KR101671626B1 - A novel expression cassette for secretion of protein - Google Patents
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Abstract
본 발명은 신규 단백질 분비용 발현 카세트 및 이의 용도에 관한 것으로, 구체적으로 코리네박테리움 속 미생물 기반의 목적 단백질 분비용 신규 발현 카세트, 및 이의 용도인 목적 단백질의 제조 방법에 관한 것이다.More particularly, the present invention relates to a novel expression cassette for a target protein fraction based on microorganisms of the genus Corynebacterium, and a method for producing a target protein for use therefor.
Description
본 발명은 신규 단백질 분비용 발현 카세트 및 이의 용도에 관한 것으로, 구체적으로 신규한 코리네박테리움 속 미생물 기반의 목적 단백질 분비용 신규 발현 카세트, 및 목적 단백질의 제조 방법에 관한 것이다.
More particularly, the present invention relates to a novel expression cassette for a target protein fraction based on a microorganism of the genus Corynebacterium, and a method for producing a target protein.
코리네박테리움 속 미생물은 산업적으로 아미노산 생산뿐 아니라 의약품, 식품, 화학산업에 주요한 재조합 단백질 생산에 많이 사용되는 플랫폼이다. 이는 코리네박테리움 속 미생물이 재조합 단백질 생산 플랫폼으로서 이상적인 특징들을 지니고 있기 때문이다. 예를 들어, i) 세포 외로 분비시키는 단백질이 매우 적다는 점, ii) 세포 밖에서의 단백질 분해 효소 활성이 거의 없다는 점, 또한 iii) 그람 양성 박테리움이기 때문에 세포막이 하나 뿐이어서 단백질의 세포 외 분비가 용이하다는 점 등이 있다 (Alain Vertes; Springer; Protein secretion systems of Corynebacterium glutamicum). 한편, 산업적으로 재조합 단백질 생산에 있어 단백질의 생산율 (production rate), 생산수율 (production yield), 질 (quality), 및 기능성 (functionality)은 중요한 요소로 꼽히고 있다. 이에 최근 재조합 단백질 생산 연구에서는 목적 단백질의 프로모터 개량, 코돈 최적화, 번역 신호 엔지니어링 (translational signals engineering) 및 부산물 생성을 줄이거나 값싼 원료를 사용할 수 있도록 숙주 균주를 개량하는 연구들을 수행하고 있다. 특히 그람 양성 박테리움의 경우, 글루코스, 원당, 프락토즈 등 다양한 당 이용성을 가지고 있으며, 고농도 세포 배양이 가능하여 전사 (transcription) 및 번역 (translation) 조절을 통해 고효율의 분비 경로 (secretion pathway)를 선별하여 목적 단백질을 세포 밖으로 분비시켜 산업적으로 재조합 단백질을 생산하고자 하는 연구 보고가 있었다 (Long Liu et al; Appl Microbiol Biotechnol (2013) 97:9597-9608). 그러나, 여전히 코리네박테리움 속 미생물 내에서 사용 가능한 신규 분비용 발현 카세트 개발은 요구되고 있다.
Corynebacterium sp. Microorganisms are widely used in industrial production of amino acids, as well as in production of major recombinant proteins in the pharmaceutical, food and chemical industries. This is because microorganisms of the genus Corynebacterium have ideal characteristics as recombinant protein production platforms. For example, i) there is very little protein secreted out of the cell, ii) there is little proteolytic activity outside the cell, and iii) there is only one cell membrane because of Gram-positive bacterium, (Alain Vertes; Springer; Protein secretion systems of Corynebacterium glutamicum). On the other hand, industrial production rate, production yield, quality, and functionality of recombinant protein are important factors in the production of recombinant proteins. Recently, studies on the production of recombinant proteins have been carried out in order to improve the promoter of target proteins, codon optimization, translational signals engineering and production of byproducts, or to improve host strains so as to use cheap raw materials. In particular, Gram-positive bacterium has various sugar availability such as glucose, raw sugar, and fructose. It can cultivate high concentration cells and selects high-efficiency secretion pathway through transcription and translation control. (Long Liu et al., Appl. Microbiol Biotechnol (2013) 97: 9597-9608), which secrete the target protein outside the cell to produce an industrially recombinant protein. However, there is still a need for the development of new, fractionally expressible cassettes that can be used in microorganisms of the genus Corynebacterium.
이러한 배경 하에 본 발명자들은 코리네박테리움 속 미생물에서 목적 단백질을 과량 분비할 수 있는 새로운 분비용 발현 카세트를 개발하고자 예의 노력한 결과, 신규 분비 펩타이드인 시그널 펩타이드 및 이의 개량체를 개발하고, 이를 활용하여 재조합 단백질 분비용 발현 카세트를 구축하여 본 발명을 완성하였다.
Under these circumstances, the present inventors have made intensive efforts to develop a cassette for expression of a novel protein capable of over-secretion of a target protein in a microorganism belonging to the genus Corynebacterium. As a result, they have developed a novel secreted peptide, a signal peptide and its modified form, The present invention has been completed by constructing a cassette expressing the cost of a recombinant protein.
본 발명의 하나의 목적은 신규한 목적 단백질 분비용 발현 카세트인 (i) 프로모터; (ii) 서열번호 1 또는 2로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 시그널 펩타이드를 코딩하는 염기 서열; 및 (iii) 목적 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는, 목적 단백질 분비용 발현 카세트를 제공하는 것이다.One object of the present invention is to provide a novel target protein cost expression cassette which comprises (i) a promoter; (ii) a base sequence encoding a signal peptide having an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2; And (iii) a gene encoding a target protein.
본 발명의 또 하나의 목적은 신규한 시그널 펩타이드인 서열번호 1 또는 2로 기재되는 아미노산 서열을 갖는, 분리된 시그널 펩타이드 및 이를 코딩하는 핵산 분자를 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a separated signal peptide having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 2 which is a novel signal peptide and a nucleic acid molecule encoding the same.
본 발명의 또 하나의 목적은 상기 발현 카세트 또는 시그널 펩타이드를 코딩하는 핵산 분자를 포함하는 벡터를 제공하는 것이다.It is another object of the present invention to provide a vector comprising the nucleic acid molecule encoding the expression cassette or the signal peptide.
본 발명의 또 하나의 목적은 상기 목적 단백질 분비용 발현 카세트 또는 벡터가 도입된, 코리네박테리움 속 미생물을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a microorganism belonging to the genus Corynebacterium, into which the expression cassette or vector expressing the desired protein fraction is introduced.
본 발명의 또 하나의 목적은 상기 코리네박테리움 속 미생물을 이용하여 목적 단백질의 제조 방법을 제공하는 것이다.
It is another object of the present invention to provide a method for producing a target protein using the microorganism of the genus Corynebacterium.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 하나의 양태로서, 신규 분비 시스템인, 목적 단백질 분비용 발현 카세트를 제공한다. 상기 목적 단백질 분비용 발현 카세트는 (i) 프로모터; (ii) 서열번호 1 또는 2로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 시그널 펩타이드를 코딩하는 염기 서열; 및 (iii) 목적 단백질을 코딩하는 유전자를 포함할 수 있다.In order to achieve the above object, the present invention provides, in one aspect, a cassette for expression of a target protein, which is a novel secretion system. The expression cassette for cost-of-interest of interest comprises (i) a promoter; (ii) a base sequence encoding a signal peptide having an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2; And (iii) a gene encoding a target protein.
상기 목적 단백질 분비용 발현 카세트는 구체적으로, 프로모터 서열 하류에 서열번호 1 또는 2로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 시그널 펩타이드를 코딩하는 염기 서열이 작동 가능하게 연결되고, 당해 서열 하류에 목적 단백질을 코딩하는 유전자를 포함할 수 있다.Specifically, the cassette for expressing a target protein is specifically a plasmid in which a base sequence encoding a signal peptide having an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or 2 is operably linked downstream of the promoter sequence, Gene. ≪ / RTI >
상기 발현 카세트는 코리네박테리움 속 미생물 내에서 상기 서열번호 1 또는 서열번호 2의 시그널 펩타이드를 코딩하는 염기서열을 포함하지 않는 발현 카세트에 비해 목적 단백질의 분비능이 개선된 것을 특징으로 한다. 본 발명에서 용어 "프로모터"란 폴리머라제에 대한 결합 부위를 포함하고 프로모터 하위 유전자의 mRNA로의 전사 개시 활성을 가지는, 암호화 영역의 상위(upstream)의 비해독된 염기서열을 의미한다. 즉, 폴리머라제가 결합하여 유전자의 전사를 개시하도록 하는 DNA 영역으로, mRNA 전사 개시부위의 5' 부위에 위치한다.The expression cassette is characterized in that the secretion ability of the target protein is improved in the microorganism of the genus Corynebacterium as compared with the expression cassette which does not contain the nucleotide sequence encoding the signal peptide of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2. In the present invention, the term "promoter " refers to a nucleotide sequence that is upstream of the coding region and contains a binding site for a polymerase and has a transcription initiation activity to the mRNA of the promoter sub-gene. That is, it is a DNA region that allows the polymerase to bind and start transcription of the gene, and is located at the 5 'site of the mRNA transcription initiation site.
본 발명에서 용어, "시그널 펩타이드"는 "분비 펩타이드"와 혼용될 수 있으며, 새롭게 합성되는 단백질이 분비 경로 (secretory pathway)를 통해 지정된 위치로 분비되도록 상기 단백질의 N-말단에 존재하는 짧은 펩타이드 (5~30개 아미노산)를 의미한다. 본 발명의 목적상 상기 시그널 펩타이드는 목적 단백질을 세포외로 분비하도록 지정하기만 하면 어떤 시그널 펩타이드도 포함될 수 있으나, 예를 들어 서열번호 1 또는 2로 기재된 아미노산 서열일 수 있다.In the present invention, the term "signal peptide" can be used in combination with a "secretory peptide ", and a short peptide present at the N-terminus of the protein such that newly synthesized protein is secreted through a
구체적으로, 상기 시그널 펩타이드는 서열번호 1 또는 2로 기재한 아미노산 서열뿐만 아니라, 상기 서열과 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 상동성을 가지는 시그널 펩타이드를 포함할 수 있다. 또한, 상기 상동성을 갖는 시그널 펩타이드 뿐 아니라, 실질적으로 상기 시그널 펩타이드와 동일하거나 상응하는 분비 활성을 나타내는 아미노산 서열이라면 제한없이 포함한다. 또한 이러한 상동성을 갖는 아미노산 서열이라면, 일부 서열이 결실, 변형, 치환 또는 부가된 아미노산 서열도 본 발명의 범위 내에 포함됨은 자명하다.Specifically, the signal peptide has not only the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 2 but also a signal peptide having 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% . ≪ / RTI > In addition, as long as it is an amino acid sequence which exhibits the same or corresponding secretory activity as that of the above-mentioned signal peptide, as well as the signal peptide having the above homology, it includes without limitation. It is also apparent that amino acid sequences in which some sequences are deleted, modified, substituted or added are also included within the scope of the present invention, provided that they have such homology.
상기 시그널 펩타이드를 코딩하는 염기서열은 실질적으로 코딩 시, 상기 시그널 펩타이드와 동일하거나 상응하는 활성을 나타내는 펩타이드로 코딩되는 염기서열이라면 제한없이 포함할 수 있다. 구체적으로 서열번호 3 또는 서열번호 4의 핵산 분자일 수 있으며, 상기 서열들과 80% 이상, 구체적으로는 90% 이상, 보다 구체적으로는 95% 이상, 더욱 구체적으로는 98% 이상, 보다 더욱 구체적으로는 99% 이상의 상동성을 나타내는 염기 서열일 수 있다. 또한 이러한 상동성을 갖는 염기서열이라면, 일부 서열이 결실, 변형, 치환 또는 부가된 염기서열도 본 발명의 범위 내에 포함됨은 자명하다. 이는 시그널 시퀀스로 명칭될 수 있으며, 상기 시그널 펩타이드와 1:1로 매칭되는 코돈 서열 이외에 추가적인 염기 서열을 포함할 수 있다.The nucleotide sequence coding for the signal peptide may be any nucleotide sequence which is substantially identical to the signal peptide or is encoded by a peptide exhibiting the corresponding activity at the time of coding. Specifically, it may be a nucleic acid molecule of SEQ ID NO: 3 or SEQ ID NO: 4, and it may be more than 80%, specifically more than 90%, more specifically more than 95%, more specifically more than 98% May be a base sequence having 99% or more homology. Also, it is obvious that base sequences having deletion, modification, substitution or addition of some sequences are also included within the scope of the present invention if they are base sequences having such homology. It may be termed a signal sequence and may include additional base sequences in addition to codon sequences that match 1: 1 with the signal peptide.
본 발명에서 용어, "상동성"은 두 개의 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩타이드 모이티 사이의 동일성의 퍼센트를 말한다. 하나의 모이티로부터 다른 하나의 모이티까지의 서열 간 상동성은 알려진 당해 기술에 의해 결정될 수 있다. 예를 들면, 상동성은 서열정보를 정렬하고 용이하게 입수 가능한 컴퓨터 프로그램을 이용하여 두 개의 폴리뉴클레오티드 분자 또는 두 개의 폴리펩티드 분자 간의 서열 정보, 예로는 점수(score), 동일성(identity) 및 유사도(similarity) 등의 매개 변수(parameter)를 직접 정렬하여 결정될 수 있다(예: BLAST 2.0). 또한, 폴리뉴클레오티드 간 상동성은 상동 영역 간의 안정된 이중가닥을 이루는 조건하에서 폴리뉴클레오티드의 혼성화한 후, 단일-가닥-특이적 뉴클레아제로 분해시켜 분해된 단편의 크기를 결정함으로써 결정할 수 있다.As used herein, the term "homology" refers to the percentage of identity between two polynucleotide or polypeptide mimetics. The homology between sequences from one moiety to another can be determined by known techniques. For example, homology can include sequence information between two polynucleotide molecules or two polypeptide molecules, such as score, identity, and similarity, using a computer program that aligns sequence information and is readily available. (E.g., BLAST 2.0). ≪ / RTI > In addition, homology between polynucleotides can be determined by hybridizing the polynucleotides under conditions that result in a stable double strand between homologous regions, then resolving the single-strand-specific nucleases to determine the size of the resolved fragment.
본 발명에서 용어, "목적 단백질" 또는 "목적 산물"은 미생물로부터 분비 발현시키거나, 미생물을 이용하여 대량으로 생산하고자 하는 단백질 또는 산물을 의미한다. 구체적으로, 코리네박테리움 속 미생물로부터 분비 발현되거나 이를 이용하여 생산될 수 있는 단백질 또는 산물이라면 제한 없이 포함할 수 있다.In the present invention, the term "target protein" or "target product" means a protein or product secreted from a microorganism or produced in large quantities using microorganisms. Specifically, it may include, without limitation, any protein or product secreted from, or produced by, a microorganism belonging to the genus Corynebacterium.
본 발명에서 용어 "발현 카세트"란, 프로모터와 시그널 펩타이드를 코딩하는 염기 서열 및 목적 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하고 있어서, 시그널 펩타이드의 하류에 작동 가능하게 연결되어 있는 목적 단백질을 분비 생산을 위해 발현시킬 수 있는 단위 카세트를 의미한다. 본 발명에서 분비용 발현 카세트는 분비 시스템과 혼용될 수 있다. 이와 같은 발현 카세트의 내부 또는 외부에는 상기 목적 단백질의 효율적인 생산을 도울 수 있는 다양한 인자가 포함될 수 있다.
The term "expression cassette " in the present invention includes a base sequence encoding a promoter and a signal peptide, and a gene encoding a target protein, so that a target protein operably linked downstream of the signal peptide is expressed The unit cassette can be used. In the present invention, the expression cassette for division can be mixed with the secretion system. Inside or outside of such an expression cassette, various factors capable of helping efficient production of the target protein can be included.
본 발명에서 용어 "작동 가능하게 연결"이란 본 발명의 프로모터 활성을 갖는 핵산 서열 및/또는 시그널 펩타이드를 코딩하는 염기서열이 목적 단백질을 코딩하는 유전자의 전사를 개시 및 매개하도록, 상기 유전자 서열과 프로모터 및/또는 시그널 펩타이드를 코딩하는 염기 서열이 기능적으로 연결되어 있는 것을 의미한다. 작동가능한 연결은 당업계의 공지된 유전자 재조합 기술을 이용하여 제조할 수 있으며, 부위-특이적 DNA 절단 및 연결은 당업계의 절단 및 연결 효소 등을 사용하여 제작할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
The term "operably linked" in the present invention means that the nucleotide sequence having the promoter activity of the present invention and / or the nucleotide sequence coding for the signal peptide is expressed in the gene sequence and the promoter And / or a base sequence encoding a signal peptide is functionally linked. Operable linkages can be made using known recombinant techniques in the art, and site-specific DNA cleavage and linkage can be made using, but not limited to, cutting and linking enzymes in the art.
본 발명은 또 하나의 양태로서, 신규한 시그널 펩타이드를 제공한다. 구체적으로 서열번호 1 또는 서열번호 2로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 분리된 시그널 펩타이드일 수 있다.In another aspect, the present invention provides a novel signal peptide. Specifically a separate signal peptide having an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2.
시그널 펩타이드는 상기에서 설명한 바와 같다.The signal peptide is as described above.
본 발명의 구체적인 실시예에 따르면, 기능이 알려져 있지 않은 가상 단백질일 것으로 규명된 Cgl1342 단백질의 N-말단 내에서, 서열번호 1의 시그널 펩타이드를 분리하여 내었다. 또한, 이를 개량한 변이체로서 서열번호 1의 아미노산 서열의 1번째 아미노산인 루이신 (Leu, L)을 메치오닌 (Met, M)으로 치환시킨 서열번호 2의 아미노산 서열을 갖는 시그널 펩타이드를 분리하였다. 상기 시그널 펩타이드는 상단의 프로모터 변경에 관계 없이 목적 단백질, 구체적으로 자일라나아제를 분비 생산하는 것을 확인하였으며 (도 5), 고농도 배양 조건에서 자일라나아제를 대량 분비시킬 수 있음을 확인하였다 (도 6).
According to a specific embodiment of the present invention, within the N-terminus of the Cgl1342 protein identified to be a hypothetical protein of unknown function, the signal peptide of SEQ ID NO: 1 was isolated. Further, a signal peptide having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 in which leucine (Leu, L), which is the first amino acid of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, was substituted with methionine (Met, M) was isolated as an improved variant. It was confirmed that the above-mentioned signal peptide secreted the target protein, specifically xylanase, irrespective of the change of the promoter at the upper end (Fig. 5), and it was confirmed that the xylanase can be mass-secreted under the high concentration culture condition ).
본 발명은 또 하나의 양태로서, 상기 시그널 펩타이드를 코딩하는 핵산 분자를 제공한다.In another aspect, the present invention provides a nucleic acid molecule encoding the above-mentioned signal peptide.
시그널 펩타이드를 코딩하는 핵산 분자는 상기에서 설명한 바와 같다.
The nucleic acid molecule encoding the signal peptide is as described above.
본 발명은 또 하나의 양태로서, 상기 발현 카세트 또는 상기 시그널 펩타이드를 코딩하는 핵산 분자를 포함하는, 벡터를 제공한다.In another aspect, the present invention provides a vector comprising the expression cassette or a nucleic acid molecule encoding the signal peptide.
상기 시그널 펩타이드를 코딩하는 핵산 분자를 포함하는 벡터는 목적 단백질을 코딩하는 유전자를 추가로 포함할 수 있으며, 상기 유전자는 벡터 내에서 상기 시그널 펩타이드를 코딩하는 핵산 분자에 작동 가능하게 연결된 형태일 수 있다.The vector comprising the nucleic acid molecule encoding the signal peptide may further comprise a gene encoding a target protein and the gene may be operably linked to a nucleic acid molecule encoding the signal peptide in the vector .
본 발명의 용어 "벡터"는 적합한 숙주 균주내에서 목적 유전자를 발현시킬 수 있도록 유전 물질을 보유하는 인위적 DNA 분자로, 구체적으로 적합한 조절 서열에 작동 가능하게 연결된 유전자의 염기서열을 함유하는 DNA 제조물을 의미한다. 상기 조절 서열은 전사를 개시할 수 있는 프로모터, 그러한 전사를 조절하기 위한 임의의 오퍼레이터 서열, 적합한 mRNA 리보좀 결합 부위를 코딩하는 서열, 및 전사 및 해독의 종결을 조절하는 서열 중 하나 이상을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.The term "vector" of the present invention refers to an artificial DNA molecule having a genetic material so that it can express a gene of interest in a suitable host strain. Specifically, a DNA preparation containing a base sequence of a gene operably linked to a suitable regulatory sequence it means. The regulatory sequence may include one or more of a promoter capable of initiating transcription, any operator sequence for regulating such transcription, a sequence encoding a suitable mRNA ribosome binding site, and a sequence regulating the termination of transcription and translation But is not limited thereto.
본 발명에서 사용되는 벡터는 숙주세포 내에서 복제 가능한 것이면 특별히 한정되지 않으며, 당업계에 알려진 임의의 벡터를 이용할 수 있다. 통상 사용되는 벡터의 예로는 천연 상태이거나 재조합된 상태의 플라스미드, 코스미드, 바이러스 및 박테리오파지를 들 수 있다. 예를 들어, 파지 벡터 또는 코스미드 벡터로서 pWE15, M13, λMBL3, λMBL4, λⅨII, λASHII, λAPII, λt10, λt11, Charon4A, 및 Charon21A 등을 사용할 수 있으며, 플라스미드 벡터로서 pBR계, pUC계, pBluescriptII계, pGEM계, pTZ계, pCL계 및 pET계 등을 사용할 수 있다. 본 발명에서 사용 가능한 벡터는 특별히 제한되는 것이 아니며 공지된 발현 벡터를 사용할 수 있다. 그 예로 pDZ, pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322, pMW118, pCC1BAC, pCES208 벡터 등을 사용할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. The vector used in the present invention is not particularly limited as long as it is replicable in the host cell, and any vector known in the art can be used. Examples of commonly used vectors include plasmids, cosmids, viruses and bacteriophages in their natural or recombinant state. For example, pWE15, M13, λMBL3, λMBL4, λXII, λASHII, λAPII, λt10, λt11, Charon4A, and Charon21A can be used as the phage vector or cosmid vector, and pBR, pUC, pBluescriptII , pGEM-based, pTZ-based, pCL-based, pET-based, and the like. The vector usable in the present invention is not particularly limited, and known expression vectors can be used. For example, pDZ, pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322, pMW118, pCC1BAC, pCES208 vectors and the like can be used.
또한, 숙주세포 내 염색체 삽입용 벡터를 통해 염색체 내에 내재적 시그널 펩타이드를 코딩하는 서열을 본 발명의 시그널 펩타이드를 코딩하는 서열인 핵산 분자로 교체 또는, 내재적 시그널 펩타이드를 포함하지 않는 서열 내로 삽입시킬 수 있다. 상기 핵산 분자의 염색체 내로의 삽입은 당업계에 알려진 임의의 방법, 예를 들면, 상동재조합에 의하여 이루어질 수 있다. 본 발명의 벡터는 상동재조합을 일으켜서 염색체 내로 삽입될 수 있으므로 상기 염색체 삽입 여부를 확인하기 위한 선별 마커(selection marker)를 추가로 포함할 수 있다. 선별 마커는 벡터로 형질전환된 세포를 선별, 즉 목적 핵산 분자의 삽입 여부를 확인하기 위한 것으로, 약물 내성, 영양 요구성, 세포 독성제에 대한 내성 또는 표면 단백질의 발현과 같은 선택가능 표현형을 부여하는 마커들이 사용될 수 있다. 선택제(selective agent)가 처리된 환경에서는 선별 마커를 발현하는 세포만 생존하거나 다른 표현 형질을 나타내므로, 형질전환된 세포를 선별할 수 있다.In addition, a sequence encoding an intrinsic signal peptide in a chromosome can be replaced with a nucleic acid molecule that is a sequence encoding a signal peptide of the present invention, or inserted into a sequence that does not contain an intrinsic signal peptide, through a vector for insertion of a chromosome in a host cell . The insertion of the nucleic acid molecule into the chromosome can be accomplished by any method known in the art, for example, homologous recombination. Since the vector of the present invention can be inserted into a chromosome by causing homologous recombination, it may further include a selection marker for confirming whether or not the chromosome is inserted. Selection markers are used to select cells that are transfected with a vector, that is, to confirm the insertion of a target nucleic acid molecule, and are provided with selectable phenotypes such as drug resistance, resistance to nutritional requirement, tolerance to cytotoxic agents, May be used. In the environment treated with the selective agent, only the cells expressing the selectable marker survive or express different phenotypes, so that the transformed cells can be selected.
따라서, 본 발명의 상기 서열번호 1 또는 2의 아미노산을 갖는 시그널 펩타이드를 코딩하는 염기서열을 가지는 핵산 분자에 목적 유전자가 작동 가능하게 연결되지 않은 벡터일 경우에도, 숙주 세포, 그 예로 코리네박테리움 속 미생물 내의 내재적 시그널 펩타이드와 상동 재조합에 의해 교체되거나, 또는 프로모터와 내재적 단백질 내로 상동 재조합에 의해 삽입될 수 있다. 이에 의해 코리네박테리움 속 미생물의 내재적 유전자를 분비 발현시킬 수 있다.
Therefore, even in the case of a vector in which a desired gene is not operably linked to a nucleic acid molecule having a base sequence coding for a signal peptide having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 2 of the present invention, the host cell may be a host cell such as Corynebacterium May be replaced by homologous recombination with an endogenous signal peptide in the genus Microorganism, or inserted by homologous recombination into a promoter and an endogenous protein. Whereby the endogenous gene of the microorganism of the genus Corynebacterium can be secreted and expressed.
본 발명은 또 하나의 양태로서, 상기 목적 단백질 분비용 발현 카세트 또는 상기 벡터가 도입된, 코리네박테리움 속 미생물을 제공한다.In another aspect of the present invention, there is provided a microorganism belonging to the genus Corynebacterium into which the above-described vector is introduced, or a cassette expressing the desired protein fraction.
상기 목적 단백질 분비용 발현 카세트 또는 벡터는 형질전환에 의해 코리테박테리움 속 미생물에 도입될 수 있다. 본 발명에서 용어 "형질전환"은 본 발명의 목적상 상기 목적 단백질 분비용 발현 카세트, 또는 시그널 펩타이드를 코딩하는 핵산 분자 또는 목적 단백질 분비용 발현 카세트를 포함하는 벡터를 숙주세포 내에 도입하여 숙주세포 내에서 상기 발현 카세트 또는 시그널 펩타이드를 코딩하는 핵산 분자가 발현할 수 있도록 하는 것을 의미한다. 목적 단백질 분비용 발현 카세트의 양쪽에 코리네박테리움 미생물의 염색체 일부분과 동일한 서열을 추가 삽입하여 특정 위치에 목적 단백질 분비용 발현카세트 통째로 삽입 (integration)시켜서 목적단백질의 발현 및 분비를 이룰 수 있는 것 역시 포함된다. 형질전환된 상기 발현 카세트 또는 벡터 내에 포함되는 시그널 펩타이드를 코딩하는 핵산 분자 및/또는 이에 작동가능하게 연결된 목적 단백질을 코딩하는 유전자는 숙주세포 내에 발현될 수 있기만 한다면, 숙주세포의 염색체 내에 삽입되어 위치하거나 염색체 외에 위치하거나 상관없이 이들 모두를 포함한다. 또한, 상기 핵산 분자는 목적 단백질을 코딩하는 유전자의 형태로 DNA 및 RNA를 포함할 수 있다. 상기 발현 카세트 또는 벡터는 숙주세포 내로 도입되어 발현될 수 있는 것이면, 어떠한 형태로 도입되는 것이든 상관없다. 예를 들면, 상기 자체적으로 발현되는데 필요한 모든 요소를 포함하는 유전자 구조체인 발현 카세트(expression cassette)는, 전사 종결신호, 리보좀 결합부위 및 번역 종결신호를 추가로 포함할 수 있다. 상기 발현 카세트는 자체 복제가 가능한 발현벡터 형태일 수 있다. 또한, 상기 발현 카세트는 그 자체의 형태로 숙주세포에 도입되어, 숙주세포에서 발현에 필요한 서열과 작동 가능하게 연결되어 있는 것일 수도 있다.The expression cassette or vector expressing the target protein fraction can be introduced into the microorganism of the genus Corotte bacteria by transformation. For the purpose of the present invention, the term "transformed" in the present invention means that, for the purpose of the present invention, a vector comprising a cassette expressing the desired protein component or a nucleic acid molecule encoding a signal peptide or a cassette for expressing a protein of interest is introduced into the host cell, Quot; means that the nucleic acid molecule encoding the expression cassette or signal peptide can be expressed. The target protein can be expressed by integrating a portion of the cassette with the same sequence as a portion of the chromosome of the Corynebacterium microorganism on both sides of the cassette and integrating the entire expression cassette for expression of the desired protein at a specific position to achieve expression and secretion of the desired protein . A gene encoding a nucleic acid molecule encoding a signal peptide contained in the expression cassette or vector and / or a gene encoding a target protein operably linked thereto may be inserted into the chromosome of the host cell, Lt; RTI ID = 0.0 > chromosomal < / RTI > In addition, the nucleic acid molecule may include DNA and RNA in the form of a gene encoding a target protein. The expression cassette or vector may be introduced in any form as long as it can be introduced into a host cell and expressed. For example, an expression cassette, which is a gene construct containing all the elements required to be expressed by itself, may further include a transcription termination signal, a ribosome binding site, and a translation termination signal. The expression cassette may be in the form of an expression vector capable of self-replication. The expression cassette may also be introduced into the host cell in its own form and operably linked to the sequence necessary for expression in the host cell.
본 발명의 벡터를 형질전환시키는 방법은 핵산을 세포 내로 도입하는 어떤 방법도 포함되며, 숙주세포에 따라 당 분야에서 공지된 바와 같이 적합한 표준 기술을 선택하여 수행할 수 있다. 예를 들어, 전기천공법 (electroporation), 인산칼슘 (CaPO4) 침전, 염화칼슘 (CaCl2) 침전, 미세주입법 (microinjection), 폴리에틸렌글리콜 (PEG)법, DEAE-덱스트란법, 양이온 리포좀법, 및 초산 리튬-DMSO법 등이 있으나, 이에 제한되지 않는다.The method of transforming the vector of the present invention includes any method of introducing a nucleic acid into a cell and may be carried out by selecting a suitable standard technique as known in the art depending on the host cell. For example, electroporation, calcium phosphate (CaPO 4 ) precipitation, calcium chloride (CaCl 2 ) precipitation, microinjection, polyethylene glycol (PEG) method, DEAE-dextran method, A lithium acetate-DMSO method, and the like, but are not limited thereto.
상기 숙주 세포로는 DNA의 도입효율이 높고, 도입된 DNA의 발현 효율이 높다면 어떤 미생물을 사용하여도 상관이 없으나, 본 발명의 목적상 코리네박테리움 속 미생물일 수 있다. 구체적으로 코리네박테리움 글루타미쿰일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
The host cell may be any microorganism as long as the DNA introduction efficiency is high and the efficiency of the introduced DNA is high, but it may be a microorganism belonging to the genus Corynebacterium for the purpose of the present invention. Specifically, it may be, but is not limited to, Corynebacterium glutamicum.
본 발명은 또 하나의 양태로서, 상기 본 발명의 발현 카세트 또는 상기 시그널 펩타이드를 코딩하는 핵산 분자를 포함하는 벡터가 도입된, 코리네박테리움 속 미생물을 배지에서 배양하여 목적 단백질을 분비 생산하는 단계, 및 상기 분비 생산된 단백질을 상기 미생물 또는 배지로부터 회수하는 단계를 포함하는, 목적 단백질의 제조 방법을 제공한다. 본 발명에서 용어 "배양"은 미생물을 적당히 인공적으로 조절한 환경조건에서 생육시키는 것을 의미한다. 본 발명에서 코리네박테리움 속 미생물을 이용하여 목적 산물을 제조하는 방법은 당업계에 널리 알려져 있는 방법을 이용하여 수행할 수 있다. 구체적으로, 상기 배양은 배치 공정, 주입 배치 또는 반복 주입 배치 공정(fed batch or repeated fed batch process)에서 연속식으로 배양할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 구체적 예로, 유가식 배양을 통해 고농도 세포 배양일 수 있다.In another embodiment of the present invention, there is provided a method for producing a target protein by secretory production of a target protein by culturing the microorganism of the genus Corynebacterium to which the vector containing the expression cassette of the present invention or the nucleic acid molecule encoding the signal peptide is introduced, And recovering the secreted protein from the microorganism or culture medium. The term "cultivation" in the present invention means cultivation of microorganisms under moderately artificially controlled environmental conditions. In the present invention, a method for producing a target product using a microorganism belonging to the genus Corynebacterium can be carried out by a method well known in the art. Specifically, the culturing can be carried out continuously in a batch process, an injection batch, or a fed batch or repeated fed batch process, but is not limited thereto. As a specific example, it may be a high-concentration cell culture through fed-batch culture.
배양에 사용되는 배지는 적절한 방식으로 특정 균주의 요건을 충족해야 한다. 코리네박테리움 속 균주에 대한 배양 배지는 공지되어 있다 (예를 들면, Manual of Methods for General Bacteriology. American Society for Bacteriology. Washington D.C., USA, 1981). 사용될 수 있는 당원으로는 글루코즈, 수크로즈, 락토즈, 프락토즈, 말토즈, 전분, 셀룰로즈와 같은 당 및 탄수화물, 대두유, 해바라기유, 피마자유, 코코넛유 등과 같은 오일 및 지방, 팔미트산, 스테아린산, 리놀레산과 같은 지방산, 글리세롤, 에탄올과 같은 알코올, 글루콘산, 아세트산, 피루브산과 같은 유기산이 포함될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 이들 물질은 개별적으로 또는 혼합물로서 사용될 수 있다. 사용될 수 있는 질소원으로는 펩톤, 효모 추출물, 육즙, 맥아 추출물, 옥수수 침지액, 대두밀 및 요소 또는 무기 화합물, 예를 들면 황산 암모늄, 염화암모늄, 인산암모늄, 탄산암모늄 및 질산암모늄이 포함될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 질소원 또한 개별적으로 또는 혼합물로서 사용할 수 있다. 사용될 수 있는 인원으로는 인산이수소칼륨 또는 인산수소이칼륨 또는 상응하는 나트륨-함유 염이 포함될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 또한, 배양 배지는 성장에 필요한 황산마그네슘 또는 황산철과 같은 금속염을 함유할 수 있다. 마지막으로, 상기 물질에 더하여 아미노산 및 비타민과 같은 필수 성장 물질이 사용될 수 있다. 또한, 배양 배지에 적절한 전구체들이 사용될 수 있다. 상기된 원료들은 배양과정에서 배양물에 적절한 방식에 의해 회분식으로 또는 연속식으로 첨가될 수 있다. 이러한 다양한 배양 방법은 예를 들어 문헌 ("Biochemical Engineering" by James M. Lee, Prentice-Hall International Editions, pp 138-176)에 개시되어 있다.The medium used for the culture should meet the requirements of the particular strain in an appropriate manner. Culture media for Corynebacterium sp. Strains are known (see, for example, Manual of Methods for General Bacteriology, American Society for Bacteriology, Washington D.C., USA, 1981). Sugar sources that may be used include sugars and carbohydrates such as glucose, sucrose, lactose, fructose, maltose, starch and cellulose, oils and fats such as soybean oil, sunflower oil, castor oil, coconut oil and the like, palmitic acid, , Fatty acids such as linoleic acid, alcohols such as glycerol, ethanol, organic acids such as gluconic acid, acetic acid, and pyruvic acid, but are not limited thereto. These materials may be used individually or as a mixture. Examples of nitrogen sources that may be used include peptone, yeast extract, gravy, malt extract, corn steep liquor, soybean meal and urea or inorganic compounds such as ammonium sulfate, ammonium chloride, ammonium phosphate, ammonium carbonate and ammonium nitrate, But is not limited thereto. The nitrogen source may also be used individually or as a mixture. The number of people that can be used includes, but is not limited to, potassium dihydrogenphosphate or dipotassium hydrogenphosphate or the corresponding sodium-containing salts. In addition, the culture medium may contain a metal salt such as magnesium sulfate or iron sulfate necessary for growth. Finally, in addition to these materials, essential growth materials such as amino acids and vitamins can be used. In addition, suitable precursors may be used in the culture medium. The above-mentioned raw materials can be added to the culture in a batch manner or in a continuous manner by an appropriate method. Such a variety of cultivation methods are disclosed, for example, in "Biochemical Engineering" by James M. Lee, Prentice-Hall International Editions, pp 138-176.
수산화나트륨, 수산화칼륨, 암모니아와 같은 기초 화합물 또는 인산 또는 황산과 같은 산 화합물을 적절한 방식으로 사용하여 배양물의 pH를 조절할 수 있다. 또한, 지방산 폴리글리콜 에스테르와 같은 소포제를 사용하여 기포 생성을 억제할 수 있다. 호기 상태를 유지하기 위해 배양물 내로 산소 또는 산소-함유 기체 (예, 공기)를 주입할 수 있다. 배양물의 온도는 보통 20℃ 내지 45℃, 바람직하게는 25℃ 내지 40℃일 수 있으나, 조건에 따라 변경이 가능하나, 이에 제한되지 않는다.Basic compounds such as sodium hydroxide, potassium hydroxide, ammonia, or acid compounds such as phosphoric acid or sulfuric acid can be used in a suitable manner to adjust the pH of the culture. In addition, bubble formation can be suppressed by using a defoaming agent such as a fatty acid polyglycol ester. An oxygen or oxygen-containing gas (e.g., air) can be injected into the culture to maintain aerobic conditions. The temperature of the culture may be usually 20 ° C to 45 ° C, preferably 25 ° C to 40 ° C, but is not limited thereto.
본 발명의 목적 단백질 또는 목적 산물을 제조하는 방법은, 미생물 또는 배양물로부터 목적 단백질 또는 산물 회수하는 단계를 포함할 수 있으며, 미생물 또는 배양물로부터 목적 단백질 또는 산물을 회수하는 방법은 당업계에 알려진 방법, 예컨대 원심분리, 여과, 음이온 교환 크로마토그래피, 결정화 및 HPLC 등이 사용될 수 있으나, 이들 예에 한정되는 것은 아니다.A method for producing a target protein or a target product of the present invention may include recovering a target protein or a product from a microorganism or a culture and a method for recovering a target protein or product from the microorganism or culture is known in the art Methods such as centrifugation, filtration, anion exchange chromatography, crystallization and HPLC can be used, but the present invention is not limited to these examples.
상기 회수 단계는 정제 공정을 포함할 수 있으며, 당업자는 공지된 여러 정제 공정 중 필요에 따라 선택하여 활용할 수 있다.
The recovering step may include a purification step, and a person skilled in the art can select and utilize it according to the needs of various known purification processes.
본 발명에서 새롭게 개발한 단백질 분비 카세트, (즉, 재조합 단백질 분비 시스템)을 사용하면, 기존의 코리네박테리움 속 미생물에서 사용되던 유전자 발현 시스템에 비하여 훨씬 강한 유전자 발현 효과를 고농도 배양 조건에서 나타낼 수 있다. 이에 본 발명의 상기 재조합 단백질 분비 시스템이 도입된 코리네박테리움 속 미생물을 이용하면 목적 단백질을 보다 높은 수율로 생산할 수 있다.
Using the newly developed protein secretion cassette (i.e., a recombinant protein secretion system) of the present invention, a much stronger gene expression effect can be exhibited in a high concentration culture condition than in a gene expression system used in conventional Corynebacterium sp. Microorganisms have. Therefore, the target protein can be produced at a higher yield by using the Corynebacterium sp. Microorganism into which the recombinant protein secretion system of the present invention is introduced.
도 1은 프로모터 서열 하류에 시그널 펩타이드가 작동 가능하게 연결되고, 당해 서열 하류에 목적 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 단백질 분비 시스템의 모식도이다.
도 2는 본 발명을 위해 코리네박테리움 글루타미쿰의 유가식 배양을 통한 고농도 세포 배양 조건을 만들어준 도이다. 세포 성장은 검은 원, 포도당 농도는 하얀 원을 통해서 나타내었다.
도 3은 본 발명을 위해 코리네박테리움 글루타미쿰의 고농도 세포 배양 (high cell density culture) 조건에서의 분비 단백체 (Secretome)를 2DE (two-dimensional electrophoresis)를 통하여 분석한 도이다. 원으로 표시된 부분이 MALDI-TOF 분석을 통하여 Cgl1342 단백질로 식별된 단백질 spot 이다.
도 4는 도 3의 프로테옴 분석 (proteome analysis)을 통해 식별된 Cgl1342 단백질의 분비 여부를 확인하기 위해 SDS PAGE 분석한 도이다. 삼각형의 표식 부분의 위치는 시그널 펩타이드가 포함된 목적 단백질, 즉 시그널 펩타이드-Cgl1342을 표시하고 있다.
도 5는 cgl1342 유전자의 프로모터와 서열번호 1 또는 서열번호 2의 시그널 펩타이드을 포함하는 분비 시스템을 이용하여, 목적 단백질인 자일라나아제 (xylanase) 분비 여부를 분석한 도이다. (a)는 자일라나아제의 분비량을 SDS PAGE 분석을 통해 확인한 것이고, (b)는 자일라나아제 활성을 측정한 값 (Absorbance 550)을 표로 나타낸 것이다.
도 6은 cgl1342 유전자의 프로모터와 서열번호 2의 시그널 펩타이드를 사용한 단백질 분비 시스템에 의해 발현되는 자일라나아제를 생산하는 코리네박테리움 글루타미쿰 균주를 이용한 자일라나아제의 발효생산 결과를 나타낸 도이다. (a)는 발효에 따른 세포 성장 곡선과 배지 내의 포도당 농도를 나타낸 것이고 (세포 성장 곡선 :(●); 포도당 농도: (◇)), (b)는 시간별로 수득한 발효액의 SDS-PAGE 실험 결과를 나타낸 것이다.
도 7은 다양한 프로모터와 서열번호 1 또는 서열번호 2의 시그널 펩타이드(도면상 "SS"와 "SS1"으로 표기됨)를 포함하는 단백질 분비 시스템에 항체 단편 (single chain antibody variable region gene: scFv)을 목적 단백질로 하여 ELISA 분석을 통해 확인된 항체 단편의 활성 측정값 (Absorbance 450)을 그래프로 나타낸 것이다.
도 8은 문헌 보고된 단백질 분비 시스템과 본 발명에서 발굴된 단백질 분비시스템을 비교 분석한 도이다. (a)는 항체 단편 (scFv) 분비량을 SDS PAGE로 분석한 것이다. (b)는 ELISA 분석을 통해 확인된 항체 단편의 활성 측정값 (Absorbance 450)을 표로 나타낸 것이다.
도 9는 cgl1342 프로모터와 서열번호 2의 시그널 펩타이드를 사용한 분비 시스템에 의해 항체 단편을 생산하는 코리네박테리움 글루타미쿰 균주를 이용한 항체 단편의 발효생산 결과를 나타낸 도이다. (a)는 발효에 따른 세포 성장 곡선과 배지 내의 포도당 농도를 나타낸 것이고 (세포 성장 곡선 :(●); 포도당 (◇)), (b)는 시간별로 수득한 발효액의 Western blot 실험 결과를 나타낸 도이다.FIG. 1 is a schematic diagram of a protein secretion system in which a signal peptide is operably linked downstream of a promoter sequence and a gene encoding a target protein is downstream of the sequence.
FIG. 2 is a graph showing the conditions for culturing cells at a high concentration through fed-batch culture of Corynebacterium glutamicum for the present invention. Cell growth was expressed in black circles and glucose concentration in white circles.
FIG. 3 is a graph showing the secretory proteome (Secretome) of Corynebacterium glutamicum under high cell density culture conditions through 2DE (two-dimensional electrophoresis) analysis for the present invention. The circled portion is the protein spot identified as Cgl1342 protein through MALDI-TOF analysis.
FIG. 4 is an SDS PAGE analysis chart for confirming the secretion of Cgl1342 protein identified through proteome analysis of FIG. 3. FIG. The position of the marker portion of the triangle indicates the target protein containing the signal peptide, i.e., the signal peptide-Cgl1342.
FIG. 5 is a graph showing the secretion of a target protein, xylanase, using a secretion system comprising the cgl1342 gene promoter and the signal peptide of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2. (a) shows the amount of xylanase secreted by SDS PAGE analysis, and (b) shows the value obtained by measuring xylanase activity (Absorbance 550).
6 shows the results of production of xylalanase fermentation using a promoter of cgl1342 gene and a Corynebacterium glutamicum strain producing xylenase expressed by a protein secretion system using the signal peptide of SEQ ID NO: 2 . (a) shows the cell growth curve after fermentation and the glucose concentration in the medium (cell growth curve: (); glucose concentration: ()) and (b) shows the result of SDS- .
Figure 7 shows an example of a single chain antibody variable region gene (scFv) in a protein secretion system comprising various promoters and a signal peptide of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2 (denoted as "SS" and "SS1" (Absorbance 450) of the antibody fragments identified by ELISA analysis as the target protein.
8 is a comparative analysis of the protein secretion system disclosed in the literature and the protein secretion system discovered in the present invention. (a) is the analysis of the amount of the antibody fragment (scFv) secreted by SDS PAGE. (b) is a table showing the activity measurement value (Absorbance 450) of the antibody fragments identified through ELISA analysis.
9 is a diagram showing the results of fermentation of antibody fragments using Corynebacterium glutamicum strains producing antibody fragments by the secretion system using the cgl1342 promoter and the signal peptide of SEQ ID NO: 2. (a) shows the cell growth curve after fermentation and the glucose concentration in the medium (cell growth curve: (); glucose ()), and (b) shows the Western blot experiment result of the fermentation liquid obtained over time to be.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세하게 설명하기로 한다. 이들 실시예는 단지 본 발명을 예시하기 위한 것으로, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지는 않는다.
Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to Examples. These embodiments are only for illustrating the present invention, and the scope of the present invention is not construed as being limited by these embodiments.
실시예Example 1: One: 유가식Oil price formula 배양을 통한 Through culture 코리네박테리움Corynebacterium 글루타미쿰Glutamicum 고농도 세포배양 High cell culture
코리네박테리움 속 미생물 중 대표적인 예로, 코리네박테리움 글루타미쿰 야생형 ATCC13032 균주의 고농도 세포 배양 (high cell density culture)액을 획득하기 위해 5L 발효조 조건에서 유가식 배양 (fed-batch culture)을 실시하였다. ATCC13032 균주를 BHI (Brain Heart Infusion, Difco Laboratories) plate에 streaking 한 후 30℃ 인큐베이터에서 밤새 배양한 후 BHI 액체배지 50ml이 담긴 500ml baffle flask에 1 백금이 접종하여 30℃, 200rpm 조건에서 24시간 동안 배양하였다. 배양이 끝난 flask 배양액은 5L 발효를 위한 seed로 접종하였다. 5L 발효조 (BioCNS Co.) 운행조건은 하기 표 1와 같다.
As a representative example of Corynebacterium sp. Microorganisms, a fed-batch culture is carried out under 5 L fermentation conditions to obtain a high cell density culture solution of Corynebacterium glutamicum wild type ATCC13032 strain Respectively. The ATCC13032 strain was streaked on a BHI (Brain Heart Infusion, Difco Laboratories) plate and incubated overnight in a 30 ° C incubator. One platinum was inoculated into a 500 ml baffle flask containing 50 ml of BHI liquid medium and incubated at 30 ° C. and 200 rpm for 24 hours Respectively. The cultured flask culture was inoculated with seed for 5L fermentation. 5L fermenter (BioCNS Co.) Operating conditions are shown in Table 1 below.
pH: 7.0
shaking: 1,200rpmTemperature: 30 ℃
pH: 7.0
shaking: 1,200rpm
또한 배양 중 포도당 고갈을 방지하기 위하여 0.5%(w/v)이하로 포도당 농도가 떨어졌을 시 포도당액 (150ml 당 90g)을 추가로 투입하였다. 포도당 농도는 글루코스 분석기 (gluose analyzer, YSI 2700 SELECT Biochemistry Analyzer; YSI Life Sciencem Yellow Springs, OH, USA)을 통해 모니터링 하였다. 또한 세포성장은 spectrophotometer (Optizen POP; Mecasys, Daejeon, Korea)를 이용하여 OD (optical density) 600nm에서 실시간 측정하여 모니터링 하였다. 상기의 과정으로 진행된 코리네박테리움 글루타미쿰 야생형 ATCC13032 균주의 유가식 배양 그래프는 도 2에 나타내었다.In order to prevent depletion of glucose during the culture, when the glucose concentration was decreased to 0.5% (w / v) or less, glucose solution (90 g per 150 ml) was added. Glucose concentrations were monitored using a glucose analyzer (YSI 2700 SELECT Biochemistry Analyzer; YSI Life Science, Yellow Springs, OH, USA). Cell growth was monitored by measuring the optical density (OD) at 600 nm using a spectrophotometer (Optizen POP; Mecasys, Daejeon, Korea). FIG. 2 shows a flow diagram of a fed-batch culture of the Corynebacterium glutamicum wild-type ATCC13032 strain.
그 결과, 도 2에 나타낸 바와 같이 33시간 유가식 배양을 통해 OD600=180 수준의 고농도 세포 배양액을 획득하였다.
As a result, as shown in FIG. 2, a high-concentration cell culture medium having an OD 600 = 180 level was obtained through a 33-hour fed-batch culture.
실시예Example 2: 2 2: 2 DEDE ( ( twotwo -- dimensionaldimensional electrophoresis전공기 )를 통한 분비 단백질 (Secretome) 분석Secretory protein (Secretome) analysis
상기 실시예 1의 코리네박테리움 글루타미쿰 고농도 세포배양을 통해서 얻은 배양액 분석을 통해 고효율로 분비된 단백질을 탐색하고자 하였다.The present inventors have searched for a highly efficient protein secreted by culturing the Corynebacterium glutamicum cell cultured in Example 1 above.
이를 위하여 실시예 1에서 획득한 고농도 세포배양액 50ml을 취하여 원심분리(5000rpm, 15분)를 통해 상등액을 분리하였다. 분리된 상등액은 프로테옴 분석 (proteome analysis)을 위하여 2DE (two-dimensional electrophoresis)를 실시하였다. 2DE gel silver staining 통해서 가장 많은 비중을 차지하는 단백질 spot을 찾았다. 그 결과는 도 3에 나타내었다.
To this end, 50 ml of the high-concentration cell culture obtained in Example 1 was taken and the supernatant was separated by centrifugation (5000 rpm, 15 minutes). The separated supernatant was subjected to two-dimensional electrophoresis (2DE) for proteome analysis. 2DE gel silver staining. The results are shown in Fig.
실시예Example 3: 3: MALDIMALDI -- TOFTOF massmass spectrophotometer분광계 분석을 통한 고효율 분비 단백질 선별 High-efficiency secretory protein screening through analysis
상기 실시예 2의 2DE 결과 (도 3)에서 가장 많은 비중을 차지하는 단백질 spot을 선별하였다. 해당 단백질을 식별하기 위하여 단백질 spot을 포함하는 gel부위를 칼을 이용하여 도려낸 후 단백질을 분리하고 트립신 처리를 통해 펩타이드 형태로 분해하였다. 이후 MALDI (Matrix-assisted laser desorption/ionization)-TOF(time of flight)ㅡmass spectrophotometer 분석 기기를 이용한 peptide finger printing method으로 분리된 펩타이드 서열을 분석하였다. 상기의 방법으로 분석된 펩타이드 서열을 기반으로 NCBI에 공지된 코리네박테리움 글루타미쿰 야생형 ATCC13032의 전체 아미노산 서열과 상동성 분석을 시행하였다.Protein spots that occupied the largest portion in the 2DE results (Fig. 3) of Example 2 were selected. In order to identify the protein, the gel site containing the protein spot was cut off using a knife, and the protein was isolated and degraded into a peptide form by trypsin treatment. The peptide sequences were analyzed by peptide finger printing method using MALDI (Matrix-assisted laser desorption / ionization) -TOF (time of flight) mass spectrophotometer analyzer. Based on the peptide sequence analyzed by the above method, homology analysis with the entire amino acid sequence of Corynebacterium glutamicum wild type ATCC13032 known to NCBI was performed.
그 결과, 2DE gel 단백질 spot에서 분리된 단백질은 Cgl1342 (Accession No. BA000036, 서열번호 5) 단백질로 확인되었다. 상기 단백질, Cgl1342은 hypothetical protein으로 그 기능이 알려지지 않은 단백질이다.
As a result, the protein isolated from the 2DE gel protein spot was identified as Cgl1342 (Accession No. BA000036, SEQ ID NO: 5) protein. This protein, Cgl1342, is a hypothetical protein whose function is unknown.
실시예Example 4: 4: Cgl1342Cgl1342 단백질의 분비 여부 확인 Confirmation of protein secretion
상기 실시예 3에서 선별한 단백질인 Cgl1342 단백질이 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032의 발효 시 실제로 고효율로 분비되는지 여부를 확인하기 위해 Cgl1342 단백질의 자가 프로모터인 pCgl1342 (서열번호 6) 프로모터를 이용하여 발현하도록 하는 재조합 발현벡터 제작을 수행하였다.In order to confirm whether the Cgl1342 protein selected in Example 3 was actually secreted at high efficiency during fermentation of Corynebacterium glutamicum ATCC13032, the expression of pCgl1342 (SEQ ID NO: 6), which is a self-promoter of Cgl1342 protein, The recombinant expression vector was constructed.
ATCC13032 유래의 genomic DNA을 주형으로 하여 KpnI/EcoRV 절단부위를 포함하는 서열번호 8 및 서열번호 9를 프라이머로 이용하여 PCR[Sambrook et al, Molecular Cloning, a Laboratory Manual (1989), Cold Spring Harbor Laboratories]을 수행하였다. PCR 조건은 94℃에서 5분간 변성 후, 94℃ 30초 변성, 60℃ 30초 어닐링, 72℃ 90초 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 7분간 중합반응을 수행하였다.(1989), Cold Spring Harbor Laboratories) using primers of SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9 containing a KpnI / EcoRV cleavage site using a genomic DNA derived from ATCC13032 as a template and a PCR (Sambrook et al, Molecular Cloning, Respectively. The PCR conditions were denaturation at 94 ° C for 5 minutes, denaturation at 94 ° C for 30 seconds, annealing at 60 ° C for 30 seconds, and polymerization at 72 ° C for 90 seconds, and the polymerization reaction was carried out at 72 ° C for 7 minutes.
그 결과, 약 1.1Kb의 pCgl1342_SS_Cgl1342_his_tag 단편 (서열번호 7)을 수득하였다. 획득한 서열번호 7의 단편과 pCES208 vector를 제한효소 KpnI/EcoRV로 처리한 후 ligation을 수행하여 Cgl1342 단백질의 발현벡터를 제작하였다. 상기의 방법으로 제작된 재조합 발현벡터는 pCES208_pCgl1342_SS_Cgl1342으로 명명하였고, 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032에 전기펄스법 (Appl. Microbiol. Biothcenol.(1999) 52:541-545)으로 형질 전환한 후 카나마이신 (kanamycin) 25mg/L를 함유한 선별 배지에서 형질전환 균주를 획득하였고 이를 ATCC13032/pCES208_pCgl1342_SS_Cgl1342로 명명하였다.
As a result, a pCgl1342_SS_Cgl1342_his_tag fragment (SEQ ID NO: 7) of about 1.1 Kb was obtained. The obtained fragment of SEQ ID NO: 7 and the pCES208 vector were treated with restriction enzyme KpnI / EcoRV and ligation was performed to prepare an expression vector of Cgl1342 protein. The recombinant expression vector prepared by the above method was named pCES208_pCgl1342_SS_Cgl1342 and transformed into Corynebacterium glutamicum ATCC13032 by the electric pulse method (Appl. Microbiol. Biothcenol. (1999) 52: 541-545) kanamycin) 25 mg / L and obtained a transformant strain and named it ATCC13032 / pCES208_pCgl1342_SS_Cgl1342.
ATCC13032 야생형 균주에서 Cgl1342 단백질의 분비 여부를 확인하기 위하여, 상기에서 획득한 형질전환 균주 ATCC13032/pCES208_pCgl1342_SS_Cgl1342을 BHI plate에 streaking 하여 30℃에서 밤새 배양한 후, BHI 액체 배지 25ml이 담긴 250ml 코너-바플 플라스크에 1 백금이 접종하여, 48 시간 동안 30℃에서 200 rpm으로 진탕 배양하였다. 배양액으로부터 원심분리(5,000 rpm, 15분)를 통하여 상등액을 획득하고 Acetone precipitation으로 5배 농축한 샘플액 8 ㎕를 단백질 loading buffer와 현탁하여 SDS-PAGE를 수행하였다.
The ATCC13032 / pCES208_pCgl1342_SS_Cgl1342 transformant strain obtained above was streaked on a BHI plate and incubated overnight at 30 ° C in order to confirm the secretion of the Cgl1342 protein in the ATCC13032 wild-type strain. The resulting mixture was incubated overnight in a 250 ml Corner-Baffle flask containing 25 ml of BHI liquid medium One platinum was inoculated and shake cultured at 30 DEG C and 200 rpm for 48 hours. The supernatant was obtained from the culture supernatant by centrifugation (5,000 rpm, 15 minutes) and 8 μl of the sample solution, which had been concentrated 5 times by acetone precipitation, was suspended in the protein loading buffer and subjected to SDS-PAGE.
그 결과, 도 4의 1번 lane에서처럼 Cgl1342 단백질이 세포 밖으로 분비되는 것을 확인할 수 있었고, 그 배양액을 Talon metal affinity resin (Clontech, Mountain view, CA) 을 통하여 his-tag을 이용하여 정제한 결과, 도 4의 2번 lane에서처럼 농축된 분비 단백질로 재확인할 수 있었다.
As a result, it was confirmed that the Cgl1342 protein was secreted out of the cell as in the
이와 같은 결과는 본 발명에서 선별한 가상 단백질인 Cgl1342의 N-terminal 부위에 코리네박테리움 속 미생물에서 이용될 수 있는 분비 펩타이드인 시그널 펩타이드를 포함하고 있음을 시사하는 것이다.
These results suggest that the N-terminal region of Cgl1342, a virtual protein selected in the present invention, contains a signal peptide, which is a secretion peptide that can be used in microorganisms of the genus Corynebacterium.
실시예Example 5: 5: Cgl1342Cgl1342 시그널 signal 펩타이드Peptides ( ( signalsignal peptidepeptide ) 분리 및 이를 활용한 단백질 분비 시스템 구축Separation and construction of protein secretion system
상기 실시예 4에서 고순도로 수득한 Cgl1342 단백질에 대해서 N-terminal amino acid sequencing 분석을 진행하여 Cgl1342 단백질의 N-term을 구성하는 아미노산 서열을 확인하고자 하였다.N-terminal amino acid sequencing analysis of the Cgl1342 protein obtained in Example 4 in high purity was performed to confirm the amino acid sequence constituting the N-term of the Cgl1342 protein.
이에, 분비 단백질의 신호서열을 분석하는 Signal P software (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/) 프로그램을 이용하여 서열번호 1의 시그널 펩타이드 (signal peptide) 및 서열번호 1의 시그널 펩타이드를 코딩하는 서열번호 3의 시그널 시퀀스 (signal sequence)를 식별해낼 수 있었다.Thus, a signal peptide of SEQ ID NO: 1 and a signal peptide of SEQ ID NO: 1 using the Signal P software ( http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/ ) It was possible to identify the signal sequence of SEQ ID NO: 3 encoding the signal peptide.
한편, Cgl1342 시그널 펩타이드의 개량을 통한 발현량 증가를 확인하고자, 서열번호 3의 개시 코돈을 TTG에서 ATG로 치환하여, 서열번호 1의 시그널 펩타이드 내의 루이신 (Leucine, Leu, L)에서 메치오닌 (Methionine, Met, M)으로 전환하였다. 상기 개량된 시그널 펩타이드는 서열번호 2로 나타냈으며, 서열번호 2의 개량된 시그널 펩타이드를 코딩하는 개량된 시그널 시퀀스는 서열번호 4로 표시된다. 아울러, 서열번호 3의 시그널 시퀀스에 cgl1342 유전자 개시 코돈 앞쪽에 불어 있는 염기서열을 포함하는 서열을 서열번호 38로, 서열번호 4의 시그널 시퀀스에 cgl1342 유전자 개시 코돈 앞쪽에 붙어 있는 염기서열을 포함하는 서열을 서열번호 39로 표시하였다.
In order to confirm the increase in the expression level of the Cgl1342 signal peptide, methionine (Leucine, Leu, L) in the signal peptide of SEQ ID NO: 1 was substituted with ATG in the start codon of SEQ ID NO: , Met, M). Wherein the improved signal peptide is represented by SEQ ID NO: 2, and the improved signal sequence encoding the improved signal peptide of SEQ ID NO: 2 is represented by SEQ ID NO: The sequence comprising the nucleotide sequence upstream of the cgl1342 gene initiation codon is shown in SEQ ID NO: 38 in the signal sequence of SEQ ID NO: 3, the sequence including the nucleotide sequence preceding the cgl1342 gene initiation codon in the signal sequence of SEQ ID NO: Is shown in SEQ ID NO: 39.
이와 같은 본 발명에서 개발한 신규한 시그널 펩타이드 및 이를 코딩하는 시그널 시퀀스를 하기 표 2에 나타냈다.
The novel signal peptides developed in the present invention and the signal sequences coding the novel signal peptides are shown in Table 2 below.
펩타이드signal
Peptides
펩타이드signal
Peptides
시퀀스signal
시퀀스signal
실시예Example 6: 6: 자일라나아제Xylanase 분비 카세트 및 재조합 분비 생산 발현 벡터 제작 Production of Secretion Cassette and Recombinant Secretion Production Expression Vector
상기 실시예 5에서 분리 및 개량한 시그널 펩타이드를 이용하여 단백질 분비 시스템을 제작하고자 하였다. 이에, 프로모터 서열 하류에 서열번호 1 또는 2로 기재되는 아미노산 서열을 코딩하는 시그널 시퀀스가 작동 가능하게 연결되고, 당해 서열 하류에 목적 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 단백질 분비 카세트 (도 1) 및 이를 포함하는 재조합 발현벡터를 제작하고자 하였다.A protein secretion system was constructed using the signal peptide isolated and improved in Example 5 above. Thus, a signal sequence encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 2 is operably linked to the downstream of the promoter sequence, and a protein secretion cassette (FIG. 1) containing a gene encoding the desired protein downstream of the sequence and a To produce a recombinant expression vector.
이를 위해 코리네박테리움 글루타미쿰 야생형 ATCC13032 균주에서 항시 발현 되는 pGap 프로모터와 본 발명에서 식별한 pCgl1342 프로모터를 각각 사용하였고, 목적 유전자로는 자일라나아제 효소의 유전자인 xlnA을 이용하였다.For this purpose, the pGap promoter constantly expressed in the Corynebacterium glutamicum wild-type ATCC13032 strain and the pCgl1342 promoter identified in the present invention were used, respectively, and xlnA, a gene of xylanase enzyme, was used as a target gene.
구체적으로, pCES208 벡터를 주형으로 하여 서열번호 10 및 서열번호 11의 프라이머를 이용하여 PCR[Sambrook et al, Molecular Cloning, a Laboratory Manual (1989), Cold Spring Harbor Laboratories]을 수행하였다. PCR 조건은 94℃에서 5분간 변성 후, 94℃ 30초 변성, 55℃ 45초 어닐링, 72℃ 6분 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 7분간 중합반응을 수행하였다. 그 결과, 약 5.9kb의 벡터 단편을 획득하였다.Specifically, PCR was performed using the primers of SEQ ID NO: 10 and SEQ ID NO: 11 using the pCES208 vector as a template (Sambrook et al., Molecular Cloning, a Laboratory Manual (1989), Cold Spring Harbor Laboratories). The PCR conditions were denaturation at 94 ° C for 5 minutes, followed by denaturation at 94 ° C for 30 seconds, annealing at 55 ° C for 45 seconds, and polymerization at 72 ° C for 6 minutes. The polymerisation reaction was carried out at 72 ° C for 7 minutes. As a result, a vector fragment of about 5.9 kb was obtained.
그리고 실시예 4를 통해 제작한 pCES208_pCgl1342_SS_Cgl1342 벡터를 주형으로 서열번호 12와 서열번호 13 프라이머로, Streptomyces coelicolor A3 genomic DNA을 주형으로 하여 서열번호 14 및 서열번호 15 프라이머를 이용하여 PCR을 수행하였다. PCR 조건은 94℃에서 5분간 변성 후, 94℃ 30초 변성, 55℃ 45초 어닐링, 72℃ 90초 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 7분간 중합반응을 수행하였다. 그 결과, 각각 약 0.4kb의 pCgl1342 프로모터_시그널시퀀스 (서열번호 38) 단편과 1.3kb의 xlnA 유전자 단편을 획득하였다. 상기의 방법을 통해 획득한 벡터 단편과 각각의 insert들은 PCR purification kit (Solgent. co)를 이용하여 정제한 후 Gibson Assembly Master Mix (NEB #2611, Gibson, D.G. et al. (2010) Nature Methods, 901-903)가 포함된 PCR tube에 각각 섞은 후 50℃, 1시간 반응으로 ligation을 수행하여 pCgl1342_SS_XlnA_his_tag 분비카세트(서열번호 16)가 포함된 재조합 발현벡터를 제작하였다. 이는 pCES208_pCgl1342_SS_XlnA 벡터로 명명하였다.The pCES208_pCgl1342_SS_Cgl1342 vector prepared in Example 4 was used as a template as a primer of SEQ ID NO: 12 and SEQ ID NO: 13, and Streptomyces PCR was carried out using primers of SEQ ID NO: 14 and SEQ ID NO: 15 using coelicolor A3 genomic DNA as a template. The PCR conditions were denaturation at 94 ° C. for 5 minutes, denaturation at 94 ° C. for 30 seconds, annealing at 55 ° C. for 45 seconds, and polymerization at 72 ° C. for 90 seconds, and the polymerization reaction was carried out at 72 ° C. for 7 minutes. As a result, a pCgl1342 promoter_signal sequence (SEQ ID NO: 38) fragment of about 0.4 kb and an xlnA gene fragment of 1.3 kb were obtained, respectively. The vector fragments and inserts obtained by the above method were purified using a PCR purification kit (Solgent. Co), and then purified using Gibson Assembly Master Mix (NEB # 2611, Gibson, DG et al. -903), followed by ligation at 50 < [deg.] ≫ C for 1 hour to prepare a recombinant expression vector containing the pCgl1342_SS_XlnA_his_tag secretion cassette (SEQ ID NO: 16). It was named pCES208_pCgl1342_SS_XlnA vector.
또한, 서열번호 2의 개량된 시그널 펩타이드를 포함하는 분비시스템을 제작하기 위하여, pCES208_pCgl1342_SS_XlnA 벡터를 주형으로 하여 서열번호 17 및 서열번호 18 프라이머를 이용하여 site-direct mutagenesis PCR을 수행하여 pCgl1342_SS1_XlnA_his_tag 분비카세트 (서열번호 19)를 포함하는 pCES208_pCgl1342_SS1_XlnA으로 명명된 재조합 발현 벡터를 제작하였다.
In order to prepare a secretion system containing the improved signal peptide of SEQ ID NO: 2, site-direct mutagenesis PCR was performed using the pCES208_pCgl1342_SS_XlnA vector as a template and SEQ ID NO: 17 and SEQ ID NO: 18 primers to generate pCgl1342_SS1_XlnA_his_tag secretion cassette ≪ / RTI > No. 19) was constructed.
또한, Cgl1342 시그널 펩타이드 (서열번호 1 또는 서열번호 2) 단독 영향으로 미생물 체외로의 단백질 분비 가능 여부를 확인하기 위해 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032균주에서 Cgl1342 단백질을 발현하고 있는 자가 프로모터인 pCgl1342 프로모터를 ATCC13032 균주에서 항시 발현된다고 알려진 pGapA 프로모터로 치환하여 단백질 분비 여부를 확인하고자 하였다. 이에 pCES208_pCgl1342_SS_XlnA 벡터를 주형으로 하여 서열번호 10 및 서열번호 22 프라이머를 이용하여 상기와 동일한 PCR을 수행하여 약 7.4kb의 벡터 단편을 획득하였다. 또한 ATCC13032 genomic DNA을 주형으로 하여 서열번호 20 및 서열번호 21을 프라이머를 이용하여 PCR을 수행해 0.4kb pGapA 프로모터 단편을 획득하였다. 각각의 단편들은 정제한 후 상기의 Gibson Assembly Master Mix 방법을 통해 ligation하여 pGapA_SS_XlnA_his_tag 분비카세트가 포함된 pCES208_pGapA_SS_XlnA으로 명명된 재조합 발현벡터를 제작하였다.
In order to confirm the possibility of protein secretion outside the microorganism by the influence of the Cgl1342 signal peptide (SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2) alone, the pCgl1342 promoter, which is a self-promoter expressing Cgl1342 protein in Corynebacterium glutamicum ATCC13032 strain, Was replaced with the pGapA promoter known to be always expressed in the ATCC13032 strain to confirm the secretion of the protein. The same PCR as above was carried out using the pCES208_pCgl1342_SS_XlnA vector as a template and primers of SEQ ID NO: 10 and SEQ ID NO: 22 to obtain a vector fragment of about 7.4 kb. In addition, PCR was performed using primers of SEQ ID NO: 20 and SEQ ID NO: 21 using ATCC13032 genomic DNA as a template and a 0.4 kb pGapA promoter fragment was obtained. Each fragment was purified and ligated through the Gibson Assembly Master Mix method to produce a recombinant expression vector named pCES208_pGapA_SS_XlnA containing the pGapA_SS_XlnA_his_tag secretion cassette.
실시예Example 7: 7: Cg11342Cg11342 분비 시스템을 통한 Through the secretion system 자일라나아제의Xylanase 분비 생산 확인 Secretion production confirmation
상기 실시예 6에서 제작된 Cgl1342 시그널 펩타이드를 포함한 단백질 분비카세트를 이용한 자일라나아제의 분비 생산여부를 확인하기 위하여, 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032에 pCES208, pCES208_pGapA_SS_XlnA, pCES208_pCgl1342_SS_XlnA, pCES208_pCgl1342_SS1_XlnA벡터를 전기펄스법 (Appl. Microbiol. Biothcenol.(1999) 52:541-545)으로 각각 형질 전환한 후, 카나마이신(kanamycin) 25mg/L를 함유한 선별배지에서 형질 전환 균주를 획득하였다. . 이 중 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032에 pCES208_pCgl1342_SS_XlnA를 CA05-5009로 명명하고, 해당 균주를 2015년 2월 2일 한국종균협회에 기탁하고 KCCM11666P의 기탁번호를 부여받았다. 이는 실시예 4와 동일한 방법으로 진탕 배양 한 후 상등액만 분리하여 SDS_PAGE을 통해 자일라나아제 단백질의 분비 생산을 확인하고자 하였다.
PCES208_pGapA_SS_XlnA, pCES208_pCgl1342_SS_XlnA, pCES208_pCgl1342_SS1_XlnA, and pCES208_pCgl1342_SS1_XlnA vectors were added to Corynebacterium glutamicum ATCC13032 using electric pulse method to confirm secretory production of xylanase using a protein secretion cassette containing the Cgl1342 signal peptide prepared in Example 6 (Appl. Microbiol. Biothcenol. (1999) 52: 541-545), and transformants were obtained in a selection medium containing 25 mg / L of kanamycin. . Among them, pCES208_pCgl1342_SS_XlnA was named as CA05-5009 in Corynebacterium glutamicum ATCC13032, and the corresponding strain was deposited with Korean Society of Bacterial Kidney on February 2, 2015, and it was given the deposit number of KCCM11666P. After shake culturing in the same manner as in Example 4, only the supernatant was separated to confirm secretory production of xylanase protein through SDS_PAGE.
그 결과, 도 5-a에서 확인할 수 있듯이, 본 발명에서 새롭게 분리한 시그널 펩타이드 (서열번호 1)를 가지는 분비카세트를 이용하여, XlnA 단백질이 코리네박테리아 세포 밖으로 분비되어 배양 상등액에서 식별되는 것을 확인하였다. 또한 개시 코돈을 TTG에서 ATG로 치환한 개량된 시그널 펩타이드 (서열번호 2)를 이용한 분비시스템에서도 XlnA 단백질 분비량이 증가하는 것을 확인하였다.As a result, as shown in FIG. 5-a, using the secretion cassette having the signal peptide newly isolated in the present invention (SEQ ID NO: 1), it was confirmed that the XlnA protein was secreted outside the Corynebacterium cell and identified in the culture supernatant Respectively. It was also confirmed that the amount of XlnA protein secretion was also increased in the secretion system using the modified signal peptide (SEQ ID NO: 2) in which the initiation codon was substituted with ATG in TTG.
구체적으로 자일라나아제 효소 활성을 측정하기 위하여 550nm에서의 흡광도를 측정하였다.Specifically, the absorbance at 550 nm was measured to measure the activity of xylanase enzyme.
그 결과, 도 5-b에 나타낸 바와 같이, SDS_PAGE에서 확인했던 XlnA 단백질의 분비된 량과 일치하는 패턴을 보였다 (도 5-b). 또한 pCgl1342 프로모터를 pGapA 프로모터로 치환하였을 시 pCgl1342 프로모터 대비 분비량이 적었지만 pGapA 프로모터를 이용하였을 시에도 XlnA 단백질이 세포 체외로 분비되어 본 발명에서 발굴한 시그널 펩타이드의 단독 효과에 의한 분비 효과를 확인하였다.
As a result, as shown in Fig. 5-b, a pattern consistent with the secreted amount of the XlnA protein confirmed in SDS_PAGE was shown (Fig. 5-b). In addition, when the pCgl1342 promoter was replaced with the pGapA promoter, the amount of secretion relative to the pCgl1342 promoter was small. However, even when the pGapA promoter was used, the XlnA protein was secreted outside the cell and the secretion effect by the single effect of the signal peptide extracted in the present invention was confirmed.
이와 같은 결과들은 본 발명에서 새롭게 개발한 분비 펩타이드인 서열번호 1 및 2가 그 유래 프로모터과 관계 없이, 다양한 프로모터에 작동 가능하게 연결되어, 분비 펩타이드로서 작동하는 것을 시사하는 것이다.
These results suggest that the secretion peptides of SEQ ID NOS: 1 and 2, which are newly developed in the present invention, are operatively linked to various promoters regardless of the promoter derived therefrom and function as secretory peptides.
실시예Example 8: 8: Cgl1342Cgl1342 분비 시스템을 통한 Through the secretion system 자일라나아제의Xylanase 대량 분비 생산 Mass production
본 발명에서 개발한 분비 생산 시스템을 자일라나아제의 대량 분비 생산에 적용하고자 유가식 배양을 진행하였다. 자일라나아제 대량 생산 배양을 위해, 실시예 7에서 가장 많은 XlnA 단백질을 분비한 ATCC13032/pCES208_pCgl1342_SS1_XlnA 균주를 이용하였고, 배양 조건은 실시예 1에서 수행한 5L 발효조 운행 조건과 동일하게 수행하였다.In order to apply the secretion production system developed in the present invention to mass production of xylanase, feed-type culture was carried out. For the mass production of xylanase, the ATCC13032 / pCES208_pCgl1342_SS1_XlnA strain which secreted the greatest amount of XlnA protein in Example 7 was used and the culturing conditions were the same as the operating conditions of the 5L fermenter performed in Example 1. [
그 결과 도 6-a에서 보듯이, 최종 33시간 배양, OD600=130 이상의 고농도 세포 배양액을 확보하였고, 각 배양 시간대별로 XlnA 단백질 분비량 역시 세포 성장이 증가함에 따라 증가하는 패턴을 확인하였다 (도 6-b). 또한 Bradford 기법을 통해 분비된 XlnA 단백질 량을 측정하였을 시, 그 농도는 최대 1.06g/L에 다다랐고, 이 수치는 기존에 문헌에 공지된 (Yim SS, An SJ, Kang M, Lee J, Jeong KJ. 2013. Isolation of fully synthetic promoters for high-level gene expression in Corynebacterium glutamicum. Biotechnol Bioeng 110(11):2959-2971.) 코리네박테리움 글루타미쿰에서 자일라나아제를 분비 생산한 746 mg/L 수치보다 40% 이상 증가한 수치로, 본 발명에서 구축한 분비 생산 시스템이 고농도 세포배양 조건에서 목적 단백질을 대량 분비 생산할 수 있는 시스템임을 확인할 수 있었다.
As a result, as shown in FIG. 6-a, a high-concentration cell culture solution having a final culture time of 33 hours or OD600 = 130 or more was obtained, and the amount of XlnA protein secretion was also increased with increasing cell growth in each culture time period b). When the amount of XlnA protein secreted by the Bradford method was measured, its concentration reached a maximum of 1.06 g / L, and this value was measured by the method of Yim SS, An SJ, Kang M, Lee J, Jeong KJ. 2013. Isolation of fully synthetic promoters for high-level gene expression in Corynebacterium glutamicum . Biotechnol Bioeng 110 (11): 2959-2971.) A 40% increase over the 746 mg / L level secreted by xylenase in Corynebacterium glutamicum, the secretory production system constructed in this invention has a high concentration It was confirmed that this system is capable of mass production of target protein under cell culture conditions.
실시예Example 9: 9: 항체단편Antibody fragment (( scFvscFv ) 분비 카세트 및 재조합 발현 벡터 제작) Secretion cassette and recombinant expression vector production
자일라나아제 이외의 다른 효소의 분비가 가능한지 여부를 확인하기 위해서 최근 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032 균주에서 분비 생산이 가능하다고 보고된 (SS Yim et al; Appl Microbiol Biotechnol (2014) 98:273-284), scFv (single-chain variable fragment)으로 명명된 항체 단편 (antibody fragment)을 목적 단백질로 하여 본 발명에서 구축한 분비시스템을 적용하고자 하였다. 또한 Cgl1342 시그널 펩타이드 (서열번호 1 또는 서열번호 2)에 의한 단독 분비 효과임을 재 검증하고자 pCgl1342 프로모터 외에 코리네박테리움 글루타미쿰에서 항시 발현된다고 알려져 있는 pTrc, pTuf, pTac, pSod, pGapA 프로모터 서열 하류에 Cgl1342 시그널 펩타이드가 작동할 수 있게 연결하여 scFv 항체 단편의 분비 여부를 확인하고자 하였다.(SS Yim et al; Appl Microbiol Biotechnol (2014) 98: 273-7) reported that secretory production was possible in Corynebacterium glutamicum ATCC13032 strain in order to confirm whether or not the secretion of enzymes other than xylanase was possible. 284), a secretion system constructed in accordance with the present invention was applied using an antibody fragment named scFv (single-chain variable fragment) as a target protein. PTac, pSod, and pGapA promoters known to be constantly expressed in Corynebacterium glutamicum in addition to the pCgl1342 promoter, in order to revalidate the effect of Cgl1342 signal peptide (SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2) To confirm the secretion of the scFv antibody fragment by ligating the Cgl1342 signal peptide so as to be operable.
이에 실시예 6에서 제작한 pCES208_pCgl1342_SS_XlnA 벡터를 주형으로 하여 서열번호 11 및 서열번호 24의 프라이머를 이용하여 PCR[Sambrook et al, Molecular Cloning, a Laboratory Manual (1989), Cold Spring Harbor Laboratories]을 수행하였다. PCR 조건은 94 ℃에서 5분간 변성 후, 94℃ 30초 변성, 55℃ 45초 어닐링, 72℃ 7분 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 7분간 중합반응을 수행하였다. 그 결과, 약 6.4kb의 pCgl1342 프로모터와 시그널 시퀀스 (서열번호 38)을 포함하는 벡터 단편을 획득하였다.PCR was carried out using the primers of SEQ ID NO: 11 and SEQ ID NO: 24 using the pCES208_pCgl1342_SS_XlnA vector prepared in Example 6 as a template (Sambrook et al., Molecular Cloning, a Laboratory Manual (1989), Cold Spring Harbor Laboratories). The PCR conditions were denatured at 94 ° C for 5 minutes, followed by denaturation at 94 ° C for 30 seconds, annealing at 55 ° C for 45 seconds, and polymerization at 72 ° C for 7 minutes. The reaction was carried out at 72 ° C for 7 minutes. As a result, a vector fragment containing about 6.4 kb of the pCgl1342 promoter and the signal sequence (SEQ ID NO: 38) was obtained.
그리고 문헌에 공지된 바에 따라 제작된 pH36M2 벡터 (SS Yim et al; Appl Microbiol Biotechnol (2014) 98:273-284, Table 1 참조)를 주형으로 하여, 서열번호 25 및 서열번호 26 프라이머을 이용하여 PCR을 수행하였다. PCR 조건은 94℃에서 5분간 변성 후, 94℃ 30초 변성, 55℃ 45초 어닐링, 72℃ 90초 중합을 30회 반복한 후, 72℃에서 7분간 중합반응을 수행하였다. 그 결과, 약 0.7kb의 M18 scFv유전자 단편을 획득하였다.PCR was carried out using the primers of SEQ ID NO: 25 and SEQ ID NO: 26 using the pH36M2 vector (SS Yim et al; Appl Microbiol Biotechnol (2014) 98: 273-284, Respectively. The PCR conditions were denaturation at 94 ° C for 5 minutes, denaturation at 94 ° C for 30 seconds, annealing at 55 ° C for 45 seconds, and polymerization at 72 ° C for 90 seconds, and the polymerization reaction was carried out at 72 ° C for 7 minutes. As a result, an M18 scFv gene fragment of about 0.7 kb was obtained.
상기의 방법을 통해 획득한 벡터 단편과 M18 scFv 유전자 단편은 PCR purification kit (Solgent. co)를 이용하여 정제한 후, Gibson Assembly Master Mix (NEB #2611, Gibson, D.G. et al. (2010) Nature Methods, 901-903)가 포함된 PCR tube에 각각 섞은 후 50℃, 1시간 반응으로 ligation을 수행하여 pCgl1342_SS_scFv_flag_tag 분비카세트(서열번호 27)가 포함된 재조합 발현벡터를 제작하였고 이를 pCES208_pCgl1342_SS_scFv 벡터로 명명하였다. 또한 개량된 시그널 펩타이드를 포함하는 벡터 제작을 위해, pCES208_pCgl1342_SS_scFv 벡터를 주형으로 하여 서열번호 17 및 서열번호 18 프라이머를 이용하여 site-direct mutagenesis PCR을 수행하여 pCgl1342_SS1_scFv_flag_tag 분비카세트(서열번호 28)를 포함하는 pCES208_pCgl1342_SS1_scFv으로 명명된 재조합 발현 벡터를 제작하였다.The vector fragments and the M18 scFv gene fragments obtained by the above method were purified using a PCR purification kit (Solgent. Co) and then purified using a Gibson Assembly Master Mix (NEB # 2611, Gibson, DG et al. , 901-903), followed by ligation at 50 ° C for 1 hour to construct a recombinant expression vector containing the pCgl1342_SS_scFv_flag_tag secretion cassette (SEQ ID NO: 27), which was named pCES208_pCgl1342_SS_scFv vector. Site-directed mutagenesis PCR was performed using the pCES208_pCgl1342_SS_scFv vector as a template and the primers of SEQ ID NO: 17 and SEQ ID NO: 18 to construct a vector containing the improved signal peptide, thereby obtaining pCES208_pCgl1342_SS1_scFv (SEQ ID NO: 28) containing the pCGL1342_SS1_scFv_flag_tag secretion cassette Was constructed.
다양한 프로모터로 치환하여 Cgl1342 시그널 시퀀스(서열번호 38)와 scFv 목적 유전자를 발현시키기 위하여 하기 표 3에 나타낸 프라이머 조합을 이용하여 상기의 pCES208_pCgl1342_SS_scFv벡터를 주형으로 하여 동일한 클로닝 방법으로 pCES208_pTrc_SS_scFv, pCES208_pTac_SS_scFv, pCES208_pTuf_SS_scFv, pCES208_pSod_SS_scFv, pCES208_pGapA_SS_scFv으로 명명된 재조합 발현 벡터를 제작하였다.
PCES208_pTrc_SS_scFv, pCES208_pTac_SS_scFv, pCES208_pTuf_SS_scFv, pCES208_pSod_SS_scFv, pCES208_pSod_SS_scFv, and pCES208_pSad_SS_scFv were constructed by using the above-described pCES208_pCgl1342_SS_scFv vector as a template using the primer combinations shown in Table 3 below in order to express the Cgl1342 signal sequence (SEQ ID NO: 38) , a recombinant expression vector named pCES208_pGapA_SS_scFv was constructed.
상기 실시예 들에서 사용된 프라이머 서열을 하기 표 4에 나타냈다.
The primer sequences used in the above examples are shown in Table 4 below.
실시예Example 10: 10: Cgl1342Cgl1342 분비 시스템을 이용한 항체 단편( Antibody fragments using secretion system ( scFvscFv ) 분비 생산 확인) Secretion production confirmation
상기 실시예 9에서 제작된 Cgl1342 시그널 펩타이드를 포함한 단백질 분비카세트를 이용한 항체 단편(scFv)의 분비 생산 여부를 확인하기 위하여, 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032에 pCES208, pCES208_pCgl1342_SS_scFv, pCES208_pCgl1342_SS1_scFv, pCES208_pTrc_SS_scFv, pCES208_pTac_SS_scFv, pCES208_pTuf_SS_scFv, pCES208_pSod_SS_scFv, pCES208_pGapA_SS_scFv 벡터를 전기펄스법 (Appl. Microbiol. Biothcenol.(1999) 52:541-545)으로 각각 형질 전환한 후 카나마이신(kanamycin) 25mg/L를 함유한 선별 배지에서 형질 전환 균주를 획득하였다.PCES208_pCgl1342_SS_scFv, pCES208_pCgl1342_SS1_scFv, pCES208_pTrc_SS_scFv, pCES208_pTac_SS_scFv, and pCES208_pTac_SS_scFv were added to Corynebacterium glutamicum ATCC13032 to confirm secretory production of the antibody fragment (scFv) using the protein secretion cassette containing the Cgl1342 signal peptide prepared in Example 9, pCES208_pTud_SS_scFv, pCES208_pSod_SS_scFv and pCES208_pGapA_SS_scFv vectors were transformed with the electric pulse method (Appl. Microbiol. Biothcenol. (1999) 52: 541-545) and then obtained transformant strains in a selection medium containing 25 mg / L of kanamycin Respectively.
이는 실시예 4와 동일한 방법으로 진탕 배양 한 후 상등액만 분리하여, ELISA(enzyme-linked immunosorbent assay) 분석을 통해 항체 단편(scFv)의 분비 여부를 확인하였다.
After shake-culturing in the same manner as in Example 4, only the supernatant was separated and the secretion of the antibody fragment (scFv) was confirmed by ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) analysis.
그 결과, 도 7의 결과에서 보듯이, 본 발명의 분비 시스템을 이용하여 코리네박테리움 글루타미쿰 ATCC13032 균주에서 항체 단편(scFv) 또한 세포 밖으로 분비되어 활성을 나타내는 것을 확인하였다. 또한 프로모터에 의한 분비량 차이는 있었으나, 본 발명에서 식별한 Cgl1342 시그널 펩타이드 (서열번호 1 또는 서열번호 2)에 의한 단독 효과로 목적 단백질을 분비할 수 있음을 확인하였다.
As a result, as shown in the results of FIG. 7, it was confirmed that the antibody fragment (scFv) was also secreted out of the cell in the Corynebacterium glutamicum ATCC13032 strain using the secretion system of the present invention. In addition, although there was a difference in the secretion amount by the promoter, it was confirmed that the target protein could be secreted by the single effect by the Cgl1342 signal peptide (SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 2) identified in the present invention.
실시예Example 11: 11: Cgl1342Cgl1342 분비 시스템을 이용한 항체 단편( Antibody fragments using secretion system ( scFvscFv ) 대량 분비 생산Production of mass secretion
기존의 코리네박테리움 글루타미쿰에서 항체 단편을 가장 많이 생산했었던 시스템인 H36 합성 프로모터와 porB 유전자의 신호서열 조합의 시스템인 pH36M2 벡터 (SS Yim et al; Appl Microbiol Biotechnol (2014) 98:273-284) 와 본 발명의 Cgl1342 분비 발현 시스템을 비교 분석하고자 하였다. 이에 실시예 10과 동일한 방법으로 pH36M2 벡터와 pCES208_pCgl1342_SS1_scFv 벡터가 도입된 균주들을 각각 배양하여 항체 단편(scFv) 분비량을 비교하였다.
(HS Yim et al; Appl Microbiol Biotechnol (2014) 98: 273-7) which is a system of the signal sequence combination of the porB gene and the H36 synthetic promoter, which is the system that produced the most antibody fragment in the existing Corynebacterium glutamicum, 284) and the Cgl1342 secretion expression system of the present invention. The strains harboring the pH36M2 vector and the pCES208_pCgl1342_SS1_scFv vector were cultured in the same manner as in Example 10 to compare the amount of scFv secreted.
그 결과, 도 8의 a의 SDS-PAGE 분석 결과와 8의 b의 활성측정 결과에서 보듯이, 플라스크 배양을 통해서는 두 분비 시스템에 의한 항체 단편(scFv) 분비 정도가 거의 차이가 나지 않았다. 하지만 본 발명의 Cgl1342 분비 발현시스템을 함유하는 코리네박테리움 글루타미쿰을 유가식 배양을 수행하여 항체 단편의 대량 생산을 시도하였을 때에는 도 9에서 보다시피 과량의 항체 단편을 분비 생산할 수 있었다. 이 수치는 대략 100 mg/L로 기존 코리네박테리움 글루타미쿰에서 가장 많은 양의 항체 단편을 생산한 H36 합성 프로모터와 porB 유전자 신호서열 조합의 분비 시스템의 68 mg/L의 기록보다 40%이상 증가한 수치이다 (SS Yim et al; Appl Microbiol Biotechnol (2014) 98:273-284). 이에 본 발명에서 구축한 Cgl1342 분비시스템을 이용하는 경우, 코리네박테리움 속 미생물의 고농도 세포 배양을 통해서 자일라나아제 및 항체 단편의 목적 단백질의 대량 분비 생산이 가능함을 재확인하였다.
As a result, as shown in the result of SDS-PAGE analysis of FIG. 8A and the activity measurement of 8B, there was almost no difference in the degree of secretion of the antibody fragment (scFv) by the two secretion system through the flask culture. However, when Corynebacterium glutamicum containing the Cgl1342 secretion expression system of the present invention was subjected to oil-bed culturing and mass production of the antibody fragment was attempted, it was possible to secrete an excess of the antibody fragment as seen in FIG. This value is approximately 100 mg / L, which is more than 40% higher than the 68 mg / L of the secretion system of the H36 synthetic promoter and the porB gene signal sequence which produced the largest amount of antibody fragments in the conventional Corynebacterium glutamicum. (SS Yim et al; Appl Microbiol Biotechnol (2014) 98: 273-284). Thus, when the Cgl1342 secretion system constructed in the present invention was used, it was confirmed that mass production of target proteins of xylanase and antibody fragments was possible through high-concentration cell culture of Corynebacterium sp. Microorganism.
상기와 같은 결과들은 본 발명에서 새롭게 개발한 분비 펩타이드인 서열번호 1의 분비 펩타이드 및 이의 개량체인 서열번호 2의 분비 펩타이드가 이에 작동 가능하게 연결되는 프로모터 및 목적 단백질에 상관없이, 분비 펩타이드에 의해 코리네박테리움 속 미생물 내에서 목적 단백질의 분비 생산을 증가시키는 것을 시사하는 것이다. 또한, 코리네박테리움 속 미생물의 고농도 세포 배양의 경우, 기존 분비 시스템에 비해 본 발명의 상기 분비 펩타이드들을 포함하는 분비 시스템이 획기적으로 목적 단백질의 분비를 증가시켜 목적 단백질의 대량 생산에 유효함을 시사하는 것이다.
The above results show that the secretory peptide of SEQ ID NO: 1 and the secretory peptide of SEQ ID NO: 2, which are newly developed secretory peptides of the present invention, can be activated by secretory peptides, regardless of the promoter and target protein operatively linked thereto, Suggesting that the secretory production of the target protein is increased in the four microorganisms of the genus Bacterium. In addition, in the case of high-concentration cell culture of Corynebacterium genus microorganisms, the secretion system comprising the secretory peptides of the present invention significantly increases the secretion of the target protein and is thus effective for the mass production of the target protein It is suggestive.
이상의 설명으로부터, 본 발명이 속하는 기술분야의 당업자는 본 발명이 그 기술적 사상이나 필수적 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 실시될 수 있다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 이와 관련하여, 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적인 것이 아닌 것으로 이해해야만 한다. 본 발명의 범위는 상기 상세한 설명보다는 후술하는 특허 청구범위의 의미 및 범위 그리고 그 등가 개념으로부터 도출되는 모든 변경 또는 변형된 형태가 본 발명의 범위에 포함되는 것으로 해석되어야 한다.
From the above description, it will be understood by those skilled in the art that the present invention may be embodied in other specific forms without departing from the spirit or essential characteristics thereof. In this regard, it should be understood that the embodiments described above are illustrative in all aspects and not restrictive. The scope of the present invention should be construed as being included in the scope of the present invention without departing from the scope of the present invention as defined by the appended claims.
<110> CJ CheilJedang Corporation Korea Advanced Institute of Science and Technology <120> KPA150069-KR <130> A novel expression cassette for secretion of protein <160> 39 <170> KopatentIn 2.0 <210> 1 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Cgl1342 signal peptide <400> 1 Leu Leu Asn Arg Val Ser Arg Ile Ala Gly Ala Ser Ala Ile 1 5 10 <210> 2 <211> 14 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Cgl1342 signal peptide (L->M) <400> 2 Met Leu Asn Arg Val Ser Arg Ile Ala Gly Ala Ser Ala Ile 1 5 10 <210> 3 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cgl1342 signal sequence <400> 3 ttgttaaaca gagtcagtcg tattgcaggc gcttctgcaa tc 42 <210> 4 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Cgl1342 signal sequence (TTG->ATG) <400> 4 atgttaaaca gagtcagtcg tattgcaggc gcttctgcaa tc 42 <210> 5 <211> 250 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Cgl1342 <400> 5 Leu Leu Asn Arg Val Ser Arg Ile Ala Gly Ala Ser Ala Ile Thr Leu 1 5 10 15 Cys Ile Gly Leu Thr Thr Ile Leu Ser Pro Thr Ser Thr Ala Gln Ser 20 25 30 Leu Glu Gln Ile Thr Pro Leu Pro Glu Ser Ala Ile Asp Leu Asn Ala 35 40 45 Glu Ile His Val Asn Thr Ser Asp Ile Ser Ala Glu Gln Ile Leu Gly 50 55 60 Ala Gln Asp Glu Ile Thr Thr Met Tyr Asp Ser His Asp Pro Tyr Glu 65 70 75 80 Tyr Phe Asp Thr Leu Thr Asp Ile Glu Gln Arg Ser Ile Ile Ala Ala 85 90 95 Leu Lys Arg Asp Pro Ser Ser Leu Gln Gln Arg Gln Glu Thr Arg Leu 100 105 110 Ala Ala Gln Ser Asp Pro Tyr Lys Ile Tyr Ile Ser Gly Leu Glu Met 115 120 125 Leu Ser Cys Ile Asn Leu Val Asp Val Val Ser Cys Gly Ile Ala Asn 130 135 140 Gln Ala Ala Thr Lys Ala Asn Asn Glu Ala Val Ala Arg Tyr Pro Gly 145 150 155 160 Asp Ser Leu Arg Asn Gly Lys Gly Asp Ala Phe Arg His Cys Ser Trp 165 170 175 Asn Ala Leu Met Thr Ile Arg Ile Gly Ser Asn Gly Ala Glu Arg Ile 180 185 190 Ala Thr Asn His Glu Thr Ile Gly Asp Gly Pro Ala Asp Glu Asn Ala 195 200 205 Met Asp Leu Phe Asn Asn Ala Gln Gly Arg Gln Ile Gly Ala Gly Phe 210 215 220 Ile Asn Ser Lys Asp Glu Thr Ser Ala Leu Ala Ile Cys Ala Leu Trp 225 230 235 240 Thr Asn Leu Gly Arg Leu Lys Thr Leu Lys 245 250 <210> 6 <211> 300 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Promoter of Cgl1342 <400> 6 agcctgacta gcggtgttta aggcactatt atgttgcttt taaacagcat cgaataagca 60 ctttaagcgt catttttttc catagcgaaa tacgtatttt tgagttcttt agtcatgcgc 120 cattaactag aagatctatt tcactacacc acaggcttcc ggaagttgca cattggaaaa 180 acccttagat aaatattgaa atatgaattt aataatagat tccgaacgaa atcggtgtta 240 gcgtctgtgc tgaaacaatc taatcgcgtt tcaggacacc tacatgatca ggagctcttt 300 300 <210> 7 <211> 1071 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pCgl1342_ss_Cgl1342_his-tag <400> 7 agcctgacta gcggtgttta aggcactatt atgttgcttt taaacagcat cgaataagca 60 ctttaagcgt catttttttc catagcgaaa tacgtatttt tgagttcttt agtcatgcgc 120 cattaactag aagatctatt tcactacacc acaggcttcc ggaagttgca cattggaaaa 180 acccttagat aaatattgaa atatgaattt aataatagat tccgaacgaa atcggtgtta 240 gcgtctgtgc tgaaacaatc taatcgcgtt tcaggacacc tacatgatca ggagctcttt 300 ttgttaaaca gagtcagtcg tattgcaggc gcttctgcaa tcacactatg catcggctta 360 accacaatac taagccctac ttccactgca caaagcctcg aacagatcac ccctttacct 420 gaatctgcaa tcgacctcaa cgccgagatt cacgtaaaca caagcgacat ttcagctgaa 480 cagatccttg gtgctcaaga tgaaatcaca actatgtacg attctcatga cccctacgag 540 tacttcgata ccctcaccga catcgaacag cgttcaataa tagcagcgct taaacgggat 600 ccgagttcac tccaacaacg ccaagaaacc cgtctcgcgg cacagtccga cccctacaaa 660 atttacatat caggcctcga aatgctttca tgcatcaatc tagttgatgt tgtatcatgc 720 gggattgcaa accaagcagc aaccaaagca aataatgagg ctgtcgcacg atacccaggc 780 gattcccttc gcaacggcaa aggcgatgca tttcggcatt gctcatggaa cgctctgatg 840 acgatacgaa tcgggagcaa tggagctgaa agaattgcaa caaaccacga gacaatcggg 900 gacggtccgg ccgatgaaaa tgcaatggac ctattcaata atgcacaagg ccgacagatc 960 ggagccggat tcattaatag taaggatgaa actagcgcgc tcgcgatatg cgcgctgtgg 1020 acaaatctcg gtagactaaa aactctaaaa catcaccatc accatcatta a 1071 <210> 8 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pCgl1342_ss_Cgl1342 primer1_KpnI primer 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480 ccaggacatt cgcaactacc tgaactggta ccagcagaag ccagacggta ccgtcaaatt 540 ccttatctac tacacctccc gtttgcagcc tggtgttcca tcccgtttct ctggctccgg 600 ttctggcacc gattactccc tgaccatcaa caacctcgaa caggaggaca ttggtaccta 660 cttctgccag cagggcaaca ccccaccttg gaccttcggc ggtggcacca agctcgaaat 720 caaacgtggt ggtggtggtt ctgacggtgg tggttccggt ggtggcggtt ctggcggtgg 780 cggttccgaa gtgcagctgc agcagtccgg tcctgagctc gttaagccgg gcgcatccgt 840 gaagatttct tgtaaagatt ccggctacgc tttcaactcc tcttggatga actgggtcaa 900 gcagcgccct ggtcagggcc ttgaatggat cggccgtatc taccctggcg atggcgactc 960 caactacaac ggcaagttcg agggcaaagc aatcctgacc gctgataagt cctcttccac 1020 cgcctacatg cagctttctt ccttgacctc cgtggactct gcagtctact tctgcgcacg 1080 ttccggtctg ctccgttacg ctatggatta ctggggtcag ggcacctccg ttaccgtgtc 1140 ttccgactac aaggacgacg atgataagtg ataa 1174 <210> 28 <211> 1174 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pCgl1342_ss1_scFv_flag-tag <400> 28 agcctgacta gcggtgttta aggcactatt atgttgcttt taaacagcat cgaataagca 60 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ggtcagggcc ttgaatggat cggccgtatc taccctggcg atggcgactc 960 caactacaac ggcaagttcg agggcaaagc aatcctgacc gctgataagt cctcttccac 1020 cgcctacatg cagctttctt ccttgacctc cgtggactct gcagtctact tctgcgcacg 1080 ttccggtctg ctccgttacg ctatggatta ctggggtcag ggcacctccg ttaccgtgtc 1140 ttccgactac aaggacgacg atgataagtg ataa 1174 <210> 29 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pCES208_SS_scFv_IST_F primer <400> 29 ttgttaaaca gagtcagtcg 20 <210> 30 <211> 40 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pTrc_ss_F primer <400> 30 acggtatcga taagcttgat ttgacaatta atcatccggc 40 <210> 31 <211> 40 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pTrc_ss_R primer <400> 31 cgactgactc tgtttaacaa ggtctgtttc ctgtgtgaaa 40 <210> 32 <211> 40 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pTac_ss_F primer <400> 32 acggtatcga taagcttgat tctggcaaat attctgaaat 40 <210> 33 <211> 40 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pTac_ss_R primer <400> 33 cgactgactc tgtttaacaa gaattctgtt tcctgtgtga 40 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Claims (8)
(ii) 서열번호 1 또는 2로 기재되는 아미노산 서열로 이루어진 시그널 펩타이드를 코딩하는 염기 서열; 및
(iii) 목적 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는, 목적 단백질 분비용 발현 카세트.
(i) a promoter;
(ii) a base sequence encoding a signal peptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2; And
(iii) an expression cassette expressing a target protein, which comprises a gene encoding a target protein.
2. The cassette of claim 1, wherein the nucleotide sequence encoding the signal peptide is a nucleic acid molecule of SEQ ID NO: 3 or SEQ ID NO: 4.
A vector comprising a nucleic acid molecule encoding an expression cassette of claim 1 or 2 or a signal peptide consisting of an amino acid sequence as set forth in SEQ ID NO: 1 or 2.
(i) a promoter; (ii) a base sequence encoding a signal peptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 or 2; And (iii) a cassette expressing the desired protein comprising the gene encoding the target protein, or a microorganism belonging to the genus Corynebacterium into which the vector of the fifth aspect is introduced.
The microorganism of claim 6, wherein the microorganism belonging to the genus Corynebacterium is Corynebacterium glutamicum.
Priority Applications (1)
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| KR1020150060841A KR101671626B1 (en) | 2015-04-29 | 2015-04-29 | A novel expression cassette for secretion of protein |
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Family Applications (1)
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