RU2002119394A - Анализ интенсивности флуоресценции для дуплексной и триплексной гибридизации нуклеиновых кислот в растворе с использованием флуоресцентных интеркаляторов - Google Patents
Анализ интенсивности флуоресценции для дуплексной и триплексной гибридизации нуклеиновых кислот в растворе с использованием флуоресцентных интеркаляторовInfo
- Publication number
- RU2002119394A RU2002119394A RU2002119394/13A RU2002119394A RU2002119394A RU 2002119394 A RU2002119394 A RU 2002119394A RU 2002119394/13 A RU2002119394/13 A RU 2002119394/13A RU 2002119394 A RU2002119394 A RU 2002119394A RU 2002119394 A RU2002119394 A RU 2002119394A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- probe
- target
- intercalating agent
- nucleic acid
- intensity
- Prior art date
Links
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 title claims abstract 10
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims 12
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims 6
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims 6
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 title claims 5
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims abstract 53
- 239000000138 intercalating agent Substances 0.000 claims abstract 15
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract 7
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 33
- 230000005855 radiation Effects 0.000 claims 10
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims 6
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 3
- 230000001678 irradiating effect Effects 0.000 claims 3
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims 2
- DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N acridine Chemical compound C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3N=C21 DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 230000005284 excitation Effects 0.000 claims 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 2
- BGWLYQZDNFIFRX-UHFFFAOYSA-N 5-[3-[2-[3-(3,8-diamino-6-phenylphenanthridin-5-ium-5-yl)propylamino]ethylamino]propyl]-6-phenylphenanthridin-5-ium-3,8-diamine;dichloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].C=1C(N)=CC=C(C2=CC=C(N)C=C2[N+]=2CCCNCCNCCC[N+]=3C4=CC(N)=CC=C4C4=CC=C(N)C=C4C=3C=3C=CC=CC=3)C=1C=2C1=CC=CC=C1 BGWLYQZDNFIFRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 claims 1
- QTANTQQOYSUMLC-UHFFFAOYSA-O Ethidium cation Chemical compound C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 QTANTQQOYSUMLC-UHFFFAOYSA-O 0.000 claims 1
- MZZINWWGSYUHGU-UHFFFAOYSA-J ToTo-1 Chemical compound [I-].[I-].[I-].[I-].C12=CC=CC=C2C(C=C2N(C3=CC=CC=C3S2)C)=CC=[N+]1CCC[N+](C)(C)CCC[N+](C)(C)CCC[N+](C1=CC=CC=C11)=CC=C1C=C1N(C)C2=CC=CC=C2S1 MZZINWWGSYUHGU-UHFFFAOYSA-J 0.000 claims 1
- GRRMZXFOOGQMFA-UHFFFAOYSA-J YoYo-1 Chemical compound [I-].[I-].[I-].[I-].C12=CC=CC=C2C(C=C2N(C3=CC=CC=C3O2)C)=CC=[N+]1CCC[N+](C)(C)CCC[N+](C)(C)CCC[N+](C1=CC=CC=C11)=CC=C1C=C1N(C)C2=CC=CC=C2O1 GRRMZXFOOGQMFA-UHFFFAOYSA-J 0.000 claims 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims 1
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N argon Substances [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 claims 1
- -1 argon ion Chemical class 0.000 claims 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 claims 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 claims 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 claims 1
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 claims 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims 1
- 238000010791 quenching Methods 0.000 claims 1
- 230000000171 quenching effect Effects 0.000 claims 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 abstract 4
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 abstract 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6839—Triple helix formation or other higher order conformations in hybridisation assays
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
Claims (32)
1. Способ анализа связывания, включающий обеспечение мишени, включающей, по меньшей мере, одну последовательность нуклеиновой кислоты; обеспечение зонда, включающего последовательность нуклеиновой кислоты или аналога нуклеиновой кислоты, не полностью комплементарную, по меньшей мере, части мишени; обеспечение интеркалирующего агента, причем любой из указанных зонда или интеркалирующего агента включает флуорофор, добавление зонда, мишени и интеркалирующего агента к гибридизационной среде для получения испытуемого образца, облучение испытуемого образца возбуждающим излучением, чтобы заставить флуорофор испускать флуоресцентное излучение, определение интенсивности флуоресцентного излучения, причем эта интенсивность является прямым показателем аффинности связывания между зондом и мишенью, и определение на основании указанной интенсивности степени ошибочного спаривания между зондом и мишенью.
2. Способ по п.1, в котором определение осуществляют путем калибровки указанной интенсивности по сравнению с интенсивностью, демонстрируемой другими зондами в сочетании с указанными мишенью и интеркалирующим агентом, при этом каждый из этих других зондов отличается, по меньшей мере, одним основанием.
3. Способ по п.2, в котором каждый из указанного зонда и других зондов представляет собой отличный от мишени элемент, выбранный из группы, состоящей из правильного спаривания, ошибочного спаривания одной пары оснований, ошибочного спаривания двух пар оснований, ошибочного спаривания трех пар оснований, делеции одной пары оснований, делеции двух пар оснований и делеции трех пар оснований, при условии, что указанный зонд не может обеспечивать правильное спаривание.
4. Способ по п.1, включающий также количественное определение аффинности связывания.
5. Способ по п.1, представляющий собой гомогенный анализ, осуществляемый без использования сигнального гасящего агента на мишени и зонде.
6. Способ по п.1, представляющий собой гомогенный анализ, осуществляемый без предварительной денатурации мишени.
7. Способ по п.1, представляющий собой гомогенный анализ, осуществляемый без амплификации мишени методом ПЦР.
8. Способ по п.1, в котором мишень представляет собой dsDNA, а зонд гибридизируется конкретно с данной мишенью, образуя триплекс.
9. Способ по п.8, в котором зонд представляет собой ssDNA или РНК.
10. Способ по п.1, в котором зонд имеет частично заряженный остов.
11. Способ по п.11, в котором зонд имеет незаряженный остов.
12. Способ по п.1, в котором зонд включает последовательность PNA.
13. Способ по п.1, в котором зонд представляет собой ssPNA, полученную с помощью параллельного синтеза.
14. Способ по п.13, в котором зонд и мишень имеют одинаковую длину.
15. Способ по п.1, в котором зонд имеет длину от 6 до 30 нуклеотидов.
16. Способ по п.1, в котором зонд имеет длину в 15 нуклеотидов.
17. Способ по п.1, в котором интеркалирующий агент ковалентно связан с зондам.
18. Способ по п.1, в котором интеркалирующий агент добавляют к гибридизационной среде в форме, свободной от зонда и мишени.
19. Способ по п.1, в котором интеркалирующий агент выбирают из группы, состоящей из YOYO-1, TOTO-1, этидийбромида, гомодимера-1 этидия, гомодимера-2 этидия и акридина.
20. Способ по п.1, в котором зонд состоит по существу из последовательности нуклеиновой кислоты или последовательности аналога нуклеиновой кислоты.
21. Способ по п.1, в котором возбуждающее излучение испускается из аргонового ионного лазера с длиной волны от около 200 до около 1000 нм.
22. Способ по п.1, осуществляемый в диапазоне температур от 5 до 85°С.
23. Способ по п.1, осуществляемый при температурах ниже 25°С.
24. Способ по п.1, в котором надежность способа не зависит от последовательности оснований зонда и мишени и не зависит от содержания гуанина и цитозина в зонде или мишени.
25. Способ по п.1, в котором испытуемый образец имеет объем около 20 микролитров и содержит около 10 фемтомоль мишени и около 10 фемтомоль зонда.
26. Способ по п.1, в котором концентрация мишени и испытуемого образца составляет не более чем 5 × 10-10 М.
27. Способ по п.23, в котором концентрация зонда и испытуемого образца составляет не более чем 5 × 10-10 М.
28. Способ анализа связывания, включающий обеспечение мишени, включающей, по меньшей мере, одну последовательность нуклеиновой кислоты, обеспечение зонда, включающего первый флуорофор и последовательность нуклеиновой кислоты или аналога нуклеиновой кислоты, не полностью комплементарную, по меньшей мере, части мишени, обеспечение интеркалирующего агента, включающего второй флуорофор, причем первый флуорофор и второй флуорофор флуоресцируют при разных длинах волн, добавление зонда, мишени и интеркалирующего агента к гибридизационной среде для получения испытуемого образца, облучение испытуемого образца возбуждающим излучением, чтобы заставить, по меньшей мере, один из указанных первого и второго флуорофоров испускать флуоресцентное излучение, определение интенсивности флуоресцентного излучения, причем эта интенсивность является прямым показателем аффинности связывания между зондом и мишенью, и определение на основании указанной интенсивности степени ошибочного спаривания между зондом и мишенью.
29. Способ по п.1, в котором длина волны, при которой флуоресцирует интеркалирующий агент, меняется на вторую длину волны после встраивания, и разница между длиной волны и второй длиной волны указывает на то, является ли комплекс, образованный между данными зондом и мишенью, дуплексом или триплексом, а также на то, представляет ли собой мишень ДНК или РНК.
30. Способ по п.1, осуществляемый в лунке или на непроницаемой поверхности.
31. Способ по п.1, осуществляемый на биочипе.
32. Способ анализа связывания, включающий обеспечение мишени, включающей, по меньшей мере, одну последовательность нуклеиновой кислоты; обеспечение зонда, включающего последовательность нуклеиновой кислоты или аналога нуклеиновой кислоты, обеспечение интеркалирующего агента, причем любой из указанных зонда или интеркалирующего агента включает флуорофор, добавление зонда, мишени и интеркалирующего агента к гибридизационной среде для получения испытуемого образца, облучение испытуемого образца возбуждающим излучением, чтобы заставить флуорофор испускать флуоресцентное излучение, определение интенсивности флуоресцентного излучения, причем эта интенсивность является прямым показателем аффинности связывания между зондом и мишенью, калибровку указанной интенсивности по сравнению со значениями интенсивности, демонстрируемыми другими зондами в сочетании с указанными зондом и интеркалирующим агентом, причем каждый из указанного зонда и других зондов представляют собой отличный от мишени элемент, выбранный из группы, состоящей из правильного спаривания, ошибочного спаривания одной пары оснований, ошибочного спаривания двух пар оснований, ошибочного спаривания трех пар оснований, делеции одной пары оснований, делеции двух пар оснований и делеции трех пар оснований; и определение на основании калибровки степени ошибочного спаривания между зондом и мишенью.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US09/468,679 US6403313B1 (en) | 1999-12-21 | 1999-12-21 | Fluorescent intensity assay for duplex and triplex nucleic acid hybridization solution utilizing fluorescent intercalators |
| US09/468,679 | 1999-12-21 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2002119394A true RU2002119394A (ru) | 2004-01-27 |
| RU2273668C2 RU2273668C2 (ru) | 2006-04-10 |
Family
ID=23860789
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2002119394/13A RU2273668C2 (ru) | 1999-12-21 | 2000-12-21 | Анализ интенсивности флуоресценции для дуплексной и триплексной гибридизации нуклеиновых кислот в растворе с использованием флуоресцентных интеркаляторов |
Country Status (17)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US6403313B1 (ru) |
| EP (1) | EP1242620B1 (ru) |
| JP (1) | JP4041867B2 (ru) |
| KR (1) | KR100537979B1 (ru) |
| CN (1) | CN1413264A (ru) |
| AT (1) | ATE372390T1 (ru) |
| AU (1) | AU778892B2 (ru) |
| BR (1) | BR0016614A8 (ru) |
| CA (1) | CA2394752C (ru) |
| DE (1) | DE60036307T2 (ru) |
| ES (1) | ES2296661T3 (ru) |
| HK (1) | HK1047454B (ru) |
| IL (2) | IL150284A0 (ru) |
| MX (1) | MXPA02006262A (ru) |
| PT (1) | PT1242620E (ru) |
| RU (1) | RU2273668C2 (ru) |
| WO (1) | WO2001046467A2 (ru) |
Families Citing this family (40)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6858390B2 (en) * | 1998-12-31 | 2005-02-22 | Ingeneus Corporation | Aptamers containing sequences of nucleic acid or nucleic acid analogues bound homologously, or in novel complexes |
| US6656692B2 (en) * | 1999-12-21 | 2003-12-02 | Ingeneus Corporation | Parallel or antiparallel, homologous or complementary binding of nucleic acids or analogues thereof to form duplex, triplex or quadruplex complexes |
| US7052844B2 (en) * | 1999-12-21 | 2006-05-30 | Ingeneus, Inc. | Purification of DS-DNA using heteropolymeric capture probes and a triplex, quadruplex or homologous duplex binding mechanism |
| US20030181412A1 (en) * | 1999-12-21 | 2003-09-25 | Ingeneus Corporation | Method for modifying transcription and/or translation in an organism for therapeutic, prophylactic and/or analytic uses |
| US7309569B2 (en) | 1999-12-21 | 2007-12-18 | Ingeneus, Inc. | Parallel or antiparallel, homologous or complementary binding of nucleic acids or analogues thereof to form duplex, triplex or quadruplex complexes |
| US20030170659A1 (en) * | 2000-01-24 | 2003-09-11 | Ingeneus Corporation | Electrical treatment of binding media to encourage, discourage and/or study biopolymer binding |
| US7220541B2 (en) | 2000-01-24 | 2007-05-22 | Ingeneus, Inc. | Homogeneous assay of biopolymer binding by means of multiple measurements under varied conditions |
| KR100386606B1 (ko) * | 2001-02-03 | 2003-06-02 | 엘지전자 주식회사 | Ｄｎａ 검출 방법 및 그 장치 |
| KR100434067B1 (ko) * | 2002-03-14 | 2004-06-04 | 엘지전자 주식회사 | 핵산 혼성화 검출을 위한 핵산검출장치 및 핵산 혼성화검출방법 |
| JP2005289810A (ja) * | 2002-03-18 | 2005-10-20 | Sangaku Renkei Kiko Kyushu:Kk | 蛍光色素基およびインターカレート基を含有する二本鎖核酸を選択的に検出するための蛍光試薬 |
| US20040019791A1 (en) * | 2002-07-24 | 2004-01-29 | Congruence, Llc | Code for object identification |
| AU2003261358A1 (en) * | 2002-08-01 | 2004-02-23 | Sensor Technologies Llc | Fluorescence correlation spectroscopy instrument |
| US20040142329A1 (en) * | 2003-01-17 | 2004-07-22 | Ingeneus Corporation | Probe conjugation to increase multiplex binding motif preference |
| US20040180345A1 (en) * | 2003-03-14 | 2004-09-16 | Ingeneus Corporation | Pre-incubation method to improve signal/noise ratio of nucleic acid assays |
| GB0310270D0 (en) * | 2003-05-03 | 2003-06-11 | Univ Edinburgh | Biomolecular devices |
| CA2567627C (en) | 2004-05-20 | 2014-09-30 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Single label comparative hybridization |
| NZ554538A (en) * | 2004-09-24 | 2009-12-24 | Ingeneus Inc | Genomic assay |
| DE602006018861D1 (de) | 2005-01-27 | 2011-01-27 | Quest Diagnostics Invest Inc | Schnelle komparative genomhybridisierung |
| US8076074B2 (en) | 2005-11-29 | 2011-12-13 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Balanced translocation in comparative hybridization |
| RU2394915C2 (ru) * | 2006-03-24 | 2010-07-20 | Александр Борисович Четверин | Бесконтактные способы обнаружения молекулярных колоний, наборы реагентов и устройство для их осуществления |
| US7807359B2 (en) | 2006-12-01 | 2010-10-05 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Methods of detecting TPMT mutations |
| US7507539B2 (en) | 2007-07-30 | 2009-03-24 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Substractive single label comparative hybridization |
| US8278047B2 (en) * | 2007-10-01 | 2012-10-02 | Nabsys, Inc. | Biopolymer sequencing by hybridization of probes to form ternary complexes and variable range alignment |
| US8093063B2 (en) | 2007-11-29 | 2012-01-10 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Assay for detecting genetic abnormalities in genomic nucleic acids |
| US9650668B2 (en) | 2008-09-03 | 2017-05-16 | Nabsys 2.0 Llc | Use of longitudinally displaced nanoscale electrodes for voltage sensing of biomolecules and other analytes in fluidic channels |
| US8882980B2 (en) | 2008-09-03 | 2014-11-11 | Nabsys, Inc. | Use of longitudinally displaced nanoscale electrodes for voltage sensing of biomolecules and other analytes in fluidic channels |
| US8262879B2 (en) | 2008-09-03 | 2012-09-11 | Nabsys, Inc. | Devices and methods for determining the length of biopolymers and distances between probes bound thereto |
| US10711298B2 (en) * | 2008-10-15 | 2020-07-14 | Axolabs Gmbh | Oligonucleotide detection method |
| US8039794B2 (en) | 2008-12-16 | 2011-10-18 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Mass spectrometry assay for thiopurine-S-methyl transferase activity and products generated thereby |
| AU2010298000A1 (en) | 2009-09-25 | 2012-04-05 | Signature Genomics Laboratories Llc | Multiplex (+/-) stranded arrays and assays for detecting chromosomal abnormalities associated with cancer and other diseases |
| US8715933B2 (en) | 2010-09-27 | 2014-05-06 | Nabsys, Inc. | Assay methods using nicking endonucleases |
| US8859201B2 (en) | 2010-11-16 | 2014-10-14 | Nabsys, Inc. | Methods for sequencing a biomolecule by detecting relative positions of hybridized probes |
| US11274341B2 (en) | 2011-02-11 | 2022-03-15 | NABsys, 2.0 LLC | Assay methods using DNA binding proteins |
| KR102012690B1 (ko) * | 2011-07-12 | 2019-08-21 | 주식회사 파나진 | 평행 결합 구조의 이중 혼성화 ｐｎａ 프로브 시스템 |
| EP2802411B1 (en) * | 2012-01-13 | 2017-04-05 | Koninklijke Philips N.V. | Dna sequencing with reagent recycling on wiregrid |
| US8956815B2 (en) | 2012-04-18 | 2015-02-17 | Toxic Report Llc | Intercalation methods and devices |
| US9914966B1 (en) | 2012-12-20 | 2018-03-13 | Nabsys 2.0 Llc | Apparatus and methods for analysis of biomolecules using high frequency alternating current excitation |
| US10294516B2 (en) | 2013-01-18 | 2019-05-21 | Nabsys 2.0 Llc | Enhanced probe binding |
| RU2675502C1 (ru) * | 2013-11-29 | 2018-12-19 | Конинклейке Филипс Н.В. | Оптический контроль химической реакции |
| CN113720837B (zh) * | 2021-09-23 | 2024-01-19 | 西北大学 | 一种快速检测水体中汞离子的比色传感器 |
Family Cites Families (43)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4220450A (en) | 1978-04-05 | 1980-09-02 | Syva Company | Chemically induced fluorescence immunoassay |
| FR2558172B1 (fr) | 1984-01-16 | 1986-06-13 | Inst Nat Sante Rech Med | Sonde contenant un acide nucleique modifie et reconnaissance par des anticorps specifiques et utilisation de cette sonde et de ces anticorps specifiques pour detecter et caracteriser une sequence d'adn homologue |
| US4876187A (en) | 1985-12-05 | 1989-10-24 | Meiogenics, Inc. | Nucleic acid compositions with scissile linkage useful for detecting nucleic acid sequences |
| US5011769A (en) | 1985-12-05 | 1991-04-30 | Meiogenics U.S. Limited Partnership | Methods for detecting nucleic acid sequences |
| US5874555A (en) | 1987-10-30 | 1999-02-23 | California Institute Of Technology | Triple helices and processes for making same |
| US5403711A (en) | 1987-11-30 | 1995-04-04 | University Of Iowa Research Foundation | Nucleic acid hybridization and amplification method for detection of specific sequences in which a complementary labeled nucleic acid probe is cleaved |
| ATE153706T1 (de) | 1988-08-31 | 1997-06-15 | Aprogenex Inc | Manuelles in situ hybridisierungsverfahren |
| US5800992A (en) * | 1989-06-07 | 1998-09-01 | Fodor; Stephen P.A. | Method of detecting nucleic acids |
| US5824477A (en) | 1990-09-12 | 1998-10-20 | Scientific Generics Limited | Electrochemical denaturation of double-stranded nucleic acid |
| JP2985446B2 (ja) | 1990-10-31 | 1999-11-29 | 東ソー株式会社 | 核酸の検出及び測定方法 |
| WO1992011390A1 (en) * | 1990-12-17 | 1992-07-09 | Idexx Laboratories, Inc. | Nucleic acid sequence detection by triple helix formation |
| US5539082A (en) | 1993-04-26 | 1996-07-23 | Nielsen; Peter E. | Peptide nucleic acids |
| US5641625A (en) * | 1992-05-22 | 1997-06-24 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Cleaving double-stranded DNA with peptide nucleic acids |
| US6048690A (en) | 1991-11-07 | 2000-04-11 | Nanogen, Inc. | Methods for electronic fluorescent perturbation for analysis and electronic perturbation catalysis for synthesis |
| US5558998A (en) * | 1992-02-25 | 1996-09-24 | The Regents Of The Univ. Of California | DNA fragment sizing and sorting by laser-induced fluorescence |
| US5332659A (en) | 1992-04-09 | 1994-07-26 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy | Light emission-or absorbance-based binding assays for polynucleic acids |
| JPH06153997A (ja) * | 1992-11-27 | 1994-06-03 | Canon Inc | 検出信号増幅による標的核酸の検出方法 |
| US6027880A (en) | 1995-08-02 | 2000-02-22 | Affymetrix, Inc. | Arrays of nucleic acid probes and methods of using the same for detecting cystic fibrosis |
| US5861124A (en) | 1993-07-15 | 1999-01-19 | Hamamatsu Photonics Kk | Method and apparatus for detecting denaturation of nucleic acid |
| JPH09506762A (ja) | 1993-08-18 | 1997-07-08 | アイディー バイオメディカル コーポレイション | 近接配列−酵素分子を利用して標的核酸配列を検出するための組成物および方法 |
| WO1995006731A2 (en) | 1993-09-02 | 1995-03-09 | Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. | Non-nucleotide containing enzymatic nucleic acid |
| US5538848A (en) | 1994-11-16 | 1996-07-23 | Applied Biosystems Division, Perkin-Elmer Corp. | Method for detecting nucleic acid amplification using self-quenching fluorescence probe |
| WO1995014106A2 (en) | 1993-11-17 | 1995-05-26 | Id Biomedical Corporation | Cycling probe cleavage detection of nucleic acid sequences |
| US5998193A (en) | 1994-06-24 | 1999-12-07 | Gene Shears Pty., Ltd. | Ribozymes with optimized hybridizing arms, stems, and loops, tRNA embedded ribozymes and compositions thereof |
| JP3189000B2 (ja) * | 1994-12-01 | 2001-07-16 | 東ソー株式会社 | 特定核酸配列の検出方法 |
| US5814516A (en) | 1995-10-13 | 1998-09-29 | Lockheed Martin Energy Systems, Inc. | Surface enhanced Raman gene probe and methods thereof |
| US5824557A (en) | 1996-04-02 | 1998-10-20 | Panvera Corporation | Method for detecting and quantitating nucleic acid impurities in biochemical preparations |
| SE506700C2 (sv) * | 1996-05-31 | 1998-02-02 | Mikael Kubista | Sond och förfaranden för analys av nukleinsyra |
| US5948897A (en) | 1996-06-14 | 1999-09-07 | Simon Fraser University | Method of binding two or more DNA double helices and products formed |
| US5912332A (en) | 1996-07-26 | 1999-06-15 | Hybridon, Inc. | Affinity-based purification of oligonucleotides using soluble multimeric oligonucleotides |
| US5691145A (en) | 1996-08-27 | 1997-11-25 | Becton, Dickinson And Company | Detection of nucleic acids using G-quartets |
| US5846729A (en) * | 1997-02-27 | 1998-12-08 | Lorne Park Research, Inc. | Assaying nucleotides in solution using a fluorescent intensity quenching effect |
| US6060242A (en) | 1997-02-27 | 2000-05-09 | Lorne Park Research, Inc. | PNA diagnostic methods |
| US6046004A (en) * | 1997-02-27 | 2000-04-04 | Lorne Park Research, Inc. | Solution hybridization of nucleic acids with antisense probes having modified backbones |
| US6251591B1 (en) | 1997-02-27 | 2001-06-26 | Lorne Park Research, Inc. | Quantitative method for detecting nucleotide concentration |
| US6312925B1 (en) * | 1997-05-08 | 2001-11-06 | Epoch Pharmaceuticals, Inc. | Methods and compositions to facilitate D-loop formation by oligonucleotides |
| US6013442A (en) * | 1997-08-05 | 2000-01-11 | Wisconsin Alumni Res Found | Direct quantitation of low copy number RNA |
| GB9725197D0 (en) * | 1997-11-29 | 1998-01-28 | Secr Defence | Detection system |
| US6017709A (en) | 1998-04-29 | 2000-01-25 | University Of Houston | DNA replication templates stabilized by guanine quartets |
| US6255050B1 (en) | 1998-05-22 | 2001-07-03 | Lorne Park Research, Inc. | Dynamic hybridization system |
| GB9812768D0 (en) * | 1998-06-13 | 1998-08-12 | Zeneca Ltd | Methods |
| GB9821989D0 (en) * | 1998-10-08 | 1998-12-02 | Hybaid Ltd | Detection of nucleic acid polymorphism |
| US6265170B1 (en) | 2000-01-24 | 2001-07-24 | Ingeneus Corporation | Homogenous assay of duplex of triplex hybridization by means of multiple measurements under varied conditions |
-
1999
- 1999-12-21 US US09/468,679 patent/US6403313B1/en not_active Expired - Lifetime
-
2000
- 2000-12-21 AT AT00979887T patent/ATE372390T1/de not_active IP Right Cessation
- 2000-12-21 AU AU17263/01A patent/AU778892B2/en not_active Ceased
- 2000-12-21 IL IL15028400A patent/IL150284A0/xx active IP Right Grant
- 2000-12-21 DE DE60036307T patent/DE60036307T2/de not_active Expired - Lifetime
- 2000-12-21 PT PT00979887T patent/PT1242620E/pt unknown
- 2000-12-21 EP EP00979887A patent/EP1242620B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2000-12-21 WO PCT/IB2000/001930 patent/WO2001046467A2/en not_active Ceased
- 2000-12-21 JP JP2001546963A patent/JP4041867B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2000-12-21 ES ES00979887T patent/ES2296661T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2000-12-21 CN CN00817639A patent/CN1413264A/zh active Pending
- 2000-12-21 RU RU2002119394/13A patent/RU2273668C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2000-12-21 HK HK02108903.7A patent/HK1047454B/en not_active IP Right Cessation
- 2000-12-21 CA CA2394752A patent/CA2394752C/en not_active Expired - Fee Related
- 2000-12-21 BR BRPI0016614A patent/BR0016614A8/pt not_active Application Discontinuation
- 2000-12-21 MX MXPA02006262A patent/MXPA02006262A/es active IP Right Grant
-
2002
- 2002-06-18 IL IL150284A patent/IL150284A/en not_active IP Right Cessation
- 2002-06-21 KR KR20027008065A patent/KR100537979B1/ko not_active Expired - Fee Related
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| DE60036307D1 (de) | 2007-10-18 |
| ES2296661T3 (es) | 2008-05-01 |
| IL150284A0 (en) | 2002-12-01 |
| KR20020079757A (ko) | 2002-10-19 |
| KR100537979B1 (en) | 2005-12-21 |
| WO2001046467A2 (en) | 2001-06-28 |
| IL150284A (en) | 2008-03-20 |
| ATE372390T1 (de) | 2007-09-15 |
| JP4041867B2 (ja) | 2008-02-06 |
| EP1242620A2 (en) | 2002-09-25 |
| CA2394752A1 (en) | 2001-06-28 |
| BR0016614A (pt) | 2003-01-07 |
| CA2394752C (en) | 2012-09-25 |
| EP1242620B1 (en) | 2007-09-05 |
| JP2003517841A (ja) | 2003-06-03 |
| MXPA02006262A (es) | 2004-09-06 |
| WO2001046467A3 (en) | 2002-05-30 |
| BR0016614A8 (pt) | 2019-01-22 |
| DE60036307T2 (de) | 2008-05-29 |
| AU1726301A (en) | 2001-07-03 |
| AU778892B2 (en) | 2004-12-23 |
| PT1242620E (pt) | 2007-12-13 |
| RU2273668C2 (ru) | 2006-04-10 |
| HK1047454B (en) | 2008-07-25 |
| CN1413264A (zh) | 2003-04-23 |
| HK1047454A1 (en) | 2003-02-21 |
| US6403313B1 (en) | 2002-06-11 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2002119394A (ru) | Анализ интенсивности флуоресценции для дуплексной и триплексной гибридизации нуклеиновых кислот в растворе с использованием флуоресцентных интеркаляторов | |
| Thomas et al. | Amplification of padlock probes for DNA diagnostics by cascade rolling circle amplification or the polymerase chain reaction | |
| JP2005537030A5 (ru) | ||
| RU2002122770A (ru) | Гомогенный анализ дуплексной или триплексной гибридизации с использованием множественных измерений при варьируемых условиях | |
| JP2004000185A (ja) | Ｐｃｒ増幅とハイブリダイゼーションプロービングアッセイを組み合わせた方法およびそのための試薬 | |
| EP0803058A4 (en) | Fluorometric assay for detecting nucleic acid cleavage | |
| EP1078101A2 (en) | Solution hybridization of nucleic acids with antisense probes having modified backbones | |
| US20050196790A1 (en) | Methods for detection and quantitation of minimum length polymers | |
| US20060008823A1 (en) | DNA profiling and SNP detection utilizing microarrays | |
| RU2003103772A (ru) | Способ анализа опосредованной катионами гибридизации тройных комплексов | |
| CA2549849A1 (en) | Improved selective ligation and amplification assay | |
| PT1171633E (pt) | Métodos para marcar materiais | |
| JPWO2012077819A1 (ja) | 標的核酸の検出方法及びキット | |
| JP3855492B2 (ja) | 混合核酸断片分析法 | |
| US20090215187A1 (en) | Methods and Compositions for the Detection and Analysis of Nucleic Acids by Signal Amplification | |
| EP2798086B1 (en) | Reagents and methods for autoligation chain reaction | |
| JPH0630799A (ja) | 遺伝子検出方法及び遺伝子検出装置 | |
| CN110546273A (zh) | 通过衔接子序列定量ngs dna | |
| JP2022516250A (ja) | 固相モログラフィーによる標的核酸の検出 | |
| US6861515B2 (en) | Analysis of biological targets using a biochip comprising a fluorescent marker | |
| WO2021215989A1 (en) | Rapid detection of specific genetic sequences using a multi-labelled dna hybrid comprising a reporter strand and an anchor strand | |
| US6911536B1 (en) | Triplex and quadruplex catalytic hybridization | |
| JP2020150862A (ja) | Ｉｄｈ−１遺伝子多型の検出方法 | |
| EP1606389B1 (en) | Methods for polynucleotide sequence detection |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20161222 |