[go: up one dir, main page]

RU2018104570A - Экспрессия fgfr и чувствительность к ингибитору fgfr - Google Patents

Экспрессия fgfr и чувствительность к ингибитору fgfr Download PDF

Info

Publication number
RU2018104570A
RU2018104570A RU2018104570A RU2018104570A RU2018104570A RU 2018104570 A RU2018104570 A RU 2018104570A RU 2018104570 A RU2018104570 A RU 2018104570A RU 2018104570 A RU2018104570 A RU 2018104570A RU 2018104570 A RU2018104570 A RU 2018104570A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
exon
expression
level
clorf43
gpi
Prior art date
Application number
RU2018104570A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2728674C2 (ru
RU2018104570A3 (ru
Inventor
Анна ВАСЛЕН-ШЕССЕ
Коринн Мулон
Франк БРИШОРИ
Анна ПОКОРСКА-БОЧЧИ
Original Assignee
Дебиофарм Интернэшнл Са
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Дебиофарм Интернэшнл Са filed Critical Дебиофарм Интернэшнл Са
Publication of RU2018104570A publication Critical patent/RU2018104570A/ru
Publication of RU2018104570A3 publication Critical patent/RU2018104570A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2728674C2 publication Critical patent/RU2728674C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/112—Disease subtyping, staging or classification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/118—Prognosis of disease development
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/705—Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • G01N2333/71—Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants for growth factors; for growth regulators
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Acyclic And Carbocyclic Compounds In Medicinal Compositions (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Claims (41)

1. Способ персонализированной терапии рака, включающий:
(a) получение биопсии опухоли или биопсии жидкости от субъекта, страдающего раком;
(b) определение уровней экспрессии FGFR1, FGFR2 и FGFR3 и
(c) в случае, если определенный уровень экспрессии по меньшей мере одного из FGFR1, FGFR2 и FGFR3 превышает предварительно установленный пороговый уровень, применение к указанному субъекту схемы лечения, которая включает введение фармацевтической композиции, содержащей эффективное количество Соединения А.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что уровни экспрессии FGFR1, FGFR2 и FGFR3 измеряют на уровне матричной РНК.
3. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии по меньшей мере одного FGFR соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 44% до 73% для по меньшей мере одного FGFR, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,104 до 0,641 для FGFR1, от 0,257 до 1,094 для FGFR2 и от 0,128 до 0,815 для FGFR3; при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой: АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPLI9, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
4. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии по меньшей мере одного FGFR соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 60% до 73%, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,301 до 0,641 для FGFR1, от 0,669 до 1,094 для FGFR2 и от 0,289 до 0,815 для FGFR3, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
5. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии по меньшей мере одного FGFR соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 65% до 73% для по меньшей мере одного FGFR, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют от 0,484 до 0,641 для FGFR1, от 0,884 до 1,094 для FGFR2 и от 0,490 до 0,815 для FGFR3, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
6. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии по меньшей мере одного FGFR соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 70% до 73% для по меньшей мере одного FGFR, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,558 до 0,641 для FGFR1, от 0,984 до 1,094 для FGFR2 и от 0,671 до 0,815 для FGFR3, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
7. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой рак желудка, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR2 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 44% до 83% для FGFR2, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют от 0,257 до 1,610 для FGFR2, при этом указанные 16 эталонные гены представляют собой: АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
8. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой рак желудка, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR2 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 60% до 83% для FGFR2, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,669 до 1,610 для FGFR2, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 CHMP2A, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
9. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой рак желудка, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR2 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 70% до 83% для FGFR2, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют от 0,984 до 1,610 для FGFR2, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой: АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
10. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой рак желудка, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR2 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 80% до 83% для FGFR2, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 1,460 до 1,610 для FGFR2, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
11. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой плоскоклеточную карциному пищевода, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR1 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 44% до 84% для FGFR1, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,104 до 1,362 для FGFR1, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
12. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой плоскоклеточную карциному пищевода, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR1 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 60% до 84% для FGFR1, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,301 до 1,362 для FGFR1, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
13. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой плоскоклеточную карциному пищевода, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR1 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 70% до 84% для FGFR1, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,558 до 1,362 для FGFR1, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
14. Способ по п. 2, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой плоскоклеточную карциному пищевода, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR1 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 80% до 84% для FGFR1, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,759 до 1,362 для FGFR1, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
15. Способ по п. 1, отличающийся тем, что уровни экспрессии FGFR1, FGFR2 и FGFR3 измеряют на уровне белка.
16. Способ выбора субъекта, страдающего раком, для применения схемы лечения, которая включает введение фармацевтической композиции, содержащей эффективное количество Соединения А, причем указанный способ включает
(a) получение биопсии опухоли или биопсии жидкости от указанного субъекта, страдающего раком;
(b) определение уровней экспрессии FGFR1, FGFR2 и FGFR3 и
(с) в случае, если определенный уровень экспрессии по меньшей мере одного из FGFR1, FGFR2 и FGFR3 превышает предварительно установленный пороговый уровень, указанного субъекта считают подходящим для применения данной схемы лечения.
17. Способ по п. 16, отличающийся тем, что уровни экспрессии FGFR1, FGFR2 и FGFR3 измеряют на уровне матричной РНК.
18. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный предварительно установленный пороговый уровень по меньшей мере одного FGFR соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 44% до 73% для по меньшей мере одного FGFR, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,104 до 0,641 для FGFR1, от 0,257 до 1,094 для FGFR2 и от 0,128 до 0,815 для FGFR3, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
19. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный предварительно установленный пороговый уровень по меньшей мере одного FGFR соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 60% до 73% для по меньшей мере одного FGFR, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,301 до 0,641 для FGFR1, от 0,669 до 1,094 для FGFR2 и от 0,289 до 0,815 для FGFR3, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7,4 GPI и экзон 6 GPI.
20. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный предварительно установленный пороговый уровень по меньшей мере одного FGFR соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 65% до 73% для по меньшей мере одного FGFR, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,484 до 0,641 для FGFR1, от 0,884 до 1,094 для FGFR2 и от 0,490 до 0,815 для FGFR3, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
21. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный предварительно установленный пороговый уровень по меньшей мере одного FGFR соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 70% до 73% для по меньшей мере одного FGFR, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,558 до 0,641 для FGFR1, от 0,984 до 1,094 для FGFR2 и от 0,671 до 0,815 для FGFR3, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
22. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой рак желудка, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR2 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 44% до 83% для FGFR2, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,257 до 1,610 для FGFR2, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
23. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой рак желудка, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR2 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 60% до 83% для FGFR2, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,669 до 1,610 для FGFR2, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 гена СНМР2А, экзон 5 гена ЕМС7, экзон 3 гена ЕМС7, экзон 4 гена GPI и экзон 6 гена GPI.
24. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой рак желудка, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR2 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 70% до 83% для FGFR2, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,984 до 1,610 для FGFR2, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 CHMP2A, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
25. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой рак желудка, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR2 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 80% до 83% для FGFR2, который соответствует уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 1,460 до 1,610 для FGFR2, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
26. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой плоскоклеточную карциному пищевода, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR1 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 44% до 84% для FGFR1, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,104 до 1,362 для FGFR1, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
27. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой плоскоклеточную карциному пищевода, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR1 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 60% до 84% для FGFR1, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,301 до 1,362 для FGFR1, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
28. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой плоскоклеточную карциному пищевода, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR1 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 70% до 84% для FGFR1, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,558 до 1,362 для FGFR1, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
29. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой плоскоклеточную карциному пищевода, и указанный предварительно установленный пороговый уровень экспрессии FGFR1 соответствует любому уровню в диапазоне предельных значений уровня экспрессии для процентилей от 80% до 84% для FGFR1, которые соответствуют уровням экспрессии относительно медианы уровней экспрессии мРНК набора из 16 эталонных генов, измеренным при помощи анализа экспрессии генов с применением системы nCounter, и составляют: от 0,759 до 1,362 для FGFR1, при этом указанные 16 эталонных генов представляют собой АСТВ, ALAS1, CLTC, MRPL19, RPL19, RPLP0, SF3A1, ТВР, TUBB, экзон 1 clorf43, экзон 2 clorf43, экзон 3 СНМР2А, экзон 5 ЕМС7, экзон 3 ЕМС7, экзон 4 GPI и экзон 6 GPI.
30. Способ по п. 16, отличающийся тем, что уровни экспрессии FGFR1, FGFR2 и FGFR3 измеряют по уровню белка.
31. Способ выбора субъекта, страдающего раком, для лечения Соединением А, причем указанный способ включает определение уровней экспрессии FGFR1, FGFR2 и FGFR3 в биопсии опухоли или биопсии жидкости, полученной от указанного субъекта, и в случае, если определенный уровень экспрессии по меньшей мере одного из FGFR1, FGFR2 и FGFR3 превышает предварительно установленный пороговый уровень, указанного субъекта считают подходящим для лечения.
32. Способ по п. 31, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой рак желудка, а указанного субъекта считают подходящим для лечения в случае, если уровень экспрессии FGFR2 превышает предварительно установленный пороговый уровень.
33. Способ по п. 31, отличающийся тем, что указанный рак представляет собой плоскоклеточную карциному пищевода, а указанного субъекта считают подходящим для лечения в случае, если уровень экспрессии FGFR1 превышает предварительно установленный пороговый уровень.
34. Способ выбора субъекта, страдающего раком желудка, для лечения Соединением А, причем указанный способ включает определение уровня экспрессии FGFR2 в биопсии опухоли или биопсии жидкости, полученной от указанного субъекта, и в случае, если определенный уровень экспрессии FGFR2 превышает предварительно установленный пороговый уровень, указанного субъекта считают подходящим для лечения.
35. Способ выбора субъекта, страдающего плоскоклеточной карциномой пищевода, для лечения Соединением А, причем указанный способ включает определение уровня экспрессии FGFR1 в биопсии опухоли или биопсии жидкости, полученной от указанного субъекта, и в случае, если определенный уровень экспрессии FGFR1 превышает предварительно установленный пороговый уровень, указанного субъекта считают подходящим для лечения.
RU2018104570A 2015-07-24 2016-07-21 Экспрессия fgfr и чувствительность к ингибитору fgfr RU2728674C2 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
IB2015001245 2015-07-24
IBPCT/IB2015/001245 2015-07-24
IB2016000290 2016-03-14
IBPCT/IB2016/000290 2016-03-14
PCT/IB2016/001044 WO2017017516A1 (en) 2015-07-24 2016-07-21 Fgfr expression and susceptibility to an fgfr inhibitor

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2018104570A true RU2018104570A (ru) 2019-08-26
RU2018104570A3 RU2018104570A3 (ru) 2020-01-17
RU2728674C2 RU2728674C2 (ru) 2020-07-30

Family

ID=56800307

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018104570A RU2728674C2 (ru) 2015-07-24 2016-07-21 Экспрессия fgfr и чувствительность к ингибитору fgfr

Country Status (12)

Country Link
US (1) US20180223371A1 (ru)
EP (2) EP3325661B1 (ru)
JP (1) JP2018524010A (ru)
KR (1) KR20180028524A (ru)
CN (1) CN108026588A (ru)
AU (1) AU2016300175A1 (ru)
BR (1) BR112018001438A2 (ru)
CA (1) CA2991846A1 (ru)
DK (1) DK3325661T3 (ru)
IL (1) IL256762A (ru)
RU (1) RU2728674C2 (ru)
WO (1) WO2017017516A1 (ru)

Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2756175T3 (es) 2013-12-27 2020-04-27 Chugai Pharmaceutical Co Ltd Genes mutantes guardián de fgfr y fármacos que se dirigen a los mismos
JP6762300B2 (ja) 2015-06-17 2020-09-30 中外製薬株式会社 アミノピラゾール誘導体
AU2017226389B2 (en) 2016-03-04 2023-02-02 Taiho Pharmaceutical Co., Ltd. Preparation and composition for treatment of malignant tumors
US11883404B2 (en) 2016-03-04 2024-01-30 Taiho Pharmaceuticals Co., Ltd. Preparation and composition for treatment of malignant tumors
US11377688B2 (en) 2017-11-17 2022-07-05 Gen-Probe Incorporated Compositions and methods for detecting C1orf43 nucleic acid
EP4353222A1 (en) * 2018-03-19 2024-04-17 Taiho Pharmaceutical Co., Ltd. Use of sodium alkyl sulfate
CN111455065B (zh) * 2019-08-22 2021-11-05 中国农业科学院植物保护研究所 Rpl19基因作为广聚萤叶甲内参基因的应用
CA3188105A1 (en) * 2020-06-22 2021-12-30 Genecentric Therapeutics, Inc. Methods for selecting and treating cancer with fgfr3 inhibitors
EP3960875A1 (en) * 2020-08-28 2022-03-02 Koninklijke Philips N.V. Pcr method and kit for determining pathway activity
EP4134451A1 (en) * 2021-08-11 2023-02-15 Universität zu Köln Method for identifying responsiveness to fibroblast growth factor receptor 1 inhibitor therapy

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US2695950A (en) * 1952-05-14 1954-11-30 Neo Ray Products Inc Adjustable magnetically supported light
US5183284A (en) * 1990-09-20 1993-02-02 George Glenn Neis Coupling mechanism
WO2008078091A1 (en) * 2006-12-22 2008-07-03 Astex Therapeutics Limited Bicyclic heterocyclic compounds as fgfr inhibitors
JP5319306B2 (ja) * 2007-01-29 2013-10-16 エーザイ・アール・アンド・ディー・マネジメント株式会社 未分化型胃癌治療用組成物
EP2132331B1 (en) * 2007-03-23 2016-08-03 The Translational Genomics Research Institute Method of classifying endometrial cancer
PT2471786E (pt) 2009-08-07 2016-03-04 Hoffmann La Roche Derivado de aminopirazol
GB201020179D0 (en) * 2010-11-29 2011-01-12 Astex Therapeutics Ltd New compounds
WO2013144339A1 (en) * 2012-03-30 2013-10-03 Novartis Ag Fgfr inhibitor for use in the treatment of hypophosphatemic disorders
EP2695950A1 (en) * 2012-08-10 2014-02-12 Blackfield AG Markers for responsiveness to an inhibitor of the fibroblast growth factor receptor
MX2015015115A (es) * 2013-05-01 2016-06-07 Five Prime Therapeutics Inc Metodos de tratamiento de cancer.
ES2756175T3 (es) * 2013-12-27 2020-04-27 Chugai Pharmaceutical Co Ltd Genes mutantes guardián de fgfr y fármacos que se dirigen a los mismos

Also Published As

Publication number Publication date
BR112018001438A2 (pt) 2018-12-04
US20180223371A1 (en) 2018-08-09
RU2728674C2 (ru) 2020-07-30
KR20180028524A (ko) 2018-03-16
CA2991846A1 (en) 2017-02-02
AU2016300175A1 (en) 2018-03-01
RU2018104570A3 (ru) 2020-01-17
EP3325661B1 (en) 2019-10-16
DK3325661T3 (da) 2020-01-20
WO2017017516A1 (en) 2017-02-02
CN108026588A (zh) 2018-05-11
IL256762A (en) 2018-03-29
JP2018524010A (ja) 2018-08-30
EP3690059A1 (en) 2020-08-05
EP3325661A1 (en) 2018-05-30
HK1256118A1 (en) 2019-09-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2018104570A (ru) Экспрессия fgfr и чувствительность к ингибитору fgfr
Chen et al. Identification of microRNA‐214 as a negative regulator of colorectal cancer liver metastasis by way of regulation of fibroblast growth factor receptor 1 expression
MX2023001945A (es) Composiciones y metodos para el cribado de tumores solidos.
Chen et al. MicroRNA-215 suppresses cell proliferation, migration and invasion of colon cancer by repressing Yin-Yang 1
Wang et al. Clinicopathologic significance of miR-10b expression in gastric carcinoma
WO2016196298A8 (en) Therapeutic and diagnostic methods for cancer
EP4574996A3 (en) Detection and treatment of disease exhibiting disease cell heterogeneity and systems and methods for communicating test results
SG10201908277TA (en) Method of determining the risk of developing breast cancer by detecting the expression levels of micrornas (mirnas)
RU2014133069A (ru) Транслокации r-спондина и способы с их использованием
JP2014533960A5 (ru)
WO2016130572A3 (en) Methods of determining levels of exposure to radiation and uses thereof
WO2016203262A3 (en) Gene signatures predictive of metastatic disease
Wang et al. Circulating microRNA-21 as noninvasive predictive biomarker for response in cancer immunotherapy
Yu et al. Up-regulation of serum miR-744 predicts poor prognosis in patients with nasopharyngeal carcinoma
WO2017217807A3 (ko) Nckap1을 유효성분으로 포함하는 대장암 진단 또는 대장암 전이 예후 예측용 바이오마커 조성물
Yang et al. Biological role of long non-coding RNA FTX in cancer progression
Jia et al. Far upstream element-binding protein 1 (FUBP1) expression differs between human colorectal cancer and non-cancerous tissue
WO2016161153A3 (en) Prognostic and diagnostic methods for colorectal cancer
Guo et al. Effect and mechanism of long non-coding RNA ZEB2-AS1 in the occurrence and development of colon cancer
Xu et al. Oleuropein inhibits pancreatic cancer through miR-190b-5p induction
WO2017203532A8 (en) Agents for use in treating drug resistant tumors and triple negative breast cancer
RU2014128454A (ru) Способ определения вероятности рецидивирования рака молочной железы
Qi et al. CDK16 as a potential prognostic biomarker correlated with an immunosuppressive tumor microenvironment and benefits in enhancing the effectiveness of immunotherapy in human cancers
Lijing et al. Differential expressions of microRNAs in rectal adenocarcinoma tissues
Klimov et al. RHOA, SEMA3B, and CKAP2 expression in leukaemia of different types: the results of a pilot experiment