[go: up one dir, main page]

RU2016122046A - Оптимальные локусы маиса - Google Patents

Оптимальные локусы маиса Download PDF

Info

Publication number
RU2016122046A
RU2016122046A RU2016122046A RU2016122046A RU2016122046A RU 2016122046 A RU2016122046 A RU 2016122046A RU 2016122046 A RU2016122046 A RU 2016122046A RU 2016122046 A RU2016122046 A RU 2016122046A RU 2016122046 A RU2016122046 A RU 2016122046A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
sequence
extragenic
maize
dna
interest
Prior art date
Application number
RU2016122046A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2016122046A3 (ru
RU2709734C2 (ru
Inventor
Лакшми САСТРИ-ДЕНТ
Цзэхуэй ЦАО
Шридхаран СРИРАМ
Стивен Р. Уэбб
Дебра Л. КАМПЕР
Навин ЭЛАНГО
Original Assignee
ДАУ АГРОСАЙЕНСИЗ ЭлЭлСи
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ДАУ АГРОСАЙЕНСИЗ ЭлЭлСи filed Critical ДАУ АГРОСАЙЕНСИЗ ЭлЭлСи
Publication of RU2016122046A publication Critical patent/RU2016122046A/ru
Publication of RU2016122046A3 publication Critical patent/RU2016122046A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2709734C2 publication Critical patent/RU2709734C2/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H5/00—Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their plant parts; Angiosperms characterised otherwise than by their botanic taxonomy
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201—Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C12N15/8213—Targeted insertion of genes into the plant genome by homologous recombination
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H5/00—Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their plant parts; Angiosperms characterised otherwise than by their botanic taxonomy
    • A01H5/10—Seeds
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H6/00—Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their botanic taxonomy
    • A01H6/46—Gramineae or Poaceae, e.g. ryegrass, rice, wheat or maize
    • A01H6/4636—Oryza sp. [rice]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H6/00—Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their botanic taxonomy
    • A01H6/46—Gramineae or Poaceae, e.g. ryegrass, rice, wheat or maize
    • A01H6/4678—Triticum sp. [wheat]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H6/00—Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their botanic taxonomy
    • A01H6/46—Gramineae or Poaceae, e.g. ryegrass, rice, wheat or maize
    • A01H6/4684—Zea mays [maize]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8273—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for drought, cold, salt resistance
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8274—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for herbicide resistance
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8279—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
    • C12N15/8286—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance for insect resistance
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A40/00—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production
    • Y02A40/10—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production in agriculture
    • Y02A40/146—Genetically Modified [GMO] plants, e.g. transgenic plants

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Pest Control & Pesticides (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Insects & Arthropods (AREA)
  • Natural Medicines & Medicinal Plants (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Claims (85)

1. Рекомбинантная последовательность, содержащая:
внегенную геномную последовательность маиса по меньшей мере 1 т.п.о., где указанная внегенная последовательность является гипометилированной, поддающейся нацеливанию, расположенной вблизи генной области в геноме маиса и демонстрирует признаки рекомбинации; и
представляющую интерес ДНК, которая вставлена в указанную внегенную последовательность.
2. Рекомбинантная последовательность по п. 1, где указанная внегенная последовательность обладает следующими характеристиками:
a. уровень метилирования указанной внегенной последовательности составляет 1% или менее;
b. указанная внегенная последовательность разделяет менее 40% идентичности последовательности с любой другой последовательностью, содержащейся в геноме Zea mays;
c. указанная внегенная последовательность расположена в пределах области 40 т.п.о. от известной или прогнозируемой экспрессируемой кодирующей последовательности маиса; и
d. указанная внегенная последовательность обладает частотой рекомбинации в геноме маиса более 0,00041 сМ/млн.п.о.
3. Рекомбинантная последовательность по п. 1, где указанная внегенная последовательность обладает максимальной длиной 8,3 т.п.о.
4. Рекомбинантная последовательность по п. 1, где указанная внегенная последовательность обладает 1% или менее метилирования нуклеотидов.
5. Рекомбинантная последовательность по п. 4, где указанная внегенная последовательность имеет длину 1 т.п.о. - 8,3 т.п.о. и не содержит метилированных остатков цитозина.
6. Рекомбинантная последовательность по п. 5, где указанная внегенная последовательность не выравнивается с более чем 40% идентичностью последовательности с любой другой последовательностью в геноме Zea mays.
7. Рекомбинантная последовательность по п. 5, где указанная внегенная последовательность демонстрирует признаки рекомбинации с частотой рекомбинации более 0,00041 сМ/млн.п.о.
8. Рекомбинантная последовательность по п. 5, где область 40 т.п.о. нативного генома маиса, содержащая указанную внегенную последовательность, содержит также по меньшей мере одну известную или прогнозируемая кодирующую последовательность маиса, или последовательность, содержащую 2 т.п.о. выше и/или 1 т.п.о. ниже последовательности известного гена маиса.
9. Рекомбинантная последовательность по п. 8, где указанная известная или прогнозируемая кодирующая последовательность маиса экспрессирует белок маиса.
10. Рекомбинантная последовательность по п. 1, где указанная внегенная последовательность не содержит метилированный полинуклеотид.
11. Рекомбинантная последовательность по п. 1, где один конец указанной внегенной последовательности находится в пределах 40 т.п.о. от экспрессируемого эндогенного гена.
12. Рекомбинантная последовательность по п. 1, где указанная представляющая интерес ДНК содержит аналитический домен.
13. Рекомбинантная последовательность по п. 1, где указанная представляющая интерес ДНК не кодирует пептид.
14. Рекомбинантная последовательность по п. 1, где указанная представляющая интерес ДНК кодирует пептид.
15. Рекомбинантная последовательность по п. 14, где указанная представляющая интерес ДНК содержит экспрессирующую генную кассету, содержащую ген устойчивости к инсектицидам, ген устойчивости к гербицидам, ген эффективности усвоения азота, ген эффективности усвоения воды, ген пищевой ценности, ген связывающего ДНК белка и ген селективного маркера.
16. Рекомбинантная последовательность по п. 1, отличающаяся тем, что указанная рекомбинантная последовательность обладает следующими характеристиками:
a. указанная внегенная последовательность содержит менее 1% метилирования ДНК;
b. указанная внегенная последовательность обладает частотой рекомбинации в геноме маиса 0,00041-62,42 сМ/млн.п.о.;
c. указанная внегенная последовательность обладает уровнем занятости нуклеосомами в геноме маиса 0-0,962;
d. указанная внегенная последовательность разделяет менее 40% идентичности последовательности с любой другой последовательностью, содержащейся в геноме маиса;
e. указанная внегенная последовательность обладает значением относительного расположения 0,00373-0,99908, представляющим собой отношение геномного расстояния от центромеры хромосомы маиса;
f. указанная внегенная последовательность обладает процентным содержанием гуанина/цитозина в диапазоне 25,17-68,3%;
g. указанная внегенная последовательность локализована вблизи генной последовательности; и
h. указанная внегенная последовательность локализована в области 1 млн.п.о. геномной последовательности маиса, содержащей одну или несколько дополнительных внегенных последовательностей.
17. Растение маиса, часть растения маиса, или клетка растения маиса, содержащие рекомбинантную последовательность по любому из пп. 1-16.
18. Растение маиса, часть растения маиса, или клетка растения маиса по п. 17, где указанная известная или прогнозируемая кодирующая последовательность маиса экспрессируется на уровне, находящимся в диапазоне от 0,00369 до 2233,06.
19. Рекомбинантная последовательность по п. 1, где указанная представляющая интерес ДНК и/или указанная внегенная последовательность модифицированы посредством вставки указанной представляющей интерес ДНК в указанную внегенную последовательность.
20. Способ получения трансгенной клетки растения, содержащей представляющую интерес ДНК, нацеленную на одну из внегенных геномных последовательностей маиса, где способ включает:
a. выбор оптимального внегенного геномного локуса маиса;
b. введение сайт-специфической нуклеазы в клетку растения, где сайт-специфическая нуклеаза расщепляет указанную внегенную геномную последовательность маиса;
c. введение представляющей интерес ДНК в клетку растения;
d. нацеливание представляющей интерес ДНК в указанный внегенный локус, где расщепление указанной внегенной последовательности облегчает интеграцию полинуклеотидной последовательности в указанный внегенный локус; и
e. отбор трансгенных клеток растений, содержащих представляющую интерес ДНК, нацеленную на указанный внегенный локус.
21. Способ получения трансгенной клетки растения по п. 20, где указанная представляющая интерес ДНК содержит аналитический домен.
22. Способ получения трансгенной клетки растения по п. 20, где указанная представляющая интерес ДНК не кодирует пептид.
23. Способ получения трансгенной клетки растения по п. 20, где указанная представляющая интерес ДНК кодирует пептид.
24. Способ получения трансгенной клетки растения по п. 20, где указанная представляющая интерес ДНК содержит экспрессирующую генную кассету, содержащую трансген.
25. Способ получения трансгенной клетки растения по п. 20, где указанная сайт-специфическая нуклеаза выбрана из группы, состоящей из нуклеазы с цинковыми пальцами, нуклеазы CRISPR, TALEN, эндонуклеазы хоминга или мегануклеазы.
26. Способ получения трансгенной клетки растения по п. 20, где указанную представляющую интерес ДНК интегрируют в указанный внегенный локус посредством способа интеграции при направляемой гомологией репарации.
27. Способ получения трансгенной клетки растения по п. 20, где указанную представляющую интерес ДНК интегрируют в указанный внегенный локус посредством способа интеграции при соединении негомологичных концов.
28. Способ получения трансгенной клетки растения по п. 20, где указанный выбранный внегенный локус обладает следующими характеристиками:
a. указанный внегенный локус содержит менее 1% метилирования ДНК в последовательности;
b. указанный внегенный локус обладает частотой рекомбинации в геноме маиса 0,00041-62,42 сМ/млн.п.о.;
c. указанный внегенный локус обладает уровнем занятости нуклеосомами в геноме маиса 0-0,962;
d. указанный внегенный локус разделяет менее 40% идентичности последовательности с любой другой последовательностью 1 т.п.о., содержащейся в геноме маиса;
e. указанный внегенный локус обладает значением относительного расположения с отношением геномного расстояния от центромеры хромосомы маиса 0,00373-0,99908;
f. указанный внегенный локус обладает процентным содержанием гуанина/цитозина в диапазоне 25,17-68,3%;
g. указанный внегенный локус локализован вблизи генной последовательности; и
h. область 1 млн.п.о. геномной последовательности маиса, содержащая указанный внегенный локус, содержит по меньшей мере одну вторую внегенную последовательность.
29. Способ получения трансгенной клетки растения по п. 28, где указанный внегенный локус имеет длину по меньшей мере 1т.п.о.
30. Способ получения трансгенной клетки растения по п. 29, где известная или прогнозируемая кодирующая последовательность маиса, или последовательность, содержащая область 2 т.п.о. выше и 1 т.п.о. ниже известного гена, локализована в пределах 40 т.п.о. от указанного внегенного локуса.
31. Способ получения трансгенной клетки растения по п. 20, где указанную представляющую интерес ДНК и/или указанный внегенный локус модифицируют в ходе указанной интеграции полинуклеотидной последовательности в указанный внегенный локус со стадии (d).
32. Рекомбинантная поддающаяся нацеливанию внегенная геномная последовательность маиса, содержащая:
внегенную последовательность из по меньшей мере 1 т.п.о., выбранную из группы, состоящей из кластера 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32 или последовательности, разделяющей 99% идентичности последовательности с последовательностью, выбранной из группы, состоящей из кластера 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32 и соответствующих комплементарных им последовательностей, где указанные кластеры получены по статистическому алгоритму PCA, включающему значения PCA, определенные в таблице 6; и
представляющую интерес ДНК, вставленную в указанную внегенную последовательность.
33. Поддающаяся нацеливанию внегенная геномная последовательность маиса по п. 32, где указанная представляющая интерес ДНК содержит аналитический домен.
34. Поддающаяся нацеливанию внегенная геномная последовательность маиса по п. 32, где указанная представляющая интерес ДНК кодирует пептид.
35. Поддающаяся нацеливанию внегенная геномная последовательность маиса по п. 32, где указанная представляющая интерес ДНК содержит экспрессирующую генную кассету, содержащую трансген.
36. Поддающаяся нацеливанию внегенная геномная последовательность маиса по п. 32, где указанная представляющая интерес ДНК содержит сайт-специфический участок расщепления.
37. Поддающаяся нацеливанию внегенная геномная последовательность маиса по п. 36, где указанный сайт-специфический участок расщепления расщепляется нуклеазой.
38. Поддающаяся нацеливанию внегенная геномная последовательность маиса по п. 37, где указанная нуклеаза выбрана из группы, состоящей из нуклеазы с цинковыми пальцами, нуклеазы CRISPR, TALEN, эндонуклеазы хоминга или мегануклеазы.
39. Поддающаяся нацеливанию внегенная геномная последовательность маиса по п. 32, где указанная вставка указанной представляющей интерес ДНК в указанную внегенную последовательность приводит к модификации указанной представляющей интерес ДНК и указанной внегенной последовательности.
40. Очищенная внегенная геномная последовательность маиса из по меньшей мере 1 т.п.о., гдн указанная внегенная последовательность является гипометилированной, поддающейся нацеливанию, расположенной вблизи генной области в геноме маиса, и демонстрирующей признаки рекомбинации.
41. Очищенная последовательность по п. 40, где указанная внегенная последовательность обладает следующими характеристиками:
a. уровень метилирования указанной внегенной последовательности составляет 1% или менее;
b. указанная внегенная последовательность разделяет менее 40% идентичности последовательности с любой другой последовательностью, содержащейся в геноме Zea mays;
c. указанная внегенная последовательность локализована в области 40 т.п.о. от известной или прогнозируемой экспрессируемой кодирующей последовательности маиса; и
d. указанная внегенная последовательность обладает частотой рекомбинации в геноме маиса более 0,00041 сМ/млн.п.о.
42. Очищенная последовательность по п. 40, где указанная внегенная последовательность обладает максимальной длиной 8,3 т.п.о.
43. Очищенная последовательность по п. 40, где указанная последовательность обладает следующими характеристиками:
a. указанная внегенная последовательность содержит менее 1% метилирования ДНК в ее нативной локализации;
b. указанная внегенная последовательность, в ее нативной локализации, обладает частотой рекомбинации в геноме маиса 0,00041-62,42 сМ/млн.п.о.;
c. указанная внегенная последовательность обладает уровнем занятости нуклеосомами в геноме маиса 0-0,962, в ее нативной локализации;
d. указанная внегенная последовательность разделяет менее 40% идентичности последовательности с любой другой последовательностью, содержащейся в геноме маиса;
e. указанная внегенная последовательность обладает значением относительного расположения с отношением геномного расстояния от центромеры хромосомы маиса 0,00373-0,99908, в ее нативной локализации;
f. указанная внегенная последовательность обладает процентным содержанием гуанина/цитозина в диапазоне 25,17-68,3%;
g. указанная внегенная последовательность локализована в пределах 40 т.п.о. от известной или прогнозируемой кодирующей последовательности маиса, или последовательности, содержащей область 2 т.п.о. выше и 1 т.п.о. ниже известного гена, в ее нативной локализации; и
h. указанная внегенная последовательность локализована в области 1 млн.п.о. геномной последовательности маиса, содержащей одну или несколько дополнительных внегенных последовательностей,в ее нативной локализации.
По доверенности
RU2016122046A 2013-11-04 2014-11-03 Оптимальные локусы маиса RU2709734C2 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201361899575P 2013-11-04 2013-11-04
US201361899541P 2013-11-04 2013-11-04
US61/899,575 2013-11-04
US61/899,541 2013-11-04
PCT/US2014/063733 WO2015066638A2 (en) 2013-11-04 2014-11-03 Optimal maize loci

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2016122046A true RU2016122046A (ru) 2017-12-11
RU2016122046A3 RU2016122046A3 (ru) 2018-06-29
RU2709734C2 RU2709734C2 (ru) 2019-12-19

Family

ID=53005411

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016122046A RU2709734C2 (ru) 2013-11-04 2014-11-03 Оптимальные локусы маиса

Country Status (17)

Country Link
US (2) US10273493B2 (ru)
EP (1) EP3065540B1 (ru)
JP (1) JP6633532B2 (ru)
KR (1) KR102269769B1 (ru)
CN (1) CN107223156A (ru)
AU (3) AU2014341929B2 (ru)
BR (1) BR102014027438B1 (ru)
CA (1) CA2928666C (ru)
CL (1) CL2016001064A1 (ru)
IL (2) IL245350B (ru)
MX (1) MX364662B (ru)
RU (1) RU2709734C2 (ru)
TW (1) TW201518504A (ru)
UA (1) UA120502C2 (ru)
UY (1) UY35812A (ru)
WO (1) WO2015066638A2 (ru)
ZA (2) ZA201604452B (ru)

Families Citing this family (52)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
BR112013024337A2 (pt) 2011-03-23 2017-09-26 Du Pont locus de traço transgênico complexo em uma planta, planta ou semente, método para produzir em uma planta um locus de traço transgênico complexo e construto de expressão
EP3613852A3 (en) 2011-07-22 2020-04-22 President and Fellows of Harvard College Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity
RS59199B1 (sr) 2012-05-25 2019-10-31 Univ California Metode i jedinjenja za rnk-upravljanu ciljanu dnk modifikaciju i za rnk- upravljanu modulaciju transkripta
KR102479178B1 (ko) 2012-12-06 2022-12-19 시그마-알드리치 컴퍼니., 엘엘씨 Crispr-기초된 유전체 변형과 조절
US20150044192A1 (en) 2013-08-09 2015-02-12 President And Fellows Of Harvard College Methods for identifying a target site of a cas9 nuclease
US9359599B2 (en) 2013-08-22 2016-06-07 President And Fellows Of Harvard College Engineered transcription activator-like effector (TALE) domains and uses thereof
EP3041344A4 (en) * 2013-09-04 2017-04-19 Dow AgroSciences LLC Rapid targeting analysis in crops for determining donor insertion
US9737604B2 (en) 2013-09-06 2017-08-22 President And Fellows Of Harvard College Use of cationic lipids to deliver CAS9
US9228207B2 (en) 2013-09-06 2016-01-05 President And Fellows Of Harvard College Switchable gRNAs comprising aptamers
US9388430B2 (en) 2013-09-06 2016-07-12 President And Fellows Of Harvard College Cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof
WO2015066636A2 (en) * 2013-11-04 2015-05-07 Dow Agrosciences Llc Optimal maize loci
US11053481B2 (en) 2013-12-12 2021-07-06 President And Fellows Of Harvard College Fusions of Cas9 domains and nucleic acid-editing domains
AU2015298571B2 (en) 2014-07-30 2020-09-03 President And Fellows Of Harvard College Cas9 proteins including ligand-dependent inteins
BR112017003757A2 (pt) * 2014-09-12 2017-12-26 Du Pont ?plantas de milho, partes de planta de milho ou sementes de milho?
AU2015355546B2 (en) 2014-12-03 2021-10-14 Agilent Technologies, Inc. Guide RNA with chemical modifications
CN107109427B (zh) * 2014-12-23 2021-06-18 先正达参股股份有限公司 用于鉴定和富集包含位点特异性基因组修饰的细胞的方法和组合物
WO2016164356A1 (en) 2015-04-06 2016-10-13 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Chemically modified guide rnas for crispr/cas-mediated gene regulation
US12043852B2 (en) 2015-10-23 2024-07-23 President And Fellows Of Harvard College Evolved Cas9 proteins for gene editing
WO2017106537A2 (en) 2015-12-18 2017-06-22 Sangamo Biosciences, Inc. Targeted disruption of the mhc cell receptor
JP6871252B2 (ja) * 2015-12-22 2021-05-12 パイオニア ハイ−ブレッド インターナショナル， インコーポレイテッド 組織優先的プロモーターおよびその使用方法
US10767175B2 (en) 2016-06-08 2020-09-08 Agilent Technologies, Inc. High specificity genome editing using chemically modified guide RNAs
GB2568182A (en) 2016-08-03 2019-05-08 Harvard College Adenosine nucleobase editors and uses thereof
WO2018031683A1 (en) 2016-08-09 2018-02-15 President And Fellows Of Harvard College Programmable cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof
US11542509B2 (en) 2016-08-24 2023-01-03 President And Fellows Of Harvard College Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing
EP3509645A4 (en) * 2016-09-07 2020-06-17 Sangamo Therapeutics, Inc. MODULATION OF LIVER GENES
US20200024610A1 (en) 2016-09-30 2020-01-23 Monsanto Technology Llc Method for selecting target sites for site-specific genome modification in plants
GB2573062A (en) 2016-10-14 2019-10-23 Harvard College AAV delivery of nucleobase editors
WO2018119359A1 (en) 2016-12-23 2018-06-28 President And Fellows Of Harvard College Editing of ccr5 receptor gene to protect against hiv infection
US11898179B2 (en) 2017-03-09 2024-02-13 President And Fellows Of Harvard College Suppression of pain by gene editing
WO2018165631A1 (en) 2017-03-09 2018-09-13 President And Fellows Of Harvard College Cancer vaccine
CN110914310A (zh) 2017-03-10 2020-03-24 哈佛大学的校长及成员们 胞嘧啶至鸟嘌呤碱基编辑器
US11268082B2 (en) 2017-03-23 2022-03-08 President And Fellows Of Harvard College Nucleobase editors comprising nucleic acid programmable DNA binding proteins
WO2018209320A1 (en) 2017-05-12 2018-11-15 President And Fellows Of Harvard College Aptazyme-embedded guide rnas for use with crispr-cas9 in genome editing and transcriptional activation
JP2020534795A (ja) 2017-07-28 2020-12-03 プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ ファージによって支援される連続的進化（ｐａｃｅ）を用いて塩基編集因子を進化させるための方法および組成物
WO2019139645A2 (en) 2017-08-30 2019-07-18 President And Fellows Of Harvard College High efficiency base editors comprising gam
WO2019046776A1 (en) 2017-08-31 2019-03-07 Dow Agrosciences Llc COMPOSITIONS AND METHODS FOR EXPRESSING TRANSGENES USING REGULATORY ELEMENTS FROM CHLOROPHYLALLY BINDING AB GENES
CA3082251A1 (en) 2017-10-16 2019-04-25 The Broad Institute, Inc. Uses of adenosine base editors
US12406749B2 (en) 2017-12-15 2025-09-02 The Broad Institute, Inc. Systems and methods for predicting repair outcomes in genetic engineering
CN108596939B (zh) * 2018-03-23 2021-09-14 沈阳理工大学 一种玉米种子特征区切割定位方法
CA3094027A1 (en) 2018-04-18 2019-10-24 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Genes, constructs and maize event dp-202216-6
CA3095045A1 (en) 2018-04-18 2019-10-24 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Improving agronomic characteristics in maize by modification of endogenous mads box transcription factors
US12157760B2 (en) 2018-05-23 2024-12-03 The Broad Institute, Inc. Base editors and uses thereof
WO2020092453A1 (en) 2018-10-29 2020-05-07 The Broad Institute, Inc. Nucleobase editors comprising geocas9 and uses thereof
US12351837B2 (en) 2019-01-23 2025-07-08 The Broad Institute, Inc. Supernegatively charged proteins and uses thereof
AU2020240109A1 (en) 2019-03-19 2021-09-30 President And Fellows Of Harvard College Methods and compositions for editing nucleotide sequences
WO2020214842A1 (en) 2019-04-17 2020-10-22 The Broad Institute, Inc. Adenine base editors with reduced off-target effects
US12435330B2 (en) 2019-10-10 2025-10-07 The Broad Institute, Inc. Methods and compositions for prime editing RNA
BR112022022603A2 (pt) 2020-05-08 2023-01-17 Broad Inst Inc Métodos e composições para edição simultânea de ambas as fitas de sequência alvo de nucleotídeos de fita dupla
BR112023002885A2 (pt) * 2020-08-18 2023-03-21 Pioneer Hi Bred Int Genes de resistência a múltiplas doenças e seus empilhamentos genômicos
WO2022187181A1 (en) * 2021-03-02 2022-09-09 President And Fellows Of Harvard College Compositions and methods for human genomic safe harbor site integration
WO2023039586A1 (en) 2021-09-10 2023-03-16 Agilent Technologies, Inc. Guide rnas with chemical modification for prime editing
CN117184789B (zh) * 2023-08-31 2025-12-12 南通理工学院 一种螺旋给料装置参数优化试验方法及其试验装置

Family Cites Families (152)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4693977A (en) 1982-08-23 1987-09-15 Queen's University At Kingston Enzyme immobilization for producing cephalosporin antibiotics
US4536475A (en) 1982-10-05 1985-08-20 Phytogen Plant vector
US4535060A (en) 1983-01-05 1985-08-13 Calgene, Inc. Inhibition resistant 5-enolpyruvyl-3-phosphoshikimate synthetase, production and use
NL8300698A (nl) 1983-02-24 1984-09-17 Univ Leiden Werkwijze voor het inbouwen van vreemd dna in het genoom van tweezaadlobbige planten; agrobacterium tumefaciens bacterien en werkwijze voor het produceren daarvan; planten en plantecellen met gewijzigde genetische eigenschappen; werkwijze voor het bereiden van chemische en/of farmaceutische produkten.
NZ207765A (en) 1983-04-15 1987-03-06 Lubrizol Genetics Inc Plant expression of transferred dna(t-dna)from plasmids associated with agrobacterium sp
US4886937A (en) 1985-05-20 1989-12-12 North Carolina State University Method for transforming pine
US4940835A (en) 1985-10-29 1990-07-10 Monsanto Company Glyphosate-resistant plants
US4810648A (en) 1986-01-08 1989-03-07 Rhone Poulenc Agrochimie Haloarylnitrile degrading gene, its use, and cells containing the gene
DE3765449D1 (de) 1986-03-11 1990-11-15 Plant Genetic Systems Nv Durch gentechnologie erhaltene und gegen glutaminsynthetase-inhibitoren resistente pflanzenzellen.
US4975374A (en) 1986-03-18 1990-12-04 The General Hospital Corporation Expression of wild type and mutant glutamine synthetase in foreign hosts
US5422251A (en) 1986-11-26 1995-06-06 Princeton University Triple-stranded nucleic acids
US5015580A (en) 1987-07-29 1991-05-14 Agracetus Particle-mediated transformation of soybean plants and lines
EP0270496B1 (de) 1986-12-05 1993-03-17 Ciba-Geigy Ag Verbessertes Verfahren zur Transformation von pflanzlichen Protoplasten
EP0333033A1 (en) 1988-03-09 1989-09-20 Meiji Seika Kaisha Ltd. Glutamine synthesis gene and glutamine synthetase
US5416011A (en) 1988-07-22 1995-05-16 Monsanto Company Method for soybean transformation and regeneration
DE3834738A1 (de) 1988-10-12 1990-04-19 Basf Lacke & Farben Verfahren zur herstellung eines mehrschichtigen ueberzuges, waessrige beschichtungszusammensetzungen, wasserverduennbare polyacrylatharze und verfahren zur herstellung von wasserverduennbaren polyacrylatharzen
US5176996A (en) 1988-12-20 1993-01-05 Baylor College Of Medicine Method for making synthetic oligonucleotides which bind specifically to target sites on duplex DNA molecules, by forming a colinear triplex, the synthetic oligonucleotides and methods of use
US5302523A (en) 1989-06-21 1994-04-12 Zeneca Limited Transformation of plant cells
US5501967A (en) 1989-07-26 1996-03-26 Mogen International, N.V./Rijksuniversiteit Te Leiden Process for the site-directed integration of DNA into the genome of plants
US5550318A (en) 1990-04-17 1996-08-27 Dekalb Genetics Corporation Methods and compositions for the production of stably transformed, fertile monocot plants and cells thereof
US7705215B1 (en) 1990-04-17 2010-04-27 Dekalb Genetics Corporation Methods and compositions for the production of stably transformed, fertile monocot plants and cells thereof
GB8920519D0 (en) 1989-09-11 1989-10-25 Rhone Poulenc Ltd New compositions of matter
GB9017539D0 (en) 1990-08-10 1990-09-26 Rhone Poulenc Agriculture New compositions of matter
HU220773B1 (hu) 1990-01-22 2002-05-28 Dekalb Genetics Corporation Eljárás termő transzgenikus kukoricanövények előállítására
US5484956A (en) 1990-01-22 1996-01-16 Dekalb Genetics Corporation Fertile transgenic Zea mays plant comprising heterologous DNA encoding Bacillus thuringiensis endotoxin
US6403865B1 (en) 1990-08-24 2002-06-11 Syngenta Investment Corp. Method of producing transgenic maize using direct transformation of commercially important genotypes
JP2859427B2 (ja) 1990-11-21 1999-02-17 株式会社東芝 超電導コイル装置
US5384253A (en) 1990-12-28 1995-01-24 Dekalb Genetics Corporation Genetic transformation of maize cells by electroporation of cells pretreated with pectin degrading enzymes
GB9101659D0 (en) 1991-01-25 1991-03-06 Rhone Poulenc Agriculture Compositions of matter
GB9310203D0 (en) 1993-05-18 1993-06-30 Rhone Poulenc Agriculture Compositions of new matter
GB9101660D0 (en) 1991-01-25 1991-03-06 Rhone Poulenc Agriculture New compositions of matter
GB9115377D0 (en) 1991-07-17 1991-09-04 Rhone Poulenc Agriculture New compositions of matter
GB9115909D0 (en) 1991-07-23 1991-09-04 Nickerson Int Seed Recombinant dna
GB9116834D0 (en) 1991-08-05 1991-09-18 Rhone Poulenc Agriculture Compositions of new matter
US5420032A (en) 1991-12-23 1995-05-30 Universitge Laval Homing endonuclease which originates from chlamydomonas eugametos and recognizes and cleaves a 15, 17 or 19 degenerate double stranded nucleotide sequence
US5334753A (en) 1992-03-12 1994-08-02 Rhone-Poulenc Agriculture Ltd Processes for preparing ortho-substituted benzoic acids
DK39692D0 (da) 1992-03-25 1992-03-25 Danisco Biologisk materiale
US5487994A (en) 1992-04-03 1996-01-30 The Johns Hopkins University Insertion and deletion mutants of FokI restriction endonuclease
US5436150A (en) 1992-04-03 1995-07-25 The Johns Hopkins University Functional domains in flavobacterium okeanokoities (foki) restriction endonuclease
US5356802A (en) 1992-04-03 1994-10-18 The Johns Hopkins University Functional domains in flavobacterium okeanokoites (FokI) restriction endonuclease
US5792632A (en) 1992-05-05 1998-08-11 Institut Pasteur Nucleotide sequence encoding the enzyme I-SceI and the uses thereof
US5591616A (en) 1992-07-07 1997-01-07 Japan Tobacco, Inc. Method for transforming monocotyledons
HUT70467A (en) 1992-07-27 1995-10-30 Pioneer Hi Bred Int An improved method of agrobactenium-mediated transformation of cultvred soyhean cells
US5607914A (en) 1993-01-13 1997-03-04 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Synthetic antimicrobial peptides
GB9302071D0 (en) 1993-02-03 1993-03-24 Rhone Poulenc Agriculture Compositions of matter
ES2141559T3 (es) 1993-05-18 2000-03-16 Rhone Poulenc Agriculture Derivados de 2-ciano-1-sulfonamidofenil-1,3-diona y su uso como herbicidas.
US6242568B1 (en) 1994-01-18 2001-06-05 The Scripps Research Institute Zinc finger protein derivatives and methods therefor
US6140466A (en) 1994-01-18 2000-10-31 The Scripps Research Institute Zinc finger protein derivatives and methods therefor
CA2681922C (en) 1994-01-18 2012-05-15 The Scripps Research Institute Zinc finger protein derivatives and methods therefor
US5767373A (en) 1994-06-16 1998-06-16 Novartis Finance Corporation Manipulation of protoporphyrinogen oxidase enzyme activity in eukaryotic organisms
GB9824544D0 (en) 1998-11-09 1999-01-06 Medical Res Council Screening system
EP0781331B1 (en) 1994-08-20 2008-09-03 Gendaq Limited Improvements in or relating to binding proteins for recognition of dna
US5506195A (en) 1994-11-01 1996-04-09 Zeneca Limited Selective 1,3-cyclohexanedione corn herbicide
US5789538A (en) 1995-02-03 1998-08-04 Massachusetts Institute Of Technology Zinc finger proteins with high affinity new DNA binding specificities
US5659026A (en) 1995-03-24 1997-08-19 Pioneer Hi-Bred International ALS3 promoter
US5994627A (en) 1995-03-31 1999-11-30 Common Wealth Scientific And Industrial Research Organisation Genetic sequences conferring nematode resistance in plants and uses therefor
FR2734842B1 (fr) 1995-06-02 1998-02-27 Rhone Poulenc Agrochimie Sequence adn d'un gene de l'hydroxy-phenyl pyruvate dioxygenase et obtention de plantes contenant un gene de l'hydroxy-phenyl pyruvate dioxygenase, tolerantes a certains herbicides
US5693512A (en) 1996-03-01 1997-12-02 The Ohio State Research Foundation Method for transforming plant tissue by sonication
CA2256501A1 (en) 1996-06-27 1997-12-31 E.I. Du Pont De Nemours And Company Plant gene for p-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase
US5925523A (en) 1996-08-23 1999-07-20 President & Fellows Of Harvard College Intraction trap assay, reagents and uses thereof
US5981840A (en) 1997-01-24 1999-11-09 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Methods for agrobacterium-mediated transformation
GB2338237B (en) 1997-02-18 2001-02-28 Actinova Ltd In vitro peptide or protein expression library
US7105724B2 (en) 1997-04-04 2006-09-12 Board Of Regents Of University Of Nebraska Methods and materials for making and using transgenic dicamba-degrading organisms
GB9710809D0 (en) 1997-05-23 1997-07-23 Medical Res Council Nucleic acid binding proteins
GB9710807D0 (en) 1997-05-23 1997-07-23 Medical Res Council Nucleic acid binding proteins
US6245968B1 (en) 1997-11-07 2001-06-12 Aventis Cropscience S.A. Mutated hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, DNA sequence and isolation of plants which contain such a gene and which are tolerant to herbicides
US6506559B1 (en) 1997-12-23 2003-01-14 Carnegie Institute Of Washington Genetic inhibition by double-stranded RNA
AU746454B2 (en) 1998-03-02 2002-05-02 Massachusetts Institute Of Technology Poly zinc finger proteins with improved linkers
AUPP249298A0 (en) 1998-03-20 1998-04-23 Ag-Gene Australia Limited Synthetic genes and genetic constructs comprising same I
US6140081A (en) 1998-10-16 2000-10-31 The Scripps Research Institute Zinc finger binding domains for GNN
US7070934B2 (en) 1999-01-12 2006-07-04 Sangamo Biosciences, Inc. Ligand-controlled regulation of endogenous gene expression
US6534261B1 (en) 1999-01-12 2003-03-18 Sangamo Biosciences, Inc. Regulation of endogenous gene expression in cells using zinc finger proteins
US6453242B1 (en) 1999-01-12 2002-09-17 Sangamo Biosciences, Inc. Selection of sites for targeting by zinc finger proteins and methods of designing zinc finger proteins to bind to preselected sites
US6599692B1 (en) 1999-09-14 2003-07-29 Sangamo Bioscience, Inc. Functional genomics using zinc finger proteins
EP1141346A2 (en) 1999-01-14 2001-10-10 Monsanto Co. Soybean transformation method
US7030215B2 (en) 1999-03-24 2006-04-18 Sangamo Biosciences, Inc. Position dependent recognition of GNN nucleotide triplets by zinc fingers
US6794136B1 (en) 2000-11-20 2004-09-21 Sangamo Biosciences, Inc. Iterative optimization in the design of binding proteins
ATE309536T1 (de) 1999-12-06 2005-11-15 Sangamo Biosciences Inc Methoden zur verwendung von randomisierten zinkfingerprotein-bibliotheken zur identifizierung von genfunktionen
AU2693501A (en) 2000-01-24 2001-07-31 Gendaq Ltd Nucleic acid binding polypeptides characterized by flexible linkers connected nucleic acid binding modules
EP2207032A1 (en) 2000-02-08 2010-07-14 Sangamo BioSciences, Inc. Cells expressing zinc finger protein for drug discovery
US20020061512A1 (en) 2000-02-18 2002-05-23 Kim Jin-Soo Zinc finger domains and methods of identifying same
US20030044787A1 (en) 2000-05-16 2003-03-06 Joung J. Keith Methods and compositions for interaction trap assays
JP2002060786A (ja) 2000-08-23 2002-02-26 Kao Corp 硬質表面用殺菌防汚剤
US7067317B2 (en) 2000-12-07 2006-06-27 Sangamo Biosciences, Inc. Regulation of angiogenesis with zinc finger proteins
GB0108491D0 (en) 2001-04-04 2001-05-23 Gendaq Ltd Engineering zinc fingers
JP2005500061A (ja) 2001-08-20 2005-01-06 ザ スクリップス リサーチ インスティテュート Ｃｎｎについての亜鉛フィンガー結合ドメイン
AU2002360986A1 (en) * 2001-12-20 2003-07-09 Sungene Gmbh And Co. Kgaa Methods for the transformation of vegetal plastids
US7262054B2 (en) 2002-01-22 2007-08-28 Sangamo Biosciences, Inc. Zinc finger proteins for DNA binding and gene regulation in plants
EP1476547B1 (en) 2002-01-23 2006-12-06 The University of Utah Research Foundation Targeted chromosomal mutagenesis using zinc finger nucleases
ATE531796T1 (de) 2002-03-21 2011-11-15 Sangamo Biosciences Inc Verfahren und zusammensetzungen zur verwendung von zinkfinger-endonukleasen zur verbesserung der homologen rekombination
CA2490274A1 (en) 2002-06-27 2004-01-08 Dow Agrosciences Llc Use of regulatory sequences in transgenic plants
US7361635B2 (en) 2002-08-29 2008-04-22 Sangamo Biosciences, Inc. Simultaneous modulation of multiple genes
AU2003298574B2 (en) 2002-09-05 2008-04-24 California Institute Of Technology Use of chimeric nucleases to stimulate gene targeting
JP2007500514A (ja) 2003-04-29 2007-01-18 パイオニア ハイ−ブレッド インターナショナル， インコーポレイテッド 新規なグリホセートｎ−アセチルトランスフェラーゼ（ｇａｔ）遺伝子
AU2003252483A1 (en) 2003-07-08 2005-01-21 Japan Science And Technology Corporation Method and system of constructing transgenic organism
WO2005014791A2 (en) 2003-08-08 2005-02-17 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for targeted cleavage and recombination
US8409861B2 (en) 2003-08-08 2013-04-02 Sangamo Biosciences, Inc. Targeted deletion of cellular DNA sequences
US7888121B2 (en) 2003-08-08 2011-02-15 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for targeted cleavage and recombination
WO2005025051A1 (en) 2003-09-10 2005-03-17 Koninklijke Philips Electronics, N.V. Variable impedance circuit using cell arrays
US7972854B2 (en) 2004-02-05 2011-07-05 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for targeted cleavage and recombination
DE602005011943D1 (de) 2004-04-08 2009-02-05 Sangamo Biosciences Inc Zusammensetzungen zur behandlung von neuropathischen und neurodegenerativen erkrankungen
JP2008506359A (ja) 2004-04-08 2008-03-06 サンガモ バイオサイエンシズ インコーポレイテッド ジンクフィンガータンパク質による神経因性疼痛の処置
EP2319932B2 (en) 2004-04-30 2016-10-19 Dow AgroSciences LLC Novel herbicide resistance gene
CA2579677A1 (en) 2004-09-16 2006-03-30 Sangamo Biosciences, Inc. Compositions and methods for protein production
US6992239B2 (en) 2005-01-31 2006-01-31 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Soybean variety 92M61
EP1877583A2 (en) 2005-05-05 2008-01-16 Arizona Board of Regents on behalf of the Unversity of Arizona Sequence enabled reassembly (seer) - a novel method for visualizing specific dna sequences
US20090263900A1 (en) 2008-04-14 2009-10-22 Sangamo Biosciences, Inc. Linear donor constructs for targeted integration
KR101419729B1 (ko) 2005-07-26 2014-07-17 상가모 바이오사이언스 인코포레이티드 외래 핵산 서열의 표적화된 통합 및 발현
AU2006304668B2 (en) 2005-10-18 2013-03-07 Duke University Rationally-designed meganucleases with altered sequence specificity and DNA-binding affinity
EP2484767B1 (en) 2005-10-28 2016-11-30 Dow AgroSciences LLC Novel Herbicide resistance genes
US7629455B2 (en) * 2005-12-07 2009-12-08 Monsanto Technology Llc Zea mays NFB2 promoter
US20070271629A1 (en) 2006-05-17 2007-11-22 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Artificial plant minichromosomes
CA2651494C (en) 2006-05-25 2015-09-29 Sangamo Biosciences, Inc. Engineered cleavage half-domains
JP2010500029A (ja) 2006-08-11 2010-01-07 ダウ アグロサイエンシィズ エルエルシー ジンクフィンガーヌクレアーゼ媒介相同組換え
JP5632610B2 (ja) 2006-12-14 2014-11-26 ダウ アグロサイエンシィズ エルエルシー 最適化された非正準ジンクフィンガータンパク質
EP2181193B1 (en) 2007-06-07 2017-10-25 Agriculture And Agri-food Canada Plant transformation with cell penetrating peptides
CA2691440A1 (en) 2007-06-29 2009-01-08 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Methods for altering the genome of a monocot plant cell
CA2937438C (en) 2007-09-27 2020-07-07 Dow Agrosciences Llc Engineered zinc finger proteins targeting 5-enolpyruvyl shikimate-3-phosphate synthase genes
EP2188384B1 (en) 2007-09-27 2015-07-15 Sangamo BioSciences, Inc. Rapid in vivo identification of biologically active nucleases
CA2701636C (en) 2007-10-05 2019-10-15 Dow Agrosciences Llc Methods for transferring molecular substances into plant cells
WO2009054985A1 (en) 2007-10-25 2009-04-30 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for targeted integration
DE102007056956B4 (de) 2007-11-27 2009-10-29 Moosbauer, Peter, Dipl.-Ing.(FH) Schaltung zur Regelung der Stromversorgung eines Verbrauchers und Verfahren zum Betrieb einer Schaltung
WO2009099580A2 (en) 2008-02-05 2009-08-13 Monsanto Technology, Llc Isolated novel nucleic acid and protein molecules from soy and methods of using those molecules to generate transgenic plants with enhanced agronomic traits
CA2729563C (en) * 2008-08-21 2018-11-13 China Agricultural University Genetic loci associated with head smut resistance in maize
EP2789691B1 (en) 2008-08-22 2018-08-08 Sangamo Therapeutics, Inc. Methods and compositions for targeted single-stranded cleavage and targeted integration
US9139173B2 (en) 2008-10-28 2015-09-22 Advics Co., Ltd. Device for controlling traveling of vehicle
KR101683928B1 (ko) 2008-12-17 2016-12-07 다우 아그로사이언시즈 엘엘씨 Ｚｐ１５ 유전자 자리 내로의 표적화 통합
US7968443B2 (en) * 2008-12-26 2011-06-28 Texas Instruments Incorporated Cross-contamination control for processing of circuits comprising MOS devices that include metal comprising high-K dielectrics
US20110239315A1 (en) 2009-01-12 2011-09-29 Ulla Bonas Modular dna-binding domains and methods of use
EP2206723A1 (en) 2009-01-12 2010-07-14 Bonas, Ulla Modular DNA-binding domains
US8385662B1 (en) 2009-04-30 2013-02-26 Google Inc. Principal component analysis based seed generation for clustering analysis
JP5940977B2 (ja) 2009-08-11 2016-06-29 サンガモ バイオサイエンシーズ， インコーポレイテッド 標的改変によるホモ接合生物
EP2467010B1 (en) 2009-08-19 2018-11-28 Dow AgroSciences LLC Aad-1 event das-40278-9, related transgenic corn lines, and event-specific identification thereof
EP2292176B1 (en) 2009-09-07 2019-01-09 Nobel Biocare Services AG Implantation set
BR122019025207B1 (pt) 2009-10-22 2022-10-04 Sangamo Biosciences, Inc. Proteína de dedo de zinco de ocorrência não natural e proteína de fusão
UA109644C2 (uk) 2009-11-24 2015-09-25 СПОСІБ ВИЗНАЧЕННЯ ЗИГОТНОСТІ ПОДІЇ У РОСЛИНИ СОЇ, ЩО ВКЛЮЧАЄ AAD-12-ПОДІЮ pDAB4468-0416 У СОЇ
CN106834320B (zh) 2009-12-10 2021-05-25 明尼苏达大学董事会 Tal效应子介导的dna修饰
WO2011085062A1 (en) * 2010-01-06 2011-07-14 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Identification of diurnal rhythms in photosynthetic and non-photosynthetic tissues from zea mays and use in improving crop plants
GB201000184D0 (en) 2010-01-07 2010-02-24 Plant Bioscience Ltd Methods and compositions for altering temperature sensing in eukaryotic organisms
UA110472C2 (ru) 2010-01-22 2016-01-12 Dow Agrosciences Llc Спосіб отримання клітини трансгенної рослини для спрямованого впливу на ген в рослинах, трансгенна рослина або рослинна тканина, насіння, отримане з трансгенної рослини
WO2011090804A1 (en) 2010-01-22 2011-07-28 Dow Agrosciences Llc Targeted genomic alteration
PE20121693A1 (es) * 2010-01-22 2012-12-01 Bayer Ip Gmbh Combinacion de espiromesifeno y abamectina como insecticidas
EP2529028A1 (en) 2010-01-26 2012-12-05 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Polynucleotide and polypeptide sequences associated with herbicide tolerance
ES2751916T3 (es) 2010-02-08 2020-04-02 Sangamo Therapeutics Inc Semidominios de escisión genomanipulados
EP2660318A1 (en) * 2010-02-09 2013-11-06 Sangamo BioSciences, Inc. Targeted genomic modification with partially single-stranded donor molecules
JP6208580B2 (ja) 2010-05-17 2017-10-04 サンガモ セラピューティクス， インコーポレイテッド 新規のｄｎａ結合タンパク質及びその使用
CA2822289A1 (en) * 2010-12-21 2012-06-28 E. I. Du Pont De Nemours And Company Plant gene expression modulatory sequences from maize
BR112013025459A2 (pt) 2011-04-05 2016-11-29 Dow Agrosciences Llc análise de alto rendimento de bordas de transgenes
BR112014019047A2 (pt) 2012-02-08 2017-06-27 Dow Agrosciences Llc análise de dados de sequências de dna
WO2013144663A2 (en) 2012-03-27 2013-10-03 Rudjer Boskovic Institute Method of determination of neutral dna sequences in the genome, system for targeting sequences obtained thereby and methods for use thereof
US11039586B2 (en) 2013-03-15 2021-06-22 Monsanto Technology Llc Creation and transmission of megaloci
US10648951B2 (en) 2017-11-14 2020-05-12 Ge Sensing & Inspection Technologies Gmbh Classification of ultrasonic indications using pattern recognition

Also Published As

Publication number Publication date
IL245350B (en) 2021-12-01
EP3065540B1 (en) 2021-12-15
KR102269769B1 (ko) 2021-06-28
CN107223156A (zh) 2017-09-29
AU2014341929B2 (en) 2017-11-30
BR102014027438A8 (pt) 2021-09-08
UA120502C2 (uk) 2019-12-26
KR20160078531A (ko) 2016-07-04
BR102014027438A2 (pt) 2016-09-20
EP3065540A2 (en) 2016-09-14
MX364662B (es) 2019-05-03
EP3065540A4 (en) 2017-04-19
US10273493B2 (en) 2019-04-30
MX2016005876A (es) 2017-03-10
WO2015066638A3 (en) 2015-11-12
AU2020203872B2 (en) 2022-06-02
ZA201901731B (en) 2021-01-27
RU2016122046A3 (ru) 2018-06-29
AU2018200955A1 (en) 2018-03-01
TW201518504A (zh) 2015-05-16
IL284967A (en) 2021-08-31
AU2018200955B2 (en) 2020-03-12
IL245350A0 (en) 2016-06-30
JP2016535604A (ja) 2016-11-17
AU2020203872A1 (en) 2020-07-02
US20150128309A1 (en) 2015-05-07
ZA201604452B (en) 2019-09-25
CA2928666C (en) 2023-05-23
CA2928666A1 (en) 2015-05-07
US20190194674A1 (en) 2019-06-27
JP6633532B2 (ja) 2020-01-22
US11098317B2 (en) 2021-08-24
AU2014341929A1 (en) 2016-05-12
BR102014027438B1 (pt) 2022-09-27
RU2709734C2 (ru) 2019-12-19
UY35812A (es) 2015-05-29
WO2015066638A2 (en) 2015-05-07
CL2016001064A1 (es) 2016-12-09

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2016122046A (ru) Оптимальные локусы маиса
RU2016121862A (ru) Оптимальные локусы сои
RU2016122067A (ru) Оптимальные локусы кукурузы
RU2016120636A (ru) Оптимальные локусы сои
RU2019143133A (ru) Способы и композиции для нацеленных генетических модификаций и способы их применения
WO2019103442A3 (ko) CRISPR/Cpf1 시스템을 이용한 유전체 편집용 조성물 및 이의 용도
Albadri et al. Genome editing using CRISPR/Cas9-based knock-in approaches in zebrafish
JP2022023040A (ja) オリゴヌクレオチド仲介型遺伝子修復を使用した標的遺伝子修飾の効率を高めるための方法および組成物
JP2019193667A5 (ru)
RU2015112593A (ru) Сконструированная способами инженерии платформа для встраивания трансгена (etip) для нацеливания генов и стэкинга признаков
Sufyan et al. An overview of genome engineering in plants, including its scope, technologies, progress and grand challenges
DE69833457D1 (de) Neuartige methode zur integration von fremd-dna ins eukaryotische genom
RU2017124909A (ru) Способы и композиции для нацеленной генетической модификации посредством одноэтапного множественного нацеливания
JP2016534727A5 (ru)
RU2016122038A (ru) Универсальная донорная система для направленного воздействия на гены
WO2011101811A3 (en) Improved meganuclease recombination system
JP2013513389A5 (ru)
Liu et al. A detailed procedure for CRISPR/Cas9-mediated gene editing in Arabidopsis thaliana
JP2017535271A5 (ru)
RU2015112583A (ru) Функциональные локусы fad2 и соответствующие специфичные для сайта-мишени связывающиеся белки, способные индуцировать направленные разрывы
CN104805078A (zh) 用于高效基因组编辑的rna分子的设计、合成及其应用
CN103667338A (zh) 一种玉米基因组定点改造方法
Carrijo et al. Two efficient CRISPR/Cas9 systems for gene editing in soybean
RU2015143201A (ru) Способы идентификации вариантных сайтов распознавания для редкощепящих сконструированных средств для индукции двунитевого разрыва и композиции с ними, и их применения
DE60121372D1 (de) Methoden zur modifikation eukaryotischer zellen

Legal Events

Date Code Title Description
PD4A Correction of name of patent owner