JP7773981B2 - 新型ポリペプチド複合物 - Google Patents
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Description
A)N末端からC末端までの第1重鎖可変ドメイン(VH1)を含み、前記VH1が第1ドメインに操作可能に連結され、前記第1ドメインがTitin-T鎖を含む第1ポリペプチドと、
N末端からC末端までの第1軽鎖可変ドメイン(VL1)を含み、前記VL1が第2ドメインに操作可能に連結され、前記第2ドメインがTitin-T鎖と互いに作用できるドメインを含む第2ポリペプチドと、を含み、
或いは
B)N末端からC末端までのVH1を含み、前記VH1が第1ドメインに操作可能に連結され、前記第1ドメインがTitin-T鎖と互いに作用できるドメインを含む第1ポリペプチドと、
N末端からC末端までのVL1を含み、前記VL1が第2ドメインに操作可能に連結され、前記第2ドメインがTitin-T鎖を含む第2ポリペプチドと、を含み、
或いは
C)N末端からC末端までのVH1を含み、前記VH1が第1ドメインに操作可能に連結され、前記第1ドメインがObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖を含む第1ポリペプチドと、
N末端からC末端までのVL1を含み、前記VL1が第2ドメインに操作可能に連結され、前記第2ドメインがObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖と互いに作用できるドメインを含む第2ポリペプチドと、を含み、
或いは
D)N末端からC末端までのVH1を含み、前記VH1が第1ドメインに操作可能に連結され、前記第1ドメインがObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖と互いに作用できるドメインを含む第1ポリペプチドと、
N末端からC末端までのVL1を含み、前記VL1が第2ドメインに操作可能に連結され、前記第2ドメインがObscurin-O鎖或Obscurin-Like-O鎖を含む第2ポリペプチドと、を含み、
前記第1抗原結合部分が第1抗原に特異的に結合し、前記第1ドメインが第2ドメインと二量体を形成できる、ポリペプチド複合物を提供する。
Titin-T鎖が25S、39T及び20C変異を有し、且つObscurin-O鎖が3C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び26C変異を有し、且つObscurin-O鎖が9C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び8C変異を有し、且つObscurin-O鎖が25S、76S及び88C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び20C変異を有し、且つObscurin-O鎖が25S、76S及び3C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び26C変異を有し、且つObscurin-O鎖が25S、76S及び9C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び8C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E及び74C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び20C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E及び84C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び22C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E及び86C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び8C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E、26S、77S及び74C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び20C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E、26S、77S及び84C変異を有し、或いは
Titin-T鎖が25S、39T及び22C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E、26S、77S及び86C変異を有し、
Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である。
(A)前記Titin-T鎖の配列が、配列番号32に示される通りであり、若しくは配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26、39、3、11、13、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端に5つのアミノ酸残基KAGIRを付加する配列であり、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C、C39T、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にKAGIRアミノ酸残基を付加する配列であり、及び/又は
(B)前記Obscurin-O鎖の配列が、配列番号33に示される通りであり、若しくは配列番号33の配列を基に3、9、25、76、88、7、11、62、2、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、67、69、89、92、94及び97から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端にKAGIRアミノ酸残基を付加する配列であり、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S、A88C、L7K又はL7R、T62K又はT62H、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、T62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖の配列が、配列番号34に示される通りであり、若しくは配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有する配列であり、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有する配列であり、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である。
(B)前記Obscurin-O鎖が配列番号33の配列を基に3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、好ましくは、前記Obscurin-O鎖が配列番号45の配列を基に7、11、62番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を更に有し、好ましくは、L7K又はL7R、T62K又はT62H、及びK11Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号45の配列の自然順番号部位であり、更に好ましくは、前記Obscurin-O鎖が配列番号50の配列を基に2、11、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、89、92、94及び97番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列の自然順番号部位であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖が配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である。
前記何れか1項に記載のポリペプチド複合物であり、第1抗原に特異的に結合する第1ポリペプチド複合物と、
第2抗原結合部分を含み、第2抗原に特異的に結合する第2ポリペプチド複合物と、を含む多重特異性ポリペプチド複合物が開示された。
N末端からC末端までのVH2を含み、第3ドメインに操作可能に連結され、前記第3ドメインがCH1を含む第3ポリペプチドと、
N末端からC末端までのVL2を含み、第4ドメインに操作可能に連結され、前記第4ドメインがCLを含む第4ポリペプチドと、を含む。
前記ドメインCH1がTitin-T鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記ドメインCLがTitin-T鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記ドメインCH1がObscurin-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記ドメインCLがObscurin-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記ドメインCH1がObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記ドメインCLがObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられる、ドメイン改造抗体を提供する。
前記ドメインCH1がTitin-T鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記ドメインCLがTitin-T鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記ドメインCH1がObscurin-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記ドメインCLがObscurin-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記ドメインCH1がObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記ドメインCLがObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられる、ドメイン改造抗体のFab断片を提供する。
前記第1重鎖のCH1ドメインがTitin-T鎖で取り替えられ、第1軽鎖のCLドメインがTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記第1軽鎖のCLドメインがTitin-T鎖で取り替えられ、前記第1重鎖のCH1ドメインがTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記第1重鎖のドメインCH1がObscurin-O鎖で取り替えられ、前記第1軽鎖のドメインCLがObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記第1軽鎖のドメインCLがObscurin-O鎖で取り替えられ、前記第1重鎖のドメインCH1がObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記第1重鎖のドメインCH1がObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記第1軽鎖のドメインCLがObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記第1軽鎖のドメインCLがObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記第1重鎖のドメインCH1がObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられる、二重特異性抗体を提供する。
前記第1軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL1-L1-T鎖であり、前記第1重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH1-L2-O鎖-L3-CH2-CH3、又はVH1-L4-OL鎖-L5-CH2-CH3であり、前記第2重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH2-CH1-CH2-CH3であり、前記第2軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL2-CLであり、
前記L1-L5がスペーサー領域であり、スペーサー領域が存在してもよく、又は存在しなくてもよく、好ましくは、前記スペーサー領域がTitin-T鎖のN末端断片、又はObscurin-O鎖のN末端断片、又はObscurin-Like-O鎖のN末端断片、又はコネクソン(例えば、(GxS)yコネクソン(但し、Xが1~5の整数から選ばれ、Yが1~6の整数から選ばれる))であり、好ましくは、前記スペーサー領域が「KAGIR」、「DQPQF」、(G4S)1及び(G4S)2から選ばれる。
前記第1軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL1-L1-T鎖であり、前記第1重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH1-L2-O鎖-L3-knob-Fc、又はVH1-L4-OL鎖-L5-knob-Fcであり、前記第2重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH2-CH1-hole-Fcであり、前記第2軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL2-CLであり、前記第1軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL1-L1-T鎖であり、前記第1重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH1-L2-O鎖-L3-hole-Fc、又はVH1-L4-OL鎖-L5-hole-Fcであり、前記第2重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH2-CH1-knob-Fcであり、前記第2軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL2-CLであり、
前記L1-L5がスペーサー領域であり、スペーサー領域が存在してもよく、又は存在しなくてもよく、好ましくは、前記スペーサー領域がTitin-T鎖のN末端断片、又はObscurin-O鎖のN末端断片、又はObscurin-Like-O鎖のN末端断片、又はコネクソン(例えば、(GxS)yコネクソン(但し、Xが1~5の整数から選ばれ、Yが1~6の整数から選ばれる))であり、好ましくは、前記スペーサー領域が「KAGIR」、「DQPQF」、(G4S)1及び(G4S)2から選ばれる。
前記Titin-T鎖における1、7~10、13~16、19~26、59~60及び96番目から選ばれる1つ又は複数の残基がObscurin-Like-O鎖における4~5、10、12~13、74、76、78及び82~91番目から選ばれる1つ又は複数の残基と互いに結合する。前記Titin-T鎖残基部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖残基部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖残基部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である。
前記Titin-T鎖が8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖が3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、或いは
Titin-T鎖が8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖が6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有する。
前記Titin-T鎖が配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有するポリペプチドであり、及び/又は前記Obscurin-O鎖が配列番号33の配列を基に3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有するポリペプチドであり、或いは
前記Titin-T鎖が配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有するポリペプチドであり、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖が配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有するポリペプチドである。
前記Titin-T鎖が8C、20C、22C、25S、26C及び39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖が3C、9C、25S、76S及び88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、或いは
前記Titin-T鎖が8C、20C、22C、25S、26C及び39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖が6E、26S、74C、77S、84C及び86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、
更に好ましくは、前記非天然鎖間結合が下記から選ばれる変異部位に位置し、即ち、
Titin-T鎖が25S、39T及び8C変異を有し、且つObscurin-O鎖が88C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び20C変異を有し、且つObscurin-O鎖が3C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び26C変異を有し、且つObscurin-O鎖が9C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び8C変異を有し、且つObscurin-O鎖が25S、76S及び88C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び20C変異を有し、且つObscurin-O鎖が25S、76S及び3C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び26C変異を有し、且つObscurin-O鎖が25S、76S及び9C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び8C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E及び74C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び20C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E及び84C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び22C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E及び86C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び8C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E、26S、77S及び74C変異を有し、
Titin-T鎖が25S、39T及び20C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E、26S、77S及び84C変異を有し、或いは
Titin-T鎖が25S、39T及び22C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖が6E、26S、77S及び86C変異を有し、
Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である。
前記Titin-T鎖がA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がA3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、或いは
前記Titin-T鎖がA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列に対する自然順部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列に対する自然順部位である。
前記Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、Obscurin-O鎖がA88C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、Obscurin-O鎖がA3C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA26C変異を有し、Obscurin-O鎖がR9C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、Obscurin-O鎖がC25S、C76S及びA88C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、Obscurin-O鎖がC25S、C76S及びA3C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA26C変異を有し、Obscurin-O鎖がC25S、C76S及びR9C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、Obscurin-Like-O鎖がC6E及びV74C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、Obscurin-Like-O鎖がC6E及びG84C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びT22C変異を有し、Obscurin-Like-O鎖がC6E及びA86C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、Obscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びV74C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、Obscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びG84C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びT22C変異を有し、Obscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びA86C変異を有し、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列に対する自然順部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列に対する自然順部位である。
(A)前記Titin-T鎖の配列が、配列番号32に示される通りであり、若しくは配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26、39、3、11、13、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端にKAGIRアミノ酸残基を付加する配列であり、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C、C39T、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にKAGIRアミノ酸残基を付加する配列であり、及び/又は
(B)前記Obscurin-O鎖の配列が、配列番号33に示される通りであり、若しくは配列番号33の配列を基に3、9、25、76、88、7、11、62、2、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、67、69、89、92、94及び97から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S、A88C、L7K又はL7R、T62K又はT62H、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、T62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖の配列が、配列番号34に示される通りであり、若しくは配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有する配列であり、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有する配列であり、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位であり、
好ましくは、
(A)前記Titin-T鎖が配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、更に好ましくは、前記Titin-T鎖が配列番号35の配列を基に3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
(B)前記Obscurin-O鎖が配列番号33の配列を基に3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、好ましくは、前記Obscurin-O鎖が配列番号45の配列を基に7、11、62番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を更に有し、好ましくは、L7K又はL7R、T62K又はT62H、及びK11Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号45の配列の自然順番号部位であり、更に好ましくは、前記Obscurin-O鎖が配列番号50の配列を基に2、11、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、89、92、94及び97番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列の自然順番号部位であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖が配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である。
A、第1重鎖の配列が配列番号89に示される通りであり、若しくは配列番号89と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号90に示される通りであり、若しくは配列番号90と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号87に示される通りであり、若しくは配列番号87と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号88に示される通りであり、若しくは配列番号88と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
B、第1重鎖の配列が配列番号93に示される通りであり、若しくは配列番号93と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号94に示される通りであり、若しくは配列番号94と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号91に示される通りであり、若しくは配列番号91と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号92に示される通りであり、若しくは配列番号92と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
C、第1重鎖の配列が配列番号97に示される通りであり、若しくは配列番号97と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号98に示される通りであり、若しくは配列番号98と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号95に示される通りであり、若しくは配列番号95と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
D、第1重鎖の配列が配列番号99に示される通りであり、若しくは配列番号99と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号100に示される通りであり、若しくは配列番号100と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号101に示される通りであり、若しくは配列番号101と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
E、第1重鎖の配列が配列番号102に示される通りであり、若しくは配列番号102と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号100に示される通りであり、若しくは配列番号100と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号95に示される通りであり、若しくは配列番号95と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
F、第1重鎖の配列が配列番号103に示される通りであり、若しくは配列番号103と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号104に示される通りであり、若しくは配列番号104と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号95に示される通りであり、若しくは配列番号95と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
G、第1重鎖の配列が配列番号107に示される通りであり、若しくは配列番号107と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号108に示される通りであり、若しくは配列番号108と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号109に示される通りであり、若しくは配列番号109と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号110に示される通りであり、若しくは配列番号110と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
H、第1重鎖の配列が配列番号122に示される通りであり、若しくは配列番号122と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号123に示される通りであり、若しくは配列番号123と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号116に示される通りであり、若しくは配列番号116と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号117に示される通りであり、若しくは配列番号117と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
I、第1重鎖の配列が配列番号118に示される通りであり、若しくは配列番号118と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号119に示される通りであり、若しくは配列番号119と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号124に示される通りであり、若しくは配列番号124と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号125に示される通りであり、若しくは配列番号125と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、から選ばれ、
前記少なくとも85%の同一性を有することは、例えば、少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%の同一性を有することである。
(A)前記Titin-T鎖の配列が配列番号32に示される通りであり、若しくは配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26、39、3、11、13、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端に5つのアミノ酸残基KAGIRを付加する配列であり、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C、C39T、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端に5つのアミノ酸残基KAGIRを付加する配列であり、及び/又は
(B)前記Obscurin-O鎖の配列が、配列番号33に示される通りであり、若しくは配列番号33の配列を基に3、9、25、76、88、7、11、62、2、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、67、69、89、92、94及び97から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S、A88C、L7K又はL7R、T62K又はT62H、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、T62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖の配列が、配列番号34に示される通りであり、若しくは配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有する配列であり、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有する配列であり、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位であり、
好ましくは、
(A)前記Titin-T鎖が配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、更に好ましくは、前記Titin-T鎖が配列番号35の配列を基に3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
(B)前記Obscurin-O鎖が配列番号33の配列を基に3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、好ましくは、前記Obscurin-O鎖が配列番号45の配列を基に7、11、62番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を更に有し、好ましくは、L7K又はL7R、T62K又はT62H、及びK11Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号45の配列の自然順番号部位であり、更に好ましくは、前記Obscurin-O鎖が配列番号50の配列を基に2、11、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、89、92、94及び97番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列の自然順番号部位であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖が配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である。
前記宿主細胞を培養してから、ポリペプチド複合物、多重特異性ポリペプチド複合物、ドメイン改造抗体、ドメイン改造抗体のFab断片、二重特異性抗体又はポリペプチド、又は多重特異性抗体を精製・回収する工程を含む、前記何れか1項に記載のポリペプチド複合物、多重特異性ポリペプチド複合物、ドメイン改造抗体、ドメイン改造抗体のFab断片、二重特異性抗体、又はポリペプチド、又は多重特異性抗体の調製方法を提供する。
オリジナル残基 保存的置換
Ala(A) Gly;Ser
Arg(R) Lys;His
Asn(N) Gln;His;Asp
Asp(D) Glu;Asn
Cys(C) Ser;Ala;Val
Gln(Q) Asn;Glu
Glu(E) Asp;Gln
Gly(G) Ala
His(H) Asn;Gln;Lys; Arg
Ile(I) Leu;Val
Leu(L) Ile;Val
Lys(K) Arg;His
Met(M) Leu;Ile;Tyr
Phe(F) Tyr;Met;Leu
Pro(P) Ala
Ser(S) Thr
Thr(T) Ser
Trp(W) Tyr;Phe
Tyr(Y) Trp;Phe
Val(V) Ile;Leu。
プライマーPCRを設計し、遺伝子断片(例えば、抗体VH/VK遺伝子断片)を組立て、更に発現ベクター(例えば、pHr(シグナルペプチド及び定常領域付きの遺伝子(例えば、CH1-Fc/CL)断片))と相同組換えを行い、発現ベクター(例えば、VH-CH1-Fc-pHr/VK-CL-pHr)を構築してから、構築された発現ベクターを原核生物又は真核生物に導入して発現し、最後に生成物を精製して、所望の抗体又はポリペプチドタンパク質を得た。非限定的に、抗体定常領域がヒトκ、λ鎖軽鎖定常領域から選ばれ、及びIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4の重鎖定常領域から選ばれてもよい。非制限的な実施例は、例えば、重鎖定常領域のL234A/L235A又はL234F/L235Eなどの部位に変異を起こさせることなど、ヒト抗体定常領域に対して最適化設計を行うことを更に含む。例示的に、抗体軽/重鎖定常領域配列は下記の通りである。
>knob-IgG1重鎖定常領域(略称knob-IgG1):
>hole-IgG1重鎖定常領域(略称hole-IgG1):
>kappa軽鎖定常領域(略称kappa又はhκ)
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号4)。
>lambda軽鎖定常領域(略称lambda又はhλ)
GQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS(配列番号5)。
>F0抗体VHアミノ酸配列:
QVQLVQSGGGVVQPGTSLRLSCAASGFIFSSSAMHWVRQAPGKGLEWVAVISYDGSNKYYVDSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARSARLYASFDYWGQGALVTVSS(配列番号6);
>F0抗体VLアミノ酸配列
DTVVTQEPSFSVSPGGTVTLTCGLSSGSVSTSHYPSWYQQTPGQAPRMLIYNTNTRSSGVPDRFSGSILGNKAALTITGAQADDESDYYCAIHVDRDIWVFGGGTKLTVL(配列番号7);
>N0抗体VHアミノ酸配列
DVQLVQSGGGLVQPGGSLRLSCAGSGFTSSLSWMSWLRQAPGKGLEWVANINQDGSEKNYVDSVKGRFTISRDNAQNSLYLQMSSLRAEDTAVYYCARGLWTFDSWGQGTLLTVSP(配列番号8);
>N0抗体VLアミノ酸配列
EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQNINNRFLAWYQQRPGQAPRLLIYAASSRATGVPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEAEDFAMYHCQQYGSFPRTFGQGTMVDIK(配列番号9);
>S0抗体VHアミノ酸配列
EVQLQESGPGLVKPGGSLSLSCAASGFVFSSYDMSWVRQTPERGLEWVAYISSGGGITYAPSTVKGRFTVSRDNAKNTLYLQMNSLTSEDTAVYYCAAHYFGSSGPFAYWGQGTLVTVSS(配列番号10);
>S0抗体VLアミノ酸配列
DIQMTQSPASLSASVGDRVTITCRASENIFSYLAWYQQKPGKSPKLLVYNTRTLAEGVPSRFSGSGSGTDFSLTISSLQPEDFATYYCQHHYGTPFTFGSGTKLEIK(配列番号11);
>V0抗体VHアミノ酸配列
QVQLQQSAAELARPGASVKMSCKASGYSFTSYTIHWVKQRPGQGLEWIGYINPNSRNTDYNQKFKDETTLTADRSSSTAYMQLISLTSEDSAVYYCARYSGSTPYWYFDVWGAGTTVTVSS(配列番号12);
>V0抗体VLアミノ酸配列
QIVLTQSPAILSASPGEKVTMTCRASSSVSYMNWYQQKPGSSPKPWIYATSNLASGVPARFSVSVSGTSHSLTISRVEAEDAATYYCQQWSSNPLTFGAGTKLELK(配列番号13);
>J0抗体VHアミノ酸配列
EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDYWMHWVRQAPGKGLEWVGHIKSKTDAGTTDYAAPVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCAREIYYYAFDSWGQGTLVTVSS(配列番号14);
>J0抗体VLアミノ酸配列
SYELTQPLSVSVALGQTARITCSGDNIGSKYVHWYQQKPGQAPVLVIYGDNERPSGIPERFSGSNSGNTATLTISRAQAGDEADYYCQAADWVDFYVFGGGTKLTVL(配列番号15);
>H0抗体VHアミノ酸配列
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSHYYMAWVRQAPGKGLEWVTSISYEGDITYYGDSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTATYYCASQTLRESFDYWGQGTLVTVSS(配列番号16);
>H0抗体VLアミノ酸配列
DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITCRASQDIANYLSWYQQKPGKSPKLLIYGTSNLEVGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCLQDKEFPRTFGGGTKVEIK(配列番号17);
>R0抗体VHアミノ酸配列
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAVSGLSLTSNSVNWIRQAPGKGLEWVGLIWSNGDTDYNSAIKSRFTISRDTSKSTVYLQMNSLRAEDTAVYYCAREYYGYFDYWGQGTLVTVSS(配列番号18);
>R0抗体VLアミノ酸配列
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCLASEGISSYLAWYQQKPGKAPKLLIYGANSLQTGVPSRFSGSGSATDYTLTISSLQPEDFATYYCQQSYKFPNTFGQGTKVEVK(配列番号19);
>Bmab(略称B0)抗体VHアミノ酸配列
QVQLQQSGAEVKKPGSSVRVSCKASGGTFNNNAINWVRQAPGQGLEWMGGIIPMFGTAKYSQNFQGRVAITADESTGTASMELSSLRSEDTAVYYCARSRDLLLFPHHALSPWGRGTMVTVSS(配列番号20);
>Bmab(略称B0)抗体VLアミノ酸配列
SSELTQDPAVSVALGQTVRVTCQGDSLRSYYASWYQQKPGQAPVLVIYGKNNRPSGIPDRFSGSSSGNTASLTITGAQAEDEADYYCSSRDSSGNHWVFGGGTELTVL(配列番号21);
>Umab(略称U0)抗体VHアミノ酸配列
EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFTTYWLGWVRQMPGKGLDWIGIMSPVDSDIRYSPSFQGQVTMSVDKSITTAYLQWNSLKASDTAMYYCARRRPGQGYFDFWGQGTLVTVSS(配列番号22);
>Umab(略称U0)抗体VLアミノ酸配列
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISSWLAWYQQKPEKAPKSLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYNIYPYTFGQGTKLEIK(配列番号23);
>Dmab(略称D0)抗体VHアミノ酸配列
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSGITGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKDPGTTVIMSWFDPWGQGTLVTVSS(配列番号24);
>Dmab(略称D0)抗体VLアミノ酸配列
EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVRGRYLAWYQQKPGQAPRLLIYGASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVFYCQQYGSSPRTFGQGTKVEIK(配列番号25);
>Tmab(略称I0)抗体VHアミノ酸配列
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGFSLIGYDLNWIRQPPGKGLEWIGIIWGDGTTDYNSAVKSRVTISKDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGGYWYATSYYFDYWGQGTLVTVSS(配列番号26);
>Tmab(略称I0)抗体VLアミノ酸配列
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISNNLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSRFHSGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCQQEHTLPYTFGQGTKLEIK(配列番号27);
>C0抗体VHアミノ酸配列
EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTDYHMNWVRQAPGQRLEWMGDINPDIGGTSYNQNFKGRVTITRDTSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCARWDFDSFANWGQGTLVTVSS(配列番号28);
>C0抗体VLアミノ酸配列
DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVSIIGTNLIHWYQQKPGQPPKLLIYHASNLETGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCLQSRKIPYTFGGGTKVEIK(配列番号29);
>A0抗体VHアミノ酸配列
EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFNKYAMNWVRQAPGKGLEWVARIRSKYNNYATYYADSVKDRFTISRDDSKNTAYLQMNNLKTEDTAVYYCVRHGNFGNEYISYWAYWGQGTLVTVSS(配列番号105);
>A0抗体VLアミノ酸配列
QTVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCGSSTGAVTSGNYPNWVQQKPGQAPRGLIGGTKFLAPGTPARFSGSLLGGKAALTLSGVQPEDEAEYYCVLWYSNRWVFGGGTKLTVL(配列番号106);
前記抗体F0、N0、S0、V0、J0、H0、R0、B0、U0、D0、I0、C0、A0抗体の重鎖定常領域配列がIgG1重鎖定常領域(配列番号1)であり、N0、S0、H0、R0、U0、I0、C0抗体軽鎖定常領域配列がkappa軽鎖定常領域(配列番号4)であり、F0、V0、J0、B0、D0、A0抗体軽鎖定常領域配列がlambda軽鎖定常領域(配列番号5)である。
LEVQVPEDPVVALVGTDATLCCSFSPEPGFSLAQLNLIWQLTDTKQLVHSFAEGQDQGSAYANRTALFPDLLAQGNASLRLQRVRVADEGSFTCFVSIRDFGSAAVSLQVAAPYSKPSMTLEPNKDLRPGDTVTITCSSYQGYPEAEVFWQDGQGVPLTGNVTTSQMANEQGLFDVHSILRVVLGANGTYSCLVRNPVLQQDAHSSVTITPQRSPTGAVEVQVPEDPVVALVGTDATLRCSFSPEPGFSLAQLNLIWQLTDTKQLVHSFTEGRDQGSAYANRTALFPDLLAQGNASLRLQRVRVADEGSFTCFVSIRDFGSAAVSLQVAAPYSKPSMTLEPNKDLRPGDTVTITCSSYRGYPEAEVFWQDGQGVPLTGNVTTSQMANEQGLFDVHSVLRVVLGANGTYSCLVRNPVLQQDAHGSVTITGQPMT DYKDDDDKHHHHHH(配列番号111);
hCD3抗原タンパク質がhCD3抗原のδサブユニットとεサブユニットからなるヘテロ二量体であり、hCD3抗原のδサブユニット配列が下記の通りである。
FKIPIEELEDRVFVNCNTSITWVEGTVGTLLSDITRLDLGKRILDPRGIYRCNGTDIYKDKESTVQVHYRMCQSCVELDPATVASAENAQCEKELQALEKENAQLEWELQALEKELAQDYKDDDDK(配列番号112);
hCD3抗原のεサブユニット配列が下記の通りである。
DGNEEMGGITQTPYKVSISGTTVILTCPQYPGSEILWQHNDKNIGGDEDDKNIGSDEDHLSLKEFSELEQSGYYVCYPRGSKPEDANFYLYLRARVCENCMEMDAKNAQCKKKLQALKKKNAQLKWKLQALKKKLAQHHHHHH(配列番号113)。
天然Titin/Obscurin複合物、Titin/Obscurin-Like O複合物とIL6Ra/IL6Rb複合物における天然の分子間相互作用を有するIg-Likeドメインをそれぞれ利用し、抗体のCH1/CLドメインを取り替えて、CH1/CLドメインが改造された抗体を得た。
>IL6Ra.0鎖配列は下記の通りである。
GILQPDPPANITVTAVARNPRWLSVTWQDPHSWNSSFYRLRFELRYRAERSKTFTTWMVKDLQHHCVIHDAWSGLRHVVQLRAQEEFGQGEWSEWSPEAMGTPW(配列番号30);
>IL6Rb.0鎖配列は下記の通りである。
FDPVYKVKPNPPHNLSVINSEELSSILKLTWTNPSIKSVIILKYNIQYRTKDASTWSQIPPEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIRCMKEDGKGYWSDWSEEASGIT(配列番号31);
>T.0鎖配列は下記の通りである。
GIPPKIEALPSDISIDEGKVLTVACAFTGEPTPEVTWSCGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIMDVQKQDGGLYTLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号32);
>O.0鎖配列は下記の通りである。
SGAPRFLTRPKAFVVSVGKDATLSCQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLTILDLALGDSGQYVCRARNAIGEAFAAVGLQVDAEA(配列番号33);
>OL.0鎖配列は下記の通りである。
QGSPPCFLRFPRPVRVVSGAEAELKCVVLGEPPPVVVWEKGGQQLAASERLSFPADGAEHGLLLTAALPTDAGVYVCRARNAAGEAYAAAAVTVLEPP(配列番号34);
CH1/CLが取り替えられた複数種の抗体を構築し、試験例2及び4の方法により、検出待ちの抗体の純度及び対応する抗原との結合活性を検出した。実験結果が下表1に示される。実験結果によれば、F0、V0、S0、N0、J0、H0、R0及びC0など異なる抗原と結合する抗体において、CH1/CLがT.0鎖/O.0鎖又はT.0鎖/OL.0鎖で同時に取り替えられた後でも、抗体は良好な結合活性を保持し、且つ抗体純度が高い。
Titin Ig-Like 152ドメイン(T.0鎖)、Obscurin Ig-Like 1ドメイン(O.0鎖)、Obscurin-Like Ig-Like 1ドメイン(OL.0鎖)の個別のアミノ酸にアミノ酸の挿入、欠失又は取り替えを含む変異を起こさせ、ドメイン改造抗体の活性を検証する。
>T.1(T.0がC25S、C39T、A8Cの変異を有する)
GIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIMDVQKQDGGLYTLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号35);
>T.2(T.0がC25S、C39T、V20Cの変異を有する)
GIPPKIEALPSDISIDEGKCLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIMDVQKQDGGLYTLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号36);
>T.3(T.0がC25S、C39T、A26Cの変異を有する)
GIPPKIEALPSDISIDEGKVLTVASCFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIMDVQKQDGGLYTLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号37);
>T.4(T.0がC25S、C39T、T22Cの変異を有する)
GIPPKIEALPSDISIDEGKVLCVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIMDVQKQDGGLYTLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号38);
>T.5(T.0がC25S、C39T、A8Cの変異を有し、N末端にKAGIRを付加する)
KAGIRGIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIMDVQKQDGGLYTLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号39);
>T.6(T.0がC25S、C39T、A8Cの変異を有し、N末端に(G4S)1コネクソンを付加する)
GGGGSGIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIMDVQKQDGGLYTLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号40);
>T.7(T.0がC25S、C39T、A8Cの変異を有し、N末端に(G4S)2コネクソンを付加する)
GGGGSGGGGSGIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIMDVQKQDGGLYTLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号41);
>O.1(O.0がA88C変異を有する)
SGAPRFLTRPKAFVVSVGKDATLSCQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLTILDLALGDSGQYVCRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号42);
>O.2(O.0がA3C変異を有する)
SGCPRFLTRPKAFVVSVGKDATLSCQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLTILDLALGDSGQYVCRARNAIGEAFAAVGLQVDAEA(配列番号43);
>O.3(O.0がR9C変異を有する)
SGAPRFLTCPKAFVVSVGKDATLSCQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLTILDLALGDSGQYVCRARNAIGEAFAAVGLQVDAEA(配列番号44);
>O.4(O.0がC25S、C76S、A88C変異を有する)
SGAPRFLTRPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLTILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号45);
>O.5(O.0がC25S、C76S、A3C変異を有する)
SGCPRFLTRPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLTILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFAAVGLQVDAEA(配列番号46);
>O.6(O.0がC25S、C76S、R9C変異を有する)
SGAPRFLTCPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLTILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFAAVGLQVDAEA(配列番号47);
> O.7(O.0がC25S、C76S、A88C、L7K、T62K変異を有する)
SGAPRFKTRPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLKILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号48);
>O.8(O.0がC25S、C76S、A88C、L7K、T62H変異を有する)
SGAPRFKTRPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLHILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号49);
>O.9(O.0がC25S、C76S、A88C、K11L、T62K変異を有する)
SGAPRFLTRPLAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLKILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号50);
>O.10(O.0がC25S、C76S、A88C、K11L、T62H変異を有する)
SGAPRFLTRPLAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLHILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号51);
>O.11(O.0がC25S、C76S、A88C変異を有し、N末端にDQPQFを付加する)
DQPQFSGAPRFLTRPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLTILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号52);
>O.12(O.0がC25S、C76S、A88C、L7K、T62K変異を有し、N末端にDQPQFを付加する)
DQPQFSGAPRFKTRPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLKILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号53);
>O.13(O.0がC25S、C76S、A88C、L7K、T62H変異を有し、N末端にDQPQFを付加する)
DQPQFSGAPRFKTRPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLHILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号54);
>O.14(O.0がC25S、C76S、A88C、L7R、T62K変異を有し、N末端にDQPQFを付加する)
DQPQFSGAPRFRTRPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLKILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号55);
>O.15(O.0がC25S、C76S、A88C、L7R、T62H変異を有し、N末端にDQPQFを付加する)
DQPQFSGAPRFRTRPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLHILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号56);
>O.16(O.0がC25S、C76S、A88C変異を有し、N末端に(G4S)1コネクソンを付加する)
GGGGSSGAPRFLTRPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLTILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号57);
>O.17(O.0がC25S、C76S、A88C変異を有し、N末端に(G4S)2コネクソンを付加する)
GGGGSGGGGSSGAPRFLTRPKAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLTILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号58);
>OL.1(OL.0がC6E、V74C変異を有する)
QGSPPEFLRFPRPVRVVSGAEAELKCVVLGEPPPVVVWEKGGQQLAASERLSFPADGAEHGLLLTAALPTDAGCYVCRARNAAGEAYAAAAVTVLEPP(配列番号59);
>OL.2(OL.0がC6E、G84C変異を有する)
QGSPPEFLRFPRPVRVVSGAEAELKCVVLGEPPPVVVWEKGGQQLAASERLSFPADGAEHGLLLTAALPTDAGVYVCRARNAACEAYAAAAVTVLEPP(配列番号60);
>OL.3(OL.0がC6E、A86C変異を有する)
QGSPPEFLRFPRPVRVVSGAEAELKCVVLGEPPPVVVWEKGGQQLAASERLSFPADGAEHGLLLTAALPTDAGVYVCRARNAAGECYAAAAVTVLEPP(配列番号61);
>OL.4(OL.0がC6E、C26S、C77S、V74C変異を有する)
QGSPPEFLRFPRPVRVVSGAEAELKSVVLGEPPPVVVWEKGGQQLAASERLSFPADGAEHGLLLTAALPTDAGCYVSRARNAAGEAYAAAAVTVLEPP(配列番号62);
>OL.5(OL.0がC6E、C26S、C77S、G84C変異を有する)
QGSPPEFLRFPRPVRVVSGAEAELKSVVLGEPPPVVVWEKGGQQLAASERLSFPADGAEHGLLLTAALPTDAGVYVSRARNAACEAYAAAAVTVLEPP(配列番号63);
>OL.6(OL.0がC6E、C26S、C77S、A86C変異を有する)
QGSPPEFLRFPRPVRVVSGAEAELKSVVLGEPPPVVVWEKGGQQLAASERLSFPADGAEHGLLLTAALPTDAGVYVSRARNAAGECYAAAAVTVLEPP(配列番号64)。
>T.8(T.1がM66S、T77S変異を有する)
GIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIISDVQKQDGGLYSLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号65);
>T.9(T.1がM66K、K70R、S79T、G81R変異を有する)
GIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIKDVQRQDGGLYTLTLRNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号66);
>T.10(T.1がP3W、S11I、I13L、T22M、N82M変異を有する)
GIWPKIECLPIDLSIDEGKVLMVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIMDVQKQDGGLYTLSLGMEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号67);
>T.11(T.1がS11I、M66K、S79T、G81R変異を有する)
GIPPKIECLPIDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIKDVQKQDGGLYTLTLRNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号68);
>T.12(T.1がG40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、L75V、E83D、F84L変異を有する)
GIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTSGKKISSEEGGRFHIESTEDLTTLIIMDVQKQDGGVYTLSLGNDLGSDSATVNIHIRSI(配列番号69);
>T.13(T.1がQ47E、Q49G、N56S、D58E、L75V変異を有する)
GIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSEEGGRFHIESTEDLTTLIIMDVQKQDGGVYTLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号70);
>T.14(T.1がN56S、D58E、L75V変異を有する)
GIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIESTEDLTTLIIMDVQKQDGGVYTLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号71);
>T.15(T.1がN56S、D58E、M66S、T77S変異を有する)
GIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIESTEDLTTLIISDVQKQDGGLYSLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号72);
>T.16(T.1がS11I、M66K、S79T、G81R変異+(G4S)1連結配列を有する)
GGGGSGIPPKIECLPIDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIENTDDLTTLIIKDVQKQDGGLYTLTLRNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号73);
>T.17(T.1がN56S、D58E、M66S、T77S変異+KAGIRを有する)
KAGIRGIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIESTEDLTTLIISDVQKQDGGLYSLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号74);
>T.18(T.1がN56S、D58E、M66S、T77S変異+KAGIR+(G4S)1連結配列を有する)
GGGGSKAGIRGIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIESTEDLTTLIISDVQKQDGGLYSLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号75);
>T.19(T.1がN56S、D58E、M66S、T77S変異+(G4S)1連結配列を有する)
GGGGSGIPPKIECLPSDISIDEGKVLTVASAFTGEPTPEVTWSTGGRKIHSQEQGRFHIESTEDLTTLIISDVQKQDGGLYSLSLGNEFGSDSATVNIHIRSI(配列番号76);
>O.18(O.9がL11K、A12S、F13Y、V14T、T22S変異を有する)
SGAPRFLTRPKSYTVSVGKDASLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLAQDGDLYRLKILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号77);
>O.19(O.9がG2E、V17E、N30D、T32P、Q34E、S36T、V44I、A45T、L58V、K62E、A67Q、G69S、A97G変異を有する)
SEAPRFLTRPLAFVVSEGKDATLSSQIVGDPPPEVTWEKDQQPITAGARFRLAQDGDVYRLEILDLQLSDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEG(配列番号78);
>O.20(O.9がD20L、T22M、A53L変異を有する)
SGAPRFLTRPLAFVVSVGKLAMLSSQIVGNPTPQVSWEKDQQPVAAGARFRLLQDGDLYRLKILDLALGDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLQVDAEA(配列番号79);
>O.21(O.9がQ41K、A45T、A67Q、G69S、V89L変異を有する)
SGAPRFLTRPLAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDKQPVTAGARFRLAQDGDLYRLKILDLQLSDSGQYVSRARNAIGEAFACLGLQVDAEA(配列番号80);
>O.22(O.9がQ42L、A45T、A67T、G69S、Q92E、D94G変異を有する)
SGAPRFLTRPLAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDQLPVTAGARFRLAQDGDLYRLKILDLTLSDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLEVGAEA(配列番号81);
>O.23(O.9がA12S、F13Y、T22S、Q42L、A45T、A67Q、G69S、Q92E、D94G変異を有する)
SGAPRFLTRPLSYVVSVGKDASLSSQIVGNPTPQVSWEKDQLPVTAGARFRLAQDGDLYRLKILDLQLSDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLEVGAEA(配列番号82);
>O.24(O.9がQ41K、A45T、A67Q、G69S、V89L変異+(G4S)1連結配列を有する)
GGGGSSGAPRFLTRPLAFVVSVGKDATLSSQIVGNPTPQVSWEKDKQPVTAGARFRLAQDGDLYRLKILDLQLSDSGQYVSRARNAIGEAFACLGLQVDAEA(配列番号83);
>O.25(O.9がA12S、F13Y、T22S、Q42L、A45T、A67Q、G69S、Q92E、D94G変異+(G4S)1連結配列を有する)
GGGGSSGAPRFLTRPLSYVVSVGKDASLSSQIVGNPTPQVSWEKDQLPVTAGARFRLAQDGDLYRLKILDLQLSDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLEVGAEA(配列番号84);
>O.26(O.9がA12S、F13Y、T22S、Q42L、A45T、A67Q、G69S、Q92E、D94G変異+ DQPQFを有する)
DQPQFSGAPRFLTRPLSYVVSVGKDASLSSQIVGNPTPQVSWEKDQLPVTAGARFRLAQDGDLYRLKILDLQLSDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLEVGAEA(配列番号85);
>O.27(O.9がA12S、F13Y、T22S、Q42L、A45T、A67Q、G69S、Q92E、D94G変異+DQPQF+(G4S)1連結配列を有する)
GGGGSDQPQFSGAPRFLTRPLSYVVSVGKDASLSSQIVGNPTPQVSWEKDQLPVTAGARFRLAQDGDLYRLKILDLQLSDSGQYVSRARNAIGEAFACVGLEVGAEA(配列番号86)。
抗体のCH1/CLがTitin-T鎖/Obscurin-O鎖又はTitin-T鎖/ Obscurin-Like-O鎖で取り替えられた後に、動物体内における抗体の安定性が影響を受けたかについて評価するために、取り替え前後の抗体の、ラット体内における半減期を検出した。例示的に、F0抗体のCH1/CLがT.1/O.9で取り替えられた抗体F20、及びC0抗体のCH1/CLがT.1/O.9で取り替えられた抗体C3の、ラット体内における半減期を検出した。具体的な方法は下記の通りである。
第1抗原に結合する抗体と第2抗原に結合する抗体を利用し、ブリッジPCRにより、二重特異性抗体を構築した。例示的に、複数種の二重特異性抗体を構築した。
まず、DI-1二重特異性抗体を構築した。DI-1二重特異性抗体は、D0抗体の1本の重鎖(Fc領域にknob修飾を行う)及び1本の軽鎖と、I0抗体のCH1/CLがTitin-T鎖/Obscurin-O鎖で取り替えられた改造抗体の1本の重鎖(Fc領域にhole修飾を行う)及び1本の軽鎖から構成されるIgG-Like二重特異性抗体である。その構造模式図は図5を参照する。その配列は下記に示される。
DI-1鎖1(DI-1-H1)のアミノ酸配列:
DI-1鎖2(DI-1-L1)のアミノ酸配列:
DI-1鎖3(DI-1-H2)のアミノ酸配列:
DI-1鎖4(DI-1-L2)のアミノ酸配列:
本開示の試験例3の方法によりDI-1を検出し、DI-1の4本鎖を細胞にコトランスフェクションして発現してから、マススペクトル分析を行った。実験結果は表11及び図6A~図6Cを参照する。マススペクトル分析結果によれば、ホモ二量体及びミスマッチ分子が検出されておらず、DI-1が正確に組み立てられた。
試験例1、抗体の発現量試験方法
モノクローナル抗体又は二重特異性抗体の発現プラスミドを利用してHEK293E細胞にトランスフェクションし、6日間後に発現上澄を収集し、高速遠心分離により不純物を除去した。上澄をProtein Aカラム(GE Healthcare)により精製した。A280読取値が基線に低減されるまで、PBSによりカラムを洗浄し、更に100mM酢酸緩衝液(pH3.5)によりクロマトグラフィーカラムを洗浄し、1M Tris-HClによりpH8.0となるように中和した。抗体の発現量が最終的に精製して得られた抗体量/発現体積によって定量された。
SEC-HPLCにより抗体純度を監視した。機器取扱説明書に従って検出を行い、Waters e2695クロマトグラフィーを使用するが、クロマトグラフィーカラムがWaters Xbridge BEH 200A SECであり、流動相がPBS(希塩酸でpH値が6.8となるように調整)であり、100 μgタンパク質を注入し、イソクラティック溶離を行い、流速が0.5 mL/minである。抗体純度は、主ピークのピーク面積がピーク総面積に占める百分率(SEC(%))である。
(一)サンプルの準備:
1. 脱グリコシル完全分子量の測定:発現された抗体30 μgを取り、冷凍乾燥してから、10 μLの8M Gua-HClを加え、70℃水浴で10 min変性させた。90 μLの蒸留水を加え、30 μLを取り、0.8 μLのPNG酵素F(ペプチドN-グリコシダーゼF)を加え、37℃水浴に置き、2 hインキュベートし、0.5 μgを取り、脱グリコシル完全分子量を測定した。
2. 脱グリコシル還元分子量の測定:発現された抗体30 μgを取り、冷凍乾燥してから、10 μLの8 M Gua-HClを加え、70℃水浴で10 min変性させた。90 μL蒸留水を加え、30 μLを取り、0.8 μLのPNG酵素F(ペプチドN-グリコシダーゼF)を加え、37℃水浴に置き、2 hrインキュベートした。更に2 μLの0.025M DTTを加え、70℃水浴で10 min還元させ、0.5 μgを取り、脱グリコシル還元分子量を測定した。
クロマトグラフィー条件:
クロマトグラフィーカラム:Poroshell 300SB-C8 5um 2.1*75mm
流動相:A:0.1%HCOOH/H2O B: 0.1% HCOOH/CAN
カラム温度:75℃
勾配:
マススペクトル:Agilent 6530 Q-TOF LC-MS
イオン化モード ESI
採集モード:1 GHz(質量範囲 500~5000 m/z)
乾燥ガス温度:325℃
乾燥ガス流量:10 L/min
アトマイザー:40psi
シースガス温度:350℃
シースガス流速:12 L/min
スプレー電圧:500 V
キャピラリー電圧:3,500 V
解離電圧:200 V
Skimmer電圧:65 V
Rf電圧:7500 V
膜タンパク質をターゲットとする抗体と抗原との結合活性検出はFACSの方法を採用してもよい。例えば、C0、N0、F0、V0、S0、及びそのCH1/CL構造が改造された抗体は、FACSの方法により検出できる。96ウェルU型底板(corning、3795)にFACS緩衝液(98% PBS、2% FBS)で再懸濁させた細胞(2×106細胞/mL、90 μL)を加え、勾配希釈された抗体10 μLを加え、4℃で1 hインキュベートし、FACS緩衝液で2回洗浄した。その後、各ウェルにAlexa Fluor 488ヒツジ 抗-ヒトIgG(H+L)(invitrogen、Cat# 2015982、1:1000で希釈)を加え、4℃で1時間インキュベートし、2回洗浄した。次に、FACS緩衝液で細胞を再懸濁させ、最後にFACS CantoII(BD)で蛍光シグナル値を読取った。最後にFlowJo 7.6及びGraphpad Prism 5でデータを処理して分析した。
一、異なる抗体軽/重鎖交差ミスマッチ分子発現の検出方法
本実験は、異なる軽/重鎖抗体のペアリング発現を分析することで、CH1/CLがTitin-T鎖/Obscurin-O鎖又はTitin-T鎖/Obscurin-Like-O鎖で取り替えられた後に重/軽鎖ミスマッチの発生が効果的に低減できることを検証した。具体的に、細胞にトランスフェクションして抗体を発現した場合、D0及びI0の重/軽鎖をそれぞれ交換した(即ち、I/D-1(D0重鎖+I0軽鎖)。I/D-2(I0重鎖+D0軽鎖)で野生型CH1とCLが交差ミスマッチ分子を形成できるか検出した。同時に、D0及びI0のCH1/CLがTitin-T鎖/Obscurin-O鎖で取り替えられた後の構造改造抗体D3(D0の重鎖CH1がT.11で取り替えられ、軽鎖CLがO.21で取り替えられた)、I3(I0の重鎖CH1がT.11で取り替えられ、軽鎖CLがO.21で取り替えられた)の重軽鎖をそれぞれ交換して、I/D-3(D0重鎖+I3軽鎖)、I/D-4(D3重鎖+I0軽鎖)、I/D-5(I0重鎖+I3軽鎖)、I/D-6(I3重鎖+D0軽鎖)のミスマッチ分子を構築した。構築された抗体の構造模式図は図7を参照する。
CH1/CLがTitin-T鎖/Obscurin-O鎖で取り替えられた後にミスマッチの発生がないこと又はミスマッチが低減されることを検証するために、本試験例は3形態の軽/重鎖交叉ペアリング発現を設計した。即ち、異なる2本の重鎖と同じ1本のVL-CL軽鎖を二重特異性抗体の発現とし、又は異なる2本の重鎖と同じ1本のObscurin-O鎖でCLの軽鎖を取り替えて発現とし、又は異なる2本の重鎖と異なる2本の軽鎖の通常の発現を対照とする(具体的なペアリングは表15を参照)。
Biacore T200(GE)機器により検出待ち抗体と抗原タンパク質との親和力を測定した。ヒト捕捉防止試薬キット(GE、Cat# BR-1008-39)の取扱書における方法により、Protein Aバイオセンサチップ(Cat. # 29127556、Ge)により検出待ち抗体を親和的に捕捉した後、チップの表面で一連の濃度勾配の可溶性抗原を流し、Biacore T200機器によりリアルタイムで反応シグナルを検出することにより、結合と解離曲線を得た。各実験のサイクル解離が完了した後、グリシン-塩酸再生溶液(pH 1.5 Cat. # BR-1003-54、GE)でバイオセンサチップを洗浄して再生した。実験で得られたデータをBIAevaluation version 4.1、GEソフトウエアにより(1:1)Langmuirモデルでフィッティングし、親和力の数値を得た。実験結果は表16に示される。
Biacore T200(GE)機器により検出待ち抗体と抗原タンパク質との親和力を測定し、本開示のCH1-CL構造が改造された二重特異性抗体と2つのターゲット抗原との同時結合を検証した。具体的な実験工程は下記の通りである。Protein Aバイオセンサチップ(Cat. # 29127556、GE)により抗体BU5を親和的に捕捉した後、チップの表面で二重特異性抗体の第1抗原分子hP40(Sino biologicalより購入し、10052-H08H)を飽和になるまで流し、更に所定濃度の第2抗原分子hBAFF(Sino biologicalより購入し、10056-HNCH)を注入し、Biacore T200機器によりリアルタイムで反応シグナルを検出し、結合と解離曲線を得た。各実験のサイクル解離が完了した後、グリシン-塩酸再生溶液(pH 1.5 Cat. # BR-1003-54、GE)でバイオセンサチップを洗浄して再生し、データフィッティングモデルはBIAevaluation version 4.1、GEソフトウエアにより(1:1)Langmuirモデルでフィッティングした。その後、更にProtein Aバイオセンサチップ(Cat. # 29127556、GE)により抗体BU5を親和的に捕捉した後、チップの表面で二重特異性抗体の第1抗原分子hP40(Sino biologicalより購入し、10052-H08H)を飽和になるまで流し、更に所定濃度の第2抗原分子hBAFF(Sino biologicalより購入し、10056-HNCH)を注入し、Biacore T200機器によりリアルタイムで反応シグナルを検出し、結合と解離曲線を得た。各実験のサイクル解離が完了した後、グリシン-塩酸再生溶液(pH 1.5 Cat. # BR-1003-54、GE)でバイオセンサチップを洗浄して再生し、データフィッティングモデルはBIAevaluation version 4.1、GEソフトウエアにより(1:1)Langmuirモデルでフィッティングした。
Raw264.7細胞(中科院細胞バンク、SCSP-5036)を消化し、再懸濁させてカウントし、24ウェル細胞培養プレート(Corning、3524)に敷き、37℃セルインキュベーターで一晩培養した。翌日、抗体溶液を異なる濃度で希釈し、RANKL(Sino biological、11682-HNCH)と均一に混合させて、細胞培養プレートに入れ、RANKL最終濃度が50 ng/mLであり、37℃で引続き培養した。96 h後に24ウェルプレートにおける溶液を除去し、各ウェルに100 μL細胞解離液(Beyotime、P0013J)を加え、均一に吹き込み、解離液をEP管に移動して、12000 gで5 min遠心分離し、上澄を取り、酒石酸耐性酸性ホスファターゼ検出試薬キット(Beyotime、P0332)により取扱書の方法で検出し、マイクロプレートリーダーにより405 nmにおける吸収値を読取った。検出値をソフトウエアにより曲線にフィッティングし、IC50値を算出した。実験結果は図10に示される。実験結果によれば、CH1/CLが取り替えられた後の二重特異性抗体DI-1は良好な活性を保持し、破骨細胞の分化を効果的に抑制する。
NGFにより誘導されたTF-1細胞(ATCC、CRL-2003)増殖実験によって、抗体の細胞レベルにおける活性を評価した。実験方法は下記の通りである。TF1細胞を消化して収集し、再懸濁させてカウントし、96ウェルプレート(Corning、3903)に敷き、37℃インキュベーターで一晩培養した。翌日、抗体溶液を異なる濃度で希釈し、NGF(Sino biological、11050-HNAC)と均一に混合させて、細胞培養プレートに入れ、NGFの最終濃度が10 ng/mLであり、細胞をインキュベーターに置いて引続き培養した。72 h後に細胞培養プレートを取り出し、各ウェルに50 μL Cell-titer Glo(Promega、G755B)検出液を入れ、オービタルシェーカーに設置し、10 minインキュベートし、室温で10 min静置した。マイクロプレートリーダー(PerkinElmer、Victor3)により発光シグナルを検出した。検出されたシグナル値をソフトウエアによりグラフにフィッティングし、IC50値を算出した。実験結果は図11に示される。実験結果によれば、CH1/CLが取り替えられた後の二重特異性抗体DI-1は良好な活性を有する。
下記のように、実験によりCH1/CLがTitin-T鎖/Obscurin-O鎖で取り替えられ、又はTCRα/TCRβで取り替えられる場合の二重特異性抗体軽重鎖ミスマッチの状況を分析した。具体的な実験は下記の通りである。
TCRα/TCRβでH0又はJ1のCH1/CLを取り替え、4本鎖からなる二重特異性抗体HJ-1とHJ-2を構築した。Titin-T鎖/Obscurin-O鎖でH0又はJ1のCH1/CLを取り替え、4本鎖からなる二重特異性抗体HJ-3とHJ-4を構築した。二重特異性抗体の構造模式図は図12を参照する。二重特異性抗体の全長配列は表18を参照する。
本試験において、3本鎖(1本のCH1がTCRβ又はTitin-T鎖で取り替えられた重鎖、1本のCH1が取り替えられていない重鎖、1本のCLが取り替えられていない野生型軽鎖(VL-CL)、具体的な配列は表18を参照)でコトランスフェクションして発現した後、発現生成物に対してマススペクトル分析を行い(方法は本開示の試験例3を参照)、抗体純度SECを検出し(方法は本開示の試験例2を参照)、野生型軽鎖(VL-CL)とCH1がTCRβ又はTitin-T鎖で取り替えられた重鎖と組合せてミスマッチ分子を形成するか検証した。実験結果は図14A、図14B、図15A、図15B及び表20に示される。
本開示は、例えば、以下に関する。
[1]
第1抗原結合部分を含み、前記第1抗原結合部分が、
A)N末端からC末端までの第1重鎖可変ドメイン(VH1)を含み、前記VH1が第1ドメインに操作可能に連結され、前記第1ドメインがTitin-T鎖を含む第1ポリペプチドと、
N末端からC末端までの第1軽鎖可変ドメイン(VL1)を含み、前記VL1が第2ドメインに操作可能に連結され、前記第2ドメインがTitin-T鎖と互いに作用できるドメインを含む第2ポリペプチドと、を含み、
或いは
B)N末端からC末端までのVH1を含み、前記VH1が第1ドメインに操作可能に連結され、前記第1ドメインがTitin-T鎖と互いに作用できるドメインを含む第1ポリペプチドと、
N末端からC末端までのVL1を含み、前記VL1が第2ドメインに操作可能に連結され、前記第2ドメインがTitin-T鎖を含む第2ポリペプチドと、を含み、
或いは
C)N末端からC末端までのVH1を含み、前記VH1が第1ドメインに操作可能に連結され、前記第1ドメインがObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖を含む第1ポリペプチドと、
N末端からC末端までのVL1を含み、前記VL1が第2ドメインに操作可能に連結され、前記第2ドメインがObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖と互いに作用できるドメインを含む第2ポリペプチドと、を含み、
或いは
D)N末端からC末端までのVH1を含み、前記VH1が第1ドメインに操作可能に連結され、前記第1ドメインがObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖と互いに作用できるドメインを含む第1ポリペプチドと、
N末端からC末端までのVL1を含み、前記VL1が第2ドメインに操作可能に連結され、前記第2ドメインがObscurin-O鎖或Obscurin-Like-O鎖を含む第2ポリペプチドと、を含み、
前記第1抗原結合部分が第1抗原に特異的に結合し、前記第1ドメインが第2ドメインと二量体を形成できる、ポリペプチド複合物。
[2]
前記Obscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖と互いに作用できるドメインがTitin-T鎖であり、
前記Titin-T鎖と互いに作用できるドメインがObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖である、前記[1]に記載のポリペプチド複合物。
[3]
前記第1抗原結合部分のVH1とVL1が第1抗原に特異的に結合する第1抗原結合部位を形成し、前記VH1のC末端が第1ドメインのN末端に操作可能に連結され、前記VL1のC末端が第2ドメインのN末端に操作可能に連結される、前記[1]又は[2]に記載のポリペプチド複合物。
[4]
前記第1ドメインが第2ドメインと天然鎖間結合及び/又は非天然鎖間結合により二量体を形成し、
好ましくは、前記第1ドメインが第2ドメインと天然鎖間結合により二量体を形成し、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖における7~15、19~24、26、55、59及び60番目から選ばれる1つ又は複数の残基がObscurin-O鎖における3~6、9、41、73、75及び80~90番目から選ばれる1つ又は複数の残基と互いに結合し、或いは
前記Titin-T鎖における1、7~10、13~16、19~26、59~60及び96番目から選ばれる1つ又は複数の残基がObscurin-Like-O鎖における4~5、10、12~13、74、76、78及び82~91番目から選ばれる1つ又は複数の残基と互いに結合し、
前記Titin-T鎖における残基部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、前記Obscurin-O鎖における残基部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、前記Obscurin-Like-O鎖における残基部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である、前記[1]~[3]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。
[5]
前記第1ドメインが第2ドメインと少なくとも1つの非天然鎖間結合により二量体を形成し、
好ましくは、前記非天然鎖間結合が第1ドメインの特定変異残基と第2ドメインの特定変異残基との間に形成され、
更に好ましくは、前記変異残基における少なくとも一対がシステイン残基であり、
最も好ましくは、前記非天然鎖間結合がジスルフィド結合であり、
更に好ましくは、前記二量体が1、2、3、4、5、6、7、8、9又は10個の非天然鎖間結合を含む、前記[1]~[4]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。
[6]
前記第1ドメインの特定変異残基と第2ドメインの特定変異残基が下記変異から選ばれ、即ち、
(A)前記Titin-T鎖が8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖が3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、或いは、
(B)前記Titin-T鎖が8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖が6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、
好ましくは、前記Titin-T鎖がA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がA3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、或いは
前記Titin-T鎖がA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、
更に好ましくは、前記第1ドメインの変異残基と第2ドメインの変異残基が下記変異から選ばれ、即ち、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がA88C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-O鎖がA3C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA26C変異を有し、且つObscurin-O鎖がR9C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S及びA88C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S及びA3C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA26C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S及びR9C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E及びV74C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E及びG84C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びT22C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E及びA86C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びV74C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びG84C変異を有し、或いは
Titin-T鎖がC25S、C39T及びT22C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びA86C変異を有し、
Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である、前記[5]に記載のポリペプチド複合物。
[7]
前記Obscurin-O鎖が7、11、62番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を更に有し、
好ましくは、前記Obscurin-O鎖がL7R又はL7K、T62K又はT62H、及びK11Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、
最も好ましくは、前記Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、L7K及びT62K変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、L7K及びT62H変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、K11L及びT62K変異を有し、或いは
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、K11L及びT62Hを有し、
Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位である、前記[6]に記載のポリペプチド複合物。
[8]
前記第1ドメインと第2ドメインが下記から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、即ち、
Titin-T鎖が3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、及び/又はObscurin-O鎖が2、11、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、89、92、94及び97番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、
好ましくは、前記第1ドメインと第2ドメインが下記から選ばれる1つ又は複数の残基変異を有し、即ち、
Titin-T鎖がP3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、及び/又はObscurin-O鎖がG2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖がM66S及びT77Sアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がL11K、A12S、F13Y、V14T及びT22Sアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がM66K、K70R、S79T及びG81Rアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がG2E、V17E、N30D、T32P、Q34E、S36T、V44I、A45T、L58V、K62E、A67Q、G69S及びA97Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がP3W、S11I、I13L、T22M及びN82Mアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がD20L、T22M及びA53Lアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がS11I、M66K、S79T及びG81Rアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ41K、A45T、A67Q、G69S及びV89Lアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がG40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、L75V、E83D及びF84Lアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ42L、A45T、A67T、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がQ47E、Q49G、N56S、D58E及びL75Vアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ42L、A45T、A67T、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がN56S、D58E及びL75Vアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ42L、A45T、A67T、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、或いは
前記Titin-T鎖がN56S、D58E、M66S及びT77Sアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がA12S、F13Y、T22S、Q42L、A45T、A67Q、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列に対する自然順番号部位である、前記[1]~[7]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。
[9]
前記VH1が第1連結ドメインにより第1ドメインに操作可能に連結され、前記VL1が第2連結ドメインにより第2ドメインに操作可能に連結され、
好ましくは、前記第1連結ドメイン及び/又は前記第2連結ドメインが下記から選ばれ、即ち、Titin-T鎖のN末端断片、Obscurin-O鎖のN末端断片、Obscurin-Like-O鎖のN末端断片、及び(G x S) y コネクソン(但し、Xが1~5の整数から選ばれ、Yが1~6の整数から選ばれる)から選ばれ、
更に好ましくは、前記第1連結ドメイン及び/又は前記第2連結ドメインが下記ポリペプチド断片、即ち、「KAGIR」、「DQPQF」、(G 4 S) 1 及び(G 4 S) 2 から選ばれ、
最も好ましくは、前記第1ドメインがTitin-T鎖であり、前記第1連結ドメインがKAGIRポリペプチドであり、前記第2ドメインがObscurin-O鎖であり、前記第2連結ドメインがDQPQFポリペプチドであり、或いは
前記第2ドメインがTitin-T鎖であり、前記第2連結ドメインがKAGIRポリペプチドであり、前記第1ドメインがObscurin-O鎖であり、前記第1連結ドメインがDQPQFポリペプチドである、前記[1]~[8]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。
[10]
(A)前記Titin-T鎖の配列が、配列番号32に示される通りであり、若しくは配列番号32の配列を基に3、8、11、13、20、22、25、26、39、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端にKAGIRアミノ酸残基を付加する配列であり、
好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C、C39T、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にKAGIRアミノ酸残基を付加する配列であり、及び/又は
(B)前記Obscurin-O鎖の配列が、配列番号33に示される通りであり、若しくは配列番号33の配列を基に2、3、7、9、11、12、13、14、17、20、22、25、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、76、88、89、92、94及び97から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S、A88C、L7K、T62K又はT62H、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、T62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖の配列が、配列番号34に示される通りであり、若しくは配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有する配列であり、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有する配列であり、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位であり、
好ましくは、
A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基に3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-O鎖が、配列番号33の配列を基に3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Obscurin-O鎖が、配列番号45の配列を基に7、11、62番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を更に有し、好ましくは、L7K又はL7R、T62K又はT62H、及びK11Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号45の配列の自然順番号部位であり、
最も好ましくは、前記Obscurin-O鎖が、配列番号50の配列を基に2、11、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、89、92、94及び97番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列の自然順番号部位であり、
或いは
A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基に3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-Like-O鎖が、配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である、前記[1]~[9]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。
[11]
前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、及び/又は前記Obscurin-O鎖が配列番号33、42~58、77~86の何れか1つに示される配列又は配列番号33、42~58、77~86の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、或いは
前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖が配列番号34、59~64の何れか1つに示される配列、又は配列番号34、59~64の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖が配列番号68に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号80に示される配列を含み、
前記Titin-T鎖が配列番号73に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号83に示される配列を含み、
前記Titin-T鎖が配列番号76に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号84に示される配列を含み、
前記Titin-T鎖が配列番号76に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号86に示される配列を含み、或いは
前記Titin-T鎖が配列番号75に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号86に示される配列を含む、前記[1]~[10]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。
[12]
前記第1抗原が外因性抗原、内因性抗原、自己抗原、新生抗原、ウイルス抗原及び腫瘍抗原から選ばれる、前記[1]~[11]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。
[13]
前記[1]~[12]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物であり、第1抗原に特異的に結合する第1ポリペプチド複合物と、
第2抗原結合部分を含み、第2抗原に特異的に結合する第2ポリペプチド複合物と、を含み、
前記第1ポリペプチド複合物と第2ポリペプチド複合物が異なる2つの抗原に結合し、又は同じ抗原における異なる2つのエピトープに結合し、
好ましくは、前記第2ポリペプチド複合物が第2重鎖可変ドメイン(VH2)と第2軽鎖可変ドメイン(VL2)とを含み、前記第1ポリペプチド複合物のVH1と第2ポリペプチド複合物のVL2との間、及び/又は第2ポリペプチド複合物のVH2と第1ポリペプチド複合物のVL1との間にミスマッチが起きにくく、更に好ましくは、二重特異性ポリペプチド複合物であり、最も好ましくは、前記第2抗原結合部分のVH2とVL2が第2抗原に特異的に結合する第2抗原結合部位を形成する、多重特異性ポリペプチド複合物。
[14]
前記第2ポリペプチド複合物の第2抗原結合部分が、
N末端からC末端までのVH2を含み、第3ドメインに操作可能に連結され、前記第3ドメインがCH1を含む第3ポリペプチドと、
N末端からC末端までのVL2を含み、第4ドメインに操作可能に連結され、前記第4ドメインがCLを含む第4ポリペプチドと、を含み、
好ましくは、前記VH2のC末端がCH1のN末端に操作可能に連結され、前記VL2のC末端がCLのN末端に操作可能に連結される、前記[13]に記載の多重特異性ポリペプチド複合物。
[15]
前記第1ポリペプチド複合物が第1二量化ドメインを更に含み、前記第2ポリペプチド複合物が第2二量化ドメインを更に含み、前記第1二量化ドメインが第2二量化ドメインに結合し、
好ましくは、前記第1ポリペプチド複合物の第1ドメインのC末端が第1二量化ドメインのN末端に操作可能に連結され、前記第2ポリペプチド複合物の第3ドメインのC末端が第2二量化ドメインのN末端に操作可能に連結され、
更に好ましくは、前記第1二量化ドメインが下記から選ばれる方式により、即ち、抗体ヒンジ領域又はその一部、コネクソン、ジスルフィド結合、水素結合、静電相互作用、塩橋、疎水-親水相互作用、又はこれらの組合せから選ばれる方式により、第2二量化ドメインに結合し、
最も好ましくは、前記第1二量化ドメインが下記から選ばれる方式により、即ち、抗体ヒンジ領域又はその一部の結合から選ばれる方式により、好ましくは、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4のヒンジ領域又はその一部から選ばれる方式により、第2二量化ドメインに結合する、前記[13]又は[14]に記載の多重特異性ポリペプチド複合物。
[16]
前記第1二量化ドメインが抗体CH2ドメイン及び/又は抗体CH3ドメインを含み、及び/又は前記第2二量化ドメインが抗体CH2ドメイン及び/又は抗体CH3ドメインを含み、
好ましくは、前記抗体CH2ドメイン及び/又は抗体CH3ドメインがIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4に由来する、前記[15]に記載の多重特異性ポリペプチド複合物。
[17]
前記第1二量化ドメインが第2二量化ドメインと異なり、ホモ二量化を阻止する方式及び/又はヘテロ二量化を促進する方式により結合し、
好ましくは、前記第1二量化ドメインが下記から選ばれる方式により、即ち、knob-into-hole、疎水相互作用、静電相互作用、親水相互作用、又は柔軟性を向上させる方式から選ばれる方式により、第2二量化ドメインに結合し、
更に好ましくは、前記第1二量化ドメインが配列番号2に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、且つ前記第2二量化ドメインが配列番号3に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、或いは
前記第1二量化ドメインが配列番号3に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、且つ前記第2二量化ドメインが配列番号2に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有する、前記[15]又は[16]に記載の多重特異性ポリペプチド複合物。
[18]
前記抗体の少なくとも1つの重鎖定常領域ドメインCH1と少なくとも1つの軽鎖定常領域ドメインCLが取り替えられ、
A)前記ドメインCH1がTitin-T鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
B)前記ドメインCLがTitin-T鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
C)前記ドメインCH1がObscurin-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
D)前記ドメインCLがObscurin-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
E)前記ドメインCH1がObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
F)前記ドメインCLがObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
好ましくは、前記Obscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインはTitin-T鎖であり、
前記Titin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインはObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖であり、
更に好ましくは、前記抗体が重鎖可変領域VH1と軽鎖可変領域VL1とを含み、前記VH1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VL1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結され、或いは
前記VL1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VH1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結される、ドメイン改造抗体。
[19]
ドメイン改造抗体のFab断片であって、前記Fab断片の定常領域ドメインCH1と定常領域ドメインCLが取り替えられ、
前記ドメインCH1がTitin-T鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記ドメインCLがTitin-T鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記ドメインCH1がObscurin-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記ドメインCLがObscurin-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記ドメインCH1がObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCLがObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記ドメインCLがObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記ドメインCH1がObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
好ましくは、前記Titin-T鎖とタンパク質間相互作用を有するドメインはObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖であり、
前記Obscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有するドメインはTitin-T鎖であり、
更に好ましくは、前記Fabが重鎖可変領域VH1と軽鎖可変領域VL1とを含み、前記VH1とVL1が抗原結合部位を形成し、前記VH1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VL1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結され、或いは
前記VL1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VH1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結される、ドメイン改造抗体のFab断片。
[20]
前記[19]に記載のFab断片を含む、ドメイン改造抗体。
[21]
第1抗原に特異的に結合する第1重鎖と第1軽鎖を含み、第2抗原に特異的に結合する第2重鎖と第2軽鎖を更に含み、
前記第1重鎖のCH1ドメインがTitin-T鎖で取り替えられ、第1軽鎖のCLドメインがTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記第1軽鎖のCLドメインがTitin-T鎖で取り替えられ、前記第1重鎖のCH1ドメインがTitin-T鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記第1重鎖のCH1ドメインがObscurin-O鎖で取り替えられ、前記第1軽鎖のCLドメインがObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記第1軽鎖のCLドメインがObscurin-O鎖で取り替えられ、前記第1重鎖のCH1ドメインがObscurin-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記第1重鎖のCH1ドメインがObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記第1軽鎖のCLドメインがObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、或いは
前記第1軽鎖のCLドメインがObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記第1重鎖のCH1ドメインがObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有することができるドメインで取り替えられ、
前記第1抗原が第2抗原と異なり、又は前記第1抗原と第2抗原が同じ抗原における異なる2つのエピトープであり、
好ましくは、前記第1重鎖と第2軽鎖との間、第1軽鎖と第2重鎖との間にミスマッチが起きにくく、更に好ましくは、前記Titin-T鎖とタンパク質間相互作用を有するドメインがObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖であり、
前記Obscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖とタンパク質間相互作用を有するドメインがTitin-T鎖である、二重特異性抗体。
[22]
前記第1重鎖が第1重鎖可変領域(VH1)を含み、前記第1軽鎖が第1軽鎖可変領域(VL1)を含み、前記VH1とVL1が第1抗原に特異的に結合する抗原結合部位を形成し、且つ
前記VH1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VL1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結され、或いは
前記VL1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VH1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結される、前記[21]に記載の二重特異性抗体。
[23]
前記第2重鎖がN末端からC末端までの第2重鎖可変領域(VH2)を含み、CH1に操作可能に連結され、前記第2軽鎖がN末端からC末端までの第2軽鎖可変領域(VL2)を含み、CLに操作可能に連結され、
好ましくは、前記VH2とVL2が第2抗原に特異的に結合する抗原結合部位を形成し、前記VH2のC末端がCH1のN末端に操作可能に連結され、前記VL2のC末端がCLのN末端に操作可能に連結される、前記[21]又は[22]に記載の二重特異性抗体。
[24]
前記第1重鎖と第2重鎖のC末端がCH2及び/又はCH3ドメインを含み、
好ましくは、前記CH1、CH2及びCH3ドメインがIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4に由来し、
更に好ましくは、前記第1重鎖が下記から選ばれる方式により、即ち、抗体ヒンジ領域又はその一部、コネクソン、ジスルフィド結合、水素結合、静電相互作用、塩橋、疎水-親水相互作用、又はこれらの組合せから選ばれる方式により、第2重鎖に結合する、前記[21]~[23]の何れか1項に記載の二重特異性抗体。
[25]
前記第1重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH1-L1-Titin-T鎖-L2-CH2-CH3であり、
前記第1軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL1-L3-Obscurin-O鎖又はVL1-L4-Obscurin-Like-O鎖であり、
前記第2重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH2-CH1-CH2-CH3であり、
前記第2軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL2-CLであり、
或いは、
前記第1軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL1-L1-Titin-T鎖であり、
前記第1重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH1-L2-Obscurin-O鎖-L3-CH2-CH3、又はVH1-L4-Obscurin-Like-O鎖-L5-CH2-CH3であり、
前記第2重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH2-CH1-CH2-CH3であり、
前記第2軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL2-CLであり、
前記L1~L5がスペーサー領域であり、スペーサー領域が存在してもよく、又は存在しなくてもよく、
好ましくは、前記スペーサー領域が下記から選ばれ、即ち、Titin-T鎖のN末端断片、Obscurin-O鎖のN末端断片、Obscurin-Like-O鎖のN末端断片、又は(G x S) y コネクソン(但し、Xが1~5の整数から選ばれ、Yが1~6の整数から選ばれる)から選ばれ、
最も好ましくは、前記スペーサー領域が下記から選ばれ、即ち、「KAGIR」、「DQPQF」、(G 4 S) 1 及び(G 4 S) 2 から選ばれる、前記[24]に記載の二重特異性抗体。
[26]
前記第1重鎖のCH2及びCH3と第2重鎖のCH2及びCH3が異なり、ホモ二量化を阻止する方式及び/又はヘテロ二量化を促進する方式により結合し、
好ましくは、前記第1重鎖が下記から選ばれる方式により、即ち、knob-into-hole、疎水相互作用、静電相互作用、親水相互作用、又は柔軟性を向上させる方式から選ばれる方式により、第2重鎖に結合し、
更に好ましくは、前記第1重鎖がknob-into-holeを含む方式により第2重鎖に結合し、
最も好ましくは、前記第1重鎖CH2-CH3ドメインが配列番号2に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、前記第2重鎖CH2-CH3ドメインが配列番号3に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、或いは
前記第1重鎖CH2-CH3ドメインが配列番号3に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、前記第2重鎖CH2-CH3ドメインが配列番号2に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有する、前記[25]に記載の二重特異性抗体。
[27]
前記操作可能に連結されることは、2本のポリペプチド配列が連結ドメインにより連結されること、又は2本のポリペプチドが直接的に連結されることである、前記[18]又は[20]に記載のドメイン改造抗体、或いは前記[19]に記載のドメイン改造抗体のFab断片、或いは前記[21]~[26]の何れか1項に記載の二重特異性抗体。
[28]
前記Titin-T鎖がObscurin-O鎖に、又はTitin-T鎖がObscurin-Like-O鎖に、天然鎖間結合により結合し、及び/又は非天然鎖間結合により二量体を形成し、
好ましくは、前記Titin-T鎖がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖と天然鎖間結合により二量体を形成し、前記Titin-T鎖における7~15、19~24、26、55、59及び60番目から選ばれる1つ又は複数の残基がObscurin-O鎖における3~6、9、41、73、75及び80~90番目から選ばれる1つ又は複数の残基と互いに結合し、或いは
前記Titin-T鎖における1、7~10、13~16、19~26、59~60及び96番目から選ばれる1つ又は複数の残基がObscurin-Like-O鎖における4~5、10、12~13、74、76、78及び82~91番目から選ばれる1つ又は複数の残基と互いに結合し、
前記Titin-T鎖残基部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖残基部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖残基部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である、前記[27]に記載のドメイン改造抗体、或いは二重特異性抗体、或いはドメイン改造抗体のFab断片。
[29]
前記Titin-T鎖がObscurin-O鎖と、又はTitin-T鎖がObscurin-Like-O鎖と、少なくとも1つの非天然鎖間結合により二量体を形成し、
好ましくは、前記非天然鎖間結合がジスルフィド結合であり、
更に好ましくは、前記二量体が1、2、3、4、5、6、7、8、9又は10個の非天然鎖間結合を含む、前記[27]又は[28]に記載のドメイン改造抗体、二重特異性抗体或いはドメイン改造抗体のFab断片。
[30]
前記Titin-T鎖が8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖が3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、或いは
前記Titin-T鎖が8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖が6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、
好ましくは、前記Titin-T鎖がA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は
前記Obscurin-O鎖がA3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、或いは
前記Titin-T鎖がA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は
前記Obscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がA88C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-O鎖がA3C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA26C変異を有し、且つObscurin-O鎖がR9C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S及びA88C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S及びA3C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA26C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S及びR9C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E及びV74C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E及びG84C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びT22C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E及びA86C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びV74C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びG84C変異を有し、或いは
Titin-T鎖がC25S、C39T及びT22C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びA86C変異を有し、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列に対する自然順部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列に対する自然順部位である、前記[27]~[29]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体、二重特異性抗体或いはドメイン改造抗体のFab断片。
[31]
前記Obscurin-O鎖が7、11及び62番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を更に有し、
好ましくは、前記Obscurin-O鎖がL7K又はL7R、K11L、及びT62K又はT62Hから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、
最も好ましくは、前記Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、L7K及びT62K変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、L7K及びT62H変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、K11L及びT62K変異を有し、或いは
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、K11L及びT62Hを有し、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位である、前記[29]又は[30]に記載のドメイン改造抗体、二重特異性抗体或いはドメイン改造抗体のFab断片。
[32]
前記Titin-T鎖が3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、及び/又は
Obscurin-O鎖が2、11、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、89、92、94及び97番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、
好ましくは、前記Titin-T鎖がP3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、及び/又は
Obscurin-O鎖がG2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖がM66S及びT77Sアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がL11K、A12S、F13Y、V14T及びT22Sアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がM66K、K70R、S79T及びG81Rアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がG2E、V17E、N30D、T32P、Q34E、S36T、V44I、A45T、L58V、K62E、A67Q、G69S及びA97Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がP3W、S11I、I13L、T22M及びN82Mアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がD20L、T22M及びA53Lアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がS11I、M66K、S79T及びG81Rアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ41K、A45T、A67Q、G69S及びV89Lアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がG40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、L75V、E83D及びF84Lアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ42L、A45T、A67T、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がQ47E、Q49G、N56S、D58E及びL75Vアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ42L、A45T、A67T、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がN56S、D58E及びL75Vアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ42L、A45T、A67T、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、或いは
前記Titin-T鎖がN56S、D58E、M66S及びT77Sアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がA12S、F13Y、T22S、Q42L、A45T、A67Q、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列に対する自然順番号部位である、前記[27]~[31]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体、二重特異性抗体或いはドメイン改造抗体のFab断片。
[33]
前記Titin-T鎖、Obscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端が連結ドメインによりVH1又はVL1に操作可能に連結され、
好ましくは、前記連結ドメインが下記から選ばれ、即ち、Titin-T鎖のN末端断片、Obscurin-O鎖のN末端断片、Obscurin-Like-O鎖のN末端断片、及び(G x S) y コネクソン(但し、Xが1~5の整数から選ばれ、Yが1~6の整数から選ばれる)から選ばれ、
更に好ましくは、前記連結ドメインが下記から選ばれ、即ち、「KAGIR」、「DQPQF」、(G 4 S) 1 及び(G 4 S) 2 から選ばれ、
最も好ましくは、前記Titin-T鎖がKAGIRポリペプチドによりVH1又はVL1に連結し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がDQPQFポリペプチドによりVL1又はVH1に連結する、前記[27]~[32]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体、二重特異性抗体或いはドメイン改造抗体のFab断片。
[34]
A)前記Titin-T鎖の配列が、配列番号32に示される通りであり、若しくは配列番号32の配列を基に3、8、11、13、20、22、25、26、39、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端に5つのアミノ酸残基KAGIRを付加する配列であり、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C、C39T、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にKAGIRアミノ酸残基を付加する配列であり、及び/又は
B)前記Obscurin-O鎖の配列が、配列番号33に示される通りであり、若しくは配列番号33の配列を基に2、3、7、9、11、12、13、14、17、20、22、25、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、76、88、89、92、94及び97から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S、A88C、L7K又はL7R、T62K又はT62H、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、T62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖の配列が、配列番号34に示される通りであり、若しくは配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有する配列であり、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有する配列であり、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位であり、
好ましくは、
A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基に3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-O鎖が、配列番号33の配列を基に3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、
好ましくは、前記Obscurin-O鎖が、配列番号45の配列を基に7、11、62番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を更に有し、好ましくは、L7K又はL7R、T62K又はT62H、及びK11Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号45の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Obscurin-O鎖が、配列番号50の配列を基に2、11、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、89、92、94及び97番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列の自然順番号部位であり、
或いは
A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基に3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-Like-O鎖が、配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である、前記[27]~[33]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体、二重特異性抗体或いはドメイン改造抗体のFab断片。
[35]
前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、及び/又は
前記Obscurin-O鎖が配列番号33、42~58、77~86の何れか1つに示される配列、又は配列番号33、42~58、77~86の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、或いは
前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、及び/又は
前記Obscurin-Like-O鎖が配列番号34、59~64の何れか1つに示される配列、又は配列番号34、59~64の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、
更に好ましくは、
前記Titin-T鎖が配列番号68に示されるポリペプチドを含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号80に示されるポリペプチドを含み、
前記Titin-T鎖が配列番号73に示されるポリペプチドを含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号83に示されるポリペプチドを含み、
前記Titin-T鎖が配列番号76に示されるポリペプチドを含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号84に示されるポリペプチドを含み、
前記Titin-T鎖が配列番号76に示されるポリペプチドを含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号86に示されるポリペプチドを含み、
前記Titin-T鎖が配列番号75に示されるポリペプチドを含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号86に示されるポリペプチドを含む、前記[27]~[34]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体、二重特異性抗体或いはドメイン改造抗体のFab断片。
[36]
下記A~Gの何れか1項に記載の二重特異性抗体から選ばれ、即ち、
A)第1重鎖の配列が配列番号89に示される通りであり、若しくは配列番号89と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号90に示される通りであり、若しくは配列番号90と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号87に示される通りであり、若しくは配列番号87と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号88に示される通りであり、若しくは配列番号88と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
B)第1重鎖の配列が配列番号93に示される通りであり、若しくは配列番号93と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号94に示される通りであり、若しくは配列番号94と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号91に示される通りであり、若しくは配列番号91と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号92に示される通りであり、若しくは配列番号92と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
C)第1重鎖の配列が配列番号97に示される通りであり、若しくは配列番号97と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号98に示される通りであり、若しくは配列番号98と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号95に示される通りであり、若しくは配列番号95と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
D)第1重鎖の配列が配列番号99に示される通りであり、若しくは配列番号99と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号100に示される通りであり、若しくは配列番号100と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号101に示される通りであり、若しくは配列番号101と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
E)第1重鎖の配列が配列番号102に示される通りであり、若しくは配列番号102と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号100に示される通りであり、若しくは配列番号100と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号95に示される通りであり、若しくは配列番号95と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
F)第1重鎖の配列が配列番号103に示される通りであり、若しくは配列番号103と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号104に示される通りであり、若しくは配列番号104と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号95に示される通りであり、若しくは配列番号95と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
G)第1重鎖の配列が配列番号107に示される通りであり、若しくは配列番号107と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号108に示される通りであり、若しくは配列番号108と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号109に示される通りであり、若しくは配列番号109と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号110に示される通りであり、若しくは配列番号110と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
H)第1重鎖の配列が配列番号122に示される通りであり、若しくは配列番号122と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号123に示される通りであり、若しくは配列番号123と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号116に示される通りであり、若しくは配列番号116と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号117に示される通りであり、若しくは配列番号117と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
I)第1重鎖の配列が配列番号118に示される通りであり、若しくは配列番号118と少なくとも85%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号119に示される通りであり、若しくは配列番号119と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号124に示される通りであり、若しくは配列番号124と少なくとも85%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号125に示される通りであり、若しくは配列番号125と少なくとも85%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
から選ばれる、前記[21]~[35]の何れか1項に記載の二重特異性抗体。
[37]
Titin-T鎖とObscurin-O鎖、又はTitin-T鎖とObscurin-Like-O鎖で抗体のCH1/CLを取り替える工程を含み、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、及び/又は
前記Obscurin-O鎖が配列番号33、42~58、77~86の何れか1つに示される配列、又は配列番号33、42~58、77~86の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、或いは
前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、及び/又は
前記Obscurin-Like-O鎖が配列番号34、59~64の何れか1つに示される配列、又は配列番号34、59~64の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、
最も好ましくは、
Titin-T鎖が配列番号68に示される配列を含み、且つObscurin-O鎖が配列番号80に示される配列を含み、
Titin-T鎖が配列番号73に示される配列を含み、且つObscurin-O鎖が配列番号83に示される配列を含み、
Titin-T鎖が配列番号76に示される配列を含み、且つObscurin-O鎖が配列番号84に示される配列を含み、
Titin-T鎖が配列番号76に示される配列を含み、且つObscurin-O鎖が配列番号86に示される配列を含み、或いは
Titin-T鎖が配列番号75に示される配列を含み、且つObscurin-O鎖が配列番号86に示される配列を含む、多重特異性抗体の調製方法。
[38]
前記[37]に記載の方法により調製され、
第1重鎖可変領域(VH1)と第1軽鎖可変領域(VL1)を含み、前記VH1とVL1が第1抗原に特異的に結合する抗原結合部位を形成し、且つ
前記VH1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VL1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結され、或いは
前記VL1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VH1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結される、多重特異性抗体。
[39]
A)前記Titin-T鎖の配列が、配列番号32に示される通りであり、若しくは配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26、39、3、11、13、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端に5つのアミノ酸残基KAGIRを付加する配列であり、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C、C39T、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にKAGIRアミノ酸残基を付加する配列であり、及び/又は
B)前記Obscurin-O鎖の配列が、配列番号33に示される通りであり、若しくは配列番号33の配列を基に3、9、25、76、88、7、11、62、2、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、67、69、89、92、94及び97から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S、A88C、L7K又はL7R、T62K又はT62H、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、T62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖の配列が、配列番号34に示される通りであり、若しくは配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有する配列であり、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有する配列であり、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位であり、
好ましくは、
A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基に3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-O鎖が、配列番号33の配列を基に3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、
好ましくは、前記Obscurin-O鎖が、配列番号45の配列を基に7、11、62番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を更に有し、好ましくは、L7K又はL7R、T62K又はT62H、及びK11Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号45の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Obscurin-O鎖が、配列番号50の配列を基に2、11、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、89、92、94及び97番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列の自然順番号部位であり、
或いは
A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基に3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-Like-O鎖が、配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である、前記[38]に記載の多重特異性抗体。
[40]
下記(A)~(F)から選ばれる何れかの物質を含み、即ち、
A)前記[1]~[12]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物と、
B)前記[13]~[17]の何れか1項に記載の多重特異性ポリペプチド複合物と、
C)前記[18]、[20]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体と、
D)前記[19]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体のFab断片と、
E)前記[21]~[36]の何れか1項に記載の二重特異性抗体と、
F)前記[38]又は[39]に記載の多重特異性抗体と、から選ばれる何れかの物質を含む、複合体。
[41]
配列が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列に示される通りであり、若しくは配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有し、或いは
配列が配列番号33、42~58、77~86の何れか1つの配列に示される通りであり、若しくは配列番号33、42~58、77~86の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有し、或いは
配列が配列番号34、59~64の何れか1つの配列に示される通りであり、若しくは配列番号34、59~64の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有し、
好ましくは、抗体CH1及び/又はCLを取り替えるために利用できる、ポリペプチド。
[42]
Titin-T鎖とObscurin-O鎖との組合せ、或いはTitin-T鎖とObscurin-Like-O鎖との組合せの、多重特異性抗体軽鎖/重鎖ミスマッチの低減における使用であって、
好ましくは、前記多重特異性抗体が第1重鎖可変領域(VH1)と第1軽鎖可変領域(VL1)を含み、前記VH1とVL1が第1抗原に特異的に結合する抗原結合部位を形成し、且つ
前記VH1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VL1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結され、或いは
前記VL1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VH1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結され、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、及び/又は前記Obscurin-O鎖が配列番号33、42~58、77~86の何れか1つに示される配列、又は配列番号33、42~58、77~86の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、或いは
前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖が配列番号34、59~64の何れか1つに示される配列、又は配列番号34、59~64の何れか1つの配列と少なくとも80%の同一性を有する配列を含み、
最も好ましくは、
Titin-T鎖が配列番号68に示される配列を含み、且つObscurin-O鎖が配列番号80に示される配列を含み、
Titin-T鎖が配列番号73に示される配列を含み、且つObscurin-O鎖が配列番号83に示される配列を含み、
Titin-T鎖が配列番号76に示される配列を含み、且つObscurin-O鎖が配列番号84に示される配列を含み、Titin-T鎖が配列番号76に示される配列を含み、且つObscurin-O鎖が配列番号86に示される配列を含み、或いは
Titin-T鎖が配列番号75に示される配列を含み、且つObscurin-O鎖が配列番号86に示される配列を含む、使用。
[43]
A)前記Titin-T鎖の配列が、配列番号32に示される通りであり、若しくは配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26、39、3、11、13、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端に5つのアミノ酸残基KAGIRを付加する配列であり、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C、C39T、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にKAGIRアミノ酸残基を付加する配列であり、及び/又は
B)前記Obscurin-O鎖の配列が、配列番号33に示される通りであり、若しくは配列番号33の配列を基に3、9、25、76、88、7、11、62、2、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、67、69、89、92、94及び97から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S、A88C、L7K又はL7R、T62K又はT62H、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、T62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖の配列が、配列番号34に示される通りであり、若しくは配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有する配列であり、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有する配列であり、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位であり、
好ましくは、
A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基に3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-O鎖が、配列番号33の配列を基に3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、
好ましくは、前記Obscurin-O鎖が、配列番号45の配列を基に7、11、62番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を更に有し、好ましくは、L7K又はL7R、T62K又はT62H、及びK11Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号45の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Obscurin-O鎖が、配列番号50の配列を基に2、11、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、89、92、94及び97番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列の自然順番号部位であり、
或いは
A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基に8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、A8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、
更に好ましくは、前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基に3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、好ましくは、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-Like-O鎖が、配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、好ましくは、C6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である、前記[42]に記載の使用。
[44]
下記(A)~(G)から選ばれ、即ち、
A)前記[1]~[12]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物と、
B)前記[13]~[17]の何れか1項に記載の多重特異性ポリペプチド複合物と、
C)前期[18]、[20]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体と、
D)前期[19]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体のFab断片と、
E)前記[21]~[36]の何れか1項に記載の二重特異性抗体と、
F)前記[41]に記載のポリペプチドと、
G)前記[38]又は[39]に記載の多重特異性抗体と、から選ばれる何れかの物質をコードする、核酸分子。
[45]
前記[44]に記載の核酸分子を含む、ベクター。
[46]
前記[45]に記載のベクターの変換により得られ、原核細胞及び真核細胞から選ばれ、好ましくは、真核細胞であり、更に好ましくは、哺乳動物細胞である、宿主細胞。
[47]
下記から選ばれ、即ち、
前記[1]~[12]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物、或いは前記[13]~[17]の何れか1項に記載の多重特異性ポリペプチド複合物、或いは前期[18]、[20]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体、或いは前期[19]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体のFab断片、或いは前記[21]~[36]の何れか1項に記載の二重特異性抗体、或いは前記[41]に記載のポリペプチド、或いは前記[38]又は[39]に記載の多重特異性抗体、から選ばれる何れかの物質を調製し、
下記工程を含み、即ち、
前記[46]に記載の宿主細胞を培養してから、ポリペプチド複合物、多重特異性ポリペプチド複合物、ドメイン改造抗体、ドメイン改造抗体のFab断片、二重特異性抗体、ポリペプチド又は多重特異性抗体を精製・回収することを含む、調製方法。
[48]
1種又は複数種の薬学的に許容可能な担体、賦形剤又は希釈剤、及び下記から選ばれ、即ち、
前記[1]~[12]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物、或いは前記[13]~[17]の何れか1項に記載の多重特異性ポリペプチド複合物、或いは前期[18]、[20]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体、或いは前期[19]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体のFab断片、或いは前記[21]~[36]の何れか1項に記載の二重特異性抗体、或いは前記[38]又は[39]に記載の多重特異性抗体、或いは前記[40]に記載の複合体、から選ばれる何れかの物質を含む、医薬組成物。
[49]
下記から選ばれ、即ち、前記[1]~[12]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物、或いは前記[13]~[17]の何れか1項に記載の多重特異性ポリペプチド複合物、或いは前記[18]、[20]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体、或いは前記[19]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体のFab断片、或いは前記[21]~[36]の何れか1項に記載の二重特異性抗体、或いは前記[48]に記載の医薬組成物、或いは前記[38]又は[39]に記載の多重特異性抗体、或いは前記[40]に記載の複合体、から選ばれる何れかの物質の、疾患又は障害を治療又は予防するための薬剤の調製における使用。
[50]
下記から選ばれ、即ち、
前記[1]~[12]の何れか1項に記載のポリペプチド複合物、或いは前記[13]~[17]の何れか1項に記載の多重特異性ポリペプチド複合物、或いは前記[18]、[20]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体、或いは前記[19]、[27]~[35]の何れか1項に記載のドメイン改造抗体のFab断片、或いは前記[21]~[36]の何れか1項に記載の二重特異性抗体、或いは前記[38]又は[39]に記載の多重特異性抗体、から選ばれる何れかの物質を検出待ちサンプルに接触させることを含む、検出方法。
Claims (46)
- 第1抗原結合部分を含み、前記第1抗原結合部分が、
A)N末端からC末端までの第1重鎖可変ドメイン(VH1)を含み、前記VH1が第1ドメインに操作可能に連結され、前記第1ドメインがTitin-T鎖を含む第1ポリペプチドと、
N末端からC末端までの第1軽鎖可変ドメイン(VL1)を含み、前記VL1が第2ドメインに操作可能に連結され、前記第2ドメインがObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖を含む第2ポリペプチドと、を含み、
或いは
B)N末端からC末端までのVH1を含み、前記VH1が第1ドメインに操作可能に連結され、前記第1ドメインがObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖を含む第1ポリペプチドと、
N末端からC末端までのVL1を含み、前記VL1が第2ドメインに操作可能に連結され、前記第2ドメインがTitin-T鎖を含む第2ポリペプチドと、を含み、
前記第1抗原結合部分が第1抗原に特異的に結合し、前記第1ドメインが第2ドメインと二量体を形成でき、
前記第1抗原結合部分のVH1とVL1が第1抗原に特異的に結合する第1抗原結合部位を形成し、前記VH1のC末端が第1ドメインのN末端に操作可能に連結され、前記VL1のC末端が第2ドメインのN末端に操作可能に連結され、
前記第1ドメインが第2ドメインと天然鎖間結合及び/又は非天然鎖間結合により二量体を形成し、前記非天然鎖間結合が第1ドメインの特定変異残基と第2ドメインの特定変異残基との間に形成され、
前記Titin-T鎖の配列が、配列番号32に示される通りであり、若しくは配列番号32の配列を基に3、8、11、13、20、22、25、26、39、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、
前記Obscurin-O鎖の配列が、配列番号33に示される通りであり、若しくは配列番号33の配列を基に2、3、7、9、11、12、13、14、17、20、22、25、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、76、88、89、92、94及び97から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、
前記Obscurin-Like-O鎖の配列が、配列番号34に示される通りであり、若しくは配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有する配列であり、
前記Titin-T鎖残基部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖残基部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖残基部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である、
ポリペプチド複合物。 - 前記第1ドメインが第2ドメインと天然鎖間結合により二量体を形成し、
前記Titin-T鎖における7~15、19~24、26、55、59及び60番目から選ばれる1つ又は複数の残基がObscurin-O鎖における3~6、9、41、73、75及び80~90番目から選ばれる1つ又は複数の残基と互いに結合し、或いは
前記Titin-T鎖における1、7~10、13~16、19~26、59~60及び96番目から選ばれる1つ又は複数の残基がObscurin-Like-O鎖における4~5、10、12~13、74、76、78及び82~91番目から選ばれる1つ又は複数の残基と互いに結合し、
前記Titin-T鎖における残基部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、前記Obscurin-O鎖における残基部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、前記Obscurin-Like-O鎖における残基部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である、請求項1に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1ドメインが第2ドメインと少なくとも1つの非天然鎖間結合により二量体を形成し、
前記非天然鎖間結合が第1ドメインの特定変異残基と第2ドメインの特定変異残基との間に形成され、
前記変異残基における少なくとも一対がシステイン残基であり、
前記非天然鎖間結合がジスルフィド結合であり、
前記二量体が1、2、3、4、5、6、7、8、9又は10個の非天然鎖間結合を含む、請求項1又は2に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1ドメインの特定変異残基と第2ドメインの特定変異残基が下記変異から選ばれ、即ち、
(A)前記Titin-T鎖が8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖が3、9、25、76及び88番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、或いは、
(B)前記Titin-T鎖が8、20、22、25、26及び39番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖が6、26、74、77、84及び86番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、
前記Titin-T鎖における変異部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、前記Obscurin-O鎖における変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、前記Obscurin-Like-O鎖における変異部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である、請求項1~3の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1ドメインの特定変異残基と第2ドメインの特定変異残基が下記変異から選ばれ、即ち、
(A)前記Titin-T鎖がA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がA3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、或いは
(B)前記Titin-T鎖がA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、
前記Titin-T鎖における変異部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、前記Obscurin-O鎖における変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、前記Obscurin-Like-O鎖における変異部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である、請求項1~4の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1ドメインの変異残基と第2ドメインの変異残基が下記変異から選ばれ、即ち、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がA88C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-O鎖がA3C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA26C変異を有し、且つObscurin-O鎖がR9C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S及びA88C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S及びA3C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA26C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S及びR9C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E及びV74C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E及びG84C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びT22C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E及びA86C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びV74C変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びV20C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びG84C変異を有し、或いは
Titin-T鎖がC25S、C39T及びT22C変異を有し、且つObscurin-Like-O鎖がC6E、C26S、C77S及びA86C変異を有し、
Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である、請求項1~5の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記Obscurin-O鎖が7、11、62番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を更に有し、
Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位である、請求項4~6の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記Obscurin-O鎖がL7R又はL7K、T62K又はT62H、及びK11Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、
Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位である、請求項4~7の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、L7K及びT62K変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、L7K及びT62H変異を有し、
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、K11L及びT62K変異を有し、或いは
Titin-T鎖がC25S、C39T及びA8C変異を有し、且つObscurin-O鎖がC25S、C76S、A88C、K11L及びT62Hを有し、
Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位である、請求項4~8の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1ドメインと第2ドメインが下記から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、即ち、
Titin-T鎖が3、11、13、22、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、及び/又はObscurin-O鎖が2、11、12、13、14、17、20、22、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、89、92、94及び97番目から選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列に対する自然順番号部位である、請求項1~9の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1ドメインと第2ドメインが下記から選ばれる1つ又は複数の残基変異を有し、即ち、
Titin-T鎖がP3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、及び/又はObscurin-O鎖がG2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列に対する自然順番号部位である、請求項1~10の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記Titin-T鎖がM66S及びT77Sアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がL11K、A12S、F13Y、V14T及びT22Sアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がM66K、K70R、S79T及びG81Rアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がG2E、V17E、N30D、T32P、Q34E、S36T、V44I、A45T、L58V、K62E、A67Q、G69S及びA97Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がP3W、S11I、I13L、T22M及びN82Mアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がD20L、T22M及びA53Lアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がS11I、M66K、S79T及びG81Rアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ41K、A45T、A67Q、G69S及びV89Lアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がG40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、L75V、E83D及びF84Lアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ42L、A45T、A67T、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がQ47E、Q49G、N56S、D58E及びL75Vアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ42L、A45T、A67T、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖がN56S、D58E及びL75Vアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がQ42L、A45T、A67T、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、或いは
前記Titin-T鎖がN56S、D58E、M66S及びT77Sアミノ酸変異を有し、及び/又は前記Obscurin-O鎖がA12S、F13Y、T22S、Q42L、A45T、A67Q、G69S、Q92E及びD94Gアミノ酸変異を有し、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列に対する自然順番号部位である、請求項1~11の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記VH1が第1連結ドメインにより第1ドメインに操作可能に連結され、前記VL1が第2連結ドメインにより第2ドメインに操作可能に連結され、
前記第1連結ドメイン及び/又は前記第2連結ドメインが下記から選ばれ、即ち、Titin-T鎖のN末端断片、Obscurin-O鎖のN末端断片、Obscurin-Like-O鎖のN末端断片、及び(GxS)yコネクソン(但し、Xが1~5の整数から選ばれ、Yが1~6の整数から選ばれる)から選ばれる、請求項1~12の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1連結ドメイン及び/又は前記第2連結ドメインが下記ポリペプチド断片、即ち、「KAGIR」、「DQPQF」、(G4S)1及び(G4S)2から選ばれる、請求項13に記載のポリペプチド複合物。
- 前記第1ドメインがTitin-T鎖であり、前記第1連結ドメインがKAGIRポリペプチドであり、前記第2ドメインがObscurin-O鎖であり、前記第2連結ドメインがDQPQFポリペプチドであり、或いは
前記第2ドメインがTitin-T鎖であり、前記第2連結ドメインがKAGIRポリペプチドであり、前記第1ドメインがObscurin-O鎖であり、前記第1連結ドメインがDQPQFポリペプチドである、請求項13又は14に記載のポリペプチド複合物。 - (A)前記Titin-T鎖の配列が、配列番号32に示される通りであり、若しくはA8C、V20C、T22C、C25S、A26C、C39T、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にKAGIRアミノ酸残基を付加する配列であり、及び/又は
(B)前記Obscurin-O鎖の配列が、配列番号33に示される通りであり、若しくはA3C、R9C、C25S、C76S、A88C、L7K、T62K又はT62H、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、T62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖の配列が、配列番号34に示される通りであり、若しくはC6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有する配列であり、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である、請求項1~15の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基にA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、或いは
前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基にP3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-O鎖が、配列番号33の配列を基にA3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、或いは
前記Obscurin-O鎖が、配列番号45の配列を基にL7K又はL7R、T62K又はT62H、及びK11Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号45の配列の自然順番号部位であり、或いは
前記Obscurin-O鎖が、配列番号50の配列を基にG2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列の自然順番号部位であり、
或いは
A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基にA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、或いは
前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基にP3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-Like-O鎖が、配列番号34の配列を基にC6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である、請求項1~16の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも90%の同一性を有する配列を含み、及び/又は前記Obscurin-O鎖が配列番号33、42~58、77~86の何れか1つに示される配列又は配列番号33、42~58、77~86の何れか1つの配列と少なくとも90%の同一性を有する配列を含み、或いは
前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも90%の同一性を有する配列を含み、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖が配列番号34、59~64の何れか1つに示される配列、又は配列番号34、59~64の何れか1つの配列と少なくとも90%の同一性を有する配列を含む、請求項1~17の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記Titin-T鎖が配列番号68に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号80に示される配列を含み、
前記Titin-T鎖が配列番号73に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号83に示される配列を含み、
前記Titin-T鎖が配列番号76に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号84に示される配列を含み、
前記Titin-T鎖が配列番号76に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号86に示される配列を含み、或いは
前記Titin-T鎖が配列番号75に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号86に示される配列を含む、請求項1~18の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1抗原が外因性抗原、内因性抗原、自己抗原、新生抗原、ウイルス抗原及び腫瘍抗原から選ばれる、請求項1~19の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。
- 前記ポリペプチド複合物が、請求項1~20の何れか1項で定義される第1抗原結合部分を含む、ドメイン改造抗体、又はそのFab断片である、請求項1~20の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。
- 請求項1~21の何れか1項に記載のポリペプチド複合物であり、第1抗原に特異的に結合する第1ポリペプチド複合物と、
第2抗原結合部分を含み、第2抗原に特異的に結合する第2ポリペプチド複合物と、を含み、
前記第1ポリペプチド複合物と第2ポリペプチド複合物が異なる2つの抗原に結合し、又は同じ抗原における異なる2つのエピトープに結合し、
前記第2ポリペプチド複合物が第2重鎖可変ドメイン(VH2)と第2軽鎖可変ドメイン(VL2)とを含み、前記第1ポリペプチド複合物のVH1と第2ポリペプチド複合物のVL2との間、及び/又は第2ポリペプチド複合物のVH2と第1ポリペプチド複合物のVL1との間にミスマッチが起きにくい、多重特異性ポリペプチド複合物。 - 前記第2ポリペプチド複合物の第2抗原結合部分が、
N末端からC末端までのVH2を含み、前記VH2が第3ドメインに操作可能に連結され、前記第3ドメインがCH1を含む第3ポリペプチドと、
N末端からC末端までのVL2を含み、前記VL2が第4ドメインに操作可能に連結され、前記第4ドメインがCLを含む第4ポリペプチドと、を含み、
前記VH2のC末端がCH1のN末端に操作可能に連結され、前記VL2のC末端がCLのN末端に操作可能に連結される、請求項22に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1ポリペプチド複合物が第1二量化ドメインを更に含み、前記第2ポリペプチド複合物が第2二量化ドメインを更に含み、前記第1二量化ドメインが第2二量化ドメインに結合し、
前記第1ポリペプチド複合物の第1ドメインのC末端が第1二量化ドメインのN末端に操作可能に連結され、前記第2ポリペプチド複合物の第3ドメインのC末端が第2二量化ドメインのN末端に操作可能に連結する、請求項22又は23に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1二量化ドメインが下記から選ばれる方式により、即ち、抗体ヒンジ領域又はその一部、コネクソン、ジスルフィド結合、水素結合、静電相互作用、塩橋、疎水-親水相互作用、又はこれらの組合せから選ばれる方式により、第2二量化ドメインに結合し、
抗体ヒンジ領域又はその一部が、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4のヒンジ領域又はその一部である、請求項24に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1二量化ドメインが抗体CH2ドメイン及び/又は抗体CH3ドメインを含み、及び/又は前記第2二量化ドメインが抗体CH2ドメイン及び/又は抗体CH3ドメインを含み、
前記抗体CH2ドメイン及び/又は抗体CH3ドメインがIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4に由来する、請求項24または25に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1二量化ドメインが第2二量化ドメインと異なり、ホモ二量化を阻止する方式及び/又はヘテロ二量化を促進する方式により結合し、
前記第1二量化ドメインが下記から選ばれる方式により、即ち、knob-into-hole、疎水相互作用、静電相互作用、親水相互作用、又は柔軟性を向上させる方式から選ばれる方式により、第2二量化ドメインに結合する、請求項24~26の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 前記第1二量化ドメインが配列番号2に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、且つ前記第2二量化ドメインが配列番号3に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、或いは
前記第1二量化ドメインが配列番号3に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、且つ前記第2二量化ドメインが配列番号2に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有する、請求項24~27の何れか1項に記載のポリペプチド複合物。 - 第1抗原に特異的に結合する第1重鎖と第1軽鎖を含み、第2抗原に特異的に結合する第2重鎖と第2軽鎖を更に含み、
前記第1重鎖のCH1ドメインがObscurin-O鎖で取り替えられ、前記第1軽鎖のCLドメインがTitin-T鎖で取り替えられ、
前記第1軽鎖のCLドメインがObscurin-O鎖で取り替えられ、前記第1重鎖のCH1ドメインがTitin-T鎖で取り替えられ、
前記第1重鎖のCH1ドメインがObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記第1軽鎖のCLドメインがTitin-T鎖で取り替えられ、或いは
前記第1軽鎖のCLドメインがObscurin-Like-O鎖で取り替えられ、前記第1重鎖のCH1ドメインがTitin-T鎖で取り替えられ、
前記第1抗原が第2抗原と異なり、又は前記第1抗原と第2抗原が同じ抗原における異なる2つのエピトープであり、
前記第1重鎖が第1重鎖可変領域(VH1)を含み、前記第1軽鎖が第1軽鎖可変領域(VL1)を含み、前記VH1とVL1が第1抗原に特異的に結合する抗原結合部位を形成し、且つ
前記VH1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VL1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結され、或いは
前記VL1のC末端がTitin-T鎖のN末端に操作可能に連結され、前記VH1のC末端がObscurin-O鎖又はObscurin-Like-O鎖のN末端に操作可能に連結され、
前記第1ドメインが第2ドメインと天然鎖間結合及び/又は少なくとも1つの非天然鎖間結合により二量体を形成し、
前記非天然鎖間結合が第1ドメインの特定変異残基と第2ドメインの特定変異残基との間に形成され、前記変異残基における少なくとも一対がシステイン残基であり、
前記非天然鎖間結合がジスルフィド結合であり、
前記第1ドメインの特定変異残基と第2ドメインの特定変異残基が下記変異から選ばれ、即ち、
(A)前記Titin-T鎖の配列が、配列番号32に示される通りであり、若しくは配列番号32の配列を基に3、8、11、13、20、22、25、26、39、40、42、45、47、49、56、58、66、70、75、77、79、81、82、83及び84から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、及び/又は
(B)前記Obscurin-O鎖の配列が、配列番号33に示される通りであり、若しくは配列番号33の配列を基に2、3、7、9、11、12、13、14、17、20、22、25、30、32、34、36、41、42、44、45、53、58、62、67、69、76、88、89、92、94及び97から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有し、または
前記Obscurin-Like-O鎖の配列が、配列番号34に示される通りであり、若しくは配列番号34の配列を基に6、26、74、77、84及び86から選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を更に有する配列であり、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列に対する自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列に対する自然順番号部位である、請求項1~21の何れか1項に定義される第1抗原結合部分を含む二重特異性抗体。 - (A)前記Titin-T鎖の配列が、配列番号32に示される通りであり、若しくは配列番号32の配列を基にA8C、V20C、T22C、C25S、A26C、C39T、P3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S又はM66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にKAGIRアミノ酸残基を付加する配列であり、及び/又は
(B)前記Obscurin-O鎖の配列が、配列番号33に示される通りであり、若しくは配列番号33の配列を基にA3C、R9C、C25S、C76S、A88C、L7K、T62K又はT62H、G2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、T62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有し、及び/又はN末端にDQPQFアミノ酸残基を付加する配列であり、或いは
前記Obscurin-Like-O鎖の配列が、配列番号34の配列を基にC6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数の部位のアミノ酸変異を有する配列であり、
前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である、請求項29に記載の二重特異性抗体。 - A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基にA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、或いは
前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基にP3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-O鎖が、配列番号33の配列を基にA3C、R9C、C25S、C76S及びA88Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号33の配列の自然順番号部位であり、或いは
前記Obscurin-O鎖が、配列番号45の配列を基にL7K又はL7R、T62K又はT62H、及びK11Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号45の配列の自然順番号部位であり、或いは
前記Obscurin-O鎖が、配列番号50の配列を基にG2E、L11K、A12S、F13Y、V14T、V17E、D20L、T22M又はT22S、N30D、T32P、Q34E、S36T、Q41K、Q42L、V44I、A45T、A53L、L58V、K62E、A67Q又はA67T、G69S、V89L、Q92E、D94G及びA97Gから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Obscurin-O鎖変異部位が配列番号50の配列の自然順番号部位であり、
或いは
A)前記Titin-T鎖が、配列番号32の配列を基にA8C、V20C、T22C、C25S、A26C及びC39Tから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号32の配列の自然順番号部位であり、或いは
前記Titin-T鎖が、配列番号35の配列を基にP3W、S11I、I13L、T22M、G40S、R42K、H45S、Q47E、Q49G、N56S、D58E、M66S、M66K、K70R、L75V、T77S、S79T、G81R、N82M、E83D及びF84Lから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸変異を有し、前記Titin-T鎖変異部位が配列番号35の配列の自然順番号部位であり、及び/又は
B)前記Obscurin-Like-O鎖が、配列番号34の配列を基にC6E、C26S、C77S、V74C、G84C及びA86Cから選ばれる1つ又は複数のアミノ酸残基変異を有し、前記Obscurin-Like-O鎖変異部位が配列番号34の配列の自然順番号部位である、請求項29に記載の二重特異性抗体。 - 前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも90%の同一性を有する配列を含み、及び/又は前記Obscurin-O鎖が配列番号33、42~58、77~86の何れか1つに示される配列又は配列番号33、42~58、77~86の何れか1つの配列と少なくとも90%の同一性を有する配列を含み、或いは
前記Titin-T鎖が配列番号32、35~41、65~76の何れか1つに示される配列、又は配列番号32、35~41、65~76の何れか1つの配列と少なくとも90%の同一性を有する配列を含み、及び/又は前記Obscurin-Like-O鎖が配列番号34、59~64の何れか1つに示される配列、又は配列番号34、59~64の何れか1つの配列と少なくとも90%の同一性を有する配列を含む、請求項29~31に記載の二重特異性抗体。 - 前記Titin-T鎖が配列番号68に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号80に示される配列を含み、
前記Titin-T鎖が配列番号73に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号83に示される配列を含み、
前記Titin-T鎖が配列番号76に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号84に示される配列を含み、
前記Titin-T鎖が配列番号76に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号86に示される配列を含み、或いは
前記Titin-T鎖が配列番号75に示される配列を含み、且つ前記Obscurin-O鎖が配列番号86に示される配列を含む、請求項29~32に記載の二重特異性抗体。 - 前記第2重鎖がN末端からC末端までの第2重鎖可変領域(VH2)を含み、前記VH2がCH1に操作可能に連結され、前記第2軽鎖がN末端からC末端までの第2軽鎖可変領域(VL2)を含み、前記VL2がCLに操作可能に連結され、
前記VH2とVL2が第2抗原に特異的に結合する抗原結合部位を形成し、前記VH2のC末端がCH1のN末端に操作可能に連結され、前記VL2のC末端がCLのN末端に操作可能に連結される、請求項29~33の何れか1項に記載の二重特異性抗体。 - 前記第1重鎖と第2重鎖のC末端がCH2及び/又はCH3ドメインを含み、
前記CH1、CH2及びCH3ドメインがIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4に由来し、
前記第1重鎖が下記から選ばれる方式により、即ち、抗体ヒンジ領域又はその一部、コネクソン、ジスルフィド結合、水素結合、静電相互作用、塩橋、疎水-親水相互作用、又はこれらの組合せから選ばれる方式により、第2重鎖に結合する、請求項34に記載の二重特異性抗体。 - 前記第1重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH1-L1-Titin-T鎖-L2-CH2-CH3であり、
前記第1軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL1-L3-Obscurin-O鎖又はVL1-L4-Obscurin-Like-O鎖であり、
前記第2重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH2-CH1-CH2-CH3であり、
前記第2軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL2-CLであり、
或いは、
前記第1軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL1-L1-Titin-T鎖であり、
前記第1重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH1-L2-Obscurin-O鎖-L3-CH2-CH3、又はVH1-L4-Obscurin-Like-O鎖-L5-CH2-CH3であり、
前記第2重鎖は、N末端からC末端までの順で、VH2-CH1-CH2-CH3であり、
前記第2軽鎖は、N末端からC末端までの順で、VL2-CLであり、
前記L1~L5がスペーサー領域であり、スペーサー領域が存在してもよく、又は存在しなくてもよく、
前記スペーサー領域が下記から選ばれ、即ち、Titin-T鎖のN末端断片、Obscurin-O鎖のN末端断片、Obscurin-Like-O鎖のN末端断片、又は(GxS)yコネクソン(但し、Xが1~5の整数から選ばれ、Yが1~6の整数から選ばれる)から選ばれる、請求項35に記載の二重特異性抗体。 - 前記スペーサー領域が下記から選ばれ、即ち、「KAGIR」、「DQPQF」、(G4S)1及び(G4S)2から選ばれる、請求項36に記載の二重特異性抗体。
- 前記第1重鎖のCH2及びCH3と第2重鎖のCH2及びCH3が異なり、ホモ二量化を阻止する方式及び/又はヘテロ二量化を促進する方式により結合し、
前記第1重鎖が下記から選ばれる方式により、即ち、knob-into-hole、疎水相互作用、静電相互作用、親水相互作用、又は柔軟性を向上させる方式から選ばれる方式により、第2重鎖に結合する、
請求項36または37に記載の二重特異性抗体。 - 前記第1重鎖のCH2及びCH3が配列番号2に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、前記第2重鎖のCH2及びCH3が配列番号3に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、或いは
前記第1重鎖のCH2及びCH3が配列番号3に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有し、前記第2重鎖のCH2及びCH3が配列番号2に示される配列における104~330番目のアミノ酸残基を有する、請求項38に記載の二重特異性抗体。 - 下記A~Iの何れか1項に記載の二重特異性抗体から選ばれ、即ち、
A)第1重鎖の配列が配列番号89に示される通りであり、若しくは配列番号89と少なくとも90%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号90に示される通りであり、若しくは配列番号90と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号87に示される通りであり、若しくは配列番号87と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号88に示される通りであり、若しくは配列番号88と少なくとも90%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
B)第1重鎖の配列が配列番号93に示される通りであり、若しくは配列番号93と少なくとも90%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号94に示される通りであり、若しくは配列番号94と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号91に示される通りであり、若しくは配列番号91と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号92に示される通りであり、若しくは配列番号92と少なくとも90%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
C)第1重鎖の配列が配列番号97に示される通りであり、若しくは配列番号97と少なくとも90%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号98に示される通りであり、若しくは配列番号98と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号95に示される通りであり、若しくは配列番号95と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも90%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
D)第1重鎖の配列が配列番号99に示される通りであり、若しくは配列番号99と少なくとも90%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号100に示される通りであり、若しくは配列番号100と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号101に示される通りであり、若しくは配列番号101と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも90%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
E)第1重鎖の配列が配列番号102に示される通りであり、若しくは配列番号102と少なくとも90%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号100に示される通りであり、若しくは配列番号100と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号95に示される通りであり、若しくは配列番号95と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも90%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
F)第1重鎖の配列が配列番号103に示される通りであり、若しくは配列番号103と少なくとも90%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号104に示される通りであり、若しくは配列番号104と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号95に示される通りであり、若しくは配列番号95と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号96に示される通りであり、若しくは配列番号96と少なくとも90%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
G)第1重鎖の配列が配列番号107に示される通りであり、若しくは配列番号107と少なくとも90%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号108に示される通りであり、若しくは配列番号108と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号109に示される通りであり、若しくは配列番号109と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号110に示される通りであり、若しくは配列番号110と少なくとも90%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
H)第1重鎖の配列が配列番号122に示される通りであり、若しくは配列番号122と少なくとも90%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号123に示される通りであり、若しくは配列番号123と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号116に示される通りであり、若しくは配列番号116と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号117に示される通りであり、若しくは配列番号117と少なくとも90%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
I)第1重鎖の配列が配列番号118に示される通りであり、若しくは配列番号118と少なくとも90%の配列同一性を有し、第1軽鎖の配列が配列番号119に示される通りであり、若しくは配列番号119と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2重鎖の配列が配列番号124に示される通りであり、若しくは配列番号124と少なくとも90%の配列同一性を有し、第2軽鎖の配列が配列番号125に示される通りであり、若しくは配列番号125と少なくとも90%の配列同一性を有する二重特異性抗体と、
から選ばれる、請求項29~39の何れか1項に記載の二重特異性抗体。 - 請求項1~21の何れか1項に記載のポリペプチド複合物、請求項22~28の何れか1項に記載の多重特異性ポリペプチド複合物、または請求項29~40の何れか1項に記載の二重特異性抗体を含む、複合体。
- 請求項1~27の何れか1項に記載のポリペプチド複合物、請求項22~28の何れか1項に記載の多重特異性ポリペプチド複合物、または請求項29~40の何れか1項に記載の二重特異性抗体をコードする、核酸分子。
- 請求項42に記載の核酸分子を含む、ベクター。
- 請求項43に記載のベクターの変換により得られ、原核細胞及び真核細胞から選ばれる、宿主細胞。
- 真核細胞が哺乳動物細胞である、請求項44に記載の宿主細胞。
- 1種又は複数種の薬学的に許容可能な担体、賦形剤又は希釈剤、及び下記から選ばれ、即ち、
請求項1~21の何れか1項に記載のポリペプチド複合物、請求項22~28の何れか1項に記載の多重特異性ポリペプチド複合物、または請求項29~40の何れか1項に記載の二重特異性抗体、或いは請求項41に記載の複合体、から選ばれる何れかの物質を含む、医薬組成物。
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