[go: up one dir, main page]

RU2011137486A - Аберрантная митохондриальная днк, ассоциированные с ней слитые транскрипты, продукты трансляции и гибрадизационные зонды - Google Patents

Аберрантная митохондриальная днк, ассоциированные с ней слитые транскрипты, продукты трансляции и гибрадизационные зонды Download PDF

Info

Publication number
RU2011137486A
RU2011137486A RU2011137486/10A RU2011137486A RU2011137486A RU 2011137486 A RU2011137486 A RU 2011137486A RU 2011137486/10 A RU2011137486/10 A RU 2011137486/10A RU 2011137486 A RU2011137486 A RU 2011137486A RU 2011137486 A RU2011137486 A RU 2011137486A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
cancer
mitochondrial
antibody
protein
acid sequence
Prior art date
Application number
RU2011137486/10A
Other languages
English (en)
Inventor
Райан ПАРР
Габриэль ДАКУБО
Эндрю ХАРБОТТЛ
Брайен РЕГЮЛИ
Дженнифер КРИД
Керри РОБИНСОН
Даниель КЛЯЙН
Original Assignee
Митомикс Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from PCT/CA2009/000351 external-priority patent/WO2009117811A1/en
Application filed by Митомикс Инк. filed Critical Митомикс Инк.
Publication of RU2011137486A publication Critical patent/RU2011137486A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4748Tumour specific antigens; Tumour rejection antigen precursors [TRAP], e.g. MAGE
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0012Oxidoreductases (1.) acting on nitrogen containing compounds as donors (1.4, 1.5, 1.6, 1.7)
    • C12N9/0036Oxidoreductases (1.) acting on nitrogen containing compounds as donors (1.4, 1.5, 1.6, 1.7) acting on NADH or NADPH (1.6)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57484Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/112Disease subtyping, staging or classification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156Polymorphic or mutational markers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y106/00Oxidoreductases acting on NADH or NADPH (1.6)

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

1. Изолированный митохондриальный гибридный белок - белок, в котором есть последовательность аминокислот, возникающая вследствие трансляции митохондриального транскрипта гибридного гена, соответствующего мутации в митохондриальной ДНК.2. Белок по п.1, в котором гибридный белок имеет последовательность аминокислот, как указано в любой из последовательностей под идентификационным номером: 36-52, 55, 58, 61, 64 или 67.3. Способ диагностирования рака у млекопитающих, включающий обобщение анализа образца ткани млекопитающего на наличие, как минимум, одного митохондриального гибридного белка, белка, имеющего последовательность аминокислот, возникающую вследствие трансляции митохондриального транскрипта гибридного гена, соответствующего мутации в митохондриальной ДНК.4. Способ по п.3, в котором рак отобран из группы, которая включает рак предстательной железы, рак яичек, рак яичников, рак молочной железы, рак ободочной и прямой кишки, рак легких и меланомный рак кожи.5. Способ по п.3, в котором гибридный белок имеет последовательность аминокислот, как указано в любой из последовательностей под идентификационным номером: 36-52, 55, 58, 61, 64 или 67.6. Антитело или антигенсвязующий домен такого антетела, имеющий специфичность в отношении белка по п.1 или 2.7. Антитело по п.6, в котором указанное антитело является поли- или моноклональным.8. Способ по п.3, в котором указанный анализ охватывает иммунологический анализ.9. Способ по п.8, в котором указанный анализ проводится с присутствием антитела или антигена связующего домена по п.6.10. Набор для проведения анализа на обнаружение присутствия рака у млекопитающих, включающий антитело или антиге

Claims (17)

1. Изолированный митохондриальный гибридный белок - белок, в котором есть последовательность аминокислот, возникающая вследствие трансляции митохондриального транскрипта гибридного гена, соответствующего мутации в митохондриальной ДНК.
2. Белок по п.1, в котором гибридный белок имеет последовательность аминокислот, как указано в любой из последовательностей под идентификационным номером: 36-52, 55, 58, 61, 64 или 67.
3. Способ диагностирования рака у млекопитающих, включающий обобщение анализа образца ткани млекопитающего на наличие, как минимум, одного митохондриального гибридного белка, белка, имеющего последовательность аминокислот, возникающую вследствие трансляции митохондриального транскрипта гибридного гена, соответствующего мутации в митохондриальной ДНК.
4. Способ по п.3, в котором рак отобран из группы, которая включает рак предстательной железы, рак яичек, рак яичников, рак молочной железы, рак ободочной и прямой кишки, рак легких и меланомный рак кожи.
5. Способ по п.3, в котором гибридный белок имеет последовательность аминокислот, как указано в любой из последовательностей под идентификационным номером: 36-52, 55, 58, 61, 64 или 67.
6. Антитело или антигенсвязующий домен такого антетела, имеющий специфичность в отношении белка по п.1 или 2.
7. Антитело по п.6, в котором указанное антитело является поли- или моноклональным.
8. Способ по п.3, в котором указанный анализ охватывает иммунологический анализ.
9. Способ по п.8, в котором указанный анализ проводится с присутствием антитела или антигена связующего домена по п.6.
10. Набор для проведения анализа на обнаружение присутствия рака у млекопитающих, включающий антитело или антигенсвязующий домен по п.6.
11. Изолированный митохондриальный транскрипт гибридного гена, имеющий последовательность нуклеиновых кислот, как указано в последовательности под идентификационным номером: 56, 59, 62 или 65.
12. Изолированная мтДНК, кодирующая транскрипт гибридного гена по п.11.
13. Изолированная мтДНК по п.12, имеющая последовательность, как указано в любой из последовательностей под идентификационным номером: 57, 60, 63 или 66.
14. Гибридизационные зонды, имеющие последовательность нуклеиновых кислот, дополняющие, как минимум, часть митохондриального транскрипта гибридного гена по п.11 или мтДНК по п.12 или 13.
15. Способ диагностирования рака у млекопитающих, включающий обобщение анализа образца ткани млекопитающего на наличие, как минимум, одного митохондриального транскрипта гибридного гена, связанного с раком посредством гибридизации образца, как минимум, одним гибридизационным зондом, имеющим последовательность нуклеиновых кислот, дополняющих, как минимум, часть митохондриального транскрипта гибридного гена по п.11.
16. Способ по п.15, в котором рак отобран из группы, которая включает рак предстательной железы, рак яичек, рак яичников, рак молочной железы, рак ободочной и прямой кишки, рак легких и меланомный рак кожи.
17. Набор для проведения анализа на обнаружение присутствия рака у млекопитающих, указанный набор включает, как минимум, один гибридазиционный зонд, дополняющий, как минимум, часть транскрипта гибридного гена по п.11.
RU2011137486/10A 2009-03-27 2010-03-29 Аберрантная митохондриальная днк, ассоциированные с ней слитые транскрипты, продукты трансляции и гибрадизационные зонды RU2011137486A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/CA2009/000351 WO2009117811A1 (en) 2008-03-28 2009-03-27 Aberrant mitochondrial dna, associated fusion transcripts and hybridization probes therefor
CAPCT/CA2009/000351 2009-03-27
PCT/CA2010/000423 WO2010115261A1 (en) 2009-03-27 2010-03-29 Aberrant mitochondrial dna, associated fusion transcripts and translation products and hybridization probes therefor

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2011137486A true RU2011137486A (ru) 2013-05-10

Family

ID=42937093

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2011137486/10A RU2011137486A (ru) 2009-03-27 2010-03-29 Аберрантная митохондриальная днк, ассоциированные с ней слитые транскрипты, продукты трансляции и гибрадизационные зонды

Country Status (6)

Country Link
EP (2) EP3272871B1 (ru)
JP (1) JP5734947B2 (ru)
KR (1) KR101720555B1 (ru)
AU (1) AU2010234238B2 (ru)
RU (1) RU2011137486A (ru)
WO (1) WO2010115261A1 (ru)

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107011428B (zh) 2008-03-28 2022-02-25 Mdna生命科学有限公司 异常线粒体dna、相关的融合转录物及其杂交探针
TWI709188B (zh) 2018-09-27 2020-11-01 財團法人工業技術研究院 基於機率融合的分類器、分類方法及分類系統
CN113025633B (zh) * 2019-12-09 2024-08-27 武汉纽福斯生物科技有限公司 编码人nadh脱氢酶亚单位1蛋白的核酸及其应用

Family Cites Families (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
NL154598B (nl) 1970-11-10 1977-09-15 Organon Nv Werkwijze voor het aantonen en bepalen van laagmoleculire verbindingen en van eiwitten die deze verbindingen specifiek kunnen binden, alsmede testverpakking.
US3817837A (en) 1971-05-14 1974-06-18 Syva Corp Enzyme amplification assay
US3939350A (en) 1974-04-29 1976-02-17 Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Fluorescent immunoassay employing total reflection for activation
US3996345A (en) 1974-08-12 1976-12-07 Syva Company Fluorescence quenching with immunological pairs in immunoassays
US4277437A (en) 1978-04-05 1981-07-07 Syva Company Kit for carrying out chemically induced fluorescence immunoassay
US4275149A (en) 1978-11-24 1981-06-23 Syva Company Macromolecular environment control in specific receptor assays
US4366241A (en) 1980-08-07 1982-12-28 Syva Company Concentrating zone method in heterogeneous immunoassays
US5807522A (en) 1994-06-17 1998-09-15 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods for fabricating microarrays of biological samples
US6218117B1 (en) * 1998-06-15 2001-04-17 Mitokor Compositions and methods for identifying agents that quantitatively alter detectable extramitochondrial DNA:mitochondrial DNA ratios
EP1397508A2 (en) * 2001-06-11 2004-03-17 1304854 Ontario Ltd Complete mitochondrial genome sequences as a diagnostic tool for the health sciences
US20030162174A1 (en) * 2001-06-11 2003-08-28 Sutherland John W. Detecting nucleic acid deletion sequences
KR101363032B1 (ko) * 2005-04-18 2014-02-13 미토믹스 인크. 일광 노출, 전립선암 및 다른 암의 검출용 진단 도구로서미토콘드리아 돌연변이 및 전위
CA2700941A1 (en) * 2007-09-26 2009-04-02 Genesis Genomics Inc. 3.4 kb mitochondrial dna deletion for use in the detection of cancer
CN107011428B (zh) 2008-03-28 2022-02-25 Mdna生命科学有限公司 异常线粒体dna、相关的融合转录物及其杂交探针

Also Published As

Publication number Publication date
EP2411522A4 (en) 2013-01-02
KR20140014360A (ko) 2014-02-06
WO2010115261A1 (en) 2010-10-14
KR101720555B1 (ko) 2017-03-29
EP2411522B1 (en) 2017-09-06
EP3272871A1 (en) 2018-01-24
JP2012521745A (ja) 2012-09-20
AU2010234238B2 (en) 2016-07-28
EP3272871B1 (en) 2020-01-15
JP5734947B2 (ja) 2015-06-17
AU2010234238A1 (en) 2011-09-29
EP2411522A1 (en) 2012-02-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2014108048A (ru) Способ обнаружения рака поджелудочной железы
DK2591363T3 (en) DIAGNOSIS AND TREATMENT OF BREAST CANCER
JP2019518452A5 (ru)
ES2659798T3 (es) Detección de la restricción de cadena ligera de inmunoglobulina por hibridación in situ de ARN
MX2015008045A (es) Anticuerpos que se unen a ligando 1 de muerte programada (pd-l1) humano.
JP2011515091A5 (ru)
SG10201407883PA (en) Multi-sample indexing for multiplex genotyping
Liu et al. Profiling of single-vesicle surface proteins via droplet digital immuno-PCR for multi-subpopulation extracellular vesicles counting towards cancer diagnostics
ES2608313T3 (es) Identificación de resistencia antibiótica en microorganismos
KR20170104518A (ko) 크기에 기초한 희귀 세포의 회수를 위한 칼럼 기반 장치 및 방법, 및 이의 용도
KR101333207B1 (ko) 자궁내막증과 연관된 유전자 마커 및 이의 용도
RU2011137486A (ru) Аберрантная митохондриальная днк, ассоциированные с ней слитые транскрипты, продукты трансляции и гибрадизационные зонды
CN103952472B (zh) 用于海豚链球菌lamp-lfd可视化检测的引物和探针及引物和探针的应用
RU2008129770A (ru) Новый ассоциированный с раком антиген
KR101182974B1 (ko) 림프종 진단 또는 예후 마커로서 Pellino 1
Shen et al. Combined detection of dickkopf-1 subtype classification autoantibodies as biomarkers for the diagnosis and prognosis of non-small cell lung cancer
CN107904307B (zh) Nfi转录因子在食管鳞癌中的应用
WO2008139169A1 (en) Sox11 expression in malignant lymphomas
JP2021019612A (ja) 治療剤に対する抵抗性の診断に使用するためのERCC1アイソフォーム3のmRNAおよび/またはタンパク質ならびにこのmRNAおよび/またはタンパク質を使用する治療剤に対する抵抗性を診断するための方法
WO2012115493A9 (ko) 암에 대한 바이오마커 및 이를 이용한 암 진단
WO2023244680A3 (en) Reagents and methods for cell identification and characterization
JP2012521745A5 (ru)
JP5298266B2 (ja) 小細胞肺癌の判定用キット
CN104531878B (zh) 一种联合lncRNA和AR3检测试剂盒及应用
EP2568286B1 (en) Method for analysing mucin 1 having sia-alpha-2-8-sia-alpha-2-3-gal-beta glycans

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20140812