JP7773466B2 - Cd3およびbcmaに対する抗体およびそれらから作製した二重特異性結合タンパク質 - Google Patents
Cd3およびbcmaに対する抗体およびそれらから作製した二重特異性結合タンパク質Info
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Description
T細胞受容体(TCR)は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)によって提示される抗原(Ags)に結合し、T細胞機能において重要な役割を果たす。しかしながら、TCR自体は細胞内シグナル伝達を行わない。代わりに、TCRは、分化抗原群3(CD3)複合体と非共有結合的に会合し、CD3の免疫受容体チロシン活性化モチーフ(immunoreceptor tyrosine-based activation motifs)(ITAM)を介して細胞内シグナル伝達を誘発する。CD3 T細胞共受容体は、細胞傷害性T細胞(CD8+ナイーブT細胞)とTヘルパー細胞(CD4+ナイーブT細胞)の両方を活性化する助けをする。それはタンパク質複合体からなり、4つの異なる鎖で構成されている。哺乳動物では、この複合体はCD3γ鎖、CD3δ鎖、および2つのCD3ε鎖を含む。これらの鎖は、T細胞受容体(TCR)およびCD3δ鎖(ゼータ鎖)と会合して、Tリンパ球に活性化シグナルを生成する。TCR、ζ鎖、およびCD3γ、δ、およびε鎖は一緒に、TCR複合体を構成する。そして、CD3の4鎖複体は、1:1:1の化学量論でCD3εγ、CD3εδ、およびζζ二量体を形成する。
B細胞成熟抗原(BCMA、TNFRSF17、CD269)は、TNF受容体スーパーファミリーのメンバーである。BCMA発現はB細胞系列に限定されており、主として形質細胞と形質芽細胞で発現し、ナイーブB細胞には存在しない。BCMAは、2つのリガンド、増殖誘導リガンド(APRIL、TNFSF13、TALL-2、CD256)およびB細胞活性化因子(BAFF、BLYS、TNFSF13B、TALL-1、CD257)に結合する。BCMAは、APRILに対してBAFFよりも高い結合親和性を有する。多発性骨髄腫(MM)細胞は、高レベルのBCMAを発現する。リガンドブロッキング活性を備えたBCMA標的抗体は、裸のIgGとしても、薬物複合体としても、MM細胞の細胞毒性を促進する可能性がある。後期成熟B細胞でのBCMAの制限された発現によってもまた、これはキメラ抗原受容体T細胞(CAR-T細胞)の理想的な補助標的となり、CAR-T細胞は、改変されたT細胞特定の細胞タンパク質に標的化するためにキメラ抗原受容体を発現するように遺伝的に操作されたT細胞である。CAR-T細胞は、B細胞癌に対して有望な免疫療法を提供するが、それらの作用機序は十分に理解されておらず、CAR-T細胞療法の副作用は、多くの場合、重度であり、サイトカイン放出症候群(サイトカインストーム)および神経毒性を含む。
前記第1のポリペプチド鎖は、アミノ末端からカルボキシル末端へ向けて、(i)VLA-CL-VHB-CH1-Fc(ここで、CLは、VHBに直接融合されている)、または(ii)VHB-CH1-VLA-CL-Fc(ここで、CH1は、VLAに直接融合されている)を含んでなり;
前記第2のポリペプチド鎖は、アミノ末端からカルボキシル末端へ向けて、VHA-CH1を含んでなり;かつ
前記第3のポリペプチド鎖は、アミノ末端からカルボキシル末端へ向けて、VLB-CLを含んでなり;
VLは軽鎖可変ドメインであり、CLは軽鎖定常ドメインであり、VHは重鎖可変ドメインであり、CH1は重鎖定常ドメインであり、Fcは免疫グロブリンFc領域であり、AはCD3またはBCMAのエピトープであり、かつBはCD3またはBCMAのエピトープであり、ただし、AとBは異なる、二重特異性Fabs-in-Tandem免疫グロブリン(FIT-Ig)結合タンパク質を提供する。本発明においては、このようなFIT-Ig結合タンパク質は、CD3とBCMAの両方に結合する。
抗体(「Ab」)+抗原(「Ag」)→Ab-Ag
Ab+Ag←Ab-Ag
本発明の抗CD3抗体および抗BCMA抗体は、当技術分野で公知の多くの技術のいずれかによって生産してもよい。例えば、宿主細胞からの発現では、重鎖および軽鎖をコードする発現ベクターが標準的な技術によって宿主細胞にトランスフェクトされる。「トランスフェクション」という用語の様々な形式は、原核または真核宿主細胞への外因性DNAの導入に一般に使用される種々の技術、例えば、エレクトロポレーション、リン酸カルシウム沈降法、DEAE-デキストラントランスフェクションなどを含むことを意図する。原核または真核宿主細胞のいずれで本発明の抗体を発現させることも可能であるが、真核細胞、例えば、哺乳動物宿主細胞での抗体の発現が好ましく、これはそのような細胞(特に、豊乳動物細胞)は原核細胞よりも適切に折りたたまれた免疫学的に活性な抗体を組み立て、分泌する可能性が高いためである。
本発明は、CD3とBCMAの両方に結合するFabs-in-Tandem免疫グロブリン結合タンパク質(FIT-Ig)を提供する。このようなFIT-Ig分子の例示的実施形態は、(1)構造式(i)VLA-CL-VHB-CH1-Fc(ここで、CLは、VHBに直接融合されている)、または構造式(ii)VHB-CH1-VLA-CL-Fc(ここで、CH1は、VLAに直接融合されている)のいずれかを含んでなる重ポリペプチド鎖;(2)式VHA-CH1の軽ポリペプチド鎖;および(3)式VLB-CLのもう1つの軽ポリペプチド鎖を含んでなり、VLは軽鎖可変ドメインであり、CLは軽鎖定常ドメインであり、VHは重鎖可変ドメインであり、CH1は重鎖定常ドメインであり、Fcは免疫グロブリンFc領域であり、AはCD3またはBCMAのエピトープであり、BはCD3またはBCMAのエピトープであり、ただし、AとBは異なる。本発明においては、このようなFIT-Ig結合タンパク質は、CD3とBCMAの両方に結合する。
ヒトCD3および/またはBCMAに結合する能力を考えると、本明細書に記載される抗体、その機能的断片、および本明細書に記載される二重特異性多価結合タンパク質は、CD3もしくはBCMA、またはその両方を、例えば、これらの標的抗原の一方または両方を発現する細胞を含む生物学的サンプルにおいて検出するために使用することができる。本発明の抗体、機能的断片、および結合タンパク質は、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)、または免疫組織化学などの従来のイムノアッセイで使用することができる。本発明は、生物学的サンプル中のCD3またはBCMAを検出するための方法であって、生物学的サンプルを本発明の抗体、その抗原結合部分、または結合タンパク質と接触させ、標的抗原に結合するかどうかを検出し、それによりその生物学的サンプル中の標的の有無を決定することを含む方法を提供する。この抗体、機能的フラグメント、または結合タンパク質は、結合したまたは結合していない抗体/フラグメント/結合タンパク質の検出を容易にするために検出可能な物質で直接または間接的に標識してもよい。好適な検出可能物質としては、種々の酵素、補欠分子族、蛍光物質、発光物質および放射性物質が挙げられる。好適な酵素の例としては、セイヨウワサビペルオキシダーゼ、アルカリ性ホスファターゼ、β-ガラクトシダーゼ、またはアセチルコリン エステラーゼが挙げられる。好適な補欠分子族複合体の例としては、ストレプトアビジン/ビオチンおよびアビジン/ビオチンが挙げられ;好適な蛍光物質としては、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、塩化ダンシルまたはフィコエリトリンが挙げられ;発光物質の例としては、ルミノールが挙げられ;好適な放射性物質の例としては、3H、 14C、 35S、90Y、99Tc、111In、125I、131I、177Lu、166Ho、または153Smが挙げられる。
抗ヒトCD3モノクローナル抗体を次のように作製した。
実施例1.1:ヒトCD3抗原による免疫誘導
抗CD3抗体は、10個体のBalb/cおよびSJL/Jマウス(Shanghai Laboratory Animal Center)の群に交互免疫誘導戦略で免疫誘導を行うことによって得た。4つの異なるCD3免疫原を使用し、これには2つのペプチド(CD3εフラグメント:LSLKEFSELEQSGYYVC(配列番号2)およびQDGNEEMGGITQTPYK(配列番号3)、組換えhuCD3εγ/Fc融合タンパク質(融合タンパク質ヘテロ二量体:第1鎖
マウスに免疫原のうち1つで、2週間隔で免疫誘導を行い(群によっては初回免疫で使用したものとは異なる免疫原で追加免疫を行った)、2回目の注射の後、週に1回、血清力価をモニタリングした。4~6回の免疫誘導の後に、脾細胞を採取し、マウス骨髄腫細胞と融合させてハイブリドーマ細胞株を作出した。次に、ハイブリドーマ細胞の上清をhuCD3/Fc二量体標的に関してスクリーニングし、無関係のタンパク質/Fc二量体で対比染色してCD3特異的マウス抗体を生産する細胞株を同定した。陽性ハイブリドーマを、抗体の細胞表面結合を確認するためのJurkat細胞標的およびTCR複合体トランスフェクトCHO細胞標的に対する細胞結合アッセイで試験した。その後、最後に、確認された細胞結合剤をcynoCD3εγ/Fc融合タンパク質を標的として用いてELISAによりカニクイザル交差反応性に関して試験し、Jurkat-NFAT-ルシフェラーゼリポーター細胞株を用いて抗CD3作動活性を特徴付けた。この様式で試験したハイブリドーマのうち2つのみが総てのアッセイで陽性判定されたモノクローナル抗体を生産していた。これらをmAbCD3-001およびmAbCD3-002と呼称した。
重鎖および軽鎖可変領域を増幅するために、各ハイブリドーマクローンの全RNAを5×106を超える細胞から、TRIzol(商標)RNA抽出試薬(Invitrogen、カタログ番号15596018)を用いて単離した。cDNAを、Invitrogen(商標)スーパースクリプト(商標)III First-Strand Synthesis SuperMixキット(ThermoFisher Scientific カタログ番号18080)を製造者の説明書に従って使用して合成し、軽および重マウス免疫グロブリン鎖の可変領域をコードするcDNAを、MilliporeSigma(商標)Novagen(商標)マウスIgプライマーセット(Fisher Scientific カタログ番号698313)を用いて増幅させた。PCR産物を、1.2%アガロースゲルでの、SYB(商標)Safe DNAゲルステイン(ThermoFisher カタログ番号S33102)を用いた電気泳動により分析した。適正なサイズのDNAフラグメントを、NucleoSpin(登録商標)ゲルおよびPCR Clean-upキット(Macherey-Nagel カタログ番号740609)を製造者の説明書に従って使用して精製し、個々にpMD18-Tベクターにサブクローニングした。各形質転換から15のコロニーを選択し、挿入フラグメントの配列をDNAシーケンシングによって分析した。少なくとも8つのコロニーフラグメントがVHおよびVLのコンセンサス配列と一致するかどうか配列を確認した。マウスモノクローナル抗体可変領域のタンパク質配列を、配列相同性アラインメントによって分析し、表1に列挙した。Kabatナンバリングに基づいて相補性決定領域(CDR)に下線を施した。
単離されたマウス抗CD3抗体の結合特性を以下のようにELISAを用いて測定した:ヘテロ二量体CD3εγ/Fc融合タンパク質を4℃で一晩、96ウェルプレート上に1μg/mLでコーティングした。プレートを洗浄バッファー(0.05%Tween 20を含有するPBS)で1回洗浄し、室温で2時間、ELISAブロッキングバッファー(0.05%Tween 20を含有するPBS中、1%BSA)でブロッキングした。次に、抗CD3抗体を加え、37℃で1時間インキュベートした。プレートを洗浄バッファーで3回洗浄した。HRP標識抗マウスIgG二次抗体(Sigma、カタログ番号A0168)を加え、プレートを37℃で30分間インキュベートし、洗浄バッファー中で5回洗浄した。100μlのテトラメチルベンジジン(TMB)発色溶液を各ウェルに加えた。発色後、反応を1規定HClで停止させ、450nmでの吸光度をVarioskan(商標)LUXマイクロプレートリーダー(ThermoFisher Scientific)で測定した。GraphPad Prism 5.0ソフトウエアを用いて結合シグナルを抗体濃度に対してプロットし、それに応じてEC50を計算した。図1および図2に示されるように、mAbCD3-002は最高の結合活性を示したが、mAbCD3-001は、米国特許第8,236,308号に報告された可変ドメイン配列を用いて発現させた参照抗CD3ε抗体と同等の結合EC50を有した。
末梢血単核細胞(PBMC)は、Lymphoprep(商標)単核細胞単離培地(STEMCELL Technologies、カタログ番号07851)を使用することで健常ドナーから取得し、CD3陰性T細胞選択キット(EasySep(商標)STEMCELL Technologies、カタログ番号17951)を用いてPBMCからT細胞を単離した。増殖(CTG)およびサイトカイン(IFN-γ)生産データを、以下のプロトコールを用いて取得した:100μlの試験抗体(mAbCD3-001、OKT3、または陰性対照IgG)を4℃で一晩、high-binding96ウェルプレート(Nunc(商標)、カタログ番号3361)上にコーティングした後、DPBSで洗浄した。市販のOKT3抗体を陽性抗CD3対照として用い、無関係のマウスIgGを陰性対照として使用した。各ウェルについて、1×105T細胞を200μlの培養培地(RPMI1640+10%FBS+1%ペニシリン-ストレプトマイシン溶液+1%GlutaMAX(商標)添加剤)中に播種し、37℃で96時間インキュベートした。増殖は、ATPにより触媒される定量キット(CellTiter-Glo(商標)、Promega)を使用することによって測定した。IFN-γは、LANCE(登録商標)(Lanthanide Chelate Excite)TR-FRETアッセイキット(PerkinElmer、カタログ番号TRF1217M)によって測定した。データは、GraphPad Prism 5.0ソフトウエアを用いて分析した。結果を図3および4に示す。細胞増殖およびIFN-γ生産データは、mAbCD3-001がin vitroでヒトT細胞を活性化することを示した。
実施例2.1:mAbCD3-001のヒト化
抗CD3 mAbCD3-001可変領域遺伝子を使用してヒト化mAbを作出した。このプロセスの最初の工程で、全体として最良に一致するヒト生殖細胞系Ig V遺伝子配列を見出すために、mAbCD3-001のVHおよびVKのアミノ酸配列(表1前掲参照)を利用可能なヒトIg V遺伝子配列データベースと比較した。さらに、VHまたはVLのフレームワーク4を、それぞれマウスVH領域およびVL領域との最大相同性を有するヒトフレームワークを見出すために、J領域データベースと比較した。軽鎖では、最も近いヒトV遺伝子一致はB3遺伝子(V-baseデータベース)であり、重鎖では、最も近いヒト一致はVH1-2遺伝子であった。次に、mAbCD3-001軽鎖のCDR-L1、CDR-L2およびCDR-L3が、CDR-L3の後のJK4フレームワーク4配列とともにB3遺伝子のフレームワーク配列にグラフトされ;mAbCD3-001 VHのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3配列が、CDR-H3の後のJH6フレームワーク4配列とともにVH1-2のフレームワーク配列にグラフトされたヒト化可変ドメイン配列を設計した。次に、mAbCD3-001の3D Fvモデルを作製し、CDR残基まで4Å未満の距離で、かつ、ループ構造またはVH/VL干渉を補助するのに重要である可能性が最も高かったフレームワーク残基が存在するかどうかを決定するために分析した。ヒト化配列におけるこれらの残基は、親和性/活性を保持するために同じ位置でマウス残基に復帰突然変異させるべきである。Q1E突然変異は、該当する場合、N末端ピログルタミン酸塩の形成を排除するために常に含まれた。重鎖の場合、Y27F、T28S、V37M、M48I、V67A、M69LおよびR71A(Kabatナンバリング)の潜在的突然変異を特定した。軽鎖の場合、T5SおよびN22Tを復帰突然変異として特定した。そのCDRとの相互作用によって判定した場合の各復帰突然変異の重要度の階層によって、最も重要な復帰突然変異が、優先度の高い順にヒト化VH配列に導入され、その後に他の復帰突然変が連続的設計として導入された。また、VK CDR-L1配列は、潜在的な脱アミド化サイトであるNSパターンを有した。このアスパラギンの脱アミド化性を取り除くために、NSはヒト化κ鎖においてQS、NT、またはNAに変異させた。ヒト化VHおよびVL構築物を表2(下記)に示す。(復帰突然変異したフレームワークアミノ酸残基を二重下線で示し、元の親抗体からのマウスCDRを下線で示す。)
種々のヒト化VHおよびVK組合せから、種々のCD3結合親和性を有するヒト化抗CD3変異体が得られた。mAbCD3-001のヒト化変異体の結合活性は、ヒトCD3発現Jurkat T細胞株でフローサイトメトリーによって試験した。FACSバッファー中の5×105のJurkat細胞を96ウェルプレートの各ウェルに播種した。細胞を400gで5分間遠心分離し、上清を廃棄した。次に、各ウェルについて、100μlの連続希釈抗体を加え、細胞と混合した。4℃で40分のインキュベーション後、プレートを数回洗浄して余分な抗体を除去した。次に、二次蛍光色素コンジュゲート抗体(Alexa Fluor(登録商標)647ヤギ抗ヒトIgG1 H&L;Jackson ImmunoResearch、カタログ番号109-606-170)を加え、細胞とともに室温で20分間インキュベートした。もう1回遠心分離および洗浄工程を行った後、CytoFLEXフローサイトメーター(Beckman Coulter)で読み取るために細胞をFACSバッファーに再懸濁させた。蛍光強度中央値(MFI)の読み取りを抗体濃度に対してプロットし、GraphPad Prism 5.0ソフトウエアで解析した。
抗BCMA抗体は、Balb/cまたはSJLマウスを、ヒトFc領域に融合されたヒトBCMA(ECD)のホモ二量体化によって形成された組換えBCMA細胞外ドメイン/Fc二量体で免疫誘導することによって得た。
4~6回の免疫誘導の後、脾細胞を採取し、マウス骨髄腫細胞に融合してハイブリドーマ細胞株を形成した。融合生成物を96ウェルプレートにて、ヒポキサンチン-アミノプテリン-チミジン(HAT)を含有する選択培地にウェル当たり1×105脾細胞の密度で播種した。融合から7~10日後に、肉眼で見えるハイブリドーマコロニーを得た。次に、ハイブリドーマ細胞の上清をスクリーニングし、BCMA特異的マウス抗体を産生する細胞株を同定する選択を行った。5種類の抗BCMA抗体を選択し、配列を決定した。
重鎖および軽鎖可変領域を増幅するために、各ハイブリドーマクローンの全RNAを、5×106を超える細胞からTRIzol(商標)RNA抽出試薬(Invitrogen、カタログ番号15596018)を用いて単離した。cDNAを、Invitrogen(商標)スーパースクリプト(商標)III First-Strand Synthesis SuperMixキット(ThermoFisher Scientific カタログ番号18080)を製造者の説明書に従って使用して合成し、軽および重マウス免疫グロブリン鎖の可変領域をコードするcDNAを、MilliporeSigma(商標)Novagen(商標)マウスIgプライマーセット(Fisher Scientific カタログ番号698313)を用いて増幅した。PCR産物を、SYBR(商標)Safe DNAゲルステイン(ThermoFisher カタログ番号S33102)を用い、1.2%アガロースゲルでの電気泳動によって分析した。適正なサイズのDNAフラグメントを、NucleoSpin(登録商標)ゲルおよびPCR Clean-upキット(Macherey-Nagel、カタログ番号740609)を製造者の説明書に従って使用して精製し、個々にpMD18-Tベクターにサブクローニングした。各形質転換から15のコロニーを選択し、挿入フラグメントの配列をDNAシーケンシングによって分析した。少なくとも8コロニーのフラグメントがVHおよびVLのコンセンサス配列と一致するかどうか、配列を確認した。マウスmAb可変領域のタンパク質配列を配列相同性アラインメントにより分析した。
抗BCMA抗体の結合親和性および速度定数は、標準的な手順を用い、Biacore T200装置(GE Healthcare)を使用した25℃での表面プラズモン共鳴によって決定した。簡単に述べれば、ヤギの抗マウスIgG Fc抗体をバイオセンサーチップに直接固定し、抗体サンプルを5μl/分の流速で反応マトリックスに注入した。マウス抗BCMA IgG試験抗体を固定化された表面に注入され、固定化された抗Fc抗体によって捕捉された。次に、ヒトおよびカニクイザルのBCMA(ECD)/Fc標的ポリペプチドを、捕捉されたマウス抗BCMAIgG表面に注入した。結合および解離速度定数、kon(M-1s-1)およびkoff(s-1)をそれぞれ30μl/分の連続流速で決定した。速度定数は、標的BCMA(ECD)ポリペプチドの5つの異なる濃度で速度論的結合測定を行うことによって導き出した。次に、抗体と関連する標的タンパク質との間の反応の平衡解離定数KD(M)を、式KD=koff/konを使用して反応速度定数から計算した。速度定数は、Biacore分析ソフトウエアを使用してデータを処理し、1:1の結合モデルに適合させることによって決定した。結果を表7に示す。
モノクローナル抗BMCA抗体の、ヒト骨髄腫細胞株NCI-H929においてBCMAリガンドBAFFにより刺激されたNFκBのリン酸化を遮断する能力を、Phospho-NFκB(Ser536)細胞アッセイキット(Cisbio;カタログ番号64 NFBPEG)を用いて評価した。NCI-H929ヒト骨髄腫細胞をアッセイ培地(RPMI1640、0.1%BSA)中で37℃にて一晩飢餓状態とした。細胞を洗浄し、再懸濁させ、384ウェルマイクロプレート(PerkinElmer、カタログ番号6008280)にウェル当たり2×105細胞で播種した。次に、抗体をウェルに加え、細胞とともに約10分間37℃でインキュベートした。抗BAFF抗体(R&D Systems、カタログ番号BAF124)を陽性対照として使用し、無関係の抗RAC1モノクローナル抗体を陰性対照として使用した。参照抗BCMA抗体TAb1およびTAb2(それぞれ国際公開第WO2012/163805号のクローンCA8および国際公開第WO2014/122143号のクローン83A10)を比較のために試験した。
実施例4.1:BCMA/CD3 FIT-Ig結合タンパク質(FIT-Ig)の作製
ヒトCD3とヒトBCMAの両方を認識する二重特異性Fabs-in-Tandem免疫グロブリン(FIT-Ig)結合タンパク質を構築した。FIT-Ig構築物は、国際公開第WO2015/103072号に記載の一般手順に従い、免疫グロブリンドメイン間の合成リンカー配列の使用をなくすように操作した。
鎖1(長鎖):VLCD3-CL-VHBCMA-CH1-hinge-CH2-CH3;
鎖2(第1の短鎖):VHCD3-CH1;
鎖3(第2の短鎖):VLBCMA-CL;
ここで、VLBCMAはBCMAを認識するモノクローナル抗体の軽鎖可変ドメインであり、VHCD3はCD3を認識するモノクローナル抗体の重鎖可変ドメインであり、VLCD3はCD3を認識するモノクローナル抗体の軽鎖可変ドメインであり、VHBCMAはBCMAを認識するモノクローナル抗体の重鎖可変ドメインであり、各CLは軽鎖定常ドメインであり、各CH1は第1の重鎖定常ドメインであり、ヒンジ-CH2-CH3は抗体C末端Fc領域である。
全長FIT-Igタンパク質を消化し、Pierce(商標)Fab Preparationキット(ThermoFisher Scientific、カタログ番号44985)を用いて精製した。この過程で、FIT-Igタンパク質のFcドメインは、アガロースビーズ上の固定化パパインを用いた酵素的切断によって除去した。次に、FIT-Ig Fabフラグメント(FIT-Fab)をプロテインAクロマトグラフィーのフロースルーから精製した。精製したFIT-Fabタンパク質の濃度をA280によって測定し、均質性をサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)によって分析した。
キメラ二重特異性BCMA/CD3 FIT-Ig抗体の結合活性を、ヒトCD3/TCR複合体トランスフェクトCHO細胞株(CHOK1/CD3/TCR細胞)およびBCMA発現NCI-H929細胞を用いてフローサイトメトリーにより調べた。簡単に述べれば、FACSバッファー中、5×105細胞を96ウェルプレートに播種した。細胞を400×gで5分間遠心分離し、上清を廃棄した。次に、各ウェルについて、100μlの連続希釈FIT-Ig抗体またはFIT-Fab抗体を加え、細胞と混合した。4℃で40分間のインキュベーションの後、プレートを数回洗浄して余分な抗体を除去した。その後、二次抗体(ヤギ抗huIgGκ鎖特異的)を加え、細胞とともに室温で20分間インキュベートした。もう1回遠心分離および洗浄を行った後、CytoFLEXフローサイトメーターで読み取るために細胞をFACSバッファーに再懸濁させた。結果を分析し、GraphPad Prism 5.0ソフトウエアを用いてプロットした。結果を図9および10に示す。
BCMA/CD3二重特異性FIT-Ig抗体およびFIT-Fab抗体によるCD3活性化のリダイレクトを測定するために、共培養したリポーター遺伝子アッセイを使用した。Jurkat-NFAT-luc細胞は、細胞表面CD3がひと度活性化されると、下流のルシフェラーゼシグナルを惹起する。NCI-H929細胞をBCMA発現標的細胞として使用したが、これはBCMAの結合時に二重特異性BCMA/CD3抗体を介してT細胞上のCD3/TCR複合体を架橋することができる。Jurkat-NFAT-luc細胞およびNCI-H929細胞を洗浄し、アッセイ培地(10%FBSを含むRPMI1640)にそれぞれ再懸濁させた。両細胞種を1:1比にて96ウェルプレート(Costar #3903)にウェル当たり1×105細胞として播種した。FIT-Ig抗体またはFIT-Fab抗体を加え、細胞と混合し、37℃で4時間インキュベートした。インキュベーションの終了時に、製造者の説明書に従ってONE-Glo(商標)発光アッセイキット(Promega、カタログ番号E6130)試薬を調製し、ウェルに加えた。プレートの発光シグナルを、Varioskan(商標)LUXマイクロプレートリーダー(ThermoFisher Scientific)を用いて読み取った。結果を図11および12に示す。
BCMA/CD3二重特異性結合タンパク質の腫瘍細胞死滅化の効力を、標的細胞としてのヒト骨髄腫細胞株NCI-H929およびエフェクター細胞としてのヒトT細胞を用いたリダイレクトT細胞細胞傷害性アッセイで測定した。簡単に述べれば、細胞を採取し、洗浄し、アッセイ培地(10%FBSを含むRPMI1640)で再懸濁させた。NCI-H929細胞を平底96ウェルプレート(Corning、カタログ番号3599)にウェル当たり5×104細胞で播種した。市販のPBMC単離キット(EasySep(商標)、Stemcell Technologies、カタログ番号17951)を用いてヒトPBMCからT細胞を精製し、ウェル当たり2×105細胞に加えた。試験抗体を加え、37℃で48時間、細胞混合物とともにインキュベートした。乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)放出は、CytoTox 96(登録商標)細胞傷害性アッセイキット(Promega、カタログ番号G1780)を用いて測定した。製造者の説明書に従って、OD490読み取り値を得た。標的細胞NCI-H929最大溶解(100%)-最小溶解(0%)を正規化の分母として示した。LDH放出のパーセンテージを二重特異性抗体の濃度に対してプロットした。図13に示されるように、抗BCMAおよび抗CD3特異性を有する二重特異性FIT-Fabは、NCI-H929腫瘍細胞に対してT細胞細胞傷害性のリダイレクトを示したが、単一特異性ヒト化抗CD3 Fab、および抗CD3 Fab(HuEM0006-01-24のFabフラグメント)と抗BCMA mAb(TAB1)の組合せは細胞傷害活性を示さなかった。
非標的CD3活性化リダイレクトを、標的細胞の不在下でJurkat-NFAT-lucに基づくリポーター遺伝子アッセイを用いて試験した。Jurkat-NFAT-luc細胞を採取し、洗浄し、アッセイ培地(10%FBSを含むRPMI1640)に再懸濁させ、96ウェルプレート(Costar #3903)にウェル当たり1×105細胞で播種した。試験抗体を加え、細胞と混合し、37℃で4時間インキュベートした。インキュベーション後、製造者の説明書に従って、ONE-Glo(商標)発光アッセイキット(Promega、カタログ番号E6130)試薬を調製した。プレートの発光シグナルをVarioskan(商標)Luxプレートリーダーを用いて読み取った。結果を図14に示す。
抗BCMAモノクローナルmAbBCMA-003は、BCMA/CD3 FIT-IgおよびFIT-Fab形式で使用した場合、より高いBCMA結合親和性およびより良い細胞死滅化のリダイレクトを示した。よって、mAbBCMA-003をヒト化および続いてのヒト化二重特異性結合タンパク質の構築における使用のために選択した。
mAbBCMA-003可変領域遺伝子を用いてヒト化mAbを作出した。この方法の第1の工程で、全体として最良に一致するヒト生殖細胞系Ig V遺伝子配列を見出すために、mAbBCMA-003のVHおよびVKのアミノ酸配列(表8参照、前掲)をヒトIg V遺伝子配列の利用可能なデータベースと比較した。さらに、VHまたはVLのフレームワーク4を、それぞれマウスVH領域およびVL領域との最大相同性を有するヒトフレームワークを見出すために、J領域データベースと比較した。軽鎖では、最も近いヒトV遺伝子一致はVK1-39(02)遺伝子であり、重鎖では、最も近いヒト一致はVH1-03遺伝子であった。次に、mAbBCMA-003軽鎖のCDR-L1、CDR-L2およびCDR-L3が、CDR-L3の後のJK2フレームワーク4配列とともにVK1-39(02)遺伝子のフレームワーク配列にグラフトされ;mAbBCMA-003 VHのCDR-H1、CDR-H2、およびCDR-H3配列が、CDR-H3の後のJH6フレームワーク4配列とともにVH1-03遺伝子のフレームワーク配列にグラフトされたヒト化可変ドメイン配列を設計した。次に、mAbBCMA-003の3D Fvモデルを作製し、CDR残基まで4Å未満の距離で、かつ、ループ構造またはVH/VL干渉を補助するのに重要である可能性が最も高かったフレームワーク残基が存在するかどうかを決定するために分析した。ヒト化配列におけるこれらの残基は、親和性/活性を保持するために同じ位置でマウス残基に復帰突然変異させるべきである。Q1E突然変異は、該当する場合、N末端ピログルタミン酸塩の形成を排除するために常に含まれた。重鎖の場合、P30T、I48M、K66R、A67V、L69I、およびA71R (Kabatナンバリング)の潜在的突然変異を望ましい復帰突然変異として特定した。軽鎖の場合、V58IおよびR69Tを復帰突然変異として特定した。そのCDRとの相互作用によって判定した場合の各復帰突然変異の重要度の階層によって、最も重要な復帰突然変異が、優先度の高い順にヒト化VH配列に導入され、その後に他の復帰突然変が連続的設計として導入された。さらに、CDR-L2のC末端に生じるDGジペプチドは、
潜在的なアスパラギン酸異性化部位を呈し、これは軽鎖変異体では、以下の択一的置換:D56A、D56E、D56S、D56T、またはG57Aによって排除した。ヒト化VHおよびVL設計構築物を表10(下記)に示す。(復帰突然変異したフレームワークアミノ酸残基を二重下線で示し、元の親抗体からのマウスCDRを下線で示す。)
鎖1(長鎖):VLBCMA-CL-VHCD3-CH1-ヒンジ-CH2-CH3;
鎖2(第1の短鎖):VHBCMA-CH1;
鎖3(第2の短鎖):VLCD3-CL
であり、ここで、VLBCMAはBCMAを認識するヒト化モノクローナル抗体の軽鎖可変ドメインであり、VHCD3はCD3を認識するヒト化モノクローナル抗体の重鎖可変ドメインであり、VLCD3はCD3を認識するヒト化モノクローナル抗体の軽鎖可変ドメインであり、VHBCMAはBCMAを認識するヒト化モノクローナル抗体の重鎖可変ドメインであり、各CLは軽鎖定常ドメイン(配列番号27)であり、各CH1は第1の重鎖定常ドメインであり、CH1-ヒンジ-CH2-CH3は、CH1からFc領域の末端までのC末端重鎖定常領域である(配列番号26参照)。
BCMA/CD3二重特異性FIT-Ig抗体の結合親和性および速度定数は、標準的な手順を用い、Biacore(商標)T200装置(GE Healthcare)を使用した25℃での表面プラズモン共鳴(SPR)によって測定した。結果を表15に示す。
BCMA/CD3ヒト化二重特異性FIT-Ig抗体の腫瘍細胞死滅化の効力を、標的細胞としてのヒト骨髄腫細胞株NCI-H929およびエフェクター細胞としてのヒトT細胞を用いたリダイレクトT細胞細胞傷害性アッセイで測定した。簡単に述べれば、細胞を採取し、洗浄し、アッセイ培地(10%FBSを含むRPMI1640)に再懸濁させた。NCI-H929細胞を平底96ウェルプレート(Corning #3599)にウェル当たり5×104細胞で播種した。T細胞を、市販のキット(Stemcell #17951)を用いてヒトPBMCから精製し、同じプレートにウェル当たり2×105細胞で加えた。次に、FIT-Ig結合タンパク質を加え、細胞混合物とともにインキュベートした。37℃で48時間のインキュベーションの後、LDH放出を、アッセイキット(Promega #G1780)を用いて測定した。製造者の説明書に従い、OD490の読み取り値を得た。標的細胞NCI-H929最大溶解(100%)-最小溶解(0%)を正規化の分母として示した。LDH放出のパーセンテージを二重特異性Abの濃度に対してプロットした。この例では、ヒト化FIT-Igは、親キメラFIT-Igと同様のT細胞細胞傷害性のリダイレクトを示した。結果を図15に示す。これらの結果は、本発明によるヒト化BCMA/CD3 FIT-Igが、共培養においてT細胞細胞傷害性をNCI-H929腫瘍細胞に対してリダイレクトすることができたことを示した。図16および17を参照すると、BCMA発現標的細胞およびCD3発現標的細胞への本発明による2つのBCMA/CD3二重特異性FIT-Ig結合タンパク質の結合が確認される。
鎖1(長鎖):VLCD3-CL-VHBCMA-CH1-ヒンジ-CH2-CH3;
鎖2(第1の短鎖):VHCD3-CH1;
鎖3(第2の短鎖):VLBCMA-CL
であった。FIT1006-31a(D-T)およびFIT1006-35a(D-T)のポリペプチド鎖のアミノ酸配列を以下に示す。
抗腫瘍有効性は、T細胞、B細胞およびナチュラルキラー細胞を欠く免疫不全系統であるNPSGマウスにおいて評価した。NCI-H929細胞(5×106)をNPSGマウスの右背側の側腹部に皮下注射した。同じ日に、マウスに単回静脈用量の5×106ヒトPBMCを施した。11日目に腫瘍サイズ(70~140mm3)に基づいて動物を無作為化し、同じ日に処置を開始した。腫瘍成長をノギス測定によって監視した。試験は25日目に終了し、腫瘍サイズが3000mm3を超えた際にマウスを安楽死させた。マウスを3週間、週1回(QW×3)、6mg/kgのFIT1006-31b(D-T)またはFIT1006-35b(D-T)またはビヒクルで腹腔内(i.p.)注射により処置した。図20に示されるように、FIT-Ig処置群のマウスは、ビヒクル群に比べて有意な腫瘍成長阻害を示した。特に、FIT1006-35b(D-T)処置群では、腫瘍は完全に根絶された。
カニクイザルB細胞は、ヒトよりも高いBCMA発現を示すことが報告されている(Seckinger, A. et al., (2017). Target Expression, Generation, Preclinical Activity, and Pharmacokinetics of the BCMA-T Cell Bispecific Antibody EM801 for Multiple Myeloma Treatment. Cancer Cell, 31(3), 396-410)。これらの動物においてBCMA×CD3 FIT-Igの、B細胞集団を枯渇させる能力を評価するために、カニクイザルにおいてパイロット非GLP毒性学および薬理学試験を行った。この試験は、群間で体重が同等の雄ザル1個体および雌ザル1個体からなる3群を有し、群1にはビヒクルを施し群2には0.5mg/kg FIT1006-31b(D-T)の単回注射を施し、群3には0.5mg/kg FIT1006-35b(D-T)の単回注射を施し、総て1日目にi.v.注射により投与した。投与2日前(-1日、ベースライン)、1日目に投与してから2、4、6および24時間後、ならびに8日目および15日目に、,前肢または後肢の皮下静脈から血液サンプルを採取した。血液サンプルを細B胞マーカーおよびT細胞マーカーに関してFACSにより分析し、各集団の相対パーセンテージ変化を-1日のベースラインレベルと比較することにより決定した。血清サンプルはまた、市販のサイトメトリービーズアレイ(CBA)キットを用いて、サイトカインレベル(INFγ、IL-2、IL-6およびTNFα)についても分析した。
Claims (7)
- 以下のようなCDRセット:
の群から選択されるCDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2、およびCDR-L3の6つのCDRのセットを含んでなる、抗CD3抗体またはその抗原結合部分。 - 以下のVH/VL対:
から選択されるアミノ酸配列を有するVHドメインおよびVLドメインを含んでなる、請求項1に記載の抗CD3抗体またはその抗原結合部分。 - 請求項1または2に記載の少なくとも1種類の抗CD3抗体またはその抗原結合部分、および薬学上許容可能な担体を含んでなる、医薬組成物。
- CD3媒介活性が有害である疾患または障害を治療するための薬剤の製造のための、請求項1または2に記載の抗CD3抗体またはその抗原結合部分の使用。
- 前記疾患または障害が癌または自己免疫疾患であり、場合により、多発性骨髄腫、黒色腫(例えば、転移性悪性黒色腫)、腎臓癌(例えば、明細胞癌)、前立腺癌(例えば、ホルモン不応性前立腺腺癌)、膵臓腺癌、乳癌、結腸癌、肺癌(例えば、非小細胞肺癌)、食道癌、頭頸部扁平上皮癌、肝臓癌、卵巣癌、子宮頸癌、甲状腺癌、膠芽腫、神経膠腫、白血病、リンパ腫、および原発骨癌(例えば、骨肉腫、ユーイング肉腫、悪性線維性組織球腫、または軟骨肉腫)から選択される、請求項4に記載の使用。
- CD3媒介活性が有害である疾患または障害を治療するための、請求項3に記載の医薬組成物。
- 前記疾患または障害が癌または自己免疫疾患であり、場合により、多発性骨髄腫、黒色腫(例えば、転移性悪性黒色腫)、腎臓癌(例えば、明細胞癌)、前立腺癌(例えば、ホルモン不応性前立腺腺癌)、膵臓腺癌、乳癌、結腸癌、肺癌(例えば、非小細胞肺癌)、食道癌、頭頸部扁平上皮癌、肝臓癌、卵巣癌、子宮頸癌、甲状腺癌、膠芽腫、神経膠腫、白血病、リンパ腫、および原発骨癌(例えば、骨肉腫、ユーイング肉腫、悪性線維性組織球腫、または軟骨肉腫)から選択される、請求項6に記載の医薬組成物。
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