RU2293990C1 - Method for predicting genetically deterministic human diseases - Google Patents
Method for predicting genetically deterministic human diseases Download PDFInfo
- Publication number
- RU2293990C1 RU2293990C1 RU2006101827/15A RU2006101827A RU2293990C1 RU 2293990 C1 RU2293990 C1 RU 2293990C1 RU 2006101827/15 A RU2006101827/15 A RU 2006101827/15A RU 2006101827 A RU2006101827 A RU 2006101827A RU 2293990 C1 RU2293990 C1 RU 2293990C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- acetylation
- patient
- phenotype
- diseases
- nat2
- Prior art date
Links
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 title claims abstract description 122
- 201000010099 disease Diseases 0.000 title claims abstract description 120
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 36
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 claims abstract description 65
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 claims abstract description 63
- 208000037560 slow acetylation Diseases 0.000 claims abstract description 23
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims abstract description 16
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract description 10
- 101000884399 Homo sapiens Arylamine N-acetyltransferase 2 Proteins 0.000 claims description 29
- 101000713305 Homo sapiens Sodium-coupled neutral amino acid transporter 1 Proteins 0.000 claims description 27
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 13
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 12
- ASWVTGNCAZCNNR-UHFFFAOYSA-N sulfamethazine Chemical compound CC1=CC(C)=NC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=N1 ASWVTGNCAZCNNR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- 230000034994 death Effects 0.000 claims description 10
- 231100000517 death Toxicity 0.000 claims description 10
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 claims description 10
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 claims description 7
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 7
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 7
- 230000037396 body weight Effects 0.000 claims description 7
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 claims description 6
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 5
- RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N caffeine Chemical compound CN1C(=O)N(C)C(=O)C2=C1N=CN2C RYYVLZVUVIJVGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims description 4
- 101150019103 NAT2 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 238000012067 mathematical method Methods 0.000 claims description 3
- 230000008520 organization Effects 0.000 claims description 3
- LPHGQDQBBGAPDZ-UHFFFAOYSA-N Isocaffeine Natural products CN1C(=O)N(C)C(=O)C2=C1N(C)C=N2 LPHGQDQBBGAPDZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 229960001948 caffeine Drugs 0.000 claims description 2
- VJEONQKOZGKCAK-UHFFFAOYSA-N caffeine Natural products CN1C(=O)N(C)C(=O)C2=C1C=CN2C VJEONQKOZGKCAK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 claims description 2
- 102100026783 N-alpha-acetyltransferase 16, NatA auxiliary subunit Human genes 0.000 claims 10
- 101710202061 N-acetyltransferase Proteins 0.000 claims 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims 1
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 abstract description 7
- 231100000518 lethal Toxicity 0.000 abstract 1
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 102100036916 Sodium-coupled neutral amino acid transporter 1 Human genes 0.000 description 17
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 description 15
- 201000001320 Atherosclerosis Diseases 0.000 description 11
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 10
- 208000001297 phlebitis Diseases 0.000 description 10
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 6
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 4
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 4
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 4
- 208000002193 Pain Diseases 0.000 description 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 3
- 206010024378 leukocytosis Diseases 0.000 description 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 3
- 238000002559 palpation Methods 0.000 description 3
- 230000000737 periodic effect Effects 0.000 description 3
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 3
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 206010019233 Headaches Diseases 0.000 description 2
- 101000884385 Homo sapiens Arylamine N-acetyltransferase 1 Proteins 0.000 description 2
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 2
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 2
- 102000003929 Transaminases Human genes 0.000 description 2
- 108090000340 Transaminases Proteins 0.000 description 2
- 206010047700 Vomiting Diseases 0.000 description 2
- 208000022440 X-linked sideroblastic anemia 1 Diseases 0.000 description 2
- 239000000853 adhesive Substances 0.000 description 2
- 230000001070 adhesive effect Effects 0.000 description 2
- 230000004596 appetite loss Effects 0.000 description 2
- 230000036772 blood pressure Effects 0.000 description 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 208000002173 dizziness Diseases 0.000 description 2
- 238000013277 forecasting method Methods 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 231100000869 headache Toxicity 0.000 description 2
- 208000006278 hypochromic anemia Diseases 0.000 description 2
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 2
- 235000021266 loss of appetite Nutrition 0.000 description 2
- 208000019017 loss of appetite Diseases 0.000 description 2
- 230000003449 preventive effect Effects 0.000 description 2
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 2
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 2
- 230000008961 swelling Effects 0.000 description 2
- 206010003571 Astrocytoma Diseases 0.000 description 1
- 201000004569 Blindness Diseases 0.000 description 1
- 208000024172 Cardiovascular disease Diseases 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 201000004624 Dermatitis Diseases 0.000 description 1
- 208000018522 Gastrointestinal disease Diseases 0.000 description 1
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 description 1
- 208000032612 Glial tumor Diseases 0.000 description 1
- 206010018338 Glioma Diseases 0.000 description 1
- 206010053240 Glycogen storage disease type VI Diseases 0.000 description 1
- 101001034811 Homo sapiens Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000639975 Homo sapiens Sodium-dependent noradrenaline transporter Proteins 0.000 description 1
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 1
- 208000007101 Muscle Cramp Diseases 0.000 description 1
- 208000012902 Nervous system disease Diseases 0.000 description 1
- 208000025966 Neurological disease Diseases 0.000 description 1
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 102100033769 Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3 Human genes 0.000 description 1
- 108010040002 Tumor Suppressor Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000001742 Tumor Suppressor Proteins Human genes 0.000 description 1
- 208000012931 Urologic disease Diseases 0.000 description 1
- 206010047163 Vasospasm Diseases 0.000 description 1
- 210000000683 abdominal cavity Anatomy 0.000 description 1
- 230000001133 acceleration Effects 0.000 description 1
- 238000002583 angiography Methods 0.000 description 1
- 206010003549 asthenia Diseases 0.000 description 1
- 208000010668 atopic eczema Diseases 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 230000036983 biotransformation Effects 0.000 description 1
- 238000009534 blood test Methods 0.000 description 1
- 230000036760 body temperature Effects 0.000 description 1
- 230000009172 bursting Effects 0.000 description 1
- NCEXYHBECQHGNR-UHFFFAOYSA-N chembl421 Chemical compound C1=C(O)C(C(=O)O)=CC(N=NC=2C=CC(=CC=2)S(=O)(=O)NC=2N=CC=CC=2)=C1 NCEXYHBECQHGNR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 239000002537 cosmetic Substances 0.000 description 1
- 238000009223 counseling Methods 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 230000006866 deterioration Effects 0.000 description 1
- 238000001784 detoxification Methods 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000000378 dietary effect Effects 0.000 description 1
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 1
- 238000002651 drug therapy Methods 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000005017 glioblastoma Diseases 0.000 description 1
- 208000014951 hematologic disease Diseases 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 229940088592 immunologic factor Drugs 0.000 description 1
- 239000000367 immunologic factor Substances 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 208000017169 kidney disease Diseases 0.000 description 1
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 208000018769 loss of vision Diseases 0.000 description 1
- 231100000864 loss of vision Toxicity 0.000 description 1
- 210000003141 lower extremity Anatomy 0.000 description 1
- 206010025135 lupus erythematosus Diseases 0.000 description 1
- 206010025226 lymphangitis Diseases 0.000 description 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 101150063195 mts gene Proteins 0.000 description 1
- 239000002858 neurotransmitter agent Substances 0.000 description 1
- 230000003448 neutrophilic effect Effects 0.000 description 1
- 201000002575 ocular melanoma Diseases 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 208000026526 progressive weakness Diseases 0.000 description 1
- 230000001850 reproductive effect Effects 0.000 description 1
- 210000003752 saphenous vein Anatomy 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000014001 urinary system disease Diseases 0.000 description 1
- 230000004393 visual impairment Effects 0.000 description 1
- 239000002676 xenobiotic agent Substances 0.000 description 1
- 230000002034 xenobiotic effect Effects 0.000 description 1
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Изобретение относится к области медицины и может быть использовано для прогнозирования генетически детерминированных заболеваний индивидуального человека на протяжении всей его жизни.The invention relates to medicine and can be used to predict the genetically determined diseases of an individual person throughout his life.
Актуальной задачей современной биологии и медицины является установление факторов индивидуальной предрасположенности человека к различным заболеваниям. В связи с расшифровкой генома человека в последнее время интенсивно ведутся работы по поиску генов, по мутации которых можно осуществить прогноз заболеваний. Разработано много способов прогнозирования различных заболеваний, основанных на мутации генов.The urgent task of modern biology and medicine is to establish factors of an individual's individual predisposition to various diseases. In connection with the decoding of the human genome, work has recently been intensively carried out to search for genes by mutation of which a disease prognosis can be made. Many methods have been developed for predicting various diseases based on gene mutations.
Известен способ диагностики и прогнозирования онкологических заболеваний, основанный на мутациях в гене многофункционального опухолевого супрессора (MTS). По мутациям в гене MTS в зародышевой линии можно осуществлять диагностику предрасположенности к таким формам рака, как меланома, окулярная меланома, лейкоз, астроцитома, глиобластома, лимфома, глиома, саркома и др. (1, 2).A known method for the diagnosis and prognosis of cancer based on mutations in the gene of a multifunctional tumor suppressor (MTS). By mutations in the MTS gene in the germ line, one can diagnose a predisposition to such forms of cancer as melanoma, ocular melanoma, leukemia, astrocytoma, glioblastoma, lymphoma, glioma, sarcoma, etc. (1, 2).
Известен способ прогнозирования риска раковых заболеваний, основанный на определении нарушений координации между аллелями в изолированных клетках по сравнению с координацией в клетках здорового человека (3).A known method for predicting the risk of cancer, based on the determination of coordination disorders between alleles in isolated cells compared with coordination in cells of a healthy person (3).
Предрасположенность людей к различным заболеваниям связывают также с индивидуальной активностью генетически детерминированной системы ферментов детоксикации ксенобиотиков. К ним относятся ферменты P-450, NAT1, NAT2 и др., варьирующие в широком диапазоне, благодаря генетическому полиморфизму.The predisposition of people to various diseases is also associated with the individual activity of a genetically determined xenobiotic detoxification enzyme system. These include enzymes P-450, NAT1, NAT2, etc., varying in a wide range, due to genetic polymorphism.
Известен способ диагностики таких заболеваний, как сердечно-сосудистые заболевания, рак, желудочно-кишечные заболевания, воспаления, гематологические болезни, неврологические заболевания, заболевания репродуктивной функции и урологические болезни, основанный на определении нарушений активности фермента NAT1 (4).A known method for the diagnosis of diseases such as cardiovascular disease, cancer, gastrointestinal diseases, inflammation, hematological diseases, neurological diseases, diseases of reproductive function and urological diseases, based on the determination of impaired activity of the NAT1 enzyme (4).
Достоинством этих способов является высокая точность прогноза.The advantage of these methods is the high accuracy of the forecast.
Однако в них не уточняется возраст пациента, при котором есть риск прогнозируемого заболевания, неизвестна степень тяжести течения заболевания и возможность летального исхода от него. Это не позволяет своевременно осуществлять профилактические мероприятия для снижения степени тяжести заболеваний и, в особенности, избежания летального исхода.However, they do not specify the age of the patient at which there is a risk of a predictable disease, the severity of the course of the disease and the possibility of death from him are unknown. This does not allow the timely implementation of preventive measures to reduce the severity of diseases and, in particular, to avoid death.
Генетически детерминированный фермент NAT2 (N-ацетилтрасфераза) принимает участие в биотрансформации экзогенных и эндогенных субстратов (липиды, гормоны, нейромедиаторы, иммунные факторы, факторы воспаления).The genetically determined enzyme NAT2 (N-acetyltrasferase) takes part in the biotransformation of exogenous and endogenous substrates (lipids, hormones, neurotransmitters, immune factors, inflammation factors).
По активности генетического фермента NAT2 все человеческие популяции делятся на две группы: с фенотипом быстрого и медленного ацетилирования (быстрых и медленных ацетиляторов). При этом не выявлено какого-либо физиологического преимущества у этих фенотипов. Количество быстрых и медленных ацетиляторов в разных этнических популяциях варьирует в широком диапазоне.According to the activity of the genetic enzyme NAT2, all human populations are divided into two groups: with the phenotype of fast and slow acetylation (fast and slow acetylators). At the same time, no physiological advantage was found in these phenotypes. The number of fast and slow acetylators in different ethnic populations varies over a wide range.
Известна связь системы метаболизма N-ацетилирования с предрасположенностью человека к ряду заболеваний. Например, больные сахарным диабетом, экземой, спаечной болезнью и нефропатиями имеют фенотип быстрого ацетилирования (5), а больные с некоторыми инфекционными заболеваниями - фенотип медленного ацетилирования (6). На основании такой закономерности по фенотипу ацетилирования можно заранее прогнозировать предрасположенность пациента к указанным заболеваниям, а также осуществлять выбор лекарственной терапии для конкретного больного.The connection between the N-acetylation metabolism system and a person’s predisposition to a number of diseases is known. For example, patients with diabetes mellitus, eczema, adhesive disease and nephropathy have the phenotype of rapid acetylation (5), and patients with some infectious diseases have the phenotype of slow acetylation (6). Based on this regularity by the acetylation phenotype, one can predict the patient's predisposition to these diseases in advance, as well as select a drug therapy for a particular patient.
Например, известен способ установления предрасположенности пациентов, больных ревматоидным артритом, к риску побочных эффектов при приеме сульфазалазина - известного и широко применяемого во всем мире препарата для лечения ревматоидного артрита (7). Прогнозирование побочных эффектов по этому способу основано на определении диплотипа конфигурации гена NAT2 пациента, так как было установлено, что побочные эффекты возникают только у медленных ацетиляторов.For example, there is a method for establishing the predisposition of patients with rheumatoid arthritis to the risk of side effects when taking sulfazalazine, a well-known and widely used drug for the treatment of rheumatoid arthritis (7). Prediction of side effects by this method is based on the determination of the patient’s NAT2 gene configuration diplotype, since it was found that side effects occur only in slow acetylators.
Однако, несмотря на известность связи между фенотипом ацетилирования и предрасположенностью фенотипа к ряду заболеваний, неизвестны способы прогнозирования этих заболеваний с уточнением возраста, при котором есть риск таких заболеваний, неизвестно прогнозирование тяжести протекания заболеваний в различных возрастных интервалах жизни человека и возможность летального исхода от прогнозируемых заболеваний.However, despite the fact that the connection between the acetylation phenotype and the phenotype predisposition to a number of diseases is known, there are no known methods for predicting these diseases with an exact age at which such diseases are at risk, the prognosis of the severity of the course of the disease at different age intervals of a person’s life and the possibility of death from the predicted diseases is unknown. .
Задачей изобретения является возможность прогнозирования генетически детерминированных заболеваний человека с уточнением возраста их развития, с оценкой тяжести протекания и риска летального исхода.The objective of the invention is the ability to predict genetically determined human diseases with the specification of the age of their development, with an assessment of the severity and risk of death.
Эта задача решена предлагаемым способом, который осуществляется следующим образом. У пациента определяют фенотип ацетилирования и прогнозируют риск генетически детерминированных заболеваний по предварительно подготовленной таблице. Для составления таблицы по данным мировой статистики, например Всемирной Организации Здравоохранения (ВОЗ), выявляют коэффициенты заболеваемости и коэффициенты смертности от различных заболеваний, которые ежегодно приводит ВОЗ для различных стран мира отдельно для мужчин и женщин с указанием следующих возрастных интервалов (годы): до года, 1-4, 5-15, 15-24, 25-34, 35-44, 45-54, 55-64, 65-74, 75 и старше. Рассчитывают среднегодовые значения этих коэффициентов для указанных возрастных интервалов, учитывая данные, приведенные за 10-20 лет.This problem is solved by the proposed method, which is carried out as follows. The patient determines the acetylation phenotype and predicts the risk of genetically determined diseases according to a previously prepared table. To compile a table according to world statistics, for example, the World Health Organization (WHO), morbidity and mortality rates from various diseases are revealed, which are given annually by WHO for different countries of the world separately for men and women, indicating the following age intervals (years): up to a year , 1-4, 5-15, 15-24, 25-34, 35-44, 45-54, 55-64, 65-74, 75 and older. Calculate the average annual values of these coefficients for the indicated age intervals, taking into account the data given for 10-20 years.
По данным научной статистики (статьи, обзоры) выявляют для тех же стран частоту встречаемости фенотипов быстрого и медленного ацетилирования (% быстрых или медленных ацетиляторов от общего населения страны). Затем, используя массив этих данных и общеизвестный математический метод статистической обработки данных, вычисляют коэффициент корреляции «а» и коэффициент «b» (по Спирману).According to scientific statistics (articles, reviews), the frequency of occurrence of phenotypes of fast and slow acetylation (% of fast or slow acetylators of the total population of the country) is revealed for the same countries. Then, using the array of this data and the well-known mathematical method of statistical data processing, the correlation coefficient “a” and coefficient “b” (according to Spearman) are calculated.
Коэффициент «а» - это коэффициент корреляции между соотношениями фенотипов быстрого и медленного ацетилирования и коэффициентами заболеваемости конкретными заболеваниями в различных странах. Коэффициент «b» - коэффициент корреляции между соотношениями тех же фенотипов и коэффициентами смертности от этих заболеваний в тех же странах. При этом риск каждого прогнозируемого заболевания и риск летального исхода от него в указанных возрастных интервалах устанавливают по коэффициентам «а» и «b», соответствующим полу и фенотипу пациента при положительном знаке этих коэффициентов для пациента с фенотипом быстрого ацетилирования и при отрицательном знаке для пациента с фенотипом медленного ацетилирования, при достоверности этих коэффициентов (р), равной или менее 0,05, а степень риска выявленных заболеваний и степень риска летального исхода от них определяют по величинам коэффициентов «а» и «b» в диапазоне их значений от -1 до +1.The coefficient “a” is the correlation coefficient between the ratios of phenotypes of fast and slow acetylation and the incidence rates of specific diseases in different countries. The coefficient "b" is the correlation coefficient between the ratios of the same phenotypes and mortality rates from these diseases in the same countries. In this case, the risk of each predicted disease and the risk of death from it in the indicated age ranges are determined by the coefficients “a” and “b” corresponding to the patient’s gender and phenotype with a positive sign of these coefficients for a patient with a rapid acetylation phenotype and a negative sign for a patient with phenotype of slow acetylation, with the reliability of these coefficients (p) equal to or less than 0.05, and the degree of risk of identified diseases and the degree of risk of death from them is determined by the values of ffitsientov «a» and «b» in the range of their values from -1 to +1.
Фенотип ацетилирования пациента может быть определен известными для специалистов методами. По одному из методов фенотип определяют по генотипу пациента. При этом у пациента производят забор венозной крови, выделяют ДНК из ядер лимфоцитов и с помощью праймеров определяют аллели гена NAT2. При обнаружении одного из аллелей NAT2*4, NAT2*12A и NAT2*12C устанавливают фенотип быстрого ацетилирования, а при обнаружении двух аллелей из NAT2*5, NAT2*6, NAT2*7, NAT2*10, NAT2*11, NAT2*13, NAT2*14 устанавливают фенотип медленного ацетилирования (8).The patient acetylation phenotype can be determined by methods known to those skilled in the art. In one of the methods, the phenotype is determined by the genotype of the patient. At the same time, venous blood is sampled from the patient, DNA is extracted from the nuclei of lymphocytes and the alleles of the NAT2 gene are determined using primers. When one of the alleles NAT2 * 4, NAT2 * 12A and NAT2 * 12C is detected, the rapid acetylation phenotype is established, and when two alleles are found from NAT2 * 5, NAT2 * 6, NAT2 * 7, NAT2 * 10, NAT2 * 11, NAT2 * 13 NAT2 * 14 establish the phenotype of slow acetylation (8).
Фенотип ацетилирования пациента может быть определен другим известным методом (9). В соответствии с этим методом утром натощак пациенту внутрь дают тестовый препарат, в качестве которого используют сульфадимезин в дозе 7 мг/кг массы тела или кофеин в дозе 4 мг/кг массы тела и определяют его количество через 6 часов в моче. При этом устанавливают фенотип быстрого ацетилирования при степени ацетилирования тестового препарата 70-100%, а фенотип медленного ацетилирования - при степени ацетилирования менее 70%.The patient acetylation phenotype can be determined by another known method (9). In accordance with this method, in the morning on an empty stomach, the patient is given a test preparation inside, which is used as sulfadimezin at a dose of 7 mg / kg of body weight or caffeine at a dose of 4 mg / kg of body weight and its amount is determined after 6 hours in urine. In this case, the phenotype of rapid acetylation at a degree of acetylation of the test preparation is 70-100%, and the phenotype of slow acetylation at a degree of acetylation of less than 70%.
Согласно заявленному способу в каждом выявленном возрастном интервале прогнозируемых заболеваний оценивают степень тяжести заболеваний для конкретного пациента с учетом прямой зависимости параметров «величина степени ацетилирования - тяжесть заболевания» для быстрых ацетиляторов и обратной зависимости этих параметров для медленных ацетиляторов.According to the claimed method, in each identified age range of predictable diseases, the severity of diseases for a particular patient is estimated taking into account the direct dependence of the parameters “acetylation degree - disease severity” for fast acetylators and the inverse relationship of these parameters for slow acetylators.
Для осуществления прогноза по предлагаемому способу у пациента проводят одну или две медицинские процедуры - взятие пробы мочи после введения тестового препарата либо забор периферической венозной крови для определения его фенотипа ацетилирования.To carry out the forecast for the proposed method, the patient undergoes one or two medical procedures - taking a urine sample after administration of the test drug or taking peripheral venous blood to determine its acetylation phenotype.
Заранее готовят таблицу (1), с помощью которой будет осуществляться прогнозирование. Для составления такой таблицы из статей, обзоров, научных монографий и другой научной литературы выявляют процентное соотношение фенотипов быстрого и медленного ацетилирования среди населения различных стран мира. Такие данные представлены в Таблице 2. Для иллюстрации в таблице 2 приведены сведения о соотношении фенотипов по 56 странам.Table (1) is prepared in advance, with the help of which forecasting will be carried out. To compile such a table from articles, reviews, scientific monographs and other scientific literature, the percentage ratio of phenotypes of fast and slow acetylation among the population of different countries of the world is revealed. Such data are presented in Table 2. For illustration, table 2 shows the phenotype ratio for 56 countries.
Для каждой из этих стран по данным Всемирной Организации Здравоохранения (ВОЗ - WHO Statistics) осуществляют поиск коэффициентов заболеваемости и смертности, которые публикуются каждый год, с указанием пола и возрастной группы, отдельно по каждому генетически детерминированному заболеванию. Все данные по каждому конкретному заболеванию подвергают статистической обработке. Коэффициенты заболеваемости (КЗ) и смертности (КС) приводятся в ВОЗ в виде стандартизированных величин количества заболеваний и смертей на 100 тысяч стандартизированного по возрастным группам населения. Отдельно приводятся данные для мужчин и женщин. При этом данные ВОЗ представлены для следующих возрастных интервалов (годы): - до 1, 1-4, 5-14, 15-24, 25-34, 45-54, 55-64, 65-74, 75 и старше.According to the World Health Organization ( WHO Statistics ), for each of these countries, they search for morbidity and mortality rates, which are published every year, indicating sex and age group, separately for each genetically determined disease. All data for each specific disease is subjected to statistical processing. The rates of morbidity (CV) and mortality (COP) are given in WHO in the form of standardized values of the number of diseases and deaths per 100 thousand standardized by age groups of the population. Separate data are provided for men and women. Moreover, WHO data are presented for the following age intervals (years): - up to 1, 1-4, 5-14, 15-24, 25-34, 45-54, 55-64, 65-74, 75 and older.
Например, по Японии за 1997 год представлены следующие данные ВОЗ для первичного рака печени:For example, in Japan for 1997, the following WHO data for primary liver cancer are presented:
Для Финляндии те же данные за 1997 год имеют следующее значение:For Finland, the same data for 1997 have the following meaning:
Таким же образом выявляются сведения о других заболеваниях. Для расчета среднегодовых значений коэффициентов показателей КЗ и КС используют массив данных по каждой стране за 10-20 лет. В результате для составления таблицы используется очень большой массив данных, включающих сведения мировой статистики по КЗ и КС по всем заболеваниям отдельно для мужчин и женщин в указанных возрастных интервалах для различных стран мира и данные по тем же странам о частоте встречаемости фенотипов быстрого и медленного ацетилирования. Используя массив этих данных и известный математический метод статистической обработки данных, вычисляют два вида коэффициентов корреляции: «а» - между частотой встречаемости каждого из двух фенотипов и коэффициентами заболеваемости прогнозируемым заболеванием и «b» - между частотой встречаемости тех же фенотипов и коэффициентами смертности от прогнозируемых заболеваний.In the same way, information about other diseases is revealed. To calculate the average annual values of the coefficients of the indicators KZ and KS use an array of data for each country for 10-20 years. As a result, a very large data set is used to compile the table, including world statistics on KZ and CS for all diseases separately for men and women in the indicated age ranges for different countries of the world and data on the same countries on the frequency of occurrence of phenotypes of fast and slow acetylation. Using an array of these data and the well-known mathematical method of statistical data processing, two types of correlation coefficients are calculated: “a” - between the frequency of occurrence of each of the two phenotypes and incidence rates of the predicted disease and “b” - between the frequency of occurrence of the same phenotypes and mortality rates from the predicted diseases.
Составив такую таблицу, осуществлять прогнозирование по предлагаемому способу не представляет особой сложности для специалиста. Для прогноза каждого заболевания в таблице достаточно найти пол пациента. Затем проследить за знаками и значениями коэффициентов корреляции «а» и «b» в различных возрастных интервалах, представленных для данного заболевания, которые соответствуют полу пациента. Кроме того, необходимо обратить внимание на достоверность величин коэффициентов «а» и «b», т.е. на значения р, приведенные в таблице 1. В том случае, если р менее или равно 0,05, то величины «а» и «b» являются достоверными показателями и могут быть использованы для прогноза степени риска заболеваний и летального исхода от них. Если р более 0,05, прогноз в данном возрастном интервале не проводится.Having compiled such a table, forecasting by the proposed method is not particularly difficult for a specialist. To predict each disease in the table, it is enough to find the patient's gender. Then follow the signs and values of the correlation coefficients “a” and “b” in the various age ranges presented for this disease, which correspond to the patient’s gender. In addition, it is necessary to pay attention to the reliability of the values of the coefficients “a” and “b”, i.e. by the p values shown in table 1. In the event that p is less than or equal to 0.05, then the values of “a” and “b” are reliable indicators and can be used to predict the degree of risk of disease and death from them. If p is more than 0.05, the forecast in this age range is not carried out.
Значения коэффициентов «а» и «b» находятся в диапазоне от -1 до +1. Как указано выше, знак этих коэффициентов - или + важен для прогноза. Для фенотипа быстрого ацетилирования знак + у коэффициентов «а» и «b» указывает на наличие предрасположенности к прогнозируемому заболеванию, а знак - указывает на отсутствие предрасположенности у этого фенотипа. Для фенотипа медленного ацетилирования, наоборот, о предрасположенности к заболеванию свидетельствует знак - у коэффициентов «а» и «b», а знак + свидетельствует об отсутствии предрасположенности к данному заболеванию.The values of the coefficients "a" and "b" are in the range from -1 to +1. As indicated above, the sign of these coefficients - or + is important for prediction. For the rapid acetylation phenotype, the + sign of the coefficients “a” and “b” indicates a predisposition to the predicted disease, and the sign indicates the absence of a predisposition to this phenotype. For the slow acetylation phenotype, on the contrary, the predisposition to the disease is indicated by the sign - at the coefficients “a” and “b”, and the + sign indicates the lack of predisposition to this disease.
При необходимости может быть проведена оценка степени тяжести прогнозируемого заболевания в выявленных возрастных интервалах риска заболевания. Это можно осуществить, учитывая фенотип пациента и конкретные данные по степени ацетилирования тестового препарата в %, полученные при установлении его фенотипа. В том случае, если пациент быстрый ацетилятор, оценка степени тяжести заболевания делается прямо пропорционально степени ацетилирования. Для медленных ацетиляторов оценка степени тяжести заболевания делается обратно пропорционально степени ацетилирования.If necessary, an assessment can be made of the severity of the predicted disease in the identified age-related intervals for the risk of the disease. This can be done taking into account the phenotype of the patient and specific data on the degree of acetylation of the test drug in%, obtained when establishing its phenotype. In the event that the patient is a fast acetylator, the assessment of the severity of the disease is made directly proportional to the degree of acetylation. For slow acetylators, the severity of the disease is assessed inversely with the degree of acetylation.
Достоверность предлагаемого способа прогнозирования была подтверждена на больных, находящихся на лечении в условиях стационара. При этом у больных с различными диагнозами, установленными на основании всестороннего обследования, брали кровь или мочу для установления фенотипа ацетилирования по методам, описанным выше. Затем осуществляли прогнозирование того же заболевания по таблице 1. Для этого в таблице находили такое же заболевание и смотрели знаки для пола пациента у коэффициентов «а» и «b». На основании знаков, стоящих перед коэффициентами «а» и «b», делали вывод о наличии или отсутствии прогнозируемого заболевания. В том случае, если знак свидетельствовал о предрасположенности к прогнозируемому заболеванию, анализировали значения коэффициентов «а» и «b» и их достоверность (р). По величине достоверных коэффициентов «а» и «b» устанавливали степень риска прогнозируемого заболевания в возрастном интервале пациента. После этого осуществляли оценку степени тяжести заболевания с учетом вышеизложенных закономерностей.The reliability of the proposed forecasting method was confirmed for patients being treated in a hospital. Moreover, blood or urine was taken from patients with various diagnoses established on the basis of a comprehensive examination to establish the acetylation phenotype according to the methods described above. Then, the same disease was predicted according to Table 1. For this, the same disease was found in the table and signs for the patient's gender were looked at the coefficients “a” and “b”. Based on the signs facing the coefficients “a” and “b”, a conclusion was made about the presence or absence of a predictable disease. In the event that the sign indicated a predisposition to the predicted disease, the values of the coefficients “a” and “b” and their reliability (p) were analyzed. By the value of the reliable coefficients “a” and “b”, the degree of risk of the predicted disease in the patient's age range was established. After that, the severity of the disease was assessed taking into account the above patterns.
Помимо этого у пациента делали прогноз относительно риска других заболеваний с оценкой степени их тяжести, в том числе, которые прогнозировали предлагаемым способом для более раннего возраста пациента. Эти сведения сопоставляли с данными, содержащимися в истории болезни пациента.In addition, the patient made a forecast regarding the risk of other diseases with an assessment of their severity, including those that were predicted by the proposed method for an earlier age of the patient. This information was compared with the data contained in the patient's medical history.
Такие прогнозы были сделаны на репрезентативной группе больных (400 человек), для которых были установлены различные заболевания после их всестороннего обследования в стационаре.Such predictions were made on a representative group of patients (400 people) for whom various diseases were established after a comprehensive examination in a hospital.
Во всех случаях прогнозы, сделанные предлагаемым способом, совпадали с диагнозами, поставленными на основании данных медицинского обследования больных.In all cases, the forecasts made by the proposed method coincided with the diagnoses made on the basis of data from a medical examination of patients.
Поскольку ацетиляторный фенотип генетически детерминирован и стабилен на протяжении всей жизни человека, предлагаемый способ позволяет прогнозировать заболевания до появления клинических симптомов этих заболеваний. При этом фенотип ацетилирования может быть определен уже в раннем возрасте (до 1 года) и занесен в медицинскую карту пациента для использования этой информации на протяжении всей его жизни.Since the acetylator phenotype is genetically determined and stable throughout a person’s life, the proposed method allows predicting diseases before the onset of clinical symptoms of these diseases. Moreover, the acetylation phenotype can be determined already at an early age (up to 1 year) and entered into the patient’s medical record to use this information throughout his life.
Таким образом, предлагаемый способ позволяет своевременно проводить профилактику прогнозируемых заболеваний.Thus, the proposed method allows the timely prevention of predictable diseases.
Кроме того, способ позволяет проводить медико-генетическое консультирование, давать диетические и фармакологические рекомендации, советы по образу жизни и трудоустройству. Это невозможно осуществлять известными способами прогнозирования, позволяющими установить диагноз на ранних стадиях развития болезни, когда профилактические мероприятия уже бесполезны.In addition, the method allows for medical and genetic counseling, give dietary and pharmacological recommendations, advice on lifestyle and employment. This cannot be done by known forecasting methods, which make it possible to establish a diagnosis in the early stages of the development of the disease, when preventive measures are already useless.
Изобретение поясняется примерами.The invention is illustrated by examples.
Пример 1. Первичный рак печени.Example 1. Primary liver cancer.
Больной Г. 68 лет обратился с жалобами на слабость, чувство тяжести справа, периодическое повышение температуры тела, потерю аппетита, веса, тошноту и рвоту, чувство тяжести и постоянные боли в правом подреберье, прогрессирующее ухудшение состояния. При обследовании больного обнаружено: печень увеличена в размерах, болезненна, плотная, бугристая, ее нижний край выходит из подреберья. Лабораторные исследования обнаружили гипохромную анемию, лейкоцитоз, ускорение СОЭ, увеличение активности трансаминаз и щелочной фосфатазы. При всестороннем обследовании больного установлен диагноз - первичный рак печени.A 68-year-old patient G. complained of weakness, a feeling of heaviness on the right, a periodic increase in body temperature, loss of appetite, weight, nausea and vomiting, a feeling of heaviness and constant pain in the right hypochondrium, progressive deterioration. An examination of the patient revealed: the liver is enlarged, painful, dense, bumpy, its lower edge comes out of the hypochondrium. Laboratory studies found hypochromic anemia, leukocytosis, accelerated ESR, increased activity of transaminases and alkaline phosphatase. A comprehensive examination of the patient established the diagnosis of primary liver cancer.
Больному утром натощак был введен тестовый препарат сульфадимезин в дозе 7 мг/кг веса тела. Через 6 часов после приема препарата у больного была взята проба мочи и сделан ее анализ на содержание в ней сульфадимезина. Количество сульфадимезина в моче составило 15%. Следовательно, 85% тестового препарата было проацетилировано. По этому показателю больной был отнесен к быстрым ацетиляторам.A test drug sulfadimesin was administered to a patient on an empty stomach in a dose of 7 mg / kg body weight. 6 hours after taking the drug, a urine sample was taken from the patient and its analysis was made for the content of sulfadimezin in it. The amount of sulfadimesin in the urine was 15%. Consequently, 85% of the test preparation was acetylated. By this indicator, the patient was assigned to fast acetylators.
Кроме того, установленный фенотип пациента был подтвержден с помощью определения генотипа ацетилирования. Для определения генотипа ацетилирования взята кровь из вены для выделения ДНК из лимфоцитов. С помощью ПЦР-реакции был определен генотип больного - NAT2*4/NAT2*4, определяющий фенотип быстрого ацетилирования.In addition, the established phenotype of the patient was confirmed by determining the acetylation genotype. To determine the acetylation genotype, blood was taken from a vein to isolate DNA from lymphocytes. Using the PCR reaction, the patient's genotype was determined - NAT2 * 4 / NAT2 * 4, which determines the phenotype of rapid acetylation.
В таблице 1 находят заболевание: первичный рак печени у мужчин (М) и смотрят на знаки, стоящие перед коэффициентами корреляции «а» и «b». Из таблицы видно, что коэффициенты «а» и «b» во всех возрастных интервалах имеют положительную величину. Поскольку пациент Г. является быстрым ацетилятором, то знак + у коэффициентов «а» и «b» свидетельствует о предрасположенности этого пациента к данному заболеванию. Анализируют значимость приведенных коэффициентов корреляции во всех возрастных интервалах. Видно, что значения коэффициентов достоверны, так как р имеет значения менее 0,05. Следовательно, прогноз по данному заболеванию для данного пациента может быть сделан по всем возрастным интервалам, приведенным в таблице. Риск данного заболевания у пациента Г. существовал во всех возрастных интервалах. Пациенту Г. в момент прогнозирования 68 лет, он относится к возрастному интервалу 65-74 года. В этом интервале коэффициенты «а» и «b» имеют значения +0,75, что свидетельствует о высокой степени риска заболевания первичным раком печени.In table 1, find the disease: primary liver cancer in men (M) and look at the signs in front of the correlation coefficients "a" and "b". The table shows that the coefficients "a" and "b" in all age intervals have a positive value. Since patient G. is a fast acetylator, the + sign of the coefficients “a” and “b” indicates that this patient is predisposed to this disease. Analyze the significance of the given correlation coefficients in all age intervals. It can be seen that the values of the coefficients are reliable, since p has values less than 0.05. Therefore, the prognosis for this disease for a given patient can be made for all age intervals shown in the table. The risk of this disease in patient G. existed at all age intervals. Patient G. at the time of prediction of 68 years, it refers to the age range of 65-74 years. In this interval, the coefficients “a” and “b” have values of +0.75, which indicates a high degree of risk of primary liver cancer.
Оценку степени тяжести течения заболевания у пациента Г. проводят с учетом прямой зависимости параметров «величина степени ацетилирования - тяжесть заболевания», т.е. степень тяжести возрастает с увеличением степени ацетилирования.Assessment of the severity of the course of the disease in patient G. is carried out taking into account the direct dependence of the parameters "the value of the degree of acetylation - the severity of the disease", i.e. severity increases with increasing degree of acetylation.
Из таблицы видно, что для пациента Г. в возрасте 68 лет (степень ацетилирования 85%) характерна средняя степень тяжести течения заболевания первичным раком печени. Это соответствует клиническим симптомам и данным лабораторного обследования этого пациента.The table shows that for patient G. at the age of 68 years (degree of acetylation of 85%), the average severity of the course of the disease with primary liver cancer is characteristic. This is consistent with the clinical symptoms and laboratory findings of this patient.
Кроме того, для иллюстрации изобретения для этого пациента было проведено прогнозирование по другим заболеваниям, в соответствии с предложенным способом по таблице 1, по флебиту, атеросклерозу и цереброваскулярным патологиям.In addition, to illustrate the invention for this patient, prediction was carried out for other diseases, in accordance with the proposed method according to table 1, for phlebitis, atherosclerosis and cerebrovascular pathologies.
Из таблицы 1 видно, что достоверные величины коэффициентов «а» и «b» при флебитах и атеросклерозе имеют отрицательный знак. Это означает, что у пациента Г. предрасположенности к флебитам и атеросклерозу нет, что и подтверждается историей болезни, в которой отсутствуют сведения о данных заболеваниях.From table 1 it is seen that the reliable values of the coefficients "a" and "b" with phlebitis and atherosclerosis have a negative sign. This means that patient G. has no predisposition to phlebitis and atherosclerosis, which is confirmed by the history of the disease, in which there is no information about these diseases.
В отношении предрасположенности к заболеваемости и смертности от цереброваскулярных патологий из данных, представленных в таблице 1, видно следующее. Коэффициенты корреляции «а» и «b» имеют положительный знак и высокие достоверные значения от 0 до 64 лет, что свидетельствует о большой предрасположенности к этому заболеванию данного пациента. В возрастной группе от 65 до 74 лет прогноз невозможен, так как значения коэффициентов «а» и «b» недостоверны.Regarding the predisposition to morbidity and mortality from cerebrovascular pathologies from the data presented in table 1, the following can be seen. The correlation coefficients "a" and "b" have a positive sign and high reliable values from 0 to 64 years, which indicates a great predisposition to this disease in this patient. In the age group from 65 to 74 years, a forecast is impossible, since the values of the coefficients “a” and “b” are unreliable.
Из данных анамнеза выяснено, что пациент Г. в возрасте 50-52 лет обращался с жалобами на головные боли, головокружения, частичную потерю зрения, периодические повышения артериального давления, что подтверждается предлагаемым способом.From the data of the anamnesis it was found that patient G. aged 50-52 years complained of headaches, dizziness, partial loss of vision, periodic increase in blood pressure, which is confirmed by the proposed method.
Оценку степени тяжести течения заболевания цереброваскулярными патологиями пациента Г. проводят с учетом прямой зависимости параметров «величина степени ацетилирования - тяжесть заболевания», т.е. степень тяжести возрастает с увеличением степени ацетилирования.Assessment of the severity of the course of the disease with cerebrovascular pathologies of patient G. is carried out taking into account the direct dependence of the parameters "the degree of acetylation - the severity of the disease", i.e. severity increases with increasing degree of acetylation.
Из таблицы видно, что для пациента Г. в возрасте 68 лет (степень ацетилирования 85%) характерна средняя степень тяжести течения заболевания. Это соответствует данным анамнеза и клиническим симптомам этого пациента.The table shows that for patient G. at the age of 68 years (the degree of acetylation of 85%), the average severity of the course of the disease is characteristic. This is consistent with the history and clinical symptoms of this patient.
+++ - тяжелая степень.Note: + - mild severity; ++ - moderate severity;
+++ - severe.
Пример 2. Первичный рак печени.Example 2. Primary liver cancer.
Больная А. 47 лет обратилась с жалобами на прогрессирующую слабость, адинамию, потерю аппетита, веса, частую тошноту и рвоту, лихорадку, чувство тяжести и постоянные боли в правом подреберье, прогрессирующее ухудшение состояния. При обследовании больной обнаружено: печень увеличена в размерах, ее нижний край определяется на уровне пупка, при пальпации она болезненна, плотная, бугристая. Лабораторные исследования обнаружили гипохромную анемию, лейкоцитоз, ускорение СОЭ, увеличение активности трансаминаз и щелочной фосфатазы. С помощью прицельной биопсии печени установлено наличие в паренхиме печени опухолевых клеток. На основании клинических, биохимических и гистологических исследований поставлен диагноз первичный рак печени.Patient A., 47 years old, complained of progressive weakness, adynamia, loss of appetite, weight, frequent nausea and vomiting, fever, feeling of heaviness and constant pain in the right hypochondrium, progressive worsening of the condition. An examination of the patient revealed: the liver is enlarged, its lower edge is determined at the level of the navel, on palpation it is painful, dense, bumpy. Laboratory studies found hypochromic anemia, leukocytosis, accelerated ESR, increased activity of transaminases and alkaline phosphatase. Using targeted biopsy of the liver, the presence of tumor cells in the liver parenchyma was established. Based on clinical, biochemical and histological studies, a diagnosis of primary liver cancer was made.
Больной А. утром натощак был введен тестовый препарат сульфадимезин в дозе 7 мг/кг веса тела. Через 6 часов после приема препарата у больной была взята проба мочи и сделан ее анализ на содержание в ней сульфадимезина. Количество сульфадимезина в моче составило 22%. Следовательно, 78% тестового препарата было проацетилировано. По этому показателю больная была отнесена к быстрым ацетиляторам.Patient A. in the morning on an empty stomach was administered a test drug sulfadimezin at a dose of 7 mg / kg body weight. 6 hours after taking the drug, a urine sample was taken from the patient and her analysis was made for the content of sulfadimezin in it. The amount of sulfadimesin in the urine was 22%. Therefore, 78% of the test drug was acetylated. By this indicator, the patient was assigned to fast acetylators.
Кроме того, установленный фенотип пациентки был подтвержден с помощью определения генотипа ацетилирования. Для определения генотипа ацетилирования взята кровь из вены для выделения ДНК из лимфоцитов. По ПЦР-реакции определили генотип пациентки - NAT2*4/NAT2*12A, определяющий быстрый фенотип.In addition, the patient's established phenotype was confirmed by determining the acetylation genotype. To determine the acetylation genotype, blood was taken from a vein to isolate DNA from lymphocytes. According to the PCR reaction, the patient's genotype was determined - NAT2 * 4 / NAT2 * 12A, which determines the fast phenotype.
В таблице 1 находят заболевание: первичный рак печени у женщин (Ж) и смотрят на знаки, стоящие перед коэффициентами корреляции «а» и «b». Из таблицы видно, что коэффициенты «а» и «b» во всех возрастных интервалах имеют положительную величину. Поскольку пациентка А. является быстрым ацетилятором, то знак + у коэффициентов «а» и «b» свидетельствует о предрасположенности этой пациентки к данному заболеванию. Анализируют достоверность приведенных коэффициентов корреляции во всех возрастных интервалах. Видно, что значения коэффициентов достоверны, так как р менее или равно 0,05. Следовательно, прогноз по данному заболеванию для данной пациентки может быть сделан по всем возрастным интервалам, приведенным в таблице. Риск данного заболевания у пациентки А. существовал во всех возрастных интервалах. Пациентке А. в момент прогнозирования 47 лет, она относится к возрастному интервалу 45-54 года. В этом интервале коэффициенты «а» и «b» имеют значения +0,56 и +0,57, соответственно, что свидетельствует о высокой степени риска у нее заболевания первичным раком печени. Оценку степени тяжести течения заболевания у пациентки А. проводят с учетом прямой зависимости параметров «величина степени ацетилирования - тяжесть заболевания», т.е. степень тяжести возрастает с увеличением степени ацетилирования.In table 1, find the disease: primary liver cancer in women (G) and look at the signs facing the correlation coefficients "a" and "b". The table shows that the coefficients "a" and "b" in all age intervals have a positive value. As patient A. is a fast acetylator, the + sign of the coefficients “a” and “b” indicates that this patient is predisposed to this disease. The reliability of the given correlation coefficients in all age intervals is analyzed. It can be seen that the values of the coefficients are reliable, since p is less than or equal to 0.05. Therefore, the prognosis for this disease for this patient can be made for all age intervals listed in the table. The risk of this disease in patient A. existed at all age intervals. Patient A. at the time of prediction of 47 years, she refers to the age interval of 45-54 years. In this interval, the coefficients “a” and “b” have values of +0.56 and +0.57, respectively, which indicates a high degree of risk for her disease of primary liver cancer. Assessment of the severity of the course of the disease in patient A. is carried out taking into account the direct dependence of the parameters "the value of the degree of acetylation - the severity of the disease" severity increases with increasing degree of acetylation.
Из таблицы видно, что для пациентки А. в возрасте 47 лет (степень ацетилирования 78%) характерно течение заболевания первичным раком печени от легкой до средней тяжести, о чем свидетельствуют ее данные анамнеза.The table shows that for the patient A. at the age of 47 years (the degree of acetylation of 78%), the course of the disease is characterized by mild to moderate primary liver cancer, as evidenced by her medical history.
Кроме того, для иллюстрации изобретения для этой пациентки было проведено прогнозирование по другим заболеваниям в соответствии с предложенным способом по таблице 1, по флебиту, атеросклерозу и цереброваскулярным патологиям.In addition, to illustrate the invention for this patient, forecasting for other diseases was carried out in accordance with the proposed method according to table 1, for phlebitis, atherosclerosis and cerebrovascular pathologies.
Из таблицы 1 видно, что у женщин достоверные величины коэффициентов «а» и «b» при флебитах и атеросклерозе имеют отрицательный знак. Это означает, что у пациентки А. предрасположенности к флебитам и атеросклерозу нет, что и подтверждается историей болезни, в которой отсутствуют сведения о данных заболеваниях.Table 1 shows that in women, the reliable values of the coefficients “a” and “b” for phlebitis and atherosclerosis have a negative sign. This means that patient A. has no predisposition to phlebitis and atherosclerosis, which is confirmed by the history of the disease, in which there is no information about these diseases.
В отношении предрасположенности к заболеваемости и смертности от цереброваскулярных патологий из данных, представленных в таблице 1, видно следующее. Коэффициенты корреляции «а» и «b» имеют положительный знак и высокие достоверные значения от 0 до 64 лет, что свидетельствует о большой предрасположенности к этому заболеванию данной пациентки. В возрастной группе от 65 до 74 лет прогноз невозможен, так как значения коэффициентов «а» и «b» недостоверны.Regarding the predisposition to morbidity and mortality from cerebrovascular pathologies from the data presented in table 1, the following can be seen. The correlation coefficients "a" and "b" have a positive sign and high reliable values from 0 to 64 years, which indicates a great predisposition to this disease of this patient. In the age group from 65 to 74 years, a forecast is impossible, since the values of the coefficients “a” and “b” are unreliable.
Из данных анамнеза выяснено, что пациентка А. в возрасте 40 лет обращалась с жалобами на головные боли, спазмы сосудов, головокружения, периодические повышения артериального давления, которые у нее есть и в настоящее время, что свидетельствует о ее предрасположенности к цереброваскулярным патологиям.From the anamnesis data, it was found that patient A., aged 40, complained of headaches, vasospasms, dizziness, periodic increase in blood pressure, which she still has at present, which indicates her predisposition to cerebrovascular pathologies.
Степень тяжести заболевания пациентки А. с учетом прямой зависимости параметра «степень ацетилирования - тяжесть заболевания» оценивают по таблице. The severity of the disease of patient A., taking into account the direct dependence of the parameter “degree of acetylation - disease severity”, is estimated according to the table.
Из таблицы видно, что для пациентки А. в возрасте 47 лет (степень ацетилирования 78%) может быть характерно течение заболевания цереброваскулярными патологиями от легкой до средней тяжести, о чем свидетельствуют данные ее анамнеза.The table shows that patient A. aged 47 years (degree of acetylation 78%) may be characterized by a mild to moderate cerebrovascular pathology, as evidenced by her medical history.
Пример 3. Флебиты.Example 3. Phlebitis.
Больной К. 45 лет обратился с жалобами на косметический дефект ног, появление на нижних конечностях плотных тяжей красного цвета, теплых на ощупь, болезненных при пальпации или спонтанно, повышение температуры кожных покровов, разлитые боли, чувство тяжести и распирания, ночные судороги ног, отеки. Больной часто ощущает общую слабость. При осмотре определяется покраснение и небольшая отечность по ходу пораженного участка вены. При пальпации определяется болезненное уплотнение в форме четок. Общий анализ крови показал небольшой лейкоцитоз с нейтрофильным сдвигом влево и ускорение СОЭ. При осмотре больного К. выявлено варикозное расширение большой подкожной вены и ее ветвей. Больному была проведена ангиография. Диагноз: стволовый лимфангит. Показано хирургическое лечение.A 45-year-old patient K. complained of a cosmetic defect in his legs, the appearance of dense red cords on the lower extremities, warm to the touch, painful on palpation or spontaneously, fever of the skin, diffuse pain, a feeling of heaviness and bursting, night leg cramps, swelling . The patient often feels general weakness. On examination, redness and slight swelling are determined along the affected area of the vein. On palpation, a painful seal in the form of a rosary is determined. A general blood test showed a slight leukocytosis with a neutrophilic left shift and an acceleration of ESR. On examination of patient K., varicose dilatation of the great saphenous vein and its branches was revealed. The patient was performed angiography. Diagnosis: stem lymphangitis. Surgical treatment is indicated.
Больному К. утром натощак был введен тестовый препарат сульфадимезин в дозе 7 мг на кг веса тела. Через 6 часов после приема препарата у больного была взята проба мочи и сделан анализ на содержание в ней сульфадимезина. Количество сульфадимезина в моче составило 72%. Следовательно, 28% тестового препарата было проацетилировано. По этому показателю больной был отнесен к медленным ацетиляторам.Patient K. in the morning on an empty stomach was given a test drug sulfadimezin at a dose of 7 mg per kg of body weight. 6 hours after taking the drug, a urine sample was taken from the patient and an analysis was made for the content of sulfadimezin in it. The amount of sulfadimesin in the urine was 72%. Therefore, 28% of the test drug was acetylated. By this indicator, the patient was assigned to slow acetylators.
Кроме того, установленный фенотип пациента был подтвержден с помощью определения генотипа ацетилирования. Для определения генотипа ацетилирования взята кровь из вены для выделения ДНК из лимфоцитов. С помощью ПЦР-реакции был определен генотип больного - NAT2*7/NAT2*10, определяющий фенотип медленного ацетилирования.In addition, the established phenotype of the patient was confirmed by determining the acetylation genotype. To determine the acetylation genotype, blood was taken from a vein to isolate DNA from lymphocytes. Using the PCR reaction, the patient's genotype was determined - NAT2 * 7 / NAT2 * 10, which determines the phenotype of slow acetylation.
В таблице 1 находят заболевание флебитами у мужчин (М) и смотрят на знаки, стоящие перед коэффициентами корреляции «а» и «b». Из таблицы видно, что коэффициенты «а» и «b» в возрастных интервалах с 15 до 75+ имеют отрицательную величину в этих возрастных интервалах. Поскольку пациент К. является медленным ацетилятором, то отрицательный знак у коэффициентов «а» и «b» свидетельствует о предрасположенности этого пациента к данному заболеванию в возрастных интервалах с 15 до 75+. Пациенту К. в момент прогнозирования 45 лет, он относится к возрастному интервалу 45-54 года. В этом интервале коэффициенты «а» и «b» имеют значения -0,58 и -0,54, соответственно, что свидетельствует о высокой степени риска заболевания флебитами в этих возрастных интервалах. Анализируют достоверность значений приведенных коэффициентов корреляции в возрастных интервалах 45-54 года. Видно, что значения коэффициентов достоверны, так как р менее или равно 0,05. Следовательно, прогноз степени риска к данному заболеванию для данного пациента может быть сделан в возрастных интервалах 45-54 года.Table 1 shows the phlebitis disease in men (M) and looks at the signs facing the correlation coefficients “a” and “b”. The table shows that the coefficients "a" and "b" in the age ranges from 15 to 75+ have a negative value in these age intervals. Since patient K. is a slow acetylator, the negative sign for the coefficients “a” and “b” indicates that this patient is predisposed to this disease in age ranges from 15 to 75+. Patient K. at the time of prediction of 45 years, he refers to the age interval of 45-54 years. In this interval, the coefficients “a” and “b” have values of -0.58 and -0.54, respectively, which indicates a high degree of risk of phlebitis in these age ranges. The reliability of the values of the correlation coefficients in the age intervals of 45-54 years is analyzed. It can be seen that the values of the coefficients are reliable, since p is less than or equal to 0.05. Therefore, a forecast of the degree of risk to a given disease for a given patient can be made at age intervals of 45-54 years.
Степень тяжести заболевания с учетом обратной зависимости параметра «величина степени ацетилирования - тяжесть заболевания» для медленных ацетиляторов возрастает с уменьшением степени ацетилирования. Степень тяжести заболевания пациента К. оценивают по таблице.The severity of the disease, taking into account the inverse relationship between the parameter “value of the degree of acetylation - severity of the disease” for slow acetylators, increases with decreasing degree of acetylation. The severity of the disease of patient K. is evaluated according to the table.
Из таблицы видно, что для пациента К. в возрасте 45 лет (степень ацетилирования 28%) характерно тяжелое течение заболевания (необходима операция), о чем свидетельствуют и данные его истории болезни.The table shows that patient K. aged 45 years (degree of acetylation 28%) is characterized by a severe course of the disease (surgery is necessary), as evidenced by the data on his medical history.
Кроме того, для иллюстрации изобретения для этого пациента было проведено прогнозирование для других заболеваний: атеросклероза, цереброваскулярных патологий и первичного рака печени, в соответствии с предложенным способом.In addition, to illustrate the invention for this patient, prediction was carried out for other diseases: atherosclerosis, cerebrovascular pathologies and primary liver cancer, in accordance with the proposed method.
Из таблицы 1 видно, что у мужчин достоверные величины коэффициентов «а» и «b» при атеросклерозе имеют отрицательный знак в возрастных интервалах с 45 до 75 лет и старше. Коэффициенты корреляции «а» и «b» в возрастном интервале 45-54 года равны -0,17 и -0,19, соответственно. Это означает, что у пациента К. 45 лет (степень ацетилирования 28%), начиная с 45 лет, имеется предрасположенность к атеросклерозу, которая будет усиливаться с возрастом.From table 1 it can be seen that in men, the reliable values of the coefficients “a” and “b” in atherosclerosis have a negative sign in the age ranges from 45 to 75 years and older. The correlation coefficients "a" and "b" in the age range of 45-54 years are -0.17 and -0.19, respectively. This means that the patient K. is 45 years old (the degree of acetylation is 28%), starting from 45 years old, there is a predisposition to atherosclerosis, which will increase with age.
Степень тяжести заболевания с учетом обратной зависимости параметра «величина степени ацетилирования - тяжесть заболевания» для медленных ацетиляторов возрастает с уменьшением степени ацетилирования Степень тяжести заболевания пациента К. оценивают по таблице.The severity of the disease, taking into account the inverse dependence of the parameter “the value of the degree of acetylation - severity of the disease” for slow acetylators, increases with decreasing degree of acetylation. The severity of the disease of patient K. is estimated according to the table.
Из таблицы видно, что для пациента К. в возрасте 45 лет (степень ацетилирования 28%) может быть характерно тяжелое течение заболевания атеросклерозом.The table shows that for the patient K. at the age of 45 years (degree of acetylation of 28%), a severe course of the disease with atherosclerosis may be characteristic.
В таблице 1 находят заболевание: первичный рак печени у мужчин (М) и смотрят на знаки, стоящие перед коэффициентами корреляции «а» и «b». Из таблицы видно, что коэффициенты «а» и «b» во всех возрастных интервалах имеют положительную величину, что свидетельствует о большой предрасположенности к этому заболеванию быстрых ацетиляторов. Поскольку пациент Г. является медленным ацетилятором, он не имеет предрасположенности к заболеванию первичным раком печени.In table 1, find the disease: primary liver cancer in men (M) and look at the signs in front of the correlation coefficients "a" and "b". The table shows that the coefficients "a" and "b" in all age intervals have a positive value, which indicates a great predisposition to this disease of fast acetylators. Since patient G. is a slow acetylator, he has no predisposition to the disease with primary liver cancer.
В отношении предрасположенности к заболеваемости и смертности от цереброваскулярных патологий из данных, представленных в таблице 1, видно следующее. Коэффициенты корреляции «а» и «b» у мужчин имеют положительный знак и высокие достоверные значения от 0 до 64 лет, что свидетельствует о большой предрасположенности к этому заболеванию быстрых ацетиляторов. Поскольку пациент К. является медленным ацетилятором, он не имеет предрасположенности к этим заболеваниям.Regarding the predisposition to morbidity and mortality from cerebrovascular pathologies from the data presented in table 1, the following can be seen. The correlation coefficients “a” and “b” in men have a positive sign and high reliable values from 0 to 64 years, which indicates a great predisposition to rapid acetylators to this disease. Since patient K. is a slow acetylator, he does not have a predisposition to these diseases.
Источники информацииInformation sources
1. Пат. RU №2161309, кл. G 01 N 33/53, опубл. 27.12.2000, Исследовательский фонд университета ЮТЫ (US) и Мириад Дженетикс. ИНК (US).1. Pat. RU No. 2161309, cl. G 01 N 33/53, publ. 12/27/2000, Utah University Research Foundation (US) and Miriad Genetics. INC (US).
2. Пат. RU №2164419, кл. А 61 К 48/00, опубл. 27.03.2001, Мириад Дженетикс, ИНК (US).2. Pat. RU No. 2164419, class A 61 K 48/00, publ. 03/27/2001, Miriad Genetics, INC (US).
3. WO 02/23187, кл. G 01 N 33/48, опубл. 31.13.2002, UNIV RAMOT (IL) et al.3. WO 02/23187, cl. G 01 N 33/48, publ. 13/31/2002, UNIV RAMOT (IL) et al.
4. WO 2005 04041, кл. C 12 Q 1/37, опубл. 06.05.2005, BAYER HEALTHCARE AG (DE) et al.4. WO 2005 04041, cl. C 12 Q 1/37, publ. 05.06.2005, BAYER HEALTHCARE AG (DE) et al.
5. ДАН, 2001 г., т.377, №1, с.129-131; В.К.Подымов «Красная волчанка». Ереван, 1981, с.220; К.С.Симонян «Спаечная болезнь брюшной полости», М., Медицина, 1966 г.5. DAN, 2001, vol. 377, No. 1, pp. 129-131; V.K. Podymov "Lupus erythematosus". Yerevan, 1981, p. 220; K.S.Simonyan "Adhesive disease of the abdominal cavity", M., Medicine, 1966
6. Иванова В.В. и др. «Вирусно-бактериальные инфекции и их роль в формировании бронхолегочных заболеваний у детей». «Педиатрия», 1992 г., Т.4, №6, с.8-12.6. Ivanova V.V. and others. "Virus-bacterial infections and their role in the formation of bronchopulmonary diseases in children." "Pediatrics", 1992, T. 4, No. 6, p. 8-12.
7. US 20042658 16, кл. C 12 Q 1/68, опубл. 30.12.2004.7. US 20042658 16, cl. C 12 Q 1/68, publ. 12/30/2004.
8. Bratton & Marshall «A method for the determination of acetylator phenotype». «J.Biol. Chem.», 1939. №128, p.537-550.8. Bratton & Marshall "A method for the determination of acetylator phenotype." "J. Biol. Chem. ”, 1939. No. 128, p. 537-550.
9. Wong P., Bachki A., Banerjee K., Leyland-Jones B. «Identification of N-methyl-2-pyridone-5-carboxamide and N-methyl-4-pyridone-5-carboxamide as components in urine extracts of individuals consuming coffee», «J Pharm Biomed Anal», 2002, v.30, №3, p.773-80.9. Wong P., Bachki A., Banerjee K., Leyland-Jones B. “Identification of N-methyl-2-pyridone-5-carboxamide and N-methyl-4-pyridone-5-carboxamide as components in urine extracts of individuals consuming coffee ”, J Pharm Biomed Anal, 2002, v. 30, No. 3, p. 773-80.
10. Hein D.W. «Molecular genetics and function of NAT1 and NAT2: role in aromatic amine metabolism and carcinogenesis», «Mutat. Res.», 2002, v.506-507, p.65-77.10. Hein D.W. "Molecular genetics and function of NAT1 and NAT2: role in aromatic amine metabolism and carcinogenesis", "Mutat. Res. ", 2002, v. 506-507, p. 65-77.
Соотношение фенотипов N-ацетилирования в некоторых этнических популяциях (56 популяций)Table 2.
The ratio of phenotypes of N-acetylation in some ethnic populations (56 populations)
Claims (6)
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2006101827/15A RU2293990C1 (en) | 2006-01-24 | 2006-01-24 | Method for predicting genetically deterministic human diseases |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2006101827/15A RU2293990C1 (en) | 2006-01-24 | 2006-01-24 | Method for predicting genetically deterministic human diseases |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2293990C1 true RU2293990C1 (en) | 2007-02-20 |
Family
ID=37863524
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2006101827/15A RU2293990C1 (en) | 2006-01-24 | 2006-01-24 | Method for predicting genetically deterministic human diseases |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2293990C1 (en) |
Citations (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2096782C1 (en) * | 1996-05-23 | 1997-11-20 | Сапоровский Станислав Сергеевич | Method for detecting predisposition to progressive myopia in children |
| RU2161309C2 (en) * | 1994-03-18 | 2000-12-27 | Исследовательский Фонд Университета Юты, | Mutations of mts gene in embryonic line and method of detection of predisposition to malignant tumors |
| WO2002023187A2 (en) * | 2000-09-12 | 2002-03-21 | Ramot At Tel Aviv University Ltd. | Facile detection of cancer and cancer risk based on level of coordination between alleles |
| RU2192639C1 (en) * | 2001-04-05 | 2002-11-10 | Дальневосточный государственный медицинский университет | Method for predicting disorders in postmenopausal period |
| WO2005040411A1 (en) * | 2003-10-17 | 2005-05-06 | Bayer Healthcare Ag | Diagnostics and therapeutics for diseases associated with n-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 1 (naaladase-like1) |
-
2006
- 2006-01-24 RU RU2006101827/15A patent/RU2293990C1/en not_active IP Right Cessation
Patent Citations (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2161309C2 (en) * | 1994-03-18 | 2000-12-27 | Исследовательский Фонд Университета Юты, | Mutations of mts gene in embryonic line and method of detection of predisposition to malignant tumors |
| RU2096782C1 (en) * | 1996-05-23 | 1997-11-20 | Сапоровский Станислав Сергеевич | Method for detecting predisposition to progressive myopia in children |
| WO2002023187A2 (en) * | 2000-09-12 | 2002-03-21 | Ramot At Tel Aviv University Ltd. | Facile detection of cancer and cancer risk based on level of coordination between alleles |
| RU2192639C1 (en) * | 2001-04-05 | 2002-11-10 | Дальневосточный государственный медицинский университет | Method for predicting disorders in postmenopausal period |
| WO2005040411A1 (en) * | 2003-10-17 | 2005-05-06 | Bayer Healthcare Ag | Diagnostics and therapeutics for diseases associated with n-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 1 (naaladase-like1) |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Romdhane et al. | Consanguinity and inbreeding in health and disease in North African populations | |
| Bates et al. | Huntington disease | |
| Duong Van Huyen et al. | MicroRNAs as non-invasive biomarkers of heart transplant rejection | |
| Saenz et al. | LGMD2A: genotype–phenotype correlations based on a large mutational survey on the calpain 3 gene | |
| Duquette et al. | Mutations in senataxin responsible for Quebec cluster of ataxia with neuropathy | |
| Ge et al. | Prioritization of drug targets for neurodegenerative diseases by integrating genetic and proteomic data from brain and blood | |
| Baudrand et al. | A prevalent caveolin-1 gene variant is associated with the metabolic syndrome in Caucasians and Hispanics | |
| Marano et al. | Neurosyphilis with complex partial status epilepticus and mesiotemporal MRI abnormalities mimicking herpes simplex encephalitis | |
| Carlos Poston et al. | Genetic bottlenecks, perceived racism, and hypertension risk among African Americans and first-generation African immigrants | |
| Ong et al. | Association of grip strength, upper arm circumference, and waist circumference with dementia in older adults of the wise study: A cross-sectional analysis | |
| Bahadır et al. | Does the MTHFR C677T gene polymorphism indicate cardiovascular disease risk in type 2 diabetes mellitus patients? | |
| Rossi et al. | Clinical relevance of clonal hematopoiesis in the oldest-old population | |
| US20230332234A1 (en) | Reagents, methods and kits for identifying pregnant human beings at risk for placental bed disorder(s) | |
| Chen et al. | Peripheral blood transcriptome sequencing reveals rejection-relevant genes in long-term heart transplantation | |
| RU2293990C1 (en) | Method for predicting genetically deterministic human diseases | |
| RU2293991C1 (en) | Method for predicting genetically deterministic human diseases | |
| El Nashar et al. | Genetic, dietary, and non-dietary risk factors of obesity among preparatory-year female students at Taibah University, Saudi Arabia | |
| RU2293992C1 (en) | Method for predicting genetically deterministic human diseases | |
| Mezzavilla et al. | Insight into genetic determinants of resting heart rate | |
| García-González et al. | Epistasis analysis of metabolic genes polymorphisms associated with ischemic heart disease in Yucatan | |
| Wight et al. | Chromosome loci vary by juvenile myoclonic epilepsy subsyndromes: linkage and haplotype analysis applied to epilepsy and EEG 3.5–6.0 Hz polyspike waves | |
| KR101954186B1 (en) | Methods for predicting psychiatric adverse events of perampanel | |
| US20210181188A1 (en) | Mhc-ii genotype restricts the oncogenic mutational landscape | |
| Yakushiji et al. | Hereditary angioedema with recurrent abdominal pain in a patient with a novel mutation | |
| EP1368651A2 (en) | Methods and material for evaluating cardiovascular conditions |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20130125 |