RU2008122909A - Детекция нуклеиновых кислот способом, основанным на связывании мишенеспецифичного гибрида - Google Patents
Детекция нуклеиновых кислот способом, основанным на связывании мишенеспецифичного гибрида Download PDFInfo
- Publication number
- RU2008122909A RU2008122909A RU2008122909/13A RU2008122909A RU2008122909A RU 2008122909 A RU2008122909 A RU 2008122909A RU 2008122909/13 A RU2008122909/13 A RU 2008122909/13A RU 2008122909 A RU2008122909 A RU 2008122909A RU 2008122909 A RU2008122909 A RU 2008122909A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- dna
- rna
- nucleic acid
- target
- hybrid
- Prior art date
Links
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims abstract 37
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims abstract 37
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims abstract 37
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract 25
- 230000027455 binding Effects 0.000 title claims abstract 9
- 238000001514 detection method Methods 0.000 title abstract 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims abstract 15
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims abstract 13
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims abstract 13
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 claims abstract 10
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims abstract 10
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 claims abstract 10
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims abstract 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims abstract 3
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 claims abstract 2
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 claims abstract 2
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 claims 8
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 claims 8
- 239000011324 bead Substances 0.000 claims 6
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims 6
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 claims 3
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 claims 3
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims 3
- 238000011901 isothermal amplification Methods 0.000 claims 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims 3
- 108020004518 RNA Probes Proteins 0.000 claims 2
- 239000003391 RNA probe Substances 0.000 claims 2
- -1 polyethylene Polymers 0.000 claims 2
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims 2
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 claims 1
- 101710203526 Integrase Proteins 0.000 claims 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 claims 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 claims 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 claims 1
- 125000003172 aldehyde group Chemical group 0.000 claims 1
- 238000000149 argon plasma sintering Methods 0.000 claims 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 claims 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 claims 1
- 238000004737 colorimetric analysis Methods 0.000 claims 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 claims 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 claims 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 239000010931 gold Substances 0.000 claims 1
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 claims 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 claims 1
- 239000000463 material Substances 0.000 claims 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims 1
- 238000002493 microarray Methods 0.000 claims 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 claims 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 claims 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 claims 1
- 229920000515 polycarbonate Polymers 0.000 claims 1
- 239000004417 polycarbonate Substances 0.000 claims 1
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 claims 1
- 229920000379 polypropylene carbonate Polymers 0.000 claims 1
- 229920001296 polysiloxane Polymers 0.000 claims 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 claims 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
- C12Q1/708—Specific hybridization probes for papilloma
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Virology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Способ детекции, по крайней мере, одной нуклеиновой кислоты-мишени, включающий: ! a) формирование множества обогащенных нуклеиновых кислот-мишеней, включающее: ! i) смешивание, по крайней мере, одной нуклеиновой кислоты-мишени с нуклеиновой кислотой-зондом, комплементарным, по крайней мере, к участку, по крайней мере, одной нуклеиновой кислоты-мишени, для формирования ДНК-РНК гибрида-мишени, причем если нуклеиновая кислота-мишень является РНК, зонд является ДНК, и причем если нуклеиновая кислота-мишень является ДНК, зонд является РНК; ! ii) связывание ДНК-РНК гибрида-мишени на твердом носителе; и ! iii) удаление любой нуклеиновой кислоты, которая не образует ДНК-РНК гибрид-мишень, или которая не связана на твердом носителе, для формирования множества обогащенных нуклеиновых кислот-мишеней; ! b) амплифицирование множества обогащенных нуклеиновых кислот-мишеней из стадии а) для формирования множества амплифицированных мишеней; и ! c) детекцию, по крайней мере, одной нуклеиновой кислоты-мишени во множестве амплифицированных мишеней при ! i) смешивании множества амплифицированных мишеней с выбираемым олигонуклеотидом и нуклеиновой кислотой-зондом, причем выбираемый олигонуклеотид гибридизуется с первым участком амплифицированных мишеней и причем нуклеиновая кислота-зонд является комплементарным ко второму участку амплифицированных мишеней, причем если амплифицированная мишень является ДНК, то выбираемый олигонуклеотид и нуклеиновая кислота-зонд являются РНК, и если амплифицированная мишень является РНК, то выбираемый олигонуклеотид и нуклеиновая кислота-зонд является ДНК, для формирования комплекса ДНК-РНК гиб�
Claims (22)
1. Способ детекции, по крайней мере, одной нуклеиновой кислоты-мишени, включающий:
a) формирование множества обогащенных нуклеиновых кислот-мишеней, включающее:
i) смешивание, по крайней мере, одной нуклеиновой кислоты-мишени с нуклеиновой кислотой-зондом, комплементарным, по крайней мере, к участку, по крайней мере, одной нуклеиновой кислоты-мишени, для формирования ДНК-РНК гибрида-мишени, причем если нуклеиновая кислота-мишень является РНК, зонд является ДНК, и причем если нуклеиновая кислота-мишень является ДНК, зонд является РНК;
ii) связывание ДНК-РНК гибрида-мишени на твердом носителе; и
iii) удаление любой нуклеиновой кислоты, которая не образует ДНК-РНК гибрид-мишень, или которая не связана на твердом носителе, для формирования множества обогащенных нуклеиновых кислот-мишеней;
b) амплифицирование множества обогащенных нуклеиновых кислот-мишеней из стадии а) для формирования множества амплифицированных мишеней; и
c) детекцию, по крайней мере, одной нуклеиновой кислоты-мишени во множестве амплифицированных мишеней при
i) смешивании множества амплифицированных мишеней с выбираемым олигонуклеотидом и нуклеиновой кислотой-зондом, причем выбираемый олигонуклеотид гибридизуется с первым участком амплифицированных мишеней и причем нуклеиновая кислота-зонд является комплементарным ко второму участку амплифицированных мишеней, причем если амплифицированная мишень является ДНК, то выбираемый олигонуклеотид и нуклеиновая кислота-зонд являются РНК, и если амплифицированная мишень является РНК, то выбираемый олигонуклеотид и нуклеиновая кислота-зонд является ДНК, для формирования комплекса ДНК-РНК гибрид-мишень /олигонуклеотид/ зонд; и
ii) детекции комплекса ДНК-РНК гибрид-мишень /олигонуклеотид/ зонд посредством ДНК-РНК гибрид-специфического связывающего агента, для детекции, по крайней мере, одной нуклеиновой кислоты-мишени.
2. Способ по п.1, в котором на стадии связывания (а) твердый носитель конъюгирован с ДНК-РНК гибрид-специфическим связывающим агентом, тем самым связывая, по крайней мере, одну нуклеиновую кислоту-мишень на твердом носителе.
3. Способ по п.1, в котором ДНК-РНК гибрид-специфический связывающий агент выбран из группы, состоящей из: ДНК-РНК гибрид-специфического антитела, моноклонального или поликлонального антитела или их фрагментов, белка, каталитически неактивной рибонуклеазы Н, нуклеиновой кислоты, аптамера нуклеиновой кислоты и олигонуклеотида, и причем ДНК-РНК гибрид-специфический связывающий агент связывается с ДНК-РНК гибридом с образованием триплексной структуры.
4. Способ по п.2, в котором ДНК-РНК гибрид-специфический связывающий агент является ДНК-РНК гибрид-специфическим антителом.
5. Способ по п.2, в котором ДНК-РНК гибрид-специфический связывающий агент является нуклеиновой кислотой-зондом, комплементарным к нуклеиновой кислоте-мишени.
6. Способ по п.3, в котором ДНК-РНК гибрид-специфический связывающий агент мечен детектируемой меткой.
7. Способ по п.6, в котором метка обнаруживается методами колориметрии, хемилюминесценции, флуоресценции или светорассеивания.
8. Способ по п.1, в котором амплифицирование производится изотермической амплификацией.
9. Способ по п.8, в котором ДНК-полимераза используется в изотермической амплификации.
10. Способ по п.8, в котором случайные праймеры используется в изотермической амплификации.
11. Способ по п.10, в котором случайные праймеры являются пентамерами.
12. Способ по п.10, в котором случайные праймеры содержат субпопуляцию последовательностей праймеров, специфических для заболевания.
13. Способ по п.1, в котором выбираемые олигонуклеотиды связаны с твердым носителем.
14. Способ по п.1, в котором твердый носитель выбран из группы, состоящей из планшета, микропланшета, микротитровального планшета, предметного стекла, чашки, микрошарика, частицы, микрочастицы, стакана, нити, чипа, микрочипа, полоски, мембраны, микроматрицы и пробирки.
15. Способ по п.14, в котором твердый носитель изготовлен из материала, выбранного из группы, состоящей из: стекла, силикона, пластика, полистирола, полиэтилена, полипропилена и поликарбоната.
16. Способ по п.14, в котором твердый носитель модифицирован для содержания карбоксильной, амино, гидразидной, альдегидной группы, нуклеиновой кислоты или нуклеотидных производных, первичной аминогруппы или красителя.
17. Способ по п.1, дополнительно включающий добавление зонда-блокатора.
18. Способ детекции каждой из, по крайней мере, одной нуклеиновой кислоты-мишени, включающий:
a) гибридизацию, по крайней мере, одной нуклеиновой кислоты-мишени с нуклеиновой кислотой-зондом, комплементарным, по крайней мере, к участку нуклеиновой кислоты-мишени, для формирования ДНК-РНК гибрида-мишени, причем если нуклеиновая кислота-мишень является РНК, зонд является ДНК, и причем если нуклеиновая кислота-мишень является ДНК, зонд является РНК;
b) связывание ДНК-РНК гибрида-мишени ДНК-РНК гибрид-специфическим антителом, конъюгированным с твердым носителем;
c) отделение несвязанной нуклеиновой кислоты-мишени от захваченного ДНК-РНК гибрида-мишени;
d) амплифицирование связанного ДНК-РНК гибрида-мишени для формирования множества амплифицированных мишеней, причем в амплифицировании используют случайные праймеры и ДНК-полимераза;
e) гибридизацию нуклеиновой кислоты-зонда, комплементарного к первому участку амплифицированных мишеней, для формирования амплифицированного гибрида ДНК-РНК;
f) гибридизацию олигонуклеотида, конъюгированного с твердым носителем, со вторым участком амплифицированного гибрида ДНК-РНК, причем твердый носитель является выбираемым; и
g) выбор амплифицированного гибрида ДНК-РНК при помощи выбираемого твердого носителя; и
h) детекцию, по крайней мере, одной амплифицированной нуклеиновой кислоты-мишени путем связывания ДНК-РНК гибрид-специфического связывающего агента с амплифицированным гибридом ДНК-РНК, причем присутствие амплифицированного гибрида ДНК-РНК указывает на присутствие нуклеиновой кислоты-мишени.
19. Способ по п.18, в котором твердый носитель, конъюгированный с олигонуклеотидами, является отличимым микрошариком.
20. Способ по п.19, в котором отличимый микрошарик имеет детектируемую метку, выбранную из группы, состоящей из флуоресцентной метки, метки золотом и ферментативной метки.
21. Мультиплексный способ детекции, по крайней мере, одной ДНК-мишени, включающий:
a) гибридизацию, по крайней мере, одной ДНК-мишени, по крайней мере, с одним первым РНК-зондом, который является комплементарным, по крайней мере, к участку, по крайней мере, одной ДНК-мишени, для формирования, по крайней мере, одного ДНК-РНК гибрида;
b) связывание, по крайней мере, одного ДНК-РНК гибрида, по крайней мере, одним ДНК-РНК гибрид-специфическим антителом, конъюгированным с микрошариком;
c) отделение несвязанной нуклеиновой кислоты от, по крайней мере, одного ДНК-РНК гибрида для формирования, по крайней мере, одной обогащенной мишени;
d) амплифицирование, по крайней мере, одной обогащенной ДНК-мишени для формирования, по крайней мере, одной амплифицированной ДНК-мишени с использованием случайных праймеров и ДНК-полимеразы;
e) гибридизацию второго РНК-зонда, комплементарного к первому участку амплифицированной ДНК-мишени, для формирования амплифицированного ДНК-РНК гибрида;
f) гибридизацию ДНК-олигонуклеотида со вторым участком амплифицированной(ых) ДНК-мишени(ей), причем ДНК-олигонуклеотид конъюгирован, по крайней мере, с одним выбираемым микрошариком; и
g) детекцию, по крайней мере, одной амплифицированной ДНК-мишени посредством связывания ДНК-РНК гибрид-специфического антитела с амплифицированным ДНК-РНК гибридом и выбор амплифицированной мишени на основе конкретного выбираемого микрошарика.
22. Способ по п.1, в котором нуклеиновые кислоты-зонды, комплементарные, по крайней мере, к участку нуклеиновой кислоты-мишени, и последовательности олигонуклеотидов включают SEQ ID NO:1.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US11/269,003 US7601497B2 (en) | 2000-06-15 | 2005-11-07 | Detection of nucleic acids by target-specific hybrid capture method |
| US11/269,003 | 2005-11-07 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2008122909A true RU2008122909A (ru) | 2009-12-20 |
| RU2437939C2 RU2437939C2 (ru) | 2011-12-27 |
Family
ID=38024066
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2008122909/10A RU2437939C2 (ru) | 2005-11-07 | 2006-11-07 | Детекция нуклеиновых кислот способом, основанным на связывании мишенеспецифичного гибрида |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (3) | US7601497B2 (ru) |
| EP (1) | EP1948832B1 (ru) |
| KR (1) | KR101334645B1 (ru) |
| CN (1) | CN101351564B (ru) |
| AU (1) | AU2006311288B2 (ru) |
| BR (1) | BRPI0801480B1 (ru) |
| CA (1) | CA2629978C (ru) |
| MX (1) | MX2008007192A (ru) |
| RU (1) | RU2437939C2 (ru) |
| WO (1) | WO2007056723A2 (ru) |
Families Citing this family (77)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2002508190A (ja) * | 1997-12-12 | 2002-03-19 | ダイジーン・コーポレーション | 万能収集媒質 |
| US7439016B1 (en) * | 2000-06-15 | 2008-10-21 | Digene Corporation | Detection of nucleic acids by type-specific hybrid capture method |
| US7601497B2 (en) | 2000-06-15 | 2009-10-13 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Detection of nucleic acids by target-specific hybrid capture method |
| US8224776B1 (en) | 2000-07-26 | 2012-07-17 | Kdl Scan Designs Llc | Method and system for hosting entity-specific photo-sharing websites for entity-specific digital cameras |
| US7354719B2 (en) | 2004-12-08 | 2008-04-08 | Gen-Probe Incorporated | Detection of nucleic acids from multiple types of human papillomaviruses |
| EP2479291A1 (en) * | 2005-10-27 | 2012-07-25 | Life Technologies Corporation | Nucleic acid amplification using non-random primers |
| EP1957645B1 (en) | 2005-12-06 | 2010-11-17 | Ambion Inc. | Reverse transcription primers and methods of design |
| EP1963531B1 (en) | 2005-12-23 | 2011-09-21 | Nanostring Technologies, Inc. | Nanoreporters and methods of manufacturing and use thereof |
| US11237171B2 (en) | 2006-02-21 | 2022-02-01 | Trustees Of Tufts College | Methods and arrays for target analyte detection and determination of target analyte concentration in solution |
| US8460879B2 (en) | 2006-02-21 | 2013-06-11 | The Trustees Of Tufts College | Methods and arrays for target analyte detection and determination of target analyte concentration in solution |
| AU2006341730B2 (en) * | 2006-04-11 | 2013-04-11 | Bio-Rad Innovations | HPV detection and quantification by real-time multiplex amplification |
| US20080311628A1 (en) * | 2006-10-03 | 2008-12-18 | Ghc Technologies, Inc. | Methods and compositions for rapid amplification and capture of nucleic acid sequences |
| CN101730847B (zh) * | 2007-04-05 | 2015-03-18 | 分类生物系统有限公司 | 组合物及检测方法 |
| WO2008143972A2 (en) * | 2007-05-18 | 2008-11-27 | Advandx, Inc. | Detection of methicillin-resistant staphylococcus aureus |
| JP5503540B2 (ja) | 2007-08-30 | 2014-05-28 | トラスティーズ・オブ・タフツ・カレッジ | 溶液中の分析物濃度を決定する方法 |
| US8877141B2 (en) * | 2007-09-06 | 2014-11-04 | Qiagen Sciences Llc | System for preparing arrays of biomolecules |
| US20090298187A1 (en) * | 2008-04-17 | 2009-12-03 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Compositions, methods, and kits using synthetic probes for determining the presence of a target nucleic acid |
| EP2279265B1 (en) | 2008-04-24 | 2014-08-27 | NewSouth Innovations Pty Limited | Cyanobacteria saxitoxin gene cluster and detection of cyanotoxic organisms |
| US8538879B2 (en) * | 2008-05-14 | 2013-09-17 | Metabank | System, program product, and computer-implemented method for loading a loan on an existing pre-paid card |
| TWI394839B (zh) | 2008-10-27 | 2013-05-01 | Qiagen Gaithersburg Inc | 快速結果雜交捕捉法及系統 |
| EP2382324A1 (en) * | 2008-12-30 | 2011-11-02 | STMicroelectronics S.r.l. | Method, microreactor and apparatus for carrying out real-time nucleic acid amplification |
| US20100285473A1 (en) * | 2009-01-27 | 2010-11-11 | John Wolff | Thermophilic helicase dependent amplification technology with endpoint homogenous fluorescent detection |
| JP5738278B2 (ja) * | 2009-05-01 | 2015-06-24 | キアジェン ゲイサーズバーグ インコーポレイテッド | 試料中のｒｎａスプライシング形態を検出するための非標的増幅法 |
| WO2011028974A1 (en) * | 2009-09-03 | 2011-03-10 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Methods and kits for determining viral load in clinical samples |
| AU2010291990B2 (en) * | 2009-09-14 | 2016-05-05 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Compositions and methods for recovery of nucleic acids or proteins from tissue samples fixed in cytology media |
| US8282895B2 (en) * | 2009-09-15 | 2012-10-09 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Reagent cabinet system |
| CN102115737B (zh) * | 2009-12-31 | 2015-06-03 | 深圳迈瑞生物医疗电子股份有限公司 | 稳定碱性磷酸酶或其标记物的试剂和方法 |
| WO2011082415A2 (en) * | 2010-01-04 | 2011-07-07 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Methods, compositions, and kits for recovery of nucleic acids or proteins from fixed tissue samples |
| AU2011204313A1 (en) | 2010-01-08 | 2012-07-26 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Materials and methods for isothermal nucleic acid amplification |
| US9605303B2 (en) * | 2010-01-29 | 2017-03-28 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Method of determining and confirming the presence of an HPV in a sample |
| EP2528932B1 (en) * | 2010-01-29 | 2016-11-30 | QIAGEN Gaithersburg, Inc. | Methods and compositions for sequence-specific purification and multiplex analysis of nucleic acids |
| EP2531612A1 (en) * | 2010-02-05 | 2012-12-12 | Institute for Systems Biology | Methods and compositions for profiling rna molecules |
| US20110195457A1 (en) * | 2010-02-09 | 2011-08-11 | General Electric Company | Isothermal amplification of nucleic acid using primers comprising a randomized sequence and specific primers and uses thereof |
| EP2542890B1 (en) | 2010-03-01 | 2015-05-06 | Quanterix Corporation | Methods for extending dynamic range in assays for the detection of molecules or particles |
| US8415171B2 (en) | 2010-03-01 | 2013-04-09 | Quanterix Corporation | Methods and systems for extending dynamic range in assays for the detection of molecules or particles |
| US8236574B2 (en) | 2010-03-01 | 2012-08-07 | Quanterix Corporation | Ultra-sensitive detection of molecules or particles using beads or other capture objects |
| CA2799200A1 (en) | 2010-05-19 | 2011-11-24 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Methods and compositions for sequence-specific purification and multiplex analysis of nucleic acids |
| EP2576840B1 (en) | 2010-05-25 | 2018-10-17 | QIAGEN Gaithersburg, Inc. | Fast results hybrid capture assay and associated strategically-truncated probes |
| CN102269761A (zh) | 2010-06-04 | 2011-12-07 | 深圳迈瑞生物医疗电子股份有限公司 | 一种碱性磷酸酶结合物的合成工艺 |
| EP2601307A4 (en) | 2010-08-06 | 2014-01-01 | Capitalbio Corp | MICROARRAY TEST WITH PARTICLES FOR THE ANALYSIS OF MOLECULAR INTERACTIONS |
| WO2012055069A1 (en) * | 2010-10-27 | 2012-05-03 | Capitalbio Corporation | Luminophore-labeled molecules coupled with particles for microarray-based assays |
| KR20120072702A (ko) * | 2010-12-24 | 2012-07-04 | 주식회사 메디센서김해 | 호흡기 바이러스의 다중 동시 진단 장치 및 이를 이용한 진단 방법 |
| CA2823627C (en) | 2011-01-07 | 2021-05-11 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Materials and methods for genotyping and quantifying a high-risk human papillomavirus |
| US9952237B2 (en) | 2011-01-28 | 2018-04-24 | Quanterix Corporation | Systems, devices, and methods for ultra-sensitive detection of molecules or particles |
| US9885092B2 (en) | 2011-02-24 | 2018-02-06 | Qiagen Gaithersburg Inc. | Materials and methods for detection of HPV nucleic acids |
| US20140302532A1 (en) | 2011-04-12 | 2014-10-09 | Quanterix Corporation | Methods of determining a treatment protocol for and/or a prognosis of a patient's recovery from a brain injury |
| DK3246416T3 (da) | 2011-04-15 | 2024-09-02 | Univ Johns Hopkins | Sikkert sekventeringssystem |
| WO2013024763A1 (ja) * | 2011-08-12 | 2013-02-21 | 独立行政法人理化学研究所 | 核酸アプタマーの作製方法 |
| US9777264B2 (en) | 2011-11-03 | 2017-10-03 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Materials and method for immobilizing, isolating, and concentrating cells using carboxylated surfaces |
| EP2785865A1 (en) * | 2011-12-02 | 2014-10-08 | Qiagen GmbH | Method and kit for characterizing rna in a composition |
| US9803237B2 (en) | 2012-04-24 | 2017-10-31 | California Institute Of Technology | Slip-induced compartmentalization |
| WO2013164319A1 (en) * | 2012-04-30 | 2013-11-07 | Qiagen Gmbh | Targeted dna enrichment and sequencing |
| US20150141259A1 (en) * | 2012-06-07 | 2015-05-21 | Somalogic, Inc. | Aptamer-Based Multiplexed Assays |
| WO2014032990A1 (en) * | 2012-08-30 | 2014-03-06 | Qiagen Gmbh | Method of determining the presence or absence of a target nucleic acid in a cell sample |
| ES2886507T5 (es) | 2012-10-29 | 2024-11-15 | Univ Johns Hopkins | Prueba de Papanicolaou para cánceres de ovario y de endometrio |
| JP6178430B2 (ja) * | 2012-12-27 | 2017-08-09 | シージーン アイエヌシー | Ｐｔｏ切断及び延長依存的非ハイブリダイゼーションアッセイによるターゲット核酸配列の検出 |
| WO2014113502A1 (en) | 2013-01-15 | 2014-07-24 | Quanterix Corporation | Detection of dna or rna using single molecule arrays and other techniques |
| CN103525942A (zh) * | 2013-10-31 | 2014-01-22 | 武汉中帜生物科技有限公司 | 一种rna扩增与杂交捕获法相结合的检测核酸方法 |
| BR112016010165A2 (pt) | 2013-11-21 | 2017-12-05 | Somalogic Inc | composições de nucleotídeos modificados de citidina-5-carboxamida e métodos relacionados às mesmas |
| AU2014368927B2 (en) | 2013-12-20 | 2018-10-25 | Biomed Valley Discoveries, Inc. | Cancer treatments using combinations of CDK and ERK inhibitors |
| EP3082779B1 (en) | 2013-12-20 | 2023-06-07 | Biomed Valley Discoveries, Inc. | Cancer treatments using combinations of type 2 mek and erk inhibitors |
| US11007183B2 (en) | 2013-12-20 | 2021-05-18 | Biomed Valley Discoveries, Inc. | Cancer treatments using combinations of PI3K/Akt pathway and ERK inhibitors |
| RU2722784C2 (ru) | 2013-12-20 | 2020-06-03 | Байомед Вэлли Дискавериз, Инк. | Лечение злокачественных опухолей с применением комбинаций ингибиторов erk и raf |
| WO2015095842A2 (en) | 2013-12-20 | 2015-06-25 | Biomed Valley Discoveries, Inc. | Methods and compositions for treating non-erk mapk pathway inhibitor-resistant cancers |
| KR101589483B1 (ko) * | 2014-02-21 | 2016-01-28 | 디엑스진주식회사 | 핵산과 신호 프로브의 비대칭 등온증폭을 이용한 핵산의 검출방법 |
| CN105368982B (zh) | 2014-08-28 | 2019-01-29 | 杭州德同生物技术有限公司 | 一种高危型人乳头瘤病毒检测及分型方法 |
| CN107002140A (zh) * | 2014-09-26 | 2017-08-01 | 双孔人公司 | 通过合成探针的纳米孔隙探测的靶序列检测 |
| WO2016168640A1 (en) | 2015-04-16 | 2016-10-20 | William Marsh Rice University | Stoichiometric tuning of nucleic acid hybridization probes by auxiliary oligonucleotide species |
| WO2017027653A1 (en) | 2015-08-11 | 2017-02-16 | The Johns Hopkins University | Assaying ovarian cyst fluid |
| US11486873B2 (en) | 2016-03-31 | 2022-11-01 | Ontera Inc. | Multipore determination of fractional abundance of polynucleotide sequences in a sample |
| CN111868260B (zh) | 2017-08-07 | 2025-02-21 | 约翰斯霍普金斯大学 | 用于评估和治疗癌症的方法和材料 |
| CN109613236B (zh) * | 2018-12-12 | 2022-04-15 | 安邦（厦门）生物科技有限公司 | 一种核酸杂交捕获免疫荧光检测方法、免疫荧光层析试条及试剂盒 |
| CN115516108A (zh) | 2020-02-14 | 2022-12-23 | 约翰斯霍普金斯大学 | 评估核酸的方法和材料 |
| CN114544937B (zh) * | 2020-11-11 | 2023-04-07 | 艾克发(北京)生物技术有限公司 | 一种多重信号放大系统及其在免疫吸附间接法检测中的应用 |
| WO2022162242A1 (en) | 2021-02-01 | 2022-08-04 | Wallac Oy | Lateral flow test strip readers, cartridges and related methods |
| AU2022214393A1 (en) * | 2021-02-01 | 2023-08-17 | Wallac Oy | Microwell assay plate and related methods |
| WO2024196941A1 (en) * | 2023-03-20 | 2024-09-26 | Fluid Discovery | Core-shell gel particles for separating and analyzing rna and dna from a cell |
Family Cites Families (149)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6A (en) * | 1836-08-10 | Thomas Blanchard | Machine for forming end pieces of plank blocks for ships | |
| US4732847A (en) | 1981-06-09 | 1988-03-22 | University Of Hawaii | Monoclonal antibodies for DNA-RNA hybrid complexes and their uses |
| FI63596C (fi) * | 1981-10-16 | 1983-07-11 | Orion Yhtymae Oy | Mikrobdiagnostiskt foerfarande som grundar sig pao skiktshybridisering av nukleinsyror och vid foerfarandet anvaenda kombinationer av reagenser |
| US4486536A (en) | 1982-05-28 | 1984-12-04 | Smithkline Diagnostics, Inc. | Specimen slide for occult blood testing |
| US4865980A (en) | 1982-12-29 | 1989-09-12 | University Of Hawaii | Monoclonal antibodies for DNA-RNA hybrid complexes and their uses |
| FI843529A0 (fi) | 1983-01-10 | 1984-09-10 | Gen Probe Inc | Foerfarande foer detektering, identifiering och kvantitering av organismer och virus. |
| US5288611A (en) | 1983-01-10 | 1994-02-22 | Gen-Probe Incorporated | Method for detecting, identifying, and quantitating organisms and viruses |
| US5200313A (en) * | 1983-08-05 | 1993-04-06 | Miles Inc. | Nucleic acid hybridization assay employing detectable anti-hybrid antibodies |
| US4743535A (en) | 1984-11-07 | 1988-05-10 | Miles Inc. | Hybridization assay employing labeled probe and anti-hybrid |
| EP0144914A3 (en) | 1983-12-12 | 1986-08-13 | Miles Inc. | Hybridization assay employing labeled pairs of hybrid binding reagents |
| US7138505B1 (en) | 1984-01-12 | 2006-11-21 | Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. | Factor VIII:C nucleic acid molecules |
| AU3844485A (en) | 1984-02-09 | 1985-08-15 | Enzo Biochem Inc. | Heterologous detection of cabeled dna |
| FI71768C (fi) | 1984-02-17 | 1987-02-09 | Orion Yhtymae Oy | Foerbaettrade nykleinsyrareagenser och foerfarande foer deras framstaellning. |
| CA1260372A (en) | 1984-04-27 | 1989-09-26 | Elazar Rabbani | Hybridization method for the detection of genetic materials |
| US6221581B1 (en) | 1984-04-27 | 2001-04-24 | Enzo Diagnostics, Inc. | Processes for detecting polynucleotides, determining genetic mutations or defects in genetic material, separating or isolating nucleic acid of interest from samples, and useful compositions of matter and multihybrid complex compositions |
| ZA853756B (en) | 1984-06-01 | 1986-01-29 | Miles Lab | Nucleic acid hybridization assay employing immobilized rna probes |
| CA1253777A (en) | 1984-06-01 | 1989-05-09 | Robert J. Carrico | Nucleic acid hybridization assay employing immobilized rna probes |
| IL75648A0 (en) | 1984-07-05 | 1985-10-31 | Gen Probe Inc | Accelerated nucleic acid reassociation method |
| US4563417A (en) | 1984-08-31 | 1986-01-07 | Miles Laboratories, Inc. | Nucleic acid hybridization assay employing antibodies to intercalation complexes |
| US4775619A (en) | 1984-10-16 | 1988-10-04 | Chiron Corporation | Polynucleotide determination with selectable cleavage sites |
| US4689294A (en) | 1984-11-19 | 1987-08-25 | Miles Laboratories, Inc. | Enhancement of hybridization of nucleic acids by anionic polymers |
| ES8707343A1 (es) | 1985-06-13 | 1987-07-16 | Amgen | Un metodo para aislar una secuencia de acido nucleico objetivo seleccionada |
| US5641630A (en) | 1985-06-13 | 1997-06-24 | Amgen Inc. | Method and kit for performing nucleic acid hybridization assays |
| US4751177A (en) | 1985-06-13 | 1988-06-14 | Amgen | Methods and kits for performing nucleic acid hybridization assays |
| US4868105A (en) | 1985-12-11 | 1989-09-19 | Chiron Corporation | Solution phase nucleic acid sandwich assay |
| US5750338A (en) * | 1986-10-23 | 1998-05-12 | Amoco Corporation | Target and background capture methods with amplification for affinity assays |
| US5220013A (en) | 1986-11-17 | 1993-06-15 | Scios Nova Inc. | DNA sequence useful for the detection of Alzheimer's disease |
| ES2112824T5 (es) | 1986-11-24 | 2008-03-01 | Gen-Probe Incorporated | Sondas de acidos nucleicos para deteccion y/o cuantificacion de organismos no virales. |
| AU601021B2 (en) | 1987-03-11 | 1990-08-30 | Molecular Diagnostics, Inc. | Assay for necleic acid sequences in a sample |
| IL85551A0 (en) | 1987-04-01 | 1988-08-31 | Miles Inc | Rapid hybridization assay and reagent system used therein |
| US5656731A (en) | 1987-10-15 | 1997-08-12 | Chiron Corporation | Nucleic acid-amplified immunoassay probes |
| US5359100A (en) | 1987-10-15 | 1994-10-25 | Chiron Corporation | Bifunctional blocked phosphoramidites useful in making nucleic acid mutimers |
| US5082830A (en) * | 1988-02-26 | 1992-01-21 | Enzo Biochem, Inc. | End labeled nucleotide probe |
| DE68916671T2 (de) | 1988-03-18 | 1995-03-02 | Baylor College Medicine | Mutationsnachweis durch kompetitiven Oligonukleotid-Priming. |
| US6326136B1 (en) | 1988-04-01 | 2001-12-04 | Digene Corporation | Macromolecular conjugate made using unsaturated aldehydes |
| US5374524A (en) | 1988-05-10 | 1994-12-20 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Solution sandwich hybridization, capture and detection of amplified nucleic acids |
| NO165894C (no) | 1988-05-24 | 1991-04-24 | Gunnar Paulsen | Analysemetode for gener. |
| ATE168724T1 (de) | 1988-09-29 | 1998-08-15 | Chiron Corp | Nachweis eines polynukleotids durch ersätzung einer kette an einer fangsonde |
| ATE118824T1 (de) * | 1989-03-10 | 1995-03-15 | Amoco Corp | Immobilisierte oligonukleotidsonden und ihre verwendungen. |
| US5106727A (en) * | 1989-04-27 | 1992-04-21 | Life Technologies, Inc. | Amplification of nucleic acid sequences using oligonucleotides of random sequences as primers |
| ATE174926T1 (de) | 1989-06-30 | 1999-01-15 | Chiron Corp | Hydrophobe nukleinsäure-sonde |
| US5116734A (en) | 1989-09-01 | 1992-05-26 | Digene Diagnostics, Inc. | Highly sensitive method for detecting peroxidase |
| WO1991008312A1 (en) | 1989-12-01 | 1991-06-13 | Gene-Trak Systems | Detection of hpv transcripts |
| US5629153A (en) | 1990-01-10 | 1997-05-13 | Chiron Corporation | Use of DNA-dependent RNA polymerase transcripts as reporter molecules for signal amplification in nucleic acid hybridization assays |
| US5792606A (en) | 1990-02-26 | 1998-08-11 | Boehringer Mannheim Gmbh | Nucleic acid hybridization based assay for determining a substance of interest |
| CA2039517C (en) | 1990-04-03 | 2006-11-07 | David Segev | Dna probe signal amplification |
| US5695926A (en) | 1990-06-11 | 1997-12-09 | Bio Merieux | Sandwich hybridization assays using very short capture probes noncovalently bound to a hydrophobic support |
| US5484699A (en) | 1990-09-28 | 1996-01-16 | Abbott Laboratories | Nucleotide sequences useful as type specific probes, PCR primers and LCR probes for the amplification and detection of human papilloma virus, and related kits and methods |
| WO1992008808A1 (en) | 1990-11-14 | 1992-05-29 | Siska Diagnostics, Inc. | Non-isotopic detection of nucleic acids using a polystyrene support-based sandwich hybridization assay and compositions useful therefor |
| US5556748A (en) | 1991-07-30 | 1996-09-17 | Xenopore Corporation | Methods of sandwich hybridization for the quantitative analysis of oligonucleotides |
| US5981179A (en) | 1991-11-14 | 1999-11-09 | Digene Diagnostics, Inc. | Continuous amplification reaction |
| EP0667918B1 (en) * | 1991-11-14 | 2000-02-16 | Digene Diagnostics, Inc. | Non-radioactive hybridization assay and kit |
| ATE199158T1 (de) | 1991-12-23 | 2001-02-15 | Bayer Ag | Hbv amplifizierungssonden zur verwendung in hybridisierungssandwichassay in der lösungsphase |
| US5747244A (en) | 1991-12-23 | 1998-05-05 | Chiron Corporation | Nucleic acid probes immobilized on polystyrene surfaces |
| US5424413A (en) | 1992-01-22 | 1995-06-13 | Gen-Probe Incorporated | Branched nucleic acid probes |
| ES2126002T3 (es) * | 1992-09-15 | 1999-03-16 | Dow Chemical Co | Modificacion de la resistencia al choque de termoplasticos. |
| EP0625213B1 (en) | 1992-10-09 | 1999-12-29 | VYSIS, Inc. | Assay methods |
| WO1994016108A1 (en) | 1993-01-15 | 1994-07-21 | The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. | Sensitive nucleic acid sandwich hybridization assays and kits |
| WO1994028156A1 (en) | 1993-05-20 | 1994-12-08 | Dana-Farber Cancer Institute | Compositions and methods for treatment of herpesvirus infections |
| CA2167838C (en) | 1993-07-23 | 1999-11-23 | Thomas B. Ryder | Methods for enhancing nucleic acid amplification |
| DE4331012A1 (de) | 1993-09-13 | 1995-03-16 | Bayer Ag | Nukleinsäuren-bindende Oligomere mit N-Verzweigung für Therapie und Diagnostik |
| US5681697A (en) | 1993-12-08 | 1997-10-28 | Chiron Corporation | Solution phase nucleic acid sandwich assays having reduced background noise and kits therefor |
| DK145493D0 (da) | 1993-12-23 | 1993-12-23 | Dako As | Antistof |
| JPH10500281A (ja) | 1994-02-14 | 1998-01-13 | ザ マクファーレーン バーネット センター フォー メディカル リサーチ リミテッド | 非病原性ｈｉｖ−１種 |
| EP0754241B1 (en) | 1994-04-04 | 1998-12-02 | Ciba Corning Diagnostics Corp. | Hibridization-ligation assays for the detection of specific nucleic acid sequences |
| EP0763133B1 (en) * | 1994-05-23 | 2001-08-01 | Biotronics Corporation | Method for detecting a target nucleic acid |
| CA2126952C (en) | 1994-06-28 | 2010-12-14 | Sithian Pandian | Probe, kit, and method of amplification for increasing the sensitivity of nucleic acid hybridization assays |
| US5681702A (en) | 1994-08-30 | 1997-10-28 | Chiron Corporation | Reduction of nonspecific hybridization by using novel base-pairing schemes |
| JP3093116B2 (ja) | 1994-09-30 | 2000-10-03 | 株式会社豊田中央研究所 | 核酸検出方法 |
| US6057099A (en) * | 1994-12-02 | 2000-05-02 | Intelligene Ltd. | Detection of nucleic acid sequences |
| US5747248A (en) | 1994-12-05 | 1998-05-05 | Chiron Corporation | Discontinuous probe design using hybritope mapping |
| US20030104361A1 (en) | 1997-09-29 | 2003-06-05 | Susan Weininger | Method of detection of nucleic acids with a specific sequence composition |
| CA2139070C (en) | 1994-12-23 | 2010-03-30 | Burton W. Blais | Method for enhancing detection ability of nucleic acid assays employing polymerase chain reaction |
| US5731153A (en) * | 1996-08-26 | 1998-03-24 | The Regents Of The University Of California | Identification of random nucleic acid sequence aberrations using dual capture probes which hybridize to different chromosome regions |
| US5888724A (en) | 1995-02-17 | 1999-03-30 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Detection of high oncogenic-risk papilloma virus in high grade cervical lesions and cancers by a PCR/ELISA assay |
| WO1996040992A2 (en) | 1995-06-07 | 1996-12-19 | Abbott Laboratories | Probe masking method of reducing background in an amplification reaction |
| US6083925A (en) | 1995-06-07 | 2000-07-04 | Connaught Laboratories Limited | Nucleic acid respiratory syncytial virus vaccines |
| FR2737502B1 (fr) | 1995-07-31 | 1997-10-24 | Genset Sa | Procede de detection d'acides nucleiques utilisant des sondes nucleotidiques permettant a la fois une capture specifique et une detection |
| CA2237891C (en) | 1995-11-15 | 2013-07-30 | Gen-Probe Incorporated | Nucleic acid probes complementary to human papillomavirus nucleic acid and related methods and kits |
| EP2368897B1 (en) | 1996-02-09 | 2016-10-19 | Cornell Research Foundation, Inc. | Detection of nucleic acid sequence differences using the ligase detection reaction with addressable arrays |
| US5853993A (en) * | 1996-10-21 | 1998-12-29 | Hewlett-Packard Company | Signal enhancement method and kit |
| US6117631A (en) | 1996-10-29 | 2000-09-12 | Polyprobe, Inc. | Detection of antigens via oligonucleotide antibody conjugates |
| GB9624165D0 (en) | 1996-11-19 | 1997-01-08 | Amdex A S | Use of nucleic acids bound to carrier macromolecules |
| US6110676A (en) * | 1996-12-04 | 2000-08-29 | Boston Probes, Inc. | Methods for suppressing the binding of detectable probes to non-target sequences in hybridization assays |
| US20020034737A1 (en) * | 1997-03-04 | 2002-03-21 | Hyseq, Inc. | Methods and compositions for detection or quantification of nucleic acid species |
| US6043038A (en) | 1998-03-31 | 2000-03-28 | Tularik, Inc. | High-throughput screening assays for modulators of primase activity |
| WO1998059044A1 (en) | 1997-06-25 | 1998-12-30 | Tularik Inc. | High-throughput screening assays for modulators of primase activity |
| US5843995A (en) | 1997-07-07 | 1998-12-01 | University Of Medicine And Dentistry Of New Jersey | Inhibition of HIV-1 replication using oligocarbamate derivatives |
| AU1232099A (en) * | 1997-11-04 | 1999-05-24 | Roche Diagnostics Gmbh | Specific and sensitive method for detecting nucleic acids |
| US6225053B1 (en) | 1997-12-12 | 2001-05-01 | Digene Corporation | Detection of hepatitis B virus |
| JP2002508190A (ja) | 1997-12-12 | 2002-03-19 | ダイジーン・コーポレーション | 万能収集媒質 |
| US20030096232A1 (en) * | 1997-12-19 | 2003-05-22 | Kris Richard M. | High throughput assay system |
| ATE397086T1 (de) | 1997-12-22 | 2008-06-15 | Hitachi Chemical Co Ltd | Reinigung von mrna auf mikroplatten |
| WO1999036571A2 (en) | 1998-01-13 | 1999-07-22 | Biochip Technologies Gmbh | Method for the detection or nucleic acid of nucleic acid sequences |
| WO1999039001A2 (en) | 1998-02-02 | 1999-08-05 | Amersham Pharmacia Biotech Ab | Nucleic acid analysis method |
| US5994079A (en) | 1998-02-06 | 1999-11-30 | Digene Corporation | Direct detection of RNA mediated by reverse transcriptase lacking RNAse H function |
| US7399589B2 (en) | 1998-02-06 | 2008-07-15 | Digene Corporation | Immunological detection of RNA:DNA hybrids on microarrays |
| US6686151B1 (en) * | 1998-02-06 | 2004-02-03 | Digene Corporation | Immunological detection of RNA:DNA hybrids on microarrays |
| ES2212251T3 (es) | 1998-03-23 | 2004-07-16 | Spal S.R.L. | Ventilador de flujo axial. |
| US6183956B1 (en) | 1998-03-31 | 2001-02-06 | Tularik, Incorporated | High throughput in vitro screening assays for transcription modulators |
| US20010055766A1 (en) | 1999-04-02 | 2001-12-27 | Alexander Aristarkhov | Immunosorbant assay using branched bis-biotin/avidin/multiple label complex as a detection reagent |
| WO2000060116A1 (en) | 1999-04-02 | 2000-10-12 | Tropix, Inc. | High throughput and high sensitivity detection assays |
| US7019822B1 (en) | 1999-04-29 | 2006-03-28 | Mss, Inc. | Multi-grade object sorting system and method |
| US6544732B1 (en) * | 1999-05-20 | 2003-04-08 | Illumina, Inc. | Encoding and decoding of array sensors utilizing nanocrystals |
| US6200746B1 (en) | 1999-08-25 | 2001-03-13 | Pharmacia & Upjohn Company | Methods of identifying anti-viral agents |
| US6893819B1 (en) * | 2000-11-21 | 2005-05-17 | Stratagene California | Methods for detection of a nucleic acid by sequential amplification |
| US6227579B1 (en) | 1999-11-30 | 2001-05-08 | Lakeshore Automatic Products Inc. | Swivel garden hose connector |
| US6436662B1 (en) | 2000-04-04 | 2002-08-20 | Digene Corporation | Device and method for cytology slide preparation |
| US6521190B1 (en) | 2000-05-19 | 2003-02-18 | Digene Corporation | Cell collection apparatus |
| US6828098B2 (en) * | 2000-05-20 | 2004-12-07 | The Regents Of The University Of Michigan | Method of producing a DNA library using positional amplification based on the use of adaptors and nick translation |
| EP1313881A2 (en) * | 2000-06-06 | 2003-05-28 | TM Bioscience Corporation | Capture moieties for nucleic acids and uses thereof |
| US7439016B1 (en) * | 2000-06-15 | 2008-10-21 | Digene Corporation | Detection of nucleic acids by type-specific hybrid capture method |
| US7601497B2 (en) | 2000-06-15 | 2009-10-13 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Detection of nucleic acids by target-specific hybrid capture method |
| ATE466930T1 (de) | 2000-06-21 | 2010-05-15 | Qiagen Gaithersburg Inc | Universelles sammelmedium |
| JP2004508019A (ja) | 2000-07-28 | 2004-03-18 | コンピュジェン インコーポレイテッド | トランスクリプトームの中に場所を占めるｒｎａ転写物及びスプライス変異体を検出するためのオリゴヌクレオチドライブラリー |
| JP2004518421A (ja) | 2000-12-12 | 2004-06-24 | インビトロジェン コーポレイション | 固体マトリックスから核酸分子を解放させるための組成物および方法 |
| WO2002066993A1 (en) | 2001-02-16 | 2002-08-29 | Cortex Biochem, Inc. | Magnetic isolation and purification of nucleic acids |
| EP1806410A3 (en) | 2001-08-23 | 2007-10-24 | Merck & Co., Inc. | Fluorescent multiplex HPV PCR assays using multiple fluorophores |
| US20050032105A1 (en) | 2001-10-12 | 2005-02-10 | Bair Robert Jackson | Compositions and methods for using a solid support to purify DNA |
| US6977148B2 (en) * | 2001-10-15 | 2005-12-20 | Qiagen Gmbh | Multiple displacement amplification |
| PT1463839E (pt) | 2002-01-07 | 2007-05-31 | Norchip As | Método para detectar arnm de um vírus do papiloma humano |
| WO2004087950A2 (en) | 2003-04-04 | 2004-10-14 | Roche Diagnostics Gmbh | Improved system for multi color real time pcr |
| US7129260B2 (en) | 2003-06-02 | 2006-10-31 | Abbott Laboratories | Isoindolinone kinase inhibitors |
| WO2005010145A2 (en) | 2003-07-05 | 2005-02-03 | The Johns Hopkins University | Method and compositions for detection and enumeration of genetic variations |
| ATE289685T1 (de) | 2003-08-25 | 2005-03-15 | Mtm Lab Ag | Verfahren zum nachweis von karzinomen in solubilisierten zervikalen körperproben |
| US8012944B2 (en) | 2003-10-30 | 2011-09-06 | Pharmascience Inc. | Method for treating cancer using IAP antisense oligomer and chemotherapeutic agent |
| JP2005243132A (ja) | 2004-02-26 | 2005-09-08 | Renesas Technology Corp | 半導体装置 |
| CN1690223B (zh) | 2004-04-27 | 2010-05-05 | 亚能生物技术（深圳）有限公司 | 人乳头瘤病毒分型基因芯片检测系统 |
| EP3342877B1 (en) | 2004-09-30 | 2020-01-29 | Epigenomics AG | Method for providing dna fragments derived from an archived sample |
| MX2007008553A (es) | 2005-01-14 | 2007-09-25 | Univ Michigan | Sistemas, metodos y composiciones para deteccion del virus de papiloma humano en muestras biologicas. |
| US20060240449A1 (en) | 2005-01-19 | 2006-10-26 | Mcglennen Ronald C | Methods and compositions for preparation of biological samples |
| EP1928560A2 (en) | 2005-04-06 | 2008-06-11 | Verenium Corporation | Enzymes and formulations for broad-specificity decontamination of chemical and biological warfare agents |
| EP1880025B1 (en) | 2005-05-12 | 2011-03-16 | Affymetrix, Inc. | Multiplex branched-chain dna assays |
| US7972776B2 (en) | 2005-11-15 | 2011-07-05 | Oncohealth Corporation | Protein chips for HPV detection |
| US20080003565A1 (en) | 2006-05-02 | 2008-01-03 | Government Of The Us, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Viral nucleic acid microarray and method of use |
| CA2652118C (en) | 2006-05-11 | 2015-07-07 | Becton, Dickinson And Company | Method of protein extraction from cells |
| EP2114990B9 (en) | 2007-02-27 | 2012-03-28 | Nuclea Biomarkers LLC | Method for predicting the response of NSCLC-patients to treatment by an EGFR-TK inhibitor |
| US7985375B2 (en) | 2007-04-06 | 2011-07-26 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Sample preparation system and method for processing clinical specimens |
| WO2008139938A1 (ja) | 2007-05-02 | 2008-11-20 | National University Corporation Tokyo Medical And Dental University | ヒトパピローマウイルス１６型遺伝子を標的とする二本鎖核酸分子及びそれを含む医薬 |
| PL2479289T3 (pl) | 2007-06-08 | 2016-10-31 | Sposób analizy metylacji | |
| JP2009106220A (ja) | 2007-10-31 | 2009-05-21 | Genodive Pharma Kk | 基板上での等温増幅反応による標的塩基配列の捕捉及び検出方法 |
| ES2584228T3 (es) | 2007-11-01 | 2016-09-26 | Self-Screen B.V. | Nuevo método de detección para los HPV cervicales |
| US20110027798A1 (en) | 2008-03-31 | 2011-02-03 | The Ohio State University Research Foundation | Hybridization Quantitation Method for Modified Micro-RNA and -DNA Based Oligonucleotides |
| US20090298187A1 (en) | 2008-04-17 | 2009-12-03 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Compositions, methods, and kits using synthetic probes for determining the presence of a target nucleic acid |
| WO2010004251A1 (en) | 2008-06-16 | 2010-01-14 | Oncomethylome Sciences Sa | Dna methylomes |
| WO2010028382A2 (en) | 2008-09-05 | 2010-03-11 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Collecting and processing complex macromolecular mixtures |
| US9090948B2 (en) | 2008-09-30 | 2015-07-28 | Abbott Molecular Inc. | Primers and probes for detecting human papillomavirus and human beta globin sequences in test samples |
| EP2184368A1 (en) | 2008-11-07 | 2010-05-12 | DKFZ Deutsches Krebsforschungszentrum | Diagnostic transcript and splice patterns of HPV16 in different cervical lesions |
| JP5738278B2 (ja) | 2009-05-01 | 2015-06-24 | キアジェン ゲイサーズバーグ インコーポレイテッド | 試料中のｒｎａスプライシング形態を検出するための非標的増幅法 |
-
2005
- 2005-11-07 US US11/269,003 patent/US7601497B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2006
- 2006-11-07 MX MX2008007192A patent/MX2008007192A/es active IP Right Grant
- 2006-11-07 WO PCT/US2006/060603 patent/WO2007056723A2/en not_active Ceased
- 2006-11-07 RU RU2008122909/10A patent/RU2437939C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2006-11-07 EP EP06846244.9A patent/EP1948832B1/en not_active Not-in-force
- 2006-11-07 AU AU2006311288A patent/AU2006311288B2/en not_active Ceased
- 2006-11-07 KR KR1020087013055A patent/KR101334645B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 2006-11-07 CA CA2629978A patent/CA2629978C/en not_active Expired - Fee Related
- 2006-11-07 CN CN200680050037.9A patent/CN101351564B/zh not_active Expired - Fee Related
-
2008
- 2008-05-16 BR BRPI0801480A patent/BRPI0801480B1/pt not_active IP Right Cessation
-
2009
- 2009-10-09 US US12/576,425 patent/US8901287B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2013
- 2013-03-15 US US13/842,114 patent/US9115410B2/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| US20130203632A1 (en) | 2013-08-08 |
| EP1948832A2 (en) | 2008-07-30 |
| CA2629978A1 (en) | 2007-05-18 |
| CA2629978C (en) | 2014-11-04 |
| CN101351564A (zh) | 2009-01-21 |
| US9115410B2 (en) | 2015-08-25 |
| MX2008007192A (es) | 2008-11-18 |
| US20100036104A1 (en) | 2010-02-11 |
| WO2007056723A3 (en) | 2007-11-01 |
| KR101334645B1 (ko) | 2013-11-29 |
| RU2437939C2 (ru) | 2011-12-27 |
| EP1948832B1 (en) | 2016-06-29 |
| US7601497B2 (en) | 2009-10-13 |
| WO2007056723A2 (en) | 2007-05-18 |
| US20060051809A1 (en) | 2006-03-09 |
| AU2006311288B2 (en) | 2012-05-03 |
| BRPI0801480A2 (pt) | 2010-05-18 |
| AU2006311288A1 (en) | 2007-05-18 |
| KR20080063425A (ko) | 2008-07-03 |
| US8901287B2 (en) | 2014-12-02 |
| EP1948832A4 (en) | 2010-08-04 |
| AU2006311288A2 (en) | 2008-08-07 |
| CN101351564B (zh) | 2014-04-30 |
| BRPI0801480B1 (pt) | 2017-03-14 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2437939C2 (ru) | Детекция нуклеиновых кислот способом, основанным на связывании мишенеспецифичного гибрида | |
| US12378594B2 (en) | Primers for immune repertoire profiling | |
| US20240327827A1 (en) | Whole transcriptome analysis of single cells using random priming | |
| CN102292635B (zh) | 微阵列底物上的生物材料的选择性处理 | |
| JP2020522262A (ja) | 単一細胞用のサンプルインデックス付加 | |
| EP1520045A1 (en) | Novel high density arrays and methods for analyte analysis | |
| WO2005010494A2 (en) | Multiplexed analyte detection | |
| CN110100010B (zh) | 单细胞中细胞内或表面分子靶标的多重检测 | |
| JP2000512148A (ja) | パドロックプローブ検出 | |
| US20180080076A1 (en) | Nucleic acid detection method, detection probe, detection probe set, and nucleic acid quantification method | |
| US20180135110A1 (en) | Devices and methods to detect biomarkers using oligonucleotides | |
| JP2006201062A (ja) | 核酸の検出あるいは定量方法 | |
| JP2006523462A (ja) | 多重結合アッセイ用オリゴヌクレオチド対 | |
| KR20220114623A (ko) | 조립된 마이크로파티클 및 이의 전구체 라이브러리 | |
| WO2021202815A1 (en) | Colorimetric and multiplexed isothermal rna-and antibody-based assay for sars-cov-2 and other viral diagnostics and cell analysis | |
| EP4638780A1 (en) | Sorting method using barcoded chambers for single cell workflow | |
| US11066697B1 (en) | Colorimetric and multiplexed isothermal RNA-based assay for SARS-CoV-2 and other viral diagnostics and cell analysis | |
| US20210285937A1 (en) | Multiplexed colocalization-by-linkage assays for the detection and analysis of analytes | |
| CN100494987C (zh) | 可用于非标记检测的固相化核酸探针 | |
| JPWO2017034019A1 (ja) | 核酸検出用デバイス及び核酸検出方法 | |
| JPWO2014156513A1 (ja) | 変異の検出方法 | |
| US20220025430A1 (en) | Sequence based imaging | |
| US20060084101A1 (en) | Two-color chemiluminescent microarray system | |
| WO2023081406A2 (en) | Colorimetric and multiplexed isothermal rna- and antibody-based assay for sars-cov-2 and other viral diagnostics and cell analysis | |
| JP2018133998A (ja) | 標的核酸の検出法 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20181108 |