RU2008127252A - Эффекты ингибиторов fgfr3 на транскрипцию генов - Google Patents
Эффекты ингибиторов fgfr3 на транскрипцию генов Download PDFInfo
- Publication number
- RU2008127252A RU2008127252A RU2008127252/14A RU2008127252A RU2008127252A RU 2008127252 A RU2008127252 A RU 2008127252A RU 2008127252/14 A RU2008127252/14 A RU 2008127252/14A RU 2008127252 A RU2008127252 A RU 2008127252A RU 2008127252 A RU2008127252 A RU 2008127252A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- patient
- biomarker
- treatment
- level
- expression
- Prior art date
Links
- 229940125832 FGFR3 inhibitor Drugs 0.000 title claims abstract 19
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims 10
- 230000035897 transcription Effects 0.000 title 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 title 1
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 claims abstract 75
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract 72
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract 56
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract 23
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 claims abstract 16
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims abstract 16
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims abstract 16
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims abstract 11
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 claims abstract 9
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims abstract 7
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims abstract 5
- 208000034578 Multiple myelomas Diseases 0.000 claims 8
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 claims 8
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims 8
- -1 AL531683 Proteins 0.000 claims 6
- PIQCTGMSNWUMAF-UHFFFAOYSA-N chembl522892 Chemical group C1CN(C)CCN1C1=CC=C(NC(=N2)C=3C(NC4=CC=CC(F)=C4C=3N)=O)C2=C1 PIQCTGMSNWUMAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 6
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims 4
- 102100036830 Annexin A9 Human genes 0.000 claims 3
- 102100032768 Complement receptor type 2 Human genes 0.000 claims 3
- 102100024460 DDB1- and CUL4-associated factor 8 Human genes 0.000 claims 3
- 102100027274 Dual specificity protein phosphatase 6 Human genes 0.000 claims 3
- 102100038514 FERM domain-containing protein 3 Human genes 0.000 claims 3
- 102100027842 Fibroblast growth factor receptor 3 Human genes 0.000 claims 3
- 101710182396 Fibroblast growth factor receptor 3 Proteins 0.000 claims 3
- 101000928294 Homo sapiens Annexin A9 Proteins 0.000 claims 3
- 101100275686 Homo sapiens CR2 gene Proteins 0.000 claims 3
- 101000832316 Homo sapiens DDB1- and CUL4-associated factor 8 Proteins 0.000 claims 3
- 101001057587 Homo sapiens Dual specificity protein phosphatase 6 Proteins 0.000 claims 3
- 101001030545 Homo sapiens FERM domain-containing protein 3 Proteins 0.000 claims 3
- 101000764294 Homo sapiens Lymphotoxin-beta Proteins 0.000 claims 3
- 101000976451 Homo sapiens Zinc finger protein 589 Proteins 0.000 claims 3
- 102100026894 Lymphotoxin-beta Human genes 0.000 claims 3
- 101100275687 Mus musculus Cr2 gene Proteins 0.000 claims 3
- 102100023640 Zinc finger protein 589 Human genes 0.000 claims 3
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 claims 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 3
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims 3
- JNDVEAXZWJIOKB-JYRVWZFOSA-N 3-[(3-(2-carboxyethyl)-4-methylpyrrol-2-yl)methylene]-2-indolinone Chemical compound CC1=CNC(\C=C/2C3=CC=CC=C3NC\2=O)=C1CCC(O)=O JNDVEAXZWJIOKB-JYRVWZFOSA-N 0.000 claims 2
- 102100036008 CD48 antigen Human genes 0.000 claims 2
- 102100027085 Dual specificity protein phosphatase 4 Human genes 0.000 claims 2
- 101000716130 Homo sapiens CD48 antigen Proteins 0.000 claims 2
- 101001057621 Homo sapiens Dual specificity protein phosphatase 4 Proteins 0.000 claims 2
- 101001015037 Homo sapiens Integrin beta-7 Proteins 0.000 claims 2
- 102100033016 Integrin beta-7 Human genes 0.000 claims 2
- DXCUKNQANPLTEJ-UHFFFAOYSA-N PD173074 Chemical compound CC(C)(C)NC(=O)NC1=NC2=NC(NCCCCN(CC)CC)=NC=C2C=C1C1=CC(OC)=CC(OC)=C1 DXCUKNQANPLTEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 238000011161 development Methods 0.000 claims 2
- 230000007170 pathology Effects 0.000 claims 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 1
- 229940126601 medicinal product Drugs 0.000 claims 1
- 230000001613 neoplastic effect Effects 0.000 claims 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Oncology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
1. Способ выявления пациента для лечения, заключающийся во: ! введении пациенту количества ингибитора FGFR3 и ! тестировании образца, полученного от пациента, после введения ингибитора с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I, ! причем детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера указывает на кандидатуру пациента для проведения лечения. ! 2. Способ выявления пациента для лечения, заключающийся в: ! тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I, ! причем детекция присутствия экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера указывает на кандидатуру пациента для проведения лечения. ! 3. Способ контроля ответа нуждающегося в этом пациента на лечение клеточного пролиферативного нарушения, заключающийся во: ! введении пациенту количества ингибитора FGFR3, ! тестировании образца, полученного от пациента, после введения ингибитора с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I, ! причем детекция изменения уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера по сравнению с исходным уровнем является показателем благоприятного ответа пациента на лечение. ! 4. Способ контроля ответа пациента на лечение ингибитором FGFR3 клеточного пролиферативного заболевания, заключающийся в: ! тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I, ! причем детекция изменения уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера
Claims (66)
1. Способ выявления пациента для лечения, заключающийся во:
введении пациенту количества ингибитора FGFR3 и
тестировании образца, полученного от пациента, после введения ингибитора с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I,
причем детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера указывает на кандидатуру пациента для проведения лечения.
2. Способ выявления пациента для лечения, заключающийся в:
тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I,
причем детекция присутствия экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера указывает на кандидатуру пациента для проведения лечения.
3. Способ контроля ответа нуждающегося в этом пациента на лечение клеточного пролиферативного нарушения, заключающийся во:
введении пациенту количества ингибитора FGFR3,
тестировании образца, полученного от пациента, после введения ингибитора с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I,
причем детекция изменения уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера по сравнению с исходным уровнем является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
4. Способ контроля ответа пациента на лечение ингибитором FGFR3 клеточного пролиферативного заболевания, заключающийся в:
тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I,
причем детекция изменения уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера по сравнению с исходным уровнем является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
5. Способ применения биомаркера в лечении клеточного пролиферативного заболевания у пациента, заключающийся во:
введении пациенту количества ингибитора FGFR3,
тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I, и
последующем введении того же или другого ингибитора FGFR3 пациенту, при условии, что благоприятное изменение уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера определяют после введения исходного ингибитора.
6. Способ лечения пациента с множественной миеломой, заключающийся во введении терапевтически эффективного количества агента, который изменяет уровень экспрессии по сравнению с исходным уровнем биомаркера, идентифицированного в табл.I, таким образом ингибируя патологии, ассоциированные с множественной миеломой.
7. Способ регуляции количества дозы ингибитора FGFR3 для лечения клеточного пролиферативного заболевания у пациента, заключающийся во:
введении пациенту исходного количества ингибитора FGFR3,
контроля экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I, после введения исходного количества ингибитора, и
регуляции количества последующего введения ингибитора пациенту на основе уровня изменения экспрессии биомаркера или биомаркеров, которое происходит при введении исходного количества.
8. Способ применения биомаркера для идентификации соединения, ингибирующего FGFR3, для потенциального лечения множественной миеломы или для того, чтобы направлять решение совершенствовать соединение, ингибирующее FGFR3, для дальнейшего развития лечения множественной миеломы, заключающийся в:
контактировании соединения с клеточной культурой KMS18 или KMS11 и
тестировании части клеточной культуры с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I,
причем детекция изменения экспрессии по меньшей мере одного биомаркера является показателем идентификации соединения для лечения или положительного решения совершенствовать соединение для дальнейшего развития.
9. Способ выбора соответствующего ингибитора FGFR3 для введения пациенту, нуждающемуся в лечении указанным ингибитором, заключающийся во:
введении пациенту исходного ингибитора FGFR3,
тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из табл.I, и
последующем введении исходного ингибитора FGFR3 пациенту, при условии, что благоприятное изменение уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера определяют после введения исходного ингибитора.
10. Способ применения биомаркера для идентификации соединения, ингибирующего FGFR3, для потенциального лечения клеточного пролиферативного заболевания, заключающийся в:
контактировании соединения с клеточной линией или тканью, ассоциированной с нарушением и
тестировании части клеточной культуры или ткани после контактирования с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, которая изменяется по сравнению с исходным уровнем,
причем детекция изменения экспрессии по меньшей мере одного биомаркера является показателем идентификации соединения для лечения.
11. Способ по пп.1 и 2, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.II, является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
12. Способ по пп.1 и 2, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.III, является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
13. Способ по пп.1 и 2, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.IV, является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
14. Способ по пп.1 и 2, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.V, является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
15. Способ по пп.1 и 2, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере двух биомаркеров, выбранных из подгруппы табл.I, представленной табл.II, является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
16. Способ по пп.1-10, в котором измерение экспрессии гена осуществляют детекцией количества РНК, транскрибируемой биомаркером.
17. Способ по пп.1-10, в котором измерение экспрессии гена осуществляют детекцией количества ДНК, образуемой при обратной транскрипции РНК, транскрибируемой биомаркером.
18. Способ по пп.1-10, в котором измерение экспрессии гена осуществляют детекцией полипептида или белка, кодируемого биомаркером.
19. Способ по пп.1-10, в котором по меньшей мере один биомаркер функционально связан с чипом генов.
20. Способ по пп.1-10, в котором по меньшей мере один биомаркер представлен в компьютерно-читаемом формате.
21. Способ по пп.1-10, в котором тестирование включает контактирование образца с чипом генов, включающим биомаркеры любой из табл.I-V.
22. Способ по пп.1-10, в котором стадия детекции включает сравнение уровня экспрессии гена биомаркера с базой данных генов.
23. Способ по пп.1-3, в котором лечение включат введение пациенту терапевтически эффективного количества того же или другого ингибитора FGFR3.
24. Способ по пп.1 и 2, в котором лечение предназначено для клеточного пролиферативного нарушения.
25. Способ по пп.1-5 или 9-10, в котором лечение предназначено для неопластического заболевания.
26. Способ по пп.1-5 или 9-10, в котором лечение предназначено для множественной миеломы.
27. Способ по пп.1-5 или 9-10, в котором лечение предназначено для множественной миеломы t (4; 14).
28. Способ по пп.1-4, 7 или 9-10, в котором ингибитор выбран из группы, состоящей из CHIR-258, SU-5402 и PD-173074.
29. Способ по пп.1-4, 7 или 9-10, в котором ингибитор представляет собой CHIR-258.
30. Способ по пп.1-10, в котором биомаркер выбран из группы, состоящей из CCL3, LOC150271, CD48, DUSP4 и ITGB7.
31. Способ по пп.1-10, в котором биомаркер выбран из группы, состоящей из LOC150271, CD48, DUSP4 и ITGB7.
32. Способ по пп.1-10, в котором биомаркер представляет собой CCL3.
33. Способ по пп.1-10, в котором биомаркер не является CCL3.
34. Способ по пп.1, 3 или 5, далее включающий установление у пациента исходного уровня перед введением ингибитора FGFR3.
35. Способ по пп.3 и 4, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.II, является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
36. Способ по пп.3 и 4, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.III, является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
37. Способ по пп.3 и 4, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.IV, является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
38. Способ по пп.3 и 4, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.V, является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
39. Способ по пп.3 и 4, в котором детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере двух биомаркеров, выбранных из подгруппы табл.I, представленной табл.II, является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
40. Способ по п.3, в котором стадию введения повторяют перед стадией тестирования образца, полученного от пациента.
41. Способ по п.3, в котором ингибитор FGFR3 вводят в терапевтически эффективном количестве.
42. Способ по п.5, в котором благоприятное изменение уровня экспрессии включает изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.II.
43. Способ по п.5, в котором благоприятное изменение уровня экспрессии включает изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.III.
44. Способ по п.5, в котором благоприятное изменение уровня экспрессии включает изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.IV.
45. Способ по п.5, в котором благоприятное изменение уровня экспрессии включает изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.V.
46. Способ по п.5, в котором благоприятное изменение уровня экспрессии включает изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере двух биомаркеров, выбранных из подгруппы табл.I, представленной табл.II.
47. Способ по п.5, в котором каждый, исходный ингибитор и позднее введенный ингибитор, выбраны из группы, состоящей из CHIR-258, SU-5402 и PD-173074.
48. Способ по п.5, в котором исходный ингибитор представляет собой CHIR-258.
49. Способ по п.5, в котором позднее введенный ингибитор представляет собой CHIR-258.
50. Применение агента, который изменяет уровень экспрессии по сравнению с исходным уровнем биомаркера, идентифицированного в табл.I, для изготовлении лекарственного препарата для лечения патологий, ассоциированных с множественной миеломой.
51. Способ по п.6, в котором изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера выбрано из подгруппы табл.I, представленной табл.II.
52. Способ по п.6, в котором изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера выбрано из подгруппы табл.I, представленной табл.III.
53. Способ по п.6, в котором изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера выбрано из подгруппы табл.I, представленной табл.IV.
54. Способ по п.6, в котором изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера выбрано из подгруппы табл.I, представленной табл.V.
55. Способ по п.6, в котором изменение по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере двух биомаркеров выбрано из подгруппы табл.I, представленной табл.II.
56. Способ по п.6, в котором агент представляет собой CHIR-258.
57. Способ по п.6, в котором пациент представляет собой пациента с t (4:14) множественной миеломой.
58. Способ по п.7, в котором контролируют экспрессию гена для по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.II.
59. Способ по п.7, в котором контролируют экспрессию гена для по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.III.
60. Способ по п.7, в котором контролируют экспрессию гена для по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.IV.
61. Способ по п.7, в котором контролируют экспрессию гена для по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из подгруппы табл.I, представленной табл.V.
62. Способ по п.7, в котором контроль включает контактирование образца с чипом генов, включающим биомаркеры из любой из табл.I-V, и сравнение уровня экспрессии гена биомаркера с базой данных генов.
63. Способ по п.10, в котором биомаркер выбран из табл.I.
64. Способ выявления пациента для лечения, заключающийся во:
введении пациенту количества ингибитора FGFR3, и
тестировании образца, полученного от пациента после введения ингибитора, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из группы, состоящей из CCL3, DUSP6, ANXA9, CR2, AL531683, ZNF589, AW274468, FRMD3, LTB и WDR42A,
причем детекция изменения уровня экспрессии по сравнению с исходным уровнем по меньшей мере одного биомаркера является показателем того, что пациент является кандидатом на лечение.
65. Способ контроля ответа пациента на лечение ингибитором FGFR3 при клеточном пролиферативном заболевании, заключающийся в:
тестировании образца, полученного от пациента, с целью измерения экспрессии гена по меньшей мере одного биомаркера, выбранного из группы, состоящей из CCL3, DUSP6, ANXA9, CR2, AL531683, ZNF589, AW274468, FRMD3, LTB и WDR42A,
причем детекция изменения уровня экспрессии по меньшей мере одного биомаркера по сравнению с исходным уровнем является показателем благоприятного ответа пациента на лечение.
66. Способ по пп.1-10, в котором биомаркер не является каким-либо или всеми из CCL3, DUSP6, ANXA9, CR2, AL531683, ZNF589, AW274468, FRMD3, LTB и WDR42A.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US74894405P | 2005-12-08 | 2005-12-08 | |
| US60/748,944 | 2005-12-08 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2008127252A true RU2008127252A (ru) | 2010-01-20 |
Family
ID=37876018
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2008127252/14A RU2008127252A (ru) | 2005-12-08 | 2006-12-07 | Эффекты ингибиторов fgfr3 на транскрипцию генов |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US8158360B2 (ru) |
| EP (2) | EP1960547A2 (ru) |
| JP (1) | JP2009523410A (ru) |
| KR (1) | KR20080080525A (ru) |
| CN (1) | CN101326292A (ru) |
| AU (1) | AU2006321602B2 (ru) |
| BR (1) | BRPI0619548A2 (ru) |
| CA (1) | CA2630597A1 (ru) |
| RU (1) | RU2008127252A (ru) |
| WO (1) | WO2007067968A2 (ru) |
Families Citing this family (46)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US9075066B2 (en) * | 2008-04-21 | 2015-07-07 | Korea Research Institute Of Bioscience And Biotechnology | CST1, DCC1, IFITM1 or MELK as markers for diagnosing stomach cancer |
| MX2010011959A (es) * | 2008-04-29 | 2010-11-30 | Novartis Ag | Metodos para monitorear la modulacion de la actividad de cinasa del receptor del factor de crecimiento de fibroblastos y uso de dichos metodos. |
| WO2009144311A1 (en) * | 2008-05-29 | 2009-12-03 | Vib Vzw | Minichromosome maintenance complex interacting protein involved in cancer |
| US20120041274A1 (en) * | 2010-01-07 | 2012-02-16 | Myriad Genetics, Incorporated | Cancer biomarkers |
| US20130149320A1 (en) * | 2010-05-31 | 2013-06-13 | Centre National De La Recherche Scientifique | Asf1b as a Prognosis Marker and Therapeutic Target in Human Cancer |
| WO2012015765A2 (en) | 2010-07-27 | 2012-02-02 | Genomic Health, Inc. | Method for using gene expression to determine prognosis of prostate cancer |
| CA2807552A1 (en) | 2010-08-06 | 2012-02-09 | Moderna Therapeutics, Inc. | Engineered nucleic acids and methods of use thereof |
| EP4108671B1 (en) | 2010-10-01 | 2024-11-20 | ModernaTX, Inc. | Modified nucleosides, nucleotides, and nucleic acids, and uses thereof |
| EP2639305A4 (en) * | 2010-11-11 | 2014-04-23 | Sysmex Corp | MARKERS FOR IDENTIFYING HUMAN FOLLICULAR HELPER T CELLS AND PROCEDURE FOR IDENTIFYING HUMAN FOLLICULAR HELPER T CELLS |
| US8710200B2 (en) | 2011-03-31 | 2014-04-29 | Moderna Therapeutics, Inc. | Engineered nucleic acids encoding a modified erythropoietin and their expression |
| US9464124B2 (en) | 2011-09-12 | 2016-10-11 | Moderna Therapeutics, Inc. | Engineered nucleic acids and methods of use thereof |
| ES2911677T3 (es) | 2011-10-03 | 2022-05-20 | Modernatx Inc | Nucleósidos, nucleótidos y ácidos nucleicos modificados, y sus usos |
| US9206128B2 (en) | 2011-11-18 | 2015-12-08 | Constellation Pharmaceuticals, Inc. | Modulators of methyl modifying enzymes, compositions and uses thereof |
| MX2014007233A (es) | 2011-12-16 | 2015-02-04 | Moderna Therapeutics Inc | Composiciones de nucleosidos, nucleotidos y acidos nucleicos modificados. |
| US9085583B2 (en) | 2012-02-10 | 2015-07-21 | Constellation—Pharmaceuticals, Inc. | Modulators of methyl modifying enzymes, compositions and uses thereof |
| US9283287B2 (en) | 2012-04-02 | 2016-03-15 | Moderna Therapeutics, Inc. | Modified polynucleotides for the production of nuclear proteins |
| US9572897B2 (en) | 2012-04-02 | 2017-02-21 | Modernatx, Inc. | Modified polynucleotides for the production of cytoplasmic and cytoskeletal proteins |
| WO2013151663A1 (en) | 2012-04-02 | 2013-10-10 | modeRNA Therapeutics | Modified polynucleotides for the production of membrane proteins |
| US9878056B2 (en) | 2012-04-02 | 2018-01-30 | Modernatx, Inc. | Modified polynucleotides for the production of cosmetic proteins and peptides |
| MX369550B (es) * | 2012-09-27 | 2019-11-12 | Chugai Pharmaceutical Co Ltd | Gen de fusion del receptor de factor de crecimiento de fibroblastos 3 (fgfr3) y medicamentos farmaceutico para tratar el mismo. |
| PT2922554T (pt) | 2012-11-26 | 2022-06-28 | Modernatx Inc | Arn modificado nas porções terminais |
| US8980864B2 (en) | 2013-03-15 | 2015-03-17 | Moderna Therapeutics, Inc. | Compositions and methods of altering cholesterol levels |
| US9745305B2 (en) | 2013-03-15 | 2017-08-29 | Constellation Pharmaceuticals, Inc. | Modulators of methyl modifying enzymes, compositions and uses thereof |
| WO2015023915A1 (en) | 2013-08-15 | 2015-02-19 | Constellation Pharmaceuticals, Inc. | Indole derivatives as modulators of methyl modifying enzymes, compositions and uses thereof |
| WO2015051214A1 (en) | 2013-10-03 | 2015-04-09 | Moderna Therapeutics, Inc. | Polynucleotides encoding low density lipoprotein receptor |
| AU2015321626B2 (en) * | 2014-09-26 | 2021-12-16 | Janssen Pharmaceutica Nv | Use of FGFR mutant gene panels in identifying cancer patients that will be responsive to treatment with an FGFR inhibitor |
| ES2911415T3 (es) | 2015-06-08 | 2022-05-19 | Arquer Diagnostics Ltd | Métodos y kits |
| US11519916B2 (en) | 2015-06-08 | 2022-12-06 | Arquer Diagnostics Limited | Methods for analysing a urine sample |
| US10577350B2 (en) | 2015-08-28 | 2020-03-03 | Constellation Pharmaceuticals, Inc. | Crystalline forms of (R)-N-((4-methoxy-6-methyl-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)methyl)-2-methyl-1-(1-(1-(2,2,2-trifluoroethyl)piperidin-4-yl)ethyl)-1H-indole-3-carboxamide |
| PL3432916T3 (pl) | 2016-09-13 | 2020-04-30 | Allergan, Inc. | Niebiałkowo stabilzowane kompozycje toksyny clostridium |
| WO2018075598A1 (en) | 2016-10-19 | 2018-04-26 | Constellation Pharmaceuticals, Inc. | Synthesis of inhibitors of ezh2 |
| CA3060443A1 (en) | 2017-04-19 | 2018-10-25 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Immune cells expressing engineered antigen receptors |
| CN107254474B (zh) * | 2017-06-16 | 2019-11-01 | 江苏省农业科学院 | 海岛棉跨膜蛋白基因、引物及其应用 |
| CN107760765A (zh) * | 2017-11-29 | 2018-03-06 | 河南农业大学 | 一种检测猪add2基因表达量的方法及应用 |
| CN108330094B (zh) * | 2018-01-10 | 2020-04-21 | 上海晶诺生物科技有限公司 | 一种产烟酸的游离型重组耻垢分枝杆菌及其构建方法 |
| EP3755349A4 (en) | 2018-02-21 | 2021-11-17 | Board of Regents, The University of Texas System | PROCESS FOR ACTIVATION AND EXPANSION OF NATURAL KILLER CELLS AND THEIR USES |
| US12331320B2 (en) | 2018-10-10 | 2025-06-17 | The Research Foundation For The State University Of New York | Genome edited cancer cell vaccines |
| WO2020117715A1 (en) | 2018-12-03 | 2020-06-11 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Oligo-benzamide analogs and their use in cancer treatment |
| CN110218789B (zh) * | 2019-04-22 | 2022-10-04 | 曾文炳 | 一种用于预测多发性骨髓瘤患者总体生存率的基因探针组合物及试剂盒 |
| CA3141871A1 (en) * | 2019-05-31 | 2020-12-03 | Qed Therapeutics, Inc. | Methods of treating urinary system cancers |
| US10835531B1 (en) * | 2019-06-18 | 2020-11-17 | Oncology Venture ApS | Methods for predicting drug responsiveness in cancer patients |
| CN111187841A (zh) * | 2020-03-11 | 2020-05-22 | 华东医院 | 一种诊断肺腺癌的甲基化分子标志物及其应用 |
| CA3189470A1 (en) | 2020-08-21 | 2022-02-24 | Yves SABBAGH | Fgfr3 antibodies and methods of use |
| CN115873955B (zh) * | 2022-12-22 | 2024-08-23 | 复旦大学附属中山医院 | 一种用于评估顺铂治疗肺腺癌敏感性的试剂盒 |
| CN116179703B (zh) * | 2023-02-16 | 2024-11-15 | 厦门艾德生物医药科技股份有限公司 | 用于黑色素瘤预后的分子标记物及其应用 |
| CN118441051B (zh) * | 2024-05-28 | 2025-05-02 | 南通大学 | 一种与肺腺癌相关的meQTL-SNPs生物标志物及其应用 |
Family Cites Families (23)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| NL154598B (nl) | 1970-11-10 | 1977-09-15 | Organon Nv | Werkwijze voor het aantonen en bepalen van laagmoleculire verbindingen en van eiwitten die deze verbindingen specifiek kunnen binden, alsmede testverpakking. |
| US3817837A (en) | 1971-05-14 | 1974-06-18 | Syva Corp | Enzyme amplification assay |
| US3939350A (en) | 1974-04-29 | 1976-02-17 | Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Fluorescent immunoassay employing total reflection for activation |
| US3996345A (en) | 1974-08-12 | 1976-12-07 | Syva Company | Fluorescence quenching with immunological pairs in immunoassays |
| US4119105A (en) | 1977-01-31 | 1978-10-10 | Olin Corporation | Air flow limiting filter |
| US4277437A (en) | 1978-04-05 | 1981-07-07 | Syva Company | Kit for carrying out chemically induced fluorescence immunoassay |
| US4275149A (en) | 1978-11-24 | 1981-06-23 | Syva Company | Macromolecular environment control in specific receptor assays |
| US4366241A (en) | 1980-08-07 | 1982-12-28 | Syva Company | Concentrating zone method in heterogeneous immunoassays |
| US5143854A (en) | 1989-06-07 | 1992-09-01 | Affymax Technologies N.V. | Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof |
| US6040138A (en) | 1995-09-15 | 2000-03-21 | Affymetrix, Inc. | Expression monitoring by hybridization to high density oligonucleotide arrays |
| US5412087A (en) | 1992-04-24 | 1995-05-02 | Affymax Technologies N.V. | Spatially-addressable immobilization of oligonucleotides and other biological polymers on surfaces |
| US6114114A (en) | 1992-07-17 | 2000-09-05 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | Comparative gene transcript analysis |
| US5578832A (en) | 1994-09-02 | 1996-11-26 | Affymetrix, Inc. | Method and apparatus for imaging a sample on a device |
| US5631734A (en) | 1994-02-10 | 1997-05-20 | Affymetrix, Inc. | Method and apparatus for detection of fluorescently labeled materials |
| US5795716A (en) | 1994-10-21 | 1998-08-18 | Chee; Mark S. | Computer-aided visualization and analysis system for sequence evaluation |
| US6138605A (en) | 1998-08-05 | 2000-10-31 | Seascape Systems Limited | Access and evacuation apparatus with articulated arm |
| ES2334641T3 (es) | 2000-09-01 | 2010-03-15 | Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. | Derivados aza heterociclicos y su uso terapeutico. |
| US20030028018A1 (en) | 2000-09-11 | 2003-02-06 | Chiron Coporation | Quinolinone derivatives |
| ES2250480T3 (es) | 2000-09-11 | 2006-04-16 | Chiron Corporation | Derivados de quinolinona como inhibidores de tirosina quinasa. |
| EP1461448A2 (en) * | 2001-11-07 | 2004-09-29 | The Board Of Trustees Of The University Of Arkansas | Diagnosis prognosis and identification of potential therapeutic targets of multiple myeloma based on gene expression profiling |
| BR0313743A (pt) | 2002-08-23 | 2005-07-05 | Chiron Corp | Benzimidazol quinolinonas e usos destas |
| US7838527B2 (en) | 2002-11-13 | 2010-11-23 | Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. | Methods of treating cancer and related methods |
| CA2544186A1 (en) | 2003-11-07 | 2005-05-26 | Chiron Corporation | Inhibition of fgfr3 and treatment of multiple myeloma with benzimidazole quinolinones |
-
2006
- 2006-12-07 EP EP06840156A patent/EP1960547A2/en not_active Withdrawn
- 2006-12-07 KR KR1020087013675A patent/KR20080080525A/ko not_active Ceased
- 2006-12-07 BR BRPI0619548-2A patent/BRPI0619548A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2006-12-07 CA CA002630597A patent/CA2630597A1/en not_active Abandoned
- 2006-12-07 RU RU2008127252/14A patent/RU2008127252A/ru not_active Application Discontinuation
- 2006-12-07 CN CNA2006800463011A patent/CN101326292A/zh active Pending
- 2006-12-07 US US12/096,222 patent/US8158360B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2006-12-07 JP JP2008544659A patent/JP2009523410A/ja active Pending
- 2006-12-07 EP EP12163693A patent/EP2546359A1/en not_active Withdrawn
- 2006-12-07 AU AU2006321602A patent/AU2006321602B2/en not_active Ceased
- 2006-12-07 WO PCT/US2006/061766 patent/WO2007067968A2/en not_active Ceased
-
2012
- 2012-02-21 US US13/400,833 patent/US20120149714A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP2546359A1 (en) | 2013-01-16 |
| BRPI0619548A2 (pt) | 2011-10-04 |
| AU2006321602A1 (en) | 2007-06-14 |
| US20090048266A1 (en) | 2009-02-19 |
| CN101326292A (zh) | 2008-12-17 |
| AU2006321602B2 (en) | 2012-03-08 |
| CA2630597A1 (en) | 2007-06-14 |
| WO2007067968A3 (en) | 2007-08-23 |
| KR20080080525A (ko) | 2008-09-04 |
| US20120149714A1 (en) | 2012-06-14 |
| EP1960547A2 (en) | 2008-08-27 |
| US8158360B2 (en) | 2012-04-17 |
| WO2007067968A2 (en) | 2007-06-14 |
| JP2009523410A (ja) | 2009-06-25 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2008127252A (ru) | Эффекты ингибиторов fgfr3 на транскрипцию генов | |
| Wasko et al. | Tumour-selective activity of RAS-GTP inhibition in pancreatic cancer | |
| US11598776B2 (en) | Biomarkers for predicting and assessing responsiveness of thyroid and kidney cancer subjects to lenvatinib compounds | |
| Hu et al. | The glutamate hypothesis of schizophrenia: evidence from human brain tissue studies | |
| Belzeaux et al. | GPR56/ADGRG1 is associated with response to antidepressant treatment | |
| Navrazhina et al. | Interleukin‐17RA blockade by brodalumab decreases inflammatory pathways in hidradenitis suppurativa skin and serum | |
| Zhang et al. | Circulating CCL20: a potential biomarker for active vitiligo together with the number of Th1/17 cells | |
| Iwamoto et al. | Gene expression profiling in schizophrenia and related mental disorders | |
| Dooley et al. | Val66Met BDNF polymorphism as a vulnerability factor for inflammation-associated depressive symptoms in women with breast cancer | |
| Selgrad et al. | JC virus infects the enteric glia of patients with chronic idiopathic intestinal pseudo-obstruction | |
| Ahmed et al. | Protein dynamics associated with failed and rescued learning in the Ts65Dn mouse model of Down syndrome | |
| WO2009121031A4 (en) | Methods of novel therapeutic candidate identification through gene expression analysis in vascular-related diseases | |
| JP2010516678A5 (ru) | ||
| Murphy et al. | Regional, cellular and species difference of two key neuroinflammatory genes implicated in schizophrenia | |
| RU2663701C2 (ru) | Маркеры, ассоциированные с ингибиторами wnt | |
| AU2003233576A8 (en) | Novel biomarkers of tyrosine kinase inhibitor exposure and activity in mammals | |
| Thatikonda et al. | Co-targeting SOS1 enhances the antitumor effects of KRASG12C inhibitors by addressing intrinsic and acquired resistance | |
| Ceylan et al. | DNA redox modulations and global DNA methylation in bipolar disorder: Effects of sex, smoking and illness state | |
| WO2017060319A1 (en) | Gene expression biomarkers for personalized cancer care to epigenetic modifying agents | |
| Zhao et al. | Long non-coding RNA HOTAIR overexpression improves premature ovarian failure by upregulating Notch-1 expression | |
| Pena et al. | G2019S selective LRRK2 kinase inhibitor abrogates mitochondrial DNA damage | |
| Kocot et al. | Clemastine fumarate accelerates accumulation of disability in progressive multiple sclerosis by enhancing pyroptosis | |
| Fourouclas et al. | Size matters: the prognostic implications of large and small deletions of the derivative 9 chromosome in chronic myeloid leukemia | |
| Turner et al. | Detection of circulating tumor DNA following neoadjuvant chemotherapy and surgery to anticipate early relapse in ER positive and HER2 negative breast cancer: analysis from the PENELOPE‐B trial | |
| JP2006517670A5 (ru) |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20121225 |