JP7681525B2 - 核酸複合体及びそれを含む医薬組成物 - Google Patents
核酸複合体及びそれを含む医薬組成物 Download PDFInfo
- Publication number
- JP7681525B2 JP7681525B2 JP2021574117A JP2021574117A JP7681525B2 JP 7681525 B2 JP7681525 B2 JP 7681525B2 JP 2021574117 A JP2021574117 A JP 2021574117A JP 2021574117 A JP2021574117 A JP 2021574117A JP 7681525 B2 JP7681525 B2 JP 7681525B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- mmol
- compound
- nucleic acid
- added
- oligonucleotide
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/54—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an organic compound
- A61K47/549—Sugars, nucleosides, nucleotides or nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/111—General methods applicable to biologically active non-coding nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/11—Antisense
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/14—Type of nucleic acid interfering nucleic acids [NA]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
- C12N2310/315—Phosphorothioates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/35—Nature of the modification
- C12N2310/351—Conjugate
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
Description
[1]下記式(I):
Yはマンノース又はGalNacを有する糖リガンドであり;
nは1から8までの整数を示し;
Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[2]下記式(II):
Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[3]下記式(III):
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[4]下記式(IV):
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[5]下記式(V):
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[6]下記式(VI):
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[7]下記式(VII):で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[8]下記式(VIII):
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[9]下記式(IX):
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[10]下記式(X):
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[11]下記式(XI):
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[12]下記式(XII):
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[13]下記式(XIII):
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[14]下記式(XIV):
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
[15]オリゴヌクレオチドが一本鎖である、上記[1]~[14]いずれか記載の核酸複合体。
[16]オリゴヌクレオチドが3’末端を介して結合している、上記[15]の核酸複合体。
[17]オリゴヌクレオチドが5’末端を介して結合している、上記[15]の核酸複合体。
[18]オリゴヌクレオチドが二本鎖である、上記[1]~[14]いずれか記載の核酸複合体。
[19]オリゴヌクレオチドが、一つの鎖の3’末端を介して結合している、上記[18]の核酸複合体。
[20]オリゴヌクレオチドが、一つの鎖の5’末端を介して結合している、上記[18]の核酸複合体。
[21]上記[1]~[20]いずれか記載の核酸複合体を含む、医薬組成物。
[22]細胞における標的遺伝子の発現を調節する、上記[21]記載の医薬組成物。
[23]細胞が樹状細胞、マクロファージ又は肝実質細胞である上記[22]記載の医薬組成物。
[24]細胞における標的遺伝子の発現を調節する方法に使用するための、上記[1]~[20]いずれか記載の核酸複合体。
[25]細胞が樹状細胞、マクロファージ又は肝実質細胞である上記[24]記載の核酸複合体。
[26]上記[1]~[20]いずれか記載の核酸複合体又は上記[21]の医薬組成物を対象に投与することを含む、対象の細胞における標的遺伝子の発現を調節する方法。
[27]細胞が樹状細胞、マクロファージ又は肝実質細胞である上記[26]記載の方法。
金属塩の好ましい例としては、例えばナトリウム塩、カリウム塩等のアルカリ金属塩、マグネシウム塩、カルシウム塩等のアルカリ土類金属塩、アルミニウム塩、亜鉛塩等が挙げられる。
アンモニウム塩の好ましい例としては、例えばアンモニウム、テトラメチルアンモニウム等の塩が挙げられる。
有機アミン付加塩の好ましい例としては、例えば、モルホリン、ピペリジン等の付加塩が挙げられる。
アミノ酸付加塩の好ましい例としては、例えば、リジン、グリシン、フェニルアラニン、アスパラギン酸、グルタミン酸等の付加塩が挙げられる。
マンノース受容体は、CD206が高発現する細胞、例えば、マクロファージや樹状細胞などの特定の細胞に高発現している。マンノースコンジュゲート及びマンノシル化された薬物担体はCD206に対して高い結合親和性を示し、薬物分子、例えばオリゴヌクレオチドをマクロファージや樹状細胞などの細胞に送達するために首尾よく使用されている。
本発明に係る核酸複合体におけるオリゴヌクレオチドとしては、核酸医薬として用いることが知られたオリゴヌクレオチドを用いることができる。本明細書において、核酸医薬とは、アンチセンス、デコイ核酸、リボザイム、siRNA、miRNA、antimiRNA及びmRNAなどとして用いられるヌクレオチドを意味する。
本発明における「リンカー」としては、核酸複合体として用いることができる任意のリンカーを用いることができる。
Cbz:ベンジルオキシカルボニル
CTC:2-クロロトリチルクロリド
DCE:1,2-ジクロロエタン
DCM:ジクロロメタン
DIPEA:N,N-ジイソプロピルエチルアミン
DMF:N,N-ジメチルホルムアミド
DMSO:ジメチルスルホキシド
EDCI:1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド塩酸塩
EtOAc:酢酸エチル
ESI:エレクトロスプレーイオン化
Fmoc:9-フルオレニルメチルオキシカルボニル
HBTU:1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-ベンゾトリアゾリウム3-オキシドヘキサフルオロホスファート
HOBT:1-ヒドロキシベンゾトリアゾール
IMS:工業用変性アルコール
MALDI-TOF-MS:マトリックス支援レーザー脱離イオン化-飛行時間型マススペクトルメトリー
MeOH:メタノール
MTBE:メチルターシャリーブチルエーテル
NaOMe:ナトリウムメトキシド
TFA:トリフルオロ酢酸
1H-NMR:プロトン核磁気共鳴スペクトルメトリー
MS:マススペクトルメトリー
HPLC:高速液体クロマトグラフィー
1H-NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.97-2.00 (m, 3H), 2.03 (s, 3H), 2.08 (s, 3H), 2.14 (s, 3H), 4.11-4.15 (m, 1H), 4.16-4.32 (m, 3H), 5.14-5.34 (m, 3H), 5.37-5.45 (m, 1H).
1H-NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):2.01 (s, 3H), 2.04 (s, 2H), 2.08 (d, J=6.8Hz, 6H), 2.20 (s, 3H), 4.15-4.22 (m, 2H), 4.24-4.32 (m, 1H), 5.37-5.42 (m, 2H), 5.46-5.49 (m, 1H), 6.28 (d, J=1.8Hz, 1H), 8.79 (s, 1H).
1H-NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.26-1.63 (m, 8H) , 3.14 (d, J=6.3Hz, 2H) , 3.34 (d, J=8.8Hz, 1H), 3.54-3.74(m, 2H) , 3.80-4.01 (m, 4H) , 4.78 (s, 1H), 5.01-5.12 (m, 2H) , 5.16-5.47 (m, 6H), 7.28-7.41 (m, 5H).
1H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.38-1.49 (m, 4H), 1.61 (dquin, J=13.3, 6.9, 6.9, 6.9, 6.9Hz, 4H), 2.73-2.88 (m, 2H), 3.31 (dt, J=3.3, 1.6Hz, 1H), 3.43 (dt, J=9.7, 6.1Hz, 1H), 3.48-3.89 (m, 8H).
1H-NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):
1.24-1.54 (m, 14H) 2.04 (t, J=7.40Hz, 2H) 3.00 (q, J=6.53Hz, 2H) 3.23-3.40 (m, 12H) 3.55-3.66 (m, 2H) 4.57 (s, 1H) 7.75 (br s, 1H)
1H-NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):
1.16-1.56 (m, 24H), 1.62-1.73 (m, 1H), 1.76-1.87 (m, 1H), 2.00-2.07 (m, 2H), 2.09-2.15 (m, 2H), 2.95-3.07 (m, 4H), 3.22-3.41 (m, 18H), 3.65 (br s, 6H), 4.10-4.19 (m, 1H), 4.57 (d, J=1.00Hz, 2H), 7.74-7.93 (m, 3H).
1H-NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):
2.01 (s, 2H), 2.18 (s, 2H), 2.32-2.63 (m, 6H), 3.40 (t, J=5.0Hz, 2H), 3.54-3.71 (m, 32H), 4.49 (s, 2H), 7.67-8.03 (m, 2H).
1H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.26-1.72 (m, 32H), 1.82-1.97 (m, 2H), 2.03-2.13 (m, 2H), 2.22-2.41 (m, 6H), 3.14-3.24 (m, 6H), 3.37-3.47 (m, 3H), 3.49-3.55 (m, 3H), 3.60 (t, J=9.5Hz, 3H), 3.65-3.86 (m, 15H), 4.22-4.42 (m, 2H), 4.73 (s, 3H).
1H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.23-1.68 (m, 24H), 1.78-1.95 (m, 2H), 2.04-2.19 (m, 2H), 2.23-2.31 (m, 2H), 2.33-2.42 (m, 2H), 2.48-2.60 (m, 2H), 3.10-3.26 (m, 6H), 3.35-3.46 (m, 5H), 3.48-3.56 (m, 3H), 3.57-3.84 (m, 50H), 4.23-4.41 (m, 2H), 4.73 (s, 3H).
1H-NMR(400MHz,DMSO-d6)δ(ppm):
1.19-1.56 (m, 40H), 1.66 (br s, 3H), 1.83 (br s, 3H), 2.00-2.15 (m, 7H), 2.94-3.05 (m, 8H), 3.29 (br d, J=5.02Hz, 24H), 3.52-3.71 (m, 24H), 4.13 (br s, 3H), 4.57 (s, 4H), 7.74-7.99 (m, 7H).
1H-NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.35 (d, J=3.8Hz, 4H), 1.45-1.66 (m, 4H), 1.77 (s, 2H), 1.94 (s, 3H),2.00 (s, 3H), 2.05 (s, 3H), 2.14 (s, 3H), 3.20 (qq, J=13.4, 6.8Hz, 2H), 3.48 (dt, J=9.6, 6.5Hz, 1H), 3.79-4.03 (m, 3H), 4.08-4.19 (m, 2H), 4.65 (d, J=8.3Hz, 1H), 4.90 (s, 1H), 5.04-5.17 (m, 2H), 5.26 (dd, J=11.2, 3.1Hz, 1H), 5.30 (s, 1H), 5.34 (d, J=2.8Hz, 1H), 5.94 (d, J=8.8Hz, 1H), 7.28-7.42 (m, 5H).
1H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.19-1.35 (m, 4H), 1.40-1.56 (m, 4H), 1.93 (s, 2H), 3.06 (t, J=7.0Hz, 2H), 3.27 (dt, J=3.3, 1.6Hz, 1H), 3.31 (s, 1H), 3.37-3.49 (m, 2H), 3.55 (dd, J=10.8, 3.3Hz, 1H), 3.65-3.76 (m, 2H), 3.78-3.94 (m, 3H), 4.31 (d, J=8.5Hz, 1H), 5.02 (s, 2H), 7.17-7.44 (m, 5H).
1H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.30-1.44 (m, 4H), 1.52-1.66 (m, 4H), 1.98 (s, 3H), 2.76-2.90 (m, 2H), 3.31 (dt, J=3.3, 1.6Hz, 2H), 3.44-3.51 (m, 2H), 3.58 (dd, J=10.8, 3.3Hz, 1H), 3.73-3.78 (m, 2H), 3.82-3.95 (m, 3H), 4.34 (d, J=8.5Hz, 1H).
1H-NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ(ppm): 0.64 (br s, 1H) 1.27 (br s, 5H) 1.33-1.52 (m, 4H) 1.67 (br s, 1H) 1.80 (s, 3H) 2.61 (br t, J=6.88Hz, 2H) 3.40-3.60 (m, 5H) 3.58-3.77 (m, 4H) 4.23 (br d, J=8.25Hz, 1H) 4.31-4.97 (m, 5H) 7.53-7.71 (m, 1H); MS (ESI+): m/z 321 [M+H]+.
1H-NMR(400MHz,MeOD)δ(ppm):
1.29-1.70 (m, 32H), 1.82-2.01 (m, 11H), 2.08 (s, 2H), 2.22-2.38 (m, 8H),3.18 (d, J=6.3Hz, 6H), 3.42-3.52 (m, 6H), 3.60 (d, J=10.5Hz, 3H), 3.71-3.95 (m, 14H), 4.28 (s, 1H), 4.36 (d, J=8.3Hz, 3H).
1H-NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ(ppm): 1.15-1.59 (m, 44H) 1.68 (br d, J=9.90Hz, 3H) 1.79 (s, 12H) 1.82-1.92 (m, 5H) 1.97-2.22 (m, 9H) 3.02 (br d, J=5.50Hz, 10H) 3.32-3.58 (m, 19H) 3.61-3.72 (m, 13H) 4.06-4.27 (m, 8H) 4.43 (br s, 4H) 4.46-4.59 (m, 9H) 7.59 (br d, J=8.80Hz, 4H) 7.74 (br s, 1H) 7.83 (br s, 3H) 7.89 (br s, 3H); MS (ESI+): m/z 1754 [M+H]+.
MS(ESI) M/Z:610〔M+H〕+
1H-NMR(600MHz,DMSO-d6)δ(ppm):
1.77 (m, 5H), 1.94 (m, 3H), 2.12-2.23 (m, 6H), 2.26 (m, 2H), 2.38 (br t, J=7.34Hz, 2H), 4.13-4.21 (m, 3H), 5.09 (s, 2H), 7.30-7.40 (m, 5H), 8.05-8.15 (m, 3H).
MS(ESI) M/Z:1162〔M+2H〕+
1H-NMR(600MHz,DMSO-d6)δ(ppm):
1.23 (br s, 16H), 1.31-1.41 (m, 8H), 1.41-1.48 (m, 8H), 1.60-1.73 (m, 4H), 1.77 (s, 12H), 1.78-1.87 (m, 4H), 1.89 (s, 12H), 1.99 (s, 12H), 2.01-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 12H), 2.11-2.21 (m, 6H), 2.33-2.37 (m, 2H), 2.95-3.07 (m, 8H), 3.37-3.43 (m, 4H), 3.65-3.72 (m, 4H), 3.82-3.90 (m, 4H), 3.98-4.05 (m, 12H), 4.09-4.20 (m, 3H), 4.48 (d, J=8.44Hz, 4H), 4.97 (dd, J=11.19, 3.12Hz, 4H), 5.08 (s, 2H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 4H), 7.30-7.39 (m, 5H), 7.80 (m, 8H), 7.86-7.95 (m, 3H).
1H-NMR(600MHz,DMSO-d6)δ(ppm):
1.24 (br s, 22H), 1.30-1.40 (m, 8H), 1.45 (br s, 8H), 1.61-1.74 (m, 4H), 1.77 (s, 12H), 1.80-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 12H), 1.99 (s, 12H), 2.01-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 12H), 2.12-2.25 (m, 4H), 2.93-3.06 (m, 8H), 3.36-3.46 (m, 4H), 3.64-3.72 (m, 4H), 3.82-3.91 (m, 4H), 3.98-4.20 (m, 16H), 4.50 (br d, J=8.07Hz, 4H), 4.94-5.02 (m, 4H), 5.21 (d, J=2.93Hz, 4H) 7.73-8.03 (m, 11H).
MS(ESI) M/Z:1200〔M+2H〕+
1H-NMR(600MHz,DMSO-d6)δ(ppm):
1.24 (br s, 20H), 1.31-1.40 (m, 8H), 1.41-1.49 (m, 8H), 1.61-1.72 (m, 2H), 1.77 (s, 12H), 1.79-1.86 (m, 2H), 1.89 (s, 12H), 1.99 (s, 12H), 2.01-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 12H), 2.12-2.21 (m, 4H), 2.25-2.31 (m, 2H), 2.80 (br t, J=7.34Hz, 2H), 2.95-3.08 (m, 8H), 3.37-3.43 (m, 4H), 3.65-3.72 (m, 4H), 3.82-3.90 (m, 4H), 3.97-4.06 (m, 12H), 4.10-4.22 (m, 3H), 4.48 (d, J=8.44Hz, 4H), 4.97 (dd, J=11.00, 2.93Hz, 4H), 5.21 (d, J=2.93Hz, 4H), 7.70-7.86 (m, 8H), 7.86-8.01 (m, 3H).
SEQ-1及びSEQ-2はジーンデザイン社にて委託合成した。SEQ-2(1.3μmol)にsodium tetraborate buffer pH8.5(最終濃度40mM)を加え、DMSOに溶解したDBCO-NHS ester(CAS No.1353016-71-3、60μmol)を加え、室温にて15分攪拌した。反応液に水を加えた後、PD-10カラム(GE Healthcare社)にてゲル濾過精製を行った。さらにAmicon Ultra 3K(Millipore社)にて精製・濃縮することで、粗生成物(SEQ-3)を得た。粗生成物(40nmol)にtriethylammonium acetate pH7.0(最終濃度50mM)を加え、水に溶解した化合物8、11、14、15、17、23、24(400nmol)をそれぞれ加え、室温にて15分攪拌した。反応液をPD-10カラム(GE Healthcare社)にてゲル濾過精製を行った。さらにAmicon Ultra 3K(Millipore社)にて精製・濃縮することで、核酸複合体、すなわち化合物8、11、14、15、17、23、24に対応する核酸複合体1~7を得た。
SEQ-2(26.6nmol)にsodium tetraborate buffer pH8.5及び、DMSOに溶解した化合物28(120nmol)を加え、室温にて攪拌した。反応液に水を加えた後、Amicon Ultra 3K(Millipore社)にて精製を行った。得られた粗生成物に5倍量の28%アンモニア水を加え、室温にて3時間静置した。反応液に水を加えた後、Amicon Ultra 3K(Millipore社)にて精製を行った。さらに逆相HPLCにて精製することで、核酸複合体8を得た。
本実施例に用いた核酸の配列は(5'-3')はA(F)^G(M)^G(F)A(M)C(F)U(M)G(F)G(M)U(F)C(M)U(F)U(F)U(M)C(F)U(M)A(F)U(M)A(F)U(M)^C(F)^U(M)であり、大文字のアルファベットはRNAを表し、(M)は2’-O-メチル修飾RNAを、(F)は2’-フルオロRNAを、^はホスホロチオエート結合を示す。またそれぞれのオリゴヌクレオチドの5’末端には蛍光色素であるシアニン色素Cy3(励起波長555nm,蛍光波長570nm)が結合している。SEQ-1,2及び本実施例において合成した核酸複合体について、MALDI-TOF-MSによる分子量の測定を行い、その結果を表1に示す。
核酸複合体のヒトCD206発現Lenti-X 293T細胞に対するin vitro取り込み活性評価
実施例で合成した核酸複合体について、ヒトCD206発現Lenti-X 293T細胞(Clontech社)に、それぞれ以下の方法で導入し、取り込みを評価した。ヒトCD206発現Lenti-X 293T細胞(Clontech社)を2×104個/100μL/wellとなるように96-well PDL-coating plate(Corning社)に播種し、37℃の5%CO2インキュベーター内で2日間培養した。最終濃度が100nmol/Lとなるように、SEQ-1又は合成した核酸複合体を添加し、37℃の5%CO2インキュベーター内で2時間インキュベーションした。10μg/mL Hoechst(Life Technologies社)を含む4%パラホルムアルデヒド/PBS(Wako)を添加し、常温で30分間細胞を固定し、4回PBSで洗浄した。IN Cell Analyzer 2200(GEヘルスケア社)で蛍光イメージング解析を行い、well内のCy3蛍光強度を核数で補正し、1細胞当たりの平均Cy3蛍光強度を算出した。この際、糖リガンド修飾の無い核酸であるSEQ-1を添加したwellの蛍光強度を1として、各核酸複合体を添加したwellの蛍光強度を相対値として算出した。
核酸複合体のヒトASGR1発現Lenti-X293T細胞に対するin vitro取り込み活性評価
実施例で合成した核酸複合体について、ヒトASGR1発現Lenti-X293T細胞(Clontech社)に、それぞれ以下の方法で導入し、取り込み活性を評価した。ヒトASGR1発現Lenti-X293T細胞(Clontech社)は、2×104個/100μL/wellとなるように96-well PDL-coating plate(Corning社)に播種し、37℃の5%CO2インキュベーター内で1日又は2日間培養した。最終濃度が100nmol/Lとなるように、SEQ-1又は合成した核酸複合体を添加し、37℃の5%CO2インキュベーター内で2時間インキュベーションした。その後の蛍光イメージング解析は試験例1と同様の方法で実施した。
マウス肝実質細胞及びクッパー細胞における核酸複合体の取り込み評価(In vivo評価)
BALB/cマウス(n=3)にSEQ-1、核酸複合体3及び6をそれぞれ1mg/kgで皮下投与した。投与4時間後、肝臓を潅流し、フローサイトメーターにて肝実質細胞及びクッパー細胞を分離して、蛍光強度を測定した。この際、SEQ-1を投与した群の蛍光強度を1として、各核酸複合体投与群の蛍光強度を相対値として算出した。
結果を表4に示す。この結果から、糖リガンドを含まないSEQ-1と比較して、CD206陽性と報告されているマウスクッパ-細胞にマンノースを有する核酸複合体3が、ASGR1陽性と報告されているマウス肝実質細胞にGalNacを有する核酸複合体6が効率よく取り込まれていることが明らかになった。
α異性体
1H NMR(600 MHz, CDCl3)δppm:
2.00 (s, 3H), 2.05 (s, 3H), 2.11 (s, 3H), 2.16 (s, 3H), 3.00 (d, J=4.03Hz, 1H), 4.15 (br d, J=10.64Hz, 1H), 4.22-4.28 (m, 2H), 5.23-5.33 (m, 3H), 5.43 (br dd, J=10.27, 3.30Hz, 1H)
1H NMR(600 MHz, CDCl3)δppm:
2.01 (s, 3H), 2.07 (s, 3H), 2.08 (s, 3H), 2.20 (s, 3H), 4.14-4.23 (m, 2H), 4.28 (dd, J=12.47, 4.77Hz, 1H), 5.38-5.43 (m, 2H), 5.47 (br s, 1H), 6.28 (s, 1H), 8.79(s, 1H)
1H NMR(600 MHz, CDCl3)δppm:
1.32-1.43 (m, 4H), 1.49-1.53 (m, 2H), 1.56-1.64 (m, 2H), 1.99 (s, 3H), 2.04 (s, 3H), 2.10 (s, 3H), 2.15 (s, 3H), 3.20 (q, J=6.72Hz, 2H), 3.40-3.48 (m, 1H), 3.64-3.71 (m, 1H), 3.97 (ddd, J=9.90, 5.32, 2.38Hz, 1H), 4.08-4.12 (m, 1H), 4.28 (dd, J=12.29, 5.32Hz, 1H), 4.79 (d, J=1.47Hz, 2H), 5.10 (s, 2H), 5.22 (dd, J=3.30, 1.83Hz, 1H), 5.28 (t, J=9.54Hz, 1H), 5.34 (dd, J=10.64, 3.67Hz, 1H), 7.29-7.33 (m, 1H), 7.36 (d, J=4.03Hz, 4H)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.30-1.37 (m, 4H), 1.51-1.61 (m, 4H), 1.94 (s, 3H), 2.03 (s, 6H), 2.11 (s, 3H), 2.72-2.80 (m, 2H), 3.42-3.50 (m, 1H), 3.63 (dt, J=9.72, 6.88Hz, 1H), 3.88-3.96 (m, 1H), 4.06 (dd, J=12.10, 2.57Hz, 1H), 4.15 (dd, J=12.29, 5.32Hz, 1H), 4.87 (s, 1H), 5.04-5.15 (m, 3H), 7.80 (br s, 3H)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.21-1.45 (m, 24H), 1.49-1.59 (m, 8H), 1.61-1.89 (m, 8H), 1.93 (s, 12H), 2.01 (s, 24H), 2.10 (s, 12H), 2.07-2.23 (m, 8H), 2.33-2.37 (m, 2H), 2.96-3.08 (m, 7H), 3.41-3.48 (m, 4H), 3.57-3.65 (m, 4H), 3.88-3.94 (m, 4H), 4.05 (dd, J=12.10, 1.83Hz, 4H), 4.10-4.20 (m, 8H), 4.85 (s, 4H), 5.06-5.13 (m, 14H), 7.31-7.40 (m, 6H), 7.69-7.94 (m, 6H);
LCMS (ESI+): m/z 1164.58 [M+2H]2+.
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.20-1.44 (m, 24H), 1.51-1.60 (m, 8H), 1.61-1.88 (m, 8H), 1.93 (s, 12H), 2.02 (s, 12H), 2.02 (s, 12H), 2.10 (s, 12H), 2.12-2.27 (m, 10H), 2.96-3.08 (m, 7H), 3.41-3.48 (m, 4H), 3.58-3.65 (m, 4H), 3.88-3.94 (m, 4H), 4.04 (br d, J=10.27Hz, 4H), 4.09-4.29 (m, 8H), 4.85 (s, 4H), 5.04-5.14 (m, 12H), 7.71-8.01 (br m, 7H)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.20-1.47 (m, 24H), 1.51-1.61 (m, 8H), 1.62-1.91 (m, 8H), 1.93 (s, 12H), 2.01 (s, 24H), 2.10 (s, 12H), 2.12-2.33 (m, 8H), 2.80 (br t, J=6.79Hz, 2H), 2.96-3.09 (m, 7H), 3.41-3.50 (m, 4H), 3.58-3.65 (m, 4H), 3.91 (br s, 4H), 4.04 (br d, J=12.10Hz, 4H), 4.10-4.28 (m, 8H), 4.85 (br s, 4H), 5.06-5.15 (m, 12H), 7.68-8.03 (m, 7H);
LCMS (ESI+): m/z 1202.46 [M+2H]2+.
1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm:
1.30-1.43 (m, 4H), 1.45-1.65 (m, 4H), 1.94 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 2.05 (s, 3H), 2.13 (s, 3H), 3.12-3.29 (m, 2H), 3.48 (dt, J=9.63, 6.50Hz, 1H), 3.79-4.02 (m, 3H), 4.06-4.21 (m, 2H), 4.65 (br d, J=8.19Hz, 1H), 4.78-4.93 (m, 1H), 5.06-5.18 (m, 2H), 5.27 (dd, J=11.25, 3.06Hz, 1H), 5.34 (d, J=2.81Hz, 1H), 5.77 (br d, J=8.44Hz, 1H), 7.29-7.42 (m, 5H)
LCMS (m/z 581 [M+H]+)
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.22-1.35 (m, 4H), 1.39-1.62 (m, 4H), 1.78 (s, 3H), 1.89 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 2.10 (s, 3H), 2.69-2.82 (m, 2H), 3.41-3.47 (m, 2H), 3.64-3.77 (m, 1H), 3.81-3.93 (m, 1H), 3.95-4.12 (m, 2H), 4.49 (d, J=8.56Hz, 1H), 4.97 (dd, J=11.25, 3.42Hz, 1H), 5.22 (d, J=3.42Hz, 1H), 7.62-7.80 (m, 3H), 7.86 (d, J=9.29Hz, 1H)
LCMS (m/z 447 [M+H]+)
カートリッジ中の樹脂に、Fmoc-D-Glu-OtBu(0.740g,1.74mmol)、N-Fmoc-L-グルタミン酸-1-t-ブチルエステル(0.740g,1.74mmol)及びHBTU(1.253g,3.30mmol)のDMF(10mL)溶液を添加し、次いでDIPEA(1.22mL,6.96mmol)を滴下した。混合物を窒素でバブリングしながら1時間混合した。次いで、溶液を、窒素気流で溶媒除去し、樹脂を、窒素でバブリングにより混合しながら、20%ピペリジンDMF(50mL)溶液で35分間処理した。溶液を排出させ、樹脂をDMFで洗浄した。
カートリッジ中の残りの樹脂に、1,5-ペンタン二酸モノベンジルエステル(0.580g,2.61mmol)及びHBTU(1.253g,3.30mmol)のDMF(10mL)溶液、次いでDIPEA(1.215mL,6.96mmol)を滴下した。混合物を、80分間、窒素でバブリングして混合した。溶液を排出させ、樹脂をDMF次いでMeOHで洗浄した。次いで、樹脂を吸引乾燥した。樹脂を25×150mm試験管に移し、30分間減圧乾燥させた後、DCM(5mL)及びTFA(5mL)で処理して、プレートシェーカーで2時間振盪した。次いで、混合物を相分離カートリッジに通して濾過し、DCMで洗浄した。濾液を減圧下濃縮し、化合物41(0.5859g)を得た。
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.68-1.84 (m, 4H), 1.86-2.01 (m, 2H), 2.13-2.23 (m, 4H), 2.23-2.29 (m, 2H), 2.38 (t, J=7.52Hz, 2H), 4.11-4.22 (m, 2H), 5.09 (s, 2H), 7.29-7.42 (m, 5H), 8.06-8.17 (m, 2H)
LCMS (m/z 481 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.23 (br s, 12H), 1.29-1.40 (m, 6H), 1.40-1.48 (m, 6H), 1.60-1.71 (m, 2H), 1.76 (s, 9H), 1.76-1.87 (m, 4H), 1.89 (s, 9H), 1.99 (s, 9H), 2.00-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.11-2.15 (m, 2H), 2.18 (br t, J=7.15Hz, 2H), 2.34-2.38 (m, 2H), 2.94-3.07 (m, 6H), 3.36-3.43 (m, 3H), 3.65-3.73 (m, 3H), 3.82-3.91 (m, 3H), 3.98-4.06 (m, 9H), 4.10-4.20 (m, 2H), 4.48 (d, J=8.44Hz, 3H), 4.97 (dd, J=11.19, 3.12Hz, 3H), 5.08 (s, 2H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.30-7.39 (m, 5H), 7.71-7.76 (m, 1H), 7.77-7.85 (m, 5H), 7.87-7.93 (m, 2H)
LCMS (m/z 1766 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6)δppm:
1.18-1.29 (m, 12H), 1.31-1.41 (m, 6H), 1.41-1.49 (m, 6H), 1.62-1.75 (m, 4H), 1.77 (s, 9H), 1.81-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 1.99 (s, 9H), 2.01-2.08 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.24 (m, 6H), 2.95-3.07 (m, 6H), 3.37-3.45 (m, 3H), 3.66-3.73 (m, 3H), 3.82-3.92 (m, 3H), 3.98-4.06 (m, 9H), 4.09-4.20 (m, 2H), 4.49 (d, J=8.44Hz, 3H), 4.97 (dd, J=11.19, 2.38Hz, 3H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.73-8.04 (m, 8H), 11.81-12.20 (m, 1H).
LCMS (m/z 1676 [M+H]+).
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6)δ ppm:
1.24 (br s, 12H), 1.31-1.40 (m, 6H), 1.41-1.48 (m, 6H), 1.61-1.73 (m, 2H), 1.76 (s, 9H), 1.79-1.93 (m, 13H), 1.99 (s, 9H), 2.01-2.06 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.11-2.18 (m, 2H), 2.27 (br t, J=7.34Hz, 2H), 2.80 (t, J=6.97Hz, 2H), 2.96-3.07 (m, 6H), 3.37-3.43 (m, 3H), 3.69 (dt, J=9.63, 6.19Hz, 3H), 3.82-3.91 (m, 3H), 3.98-4.06 (m, 9H), 4.09-4.22 (m, 2H), 4.48 (d, J=8.44Hz, 3H), 4.97 (dd, J=11.37, 3.30Hz, 3H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.73 (br t, J = 5.14Hz, 1H), 7.77-7.85 (m, 5H), 7.91 (br dd, J = 11.19, 7.89Hz, 1H), 7.98 (br d, J = 8.07Hz, 1H)
LCMS (m/z 1843.56 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.23-1.34 (m, 12H), 1.34-1.43 (m, 6H), 1.50-1.59 (m, 6H), 1.62-1.72 (m, 2H), 1.74-1.80 (m, 2H), 1.81-1.89 (m, 2H), 1.93 (s, 9H), 2.01 (s, 18H), 2.03-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.11-2.15 (m, 2H), 2.16-2.21 (m, 2H), 2.33-2.38 (m, 2H), 2.97-3.07 (m, 6H), 3.41-3.48 (m, 3H), 3.57-3.64 (m, 3H), 3.87-3.94 (m, 3H), 4.05 (dd, J=12.10, 2.57Hz, 3H), 4.10-4.19 (m, 5H), 4.85 (s, 3H), 5.0-5.13 (m, 11H), 7.29-7.39 (m, 5H), 7.71 (br t, J=4.95Hz, 1H), 7.76-7.84 (m, 2H), 7.85-7.91 (m, 2H)
LCMS (m/z 1769 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.28 (br s, 12H), 1.34-1.44 (m, 6H), 1.49-1.60 (m, 6H), 1.61-1.76 (m, 4H), 1.81-1.90 (m, 2H), 1.93 (s, 9H), 2.02 (s, 9H), 2.02 (s, 9H), 2.04-2.08 (m,2H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.23 (m, 6H), 2.96-3.07 (m, 6H), 3.40-3.48 (m, 3H), 3.57-3.65 (m, 3H), 3.86-3.94 (m, 3H), 4.05 (dd, J=12.10, 2.38Hz, 3H), 4.09-4.18 (m, 5H), 4.85 (s, 3H), 5.01-5.14 (m, 9H), 7.62-8.17 (m, 5H), 11.84-12.15 (m, 1H).
LCMS (m/z 1679 [M+H]+).
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.23-1.33 (m, 12H), 1.34-1.43 (m, 6H), 1.50-1.60 (m, 6H), 1.62-1.77 (m, 2H), 1.80-1.91 (m, 4H), 1.93 (s, 9H), 2.01 (s, 18H), 2.03-2.07 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.20 (m, 2H), 2.25-2.30 (m, 2H), 2.77-2.82 (m, 2H), 2.96-3.08 (m, 6H), 3.41-3.48 (m, 3H), 3.53-3.68 (m, 3H), 3.86-3.95 (m, 3H), 4.00-4.07 (m, 3H), 4.10-4.23 (m, 5H), 4.85 (s, 3H) 5.04-5.13 (m, 9H), 7.71 (br t, J=5.32Hz, 1H), 7.78-7.85 (m, 2H), 7.89 (dd, J=12.84, 8.07Hz, 1H), 7.96 (d, J=8.07Hz, 1H)
LCMS (m/z 1845.47 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, CDCl3) δ ppm:
1.90 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 2.04 (s, 3H), 2.13 (s, 3H), 3.26-3.86 (m, 8H), 3.87-4.00 (m, 2H), 4.05-4.19 (m, 2H), 4.76 (br d, J=7.70Hz, 1H), 5.10-5.20 (m, 2H), 5.26 (br dd, J=6.60, 3.30Hz, 1H), 5.32 (br s, 1H), 5.43 (br s, 1H), 5.75 (br d, J=7.34Hz, 1H), 7.28-7.42 (m, 5H).
LCMS (m/z 569 [M+H]+).
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.77-1.84 (m, 3H), 1.86-1.92 (m, 3H), 1.97-2.03 (m, 3H), 2.06-2.13 (m, 3H), 2.92-3.00 (m, 2H), 3.52-3.75 (m, 5H), 3.83 (ddd, J=11.28, 5.41, 3.85Hz, 1H), 3.86-3.93 (m, 1H), 3.95-4.17 (m, 3H), 4.57 (d, J=8.44Hz 1H), 4.99 (dd, J=11.19, 3.48Hz, 1H), 5.23 (d, J=3.67Hz, 1H), 7.81 (br s, 3H), 7.85-7.92 (m, 1H)
LCMS (m/z 435 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.62-1.73 (m, 2H), 1.77 (s, 9H), 1.80-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 1.99 (s, 9H), 2.02-2.08 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.11-2.24 (m, 4H), 2.34-2.38 (m, 2H), 3.13-3.22 (m, 4H), 3.34-3.42 (m, 7H), 3.44-3.54 (m, 7H), 3.55-3.61 (m, 3H), 3.73-3.80 (m, 3H), 3.84-3.91 (m, 3H), 3.97-4.08 (m, 9H), 4.13-4.25 (m, 2H), 4.55 (dd, J=8.07, 3.67Hz, 3H), 4.99 (br d, J=11.00Hz, 3H), 5.07-5.10 (m, 2H), 5.22 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.31-7.40 (m, 5H), 7.60-7.97 (m, 8H)
LCMS (m/z 1730/1731 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.62-1.75 (m, 4H), 1.78 (s, 9H), 1.81-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 2.00 (s, 9H), 2.05-2.32 (m, 17H), 3.12-3.23 (m, 4H), 3.36-3.43 (m, 7H), 3.45-3.54 (m, 7H), 3.55-3.61 (m, 3H), 3.74-3.81 (m, 3H), 3.83-3.92 (m, 3H), 3.98-4.08 (m, 9H), 4.11-4.23 (m, 2H), 4.51-4.59 (m, 3H), 4.99 (br d, J=11.00Hz, 3H), 5.22 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.62-8.04 (m, 8H)
LCMS (m/z 1640/1641 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.57-1.75 (m, 4H), 1.77 (s, 9H), 1.86-1.95 (m, 11H), 2.00 (s, 9H), 2.05-2.33 (m, 15H), 2.77-2.88 (m, 2H), 3.11-3.24 (m, 4H), 3.41-3.54 (m, 14H), 3.55-3.62 (m, 3H), 3.74-3.81 (m, 3H), 3.84-3.91 (m, 3H), 3.98-4.07 (m, 9H), 4.11-4.23 (m, 2H), 4.55 (br dd, J=8.07, 3.67Hz, 3H), 4.99 (br d, J=11.00Hz, 3H), 5.22 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.65-8.04 (m, 8H)
LCMS (m/z 1806.83 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, CDCl3) δppm:
1.92 (s, 3H), 1.98 (s, 3H), 2.03 (s, 3H), 2.14 (s, 3H), 3.32-3.50 (m, 2H), 3.53-3.73 (m, 8H), 3.77-3.94 (m, 3H), 4.02-4.22 (m, 3H), 4.74 (br d, J=8.44Hz, 1H), 5.03-5.08 (m, 1H), 5.11 (br s, 2H), 5.26 (br s, 1H), 5.40-5.53 (m, 1H), 6.11-6.21 (m, 1H), 7.30-7.40 (m, 5H).
LCMS (m/z 613 [M+H]+).
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.79 (s, 3H), 1.89 (s, 3H), 2.00 (s, 3H,) 2.11 (s, 3H), 2.94-3.02 (m, 2H), 3.50-3.62 (m, 9H), 3.77-3.84 (m, 1H), 3.86-3.94 (m, 1H), 3.98-4.10 (m, 3H), 4.54 (d, J=8.44Hz, 1H), 4.97 (dd, J=11.19, 3.48Hz, 1H), 5.22 (d, J=3.67Hz, 1H), 7.70-7.93 (m, 4H)
LCMS (m/z 479 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.61-1.74 (m, 2H), 1.77 (s, 9H), 1.80-1.85 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 2.00 (s, 9H), 2.03-2.08 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.24 (m, 4H), 2.35-2.38 (m, 2H), 3.10-3.23 (m, 4H), 3.36-3.42 (m, 7H), 3.44-3.63 (m, 22H), 3.74-3.81 (m, 3H), 3.83-3.91 (m, 3H), 3.99-4.08 (m, 9H), 4.13-4.25 (m, 2H), 4.55 (d, J=8.44Hz, 3H), 4.95-5.00 (m, 3H), 5.09 (s, 2H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.31-7.41 (m, 5H), 7.72-7.86 (m, 4H), 7.86-7.99 (m, 4H)
LCMS (m/z 1862/1863 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.63-1.75 (m, 4H), 1.77 (s, 9H), 1.81-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 9H),2.00 (s, 9H), 2.03-2.24 (m, 17H), 3.09-3.23 (m, 4H), 3.35-3.43 (m, 7H), 3.44-3.64 (m, 22H), 3.74-3.81 (m, 3H), 3.84-3.91 (m, 3H), 3.98-4.07 (m, 9H), 4.10-4.24 (m, 2H), 4.56 (br d, J=8.80Hz, 3H), 4.98 (br d, J=11.00Hz, 3H), 5.22 (d, J=2.93Hz, 3H), 7.70-8.06 (m, 8H).
LCMS (m/z 1772/1773 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.62-1.75 (m, 2H), 1.77 (s, 9H), 1.85-1.95 (m, 13H), 2.00 (s, 9H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.33 (m, 6H), 2.78-2.86 (m, 2H), 3.12-3.24 (m, 4H), 3.35-3.44 (m, 7H), 3.45-3.64 (m, 22H), 3.75-3.81 (m, 3H), 3.83-3.92 (m, 3H), 3.99-4.06 (m, 9H), 4.12-4.26 (m, 2H), 4.55 (d, J=8.44Hz, 3H), 4.98 (dd, J=11.19, 2.02Hz, 3H), 5.21 (d, J=3.67Hz, 3H), 7.64-8.03 (m, 8H)
LCMS (m/z 1939.01 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, CDCl3) δ ppm:
1.95 (s, 3H), 1.96 (s, 3H), 2.04 (s, 3H), 2.15 (s, 3H), 3.39 (br d, J=4.77Hz, 2H), 3.52-3.72 (m, 12H), 3.79-3.94 (m, 3H), 4.09-4.14 (m, 1H), 4.14-4.18 (m, 1H), 4.18-4.25 (m, 1H), 4.77 (br d, J=8.44Hz, 1H), 4.98-5.06 (m, 1H), 5.10 (br s, 2H), 5.31 (br s, 1H), 5.34-5.45 (m, 1H), 6.29-6.39 (m, 1H), 7.29-7.33 (m, 1H), 7.36 (d, J=4.40Hz, 4H)
LCMS (m/z 657 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.78 (s, 3H), 1.89 (s, 3H), 2.00 (s, 3H), 2.11 (s, 3H), 2.94-3.01 (m, 2H), 3.48-3.62 (m, 13H), 3.76-3.82 (m, 1H), 3.85-3.93 (m, 1H), 3.99-4.08 (m, 3H), 4.55 (d, J=8.44Hz, 1H), 4.94-5.01 (m, 1H), 5.22 (d, J=3.67Hz, 1H), 7.75-7.88 (m, 4H)
LCMS (m/z 423 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.61-1.73 (m, 2H), 1.77 (s, 9H), 1.79-1.85 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 2.00 (s, 9H), 2.03-2.08 (m, 2H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.22 (m, 4H), 2.33-2.37 (m, 2H), 3.07-3.23 (m, 4H), 3.34-3.42 (m, 7H), 3.43-3.55 (m, 30H), 3.55-3.62 (m, 4H), 3.75-3.81 (m, 3H), 3.85-3.92 (m, 3H), 3.99-4.07 (m, 9H), 4.13-4.24 (m, 2H), 4.56 (d, J=8.80Hz, 3H), 4.97 (dd, J=11.00, 3.30Hz, 3H), 5.06-5.11 (m, 2H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.30-7.39 (m, 5H), 7.62-7.84 (m, 5H), 7.85-7.95 (m, 3H)
LCMS (m/z 1994/1995 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.60-1.75 (m, 4H), 1.78 (s, 9H), 1.80-1.87 (m, 2H), 1.89 (s, 9H), 2.00 (s, 9H), 2.03-2.32 (m, 17H), 3.12-3.23 (m, 4H), 3.36-3.42 (m, 7H), 3.43-3.63 (m, 34H), 3.74-3.81 (m, 3H), 3.84-3.92 (m, 3H), 3.99-4.07 (m, 9H), 4.09-4.22 (m, 2H), 4.57 (br d, J=8.44Hz, 3H), 4.98 (dd, J=11.19, 3.12Hz, 3H), 5.21 (d, J=3.30Hz, 3H), 7.61-8.05 (m, 8H), 12.01 (br s, 1H)
LCMS (m/z 1904/1905 [M+H]+)
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6) δ ppm:
1.59-1.73 (m, 2H), 1.77 (s, 9H), 1.85-1.95 (m, 13H), 2.00 (s, 9H), 2.10 (s, 9H), 2.12-2.34 (m, 6H), 2.77-2.89 (m, 2H), 3.11-3.23 (m, 4H), 3.35-3.44 (m, 7H), 3.45-3.63 (m, 34H), 3.75-3.80 (m, 3H), 3.84-3.91 (m, 3H), 4.00-4.07 (m, 9H), 4.16-4.26 (m, 2H), 4.56 (d, J=8.80Hz, 3H), 4.97 (dd, J=11.37, 3.30Hz, 3H), 5.21 (d, J=3.67Hz, 3H), 7.62-8.03 (m, 8H).
QC LCMS (m/z 1035.97 [M+2H]2+)
B2M(β2-マイクログロブリン)標的siRNAのセンス鎖(215nmol)にsodium tetraborate buffer pH8.5及び、DMSOに溶解した化合物28又は44(1000nmol)を加え、室温にて攪拌した。反応液に水を加えた後、Vivaspin 3K(Sartorius社)にて精製を行った。得られた粗生成物に5倍量の28%アンモニア水を加え、室温にて2時間静置した。反応液に水を加えた後、Vivaspin 3K(Sartorius社)にて精製を繰り返し行うことで、核酸複合体9~12を得た。本実施例において合成した核酸複合体の分子量を、ESI-MS又はMALDI-TOF-MSにより行った。使用したセンス鎖の配列、アンチセンス鎖の配列及び分子量を表5に示す。
アンチセンス鎖(siB2M-as)と核酸複合体9~12を等モル量加えることで、B2Mを標的とするsi-RNAを調製した。表7にsi-RNAのセンス鎖及びアンチセンス鎖を示す。
実施例13~16で調製した核酸複合体(si-RNA)を、1.0mg/kg又は5.0mg/kgにて、BALB/cマウス(一群につき3匹)に皮下投与し、投与から7日後に肝臓を採取した。肝臓中のB2M及び内部対照としてGAPDH(グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ)のmRNA発現量をTaqManプローブ(Applied Biosystems社)を用いてqPCRにより測定した。無処置群(Control)のマウス肝臓中のB2M mRNA発現レベルを100%とし、核酸複合体投与群のB2M mRNA発現レベル(相対値)を算出した。表8に結果を示す。
核酸として、3-10-3モチーフを有するGapmer型LNAアンチセンス(ASO;ISIS-549148)を用い、化合物44、47又は53aを用いた以外は、実施例9~11と同様の方法で核酸複合体を調製した。使用したセンス鎖の配列、アンチセンス鎖の配列及び分子量を表9に示す。
核酸複合体のヒトCD206発現Lenti-X 293T細胞に対するin vitro取り込み活性評価
試験例1と同様にして、核酸複合体17~19の評価を行った。試験例5では、糖リガンド修飾の無い核酸であるASO_3’Cy3を添加したwellの蛍光強度を1として、各核酸複合体を添加したwellの蛍光強度を相対値として算出した。
核酸複合体のヒトASGR1発現Lenti-X293T細胞に対するin vitro取り込み活性評価
試験例2と同様にして、核酸複合体17~19の評価を行った。試験例6では、糖リガンド修飾の無い核酸であるASO_3’Cy3を添加したwellの蛍光強度を1として、各核酸複合体を添加したwellの蛍光強度を相対値として算出した。
Claims (18)
- 下記式(III):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。 - 下記式(IV):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。 - 下記式(V):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。 - 下記式(VI):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。 - 下記式(VII):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。 - 下記式(VIII):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。 - 下記式(IX):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。 - 下記式(X):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。 - 下記式(XI):
[Zはオリゴヌクレオチドを含む基である。]
で表される核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。 - オリゴヌクレオチドが一本鎖である、請求項1~9のいずれか一項に記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
- オリゴヌクレオチドが3’末端を介して結合している、請求項10に記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
- オリゴヌクレオチドが5’末端を介して結合している、請求項10に記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
- オリゴヌクレオチドが二本鎖である、請求項1~9のいずれか一項に記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
- オリゴヌクレオチドが、一つの鎖の3’末端を介して結合している、請求項13に記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
- オリゴヌクレオチドが、一つの鎖の5’末端を介して結合している、請求項13に記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩。
- 請求項1~15のいずれか一項に記載の核酸複合体又はその薬剤学的に許容される塩を含む、医薬組成物。
- 細胞における標的遺伝子の発現を調節する、請求項16に記載の医薬組成物。
- 細胞が樹状細胞、マクロファージ又は肝実質細胞である請求項17に記載の医薬組成物。
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2020013997 | 2020-01-30 | ||
| JP2020013997 | 2020-01-30 | ||
| PCT/JP2021/003085 WO2021153687A1 (ja) | 2020-01-30 | 2021-01-28 | 核酸複合体及びそれを含む医薬組成物 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPWO2021153687A1 JPWO2021153687A1 (ja) | 2021-08-05 |
| JP7681525B2 true JP7681525B2 (ja) | 2025-05-22 |
Family
ID=77078383
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2021574117A Active JP7681525B2 (ja) | 2020-01-30 | 2021-01-28 | 核酸複合体及びそれを含む医薬組成物 |
Country Status (6)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20230151360A1 (ja) |
| EP (1) | EP4071163A4 (ja) |
| JP (1) | JP7681525B2 (ja) |
| CN (1) | CN114929729B (ja) |
| TW (1) | TWI877296B (ja) |
| WO (1) | WO2021153687A1 (ja) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20250032621A1 (en) * | 2023-06-29 | 2025-01-30 | SeeCure Taiwan Co., Ltd. | Drug conjugate, pharmaceutical composition and method of treating hepatitis |
Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2015042447A1 (en) | 2013-09-20 | 2015-03-26 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Targeted therapeutic nucleosides and their use |
| JP2016526874A (ja) | 2013-05-01 | 2016-09-08 | アイオーニス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッドIonis Pharmaceuticals,Inc. | アポリポタンパク質c−iiiの発現を調節するための組成物および方法 |
| WO2018140920A1 (en) | 2017-01-30 | 2018-08-02 | Arrowhead Pharmaceuticals Inc. | Compositions and methods for inhibition of factor xii gene expression |
| WO2018187515A1 (en) | 2017-04-04 | 2018-10-11 | Avidea Technologies, Inc. | Peptide-based vaccines, methods of manufacturing, and uses thereof for inducing an immune response |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP5519523B2 (ja) | 2007-12-04 | 2014-06-11 | アルニラム ファーマスーティカルズ インコーポレイテッド | オリゴヌクレオチドの送達剤としての糖質コンジュゲート |
| WO2011100131A2 (en) * | 2010-01-28 | 2011-08-18 | Alnylam Pharmacuticals, Inc. | Monomers and oligonucleotides comprising cycloaddition adduct(s) |
| SMT202000308T1 (it) | 2011-11-18 | 2020-07-08 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | Agenti rnai, composizioni e loro metodi di utilizzo per il trattamento di malattie associate a transtiretina (ttr) |
| WO2015105083A1 (ja) | 2014-01-07 | 2015-07-16 | 塩野義製薬株式会社 | アンチセンスオリゴヌクレオチド及び糖誘導体を含む二本鎖オリゴヌクレオチド |
| EP3569711B1 (en) | 2014-12-15 | 2021-02-03 | Dicerna Pharmaceuticals, Inc. | Ligand-modified double-stranded nucleic acids |
| ES2952757T3 (es) * | 2016-06-30 | 2023-11-03 | Kyowa Kirin Co Ltd | Complejo de ácidos nucleicos |
| MX2019008252A (es) * | 2017-01-10 | 2019-09-06 | Arrowhead Pharmaceuticals Inc | Agentes de interferencia de acido ribonucleico (iarn) de alfa-1 antitripsina (aat), composiciones que incluyen agentes de iarn aat y metodos de uso. |
-
2021
- 2021-01-28 TW TW110103325A patent/TWI877296B/zh active
- 2021-01-28 US US17/791,343 patent/US20230151360A1/en active Pending
- 2021-01-28 WO PCT/JP2021/003085 patent/WO2021153687A1/ja not_active Ceased
- 2021-01-28 JP JP2021574117A patent/JP7681525B2/ja active Active
- 2021-01-28 CN CN202180008225.XA patent/CN114929729B/zh active Active
- 2021-01-28 EP EP21747841.1A patent/EP4071163A4/en active Pending
Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2016526874A (ja) | 2013-05-01 | 2016-09-08 | アイオーニス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッドIonis Pharmaceuticals,Inc. | アポリポタンパク質c−iiiの発現を調節するための組成物および方法 |
| WO2015042447A1 (en) | 2013-09-20 | 2015-03-26 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Targeted therapeutic nucleosides and their use |
| WO2018140920A1 (en) | 2017-01-30 | 2018-08-02 | Arrowhead Pharmaceuticals Inc. | Compositions and methods for inhibition of factor xii gene expression |
| WO2018187515A1 (en) | 2017-04-04 | 2018-10-11 | Avidea Technologies, Inc. | Peptide-based vaccines, methods of manufacturing, and uses thereof for inducing an immune response |
Non-Patent Citations (2)
| Title |
|---|
| JAYAPRAKASH, K.N., et al.,"Non-nucleoside building blocks for copper-assisted and copper-free click chemistry for the efficient synthesis of RNA conjugates.",ORGANIC LETTERS,2010年12月03日,Vol.12, No.23,pp.5410-5413,DOI: 10.1021/ol102205j,[Published on Web November 04, 2010] |
| KIZIL, C., et al.,"Efficient cargo delivery into adult brain tissue using short cell-penetrating peptides.",PLOS ONE,2015年04月20日,Vol.10, No.4,e0124073 (pp.1-15),DOI: 10.1371/journal.pone.0124073 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| US20230151360A1 (en) | 2023-05-18 |
| EP4071163A4 (en) | 2024-03-20 |
| EP4071163A1 (en) | 2022-10-12 |
| CN114929729A (zh) | 2022-08-19 |
| TW202142260A (zh) | 2021-11-16 |
| JPWO2021153687A1 (ja) | 2021-08-05 |
| CN114929729B (zh) | 2024-12-03 |
| WO2021153687A1 (ja) | 2021-08-05 |
| TWI877296B (zh) | 2025-03-21 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN111164091B (zh) | 寡核苷酸组合物及其使用方法 | |
| CN110997692B (zh) | 寡核苷酸组合物及其使用方法 | |
| JP6983797B2 (ja) | 治療化合物用の標的化リガンド | |
| JP6853193B2 (ja) | 核酸複合体 | |
| JP7383308B2 (ja) | 新規化合物及びその適用 | |
| CN112105625B (zh) | 核苷酸前体、核苷酸类似物以及含其的寡聚化合物 | |
| AU2020202289A1 (en) | Functionally-modified oligonucleotides and subunits thereof | |
| JP2024546952A (ja) | 脂質ナノ粒子製剤に用いるための脂質 | |
| TW201909925A (zh) | 核酸複合體 | |
| JP6667179B2 (ja) | オリゴヌクレオチド誘導体及びそれを用いたオリゴヌクレオチド構築物並びにそれらの製造方法 | |
| CN114728999A (zh) | 含有核苷酸类似物的寡核苷酸 | |
| JPWO2018110678A1 (ja) | ヌクレオシド誘導体及びその利用 | |
| US20250161461A1 (en) | Targeting ligand containing n-acetylgalactosamine | |
| JP2025500860A (ja) | dsRNA、その調製方法及び使用 | |
| JP7681525B2 (ja) | 核酸複合体及びそれを含む医薬組成物 | |
| WO2021085509A1 (ja) | ヌクレオシド誘導体及びその利用 | |
| EP3888663A1 (en) | Nucleic acid complex | |
| WO2024093907A1 (zh) | 向眼部和中枢神经系统递送sirna的配体 | |
| TW201920668A (zh) | 核酸複合體 | |
| JP2023528966A (ja) | 二本鎖siRNA類似体のコンジュゲート | |
| WO2025143262A1 (ja) | カルバモイルエチル修飾を含有する二本鎖rna | |
| CN118638166A (zh) | 含有三氮唑结构的GalNAc化合物及其寡核苷酸缀合物 | |
| WO2024002006A1 (zh) | 具有增强的稳定性的核苷酸替代物 | |
| HK40059056A (en) | Nucleic acid complex |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20231128 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20241126 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20250121 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20250507 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20250512 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 7681525 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |