RU2007129848A - Молочнокислые бактерии, устойчивые к бактериофагам - Google Patents
Молочнокислые бактерии, устойчивые к бактериофагам Download PDFInfo
- Publication number
- RU2007129848A RU2007129848A RU2007129848/13A RU2007129848A RU2007129848A RU 2007129848 A RU2007129848 A RU 2007129848A RU 2007129848/13 A RU2007129848/13 A RU 2007129848/13A RU 2007129848 A RU2007129848 A RU 2007129848A RU 2007129848 A RU2007129848 A RU 2007129848A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- yjae
- lactic acid
- acid bacterium
- protein
- dna sequence
- Prior art date
Links
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims abstract 68
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 title claims abstract 35
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 title claims abstract 34
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 title claims abstract 34
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 title claims abstract 13
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract 41
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract 25
- 239000007858 starting material Substances 0.000 claims abstract 7
- 235000013305 food Nutrition 0.000 claims abstract 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims 14
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims 14
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims 14
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 14
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims 7
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims 7
- 238000009826 distribution Methods 0.000 claims 5
- 230000004952 protein activity Effects 0.000 claims 4
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims 3
- 241000194035 Lactococcus lactis Species 0.000 claims 3
- 235000014897 Streptococcus lactis Nutrition 0.000 claims 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims 3
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 claims 3
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims 3
- 241000178948 Lactococcus sp. Species 0.000 claims 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims 1
- 238000009776 industrial production Methods 0.000 claims 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 claims 1
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 1
- 241000894007 species Species 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/315—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Streptococcus (G), e.g. Enterococci
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
- A23K—FODDER
- A23K10/00—Animal feeding-stuffs
- A23K10/10—Animal feeding-stuffs obtained by microbiological or biochemical processes
- A23K10/12—Animal feeding-stuffs obtained by microbiological or biochemical processes by fermentation of natural products, e.g. of vegetable material, animal waste material or biomass
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
- A23L—FOODS, FOODSTUFFS OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; PREPARATION OR TREATMENT THEREOF
- A23L29/00—Foods or foodstuffs containing additives; Preparation or treatment thereof
- A23L29/065—Microorganisms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
- C12N1/205—Bacterial isolates
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
- A23V—INDEXING SCHEME RELATING TO FOODS, FOODSTUFFS OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES AND LACTIC OR PROPIONIC ACID BACTERIA USED IN FOODSTUFFS OR FOOD PREPARATION
- A23V2002/00—Food compositions, function of food ingredients or processes for food or foodstuffs
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
- C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
- C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
- C12R2001/225—Lactobacillus
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Polymers & Plastics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Physiology (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Animal Husbandry (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Sustainable Development (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Ceramic Products (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Fodder In General (AREA)
Claims (25)
1. Молочнокислая бактерия, где белок YjaE, экпрессируемый геном yjaE, неактивен, и где белок YjaE экспрессируется геном yjaE, включающим в себя последовательность ДНК, выбранную из группы, состоящей из
(а) последовательности ДНК, соответствующей положениям 1-2400 в SEQ ID NO 1 (последовательность ДНК, кодирующая yjaE IL 1403); и
(b) последовательности ДНК, которая кодирует полипептид, необязательно имеющий активность белка YjaE, который не менее чем на 70% идентичен полипептидной последовательности, соответствующей положениям 1-799 в SEQ ID NO 2 (последовательность белка YjaE IL 1403).
2. Молочнокислая бактерия по п.1, где указанный неактивный белок YjaE является функционально неактивным относительно фаговой инфекции.
3. Молочнокислая бактерия по п.1, где указанная бактерия имеет повышенную устойчивость к бактериофагу, приводящую предпочтительно к снижению БОЕ/мл по меньшей мере в 50, а именно, по меньшей мере в 100, например, в 500, предпочтительно по меньшей мере в 1000, более предпочтительно по меньшей мере в 10000 или более раз.
4. Молочнокислая бактерия по любому из предшествующих пунктов, где молочнокислая бактерия представляет собой Lactococcus sp., предпочтительно Lactococcus sp., выбранный из группы, состоящей из Lactococcus lactis, подвид cremoris, Lactococcus lactis, подвид lactis, и Lactococcus lactis, подвид lactis биовариант diacetylactis.
5. Молочнокислая бактерия по любому из пп.1-3, где последовательность ДНК, которая кодирует полипептид из (b), представляет собой последовательность ДНК, которая кодирует полипептид, не менее чем на 90% идентичный полипептидной последовательности, соответствующей положениям 1-799 в SEQ ID NO 2, более предпочтительно последовательность ДНК, которая кодирует полипептид, не менее чем на 96% идентичный полипептидной последовательности, соответствующей положениям 1-799 в SEQ ID NO 2.
6. Молочнокислая бактерия по п.4, где последовательность ДНК, которая кодирует полипептид из (b), представляет собой последовательность ДНК, которая кодирует полипептид, не менее чем на 90% идентичный полипептидной последовательности, соответствующей положениям 1-799 в SEQ ID NO 2, более предпочтительно последовательность ДНК, которая кодирует полипептид, не менее чем на 96% идентичный полипептидной последовательности, соответствующей положениям 1-799 в SEQ ID NO 2.
7. Молочнокислая бактерия по любому из пп.1-3, где ген yjaE кодирует белок YjaE, который лишен по меньшей мере одного из предсказанных трансмембранных доменов.
8. Молочнокислая бактерия по п.4, где ген yjaE кодирует белок YjaE, который лишен по меньшей мере одного из предсказанных трансмембранных доменов.
9. Молочнокислая бактерия по п.5, где ген yjaE кодирует белок YjaE, который лишен по меньшей мере одного из предсказанных трансмембранных доменов.
10. Молочнокислая бактерия по любому из пп. 1-3, где ген yjaE кодирует белок YjaE, при этом предсказанное распределение внутри- и внеклеточных доменов белка YjaE изменено по сравнению с расположением в штамме IL 1403.
11. Молочнокислая бактерия по п.4, где ген yjaE кодирует белок YjaE, при этом предсказанное распределение внутри- и внеклеточных доменов белка YjaE изменено по сравнению с расположением в штамме IL 1403.
12. Молочнокислая бактерия по п.5, где ген yjaE кодирует белок YjaE, при этом предсказанное распределение внутри- и внеклеточных доменов белка YjaE изменено по сравнению с расположением в штамме IL 1403.
13. Молочнокислая бактерия по п.8, где ген yjaE кодирует белок YjaE, при этом предсказанное распределение внутри- и внеклеточных доменов белка YjaE изменено по сравнению с расположением в штамме IL 1403.
14. Молочнокислая бактерия по п.9, где ген yjaE кодирует белок YjaE, при этом предсказанное распределение внутри- и внеклеточных доменов белка YjaE изменено по сравнению с расположением в штамме IL 1403.
15. Молочнокислая бактерия по любому из пп.1-3, где белок YjaE неактивен вследствие того, что подходящая модификация была внесена в ген yjaE, предпочтительно, подходящая модификация выбрана из группы, состоящей из стоп-кодона, вставки, которая вызывает, например, сдвиг рамки считывания, делеции и мутации.
16. Молочнокислая бактерия по п.5, где белок YjaE неактивен вследствие того, что подходящая модификация была внесена в ген yjaE, предпочтительно, подходящая модификация выбрана из группы, состоящей из стоп-кодона, вставки, которая вызывает, например, сдвиг рамки считывания, делеции и мутации.
17. Молочнокислая бактерия по п.7, где белок YjaE неактивен вследствие того, что подходящая модификация была внесена в ген yjaE, предпочтительно, подходящая модификация выбрана из группы, состоящей из стоп-кодона, вставки, которая вызывает, например, сдвиг рамки считывания, делеции и мутации.
18. Молочнокислая бактерия по любому из пп.1-3, где молочнокислая бактерия отличается тем, что она имеет повышенную устойчивость по меньшей мере к одному бактериофагу, где бактериофаг выбран из подходящего репрезентативного ряда различных бактериофагов, где ряд подходящих бактериофагов предпочтительно включает в себя различные релевантные фаги, представляющие собой широко распространенные бактериофаги вида с2, маленькие изометрические фаги вида 936, маленькие изометрические фаги вида р335 и большие изометрические фаги вида 949.
19. Молочнокислая бактерия по п.5, где молочнокислая бактерия отличается тем, что она имеет повышенную устойчивость по меньшей мере к одному бактериофагу, где бактериофаг выбран из подходящего репрезентативного ряда различных бактериофагов, где ряд подходящих бактериофагов предпочтительно включает в себя различные релевантные фаги, представляющие собой широко распространенные бактериофаги вида с2, маленькие изометрические фаги вида 936, маленькие изометрические фаги вида р335 и большие изометрические фаги вида 949.
20. Молочнокислая бактерия по любому из пп.1-3, где молочнокислая бактерия не содержит измеримого уровня активности белка YjaE в мембране.
21. Молочнокислая бактерия по п.5, где молочнокислая бактерия не содержит измеримого уровня активности белка YjaE в мембране.
22. Молочнокислая бактерия по п.7, где молочнокислая бактерия не содержит измеримого уровня активности белка YjaE в мембране.
23. Композиция заквасочной культуры, содержащая молочнокислую бактерию по любому из пп.1-20, где концентрация жизнеспособных клеток в композиции заквасочной культуры предпочтительно составляет от 104 до 1012 КОЕ на грамм композиции.
24. Способ промышленного получения продукта питания или корма, включающий в себя добавление композиции заквасочной культуры по п.23 к исходному материалу продукта питания или корма и хранение инокулированного таким образом исходного материала в условиях, при которых молочнокислая бактерия метаболически активна.
25. Способ получения молочнокислой бактерии по любому из пп.1-20, где белок YjaE, экспрессируемый геном yjaE, неактивен, включающий в себя получение подходящей модификации гена yjaE, чтобы предотвратить экспрессию активного белка YjaE, где ген включает в себя последовательность ДНК, выбранную из группы, состоящей из
(а) последовательности ДНК, соответствующей положениям 1-2400 в SEQ ID NO 1 (последовательность ДНК, кодирующая yjaE IL1403);
(в) последовательности ДНК, которая кодирует полипептид, необязательно обладающий активностью белка YjaE, который не менее чем на 80% идентичен полипептидной последовательности соответствующей положениям 1-799 в SEQ ID NO 2 (последовательность белка YjaE IL1403).
Applications Claiming Priority (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP05100052 | 2005-01-06 | ||
| EP05100052.9 | 2005-01-06 | ||
| US64359105P | 2005-01-14 | 2005-01-14 | |
| US60/643,591 | 2005-01-14 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2007129848A true RU2007129848A (ru) | 2009-02-20 |
Family
ID=34938488
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2007129848/13A RU2007129848A (ru) | 2005-01-06 | 2006-01-06 | Молочнокислые бактерии, устойчивые к бактериофагам |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US8137950B2 (ru) |
| EP (1) | EP1838839B2 (ru) |
| CN (1) | CN101175848B (ru) |
| AT (1) | ATE517981T1 (ru) |
| AU (1) | AU2006204470A1 (ru) |
| BR (1) | BRPI0606433A2 (ru) |
| DK (1) | DK1838839T4 (ru) |
| PL (1) | PL1838839T5 (ru) |
| RU (1) | RU2007129848A (ru) |
| WO (1) | WO2006072631A1 (ru) |
Families Citing this family (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20090038453A (ko) | 2006-07-14 | 2009-04-20 | 레가르트, 론 | 정상발효 제품 |
| WO2009003491A1 (en) * | 2007-07-03 | 2009-01-08 | Danmarks Tekniske Universitet | Phage resistance |
| TR201807378T4 (tr) | 2010-01-28 | 2018-06-21 | Chr Hansen As | Faj dayanımına göre seçilen gıda ürünlerinin tekstüre edilmesi için laktik bakteriler. |
| EP2630265B1 (en) | 2010-10-22 | 2017-03-22 | Chr. Hansen A/S | Texturizing lactic acid bacteria strains |
| US9635870B2 (en) | 2011-02-28 | 2017-05-02 | Franklin Foods Holdings Inc. | Direct-set cheese |
| US9462817B2 (en) | 2011-02-28 | 2016-10-11 | Franklin Foods Holdings Inc. | Processes for making cheese products utilizing denatured acid whey proteins |
| CN109068676B (zh) * | 2016-04-15 | 2024-03-05 | 科·汉森有限公司 | 新细菌 |
| EP4031155A4 (en) * | 2019-09-18 | 2023-10-18 | Ancilia, Inc. | Compositions and methods for microbiome modulation |
| EP4164399A1 (en) * | 2020-06-11 | 2023-04-19 | Chr. Hansen A/S | Method of increasing nisin production inlactococcus lactis |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| FR2807446B1 (fr) | 2000-04-11 | 2005-05-06 | Agronomique Inst Nat Rech | Genomes de lactococcus lactis, polypeptides et utilisations |
| FR2807764B1 (fr) * | 2000-04-18 | 2004-09-10 | Agronomique Inst Nat Rech | Mutants de bacteries lactiques surproducteurs d'exopolysaccharides |
-
2006
- 2006-01-06 EP EP06701244.3A patent/EP1838839B2/en active Active
- 2006-01-06 PL PL06701244T patent/PL1838839T5/pl unknown
- 2006-01-06 DK DK06701244.3T patent/DK1838839T4/da active
- 2006-01-06 AT AT06701244T patent/ATE517981T1/de not_active IP Right Cessation
- 2006-01-06 WO PCT/EP2006/050078 patent/WO2006072631A1/en not_active Ceased
- 2006-01-06 BR BRPI0606433-7A patent/BRPI0606433A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2006-01-06 US US11/794,862 patent/US8137950B2/en active Active
- 2006-01-06 CN CN200680001787.7A patent/CN101175848B/zh active Active
- 2006-01-06 RU RU2007129848/13A patent/RU2007129848A/ru not_active Application Discontinuation
- 2006-01-06 AU AU2006204470A patent/AU2006204470A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| BRPI0606433A2 (pt) | 2009-06-30 |
| ATE517981T1 (de) | 2011-08-15 |
| CN101175848B (zh) | 2014-07-02 |
| DK1838839T4 (da) | 2020-07-13 |
| PL1838839T3 (pl) | 2012-01-31 |
| US8137950B2 (en) | 2012-03-20 |
| EP1838839B2 (en) | 2020-04-15 |
| WO2006072631A1 (en) | 2006-07-13 |
| US20080317903A1 (en) | 2008-12-25 |
| EP1838839B1 (en) | 2011-07-27 |
| EP1838839A1 (en) | 2007-10-03 |
| AU2006204470A1 (en) | 2006-07-13 |
| CN101175848A (zh) | 2008-05-07 |
| DK1838839T3 (da) | 2011-11-07 |
| PL1838839T5 (pl) | 2020-11-16 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Lahiri et al. | Bacteriocin: A natural approach for food safety and food security | |
| De Kwaadsteniet et al. | Characterization of a 3944 Da bacteriocin, produced by Enterococcus mundtii ST15, with activity against Gram-positive and Gram-negative bacteria | |
| Martı́nez et al. | Synthesis of lactococcin 972, a bacteriocin produced by Lactococcus lactis IPLA 972, depends on the expression of a plasmid-encoded bicistronic operon | |
| Uzelac et al. | A Zn-dependent metallopeptidase is responsible for sensitivity to LsbB, a class II leaderless bacteriocin of Lactococcus lactis subsp. lactis BGMN1-5 | |
| Heidrich et al. | Isolation, characterization, and heterologous expression of the novel lantibiotic epicidin 280 and analysis of its biosynthetic gene cluster | |
| Flynn et al. | Characterization of the genetic locus responsible for the production of ABP-118, a novel bacteriocin produced by the probiotic bacterium Lactobacillus salivarius subsp. salivarius UCC118 | |
| Balla et al. | Characterization and cloning of the genes encoding enterocin 1071A and enterocin 1071B, two antimicrobial peptides produced by Enterococcus faecalis BFE 1071 | |
| Georgalaki et al. | Macedocin, a food-grade lantibiotic produced by Streptococcus macedonicus ACA-DC 198 | |
| Lozo et al. | Characterization and antimicrobial activity of bacteriocin 217 produced by natural isolate Lactobacillus paracasei subsp. paracasei BGBUK2-16 | |
| Zendo et al. | Kunkecin A, a new nisin variant bacteriocin produced by the fructophilic lactic acid bacterium, Apilactobacillus kunkeei FF30-6 isolated from honey bees | |
| Mills et al. | A multibacteriocin cheese starter system, comprising nisin and lacticin 3147 in Lactococcus lactis, in combination with plantaricin from Lactobacillus plantarum | |
| Derbise et al. | A horizontally acquired filamentous phage contributes to the pathogenicity of the plague bacillus | |
| Ross et al. | Novel cultures for cheese improvement | |
| Cui et al. | Plasmids from food lactic acid bacteria: diversity, similarity, and new developments | |
| Todorov et al. | Characterization of bacteriocins produced by lactic acid bacteria isolated from spoiled black olives | |
| Caridi | Identification and first characterization of lactic acid bacteria isolated from the artisanal ovine cheese Pecorino del Poro | |
| Genay et al. | prtH2, not prtH, is the ubiquitous cell wall proteinase gene in Lactobacillus helveticus | |
| Mirkovic et al. | Lactococcus lactis LMG2081 produces two bacteriocins, a nonlantibiotic and a novel lantibiotic | |
| RU2007129848A (ru) | Молочнокислые бактерии, устойчивые к бактериофагам | |
| Majhenič et al. | DNA analysis of the genes encoding acidocin LF221 A and acidocin LF221 B, two bacteriocins produced by Lactobacillus gasseri LF221 | |
| CA2072007C (en) | Cloning vector for use in lactic acid bacteria and a method for constructing the same | |
| Thirumurugan et al. | Optimization of medium components for maximizing the bacteriocin production by Lactobacillus plantarum ATM11 using statistical design | |
| Bravo et al. | Nisin and lacticin 481 coproduction by Lactococcus lactis strains isolated from raw ewes’ milk | |
| Kojic et al. | Cloning and expression of a novel lactococcal aggregation factor from Lactococcus lactis subsp. lactis BGKP1 | |
| Kawai et al. | DNA sequencing and homologous expression of a small peptide conferring immunity to gassericin A, a circular bacteriocin produced by Lactobacillus gasseri LA39 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20090819 |