RU2011134898A - Композиции и способы, используемые для оценки цитотоксичности отдельных клеток - Google Patents
Композиции и способы, используемые для оценки цитотоксичности отдельных клеток Download PDFInfo
- Publication number
- RU2011134898A RU2011134898A RU2011134898/10A RU2011134898A RU2011134898A RU 2011134898 A RU2011134898 A RU 2011134898A RU 2011134898/10 A RU2011134898/10 A RU 2011134898/10A RU 2011134898 A RU2011134898 A RU 2011134898A RU 2011134898 A RU2011134898 A RU 2011134898A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- cells
- specified
- microwell
- effector
- cell
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract 96
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 title claims 3
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 title claims 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 claims abstract 29
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 claims abstract 15
- 239000000725 suspension Substances 0.000 claims abstract 10
- 230000002934 lysing effect Effects 0.000 claims abstract 9
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims abstract 7
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 6
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 claims abstract 6
- 239000011575 calcium Substances 0.000 claims abstract 6
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims abstract 5
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 claims abstract 2
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims abstract 2
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 claims abstract 2
- DZNKOAWEHDKBEP-UHFFFAOYSA-N methyl 2-[6-[bis(2-methoxy-2-oxoethyl)amino]-5-[2-[2-[bis(2-methoxy-2-oxoethyl)amino]-5-methylphenoxy]ethoxy]-1-benzofuran-2-yl]-1,3-oxazole-5-carboxylate Chemical group COC(=O)CN(CC(=O)OC)C1=CC=C(C)C=C1OCCOC(C(=C1)N(CC(=O)OC)CC(=O)OC)=CC2=C1OC(C=1OC(=CN=1)C(=O)OC)=C2 DZNKOAWEHDKBEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 70
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 claims 23
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 claims 21
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims 18
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 11
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 claims 9
- 108010029697 CD40 Ligand Proteins 0.000 claims 5
- 102100032937 CD40 ligand Human genes 0.000 claims 5
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 claims 5
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 claims 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 5
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims 4
- MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N (3s)-4-[[(2s)-1-[[(2s)-1-[[(1s)-1-carboxy-2-hydroxyethyl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-[[2-[[(2s)-2,6-diaminohexanoyl]amino]acetyl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical group OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N 0.000 claims 3
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 claims 3
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 claims 3
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 claims 3
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 claims 3
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 claims 3
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 claims 3
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 claims 3
- 239000006166 lysate Substances 0.000 claims 3
- 102000001398 Granzyme Human genes 0.000 claims 2
- 108060005986 Granzyme Proteins 0.000 claims 2
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 claims 2
- 208000037357 HIV infectious disease Diseases 0.000 claims 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 claims 2
- 208000033519 human immunodeficiency virus infectious disease Diseases 0.000 claims 2
- 230000008348 humoral response Effects 0.000 claims 2
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims 2
- 238000002372 labelling Methods 0.000 claims 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 2
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 claims 2
- 101710149863 C-C chemokine receptor type 4 Proteins 0.000 claims 1
- 102100036301 C-C chemokine receptor type 7 Human genes 0.000 claims 1
- 102100028990 C-X-C chemokine receptor type 3 Human genes 0.000 claims 1
- 102100032976 CCR4-NOT transcription complex subunit 6 Human genes 0.000 claims 1
- 108010092574 CD69 antigen Proteins 0.000 claims 1
- 101000716065 Homo sapiens C-C chemokine receptor type 7 Proteins 0.000 claims 1
- 101000916050 Homo sapiens C-X-C chemokine receptor type 3 Proteins 0.000 claims 1
- 101001018097 Homo sapiens L-selectin Proteins 0.000 claims 1
- 101000917858 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-A Proteins 0.000 claims 1
- 101000917839 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-B Proteins 0.000 claims 1
- 102000003814 Interleukin-10 Human genes 0.000 claims 1
- 108090000174 Interleukin-10 Proteins 0.000 claims 1
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 claims 1
- 102000004388 Interleukin-4 Human genes 0.000 claims 1
- 102100033467 L-selectin Human genes 0.000 claims 1
- 102100029185 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-B Human genes 0.000 claims 1
- KHGNFPUMBJSZSM-UHFFFAOYSA-N Perforine Natural products COC1=C2CCC(O)C(CCC(C)(C)O)(OC)C2=NC2=C1C=CO2 KHGNFPUMBJSZSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 claims 1
- 230000036436 anti-hiv Effects 0.000 claims 1
- 238000011225 antiretroviral therapy Methods 0.000 claims 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims 1
- BQRGNLJZBFXNCZ-UHFFFAOYSA-N calcein am Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC(CN(CC(=O)OCOC(C)=O)CC(=O)OCOC(C)=O)=C(OC(C)=O)C=C1OC1=C2C=C(CN(CC(=O)OCOC(C)=O)CC(=O)OCOC(=O)C)C(OC(C)=O)=C1 BQRGNLJZBFXNCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 claims 1
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 claims 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 claims 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 1
- 229930192851 perforin Natural products 0.000 claims 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/569—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses
- G01N33/56966—Animal cells
- G01N33/56972—White blood cells
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
- G01N33/5008—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
- G01N33/5044—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics involving specific cell types
- G01N33/5047—Cells of the immune system
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/52—Use of compounds or compositions for colorimetric, spectrophotometric or fluorometric investigation, e.g. use of reagent paper and including single- and multilayer analytical elements
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/563—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor involving antibody fragments
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B30/00—Methods of screening libraries
- C40B30/06—Methods of screening libraries by measuring effects on living organisms, tissues or cells
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/005—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from viruses
- G01N2333/08—RNA viruses
- G01N2333/15—Retroviridae, e.g. bovine leukaemia virus, feline leukaemia virus, feline leukaemia virus, human T-cell leukaemia-lymphoma virus
- G01N2333/155—Lentiviridae, e.g. visna-maedi virus, equine infectious virus, FIV, SIV
- G01N2333/16—HIV-1, HIV-2
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Pathology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Virology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
Abstract
1. Способ идентификации CD8-клеток, способных лизировать CD4-ВИЧ-инфицированные клетки у индивидуума, где указанный способ включает:получение суспензии эффекторных CD8-клеток и клеток-мишеней, взятых у индивидуума и нанесенных на сформованную пластину, содержащую по меньшей мере одну микролунку в микролуночном массиве, где указанная по меньшей мере одна микролунка в указанном микролуночном массиве имеет отдельную эффекторную клетку;культивирование указанной суспензии в условиях, позволяющих осуществлять лизис указанной клетки-мишени под действием указанных CD8-клеток;детектирование лизиса указанной клетки-мишени указанными эффекторными клетками; иидентификацию CD8-клеток, способных лизировать CD4-ВИЧ-инфицированные клетки.2. Способ по п.1, который также включает выделение эффекторных клеток, лизирующих указанную клетку-мишень.3. Способ по п.2, который также включает культивирование эффекторных клеток, лизирующих указанную клетку-мишень.4. Способ по п.1, где указанные эффекторные клетки и клетки-мишени смешивают перед их помещением в указанную микролунку.5. Способ по п.1, где указанные эффекторные клетки и клетки-мишени смешивают после их помещения в указанную микролунку.6. Способ по п.1, где лизис детектируют путем мониторинга изменения интенсивности флуоресценции меченных клеток.7. Способ по п.1, где лизис детектируют путем мониторинга изменения уровней внутриклеточного кальция в указанной клетке-мишени.8. Способ по п.7, где указанный кальций детектируют с использованием флуоресцентного красителя, чувствительного к кальцию.9. Способ по п.8, где указанным красителем является Fura 2АМ (Invitrogen).10. Способ по п.1, который такж
Claims (68)
1. Способ идентификации CD8+-клеток, способных лизировать CD4+-ВИЧ-инфицированные клетки у индивидуума, где указанный способ включает:
получение суспензии эффекторных CD8+-клеток и клеток-мишеней, взятых у индивидуума и нанесенных на сформованную пластину, содержащую по меньшей мере одну микролунку в микролуночном массиве, где указанная по меньшей мере одна микролунка в указанном микролуночном массиве имеет отдельную эффекторную клетку;
культивирование указанной суспензии в условиях, позволяющих осуществлять лизис указанной клетки-мишени под действием указанных CD8+-клеток;
детектирование лизиса указанной клетки-мишени указанными эффекторными клетками; и
идентификацию CD8+-клеток, способных лизировать CD4+-ВИЧ-инфицированные клетки.
2. Способ по п.1, который также включает выделение эффекторных клеток, лизирующих указанную клетку-мишень.
3. Способ по п.2, который также включает культивирование эффекторных клеток, лизирующих указанную клетку-мишень.
4. Способ по п.1, где указанные эффекторные клетки и клетки-мишени смешивают перед их помещением в указанную микролунку.
5. Способ по п.1, где указанные эффекторные клетки и клетки-мишени смешивают после их помещения в указанную микролунку.
6. Способ по п.1, где лизис детектируют путем мониторинга изменения интенсивности флуоресценции меченных клеток.
7. Способ по п.1, где лизис детектируют путем мониторинга изменения уровней внутриклеточного кальция в указанной клетке-мишени.
8. Способ по п.7, где указанный кальций детектируют с использованием флуоресцентного красителя, чувствительного к кальцию.
9. Способ по п.8, где указанным красителем является Fura 2АМ (Invitrogen).
10. Способ по п.1, который также включает:
приведение в контакт микролуночного массива с субстратом, где указанный субстрат предварительно обрабатывают по меньшей мере одним средством, которое позволяет специфически детектировать продукт указанных эффекторных клеток; и
детектирование указанного средства.
11. Способ по п.10, где указанным средством является антитело, цитокин или растворимый медиатор лизиса.
12. Способ по п.10, где указанным средством является цитокин.
13. Способ по п.12, где указанным цитокином является TNF-α или IFN-γ.
14. Способ по п.8, где указанным средством является растворимый медиатор лизиса.
15. Способ по п.14, где указанным растворимым медиатором лизиса является гранзим В (GzB) или перфорин.
16. Способ по п.1, где указанный способ также включает, мечение эффекторных клеток антигеном CD69.
17. Способ характеристики гуморального ответа у индивидуума, где указанный способ включает:
получение суспензии В-клеток, взятых у индивидуума и нанесенных на сформованную пластину, содержащую по меньшей мере одну микролунку в микролуночном массиве, где указанный индивидуум инфицирован или, вероятно, инфицирован ВИЧ, и где по меньшей мере одна микролунка в указанном микролуночном массиве имеет отдельную клетку;
приведение в контакт указанного микролуночного массива с субстратом, где указанный субстрат предварительно обрабатывают по меньшей мере одним средством для детектирования В-клеток; и
детектирование указанного средства с последующей характеристикой указанного гуморального ответа.
18. Способ по п.17, где указанным средством для детектирования В-клеток является антитело, специфичное к эпитопу в gp120.
19. Способ по п.17, который также включает приведение в контакт указанного микролуночного массива со вторым субстратом, где указанный субстрат предварительно обрабатывают по меньшей мере одним первым средством для детектирования В-клеток.
20. Способ по п.19, где указанным первым средством для детектирования В-клеток является антитело против gp120 ВИЧ.
21. Способ по п.20, где указанное антитело направлено против С-концевого gp120 ВИЧ.
22. Способ по п.17, который также включает определение изотипа антитела, продуцируемого указанной В-клеткой в указанном микролуночном массиве.
23. Способ по п.17, который также включает выделение В-клетки, экспрессирующей антитело, реагирующее с ВИЧ.
24. Способ по п.23, который также включает амплификацию и выделение вариабельных областей легкой цепи и тяжелой цепи указанного антитела.
25. Способ по п.17, где указанные В-клетки обрабатывают средством, стимулирующим продуцирование антител в указанной клетке.
26. Способ по п.25, где указанными средствами являются CD40L или анти-BCR антитело.
27. Способ по п.25, где указанные В-клетки обрабатывают CD40L и анти-BCR антителом.
28. Способ характеристики перекрестной реактивности В-клеток с множеством ВИЧ-изолятов, где указанный способ включает:
получение суспензии В-клеток, взятых у индивидуума и нанесенных на сформованную пластину, содержащую по меньшей мере одну микролунку в микролуночном массиве, где указанный индивидуум инфицирован или, предположительно, инфицирован ВИЧ, и где по меньшей мере одна микролунка в указанном микролуночном массиве имеет отдельную клетку;
приведение в контакт указанного микролуночного массива с первым субстратом, где указанный субстрат предварительно обрабатывают антителами, продуцируемыми указанными В-клетками по меньшей мере в одной указанной микролунке;
приведение в контакт указанного субстрата с первым меченым вирионом ВИЧ и со вторым меченным вирионом ВИЧ; и
определение наличия связывания указанного первого меченого вириона и второго меченого вириона с антителами, продуцируемыми той же самой клеткой в указанной микролунке.
29. Способ по п.28, где указанный способ дополнительно включает выделение В-клеток, продуцирующих антитела, которые специфически связываются с указанным первым меченым вирионом и вторым меченым вирионом.
30. Способ по п.29, который также включает культивирование указанных выделенных В-клеток.
31. Способ по п.17, где по меньшей мере один из указанных вирионов является меченным.
32. Способ по п.21, где указанный первый вирион и второй вирион метят различными средствами.
33. Способ создания функционального профиля для эффекторных клеток, чувствительных к ВИЧ-инфекциям у индивидуума, где указанный способ включает:
получение популяции эффекторных клеток, выбранных из группы, состоящей из клеток CTL (CD8+), NK-клеток (CD16+), NK-T-клеток (CD1d+, Vα24+) или γδ-Т-клеток (Vγ9+, Vδ2+), где указанные эффекторные клетки получают от индивидуума и наносят на сформованную пластину, содержащую по меньшей мере одну микролунку в микролуночном массиве, где по меньшей мере одна микролунка в указанном микролуночном массиве имеет отдельную эффекторную клетку, и где указанная популяция эффекторных клеток загружена вместе с популяцией когнатных клеток-мишеней;
визуализацию указанных эффекторных клеток;
оценку цитотоксичности указанных эффекторных клеток;
приведение в контакт микролуночного массива с первым субстратом, где указанный субстрат предварительно обрабатывают средством, которое позволяет специфически детектировать один или более из IL-2, IL-4, IL-10, TNF-α и IFN-γ; и
определение связывания указанных эффекторных клеток, находящихся в указанной микролунке, с одним или несколькими указанными средствами.
34. Способ по п.33, где цитотоксичность оценивают путем детектирования высвобождения кальцеина AM.
35. Способ по п.33, который также включает мечение клеток одним или несколькими поверхность-специфическими маркерными белками.
36. Способ по п.35, где указанными поверхностными маркерными белками являются CD62L, CXCR3, CCR4 или CCR7.
37. Способ по п.33, который также включает выделение эффекторной клетки из одной или нескольких микролунок.
38. Способ по п.37, где указанный способ также включает культивирование выделенных клеток до достижения клональной амплификации указанных выделенных клеток.
39. Способ по п.37, где указанный способ также включает характеристику экспрессии одного или нескольких генов в указанной выделенной клетке.
40. Способ по п.33, где указанными клетками являются CD8+-цитотоксические Т-клетки (CTL), природные киллеры (NK), NK-T-клетки или γδ-Т-клетки.
41. Способ по п.33, где указанный индивидуум имеет инфекцию в острой стадии, проходит высокоинтенсивную антиретровирусную терапию (HAART) или является «элит-контроллером».
42. Способ оценки природного иммунного ответа у индивидуума с ВИЧ-инфекцией, где способ включает:
получение суспензии NK-клеток, взятых у индивидуума и нанесенных на сформованную пластину, содержащую по меньшей мере одну микролунку в микролуночном массиве, где указанный индивидуум инфицирован или, вероятно, инфицирован ВИЧ, и где по меньшей мере одна микролунка в указанном микролуночном массиве имеет отдельную клетку;
приведение в контакт микролуночного массива с субстратом, где субстрат предварительно обрабатывают по меньшей мере одним средством для детектирования NK-клеток;
детектирование указанного средства; и тем самым
оценку указанного природного иммунного ответа.
43. Способ по п.42, где указанные NK-клетки детектируют с использованием NKp46-Cy3, CD107a-Alexa647 и/или CD69-Alexa488.
44. Способ по п.32, где указанные клетки совместно культивируют перед их нанесением на сформованную пластину.
45. Способ по п.44, где указанные клетки совместно культивируют с IL-12 и IL-18.
46. Способ по п.45, где указанное средство для детектирования NK-клеток позволяет детектировать NK-клетки.
47. Способ оценки клонального разнообразия популяции NK-клеток, где способ включает:
получение суспензии NK-клеток и клеток-мишеней, взятых у индивидуума и нанесенных на сформованную пластину, содержащую по меньшей мере одну микролунку в микролуночном массиве, где по меньшей мере одна микролунка в указанном микролуночном массиве имеет отдельную эффекторную клетку;
культивирование указанной суспензии в условиях, позволяющих осуществлять лизис указанной клетки-мишени указанными NK-клетками;
детектирование лизиса указанных клеток-мишеней указанными эффекторными клетками; и
идентификацию указанных эффекторных клеток; и тем самым
оценку клонального разнообразия указанной популяции NK-клеток.
48. Способ по п.41, который также включает выделение эффекторных клеток, лизирующих указанную клетку-мишень.
49. Способ по п.48, который также включает культивирование указанных выделенных клеток.
50. Способ по п.47, который также включает культивирование NK-клеток, которые лизируют указанную клетку-мишень.
51. Способ по п.47, где указанные NK-клетки и клетки-мишени смешивают перед введением клеток в указанную микролунку.
52. Способ по п.47, где указанные NK-клетки и клетки-мишени смешивают после введения клеток в указанную микролунку.
53. Способ по п.47, где лизис клеток-мишеней определяют путем мониторинга изменения интенсивности флуоресценции меченой клетки.
54. Способ по п.47, который также включает приведение в контакт микролуночного массива с субстратом, где указанный субстрат предварительно обрабатывают по меньшей мере одним средством, которое позволяет специфически детектировать продукт указанных NK-клеток; и
детектирование указанного средства.
55. Способ по п.54, где указанным средством является антитело, цитокин или растворимый медиатор лизиса.
56. Способ по п.55, где указанным цитокином является TNF-α или IFN-γ.
57. Способ оценки клонального разнообразия популяции NK-клеток и В-клеток, где способ включает:
получение клеточной суспензии, содержащей повышенное количество ВИЧ-инфицированных CD4+-T-клеток, активированных NK-клеток, В-клеток и клеток-мишеней, где указанную суспензию наносят на сформованную пластину, содержащую по меньшей мере одну микролунку в микролуночном массиве, где указанная по меньшей мере одна микролунка в указанном микролуночном массиве имеет отдельную Т-клетку;
культивирование клеток в условиях, позволяющих антителам, продуцируемым В-клетками, связываться с поверхностью Т-клеток;
идентификацию лунок, содержащих В-клетки, NK-клетки и лизированные Т-клетки, и
идентификацию В-клеток или NK-клеток.
58. Способ по п.57, где указанные NK-клетки активируют IL-2.
59. Способ по п.57, где указанные В-клетки активируют CD40L или анти-BCR антителом.
60. Способ по п.57, где В-клетки активируют CD40L и анти-BCR антителом.
61. Способ по п.57, где указанные NK-клетки активируют IL-2.
62. Способ по п.57, где указанные В-клетки активируют CD40L или анти-BCR антителом.
63. Способ по п.57, где указанный способ также включает:
выделение В-клеток или NK-клеток из указанной лунки; и
характеристику одного или нескольких свойств указанных В-клеток.
64. Способ по п.63, где указанный способ включает характеризацию генов антитела в указанных В-клетках.
65. Способ по п.64, где указанный способ включает анализ области VDJ генов, кодирующих антитела в указанных В-клетках.
66. Способ по п.57, где указанный способ включает приведение в контакт микролуночного массива с субстратом в условиях, стимулирующих связывание антител, продуцируемых В-клетками, с указанным субстратом.
67. Способ по п.57, где указанный способ включает приведение в контакт указанного субстрата с лизатами ВИЧ-инфицированных клеток, и
идентификацию лунок с В-клетками, продуцирующими антитела, которые связываются с указанным ВИЧ-лизатом, или анти-IgG3 антитело.
68. Способ по п.67, включающий идентификацию лунок с В-клетками, продуцирующими антитела, которые связываются с указанным ВИЧ-лизатом, или анти-IgG3 антитело.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US14610609P | 2009-01-21 | 2009-01-21 | |
| US61/146,106 | 2009-01-21 | ||
| PCT/US2009/050411 WO2010085275A1 (en) | 2009-01-21 | 2009-07-13 | Compositions and methods for assessing cytotoxicity of single cells |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2011134898A true RU2011134898A (ru) | 2013-02-27 |
| RU2532228C2 RU2532228C2 (ru) | 2014-10-27 |
Family
ID=42356144
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2011134898/10A RU2532228C2 (ru) | 2009-01-21 | 2009-07-13 | Композиции и способы, используемые для оценки цитотоксичности отдельных клеток |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US9244071B2 (ru) |
| EP (1) | EP2389446B1 (ru) |
| JP (2) | JP2012515548A (ru) |
| KR (1) | KR20110134386A (ru) |
| CN (2) | CN102388145A (ru) |
| AU (1) | AU2009338127B2 (ru) |
| CA (1) | CA2689681C (ru) |
| IL (1) | IL213938A0 (ru) |
| RU (1) | RU2532228C2 (ru) |
| SG (2) | SG172889A1 (ru) |
| WO (1) | WO2010085275A1 (ru) |
Families Citing this family (31)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR101550086B1 (ko) | 2008-12-04 | 2015-09-03 | 메사추세츠 인스티튜트 오브 테크놀로지 | 알레르기 반응의 진단 방법 |
| US9404924B2 (en) | 2008-12-04 | 2016-08-02 | Massachusetts Institute Of Technology | Method of performing one-step, single cell RT-PCR |
| WO2010085275A1 (en) | 2009-01-21 | 2010-07-29 | Massachusetts Institute Of Technology | Compositions and methods for assessing cytotoxicity of single cells |
| EP2646830B1 (en) * | 2010-12-03 | 2016-04-13 | Cellply S.R.L. | Rapid screening of monoclonal antibodies |
| CN103392124B (zh) | 2010-12-03 | 2016-04-20 | 塞普莱有限公司 | 细胞功能的微分析 |
| WO2013090404A2 (en) * | 2011-12-13 | 2013-06-20 | Single Cell Technology, Inc. | Method of screening a plurality of single secreting cells for functional activity |
| WO2014001459A1 (en) | 2012-06-29 | 2014-01-03 | Danmarks Tekniske Universitet | A method of charging a test carrier and a test carrier |
| EP4148118A1 (en) * | 2012-08-24 | 2023-03-15 | Yale University | System, device and method for high-throughput multi-plexed detection |
| WO2015031190A1 (en) * | 2013-08-26 | 2015-03-05 | President And Fellows Of Harvard College | Determination of immune cells and other cells |
| US9877486B2 (en) | 2014-01-31 | 2018-01-30 | AgBiome, Inc. | Methods of growing plants using modified biological control agents |
| CN110915818B (zh) | 2014-01-31 | 2022-04-26 | 农业生物群落股份有限公司 | 经修饰的生物防治剂及其用途 |
| US20160160169A1 (en) | 2014-12-03 | 2016-06-09 | IsoPlexis Corporation | Analysis and screening of poly-functional secretion profiles |
| WO2016149639A1 (en) | 2015-03-19 | 2016-09-22 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Devices and methods for high-throughput single cell and biomolecule analysis and retrieval in a microfluidic chip |
| JP6855382B2 (ja) | 2015-03-26 | 2021-04-14 | ユニバーシティー オブ ヒューストン システム | 細胞の統合された機能性および分子のプロファイリング |
| WO2017124101A2 (en) | 2016-01-15 | 2017-07-20 | The Broad Institute Inc. | Semi-permeable arrays for analyzing biological systems and methods of using same |
| WO2017165791A1 (en) | 2016-03-25 | 2017-09-28 | President And Fellows Of Harvard College | Microfluidic determination of immune and other cells |
| EP3438242B1 (en) * | 2016-03-30 | 2021-02-17 | Sony Corporation | Cell observation device, method for evaluating activity level of immune cells, and method for controlling quality of immune cells |
| CA3027317A1 (en) | 2016-06-14 | 2017-12-21 | Cellply S.R.L. | Screening kit and method |
| CN106086171A (zh) * | 2016-06-15 | 2016-11-09 | 广州中大南沙科技创新产业园有限公司 | 一种抑制肿瘤细胞增殖的药物筛选方法 |
| DK3472351T3 (da) | 2016-06-15 | 2020-11-09 | Univ Muenchen Ludwig Maximilians | Enkeltmolekylepåvisning eller -kvantificering ved hjælp af DNA-nanoteknologi |
| WO2018049418A1 (en) | 2016-09-12 | 2018-03-15 | IsoPlexis Corporation | System and methods for multiplexed analysis of cellular and other immunotherapeutics |
| CN110168069A (zh) * | 2016-10-19 | 2019-08-23 | 通用自动化实验技术公司 | 用于筛选微生物和其他高通量微生物学应用的高分辨率系统、试剂盒、设备和方法 |
| JP7348066B2 (ja) * | 2016-11-11 | 2023-09-20 | アイソプレキシス コーポレイション | 単一細胞のゲノム、トランスクリプトームおよびプロテオームの同時解析のための組成物および方法 |
| US11085912B2 (en) * | 2016-12-14 | 2021-08-10 | University Of Cincinnati | Methods of diagnosing Clostridium difficile infection or recurrence in a subject |
| SE543211C2 (en) * | 2017-06-29 | 2020-10-27 | Mabtech Production Ab | Method and system for analyzing Fluorospot assays |
| US11767557B2 (en) | 2017-12-07 | 2023-09-26 | Massachusetts Institute Of Technology | Single cell analyses |
| CN108728356B (zh) * | 2018-05-23 | 2022-02-22 | 北京科技大学 | 用于不同三维细胞团配对的装置及共培养方法 |
| CN113614532A (zh) * | 2019-01-16 | 2021-11-05 | 烟台澳斯邦生物工程有限公司 | 沉积用于显微镜检查的生物样品的自动液体处理系统和方法 |
| US11357787B2 (en) * | 2019-02-18 | 2022-06-14 | Nb Health Laboratory Co., Ltd. | Method for selecting cells, method for producing nucleic acid, method for producing recombinant cells, method for producing target substance, method for producing pharmaceutical composition, and reagent |
| US12064768B2 (en) | 2020-02-21 | 2024-08-20 | Northeastern University | Single cell isolation and processing system with reversible well shape |
| EP4615951A2 (en) | 2022-11-07 | 2025-09-17 | Shennon Biotechnologies Inc. | Microfluidic devices for high throughput screening of cell-cell interactions |
Family Cites Families (14)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| IL68507A (en) | 1982-05-10 | 1986-01-31 | Univ Bar Ilan | System and methods for cell selection |
| SU1650094A1 (ru) * | 1987-12-29 | 1991-05-23 | Научно-исследовательский институт проктологии | Способ диагностики прот женности активного воспалени в толстой кишке при неспецифическом звенном колите |
| US6410252B1 (en) | 1995-12-22 | 2002-06-25 | Case Western Reserve University | Methods for measuring T cell cytokines |
| US6210910B1 (en) | 1998-03-02 | 2001-04-03 | Trustees Of Tufts College | Optical fiber biosensor array comprising cell populations confined to microcavities |
| AU4200900A (en) * | 1999-04-09 | 2000-11-14 | Human Genome Sciences, Inc. | 49 human secreted proteins |
| CA2383041A1 (en) * | 1999-06-11 | 2000-12-21 | Human Genome Sciences, Inc. | 49 human secreted proteins |
| US7332286B2 (en) | 2001-02-02 | 2008-02-19 | University Of Pennsylvania | Peptide or protein microassay method and apparatus |
| US20020141906A1 (en) | 2001-03-30 | 2002-10-03 | American Type Culture Collection | Microtiter plate sealing cover with well identifiers |
| WO2007035633A2 (en) * | 2005-09-16 | 2007-03-29 | President & Fellows Of Harvard College | Screening assays and methods |
| JP5718221B2 (ja) | 2008-05-30 | 2015-05-13 | マサチューセッツ インスティテュート オブ テクノロジー | 細胞の空間的分離およびスクリーニングのための組成物および方法 |
| KR101550086B1 (ko) | 2008-12-04 | 2015-09-03 | 메사추세츠 인스티튜트 오브 테크놀로지 | 알레르기 반응의 진단 방법 |
| US9404924B2 (en) | 2008-12-04 | 2016-08-02 | Massachusetts Institute Of Technology | Method of performing one-step, single cell RT-PCR |
| WO2010085275A1 (en) | 2009-01-21 | 2010-07-29 | Massachusetts Institute Of Technology | Compositions and methods for assessing cytotoxicity of single cells |
| US8569046B2 (en) | 2009-02-20 | 2013-10-29 | Massachusetts Institute Of Technology | Microarray with microchannels |
-
2009
- 2009-07-13 WO PCT/US2009/050411 patent/WO2010085275A1/en not_active Ceased
- 2009-07-13 RU RU2011134898/10A patent/RU2532228C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2009-07-13 SG SG2011049459A patent/SG172889A1/en unknown
- 2009-07-13 US US13/145,300 patent/US9244071B2/en active Active
- 2009-07-13 JP JP2011547913A patent/JP2012515548A/ja not_active Withdrawn
- 2009-07-13 CN CN2009801551526A patent/CN102388145A/zh active Pending
- 2009-07-13 SG SG10201401643PA patent/SG10201401643PA/en unknown
- 2009-07-13 EP EP09839012.3A patent/EP2389446B1/en not_active Not-in-force
- 2009-07-13 KR KR1020117018895A patent/KR20110134386A/ko not_active Ceased
- 2009-07-13 AU AU2009338127A patent/AU2009338127B2/en not_active Ceased
- 2009-07-13 CN CN201510140107.0A patent/CN104745669A/zh active Pending
- 2009-07-13 CA CA2689681A patent/CA2689681C/en not_active Expired - Fee Related
-
2011
- 2011-07-05 IL IL213938A patent/IL213938A0/en unknown
-
2015
- 2015-05-05 JP JP2015094509A patent/JP6017620B2/ja active Active
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| AU2009338127B2 (en) | 2015-11-26 |
| EP2389446B1 (en) | 2017-07-05 |
| SG172889A1 (en) | 2011-08-29 |
| CN104745669A (zh) | 2015-07-01 |
| EP2389446A1 (en) | 2011-11-30 |
| IL213938A0 (en) | 2011-07-31 |
| US20120149592A1 (en) | 2012-06-14 |
| RU2532228C2 (ru) | 2014-10-27 |
| JP2015144617A (ja) | 2015-08-13 |
| EP2389446A4 (en) | 2012-10-03 |
| CN102388145A (zh) | 2012-03-21 |
| SG10201401643PA (en) | 2014-08-28 |
| US9244071B2 (en) | 2016-01-26 |
| AU2009338127A1 (en) | 2011-07-28 |
| CA2689681C (en) | 2017-08-29 |
| JP2012515548A (ja) | 2012-07-12 |
| JP6017620B2 (ja) | 2016-11-02 |
| KR20110134386A (ko) | 2011-12-14 |
| WO2010085275A1 (en) | 2010-07-29 |
| CA2689681A1 (en) | 2010-07-21 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2011134898A (ru) | Композиции и способы, используемые для оценки цитотоксичности отдельных клеток | |
| JP2012515548A5 (ru) | ||
| JP2015144617A5 (ru) | ||
| Thakur et al. | Immune markers and correlates of protection for vaccine induced immune responses | |
| Liechti et al. | OMIP‐060: 30‐parameter flow cytometry panel to assess T cell effector functions and regulatory T cells | |
| Kohler et al. | The early cellular signatures of protective immunity induced by live viral vaccination | |
| US8975069B2 (en) | Method for identifying antigen-specific regulatory T cells | |
| Grimaldi et al. | Cytokine release: a workshop proceedings on the state-of-the-science, current challenges and future directions | |
| Ghofrani et al. | Semaphorin 7A modulates cytokine‐induced memory‐like responses by human natural killer cells | |
| Moens et al. | Naïve and memory B cells exhibit distinct biochemical responses following BCR engagement | |
| JPWO2018124005A1 (ja) | 被験物質の免疫原性を評価する方法 | |
| WO2021195136A3 (en) | Devices for detecting antibodies to coronavirus antigens | |
| Fernandez et al. | Ex-vivo α-galactosylceramide activation of NKT cells in humans and macaques | |
| Kowalewicz-Kulbat et al. | Tuberculin skin test reaction is related to memory, but not naive CD4+ T cell responses to mycobacterial stimuli in BCG-vaccinated young adults | |
| Tang et al. | The co-stimulation of anti-CD28 and IL-2 enhances the sensitivity of ELISPOT assays for detection of neoantigen-specific T cells in PBMC | |
| Han et al. | Development of an IFNγ ELISPOT for the analysis of the human T cell response against mumps virus | |
| Morrow et al. | A splenic marginal zone-like peripheral blood CD27+ B220− B cell population is preferentially depleted in HIV type 1-infected individuals | |
| Dennert et al. | Fine specificity mapping of two allospecific T cell lines: recognition of private specificities in the H‐2 IA subregion | |
| Navarrete et al. | Usage of standardized antigen-presenting cells improves ELISpot performance for complex protein antigens | |
| Munier et al. | A culture amplified multi-parametric intracellular cytokine assay (CAMP-ICC) for enhanced detection of antigen specific T-cell responses | |
| Comber et al. | In vitro derivation of interferon-γ producing, IL-4 and IL-7 responsive memory-like CD4+ T cells | |
| Richard | Toll-like receptor (TLR) 7 and TLR8 stimulation of mucosal-associated invariant T cells and gamma delta T cells: a role in HIV susceptibility | |
| Vara | Vaccine-and infection-induced cellular immunity against SARS-CoV-2 in humans | |
| JP2025538870A (ja) | 抗原特異的t細胞応答を評価するための方法 | |
| Esteso et al. | BCG-activation of leukocytes is sufficient for the generation of donor-independent innate anti-tumor NK and¿ d T-cells that can be further expanded in vitro |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20180714 |