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JP7681525B2 - 核酸複合体及びそれを含む医薬組成物 - Google Patents

核酸複合体及びそれを含む医薬組成物 Download PDF

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Description

本発明は、核酸複合体及び該核酸複合体を含む医薬組成物等に関する。
核酸医薬として、アンチセンス、デコイ核酸、リボザイム、アプタマー、siRNA、miRNA、メッセンジャーRNA(mRNA)などが知られている。中でもmRNAに作用する核酸医薬は、細胞内のあらゆる遺伝子を制御できる汎用性の高さから、今まで治療困難とされてきた疾患への臨床応用が期待されている。すなわち、核酸医薬は、低分子、抗体医薬に次ぐ、次世代医薬として期待されている。しかしながら核酸医薬は、核酸医薬の比較的大きなサイズ、リン酸バックボーンの負電荷による著しく低い細胞膜透過性、血中ヌクレアーゼによるsiRNAの分解などにより、核酸医薬の作用点である細胞内への送達が困難であることが問題点として挙げられる(非特許文献1)。
かかる問題点に対して、核酸医薬に送達手段を適応して解決する方法が取られている。送達手段の1つとして、標的リガンドと核酸との核酸複合体(コンジュゲート核酸)が報告されている。標的リガンドとしては、細胞表面に発現する受容体に結合する形態が挙げられる。たとえば、肝実質細胞に高発現しているアシアロ糖タンパク質受容体(ASGPR)に対するリガンドとして、N-アセチル-D-ガラクトサミン(GalNAc)等を利用した核酸複合体が複数報告されている(特許文献1,特許文献2,特許文献3,非特許文献2)。さらには、マクロファージや樹状細胞などの免疫細胞に高発現しているマンノース受容体(CD206)に対して送達させる薬物担体として、マンノースコンジュゲート及びマンノシル化された核酸複合体が報告されている(特許文献4)。またコレステロール及び脂肪酸などの脂溶性化合物を核酸医薬に修飾し、血漿中のリポプロテイン等との親和性を高めることで、対応するリポプロテイン受容体(LDL受容体、HDL受容体、スカベンジャー受容体SRB1)を発現する細胞への送達を実現することが報告されている(非特許文献3)。
国際公開第2009/073809号 国際公開第2014/179620号 国際公開第2016/100401号 国際公開第2018/004004号
Nature Reviews Drug Discovery. 8, 129-138 (2009). J. Am. Chem. Soc. 2014,136, 16958-16961. Nucleic Acids Research, 2019, Vol.47, No.3,1082-1096.
これまで多くの標的リガンド、並びにリガンドを含む核酸複合体が提案されているが、現状において、受容体への特異的な結合性の改善、核酸医薬の細胞内取り込みの増強について、十分に満足し得るものは未だに見出されていない。
本発明者らは上記課題を解決すべく、鋭意研究した結果、細胞選択的に取り込まれる核酸複合体を見出した。すなわち、本発明は下記の[1]-[27]に関する。
[1]下記式(I):
[XはCH又はOであり;
Yはマンノース又はGalNacを有する糖リガンドであり;
nは1から8までの整数を示し;
Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[2]下記式(II):
[Yはマンノース又はGalNacを有する糖リガンドであり;
Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[3]下記式(III):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[4]下記式(IV):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[5]下記式(V):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[6]下記式(VI):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[7]下記式(VII):で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[8]下記式(VIII):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。〕
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[9]下記式(IX):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[10]下記式(X):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[11]下記式(XI):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[12]下記式(XII):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[13]下記式(XIII):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[14]下記式(XIV):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[15]オリゴヌクレオチドが一本鎖である、上記[1]~[14]いずれか記載の核酸複合体。
[16]オリゴヌクレオチドが3’末端を介して結合している、上記[15]の核酸複合体。
[17]オリゴヌクレオチドが5’末端を介して結合している、上記[15]の核酸複合体。
[18]オリゴヌクレオチドが二本鎖である、上記[1]~[14]いずれか記載の核酸複合体。
[19]オリゴヌクレオチドが、一つの鎖の3’末端を介して結合している、上記[18]の核酸複合体。
[20]オリゴヌクレオチドが、一つの鎖の5’末端を介して結合している、上記[18]の核酸複合体。
[21]上記[1]~[20]いずれか記載の核酸複合体を含む、医薬組成物。
[22]細胞における標的遺伝子の発現を調節する、上記[21]記載の医薬組成物。
[23]細胞が樹状細胞、マクロファージ又は肝実質細胞である上記[22]記載の医薬組成物。
[24]細胞における標的遺伝子の発現を調節する方法に使用するための、上記[1]~[20]いずれか記載の核酸複合体。
[25]細胞が樹状細胞、マクロファージ又は肝実質細胞である上記[24]記載の核酸複合体。
[26]上記[1]~[20]いずれか記載の核酸複合体又は上記[21]の医薬組成物を対象に投与することを含む、対象の細胞における標的遺伝子の発現を調節する方法。
[27]細胞が樹状細胞、マクロファージ又は肝実質細胞である上記[26]記載の方法。
本発明に係る核酸複合体は、下記の薬理試験において示されているように、マンノース受容体又はASGPRが発現した細胞へ選択的に取り込まれる。本発明に係る核酸複合体を含む医薬組成物を哺乳動物(ヒトを含む)に投与することで、各種関連疾患を治癒できる可能性を有している。
以下、本発明の内容について詳細に説明する。
本明細書中における化合物は、その構造式が便宜上一定の異性体を表すことがあるが、便宜上の式の記載に限定されるものではなく、化合物の構造上生ずるすべての幾何異性体、光学異性体、回転異性体、立体異性体、互変異性体等の異性体及び異性体混合物を含み、いずれか一方の異性体でも、各異性体を任意の比率で含む混合物でもよい。したがって例えば、本明細書中の化合物には、光学異性体及びラセミ体が存在することがありえるが、本明細書においてはいずれにも限定されず、ラセミ体であっても、各光学活性体のいずれかであっても、各光学活性体を任意の比率で含む混合物でもよい。
また、本明細書中における化合物は結晶多形が存在することもあるが同様にいずれにも限定されず、いずれかの結晶形の単一物であっても混合物であってもよく、また、本明細書中における化合物には非晶質体も含まれ、そして、本明細書中における化合物には、無水物と溶媒和物(特に水和物)とが包含される。
本明細書中における化合物には、化合物の同位体標識された化合物も含まれる。同位体標識された化合物は1つ又はそれ以上の原子が自然界に通常見出される原子質量か質量数と異なった原子質量か質量数を有する原子で置き換えられていること以外、化合物と同一である。本明細書中における化合物に組み入れることができる同位元素は、例えば、水素、炭素、窒素、酸素、フッ素、リン、硫黄、沃素、及び塩素の同位元素であり、H、H、11C、14C、15N、18O、18F及び35S等が含まれる。
本明細書における「薬剤学的に許容される塩」とは、化合物と塩を形成されるものであれば特に限定されず、具体的には例えば、酸付加塩、金属塩、アンモニウム塩、有機アミン付加塩、アミノ酸付加塩等の塩が挙げられる。
酸付加塩の好ましい例としては、例えば塩酸塩、臭化水素酸塩、硫酸塩、硝酸塩、リン酸塩等の無機酸塩や、酢酸塩、コハク酸塩、フマル酸塩、マレイン酸塩、酒石酸塩、クエン酸塩、乳酸塩、ステアリン酸塩、安息香酸塩、メタンスルホン酸塩、p-トルエンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩等の有機酸塩が挙げられる。
金属塩の好ましい例としては、例えばナトリウム塩、カリウム塩等のアルカリ金属塩、マグネシウム塩、カルシウム塩等のアルカリ土類金属塩、アルミニウム塩、亜鉛塩等が挙げられる。
アンモニウム塩の好ましい例としては、例えばアンモニウム、テトラメチルアンモニウム等の塩が挙げられる。
有機アミン付加塩の好ましい例としては、例えば、モルホリン、ピペリジン等の付加塩が挙げられる。
アミノ酸付加塩の好ましい例としては、例えば、リジン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、グルタミン酸等の付加塩が挙げられる。
本明細書中における化合物がフリー体として得られる場合、化合物が形成していてもよい塩又はそれらの水和物の状態に常法に従って変換することができる。
本明細書中における化合物が塩又は水和物として得られる場合、フリー体に常法に従って変換することができる。
また、本明細書中における化合物について得られる種々の異性体(例えば幾何異性体、光学異性体、回転異性体、立体異性体、互変異性体等)は、通常の分離手段、例えば、再結晶、ジアステレオマー塩法、酵素分割法、種々のクロマトグラフィー(例えば薄層クロマトグラフィー、カラムクロマトグラフィー、ガスクロマトグラフィー、高速液体クロマトグラフィー等)を用いることにより精製し、単離することができる。
本発明に係る医薬組成物は、薬剤学的に許容される添加物を核酸複合体またはその薬剤学的に許容される塩と混和することにより製造することができる。本発明に係る医薬組成物は例えば第十七改正日本薬局方の製剤総則に記載の方法など既知の方法に従って製造することができる。
本発明に係る医薬組成物は、その剤形に応じて適切に患者に投与することができる。
本発明に係る核酸複合体の投与量は、症状の程度、年齢、性別、体重、投与形態・塩の種類、疾患の具体的な種類等に応じて異なるが、通常、成人の場合は1日あたり経口投与でオリゴヌクレオチドに換算した投与量が約30μg~10g、好ましくは100μg~1gを、注射投与で約1μg~1g、好ましくは100μg~300mgをそれぞれ1回又は数回に分けて投与する。
本発明に係る核酸複合体は、糖リガンドがリンカーを介してオリゴヌクレオチドと結合した核酸複合体であって、糖リガンドが、O、N、又はC結合、好ましくはO結合マンノース又はGalNacを有する、核酸複合体である。すなわち、本発明に係る核酸複合体は、(糖リガンド)-(リンカー)-(オリゴヌクレオチド)という構造を有する。
一実施形態では、核酸複合体は、2つ以上の糖、好ましくは3つ又は4つの糖を含む。一実施形態では、核酸複合体は、少なくとも3つのマンノース又は少なくとも3つのGalNacを含み、これらの核酸複合体はそれぞれマクロファージ又は肝実質細胞を標的とし送達され得る。
<糖リガンドについて>
マンノース受容体は、CD206が高発現する細胞、例えば、マクロファージや樹状細胞などの特定の細胞に高発現している。マンノースコンジュゲート及びマンノシル化された薬物担体はCD206に対して高い結合親和性を示し、薬物分子、例えばオリゴヌクレオチドをマクロファージや樹状細胞などの細胞に送達するために首尾よく使用されている。
ASGPRは、肝実質細胞などの特定の細胞に高発現している。GalNacコンジュゲート及びGalNac化された薬物担体はASGPRに対して高い結合親和性を示し、薬物分子、例えばオリゴヌクレオチドを肝実質細胞などの細胞に送達するために首尾よく使用されている。
糖リガンドは標的細胞に発現している受容体に結合可能な糖類に由来する基を意味し、本発明に係る核酸複合体において好ましい糖リガンドの態様の一つとして、以下の構造が例示できる。波線は、リンカーとの結合手を意味する。
<オリゴヌクレオチドについて>
本発明に係る核酸複合体におけるオリゴヌクレオチドとしては、核酸医薬として用いることが知られたオリゴヌクレオチドを用いることができる。本明細書において、核酸医薬とは、アンチセンス、デコイ核酸、リボザイム、siRNA、miRNA、antimiRNA及びmRNAなどとして用いられるヌクレオチドを意味する。
また、オリゴヌクレオチドは、一本鎖又は二本鎖のオリゴヌクレオチドであってもよい。
本発明に係る核酸複合体におけるリンカーとオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドなどのヌクレオチドで結合してもよく、例えばオリゴヌクレオチドの3’末端又は5’末端で結合する。オリゴヌクレオチドが二本鎖である場合には、リンカーは、二本鎖核酸を構成するセンス鎖の3’末端又は5’末端と結合していることが好ましいが、当該結合に限定されるものではない。
核酸複合体におけるオリゴヌクレオチドが結合するリンカーの数は1つに限られず、2つ以上であってもよい。
いくつかの実施形態では、例えば、安定性を高めるために、突出に特定の塩基を含めるか、又は一本鎖突出(例えば、5’突出もしくは3’突出、もしくはその両方)に修飾ヌクレオチドもしくはヌクレオチド代用物を含めることが可能である。
本発明に係る核酸複合体を構成するするオリゴヌクレオチドは、哺乳動物細胞に導入された場合、標的遺伝子の発現を制御する能力を有するものであればいかなる形状でもよく、一本鎖のオリゴヌクレオチド又は二本鎖のオリゴヌクレオチドが好適に用いられる。
オリゴヌクレオチドとしては、ヌクレオチド又はヌクレオチドと同等の機能を有する分子の重合体であればいかなる分子であってもよく、例えばデオキシリボヌクレオチドの重合体であるDNA、リボヌクレオチドの重合体であるRNA、DNAとRNAの重合体であるキメラ核酸が挙げられる。また、DNA、RNA及びキメラ核酸において、少なくとも一つのデオキシリボヌクレオチドやリボヌクレオチド等のヌクレオチドがヌクレオチドと同等の機能を有する分子で置換されたヌクレオチド重合体であってもよい。なお、RNA中のウラシル(U)は、DNAにおいてはチミン(T)に一義的に読み替えられる。
ヌクレオチドと同等の機能を有する分子としては、例えば、ヌクレオチドに修飾を施したヌクレオチド誘導体等が挙げられ、例えばDNA又はRNAと比較して、ヌクレアーゼ耐性の向上もしくは安定化させるため、相補鎖核酸とのアフィニティーを上げるため、細胞透過性を上げるため、又は可視化させるために、デオキシリボヌクレオチド又はリボヌクレオチドに修飾を施した分子等が好適に用いられる。
ヌクレオチド誘導体としては、例えば糖部修飾ヌクレオチド、リン酸ジエステル結合修飾ヌクレオチド、塩基修飾ヌクレオチド等、糖部、リン酸ジエステル結合及び塩基の少なくとも一つが修飾されたヌクレオチド等が挙げられる。
糖部修飾ヌクレオチドとしては、ヌクレオチドの糖の化学構造の一部あるいは全てに対し、任意の置換基で修飾もしくは置換したもの、又は任意の原子で置換したものであればいかなるものでもよいが、2’-修飾ヌクレオチドが好ましく用いられる。
2’-修飾ヌクレオチドとしては、例えばリボースの2’-OH基がOR、R、R’OR、SH、SR、NH、NHR、NR、N、CN、F、Cl、Br及びIからなる群(Rはアルキル又はアリール、好ましくは炭素数1~6のアルキルであり、R’はアルキレン、好ましくは炭素数1~6のアルキレンである)から選択される置換基で置換された2’-修飾ヌクレオチドが挙げられ、2’-修飾としては、好ましくはF、メトキシ基及びエトキシ基での置換が挙げられる。また、リボースの2’位の酸素原子と4’位の炭素がメチレンで架橋された2’-修飾ヌクレオチド、すなわちロック核酸であってもよい。
リン酸ジエステル結合修飾ヌクレオチドとしては、ヌクレオチドのリン酸ジエステル結合の化学構造の一部あるいは全てに対し、任意の置換基で修飾もしくは置換したもの、又は任意の原子で置換したものであればいかなるものでもよく、例えば、リン酸ジエステル結合がホスホロチオエート結合に置換されたヌクレオチド、リン酸ジエステル結合がホスホロジチオエート結合に置換されたヌクレオチド、リン酸ジエステル結合がアルキルホスホネート結合に置換されたヌクレオチド、リン酸ジエステル結合がホスホロアミデート結合に置換されたヌクレオチド等が挙げられ、好ましくはリン酸ジエステル結合がホスホロチオエート結合に置換されたヌクレオチドが挙げられる。
オリゴヌクレオチドは、その分子中の一部あるいは全部の原子が質量数の異なる原子(同位体)で置換されたものも包含する。
一態様では本発明に係る核酸複合体におけるオリゴヌクレオチドは細胞における標的遺伝子の発現を調節する。
一態様では、本発明の核酸複合体におけるオリゴヌクレオチドは、リンカーを介してリガンド(リンカーリガンドとも称する)に結合する。
<リンカーについて>
本発明における「リンカー」としては、核酸複合体として用いることができる任意のリンカーを用いることができる。
リンカー構造の例示としては、例えば、国際公開第2009/073809号、国際公開第2013/075035号、国際公開第2015/105083号に開示される構造を採用することができる。
一実施形態では、リンカーは、少なくとも1つの切断可能な結合基を含む。
切断可能な結合基とは、細胞外では十分に安定であるが、標的細胞内に入ると切断され、リンカーが結びついている部分を放出する基のことである。
例えば、リン酸ベースの切断可能な結合基は、リン酸基を分解又は加水分解する薬剤によって切断される。細胞内でリン酸基を切断する例は、ホスファターゼなどの酵素である。リン酸ベースの結合基の好ましい実施形態は、-O-P(O)(OH)-O-又はO-P(S)(OH)-O-である。
リンカーの実施形態としては下記構造のいずれかであり、X、Yはそれぞれ存在ごとに独立して、XはCH又はOを表し、Yは糖リガンドを表し、Zはオリゴヌクレオチドを含む基を表し、nは1から8の整数を表す。
本発明に係る核酸複合体は、例えば、以下の製造例に記載した方法により、製造することができ、また、当該化合物の効果は、以下の試験例に記載した方法により確認することができる。ただし、これらは例示的なものであって、本発明は、いかなる場合も以下の具体例に制限されるものではなく、また本発明の範囲を逸脱しない範囲で変化させてもよい。本発明における実施例は当業者に知られている合成化学技術を使用して製造することができる。
また、本明細書に使用される略号は当業者に周知の慣用的な略号である。本明細書においては以下の略号を使用する。
Cbz:ベンジルオキシカルボニル
CTC:2-クロロトリチルクロリド
DCE:1,2-ジクロロエタン
DCM:ジクロロメタン
DIPEA:N,N-ジイソプロピルエチルアミン
DMF:N,N-ジメチルホルムアミド
DMSO:ジメチルスルホキシド
EDCI:1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩
EtOAc:酢酸エチル
ESI:エレクトロスプレーイオン化
Fmoc:9-フルオレニルメチルオキシカルボニル
HBTU:1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-ベンゾトリアゾリウム3-オキシドヘキサフルオロホスファート
HOBT:1-ヒドロキシベンゾトリアゾール
IMS:工業用変性アルコール
MALDI-TOF-MS:マトリックス支援レーザー脱離イオン化-飛行時間型マススペクトルメトリー
MeOH:メタノール
MTBE:メチルターシャリーブチルエーテル
NaOMe:ナトリウムメトキシド
TFA:トリフルオロ酢酸
H-NMR:プロトン核磁気共鳴スペクトルメトリー
MS:マススペクトルメトリー
HPLC:高速液体クロマトグラフィー
以下の実施例及び製造例中の「室温」は通常約10℃から約35℃を示す。%は特記しない限り重量又は体積パーセントを示す。
プロトン核磁気共鳴スペクトルの化学シフトは、テトラメチルシランに対するδ単位(ppm)で記録、カップリング定数はヘルツ(Hz)で記録されている。パターンは、s:シングレット、d:ダブレット、t:トリプレット、q:カルテット、quin:クインテット、m:マルチプレット、br:ブロード、br.s:ブロードシングレット。
シリカゲルカラムクロマトグラフィーに関して、シリカゲルは、Merck社製Silica Gel60(70-230mesh、もしくは、230-400mesh ASTM)、富士シリシア化学社製PSQ60B、又はプレパックカラム(カラム:YAMAZEN社製 Hi-FlashTM Column(Silicagel)、もしくはBiotage社製BiotageTMSNAP Ultra Silica Cartridge)を用いた。
化合物の命名は、一般的に用いられる試薬を除き、「E-ノートブック」バージョン12又は13(パーキンエルマー社)又は「MarvinSketch」バージョン16(ChemAxon社)で表示されるものを用いた。
下記製造例を参考に、当業者に公知の方法により製造することができる。
化合物6の合成スキーム
化合物2の合成
酢酸ヒドラジン(5.19g、56.4mmol)にDMF(200mL)を加え、55℃で撹拌後、反応混合物を15℃に冷却し、1-O,2-O,3-O,4-O,6-O-ペンタアセチル-β-D-マンノピラノース(化合物1)(20.0g、51.2mmol)を加え、15℃で16時間攪拌した。反応混合物を水に加え、EtOAcで抽出した。併せた有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過後、減圧下で濃縮し、化合物2(14.3g)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl)δ(ppm):1.97-2.00 (m, 3H), 2.03 (s, 3H), 2.08 (s, 3H), 2.14 (s, 3H), 4.11-4.15 (m, 1H), 4.16-4.32 (m, 3H), 5.14-5.34 (m, 3H), 5.37-5.45 (m, 1H).
化合物3の合成
DCM(50mL)に化合物2(5.00g、14.4mmol)、2,2,2-トリクロロアセトニトリル(20.7g、143mmol)及びCsCO(5.14g、15.8mmol)を加え、25℃で2時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(50:1-20:1 石油エーテル/EtOAc)により精製し、化合物3(2.70g)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl)δ(ppm):2.01 (s, 3H), 2.04 (s, 2H), 2.08 (d, J=6.8Hz, 6H), 2.20 (s, 3H), 4.15-4.22 (m, 2H), 4.24-4.32 (m, 1H), 5.37-5.42 (m, 2H), 5.46-5.49 (m, 1H), 6.28 (d, J=1.8Hz, 1H), 8.79 (s, 1H).
化合物4の合成
化合物3(14.0g、28.4mmol)、6-(Cbz-アミノ)-1-ヘキサノール(8.57g、34.1mmol)及びモレキュラーシーブ4A(10.0g)をDCM(140mL)に加え、0℃で30分間撹拌した。次いで、反応混合物にトリメチルシリルトリフルオロメタンスルホネート(6.32g、28.4mmol)を-65℃で滴下し、反応混合物を25℃で16時間撹拌した。反応混合物をDCMで希釈し、濾過後、濾液を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、水及び食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過後、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(50:1-20:1 石油エーテル/EtOAc)により精製し、化合物4(7.50g)を得た。
化合物5の合成
化合物4(7.50g、12.9mmol)をMeOH(300mL)に溶解させ、NaOMe(2.79g、51.6mmol)を加え、室温で3時間反応させた。反応混合物を一部濃縮し、冷水に注ぎ、酢酸をpH=5となるまで加え、得られた粗体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(50:1-20:1 DCM/MeOH)により精製し、化合物5(3.90g)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl)δ(ppm):1.26-1.63 (m, 8H) , 3.14 (d, J=6.3Hz, 2H) , 3.34 (d, J=8.8Hz, 1H), 3.54-3.74(m, 2H) , 3.80-4.01 (m, 4H) , 4.78 (s, 1H), 5.01-5.12 (m, 2H) , 5.16-5.47 (m, 6H), 7.28-7.41 (m, 5H).
化合物6の合成
乾燥10%パラジウム-炭素(0.40g)にMeOH(40mL)、化合物5(3.90g、9.43mmol)を加え、25℃、水素圧力下(50psi)で3時間撹拌した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮して、化合物6(1.50g)を得た。
H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.38-1.49 (m, 4H), 1.61 (dquin, J=13.3, 6.9, 6.9, 6.9, 6.9Hz, 4H), 2.73-2.88 (m, 2H), 3.31 (dt, J=3.3, 1.6Hz, 1H), 3.43 (dt, J=9.7, 6.1Hz, 1H), 3.48-3.89 (m, 8H).
化合物8の合成
6-アジドヘキサン酸(化合物7)(50.2mg、319μmol)及び化合物6(268mg、959μmol)のDMF(3mL)溶液に、HOBt(129mg、959μmol)、DIPEA(248mg、1.92mmol)及びEDCI(183mg、959μmol)を加え、25℃で3時間撹拌した。反応混合物を分取HPLC(TFA条件)により精製して、化合物8(20.1mg)を得た。
H-NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):
1.24-1.54 (m, 14H) 2.04 (t, J=7.40Hz, 2H) 3.00 (q, J=6.53Hz, 2H) 3.23-3.40 (m, 12H) 3.55-3.66 (m, 2H) 4.57 (s, 1H) 7.75 (br s, 1H)
化合物11の合成スキーム
化合物10の合成
CTC樹脂(0.50g、0.50mmol、1.00mmol/g)とN-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-グルタミン酸5-tert-ブチル(化合物9)(212mg、0.50mmol)を含む混合物に、DCM(30mL)及びDIPEA(258mg、2.00mmol)を加え、反応混合物を2時間撹拌した。反応混合物にMeOHを加え(0.2mL)、30分間撹拌した。反応混合物に6-アジドヘキサン酸(化合物7)(118mg、0.75mmol)、DIPEA(258mg、2.00mmol)、HBTU(270mg、712umol)及びDMF(3mL)を加え、25℃にて1時間撹拌した。反応混合物に90%TFA/10%DCMを加え、2時間攪拌した。反応混合物を濾過し、濾液を減圧下濃縮して、化合物10(110mg)を得た。
化合物11の合成
化合物10(50.0mg、174μmol)及び化合物6(292mg、1.05mmol)のDMF(3mL)溶液に、HOBt(141mg、1.05mmol)、DIPEA(270mg、2.10mmol)及びEDCI(200mg、1.05mmol)を加えた。反応混合物を25℃で16時間撹拌した。分取HPLC(TFA条件)により精製し、化合物11(18.1mg)を得た。
H-NMR(400MHz,DMSO-d)δ(ppm):
1.16-1.56 (m, 24H), 1.62-1.73 (m, 1H), 1.76-1.87 (m, 1H), 2.00-2.07 (m, 2H), 2.09-2.15 (m, 2H), 2.95-3.07 (m, 4H), 3.22-3.41 (m, 18H), 3.65 (br s, 6H), 4.10-4.19 (m, 1H), 4.57 (d, J=1.00Hz, 2H), 7.74-7.93 (m, 3H).
化合物12の合成
CTC樹脂(1.00g、1.00mmol、1.00mmol/g)及びN-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-グルタミン酸5-tert-ブチル(化合物9)(511mg、1.20mmol)にDCM(20mL)、DIPEA(516mg、4.00mmol)を加え、反応混合物をNバブリングして2時間撹拌した。反応混合物にMeOHを加え(1mL)、30分間撹拌した。20%ピペリジンのDMF(30mL)溶液を反応混合物に加え30分間撹拌し、樹脂をDMFで洗浄し、N-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-グルタミン酸1-tert-ブチル(N-Fmoc-glutamic acid-1-tert-butyl ester)(851mg、2.00mmol)、HBTU(720mg、1.90mmol)及びDIPEA(516mg、4.00mmol)のDMF(5mL)溶液を加え、25℃で1時間撹拌した。20%ピペリジンのDMF(30mL)溶液を加え、30分間撹拌し樹脂をDMFで洗浄した。次いで、6-アジドヘキサン酸(化合物7)(0.30g、1.91mmol)、HBTU(720mg、1.90mmol)及びDIPEA(516mg、4.00mmol)のDMF(5mL)溶液を加え、25℃で1時間撹拌し、樹脂をDMFで洗浄し、MeOHで洗浄し、減圧下で乾燥させた。得られた残渣(0.60g)に50%TFA/50%DCMを加え、2時間撹拌し、反応混合物を減圧下で濃縮し、化合物12(240mg)を得た。
化合物13の合成
化合物13の合成は化合物12の合成方法に準じ、6-アジドヘキサン酸の代わりにAzido-PEG8-acid(CAS No.1214319-92-2)を用いることで、化合物13(350mg)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl)δ(ppm):
2.01 (s, 2H), 2.18 (s, 2H), 2.32-2.63 (m, 6H), 3.40 (t, J=5.0Hz, 2H), 3.54-3.71 (m, 32H), 4.49 (s, 2H), 7.67-8.03 (m, 2H).
化合物14の合成
化合物12(0.20g、481μmol)及び化合物7(1.08g、3.85mmol)のDMF(0.5mL)溶液に、DIPEA(996mg、7.70mmol)、HOBt(520mg、3.85mmol)及びEDCI(738mg、3.85mmol)を加えた。反応混合物を25℃で16時間撹拌し、分取HPLC(TFA条件)により精製して、化合物14(103mg)を得た。
H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.26-1.72 (m, 32H), 1.82-1.97 (m, 2H), 2.03-2.13 (m, 2H), 2.22-2.41 (m, 6H), 3.14-3.24 (m, 6H), 3.37-3.47 (m, 3H), 3.49-3.55 (m, 3H), 3.60 (t, J=9.5Hz, 3H), 3.65-3.86 (m, 15H), 4.22-4.42 (m, 2H), 4.73 (s, 3H).
化合物15の合成
化合物13(0.20g、275μmol)及び化合物7(616mg、2.20mmol)のDMF(0.5mL)溶液に、DIPEA(570mg、4.41mmol)、HOBT(298mg、2.20mmol)及びEDCI(423mg、2.20mmol)を加え、反応混合物を25℃で16時間撹拌した。反応混合物を分取HPLC(TFA条件)により精製して、化合物15(127mg)を得た。
H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.23-1.68 (m, 24H), 1.78-1.95 (m, 2H), 2.04-2.19 (m, 2H), 2.23-2.31 (m, 2H), 2.33-2.42 (m, 2H), 2.48-2.60 (m, 2H), 3.10-3.26 (m, 6H), 3.35-3.46 (m, 5H), 3.48-3.56 (m, 3H), 3.57-3.84 (m, 50H), 4.23-4.41 (m, 2H), 4.73 (s, 3H).
化合物17の合成スキーム
化合物16の合成
CTC樹脂(0.50mmol、0.50g、1.00mmol/g)及びN-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-グルタミン酸5-tert-ブチル(化合物9)(212mg、0.50mmol)に、DCM(30mL)及びDIPEA(258mg、2.00mmol)を加えた。反応混合物を2時間撹拌後、MeOH(0.2mL)を加え、30分間撹拌した。反応混合物にHBTU(360mg、950μmol)及びDIPEA(258mg、2.00mmol)のDMF(3mL)溶液及びN-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-グルタミン酸1-tert-ブチル(N-Fmoc-glutamic acid-1-tert-butyl ester)(425mg、1.00mmol)を加え、25℃で1時間撹拌後、N-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-グルタミン酸1-tert-ブチル(N-Fmoc-glutamic acid-1-tert-butyl ester)(425mg、1.00mmol)、HBTU(360mg、950μmol)及びDIPEA(258mg、2.00mmol)のDMF(3mL)溶液を加え25℃にて1時間で加えた。次に、6-アジドヘキサン酸(化合物7)(118mg、750μmol)、HBTU(360mg、950μmol)、DIPEA(258mg、2.00mmol)を加え1時間撹拌した。90%TFA/10%DCMを加え、室温で2時間攪拌した。反応混合物を濾過し、減圧下濃縮し、化合物16(200mg)を得た。
化合物17の合成
化合物16(50.0mg、91.8μmol)及び化合物7(256mg、918μmol)のDMF(3mL)溶液に、HOBt(124mg、918μmol)、DIPEA(237mg、1.84mmol)及びEDCI(176mg、918μmol)を加え、反応混合物を25℃で16時間撹拌した。反応混合物を分取HPLC(TFA条件)により精製し、化合物17(18.2mg)を得た。
H-NMR(400MHz,DMSO-d)δ(ppm):
1.19-1.56 (m, 40H), 1.66 (br s, 3H), 1.83 (br s, 3H), 2.00-2.15 (m, 7H), 2.94-3.05 (m, 8H), 3.29 (br d, J=5.02Hz, 24H), 3.52-3.71 (m, 24H), 4.13 (br s, 3H), 4.57 (s, 4H), 7.74-7.99 (m, 7H).
化合物21及び22の合成スキーム
化合物19の合成
ガラクトサミンペンタアセテート化合物18(12.0g、30.8mmol)、6-(Cbz-アミノ)-1-ヘキサノール(10.3g、41.1mmol)及びZnCl(5.60g、41.1mmol)(使用前に110℃で1時間減圧乾燥した)の混合物にDCE(120mL)を加え、反応混合物を70℃で3時間撹拌した。反応混合物をEtOAc及び炭酸水素ナトリウム水溶液で希釈し、混合物を10分間撹拌し、セライト(登録商標)濾過し、EtOAcで洗浄した。濾液を水及び食塩水で洗浄した。水層をEtOAcで抽出し、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過後、減圧下濃縮し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(2:1 石油エーテル/EtOAc)にて精製し、化合物19(14.0g)を得た。
H-NMR(400MHz,CDCl)δ(ppm):1.35 (d, J=3.8Hz, 4H), 1.45-1.66 (m, 4H), 1.77 (s, 2H), 1.94 (s, 3H),2.00 (s, 3H), 2.05 (s, 3H), 2.14 (s, 3H), 3.20 (qq, J=13.4, 6.8Hz, 2H), 3.48 (dt, J=9.6, 6.5Hz, 1H), 3.79-4.03 (m, 3H), 4.08-4.19 (m, 2H), 4.65 (d, J=8.3Hz, 1H), 4.90 (s, 1H), 5.04-5.17 (m, 2H), 5.26 (dd, J=11.2, 3.1Hz, 1H), 5.30 (s, 1H), 5.34 (d, J=2.8Hz, 1H), 5.94 (d, J=8.8Hz, 1H), 7.28-7.42 (m, 5H).
化合物20の合成
化合物19(7.50g、12.9mmol)にMeOH(300mL)及びNaOMe(2.79g、51.7mmol)を加え、室温にて3時間撹拌した。反応混合物を一部濃縮し、冷水に注ぎ、酢酸をpH=5となるまで加えた。次に、得られた粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(50:0-50:1 DCM/MeOH)により精製し、化合物20(4.00g)を得た。
H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.19-1.35 (m, 4H), 1.40-1.56 (m, 4H), 1.93 (s, 2H), 3.06 (t, J=7.0Hz, 2H), 3.27 (dt, J=3.3, 1.6Hz, 1H), 3.31 (s, 1H), 3.37-3.49 (m, 2H), 3.55 (dd, J=10.8, 3.3Hz, 1H), 3.65-3.76 (m, 2H), 3.78-3.94 (m, 3H), 4.31 (d, J=8.5Hz, 1H), 5.02 (s, 2H), 7.17-7.44 (m, 5H).
化合物21の合成
アルゴン雰囲気下、乾燥10%パラジウム-炭素(240mg)に、MeOH(25mL)及び化合物20(2.40g、5.28mmol)を加え、水素圧力下(50psi)で25℃にて3時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を減圧下濃縮し、化合物21(0.66g)を得た。
H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.30-1.44 (m, 4H), 1.52-1.66 (m, 4H), 1.98 (s, 3H), 2.76-2.90 (m, 2H), 3.31 (dt, J=3.3, 1.6Hz, 2H), 3.44-3.51 (m, 2H), 3.58 (dd, J=10.8, 3.3Hz, 1H), 3.73-3.78 (m, 2H), 3.82-3.95 (m, 3H), 4.34 (d, J=8.5Hz, 1H).
化合物22の合成
化合物19(202mg、0.35mmol)にエタノール(6mL),10%パラジウム-炭素(50%含水品)42mg)を加え、水素雰囲気下、室温で3時間撹拌した。反応混合物をセライト(登録商標)で濾過し、エタノールで洗浄した。濾液を減圧下濃縮し、化合物22(159mg)を得た。
H-NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ(ppm): 0.64 (br s, 1H) 1.27 (br s, 5H) 1.33-1.52 (m, 4H) 1.67 (br s, 1H) 1.80 (s, 3H) 2.61 (br t, J=6.88Hz, 2H) 3.40-3.60 (m, 5H) 3.58-3.77 (m, 4H) 4.23 (br d, J=8.25Hz, 1H) 4.31-4.97 (m, 5H) 7.53-7.71 (m, 1H); MS (ESI+): m/z 321 [M+H]+.
化合物23の合成
化合物12(602mg、1.88mmol)及び化合物21(601mg、1.88mmol)のDMF(0.5mL)溶液に、DIPEA(485mg、3.76mmol)、HOBt(254mg、1.88mmol)及びEDCI(360mg、1.88mmol)を加え、反応混合物を25℃で16時間撹拌した。残渣を分取HPLC(TFA条件)により精製して、化合物23(104mg)を得た。
H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.29-1.70 (m, 32H), 1.82-2.01 (m, 11H), 2.08 (s, 2H), 2.22-2.38 (m, 8H),3.18 (d, J=6.3Hz, 6H), 3.42-3.52 (m, 6H), 3.60 (d, J=10.5Hz, 3H), 3.71-3.95 (m, 14H), 4.28 (s, 1H), 4.36 (d, J=8.3Hz, 3H).
化合物24の合成
化合物23の合成と同様にして、化合物12の代わりに化合物16を用いることで化合物24を得た。
H-NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ(ppm): 1.15-1.59 (m, 44H) 1.68 (br d, J=9.90Hz, 3H) 1.79 (s, 12H) 1.82-1.92 (m, 5H) 1.97-2.22 (m, 9H) 3.02 (br d, J=5.50Hz, 10H) 3.32-3.58 (m, 19H) 3.61-3.72 (m, 13H) 4.06-4.27 (m, 8H) 4.43 (br s, 4H) 4.46-4.59 (m, 9H) 7.59 (br d, J=8.80Hz, 4H) 7.74 (br s, 1H) 7.83 (br s, 3H) 7.89 (br s, 3H); MS (ESI+): m/z 1754 [M+H]+.
化合物28の合成スキーム
化合物25の合成
CTC樹脂(1.33mmol/g,0.375g,0.50mmol)と化合物9(212mg,0.50mmol)を含む混合物にDCM(30mL)を加え、DIPEA(0.35mL,2.00mmol)を滴下し、反応液を2時間撹拌した。反応液にMeOH(0.2mL,4.94mmol)を加え、35分間撹拌した。反応液に20%ピペリジンのDMF(15mL)溶液で30分間撹拌した。反応混合物を濾過し、得られた固体をDMFで洗浄した。次いでN-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-D-グルタミン酸1-tert-ブチル(N-Fmoc-D-glutamic acid-1-tert-butyl ester)(213mg,0.499mmol)及びN-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-L-グルタミン酸1-tert-ブチル(N-Fmoc-L-glutamic acid-1-tert-butyl ester)(213mg,0.499mmol)、HBTU(360mg,0.949mmol)、DMF(3mL)及びDIPEA(0.35mL,2.00mmol)を加え、反応混合物を窒素でバブリングさせながら1時間撹拌した。20%ピペリジンのDMF(15mL)溶液を加え、30分間撹拌した。そして、樹脂をDMFで洗浄した。次いでN-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-D-グルタミン酸1-tert-ブチル(N-Fmoc-D-glutamic acid-1-tert-butyl ester)(213mg,0.499mmol),N-[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]-L-グルタミン酸1-tert-ブチル(N-Fmoc-L-glutamic acid-1-tert-butyl ester)(213mg,0.499mmol)、HBTU(360mg,0.949mmol)及びDMF(3mL)を加え、DIPEA(0.35mL,2.00mmol)をゆっくりと滴下した。反応混合物を窒素でバブリングさせながら80分撹拌した。そして、樹脂をDMFで洗浄し、MeOHで洗浄し、減圧下で乾燥させた。得られた残渣に50%TFA/50%DCMを加え、2時間撹拌し濾過後、濾液を減圧下濃縮して、化合物25(307.3mg)を得た。
MS(ESI) M/Z:610〔M+H〕
H-NMR(600MHz,DMSO-d)δ(ppm):
1.77 (m, 5H), 1.94 (m, 3H), 2.12-2.23 (m, 6H), 2.26 (m, 2H), 2.38 (br t, J=7.34Hz, 2H), 4.13-4.21 (m, 3H), 5.09 (s, 2H), 7.30-7.40 (m, 5H), 8.05-8.15 (m, 3H).
化合物26の合成
化合物22(154mg,0.344mmol)と化合物25(21.0mg,0.034mmol)にDMF(2mL)溶液にHOBt(52.8mg,0.344mmol),DIPEA(0.12mL,0.689mmol)及びEDCI(66.0mg,0.344mmol)を加えた。反応混合物を室温で18時間撹拌し、水及びEtOAc、少量のメタノールを加え抽出し、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させた。濾過後減圧下濃縮した。残渣を分取HPLCにより精製して化合物26(16.7mg)を得た。
MS(ESI) M/Z:1162〔M+2H〕
H-NMR(600MHz,DMSO-d)δ(ppm):
1.23 (br s, 16H), 1.31-1.41 (m, 8H), 1.41-1.48 (m, 8H), 1.60-1.73 (m, 4H), 1.77 (s, 12H), 1.78-1.87 (m, 4H), 1.89 (s, 12H), 1.99 (s, 12H), 2.01-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 12H), 2.11-2.21 (m, 6H), 2.33-2.37 (m, 2H), 2.95-3.07 (m, 8H), 3.37-3.43 (m, 4H), 3.65-3.72 (m, 4H), 3.82-3.90 (m, 4H), 3.98-4.05 (m, 12H), 4.09-4.20 (m, 3H), 4.48 (d, J=8.44Hz, 4H), 4.97 (dd, J=11.19, 3.12Hz, 4H), 5.08 (s, 2H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 4H), 7.30-7.39 (m, 5H), 7.80 (m, 8H), 7.86-7.95 (m, 3H).
化合物27の合成
化合物26(19.0mg,8.18μmol)のエタノール(3mL)溶液に10%パラジウム-炭素(50%含水品)(5.3mg)を加えた。反応混合物を水素雰囲気下、室温で3時間撹拌した。反応混合物をセライト(登録商標)で濾過し、エタノールで洗浄した。濾液を減圧下濃縮し、化合物27(19.6mg)を得た。
H-NMR(600MHz,DMSO-d)δ(ppm):
1.24 (br s, 22H), 1.30-1.40 (m, 8H), 1.45 (br s, 8H), 1.61-1.74 (m, 4H), 1.77 (s, 12H), 1.80-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 12H), 1.99 (s, 12H), 2.01-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 12H), 2.12-2.25 (m, 4H), 2.93-3.06 (m, 8H), 3.36-3.46 (m, 4H), 3.64-3.72 (m, 4H), 3.82-3.91 (m, 4H), 3.98-4.20 (m, 16H), 4.50 (br d, J=8.07Hz, 4H), 4.94-5.02 (m, 4H), 5.21 (d, J=2.93Hz, 4H) 7.73-8.03 (m, 11H).
化合物28の合成
窒素雰囲気下、化合物27(17.4mg,7.79μmol)のDMF(2mL)溶液にトリエチルアミン(8.7μL,62μmol)及びトリフルオロ酢酸ペンタフルオロフェニル(5.4μL,31μmol)を加え、反応混合物を室温で1.5時間撹拌した。反応液に水を加え、EtOAcで抽出した。有機層を飽和炭酸水素ナトリウム、硫酸水素ナトリウム、飽和食塩水で洗浄した。減圧下濃縮後、残渣をペンタンでトリチュレートし、濾取し40度で減圧下乾燥させ化合物28(11.72mg)を得た。
MS(ESI) M/Z:1200〔M+2H〕
H-NMR(600MHz,DMSO-d)δ(ppm):
1.24 (br s, 20H), 1.31-1.40 (m, 8H), 1.41-1.49 (m, 8H), 1.61-1.72 (m, 2H), 1.77 (s, 12H), 1.79-1.86 (m, 2H), 1.89 (s, 12H), 1.99 (s, 12H), 2.01-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 12H), 2.12-2.21 (m, 4H), 2.25-2.31 (m, 2H), 2.80 (br t, J=7.34Hz, 2H), 2.95-3.08 (m, 8H), 3.37-3.43 (m, 4H), 3.65-3.72 (m, 4H), 3.82-3.90 (m, 4H), 3.97-4.06 (m, 12H), 4.10-4.22 (m, 3H), 4.48 (d, J=8.44Hz, 4H), 4.97 (dd, J=11.00, 2.93Hz, 4H), 5.21 (d, J=2.93Hz, 4H), 7.70-7.86 (m, 8H), 7.86-8.01 (m, 3H).
実施例1~7:核酸複合体1~7の合成
SEQ-1及びSEQ-2はジーンデザイン社にて委託合成した。SEQ-2(1.3μmol)にsodium tetraborate buffer pH8.5(最終濃度40mM)を加え、DMSOに溶解したDBCO-NHS ester(CAS No.1353016-71-3、60μmol)を加え、室温にて15分攪拌した。反応液に水を加えた後、PD-10カラム(GE Healthcare社)にてゲル濾過精製を行った。さらにAmicon Ultra 3K(Millipore社)にて精製・濃縮することで、粗生成物(SEQ-3)を得た。粗生成物(40nmol)にtriethylammonium acetate pH7.0(最終濃度50mM)を加え、水に溶解した化合物8、11、14、15、17、23、24(400nmol)をそれぞれ加え、室温にて15分攪拌した。反応液をPD-10カラム(GE Healthcare社)にてゲル濾過精製を行った。さらにAmicon Ultra 3K(Millipore社)にて精製・濃縮することで、核酸複合体、すなわち化合物8、11、14、15、17、23、24に対応する核酸複合体1~7を得た。
核酸複合体1
核酸複合体2
核酸複合体3
核酸複合体4
核酸複合体5
核酸複合体6
核酸複合体7
実施例8:核酸複合体8の合成
SEQ-2(26.6nmol)にsodium tetraborate buffer pH8.5及び、DMSOに溶解した化合物28(120nmol)を加え、室温にて攪拌した。反応液に水を加えた後、Amicon Ultra 3K(Millipore社)にて精製を行った。得られた粗生成物に5倍量の28%アンモニア水を加え、室温にて3時間静置した。反応液に水を加えた後、Amicon Ultra 3K(Millipore社)にて精製を行った。さらに逆相HPLCにて精製することで、核酸複合体8を得た。
核酸複合体8
核酸配列の説明
本実施例に用いた核酸の配列は(5'-3')はA(F)^G(M)^G(F)A(M)C(F)U(M)G(F)G(M)U(F)C(M)U(F)U(F)U(M)C(F)U(M)A(F)U(M)A(F)U(M)^C(F)^U(M)であり、大文字のアルファベットはRNAを表し、(M)は2’-O-メチル修飾RNAを、(F)は2’-フルオロRNAを、^はホスホロチオエート結合を示す。またそれぞれのオリゴヌクレオチドの5’末端には蛍光色素であるシアニン色素Cy3(励起波長555nm,蛍光波長570nm)が結合している。SEQ-1,2及び本実施例において合成した核酸複合体について、MALDI-TOF-MSによる分子量の測定を行い、その結果を表1に示す。
Figure 0007681525000056
<試験例1>
核酸複合体のヒトCD206発現Lenti-X 293T細胞に対するin vitro取り込み活性評価
実施例で合成した核酸複合体について、ヒトCD206発現Lenti-X 293T細胞(Clontech社)に、それぞれ以下の方法で導入し、取り込みを評価した。ヒトCD206発現Lenti-X 293T細胞(Clontech社)を2×10個/100μL/wellとなるように96-well PDL-coating plate(Corning社)に播種し、37℃の5%COインキュベーター内で2日間培養した。最終濃度が100nmol/Lとなるように、SEQ-1又は合成した核酸複合体を添加し、37℃の5%COインキュベーター内で2時間インキュベーションした。10μg/mL Hoechst(Life Technologies社)を含む4%パラホルムアルデヒド/PBS(Wako)を添加し、常温で30分間細胞を固定し、4回PBSで洗浄した。IN Cell Analyzer 2200(GEヘルスケア社)で蛍光イメージング解析を行い、well内のCy3蛍光強度を核数で補正し、1細胞当たりの平均Cy3蛍光強度を算出した。この際、糖リガンド修飾の無い核酸であるSEQ-1を添加したwellの蛍光強度を1として、各核酸複合体を添加したwellの蛍光強度を相対値として算出した。
結果を表2に示す。この結果から、糖リガンドを含まないSEQ-1と比較して、GalNacを有する核酸複合体6はCD206が発現した細胞に効率的に取り込まれない一方、マンノースを有する核酸複合体核酸複合体1から5はCD206が発現した細胞に効率的に取り込まれることが明らかになった。
Figure 0007681525000057
<試験例2>
核酸複合体のヒトASGR1発現Lenti-X293T細胞に対するin vitro取り込み活性評価
実施例で合成した核酸複合体について、ヒトASGR1発現Lenti-X293T細胞(Clontech社)に、それぞれ以下の方法で導入し、取り込み活性を評価した。ヒトASGR1発現Lenti-X293T細胞(Clontech社)は、2×10個/100μL/wellとなるように96-well PDL-coating plate(Corning社)に播種し、37℃の5%COインキュベーター内で1日又は2日間培養した。最終濃度が100nmol/Lとなるように、SEQ-1又は合成した核酸複合体を添加し、37℃の5%COインキュベーター内で2時間インキュベーションした。その後の蛍光イメージング解析は試験例1と同様の方法で実施した。
結果を表3に示す。この結果から、糖リガンドを含まないSEQ-1と比較して、マンノースを有する核酸複合体1から5はASGR1が発現した細胞に効率的に取り込まれない一方、GalNacを有する核酸複合体6から8はASGR1が発現した細胞に効率的に取り込まれることが明らかになった。
Figure 0007681525000058
<試験例3>
マウス肝実質細胞及びクッパー細胞における核酸複合体の取り込み評価(In vivo評価)
BALB/cマウス(n=3)にSEQ-1、核酸複合体3及び6をそれぞれ1mg/kgで皮下投与した。投与4時間後、肝臓を潅流し、フローサイトメーターにて肝実質細胞及びクッパー細胞を分離して、蛍光強度を測定した。この際、SEQ-1を投与した群の蛍光強度を1として、各核酸複合体投与群の蛍光強度を相対値として算出した。
結果を表4に示す。この結果から、糖リガンドを含まないSEQ-1と比較して、CD206陽性と報告されているマウスクッパ-細胞にマンノースを有する核酸複合体3が、ASGR1陽性と報告されているマウス肝実質細胞にGalNacを有する核酸複合体6が効率よく取り込まれていることが明らかになった。
Figure 0007681525000059
化合物37の合成スキーム
化合物30の合成
酢酸ヒドラジン(1.29g,14.06mmol)とDMF(50mL)の混合物を50℃で加熱した。次いで、これを15℃の水浴中で冷却し、α-D-マンノースペンタアセテート(4.99g,12.8mmol)を添加した。得られた溶液を15-19℃の水浴中で16時間撹拌した。混合物に水とEtOAcを加え抽出し、水層をEtOAcでさらに抽出した。合わせた有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。残渣をBiotage Isolera(100g KP-Sil、20-100%EtOAc/シクロヘキサン)を用いたカラムクロマトグラフィーによって精製し、α及びβジアステレオマーの9:1混合物として化合物30(4.19g)を得た。
α異性体
1H NMR(600 MHz, CDCl3)δppm:
2.00 (s, 3H), 2.05 (s, 3H), 2.11 (s, 3H), 2.16 (s, 3H), 3.00 (d, J=4.03Hz, 1H), 4.15 (br d, J=10.64Hz, 1H), 4.22-4.28 (m, 2H), 5.23-5.33 (m, 3H), 5.43 (br dd, J=10.27, 3.30Hz, 1H)
化合物31の合成
化合物30(3.64g,10.5mmol)のDCM(218mL)溶液に、窒素雰囲気下、トリクロロアセトニトリル(10.48mL,104.5mmol)、次いでDBU(0.158mL,1.05mmol)を滴下した。混合物を窒素雰囲気下、室温で2.25時間撹拌した。減圧下濃縮し、残渣をBiotage Isolera(100g KP-Sil、0-50%EtOAc/シクロヘキサン)を用いたカラムクロマトグラフィーにより精製し、化合物31(4.567g)を得た。
1H NMR(600 MHz, CDCl3)δppm:
2.01 (s, 3H), 2.07 (s, 3H), 2.08 (s, 3H), 2.20 (s, 3H), 4.14-4.23 (m, 2H), 4.28 (dd, J=12.47, 4.77Hz, 1H), 5.38-5.43 (m, 2H), 5.47 (br s, 1H), 6.28 (s, 1H), 8.79(s, 1H)
化合物33の合成
化合物31(2.45g,4.96mmol)及びN-Cbz-6-アミノ-ヘキサン-1-オール(1.87g,7.45mmol)のDCM(90mL)溶液を2℃(内部温度)に冷却し、窒素雰囲気下、三フッ化ホウ素ジエチルエーテラート(0.126mL,0.993mmol)を滴下した。得られた混合物を2℃で25分間撹拌し、次いで室温で、1時間20分撹拌した。混合物に飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え抽出し、水層をDCMで抽出した。合わせた有機層を飽和食塩水で洗浄し、疎水性濾紙で濾過し、減圧下濃縮した。残渣をBiotage Isolera(100g KP-Sil、0-100%EtOAc/シクロヘキサン)を用いたカラムクロマトグラフィーにより精製し、化合物33(1.37g)を得た。
1H NMR(600 MHz, CDCl3)δppm:
1.32-1.43 (m, 4H), 1.49-1.53 (m, 2H), 1.56-1.64 (m, 2H), 1.99 (s, 3H), 2.04 (s, 3H), 2.10 (s, 3H), 2.15 (s, 3H), 3.20 (q, J=6.72Hz, 2H), 3.40-3.48 (m, 1H), 3.64-3.71 (m, 1H), 3.97 (ddd, J=9.90, 5.32, 2.38Hz, 1H), 4.08-4.12 (m, 1H), 4.28 (dd, J=12.29, 5.32Hz, 1H), 4.79 (d, J=1.47Hz, 2H), 5.10 (s, 2H), 5.22 (dd, J=3.30, 1.83Hz, 1H), 5.28 (t, J=9.54Hz, 1H), 5.34 (dd, J=10.64, 3.67Hz, 1H), 7.29-7.33 (m, 1H), 7.36 (d, J=4.03Hz, 4H)
化合物34の合成
化合物33(1.35g,2.31mmol)のIMS(38mL)溶液に、窒素雰囲気下、10%パラジウム-炭素(0.293g、50%含水品)を加え、水素雰囲気下、室温で1.5時間撹拌した。混合物をセライト(登録商標)で濾過し、IMSで洗浄した。濾液に、4N塩化水素の1,4-ジオキサン溶液(0.78mL,3.12mmol)を加え、減圧下濃縮し、化合物34(1.06g)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.30-1.37 (m, 4H), 1.51-1.61 (m, 4H), 1.94 (s, 3H), 2.03 (s, 6H), 2.11 (s, 3H), 2.72-2.80 (m, 2H), 3.42-3.50 (m, 1H), 3.63 (dt, J=9.72, 6.88Hz, 1H), 3.88-3.96 (m, 1H), 4.06 (dd, J=12.10, 2.57Hz, 1H), 4.15 (dd, J=12.29, 5.32Hz, 1H), 4.87 (s, 1H), 5.04-5.15 (m, 3H), 7.80 (br s, 3H)
化合物35の合成
化合物34(510mg,1.05mmol)及び化合物25(128.4mg,0.21mmol)のDMF(3mL)溶液に、HOBt(161mg,1.05mmol)及びEDCI(202mg,1.05mmol)を順次加えた。得られた混合物を室温で10分間撹拌し、次いでDIPEA(0.18mL,1.05mmol)を加えた。得られた溶液を室温で22時間撹拌した。化合物34(505.9mg,1.04mmol)のDMF(1.5mL)溶液、HOBt(161mg,1.05mmol)及びEDCI(202mg,1.05mmol)を追加し、10分後にDIPEA(0.18mL,1.05mmol)を加えた。混合物をさらに3時間撹拌した。混合物を分取HPLCにより精製し、化合物34(46.3mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.21-1.45 (m, 24H), 1.49-1.59 (m, 8H), 1.61-1.89 (m, 8H), 1.93 (s, 12H), 2.01 (s, 24H), 2.10 (s, 12H), 2.07-2.23 (m, 8H), 2.33-2.37 (m, 2H), 2.96-3.08 (m, 7H), 3.41-3.48 (m, 4H), 3.57-3.65 (m, 4H), 3.88-3.94 (m, 4H), 4.05 (dd, J=12.10, 1.83Hz, 4H), 4.10-4.20 (m, 8H), 4.85 (s, 4H), 5.06-5.13 (m, 14H), 7.31-7.40 (m, 6H), 7.69-7.94 (m, 6H);
LCMS (ESI+): m/z 1164.58 [M+2H]2+.
化合物36の合成
化合物35(40.7mg,0.02mmol)のIMS(6mL)溶液に、窒素雰囲気下、10%パラジウム-炭素(11.5mg、50%含水品)を加え、水素雰囲気下、室温で2時間撹拌した。混合物をセライト(登録商標)で濾過し、IMSで洗浄した。合わせた濾液を減圧下で濃縮し、化合物36(43.8mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.20-1.44 (m, 24H), 1.51-1.60 (m, 8H), 1.61-1.88 (m, 8H), 1.93 (s, 12H), 2.02 (s, 12H), 2.02 (s, 12H), 2.10 (s, 12H), 2.12-2.27 (m, 10H), 2.96-3.08 (m, 7H), 3.41-3.48 (m, 4H), 3.58-3.65 (m, 4H), 3.88-3.94 (m, 4H), 4.04 (br d, J=10.27Hz, 4H), 4.09-4.29 (m, 8H), 4.85 (s, 4H), 5.04-5.14 (m, 12H), 7.71-8.01 (br m, 7H)
化合物37の合成
化合物36(32.8mg,0.015mmol)のDMF(3mL)溶液に、トリメチルアミン(16.3μL、0.12mmol)を加え、次いでトリフルオロ酢酸ペンタフルオロフェニル(10.0μL、0.06mmol)を滴下し、得られた混合物を室温で1.25時間撹拌した。反応混合物を水に注ぎ、飽和食塩水を加え、EtOAcで抽出した。有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、1M硫酸水素ナトリウム水溶液及び飽和食塩水で順次洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下濃縮した。残渣をペンタンでトリチュレートした。次いで、固体を40℃で減圧乾燥させて、化合物37(36.7mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.20-1.47 (m, 24H), 1.51-1.61 (m, 8H), 1.62-1.91 (m, 8H), 1.93 (s, 12H), 2.01 (s, 24H), 2.10 (s, 12H), 2.12-2.33 (m, 8H), 2.80 (br t, J=6.79Hz, 2H), 2.96-3.09 (m, 7H), 3.41-3.50 (m, 4H), 3.58-3.65 (m, 4H), 3.91 (br s, 4H), 4.04 (br d, J=12.10Hz, 4H), 4.10-4.28 (m, 8H), 4.85 (br s, 4H), 5.06-5.15 (m, 12H), 7.68-8.03 (m, 7H);
LCMS (ESI+): m/z 1202.46 [M+2H]2+.
化合物44の合成スキーム
化合物39の合成
無水塩化亜鉛(3.65g,26.8mmol)をアルゴン下で250mLの3口フラスコに秤量した。フラスコを減圧下110℃で1時間乾燥させ、次いで減圧下で一晩放冷した。次いで、フラスコをアルゴンで満たし、((2S,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロ-2H-ピラン-2,4,5-トリイルトリアセテート(7.85g,20.2mmol)、N-Cbz-6-アミノ-ヘキサン-1-オール(6.74g,26.8mmol)及びDCE(85mL)を添加した。混合物をアルゴン下、70℃(外部温度)で3時間加熱後、混合物を冷却し、次いで酢酸エチル及び飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で希釈した。混合物を20分間撹拌し、セライト(登録商標)で濾過し、酢酸エチルで洗浄した。合わせた濾液を分配し、有機層を水、次いで飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下濃縮した。残渣を、CombiFlashを用いたカラムクロマトグラフィー(330g PuriFlash Si、20-100%EtOAc/シクロヘキサン)により精製して、化合物39(9.42g)を得た。
1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm:
1.30-1.43 (m, 4H), 1.45-1.65 (m, 4H), 1.94 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 2.05 (s, 3H), 2.13 (s, 3H), 3.12-3.29 (m, 2H), 3.48 (dt, J=9.63, 6.50Hz, 1H), 3.79-4.02 (m, 3H), 4.06-4.21 (m, 2H), 4.65 (br d, J=8.19Hz, 1H), 4.78-4.93 (m, 1H), 5.06-5.18 (m, 2H), 5.27 (dd, J=11.25, 3.06Hz, 1H), 5.34 (d, J=2.81Hz, 1H), 5.77 (br d, J=8.44Hz, 1H), 7.29-7.42 (m, 5H)
LCMS (m/z 581 [M+H]+)
化合物40の合成
化合物39(9.23g,15.9mmol)のIMS(275mL)溶液に、窒素雰囲気下、4M塩化水素のジオキサン溶液(5.17mL,20.7mmol)及び10%パラジウム-炭素(1.895g;50%含水品)を加え、水素雰囲気下、室温で2.5時間撹拌した。混合物をセライト(登録商標)で濾過し、IMSで洗浄した。濾液を減圧下濃縮し、化合物40(8.07g)を得た。
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.22-1.35 (m, 4H), 1.39-1.62 (m, 4H), 1.78 (s, 3H), 1.89 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 2.10 (s, 3H), 2.69-2.82 (m, 2H), 3.41-3.47 (m, 2H), 3.64-3.77 (m, 1H), 3.81-3.93 (m, 1H), 3.95-4.12 (m, 2H), 4.49 (d, J=8.56Hz, 1H), 4.97 (dd, J=11.25, 3.42Hz, 1H), 5.22 (d, J=3.42Hz, 1H), 7.62-7.80 (m, 3H), 7.86 (d, J=9.29Hz, 1H)
LCMS (m/z 447 [M+H]+)
化合物41の合成
250mLのQuickfit(登録商標)三角フラスコ中のCTC樹脂(1.33mmol/g,1.31g,1.74mmol)、Fmoc-Glu(OtBu)-OH(0.370g,0.87mmol)、Fmoc-D-Glu(OtBu)-OH(0.370g,0.87mmol)及びDCM(105mL)の混合物に、DIPEA(1.215mL,6.96mmol)を滴下した。フラスコに栓をし、プレートシェーカーに取り付け、300rpmで2時間振盪した。MeOH(0.7mL,17.3mmol)を添加し、混合物をさらに35分間振盪した。混合物を70mLプラスチック相分離カートリッジで濾過し、窒素でバブリングしながら20%ピペリジンのDMF溶液(50mL)で30分間処理した。溶液を排出させ、樹脂をDMFで洗浄した。
カートリッジ中の樹脂に、Fmoc-D-Glu-OtBu(0.740g,1.74mmol)、N-Fmoc-L-グルタミン酸-1-t-ブチルエステル(0.740g,1.74mmol)及びHBTU(1.253g,3.30mmol)のDMF(10mL)溶液を添加し、次いでDIPEA(1.22mL,6.96mmol)を滴下した。混合物を窒素でバブリングしながら1時間混合した。次いで、溶液を、窒素気流で溶媒除去し、樹脂を、窒素でバブリングにより混合しながら、20%ピペリジンDMF(50mL)溶液で35分間処理した。溶液を排出させ、樹脂をDMFで洗浄した。
カートリッジ中の残りの樹脂に、1,5-ペンタン二酸モノベンジルエステル(0.580g,2.61mmol)及びHBTU(1.253g,3.30mmol)のDMF(10mL)溶液、次いでDIPEA(1.215mL,6.96mmol)を滴下した。混合物を、80分間、窒素でバブリングして混合した。溶液を排出させ、樹脂をDMF次いでMeOHで洗浄した。次いで、樹脂を吸引乾燥した。樹脂を25×150mm試験管に移し、30分間減圧乾燥させた後、DCM(5mL)及びTFA(5mL)で処理して、プレートシェーカーで2時間振盪した。次いで、混合物を相分離カートリッジに通して濾過し、DCMで洗浄した。濾液を減圧下濃縮し、化合物41(0.5859g)を得た。
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.68-1.84 (m, 4H), 1.86-2.01 (m, 2H), 2.13-2.23 (m, 4H), 2.23-2.29 (m, 2H), 2.38 (t, J=7.52Hz, 2H), 4.11-4.22 (m, 2H), 5.09 (s, 2H), 7.29-7.42 (m, 5H), 8.06-8.17 (m, 2H)
LCMS (m/z 481 [M+H]+)
化合物42の合成
化合物40(4.06g,8.41mmol)及び化合物41(0.5821g,1.21mmol)のDMF(8mL)溶液に、HOBt(1.392g,9.09mmol)、EDCI(1.742g,9.09mmol)、次いでDIPEA(1.587mL,9.09mmol)を順次添加した。混合物を室温で20時間撹拌した。混合物を分取HPLCで精製して、化合物42(0.48g)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.23 (br s, 12H), 1.29-1.40 (m, 6H), 1.40-1.48 (m, 6H), 1.60-1.71 (m, 2H), 1.76 (s, 9H), 1.76-1.87 (m, 4H), 1.89 (s, 9H), 1.99 (s, 9H), 2.00-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.11-2.15 (m, 2H), 2.18 (br t, J=7.15Hz, 2H), 2.34-2.38 (m, 2H), 2.94-3.07 (m, 6H), 3.36-3.43 (m, 3H), 3.65-3.73 (m, 3H), 3.82-3.91 (m, 3H), 3.98-4.06 (m, 9H), 4.10-4.20 (m, 2H), 4.48 (d, J=8.44Hz, 3H), 4.97 (dd, J=11.19, 3.12Hz, 3H), 5.08 (s, 2H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.30-7.39 (m, 5H), 7.71-7.76 (m, 1H), 7.77-7.85 (m, 5H), 7.87-7.93 (m, 2H)
LCMS (m/z 1766 [M+H]+)
化合物43の合成
化合物42(0.43g,0.243mmol)のIMS(85mL)溶液に、窒素雰囲気下、10%パラジウム-炭素(0.158g,0.074mmol;50%含水品)を加え、水素雰囲気下、室温で2.75時間撹拌した。混合物をセライト(登録商標)で濾過し、IMSで洗浄した。濾液を減圧下濃縮し、残渣をDCM/EtOH(2:1)に溶解し、セライト(登録商標)で濾過し、DCM-EtOH(2:1)で洗浄した。濾液を減圧下濃縮し、化合物43(0.4252g)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6)δppm:
1.18-1.29 (m, 12H), 1.31-1.41 (m, 6H), 1.41-1.49 (m, 6H), 1.62-1.75 (m, 4H), 1.77 (s, 9H), 1.81-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 1.99 (s, 9H), 2.01-2.08 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.24 (m, 6H), 2.95-3.07 (m, 6H), 3.37-3.45 (m, 3H), 3.66-3.73 (m, 3H), 3.82-3.92 (m, 3H), 3.98-4.06 (m, 9H), 4.09-4.20 (m, 2H), 4.49 (d, J=8.44Hz, 3H), 4.97 (dd, J=11.19, 2.38Hz, 3H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.73-8.04 (m, 8H), 11.81-12.20 (m, 1H).
LCMS (m/z 1676 [M+H]+).
化合物44の合成
化合物43(0.4239g,0.253mmol)のDMF(50mL)溶液に、窒素雰囲気下、トリエチルアミン(0.282mL,2.024mmol)、次いでトリフルオロ酢酸ペンタフルオロフェニル(0.174mL,1.012mmol)を滴下した。混合物を室温で1時間撹拌し、水に注いだ。水層に飽和食塩水を加え、EtOAcで抽出した。合わせた有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、1M硫酸水素ナトリウム水溶液及び飽和食塩水で順次洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、次いで減圧下濃縮し得られた残渣にEtOAcを加え、1M硫酸水素ナトリウム水溶液、次いで飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下濃縮させることで、化合物44(0.4513g)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6)δ ppm:
1.24 (br s, 12H), 1.31-1.40 (m, 6H), 1.41-1.48 (m, 6H), 1.61-1.73 (m, 2H), 1.76 (s, 9H), 1.79-1.93 (m, 13H), 1.99 (s, 9H), 2.01-2.06 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.11-2.18 (m, 2H), 2.27 (br t, J=7.34Hz, 2H), 2.80 (t, J=6.97Hz, 2H), 2.96-3.07 (m, 6H), 3.37-3.43 (m, 3H), 3.69 (dt, J=9.63, 6.19Hz, 3H), 3.82-3.91 (m, 3H), 3.98-4.06 (m, 9H), 4.09-4.22 (m, 2H), 4.48 (d, J=8.44Hz, 3H), 4.97 (dd, J=11.37, 3.30Hz, 3H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.73 (br t, J = 5.14Hz, 1H), 7.77-7.85 (m, 5H), 7.91 (br dd, J = 11.19, 7.89Hz, 1H), 7.98 (br d, J = 8.07Hz, 1H)
LCMS (m/z 1843.56 [M+H]+)
化合物47の合成スキーム
化合物45の合成
化合物34(1383mg,2.86mmol)及び化合物41(183.1mg,0.381mmol)のDMF(3.0mL)溶液に、HOBt(438mg,2.86mmol)、EDCI(548mg,2.86mmol)及びDIPEA(0.50mL,2.86mmol)を順次加えた。得られた混合物を室温で24時間撹拌した。混合物を分取HPLCにより精製して、化合物45(133.4mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.23-1.34 (m, 12H), 1.34-1.43 (m, 6H), 1.50-1.59 (m, 6H), 1.62-1.72 (m, 2H), 1.74-1.80 (m, 2H), 1.81-1.89 (m, 2H), 1.93 (s, 9H), 2.01 (s, 18H), 2.03-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.11-2.15 (m, 2H), 2.16-2.21 (m, 2H), 2.33-2.38 (m, 2H), 2.97-3.07 (m, 6H), 3.41-3.48 (m, 3H), 3.57-3.64 (m, 3H), 3.87-3.94 (m, 3H), 4.05 (dd, J=12.10, 2.57Hz, 3H), 4.10-4.19 (m, 5H), 4.85 (s, 3H), 5.0-5.13 (m, 11H), 7.29-7.39 (m, 5H), 7.71 (br t, J=4.95Hz, 1H), 7.76-7.84 (m, 2H), 7.85-7.91 (m, 2H)
LCMS (m/z 1769 [M+H]+)
化合物46の合成
化合物45(101.9mg,0.058mmol)のIMS(20mL)溶液に、窒素雰囲気下、10%パラジウム-炭素(37.4mg;50%含水品)を添加した。混合物を水素雰囲気下、室温で2.5時間撹拌した。混合物をセライト(登録商標)で濾過し、次いでIMSで洗浄した。合わせた濾液を減圧下濃縮し、化合物46(95.9mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.28 (br s, 12H), 1.34-1.44 (m, 6H), 1.49-1.60 (m, 6H), 1.61-1.76 (m, 4H), 1.81-1.90 (m, 2H), 1.93 (s, 9H), 2.02 (s, 9H), 2.02 (s, 9H), 2.04-2.08 (m,2H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.23 (m, 6H), 2.96-3.07 (m, 6H), 3.40-3.48 (m, 3H), 3.57-3.65 (m, 3H), 3.86-3.94 (m, 3H), 4.05 (dd, J=12.10, 2.38Hz, 3H), 4.09-4.18 (m, 5H), 4.85 (s, 3H), 5.01-5.14 (m, 9H), 7.62-8.17 (m, 5H), 11.84-12.15 (m, 1H).
LCMS (m/z 1679 [M+H]+).
化合物47の合成
化合物46(94.6mg,0.056mmol)のDMF(9mL)溶液に、窒素雰囲気下、トリエチルアミン(62.8μL,0.451mmol)を加え、トリフルオロ酢酸ペンタフルオロフェニル(38.7μL,0.225mmol)を滴下した。得られた混合物を室温で1時間撹拌した。混合物を水に注ぎ、飽和食塩水を加え、EtOAcで抽出した。合わせた有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、1M硫酸水素ナトリウム水溶液及び飽和食塩水で順次洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、次いで減圧下濃縮することで、化合物47(109.0mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.23-1.33 (m, 12H), 1.34-1.43 (m, 6H), 1.50-1.60 (m, 6H), 1.62-1.77 (m, 2H), 1.80-1.91 (m, 4H), 1.93 (s, 9H), 2.01 (s, 18H), 2.03-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.20 (m, 2H), 2.25-2.30 (m, 2H), 2.77-2.82 (m, 2H), 2.96-3.08 (m, 6H), 3.41-3.48 (m, 3H), 3.53-3.68 (m, 3H), 3.86-3.95 (m, 3H), 4.00-4.07 (m, 3H), 4.10-4.23 (m, 5H), 4.85 (s, 3H) 5.04-5.13 (m, 9H), 7.71 (br t, J=5.32Hz, 1H), 7.78-7.85 (m, 2H), 7.89 (dd, J=12.84, 8.07Hz, 1H), 7.96 (d, J=8.07Hz, 1H)
LCMS (m/z 1845.47 [M+H]+)
化合物53a、53b及び53cの合成スキーム
化合物49aの合成
50mLの三口フラスコに入れた塩化亜鉛(285mg,2.09mmol)を減圧下110℃で1時間乾燥させ、減圧下で一晩放冷した。フラスコを窒素置換し、化合物38(611mg,1.57mmol)及び化合物48a(500mg,2.09mmol)のDCE(5mL)溶液を加えた。混合物を窒素雰囲気下、70℃(外部温度)で3時間加熱した。混合物を放冷し、酢酸エチル(10mL)/飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(5mL)で希釈した。混合物を10分間撹拌し、セライト(登録商標)で濾過し、酢酸エチルで洗浄した。合わせた濾液を水及び飽和食塩水で洗浄した。有機層を疎水性濾紙で濾過し、減圧下濃縮した。残渣をBiotage Isolera(50g KP-Sil、0-50%(3:1 EtOAc-IMS)/MTBE)を用いたカラムクロマトグラフィーによって精製することで、化合物49a(599.4mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, CDCl3) δ ppm:
1.90 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 2.04 (s, 3H), 2.13 (s, 3H), 3.26-3.86 (m, 8H), 3.87-4.00 (m, 2H), 4.05-4.19 (m, 2H), 4.76 (br d, J=7.70Hz, 1H), 5.10-5.20 (m, 2H), 5.26 (br dd, J=6.60, 3.30Hz, 1H), 5.32 (br s, 1H), 5.43 (br s, 1H), 5.75 (br d, J=7.34Hz, 1H), 7.28-7.42 (m, 5H).
LCMS (m/z 569 [M+H]+).
化合物50aの合成
化合物49a(594.2mg,1.05mmol)のIMS(18mL)溶液に、窒素雰囲気下、4M塩化水素の1,4-ジオキサン溶液(0.34mL,1.36mmol)及び10%パラジウム-炭素(50%含水品、125mg)を加えた。混合物を、水素雰囲気下、室温で2.5時間撹拌した。混合物をセライト(登録商標)で濾過し、IMSで洗浄した。合わせた濾液を減圧下濃縮し、減圧下濃縮することで、化合物50a(507.9mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.77-1.84 (m, 3H), 1.86-1.92 (m, 3H), 1.97-2.03 (m, 3H), 2.06-2.13 (m, 3H), 2.92-3.00 (m, 2H), 3.52-3.75 (m, 5H), 3.83 (ddd, J=11.28, 5.41, 3.85Hz, 1H), 3.86-3.93 (m, 1H), 3.95-4.17 (m, 3H), 4.57 (d, J=8.44Hz 1H), 4.99 (dd, J=11.19, 3.48Hz, 1H), 5.23 (d, J=3.67Hz, 1H), 7.81 (br s, 3H), 7.85-7.92 (m, 1H)
LCMS (m/z 435 [M+H]+)
化合物51aの合成
化合物50a(506.5mg,1.08mmol)及び化合物41(68.9mg,0.14mmol)のDMF(2.0mL)溶液に、HOBt(165mg,1.08mmol)、EDCI(206mg,1.08mmol)及びDIPEA(188μL、1.08mmol)を順次添加した。得られた混合物を室温で20時間撹拌した。混合物を分取HPLCによって精製することで、化合物51a(40.0mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.62-1.73 (m, 2H), 1.77 (s, 9H), 1.80-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 1.99 (s, 9H), 2.02-2.08 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.11-2.24 (m, 4H), 2.34-2.38 (m, 2H), 3.13-3.22 (m, 4H), 3.34-3.42 (m, 7H), 3.44-3.54 (m, 7H), 3.55-3.61 (m, 3H), 3.73-3.80 (m, 3H), 3.84-3.91 (m, 3H), 3.97-4.08 (m, 9H), 4.13-4.25 (m, 2H), 4.55 (dd, J=8.07, 3.67Hz, 3H), 4.99 (br d, J=11.00Hz, 3H), 5.07-5.10 (m, 2H), 5.22 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.31-7.40 (m, 5H), 7.60-7.97 (m, 8H)
LCMS (m/z 1730/1731 [M+H]+)
化合物52aの合成
化合物51a(42.7mg,0.03mmol)のIMS(8mL)溶液に、窒素雰囲気下で10%パラジウム-炭素(50%含水品;16.0mg)を加えた。混合物を水素雰囲気下、室温で2.5時間撹拌した。混合物をセライト(登録商標)で濾過し、IMSで洗浄した。濾液を減圧下濃縮し、化合物52a(41.2mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.62-1.75 (m, 4H), 1.78 (s, 9H), 1.81-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 2.00 (s, 9H), 2.05-2.32 (m, 17H), 3.12-3.23 (m, 4H), 3.36-3.43 (m, 7H), 3.45-3.54 (m, 7H), 3.55-3.61 (m, 3H), 3.74-3.81 (m, 3H), 3.83-3.92 (m, 3H), 3.98-4.08 (m, 9H), 4.11-4.23 (m, 2H), 4.51-4.59 (m, 3H), 4.99 (br d, J=11.00Hz, 3H), 5.22 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.62-8.04 (m, 8H)
LCMS (m/z 1640/1641 [M+H]+)
化合物53aの合成
化合物52a(41.6mg,0.03mmol)のDMF(4mL)溶液に、窒素雰囲気下、トリエチルアミン(28μL、0.20mmol)、次いでトリフルオロ酢酸ペンタフルオロフェニル(17μL、0.10mmol)を滴下した。得られた混合物を室温で1.5時間撹拌し、水に注ぎ、飽和食塩水を加え、EtOAcで抽出した。合わせた有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、1M硫酸水素ナトリウム水溶液及び飽和食塩水で順次洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、減圧下濃縮した。残渣をDCM/MeOH入りのサンプルバイアルに移し、溶媒を蒸発させた後、40℃で2時間減圧乾燥させることで、化合物52c(27.1mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.57-1.75 (m, 4H), 1.77 (s, 9H), 1.86-1.95 (m, 11H), 2.00 (s, 9H), 2.05-2.33 (m, 15H), 2.77-2.88 (m, 2H), 3.11-3.24 (m, 4H), 3.41-3.54 (m, 14H), 3.55-3.62 (m, 3H), 3.74-3.81 (m, 3H), 3.84-3.91 (m, 3H), 3.98-4.07 (m, 9H), 4.11-4.23 (m, 2H), 4.55 (br dd, J=8.07, 3.67Hz, 3H), 4.99 (br d, J=11.00Hz, 3H), 5.22 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.65-8.04 (m, 8H)
LCMS (m/z 1806.83 [M+H]+)
化合物49bの合成
50mLの三口フラスコに入れた塩化亜鉛(0.466g,3.42mmol)を減圧下110℃で95分間乾燥させ、減圧下で一晩放冷した。フラスコを窒素置換し、化合物38(1.00g,2.57mmol)及び化合物48b(0.97g,3.42mmol)のDCE(10mL)溶液を加えた。混合物を窒素雰囲気下、70℃(外部温度)で3時間加熱した。混合物を放冷し、酢酸エチル(20mL)/飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(10mL)で希釈した。混合物を15分間撹拌し、セライト(登録商標)で濾過し、酢酸エチルで洗浄した。濾液を水及び飽和食塩水で洗浄した。有機層を疎水性濾紙で濾過し、減圧下濃縮した。残渣をBiotage Isolera(100g Sfar Duo Si、0-50%(3:1 EtOAc-IMS)/MTBE)を用いたカラムクロマトグラフィーによって精製することで、化合物49b(1.14g)を得た。
1H NMR (600 MHz, CDCl3) δppm:
1.92 (s, 3H), 1.98 (s, 3H), 2.03 (s, 3H), 2.14 (s, 3H), 3.32-3.50 (m, 2H), 3.53-3.73 (m, 8H), 3.77-3.94 (m, 3H), 4.02-4.22 (m, 3H), 4.74 (br d, J=8.44Hz, 1H), 5.03-5.08 (m, 1H), 5.11 (br s, 2H), 5.26 (br s, 1H), 5.40-5.53 (m, 1H), 6.11-6.21 (m, 1H), 7.30-7.40 (m, 5H).
LCMS (m/z 613 [M+H]+).
化合物50bの合成
化合物49b(1.14g,1.86mmol)のIMS(32mL)溶液に、窒素雰囲気下、4M塩化水素の1,4-ジオキサン(0.60mL,2.42mmol)溶液及び10%パラジウム-炭素(50%含水品;0.221g)を加えた。混合物を、水素雰囲気下、室温で2.5時間撹拌した。混合物をセライト(登録商標)で濾過し、IMSで洗浄した。合わせた濾液を減圧下濃縮し、化合物50b(0.97g)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.79 (s, 3H), 1.89 (s, 3H), 2.00 (s, 3H,) 2.11 (s, 3H), 2.94-3.02 (m, 2H), 3.50-3.62 (m, 9H), 3.77-3.84 (m, 1H), 3.86-3.94 (m, 1H), 3.98-4.10 (m, 3H), 4.54 (d, J=8.44Hz, 1H), 4.97 (dd, J=11.19, 3.48Hz, 1H), 5.22 (d, J=3.67Hz, 1H), 7.70-7.93 (m, 4H)
LCMS (m/z 479 [M+H]+)
化合物51bの合成
化合物50b(556mg,1.08mmol)及び化合物41(74.1mg,0.15mmol)のDMF(3mL)溶液に、HOBt(165mg,1.08mmol)、EDCI(207mg,1.08mmol)、及びDIPEA(189μL、1.08mmol)を順次添加した。得られた混合物を室温で19時間撹拌した。混合物を分取HPLCによって精製することで、化合物51b(67.5mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.61-1.74 (m, 2H), 1.77 (s, 9H), 1.80-1.85 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 2.00 (s, 9H), 2.03-2.08 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.24 (m, 4H), 2.35-2.38 (m, 2H), 3.10-3.23 (m, 4H), 3.36-3.42 (m, 7H), 3.44-3.63 (m, 22H), 3.74-3.81 (m, 3H), 3.83-3.91 (m, 3H), 3.99-4.08 (m, 9H), 4.13-4.25 (m, 2H), 4.55 (d, J=8.44Hz, 3H), 4.95-5.00 (m, 3H), 5.09 (s, 2H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.31-7.41 (m, 5H), 7.72-7.86 (m, 4H), 7.86-7.99 (m, 4H)
LCMS (m/z 1862/1863 [M+H]+)
化合物52bの合成
化合物51b(66.1mg,0.04mmol)のIMS(13mL)溶液に、窒素雰囲気下で10%パラジウム-炭素(50%含水品;23.1mg)を加えた。混合物を水素雰囲気下、室温で2.5時間撹拌した。混合物をセライト(登録商標)で濾過し、IMSで洗浄した。合わせた濾液を減圧下濃縮し、化合物52b(61.3mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.63-1.75 (m, 4H), 1.77 (s, 9H), 1.81-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 9H),2.00 (s, 9H), 2.03-2.24 (m, 17H), 3.09-3.23 (m, 4H), 3.35-3.43 (m, 7H), 3.44-3.64 (m, 22H), 3.74-3.81 (m, 3H), 3.84-3.91 (m, 3H), 3.98-4.07 (m, 9H), 4.10-4.24 (m, 2H), 4.56 (br d, J=8.80Hz, 3H), 4.98 (br d, J=11.00Hz, 3H), 5.22 (d, J=2.93Hz, 3H), 7.70-8.06 (m, 8H).
LCMS (m/z 1772/1773 [M+H]+)
化合物53bの合成
化合物52b(60.7mg,0.03mmol)のDMF(6mL)溶液に、窒素雰囲気下、トリエチルアミン(38μL,0.27mmol)、次いでトリフルオロ酢酸ペンタフルオロフェニル(24μL,0.14mmol)を滴下した。得られた混合物を室温で77分間撹拌し、水に注ぎ、飽和食塩水を加え、EtOAcで抽出した。合わせた有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、1M硫酸水素ナトリウム水溶液、4%塩化リチウム水溶液及び飽和食塩水で順次洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、次いで濃縮し、40℃で4時間減圧乾燥させることで、化合物53b(29.3mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.62-1.75 (m, 2H), 1.77 (s, 9H), 1.85-1.95 (m, 13H), 2.00 (s, 9H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.33 (m, 6H), 2.78-2.86 (m, 2H), 3.12-3.24 (m, 4H), 3.35-3.44 (m, 7H), 3.45-3.64 (m, 22H), 3.75-3.81 (m, 3H), 3.83-3.92 (m, 3H), 3.99-4.06 (m, 9H), 4.12-4.26 (m, 2H), 4.55 (d, J=8.44Hz, 3H), 4.98 (dd, J=11.19, 2.02Hz, 3H), 5.21 (d, J=3.67Hz, 3H), 7.64-8.03 (m, 8H)
LCMS (m/z 1939.01 [M+H]+)
化合物49cの合成
50mLの三口フラスコに入れた塩化亜鉛(210mg,1.54mmol)を減圧下110℃で75分間乾燥させ、減圧下で一晩放冷した。フラスコを窒素置換し、化合物38(450.2mg,1.16mmol)及び化合物48c(503.4mg,1.54mmol)のDCE(5mL)溶液を加えた。混合物をアルゴン雰囲気下、70℃(外部温度)で3時間加熱した。混合物を放冷し、酢酸エチル(10mL)/飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(5mL)で希釈した。混合物を15分間撹拌し、セライト(登録商標)で濾過し、酢酸エチルで洗浄した。濾液を水及び飽和食塩水で洗浄した。有機層を疎水性濾紙で濾過し、減圧下濃縮した。残渣をBiotage Isolera(50g Sfar Si、0-50%(3:1 EtOAc-IMS)/MTBE)を用いたカラムクロマトグラフィーによって精製することで、化合物49c(469.0mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, CDCl3) δ ppm:
1.95 (s, 3H), 1.96 (s, 3H), 2.04 (s, 3H), 2.15 (s, 3H), 3.39 (br d, J=4.77Hz, 2H), 3.52-3.72 (m, 12H), 3.79-3.94 (m, 3H), 4.09-4.14 (m, 1H), 4.14-4.18 (m, 1H), 4.18-4.25 (m, 1H), 4.77 (br d, J=8.44Hz, 1H), 4.98-5.06 (m, 1H), 5.10 (br s, 2H), 5.31 (br s, 1H), 5.34-5.45 (m, 1H), 6.29-6.39 (m, 1H), 7.29-7.33 (m, 1H), 7.36 (d, J=4.40Hz, 4H)
LCMS (m/z 657 [M+H]+)
化合物50cの合成
化合物49c(0.45g,0.69mmol)のIMS(12mL)溶液に、窒素雰囲気下、4M塩化水素の1,4-ジオキサン溶液(225μL,0.90mmol)及び10%パラジウム-炭素(50%含水品;0.083g)を加えた。混合物を、水素雰囲気下、室温で2.5時間撹拌した。混合物をセライト(登録商標)で濾過し、IMSで洗浄した。濾液を減圧下濃縮し、化合物50c(0.40g)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.78 (s, 3H), 1.89 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 2.11 (s, 3H), 2.94-3.01 (m, 2H), 3.48-3.62 (m, 13H), 3.76-3.82 (m, 1H), 3.85-3.93 (m, 1H), 3.99-4.08 (m, 3H), 4.55 (d, J=8.44Hz, 1H), 4.94-5.01 (m, 1H), 5.22 (d, J=3.67Hz, 1H), 7.75-7.88 (m, 4H)
LCMS (m/z 423 [M+H]+)
化合物51cの合成
化合物50c(379.8mg,0.679mmol)及び化合物41(47.2mg,0.10mmol)のDMF(2mL)溶液に、HOBt(104mg,0.68mmol)、EDCI(130mg,0.68mmol)及びDIPEA(119μL,0.68mmol)を順次加えた。得られた混合物を室温で19時間撹拌した。混合物を、分取HPLCによって精製することで、化合物51c(53.8mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.61-1.73 (m, 2H), 1.77 (s, 9H), 1.79-1.85 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 2.00 (s, 9H), 2.03-2.08 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.22 (m, 4H), 2.33-2.37 (m, 2H), 3.07-3.23 (m, 4H), 3.34-3.42 (m, 7H), 3.43-3.55 (m, 30H), 3.55-3.62 (m, 4H), 3.75-3.81 (m, 3H), 3.85-3.92 (m, 3H), 3.99-4.07 (m, 9H), 4.13-4.24 (m, 2H), 4.56 (d, J=8.80Hz, 3H), 4.97 (dd, J=11.00, 3.30Hz, 3H), 5.06-5.11 (m, 2H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.30-7.39 (m, 5H), 7.62-7.84 (m, 5H), 7.85-7.95 (m, 3H)
LCMS (m/z 1994/1995 [M+H]+)
化合物52cの合成
化合物51c(84mg,0.04mmol)のIMS(17mL)溶液に、窒素雰囲気下で10%パラジウム-炭素(50%含水品;27.3mg)を加えた。混合物を水素雰囲気下、室温で2.5時間撹拌した。混合物をセライト(登録商標)で濾過し、IMSで洗浄した。濾液を減圧下濃縮し、化合物52c(78.9mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.60-1.75 (m, 4H), 1.78 (s, 9H), 1.80-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 2.00 (s, 9H), 2.03-2.32 (m, 17H), 3.12-3.23 (m, 4H), 3.36-3.42 (m, 7H), 3.43-3.63 (m, 34H), 3.74-3.81 (m, 3H), 3.84-3.92 (m, 3H), 3.99-4.07 (m, 9H), 4.09-4.22 (m, 2H), 4.57 (br d, J=8.44Hz, 3H), 4.98 (dd, J=11.19, 3.12Hz, 3H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.61-8.05 (m, 8H), 12.01 (br s, 1H)
LCMS (m/z 1904/1905 [M+H]+)
化合物53cの合成
化合物52c(77.3mg,0.04mmol)のDMF(3mL)溶液に、窒素雰囲気下、トリエチルアミン(45μL,0.33mmol)、次いでトリフルオロ酢酸ペンタフルオロフェニル(27μL、0.16mmol)を滴下した。得られた混合物を室温で1.5時間撹拌し、水に注ぎ、飽和食塩水を加え、次いでEtOAcで抽出した。有機層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、1M硫酸水素ナトリウム水溶液、次いで飽和食塩水で順次洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、次いで減圧下濃縮した。残渣をDCM/MeOH入りのサンプルバイアルに移し、溶媒を蒸発させた後、40℃で2時間減圧乾燥させて、残渣を得た。これをEtOAc(20mL)に溶解し、4%塩化リチウム水溶液(5mL)、次いで飽和食塩水(5mL)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、次いで蒸発させた。残渣をEtOAc入りのサンプルバイアルに移し、蒸発させ、40℃で減圧乾燥させた。DCMを残渣に添加し、減圧下濃縮し、残渣を40℃で4時間減圧乾燥させることで、化合物53c(19.4mg)を得た。
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.59-1.73 (m, 2H), 1.77 (s, 9H), 1.85-1.95 (m, 13H), 2.00 (s, 9H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.34 (m, 6H), 2.77-2.89 (m, 2H), 3.11-3.23 (m, 4H), 3.35-3.44 (m, 7H), 3.45-3.63 (m, 34H), 3.75-3.80 (m, 3H), 3.84-3.91 (m, 3H), 4.00-4.07 (m, 9H), 4.16-4.26 (m, 2H), 4.56 (d, J=8.80Hz, 3H), 4.97 (dd, J=11.37, 3.30Hz, 3H), 5.21 (d, J=3.67Hz, 3H), 7.62-8.03 (m, 8H).
QC LCMS (m/z 1035.97 [M+2H]2+)
実施例9~12:核酸複合体9~12の合成
B2M(β2-マイクログロブリン)標的siRNAのセンス鎖(215nmol)にsodium tetraborate buffer pH8.5及び、DMSOに溶解した化合物28又は44(1000nmol)を加え、室温にて攪拌した。反応液に水を加えた後、Vivaspin 3K(Sartorius社)にて精製を行った。得られた粗生成物に5倍量の28%アンモニア水を加え、室温にて2時間静置した。反応液に水を加えた後、Vivaspin 3K(Sartorius社)にて精製を繰り返し行うことで、核酸複合体9~12を得た。本実施例において合成した核酸複合体の分子量を、ESI-MS又はMALDI-TOF-MSにより行った。使用したセンス鎖の配列、アンチセンス鎖の配列及び分子量を表5に示す。
核酸複合体の配列及び分子量を表6に示す。
核酸複合体9
核酸複合体10
核酸複合体11
核酸複合体12
実施例13~16:核酸複合体13~16(si-RNA)の調製
アンチセンス鎖(siB2M-as)と核酸複合体9~12を等モル量加えることで、B2Mを標的とするsi-RNAを調製した。表7にsi-RNAのセンス鎖及びアンチセンス鎖を示す。
<試験例4>
実施例13~16で調製した核酸複合体(si-RNA)を、1.0mg/kg又は5.0mg/kgにて、BALB/cマウス(一群につき3匹)に皮下投与し、投与から7日後に肝臓を採取した。肝臓中のB2M及び内部対照としてGAPDH(グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ)のmRNA発現量をTaqManプローブ(Applied Biosystems社)を用いてqPCRにより測定した。無処置群(Control)のマウス肝臓中のB2M mRNA発現レベルを100%とし、核酸複合体投与群のB2M mRNA発現レベル(相対値)を算出した。表8に結果を示す。
表8に示した結果から明らかなように、siRNA-2、siRNA-3、siRNA-4及びsiRNA-5は用量依存的な遺伝子発現抑制効果を示した。糖リガンドを含まないsiRNA-1は5.0mg/kgにおいても遺伝子発現抑制効果がほぼ認められないに対し、糖リガンドを含むsiRNAは1.0mg/kgにおいても高い遺伝子発現抑制効果を示した。
実施例17~19:核酸複合体17~19の合成
核酸として、3-10-3モチーフを有するGapmer型LNAアンチセンス(ASO;ISIS-549148)を用い、化合物44、47又は53aを用いた以外は、実施例9~11と同様の方法で核酸複合体を調製した。使用したセンス鎖の配列、アンチセンス鎖の配列及び分子量を表9に示す。
核酸複合体の配列及び分子量を表10に示す。
核酸複合体17
核酸複合体18
核酸複合体19
<試験例5>
核酸複合体のヒトCD206発現Lenti-X 293T細胞に対するin vitro取り込み活性評価
試験例1と同様にして、核酸複合体17~19の評価を行った。試験例5では、糖リガンド修飾の無い核酸であるASO_3’Cy3を添加したwellの蛍光強度を1として、各核酸複合体を添加したwellの蛍光強度を相対値として算出した。
結果を表11に示す。この結果から、糖リガンドを含まない核酸であるASO_3’Cy3と比較して、GalNacを有する核酸複合体17及び19はCD206が発現した細胞に効率的に取り込まれない一方、マンノースを有する核酸複合体18はCD206が発現した細胞に効率的に取り込まれることが明らかになった。
<試験例6>
核酸複合体のヒトASGR1発現Lenti-X293T細胞に対するin vitro取り込み活性評価
試験例2と同様にして、核酸複合体17~19の評価を行った。試験例6では、糖リガンド修飾の無い核酸であるASO_3’Cy3を添加したwellの蛍光強度を1として、各核酸複合体を添加したwellの蛍光強度を相対値として算出した。
結果を表12に示す。この結果から、糖リガンド修飾の無い核酸であるASO_3’Cy3と比較して、マンノースを有する核酸複合体18はASGR1が発現した細胞に効率的に取り込まれない一方、GalNacを有する核酸複合体17及び19はASGR1が発現した細胞に効率的に取り込まれることが明らかになった。

Claims (18)

  1. 下記式(III):

    [Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
    で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
  2. 下記式(IV):

    [Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
    で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
  3. 下記式(V):

    [Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
    で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
  4. 下記式(VI):

    [Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
    で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
  5. 下記式(VII):

    [Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
    で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
  6. 下記式(VIII):

    [Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
    で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
  7. 下記式(IX):

    [Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
    で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
  8. 下記式(X):

    [Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
    で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
  9. 下記式(XI):

    [Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
    で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
  10. オリゴヌクレオチドが一本鎖である、請求項1~9のいずれか一項記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩
  11. オリゴヌクレオチドが3’末端を介して結合している、請求項10に記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩
  12. オリゴヌクレオチドが5’末端を介して結合している、請求項10に記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩
  13. オリゴヌクレオチドが二本鎖である、請求項1~9のいずれか一項記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩
  14. オリゴヌクレオチドが、一つの鎖の3’末端を介して結合している、請求項13に記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩
  15. オリゴヌクレオチドが、一つの鎖の5’末端を介して結合している、請求項13に記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩
  16. 請求項1~15のいずれか一項記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩を含む、医薬組成物。
  17. 細胞における標的遺伝子の発現を調節する、請求項16に記載の医薬組成物。
  18. 細胞が樹状細胞、マクロファージ又は肝実質細胞である請求項17に記載の医薬組成物。
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