RU2014127493A - Способ детекции аддуктов нуклеосом - Google Patents
Способ детекции аддуктов нуклеосом Download PDFInfo
- Publication number
- RU2014127493A RU2014127493A RU2014127493A RU2014127493A RU2014127493A RU 2014127493 A RU2014127493 A RU 2014127493A RU 2014127493 A RU2014127493 A RU 2014127493A RU 2014127493 A RU2014127493 A RU 2014127493A RU 2014127493 A RU2014127493 A RU 2014127493A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleosome
- adduct
- receptor
- hormone
- protein
- Prior art date
Links
- 210000001623 nucleosome Anatomy 0.000 title claims abstract 33
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract 30
- 108010047956 Nucleosomes Proteins 0.000 claims abstract 37
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 claims abstract 13
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract 10
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract 10
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 claims abstract 8
- 239000005556 hormone Substances 0.000 claims abstract 8
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 claims abstract 7
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims abstract 6
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims abstract 6
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims abstract 5
- 108020005497 Nuclear hormone receptor Proteins 0.000 claims abstract 5
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims abstract 5
- 102000006255 nuclear receptors Human genes 0.000 claims abstract 5
- 108020004017 nuclear receptors Proteins 0.000 claims abstract 5
- 239000003098 androgen Substances 0.000 claims abstract 4
- 239000000262 estrogen Substances 0.000 claims abstract 4
- 229940011871 estrogen Drugs 0.000 claims abstract 4
- 102000004217 thyroid hormone receptors Human genes 0.000 claims abstract 4
- 108090000721 thyroid hormone receptors Proteins 0.000 claims abstract 4
- 229960001727 tretinoin Drugs 0.000 claims abstract 4
- 102100032187 Androgen receptor Human genes 0.000 claims abstract 3
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 claims abstract 3
- 102100038595 Estrogen receptor Human genes 0.000 claims abstract 3
- 102000018802 High Mobility Group Proteins Human genes 0.000 claims abstract 3
- 101710176246 High mobility group protein Proteins 0.000 claims abstract 3
- 102100025803 Progesterone receptor Human genes 0.000 claims abstract 3
- AUYYCJSJGJYCDS-LBPRGKRZSA-N Thyrolar Chemical class IC1=CC(C[C@H](N)C(O)=O)=CC(I)=C1OC1=CC=C(O)C(I)=C1 AUYYCJSJGJYCDS-LBPRGKRZSA-N 0.000 claims abstract 3
- SHGAZHPCJJPHSC-YCNIQYBTSA-N all-trans-retinoic acid Chemical compound OC(=O)\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C SHGAZHPCJJPHSC-YCNIQYBTSA-N 0.000 claims abstract 3
- 108010080146 androgen receptors Proteins 0.000 claims abstract 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims abstract 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims abstract 3
- 108010038795 estrogen receptors Proteins 0.000 claims abstract 3
- 239000003862 glucocorticoid Substances 0.000 claims abstract 3
- 239000000583 progesterone congener Substances 0.000 claims abstract 3
- 108090000468 progesterone receptors Proteins 0.000 claims abstract 3
- 229930002330 retinoic acid Natural products 0.000 claims abstract 3
- 102000003702 retinoic acid receptors Human genes 0.000 claims abstract 3
- 108090000064 retinoic acid receptors Proteins 0.000 claims abstract 3
- 239000003270 steroid hormone Substances 0.000 claims abstract 3
- 239000005495 thyroid hormone Substances 0.000 claims abstract 3
- 229940036555 thyroid hormone Drugs 0.000 claims abstract 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims abstract 2
- 108090000079 Glucocorticoid Receptors Proteins 0.000 claims abstract 2
- 102100033417 Glucocorticoid receptor Human genes 0.000 claims abstract 2
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 claims abstract 2
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 claims abstract 2
- 102000016397 Methyltransferase Human genes 0.000 claims abstract 2
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 claims abstract 2
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 claims abstract 2
- 208000037979 autoimmune inflammatory disease Diseases 0.000 claims abstract 2
- 239000003246 corticosteroid Substances 0.000 claims abstract 2
- 230000006196 deacetylation Effects 0.000 claims abstract 2
- 238000003381 deacetylation reaction Methods 0.000 claims abstract 2
- 230000017858 demethylation Effects 0.000 claims abstract 2
- 238000010520 demethylation reaction Methods 0.000 claims abstract 2
- 230000030609 dephosphorylation Effects 0.000 claims abstract 2
- 238000006209 dephosphorylation reaction Methods 0.000 claims abstract 2
- 230000029180 desumoylation Effects 0.000 claims abstract 2
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims abstract 2
- 230000011987 methylation Effects 0.000 claims abstract 2
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 claims abstract 2
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 claims abstract 2
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 claims abstract 2
- 230000010741 sumoylation Effects 0.000 claims abstract 2
- 238000010798 ubiquitination Methods 0.000 claims abstract 2
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 claims 6
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 claims 6
- 108091008039 hormone receptors Proteins 0.000 claims 5
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims 4
- 108010077544 Chromatin Proteins 0.000 claims 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 2
- 210000003483 chromatin Anatomy 0.000 claims 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 2
- 230000001973 epigenetic effect Effects 0.000 claims 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims 2
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims 1
- 101100339431 Arabidopsis thaliana HMGB2 gene Proteins 0.000 claims 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 claims 1
- 201000009273 Endometriosis Diseases 0.000 claims 1
- 108700010013 HMGB1 Proteins 0.000 claims 1
- 101150021904 HMGB1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 102100037907 High mobility group protein B1 Human genes 0.000 claims 1
- 102100038970 Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 Human genes 0.000 claims 1
- 101000882127 Homo sapiens Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 Proteins 0.000 claims 1
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 claims 1
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 claims 1
- 206010040047 Sepsis Diseases 0.000 claims 1
- 208000006011 Stroke Diseases 0.000 claims 1
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 claims 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 claims 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 claims 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims 1
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 claims 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims 1
- 208000010125 myocardial infarction Diseases 0.000 claims 1
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 claims 1
- 230000000770 proinflammatory effect Effects 0.000 claims 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 claims 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57484—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
- G01N33/57496—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites involving intracellular compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/564—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for pre-existing immune complex or autoimmune disease, i.e. systemic lupus erythematosus, rheumatoid arthritis, multiple sclerosis, rheumatoid factors or complement components C1-C9
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57484—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
- G01N33/57488—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites involving compounds identifable in body fluids
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6875—Nucleoproteins
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/46—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
- G01N2333/47—Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/56—Staging of a disease; Further complications associated with the disease
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/70—Mechanisms involved in disease identification
- G01N2800/7095—Inflammation
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Rehabilitation Therapy (AREA)
- Rheumatology (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
Abstract
1. Применение аддукта нуклеосома-белок в качестве биомаркера в крови для диагностики рака, аутоиммунного заболевания или воспалительного заболевания.2. Применение по п. 1, где биомаркер используют для диагностики рака.3. Применение по п. 1 или 2, где аддукт нуклеосома-белок содержит модифицирующий хроматин фермент, ядерный рецептор или гормон.4. Применение по п. 2, где аддукт нуклеосома-белок содержит белок группы с высокой подвижностью.5. Применение по п. 3, где модифицирующий хроматин фермент представляет собой фермент ацетилирования, деацетилирования, метилирования, деметилирования, фосфорилирования, дефосфорилирования, убиквитинилирования, деубиквитинилирования, сумоилирования, десумоилирования гистона или ДНК-метилтрансферазу.6. Применение по п. 3, где ядерный рецептор представляет собой эстрогеновый рецептор, андрогенный рецептор, прогестероновый рецептор, рецептор гормона щитовидной железы, рецептор глюкокортикоидов или рецептор ретиноевой кислоты.7. Применение по п. 3, где гормон представляет собой гормон щитовидной железы, глюкокортикоидный гормон или стероидный гормон, включая эстроген, андроген, прогестаген, кортикостероид или ретиноевую кислоту.8. Способ детекции наличия аддукта нуклеосома-белок вобразце, который включает этапы:(i) приведения образца в контакт с первым связывающим средством, которое связывается с нуклеосомами или их компонентом;(ii) приведения нуклеосом или образца в контакт со вторым связывающим средством, которое связывается с белком, связанным с нуклеосомой;(iii) детектирования или количественного определения связывания указанного второго связывающего средства со связанным бе
Claims (31)
1. Применение аддукта нуклеосома-белок в качестве биомаркера в крови для диагностики рака, аутоиммунного заболевания или воспалительного заболевания.
2. Применение по п. 1, где биомаркер используют для диагностики рака.
3. Применение по п. 1 или 2, где аддукт нуклеосома-белок содержит модифицирующий хроматин фермент, ядерный рецептор или гормон.
4. Применение по п. 2, где аддукт нуклеосома-белок содержит белок группы с высокой подвижностью.
5. Применение по п. 3, где модифицирующий хроматин фермент представляет собой фермент ацетилирования, деацетилирования, метилирования, деметилирования, фосфорилирования, дефосфорилирования, убиквитинилирования, деубиквитинилирования, сумоилирования, десумоилирования гистона или ДНК-метилтрансферазу.
6. Применение по п. 3, где ядерный рецептор представляет собой эстрогеновый рецептор, андрогенный рецептор, прогестероновый рецептор, рецептор гормона щитовидной железы, рецептор глюкокортикоидов или рецептор ретиноевой кислоты.
7. Применение по п. 3, где гормон представляет собой гормон щитовидной железы, глюкокортикоидный гормон или стероидный гормон, включая эстроген, андроген, прогестаген, кортикостероид или ретиноевую кислоту.
8. Способ детекции наличия аддукта нуклеосома-белок в
образце, который включает этапы:
(i) приведения образца в контакт с первым связывающим средством, которое связывается с нуклеосомами или их компонентом;
(ii) приведения нуклеосом или образца в контакт со вторым связывающим средством, которое связывается с белком, связанным с нуклеосомой;
(iii) детектирования или количественного определения связывания указанного второго связывающего средства со связанным белком в образце и
(iv) использования наличия или степени такого связывания в качестве показателя наличия аддуктов нуклеосом в образце.
9. Способ детекции наличия аддукта нуклеосом в образце, который включает этапы:
(i) приведения образца в контакт с первым связывающим средством, которое связывается с белком, связанным с нуклеосомой;
(ii) приведения нуклеосом или образца в контакт со вторым связывающим средством, которое связывается с нуклеосомами или их компонентом;
(iii) детектирования или количественного определения связывания указанного второго связывающего средства с нуклеосомами или их компонентом в образце, и
(iv) использования наличия или степени такого связывания в качестве показателя наличия аддуктов нуклеосом в образце.
10. Способ по п. 8 или 9, где аддукт нуклеосом включает провоспалительный белок, белок группы с высокой подвижностью,
белок polycomb, модифицирующий хроматин фермент, ядерный рецептор или гормон.
11. Способ по п. 10, где белок группы с высокой подвижностью представляет собой HMGB1.
12. Способ по п. 10, где модифицирующий хроматин фермент представляет собой EZH2.
13. Способ по п. 10, где рецептор гормона представляет собой эстрогеновый рецептор, андрогенный рецептор, прогестероновый рецептор, рецептор гормона щитовидной железы или рецептор ретиноевой кислоты.
14. Способ по п. 10, где гормон представляет собой гормон щитовидной железы, глюкокортикоидный гормон или стероидный гормон, включая эстроген, андроген, прогестаген или ретиноевую кислоту.
15. Способ по любому из пп. 8, 9 и 11-14, где связывающее средство для нуклеосомы или компонента нуклеосомы направлено, чтобы связываться с конкретной эпигенетической сигнальной структурой, таким образом, что детектируют только конкретную подгруппу аддуктов нуклеосом, содержащих указанную эпигенетическую сигнальную структуру.
16. Способ по любому из пп. 8, 9 и 11-14, где связывающее средство представляет собой антитело, фрагмент антитела или аптамер.
17. Способ по любому из пп. 8, 9 и 11-14, где образец представляет собой биологическую жидкость.
18. Способ по любому из пп. 8, 9 и 11-14, где образец представляет собой кровь или сыворотку, или плазму.
19. Способ детекции наличия аддукта нуклеосома-белок в клетке по любому из пп. 8-18, который включает этапы:
(i) выделения хроматина из клетки;
(ii) расщепления, обработки ультразвуком или иным образом разрушения хроматина с образованием мононуклеосом и/или олигонуклеосом и
(iii) детекции или измерения присутствия аддукта нуклеосом по любому из пп. 8-18.
20. Способ детекции или диагностики статуса заболевания у индивидуума, являющегося животным или человеком, который включает этапы:
(i) детекции или измерения аддукта нуклеосом в жидкости организма индивидуума, как определено в любом из способов по п. 8 или 9, и
(ii) использования обнаруженного уровня аддукта нуклеосом для идентификации статуса заболевания у индивидуума.
21. Способ оценки индивидуума, являющегося животным или человеком, в отношении применимости медицинского лечения, который включает этапы:
(i) детекции или измерения аддукта нуклеосом в жидкости организма индивидуума, как определено в любом из способов по п. 8 или 9, и
(ii) использования обнаруженного уровня аддукта нуклеосом в качестве параметра для выбора подходящего лечения для индивидуума.
22. Способ мониторинга лечения индивидуума, являющегося животным или человеком, который включает этапы:
(i) детекции или измерения аддукта нуклеосом в жидкости организма индивидуума, как определено в любом из способов по п. 8 или 9;
(ii) повторения детекции или измерения аддукта нуклеосом в жидкости организма индивидуума один или более раз;
(iii) использования любых изменений обнаруженного уровня аддукта нуклеосом в качестве параметра любого изменения состояния индивидуума.
23. Способ по любому из пп. 20-22, где аддукт нуклеосом детектируют или измеряют в виде одной из панелей измерений.
24. Способ по любому из пп. 20-22 для применения у индивидуумов с существующей или предполагаемой злокачественной опухолью, доброкачественными опухолями, воспалительным заболеванием, аутоиммунным заболеванием, эндометриозом, инфекционным заболеванием, сепсисом, инсультом или инфарктом миокарда.
25. Способ по любому из пп. 8, 9, 11-14 и 19-22 для применения для детекции аддуктов комплекса гормон-рецептор гормона-нуклеосома.
26. Способ по п. 25, где аддукты комплекса гормон-рецептор гормона-нуклеосома включают аддукт комплекса тироксин-рецептор гормона щитовидной железы-нуклеосома, аддукт комплекса трийодтиронин-рецептор гормона щитовидной железы-нуклеосома, аддукт комплекса ретиноевая кислота-рецептор ретиноевой кислоты-нуклеосома, аддукт комплекса андроген-андрогенный рецептор-нуклеосома или аддукт комплекса эстроген-эстрогеновый рецептор-нуклеосома.
27. Способ по п. 25, который включает антитело или другое связывающее средство, направленное, чтобы связываться с гормоном.
28. Способ по п. 25, который включает этап выделения гормона из захваченного антителом аддукта комплекса гормон-рецептор гормона-нуклеосома с последующим этапом количественного определения.
29. Способ идентификации биомаркера аддукта нуклеосом для детекции или диагностики статуса заболевания у индивидуума, являющегося животным или человеком, который включает этапы:
(i) детекции или измерения аддукта нуклеосом в жидкости организма индивидуума, как определено в любом из способов по п. 8 или 9;
(ii) детекции или измерения аддукта нуклеосом в жидкости организма здорового индивидуума или контрольного индивидуума и
(iii) использования разницы между уровнями, обнаруженными у больных и контрольных индивидуумов, для идентификации, является ли аддукт нуклеосом пригодным в качестве биомаркера статуса заболевания.
30. Биомаркер, идентифицируемый способом по п. 29.
31. Набор для детекции аддукта нуклеосом, который содержит лиганд или связывающее средство, специфичное к белку в аддукте или части его компонента, или средство, имитирующее структуру/форму белка в аддукте или части его компонента, совместно с инструкциями по применению набора любым из способов по пп. 3-28.
Applications Claiming Priority (7)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201161568090P | 2011-12-07 | 2011-12-07 | |
| GB201121040A GB201121040D0 (en) | 2011-12-07 | 2011-12-07 | Method for detecting nucleosome adducts |
| GB1121040.8 | 2011-12-07 | ||
| US61/568,090 | 2011-12-07 | ||
| GB1121230.5 | 2011-12-12 | ||
| GBGB1121230.5A GB201121230D0 (en) | 2011-12-12 | 2011-12-12 | Methods of detecting nucleosome adducts |
| PCT/GB2012/053057 WO2013084002A2 (en) | 2011-12-07 | 2012-12-07 | Method for detecting nucleosome adducts |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2014127493A true RU2014127493A (ru) | 2016-01-27 |
| RU2634266C2 RU2634266C2 (ru) | 2017-10-24 |
Family
ID=48575008
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2014127493A RU2634266C2 (ru) | 2011-12-07 | 2012-12-07 | Способ детекции аддуктов нуклеосом |
Country Status (19)
| Country | Link |
|---|---|
| US (3) | US9187780B2 (ru) |
| EP (3) | EP4092415A1 (ru) |
| JP (1) | JP6263474B2 (ru) |
| KR (1) | KR102039756B1 (ru) |
| CN (1) | CN104067125B (ru) |
| AU (1) | AU2012349855B2 (ru) |
| BR (1) | BR112014013082B1 (ru) |
| CA (1) | CA2855375C (ru) |
| DK (1) | DK2788767T3 (ru) |
| ES (1) | ES2649404T3 (ru) |
| HR (1) | HRP20171680T1 (ru) |
| HU (1) | HUE035855T2 (ru) |
| MX (1) | MX356986B (ru) |
| PL (1) | PL2788767T3 (ru) |
| PT (1) | PT2788767T (ru) |
| RU (1) | RU2634266C2 (ru) |
| SG (2) | SG11201402982TA (ru) |
| WO (1) | WO2013084002A2 (ru) |
| ZA (1) | ZA201403260B (ru) |
Families Citing this family (55)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| GB201115095D0 (en) * | 2011-09-01 | 2011-10-19 | Singapore Volition Pte Ltd | Method for detecting nucleosomes containing nucleotides |
| EP4092415A1 (en) | 2011-12-07 | 2022-11-23 | Belgian Volition Srl | Method for detecting nucleosome adducts |
| US9605313B2 (en) | 2012-03-02 | 2017-03-28 | Sequenom, Inc. | Methods and processes for non-invasive assessment of genetic variations |
| GB201303576D0 (en) * | 2013-02-28 | 2013-04-10 | Singapore Volition Pte Ltd | Method for predicting therapy efficacy using nucleosome structure biomarkers |
| EP2971100A1 (en) | 2013-03-13 | 2016-01-20 | Sequenom, Inc. | Primers for dna methylation analysis |
| US11365447B2 (en) | 2014-03-13 | 2022-06-21 | Sequenom, Inc. | Methods and processes for non-invasive assessment of genetic variations |
| KR20160149258A (ko) | 2014-04-30 | 2016-12-27 | 익스프레션 패톨로지, 인크. | 안드로겐 수용체(ar) 단백질에 대한 srm/mrm 검정 |
| SG10201903822XA (en) * | 2014-10-29 | 2019-05-30 | Belgian Volition Sprl | Method for the enrichment of circulating tumor dna |
| GB201421933D0 (en) * | 2014-12-10 | 2015-01-21 | Singapore Volition Pte Ltd | Method for a detection of hormone sensitive diease progression |
| GB201511512D0 (en) * | 2015-07-01 | 2015-08-12 | Singapore Volition Pte Ltd | Use of cell-free nucleosomes as biomarkers |
| GB201511542D0 (en) * | 2015-07-01 | 2015-08-12 | Singapore Volition Pte Ltd | Use of cell free nucleosomes as biomarkers |
| GB201518665D0 (en) | 2015-10-21 | 2015-12-02 | Singapore Volition Pte Ltd | Method for enrichment of cell free nucleosomes |
| GB201518674D0 (en) * | 2015-10-21 | 2015-12-02 | Singapore Volition Pte Ltd | Method for detecting nuleosomes containing histone modifications and variants |
| GB201604806D0 (en) * | 2016-03-22 | 2016-05-04 | Singapore Volition Pte Ltd | Method of identifying a cancer of unknown origin |
| GB201612815D0 (en) * | 2016-07-25 | 2016-09-07 | Belgian Volition Sa | Novel combination test |
| IL273413B2 (en) | 2017-09-18 | 2024-05-01 | Santersus Ag | Method and device for purification of blood from circulating cell free dna |
| GB201721569D0 (en) | 2017-12-21 | 2018-02-07 | Belgian Volition Sprl | Method for the detection and treatment of colorectal adenomas |
| WO2019175876A2 (en) * | 2018-03-13 | 2019-09-19 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem Ltd. | Diagnostic use of cell free dna chromatin immunoprecipitation |
| GB201818963D0 (en) | 2018-11-21 | 2019-01-09 | Belgian Volition Sprl | Methof for the detection of prostate cancer |
| GB201818965D0 (en) | 2018-11-21 | 2019-01-09 | Belgian Volition Sprl | Method for the detection of colorectal cancer |
| GB201906199D0 (en) | 2019-05-02 | 2019-06-19 | Belgian Volition Sprl | Method for the detection of cancer |
| GB201906201D0 (en) | 2019-05-02 | 2019-06-19 | Belgian Voltion Sprl | Method for the detection of protate cancer |
| US20220290252A1 (en) | 2019-08-27 | 2022-09-15 | Belgian Volition Srl | Method of isolating circulating nucleosomes |
| GB201912251D0 (en) | 2019-08-27 | 2019-10-09 | Belgian Volition Sprl | Method of isolating circulating nucleosomes |
| AU2020395504A1 (en) | 2019-12-02 | 2022-06-23 | Belgian Volition Srl | Use of cell free nucleosomes as biomarkers |
| MX2022011614A (es) | 2020-03-20 | 2022-10-13 | Belgian Volition Srl | Metodo de triaje utilizando niveles de nucleosomas libres de celulas. |
| CN111413497A (zh) * | 2020-04-15 | 2020-07-14 | 上海市东方医院（同济大学附属东方医院） | 组蛋白甲基转移酶ezh2在制备用于诊断脓毒症的生物标记物中的用途 |
| WO2022058604A1 (en) | 2020-09-21 | 2022-03-24 | Belgian Volition Srl | Device for inline monitoring of free nucleosomes in blood |
| TW202238131A (zh) | 2020-11-25 | 2022-10-01 | 比利時商比利時意志有限公司 | 測量無細胞核蛋白染色質片段之方法 |
| TW202238132A (zh) | 2020-12-08 | 2022-10-01 | 比利時商比利時意志有限公司 | 多發性硬化症之診斷方法 |
| TW202242145A (zh) | 2020-12-29 | 2022-11-01 | 比利時商比利時意志有限公司 | 核小體耗盡循環無細胞染色質片段之轉錄因子結合位點分析 |
| TW202242130A (zh) | 2020-12-29 | 2022-11-01 | 比利時商比利時意志有限公司 | 循環轉錄因子分析 |
| TW202242146A (zh) | 2021-01-13 | 2022-11-01 | 比利時商比利時意志有限公司 | 肺癌的檢測方法 |
| GB202108185D0 (en) | 2021-06-08 | 2021-07-21 | Belgian Volition Sprl | Standardisation of nucleosome assays using biologically derived calibrants |
| GB202108452D0 (en) | 2021-06-14 | 2021-07-28 | Belgian Volition Sprl | Triaging method using cell free nucleosome levels |
| US20250012783A1 (en) | 2021-10-29 | 2025-01-09 | Belgian Volition Srl | Homogeneous immunoassay method |
| GB202117799D0 (en) | 2021-12-09 | 2022-01-26 | Belgian Volition Srl | Method for the detection of blood cancer |
| US12053567B2 (en) | 2021-12-27 | 2024-08-06 | Santersus Ag | Method and device for removal of circulating cell free DNA |
| US20250197944A1 (en) | 2022-03-11 | 2025-06-19 | Belgian Volition Srl | Differential diagnosis method |
| GB202205212D0 (en) | 2022-04-08 | 2022-05-25 | Belgian Volition Sprl | Method for transplant organ health assessment |
| WO2024042208A1 (en) | 2022-08-25 | 2024-02-29 | Belgian Volition Srl | Method for the detection of dementia |
| EP4577833A1 (en) | 2022-08-25 | 2025-07-02 | Belgian Volition SRL | Method for measuring cell free chromatin |
| EP4639173A1 (en) | 2022-12-19 | 2025-10-29 | Belgian Volition SRL | Calibration |
| EP4639165A1 (en) | 2022-12-19 | 2025-10-29 | Belgian Volition SRL | Assessment of biological samples for nucleic acid analysis |
| GB202300607D0 (en) | 2023-01-16 | 2023-03-01 | Belgian Volition Srl | Proteins and methods for isolating circulating nucleosomes |
| GB202303562D0 (en) | 2023-03-10 | 2023-04-26 | Belgian Volition Sprl | Sample collection for liquid biopsy |
| WO2024213795A1 (en) | 2023-04-14 | 2024-10-17 | Belgian Volition Srl | Diagnosis method using cell free nucleosome levels |
| WO2024223947A1 (en) | 2023-04-28 | 2024-10-31 | Belgian Volition Srl | Use of cell free nucleosomes as biomarkers of carcinomas |
| GB202307768D0 (en) | 2023-05-24 | 2023-07-05 | Belgian Volition Srl | Use of cell free nucleosomes as biomarkers |
| GB202310137D0 (en) | 2023-07-03 | 2023-08-16 | Belgian Volition Srl | Method for the detection of cancer |
| WO2025012440A1 (en) | 2023-07-13 | 2025-01-16 | Belgian Volition Srl | Method for detection of the potential of a body fluid sample to produce extracellular traps |
| WO2025061853A1 (en) | 2023-09-19 | 2025-03-27 | Belgian Volition Srl | Lateral flow test device |
| WO2025093747A1 (en) | 2023-11-02 | 2025-05-08 | Belgian Volition Srl | Novel rapid high-throughput method of netosis induction and inhibition with physiologically relevant molecules |
| WO2025181348A1 (en) | 2024-03-01 | 2025-09-04 | Belgian Volition Srl | Method for determining the origin of circulating dna |
| WO2025253002A1 (en) | 2024-06-07 | 2025-12-11 | Belgian Volition Srl | Sample collection for liquid biopsy |
Family Cites Families (16)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| FR2652901A1 (fr) | 1989-10-11 | 1991-04-12 | Pasteur Institut | Complexes biologiques a base de nucleosomes, et leurs applications, notamment dans le domaine du diagnostic in vitro du lupus erythemateux dissemine (led). |
| JP3517642B2 (ja) * | 1998-03-18 | 2004-04-12 | ロシュ ダイアグノスティックス ゲーエムベーハー | アポトーシス産物の検出 |
| JP2001029077A (ja) * | 1999-07-21 | 2001-02-06 | Yoshihiro Koseki | 新規ｍｉｔｅ様因子 |
| NL1014106C2 (nl) | 2000-01-18 | 2001-07-20 | Univ Amsterdam | Werkwijze voor het detecteren van een pathologische afwijking bij een cel, een antistof en een assay kit. |
| GB0319376D0 (en) | 2003-08-18 | 2003-09-17 | Chroma Therapeutics Ltd | Histone modification detection |
| WO2005040814A1 (en) * | 2003-10-14 | 2005-05-06 | Cancer Research Technology Limited | Methods and means of cancer detection by histone modification |
| CA2631212A1 (en) | 2005-11-28 | 2007-07-05 | Medimmune, Llc | Antagonists of hmgb1 and/or rage and methods of use thereof |
| RU2322264C1 (ru) * | 2006-07-27 | 2008-04-20 | Михаил Аркадьевич Шурдов | Способ лечения заболеваний |
| KR101468055B1 (ko) * | 2007-04-05 | 2014-12-02 | 심바이오텍 게젤샤프트 주어 포르슝 운트 엔트빅클룽 아우프 뎀 게비엣 데어 바이오테크놀로지 엠베하 | 비스-ｍｅｔ 히스톤 |
| EP2865387B1 (en) | 2008-11-21 | 2019-06-12 | Københavns Universitet (University Of Copenhagen) | Priming of an immune response |
| WO2010120942A2 (en) * | 2009-04-14 | 2010-10-21 | The Regents Of The University Of California | Histone modification patterns for clinical diagnosis and prognosis of cancer |
| US20130183662A1 (en) | 2010-04-22 | 2013-07-18 | Max-Planck-Gesellschaft Zur Forderung Der Wissenschaften E.V. | Means and methods for identifying an increased risk of systemic lupus erythematosus (sle) patients for developing renal manifestations |
| FI20105715A0 (fi) | 2010-06-18 | 2010-06-18 | Helsingin Yliopisto | Asetyloituun HMGB1:een sitoutuva polyklonaalinen vasta-aine |
| CN102147409B (zh) * | 2010-12-31 | 2016-06-22 | 深圳市亚辉龙生物科技股份有限公司 | 一种测定抗核小体抗体IgG的方法及试剂装置 |
| WO2012120942A1 (ja) | 2011-03-08 | 2012-09-13 | 三菱樹脂株式会社 | 触媒、窒素酸化物浄化用素子、及び窒素酸化物浄化用システム |
| EP4092415A1 (en) | 2011-12-07 | 2022-11-23 | Belgian Volition Srl | Method for detecting nucleosome adducts |
-
2012
- 2012-12-07 EP EP22169206.4A patent/EP4092415A1/en not_active Withdrawn
- 2012-12-07 EP EP12803518.5A patent/EP2788767B1/en active Active
- 2012-12-07 CN CN201280060149.8A patent/CN104067125B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2012-12-07 HU HUE12803518A patent/HUE035855T2/en unknown
- 2012-12-07 SG SG11201402982TA patent/SG11201402982TA/en unknown
- 2012-12-07 SG SG10201604081YA patent/SG10201604081YA/en unknown
- 2012-12-07 JP JP2014545358A patent/JP6263474B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2012-12-07 CA CA2855375A patent/CA2855375C/en active Active
- 2012-12-07 DK DK12803518.5T patent/DK2788767T3/da active
- 2012-12-07 MX MX2014006866A patent/MX356986B/es active IP Right Grant
- 2012-12-07 KR KR1020147014917A patent/KR102039756B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 2012-12-07 RU RU2014127493A patent/RU2634266C2/ru active
- 2012-12-07 WO PCT/GB2012/053057 patent/WO2013084002A2/en not_active Ceased
- 2012-12-07 EP EP17184496.2A patent/EP3264090B1/en not_active Not-in-force
- 2012-12-07 BR BR112014013082-5A patent/BR112014013082B1/pt not_active IP Right Cessation
- 2012-12-07 HR HRP20171680TT patent/HRP20171680T1/hr unknown
- 2012-12-07 US US14/362,596 patent/US9187780B2/en active Active
- 2012-12-07 PT PT128035185T patent/PT2788767T/pt unknown
- 2012-12-07 ES ES12803518.5T patent/ES2649404T3/es active Active
- 2012-12-07 PL PL12803518T patent/PL2788767T3/pl unknown
- 2012-12-07 AU AU2012349855A patent/AU2012349855B2/en not_active Ceased
-
2014
- 2014-05-06 ZA ZA2014/03260A patent/ZA201403260B/en unknown
-
2015
- 2015-10-05 US US14/875,632 patent/US9709569B2/en active Active
-
2017
- 2017-06-12 US US15/620,436 patent/US11193939B2/en active Active
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2014127493A (ru) | Способ детекции аддуктов нуклеосом | |
| Ivashkevich et al. | Use of the γ-H2AX assay to monitor DNA damage and repair in translational cancer research | |
| BRPI0707645B8 (pt) | métodos in vitro para detecção de câncer em um indivíduo e para avaliação de prognóstico de um indivíduo tendo, ou suspeito de ter, câncer ovariano | |
| RU2014123987A (ru) | Анализ адромедуллина и способы определения зрелого адромедуллина | |
| JP2019530875A5 (ru) | ||
| WO2010099137A3 (en) | In situ methods for monitoring the emt status of tumor cells in vivo | |
| WO2011085165A2 (en) | Ca-125 immune complexes as biomarkers of ovarian cancer | |
| RU2018123581A (ru) | Способ для выделения раковых стволовых клеток | |
| Haslene-Hox et al. | Quantification of the concentration gradient of biomarkers between ovarian carcinoma interstitial fluid and blood | |
| JPWO2011148669A1 (ja) | 大腸がんマーカービトロネクチン、及び採血試料中のビトロネクチン濃度の分析方法 | |
| Chao et al. | Towards proteome standards: the use of absolute quantitation in high-throughput biomarker discovery | |
| US20250044291A1 (en) | Method for the detection of blood cancer | |
| Wang et al. | Donor-derived cell-free DNA-based liquid biopsies to determine future kidney transplant rejection | |
| EP2972377A1 (en) | Systems and methods employing human stem cell markers for detection, diagnosis and treatment of circulating tumor cells | |
| JP2012107935A (ja) | Ｄｅｓｍｏｇｌｅｉｎ−２蛋白質による脳梗塞の検査方法 | |
| JP2011237402A (ja) | ガレクチン−３結合蛋白質による脳梗塞の検査方法 | |
| JPWO2022144407A5 (ru) | ||
| WO2025253002A1 (en) | Sample collection for liquid biopsy | |
| JP2012107932A (ja) | Ｃｌｕｓｔｅｒｉｎ蛋白質による脳梗塞の検査方法 | |
| JPWO2012067150A1 (ja) | Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ−６ｒｅｃｅｐｔｏｒｓｕｂｕｎｉｔｂｅｔａ蛋白質による脳梗塞の検査方法 | |
| JP2022022635A (ja) | 自己免疫性肝炎を判定するためのバイオマーカー | |
| JP2017215151A (ja) | 腎細胞癌マーカー及びその使用 | |
| HK1249176B (en) | Method for detecting nucleosome adducts | |
| JP2012107931A (ja) | Ｂｃｌ−ＸＬ蛋白質による脳梗塞の検査方法 | |
| JP2015111050A (ja) | Ｋａｌｌｉｓｔａｔｉｎ蛋白質による脳梗塞検査方法 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| HZ9A | Changing address for correspondence with an applicant |