이하 본 발명을 실험예 및 실시예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나, 이들 실험예 및 실시예는 본 발명을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 발명의 범위가 이들 실험예 및 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실험예 1. 실험 재료 및 방법
모든 상업용 시약 및 용매는 상업용 공급 업체에서 구입하여 사용하였다. 테트라히드로푸란(Tetrahydrofuran)은 소듐 벤조페논 케틸(sodium benzophenone ketyl)로부터 증류되었고, 디클로로메탄, 아세토니트릴, 트리에틸아민 및 피리딘은 칼슘 하이드라이드로 새로 증류되었다. 플래시 컬럼 크로마토그래피는 실리카겔 60 (230-400 메쉬, Merck)을 사용하여 수행되었고 예비 박막 크로마토그래피는 유리-지지 실리카겔 플레이트 (1mm, Merck)와 함께 사용되었다. 반응을 모니터링하기 위해 박막 크로마토그래피를 수행하였다. 모든 반응을 플래임-건조된 유리 제품에서 건조한 아르곤 대기로 수행하였다. 1H NMR 및 13C NMR 스펙트럼을 Bruker Avance III HD (800MHz, 5mm CPTCI CryoProbe 사용) 분광계에서 기록하였다. 화학적 이동을 헤르츠 (Hz) 단위의 커플링 상수와 함께 테트라메틸실란 (내부 표준)에서 다운 필드 ppm(δ)으로 나타내었다. 다중도를 싱글렛 (s), 더블렛 (d), 더블렛의 더블렛(dd), 트리플렛 (t), 쿼텟 (q), 멀티플렛 (m) 및 broad (br)과 같은 약어로 표시하였다. 질량 스펙트럼 및 HRMS를 각각 VG Trio 2 GC-MS 기기 및 JEOL JMS AX로 기록하였다. 모든 유사체를 순도 95% 이상으로 정제하였다. 유사체의 순도를 역상 고성능 액체 크로마토그래피 (HPLC) (Shimadzu, LC 20AD 액체 크로마토 그래프, waters/sunfire® TM C18 5μm (4.6 × 150mm))에 의해 결정하였다.
실험예 2. 세포 이동 분석
세포 이동 분석은 제조업체의 지침에 따라 CytoSelect 96-웰 세포 이동 시스템 (8.0 μm의 기공 크기, Cell Biolabs)을 사용하여 수행하였다. 간단히, 인간 KRS T52D 돌연변이체의 고수준 발현을 위한 인간 유방암 MDA-MB-231 테트라 사이클린 유도성 세포주를 분석에서 사용하였다.
3일 동안 2μg/ml의 독시사이클린으로 처리된 세포를 무혈청 DMEM 배지에 현탁시켰다. 양성 대조군으로서 YH21931을 포함하는 억제제 화합물을 세포 현탁액과 혼합하고 웰당 1x104 세포의 밀도로 96-웰 세포 이동 플레이트의 상부 챔버에 첨가하였다. 10μg/ml의 라미닌(Sigma)을 함유하는 무 혈청 배지를 유인제로 피더 트레이의 웰에 첨가하였다. 세포를 37 ℃에서 4 시간 동안 이동하도록 허용하고, 이동성 세포를 세포 분리 용액을 사용하여 멤브레인의 밑면에서 분리하고 용해 완충액으로 용해하여 CyQuant GR 염료 용액으로 염색하였다. 형광 강도를 480 nm/520 nm에서 형광 플레이트 판독기로 측정하였다. 데이터를 삼중의 평균±표준 편차 (SD)로 표시하여 나타내었다.
실험예 3. 단백질 준비
pET28a 벡터에서 N-말단 헥사히스티딘 태그가 있는 15N-표지 KRS1-207은 유일한 질소 공급원으로 15NH4Cl(99% 15N; cambridge Isotope Labolatories)이 풍부한 M9 최소 배지에서 E. coli Bl21 (DE3)에서 과발현되었다. 0.5mM 이소프로필 β-D-1 티오갈락토피라노사이드 (IPTG)를 첨가하여 OD600에서 0.5~0.6 값의 단백질을 발현시킨 후, 세포를 흔들면서 37 ℃에서 3시간 동안 성장시켰다. 세포를 4 ℃에서 30분 동안 2,970xg에서 원심분리하여 수확하고, 20mM HEPES pH 7.0, 500mM NaCl, 10% 글리세롤, 및 1mM PMSF 을 포함하는 용해 버퍼에 재현탁하고, 얼음에서 간헐적인 초음파 처리로 파괴하였다. 제거된 상층액을 4 ℃에서 60분 동안 32,500xg에서 원심분리하여 용 해물로부터 분리하고 용해 완충액으로 미리 평형화된 5ml HisTrap (GE Healthcare) 컬럼에 적용하고 20mM HEPES pH 7.0, 500mM NaCl 및 50mM 이미다졸을 포함하는 버퍼A로 세척하였다. His-태그가 부착된 단백질을 500 mM 이미다졸을 함유하는 완충액 A로 용출시켰다. His-태그는 PMSF가 없는 완충액 20mM HEPES pH 7.0, 500mM NaCl을 포함하는 버퍼로 투석하는 동안 4 ℃에서 트롬빈과 함께 밤새 배양하여 절단하고, His-태그를 단백질로부터 HisTrap 컬럼을 통과시켜 제거하였다. 초미세여과 (Millipore)에 의하여 농축시킨 후, 단백질을 20mM HEPES pH 7.0, 150mM NaCl 및 7mM B-ME (베타-머캅토에탄올)로 사전 평형화된 Superdex 200 16/60 겔 여과 컬럼 (GE Healthcare)에 로딩하였다.
실험예 4. NMR 분석
프로브(Bruker)가 장착된 Avance 600MHz NMR 분광기를 사용하여 버퍼와 삼중 공명 298K에서 0.4mM SL10의 존재하 또는 부재하에서 20mM HEPES (pH 7.0), 150mM NaCl, 7mM B ME 및 0.8 % DMSO를 포함하는 버퍼에서 0.2mM 15N-표지 KRS1-207의 1H-15N TROSY (transverse relaxation optimized spectroscopy) 횡 이완 최적화 분광법) 실험을 수행하였다. 15N 및 1H 핵의 화학적 이동 교란 (Chemical Shift Perturbation : CSP)은 유리 단백질의 1H-15N TROSY 스펙트럼을 SL10이 있는 스펙트럼과 오버레이하여 분석하였다. 결합된 15N-1H 화학적 이동 섭동 (δ, ppm)의 크기는 방정식을 기반으로 계산되었으며, 여기서 H 및 N은 각각 양성자 (1H) 및 질소 (15N) 화학적 이동의 변화를 나타낸다.
실험예 5. 분자 도킹의 확인
LysRS의 안티코돈 도메인 구조 (PDB ID : 3BJU)는 Gasteiger Charge를 사용하여 준비하고, 단백질 구조는 도킹시 견고하게 유지되었고, SL10 결합 부위를 NMR 결합 실험에서 얻은 CSP 매핑된 잔기로부터 정의하였다. 65X65X69 포인트 및 0.375Å 그리드 간격을 갖는 그리드 치수는 CSP 기반 결합 부위에서 리간드 형태의 샘플링에 사용되었다. SL10 화학 유도체는 SYBY LX 2.0 분자 모델링 패키지 (http://tripos.com)로 모델링되었으며, 0.05kcal / (mol · Å)의 종결 구배에 따라 5000 회 반복을 위해 Powell 알고리즘 및 Tripos 역장을 사용하여 진공 유전체 환경에서 설정된 Gasteiger Huckel 전하로 에너지를 최소화하였다. 에너지 최소화 SL10 유도체는 Autodock을 에서 준비되었고, Gasteiger 전하가 화학 물질에 할당되었습니다. Autodock4.2 (http://autodock.scripps.edu/) 공개 도메인 소프트웨어를 사용하여 리간드의 200 개의 도킹 포즈를 샘플링하였다. 리간드 형태는 Lamarckian 유전 알고리즘에 의해 샘플링되었으며, 매개 변수는 200 개의 독립적인 실행, 무작위로 배치 된 150 개로 구성된 초기 모집단으로 설정되었으며, 2.5 X 106 개의 에너지 평가, 최대 27000 회 반복, 돌연변이율 0.02, 크로스오버율 0.80 및 엘리티즘 값에 의하여 설정하였다. 저에너지 포즈인 가장 빈도수가 많은 클러스터의 도킹 포즈를 분석을 위해 선택하였다. 거리 분석을 위하여 Pymol (http://www.pymol.org)을 사용하였다.
실험예 6. 마우스의 유방암 4T1 세포에서의 전이의 확인
4T1 유방암 세포주에서의 전이 정도의 확인 위하여, 마취된 7 주령의 암컷 BALB / cAnCr 마우스의 2 유방 지방 패드에 수술적으로 4T1 세포 (4 x 104)를 주입하였다. 원발성 종양은 접종 후 10 일 이내에 제거되었고 (일차 종양 부피 : 100-150 mm3), 절제된 원발성 종양이 균일한 분포를 갖는 마우스를 대조군과 100 mg/kg으로 SL-1910 및 SL-7620 처리한 군(각 군당 8마리)으로 나누어 실험을 수행하였다. SL-1910, SL-7620 및 비히클 (옥수수 오일 : 폴리에틸렌 글리콜 400 : Tween 80 : 메틸 셀룰로오스 (1 %) = 20 : 30 : 1 : 49)을 종양 절제 후 1일부터 시작하여 하루에 한번씩 경구 투여하였다. 모든 마우스를 희생시키고, 4T1 세포를 주입한 후 28 일 후의 폐를 절제하였다. 폐를 Bouin 용액에 고정하고 폐 결절을 계수하여 전이 정도를 평가하였다. 모든 동물을 승인된 동물 연구 프로토콜과 함께 WOJUNGBIO의 동물 관리 및 사용위원회 지침에 따라 처리하였다.
실시예 1. N,N-디알킬티아졸로[5,4-b]피리딘-2-아민(N,N-dialkylthiazolo[5,4-b]pyridin-2-amine: SL-1910)의 합성
1.1 N,N-디알킬티아졸로[5,4-b]피리딘-2-아민(N,N-dialkylthiazolo[5,4-b]pyridin-2-amine: SL-1910)과 이의 유사체의 합성
바이사이클릭 코어와 3 차 아민 모이어티로 구성된 SL-1910와 이의 유사체의 합성은 3 단계 시퀀스를 통해 합성하였다. 코어 스캐폴드 호핑 유도체의 효율적인 합성을 위해 후기 단계에서 마이크로파 지원 방향족 친핵성 치환을 수행하였다. 이에 따라 제조된 N,N-디알킬티아졸로[5,4-b]피리딘-2-아민(N,N-dialkylthiazolo[5,4-b]pyridin-2-amine: SL-1910)을 비롯한 이의 유도체 화합물에 대한 반응스킴은 다음과 같다 :
<반응 스킴 1>
1.2 환원성 알킬화를 위한 반응
반응스킴 1의 아민 1을 합성하기 위하여, MeOH 중의 4-메톡시펜에틸아민(2.5 당량) 및 또는 4-포밀벤조니트릴, 1 당량)의 용액에 NaHB(OAc)3 (2 당량)을 0 ℃에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온으로 가온하고 반응이 완료될 때까지 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트로 추출하였다. 혼합된 유기층을 MgSO4로 건조시키고 감압하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카겔상의 플래쉬 컬럼 크로마토그래피를 사용하여 정제하여 상응하는 반응스킴 1의 2차 아민 2a 또는 2b를 제조하였다.
1.3 방향족 친핵성 치환 및 가수 분해를 위한 반응 유도
반응스킴 1의 톨루엔 내 1.5 당량의 2a 또는 2b와 3a-l (1 당량)을 첨가하고, 그 용액에 5 당량의 TEA를 실온에서 첨가하였다. 반응이 완료될 때까지 반응 혼합물을 환류시키고, 감압하에 농축시켰다. 잔류물을 물에 용해시키고 염수를 첨가하였다. 혼합물을 에틸 아세테이트로 추출하였다. 혼합된 유기층을 MgSO4상에서 건조시키고 감압하에 농축하여 상응하는 미가공 벤조에이트 또는 벤조니트릴을 수득하였다. 상기 벤조에이트 또는 벤조니트릴 1 당량을 0.25 M의 MeOH에 용해하기 위하여 10 당량의 4N NaOH 수용액을 첨가하고 60 ℃로 가온시켰다. 반응 완료 후, 반응 혼합물을 에틸 아세테이트로 추출하였다. 혼합한 유기층을 MgSO4로 건조시키고 감압하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카 겔상의 플래쉬 컬럼 크로마토그래피를 사용하여 정제하여 상응하는 아민 유도체 4a-l을 수득하였다.
1.4 타겟 물질의 합성과 합성된 화합물의 물질구조 분석
1.4.1. 메틸 4-(((4-메톡시펜에틸)아미노)메틸) 벤조에이트 (반응스킴 1의 2a)
반응스킴 1의 아민 1 (47mL, 320.8mmol) 및 메틸 4-포밀벤조에이트 (20.6g, 125.5mmol)의 커플링 반응을 NaHB(OAc)3 (53.1g, 251.0 mmol)의 존재하에 상기 실시예의 환원성 알킬화를 위한 반응 절차에 따라 수행하였다. 실리카겔 (EtOAc/n-Hexane = 1 : 3)에서 미가공 생성물의 플래시 컬럼 크로마토 그래피로 34.9g (93 %)의 2a를 수득하였다. 1H-NMR (CDCl3, 800MHz) δ 7.96 (d, J = 8.2Hz, 2H), 7.36 (d, J = 8.0Hz, 2H), 7.09 (d, J = 8.5Hz, 2H), 6.81 (d, J = 8.4Hz, 2H), 3.88 (s, 3H), 3.85 (s, 2H), 3.77 (s, 3H), 2.85 (t, J = 7.2Hz, 2H), 2.78 (t, J = 7.1Hz, 2H).
1.4.2. 메틸 4-(((4-메톡시펜에틸)아미노)메틸) 벤조니트릴 (반응스킴 1의 2b)
반응스킴 1의 아민 1 (1.3mL, 8.6mmol) 및 4-포밀벤조니트릴(500mg, 3.4mmol)의 커플링 반응을 NaHB(OAc)3 (1.5g, 6.9 mmol)의 존재하에 상기 실시예의 환원성 알킬화를 위한 반응 절차에 따라 수행하였다. 실리카겔 (EtOAc/n-Hexane = 1 : 3)에서 미가공 생성물의 플래시 컬럼 크로마토 그래피로 819.7mg (93 %)의 2b를 수득하였다. 1H-NMR (CDCl3, 800MHz) δ 7.57(d, J = 8.1 Hz, 2H), 7.38 (d, J = 8.1 Hz, 2H), 7.09 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 6.82 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 3.83 (s, 2H), 3.77 (s, 3H), 2.83 (t, J = 7.0 Hz, 2H), 2.75 (t, J = 6.9 Hz, 2H).
1.4.3. 4-(((4-메톡시펜에틸)(5,6,7-트리플루오로벤조[d]티아졸-2-일)아미노)메틸)벤조산 (도 1의 4a)
TEA (1.5 mL, 11 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3a (487 mg, 2.2 mmol) 및 아민 2a (718 mg, 2.4 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4 N NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 15 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 330mg (2 단계에서 32 %)의 4a를 수득하였다 : 1H-NMR (CDCl3, 800MHz) δ 8.03 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.31 (d, J= 8.0 Hz, 2H), 7.15 (dd, J= 10.8, 5.5 Hz, 1H), 7.10 -7.05 (m, 2H), 6.83 (d, J= 8.3 Hz, 2H), 4.67 (s, 2H), 3.77 (s, 3H), 3.64 (t, J= 7.5 Hz, 2H), 2.92 (t, J= 7.6 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CDCl3) δ171.20, 169.98, 168.87, 148.48, 142.35, 131.09, 130.75 (2 carbons), 129.93, 129.77 (2 carbons), 128.73, 127.84, 127.52 (2 carbons), 114.24, 114.21 (2 carbons), 113.71, 102.54, 55.29, 54.68, 53.63, 32.64; HR-MS (FAB) C24H20N2O3S (M+ H+) 에 대한 계산치 473.1147, 실측치 473.1136.
1.4.4. 2-((4-카르복시벤질)(4-메톡시펜에틸)아미노)벤조[d]티아졸-6-카르복실산(도 1의 4b)
TEA (0.1 mL, 0.5 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3b (21 mg, 0.1 mmol) 및 아민 2a (32 mg, 0.1 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4 N NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 10 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 14mg (2 단계에서 31 %)의 4b를 수득하였다 : 1H-NMR (CDCl3, 800MHz) δ 8.30 (s, 1H), 7.96 (d, J = 8.4 Hz, 1H), 7.84 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.49 (d, J = 8.1 Hz, 1H), 7.38 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 7.14 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 6.84 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 4.78 (s , 2H), 3.77-3.71 (m, 5H), 3.74- 2.95 (t, J = 7.5 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CD3OD) δ 172.87, 172.79, 164.07, 163.89, 163.72, 160.84, 157.98, 142.92, 135.22, 132.49 (2 carbons), 131.77 (2 carbons), 129.99 (2 carbons), 129.42 (2 carbons), 124.75, 119.56, 115.93 (2 carbons), 56.46, 55.59, 50.65, 34.38; HR MS (FAB) C25H22N2O5S(M) 에 대한 계산치 462.1249, 실측치 462.1247.
1.4.5. 4-(((6-(하이드록시메틸)벤조[d]티아졸-2-일)(4-메톡시펜에틸)아미노)메틸)벤조산 (도 1의 4c)
TEA (0.03mL, 0.3 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 브로마이드 3c (13 mg, 0.1 mmol) 및 아민 2a (18 mg, 0.1 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4 N NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 10 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 15mg (2 단계에서 62 %)의 4c를 수득하였다 : 1H-NMR (CDCl3, 800MHz) δ 7.95 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 7.64 (d, J = 1.8 Hz, 1H), 7.46 (d, J = 8.1 Hz, 1H), 7.31 (d, J = 8.1 Hz, 2H), 7.28 (dd, J = 8.3, 1.7 Hz, 1H), 7.12 (d, J = 8.7 Hz, 2H), 6.83 (d, J = 8.6 Hz, 2H), 4.72 (s, 2H), 4.62 (s, 2H), 3.74 (s, 3H), 3.69 (t, J = 7.5 Hz, 2H), 2.92 (t, J = 7.5 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CD 3 OD) δ 170.99, 166.23, 160.77, 153.94, 142.97, 137.12, 132.64, 132.52, 131.83 (2 carbons), 131.81, 131.75 (2 carbons), 129.05 (2 carbons), 127.47, 121.47, 120.03, 115.89 (2 carbons), 66.03, 56.46, 56.26, 55.33, 34.42.; HR MS (FAB) C25H25N2O4S (M+ H+)에 대한 계산치 449.1535, 실측치 449.1533.
1.4.6. 4-((벤조[d]옥사졸-2-일(4-메톡시펜에틸)아미노)메틸)벤조산 (도 1의 4d)
TEA (0.1 mL, 0.5 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3d(15 mg, 0.1 mmol) 및 아민 2a (32 mg, 0.1 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4 N NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 10 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 28mg (2 단계에서 71 %)의 4d를 수득하였다 : 1H-NMR (CDCl3, 800MHz) δ 8.02 (d, J= 7.9 Hz, 2H), 7.42 (d, J= 7.8 Hz, 1H), 7.32 (d, J= 8.0 Hz, 2H), 7.27(d, J= 7.9 Hz, 1H), 7.18 (t, J= 7.7 Hz, 1H), 7.08 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.04 (t, J= 7.7 Hz, 1H), 6.80 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 4.68 (s, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.70 (t, J= 7.5 Hz, 2H), 2.92 (t, J= 7.4 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CD3OD) δ170.30, 164.62, 160.62,150.74, 144.57, 144.29, 132.45, 132.01 (2 carbons), 131.67 (2 carbons), 129.26(2 carbons),126.11, 122.84, 117.46, 115.79 (2 carbons), 110.77, 56.39, 56.38, 53.79, 52.31, 34.90; HR-MS (FAB) C24H23N2O4S (M+ H+)에 대한 계산치 403.1658, 실측치 403.1664.
1.4.7. 4-(((4-메톡시펜에틸)(5-니트로벤조[d]옥사졸-2-일)아미노)메틸)벤조산 (도 1의 4e)
TEA (1.8 mL, 13 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3e (500mg, 2.5 mmol) 및 아민 2b (738 mg, 2.8 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4N-NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 20 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 530mg (2 단계에서 47 %)의 4e를 수득하였다 : 1H-NMR (CDCl3, 800MHz) δ8.22 (d, J= 2.2 Hz, 1H), 8.01 (dd, J= 8.6, 2.3 Hz, 1H), 7.77 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.37 -7.26 (m, 3H), 7.07 (d, J= 8.5 Hz, 2H), 6.81 (d, J= 8.3 Hz, 2H), 4.68 (s, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.71 (t, J= 7.4 Hz, 2H), 2.92 (t, J= 7.4 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CDCl3) δ168.62, 163.87, 158.51, 152.70, 145.34, 143.78, 140.24, 133.01, 129.88, 129.77 (2 carbons), 127.98 (2 carbons), 127.90 (2 carbons), 117.30, 114.16 (2 carbons), 111.85, 108.52, 55.29, 52.33, 50.29, 33.26.; HR-MS (FAB) C24H21N3O6S (M)에 대한 계산치 447.1430, 실측치 447.1446.
1.4.8. 4-(((5,7-디플루오로-1H-벤조[d]이미다졸-2-일)(4-메톡시펜에틸)아미노)메틸)벤조산 (도 1의 4f)
TEA (0.1 mL, 1 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3f (27 mg, 0.1 mmol) 및 아민 2a (47 mg, 0.2 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4N-NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 10 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 18mg (2 단계에서 29 %)의 4f를 수득하였다 : 1H-NMR (CD3OD3, 800MHz) δ7.95 (d, J= 8.0 Hz, 2H), 7.28 (d, J= 7.8 Hz, 2H), 7.12 (d, J= 8.7 Hz, 2H), 6.81 (d, J= 8.5 Hz, 2H), 6.78 (dd, J= 8.8, 2.3 Hz, 1H), 6.60 (td, J= 10.4, 2.2 Hz, 1H), 4.65 (s, 2H), 3.73 (s, 3H), 3.65 (t, J= 7.4 Hz, 2H), 2.89 (t, J= 7.3 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CD3OD) δ170.13, 164.07, 163.90, 163.72, 160.69, 160.40, 159.10, 158.85, 143.89, 132.88, 131.87 (2 carbons), 131.80 (2 carbons), 131.51,128.96 (2 carbons), 115.78 (2 carbons), 97.12, 56.44, 53.93, 52.33, 34.76.; HR-MS (FAB) C24H21F2N3O3S (M + H+) 에 대한 계산치 438.1629, 실측치 438.1630.
1.4.9. 4-(((4-메톡시펜에틸)(티아졸로[5,4-b]피리딘-2-일)아미노)메틸)벤조산 (도 1의 4g, SL-1910)
TEA (6.8 mL, 48.9 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3g (1.7 mg, 9.8 mmol) 및 아민 2a (3.2 mg, 10.8 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4N-NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 15 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 2.9mg (2 단계에서 70 %)의 4g 를 수득하였다 : 1H-NMR (CDCl3, 800MHz) δ 8.22 (d, J= 4.8 Hz, 1H), 8.04 (d, J= 8.2 Hz, 2H), 7.76 (dd, J= 8.1, 1.5 Hz, 1H), 7.31 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.26 -7.22 (m, 1H), 7.08 (d, J= 8.7 Hz, 2H), 6.82 (d, J= 8.6 Hz, 2H), 4.71 (s, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.68 (t, J= 7.4 Hz, 2H), 2.93 (t, J= 7.5 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CDCl3) δ170.47, 167.14, 158.44, 154.94, 147.34, 142.11, 141.82, 130.61 (2 carbons), 130.05, 129.77 (2 carbons), 129.36, 127.45 (2 carbons), 125.11, 121.41, 114.15 (2 carbons), 55.24, 54.02, 52.98, 32.65; HR-MS (FAB) C23H22N3O3S (M + H+) 에 대한 계산치 420.1382, 실측치 420.1384.
1.4.10. 4-(((4-메톡시펜에틸)(티아졸로[4,5-b]피리딘-2-일)아미노)메틸)벤조산 (도 1의 4h)
TEA (0.1 mL, 0.6 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3h (20.0 mg, 0.1 mmol) 및 아민 2a (38.9 mg, 0.1 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4N-NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 15 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 26mg (2 단계에서 54 %)의 4h 를 수득하였다 : 1H-NMR (CDCl3, 800MHz) δ 8.47 -8.37 (m, 1H), 8.01 (d, J= 7.7 Hz, 2H), 7.86 (d, J= 7.8 Hz, 1H), 7.38 -7.27 (m, 2H), 7.08 (d, J= 7.9 Hz, 2H), 6.97 (dd, J= 6.6, 4.0 Hz, 1H), 6.80 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 4.72 (s, 2H), 3.75 (s, 3H),3.69 (s, 2H), 2.93 (s, 2H); 13C NMR (200 MHz, CDCl3) δ170.16, 169.63, 164.15, 158.45, 146.47, 141.89, 130.61 (2 carbons), 130.07, 129.83 (2 carbons), 129.48, 129.17, 127.64 (2 carbons), 125.27, 116.34, 114.15 (2 carbons), 55.26, 54.47, 53.23, 32.64; HR-MS (FAB) C23H22N3O3S (M + H+)에 대한 계산치 420.1382, 실측치 420.1368.
1.4.11 4-(((4-메톡시펜에틸)(티아졸로[4,5-c]피리딘-2-일)아미노)메틸)벤조산 (도 1의 4i)
TEA (0.1 mL, 0.6 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3i (20.0 mg, 0.1 mmol) 및 아민 2a (38.9 mg, 0.1 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4N-NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 15 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 10mg (2 단계에서 21 %)의 4i 를 수득하였다 : 1H-NMR (CD3OD, 800 MHz) δ 8.64 (s, 1H), 8.13 (d, J= 5.3 Hz, 1H), 7.95 (d, J= 7.9 Hz, 2H), 7.75 (d, J= 5.3 Hz, 1H), 7.31 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.12 (d, J= 8.6 Hz, 2H), 6.83 (d, J= 8.5 Hz, 2H), 4.77 (s, 2H), 3.79 -3.68 (m, 5H), 2.93 (t, J= 7.4 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CD3OD) δ171.46, 160.83, 152.21, 142.64, 141.66, 141.54, 140.49, 137.60, 132.44 (2 carbons), 131.78 (2 carbons), 130.24, 128.98 (2 carbons), 127.33, 118.53, 115.91 (2 carbons), 56.46 (2 carbons), 55.60, 34.31; HR-MS (FAB) C23H22N3O3S (M + H+)에 대한 계산치 420.1382, 실측치 420.1386.
1.4.12.
4-(((6-클로로티아졸로[5,4-b]피리딘-2-일)(4-메톡시펜에틸)아미노)메틸)벤조산 (
도 1의
4j)
TEA (0.1 mL, 0.9 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3j (35.0 mg, 0.2 mmol) 및 아민 2a (56.9 mg, 0.2 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4N-NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 10 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 46mg (2 단계에서 59 %)의 4j 를 수득하였다 : 1H-NMR (CDCl3, 800 MHz) δ 8.14 (d, J= 2.1 Hz, 1H), 8.03 (d, J= 8.2 Hz, 2H), 7.72 (d, J= 2.1 Hz, 1H), 7.31 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.08 (d, J= 8.2 Hz, 2H), 6.83 (d, J= 8.4 Hz, 2H), 4.70 (s, 2H), 3.77 (s, 3H), 3.67 (t, J= 7.5 Hz, 2H), 2.92 (t, J= 7.5 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CDCl3) δ169.55, 168.26, 158.55, 153.19, 147.72, 142.13, 140.72, 130.74 (2 carbons), 129.93, 129.85, 129.78 (2 carbons), 128.79, 127.56 (2 carbons), 124.55, 114.22 (2 carbons), 55.28, 54.02, 53.17, 32.67; HR-MS (FAB) C23H21N3O3SCl (M + H+)에 대한 계산치 454.0992, 실측치 454.0998.
1.4.13. 4-(((4-메톡시펜에틸)(티아졸로[5,4-d]피리미딘-2-일)아미노)메틸) 벤조산 (도 1의 4k)
TEA (0.2 mL, 1.37 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3k (47.0 mg, 0.3 mmol) 및 아민 2a (89.8 mg, 0.3 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4N-NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 10 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 56mg (2 단계에서 49 %)의 4k 를 수득하였다 : 1H-NMR (CD3OD, 800 MHz) δ 8.68 (s, 1H), 8.66 (s, 1H), 7.79 (d, J= 8.3 Hz, 2H), 7.39 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.13 (d, J= 8.6 Hz, 2H), 6.83 (dd, J= 6.7, 1.9 Hz, 2H), 4.80 (s, 2H), 3.82-3.77 (m, 2H), 3.73 (s, 3H), 2.96 (t, J= 7.3 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CD3OD) δ 169.72, 166.09, 164.12, 163.97, 163.51, 160.91, 151.57, 148.06, 144.93, 132.24, 132.05 (2 carbons), 131.84 (2 carbons), 129.36 (2 carbons), 115.95 (2 carbons), 65.55, 56.45, 34.30, 31.47; HR-MS (FAB) C22H21N4O3S (M + H+) 에 대한 계산치 421.1334, 실측치 421.1344.
1.4.14. 4-(((4-메톡시펜에틸)(옥사졸로[5,4-b]피리딘-2-일)아미노)메틸)벤조산 (도 1의 4l)
TEA (0.2 mL, 1.3 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3l (41.0 mg, 0.3 mmol) 및 아민 2a (87.4 mg, 0.3 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 생성된 메틸 에스테르를 표준 절차에 따라 MeOH에 첨가된 4N-NaOH 용액으로 가수분해 하였다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 10 : 1)에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 36mg (2 단계에서 34 %)의 4l을 수득하였다 : 1H-NMR (CDCl3, 800 MHz) δ 7.93 (dd,J= 5.2, 1.7 Hz, 1H), 7.75 (d, J= 8.2 Hz, 2H), 7.58 (dd, J= 7.7, 1.5 Hz, 1H), 7.31 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.13 (dd, J= 7.6, 5.0 Hz, 1H), 7.07 (d, J= 8.5 Hz, 2H), 6.80 (d, J= 8.6 Hz, 2H), 4.65 (s, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.68 (t, J= 7.4 Hz, 2H), 2.91 (t, J= 7.4 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CDCl3) δ168.78, 161.61, 158.41, 158.38, 140.59, 138.87, 135.98, 132.88, 130.11, 129.80 (2 carbons), 127.89 (2 carbons), 127.87 (2 carbons), 123.18, 120.65, 114.11 (2 carbons), 55.27, 51.91, 49.97, 33.29; HR-MS (FAB) C23H21N3O4(M) 에 대한 계산치 403.1532, 실측치 403.1540.
1.4.15. 4-(((4-메톡시펜에틸)(6-니트로벤조[d]옥사졸-2-일)아미노)메틸)벤조니트릴 (도 1의 5)
TEA (0.3 mL, 2.3 mmol)의 존재 하에, 반응스킴 1의 클로라이드 3e (300 mg, 1.5 mmol) 및 아민 2b (335.3 mg, 1.3 mmol)을 상기 실시예의 방향족 친핵성 치환반응 절차에 따라 수행하였다. 반응 완료 후 (TLC로 모니터링), 반응 혼합물을 농축하고 물에 용해시키고 염수(brine)를 첨가하였다. 혼합물을 IPA와 클로로포름(1:4)의 혼합물로 추출하였다. 유기층을 MgSO4로 건조시키고 농축시켰다. 실리카겔 (EtOAc / n-Hexane = 1:3)상의 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 403mg (62 %)의 화합물 5를 수득하였다 : 1H-NMR (CDCl3, 800 MHz) δ 8.20 (d, J= 2.2 Hz, 1H), 8.01 (dd, J= 8.7, 2.3 Hz, 1H), 7.61 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.34 (d, J= 8.0 Hz, 2H), 7.31 (d, J= 8.8 Hz, 1H), 7.07 (d, J= 8.5 Hz, 2H), 6.81 (d, J= 8.4 Hz, 2H), 4.66 (s, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.71 (t, J= 7.3 Hz, 2H), 2.93 (t, J= 7.3 Hz, 2H).
1.4.16. 4-(((6-아미노벤조[d]옥사졸-2-일)(4-메톡시펜에틸)아미노)메틸)벤조니트릴(도 1의 6)
반응스킴 1의 니트로벤족사졸 5 화합물 (100 mg, 0.2 mmol)을 포함한 에탄올 용액에 SnCl2 · 2H2O (263 mg, 1.2mmol). 반응 혼합물을 3 시간 동안 환류시키고 감압하에 농축시켰다. 잔류물을 CH2Cl2에 용해시키고 2N-NaOH를 첨가하였다. 유기층을 염수로 세척하고 MgSO4로 건조시켰다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 20 : 1)상의 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 61 mg (62 %)의 화합물 6을 수득하였다 : 1H NMR (CDCl3, 800 MHz) δ 7.59 (dd, J = 8.3 , 4.6Hz, 2H), 7.44 (s, 1H), 7.34 7.31 (m, 2H), 7.23 7.19 (m, 1H), 7.11 7.07 (m, 1H), 7.06 (d, J = 6.4Hz, 2H), 6.81 (dd, J = 8.5, 4.1Hz, 2H), 4.65 (s, 2H), 3.75 (s, 3H), 3.67 (t, J = 7.3Hz, 2H), 2.90 (t, J = 7.3Hz, 2H).
1.4.17. 4-(((4-메톡시페네틸)(5-(2-(4-메톡시페닐)아세트아미도)벤조[d]옥사졸-2-일)아미노)메틸) 벤조산 (도 1의 7a)
반응스킴 1의 아미노벤조옥사졸 6 (13.7mg, 0.03mmol), 4-메톡시페닐아세트산(4.8mg, 0.03mmol) 및 HATU (10.1mg, 0.03mmol)및 건조 CH2Cl2을 포함한 용액에 DIPEA (0.01mL, 0.1mmol))를 첨가하였다. 반응이 완료될 때까지 반응 혼합물을 40 ℃에서 교반하고 CH2Cl2로 희석하였다. 혼합물을 포화된 수성(aqueous) NaHCO3 용액으로 세척하였다. 유기층을 MgSO4로 건조시키고 감압하에 농축시켰다. 실리카겔 (EtOAc / n-Hexane = 1:1)상에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토그래피로 13 mg (79 %)의 N-(2-((4-시아노벤질)(4-메톡시펜에틸)아미노)벤조[d]옥사졸-5- 일)2-(4-메톡시펜일)아세트아미드를 수득하였다 : 1H NMR (CDCl3, 800MHz) δ 7.57 (d, J = 7.9Hz, 2H), 7.40 (d, J = 1.8Hz, 1H ), 7.31 (d, J = 8.0Hz, 2H), 7.27 7.23 (m, 2H), 7.15 7.10 (m, 2H), 7.08 (s, 1H), 7.05 (d, J = 8.5Hz, 2H), 6.92 (d, J = 8.5Hz, 2H), 6.80 (d, J = 8.4Hz, 2H), 4.6 1 (s, 2H), 3.81 (s, 3H), 3.76 (s, 3H), 3.68 (s, 2H), 3.65 (t, J = 7.5 Hz, 2H), 2.89 (t, J = 7.3 Hz, 2H). 상기 아세트아미드는 4N-NaOH를 포함한 MeOH로 표준 절차에 따라 가수분해하였고, 이후 2mg (14%)의 화합물 7a를 수득하였다 : 1H-NMR (DMSO-d6, 800 MHz) δ7.83 (d, J= 8.2 Hz, 2H), 7.60 (d, J= 2.1 Hz, 1H), 7.37 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.33 (s, 1H), 7.28 (d, J= 8.6 Hz, 1H), 7.25 (d, J= 8.6 Hz, 2H), 7.16 (dd, J= 1.9 Hz, 1H), 7.15 (d, J= 8.8 Hz, 2H), 6.89 (d, J= 8.6 Hz, 2H), 6.84 (d, J= 8.4 Hz, 2H), 4.73 (s, 2H), 3.73 (s, 3H), 3.69 (s, 3H), 3.65 (t, J= 7.6 Hz, 2H), 3.55 (s, 2H), 2.86 (t, J= 7.6 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, DMSO-d6) δ169.11, 167.57, 162.62, 157.99, 157.80, 144.53, 143.33, 140.62, 135.77, 133.42, 130.35, 130.07 (2 carbons), 129.72 (2 carbons), 128.00, 127.79 (2 carbons), 127.12 (2 carbons), 113.83 (2 carbons), 113.71 (2 carbons), 111.64, 108.43, 106.99, 55.01, 54.95, 51.06, 42.41, 40.41, 32.47.; HR-MS (FAB) C33H31N3O6(M) 에 대한 계산치 565.2213, 실측치 565.2205.
1.4.18. 4-(((((4-메톡시페네틸)(5-(4-(4-메틸피페라진-1-일)벤즈아미도)벤조[d]옥사졸-2-일)아미노) 메틸) 벤조산 (도 1의 7b)
반응스킴 1의 아미노벤조옥사졸 6 (32.7 mg, 0.1 mmol), 4-(4-메틸피페라진-1-일)벤조산 (18.1mg, 0.1mmol), HOBt (13.3mg, 0.1mmol) 및 DMF에 첨가한 EDC·HCl (15.7mg, 0.1mmol)를 포함한 용액에 DIPEA (0.01 mL, 0.1mmol를 0 ℃에서 첨가하였다. 반응이 완료될 때까지 반응 혼합물을 실온에서 교반하고 CH2Cl2로 희석 하였다. 유기층을 MgSO4로 건조시키고 감압하에 농축시켰다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 10 : 1)상에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토 그래피로 23 mg (48 %)의 N- (2-((4-시아노벤질)(4-메톡시펜에틸)아미노)벤조[d]옥사졸-5-일)4-(4-메틸피페라진-1-일)벤자아미드를 수득하였다 : 1H-NMR (CDCl3, 800 MHz) δ7.74 (d, J= 8.0 Hz, 2H), 7.57 (s, 1H), 7.55 (d, J= 7.9 Hz, 2H), 7.35 -7.30 (m, 1H), 7.30 (d, J= 7.9 Hz, 2H), 7.19 (d, J= 8.4 Hz, 1H), 7.04 (d, J= 8.2 Hz, 2H), 6.89 -6.82 (m, 2H), 6.78 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 4.60 (s, 2H), 3.74 (s, 3H), 3.70 -3.53 (m, 2H), 3.42 -3.22 (br s, 4H), 2.92 -2.84 (m, 2H), 2.83 -2.67 (br s, 4H), 2.47 (s, 3H).
상기 벤자아미드를 4N-NaOH를 포함한 MeOH로 표준 절차에 따라 가수분해하였고, 이후 3 mg (12 %)의 화합물 7b를 수득하였다 : 1H-NMR (CD3OD, 800 MHz) δ7.90 (d, J= 8.7 Hz, 2H), 7.85 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.68 (d, J= 2.0 Hz, 1H), 7.39 (d, J= 8.0 Hz, 2H), 7.31 (dd, J= 8.5, 2.1 Hz, 1H), 7.28 (d, J= 8.6 Hz, 1H), 7.13 (d, J= 8.5 Hz, 2H), 7.08 (d, J= 8.8 Hz, 2H), 6.81 (d, J= 8.7 Hz, 2H), 4.73 (s, 2H), 3.76 -3.69 (m, 5H), 3.54 -3.43 (br s, 4H), 3.17 -3.01 (br s, 4H), 2.92 (t, J= 7.4 Hz, 2H), 2.72 (s, 3H); 13C NMR (200 MHz, DMSO-d6) δ167.59, 164.85, 162.57, 157.81, 152.97, 144.67, 143.21, 140.67, 135.94, 133.44, 130.38, 129.74 (2 carbons), 128.99 (2 carbons), 127.81 (2 carbons), 127.15 (2 carbons), 123.79, 113.84 (2 carbons), 113.48 (2 carbons), 112.98, 108.33, 108.23, 54.97, 54.37 (2 carbons), 51.09, 49.89 (2 carbons), 46.96, 45.75, 32.50.; HR-MS (FAB) C36H37N5O5(M) 에 대한 계산치 619.2795, 실측치 619.2800.
1.4.19. 2-((4-카르복시벤질)(4-메톡시펜에틸)아미노)티아졸로[5,4-b]피리딘4-옥사이드 (도 1의 8)
CH2Cl2에 용해시킨 화합물 4g (30mg, 0.01mmol)의 용액에 mCPBA (26.4mg, 0.1mmol)를 실온에서 첨가하였다. 반응 현탁액이 투명하고 무색에서 담황색이 된 후, 반응이 완료될 때까지 혼합물을 교반하였다. 반응 혼합물을 CH2Cl2로 희석하고 포화된 수성(aqueous) NaHCO3 용액으로 세척하였다. 유기층을 MgSO4로 건조시키고 감압하에 농축시켰다. 실리카겔 (CH2Cl2 / MeOH = 16 : 1)상에서 조 생성물의 플래시 컬럼 크로마토 그래피로 24 mg (76 %)의 화합물 8을 수득하였다 : 1H-NMR (CD3OD, 800 MHz) δ8.06 (d, J= 6.3 Hz, 1H), 7.99 (d, J= 8.4 Hz, 2H), 7.59 (d, J= 8.3 Hz, 1H), 7.42 (dd, J= 8.2, 6.3 Hz, 1H), 7.39 (d, J= 8.1 Hz, 2H), 7.14 (d, J= 8.6 Hz, 2H), 6.83 (d, J= 8.5 Hz, 2H), 4.83 (s, 2H), 3.83 -3.75 (br s, 2H), 3.74 (s, 3H), 2.97 (t, J= 7.3 Hz, 2H); 13C NMR (200 MHz, CD3OD) δ170.97, 169.67, 160.93, 152.80, 145.53, 142.88, 133.69, 133.48, 132.14, 132.06 (2 carbons), 131.84 (2 carbons), 129.39 (2 carbons), 125.31, 120.74, 115.98 (2 carbons), 56.46, 55.83, 50.65, 34.22.; HR-MS (FAB) C23H22N3O4S (M + H+) 에 대한 계산치 436.1331, 실측치 436.1320.
실시예 2. N-(4-메톡시페닐에틸)-N-(티아졸로[5,4-b]피리딘-2-일)아세트아미드: SL-7620) 및 이의 유사체의 합성
2.1 SL-7620 의 유사체의 합성
바이사이클릭 코어와 3 차 아민 모이어티로 구성된 SL-7620의 유사체를 하기의 방법으로 합성하였다. 코어 스캐폴드 호핑 유도체의 효율적인 합성을 위해 후기 단계에서 마이크로파 지원 방향족 친핵성 치환을 수행하였다. 구체적으로 본 합성에서 기재하고 있지 않으면 본 합성방법은 실시예 1의 합성예를 따랐다. 이에 따라 제조된 SL-7620을 비롯한 이의 유도체 화합물에 대한 반응스킴은 다음과 같다 :
<반응 스킴 2>
상기 반응스킴 2에서 각각 a 와 b단계에서 사용한 시약 및 반응 조건은 다음과 같다. a 단계는 70 °C 에서 할로젠화물(halides), DIPEA, Cs2CO3, 아세토니트릴, 또는 실온에서 할로젠화물(halides), DIPEA, CH2Cl2이다. b단계는 60 °C 에서 NaOH, H2O, 및 MeOH을 첨가하여 각각의 하기 표 1의 화합물을 합성하였다.
2.2 타겟 물질의 합성과 합성된 화합물의 물질구조 분석
상기 화학식 1에서 R1 및 R2를 하기의 작용기로 한 타겟 물질 화합물인 화합물을 상기 반응스킴과 하기 기재한 합성 방법에 의하여 합성하고, 이의 물질 구조를 분석하였다.
[표 1]
2.2.1. N-(4-메톡시페닐에틸)-N-(티아졸로[5,4-b]피리딘-2-일)아세트아미드(화합물 10h, SL-7620)
무수 아세토니트릴 중 1 당량의 N-(4-메톡시펜에틸)티아졸로[5,4-b]피리딘-2-아민을 용액으로 제조하기 위하여, 1.5 당량의 탄산 세슘(cesium carbonate) 및 1 당량의 아세틸 클로라이드를 0℃에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온으로 가온하고 반응이 완료될 때까지 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트로 추출하였다. 혼합한 유기층을 MgSO4로 건조시키고 감압하에 농축시켰다. 잔류물을 실리카겔에서 플래쉬 컬럼 크로마토그래피를 사용하고 정제하여 화합물 10h인 N-(4-메톡시페닐에틸)-N-(티아졸로[5,4-b]피리딘-2-일)아세트아미드를 수득하였다 : 1H NMR (800MHz, CDCl3) δ 8.50 (dd, J = 4.7, 1.5Hz, 1H), 8.06 (dd, J = 8.1, 1.5Hz, 1H), 7.36 (dd, J = 8.1, 4.6Hz, 1H), 7.13 - 7.09 (m, 2H), 6.87 - 6.83 (m, 2H), 4.40 (t, J = 7.3Hz, 2H), 3.78 (s, 3H), 3.07 (t, J = 7.3Hz, 2H), 2.15 (s, 3H); 13C NMR (201MHz, CDCl3) δ 171.03, 158.61, 156.87, 145.84, 141.67, 129.97, 129.95, 127.92, 121.05, 114.26, 55.28, 49.95, 33.49, 29.69, 22.94; HR-MS (FAB) C17H17N3O2S (M + H+)에 대한 계산치 328.1114, 실측치 328.1115.
2.2.1. N-(4-메톡시페닐에틸)-N-(티아졸로[5,4-b]피리딘-2-일)아세트아미드(화합물 10h, SL-7620)의 유사체에 대한 구조 분석
합성된 화합물 9의 구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, CDCl3) δ 8.18 (dd, J = 4.8, 1.5 Hz, 1H), 8.00 - 7.95 (m, 2H), 7.77 - 7.74 (m, 1H), 7.31 - 7.27 (m, 2H), 7.24 (q, J = 4.7 Hz, 1H), 7.09 - 7.05 (m, 2H), 6.84 - 6.80 (m, 2H), 4.69 (s, 2H), 3.88 (s, 3H), 3.76 (s, 3H), 3.66 (t, J = 7.5 Hz, 2H), 2.91 (t, J = 7.5 Hz, 2H); 13C NMR (201 MHz, CDCl3) δ 206.91, 167.09, 166.63, 166.15, 158.45, 154.82, 147.37, 141.43, 130.07 (2C), 129.75 (2C), 129.72, 127.45 (2C), 125.15, 121.38, 114.14 (2C), 55.24, 53.98, 52.97, 52.13, 32.64; HR-MS (FAB) C24H24N3O3S+ (M + H+) 에 대한 계산치 434.1533, 실측치434.1534.
합성된 화합물 10a의 구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, CDCl3) δ 8.23 (d, J = 5.0 Hz, 1H), 7.96 (d, J = 8.2 Hz, 1H), 7.63 - 7.59 (m, 2H), 7.43 (d, J = 6.8 Hz, 1H), 7.31 (d, J = 8.1 Hz, 2H), 7.09 - 7.05 (m, 2H), 6.85 - 6.81 (m, 2H), 4.70 (s, 2H), 3.78 (s, 3H), 3.71 (d, J = 7.8 Hz, 2H), 2.95 (t, J = 7.3 Hz, 2H); 13C NMR (201 MHz, CDCl3) δ 167.65, 158.70, 142.77, 132.72 (2C), 129.77 (2C), 129.29, 128.10 (2C), 124.81, 122.07, 118.35, 114.34 (2C), 112.09, 70.26, 67.98, 58.01, 55.30, 53.73, 32.64, 30.17; HR-MS (FAB) C23H21N4OS+ (M + H+) 에 대한 계산치 401.1431, 실측치 401.1443.
합성된 화합물 11의 구조를 분석한 결과는 다음과 같다:1H NMR (800 MHz, DMSO) δ 8.40 (t, J = 5.4 Hz, 1H), 8.08 (dd, J = 4.7, 1.5 Hz, 1H), 7.67 (dd, J = 8.0, 1.5 Hz, 1H), 7.24 (dd, J = 8.0, 4.7 Hz, 1H), 7.20 - 7.16 (m, 2H), 6.89 - 6.85 (m, 2H), 3.72 (s, 3H), 3.58 (td, J = 7.3, 5.4 Hz, 2H), 2.85 (t, J = 7.3 Hz, 2H); 13C NMR (201 MHz, DMSO) δ 164.69, 157.75, 154.82, 146.53, 141.54, 130.98, 129.67 (2C), 123.61, 121.12, 113.78 (2C), 54.97, 45.04, 33.65; HR-MS (FAB) C15H16N3OS+ (M + H+) 에 대한 계산치 286.1009, 실측치286.1009.
합성된 화합물 10b의 구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, CDCl3) δ 8.14 (dd, J = 4.7, 1.5 Hz, 1H), 7.69 (dd, J = 8.1, 1.5 Hz, 1H), 7.18 (dd, J = 8.0, 4.7 Hz, 1H), 7.15 - 7.11 (m, 2H), 6.85 - 6.80 (m, 2H), 3.76 (s, 3H), 3.71 (t, J = 7.5 Hz, 2H), 3.08 (s, 3H), 2.92 (dd, J = 8.4, 6.7 Hz, 2H); 13C NMR (201 MHz, CDCl3) δ 166.80, 158.35, 155.62, 147.37, 141.75, 129.78 (2C), 124.33, 121.11, 114.08 (2C), 113.73, 55.22, 38.44, 32.64, 29.66; HR-MS (FAB) C16H18N3OS+ (M + H+) 에 대한 계산치 300.1165, 실측치 300.1171.
합성된 화합물 10c구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, CDCl3) δ 8.53 (dd, J = 4.8, 1.4 Hz, 1H), 8.10 (dd, J = 8.1, 1.5 Hz, 1H), 7.48 (t, J = 7.6 Hz, 1H), 7.42 - 7.38 (m, 3H), 7.27 - 7.23 (m, 2H), 6.82 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 6.74 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 4.42 (t, J = 7.3 Hz, 2H), 3.76 (s, 3H), 2.97 (t, J = 7.3 Hz, 2H); 13C NMR (201 MHz, CDCl3) δ 171.68, 159.21, 158.46, 156.75, 146.05, 141.84, 134.37, 130.72, 129.98 (2C), 129.75, 128.55 (2C), 128.08, 126.87 (2C), 121.17, 114.03 (2C), 55.28, 51.20, 33.51; HR-MS (FAB) C22H20N3O2S+ (M + H+) 에 대한 계산치 390.1271, 실측치 390.1279.
합성된 화합물 10d구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, CDCl3) δ 8.56 (dd, J = 4.7, 1.5 Hz, 1H), 8.12 (dd, J = 8.1, 1.5 Hz, 1H), 7.64 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 7.42 (dd, J = 8.1, 4.7 Hz, 1H), 7.19 (d, J = 8.1 Hz, 2H), 6.79 (d, J = 8.6 Hz, 2H), 6.75 (d, J = 8.6 Hz, 2H), 4.38 (t, J = 6.7 Hz, 2H), 3.78 (s, 3H), 2.98 (t, J = 6.7 Hz, 2H); 13C NMR (201 MHz, CDCl3) δ 169.67, 158.73, 158.60, 156.60, 146.49, 141.73, 138.43, 132.27 (2C), 130.17 (2C), 129.41, 128.44, 127.55 (2C), 121.42, 117.74, 114.35, 114.21 (2C), 55.35, 51.27, 33.34; HR-MS (FAB) C23H19N4O2S+ (M + H+) 에 대한 계산치 415.1223, 실측치415.1232.
합성된 화합물 10e구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, CDCl3) δ 8.52 (dd, J = 4.7, 1.5 Hz, 1H), 8.09 (dd, J = 8.1, 1.5 Hz, 1H), 7.38 (dd, J = 8.1, 4.7 Hz, 1H), 7.19 (q, J = 8.1 Hz, 4H), 6.87 - 6.83 (m, 2H), 6.76 - 6.72 (m, 2H), 4.44 (dd, J = 8.1, 6.5 Hz, 2H), 3.75 (s, 3H), 2.98 (t, J = 7.3 Hz, 2H), 2.39 (s, 3H); 13C NMR (201 MHz, CDCl3) δ 171.86, 159.44, 158.40, 156.71, 145.92, 141.90, 141.20, 131.40, 129.97 (2C), 129.82 (2C), 129.14, 128.00 (2C), 127.05, 121.11, 113.97 (2C), 55.26, 51.22, 33.49, 21.50; HR-MS (FAB) C23H22N3O2S+ (M + H+) 에 대한 계산치 404.1427, 실측치 404.1437.
합성된 화합물 10 f 구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, CDCl3) δ 8.54 (dd, J = 4.7, 1.5 Hz, 1H), 8.11 (dd, J = 8.1, 1.6 Hz, 1H), 7.49 - 7.44 (m, 1H), 7.40 (dd, J = 8.1, 4.7 Hz, 1H), 7.16 (td, J = 7.5, 1.0 Hz, 1H), 7.13 (t, J = 8.9 Hz, 1H), 7.03 - 6.99 (m, 1H), 6.80 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 6.75 - 6.72 (m, 2H), 4.35 (q, J = 7.2 Hz, 2H), 3.75 (s, 3H), 2.97 (t, J = 7.2 Hz, 2H); 13C NMR (201 MHz, CDCl3) δ 167.22, 158.47, 158.32, 157.08, 156.59, 146.20, 141.71, 132.48, 129.94 (2C), 129.73, 129.10, 128.22, 124.74, 122.83, 121.22, 115.93, 114.07 (2C), 55.28, 50.78, 33.39; HR-MS (FAB) C22H19FN3O2S+ (M + H+) 에 대한 계산치 408.1177, 실측치 408.1179.
합성된 화합물 10 g 구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, CDCl3) δ 8.52 (dd, J = 4.6, 1.5 Hz, 1H), 8.10 (dd, J = 8.1, 1.5 Hz, 1H), 7.62 (dd, J = 1.7, 0.9 Hz, 1H), 7.38 (dd, J = 8.1, 4.6 Hz, 1H), 7.31 (dd, J = 3.6, 0.9 Hz, 1H), 7.20 - 7.16 (m, 2H), 6.85 - 6.81 (m, 2H), 6.58 (dd, J = 3.5, 1.7 Hz, 1H), 4.82 - 4.78 (m, 2H), 3.77 (s, 3H), 3.19 - 3.14 (m, 2H); 13C NMR (201 MHz, CDCl3) δ 159.57, 159.30, 158.41, 156.81, 146.57, 146.03, 145.43, 141.72, 130.20, 129.82 (2C), 128.13, 121.12, 120.68, 114.04 (2C), 112.42, 55.28, 49.72, 34.23; HR-MS (FAB) C20H18N3O3S+ (M + H+) 에 대한 계산치 380.1063, 실측치 380.1066.
합성된 화합물 12 구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, DMSO) δ 9.03 (s, 1H), 8.13 (dd, J = 4.8, 1.5 Hz, 1H), 7.95 - 7.91 (m, 2H), 7.70 (dd, J = 8.0, 1.5 Hz, 1H), 7.51 - 7.47 (m, 2H), 7.27 (dd, J = 8.1, 4.8 Hz, 1H), 4.71 (d, J = 4.8 Hz, 2H); 13C NMR (201 MHz, DMSO) δ 167.09, 165.00, 154.44, 146.11, 143.68, 141.68, 129.60, 129.52 (2C), 127.34 (2C), 124.13, 121.32, 46.31; HR-MS (FAB) C14H12N3O2S+ (M + H+) 에 대한 계산치 286.0645, 실측치 286.0647.
합성된 화합물 13a 구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, DMSO) δ 8.15 (dd, J = 4.7, 1.5 Hz, 1H), 7.93 (dd, J = 8.5, 2.1 Hz, 2H), 7.76 (dd, J = 8.0, 1.5 Hz, 1H), 7.42 (d, J = 8.1 Hz, 2H), 7.31 (dd, J = 8.1, 4.8 Hz, 1H), 4.91 (s, 2H), 3.18 (s, 3H); 13C NMR (201 MHz, DMSO) δ 166.60, 155.03, 146.80, 141.84, 129.73 (2C), 129.36, 127.32 (2C), 124.35, 121.77, 121.62, 115.36, 56.95, 38.13; HR-MS (FAB) C15H14N3O2S+ (M + H+) 에 대한 계산치 300.0801, 실측치 300.0808.
합성된 화합물 13b 구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, DMSO) δ 8.18 - 8.13 (m, 3H), 7.92 (s, 2H), 7.77 (dd, J = 8.1, 1.5 Hz, 1H), 7.59 - 7.55 (m, 2H), 7.42 (d, J = 8.1 Hz, 2H), 7.31 (dd, J = 8.1, 4.7 Hz, 1H), 4.87 (s, 2H), 3.86 (t, J = 7.3 Hz, 2H), 3.15 (t, J = 7.5 Hz, 2H); 13C NMR (201 MHz, DMSO) δ 166.13, 154.88, 146.84, 146.49, 146.24, 142.06, 141.61, 130.27 (2C), 130.23, 129.66 (2C), 127.28 (2C), 126.02, 124.55, 123.52 (2C), 121.60, 62.00, 51.89, 32.6; HR-MS (FAB) C22H19N4O4S+ (M + H+) 에 대한 계산치 435.1122, 실측치 435.1126.
합성된 화합물 13c구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, DMSO) δ 8.15 (dd, J = 4.7, 1.5 Hz, 1H), 7.94 - 7.90 (m, 2H), 7.76 (dd, J = 8.1, 1.5 Hz, 1H), 7.43 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.31 (dd, J = 8.1, 5.0 Hz, 3H), 7.16 - 7.07 (m, 2H), 4.87 (s, 2H), 3.80 - 3.73 (m, 2H), 2.97 (t, J = 7.6 Hz, 2H); 13C NMR (201 MHz, DMSO) δ 167.04, 166.18, 161.60, 160.40, 154.82, 146.56, 141.91, 134.51, 130.72 (2C), 129.91, 129.68 (2C), 127.36 (2C), 124.50, 121.60, 115.23 (2C), 62.00, 52.67, 31.93; HR-MS (FAB) C22H19FN3O2S+ (M + H+) 에 대한 계산치 408.1177, 실측치 408.1180.
합성된 화합물 13d구조를 분석한 결과는 다음과 같다: 1H NMR (800 MHz, DMSO) δ 8.15 (dd, J = 4.8, 1.5 Hz, 1H), 7.91 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.77 (dd, J = 8.1, 1.5 Hz, 1H), 7.48 (d, J = 8.3 Hz, 2H), 7.43 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 7.31 (dd, J = 8.1, 4.8 Hz, 1H), 7.25 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 4.87 (s, 1H), 3.81 - 3.73 (m, 2H), 2.96 (t, J = 7.6 Hz, 2H); 13C NMR (201 MHz, DMSO) δ 167.03, 166.16, 154.81, 146.56, 141.93, 137.81, 131.31 (2C), 131.16 (2C), 129.92, 129.69 (2C), 129.59, 127.36 (2C), 124.55, 121.62, 119.56, 62.00, 51.53, 32.15; HR-MS (FAB) C22H19BrN3O2S+ (M + H+) 에 대한 계산치 468.0376, 실측치 468.0387.
실시예 3. SL-1910 및 SL-7620의 암 전이 억제 활성 확인
3.1 SL-1910의 암 전이 억제 활성 확인
상기 합성된 SL-1903과 같은 삼차 아민 가지를 가지는 융합된-헤테로사이클릭 코어 포함바이사이클릭 유사체가 KRS-선택적 세포 이동을 저해하여 전이 저해활성이 나타나는지 확인하기 위하여 인간 KRS T52D 돌연변이인 삼중-음성 인간 유방암 세포주인 MDA-MB-231 테트라사이클린-유도성 세포주를 사용하여 KRS 의존적 이동 억제 활성을 확인하였고, 이의 실험결과를 도 1에 나타내었다.
도 1A 및 1B에서 확인한 바와 같이, 모 화합물(parent compound, 4a)에 해당하는 SL-1903을 가지는 2-아미노트리플로오로벤조티아졸 코어를 가진 화합물은 3μM에서 약 28%의 암 전이 억제를 나타내는 것을 확인하였다. 반면, YH16899는 같은 농도에서 전이 억제활성이 현저히 떨어지는 것을 확인하였다. 이러한 결과를 통하여, 이미노벤조티아졸 코어와 비교하여 2-아미노벤조티아졸 코어의 유연한 형태가 주요 잔류물과 더 긴밀한 상호 작용을 유도했음을 확인하였다. 상기 화합물 4b 및 4c와 같은 다른 치환기를 갖는 벤조티아졸 유사체는 이동 억제활성이 거의 없는 반면, 벤조옥사졸 유사체인 화합물 4d, 4e, 7a 및 7b는 중간정도의 세포 이동 억제활성을 나타내는 것을 확인하였다.
Glu195 및 Gln 155로 구성된 소수성 포켓에 추가 점유를 예상하여 벤조옥사졸 코어 (7a 및 7b)의 5 위치에 4-메톡시페닐아세트아미도 또는 4-(4-메틸피페라진-1-일)벤조아미도 그룹 치환기를 도입하였다. 도 1B에서 확인한 바와 같이 소수성 4-메톡시페닐아세트아미도 그룹을 갖는 유사체 화합물 7a는 우수한 세포 이동 억제 활성을 보인 반면, 피페라진 그룹을 갖는 화합물 7b는 낮은 억제 활성을 나타나는 것을 확인하였다. 또한 벤조티아졸 대신 벤즈이미다졸로 구성된 유사체 4f는 낮은 세포 이동 억제 활성을 나타내는 것을 확인하였고. 특히, 벤조티아졸 코어 대신 티아 졸로 [5,4-b] 피리딘을 보유한 화합물 4g (SL-1910)은 3μM에서 약 70 %의 세포 이동 억제활성을 나타내 가장 우수한 암 전이 억제 활성을 가질 수 있음을 확인하였다. 이 결과는 YH16899 또는 SL-1903보다 높은 SL-1910 (19.26)의 도킹 점수와 밀접한 관련이 있기 때문에 나타나는 것으로 확인되었다. 티아졸로[4,5-b]피리딘 및 티아졸로[4,5-c] 피리딘을 갖는 화합물 4h 및 4i(SL-1910의 이성질체 유사체)는 벤조티아졸을 함유한 SL-1903보다 낮은 세포 이동 억제활성을 나타내는 것을 확인하였다. 이러한 결과는 티아졸에서 황이 중요한 위치 결정 효과를 나타낼 수 있음을 보여주며, 피리딘에서 질소 역시 중요한 위치 결정 효과를 나타내는 것임을 확인할 수 있었다. 이에 따라, 화합물 4g와 유사한 황 및 질소 위치를 가지는 화합물 4j에서는 도 1B에서 확인한 것과 같이, 티아졸로 [5,4-b] 피리딘의 6-위치에 염화물 치환기가 첨가되어도 세포 이동 억제 활성이 4g와 비슷하게 유지되는 것을 확인할 수 있었다. 화합물 4g인 SL-1910 (cLogP 5.40, tPSA 74.49)보다 cLogP 가 4.27로 낮고 tPSA가 96.87로 더 낮은 티아졸로[5,4-b]피리딘을 가지는 화합물 8의 N-옥사이드 유사체와 티아졸로 [5,4-d] 피리미딘 코어를 가진 화합물 4k 는 3μM에서 세포 이동 억제 효과가 나타나지 않았으며. 또한 티아졸로피리딘 (화합물 4g, SL-1910)과 벤족사졸 (화합물 4d)의 하이브리드인 옥사졸로 피리딘으로 구성된 유사체 화합물 4l은 세포 이동 억제 효과가 다소 나타나는 것을 확인하였다.
또한 도 1C에서 확인한 바와 같이, 화합물 4g인 SL-1910은 KRS 돌연변이 MDA-MB-231 세포주에 대해서도 EC50 값이 81nM인 것을 확인하였고, 이는 종전에 알려진 화합물 YH16899 H226 세포주에 대해 갖는 EC50값인 8.5μM보다 약 효능의 100 배 이상인 것을 확인하였다.
종합적으로 화합물 4g인 SL-1910에서 가장 우수한 암세포 이동능 억제 활성이 나타나는 것을 확인하였다.
3.2 SL-7620의 암 전이 억제 활성 확인
상기 실시예 3.1과 동일한 방법 및 조건으로 화합물만을 달리하여, SL-7620을 포함한 화합물의 암 전이 억제 활성을 구체적으로 확인하고 이를 표 2에 나타내었다.
[표 2]
상기 표 2에서 확인한 바와 같이, 상기 실시예 3.1에서 확인한 SL-1910과 유사하게 화합물 5h인 SL-7620은 3μM을 처리한 경우 70 %이상의 세포 이동 억제활성을 나타내 가장 우수한 암 전이 억제 활성을 가질 수 있음을 확인하였다.
따라서, 종합적으로 화합물 4g인 SL-1910 및 10h인 SL-7620에서 가장 우수한 암세포 이동능 억제 활성이 나타나는 것을 확인할 수 있어 항암제 또는 암 전이 억제제로 활용될 수 있는 가능성을 확인하였다.
실시예 4. SL-1910과 KRS 단백질과의 결합 부위의 확인
아울러, 상기 암 전이 억제 활성이 나타나는 SL-1910이 인간 KRS 단백질과의 결합활성을 구체적으로 확인하기 위하여 형광-기반 결합 적정 실험을 수행하였고, 이를 확인한 결과를 도 2에 나타내었고, 구체적으로 YH16899의 결합 분석을 도 2A에 및 SL-1910의 결합분석을 확인한 결과를 도 2B에 나타내었다. 각각 310 nm, 365 nm 및 445 nm에서 KRS와의 결합에 따른 형광 방출의 변화를 측정하여 인간 KRS 단백질에 결합하는 YH16899 및 SL-1910에 대한 Kd 값을 확인하였다.
도 2A 및 2B에서 확인한 바와 같이, SL-1910의 Kd 값은 5.75μM로 YH16899의 Kd 값인 49.24μM 보다 약 9배 정도 낮은 것을 확인하였다. 이를 통해 화합물 4g인 SL-1910이 종래 알려진 YH16899보다 훨씬 더 높은 인간 KRS 단백질에 대한 결합 친화성을 나타내는 것을 구체적으로 확인할 수 있었다.
실시예 5. SL-1910의 KRS 단백질에 대한 도킹 메커니즘의 확인
티아졸로피리딘을 고급 바이사이클릭 코어를 보유한 SL-1910의 KRS에 대한 도킹 메커니즘을 확인하기 위해, 2D-NMR 결합 분석을 수행하였다. 상기 분석을 통하여 상호 작용 잔기의 식별을 포함한 SL-1910과 인간 KRS 단백질과의 결합 메커니즘을 도 3에 나타내었다. YH16899의 방향적 모이어티는 Leu142, Phe144, Met157, Thr191 및 Ile199의 측쇄에 의해 형성된 소수성 포켓에 의하여 이루어지는 것을 확인하였다. 이 무극성 포켓은 His120, Asn159, Arg161 및 Lys192의 극성 측쇄에 의해 더 구부러져 단백질 결합 및 약물 표적화를 위한 최적의 부위를 형성하는 것으로 알려져 있다.
도 3A, 3B 및 3C에서 확인한 바와 같이, SL-1910은 Tyr 112, Gly 118 및 His 120와 상호 작용하는 것을 확인하여, YH16899와 동일한 결합 포켓이 나타나는 것을 확인하였다. 특히 도 3D 및 도 3E에서 확인한 바와 같이, 2D-NMR 결합 분석을 기반으로 한 도킹 시뮬레이션을 통하여 YH16899 및 SL-1910는 유사한 결합 패턴이 나타나는 것을 확인하였다. 특히 YH16899에 비해 SL-1910은 분자 중간에 유연한 3 차 아민 구조를 가지고 있고, 이는 161Arg, 190Lys 및 191Thr을 포함한 추가 아미노산 잔기와 상호 작용하는 것으로 예측되며, 따라서 이러한 추가적인 상호 작용을 통하여 SL-1910는 보다 우수한 암 세포 이동 억제 효과를 나타내는 것을 확인할 수 있었다.
실시예 6. SL-1910 및 SL-7620의 마우스 모델에서의 실제적인 암 전이 억제 활성에 대한 확인
상기 실시예를 통해 확인한 화합물 4g인 SL-1910 및 SL-7620가 실질적인 치료 효과를 나타내는지 확인하기 위하여, 이종 이식 마우스 모델을 이용한 생체 내(in vivo) 암 전이 억제 분석 실험을 수행하였다. 구체적으로 마우스 4T1 이종 이식 전이 모델에서 SL-1910 및 SL-7620의 생체 내 암세포 항-전이 활성을 조사하고, 이를 도 4에 나타내었다.
100mg/kg의 용량으로 SL-1910 및 SL-7620의 경구 투여를 수행한 군은 도 4A 및 4B에서 확인한 바와 같이 대조군보다 SL-1910이 처리된 군에서 전이성 폐암 결절의 수가 약 절반 가까이 줄어든 것을 확인할 수 있었다. 특히 SL-7620을 처리한 군은 SL-1910 처리군 보다도 전이성 폐암 결절의 수를 줄일수 있는 현저한 항-전이 활성이 나타나는 것을 확인하였다. 또한 도 4C에서 확인한 것과 같이, SL-1910 및 SL-7620는 대조군에 비해 검출 가능한 독성이 전혀 없는 것을 확인하였다.
따라서, 종합적으로 SL-1910 및 SL-7620는 독성이 없으면서도 암세포에 대한 우수한 항-전이 활성이 나타나 암세포 전이 억제제로 널리 활용될 수 있음을 확인할 수 있었다.