RU2018122664A - Разработанные бактериальные композиции - Google Patents
Разработанные бактериальные композиции Download PDFInfo
- Publication number
- RU2018122664A RU2018122664A RU2018122664A RU2018122664A RU2018122664A RU 2018122664 A RU2018122664 A RU 2018122664A RU 2018122664 A RU2018122664 A RU 2018122664A RU 2018122664 A RU2018122664 A RU 2018122664A RU 2018122664 A RU2018122664 A RU 2018122664A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- dbc
- composition according
- composition
- paragraphs
- population
- Prior art date
Links
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims 25
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 title claims 7
- 241000894007 species Species 0.000 claims 9
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims 7
- 241000193163 Clostridioides difficile Species 0.000 claims 6
- 108020004465 16S ribosomal RNA Proteins 0.000 claims 4
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims 4
- 229940121372 histone deacetylase inhibitor Drugs 0.000 claims 3
- 239000003276 histone deacetylase inhibitor Substances 0.000 claims 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims 3
- 108010000231 Choloylglycine hydrolase Proteins 0.000 claims 2
- 208000027244 Dysbiosis Diseases 0.000 claims 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims 2
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N Indole Chemical compound C1=CC=C2NC=CC2=C1 SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 239000002775 capsule Substances 0.000 claims 2
- 230000007140 dysbiosis Effects 0.000 claims 2
- 244000000010 microbial pathogen Species 0.000 claims 2
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims 2
- 108010073927 12-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase Proteins 0.000 claims 1
- WLAMNBDJUVNPJU-UHFFFAOYSA-M 2-methylbutyrate Chemical compound CCC(C)C([O-])=O WLAMNBDJUVNPJU-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 1
- GWYFCOCPABKNJV-UHFFFAOYSA-M 3-Methylbutanoic acid Natural products CC(C)CC([O-])=O GWYFCOCPABKNJV-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 1
- 102100039358 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2 Human genes 0.000 claims 1
- 101710172561 3alpha-hydroxysteroid dehydrogenase Proteins 0.000 claims 1
- 108010014831 7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase Proteins 0.000 claims 1
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M Butyrate Chemical compound CCCC([O-])=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 1
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Natural products CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 102100036504 Dehydrogenase/reductase SDR family member 9 Human genes 0.000 claims 1
- 108010015031 Glycochenodeoxycholic Acid Proteins 0.000 claims 1
- 108010007979 Glycocholic Acid Proteins 0.000 claims 1
- 108090000353 Histone deacetylase Proteins 0.000 claims 1
- 102000003964 Histone deacetylase Human genes 0.000 claims 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical class C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 claims 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 claims 1
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M Propionate Chemical compound CCC([O-])=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 1
- 239000003613 bile acid Substances 0.000 claims 1
- 229940009025 chenodeoxycholate Drugs 0.000 claims 1
- RUDATBOHQWOJDD-BSWAIDMHSA-N chenodeoxycholic acid Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(O)=O)C)[C@@]2(C)CC1 RUDATBOHQWOJDD-BSWAIDMHSA-N 0.000 claims 1
- 229940099352 cholate Drugs 0.000 claims 1
- BHQCQFFYRZLCQQ-OELDTZBJSA-N cholic acid Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 BHQCQFFYRZLCQQ-OELDTZBJSA-N 0.000 claims 1
- 229940110456 cocoa butter Drugs 0.000 claims 1
- 235000019868 cocoa butter Nutrition 0.000 claims 1
- 229940009976 deoxycholate Drugs 0.000 claims 1
- KXGVEGMKQFWNSR-LLQZFEROSA-N deoxycholic acid Chemical compound C([C@H]1CC2)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 KXGVEGMKQFWNSR-LLQZFEROSA-N 0.000 claims 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims 1
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 claims 1
- GHCZAUBVMUEKKP-GYPHWSFCSA-N glycochenodeoxycholic acid Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCC(O)=O)C)[C@@]2(C)CC1 GHCZAUBVMUEKKP-GYPHWSFCSA-N 0.000 claims 1
- RFDAIACWWDREDC-FRVQLJSFSA-N glycocholic acid Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCC(O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 RFDAIACWWDREDC-FRVQLJSFSA-N 0.000 claims 1
- PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N indole Natural products CC1=CC=CC2=C1C=CN2 PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N indolenine Natural products C1=CC=C2CC=NC2=C1 RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- KQNPFQTWMSNSAP-UHFFFAOYSA-N isobutyric acid Chemical compound CC(C)C(O)=O KQNPFQTWMSNSAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- GWYFCOCPABKNJV-UHFFFAOYSA-N isovaleric acid Chemical compound CC(C)CC(O)=O GWYFCOCPABKNJV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 claims 1
- WBWWGRHZICKQGZ-HZAMXZRMSA-N taurocholic acid Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(=O)NCCS(O)(=O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 WBWWGRHZICKQGZ-HZAMXZRMSA-N 0.000 claims 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K35/00—Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
- A61K35/66—Microorganisms or materials therefrom
- A61K35/74—Bacteria
- A61K35/741—Probiotics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K35/00—Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
- A61K35/66—Microorganisms or materials therefrom
- A61K35/74—Bacteria
- A61K35/741—Probiotics
- A61K35/742—Spore-forming bacteria, e.g. Bacillus coagulans, Bacillus subtilis, clostridium or Lactobacillus sporogenes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Mycology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Virology (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicinal Preparation (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Acyclic And Carbocyclic Compounds In Medicinal Compositions (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Food Preservation Except Freezing, Refrigeration, And Drying (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Claims (20)
1. Композиция, содержащая жизнеспособную популяцию бактерий, включающую бактериальные виды DBC 1, DBC 2, DBC 3, DBC 4, DBC 5, DBC 6, DBC 7, DBC 8, или DBC 9 из Таблицы 3, или DBC S1, DBC S2, DBC S4, DBC S5, DBC S6, DBC S7, DBC S8, DBC S9, DBC S10, DBC S11, DBC S12, DBC S13, DBC S14, DBC S15, DBC S16, DBC S17, DBC S18, DBC S19, DBC S20, DBC S21, DBC S22, DBC S23 или DBC S24 из Таблицы 4.
2. Композиция по п. 1, отличающаяся тем, что 16S рДНК каждого из бактериальных видов в DBC имеет по меньшей мере 97% идентичности с по меньшей мере одной последовательностью 16S рДНК на Фигуре 1.
3. Композиция по п. 1, отличающаяся тем, что композиция состоит из жизнеспособной популяции бактериальных видов DBC 1, DBC 2, DBC 3, DBC 4, DBC 5, DBC 6, DBC 7, DBC 8, DBC 9, DBC S1, DBC S2, DBC S4, DBC S5, DBC S6, DBC S7, DBC S8, DBC S9, DBC S10, DBC S11, DBC S12, DBC S13, DBC S14, DBC S15, DBC S16, DBC S17, DBC S18, DBC S19, DBC S20, DBC S21, DBC S22, DBC S23 или DBC S24.
4. Композиция по п. 3, отличающаяся тем, что 16S рДНК каждого из бактериальных видов в DBC имеет по меньшей мере 97% идентичности с по меньшей мере одной последовательностью 16S рДНК на Фигуре 1.
5. Композиция по любому из пп. 1-4, отличающаяся тем, что популяция бактериальных видов способна утилизировать по меньшей мере 90% источников углерода, перечисленных на Фигуре 4.
6. Композиция, содержащая популяцию по меньшей мере пяти видов жизнеспособных бактерий, отличающаяся тем, что по меньшей мере один из видов популяции имеет один или несколько признаков, выбранных из группы, состоящей из: (i) утилизации одного или нескольких источников углерода, утилизируемых патогенным микроорганизмом, (ii) продуцирования ингибитора гистондеацетилазы (HDAC), (iii) продуцирования индола или других метаболитов триптофана, и (iv) продуцирования фермента, участвующего в регуляции желчных кислот.
7. Композиция по п. 6, отличающаяся тем, что патогенный микроорганизм представляет собой C. difficile, и популяция включает один или несколько видов жизнеспособных бактерий, которые могут утилизировать по меньшей мере пять разных источников углерода C. difficile.
8. Композиция по п. 7, отличающаяся тем, что источники углерода C. difficile выбирают из группы, состоящей из: таурохолата, гликохолата, гликохенодезоксихолата, таурохенодезоксихолата, холата, хенодезоксихолата и дезоксихолата.
9. Композиция по п. 6, отличающаяся тем, что популяция включает один или несколько видов жизнеспособных бактерий, которые продуцируют ингибитор HDAC, выбранный из группы, состоящей из: бутирата, изовалерата, изобутирата, пропионата и 2-метилбутирата.
10. Композиция по п. 6, отличающаяся тем, что популяция включает один или несколько видов, которые продуцируют один или несколько ферментов, выбранных из группы, состоящей из гидролазы желчных солей (BSH), 3-α-гидроксистероиддегидрогеназы (3-α-HSDH), 7-α-гидроксистероиддегидрогеназы (7-α-HSDH) и 12-α-гидроксистероиддегидрогеназы (12-α-HSDH).
11. Композиция, содержащая по меньшей мере один вид из каждого из кладов 86, 90, 101, 139, 195, 197, 206, 233, 238, 241, 244 и 290, и необязательно вид из клада 202.
12. Композиция по любому из пп. 6-11, отличающаяся тем, что композиция включает 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 видов бактерий.
13. Композиция по любому из пп. 1-12, отличающаяся тем, что по меньшей мере 75% бактерий являются спорами.
14. Состав, содержащий композицию по любому из пп. 1-13 и фармацевтически приемлемый эксципиент.
15. Состав по п. 14, отличающийся тем, что фармацевтически приемлемый эксципиент содержит глицерин, полиэтиленгликоль или масло какао.
16. Состав по п. 14 или 15, отличающийся тем, что состав находится в капсуле или таблетке.
17. Использование фармацевтически эффективного количества композиции по любому из пп. 1-13 для предотвращения или лечения дисбиоза у субъекта с риском, или с диагнозом, дисбиоза.
18. Использование по п. 17, отличающееся тем, что общая концентрация бактерий в композиции составляет от 10e1 до 10e9.
19. Использование по п. 17 или 18, отличающееся тем, что бактерии композиции содержатся в 1, 2, 3, 4 или 5 капсулах.
20. Использование терапевтически эффективного количества композиции по любому из пп. 1-13 для лечения инфекции C. difficile, или предотвращения инфекции C. difficile, или предотвращения рецидива инфекции C. difficile.
Applications Claiming Priority (7)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201562259523P | 2015-11-24 | 2015-11-24 | |
| US62/259,523 | 2015-11-24 | ||
| US201662351696P | 2016-06-17 | 2016-06-17 | |
| US62/351,696 | 2016-06-17 | ||
| US201662401011P | 2016-09-28 | 2016-09-28 | |
| US62/401,011 | 2016-09-28 | ||
| PCT/US2016/063697 WO2017091783A2 (en) | 2015-11-24 | 2016-11-23 | Designed bacterial compositions |
Related Child Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2022114519A Division RU2022114519A (ru) | 2015-11-24 | 2016-11-23 | Разработанные бактериальные композиции |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2018122664A true RU2018122664A (ru) | 2019-12-25 |
| RU2018122664A3 RU2018122664A3 (ru) | 2020-04-15 |
| RU2773327C2 RU2773327C2 (ru) | 2022-06-02 |
Family
ID=
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| FI3380108T3 (fi) | 2023-03-03 |
| ES2938361T3 (es) | 2023-04-10 |
| PL3380108T3 (pl) | 2023-03-27 |
| JP2019501136A (ja) | 2019-01-17 |
| CA3006187A1 (en) | 2017-06-01 |
| BR112018010430A2 (pt) | 2018-11-27 |
| EP4233884A3 (en) | 2023-10-04 |
| WO2017091783A3 (en) | 2017-07-13 |
| WO2017091783A2 (en) | 2017-06-01 |
| MX2018006283A (es) | 2019-09-06 |
| DK3380108T3 (da) | 2023-02-06 |
| RU2018122664A3 (ru) | 2020-04-15 |
| PT3380108T (pt) | 2023-02-17 |
| AU2016359178A1 (en) | 2018-06-14 |
| US20240216444A1 (en) | 2024-07-04 |
| JP2022033885A (ja) | 2022-03-02 |
| EP3380108A2 (en) | 2018-10-03 |
| KR20180083894A (ko) | 2018-07-23 |
| EP3380108B1 (en) | 2022-11-16 |
| EP4233884A2 (en) | 2023-08-30 |
| AU2024200663A1 (en) | 2024-02-22 |
| US20190247447A1 (en) | 2019-08-15 |
| JP7523884B2 (ja) | 2024-07-29 |
| CN109661236A (zh) | 2019-04-19 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP2019501136A5 (ru) | ||
| Dubois et al. | Control of Clostridium difficile physiopathology in response to cysteine availability | |
| Kaiser et al. | The role of two branched‐chain amino acid transporters in S taphylococcus aureus growth, membrane fatty acid composition and virulence | |
| Sun et al. | Fatty acids regulate stress resistance and virulence factor production for Listeria monocytogenes | |
| Nilsen et al. | Novel selective inhibition of Lactobacillus iners by Lactobacillus-derived bacteriocins | |
| Azriel et al. | The stringent response regulator DksA is required for Salmonella enterica serovar Typhimurium growth in minimal medium, motility, biofilm formation, and intestinal colonization | |
| AU2017279037A1 (en) | New medical use of probiotics | |
| JP2018039833A5 (ru) | ||
| EA201490512A1 (ru) | Композиции, содержащие культивируемую в анаэробных условиях микробиоту кишечника человека | |
| Zhao et al. | SpoT-mediated NapA upregulation promotes oxidative stress-induced Helicobacter pylori biofilm formation and confers multidrug resistance | |
| MY200941A (en) | (r)- and (s)-1-(3-(3-n,n-dimethylaminocarbonyl)phenoxyl-4-nitrophenyl)-1-ethyl-n,n-bis(ethylene)phosphoramidate, compositions and methods for their use and preparation | |
| EA202092490A1 (ru) | Модуляторы метилмодифицирующих ферментов, композиции и их применения | |
| Shang et al. | Comparative fitness and determinants for the characteristic drug resistance of ST239-MRSA-III-t030 and ST239-MRSA-III-t037 strains isolated in China | |
| EA201892075A1 (ru) | Комбинации ингибиторов lsd1 для применения для лечения солидных опухолей | |
| BR112014031730A2 (pt) | entidades químicas, composições farmacêuticas, compostos ou sais farmaceuticamente aceitáveis dos mesmos, usos de entidades químicas ou composições e métodos para tratar doenças, distúrbios ou condições médicas mediadas pela atividade enzimática de pde1 e para modular a atividade da enzima pde1 | |
| WO2014100071A3 (en) | Substituted pyrrolopyrimidines as hdm2 inhibitors | |
| EA201300874A1 (ru) | Новые азаиндолилфенилсульфонамиды в качестве ингибиторов серин/треонинкиназы | |
| Sun et al. | Gut microbiota‐mediated NLRP12 expression drives the attenuation of dextran sulphate sodium‐induced ulcerative colitis by Qingchang Wenzhong decoction | |
| Binesse et al. | Roles of reactive oxygen species-degrading enzymes of Francisella tularensis SCHU S4 | |
| MacDonald et al. | Coxiella burnetii alters cyclic AMP-dependent protein kinase signaling during growth in macrophages | |
| Chen et al. | Lactate-utilizing bacteria ameliorates DSS-induced colitis in mice | |
| Yau et al. | Randomised clinical trial: Faecal microbiota transplantation for irritable bowel syndrome with diarrhoea | |
| MX2023001287A (es) | Bancos universales de células t específicas de antígeno y métodos de fabricación y uso terapéutico de los mismos. | |
| Li et al. | Salmonella proteomic profiling during infection distinguishes the intracellular environment of host cells | |
| EA202192925A1 (ru) | Твердые формы ингибитора glyt1 |