KR20170060418A - Protein crystal of CEP55-TEX14 complex and its use - Google Patents
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Abstract
본원은 CEP55-EABR 및 TEX 복합체의 3차원 결정 구조 및 그 용도를 개시한다. 본원에 따른 복합체 결정은 CEP55-TEX14 결합 부위의 정확한 삼차원 구조에 대한 세부정보를 제공하며, 이를 이용하여 CEP55 단백질에 강하게 결합하여 세포 분열을 억제할 수 있는 펩타이드 유도체 또는 저분자 화합물을 발굴함으로써 세포질 분열을 억제하는 형태의 항암제 개발에 이용될 수 있다.This disclosure discloses three-dimensional crystal structures of CEP55-EABR and TEX complexes and their uses. The complex crystals according to the present invention provide detailed information on the precise three-dimensional structure of the CEP55-TEX14 binding site and use it to identify peptide derivatives or low molecular compounds capable of binding to the CEP55 protein to inhibit cell division, Can be used to develop anticancer drugs in the form of suppression.
Description
본원은 세포분열에 관여하는 단백질 복합체 결정과 관련된 분야이다.This is a field related to protein complex crystals involved in cell division.
새로운 항암제를 개발하는 데 있어서 항암 표적 단백질의 삼차원 구조는 매우 유용하게 사용될 수 있다. 체세포가 두 개의 딸세포로 분열되기 위해서는 세포질분열의 마지막 단계에서 세포막이 절단되어야 하며, 이를 위해 CEP55 (Centrosomal Protein 55)에 대한 ALIX (ALG-2 interacting protein X, 또한 programmed cell death 6 interacting protein으로도 알려짐) 결합이 필수적이다.The three-dimensional structure of anticancer target proteins can be very useful in developing new anticancer drugs. In order for somatic cells to divide into two daughter cells, the cell membrane must be cleaved at the end of cytoplasmic cleavage, known as ALIX (ALG-2 interacting protein X, also called programmed
하지만 생식세포에서는 ALIX 대신에 TEX14 (Testis Expressed Gene 14)이 CEP55에 결합하여 세포분열의 마지막 단계에서 세포분열이 완료되지 않고 0.5에서 3-μm 정도의 세포간 브릿지로 연결된다. However, in germ cells, TEX14 (Testis Expressed Gene 14) binds to CEP55 instead of ALIX, which leads to a 0.5 to 3-μm intercellular bridge without complete cell division at the end of cell division.
미국 특허출원 공개공보 2013-0225503은 TEX14 펩타이드를 이용한 항암제 조성물 및 세포 증식을 억제하는 방법을 개시한다. United States Patent Application Publication No. 2013-0225503 discloses an anticancer composition using a TEX14 peptide and a method for inhibiting cell proliferation.
하지만 CEP55에 TEX14 보다 더 강하게 결합되는 TEX14 펩타이드 유도체 또는 저분자 화합물을 발굴하면 암세포의 세포질분열을 억제하는 형태의 새로운 항암제 개발이 가능하다.However, if a TEX14 peptide derivative or a low molecular weight compound, which is more tightly bound to CEP55 than TEX14, is discovered, it is possible to develop a new anticancer agent that inhibits the cytoplasmic division of cancer cells.
따라서 이러한 새로운 유형의 항암제의 개발은 CEP55-TEX14의 결합체의 삼차원 구조에 대한 상세한 분석을 필요로 한다.Therefore, the development of these new types of anticancer agents requires a detailed analysis of the three-dimensional structure of CEP55-TEX14 conjugates.
본원은 CEP55-TEX14의 결합체의 삼차원 구조 및 그 용도를 제공하고자 한다. The present disclosure provides a three-dimensional structure of a complex of CEP55-TEX14 and its use.
한 양태에서 본원은 CEP55-EABR과 TEX14 펩타이드 복합체의 3차원 결정구조를 제공한다. In one embodiment, the present disclosure provides a three-dimensional crystal structure of a CEP55-EABR and TEX14 peptide complex.
일 구현예에서 상기 복합체의 결정은 공간군이 P22121 이고, 단위 셀 디멘션(unit-cell dimension)은 a =53.9 Å, b = 102.6 Å, c = 132.5 Å 이며, 상기 CEP (Centrosomal Protein 55) 단백질은 서열번호 1의 160 내지 217 잔기의 아미노산 서열로 표시되고, 상기 TEX14 (Testis-Expressed Gene 14)는 서열번호 2의 792 내지 804 잔기의 아미노산 서열로 표시된다. In one embodiment, the crystal of the complex has a space group of
일 구현예에 따르면 본원에 따른 결정은 2.3Å 해상도로, 표 3 에 기재된 데이터에 의해 정의되는 구조좌표(structure coordinate) 결정의 X-선 회절 데이터를 나타낸다. According to one embodiment, the crystal according to the present invention shows X-ray diffraction data of a structure coordinate determination defined by the data described in Table 3 at a resolution of 2.3 Å.
일 구현예에 따르면 본원에 따른 복합체에서 TEX의 CEP55와 상호작용하는 아미노산 잔기는 Ala793, Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 및 Pro804 잔기이며, 또는 Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 및 Pro804이고, 상기 CEP55의 상기 TEX와 상호작용하는 잔기는 Trp184, Tyr187, Lys180, Glu183 및 Arg191이다. According to one embodiment, the amino acid residues that interact with CEP55 of TEX in the complex according to the present invention are residues Ala793, Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 and Pro804 or Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 and Pro804, The residues interacting with the TEX of CEP55 are Trp184, Tyr187, Lys180, Glu183 and Arg191.
일 구현예에 따르면 TEX의 Gly795, Pro796, Pro797 잔기는 상기 CEP55의 Trp184, Tyr187, Lys180 및 Gln183 잔기와 접촉하며, 상기 TEX의 Pro796, Tyr801, 및 Pro804 잔기는 상기 CEP55의 Tyr187 잔기와 접촉한다. According to one embodiment, the Gly795, Pro796, and Pro797 residues of TEX are contacted with the Trp184, Tyr187, Lys180, and Gln183 residues of the CEP55, and the Pro796, Tyr801, and Pro804 residues of the TEX are contacted with the Tyr187 residue of the CEP55.
다른 양태에서 본원은 또한 본원에 따른 단백질 복합체 결정 및 염을 포함하는 조성물에 관한 것이다.In another aspect, the present invention is also directed to compositions comprising protein complex crystals and salts according to the present invention.
또 다른 양태에서 본원은 본원에 따른 단백질 복합체 결정의 제조방법을 제공한다. In another aspect, the present invention provides a method for preparing a protein complex crystal according to the present invention.
일 구현예에서 상기 방법은 a) 정제된 CEP55 단백질 및 TEX 14 펩타이드를 제공하는 단계로, 상기 CEP55 단백질은 20mM Tris-HCL (pH7.4) 용액 중에, 상기 TEX14 펩타이드는 150mM Tris-HCL (pH8.0) 용액에 포함된 것이고; b) 상기 정제된 단백질 및 펩타이드는 1:2의 몰비로 혼합하는 단계; 및 c) 상기 혼합된 단백질 및 펩타이드를 0.1 M imidazole (pH 8.0), 1 M 인산이암모늄 용액에서 결정화하는 단계를 포함한다. In one embodiment, the method comprises the steps of: a) providing a purified CEP55 protein and a
다른 양태에서 본원은 또한 본원에 따른 복합체 결정을 사용하여 복합체 간의 결합을 저해 또는 향상시키는 물질을 디자인 또는 스크리닝하는 방법을 제공한다. In another aspect, the present invention also provides a method of designing or screening a substance that inhibits or enhances binding between complexes using the complex crystals according to the present invention.
다른 양태에서 본원은 또한 CEP55-EABR 영역에 결합하는, 항암제 후보물질인 TEX14 유도체를 스크리닝하는 방법을 제공한다. In another aspect, the invention also provides a method of screening for a TEX14 derivative that is an anticancer agent candidate, which binds to the CEP55-EABR region.
일 구현예에서 상기 방법은 서열번호 1의 160 내지 217 아미노산 잔기로 표시되는 CEP55-EABR 영역 또는 상기 영역을 포함하는 CEP55 전장 또는 상기 영역을 포함하는 CEP55 단편 및 AxGPPx3YxPP로 표시되는 TEX14 펩타이드를 제공하는 단계로, 상기 AxGPPx3YxPP에서 A는 Ala, G는 Gly, P는 Pro, Y는 Tyr, X는 임의의 아미노산이며, 상기 CEP55-EABR 영역, 이를 포함하는 CEP55 전장 또는 단편 및 상기 TEX14 펩타이드를 시험물질과 접촉시키는 단계로, 상기 시험물질은 상기 CEP55-EABR 영역에 상기 TEX14 펩타이드와 경쟁적으로 결합을 할 수 있는 TEX14 유도체이고; 상기 시험물질의 존재 중에서 상기 CEP55-EABR에의 상기 TEX14 펩타이드의 결합을 측정하는 단계; 및 상기 측정 결과, 상기 시험물질과 접촉되지 않은 대조군과 비교하여 접촉된 실험군에서, 상기 CEP55-EABR에의 상기 TEX14 펩타이드의 결합이 감소한 경우, 상기 시험물질을 항암제 후보물질로 선별하는 단계를 포함한다.In one embodiment, the method comprises providing a CEP55-EABR region represented by the
일 구현예에서 상기 TEX 펩타이드는 서열번호 2의 793 내지 804 잔기의 아미노산 서열, 서열번호 2의 792 내지 804 잔기의 아미노산 서열 또는 서열번호 2의 791 내지 804 잔기의 아미노산 서열로 표시된다. In one embodiment, the TEX peptide is represented by an amino acid sequence of residues 793 to 804 of SEQ ID NO: 2, an amino acid sequence of
일 구현예에서 상기 CEP55-EABR 영역은 인간 유래로 서열번호 1의 160 내지 217 잔기로 표시되는 아미노산 서열로 표시되고, 상기 CEP55 전장 (full length)은 서열번호 1의 아미노산 서열로 표시된다. In one embodiment, the CEP55-EABR region is represented by an amino acid sequence represented by 160 to 217 residues of SEQ ID NO: 1 from human, and the full length of CEP55 is represented by an amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.
일 구현예에서 TEX14 유도체는 상기 EABR 영역에 결합할 수 있는 폴리펩타이드이며, AxGPPx3YxPP 아미노산 서열의 폴리펩타이드에서 상기 Ala, Gly, Pro, Pro, Tyr, Pro 및 Pro 중 어느 하나가, 상기 TEX14 유도체의 상기 EABR 영역에서 결합을 증가시키는 방식으로 변형된 것으로, 상기 변형은 아미노산 잔기의 치환 또는 아미노산 측쇄의 화학적 변형된 것이며, 상기 치환은 비보전적 치환 또는 보전적 치환을 포함한다. In one embodiment TEX14 derivative is a polypeptide capable of binding to the EABR area, AxGPPx 3 YxPP in the polypeptide of the amino acid sequence is any one of Ala, Gly, Pro, Pro, Tyr, Pro and Pro, the TEX14 derivative Wherein the modification is a chemical modification of a substitution or amino acid side chain of an amino acid residue, wherein the substitution comprises non-conservative substitution or conservative substitution.
본원에 따른 복합체 결정은 CEP55-TEX14 결합 부위의 정확한 삼차원 구조에 대한 세부정보를 제공하며, 이를 이용하여 CEP55 단백질에 강하게 결합하여 세포 분열을 억제할 수 있는 펩타이드 유도체 또는 저분자 화합물을 발굴함으로써 세포질 분열을 억제하는 형태의 항암제 개발에 이용될 수 있다.The complex crystals according to the present invention provide detailed information on the precise three-dimensional structure of the CEP55-TEX14 binding site and use it to identify peptide derivatives or low molecular compounds capable of binding to the CEP55 protein to inhibit cell division, Can be used to develop anticancer drugs in the form of suppression.
도 1은 본원의 일 실시예에 따른 TEX14 펩타이드에 결합된 CEP55-EABR 결정 구조 및 경합 에세이를 나타낸 것이다. (A) CEP55 및 TEX14의 도메인 구조물을 나타낸다. ANK는 ankyrin 반복을 나타낸다. CC는 코일화된-코일 구조를 나타낸다. (B) TEX14, ALIX, TSG101, 및 상응하는 키메릭 펩타이드의 CEP55-결합 서열을 나타낸다. 노란색으로 표시된 부분은 엄격하게 보존된 잔기를 의미한다. 굵은 글씨와 회색으로 표시된 부분은 중요 특징을 강조한 것이다. (C) CEP55-EABR을 TEX14 또는 ALIX 펩타이드와 같이 SPR(Surface plasmon resonance) 분석한 것이다. RU는 반응 유닛(response unit)을 의미한다. (D) 지시된 양의 TEX14792 -807 펩타이드 경쟁자의 존재 하에서 GST-ALIX795 -811에 의한 CEP55-EABR 풀-다운(pull-down) 분석을 나타낸 것이다. (E) TEX14-결합된 CEP55-EABR에의 ALIX의 경쟁적 결합을 SPR 분석을 나타낸다. (F) CEP55-EABR에 결합된 TEX14(주황색) 및 ALIX(녹색) 펩타이드를 중첩(Superposition)한 것을 나타낸다. (G) TEX14792 -804 펩타이드 주변에 2Fo - Fc 맵을 그린 것이다(1.0 σ).
도 2는 본원의 일 실시예에 따른 CEP55-EABR 및 TEX14 (또는 ALIX)와의 상호작용을 나타낸 것이다. (A) TEX14 펩타이드와 함께 있는 CEP55-EABR 표면의 선택 영역을 클로즈업하여 본 것이다. (B) TEX14 단편에 결합한 CEP55-EABR에 영향을 미치는 야생형 및 돌연변이 구조물을 SPR 분석한 것이다. (C) 자유 상태(검정색) 및 몰비율 1:0.25(적색) 및 1:0.5(파란색)로 TEX14 또는 ALIX 펩타이드와 복합체에 있는 15N-표지된 CEP55-EAB에서 얻은 NMR 1H-15N TROSY 스펙트라(도 S4 A 및 B)의 선택 부위를 타나낸다.
도 3은 본원의 일 실시예에 따른, 키메릭 펩타이드에 결합된 CEP55-EABR의 결정 구조를 나타낸다. (A) CEP55-EABR 및 키메릭 펩타이드 사이의 상호작용에 대한 GST 풀-다운 분석을 나타낸 것이다. 각 겔상에 분리된 단백질은 쿠마씨 블루 염색으로 가시화하였다. 각 구조물은 적절한 겔 영상 위에 나타내었고, 화살표는 GST-TEX14N-ALIXC 또는 GST-ALIXN-TEX14C를 함유하는 GST 레진에 결합된 CEP55160 - 217를 나타낸다. M은 단백질 마커를 나타낸다. (B) CEP55-EABR 키메라 (GST-TEX14N-ALIXC 및 GST-ALIXN-TEX14C) 상호작용의 SPR 센서그램을 나타낸다. 모든 센서그램은 GST-TEX14N-ALIXC 또는 GST-ALIXN-TEX14C 에 결합된 유세포 위에 지시된 양의 CEP55160-217 단백질을 통과시켜 측정하였다. (C) TEX14N-ALIXC (청록색) 및 ALIXN-TEX14C (노란색)을 중첩한 것이다. (D 및 E) 각각 TEX14N-ALIXC 펩타이드(1.0 σ) 및 ALIXN-TEX14C 펩타이드(1.0 σ) 주변에 2Fo - Fc 맵을 그린 것이다.
도 4는 중앙체(midbody) 로컬화 및 다핵화에 대한 TEX14의 점 돌연변이의 형향을 나타낸 것이다. (A) 체세포 및 마우스 테스트 모두에서의 ALIX, TSG101, MKLP1, CEP55, 및 TEX14 발현을 RT-PCR 분석한 것이다. 마우스 테스트에서의 ALIX, TSG101, MKLP1, CEP55, 및 TEX14의 상대적 발현 레벨을 결정하기 위하여 정량 RT-PCR 분석을 추가적으로 수행하였다(도 S4C). 수컷 생식 세포에 대한 마커로 DAZL를 사용하였고, GAPDH를 내부 대조군으로 사용하였다. (B) 야생형 TEX14 및 돌연변이의 중앙체 로컬화를 나타낸다. GFP-TEX14 WT 및 이의 돌연변이는 일시적으로 HeLa 세포로 트랜스펙션하였다. HeLa 세포에 포획된 모든 중앙체는 GFP (녹색), α-튜블린 (적색), 및 DAPI (파란색)로 염색하였다. (인셋) 파선(dashed-line) 박스를 확대하여 본 것이다[스케일 바, 10 μm; 1 μm (인셋).]. (C) B에 나타난 실험에서 중앙체에 GFP 강도를 정량화한 것이다. 세포에 포획된 총 150 중앙체를 세 번의 반복된 실험에서 계수하였다. 상대적 GRP 강도는 TEX14 WT 트랜스펙트된 세포에서의 GFP 평균 강도로 노말라이즈하였다. 에러 바는 SEM을 나타낸다. N.D.는 결정되지 않음(not determined)을 나타낸다. (D) 야생형 및 돌연변이 TEX14-플래그 안정세포 라인에서 2n, 4n, 및 8n DNA를 함유하는 다핵화 세포의 퍼센트를 나타낸다(n=3; 컨디션 당 세포수 > 200). 에러바는 SEM을 나타낸다. (E) 독시싸이클린 부재(-dox) 및 1㎍/mL 독시싸이클린 존재(+dox)시의 TEX12 WT-플래그 안정세포에 대한 대표적 현미경 영상을 나타낸 것이다. 중앙체 포획된 안정 세포 둘다 GFP(녹색), α-튜블린(적색), 및 DAPI(파란색)으로 염색하였다. (인셋) 파선(dashed-line) 박스를 확대하여 본 것이다[스케일 바, 10 μm; 1 μm (인셋).].
도 5는 ALIX를 TEX14로 중앙체 치환한 것이다. (A) 야생형 TEX14 및 돌연변이 안정세포의 중앙체에서 내인성 ALIX 치환의 대표적 현미경 영상을 나타낸 것이다. 안정세포는 flag (녹색), ALIX (적색), α-튜블린 (청록색), 및 DAPI (파란색)로 염색하였다. 점선은 중앙체 포획세포의 테두리를 나타낸다. (인셋) 파선(dashed-line) 박스를 확대하여 본 것이다[스케일 바, 10 μm; 1 μm (인셋).]. (B) A에 기재한 실험에서 중앙체에서 ALIX 강도를 정량화한 것이다. 150이상의 중앙체 포획된 세포를 각 안정세포 라인에서 계수하였고, 실험은 세 번 반복하였다. 상대적 ALIX 강도는 빈(empty) HeLa FRT/TO 세포에서의 평균 강도로 노말라이즈하였다. 에러바는 SEM을 나타낸다. ***P<0.001.
도 6은 본원의 일 실시예에 따른 CEP55-TEX14 및 CEP55-ALIX 상호작용 및 전체 모델을 SPR 분석한 것이다. (A) CEP55-EABR-TEX14 및 CEP55-EABR-ALIX 상호작용의 해리율을 SPR 분석한 것이다. 해리율을 계산하기 위하여, 고정된 GST-TEX14792 -807 또는 GST-ALIX795 -811에서 결합 CEP55-EABR(지시된 양)의 해리 커브를 측정하여 맞춘 것이다. (B) 중앙체에서 CEP55-TEX14 및 CEP55-ALIX 복합체의 구성(또는ganization)에 대한 모델을 나타낸다. 본 발명에 개시한, 생식세포의 세포간 브릿지를 호송하기 위한 다층화된 시스템의 도식도이다. 각 중앙체 단계에서의 세포 도식도가 나타나 있으며, CEP55, TEX14, ALIX, 및 MKLP1의 도메인 구조(architecture)가 나타나있다.
Figure 1 depicts a CEP55-EABR crystal structure and competition assay coupled to a TEX14 peptide according to one embodiment of the invention. (A) Represents the domain structure of CEP55 and TEX14. ANK represents ankyrin repeats. CC represents a coiled-coil structure. (B) the CEP55-binding sequence of TEX14, ALIX, TSGlOl, and the corresponding chimeric peptide. The area marked in yellow means a strictly conserved residue. The bold and gray areas highlight important features. (C) Surface plasmon resonance (SPR) analysis of CEP55-EABR with TEX14 or ALIX peptides. RU means the response unit. (D) an amount of 792 -807 TEX14 CEP55 EABR-pool by the presence of a competitor peptide to GST-ALIX 795 -811 Instruction-down (pull-down) shows an analysis. (E) Competitive binding of ALIX to TEX14-bound CEP55-EABR is shown by SPR analysis. (F) Superposition of TEX14 (orange) and ALIX (green) peptides bound to CEP55-EABR. (G) TEX14 792 -804 2F o -F c around peptide I draw the map (1.0 σ).
Figure 2 illustrates the interaction with CEP55-EABR and TEX14 (or ALIX) according to one embodiment of the present disclosure. (A) Close-up of the selection area of the CEP55-EABR surface with the TEX14 peptide. (B) SPR analysis of wild type and mutant structures affecting CEP55-EABR bound to TEX14 fragment. (C)
Figure 3 depicts the crystal structure of CEP55-EABR bound to a chimeric peptide, according to one embodiment of the disclosure. (A) GST pull-down analysis of the interaction between CEP55-EABR and chimeric peptides. The separated proteins on each gel were visualized by Coomassie blue staining. Each structure is exhibited over a suitable gel image, the arrow a CEP55 160 coupled to GST resin containing GST-TEX14 N -ALIX C or GST-ALIX N -TEX14 C - shows a 217. M represents a protein marker. (B) SPR sensorgram of CEP55-EABR chimera (GST-TEX14 N -ALIX C and GST-ALIX N- TEX14 C ) interaction. All sensorgrams are GST-TEX14 N -ALIX C or GST-ALIX N- TEX14 C Lt; RTI ID = 0.0 > CEP55 < / RTI > 160-217 protein. (C) It overlaps TEX14 N- ALIX C (cyan) and ALIX N -TEX14 C (yellow). (D and E), respectively TEX14 N -ALIX peptide C (1.0 σ) and ALIX N -TEX14 C around the peptide (1.0 σ) 2F o - F c I draw the map.
Figure 4 shows the shape of the point mutation of TEX14 for midbody localization and polynucleation. (A) RT-PCR analysis of expression of ALIX, TSG101, MKLP1, CEP55, and TEX14 in both somatic and mouse tests. Quantitative RT-PCR analysis was additionally performed to determine the relative expression levels of ALIX, TSGlOl, MKLPl, CEP55, and TEX14 in mouse tests (Fig. S4C). DAZL was used as a marker for male reproductive cells and GAPDH was used as an internal control. (B) centralized localization of wild-type TEX14 and mutants. GFP-TEX14 WT and its mutants were transiently transfected into HeLa cells. All mediators captured in HeLa cells were stained with GFP (green), alpha -tubulin (red), and DAPI (blue). (Inset) dashed-line box (scale bar, 10 μm; 1 μm (inset).]. (C) In the experiment shown in B, GFP intensity was quantified in the center sieve. A total of 150 entities captured in the cells were counted in three repeated experiments. Relative GRP intensities were normalized to GFP mean intensities in TEX14 WT transfected cells. The error bar indicates the SEM. ND indicates not determined. (D) Percentage of polynucleated cells containing 2n, 4n, and 8n DNA in wild type and mutant TEX14-flag stable cell lines (n = 3; number of cells per condition> 200). The error bar indicates the SEM. (E) Representative microscopic images of TEX12 WT-flagstabilized cells in the absence of doxycycline (-dox) and presence of 1 μg / mL doxycycline (+ dox). Both centrally captured stable cells were stained with GFP (green), alpha -tubulin (red), and DAPI (blue). (Inset) dashed-line box (scale bar, 10 μm; 1 μm (inset).].
Figure 5 shows the ALIX substituted centrally with TEX14. (A) Representative microscopic images of endogenous ALIX substitutions in wild-type TEX14 and in the center of mutant stable cells. Stable cells were stained with flag (green), ALIX (red), α-tubulin (cyan), and DAPI (blue). The dashed line represents the rim of the medulla fetus cell. (Inset) dashed-line box (scale bar, 10 μm; 1 μm (inset).]. (B) In the experiment described in A, the ALIX intensity was quantified in the center sieve. 150 or more centrioles of captured cells were counted in each stable cell line and the experiment was repeated three times. Relative ALIX intensity was normalized to mean intensity in empty HeLa FRT / TO cells. The error bar indicates the SEM. *** P <0.001.
6 is a SPR analysis of the CEP55-TEX14 and CEP55-ALIX interactions and the overall model according to one embodiment of the present disclosure. (A) SPR analysis of dissociation rates of CEP55-EABR-TEX14 and CEP55-EABR-ALIX interactions. , It is focused by measuring the dissociation curve of the combination at the fixed GST-TEX14 792 -807 or GST-ALIX 795 -811 CEP55-EABR ( the indicated amount) to calculate the dissociation rate. (B) Models for the construction (or ganization) of the CEP55-TEX14 and CEP55-ALIX complexes in the central body. FIG. 1 is a schematic diagram of a multi-layered system for delivering intercellular bridges of germ cells disclosed in the present invention. The cell schematic diagrams at each central stage are shown and the domain architecture of CEP55, TEX14, ALIX, and MKLP1 is shown.
본원에서는 CEP55-TEX14 복합체 결정의 3차 구조 결정을 통해 상기 복합체의 구조적 특징, 상호작용하는 잔기 및 상호작용 기전을 규명하였다. 생식세포는 TEX14 (testis-expressed gene 14)와의 결합을 통해 세포절단을 불활성화시키는 작용을 가지고 있다. 본원에서는 TEX14가 AxGPPx3YxPP 모티브를 통해 CEP55 (centrosomal protein 55 kDa)-EABR[endosomal sorting complex required for transport (ESCRT) and ALIX-binding region]에 ESCRT 장치의 한 성분이며 AxGPPx3Y 모티브를 포함하는 ALIX와 경쟁적으로 결합하여 ALIX가 리쿠르트되는 것을 막는 것을 규명하였으며, 이를 통해 TEX14은 ALIX에 존재 중에서도 CEP55-EABR에 우위적으로 결합하여 생식세포의 세포간 브릿지를 보호한다는 것을 밝혔다. The structural features, interacting residues, and interaction mechanism of the complex were identified through the determination of the tertiary structure of the CEP55-TEX14 complex crystals. The germ cells have a function to inactivate the cell cleavage by binding to TEX14 (testis-expressed gene 14). Here we demonstrate that TEX14 is a component of the ESCRT device in the CEP55 (centrosomal protein 55 kDa) -EABR [ESCRT and ALIX-binding region] through the AxGPPx 3 YxPP motif and competes with the ALIX containing the AxGPPx3Y motif To prevent recruiting of ALIX, thereby revealing that TEX14 protects intercellular bridges of germ cells by predominantly binding to CEP55-EABR in the presence of ALIX.
이에, 본원은 CEP55-TEX14 단백질 복합체 결정에 관한 것이다. Accordingly, the present invention relates to a CEP55-TEX14 protein complex crystal.
본원에 따른 CEP55는 생식세포생성과정에서 세포간 브릿지 형성 그리고 체세포분열에서 카이네토코어-마이크로튜블 부착에 관여하는 단백질로 인간서열은 GenBank No. NP_001120654 (서열번호 1)로 표시된다. 본원에서는 특히 CEP55-EABR 영역을 포함한다. 일 구현예에서 CEP55-EABR 영역은 서열번호 1의 서열의 아미노산 잔기 160 내지 217로 표시된다. 본원에 따른 단백질은 야생형 단백질, 또는 돌연변이, 또는 상기 서열에 치환이 있으나 야생형 단백질과 동일한 3차 구조를 갖는 단백질 결정을 포함하는 것이다. CEP55 according to the present invention is a protein involved in attachment of carinat core-microtubule in intercellular bridge formation and somatic cell division in the process of germ cell production. It is indicated by NP_001120654 (SEQ ID NO: 1). In particular, the present invention encompasses the CEP55-EABR region. In one embodiment, the CEP55-EABR region is represented by
본원에 따른 TEX14은 정자생성과정에서 생식세포의 세포간 브릿지 형성에 필요한 단백질로서 인간 서열은 GenBank No. AAH40526 (서열번호 2)의 아미노산 서열로 표시될 수 있다. 본원에 따른 복합체 결정에는 상기 서열의 792 내지 804 잔기의 아미노산 서열의 폴리펩타이드를 포함한다. TEX14 according to the present invention is a protein necessary for the formation of intercellular bridges of germ cells in the process of sperm production. Can be represented by the amino acid sequence of AAH40526 (SEQ ID NO: 2). The complex crystals according to the present invention include polypeptides having an amino acid sequence of 792 to 804 residues of the above sequence.
본원의 결정은 다양한 형태를 취할 수 있으며, 예를 들면 조성물의 형태로 제공될 수 있으며, 본원의 일 구현예에서 복합체 결정은 염을 포함하는 조성물의 형태로 제공된다. The crystals herein may take a variety of forms and may be provided, for example, in the form of a composition, wherein in one embodiment the complex crystals are provided in the form of a composition comprising a salt.
일 구현예에서 본원의 결정은 표 3에 기재된 3차 구조를 갖는다. 본원의 결정은 복합체 결정은 공간군이 P22121 이고, 단위 셀 디멘션(unit-cell dimension)은 a =53.9 Å, b = 102.6 Å, c = 132.5 Å 이다. In one embodiment, the crystals herein have a tertiary structure as set forth in Table 3. In the crystal of the present invention, the complex crystal has a space group of
다른 구현예에서 본원의 결정은 표 3의 좌표로 기술할 수 있는데, 표 3의 데이터는 3차원에서의 모양을 결정하는 상대적 위치의 데이터 세트를 제공한다. 상이한 오리진 및 축을 갖는 전적으로 상이한 위치 테이터 세트도 유사한 3차원 모양을 결정할 수 있다. 마찬가지로 데이터세트를 다양한 원자 사이의 거리를 증가 또는 감소시키거나 또는 용매 분자를 추가 또는 제거하기 위해 데이터 세트를 조정하더라도 표 3의 데이터세트에 의해 규정된 전체적 3차 구조는 유의성있게 변하지 않을 것이다. 따라서 표 3 에 대한 언급은 동일한 일반적 CEP55-TEX14 복합체의 좌표 세트 (Coordinate set) 또는 이에 약간의 변형이 가해진 데이터세트를 포함하는 것이다. 동일하지 않으나, 표 3의 데이터세트에 의해 정의되는 것과 유사한 구조는 컴퓨터 프로그램 예컨대 Molecular Similarity application of QUANTA(Molecular Simulations Inc, USA)를 사용할 수 있다. In another embodiment, the determination of the present disclosure can be described by the coordinates of Table 3, where the data in Table 3 provides a data set of relative positions that determine the shape in three dimensions. An entirely different set of positional data with different origins and axes can also determine similar three-dimensional shapes. Similarly, the overall tertiary structure defined by the data set of Table 3 will not change significantly, even if the data set is adjusted to increase or decrease the distance between various atoms or to add or remove solvent molecules. Thus, the reference to Table 3 includes a Coordinate set of the same generic CEP55-TEX14 complex or a data set to which a slight modification has been made. A structure similar to that defined by the data set of Table 3, although not identical, may be a computer program such as the Molecular Similarity application of QUANTA (Molecular Simulations Inc, USA).
나아가 표 3의 데이터세트에 의해 정의되는 3차 구조에는 일반적 CEP55-TEX14 복합체의 3차 구조를 변형함이 없이, CEP55 또는 TEX14단백질 서열의 하나 이상에 부가, 치환, 결실이 발생한 것도 포함하는 것이다. 3차 구조 및 또는 활성을 변경하지 않고도, 단백질의 1차 구조 (서열)를 변경하는 방법은 당업계에 알려져 있다. 또한 당업자라면, 제공된 3차 구조를 보고, 단백질의 접힘/구조, 활성 등에 변화를 주지 않는 부위를 용이하게 파악할 수 있을 것이며, 이러한 부위의 변이는 3차 구조 또는 활성에 큰 변화를 가져오지 않으며, 이러한 것도 표 3에 의해 정의되는 3차 구조에 포함되는 것이다. Furthermore, the tertiary structure defined by the data set of Table 3 includes those in which addition, substitution or deletion occurs in one or more of the CEP55 or TEX14 protein sequences, without modifying the tertiary structure of the general CEP55-TEX14 complex. Methods for altering the primary structure (sequence) of a protein without altering its tertiary structure and / or activity are known in the art. Those skilled in the art will also be able to readily identify sites that do not alter the folding / structure, activity, etc. of the protein by viewing the provided tertiary structure, and such variations do not lead to a significant change in tertiary structure or activity, These are also included in the tertiary structure defined by Table 3.
다른 구현예에서 본원은 2.3 Å의 해상도로 표 3의 구조 결정용 구조 좌표 (Structure coordinate)의 X-선 회절 데이터를 나타내는 CEP55-TEX14 단백질 복합체이다. In another embodiment, the present invention is a CEP55-TEX14 protein complex showing X-ray diffraction data of structure coordinates for structure determination in Table 3 at a resolution of 2.3 A.
본원에 따른 복합체에서 CEP55-EABR과 TEX14 폴리펩타이드는 소수성 결합을 통해 상호작용을 한다. In the complex according to the present invention, CEP55-EABR and TEX14 polypeptides interact via hydrophobic binding.
일 구현예에서 상기 TEX에서 상기 CEP55와 상호작용하는 잔기는 Ala793, Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 및 Pro804 잔기; 또는 Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 및 Pro804이고, 상기 CEP55에서 상기 TEX와 상호작용하는 잔기는 Trp184, Tyr187, Lys180, Glu183 및 Arg191인, CEP55-TEX14 단백질 복합체 결정.In one embodiment, the residue interacting with the CEP55 in the TEX is selected from the group consisting of Ala793, Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 and Pro804 residues; Or a CEP55-TEX14 protein complex crystal wherein the residues interacting with the TEX in CEP55 are Trp184, Tyr187, Lys180, Glu183 and Arg191, wherein Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 and Pro804.
다른 구현예에서 TEX의 Gly795, Pro796, Pro797 잔기는 상기 CEP55의 Trp184, Tyr187, Lys180 및 Gln183 잔기와 접촉하며, 상기 TEX의 Pro796, Tyr801, 및 Pro804 잔기는 상기 CEP55의 Tyr187 잔기와 접촉한다. In another embodiment, the Gly795, Pro796, and Pro797 residues of TEX are contacted with the Trp184, Tyr187, Lys180, and Gln183 residues of the CEP55, and the Pro796, Tyr801, and Pro804 residues of the TEX are contacted with the Tyr187 residue of the CEP55.
본원의 결정은 다양한 형태를 취할 수 있으며, 예를 들면 조성물의 형태로 제공될 수 있으며, 일 구현예에서 본원에 따른 복합체 결정은 염을 포함하는 조성물의 형태로 제공된다. The crystals herein may take a variety of forms, for example in the form of a composition, and in one embodiment the complex crystals according to the invention are provided in the form of a composition comprising a salt.
다른 양태에서 본원은 하기를 포함하는 본원에 따른 단백질 복합체 결정의 제조 방법에 관한 것이다. 일 구현예에서 본원에 따른 방법은 a) 정제된 CEP55-EABR 영역, 정제된 CEP55 단백질 또는 상기 영역을 포함하는 단편 및 TEX14 펩타이드를 제공하는 단계로 CEP55-EABR 영역, 정제된 CEP55 단백질 또는 상기 영역을 포함하는 단편은 20mM Tris-HCL (pH7.4) 용액 중에, 상기 TEX14 펩타이드는 150mM Tris-HCL (pH8.0) 용액에 포함된 것이고, b) 상기 CEP55-EABR 영역, 정제된 CEP55 단백질 또는 상기 영역을 포함하는 단편 및 펩타이드를 1:2의 몰비로 혼합하는 단계; 및 c) 상기 혼합된 단백질 및 펩타이드를 0.1 M imidazole (pH 8.0), 1 M ammonium phosphate dibasic 용액에서 결정화하는 단계를 포함한다. In another aspect, the present invention is directed to a method of making a protein complex crystal according to the present invention, including: In one embodiment, a method according to the present invention comprises the steps of: a) providing a purified CEP55-EABR region, a purified CEP55 protein or a fragment comprising said region and a TEX14 peptide, wherein the CEP55-EABR region, the purified CEP55 protein, The TEX14 peptide is contained in a solution of 20 mM Tris-HCl (pH 7.4), the TEX14 peptide is contained in a solution of 150 mM Tris-HCl (pH 8.0), and b) the CEP55-EABR region, And a peptide at a molar ratio of 1: 2; And c) crystallizing the mixed proteins and peptides in 0.1 M imidazole (pH 8.0), 1 M ammonium phosphate dibasic solution.
본원에 따른 방법에 사용되는 CEP55-EABR 영역, 정제된 CEP55 단백질 또는 상기 영역을 포함하는 단편에서, CEP55-EABR 영역은 인간유래로 서열번호 1의 잔기 160 내지 217 아미노산 서열로 표시될 수 있고, 상기 전장은 서열번호 1의 아미노산 서열로 표시될 수 있으며, 상기 단편은 상기 CEP55-EABR 영역을 포함하는 것으로, 상기 전장보다 짧은 것을 의미하는 것으로 당업자에게 명확한 것이다. In a CEP55-EABR region, a purified CEP55 protein or a fragment comprising such a region as used in the method according to the present invention, the CEP55-EABR region may be represented by a human 160 to 217 amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, The total length may be represented by the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and the fragment includes the CEP55-EABR region and is apparent to those skilled in the art to mean shorter than the total length.
본원에 따른 방법에 사용되는 TEX14 펩타이드는 서열번호 2의 아미노산 잔기 791 내지 804, 792 내지 804 또는 793 내지 804 잔기의 아미노산 서열 중 어느 하나로 표시될 수 있다.The TEX14 peptide used in the method according to the present invention may be represented by any one of the amino acid residues 791 to 804, 792 to 804, or 793 to 804 residues of SEQ ID NO: 2.
본원에 따른 방법에 사용되는 폴리펩타이드 또는 단백질 발현은 당업계의 공지된 통상의 방법을 사용하여 실시할 수 있다. 예를 들어, 단백질을 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 PCR과 같은 당엄계의 통상적인 방법을 이용하여, 통상적으로 이용되는 벡터, 예컨대 pQE30, pGEM-T, pSC101, ColE1,pBR322, pUC8/9, pHC79, pUC19 또는 pET 와 같은 발현벡터에 삽입한 다음, 적합한 숙주 세포, 그람음성 박테리아 등에 형질전환시키고, 형질전환된 세포를 배양하여 목적하는 단백질을 대량으로 발현시킬 수 있다.The polypeptide or protein expression used in the method according to the present invention can be carried out using conventional methods known in the art. For example, a nucleotide sequence encoding a protein may be inserted into a commonly used vector such as pQE30, pGEM-T, pSC101, ColE1, pBR322, pUC8 / 9, pHC79, pUC19 Or pET, and then transformed into a suitable host cell, gram-negative bacterium or the like, and the transformed cells are cultured to express a desired protein in a large amount.
발현된 단백질은 당업계에 공지된 다양한 정제 방법에 따라 정제할 수 있다. 예를 들어, 이로 제한하는 것은 아니나 배양된 형질전환 세포를 파쇄하여 얻은 크루드 추출물을 다양한 크로마토그래피 (크기, 전하, 소수성 또는 친화성에 따른 분리를 위해 제작된 것)에 적용하여 단백질을 정제할 수 있다.The expressed protein can be purified according to various purification methods known in the art. For example, the protein may be purified by applying a crude extract obtained by disrupting the cultured transformed cells, but not limited thereto, to various chromatographies (prepared for separation by size, charge, hydrophobicity, or affinity) have.
상기 방법은 특히 CEP55-EABR과 TEX14 펩타이드 결정화하기에 효과적이다. 본원에 따른 방법에서 정제된 단백질을 결정화에 적합하도록 복합체를 안정화시킬 수 있는 조건에서 처리한다. 이러한 결정을 얻기 위한 용액은 알카리성 조건, 특히 약 알카리성 조건에서 수행되며 당업계의 공지된 다양한 완충액이 사용될 수 있다. 본원의 한 구현예에서는 트리스가 사용된다. 상기 용액은 또한 이미다졸 및 암모늄 포스페이트를 포함한다. 한 구현에에서 상기 용액은 0.1mM 이미다졸 및 1mM 암모늄포스페이트를 포함한다. 본원에 따른 방법은 약 4℃ 내지 약 30℃에서 수행될 수 있으며, 한 구현예에서 22℃에서 수행된다. The method is particularly effective for crystallizing CEP55-EABR and TEX14 peptides. In the method according to the invention, the purified protein is treated under conditions which allow the complex to stabilize for crystallization. Solutions for obtaining such crystals are carried out under alkaline conditions, especially weakly alkaline conditions, and various buffers known in the art can be used. In one embodiment of the invention, tris is used. The solution also includes imidazole and ammonium phosphate. In one embodiment, the solution comprises 0.1 mM imidazole and 1 mM ammonium phosphate. The process according to the present invention may be carried out at about 4 ° C to about 30 ° C, and in one embodiment at 22 ° C.
본원에서는 3차 구조 및 본원 실시예에 기재된 다양한 생화학적 실험을 통해 TEX 펩타이드에서 CEP55와 결합하는 잔기는 Ala793, Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 및 Pro804 잔기이고, CEP55의 상기 TEX와 결합하는 잔기는 Trp184, Tyr187, Lys180, Glu183 및 Arg191인 것을 규명하였다. 특히 TEX의 Gly795, Pro796, Pro797 잔기는 CEP55의 Trp184, Tyr187, Lys180 및 Gln183 잔기와 접촉하며, 상기 TEX의 Pro796, Tyr801, 및 Pro804 잔기는 상기 CEP55의 Tyr187 잔기와 상호작용을 한다. Throughout the various biochemical experiments described herein in the tertiary structure and in the Examples herein, the residues that bind to CEP55 in the TEX peptide are residues Ala793, Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 and Pro804 and the residue of CEP55 that binds to the TEX Were Trp184, Tyr187, Lys180, Glu183 and Arg191. Specifically, the Gly795, Pro796, and Pro797 residues of TEX are contacted with Trp184, Tyr187, Lys180, and Gln183 residues of CEP55, and the Pro796, Tyr801, and Pro804 residues of the TEX interact with the Tyr187 residue of the CEP55.
본원에 따른 결정화된 복합체의 결정의 전부 또는 일부 및 결정화 데이터와 정보는 다양한 용도로 사용될 수 있다. 본원 이전에는 이러한 정보는 존재하지 않았다. All or part of the crystals of the crystallized complex according to the present invention and the crystallization data and information can be used for various purposes. Prior to this, this information did not exist.
새로운 항암제를 개발하는 데 있어서 항암 표적 단백질의 삼차원 구조는 매우 유용하게 사용될 수 있다. 따라서 본원에서 규명된 항암 표적 단백질인 CEP55-EABR과 TEX14 펩타이드와의 결합체의 3차원 구조의 정보를 이용하여 CEP55 EABR 영역에 강하게 결합하여 세포 분열을 억제할 수 있는 펩타이드의 유도체 또는 저분자 화합물을 발굴함으로써 세포질 분열을 억제하는 형태의 항암제 개발에 유용하게 이용될 수 있다.The three-dimensional structure of anticancer target proteins can be very useful in developing new anticancer drugs. Therefore, by using the information of the three-dimensional structure of the complex of the anticancer target protein CEP55-EABR and TEX14 peptide identified herein, it is possible to identify a peptide derivative or a low molecular compound capable of binding to the CEP55 EABR region to inhibit cell division And may be useful for the development of anticancer agents that inhibit cytoplasmic division.
이러한 관점에서 본원은 한 양태에서 본원에 따른 복합체 결정을 사용하여 이의 결합을 저해 및/또는 증가시키는 물질을 스크리닝하거나 또는 디자인하는 방법을 제공한다. 상기 방법에는 기본적으로 본원에서 수득한 복합체 결합부위에 대한 3차 구조를 사용될 수 있으며, 적어도 하나의 후보물질을 상기 3차 구조의 결합부위와 겹쳐 결합에 대한 영향을 평가하여, 결합부위와 공간적으로 적합한 물질을 약물로서 선별할 수 있다. In this regard, the present invention provides in one aspect a method of screening or designing a substance that inhibits and / or increases binding thereof using a complex crystal according to the present disclosure. In this method, a tertiary structure based on the complex binding site obtained in the present invention can be used, and at least one candidate substance can be evaluated for the effect of overlapping the binding site of the tertiary structure, Suitable substances can be selected as drugs.
다른 양태에서 본원의 방법은 본원의 3차 구조를 사용하여 체계적 약물 설계(rational drug design)를 사용할 수 있다. 후보 화합물을 결합영역의 전부 또는 일부와 결합시킨 후 이의 결합 잠재성(potential)을 측정하고 이를 기존의 알려진 물질의 결합력과 비교하여 후보 물질을 선별할 수 있다. In other embodiments, the methods herein may use rational drug design using the tertiary structure of the present disclosure. The candidate compound can be bound to all or a portion of the binding region, and the binding potential of the candidate compound can be measured and compared with the binding force of existing known substances to select candidates.
또다른 양태에서 본원의 방법은 복합체의 결합을 증진시키는 화합물의 디자인하는 방법에 관한 것이다. 본 방법은 컴퓨터에 본원에서 밝혀진 3차 구조에 대한 데이터를 제공하고, 소프트웨어를 이용하여 이러한 물질을 디자인한다. 본 방법은 공지된 방법을 이용하여 디자인된 화합물을 합성한 후, 이를 인비트로 및/또는 인비보에서 평가하는 단계를 포함한다. In another embodiment, the methods of the invention relate to methods of designing compounds that enhance binding of the complex. The method provides data for the tertiary structure disclosed herein to a computer and designs such materials using software. The method includes synthesizing the designed compounds using known methods and then evaluating them in Invitro and / or Invivo.
또한 본원에 따른 단백질 결정화조건은 리드화합물(lead compound)과의 복합체 결정을 만드는데도 사용될 수 있으며, 이러한 복합체의 구조는 효과적인 항암제 재디자인에 필수적이다. Protein crystallization conditions according to the present invention can also be used to make complex crystals with lead compounds, and the structure of such complexes is essential for effective anti-cancer agent redesign.
상기 물질은 복합체 접촉부위에서 상호작용하는 저분자화합물, 항체, 펩타이드, 단백질을 의미하는 것으로 이러한 물질을 디자인 또는 스크리닝하는 방법은 당업계에 공지되어 있다.This material means low molecular compounds, antibodies, peptides, proteins interacting on a complex contact, and methods for designing or screening such materials are well known in the art.
본원은 또한 다음의 단계를 포함하는 CEP55와 TEX14의 상호작용을 증가시키는 물질을 스크리닝하는 방법에 관한 것이다. The present invention also relates to a method of screening a substance that increases the interaction of CEP55 and TEX14, comprising the steps of:
본원에 따른 방법은 CEP55-EABR (서열번호 1의 160 내지 217 잔기)와 TEX14 펩타이드 (AxGPPxxxYxPP) 또는 펩타이드 (DLAxGPPxxxYxPP)을 제공하는 단계; 상기 단백질과 펩타이드의 혼합물을 시험물질과 접촉시키는 단계; 및 상기 시험물질과 접촉된 혼합물과 접촉되지 않은 대조군에서의 CEP55-EABR와 TEX14 펩타이드의 상호작용을 비교하는 단계를 포함한다. The method according to the present invention comprises providing a CEP55-EABR (residues 160-217 of SEQ ID NO: 1) and a TEX14 peptide (AxGPPxxxYxPP) or a peptide (DLAxGPPxxxYxPP); Contacting the mixture of the protein and the peptide with the test substance; And comparing the interaction of the CEP55-EABR and TEX14 peptides in a control not contacted with the mixture contacted with the test substance.
다른 측면에서 본원은 또한 다음의 단계를 포함하는 CEP55-EABR 영역에 결합하는, 항암제 후보물질로서 TEX14 유도체를 스크리닝하는 방법에 관한 것이다. In another aspect, the invention also relates to a method of screening a TEX14 derivative as an anticancer candidate agent, which binds to a CEP55-EABR region, comprising the steps of:
일 구현예에서 상기 방법은 CEP55-EABR 영역, CEP55-EABR 영역을 포함하는 CEP55 전장 단백질 또는 CEP55-EABR 영역을 포함하는 CEP55 단백질 단편, 및 AxGPPx3YxPP로 표시되는 아미노산 서열을 포함하는 TEX14 펩타이드를 제공하는 단계로, 상기 AxGPPx3YxPP에서 A는 Ala, G는 Gly, P는 Pro, Y는 Tyr, X는 임의의 아미노산이고; 상기 CEP55-EABR 영역, CEP55-EABR 영역을 포함하는 CEP55 전장 또는 CEP55-EABR 영역을 포함하는 CEP55 단편 및 상기 TEX14 펩타이드를 시험물질과 접촉시키는 단계로, 상기 시험물질은 상기 CEP55-EABR 영역에 상기 TEX14 펩타이드와 경쟁적으로 결합을 할 수 있는 TEX14 유도체이고; 상기 시험물질의 존재 중에서 상기 CEP55-EABR 영역에의 상기 TEX14 펩타이드의 결합을 측정하는 단계; 및 상기 측정 결과, 상기 시험물질과 접촉되지 않은 대조군과 비교하여 접촉된 실험군에서, 상기 CEP55-EABR 영역에의 상기 TEX14 펩타이드의 결합이 감소한 경우, 상기 시험물질을 항암제 후보물질로 선별하는 단계를 포함한다. In one embodiment, the method comprises providing a CEP55-EABR region, a CEP55 full-length protein comprising a CEP55-EABR region or a CEP55 protein fragment comprising a CEP55-EABR region, and a TEX14 peptide comprising an amino acid sequence represented by AxGPPx 3 YxPP Wherein A is Ala, G is Gly, P is Pro, Y is Tyr, and X is any amino acid in the above AxGPPx 3 YxPP; Contacting the CEP55 fragment comprising the CEP55-EABR region, the CEP55 full-length or CEP55-EABR region comprising the CEP55-EABR region and the TEX14 peptide with the test material, wherein the test material comprises the TEX14 A TEX14 derivative capable of competitive binding to a peptide; Measuring the binding of the TEX14 peptide to the CEP55-EABR region in the presence of the test substance; And selecting the test substance as an anticancer candidate substance when the binding of the TEX14 peptide to the CEP55-EABR region is decreased in the test group which is contacted with the test substance as compared with the control group not in contact with the test substance as a result of the measurement do.
또 다른 구현예에서 본원에 따른 방법은 서열번호 1의 160 내지 217 아미노산 잔기로 표시되는 CEP55-EABR 영역 및 서열번호 2의 793 내지 804 아미노산 잔기로 표시되는 TEX14 펩타이드, 서열번호 2의 792 내지 804 아미노산 잔기로 표시되는 TEX14 펩타이드 및 서열번호 2의 791 내지 804 아미노산 잔기로 표시되는 TEX14 펩타이드로 구성되는 군으로부터 선택되는 TEX14 펩타이드를 제공하는 단계; 및 상기 CEP55-EABR 영역 및 상기 TEX14 펩타이드를 시험물질과 접촉시키는 단계로, 상기 시험물질은 상기 CEP55-EABR 영역에 상기 TEX14 펩타이드와 경쟁적으로 결합을 하는 TEX14 유도체로, 상기 시험물질의 존재 중에서 상기 CEP55-EABR에의 상기 TEX14 펩타이드의 결합을 측정하는 단계를 포함한다. In another embodiment, the method according to the present invention comprises: a TEX14 peptide represented by the CEP55-EABR region represented by the
본원에 따른 방법에 사용될 수 있는 CEP55-EABR 영역은 인간 유래로 서열번호 1의 160 내지 217 잔기로 표시되는 아미노산 서열로 표시되고, 상기 CEP55 전장은 서열번호 1의 아미노산 서열로 표시된다. The CEP55-EABR region which can be used in the method according to the present invention is represented by the amino acid sequence represented by 160 to 217 residues of SEQ ID NO: 1 from human and the CEP55 total length is represented by the amino acid sequence of SEQ ID NO:
본원에 따른 방법에 사용될 수 있는 TEX14 펩타이드는 인간유래의 야생형 서열로, 서열번호 2의 793 내지 804 잔기의 아미노산 서열, 서열번호 2의 792 내지 804 잔기의 아미노산 서열 또는 서열번호 2의 791 내지 804 잔기의 아미노산 서열로 표시될 수 있다. The TEX14 peptide which can be used in the method according to the present invention is a wild-type sequence derived from a human, which comprises an amino acid sequence of residues 793 to 804 of SEQ ID NO: 2, an amino acid sequence of
본원에 따른 방법에서 상기 측정 결과 시험물질로서 TEX14 펩타이드 유도체와 접촉되지 않은 대조군과 비교하여 접촉된 실험군에서, 상기 CEP55-EABR에의 TEX14 펩타이드의 결합이 감소한 경우, 상기 시험물질을 항암제 후보물질로 선별하는 단계를 포함한다. In the method according to the present invention, when the binding of the TEX14 peptide to the CEP55-EABR is decreased in the test group that is contacted with the test group as compared with the control group not in contact with the TEX14 peptide derivative as a test substance, the test substance is selected as an anticancer candidate substance .
본원에 따른 방법에서 펩타이드 유도체는 AxGPPx3YxPP 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드로, TEX14 펩타이드와 상이한 아미노산 서열 및/또는 구조를 가지며 상기 EABR 영역에서 결합을 증가시키는 방식으로 변형된 것이다. In the method according to the present invention, the peptide derivative is a polypeptide comprising the amino acid sequence of AxGPPx 3 YxPP, which has a different amino acid sequence and / or structure from the TEX14 peptide and has been modified in such a way as to increase binding in the EABR region.
일 구현예에서 본원에 따른 TEX14 유도체는 AxGPPx3YxPP 아미노산 서열의 폴리펩타이드에서 표시되는 순서대로 Ala, Gly, Pro, Pro, Tyr, Pro 및 Pro 중 어느 하나가, 상기 TEX14 유도체의 상기 EABR 영역에서 결합을 증가시키는 방식으로 변형된 것으로, 상기 변형은 아미노산 잔기의 치환 및/또는 아미노산 측쇄의 화학적 변형을 포함하는 것이다. In one embodiment, the TEX14 derivative according to the present invention is selected from the group consisting of Ala, Gly, Pro, Pro, Tyr, Pro and Pro in the order indicated in the polypeptide of the AxGPPx 3 YxPP amino acid sequence, Wherein said modification comprises substitution of amino acid residues and / or chemical modification of amino acid side chains.
본원에 따른 TEX14 펩타이드 또는 펩타이드 유도체는 천연 또는 비천연 아미노산을 포함하며 아미노산 유사체 및 자연에서 발견되는 아미노산과 유사한 방식으로 작용하는 아미노산 모방체를 포함한다. 천연의 아미노산은 공지된 20개의 아미노산 (alanine, arginine, asparagine, aspartic acid, cysteine, glutamine, glutamic acid, glycine, histidine, isoleucine, leucine, lysine, methionine, phenylalanine, proline, serine, threonine, tryptophan, tyrosine, and valine)과 피롤라이신 및 셀로노시스테인이다. 아미노산 유사체란 자연에서 발견되는 아미노산과 동일한 기본 화학적 구조, 즉 알파 탄소가 수소, 카복실기, 아미노기 및 R기에 결합된 구조를 가지는 것으로, R기가 변형되거나 또는 펩타이드 골격(백본)이 변형된 것을 포함하며 예를 들면 2-아미노아디프산, 하이드록시라이신호모세린, 노르루이신, 설폭사이드, 메틸설포늄을 포함한다. TEX14 peptide or peptide derivatives according to the present invention include natural or unnatural amino acids and include amino acid mimetics and amino acid mimetics that act in a manner similar to amino acids found in nature. Naturally occurring amino acids include the known 20 amino acids (alanine, arginine, asparagine, aspartic acid, cysteine, glutamine, glutamic acid, glycine, histidine, isoleucine, leucine, lysine, methionine, phenylalanine, proline, serine, threonine, tryptophan, tyrosine, and valine) and pyrrolic acid and cellocysteine. Amino acid analogs include those having the same basic chemical structure as the amino acids found in nature, that is, the structure in which the alpha carbon is bonded to hydrogen, a carboxyl group, an amino group and an R group, in which the R group is modified or a peptide skeleton (backbone) For example, 2-amino adipic acid, hydroxy lysine homoserine, norleucine, sulfoxide, methylsulfonium.
본원에 따른 펩타이드 유도체는 공지된 20개의 아미노산 및 피롤라이신 또는 셀레노시스테인 이외의 아미노산 잔기를 포함하는 것으로 펩타이드 모방체 (전형적으로 합성 펩타이드), 및 펩토이드 및 세미펩토이드와 같은 펩타이드 유사체를 포함하는 것이다. Peptide derivatives according to the present invention include peptidomimetics (typically synthetic peptides), which include the known 20 amino acids and amino acid residues other than pyrrolicin or selenocysteine, and peptide analogs such as peptoids and semipeptides .
일 구현예에서 펩타이드 유도체는 N-말단 변형, C-말단 변형, CH2-NH, CH2-S, CH2-S=O, CH2-CH2와 같은 펩타이드 결합 변형, 백본 변형, 측쇄 변형을 포함한다. 펩타이드 모방체 화합물을 제조하는 방법은 기술분야에 공지된 것으로, 예를 들면 Quantitative Drug Design, C.A. Ramsden Gd., Choplin Pergamon Press (1992)에 기재된 내용을 참조할 수 있다. In one embodiment, the peptide derivative is selected from the group consisting of N-terminal modifications, C-terminal modifications, peptide bond modifications such as CH 2 -NH, CH 2 -S, CH 2 -S═O, CH 2 -CH 2 , . Methods for preparing peptide mimetic compounds are well known in the art and can be found in, for example, Quantitative Drug Design, CA Ramsden Gd., Choplin Pergamon Press (1992).
일 구현예에서 펩타이드 유도체는 이를 구성하는 적어도 하나 이상의 아미노산 잔기가 변형된 것을 의미한다. In one embodiment, the peptide derivative means that at least one of the amino acid residues constituting the derivative is modified.
변형이란 본원에 따른 목적에 부합하는 특징을 갖는 펩타이드 유도체를 수득하기 위해서, 즉 TEX 펩타이드 유도체가 CEP55에 야생형 TEX14 펩타이드의 결합력과 비교하여, 적어도 같거나 또는 높은 결합력을 갖는 방식으로 변형된 것을 의미한다. Means that the TEX peptide derivative is modified in a manner that has at least the same or higher binding force as compared to the binding force of the wild-type TEX14 peptide to CEP55, in order to obtain a peptide derivative having characteristics meeting the purpose according to the present invention .
일 구현예에서는 펩타이드를 구성하는 하나 이상의 잔기를 물리적, 즉 화학적 또는 생화학적으로 변형하는 것을 포함한다. In one embodiment, it involves physical, i.e., chemical or biochemical, modification of one or more residues that make up the peptide.
다른 구현예에서 변형은 예를 들면 펩타이드를 구성하는 하나 이상의 아미노산 잔기의 보전적 또는 비보전적 치환, 결실 또는 부가, 또는 아미노산 잔기를 구성하는 측쇄 (R)기가 화학적 또는 생화학적으로 변형된 것일 수 있다. R기가 변형된 아미노산은 아미노산 유사체로 분류될 수도 있다. In other embodiments, the modification may be, for example, a conservative or non-conservative substitution, deletion or addition of one or more amino acid residues constituting the peptide, or a chemical or biochemical modification of the side chain (R) group constituting the amino acid residue . The amino acid in which the R group has been modified may be classified as an amino acid analogue.
일 구현예에서 본원에 따른 TEX14 펩타이드 유도체는 서열번호 2로 표시되는 TEX 펩타이드의 잔기 중 Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 및 Pro804로 구성되는 군으로부터 선택되는 잔기 중 하나 이상이 변형된 것이다. In one embodiment, the TEX14 peptide derivative according to the present invention is a modification of one or more residues selected from the group consisting of Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 and Pro804 among residues of TEX peptide shown in SEQ ID NO: 2.
다른 구현예에서 본원에 따른 TEX14 펩타이드 유도체는 서열번호 2로 표시되는 TEX 펩타이드의 잔기 중 Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 및 Pro804로 구성되는 군으로부터 선택되는 잔기 중 하나 이상이 다른 보전적 또는 비보전적 아미노산 잔기로 치환된 것이다. In another embodiment, the TEX14 peptide derivative according to the present invention is one wherein at least one of the residues selected from the group consisting of Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 and Pro804 among the residues of the TEX peptide shown in SEQ ID NO: 2 is different conservative or non- It is completely replaced by an amino acid residue.
본원에 따른 치환은 보전적 치환 또는 TEX14 펩타이드 유도체의 CEP55에의 결합력을 증가시킬 수 있는 다른 아미노산으로 치환된 비보전적 치환을 포함한다. 보수적 치환은 하나의 아미노산이 측쇄 크기, 전하량, 소수성, 친수성, 및/또는 방향족성 특징 등에서 유사한 특징을 갖는 것으로, 다음 군 간의 잔기는 보수적 치환일 수 있다: 작은 크기의 지방족, 비극성 또는 약극성의 잔기 군: Ala, Ser, Thr, Pro, Gly; 극성, 음하전된 잔기 및 이의 아미드 및 에스테르: Asp, Asn, Glu, Gln, cysteic acid 및 homocysteic acid; 극성, 양하전 잔기 군: His, Arg, Lys; Ornithine (Orn); 및 큰 측쇄, 지방족, 비극성 잔기 군: Met, Leu, Ile, Val, Cys, Norleucine (Nle), homocysteine; 큰 측쇄의 방향족 잔기: Phe, Tyr, Trp, acetyl phenylalanine. Substitutions according to the present disclosure include conservative substitutions or non-conservative substitutions with other amino acids that can increase the binding of TEX14 peptide derivatives to CEP55. A conservative substitution is one in which an amino acid has similar characteristics in terms of side chain size, charge, hydrophobicity, hydrophilicity, and / or aromatic character, such that residues in the following group may be conservative substitutions: small aliphatic, nonpolar, Residues group: Ala, Ser, Thr, Pro, Gly; Polar, negatively charged residues and their amides and esters: Asp, Asn, Glu, Gln, cysteic acid and homocysteic acid; Polarity, positive charge residue group: His, Arg, Lys; Ornithine (Orn); And large branched, aliphatic, nonpolar residue groups: Met, Leu, Ile, Val, Cys, Norleucine (Nle), homocysteine; Large side chain aromatic moieties: Phe, Tyr, Trp, acetyl phenylalanine.
본원에 따른 R기의 화학적 변형은 해당 잔기가 포함된 펩타이드의 CEP55의 결합력을 증가시키는 방식으로 변형된 것으로 예를 들면 소수성, 친수성, 하전된 정도, 및/또는 크기의 변화를 가져오는 방식으로 변형되는 것을 포함하며, 당업자라면 본원에 개시된 3차 구조 정보를 고려하여 적절한 작용기로의 변형이 가능할 것이다. The chemical modification of the R group according to the present invention is modified in such a way as to increase the binding force of the CEP55 of the peptide containing the residue, for example, modified in such a manner as to bring about changes in hydrophobicity, hydrophilicity, degree of charge, and / And those skilled in the art will be able to make modifications to suitable functional groups in view of the tertiary structure information disclosed herein.
예를 들면 아미노산 치환을 도입하는 데 있어서, 아미노산의 소수성 인덱스(hydropathic index)가 고려될 수 있다. 각각의 아미노산은 소수성과 전하에 따라 소수성 인덱스가 부여되어 있다: 아이소루이신(+4.5); 발린(+4.2); 루이신(+3.8); 페닐알라닌(+2.8); 시스테인/시스타인(+2.5); 메티오닌(+1.9); 알라닌(+1.8); 글라이신(-0.4); 쓰레오닌(-0.7); 세린(-0.8); 트립토판(-0.9); 타이로신(-1.3); 프롤린(-1.6); 히스티딘(-3.2); 글루타메이트(-3.5); 글루타민(-3.5); 아스파르테이트(-3.5); 아스파라긴(-3.5); 라이신(-3.9); 및 아르기닌(-4.5). 상기와 같은 소수성 인덱스는 특히 단백질간의 상호작용 또는 결합력을 부여하는 데 있어서 중요하다. For example, in introducing an amino acid substitution, the hydropathic index of the amino acid can be considered. Each amino acid is assigned a hydrophobic index according to its hydrophobicity and charge: isoruicin (+4.5); Valine (+4.2); Leucine (+3.8); Phenylalanine (+2.8); Cysteine / cysteine (+2.5); Methionine (+1.9); Alanine (+1.8); Glycine (-0.4); Threonine (-0.7); Serine (-0.8); Tryptophan (-0.9); Tyrosine (-1.3); Proline (-1.6); Histidine (-3.2); Glutamate (-3.5); Glutamine (-3.5); Aspartate (-3.5); Asparagine (-3.5); Lysine (-3.9); And arginine (-4.5). Such hydrophobic indexes are particularly important in imparting interactions or binding forces between proteins.
또한 유사한 친수성 수치(hydrophilicity value)를 또한 단백질의 상호작용 또는 결합력 결정에 중요하다. 따라서 예를 들면 미국 특허 제4,554,101호에 개시된 바와 같이, 아르기닌(+3.0); 라이신(+3.0); 아스팔테이트(+3.0±1); 글루타메이트(+3.0±1); 세린(+0.3); 아스파라긴(+0.2); 글루타민(+0.2); 글라이신(0); 쓰레오닌(-0.4); 프롤린(-0.5±1); 알라닌(-0.5); 히스티딘(-0.5); 시스테인(-1.0); 메티오닌(-1.3); 발린(-1.5); 루이신(-1.8); 아이소루이신(-1.8); 타이로신(-2.3); 페닐알라닌(-2.5); 트립토판(-3.4)의 친수성 수치를 고려하여 아미노산 치환을 수행할 수 있다. Similar hydrophilicity values are also important for determining protein interactions or binding forces. Thus, for example, as disclosed in U.S. Patent No. 4,554,101, arginine (+3.0); Lysine (+3.0); Aspartate (+ 3.0 ± 1); Glutamate (+ 3.0 ± 1); Serine (+0.3); Asparagine (+0.2); Glutamine (+0.2); Glycine (0); Threonine (-0.4); Proline (-0.5 ± 1); Alanine (-0.5); Histidine (-0.5); Cysteine (-1.0); Methionine (-1.3); Valine (-1.5); Leucine (-1.8); Isoru Isin (-1.8); Tyrosine (-2.3); Phenylalanine (-2.5); Amino acid substitution can be performed taking into account the hydrophilicity of tryptophan (-3.4).
본원에 사용되는 단백질은 앞서 언급한 바를 참조할 수 있으며 이는 당업계에 공지된 방법을 사용하여 제조될 수 있다. 특히 단백질의 제조방법은 유전자 재조합 기술을 이용하는 것이다. 예를 들면 상기 단백질을 코딩하는 상응하는 유전자를 포함하는 플라스미드를 원핵 또는 진핵세포 세포 예를 들면 곤충세포, 포유류 세포에 전달하여 과발현 시킨 후 정제하여 사용할 수 있다. Proteins used herein may be referred to above and may be prepared using methods known in the art. Particularly, a method for producing a protein is to use a gene recombination technique. For example, a plasmid containing the corresponding gene encoding the protein may be transferred to prokaryotic or eukaryotic cells such as insect cells and mammalian cells for overexpression, followed by purification.
또는 스크리닝 단백질을 암호화하는 DNA 또는 RNA 서열을 적당한 숙주 세포에서 발현시켜 그 세포 파쇄 물을 만들거나 상기 스크리닝 단백질의 mRNA를 시험관내에서 번역한 후 당업계에 공지된 단백질 분리 방법에 의해 스크리닝 단백질을 정제할 수 있다. 통상, 세포잔여물(cell debris) 등을 제거하기 위해 상기 세포 파쇄물 또는 시험관내 번역한 결과물을 원심분리한 후, 침전, 투석, 각종 컬럼 크로마토그라피 등을 적용한다. 이온교환 크로마토그라피, 겔-퍼미에이션 크로마토그라피, HPLC, 역상-HPLC, 프렙용 SDS-PAGE, 친화성 컬럼 등은 컬럼크로마토그라피의 예이다. 친화성 컬럼은, 예를 들어, 항-스크리닝 단백질 항체를 이용하여 만들 수 있다.Alternatively, a DNA or RNA sequence encoding the screening protein may be expressed in an appropriate host cell to produce a cell lysate thereof, or the mRNA of the screening protein may be translated in vitro, followed by purification of the screening protein by a protein separation method known in the art can do. Usually, the cell lysate or the translation product in vitro is centrifuged to remove cell debris and the like, and then precipitation, dialysis, various column chromatography and the like are applied. Ion exchange chromatography, gel-permeation chromatography, HPLC, reversed phase-HPLC, SDS-PAGE for affinity column, and affinity column are examples of column chromatography. Affinity columns can be made, for example, using anti-screening protein antibodies.
또한 펩타이드는 시중의 회사에서 인공적으로 합성할 수 있다. Peptides can also be artificially synthesized by commercial companies.
상기 정제된 단백질의 접촉은 시험관내에서 이들을 직접 사용하여 시험물질의 부재 또는 존재하에서 결합여부를 확인할 수 있다. 이 경우 단백질은 검출의 편이를 위해 다양한 표식물질, 예를 들면 바이오틴, 형광물질, 아세틸화, 방사선 동위원소와 같은 것으로 공지된 방법 또는 시중의 단백질 표지 키트를 사용하여 표지될 수 있으며, 표지된 물질에 적합한 검출기기를 사용하여 검출될 수 있다. 단백질-단백질 상호작용은 당업계에 공지된 다양한 방법을 이용하여 측정될 수 있다. 예를 들면 세포내 단백질의 결합/상호작용을 확인하는 이스트투하이브리드법, 콘포칼현미경법. 공동면역침전법, 표면플라즈마공명 (SPR) 및 스펙트로스코피법을 포함하나 이로 제한하는 것은 아니며, 이러한 방법에 관한 비교 및 자세한 실험법에 관한 추가의 참고문헌은 Berggard et al.,(2007) "Methods for the detection and analysis of protein-protein interactions", PROTEOMICS Vol7: pp 2833 - 2842에 기재된 것을 참고할 수 있다.The contact of the purified protein can be directly confirmed in the absence or presence of the test substance by directly using them in vitro. In this case, the protein may be labeled using various known markers such as biotin, fluorescent material, acetylation, radioisotope or the like using a known protein labeling kit or a commercially available labeled substance Lt; RTI ID = 0.0 > detectors < / RTI > Protein-protein interactions can be measured using a variety of methods known in the art. For example, the yeast two-hybrid method, the confocal microscope method, which confirms the binding / interaction of intracellular proteins. (SPR) and spectroscopy methods, and further references to comparative and detailed experimental methods for such methods are provided in Berggard et al., (2007) "Methods for protein-protein interactions ", PROTEOMICS Vol 7: pp 2833-2842.
본 방법에서 사용되는 단백질의 양, 세포의 종류 및 농도와 시험물질의 양 및 종류 등은 사용하는 구체적인 실험방법 및 시험물질의 종류에 따라 달라지며, 당업자라면 적절한 양을 선택할 수 있을 것이다. The amount of the protein used, the type and concentration of the cells used, the amount and type of the test substance, and the like are dependent on the specific experimental method used and the kind of the test substance. Those skilled in the art will be able to select an appropriate amount.
본원의 방법에서 스크리닝하고자 하는 TEX14 유도체는 야생형 TEX14과 비교하여 CEP55에 대한 결합력이 높은 것이다. 이러한 TEX14 유도체는 야생형 TEX14의 존재하에서 CEP55의 경쟁적 결합 방식에 의해 선별될 수 있거나 또는 야생형 TEX14과의 CEP55에 대한 결합력을 측정하여 선별될 수 있다. The TEX14 derivative to be screened in the method of the present invention has a higher binding capacity to CEP55 than wild-type TEX14. Such TEX14 derivatives can be screened by competitive binding methods of CEP55 in the presence of wild-type TEX14 or by measuring their binding capacity to CEP55 with wild-type TEX14.
이러한 TEX 14 유도체는 야생형 대조군과 비교 약 100% 이상 증가 약 105% 이상 증가, 약 110% 증가, 약 115% 증가, 약 120% 증가, 약 125% 증가, 약 130% 증가, 약 135% 증가, 약 140% 증가, 약 145% 감소, 약 150% 증가를 의미하나, 이를 벗어나는 범위를 제외하는 것은 아니다.These
본 발명에서 상호작용은 단백질 간의 접촉/결합을 일컫는 것으로서, 공유 및 비공유 결합에 의한 상호작용을 모두 포함하는 것이다. In the present invention, the interaction refers to the protein / protein / protein / protein interaction, which includes both covalent and noncovalent interactions.
이하, 본 발명의 이해를 돕기 위해서 실시예를 제시한다. 그러나 하기의 실시예는 본 발명을 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐 본 발명이 하기의 실시예에 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, embodiments are provided to facilitate understanding of the present invention. However, the following examples are provided only for the purpose of easier understanding of the present invention, and the present invention is not limited to the following examples.
실시예Example
실험방법 및 결과Experimental methods and results
단백질 정제 및 결정화/ 데이터 수집, 구조 결정과 정밀화Protein purification and crystallization / data collection, structure determination and refinement
CEP55160 - 217를 BamHI과 XhoI 제한효소를 이용하여 pGST2 벡터에 클로닝 한 후에 CEP55(160-217, pGST2) 플라스미드를 BL21(DE3) 대장균에 형질전환 시켰다. 형질전환된 대장균을 LB broth (100μg/ml 암피실린 포함) 배양액(1L)에 접종하여 37℃에서 흡광도 A600 값이 0.8에 이르기까지 배양하였다. 배양액에 0.5mM IPTG (Isopropyl-β-D-Thiogalactopyranoside)를 첨가하여 25℃에서 18시간 동안 배양하였다. 배양액을 5,000 rpm으로 10분 간 원심분리를 한 후, 상층액을 버리고 침전된 pellet을 20mM Tris-HCl pH 7.4, 100mM NaCl 버퍼 (1mM PMSF 포함)로 녹인 후에 Microfluidizer(French press)를 이용하여 세포를 파쇄한 후, 12,000rpm으로 1시간 원심분리를 하여 상층액을 얻었다. 분리된 상층액은 GST-column을 통과시키고 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 15 mM GSH 버퍼를 이용하여 용출 (elution) 하였다. GST-column에서 얻은 단백질에 TEV protease를 처리하여 GST tag 제거하였다. (4℃에서 overnight 처리) TEV protease 처리를 통해 얻은 sample을 4ml로 농축하여 gel filtration column (Superdex 200 pg 16/60)에 injection하였을 때, 약 92~102 ml (flow rate: 1ml/min)에서 CEP55 단백질과 GST 단백질이 같이 용리 되었다. (Running buffer: 20mM Tris-HCl pH 7.4, 100mM NaCl). GST를 제거하기 위해 Hi-trap Q HP column에 통과 시켰으며, 버퍼는 20mM Tris-HCl pH 7.4, 100mM NaCl과 용출버퍼로는 20mM Tris-HCl pH 7.4, 1M NaCl 을 사용하였다. Q-column을 통과시켜 GST가 제거된 CEP55160 - 217단백질을 모아서 7mg/ml (20mM Tris-HCl pH 7.4, 100 mM NaCl)로 농축한 뒤에 TEX14 펩타이드가 CEP55의 2배의 몰비가 되도록 섞고 ice에서 1시간 배양한 후, 결정화 스크리닝을 수행하고 결정을 얻었다. 결정화 조건은 0.1 M 이미다졸 (pH 8.0), 1 M 제이인산암모?이다. 시팅-드롭(sitting-drop) 증기 확산을 사용하여 22℃에서 발생시켰다. X-ray 회절 데이터는 한국의 포항 가속 연구소(PAL)의 빔라인(beamline) 7A에서 얻었으며, 30%(v/v)의 글리세롤을 이용하여, 결정은 직접적으로 동결되었고 110K의 액체 질소로 순간 냉각시켰다. 원 데이터는 HKL2000를 사용하여 처리하였으며, 회절 데이터는 P22121의 공간군을 갖는 2.3Å의 최대 해상도로 수집하였다. 표 2에 수집된 테이터의 통계를 요약했다. CEP55160 -217-TEX14792-804 복합체 결정은 a = 53.9 Å, b = 102.6 Å, 및 c = 132.5 Å의 단위 세포 파라미터를 지닌, 스페이스 그룹 P22121에 속한다(표 2). CEP55160 -217-TEX14N-ALIXC 복합체 및 CEP55160 -217-ALIXN-TEX14C 복합체의 결정화 및 데이터 수집에는 CEP55160-217-TEX14792-804 복합체에 대해 사용된 것과 유사한 단계에서 관여되었다. CEP55160-217-TEX14N-ALIXC 복합체 결정은 20% (wt/vol) 폴리아크릴산 5100, 0.2 M 염화 마그네슘, 0.1 M 4-(2-히드록시에틸)-1-피페라진에탄술폰산(HEPES)(pH 7.5)를 사용하여 생성시켰고, CEP55160 -217-ALIXN-TEX14C 복합체 결정에는 0.8M 암모늄 설페이트, 0.1M 소디움 시트레이트(pH 5.0)를 사용하였다. CEP55160 -217-TEX14N-ALIXC 복합체 및 CEP55160 -217-ALIXN-TEX14C 복합체의 결정은 25-30%(v/v)의 글리세롤 용액에 담은 후 액체질소로 급속 냉동시켰다. CEP55 160 - 217 then cloned into the BamHI and XhoI pGST2 vector by using the restriction enzymes was transformed to CEP55 (160-217, pGST2) plasmid in BL21 (DE3) E. coli. The transformed Escherichia coli was inoculated into 1 L of LB broth (containing 100 μg / ml ampicillin) and cultured at 37 ° C until the absorbance A600 reached 0.8. 0.5 mM IPTG (Isopropyl-β-D-Thiogalactopyranoside) was added to the culture solution and cultured at 25 ° C. for 18 hours. After centrifuging the culture at 5,000 rpm for 10 minutes, discard the supernatant and dissolve the precipitated pellet in 20 mM Tris-HCl pH 7.4, 100 mM NaCl buffer (1 mM PMSF), and then use a Microfluidizer (French press) After crushing, the mixture was centrifuged at 12,000 rpm for 1 hour to obtain a supernatant. The separated supernatant was passed through a GST-column and eluted with 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 15 mM GSH buffer. GST-column was treated with TEV protease to remove GST tag. (4 ° C overnight). The sample obtained from TEV protease treatment was concentrated to 4 ml and injected into a gel filtration column (
구조 결정 및 정제Structure determination and purification
CEP55160 -217-TEX14792 -804 복합체, CEP55160 -217-TEX14N-ALIXC 복합체 및 CEP55160 -217-ALIXN-TEX14C 복합체의 결정 구조는 human CEP55160 -217 [Protein Data Bank (PDB) ID code 3E1R]의 Dimer 모델로부터 molecular replacement method를 이용하였으며, 결정학적인 계산은 CCP4를 사용하여 수행하였다. Phaser 프로그램을 사용하여 병진식 연구(translational search) 후에 교차-회전 연구(cross-rotational search)를 수행하였다(McCoy AJ, et al., Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 61(4):458-464.). 이어 Coot 프로그램(Emsley P, et al., Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60(12):2126-2132)을 사용하여 manual model building을 수행하였고, REFMAC5 프로그램(Murshudov GN, et al., Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 53(3):240-255.)을 사용하여 restrained refinement을 수행하였다. 여러 차례의 모델 빌딩(model building), 시뮬레이티드 어닐링(simulated annealing), 포지션날 리파인멘트, 및 개별적 B-인자 리파인먼트를 수행하였다. 표 2에 리파인컨트 통계가 기재되어 있다. CEP55160 -217-TEX14792 -804 복합체의 결정학적 비대칭 유닛은 CEP55 펩타이드의 4개 호모다이머 및 TEX14 펩타이드의 4개 호모다이머를 포함하며, 상기에서 A, B, D, E, G, H, J, 및 K 체인은 CEP55160 -217에 상응하며, C, F, I, 및 L 체인은 TEX14 펩타이드에 상응한다. 리파인된 모델에는 188개의 물분자를 함유하며, 98.8%의 잔기는 Ramachandran 플랏의 most-allowed 부위에 있다. CEP55160 -217의 A 체인의 212-217 잔기, B 및 J 체인의 160-167 잔기, 및 D 및 E 체인의 210-217 잔기, G 체인의 211-217 잔기, H 체인의 209-217 잔기, 및 K 체인의 209-217 잔기에는 전자 밀도는 전혀 관찰되지 않았다. CEP55160 -217-TEX14792 -804 복합체, CEP55160 -217-TEX14N-ALIXC 복합체 및 CEP55160 -217-ALIXN-TEX14C 복합체의 원자 좌표 및 결정 구조는 Protein Data Bank (각각 PDB ID codes 3WUT, 3WUU, 및 3WUV)에 기탁하였다.The crystal structure of CEP55 160 -217 792 -804 -TEX14 complex, CEP55 160 -217 -TEX14 N -ALIX C composite and CEP55 160 -217 -ALIX N -TEX14 C composite human CEP55 160 -217 [Protein Data Bank (PDB) ID code 3E1R] using the molecular replacement method, and the crystallographic calculation was performed using CCP4. A cross-rotational search was performed after a translational search using the Phaser program (McCoy AJ, et al., Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 61 (4): 458-464.). Manual model building was then performed using the Coot program (Emsley P, et al., Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60 (12): 2126-2132) and the REFMAC5 program (Murshudov GN, et al., Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 53 (3): 240-255.) Was used for restrained refinement. Several model building, simulated annealing, position fly refinement, and individual B-factor refinement were performed. Table 2 shows refinement statistics. CEP55 160 -217 crystallographic asymmetric unit of the -TEX14 792 -804 complex comprises four homodimer of four homodimer and TEX14 CEP55 peptide of the peptide, in the A, B, D, E, G, H, J , and K chain corresponds to 160 -217 CEP55, C, F, I, and the L chain corresponds to TEX14 peptide. The refined model contains 188 water molecules, with 98.8% residues in the most-allowed region of the Ramachandran plot. 160-167 residues of residues 212-217 A, B, and J chain in the chain of CEP55 160 -217, 210-217, and residues of the D and E chain, G residues 211-217, residues 209-217 of the H chain of the chain, And no electron density was observed in the 209-217 residues of the K chain. CEP55 160 -217 -TEX14 792 -804 complex, CEP55 160 -217 -TEX14 N -ALIX C composite and CEP55 160 -217 -ALIX N atom coordinates and crystal structure of the complex is -TEX14 C Protein Data Bank (PDB ID codes each 3WUT , 3 WUU, and 3 WUV).
컴피티션Competition 분석법 Analysis method
컴피티션 분석을 하기 위하여, 350㎍의 CEP55160 - 217를 TEX14 펩타이드(20, 40, 160, 또는 250 ㎍)와 함께 1시간 동안 4℃에서 배양하였다. GST-ALIX795 - 811를 글루타치온-세파로스 비드(GE Healthcare)에 결합시켜, 그후 CEP55160 -217 및 TEX14 펩타이드 혼합물을 첨가한 후 1시간 동안 배양시켰다. 20 mM Tris (pH 7.4), 100 mM NaCl 버퍼를 사용하여 상기 비드를 세척하였다. 결합되어 있는 단백질을 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 15 mM GSH 버퍼를 이용하여 용리(elution) 한 후에 SDS-PAGE로 분리하여 쿠마씨 브릴리언트블루(Coomassie Brilliant Blue)로 염색하였다.To the Competition analysis, CEP55 160 of 350㎍ - 217 were cultured at 4 ℃ for 1 hour with the peptide TEX14 (20, 40, 160, or 250 ㎍). GST-ALIX 795 - 811 a glutathione-combines the sepharose beads (GE Healthcare), was then incubated followed by the addition of 160 -217 and CEP55 TEX14 peptide mixture for 1 hour. The beads were washed using 20 mM Tris (pH 7.4), 100 mM NaCl buffer. The bound proteins were eluted with 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 15 mM GSH buffer, and then separated by SDS-PAGE and stained with Coomassie Brilliant Blue.
GSTGST Pull-Down Assay. Pull-Down Assay.
GST-TEX14N-ALIXC 및 GST-ALIXN-TEX14C 융합 단백질을 글루타치온-세파로스 비드(GE Healthcare)에 결합시켰다. CEP55160 -217 단백질을 GST (TEV로 표지함), GST-TEX14N-ALIXC (No TEV로 표지함), 또는 GST-ALIXN-TEX14C (No TEV로 표지함)와 함께 100 mM NaCl을 함유하는 20 mM Tris·HCl (pH 7.4)에서 부드럽게 흔들면서 4℃에서 1시간동안 배양하였다. 세척한 후, 결합된 단백질은 용출 버퍼(30 mM 글루타치온, 150 mM Tris·HCl, pH 8.0)로 용출시켜, SDS/PAGE로 분리시키고, 쿠마씨 브릴리언트블루로 염색하였다.GST-TEX14 N -ALIX C and GST-ALIX N- TEX14 C fusion proteins were conjugated to glutathion-Sepharose beads (GE Healthcare). The CEP55 160 -217 protein (also labeled with TEV) GST, the 100 mM NaCl with the GST-N TEX14 -ALIX C (also labeled with No TEV), or GST-ALIX N -TEX14 C (also labeled with No TEV) In 20 mM Tris.HCl (pH 7.4) for 1 h at 4 < 0 > C with gentle shaking. After washing, the bound proteins were eluted with elution buffer (30 mM glutathione, 150 mM Tris.HCl, pH 8.0), separated by SDS / PAGE and stained with Coomassie Brilliant Blue.
NMR Spectroscopy.NMR Spectroscopy.
유일 질소원으로써 15NH4Cl가 보충된 최소 배지에서 Escherichia coli BL21(DE3) 세포를 키워 20℃에서 18시간동안 0.5 mM 이소프로필β-D-1-티오갈락토피라노사이드(IPTG)로 발현을 유도시켜, 균일하게 15N-표지된 human CEP55160 -217 (pGST2, 160217 잔기)를 발현시켰다. GST-친화력 및 사이즈-배제 크로마토그래피를 사용하여 상기 단백질을 정제하였다. 크리오프로브(cryoprobe)가 장착된 ruker Avance 600 스펙트로미터에서 298K에서 600㎕ 샘플(200 μM 단백질, 50mMTris·HCl, pH 7.2, 10% D2O)을 사용하여, 균일하게 15N-표지된 CEP160217 으로 NMR 적정 실험을 수행하였다. 15N-표지된 CEP160 - 217 단독 또는 TEX14 (또는 ALIX) 펩타이드 (50 및 100 μM)와 함께 1H-15N TROSY(transverse relaxation optimized spectroscopy) 스펙트럼을 수행하여 TopSpin (versions 1.3 및 3.0; Bruker)으로 분석하였다. CEP55160-217 단독, CEP55160 -217-TEX14 복합체, 및 CEP55160 -217-ALIX 복합체의 순차적 얼라인먼트에 대해서는 NMR 스펙트럼을 수집할 수 없었는데, 이는 20 mM Tris·HCl (pH 7.2), 10% D2O 내의 균일하게 15N, 13C-표지된 CEP55160 -217 구축물 (1 mM)은 측정동안 응집하는 경향이 있기 때문이다.In the minimal medium supplemented with 15 NH 4 Cl as the only nitrogen source, Escherichia an coli BL21 (DE3) cells at 20 ℃ grow for 18 h 0.5 mM isopropyl-β-D-1- thio going to induce the expression in Lactococcus pyrano side (IPTG), a uniformly labeled 15 N- human CEP55 160 - 217 (pGST2, 160217 residue). The protein was purified using GST-affinity and size-exclusion chromatography. Using a 600 μl sample at 298 K (200 μM protein, 50 mM Tris.HCl, pH 7.2, 10% D 2 O) in a
역전사Reverse transcription 및 정량적 실시간 And quantitative real-time PCRPCR
서울대학교의 동물실험 윤리위원회의 승인 하에 모든 실험 동물(C57BL/6)을 돌보고 실험하였다. 본 발명에서, 성숙 마우스(7주) 및 7-d- 및 17-d-산후 마우스를 PCR 시험에 사용하였다. TRIzol 시약(Invitrogen)을 사용하여 생후 7, 17, 및 42일의 마우스에서 총 RNA를 추출하였다. 랜덤 헥사머를 사용하여 역전사를 수행하였다. 다음 표 1에 나열된 유전자-특이적 프라이머를 사용하여 실시간 PCR을 수행하였다. 상대적 Ct 방법을 사용하여 상대적 유전자 발현 레벨을 계산하여 GAPDH의 발현으로 노말라이즈하였다. All experimental animals (C57BL / 6) were examined and tested under the approval of Seoul National University 's Animal Experimental Ethics Committee. In the present invention, maturation mice (7 weeks) and 7-d- and 17-d-postpartum mice were used for the PCR test. Total RNA was extracted from 7, 17, and 42 days old mice using TRIzol reagent (Invitrogen). Reverse transcription was performed using a random hexamer. Real-time PCR was performed using the gene-specific primers listed in Table 1 below. Relative gene expression levels were calculated using the relative Ct method and normalized to the expression of GAPDH .
[표 1][Table 1]
표면 surface 플라즈몬Plasmon 공명(Surface Resonance PlasmonPlasmon Resonance Resonance SPRSPR ))
표면 플라즈몬 공명(SPR)은 결합속도(on-rate) 및 해리속도(off-rate) 상수의 반응속도론적 측정에 의해 상호 결합력을 측정한다. 야생형 및 돌연변이 CEP55160-217 컨스트럭트와 TEX14 펩타이드의 결합을 SPR (ProteOn XPR36 system, Bio-Rad)을 통하여 25℃에서 100㎕/분의 유속으로 분석하였다. SPR 실험을 위하여 GST-TEX14792-807 (야생형, G795A, P796A, P797A, Y801A, P803A, 및 P804A 돌연변이)과 GST-ALIX795 - 811를 GST의 N-말단과의 공유결합을 통해 표면에 고정시켰다. GLM 센서칩 (Bio-Rad)의 카르복시메틸화 덱스트란 (carboxymethylated dextran) 표면을 1:1 N-히드록시숙신이미드(NHS)/1-에틸-3-(3-디메틸아미노프로필)카보디이미드(EDC)을 이용해 30μL/분의 유속으로 5분 동안 활성화시켰다. 활성화된 표면에 10mM 아세트산나트륨 (pH 4.5) 내의 각 단백질 샘플(10μM)를 30μL/분의 유속으로 5분 동안 통과시킨 후, 에탄올아민(1 M, pH 8.5)으로 30μL/분의 유속으로 5분 동안 블락킹하였다. 모든 결합 실험은 20 mM Tris (pH 7.5), 100 mM NaCl에서 수행하였다. CEP55160 - 217단백질과 야생형 TEX14와의 결합은, CEP55160 - 217단백질 (야생형, W184A, Y187A, R191A, 및 E192A)을 각각 300 및 400s의 결합 및 해리 시간동안 GST-TEX14792-807이 결합되어 있는 플로우셀(flow cell)에 통과시켜 결합 속도 상수 Kon(단위 M-1s- 1)및 해리 속도 상수 koff(단위 s-1)를 측정했다. 야생형 CEP55160 -217과 ALIX, TEX14 돌연변이, 및 키메릭 펩타이드의 결합은 CEP55160 - 217를 각각 300 및 400s의 결합 및 해리 시간동안 GST-ALIX795 -811, GST-TEX14792 -807 돌연변이(G795A, P796A, P797A, Y801A, P803A, 및 P804A), 또는 GST-키메라 펩타이드(TEX14N-ALIXC 및 ALIXN-TEX14C)이 결합되어 있는 플로우셀에 통과시켜 측정하였다. 모든 단백질은 연속적으로 주입하는 사이에, 20 mM ris (pH 7.5), 500 mM NaCl를 30μL/분 유속으로 10-30초간 주입하여 표면을 재생시켰다.Surface plasmon resonance (SPR) measures bond strengths by kinetic measurements of on-rate and off-rate constants. The binding of the wild-type and mutant CEP55 160-217 construct to the TEX14 peptide was analyzed by SPR (ProteOn XPR36 system, Bio-Rad) at 25 ° C at a flow rate of 100 μl / min. To 811 were fixed to the surface via a covalent bond between the N- terminus of the GST - GST-TEX14 792-807 (wild-type, G795A, P796A, P797A, Y801A , P803A, P804A and mutations) and GST-ALIX 795 for the SPR experiment . The carboxymethylated dextran surface of the GLM sensor chip (Bio-Rad) was treated with 1: 1 N-hydroxysuccinimide (NHS) / 1-ethyl-3- (3- dimethylaminopropyl) carbodiimide EDC) at a flow rate of 30 μL / min for 5 minutes. Each protein sample (10 μM) in 10 mM sodium acetate (pH 4.5) was passed through the activated surface for 5 minutes at a flow rate of 30 μL / min and then eluted with ethanolamine (1 M, pH 8.5) at a flow rate of 30 μL / . All binding experiments were performed in 20 mM Tris (pH 7.5), 100 mM NaCl. CEP55 160 - 217. Binding of the wild-type protein and is TEX14, CEP55 160 - 217 protein (wild-type, W184A, Y187A, R191A, and E192A) to each of the
세포 생물학 실험용 Cell biology experiment 컨스트럭트Construct 및 안정화 세포주의 생성 And the generation of stabilizing cell lines
GFP-TEX14 컨스트럭트를 pEGFP-C2 벡터(Clontech)의 EcoRI/XmaI 사이트 내로 클론시켰다. QuikChange Mutagenesis Kit (Stratagene)를 사용하여 GFP-TEX14 (G795A, P796A, P797A, Y801A, P803A, 및 P804A)의 위치지정 돌연변이를 생성시켰고 상기 돌연변이는 DNA 시퀸싱으로 확인하였다. HindIII/SmaI으로 미리 클론한 GFPTEX14 WT 및 돌연변이 컨스트럭트에서 절단한 야생형 TEX14 및 돌연변이(Y801A, P804A, 및 Y801A/P804A) 인코딩 유전자를 pcDNA5/TO/FRT/3xflag 벡터에 삽입하였다. TEX14 WT 및 돌연변이를 발현하는 안정 세포 라인을 확립하기 위하여, 매뉴얼(Roche)에 따라 TEX14 및 POG44를 함유하는 pcDNA5/TO/FRT/3xflag를 9:1 비율로 혼합하여 FuGENE가 있는 HeLa FRT/TO 세포 내로 트랜스팩션하였다. 생존 콜로니를 모으기 위하여 하이그로마이신(hygromycin)으로 선택을 하였다. 확립된 안정 세포 라인은 37℃, 5% CO2 인큐베이터에서 10% FBS가 보충된 DMEM 내에서 유지시켰다. TEX14 발현을 유도하기 위하여, 상기 세포를 독시사이클린(1㎍/mL)로 처리하였다.The GFP-TEX14 construct was cloned into the Eco RI / Xma I site of the pEGFP-C2 vector (Clontech). Positional mutations of GFP-TEX14 (G795A, P796A, P797A, Y801A, P803A, and P804A) were generated using the QuikChange Mutagenesis Kit (Stratagene) and this mutation was confirmed by DNA sequencing. The wild-type and mutant TEX14 (Y801A, P804A, Y801A and / P804A) encoding gene from the cut Hind III / Sma I pre clones GFPTEX14 WT and mutant constructs were inserted into a root pcDNA5 / TO / FRT / 3xflag vector. In order to establish a stable cell line expressing TEX14 WT and mutants, a 9: 1 ratio of pcDNA5 / TO / FRT / 3xflag containing TEX14 and POG44 according to the manual (Roche) was used to generate HeLa FRT / TO cells with FuGENE Lt; / RTI > Hygromycin was chosen to collect survival colonies. Established stable cell lines were maintained in DMEM supplemented with 10% FBS in a 5% CO 2 incubator at 37 ° C. To induce TEX14 expression, the cells were treated with doxycycline (1 [mu] g / mL).
실시예Example 1. TEX 1. TEX 14 과14th CEP55CEP55 -- EABREABR 복합체의 결정 구조 규명 Identification of crystal structure of complex
SPR 실험결과 CEP55-EABR은 TEX14의 13개 잔기와 결합을 하는 것으로 나타났으며, 이 결합의 해리상수 (Kd)는 ~300nM인 것으로 나타났다 (도 1 A-C 참고). 이러한 결과는 펩타이드가 ALIX 및 TSG101 (1-3uM)보다 높은 결합력을 가지고 있음을 나타낸다 (Lee HH, et al, Science 322(5901):576-580.). 증가하는 양의 TEX14 펩타이드를 이용한 경쟁실험결과에서도 나타난 바와 같이 TEX14 및 ALIX 펩타이드가 CEP55-EABR의 동일 부위에 결합한다는 것을 나타낸다 (도 1 D, E). 이러한 결과는 TEX14, ALIX 및 TSG101 펩타이드가 CEP55-EABR의 동일한 부위에 결합하는 것을 나타낸다. SPR experiments showed that CEP55-EABR binds to 13 residues of TEX14 and the dissociation constant (Kd) of this bond is ~300 nM (see Figure 1 A-C). These results indicate that the peptide has a higher binding capacity than ALIX and TSG101 (1-3 uM) (Lee HH, et al, Science 322 (5901): 576-580.). (Fig. 1 D, E). As shown in the results of competitive experiments using an increasing amount of TEX14 peptide, TEX14 and ALIX peptides bind to the same site of CEP55-EABR. These results indicate that TEX14, ALIX and TSG101 peptides bind to the same site of CEP55-EABR.
회절 데이터는 P22121의 공간군을 갖는 2.3Å의 최대 해상도로 수집하였다. 표 2에 수집된 테이터의 통계를 요약했다. CEP55-EABR 및 TEX14 복합체의 결정 구조를 2.3Å 해상도로 분석한 결과, 도 1 G, F에 나타난 바와 같이, 전장에 걸쳐 평행한 꼬아진 코일 (coiled coil) 구조를 형성하였으며, 7개의 heptad 반복체를 형성하였다. 나아가 ALIX와 동일한 부위에 TEX 펩타이드가 결합하는 것으로 나타났으며, CEP55-EABR 대 TEX14의 스토이키오메트리는 2:1 이었다. The diffraction data were collected at a maximum resolution of 2.3 A with a space group of
[표 2][Table 2]
표 3은 복합체 결정의 구조좌표(structure coordinate) X-선 회절 데이터이다. Table 3 is the structure coordinate X-ray diffraction data of the composite crystal.
[표 3][Table 3]
실시예Example 2. 2. CEP55CEP55 -- EABREABR -- TEX14TEX14 복합체의 결합의 중요한 Important of coupling of complex 잔기Residue 규명 Identification
CEP55-EABR에서 TEX14과 접하는 부위 잔기 (interfacial residue)를 Ala으로 치환하고, 이들의 상호작용을 SPR로 규명하였다. TEX14의 N 말단은 CEP55-EABR의 Tyr 187 잔기를 감싸면서 GPP 모티브 및 Tyr801 사이에서 꺾여져 있다. Y187A 치환 돌연변이로 인해 TEX14 펩타이드에 대한 결합력이 감소하였다 (Kd 149.1 μM) (도 2A, B). TEX14 펩타이드의 GPP 서열은 CEP55-EABR의 Trp184 및 Tyr187과, 그리고 Lys180 및 Gln183의 지방족 곁쇄와 상당한 접촉을 한다 (도 2A). CEP55-EABR Trp184 돌연변이로 인해 TEX14와의 결합이 거의 사라진 것으로 나타났다 (도 2B).In CEP55-EABR, the interfacial residue in contact with TEX14 was replaced with Ala, and their interaction was identified by SPR. The N-terminus of TEX14 is folded between the GPP motif and Tyr801 while surrounding the Tyr 187 residue of CEP55-EABR. The Y187A substitution mutation resulted in a decrease in binding to the TEX14 peptide (Kd 149.1 [mu] M) (Fig. 2A, B). The GPP sequence of the TEX14 peptide makes substantial contact with Trp184 and Tyr187 of CEP55-EABR, and the aliphatic side chains of Lys180 and Gln183 (Figure 2A). The CEP55-EABR Trp184 mutation almost disappeared with TEX14 (Fig. 2B).
TEX14의 Pro796 및 Pro797도 CEP55-EABR와 상당한 접촉을 하며 (도 2A), 이들 잔기를 Ala으로 치환하는 경우 결합력이 현저하게 감소하는 것으로 나타났다 (각각 Kd 116.1 및 40.4 μM) (도 2B). 나아가 G795A 돌연변이도 결합력을 Fact또는∼10 (도 2B)으로 감소시키는 것으로 나타났다. 또한 TEX14 Tyr801 (ALIX의 Tyr806 해당)도 Glu192′(프라임은 주위 서브유니트의 잔기를 나타낸다)의 OE1 원자와 강한 수소결합(2.8 Å)을 하며 결합에 기여하는 것으로 나타났다 (도 2A). Pro796 and Pro797 of TEX14 also showed significant contact with CEP55-EABR (Fig. 2A) and showed a significant decrease in binding when substituting these residues with Ala (Kd 116.1 and 40.4 μM, respectively) (Fig. 2B). Furthermore, the G795A mutation was also shown to reduce the binding force to Fact or ~ 10 (Figure 2B). TEX14 Tyr801 (corresponding to Tyr806 of ALIX) also showed strong hydrogen bonding (2.8 A) with OE1 atoms of Glu192 '(prime represents residues of surrounding subunits) and contributed to binding (Fig. 2A).
Tyr801 및 Glu192′잔기를 Ala으로 치환하는 경우 결합력이 감소하였다(각각 Kd 184.3 및 119.2 μM)(도 2B). CEP55의 Arg191을 Ala으로 치환하면 미드바디의 로칼리제이션이 심각한 타격을 받는 것으로 나타났으며 TEX14와의 결합에도 영향을 미쳤다(Kd 222.3 μM) (도 2B). CEP55-EABR 및 TEX14에서 이중 돌연변이는 각각의 단일 치환보다 결합력에 더 심각한 영향을 미치는 것으로 나타났다 (도 2B).When the Tyr801 and Glu192 'residues were substituted with Ala, the binding capacity decreased (Kd 184.3 and 119.2 μM, respectively) (Fig. 2B). Substitution of Arg191 for CEP55 with Ala has shown that mid-body localization is severely affected and also has an effect on binding to TEX14 (Kd 222.3 [mu] M) (Fig. 2B). In CEP55-EABR and TEX14, the double mutation appeared to have a more serious impact on the binding force than either single substitution (Fig. 2B).
CEP55-EABR의 Tyr187은 TEX14의 Pro796, Tyr801, 및 Pro804과 상당한 접촉을 하는 것으로 나타났으며 (도 2A), CEP55-EABR에 Y187A 돌연변이를 포함하는 이중 치환은 상호작용에 심각한 악영향을 미치는 것으로 나타났다(CEP55-EABR-TEX14 Y187A/P796A, Y187A/Y801A, 및 Y187A/P804A) (도 2B). 이러한 결과는 CEP55-EABR의 Tyr187 주위로 TEX14 펩타이드의 결합이 CEP55-EABR 및 TEX14 상호작용에 중요하다는 것을 나타낸다. Tyr187 of CEP55-EABR was found to have significant contact with Pro796, Tyr801, and Pro804 of TEX14 (Fig. 2A), and double substitutions involving the Y187A mutation in CEP55-EABR showed severe adverse effects on interaction CEP55-EABR-TEX14 Y187A / P796A, Y187A / Y801A, and Y187A / P804A) (Fig. 2B). These results indicate that binding of TEX14 peptide around Tyr187 of CEP55-EABR is important for CEP55-EABR and TEX14 interaction.
실시예Example 3. 3. TEX14의Of TEX14 C 말단 구조 (Conformation) 규명 Identification of C terminal structure (Conformation)
TEX14 펩타이드의 전체적 구조는 C말단을 제외하고는 ALIX 펩타이드와 유사하다(Lee HH, et al, Science 322(5901):576-580.) (도 1F). CEP55-EABR-TEX14 복합체를 CEP55-EABR-ALIX 복합체와 겹쳐보면, TEX14의 C-말단 고리가 ALIX와 반대방향을 향하는 것을 알 수 있다(도 1F).The overall structure of the TEX14 peptide is similar to the ALIX peptide except at the C-terminus (Lee HH, et al, Science 322 (5901): 576-580. When the CEP55-EABR-TEX14 complex is overlapped with the CEP55-EABR-ALIX complex, it can be seen that the C-terminal ring of TEX14 is oriented in the opposite direction to the ALIX (FIG. 1F).
이러한 구조가 용액 중에서도 유지되는지를 보기위하여 각 펩타이드의 농도를 증가시키면서 CEP55-EABR의 15N-1H HSQC (heteronuclear single-quantum coherence) 스펙트럼 촬영을 하였다. The perturbation peaks에 의하면 전반적 상호작용이 화학적 교환 측면에서 매우 느린 것으로 나타났다 (데이터 나타내지 않음). CEP55 Trp184 단일 피크가 TEX14의 Val794, Gly795, 및 Pro796 (Gln799, Gly800 및 Pro801 of ALIX)와 강한 접촉을 하는데 CEP55-EABR-TEX14 및 CEP55-EABR-ALIX에서 별개의 마이그레이션을 보이며 스플리트 된 것으로 나타났는데 이는 TEX14 또는 ALIX 펩타이드에 결합한 경우 Trp184 과 Trp184′의 환경이 불균형적임을 나타낸다 (도 2C).A 15N-1H HSQC (heteronuclear single-quantum coherence) spectroscopy of CEP55-EABR was performed with increasing concentrations of each peptide to see if this structure was retained in solution. The perturbation peaks showed that overall interactions were very slow in terms of chemical exchange (data not shown). A single peak of CEP55 Trp184 showed strong contact with Val794, Gly795, and Pro796 (Gln799, Gly800 and Pro801 of ALIX) of TEX14, showing a separate migration in CEP55-EABR-TEX14 and CEP55-EABR-ALIX This indicates that the environment of Trp184 and Trp184 'is unbalanced when bound to TEX14 or ALIX peptide (Fig. 2C).
TEX14 또는 ALIX 펩타이드의 C 말단에 가까이 (913 Å apart)있는 Gly197 및 Gly197′ 잔기의 화학적 쉬프트도 상이한 것으로 나타났다 (도 2C). 이러한 결과는 TEX14 및 ALIX 펩타이드의 C 말단 꼬리가 CEP55-EABR에 상이한 방식으로 결합하는 것을 나타낸다 (도 1F).The chemical shifts of Gly197 and Gly197 'residues near the C-terminus of TEX14 or ALIX peptide (913A apart) were also different (FIG. 2C). These results indicate that the C-terminal tail of TEX14 and ALIX peptides bind differently to CEP55-EABR (Fig. 1F).
실시예Example 4. 상이한 구조의 4. Different structures TEX14TEX14 또는 or ALIXALIX , , 펩타이드Peptides C-말단에서 Pro의 역할 규명 Identifying the role of Pro at the C-terminus
상이한 구조를 갖는 TEX14 (또는 ALIX) 펩타이드 C-말단의 원인을 규명하였다. TEX14에서는 ALIX와 비교하여 하나의 잔기 Ile802가 Tyr801 및 Pro803 사이에 부가되어 있었다 (도 1F). 타이로신 잔기는 Tyr-Pro 서열에서 프롤린 잔기가 cis 구조를 취하도록 하는 경향이 있다 (16). ALIX 및 TEX14 펩타이드의 Pro807 잔기는 trans 구조를 취하는 것으로 나타났다(도 1F 및 2A). C-말단의 방향에 미치는 프롤린 잔기(TEX14의 Pro803; ALIX의 Pro807)의 역할을 추가로 규명하기 위하여, 프롤린 잔기의 위치를 변경하였다. 이를 위해 두 개의 키메라 펩타이드 (TEX14N-ALIXC 및 ALIXN-TEX14C): N-말단 TEX14 (잔기 792-801)이 C-말단 ALIX (residues 807-811)에 연결됨 및 N-말단 ALIX (residues 795-806)이 C-말단 TEX14 (residues 802-807)에 연결됨 (도 1B). GST 풀다운 분석 및 SPR 실험결과 TEX14N-ALIXC 및 ALIXN-TEX14C 펩타이드 모두가 CEP55-EABR에 대하여 야생형 TEX14 또는 ALIX 펩타이드와 비교하여 낮은 결합력을 갖는 것으로 나타났다 (각각 Kd 7.3 및 6.7 μM) (도 3 A 및 B). 실제 결정구조에서도 TEX14N-ALIXC 또는 ALIXN-TEX14C 펩타이드와 복합체를 형성한 CEP55-EABR은 C-말단의 방향이 변한 것으로 나타났다. 이러한 결과는 Pro 잔기가 C-말단의 방향 결정에 역할을 하는 것을 나타낸다(도 3 C-E).The cause of the C-terminal of TEX14 (or ALIX) peptide with different structure was identified. In TEX14, one residue Ile802 was added between Tyr801 and Pro803 compared to ALIX (Fig. 1F). The tyrosine residue tends to cause the proline residue in the Tyr-Pro sequence to assume the cis structure (16). The Pro807 residue of the ALIX and TEX14 peptides appeared to take a trans structure (Figures 1F and 2A). To further characterize the role of the proline residue (Pro803 of TEX14; Pro807 of ALIX) on the orientation of the C-terminus, the position of the proline residue was changed. To this end, two chimeric peptides (TEX14 N- ALIX C and ALIX N- TEX14 C ): N-terminal TEX14 (residues 792-801) are linked to the C-terminal ALIX (residues 807-811) 795-806) is linked to C-terminal TEX14 (residues 802-807) (Fig. 1B). GST pulldown analysis and SPR experiments showed that both TEX14 N- ALIX C and ALIX N- TEX14 C peptides had low binding (relative to wild-type TEX14 or ALIX peptide to CEP55-EABR (Kd 7.3 and 6.7 μM, respectively) 3 A and B). The actual crystal structure CEP55-EABR in the formation of the N TEX14 -ALIX C or N ALIX -TEX14 C-peptide and the complex was found to have changed direction of the C- terminal. These results indicate that the Pro residue plays a role in determining the orientation of the C-terminus (Fig. 3 CE).
실시예Example 5. 5. TEX14의Of TEX14 CEP55CEP55 -- EABR에의To EABR 우위적Predominant 결합 기전 규명 Identification of binding mechanism
체세포에서 TEX14는 발현되지 않고, 그 결과 ALIX (또는 TSG101)CEP55-EABR에의 결합을 점하게 된다(1). 대조적으로 도 4A의 실시간 역전사 정량 PCR 결과에도 나타난 바와 같이 생식세포에서는 TEX 14, ALIX 및 TSG101 모두가 발현되기 때문에 TEX14의 CEP55-EABR에의 결합은 정교한 조절이 필요하다. In somatic cells, TEX14 is not expressed, resulting in binding to ALIX (or TSG101) CEP55-EABR (1). In contrast, the binding of TEX14 to CEP55-EABR requires elaborate regulation, since
따라서 생식세포에서 TEX14가 경쟁자인 ALIX 또는 TSG101의 존재 중에서 CEP55에의 결합을 점하는 기전을 규명하였다. 이를 위해 TEX14의 CEP55에 대한 결합력(Kd 323 nM)이 ALIX (또는 TSG101)의 CEP55에 대한 결합력(Kd 1-3 μM)보다 강하기 때문에 차별적 또는 임시적으로 미드바디로 리쿠르트된다는 가설을 세웠다.Thus, we have identified the mechanism by which TEX14 in germ cells is responsible for binding to CEP55 in the presence of competitor ALIX or TSG101. For this, we hypothesized that the binding force of TEX14 to CEP55 (Kd 323 nM) is stronger than that of ALIX (or TSG101) against CEP55 (Kd 1-3 μM), so it is differentiated or temporarily recoated in midbodies.
하지만 친화도 자체만으로도 ALIX (또는 TSG101)의 CEP55-EABR의 리쿠르트를 완전히 막을 수는 없으며 이는 생식세포에서 미드바디로 리쿠르트되는 순서는 MKLP1→TEX14→CEP55이고, 반면 체세포에서 MKLP1→CEP55→ALIX (또는 TSG101)인 것으로 나타났다 (Iwamori T, et al. (2011) PLoS One 6(2):e17066.). 본원에 따른 모델에서 생식세포에서 TEX14는 ALIX 또는 TSG101 전에 CEP55-EABR의 도움을 받지 않고 미드바디로 리쿠르트되며, 그 결과 미드바디에서 TEX14 792-804 펩타이드의 국소적 농도가 ALIX 및 TSG101 펩타이드보다 높아, 결국 TEX14 792-804 이 CEP55-EABR를 점하게 되는 것이다. 이런 경우, TEX14의 리쿠르트에 관여하는 CEP55-EABR-TEX14 영역을 분석하였다. 이를 위해 CEP55-EABR-TEX14 결합을 방해하는 돌연변이가 미드바디에서 국소적 농도에 영향을 미치는 지를 조사하였다. HeLa 세포에서 GFP-TEX14와의 발현을 분석하고 이의 세포내 위치를 조사하였다. 그 결과 야생형 및 돌연변이 GFP-TEX14는 CEP55-EABR의 도움없이 미드바디로 리쿠르트된 것으로 나타났다 (도 4 B 및 C). 이러한 결과는 생식세포에서 CEP55 결합전에 MKLP1에 결합하여 미드바디로 리쿠르트된다는 것과 일치하는 것이다((Iwamori T, et al. PLoS One 6(2):e17066.). 이러한 결과가 TEX14의 엑토픽 과발현에 기인할 가능성을 배제하기 위하여, TEX14를 발현하는 안정화 세포주를 제작하였다. 이 경우 야생형 TEX14의 기초 발현은 감소되었으나, 독시사이클린의 부재에도 TEX14가 낮은 수준으로 누수발현되는 것으로 나타났다(도 4E). flag 표지된 야생형 및 돌연변이 TEX14는 유사한 수준으로 안정적으로 발현되는 것으로 나타났다(도 5A). 나아가 야생형 및 돌연변이 TEX14 안정화 세포주를 이용하여 정상 세포의 분열에 미치는 영향을 조사하였다. 이를 위해 2n, 4n, 및 8n DNA 와 같이 다핵세포 수를 계측하였다 (도 4D). 그 결과 야생형 TEX14를 발현하는 세포는 다핵의 세포간 브릿지가 축적되는 양상을 보이는 비정상 상태인 것으로 나타났다(P < 0.0001). 이러한 결과는 TEX14가 미드바디로 ESCRT가 리쿠르트되는 것을 막는다는 것을 나타낸다. 또한 TEX14 돌연변이 (Y801A, P804A, 및 Y801A/P804A)에서는 다핵세포가 유의적으로 감소한 것으로 나타났다 (7.96%, 7.13%, 및 7.64%, respectively; P <0.05) (도 4D). 이러한 결과는 CEP55-EABR 및 TEX14 간의 상호작용으로 인해 TEX14가 세포 분열을 억제할 수 있음을 나타낸다. However, affinity itself alone can not completely prevent the recruitment of CEP55-EABR from ALIX (or TSG101), which is recruited from the germ cells to the midbodies in order of MKLP1 → TEX14 → CEP55, whereas in somatic cells, MKLP1 → CEP55 → ALIX TSG101) (Iwamori T, et al. (2011) PLoS One 6 (2): e17066.). In the model according to the present invention, TEX14 in germ cells is recycled mid-body without the aid of CEP55-EABR before ALIX or TSG101, resulting in a local concentration of TEX14 792-804 peptide in the midbodies higher than ALIX and TSG101 peptides, In the end, TEX14 792-804 will take over CEP55-EABR. In this case, the CEP55-EABR-TEX14 region involved in the recruitment of TEX14 was analyzed. For this, we investigated whether the mutations that interfere with CEP55-EABR-TEX14 binding affect local concentrations in the midbodies. Expression of GFP-TEX14 was analyzed in HeLa cells and its intracellular location was examined. As a result, wild-type and mutant GFP-TEX14 were recruited to the midbodies without the aid of CEP55-EABR (Fig. 4B and C). These results are in agreement with the fact that they bind to MKLP1 and are recruited in midbodies before the binding of CEP55 to germ cells ((Iwamori T, et al., PLoS One 6 (2): e17066.) These results suggest that the overexpression of TEX14 In order to exclude the possibility of inducing TEX14 expression, a stabilized cell line expressing TEX14 was prepared, in which the basal expression of wild-type TEX14 was reduced, but the leakage of TEX14 was also found to be low even in the absence of doxycycline (FIG. (Fig. 5A). Further, the effect of wild-type and mutant TEX14-stabilized cell lines on the division of normal cells was investigated. For this, 2n, 4n, and 8n DNA (Fig. 4D). As a result, the cells expressing wild-type TEX14 showed accumulation of polynuclear intercellular bridges (P <0.0001), indicating that TEX14 prevents ESCRT from being recruited into the midbodies. In addition, TEX14 mutations (Y801A, P804A, and Y801A / P804A) (Fig. 4D). These results indicate that TEX14 can inhibit cell division due to the interaction between CEP55-EABR and TEX14 (Fig. .
실시예Example 6. 6. 인비보에서In Invivo TEX14가TEX14 ALIXALIX 미드바디Mid-body 교체에 미치는 영향 분석 Analysis of impact on replacement
TEX14가 CEP55-EABR에 경쟁적 결합을 통해 ALIX가 리쿠르트되는 것을 막는지를 조사하기 위하여 야생형 및 돌연변이 TEX14 안정화 세포주를 이용하여 ALIX 교체 (displacement) 실험을 수행하였다 (도 5 A 및 B). 구체적으로 미드바디에 TEX14 또는 그 돌연변이체가 존재하는 경우 내인성 ALIX가 미드바디로 갈 수 있는지 조사하였으며, 이는 TEX14 발현이 내인성 ALIX가 미드바디로 가는 것을 막을 수 있다는 가설에 의한 것이다. 도 5 A 및 B에 기재된 바와 같이 야생형 TEX14이 발현되는 경우 ALIX이 완전히 교체되는 것으로 나타났으며, 이는 TEX14가 ALIX 및 CEP55-EABR 간의 상호작용을 방해하는 것을 나타낸다. TEX14 돌연변이의 효과를 조사하기 위하여, 야생형과 돌연변이간의 상대적 형광강도를 분석하였다(도 5B). 전달이입되지 않은 세포에서 내인성 ALIX의 강도는 야생형 TEX14이 발현된 경우에 강도와 비교하여 유의적으로 높은 것으로 나타났다 (P < 0.001; 도 5B). 그러나 TEX14 돌연변이(Y801A, P803A, 및 Y801A/P803A)가 발현된 경우에는 ALIX의 상대적 강도는 야생형 TEX14이 발현된 경우와 비교하여 유의적으로 증가한 것으로 나타났다(P < 0.001)(도 5B). 이러한 결과는 TEX14의 AxGPPx3YxPP 모티브의 돌연변이가 유발된 경우, TEX14 및 CEP55-EABR 간의 결합이 약화되고, 그 결과 ALIX 교체효과가 감소되는 것을 나타낸다. ALIX displacement experiments were performed using wild-type and mutant TEX14-stabilized cell lines to investigate whether TEX14 prevented ALIX from being recruited through competitive binding to CEP55-EABR (FIGS. 5A and B). Specifically, the presence of TEX14 or its mutants in the midbodies investigated whether the endogenous ALIX could go to the midbodies, which is based on the hypothesis that TEX14 expression can prevent the endogenous ALIX from going to the midbodies. As shown in Figures 5A and B, when wild-type TEX14 is expressed, ALIX has been shown to be completely replaced, indicating that TEX14 interferes with the interaction between ALIX and CEP55-EABR. To investigate the effect of the TEX14 mutation, the relative fluorescence intensity between the wild type and the mutant was analyzed (Fig. 5B). The intensity of endogenous ALIX in the non-transfected cells was significantly higher (P <0.001; FIG. 5B) when wild-type TEX14 was expressed compared to the intensity. However, when the TEX14 mutations (Y801A, P803A, and Y801A / P803A) were expressed, the relative intensity of ALIX was significantly increased (P <0.001) compared to wild-type TEX14 expression (FIG. These results indicate that when the mutation of the AxGPPx 3 YxPP motif of TEX14 is induced, the binding between TEX14 and CEP55-EABR is weakened and as a result the ALIX replacement effect is reduced.
실시예Example 7. 7. TEX14TEX14 펩타이드의Of peptide 머무름 시간 증가에 따른 Increased retention time TEX14의Of TEX14 CEP55CEP55 -- EABR에EABR 의 of 우위적Predominant 결합 규명 Bond identification
ESCRT 장치는 체세포의 정상적 분열에 필요하지만, 생식세포에는 세포간 브릿지가 정자생성과정에서 절단되지 않아야 하기 때문에 세포막에 손상을 가할 수도 있다. 따라서 아무리 적은 수의 ALIX 분자라도 CEP55-EABR에 결합하면 문제가 생길 수 있다. TEX14 펩타이드의 CEP55-EABR에 대한 고친화도와 TEX14의 국소적으로 높은 농도가 TEX14의 우위적 결합에 기여하는 것으로 나타났다. 그러나, TEX14 펩타이드의 CEP55-EABR에 대한 결합 카이네틱스가 세포가 우위적 결합에 유리하지 않다면, 세포가 브릿지는 여전히 안전하지 않다. TEX14가 CEP55-EABR에 머무르는 시간이 짧다면 ALIX가 CEP55-EABR에 결합할 것이다. 이러한 문제를 규명하기 위하여, SPR을 이용하여 TEX14 및 ALIX 펩타이드의 해리속도를 측정하였다(도 6A). TEX14 펩타이드의 해리상수 0.012 ± 0.001 s-1인 것으로 나타났으며 이는 ALIX 펩타이드 (0.19 ± 0.02 s- 1)와 비교하여 ∼15배 느린 것이다 (도 6A). 이러한 결과는 TEX14 펩타이드가 머무르는 시간이 ∼80 s로 더 길고 이것이 TEX14 펩타이드의 CEP55-EABR에의 우위적 결합에 더 유리하게 작용하는 것을 나타낸다. ESCRT devices are necessary for normal cell division, but intercellular bridges in germ cells may damage cell membranes because they must not be cleaved during spermatogenesis. Thus, even small numbers of ALIX molecules can be problematic when bound to CEP55-EABR. The high affinity of TEX14 peptide for CEP55-EABR and the locally high concentration of TEX14 were found to contribute to the dominant binding of TEX14. However, if the binding kinetic of the TEX14 peptide to CEP55-EABR is not beneficial for predominant binding of the cell, the cell bridge is still not safe. If the time for TEX14 to stay in CEP55-EABR is short, ALIX will bind to CEP55-EABR. To identify these problems, dissociation rates of TEX14 and ALIX peptides were measured using SPR (Fig. 6A). It was shown to be the dissociation constant of 0.012 ± 0.001 s -1 TEX14 ALIX peptide which peptide is to 15 times slower in comparison with (0.19 ± 0.02 s 1) (Fig. 6A). These results indicate that the residence time of the TEX14 peptide is longer to ~80 s, which is more advantageous for the predominant binding of the TEX14 peptide to CEP55-EABR.
SPR 실험을 통하여 CEP55160 -217-TEX14 펩타이드 해리 상수(Kd)는 ∼300 nM, CEP55160-217-ALIX 펩타이드 해리 상수(Kd)는 ∼3 μM로 ALIX 펩타이드에 비해서 높은 친화력을 갖는 것을 확인할 수 있었으며, GST-TEX14792 -807 돌연변이들에서는 해리 상수(Kd)가 낮아지는 것을 실험을 통해 확인하였다. 또한, TEX14 펩타이드의 해리 속도 상수는 0.012 ± 0.001 s-1, ALIX 펩타이드의 해리 속도 상수는 0.19 ± 0.02 s-1로 TEX14 펩타이드가 Alix 펩타이드에 비해서 월등히 느린데, 이 결과는 TEX14 펩타이드가 CEP55와의 결합에 있어서 지배적으로 유리하다는 것을 보여준다. TEX14의 다층(multi-layered) 세이프가드 시스템이 ALIX가 CEP55의 EABR에 결합하지 못하게 하여 궁극적으로 생식 세포의 세포간 브릿지를 세포막 가위로서 작용하는 잠재적인 위험요소인 ESCRT machinery로부터 보호한다는 것을 증명했다. 그러므로 TEX14를 통해 세포분열을 억제하는 생식 세포의 세포 분열 메커니즘을 규명함으로써 암세포와 같은 비정상적인 세포의 분열을 막는 효과적인 방안을 제시했다고 할 수 있다. Through the SPR experiment CEP55 160 -217 -TEX14 peptide dissociation constant (Kd) has been able to check that it has a high affinity compared to ~300 nM, CEP55 160-217 -ALIX peptide dissociation constant (Kd) is ALIX peptide to ~3 μM , And the dissociation constant (Kd) of the GST-TEX14 792 -807 mutants was lowered by experiments. In addition, the dissociation rate constant of the TEX14 peptide is 0.012 ± 0.001 s -1 and the dissociation rate constant of the ALIX peptide is 0.19 ± 0.02 s -1 . The
따라서 본원에 따른 결과에 의하면 CEP55는 TEX14와 ALIX의 경쟁적인 interplay를 통해 이루어지는 세포분열의 조절자로서 세포분열을 인위적으로 제어할 수 있는 효과적인 표적단백질로 작용할 수 있다. 특히 종양 세포에서 CEP55의 발현이 증가한다는 사실을 볼 때, CEP55는 다양한 질병의 치료제 표적이 될 수 있다. AxGPPX3YxPP motif를 포함하고 있는 TEX14 펩타이드 유도체는 CEP55-EABR에 결합하여 안정한 세포간 브릿지를 형성하여 암세포의 분열 및 증식을 억제하는 치료제 표적이 될 수 있다. Thus, according to the results of the present application, CEP55 can act as an effective target protein that can artificially control cell division as a regulator of cell division through competitive interplay of TEX14 and ALIX. In particular, in view of the increased expression of CEP55 in tumor cells, CEP55 can be a therapeutic target for a variety of diseases. The TEX14 peptide derivative containing the AxGPPX 3 YxPP motif may be a therapeutic target for inhibiting the division and proliferation of cancer cells by binding to CEP55-EABR to form a stable intercellular bridge.
실시예Example 8. 생식세포 분열의 억제 모델 정리 및 용도 8. Assay model of germ cell division inhibition and its use
본원에 개시된 결과는 TEX14의 다중 안전시스템이 ALIX (및 TSG101)의 CEP55-EABR에의 결합을 억제하고, 생식세포 세포간 브릿지를 ESCRT 장치로부터 보호하여, 가능한 막 손상을 예방하는 것을 나타낸다. 따라서 TEX14을 통한 세포 절단을 불활성화하는 내인성 능력을 갖는 생식세포에서 세포를 절단하는 기전을 규명하면, 암세포와 같은 비정상 세포의 분열을 막을 수 있는 방법을 또한 알아낼 수 있을 것이다 (도 6B). The results presented herein demonstrate that multiple safety systems of TEX14 inhibit the binding of ALIX (and TSG101) to CEP55-EABR and protect germ cell intercellular bridges from ESCRT devices, thereby preventing possible membrane damage. Therefore, it would be possible to find a method of preventing the division of abnormal cells such as cancer cells by identifying the mechanism of cleaving the cells in germ cells having endogenous ability to inactivate the cell cleavage through TEX14 (Fig. 6B).
TEX14 및 ALIX (또는 TSG101)와의 경쟁적 상호작용을 통해 세포 절단의 조절자로 작용하는 CEP55의 역할을 고려하면, CEP55는 세포분열을 효과적으로 조절하기 위한 표적이 될 수 있다. 실제 CEP55는 염색체 불안정성과 관련된 것으로 나타난 70개 유전자 중의 하나이며, 이의 발현이 많은 암세포에서 증가된 것으로 나타났다 (18). 따라서 CEP55는 다양한 질환의 치료 표적이 될 수 있으며, 이에, AxGPPx3YxPP 모티브를 포함하는 TEX14 펩타이드, 또는 그 유도체를 이용하면 CEP55-EABR에의 결합 및 안정적 세포간 브릿지 형성을 통해 암세포 증식을 억제할 수 있을 것이다. 이러한 본원의 제안은 TEX14을 발현시켜 체세포의 미드바디를 생식세포 세포간 브릿지로 전환하는 것이 가능하다는 종전의 연구에 의해 뒷받침되는 것이다 (Greenbaum MP, et al. (2007) Dev Biol 305(2):389-396; Iwamori T, et al. (2010) Mol Cell Biol 30(9):2280-2292.).Taking into consideration the role of CEP55 as a modulator of cell cleavage through competitive interactions with TEX14 and ALIX (or TSG101), CEP55 can be a target for effectively controlling cell division. In fact, CEP55 is one of the 70 genes associated with chromosomal instability and its expression has been shown to be increased in many cancer cells (18). Thus, CEP55 can be a therapeutic target for various diseases. Thus, using TEX14 peptide or derivatives thereof containing AxGPPx 3 YxPP motif, it is possible to inhibit cancer cell proliferation through binding to CEP55-EABR and stable intercellular bridge formation There will be. These proposals are supported by previous research showing that it is possible to express TEX14 and convert the somatic midbodies into germ cell intercellular bridges (Greenbaum MP, et al. (2007) Dev Biol 305 (2): 389-396; Iwamori T, et al (2010) Mol Cell Biol 30 (9): 2280-2292.).
이상에서 본원의 예시적인 실시예에 대하여 상세하게 설명하였지만 본원의 권리범위는 이에 한정되는 것은 아니고 다음의 청구범위에서 정의하고 있는 본원의 기본 개념을 이용한 당업자의 여러 변형 및 개량 형태 또한 본원의 권리범위에 속하는 것이다.While the present invention has been described in connection with what is presently considered to be the preferred embodiments, it is to be understood that the invention is not limited to the disclosed embodiments, but, on the contrary, .
본 발명에서 사용되는 모든 기술용어는, 달리 정의되지 않는 이상, 본 발명의 관련 분야에서 통상의 당업자가 일반적으로 이해하는 바와 같은 의미로 사용된다. 본 명세서에 참고문헌으로 기재되는 모든 간행물의 내용은 본 발명에 도입된다. All technical terms used in the present invention are used in the sense that they are generally understood by those of ordinary skill in the relevant field of the present invention unless otherwise defined. The contents of all publications referred to herein are incorporated herein by reference.
<110> SEOUL NATIONAL UNIVERSITY R&DB FOUNDATION <120> Protein crystal of CEP55-TEX14 complex and its use <130> DP201510006P <160> 2 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 464 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <221> DOMAIN <222> (160)..(217) <223> EABR <400> 1 Met Ser Ser Arg Ser Thr Lys Asp Leu Ile Lys Ser Lys Trp Gly Ser 1 5 10 15 Lys Pro Ser Asn Ser Lys Ser Glu Thr Thr Leu Glu Lys Leu Lys Gly 20 25 30 Glu Ile Ala His Leu Lys Thr Ser Val Asp Glu Ile Thr Ser Gly Lys 35 40 45 Gly Lys Leu Thr Asp Lys Glu Arg His Arg Leu Leu Glu Lys Ile Arg 50 55 60 Val Leu Glu Ala Glu Lys Glu Lys Asn Ala Tyr Gln Leu Thr Glu Lys 65 70 75 80 Asp Lys Glu Ile Gln Arg Leu Arg Asp Gln Leu Lys Ala Arg Tyr Ser 85 90 95 Thr Thr Ala Leu Leu Glu Gln Leu Glu Glu Thr Thr Arg Glu Gly Glu 100 105 110 Arg Arg Glu Gln Val Leu Lys Ala Leu Ser Glu Glu Lys Asp Val Leu 115 120 125 Lys Gln Gln Leu Ser Ala Ala Thr Ser Arg Ile Ala Glu Leu Glu Ser 130 135 140 Lys Thr Asn Thr Leu Arg Leu Ser Gln Thr Val Ala Pro Asn Cys Phe 145 150 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Gln Pro His Ser Pro Arg Val His Ser 565 570 575 Leu Phe Thr Glu Gly Thr Leu Asp Pro Gln Ala Pro Asp Pro Cys Leu 580 585 590 Met Ala Arg Glu Thr Gln Asn Gln Asp Ala Pro Cys Pro Ala Pro Phe 595 600 605 Met Ala Glu Glu Ala Ser Ser Pro Thre Gly Gln Pro Ser Leu Cys 610 615 620 Ser Phe Glu Ile Asn Glu Ile Tyr Ser Gly Cys Leu Ile Leu Glu Asp 625 630 635 640 Asp Ile Glu Glu Pro Pro Gly Ala Ser Ser Leu Glu Ala Asp Gly 645 650 655 Pro Asn Gln Val Asp Glu Leu Lys Ser Met Glu Glu Glu Leu Asp Lys 660 665 670 Met Glu Arg Glu Ala Cys Cys Phe Gly Ser Glu Asp Glu Ser Ser Ser 675 680 685 Lys Ala Glu Thr Glu Tyr Ser Phe Asp Asp Trp Asp Trp Gln Asn Gly 690 695 700 Ser Leu Ser Ser Leu Ser Leu Pro Glu Ser Thr Arg Glu Ala Lys Ser 705 710 715 720 Asn Leu Asn Asn Met Ser Thr Thr Glu Glu Tyr Leu Ile Ser Lys Cys 725 730 735 Val Leu Asp Leu Lys Ile Met Gln Thr Ile Met His Glu Asn Asp Asp 740 745 750 Arg Leu Arg Asn Ile Glu Gln Ile Leu Asp Glu Val Glu Met Lys Gln 755 760 765 Lys Glu Gln Glu Glu Arg Met Ser Leu Trp Ala Thr Ser Arg Glu Phe 770 775 780 Thr Asn Ala Tyr Lys Leu Pro Leu Ala Val Gly Pro Pro Ser Leu Asn 785 790 795 800 Tyr Ile Pro Pro Val Leu Gln Leu Ser Gly Gly Gln Lys Pro Asp Thr 805 810 815 Ser Gly Asn Tyr Pro Thr Leu Pro Arg Phe Pro Arg Met Leu Pro Thr 820 825 830 Leu Cys Asp Pro Gly Lys Gln Asn Thr Asp Glu Gln Phe Gln Cys Thr 835 840 845 Gln Gly Ala Lys Asp Ser Leu Glu Thr Ser Arg Ile Gln Asn Thr Ser 850 855 860 Ser Gln Gly Arg Pro Arg Glu Ser Thr Ala Gln Ala Lys Ala Thr Gln 865 870 875 880 Phe Asn Ser Ala Leu Phe Thr Leu Ser Ser His Arg Gln Gly Pro Ser 885 890 895 Ala Ser Pro Ser Cys His Trp Asp Ser Thr Arg Met Ser Val Glu Pro 900 905 910 Val Ser Ser Glu Ile Tyr Asn Ala Glu Ser Arg Asn Lys Asp Asp Gly 915 920 925 Lys Val His Leu Lys Trp Lys Met Glu Val Lys Glu Met Ala Lys Lys 930 935 940 Ala Ala Thr Gly Gln Leu Thr Val Pro Pro Trp His Pro Gln Ser Ser 945 950 955 960 Leu Thr Leu Glu Ser Glu Ala Glu Asn Glu Pro Asp Ala Leu Leu Gln 965 970 975 Pro Pro Ile Arg Ser Pro Glu Asn Thr Asp Trp Gln Arg Val Ile Glu 980 985 990 Tyr His Arg Glu Asn Asp Glu Pro Arg Gly Asn Gly Lys Phe Asp Lys 995 1000 1005 Thr Gly Asn Asn Asp Cys Asp Ser Asp Gln His Gly Arg Gln Pro Arg 1010 1015 1020 Leu Gly Ser Phe Thr Ser Ile Arg His Pro Ser Pro Arg Gln Lys Glu 1025 1030 1035 1040 Gln Pro Glu His Ser Glu Ala Phe Gln Ala Ser Ser Asp Thr Leu Val 1045 1050 1055 Ala Val Glu Lys Ser Tyr Ser His Gln Ser Met Gln Ser Thr Cys Ser 1060 1065 1070 Pro Glu Ser Ser Glu Asp Ile Thr Asp Glu Phe Leu Thr Pro Asp Gly 1075 1080 1085 Glu Tyr Phe Tyr Ser Ser Thr Ala Gln Glu Asn Leu Ala Leu Glu Thr 1090 1095 1100 Ser Ser Pro Ile Glu Glu Asp Phe Glu Gly Ile Gln Gly Ala Phe Ala 1105 1110 1115 1120 Gln Pro Gln Val Ser Gly Glu Glu Lys Phe Gln Met Arg Lys Ile Leu 1125 1130 1135 Gly Lys Asn Ala Glu Ile Leu Pro Arg Ser Ser Gln Phe Gln Pro Val Arg 1140 1145 1150 Ser Thr Glu Asp Glu Glu Glu Glu Thr Ser Lys Glu Ser Pro Lys Glu 1155 1160 1165 Leu Lys Glu Lys Asp Ile Ser Leu Thr Asp Ile Gln Asp Leu Ser Ser 1170 1175 1180 Ile Ser Tyr Glu Pro Asp Ser Ser Phe Lys Glu Ala Ser Cys Lys Thr 1185 1190 1195 1200 Pro Lys Ile Asn His Ala Pro Thr Ser Val Ser Thr Pro Leu Ser Pro 1205 1210 1215 Gly Ser Val Ser Ser Ala Ala Ser Gln Tyr Lys Asp Cys Leu Glu Ser 1220 1225 1230 Ile Thr Phe Gln Val Lys Thr Glu Phe Ala Ser Cys Trp Asn Ser Gln 1235 1240 1245 Glu Phe Ile Gln Thr Leu Ser Asp Asp Phe Ile Ser Val Arg Glu Arg 1250 1255 1260 Ala Lys Lys Leu Asp Ser Leu Leu Thr Ser Ser Glu Thr Pro Pro Ser 1265 1270 1275 1280 Arg Leu Thr Gly Leu Lys Arg Leu Ser Ser Phe Ile Gly Ala Gly Ser 1285 1290 1295 Pro Ser Leu Val Lys Ala Cys Asp Ser Ser Pro Pro His Ala Thr Gln 1300 1305 1310 Arg Arg Ser Leu Pro Lys Val Glu Ala Phe Ser Gln His His Ile Asp 1315 1320 1325 Glu Leu Pro Pro Ser Glu Glu Leu Leu Asp Asp Ile Glu Leu Leu 1330 1335 1340 Lys Gln Gln Gln Gly Ser Ser Thr Val Leu His Glu Asn Thr Ala Ser 1345 1350 1355 1360 Asp Gly Gly Gly Thr Ala Asn Asp Gln Arg His Leu Glu Glu Gln Glu 1365 1370 1375 Thr Asp Ser Lys Lys Glu Asp Ser Ser Met Pro Leu Ser Lys Glu Thr 1380 1385 1390 Glu Asp Leu Gly Glu Asp Thr Glu Arg Ala His Ser Thr Leu Asp Glu 1395 1400 1405 Asp Leu Glu Arg Trp Leu Gln Pro Pro Glu Glu Ser Val Glu Leu Gln 1410 1415 1420 Asp Leu Pro Lys Gly Ser Glu Arg Glu Thr Asn Ile Lys Asp Gln Lys 1425 1430 1435 1440 Val Gly Glu Glu Lys Arg Lys Arg Glu Asp Ser Ile Thr Pro Glu Arg 1445 1450 1455 Arg Lys Ser Glu Gly Val Leu Gly Thr Ser Glu Glu Asp Glu Leu Lys 1460 1465 1470 Ser Cys Phe Trp Lys Arg Leu Gly Trp Ser Glu Ser Ser Arg Ile Ile 1475 1480 1485 Val Leu Asp Gln Ser Asp Leu Ser Asp 1490 1495
Claims (11)
The space group is P22 1 2 1 and the unit cell dimension is a CEP55-TEX14 protein complex crystal having a = 53.9 Å, b = 102.6 Å and c = 132.5 Å. The CEP (Centrosomal Protein 55) Is expressed by the amino acid sequence of residues 160 to 217 of SEQ ID NO: 1, and TEX14 (Testis-Expressed Gene 14) is represented by the amino acid sequence of residues 792 to 804 of SEQ ID NO: 2.
상기 결정은 2.3Å 해상도로 표 3 에 기재된 데이터에 의해 정의되는 구조좌표(structure coordinate) 결정의 X-선 회절 데이터를 나타내는, CEP55-TEX14 단백질 복합체 결정.
The method according to claim 1,
Wherein the crystal shows X-ray diffraction data of structure coordinate determinations defined by the data set forth in Table 3 at a resolution of 2.3 A; a CEP55-TEX14 protein complex crystal.
상기 복합체에서 상기 TEX의 상기 CEP55와 상호작용하는 잔기는 Ala793, Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 및 Pro804 잔기; 또는 Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 및 Pro804이고,
상기 CEP55의 상기 TEX와 상호작용하는 잔기는 Trp184, Tyr187, Lys180, Glu183 및 Arg191인, CEP55-TEX14 단백질 복합체 결정.
3. The method according to claim 1 or 2,
Residues interacting with the CEP55 of the TEX in the complex include residues Ala793, Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 and Pro804; Or Gly795, Pro796, Pro797, Tyr801, Pro803 and Pro804,
Wherein the residues interacting with the TEX of the CEP55 are Trp184, Tyr187, Lys180, Glu183 and Arg191.
상기 TEX의 Gly795, Pro796, Pro797 잔기는 상기 CEP55의 Trp184, Tyr187, Lys180 및 Gln183 잔기와 접촉하며, 상기 TEX의 Pro796, Tyr801, 및 Pro804 잔기는 상기 CEP55의 Tyr187 잔기와 접촉하는 것인, CEP55-TEX14 단백질 복합체 결정.
The method of claim 3,
Wherein the Gly795, Pro796, and Pro797 residues of the TEX are in contact with the Trp184, Tyr187, Lys180 and Gln183 residues of the CEP55 and the Pro796, Tyr801, and Pro804 residues of the TEX are in contact with the Tyr187 residue of the CEP55. Protein complex.
A composition comprising a protein complex crystal according to any one of claims 1 to 4 and a salt.
a) 정제된 CEP55의 EABR 영역 또는 상기 영역을 포함하는 정제된 CEP55 단백질 또는 상기 영역을 포함하는 CEP55 단편, 및 TEX14 펩타이드를 제공하는, 단계로 상기 CEP55의 EABR 영역 또는 CEP55 단백질 또는 CEP55 단편은 20mM Tris-HCL (pH7.4) 용액 중에, 상기 TEX14 펩타이드는 150mM Tris-HCL (pH8.0) 용액에 포함된 것이고,
b) 상기 정제된 CEP55의 EABR 영역 또는 CEP55 단백질 또는 CEP55 단편, 및 상기 TEX14 펩타이드는 1:2의 몰비로 혼합하는 단계; 및
c) 상기 b) 단계의 혼합물을 0.1 M imidazole (pH 8.0), 1 M 인산이암모늄 용액에서 결정화하는 단계.
A process for producing a composite crystal according to any one of claims 1 to 4, comprising:
a) providing an EABR region of purified CEP55 or a purified CEP55 protein comprising said region, or a CEP55 fragment comprising said region, and a TEX14 peptide, wherein said CEP55 EABR region or CEP55 protein or CEP55 fragment comprises 20 mM Tris -HCL (pH 7.4) solution, the TEX14 peptide was contained in a solution of 150 mM Tris-HCl (pH 8.0)
b) mixing the EABR region of the purified CEP55 or the CEP55 protein or CEP55 fragment, and the TEX14 peptide in a molar ratio of 1: 2; And
c) crystallizing the mixture of step b) in 0.1 M imidazole (pH 8.0), 1 M ammonium phosphate solution.
A method of designing or screening a substance that inhibits or enhances binding between said complexes using the complex crystals of any one of claims 1 to 4.
CEP55-EABR 영역, CEP55-EABR 영역을 포함하는 CEP55 전장 단백질 또는 CEP55-EABR 영역을 포함하는 CEP55 단백질 단편, 및 AxGPPx3YxPP로 표시되는 아미노산 서열을 포함하는 TEX14 펩타이드를 제공하는 단계로, 상기 AxGPPx3YxPP에서 A는 Ala, G는 Gly, P는 Pro, Y는 Tyr, X는 임의의 아미노산이며,
상기 CEP55-EABR 영역, CEP55-EABR 영역을 포함하는 CEP55 전장 또는 CEP55-EABR 영역을 포함하는 CEP55 단편 및 상기 TEX14 펩타이드를 시험물질과 접촉시키는 단계로, 상기 시험물질은 상기 CEP55-EABR 영역에 상기 TEX14 펩타이드와 경쟁적으로 결합을 할 수 있는 TEX14 유도체로,
상기 시험물질의 존재 중에서 상기 CEP55-EABR 영역에의 상기 TEX14 펩타이드의 결합을 측정하는 단계; 및
상기 측정 결과, 상기 시험물질과 접촉되지 않은 대조군과 비교하여 접촉된 실험군에서, 상기 CEP55-EABR 영역에의 상기 TEX14 펩타이드의 결합이 감소한 경우, 상기 시험물질을 항암제 후보물질로 선별하는 단계를 포함하는 방법.
A method for screening a TEX14 derivative which is an anticancer agent candidate, which binds to a CEP55-EABR region comprising the steps of:
A step of providing a CEP55-EABR area, TEX14 peptide comprising the amino acid sequence shown in CEP55 protein fragments, and AxGPPx 3 YxPP containing CEP55 full-length protein or CEP55-EABR region including the CEP55-EABR region, said AxGPPx 3 In YxPP, A is Ala, G is Gly, P is Pro, Y is Tyr, X is any amino acid,
Contacting the CEP55 fragment comprising the CEP55-EABR region, the CEP55 full-length or CEP55-EABR region comprising the CEP55-EABR region and the TEX14 peptide with the test material, wherein the test material comprises the TEX14 As a TEX14 derivative capable of competitive binding with peptides,
Measuring the binding of the TEX14 peptide to the CEP55-EABR region in the presence of the test substance; And
Selecting the test substance as an anticancer candidate substance when binding of the TEX14 peptide to the CEP55-EABR region is decreased in the test group that is contacted with the test substance as compared with the control group not in contact with the test substance as a result of the measurement Way.
상기 CEP55-EABR 영역은 인간 유래로 서열번호 1의 160 내지 217 잔기의 아미노산 서열로 표시되고, 상기 CEP55 전장은 서열번호 1의 아미노산 서열로 표시되는 것인, 방법.
9. The method of claim 8,
Wherein the CEP55-EABR region is derived from human by an amino acid sequence of 160 to 217 residues of SEQ ID NO: 1 and the CEP55 total length is represented by an amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.
상기 TEX14 펩타이드는 서열번호 2의 793 내지 804 잔기의 아미노산 서열, 서열번호 2의 792 내지 804 잔기의 아미노산 서열 또는 서열번호 2의 791 내지 804 잔기의 아미노산 서열로 표시되는 것인, 방법.
9. The method of claim 8,
Wherein said TEX14 peptide is represented by an amino acid sequence of residues 793 to 804 of SEQ ID NO: 2, an amino acid sequence of residues 792 to 804 of SEQ ID NO: 2, or residues 791 to 804 of SEQ ID NO: 2.
상기 TEX14 유도체는 AxGPPx3YxPP 아미노산 서열의 폴리펩타이드에서 상기 Ala, Gly, Pro, Pro, Tyr, Pro 및 Pro 중 어느 하나가, 상기 TEX14 유도체의 상기 EABR 영역에서 결합을 증가시키는 방식으로 변형된 것으로, 상기 변형은 아미노산 잔기의 치환 또는 아미노산 측쇄의 화학적 변형인, 방법. 9. The method of claim 8,
Wherein the TEX14 derivative is modified in such a manner that any one of Ala, Gly, Pro, Pro, Tyr, Pro and Pro in the polypeptide of the amino acid sequence of AxGPPx 3 YxPP is increased in the EABR region of the TEX14 derivative, Wherein said modification is a chemical modification of a substitution or amino acid side chain of an amino acid residue.
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