RU2017106872A - Способ одновременной генодиагностики четырех мутантных аллелей каппа-казеина у крупного рогатого скота и тест-система для его осуществления - Google Patents
Способ одновременной генодиагностики четырех мутантных аллелей каппа-казеина у крупного рогатого скота и тест-система для его осуществления Download PDFInfo
- Publication number
- RU2017106872A RU2017106872A RU2017106872A RU2017106872A RU2017106872A RU 2017106872 A RU2017106872 A RU 2017106872A RU 2017106872 A RU2017106872 A RU 2017106872A RU 2017106872 A RU2017106872 A RU 2017106872A RU 2017106872 A RU2017106872 A RU 2017106872A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- csn3
- pcr
- cattle
- reaction
- rtq1
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims 4
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 title claims 2
- 239000005018 casein Substances 0.000 title 1
- 101710138623 Kappa-casein Proteins 0.000 claims 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims 4
- UDGUGZTYGWUUSG-UHFFFAOYSA-N 4-[4-[[2,5-dimethoxy-4-[(4-nitrophenyl)diazenyl]phenyl]diazenyl]-n-methylanilino]butanoic acid Chemical compound COC=1C=C(N=NC=2C=CC(=CC=2)N(C)CCCC(O)=O)C(OC)=CC=1N=NC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 UDGUGZTYGWUUSG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims 3
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 claims 3
- 208000034454 F12-related hereditary angioedema with normal C1Inh Diseases 0.000 claims 2
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 claims 2
- 208000016861 hereditary angioedema type 3 Diseases 0.000 claims 2
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 2
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 claims 1
- 108010076119 Caseins Proteins 0.000 claims 1
- 102000011632 Caseins Human genes 0.000 claims 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 claims 1
- 230000001351 cycling effect Effects 0.000 claims 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 claims 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 claims 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 claims 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims 1
- 235000021246 κ-casein Nutrition 0.000 claims 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6809—Methods for determination or identification of nucleic acids involving differential detection
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6853—Nucleic acid amplification reactions using modified primers or templates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6858—Allele-specific amplification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (4)
1. Способ одновременной генодиагностики четырех (κ-CNA, κ-CNB, κ-CNC, κ-CNE) мутантных аллелей каппа-казеина у крупного рогатого скота включает выделение ДНК из биологического материала, постановку полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, с использованием трех реакционных смесей, содержащей все необходимые реактивы для проведения ПЦР-РВ, разбавитель, Taq ДНК-полимеразу, три положительных и один отрицательный контрольный образец для каждой реакционной смеси, при подготовке к проведению реакции рассчитывают необходимый объем компонентов, исходя из количества исследуемых образцов плюс 4, реактивы смешивают, затем в подготовленные для ПЦР пробирки вносят по 20 мкл приготовленной ПЦР-смеси, в каждую ПЦР пробирку добавляют по 5 мкл контрольных и исследуемых образцов, пробирки помещают в амплификатор, отжиг праймеров проходит на этапе циклирования при 64°С в течение 30 с при числе циклов амплификации равном 40, анализ полученных данных проводят путем сравнения амплифицированных участков генов, результаты интерпретируют на основании наличия или отсутствия пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией.
2. Тест-система для осуществления способа по п. 1 методом постановки полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, характеризующаяся тем, что включает реактивы в виде трех комплектов, каждый комплект состоит из компонентов (реакционная смесь, разбавитель, полимераза и 4 контрольных образца), которые необходимо смешать в нужном объеме непосредственно перед проведением исследования. ПЦР смесь, содержащую все необходимые реагенты для проведения ПЦР РВ, а именно 50 мМ KCl, 50 мМ TRIS-HCl, 250 нМ dNTP, 2,5 мМ MgCl2, праймеры - в концентрации 200 нМ, флуоресцентно-меченных олигонуклеотидных проб - в концентрации 100 нМ, имеющие следующие последовательности:
разбавитель, 2,5 ед. Taq ДНК-полимеразы.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2017106872A RU2691995C2 (ru) | 2017-03-02 | 2017-03-02 | Способ одновременной генодиагностики четырех мутантных аллелей каппа-казеина у крупного рогатого скота и тест-система для его осуществления |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2017106872A RU2691995C2 (ru) | 2017-03-02 | 2017-03-02 | Способ одновременной генодиагностики четырех мутантных аллелей каппа-казеина у крупного рогатого скота и тест-система для его осуществления |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2017106872A true RU2017106872A (ru) | 2018-09-04 |
| RU2017106872A3 RU2017106872A3 (ru) | 2018-10-24 |
| RU2691995C2 RU2691995C2 (ru) | 2019-06-19 |
Family
ID=63478945
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2017106872A RU2691995C2 (ru) | 2017-03-02 | 2017-03-02 | Способ одновременной генодиагностики четырех мутантных аллелей каппа-казеина у крупного рогатого скота и тест-система для его осуществления |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2691995C2 (ru) |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2386700C1 (ru) * | 2008-11-18 | 2010-04-20 | ООО "Лаборатория Изоген" | Способ определения а- и в-аллелей гена каппа-казеина крупного рогатого скота методом тетрапраймерной пцр |
| RU2601151C2 (ru) * | 2015-02-11 | 2016-10-27 | Общество с ограниченной ответственностью "АгроВет" | Способ одновременной генодиагностики двух мутантных аллелей, вызывающих cvm и blad у крупного рогатого скота, и тест-система для его осуществления |
-
2017
- 2017-03-02 RU RU2017106872A patent/RU2691995C2/ru not_active IP Right Cessation
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2017106872A3 (ru) | 2018-10-24 |
| RU2691995C2 (ru) | 2019-06-19 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Romsos et al. | Rapid PCR of STR markers: Applications to human identification | |
| US20110111463A1 (en) | Lysis and reverse transcription for mrna quantification | |
| US20210246499A1 (en) | Detection of short homopolymeric repeats | |
| Pisal et al. | Detection of mycoplasma contamination directly from culture supernatant using polymerase chain reaction | |
| Venter et al. | Macroarray assay for differential diagnosis of meningoencephalitis in southern Africa | |
| RU2013153505A (ru) | Способы, системы и композиции для детекции микробной днк при помощи пцр | |
| RU2612137C1 (ru) | Способ идентификации подвидов возбудителя туляремии Francisella tularensis subsp. tularensis, Francisella tularensis subsp. mediasiatica и Francisella tularensis subsp. holarctica | |
| US20070042354A1 (en) | Detecting pathogens in companion animals | |
| RU2015104459A (ru) | Способ одновременной генодиагностики двух мутантных аллелей, вызывающих CVM и BLAD у крупного рогатого скота и тест-система для его осуществления | |
| US20210139968A1 (en) | Rna amplification method, rna detection method and assay kit | |
| RU2017106872A (ru) | Способ одновременной генодиагностики четырех мутантных аллелей каппа-казеина у крупного рогатого скота и тест-система для его осуществления | |
| CN113388700A (zh) | 一种核酸免提取三重荧光rt-lamp检测fcv、fpv及fhv-1病毒的试剂盒 | |
| JP7783226B2 (ja) | 核酸抽出のための細胞溶解用組成物を用いた分子診断方法 | |
| JP6880692B2 (ja) | 改良された腸内細菌のスクリーニング方法 | |
| Li et al. | Developmental validation of the EX20+ 4 system | |
| CN105950765B (zh) | 一种用于支原体检测试剂盒质控质粒的构建及应用 | |
| CN117327813A (zh) | 基于ngs检测结核分枝杆菌复合群及耐药基因型的组合物 | |
| RU2736649C1 (ru) | Способ генетической дифференциации штаммов Yersinia pseudotuberculosis путем молекулярно-генетического типирования | |
| Yamaguchi et al. | Development of a rapid and sensitive one-step reverse transcription-nested polymerase chain reaction in a single tube using the droplet-polymerase chain reaction machine | |
| Lee et al. | Comparison of primer sets and one-step reverse transcription polymerase chain reaction kits for the detection of bluetongue viral RNA | |
| RU2022109675A (ru) | Способ одновременной генодиагностики четырех мутантных аллелей бета-казеина у крупного рогатого скота и тест-система для его осуществления | |
| RU2642273C1 (ru) | Способ дифференциации штаммов Yersinia pestis на основной и неосновные подвиды методом ПЦР в режиме реального времени | |
| Van Nguyen et al. | Development and clinical validation of a DNA gyrase subunit B gene based loop-mediated isothermal amplification method for detection of Melissococcus plutonius | |
| CN111662996A (zh) | 一种引物组及其在基于微流控芯片用于快速检测向日葵黑茎病菌的应用 | |
| JP6468555B2 (ja) | 検出キット，及び検出方法 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| HZ9A | Changing address for correspondence with an applicant | ||
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20200303 |