием масс-спектрометра MALDI-TOF, исходного соединения, используемого для получения соединения по настоящему изобретению, содержащего биотин в качестве группы мечения, а также представлена увеличенная картина некоторой области, полученная в результате исследования.Figure 6 presents the result of the study, obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer, the starting compound used to obtain the compound of the present invention containing biotin as a labeling group, and also presents an enlarged picture of a certain area obtained from the study.

На фиг.7 представлен результат исследования комплекса цинка по настоящему изобретению, полученный с использованием масс-спектрометра MALDI-TOF, а также представлена увеличенная картина некоторой области, полученная в результате исследования.Figure 7 presents the result of the study of the zinc complex of the present invention, obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer, and also presents an enlarged picture of a certain area obtained as a result of the study.

На фиг.8 представлен результат исследования комплекса цинка по настоящему изобретению, полученный с использованием масс-спектрометра MALDI-TOF.On Fig presents the result of a study of the zinc complex of the present invention, obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer.

На фиг.9 представлены гели для электрофореза, окрашенные комплексом цинка (A) по настоящему изобретению и другим традиционным красителем (B). Эта иллюстрация наглядно демонстрирует, что способом по настоящему изобретению можно идентифицировать только фосфорилированный пептид, тогда как при использовании традиционного способа окрашиваются все пептиды.Figure 9 shows the electrophoresis gels stained with the zinc complex (A) of the present invention and other traditional dye (B). This illustration clearly demonstrates that only the phosphorylated peptide can be identified by the method of the present invention, while using the traditional method, all peptides are stained.

Лучший способ осуществления изобретенияThe best way of carrying out the invention

Основным отличительным признаком способа по настоящему изобретению является то, что фосфорилированный пептид можно легко идентифицировать путем образования сложного соединения, в котором комплексное соединение, содержащее группу мечения, представленное формулой (I), специфически связано с фосфорилированным пептидом.The main distinguishing feature of the method of the present invention is that a phosphorylated peptide can be easily identified by the formation of a complex compound in which a complex compound containing a labeling group represented by formula (I) is specifically associated with a phosphorylated peptide.

До настоящего времени были известны различные комплексы металлов, способные связываться с группой фосфорной кислоты. Однако соединение, которое является аналогичным соединению, представленному формулой (I), и которое содержит группу мечения, не было известно. Авторы настоящего изобретения обнаружили, что использование комплексного соединения, представленного формулой (I), является выгодным для обеспечения легкой детекции и идентификации фосфорилированного пептида даже в образце, полученном из живого организма, содержащего множество различных пептидов, и таким образом было создано настоящее изобретение.To date, various metal complexes capable of binding to a phosphoric acid group have been known. However, a compound that is similar to the compound represented by formula (I) and which contains a labeling group was not known. The inventors of the present invention have found that the use of the complex compound represented by formula (I) is advantageous for providing easy detection and identification of a phosphorylated peptide even in a sample obtained from a living organism containing many different peptides, and thus the present invention has been created.

Ниже описан способ мечения фосфорилированных пептидов в соответствии с одним вариантом осуществления настоящего изобретения.The following describes a method for labeling phosphorylated peptides in accordance with one embodiment of the present invention.

Сначала получают образец, содержащий, по существу, все возможные виды пептидов, составляющих клетку ткани, которую нужно исследовать. Такое получение осуществляют в соответствии с традиционным способом, широко используемым в биохимии.First get a sample containing essentially all possible types of peptides that make up the tissue cell that you want to explore. This preparation is carried out in accordance with the traditional method widely used in biochemistry.

Затем пептиды, содержащиеся в образце, разделяют. Способ разделения конкретно не ограничен, и можно использовать такой традиционный способ разделения, как электрофорез.Then the peptides contained in the sample are separated. The separation method is not particularly limited, and a conventional separation method such as electrophoresis can be used.

При осуществлении электрофореза гель после электрофореза погружают в раствор, содержащий комплексное соединение, представленное формулой (I), для мечения фосфорилированного пептида, и затем фосфорилированный пептид определяют способом детекции в зависимости от типа группы мечения.In electrophoresis, the gel after electrophoresis is immersed in a solution containing the complex compound represented by formula (I) for labeling a phosphorylated peptide, and then the phosphorylated peptide is determined by a detection method depending on the type of labeling group.

Растворитель, который используют в растворе, содержащем комплексное соединение, представленное формулой (I), конкретно не ограничен при условии, что он не должен мешать детекции фосфорилированного пептида. Примерами такого растворителя являются вода, включающая буфер, и раствор, содержащий соль, отличную от буфера; спирты, такие как метанол и этанол; и смешанный растворитель, содержащий указанные компоненты. Предпочтительно, используют водный растворитель, в основном, в целях предотвращения денатурирования пептида.The solvent used in the solution containing the complex compound represented by formula (I) is not particularly limited provided that it does not interfere with the detection of the phosphorylated peptide. Examples of such a solvent are water, including a buffer, and a solution containing a salt other than the buffer; alcohols such as methanol and ethanol; and a mixed solvent containing these components. Preferably, an aqueous solvent is used mainly to prevent denaturing of the peptide.

Ниже описано соединение (I), используемое в указанном выше способе.The following describes the compound (I) used in the above method.

Figure 00000007
Figure 00000007

где X представляет собой линкерную группу и Y представляет собой группу мечения.where X represents a linker group and Y represents a tagging group.

В формуле (I) Zn выбран в качестве координационного металла, поскольку Zn обладает высокой координационной способностью в отношении группы фосфорной кислоты в фосфорилированном белке, а именно сложного моноэфира фосфорной кислоты.In formula (I), Zn is selected as the coordination metal, since Zn has a high coordination ability with respect to the phosphoric acid group in the phosphorylated protein, namely the phosphoric acid monoester.

Линкерная группа в настоящем описании и формуле изобретения означает группу, способную связываться с основным скелетом и с группой мечения. Линкерная группа способствует получению соединения (I) и ингибирует действие группы мечения, препятствующее координации соединения (I) с группой фосфорной кислоты, связанной с пептидом. Учитывая это обстоятельство, линкерная группа может представлять собой координационную связь, непосредственно связывающую основной скелет с группой мечения, если можно легко получить исходное соединение, в котором группа мечения непосредственно связана с основным скелетом, в синтезе соединения (I) или если группа мечения имеет такой небольшой размер, что можно легко предотвратить действие, препятствующее координации соединения (I) с группой фосфорной кислоты.A linker group in the present description and claims means a group capable of binding to the main skeleton and to the labeling group. The linker group promotes the preparation of compound (I) and inhibits the action of the labeling group, which impedes the coordination of compound (I) with the phosphoric acid group associated with the peptide. Given this circumstance, the linker group can be a coordination bond directly linking the main skeleton to the tagging group, if it is easy to obtain the starting compound in which the tagging group is directly linked to the main skeleton, in the synthesis of compound (I) or if the tagging group has such a small size, which can easily prevent the effect of preventing the coordination of compound (I) with the phosphoric acid group.

Тип линкерной группы в настоящем описании и формуле изобретения конкретно не ограничен, при условии, что линкерная группа обладает указанными выше функциями. Примерами линкерных групп являются следующие: C1-C6 алкиленовая группа, аминогруппа (-NH-), группа простого эфира (-O-), тиоэфирная группа (-S-), карбонильная группа (-C(=O)-), тионильная группа (-C(=S)-), группа сложного эфира, амидная группа, группа мочевины (-NHC(=O)NH-), группа тиомочевины (-NHC(=S)NH-); C1-C6 алкиленовая группа, содержащая на одном конце группу, выбранную из группы, включающей аминогруппу, группу простого эфира, тиоэфирную группу, карбонильную группу, тионильную группу, группу сложного эфира, амидную группу, группу мочевины и группу тиомочевины; C1-C6 алкиленовая группа, содержащая на противоположных концах две группы, выбранные из группы, включающей аминогруппу, группу простого эфира, тиоэфирную группу, карбонильную группу, тионильную группу, группу сложного эфира, амидную группу, группу мочевины и группу тиомочевины, где группы, расположенные на противоположных концах, являются одинаковыми или отличными друг от друга; и группа, в которой две или более двух групп выбраны из группы, включающей аминогруппу, группу простого эфира, тиоэфирную группу, карбонильную группу, тионильную группу, группу сложного эфира, амидную группу, группу мочевины и группу тиомочевины, и C1-C6 алкиленовая группа являются линейно связанными.The type of linker group in the present description and the claims is not particularly limited, provided that the linker group has the above functions. Examples of linker groups are: C1-C6 alkylene group, amino group (-NH-), ether group (-O-), thioether group (-S-), carbonyl group (-C (= O) -), thionyl group (-C (= S) -), ester group, amide group, urea group (-NHC (= O) NH-), thiourea group (-NHC (= S) NH-); A C1-C6 alkylene group containing at one end a group selected from the group consisting of an amino group, an ether group, a thioether group, a carbonyl group, a thionyl group, an ester group, an amide group, a urea group and a thiourea group; A C1-C6 alkylene group containing at the opposite ends two groups selected from the group consisting of an amino group, an ether group, a thioether group, a carbonyl group, a thionyl group, an ester group, an amide group, a urea group and a thiourea group, where the groups located at opposite ends are the same or different from each other; and a group in which two or more two groups are selected from the group consisting of an amino group, an ether group, a thioether group, a carbonyl group, a thionyl group, an ester group, an amide group, a urea group and a thiourea group, and a C1-C6 alkylene group are linearly connected.

C1-C6 алкиленовая группа означает двухвалентную алифатическую углеводородную группу, содержащую 1-6 атомов углерода, которая является линейной или разветвленной, например метиленовая, этиленовая, пропиленовая, тетраметиленовая, гексаметиленовая, метилэтиленовая, метилпропиленовая и диметилпропиленовая группа, предпочтительно представляет собой C1-C4 алкиленовую группу и более предпочтительно представляет собой C1-C2 алкиленовую группу.C1-C6 alkylene group means a divalent aliphatic hydrocarbon group containing 1-6 carbon atoms, which is linear or branched, for example methylene, ethylene, propylene, tetramethylene, hexamethylene, methylene, methylpropylene and dimethylpropylene group, preferably represents a C1-C4 alkylene group and more preferably represents a C1-C2 alkylene group.

Группа мечения в настоящем описании и формуле изобретения конкретно не ограничена при условии, что она является группой, традиционно используемой в биохимии. Однако соединение, содержащее радиоизотоп, не является предпочтительным с точки зрения обращения с ним. Примерами группы мечения являются флуоресцентная группа, группа, содержащая радикал окиси азота, и биотин.The labeling group in the present description and the claims is not particularly limited provided that it is a group traditionally used in biochemistry. However, a compound containing a radioisotope is not preferred in terms of handling it. Examples of the labeling group are a fluorescent group, a group containing a nitric oxide radical, and biotin.

Флуоресцентная группа представляет собой заместитель, способный стабильно генерировать флуоресценцию с относительно длинной длиной волны, и группу, обычно используемую в биохимии, можно неограниченно использовать в качестве флуоресцентной группы, независимо от того, является ли соединение растворимым в воде или в масле. Примерами флуоресцентных групп являются аминометилкумарин и его производные, флуоресцеин и его производные, тетраметилродамин и его производные, антранилоил и его производные, нитробензоксадиазол и его производные и диметиламинонафталин и его производные.A fluorescence group is a substituent capable of stably generating fluorescence with a relatively long wavelength, and the group commonly used in biochemistry can be used indefinitely as a fluorescent group, regardless of whether the compound is soluble in water or in oil. Examples of fluorescent groups are aminomethylcoumarin and its derivatives, fluorescein and its derivatives, tetramethylrodamine and its derivatives, anthraniloyl and its derivatives, nitrobenzoxadiazole and its derivatives and dimethylaminonaphthalene and its derivatives.

Группа, содержащая радикал окиси азота, представляет собой группу, содержащую стабильный радикал, и является способной к детекции фосфорилированного пептида посредством электронного спинового резонанса (ESR). Как правило, биологическая молекула не демонстрирует электронный спиновый резонанс, поскольку она не содержит непарный электрон. С другой стороны, поскольку пептид, связанный с соединением (I), содержащим радикал окиси азота, координированный с ним, демонстрирует электронный спиновый резонанс, фосфорилированный пептид может быть идентифицирован.A group containing a nitric oxide radical is a group containing a stable radical, and is capable of detecting a phosphorylated peptide by electron spin resonance (ESR). As a rule, a biological molecule does not exhibit electron spin resonance, because it does not contain an unpaired electron. On the other hand, since the peptide associated with the compound (I) containing the nitric oxide radical coordinated with it exhibits electron spin resonance, a phosphorylated peptide can be identified.

Биотин обладает специфической и высокой аффинностью к авидину, полученному из альбумина, и к стрептоавидину, полученному из actinomycetes. В свете этого комплексное соединение может специфически связываться с ферментом посредством биотина и авидина или стрептоавидина путем связывания авидина или стрептоавидина с соединением (I), содержащим биотин в качестве группы мечения, и затем связывания с биотинилированным ферментом. Фосфорилированный пептид можно идентифицировать с использованием фермента, такого как щелочная фосфатаза, пероксидаза и люцифераза, и с использованием агента окрашивания, в зависимости от типа фермента. Например, если сначала фосфорилированный пептид связывают при помощи комплексного соединения по настоящему изобретению, после чего комплексное соединение связывают при помощи щелочной фосфатазы в качестве фермента через стрептоавидин, затем добавляют нитросиний тетразолий и 5-бром-4-хлор-3-индолилфосфат в качестве агентов окрашивания и смеси дают прореагировать в течение нескольких часов, фосфорилированный пептид становится пурпурного цвета, что дает возможность идентифицировать фосфорилированный пептид. Кроме того, стрептоавидин, меченный флуоресцентным пигментом, таким как родамин, является коммерчески доступным. Использование стрептоавидина, меченного флуоресцентным пигментом, дает возможность идентифицировать фосфорилированный пептид известным способом анализа флуоресцентного изображения.Biotin has a specific and high affinity for avidin derived from albumin and streptavidin derived from actinomycetes. In light of this, the complex compound can specifically bind to the enzyme via biotin and avidin or streptavidin by binding of avidin or streptavidin to compound (I) containing biotin as a labeling group, and then binding to the biotinylated enzyme. The phosphorylated peptide can be identified using an enzyme such as alkaline phosphatase, peroxidase and luciferase, and using a staining agent, depending on the type of enzyme. For example, if the phosphorylated peptide is first coupled using the complex compound of the present invention, after which the complex compound is coupled using alkaline phosphatase as an enzyme via streptavidin, then nitrosine tetrazolium and 5-bromo-4-chloro-3-indolylphosphate are added as staining agents and the mixture is allowed to react for several hours, the phosphorylated peptide turns purple, which makes it possible to identify the phosphorylated peptide. In addition, streptavidin labeled with a fluorescent pigment such as rhodamine is commercially available. The use of streptavidin labeled with a fluorescent pigment makes it possible to identify a phosphorylated peptide by a known method for analyzing a fluorescence image.

Ниже описан способ селективной адсорбции фосфорилированных пептидов в соответствии с вариантом осуществления настоящего изобретения.The following describes a method for the selective adsorption of phosphorylated peptides in accordance with an embodiment of the present invention.

В соответствии со способом селективной адсорбции фосфорилированных пептидов биотин или подобное вещество, способное к специфическому связыванию со специфическим соединением, используют в качестве группы мечения. Например, коммерчески доступным является агарозный гель со связанным с ним стрептоавидином. Агарозный гель с комплексным соединением по настоящему изобретению, связанным с ним, можно получить путем соединения его с комплексным соединением, содержащим биотин в качестве группы мечения, для взаимодействия. Фосфорилированный пептид в смешанном образце можно селективно адсорбировать в комплексное соединение по настоящему изобретению путем нанесения смешанного образца на агарозный гель. После селективной адсорбции добавление фосфорнокислого буфера или подобного соединения, способного к десорбции фосфорилированного пептида из комплексного соединения по настоящему изобретению, обеспечивает возможность эксклюзивного получения фосфорилированного пептида. Таким же образом, использование агарозного геля является выгодным для очистки или концентрации фосфорилированного пептида без использования электрофореза. Также, коммерчески доступны магнитные бусинки со связанным с ними стрептоавидином. Использование магнитных бусинок также делает возможным очистку или концентрацию фосфорилированного пептида. Кроме того, коммерчески доступны пластины со связанным с ними стрептоавидином для измерения поверхностного плазмонного резонанса (SPR). Пластину с комплексным соединением по настоящему изобретению, связанным с ней, для измерения поверхностного плазмонного резонанса можно получить нанесением на эту пластину комплексного соединения по настоящему изобретению, содержащего биотин в качестве группы мечения. Присутствие или отсутствие фосфорилированного пептида в образце можно определить путем измерения поверхностного плазмонного резонанса (SPR) пластины.According to a method for the selective adsorption of phosphorylated peptides, biotin or a similar substance capable of specific binding to a specific compound is used as a labeling group. For example, an agarose gel with associated streptavidin is commercially available. An agarose gel with a complex compound of the present invention bound thereto can be prepared by combining it with a complex compound containing biotin as a labeling group for interaction. The phosphorylated peptide in the mixed sample can be selectively adsorbed into the complex compound of the present invention by applying the mixed sample to an agarose gel. After selective adsorption, the addition of phosphoric acid buffer or the like, capable of desorption of the phosphorylated peptide from the complex compound of the present invention, enables exclusive production of the phosphorylated peptide. In the same way, the use of an agarose gel is beneficial for purification or concentration of a phosphorylated peptide without the use of electrophoresis. Also, magnetic beads with associated streptavidin are commercially available. The use of magnetic beads also makes it possible to purify or concentrate the phosphorylated peptide. In addition, plates with associated streptavidin for measuring surface plasmon resonance (SPR) are commercially available. A plate with a complex compound of the present invention associated with it for measuring surface plasmon resonance can be obtained by applying to the plate a complex compound of the present invention containing biotin as a labeling group. The presence or absence of a phosphorylated peptide in a sample can be determined by measuring the surface plasmon resonance (SPR) of the plate.

Можно синтезировать соединение, эквивалентное соединению (I), в котором в пиридиновое кольцо введена метильная группа или подобная группа, для обеспечения, по существу, такого же действия и эффектов, как и в описанном варианте воплощения настоящего изобретения. Такое соединение, эквивалентное соединению (I), входит в объем настоящего изобретения.You can synthesize a compound equivalent to compound (I) in which a methyl group or a similar group is introduced into the pyridine ring to provide essentially the same action and effects as in the described embodiment of the present invention. Such a compound equivalent to compound (I) is included in the scope of the present invention.

Расположение (-X-Y) группы в соединении по настоящему изобретению конкретно не ограничено. Группа (-X-Y) может быть расположена на участке, как показано в соединении (I').The position of the (-X-Y) group in the compound of the present invention is not particularly limited. Group (-X-Y) may be located on the site, as shown in compound (I ').

Figure 00000008
Figure 00000008

Соединение (I) и соединение (I') являются, по существу, эквивалентными. Хотя и непонятно, какое соединение синтезируется, соединение (I) или соединение (I'), что действительно понятно, это то, что синтезируется смесь соединения (I) и соединения (I'). Нет необходимости указывать, что соединение (I') входит в объем настоящего изобретения.Compound (I) and compound (I ') are substantially equivalent. Although it is not clear which compound is synthesized, compound (I) or compound (I '), which is really understood, is that a mixture of compound (I) and compound (I') is synthesized. It is not necessary to indicate that the compound (I ') is included in the scope of the present invention.

Комплексное соединение, представленное формулой (I), можно легко получить способом, включающим схему 1.The complex compound represented by formula (I) can be easily prepared by a process comprising Scheme 1.

Схема 1Scheme 1

Figure 00000009
Figure 00000009

где X и Y определены выше и R1 и R2 каждый представляет собой реакционноспособную группу для образования линкерной группы X.where X and Y are defined above and R 1 and R 2 each represents a reactive group to form a linker group X.

На указанной выше схеме группу мечения Y вводят в основной скелет через линкерную группу X путем взаимодействия реакционноспособных групп R1 и R2.In the above scheme, the labeling group Y is introduced into the main skeleton through the linker group X by reacting the reactive groups R 1 and R 2 .

Тип групп R1, R2, растворитель, температура реакции, реагент, отличный от указанных выше, способ очистки и другие факторы в основном определяются типом группы X. Например, в случае введения группы мечения через аминогруппу (вторичную или третичную аминогруппу), в качестве комбинации R1 и R2, комбинация группы, содержащей аминогруппу (первичную или вторичную аминогруппу) на ее удаленном конце и удаляемой группы, такой как атом галогена. Конденсация R1 и R2 в присутствии основных групп в растворителе является примером общего условия реакции. В случае, если R1 является активной группой, можно легко ввести группу мечения.The type of groups R 1 , R 2 , solvent, reaction temperature, a reagent different from the above, the purification method and other factors are mainly determined by the type of group X. For example, if a labeling group is introduced through an amino group (secondary or tertiary amino group), as combinations of R 1 and R 2 , a combination of a group containing an amino group (primary or secondary amino group) at its remote end and a leaving group, such as a halogen atom. The condensation of R 1 and R 2 in the presence of basic groups in a solvent is an example of a general reaction condition. In case R 1 is an active group, a tagging group can be easily entered.

Затем соединение (I) можно синтезировать путем добавления соли металла к раствору, содержащему соединение (IV). В качестве соли металла можно добавлять нитрат цинка (II) или ацетат цинка (II). В случае добавления ацетата цинка (II) получают соединение формулы (V), представленной ниже, где уксусная кислота является временно координированной.Compound (I) can then be synthesized by adding a metal salt to a solution containing compound (IV). As a metal salt, zinc (II) nitrate or zinc (II) acetate can be added. When zinc (II) acetate is added, a compound of formula (V) is provided below, wherein the acetic acid is temporarily coordinated.

Figure 00000010
Figure 00000010

Соединение (V) является более химически стабильным, чем соединение (I) и, следовательно, полезно для хранения. Соединение (V) является эквивалентным соединению (I) и может быть использовано таким же образом, как и соединение (I). Конкретно, путем добавления соединения (V) к смеси, содержащей пептид, можно осуществить детекцию фосфорилированного пептида, поскольку группа сложного моноэфира фосфорной кислоты взаимозаменяемым образом координируется к соединению (I) вместо уксусной кислоты.Compound (V) is more chemically stable than compound (I) and is therefore useful for storage. Compound (V) is equivalent to compound (I) and can be used in the same way as compound (I). Specifically, by adding compound (V) to a mixture containing a peptide, phosphorylated peptide can be detected since the phosphoric acid monoester group is coordinated interchangeably to compound (I) instead of acetic acid.

Соединение (II), т.е. исходное соединение для соединения (I), можно синтезировать в соответствии с представленной ниже схемой 2.Compound (II), i.e. the starting compound for compound (I) can be synthesized in accordance with scheme 2 below.

Схема 2Scheme 2

Figure 00000011
Figure 00000011

где R1 определен выше и "Hal" представляет собой атом галогена и, предпочтительно, бром.where R 1 is defined above and "Hal" represents a halogen atom and, preferably, bromine.

Соединение (VI), т.е. 1,3-диамино-2-пропанол, как соединение, являющееся исходным веществом, может быть коммерчески доступным. Кроме того, поскольку соединение (VII) и соединение (IX) оба имеют относительно простую структуру, соединения (VII) и (IX) могут быть коммерчески доступными или их можно синтезировать способом, хорошо известным специалистам в данной области.Compound (VI), i.e. 1,3-diamino-2-propanol, as a starting material compound, may be commercially available. In addition, since compound (VII) and compound (IX) both have a relatively simple structure, compounds (VII) and (IX) may be commercially available or can be synthesized by a method well known to those skilled in the art.

На схеме 2 сначала соединение (VI) и соединение (VII) подвергают взаимодействию друг с другом в присутствии катализатора конденсации с получением соединения (VIII). Такое взаимодействие может быть осуществлено постадийно путем введения соединения (VII). Альтернативно, соединение (VIII) можно получить в одну стадию, используя 3 или более эквивалентов соединения (VII) относительно соединения (VI).In Scheme 2, first, compound (VI) and compound (VII) are reacted with each other in the presence of a condensation catalyst to give compound (VIII). Such an interaction can be carried out stepwise by the administration of compound (VII). Alternatively, compound (VIII) can be prepared in one step using 3 or more equivalents of compound (VII) relative to compound (VI).

На схеме 2 восстановительное аминирование осуществляют как реакцию конденсации. Растворитель, используемый в восстановительном аминировании, конкретно не ограничен при условии, что растворитель способен существенно растворять соединение (VI) и соединение (VII) и не ингибирует аминирование. Например, спирты, такие как метанол, этанол и изопропанол; простые эфиры, такие как диэтиловый эфир, тетрагидрофуран и диоксан; вода или смешанный растворитель, содержащий два или более из указанных компонентов, могут быть использованы в качестве растворителя.In Scheme 2, reductive amination is carried out as a condensation reaction. The solvent used in reductive amination is not particularly limited provided that the solvent is able to substantially dissolve compound (VI) and compound (VII) and does not inhibit the amination. For example, alcohols such as methanol, ethanol and isopropanol; ethers, such as diethyl ether, tetrahydrofuran and dioxane; water or a mixed solvent containing two or more of these components can be used as a solvent.

Восстановительное аминирование можно осуществить с использованием традиционного восстановителя после конденсации соединения (VI) и соединения (VII) в присутствии концентрированной хлористоводородной кислоты в качестве катализатора.Reductive amination can be carried out using a conventional reducing agent after condensation of compound (VI) and compound (VII) in the presence of concentrated hydrochloric acid as a catalyst.

Оптимальные условия, касающиеся температуры реакции и времени реакции, могут быть выбраны, необязательно, в зависимости от типа исходного соединения или других факторов. Например, реакцию можно осуществить при температуре реакции от 20 до 80°С в течение времени от 12 до 100 часов.Optimum conditions regarding the reaction temperature and reaction time may be selected, optionally, depending on the type of the starting compound or other factors. For example, the reaction can be carried out at a reaction temperature of from 20 to 80 ° C. for a time of 12 to 100 hours.

После завершения реакции растворитель и т.п. отгоняют при пониженном давлении до того, как добавляют воду. После добавления воды полученную смесь экстрагируют растворителем, нерастворимым в воде, и органический слой сушат над безводным сульфатом магния или подобным веществом. Затем растворитель отгоняют при пониженном давлении. После этого остаток очищают хорошо известным способом, таким как колоночная хроматография на силикагеле, с получением соединения (VIII).After completion of the reaction, a solvent and the like. distilled off under reduced pressure before water is added. After adding water, the resulting mixture was extracted with a solvent insoluble in water, and the organic layer was dried over anhydrous magnesium sulfate or the like. Then, the solvent was distilled off under reduced pressure. After that, the residue is purified by a well-known method, such as silica gel column chromatography, to give compound (VIII).

Способ получения соединения (VIII) не ограничивается способом, показанным на схеме 2. Альтернативно, соединение (VIII) можно синтезировать с использованием, например, соединения (VI) и галогенсодержащего соединения.The method for preparing compound (VIII) is not limited to the method shown in Scheme 2. Alternatively, compound (VIII) can be synthesized using, for example, compound (VI) and a halogen-containing compound.

Затем соединение (II) можно синтезировать путем взаимодействия соединения (VIII) с соединением (IX). Такое взаимодействие можно осуществить известным способом синтеза третичных аминов. Например, соединение (VIII) и соединение (IX) конденсируют в присутствии основания в растворителе. На стадии конденсации защитную группу можно вводить и отщеплять, в зависимости от типа R1, как это необходимо. Альтернативно, соединение (II) можно синтезировать при осуществлении стадии конденсации с использованием соединения, содержащего неактивную группу заместителя, вместо использования R1 в соединении (IX), и путем замещения неактивного заместителя группой R1 путем преобразования функциональных групп. Например, стадию конденсации осуществляют с использованием соединения, содержащего в качестве неактивного заместителя нитрогруппу, и замещением нитрогруппы аминогруппой как группой, являющейся реакционноспособной.Compound (II) can then be synthesized by reacting compound (VIII) with compound (IX). This interaction can be carried out in a known manner for the synthesis of tertiary amines. For example, compound (VIII) and compound (IX) are condensed in the presence of a base in a solvent. In the condensation step, a protecting group can be introduced and cleaved, depending on the type of R 1 , as necessary. Alternatively, compound (II) can be synthesized by performing a condensation step using a compound containing an inactive substituent group instead of using R 1 in compound (IX), and by replacing the inactive substituent with R 1 by converting functional groups. For example, the condensation step is carried out using a compound containing a nitro group as an inactive substituent, and replacing the nitro group with an amino group as a reactive group.

Представленное ниже комплексное соединение (X) можно использовать в способе по настоящему изобретению вместо комплексного соединения (I).The following complex compound (X) can be used in the method of the present invention instead of complex compound (I).

Figure 00000012
Figure 00000012

где X, Y определены выше, и R3 - R5 каждый представляет собой группу электронно-донорного заместителя в положении 4 или 6 пиридинового кольца.where X, Y are defined above, and R 3 - R 5 each represents a group of an electron-donor substituent at position 4 or 6 of the pyridine ring.

Комплексное соединение (X), используемое в способе по настоящему изобретению, является электрообогащенным азотом пиридина посредством электронно-донорной группы заместителя, введенной в соответствующее положение для замещения. Следовательно, комплексное соединение (X), используемое в способе по настоящему изобретению, является высококоординированным к цинку, обеспечивая, таким образом, возможность получения комплексного соединения (X) простым способом с обеспечением при этом стабильности.The complex compound (X) used in the method of the present invention is electrically enriched with pyridine nitrogen through an electron-donating substituent group introduced at the appropriate position for substitution. Therefore, the complex compound (X) used in the method of the present invention is highly coordinated to zinc, thus providing the possibility of obtaining the complex compound (X) in a simple manner while ensuring stability.

Способ использования комплексного соединения (X), способ получения комплексного соединения (X) и исходное соединение для комплексного соединения (X) являются, по существу, такими же, как указано для комплексного соединения (I).The method for using complex compound (X), the method for producing complex compound (X) and the starting compound for complex compound (X) are essentially the same as indicated for complex compound (I).

В указанных выше способах и соединении (I) предпочтительно использовать в качестве группы мечения биотин при получении комплексного соединения. Использование биотина является предпочтительным, поскольку биотин не представляет трудностей в обращении с ним, и он нашел широкое применение, поскольку демонстрирует различные реакции окрашивания. Использование биотина является эффективным для легкой идентификации фосфорилированного пептида.In the above methods and compound (I), it is preferable to use biotin as a labeling group in the preparation of the complex compound. The use of biotin is preferred, since biotin is not difficult to handle, and it has been widely used because it exhibits various staining reactions. The use of biotin is effective for easy identification of a phosphorylated peptide.

Ниже представлены примеры получения и экспериментальные примеры для более подробного описания настоящего изобретения. Однако настоящее изобретение не ограничивается приведенными примерами.Below are examples of obtaining and experimental examples for a more detailed description of the present invention. However, the present invention is not limited to the examples given.

ПримерыExamples

Пример получения 1-1: Метил 6-бромметилникотинатProduction Example 1-1: Methyl 6-bromomethyl nicotinate

Figure 00000013
Figure 00000013

К раствору метил 6-метилникотината (50 г, 331 ммоль) в тетрахлориде углерода (625 мл) добавляли N-бромсукцинимид (59 г, 331 ммоль). Затем добавляли 1,0 г бензоилпероксида, реакцию смеси осуществляли при температуре от 40 до 50°С в течение 24 часов при облучении светом от прожектора.To a solution of methyl 6-methylnicotinate (50 g, 331 mmol) in carbon tetrachloride (625 ml) was added N-bromosuccinimide (59 g, 331 mmol). Then 1.0 g of benzoyl peroxide was added, the reaction of the mixture was carried out at a temperature of from 40 to 50 ° C for 24 hours when irradiated with light from a searchlight.

После охлаждения реакционной смеси осажденные кристаллы отделяли фильтрованием. Фильтрат промывали водным раствором, содержащим гидрокарбонат натрия, и концентрировали. Остаток, полученный в результате концентрации, очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 37 г целевого соединения.After cooling the reaction mixture, the precipitated crystals were separated by filtration. The filtrate was washed with an aqueous solution containing sodium bicarbonate and concentrated. The residue obtained by concentration was purified by silica gel column chromatography to obtain 37 g of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 3,96 (3H, с, OCH3), 4,58 (2H, с, CH2Br), 7,54 (1H, д, Py), 8,30 (1H, дд, Py), 9,17 (1H, д, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 3.96 (3H, s, OCH 3 ), 4.58 (2H, s, CH 2 Br), 7.54 (1H, d, Py), 8 30 (1H, dd, Py); 9.17 (1H, d, Py).

Пример получения 1-2: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-1,3- диаминопропан-2-олProduction Example 1-2: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000014
Figure 00000014

К раствору 1,3-диаминопропан-2-ола (32,6 г, 362 ммоль) в метаноле (2400 мл) добавляли 60 мл концентрированной хлористоводородной кислоты. Затем добавляли по каплям 2-пиридинальдегид (116,3 г, 1,09 моль), а затем добавляли цианоборгидрид натрия (50,16 г, 798 ммоль). По завершении добавления реакцию смеси осуществляли при комнатной температуре в течение 3 дней.To a solution of 1,3-diaminopropan-2-ol (32.6 g, 362 mmol) in methanol (2400 ml) was added 60 ml of concentrated hydrochloric acid. Then, 2-pyridinaldehyde (116.3 g, 1.09 mol) was added dropwise, and then sodium cyanoborohydride (50.16 g, 798 mmol) was added. Upon completion of the addition, the reaction of the mixture was carried out at room temperature for 3 days.

После добавления к раствору концентрированной хлористоводородной кислоты и доведения pH раствора до 6 полученный раствор концентрировали до некоторой степени. Затем добавляли 0,1 н. водный раствор гидроксида натрия для доведения pH раствора до 7, а затем экстрагировали хлороформом. Экстракты собирали и сушили, полученное вещество концентрировали. Остаток, полученный в результате концентрации, очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 34 г целевого соединения.After adding concentrated hydrochloric acid to the solution and adjusting the pH of the solution to 6, the resulting solution was concentrated to some extent. Then added 0.1 N. an aqueous solution of sodium hydroxide to adjust the pH of the solution to 7, and then was extracted with chloroform. The extracts were collected and dried, the resulting substance was concentrated. The residue obtained by concentration was purified by silica gel column chromatography to obtain 34 g of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 2,59-2,83 (4H, м, CH2), 3,86-4,01 (7H, м, NCH2Py, CH), 7,15 (3H, дд, Py), 7,23-7,32 (3H, м, Py), 7,56-7,65 (3H, м, Py), 8,53 (3H, дд, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 2.59-2.83 (4H, m, CH 2 ), 3.86-4.01 (7H, m, NCH 2 Py, CH), 7, 15 (3H, dd, Py), 7.23-7.32 (3H, m, Py), 7.56-7.65 (3H, m, Py), 8.53 (3H, dd, Py).

Пример получения 1-3: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(5- метоксикарбонил-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 1-3: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (5-methoxycarbonyl-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000015
Figure 00000015

К раствору N,N,N'-три(2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-ола (18,2 г, 50 ммоль), полученного в примере получения 1-2, в безводном диметилформамиде (150 мл) добавляли карбонат калия (13,8 г, 100 ммоль), а затем добавляли по каплям раствор метил 6-бромметилникотината (11,5 г, 50 ммоль), полученного в примере получения 1-1, в безводном диметилформамиде (75 мл). После завершения добавления по каплям смесь подвергали взаимодействию при 50°С в течение 1 часа.To a solution of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol (18.2 g, 50 mmol) obtained in Production Example 1-2 in anhydrous dimethylformamide (150 ml) potassium carbonate (13.8 g, 100 mmol) was added, and then a solution of methyl 6-bromomethyl nicotinate (11.5 g, 50 mmol) obtained in Production Example 1-1 in anhydrous dimethylformamide (75 ml) was added dropwise. After completion of the dropwise addition, the mixture was reacted at 50 ° C. for 1 hour.

По завершении реакции раствор охлаждали. Затем охлажденный раствор выливали в 750 мл воды и pH раствора доводили до 8 путем добавления 1 н. раствора хлористоводородной кислоты. После экстракции этилацетатом экстракты собирали, промывали водой и насыщенным солевым раствором и концентрировали. Остаток, полученный в результате концентрации, очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 21,5 г целевого соединения.Upon completion of the reaction, the solution was cooled. Then the cooled solution was poured into 750 ml of water and the pH of the solution was adjusted to 8 by adding 1 N. hydrochloric acid solution. After extraction with ethyl acetate, the extracts were collected, washed with water and brine, and concentrated. The residue obtained by concentration was purified by silica gel column chromatography to obtain 21.5 g of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 2,58-2,73 (4H, м, CH2), 3,83-3,95 (12H, м, OCH3, NCH2Py, CH), 7,10-7,14 (3H, м, Py), 7,34 (3H, д, Py), 7,50-4,60 (4H, м, Py), 8,17 (1H, дд, Py), 8,50 (3H, д, Py), 9,09 (1H, д, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 2.58-2.73 (4H, m, CH 2 ), 3.83-3.95 (12H, m, OCH 3 , NCH 2 Py, CH) 7.10-7.14 (3H, m, Py), 7.34 (3H, d, Py), 7.50-4.60 (4H, m, Py), 8.17 (1H, dd, Py), 8.50 (3H, d, Py), 9.09 (1H, d, Py).

Пример получения 1-4: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-(2-аминоэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 1-4: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- (2-aminoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000016
Figure 00000016

К раствору N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(5-метоксикарбонил-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-ола (9,7 г, 18,9 ммоль), полученного в примере получения 1-3, в метаноле (100 мл) добавляли по каплям этилендиамин (22,7 г, 378 ммоль). После завершения добавления по каплям смесь подвергали взаимодействию при комнатной температуре в течение 3 дней.To a solution of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (5-methoxycarbonyl-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol (9.7 g, 18.9 mmol), obtained in Production Example 1-3, ethylene diamine (22.7 g, 378 mmol) was added dropwise in methanol (100 ml). After completion of the dropwise addition, the mixture was reacted at room temperature for 3 days.

По завершении реакции раствор концентрировали и остаток, полученный в результате концентрации, очищали колоночной хроматографией на силикагеле, с получением 9,72 г целевого соединения.Upon completion of the reaction, the solution was concentrated and the residue obtained by concentration was purified by silica gel column chromatography to obtain 9.72 g of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 2,54-2,71 (4H, м, CH2), 2,94 (2H, т, CH2N), 3,49 (2H, дт, CH2N), 3,80-3,99 (9H, м, NCH2Py, CH), 7,12 (3H, ддд, Py), 7,35 (3H, д, Py), 7,45 (1H, д, Py), 7,58 (3H, ддд, Py), 8,02 (1H, дд, Py), 8,49 (3H, ддд, Py), 8,89 (1H, д, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 2.54-2.71 (4H, m, CH 2 ), 2.94 (2H, t, CH 2 N), 3.49 (2H, dt, CH 2 N), 3.80-3.99 (9H, m, NCH 2 Py, CH), 7.12 (3H, ddd, Py), 7.35 (3H, d, Py), 7.45 ( 1H, d, Py), 7.58 (3H, ddd, Py), 8.02 (1H, ddd, Py), 8.49 (3H, ddd, Py), 8.89 (1H, d, Py) .

Пример получения 1-5: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-(7-нитро-2,1,3-бензоксадиазол-4-иламиноэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 1-5: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- (7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-ylaminoethyl) carbamoyl-2- pyridylmethyl] -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000017
Figure 00000017

К раствору N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-(2-аминоэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-ола (200 мг, 0,37 ммоль), полученного в примере получения 1-4, в ацетонитриле (20 мл) добавляли гидрокарбонат натрия (336 мг, 4,0 ммоль), затем добавляли 4-хлор-7-нитро-2,1,3-бензоксадиазол (73,8 мг, 0,37 ммоль). Смесь подвергали взаимодействию при комнатной температуре в течение 2 часов.To a solution of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- (2-aminoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1,3-diaminopropan-2-ol (200 mg, 0.37 mmol) obtained in Production Example 1-4, sodium bicarbonate (336 mg, 4.0 mmol) was added in acetonitrile (20 ml), then 4-chloro-7-nitro-2,1,3-benzoxadiazole was added (73.8 mg, 0.37 mmol) The mixture was reacted at room temperature for 2 hours.

По завершении реакции раствор концентрировали. Затем добавляли 50 мл дихлорметана и 50 мл воды и органический слой и водный слой разделяли. Органический слой сушили над безводным сульфатом натрия, концентрировали и полученный остаток очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 71,2 мг целевого соединения.Upon completion of the reaction, the solution was concentrated. Then, 50 ml of dichloromethane and 50 ml of water were added, and the organic layer and the aqueous layer were separated. The organic layer was dried over anhydrous sodium sulfate, concentrated, and the obtained residue was purified by silica gel column chromatography to obtain 71.2 mg of the target compound.

lH-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 2,46-2,69 (4H, м, CH2), 3,65-3,95 (13H, м, NCH2CH2N, NCH2Py, CH), 6,06 (1H, д, Ar), 7,08-7,13 (3H, м, Py), 7,32 (3H, д, Py), 7,42 (1H, д, Py), 7,56 (3H, ддд, Py), 7,96 (1H, дд, Py), 8,44-8,48 (3H, м, Py), 8,19 (1H, д, Ar), 8,83 (1H, д, Py). l H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 2.46-2.69 (4H, m, CH 2 ), 3.65-3.95 (13H, m, NCH 2 CH 2 N, NCH 2 Py , CH), 6.06 (1H, d, Ar), 7.08-7.13 (3H, m, Py), 7.32 (3H, d, Py), 7.42 (1H, d, Py ), 7.56 (3H, ddd, Py), 7.96 (1H, dd, Py), 8.44-8.48 (3H, m, Py), 8.19 (1H, d, Ar), 8.83 (1H, d, Py).

Пример получения 1-6: Раствор, содержащий комплекс цинка по настоящему изобретениюProduction Example 1-6: A Solution Containing the Zinc Complex of the Present Invention

Figure 00000018
Figure 00000018

Получали 50 мкМ водного раствора, содержащего соединение, полученное в примере получения 1-5, затем к раствору добавляли 2 эквивалента нитрата цинка. Таким образом, получали раствор, содержащий комплекс цинка по настоящему изобретению.A 50 μM aqueous solution was obtained containing the compound obtained in Production Example 1-5, then 2 equivalents of zinc nitrate were added to the solution. Thus, a solution containing the zinc complex of the present invention was obtained.

Комплекс цинка идентифицировали в соответствии со следующим способом. А именно, соединение, полученное в примере получения 1-5, растворяли в фосфорнокислом буфере (pH=6,86) с получением 50 мкМ раствора, затем к раствору добавляли 2 эквивалента нитрата цинка. Комплекс цинка по настоящему изобретению в растворе показывал следующую структуру, определенную при помощи масс-спектрометра MALDI-TOF (матрица: 2',4',6'-тригидроксиацетофенон, тип волн: рефлектор, ускоряющее напряжение: 20000 В, сеточное напряжение: 57,500%, лазер: 2500, сканы, в среднем: 128, давление: 5.05e-07).The zinc complex was identified in accordance with the following method. Namely, the compound obtained in Production Example 1-5 was dissolved in phosphoric acid buffer (pH = 6.86) to obtain a 50 μM solution, then 2 equivalents of zinc nitrate were added to the solution. The zinc complex of the present invention in solution showed the following structure, determined using a MALDI-TOF mass spectrometer (matrix: 2 ', 4', 6'-trihydroxyacetophenone, wave type: reflector, accelerating voltage: 20,000 V, grid voltage: 57,500% , laser: 2500, scans, average: 128, pressure: 5.05e-07).

Figure 00000019
Figure 00000019

Результаты измерений, полученные при помощи масс-спектрометра MALDI-TOF, представлены на фиг.1. Как показано на фиг.1, наблюдали молекулярный ионный пик при 926,2 (точная масса: 926,11). Считается, что появление молекулярного ионного пика при 910,2 вызвано отщеплением кислорода в группе оксадиазола.The measurement results obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer are presented in figure 1. As shown in FIG. 1, a molecular ion peak was observed at 926.2 (exact mass: 926.11). It is believed that the appearance of a molecular ion peak at 910.2 is caused by the elimination of oxygen in the oxadiazole group.

Пример получения 2-1: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-(2-D-биотинамидоэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 2-1: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- (2-D-biotinamidoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1,3-diaminopropane-2 ol

Figure 00000020
Figure 00000020

К раствору D-биотина (137 мг, 0,56 ммоль) в диметилформамиде (10 мл) добавляли 1,1'-карбонилдиимидазол (116 мг, 0,72 ммоль). Смесь подвергали взаимодействию при комнатной температуре в течение 12 часов. Затем раствор охлаждали льдом, после чего добавляли по каплям раствор N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-(2-аминоэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-ола (260 мг, 0,48 ммоль), полученного в примере получения 1-4, в диметилформамиде (3 мл). Охлаждающую баню удаляли и реакцию осуществляли при комнатной температуре в течение 2 часов.To a solution of D-biotin (137 mg, 0.56 mmol) in dimethylformamide (10 ml) was added 1,1'-carbonyldiimidazole (116 mg, 0.72 mmol). The mixture was reacted at room temperature for 12 hours. The solution was then cooled with ice, after which a solution of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- (2-aminoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1,3- was added dropwise. diaminopropan-2-ol (260 mg, 0.48 mmol) obtained in Production Example 1-4 in dimethylformamide (3 ml). The cooling bath was removed and the reaction was carried out at room temperature for 2 hours.

По завершении реакции раствор выливали в 50 мл воды, а затем дважды экстрагировали 50 мл хлороформа. Затем экстракты концентрировали, неочищенный продукт очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 265 мг целевого соединения.Upon completion of the reaction, the solution was poured into 50 ml of water, and then 50 ml of chloroform was extracted twice. Then, the extracts were concentrated, the crude product was purified by silica gel column chromatography to obtain 265 mg of the target compound.

1H-ЯМР (CDC13, 300 МГц): δ 1,27-1,47 (2H, м, CH2), 1,50-1,75 (4H, м, CH2), 2,13-2,26 (2H, м, COCH2), 2,52-2,74 (5H, м, NCH2, SCH2), 2,79-2,88 (1H, м, SCH2), 3,01-3,12 (1H, м, SCH), 3,43-3,65 (4H, м, NCH2CH2N), 3,80-4,02 (9H, м, NCH2Py, CHO), 4,22-4,28 (1H, м, NCH), 4,42-4,49 (1H, м, NCH), 5,83 (1H, шир.с, NHCO), 6,60 (1H, шир.с, NHCO), 7,07-7,18 (3H, м, Py), 7,31-7,38 (3H, м, Py), 7,44 (1H, д, Py), 7,59 (3H, ддд, Py), 8,03 (1H, дд, Py), 8,15 (1H, шир.с, NHCO), 8,42-8,58 (3H, м, Py), 8,94 (1H, д, Py). 1 H-NMR (CDC1 3 , 300 MHz): δ 1.27-1.47 (2H, m, CH 2 ), 1.50-1.75 (4H, m, CH 2 ), 2.13-2 26 (2H, m, COCH 2 ), 2.52-2.74 (5H, m, NCH 2 , SCH 2 ), 2.79-2.88 (1H, m, SCH 2 ), 3.01- 3.12 (1H, m, SCH), 3.43-3.65 (4H, m, NCH 2 CH 2 N), 3.80-4.02 (9H, m, NCH 2 Py, CHO), 4 22-4.28 (1H, m, NCH), 4.42-4.49 (1H, m, NCH), 5.83 (1H, br s, NHCO), 6.60 (1H, br. s, NHCO), 7.07-7.18 (3H, m, Py), 7.31-7.38 (3H, m, Py), 7.44 (1H, d, Py), 7.59 ( 3H, ddd, Py), 8.03 (1H, dd, Py), 8.15 (1H, br s, NHCO), 8.42-8.58 (3H, m, Py), 8.94 ( 1H, d, Py).

Пример получения 2-2: Раствор, содержащий комплекс цинка по настоящему изобретениюProduction Example 2-2: Solution Containing Zinc Complex of the Present Invention

Figure 00000021
Figure 00000021

Соединение, полученное в примере получения 2-1, растворяли в фосфорнокислом буфере (pH=6,86) с получением 3 мМ раствора, затем к раствору добавляли 2 эквивалента нитрата цинка.The compound obtained in Production Example 2-1 was dissolved in phosphoric acid buffer (pH = 6.86) to obtain a 3 mM solution, then 2 equivalents of zinc nitrate were added to the solution.

Комплекс цинка по настоящему изобретению в растворе показывал следующую структуру, определенную при помощи масс-спектрометра MALDI-TOF (матрица: 2',4',6'-тригидроксиацетофенон).The zinc complex of the present invention in solution showed the following structure, determined using a MALDI-TOF mass spectrometer (matrix: 2 ′, 4 ′, 6′-trihydroxyacetophenone).

Figure 00000022
Figure 00000022

Результаты измерений, полученные при помощи масс-спектрометра MALDI-TOF, представлены на фиг.3. Как показано на фиг.3, наблюдали молекулярный ионный пик при 989,6 (точная масса: 989,19).The measurement results obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer are shown in FIG. 3. As shown in FIG. 3, a molecular ion peak was observed at 989.6 (exact mass: 989.19).

Экспериментальный пример 1: Электрофорез в 10% нативном полиакриламидном гелеExperimental example 1: Electrophoresis in 10% native polyacrylamide gel

Сначала получали гели для электрофореза, pH буфер для электрофореза и окрашивающий раствор для растворения образцов в указанных ниже условиях.First, electrophoresis gels, a pH buffer for electrophoresis, and a staining solution were prepared to dissolve the samples under the following conditions.

Концентрирующий гель:Concentrating Gel:

125 мМ буфера Трис-хлористоводородная кислота (pH=6,8)125 mM Tris-hydrochloric acid buffer (pH = 6.8)

4,5% (масс./об.) полиакриламида (акриламид:бисакриламид = 30:1)4.5% (w / v) polyacrylamide (acrylamide: bisacrylamide = 30: 1)

Разделяющий гель:Separating gel:

375 мМ буфера Трис-хлористоводородная кислота (pH=8,8)375 mM Tris-hydrochloric acid buffer (pH = 8.8)

10% (масс./об.) полиакриламидного (акриламид:бисакриламид = 30:1) 10% (w / v) polyacrylamide (acrylamide: bisacrylamide = 30: 1)

pH буфера для электрофореза (pH=8,3):pH of electrophoresis buffer (pH = 8.3):

25 мМ Трис25 mm Tris

190 мМ глицина190 mm glycine

Окрашивающий раствор для растворения образцов (3×концентрированный раствор):Staining solution for dissolving samples (3 × concentrated solution):

195 мМ буфера Трис-хлористоводородная кислота (pH=6,8)195 mM Tris-hydrochloric acid buffer (pH = 6.8)

10% (масс./об.) глицерина10% (w / v) glycerin

0,1% (масс./об.) бромфенолового синего (BPB), используемого в электрофорезе в качестве окрашивающего маркера0.1% (w / v) bromophenol blue (BPB) used in electrophoresis as a staining marker

Затем 2 мкг каждого из 1: бычьего сывороточного альбумина, 2: β-казеина (фосфорилированный), и 3: β-казеина (дефосфорилированный) растворяли в окрашивающем растворе для получения образцов. Соответствующие образцы наносили на гель. Затем сообщали постоянный электрический ток 4 мА до тех пор, пока окрашивающий маркер не вытек.Then 2 μg of each of 1: bovine serum albumin, 2: β-casein (phosphorylated), and 3: β-casein (dephosphorylated) were dissolved in a staining solution to obtain samples. Appropriate samples were applied to the gel. A direct current of 4 mA was then reported until the stain marker leaked.

Гель погружали в раствор, содержащий комплекс цинка (50 мкМ), полученный в примере получения 1-6, примерно на 30 минут. Затем гель извлекали из раствора и фотографировали при облучении УФ-лампой. Затем гель окрашивали кумасси бриллиантовым голубым в соответствии с традиционным способом окрашивания и окрашенный гель фотографировали. Гель, окрашенный раствором, содержащим комплекс цинка, указан как "гель A", а гель, окрашенный кумасси бриллиантовым голубым, указан как "гель B", оба эти геля показаны на фиг.2.The gel was immersed in a solution containing a zinc complex (50 μM) obtained in Production Example 1-6 for about 30 minutes. Then the gel was removed from the solution and photographed by irradiation with a UV lamp. Then the gel was stained with Coomassie brilliant blue in accordance with the traditional method of staining and the stained gel was photographed. A gel stained with a solution containing a zinc complex is indicated as “gel A”, and a gel stained with Coomassie brilliant blue is indicated as “gel B”, both of these gels are shown in FIG.

Как видно из фиг.2, в соответствии со способом по настоящему изобретению β-казеин, связанный с фосфорной кислотой, может быть отдельно идентифицирован. Таким образом, очевидно, что способ по настоящему изобретению является выгодным для идентификации исключительно только фосфорилированных пептидов в образцах, полученных из живых организмов.As can be seen from figure 2, in accordance with the method of the present invention, β-casein associated with phosphoric acid can be separately identified. Thus, it is obvious that the method of the present invention is advantageous for identifying exclusively phosphorylated peptides in samples obtained from living organisms.

Пример получения 3-1: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"- 2-(6-D-биотинамидогексакарбоксиамидоэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 3-1: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- 2- (6-D-biotinamidohexacarboxyamidoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1,3-diaminopropane -2-ol

Figure 00000023
Figure 00000023

К раствору N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-(2-аминоэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-ола (113 мг, 0,21 ммоль), полученного в примере получения 1-4, в ацетонитриле (10 мл) добавляли по каплям раствор 5-(N-сукцинимидилоксикарбонил)пентил-D-биотинамида (95 мг, 0,21 ммоль) в диметилсульфоксиде (2 мл).To a solution of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- (2-aminoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1,3-diaminopropan-2-ol (113 mg, 0.21 mmol) obtained in Production Example 1-4 in acetonitrile (10 ml) was added dropwise a solution of 5- (N-succinimidyloxycarbonyl) pentyl-D-biotinamide (95 mg, 0.21 mmol) in dimethyl sulfoxide (2 ml )

После взаимодействия смеси при комнатной температуре в течение 6 часов реакционную смесь концентрировали и неочищенный продукт, полученный в результате концентрации, очищали колоночной хроматографией на силикагеле, с получением 136 мг целевого соединения (выход: 76%).After the mixture was reacted at room temperature for 6 hours, the reaction mixture was concentrated and the crude product obtained by concentration was purified by silica gel column chromatography to obtain 136 mg of the target compound (yield: 76%).

1H-ЯМР (CDCl3, 500 МГц): δ 1,25-1,32 (2H, м, CH2), 1,38-1,47 (4H, м, CH2), 1,56-1,67 (5H, м, CH2), 1,68-1,77 (1H, м, CH2), 2,11-2,22 (4H, м, COCH2), 2,58 (2H, дд, J=8,0 и 13,3 Гц, NCH), 2,66 (1H, дд, J=3,9 и 13,3 Гц, NCH), 2,68 (1H, дд, J=3,9 и 13,3 Гц, NCH), 2,71 (1H, дд, J=3,0 и 13,3 Гц, SCH), 2,88 (1H, дд, J=5,2 и 13,0 Гц, SCH), 3,07-3,21 (3H, м, NCH, SCH), 3,45-3,59 (4H, м, NCH2), 3,82-3,91 (8H, м, NCH2Py), 3,94 (1H, тт, J=3,9 и 8,0 Гц, OCH), 4,28-4,32 (1H, м, NCH), 4,46-4,50 (1H, м, NCH), 5,62 (1H, шир.с, NHCO), 6,40 (1H, шир.с, NHCO), 6,62 (1H, т, J=5,7 Гц, NHCO), 7,10-7,14 (3H, м, Py), 7,23 (1H, т, J=6,0 Гц, NHCO), 7,32-7,36 (3H, м, Py), 7,43 (1H, д, J=8,2 Гц, Py), 7,56-7,61 (3H, м, Py), 8,06 (1H, дд, J=2,3 и 8,2 Гц, Py), 8,17 (1H, т, J=5,0 Гц, NHCO), 8,46-8,50 (3H, м, Py), 8,96 (1H, д, J=2,3 Гц, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 500 MHz): δ 1.25-1.32 (2H, m, CH 2 ), 1.38-1.47 (4H, m, CH 2 ), 1.56-1 67 (5H, m, CH 2 ), 1.68-1.77 (1H, m, CH 2 ), 2.11-2.22 (4H, m, COCH 2 ), 2.58 (2H, dd , J = 8.0 and 13.3 Hz, NCH), 2.66 (1H, dd, J = 3.9 and 13.3 Hz, NCH), 2.68 (1H, dd, J = 3.9 and 13.3 Hz, NCH), 2.71 (1H, dd, J = 3.0 and 13.3 Hz, SCH), 2.88 (1H, dd, J = 5.2 and 13.0 Hz, SCH), 3.07-3.21 (3H, m, NCH, SCH), 3.45-3.59 (4H, m, NCH 2 ), 3.82-3.91 (8H, m, NCH 2 Py), 3.94 (1H, tt, J = 3.9 and 8.0 Hz, OCH), 4.28-4.32 (1H, m, NCH), 4.46-4.50 (1H, m, NCH), 5.62 (1H, br s, NHCO), 6.40 (1H, br s, NHCO), 6.62 (1H, t, J = 5.7 Hz, NHCO), 7 10-7.14 (3H, m, Py), 7.23 (1H, t, J = 6.0 Hz, NHCO), 7.32-7.36 (3H, m, Py), 7.43 (1H, d, J = 8.2 Hz, Py), 7.56-7.61 (3H, m, Py), 8.06 (1H, dd, J = 2.3 and 8.2 Hz, Py ), 8.17 (1H, t, J = 5.0 Hz, NHCO), 8.46-8.50 (3H, m, Py), 8.96 (1H, d, J = 2.3 Hz, Py).

13C-ЯМР (CDCl3, 125 МГц): δ 25,0 (CH2), 25,5 (CH2), 26,2 (CH2), 27,7 (CH2), 27,8 (CH2), 29,0 (CH2), 35,6 (CH2CO), 36,1 (CH2CO), 39,0 (CH2NH), 39,3 (CH2NH), 40,7 (CH2S), 41,0 (CH2NH), 55,6 (CH2S), 59,2 (CH2N), 60,2 (CHNH), 60,7 (CH2Py), 60,8 (CH2Py), 61,0 (CH2Py), 61,8 (CHNH), 67,4 (CHOH), 122,1 (Py), 122,8 (Py), 123,2 (Py), 128,5 (Py), 135,6 (Py), 136,5 (Py), 148,0 (Py), 149,0 (Py), 159,3 (Py), 159,4 (Py), 162,6 (Py), 163,9 (NCON), 166,3 (CONH), 173,4 (COM), 174,9 (CONH). 13 C-NMR (CDCl 3 , 125 MHz): δ 25.0 (CH 2 ), 25.5 (CH 2 ), 26.2 (CH 2 ), 27.7 (CH 2 ), 27.8 (CH 2 ), 29.0 (CH 2 ), 35.6 (CH 2 CO), 36.1 (CH 2 CO), 39.0 (CH 2 NH), 39.3 (CH 2 NH), 40.7 (CH 2 S), 41.0 (CH 2 NH), 55.6 (CH 2 S), 59.2 (CH 2 N), 60.2 (CHNH), 60.7 (CH 2 Py), 60 8 (CH 2 Py), 61.0 (CH 2 Py), 61.8 (CHNH), 67.4 (CHOH), 122.1 (Py), 122.8 (Py), 123.2 (Py ), 128.5 (Py), 135.6 (Py), 136.5 (Py), 148.0 (Py), 149.0 (Py), 159.3 (Py), 159.4 (Py) 162.6 (Py); 163.9 (NCON); 166.3 (CONH); 173.4 (COM); 174.9 (CONH).

Пример получения 3-2: Раствор, содержащий комплекс цинка по настоящему изобретениюProduction Example 3-2: Solution Containing Zinc Complex of the Present Invention

Figure 00000024
Figure 00000024

В фосфорнокислотном буфере (pH=6,86) растворяли 200 нмоль соединения, полученного в примере получения 3-1, для получения 3 мМ раствора, содержащего соединение, затем к раствору добавляли 2 эквивалента нитрата цинка. Таким образом, получали раствор, содержащий комплекс цинка по настоящему изобретению.200 nmol of the compound obtained in Production Example 3-1 was dissolved in phosphoric acid buffer (pH = 6.86) to obtain a 3 mM solution containing the compound, then 2 equivalents of zinc nitrate were added to the solution. Thus, a solution containing the zinc complex of the present invention was obtained.

Раствор анализировали при помощи масс-спектрометра MALDI-TOF (матрица: 2',4',6'-тригидроксиацетофенон) и идентифицировали комплекс цинка. Результаты измерений, полученные при помощи масс-спектрометра MALDI-TOF, представлены на фиг.4. Как показано на фиг.4, наблюдали молекулярный ионный пик при 1102,3 (точная масса: 1102,27).The solution was analyzed using a MALDI-TOF mass spectrometer (matrix: 2 ′, 4 ′, 6′-trihydroxyacetophenone) and a zinc complex was identified. The measurement results obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer are presented in FIG. 4. As shown in FIG. 4, a molecular ion peak was observed at 1102.3 (exact mass: 1102.27).

Экспериментальный пример 2Experimental Example 2

Суспензию (0,3 мл), содержащую стрептавидинагарозу (количество связанной группы биотина: 60-120 нмоль/мл) и буфер (Sigma-Aldrich Co.), загружали в центрифужную фильтровальную установку (объем: 0,5 мл, диаметр пор фильтра: 0,22 мкм). Фильтровальную установку подвергали центрифугированию для осуществления разделения при центрифужном ускорении 2000g в течение 15 секунд, после чего суспензию фильтровали. В фильтровальную установку загружали 5,0 мМ Трис-ацетатного буфера (pH=7,4, 0,30 мл), затем осуществляли разделение, подвергая фильтровальную установку центрифугированию при центрифужном ускорении 2000g в течение 15 секунд, и фильтрацию для промывки. Такую стадию центрифужного разделения и фильтрации для промывки повторяли 5 раз.A suspension (0.3 ml) containing streptavidinagarose (amount of biotin bound group: 60-120 nmol / ml) and buffer (Sigma-Aldrich Co.) were loaded into a centrifugal filter unit (volume: 0.5 ml, filter pore diameter: 0.22 μm). The filter unit was centrifuged to separate at a centrifuge acceleration of 2000 g for 15 seconds, after which the suspension was filtered. 5.0 mM Tris-Acetate buffer (pH = 7.4, 0.30 ml) was loaded into the filter unit, then separation was performed by centrifuging the filter unit under centrifugal acceleration at 2000 g for 15 seconds and filtering for washing. This stage of centrifugal separation and filtration for washing was repeated 5 times.

В фильтровальную установку загружали 5,0 мМ Трис-ацетатного буфера (pH=7,4, 0,30 мл) с растворенными в нем 120 нмоль/мл соединения, полученного в примере получения 3-1, и 500 нмоль/мл ацетата цинка. Фильтровальную установку приводили в состояние равновесия в течение 5 минут и затем осуществляли разделение центрифугированием при 2000g в течение 15 секунд и фильтрацию. Затем в фильтровальную установку загружали 5,0 мМ Трис-ацетатного буфера (pH=7,4, 0,30 мл) и осуществляли центрифужное разделение при 2000g в течение 15 секунд и фильтрацию для промывки. Стадию центрифужного разделения и фильтрации для промывки циклически повторяли 5 раз. Затем в фильтровальную установку загружали 5,0 мМ Трис-ацетатного буфера (pH=7,4, 0,30 мл), в котором было растворено 10 нмоль/мл ацетата цинка, и осуществляли центрифужное разделение при 2000g в течение 15 секунд и фильтрацию для промывки. Стадию центрифужного разделения и фильтрации для промывки циклически повторяли 5 раз.5.0 mM Tris-acetate buffer (pH = 7.4, 0.30 ml) with 120 nmol / ml of the compound obtained in Production Example 3-1 and 500 nmol / ml of zinc acetate dissolved in it was loaded into the filter unit. The filter unit was brought into equilibrium for 5 minutes and then separated by centrifugation at 2000 g for 15 seconds and filtered. Then, 5.0 mM Tris-acetate buffer (pH = 7.4, 0.30 ml) was loaded into the filter unit and centrifugal separation was carried out at 2000 g for 15 seconds and filtered for washing. The centrifugal separation and filtration step for washing is cyclically repeated 5 times. Then, 5.0 mM Tris-acetate buffer (pH = 7.4, 0.30 ml), in which 10 nmol / ml zinc acetate was dissolved, was loaded into the filter unit, and centrifugal separation was carried out at 2000 g for 15 seconds and filtered flushing. The centrifugal separation and filtration step for washing is cyclically repeated 5 times.

В фильтровальную установку загружали 5,0 мМ Трис-ацетатного буфера (pH=7,4, 0,30 мл) с растворенным в нем нефосфорилированным пептидом p60c (p60c-src пептид 521-533, 14 нмоль/мл) и фосфорилированным пептидом P-p60c (O-фосфорил p60c-src пептид 521-533, 12 нмоль/мл), в качестве образцов. Фильтровальную установку приводили в состояние равновесия в течение 5 минут и затем осуществляли разделение центрифугированием при 2000g в течение 15 секунд и фильтрацию. Полученный фильтрат извлекали как фракцию 1.5.0 mM Tris-acetate buffer (pH = 7.4, 0.30 ml) was loaded into the filter unit with the unphosphorylated p60c peptide (p60c-src peptide 521-533, 14 nmol / ml) and phosphorylated P- peptide dissolved in it p60c (O-phosphoryl p60c-src peptide 521-533, 12 nmol / ml), as samples. The filter unit was brought into equilibrium for 5 minutes and then separated by centrifugation at 2000 g for 15 seconds and filtered. The resulting filtrate was recovered as fraction 1.

Затем в фильтровальную установку загружали 5,0 мМ Трис-ацетатного буфера (pH=7,4, 0,50 M NaNO3, 0,30 мл) и осуществляли центрифужное разделение при 2000g в течение 15 секунд и фильтрацию (3 раза). Фильтрат, полученный после первой фильтрации, извлекали как фракцию 2, фильтрат после второй фильтрации извлекали как фракцию 3, и фильтрат после третьей фильтрации извлекали как фракцию 4.Then, 5.0 mM Tris-acetate buffer (pH = 7.4, 0.50 M NaNO 3 , 0.30 ml) was loaded into the filter unit and centrifugal separation was carried out at 2000 g for 15 seconds and filtered (3 times). The filtrate obtained after the first filtration was recovered as fraction 2, the filtrate after the second filtration was recovered as fraction 3, and the filtrate after the third filtration was recovered as fraction 4.

Кроме того, в фильтровальную установку загружали 1,0 мМ буфера, содержащего фосфорную кислоту-гидроксид натрия (pH=7,4, 0,50 M NaNO3, 0,30 мл), и осуществляли центрифужное разделение при 2000g в течение 15 секунд и фильтрацию (2 раза). Фильтрат, полученный после первой фильтрации, извлекали как фракцию 5, и фильтрат после второй фильтрацию извлекали как фракцию 6.In addition, 1.0 mM buffer containing phosphoric acid-sodium hydroxide (pH = 7.4, 0.50 M NaNO 3 , 0.30 ml) was loaded into the filter unit, and centrifugal separation was carried out at 2000 g for 15 seconds and filtration (2 times). The filtrate obtained after the first filtration was recovered as fraction 5, and the filtrate after the second filtration was recovered as fraction 6.

Количество пептида в соответствующих фракциях 1-6 определяли методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ). Показатели выделения/извлечения соответствующих пептидов относительно общего количества представлены в таблице 1.The amount of peptide in the appropriate fractions 1-6 was determined by high performance liquid chromatography (HPLC). Indicators of isolation / extraction of the corresponding peptides relative to the total amount are presented in table 1.

Таблица 1Table 1 Фракция №Faction No. 1one 22 33 4four 55 66 p60с (%)p60s (%) 6767 2424 99 00 00 00 Р-р60с (%)R-p60s (%) 00 00 00 00 8383 1717

Условия анализа ВЭЖХ:HPLC analysis conditions:

колонка: Capcell Pak C18 type UG80, 4,6 мм (диаметр)column: Capcell Pak C18 type UG80, 4.6 mm (diameter)

подвижная фаза: ацетонитрил:вода = 14:86 (об./об.), 0,1% (об./об.) трифторуксусной кислотыmobile phase: acetonitrile: water = 14:86 (vol./about.), 0.1% (vol./about.) trifluoroacetic acid

скорость потока: 1 мл/минflow rate: 1 ml / min

температура колонки: 40°Сcolumn temperature: 40 ° C

способ детекции: УФ 266 нмdetection method: UV 266 nm

время удерживания: P-p60c (5,3 минуты), p60c (13,4 минуты)retention time: P-p60c (5.3 minutes), p60c (13.4 minutes)

Представленные выше результаты показывают, что комплексное соединение по настоящему изобретению может селективно адсорбировать фосфорилированный пептид, и что использование комплексного соединения по настоящему изобретению является выгодным для селективного выделения фосфорилированного пептида в смешанном образце фосфорилированного пептида и нефосфорилированного пептида.The above results show that the complex compound of the present invention can selectively adsorb a phosphorylated peptide, and that the use of the complex compound of the present invention is beneficial for the selective isolation of a phosphorylated peptide in a mixed sample of a phosphorylated peptide and a non-phosphorylated peptide.

Сравнительный пример 1Comparative Example 1

Суспензию (0,3 мл), содержащую стрептавидинагарозу (количество связанной группы биотина: 60-120 нмоль/мл) и буфер (Sigma-Aldrich Co.), загружали в центрифужную фильтровальную установку (объем: 0,5 мл, диаметр пор фильтра: 0,22 мкм). Фильтровальную установку подвергали центрифужному разделению при 2000g в течение 15 секунд, затем суспензию фильтровали. Затем в фильтровальную установку загружали 5,0 мМ Трис-ацетатного буфера (pH=7,4, 0,30 мл) и осуществляли центрифужное разделение при 2000g в течение 15 секунд и фильтрацию для промывки. Стадию центрифужного разделения и фильтрации для промывки циклически повторяли 5 раз.A suspension (0.3 ml) containing streptavidinagarose (amount of biotin bound group: 60-120 nmol / ml) and buffer (Sigma-Aldrich Co.) were loaded into a centrifugal filter unit (volume: 0.5 ml, filter pore diameter: 0.22 μm). The filter unit was centrifuged at 2000g for 15 seconds, then the suspension was filtered. Then, 5.0 mM Tris-acetate buffer (pH = 7.4, 0.30 ml) was loaded into the filter unit and centrifugal separation was carried out at 2000 g for 15 seconds and filtered for washing. The centrifugal separation and filtration step for washing is cyclically repeated 5 times.

Осуществляли способ, аналогичный способу экспериментального примера 2, с использованием образцов, эквивалентных тем, которые использовали в экспериментальном примере 2, используя фильтровальную установку (в этом сравнительном примере не использовали комплексное соединение по настоящему изобретению). Таким образом, получали фракции 7-12.A method similar to that of Experimental Example 2 was carried out using samples equivalent to those used in Experimental Example 2 using a filter unit (the complex compound of the present invention was not used in this comparative example). Thus, fractions 7-12 were obtained.

ВЭЖХ для анализа фракций 7-12 осуществляли таким же способом, как и в экспериментальном примере 2. Результаты анализа представлены в таблице 2.HPLC for the analysis of fractions 7-12 was carried out in the same manner as in experimental example 2. The results of the analysis are presented in table 2.

Таблица 2table 2 Фракция №Faction No. 77 88 99 1010 11eleven 1212 p60с (%)p60s (%) 7575 20twenty 55 00 00 00 Р-р60с (%)R-p60s (%) 8383 1717 00 00 00 00

Результаты, представленные в таблице 2, показывают, что отделение фосфорилированного пептида от нефосфорилированного пептида не было успешным, даже при осуществлении способа, аналогичного способу экспериментального примера 2, поскольку не было использовано комплексное соединение по настоящему изобретению.The results presented in table 2 show that the separation of the phosphorylated peptide from the non-phosphorylated peptide was not successful, even with a method similar to that of experimental example 2, since the complex compound of the present invention was not used.

Пример получения 4-1: 2-ацетоксиметил-4-нитропиридинProduction Example 4-1: 2-acetoxymethyl-4-nitropyridine

Figure 00000025
Figure 00000025

200 мл уксусного ангидрида нагревали до 100°С, после чего постепенно добавляли 2-метил-4-нитропиридин N-оксид (25,0 г, 162 ммоль). После добавления смесь постепенно нагревали и поддерживали при 130°С в течение 20 минут. Затем реакционную смесь охлаждали до 80°С, после чего добавляли по каплям 200 мл этанола для остановки реакции.200 ml of acetic anhydride was heated to 100 ° C, after which 2-methyl-4-nitropyridine N-oxide (25.0 g, 162 mmol) was gradually added. After addition, the mixture was gradually heated and maintained at 130 ° C for 20 minutes. Then the reaction mixture was cooled to 80 ° C, after which 200 ml of ethanol was added dropwise to stop the reaction.

Затем реакционную смесь концентрировали, остаток переносили в воду (500 мл) и pH смеси доводили до 9 путем добавления гидрокарбоната натрия. После экстракции этилацетатом 2 раза (500 мл для первой экстракции и 200 мл для второй экстракции) полученные органические слои промывали 200 мл воды и 200 мл насыщенного солевого раствора. После концентрации органического слоя полученный неочищенный продукт очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 7,68 г целевого соединения.Then the reaction mixture was concentrated, the residue was taken up in water (500 ml) and the pH of the mixture was adjusted to 9 by adding sodium bicarbonate. After extraction with ethyl acetate 2 times (500 ml for the first extraction and 200 ml for the second extraction), the resulting organic layers were washed with 200 ml of water and 200 ml of saturated saline. After concentration of the organic layer, the resulting crude product was purified by silica gel column chromatography to obtain 7.68 g of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 2,23 (3H, с, COCH3), 3,36 (2H, с, CH2Py), 7,97 (1H, дд, Py), 8,07 (1H, д, Py), 8,90 (1H, д, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 2.23 (3H, s, COCH 3 ), 3.36 (2H, s, CH 2 Py), 7.97 (1H, dd, Py), 8 07 (1H, d, Py); 8.90 (1H, d, Py).

Пример получения 4-2: 2-гидроксиметил-4-нитропиридинProduction Example 4-2: 2-hydroxymethyl-4-nitropyridine

Figure 00000026
Figure 00000026

К 2-ацетоксиметил-4-нитропиридину (7,68 г, 39,2 ммоль), полученному в примере получения 4-1, добавляли 30 мл 10% раствора хлористоводородной кислоты. Реакцию смеси осуществляли при 50°С в течение 30 минут. После охлаждения реакционной смеси раствор выливали в 200 мл воды и pH смеси доводили до 9 путем добавления гидрокарбоната натрия. Смесь экстрагировали 100 мл этилацетата (три раза) и полученный органические слои концентрировали. Остаток, полученный в результате концентрации, очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 4,70 г целевого соединения.To 2-acetoxymethyl-4-nitropyridine (7.68 g, 39.2 mmol) obtained in Production Example 4-1, 30 ml of a 10% hydrochloric acid solution was added. The reaction of the mixture was carried out at 50 ° C for 30 minutes. After cooling the reaction mixture, the solution was poured into 200 ml of water and the pH of the mixture was adjusted to 9 by adding sodium bicarbonate. The mixture was extracted with 100 ml of ethyl acetate (three times) and the resulting organic layers were concentrated. The residue obtained by concentration was purified by silica gel column chromatography to give 4.70 g of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 3,36 (1H, т, OH), 4,94 (2H, д, CH2Py), 7,95 (1H, ддт, Py), 8,09 (1H, дт, Py), 8,86 (1H, д, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 3.36 (1H, t, OH), 4.94 (2H, d, CH 2 Py), 7.95 (1H, ddt, Py), 8, 09 (1H, dt, Py); 8.86 (1H, d, Py).

Пример получения 4-3: 2-бромметил-4-нитропиридинAn example of obtaining 4-3: 2-bromomethyl-4-nitropyridine

Figure 00000027
Figure 00000027

К суспензии 2-гидроксиметил-4-нитропиридина (1,00 г, 6,49 ммоль), полученного в примере получения 4-2, в безводном простом эфире (40 мл) добавляли по каплям трибромид фосфора (0,88 г, 3,24 ммоль) при 0°С. После завершения добавления по каплям реакцию смеси осуществляли при 0°С в течение 2 часов, после чего реакцию осуществляли при 20°С в течение 64 часов.To a suspension of 2-hydroxymethyl-4-nitropyridine (1.00 g, 6.49 mmol) obtained in Production Example 4-2 in anhydrous ether (40 ml) was added dropwise phosphorus tribromide (0.88 g, 3, 24 mmol) at 0 ° C. After completion of the dropwise addition, the reaction of the mixture was carried out at 0 ° C. for 2 hours, after which the reaction was carried out at 20 ° C. for 64 hours.

Реакционную смесь выливали в 250 мл охлажденной льдом воды и pH водного слоя доводили до 8 путем добавления гидрокарбоната натрия. Затем эфирный слой и водный слой разделяли, водный слой дважды экстрагировали 100 мл этилацетата. Органические слои собирали и сушили над безводным сульфатом натрия. Затем растворитель отгоняли, неочищенный продукт очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 0,80 г целевого соединения.The reaction mixture was poured into 250 ml of ice-cold water and the pH of the aqueous layer was adjusted to 8 by adding sodium bicarbonate. Then the ether layer and the aqueous layer were separated, the aqueous layer was extracted twice with 100 ml of ethyl acetate. The organic layers were collected and dried over anhydrous sodium sulfate. Then, the solvent was distilled off, the crude product was purified by silica gel column chromatography to obtain 0.80 g of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 4,66 (2H, с, CH2Py), 7,96 (1H, дд, Py), 8,19 (1H, дд, Py), 8,88 (1H, дд, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 4.66 (2H, s, CH 2 Py), 7.96 (1H, dd, Py), 8.19 (1H, dd, Py), 8, 88 (1H, dd, Py).

Пример получения 4-4: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(4-нитро-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 4-4: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (4-nitro-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000028
Figure 00000028

К раствору N,N,N'-три(2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-ола (2,65 г, 7,28 ммоль), полученного в примере получения 1-2, в безводном диметилформамиде (40 мл) добавляли безводный карбонат калия (2,02 г, 14,6 ммоль) и смесь нагревали до 55°С. Затем добавляли по каплям раствор 2-бромметил-4-нитропиридина (1,58 г, 7,28 ммоль), полученного в примере получения 4-3, в безводном диметилформамиде (20 мл) при той же температуре, т.е. 55°С. После чего реакцию смеси осуществляли при 55°С в течение 1,5 часа и смесь охлаждали.To a solution of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol (2.65 g, 7.28 mmol) obtained in Production Example 1-2 in anhydrous dimethylformamide (40 ml) was added anhydrous potassium carbonate (2.02 g, 14.6 mmol) and the mixture was heated to 55 ° C. Then, a solution of 2-bromomethyl-4-nitropyridine (1.58 g, 7.28 mmol) obtained in Production Example 4-3 was added dropwise in anhydrous dimethylformamide (20 ml) at the same temperature, i.e. 55 ° C. After which the reaction of the mixture was carried out at 55 ° C for 1.5 hours and the mixture was cooled.

Реакционную смесь выливали в 200 мл воды и pH смеси доводили до 8 путем добавления 1 н. раствора хлористоводородной кислоты. После экстракции 400 мл этилацетата (3 раза) органический слой промывали 250 мл насыщенного солевого раствора. После сушки над безводным сульфатом магния органический слой концентрировали. Затем отгоняли растворитель, неочищенный продукт очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 3,30 г целевого соединения.The reaction mixture was poured into 200 ml of water and the pH of the mixture was adjusted to 8 by adding 1N. hydrochloric acid solution. After extraction with 400 ml of ethyl acetate (3 times), the organic layer was washed with 250 ml of saturated saline. After drying over anhydrous magnesium sulfate, the organic layer was concentrated. Then the solvent was distilled off, the crude product was purified by silica gel column chromatography to obtain 3.30 g of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 2,60-2,78 (4H, м, NCH2), 3,84-3,96 (6H, м, CH2Py), 3,96-4,03 (1H, м, OCH), 4,07 (2H, с, CH2Py), 7,09-7,14 (3H, м, Py), 7,34 (3H, т, Py), 7,55-7,62 (3H, м, Py), 7,80 (1H, дд, Py), 8,22 (1H, д, Py), 8,49-8,52 (3H, м, Py), 8,76 (1H, дд, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 2.60-2.78 (4H, m, NCH 2 ), 3.84-3.96 (6H, m, CH 2 Py), 3.96- 4.03 (1H, m, OCH), 4.07 (2H, s, CH 2 Py), 7.09-7.14 (3H, m, Py), 7.34 (3H, t, Py), 7.55-7.62 (3H, m, Py), 7.80 (1H, dd, Py), 8.22 (1H, d, Py), 8.49-8.52 (3H, m, Py ), 8.76 (1H, dd, Py).

Пример получения 4-5: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(4-азид- 2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 4-5: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (4-azide-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000029
Figure 00000029

К раствору N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(4-нитро-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-ола (1,01 г, 2,00 ммоль), полученного в примере получения 4-4, в безводном тетрагидрофуране (17 мл) добавляли по каплям при комнатной температуре азид натрия (156 мг, 2,40 ммоль) в воде (3,3 мл). Реакционную смесь нагревали до 50°С и подвергали взаимодействию при той же температуре, т.е. 50°С, в течение 17 часов.To a solution of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (4-nitro-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol (1.01 g, 2.00 mmol), obtained in Production Example 4-4, in anhydrous tetrahydrofuran (17 ml) was added dropwise at room temperature sodium azide (156 mg, 2.40 mmol) in water (3.3 ml). The reaction mixture was heated to 50 ° C and reacted at the same temperature, i.e. 50 ° C, for 17 hours.

Затем смесь охлаждали, водный слой дважды экстрагировали 10 мл хлороформа. Экстракты собирали и концентрировали и полученный неочищенный продукт очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 980 мг целевого соединения.Then the mixture was cooled, the aqueous layer was extracted twice with 10 ml of chloroform. The extracts were collected and concentrated, and the obtained crude product was purified by silica gel column chromatography to obtain 980 mg of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 2,58-2,74 (4H, м, NCH2), 3,83-3,92 (8H, м, CH2Py), 3,92-4,01 (1H, м, OCH), 6,74 (1H, дд, Py), 7,09-7,14 (3H, м, Py), 7,20 (1H, д, Py), 7,32-7,36 (3H, м, Py), 7,55-7,60 (3H, м, Py), 8,39 (1H, д, Py), 8,49-8,52 (3H, м, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 2.58-2.74 (4H, m, NCH 2 ), 3.83-3.92 (8H, m, CH 2 Py), 3.92- 4.01 (1H, m, OCH), 6.74 (1H, dd, Py), 7.09-7.14 (3H, m, Py), 7.20 (1H, d, Py), 7, 32-7.36 (3H, m, Py), 7.55-7.60 (3H, m, Py), 8.39 (1H, d, Py), 8.49-8.52 (3H, m , Py).

Пример получения 4-6: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(4-амино-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 4-6: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (4-amino-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000030
Figure 00000030

К раствору N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(4-азид-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-ола (980 мг, 1,98 ммоль), полученного в примере получения 4-5, в этаноле (20 мл) добавляли 100 мг оксида платины. Реакцию смеси осуществляли при давлении водорода 30 кПа в течение 2 часов. Затем катализатор (оксид платины) удаляли фильтрованием, фильтрат концентрировали и полученный неочищенный продукт очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 690 мг целевого соединения.To a solution of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (4-azide-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol (980 mg, 1.98 mmol) obtained in Production Example 4-5, 100 mg of platinum oxide was added in ethanol (20 ml). The reaction of the mixture was carried out at a hydrogen pressure of 30 kPa for 2 hours. Then, the catalyst (platinum oxide) was removed by filtration, the filtrate was concentrated, and the obtained crude product was purified by silica gel column chromatography to obtain 690 mg of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 2,43-2,71 (4H, м, NCH2), 3,66-3,92 (8H, м, CH2Py), 3,92-4,01 (1H, м, OCH), 6,35 (1H, дд, Py), 6,63 (1H, д, Py), 7,08-7,14 (3H, м, Py), 7,27-7,39 (3H, м, Py), 7,54-7,62 (3H, м, Py), 8,10 (1H, д, Py), 8,49-8,50 (3H, м, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 2.43-2.71 (4H, m, NCH 2 ), 3.66-3.92 (8H, m, CH 2 Py), 3.92- 4.01 (1H, m, OCH), 6.35 (1H, dd, Py), 6.63 (1H, d, Py), 7.08-7.14 (3H, m, Py), 7, 27-7.39 (3H, m, Py), 7.54-7.62 (3H, m, Py), 8.10 (1H, d, Py), 8.49-8.50 (3H, m , Py).

Пример получения 4-7: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(4-D- биотинамидо-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 4-7: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (4-D-biotinamido-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000031
Figure 00000031

62,4 мг D-биотина (0,26 ммоль) суспендировали в 5 мл дихлорметана, затем добавляли при комнатной температуре 5,2 мг 4-диметиламинопиридина (0,04 ммоль) и 35,8 мкл триэтиламина (0,26 ммоль). К полученной смеси добавляли по каплям при комнатной температуре раствор N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(4-амино-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-ола (100 мг, 0,21 ммоль), полученного в примере получения 4-6, в дихлорметане (2 мл). После завершения добавления по каплям добавляли при комнатной температуре гидрохлорид 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимида (49,0 мг, 0,26 ммоль). Реакционную смесь нагревали и реакцию осуществляли при кипячении с обратным холодильником в течение 5 часов. К реакционной смеси добавляли D-биотин (6,0 мг, 0,02 ммоль), гидрохлорид 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимида (10,0 мг, 0,05 ммоль) и 2 мл дихлорметана, после чего реакцию осуществляли при кипячении с обратным холодильником в течение 6 часов.62.4 mg of D-biotin (0.26 mmol) was suspended in 5 ml of dichloromethane, then 5.2 mg of 4-dimethylaminopyridine (0.04 mmol) and 35.8 μl of triethylamine (0.26 mmol) were added at room temperature. To the resulting mixture was added dropwise at room temperature a solution of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (4-amino-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol (100 mg, 0.21 mmol) obtained in Production Example 4-6 in dichloromethane (2 ml). After completion of the addition, 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide hydrochloride (49.0 mg, 0.26 mmol) was added dropwise at room temperature. The reaction mixture was heated and the reaction was carried out at the boil under reflux for 5 hours. D-Biotin (6.0 mg, 0.02 mmol), 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide hydrochloride (10.0 mg, 0.05 mmol) and 2 ml of dichloromethane were added to the reaction mixture, followed by the reaction was carried out under reflux for 6 hours.

Затем реакционную смесь охлаждали и выливали в 40 мл воды. После экстракции 30 мл хлороформа (3 раза) органические слои промывали 30 мл воды (два раза) и 30 мл насыщенного солевого раствора. Затем органический слой сушили над безводным сульфатом магния и концентрировали, полученный неочищенный продукт очищали ВЭЖХ с получением 62,5 мг целевого соединения.Then the reaction mixture was cooled and poured into 40 ml of water. After extraction with 30 ml of chloroform (3 times), the organic layers were washed with 30 ml of water (two times) and 30 ml of saturated saline. Then the organic layer was dried over anhydrous magnesium sulfate and concentrated, the resulting crude product was purified by HPLC to obtain 62.5 mg of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 1,37-1,45 (2H, м, CH2), 1,53-1,71 (4H, м, CH2), 2,19-2,25 (2H, м, COCH2), 2,62-2,75 (5H, м, NCH2, SCH2), 2,87-2,93 (1H, дд, SCH2), 3,09-3,15 (1H, м, SCH), 3,67-3,80 (9H, м, OCH, NCH2Py), 4,28-4,32 (1H, м, NCH), 4,48-4,52 (1H, м, NCH), 5,15-5,40 (2H, м, NHCO), 5,89 (1H, шир.с, NHCO) 6,48-6,50 (1H, м, Py), 6,72-6,76 (1H, м, Py), 7,13-7,17 (3H, м, Py), 7,27-7,29 (1H, м, Py), 7,37 (2H, д, Py), 7,56-7,66 (3H, м, Py), 8,00 (lH, дд, Py), 8,49-8,50 (3H, м, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 1.37-1.45 (2H, m, CH 2 ), 1.53-1.71 (4H, m, CH 2 ), 2.19-2 25 (2H, m, COCH 2 ), 2.62-2.75 (5H, m, NCH 2 , SCH 2 ), 2.87-2.93 (1H, dd, SCH 2 ), 3.09- 3.15 (1H, m, SCH), 3.67-3.80 (9H, m, OCH, NCH 2 Py), 4.28-4.32 (1H, m, NCH), 4.48-4 52 (1H, m, NCH), 5.15-5.40 (2H, m, NHCO), 5.89 (1H, broad s, NHCO) 6.48-6.50 (1H, m, Py ), 6.72-6.76 (1H, m, Py), 7.13-7.17 (3H, m, Py), 7.27-7.29 (1H, m, Py), 7.37 (2H, d, Py), 7.56-7.66 (3H, m, Py), 8.00 (lH, dd, Py), 8.49-8.50 (3H, m, Py).

Это соединение анализировали при помощи масс-спектрометра MALDI-TOF с использованием α-циано-4-гидроксикоричной кислоты (CHCA) в качестве матрицы. Результат измерений представлен на фиг.5. Как видно из фиг.5, наблюдали молекулярный ионный пик 696,2 иона протонного аддукта (M++1).This compound was analyzed using a MALDI-TOF mass spectrometer using α-cyano-4-hydroxycinnamic acid (CHCA) as a matrix. The measurement result is presented in figure 5. As can be seen from FIG. 5, a molecular ion peak of 696.2 proton adduct ions (M + +1) was observed.

Пример получения 5-1: Гидрохлорид метил 6-аминогексаноатаProduction Example 5-1: Methyl 6-Aminohexanoate Hydrochloride

Figure 00000032
Figure 00000032

К суспензии 6-аминогексановой кислоты (10,0 г, 76,2 ммоль) в метаноле (300 мл) добавляли 5,51 г концентрированной серной кислоты. Смесь нагревали и осуществляли ее взаимодействие в течение 8 часов, отгоняя при этом воду, образуемую в ходе реакции этерификации, при помощи метанола, и 60 мл метанола добавляли поочередно четыре раза. Реакционную смесь охлаждали и pH смеси доводили до 6,2 путем добавления 28% раствора метилата натрия в метаноле. Растворитель отгоняли, остаток переносили в 500 мл воды и pH смеси доводили до 10,3 путем добавления карбоната натрия. После экстракции 350 мл дихлорметана (3 раза) экстракт сушили над безводным сульфатом магния. Затем отгоняли растворитель с получением метил 6-аминогексаноата.5.51 g of concentrated sulfuric acid was added to a suspension of 6-aminohexanoic acid (10.0 g, 76.2 mmol) in methanol (300 ml). The mixture was heated and its interaction was carried out for 8 hours, while distilling off the water formed during the esterification reaction with methanol, and 60 ml of methanol was added four times in turn. The reaction mixture was cooled and the pH was adjusted to 6.2 by adding a 28% solution of sodium methylate in methanol. The solvent was distilled off, the residue was taken up in 500 ml of water, and the pH of the mixture was adjusted to 10.3 by adding sodium carbonate. After extraction with 350 ml of dichloromethane (3 times), the extract was dried over anhydrous magnesium sulfate. Then, the solvent was distilled off to obtain methyl 6-aminohexanoate.

Полученный метил 6-аминогексаноат растворяли в 40 мл диоксана, затем добавляли 7,1 мл 4-н-гидрохлоридного раствора диоксана. После этого смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 30 минут, растворитель отгоняли, затем к остатку добавляли простой эфир. Осажденные кристаллы выделяли фильтрованием и сушили при пониженном давлении с получением 3,3 г целевого соединения.The resulting methyl 6-aminohexanoate was dissolved in 40 ml of dioxane, then 7.1 ml of a 4-n-hydrochloride solution of dioxane was added. After this, the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes, the solvent was distilled off, then ether was added to the residue. Precipitated crystals were isolated by filtration and dried under reduced pressure to obtain 3.3 g of the target compound.

1H-ЯМР (ДМСО-d6, 300 МГц): δ 1,26-1,36 (2H, м, CH2), 1,48-1,61 (4H, м, CH2), 2,31 (2H, т, CH2CO), 2,73 (2H, т, CH2N), 3,59 (3H, с, CH3), 8,1 (3H, шир.с, NH3). 1 H-NMR (DMSO-d 6 , 300 MHz): δ 1.26-1.36 (2H, m, CH 2 ), 1.48-1.61 (4H, m, CH 2 ), 2.31 (2H, t, CH 2 CO), 2.73 (2H, t, CH 2 N), 3.59 (3H, s, CH 3 ), 8.1 (3H, br s, NH 3 ).

Пример получения 5-2: 5-карбометоксипентил-D-биотинамидProduction Example 5-2: 5-carbomethoxypentyl-D-biotinamide

Figure 00000033
Figure 00000033

К раствору гидрохлорида метил 6-аминогексаноата (1,00 г, 5,50 ммоль), полученного в примере получения 5-1, в диметилформамиде (40 мл) добавляли триэтиламин (1,20 г, 11,8 ммоль) и 4-диметиламинопиридин (137 мг, 1,1 ммоль). Кроме того, добавляли D-биотин (1,34 г, 5,50 ммоль) и гидрохлорид 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимида (1,42 г, 7,42 ммоль). Реакцию смеси осуществляли при температуре от 35 до 45°С в течение 23 часов.To a solution of methyl 6-aminohexanoate hydrochloride (1.00 g, 5.50 mmol) obtained in Production Example 5-1 in dimethylformamide (40 ml) was added triethylamine (1.20 g, 11.8 mmol) and 4-dimethylaminopyridine (137 mg, 1.1 mmol). In addition, D-biotin (1.34 g, 5.50 mmol) and 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide hydrochloride (1.42 g, 7.42 mmol) were added. The reaction of the mixture was carried out at a temperature of from 35 to 45 ° C for 23 hours.

Реакционную смесь выливали в 300 мл воды и экстрагировали 150 мл хлороформа (5 раз). Затем экстракты сушили над безводным сульфатом магния и растворитель отгоняли. Полученный неочищенный продукт очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 1,04 г целевого соединения.The reaction mixture was poured into 300 ml of water and extracted with 150 ml of chloroform (5 times). Then, the extracts were dried over anhydrous magnesium sulfate, and the solvent was distilled off. The resulting crude product was purified by silica gel column chromatography to give 1.04 g of the target compound.

1H-ЯМР (ДМСО-d6, 300 МГц): δ 1,18-1,65 (12H, м, CH2), 2,04 (2H, т, CH2CO), 2,28 (2H, т, CH2CO), 2,57 (1H, д, CH2S), 2,82 (1H, дд, CH2S), 3,00 (1H, дт, NHCO), 3,06-3,12 (1H, м, CH2S), 3,58 (3H, с, OCH3), 4,09-4,15 (1H, м, CHN), 4,28-4,32 (1H, м, CHN), 6,35 (1H, шир.с, NHCO), 6,41 (1H, шир.с, NHCO), 7,72 (1H, т, NHCO). 1 H-NMR (DMSO-d 6 , 300 MHz): δ 1.18-1.65 (12H, m, CH 2 ), 2.04 (2H, t, CH 2 CO), 2.28 (2H, t, CH 2 CO), 2.57 (1H, d, CH 2 S), 2.82 (1H, dd, CH 2 S), 3.00 (1H, dt, NHCO), 3.06-3, 12 (1H, m, CH 2 S), 3.58 (3H, s, OCH 3 ), 4.09-4.15 (1H, m, CHN), 4.28-4.32 (1H, m, CHN), 6.35 (1H, br s, NHCO), 6.41 (1H, br s, NHCO), 7.72 (1H, t, NHCO).

Пример получения 5-3: 5-карбоксипентил-D-биотинамидAn example of obtaining 5-3: 5-carboxypentyl-D-biotinamide

Figure 00000034
Figure 00000034

В смеси 25 мл тетрагидрофурана и 25 мл метанола растворяли 5-карбометоксипентил-D-биотинамид (800 мг, 2,15 ммоль), полученный в примере получения 5-2, затем добавляли по каплям при комнатной температуре раствор гидроксида натрия (2,33 г, 58,3 ммоль) в воде (12,5 мл). По завершении добавления смесь нагревали до 40°С и реакцию осуществляли в течение 2 часов.In a mixture of 25 ml of tetrahydrofuran and 25 ml of methanol was dissolved 5-carbomethoxypentyl-D-biotinamide (800 mg, 2.15 mmol) obtained in Production Example 5-2, then sodium hydroxide solution (2.33 g) was added dropwise at room temperature. 58.3 mmol) in water (12.5 ml). Upon completion of the addition, the mixture was heated to 40 ° C and the reaction was carried out for 2 hours.

После охлаждения реакционную смесь концентрировали, затем добавляли 60 мл воды. Затем добавляли 1 н. раствор хлористоводородной кислоты и pH смеси доводили до 2,0. Осажденные кристаллы выделяли фильтрованием и промывали водой. Полученные кристаллы сушили в вакууме с получением 724 мг целевого соединения.After cooling, the reaction mixture was concentrated, then 60 ml of water was added. Then added 1 N. a solution of hydrochloric acid and the pH of the mixture were adjusted to 2.0. Precipitated crystals were isolated by filtration and washed with water. The resulting crystals were dried in vacuo to give 724 mg of the target compound.

1H-ЯМР (ДМСО-d6, 300 МГц): δ 1,17-1,67 (12H, м, CH2), 2,04 (2H, т, CH2CO), 2,19 (2H, т, CH2CO), 2,57 (1H, д, CH2S), 2,82 (1H, дд, CH2S), 3,00 (1H, дт, NHCO), 3,06-3,12 (1H, м, CH2S), 4,13 (1H, т, CHN), 4,30 (1H, т, CHN), 6,36 (1H, шир.с, NHCO), 6,43 (1H, шир.с, NHCO), 7,74 (1H, т, NHCO), 11,95 (1H, шир.с, CO2H). 1 H-NMR (DMSO-d 6 , 300 MHz): δ 1.17-1.67 (12H, m, CH 2 ), 2.04 (2H, t, CH 2 CO), 2.19 (2H, t, CH 2 CO), 2.57 (1H, d, CH 2 S), 2.82 (1H, dd, CH 2 S), 3.00 (1H, dt, NHCO), 3.06-3, 12 (1H, m, CH 2 S), 4.13 (1H, t, CHN), 4.30 (1H, t, CHN), 6.36 (1H, br s, NHCO), 6.43 ( 1H, broad s, NHCO), 7.74 (1H, t, NHCO), 11.95 (1H, broad s, CO 2 H).

Пример получения 5-4: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[4-(6-D- биотинамидогексакарбоксиамидо)-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 5-4: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [4- (6-D-biotinamidohexacarboxyamido) -2-pyridylmethyl] -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000035
Figure 00000035

К раствору 5-карбоксипентил-D-биотинамида (99,0 мг, 0,27 ммоль), полученного в примере получения 5-3, в безводном диметилформамиде добавляли триэтиламин (38,1 мкл, 0,27 ммоль) и 4-диметиламинопиридин (5,7 мг, 0,04 ммоль), затем добавляли по каплям раствор N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(4-амино-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-ола (100 мг, 0,21 ммоль), полученного в примере получения 4-6, в безводном диметилформамиде (1 мл). После этого добавляли гидрохлорид 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимида (51,7 мг, 0,27 ммоль). Реакцию смеси осуществляли при 40°С в течение 24 часов. К реакционной смеси добавляли 8,9 мкл триэтиламина (0,06 ммоль), 22,8 мг 5-карбоксипентил-D-биотинамида (0,06 ммоль) и 12,2 мг гидрохлорида 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимида (0,06 ммоль). Реакцию смеси осуществляли при 40°С в течение 6 часов.To a solution of 5-carboxypentyl-D-biotinamide (99.0 mg, 0.27 mmol) obtained in Production Example 5-3, anhydrous dimethylformamide was added triethylamine (38.1 μl, 0.27 mmol) and 4-dimethylaminopyridine ( 5.7 mg, 0.04 mmol), then a solution of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (4-amino-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropane-2 was added dropwise -ol (100 mg, 0.21 mmol) obtained in Production Example 4-6 in anhydrous dimethylformamide (1 ml). After this, 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide hydrochloride (51.7 mg, 0.27 mmol) was added. The reaction of the mixture was carried out at 40 ° C for 24 hours. 8.9 μl of triethylamine (0.06 mmol), 22.8 mg of 5-carboxypentyl-D-biotinamide (0.06 mmol) and 12.2 mg of 1-ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) hydrochloride were added to the reaction mixture. carbodiimide (0.06 mmol). The reaction of the mixture was carried out at 40 ° C for 6 hours.

После охлаждения реакционной смеси смесь выливали в 150 мл воды, затем добавляли хлорид натрия для насыщения раствора. После экстракции при помощи 40 мл хлороформа (5 раз) органические слои промывали 150 мл воды (дважды) и 150 мл насыщенного солевого раствора. Затем экстракт сушили над безводным сульфатом магния и отгоняли растворитель. Полученный неочищенный продукт очищали методом ВЭЖХ с получением 37,5 мг целевого соединения.After cooling the reaction mixture, the mixture was poured into 150 ml of water, then sodium chloride was added to saturate the solution. After extraction with 40 ml of chloroform (5 times), the organic layers were washed with 150 ml of water (twice) and 150 ml of saturated saline. The extract was then dried over anhydrous magnesium sulfate and the solvent was distilled off. The resulting crude product was purified by HPLC to give 37.5 mg of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 1,30-1,80 (12H, м, CH2), 2,14-2,25 (4H, м, COCH2), 2,60-2,76 (5H, м, NCH2, CH2S), 2,87 (1H, дд, CH2S), 3,10-3,25 (3H, м, CH2NHCO, SCH), 3,68-3,82 (9H, м, NCH2Py, OCH), 4,28-4,33 (1H, м, NCH), 4,45-4,52 (1H, м, NCH), 5,27 (1H, шир.с, NHCO), 5,50 (1H, шир.с, NHCO), 5,60 (1H, шир.с, NHCO), 6,22 (1H, шир.с, NHCO), 6,52-6,57 (1H, м, Py), 6,72-6,75 (1H, м, Py), 7,16 (3H, т, Py), 7,27-7,30 (1H, м, Py), 7,37 (2H, д, Py), 7,57-7,66 (3H, м, Py), 7,99 (1H, д, Py), 8,46-8,52 (3H, м, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 1.30-1.80 (12H, m, CH 2 ), 2.14-2.25 (4H, m, COCH 2 ), 2.60-2 76 (5H, m, NCH 2 , CH 2 S), 2.87 (1H, dd, CH 2 S), 3.10-3.25 (3H, m, CH 2 NHCO, SCH), 3.68 -3.82 (9H, m, NCH 2 Py, OCH), 4.28-4.33 (1H, m, NCH), 4.45-4.52 (1H, m, NCH), 5.27 ( 1H, broad s, NHCO), 5.50 (1H, broad s, NHCO), 5.60 (1H, broad s, NHCO), 6.22 (1H, broad s, NHCO), 6, 52-6.57 (1H, m, Py), 6.72-6.75 (1H, m, Py), 7.16 (3H, t, Py), 7.27-7.30 (1H, m , Py), 7.37 (2H, d, Py), 7.57-7.66 (3H, m, Py), 7.99 (1H, d, Py), 8.46-8.52 (3H , m, Py).

Это соединение анализировали при помощи масс-спектрометра MALDI-TOF с использованием CHCA в качестве матрицы. Результат измерений представлен на фиг.6. Как видно из фиг.6, наблюдали молекулярный ионный пик 809,5 иона протонного аддукта (M++1).This compound was analyzed using a MALDI-TOF mass spectrometer using CHCA as a matrix. The measurement result is presented in Fig.6. As can be seen from FIG. 6, a molecular ion peak of 809.5 proton adduct ions (M + +1) was observed.

Пример получения 6-1: 2-бромметил-3-гидроксипиридинProduction Example 6-1: 2-bromomethyl-3-hydroxypyridine

Figure 00000036
Figure 00000036

К 25% раствору бромистого водорода в уксусной кислоте (12,8 г, 39,6 ммоль) добавляли гидрохлорид 3-гидрокси-2-гидроксиметилпиридина (5,0 г, 54,7 ммоль). Реакцию смеси осуществляли при 110°С в течение 1 часа. Добавляли по каплям дополнительное количество 25% раствора бромистого водорода в уксусной кислоте (4,90 г, 15,1 ммоль) и реакцию смеси осуществляли в течение 2 часов.To a 25% solution of hydrogen bromide in acetic acid (12.8 g, 39.6 mmol) was added 3-hydroxy-2-hydroxymethylpyridine hydrochloride (5.0 g, 54.7 mmol). The reaction of the mixture was carried out at 110 ° C for 1 hour. An additional amount of a 25% solution of hydrogen bromide in acetic acid (4.90 g, 15.1 mmol) was added dropwise and the mixture was reacted for 2 hours.

После охлаждения реакционную смесь выливали в 50 мл воды и pH смеси доводили до 8 путем добавления насыщенного водного раствора гидрокарбоната натрия. После экстракции при помощи 50 мл дихлорметана (четыре раза) дихлорметановые слои концентрировали. Неочищенный продукт после концентрации очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 1,36 г целевого соединения.After cooling, the reaction mixture was poured into 50 ml of water and the pH of the mixture was adjusted to 8 by adding a saturated aqueous solution of sodium bicarbonate. After extraction with 50 ml of dichloromethane (four times), the dichloromethane layers were concentrated. The crude product after concentration was purified by silica gel column chromatography to obtain 1.36 g of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 5,31 (2H, с, CH2Br), 7,20-7,32 (2H, м, Py), 8,18-8,21 (1H, м, Py), 8,55 (1H, шир.с, OH). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 5.31 (2H, s, CH 2 Br), 7.20-7.32 (2H, m, Py), 8.18-8.21 (1H , m, Py), 8.55 (1H, br s, OH).

Пример получения 6-2: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(3- гидрокси-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 6-2: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (3-hydroxy-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000037
Figure 00000037

В диметилформамиде (15 мл) растворяли N,N,N'-три(2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-ол (1,00 г, 2,75 ммоль), полученный в примере получения 1-2, и 2-бромметил-3-гидроксипиридин (633 мг, 3,37 ммоль), полученный в примере получения 6-1, затем добавляли карбонат калия (760 мг, 5,50 ммоль). Реакцию смеси осуществляли при 50°С в течение 2 часов и смесь охлаждали.In dimethylformamide (15 ml) was dissolved N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol (1.00 g, 2.75 mmol) obtained in Production Example 1-2, and 2-bromomethyl-3-hydroxypyridine (633 mg, 3.37 mmol) obtained in Production Example 6-1, then potassium carbonate (760 mg, 5.50 mmol) was added. The reaction of the mixture was carried out at 50 ° C for 2 hours and the mixture was cooled.

Реакционную смесь выливали в 100 мл воды и pH смеси доводили до 8 путем добавления 1 н. раствора хлористоводородной кислоты. После экстракции 100 мл этилацетата (3 раза) органические слои промывали 100 мл воды и 100 мл насыщенного солевого раствора и сушили над безводным сульфатом натрия. Полученный неочищенный продукт очищали и собирали при помощи ВЭЖХ с получением 660 мг целевого соединения.The reaction mixture was poured into 100 ml of water and the pH of the mixture was adjusted to 8 by adding 1N. hydrochloric acid solution. After extraction with 100 ml of ethyl acetate (3 times), the organic layers were washed with 100 ml of water and 100 ml of saturated saline and dried over anhydrous sodium sulfate. The resulting crude product was purified and collected by HPLC to give 660 mg of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 2,51-2,69 (4H, м, NCH2), 3,71-4,08 (9H, м, CH2Py, OCH), 7,05-7,14 (4H, м, Py), 7,15-7,19 (1H, т, Py), 7,23-7,28 (3H, м, Py), 7,55 (2H, дт, Py), 7,64 (1H, дт, Py), 7,91 (1H, дд, Py), 8,48-8,55 (3H, м, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 2.51-2.69 (4H, m, NCH 2 ), 3.71-4.08 (9H, m, CH 2 Py, OCH), 7, 05-7.14 (4H, m, Py), 7.15-7.19 (1H, t, Py), 7.23-7.28 (3H, m, Py), 7.55 (2H, dt , Py), 7.64 (1H, dt, Py), 7.91 (1H, dd, Py), 8.48-8.55 (3H, m, Py).

Пример получения 6-3: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(3-D- биотинилокси-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 6-3: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (3-D-biotinyloxy-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000038
Figure 00000038

К раствору N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(3-гидрокси-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-ола (100 мг, 0,21 ммоль), полученного в примере получения 6-2, в безводном диметилформамиде (5 мл) добавляли гидрид натрия (дисперсия в минеральном масле) (9,0 мг, 0,23 ммоль) при 3°С. После того как температура снова повышалась до комнатной, реакцию смеси осуществляли при комнатной температуре в течение 30 минут, затем добавляли по каплям раствор N-сукцинимидил D-биотината (79,8 мг, 0,23 ммоль) в безводном диметилсульфоксиде (1 мл).To a solution of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (3-hydroxy-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol (100 mg, 0.21 mmol) obtained in Production Example 6-2, in anhydrous dimethylformamide (5 ml) was added sodium hydride (dispersion in mineral oil) (9.0 mg, 0.23 mmol) at 3 ° C. After the temperature rose again to room temperature, the mixture was reacted at room temperature for 30 minutes, then a solution of N-succinimidyl D-biotinate (79.8 mg, 0.23 mmol) in anhydrous dimethyl sulfoxide (1 ml) was added dropwise.

После завершения добавления по каплям реакцию смеси осуществляли при комнатной температуре в течение 3,5 часов и смесь выливали в 100 мл воды. После экстракции 300 мл хлороформа (3 раза) хлороформные слои сушили над безводным сульфатом натрия. Затем растворитель отгоняли, неочищенный продукт собирали и очищали при помощи ВЭЖХ с получением 63,6 мг целевого соединения.After completion of the dropwise addition, the reaction of the mixture was carried out at room temperature for 3.5 hours, and the mixture was poured into 100 ml of water. After extraction with 300 ml of chloroform (3 times), the chloroform layers were dried over anhydrous sodium sulfate. Then, the solvent was distilled off, the crude product was collected and purified by HPLC to obtain 63.6 mg of the target compound.

1H-ЯМР (CDCl3, 300 МГц): δ 1,43-1,56 (2H, м, CH2), 1,60-1,85 (4H, м, CH2), 2,53 (2H, т, COCH2), 2,58-2,68 (4H, м, NCH2), 2,71-2,77 (1H, м, SCH2), 2,91 (1H, дд, SCH2), 3,13-3,19 (1H, м, SCH), 3,76-3,99 (9H, м, OCH, NCH2Py), 4,28-4,36 (1H, м, NCH), 4,47-4,53 (1H, м, NCH), 5,16 (1H, шир.с, NHCO), 5,93 (1H, д, NHCO) 7,08-7,14 (3H, м, Py), 7,20 (1H, дд, Py), 7,33-7,42 (4H, м, Py), 7,52-7,62 (3H, м, Py), 8,42 (1H, дд, Py), 8,51 (3H, м, Py). 1 H-NMR (CDCl 3 , 300 MHz): δ 1.43-1.56 (2H, m, CH 2 ), 1.60-1.85 (4H, m, CH 2 ), 2.53 (2H , t, COCH 2 ), 2.58-2.68 (4H, m, NCH 2 ), 2.71-2.77 (1H, m, SCH 2 ), 2.91 (1H, dd, SCH 2 ) , 3.13-3.19 (1H, m, SCH), 3.76-3.99 (9H, m, OCH, NCH 2 Py), 4.28-4.36 (1H, m, NCH), 4.47-4.53 (1H, m, NCH), 5.16 (1H, br s, NHCO), 5.93 (1H, d, NHCO) 7.08-7.14 (3H, m, Py), 7.20 (1H, dd, Py), 7.33-7.42 (4H, m, Py), 7.52-7.62 (3H, m, Py), 8.42 (1H, dd, Py), 8.51 (3H, m, Py).

Пример получения 6-4: Раствор, содержащий комплекс цинка по настоящему изобретениюProduction Example 6-4: A Solution Containing the Zinc Complex of the Present Invention

Figure 00000039
Figure 00000039

К раствору, содержащему 200 нмоль N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-(3-D-биотинилокси-2-пиридилметил)-1,3-диаминопропан-2-ола, полученного в примере получения 6-3, в ацетонитриле (66,7 мкл) добавляли 40,1 мкл водного раствора нитрата цинка (100 мМ), затем добавляли 560 мкл фосфорнокислотного буфера (pH=6,86). Раствор анализировали при помощи масс-спектрометра с использованием в качестве матрицы 2',4'-6'-тригидроксиацетофенона (THAP) и идентифицировали комплекс цинка. Результаты измерений, полученные при помощи масс-спектрометра MALDI-TOF, представлены на фиг.7. Как показано на фиг.7, наблюдали молекулярный ионный пик при 919,1 (точная масса: 919,13).To a solution containing 200 nmol N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- (3-D-biotinyloxy-2-pyridylmethyl) -1,3-diaminopropan-2-ol obtained in Production Example 6 -3, in acetonitrile (66.7 μl) 40.1 μl of an aqueous solution of zinc nitrate (100 mM) was added, then 560 μl of phosphoric acid buffer (pH = 6.86) was added. The solution was analyzed using a mass spectrometer using 2 ', 4'-6'-trihydroxyacetophenone (THAP) as a matrix and the zinc complex was identified. The measurement results obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer are presented in Fig.7. As shown in FIG. 7, a molecular ion peak was observed at 919.1 (exact mass: 919.13).

Пример получения 7-1: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-(2-дансиламиноэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 7-1: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- (2-dansylaminoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1,3-diaminopropan-2-ol

Figure 00000040
Figure 00000040

В безводном ацетонитриле (9 мл) растворяли N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-2-(аминоэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-ол (1,1 г, 2,1 ммоль), полученный в примере получения 1-4, затем добавляли дансилхлорид (840 мг, 3,1 ммоль). Реакционную смесь нагревали и подвергали взаимодействию при 50°С в течение 3 часов. Затем реакционную смесь концентрировали, неочищенный продукт очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 1,30 г целевого соединения.In anhydrous acetonitrile (9 ml), N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "-2- (aminoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1,3-diaminopropane-2 was dissolved -ol (1.1 g, 2.1 mmol) obtained in Production Example 1-4, then dansyl chloride (840 mg, 3.1 mmol) was added.The reaction mixture was heated and reacted at 50 ° C. for 3 hours. Then the reaction mixture was concentrated, the crude product was purified by silica gel column chromatography to obtain 1.30 g of the target compound.

lH-ЯМР (CDCl3, 500 МГц): δ 2,57 (1H, дд, CH2), 2,60 (1H, дд, CH2), 2,67 (1H, дд, CH2), 2,69 (1H, дд, CH2), 2,85 (6H, с, NCH3), 3,17 (2H, дд, NCH2CH2N), 3,50 (2H, дд, NCH2CH2N), 3,88 (8H, дд, NCH2Py), 3,83-3,92 (1H, м, OCH), 6,31 (1H, м, SO2NH), 7,11 (1H, д, Ar), 7,13 (3H, ддд, Py), 7,35 (3H, д, Py), 7,36 (1H, д, Py), 7,42 (1H, м, CONH), 7,46 (1H, дд, Ar), 7,49 (1H, дд, Ar), 7,60 (2H, дт, Py), 7,60 (1H, дт, Py), 7,90 (1H, дд, Py), 8,23 (1H, дд, Ar), 8,27 (1H, д, Ar), 8,49 (2H, ддд, Py), 8,50 (1H, ддд, Py), 8,51 (1H, дд, Ar), 8,80 (1H, д, Py). l H-NMR (CDCl 3 , 500 MHz): δ 2.57 (1H, dd, CH 2 ), 2.60 (1H, dd, CH 2 ), 2.67 (1H, dd, CH 2 ), 2 69 (1H, dd, CH 2 ), 2.85 (6H, s, NCH 3 ), 3.17 (2H, dd, NCH 2 CH 2 N), 3.50 (2H, dd, NCH 2 CH 2 N), 3.88 (8H, dd, NCH 2 Py), 3.83-3.92 (1H, m, OCH), 6.31 (1H, m, SO 2 NH), 7.11 (1H, d, Ar), 7.13 (3H, ddd, Py), 7.35 (3H, d, Py), 7.36 (1H, d, Py), 7.42 (1H, m, CONH), 7 46 (1H, dd, Ar), 7.49 (1H, dd, Ar), 7.60 (2H, dt, Py), 7.60 (1H, dt, Py), 7.90 (1H, dd , Py), 8.23 (1H, dd, Ar), 8.27 (1H, d, Ar), 8.49 (2H, ddd, Py), 8.50 (1H, ddd, Py), 8, 51 (1H, dd, Ar); 8.80 (1H, d, Py).

13C-ЯМР (CDCl3, 125 МГц): 39,9 (NCH2CH2N), 42,7 (NCH2CH2N), 45,3 (NCH3), 59,0 (CH2), 59,1 (CH2), 60,6 (CH2Py), 60,7 (CH2Py), 61,3 (CH2Py), 67,l (CHO), 115,2 (Ar), 118,6 (Ar), 122,l (Py), 122,8 (Py), 123,2 (Ar), 123,2 (Py), 128,1 (Ar), 128,5 (Ar), 129,5 (Ar), 129,6 (Ar), 129,9 (Py), 130,6 (Ar), 134,5 (Ar), 135,4 (Py), 136,5 (Py), 136,6 (Py), 147,6 (Py), 148,9 (Py), 149,0 (Py), 152,0 (Ar), 159,1 (Py), 159,l (Py), 162,8 (Py), 166,2 (CONH). 13 C-NMR (CDCl 3 , 125 MHz): 39.9 (NCH 2 CH 2 N), 42.7 (NCH 2 CH 2 N), 45.3 (NCH 3 ), 59.0 (CH 2 ), 59.1 (CH 2 ), 60.6 (CH 2 Py), 60.7 (CH 2 Py), 61.3 (CH 2 Py), 67, l (CHO), 115.2 (Ar), 118 6 (Ar), 122, l (Py), 122.8 (Py), 123.2 (Ar), 123.2 (Py), 128.1 (Ar), 128.5 (Ar), 129, 5 (Ar), 129.6 (Ar), 129.9 (Py), 130.6 (Ar), 134.5 (Ar), 135.4 (Py), 136.5 (Py), 136.6 (Py), 147.6 (Py), 148.9 (Py), 149.0 (Py), 152.0 (Ar), 159.1 (Py), 159, l (Py), 162.8 ( Py), 166.2 (CONH).

Пример получения 7-2: Раствор, содержащий комплекс цинка по настоящему изобретениюProduction Example 7-2: A Solution Containing the Zinc Complex of the Present Invention

Figure 00000041
Figure 00000041

В фосфорнокислом буфере (pH=6,86) растворяли 200 нмоль N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-(2-дансиламиноэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-ола, полученного в примере получения 7-1, с получением 3 мМ раствора, затем к раствору добавляли 2 эквивалента нитрата цинка. Раствор анализировали при помощи масс-спектрометра MALDI-TOF, используя THAP в качестве матрицы, и идентифицировали комплекс цинка. Результаты измерений, полученные при помощи масс-спектрометра MALDI-TOF, представлены на фиг.8. Как показано на фиг.8, наблюдали молекулярный ионный пик при 996,2 (точная масса: 996,16).200 nmol of N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- (2-dansylaminoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1 was dissolved in phosphoric acid buffer (pH = 6.86), The 3-diaminopropan-2-ol obtained in Production Example 7-1 to obtain a 3 mM solution, then 2 equivalents of zinc nitrate was added to the solution.The solution was analyzed using a MALDI-TOF mass spectrometer using THAP as a matrix, and identified zinc complex The measurement results obtained using a MALDI-TOF mass spectrometer are shown in Fig. 8. As shown in Fig. 8, a molecular ion peak was observed at 996.2 (i.e. actual mass: 996.16).

Пример получения 8-1: N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-(2-N-5-флуоресцеинилтиоуреидоэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-олProduction Example 8-1: N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- (2-N-5-fluoresceinylthioureidoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1,3-diaminopropane -2-ol

Figure 00000042
Figure 00000042

В безводном диметилформамиде (150 мл) растворяли N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-(2-аминоэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-ол (950 мг, 1,76 ммоль), полученный в примере получения 1-4, затем добавляли безводный пиридин (38 мл). Затем добавляли по каплям раствор флуоресцеин-5-изотиоцианата (750 мг, 1,92 ммоль) в безводном диметилформамиде (150 мл) и реакцию смеси осуществляли при комнатной температуре в течение 3 часов. Затем реакционную смесь концентрировали, неочищенный продукт очищали колоночной хроматографией на силикагеле с получением 961 мг целевого соединения.N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- (2-aminoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1,3-diaminopropane-2 was dissolved in anhydrous dimethylformamide (150 ml) -ol (950 mg, 1.76 mmol) obtained in Production Example 1-4, then anhydrous pyridine (38 ml) was added, then a solution of fluorescein-5-isothiocyanate (750 mg, 1.92 mmol) in anhydrous was added dropwise. dimethylformamide (150 ml) and the reaction mixture was carried out at room temperature for 3 hours, then the reaction mixture was concentrated, the crude product was purified by silica gel column chromatography to obtain 961 mg of cete evogo compound.

1H-ЯМР (ДМСО-d6, 300 МГц): δ 2,33-2,43 (2H, м, CH2), 2,50-2,61 (2H, м, CH2), 3,38-3,57 (4H, м, NCH2CH2N), 3,67-3,92 (9H, м, NCH2Py, CHO), 6,52-6,67 (6H, м, Ar), 7,16-7,23 (3H, м, Py), 7,17 (1H, д, Ar), 7,34-7,41 (3H, м, Py), 7,52 (1H, д, Py), 7,69 (3H, дт, Py), 7,68-7,77 (1H, м, Ar), 8,14 (1H, дд, Py), 8,24 (1H, д, Ar), 8,41-8,46 (3H, м, Py), 8,78 (1H, м, NHCO), 8,92 (1H, д, Py). 1 H-NMR (DMSO-d 6 , 300 MHz): δ 2.33-2.43 (2H, m, CH 2 ), 2.50-2.61 (2H, m, CH 2 ), 3.38 -3.57 (4H, m, NCH 2 CH 2 N), 3.67-3.92 (9H, m, NCH 2 Py, CHO), 6.52-6.67 (6H, m, Ar), 7.16-7.23 (3H, m, Py), 7.17 (1H, d, Ar), 7.34-7.41 (3H, m, Py), 7.52 (1H, d, Py ), 7.69 (3H, dt, Py), 7.68-7.77 (1H, m, Ar), 8.14 (1H, dd, Py), 8.24 (1H, d, Ar), 8.41-8.46 (3H, m, Py); 8.78 (1H, m, NHCO); 8.92 (1H, d, Py).

Экспериментальный пример 3: Электрофорез в 10% нативном полиакриламидном гелеExperimental Example 3: Electrophoresis in 10% native polyacrylamide gel

Сначала получали гели для электрофореза, pH буфер для электрофореза и окрашивающий раствор для растворения образцов в тех же условиях, как описано в экспериментальном примере 1.First, gels for electrophoresis, a pH buffer for electrophoresis and a staining solution for dissolving the samples under the same conditions as described in experimental example 1 were prepared.

Затем по 2 мкг каждого из 1: бычьего сывороточного альбумина, 2: сывороточного альбумина человека, 3: карбонангидразы, 4: β-галактозидазы, 5: α-казеина (фосфорилированного), 6: α-казеина (дефосфорилированного), 7: β-казеина (фосфорилированного), 8: β-казеина (дефосфорилированного), 9: пепсина (фосфорилированного), и 10: пепсина (дефосфорилированного) растворяли в окрашивающем растворе для получения образцов. Соответствующие образцы наносили на гель. Затем сообщали постоянный электрический ток 40 мА до тех пор, пока окрашивающий маркер не вытек.Then, 2 μg each of 1: bovine serum albumin, 2: human serum albumin, 3: carbonic anhydrase, 4: β-galactosidase, 5: α-casein (phosphorylated), 6: α-casein (dephosphorylated), 7: β- casein (phosphorylated), 8: β-casein (dephosphorylated), 9: pepsin (phosphorylated), and 10: pepsin (dephosphorylated) were dissolved in a staining solution to obtain samples. Appropriate samples were applied to the gel. A direct current of 40 mA was then reported until the stain marker leaked.

Полученный гель погружали на 30 минут в 10 мМ Трис-ацетатного буфера (pH=7,4), содержащего 1 мкМ N,N,N'-три(2-пиридилметил)-N'-[5-N"-(2-N-5-флуоресцеинилтиоуреидоэтил)карбамоил-2-пиридилметил]-1,3-диаминопропан-2-ола, полученного в примере получения 8-1, и 100 мкМ ацетата цинка. Затем гель извлекали из раствора. Этот гель дважды промывали 100 мл 10 мМ Трис-ацетатного буфера (pH=7,4) в течение 10 минут. Затем получали флуоресцентное изображение геля при помощи фотографии, используя анализатор флуоресцентного изображения FLA-5000 (Fuji Photo Film Co., Ltd.), при длине волны возбуждения 473 нм с использованием фильтра детекции флуоресценции 510 нм. Затем гель окрашивали кумасси бриллиантовым голубым в соответствии с традиционным способом окрашивания и окрашенный гель фотографировали. Гель, окрашенный раствором, содержащим комплекс цинка, указан как "гель A", а гель, окрашенный кумасси бриллиантовым голубым, указан как "гель B", оба эти геля показаны на фиг.9.The resulting gel was immersed for 30 minutes in 10 mM Tris-acetate buffer (pH = 7.4) containing 1 μM N, N, N'-tri (2-pyridylmethyl) -N '- [5-N "- (2- N-5-fluoresceinylthioureidoethyl) carbamoyl-2-pyridylmethyl] -1,3-diaminopropan-2-ol obtained in Production Example 8-1 and 100 μM zinc acetate. The gel was then removed from the solution. This gel was washed twice with 100 ml 10 mM Tris Acetate Buffer (pH = 7.4) for 10 minutes, then a fluorescent gel image was obtained using a photograph using a FLA-5000 fluorescence image analyzer (Fuji Photo Film Co., Ltd.) at an excitation wavelength of 47 3 nm using a 510 nm fluorescence detection filter, the gel was then stained with Coomassie brilliant blue according to the traditional staining method and the colored gel was photographed. The gel stained with a solution containing zinc complex is indicated as “Gel A” and the gel stained with Coomassie brilliant blue is indicated as "gel B", both of these gels are shown in Fig.9.

Как видно из фиг.9, в случае окрашивания традиционным способом все пептиды были окрашены, как показано на примере геля B. С другой стороны, только 5: α-казеин (фосфорилированный), 7: β-казеин (фосфорилированный), и 9: пепсин (фосфорилированный), все связанные с фосфорной кислотой, были идентифицированы каждый отдельно, как показано на примере геля A, который был обработан раствором, содержащим комплекс цинка по настоящему изобретению. Таким образом, очевидно, что способ по настоящему изобретению является выгодным для идентификации исключительно только фосфорилированных пептидов в образцах, полученных из живых организмов.As can be seen from figure 9, in the case of staining in the traditional way, all peptides were stained, as shown in the example of gel B. On the other hand, only 5: α-casein (phosphorylated), 7: β-casein (phosphorylated), and 9: pepsin (phosphorylated), all associated with phosphoric acid, were each identified individually, as shown in gel A, which was treated with the solution containing the zinc complex of the present invention. Thus, it is obvious that the method of the present invention is advantageous for identifying exclusively phosphorylated peptides in samples obtained from living organisms.

В основе настоящей заявки лежат Японские патентные заявки № 2003-56068, подана 3 марта 2003 г., № 2003-113707, подана 18 апреля 2003 г. и № 2003-356934, подана 16 октября 2003 г., содержание которых включено в настоящую заявку посредством ссылки.The basis of this application is Japanese patent application No. 2003-56068, filed March 3, 2003, No. 2003-113707, filed April 18, 2003 and No. 2003-356934, filed October 16, 2003, the contents of which are included in this application by reference.

Хотя настоящее изобретение было подробно описано при помощи примеров, следует понимать, что возможны различные изменения и модификации, очевидные для специалистов в данной области. Поэтому, если такие изменения и модификации не являются отступлением от объема настоящего изобретения, определенного далее, они должны рассматриваться как включенные в объем настоящего изобретения.Although the present invention has been described in detail by way of examples, it should be understood that various changes and modifications are obvious to those skilled in the art. Therefore, if such changes and modifications are not a departure from the scope of the present invention defined hereinafter, they should be construed as being included in the scope of the present invention.

Claims (11)

1. Способ мечения фосфорилированного пептида комплексным соединением формулы (I)1. The method of labeling a phosphorylated peptide with a complex compound of the formula (I)
Figure 00000043
Figure 00000043
где Х представляет собой линкерную группу, и Y представляет собой флуоресцентную группу или биотин в качестве группы мечения.where X represents a linker group, and Y represents a fluorescent group or biotin as a labeling group.
2. Способ по п.1, где комплексное соединение представляет собой соединение, содержащее биотин в качестве группы мечения.2. The method according to claim 1, where the complex compound is a compound containing biotin as a labeling group. 3. Способ адсорбции фосфорилированного пептида с использованием комплексного соединения формулы (I)3. A method for adsorption of a phosphorylated peptide using a complex compound of the formula (I)
Figure 00000043
Figure 00000043
где X представляет собой линкерную группу, и Y представляет собой флуоресцентную группу или биотин в качестве группы мечения.where X represents a linker group, and Y represents a fluorescent group or biotin as a labeling group.
4. Способ по п.3, где комплексное соединение представляет собой соединение, содержащее биотин в качестве группы мечения.4. The method according to claim 3, where the complex compound is a compound containing biotin as a labeling group. 5. Комплексное соединение формулы (I)5. The complex compound of the formula (I)
Figure 00000043
Figure 00000043
где Х представляет собой линкерную группу, и Y представляет собой флуоресцентную группу или биотин в качестве группы мечения.where X represents a linker group, and Y represents a fluorescent group or biotin as a labeling group.
6. Комплексное соединение по п.5, где группа мечения представляет собой биотин.6. The complex compound according to claim 5, where the labeling group is biotin. 7. Соединение формулы (II)7. The compound of formula (II)
Figure 00000044
Figure 00000044
где R1 представляет собой (амино(С16алкил)карбамоильную группу или гидроксигруппу.where R 1 represents a (amino (C 1 -C 6 alkyl) carbamoyl group or hydroxy group.
8. Соединение-предшественник соединения (I), представленное формулой (IV)8. The precursor compound of compound (I) represented by formula (IV)
Figure 00000045
Figure 00000045
где X представляет линкерную группу, и Y представляет собой флуоресцентную группу или биотин в качестве группы мечения.where X represents a linker group, and Y represents a fluorescent group or biotin as a labeling group. Приоритет по пунктам:Priority on points:
03.03.2003 по пп.1, 3, 5 и 8, кроме признака, когда Y представляет собой биотин в качестве группы мечения, п.7;03.03.2003 according to claims 1, 3, 5 and 8, except for the sign when Y represents biotin as a labeling group, claim 7; 18.04.2003 по пп.1, 3, 5 и 8 для случая, когда Y представляет собой биотин в качестве группы мечения, пп.2, 4 и 6;04/18/2003 according to claims 1, 3, 5 and 8 for the case when Y represents biotin as a labeling group, claims 2, 4 and 6; 16.10.2003 по пп.1-6 и 8 для случая вариации значений радикалов.10.16.2003 according to claims 1-6 and 8 for the case of variation of the values of radicals.
RU2005130481/04A 2003-03-03 2004-02-23 Method for labeling phosphorylated peptides, method for selective adsorption of phosphorylated peptides, chelating compounds used in such methods, method for preparing chelating compounds and parent compounds for preparing chelating compounds RU2315771C2 (en)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2003056068 2003-03-03
JP2003-056068 2003-03-03
JP2003-113707 2003-04-18
JP2003113707 2003-04-18
JP2003-356934 2003-10-16

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2005130481A RU2005130481A (en) 2006-02-10
RU2315771C2 true RU2315771C2 (en) 2008-01-27

Family

ID=36049833

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2005130481/04A RU2315771C2 (en) 2003-03-03 2004-02-23 Method for labeling phosphorylated peptides, method for selective adsorption of phosphorylated peptides, chelating compounds used in such methods, method for preparing chelating compounds and parent compounds for preparing chelating compounds

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2315771C2 (en)

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SU1612264A1 (en) * 1989-03-01 1990-12-07 Институт биоорганической химии им.М.М.Шемякина Method of solid-phase immuno-ferment determination of antibodies to virus of manъs immunodefficiency and synthetic peptide labeled with biotin for effecting same

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SU1612264A1 (en) * 1989-03-01 1990-12-07 Институт биоорганической химии им.М.М.Шемякина Method of solid-phase immuno-ferment determination of antibodies to virus of manъs immunodefficiency and synthetic peptide labeled with biotin for effecting same

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Adams H. et al. "Zinc(II) complexes of tetrapodal ligands derived from tetra-substituted 1,n-diaminoalcohols", J. Chem. Soc., Dalton Trans., 2002, 925-930. Yamaguchi K. et al. "Hydrolysis of phosphodiester with hydroxo- or carboxylate-bridged dinuclear Ni(II) and Cu(II) complexes, J. Chem. Commun., 2001, 375-376. Yashiro M. et al. "Preparation and study of dinuclear zinc(II) complex for the efficient hydrolysis of the phosphodiester lincage in a diribonucleotide", J.Chem. Soc., Chem. Commun., 1995, 1793-1794. *

Also Published As

Publication number Publication date
RU2005130481A (en) 2006-02-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP5352460B2 (en) Luminescent macrocyclic lanthanide complexes
JP4195200B2 (en) Porphyrin compounds, their conjugates and assay methods based on the use of said conjugates
EP1455189B1 (en) Method for labelling phosphorylated peptides, complex compounds used in the methods, process for producing the same, and their intermediates
US9651528B2 (en) Diarylamine-based fluorogenic probes for detection of peroxynitrite
EP0403593B1 (en) Terpyridine derivatives
EP0510668A2 (en) Phenothiazine derivatives, their production and use
WO2012050393A2 (en) Novel compound of a reverse-turn mimetic and a production method and use therefor
PT94226B (en) PREPARATION PROCEDURE OF 1,2-DIOXETHANES THAT PRODUCE QUIMIOLUMINESCENCE BY DOUBLE ACTIVATION
CN108276990A (en) A kind of differentiation GSH, Cys, NAC fluorescence probe and its preparation method and application
Murakami et al. Aggregate morphology and intermembrane interaction of synthetic peptide lipids bearing various head groups
RU2315771C2 (en) Method for labeling phosphorylated peptides, method for selective adsorption of phosphorylated peptides, chelating compounds used in such methods, method for preparing chelating compounds and parent compounds for preparing chelating compounds
Smith et al. Modular synthesis of biologically active phosphatidic acid probes using click chemistry
Rydberg et al. Synthesis and characterization of N-substituted valines and their phenyl-and pentafluorophenyl-thiohydantoins
Hamilton et al. Synthesis and characterization of a photoaffinity labelling probe based on the structure of the cystic fibrosis drug ivacaftor
EP0298939B1 (en) Metal-chelating 2,6-disubstituted pyridine compounds and their use
RU2326377C2 (en) Method of determining molecular mass of compounds, containing monoester of phosphoric acid, and additive for massspectrometry
AU2022328136A1 (en) Nicotinamide ripk1 inhibitors
JP4109621B2 (en) Method for determining molecular weight of phosphoric acid monoester compound and additive for mass spectrum measurement
CN114907222A (en) A TPE-based aggregation-induced luminescence fluorescent probe and use thereof
US6127529A (en) Metal-chelating 2,6-disubstituted pyridine compounds and their use
CN115894426B (en) Fluorescent probe for high-selectivity sensitive detection of carbon monoxide, preparation method and application
KR100271124B1 (en) Cholanic acid ring based 4-trifluoroacdtohpenone derivatives, process for preparation and use thereof
CN120329373A (en) Fluorescent compounds and their application in preparing probes for specific imaging of autophagy process in biological samples or screening preparations for autophagy regulators
WO2025239453A1 (en) Functional compound
Manetsch et al. Photoactivatable probes and uses thereof