[go: up one dir, main page]

RU2172346C2 - Method of synthesis of polypeptide eliciting antigenic activity of hepatitis e virus and set for assay of antibody raised to hepatitis e pathogen - Google Patents

Method of synthesis of polypeptide eliciting antigenic activity of hepatitis e virus and set for assay of antibody raised to hepatitis e pathogen

Info

Publication number
RU2172346C2
RU2172346C2 RU98119633/13A RU98119633A RU2172346C2 RU 2172346 C2 RU2172346 C2 RU 2172346C2 RU 98119633/13 A RU98119633/13 A RU 98119633/13A RU 98119633 A RU98119633 A RU 98119633A RU 2172346 C2 RU2172346 C2 RU 2172346C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
hepatitis
dna
virus
fragment
open reading
Prior art date
Application number
RU98119633/13A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU98119633A (en
Inventor
Г.И. Алаторцева
В.А. Гольцов
А.А. Гринев
В.В. Зверев
Л.Л. Суханова
А.В. Титаев
Original Assignee
Закрытое акционерное общество Биотехнологическая компания "БИОСЕРВИС"
Filing date
Publication date
Application filed by Закрытое акционерное общество Биотехнологическая компания "БИОСЕРВИС" filed Critical Закрытое акционерное общество Биотехнологическая компания "БИОСЕРВИС"
Publication of RU98119633A publication Critical patent/RU98119633A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2172346C2 publication Critical patent/RU2172346C2/en

Links

Images

Abstract

FIELD: medicine, molecular biology, genetic engineering of proteins. SUBSTANCE: invention proposes a method for preparing recombinant polypeptides for their using in set for assay of antibodies raised to hepatitis E virus. Set has series of recombinant antigens synthesized in E. coli cells transformed with recombinant DNAs. Recombinant DNAs involve fragment of the second and the third open reading frames of hepatitis E virus genome. Sets can contain E. coli β-galactosidase as a control antigen. EFFECT: enhanced sensitivity and specificity in assay of spectrum of antibodies to individual viral proteins. 6 cl, 2 tbl, 13 ex

Description

Изобретение относится к биотехнологии и иммунологии и представляет собой способ получения рекомбинатных белков путем синтеза в бактериальных клетках, обладающих антигенной активностью к вирусу гепатита E, и набор белков, полученных этим способом и позволяющих проводить серодиагностику гепатита Е. Гепатит E возникает в результате заражения человека вирусом гепатита Е. Обычным способом заражения вирусом гепатита E является употребление контаминированной фекалиями воды, возможен также трансплацентарный путь заражения ребенка от больной матери. Гепатит E является эндемичным заболеванием для стран с жарким климатом, во время эпидемий эта инфекция характеризуется значительной скоростью распространения и высокой летальностью среди беременных женщин (до 25%) и новорожденных детей, родившихся у заболевших матерей (до 77%). Поэтому для проведения экстренных противоэпидемических, профилактических мероприятий и своевременного начала лечения гепатита E крайне актуальна разработка диагностических тест-систем, позволяющих выявлять инфицированных людей на ранних этапах развития эпидемического процесса. The invention relates to biotechnology and immunology, and is a method of producing recombinant proteins by synthesis in bacterial cells with antigenic activity to hepatitis E virus, and a set of proteins obtained by this method and allowing serodiagnosis of hepatitis E. Hepatitis E occurs as a result of infection of a person with hepatitis V E. The usual way to get hepatitis E virus is by drinking feces contaminated with feces; a transplacental way of infecting a child from pain is also possible. th mother. Hepatitis E is an endemic disease in countries with a hot climate, during epidemics this infection is characterized by a significant spread rate and high mortality among pregnant women (up to 25%) and newborn babies born to sick mothers (up to 77%). Therefore, to conduct emergency antiepidemic, preventive measures and timely start of treatment for hepatitis E, the development of diagnostic test systems is extremely urgent, allowing the detection of infected people in the early stages of the development of the epidemic process.

Многочисленные исследования молекулярно-биологических основ иммунного ответа на вирус гепатита E позволили определить структуру вирусного генома и локализовать основные вирусные антигенные детерминанты. Благодаря определению нуклеотидных последовательностей геномов вирусных изолятов различного географического происхождения и успехам в изучении антигенной структуры вирусных белков доказано существование двух основных серовариантов вируса: серотипа Бирма, к которому относят вирусные изоляты азиатского происхождения, и серотипа Мексика, объединяющего американские изоляты. Numerous studies of the molecular biological basis of the immune response to hepatitis E virus have made it possible to determine the structure of the viral genome and to localize the main viral antigenic determinants. Thanks to the determination of the nucleotide sequences of the genomes of viral isolates of various geographical origin and the success in studying the antigenic structure of viral proteins, the existence of two main serovariants of the virus has been proved: the Burma serotype, which includes Asian viral isolates, and the Mexico serotype, which combines American isolates.

Первоначально диагностика гепатита E основывалась на серологическом исключении вирусных гепатитов другой этиологии. Большинство разработаных к настоящему времени методов диагностики гепатита E основано на определении антител к белкам-продуктам второй и третьей открытых рамок считывания генома вируса гепатита E в сыворотках крови (серодиагностика). Для этих целей используются различные подходы, в которых применяется принцип иммуноферментного анализа (ИФА), метода иммунофлюоресценции, иммуноблотинга. Применение этой группы методов базируется на использовании синтетических пептидов-фрагментов вирусных белков или рекомбинантных полипептидов, содержащих фрагменты вирусных антигенов. Одним из наиболее перспективных путей совершенствования диагностических тест-систем является применение в качестве антителосвязывающего субстрата рекомбинантных белков вируса гепатита E, синтезированных в различных экспрессирующих системах. Такие рекомбинантные белки, сохраняющие антигенные детерминанты вируса гепатит E, используются в серодиагностике заболевания, обеспечивая высокие показатели чувствительности и специфичности используемых тестов (патент US 5563032, кл. 435/5, 08.10.96). The initial diagnosis of hepatitis E was based on the serological exclusion of viral hepatitis of a different etiology. Most hepatitis E diagnostic methods developed to date are based on the determination of antibodies to protein products of the second and third open reading frames of the hepatitis E virus genome in blood serum (serodiagnosis). For these purposes, various approaches are used in which the principle of enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), immunofluorescence method, immunoblotting are used. The use of this group of methods is based on the use of synthetic peptides fragments of viral proteins or recombinant polypeptides containing fragments of viral antigens. One of the most promising ways to improve diagnostic test systems is the use of recombinant hepatitis E virus proteins synthesized in various expression systems as an antibody-binding substrate. Such recombinant proteins preserving the antigenic determinants of the hepatitis E virus are used in the serodiagnosis of the disease, providing high sensitivity and specificity of the tests used (US patent 5563032, CL 435/5, 08/10/96).

Сущность данного технического решения состоит в том, что предложен способ получения рекомбинантных антигенов и набор для определения антител к вирусу гепатита E, содержащий в качестве антигена полипептид/полипептиды, полученные предложенным способом. Рекомбинантные антигены к вирусу гепатита E бирманского сероварианта получены с помощью методов генетической инженерии из штаммов-продуцентов E.coli. трансформированных рекомбинантными ДНК, содержащими фрагменты второй и третьей открытых рамок считывания вирусного генома. В качестве контрольного антигена набор может содержать бета-галактозидазу E. coli. При этом антигены, входящие в набор, иммобилизуют на твердом носителе в смеси или по отдельности в зависимости от решаемой задачи. Твердым носителем могут служить полистироловые или полихлорвиниловые шарики и планшеты для иммунологических реакций, нитроцеллюлоза, найлон, латексы, эритроциты, а также другие твердофазные носители. Повысить чувствительность и специфичность набора позволяет введение в набор дополнительного (по сравнению с прототипом) рекомбинантного антигена, содержащего фрагмент продукта гена ORF2 с 403 по 461 аминокислотные остатки, а также раздельная сорбция различных рекомбинантных антигенов, которая способствует определению спектра антител к индивидуальным вирусным белкам. The essence of this technical solution lies in the fact that the proposed method for producing recombinant antigens and a kit for determining antibodies to hepatitis E virus, containing as an antigen a polypeptide / polypeptides obtained by the proposed method. Recombinant antigens for hepatitis E virus of the Burmese serovariant were obtained using genetic engineering methods from E. coli producer strains. transformed with recombinant DNA containing fragments of the second and third open reading frames of the viral genome. As a control antigen, the kit may contain beta-galactosidase E. coli. In this case, the antigens included in the kit are immobilized on a solid carrier in a mixture or separately, depending on the problem being solved. Polystyrene or polyvinyl chloride beads and tablets for immunological reactions, nitrocellulose, nylon, latexes, erythrocytes, and other solid-phase carriers can serve as solid carriers. The sensitivity and specificity of the kit can be increased by introducing into the kit an additional (compared to the prototype) recombinant antigen containing an ORF2 gene product fragment from 403 to 461 amino acid residues, as well as separate sorption of various recombinant antigens, which helps to determine the spectrum of antibodies to individual viral proteins.

Изобретение иллюстрируется примерами. The invention is illustrated by examples.

Пример 1. Example 1

Получение фрагмента ДНК НЕ40. Obtaining a DNA fragment of HE40.

Для получения фрагмента ДНК были использованы олигонуклеотиды d1, d2, r1, r2, приведенные в конце описания. To obtain the DNA fragment were used oligonucleotides d1, d2, r1, r2, given at the end of the description.

Олигонуклеотиды смешивают и кинируют с помощью полинуклеотидкиназы фага T4. Для этого в эппендорфовскую пробирку на 1,5 мл вносят по 50 пмолей каждого из олигонуклеотидов, 50 мкл десятикратного буфера для киназы (0,5 М Трис-HCl, pH 7,6, 0,1 М MgCl, 50 mM дитиотреитола, 1 mM спермидина и 1 mM ЭДТА), 250 пмолями (150 мкКИ) [гамма-P] АТФ (удельная активность 3000 Ки/моль), 150 единицами активности полинуклеотидкиназы фага T4 и бидистиллированной воды до объема 500 мкл и инкубируют 30-60 минут при температуре 37oC. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 98oC, охлаждают до 16oC и смешивают с ДНК-лигазой. Для этого 100 мкл смеси обработанных киназой олигонуклеотидов смешивают с 12 мкл десятикратного буфера для лигирования (0,66 М Трис-HCl, pH 7,6, 50 mM MgCl, 50 mМ дитиотреитола и 10 mM АТФ), 8 мкл (50 единиц активности) ДНК-лигазы фага T4 и инкубируют при 4oC в течение 5 часов. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 65oC в течение 15 минут для инактивации фермента.The oligonucleotides are mixed and knocked out using a T4 phage polynucleotide kinase. For this, 50 pmoles of each of the oligonucleotides, 50 μl of ten-fold kinase buffer (0.5 M Tris-HCl, pH 7.6, 0.1 M MgCl, 50 mM dithiothreitol, 1 mM) are added to an 1.5 ml Eppendorf tube spermidine and 1 mM EDTA), 250 pmoles (150 μCI) [gamma-P] ATP (specific activity 3000 Ci / mol), 150 units of phage T4 polynucleotide kinase activity and bidistilled water to a volume of 500 μl and incubated for 30-60 minutes at 37 o C. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 98 o C, cooled to 16 o C and mixed with DNA ligase. For this, 100 μl of a mixture of kinase-treated oligonucleotides is mixed with 12 μl of ten-fold ligation buffer (0.66 M Tris-HCl, pH 7.6, 50 mM MgCl, 50 mM dithiothreitol and 10 mM ATP), 8 μl (50 activity units) Phage T4 DNA ligases and incubated at 4 o C for 5 hours. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 65 o C for 15 minutes to inactivate the enzyme.

10 мкл раствора обработанных киназой и лигазой олигонуклеотидов используют для анализа ДНК методом электрофореза в 12% полиакриламидном геле по обычной методике (Molecular cloning, New York, CSHL, 1982). После радиоавтографии геля виден ряд фрагментов размером больше или равным 92 п.н. 10 μl of the solution treated with kinase and ligase oligonucleotides is used for DNA analysis by electrophoresis in 12% polyacrylamide gel according to the usual method (Molecular cloning, New York, CSHL, 1982). After radio gel autography, a series of fragments larger than or equal to 92 bp is visible.

100 мкл раствора полученного фрагмента ДНК гидролизуют рестриктазами BamHI и PstI в буферном растворе для рестрикции (конечная концентрация 20 mМ Трис-HCl, pH 7,5, 50 mМ NaCl, 10 mM MgCl, 1 mМ дитиотреитола) в течение 5 часов при температуре 37oC. Ферменты инактивируют нагреванием при 70oC.100 μl of a solution of the obtained DNA fragment is hydrolyzed with restriction enzymes BamHI and PstI in a restriction buffer solution (final concentration of 20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 50 mM NaCl, 10 mM MgCl, 1 mM dithiothreitol) for 5 hours at 37 o C. Enzymes are inactivated by heating at 70 o C.

10 мкл раствора фрагментов ДНК, гидролизованных рестрикционными эндонуклезами, используют для анализа ДНК в 12% полиакриламидном геле (после радиоавтографии виден фрагмент размером около 92 п.н.). 10 μl of a solution of DNA fragments hydrolyzed by restriction endonucleoses is used for DNA analysis in a 12% polyacrylamide gel (a fragment of about 92 bp is visible after radio-autography).

ДНК осаждают этиловым спиртом и растворяют в 20 мкл дистиллированной воды. 10 мкл обработанного рестриктазами фрагмента ДНК вносят в эппендорфовскую пробирку, содержащую 7 мкл (0,1 мкг/мл) ДНК векторной плазмиды pUC18, обработанной рестриктазами BamHI и PstI, 2 мкл десятикратного буфера для лигирования, 1 мкл (5 единиц активности) ДНК-лигазы фага T4 и инкубируют при 4oC в течение 5 часов.DNA is precipitated with ethyl alcohol and dissolved in 20 μl of distilled water. 10 μl of the restriction enzyme-treated DNA fragment was added to an Eppendorf tube containing 7 μl (0.1 μg / ml) of DNA vector plasmid pUC18 treated with BamHI and PstI restriction enzymes, 2 μl of ten-fold ligation buffer, 1 μl (5 units of activity) of DNA ligase phage T4 and incubated at 4 o C for 5 hours.

Полученной лигазной смесью трансформируют клетки E.coli штамм JM109 по обычной методике (Molecular cloning. New York. CSHL, 1982). Трансформированные клетки высевают на чашки с 1,2% LB-агаром, содержащим 10 мкг/мл ампициллина. Выросшие колонии проверяют на наличие рекомбинантных плазмид. Для этого бактериальные клетки лизируют и выделяют плазмидную ДНК, как описано (Nature, 1981, 145, 1365). Выделенную плазмидную ДНК дорабатывают рестриктазами BamHI и PstI и гидролизат исследуют электрофорезом в 12% полиакриламидном геле. Отбирают штамм, содержащий плазмиду, гидролизат которой имеет на электрофореграмме 1 полосы ДНК размерами 1686 и 92 п.н., что соответствует размерам вектора и синтезированного нами фрагмента ДНК. The resulting ligase mixture transform cells of E. coli strain JM109 by the usual method (Molecular cloning. New York. CSHL, 1982). Transformed cells are plated on plates with 1.2% LB agar containing 10 μg / ml ampicillin. The grown colonies are checked for the presence of recombinant plasmids. For this, bacterial cells lyse and secrete plasmid DNA as described (Nature, 1981, 145, 1365). The isolated plasmid DNA was finalized with BamHI and PstI restriction enzymes and the hydrolyzate was examined by electrophoresis on a 12% polyacrylamide gel. A strain containing a plasmid is selected, the hydrolyzate of which has 1 DNA strip of 1686 and 92 bp on the electrophoregram, which corresponds to the size of the vector and the DNA fragment synthesized by us.

Методом Сэнгера (PNAS, 1977, 74, 5463) определяют нуклеотидную последовательность клонированного фрагмента ДНК (см. в конце описания). Using the Sanger method (PNAS, 1977, 74, 5463), the nucleotide sequence of the cloned DNA fragment is determined (see the end of the description).

Пример 2. Example 2

Получение плазмиды pHЕ40. Obtaining plasmids pHE40.

Фрагмент ДНК HE40 лигируют с ДНК векторной плазмиды рЕL5А, обработанной рестриктазами BamHI и PstI. The HE40 DNA fragment is ligated with the DNA of the vector plasmid pEL5A treated with restriction enzymes BamHI and PstI.

Лигазной смесью трансформируют клетки E.coli штамм PLT90. Трансформированные клетки высевают на чашки с 1% LB-агаром. содержащие 50 мкг/мл ампициллина. Выросшие колонии проверяют на наличие рекомбинантных плазмид. Для этого бактериальные клетки лизируют и выделяют плазмидную ДНК. Выделенную плазмидную ДНК обрабатывают рестриктазами BamHI и PstI и гидролизат исследуют электрофорезом в 2% агарозе. Отбирают штамм SHE40. Гидролизат плазмидной ДНК из рекомбинантного штамма SHE40 имеет на электрофореграмме 2 полосы ДНК размерами 6400 и 92 нуклеотида, что соответствует размерам вектора и синтезированного фрагмента ДНК НЕ40. The ligase mixture transform cells of E. coli strain PLT90. Transformed cells are plated on plates with 1% LB agar. containing 50 μg / ml ampicillin. The grown colonies are checked for the presence of recombinant plasmids. For this, bacterial cells lyse and secrete plasmid DNA. The isolated plasmid DNA is treated with restriction enzymes BamHI and PstI and the hydrolyzate is examined by electrophoresis in 2% agarose. Select strain SHE40. The plasmid DNA hydrolyzate from the recombinant SHE40 strain has 2 DNA bands of 6400 and 92 nucleotides on the electrophoregram, which corresponds to the dimensions of the vector and synthesized DNA fragment 40.

При определении нуклеотидной последовательности плазмиды pHЕ40 установлено, что синтезированный фрагмент гена ORF2 вируса гепатита E через BamHI сайт присоединен к 3'-концу гена бета-галактозидазы E.coli. Таким образом плазмида pHЕ40 кодирует рекомбинантный белок, содержащий аминокислотные последовательности продукта гена ORF2 вируса гепатита E, слитые с последовательностью β-галактозидазы E.coli. When determining the nucleotide sequence of the plasmid pHE40, it was found that the synthesized fragment of the hepatitis E virus ORF2 gene through the BamHI site is attached to the 3'-end of the E. coli beta-galactosidase gene. Thus, the plasmid pHE40 encodes a recombinant protein containing the amino acid sequences of the hepatitis E virus ORF2 gene product fused to the E. coli β-galactosidase sequence.

Пример 3. Example 3

Синтез полипептида НЕ40. Synthesis of the HE40 polypeptide.

Штамм E. coli, содержащий плазмиду pHЕ40, выращивают в 100 мл среды LB при 30oC до плотности 8х10 кл./мл. После этого температуру повышают до 40oC и растят клетки еще в течение 2-х часов. Клетки собирают центрифугированием при 4000 об/мин в течение 15 мин. Клетки лизируют ультразвуком и выделяют белки по описанному методу (EMBO J., 1984, 3, 1429).The E. coli strain containing the plasmid pHE40 is grown in 100 ml of LB medium at 30 ° C. to a density of 8x10 cells / ml. After that, the temperature was raised to 40 o C and cells were grown for another 2 hours. Cells are harvested by centrifugation at 4000 rpm for 15 minutes. Cells are lysed by ultrasound and proteins are isolated according to the method described (EMBO J., 1984, 3, 1429).

Выделенные белки анализируют в 10% ПААГ по стандартному методу Лэммли (Nature, 227, 680-685, 1970). В качестве маркеров молекулярных масс белков используют набор фирмы "Pharmacia", содержащий маркеры молекулярных масс от 20 до 160 кД. В качестве контроля используют полученный аналогичным образом лизат клеток штамма E.coli PLT90, содержащий векторную плазмиду рЕL5А и не содержащий плазмид pHЕ40. Сравнительный анализ белкового состава показывает, что штамм E.coli, содержащий плазмиду pHЕ40, экспрессирует полипептид с молекулярной массой - 122 кД. Ниже представлена аминокислотная последовательность полипептида, определенная на основании нуклеотидной последовательности клонированного фрагмента ДНК, соответствующая фрагменту продукта второй открытой рамки считывания с 633 по 659 аминокислотные осадки:
X - L G L Q G C A F Q S T V A E L Q R L K M K V G K T R E L Q P S L L I D,
где X - аминокислотная последовательность бета-галактозидазы E.coli.
The isolated proteins are analyzed in 10% PAG according to the standard Laemmli method (Nature, 227, 680-685, 1970). As markers of molecular masses of proteins, a Pharmacia kit containing molecular weight markers from 20 to 160 kD is used. As a control, a similarly obtained cell lysate of E. coli strain PLT90 containing vector plasmid pEL5A and without plasmids pHE40 is used. A comparative analysis of the protein composition shows that the E. coli strain containing the plasmid pHE40 expresses a polypeptide with a molecular weight of 122 kD. Below is the amino acid sequence of the polypeptide, determined on the basis of the nucleotide sequence of the cloned DNA fragment, corresponding to the product fragment of the second open reading frame from 633 to 659 amino acid residues:
X - LGLQGCAFQSTVAELQRLKMK VGKTRELQPSLLID,
where X is the amino acid sequence of beta-galactosidase E. coli.

Пример 4. Example 4

Получение фрагмента ДНК НЕ60. Obtaining a DNA fragment of HE60.

Для получения фрагмента ДНК были использованы олигонуклеотиды d1, d2, r1, r2, приведенные в конце описания. To obtain the DNA fragment were used oligonucleotides d1, d2, r1, r2, given at the end of the description.

Олигонуклеотиды смешивают и кинируют с помощью полинуклеотидкиназы фага T4. Для этого в эппендорфовскую пробирку на 1,5 мл вносят по 50 пмолей каждого из олигонуклеотидов, 50 мкл десятикратного буфера для киназы (0,5 М Трис-HCl, pH 7,6, 0,1 М MgCl, 50 mM дитиотреитола, 1 mM спермидина и 1 mM ЭДТА), 250 пмолями (150 мкКИ) [гамма-P] АТФ (удельная активность 3000 Ки/моль), 150 единицами активности полинуклеотидкиназы фага T4 и бидистиллированной воды до объема 500 мкл и инкубируют 30-60 минут при температуре 37oC. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 98oC, охлаждают до 16oC и смешивают с ДНК-лигазой. Для этого 100 мкл смеси обработанных киназой олигонуклеотидов смешивают с 12 мкл десятикратного буфера для лигирования (0,66 М Трис-HCl, pH 7,6, 50 mM MgCl, 50 mM дитиотреитола и 10 mM АТФ), 8 мкл (50 единиц активности) ДНК-лигазы фага T4 и инкубируют при 4oC в течение 5 часов. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 65oC в течение 15 минут для инактивации фермента.The oligonucleotides are mixed and knocked out using a T4 phage polynucleotide kinase. For this, 50 pmoles of each of the oligonucleotides, 50 μl of ten-fold kinase buffer (0.5 M Tris-HCl, pH 7.6, 0.1 M MgCl, 50 mM dithiothreitol, 1 mM) are added to an 1.5 ml Eppendorf tube spermidine and 1 mM EDTA), 250 pmoles (150 μCI) [gamma-P] ATP (specific activity 3000 Ci / mol), 150 units of phage T4 polynucleotide kinase activity and bidistilled water to a volume of 500 μl and incubated for 30-60 minutes at 37 o C. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 98 o C, cooled to 16 o C and mixed with DNA ligase. For this, 100 μl of a mixture of kinase-treated oligonucleotides is mixed with 12 μl of ten-fold ligation buffer (0.66 M Tris-HCl, pH 7.6, 50 mM MgCl, 50 mM dithiothreitol and 10 mM ATP), 8 μl (50 activity units) Phage T4 DNA ligases and incubated at 4 o C for 5 hours. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 65 o C for 15 minutes to inactivate the enzyme.

10 мкл раствора обработанных киназой и лигазой олигонуклеотидов используют для анализа ДНК методом электрофореза в 12% полиакриламидном геле по обычной методике (Molecular cloning, New York, CSHL. 1982). После радиоавтографии геля виден ряд фрагментов размером больше или равным 92 п.н. 10 μl of the solution treated with kinase and ligase oligonucleotides is used for DNA analysis by electrophoresis in 12% polyacrylamide gel according to the usual method (Molecular cloning, New York, CSHL. 1982). After radio gel autography, a series of fragments larger than or equal to 92 bp is visible.

100 мкл раствора полученного фрагмента ДНК гидролизуют рестриктазами BaniHI и PstI в буферном растворе для рестрикции (конечная концентрация 20 mM Трис-HCl, pH 7,5, 50 mM NaCl, 10 mM MgCl, 1 mM дитиотреитола) в течение 5 часов при температуре 37oC. Ферменты инактивируют нагреванием при 70oC.100 μl of the solution of the obtained DNA fragment is hydrolyzed with restriction enzymes BaniHI and PstI in restriction buffer solution (final concentration of 20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 50 mM NaCl, 10 mM MgCl, 1 mM dithiothreitol) for 5 hours at 37 o C. Enzymes are inactivated by heating at 70 o C.

10 мкл раствора фрагментов ДНК, гидролизованных рестрикционными эндонуклеазами, используют для анализа ДНК в 12% полиакриламидном геле (после радиоавтографии виден фрагмент размером около 92 п.н.). 10 μl of a solution of DNA fragments hydrolyzed by restriction endonucleases is used for DNA analysis in a 12% polyacrylamide gel (a fragment of about 92 bp is visible after radio-autography).

ДНК осаждают этиловым спиртом и растворяют в 20 мкл дистиллированной воды. 10 мкл обработанного рестриктазами фрагмента ДНК вносят в эппендорфовскую пробирку, содержащую 7 мкл (0,1 мкг/мл) ДНК векторной плазмиды pUC18, обработанной рестриктазами BamHI и PstI, 2 мкл десятикратного буфера для лигирования, 1 мкл (5 единиц активности) ДНК-лигазы фага T4 и инкубируют при 4oC в течение 5 часов.DNA is precipitated with ethyl alcohol and dissolved in 20 μl of distilled water. 10 μl of the restriction enzyme-treated DNA fragment was added to an Eppendorf tube containing 7 μl (0.1 μg / ml) of DNA vector plasmid pUC18 treated with BamHI and PstI restriction enzymes, 2 μl of ten-fold ligation buffer, 1 μl (5 units of activity) of DNA ligase phage T4 and incubated at 4 o C for 5 hours.

Полученной лигазной смесью трансформируют клетки E.coli штамм JM109 по обычной методике (Molecular cloning. New York. CSHL, 1982). Трансформированные клетки высевают на чашки с 1,2% LB-агаром, содержащим 10 мкг/мл ампициллина. Выросшие колонии проверяют на наличие рекомбинантных плазмид. Для этого бактериальные клетки лизируют и выделяют плазмидную ДНК, как описано (Nature, 1981, 145, 1365). Выделенную плазмидную ДНК обрабатывают рестриктазами BamHI и PstI и гидролизат исследуют электрофорезом в 12% полиакриламидном геле. Отбирают штамм, содержащий плазмиду, гидролизат которой имеет на электрофореграмме 1 полосы ДНК размерами 1686 и 107 п.н., что соответствует размерам вектора и синтезированного нами фрагмента ДНК. The resulting ligase mixture transform cells of E. coli strain JM109 by the usual method (Molecular cloning. New York. CSHL, 1982). Transformed cells are plated on plates with 1.2% LB agar containing 10 μg / ml ampicillin. The grown colonies are checked for the presence of recombinant plasmids. For this, bacterial cells lyse and secrete plasmid DNA as described (Nature, 1981, 145, 1365). The isolated plasmid DNA is treated with BamHI and PstI restriction enzymes and the hydrolyzate is examined by electrophoresis on a 12% polyacrylamide gel. A strain containing a plasmid is selected, the hydrolyzate of which has 1 DNA strip on the electrophoregram 1 with sizes of 1686 and 107 bp, which corresponds to the size of the vector and the DNA fragment synthesized by us.

Методом Сэнгера (PNAS, 1977. 74, 5463) определяют нуклеотидную последовательность клонированного фрагмента ДНК (см. в конце описания). The Sanger method (PNAS, 1977. 74, 5463) determines the nucleotide sequence of the cloned DNA fragment (see the end of the description).

Пример 5. Example 5

Получение плазмиды pHЕ60. Obtaining plasmids pHE60.

Фрагмент ДНК HE60 лигируют с ДНК векторной плазмиды pEL5A, обработанной рестриктазами BamHI и PstI. The HE60 DNA fragment is ligated with the DNA of the vector plasmid pEL5A treated with restriction enzymes BamHI and PstI.

Лигазной смесью трансформируют клетки E.coli штамм PLT90. Трансформированные клетки высевают на чашки с 1% LB-агаром, содержащие 50 мкг/мл ампициллина. Выросшие колонии проверяют на наличие рекомбинантных плазмид. Для этого бактериальные клетки лизируют и выделяют плазмидную ДНК. Выделенную плазмидную ДНК обрабатывают рестриктазами BamHI и PstI и гидролизат исследуют электрофорезом в 2% агарозе. Отбирают штамм SHE60. Гидролизат плазмидной ДНК из рекомбинантного штамма SHE60 имеет на электрофореграмме 2 полосы ДНК размерами 6400 и 107 нуклеотидов, что соответствует размерам вектора и синтезированного фрагмента ДНК HE60. The ligase mixture transform cells of E. coli strain PLT90. Transformed cells are plated on plates with 1% LB agar containing 50 μg / ml ampicillin. The grown colonies are checked for the presence of recombinant plasmids. For this, bacterial cells lyse and secrete plasmid DNA. The isolated plasmid DNA is treated with restriction enzymes BamHI and PstI and the hydrolyzate is examined by electrophoresis in 2% agarose. Select strain SHE60. The plasmid DNA hydrolyzate from the recombinant strain SHE60 has 2 DNA bands on the electrophoregram of 6400 and 107 nucleotides in size, which corresponds to the sizes of the vector and the synthesized HE60 DNA fragment.

При определении нуклеотидной последовательности плазмиды pHE60 установлено, что синтезированный фрагмент гена ORF3 вируса гепатита E через BamHI сайт присоединен к 3'-концу гена бета-галактозидазы E.coli. Таким образом плазмида pHЕ60 кодирует рекомбинантный белок, содержащий аминокислотные последовательности продукта гена ORF3 вируса гепатита E слитые с последовательностью β-галактозидазы E.coli. When determining the nucleotide sequence of the plasmid pHE60, it was found that the synthesized fragment of the hepatitis E virus ORF3 gene through the BamHI site is attached to the 3'-end of the E. coli beta-galactosidase gene. Thus, the plasmid pHE60 encodes a recombinant protein containing the amino acid sequences of the hepatitis E virus ORF3 gene product fused to the E. coli β-galactosidase sequence.

Пример 6. Example 6

Синтез полипептида НЕ60. Synthesis of the HE60 polypeptide.

Штамм E. coli, содержащий плазмиду pHЕ60, выращивают в 100 мл среды LB при 30oC до плотности 8х10 кл./мл. После этого температуру повышают до 40oC и растят клетки еще в течение 2-х часов. Клетки собирают центрифугированием при 4000 об/мин в течение 15 мин. Клетки лизируют ультразвуком и выделяют белки по описанному методу (EMBO J., 1984, 3, 1429).The E. coli strain containing the plasmid pHE60 was grown in 100 ml of LB medium at 30 ° C. to a density of 8x10 cells / ml. After that, the temperature was raised to 40 o C and cells were grown for another 2 hours. Cells are harvested by centrifugation at 4000 rpm for 15 minutes. Cells are lysed by ultrasound and proteins are isolated according to the method described (EMBO J., 1984, 3, 1429).

Выделенные белки анализируют в 10% ПААГ по стандартному методу Лэммли (Nature, 227, 680-685, 1970). В качестве маркеров молекулярных масс белков используют набор фирмы "Pharmacia", содержащий маркеры молекулярных масс от 20 до 160 кД. В качестве контроля используют полученный аналогичным образом лизат клеток штамма E.coli PLT90, содержащий векторную плазмиду рЕL5A и не содержащий плазмид pHЕ60. Сравнительный анализ белкового состава показывает, что штамм E.coli, содержащий плазмиду pHЕ60, экспрессирует полипептид с молекулярной массой - 122 кД. Ниже представлена аминокислотная последовательность полипептида, определенная на основании нуклеотидной последовательности клонированного фрагмента ДНК, соответствующая фрагменту продукту третьей открытой рамки считывания с 92 по 123 аминокислотные остатки:
X - S N P P D H S A P L G V T R P S A P P L P H V V D L P Q L G P R R C S Q A C,
где X - аминокислотная последовательность бета-галактозидазы E.coli.
The isolated proteins are analyzed in 10% PAG according to the standard Laemmli method (Nature, 227, 680-685, 1970). As markers of molecular masses of proteins, a Pharmacia kit containing molecular weight markers from 20 to 160 kD is used. As a control, a similarly obtained cell lysate of E. coli strain PLT90 containing the vector plasmid pEL5A and without the plasmids pHE60 is used. A comparative analysis of the protein composition shows that the E. coli strain containing the plasmid pHE60 expresses a polypeptide with a molecular weight of 122 kD. Below is the amino acid sequence of the polypeptide, determined based on the nucleotide sequence of the cloned DNA fragment, corresponding to the fragment of the product of the third open reading frame from 92 to 123 amino acid residues:
X - SNPPDHSAPLGVTRPSAPPLP HVVDLPQLGPRRCSQAC,
where X is the amino acid sequence of beta-galactosidase E. coli.

Пример 7. Example 7

Получение фрагмента ДНК НЕ70. Obtaining DNA fragment HE70.

Для получения фрагмента ДНК были использованы олигонуклеотиды d1, d2, d3, d4, r1, r2, r3, r4, приведенные в конце описания. To obtain the DNA fragment were used oligonucleotides d1, d2, d3, d4, r1, r2, r3, r4, given at the end of the description.

Олигонуклеотиды d1, d2, r1, r2 смешивают и кинируют с помощью полинуклеотидкиназы фага T4. Для этого в эппендорфовскую пробирку на 1,5 мл вносят по 50 пмолей каждого из олигонуклеотидов, 50 мкл десятикратного буфера для киназы (0,5 М Трис-HCl, pH 7,6, 0,1 М MgCl, 50 mM дитиотреитола, 1 mM спермидина и 1 mM ЭДТА), 250 пмолями (150 мкКИ) [гамма-P] АТФ (удельная активность 3000 Ки/моль), 150 единицами активности полинуклеотидкиназы фага T4 и бидистиллированной воды до объема 500 мкл и инкубируют 30-60 минут при температуре 37oC. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 98oC. охлаждают до 16oC и смешивают с ДНК-лигазой. Для этого 100 мкл смеси обработанных киназой олигонуклеотидов смешивают с 12 мкл десятикратного буфера для лигирования (0,66 М Трис-HCl, pH 7,6, 50 mM MgCl, 50 mM дитиотреитола и 10 mM АТФ), 8 мкл (50 единиц активности) ДНК-лигазы фага T4 и инкубируют при 4oC в течение 5 часов. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 65oC в течение 15 минут для инактивации фермента.The oligonucleotides d1, d2, r1, r2 are mixed and knocked out using phage T4 polynucleotide kinase. For this, 50 pmoles of each of the oligonucleotides, 50 μl of ten-fold kinase buffer (0.5 M Tris-HCl, pH 7.6, 0.1 M MgCl, 50 mM dithiothreitol, 1 mM) are added to an 1.5 ml Eppendorf tube spermidine and 1 mM EDTA), 250 pmoles (150 μCI) [gamma-P] ATP (specific activity 3000 Ci / mol), 150 units of phage T4 polynucleotide kinase activity and bidistilled water to a volume of 500 μl and incubated for 30-60 minutes at 37 o C. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 98 o C. cooled to 16 o C and mixed with DNA ligase. For this, 100 μl of a mixture of kinase-treated oligonucleotides is mixed with 12 μl of ten-fold ligation buffer (0.66 M Tris-HCl, pH 7.6, 50 mM MgCl, 50 mM dithiothreitol and 10 mM ATP), 8 μl (50 activity units) Phage T4 DNA ligases and incubated at 4 o C for 5 hours. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 65 o C for 15 minutes to inactivate the enzyme.

Олигонуклеотиды d3, d4, r3, r4 смешивают и кинируют с помощью полинуклеотидкиназы фага T4. Для этого в эппендорфовскую пробирку на 1,5 мл вносят по 50 пмолей каждого из олигонуклеотидов, 50 мкл десятикратного буфера для киназы (0,5 М Трис-HCl, pH 7,6, 0,1 М MgCl, 50 mM дитиотреитола, 1 mM спермидина и 1 mM ЭДТА), 150 единицами активности полинуклеотидкиназы фага T4 и бидистиллированной воды до объема 500 мкл и инкубируют 30-60 минут при температуре 37oC. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 98oC, охлаждают до 16oC и смешивают с ДНК-лигазой. Для этого 100 мкл смеси обработанных киназой олигонуклеотидов смешивают с 12 мкл десятикратного буфера для лигирования (0,66 М Трис-HCl, pH 7,6, 50 mM MgCl, 50 mM дитиотреитола и 10 mM АТФ), 8 мкл (50 единиц активности) ДНК-лигазы фага T4 и инкубируют при 4oC в течение 5 часов. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 65oC в течение 15 минут для инактивации фермента.Oligonucleotides d3, d4, r3, r4 are mixed and knocked out using the T4 phage polynucleotide kinase. For this, 50 pmoles of each of the oligonucleotides, 50 μl of ten-fold kinase buffer (0.5 M Tris-HCl, pH 7.6, 0.1 M MgCl, 50 mM dithiothreitol, 1 mM) are added to an 1.5 ml Eppendorf tube spermidine and 1 mM EDTA), 150 units of phage T4 polynucleotide kinase activity and bidistilled water to a volume of 500 μl and incubated for 30-60 minutes at a temperature of 37 o C. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 98 o C, cooled to 16 o C and mixed with DNA ligase. For this, 100 μl of a mixture of kinase-treated oligonucleotides is mixed with 12 μl of ten-fold ligation buffer (0.66 M Tris-HCl, pH 7.6, 50 mM MgCl, 50 mM dithiothreitol and 10 mM ATP), 8 μl (50 activity units) Phage T4 DNA ligases and incubated at 4 o C for 5 hours. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 65 o C for 15 minutes to inactivate the enzyme.

Полученные фрагменты ДНК смешивают и снова подвергают обработке полинуклеотидкиназой фага T4. Для этого в эппендорфовскую пробирку на 1,5 мл вносят по 50 пмолей каждого из фрагментов ДНК, 50 мкл десятикратного буфера для киназы (0,5 М Трис-HCl, pH 7,6, 0,1 М MgCl, 50 mM дитиотреитола, 1 mM спермидина и 1 mM ЭДТА), 150 единицами активности полинуклеотидкиназы фага T4 и бидистиллированной воды до объема 500 мкл и инкубируют 30-60 минут при температуре 37oC. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 98oC, охлаждают до 16oC и смешивают с ДНК-лигазой. Для этого 100 мкл смеси обработанных киназой олигонуклеотидов смешивают с 12 мкл десятикратного буфера для лигирования (0,66 М Трис-HCl, pH 7,6, 50 mM MgCl, 50 mM дитиотреитола и 10 mM АТФ), 8 мкл (50 единиц активности) ДНК-лигазы фага T4 и инкубируют при 4oC в течение 5 часов. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 65oC в течение 15 минут для инактивации фермента.The resulting DNA fragments are mixed and again subjected to treatment with T4 phage polynucleotide kinase. For this, 50 pmoles of each of the DNA fragments, 50 μl of ten-fold kinase buffer (0.5 M Tris-HCl, pH 7.6, 0.1 M MgCl, 50 mM dithiothreitol, 1) are added to the 1.5 ml Eppendorf tube mM spermidine and 1 mM EDTA), 150 units of phage T4 polynucleotide kinase activity and bidistilled water to a volume of 500 μl and incubated for 30-60 minutes at a temperature of 37 o C. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 98 o C, cooled to 16 o C and mixed with DNA ligase. For this, 100 μl of a mixture of kinase-treated oligonucleotides is mixed with 12 μl of ten-fold ligation buffer (0.66 M Tris-HCl, pH 7.6, 50 mM MgCl, 50 mM dithiothreitol and 10 mM ATP), 8 μl (50 activity units) Phage T4 DNA ligases and incubated at 4 o C for 5 hours. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 65 o C for 15 minutes to inactivate the enzyme.

10 мкл раствора обработанных киназой и лигазой олигонуклеотидов используют для анализа ДНК методом электрофореза в 12% полиакриламидном геле по обычной методике (Molecular cloning, New York, CSHL, 1982). После радиоавтографии геля виден ряд фрагментов размером больше или равным 182 п.н. 10 μl of the solution treated with kinase and ligase oligonucleotides is used for DNA analysis by electrophoresis in 12% polyacrylamide gel according to the usual method (Molecular cloning, New York, CSHL, 1982). After radio gel autography, a series of fragments larger than or equal to 182 bp is visible.

100 мкл раствора полученного фрагмента ДНК гидролизуют рестриктазами BamHI и PstI в буферном растворе для рестрикции (конечная концентрация 20 mМ Трис-HCl, pH 7,5, 50 mM NaCl, 10mM MgCl, 1 mM дитиотреитола) в течение 5 часов при температуре 37oC. Ферменты инактивируют нагреванием при 70oC.100 μl of a solution of the obtained DNA fragment is hydrolyzed with restriction enzymes BamHI and PstI in a restriction buffer solution (final concentration of 20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 50 mM NaCl, 10mM MgCl, 1 mM dithiothreitol) for 5 hours at 37 ° C The enzymes are inactivated by heating at 70 o C.

10 мкл раствора фрагментов ДНК, гидролизованных рестрикционными эндонуклеазами, используют для анализа ДНК в 12% полиакриламидном геле (после радиоавтографии виден фрагмент размером около 92 п.н.). 10 μl of a solution of DNA fragments hydrolyzed by restriction endonucleases is used for DNA analysis in a 12% polyacrylamide gel (a fragment of about 92 bp is visible after radio-autography).

ДНК осаждают этиловым спиртом и растворяют в 20 мкл дистиллированной воды. 10 мкл обработанного рестриктазами фрагмента ДНК вносят в эппендорфовскую пробирку, содержащую 7 мкл (0,1 мкг/мл) ДНК векторной плазмиды pUC18, обработанной рестриктазами BamHI и PstI, 2 мкл десятикратного буфера для лигирования, 1 мкл (5 единиц активности) ДНК-лигазы. Олигонуклеотиды d3, d4, r3, r4 смешивают и кинируют с помощью полинуклеотидкиназы фага T4. Для этого в эппендорфовскую пробирку на 1,5 мл вносят по 50 пмолей каждого из олигонуклеотидов, 50 мкл десятикратного буфера для киназы (0,5 М Трис-HCl, pH 7,6, 0,1 M MgCl, 50 mM дитиотреитола, 1 mM спермидина и 1 mM ЭДТА), 250 пмолями (150 мкКИ) [гамма-P] АТФ (удельная активность 3000 Ки/моль), 150 единицами активности полинуклеотидкиназы фага Т4 и бидистиллированной воды до объема 500 мкл и инкубируют 30-60 минут при температуре 37oC. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 98oC, охлаждают до 16oC и смешивают с ДНК-лигазой. Для этого 100 мкл смеси обработанных киназой олигонуклеотидов смешивают с 12 мкл десятикратного буфера для лигирования (0,66 М Трис-HCl, pH 7,6, 50 mM MgCl, 50 mM дитиотреитола и 10 mM АТФ), 8 мкл (50 единиц активности) ДНК-лигазы фага T4 и инкубируют при 4oC в течение 5 часов. Затем реакционную смесь нагревают до температуры 65oC в течение 15 минут для инактивации фермента. Полученной лигазной смесью трансформируют клетки E.coli штамм JM109 по обычной методике (Molecular cloning, New York. CSHL, 1982). Трансформированные клетки высевают на чашки с 1,2% LB-агаром, содержащим 10 мкг/мл ампициллина. Выросшие колонии проверяют на наличие рекомбинантных плазмид. Для этого бактериальные клетки лизируют и выделяют плазмидную ДНК, как описано (Nature, 1981, 145, 1365). Выделенную плазмидную ДНК обрабатывают рестриктазами BamHI и PstI и гидролизат исследуют электрофорезом в 12% полиакриламидном геле. Отбирают штамм, содержащий плазмиду, гидролизат которой имеет на электорофореграмме две полосы ДНК размерами 1686 и 182 п. н. , что соответствует размерам вектора и синтезированного нами фрагмента ДНК.DNA is precipitated with ethyl alcohol and dissolved in 20 μl of distilled water. 10 μl of the restriction enzyme-treated DNA fragment was added to an Eppendorf tube containing 7 μl (0.1 μg / ml) of DNA vector plasmid pUC18 treated with BamHI and PstI restriction enzymes, 2 μl of ten-fold ligation buffer, 1 μl (5 units of activity) of DNA ligase . Oligonucleotides d3, d4, r3, r4 are mixed and knocked out using the T4 phage polynucleotide kinase. For this, 50 pmoles of each of the oligonucleotides, 50 μl of ten-fold kinase buffer (0.5 M Tris-HCl, pH 7.6, 0.1 M MgCl, 50 mM dithiothreitol, 1 mM) are added to the 1.5 ml Eppendorf tube spermidine and 1 mM EDTA), 250 pmoles (150 μCI) [gamma-P] ATP (specific activity 3000 Ci / mol), 150 units of phage T4 polynucleotide kinase activity and bidistilled water to a volume of 500 μl and incubated for 30-60 minutes at 37 o C. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 98 o C, cooled to 16 o C and mixed with DNA ligase. For this, 100 μl of a mixture of kinase-treated oligonucleotides is mixed with 12 μl of ten-fold ligation buffer (0.66 M Tris-HCl, pH 7.6, 50 mM MgCl, 50 mM dithiothreitol and 10 mM ATP), 8 μl (50 activity units) Phage T4 DNA ligases and incubated at 4 o C for 5 hours. Then the reaction mixture is heated to a temperature of 65 o C for 15 minutes to inactivate the enzyme. The obtained ligase mixture transform cells of E. coli strain JM109 by the usual method (Molecular cloning, New York. CSHL, 1982). Transformed cells are plated on plates with 1.2% LB agar containing 10 μg / ml ampicillin. The grown colonies are checked for the presence of recombinant plasmids. For this, bacterial cells lyse and secrete plasmid DNA as described (Nature, 1981, 145, 1365). The isolated plasmid DNA is treated with BamHI and PstI restriction enzymes and the hydrolyzate is examined by electrophoresis on a 12% polyacrylamide gel. A strain containing a plasmid is selected, the hydrolyzate of which has two DNA bands 1686 and 182 bp in size on the electrophoregram. , which corresponds to the size of the vector and the DNA fragment synthesized by us.

Методом Сэнгера (PNAS, 1977, 74, 5463) определяют нуклеотидную последовательность клонированного фрагмента ДНК (см. в конце описания). Using the Sanger method (PNAS, 1977, 74, 5463), the nucleotide sequence of the cloned DNA fragment is determined (see the end of the description).

Пример 8. Example 8

Получение плазмиды pHЕ70. Obtaining plasmids pHE70.

Фрагмент ДНК НЕ70 лигируют с ДНК векторной плазмиды pEL5A, обработанной рестриктазами BamHI и PstI. The DNA fragment HE70 is ligated with the DNA of the vector plasmid pEL5A treated with restriction enzymes BamHI and PstI.

Лигазной смесью трансформируют клетки E.coli штамм PLT90. Трансформированные клетки высевают на чашки с 1% LB-агаром, содержащие 50 мкг/мл ампициллина. Выросшие колонии проверяют на наличие рекомбинантных плазмид. Для этого бактериальные клетки лизируют и выделяют плазмидную ДНК. Выделенную плазмидную ДНК обрабатывают рестриктазами BamHI и PstI и гидролизат исследуют электрофорезом в 2% агарозе. Отбирают штамм SHE70. Гидролизат плазмидной ДНК из рекомбинантного штамма SHE70 имеет на электрофореграмме 2 полосы ДНК размерами 6400 и 182 нуклеотида, что соответствует размерам вектора и синтезированного фрагмента ДНК НЕ70. The ligase mixture transform cells of E. coli strain PLT90. Transformed cells are plated on plates with 1% LB agar containing 50 μg / ml ampicillin. The grown colonies are checked for the presence of recombinant plasmids. For this, bacterial cells lyse and secrete plasmid DNA. The isolated plasmid DNA is treated with restriction enzymes BamHI and PstI and the hydrolyzate is examined by electrophoresis in 2% agarose. Select strain SHE70. The plasmid DNA hydrolyzate from the recombinant strain SHE70 has 2 DNA bands of 6400 and 182 nucleotides on the electrophoregram, which corresponds to the size of the vector and the synthesized HE70 DNA fragment.

При определении нуклеотидной последовательности плазмиды pHЕ70 установлено, что синтезированный фрагмент гена ORF2 вируса гепатита E через BamHI сайт присоединен к 3'-концу гена β-галактозидазы E.coli. Таким образом плазмида pHЕ70 кодирует рекомбинантный белок, содержащий аминокислотные последовательности продукта гена ORF2 вируса гепатита E, слитые с последовательностью β-галактозидазы E.coli. When determining the nucleotide sequence of the plasmid pHE70, it was found that the synthesized fragment of the hepatitis E virus ORF2 gene via the BamHI site is attached to the 3'-end of the E. coli β-galactosidase gene. Thus, the plasmid pHE70 encodes a recombinant protein containing the amino acid sequences of the hepatitis E virus ORF2 gene product fused to the E. coli β-galactosidase sequence.

Пример 9. Example 9

Синтез полипептида НЕ70. Synthesis of the HE70 polypeptide.

Штамм E. coli. содержащий плазмиду pHЕ70, выращивают в 100 мл среды LB при 30oC до плотности 8х10 кл/мл. После этого температуру повышают до 40oC и растят клетки еще в течение 2-х часов. Клетки собирают центрифугированием при 4000 об/мин в течение 15 мин. Клетки лизируют ультразвуком и выделяют белки по описанному методу (EMBO J. 1984, 3, 1429).Strain E. coli. containing the plasmid pHE70, grown in 100 ml of LB medium at 30 o C to a density of 8x10 cells / ml After that, the temperature was raised to 40 o C and cells were grown for another 2 hours. Cells are harvested by centrifugation at 4000 rpm for 15 minutes. Cells are lysed by ultrasound and proteins are isolated according to the method described (EMBO J. 1984, 3, 1429).

Выделенные белки анализируют в 10% ПААГ по стандартному методу Лэммли (Nature, 227, 680-685, 1970). В качестве маркеров молекулярных масс белков используют набор фирмы "Pharmacia", содержащий маркеры молекулярных масс от 20 до 160 кД. В качестве контроля используют полученный аналогичным образом лизат клеток штамма E.coli PLT90, содержащий векторную плазмиду pEL5A и не содержащий плазмид pHЕ70. Сравнительный анализ белкового состава показывает, что штамм E.coli, содержащий плазмиду pHЕ70, экспрессирует полипептид с молекулярной массой - 124 кД. Ниже представлена аминокислотная последовательность полипептида, определенная на основании нуклеотидной последовательности клонированного фрагмента ДНК, соответствующая фрагменту продукта второй открытой рамки считывания с 403 по 461 аминокислотные остатки:
X - A N G E P T V K L Y T S V E N A Q Q D K G I A I P H D I D L G E S R V V I Q D Y D N Q H E Q D R P T P S P A P S R P,
где X - аминокислотная последовательность бета-галактозидазы E.coli.
The isolated proteins are analyzed in 10% PAG according to the standard Laemmli method (Nature, 227, 680-685, 1970). As markers of molecular masses of proteins, a Pharmacia kit containing molecular weight markers from 20 to 160 kD is used. As a control, a similarly obtained cell lysate of E. coli strain PLT90 containing the vector plasmid pEL5A and not containing plasmids pHE70 is used. A comparative analysis of the protein composition shows that the E. coli strain containing the plasmid pHE70 expresses a polypeptide with a molecular weight of 124 kD. Below is the amino acid sequence of the polypeptide, determined on the basis of the nucleotide sequence of the cloned DNA fragment, corresponding to the product fragment of the second open reading frame from 403 to 461 amino acid residues:
X - ANGEPTVKLYTSVENAQQDKG IAIPHDIDLGESRVVIQDYDN QHEQDRPTPSPAPSRP,
where X is the amino acid sequence of beta-galactosidase E. coli.

Пример 10. Example 10

Контроль антигенной активности рекомбинантных полипептидов НЕ40, НЕ60, НЕ70. Control of antigenic activity of recombinant HE40, HE60, HE70 polypeptides.

Контроль антигенной активности полипептидов НЕ40, НЕ60, НЕ70 осуществляют методом иммуноблотинга. Для этого проводят процедуру электрофореза (как описано в примере 3), затем осуществляют перенос электрофоретически разделенных белков на нитроцеллюлозные мембраны ВН85 с помощью аппарата для электроблотинга в режиме 24В, 400 мА в течение 1 часа. Качество переноса проверяют окрашиванием мембран раствором 0,2% Понсо S в 3%-ной ТХУ в течение 5 мин при комнатной температуре. Краску дважды отмывают в течение 30 мин буфером TBS (0,15 М NaCl, 20 mM Трис-HCl, pH 7,4) с 0,05% Твина-20 при комнатной температуре. На следующем этапе проводят блокирование нитроцеллюлозных мембран с иммобилизованными белками раствором 5%-ного обезжиренного сухого молока в 0,1 М Na-фосфатном буфере, pH 7,4, в течение 30 минут при комнатной температуре. После блокирования мембраны в течение 1 ч при 37oC обрабатывают сыворотками, содержащими антитела к вирусу гепатита E, в разведении 1:100. Затем проводят трехкратную отмывку мембран TBS с 0,05%-ным Твином-20 в течение 30 мин при комнатной температуре. Выявление специфических антител осуществляют инкубацией фильтра с антивидовым пероксидазным конъюгатом при 37oC в течение 1 часа. Далее повторяют процедуру трехкратной отмывки. Реакцию проверяют добавлением 100 мкл 30%-ной перекиси водорода и 50 мл раствора диамнобензидина в 50 mM Трис-HCl, pH 7,5. Анализ показывает, что полученные полипептиды связываются с антителами к вирусу гепатита E.Control of the antigenic activity of the HE40, HE60, HE70 polypeptides is carried out by immunoblotting. For this, the electrophoresis procedure is carried out (as described in Example 3), then the electrophoretically separated proteins are transferred to the BH85 nitrocellulose membranes using a 24 V, 400 mA electro-blotting apparatus for 1 hour. The quality of the transfer is checked by staining the membranes with a solution of 0.2% Ponso S in 3% TCA for 5 min at room temperature. The paint is washed twice for 30 minutes with TBS buffer (0.15 M NaCl, 20 mM Tris-HCl, pH 7.4) with 0.05% Tween-20 at room temperature. In the next step, nitrocellulose membranes with immobilized proteins are blocked with a solution of 5% skimmed milk powder in 0.1 M Na-phosphate buffer, pH 7.4, for 30 minutes at room temperature. After blocking the membrane for 1 h at 37 o C treated with sera containing antibodies to hepatitis E virus, at a dilution of 1: 100. Then, TBS membranes were washed three times with 0.05% Tween-20 for 30 min at room temperature. Identification of specific antibodies is carried out by incubating the filter with an antispecies peroxidase conjugate at 37 ° C for 1 hour. Next, repeat the procedure three times washing. The reaction is checked by adding 100 μl of 30% hydrogen peroxide and 50 ml of a solution of diamnobenzidine in 50 mM Tris-HCl, pH 7.5. Analysis shows that the resulting polypeptides bind to antibodies to hepatitis E.

Пример 11. Example 11

Набор для массового серологического исследования образцов сыворотки или плазмы крови на присутствие антител к рекомбинантным антигенам, содержащим фрагменты белков - продуктов второй и третьей открытых рамок считывания вируса гепатита Е. Kit for mass serological testing of serum or plasma samples for the presence of antibodies to recombinant antigens containing protein fragments - products of the second and third open reading frames of hepatitis E.

Штаммы бактерий E.coli - продуценты полипептидов:
НЕ70 - продукта второй открытой рамки считывания с аминокислотной последовательностью
A N G E P T V K L Y T S V E N A Q Q D K G I A I P H D I D L G E S R V V I Q D Y D N Q H E Q D R P T P S P A P S R P
HE40 - продукта второй открытой рамки считывания с аминокислотной последовательностью
L G L Q G C A F Q S T V A E L Q R L K M K V G K T R E L Q P S L L I D
НЕ60 - продукта третьей открытой рамки считывания с аминокислотной последовательностью
S N P P D H S A P L G V T R P S A P P L P H V V D L P Q L G P R R C S Q A C
выращивают на среде LB с селективными добавками, клетки собирают центрифугированием, разрушают ультразвуком. Тельца включения, содержащие рекомбинантные полипептиды, промывают с помощью центрифугирования, солюбилизируют. Полипептиды очищают с помощью хроматографических методов, чистоту полученных полипептидов анализируют с помощью ДДС-Na-электрофореза. При изготовлении иммуносорбента для наборов сорбируют смесь полипептидов - продуктов второй открытой рамки считывания (концентрация каждого полипептида - 2,5 мкг/мл), и третьей открытой рамки считывания (5 мкг/мл) растворенных в 0,1 М фосфатно-солевом буфере pH 7,6. Сорбцию ведут при 4oC в течение 18 часов.
Strains of bacteria E.coli - producers of polypeptides:
HE70 - product of the second open reading frame with amino acid sequence
ANGEPTVKLYTSVENAQQDKG IAIPHDIDLGESRVVIQDYDN QHEQDRPTPSPAPSRP
HE40 - product of the second open reading frame with amino acid sequence
LGLQGCAFQSTVAELQRLKMK VGKTRELQPSLLID
HE60 - product of the third open reading frame with amino acid sequence
SNPPDHSAPLGVTRPSAPPLP HVVDLPQLGPRRCSQAC
grown on LB medium with selective additives, cells are harvested by centrifugation, destroyed by ultrasound. Inclusion bodies containing recombinant polypeptides are washed by centrifugation and solubilized. The polypeptides are purified using chromatographic methods, the purity of the obtained polypeptides is analyzed using DDS-Na electrophoresis. In the manufacture of immunosorbent for kits, a mixture of polypeptides is adsorbed - products of the second open reading frame (the concentration of each polypeptide is 2.5 μg / ml), and the third open reading frame (5 μg / ml) dissolved in 0.1 M phosphate-buffered saline pH 7 , 6. Sorption is carried out at 4 o C for 18 hours.

Конъюгат пероксидазы хрена с белком A St.aureus или с антивидовыми антителами получают с помощью периодатного окисления с последующей хроматографической очисткой готового конъюгата. Конъюгат, контрольные сыворотки и буферную смесь с гидроперитом (БСГ) для пероксидазной реакции лиофилизируют в ампулах, запаивают в атмосфере инертного газа. В качестве контрольного положительного иммунореагента используют сыворотку крови человека, содержащую антитела к вирусу гепатита E (К+). В качестве контрольного отрицательного иммунореагента (К-) используют сыворотку крови человека, не содержащую антитела к вирусу гепатита Е. The horseradish peroxidase conjugate with St. Aureus Protein A or with anti-species antibodies is obtained by periodical oxidation followed by chromatographic purification of the finished conjugate. The conjugate, control sera and the buffer mixture with hydroperite (BSH) for the peroxidase reaction are lyophilized in ampoules, sealed in an inert gas atmosphere. As a control positive immunoreagent, human blood serum containing antibodies to hepatitis E virus (K +) is used. As a control negative immunoreagent (K-), human blood serum is used that does not contain antibodies to hepatitis E.

Иммуносорбент представляет собой полистироловые или полихлорвиниловые планшеты для иммунологических реакций с иммобилизованной смесью рекомбинантных антигенов. Иммуносорбент перед использованием трехкратно промывают. Для промывок используют фосфатный буферный раствор pH 7,2 с 0,5% Твином-20 (ФСБ-Т) с помощью автоматического или ручного промывателя, внося не менее 0,2 мл раствора в лунку. По окончании промывки удаляют влагу из планшета. An immunosorbent is a polystyrene or polyvinyl chloride tablet for immunological reactions with an immobilized mixture of recombinant antigens. The immunosorbent is washed three times before use. For washing, use a phosphate buffer solution of pH 7.2 with 0.5% Tween-20 (FSB-T) using an automatic or manual washer, adding at least 0.2 ml of the solution to the well. At the end of the wash, moisture is removed from the tablet.

В 88 из 96 лунок вносят по 90 мкл раствора для разведения сывороток, содержащего 4% раствор клеток E.coli, лизированных ультразвуком, в ФСБ-Т и добавляют по 10 мкл предварительно разведенных (1:10) исследуемых сывороток, перемешивая содержимое лунок пипетированием или с помощью встряхивателя. В незаполненном ряду, например в 1-ом, в две лунки вносят 100 мкл К-, в 4 лунки - по 100 мкл К+ и в 2 лунки по 100 мкл раствора для разведения сывороток (контроль конъюгата). Планшет заклеивают пленкой и выдерживают в течение 60 минут при температуре 37oС.In 88 of 96 wells, 90 μl of serum dilution solution containing a 4% ultrasound lysed E.coli cell solution is added to PBS-T and 10 μl of previously diluted (1:10) test sera are added, mixing the contents of the wells by pipetting or with a shaker. In an unfilled row, for example, in the 1st row, 100 μl of K- are added to two wells, 100 μl of K + to 4 wells and 100 μl of serum dilution solution to 2 wells (conjugate control). The tablet is sealed with a film and incubated for 60 minutes at a temperature of 37 o C.

Содержимое лунок удаляют, планшет 5-кратно промывают и полностью удаляют влагу. Во все лунки планшета вносят по 100 мкл конъюгата. Планшет заклеивают новым листом пленки и выдерживают в течение 30 минут при температуре 37oС.The contents of the wells are removed, the plate is washed 5 times and the moisture is completely removed. 100 μl of conjugate are added to all wells of the plate. The tablet is sealed with a new sheet of film and incubated for 30 minutes at a temperature of 37 o C.

Содержимое лунок удаляют, планшет 5-кратно промывают и полностью удаляют влагу. В каждую лунку планшета вносят по 100 мкл 0,05% ортофенилендиамина в растворе БСГ. Планшет помещают в защищенное от света место на 15-20 минут при температуре 15-25oС. Реакцию останавливают внесением во все лунки по 50 мкл 2N серной кислоты.The contents of the wells are removed, the plate is washed 5 times and the moisture is completely removed. 100 μl of 0.05% orthophenylenediamine in a BSH solution are added to each well of the plate. The tablet is placed in a dark place for 15-20 minutes at a temperature of 15-25 o C. The reaction is stopped by adding 50 μl of 2N sulfuric acid to all wells.

Регистрацию проводят немедленно на спектрофотометре типа "Мультискан", измеряя оптическую плотность (ОП) при длине волны 492 нм. Выведение спектрофотометра на нулевой уровень осуществляют по воздуху или по чистому сухому планшету. Registration is carried out immediately on a Multiscan-type spectrophotometer, measuring the optical density (OD) at a wavelength of 492 nm. Bringing the spectrophotometer to zero is carried out by air or on a clean, dry tablet.

Вычисляют среднее значение ОП (ОПср) для контроля конъюгата, которое должно быть не более 0,15; ОПср К- - не более 0,2; ОПср К+ - в пределах от 0,8 до 1,8. Пороговое значение ОП вычисляют по формуле: ОПср К+, умноженное на расчетный коэффициент, указываемый в паспорте набора. Сыворотку учитывают как положительную, если значение ОП образца выше порогового. Чувствительность препарата не менее 99%, специфичность не менее 98%. Calculate the average value of OD (OPsr) to control the conjugate, which should be no more than 0.15; Opsr K- - not more than 0.2; OPSr K + - in the range from 0.8 to 1.8. The threshold value of OD is calculated by the formula: OPsr K +, multiplied by the calculated coefficient indicated in the passport set. Serum is considered positive if the OD value of the sample is above the threshold. The sensitivity of the drug is not less than 99%, specificity is not less than 98%.

Пример 12. Example 12

Набор для повторного (уточняющего и дифференцирующего) серологического исследования образцов сыворотки или плазмы крови на присутствие антител к каждому из соответствующих антигенов вируса гепатита E. A kit for repeated (specifying and differentiating) serological testing of serum or plasma samples for the presence of antibodies to each of the corresponding hepatitis E virus antigens.

Штаммы бактерий E. coli - продуценты полипептидов продуктов второй и третьей открытых рамок считывания вируса гепатита E, а также продуцент β-галактозидазы выращивают на среде LB с селективными добавками. Клетки собирают центрифугированием, разрушают ультразвуком. Тельца включения, содержащие рекомбинантные полипептиды, промывают с помощью центрифугирования, солюбилизируют. Полипептиды очищают хроматографическими методами, чистоту полученных полипептидов анализируют с помощью ДДС-Na-электрофореза. При изготовлении иммуносорбента для наборов готовят растворы вышеперечисленных полипептидов и "KАг" (контрольный антиген β-галактозидаза), каждый в виде отдельного раствора в 0,1 М фосфатно-солевом буфере, pH 7,6, в концентрации соответственно 5 мкг/мл. Сорбцию ведут при 4oC в течение 18 часов.The bacterial strains of E. coli, producers of polypeptides of the products of the second and third open reading frames of hepatitis E virus, as well as the producer of β-galactosidase, are grown on LB medium with selective additives. Cells are harvested by centrifugation, destroyed by ultrasound. Inclusion bodies containing recombinant polypeptides are washed by centrifugation and solubilized. The polypeptides are purified by chromatographic methods, the purity of the obtained polypeptides is analyzed by DDS-Na electrophoresis. In the manufacture of the immunosorbent for the kits, solutions of the above polypeptides and KAG (control β-galactosidase antigen) are prepared, each as a separate solution in 0.1 M phosphate-buffered saline, pH 7.6, at a concentration of 5 μg / ml, respectively. Sorption is carried out at 4 o C for 18 hours.

Конъюгат пероксидазы хрена с белком A St.aureus или с антивидовыми антителами получают при помощи периодатного окисления с последующей хроматографической очисткой готового конъюгата. Конъюгат, контрольные сыворотки и буферную смесь с гидроперитом (БСГ) для пероксидазной реакции лиофилизируют в ампулах, запаивают в атмосфере инертного газа. The horseradish peroxidase conjugate with St. Aureus Protein A or with anti-species antibodies is obtained by periodical oxidation followed by chromatographic purification of the finished conjugate. The conjugate, control sera and the buffer mixture with hydroperite (BSH) for the peroxidase reaction are lyophilized in ampoules, sealed in an inert gas atmosphere.

В качестве контрольного положительного иммунореагента используют сыворотку крови человека, содержащую антитела к вирусу гепатита E (K1+). В качестве контрольного отрицательного иммунореагента (К-) используют сыворотку крови человека, не содержащую антител к вирусу гепатита Е. As a control positive immunoreagent, human blood serum containing antibodies to hepatitis E virus (K1 +) is used. As a control negative immunoreagent (K-), human blood serum is used that does not contain antibodies to hepatitis E.

Иммуносорбент представляет собой полистироловые или полихлорвиниловые планшеты для иммунологических реакций с рекомбинантными антигенами - продуктами второй и третьей открытых рамок считывания генома вируса гепатита E, и контрольным антигеном, иммобилизованными по отдельности. Лунки планшета, в которых иммобилизованы антигены, называют рабочими. The immunosorbent is polystyrene or polyvinyl chloride tablets for immunological reactions with recombinant antigens - the products of the second and third open reading frames of the hepatitis E virus genome, and the control antigen, individually immobilized. Wells of the plate in which antigens are immobilized are called workers.

Иммуносорбент перед использованием трехкратно промывают раствором ФСБ-Т, удаляют влагу из планшета. В 88 из 96 лунок вносят по 90 мкл раствора для разведения сывороток, оставляя, как указано в табл. 1, пустыми лунки для К- и К+. Immunosorbent before use is washed three times with a solution of FSB-T, remove moisture from the tablet. In 88 out of 96 wells, 90 μl of serum dilution solution is added, leaving as indicated in the table. 1, empty wells for K- and K +.

Табл. 1 показывает расположение сорбированных рекомбинантных антигенов и KАг в рядах планшета a, b, c, d соответственно. Tab. 1 shows the location of the sorbed recombinant antigens and KAG in the rows of the tablet a, b, c, d, respectively.

Добавляют по 10 мкл предварительно разведенных (1:10) исследуемых сывороток в каждую из 4-х рабочих лунок горизонтального ряда, перемешивая содержимое лунок пипетированием или с помощью встряхивателя. В незаполненные ряды в соответствии с табл. 1 вносят К- и К+ по 100 мкл в каждую из восьми лунок. Планшет заклеивают пленкой и выдерживают в течение 60 минут при температуре 37oC.10 μl of pre-diluted (1:10) test sera are added to each of the 4 working wells of the horizontal row, mixing the contents of the wells by pipetting or using a shaker. In unfilled rows in accordance with table. 1 add K- and K + 100 μl to each of the eight wells. The tablet is sealed with a film and incubated for 60 minutes at a temperature of 37 o C.

Содержимое лунок удаляют с помощью промывателя, затем планшет 5-кратно промывают и полностью удаляют влагу. Во все рабочие лунки планшета вносят по 100 мкл конъюгата. Планшет заклеивают новым листом пленки и выдерживают в течение 30 минут при температуре 37oC.The contents of the wells are removed using a washer, then the plate is washed 5 times and the moisture is completely removed. 100 μl of conjugate are added to all working wells of the plate. The tablet is sealed with a new sheet of film and incubated for 30 minutes at a temperature of 37 o C.

Содержимое лунок удаляют, планшет 5-кратно промывают и полностью удаляют влагу. В каждую рабочую лунку планшета вносят по 100 мкл 0,05% ортофенилендиамина в растворе БСГ. Планшет помещают в защищенное от света места на 15-20 минут при температуре 15-25oC. Реакцию останавливают внесением во все лунки по 50 мкл 2N серной кислоты.The contents of the wells are removed, the plate is washed 5 times and the moisture is completely removed. In each working well of the tablet, 100 μl of 0.05% orthophenylenediamine in a BSH solution are added. The tablet is placed in a dark place for 15-20 minutes at a temperature of 15-25 o C. The reaction is stopped by adding 50 μl of 2N sulfuric acid to all wells.

Регистрацию проводят немедленно на спектрофотометре типа "Мультискан", измеряя оптическую плотность (ОП) при длине волны 492 нм. Выведение спектрофотометра на нулевой уровень осуществляют по воздуху или по чистому сухому планшету. Registration is carried out immediately on a Multiscan-type spectrophotometer, measuring the optical density (OD) at a wavelength of 492 nm. Bringing the spectrophotometer to zero is carried out by air or on a clean, dry tablet.

Вычисляют среднее по 5-ти лункам значение ОП для К-, которое должно быть не более 0,2. Значение ОП К+ по лункам с контрольным антигеном (11Н) должно быть не более 0,2. A 5-well average of the OD value for K- is calculated, which should be no more than 0.2. The value of OP K + in wells with a control antigen (11H) should be no more than 0.2.

Для каждой сыворотки вычисляют отношения ОП по каждому рекомбинантному антигену к ОП по контрольному антигену. Сигнал по антигену учитывают как положительный, если соответствующее отношение превышает коэффициент R, указанный в паспорте. Сигнал по антигену учитывают как отрицательный, если соответствующее отношение меньше коэффициента N, указанного в паспорте. Промежуточный вариант учитывают как сомнительный. For each serum, the OD ratios of each recombinant antigen to the OD of the control antigen are calculated. The antigen signal is considered positive if the corresponding ratio exceeds the coefficient R indicated in the passport. The signal for the antigen is considered negative if the corresponding ratio is less than the coefficient N indicated in the passport. The intermediate option is considered as doubtful.

Чувствительность препарата не менее 99%, специфичность не менее 98%. В качестве твердого носителя для нанесения рекомбинантных антигенов могут быть использованы не только планшеты для иммунологических реакций, но и любая другая твердая фаза. Например, полистироловые шарики, нитроцеллюлоза, латекс, эритроциты и др. В этих случаях рекомбинантные антигены выделяют тем же методом, что и в примерах 1 и 2, используют те же либо другие иммунохимические реакции (например, агглютинациии) и результаты учитывают как спектрофотометрически, так и визуально либо при помощи других приборов. The sensitivity of the drug is not less than 99%, specificity is not less than 98%. As a solid carrier for applying recombinant antigens, not only immunological reaction plates can be used, but also any other solid phase. For example, polystyrene beads, nitrocellulose, latex, erythrocytes, etc. In these cases, recombinant antigens are isolated by the same method as in examples 1 and 2, the same or other immunochemical reactions (for example, agglutination) are used and the results are taken into account both spectrophotometrically and and visually or using other devices.

Пример 13. Example 13

Рекомбинантные белки НЕ40, НЕ60, НЕ70 и β-галактозидазу очищают, как описано в примере 1. Сорбцию антигенов на планшет ведут при 4oC, как описано в примерах 11 и 12. Ряд А планшета сорбируют только полипептидом НЕ40; ряд В сорбируют смесью полипептидов НЕ40, НЕ60 и НЕ70; ряд С смесью полипептидов НЕ40 и НЕ60; ряд D смесью полипептидов НЕ40 и НЕ70; ряд E смесью полипептидов НЕ60 и НЕ70.Recombinant proteins HE40, HE60, HE70 and β-galactosidase are purified as described in Example 1. Sorption of antigens on a plate is carried out at 4 ° C, as described in examples 11 and 12. Row A of the plate is sorbed only by HE40 polypeptide; row B is sorbed with a mixture of HE40, HE60 and HE70 polypeptides; series C with a mixture of HE40 and HE60 polypeptides; row D with a mixture of HE40 and HE70 polypeptides; row E with a mixture of HE60 and HE70 polypeptides.

В лунки с номерами 1-11 рядов A-E планшета добавляют 11 различных сывороток больных гепатитом E, а в лунки 12 отрицательную сыворотку. 11 different sera of hepatitis E patients are added to wells 1 to 11 rows of the A-E plate, and negative serum to wells 12.

Постановку иммунологических реакций и обработку полученных данных осуществляют как описано в примере 12. Результаты экспериментов представлены в табл. 2. Знаком (+) отмечены лунки, в которых исследуемые сыворотки положительно прореагировали с иммуносорбентом, знаком (-) - лунки с отрицательно прореагировавшими сыворотками. The formulation of immunological reactions and the processing of the obtained data is carried out as described in example 12. The experimental results are presented in table. 2. The (+) mark marks the wells in which the test sera reacted positively with the immunosorbent, the (-) mark marks the wells with negatively reacted sera.

Как видно из табл. 2, только сорбция всех четырех антигенов (ряд В планшета) приводит к идентификации всех положительных сывороток (чувствительность - 100%). В других вариантах постановки чувствительность тест-системы колеблется от 82 до 90%. As can be seen from the table. 2, only the sorption of all four antigens (row B of the tablet) leads to the identification of all positive sera (sensitivity - 100%). In other settings, the sensitivity of the test system ranges from 82 to 90%.

Таким образом, данное изобретение позволяет повысить чувствительность и специфичность набора за счет определения антител к большему числу вирусных белков и спектра антител к индивидуальным вирусным белкам. Thus, this invention allows to increase the sensitivity and specificity of the kit by determining antibodies to a greater number of viral proteins and the spectrum of antibodies to individual viral proteins.

Claims (5)

1. Способ получения полипептида, обладающего антигенной активностью вируса гепатита Е, предусматривающий создание участка ДНК, кодирующего полипептид, клонирование в векторной экспрессии с получением рекомбинантной ДНК, трансформацию полученной рекомбинантной ДНК штамма-хозяина, культивирование трансформантов и выделение целевого продукта, отличающийся тем, что создают участок ДНК, кодирующий полипептид, содержащий фрагмент белков - продуктов второй или третьей открытых рамок считывания вирусного генома. 1. A method of producing a polypeptide having antigenic activity of hepatitis E virus, comprising creating a DNA region encoding a polypeptide, cloning in vector expression to obtain recombinant DNA, transforming the obtained recombinant DNA of the host strain, culturing transformants and isolating the target product, characterized in that they create the target product a piece of DNA encoding a polypeptide containing a fragment of proteins - products of the second or third open reading frame of the viral genome. 2. Способ по п.1, отличающийся тем, что создают участок ДНК, кодирующий полипептид, содержащий фрагмент белков - продуктов второй открытой рамки считывания вирусного генома с аминокислотной последовательностью (см. графическую часть формулы). 2. The method according to claim 1, characterized in that they create a plot of DNA encoding a polypeptide containing a fragment of proteins - products of the second open reading frame of the viral genome with the amino acid sequence (see graphic part of the formula). 3. Способ по п.1, отличающийся тем, что создают участок ДНК, кодирующий полипептид, содержащий фрагмент белков-продуктов второй открытой рамки считывания вирусного генома с аминокислотной последовательностью (см. графическую часть формулы). 3. The method according to claim 1, characterized in that create a plot of DNA encoding a polypeptide containing a fragment of the protein products of the second open reading frame of the viral genome with the amino acid sequence (see graphic part of the formula). 4. Способ по п.1, отличающийся тем, что создают участок ДНК, кодирующий полипептид, содержащий фрагмент белков-продуктов третьей открытой рамки считывания вирусного генома с аминокислотной последовательностью (см. графическую часть формулы). 4. The method according to claim 1, characterized in that create a plot of DNA encoding a polypeptide containing a fragment of the protein products of the third open reading frame of the viral genome with the amino acid sequence (see graphic part of the formula). 5. Набор для определения антител к возбудителю гепатита Е-вирусу гепатита Е, включающий иммуносорбент, на основе антигенов вируса гепатита Е, реагенты для определения присутствия антител, отличающийся тем, что в качестве антигена вируса гепатита Е он содержит фрагменты белков - продуктов второй и/или третьей открытых рамок считывания вирусного генома, имеющие аминокислотные последовательности, охарактеризованные в пп.2-4 соответственно, иммобилизованные на твердом носителе в смеси и/или по отдельности. 5. A kit for determining antibodies to the causative agent of hepatitis E hepatitis E virus, including an immunosorbent based on hepatitis E virus antigens, reagents for determining the presence of antibodies, characterized in that it contains fragments of proteins, the second and / or second products, as an antigen of the hepatitis E virus or a third open reading frame of the viral genome having the amino acid sequences described in claims 2-4, respectively, immobilized on a solid carrier in a mixture and / or separately.
RU98119633/13A 1998-10-26 Method of synthesis of polypeptide eliciting antigenic activity of hepatitis e virus and set for assay of antibody raised to hepatitis e pathogen RU2172346C2 (en)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU98119633A RU98119633A (en) 2000-10-20
RU2172346C2 true RU2172346C2 (en) 2001-08-20

Family

ID=

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2711907C2 (en) * 2017-12-22 2020-01-23 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова" (ФГБНУ НИИВС им. И.И. Мечникова) Recombinant protein containing antigen-significant fragments of hepatitis e virus proteins, used in test systems for hepatitis e serodiagnosis (embodiments)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU93051201A (en) * 1993-11-04 1997-01-10 Северо-Осетинский государственный медицинский институт METHOD FOR DETECTING HEPATITIS E VIRUS ANTIGEN
EP0419182B1 (en) * 1989-09-15 2000-01-19 Oya, Akira, Dr., Director General of the National Institute of Health of Japan, on behalf of The National Institute of Japan New HCV isolate J-1

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0419182B1 (en) * 1989-09-15 2000-01-19 Oya, Akira, Dr., Director General of the National Institute of Health of Japan, on behalf of The National Institute of Japan New HCV isolate J-1
RU93051201A (en) * 1993-11-04 1997-01-10 Северо-Осетинский государственный медицинский институт METHOD FOR DETECTING HEPATITIS E VIRUS ANTIGEN

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2711907C2 (en) * 2017-12-22 2020-01-23 Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова" (ФГБНУ НИИВС им. И.И. Мечникова) Recombinant protein containing antigen-significant fragments of hepatitis e virus proteins, used in test systems for hepatitis e serodiagnosis (embodiments)

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Kuno et al. Detecting artificial anti-dengue IgM immune complexes using an enzyme-linked immunosorbent assay
Saikawa et al. Neutralizing linear epitopes of B19 parvovirus cluster in the VP1 unique and VP1-VP2 junction regions
RU2130969C1 (en) Composition for diagnosis of human hepatitis c (variants), method and set for detection of antibodies to human hepatitis c virus
EP0199438B1 (en) Htlv iii polypeptides
Deneke et al. Evaluation of recombinant LigB antigen-based indirect ELISA and latex agglutination test for the serodiagnosis of bovine leptospirosis in India
Wang et al. Immunogenic domains of hepatitis delta virus antigen: peptide mapping of epitopes recognized by human and woodchuck antibodies
DE69131707T2 (en) Detection of hepatits C using recombinant antigens
DK167158B1 (en) DNA DNA DNA, CODES FOR A PROTEIN THAT IS IMMUNOLOGY-REACTIVE AGAINST ANTIBODIES, LAVES, A RECOMBINANT PLASMID
Abd-Alla et al. Serum IgM antibody response to the galactose-inhibitable adherence lectin of Entameoba histolytica.
JP3095219B2 (en) Gag-encoded peptides reactive with antibodies to LAV and uses thereof
Koopmans et al. Enzyme-linked immunosorbent assay reactivity of torovirus-like particles in fecal specimens from humans with diarrhea
CN106279378A (en) Varicella zoster virus gE antigen and the purposes in detection varicella zoster virus antibody thereof
JPH04297871A (en) Method of measuring chlamydia trachomatis antibody and medicine for diagnosing trachomatis chlamydia infectious disease
JP2001505778A (en) Novel EIA test using non-dentured HIV antigen for early detection of HIV infection
Della-Porta et al. A serological comparison of the Australian isolate of bluetongue virus type 20 (CSIRO 19) with bluetongue group viruses
Lozano et al. Rapid diagnosis of Argentine hemorrhagic fever by reverse transcriptase PCR-based assay
CN106885903A (en) A kind of zika virus E antigens and its application in anti-zika virus antibody is detected
MacLachlan et al. Humoral immune response of calves to bluetongue virus infection
Johansson et al. Enzyme‐linked immunosorbent assay for detection of enteric adenovirus 41
Cook et al. The effects of vaccination with tissue culture-derived viral vaccines on detection of antibodies to equine arteritis virus by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA)
PT643835E (en) TEST AND METHOD FOR HTLV-I / HTLV-II
RU2172346C2 (en) Method of synthesis of polypeptide eliciting antigenic activity of hepatitis e virus and set for assay of antibody raised to hepatitis e pathogen
CN106279408B (en) Monoclonal antibody and antibody combination for resisting foot-and-mouth disease type O virus and application of monoclonal antibody and antibody combination in detection of virus antigen and antibody
Hacham et al. Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of virus-specific IgM antibodies to varicella-zoster virus
Pagano et al. The specificity and interaction with poliovirus of an inhibitory bovine serum