RU2015123570A - Цифровой анализ молекулярных анализируемых веществ с использованием одномолекулярного обнаружения - Google Patents
Цифровой анализ молекулярных анализируемых веществ с использованием одномолекулярного обнаружения Download PDFInfo
- Publication number
- RU2015123570A RU2015123570A RU2015123570A RU2015123570A RU2015123570A RU 2015123570 A RU2015123570 A RU 2015123570A RU 2015123570 A RU2015123570 A RU 2015123570A RU 2015123570 A RU2015123570 A RU 2015123570A RU 2015123570 A RU2015123570 A RU 2015123570A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- bits
- information
- different
- signals
- analytes
- Prior art date
Links
- 238000001514 detection method Methods 0.000 title claims 8
- 238000010252 digital analysis Methods 0.000 title 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 title 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims 22
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 17
- 239000012491 analyte Substances 0.000 claims 7
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims 7
- 239000013076 target substance Substances 0.000 claims 4
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims 3
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 claims 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 claims 2
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims 2
- 108010079855 Peptide Aptamers Proteins 0.000 claims 1
- 229920001519 homopolymer Polymers 0.000 claims 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
- G01N33/54306—Solid-phase reaction mechanisms
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
- G01N33/582—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with fluorescent label
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B25/00—ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
- C12Q1/6825—Nucleic acid detection involving sensors
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N1/00—Sampling; Preparing specimens for investigation
- G01N1/28—Preparing specimens for investigation including physical details of (bio-)chemical methods covered elsewhere, e.g. G01N33/50, C12Q
- G01N1/30—Staining; Impregnating ; Fixation; Dehydration; Multistep processes for preparing samples of tissue, cell or nucleic acid material and the like for analysis
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/6486—Measuring fluorescence of biological material, e.g. DNA, RNA, cells
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/536—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with immune complex formed in liquid phase
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
-
- H—ELECTRICITY
- H03—ELECTRONIC CIRCUITRY
- H03M—CODING; DECODING; CODE CONVERSION IN GENERAL
- H03M13/00—Coding, decoding or code conversion, for error detection or error correction; Coding theory basic assumptions; Coding bounds; Error probability evaluation methods; Channel models; Simulation or testing of codes
- H03M13/03—Error detection or forward error correction by redundancy in data representation, i.e. code words containing more digits than the source words
- H03M13/05—Error detection or forward error correction by redundancy in data representation, i.e. code words containing more digits than the source words using block codes, i.e. a predetermined number of check bits joined to a predetermined number of information bits
- H03M13/13—Linear codes
- H03M13/15—Cyclic codes, i.e. cyclic shifts of codewords produce other codewords, e.g. codes defined by a generator polynomial, Bose-Chaudhuri-Hocquenghem [BCH] codes
- H03M13/151—Cyclic codes, i.e. cyclic shifts of codewords produce other codewords, e.g. codes defined by a generator polynomial, Bose-Chaudhuri-Hocquenghem [BCH] codes using error location or error correction polynomials
- H03M13/1515—Reed-Solomon codes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Evolutionary Computation (AREA)
- Artificial Intelligence (AREA)
- Bioethics (AREA)
- Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Databases & Information Systems (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Public Health (AREA)
Claims (29)
1. Способ обнаружения множества анализируемых веществ, включающий:
получение множества упорядоченных наборов реагентов-зондов, каждый из указанных упорядоченных наборов реагентов-зондов, содержащий один или несколько зондов, направленных на определенное подмножество N различных анализируемых веществ-мишеней, причем каждое анализируемое вещество-мишень представляет собой компонент физиологического образца, причем каждое различное анализируемое вещество-мишень N различных анализируемых веществ-мишеней иммобилизуют на твердой подложке в положении, которое пространственно разделено от любого другого различного анализируемого вещества-мишени N различных анализируемых веществ-мишеней, и причем каждый из указанных зондов помечен такой обнаруживаемой меткой, что обнаруживаемый сигнал образуется благодаря связыванию одного зонда с одним различным анализируемым веществом-мишенью;
выполнение по меньшей мере M циклов связывания зондов и обнаружения сигналов, каждый цикл, содержащий один или несколько проходов, причем проход включает использование по меньшей мере одного из указанных упорядоченных наборов реагентов-зондов;
обнаружение из по меньшей мере M циклов наличия или отсутствия множества сигналов от указанных пространственно разделенных положений указанной подложки и
определение из указанного множества сигналов по меньшей мере K битов информации за один цикл одного или нескольких из указанных N различных анализируемых веществ-мишеней, причем указанные по меньшей мере K битов информации используют для определения L общих битов информации, причем K×М=L битов информации и L>log2(Ν), и причем указанные L битов информации используют для определения наличия или отсутствия одного или нескольких из указанных N различных анализируемых веществ-мишеней.
2. Способ по п. 1, при котором L>log2(Ν) и при котором L содержит биты информации для идентификации мишеней.
3. Способ по п. 1, при котором L>log2(Ν) и при котором L содержит биты информации, содержащие ключ для декодирования порядка указанного множества упорядоченных наборов реагентов-зондов.
4. Способ по п. 1, дополнительно включающий стадию оцифровки указанного множества сигналов для расширения динамического диапазона обнаружения указанного множества сигналов.
5. Способ по п. 1, при котором указанные по меньшей мере K битов информации содержат информацию о количестве проходов в цикле.
6. Способ по п. 1, при котором указанные по меньшей мере K битов информации содержат информацию об отсутствии сигнала для одного из указанных N различных анализируемых веществ-мишеней.
7. Способ по п. 1, при котором указанная обнаруживаемая метка представляет собой флуоресцентную метку.
8. Способ по п. 1, при котором указанный зонд содержит антитело.
9. Способ по п. 1, при котором указанный зонд содержит аптамер.
10. Способ по п. 9, при котором указанный аптамер содержит гомополимерную область оснований.
11. Способ по п. 1, при котором указанное множество анализируемых веществ содержит белок, пептидный аптамер или молекулу нуклеиновой кислоты.
12. Способ по п. 1, при котором указанное обнаружение из указанных по меньшей мере M циклов наличия или отсутствия множества сигналов включает оптическое обнаружение указанного множества сигналов.
13. Способ по п. 1, при котором указанное обнаружение по меньшей мере из указанных M циклов наличия или отсутствия множества сигналов включает электрическое обнаружение указанного множества сигналов.
14. Способ по п. 1, дополнительно включающий стадию определения из указанных L битов информации коррекции ошибок для указанного множества выходных сигналов.
15. Способ по п. 14, при котором указанная коррекция ошибок включает использование кода Рида-Соломона.
16. Способ по п. 1, при котором указанные N различных анализируемых веществ-мишеней присутствуют в образце и при котором образец разделяют на множество аликвот, которые разбавляют до множества различных конечных разведений, каждую из указанного множества аликвот иммобилизуют на отдельной секции подложки.
17. Способ по п. 16, при котором концентрацию одного из N различных анализируемых веществ-мишеней определяют путем подсчета встречаемости анализируемого вещества-мишени в пределах одной из различных секций и корректировки количества в соответствии с разбавлением соответствующей аликвоты.
18. Набор для обнаружения множества анализируемых веществ, содержащий:
множество упорядоченных наборов реагентов-зондов, каждый из указанных упорядоченных наборов реагентов-зондов, содержащий один или несколько зондов, направленных на определенное подмножество N различных анализируемых веществ-мишеней, причем каждое анализируемое вещество-мишень представляет собой компонент физиологического образца, причем каждое различное анализируемое вещество-мишень иммобилизуют на твердой подложке в положении, которое пространственно разделено от любого другого N различного анализируемого вещества-мишени N различных анализируемых веществ-мишеней, и причем каждый из указанных зондов помечен такой обнаруживаемой меткой, что обнаруживаемый сигнал образуется благодаря связыванию одного зонда с одним различным анализируемым веществом-мишенью;
инструкции для обнаружения указанных N различных анализируемых веществ на основе множества обнаруживаемых сигналов, указанные инструкции, содержащие:
инструкции для выполнения по меньшей мере M циклов связывания зондов и обнаружения сигналов, каждый цикл, содержащий один или несколько проходов, причем проход включает использование по меньшей мере одного из указанных упорядоченных наборов реагентов-зондов;
инструкции для обнаружения по меньшей мере из M циклов наличия или отсутствия множества сигналов от указанных пространственно разделенных положений указанной подложки и
инструкции для определения из указанного множества сигналов по меньшей мере K битов информации за один цикл для одного или нескольких из указанных N различных анализируемых веществ-мишеней, причем указанные по меньшей мере K битов информации используются для определения L общих битов информации, причем K×M=L битов информации и L>log2(Ν) и причем указанные L битов информации используются для определения наличия или отсутствия одного или нескольких из указанных N различных анализируемых веществ-мишеней.
19. Набор по п. 18, в котором указанный один или несколько зондов содержит антитело.
20. Набор по п. 18, в котором указанная метка представляет собой флуоресцентную метку.
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201261728067P | 2012-11-19 | 2012-11-19 | |
| US61/728,067 | 2012-11-19 | ||
| US201361869020P | 2013-08-22 | 2013-08-22 | |
| US61/869,020 | 2013-08-22 | ||
| PCT/US2013/070797 WO2014078855A1 (en) | 2012-11-19 | 2013-11-19 | Digital analysis of molecular analytes using single molecule detection |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2015123570A true RU2015123570A (ru) | 2017-01-10 |
| RU2670133C2 RU2670133C2 (ru) | 2018-10-18 |
Family
ID=50731772
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2015123570A RU2670133C2 (ru) | 2012-11-19 | 2013-11-19 | Цифровой анализ молекулярных анализируемых веществ с использованием одномолекулярного обнаружения |
Country Status (13)
| Country | Link |
|---|---|
| US (4) | US20150330974A1 (ru) |
| EP (2) | EP2920725B1 (ru) |
| JP (1) | JP6395718B2 (ru) |
| KR (1) | KR102061257B1 (ru) |
| CN (1) | CN105264532B (ru) |
| AU (1) | AU2013344340B2 (ru) |
| CA (1) | CA2891939C (ru) |
| DK (1) | DK2920725T3 (ru) |
| ES (1) | ES2905265T3 (ru) |
| HU (1) | HUE058723T2 (ru) |
| MX (2) | MX390589B (ru) |
| RU (1) | RU2670133C2 (ru) |
| WO (1) | WO2014078855A1 (ru) |
Families Citing this family (28)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US10829816B2 (en) | 2012-11-19 | 2020-11-10 | Apton Biosystems, Inc. | Methods of analyte detection |
| CA2891939C (en) | 2012-11-19 | 2020-10-27 | Apton Biosystems, Inc. | Digital analysis of molecular analytes using single molecule detection |
| EP3036358B8 (en) | 2013-08-22 | 2023-11-22 | Pacific Biosciences of California, Inc. | Digital analysis of molecular analytes using electrical methods |
| US10872679B2 (en) | 2014-07-17 | 2020-12-22 | California Institute Of Technology | Multiplex analysis of molecules in single cells by image correlation |
| US20170141793A1 (en) * | 2015-11-13 | 2017-05-18 | Microsoft Technology Licensing, Llc | Error correction for nucleotide data stores |
| EP3548652B1 (en) * | 2016-12-01 | 2024-04-03 | Nautilus Subsidiary, Inc. | Methods of assaying proteins |
| CN110582715B (zh) | 2017-03-03 | 2022-04-29 | 雅普顿生物系统公司 | 具有加速跟踪的高速扫描系统 |
| CA3055565A1 (en) | 2017-03-08 | 2018-09-13 | The Regents Of The University Of Michigan | Analyte detection |
| CN114921537A (zh) | 2017-03-17 | 2022-08-19 | 雅普顿生物系统公司 | 测序和高分辨率成像 |
| EP3601599A4 (en) * | 2017-03-23 | 2020-12-23 | Apton Biosystems, Inc. | POLYMORPHISM DETECTION WITH INCREASED ACCURACY |
| EP3602011A2 (en) | 2017-03-31 | 2020-02-05 | University of Strathclyde | Infra-red spectroscopy system |
| EP3669018A4 (en) | 2017-08-18 | 2021-05-26 | Nautilus Biotechnology, Inc. | Binding reagent selection methods |
| AU2018353967B2 (en) * | 2017-10-23 | 2024-02-29 | Nautilus Subsidiary, Inc. | Methods and systems for protein identification |
| US11721412B2 (en) | 2017-10-23 | 2023-08-08 | Nautilus Subsidiary, Inc. | Methods for identifying a protein in a sample of unknown proteins |
| CA3086915A1 (en) | 2017-12-29 | 2019-07-04 | Sujal M. Patel | Decoding approaches for protein identification |
| WO2019148001A1 (en) * | 2018-01-25 | 2019-08-01 | Apton Biosystems, Inc. | Methods and composition for high throughput single molecule protein detection systems |
| WO2019195633A1 (en) | 2018-04-04 | 2019-10-10 | Ignite Biosciences, Inc. | Methods of generating nanoarrays and microarrays |
| WO2020061237A1 (en) * | 2018-09-19 | 2020-03-26 | Apton Biosystems, Inc. | Densely-packed analyte layers and detection methods |
| EP3884048A4 (en) | 2018-11-20 | 2022-08-17 | Nautilus Biotechnology, Inc. | DESIGN AND SELECTION OF AFFINITY REAGENTS |
| EP3963091A4 (en) | 2019-04-29 | 2023-07-19 | Nautilus Biotechnology, Inc. | METHODS AND SYSTEMS FOR ON-CHIP INTEGRATED SINGLE MOLECULE DETECTION |
| CN114667723A (zh) | 2019-09-05 | 2022-06-24 | 雅普顿生物系统公司 | 用于超分辨率成像的高速扫描系统 |
| US12377635B2 (en) | 2019-10-30 | 2025-08-05 | Nautilus Subsidiary, Inc. | Flow cell systems and methods |
| EP4096694A4 (en) | 2020-01-30 | 2024-01-24 | Prognomiq Inc | LUNG BIOMARKERS AND METHODS OF USE THEREOF |
| KR20230118570A (ko) | 2020-11-11 | 2023-08-11 | 노틸러스 서브시디어리, 인크. | 강화된 결합 및 검출 특성을 갖는 친화성 시약 |
| US12334190B2 (en) | 2021-03-31 | 2025-06-17 | PrognomIQ, Inc. | Multi-omic assessment using proteins and nucleic acids |
| WO2023039479A1 (en) | 2021-09-10 | 2023-03-16 | PrognomIQ, Inc. | Direct classification of raw biomolecule measurement data |
| AU2022341187A1 (en) | 2021-09-13 | 2024-03-21 | PrognomIQ, Inc. | Enhanced detection and quantitation of biomolecules |
| IL317683A (en) * | 2022-06-15 | 2025-02-01 | Seegene Inc | Method and device for creating a technical construction file |
Family Cites Families (87)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5302509A (en) | 1989-08-14 | 1994-04-12 | Beckman Instruments, Inc. | Method for sequencing polynucleotides |
| US5494810A (en) | 1990-05-03 | 1996-02-27 | Cornell Research Foundation, Inc. | Thermostable ligase-mediated DNA amplifications system for the detection of genetic disease |
| DE4497968T1 (de) | 1993-10-20 | 1996-12-05 | Cambridge Imaging Ltd | Abbildungsverfahren und Abbildungseinrichtung |
| US7569341B2 (en) | 1994-01-31 | 2009-08-04 | Trustees Of Boston University | Nucleic acid directed immobilization arrays and methods of assembly |
| US6214987B1 (en) | 1994-09-02 | 2001-04-10 | Andrew C. Hiatt | Compositions for enzyme catalyzed template-independent formation of phosphodiester bonds using protected nucleotides |
| US6232465B1 (en) | 1994-09-02 | 2001-05-15 | Andrew C. Hiatt | Compositions for enzyme catalyzed template-independent creation of phosphodiester bonds using protected nucleotides |
| US5763594A (en) | 1994-09-02 | 1998-06-09 | Andrew C. Hiatt | 3' protected nucleotides for enzyme catalyzed template-independent creation of phosphodiester bonds |
| US6654505B2 (en) | 1994-10-13 | 2003-11-25 | Lynx Therapeutics, Inc. | System and apparatus for sequential processing of analytes |
| US6852487B1 (en) | 1996-02-09 | 2005-02-08 | Cornell Research Foundation, Inc. | Detection of nucleic acid sequence differences using the ligase detection reaction with addressable arrays |
| US5853993A (en) * | 1996-10-21 | 1998-12-29 | Hewlett-Packard Company | Signal enhancement method and kit |
| WO1999067641A2 (en) * | 1998-06-24 | 1999-12-29 | Illumina, Inc. | Decoding of array sensors with microspheres |
| EP1110090B1 (en) * | 1998-09-03 | 2009-03-25 | Trellis Bioscience, Inc. | Multihued labels |
| US6632655B1 (en) | 1999-02-23 | 2003-10-14 | Caliper Technologies Corp. | Manipulation of microparticles in microfluidic systems |
| US20060275782A1 (en) | 1999-04-20 | 2006-12-07 | Illumina, Inc. | Detection of nucleic acid reactions on bead arrays |
| US6376191B1 (en) | 2000-03-22 | 2002-04-23 | Mergen, Ltd. | Microarray-based analysis of polynucleotide sequence variations |
| US20030207300A1 (en) | 2000-04-28 | 2003-11-06 | Matray Tracy J. | Multiplex analytical platform using molecular tags |
| US7833701B2 (en) | 2001-05-11 | 2010-11-16 | Panasonic Corporation | Biomolecule substrate, and test and diagnosis methods and apparatuses using the same |
| US6636623B2 (en) * | 2001-08-10 | 2003-10-21 | Visiongate, Inc. | Optical projection imaging system and method for automatically detecting cells with molecular marker compartmentalization associated with malignancy and disease |
| US7057026B2 (en) | 2001-12-04 | 2006-06-06 | Solexa Limited | Labelled nucleotides |
| GB0129012D0 (en) | 2001-12-04 | 2002-01-23 | Solexa Ltd | Labelled nucleotides |
| AU2003287527A1 (en) | 2002-12-18 | 2004-07-29 | Aclara Biosciences, Inc. | Single cell analysis of membrane molecules |
| CN101410530B (zh) | 2003-04-18 | 2013-03-27 | 贝克顿·迪金森公司 | 免疫-扩增 |
| US20050250094A1 (en) | 2003-05-30 | 2005-11-10 | Nanosphere, Inc. | Method for detecting analytes based on evanescent illumination and scatter-based detection of nanoparticle probe complexes |
| CN1584592A (zh) * | 2003-08-22 | 2005-02-23 | 中国科学院上海原子核研究所 | 免疫微阵列蛋白质芯片 |
| US20050049796A1 (en) * | 2003-09-03 | 2005-03-03 | Webb Peter G. | Methods for encoding non-biological information on microarrays |
| US20050153320A1 (en) | 2003-11-06 | 2005-07-14 | Herron James N. | Single base extension |
| JP4995720B2 (ja) | 2004-07-02 | 2012-08-08 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | ダブルクラッドファイバを有する内視鏡撮像プローブ |
| US7170050B2 (en) | 2004-09-17 | 2007-01-30 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Apparatus and methods for optical analysis of molecules |
| EP1907571B1 (en) | 2005-06-15 | 2017-04-26 | Complete Genomics Inc. | Nucleic acid analysis by random mixtures of non-overlapping fragments |
| US20090081688A1 (en) | 2005-06-20 | 2009-03-26 | Advanced Cell Diagnostics | Methods of detecting nucleic acids in individual cells and of identifying rare cells from large heterogeneous cell populations |
| KR20080066705A (ko) | 2005-09-29 | 2008-07-16 | 더 제너럴 하스피탈 코포레이션 | 점진적으로 증가하는 분해능을 이용하여 하나 이상의 생물학적 샘플을 관찰 및 분석하기 위한 방법 및 장치 |
| US7960104B2 (en) | 2005-10-07 | 2011-06-14 | Callida Genomics, Inc. | Self-assembled single molecule arrays and uses thereof |
| DK4282332T3 (da) | 2006-02-22 | 2024-06-24 | Dexcom Inc | Analytsensor |
| EP2351610A3 (en) | 2006-03-28 | 2011-10-12 | Inanovate, Inc. | Nano-particle biochip substrates |
| US20090317810A1 (en) | 2006-04-17 | 2009-12-24 | Epigenomics Ag | Methods and nucleic acids for the detection of colorectal cell proliferative disorders |
| US7839507B2 (en) | 2006-06-28 | 2010-11-23 | Applied Biosystems, Llc | Minimizing effects of dye crosstalk |
| US7838302B2 (en) | 2006-08-07 | 2010-11-23 | President And Fellows Of Harvard College | Sub-diffraction limit image resolution and other imaging techniques |
| AU2007334393A1 (en) | 2006-12-14 | 2008-06-26 | Life Technologies Corporation | Methods and apparatus for measuring analytes using large scale FET arrays |
| EP2126765B1 (en) | 2007-01-26 | 2011-08-24 | Illumina Inc. | Nucleic acid sequencing system and method |
| EP2251435B1 (en) | 2007-03-02 | 2013-10-16 | DNA Electronics Ltd | Sensing apparatus for monitoring nucleic acid amplification, using an ion-sensitive field effect transistor (ISFET) for pH sensing |
| US7769548B2 (en) | 2007-05-10 | 2010-08-03 | Illumina, Inc. | Microarray analytical data stitching system and method |
| US9551026B2 (en) | 2007-12-03 | 2017-01-24 | Complete Genomincs, Inc. | Method for nucleic acid detection using voltage enhancement |
| EP2247741A4 (en) | 2008-02-03 | 2011-02-23 | Helicos Biosciences Corp | READ-ENHANCED READING ELEMENTS IN SYNTHESIS SEQUENCING |
| US20100301398A1 (en) | 2009-05-29 | 2010-12-02 | Ion Torrent Systems Incorporated | Methods and apparatus for measuring analytes |
| US9524369B2 (en) | 2009-06-15 | 2016-12-20 | Complete Genomics, Inc. | Processing and analysis of complex nucleic acid sequence data |
| US10072287B2 (en) | 2009-09-10 | 2018-09-11 | Centrillion Technology Holdings Corporation | Methods of targeted sequencing |
| US8900850B2 (en) | 2009-09-17 | 2014-12-02 | Michael J. Lane | Lateral flow based methods and assays for rapid and inexpensive diagnostic tests |
| CA2774576C (en) | 2009-09-24 | 2017-12-12 | Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation | Method of contaminant prediction |
| JP5954876B2 (ja) | 2009-10-13 | 2016-07-20 | ナノストリング テクノロジーズ， インコーポレイテッド | ナノレポーターによるタンパク質の検出 |
| US8965076B2 (en) | 2010-01-13 | 2015-02-24 | Illumina, Inc. | Data processing system and methods |
| US8774494B2 (en) | 2010-04-30 | 2014-07-08 | Complete Genomics, Inc. | Method and system for accurate alignment and registration of array for DNA sequencing |
| CN101865843B (zh) * | 2010-05-04 | 2012-05-23 | 中国科学院深圳先进技术研究院 | 多组分生物标识物的检测方法 |
| US8465922B2 (en) | 2010-08-26 | 2013-06-18 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Methods and systems for monitoring reactions |
| US9671344B2 (en) | 2010-08-31 | 2017-06-06 | Complete Genomics, Inc. | High-density biochemical array chips with asynchronous tracks for alignment correction by moiré averaging |
| US8175452B1 (en) | 2010-10-26 | 2012-05-08 | Complete Genomics, Inc. | Method and system for imaging high density biochemical arrays with sub-pixel alignment |
| JP2014516514A (ja) | 2011-04-14 | 2014-07-17 | コンプリート・ジェノミックス・インコーポレイテッド | 複合核酸配列データの処理および解析 |
| GB201108678D0 (en) | 2011-05-24 | 2011-07-06 | Olink Ab | Multiplexed proximity ligation assay |
| US9001231B2 (en) | 2011-06-03 | 2015-04-07 | Rambus Inc. | Image acquisition using oversampled one-bit poisson statistics |
| EP2724278B1 (en) | 2011-06-21 | 2020-09-16 | Illumina Cambridge Limited | Methods and systems for data analysis |
| US20130265459A1 (en) | 2011-06-28 | 2013-10-10 | Pelican Imaging Corporation | Optical arrangements for use with an array camera |
| US10704164B2 (en) | 2011-08-31 | 2020-07-07 | Life Technologies Corporation | Methods, systems, computer readable media, and kits for sample identification |
| CN104583421A (zh) | 2012-07-19 | 2015-04-29 | 阿瑞奥萨诊断公司 | 遗传变体的基于多重的顺序连接的检测 |
| CA2891939C (en) * | 2012-11-19 | 2020-10-27 | Apton Biosystems, Inc. | Digital analysis of molecular analytes using single molecule detection |
| US10829816B2 (en) | 2012-11-19 | 2020-11-10 | Apton Biosystems, Inc. | Methods of analyte detection |
| JP2014164004A (ja) | 2013-02-22 | 2014-09-08 | Hitachi High-Technologies Corp | 蛍光顕微鏡 |
| US9193998B2 (en) | 2013-03-15 | 2015-11-24 | Illumina, Inc. | Super resolution imaging |
| CN105392897B (zh) | 2013-03-19 | 2020-03-20 | 定向基因组学公司 | 靶序列的富集 |
| CN110669826B (zh) | 2013-04-30 | 2025-01-07 | 加州理工学院 | 通过顺序杂交编条形码的分子多重标记 |
| US10510435B2 (en) | 2013-04-30 | 2019-12-17 | California Institute Of Technology | Error correction of multiplex imaging analysis by sequential hybridization |
| EP3036358B8 (en) | 2013-08-22 | 2023-11-22 | Pacific Biosciences of California, Inc. | Digital analysis of molecular analytes using electrical methods |
| ES3014093T3 (en) | 2014-07-30 | 2025-04-16 | Harvard College | Method for determining nucleic acids |
| CN104372093B (zh) | 2014-11-10 | 2016-09-21 | 博奥生物集团有限公司 | 一种基于高通量测序的snp检测方法 |
| CN113528623A (zh) | 2015-02-18 | 2021-10-22 | 卓异生物公司 | 用于单分子检测的测定及其应用 |
| EP3783109B1 (en) | 2015-03-31 | 2024-05-29 | Illumina Cambridge Limited | Surface concatamerization of templates |
| KR20180097536A (ko) | 2015-11-04 | 2018-08-31 | 아트레카, 인크. | 단일 세포와 연관된 핵산의 분석을 위한 핵산 바코드의 조합 세트 |
| CN108348380B (zh) | 2015-11-04 | 2021-06-01 | 宝洁公司 | 薄型且柔性的吸收制品 |
| US10612089B2 (en) | 2016-01-12 | 2020-04-07 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Synthesizing barcoding sequences utilizing phase-shift blocks and uses thereof |
| WO2017161251A1 (en) | 2016-03-17 | 2017-09-21 | President And Fellows Of Harvard College | Methods for detecting and identifying genomic nucleic acids |
| WO2017196527A1 (en) | 2016-05-10 | 2017-11-16 | Arizona Board Of Regents On Behalf Of Arizona State University | Consecutive hybridization for multiplexed analysis of biological samples |
| CN109477095A (zh) | 2016-05-26 | 2019-03-15 | 卓异生物公司 | 用于单分子检测的阵列及其应用 |
| CA3021017C (en) | 2016-06-21 | 2022-12-13 | Illumina, Inc. | Super-resolution microscopy |
| GB201701296D0 (en) | 2017-01-26 | 2017-03-15 | Univ College Cork - Nat Univ Of Ireland | Smart coded access optical sensor |
| CN110582715B (zh) | 2017-03-03 | 2022-04-29 | 雅普顿生物系统公司 | 具有加速跟踪的高速扫描系统 |
| CN114921537A (zh) | 2017-03-17 | 2022-08-19 | 雅普顿生物系统公司 | 测序和高分辨率成像 |
| EP3601599A4 (en) | 2017-03-23 | 2020-12-23 | Apton Biosystems, Inc. | POLYMORPHISM DETECTION WITH INCREASED ACCURACY |
| US20200217850A1 (en) | 2017-09-15 | 2020-07-09 | Apton Biosystems, Inc. | Heterogeneous single cell profiling using molecular barcoding |
| CA3067144C (en) | 2018-03-09 | 2023-09-05 | Illumina Cambridge Limited | Generalized stochastic super-resolution sequencing |
-
2013
- 2013-11-19 CA CA2891939A patent/CA2891939C/en active Active
- 2013-11-19 MX MX2015006219A patent/MX390589B/es unknown
- 2013-11-19 EP EP13855452.2A patent/EP2920725B1/en active Active
- 2013-11-19 WO PCT/US2013/070797 patent/WO2014078855A1/en not_active Ceased
- 2013-11-19 RU RU2015123570A patent/RU2670133C2/ru active
- 2013-11-19 CN CN201380070866.3A patent/CN105264532B/zh active Active
- 2013-11-19 JP JP2015543118A patent/JP6395718B2/ja active Active
- 2013-11-19 ES ES13855452T patent/ES2905265T3/es active Active
- 2013-11-19 DK DK13855452.2T patent/DK2920725T3/da active
- 2013-11-19 EP EP21206285.5A patent/EP4012716A1/en active Pending
- 2013-11-19 US US14/443,655 patent/US20150330974A1/en not_active Abandoned
- 2013-11-19 HU HUE13855452A patent/HUE058723T2/hu unknown
- 2013-11-19 AU AU2013344340A patent/AU2013344340B2/en active Active
- 2013-11-19 KR KR1020157016299A patent/KR102061257B1/ko active Active
-
2015
- 2015-05-18 MX MX2022002931A patent/MX2022002931A/es unknown
-
2019
- 2019-12-26 US US16/727,732 patent/US20210072233A1/en not_active Abandoned
-
2022
- 2022-02-09 US US17/650,443 patent/US11650202B2/en active Active
-
2023
- 2023-04-06 US US18/131,821 patent/US20240069012A1/en active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP2920725A1 (en) | 2015-09-23 |
| US20150330974A1 (en) | 2015-11-19 |
| US20240069012A1 (en) | 2024-02-29 |
| US20220214335A1 (en) | 2022-07-07 |
| CA2891939C (en) | 2020-10-27 |
| EP2920725B1 (en) | 2021-11-10 |
| CA2891939A1 (en) | 2014-05-22 |
| HUE058723T2 (hu) | 2022-09-28 |
| US20210072233A1 (en) | 2021-03-11 |
| EP4012716A1 (en) | 2022-06-15 |
| AU2013344340A1 (en) | 2015-07-02 |
| CN105264532A (zh) | 2016-01-20 |
| KR20150095691A (ko) | 2015-08-21 |
| MX390589B (es) | 2025-03-21 |
| MX2022002931A (es) | 2022-04-06 |
| AU2013344340B2 (en) | 2019-09-19 |
| EP2920725A4 (en) | 2016-08-31 |
| US11650202B2 (en) | 2023-05-16 |
| DK2920725T3 (da) | 2022-02-07 |
| WO2014078855A1 (en) | 2014-05-22 |
| JP6395718B2 (ja) | 2018-09-26 |
| CN105264532B (zh) | 2019-02-26 |
| RU2670133C2 (ru) | 2018-10-18 |
| MX2015006219A (es) | 2015-11-13 |
| ES2905265T3 (es) | 2022-04-07 |
| KR102061257B1 (ko) | 2019-12-31 |
| JP2016502079A (ja) | 2016-01-21 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2015123570A (ru) | Цифровой анализ молекулярных анализируемых веществ с использованием одномолекулярного обнаружения | |
| Palstrøm et al. | Recent developments in clinical plasma proteomics—applied to cardiovascular research | |
| Suhre et al. | Genetics meets proteomics: perspectives for large population-based studies | |
| Xie et al. | The intriguing landscape of single‐cell protein analysis | |
| Fu et al. | Multiplex assays for biomarker research and clinical application: translational science coming of age | |
| Zangar et al. | ELISA microarray technology as a high-throughput system for cancer biomarker validation | |
| Leligdowicz et al. | Validation of two multiplex platforms to quantify circulating markers of inflammation and endothelial injury in severe infection | |
| Mobed et al. | Biosensing: The best alternative for conventional methods in detection of Alzheimer's disease biomarkers | |
| US11435356B2 (en) | Digital analysis of molecular analytes using electrical methods | |
| JP2019535003A5 (ru) | ||
| Metzgar et al. | Broad-spectrum biosensor capable of detecting and identifying diverse bacterial and Candida species in blood | |
| MX2012009538A (es) | Metodo para la determinacion de variantes de secuencia de polipeptido. | |
| Kaur et al. | Analytical techniques for characterization of biological molecules–proteins and aptamers/oligonucleotides | |
| Edfors et al. | Proteomics in thrombosis research | |
| Van Puyvelde et al. | Add mass spectrometry to the pandemic toolbox | |
| Kim et al. | Development of an electrochemical biosensor for tetrodotoxin using specific binding peptide on polypyrrole/au nanoparticle-modified electrodes | |
| Rountree et al. | Sources of variability in Luminex bead-based cytokine assays: Evidence from twelve years of multi-site proficiency testing | |
| Acquah et al. | Aptameric sensing in food safety | |
| Marín-Romero et al. | MAGPIX and FLEXMAP 3D Luminex platforms for direct detection of miR-122-5p through dynamic chemical labelling | |
| Garebaghi et al. | Recent advances of nanozyme-enhanced electrochemical biosensors for antibiotic detection in foods: Trends, opportunities, and challenges | |
| Percy et al. | Targeted quantitation of CVD-linked plasma proteins for biomarker verification and validation | |
| Duan et al. | MetaDIA: A Novel Database Reduction Strategy for DIA Human Gut Metaproteomics | |
| WO2017223313A1 (en) | Aptamer-based compositions and methods for extraction and detection of microbial contamination | |
| CN106680411A (zh) | 一种用于检测系统性红斑狼疮（sle)的试剂盒及其检测方法 | |
| JP6228206B2 (ja) | タンパク質特異的な光検出 |