[go: up one dir, main page]

RU2008145591A - Полипептиды с активностью глюкоамилазы, и полинуклеотиды, их кодирующие - Google Patents

Полипептиды с активностью глюкоамилазы, и полинуклеотиды, их кодирующие Download PDF

Info

Publication number
RU2008145591A
RU2008145591A RU2008145591/13A RU2008145591A RU2008145591A RU 2008145591 A RU2008145591 A RU 2008145591A RU 2008145591/13 A RU2008145591/13 A RU 2008145591/13A RU 2008145591 A RU2008145591 A RU 2008145591A RU 2008145591 A RU2008145591 A RU 2008145591A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
polypeptide
sequence
amylase
alpha
strain
Prior art date
Application number
RU2008145591/13A
Other languages
English (en)
Inventor
Сара ЛАНДВИК (DK)
Сара ЛАНДВИК
Цзиинь ЛЮ (US)
Цзиинь ЛЮ
Карстен Хорслев ХАНСЕН (DK)
Карстен Хорслев ХАНСЕН
Чее-леонг СООНГ (US)
Чее-Леонг Соонг
Еппе Вегенер ТАМС (DK)
Еппе Вегенер ТАМС
Original Assignee
Новозаймз Норт Америка, Инк. (Us)
Новозаймз Норт Америка, Инк.
Новозимс А/С (Dk)
Новозимс А/С
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Новозаймз Норт Америка, Инк. (Us), Новозаймз Норт Америка, Инк., Новозимс А/С (Dk), Новозимс А/С filed Critical Новозаймз Норт Америка, Инк. (Us)
Publication of RU2008145591A publication Critical patent/RU2008145591A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/24Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405Glucanases
    • C12N9/2408Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411Amylases
    • C12N9/2428Glucan 1,4-alpha-glucosidase (3.2.1.3), i.e. glucoamylase

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

1. Полипептид с глюкоамилазной активностью, выбранный из группы, состоящей из ! (a) полипептида с аминокислотной последовательностью, которая по меньшей мере на 60% идентична аминокислотной последовательности зрелого полипептида, аминокислоты 1-558 последовательности SEQ ID NO:2; ! (b) полипептид, который кодируется нуклеотидной последовательностью, (i) которая гибридизуется по меньшей мере в условиях низкой жесткости с нуклеотидами 61-2301 последовательности SEQ ID NO:1, либо (ii) которая гибридизуется по меньшей мере в условиях низкой жесткости с последовательностью кДНК, содержащей нуклеотиды 61-1734 последовательности SEQ ID NO:3, либо (iii) комплеметарной цепью (i) или (ii); ! (c) вариант, содержащий консервативную замену, делецию и/или инсерцию одной или нескольких аминокислот в аминокислотной последовательности 1-558 последовательности SEQ ID NO:2. ! 2. Полипептид, обладающий углеводсвязывающей аффинностью, выбранный из группы, включающей ! (a) i) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 60% идентичную аминокислотам 464-558 последовательности SEQ ID NO:2; ! (b) полипептид, кодируемый нуклеотидной последовательностью, которая гибридизуется в условиях низкой жесткости с полинуклеотидным зондом, выбранным из группы, состоящей из ! (i) комплементарной цепи нуклеотидов 1845-2301 последовательности SEQ ID NO:1; ! (ii) комплементарной цепи нуклеотидов 1450-1734 последовательности SEQ ID NO:3; ! (с) фрагмента (а) или (b), обладающего углеводсвязывающей аффинностью. ! 3. Полинуклеотид с нуклеотидной последовательностью, кодирующей полипептид по пп.1 и 2. ! 4. Конструкция нуклеиновой кислоты, содержащая полинуклеотид по п.3, функционально связанный

Claims (29)

1. Полипептид с глюкоамилазной активностью, выбранный из группы, состоящей из
(a) полипептида с аминокислотной последовательностью, которая по меньшей мере на 60% идентична аминокислотной последовательности зрелого полипептида, аминокислоты 1-558 последовательности SEQ ID NO:2;
(b) полипептид, который кодируется нуклеотидной последовательностью, (i) которая гибридизуется по меньшей мере в условиях низкой жесткости с нуклеотидами 61-2301 последовательности SEQ ID NO:1, либо (ii) которая гибридизуется по меньшей мере в условиях низкой жесткости с последовательностью кДНК, содержащей нуклеотиды 61-1734 последовательности SEQ ID NO:3, либо (iii) комплеметарной цепью (i) или (ii);
(c) вариант, содержащий консервативную замену, делецию и/или инсерцию одной или нескольких аминокислот в аминокислотной последовательности 1-558 последовательности SEQ ID NO:2.
2. Полипептид, обладающий углеводсвязывающей аффинностью, выбранный из группы, включающей
(a) i) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, по меньшей мере на 60% идентичную аминокислотам 464-558 последовательности SEQ ID NO:2;
(b) полипептид, кодируемый нуклеотидной последовательностью, которая гибридизуется в условиях низкой жесткости с полинуклеотидным зондом, выбранным из группы, состоящей из
(i) комплементарной цепи нуклеотидов 1845-2301 последовательности SEQ ID NO:1;
(ii) комплементарной цепи нуклеотидов 1450-1734 последовательности SEQ ID NO:3;
(с) фрагмента (а) или (b), обладающего углеводсвязывающей аффинностью.
3. Полинуклеотид с нуклеотидной последовательностью, кодирующей полипептид по пп.1 и 2.
4. Конструкция нуклеиновой кислоты, содержащая полинуклеотид по п.3, функционально связанный с одной или несколькими контролирующими последовательностями, которые направляют продукцию полипептида в экспрессирующем хозяине.
5. Рекомбинантный вектор экспрессии, содержащий конструкцию нуклеиновой кислоты по п.4.
6. Рекомбинантная клетка-хозяин, содержащая конструкцию нуклеиновой кислоты по п.4 или рекомбинантный вектор экспрессии по п.5.
7. Способ продукции полипептида по любому из пп.1 и 2, включающий
(a) культивирование клеток, которые в форме дикого типа способны продуцировать полипептид, в условиях, благоприятных для продукции полипептида; и
(b) выделение полипептида.
8. Способ продукции полипептида по любому из пп.1 и 2, включающий (а) культивирование клеток-хозяев, содержащих конструкцию нуклеиновой кислоты, содержащую нуклеотидную последовательность, кодирующую полипептид, в условиях, благоприятных для продукции полипептида; и (b) выделение полипептида.
9. Полинуклеотид, кодирующий полипептид с глюкоамилазной активностью, который выбран из группы, состоящей из
(a) полинуклеотида, кодирующего полипептид с аминокислотной последовательностью, которая по меньшей мере на 60% идентична аминокислотной последовательности зрелого полипептида с аминокислотами 1-558 последовательности SEQ ID NO:2;
(b) полинуклеотида, который по меньшей мере на 60% идентичен нуклеотидам 61-2301 последовательности SEQ ID NO:1; либо
(c) полинуклеотида, который по меньшей мере на 60% идентичен нуклеотидам 61-1734 последовательности SEQ ID NO:3;
(d) полипептида, кодируемого нуклеотидной последовательностью (i), которая гибридизуется по меньшей мере в условиях низкой жесткости с нуклеотидами 61-2301 последовательности SEQ ID NO:1, либо (ii), которая гибридизуется по меньшей мере в условиях средней жесткости с последовательностью кДНК, содержащей последовательности нуклеотидов 61-1734 последовательности SEQ ID NO:3, либо (iii) комплементарной цепью (i) или (ii).
10. Способ производства продукта ферментации из крахмалсодержащего сырья, включающий следующие этапы:
(a) разжижение крахмалсодержащего сырья;
(b) осахаривание разжиженного материала с помощью полипептида с глюкоамилазной активностью по п.1;
(c) ферментации осахаренного материала с помощью ферментирующего организма.
11. Способ производства продукта ферментации из крахмалсодержащего сырья, включающий
(a) осахаривание крахмалсодержащего сырья с помощью полипептида с глюкоамилазной активностью по п.1, при температуре ниже начальной температуры клейстеризации указанного крахмалсодержащего сырья,
(b) ферментацию с применением ферментирующего организма.
12. Способ по любому из пп.10 и 11, где крахмалсодержащее сырье представляет собой гранулярный крахмал.
13. Способ по любому из пп.10 и 11, в котором присутствует альфа-амилаза.
14. Способ по любому из пп.10 и 11, где температура во время осахаривания на этапе (а) составляет от 30°С до 75°С, предпочтительно, между 45 и 60°С.
15. Способ по любому из пп.10 и 11, где этапы (а) и (b) проводятся последовательно или синхронно (то есть, одностадийная ферментация).
16. Способ по любому из пп.10 и 11, где глюкоамилаза присутствует в количестве от 0,001 до 10 AGU/г DS, предпочтительно, от 0,01 до 5 AGU/г DS, в частности, от 0,1 до 0,5 AGU/г DS.
17. Способ получения сиропа из крахмалсодержащего сырья, включающий
(a) разжижение крахмалсодержащего сырья, предпочтительно, в присутствии альфа-амилазы,
(b) осахаривание материала, полученного на этапе (а), с помощью глюкоамилазы по изобретению.
18. Способ по п.17, дополнительно включающий очистку, переработку и/или выделение сиропа.
19. Применение полипептида с глюкоамилазной активностью по п.1 или полипептида, обладающего углеводсвязывающей аффинностью, по п.2 для получения сиропа и/или продукта ферментации.
20. Применение по п.19, где исходным материалом является клейстеризованное и/или неклейстеризованное крахмалсодержащее сырье.
21. Применение полипептида с глюкоамилазной активностью по п.1 или полипептида, обладающего углеводсвязывающей аффинностью, по п.2 для пивоварения.
22. Композиция, содержащая полипептид с глюкоамилазной активностью по п.1 или полипептид, обладающий углеводсвязывающей аффинностью, по п.2.
23. Композиция по п.22, дополнительно содержащая альфа-амилазу.
24. Композиция по п.23, где альфа-амилаза является кислой альфа-амилазой, предпочтительно, кислой альфа-амилазой грибов.
25. Композиция по п.23 или 24, где альфа-амилаза является альфа-амилазой грибного происхождения.
26. Композиция по любому из пп.23 или 24, где альфа-амилаза получена из рода Aspergillus, предпочтительно, штамма A. niger, A. oryzae, Aspergillus awamori, либо A. kawachii, рода Rhizomucor, предпочтительно, штамма Rhizomucor puslllus, или рода Merlpilus, предпочтительно, штамма Meripilus giganteus.
27. Композиция по любому из пп.23 или 24, где альфа-амилаза является гибридной, предпочтительно, альфа-амилазой Rhizomucor pusillus с Athelia rolfsii AMG линкером и SBD; Rhizomucor pusillus альфа-амилазой с Aspergillus niger глюкоамилазным линкером и SBD; либо Aspergillus niger альфа-амилазой с Aspergillus kawachii линкером и крахмалсвязывающим доменом (SBD).
28. Композиция по любому из пп.23 или 24, дополнительно содержащая другую глюкоамилазу.
29. Композиция по п.28, где глюкоамилаза получена из рода Aspergillus, предпочтительно, штамма Aspergillus niger, Aspergillus oryzae, Aspergillus awamori, или рода Athelia, предпочтительно, штамма Athelia rolfsii, рода Talaromyces, предпочтительно, штамма Talaromyces emersonii, или штамма рода Trametes, предпочтительно, штамма Trametes cingulata; или штамма рода Rhizopus, такого как штамм Rhizopus nivius; или штамма рода Humicola, предпочтительно, штамма Humicola grisea var. thermoidea.
RU2008145591/13A 2006-04-19 2007-04-13 Полипептиды с активностью глюкоамилазы, и полинуклеотиды, их кодирующие RU2008145591A (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US60/793,128 2006-04-14
US79312806P 2006-04-19 2006-04-19

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2008145591A true RU2008145591A (ru) 2010-05-27

Family

ID=38625705

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008145591/13A RU2008145591A (ru) 2006-04-19 2007-04-13 Полипептиды с активностью глюкоамилазы, и полинуклеотиды, их кодирующие

Country Status (7)

Country Link
US (1) US7871800B2 (ru)
EP (1) EP2010653A4 (ru)
CN (1) CN101443447A (ru)
CA (1) CA2645006A1 (ru)
MX (1) MX2008013100A (ru)
RU (1) RU2008145591A (ru)
WO (1) WO2007124285A2 (ru)

Families Citing this family (41)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20110097779A1 (en) 2008-06-23 2011-04-28 Chee-Leong Soong Processes for Producing Fermentation Products
CN111593035B (zh) 2009-12-01 2024-06-11 诺维信公司 具有葡糖淀粉酶活性的多肽及其编码多核苷酸
CN102791854A (zh) 2009-12-22 2012-11-21 诺维信公司 普鲁兰酶变体及其用途
WO2011100161A1 (en) 2010-02-09 2011-08-18 Novozymes North America, Inc. Addition of alpha - glucosidase and cobalt for producing fermentation products from starch
ES2565060T3 (es) 2010-04-14 2016-03-31 Novozymes A/S Polipéptidos que tienen actividad de glucoamilasa y polinucleótidos que codifican los mismos
EP2654567B1 (en) 2010-12-22 2018-04-04 Novozymes North America, Inc. Process for producing fermentation products from starch containing materials
CN113930458A (zh) 2011-10-11 2022-01-14 诺维信北美公司 用于产生发酵产物的方法
CA2857963C (en) 2011-12-02 2022-08-30 Novozymes North America, Inc. Processes for producing fermentation products
EP4209595A1 (en) 2012-03-30 2023-07-12 Novozymes North America, Inc. A method of dewatering whole stillage
ES2935920T3 (es) 2012-03-30 2023-03-13 Novozymes North America Inc Procesos de elaboración de productos de fermentación
EP3063282B1 (en) 2013-09-11 2020-03-25 Novozymes A/S Processes for producing fermentation products
US11072786B2 (en) 2014-04-10 2021-07-27 Novozymes A/S Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding same
CN106488982A (zh) 2014-06-06 2017-03-08 诺维信公司 酶组合物及其用途
EP3310910A1 (en) 2015-06-18 2018-04-25 Novozymes A/S Polypeptides having trehalase activity and the use thereof in process of producing fermentation products
US20190010470A1 (en) 2015-12-22 2019-01-10 Novozymes A/S Processes for producing fermentation products
WO2018098381A1 (en) 2016-11-23 2018-05-31 Novozymes A/S Improved yeast for ethanol production
MX2019014142A (es) 2017-06-02 2020-02-07 Novozymes As Levadura mejorada para produccion de etanol.
BR112019027861A2 (pt) 2017-06-28 2020-09-15 Novozymes A/S polipeptídeo, composição, formulação de caldo integral ou composição de cultura celular, polinucleotídeo, construção de ácido nucleico ou vetor de expressão, célula hospedeira recombinante, método de produção de um polipeptídeo, e, processo de produção de um produto de fermentação.
US11220679B2 (en) 2017-08-08 2022-01-11 Novozymes A/S Polypeptides having trehalase activity
EP3682014A1 (en) 2017-09-15 2020-07-22 Novozymes A/S Enzyme blends and processes for improving the nutritional quality of animal feed
CA3075907A1 (en) 2017-10-23 2019-05-02 Novozymes A/S Processes for reducing lactic acid in a biofuel fermentation system
CN111511771A (zh) * 2017-12-22 2020-08-07 诺维信公司 小麦研磨方法和gh8木聚糖酶
MX2020007914A (es) 2018-01-29 2020-10-28 Novozymes As Microorganismos con uso de nitrogeno mejorado para produccion de etanol.
CA3107124A1 (en) 2018-02-15 2019-08-22 Novozymes A/S Improved yeast for ethanol production
CA3098718A1 (en) 2018-05-31 2019-12-05 Novozymes A/S Processes for enhancing yeast growth and productivity
AU2019309683A1 (en) 2018-07-25 2021-02-11 Novozymes A/S Enzyme-expressing yeast for ethanol production
EP3864164A1 (en) 2018-10-08 2021-08-18 Novozymes A/S Enzyme-expressing yeast for ethanol production
WO2020160126A1 (en) 2019-01-31 2020-08-06 Novozymes A/S Polypeptides having xylanase activity and use thereof for improving the nutritional quality of animal feed
US20220186266A1 (en) 2019-04-02 2022-06-16 Novozymes A/S Process For Producing A Fermentation Product
MX2022000355A (es) 2019-07-09 2022-03-17 Dupont Nutrition Biosci Aps Composiciones de enzimas particuladas recubiertas de grasa.
CN114450390A (zh) 2019-07-26 2022-05-06 诺维信公司 用于乙醇生产的氮转运提高的微生物
CN114127124A (zh) 2019-08-06 2022-03-01 诺维信公司 用于提高酶表达的融合蛋白
CN110628648B (zh) * 2019-08-07 2022-04-22 中国科学院成都生物研究所 一种产液化型淀粉酶的根毛霉菌及应用
WO2021046073A1 (en) 2019-09-05 2021-03-11 Dupont Nutrition Biosciences Aps Feed composition
CN115175923A (zh) 2019-12-10 2022-10-11 诺维信公司 用于改善的戊糖发酵的微生物
MX2022006438A (es) 2019-12-16 2022-06-22 Novozymes As Procesos para obtener productos de fermentacion.
CN117795089A (zh) 2021-06-07 2024-03-29 诺维信公司 用于改善的乙醇发酵的工程化微生物
EP4408186A1 (en) 2021-09-27 2024-08-07 International N&H Denmark ApS Feed additive compositions and methods for using the same
EP4525634A1 (en) 2022-05-17 2025-03-26 International N&H Denmark ApS Feed additive comprising enzyme combinations
CN121001575A (zh) 2023-04-28 2025-11-21 国际营养与健康丹麦有限公司 反刍动物饲料添加剂组合物
WO2024258820A2 (en) 2023-06-13 2024-12-19 Novozymes A/S Processes for producing fermentation products using engineered yeast expressing a beta-xylosidase

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
NO840200L (no) 1983-01-28 1984-07-30 Cefus Corp Glukoamylase cdna.
US4727046A (en) 1986-07-16 1988-02-23 Fairchild Semiconductor Corporation Method of fabricating high performance BiCMOS structures having poly emitters and silicided bases
CA2312836A1 (en) 1997-12-02 1999-06-10 Vermund Rust Christensen Processes for the production of man-made vitreous fibres
AU5061000A (en) 1999-06-02 2000-12-28 Novozymes A/S Novel glucoamylase
US20060270007A1 (en) 2003-06-13 2006-11-30 Nielsen Anders V Method for producing glucoamylases and their uses
EP1745122A4 (en) * 2004-01-16 2010-11-03 Novozymes North America Inc METHOD FOR PRODUCING A FERMENTATION PRODUCT
WO2006069289A2 (en) * 2004-12-22 2006-06-29 Novozymes North America, Inc Polypeptides having glucoamylase activity and polynucleotides encoding same

Also Published As

Publication number Publication date
EP2010653A2 (en) 2009-01-07
CA2645006A1 (en) 2007-11-01
EP2010653A4 (en) 2010-03-03
MX2008013100A (es) 2008-10-27
WO2007124285A2 (en) 2007-11-01
WO2007124285A3 (en) 2009-02-19
US7871800B2 (en) 2011-01-18
CN101443447A (zh) 2009-05-27
US20100120108A1 (en) 2010-05-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2008145591A (ru) Полипептиды с активностью глюкоамилазы, и полинуклеотиды, их кодирующие
Amore et al. Potential of fungi as category I Consolidated BioProcessing organisms for cellulosic ethanol production
Liu et al. Molecular characterization and expression of microbial inulinase genes
Xu et al. Efficient hydrolysis of raw starch and ethanol fermentation: a novel raw starch-digesting glucoamylase from Penicillium oxalicum
CN102712915B (zh) 具有改良比活和/或热稳定性的葡糖淀粉酶的组合变体
CN1875099B (zh) 颗粒淀粉水解酶在木霉菌中的表达和从颗粒淀粉底物产生葡萄糖的方法
EP2118276A1 (en) Starch hydrolysis using phytase with an alpha amylase
CA2575875A1 (en) Maltogenic alpha-amylase variants
FI3091073T4 (fi) Ksylanaasiaktiivisuutta omaavia polypeptidejä ja niitä koodaavia polynukleotideja
WO2011011796A9 (en) Methods and compositions for improving sugar transport, mixed sugar fermentation, and production of biofuels
JP2011500020A (ja) 性質が変えられたグルコアミラーゼ変異種
RU2008143371A (ru) Способ получения сусла
CN107299123A (zh) 葡糖淀粉酶的变体
JP2015526090A (ja) グルコアミラーゼ活性を有する変異体
JP2017518026A (ja) アルファ−グルコシダーゼ酵素を用いた二糖およびオリゴ糖の酵素性加水分解
CN103642778B (zh) 一种β-内切葡聚糖酶突变体及其应用
WO2012019159A1 (en) Neutral ph saccharification and fermentation
CN108239609A (zh) 重组酵母及其应用
US20090117630A1 (en) Fermentation product processes
Liu et al. Characterization of a novel thermostable α-l-arabinofuranosidase for improved synergistic effect with xylanase on lignocellulosic biomass hydrolysis without prior pretreatment
CN102719418B (zh) α-淀粉酶的截断体及其应用
CN105925594A (zh) 生淀粉糖化酶及其制备方法与其在生淀粉水解和生料同步糖化发酵产酒精中的应用
CN103614354A (zh) 一种糖化酶及其重组表达菌株
WO2009008756A4 (en) DNA SEQUENCE ENCODING A SPECIFIC L-ARABINOSE TRANSPORTER, A cDNA MOLECULE, A PLASMID COMPRISING THE SAID DNA SEQUENCE, HOST CELL TRANSFORMED WITH SUCH PLASMID AND APPLICATION THEREOF
AU2020204527A1 (en) Trehalase in fermentations

Legal Events

Date Code Title Description
FA93 Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination)

Effective date: 20100701