[go: up one dir, main page]

RU2004132861A - Промоторы с модифицированной эффективностью транскрипции - Google Patents

Промоторы с модифицированной эффективностью транскрипции Download PDF

Info

Publication number
RU2004132861A
RU2004132861A RU2004132861/13A RU2004132861A RU2004132861A RU 2004132861 A RU2004132861 A RU 2004132861A RU 2004132861/13 A RU2004132861/13 A RU 2004132861/13A RU 2004132861 A RU2004132861 A RU 2004132861A RU 2004132861 A RU2004132861 A RU 2004132861A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
dna sequence
sequence
promoter
palindromic
binding site
Prior art date
Application number
RU2004132861/13A
Other languages
English (en)
Inventor
Манфред САКОВ (DE)
Манфред САКОВ
Original Assignee
Рейн Биотек Гесельшафт Фур Неу Биотекнолоджиш Процесс Унд Продукт Мбх (De)
Рейн Биотек Гесельшафт Фур Неу Биотекнолоджиш Процесс Унд Продукт Мбх
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Рейн Биотек Гесельшафт Фур Неу Биотекнолоджиш Процесс Унд Продукт Мбх (De), Рейн Биотек Гесельшафт Фур Неу Биотекнолоджиш Процесс Унд Продукт Мбх filed Critical Рейн Биотек Гесельшафт Фур Неу Биотекнолоджиш Процесс Унд Продукт Мбх (De)
Publication of RU2004132861A publication Critical patent/RU2004132861A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/80Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
    • C12N15/81Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts
    • C12N15/815Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts for yeasts other than Saccharomyces
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/37Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi
    • C07K14/39Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi from yeasts
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/80Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
    • C12N15/81Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Claims (27)

1. Последовательность ДНК, содержащая по меньшей мере одну последовательность промотора, полученную из промотора дикого типа метилотрофных дрожжей, отличающаяся тем, что она имеет повышенную эффективность транскрипции этого промотора в сравнении с эффективностью промотора дикого типа вследствие введения или модификации сайта связывания.
2. Последовательность ДНК по п.1, отличающаяся тем, что эффективность транскрипции с последовательности промотора увеличена по сравнению эффективностью промотора дикого типа по меньшей мере в 1,5 раза, предпочтительнее по меньшей мере в 2 раза, особенно предпочтительно по меньшей мере в 2,5 раза.
3. Последовательность ДНК по п.1, отличающаяся тем, что последовательность промотора получена из промотора дрожжей одного из следующих родов: Candida, Hansenula, Pichia или Torulopsis.
4. Последовательность ДНК по п.3, отличающаяся тем, что последовательность промотора получена из промотора дрожжей Hansenula polymorpha.
5. Последовательность ДНК по п.1, отличающаяся тем, что последовательность промотора получена из следующих промоторов: МОХ, FMD, TPS1, DHAS, АОХ, GAPDH и РМА1.
6. Последовательность ДНК по п.1, отличающаяся тем, что последовательность промотора получена из промотора дикого типа путем вставки, делеции и/или замены по меньшей мере одного основания, предпочтительно путем замены одного или двух оснований.
7. Последовательность ДНК по п.1, отличающаяся тем, что последовательность промотора содержит по меньшей мере одну последовательность ДНК, которая представляет собой
а) сайт связывания, предпочтительно палиндромный сайт связывания, для транскрипционных факторов, которые относятся к белкам класса bZip; и/или
б) палиндромную последовательность ДНК, которая содержит по меньшей мере 8-20, предпочтительно 8-12, особенно предпочтительно 10 оснований; и/или
в) палиндромную последовательность ДНК, которая получена из одной из последовательностей, SEQ ID No.:1 - SEQ ID No.:23, и отличающуюся от исходной последовательности не более чем двумя основаниями, при этом палиндромная последовательность является симметричной или ассиметричной, предпочтительно симметричной, и отличается от полностью палиндромной последовательности не более чем двумя основаниями в каждой из нитей, предпочтительно только одним основанием, особенно предпочтительно без отличий.
8. Последовательность ДНК по п.1, отличающаяся тем, что последовательность промотора содержит по меньшей мере одну последовательность ДНК, которая представляет собой
а) сайт связывания, предпочтительно палиндромный сайт связывания, для белков, содержащих мотив "цинковые пальцы"; и/или
б) палиндромную последовательность ДНК, которая содержит по меньшей мере 8-20, предпочтительно 8-12, особенно предпочтительно 10 оснований; и/илив) палиндромную последовательность ДНК,
которая получена из одной из последовательностей, SEQ ID No.:1 - SEQ ID No.:23, и отличающуюся от исходной последовательности не более чем двумя основаниями, при этом палиндромная последовательность является симметричной или ассиметричной, предпочтительно симметричной, и отличается от полностью палиндромной последовательности не более чем двумя основаниями в каждой из нитей, предпочтительно только одним основанием, особенно предпочтительно без отличий.
9. Последовательность ДНК по п.1, отличающаяся тем, что последовательность промотора содержит по меньшей мере одну последовательность ДНК, которая представляет собой
а) сайт связывания, который, по существу, представляет собой сайт связывания белков, который выбирают из группы, включающей сайт связывания ATF/CREB, сайт связывания YAP, сайт связывания С/ЕВР, сайт связывания АР1 или G-бокс; и/или
б) палиндромную последовательность ДНК, которая содержит по меньшей мере 8-20, предпочтительно 8-12, особенно предпочтительно 10 оснований; и/или
в) палиндромную последовательность ДНК, которая получена из одной из последовательностей, SEQ ID No.:1 - SEQ ID No.:23, и отличающуюся от исходной последовательности не более чем двумя основаниями, при этом палиндромная последовательность является симметричной или ассиметричной, предпочтительно симметричной, и отличается от полностью палиндромной последовательности не более чем двумя основаниями в каждой из нитей, предпочтительно только одним основанием, особенно предпочтительно без отличий.
10. Последовательность ДНК по п.1, отличающаяся тем, что она дополнительно содержит по меньшей мере одну последовательность ДНК для гомологичного или гетерологичного гена, транскрипция которого находится под контролем указанной последовательности промотора.
11. Последовательность ДНК по п.1, отличающаяся тем, что она дополнительно содержит последовательность ДНК, кодирующую сигнал секреции.
12. Последовательность ДНК по п.1, отличающаяся тем, что сигнал секреции выбран из следующей группы: GAM, GAM-kex2, CHH-kex2, MFα-prepro, сигнал секреции куриного лизоцима.
13. Последовательность ДНК по любому из пп.1-12, отличающаяся тем, что ее используют для экспрессии гена.
14. Последовательность ДНК по любому из пп.1-12, отличающаяся тем, что ее используют для получения одного или нескольких белков.
15. Клетка-хозяин, отличающаяся тем, что она содержит по меньшей мере одну из последовательностей ДНК по любому из пп.1-12.
16. Клетка-хозяин по п.15, отличающаяся тем, что последовательность ДНК встроена в геном клетки - хозяина, или присутствует в клетке как внехромосомная молекула ДНК, предпочтительно в виде эписомы.
17. Клетка-хозяин по п.15, отличающаяся тем, что представляет собой дрожжевую клетку, предпочтительно, клетку метилотрофных дрожжей, особенно предпочтительно клетку одного из родов Candida, Torulopsis, Hansenula или Pichia, особенно предпочтительно клетку Hansenula polymorpha.
18. Клетка-хозяин по п.15 отличающаяся тем, что ее используют для экспрессии гена.
19. Клетка-хозяин по п.15 отличающаяся тем, что ее используют для получения одного или нескольких белков.
20. Вектор экспрессии, предпочтительно плазмида, отличающийся тем, что содержит ДНК по любому из пп.1-12.
21. Вектор экспрессии по п.20, содержащий ген phytase или lacZ в качестве рамки считывания репортерного гена.
22. Вектор экспрессии по п.20 отличающийся тем, что его используют для экспрессии гена.
23. Вектор экспрессии по п.20 отличающийся тем, что его используют для получения одного или нескольких белков.
24. Набор, включающий
(а) вектор экспрессии по п20, подходящий для клонирования ДНК, кодирующей рекомбинантный белок, и
(б) клетку - хозяин, подходящую для получения указанного рекомбинантного белка.
25. Способ получения одного или нескольких белков, включающий
(i) введение вектора по экспрессии по п.20 в клетку-хозяин, которая подходит для получения рекомбинантного белка, возможно, после проведения индукции последовательности промотора,
(ii) культивирование клетки-хозяина, полученной в (i),
(iii) возможно, проведение индукции последовательности промотора одним из известных способов, с продуцированием белка/белков клеткой-хозяином.
26. Способ получения одного или нескольких белков, включающий
(i) конструирование вектора экспрессии, содержащего последовательность ДНК по любому из пп.7-11,
(ii) введение вектора экспрессии в клетку-хозяин, подходящую для получения рекомбинантного белка, возможно, после проведения индукции последовательности промотора,
(iii) культивирование клетки - хозяина, полученной в (ii),
(iv) возможное проведение индукции последовательности промотора одним из известных способов, с продуцированием белка/белков клеткой-хозяином.
27. Способ получения вектора экспрессии по п.20, включающий
(i) введение последовательности ДНК по любому из пп.1-12 в вектор экспрессии, или
(ii) модификацию последовательности промотора метилотрофных дрожжей в составе вектора экспрессии путем делеции и/или вставки по меньшей мере одной пары оснований одним из известных способов для получения палиндромного связывающего сайта для транскрипционных факторов, которые относятся к белкам класса bZip или белкам содержащим мотив "цинковые пальцы", и
(iii) возможное введение одним из известных способов гетерологичного гена таким образом, чтобы гетерологичный ген находился под контролем последовательности ДНК из (i) или (ii).
RU2004132861/13A 2002-05-10 2003-05-08 Промоторы с модифицированной эффективностью транскрипции RU2004132861A (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE10220894.8 2002-05-10
DE10220894A DE10220894A1 (de) 2002-05-10 2002-05-10 Promotoren mit veränderter Transkriptionseffizienz

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2009100910/10A Division RU2009100910A (ru) 2002-05-10 2009-01-13 Промоторы с повышенной эффективностью транскрипции

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2004132861A true RU2004132861A (ru) 2005-07-20

Family

ID=29285267

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2004132861/13A RU2004132861A (ru) 2002-05-10 2003-05-08 Промоторы с модифицированной эффективностью транскрипции
RU2009100910/10A RU2009100910A (ru) 2002-05-10 2009-01-13 Промоторы с повышенной эффективностью транскрипции

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2009100910/10A RU2009100910A (ru) 2002-05-10 2009-01-13 Промоторы с повышенной эффективностью транскрипции

Country Status (10)

Country Link
US (1) US7718398B2 (ru)
EP (1) EP1504103B1 (ru)
KR (1) KR20050025180A (ru)
AT (1) ATE534743T1 (ru)
AU (1) AU2003240610A1 (ru)
CA (1) CA2485119A1 (ru)
DE (1) DE10220894A1 (ru)
ES (1) ES2377116T3 (ru)
RU (2) RU2004132861A (ru)
WO (1) WO2003095653A1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2568056C2 (ru) * 2009-10-22 2015-11-10 ДАУ АГРОСАЙЕНСИЗ ЭлЭлСи Конструируемые белки с цинковыми пальцами, направленные на гены растений, вовлеченные в биосинтез жирных кислот

Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP5290997B2 (ja) * 2007-01-26 2013-09-18 ノボザイムス アクティーゼルスカブ ピキアにおけるメタノール誘導性プロモーターからのメタノール非依存的誘導の方法
CN101182499B (zh) * 2007-11-13 2010-06-02 沈阳市信利生物技术发展有限公司 一种以甘油为碳源的制备植酸酶的方法
HUE050997T2 (hu) * 2008-05-06 2021-03-01 Archer Daniels Midland Co Keményítõ- és xilánbontó enzimek expresszálásával keményítõ és xilán alkoholos fermentációjára képes hõtûrõ Hansenula polymorpha élesztõtörzsek kifejlesztése
WO2010141924A2 (en) * 2009-06-05 2010-12-09 The General Hospital Corporation Enhanced engineered native promoters and uses thereof
ES2740449T3 (es) * 2015-12-22 2020-02-05 Bisy E U Célula de levadura
EP3922726A1 (en) 2020-06-10 2021-12-15 Erber Aktiengesellschaft Truncated promoter for recombinant gene expression

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2568056C2 (ru) * 2009-10-22 2015-11-10 ДАУ АГРОСАЙЕНСИЗ ЭлЭлСи Конструируемые белки с цинковыми пальцами, направленные на гены растений, вовлеченные в биосинтез жирных кислот

Also Published As

Publication number Publication date
EP1504103A1 (de) 2005-02-09
KR20050025180A (ko) 2005-03-11
EP1504103B1 (de) 2011-11-23
CA2485119A1 (en) 2003-11-20
DE10220894A1 (de) 2003-11-27
RU2009100910A (ru) 2010-07-20
WO2003095653B1 (de) 2004-03-04
AU2003240610A1 (en) 2003-11-11
ES2377116T3 (es) 2012-03-22
US7718398B2 (en) 2010-05-18
ATE534743T1 (de) 2011-12-15
WO2003095653A1 (de) 2003-11-20
US20060089492A1 (en) 2006-04-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2009100910A (ru) Промоторы с повышенной эффективностью транскрипции
EP0460716B2 (en) Yeast expression systems with vectors having GAPDH promoters, and synthesis of HBsAg
Mansur et al. Multiple gene copy number enhances insulin precursor secretion in the yeast Pichia pastoris
JP2020509755A5 (ru)
CN103555749B (zh) 一种离体构建多拷贝毕赤酵母表达载体的方法
JPH02283276A (ja) トランスジェニック塊茎形成双子葉植物の製法、発現カセットを含有する植物細胞、パタチンプロモータ配列及び発現カセット
JP7576362B2 (ja) 修飾植物胚乳特異的プロモータとその使用
CN104630174A (zh) 磷脂酶c突变体及其用途
CN118546240A (zh) 一种重组人纤连蛋白及其制备方法和应用
EP2300615A2 (en) Pichia pastoris das promoter variants
EP0129073B1 (en) Hybrid dna synthesis of mature growth hormone releasing factor
KR930021783A (ko) 진균 프로테아제
KR100237953B1 (ko) 돌연변이 aox2 프로모터, 이 프로모터를 함유한 미생물, 이 미생물의 제조방법 및 이 미생물을 사용한 이종단백질의 제조방법
CN103773793B (zh) 一种高效表达人血清白蛋白的方法
JP2022516819A (ja) 植物の調節エレメント及びその使用
DE60124921D1 (de) GENE, WELCHE FüR LUZIFERIN REGENERIERENDE PROTEINE KODIEREN, REKOMBINANTE DNA UND VERFAHREN ZUR HERSTELLUNG EINES LUZIFERIN REGENERIERENDEN PROTEINS
US5741674A (en) Recombinant production of proteins in yeast
US20080064061A1 (en) Yeast Promoter
CN119161455B (zh) 抑制乳腺癌增长的重组羟基化胶原蛋白及其制备方法与应用
DE50115564D1 (de) Verfahren zum herstellen von proteinen in einer hefe der gattung arxula und dafür geeignete promotoren
US7459545B2 (en) Chemically synthesized artificial promoter for high level expression of transgenes and a method for its synthesis
KR960006121B1 (ko) 인간 상피세포 성장인자(hEGF) 발현벡터 및 그를 이용한 hEGF의 제조방법
EP0245479A1 (en) SHORTENED PHOSPHOGLYCERATE KINASE PROMOTER.
JP2008017733A (ja) 異種タンパク質の発現方法及び異種タンパク質の発現方法により得られたタンパク質
CN119241689A (zh) 具有细胞粘附性的重组羟基化人ⅲ型胶原蛋白及其制备方法和应用